Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP021262 | Legionella pneumophila subsp. pascullei strain U8W (D-7160) chromosome, complete genome | 1 crisprs | csa3,DEDDh,DinG,cas3,WYL | 0 | 8 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP021262_1 | 513744-514255 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP021262_1
|
8 spacers
spacers of NZ_CP021262_1
>1.1|513776|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder AGCTGAGTTAAAAGCGGCCGGTTTTAGT >1.2|513836|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder AAAGGAATTGCGTGATGCGGGATTCTCC >1.3|513896|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder AAAAGATCTAAAAGACGCTGGTTTTTCT >1.4|513956|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder AGCACAGCTCAAGGCCGCTGGGTTTTCT >1.5|514016|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder CGCAGAGTTAAAAGCAGCAGGATTTGAC >1.6|514076|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder TGCAGAATTAAAAGCAGCCGGATTTAGC >1.7|514136|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder CTCGGATTTGAAAAACGCAGGGTTTAGT >1.8|514196|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder CGACGAGCTAAAAAAAGCAGGATATACC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP021262_1
The CRISPR arrays of NZ_CP021262_1 >merge|NZ_CP021262|1|513744-514255|CRISPRCasFinder GCAAAAGAGCTGAAAGATGCCGGGTTTACTGCAGCTGAGTTAAAAGCGGCCGGTTTTAGTGCTAAAGACTTAAAAGACGCCGGTTTTACAGCAAAGGAATTGCGTGATGCGGGATTCTCCGCTCAGGAATTAAAAGATGCTGGTTTTAGCGCAAAAGATCTAAAAGACGCTGGTTTTTCTGCTGCAGAATTAAAAGCAGCTGGATTTACAGCAGCACAGCTCAAGGCCGCTGGGTTTTCTGCAAAAGATCTAAAAGATGCTGGTTTTTCTGCCGCAGAGTTAAAAGCAGCAGGATTTGACGCAAAAGAATTGAAAGATGCTGGTTTTTCTGCTGCAGAATTAAAAGCAGCCGGATTTAGCGCAAAAGAATTGAAAGATGCTGGTTTTAGTGCCTCGGATTTGAAAAACGCAGGGTTTAGTGCCTCAGAATTAAAGAATGCTGGATATTCTGCCGACGAGCTAAAAAAAGCAGGATATACCTCAGCTGAACTGAGAAATGCTGGTTTTTCTCC >NZ_CP021262|1|1|513744-514255|CRISPRCasFinder GCAAAAGAGCTGAAAGATGCCGGGTTTACTGC AGCTGAGTTAAAAGCGGCCGGTTTTAGT GCTAAAGACTTAAAAGACGCCGGTTTTACAGC AAAGGAATTGCGTGATGCGGGATTCTCC GCTCAGGAATTAAAAGATGCTGGTTTTAGCGC AAAAGATCTAAAAGACGCTGGTTTTTCT GCTGCAGAATTAAAAGCAGCTGGATTTACAGC AGCACAGCTCAAGGCCGCTGGGTTTTCT GCAAAAGATCTAAAAGATGCTGGTTTTTCTGC CGCAGAGTTAAAAGCAGCAGGATTTGAC GCAAAAGAATTGAAAGATGCTGGTTTTTCTGC TGCAGAATTAAAAGCAGCCGGATTTAGC GCAAAAGAATTGAAAGATGCTGGTTTTAGTGC CTCGGATTTGAAAAACGCAGGGTTTAGT GCCTCAGAATTAAAGAATGCTGGATATTCTGC CGACGAGCTAAAAAAAGCAGGATATACC TCAGCTGAACTGAGAAATGCTGGTTTTTCTCC
>NZ_CP021262.1|WP_027223523.1|510982_512065_+|DotH/IcmK-family-type-IV-secretion-protein MKKHYQLCKYCLVISLTFSMSCSVYAADQSDDAQQALQQLRMLQQKLSQNPAPDVQLGTGDGGDNAASDGTQQSNQAGQTNTPAANQTANAGGEGQIISQDDAEVIDKKAFKDMTRNLYPLNPEQVVRLKQIYETSEYAKAATPGTPPKPTATSQFVNLSPGSTPPVIRLSQGFVSSLVFLDSTGAPWPIAAYDLGDPSSFNIQWDKTSNTLMIQATKLYNYGNLAVRLRGLNTPVMLTLIPGQKAVDYRVDLRVQGYGPNAKSMPTEEGIPPSANDLLLHVLEGVPPPGSRRLVVSGGDARAWLSNEKMYVRTNLTILSPGWLASMTSADGTHAYEMQKSPVLLVSWHGKVMQLKVEGL >NZ_CP021262.1|WP_027223522.1|510341_510980_+|type-IVB-secretion-system-apparatus-protein-IcmL/DotI MAEDALTVVALRNKFYKDSQRKVILALLIAILVNVVLASLVVYMITHPPAPKYFATSINGRITPLFPLDEPNQSDSAVLQWANQAAIAAFTYNFVNYRDELQASSGFFTAEGWDQFLGALEQSNNLDAVKAKKLVVSAVATRAPIILQKGVLNGRYSWRVQMPILVTYQSASEFTQQNNVVTMLITRVSTLNSPRGIGISQFVVGPASGGVS >NZ_CP021262.1|WP_027223521.1|510042_510327_+|hypothetical-protein MSRETWALIKRNKNFNVHIYRRGLTLLILSLGLNCGLSGLIYYVHMHEPERDFYATSGITPPIQLKPMSTPNMSSQALLPPDPPDDDSQRIIPQ >NZ_CP021262.1|WP_027223520.1|509461_510031_+|OmpA-family-protein MRSLRTNYIYVLFKTTGLFFLLFLSACHRSGYIPENEVPKLPCRVDGACDATIIKMMTDLNKKGIKVASVGQNYLISIPASALFADQSPRLHWASYSLLNEIATFLKQFRKIAITVTSYSSKYVSVKRERALTLARSRVVSEYLWSQGVDSRIIFTQGLGSDKPITSYTLGGDRSPNARVEITFRRAVA >NZ_CP021262.1|WP_027223519.1|506714_509066_+|TraM-recognition-domain-containing-protein MMRGIDSRHELDPTLLLRDTRTFTQRLADFFADPTNISIVLISLAAVSYYFSESATFLLIMGGIFFLYSYTRKQKLPFRLPQISRAKDYNDLKPGINKPNIARGITFFGNDRKTGEELWFANDDMRTHALIFGSTGSGKTETLVSLSYNALVQGSGFIYVDGKGDNSLYAKVFSMVRSMGREDDLLLINFMTGARDIVGPQEKRLSNTLNPFCQGSSSMLTQLVVSLMGSSGQSSDGDMWKGRAIAFVEALMRLLVYMRDEGAILLDANTIRNYFDLQRLESIVIDKVFPRDDQESVNIETIPKLVTDPLRNYLNTLPGYNKEKKGKQVSQVLEQHGFITMQLVRSFSSLADTYGHIIRTNLAEVDFKDVVLNRRILVVLLPALEKSPDELSNLGKIIVSSLKAMMAAGLGEEVEGDYRDVILRKPTNAPTPYMCILDEYGYYAVQGFAVVPAQARSLGFSAIFAGQDLPAFQKASKEEAASIGANTNIKICMKLEDPTETWDFFTKTAGEAYVTKVDSFQTKETSIANSYMDTKSSSFEKRARVDLLDLKEQTEGEAHIFFKSKIVRARMFYANPKPVKQLKINQFLKVEPPPDDYLMKLQKQLASFQSILESGDLSINKTVENEEITLISKALKESTIVEPIERGVAALIAFHGQNEPEPVEDIVEEEVEGALTIFSKLRIDPDAPPILVADKEAFSEPLLPINETRNQMITIERLAGAKDKYAGTVANELIKDFQIATSYPPEERDVIDNQELTDIIRDLSAKISAEREKANKKAAEELT >NZ_CP021262.1|WP_027223518.1|505587_506718_+|type-IVB-secretion-system-coupling-complex-protein-DotM/IcmP MAQQQQQSGSDNSMAPVWIVILLFITAYFIWALAHQYIVSFVFTINIWQARLVNLFLNNQLLANQIYLMQTLDPNTVNWDQMVTVMRAVGDYMRYPVICILVVLAFVLYNSNVTLKYRKTYDMKSLRAQEQFNWPAIMPIIKEDLVSQDINKGPWAMALTPMEFARKYNLLRKDDALLDNPVPGEEMTAGIRRGDAKRVFTMQLGPYWDGFERCSPQAYALSAVFMARMNRDRDAANNILKVLDKTFVDGKPDFSVARPVMKKYQNTELVQEVVAKHAYVLTVIASLLEAAREDGVVPSSEFLWLKPVDRRLWYMLNCVGRQTPYSEVAGPFAHWKAEKEMGRRSLVPMIDEAIRALEIAVKEVKLSPRQMEELEP >NZ_CP021262.1|WP_027223517.1|504825_505401_+|Dot/Icm-secretion-system-protein-IcmQ MKDQLSDEQKETILKALNDAIEKGPWDKSNFLRVIGKKLIAIRDRFLKRIGAASQAKLKAESHLANRIALRSGQQEIYVSLYSSDGSNIQSWEKIVGSLPRQMISRPIYADEEDIKAVLKTKENKQNEAYVSIYINQSDILHLSADKAPVDKLGKPLLTLKDKSISLENISRFVHVTGVYRYSNGRLIKNG >NZ_CP021262.1|WP_027223516.1|504372_504735_+|hypothetical-protein MGNNTDDSARNPFGFYTPPRVKEIGETDVTDATLDSVYSEIISPVKDCILTVAKAVSFNPGGKDNTDAVEVLTELNTKVERAALNQPGLTTKTERMFGATEPEKSSEQPSHEERGFKLSS >NZ_CP021262.1|WP_014843348.1|503928_504273_+|Dot/Icm-secretion-system-substrate-recognition-protein MERDISKCMAKIAASMNAKFYLNDRFVSFDEVFSETGLLPAIAKRADQLCSLCLGYGLGATYDEAEGALLGIRVVFDEVTPNVLRLLCMTDVMNELIQGGPSRDYTPLDELMYD >NZ_CP021262.1|WP_027223515.1|503281_503494_+|hypothetical-protein MDIHSTYKMLAKMQGNKELSSHKIAETEQTEADTVPQLKLQAEPEAKPDMQNILSNMLGISSNKKHSPMD >NZ_CP021262.1|WP_027223525.1|515224_516034_+|hypothetical-protein MMAEHDQNNDEYKFAELDSYDMDQAGESDLDSQASFQSGKEGLTKKKDIKRNALIAIGVVIFIMVMYKIIGWMFFSDKSKQVTSQPAIPPVTQVATPQPVQTIPTTTPIQQVQPTTIVEDDSDLKKKVSAIEMTQQSLRSEVTALSEQINAVNNNIKNLNAQIVNLNQIIGNMSNQIARQSEVINVLMVRTTPKKVVKISRPTVAARVIYYIQAVIPGRAWLIGSNGSTLTVREGSKIPGYGIVKLIDSLQGRILTSSGQVIKFSQEDS >NZ_CP021262.1|WP_027223526.1|516041_516626_+|hypothetical-protein MADPTCTGGTVSCWIVSQANILANVANQLEPVQRLITGGAYLIGCAFIFKAIYSLKVYGEARTMMSSNTSIKEPVMYLLVGALLIYFPSLVSSVLQTTFGYSSPLAYSGGVSSGSDTITALFGSGSLVGRPLVMIIRVIGLIAFVRGWVLIARSASQGQPPGGTGKGLIHVFGGILAINIVGTIDMINNTLYGT >NZ_CP021262.1|WP_027223527.1|516650_517049_+|hypothetical-protein MNIKVIHKSGYKHWLVSAVCLALLTLICQDAAAGVSLGKMASQITGSFTSLTKLITAGSYLAGLGFSIGAIMKFKQHKDNPTQIPIGTPIALIFIAAALLFLPSILGVAGVTMFGGSGGKTAGPTGTIYKTN >NZ_CP021262.1|WP_027223528.1|517248_517875_+|HNH-endonuclease MADNQQRCELKLIASPGSWRLYSARKIDERFKSYEQKIFQRDRFTCQFCGFQARLYQDIVNLDGDYTNNRLSNLVTACCFCAQCFFVESVGVGGYGGGTLIYLPELTQAELNSLCHVLFCAITNDTGYKSSAQNIYRSFKFRSQIVEEKFGEGTSDPAIFGQLMIDSGVNSEEIRQKLFKNIRLLPSRAKFRKQIEKWAASALEEIAD >NZ_CP021262.1|WP_027223529.1|517910_520940_+|type-IV-secretion-protein-IcmB MANWSESFFEGVDTFFAWLSTSLKQTTESYIDLETADSPTVLVNHDGSLLSILKIEGITGLAGPEEFERLVEGLANSFQAAMGRPGHALQVYFSHDKQNIVKMIKDIYDPAEATANRLELNLRDLFEERVNYLSQYCAEERVYFVLYTRPFNLASDQLKAANKAKMKMIKDTKAPPFKNSQTIFAAVPEIRDTHDAYVRAILNDLDALNVIAKLLEVHDAVHAIRMTGDPDYTADDWRATLPGDKISVRELNNFEGDPSDLLWPPLSKQVLPRDAEIIDLRTVRVGDKIYASTYIDLFPKDVRPFISLFSRILPSHVPWKISFLLESEGLSTIKLKGLLAAILSFSSAQNRLISDSVNLLKYIQLNTDEAIVRLRVVATTWAPEGNIPLLRRRSSELVKAIEGWGSTDVSEICGDPFAGFVSSMLATTLNSSAVASVAPLSDVISMLPITRPASPWKTGALLFRTPDGKPWPFQPGSTEQTTWIDLVYARPGSGKSVLSNALNLALCLSGGLMRLPRIAIIDIGPSSSGLISLLKEALPASKRHLVAYHRLRMTPDYSINPFDTQLGCRYPTALERSFLVNFMTLLTTPLGAAKPYDGMADLAGMVVDELYKSLADEFNPTPYAPGIEEFIDSILEEIGFVRDAKSTWWEVTDALYSAGFVHEAMLAQRYAMPLLADAASICRTPSIEDLYEKITAPTGESLINAFSRMISSAVREYPILSRVTSFDIGDARVVSLDLDEVAKSGGDAADRQTAVMYMLARYVLARHYYLTEESLNNVPEQYKEYHKQRVLEIREDHKRIVYDEFHRTAKSSAVREQVIIDMREGRKWKVQISLLSQAVDDFDPVMIDFATAIYVMDAGPSQAVEKTSQIFGLSETAKIALRTRVHGPRQGGATFLAQFATKTGINVQLLTLTLGPVELWAFSTTAEDATVRNLLYRHLGPSEARRLLAALFPNGTVTKELEARLASMKQKVGLIEDDEREGMINQLVNDILEAYSKDPNVKSLPAKVG >NZ_CP021262.1|WP_027223530.1|521089_522346_-|MFS-transporter MKQNTKHSIIAGLYGNALEWYDFLLYASFAPVFAEIFFPSKIHFVSLIATFSLFAIGFIMRPIGGLLLGHYADHVGRRKALILSMSVMTISTALIAVLPDFNSWGIIAPILFSVLRLIQGLAVGGELPGSTTYLIEHMFQNRRGLAGSLVLSSAFLGIFIGALTASIFSTLFTGDSLLNWGWRYAYLLGGILGILGIYLRIKSFESPTFLKDKHTTKLPAKVVFTQFKQQLFLSVIITSILAMANYVLIAYVTTFLVKSEYFLLKDALLINLIALALLTVLIPLMGFLSDAVGRKPIFLIGLFSLSILIFPFFWLLLSGSWWIALCCELLLALVLAPINATVPTIIAEMFPTSVRASGISISYNIGQALFGGTMPLVAFTLIELSNNKMAPAWYLFLWILIVIPITISIRESYQKELI >NZ_CP021262.1|WP_027223531.1|522348_525270_-|type-VI-secretion-protein-IcmF MDNSLRALCDAIKKILSQLKPQVNQLSFIIITGKNAQGKSALLKQSNMEEMPVFSEEHAKLYFNQKGIIVELGENWLTNSKTLLLTTLKQLNKCNRHLKITGLILCVDVNDLLIAEPAQFTEQKKSHLQLLQRLGVNLGYQAELALIFTKMDTLAGFSEFYQMDHVNDLSKPLGFSLDCVNQPSKKIETYSLQFNQLIEALGQQVINKMHPVRSTIKRSLIREFPMQLASLRAPIQSLIQGISPKLFHVHSIFFTSAQQGGVSIDRLNKKIQHEYALVVQDTFPQATNFRSYFVEGALKTIQEQCVQIPQVTKFSQRPFIAVAVSLAGLSLLTLSYNHYKTSHILDEASKELLAYEALNNQGTSGAQALYHLSQAANKMNHITSNSISLPTVHQLKLNLQNNTQNRLQGEFLPSLANELEQVITNPGNTPITRYKALKIYLMLGQAKYFSAQPILDWFQQQWKGHASGTIQKQLALLKQTLNNPPQNIPIKSQVISDARNYLNALPTSYLYYSIAKEYFPQEKQKIVIEGFTLPTDEVPTYFTKTGFTKTINDLPKITNTLQSENWVLARQDLSQLHNMLIQAYCFDYVTWWQTFMKKSQPLRYQDYQQGRQLTKLIQQSNSFYKFANLIQQETKPDLTEGISTFNQFIANQFTDLNLTTLSSIKELDLRISELERFIATLSVVNDGGKTAFTITRSRFINDNSSDPVSLLYSQARQLPEPLSSWTRQIAGDAWVILIRDSRQFINNQWQKTVYREFQNSIAKRYPFDSSQTAEIDIADFNRFFSTHGLLNTYSEQYIKPFLDTSSPEWKPKAVNDFILPISNEVIDELIRANIITNMFFPDHSDESKIDFSLQKISLDPVVSNLVLEIGGTKLMDNQTSDSLIRFTWPQNNAKLALDSIEGNHYELTEHGTWAIFKLLEKVNVLVDEQDSSSLQILFEVNSNSGRYLLKTNNQINPFTPGILNGFTLNDHIA >NZ_CP021262.1|WP_027223532.1|525269_526055_-|DotU-family-type-IV/VI-secretion-system-protein MTTEQYPSSLVNRLAITEPALVPSGYYRSKLFIAPFSTNILVAAAGPLLSLLERLCLSPSLPPVEDIRENIQHELRAFHSKLDASKYPLDIISIAQYLLSATIDEILGKSYLRVYNLTTEFKSFTPLSSDGAQPQQRFFEILNYIKERPNQFLDLIELTYFCLIAGFEGEYHLKADGRQSLDNTIEDLYQIIQKYRFNKPHRLFNENPLPKTIKKNYKATWITTIGAAGIVILAFVTSHVLLENKAKTVLFGHTQLAMLEN >NZ_CP021262.1|WP_027223533.1|526324_527914_-|bifunctional-phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide-formyltransferase/IMP-cyclohydrolase MAKKQIYSSFKPRRALLSVSDKRGIKELGQALHDHGVELIATGNTAAMLREHQLPVTDVSDCTGFPEIMDGRVKTLHPAIHAGLLARGEQDSPVLKQHGIKPIDLLIVNLYPFEQVINHPDCDFNKAIENIDIGGPTMVRAAAKNHAHAYVIVDPNDYPKLIHYLQDEKAPSHWSFTLAKKAFAHTAAYDAAIANYLTTLDNDYVPTGFPNVLTCQFNKITELRYGENPHQQAIFYADKNSHPGSLGTATLLQGKQLSYNNILDADAALDCVKSFSNEKSVCVIVKHTNPCGIALSDTSLDAYLKAFQSDPISAYGGIIAFNGTLDSDTAKAILEKQFVEVIIAPDANEEAKKILAAKENIRVLLTGFWQQGTHFRLNMKKVDGGLLVQEHDSLSLESCELQTVTQIKPSDHQLQNLMFAWLAAKHVKSNAIVYAKDLATIGIGGGQTSRVMSARIGLWQAEQMGFDPKGSVMASDAFIPFPDTVEIAAKAGISAIIQPGGSIRDEQIISCADQHKMAMIFTGIRHFKH >NZ_CP021262.1|WP_027223534.1|527940_528810_-|50S-ribosomal-protein-L11-methyltransferase MWFQLKIEHCPNDKIEEITEELEEYGALSIMLTDKNDNPVLEPEPGTTPLWPEVIIHALFAQAEEVQYTRKQLVAKRPSLHCSLETLPDKNWERAWMEDFKPHRFGNRLWVCPTWLTPPEPDAVNLMLDPGLAFGTGTHATTSLCLTWLEQADLKNKSIIDYGCGSGILSLAAIKLGAKHVYAVDIDNQALQATQNNAHVNHIKENQLSISSPEALQNPVNLIIANILLAPLISLKERFHQLLPSGAHLVTSGILEEQAPLLIEAYDSAFTHISTEYYEGWALLVFTSK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP021262_1 | 1.1|513776|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder | 513776-513803 | 28 | MH617420 | Microviridae sp. isolate ctda655, complete genome | 2114-2141 | 4 | 0.857 |
NZ_CP021262_1 | 1.2|513836|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder | 513836-513863 | 28 | NZ_CP039340 | Ralstonia solanacearum strain UW386 plasmid pUW386, complete sequence | 1112477-1112504 | 4 | 0.857 |
NZ_CP021262_1 | 1.1|513776|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder | 513776-513803 | 28 | KX513870 | Human gut gokushovirus isolate SH-CHD7, complete genome | 3712-3739 | 5 | 0.821 |
NZ_CP021262_1 | 1.5|514016|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder | 514016-514043 | 28 | MN694311 | Marine virus AFVG_250M573, complete genome | 10970-10997 | 5 | 0.821 |
NZ_CP021262_1 | 1.5|514016|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder | 514016-514043 | 28 | MH572400 | Microviridae sp. isolate SD_SF_26, complete genome | 1865-1892 | 5 | 0.821 |
NZ_CP021262_1 | 1.3|513896|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder | 513896-513923 | 28 | NZ_CP009266 | Vibrio coralliilyticus strain OCN014 plasmid pOCN014, complete sequence | 77668-77695 | 6 | 0.786 |
NZ_CP021262_1 | 1.3|513896|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder | 513896-513923 | 28 | AP013512 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G21, isolate: uvMED-CGR-C84-MedDCM-OCT-S29-C65 | 18412-18439 | 6 | 0.786 |
