Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP028102 | Fusobacterium mortiferum ATCC 9817 chromosome, complete genome | 3 crisprs | cas14j,csm6,csa3,cas3,cas4,DEDDh,DinG,WYL,cas6,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10,cas2,cas1 | 0 | 0 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP028102_1 | 427012-427105 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP028102_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP028102_1
>1.1|427040|38|NZ_CP028102|CRISPRCasFinder ATTTTGCCCATAATTTCCTTTATTATGTATTAATCCAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP028102_1
The CRISPR arrays of NZ_CP028102_1 >merge|NZ_CP028102|1|427012-427105|CRISPRCasFinder AATTATAACCTACTCCATTACTTCCTATATTTTGCCCATAATTTCCTTTATTATGTATTAATCCAAAATTATAACCTATTCCATTACTTCCTAT >NZ_CP028102|1|1|427012-427105|CRISPRCasFinder AATTATAACCTACTCCATTACTTCCTAT ATTTTGCCCATAATTTCCTTTATTATGTATTAATCCAA AATTATAACCTATTCCATTACTTCCTAT
>NZ_CP028102.1|WP_005885845.1|423776_424202_-|hypothetical-protein MVSHKTLIIYFFIWRNSGIVIMVRMEKTYIRKREKKYAIYSLFDKKRLTKYYDNIEELEENVYIAKDEKTGKFAFLSSRFSTKTEYKEIIKVLDTEINEYLYIGIVAEEERTDILTKIDKINIKELSEKEYNKIINLLPKN >NZ_CP028102.1|WP_005885846.1|422639_423596_-|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MKMKDIAKELGLSIATVSRVVNGHTNVNEETKKRVQEFIEKKNYTPNVIAQNLSKMENKTIALLVPNISNPFFATLTNYICKNFNRGGYQIALYNTVESLEQEKEAIKNILGHRIAGVIAILINGDYEENPLTPLLKQKIQVYLVDREFEDSKLPGVFIDNYIGAYKLTKELLERGHRDIALITGNLDFLNARERMRGYIEAHNDMGVEVKEKNIYEGDYLFESGYIAGKKILDSSVTAVFSSNNLMLYGVLKALKEKDKELELACFEKTEFLELLDRNILSCSIPLEIMGEKIYQLFVNKEKRKKIHIEPLLEKRGE >NZ_CP028102.1|WP_005885848.1|421715_422639_-|ribokinase MKKVVVVGSINMDLVTRCKRAPKGGETLFGEEFFQVPGGKGANQAVAIGKLGTEVTMLGKVGKDSFGKDLINSMKESGVDARYIEEGEKSTGIAKIIVEENGQNRILVVAGANSEVDKAYIDRYLDVIKECDIVVAQLEIPVEIVAYALAKAKEFGKMTILNPAPARELDDEIIKNSDLIIPNESELALITGMPTETEEEIKKAGEKLLDMGVSNLIVTLGSKGSLHLNREVCEFHSAYKVKAIDTTAAGDSFIGGLVRELKDNNVGEAIEFATKVSAIAVTRKGAQTSIPTIEEVENFEGVKNEEK >NZ_CP028102.1|WP_005885849.1|421321_421729_-|D-ribose-pyranase MKRSRLLNSELSYEIAKIGHTAHITLCDAGLPIPNGVKRIDLAVEAGLPSFISVLKPILSEMQVEEIVLAEEIKEKNPVMLEKILKSFEEVGMNPNIIWVKHEEFKKITRESEAIVRTGECSPYANVILKSGVVF >NZ_CP028102.1|WP_005885851.1|419816_421313_-|ribose-ABC-transporter-ATP-binding-protein-RbsA MNKEIVLRMSDIVKTFPGVKALDGASLNIYKGRVMALMGENGAGKSTLIKVMTGIYNMDSGSLYVGNSKVDFRNVNDSQEKGIAVIHQELNLIPELSITENIFLGRELVNGFGKIDSSLMKSEARVLLDKLNVKENENTLVKELTIGKMQMVEIAKALSQNAKIIVMDEPTDALTDSETESLFKVIRELTAEGKSIVYISHRLKEIPEICDDITIMRDGKFICEAEVKDIDEEFIIRNMVGRTLDEQFPRVKVERGKEILRVENLKNSYVDGVSFSLHEGEILGISGLMGAGRSELVKTIYGHLKKDSGKVFIDGEEKNIRSAKEGIECGIAYVSEDRKGDGLVLGMSVKENMTLSALNFFSTLFKLEHKKEEASVEEYIGKFRVKTPSMEQKIKNLSGGNQQKVAIAKALLTNPKILILDEPTRGVDVGAKKEIYDFINDLKTKGLSIIMISSEMPEIMGLSDRIMVIHNGKVTGEFLAEEATQEKIMRCAVGGKEC >NZ_CP028102.1|WP_005885853.1|418896_419823_-|ribose-ABC-transporter-permease MLKKIWSNKPLIGLIIFAVIVSVLNPRFLTHANILNVLRQTSINSIIAIGMTLVILTGGIDLSVGSILAFCGAVMASLLNAGHNPILAFIVTLALGLVFGFFNGFLVSKMKLQAFIVTLVTMTFLRGATLVFTEGKPITVDDGGLLFENIGGGYLFDIPIPIYIMIALFVAGHYLLMHTKFGRYTYAIGGNEEATKLSGINVDKVKMWVYGLCGMLSALAGVILTSRLYSAQPTAGSGYELDAIAAVVLGGTSLAGGVGRVTGTALGALIIGVLGNALNLLNVSSYYQMMIKAIVILIAVLIDRKSNK >NZ_CP028102.1|WP_005885855.1|418007_418880_-|ribose-ABC-transporter-substrate-binding-protein-RbsB MKKTMKLFGMAALIMVASTVANAEKIGLVVSTQNNPFFVTLKEGAEAKAKELGHELIVLDSQNDPSKELGNVEDLLIRGVDVLLINPTDSDAVASSVRAANRSKIPVVTLDRAANKGKVVSHVASDNVLGGEMAGNYIVEKLNGAGKVVELEGIPGTTAARDRGEGFNKAVNGKLTTVAKQAADFDRTRGLTVMENILQAQPEIDAVFAHNDEMALGALKAIEASGRDILVVGFDATDDAVASVKEGKMGATVAQKPAEIGAVGVEVADKIIKKEEVPANVPVALELIVK >NZ_CP028102.1|WP_005885857.1|416746_417664_-|dihydrodipicolinate-synthase-family-protein MRNLEKYHGVIPAFYACYDKEGNISVEGVKALTRYFIEAGVQGVYVGGSSGECIYQGKEERKLVLETIMKEAQGRLTVIAHVACNNTADSMELAAHAESLGVDAIAAIPPIYFRLPEHAIAKYWNDISSAAPNTDFVIYNIPQLAGVALTPSLYKEMLKNPRVIGVKNSSMPIQDIQTFKAIGGKDTIVFNGPDEQFIGGFMIGAEGGIGGTYGAMPKLFLKALECFKKGDYETARAIQYDVNDIITALCSCKGNMYGVIKATLKINHNIEIGGVRSPLANLVEEDMPKVEAVAKLIRDTEAKYL >NZ_CP028102.1|WP_005885859.1|415659_416631_-|uridine-diphosphate-N-acetylglucosamine-binding-protein-YvcK MNRKPKVVVLGGGSGISVVLRGLKYLPIDLTAIVSVADDGGSSGALRKEFDSPPPGDLRNVLIALSDVEPIIEDVFQYRFKEESSIGAHPLGNLLIMAMNEITGNIGDAVDRLRKLFNIKAKILPATLEKVFLYAETESGKIVEGESNIPFSKEKIKRVFYKNERKAPLENLKALEEADLVVFGIGSLYTSLIPNLLLKEVKESLKKTKGKVVYVCNAMQQPGETEGYDALAHIEAICEVIGEGIIDEVIVDTVEIPEEILSRYKKQRSDRVLVNKESIKKKGIKVKDRDILEIDSKGMVRHHPYKLAATLYSLIDKWEEFYV >NZ_CP028102.1|WP_005885861.1|414836_415667_-|radical-SAM-protein MFKHVFGPVPSRRLGISLGVDLVLPKSCNMNCIFCECGATKKLTLKRERFKDPEEVKEEIKEVLKKIKPDYITFSGSGEPTLSKDIGEIIDWIKEHTDVKVCVITNGLLLEDGKVIEDIKKADLIIPTLNSVDNLIFKKINRPSVESDISQVMGGLRNLSEKYRGEIYIETFIIEGLNDSDEHTERMVKFLKNLKFTKLQLNSLDRPGTEEWVKPASKSTLKRIKDKYIELGIKNVEIVNEMKEVEKKLDVDKELLKNMKEKREYSEKELKKIYNI >NZ_CP028102.1|WP_005885841.1|428090_428396_-|DNA-binding-protein MDNKNKRSGRKTGKITVGMNHEEYIFYKLSRLSKVDKKLARAMVRDLGVWTSPKKAAAYLTKYVSTIYEKINSKEIFAKKVGNKYLILTESLILLLEGLDN >NZ_CP028102.1|WP_005885839.1|428419_428638_-|hypothetical-protein