Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP029084 | Staphylococcus aureus strain AR464 chromosome, complete genome | 5 crisprs | WYL,cas3,DEDDh,DinG,csa3 | 3 | 0 | 10 | 0 |
| NZ_CP029083 | Staphylococcus aureus strain AR464 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
1. NZ_CP029084
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP029084_1 | 180547-180685 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029084_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP029084_1
>1.1|180598|37|NZ_CP029084|CRISPRCasFinder AGCTCACAAAACCCTTGATATCATTGGTTTCCCATGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029084_1
The CRISPR arrays of NZ_CP029084_1 >merge|NZ_CP029084|1|180547-180685|CRISPRCasFinder TTTTTAATATTTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCGAAAGCTCACAAAACCCTTGATATCATTGGTTTCCCATGATTTTTAATATTTTTCTTTTAAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCGAA >NZ_CP029084|1|1|180547-180685|CRISPRCasFinder TTTTTAATATTTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCGAA AGCTCACAAAACCCTTGATATCATTGGTTTCCCATGA TTTTTAATATTTTTCTTTTAAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCGAA
>NZ_CP029084.1|WP_000655242.1|179402_179585_-|hypothetical-protein MKDSIFWKKAFIPVYFIVAMLVFLLFRFYIKTDNFSIYLMIIFLICLGTASIIYNYKTNR >NZ_CP029084.1|WP_001622005.1|179220_179421_+|hypothetical-protein MSLSLVFSRWRFEIVVLWWNEFVVLWRYKNAVLWQFQNGVSIKKSQQDLELTVTYTFHTYIYRLVL >NZ_CP029084.1|WP_000130128.1|177267_178932_-|acetolactate-synthase-AlsS MTDKKYTAADIVIDTLKNNGVEYVFGIPGAKIDYLFNALIDDGPELIVTRHEQNAAMMAQGIGRLTGKPGIVLVTSGPGVSNLTTGLLTATSEGDPVLALGGQVKRNDLLRLTHQSIDNAALLKYSSKYSEEVQDPESLSEVMTNAIRIATSGKNGASFISIPQDVISSPVESKAISLCQKPNLGVPSEQDINDVIEAIKNASFPVLLAGMRSSSADETNAIRKLVERTNLPVVETFQGAGVISRELENHFFGRVGLFRNQVGDELLRKSDLVVTIGYDPIEYEASNWNKELETQIINIDEVQAEITNYMQPKKELIGNIAKTIEMISEKVDEPFINQQHLDELEQLRTHIDEETGIKATHEEGILHPVEIIESMQKVLTDDTTVTVDVGSHYIWMARNFRSYNPRHLLFSNGMQTLGVALPWAISAALVRPNTQVVSVAGDGGFLFSSQDLETAVRKNLNIIQLIWNDGKYNMVEFQEEMKYKRSSGVDFGPVDFVKYAESFGAKGLRVTNQEELEAAIKEGYETDGPVLIDIPVNYKDNIKLSTNMLPDVFN >NZ_CP029084.1|WP_000186132.1|176526_177231_-|acetolactate-decarboxylase MTNVLYQHGTLGTLMAGLLKGTASINELLQHGDLGIATLTGSNGEVIFLDGKAYHANEHKEFVELKGDELTPYATVTKFVADTSYETKDKSSEAVFAEIKEKMLSENLFSAVKISGLFKKMHIRMMPAQEPPYTRLIDSARRQPEQTETYVKGSVVGFFTPELFHGIGSAGFHVHFANDDRNFGGHVLDFEVEDVKVEIQNIETFEQHFPIHDEDFTNANIDYKDISDEIREAE >NZ_CP029084.1|WP_000769707.1|175725_176151_+|MAP-domain-containing-protein MKLKSFVTATLALGLLSTVGAALPSHEASADSNNGYKEMTMDGYHTVPYTISVDGITALHRTYFVFPENKKVLYQEIDSKVKNELASQRGVTTEKINNAQTATYTLTLNDGNKKVVNLKKNDDAKNLIDPSTIKQIQIVVK >NZ_CP029084.1|WP_000044372.1|174615_175431_-|HAD-IIB-family-hydrolase