NZ_CP021262_1 | 1.5|514016|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder | 514016-514043 | 28 | CP001772 | Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN03, complete sequence | 9571-9598 | 6 | 0.786 |
NZ_CP021262_1 | 1.6|514076|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder | 514076-514103 | 28 | MG945627 | UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 6152-1602, complete genome | 4943-4970 | 6 | 0.786 |
NZ_CP021262_1 | 1.7|514136|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder | 514136-514163 | 28 | MK016664 | Synechococcus phage S-B68, complete genome | 82125-82152 | 6 | 0.786 |
NZ_CP021262_1 | 1.7|514136|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder | 514136-514163 | 28 | MG945357 | UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 2878-18011, complete genome | 4023-4050 | 6 | 0.786 |
NZ_CP021262_1 | 1.7|514136|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder | 514136-514163 | 28 | MG945367 | UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 2878-1801, partial genome | 2152-2179 | 6 | 0.786 |
NZ_CP021262_1 | 1.8|514196|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder | 514196-514223 | 28 | MN657032 | Psychrobacter sp. strain ANT_P15B plasmid pA15BP2, complete sequence | 7476-7503 | 6 | 0.786 |
NZ_CP021262_1 | 1.4|513956|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder | 513956-513983 | 28 | MK033137 | UNVERIFIED: Pseudomonas phage UNO-SLW1, complete genome | 19369-19396 | 7 | 0.75 |
NZ_CP021262_1 | 1.4|513956|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder | 513956-513983 | 28 | KX449362 | Pseudomonas phage UNO-SLW3, complete genome | 16334-16361 | 7 | 0.75 |
NZ_CP021262_1 | 1.4|513956|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder | 513956-513983 | 28 | KX449363 | Pseudomonas phage UNO-SLW4, complete genome | 16320-16347 | 7 | 0.75 |
NZ_CP021262_1 | 1.4|513956|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder | 513956-513983 | 28 | NC_047873 | Pseudomonas phage UNO-SLW1, complete genome | 16414-16441 | 7 | 0.75 |
NZ_CP021262_1 | 1.4|513956|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder | 513956-513983 | 28 | KX449361 | Pseudomonas phage UNO-SLW2, complete genome | 16320-16347 | 7 | 0.75 |
NZ_CP021262_1 | 1.5|514016|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder | 514016-514043 | 28 | NC_031070 | Bacillus phage Nemo, complete genome | 129971-129998 | 7 | 0.75 |
NZ_CP021262_1 | 1.5|514016|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder | 514016-514043 | 28 | MN038179 | Bacillus phage ALPS, complete genome | 129126-129153 | 7 | 0.75 |
NZ_CP021262_1 | 1.5|514016|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder | 514016-514043 | 28 | MH638311 | Bacillus phage OmnioDeoPrimus, complete genome | 128883-128910 | 7 | 0.75 |
NZ_CP021262_1 | 1.5|514016|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder | 514016-514043 | 28 | MF288918 | Bacillus phage Bubs, complete genome | 130009-130036 | 7 | 0.75 |
NZ_CP021262_1 | 1.6|514076|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder | 514076-514103 | 28 | NC_019401 | Cronobacter phage vB_CsaM_GAP32, complete genome | 180398-180425 | 7 | 0.75 |
NZ_CP021262_1 | 1.8|514196|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder | 514196-514223 | 28 | NZ_CP015329 | Bacillus filamentosus strain Hbe603 plasmid pBEH7, complete sequence | 1016-1043 | 7 | 0.75 |
1. spacer 1.1|513776|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder matches to MH617420 (Microviridae sp. isolate ctda655, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
agctgagttaaaagcggccggttttagt CRISPR spacer tgctgacttaaaagcggccggtcttaat Protospacer ***** ***************.***.*
2. spacer 1.2|513836|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039340 (Ralstonia solanacearum strain UW386 plasmid pUW386, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
aaaggaattgcgtgatgcgggattctcc CRISPR spacer acatgaattgcctgctgcgggattctcc Protospacer * * ******* ** *************
3. spacer 1.1|513776|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder matches to KX513870 (Human gut gokushovirus isolate SH-CHD7, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agctgagttaaaagcggccggttttagt CRISPR spacer cgctgatttaaaagcggcaggtttaaat Protospacer ***** *********** ***** *.*
4. spacer 1.5|514016|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder matches to MN694311 (Marine virus AFVG_250M573, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
cgcagagttaaaagcagcaggatttgac CRISPR spacer cgcagagtttcaagcagcaggatttata Protospacer ********* **************.
5. spacer 1.5|514016|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder matches to MH572400 (Microviridae sp. isolate SD_SF_26, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
cgcagagttaaaagcagcaggatttgac CRISPR spacer ggcagatttaaaagcagcaggaattaat Protospacer ***** *************** **.*.
6. spacer 1.3|513896|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009266 (Vibrio coralliilyticus strain OCN014 plasmid pOCN014, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
aaaagatctaaaagacgctggtttttct CRISPR spacer ccccgatctaaaagacgcaggttttcct Protospacer ************** ******.**
7. spacer 1.3|513896|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder matches to AP013512 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G21, isolate: uvMED-CGR-C84-MedDCM-OCT-S29-C65) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
aaaagatctaaaagacgctggtttttct CRISPR spacer atttaatctaaaagatgctgatttttct Protospacer * .**********.****.*******
8. spacer 1.5|514016|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder matches to CP001772 (Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN03, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
cgcagagttaaaagcagcaggatttgac CRISPR spacer aaaagaattaaaagcagtaggatttgat Protospacer . ***.**********.*********.
9. spacer 1.6|514076|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder matches to MG945627 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 6152-1602, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
tgcagaattaaaagcagccggatttagc CRISPR spacer agccgacttaaaagcagccggattaaat Protospacer ** ** ***************** *..
