Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP028333 | Listeria monocytogenes strain CFSAN054108 chromosome, complete genome | 3 crisprs | DinG,csa3,WYL,cas3,DEDDh,casR | 0 | 0 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP028333_1 | 138780-138934 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP028333_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP028333_1
>1.1|138830|55|NZ_CP028333|CRISPRCasFinder TTCGAATGAGCTCGGTTCCGATGTAGCAGGAGCATTAAAACCAAGAAGCATCGGT |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP028333_1
The CRISPR arrays of NZ_CP028333_1 >merge|NZ_CP028333|1|138780-138934|CRISPRCasFinder GTCTCTGGCAAAGCAAGTCTTAACTCTTCATCCGTAGGTGGTGGTGGAAATTCGAATGAGCTCGGTTCCGATGTAGCAGGAGCATTAAAACCAAGAAGCATCGGTGTCTCTGGCAAAGCAAGTCTTAACTCTTCATCCGTAGGTGGTGGTGGAAA >NZ_CP028333|1|1|138780-138934|CRISPRCasFinder GTCTCTGGCAAAGCAAGTCTTAACTCTTCATCCGTAGGTGGTGGTGGAAA TTCGAATGAGCTCGGTTCCGATGTAGCAGGAGCATTAAAACCAAGAAGCATCGGT GTCTCTGGCAAAGCAAGTCTTAACTCTTCATCCGTAGGTGGTGGTGGAAA
>NZ_CP028333.1|WP_003734712.1|136901_137771_-|phosphatidylcholine-phospholipase-C MKFKKVVLGMCLTASVLVFPVTIKASACCDEYLKPPAAPHDIDSKLPHKLSWSADNPTNTDVNTHYWLFKQAEKILAKDVDHMRANLMNELKNFDKQIAQGIYDADHKNPYYDTSTFLSHFYNPDKDNTYLPGFANAKITGAKYFNQSVADYREGKFDTAFYKLGLAIHYYTDISQPMHANNFTAISYPPGYHCAYENYVDTIKHNYQATEDMVVKRFCSNDVKEWLYENAKRAKADYPKIVNAKTKKSYLVGNSEWKKDTVEPTGARLRDSQQTLAGFLEFWSKKTNE >NZ_CP028333.1|WP_003734713.1|136506_136830_-|DUF5502-family-protein MYIKGGLIFFFVMFVIALCSVLILLIIKMSVWKEEPFNLSDAKEIECLGSCKIKNTNQKIHFFSIKKNLFEEEGNMAGILNEHERKGADKSIFIVILDDEKGIANEE >NZ_CP028333.1|WP_003725734.1|135912_136374_-|YehR-family-lipoprotein MKMLKKGTTVLFVMIMAVMLVACGDKEETKTYSLSQNGVDSKLTYTYKGDKVTKQTAENTMSYASLGVASKEDAEKMLKATSDKFQGIDGLKEKIEYKDDKAIETLEVDYTKISSEDMNKIPGMSSNGDTSKGISMEESAKMLESQGYKEVSK >NZ_CP028333.1|WP_003725735.1|135527_135860_+|putative-heavy-metal-binding-protein MIVTTSPNIEGKQIIEYKKIVFGEVITGVNFMKDIGAGLRNFFGGRSQGYEDELINAREEAIREMEQRAKDIGANAVIGVDIDYEVLGADNGMLMVTASGTAVVIEAQDY >NZ_CP028333.1|WP_003725736.1|134729_135461_+|DNA-alkylation-repair-protein MRLRMLFLLYLIYSRGVTRTITFDQLNTELQALENPNTIKIFRNHGCPDSLDLYGLKIGDLKKIIRREKLTKNHELAVELIESNNSDLIYLGLLAINPDKITTEQIEKWNIIFRETWSQLTFGLASIVSKRDDALLFAKTWIESDYDLTKSMGWQIYSEHINNLPEAEALLQRAKETLQTETNRTRYSMNGFIITCGIYKDDLHEKAMEAAKSVGKVHVNLGNTACKVPDAISYIEKARNRTK >NZ_CP028333.1|WP_003722739.1|133767_134709_+|L-lactate-dehydrogenase MKDHQKIILVGDGAVGSSYAFACVNLSIGQEFGIIDIDKDRTIGDAMDLSHAVPFSTPKKIYSANYSDCHDADLVVVTAGTAQKPGETRLDLVNRNIKIMKGIVDEVMASGFDGIFLIASNPVDILTYATWKFSGLPKERVIGSGTSLDTARFRMSIADYLKVDARNVHGYILGEHGDTEFPAWSHTTVGGLPITEWISEDEQGAMDTIFVSVRDAAYEIINKKGATFYGVAAALARITKAILNNENAILPLSVYLDGHYGMNDIYIGAPAVVNRQGVRHIVEMNLNDKEKEQMKNSADTLKKVLDDAMKQID >NZ_CP028333.1|WP_003722740.1|132850_133474_-|50S-ribosomal-protein-L25/general-stress-protein-Ctc MATTLEVQKRETTQHSEVTRLRSEGKVPGIIYGYKSENVPVSVDSLELIKAVRDNGRNAVFSVTVDGKKLNVLLHEYQVDPLKDVLVHVDLLAVDMNEEVETDVRVVLVGDAPGVKAGGVLQQIIHDVKVSATPEKLPETIELDISSLEIGDVLTTNDLPENKDYVVQAEEEETVVTVSAPRAEEEPTTTEAPEPEAVHGKDEEPVE >NZ_CP028333.1|WP_003725737.1|132176_132761_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MLDKSVPHISAIMVNHDATNYPEFHLPEGYSFCFYKDGLEEDWCRLQLETGQVLSMDSIRARFETEFGNEKEKLAKRCVFVEAPNGEIIGTAMLWDGNTFGEMASRIHWVAVLDSHGGKGIAKALLSKILGLNKSSFVYLTTQTGSYQAIYLYQKFGFEKYVGKTPENWKTVNFQEEKEAAWQIIENKIAEHQA >NZ_CP028333.1|WP_003725738.1|131509_132070_-|aminoacyl-tRNA-hydrolase MKLIAGLGNPGKKYERTRHNVGFMVVDELSFRHQTPWKKSKFNGMTSEIIVGGEKMILVKPLTFMNASGECIRPLMDYYNIPIEDVVIVYDDLDLPVGKIRLRQKGSAGGHNGMKSIIQHVKTQEFNRIRVGVSRPLKGEVIHYVLGDFPKAEQPDIIAAIQKSADAIEDFAQTPFIEVMNKYNQK >NZ_CP028333.1|WP_003728167.1|127856_131396_-|transcription-repair-coupling-factor MKGLQQLIYEQKDIRAVLNALDEKEKAQLVTGLTGSSRALFASVVEGASKRPVVFVTHNLYHAQKLYDDLLSLMDVDRLFLYPADELISSELSISSPELRGQRVEALDFLLSGKPGIVIVPVAGLRKMLPPVSLWKHFNISIVEGEEIDPDVLRQKLVTMGYTMSGMVNTPGEFSVRGGIIDIYPITEEFPIRIELFDTEVDSLRFFDVETQRSTTRVEEFRLLPATEIILDQSYYPDIVKRLEKKMTHTLNELKENEDKQALVENLEEDLEMLRSGVKPDMFFKYIGLAYPDPASLFDYFPKNTAILLDEFGRILETEESLEREEAEWQTETLSRMETVRDVQVSHSFKKLLEANHSPKIYLSLFQKQMASMRVSKTTNIVYKQMQQFHGQMNVLKTELESWHKNNYAVVILAPNLERAEKMQQTLTDYDMESTILKKESDVPKYGMVQFVIGTFQNGFELPLAKVAIISETELFNKKIKKVKKRQKLSNAERIQSYSELKVGDYVVHVNHGIARYVGMETLDINGVHKDYLLLVYQGEDKLFIPVDQLDLVQKYVGAEGKSPRLNKLGGAEWKRVKKKVQASVQDIADDLIKLYAEREAEKGYAFSADDEMQREFEEAFPYQETEDQLRSISEIKKDMERPRPMDRLLVGDVGYGKTEVALRAAFKAIMDGKQVAFLVPTTILAQQHFETMKERFQGFPIEIGLLSRFRTKKQQTETLKGMKNGTVDVVVGTHRLLSKDVEYQDLGLLIVDEEQRFGVTHKEKIKQMRSKIDVLTLTATPIPRTLHMSMLGVRDLSVIETPPANRFPVQTYVAEQNNVLVREAIERELARDGQVYYLYNRVESITQKADEISAMVPDARVATAHGQMGESELESVILSFLEGEFDVLVTTTIIETGVDIPNVNTLFVQDADRMGLSQLYQLRGRVGRWNRIAYAYFMYQKDKILREEAEKRLSAIKEFTELGSGFKIAMRDLSIRGAGNILGAQQHGFIDSVGFDLYSQMLKEAIEAKKPKEEQKQIVPVEIDIQADAYIPEYYITDGRQKIEMYKRFRNIETLSELEDLQSDMIDRFGEYPEEVEYLFTMTELKVHALEVGIESVKQEQNKITMLFSESGTAGIRGDIVMQIIGEFGRMVGVGMEGTQLKITINVQNKPLKEWLYQVKSLAEKLRGAMKERASAEN >NZ_CP028333.1|WP_003725730.1|139925_141458_-|zinc-metalloproteinase-Mpl MKSKLICIIMVIAFQAHFNMAVKADSVGEERLRNNIQAKRNPADLKALPDSCEAKDFYKNFKILDMTKDKLGVTHYTLALSSDGYLTDNDEIKVHVTPDNKIAFINGDLQQGQLRITNQIKITEKNAIEKAFEAIGQSEAHVKSYIGNPVKEKEIIINSRTKRLVYNIKLIFAEPEVASWIIQVDAETGAILKKQNMLSEVERADTHKDFQALGKGANRLLQRPLHVMKINDLFYLVDRTHKGLIRTFDLNHKTDASFGKVVSNKTNMFTDPEFSSAVDAHFYASEVYDYYKNVHQLESLDGKGGEIDSFVHYGLNCNNAFWDGREILYGDGDKKNFKPFSCAKTIVGHELTHAVIQYSAGLEYEGQSGALNESFADVFGYFIAPNHWLIGEDVCVRGLRDGRIRSIKDPDKYNQAAHMKDYESLPITEEGDWGGVHFNSGIPNKAAYNTITKLGKEKTEQLYFRALKYYLTKKAQFTDAKKALQQAAKDLYGEDASKKVAEAWEAVGVN >NZ_CP028333.1|WP_003728174.1|141792_143382_-|cholesterol-dependent-cytolysin-listeriolysin-O MKKIMLVFITLILVSLPIAQQTEAKDASAFNKENLISSMAPPASPPASPKTPIEKKHADEIDKYIQGLDYNKNNVLVYHGDAVTNVPPRKGYKDGNEYIVVEKKKKSINQNNADIQVVNAISSLTYPGALVKANSELVENQPDVLPVKRDSLTLSIDLPGMTNQDNKIVVKNATKSNVNNAVNTLVERWNEKYAQAYPNVSAKIDYDDEMAYSESQLIAKFGTAFKAVNNSLNVNFGAISEGKMQEEVISFKQIYYNVNVNEPTRPSRFFGKAVTKEQLQALGVNAENPPAYISSVAYGRQVYLKLSTNSHSTKVKAAFDAAVSGKSVSGDVELTNIIKNSSFKAVIYGGSAKDEVQIIDGNLGDLRDILKKGATFNRETPGVPIAYTTNFLKDNELAVIKNNSEYIETTSKAYTDGKINIDHSGGYVAQFNISWDEINYDPEGNEIVQHKNWSENNKSKLAHFTSSIYLPGNARNINVYAKECTGLAWEWWRTVIDDRNLPLVKNRNISIWGTTLYPKYSNSVDNPIE >NZ_CP028333.1|WP_003726703.1|143624_144578_+|phosphatidylinositol-specific-phospholipase-C MYKNYLQRTLVLVLCFILCFFTFPLGGKAYSLNNWNKPIKNSVTTKQWMSALPDTTSLAALSIPGTHDTMSYNGDMTWTLTKPLAQTQTMSLYQQLEAGIRYIDIRAKDNLKIYHGPIFLNASLSGVLETITQFLKKNPKETIIMRLKDEQNSNDSFDYRIQPLINIYKDYFYTTPRTDTSNKIPTLKDVRGKILLLSENHTKKPLVINSHKFGMQFGASNQVIQDDYNGPSVKTKFKEIVQTAYQASKADNKLFLNHISATSLTFTPRQYAAALNNKVEQFVLNLTSEKVRGLGILIMDFPEKQTIKNIIKNNKFN >NZ_CP028333.1|WP_003722729.1|144850_145564_+|listeriolysin-transcriptional-regulator-PrfA MNAQAEEFKKYLETNGIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGITKLTSISENGTIMNLQYYKGAFVIMSGFIDTETSVGYYNLEVISEQATAYVIKINELKELLSKNLTHFFYVFQTLQKQVSYSLAKFNDFSINGKLGSICGQLLILTYVYGKETPDGIKITLDNLTMQELGYSSGIAHSSAVSRIISKLKQEKVIVYKNSCFYVQNLDYLKRYAPKLDEWFYLACPATWGKLN >NZ_CP028333.1|WP_003722728.1|145607_146564_-|ribose-phosphate-diphosphokinase MSNEYFDPKLKIFSLNSNRELAEEIAKEVGIELGKSSVTHFSDGEIQINIEESIRGCHVYVIQSTSNPVNQNLMELLIMIDALKRASAATINIVMPYYGYARQDRKARSREPITAKLVANLIETAGATRMITLDMHAPQIQGFFDIPIDHLNAVRLLSDYFSERHLGDDLVVVSPDHGGVTRARKMADRLKAPIAIIDKRRPRPNVAEVMNIVGNVEGKVCIIIDDIIDTAGTITLAAKALREAGATKVYACCSHPVLSGPAMKRIEESPIEKLVVTNSIALPEEKWIDKMEQLSVAALLGEAIVRVHENASVSSLFE >NZ_CP028333.1|WP_003734710.1|146614_147988_-|bifunctional-UDP-N-acetylglucosamine-diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate-N-acetyltransferase-GlmU MSKRYAVVLAAGQGTRMKSKLYKVLHPVCGKPMVEHVVDQISTLNVDKVVTIVGHGAEKVQEHLAGKSEFVKQEEQLGTAHAVLQAKAELAGKDGVTLVVCGDTPLIEASTMEALLKYHHEKRAKATILTTVIEDPTGYGRIIRDDLGIVEKIVEHKDATEKEQRISEINTGTYCFDNKALFEALENVSNDNVQGEYYLPDVIKILKDSDEVVAAYRMESFEESLGVNDRIALAEASRLMQRRINENHMRNGVTLVNPENTYIDIDVKIGQDTVIEPGVMLRGETVIGDDCVVTTGSEIVNSVIGERVYVRTSSIFESKVGDDVQIGPYAHLRPESDIHDHVKIGNYVETKKAVVGEGTKLPHFIYMGDAEIGKNVNVGCGSIAVNYDGKNKAKTIIGDNVFVGCNSNLIAPVKVGDRAFIAAGSTITKDVPDDALGIARAKQDNKLGYAKHLNHGK >NZ_CP028333.1|WP_003722726.1|148374_148683_-|septation-protein-SpoVG MQVTDVRLRRVETDGRMRAIASITLDEEFVVHDIRVIDGNNGLFVAMPSKRGVDGEFRDIAHPINSDTRAKIQEVVLAEYERVGEEEATAVTEEESESVSAE >NZ_CP028333.1|WP_003722725.1|148801_149110_-|septation-protein-SpoVG MEITDVRLRRVETDGRMKAISSITIDGEFVIHDIRVIDGNEGLFVAMPSKRTPDGEFRDIAHPINSGTRAKIQEAVLAAYEVADEPAVNEESSADESIVEEN >NZ_CP028333.1|WP_003725507.1|149793_151002_-|FtsX-like-permease-family-protein MNVLQSMKMAWKQLKASKLRSFLTMLGIIIGVASVILLVSLGNGVTQEVDDQMGDLGSNLITVVNSSVNPNDKYTYDEVMKYQNIDGVKSVSPELSGQVNATFDYKNSSNKVIGTNDQYKAARSLEMKEGRFLLPIDTEYGQKVAVIGSTVASDLFGFGDPIGETIRLNGMPYKVVGVLKEKGASMMGSSDDQIFIPISSAQRLLKDTNVRTIYVETKSAEDVDFVVNTLESRLAIKFGDEKEQEKNASSAQMGPSYQVINQQEILNAFNTISTTLTTALGAIAAISLVVGGIGIMNIMLVSVSERTREIGIRKALGAKKRAILLQFLIESIVISVCGGIIGIIIGVSGALIFGSVAGISSGITAGTIIFSFVFSLCIGVIFGIAPANKASKLRPIDALRSE >NZ_CP028333.1|WP_003722723.1|150998_151691_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MPKPLIDMKNLTKTYTLGGETFKALDDVTFTVEQGEFLSIVGPSGSGKSTLMNMIGCLDVPDEGSYHLDDVDVFKLSDNKLSEIRNKKIGFIFQQFNLLPKLSAFENVELPLIYAGLSVSAREKAAIECLEKVGLLEKRRNLPTQLSGGQQQRVAIARALAGKPQILLADEPTGALDSKTGKEVMGILQELNRAGNTIVMITHDPTIASYGTRSIRIQDGKLFHEEATQA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP028333_2 | 2818466-2819050 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP028333_2
|
7 spacers
spacers of NZ_CP028333_2
>2.1|2818505|39|NZ_CP028333|CRT AAGCTTCTCCAGTTTTTCATTATCAGAAAACATGGCAGC >2.2|2818583|39|NZ_CP028333|CRT TAACGCTTCAAGACTAGTACAACCAGCAAACATGGCACG >2.3|2818661|39|NZ_CP028333|CRT CAACTTCTCAAGGGCGCTACAATTTCTAAACATTTGAAC >2.4|2818739|39|NZ_CP028333|CRT TAGTTTCTTCAGTTTTTCACAGCCATTAAACACTCTATA >2.5|2818817|39|NZ_CP028333|CRT CAGCTCTTCAAGACTAGTACAATCTTCAAACATGGCATA >2.6|2818895|39|NZ_CP028333|CRT CAGCACCTCAAGGTTTCTATTATCATAAAACATGTAAGA >2.7|2818973|39|NZ_CP028333|CRT CAGTTCCTCAAGTGCCCTACAGCTGTTAAACATATCCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP028333_2
The CRISPR arrays of NZ_CP028333_2 >merge|NZ_CP028333|2|2818466-2819050|CRT CATGTTAGTCACTGAACTGGTATCAAAGGTACTTAAATCAAGCTTCTCCAGTTTTTCATTATCAGAAAACATGGCAGCCATATTAGTTACTGAACTCGTATCAAAATTACTTACATCTAACGCTTCAAGACTAGTACAACCAGCAAACATGGCACGCATATCAGTTACTAAGCTCGTATTAAAATTACTTACATCCAACTTCTCAAGGGCGCTACAATTTCTAAACATTTGAACCATTTCAGTAGCGGAACTGGTATCGAAATTACTTACATCTAGTTTCTTCAGTTTTTCACAGCCATTAAACACTCTATACATATCAGTTACTGAACTCGTATCAAAATTACTTACATCCAGCTCTTCAAGACTAGTACAATCTTCAAACATGGCATACATATTAGTTACTGAACTCGTATCAAGGTTGCTTACATCCAGCACCTCAAGGTTTCTATTATCATAAAACATGTAAGACATATTAGTTACTGAACTCGTATCAAAATGACTTACATCCAGTTCCTCAAGTGCCCTACAGCTGTTAAACATATCCCACATAGTAGTTACCGCACTAGTATCAAGACCACTCAAATC >NZ_CP028333|2|1|2818466-2819050|CRT CATGTTAGTCACTGAACTGGTATCAAAGGTACTTAAATC AAGCTTCTCCAGTTTTTCATTATCAGAAAACATGGCAGC CATATTAGTTACTGAACTCGTATCAAAATTACTTACATC TAACGCTTCAAGACTAGTACAACCAGCAAACATGGCACG CATATCAGTTACTAAGCTCGTATTAAAATTACTTACATC CAACTTCTCAAGGGCGCTACAATTTCTAAACATTTGAAC CATTTCAGTAGCGGAACTGGTATCGAAATTACTTACATC TAGTTTCTTCAGTTTTTCACAGCCATTAAACACTCTATA CATATCAGTTACTGAACTCGTATCAAAATTACTTACATC CAGCTCTTCAAGACTAGTACAATCTTCAAACATGGCATA CATATTAGTTACTGAACTCGTATCAAGGTTGCTTACATC CAGCACCTCAAGGTTTCTATTATCATAAAACATGTAAGA CATATTAGTTACTGAACTCGTATCAAAATGACTTACATC CAGTTCCTCAAGTGCCCTACAGCTGTTAAACATATCCCA CATAGTAGTTACCGCACTAGTATCAAGACCACTCAAATC
>NZ_CP028333.1|WP_003721252.1|2817098_2817572_-|hypothetical-protein MKKKRVVIISLLLLLVSVIGISSYFLFKDKINLLDVDHSAVDWNGKKQKDTSGEENTIAIPGFEKVTLYANETKQAVNFHNPEINDCYFKISLIHPDGSVLWISDLIEPGKGMYSIELEKTLAVGEYENAVLKYECFSLNDQSPLNGSEINLKLVVV >NZ_CP028333.1|WP_010958986.1|2816593_2817079_-|hypothetical-protein MNKLVLSTLSVAAMGMVIFSGGTAYAADKEGNTVVEYSVEGDYTLVVPEKVNLSNDNATEMSVKTINRNLEPGKEVEVTLSSGLSADGEIELQRVGAISDVITSSFKSNNSVVPMANPVIGSFSGYAMEETEVSKIQIGNPQGDKKAGAYQTTLTFTAAFK >NZ_CP028333.1|WP_003740435.1|2816260_2816566_-|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-containing-protein MKRKLVLAMVLISFCGMFLLSPERVQASQTVVEVFISEDDLDVSEENIQEIPKKELAASSDKDNKQPILPKAGDTVTNYTLLGLVLVLIWLIMQRKRKKKE >NZ_CP028333.1|WP_020830750.1|2815918_2816185_-|transposase MARIEYGEEIQKSLLVLYSRGSTIQSICREYGIPRYEFHKWMKLHDADKLETKEVKTFLQVRELKQQKNKLEEEILFLNEAINLLESP >NZ_CP028333.1|WP_003734772.1|2814565_2815183_-|hypothetical-protein MLMSLSVLPLATYASETENTPTESYDGENFIATQTGNTLVIEDKKTGETVKIEMNDEENGVITSDDGTIENVHRDEEGNVYVDNELELEAPPLDIEDGINIATQPRLLKASKWIYVQTTKYNTTTQGNMRSLALGILSFMPITGPIFGIVAIIDAARSMGAKTLYVRVKQYRTSGYQFYKYDSYYYANASLTKLVKKTSQTKRMW >NZ_CP028333.1|WP_003734774.1|2813263_2813506_-|hypothetical-protein MKRIILTSTLIVWTIVCIYMSISMVSNNTGIAFPIWLHIILLICFLATGIVNVKKKEYLWSTMLFEGVLVVLLSLIIVLV >NZ_CP028333.1|WP_003734775.1|2812203_2813181_+|HD-domain-containing-protein MKITDPLYGTFEIEPVLAELIQSPLVSRLAYVHQGGSSYLVNPLWDLSRLDHSIGVMLFIRKFGGSLEEQIAGLLHDVSHTAFSHVVDYALDFEEEDYHEQIFEDFVKTSTIPAILEKYGYSFEGIFDDISKWKILEQEAPELCADRIDYTLQDLYRHRKISLAEVEEFLQALVMVDGRLYLANIALAEWFVAQYYSEVIDYFYDPLNVYSYEILAEAMRIAFQQETITTADLRLTDTELLAKLNANSDAREKIQLLASAHLEENEADFTYHHKKKMRLINPSILVDGRLIPADELSEKVRKMNDWASERSKHGIYIKATKKSKQ >NZ_CP028333.1|WP_012681110.1|2810614_2811442_-|hypothetical-protein MKKRLIGIITALLLVSGILLSPQMAQAETKVDYDALYQQGVSEGIINKADVSLETWIKENESEYNQVYQDGLKDGVYDASLSYEEWIKLNNYGQPPVVDENWEEVPQKPMLKGVYKGYNIKKGDILITNGTSSSGLLGHAAIANGNEYILDIPGAGKTTRQVPTSKWMSDYDPEGWVKVYRLKDSSVANAAANWADKNYYSTKGTSKQNIFPKYGMTGSRYSKNPTYCSKIVLQAYYFGTGNKPVVQVFPSLVTVYDLPNYFSKAYKPQQVKYFK >NZ_CP028333.1|WP_003727314.1|2810227_2810587_-|DUF3139-domain-containing-protein MKKYKKWWITIGLVLIICIIGYIYWFAIPKHTANEAVDDYLAAQKINSTQVKTRDIQKDWTRGGYYVTIVFKDDPNLVYEYNYNSKRNTPYHINLLVFKDGSSQEDDQVKHPPLQEQKD >NZ_CP028333.1|WP_003734776.1|2809341_2809902_-|TetR-family-transcriptional-regulator MAESLITKKAIAGGLMELCQHKRFEKISIADITNICGLNRQTFYYHFTDKYDLLTWTYENDFFHCLADGITLENWDKHVLKMLESIKENDDFYKNTVSADASILSFCFSKLTNSLFMDLFEKIDTNGAVNEADRVFYAEFFSYGCSGVLIKWITRGFKEAPETIANQLFRLAKDTEFLANSMYREN >NZ_CP028333.1|WP_014929030.1|2819842_2821690_-|BspA-family-leucine-rich-repeat-surface-protein MKKFSMRVVLIISVLFIALGNANVSIAQERDTTNKLPEEELGSLDTSDVITEGVPQEKPAEAENLEEIPTTDELMQNPNVLERSVADSDDSDLTVVSSGAYWTLYYNSANGEYSLRMFGNVPSSRPTAWNNYLKRIKHIEIEEATLTGDFVGYFGWFIGLKGVRIEGSDLSGVTSFQQAFSNSSLEKVIIKNNYYSNSQSLTNTKQMFFMAKNLSELDLSGLNTSFVTTMERMFEGCENLKILNLSNFDFDTSSVINMDYMFADCTNLEELDVSKFDTSSVTFMQMMFQYCKSLEKLNLSSFDTSSVTRMNSMFEGCTSFEELDLSSFDTSSVGNMQTMFQGCTNLKVLYLDKFDDNITTNKNNMFGNTPLLSYLRFSHRFTKLENIGLENTNWYDEKNWVQFSNITQLQTYNKQQSEPTGYRKGAFFSLTMDAMGGEFEDAEEQKVQNKVSGEYWEEIVPVKEDYYFDGWYLDQNFTNKFDFSLPAAVSTTIYAKWVENYTVIIPASISLNEASELKVEGINRGGKTLSVGLNYGKTTISESNKLTLSNTADTTVQCLAPLSWDGSETNPKNAILTLAPGSEITEGDAVMAIEAPENIQAGKYTGNLVFSVNYE >NZ_CP028333.1|WP_014929029.1|2821953_2823492_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MREYLDSKSQKKVALLEKIFYAENHTSTQEELLNDLNITYPTLISTIKTINFDIERFGYKAFSIVHSAPNLSYTLKISDNCSIQLIINAYIRESPKFQILETLLLSSFPNLQALAKKVHVSYSGIKKEIKELNEELSERNLSISTGNQVEITGDEFSLRIFYAFLFLVAYSGDRWPFSFVRYDEITDILESCPKEIYRANSIDKAMMIHYYVAMHLLRDRMNCQIDTTRQFKVALYKACTEESKKSESAFIKKVAKQLPNRNYKEMTYTTQIILSTIVAFGSYSSIEKMPSFFYMDEQLEEMGFMKLVDFASEQVNNNLSIPFSEKEMELLRYSFASINYRYFLLDNLINKFNNIVPGYTDLDRNIRKIHKVNHLEPLISQLVNLKEMDPLKPFEERLTSDYLIILDKRIDFSIHTLPIKVTILSTISNETAVFDFMRYFSSYYNLEILNQVDPVVDLYISDFSVSPEVLTSLRINQPIIYVNTRWLESDYVKINDNLAKIARKKFIANKKD >NZ_CP028333.1|WP_003728092.1|2824125_2825676_-|hydantoinase/oxoprolinase-family-protein MYKIGIDVGGTNTDAVILDENQQLIHSVKMPTSEDIETGITESLHRVLSETGIDRSKVTHAMLGTTQCTNAIVERKKLAKVGVLRLGYPATASVLPYTAWPEDMVGFLSGKYKLTGGGYEYDGQVLSEINEAEIRETLASWKGEVESVAVVGVFSSLKNDQELAVQKIIEEELGADIPVSISSSVGSVGLIERENATILNAALFKVIAATSDGFEKALEQEGIAHAEIYLCQNDGTLMSLNYARQFPILTIACGPTNSIRGASYLAGLKDAMVLDVGGTTSDIGVLTDGFPRESSLAVDVGGVRTNFRMPDIISIGLGGGSIVREKDGDITIGPDSVGYRISEEALVFGGKTMTTTDIAVRLGRAEIGNPELVAHIPTDFAEKAYKKIAEMTEDAIDKMKTSSGSVSLVLVGGGSVIIPDEISGVAQIFRDKNGPVANAIGASISQISGQYEQIYIYSQIEREEALQDAEQKAREQATLAGAVTDSIEVVEVEEIPLAYHPGNATRLRVKVVGNLV >NZ_CP028333.1|WP_003728093.1|2825668_2826769_-|DUF917-domain-containing-protein MRYLDEQAIENIAIGAAFLGTGGGGDPYIGKMMALTAIKKHGPIKLLSPEEIADDDYFIPAAMMGAPSVLIEKFPKGDEFVRVFEKLGRYVGKEVKGTFPMEAGGVNSMIPIVVAAQLGLPMVDCDGMGRAFPELQMVTFHLDGISATPMAITDEKGNIGIMETIDNKWTERLARVTTVEMGASSLVSLYPCNGAQIKQSSIKNIVTLSEEIGKVIRETSMDEAEKLQKLLDVTHGYHLFEGKITDVVRETRAGFNFGRVKIDGLNKDTGSEVIVHFQNENLVAEKNGEPIAITPDLICMVDLETLMPVTTEALKYGKRVRVMALPADDAWRTDKGIETVGPRYFGYDVDFEPLEELVKKEERRHV >NZ_CP028333.1|WP_003725189.1|2826769_2828053_-|cytosine-permease MTEKKSVEQTQSWQSLAFVWTGAMICVPSLLVGGTLISGMPLWEAILIALLGYGVIVLFMIYQGMQSSDLGIPAVSVASQVFGEQGSKKIISILLAIACLGWFGIQANVCGAAFSQFLGIYGINLPVPVSSLIWGVIMLLSAIYGIRILSILNYIAVPVLLFVCIYGLVVSLNDGGLAIVENYKPAGSMSFMTGLAITIGSFALGAVIAGDYSQYTKSRKDVVKAAIVGILPSGVLMITVGAVLALTAGTADISVVFTNLGLPVLGIIGLILAAWTTNAVNAFSGGIAIINVFNISEKYHKVAVAVAGGLGTILAVIGILNHFVPIMSVLSAMVPPVAGVMIASYWIVQKGDKSKWAPVPGVNWLGVSSWLVGAVIAGIPVILTFFPELPQLPNQPLIGIILSLAVYLIGAKVLSGKTNNVENLEGK >NZ_CP028333.1|WP_003740428.1|2828187_2829783_-|PucR-family-transcriptional-regulator MSVKLADLMKLPSLKEAKVVSGKSGLSKLVSSISVLEYTEVALLEDDLFDNDEFYGSEIVVSAFVNIRDDVEAQCRTIERLHKVGEVALILYYVGIFVPKMDQKLIDFANELDFTIIVMPENEMSLRYSEVIYEVVEAIVKQEMTDTNFVTESLEQISSVRPPQRNIDTTLKILSDRTHTSLVLTDNSFQVINSITWPRTRHWDFERIIEASKQIGEHELVQLTLDERDFYTARKPIFQDGMQAMHLFMMKEKGVLTADVVMQITEVVQVFMNLWGRNYVEISTAELMKAILNDESVKMRRLGKILNVDVSSIKWMWLVKTEEIRDNEQVLAELKSFVASHFQVSLIDLFEDNIVVLLDNSVAQRDRTHTANEFAMMMKEHGIDLKITVCQGMEQTSDVQSAYSLVNEYKNAANAIYANKSIYSLQEIDFAAKCVEIVDRGELAIAEQMRPLKPLEDNDELIETLSVFLLEGESNYNQAAELLFLHKNTIKYRIQRINELLQYPATKIPESYNLYLAVAIRRILGGNNNNK >NZ_CP028333.1|WP_003721242.1|2829938_2830886_+|MoxR-family-ATPase MSIEPSIKIEEIINEVEKVIVGKRHVVKLSLTALLAGGHVLLEDVPGVGKTMMVRTLSKTIGVSFKRIQFTPDLLPADVTGVSIFNPETRDFEFRPGPVMGNIVLADEINRTAPRTQAALLEGMAENSVTVDGITRKLANPFFVMATQNPIEYEGTYALPEAQLDRFLLKINIGYPTVEEEMQLLTLKQYQDPLDQTQQVVTLSELLDLKNKAKQVFIDDVLKNYIIRLVDATRKHPSVALGISPRGSLAFMQAAQAFALIEGRDYVIPDDIQYLAPYIFTHRLILKSEAYYNEETAESIIASILKNTSVPVEKR >NZ_CP028333.1|WP_003734634.1|2830890_2832039_+|DUF58-domain-containing-protein MLKKRLLLAFRWIIMLIIYAGLWTYTLFQGDTASWFLTYFFSFILLLLFLSSIYPLKAWKVNRRFVKNTYHDGDLVDMQVSFTRKSRYPVGYLLFQQKIPASFGNVSARQQVVYPLFKKHFTVTLAGFVGVRGIHSFPPVDVETSDAFGLLERSRQLSSEKSLTIYPTYFPDVLEKISEASPENERNAAYWTLKKNSNLHSLREFSSGDRISLIDWKSSAKSDQLMTREFENSATSRLSVIFYGASHPNFELSLRAAYSFIRKISEDNGEIRVTLLGDQTSKFAPAKGTSRLQDISTAFAEIAPVDSLTLQESLDSNLHSGEKILLFTPCIDTMLMQKVTRLTDNKQLQIITFQSEHSKAMDAPAIFLEPASLLSRWEREAK >NZ_CP028333.1|WP_003734633.1|2832035_2834195_+|transglutaminase MKRYLTLVMLFILSVLLISEWIYPFAELTELSTANWIILFITLSLGSFFLRLKYYWTIPLHIVMIIFVSGIYYAKGGILAGNWFVSFFQITFNGFRDMVQFRSSDISMDFILIVFLIALWLLSYITTYSILRKQRVMSVLVLTVAYLAVINTFTDYNSNWAIVRTVLEGFLLLHLALASRIAAPNRISADSLKRNGLFYHIFVILLLAVFVFSSLMLPKKAPIFPDPVPTIKNALGINTTRTVGYSEDDTTLGGALKKDNATVFTARAEKGHYWRVESKTVYTGTGWANANSADVISFSSGDNFPIQLTEQTTGATNTAEISFASSNDYMPYPYGTQTVNGAVDSFSANLTIERVGPVDTIKNYTVQLKTPVYNIEKMQNADFSTLSNAFVSQYTQTPKDLPDRVTKLANKVTKDADSIYDKTKAIERYLSASGTFTYSTEDAKETPRGADYVDQFLFETQIGYCDNFSTSMVVMLRSLGIPARWAKGYTPGEGEKKENDAKTTYTITNNNAHSWPEVFFPGTGWVPFEPTATFSNPENFQEPTTETANKPETPNDSTSTPETPNTADKTPEQDNGSSSTGETPKKEEPKTETAASNFEIPSWVWWIPAGLVVALLALVIIFRRRIRSYLLLRSLRNSPEFGKTYHRLMKLLASYGYVRESSETLRHFGTRVDAELTTTEFSRLTKMYEAQIYSNNLTEKVITAEETQLVQQVIARLTK >NZ_CP028333.1|WP_003734632.1|2834311_2835067_+|DUF4866-family-protein MTTIFPKEQNVAPLFEQILANPTACRRFKDVFLDNLESYQETRGFEKDDTLFAKIILSAYRQSDVSALLLGVCGRTLFELLRQAFLIPKKLTVDNPFFLTDKEGNFIAKKDDISNREQEKFQEIYQSDLHHSETTIFLVDDDDIIHSYEPDFSISTKRINKKRGILVLYSLPDTLKLGMTESEVYAFIWKTFLHIQEIIPSSRIFYGQETSENADELGVFLPIHHFEKKMLQNIEQVNELVDALREQMVNK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP028333_3 | 2820696-2820874 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP028333_3
