Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020098 | Lactiplantibacillus plantarum strain K25 plasmid unnamed5, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP020099 | Lactiplantibacillus plantarum strain K25 plasmid unnamed6, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP020097 | Lactiplantibacillus plantarum strain K25 plasmid unnamed4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP020094 | Lactiplantibacillus plantarum strain K25 plasmid unnamed1, complete sequence | 1 crisprs | NA | 0 | 4 | 0 | 0 |
NZ_CP020093 | Lactiplantibacillus plantarum strain K25 chromosome, complete genome | 2 crisprs | csa3,cas9,cas1,DinG,cas3,DEDDh | 0 | 3 | 7 | 0 |
NZ_CP020095 | Lactiplantibacillus plantarum strain K25 plasmid unnamed2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP020096 | Lactiplantibacillus plantarum strain K25 plasmid unnamed3, complete sequence | 1 crisprs | NA | 0 | 1 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020096_1 | 31838-31994 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP020096_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP020096_1
>1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder AACCCGCATGATACCGTTGAACCCCTTGGTACAAGCGGACTTCTCAAAAAGAGAAACCCGCATGATACCGTTTCTGATACGTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020096_1
The CRISPR arrays of NZ_CP020096_1 >merge|NZ_CP020096|1|31838-31994|CRISPRCasFinder TAAACCCCTTGGTACAAGCGGACTTCTCAAAAAGAGAAACCCGCATGATACCGTTGAACCCCTTGGTACAAGCGGACTTCTCAAAAAGAGAAACCCGCATGATACCGTTTCTGATACGTCTGAATCCCTTGGTACAAGCGGACTTCTCAAAAAGAGA >NZ_CP020096|1|1|31838-31994|CRISPRCasFinder TAAACCCCTTGGTACAAGCGGACTTCTCAAAAAGAGA AACCCGCATGATACCGTTGAACCCCTTGGTACAAGCGGACTTCTCAAAAAGAGAAACCCGCATGATACCGTTTCTGATACGTC TGAATCCCTTGGTACAAGCGGACTTCTCAAAAAGAGA
>NZ_CP020096.1|WP_106904901.1|30570_30819_+|ribbon-helix-helix-protein,-CopG-family MSLDSFNHKKDEEMRESYETTLKDNKKDAVAFLKNISRKEVERKRSVTFSITESQLKKIDVAARKNGFKNRSEFLASIIDAI >NZ_CP020096.1|WP_060463334.1|29750_30557_+|ParA-family-protein MKIITFTAIKGGVGKTTLTLNYGDWLAKNGKKVLLIDLDHQCNLTTVFEKTRRNNTIAEAFKEDDNAQKVKIDSVGPNLDLIAGFIDLDVLGSYLENNSNKEMMLFMWFKNNSDSLSLTDYDYILIDTHPDFSTITKNAIAISNYLLSPITPSEHGYNAKFDLETRLEKFRKSLFDYRTGETYVDAKLFFIGNMIRHNTSMSRDLLKHIEGDETVATIIPERELFNKATARHASIFELANHDESILKQNQKFIEHADHLFQELANKTK >NZ_CP020096.1|WP_106904900.1|28338_29268_-|IS30-family-transposase MSSITYSERIKIETFCELGLSNIQMGVRLNRSPSTISYELARCQPYQAELAQTDAEYKRSRCGRKTKLSDESKQKILNHLRLSWSPGMIAHEFKLATKSIYNWLNQGRIGFSLNDLPEHGVRQRRNVDQRSKYNQSLGRSIEQRPIVVNRRNRIGDFELDTIVGPRGHSKAVLLTLIDRKSRFLWAYRLKNRTAVTVNEALNKFLATFNGPVHSFTVDRGTEFSGLVSLEAQYGIKTYYCHAYTPAERGSNERFNRNLRYFYPKGTYFEHISAQGLKTTLLEINQRPLKILDWQTPYQVMLTNLSKNSD >NZ_CP020096.1|WP_106904899.1|27170_28007_+|dTDP-4-dehydrorhamnose-reductase MSKVMIVGANGQLGNELQRLLNEQGIAFDALTKKELDVTNLDAVKAKVAELQPVVLYDCAAYTAVDKAEDEGKALNWLVNVDGTKNLAQIAAEQDVKLVYVSTDYIFDGTNKDEYLEDDPANPKNEYGRAKWAGEEAVRHSGADYYIVRTSWVFGEFGHNFVFTMQNLAKTHDKLTVVNDQLGRPTWTRTLAEFMVHLVKTEAASGTYQLSNDNTATWYDFAKEILKNTDVEVVPVTSEQFPQKACRPRHSVMNLSKAKKTGFIISDWKSAVAKLLSE >NZ_CP020096.1|WP_027822971.1|26109_27138_+|dTDP-glucose-4,6-dehydratase MENLLVTGGAGFIGSNFVHYVYNHHPEVKITVLDKLTYAGNRANLEEILGDRVKLVVGDICDAPLVDELMQQTDAVVHYAAESHNDNSLKDPWPFIETNIIGTYTLIQSAHKFNKRFHHVSTDEVYGDLPLREDLPGHGEGVGEKFTPTSRYKPSSPYSSSKASSDLLVRAWVRSFGLQATISNCSNNYGPYQYIEKFIPRQITNILSGIRPKLYGSGKNVRDWIHTNDHSAAVWDILTKGKIGETYLIGADGEMNNKDVLEMILELMGQPKDAYDVVKDRPGHDLRYAIDSTKLRTELGWQPEFTDFRSGLKATIDWYTDHQDWWQADKSKVESNYAKNGQ >NZ_CP020096.1|WP_060416961.1|25518_26100_+|dTDP-4-dehydrorhamnose-3,5-epimerase MGKLKVITTKLQDVKIIEPAVFGDKRGFFTETYSDRDFKEAGIDFDFIQDNQSLSAEAGVLRGLHFQRGKAAQTKLIRVVTGAVLDVIVDVRAGSPTYGEWEGYIISESNHRQLLVPRGFAHGFVTLTDNVNFLYKCDNYYNAEADGGITFMDKDLNINWPIDYDQAMTSDKDAKQQTFKEFEQNNPFVYGEI >NZ_CP020096.1|WP_060678065.1|24645_25515_+|glucose-1-phosphate-thymidylyltransferase-RfbA MKGIILAGGSGTRLYPITRAISKQLIPIYDKPMIYYPLSTLMLAGIQDILVISTPVDTPRFKELLGDGHDLGLNLSYAVQEKPNGLAEAFILGADFIGNDSVCLILGDNIYYGGGLSKMLQHASAKPKGATVFGYHVNDPERFGVVDFDENMHATSIVEKPVHPASNYAVTGMYFYDNQVVDIAKNIQPSPRGELEITDINKVYLEHNELDVELMGRGFAWLDTGTHDSLQEASSFIATVQKRQNLKVACLEEVAYRMGYIGADKVYELAQPLKKNDYGQYLLRLIGRA >NZ_CP020096.1|WP_106904898.1|23649_24579_+|IS30-family-transposase MSSITYSERIKIETFCELGLSNIQMSDRLKRSPATISYELARCEPYQAEVAQTDAEYKRSRCGRKTKLNDKLRQIILNHLRLSWSPEMIAHEFKLATKSIYNWLNQGKIEFSLNDLPEHGVRQRHNLDQRSKYNQSLGRSIEQRPIVVNRRNRIGDFELDTIVGPRGHSKAVLLTLIDRKSRFLWAYRLKDRTTATVNEALTKFLTTFNGPVHSFTVDRGTEFSGLVSLEAQYGIKTYYCHAYTPAERGSNERFNRNLRYFYPKGTYFEHISAQGLKTTLLEINQRPLKILDWQTPYQVMLTNLSKNSD >NZ_CP020096.1|WP_106904896.1|22303_23077_+|tyrosine-protein-phosphatase MKINNLVDLHCHILPAIDDGSPSLEASLELARQAVADGIRYILATPHHMDRHYLNHAGDVAAAVKVFQAELDANDIPLTIFPGQEVHLNGQLMENIDDLLGIDASRHYLLLELPHEMVPSYLDEMIFQLSCEGITPVIAHPERNAQIIAEPQRLYKLVEDGGLAQVTATSLVGAFGEQVQRTAKEFVKCGLVQVVASDAHTLKNRGFAMTKAYQVLNEMDSQYPERFATNARNLLNGEQIAIGRVVVPEKQKRFWLL >NZ_CP020096.1|WP_106904895.1|21588_22317_+|CpsD/CapB-family-tyrosine-protein-kinase MFKRKEQNITTTAPINLTTINEPMSVITEQIKTIRTNINFAATDKNLRTLMVTSAMIGEGKSTVSGNLAVEYAKEGMQVLLVDADLRRPTIHKTFGLKNHKGLSSWLANQLDDVNDAIHPVIGNLFVMTSGPKPPNPAELLGSNKMTEFLTSATRKLDLVIVDAPTILPVTDSQLLANKVDGTVLVVRQGVAQKAAVRDAVNSLKKSQANILGAVLNDVRDSSHHGYYGYNSGYGYYSDEDK >NZ_CP020096.1|WP_054762704.1|32670_32868_+|hypothetical-protein MTKPSKEIETIDQLLADPWAVNIQDIWEQAAYNPDPDKRKLFDALHTYLLDKRQEQIINEKHFVI >NZ_CP020096.1|WP_106904903.1|32918_33668_+|Fic-family-protein MAKTRTYMDKYKFTAAENQRFARANFTKLVHTNARFEGVNTTLPQTQTIMDGMSVAGVPVEDILTIVNLKRGWQYITAQNSPLTLTMEKQINKIVAAEDALVPGELRQGKGGVDLGSEDFFEPPLINEKQEQSFLQKILADPRTTITDKALTVMYHNMRQQIFWDGNKRTATLSANKIMIDGGAGLINVPLDKWDQWNELIANYYQTNDMTKIKQWTYDNGIQGLQIRANKKLSANELNQMYKQLKKNG >NZ_CP020096.1|WP_106904904.1|33790_34069_-|hypothetical-protein MPNQYEKLVEQQARLKQKIEREDFKLRQSKYYENRQARKVRSRRLIQKGALLEKYFQADNLSVEQTEELLKIFADYVNAHKPNKLKNDQPNN >NZ_CP020096.1|WP_106904905.1|34088_34298_-|hypothetical-protein MSQSNLEKQEAKLKQLNQKIKAEKNKIEQNLGKQIIRSANLDYGTLTTPQIKMIAKKVAAFLKQAQNNR >NZ_CP020096.1|WP_106904906.1|34569_36630_+|MobA/MobL-family-protein MAIFHMSFSNISAGKGRSAIASAAYRSGEKLFDNQEGRHYFYARSVMPESFILTPKNAPEWASNREQLWNEVEKNDRKSNSRYAKEFNVALPVELSESEQKELLTKYVQENFADQGMVADVAIHRDHPDNPHAHVMLTNRPFNPDGSWGLKAKTQYIKDENGKQLLTKSGFPKQRKIWLVDWDKKEKINEWRHNWATSVNQSLAQKNITDRISEKSFVDQGIQETPTQHEGINNQRKNRKAFNQQVSAQRSAQAKYHNLDEKIRNHEHFDALTDELSFSEKHTISHLSQQLKTYVDLEHLDDKQRMLFNWKNSLLIKHAVGEDVTKQLLTIDQQTTSLAQANQLLNKVVERATKKLYPELNFEQTTAAERRELIKETNSEQTIFKGSELAERLADIRSDLLTQQLLTFTKRPYTSWQLVNQQAQTIEKQLTTVLAKHGHQLDDLKHTDRGILAAYQPSELEFISKAVKDLRVMREVKAVVQTQYDSILTTTFPDSDLDKLETIDKEQIYTAVVYYDPELKPLSANDLSQLQQQPPVVFTSQQHQAGLNYLLGKIELKDIQNHRLQRVLKHDGTRQLFIGECGQDPKLDHKQIEMVQTRLKQQTTRFDQYRQAQVKDYRAINYHPTSPKNYLTNILDEALITILYAKNTDYLRKQQLRGLKETEWAMTKKQRQHQTRNRHEDGGMHL >NZ_CP020096.1|WP_106904907.1|36813_37938_+|hypothetical-protein MPSKSDVKAWKAQLVAQAEQQILKLTDSDRFKQYLNTLAKFHHYSARNIDLIYAQNPQATQVAGFKQWQTAFNRTVKRGAKSIRIAAPIIKKLTPAEQKRLDTTDERAIVGYRYLPVFDVSQTSGEPVLSAKDFVKENLADHQNVTSLYNAFKDYLNQQTDLQVSEVPLATLNGAKGYFQPSTNEIVIGGDEPDNALKLKTLYHEYAHSQLHGLKSAFKDRPRAYQETQAEAVAYVAMQNIGVDTGNYSLGYVATWAKDKAVIHSALSEIQQVSNKVIELSDGLTKQLGLQEAQKEPEHDLKKLSAQDLNQSYQSLQQQVQQATNPQQKSELKNKLNDVHQKISNRTQKQLQDFVRQNPKIKQPVQDEAKKRQL >NZ_CP020096.1|WP_106904908.1|37966_38446_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIIKRFFKDSDAEEVANLVKETMLTTNIKDYSKKYLENDLEHLTAQDFKEKAEYFHCYVFIDDTLNKIIAVGSIGPYWGRQDESSLFNIFVSPEFQGQGIGKQLIQVLEQDEYFKRAKQIEIPASITGLGFYQKMGYHFKNGNSSLDNEQLYRLEKFNN >NZ_CP020096.1|WP_106904909.1|38518_38905_-|hypothetical-protein MNNQEFDLATVKHFFEHDYHDRGMMKWQGFYLSDHTAALNQQNQQLNEIYVPRPQQSLAVITEVLADAYQRQQPVTIQLKTVNQNNRHLPDITTLIHGYNANDIVVDSDRFIPLLEIRNVADKKTEKL >NZ_CP020096.1|WP_106904910.1|38897_39218_-|acetyl-CoA-carboxylase MNSDIEIIKGRLTLLFKRRPQTRYWLMLTNDTYDQTYNLFFNSQRANERLQSVPLHKLAHYDLADLEKLLKALRQDIKLMIEFVGFTGERWPASQKLIQRKRVPLE >NZ_CP020096.1|WP_106904911.1|41237_42170_+|NAD-dependent-epimerase/dehydratase-family-protein MSKYLVTGGAGFIGSNLVDELIKGDNQITVVDDLSMGLLSNLPDSDKVTFIKHDITDHDFMSELLINEKFDYIVLLAAIASVADSVDRPYYTHEINQEANLNIIETIRREHLPLKKLFFASSAAVYGENPTLPKVETLAVDPLTQYAVDKYATERAIINYSRLYDLPFVTVRFFNVFGPKQNPASPYSGVLSIIMNALQNDKPFTFFGDGGQTRDFVFVGDVVSAIIGLLHTPEARADVFNIANGQQTTLQEVANDLQAITGKMLNASYKEARQGDIRDSYANVDKINAFGFMTHTPLKEGLKIYADSVK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP031319 | Lactobacillus plantarum strain DR7 plasmid unnamed1, complete sequence | 27217-27299 | 23 | 0.723 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP029350 | Lactobacillus plantarum strain HAC01 plasmid pLP-HAC01, complete sequence | 2645-2727 | 23 | 0.723 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP023492 | Lactobacillus plantarum strain NCIMB 700965 plasmid unamed2, complete sequence | 1319-1401 | 23 | 0.723 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP014919 | Lactobacillus paracollinoides strain TMW 1.1994 plasmid pL11994-4, complete sequence | 2234-2316 | 23 | 0.723 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP035016 | Lactobacillus plantarum strain 12_3 plasmid pldD, complete sequence | 8775-8857 | 23 | 0.723 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP020096 | Lactobacillus plantarum strain K25 plasmid unnamed3, complete sequence | 31875-31957 | 23 | 0.723 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NC_015429 | Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 plasmid pLBUC02, complete sequence | 17641-17723 | 23 | 0.723 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP032467 | Lactobacillus plantarum strain ATG-K8 plasmid pK8, complete sequence | 10898-10980 | 23 | 0.723 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP032467 | Lactobacillus plantarum strain ATG-K8 plasmid pK8, complete sequence | 43774-43856 | 23 | 0.723 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP026507 | Lactobacillus plantarum strain NCIMB700965.EF.A plasmid punamed2, complete sequence | 35987-36069 | 23 | 0.723 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP032465 | Lactobacillus plantarum strain ATG-K6 plasmid pK6, complete sequence | 8939-9021 | 23 | 0.723 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP032465 | Lactobacillus plantarum strain ATG-K6 plasmid pK6, complete sequence | 41815-41897 | 23 | 0.723 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP018868 | Lactobacillus alimentarius DSM 20249 plasmid pLDW-11, complete sequence | 5943-6025 | 23 | 0.723 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP018868 | Lactobacillus alimentarius DSM 20249 plasmid pLDW-11, complete sequence | 54801-54883 | 23 | 0.723 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP019723 | Lactobacillus plantarum strain CLP0611 plasmid pUnnamed, complete sequence | 30205-30287 | 23 | 0.723 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP028231 | Lactobacillus plantarum strain SRCM101222 plasmid unnamed2, complete sequence | 18509-18591 | 23 | 0.723 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP053913 | Lactobacillus plantarum subsp. plantarum strain G1 plasmid p1, complete sequence | 4550-4632 | 23 | 0.723 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP037432 | Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM3, complete sequence | 20405-20487 | 23 | 0.723 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP037432 | Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM3, complete sequence | 32434-32516 | 23 | 0.723 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP035575 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103303 plasmid unnamed4 | 27497-27579 | 23 | 0.723 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP013756 | Lactobacillus plantarum strain DF plasmid unnamed3, complete sequence | 12389-12471 | 23 | 0.723 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP013756 | Lactobacillus plantarum strain DF plasmid unnamed3, complete sequence | 60459-60541 | 23 | 0.723 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP013752 | Lactobacillus plantarum strain KP plasmid unnamed3, complete sequence | 33084-33166 | 23 | 0.723 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP023177 | Lactobacillus plantarum strain BDGP2 plasmid pLtBDGP2C, complete sequence | 2282-2364 | 23 | 0.723 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP028280 | Lactobacillus plantarum strain SRCM100995 plasmid unnamed5, complete sequence | 15336-15418 | 23 | 0.723 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP040738 | Lactobacillus futsaii strain Y97 plasmid p2, complete sequence | 9385-9467 | 24 | 0.711 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP035561 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103297 plasmid unnamed5 | 2455-2537 | 24 | 0.711 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP035561 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103297 plasmid unnamed5 | 44108-44190 | 24 | 0.711 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP014884 | Lactobacillus backii strain TMW 1.1991 plasmid pL11991-3, complete sequence | 21803-21885 | 24 | 0.711 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP014875 | Lactobacillus backii strain TMW 1.1989 plasmid pL11989-2, complete sequence | 21765-21847 | 24 | 0.711 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP014627 | Lactobacillus backii strain TMW 1.1988 plasmid L11988-3, complete sequence | 5895-5977 | 24 | 0.711 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP014901 | Lactobacillus backii strain TMW 1.2002 plasmid pL12002-2, complete sequence | 12372-12454 | 24 | 0.711 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP028336 | Lactobacillus plantarum strain SRCM101167 plasmid unnamed2, complete sequence | 2281-2363 | 24 | 0.711 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP014892 | Lactobacillus backii strain TMW 1.1992 plasmid pL11992-2, complete sequence | 29785-29867 | 24 | 0.711 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NZ_CP032745 | Lactobacillus paraplantarum strain DSM 10667 plasmid unnamed1, complete sequence | 39955-40037 | 34 | 0.59 |
NZ_CP020096_1 | 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder | 31875-31957 | 83 | NC_016607 | Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 plasmid pPECL-4, complete sequence | 3707-3789 | 35 | 0.578 |
1. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP031319 (Lactobacillus plantarum strain DR7 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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2. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029350 (Lactobacillus plantarum strain HAC01 plasmid pLP-HAC01, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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3. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023492 (Lactobacillus plantarum strain NCIMB 700965 plasmid unamed2, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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4. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014919 (Lactobacillus paracollinoides strain TMW 1.1994 plasmid pL11994-4, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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5. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035016 (Lactobacillus plantarum strain 12_3 plasmid pldD, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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6. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020096 (Lactobacillus plantarum strain K25 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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7. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NC_015429 (Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 plasmid pLBUC02, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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8. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032467 (Lactobacillus plantarum strain ATG-K8 plasmid pK8, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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9. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032467 (Lactobacillus plantarum strain ATG-K8 plasmid pK8, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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10. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026507 (Lactobacillus plantarum strain NCIMB700965.EF.A plasmid punamed2, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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11. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032465 (Lactobacillus plantarum strain ATG-K6 plasmid pK6, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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12. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032465 (Lactobacillus plantarum strain ATG-K6 plasmid pK6, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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13. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018868 (Lactobacillus alimentarius DSM 20249 plasmid pLDW-11, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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14. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018868 (Lactobacillus alimentarius DSM 20249 plasmid pLDW-11, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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15. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019723 (Lactobacillus plantarum strain CLP0611 plasmid pUnnamed, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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16. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028231 (Lactobacillus plantarum strain SRCM101222 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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17. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053913 (Lactobacillus plantarum subsp. plantarum strain G1 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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18. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP037432 (Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM3, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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19. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP037432 (Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM3, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg CRISPR spacer aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg Protospacer ************************************************************
20. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035575 (Lactobacillus plantarum strain SRCM103303 plasmid unnamed4) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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21. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013756 (Lactobacillus plantarum strain DF plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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22. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013756 (Lactobacillus plantarum strain DF plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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23. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013752 (Lactobacillus plantarum strain KP plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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24. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023177 (Lactobacillus plantarum strain BDGP2 plasmid pLtBDGP2C, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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25. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028280 (Lactobacillus plantarum strain SRCM100995 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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26. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040738 (Lactobacillus futsaii strain Y97 plasmid p2, complete sequence) position: , mismatch: 24, identity: 0.711
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27. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035561 (Lactobacillus plantarum strain SRCM103297 plasmid unnamed5) position: , mismatch: 24, identity: 0.711
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28. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035561 (Lactobacillus plantarum strain SRCM103297 plasmid unnamed5) position: , mismatch: 24, identity: 0.711
aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg CRISPR spacer aacccgtatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg Protospacer ******.*****************************************************
29. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014884 (Lactobacillus backii strain TMW 1.1991 plasmid pL11991-3, complete sequence) position: , mismatch: 24, identity: 0.711
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30. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014875 (Lactobacillus backii strain TMW 1.1989 plasmid pL11989-2, complete sequence) position: , mismatch: 24, identity: 0.711
aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg CRISPR spacer aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaaacggacttctcaaaaagagaaacccg Protospacer **********************************.*************************
31. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014627 (Lactobacillus backii strain TMW 1.1988 plasmid L11988-3, complete sequence) position: , mismatch: 24, identity: 0.711
aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg CRISPR spacer aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaaacggacttctcaaaaagagaaacccg Protospacer **********************************.*************************
32. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014901 (Lactobacillus backii strain TMW 1.2002 plasmid pL12002-2, complete sequence) position: , mismatch: 24, identity: 0.711
aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg CRISPR spacer aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaaacggacttctcaaaaagagaaacccg Protospacer **********************************.*************************
33. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028336 (Lactobacillus plantarum strain SRCM101167 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 24, identity: 0.711
aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg CRISPR spacer aacccgtatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg Protospacer ******.*****************************************************
34. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014892 (Lactobacillus backii strain TMW 1.1992 plasmid pL11992-2, complete sequence) position: , mismatch: 24, identity: 0.711
aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg CRISPR spacer aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaaacggacttctcaaaaagagaaacccg Protospacer **********************************.*************************
35. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032745 (Lactobacillus paraplantarum strain DSM 10667 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 34, identity: 0.59
aacccgcatgataccg-ttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaaccc CRISPR spacer -gagccaatgaaatcgcctaaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaaccc Protospacer . * **** *.** .*.****************************************
36. spacer 1.1|31875|83|NZ_CP020096|CRISPRCasFinder matches to NC_016607 (Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 plasmid pPECL-4, complete sequence) position: , mismatch: 35, identity: 0.578
aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg CRISPR spacer gagccattaaaatcgcctgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg Protospacer .* **.. .* * .*******************************************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
23649 : 30557
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP020096|23649:30557|DBSCAN-SWA TTTGTCTAGTATAACCTATTCCGAACGAATTAAAATCGAAACCTTTTGTGAACTAGGGCTGTCCAATATCCAAATGAGCGATCGCCTAAAACGATCACCTGCCACAATTTCTTATGAATTAGCTCGATGTGAACCTTACCAGGCCGAAGTGGCCCAAACAGATGCCGAATACAAGCGGTCACGATGTGGCCGAAAGACTAAATTGAATGACAAATTAAGGCAAATAATTTTAAACCATTTACGGCTAAGTTGGTCACCAGAAATGATAGCTCACGAATTTAAACTAGCGACTAAATCAATTTATAATTGGTTAAATCAAGGGAAAATTGAGTTTTCTTTAAATGATTTGCCTGAACATGGCGTGCGCCAACGGCATAACCTTGACCAACGTTCTAAATATAATCAATCATTAGGACGGTCAATTGAACAGCGACCCATCGTAGTTAATCGACGTAATCGCATCGGTGATTTTGAATTAGATACAATTGTTGGCCCCCGTGGGCATAGTAAGGCAGTTTTATTAACTTTAATCGATCGCAAATCACGGTTCCTTTGGGCATACCGGTTAAAAGATCGGACGACAGCGACTGTTAATGAAGCACTAACTAAGTTCCTAACCACTTTTAATGGTCCGGTGCACAGCTTTACTGTGGACCGTGGCACTGAGTTTAGTGGGCTAGTATCACTTGAAGCACAATACGGTATTAAGACCTATTACTGCCATGCTTATACGCCAGCTGAGCGCGGCAGTAATGAACGATTTAATCGGAACTTACGCTATTTTTATCCTAAGGGGACTTATTTTGAGCACATTAGTGCTCAAGGCTTGAAAACCACCTTACTCGAAATTAATCAGCGACCACTTAAAATACTTGACTGGCAAACACCTTATCAGGTCATGCTGACCAATTTGTCAAAAAATTCGGATTAAATTTGCAATCTACCTTTTGAAAATAGAAATATAATTAAAATAAGCAACTATTCAGGGAGGCTCTAAATGAAAGGAATTATTCTTGCAGGGGGATCCGGTACACGGCTGTATCCAATTACACGGGCGATTTCAAAACAATTGATCCCGATTTATGATAAGCCAATGATTTATTATCCGTTATCGACGTTAATGTTGGCAGGAATCCAAGATATTTTGGTTATTTCAACACCTGTTGATACACCACGGTTCAAAGAACTGTTAGGCGATGGTCATGATTTGGGCTTGAATCTATCCTATGCTGTCCAAGAAAAGCCGAACGGTTTAGCTGAAGCTTTTATTTTGGGTGCTGATTTCATTGGAAATGATTCAGTCTGTCTTATTTTAGGTGATAACATTTATTATGGTGGCGGCTTATCCAAGATGCTTCAACATGCTAGCGCTAAGCCGAAGGGGGCCACGGTCTTTGGTTACCATGTCAATGATCCGGAACGGTTTGGTGTCGTTGACTTTGATGAAAATATGCATGCAACGTCCATTGTTGAAAAGCCTGTACACCCAGCTAGTAATTATGCTGTCACGGGAATGTATTTTTATGATAATCAAGTCGTTGATATTGCGAAGAATATTCAACCATCACCACGTGGTGAATTGGAGATTACGGATATCAACAAAGTTTACTTAGAACATAATGAGTTAGATGTTGAACTCATGGGCCGTGGTTTTGCTTGGCTTGATACTGGGACCCATGACTCATTACAAGAAGCAAGTAGTTTTATCGCAACCGTGCAAAAACGCCAGAACTTAAAAGTGGCTTGCTTAGAAGAAGTGGCGTATCGAATGGGTTATATTGGTGCTGATAAAGTGTATGAATTGGCGCAACCATTAAAGAAGAATGATTACGGTCAATACTTATTAAGATTAATTGGGAGGGCTTAAATTTTGGGCAAATTAAAGGTAATAACGACTAAATTACAAGATGTTAAGATTATTGAACCAGCAGTTTTTGGTGATAAGCGGGGGTTCTTTACGGAAACTTACTCTGACCGTGATTTCAAAGAAGCTGGCATTGATTTTGATTTCATTCAGGATAATCAATCATTGTCAGCGGAAGCGGGTGTTTTGCGGGGACTGCATTTTCAACGTGGCAAGGCAGCGCAAACTAAATTAATTCGCGTGGTGACTGGTGCCGTACTTGATGTTATTGTGGACGTTCGTGCTGGCTCGCCTACGTACGGGGAATGGGAGGGCTATATTATCTCTGAAAGTAACCATCGTCAATTGTTAGTCCCCCGTGGTTTTGCCCATGGCTTTGTGACATTGACTGATAATGTTAATTTCTTATACAAGTGTGATAACTACTACAACGCTGAAGCCGACGGTGGTATTACCTTTATGGATAAAGATTTAAATATTAACTGGCCTATTGACTATGATCAAGCTATGACTTCTGATAAGGATGCCAAACAACAGACTTTCAAAGAATTTGAACAGAATAATCCGTTTGTTTACGGCGAAATTTAAGGAGACGTTATGGAAAACTTATTAGTTACCGGTGGTGCCGGCTTTATTGGTTCTAACTTTGTTCACTATGTTTATAATCATCATCCCGAAGTCAAGATTACCGTGTTAGATAAGTTAACTTATGCTGGTAATCGGGCCAACTTGGAAGAAATTCTAGGCGACCGGGTCAAATTAGTTGTGGGTGACATTTGTGACGCGCCCTTGGTTGATGAATTAATGCAACAAACTGACGCGGTTGTCCATTACGCCGCTGAAAGCCATAATGATAATTCATTAAAGGATCCATGGCCATTCATCGAAACGAATATTATCGGGACTTATACGCTGATCCAGTCCGCACATAAGTTTAATAAACGCTTCCACCATGTTTCCACTGATGAAGTATACGGTGATTTACCATTACGGGAAGACTTACCGGGCCATGGTGAGGGTGTTGGCGAGAAGTTTACACCAACTAGTCGTTATAAGCCTTCCAGTCCATACTCTTCGTCTAAGGCCAGCAGTGATCTTTTAGTTCGGGCTTGGGTACGTTCGTTTGGCTTACAAGCCACCATTTCGAACTGTTCAAATAACTATGGCCCTTATCAATATATTGAGAAATTTATTCCACGCCAAATTACCAATATTTTAAGTGGGATTCGGCCAAAATTATATGGTAGTGGTAAAAACGTTCGTGACTGGATTCACACGAACGACCATTCTGCGGCCGTTTGGGATATTTTAACCAAAGGTAAGATTGGCGAGACCTACCTGATTGGTGCCGATGGCGAAATGAACAATAAGGACGTCTTGGAAATGATTCTTGAATTAATGGGTCAGCCTAAAGATGCTTATGATGTTGTTAAGGACCGTCCCGGCCATGATTTACGTTATGCGATCGATTCAACTAAGTTGCGCACGGAATTAGGTTGGCAGCCAGAGTTTACTGACTTCCGGTCTGGTTTGAAAGCAACGATTGATTGGTATACTGACCATCAAGACTGGTGGCAAGCAGATAAGAGCAAGGTTGAATCAAACTACGCCAAGAACGGGCAATAATAGTGTGAAATGCTAGAGGAGGAGGTTTCTAAATGTCAAAAGTAATGATTGTTGGTGCCAATGGTCAATTGGGGAATGAGTTGCAACGACTATTAAATGAACAAGGGATTGCATTTGATGCACTGACTAAAAAAGAATTGGATGTCACGAACCTAGATGCAGTCAAAGCTAAGGTTGCGGAATTACAACCTGTGGTCTTATATGATTGCGCAGCTTACACAGCAGTTGATAAGGCCGAAGATGAAGGCAAAGCCCTCAATTGGCTGGTCAATGTTGATGGAACAAAAAATTTAGCCCAAATAGCAGCTGAACAGGATGTTAAATTGGTTTATGTTTCTACTGACTATATTTTTGATGGCACCAATAAAGATGAATATTTAGAAGATGATCCAGCCAATCCCAAGAATGAGTACGGGCGTGCTAAGTGGGCTGGTGAAGAAGCCGTTCGTCACAGTGGTGCTGATTATTATATTGTTCGGACTAGCTGGGTTTTCGGTGAATTTGGACATAACTTTGTCTTCACAATGCAGAATTTAGCGAAGACACATGATAAGTTGACAGTCGTTAATGATCAACTTGGACGGCCGACCTGGACGCGAACATTAGCAGAATTTATGGTTCACCTAGTGAAAACTGAGGCCGCTTCAGGGACTTATCAATTAAGCAACGATAATACAGCCACCTGGTATGACTTTGCAAAAGAAATTTTGAAGAACACTGATGTTGAAGTAGTACCAGTTACTTCTGAACAATTTCCACAAAAGGCTTGTCGGCCACGGCATTCAGTGATGAACTTGAGCAAGGCCAAAAAAACTGGATTTATAATTTCTGACTGGAAGAGTGCAGTTGCAAAGCTTTTATCGGAGTAAAGGTTGTGTGACCCTATGCAAGATAGAGAAAAAATAGAACATATTTTTATAGATATTAGAAGCAAAAGGAATGATTTGAGTTATCGCTTTATTAAACGCCTATTTGATATAGTTGCTAGTATTTCAGCACTTCTTTTATTAACGCCCGTTTTTCTAATATTAATTATTGCAATAAAAATCAGTAGCCCAAGAGAAAACGTTTTTTATGTGCAAACACGCCTTGGAAGAAATGAAACGCCATTCAAAATGTATAAGTTTCGTTCAATGGTGTCTAATGCTGATAAAATGTTGTCTCATTTAAAAAGTAAAAATGAAGTGGTAGATTGCAAATTTAATCCGAATTTTTTGACAAATTGGTCAGCATGACCTGATAAGGTGTTTGCCAGTCAAGTATTTTAAGTGGTCGCTGATTAATTTCGAGTAAGGTGGTTTTCAAGCCTTGAGCACTAATGTGCTCAAAATAAGTCCCCTTAGGATAAAAATAGCGTAAGTTCCGATTAAATCGTTCATTACTGCCGCGCTCAGCTGGCGTATAAGCATGGCAGTAATAGGTCTTAATACCGTATTGTGCTTCAAGTGATACTAGACCGCTAAACTCAGTGCCACGGTCCACCGTAAAACTATGCACCGGGCCATTAAAAGTTGCTAGAAACTTATTTAGGGCTTCATTAACAGTTACTGCTGTCCGGTTTTTTAATCGGTAGGCCCAAAGGAAACGTGATTTGCGATCGATTAAGGTTAATAAAACTGCCTTACTATGCCCACGGGGGCCAACAATTGTATCTAATTCAAAATCACCGATGCGATTACGTCGATTAACCACGATGGGTCGCTGTTCAATTGACCGTCCTAATGATTGATTATATTTGGATCGTTGGTCAACGTTACGCCGTTGGCGTACGCCATGTTCAGGTAGATCATTCAAGGAGAAACCAATTCTCCCCTGATTTAGCCAATTATAAATAGATTTAGTAGCTAGTTTAAATTCGTGAGCAATCATTCCTGGTGACCAGCTTAGACGTAAATGGTTGAGAATTTTTTGCTTTGACTCATCGCTCAGCTTAGTTTTCCGACCACATCGTGATCGCTTGTATTCGGCATCTGTTTGTGCTAATTCAGCCTGATAAGGTTGACATCGAGCTAATTCATAAGAAATTGTTGACGGTGATCGGTTCAGCCGAACGCCCATTTGGATATTGGACAGCCCTAGTTCACAAAAGGTTTCGATTTTAATTCGTTCGGAATAGGTTATACTAGACAAAAGATCAGCTCCTAAAAGATGGGTTTGTGGTAAACACCATTTTAAAGGAAGCTGATCTTTTTTGTCCGAACAGCGTTCGGATTAATTTTACAATCTACCATATAACTAACCCTAATTTTCTGTTTTTCATTGTTCATCGACCCCCTAAAGTAGCAAAATCTTAGTCTACGAATTATATAAAAATATTTACAAGCAAACCATAAGTCTTATTTTTAGTATTTTCAATTATAATACTCATACGCGTGGTGCTAGTTAAATTTAGACAGCAAAAAAGCCTGACGGTTTACACTTAAAGCAATCTATAGTAAAGAAGTGTTAAGCATATCAGACTAGTTTAAGCCTTATCAGCCGGGAATGAGTGCTGTTGATATTGCCGAAGTACATGATTAAACCGGCCAAAATTGTTACGTTAATTATTTAATAAATTGTTTATTTGTTTGCCTGATAATGATATAATTAAGCTAGATGAAGGAGGCATCAAGATGAAGATTATTACTTTTACTGCTATCAAGGGTGGTGTCGGTAAAACAACCTTGACTTTGAATTATGGTGATTGGTTAGCTAAAAATGGTAAGAAGGTTCTATTAATCGATTTAGACCATCAGTGCAATTTAACAACCGTTTTTGAAAAGACACGACGAAACAATACCATCGCTGAAGCATTCAAAGAAGACGATAATGCTCAAAAAGTAAAAATTGACAGTGTCGGACCAAATCTAGATTTAATCGCCGGTTTTATAGACCTAGATGTTTTAGGAAGTTATCTAGAAAATAACAGTAACAAAGAAATGATGTTGTTCATGTGGTTTAAAAACAACTCCGATTCATTAAGCTTAACCGACTATGACTATATCTTAATTGATACACACCCAGATTTTAGCACCATCACTAAAAATGCTATTGCTATCAGTAATTACCTTCTCAGTCCCATCACACCCAGTGAACATGGCTACAATGCTAAGTTTGATCTAGAAACACGACTCGAAAAATTCAGAAAATCACTTTTTGATTATCGAACTGGCGAAACTTACGTAGACGCAAAGCTTTTCTTTATCGGCAATATGATTAGACATAATACAAGCATGTCTCGCGATTTGCTCAAACACATAGAAGGCGATGAAACAGTCGCGACTATAATTCCTGAAAGAGAGCTCTTTAATAAAGCTACTGCAAGGCACGCTTCAATATTTGAATTAGCCAATCATGATGAATCCATTTTAAAGCAAAATCAAAAGTTCATAGAACACGCCGATCATCTTTTTCAAGAATTAGCAAATAAAACCAAGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP020096|23649:30557|23649_24579_+|WP_106904898.1|transposase|DBSCAN-SWA