10. spacer 1.7|514136|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder matches to MK016664 (Synechococcus phage S-B68, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
ctcggatttgaaaaacgcagggtttagt CRISPR spacer agtcgatttgaaaaacgcagcgtttaat Protospacer . **************** *****.*
11. spacer 1.7|514136|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder matches to MG945357 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 2878-18011, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
ctcggatttgaaaaacgcagggtttagt CRISPR spacer acaggatttgaaaaacgcaggtttgaat Protospacer . ****************** ** *.*
12. spacer 1.7|514136|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder matches to MG945367 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 2878-1801, partial genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
ctcggatttgaaaaacgcagggtttagt CRISPR spacer acaggatttgaaaaacgcaggtttgaat Protospacer . ****************** ** *.*
13. spacer 1.8|514196|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder matches to MN657032 (Psychrobacter sp. strain ANT_P15B plasmid pA15BP2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
cgacgagctaaaaaaagcaggatatacc CRISPR spacer tgatcagctaaaaaaagcaggttataaa Protospacer .**. **************** ****
14. spacer 1.4|513956|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder matches to MK033137 (UNVERIFIED: Pseudomonas phage UNO-SLW1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
agcacagctcaaggccgctgggttttct CRISPR spacer agcgcagctcaaggccgctggcgtccac Protospacer ***.***************** *.. .
15. spacer 1.4|513956|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder matches to KX449362 (Pseudomonas phage UNO-SLW3, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
agcacagctcaaggccgctgggttttct CRISPR spacer agcgcagctcaaggccgctggcgtccac Protospacer ***.***************** *.. .
16. spacer 1.4|513956|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder matches to KX449363 (Pseudomonas phage UNO-SLW4, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
agcacagctcaaggccgctgggttttct CRISPR spacer agcgcagctcaaggccgctggcgtccac Protospacer ***.***************** *.. .
17. spacer 1.4|513956|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder matches to NC_047873 (Pseudomonas phage UNO-SLW1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
agcacagctcaaggccgctgggttttct CRISPR spacer agcgcagctcaaggccgctggcgtccac Protospacer ***.***************** *.. .
18. spacer 1.4|513956|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder matches to KX449361 (Pseudomonas phage UNO-SLW2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
agcacagctcaaggccgctgggttttct CRISPR spacer agcgcagctcaaggccgctggcgtccac Protospacer ***.***************** *.. .
19. spacer 1.5|514016|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder matches to NC_031070 (Bacillus phage Nemo, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
cgcagagttaaaagcagcaggatttgac CRISPR spacer gaacaagttaaaggcagcaggatttgaa Protospacer . .*******.**************
20. spacer 1.5|514016|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder matches to MN038179 (Bacillus phage ALPS, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
cgcagagttaaaagcagcaggatttgac CRISPR spacer gaacaaattaaaagcagcaggatttgaa Protospacer . .*.********************
21. spacer 1.5|514016|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder matches to MH638311 (Bacillus phage OmnioDeoPrimus, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
cgcagagttaaaagcagcaggatttgac CRISPR spacer gaacaagttaaaggcagcaggatttgaa Protospacer . .*******.**************
22. spacer 1.5|514016|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder matches to MF288918 (Bacillus phage Bubs, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
cgcagagttaaaagcagcaggatttgac CRISPR spacer gaacaagttaaaggcagcaggatttgaa Protospacer . .*******.**************
23. spacer 1.6|514076|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder matches to NC_019401 (Cronobacter phage vB_CsaM_GAP32, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
tgcagaattaaaagcagccggatttagc CRISPR spacer aagagaattacaagcagccggaattact Protospacer . ******* *********** *** .
24. spacer 1.8|514196|28|NZ_CP021262|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015329 (Bacillus filamentosus strain Hbe603 plasmid pBEH7, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
cgacgagctaaaaaaagcaggatatacc CRISPR spacer aatagaactagaaaaagcaggatatact Protospacer . **.***.****************.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
965500 : 972383