|
2 spacers
spacers of NZ_CP028333_3
>3.1|2820719|55|NZ_CP028333|CRISPRCasFinder GTCTAGCTCTTCAAAACTAGTACATCCTTCAAACATACTATTCATGCGAGTTACT >3.2|2820797|55|NZ_CP028333|CRISPRCasFinder ATTCAGTTTCTCAAGCGATTTACAATATTGAAACATCATCTGCATAAAAGTAACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP028333_3
The CRISPR arrays of NZ_CP028333_3 >merge|NZ_CP028333|3|2820696-2820874|CRISPRCasFinder GAACTCGTATCAAAACTGCTTAAGTCTAGCTCTTCAAAACTAGTACATCCTTCAAACATACTATTCATGCGAGTTACTGAGCTCGTATCAAAACTGCTTAAATTCAGTTTCTCAAGCGATTTACAATATTGAAACATCATCTGCATAAAAGTAACAGAGCTGGTATCAAATTTGCTTAC >NZ_CP028333|3|2|2820696-2820874|CRISPRCasFinder GAACTCGTATCAAAACTGCTTAA GTCTAGCTCTTCAAAACTAGTACATCCTTCAAACATACTATTCATGCGAGTTACT GAGCTCGTATCAAAACTGCTTAA ATTCAGTTTCTCAAGCGATTTACAATATTGAAACATCATCTGCATAAAAGTAACA GAGCTGGTATCAAATTTGCTTAC
>NZ_CP028333.1|WP_003734991.1|2817637_2819707_-|BspA-family-leucine-rich-repeat-surface-protein MKKLSMRVILIVTVIFIAFGSANVSIAQERDTINKLPEVELGSLYTSNLITEEVAQDKPAEVENLEEAPTTDDLVQNPDVLEQLIADSDDSDLTVVNSGDFWTIYRNTVNGEYSLHMFGNVPSSKPTAWNSYLNRIKHIEIEEATLTGNFSSYFRNNVFTVLESVRIERSNLSRVTSFALAFYGSGIEKVIIRDNNYPTAPSLLTTEGMFKNCSNLMEVDLSGLDTSAVTTMWDMFNSCRALEELDVSHFDTSSVTNMSYMFYDNRNLEVLDVSNLDTSSVTNMYAMFEDCTSLEELDVSNFDTSSVTDMYRVFNGCEKLKKLDVSNFDTSSATEMVQMFRNCSALEKLDVSNFNTSLVTDMRAMFAGCTSLEALDVSNFDTSSVTNMAAMFSDNEKLEKLDLSTFDTSSVTNMGTMFKNCTALKSLFLDNFTHAASSTDMFTGTTSLTYLFVSHNVSNFNGLENTSWYDEKNWVQFSNLSQLQTYHRQQSEPIGYRKGAFLSLTMDAMGGEFEDAEEQKVQNKISGEYWEEVIPVKEGHYFDGWYLDQNFTNKFDFSLPAAVSTTIYAKWVENYTVIIPASISLNEASELKVQGINRGSKTLSVGLNYEETTISESNKLTLANTADTTVQCLAPLSWDGSETNPEKAILTLAPGSEITEGEAVMVIEAPENIQAGKYTGNVVFSIKYE >NZ_CP028333.1|WP_003721252.1|2817098_2817572_-|hypothetical-protein MKKKRVVIISLLLLLVSVIGISSYFLFKDKINLLDVDHSAVDWNGKKQKDTSGEENTIAIPGFEKVTLYANETKQAVNFHNPEINDCYFKISLIHPDGSVLWISDLIEPGKGMYSIELEKTLAVGEYENAVLKYECFSLNDQSPLNGSEINLKLVVV >NZ_CP028333.1|WP_010958986.1|2816593_2817079_-|hypothetical-protein MNKLVLSTLSVAAMGMVIFSGGTAYAADKEGNTVVEYSVEGDYTLVVPEKVNLSNDNATEMSVKTINRNLEPGKEVEVTLSSGLSADGEIELQRVGAISDVITSSFKSNNSVVPMANPVIGSFSGYAMEETEVSKIQIGNPQGDKKAGAYQTTLTFTAAFK >NZ_CP028333.1|WP_003740435.1|2816260_2816566_-|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-containing-protein MKRKLVLAMVLISFCGMFLLSPERVQASQTVVEVFISEDDLDVSEENIQEIPKKELAASSDKDNKQPILPKAGDTVTNYTLLGLVLVLIWLIMQRKRKKKE >NZ_CP028333.1|WP_020830750.1|2815918_2816185_-|transposase MARIEYGEEIQKSLLVLYSRGSTIQSICREYGIPRYEFHKWMKLHDADKLETKEVKTFLQVRELKQQKNKLEEEILFLNEAINLLESP >NZ_CP028333.1|WP_003734772.1|2814565_2815183_-|hypothetical-protein MLMSLSVLPLATYASETENTPTESYDGENFIATQTGNTLVIEDKKTGETVKIEMNDEENGVITSDDGTIENVHRDEEGNVYVDNELELEAPPLDIEDGINIATQPRLLKASKWIYVQTTKYNTTTQGNMRSLALGILSFMPITGPIFGIVAIIDAARSMGAKTLYVRVKQYRTSGYQFYKYDSYYYANASLTKLVKKTSQTKRMW >NZ_CP028333.1|WP_003734774.1|2813263_2813506_-|hypothetical-protein MKRIILTSTLIVWTIVCIYMSISMVSNNTGIAFPIWLHIILLICFLATGIVNVKKKEYLWSTMLFEGVLVVLLSLIIVLV >NZ_CP028333.1|WP_003734775.1|2812203_2813181_+|HD-domain-containing-protein MKITDPLYGTFEIEPVLAELIQSPLVSRLAYVHQGGSSYLVNPLWDLSRLDHSIGVMLFIRKFGGSLEEQIAGLLHDVSHTAFSHVVDYALDFEEEDYHEQIFEDFVKTSTIPAILEKYGYSFEGIFDDISKWKILEQEAPELCADRIDYTLQDLYRHRKISLAEVEEFLQALVMVDGRLYLANIALAEWFVAQYYSEVIDYFYDPLNVYSYEILAEAMRIAFQQETITTADLRLTDTELLAKLNANSDAREKIQLLASAHLEENEADFTYHHKKKMRLINPSILVDGRLIPADELSEKVRKMNDWASERSKHGIYIKATKKSKQ >NZ_CP028333.1|WP_012681110.1|2810614_2811442_-|hypothetical-protein MKKRLIGIITALLLVSGILLSPQMAQAETKVDYDALYQQGVSEGIINKADVSLETWIKENESEYNQVYQDGLKDGVYDASLSYEEWIKLNNYGQPPVVDENWEEVPQKPMLKGVYKGYNIKKGDILITNGTSSSGLLGHAAIANGNEYILDIPGAGKTTRQVPTSKWMSDYDPEGWVKVYRLKDSSVANAAANWADKNYYSTKGTSKQNIFPKYGMTGSRYSKNPTYCSKIVLQAYYFGTGNKPVVQVFPSLVTVYDLPNYFSKAYKPQQVKYFK >NZ_CP028333.1|WP_003727314.1|2810227_2810587_-|DUF3139-domain-containing-protein MKKYKKWWITIGLVLIICIIGYIYWFAIPKHTANEAVDDYLAAQKINSTQVKTRDIQKDWTRGGYYVTIVFKDDPNLVYEYNYNSKRNTPYHINLLVFKDGSSQEDDQVKHPPLQEQKD >NZ_CP028333.1|WP_014929029.1|2821953_2823492_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MREYLDSKSQKKVALLEKIFYAENHTSTQEELLNDLNITYPTLISTIKTINFDIERFGYKAFSIVHSAPNLSYTLKISDNCSIQLIINAYIRESPKFQILETLLLSSFPNLQALAKKVHVSYSGIKKEIKELNEELSERNLSISTGNQVEITGDEFSLRIFYAFLFLVAYSGDRWPFSFVRYDEITDILESCPKEIYRANSIDKAMMIHYYVAMHLLRDRMNCQIDTTRQFKVALYKACTEESKKSESAFIKKVAKQLPNRNYKEMTYTTQIILSTIVAFGSYSSIEKMPSFFYMDEQLEEMGFMKLVDFASEQVNNNLSIPFSEKEMELLRYSFASINYRYFLLDNLINKFNNIVPGYTDLDRNIRKIHKVNHLEPLISQLVNLKEMDPLKPFEERLTSDYLIILDKRIDFSIHTLPIKVTILSTISNETAVFDFMRYFSSYYNLEILNQVDPVVDLYISDFSVSPEVLTSLRINQPIIYVNTRWLESDYVKINDNLAKIARKKFIANKKD >NZ_CP028333.1|WP_003728092.1|2824125_2825676_-|hydantoinase/oxoprolinase-family-protein MYKIGIDVGGTNTDAVILDENQQLIHSVKMPTSEDIETGITESLHRVLSETGIDRSKVTHAMLGTTQCTNAIVERKKLAKVGVLRLGYPATASVLPYTAWPEDMVGFLSGKYKLTGGGYEYDGQVLSEINEAEIRETLASWKGEVESVAVVGVFSSLKNDQELAVQKIIEEELGADIPVSISSSVGSVGLIERENATILNAALFKVIAATSDGFEKALEQEGIAHAEIYLCQNDGTLMSLNYARQFPILTIACGPTNSIRGASYLAGLKDAMVLDVGGTTSDIGVLTDGFPRESSLAVDVGGVRTNFRMPDIISIGLGGGSIVREKDGDITIGPDSVGYRISEEALVFGGKTMTTTDIAVRLGRAEIGNPELVAHIPTDFAEKAYKKIAEMTEDAIDKMKTSSGSVSLVLVGGGSVIIPDEISGVAQIFRDKNGPVANAIGASISQISGQYEQIYIYSQIEREEALQDAEQKAREQATLAGAVTDSIEVVEVEEIPLAYHPGNATRLRVKVVGNLV >NZ_CP028333.1|WP_003728093.1|2825668_2826769_-|DUF917-domain-containing-protein MRYLDEQAIENIAIGAAFLGTGGGGDPYIGKMMALTAIKKHGPIKLLSPEEIADDDYFIPAAMMGAPSVLIEKFPKGDEFVRVFEKLGRYVGKEVKGTFPMEAGGVNSMIPIVVAAQLGLPMVDCDGMGRAFPELQMVTFHLDGISATPMAITDEKGNIGIMETIDNKWTERLARVTTVEMGASSLVSLYPCNGAQIKQSSIKNIVTLSEEIGKVIRETSMDEAEKLQKLLDVTHGYHLFEGKITDVVRETRAGFNFGRVKIDGLNKDTGSEVIVHFQNENLVAEKNGEPIAITPDLICMVDLETLMPVTTEALKYGKRVRVMALPADDAWRTDKGIETVGPRYFGYDVDFEPLEELVKKEERRHV >NZ_CP028333.1|WP_003725189.1|2826769_2828053_-|cytosine-permease MTEKKSVEQTQSWQSLAFVWTGAMICVPSLLVGGTLISGMPLWEAILIALLGYGVIVLFMIYQGMQSSDLGIPAVSVASQVFGEQGSKKIISILLAIACLGWFGIQANVCGAAFSQFLGIYGINLPVPVSSLIWGVIMLLSAIYGIRILSILNYIAVPVLLFVCIYGLVVSLNDGGLAIVENYKPAGSMSFMTGLAITIGSFALGAVIAGDYSQYTKSRKDVVKAAIVGILPSGVLMITVGAVLALTAGTADISVVFTNLGLPVLGIIGLILAAWTTNAVNAFSGGIAIINVFNISEKYHKVAVAVAGGLGTILAVIGILNHFVPIMSVLSAMVPPVAGVMIASYWIVQKGDKSKWAPVPGVNWLGVSSWLVGAVIAGIPVILTFFPELPQLPNQPLIGIILSLAVYLIGAKVLSGKTNNVENLEGK >NZ_CP028333.1|WP_003740428.1|2828187_2829783_-|PucR-family-transcriptional-regulator