MSSITYSERIKIETFCELGLSNIQMSDRLKRSPATISYELARCEPYQAEVAQTDAEYKRSRCGRKTKLNDKLRQIILNHLRLSWSPEMIAHEFKLATKSIYNWLNQGKIEFSLNDLPEHGVRQRHNLDQRSKYNQSLGRSIEQRPIVVNRRNRIGDFELDTIVGPRGHSKAVLLTLIDRKSRFLWAYRLKDRTTATVNEALTKFLTTFNGPVHSFTVDRGTEFSGLVSLEAQYGIKTYYCHAYTPAERGSNERFNRNLRYFYPKGTYFEHISAQGLKTTLLEINQRPLKILDWQTPYQVMLTNLSKNSD >NZ_CP020096|23649:30557|24645_25515_+|WP_060678065.1|DBSCAN-SWA MKGIILAGGSGTRLYPITRAISKQLIPIYDKPMIYYPLSTLMLAGIQDILVISTPVDTPRFKELLGDGHDLGLNLSYAVQEKPNGLAEAFILGADFIGNDSVCLILGDNIYYGGGLSKMLQHASAKPKGATVFGYHVNDPERFGVVDFDENMHATSIVEKPVHPASNYAVTGMYFYDNQVVDIAKNIQPSPRGELEITDINKVYLEHNELDVELMGRGFAWLDTGTHDSLQEASSFIATVQKRQNLKVACLEEVAYRMGYIGADKVYELAQPLKKNDYGQYLLRLIGRA >NZ_CP020096|23649:30557|29750_30557_+|WP_060463334.1|DBSCAN-SWA MKIITFTAIKGGVGKTTLTLNYGDWLAKNGKKVLLIDLDHQCNLTTVFEKTRRNNTIAEAFKEDDNAQKVKIDSVGPNLDLIAGFIDLDVLGSYLENNSNKEMMLFMWFKNNSDSLSLTDYDYILIDTHPDFSTITKNAIAISNYLLSPITPSEHGYNAKFDLETRLEKFRKSLFDYRTGETYVDAKLFFIGNMIRHNTSMSRDLLKHIEGDETVATIIPERELFNKATARHASIFELANHDESILKQNQKFIEHADHLFQELANKTK >NZ_CP020096|23649:30557|25518_26100_+|WP_060416961.1|DBSCAN-SWA MGKLKVITTKLQDVKIIEPAVFGDKRGFFTETYSDRDFKEAGIDFDFIQDNQSLSAEAGVLRGLHFQRGKAAQTKLIRVVTGAVLDVIVDVRAGSPTYGEWEGYIISESNHRQLLVPRGFAHGFVTLTDNVNFLYKCDNYYNAEADGGITFMDKDLNINWPIDYDQAMTSDKDAKQQTFKEFEQNNPFVYGEI >NZ_CP020096|23649:30557|27170_28007_+|WP_106904899.1|DBSCAN-SWA MSKVMIVGANGQLGNELQRLLNEQGIAFDALTKKELDVTNLDAVKAKVAELQPVVLYDCAAYTAVDKAEDEGKALNWLVNVDGTKNLAQIAAEQDVKLVYVSTDYIFDGTNKDEYLEDDPANPKNEYGRAKWAGEEAVRHSGADYYIVRTSWVFGEFGHNFVFTMQNLAKTHDKLTVVNDQLGRPTWTRTLAEFMVHLVKTEAASGTYQLSNDNTATWYDFAKEILKNTDVEVVPVTSEQFPQKACRPRHSVMNLSKAKKTGFIISDWKSAVAKLLSE >NZ_CP020096|23649:30557|26109_27138_+|WP_027822971.1|DBSCAN-SWA MENLLVTGGAGFIGSNFVHYVYNHHPEVKITVLDKLTYAGNRANLEEILGDRVKLVVGDICDAPLVDELMQQTDAVVHYAAESHNDNSLKDPWPFIETNIIGTYTLIQSAHKFNKRFHHVSTDEVYGDLPLREDLPGHGEGVGEKFTPTSRYKPSSPYSSSKASSDLLVRAWVRSFGLQATISNCSNNYGPYQYIEKFIPRQITNILSGIRPKLYGSGKNVRDWIHTNDHSAAVWDILTKGKIGETYLIGADGEMNNKDVLEMILELMGQPKDAYDVVKDRPGHDLRYAIDSTKLRTELGWQPEFTDFRSGLKATIDWYTDHQDWWQADKSKVESNYAKNGQ >NZ_CP020096|23649:30557|28338_29268_-|WP_106904900.1|transposase|DBSCAN-SWA MSSITYSERIKIETFCELGLSNIQMGVRLNRSPSTISYELARCQPYQAELAQTDAEYKRSRCGRKTKLSDESKQKILNHLRLSWSPGMIAHEFKLATKSIYNWLNQGRIGFSLNDLPEHGVRQRRNVDQRSKYNQSLGRSIEQRPIVVNRRNRIGDFELDTIVGPRGHSKAVLLTLIDRKSRFLWAYRLKNRTAVTVNEALNKFLATFNGPVHSFTVDRGTEFSGLVSLEAQYGIKTYYCHAYTPAERGSNERFNRNLRYFYPKGTYFEHISAQGLKTTLLEINQRPLKILDWQTPYQVMLTNLSKNSD |
7 | Escherichia_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020094_1 | 11828-12018 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP020094_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP020094_1
>1.1|11868|48|NZ_CP020094|PILER-CR ATTTAAGTAATATTATTTTAAAGTAATAAGCTTTGTATAAGTCTTATC >1.2|11956|36|NZ_CP020094|PILER-CR CCACTTTAATGTAATATAGCTTATGTAGAACTAGAT >1.3|11855|50|NZ_CP020094|CRISPRCasFinder ATTTAAGTAATATTATTTTAAAGTAATAAGCTTTGTATAAGTCTTATCAC >1.4|11932|49|NZ_CP020094|CRISPRCasFinder TGACACTAAAACCACTTTAATGTAATATAGCTTATGTAGAACTAGATAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020094_1
The CRISPR arrays of NZ_CP020094_1 >merge|NZ_CP020094|1|11828-12018|PILER-CR,CRISPRCasFinder TAAGCATAGGTATATATACCTATGCTTATTTAAGTAATATTATTTTAAAGTAATAAGCTTTGTATAAGTCTTATCACTAAGCATAGGTATATATACCTATGCTTTGACACTAAAACCACTTTAATGTAATATAGCTTATGTAGAACTAGATACTAAGCATAGGTATATATACCTATGCTTTTAAAATAAAA >NZ_CP020094|1|1|11828-12018|PILER-CR TAAGCATAGGTATATATACCTATGCTTATTTAAGTAATAT TATTTTAAAGTAATAAGCTTTGTATAAGTCTTATCACTAAGCATAGGT ATATATACCTATGCTTTGACACTAAAACCACTTTAATGTA ATATAGCTTATGTAGAACTAGATACTAAGCATAGGT ATATATACCTATGCTTTTAAAATAAAA >NZ_CP020094|1|1|11828-12007|CRISPRCasFinder TAAGCATAGGTATATATACCTATGCTT ATTTAAGTAATATTATTTTAAAGTAATAAGCTTTGTATAAGTCTTATCAC TAAGCATAGGTATATATACCTATGCTT TGACACTAAAACCACTTTAATGTAATATAGCTTATGTAGAACTAGATAC TAAGCATAGGTATATATACCTATGCTT
>NZ_CP020094.1|WP_106904864.1|11391_11772_-|nucleotidyl-transferase-AbiEii/AbiGii-toxin-family-protein MNQEQIRNIVITSIFSNDILLDKLTLKGGNALAFQGVTDRASQDIDFAITEGVNFNCEKYGPMIKKSLVDGFAAAGYEVINFKLDVRPQKRSKVIDQYSSKINFEDIVWGDTTLNLESYRKKNMNL >NZ_CP020094.1|WP_106904863.1|10870_11380_-|hypothetical-protein MENIGAHAETTWENKKNIEIDLSKEEYTDPREEKELDGYTIYIYTPIMLVYEKIRASCQQLPQYTIGNSKERARDLSDIYGIIIQTDNLYEQILDPKNIYILKKMFILKGVDFKLLTELNSYKEELAKDYKSNVLPQIHSDKNKQGFDFIFSFAETLFNQVYELVMENQ >NZ_CP020094.1|WP_106904862.1|9731_10850_-|TIR-domain-containing-protein MVESPKVFISYSHQNSEYNKKVLDFSNNFRLKGIDTNIDQYVEAPSEGWPQWMERQIYDSDYVLVCCSKSYIEKFRENTEGLGVSWETSMIYQFIYDNATKNSKIIPVFFDEKDKSFVPRPLKKYTFYNLSKEADYVRLYNRLIGKTTNNKAPLGQLKPLDEKKPKTLFVSTPIDIEKWNQARWRGIMYISIAGDVPVLGLVFKNYQKGLEIFDQWRKLSTYRYIDEFVSFCFITPPFSKKSLIYSSKKYNFGKGYFAYIGPNIKEAENRAQKLGLSKENLVITAINRFRWMDEKSNAQNRKKFQESVKERAECLIVPIALEKLTSGLLSDKDSIRDVINFDGALKIRNISFKNGRDLDENTPEGAVLKSLV >NZ_CP020094.1|WP_106904860.1|7885_8395_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MSETYYTIKQLADMAGTSKVTMFRYIKQKSIHETKHKGNANLYDESKKTLILKGFKGKSASNVSEMVHDETALIQELKSQLKAKDIQIDDLHLIIKQNQRLLDQQQQLNLATNRQNEKLLDGNADNTAQKVSESPNKDDTDGLEPNEDNHEVEDNKTPKKGFFDWLKRG >NZ_CP020094.1|WP_106904859.1|6791_7169_-|YxeA-family-protein MSKFAIKNHWIEVVLVVLLVGVTILSIGWHIYRYGGDYYYMRVNDSSESFPVTVPVGITQNGYIYRGIAKDKYGNRQRLEVKTVADDLGPFHKGQIIRITYNPKFGVTNYKKVSRDQVPPLARIH >NZ_CP020094.1|WP_133254077.1|6129_6648_+|hypothetical-protein MKSTLYRKSISILKYLGLLVATILLFLGLNFWSNQLDDLHIQDVKIYNTFFAMENGKPTFYLYGKLKPTFASYSGGAFTQYNNSNGGNYGWNTSKNNVYIDGQQTHSPFGSKEVVFRIKSDSKEGLTLLNQNLYLTDHHHHKIKIYNAQTKTQPYSINQKDTQKFIKQNKLH >NZ_CP020094.1|WP_106904857.1|5081_5417_+|hypothetical-protein MPEPSEEIKKTEARIAKLDEQQKQLKAKKRVLRNRLSQQARKARTKRLIEKGALLEKLLDDHGDQIKTEQRLQQLLSTEKRYQELKQFTSTLKYQDQSTVFQHFVKEIKSR >NZ_CP020094.1|WP_106904856.1|3549_4698_-|MobA/MobL-family-protein MAIYHLSLKTISRSKGQSAVASAAYRSGSKLKDRETGETKDFTKKHGVAYSEIQLPAQAPAKFTDREEFWNAVEEKESKSNSQLAREVELALPSELERPTQIKLVHDYVQTNFVDRGMCADWSIHDKEDGNPHAHIMLTTRAIKKNGTWAPKQKSTYLLDESGAKVPQIDPKTGQQKIGARGRKMWKRTTESYTDWNDRSNAEIWRKSWAESCNQYLAPENKIDHRSYERQGVEQIPTIHEGHVAREMGDRSERVQTNIDVKAGNRELSGLSATIAKIQEEARKLFRQIAELTELIRKRAQEKAEAKRQVEQLAQTGSAEPTPNVADNFLKKLNADKAKQAKPAPPEESVAGDFLKKLNSDRSERQAHKYRERTHDQGGPEL >NZ_CP020094.1|WP_106904855.1|2861_3575_-|MobB MTKEGQNYDRNEQALVQLLKAYDNGEIDFTKVPAIQVIIRQEVARQVAQAVNPAQIKEQASQQLKSDQTNYNEQVNKILKQQGARLQEQASQLDVEGVKKQLLADIDRRSKAVKEAQAKLDDERERLADREKKQFWRELIPNLAGGIVSLFFASMILLLFKALLWDGVWRGLGLNRLTEFVLTLAKSHPFGGGVLGLILMILVVTAIIASFWAMVQAVKTLSDWDADKLMFWRHDRY >NZ_CP020094.1|WP_076640293.1|2080_2704_+|cation-transporter MQSHATTSSLVSRSLHTEYFSTGWMAFEFLVGFSSGLQAGSILLIAFGLDSFLEIISGSTLIWRLRKEANGAPKAEIEQAERKSSLIVGSVLLLLSVYVIGVSLYNLLNHQAADTSTPGISIAIASVILMPILTLKKRSLGKALHSDALVEDGMCNITCAYMAATVLVGALLTALFNWWWADSVAALILVYFIASEGWESFQEGRKG >NZ_CP020094.1|WP_106904865.1|12048_13005_+|hypothetical-protein MKVTATQQLLDNKIDILEFISNHGNILNRSSLMELLHTLQKQKNILNETTLHGLTTLLVRLNFLEPVNILYQKRLLYRYLSTTTKPNAYEIALSIAPKKAHLSHLSALYINGITNLDPSTIYINYEQSPKPINKSNAKLTQKKVDHAFLKPVRKTNNMATFIYHNRSYTVILLNGKHTNYIGVQVIKPLNFSNEVRVSNIERSLIEATIRPSYSGGVSEVLLSFKNAKSEAVSINRLLSYLKKMKYIYPYFQNIYFYIYYAHYDPIQLNLVQKLLDNSNKANQINFYLDHQLIKPKLDPYSKVYYPENMILDTDSKEF >NZ_CP020094.1|WP_106904866.1|13169_13526_-|type-II-toxin-antitoxin-system-YafQ-family-toxin MKKLRFKPRATFNADLKRLASLDKTIIDEVRAAIDLLLEQQQLPPEFEDHELNRRMSGYNEFHLRDTPKNRTPSETNDVLVVYTIDKDELVLIGIRVGSHDRLFPGQNRAKRYRKSDE >NZ_CP020094.1|WP_106904867.1|13525_13804_-|type-II-toxin-antitoxin-system-Phd/YefM-family-antitoxin MTLALTQSDFRANLKKYLDQVNDEDETVYIARSNNRAVAIVSQEKMDWLERALKAKEGSLEYAIARDQLIKRHVLPDDEIVESNDDYWGQFK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020094_1 | 1.1|11868|48|NZ_CP020094|PILER-CR | 11868-11915 | 48 | NZ_CP020094 | Lactobacillus plantarum strain K25 plasmid unnamed1, complete sequence | 11855-11902 | 0 | 1.0 |
NZ_CP020094_1 | 1.2|11956|36|NZ_CP020094|PILER-CR | 11956-11991 | 36 | NZ_CP020094 | Lactobacillus plantarum strain K25 plasmid unnamed1, complete sequence | 11943-11978 | 0 | 1.0 |
NZ_CP020094_1 | 1.3|11855|50|NZ_CP020094|CRISPRCasFinder | 11855-11904 | 50 | NZ_CP020094 | Lactobacillus plantarum strain K25 plasmid unnamed1, complete sequence | 11855-11904 | 0 | 1.0 |
NZ_CP020094_1 | 1.4|11932|49|NZ_CP020094|CRISPRCasFinder | 11932-11980 | 49 | NZ_CP020094 | Lactobacillus plantarum strain K25 plasmid unnamed1, complete sequence | 11932-11980 | 0 | 1.0 |
1. spacer 1.1|11868|48|NZ_CP020094|PILER-CR matches to NZ_CP020094 (Lactobacillus plantarum strain K25 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atttaagtaatattattttaaagtaataagctttgtataagtcttatc CRISPR spacer atttaagtaatattattttaaagtaataagctttgtataagtcttatc Protospacer ************************************************
2. spacer 1.2|11956|36|NZ_CP020094|PILER-CR matches to NZ_CP020094 (Lactobacillus plantarum strain K25 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ccactttaatgtaatatagcttatgtagaactagat CRISPR spacer ccactttaatgtaatatagcttatgtagaactagat Protospacer ************************************
3. spacer 1.3|11855|50|NZ_CP020094|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020094 (Lactobacillus plantarum strain K25 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atttaagtaatattattttaaagtaataagctttgtataagtcttatcac CRISPR spacer atttaagtaatattattttaaagtaataagctttgtataagtcttatcac Protospacer **************************************************
4. spacer 1.4|11932|49|NZ_CP020094|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020094 (Lactobacillus plantarum strain K25 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tgacactaaaaccactttaatgtaatatagcttatgtagaactagatac CRISPR spacer tgacactaaaaccactttaatgtaatatagcttatgtagaactagatac Protospacer *************************************************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
---|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020093_1 | 130949-131447 |
NA
Consensus repeat of NZ_CP020093_1
|
7 spacers
spacers of NZ_CP020093_1
>1.1|130985|31|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTATTATCTAATCGTAATTGAGTACCGTA >1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTAAATGCAAGTACTGTCTTTCGAATAT >1.3|131118|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTGGAAATGTGAGTGCATCCGCTGCATC >1.4|131184|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGAAAGATTTGGCGCGCGTGACATTATCA >1.5|131250|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAACGTCTTTAGCGTAGTCATTCATTGGCT >1.6|131316|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGTCGGCGAAATCTTCACCACGCCGATTA >1.7|131382|30|NZ_CP020093|CRT GATGCTGAGGAAACGAAGCATAGAACGTTT |
cas1,cas9,csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020093_1
The CRISPR arrays of NZ_CP020093_1 >merge|NZ_CP020093|1|130949-131447|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAACTTGTATTATCTAATCGTAATTGAGTACCGTAGTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAACGATTAAATGCAAGTACTGTCTTTCGAATATGTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAACAATTGGAAATGTGAGTGCATCCGCTGCATCGTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAACCTGAAAGATTTGGCGCGCGTGACATTATCAGTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAACAAACGTCTTTAGCGTAGTCATTCATTGGCTGTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAACACGTCGGCGAAATCTTCACCACGCCGATTAGTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAACGATGCTGAGGAAACGAAGCATAGAACGTTTGTCTTGAATAGCGGCCACATCAAAAACAGTTTCACG >NZ_CP020093|1|1|130949-131381|PILER-CR GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC TTGTATTATCTAATCGTAATTGAGTACCGTA GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC GATTAAATGCAAGTACTGTCTTTCGAATAT GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC AATTGGAAATGTGAGTGCATCCGCTGCATC GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC CTGAAAGATTTGGCGCGCGTGACATTATCA GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC AAACGTCTTTAGCGTAGTCATTCATTGGCT GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC ACGTCGGCGAAATCTTCACCACGCCGATTA GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC >NZ_CP020093|1|1|130949-131381|CRISPRCasFinder GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC TTGTATTATCTAATCGTAATTGAGTACCGTA GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC GATTAAATGCAAGTACTGTCTTTCGAATAT GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC AATTGGAAATGTGAGTGCATCCGCTGCATC GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC CTGAAAGATTTGGCGCGCGTGACATTATCA GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC AAACGTCTTTAGCGTAGTCATTCATTGGCT GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC ACGTCGGCGAAATCTTCACCACGCCGATTA GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC >NZ_CP020093|1|1|130949-131447|CRT GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC TTGTATTATCTAATCGTAATTGAGTACCGTA GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC GATTAAATGCAAGTACTGTCTTTCGAATAT GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC AATTGGAAATGTGAGTGCATCCGCTGCATC GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC CTGAAAGATTTGGCGCGCGTGACATTATCA GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC AAACGTCTTTAGCGTAGTCATTCATTGGCT GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC ACGTCGGCGAAATCTTCACCACGCCGATTA GTCTTGAATAGTAGTCATATCAAACAGGTTTAGAAC GATGCTGAGGAAACGAAGCATAGAACGTTT GTCTTGAATAGCGGCCACATCAAAAACAGTTTCACG