MEYIKIISGVLAIFIGYHKFILSLLDRKIDKEIWEREKKLLERIEKENRKNLVEGLRRIEERITRIEEKLMR >NZ_CP028102.1|WP_005885837.1|428747_428930_-|hypothetical-protein MGKVLDMVIKFVKYFICKWFATRVIERIVILLLEELVKRTDSKLDDRIYQAVFEEVEKEV >NZ_CP028102.1|WP_005885835.1|429371_429746_-|hypothetical-protein MNKASVRSKKKLEGVDSRLVLLVGYALAISPVDFFVNEGVRSEKKQKEYYKQGKSKCDGVVNRSKHQDGKAIDVYYVGWESDDSLTDGRWYILIESFKKAGKMLGLKLRFGYDWGWDNPHIELR >NZ_CP028102.1|WP_005885833.1|429850_430150_-|hypothetical-protein MSVVTTVQKEIESLKNSIKREKAIESNIFDMTAVIEHIAELKEASEPMAEESPYESYEEWQAAAEKELKGYQSSLATIAENKEILVALETYISEHPEGV >NZ_CP028102.1|WP_005885829.1|430289_431096_-|ATP-binding-protein MKCQYCGKEYVKNESEGIEYLPEFIRKHIEYIPSCDCLEKIKEREREEEIRKQQAESIKNRVKKYRDISVVDSKFLKSTFEIADMSEKYMKVALRYAKSFMEKKMDIGIIFYGGVGVGKTFATACIANYLMSRGKSVFVINLGLYLLKLTKEWGQGEMELLKIVENCDLLIIDDFGVEKSLEDKNASWRAEKIYNLIDSRYRCGKPLIISTNLEFDEDEDRCEIARRFSAKGKNRIRDRIVEMCYPIKVEGKSRRKVNKQRFYELLKE >NZ_CP028102.1|WP_005885828.1|431106_432069_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MERPSYFAVIPASVRYDERLKPSEKILYAEITALINIKGYCYATNQYFSKLYGVHKNSISIWINNLIKCGYLKVKYVIREIEGQKRQERRIYVVKRKEIKKEIETIQEKIVSESVKEYEEDRILKDEKSEEKEECKEKLEEIAQKNLGDSQKDIIEGTNKKLEKINTSRLVQEDYILHTHSQKESEKFPVIREILEKYNQVGLPSFEFPPDNHIILKAYGELGASGVFKALEIMGESEFVKNNMSVNTIFKLENLKKALNGSFKNRDSRVYFEREKKCEKKEGENEKKRDRELEEFLNSNPDNRDDIPELFSSEELFDRN >NZ_CP028102.1|WP_005885826.1|432288_433638_-|ATP-binding-protein MLKRKLYNSLLEWKEKSQGKSALLIDGARRIGKSYLCEEFGKNEYKSYLIIDFGNISREIVDLFENESSNLDLFFIKLSAFYGVQLFRRESLIVFDEVQQFPKARQLIKYLVKDGRYDYIETGSLLSLKRNTENIILPSEEKHIQMYPLDFEEFLWALGDTTTIPFLKMCFDEKKPLGQALHRKVMNDFRQYILVGGMPQAVNEYIATKDFANVDEIKRDILTLYRNDISKFAKGYENKVISIFDEIQSQLSKKEKKYKLSSISKEARYREYEDSFMWLNDAMIVNPCYNSTDPNVGLNLNSDYSTRKCYLMDTGLLVTQTFMDGSYTDNEIYKAILFNKLNINEGMIMENIVAQILRTNGHKLFFYSRYDKENKENNMELDFLIKDKKNIKKLAVIEVKSSTYRQHSSLDKFRKKYSERINNSYILYQKDLMVKDGVIHLPIYMGIFL >NZ_CP028102.1|WP_005885823.1|433932_434283_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MEKIKLSCEMDFTLKLIGGKYKLLILYFLLEDEKKRFNELLSAIGSISKKTLTNQLRELENDGLIQRKIYPEVPPKVEYSLTEKGKSLSDILNLLCEWGEKNLDRDIYEITNPQCK >NZ_CP028102.1|WP_005885821.1|434907_435819_-|ATPase MIRDIISNEEVKEFFRNELKLKKDSGTYLFYGSDMSLLMEFALHFAKGLCCETLEGDFCGECNICKRIDKMLYSDLEILDNPDGLKVDEIRELAYKSSSSSYEGNRKIFIIKDISKMKKEASNALLKLIEEPNKGSFFILLNTNLNILPTIKSRSILVKVKKRTAEELEVDNYTYTFFRGNSEDIEKYKLLDIDLESGYSYQEIGKAIKGYEETKELEYKINIYKALRDFINNREYLKLHEKIFFAEEIVRATSDRNIYREIVSYIVDIMGYLNGLEERLTMKSMLRFPINMKVFFINLFLEL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP028102_2 | 2393871-2394225 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP028102_2
|
4 spacers
spacers of NZ_CP028102_2
>2.1|2393908|44|NZ_CP028102|CRISPRCasFinder,CRT AGAGAGATATTTCTTACTTAAGTATTTCCATATCAAGACTGATG >2.2|2393989|44|NZ_CP028102|CRISPRCasFinder,CRT AAGAAATAAGCATAGGTTTGTATCTAGATAGTAAAACATATTTA >2.3|2394070|43|NZ_CP028102|CRISPRCasFinder,CRT GTACAGATATGACAGCTCTTAAAGGAAGTTCTCAATTAGAGAA >2.4|2394150|39|NZ_CP028102|CRISPRCasFinder,CRT ATTGAACTATATATAAAATAAGGTGATAATATGAATAAT >2.5|2393909|44|NZ_CP028102|PILER-CR AGAGAGATATTTCTTACTTAAGTATTTCCATATCAAGACTGATG >2.6|2393990|44|NZ_CP028102|PILER-CR AAGAAATAAGCATAGGTTTGTATCTAGATAGTAAAACATATTTA >2.7|2394071|43|NZ_CP028102|PILER-CR GTACAGATATGACAGCTCTTAAAGGAAGTTCTCAATTAGAGAA >2.8|2394151|39|NZ_CP028102|PILER-CR ATTGAACTATATATAAAATAAGGTGATAATATGAATAAT |
cas6,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP028102_2
The CRISPR arrays of NZ_CP028102_2 >merge|NZ_CP028102|2|2393871-2394225|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCTTATCTTTTAACAGAGAGATATTTCTTACTTAAGTATTTCCATATCAAGACTGATGGTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCTTATCTTTTAACAAGAAATAAGCATAGGTTTGTATCTAGATAGTAAAACATATTTAGTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCTTATCTTTTAACGTACAGATATGACAGCTCTTAAAGGAAGTTCTCAATTAGAGAAGTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCTTATCTTTTAACATTGAACTATATATAAAATAAGGTGATAATATGAATAATGTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCTTATCTTTTAAC >NZ_CP028102|2|2|2393871-2394225|CRISPRCasFinder TTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCTTATCTTTTAAC AGAGAGATATTTCTTACTTAAGTATTTCCATATCAAGACTGATG GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCTTATCTTTTAAC AAGAAATAAGCATAGGTTTGTATCTAGATAGTAAAACATATTTA GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCTTATCTTTTAAC GTACAGATATGACAGCTCTTAAAGGAAGTTCTCAATTAGAGAA GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCTTATCTTTTAAC ATTGAACTATATATAAAATAAGGTGATAATATGAATAAT GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCTTATCTTTTAAC >NZ_CP028102|2|1|2393871-2394225|CRT TTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCTTATCTTTTAAC AGAGAGATATTTCTTACTTAAGTATTTCCATATCAAGACTGATG GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCTTATCTTTTAAC AAGAAATAAGCATAGGTTTGTATCTAGATAGTAAAACATATTTA GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCTTATCTTTTAAC GTACAGATATGACAGCTCTTAAAGGAAGTTCTCAATTAGAGAA GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCTTATCTTTTAAC ATTGAACTATATATAAAATAAGGTGATAATATGAATAAT GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCTTATCTTTTAAC >NZ_CP028102|2|1|2393872-2394225|PILER-CR TTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCTTATCTTTTAACA GAGAGATATTTCTTACTTAAGTATTTCCATATCAAGACTGATGG TTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCTTATCTTTTAACA AGAAATAAGCATAGGTTTGTATCTAGATAGTAAAACATATTTAG TTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCTTATCTTTTAACG TACAGATATGACAGCTCTTAAAGGAAGTTCTCAATTAGAGAAG TTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCTTATCTTTTAACA TTGAACTATATATAAAATAAGGTGATAATATGAATAATG TTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCTTATCTTTTAAC
>NZ_CP028102.1|WP_106991863.1|2393039_2393855_-|4Fe-4S-binding-protein MKKVWGMYFSGTGTTEKVVKRIANTLGEKLGVERENIDFTSKSAREKEYIFSKEDIVVFGVPVIAGRVPNLLLKFLDTIRGEGALAVPIVLFGNRNYDDALIELRDILLKDGFFVVGAGAFVGEHSFSRELGKGRPDREDLEIADILAEKVIENMENKKYLSEKLYVKGESPYRWYYQPRDSKGNPIDIRKVKPKTNMELCNNCGLCVELCPLGSIEKERVDVVSGICMKCCACIKKCPQGAKYFDDKNFIYHKEELELEYSRRAKVEIFY >NZ_CP028102.1|WP_040494122.1|2392547_2392925_-|rhodanese-like-domain-containing-protein MKRVIIGVLIMINTITNSYGKELAYQIISQEKAKEMMEENNNYIILDVRTDWEYKMGHIAGAINIPNEEIGHQEIEELPDKNQPILVYCRSGHRSKQASSKLAVLGYKNIYEFGGVITWEYGLVE >NZ_CP028102.1|WP_005886910.1|2392120_2392453_-|lipoprotein MKKIVKLFVIIMVIVLAGCSNTETQEPPRQRTTGEKVALVTEFIIDNAIYNGYDLGFGREIIKSKSVSQSDSVTTTGIDASGNLNTHTTTKTTTKTKSKGAGFGIGIGDY >NZ_CP028102.1|WP_005886912.1|2390858_2392103_+|YihY/virulence-factor-BrkB-family-protein MKLTSLIDSYKEIISQGKLNNIISVSKKALESYKRANSGLWVTSLCFYTILSLVPIFAILFSLGTWFGVADYLLVKLREYSPLNEESINLLITFAQNFLENTRTGILAGIGFLFLGWTLISMFAIIEKAFNDIWRVEKSRMLLRKITDYISFFILFPTLMVISSGIVKIIGNRIGMENLILTIFIKFVPFLTLLFFFTIMYMLIPNTKVRFIPALISAMFIAMFFSGFQSLFLLLQDMVNAYNKIYGSFSVIFIFLFWLKIMWFFIILGSHLCYFLQNRELHLFTKGAEDVNFKIKEYTAVIVMKELIERYYSNLSPLSINEIVKKYDIPYEVVKHILEIFISDELVGEIGDKDEKNYVIIKNIDTISFKTVFKSLENYGEKINFKNSDELESLLDCVREKNFKFSFKEYIEKN >NZ_CP028102.1|WP_005886914.1|2390387_2390843_+|hypothetical-protein MKKFFIGIFTMIALLTVKVQGAEIIPEYFLMERLIMLMDVAPTYISNDGKQELKAMQVDKEVMNILGNSENPFYIYDSNNEKKIVRMGDYFYSPTTLSSIYTLDKENFESNFRDKSLPEEKLETTIEKTQDKIDISDIDEGTGVPADENSN >NZ_CP028102.1|WP_005886916.1|2389536_2390379_+|zinc-metalloprotease-HtpX MNTLKTFVLMGVLTFILLLLGNAIGGQNGIFIALIMAGFMNFFSYWYSDKIVLSMYGAQPVDKNTHLYQLVEKLAKSADLPMPKVYIINEAQPNAFATGRNPKNAAVAVTRGLMDLVDDYELAGVIGHELGHVHNKDILISTVAATMAGAIAFLANMAKWAAIFGNHRDDEDGGSNPIALIGIAIFAPLAAMLVQMAISRTREYKADRFGAKVSGNPLYLANALRKLDMYSRRIPMPNAAPATENMFIVSPLAGSKMANLFSTHPSTEDRIRKLEEMRYE >NZ_CP028102.1|WP_005886918.1|2387301_2389281_-|3-dehydroquinate-synthase MNIIDVKTSSGEYPIILGCNIISELKKYTIPYDKILILSNEDIGDIYFEKLLWELNDERIKTFTIPEGEKFKNLETVSTIYDFMAKENFSRKSLIISLGGGVVCDMGGFVGATYMRGIDFIQVPTSLLAQVDASIGGKTAVDHTRGKNLIGVFKQPKAVLIDVEFLKTLPKEQFSSGMAEVIKHSLLLENRDYFRFLMERREEILSLESSSLIEMIKKSCEIKREIVEKDEFELGERASLNLGHTYGHSLEKLFNFENITHGEAVAKGIVFELELSNILNGIEDEFINEIKDIFRSYGLNSNPIYYPEKILLDVMKKDKKNSFDKINFILFDKNKKVYKDSVEVKNILEVNNLFSSRYIKGIIDIGTNSCRLFLAQVYEDREIKIEKEISKDVEIVKLGEDVNKNGYLKKEAIKRTIDCLKKYKEKADKFGASKVIAFATSATRDSQNREEFLSQVRDIGIDIRCIAGEREAQLNFLGNSIVFKDRILVLDIGGGSTEFTLGENGNIEFTKSINIGAVRGTERFFPEQNYTEENIEECRNWIKEMVSGVKFLKDDNFTLVGVAGTATTQISVQKQMEIYDSSEVHLSKINLDELRQNLQLFLSCDGKKRKEIVGLEAKRADVIIAGTIILIAIMEELGVDSMVVSESDNLNGAMISKEI >NZ_CP028102.1|WP_005886920.1|2386960_2387221_-|hypothetical-protein MTPRLAKILDAYDSFNSTTRKRLVAGNLYDYFMQEFRGEIEMIYNSATKEDIKEDVKGMAEIIYKEEEKEKRDFLVGVLVDIVKMM >NZ_CP028102.1|WP_081462374.1|2385907_2386936_-|selenide,-water-dikinase-SelD MDKLHLDRCSIGGUASKIGPEVLSEILHDLPSVEDKNLIVGFEKSDDAAVYKLTEDLAIIQTLDFFTPMTDDPYIFGQIAAANSLSDVYAMGGQPKTAMNIVCFPQKMDIKILGEILRGGAEKVMEAGAVLSGGHSIHDPEVKYGLSVTGIAHPDKILKNHGCENGDILICTKKLGTGIVTTASKVNLASKEAIDESVKQMTTLNKYAAEIIVNYPITACTDITGFGFLGHAYEMAKGSDKTLVFEGDFIPYIADAKEYAKEFLITTGGQQNRNFIGRDIDFGKNPLWLQEIMFDPQTSGGLLFSVKKEQVGALMKEFQEKNIDAYIIGSVEEKKEKYLIVR >NZ_CP028102.1|WP_106991862.1|2384542_2385904_-|L-seryl-tRNA(Sec)-selenium-transferase MNNLFRKLPKLDILMKNEKLDECREKLNYNTLYTLVKNEIDSFREKIKNREIEDFQVEDIIKNILDRAKFAGNNKLKKVINGSGVIIHTNLGRSVLNKKVVEKMGEVVSNYNNLEYDLETGKRGHRNSHVEELICKITGAEGALVVNNNAAAVIICLNEFARGKNSIVSRGELVEIGGSFRIPDIMELSGSKLKEVGTTNKTNISDYERAIDEETALILKVHRSNFKITGFTDEVGNRDISNLGKENGILTMEDLGSGVLVDFSKYGVVKEPTVQESISSGIDIITISGDKLLGGPQCGIILAKQEYIARLKKNQYLRAFRVDKLVLSALEGTLRYYLDEREAVREIPTLRMITEDKKEVLKRAEKLQKMLIEKNISTSIIETRAKIGGGSMPEETVPSYALVFTGDAVKLEKYFRTGDINIIGRVADDSFILDIKTIRDEDMEIIVEKAINM >NZ_CP028102.1|WP_005886904.1|2394460_2395189_-|CRISPR-system-precrRNA-processing-endoribonuclease-RAMP-protein-Cas6 MICSFTIYLKPLSFGEKIKKYKNYDYFIKELKIEFTDKELKKVVITNFLTKDNYIEDKKYSIKISALDSGILIKLFQFFFLKKIGEERIKIGETEFAILNIYNSNKYARQLNEESDIEISEDRLRVKIITPIFFKIGNRFIATNDINLILKNIEKKLKNSNILDIEDYLGISKYSSKIEMLEDYSREVKIEKEVVGKVGEIIYDISSLDDKEKREVIFLLKFAFFSGIGYMTEKGYGQIEMI >NZ_CP028102.1|WP_005886902.1|2395191_2396343_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 