MSVKLADLMKLPSLKEAKVVSGKSGLSKLVSSISVLEYTEVALLEDDLFDNDEFYGSEIVVSAFVNIRDDVEAQCRTIERLHKVGEVALILYYVGIFVPKMDQKLIDFANELDFTIIVMPENEMSLRYSEVIYEVVEAIVKQEMTDTNFVTESLEQISSVRPPQRNIDTTLKILSDRTHTSLVLTDNSFQVINSITWPRTRHWDFERIIEASKQIGEHELVQLTLDERDFYTARKPIFQDGMQAMHLFMMKEKGVLTADVVMQITEVVQVFMNLWGRNYVEISTAELMKAILNDESVKMRRLGKILNVDVSSIKWMWLVKTEEIRDNEQVLAELKSFVASHFQVSLIDLFEDNIVVLLDNSVAQRDRTHTANEFAMMMKEHGIDLKITVCQGMEQTSDVQSAYSLVNEYKNAANAIYANKSIYSLQEIDFAAKCVEIVDRGELAIAEQMRPLKPLEDNDELIETLSVFLLEGESNYNQAAELLFLHKNTIKYRIQRINELLQYPATKIPESYNLYLAVAIRRILGGNNNNK >NZ_CP028333.1|WP_003721242.1|2829938_2830886_+|MoxR-family-ATPase MSIEPSIKIEEIINEVEKVIVGKRHVVKLSLTALLAGGHVLLEDVPGVGKTMMVRTLSKTIGVSFKRIQFTPDLLPADVTGVSIFNPETRDFEFRPGPVMGNIVLADEINRTAPRTQAALLEGMAENSVTVDGITRKLANPFFVMATQNPIEYEGTYALPEAQLDRFLLKINIGYPTVEEEMQLLTLKQYQDPLDQTQQVVTLSELLDLKNKAKQVFIDDVLKNYIIRLVDATRKHPSVALGISPRGSLAFMQAAQAFALIEGRDYVIPDDIQYLAPYIFTHRLILKSEAYYNEETAESIIASILKNTSVPVEKR >NZ_CP028333.1|WP_003734634.1|2830890_2832039_+|DUF58-domain-containing-protein MLKKRLLLAFRWIIMLIIYAGLWTYTLFQGDTASWFLTYFFSFILLLLFLSSIYPLKAWKVNRRFVKNTYHDGDLVDMQVSFTRKSRYPVGYLLFQQKIPASFGNVSARQQVVYPLFKKHFTVTLAGFVGVRGIHSFPPVDVETSDAFGLLERSRQLSSEKSLTIYPTYFPDVLEKISEASPENERNAAYWTLKKNSNLHSLREFSSGDRISLIDWKSSAKSDQLMTREFENSATSRLSVIFYGASHPNFELSLRAAYSFIRKISEDNGEIRVTLLGDQTSKFAPAKGTSRLQDISTAFAEIAPVDSLTLQESLDSNLHSGEKILLFTPCIDTMLMQKVTRLTDNKQLQIITFQSEHSKAMDAPAIFLEPASLLSRWEREAK >NZ_CP028333.1|WP_003734633.1|2832035_2834195_+|transglutaminase MKRYLTLVMLFILSVLLISEWIYPFAELTELSTANWIILFITLSLGSFFLRLKYYWTIPLHIVMIIFVSGIYYAKGGILAGNWFVSFFQITFNGFRDMVQFRSSDISMDFILIVFLIALWLLSYITTYSILRKQRVMSVLVLTVAYLAVINTFTDYNSNWAIVRTVLEGFLLLHLALASRIAAPNRISADSLKRNGLFYHIFVILLLAVFVFSSLMLPKKAPIFPDPVPTIKNALGINTTRTVGYSEDDTTLGGALKKDNATVFTARAEKGHYWRVESKTVYTGTGWANANSADVISFSSGDNFPIQLTEQTTGATNTAEISFASSNDYMPYPYGTQTVNGAVDSFSANLTIERVGPVDTIKNYTVQLKTPVYNIEKMQNADFSTLSNAFVSQYTQTPKDLPDRVTKLANKVTKDADSIYDKTKAIERYLSASGTFTYSTEDAKETPRGADYVDQFLFETQIGYCDNFSTSMVVMLRSLGIPARWAKGYTPGEGEKKENDAKTTYTITNNNAHSWPEVFFPGTGWVPFEPTATFSNPENFQEPTTETANKPETPNDSTSTPETPNTADKTPEQDNGSSSTGETPKKEEPKTETAASNFEIPSWVWWIPAGLVVALLALVIIFRRRIRSYLLLRSLRNSPEFGKTYHRLMKLLASYGYVRESSETLRHFGTRVDAELTTTEFSRLTKMYEAQIYSNNLTEKVITAEETQLVQQVIARLTK >NZ_CP028333.1|WP_003734632.1|2834311_2835067_+|DUF4866-family-protein MTTIFPKEQNVAPLFEQILANPTACRRFKDVFLDNLESYQETRGFEKDDTLFAKIILSAYRQSDVSALLLGVCGRTLFELLRQAFLIPKKLTVDNPFFLTDKEGNFIAKKDDISNREQEKFQEIYQSDLHHSETTIFLVDDDDIIHSYEPDFSISTKRINKKRGILVLYSLPDTLKLGMTESEVYAFIWKTFLHIQEIIPSSRIFYGQETSENADELGVFLPIHHFEKKMLQNIEQVNELVDALREQMVNK >NZ_CP028333.1|WP_003725184.1|2835087_2835753_+|DUF1275-domain-containing-protein MARSRQISESIGLGLLLALAGGFMDAYSYIERGQVFANAQTGNILLFGINISEGNWAIAIQYFWPVVSFTVGIAISEVIHRRDIRRLHWRQLSVLIEAVILIGVAFIPLDHNLIANSLISFVCGIQVESFRKMHGRGVATTMCIGNLRSATQNLCDYFEYKEKQYLRNSLLYFTVILSFIIGAVVGNFFIQLFAQYAILVCAFLQFIAFMMMFIDRESKII |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
215650 : 301466
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP028333|215650:301466|DBSCAN-SWA CCTACCGATAAATGAACGGAAAATTAAAAGCAATCGTTACATCCGTTACACCTTTGATTTCAAAATCGTTCCAGCCTTTTTCAAGGGTGATAATCCCATGATTGGTATCTTTTCCAACACGGCGGTTATTAACAAGTGGATAAATATTGTTCAACAGTAAAACATCTGTTTTTTGTAGCTCTTTCCGATACTCGAAGGATTCTCCCGTTGTAAGATTATGAATCGTTGGTGTCCCATTCGCCGTCATAGCAATATCTAATTCATGTCGCATCAGTGGATTAACACGGTCGCTCCCCGCATTATAGACCCGAAATGTATTTTCTTTAAAAATATAAAATAAATCATCACGGTTCGATAAATTCATTCCCATTTGCCATAAATCCACTTCAAAAGTCATAGGGTCAAGGCTCGTGCCACGTGACTCCGCATAGCCTTTAAATACATCAAATTCTATAGTGAGTAAACCAACACGATCCGATTCTCGACTAAAATCAACTGGTTTAGGATGCACCTCATACCGAATTCCTGGCATTTGATCGCTCCAAATATAATAACTATCGCGCTGGAATAAAAATTCATAAATTTCTCTGACTGCCAAATGATAATCTGGAATATCAAGTGCTTGCAAATTACATTTTGCTGAAAAGATAAACGGTTTAAATTGGGTCATTCCCGGGATAACCCCATCAGTCCCAGCGATTTCAGCAGTTTCCATGCTTAACTGGGGACTTTGTCTGGAAACTTCTTGTACAGAAAGACCTGGAAATGTCTCACTAAGCGAATGCACTTTTCCATTTAATTCTAAAAACAAGTCGCTCATGAATAAGCTGCACCTCCCATTGTGTAATTGTACTGATCAAATGAGTTAGCTTGGTTACGGCTAACTACCTCGGCTACCACTTTGTCATCCATTTTGATTACAGGATTTTTTTGTAGTAAGCGCTCGAGAAGATTTTCAACTCTAGCCAAATCAGCACCTTGACTCGTGTAAAGCATTGATTTATTTCCGCGCGCACTTTCCCTTGCGTATTTCATCGTTGCATCGTGCGGAATTACTTGCGAACCCGACGGTAAAACCACCATTTCGCCTCGGCCGCCTTCATTCATTCGAGCAAAGCCACCTTGGAAATTTGTTGTACCGGAAATTAATTGTGGTATTTTGCCGATTTCAACGCCTGGAATCTTATTAATTAAACCAATGGCTCCATTAATCCCTCGAATTACGACGTTTACAAAACCTTTGACATTATCTACCACGGTTTGAATTGCACTTGAAACACCATCGAAAATATTTCCTACAAAATCAGTTAAACCACCCCAAGCACTTTTGATTCCGTCAAAAACACCTGTAATAATGCGCTTCACTCCGTTAAACACTGATGAAACCGTAGTAGAAATACCTGTGATGACTGCTTTGATTCCTTCAATAATTCCGGAAATCGTCGTCATAATGGCATTCCAGATTTTGGATGCAACAGTAAATACCATTTGGAAAGCTGCACCAATAATCGTCACGATAGTCGTAAAGATATTAGTAATAAAGCCAATAATTGGTTGCACAATCCCGATAACCGCCGTAATAACACTCGCAATAAAGCTAATAATTTTCCCAATAACACTAGCAATCGTCGTCGCAATAATAACGACGTAACTAATAATCGTTGTGATAATCGAAACAATAACGCCAATAATCGTCATAACAATCGGCATAATTTTACTTATATAAGAAATAATCGTTACAACAATTTGTACAACCACCGTCGCAATTTGCATGATTATCGGAATTAAAAATTGAATAACGCTCATAATGCCTTGAATCACTGTCATGATGCTCGGTAATAGTGCCGAAACAAGTGACATAACAACTTGAACAATCTGCATAATAACAGGCATAAGCATGGAAATCAGCATATTAATAAACGGCATTAATTGGGCTAACAATTGCGCAAAAAAGCTAATAAATTGCATAACCATCGGCATTAACGCGGCACCAATTTGCATAACCGCAGTAACAATTTGCATGATAATCGGCATTAAACTGGCGACAAGTTGACCGAACAGTTGCGCAACCTGTGTTACAACTGACATCACCGTATTTCGGAATGATTCATTCGTCGTCATCAAATACGCAAATGCAGCTACTAACGCTACAATCCCGATAATTACTAACCCCATTGGAGAGGTCAGTTTACCCATAATTCCACCAACGCCACCAATAGATGACATCAAACCGCCTAGATGCTTCTTCAATTCCATAAATCCACTAGCTAGATTTGTAATTCCTTGAACGCCGCCAGATACTCCACCAAGCATTGTACTCATGCCACCAATCCCGGTTGCCAAGCTTGAAAATAACGTACCATTTTGCACACTTGAACCTAGATTTTTAAACGCATCCGTGATTCCACCAACAGAACCAACCGCAGTACCGAATCCGGATGTAATCGCCTCACTACTAGAACCCAGTTGTCCAAACGCCGAACTAATCGTGCCAAGCCCAGACTGCAGCCCACCTAAAGATTCGGAAATTTTCGAACCTGGATCAGCATTTCCAACATCTTCAATAGTCATTTTGAGCTCTGAAAACCGCCGCTCTACAACCATCGCCATCTCATCTAGCCTGCCAACTTGCGCTGTTAAAACGCTCTCGTTCAGTTCAAATGTAAAACTTTTAGAATCCGCCATTCACTTTCCCCCTTTCTTCTTTATTCTTAGGTCTTCGTAACCCATTTGCACCATAAATCCGATCAATCCACGCTTTACCTTCCTTCGCTTCATTATCGGAAATTGCTTGAAGTGCATTTACTGTATAATTAACATCGGCTTTCTTCTGACGTTTTTTATGCAAGTCGATAAAACGTGAATTTCGTTTTCGATTGAGATTTTGTTCCGCATTTAAAACTGCATTTCGAAGCATAGTAGATTCAAAAATCACCTTGTTTTCCCATTCTTTCATGATGAAATTTTTCTCCACTTCAGTAAGTTCTTCAAAATCATGCTTGGACATCTGAAAATTAACTACAAAAAAAGCGAATTGTTTTTCCAAATCAAAATCATGGTTCATTTCACTATCCACTTCTTCGTCCTCAGCACCAAAATACTCAAATTCAATCTGTTTTAACGGAACAAAAAACCCATATCCTCTTGCAATTTCTCAATAACAGCTACATTAAGCGAAATTAAGCCTTGTTCTTCTACTAATTTGTCGAAAATCTCCAAAGCTTCTTTTTGTTTTACAGGTACTAAGCCTTTTTCTTCCACAAGTCCTGAAACAAATAGCGTTTCAATCACTTGGTAGCTCAAAATCCCTTTATTCGCAGTCAAAGCTGCAACTAAACTAATCCCTGATGTTAATTCCACCGTTTTAACTTTTTGTTTATTAAATCGTAAAATATAAGTTGTATCATTCACTTCAAACATTTATTTTCCTCCTAAGGGAAAGCCACTTATTTCAGTGGCTCTCTATTTTATTCTGCTGGTGCTACAGGTGTTTCGCCGGGCATTTGATCTCCGCCCTCAGTAATCGTTAAATCAACAAGCGCACCCATTCCGTCTAGTTTTACAGAGTAAGTCATCGCTTCATCAAAAGGTGCTTCAAAACTATAGTCAGCTACAATTGCCAAACCACCGAAAAGACCTTTTTTAGATGCTTGATTAATGATTTTCACGCAAACCGGGCTATCACTTTCGAAATATTTCGCCAATTCTTTGTGAGACTCTGCATCAGCGACATATAATCCGTCATTTTCAATTGACCATTCTTTCATACCGCCAATTTTGGATTTCCATCCGCCAACTGTATCTTTAGATGTAATTTCAATGCTATCTTTAGAACGGTTTACAGTTAGACCTTGTTGCCCCGCAACCGCTAATAGCTTATCCCCCGCTGCGTTAAAAACTGCTAAAATTACATCTTTCCCCGCGACCGCTTTAGCAGCTCCCGGTGTATAATCACAATATAAATTCTCTTCAAATGCCATTAATATTTCCCCCTAAATTTTTACTTTTAATTCACGACAAATACTTACTTCAAAACTGGTTTTTGCGTGAATTAACGTATTTTCTTTGACTAAATTTTGTTTTCCGTAATGTCGAACAGCGATTAATTTGTATCCTTCAGGCAAAGTGAACCCTGTTTGGATAAGCGTATCTATCATTTCGACTCCCGCTAAGTCCGTTTCATTTGTATAATGATGGATTGCAAAACGGTATTTTTCTTTCCAGGCAGTTTGGCTTTCTTCTTCCTCTTGATCAATCATCTCGATCATCGTTGTAGGCATTTCCACTTGGTCACGCATTACAATAGAAACATCTAGTCCGCCTTTTTCCTGGAGCATTGTTCTCACTGCTTCCAAAACTCTCATGAAGCTTAAACTCTTCACCAAGCGTTCACTCCTTTAAAAACAGAAAGTAAAATTCGGTCGAGACCACATTTGATAATTTATTCCTCCGAACATTACTTTCCAAAATAGAATATTTGTTTATGTCAACGGATGAAAAATCCAATCATAAAAACAAATTTCTTGTACAACCTCTTGTATTATCAGAAAATCGGTGCACCTTCATTCTGATGCAGCTTTTATTGTCATCCGCTTACTGGACAATTAGCTTACTTCTATATTAATCGTAAAATGACGTTTCAAAATATCACGAAAGTATCATCATTTCCTTACTAAAATTCCCATTAGCGTTGCGATTTCTAATACTGCTCGTTTTTTTATCCGTTTAAACTGGGCAATTTCGTACGGTAAATCCATCATTACCGCCACATCTTGTTTTCGTTCCACGTAACATTCCATCAAAATAGTGCGATATAAATCATCCATCTGATTTAACATTTCAGTATATTTCTCTACCAACCATCGCGCTTCCAAAATGACCTCTTTATTATATCTAGCAGAAAATGCTACCGGCTCAAACTGCGGCTCTTCCAGAAAACCATTTCTAAGTAAGTGTGGCTTTTTTGATAACCCCGTAATCATCCGAAACCGCTCAAGATC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105 | Listeria_phage(86.76%) | holin,plate,capsid,integrase,tail,terminase,transposase | attL 263089:263133|attR 300348:300392 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
773940 : 781785
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP028333|773940:781785|DBSCAN-SWA AATGGCTAGTGAAGAAAAAATTTATGATGTGATTATTATTGGAGCGGGACCAGCTGGAATGACAGCTGCTTTATATACTTCCCGTGCAGATTTAGATACGTTAATGATTGAACGCGGAGTACCCGGCGGACAAATGGTTAACACAGCTGAGGTTGAAAATTACCCTGGATTTGATAGTATTTTAGGACCAGATTTATCCGATAAGATGCTTAGCGGTGCGAAACAATTTGGCGCTGAGTATGCTTATGGGGACATTAAAGAAGTCGTTGATGGCAAAGAATTTAAAACTGTAACGGCTGGATCGAAAACCTATAAAGCTCGGGCGATTATTATTGCGACTGGTGCTGAACACCGGAAACTTGGTGCAGCTGGCGAAGAAGAGCTTAGTGGACGCGGCGTTTCTTATTGTGCTGTTTGTGATGGAGCTTTCTTCAAAAATCGCGAATTAATCGTGGTTGGCGGCGGAGACTCTGCAGTGGAAGAAGGAACTTATTTGACTCGTTATGCAGATAAAGTAACGATAGTACACCGTCGTGATAAATTGCGCGCACAACAAATTTTACAAGATCGTGCTTTCAAAGATGAAAAAGTTGATTTCATTTGGAATAGTACAGTAGAAGAAATTGTTGGCGATGGCAAAAAAGTAACTGGAGCAAAACTTGTTTCCACAGTGGATGGTTCCGAATCTATTATGCCAGTGGATGGTGTTTTCATCTATGTTGGACTTGTTCCACTTACGAAAGCATTCTTAAATTTAGGTATTACAGATGATGAAGGATACATCGTAACGGACGAGGAAATGCGTACAAACCTTCCTGGTATTTTTGCAGCTGGTGATGTTCGTGCGAAAAGCTTACGCCAAATTGTAACAGCAACAGGCGATGGCGGACTTGCTGGACAAAACGCTCAAAAATATGTAGAAGAATTAAAAGAGTCGCTAGAAGCAGAGGCAGCTAAATAACAGTAAAGAAAACTCGAATGGGTCTGAGATTATTTATCTTAGACCCATTTTTGCGTGACTATATAGACTTGAGTAGTGTAAAATGGAAGACAAAGACTATTGTTAGGAGAGAGATAATAATGAGTATTGTTGTACTTGGTGGCGCTGGCTATATCGGTTCACATGCAGTAGATGAGTTAATTACTCGCGGATATGAAGTAGTAGTTATTGATAATTTAAGAACAGGGCACAAGGAATCCATTCATACAAAGGCAAAATTTTATGAAGGAGATATTCGAGATAAGGCATTTTTAAGTTCAGTTTTTGAAAAAGAAAAGGTAGATGGTGTGATTCACTTTGCTGCTAGTTCACTTGTAGGAGAATCGATGGAAGTACCGCTTGTTTATTTAAATAATAATGTTTATGGTACGCAAATTGTCTTAGAAGTGATGGAGCAATTTGGTGTGAAGCATATTGTCTTTTCTTCTAGCGCTGCAACATATGGTGAGCCAGAACGAGTACCGATTACGGAAGATATGCCAACAAATCCGGAAAGTACTTACGGCGAAACGAAGCTAATCATGGAAAAAATGATGAAATGGTGCGATAAAGCGTATGATATGAAATATGTTGCACTCCGGTATTTTAATGTTGCTGGCGCCAAAGCGGATGGTTCAATTGGGGAAGATCACAAACCAGAATCACACTTAGTCCCAATTATTTTACAAGTTGCGCTTGGTCAACGAGAAAAATTAGCGATTTACGGTGACGACTACAATACGCCTGATGGTACTTGTATTCGTGATTATGTACAAGTAGAAGATTTAATTGACGCGCATATTAAAGCGCTAGAATACTTGAAAAATGGCGGGGAAAGTAATATTTTCAACCTTGGTAGCAGTAACGGTTTTTCAGTGAAAGAAATGCTTGAAGCAGCTCGTACTGTAACAGGTAAAGAAATTCCAGCTGAAGTTGTACCACGCCGTGCAGGAGATCCAGGAACGTTAATTGCTTCAAGTGATAAAGCGCGTGAAATTCTTGGTTGGGAGCCAACTTATACAGACGTAAAAGATATTATCGCCACTGCTTGGAAATGGCACGTATCTCATCCAAATGGCTATTAATAACTTATGAAGGAATGTGATTTTTATCGAAGTAATGAAGGAGCGATTTGGGGAGTTTGAGGGAGAAACTGTTTGGAAGTGGACGATGGTAAATGATCATGGTATGCGCATGAGTGTTTTAAATTACGGAGCGATTGTTACTTCCCTTGAAACAAAAGATAAATTTGGTGATTTTGCGAATATTAGTCTTGGTTTTACAAATTTAGATGATTATTTGGCACACTCCCCATACTTCGGCGCGACACTTGGCCCTGTTGCTGGACGCATTACAAATGGGCAATTTAGTTTGGACGGTAAACAATTTCAACTGATTCAAAATGAAGGAGCTAACCATCGTCACGGTGGGAAATTCAATTTTAGTAAGAAGCTTTGGGATGTTTCAGTAGAAAAAAGTCTTGATCAAATTGTGATGACTTTTGAATACTGCTGGGCGGATGGAGAAAATGGCTATCCAGGAAATATTGATGCAAAAATGACATATACGTTAAATAATAAAAATGAATGGCTGCTTGATTATGAAGCGAAAAGCGATCAGCCGACTATATATAACCCGAGCAATCATATTTATTTTAATCTAAGCGGAGAAGCTGGTTCAACGGTTTTACAACATCAGCTTTGGGTTAATAGTGACAGCTTCCTACCAATTGATGAAGAGTTTCTCCCAATTGGGGAAAAGCGGTTAGCGGAAAATACTATCTTTGATTTGCGTGCAGGTCGTGAAGTAGCGGAGATTACACAAAGTCAGGACCAGCAAGTAAAATTAGTTGGTGCGGGGCTGGATCATGCATTCATTTTAAAACATGAAAATAGTCGTCCAGATGCAGTTTTGTTTGATCCAAAGTCAGGACGGCGCTTGGAAATGGAAACCAAAGCTGACTCGGTATTAATTTATACGGCGAATAGTTTGGATGGCTCTTTTGAGATTGGCGAGCGAACTGTGCCAAAATATGCTGGCATAACAATGGAAACACAGGGTTTAGTAGATGCGATTAACCATGACGGATTTGGTGATATTGTACTTCGACCAGAAAAACCTTTTACATCTAGAACAGCTTTTCGTTTCACAGTGGAGAGCTGATAAATTTTAATTAAAGAGTTCTAAATGAAGGAGTGTAGAGAATGAATTGGCAAGAAGAATATCAAAAATGGGTTGCTAATGACAAATTAGATAGCACATTAAGAAAACAATTAACGAATATGGAAGCAAATGAAAAAGAACTTGAGGATAGTTTTTATCGTAATATGGAATTTGGAACGGCTGGGATGCGTGGTGTACTAGGCGCTGGAACAAACCGCATGAATATCTATACTATTCGTAAGGCTTCTCTAGGTTTGGCGCAATTTGTGGCGGAGAACGGGGAAGAGGCTAAAAAACGTGGGATAGTTATTGCGTATGATCCTCGTCATATGTCGCGTGAATTTGCTTTTGAATCGGCGGCGGTATTAGGGCATCATGGTGTGAAAAGCTATGTTTTTGATGCGCTTCGACCAACACCGGAACTTTCCTTTGCAGTACGTCATTTAAATGCGTTTGGTGGGATTGTTATTACAGCTAGCCATAACCCACCAGAATACAATGGCTACAAGATTTATGGTGAAGATGGCGGACAAATGCCTCCAACAGGGGCAAGTGCTGTAATTGAATACATAAACGCGGTAGAGGATATTTTTTCTGTAGAAGTAGCGAACCAAGAGCTATTAATTGAAAATGGTTTACTTGAGGTAATCAGTGAAAAAGTAGACCGTCCATATTTGGAAAAATTAAAAGAGGTTATTGTCAATAAAGAGCTTGTTCAAGAACGAGGGGAGGATTTGAAAATTGTTTTCACGCCCCTTCATGGTACTGGCGGAATTCTTGGCGTTCCTGCGCTTGAAAGTGTTGGCTTTACGAATATTGTTAAGGTTGACGAGCAATTTGTGAATGATCCCGATTTTGGAACGGTAAAATCGCCTAACCCGGAAAACCGCGAAGCCTTTTTACTTGCGATTGAATATGGTAAGAAGTTTGGTGGCGACATTTTAGTCGGAACAGATCCGGATGCTGACCGTTTAGGCGTGGCAGTTCGTAATCTTGACGGCGAATATGAAGTGTTATCTGGAAACCAAATTGGCGCGATTATTTTACATTATTTATTAAAACAAAAGAAAGCGCAAAATGAATTGCCAGCTAATGCAGCGGTATTAAAATCTATTGTAACAAGTAATCTTGGAACAGAAATCGCGAAACATTACGGTGCGGAAATGATTGAAGTATTAACTGGTTTCAAATTTATTGCAGAACAAATTAAGCACTTTGAAGAAACTGGCAAGCATACGTTTGAATTTGGTTATGAAGAAAGTAATGGTTATATGGTTAAGCCGTTTACGCGTGATAAAGATGCGATTCAAGCGGTGCTTGCGATTGCGGAAGTGGCGCTCGTTAGCAAAGTAGAAGGTGGAAGTTTACTAGAAGATTTAGAGCAAATTTATGCTGAGTTTGGCTATTACAAAGAAGATCTAGTTTCCTTAACTTTAAGCGGTAAGGATGGTTCTCGGCGCATCAAAGAAATTACAAGTAATTTTCGCGAGCAACTACCAACAAGTATGGGTGGATTCCCCGTGGAACGTGCGGAAGATTATTTAAGAAGCGAAACAACTTGGATTGCTACCGGAAAAACGGAAGCGATTCATTTGCCAACAGCAGATGTCATTAAATGTTATTTTGAAGATGGTTCATGGTTCTGTTTACGTCCATCCGGCACAGAACCGAAAATCAAATTCTACTTTAGTATTCGTGGTGAAAGTAAAGAAGAAAGTGCAACAAAATTAGAAAAAGTGAAAGCTGATTTGATGCAACATATCGAAGCTTAAAAAGAAAAATCCCGGAAACTCGCTTTAGAGACTTTTCCGGGATTTTCTAGTGAGAAGTGTGCTAAAATGGAAGATAGATATTATTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP028333|773940:781785|776019_777081_+|WP_003741152.1|DBSCAN-SWA