>NZ_CP020093.1|WP_027821587.1|129061_129967_+|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGWRNVIITQHAKVSYSMNRILVQTSSDKYAVPISDIQLLLVGTTQAVITSAALCALAEAHVKVIFTDHQGEPISETNDYYPTRRTADLVRQQVTWPEARIATLWTKNVGSKILNQIQVIDFVGGDTQTLVDELDKLELNDVTNREAVVANKYFSLLFGAQFYRRDFSPINAALNYGYAVLLSMVNREIVLNGYLTCIGIHHENNENEFNLGSDLMEPFRPIVDQWVSQQRFKDFTPDIKIGLVSLLDLEIGFNGHQTIVSHAITEYVAACLHYLSGETEELKIEVKLPNEVSSDAINSHV >NZ_CP020093.1|WP_106904639.1|124790_128867_+|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MKEPYGVGLDIGTNSVGWTVVDASGHVRKIKGQTGIGVRLFKEGAAAADRRGFRTTRRRLKRVKWRLRLLREFFDQPISKVDINFFARRKYSDISPRDPNYNGLEKTLFNDRSDQDFYHDYPTIYHLREALMTQHRKFDVREIYLAIHHIVKYRGNFLRNDAATAYRSGTLDLQQHFETLNHLFSQADLELNLNLTTDVALLDSIKQTLVRTDISRSDRQKLIMPLLAVLTGATTAEKKRQKAVVTEFAKALVGNKTKIDVLTLTDIDATEAKDWAFSLEENQDKLPGIEDRFSEVGQQIIDEVIRLYASVNLAQLIPEGKRFSQSMVEKYKRHGEDLKLLKAYIRSQSDAKRGRAIRATYDQYIDGVKSKQVTQEAFQKALGKFVDADVDLNSWAAQIKQAIDSEQFMPKLRIKQNGAIPYQVQQNELDQIISNQKEYYPWLGEENPVIKRRGKFPYKLDELVGFRVPYYVGPLITKEMQAATANAGFAWMVRKADGPITPWNFDDKVDRVASATAFIQRMQTTDTYLIGEEVLPARSLIYQRFMVLNELNNIRVDDGQLTPRQKQRLYNQVFKKHKRVTAKNIQDNLVAAGEFPTAPRITGLADPKVFNSSLSTYHDLKQVLPEAMSDVRKQADIEKIILWSTIFEDSTIFKQKLTEISWLTAAQLKQLGQLRYRGWGQLSRKLLTGLKDDNNRSIMDGLWETNANFMQLRSQPAIENQIKSANQANLTTADLQDTINELYTSPQNKKAIREVMVVLADIKDAMHGQTPNWIFVEAARGGGVAGRRTQSRSKQIVAAYQGTAQAIVSDQVQRELKEKIKNKANFNTRLVLYFLQNGRDLYTGDAINIDRLSEYDIDHILPQSLVKDDSLDNRVLTNARINREKNDTFASEKFGKKMGAKWKEMHRMGLMTKRKLDHLLMRPDEISKYATGFINRQLFETRQVIKLVEELINAEYPSTAIVSVKANLTHQFRQTFDFPKIREVNDYHHAFDAALTAFIGTYLLKRYPKLERFFVYGKFAKQPVNLTRFNVIRKLAKTDTPITDIDTGEVLWDKLTDIKYFETLYDYKRLLVTREVSENYGAMFDQTLLKASDNGKRLIRKKQSFDTAIYGGYTGKTLAYMAIVKVSTKKDVQYQVVGVPTTMVTQIEQLEQQGMTNKQAVTKVIEPLIAANNKKMLTYEVLLPKVRFEQVVRDRIKGQTHRFALGTDTYYHNIQELYLPLTLQRAFLGKQNESEVQLNQNLLTVFDATLAQVNRYFPLYEMNKFKKILNSARDQIELLEAKNQFVKNKLVLGKQGILTNMFIGLHANASYGDLKVLGVKTDFGKLQVPGGIKLTGDAEIIYQSPTGLFERKISLKDL >NZ_CP020093.1|WP_027821589.1|123719_124502_+|alpha/beta-hydrolase MRFITSDHVQLDYTDEGQGQPIVILTGFGGAKDIWRAQIPVLIQAGYRVINLDGRCQGLSEHTAKGLRMSRRAVDAHELIEKLQLKQPILLGNSMGAATWFAYVSLYGDTGIKALIDVDQTPRMINTPHWQYGFKQVQWQDIPDYFRMPLGHSTFKHIDDATYARVKAVEAQAPFDAKLMFPLLVNHAVQDWRDVIRQLTVPFLIIAGAKSPFFNPDFAAVTAQMALRGQSVVIPEAGHIVMAEQSVAFNKALLEFLATC >NZ_CP020093.1|WP_027821590.1|122987_123695_+|hypothetical-protein MVKQGHYAKVSKQKRLRQLKQRRQAQEKRAIMPEMVSEFLQVRYHLTQAAKQRPAMRQMMQRFMAQWLAAGQAELSDNGQTTWSVVALTKQTLQTFNRQLPWQGYALVDQEMARWTAFLNKEVPAVPLSERITLTEALSPATWQACLSEQLAINALLALTGDSRQLGQITTEQVRQLQTSIQTATGIDWEKVAQLLDSTVIAQNTLSKAGLDDKTRQWLEKLKKLTPQDFNDHVE >NZ_CP020093.1|WP_003641725.1|121499_122864_+|amino-acid-permease MQRKLSTGQMQMIALGGTIGVGLFMGSSSTIKWTGPSVLIAYIVSGAFLYLIMRALGEMLYVDPNTGSFAKFASEYIHPVFGYLTAWSNIFQFVVVGMSEMIALGGYCRYWWPNLPDWIPGLIAIVFLCAANLISVKMFGTLETWFSLIKVVTIILMIIAGLGLIIFGIGNGGHPIGISNLWTHGGFFTGGVKGFVFALAIVLASYQGIELIGVTAGEAENPQSTIVKAIRSTVARILIFYVGAIFVIVSIYPWDKLSQIGSPFVQTFAKIGITAAASIINFVVITASLSGTNSGIYSASRMTYTLAESHQLPRKMTLLNRHGVPFYSVIAIATGILIGVVLNVVLPMFFKDASEIFVMVYSSSVLPGMVPWFVILVSQIAFRKQNAAKMANHPFKMPLSPYSNYLTLAFLALTLVFMFINPETRYSILVGVVFLVIMTLIYFRKYAGNKEETL >NZ_CP020093.1|WP_003641724.1|120796_121267_-|NUDIX-hydrolase MANYIKEIRALVGHKPIILNTAAGILVNDQQQVLLNLRTDTHNWSLPGGYLEYGETYATACVREYKEDSGIDVEVVDRIGIFDKGETAYPNGDVAQTISALFLVKPIGGHVLTQATDETLKLDYFDFDNLPPLLNQQNADMIHAAQEYLQTHSATK >NZ_CP020093.1|WP_046037886.1|119088_120681_+|HIRAN-domain-containing-protein MERIEAGMSVMTLKKQTYRVIAVINQGQELLVRAHEPETADIEIIPVTTVVQVTEQNSTGDAAVALDTVTVVGERYVDDIVATLTTLRVGMAVLLQRESGNQYDDNAISVWTLQHAKLGYIARYQNQPYAALMDQGQRLYGIVTVLDQQKQHLELMLWRTTAVPSPIEALQIRQRLAKPRTNLGAVPTHSLQTPLGTIVMMCNGHPIKYQQVPLSPWLTPADELHVTKRYLLTPDWSQVPPDSLITCQVTAKADVVQRWQNEHISAAVLTNASSFYVVGISAQTKTGLNDNLVDDAAQPAVIYRVGQVSAHMQAGFMVSWAPFGDPRVQPALKLALHFSSQPLVPYHPVTPSRTNATFTQQELAALLVSALPNYQGGQRLEPSVTAITVEKLRQTLGDQTYHALANYQRHVQLVAGSTEGVNETLLQALIHAVTYHELTTMHYYQPTVGMVDQVIYPIQLFSTTTKDEDDAQLVGCLALYNYETFEIQQVPLTAIARIAIIADPEHPQTTPETESPDWLRIFLHGWNDDF >NZ_CP020093.1|WP_003641722.1|118104_118845_+|gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate-hydrolase-family-protein MVKPIIGIAPGVVTVNSQMFPGRVRDYVNRDYLKSVTDNGGVPLVLPVTTDATTIERYVGMIDGLLLCGGADVAPLTYGEEPQPKLGGVDPERDQYEIALIRATHAVGKPVLGICRGLQILNVCYGGNLYQDMSELPAGQGTLKHMQGQLAAYGMHHVKVVPGTTLAEYLGTTSDAITVNSFHHQAVKQVATGFQVVAQSADQVVEAIEATAGGLQLGVQWHPEMMQQVNSVQARLFAAFMRACVA >NZ_CP020093.1|WP_003641721.1|116823_118023_+|putative-hydroxymethylpyrimidine-transporter-CytX MKHDGIFRSQFLLWLGAAISIAEILTGTLMAPLGLTRGLAAIVLGHLIGCGLFLVPAGYLGAKLHQSALASAQLAFGRGGVLLASGLNALQLVGWTAVMIVNAQLAMNSISGKLFGFRSPLLMATIVAILIIAWLLMGSQLLFKINNAVVGLLVLGTVLMLVMVFMAPTTSQSVSTTSMTFGQAVELNVTMALSWLPLIGDYTQRVDRPLPVALVSAGGYMLGSLVMFVTGLLVVLRTGQTDITALLTRSGLGLVALLIIVFSTVTTTFLDTYSAATSLANLTDSRYVNRLAVGVTVVGLLIALTVAMTYYQNFLYLIGSVFTPLYAIIFVTYFVRHATLPYWLNFCWWVVGIVAYYQLQAIDFIGGTTLLVLVGLSIAVWLTGIIVKPTELEYRELSH >NZ_CP020093.1|WP_003641720.1|116170_116824_+|thiamine-phosphate-synthase MTLKFEPTQLRAYFVCGTQDVPGQDLNVVVQTALDAGITAFQYRDKGNSQLTTAERFALGQQLRERCAQAHVPFIVDDDVELALALQADGIHVGQKDDRVTQVIQRVANQMFVGLSCSTLAEVQIANQLEGIAYLGSGPIFPTTSKADADPVVGLTGLRQLVVTATCPVVAIGGITVAQLPAIAATGAAGAAVISMLTRSPDMAATVKAMLTATEGH >NZ_CP020093.1|WP_053339208.1|131511_134250_-|cation-transporting-P-type-ATPase MIKDDNQSLTSNEEQNDTQNPPDADNLWQLDESALAAKYATDPENGLSTAEAAERLQHNGRNELETKRTSRFVQFIKQFNNSIIYILAAAAVLTFFMHHYSDSIVIGLVIIANAIIGYVQERQAGNALERIREMLISKNFVIRDGKKLEIDARELVVGDLVNLEAGDAVPADMRLISADNFNVQESVLTGETNPVEKQEEPMTETTLALADRKNMVYASTAVTSGSAVGIVTATAEDTEIGHIQQSVSDVKQTTTPLMRNLNSLGVGLSIAIVVAAVLLFLLGMVMDTYSLPTLLIAVITMVVGSMPEGLPASTSVVLAMGTRQMTKKNVIVKSLPAVETLGAVDIVNTDKTGTLTKNEMTVTKVVTPEHTFDVTGVGYDDNGGVNFDGHLKLNGNKVDWHQDNAMEWLVKIAGQTTDAELHFENNRWELTGEPTDGALTTLYRKMTGHDPEVEEVDSLPFDSAFRFSARLADLDGQRLLMVKGSPATVLRLTDQANQTAYWDDAMDDLTADGLRVVALAYQEVDDDVTTIDAQAIGGLHLAGLVGIIDPPREEAATAIAELRQAGVQVKMITGDHPDTAMAIANKLNLAANVKAITGPEIDAMDDQQLQAHIDDYNVFARATPNNKLRIVRAQQANNHVVSMTGDGVNDAPALKQADIGVAMGIKGTEVAKESADMVLADDDFADIVAAVREGRHVFDNIRKTIRFLLPTSFAEGLVVIISILMGHELPLYPTQLLWINMVSALTIQFAFIFEPPEAGIMARGPRNVKSGLLSKLDYFEIGYVSFLISGLGIFAYNYLTALGLPNVVGSTMSLNIIIFGKIFYLFNLRNDHPVISKYFFQNKMAFYIIGILILLQLGIIYLPFMQSVFHTTSINFWYGWGIPIICGIVVLIVTEVGKFIRFRWMGKDGVID >NZ_CP020093.1|WP_003641730.1|135335_135530_-|PspC-domain-containing-protein MKIDIHRSATDRVIAGVIGGIAEHFNWNTNVTRLLFVVLAITPMFPGIIAYLILWLLMKDPIKD >NZ_CP020093.1|WP_011100896.1|135595_136198_-|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MFKIAIILGSTRSQANGRALLNHLKLIIDQLPTHSPIHYQFLDLANYQLPFFDEPEPPMANPHRELPANQQQWLTDMASADGYIILTPEYNHAMPAGLKNAFDFLAFEGARKPAKIISYSDNMRGGQFGAAALVPVLQRLGIVVLPKPTPIGNVPQTLQSNGHFIDNAPLSKRYDHTLHQALTEITYYTTVLTTTPFPTD >NZ_CP020093.1|WP_011100897.1|136310_136784_+|MarR-family-transcriptional-regulator MTTPLVSQLMTELNQFLTQDSVDDQEKRWAMQQTTDPQLQAALKQLSTTDIKIMAYLGRRGASRAKSLPAPTELSQATISRGLTKLSRLKLATKYRDLTNNKEILVRLTTLGEAVADLHTQLDATIAAKAQAIADDYSDAELRRFVSLMRRIREIKI >NZ_CP020093.1|WP_011100898.1|136929_137352_+|Hsp20/alpha-crystallin-family-protein MANTLMNRNDFGMLDPFERMARSFWAPLENMDQVLKTDINETDDQYQVKVDVPGIDKQDVKLDYRDNVLSIKVQKDSFVDHEDQDQNIVMNERHTGTLQRQYMLPNVAANKITASQADGVLTITLPKTQPSANDGQIEIQ >NZ_CP020093.1|WP_106904640.1|137460_137895_-|DUF3021-domain-containing-protein MKRLWHTLLIGAIGGIVIGYLMALGFSTFFNTTYLFPSNPTFVSHWSSPLAATQLSTLLWILIGEVWAFSSWLFEIETWSITKQTIAHCLCSFLGMTPLAILCGWFPLNVRWFGFYTLVYTGAYIGLWLIEMALARIKVIQLNQ >NZ_CP020093.1|WP_071542797.1|137891_138176_-|LytTR-family-transcriptional-regulator MPLQSVSRFYTANKRLYCETTTGAYLVHSHLHTLMDQLPPHQFLRISSSEIVRIACVKNFTLTKWGSFQVNLTTGTTTYASRRYTQQIRKAAQL >NZ_CP020093.1|WP_106904641.1|138564_139797_+|MFS-transporter MDDVERERGPWHRNLIVLWFCTFVAGMAFSEIMPFLSLFVSQLGDFTKAQITFYSGLAFAADYAISAISAPLWGIIADKKGRKIMLLRASLGMAVAMGLMGFVTNVWQLVALRALQGVFAGFISNAQALVASQTPRKYSGRALSTLITGAVSGQLFGPVIGGLLAQLFSIRNTFFITAGLLMVAFLLSLFFVQEHFKPVAHHREPGDSRNPLAAFQNPRLIIVMLCSTAIVQFGNASIAPIISLYVRELMHYRGPITVVAGIIAALPGISNIFSAPRLGRYGDQHGSGKVLLFGYIFAVIMYFPQGIVTSVVALGILRFAIGISDGALYPEIQTVLTKNTPVHLTSTIFSYNQSFQAIGNMFGALLGGLVAGWFNYNAVFIMTALLLLINLGLILWLVPDIWKNGKRAVS >NZ_CP020093.1|WP_015379645.1|139887_140187_+|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNIEISKQDQADQQRVAIFKALADANRLRIIRVLYQAQREMTCSEVGAQLNISKSTVSYHFKTLRLVGLTNTRRKAQTKYLSLQLATFDRFLPGFLATL >NZ_CP020093.1|WP_003641738.1|140251_141445_+|MFS-transporter MTTTHQHSRYLTLGMMLAATNMRLPITMMPGLISSLKRTLGLPSSMAGLLTTIPLLTFAIMSPLIAHWGRRFGNELTIYVMLIFLAVGSYLRVIPTIAALFIGTLLVGIGADGGNVLIPAIIKDNFPTKIPVATSQYTLSMLLVGSLGTGLSGVLAAHWSLPLTMAVLSVIGLINLVVWLPNLKYNHRAPTVAMTASDGQSTATHGSVWRRPLAWVVTAFFGLQALVYYSLLTWLPTVFVAHGFSLIVAGNLVTVMQLSGLPMSYLVPATSGHRRGVWAMIMVVGVGFIAGIGGILLSGTNFWVAALSCVLLGLGSGAAFSLAVVFFTQKTTNGFETADLSGMAQSAGYLLAAVGPVLFGWLGGQLGWGPVLWLAIILSALLALSGSIIFQHATIYE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020093_2 | 1805023-1805324 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP020093_2
|
2 spacers
spacers of NZ_CP020093_2
>2.1|1805070|49|NZ_CP020093|CRISPRCasFinder TGTAGAGTTGTTGCTTATCCCAGCACTAGCTTGGCTACCAACTGCCTGA >2.2|1805166|112|NZ_CP020093|CRISPRCasFinder ATTAGACTGGACGGCTATTTCTGAATTGGCGTAGTTGTAATTGCTATCTGCGGCTGATTTAGCGGCATTCGCTGTAGACTGTGCAATTAAAGCAGCGCTATCAGCATTTCCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020093_2
The CRISPR arrays of NZ_CP020093_2 >merge|NZ_CP020093|2|1805023-1805324|CRISPRCasFinder GCTTGGCTAAACGCATTATCAGCTGTACTTTGAGCCTTAGCAGTAGCTGTAGAGTTGTTGCTTATCCCAGCACTAGCTTGGCTACCAACTGCCTGAGCTTGGCTAAACGCATTGTCAGCTGTACTTTGAGCCTTAGCAGTAGCATTAGACTGGACGGCTATTTCTGAATTGGCGTAGTTGTAATTGCTATCTGCGGCTGATTTAGCGGCATTCGCTGTAGACTGTGCAATTAAAGCAGCGCTATCAGCATTTCCTGCTTGACTAGCCGCATTATCAGCCGTATTTTGAGCATTGATAATCTT >NZ_CP020093|2|2|1805023-1805324|CRISPRCasFinder GCTTGGCTAAACGCATTATCAGCTGTACTTTGAGCCTTAGCAGTAGC TGTAGAGTTGTTGCTTATCCCAGCACTAGCTTGGCTACCAACTGCCTGA GCTTGGCTAAACGCATTGTCAGCTGTACTTTGAGCCTTAGCAGTAGC ATTAGACTGGACGGCTATTTCTGAATTGGCGTAGTTGTAATTGCTATCTGCGGCTGATTTAGCGGCATTCGCTGTAGACTGTGCAATTAAAGCAGCGCTATCAGCATTTCCT GCTTGACTAGCCGCATTATCAGCCGTATTTTGAGCATTGATAATCTT
>NZ_CP020093.1|WP_069137033.1|1802362_1802614_-|hypothetical-protein MDSILITNYKPDYTNNIMTISIQINTLGISSQVSITMDDFNTAIAGGAGGTDRVKLKVLNTLIDSLTALKPVTTTTTTTTKEA >NZ_CP020093.1|WP_187337693.1|1802197_1802359_-|hypothetical-protein MNIDAQALINKLTSNYAQAIAVKEQQLAMAQVQIDQLNAKLAEKEAPKDGENA >NZ_CP020093.1|WP_106904761.1|1801179_1802214_-|hypothetical-protein MAKTLSFTDTSPQTVKIGDTTTSFTLICGNDNVATDLTKATSITVKLGNNSGYLKSATVDPTSLTDPTTGQVTVNFNADLMTSLTAGSYAIEVWVVDPTGTSIYPSDGSTGFTIANNIQSANGSTITTITFDDFVKELNKAASTIAKGDKGDTGTVDNTGLISAPAFQSLQTQVNNSAVGTNLLTGTGYHTVTGSNAYGYLSNETTDDLLVLFKGLEGQAVTVSVDYEYSGFIAGSSSNRIGWETAIEADTTTHSGPWYYPNNDSGSGRMSSTFVVPKNITKVWSAMGYIQFSGSGTGALSHLKLEKGSVATDWCPNPAEILTQSDYAKIKAAIVALGGHCHEF >NZ_CP020093.1|WP_106904760.1|1800944_1801190_-|hypothetical-protein MSFDLSEFLTDGLISSINNGLIPSDLATVYAGNYLVKSLITQAQVTKVSDTITAYKAAQAAADKAQQQEENHTSAPENTLK >NZ_CP020093.1|WP_069137375.1|1799766_1800882_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MAFLMVNVTSQAARMDMVDVSNNNGYMSTTEYVSMRNEFGVKALTVKISEGTTFKDGYAASNIANGQAAGLYVNGYHFAHYKTKAQAIAKADFAGQAAKAARLPVGAVLATDVESAEEQGILSQAANDRNNAAFMKEIQKFGYRADIYTSGSWANNKMTIKGKTGWVAGYPYVMSGQKWYTNNNAWQWSGAARFRISYGGFDVSQLYTDYYTAGQKSTVKPTDPNAVNDNNQEANKNTSKPSNSVKWVKESKNYTLKTAVKLRTGTSTASSVIAILPAGTTVKTDQAIIQNGYRWVRQPRFNGYGYLATGPASNTLEYVKSGATHTYYTVKSGDSWWAIAQRNSLSMTTLASQNGKTIYTTIYPGQRLVVR >NZ_CP020093.1|WP_069137035.1|1799469_1799766_-|hypothetical-protein MHTLLGLGWDEWGSIVAIVTSICVLANWILNKTVRIPLNNLGKRLSRFTDESLKVRQQNAEAMNAIENRVIKVEDRLDGHDIEFKHLYEKEAKGNEKN >NZ_CP020093.1|WP_069137036.1|1799105_1799483_-|holin MKKISFKNADGSLNGKLIAGIISLLIVLIQQVLAVFGIKFAGDWSAIVAVINTVLTILGMLGVITDVQTVTAPTVKSDEESQIEATANQTADELQAPTSTVAVVNSSASSDTETASESASQAGEK >NZ_CP020093.1|WP_003644508.1|1796650_1797862_-|FtsW/RodA/SpoVE-family-cell-cycle-protein MNNRELGRWQEHKHIGDYGWGIILCVIILCCIGMWAVYYACLHDLKVIDPVRTTMMQCLWYLVGALIATTMLHLSEKQLMQWAPIGYSIGMLLLILLLVFYSREYYVQTGAKSWFAIGTLTFQPVEVMKPLYILMMGRLIVQDQQWGPHNNFNADWRLTRRLVIYTFPIIVALKIINDFGTTLVFLTIFIGMLIVSPCRFSFLWRVLLVAGSIGVVLILLATSSTGQSLLSHIGFKLYQFDRINTWLNPSNGVSDQSYQLWQSMRAVGVGGLTGNGVTHNAVYVPVRESDMIFSVVGETTGFIGCSVLLIVYMYLFYLIFRSAFASRRRFYVYVSTGVAVMLAFHMFENIGMTIGLLPLTGIPLPFVSQGGSAIIGDFMGVGLVLATQYPNVRSIFSVPRIFH >NZ_CP020093.1|WP_053338923.1|1793620_1794412_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MKKAVLLDVDHVSKSFILSKQRQSELILEAVSLQVQTHQFISIIGSSGVGKSTLLRMIAGIIRPSYGAITFDGNLVTAPNRRMSMVFQNFALFPWLTVRQNIMFGLESQLNSDCQYVDNQIDNLINLIGLKGLKNAYPYELSGGMKQRVGFARALAVEPELLLLDEPFSALDVLTGQRLGQDLITLWERRKFKMQAIVLITHNISEAVRLSDVIYVLGGKPAQIMNTYQIKTPRNQRTEQQIRAKTMAITDQFKRDMNEMRGD >NZ_CP020093.1|WP_003644505.1|1792455_1793640_-|LCP-family-protein MKCGGTEFMRRRQLPKWQRKRLIVLVTSCITFMLVAFTIQGIRLFDMLHSFHESRVIKSHHNLTQQPVSTFLLMGLDNSGKRKLSTTRTDGMMVVIVNHKTKTMTLCSLLRDTFVKIHSQQYHGYQRIESAYTYGGDAAAIATVEHYLNLPIDYYLTVNWDGFIRAIDDIGPVEVNVDRDFIGQDYWGKPEKFKAGLQSMSGARALAYARERHIDNDQHRGFRQQAVFYAMVKRLNQEGLSSKGAKVVGDLKDQMRTNLTNHDMLTLFKSRKTFKRYRVKRLTFQWRTFDVAGRSMVEVYPDSRVQVSRQLQAAAGLRPDLPSQTFTTNGHYRYASDESVESKADEAKADTHYGQSHVYVGHAGNTTIGKLPAAVPLKNGFRVSDRTETMYTVH >NZ_CP020093.1|WP_069137031.1|1805364_1807743_-|phage-tail-protein MALNNQYLILDPNLKRIGTLTVDGATKFSNDSVKIQLADADTTSTSYDDDVNVGTKDSYTGTINLNAQSKKFDHQGQLDVIQGQPDSDKVVAGNNLAYYDALSGHWYVMRIYSVEESNTAAVKHVTTANFTNLCLYNLAHHYPVAITASDSSIQTAFNQCFNATGWTLDYQTTNVMTPSIDIDGKTKASTLLQTLIQTYDVEIDPYVEIDSQGNITKKVCVITDQLNANVVYNEAIFGKNMTSLKRTTVSNPITKLIPYGANGNTIGLVNDGKSYIVDDEANQTYNPDWQSGLYYEGVVTANSIEDPAGLKAWAEEMLQLYNHPRTYYEVNVTSKFNPPLGATIRFKDELIKPALDASGRVIQRTISFANPYGNTVGFGEYVTVPVATPAWMQGYQSAINSAIEKAKEDASSVKPVALTPDGNNFTDTTQTKRLILQAWEGNTNISAYIDNKGFIWHRYNTDGTLDTSFNQTGYLIQAPYSAVGTLRGTIETSYIQNEPEIKLETSAIRSLGSFNPDDSALGITDAAQYMCPLSNGQYITSRAVNQSTTGDVMFVLHDTNFNPISKMIVSHGGHGSSFSIEEADGAIYIWSATKPNLNVNEYAISRIPYIANTTLDNDDNRITRFCTVNRYIRVSVDFKHGYVLCGYDNGKHDVLRLDEIKQGNYNVLYSFNVANYGFDWNRQTYQSQGIDFPYVYFHSGGYNMKDPRMVYAVNVVHGGQEFASNYLLDMNLGLTDDVIEPETCNIIYSQTNQPELLVTFNCKYQGDYLQRVFVIPIEERLPMTKKGDELSG >NZ_CP020093.1|WP_106904762.1|1807809_1809579_-|phage-tail-family-protein