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP021262|965500:972383|DBSCAN-SWA ATTAATTATGCATCAGTTCCTGTAATGCTTTCCCGATGTTATCAGCTCTCATTAAACTTTCTCCAATCAAAAAGGCATTAATTCCATGGGATTGCATTAATTTTATGTCTTCACGGGTGTTAATTCCGCTTTCGGTAATAATAATTTTATCTTTAGGGGCCAGTTGTTTTAATTGGATACTCAACTGAATGTCTGTTTTAAAGGTGTGAAGGCTGCGGTTGTTAATGCCTATAAGAGGGGTAGGTAAGCGTAAGGCTCTTTCTAACTCATCTTGCGTGTGGCTTTCAACCAAAACAGACATTTTAAGTTCTTGAGCCAGTTGGCAAAAATCCATTAATTGCACATCATCCAATAAGGCGACAATCAACAAAATACAATCAGCGCCCAAGACGAGACTTTCGTAGATTTGATAAGAATCAATAATAAAATCTTTACGTAATACGGGTAAAGTACTTTTTGATTTTGCCAAGGCTAAATAATCCGGATGACCCTGAAAAAACTCAATATCCGTTAAAACAGATAAGCATCTTGCACCATGCTGAGTATAAGTTTTGGCAATTTCTGCAACATTAAAATCTTTTCGAATTAAACCCTTGCTTGGAGAAGCTTTTTTTATCTCAGCGATGATTGCCGGGGAAGCATTGGATTTTAAAGCGGTTGTGAAGTCACGTATTTCTCCCGGCCGTTGTTTTGACAGAACATGCAAAGGTTTGTTCTTTTTCGCGACTGCAATTTCCTCTAATTTATGCTGAGCTATGCGTTCTAGGATACTATTCATGATTTGATTCTTTATTTAAAGTTTGAGTCAATAAACGAAGTTTGTTAAAGCAATCATTTGCCTTACCACTATCAATAGCAATTCTTGCTTCCTCTATGGCCGCATCAAACGATATATCATCTTTGGCACAATAAATGGCTGCGGCAGAATTGAGAAGGACTATATCTCGAGCTGGGCCAGAATCACCGGAAAGTACTGATTGAATCAAATGCAGACTTTGTTCCGGTGAGTCCACTATGATTGCATCTAAAGAAGAATGCTTTAGACCATAATCTTCAGGAAAAATGAACCATTGCTTAAAATGTCCATCACGGTATTCAACCACTTCGCTTTTGGCCGCAATACTAATTTCATCCAGTCCATCCTGGGAGCTTATTACTAATGATCTTTCACTACCCAAATTAGCCAGAACAGTGGCTATTGTTTTGAGCCAACTCGTAGAAAATACACCAACAACTTGTCGTTTTACCTGAGCCGGGTTAATCAGCGGGCCAAGTAAATTAAATAAAGTCCTTATTCCTAATTGTTGTCTTGCAGCTCTCGCATGTTGCATGGCAGGATGATAATGGGGAGCAAACAAGAAAGCCAATTGACATTGGTTCATGCAGTCTTGTACATGTAAGTCAGAAAGATTGAGTATAAATCCAGCTTGTTCTAATAGATCAGCGCTGCCACTTCGGCTTGAAACAGAACGGTTACCATGCTTTGCAACCTTTATCCCTGCCGCAGCTGCTACAAAACCACATGCTGTCGATACATTAAAAGTATTTCTTCCATCTCCGCCAGTGCCAACTATATCAATGAGATTATTTCCTAAATCTATTTTGTGGGCTAATTGTCTCATGACTTTAGCAGCTGCAGTAAGCTCATTGACGGTTTCGCCTTTCATGCGCATTAATACCAGAAAGGTTGCAATTTGCACATCACTAAACTCACCTGTCATACAAGCATGGATGATCTCTTGCATCTGTTCTGAGCTCAAATCCTGTCGGGATAGAAGCTGTTCAAATAGAAGTTTGGGTTTCATAACGTAAAAAATTCTCGAGTATTTGTAAGCCAAATTGACTTAATATGGCTTCAGGATGAAATTGTAGACCAAAAAGAGGAAATTGACGATGTGATATTGCCATTATTGTATTGTTTGCCCATGCATCTATCGAAAAGCAATTGGGCAAGCTCATGATATCTACAGCTAAAGAATGATACCTTGTCGCTTGAAAGTGATTCGGTATTCCTTTAAATAAGCCCTGGTAATGATGGGTAATTTCTGAAGTTTTACCATGCATGATTTCTGACGCTGGAATAATTTTACCTCCAAAAGCCTGAGCTATGCACTGATGGCCAAGACAAATACCCAATATCGGGGTATGTCCATGAAATTCCTTAATAACTTCTATAGAAACTCCTGATTCATCAGGAGAGTTGGGGCCTGGTGAAATGACTATGTATTGTGGAGCTGATTTTCGGATAGCATCAATTTGAATTTGGTCATTTTTAAAAACGACCACTTCTTGATTCAGGCTCTGGAAATACTGGACCAGGTTATAAGTAAATGAATCGTAGTTATCAATAATTAGCAACATAATATAATTAAAAATGTATTTTTTAAATTAGGCTACAAAGCAAATTCTTCACCCAAATAGACTTGCCTTACTTGCTGATTGGCGAGTATGGCTTCCGGGGTTCCTTCGCAAAGAATTTTTCCCTGACTGACAATATAAGCGCGTTCACAAATGTCTAAAGTCTCTCTTACGTTATGATCTGTAATTAAAACCCCTATGCCTTTATCGCACAAATGCAAGATAATTTTTTTGATATCGATTACAGAAATTGGATCAACTCCTGCAAAGGGTTCGTCAAGTAAGATAAAGGATGGCTCTATTGCCAGAGCTCTTGCAATCTCAACACGCCTTCTTTCACCGCCAGATAATGCCATGCCCAAGCTGTTTTCTATGTGGGAAATATGAAACTCTTGTAAGAGGAGATCCAGCTTTTCTTCCCGCGTTTGATCATCTAAATCTTTTCTTAGTTCCAGAATTGCCATGATATTTTCGGCAACAGTAAGCTTTCTAAAAACAGAGGCTTCTTGCGGAAGGTAACTAATACCGTGCCTTGCTCTCAGATGCATAGCATCTTGAGTTATGTCTTTTCCGTTAAGAATAATGTGACCTTCATCACAGGATTGCAGACCTACAATCATATAAAAACAAGTGGTTTTACCCGCTCCGTTAGGACCCAACAACCCTACACATTCACCTTGCTTAATGTGAATGCTGACACCATTAACAACCGTTCGGCCCTTAAATGATTTTTTTAATTGTTTGGCTTCTAGTAAACTCATGATTTCTTTTCAGGATAAATAATGATTGTCGTTCTTGTTTTTTCGTCACTATGAGATAAAACATGTTGTTCCTGAGTATCATAACTAATTTTGGCCGCTGAAAGAGAGTTGGGTCCCTGCTCTATGCGAGCGTTCCCTATTAATTCGATTAAATGTTTGAGCGGGTAATATTTTATAGTATCCGCATAGGCATGGAATGGGGGTTTATCCGGGGCTGTTGTAGTCCAATAATGAGCTTGCTTATCTTTAGAGCCTTCAGCGATAGCTAAAGTAAGCTGATTTTTGGCATCCCCTTGAGTAATGGCTTTTGCTGCACGTAAATTGGTTGAGCCTTGAACGAATTCAACATTTCCTATATAGACTCCCTGATGGTTTTTTTGATTTAAATCCGCTGAATCAGAAACCACTTGCACCATTTTTTCCTTATCAAACGGAAGGGCGTTTCCTGAAATAGAGCACAACATCAACAATAACAGTATAATGTATTTAACCTTTAGCTGGGTCATAACTACCTCTGGCTTTATGGAGTAACTCTACTCTTTTCTCATCCAAATAGGCATTCATTCCAGTAGACTGTATAATATTGCCTGGTTGTTCAAAGGTTACAAAAAGACTTGTTGTTGCTTTTTTTTCCTTGGGGTAATAAGTGATTTCTTCAGTTTTTAAAGTACTTTCCCGAGTGCTTTCCCCGGGACTTTGATGAACCACTACTTGCTCGATAAATGTAATTTGTTTACCACCGTCAAATGATTTTGCCCGTAATGAATTGATTTCCCATGCCGGTTGATTGTCTTGCTTAATAATAATATGAGGGTTTTTAAGCAAATGAAGATTATTGTTAGGAATATATTCTACCTGTGGAGTGGTTAATAAGTTAATTAACACACCTTCTGAATTAAATTGCTTTACGGTAAGCTGCGAAATCGTTGTGTCAACTTCATTTGACAACGTTTTCTTATTGATAATAGCCTGATTAAAATGAGCATAATACCAACCCGAGCCTGCTAAAACAAGCAAGGTCAAGAATAGCCAAATTGCTTGCTTGGTAGTATTCATTGTTTTAAATAGCCTGTGATTGCTAATTCTGCTTTATTTTGTGCGTTAAGAATTAAGTCACATAATTCACGAACCGCACCTCGACCACCAGTTCGCTCTGTCCTCCAATCCGCAAATTCGAGAACCTGAGGCACGGCATTACTCACCGCAACACCTAATCCCACTTGTTGTATTAAAGGTAAGTCAGGCAAATCATCACCAATATAGGCGAACTCTTCATCATTGAGGCCTAATGTTTTTTTTAGATGTTGGTAAGCGTTACGTTTATCAACCTGACCTTTATAATAATGAGTTATACCTAATTGCTCCATTCGATGGTCAACCACAGTGTTTTGTGCAGTGGTAATGATTGCGACTTGTATCCCGGCAGCCATTAATAATTTTAATCCCATTCCATCTTGTACATGGAATGATTTCAGTTCATTACCGTGATTATCAATGTGAAGAAGACCATCACTGAGCACACCATCGACATCACAAATAAGACATTTAATTTTTTTCGCTTTTTCCAATAAGTCGTTCATTCTTTTCTCTATATATTAAAAAACACCTGCTTTTAGCAAGTCATGTAAATGGAGTACCGCATAAGGTCTATTATCATTTTCAACTACCACCAGGGATGTGATGCTATATTTTTGCATGATTGCTAAAGCTTCGGCAGCCAACATGCCTTTAGGAATGGTTCTGCAGTTTTTAGTCATGACGTCCTTAATTAAAGTGGTGTTGATATTAAATTGACGTGTCAATGTTCGACGTATATCTCCATCAGTATATACACCCACTAAATAGCCATGCTTGTCTACAACACAAGTCATTCCCAGTTTTTTATTCGTGACTTCAATTAAAGCGTCACTCACTGTGGCGTTTTCATTCGCTAATGGAAGTTGCTCTCCTGTATGACATAAATCATCTATTCTTAGCAAGAGCTTTTTGCCAAGTGTTCCTCCTGGATGGGAAAGGGCGAAATCTTCTGCGCTAAATCCCCGTGCTTGTAAAAGAGATATAGCCAATGCATCTCCCATAACCAGCGATACAGTAGTGCTGGTTGTTGGAGCAAGACCTAGTGGGCAGGCCTCTTGTTTAATACTGACATCTATATTGATATCGGCCGATTTAGCCAGAGTTGATTGTTTATTACCGGTCAATGCAATTAAGGGTACTTCAAGCCTTTTTAATAATGGAAGCAACGTAACTATTTCATGGGTATTACCCGAATTGGAAATGGCAACAACTATATCCTGACGGGTTATCATGCCTAAGTCTCCATGACTTGCCTCCCCAGGATGCATAAAAAAAGCAGGGCTGCCAGTGCTGGAAAAAGTAGACGCCAGTTTATTAGCTATGTGGCCAGATTTCCCCATGCCTGTGACGACAATGCGCCCTTTGCATGATAAGAGTAATTCACAAGCTTTTTCAAAACGTTCATCAATTCGTTGAGTTAGCTCAAATACAGCTTGTGCTTCAGTTTCAATAACTGCTAGTCCAAGTGTGCAAAAGTTCATAGGCCGTTGCGTTGTAATTTTGTTTGGCTTTCATTCTAACATAATGCATTTAAATGATGTACCCTATATTTGAGTAACTGATACAATTGTGTAATATTTGAATAGGTTGTTGGTATCTTAATACGGTTTAATATGTAGTGCTTATAATATTATTTTTGGATTAAATAAAATCCAGTTTTCTCTCTTTTTGCGAAAAATGAATTTTATTTGAATTTTATGAACAATTATTGAAAAAATTGGTTGTGTAAAAAAAATTTTATAAAGTTTTTTTTAGTGGAAACGCAATTATTAAACACATTTTTATTTATCCAGTATATACTTCATTAAAGAGATAAAAAAGCATTACCTGTCTTTGATAGATATCGAACTGACATCATTACCCGTTAAAATAATAATTGGATAATAAAGCATGCCTGATAATTGGGTTGAAATAAAAAATCTATTCTTTAGCCTTGATGATCGCTGCATTTTTGATGGCATTGATATGGTAGTGAAACAAGGCAAGATTACCGCTATTATGGGACCCAGTGGTTCTGGAAAGACTACTTTACTGCGGTTAATTGGTGCGCAATTAACGCCTGATAGTGGCCAAATTTATGTCAATGGCCAGAATATCCATCAATTATCCCGCAAAGCGCTTTATGAAACCAGGCGAAACATGGGATTGCTTTTTCAAAGTAGTGCCTTATTTACTCATCTTTCAGTATTTGAAAATGTTGCTTTTCCACTAAGAGAACATACTGAATTAAATGCATCCATGATAAGAAACATTGTATTAATGAAACTAGAAGCCGTTGGTTTGCGTGGAGCTGCGCATCTAATGCCTGCTCAATTATCCGGGGGGATGTGCAGGCGAGTTGCATTAGCCAGAACCATTGCCCTTGACCCTGTGTTAATGATGTATGATGAGCCTTTTACGGGGCAAGACCCAATTTCTATGGGAGTATTGGTCAGGTTAATACAACGATTGAATCAATTATTGCATACTACTACTATTATCGTATCTCATGATGTTGAAGAAACGTGTTCAATAGCAGATTACATCTACTTAATATCAGGAGGTAAGATTATAGGTCAAGGTACGCCGGAAGAATTAAAGCGATCTATTGAACCTCAGATAAGACAGTTTATGCATGGAGAAGCGGATGGGGTAGTTCCATTCCATTATCCGGCGAAGCCGTATACAGAGGAGTTATTAAATGCTTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP021262|965500:972383|967281_967860_-|WP_027221198.1|DBSCAN-SWA MLLIIDNYDSFTYNLVQYFQSLNQEVVVFKNDQIQIDAIRKSAPQYIVISPGPNSPDESGVSIEVIKEFHGHTPILGICLGHQCIAQAFGGKIIPASEIMHGKTSEITHHYQGLFKGIPNHFQATRYHSLAVDIMSLPNCFSIDAWANNTIMAISHRQFPLFGLQFHPEAILSQFGLQILENFLRYETQTSI >NZ_CP021262|965500:972383|971585_972383_+|WP_027221204.1|DBSCAN-SWA MPDNWVEIKNLFFSLDDRCIFDGIDMVVKQGKITAIMGPSGSGKTTLLRLIGAQLTPDSGQIYVNGQNIHQLSRKALYETRRNMGLLFQSSALFTHLSVFENVAFPLREHTELNASMIRNIVLMKLEAVGLRGAAHLMPAQLSGGMCRRVALARTIALDPVLMMYDEPFTGQDPISMGVLVRLIQRLNQLLHTTTIIVSHDVEETCSIADYIYLISGGKIIGQGTPEELKRSIEPQIRQFMHGEADGVVPFHYPAKPYTEELLNA >NZ_CP021262|965500:972383|969104_969674_-|WP_027221201.1|DBSCAN-SWA MNTTKQAIWLFLTLLVLAGSGWYYAHFNQAIINKKTLSNEVDTTISQLTVKQFNSEGVLINLLTTPQVEYIPNNNLHLLKNPHIIIKQDNQPAWEINSLRAKSFDGGKQITFIEQVVVHQSPGESTRESTLKTEEITYYPKEKKATTSLFVTFEQPGNIIQSTGMNAYLDEKRVELLHKARGSYDPAKG >NZ_CP021262|965500:972383|965500_966277_-|WP_027221196.1|DBSCAN-SWA MNSILERIAQHKLEEIAVAKKNKPLHVLSKQRPGEIRDFTTALKSNASPAIIAEIKKASPSKGLIRKDFNVAEIAKTYTQHGARCLSVLTDIEFFQGHPDYLALAKSKSTLPVLRKDFIIDSYQIYESLVLGADCILLIVALLDDVQLMDFCQLAQELKMSVLVESHTQDELERALRLPTPLIGINNRSLHTFKTDIQLSIQLKQLAPKDKIIITESGINTREDIKLMQSHGINAFLIGESLMRADNIGKALQELMHN >NZ_CP021262|965500:972383|967892_968618_-|WP_027221199.1|DBSCAN-SWA MSLLEAKQLKKSFKGRTVVNGVSIHIKQGECVGLLGPNGAGKTTCFYMIVGLQSCDEGHIILNGKDITQDAMHLRARHGISYLPQEASVFRKLTVAENIMAILELRKDLDDQTREEKLDLLLQEFHISHIENSLGMALSGGERRRVEIARALAIEPSFILLDEPFAGVDPISVIDIKKIILHLCDKGIGVLITDHNVRETLDICERAYIVSQGKILCEGTPEAILANQQVRQVYLGEEFAL >NZ_CP021262|965500:972383|966269_967304_-|WP_027221197.1|DBSCAN-SWA MKPKLLFEQLLSRQDLSSEQMQEIIHACMTGEFSDVQIATFLVLMRMKGETVNELTAAAKVMRQLAHKIDLGNNLIDIVGTGGDGRNTFNVSTACGFVAAAAGIKVAKHGNRSVSSRSGSADLLEQAGFILNLSDLHVQDCMNQCQLAFLFAPHYHPAMQHARAARQQLGIRTLFNLLGPLINPAQVKRQVVGVFSTSWLKTIATVLANLGSERSLVISSQDGLDEISIAAKSEVVEYRDGHFKQWFIFPEDYGLKHSSLDAIIVDSPEQSLHLIQSVLSGDSGPARDIVLLNSAAAIYCAKDDISFDAAIEEARIAIDSGKANDCFNKLRLLTQTLNKESNHE >NZ_CP021262|965500:972383|970213_971176_-|WP_027221203.1|DBSCAN-SWA MNFCTLGLAVIETEAQAVFELTQRIDERFEKACELLLSCKGRIVVTGMGKSGHIANKLASTFSSTGSPAFFMHPGEASHGDLGMITRQDIVVAISNSGNTHEIVTLLPLLKRLEVPLIALTGNKQSTLAKSADINIDVSIKQEACPLGLAPTTSTTVSLVMGDALAISLLQARGFSAEDFALSHPGGTLGKKLLLRIDDLCHTGEQLPLANENATVSDALIEVTNKKLGMTCVVDKHGYLVGVYTDGDIRRTLTRQFNINTTLIKDVMTKNCRTIPKGMLAAEALAIMQKYSITSLVVVENDNRPYAVLHLHDLLKAGVF >NZ_CP021262|965500:972383|969670_970198_-|WP_027221202.1|DBSCAN-SWA MNDLLEKAKKIKCLICDVDGVLSDGLLHIDNHGNELKSFHVQDGMGLKLLMAAGIQVAIITTAQNTVVDHRMEQLGITHYYKGQVDKRNAYQHLKKTLGLNDEEFAYIGDDLPDLPLIQQVGLGVAVSNAVPQVLEFADWRTERTGGRGAVRELCDLILNAQNKAELAITGYLKQ >NZ_CP021262|965500:972383|968614_969124_-|WP_027221200.1|DBSCAN-SWA MTQLKVKYIILLLLMLCSISGNALPFDKEKMVQVVSDSADLNQKNHQGVYIGNVEFVQGSTNLRAAKAITQGDAKNQLTLAIAEGSKDKQAHYWTTTAPDKPPFHAYADTIKYYPLKHLIELIGNARIEQGPNSLSAAKISYDTQEQHVLSHSDEKTRTTIIIYPEKKS |
9 | Acinetobacter_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
1229436 : 1279988
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP021262|1229436:1279988|DBSCAN-SWA 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54 | Salmonella_phage(20.0%) | integrase,transposase | attL 1226363:1226378|attR 1245240:1245255 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1355457 : 1364865
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP021262|1355457:1364865|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP021262|1355457:1364865|1358925_1359999_+|WP_027221418.1|DBSCAN-SWA MHEQFLLAALEQAKLGRGFCAPNPSVGAVAVQNGNIIAQAWHRGAGTPHAEQLLLSQIPPKTPGVKLYVTLEPCNHWGKTPPCVDAIISHGIEEVIFSYFDPNPIVAKSNSSAKLREHGIQVRHIPITVIDEFYKSYAYWTVTHKPRVTVKIAQTFDGKIGRSKGERLVLSNGLCEKFTHQMRAASDVILTSAKTVQMDNPRMNARLDSGVVAKPVAIIDRDLSLSDDAIIFSTAKHCHIYHQAQANQAKTYPNSTHYAMPLHNRLMDLDAIITHLGQLGYHDVWVEAGGAIFSALHSKGLVHRTYLYLVPRSLGDQAISAYQQQGIFEKAHTVSWNAMGDNMIVCLDWQEDECLPD >NZ_CP021262|1355457:1364865|1357426_1358863_-|WP_027221417.1|DBSCAN-SWA MIKLNLNYKLTRKNILPKLFHWGLVVIFFFLASTTHAGSLSPYTTKELEQLEKEFIQLINQSDSVERNPLASQYINYIGKKLAHYGRIKTPYFFIVKSKEINAFAGPGGYIGINTQLILTTSNESELAAVMAHEIAHVRLHHLYSIIEHQKQMRVPLLASILASAALGVLNPTVGMGAMMASVSGFSQDNINFTRSKEKEADRIGIDMLIKAGFNPQGMAAFFNKMQENSRYYYTANIPAILRTHPLDADRIAEAENRTSRLPKKHYTDSLDYALFKELIRVSVASNNKQILDYYEHHCHKKNPATACQYGYVLALLNNNNFQKAAEKLNSLLLQDNGNLNFQIAMAQAELGLSQYQSALARLAELQNNFPDNYAALMAYAQGLLTANKPEKATAVLLKGSRQYKEDLPLCRELARAQAESHQKSYAYFTQAQCLLLEGQKRGAIAQLKVAQKLARKDAYLSARISAKIDEIKFMVEN >NZ_CP021262|1355457:1364865|1359983_1360598_+|WP_027221419.1|DBSCAN-SWA MFTGLIENTGKVLVNRQGENSSRLVVSSSYQDLKPGESIAVNGVCLTLLPSDLPDLCFDISPETLQVTTLSKLSSGDIVNLERAMLASTRFGGHYVSGHVDTKVKVKSIQAVNEFIAMDLEGFIPEHKCYLIPKGSITVNGVSLTINTVSEQTIGLMLVPHTLLMTNLGSLTVGQQVNIEFDYLTRIVAHQLQTIGKLNHEVVS >NZ_CP021262|1355457:1364865|1364040_1364865_+|WP_027221423.1|DBSCAN-SWA MRLCGFEVGLDKPLFLIAGPCVIESEELALETAGYLKEMCSQLNIPFIYKSSFDKANRSSISSYRGPGFEKGLSILEKVKSQIGVPVLTDVHEDTPLFEVSSVVDVLQTPAFLCRQTNFIQKVAAMNKPVNIKKGQFLAPWEMKHVIAKAKAQGNEQIMACERGVSFGYNNLVSDMRSLVIMRETGCPVVYDATHSVQLPGGNNGVSGGQREFIPALARAAVAVGISGLFMETHPDPDKALSDGPNSWPLGKMKQLLESLKATDEVYKKYRDDF >NZ_CP021262|1355457:1364865|1362406_1364044_+|WP_027221422.1|DBSCAN-SWA MTKYIFITGGVVSSLGKGIAAASLAAILEARGLRVTLIKLDPYINVDPGTMSPFQHGEVFVTNDGAETDLDLGHYERFVKTTMTKRNNFTSGKIYENVIKKERRGDYLGGTVQVIPHITNEIKRCIKLGADAFDVAMVEIGGTVGDIESLPFLEAIRQMRIELGSQRAIFIHLTLVPYIATSGETKTKPTQHSVKELRSIGIQPDVLICRSEKPLSMADRAKIALFTNVEKEAVISLEDANSIYQIPMILHAQYLDEIVVKKLSLEAKQADLSEWQRVVDMQAVQTMTVKIAMVGKYTELNDAYKSINEALLHAGIHTETKVEIIYFDAELIEKHGALLLESVDAILVPGGFGERGVEGKIKAIQYAREHKVPFLGICLGMQTAVIEFARNVVGLTGANSTEFNKETLYPVLGLISEWMDADGSKQTRDENTDLGGTMRLGGQYCHLAEGTLARKVYGKPQIVERHRHRYEVNNKYVDSLVKHGLIISGRSADNSLVEMIELADHPWFLACQFHPEFTSNPRDSHPLFKKFVLAARIHHQEKDKK >NZ_CP021262|1355457:1364865|1361813_1362281_+|WP_050598266.1|DBSCAN-SWA MREIKTIVSDNVTFPIAIVVSTFNELITSALKQGALDRLTELGFKSNDITLVEVPGAVEIPFVAQLLAKKLQVEVIVALGAVIRGETSHYDYVCEQVSQGCQRVMLDYNIPVIFGVLTTENDEQALERVGGTHGHKGREAIDCAVSMRSIKQQLQ >NZ_CP021262|1355457:1364865|1360594_1361806_+|WP_027221420.1|DBSCAN-SWA MKHSLATIEEAIATLKAGKMIILMDDEDRENEGDLVIAAEHATPEAINFMSRFGCGLICLPMAEELIDKLQLPMMARHNKSPYGTAFTVSIEAANGVSTGISARDRARTIQVAIDPQSGPSDIISPGHVFPLRARKKGVLERPGQTEGSVDLVKLAGLTPAAVICEIINEDGTMSRRDELALFSKKHQIPLVTIKDLIHYRIRHENLVHAVATTRIPLEGNGVFTMTVFENQMDSAEHFALVKPPLYGNQVPLVRIHSECITGDVFGSRKCDCGKQLELSLSQIGAEGGILIYLRQEGRGIGLANKLKAYALQEEQGLDTVEANLKLGLPADDRDYAVAYQMLKYLGVEALRMLTNNPLKIASLERYGMKITQRIPLEIEPSRENHSYLKTKKIKLGHLLAID >NZ_CP021262|1355457:1364865|1355457_1356786_+|WP_027221416.1|DBSCAN-SWA MTKSKVLVIDDEPDIRELLTLTLSRMGLACDAVSDFKQGLEHIKQNYYSLVLTDMRLPDGDGIEIVKFIQKYKPQLPVAVITAYGNVEGAVNTLKAGAFDYVSKPVDLKMLRDLVKTALSMQNPSTENPDEGLLVGESLVMQQLRESIHKLARSQAPVFIQGDSGVGKELVAQLIHANGPRKDKPFIPVNCGAIPGELMESEFFGHKKGSFTGAISDKTGLFVAAHGGTLFLDEIAELPLAMQVKLLRAIQEKAIKPIGELYEIPVDVRILSASHKSLIEEINAGKFRQDLYYRINVIELRVPTLMERLSDIPCLTEAILKKLSKNQNRSLVKINPACFEILSHYHFPGNVRELENILERAMAMCEEEIIEPGDLHLPRTTITPVVAASPVSTNLNGYLQDQEKELILDALEKTKWNRTAAAQLLGVSFRTLRYRLKKLGLD >NZ_CP021262|1355457:1364865|1357049_1357295_+|WP_011213531.1|DBSCAN-SWA MNSWNSVVFLKTKNAWSDSAAIAKMNGVQSLWSTSGDWDWCIKLDSKHSSPEETALFVKNLRNADWVAETKTSWWKEVAVK |
9 | Staphylococcus_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2283877 : 2293995
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP021262|2283877:2293995|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP021262|2283877:2293995|2288170_2289319_-|WP_027222198.1|DBSCAN-SWA MNEVHVFTSESVSEGHPDKIADQISDAILDAILAQDPKARVACEVLVKTGMVLVGGEITTKAWVDVEDITRHVIKDIGYNSSQMGFDWESCAVLSAIGKQSPDIAQGVDNQQTKILGAGDQGLMFGYASRETDVFMPAPIAYAHRLMEKLAFMRKSGQLPWLRPDAKCQLTLKYEQGMPVEVDTVVFSTQHSPDIEHKDLVEAIREEIIKPVLPAEWLNDKTRYFINPTGRFVIGGPLGDCGLTGRKIIVDTYGGMARHGGGCFSGKDPSKVDRSAAYAARHVAKNIVAAGLADKCELQISYAIGVAEPTSIFVETFGTGRLKNSEIIDLIHTHFDLTPQGIIDQHDLLRPIYRQTATYGHYGRENFPWERLNKVAELSKAL >NZ_CP021262|2283877:2293995|2283877_2285560_-|WP_027222195.1|DBSCAN-SWA MGLKSGILGLSLLSLACGSFAATETIRVIIKYKQQPVAISSLKSQIFKSIQIPVKEMKPMANGAYSLVFDVSSAPAVVKAKEEDVTANVLERLRKNPNVLYAVKDRIGHFKPLPDPAINHELSQLLSHESQWDEFERPAGIRLESKPGLRDGAWAYTTGKSRKPIVVAVLDTGIALNDSLVNNLVKDNEGNVFGWNFAANNNDLSDETRSYHGTHVAGTIAGYGDIMNGVGEDLKILTVKIPAENGMFYESAVVNSIYWSVGGDVPGVPKNIHPAKVLNMSFGVDLEPGKEIDYCDEALQEALFFARKKGAVVAVAAGNDNVWEHYNAPAVCNGTIKVASTGPEGLRSYFSNYGPSITLAAPGGDKRYGTAGGILSTVNPGGGYNSSGFDFYQGTSMASPHVAGVAGLIFAVSNKSLKPEQVEQILYVTTHEFGQSNDANKSCVGKKPCGHGILDADNAVQVALNGYDVLFSAPKMADLATHECGKNRLKPGKNIINDNTVTWIQTKASCEADISYQNPHVEKTKDGKIYAYYGSISYELDQSAYKECHVIGYDGVGCYL >NZ_CP021262|2283877:2293995|2289521_2290634_-|WP_027222199.1|DBSCAN-SWA MINKSAILALADGTVFEGLSVGATGDSVGELVFNTSMTGYQEMLTDPSYARQIITLTTAHVGNTGCNMEDMESTKVWAAGLVMRSCTAIPSNYRAEQSFPDWLNKNGVVAISGIDTRALTLKLREKGAIGACISTNVEKPEIALAKAKSFAGLQGADLALEVTRQTTERWHEGQGEWSLSKQPQQLHVVAYDFGVKHNILRILHDKGCHITIVPAKTSAEEVLAMNPNGVFLSNGPGDPQACDYAIKATQVFLDNNIPLFGICLGFQILALACGGITKKMKFGHHGSNHPVIETTGKKRVFITSQNHGFAVDEDSLPNCLEVTHRSLFDNSLQGIRHKTKPAFGFQGHPEASPGPHDIDILFNEFVNLMK >NZ_CP021262|2283877:2293995|2285693_2286701_-|WP_027222196.1|DBSCAN-SWA MDLVIAANYLSTLEKCLEQFGIKHFLEKIGFDLIRVHDPNAYLTQDEFNHVIIEAYKLSQCPELGLIFGQNLSIVNHGFLGYAAMSSPTFGTAIQTVLSYLNTRTSLLSLELHQFNNKNNAYIKLLSHTKEMVLSRFITELAITHLIKMRNFLISCNNPMLKIELNYDEPPYAKYYQTIFQCEIVFNTESTRVWFKAEELNYPIHFADDVSYQLAKKQLQEIEKKMSLNEDMASKIKSILINQNLNHVSMDEIASQLCMTSRTLRRHLQRLHVTYQELLDEVREQKAKTFLLNNNISMTEISFLLGFQDTSNFSKAFKRWTGITPTEYREKHEIQ >NZ_CP021262|2283877:2293995|2290732_2291872_-|WP_027222200.1|DBSCAN-SWA MEQRDYYELLEVSRNASDAEIKKAYRRLAMKYHPDRNPGDASAEEKFKEIQKAYNILSDKQKRAAYDQFGHAGVDPSMGGGPGGFGGFGGFGDVFEDIFENIFSGGRGHGRQSRGQRGADLQFNVQLTLEEAAIGKEVEITVPRHGTCTVCEGSGAKKGTSPKTCETCQGMGQVRIQQGFFSIQQTCPSCHGEGKIISDPCVSCHGQGRVRESKKINVKIPAGVDNGDRVRLSGEGEAGVHGGGSGDLYVQISLKKHAIFERHENDLHCEVPIGFATAALGGSIEVPTLEGRVTLKIPAETQTGKVFRLRSKGMKSVRGYGQGDLLCKVVVETPVNLSREQKELLNKLQDSLENAKGTHSPKTSSWFAGVKKFFEDMKF >NZ_CP021262|2283877:2293995|2292060_2293995_-|WP_027222201.1|DBSCAN-SWA