MIFIEVMKERFGEFEGETVWKWTMVNDHGMRMSVLNYGAIVTSLETKDKFGDFANISLGFTNLDDYLAHSPYFGATLGPVAGRITNGQFSLDGKQFQLIQNEGANHRHGGKFNFSKKLWDVSVEKSLDQIVMTFEYCWADGENGYPGNIDAKMTYTLNNKNEWLLDYEAKSDQPTIYNPSNHIYFNLSGEAGSTVLQHQLWVNSDSFLPIDEEFLPIGEKRLAENTIFDLRAGREVAEITQSQDQQVKLVGAGLDHAFILKHENSRPDAVLFDPKSGRRLEMETKADSVLIYTANSLDGSFEIGERTVPKYAGITMETQGLVDAINHDGFGDIVLRPEKPFTSRTAFRFTVES >NZ_CP028333|773940:781785|773940_774900_+|WP_003722610.1|DBSCAN-SWA MASEEKIYDVIIIGAGPAGMTAALYTSRADLDTLMIERGVPGGQMVNTAEVENYPGFDSILGPDLSDKMLSGAKQFGAEYAYGDIKEVVDGKEFKTVTAGSKTYKARAIIIATGAEHRKLGAAGEEELSGRGVSYCAVCDGAFFKNRELIVVGGGDSAVEEGTYLTRYADKVTIVHRRDKLRAQQILQDRAFKDEKVDFIWNSTVEEIVGDGKKVTGAKLVSTVDGSESIMPVDGVFIYVGLVPLTKAFLNLGITDDEGYIVTDEEMRTNLPGIFAAGDVRAKSLRQIVTATGDGGLAGQNAQKYVEELKESLEAEAAK >NZ_CP028333|773940:781785|780813_781785_+|WP_003725407.1|DBSCAN-SWA MSFASETKKELTHMDVSDSDAKVELAAFIRMNGAISFSNQLVIMDVQTENAAIARRMYQLLKDLYEVPIELLVRRKMKLKKNNVYIVRLKSGTRGILEDLRILEPPMTFTKSIDRGFVKKRSAKRAYLRGAFLASGSVNNPETSSYHLEIFSVYEEHNEAICALMNQFDLNARTLERKNGFITYLKEAEKITEFLSIIGATSALLHFEDVRIMRDMRNSVNRLVNCETANLNKTINAAVRQIDNIKYIQSTVGLEALPERLREIAALRIANEDVTLKELGEMLTTGQVSKSGINHRLRKLDQIAERLRSGETPAQVGLKISNS >NZ_CP028333|773940:781785|777122_778853_+|WP_003734494.1|DBSCAN-SWA MNWQEEYQKWVANDKLDSTLRKQLTNMEANEKELEDSFYRNMEFGTAGMRGVLGAGTNRMNIYTIRKASLGLAQFVAENGEEAKKRGIVIAYDPRHMSREFAFESAAVLGHHGVKSYVFDALRPTPELSFAVRHLNAFGGIVITASHNPPEYNGYKIYGEDGGQMPPTGASAVIEYINAVEDIFSVEVANQELLIENGLLEVISEKVDRPYLEKLKEVIVNKELVQERGEDLKIVFTPLHGTGGILGVPALESVGFTNIVKVDEQFVNDPDFGTVKSPNPENREAFLLAIEYGKKFGGDILVGTDPDADRLGVAVRNLDGEYEVLSGNQIGAIILHYLLKQKKAQNELPANAAVLKSIVTSNLGTEIAKHYGAEMIEVLTGFKFIAEQIKHFEETGKHTFEFGYEESNGYMVKPFTRDKDAIQAVLAIAEVALVSKVEGGSLLEDLEQIYAEFGYYKEDLVSLTLSGKDGSRRIKEITSNFREQLPTSMGGFPVERAEDYLRSETTWIATGKTEAIHLPTADVIKCYFEDGSWFCLRPSGTEPKIKFYFSIRGESKEESATKLEKVKADLMQHIEA >NZ_CP028333|773940:781785|775019_776003_+|WP_003725411.1|DBSCAN-SWA MSIVVLGGAGYIGSHAVDELITRGYEVVVIDNLRTGHKESIHTKAKFYEGDIRDKAFLSSVFEKEKVDGVIHFAASSLVGESMEVPLVYLNNNVYGTQIVLEVMEQFGVKHIVFSSSAATYGEPERVPITEDMPTNPESTYGETKLIMEKMMKWCDKAYDMKYVALRYFNVAGAKADGSIGEDHKPESHLVPIILQVALGQREKLAIYGDDYNTPDGTCIRDYVQVEDLIDAHIKALEYLKNGGESNIFNLGSSNGFSVKEMLEAARTVTGKEIPAEVVPRRAGDPGTLIASSDKAREILGWEPTYTDVKDIIATAWKWHVSHPNGY >NZ_CP028333|773940:781785|778960_779836_+|WP_003722606.1|DBSCAN-SWA MASKQLKLVIITGMSGAGKTVAMQSLEDLGYFCVDNLPPSLLPKFWELMKESDKMDKIALVMDLRGREFFDSIEPALDELDNTNFITTKILFLEADDKVLVSRYKETRRHHPLEPNGSVLDGINAERELLSDLKGRSQLVINTSNMAPRELRERINNEFQTEDKDIFNVQLMSFGFKYGIPIDADLVFDVRFLPNPHYIDKMRPLTGLDEDVYEYVMKWPETQTFLDKLVDLLMFTLPFYKREGKTQLVIAIGCTGGQHRSVALTEFVGKAIQQKYETTISHRDMKRRKGR >NZ_CP028333|773940:781785|779837_780806_+|WP_003734495.1|DBSCAN-SWA MKKEMKPKVVVIGGGTGLPVILKGLKKKDIHLTAIVTVADDGGSSGKIREQMDVLPPGDIRNVMLALSNVDPRVVDLFQYRFAVDGDLSGHVIGNLILTALSQLNDSYVDAINVLATVLKIRGKVIPATDQPLILNAEMEDGSIVHGESLIPLQGKHINRVYIEPENVKPYPTAVEAVKEADLIVIGPGSLYTSILPNLLLTELADEIIASKAPKVYITNILTQIGETDFFSDADHIKVIHEHVGKSFIDKTLINTTTVPKELLFPEDVAQVEHNAKGMEELGVEAIYQDFLSTEDGLVRHAAEKVADALLAMLPNQTIEKE |
7 | Streptococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1506991 : 1515277
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP028333|1506991:1515277|DBSCAN-SWA GATGTTAGAACGTTATACTCGTAAAGAAATGGGCAACATTTGGACAGAACAAAATCGTTATCAGGCTTGGCTAGAAGTGGAGATTTTGGCTTGTGAAGCATGGGCAGAGCTTGGTGATATTCCGAAAGAAGATGTTGCGAAGATCCGTGCTAATGCAAAGTTTGATGTGGATCGGATTCATGAGATTGAACTAGAAACGAGACATGATGTTGTGGCATTTACTCGTTCAGTTTCTGAGTCGCTTGGTGCGGAACGTAAATGGGTTCATTATGGCTTAACTTCAACAGACGTAGTGGATACAGCGAATTCTTATTTACTTAAACAAGCGAATGAGATTTTGCGTAAGGATTTGGAAAATTTCATTGCGATTATTGGCGAAAAAGCAAAAGAACATAAATATACCGTAACAATGGGACGTACACATGGTGTTCACGCGGAACCTACTACTTTTGGCTTGAAGCTTGCTCTATGGTACGAGGAAATGAAACGTAACCTAGAACGTTTTAATTTTGCAGCTGATGGTGTGGAATTCGGGAAAATCTCTGGTGCGGTCGGGACGTATGCGAATATTGATCCTTTTGTGGAGGCTTACGTATGTGAAAAATTAGGAACAACTCCTGCGCCGATTTCTACACAAACGTTGCAACGCGATCGCCATGCAGAATATTTGGCAACACTTGCATTAATTGCAACTTCTGTAGAAAAATTTGCGGTAGAAGTACGTGCACTGCAAAAAAGTGAAGTGCGTGAAGTGGAAGAATTCTTTGCAAAAGGACAAAAAGGTTCATCTGCAATGCCGCATAAACGTAATCCAATTGGTTCTGAAAATGTAACTGGATTAGCGCGCGTTATTCGCGGTCATATGGTTACTGCTTATGAAAATGTGCCACTTTGGCATGAACGTGATATTTCTCATAGCTCAGCGGAACGAATTATTCTGCCAGATTCCACTATTTTACTTGATTATATTTTGAATCGTTTTGGAAATATCGTGAAAAACTTGACGGTGTTCCCAGAAAATATGAAACGCAATATGGACAGAACACTGGGACTTATTTATTCACAGCGTGTATTACTGGCACTTATTGATAAAGGTTTAGCTCGTGAGGCGGCGTATGATGTCGTACAACCAAGAGCAATGGAAGCTTGGGAAAAACAAGTACCTTTCCGTGAATTAGTAGAACAAGATGCAACCATTATTGAAAACCTATCTGCGGAAGAAATTGCAGATTGCTTTGATTACAACTATCACCTGAAGAATGTCGACTTAATTTTTGATCGTTTAGGATTATAATTACGGGCAGAATACAACCTAACCTCTTTGATATTTATTTTTTCAAAGAGGTTAAGTAATTTATAAGGAGATAAATTATCGTGACTAATGAACTGGTTTATGAAGGAAAGGCAAAACGACTTTTTAAAACAGAAGAAGCAGGTGTCTTGCGTGTTGCCTATAAGGATGATGCGACAGCGCTAAACGGGGTGCGAAAGGAATCTTTTGCTGGGAAGGGTGAGCTTAATAACCAAATTACATCGCTTATTTTTTCTCATTTAGCAAGAGCGGGAATAGAGAGTCACTTTATTCGGGCGATTTCGGAAACGGAGCAATTGGTGAAAGAAGTATCAATTATTCCACTTGAAGTGGTTGTTCGCAATGTAATGGCTGGGAGTCTTGCGAAACGGCTTGGAAAAGAAGAAGGCGAGCTAATTCCAAATGCGATAGTAGAATTTTACTATAAAGATGATGCGTTAGATGACCCGTTTATTAATGATGACCATGTGCTTTATTTAGAGCTTGCGACAACGAGTGAGATGGATATAATTCGCCAGGCTGCTCGTTCGATTAATAAGGTGTTACAAGAATTATTCAATCAAATGAATATTACGCTAATTGATTTTAAATTAGAATTTGGTCGGGATGCGACTGGGAATATTTTACTAGCAGATGAGATTTCGCCTGATACATGTAGACTTTGGGACAAGGAAACAAATCAAAAGCTCGATAAGGATGTCTTTCGTCGGAATATTGGCAATTTAACAGATGTGTATACAGAAGTATTGAATAGATTAAAGCAAGTTCAAAACTAGGAGGCCACAAAATGTATAATGTCAAAGTTTATGTCACTTTAAAGAAAAGCGTATTAGATCCACAAGGTGTTGCAGTAAAAGATGCAGCGAAAAGCATGGGTTACGAGGAAGTAGAAGATGTTCGTATTGGTAAATTTATGGAACTTAAAGTTGCAAAATCAGATCGAGATATTCATGAAGTATTGAATGAAATGTGCGACAAACTGCTAACAAATCCGGTGATGGAAGATTACCGATATGAAATAGAGGAGGCTTAAACGATGAAATTTGCTGTCATTCAGTTCCCAGGTTCTAATTGTGATCTTGATATGCTACATGCGATTCGCGATTCTCTTGGCGAGGAGGCGGAATATGTATGGCATGCGGAAACAAGTCTTGCAGGTTTTGATGCGGTTTTACTTCCAGGTGGATTTTCTTACGGAGATTACTTGCGAACTGGTGCGATTGCAAAATTTTCAAGTATTATGCCAGAAGTTTTGCGCTTTGCTGAAATGGGAAAACCAGTGCTTGGTGTGTGTAACGGATTCCAAATTTTAACTGAAATTGGTTTACTGCCAGGTGCTTTAATTAGAAACAATAATTTGCATTTTATTTGTAAGACGGTGCCGCTTCGTGTGGCGAATGCAAGTACGATGGTTACCGGGCTTTATAAAGAAGGCGAAATTATCCAAGTTCCAGTTGCTCACGGGGAAGGTAATTATTACTGTGACGATGAAACACTTTTAAAATTAAAAGATAATAACCAAATTGTGTTTACATATGATAGCGTGAATCCGAATGGTAGCCGTGCGGATATTGCGGGGATCGTAAATGAGCGCGGTAATGTGCTTGGAATGATGCCACACCCAGAACGCGCGGTAGAAGAAATTATTGGCGGTACAGATGGTTTAAGACTTTTCGAGTCCGTTGTAAAAGCTTGGAAGGAGGAACAAGTAAATGCCTAACATGGAGCCAACGACAAAAGAAATTAAAGAACAAAAGATTTATCAAGAAATGGGCTTAACTGATAGTGAATATGAGCTTGTTTGTTCGATTCTTGGACGCGAGCCTAATTATACAGAAACTGGGCTTTTCTCTGTTATGTGGTCGGAACATTGTAGCTATAAAAATTCTAAACCAGTACTTCGGAAATTTCCTACAGAAGGCAAACAAGTATTACAAGGACCTGGTGAAGGCGCTGGGATTGTCGATATTGGCGATGGTTTAGGTGTTGCTTTTAAAGTGGAGAGTCATAATCATCCATCCTACGTGGAGCCGTATCAAGGGGCTGCGACTGGGGTCGGCGGGATTATCCGTGATGTGTTCTCGATGGGAGCTAGACCGATTGCAATGCTTAACTCGCTTCGTTTTGGTGAGTTAGATACACCCCATGCGAAATACTTAGTTAGTGAAGTCGTTGCGGGAATCGCAGGATACGGTAACTCCATTGGGATTCCAACGGTTGGTGGCGAAATCCAATTTGATCCTTGTTATACAAAAAATCCGCTAGTTAATGCAATGTGTGTAGGCTTAATTGAAGCGAAAGATATTCAAAAAGGGCAAGCTAAAGGAATTGGCAACCCGGTGATGTATGTTGGTGCTAAAACTGGTCGTGACGGGATTCATGGTGCTACTTTTGCTTCTGTAGAGTTTAGTGAAGAAGGTGAACAACAACGCTCTGCTGTACAGGTTGGCGATCCTTTTATGGAGAAATTGTTGCTTGAAGCTTGTTTAGATGTGATTCGTGATCATTCGGATATTTTAGTGGGAATTCAAGATATGGGAGCAGCTGGTCTCGTTAGTTCAAGTTCTGAAATGGCCTCAAAAGCGGGCGCTGGGCTAGAATTAATTATGGATGATGTGCCGCAACGAGAACTAAATATGACGCCTTATGAAATGTTGCTTTCTGAATCGCAAGAACGGATGCTTCTATGTGTGAAAAAAGGGCATGTGGAAGAAATCCAAGCGTTATTTGAACGTTATGGTTTAGAGGCTGTTGTGATTGGTCAAGTAACAGATGATAAAATGTACAAAATTATTCATCATGGTGAAGTAGTTGCGAACGTTCCTGTAGATGCGCTTGCAGAAGATGCGCCAGTTTATCATAAACCTTCCAAAGAGCCAGCTCGTTATCAAGCTTTCCAAGAAGAGGAATCGTTTGTGCCAGTTATGGAAGATGTGGTCGGTGTTTGGAAGGAACTGCTTGCTCAGCCAACGATTGCTAGTAAGCGCCATATTTATGAGCAATATGATTATCAAGTTCGGACGGATACAGCTGTTGTACCTGGTTCAGATGCGGCGATTGTTCGTGTGCGTGGGACCGAGAAGGCAATTGCCATGACAACTGATTGTAACTCACGCTATTTGTATCTTGATCCAGAAGTAGGCGGAGCGATAGCGGTTGCGGAAGCGGCGCGCAATATCGTTTGTTCTGGCGGGAAACCACTAGCGATTACAGATGGACTGAACTTTGGAAATCCTGAAAAACCAGAAATTTTTTGGGAAATTGAAAAAGCGGCTGATGGTATTAGTGCGGCTTGTTTAGAACTTGATACGCCTGTTATCTCTGGTAATGTATCGCTTTATAATGAAACAGATGGTACCGGAATTTATCCAACGCCAGTCATTGGAATGGTTGGTTTAGTAGAAGATTTGGCACATATTACGACACAAGATTTTAAAAATAGTGGCGATGTGATTTTCTTAATTGGTGAAACAAAAGCTGAATATAGTGGTTCGGAATTGCAAAAATTGCAACAAGGGAAAATTAGCGGACGTGCGCCGGAATTAGATTTAACGACAGAGAAAAAATACCAACAATTACTTCTAACGGCGATTCAGGAAGGTCTAGTTGCTTCTAGTCACGATTTGGCAGAAGGTGGATTTGGTGTTGCCCTTGCGGAAGCGACTTTTAAAGCAGGGCTTGGTGCGGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP028333|1506991:1515277|1506991_1508284_+|WP_003726215.1|DBSCAN-SWA MLERYTRKEMGNIWTEQNRYQAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVAKIRANAKFDVDRIHEIELETRHDVVAFTRSVSESLGAERKWVHYGLTSTDVVDTANSYLLKQANEILRKDLENFIAIIGEKAKEHKYTVTMGRTHGVHAEPTTFGLKLALWYEEMKRNLERFNFAADGVEFGKISGAVGTYANIDPFVEAYVCEKLGTTPAPISTQTLQRDRHAEYLATLALIATSVEKFAVEVRALQKSEVREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENVTGLARVIRGHMVTAYENVPLWHERDISHSSAERIILPDSTILLDYILNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMDRTLGLIYSQRVLLALIDKGLAREAAYDVVQPRAMEAWEKQVPFRELVEQDATIIENLSAEEIADCFDYNYHLKNVDLIFDRLGL >NZ_CP028333|1506991:1515277|1510014_1512234_+|WP_003731570.1|DBSCAN-SWA MPNMEPTTKEIKEQKIYQEMGLTDSEYELVCSILGREPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTEGKQVLQGPGEGAGIVDIGDGLGVAFKVESHNHPSYVEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPIAMLNSLRFGELDTPHAKYLVSEVVAGIAGYGNSIGIPTVGGEIQFDPCYTKNPLVNAMCVGLIEAKDIQKGQAKGIGNPVMYVGAKTGRDGIHGATFASVEFSEEGEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLDVIRDHSDILVGIQDMGAAGLVSSSSEMASKAGAGLELIMDDVPQRELNMTPYEMLLSESQERMLLCVKKGHVEEIQALFERYGLEAVVIGQVTDDKMYKIIHHGEVVANVPVDALAEDAPVYHKPSKEPARYQAFQEEESFVPVMEDVVGVWKELLAQPTIASKRHIYEQYDYQVRTDTAVVPGSDAAIVRVRGTEKAIAMTTDCNSRYLYLDPEVGGAIAVAEAARNIVCSGGKPLAITDGLNFGNPEKPEIFWEIEKAADGISAACLELDTPVISGNVSLYNETDGTGIYPTPVIGMVGLVEDLAHITTQDFKNSGDVIFLIGETKAEYSGSELQKLQQGKISGRAPELDLTTEKKYQQLLLTAIQEGLVASSHDLAEGGFGVALAEATFKAGLGADVEVPFELNQLFSESQSRFLVSVKPENEAAFAQLMELEKVYRLGVVTEDDTIRVKHKEDQVTAKTTELRSIWEGAIPCLLK >NZ_CP028333|1506991:1515277|1508364_1509078_+|WP_003734637.1|DBSCAN-SWA MTNELVYEGKAKRLFKTEEAGVLRVAYKDDATALNGVRKESFAGKGELNNQITSLIFSHLARAGIESHFIRAISETEQLVKEVSIIPLEVVVRNVMAGSLAKRLGKEEGELIPNAIVEFYYKDDALDDPFINDDHVLYLELATTSEMDIIRQAARSINKVLQELFNQMNITLIDFKLEFGRDATGNILLADEISPDTCRLWDKETNQKLDKDVFRRNIGNLTDVYTEVLNRLKQVQN >NZ_CP028333|1506991:1515277|1509089_1509335_+|WP_003722248.1|DBSCAN-SWA MYNVKVYVTLKKSVLDPQGVAVKDAAKSMGYEEVEDVRIGKFMELKVAKSDRDIHEVLNEMCDKLLTNPVMEDYRYEIEEA >NZ_CP028333|1506991:1515277|1513664_1514714_+|WP_003726210.1|DBSCAN-SWA MAENAYSKAGVDVEAGYQVVERIKKHVARTERLGAMGALGSFGGMFDLSSLHLKEPVLVSGTDGVGTKLLLAIEADKHDTIGIDCVAMCVNDILAQGAEPLFFLDYIATGKTDPVKMEQIVKGVADGCEQAGAALIGGETAEMPDMYGAEDYDLAGFTVGAVEKQKLITEGAVKEGDTLIGIPSSGIHSNGYSLVRKIFFKDNELTLDAEISELDVPLVEELLKPTRIYVKPVLEVLKEVDVHGITHVTGGGFVENLPRMLTNDLAVKVELGSWPVLPIFDVMKKYGQLSELEMYEIFNMGIGMVLAVAKADVERTLEVLVQNGEAAYVIGEVTTRENDAVIFTGGTKG >NZ_CP028333|1506991:1515277|1509338_1510022_+|WP_003734638.1|DBSCAN-SWA MKFAVIQFPGSNCDLDMLHAIRDSLGEEAEYVWHAETSLAGFDAVLLPGGFSYGDYLRTGAIAKFSSIMPEVLRFAEMGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALIRNNNLHFICKTVPLRVANASTMVTGLYKEGEIIQVPVAHGEGNYYCDDETLLKLKDNNQIVFTYDSVNPNGSRADIAGIVNERGNVLGMMPHPERAVEEIIGGTDGLRLFESVVKAWKEEQVNA >NZ_CP028333|1506991:1515277|1512218_1513646_+|WP_003722245.1|DBSCAN-SWA MLAEVKGLNEECGIFGIWDHPNAAEITYYGLHSLQHRGQEGAGIVSTDGETLKGHRNLGLLADVFKHGELDDLKGKAAIGHVRYATAGQKNLGNVQPFLFHFHSSSLALAHNGNLVNAKSLRRELEEEGAIFQTSSDTEVLAHLIKRSHTGDFVEDLKVALNKVKGGFAYMLLTEDTMYAALDPNGFRPLSIGRIGDSYVVASETCAFETVGAEFVRDVEPGELIIINDDGLRIEKFTENVTHSICSMEYIYFARPDSNIAGINVHSARKRSGKRLAKEAFIDADVVTGVPDSSISAAIGYAEEAGLPYELGLIKNRYVARTFIQPSQELREQGVRMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVQLLREAGAAEVHVRIASPPLAYPCFYGIDIQTRNELIASNYSVDEICRIIGADSLEYLSEEGLVDSIGRPYPNEPYGGLCMAYFNGDYPTPLYDYEAEYLASLEAEK >NZ_CP028333|1506991:1515277|1514710_1515277_+|WP_107131806.1|DBSCAN-SWA MNIAIFTSGNGSNFQALVDDAFIKPHVKLLVCDKPNAYVLERANTHQIPVFLFEAKNYPDKEAFETEILLELRGLEIDLLVLAGYMRLIGPTLLAEFPEQIVNLHPSLLPEFKGKDAIGQAIQANVSETGVTAHFVDAGMDTGPIIDQVKVPIEHAETVDTLAGKIHQVEHIFYPKVIRGLIQNGGND |
8 | Prochlorococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2009574 : 2068173
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP028333|2009574:2068173|DBSCAN-SWA 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57 | Streptococcus_phage(16.67%) | tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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