MIRKDIEKIECTIMPLTDIHIGSGIDLASYEYVIKDGVFYRIDLGEIFYNFPEDMRLKLTELMEENNIIKIRKYIKDNYKVEYGYSYSCEVADDVNELYEEKIGGARNSNDENSLTISEFIGNYRGKYIPGSSIKGSIRNAYIGDNFQGSYEIMRNKKINTAPFIIAKEKEYLARKIEAEALGLKELEPKFDPFKNLQVTDSEISKDMLKIVKVERVNLKKDKINVPMGNHEMMRGYLLSRDKKSLKFKINISELSFDRESEIKYRNLSQNKKGETIIEELNKELYVDSVLFPALREKSNKVLEEDLKFFKEAKNLIGIKACEEIKNYSATLKENEVLIKFGKGAGFNSTTLNLFNRNKKDVFTRVMAEGYPVGWAVLSYNEE >NZ_CP028102.1|WP_005886900.1|2396339_2397284_-|hypothetical-protein MYQTYLWNIKPLSSYMTPWQSDTIYGHFFWGVALLEGEDELKKILAEFEKNNPPFIVSDGFVDNRLPMISKRVIKNSEVERMAVEKNESIIDIATKIKRLKKVSTISLELFNKLRKKENDIVELVDEILDDNSKNRGIISIENTHNRIDRLSGSTGENAIFSLKENFVAENIFIYIKVRGDYPINKLEKILRFVEENGFGKKVSIGKGAFKTESFERFDGFEKISGNGFISLSNYIPKEEDYEYVENSLVLIKRGKVANLYGDEGNPFKKPFSCFRAGAIFRGKSSGIKGRVLTNLHRKKIIQVGIPFIVEVEL >NZ_CP028102.1|WP_005886898.1|2397292_2397988_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MRLKSIKKIDGIIELLTGTRVGGSSDTIEIGGNDSPIVRNPLNNESYIPGSSLKGKMRMFMEWVEGKIDENGNVHSCTTPECPICRVFGRGAGDSEIAKSGPTRISVKDAYLTEESREILEKLREKVGFDTEWKYENNINRLTSKATPRNSERIPAGIKFEFSISYKVFDMNDNGKLDEELFEKVVLKGLKTLLIEGIGGGVSRGNGQIRFVKLDVDGESYIDKIENISIR >NZ_CP028102.1|WP_005886896.1|2398001_2398469_-|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MFNNKGFDNRSRGNSRGYDNPEPVVFEFSKLGFLDNKGNLREELMTTEAENIAKSFERVSTAQLRAFFNEIKALKNRLENNDNNEHFERIYPFILMIKSKVQYRIAKDKKLEPLKNFLYAGIEEIQKQNKVGKGKEAFENFAIFFETIVGYAYKG >NZ_CP028102.1|WP_005886894.1|2398461_2400855_-|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MVRLQDDKERVILGGLLHDIGKFIGRSEKYMSQCHIGKKHPHLSWWFIKFLEEKKVIEEDRVLEELVLKHHEGNFFSEDINVAGLEDKYLRRLAYIVARADNYSSAERNEDEMKMRPFTKVPLDSIFGNIDIGRGKDRESKKRYKLKEFLFGNIFPMEFEENSQEELNLLIEKFLKEVEKIETESFKVLYTTLLELIRKYCWSIPSDTQKEICDLSLYDHLKTTSAISLATYNYVKDLRGSIEKATDADIKNAKLKDYFLLIAGDISGIQNYIFNLESTEGAGKRIRFRSFFIKIFTNMIAYKIIEELDLEVGNIIISSSGKFYILAQNTQVTREKISKLKNEINRELYQKYYGEIFFNIEYLALTGDDLGLKFSKKYAEINDLLAEGKRLKFLKEVVELPVLDEEINEMKSVQQCKICGKRLVEKGNICEYCLKDFQLGELLPKLRKVAFYKGDSDVVGDIEILGVKCKLYKDEEIEGKPFLVQEYEEDIRGDYPWVREYYGGYTPIDSKGNSISFEEIAQLSSSKNLGILKGDVDNLGLIMAYGLKIDDVDGEEKKVKDITSISRVATVSRMFDSFFSYWLKEKIKYENESYIVYSGGDDFMIVGAWDKLIDTAKEIRESFRKFVRDNENITLTCGVVLTKAKAPLFYGVKTVQEAEEFGKNSGKNGIVLFDTYIPWDRFYEVDRVINFIDENMKSGLFSQSFVYRLLRYTEMARKYSESKNGKYLKYISDFTYDIGRNISKKLKNPSSDERIIFLSRYFGMESIQSREKQRFLSEYMKVVLNYVVRKNRGGSDV >NZ_CP028102.1|WP_005886892.1|2400855_2401500_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas6 MKLVKIILKSNEKFENRDAEKLRGYFGRLFQENILFHNHKDDYNFNYDFSFIQYKVKNGEFLIVGIDKGGDILLEKIEDIREIVIEDRKIEITPEINISFPQLKVDDEKKYRYRFETIWLALNDKNFLRYKVGEFDLNKQLANNILEFFKMCGIRVEKRVEVVGEFQELKLRQKDTTILGFVGEFVTNAYLPDNISLGKRKSIGMGRIKRKGEV >NZ_CP028102.1|WP_005886890.1|2401508_2403224_-|hypothetical-protein MKKYEVANSLKSFLGKENNKILLKYSLEEKLSDEEKTELEKIYLENLQKQRKRIANKIKLENIEILISYVSYSYSENEKIYFENILEKNLRIFPNIKCFLLIYSKETEEIFKKTKVKFKNVDVNGILLEEVTSAHIQSNIQKYISKFKPNKNNSIIDITLGMKIITVYLYKLAVERGIFSINWQESQIPKYIYCEKQDEYIKDIGMRRYPFNTKLELMIEPEKENIKIYEYINKSLKKFEFSATESYYNQIGNSGMENFYRELSKIFSFQNMLSLDGENFYSQMENFFIKLSENRELSRENILKLKPFLSNLLSLILFESSEENIETRSFFWLDRFLTKFQIKSDELLENGFLSEYREKIYYFFILKYFESKKEEENSYYYEKFIKDLRKNILKELRVDEKEGKDFLRDGNIFELLDIDIEDIVENLNPSISLTESIKGDFYFENKVLYIEKYNLKIDCEKDERINFINNKGADILRELMKNYTVTFGGRELFERLAKYKNDESELARSNRFRKNLTVLKNKAKDFNNHLKEIGREEGIELGELILYQKIEEKESNYSHQFQINPKFYTLV >NZ_CP028102.1|WP_005886888.1|2404090_2404375_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MKVIIAYDIIENGVRNRIIEVLLEEGMMRIQKSVFFGEINEKKIKKLVKRVEGIIDKEIDSLYFFKLCEKDFSKVNYFGKNIEFHFFNKDFFII >NZ_CP028102.1|WP_005886886.1|2404381_2404672_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MKYIVSYDISVGKIRKEFSDFLKSEGFIRIQKSVFLGKINKKYMYKRFRDWIEKIDKIEDSIIVFPLCDLDFEESYFLGITFDIKDIEKFENMFIM |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP028102_3 | 2403345-2403858 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP028102_3
|
6 spacers
spacers of NZ_CP028102_3
>3.1|2403382|45|NZ_CP028102|CRISPRCasFinder,CRT TTAAATAGCTTTATTATGCAATTAGGAATAGAATTGCATTTAGGA >3.2|2403464|48|NZ_CP028102|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTATAAGGAAACTCGAGCCAGAGAGCCGTAACCCTTTAAATTAATAAA >3.3|2403549|42|NZ_CP028102|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAAAACAACTAAAATTCAAGGTGGAAAAACAAATAATTTAG >3.4|2403628|36|NZ_CP028102|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAAAAATATTAAAAATTGAATTAAGAGGTAAAAAA >3.5|2403701|41|NZ_CP028102|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTGGTAAGTGCTATGAGTGTAAAAAAGCTAGAAAATCAAA >3.6|2403779|43|NZ_CP028102|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAAAACGATAAGGGGGTATAATGAGAACTGAAATATTAGTTT |
cas6,cas10,csm2gr11,csm3gr7,csm4gr5,csm5gr7,cas2,cas1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP028102_3