MTLQRDDFEYAGLNSRDDLQVEMGNVVLPSAPAMAEQATDIPAMYGNQFNGTDFTSRTISIPVSIYCADNQDRFNQVMHNLSGLLLSDDPSDNGKEYPLVFGFEPKVTYWGHITAISDPTPINTGMYDMTLTITFVQSDPRATLPQVEKPLNNGLNTITVDGTARTEPVIQVIPKRDLKYIGFSLNGGQFGLGPESPGDQATAVQPYTKVVDDPLGTMAMWTNDANAIGNMKTGETYTYQGHSAIKTSTNVMRPGVNSNGYDFGPIPTTGEDRWYGPAYRYTGMTQSLTDWRVRTGIHQFKYSGTHNGRAMGRVEVLLLDPNGNTIGRFGMRDMAYGAKPIARLQICEPGSTLEYGDRYTDLYYGSGPAGSFTNKPDQKIQIKTGTTTKTVTKYGRSRNGKVTKRTVKETVDTYTTVVNKEEDSALAGAWLILDITKRGQVFTWSITQYSTRTGRPFLDPNIHMLVHGTYVDTQNKYQTALGGIGSVFLKHPITEDSYKIAYRNPFMSMTDLQIWQVNKVDPTKPTYIANAGEEIVMDCESDTVTVNGKLVSPVWSTDFPKLKPGVNGLSMIGDLDDAQMTLKYLPRIL >NZ_CP020093.1|WP_106904763.1|1809652_1814131_-|C40-family-peptidase MAKKVVAGEMTGRVNLDSTEAVKSLKQLTAEVKASTSGWKAQEVALNSAGKYQEATAAKVDGLAKSMELQKSKIDELKKRQSGLNQDTKDGALEYTKLTDEINKANRSYDSMGGQLDRAKNRLQYYNSGLADLQKGYKQSTALSESYVKRLEAEGKQEDANKARLSGLKQAYSNIQAQYKTQSDELDKIRKASGDTSDAYKRQQVRVNETATSMAKLKSETNELDSAMNKAKPTAFTRMLDSAKSKLGLVRDEEKKTNNETKHFALGYVIGNTISNAASSAVGYIKNVTEQGYKLAEAGGTIKKQWTNLGLSDSEATKMTKQIGDIRSKANMSGGAIDQMQKKFYAMTNSTTKARAMTEVLASYGSAAGKSGDQIAQLSQGVAKLSGSAKVTASLFKRNFGQVPELQKAIVKASGMSTSAFNKQLAAGKITGSQLQGYMVKAAKTSGKAWSEFGETTKGKMAAIQGTYTNLKVAFAKPLVSGVEKAIDGVSKKKGALDGVKKSLTGLVGTLGKKTGQYVGDVISFLVKNEKPIEKTGGAIASIVGSLAKGVWSAIAGTLKLIGGHSKDASKGMNGVADATAKIAKHKTAIENVGKAIMVYLAVSKLKGIVSTISGVAGGIGKVIGTMTRLAKSEKLATAAQWLFNAAMDANPIGIAVIAIAALTAGLVLAYKHIKPFREWVNKTAKAVINFGKGIAKWGANVGKSVGKALGNMGKKWNGFKKSFKKSWNKHWSDAGKNLKGAWNGSLKHTREFFSSVGKKWDGWKSSFKKSWSKHWNSTKSGLHDAWNGAYKHTRDFFSGMGTKWAGWKKSWSHSWNNHWDTMRSNLHSYWNKDLSHTKVFGKSMGGWLSTFKTSFSKGWSSLGTGVRNIFKGLWKDLKGFAKDGINDVIDLINGGINAVDAVIHTFGGKKKTIADLSHVHFAEGTGMFSGQRKPITRPTMAMLNDGNDSPETGNKEMVMLPNGDSGIVQGRNTKMMLPAGTEVLNASETAMLMSMQGVTKYANGTGVGGFFGDILNSVTSGISGVTSWVSKKVGSLEKFFKTAENIIAHPIKSLENLFSWSSKGVSGVMSNIGHGLFNGVEKQAKTWWSTLWGGVSDSLDSGASSSTLVNAMEKYGSTNKYVYGAEGPSAFDCSGLVEYTLKKLGISFPRTSGEQYKASKHVSNPKPGDLVFFGPGGSDHVGVYTGNGEFYSAENEKDGMGISKVHGGGYGSFAGYGRVPGLSDSDSSDKSSKSSGLLGTIKKQVGSGFWKFISKLADEFGDRGSSNPGGSGVQRWKPDVIKALKKNGFEASASQVSAWMKVIARESNGDPSVVNNWDSNAKMGMPSMGLVQTIRPTFEAYKFPGHNNPLNGYDDLLAGIHYMKAKYGSGASAFARVSGPEGYENGGIINTNQLIEVAEHNKPEMVLPLTNKSRANQLIAQASQVVNGNNGSQIASTNSESNEKLDKLISLMSAILGNMGSVQAVIAKSDVVNAVKSDNKTASQYSQMMGY >NZ_CP020093.1|WP_069137028.1|1814162_1814348_-|hypothetical-protein MKNQQEDFNLLAQQLLTEGLSPKDFDDSSFFSLMETLNARKKEDRAELVDPLEAINQTYGL >NZ_CP020093.1|WP_063488422.1|1814392_1814767_-|phage-tail-assembly-chaperone MKINAKNYFKINKTADVTPTNNIIRLATKVQIGMLESQDTEKEVTELDAMKNGLELQDKMTNFVQRVMGYTDKQMETINDTISIERFGEGVGYLIMRLNGISDDDIKLSEQKQRKAIEDAKSSK >NZ_CP020093.1|WP_106904764.1|1814842_1815484_-|phage-tail-protein MSKHNIVKATFALLDDNGDLIKDPTKGLSADGIYVADHNGEGFSQINVTAIEAAGVAGWGNGQIKRVSYGKSMPTLALTALDLDFRINQMLKGYTQSANTGAWVRQLPKPHVAMITESQSLDGDISIYECFNNIEFVEEGSNNGTDTNSQVAYSTVLNGSVLAPLKPNIFLAANGVQQPYMIAKSTDTGFDLNKLMAETFGGYTPSTGGTTTH >NZ_CP020093.1|WP_069137026.1|1815499_1815880_-|DUF806-family-protein MLLPVSQVSSLVNALNLTWVDKVYLNEIPNEDLDNTTSTVILLQETDSSPAYLANSTFKGLAMGVEIQIFYKVNLEDDFNPLEAEIALMKALKQAGWLIVSSQHHTTDPDTNQVTKTIYVTKNEML >NZ_CP020093.1|WP_069137025.1|1815879_1816287_-|HK97-gp10-family-phage-protein MANDDMAGQLESWLKNVHKLVPDESEQEKITAAGAKKLADNLTEATKNKHYSSHKDKKYGHMADNISYNSNDIDGEHDGSSIVGWTNKFHDMNARRLNDGTKYIKADHFVDDNLADSQDDVFNAMLDEYKKGDDD >NZ_CP020093.1|WP_069137024.1|1816289_1816637_-|phage-head-closure-protein MALNKFTPASFNRKLQIGTTKTVQNPINGTSKQTFVVTASLWCAPYTRSIASSYQLTAEQLEQVVVVIRHNSTVKEGIKCQYQGDLYSVVNDSMDDSNSYLTYDYLTLKLVTKGA >NZ_CP020093.1|WP_069137021.1|1818394_1819000_-|HK97-family-phage-prohead-protease MELSATKIHNDENVRSIYIQDLKTRDLSSDGTTAIGQVSGYAVVFGKPSEDMGFTEYISPDAFNGVNMNSVIALYDHNLDNILGRVDSGSLELKVDQNGVLFTLNMPNTTLGRDVYENIKNGNLKGCSFGFTIADDDWEFDNSDNVIHTVNQIDQLVEISITALPAYTQTSVSVSRGLKQFNNDQQYRLKAGFWLDLLEKE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020093_1 | 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131052-131081 | 30 | NZ_CP032752 | Lactobacillus plantarum subsp. argentoratensis strain DSM 16365 plasmid unnamed1, complete sequence | 44248-44277 | 0 | 1.0 |
NZ_CP020093_1 | 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131052-131081 | 30 | NZ_CP021472 | Pediococcus pentosaceus strain SRCM100892 plasmid pPC892-2, complete sequence | 22320-22349 | 0 | 1.0 |
NZ_CP020093_1 | 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131052-131081 | 30 | NZ_CP017356 | Lactobacillus plantarum strain TMW 1.25 plasmid pL125-2, complete sequence | 554-583 | 0 | 1.0 |
NZ_CP020093_1 | 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131052-131081 | 30 | NZ_CP017366 | Lactobacillus plantarum strain TMW 1.277 plasmid pL1277-3, complete sequence | 3851-3880 | 0 | 1.0 |
NZ_CP020093_1 | 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131052-131081 | 30 | NZ_CP017381 | Lactobacillus plantarum strain TMW 1.1623 plasmid pL11623-2, complete sequence | 5167-5196 | 0 | 1.0 |
NZ_CP020093_1 | 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131052-131081 | 30 | NZ_CP018868 | Lactobacillus alimentarius DSM 20249 plasmid pLDW-11, complete sequence | 44155-44184 | 0 | 1.0 |
NZ_CP020093_1 | 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131052-131081 | 30 | NZ_CP028231 | Lactobacillus plantarum strain SRCM101222 plasmid unnamed2, complete sequence | 7973-8002 | 0 | 1.0 |
NZ_CP020093_1 | 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131052-131081 | 30 | NZ_CP035557 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103297 plasmid unnamed1 | 6645-6674 | 0 | 1.0 |
NZ_CP020093_1 | 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131052-131081 | 30 | NZ_CP035557 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103297 plasmid unnamed1 | 48912-48941 | 0 | 1.0 |
NZ_CP020093_1 | 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131052-131081 | 30 | NZ_CP021933 | Lactobacillus plantarum strain TMW 1.1478 plasmid pL11478-1, complete sequence | 52769-52798 | 0 | 1.0 |
NZ_CP020093_1 | 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131052-131081 | 30 | NZ_CP016492 | Lactobacillus pentosus strain BGM48 plasmid pBGM48-1, complete sequence | 20119-20148 | 0 | 1.0 |
NZ_CP020093_1 | 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131052-131081 | 30 | NC_022114 | Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700:2 plasmid 1, complete sequence | 11474-11503 | 0 | 1.0 |
NZ_CP020093_1 | 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131052-131081 | 30 | NZ_AP014682 | Lactobacillus hokkaidonensis JCM 18461 strain LOOC260 plasmid pLOOC260-2, complete sequence | 11051-11080 | 0 | 1.0 |
NZ_CP020093_1 | 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131052-131081 | 30 | NC_016608 | Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 plasmid pPECL-5, complete sequence | 10937-10966 | 0 | 1.0 |
NZ_CP020093_1 | 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131052-131081 | 30 | NZ_CP028242 | Lactobacillus plantarum strain SRCM101518 plasmid unnamed1, complete sequence | 8123-8152 | 0 | 1.0 |
NZ_CP020093_1 | 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131052-131081 | 30 | NZ_CP035152 | Pediococcus acidilactici strain SRCM103367 plasmid unnamed1 | 43974-44003 | 0 | 1.0 |
NZ_CP020093_1 | 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131052-131081 | 30 | NZ_CP046657 | Lactobacillus plantarum strain 123-17 plasmid p123-18.1, complete sequence | 10801-10830 | 1 | 0.967 |
NZ_CP020093_1 | 1.6|131316|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131316-131345 | 30 | NZ_CP013054 | Sinorhizobium americanum CCGM7 plasmid C, complete sequence | 284024-284053 | 4 | 0.867 |
NZ_CP020093_1 | 1.6|131316|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131316-131345 | 30 | AB981169 | Ralstonia phage RSY1 DNA, complete genome | 19536-19565 | 6 | 0.8 |
NZ_CP020093_1 | 1.6|131316|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131316-131345 | 30 | NC_049432 | Ralstonia phage RsoM1USA, complete genome | 13669-13698 | 6 | 0.8 |
NZ_CP020093_1 | 1.6|131316|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131316-131345 | 30 | NZ_CP039965 | Pseudorhodobacter sp. S12M18 plasmid unnamed1, complete sequence | 1133280-1133309 | 6 | 0.8 |
NZ_CP020093_1 | 1.3|131118|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131118-131147 | 30 | NZ_CP027853 | Plesiomonas shigelloides strain MS-17-188 plasmid pPS-MS-17-188-1, complete sequence | 118657-118686 | 8 | 0.733 |
1. spacer 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032752 (Lactobacillus plantarum subsp. argentoratensis strain DSM 16365 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat CRISPR spacer gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat Protospacer ******************************
2. spacer 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021472 (Pediococcus pentosaceus strain SRCM100892 plasmid pPC892-2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat CRISPR spacer gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat Protospacer ******************************
3. spacer 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017356 (Lactobacillus plantarum strain TMW 1.25 plasmid pL125-2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat CRISPR spacer gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat Protospacer ******************************
4. spacer 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017366 (Lactobacillus plantarum strain TMW 1.277 plasmid pL1277-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat CRISPR spacer gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat Protospacer ******************************
5. spacer 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017381 (Lactobacillus plantarum strain TMW 1.1623 plasmid pL11623-2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat CRISPR spacer gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat Protospacer ******************************
6. spacer 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018868 (Lactobacillus alimentarius DSM 20249 plasmid pLDW-11, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat CRISPR spacer gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat Protospacer ******************************
7. spacer 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028231 (Lactobacillus plantarum strain SRCM101222 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat CRISPR spacer gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat Protospacer ******************************
8. spacer 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035557 (Lactobacillus plantarum strain SRCM103297 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat CRISPR spacer gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat Protospacer ******************************
9. spacer 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035557 (Lactobacillus plantarum strain SRCM103297 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat CRISPR spacer gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat Protospacer ******************************
10. spacer 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021933 (Lactobacillus plantarum strain TMW 1.1478 plasmid pL11478-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat CRISPR spacer gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat Protospacer ******************************
11. spacer 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016492 (Lactobacillus pentosus strain BGM48 plasmid pBGM48-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat CRISPR spacer gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat Protospacer ******************************
12. spacer 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_022114 (Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700:2 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat CRISPR spacer gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat Protospacer ******************************
13. spacer 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP014682 (Lactobacillus hokkaidonensis JCM 18461 strain LOOC260 plasmid pLOOC260-2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat CRISPR spacer gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat Protospacer ******************************
14. spacer 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_016608 (Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 plasmid pPECL-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat CRISPR spacer gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat Protospacer ******************************
15. spacer 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028242 (Lactobacillus plantarum strain SRCM101518 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat CRISPR spacer gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat Protospacer ******************************
16. spacer 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035152 (Pediococcus acidilactici strain SRCM103367 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat CRISPR spacer gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat Protospacer ******************************
17. spacer 1.2|131052|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP046657 (Lactobacillus plantarum strain 123-17 plasmid p123-18.1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
gattaaatgcaagtactgtctttcgaatat CRISPR spacer gattaaatgcaggtactgtctttcgaatat Protospacer ***********.******************
18. spacer 1.6|131316|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013054 (Sinorhizobium americanum CCGM7 plasmid C, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
acgtcggcgaaatcttcacca----cgccgatta CRISPR spacer acgtcggcgaaatcttcaccaacaccgccg---- Protospacer ********************* *****
19. spacer 1.6|131316|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AB981169 (Ralstonia phage RSY1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
acgtcggcgaaatcttcaccacgccgatta CRISPR spacer ccatcggcgacatcctcaccacgccgatcg Protospacer *.******* ***.*************..
20. spacer 1.6|131316|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_049432 (Ralstonia phage RsoM1USA, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
acgtcggcgaaatcttcaccacgccgatta CRISPR spacer ccatgggcgacatcctcaccacgccgattg Protospacer *.* ***** ***.**************.
21. spacer 1.6|131316|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP039965 (Pseudorhodobacter sp. S12M18 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
acgtcgg-cgaaatcttcaccacgccgatta CRISPR spacer -ggtcagtcgaaatattcaccacgccgatag Protospacer ***.* ****** ************** .