MAKIIGIDLGTTNSCVAVMEGDKPKVIENSEGHRTTPSIVAFTDDNEILVGQSAKRQSVTNPEKTLFAIKRLIGRRFDDPIVQKDIKMVPYKIIKADNGDAWVRVKDQDKAPPQISAEVLRKMKKTAEDYLGEEVKEAVITVPAYFNDSQRQATKDAGRIAGLEVKRIINEPTAAALAYGMDKKRGDSVIAVYDLGGGTFDISIIEIAEVDGEHQFEVLATNGDTFLGGEDFDLALIEYLASEFKKDTGIDLHNDPLALQRLKEAAEKAKIELSSAQQTDVNLPYITADASGPKHLNIKLTRAKLESLVEKLVERTVEPCKIALKDAGLTVSQINEVILVGGQTRMPLVQKTVEEFFGKEPRKDVNPDEAVAVGAAIQAAVLSGEVKDILLLDVTPLSLGIETMGGVMTKLIEKNTTIPTKATQVFSTADDNQTAVTVHVLQGEREQASANKSLGRFDLRDIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAKDKATGKAQSIVIKASSGLSEEEVAAMVKDAQAHAEEDKKFKEMAELRNQADSLIHSCEKSMKDLANDLSEDEKKGIETAISELKEAVQGTDKARIEDKLKVLTDASAKMAERIYAKKSSEGQAAQGQTQSQESTKPEEEGVVDAEFEEVKEEDKK >NZ_CP021262|2283877:2293995|2286826_2288152_-|WP_027222197.1|DBSCAN-SWA MELVEEGVQKINTLQDYKVADISLAEWGRKEIAIAETEMPGLMALREEFSAKKPLQGARIAGCLHMTIQTAVLIETLVALGAEVRWSSCNIFSTQDHAASAIAAKGIPVFAWKGETEDEYWWCVEQTLSGPNGWKPNLLLDDGGDLTQVVHQKYPQLLAAIKGVSEETTTGVARLYEMAKHGHLKIPAINVNNAVTKSKFDNLYGCRESLLDGLKRATDVMIAGKVALILGYGDVGKGCAQALRGQGATVLVAEIDPICALQAAMEGYRVVTLDDVAEQVDIVVTATGNYHVVTHEHMKRMRNQAILCNIGHFDSEIDIQSLKQYQWENIKPQVDHVIFPDGKRIIILAEGRLVNLGCATGHPSFVMSASFTNQVLAQIELFQNSSQYQNQVYVLPKVLDEKVARLHLGRIGAKLTQLSNEQADYIGVDKNGPYKPDHYRY |
7 | Bacillus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2646022 : 2657448
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP021262|2646022:2657448|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP021262|2646022:2657448|2648121_2649855_+|WP_027222455.1|DBSCAN-SWA MSGLIPQPFIDDLLHRTDLVELIDGYVPLKKRGNSHIACCPFHNEKTPSFNVVAKKQFYHCFGCGASGNAISFIMNYLNQGFTDAVETLATRLGLSVPRDGTGEKHKSSLNLYNLMTEVSQYYQKKLKYNGQVAIDYLRSRGLSGEIAKRYHLGYAPEGWHNLEKAFPNNQRELLSTGMLIKSDDGKIYDRYRNRIMFPIHDRNGRVIGFGGRVLDKDQKPKYLNSPETVLFQKSRELYGLHQVLSQQKNPDSIIVVEGYMDVIALAQHGIFNVVATLGTATSTFHIQLLAKHTKHLIFCFDGDAAGRQAAWRALESSLPHLNAGLDAGFIFLPAEHDPDSLVRNEGKNGFLELLRQATPLHRFFFDTLSKDINLLNPAGKTQLINAVKPYLQKMVEGSYKQLLIDDLARLTHIESHRLNNLITEKSESKPEVQAAISRSPLRIAIALLLQNPEIYSVAIQQINPELLNEQEHHILLKLLQQLKDNPNANTATLIEFWRNSSYFELIVKLAAWDHQVPDQELIKEFIDVLLFLQKQNREILIRQYIEKSRKIGLTENERLNLQNLLKERHGQAEIEK >NZ_CP021262|2646022:2657448|2652669_2652891_-|WP_027222459.1|DBSCAN-SWA MCQIKKGTNKIYCWLKNKFGGNGIPTDMKILETIYSLYLEDFLNYSPENKTREEKIYLPIEIKKIAEILRTDE >NZ_CP021262|2646022:2657448|2647228_2647468_+|WP_027222453.1|DBSCAN-SWA MPTVRVKEGENPEYALRRFKRSCEKAGILTELRRREFYEKPTAERKRKQAAAVKRHLKKISRDVSSKRGVGHRRKKSTT >NZ_CP021262|2646022:2657448|2649941_2651807_+|WP_027222456.1|DBSCAN-SWA MTMNDQDQQSSQITKVISLGKEQGYLTYSQINDLLPNIVDTEHFDVIISMLEGMNIKVFELPPSEDELALLLNTEEVPDIEEAAMVLASVDKETGRTTDPVRMYMREMGTVELLTREGEIRIAKRIEEGIYQVLKSLAHYPETVQLVLEDYDRFLVEEIRLNEIISGFADVDEEIAPATNIGSMLDEEQQEDILLDVDEEDEDGEGGISDVDDGPNPEQAKAYFDELREAFDKAMKALKEHGRTNKKTVELLDSMSESFLKLKLTSRQVDKLTRHFRQLRNHIREFERSIMRLCIEKARIPRKLFIDTFPGQETDLSWLETIISKHAKKLDLERIEEYREEILRLQSKLASFEIEYGLTISEIKDINRKMSIGEAKARRAKKEMVEANLRLVISIAKKYTNRGLQFLDLIQEGNIGLMKAVDKFEYRRGYKFSTYATWWIRQAITRSIADQARTIRIPVHMIETINKLNRISRQILQETGREATPEELAEKMELSEDKIRKVLKIAKEPISMETPVGDDDDSHLGDFIEDNNIESPIDMATAEGLREATLEILETLTPREAKVLRMRFGIEMNTDHTLEEVGKQFDVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSEKLRSFLEGDEG >NZ_CP021262|2646022:2657448|2654796_2657448_-|WP_027222462.1|DBSCAN-SWA MAIAFARVSIHSRSKGHSAIAAISYRAGIKLVDERTGLTHDFSHRQDVVFSEVLLPNNSDSAFSDRSILWSAVETAEKRVDAQLCKDVVLALPKELNREQQIDLTRRFAHTHFVENGLPADIAIHDHGDGNPHAHILIPTRRLEGKQFSKYKARDLNPTFAKGFIVENDYWGELWREMQNEYFVEQNLDLEVDANHLISERHRGQQRNSSAHYLQEENQLIQQARMEMTRDNINHVIEHLSSQHSVFTRRDVERLLFKTFSPSNNPQEYLQFVEKVLSDKDVILLGENSKGKVSYTTRSHFLEEAGLLDDIENMMRSNKHRNNQSIDYLAQQYTLSEEQKEAFHYITQSPDIAVVIGRPGTGKSYLLKPVNEFYKQANQLVIGAALSGKVAKALQSETGIKSSTIKSLSYRLANNMMQLSDKHVLIIDEAGMVDFASLAYLIKEAHKAGSKVVLIGDPDQLKPIQKGEIFRGIAARTGYIEIENIKRQQDLGDRQASLDLAKGDIDKAIQHYQDKGAITITDTKLQAIEQVVTGWKQDLEITNMADTIMLSYTRKAVNQLNDLARESLIAENKLGEENIVYQGLERSLKISTGERLLFRENNKVLGVRNGDTATVKEISSQQMSVQLDSGELLTIPREYKALDYAYALTVHKSQGMTAKKVRVLIDSKYWDRNLSFVAMTRHKEQLNIYADQENHPTVQALKQTLSRSSTKDNVIDWPLDFATRAGFDSDSLISRAVNHIVGVGHKIKQAYNFIVNYEAYLLKARKQGKLQDIGEARADARQEALKVDATMPENKAYKISHQSFETLKKDFPQLGELETLINKRQRMTGYFAEKADKQITTMSRQLLTNKAVANQVKSQYPEFYQKIQSIYNKQKEKALLYDR >NZ_CP021262|2646022:2657448|2652060_2652420_+|WP_027222457.1|DBSCAN-SWA MRRDWDVIRNILIKIENLETNTYLQLKNFPESEHNKISHHIELLCDDNLIECNIHKTTAGRPYDFHVSRLTWRGHEFLDSVRSDTVWSKTKEVFKNKGVDMGFNLIIATAQKIAGTLLS >NZ_CP021262|2646022:2657448|2647669_2648113_+|WP_027222454.1|DBSCAN-SWA MTIKEQINNDIKDAMRAKDKNLLNALRLISAAVKQIEVDERIEVDNERMLVILDKMSKQRKESIAQFEKANRDDLVAQEQFELDVIAKYLPEPLTDDEIDALISDAIKSTGAEKMSDMGKVMAILKPKLQGRADMAQVSAQIKAKLS >NZ_CP021262|2646022:2657448|2653406_2654243_-|WP_032828924.1|DBSCAN-SWA MRKNNEQALIVPIRPFLKWAGGKFQIINKIRASLPKGARLIEPFVGSGAVFLNMDYDKFLLADINADLINLFEHLKSERHDFIHFCKQFFSDEFNKKSTFLTLRSEFNSTKDSYLKAALFLYLNRHAFNGLMRYNSSGKFNTAFGDYKKPYFPENEMLTFIQKSEKAEFKCADYSLIMNEATKGDVVYCDPPYVPLSASANFTKYHSTDFGSEDQRRLVELAKELAAKGIPVILSNHDTAFTQNLYQGSSILSFDVQRSISCNGSTRGRAREVLALFN >NZ_CP021262|2646022:2657448|2646022_2647024_-|WP_027222452.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLVLGIESSCDETGVAVYDSESGLLSHALHSQIATHRVHGGVVPELASRDHVNYLIPLVDEVLTKAQIRKNQLDGIAYTAGPGLIGALLVGSCFAKSLAYALNIPALAIHHLEAHLLAAKMETPSLDFPFIALLVSGGHCQLIEVNNIGEYRLLGDTLDDAVGEAFDKTAKLMGIPYPGGAVLANLADQCLSTPYQFPRPMTDRPGLDFSFSGLKTHALNTWNQSAKKENDRSEIAKAFQQAVVETLIIKCKRAIKESQSKRLVVAGGVGANKALRSALQKWIKDIQGEVYFPALEYCTDNGAMVAYAGCLRMLRGESDEGWGVVVKPRWPLA >NZ_CP021262|2646022:2657448|2652905_2653397_-|WP_027222460.1|DBSCAN-SWA MKQGGSYANSSGGVLEGLVEFALTKKGFTVVRYKDWKLNPSSYGDELLLKNVPYEGLYKHASATEFVLMSKAYNLNTRIECKWQQVSGSVDEKLPYLFLNCSEKMIEPHIIILLDGGGAKPGAIEWLRESCEKFNLRELDVSKRRIDLMNMTEFVQWVNSVFK |
10 | Vibrio_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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