The CRISPR arrays of NZ_CP028102_3 >merge|NZ_CP028102|3|2403345-2403858|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGACTATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAACTTAAATAGCTTTATTATGCAATTAGGAATAGAATTGCATTTAGGAGTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAACTTATAAGGAAACTCGAGCCAGAGAGCCGTAACCCTTTAAATTAATAAAGTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAACAAAAAACAACTAAAATTCAAGGTGGAAAAACAAATAATTTAGGTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAACTTAAAAATATTAAAAATTGAATTAAGAGGTAAAAAAGTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAACTGTGGTAAGTGCTATGAGTGTAAAAAAGCTAGAAAATCAAAGTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAACTTAAAACGATAAGGGGGTATAATGAGAACTGAAATATTAGTTTGTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAAC >NZ_CP028102|3|3|2403345-2403858|CRISPRCasFinder TTGACTATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAAC TTAAATAGCTTTATTATGCAATTAGGAATAGAATTGCATTTAGGA GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAAC TTATAAGGAAACTCGAGCCAGAGAGCCGTAACCCTTTAAATTAATAAA GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAAC AAAAAACAACTAAAATTCAAGGTGGAAAAACAAATAATTTAG GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAAC TTAAAAATATTAAAAATTGAATTAAGAGGTAAAAAA GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAAC TGTGGTAAGTGCTATGAGTGTAAAAAAGCTAGAAAATCAAA GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAAC TTAAAACGATAAGGGGGTATAATGAGAACTGAAATATTAGTTT GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAAC >NZ_CP028102|3|2|2403345-2403858|CRT TTGACTATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAAC TTAAATAGCTTTATTATGCAATTAGGAATAGAATTGCATTTAGGA GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAAC TTATAAGGAAACTCGAGCCAGAGAGCCGTAACCCTTTAAATTAATAAA GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAAC AAAAAACAACTAAAATTCAAGGTGGAAAAACAAATAATTTAG GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAAC TTAAAAATATTAAAAATTGAATTAAGAGGTAAAAAA GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAAC TGTGGTAAGTGCTATGAGTGTAAAAAAGCTAGAAAATCAAA GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAAC TTAAAACGATAAGGGGGTATAATGAGAACTGAAATATTAGTTT GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAAC >NZ_CP028102|3|2|2403427-2403858|PILER-CR GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAAC TTATAAGGAAACTCGAGCCAGAGAGCCGTAACCCTTTAAATTAATAAA GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAAC AAAAAACAACTAAAATTCAAGGTGGAAAAACAAATAATTTAG GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAAC TTAAAAATATTAAAAATTGAATTAAGAGGTAAAAAA GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAAC TGTGGTAAGTGCTATGAGTGTAAAAAAGCTAGAAAATCAAA GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAAC TTAAAACGATAAGGGGGTATAATGAGAACTGAAATATTAGTTT GTTTCAATCCTTATTGTTACTGGTCCTATCTTTTAAC
>NZ_CP028102.1|WP_005886890.1|2401508_2403224_-|hypothetical-protein MKKYEVANSLKSFLGKENNKILLKYSLEEKLSDEEKTELEKIYLENLQKQRKRIANKIKLENIEILISYVSYSYSENEKIYFENILEKNLRIFPNIKCFLLIYSKETEEIFKKTKVKFKNVDVNGILLEEVTSAHIQSNIQKYISKFKPNKNNSIIDITLGMKIITVYLYKLAVERGIFSINWQESQIPKYIYCEKQDEYIKDIGMRRYPFNTKLELMIEPEKENIKIYEYINKSLKKFEFSATESYYNQIGNSGMENFYRELSKIFSFQNMLSLDGENFYSQMENFFIKLSENRELSRENILKLKPFLSNLLSLILFESSEENIETRSFFWLDRFLTKFQIKSDELLENGFLSEYREKIYYFFILKYFESKKEEENSYYYEKFIKDLRKNILKELRVDEKEGKDFLRDGNIFELLDIDIEDIVENLNPSISLTESIKGDFYFENKVLYIEKYNLKIDCEKDERINFINNKGADILRELMKNYTVTFGGRELFERLAKYKNDESELARSNRFRKNLTVLKNKAKDFNNHLKEIGREEGIELGELILYQKIEEKESNYSHQFQINPKFYTLV >NZ_CP028102.1|WP_005886892.1|2400855_2401500_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas6 MKLVKIILKSNEKFENRDAEKLRGYFGRLFQENILFHNHKDDYNFNYDFSFIQYKVKNGEFLIVGIDKGGDILLEKIEDIREIVIEDRKIEITPEINISFPQLKVDDEKKYRYRFETIWLALNDKNFLRYKVGEFDLNKQLANNILEFFKMCGIRVEKRVEVVGEFQELKLRQKDTTILGFVGEFVTNAYLPDNISLGKRKSIGMGRIKRKGEV >NZ_CP028102.1|WP_005886894.1|2398461_2400855_-|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MVRLQDDKERVILGGLLHDIGKFIGRSEKYMSQCHIGKKHPHLSWWFIKFLEEKKVIEEDRVLEELVLKHHEGNFFSEDINVAGLEDKYLRRLAYIVARADNYSSAERNEDEMKMRPFTKVPLDSIFGNIDIGRGKDRESKKRYKLKEFLFGNIFPMEFEENSQEELNLLIEKFLKEVEKIETESFKVLYTTLLELIRKYCWSIPSDTQKEICDLSLYDHLKTTSAISLATYNYVKDLRGSIEKATDADIKNAKLKDYFLLIAGDISGIQNYIFNLESTEGAGKRIRFRSFFIKIFTNMIAYKIIEELDLEVGNIIISSSGKFYILAQNTQVTREKISKLKNEINRELYQKYYGEIFFNIEYLALTGDDLGLKFSKKYAEINDLLAEGKRLKFLKEVVELPVLDEEINEMKSVQQCKICGKRLVEKGNICEYCLKDFQLGELLPKLRKVAFYKGDSDVVGDIEILGVKCKLYKDEEIEGKPFLVQEYEEDIRGDYPWVREYYGGYTPIDSKGNSISFEEIAQLSSSKNLGILKGDVDNLGLIMAYGLKIDDVDGEEKKVKDITSISRVATVSRMFDSFFSYWLKEKIKYENESYIVYSGGDDFMIVGAWDKLIDTAKEIRESFRKFVRDNENITLTCGVVLTKAKAPLFYGVKTVQEAEEFGKNSGKNGIVLFDTYIPWDRFYEVDRVINFIDENMKSGLFSQSFVYRLLRYTEMARKYSESKNGKYLKYISDFTYDIGRNISKKLKNPSSDERIIFLSRYFGMESIQSREKQRFLSEYMKVVLNYVVRKNRGGSDV >NZ_CP028102.1|WP_005886896.1|2398001_2398469_-|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MFNNKGFDNRSRGNSRGYDNPEPVVFEFSKLGFLDNKGNLREELMTTEAENIAKSFERVSTAQLRAFFNEIKALKNRLENNDNNEHFERIYPFILMIKSKVQYRIAKDKKLEPLKNFLYAGIEEIQKQNKVGKGKEAFENFAIFFETIVGYAYKG >NZ_CP028102.1|WP_005886898.1|2397292_2397988_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MRLKSIKKIDGIIELLTGTRVGGSSDTIEIGGNDSPIVRNPLNNESYIPGSSLKGKMRMFMEWVEGKIDENGNVHSCTTPECPICRVFGRGAGDSEIAKSGPTRISVKDAYLTEESREILEKLREKVGFDTEWKYENNINRLTSKATPRNSERIPAGIKFEFSISYKVFDMNDNGKLDEELFEKVVLKGLKTLLIEGIGGGVSRGNGQIRFVKLDVDGESYIDKIENISIR >NZ_CP028102.1|WP_005886900.1|2396339_2397284_-|hypothetical-protein MYQTYLWNIKPLSSYMTPWQSDTIYGHFFWGVALLEGEDELKKILAEFEKNNPPFIVSDGFVDNRLPMISKRVIKNSEVERMAVEKNESIIDIATKIKRLKKVSTISLELFNKLRKKENDIVELVDEILDDNSKNRGIISIENTHNRIDRLSGSTGENAIFSLKENFVAENIFIYIKVRGDYPINKLEKILRFVEENGFGKKVSIGKGAFKTESFERFDGFEKISGNGFISLSNYIPKEEDYEYVENSLVLIKRGKVANLYGDEGNPFKKPFSCFRAGAIFRGKSSGIKGRVLTNLHRKKIIQVGIPFIVEVEL >NZ_CP028102.1|WP_005886902.1|2395191_2396343_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 MIRKDIEKIECTIMPLTDIHIGSGIDLASYEYVIKDGVFYRIDLGEIFYNFPEDMRLKLTELMEENNIIKIRKYIKDNYKVEYGYSYSCEVADDVNELYEEKIGGARNSNDENSLTISEFIGNYRGKYIPGSSIKGSIRNAYIGDNFQGSYEIMRNKKINTAPFIIAKEKEYLARKIEAEALGLKELEPKFDPFKNLQVTDSEISKDMLKIVKVERVNLKKDKINVPMGNHEMMRGYLLSRDKKSLKFKINISELSFDRESEIKYRNLSQNKKGETIIEELNKELYVDSVLFPALREKSNKVLEEDLKFFKEAKNLIGIKACEEIKNYSATLKENEVLIKFGKGAGFNSTTLNLFNRNKKDVFTRVMAEGYPVGWAVLSYNEE >NZ_CP028102.1|WP_005886904.1|2394460_2395189_-|CRISPR-system-precrRNA-processing-endoribonuclease-RAMP-protein-Cas6 MICSFTIYLKPLSFGEKIKKYKNYDYFIKELKIEFTDKELKKVVITNFLTKDNYIEDKKYSIKISALDSGILIKLFQFFFLKKIGEERIKIGETEFAILNIYNSNKYARQLNEESDIEISEDRLRVKIITPIFFKIGNRFIATNDINLILKNIEKKLKNSNILDIEDYLGISKYSSKIEMLEDYSREVKIEKEVVGKVGEIIYDISSLDDKEKREVIFLLKFAFFSGIGYMTEKGYGQIEMI >NZ_CP028102.1|WP_106991863.1|2393039_2393855_-|4Fe-4S-binding-protein MKKVWGMYFSGTGTTEKVVKRIANTLGEKLGVERENIDFTSKSAREKEYIFSKEDIVVFGVPVIAGRVPNLLLKFLDTIRGEGALAVPIVLFGNRNYDDALIELRDILLKDGFFVVGAGAFVGEHSFSRELGKGRPDREDLEIADILAEKVIENMENKKYLSEKLYVKGESPYRWYYQPRDSKGNPIDIRKVKPKTNMELCNNCGLCVELCPLGSIEKERVDVVSGICMKCCACIKKCPQGAKYFDDKNFIYHKEELELEYSRRAKVEIFY >NZ_CP028102.1|WP_040494122.1|2392547_2392925_-|rhodanese-like-domain-containing-protein MKRVIIGVLIMINTITNSYGKELAYQIISQEKAKEMMEENNNYIILDVRTDWEYKMGHIAGAINIPNEEIGHQEIEELPDKNQPILVYCRSGHRSKQASSKLAVLGYKNIYEFGGVITWEYGLVE >NZ_CP028102.1|WP_005886888.1|2404090_2404375_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MKVIIAYDIIENGVRNRIIEVLLEEGMMRIQKSVFFGEINEKKIKKLVKRVEGIIDKEIDSLYFFKLCEKDFSKVNYFGKNIEFHFFNKDFFII >NZ_CP028102.1|WP_005886886.1|2404381_2404672_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MKYIVSYDISVGKIRKEFSDFLKSEGFIRIQKSVFLGKINKKYMYKRFRDWIEKIDKIEDSIIVFPLCDLDFEESYFLGITFDIKDIEKFENMFIM >NZ_CP028102.1|WP_005886883.1|2404649_2405633_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MDLFVQKNGSKIYREKEYFVVERKEEGKEYFSYNLIDNIIIQEGNQLTSDFLLEIIEKDIPLYLGDKYGNIRGKFTPITYNTNSNIRERQYQLWIREYGKELGKSWIMEKIENQKKHIQKIYSRRGVLDKFLEIERKFDENITKIKNITWNDKDFENRVMGYEGRSSILYYEEIKKFLPENWSFTKRETQGAKEPYNIVLNYAFGILYFKLERYLTLAGLDIQLGIIHSNNNKSNSLIFDFIEPFRILAWECAFSLFSKKELNKNYFNLNEGKIELEGKRVIAKDLYNRLKNIVEYNGKKMSYEEKIEKRAKELVKELMKNEIYSKL >NZ_CP028102.1|WP_005886880.1|2405775_2406609_+|hypothetical-protein MEIFLELNYYYNKYPHISLVKNKMEIVKKFKSLENSLLLSKNILNLDEIIFKQLNFTVSFSNYRYIYLLSQINSIKNIQENILQFIFKFFDNFIYSSTYYPHIHYLIKILAKFFTNKIEEKILTFKNKPIFDTYLKEFIILMGNIGGKSSLSILFSIIKKDFTQREYCFLSIGKITSYQRYPVIKRTFLKDYINFICKILHRDISINQSSYLYYSLIEIFLLPNGIDGKLQNKLSEVLYLHKDKNLYKNIALKVINNSLLDENEKNLIKSLYLIIPL >NZ_CP028102.1|WP_005886877.1|2406932_2407772_-|5'-nucleotidase,-lipoprotein-e(P4)-family 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DBSCAN-SWA_1 |
1294640 : 1316146
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP028102|1294640:1316146|DBSCAN-SWA 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30 | Clostridium_phage(36.36%) | portal,capsid,plate,head,tail,holin,protease,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
1395220 : 1471102
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP028102|1395220:1471102|DBSCAN-SWA 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87 | Fusobacterium_phage(75.86%) | portal,capsid,plate,integrase,tail,protease,transposase,holin,terminase | attL 1422302:1422318|attR 1472627:1472643 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1920044 : 1924745
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP028102|1920044:1924745|DBSCAN-SWA AATGAATACAAAGTATATTTTTGTTACTGGAGGAGTTGTATCATCACTTGGAAAAGGAATTACTGCTGCCTCATTAGGAAATTTATTAAAAGCTAGGGGGTATAATGTGACTATACAAAAGTTTGACCCTTATATTAATGTAGACCCAGGAACAATGAATCCATATGAGCATGGAGAAGTATTTGTAACTGATGATGGAGCTGAAACAGACTTAGATTTAGGACATTATGAAAGATTTATTGATGAAAATTTAACTAAATATAATAATATAACTACTGGAAAAATATATCAAACTGTTATAGAAAAAGAGAGAAATGGAGAGTATCTTGGAAAAACTGTACAAGTAGTTCCACATATAACAAATGAGATAAAATCAAAGATAGAGATAGCTGGAAAAGTTAATAATTCTGATATCGTTATAACAGAGATAGGAGGAACAGTAGGAGATATAGAATCTACTCCTTTTTTAGAGGCAATCAGACAATTTAAATATGATATAGGGCGTGAAAATGTACTATATATTCATGTGGCTTTAGTTCCATATTTAAAAGCAGCTGGAGAATTAAAAACAAAACCAGCTCAACACTCTGTAAAAGAATTAATGAGTTTAGGAATTCGTCCAGATATATTAGTTTGTAGAACTGAGCATGACTTAAACGAAGGACTTAGAAAAAAATTAGCTATGTTTTGTGATATAGATTATGACGCCGTGATAGAAGCTAAAGATGCTAGTACTATATATGAAATTCCTTTAATTATGGAAAAAGAGGGATTAGCAGATGTAACTTGTAAAAAATTAGGTATAGAAAATAAAAAAGCTGACTTAGCTCCTTGGGAAAAAATAGTATATGATATAAAAAATCCTCAAGCAGAAGTAAAAATAGCTGTAGTAGGAAAATATGTTGAATTAAAAGATGCTTATATCAGTATAAATGAATCATTAGAACATGCTGCTTACTCTTTAGGATATAAGGCTAGAATAAAATATATACAAGCTGAAAATTTAGATGTAGAGTCTCTAAAAGAGTATCAAGGTATACTAGTTCCTGGTGGATTTGGTAATAGAGGGGTAGAGGGAAAAATAGCAGCTATAAAATATGCTAGAGAGAATAAAATCCCTTTCTTAGGAATATGTTTGGGTATGCAATTAGCAGTTGTAGAATTTGCTAGAAATGTTTTAGGTTACACTGATGCTAACTCAAGTGAATTAGATGAAAATACTACTCATCCTGTTATTCATATAATGGAAGATCAAAAATATATTGAAAAGATGGGAGGAACTATGAGATTAGGAGCTTATCCATGTATTTTAGGAGATGGAACTTTAGCAAAAGAGTTATATGAATCTAAAGAGATAAGTGAAAGACATAGACATAGATATGAGTATAATAACATATATAGAGAAGAATTAGAAAAAGCAGGTTTAAAAGTTTCTGGGACATCTCCTGATAACACTCTTGTTGAAATAGTAGAGTTACCAAGAGAGGTGCACCCATTCTATATAGCTGGACAATTCCATCCTGAGTTTAAGACAAGACCAAATAGACCTCACCCATTATTTAAAGGATTTATAGAAGCAAGTACAAAATAAAATTGAGAGGGAAGCTCCCTCTCATATTTTTTTTGACAAAATATTATAAGTGTGCTATTATAAAAAAGAATAAAGCTGAAAGACAGTTCATTTGTACCATCCTGTCTATAAACAAAACTAGGGCTCTTTTTTTATTATAATTTTTTGAATTAAAGAAAAGTTTGCTTATTTAGTTTCTTTGTTGATAGGAGGATAAAAGTAGACTTTTCTTTTTTATTCTCAAAATTATTTTAAGGAGGCAAATAATGTATACATTAATTAGTGAAGCAAGTTTTGATAGTGCTCATTTTTTATCTGGATACAACGGAAAATGTAAAAATATCCATGGACATCGTTGGACAATAAAGATGGAAATATATGGAGAAAAATTGCAAAGTGAAGGACACTTAAGGGGAATGATTTTAGATTTTGGAGATATAAAATCTATGTTGAAAGAGTTGGCTGATTATTTTGATCATTCTCTAATTATAGAGAGAGATAGTATGAGAAATGCTACATTAAATTATTTGAAAGAAGATGGTTTTAAAATCGTAGAAATAGATTTTAGACCAACAGCTGAAAATTTTTCTAGATATATTTTTGATTATTTTAAAGAGAGAAAAATTCCTGTAAAAAAGGTAATAGTCTATGAAACTCCAAATAACTGTGCAACATATAGTGAGGAGATAAAATAATGGCAAATTTTAAGGTTGTAGAGATATTTGAAAGTATAAATGGAGAAGGGAGAAGAGTTGGACAATTAGCTATTTTTATAAGATTGCAAAAATGTAATCTGAATTGTAGTTACTGTGATACAAGATGGGCTAATGGAGATGATGCCCCTTATACTCTAATGAGTGAAGATAAAATATATGACAGAATATTGAAAAGTGGAATAAAAAATATAACTCTTACTGGAGGAGAACCACTTTTGCATAAAGATGTGGAGATACTACTAGAGAAAATAGGAGAGAACCCAAACTTAAGTTTAGAAATAGAAACAAATGGAAGTATTGAATTAGAAAAATTCTCTAAATTAAAAAATCCTCCATTATTTACTATGGACTATAAATTGCCAAGTAGCAAAATGGAAAATAAAATGTGTTTAGATAATTTTAAATATTTAACTTTAAAAGATACTGTGAAATTTGTAGTAGGAACTATTGAAGATTTAAAAAAAGCTAAAGAGATAATTGAAAGATACTCTTTAATAGGAAAATGTGCTGTATATTTTAGTCCAGTTTTTAATTCCATTGACCCAATTGAAATAGTAAAATTTATGAAAGAAAACAGATTAAATGGAGTAAATCTACAATTACAAATTCATAAGTTTATATGGGATCCAGAAAGTAAAGGTGTATAATGATAGATAAAGAAGCAATAGAAAAACATATTAGGGGAATACTCATAGCTTTAGGGGATAATCCAGATAGAGAGGGACTTATAGAAACACCTAAAAGAGTAGCTAATATGTATGAAGAGATTTTTCAAGGAATGAATTATACTAATGATGAAATAATTAAGATCTATAATAAGAATTTTGAAGTTTCAAATAATTTAGATAGCAATGATATGGTTATAGTTAAAGATATTGAAATTTTTAGTTGTTGTGAACATCACTTAGCTCTTATGTATGATATGAGTGTAACAGTAGCATATATACCTAAAGATAGAGTTATTGGACTTAGTAAAATTGCTAGGATTTGTGATATGGTAGGAAAAAGGCTACAACTTCAAGAGAGAATAGGAAGAGATATAGCTTATATAGTTAGTAAAATCATTAACTCAGAAGATATTGCTGTTCTTATTAAAGGAAAACATAGTTGTATGACAGCTAGAGGAATAAATAAAACAAATAGTTTTACTGAAACTTCCACTTTTATGGGAGAATTTAAAAAAAATTATGTATTACAAAATAGGTTATTCAATAGATTATAAAGGAGAAAAGAGATGAGAGTTTTAGTATTATTAAGTGGTGGAGTAGATAGCTCAACTTGTTTGGCTATGGCTGTAGATAGGTATGGAAAAGATAATGTTGTAGCTTTGTCTGCATCTTATGGACAAAAACATACTAAGGAATTAGAGTCTGCTAGAAAAATAGCTAGTTACTATCAAATAGAATTAATAGAGATAAATTTAGGGAAGATTTTTTCATTTAGTAATTGTTCTCTACTTTCTCATTCGGATAAGGAGATACCACAAGGAAGTTATGATGAACAACTAAGGAATATAGATGGAGAAAAACTTTCTACCTATGTACCATTTAGAAATGGATTATTTTTGTCTACAGCAGCAAGTATAGCACTTTCTAAAAATTGTCAAGTAATATATTATGGAGCTCATAGTGATGACTCAGCTGGAGATGCTTATCCAGATTGTAGTCCAGAATTTAATGAAGCTATGAATAGAGCTATATATTTAGGAAGTGGAAAAGAATTAAAAATAGAAGCACCCTTTGTAAATATGCATAAAAGCGATATTGTAAAAAAGGGACTAGAATTAAATCTGCCATATGAATTAACTTGGAGTTGTTATGAAGGAGGAGAATATCCTTGTGGTAAATGTGGAACTTGCATTGATAGAGAAAAGGCTTTTGAGATTAATAATTCAATTGATCCGCTAGTAAAATTAAGAAAAGGAGATAAATAGATGAGAGATTTAAAAGATTTAACACTACTAGGAAATCAAGGAGTAAAATATCCAGATAATTATGCCCCAGAGATTTTAGAAACTTTTGATAATAAACATCCTGAAAATGATTACTTTGTAAAATTTAATTGCCCAGAATTTACAAGTTTATGTCCTATCACAGGGCAACCAGACTTTGCTAATATTATAATATCTTATGTACCAAATATAAAAATGGTAGAGAGTAAATCTTTAAAATTATATCTATTTAGTTTTCGTAATCATGGGGATTTTCATGAGGATTGTGTAAATATTATTATGAAAGATTTAATAAGATTAATGGATCCTAAATATATAGAAGTATGGGGAAAATTTACTCCAAGGGGAGGAATTTCAATAGATCCTTATTGTAATTATGGAAAAAAAGGAAGTAAATGGGAAGAGATAGCTTTAAATAGATTGGCTAATCATGATATGTATCCTGAAAAAGTGGATAATAGATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP028102|1920044:1924745|1924262_1924745_+|WP_005885467.1|DBSCAN-SWA MRDLKDLTLLGNQGVKYPDNYAPEILETFDNKHPENDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFANIIISYVPNIKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCVNIIMKDLIRLMDPKYIEVWGKFTPRGGISIDPYCNYGKKGSKWEEIALNRLANHDMYPEKVDNR >NZ_CP028102|1920044:1924745|1921879_1922308_+|WP_005885471.1|DBSCAN-SWA MYTLISEASFDSAHFLSGYNGKCKNIHGHRWTIKMEIYGEKLQSEGHLRGMILDFGDIKSMLKELADYFDHSLIIERDSMRNATLNYLKEDGFKIVEIDFRPTAENFSRYIFDYFKERKIPVKKVIVYETPNNCATYSEEIK >NZ_CP028102|1920044:1924745|1923563_1924262_+|WP_005885468.1|DBSCAN-SWA MRVLVLLSGGVDSSTCLAMAVDRYGKDNVVALSASYGQKHTKELESARKIASYYQIELIEINLGKIFSFSNCSLLSHSDKEIPQGSYDEQLRNIDGEKLSTYVPFRNGLFLSTAASIALSKNCQVIYYGAHSDDSAGDAYPDCSPEFNEAMNRAIYLGSGKELKIEAPFVNMHKSDIVKKGLELNLPYELTWSCYEGGEYPCGKCGTCIDREKAFEINNSIDPLVKLRKGDK >NZ_CP028102|1920044:1924745|1922307_1922976_+|WP_005885470.1|DBSCAN-SWA MANFKVVEIFESINGEGRRVGQLAIFIRLQKCNLNCSYCDTRWANGDDAPYTLMSEDKIYDRILKSGIKNITLTGGEPLLHKDVEILLEKIGENPNLSLEIETNGSIELEKFSKLKNPPLFTMDYKLPSSKMENKMCLDNFKYLTLKDTVKFVVGTIEDLKKAKEIIERYSLIGKCAVYFSPVFNSIDPIEIVKFMKENRLNGVNLQLQIHKFIWDPESKGV >NZ_CP028102|1920044:1924745|1920044_1921634_+|WP_005885472.1|DBSCAN-SWA