22. spacer 1.3|131118|30|NZ_CP020093|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP027853 (Plesiomonas shigelloides strain MS-17-188 plasmid pPS-MS-17-188-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aattggaaatgtgagtgcatccgctgcatc CRISPR spacer cagtggacacgtgagtgcatccgctgtcag Protospacer * **** *.****************.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
37638 : 54825
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP020093|37638:54825|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP020093|37638:54825|37638_38793_-|WP_003643617.1|integrase|DBSCAN-SWA MATIKKYQDKDGNTRYQFQVYLGVDPQTGKKKSTRRRGFKSKSAARIALSRIEVELQQEPVLPVDNNILFVDVYHEWYDQYINTVRESTWARTAGMFDNHILPLFGNKRLRTITVNQCQRAVNLWFKEVTYNYKRWYNYLVSVFEYGLKHGYITHNPARMITMPVKPDSWGDKPDNFWDRDQLKTFFKCIDQQKEPEKYCLFRVLAFAGVRRGECLALTWQDIDFVHKTLRVNKTLTQGKRGKQIIQAPKTKKGRRTVSLDNTTVEILQRWHKQQREYYLFLGFNTLQPDQLVFANTKNGFKSLNTPGKWLKRIITDYHLTPSITVHGFRHSHASALFAAGATIKEVQTRLGHEDVATTLNVYTHVTKGQNQQAANKLANYLGF >NZ_CP020093|37638:54825|39668_39851_+|WP_142262895.1|DBSCAN-SWA MKESLPRYMSIKQTLVYFNIKSRNTLKKNYIAKGLPVVIINGTKRIDQLDADKFMEAHKV >NZ_CP020093|37638:54825|50188_50458_+|WP_106904631.1|head,tail|DBSCAN-SWA MAVTVDDIKLSLRIDVTEDDPMIQSYLDAAKDYVQTAVSKNEDLTVYKQYDFSVSLLTQFWYQNRVTDMTKTPYQVVSMIQQLRGLVTG >NZ_CP020093|37638:54825|50616_50985_+|WP_187346305.1|DBSCAN-SWA MRQDVKKIRNLLKQYAKLKRDLTAFNQVSSPSFDGVSSHSSRNGAESRLINHVDLSYQLKEVEDALNSIDDPQYQFILHDYIIDKRFSRNEACNQLSVSVSKFNYLKNRALEVFKLNYLRTP 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MIEYVDQVLSGQVLAGQKIKWACERFKRDLSRSKKTSFPFYYDEDKAAQAVKFIELMPKTDGSKLAMQPFQKWIISELYGWREKATGNRRYDRAFISMARKNGKTYLASGMAANGLLRERQPARNRQVLFVSNALKQAKLGYDMLSSGLRQVRKQSKYMRQRIKVQKQAITDLETDSQALALASDTSTLDGYAGTTVILDEWHEAKDRKVYNVLKSGQAQEDNSLLAVISTSGLNLNVPMHAEYEMLTDVLKGKTEADRYFVAIWELDDREEVYDQANWIKANPLFSEPHVKQRMTEKIQADVDLAIKQNNLIPVLVKNFNMWLQASEDSYISADDWAAGKLAKVPDLHNRDAYIGIDLSKSNDLTAVSWLIPIGNGQFYCDSHSFVGTKYGLDSKIKRDGIDYRSMERAGECSITRLDSGIIDYDDLFDFVQKLVGKYNWKVKAVAYDPYNAQTLITKFEKLSYPLFEVRQGTKTLNIPTRNFRDQLYDDKIKHNGNKILAYAVNNAILKVLNNGWQLDKARNSNRIDPIAALINAFVAGMDYYQESEDQQHAEDYYKTATAADLF |
20 | Staphylococcus_phage(27.27%) | head,capsid,portal,tail,terminase,integrase | attL 37079:37093|attR 44061:44075 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
348708 : 445733
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP020093|348708:445733|DBSCAN-SWA CCTAAAGCCTGCCAACTGGTAAGCGGTAACGCAGCCGCACCGCCGCGCTATCGGCTGCACTAATACCGTTATAGCGATTATCAGCTAACATGACACTGTGGCGATCGCGGCTGTGTTCCAAACCAATGGTATGTCCTAACTCGTGTTCAGCCACGTGGACTTGATCTGAATAGGAATAGTGGTAGCGTACAAAATTACGTGTTAACAAGTACACTTGCGCTTTTGTGTAATAACCATTGGTATAACCGGTCGAAAAAGTAATACCGGCTAAGCGATAATACTGCCCACTGGTGGCATTACTGGTCCCCAAAGTAATTTGATGGTGAGCAGTGGTTCCCGGCACGAATTTAAAGTGACCAGTCGCATTCCAGGCTTGGATAGCTGCCTGGTAGACGTGCCGCTCATACGATGATGCTTGAATGACATAAGTCACTTGGGCGTGTGGCCAACGGCTCCGTGAATATGGTGTCGCAATCGATTTTGCGTTGGCAATTGGTGTCAGCCCAAGACCAAAAATCACGGTTAATGTGGTTAAACCTAACTTAGCACTGTACTTATTCTTCATTGTTGTAACCCTCTTTCCCCCAAAAACGAAGGTCGCCATCAATAATTGTATTTTAAAACGTTGCTGAGATAGGGGCCTCATCCTAGACCCGGATTTGACCCAAAATTGCGAGATTTGGTGATGATTAAAGTTAGTTAAATAGGTTATCACGTGCTATGATGAGAACATCTTATGATGATGGAAGGAAATTGATATGACGATTAAACAGGCAATTGTTCAACAAGCCTTGACGTTAATAAAACCGCAAATGGTTGTTGGTTTTGGTGGTGGCTCGACGGTTGGTGAACTGGTCAAGGAGGCAGCCAATCATGTGAATGATATTACGGTCGTCACCCCATCACCGACGACCCGCCAACTTGCGACCGTGCTCGGGTATACCGTTGTAGATACTGCATATTGTGACCGCGTCGATATTGCTTTTGACGGCTGCGATCAGTTAGATCATCACGGTAACGCGCTCAAAAGTGGCGGTGGAATCCATGCTAATGAGAAGATTATTGCCAGCTTGGCGGATGAATATTGGTTACTAACGATGCAGGACCGGTTAGTCGATCAATTTGATATCAAGACGCCACTAGTCTTAGAAGTGCTACCAGCGGCCTTGTCATTAGTCATGCGGACGGTGAGTGATCTTGGCGGTCAGGCAACCATTCGAACTGCTAATAATCGGGACGGCTTCACGTTAACCGATAGTGGCAATTTATTGATCGATTGTCATTTTCCAACGTATGCCAAGCTCACGGACCTGAATGTTGAATTAGCAACTTTGGCTGGCGTTGTTGAAACGAGCTATTTTGATCACTTGGTGACGAATGCTTGGTTGGGCGATGCGGCCACGAATACGGTCAAAGCGCTATTTTAAGTGTCATCAGGAACGATAGCATGACCTTAATGATTAGCAATTGAGCGCTGAAATTCGTTTGACACTTTTTTAAAATAATTCTAAACTGAAGGTGACGTATAAAAGCGCCACCATTTTTTGAATCTATGTTATTTTAAATATCTAAGGGGATGTCAACATGGTAAAAAAAGTCTATACTGATTATTTTTTTGATGAACCTGCTTACAACACACATGACGGTGGCTATATTCCACTAGTTACACCGAAAGTCGATCCACAACCGTTAGCGATTCCACCGTTATTGAAGCCGGACCGCCAGACGGATACGGATGATTACTATACCGTCACGGCACAAGAAAGCGAAACCCAGTTTTTACCTGGTAAGAAGACTAAAACGTGGGGCTATAATGCGGGCTTCCTAGGCCAAACCATCGTCTTTCGTAATGGTAAGCAGACCCATATTGACTTGAAAAATAAACTCCCTGAATTGACGACTTTCCATTGGCACGGCTTGAATGTCCCAGGGCCGATTACCGATGGTGGCTGCCACGCACCGGTCTATCCCGGTGAAACGAACCACATTGACTTTAAAGTACATCAACCAGCTGCGACTACGTGGTTACATGCTCATCCGTGCCCATCGACTGCGACGCAGGTTTGGAAAGGCCTAGCAACGATGGTGATTATTAAGGATGACGTTGAAGATCAGTTACCGTTACCACGTAATTATGGTGTGGATGATATTCCGTTGGTATTACAAGACCGTGAATTTCACGATGATAACCAATTTGATTACCGGGCGGACTACGATCCAGATGGTGTTCAAGGGCATACGGCGTTAGTTAACGGGACGGTCAACCCATATTTTGATGTGACGACGCAGCGGGTGCGGCTACGAATCTTGGATGGGTCGAACCGGCGCGAATGGCGTCTGCACTTCAATGACGATTTGGAATTTGCACAGGTCGCTTCCGATGGTGGCATTTTGCCGGCACCGGTTTATATGACTAAAGTGATGATGACCTGTGCGGAACGGGACGAAATTGTCGTTGATTTCGGTCAGTATCAGCCGGGCGATGAAGTCACGCTGATGACGGATGATACGCCGCTATGTCGCTTCCGAATCAAGTCGTTCGTACCGGATGCCACCAAACTACCAGAACATTTAGTTGATATTCCTGATGATACCCCAACACCTGACTTACCTGTTCGCACAATCACGATGGATGGGATGGATGATGAAGTCGCGCTGGATGGTAAGAAATTCGATATGAGTCGCATCGACGCTCGGCAGAAAGTTGGGGATGTCGCCATTTGGGAAATCCGCAACACCAACAGTACTGAAAACGGCATGGTTCATCCATTCCACGTTCATGGGACTCAATTTAGAGTTTTGGCACGGAACGATGGCCCAGTTTATCCTAATGAACATGGGCTGAAAGATACGGTCGGTGTCAACCCTGGTGAAACGGTGCGGATCAAGGTCAAATTTGAGCTGACGGGGGTTTACATGTATCACTGCCATATCATCGAACATGAAGATGGTGGTATGATGGCCCAAATTGAATCATATGATCCACAACACCCACAAACTTATCATTTAATGGATATGGACACCTTACGGAATGCTTTTGCGAAGGAACAAGGCATCAAGCCCGAAGATGTTTGGATGCCTGGTATGTAAGTGTAGATTAAGCTAATTTAGTGATGAGATGTGAATAAAGTCCGGTTGCAACCAGCAAGTTATCTGCTTGGTCGTAGCCGGGCTTTATCATTTAAAGACACCTCGGAGTCAAAACGGTGGCGGTTTTGACCCCGGATTTACCATGTTTTAATCATGATTTGTAACGAATTAGCTCGGATAAAGACAAGTAAGTCTGTATTTCTACAGTTTAGGCGCAGTAACTGGTACAATTCAAGTAAGGACCGAAAAAGGAGGGGATTAGGATGCACGTTGCAGCAATGATTATGGCAATCTTGGTTGCCGTTGAACATTTATTTATTTTGTGGCTGGAAATGTTTAATGCGGATAGTGAAATGGCCGCAAAAGCGTTTGGAATTCCACGGCAAACGCTACAGTCGCCGTCAGTGCAATTATTGTTTAAAAATCAAGGGTTATATAACGGTTTCTTGGCCGTCGGTATTTTATACAGCTTGTTTGTGATTCCGGCCGTCGCGAGCGCCGGTGCAACCCTGTTTTTCTTAGCCTGTGTGATGGTTGCCGCGGTTTATGGTAGTATTACTGTCAGTCGCGCGATCGTCGTGATTCAGGGGCTACCGGCATTAATTGCGTTTATTCTGATGTATTTTGCTTAGCCGGTTCTTTGAAGTAATGCCATTATATTAGTGTTAATAAAAAACGTTGCTACGTGATCCGTAGCAACGTTTTTGGTTGTCTAAGCTATCAATATTATATGGCAGATTGGATTACACTTTGCCAATGACCGTCGTTTTAGCAGTTGCTAGCACGTGACCGGCAATGGCATCATGAAATTCGTTGAGCCAGTATCCAGGTTGGAGGTCTAACTCAGTATCAAGTGCAAATAGTTTAAATGAATAACGATGATCCTTGTCAGGCGGATACGGGCCGACGTAGTGTTGGCTAACTTTCGGATCAGTCTCGTGAACATAGGCGCCCGCTGTGGAATTATTACCTTGGACCATCGGAATAGCACCGGTCTGACTGGCATTTTCAGGGATGTGGGTCGTGGTTGCCGGTAAATTGGCGGCAATCCAATGAATCCAGGTGAAGCCACCTACCGGAATCGCATCGTGGTCAACGAAAGTGAACGCCAGTGAATGCGTGCCAGCTGGCACATCACTAATGTCAACGGGAAACGAGATGATGGGGTGGCCCTTATACGTTTGGGCGACGGCTGCTTGTTTGGAATAGGTGGCAGCAAGGGCCCCATTGATGGTCGGAATTGATAGTTGCATTGCAAATCCCTCCTCGTGTAATTAGTCTTATTATAACGCTAACAGTCGCTGGCGTAGTGCTGGGTCAACCGCATAAATATAAAGCCCATAACGCCCACGTTTCATCAAGACGTTGATTGAGTTAAAGATAATCTGCTGTTTAAGGGGACGCAGATCGCCTAAGTCTGTCCGGTTTTTGAACGCTTCTTGATCTTCATAGCGTTCAGGGCGAACGACAATCCGATCATGGTCTTCATCATAGCCCACAGAAGGGCCAAGAATGACCCCCGCATAATTCAAATCAAACCCTTGAATGGTATAAATAGAACCAACTTCATTCAGTGTCTCATGTCGTAAGGCCCAAGGCTCATCAGTTAAGTTGACTTTATCCCACGGAAGCTTCAATTGTCCGGCCGTCACGTACCAAGTGCCATGATTAACGACGTACGGAAAGTCAGCGGTTGCCACCATCCGAGCGAGTCCATACTGCTGGTCGCGTTGTTTGATCAGGTCGTATAAGGGTTGCCCGTCATCAAAAAAGCGTAGATCAAAGTTATCGCTAACGGGTTTTGGCTGTAATTGCCCGTGGGTAAAACCATCGATCCAGTCGACAACATCGGCGCCGCCAGTGACCCGAAATTGCTCGTCTAAGTTGTAGCTCGCGTGCGGGTACTGGTC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87 | Bacillus_virus(15.38%) | bacteriocin,protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
553973 : 616018
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP020093|553973:616018|DBSCAN-SWA 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65 | Lactobacillus_phage(44.44%) | holin,protease,capsid,portal,tail,tRNA,plate,integrase | attL 568661:568677|attR 594916:594932 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
627696 : 636321
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP020093|627696:636321|DBSCAN-SWA CATGTATCGGGCACTATATCGGGTTTGGCGTCCCCAACGCTTTGATGAGATTGTCGGGCAACAGATGATTACCCAGACACTAAAAAATGCCATTATGACCCACCAGACGAGTCATGCGTATCTGTTTACCGGTCCCCGGGGAACTGGGAAAACGTCGGCAGCAAAGATTTTTGCCAAGGCAATTAACTGTCACCATCTTGTTGATGGGGAACCTTGCAATGAATGTGAGACTTGTACGGCGATTACCAAGGGGCAACTAAATGATGTCATCGAAATTGATGCGGCTTCTAATAATGGCGTGGAAGAGATTCGTGATATTCGGGACAAAGCGAAGTATGCTCCAACGCAAGCGGACTATAAAGTCTACATTATTGATGAAGTTCATATGTTATCGACTGGCGCGTTTAATGCGTTGCTCAAAACGCTAGAAGAACCCCCGGCTAACGTTATATTTATCTTAGCGACAACGGAGCCCCATAAGATTCCATTAACGATTATTTCACGGACGCAACGGTTTGATTTTCGGCGGATTACAGCTAAGGATAGCTACGATCGGATGGTGTACATCCTCAATGAGAAGGATGTGACCTATGATGAAAAAGCGCTACGCGTCATTGCAGCGGCTGCTGAAGGTGGAATGCGGGATGCTTTAAGTATTCTGGATCAAGTAATTTCGTTTGGGGATAACACGGTTACGTTGGATGATGCGTTAATGGTGACGGGAAGTGTGACCAAGCAGTTGCTGGCTAACTATGTCAGTGAGGTCACCGACCATGATACGAAGCCGGCACTAGAGACGATGCGACAAATCTTACAAGAAGGTAAAGATGCGAACCGTTTCATTGAAGATTTGATCAGTTATACGCGTGACGTGTTACTCTATCAACAGGCCCCTGAAATGGTCGATAGTGTGGCGATGGGCGAGGATGATCAACAATTTGAAGCATTTGCCAAGCAAATCGATGCTGAAGTCCTGTACCAAATGGTCAAGACGTTGAACGATATTCAACAACAAATGCGGTTCACGACGCACCCCGACGTTTATTTAGAAGTGTTGACGGTCAAGCTAGCTCAGTTGGATGGTCAGGCGGCCGTTCAACCGGTAGCTGCGGCAACGGTCAATCCTGAAGATCCCACTGTGCATAAACTGGCACAACAAGTTGAACAGTTGCAAAGCGAGGTTAAAACGTTACGTTCTCAAGGTGGTAGTGTCACTAAACCCGCACCGGCTAAGCCGCGGTCGAGTAATGGCCCGGTTGTTAAGAAGGTTAATGTCAGTCAGATTTATCCTATTCTGGGAGCGGCAACGAAGAATGATCTCATTAAGGTGCGCGATGTTTGGACTGATTTGATGAACATTTTGAGTGTGACGCAGCGGGCCCTAATGCACGTGGCCCAACCAGTTGCGGCCAGTTCAGAAGGTGTTGTGGTTGCGTTTGACTATGCGTTTGTTTATCAAAAAGCGATTGATGACCAGACCTTGATCGATGCACTCGGAAATGGTTTGGATCGGCTGATGGGACAGGCACCCAAGATTGTCTGTGTGCCTAAAGAACAGTGGCCACAAATTCGTAAGGATTATTTGGCCACTCACCAGCCAGGAGGTGCAATATCAGAGCAACAAGCACCGGCCAAAGAACCGGTCGTTGAAGAAGCTAAGAACATGTTCGGTGATTTAGTTGAAGTACAGCCGGACTAAAGACGAAAGGAACTGATAATTATGATGCGTGGAATGGGCAATATGCAAAGTATGATGAAACAAATGAAGAAGATGCAGGCGCAAATGACAGCCGAACAAGCGGCTTTAAATGAACAAACCTTCACGGGTGCGGCGCCAGACGACATGGTCAAAGTCACTTTTACTGGTGATAAGAAGATGAAGGATATTACGATTAACCCTGATGCTGTTGATCCTGATGATGTGGATATGTTACAGGACTTAGTCGTTGCTGCGGTGAACGACGCGTTGACTAAGGTCGATGAACAGACACAAAGTACGATGGGAAAATATACTAAGGGATTACAGTAAAAACGAGGTAAGTACATGCAGTATCCAGAACCAATTGCTAAGTTGATTGATAGTTATATGAAGTTGCCCGGCATTGGTGGCAAGACTGCGACGCGGCTGGCGTTTTATACAATTGATATGAACGGTGATGACGTCACCGAGTTCGCTAAGTCGCTGATTGCGGCCAAACGGGACCTGCATTTTTGTAGTATTTGCGGTAATATCACCGAAGATGATCCGTGTGTGATTTGTAAGGATAAGTCGCGTGATCAAAGCACCGTTCTGGTTGTTGAAGAGGCCAAGGATGTCATGGCAATGGAAAAGATTAAGGAATACAACGGGCTGTATCACGTCTTACATGGGGTATTGTCACCCATTGATGGCAAAGGTCCGGAAGATATCAACATTGCCAGTTTATTGAAACGGCTACAGCAAAATGAAGCCATCAAGGAAGTCATTATTGCCACAAATGCCACGCCTGAAGGTGAAGCAACAGCGATGTACATCTCGCGGTTAGTTAAGCCGGCGGGGATCAAAGTGACCCGATTGGCGCACGGCTTGTCGGTTGGTAGTGATATTCAATATGCGGATGAAATGACCTTATTCAAAGCAGTTGAAGGTCGCCAAGAAATGTAATTGGAGGTGCCACCATGTTTAAACGTAAACAGAAGATCAAGCATCCCAAGGAAGTTTTTGATGAACAGTTATTGTCGACCCTGAATGCCGCTAAGTTGGACTGGGACCGTGCGAAGCAGAACCAAGAAGCGGTCTATGATAATAATACGAGTGAACTAGTTACGCAGACCGCCTTAGCGCGTGCTAAGTATTTATATCTGTATCGTGAAGCACGTTTACGTCAAGTTCATGGGCAGACGATTCAGCGCTCGGTCATTGATAAATAGACTGTTAGTGATTTAAGAGATAACTTGTTTCAAAATAAAGACGCACGTCGTTGATTTTTGTAAATCTACGGCGTGCGTTTTTGATTTAGAACCCTAAGCATTATTTTACCAGTTAATCTGTCATGCATTGTGATTAAGACATGCTAGGTGCGGCAATTGGAATAGAAGATGTGTATCTACTAATGAATAACAAACTAAAATCGGTATTTATCAATCGTGGGTAGTACTACCTAATAACTTTTTAGCAATTCACCGAATAAATCATCAAAACCACAATTGGTAGTAGCCGACCCACGTAAAAATCGTGAAAAAGTACCCTCACTAGTGGTAACCGTATTAGACAGGTACTCAAAAATCAAGTACAATTGCTACATATAAGAAAATAGATGGGATTGGGAATGTTGACAGGAAAATTAGTTACTTTTGAAGGGCCAGACGGTGCCGGCAAAACGTCAGCTTTAAACGCGATTGTGGCCAAATTACAGCCACAATTAGGGGATCGCTTAGTTGTGACGCGTGAACCGGGCGGGAATCAAATCTCAGAAGCAATTCGAAAAATCATTTTAGACCGTCATAATACGGCGATGGACGACCGTACGGAAGCGTTACTCTATGCGGCAGCACGGCGACAACATATCGTCCAAACCATTCAACCAGCATTGCAGAACGACCAACTTGTCTTGTGTGATCGCTACATCGATAGCTCGGTCGCTTATCAGGGGGCCGGTCGTGGTATTGGGGAACAAGCGGTTTATGATATGAATCAGTTCGCGACCGCGGGGTTAACCGCAGATTTAACGTTGTATTTTGACGTAGATGCTGCCGTTGGATTAAACCGCATTCAACAACATCGCCAAAATGAAATTAATCGCTTGGACGTGGAAGCCTTAAGTTTTCATCACCGGGTGCAAGCAGCGTATTTGAGATTACTGGCTGATCATCCTGACCGTATCAAGCGCGTCGATGCAAGTCAGCCATTGGACCAAGTTGTGACGCAGGCCTTAGAGATTATGGCGTTACAGTTACCGACTTATGTGGCATCCAAGGGAGGGGAAGACCAATGAAATTAATTATTGCAATCGTTCAAGATAAGGACAGTAACCGGTTGAGCAGCCAGTTCATTGAAGCCAATGTTCGGGCCACGAAGCTCTCAACGACGGGGGGCTTCCTACGTTCAGGTAATACCACTTTTATGATCGGTATTGATGATGACCGTGTGGATGAAGTTTTAGCCATGATTAAAGAAACGAGTCATGCGCGGGAACAGTTTATGACACCACCAGTCAATCTAGACGTGACGATGGATGGCGCAGCTGCCTATCCAGTTGAAGTTCAAGTCGGTGGCGCCACGGTCTTTGTTCTACCAATTGAACAATTTCACCAATTTTAATGAAGGATGATTATTAATGGCAACAACCGAGTCATTTGCGCAAACGTTAGCGGCGAAACAGCCCCGCTTATTAGCGGCATTTAAACACATCATCGCCCAGAACCATCTGGCCCACGCGTACTTATTCGCGGGGATGGAAGGCGCTGGACAACCAGAACTGGCCCATTGGATTGCGCAACGGTTGTTCTGCCTGCATATTAATGATGGTGAACCAGATGGCACTTGTGAGGAGTGCGTCCGGATTGCTAATGGGTCGCACCCTGATATTGTGACAGTGGCTCCCGAGGGTCAGCGAATTCACGTTGATCAGGTTCGTTACTTAAAAGCTGAATTCTCTAAGAGTGCGGTCGAAGGTAACCGGAAACTGTTCATCATTAATGATGCGGAGAAGATGACAGCGAGTGCTGCCAATAGCTTATTGAAGTTTATTGAGGAGCCAAGTGGTAACGTCACGGCCTTGTTATTAACGACTAATAAGCAACTGATGCTACCAACGATTATTTCACGAACCCAGGTGATCGAATTCCCACCATTAAATGCGCAGGCGTTACAGCAGACGTTTGAACAGGCCGGGATTGCGCCAAACCAAGCACAGATGTTACGGGGCCTGACAAATAGCGTGACCCAGGCGCAGGCGTTGCTAGCGGATGATTGGTTACCACAAGCTGCGCAAGCATTGTGGCGGTGGTTTGACCAGGCTGTTAAGGGTGACCCACGGAGTTTTGTGGCTGTGCAGGTCAATTTAGTTAGTTTGGCTAAGGACGCTGACCATCAGCTGGTTATGTTGGATTTAATTGCGGCCTTGTTCCAAGATCTATTGCAATTACATTTTGAGGTGGCAACGACAGCGTTAACCTTTGGTCAGTACCAAAAAGAATTGGCCGGGTTAACGGCTGAAGTCAGCGATGAGCAGTTGATTGCGGCGACAGAACTAGCTTTAACGGCCAAGCGCCAGCTAGCTAGCAATATTAGTTTTCAAAATGTCTTAGAAGGCTTAACGTTAAAGTTATGGCCGATTTTTCAAACAAACGCTTAAATAAAGGAAAACGAGGGTGAGCGCGTGGATAAGCGTGATTTATACGATAGTTTCGGTGAAATGGAACAACAGATGCAACAAATGCTAGACAAAATGGCTAAGTTACGCGCCGATATGACAACGGTGTTAGAGAAAAACGCGGAATTGGTCATTGAAAATGAACATTTACGTGAACACATGGTCGAAATTGAAAATGAATTGCCGAAAAAAGCGGCTAGCACGACCACGCTCTCAAAGTCACGGCAAAACTTGGAAAAACTCTATGATGAGGGCTTCCACGTCTGCAACCAGTTTTACGGCAAACGGCGTGACGATGACGAATCCTGCGTTTTTTGTTTGGAAGTCATTTATGGTGAACGTGAACGCGCATAGTCGAAAAAGTCTGGGAGTAGTCCCAGACTTTTTGTGCTTTTCACCACGAGTCACTCATAGGAACAAGTCACGATCGAGAGGATTGTTAGGAGGACGTTTTGGAAACACAACAAAGTTTTGCAGATCATGCGGGTATCGGGACCTTGTACTTAGTACCGACGCCAATTGGCAACTTACAGGATATGACTTATCGGGCAGTGGCGACGCTTAAAACGGTTGACCTAATTGCCGCAGAAGATACCCGGAATACCCAAAAGTTATTGAATCATTTTGAAATTACAACGAAACAAATTAGCTTTCATGAACATAACACCCAAGAACGGATTCCCCAGTTAATTGAAAAATTACAGACGGGCGCTAACTTAGCACAAGTTAGCGATGCGGGGATGCCGTCAATCAGTGATCCCGGCAAAGAACTTGTGGCAGCCTGTATTGCCGCGAATATTCCAGTCGTGCCACTACCAGGTGCCAATGCCGGCCTGACTGCGCTGATTGCTTCTGGCCTAGTGCCACAGCCATTTTATTTCTACGGTTTTTTACCGCGTAAGAAGAATGAACAAAAAGCTGATTTAGCTAAATTGGCTCGGCGACATGAAACAGTGGTCTTGTACGAATCGCCATTCCGTGTTGCCAAGACCTTGACCCTCCTAGCGACCGTCTGTGAAGGGACGCGGCTAATTGTGGCGTGCCGGGAATTGACTAAGCGTTACGAGGAATTCGCGCGTGGAACCTTGGCTGAAATGGTGACGTGGGCGCAGGATCATCAGTTAAAGGGCGAATTTGTCCTTTTGATCGGTGGTAATCCGGATAAGGATGAACCAGAAACAACGGATGAATTGGCACAGTTGCCAGTCAAAGCCCAAGTCGAAGCGTTGATTGCAGCCGGAGATAAGCCCAACGTGGCCATTAAGACGATTGCGAAGCGACGGAATATTCCCCGGCAAAGCGTTTATAATCAGTTTCATGAACTAAATACCAACGATGAGGAGTCTTGATGAATGGCAACTTTAGGCGCAAATGCGAGTCTTTACAGTGAACAGCACCGGATTACGTATTATGAATGTGACCGCACTGGTCGCGCAACCTTAACGACATTAATTGATATTGCTGTACTGGCATCAGAGGATCAAAGCGACGCCCTTGGTTTAACGACGGAAATGGTGCAAAGCCATGGTGTCGGTTGGGTCGTCACGCAATATGCCATCGATATTACACGGATGCCCCGCCAAGACGAAGTCGTTACGATTGCCGTTCGGGGTAGTGCTTATAATCCATATTTTGCTTACCGTGAATTTTGGATTCGGGACGCAGATGGTCAACAGTTGGCCTATATTACGAGTATCTGGGTCATGATGAGTCAAACGACCCGGCGAATCGTAAAAATTTTACCAGAACTGGTCGCGCCGTATCAGTCGGAAGTCGTCAATCGTATTCCGCGCTTGCCACGACCGATTAGTTTTGAAGCGACCGATACAACGATTACGAAGCTGTACCATGTCCGCTTCTTTGACATTGATCCCAACCGGCATGTTAATAATGCACACTATTTTGATTGGCTCGTAGATACGCTACCCGCGACGTTCTTGCTTCAACATGATTTAGTTCACGTTGACGTTCGCTATGAAAATGAAGTCAAGTACGGGCAAACGGTGACTGCTCATGCGAACATCTTACCGAGCGAAGTGGCCGATCAGGTCACGACGAGTCATTTGATCGAAGTTGATGATGAGAAGTGTTGTGAGGTCACGATTCAATGGCGGACTTTACCAGAGCCGATTCAGTAATTTGCTGGGTTGGTATTTACACTAGTGTGTTAATGATGTGATCGTGAGCGACTTGGTCGATTAGAACGCACGTTTTTATTAGAGTCGCTGGCGATTCAGTATGCTATGATTAATACATCCATACAGGGGAGGTTCATTATGTCAATTTTAGTTTTAGGGGGAGCTGGCTACATTGGTTCTCACATGGTCGATCGGTTAGTAGAACACGGTACGGACGTCGTGGTCGTTGATAATTTGGTCACGGGACACCGTGCTGCTGTTAATTCGGCGGCCAAGTTTTATCAGGGTGATTTGCGGGATGCGGATTTTTTGAATCACGTTTTTGATACTGAGGACATTGAAGCTGTCGTGCATTTTGCCGCCTTTTCAATCGTACCAGAATCAATGAGTAAGCCACTGAAGTACTTTGATAACAATACTGGTGGGATGATCACGTTACTTGAAACGATGCAGGCCCATGATGTGAAGCAAATCGTCTTCTCATCAACGGCCGCTACTTATGGGACACCTAAGCAGATTCCAATTAAAGAAACTGATCCACAGTTACCAATCAACCCGTATGGCGCTAGCAAGTTAATGATGGAACAGATTATGCACTGGGCGGACGTCGCCTATGGCATTAAGTTTGTCGCGTTACGTTACTTTAACGTTGCGGGTGCCAAGCCAGAGGGCAGTATTGGCGAAGATCATGGCCCCGAAACACATCTGGTTCCAATCATTTTACAAGTTGCGCAAGGAAAACGCGATGAACTTAAAATCTTCGGTGATGACTATAATACGCCGGATGGGACGAATGTGCGTGACTATGTGCATGTTATCGACTTAGCTGATGCACACATCTTGGCTTTGAAGTACTTGGCTGCAGGAAATGACAGTAATGCCTTTAACCTGGGTTCTTCAACTGGTTTCTCTAACAAACAAATGTTAGCGGCTGCTCGTGAAGTTACCGGGCAACCAATTCCAGCTAAGTTAGCGCCACGGCGGCCTGGTGATCCAGACTCATTGGTTGCGGCGAGTGATAAGGCGCGTGACGTGCTAGGTTGGCAACCAAATTATGACAATGTTAACGATATTATTGAAACAGCGTGGGCTTGGACGCAGAAGCATCCCAATGGCTACGATGATCGTGACTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP020093|627696:636321|633501_634398_+|WP_053338711.1|DBSCAN-SWA METQQSFADHAGIGTLYLVPTPIGNLQDMTYRAVATLKTVDLIAAEDTRNTQKLLNHFEITTKQISFHEHNTQERIPQLIEKLQTGANLAQVSDAGMPSISDPGKELVAACIAANIPVVPLPGANAGLTALIASGLVPQPFYFYGFLPRKKNEQKADLAKLARRHETVVLYESPFRVAKTLTLLATVCEGTRLIVACRELTKRYEEFARGTLAEMVTWAQDHQLKGEFVLLIGGNPDKDEPETTDELAQLPVKAQVEALIAAGDKPNVAIKTIAKRRNIPRQSVYNQFHELNTNDEES >NZ_CP020093|627696:636321|627696_629394_+|WP_106904701.1|DBSCAN-SWA MYRALYRVWRPQRFDEIVGQQMITQTLKNAIMTHQTSHAYLFTGPRGTGKTSAAKIFAKAINCHHLVDGEPCNECETCTAITKGQLNDVIEIDAASNNGVEEIRDIRDKAKYAPTQADYKVYIIDEVHMLSTGAFNALLKTLEEPPANVIFILATTEPHKIPLTIISRTQRFDFRRITAKDSYDRMVYILNEKDVTYDEKALRVIAAAAEGGMRDALSILDQVISFGDNTVTLDDALMVTGSVTKQLLANYVSEVTDHDTKPALETMRQILQEGKDANRFIEDLISYTRDVLLYQQAPEMVDSVAMGEDDQQFEAFAKQIDAEVLYQMVKTLNDIQQQMRFTTHPDVYLEVLTVKLAQLDGQAAVQPVAAATVNPEDPTVHKLAQQVEQLQSEVKTLRSQGGSVTKPAPAKPRSSNGPVVKKVNVSQIYPILGAATKNDLIKVRDVWTDLMNILSVTQRALMHVAQPVAASSEGVVVAFDYAFVYQKAIDDQTLIDALGNGLDRLMGQAPKIVCVPKEQWPQIRKDYLATHQPGGAISEQQAPAKEPVVEEAKNMFGDLVEVQPD >NZ_CP020093|627696:636321|629739_630339_+|WP_003637790.1|DBSCAN-SWA MQYPEPIAKLIDSYMKLPGIGGKTATRLAFYTIDMNGDDVTEFAKSLIAAKRDLHFCSICGNITEDDPCVICKDKSRDQSTVLVVEEAKDVMAMEKIKEYNGLYHVLHGVLSPIDGKGPEDINIASLLKRLQQNEAIKEVIIATNATPEGEATAMYISRLVKPAGIKVTRLAHGLSVGSDIQYADEMTLFKAVEGRQEM >NZ_CP020093|627696:636321|629415_629724_+|WP_003640956.1|DBSCAN-SWA MMRGMGNMQSMMKQMKKMQAQMTAEQAALNEQTFTGAAPDDMVKVTFTGDKKMKDITINPDAVDPDDVDMLQDLVVAAVNDALTKVDEQTQSTMGKYTKGLQ >NZ_CP020093|627696:636321|632011_633031_+|WP_106904702.1|DBSCAN-SWA MATTESFAQTLAAKQPRLLAAFKHIIAQNHLAHAYLFAGMEGAGQPELAHWIAQRLFCLHINDGEPDGTCEECVRIANGSHPDIVTVAPEGQRIHVDQVRYLKAEFSKSAVEGNRKLFIINDAEKMTASAANSLLKFIEEPSGNVTALLLTTNKQLMLPTIISRTQVIEFPPLNAQALQQTFEQAGIAPNQAQMLRGLTNSVTQAQALLADDWLPQAAQALWRWFDQAVKGDPRSFVAVQVNLVSLAKDADHQLVMLDLIAALFQDLLQLHFEVATTALTFGQYQKELAGLTAEVSDEQLIAATELALTAKRQLASNISFQNVLEGLTLKLWPIFQTNA >NZ_CP020093|627696:636321|634401_635187_+|WP_069137131.1|DBSCAN-SWA MATLGANASLYSEQHRITYYECDRTGRATLTTLIDIAVLASEDQSDALGLTTEMVQSHGVGWVVTQYAIDITRMPRQDEVVTIAVRGSAYNPYFAYREFWIRDADGQQLAYITSIWVMMSQTTRRIVKILPELVAPYQSEVVNRIPRLPRPISFEATDTTITKLYHVRFFDIDPNRHVNNAHYFDWLVDTLPATFLLQHDLVHVDVRYENEVKYGQTVTAHANILPSEVADQVTTSHLIEVDDEKCCEVTIQWRTLPEPIQ >NZ_CP020093|627696:636321|633055_633403_+|WP_003640967.1|DBSCAN-SWA MDKRDLYDSFGEMEQQMQQMLDKMAKLRADMTTVLEKNAELVIENEHLREHMVEIENELPKKAASTTTLSKSRQNLEKLYDEGFHVCNQFYGKRRDDDESCVFCLEVIYGERERA >NZ_CP020093|627696:636321|635325_636321_+|WP_053338713.1|DBSCAN-SWA MSILVLGGAGYIGSHMVDRLVEHGTDVVVVDNLVTGHRAAVNSAAKFYQGDLRDADFLNHVFDTEDIEAVVHFAAFSIVPESMSKPLKYFDNNTGGMITLLETMQAHDVKQIVFSSTAATYGTPKQIPIKETDPQLPINPYGASKLMMEQIMHWADVAYGIKFVALRYFNVAGAKPEGSIGEDHGPETHLVPIILQVAQGKRDELKIFGDDYNTPDGTNVRDYVHVIDLADAHILALKYLAAGNDSNAFNLGSSTGFSNKQMLAAAREVTGQPIPAKLAPRRPGDPDSLVAASDKARDVLGWQPNYDNVNDIIETAWAWTQKHPNGYDDRD >NZ_CP020093|627696:636321|631003_631669_+|WP_003644908.1|DBSCAN-SWA MLTGKLVTFEGPDGAGKTSALNAIVAKLQPQLGDRLVVTREPGGNQISEAIRKIILDRHNTAMDDRTEALLYAAARRQHIVQTIQPALQNDQLVLCDRYIDSSVAYQGAGRGIGEQAVYDMNQFATAGLTADLTLYFDVDAAVGLNRIQQHRQNEINRLDVEALSFHHRVQAAYLRLLADHPDRIKRVDASQPLDQVVTQALEIMALQLPTYVASKGGEDQ >NZ_CP020093|627696:636321|631665_631995_+|WP_003640965.1|DBSCAN-SWA MKLIIAIVQDKDSNRLSSQFIEANVRATKLSTTGGFLRSGNTTFMIGIDDDRVDEVLAMIKETSHAREQFMTPPVNLDVTMDGAAAYPVEVQVGGATVFVLPIEQFHQF >NZ_CP020093|627696:636321|630353_630605_+|WP_003640957.1|DBSCAN-SWA MFKRKQKIKHPKEVFDEQLLSTLNAAKLDWDRAKQNQEAVYDNNTSELVTQTALARAKYLYLYREARLRQVHGQTIQRSVIDK |
11 | Streptococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1752233 : 1837935
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP020093|1752233:1837935|DBSCAN-SWA CTTAATTGACCGCAAACATTTTGAACGGCTTGTACCGCTGTTCGTCCGGTCGATAACTATATAGACATTTTAGGCTGTTTTGGTAAACTAACGCAACCATCGTGTTCGCATCTGGATCAGTTTGTTGCCCTTCTGCCGCCGTAATAAAGGCCCCATTCTTGACCCGTTGCCACTGCTCATCCGTTAACGTGACTCGCGGGTACTGACTTAAAGCTTTATCAATTGGCGCCAATAATGCTCCGGCCGTTCCAGCATCGACGTGGGCCGCGATTTCCTCAAAGGTCACGGTTTCATCTAAAGTAAAGCCGCCACTCTTTAATCGGGTCAAATCACTCATCACAGCGGGTATCCCGAGCACTTTGCCGACATCCACCGCTAGCGTGCGAACATAAGTCCCTTTACTACAAGCGACCGTAAAATAGATCGTCTGAGTCTGGGTTGCCGAGTCATAGGTAGATGCCTGCCGTTGCTTGAAGCTGCTAATTGTGACATGCCGTTCTGGGCGCTCGACAGTTTCACCACTGCGCGCATAGTCATATAAACGCCGCCCATTTACTTTTACTGCTGAAAACATCGGTGGAATTTGCGTAATGGCCCCCGTCATCTGTGCCAGCGCAGCATCAACTTGGTCACTTGTGAACGGCTCTGTGACCGCTTGGCGCGCAATCTCCTCACCATCTAAATCTTCAGTAGTCGTTGCAAATCCGAGGGTAATGCTCCCTTGGTATTCTTTGCCAGAAGCCACTAAAAATTGCACAACTTTAGTCGCATTCCCAATACAAATCGGTAAAACGCCATCCACATTTGGGTCCAGTGTCCCTGAATGACCTACTTTGCGGGTCTGATAGAGTCGTCGGATTTTAGCGACACAGTCAAAGCTCGTCATCCCACGAGGTTTATATAATGGTAGAATCCCGTTCAACATAAAAAACGCCTTCAATCATTTAAATTCGGTTTCTAGTGGCAGCCAATCGCCGTGCCACGGATTCGATCGTTCTTAATCGACGGTTTTCAGTATACCACACCTCACAAATATGTAAGCGGATTATCACAGAATTCAAGGCCCTGAGCACCGCAACTAAGATACCCCAAATCGACACGCTGGTCCGGTGCCACTGACGACCACGTATGTGCCTGGCAAAGCTGTATTTAACTCATTGATCCAGAAAACCGTGAGCTTAATCCCTATTAGTCAAATAAAACGACTGAAAAACAAGAATCGCACAAATTAGTCCCCTTATCAAAAGGATACCGCGCGGGACCGTCCCTAATTACGCCGATGACTTTCAACATATGCTGCCATCAAAAAAGCGTGCAACGGCCTTAGTGTGGCTGATGTACGCTTATTCAATGTTATCGTCTTAAAATGCAACCGGCACGCTAACCGCAGTTGACAGCTACATGGTTCTTCAAGCTTGGAGCGCAACTGGCTGCTGATTCAACCACTGCTGAATTTGACGGGCAATCTGATGGGGTGTCAGTTGATCGGTTGCGATCGTCAAATCGGCCGCATCAGCATATAAGGCTTGGCGCCGCTGCTTCAACGCAATCAGTGCCCCTGTATCCAATTCATTGACAAGTGGTCGGCTAGTATCATTTTTAACACGGTTAATAGTGGTTTGATCACTAGCCGTCAACCAGATAACTGGCACCGCGCTTTGTTTCAGGCTAATTGCATTCATTGCAATGGTCGGAGTACCACCACCGGTCGATAAAATCCCGGGTGTTTCGAGTGCTTGGAGCAAAGTCTGATGCTCCAATTGCCGGAAGTACCCCTCTCCTTGCTCCGCAAAAATAGTCGTAATCGACCGTCCCGCCCGCTGAACAATCAAATCATCTAAATCAGCATGTTTAGTTGCTAACCCGGCCGCCAAAAGCCGACCGACCGTTGTTTTCCCACTACCCATAAATCCAATTAAAATTGCTCGCATTCTTAATTCCTCCTTACAATCTGATAACCCGCATCAGCTAACAACGACGATGCTTGCGTTCTCGTCTTTAGATCACTAAATGTCAGTTGCAAGACACCATCAATCTCTTCACGAATCTCTAAAATATGAATATTGACTAAGCTCAGCTGAGCCTGTGCGAGCCGCTGAGTGACATCCGCGAGAGCACCAACACGGTCGGGGACGTTCAAAAACAAATCATAAAAGTTTGGTAGTCCTCCCAACTGTTCCGGTCCCAAGTGATCACGCGTCACCTTAGCTGTCGCAAAAAATTCGTACAATGTTGCTTGATCATGCACCCTAATAGCTGTCTTGATGCGCAACAGTTGTTCAATATAATCCTGCAATTGATTGGTTATTAGTTCAGCATTAGTCATCAGGATGGCCGCCCACATCGTGGGGTCCGAACTGGCAATCCGAGTAATACTTTTAAACCCACCAGCCGCTAATCGCAACCCGAGTGCTGAATCTGCCAAAGCCACCTGAGTCTGATCAACTAATGCCGCAGCGACAATATGTGGCAAATGACTTAACTGTCCTACAATCCGGTCATGCTGTATTGCAGTGACCGTCAACCATTTGACGTGAGTCGCTTGTAACAATGCTTGCAGCCGTTGAACGGCTGCTCGATTAGTCCGGCCCGGCACTAACAAGTAAAAGGCGTTCTCGAATAAGTTGGCGCGGCCAGCCGTCACACCCGATTTATGTGAACCCGCCATTGGATGACCGCCGATGAAAGTCACACCGTGCTGTTGTATGGCAAGCGCGGCATGCATCACCACTTGTTTAGTACTCCCGACATCCGTCACAAGCACCCCTGCCTTGAGTGGCATCATAGCCAGTCGGTGCAAATCAGCAACGATCACATCAACTGGCCCCGCTAAAATAATCACATCAGCGTCGCTCGCGACCGCGGCCAAATCAGTGCCACTAGCATCGATCATACCCTGTTGACGCGCATAACTCAGGCTGACATCGTCACGATCAATCCCAATAATGTGCACCGTGGGATGGGCCTGCTTAATGCTTAGTGCCAACGAACTGCCAATTAGCCCCAAACCTTTGATCAATACAGTTGTCATCTTCACACCCCCTGGCTTAAACGTGCTAAATCTTCAAAGAACGTCGGGTATGAAATGTTCACAGCTTCGGCGGACTCTAGTTCGGCGGGAGCGGCTAATCGCAACGCTGCAATTGCCATCATCATACCGATTCGGTGATCGCCATGGCTGGCTAATGGCTCGGTCGGCTGCCGCCAAGACTTGCGACCATCAATCACGAAGCCATCCGGTTGCGAAGTGATCTGCACACCAAGTTTTCGAAGCTCGGTCACAATCGTTGCAATGCGATCGGTTTCCTTGACTCGTAATTCAGCAGCCCCACTGATTGTGCTAATACCATTCGCAGTCGCAGCCAACAATGCAACTAGTGGCAGTTCATCGATTACGGCAGGAATTTCAGTAGCAGTGACTTGGACCGGATGCAGTTGTGCAAACCGCACGTCAAGCGTGCCAACTGGTTCGCCCATCCGGTGTTCATGATCGACCGTCACTTGACCACCCATCCGTCGTAAAATGTTTAAGAAACCCGTTCGTGTCGGATTCAGTCCCACGTTCGTTAACCGGACATGTGAATTTGGAATAATCGTCGCGGCTGTCACGAAAAACGCAGCCGAGGAAAAATCGCCAGGAATCGTTAGTGACTGACCAACCAAGGCTGGCTGCGGTTGGACCGTGATTGTTCGTTGATCAGGCGCCGTTTCAATTTGACCACCAAATTGTTGCAACAACCGTTCAGTGTGGTCACGAGTCGGTAATTTTTCAATAATCGTACTTGCCTGATCGGCTTGCAGGGCTGCTAAAATCAAGGCGCTCTTAACTTGTGCACTAGCGACCTGCATCTCGGTACAACTACCATGTAAAGTCCGACCAGTGATCGTCATCGGTAAGTGCCCGGCTGTTAATTGTACCTGCGCCCCCATGGCTTGTAATGGTTGACGCACTCGCTCCATCGGCCGTTGACTAAGGGACGTATCACCGACCAAGGTCGTCTCAAACGGTTGACCGGCTAACAACCCAGTTAATAAGCGAGTGGCCGTCCCCGCATTCCCCATGTCTAATGGTTGTTGTGGTTGGGTCAACCCACGTAAGCCGCGGCCACTGATAGTAACGGTCGTATCGACACGCTTGATTGGCACCCCTAACTTTTGCAGCGCCGTTAAAGTCGATAAGCAATCGGCGGCTGGCAAAAAGTGGTGCAAGGTCGTCGTCCCTTGACTAATTGCCCCTAAAATCAAGCCTCGATGTGAGACACTTTTATCGCCTGGTACACTTAAGTCACCTTGTAACCCACTAGCTGGTTGAATACTTAGTTTTTTTATCATTAATCATCATCACCTAATTTATTTGATAGACGCACCACACCATCGAAGGTGTCAAACGTGCAAGTTCACGTTCATGAGTCGTCAGTGTCACGTTTTTCTCATTAGTTAGCACGTAGGCCGCCTGATTACGTTGATAAACCTGATACGCTAAATACTTACTGGCGACTGTTTGCACCACGACCTGATGCACGACCCTCGTCAACAATTGGGCGGTCGCTGCATGCGTGTAACCAATTTGATTATCGGCATTTACTCGTTGGAGCACGACGAGTGGATCGAGCTGGGTCATAAAACAACTGGTCAACGTTAATTGGGACAATAATGCGTAATGTATATCCCCCCAACTGGCATTCAGTGTGTCTGATTTGAAAGCAGCTGGTATCACCAGTTGGTCACCAGAATAGGCCGTTAAATCAGTTAAAATGGCTTCAAAGCTCGGGTGTTCGACAATCACCGCTTGGTCCTGCCAGTTGCGATGATTATAAACTTGCGCGGCCGCGTAACTATCCGTGGCGGTCGGGCCTAAAGTATGAATCTGCATAGGCCCTCCTAATATTGCCGGAGTTCTTCGCGGTATGCCGTCACTGTTTGCTGGAGGCGAGCTAAGTTACTCCCGTCAAACGTTGCCGTCAATGCTCGCGTTAATTCAATCGCTACCACACTTTCAA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94 | Lactobacillus_phage(73.47%) | head,holin,protease,tail,portal,integrase,tRNA,terminase,transposase | attL 1777816:1777833|attR 1844869:1844886 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2132571 : 2145514
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP020093|2132571:2145514|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP020093|2132571:2145514|2144356_2145514_+|WP_069137346.1|integrase|DBSCAN-SWA MATIKKYQDKDGNTRYQFQVYLGVDPLTGKKKNTRRRGFKTKKEAQIVLSRLELDIYNHGLPTKNDNTIFEDIYQLWFTQYKQTVKESTWVTTQRLFRLHILPIFSDYRIAKISIKDCQKAINQWFNAGLAKYHTLMNYVAKVLDYAINIDLISENPAKRVIVPVNKNDRSRKNLENYFDKAELQHFFECLNDDDNTPQASVFFRLAAFTGMRKSEMLCLEWSDIDFSNHTIRVNKTQSRGEGARLLVQAPKTARSNRTVYLDPNTVKILQRWQVDQKEWLLRFGFNINQGNHYVFANENNEMFQPSKPRKWLEHTLTKYDLKHVTVHAFRHTYATLAFEAHASIKSVQDQLGHSSYRTTLDIYTAVTAKQKNEATEKLANYLNF >NZ_CP020093|2132571:2145514|2143731_2144298_+|WP_069137347.1|DBSCAN-SWA MLANRLKVLLAERQLTNKQVSDDTKISRNTISNIINNPDANIATNTIDRLCNYLEIDPSNFFEYSPYLITFEYKVGIYDEYDSDPKIAPFALLHVVSGDTEDSFRFIYEPDDYLNSNIATRDYDGFDEIYSCLPLSFKSDIMDILVGGAKKFVIDKSIKLDHEYKSGDTLKLLIRDIGKSYHYKYFTI >NZ_CP020093|2132571:2145514|2140686_2142081_-|WP_069137350.1|DBSCAN-SWA MGKAMDLPAETREAANNVIKMQRDADWQNDFKKNSDDGIKTQSLYNIRLIMEHDEMLKGLVVFDEFSEQIVKTPQADNSLFKKGFWNDSDDTLLRSYIEDHYNLLFSKENITDAVVTEARRKTINPVKARIEAVEWDGQPRAERYFIDYLGAEDNHYTRTITKKWLTGLIARAYVPGVKFEIVPILEGSQGLGKSTAGKNLYPDKFNDSLKGMGKQKDDYQQLQGSWIIEVAELSAMKKTDVEGIKNFISAQSDTYRNSYGRYALPHPRKCVFIGTTNQTDYLKDATGERRFYPLKCGVNKAKLDVWHPDENYILQVLAEAAYWFRNGELLYLDQATMKEAKAYQMAAEAVDPMRDAIEAFLAMEVPTDWENMSISLKQSYVSDYGQQSKWLQDQVSNERKPLNQTTTLEIMEIVFHKTVDRYLTGRINSEAKRIKLLMDNMDGWEAKRIRMNGKFPHGYVRVQ >NZ_CP020093|2132571:2145514|2140122_2140542_-|WP_069137351.1|DBSCAN-SWA MKVIYPSLVEQAFNIYVKQYGPVIPSRVNELKSDIYGVLIKNGVLDQNGDPTQKAKDKGLVGNFTLNEDGEYEPETVRDLKLVYPMYAQFSDDHFMKSSQGWLADAYVIRSISSQVLNDPSSDEGQRQNAYKMLEQLDD >NZ_CP020093|2132571:2145514|2143393_2143573_-|WP_016511388.1|DBSCAN-SWA MQNELPKQMNYKQALKFFNIGSYNTLYSYIKEGLKVTQIGSVKRIDQDDANEFLEAHKV >NZ_CP020093|2132571:2145514|2142080_2142881_-|WP_069137349.1|DBSCAN-SWA MKEFATLDKAIELAQQGYAVYPLIKNTKKPPKGVAGYQAATSDQNTIFAWFKKHPTYNLGLRLDLSDLLVVDIDMHEPTKNGRTSLARLFKQGLTLPKDTYIERTANGGVHYFLKYAGDKVRKIDVWPGIDLLSDFTVIAPSEINGKPYAPLDGRTLADIKPAPQWLVDKLTGQKVNWSSDRAYTTRQKKYTGRLLDEMVTGTTQGNRNAWLTKIAGRMFGVGADPKTVYNMLSVINDSFVDPALPSKEVNVIFQSILKRESKGVH >NZ_CP020093|2132571:2145514|2133250_2134792_-|WP_106904777.1|capsid|DBSCAN-SWA MKQDRRLTIDAELRAQTPQSETPEDGPAENSADPQPKDSQTSKGKTISGYAIVWNSPSKDLGGFTEIVTPKALDGVDLSNVLMLNNHDYTQVLASVKAGTLTLETDDKGLHFIAQLPNTSFANDVYEEVQSGNVDSCSFGFDSDDNTDEWAKDDDGNITRTINQVKSLFDVSVVAVPAYDDTNVQVDTRSYEKFINQEKEPDNMAKQTIIDPNNNDNGNENKTGIPAFEQYVRTHGETRDGLKTDGASAVIPKELITPVFQLKQSNYNLAQYATVKQVSSGSGTYPIATSQQSAVLATKNELADIADVDANMFTEVPFDVKTRAGKIALSNEVVEDSEVDIVSEVKTQLQQLVDNTDNTQIMGLLTGSSFAKATATSIDDLKKIFNVTLDPALSKMWLVNQSGFNYLDTLKDTEGRYLLQPNPTAPSGFTLLGAPVVMISDKLLANNADGTFPMIAGDLSQAVAVFRRNQVTAQWDKFDQFSQGLSVIVRNDYEVIDKTAVINVALGTATAGK >NZ_CP020093|2132571:2145514|2139913_2140099_-|WP_064578496.1|DBSCAN-SWA MIKTKTVVRPTPRELDTGVSSAIKRLETQDYDVLDVKFSTNACSEDEDSALVEYCAMIIYK >NZ_CP020093|2132571:2145514|2139565_2139904_-|WP_069137352.1|head|DBSCAN-SWA MKNYNLSRLNKRAQFGTVKSVENLINGTTKQQFVPLFTVWCGEYTLTISNTISLTGTTATTNQLIAVRHDDRITTTLEAILDGVTYRVAGASSDSELNAYDVVTLTKVNGHG >NZ_CP020093|2132571:2145514|2136043_2137747_-|WP_069137355.1|terminase|DBSCAN-SWA MIEYVDQVLSGQVLAGQKIKWACERFKRDLSRSKDDSFPFYYDEDEAAQAVKFIELMPKTDGSQLTMQPFQKWIISELYGWREKATGNRRYDRAFISMARKNGKTYLASGMAANGLLRERQPARNRQVLFVSNALKQAKLGYDMLSSGLRQVRKQSKYMRQRIKVQKQAITDLETDSQALALASDTSTLDGYAGTTVILDEWHEAKDRKVYNVLKSGQAQEDNSLLAVISTSGLNLNVPMHAEYDMLTDVLKGKTEADRYFVAIWELDDREEVYDQANWIKANPLFSEPHVKQRMTEKIQADVDLAIKQNNLIPVLVKNFNMWLQASEDSYISADDWAAGKLAKVPDLHNRDAYIGIDLSKSNDLTAVSWLIPIGNGQFYCDSHSFVGTKYGLDSKIKRDGIDYQSMERAGECSITRLDSGIIDYDELFDFVQKLVGKYNWKVKAVAYDPYNAQTLITKFEKLSYPLFEVRQGTKTLNIPTRNFRDQLYDDKIKHNGNKILAYAVNNAILKVLNNGWQLDKARNSNRIDPIAALINAFVAGMDYYQESEDQQHAEDYYKTATAADLF >NZ_CP020093|2132571:2145514|2134788_2135889_-|WP_057705764.1|portal|DBSCAN-SWA MSFFVKSSTTSGTHDPVADALVSLSSNDPYTFVSAAVLRNSDIYAAINIIASDIASNPIVCDTAIFNTMINQTPNSQMDGYHFKYALAANLLLNGNSFAEILPNHTLKLIANNQLTVEQDDVSGALTYTYTPIGGNSRQIAPNNILHFKYFTKDGVSGISPLYALKDERQIQSAGNKLLTGFFTAGVHGTTIIKVHQSDLGPEAKGNIRNQFDEANTGDNAINTIVTDDTMDISNLSLNTDVLKLVNSNDWTTRQIAKAFGLPPERLGVENDHSNQEQSGVQYLQGTLQHYFDSFTSELSFKFGHDFTFNTDKLLSLDPQTQQAQAVAGFTGGVMSRNEARAKIGLPPTDDGNIFLNLQKNGVTNS >NZ_CP020093|2132571:2145514|2139183_2139573_-|WP_069137353.1|DBSCAN-SWA MAKPMKQCEHPGCRTLVAYDTRYCEKHRKATNKWRYHKRMYDSDESKYQQFYKSSAWRKLSRRFLESNPVCVQCYQDGVIRKADVVDHVIEIKDDWSRRLDESNLQPLCYRHHNRKTRLAREQREQQTK >NZ_CP020093|2132571:2145514|2135889_2136090_-|WP_072535853.1|DBSCAN-SWA MQKITTKQRLRRICSDYVQTILLVIGLICLVIGFGCWISWQAGLILAGIAMILLALLINYEKQRGD >NZ_CP020093|2132571:2145514|2137743_2138217_-|WP_106904778.1|terminase|DBSCAN-SWA MSQKVKALASMKKHLTNDERDQRKDAEKALFDYPVPDLTPPDWLHDRALTEWQRVAPYLKANTPISELDRAMLASYCRTYATVQTCENDIRKNGLVQTNQETGARKPNPYVALQSQAMKDLKALANDLGMSLSSRARMELNKQKDKTPEDTFEAMLS >NZ_CP020093|2132571:2145514|2132571_2132841_-|WP_027823052.1|head,tail|DBSCAN-SWA MSVTVDDIKLSLRIDVTEDDPMIQSYLDAAKDYVQTAVSKNEDLTVYKQYDFAVSLLTQFWYQNRVTDMTKTPYQVVSMIQQLRGKIEA >NZ_CP020093|2132571:2145514|2142894_2143125_-|WP_069137348.1|DBSCAN-SWA MTNKELVEQSEKLETAYDHLKMAVDYLDMVSASVNSGDTWAGTFFFSDNRAGNVVENMQKVADSIIAVSNDICPED |
16 | Lactobacillus_phage(25.0%) | head,capsid,portal,tail,terminase,integrase | attL 2131545:2131566|attR 2145691:2145712 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2341325 : 2349836
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP020093|2341325:2349836|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP020093|2341325:2349836|2346569_2347250_-|WP_011101895.1|DBSCAN-SWA MMKFAVPVFPGSNCDHDMVNALRDILHVTADLIPATATSLAGYDAVVLPGGFSYGDYLRSGAIARFAPIMPAVIAFANAGKPVIGICNGFQVLTEAGLLPGALQANRSAKFICQDSPLRIANHETIFTTAYGSTDQISLPIAHGEGNYYCDEATLAQLRANHQIIFEYVENPNGSTANIAGITNEAGNVLGMMPHPERAVEMILGSTDGLGIFQSVIASQEEVTHA >NZ_CP020093|2341325:2349836|2341896_2342922_-|WP_069137327.1|DBSCAN-SWA MSDAYKRAGVDINAGYDVLKTVKQMSGNQQLGAFGGAFPLSSDATANDPVLVAGTDGVGTKLLVAIAADQHTTIGIDLVAMCVNDILAQGATPQFFLDYLGLGHTDQKRVKAILTGVVTGCQQAHTALIGGETAEMPDMYGQDHYDLAGFAVGIANRADLLSPANVRAGDVLIGLPSNGLHSNGFSLVRDILFKQQDYQLTTVFDELGHDLQTELLRPTTIYVDAVQPLLQQKLVTSIAHITGGGLIENVARALPAGLSAHLELGQWPAPPIMTLLAELGGLTAMDLRSTFNLGLGMVLIVHSDQVAAVTANLTANAQSYYRVGTVQTGTTPVVFEEAEHA >NZ_CP020093|2341325:2349836|2348239_2349370_-|WP_053339078.1|DBSCAN-SWA MNANFKEALLPPATIGIVGGGQLGQMMTLSAKAMGYRVGVLDPTPKAPAAQVADFQIVAAYDDQAALLDLARRSDVLTYEFENVDENALIAAQAYAKLPQGTALLHITGDRLNEKQFLHDHGIPVTSFAPVADLQSLNYALNRVGTPAILKTAAGGYDGHGQTDLDTAVVTKAASALLTQPCILEARQKFRTEVSMMVTRSAAGVVTTFPLVENQHQHHILHTTIAPANVQPSVHSAARKIAVSIAESLKLRGVLGIEFFVLPDDTLLVNELAPRPHNSGHYTIEACNISQFEAHIRSICGLPIPAITQTSPAVMRNLLGDDLTVARQQLVEHPEWHFHDYGKAAIKPQRKMGHVTVLNHDIDAALASMANLKGEQ >NZ_CP020093|2341325:2349836|2341325_2341904_-|WP_003645867.1|DBSCAN-SWA MPNKIAVFASGNGTNFVALHQAIIERQLPVVIGLLVCDQPTAPVIDKARAANVPILIVDFHDYANKAAAEAIILTALQARQIELVLLAGYMRIIGPTLLNAYAHKIINIHPALLPKFPGRHGIEDAFAAGVTETGVTIHYIDAGIDTGQIIAQRVVPVAPDDTLASLATRIHDCEHQFYPDVLQTLINEGAI >NZ_CP020093|2341325:2349836|2349353_2349836_-|WP_003645861.1|DBSCAN-SWA MAKVGLIMGSISDWPTMQLAAEQLTALGVSYERHVISAHRMPQTLQSYGEEAASRGIQVIIAGAGGAAHLPGMLAANTLLPVIGVPIKTHTLNGVDSLLSIVQMPAGVPVATMAIGDAGAKNGALMAAQIIGLREPQVQHAIGEFRARQRQEAEQSERQF >NZ_CP020093|2341325:2349836|2347505_2348237_-|WP_021356104.1|DBSCAN-SWA MTAAIEKQALLYTGKAKAMYATNDPEILWVEYLDQATALNGKRKVPIDQKGRLNNRIASLIFKDLANHGIANHFIEQPSDYVQLVRRVTMIPLETVVRNAASGSFERKFAVPHLTKFAEPVLEFFYKSDQLDDPFINDSQIHALNVATPAIVAEIKRQALQVNQRLMAIFAAMGVQLVDFKIEFGLTTTGKVLLADEISPDSCRLVDLKTGASLDKDVFRKDLGDLTSVYQEVLTRLATVEEA >NZ_CP020093|2341325:2349836|2342918_2344373_-|WP_003642591.1|DBSCAN-SWA MPTEVRSLNEECGVFGVWGSPDAAQLTYFGLHALQHRGQEGAGITANDHGKLQTERGLGLLADVFRDPRRLARLTGQAAVGHVRYATAGNHGLENIQPLSFNFSDSQFALAHNGNLTNAVTLRRRLEQHGAIFHASSDSEILMHLIRRSPAATLTEQVKDALRQVHGGFAYLLLTNDCLIAALDPNGLRPLVVGQLPTGGYVVCSETCALDTIGATFVQDVQPGELLTIDDHGLTIDHYTTDTQLAICSMEFIYFARPDSDIHGVNVHSARKRMGAQLAVEQPVDADIVVGVPNSSLSAATGYAEASGLPYEMGLIKNQYSSRTFIQPTQALREQGVRMKLSAVKGVVAGKRVVLIDDSIVRGTTSRRIVKLLKDAGAKSVHLRIASPPLRYPCFYGIDIQSTNELIAAQQTIREMCQTFGADSLGFLSEQGVVDAVGLSTTEPYGGLCMAYFNGDYPTALYDYQAEYDAEIAQLQANHEGVIK >NZ_CP020093|2341325:2349836|2347249_2347504_-|WP_003642588.1|DBSCAN-SWA MYLVKIYVTYKQSILDPKGEAIHDALHRLGYTNVDAVELGKYFEVKIHADDRPVAAEIDEMCDRLLANVNMETYRYEITEMEAL >NZ_CP020093|2341325:2349836|2344357_2346577_-|WP_069137326.1|DBSCAN-SWA MLKKQPLSPTDVRDSKVYRDWGLTDAEYQLLTDKVLQRLPNETETGLFSGMWSEHCSYKNSKPVLKKFWTQGEQVLEGPGEGAGIIDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGEPTDAHTKYLISQVVAGIGGYGNCIGIPTIGGDTVFDASYQKNPLVNAMCVGILDQADIQKGQATGIGNAVIYVGAKTGRDGINGASFASAEFNDANETQRSAVQVGDPFMEKLLMEACLEVIHDHRDVLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLSLNLDLVPQRETGMTPFELMLSESQERMLLCVKAGAEAEIYQVFEKYGLDAVTIGKVTAGHQYQLFHHGKLVADVPVDALATKAPVYEREKKRPTRLNHQSHHQFMPRLVDATGTLKKMLQQPTIASKASLYGTYDSQVQTNTVVKPGSDAGVIRIRHTDKALAVTTDVNGRYLYLNPRVGGEIAVAEAARNIVASGGQPLGITDCLNYGNPEKPEQFYDLDESAMGIARACQLFNTPVISGNVSLNNESNGEAIYPTPMIGMVGLIKHQKDITTSNFKHAGDAVYVLGTTEADFNGSELQKMLTGTISGELFDFDLVTENRNQRLLLTAIQKGLVASAHDVSEGGLITTIAESCFPQNIGVELASDLPAANFFAETQSRFVISVTPAQQAAFESLMEPYVTYLGRTTATDRLHVQTADQAFDIKVSFAKQLWEGALPCLLK |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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