MSKRLLLFDFDETYFKHNTNEEDLSHLREMEKLLEKLTNNNEVMTAVLTGSTFQSVMDKMDQVNMTFKPLHIFSDLSSKMFTWNNGEYVESETYKKKVLSEPFLFEDIEDILRHISAQYNVEFIPQRAFEGNETHYNFYFHSIGNHNKDRRILESLVRYANDQNYTARFSRSNPLAGDPENAYDIDFTPSNAGKLYATQFLMKKYNIPVKSILGFGDSGNDEAYLSYLEHAYLMSNSRDEALKQKFRLTKYPYYQGITLHVKEFVEGKYDY >NZ_CP029084.1|WP_000214774.1|172873_174391_+|glycosyltransferase MTTYMLMYSIPEKAGGITSVMLNRSKLLAEKGYSCALLTLDDKNYDPLRAKLTNSGRLHKEVKIVNLYEELKMLYDVENTEIENKNMQTFEKLNLLNQEGFYIQKDEYEEKKYARYFKDNNYIMYKKWINGQLSHIDYFQNRKRIKRHVFQNKILRKEITFNDKNKMSEVKYLSNDGFCYLSYWYGDNENIVNIFYFDKNSKEVLNFKNNKMFHSYWLDKNLTSNDVLILDGIGTYPKVENMQNNDVKKIFTIHTNHFLSPYSYGAEIKPEFRNMLLNLKELDTLVVLTKEQKDDIIKQFGDYNNIKVIPNAVSFEENLTQNIREKNSIIVLQRFVAMKNITHIISAINIVRKKVKDVKLHIYGTGTQKENYTKLIKKLKLQDNVFIHDYAFDIRGLYTKASLSVLTSDYEGLPMSLLEAMSYGVPVISYPINYGPKSIIQNNINGIITKKKDNINELAKKIIHVLKKETLISQFSENARTTIKTNFSYEAVSKKWIELIDEKSK >NZ_CP029084.1|WP_000143638.1|172585_172864_+|hypothetical-protein MTFNEYNYNNELILKLNKIEVQKNNEKISEVFKDYEILKPKIVFNGSNPYLALNHIIVAEIENYSSLETFSKIYVDEDYYYNYGELIIKCKK >NZ_CP029084.1|WP_001044440.1|170856_171711_-|M23-family-metallopeptidase MNKTNFGDYLNKSKSRKIYKIFDQNLKREFSYWQFRKLFKSYTRQSDVHELKVCTQNDDTMEQIWIDKAKQFGVSVTWKDNSIIGFVMRPLINYDAIKNETTLKYAVPTTDCYEVFWGGDNELYNYHYLYPHQRYAIDLVIKENHKTYKKQGKVNTDYFCFGKDIIAPANGTVEKVVNGVQDNSIGSTNESQFLGNYIVIKHAENEYSLIAHLQQYSIIVNEGQNVKYGDIIGKVGNSGNSTEPHIHFQVMNDKNIEACTSLKIRFLNNRELIKGDVVCGLQGE >NZ_CP029084.1|WP_000222277.1|168237_170658_+|polysaccharide-lyase-8-family-protein MTYRMKKWQKLSTITLLMAGVITLSDGEFRSVDKHQIAVADTNTQTPNYEKLKNTWLDVNYGYDKYDESNPDMKKKFEATENEAKKLLSEMKTESGRTYLWESSKDIDTKSADMTRTYRNIEKIAEAMNHPKTTLKNDENKKKLKDALEWLHKNAYGKDPDKKVADLKTNFSKSAPQKNTNLNWWDYEIGTPKSLTNTLILLNGDISSDEKKKYTAPIKTFAPKSDEILSSVGKAEPAKGGNLVDIAKVKLLESIIEEDKDMTKNSIDSFNKVFTYVQSNSTGKERNGFYKDGSYIDHQDVPYTGAYGVVLLEGISQMMPMIKETPFKETSQNDTILKSWIDDGFMPLIYKGEMMDLSRGRAISRENETSHSASVTVMKSLLRLSDAMDESTKAKYKKIVKTSVKSDSSYKQNDYLSSYSDISKMKALMEDSTLSTNDLTQQLKIYNDMDRVTYHNKDLDFAFGLSMTSKNVARYESINNENLKGWHTGAGMSYLYNSDVKHYRDNFWATADMKRLAGTTTLDNEEPKENKNSDKTFVGGTKFDDQHASIGMEFENQDKTLTAKKSYFILNDKIVFLGTGIKNTDSSMNPVTTIENRKANGYTLYTDDKQTTNSDNQETNSVFLESTDTKKNIGYHFLNKSKINVKKESHTGKWSEINKSQKTEDKKDEYYEVTQKHSNSDNKYGYVLYPSLSKDVFKSKASQVTVVKQDDDFHVVKDNESVWAGVNYSDSAKTFEINGTKVEVKAKGMFILKKKDDKTYECSFYNPESTNTASDIESKISMTGYSITNKNASTTNESGVRFELTK >NZ_CP029084.1|WP_108720668.1|182461_182860_-|30S-ribosomal-protein-S9 MTLAQVEYRGTGRRKNSVARVRLVPGEGNITVNNRDVREYLPFESLILDLNQPFDVTENKGNYDVLVNVHGGGFTGQAQAIRHGIARALLEADPEYRGSLKRAGLLTRDPRMKERKKPGLKAARRSPQFSKR >NZ_CP029084.1|WP_001250038.1|182873_183311_-|50S-ribosomal-protein-L13 MRQTFMANESNIERKWYVIDAEGQTLGRLSSEVASILRGKNKVTYTPHVDTGDYVIVINASKIEFTGNKETDKVYYRHSNHPGGIKSITAGELRRTNPERLIENSIKGMLPSTRLGEKQGKKLFVYGGAEHPHAAQQPENYELRG >NZ_CP029084.1|WP_001221849.1|183550_184354_-|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA MRILVEIAYQGNNFLGFQIQQNGRTVQQQFEKLLQRMHKRHVRIHPSSRTDRGVHAIQQYFHFDTELNIPMSQWQYAMNRTLPDDIYVNNVVTVDDDFHCRYDCVGKRYRYKVYQAQHRDPFQSGLKTFIPETLDLDKMNKAAQQFIGTHDFTGFCSQKTEVESKVRTLYQSEIVKTDDGFDYIVTGSGFLYNMVRVLVAFLIEVGKGRHEISDVPKLLESKNRKNVPFTAPAEGLYLEKIYLDENELLKDFGNDIKIHRKKSLQND >NZ_CP029084.1|WP_000791632.1|184358_185165_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MKNKLIIGRYLPNDSYVHHLDPRAKLMFVFLFIILIFVCHSPLTYLWVFALILFFMRLAKIQLWFLIKGLTPIFFFLIFTLMMHIFLTKGGYVLVEWHGITIETNGILEGLYISLRLIGIVMIATIMTLSTSPIDLTDAFERLLAPLKMFKLPVHQLSMIMSIALRFIPTLMDELDKIILAQKSRGSEISSGNIATRIKSFIPLLVPLFISAFQRAEELAVAMEVRGYDANVQRTSYRQLKWQLRDTLSLIMIIPIAIILFVLKYSGV >NZ_CP029084.1|WP_000027572.1|185154_186015_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MSIRFNDVSYTYQQGTPYEHQAIHDINTEFEQGKYYAIVGQTGSGKSTLIQNINALIKPTSGTVTIDDVTVTHKTKDKYIRPVRKRIGMVFQFPESQLFEDTVEREMIFGPKNFKMDLDEAKNYAHRLLMDLGFSRDVMSQSPFQMSGGQMRKIAIVSVLAMNPDIIVVDEPTAGLDPQSKRQVMRLLKSLQTDENKTIILISHDMNEVARYADEVIVMKEGSIVSQTSPKELFKEKEKLAGWHIGLPDIVQLQYDFEQKHQTKLKDIALTEEAFVSLYKEWQHEK >NZ_CP029084.1|WP_000389669.1|186011_186821_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MEDKNSVIVFKNVSFQYQSDASFTLKDVSFNIPKGQWTSIVGHNGSGKSTIAKLMIGIENVKSGEIFYNNQTITDDNFEKLRKDIGIVFQNPDNQFVGSIVKYDVAFGLENHAVPHDEMHRRVSEALKQVDMLERADYEPNALSGGQKQRVAIASVLALNPSVIILDEATSMLDPDARQNLLDLVRIVKSEHNITIISITHDLSEAMEADHVIVMNKGTVYKEGTAIEIFDHAEELTTIGLDLPFPIKINQMLGHQTSFLTYEGLVNQL >NZ_CP029084.1|WP_000542274.1|187358_187727_-|50S-ribosomal-protein-L17 MGYRKLGRTSDQRKAMLRDLATSLIISERIETTEARAKEVRSVVEKLITLGKKGDLASRRNAAKTLRNVEILNEDETTQTALQKLFGEIAERYTERQGGYTRILKQGPRRGDGAESVIIELV >NZ_CP029084.1|WP_000569649.1|187743_188688_-|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-alpha MIEIEKPRIETIEISEDAKFGKFVVEPLERGYGTTLGNSLRRILLSSLPGAAVKYIEIEGVLHEFSAVDNVVEDVSTIIMNIKQLALKIYSEEDKTLEIDVRDEGEVTASDITHDSDVEILNPELKIATVSKGGHLKIRLVANKGRGYALAEQNNTSDLPIGVIPVDSLYSPVERVNYTVENTRVGQSSDFDKLTLDVWTNGSITPQESVSLAAKIMTEHLNIFVGLTDEAQNAEIMIEKEEDQKEKVLEMSIEELDLSVRSYNCLKRAGINSVQELADKSEADMMKVRNLGRKSLEEVKYKLEDLGLGLRKED >NZ_CP029084.1|WP_000101625.1|188762_189152_-|30S-ribosomal-protein-S11 MARKQVSRKRRVKKNIENGVAHIRSTFNNTIVTITDEFGNALSWSSAGALGFKGSKKSTPFAAQMASETASKSAMEHGLKTVEVTVKGPGPGRESAIRALQSAGLEVTAIRDVTPVPHNGCRPPKRRRV >NZ_CP029084.1|WP_000090796.1|189175_189541_-|30S-ribosomal-protein-S13 MARIAGVDIPREKRVVISLTYIYGIGTSTAQKILEEANVSADTRVKDLTDDELGRIREVVDGYKVEGDLRRETNLNIKRLMEISSYRGIRHRRGLPVRGQKTKNNARTRKGPVKTVANKKK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP029084_2 | 371702-371795 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029084_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP029084_2
>2.1|371728|42|NZ_CP029084|CRISPRCasFinder CTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCAACTGCGTTCCTCCGTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029084_2