MNTKYIFVTGGVVSSLGKGITAASLGNLLKARGYNVTIQKFDPYINVDPGTMNPYEHGEVFVTDDGAETDLDLGHYERFIDENLTKYNNITTGKIYQTVIEKERNGEYLGKTVQVVPHITNEIKSKIEIAGKVNNSDIVITEIGGTVGDIESTPFLEAIRQFKYDIGRENVLYIHVALVPYLKAAGELKTKPAQHSVKELMSLGIRPDILVCRTEHDLNEGLRKKLAMFCDIDYDAVIEAKDASTIYEIPLIMEKEGLADVTCKKLGIENKKADLAPWEKIVYDIKNPQAEVKIAVVGKYVELKDAYISINESLEHAAYSLGYKARIKYIQAENLDVESLKEYQGILVPGGFGNRGVEGKIAAIKYARENKIPFLGICLGMQLAVVEFARNVLGYTDANSSELDENTTHPVIHIMEDQKYIEKMGGTMRLGAYPCILGDGTLAKELYESKEISERHRHRYEYNNIYREELEKAGLKVSGTSPDNTLVEIVELPREVHPFYIAGQFHPEFKTRPNRPHPLFKGFIEASTK >NZ_CP028102|1920044:1924745|1922975_1923551_+|WP_005885469.1|DBSCAN-SWA MIDKEAIEKHIRGILIALGDNPDREGLIETPKRVANMYEEIFQGMNYTNDEIIKIYNKNFEVSNNLDSNDMVIVKDIEIFSCCEHHLALMYDMSVTVAYIPKDRVIGLSKIARICDMVGKRLQLQERIGRDIAYIVSKIINSEDIAVLIKGKHSCMTARGINKTNSFTETSTFMGEFKKNYVLQNRLFNRL |
6 | uncultured_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1968316 : 2006606
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP028102|1968316:2006606|DBSCAN-SWA 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49 | Clostridium_phage(26.67%) | head,integrase,tail,holin,terminase | attL 1967454:1967470|attR 2011739:2011755 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2287665 : 2293701
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP028102|2287665:2293701|DBSCAN-SWA 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AATACATCTACTAAGTGAGTTTTTATTCCATTTTTCTCTAACATTCTGAATAACATAGCTGTTATTTTGTTGTTCATTACACCTTTATTTACTATTGTTCCTTTTTTAGCTCCATTTCCTGCTGTTGCATCATCTTTATAGTGAATTATTACTAAGTTCTCATCTGTTGTTGAATATACTTGTTTAGCTTTTCCTTCATAAATAAAATCTTTTTTTTCTACTGACATTTTAATTCCTCCTGAGATACTTTTAATATTTTATACCTTATTTTTATTTTTTATTGAAATTTAAATTTGAAAACTTCTATTATCTGTAACTTCATAGAAAATCTCTTGATTAAAATCAAGAATAACGAAGATTGAGGAGAATATTAGAGCAAGTCAGTGAAAGCGAATGCCCAAAAACACAATAAGCCAAAGGCTTAACCCTTGTGTTTTTAATGAGCTGAGCCATACTTGCTCTTTATTCTTTGAACGAAAGTTATTCTTGAATTTTATACCTCTAACTTCTTTACGTAATTTACGCAACTCTTTAAGTTTTCAATATTATAATTTATCTTATAGTTCTACTCCTGATTCATTATCAGCTATAAACTTAGCTTTCATATCTTTTCTGAAGTTTCTTAATTTCTCTTTTAGTTCTGGAGATTTTAATGAAAGCATTTGTACAGCTAACATTCCTGCGTTGTATGAGTTATTTACTCCAACAGTTGCAACTGGAATTGATTTAGGCATCTGTACTATTGATAATAATGCGTCCATTCCGTTGAAAGCTGCCTCAATAGGTACTCCTATTACTGGTAGTGTAGTTTTTGAAGCTATAACTCCAGGTAAATGAGCTGCAAGCCCAGCTCCAGCTATAATTACATCATAACCTTCTACCTCTAATTTTTCTAATGTTTCTTCTAATTTTTCAGGTACTCTATGAGCTGAAAGTACATGAGCTGAATACTCTATTCCAAACTCTTTTAAGCAGTTAGCTGCTCCTCTCATCTTCTCTGTATCTGATTTACTTCCGAAAATAATAGCTACTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP028102|2287665:2293701|2289182_2289761_-|WP_005887050.1|DBSCAN-SWA MFKIGVLVSGGGSNLQSIIDKSQSRELQCKVEVVIGDRECYGVERAKEAGIDGYTLDRKVLKKELCREIDKIVSERGIDLIVLAGFLSIIDEEFVNKWKGRIINIHPSLLPKFGGPGMYGIRVHEAVLKAGEQESGCTVHYVDTGVDSGEIIAQKRVKVLEGDTPEILQKRVLVEEHKLLPESIAKIISERR >NZ_CP028102|2287665:2293701|2290777_2292175_-|WP_005887048.1|DBSCAN-SWA MNCTEILMAKDKMEEECGVFGIYSKEVNEVAQITYYGLYALQHRGQESAGISVSNFGEIVTYKGMGLTADVFTPETLNNLVGNAAIGHVRYSTTGASKLENAQPLESRYKLGQIAVAHNGNLTNAKIIRELLEDAGSTFNTSIDSEVIIKMIARKANGNVEDAIRSTVGAIKGAYALVILAGNKLVGVRDPYGIRPLCLGINENGDYILASESCAIDAVGGTLIRDVLPGEMVIIDENGVKSVKYSENNKKAPCSFEHIYFARPDSVIDGLNVYESRVEAGRLLAKQMKVEADVVIGVPDSGIPAAIGFAEASGIPYAIGLVKNKYIGRTFIKPTQALREQAVMVKLNPLKVNLEGKRVVIIDDSLVRGTTSKILIEIIRRAGAKEVHFRSASPAVKHSCYFGIDTAHREELIAARLSVEEIRKEINADTLDYLSMENMLKSLKGCDYCVGCFNGEYPVDTPTEE >NZ_CP028102|2287665:2293701|2287665_2289171_-|WP_040494135.1|DBSCAN-SWA MMKRALISVFDKNGILEFAQFLVKHNVEIISTGGTYRYLKENGVPVIEVAEVTKAPEMLDGRVKTLHPVIHGGILAIRDNEEHMATIKARGIETIDMVVVNLYPFFKKVNEDLTFEEKVEFIDIGGPTMLRSAAKSFKDVVVISDTTDYETVMREMEAGEVTFETRKRLAGKVFNLTSAYDAAISSFLLGDEMPHYLNASYEKVMDLRYGENPHQKAAYYVSTTDSGAMKDFEQLNGKELSFNNIRDMDVAWKVACEFEEPACCGVKHSTPCGAAIGKDIHEAYVKAYECDPVSIFGGIVALNKEVDKATAEELVKIFLEIVIAPSFTEEALEVLRTKKNLRVIKCYHKPMDKVNLVKVDGGILVQDEDLSFSTHYETVTEKAPTEKEMSDLDFGMKIVKHVKSNAIVVAKDKMAIGIGNGETNRIWPTEQAIERAGERIEGAVLASDAFFPFRDVVDTCAKHGIKAIIQPGGSIRDKESIEACNEHGIAMIFNGMRHFKH >NZ_CP028102|2287665:2293701|2293221_2293701_-|WP_005887045.1|DBSCAN-SWA MKVAIIFGSKSDTEKMRGAANCLKEFGIEYSAHVLSAHRVPEKLEETLEKLEVEGYDVIIAGAGLAAHLPGVIASKTTLPVIGVPIEAAFNGMDALLSIVQMPKSIPVATVGVNNSYNAGMLAVQMLSLKSPELKEKLRNFRKDMKAKFIADNESGVEL >NZ_CP028102|2287665:2293701|2292177_2292891_-|WP_005887046.1|DBSCAN-SWA MSVEKKDFIYEGKAKQVYSTTDENLVIIHYKDDATAGNGAKKGTIVNKGVMNNKITAMLFRMLEKNGIKTHLVDVLNDRDQLCQKVKIFPLEVIVRNVIAGSMAARVGIPEGTKPTNTIFEICYKNDAYGDPLINDHHAVALGLCTYEELAEIYRITGQINNLLKDAFDKIGITLVDFKIEFGKNAAGEILLADEITPDTCRLWDKETGKKLDKDRFRRDLGGIEEAYIEVLKRLGA >NZ_CP028102|2287665:2293701|2289748_2290750_-|WP_005887049.1|DBSCAN-SWA MAISYKEAGVDKEEGYRAVELMKKAVAKTMNSNVLNGLGSFGAMYELGKYENPVLVSGTDGVGTKLEIALTTKKYDTVGIDAVAMCVNDVLCHGAKPIFFLDYLACGKLDAEVAAELVSGVAEGCYQAGAALIGGETAEMPGFYKVGDYDIAGFCVGAVEKSKIVNGSTTSEGDILIAIPSSGVHSNGFSLVRKVITDYNKEYNGKPISETLLTPTKIYVKPVLAVLEKYNVKGMAHITGGGLPENLPRTISEGHQPVVLKEKLRVLDIFKYIQKEGDIPEDEMYGTFNMGVGFVLVVDPKDKDGVIEELAKYGEEAFEIGYVQKGEKGLCLK |
6 | Prochlorococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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