The CRISPR arrays of NZ_CP029084_2 >merge|NZ_CP029084|2|371702-371795|CRISPRCasFinder TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGGCTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCAACTGCGTTCCTCCGTCTTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGG >NZ_CP029084|2|2|371702-371795|CRISPRCasFinder TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGG CTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCAACTGCGTTCCTCCGTC TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGG
>NZ_CP029084.1|WP_000019132.1|370694_371561_-|cation-transporter MSHNENLKLAQRGAYLSLIVYIILSIVKYVTGFVFNSAAVRADALNNMTDIIVSLAVIIGLKISIKPADRNHPYGHLKSENISSLLVSFVIMFVGIQVVIQNAPRLFKEDDVVPNEITIIVSLISGLVMLIVFAVNQRLAKRTKSSSLNSAAKDNLSDSLVSIGTAIGLIFTQIGFPIVDIILATLLGLLIVYTGFGIFKEAIFMLSDGFNETELEAYRNDILEVDEVQEVKSIKGRYHGSSVFIDVTIVVDANLSLVEAHQICDNVEHHLHKKGISSVYVHPEPDHL >NZ_CP029084.1|WP_001125208.1|369681_370368_-|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase MPKLILCRHGQSEWNAKNLFTGWEDVNLSEQGINEATRAGEKVRENNIAIDVAFTSLLTRALDTTHYILTESKQQWIPVYKSWRLNERHYGGLQGLNKDDARKEFGEEQVHIWRRSYDVKPPAETEEQREAYLADRRYNHLDKRMMPYSESLKDTLVRVIPFWTDHISQYLLDGQTVLVSAHGNSIRALIKYLEDVSDEDIINYEIKTGAPLVYELTDDLEVIDKYYL >NZ_CP029084.1|WP_000762708.1|369423_369528_+|putative-metal-homeostasis-protein MKLDLQTARRNLNSPNIKTRKRALKIIKQHKRAK >NZ_CP029084.1|WP_000038955.1|367810_369250_-|multidrug-efflux-MFS-transporter-MdeA MSKKQKLTMIITMLMGGFFGLLNETLLVTALPSIMKDFEISYTQVQWLTTAFLLTNGIVIPLSALVIQRYTTRQVFLVGISIFFLGTLLGGLSPHFATLLVARIIQALGAGIMMPLMMTTILDVFQPHERGKYMGIFGLVIGLAPAIGPTLSGYLVEYFNWRSLFHVVAPIAAVTFLIGFKTIKNVGTTIKVPIDFISVIFSVLGFGGLLYGTSSISEKGFDNPIVLVSMIGGIVLVALFVLRQYRLSTPLLNFAVFKNKQFTVGIIIMGVTMVSMIGSETILPIFVQNLLHRSALDSGLTLLPGAIVMAFMSMTSGALYEKFGPRKLALVGMAIVVITTAYFVVMDEQTSTIMLATVYAIRMVGIALGLIPVMTHTMNQLKPEMNAHGSSMTNTVQQIAGSIGTAALITILSHASKNFSPTMSDYNGMNKIEMMNQIKIDTMLHGYHAGFLFALLITVISFFCSFMLQGKKKEVDSHQ >NZ_CP029084.1|WP_000825936.1|366910_367690_-|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MKRLLFVVIAFVFILAACGNNSSKDKEASKDSKTINVGTEGTYAPFSFHDKDGKLTGYDIDVIKAVAKAEGLKLKFNETSWDSMFAGLDAGRFDVIANQVGINPDREKKYKFSKPYTFSSAVLVIRENEKDIKDFDDVKGKKLAQTFTSNYGKLAKDKGADITKVDGFNQSMDLLLSKRVDGTFNDSLSYLDYKKQKPNAKIKAIKGNAEQSKSAFAFSKKVDDETVQKFNDGLKKIEENGELAKIGKKWFGQDVSKSK >NZ_CP029084.1|WP_000479573.1|366210_366930_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MFLNLNSEQLHALDAAKQAFGPMLEGLVKYSIPITLVTFVLGLIIALFTALMRISTSKVLRSIARVYVSIIRGTPMIVQLFIIFYGIPELGRLLTNDADNQWTLAPVVAAIIGLSLNVGAYASEIIRGGIISIPKGQTEAAYSIGMTYRQTIQRIILPQAIRVSIPALGNTFLSLIKDTSLLGFILVAEMFRKAQEVASTTYEYLTIYVLVALMYWVVCFIISIIQGIYESYIERGYRS >NZ_CP029084.1|WP_000615468.1|365482_366214_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIQLNNIHKSFNDVEVIKGIDLSVGKGEVVTLIGRSGSGKTTLLRMINALEIPTEGTVYVNGKTYTSKDKKSQIEVRKQSGMVFQSYNLFPHKTALENVMEGLITVKKLKKDEARGKSLELLEKVGLTHVKDQRPHALSGGQQQRVAIARALAMNPKVMLFDEPTSALDPELVNDVLKVIKDLANEGMTMVIVTHEMRFAKEVSNNIVFIHEGMIGEQGAPEEIFNNPKTEELKRFLNVINEE >NZ_CP029084.1|WP_001012230.1|364135_365386_+|FemA/FemB-family-glycyltransferase-FmhA MNFVTLTSDEFNAFTTKHFSHYTQSAIHYNHRVDLKGDVHLVGVKDDNGQVIAGCLLTEARTLKFFKYFYTHRGPVMDYTNQSLVAFFFKALTSYLKKQNCLYVLIDPYLIENLRNAEGEIVKSYDNRAFVRTMDTLGYKHQGFPVGYDSMSQIRWLSVLDLKDKTEDQLLKEMDYQTRRNIKKTYDIGVKTKTLTIDETQTFFDLFHMAEEKHGFKFRELPYFEEMQKLYDDHAMLKLAYIDLNEYLKTLQLKQQQLTAELSGVEEALEESPNSKKNKTKRTQLEQQLNSNKRKIDNTIEQIEQDGAVLNLASALFIYNEHEVYYLSSGSNPKYNAYMGAYHLQWEMIKFAKAHHIDRYNFYGITGDFSESAEDYGVQQFKKGFNAHVEEYIGDFIKPIKPMLYKLQTYLKHKRR >NZ_CP029084.1|WP_000819842.1|363518_363881_-|DUF4467-domain-containing-protein MKRFVATVLLLLVFISGCGNDKYVKEIDEAVKIQNQKQEQLAKKGNGDRVDHFERKDANIYVYDKDKIIILAYKPLSNDDEVHYYAYDFSDERVSYKQDFDSRRYYQQHDADYHEENMTN >NZ_CP029084.1|WP_000162809.1|362900_363500_-|DsbA-family-protein MTKKLLTLFIVSMLILTACGKKESATTSSKNGKPLVVIYGDYKCPYCKELDEKVMPKLRKNYIDNHKVEYQFVNLAFLGKDSIVGSRASHAVLMYAPKSFLDFQKQLFAAQQDENKEWLTKELLDKHIKQLHLDKETENKIIKDYKTKDSKSWKAAEKDKKIAEDHHIKTTPTAFINGEKVEDPYDYESYEKLLKDKIK >NZ_CP029084.1|WP_001791249.1|371989_372094_-|hypothetical-protein MLTNRLTSVNYVKKRLIQNIQRILSKKVLYGEMQ >NZ_CP029084.1|WP_000792549.1|372188_373502_+|hypothetical-protein MKNKYISKLLVGAATITLATMISNGEAKASENTQQSSTKHQTTQNNYVTDQQKAFYQVLHLKGITEEQRNQYIKTLREHPERAQEVFSESLKDSKNPDRRVAQQNAFYNVLKNDNLTEQEKNNYIAQIKENPDRSQQVWVESVQSSKAKERQNIENADKAIKDFQDNKAPHDKSAAYEANSKLPKDLRDKNNRFVEKVSIEKAIVRHDERVKSANDAISKLNEKDSIENRRLAQREVNKAPMDVKEHLQKQLDALVAQKDAEKKVAPKVEAPQIQSPQIEKPKAESPKVEVPQIQSPKVEVPQSKLLGYYQSLKDSFNYGYKYLTDTYKSYKEKYDTAKYYYNKYYQYKGLIDKTVLTTIGSGYGSYIKPLEVSKESGNLAKSYAQVRNYVTESINTGKVLYAFYQKPELVKTAIKAQETATTFKNALTGIFKSFWK >NZ_CP029084.1|WP_000594516.1|374037_374967_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB-subunit-A MIKNKILTATLAVGLIAPLANPFIEISKAENKIEDIGQGAEIIKRTQDITSKRLAITQNIQFDFVKDKKYNKDALVVKMQGFISSRTTYSDLKKYPYIKRMIWPFQYNISLKTKDSNVDLINYLPKNKIDSADVSQKLGYNIGGNFQSAPSIGGSGSFNYSKTISYNQKNYVTEVESQNSKGVKWGVKANSFVTPNGQVSAYDQYLFAQDPTGPAARDYFVPDNQLPPLIQSGFNPSFITTLSHEKGKGDKSEFEITYGRNMDATYAYVTRHRLAVDRKHDAFKNRNVTVKYEVNWKTHEVKIKSITPK >NZ_CP029084.1|WP_000916696.1|375534_376482_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgCB-subunit-C MLKNKILATTLSVSLLAPLANPLLEKAKAANDTEDIGKGNDVEIIKRTEDKTSNKWGVTQNIQFDFVKDKKYNKDALILKMQGFISSRTTYYNYKNTNHIKSMRWPFQYNIGLKTNDPNVSLINYLPKNKIESTNVSQTLGYNIGGNFQSAPSLGGNGSFNYSKSISYTQQNYVSEVEQQNSKSVLWGVKANSFVTASGQKSAFDSDLFVGYKPHSKDPRDYFVPDSELPPLVQSGFNPSFIATVSHEKGSGDTSEFEITYGRNMDVTHAIKRSTHYGNSYLDGHRIHNAFKNRNYTVKYEVNWKTHEIKVKGQN >NZ_CP029084.1|WP_001056918.1|376483_377461_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB/HlgCB-subunit-B MNMNKLVKSSVATSMALLLLSNTANAEGKITPVSVKKVDDKVTLYKTTATADSDKFKISQILTFNFIKDKSYDKDTLVLKAAGNINSGYERPNPKDYDFSKIYWGAKYNVSISSQSNDSVNVVDYAPKNQNEEFQVQNTLGYTFGGDISISNGLSGGLNGNTAFSETINYKQESYRTTLSRNTNYKNVGWGVEAHKIMNNGWGPYGRDSFHPTYGNELFLAGRQSSAYAGQNFIAQHQMPLLSRSNFNPEFLSVLSHRQDGAKKSKITVTYQREMDLYQIRWNGFYWAGANYKNYKTRTFKSTYEIDWENHKVKLLDTKETEINK >NZ_CP029084.1|WP_000200952.1|377519_377987_-|QueT-transporter-family-protein MTSKDITQISVIAAILTILAVLKIPSIIPGLDFQLSAPAALLILAFFGIKKYFLGGLLSSVLLLIFGVFNPINVIISIIFRVIAIAVVYLLKINVLSLVLASVLGSLVSRLILSVILNLPVWVVLLNAIPGVIFTLIVAIPLYLTLRKRMAVLLR >NZ_CP029084.1|WP_000286884.1|377997_378690_-|6-carboxyhexanoate--CoA-ligase MYSIKMRSSNQDVHISGAETICEFDKIEQTVQRFYNKGFFHENGQPDFLNIKIQKIMEPIQQIKALQIIEDDKANLQNLTQECGVTEQALNQGMTYIKNETVYTGAIILSAISGKRLDSFGQRGIRATHFSFEDINNKGDLNERVTDALAIASCINAHPYVKGELCVSDDLTYTTGYFASAKIGYHRLFDIKPVNTRYGGRIIFVDDRIDLNHYISFLESTPKQVVYETV >NZ_CP029084.1|WP_000971558.1|378700_379816_-|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase-family-protein MMFQEQIDLLQQKGLYRSLKTVGYIDRQYIEVENQRCTNYTSNDYLGLGQIAFDKNDFEKFMRKYSYHLSSSRLISGSSAAYEEIETMLAGWLGYSACTILNSGYDANLTLFNIFKNTNCVVFSDQENHASIIDGIKLSGLEKVIYKHLDIADLEKRLAECPNQNIQKIIISDSVFSTNGDVVDIGQLVSLKHKYNATLILDVSHSFGIENYSNYQGVDILTSSLSKACGAYGGVILSSNDVKDMLINHGRPLIYSSSLPIYNLYFIKRNIEKLINADDRRTKLNSLSKYFNQKLKSLNVNYNSSNSPIKFIEFDDIEAAENIHQILLKHHVFTSYLRYPTVTKPMLRISLSYFHTEQDIDRLFEILHQED >NZ_CP029084.1|WP_001046647.1|379793_380801_-|biotin-synthase-BioB MNLAKRILQGEQLTKETVLKIYEDTNIDTLDLLNEAYILRKHYFGKKVKLNMILNAKSGICPENCGYCGQSRDIKQKQRYALIPEEQIIDGAKVAHDNHIGTYCIVMSGRGPSDKEVDHISNTVRTIKSQHPQLKICACLGLTNDEQAKKLKSAGVDRYNHNINTSENYHDNVVTTHSYKDRTDTIELMKANNISPCSGVICGMGESNQDIVDMAFALKEMDADSIPINFLHPIKGTKFGSMDDLTPMKCLRIVALFRLINPTKEIRIAGGREVNLRSLQPLALKAANSIFVGDYLITGGQPNQLDYDMINDLGFEIDYGTCENKENKNDVSRAN >NZ_CP029084.1|WP_001110067.1|380802_382161_-|adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate-transaminase MNYTQQLKQKDSEYVWHPFTQMGVYSKEEAIIIEKGKGSYLYDTNGNKYLDGYASLWVNVHGHNNKYLNKVIKKQLNKIAHSTLLGSSNIPSIELAEKLIEITPSNLRKVFYSDTGSASVEIAIKMAYQYWKNIDREKYAKKNKFITLNHGYHGDTIGAVSVGGIKTFHKIFKDLIFENIQVESPSFYRSNYDTENEMMTAILTNIEQILIERNDEIAGFILEPLIQGATGLFVHPKGFLKEVEKLCKKYDVLLICDEVAVGFGRTGKMFACNHEDVQPDIMCLGKAITGGYLPLAATLTSQKIYNAFLSDSHGVNTFFHGHTYTGNQIVCTVALENIRLYEKCKLLSHIETTSSTLEKQLHALKRHRNVGDVRGRGLMFGVELVTDKDSKTPLEIEKVERIVRNCKENGLMIRNLENVITFVPLLSMSNKEVKTMVRIFKKAVHNILDRKC |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP029084_3 | 1408509-1408610 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029084_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP029084_3
>3.1|1408542|36|NZ_CP029084|CRISPRCasFinder ACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029084_3
The CRISPR arrays of NZ_CP029084_3 >merge|NZ_CP029084|3|1408509-1408610|CRISPRCasFinder CATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAACCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGG >NZ_CP029084|3|3|1408509-1408610|CRISPRCasFinder CATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGG ACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTG CATAAGAACCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGG
>NZ_CP029084.1|WP_000687415.1|1407468_1408335_+|LysR-family-transcriptional-regulator MKIEDYRLLITLDETKTLRKAAEILYISQPAVTQRLKAIENAFGVDIFIRTKKQLITTTEGTMIIEHARDMLKRERLFFDKMQAHIGEVNGTISIGCSSLIGQTLLPEVLSLYNAQFPNVEIQVQVGSTEQIKANHRDYHVMITRGNKVMNLANTHLFNDDHYFIFPKNRRDDVTKLPFIEFQADPIYINQIKQWYNDNLEQDYHATITVDQVATCKEMLISGVGVTILPEIMMKNISREQFEFEKVEIDNEPLIRSTFMSYDPSMLQLPQVDSFVNLMASFVERPKA >NZ_CP029084.1|WP_000865625.1|1406708_1407353_+|DUF402-domain-containing-protein MKVKYIDKRHWRRLIDREYTEVKVNNNRFKGIIGLVTMKKVRDPLEVTVVGQNIIVADDNYKWLQILPEKKRYSITVMFDNKGNPLEYYFDINIKNITQKGNARTVDLCLDVLALPSGEYELVDEDDLMFALESEQITKKQFHEAYMIAHQIMAELENDFKGFQKKIMYCFNKINAKAQKNRQKPQNKTNFEKSKQIKPKQYNQTKNHQQQKKN >NZ_CP029084.1|WP_001806154.1|1406447_1406564_+|hypothetical-protein MLQLFLMKLTLNGFENDKTIIFIFLKNHFYEEMCVLSN >NZ_CP029084.1|WP_000844823.1|1405882_1406356_+|cupin MKTAKQWINELQLESHPEGGFYRETIREVLKDGHRAPFSSIYFLLTDDNISHFHRIDADEVWYYHAGDSLTIHMINPDGAYTTATLGTDIQNGDVLQYVVPKGTIFASSIENLNSYSLVGCMCQPAFEFKQFELFKQSELFVQYPHLKSVIEKYALK >NZ_CP029084.1|WP_000532969.1|1405166_1405883_+|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MGRKWNNIKEKKAQKDKNTSRIYAKFGKEIYVAAKSGEPNPESNQALRLVLERAKTYSVPNHIIEKAIDKAKGAGDENFDHLRYEGFGPSGSMLIVDALTNNVNRTASDVRAAFGKNGGNMGVSGSVAYMFDHVATFGIEGKTVDDILETLMEQDVDVNDVIDDNGLTIVYAEPDQFAVVQDALRAAGVEEFKVAEFEMLPQTDIELSEEDQVTFEKLIDALEDLEDVQNVFHNVDLK >NZ_CP029084.1|WP_001805574.1|1404617_1404977_+|HTH-type-transcriptional-regulator-SarX MNTEKLETLLGFYKQYKALSEYIDKKYKLSLNDLAVLDLTMKYCKDEKVLMQSFLKTAMDELDLSRTKLLVSIRRLIEKERLSKVRSSKDERKIYIYLNDDDISKFNALFEDVEQFLNI >NZ_CP029084.1|WP_001129741.1|1402321_1404472_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MAKSCLHILTNNEYATTRCQDGIVLFWPIDGEIELQKFRKSKIIEDDIYIINHLDVFSIKNNKKTIMLYLSSDWFAELGFTFFNYHYTAKLIKSSYNLKCLLLKLTYRYLDNQPINDADIRKLQDIIKIIAKEASMDKKIAQNQYRYAYYGDLRDELEYIYQNVNQRLTLKSVADKLFVSKSNLSSQFHLLMGMGFKKYIDTLKIGKSIEILLTTDSTISNISEHLGFSSSSTYSKMFKSYMDITPNEYRNLSKFNKCIMLNPEPLVGGMAQEVKEVILNYIDHYKNHLTDVIHIDEDKFEIPKLFQTVIQINTYTEMKLVFLEGIFKTLLNKNSQVVFFIMPSILKSKNTMSEEEKFTIIKTIIESDLKIAFNINDIETTYYVEEAFMNVIRQLSPNEINHHNNYEVHFVFDLSLMEIRTIYRMILKLHNIMLNVKLGLNITCLFDKPSVFKSLVSQIKRLKFDSLIIDNANLSSPYLMGESDELLLKNILHFKNLKQVINELDIEQEKLIFLNVENHKLLNNKERDLSNSAPLIYKTLSALYHNFDGFGLNIFDNHQTFNAMHLYDKNGFKTTLGLILEKFIEYVSKPKYENSYYSIFDIENYYCLVIYDWRVIESETIMSNFEDSQVYINFKNNVLNDKYLIVIETLDENSGNINHLISKELRDKYEWNPSLLSKIDNYLKPAIEIKEHNFSNNSLNINVTFNALYIIKIGKK >NZ_CP029084.1|WP_000081596.1|1400980_1401625_+|hypothetical-protein MSQNTNHSYFQQNQHAQSISKVWLYFMYYWIIFGIGCYLGQFLPLSWRQPLSFGLLIIILATLVFERARRFGLIISHIYAVVIGLLSYATFTTYLQNLGPDIFYKNIALAIFAFIAFGIIGYFFVGDASSIGKYLFVTLITLIIASLIGIFLQNPIFYTIITVVSLLLFLLYTLYDFNRLKRGDYSPREMGFNLFINLLNIIKDILYLANMFRR >NZ_CP029084.1|WP_000731644.1|1399822_1400620_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MKKLAFAITATSGAAAFLTHHDAQASTQHTVQSGESLWSIAQKYNTSVESIKQNNQLDNNLVFPGQVISVGGSDAQNTSNTSPQAGSASSHTVQAGESLNIIASRYGVSVDQLMAANNLRGYLIMPNQTLQIPNGGSGGTTPTATTGSNGNASSFNHQNLYTAGQCTWYVFDRRAQAGSPISTYWSDAKYWAGNAANDGYQVNNTPSVGSIMQSTPGPYGHVAYVERVNGDGSILISEMNYTYGPYNMNYRTIPASEVSSYAFIH >NZ_CP029084.1|WP_000120368.1|1398229_1399237_+|inorganic-phosphate-transporter MSYIIIVTIAVVIFSLIFDFINGFHDTANAVATAVSTRALTPKTAILMAAVMNFIGALTFTGVAGTITKDIVDPFKLENGLVVVLAAILAAIIWNLATWFYGIPSSSSHALIGSIAGAAIASEGSFGVLHYQGFTKIIIVLIVSPIIAFCVGFLMYSIFKVIFKNANLTRANRNFRFFQIFTAALQSFSHGTNDAQKSMGIITLALIVANVQNDGSVEPQLWVKFACATAMGLGTAIGGWKIIKTVGGNIMKIRPANGAAADLSSALTIFVASSLHFPLSTTHVVSSSILGVGASNRAKGVKWSTAQRMIITWVITLPISALLAGLLFYILNLFF >NZ_CP029084.1|WP_000367064.1|1408627_1409848_+|MFS-transporter MDMFAALLQIKNYKLFVANMFLLGMGIAVTVPYLVLFATKDLGMTTNQYGLLLASAAISQFTVNSIIARFSDTHHFNRKIIIILALLMGALGFSIYFFVDTIWLFILLYAIFQGLFAPAMPQLYASARESINVSSSKDRAQFANTVLRSMFSLGFLFGPFIGAQLIGLKGYAGLFGGTISIILFTLVLQVFFYKDLNIKHPISTQQHVEKIAPNMFKDKTLLLPFIAFILLHIGQWMYTMNMPLFVTDYLKENEQHVGYLASLCAGLEVPFMIILGVLSSRLQTRTLLIYGAIFGGLFYFSIGVFKNFYMMLAGQVFLAIFLAVLLGIGISYFQDILPDFPGYASTLFSNAMVIGQLGGNLLGGAMSHWVGLENVFFVSAASIMLGMILIFFTKNQKITKEDVIST >NZ_CP029084.1|WP_000152582.1|1409844_1410333_+|DUF456-domain-containing-protein MTIILWLLIIAAFMLAFVGLIKPIIPSVLVLWVGFLIYQFGFHNQHLSWVFYVSMALLTILILCADFLANKYFVNRFGGSKFGEYAALIGVVIGCFVLPPFGIIIIPFILVFIVELIQGYSFERAVKVSIGSIVAFLTSSIAQAIIMFIMIVWFFIDALLIN >NZ_CP029084.1|WP_000842865.1|1410431_1411121_-|DUF1129-family-protein MKSTAQLTKENNVKSLRLSNTDREIFENYMTYMRSDFRVNPHDTELIINRILKQLLSAEQHGLLALDFFNHDPKAHAIKELKAMPNETFKNIFKYIYQHIVLLIGIVSFLKGFLGFFMEKSGSNLYFVSFPFSVVVGFFIVFLFIWFSFKTIQLQCFNNSNWIWIFTYLAIILLIVGFFYVFFIPQSLLAFGPYIQVSNWVFIIFSFIVMPIGLRIERNISKKHSHTFL >NZ_CP029084.1|WP_001259685.1|1411248_1411692_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MRTLNKDEHNYIKQIASIHETLLSQSESNYKCTKLSIALRYEMICSRLEHTNDKIYIYENEGQLIAFIWGHFSNEKSMVNIELLYVEPQFRKLGIATQLKIALEKWAKTMNAKQISSTIHKSNLPMISLNKDLGYQVSHVKMYKDID >NZ_CP029084.1|WP_042744226.1|1411758_1412148_+|hypothetical-protein MKKLIISIMAVMLFLTGCGKSQEKATLEKDIDNLQKENKELKDKKEKLQQEKEKLADKQKDLEKEVKDLKPSKEDNKDDKKDNKKDENKDKEASQDKQPKDQTKSSNKDNHKKPTSTDKDQKANDKHQP >NZ_CP029084.1|WP_000545116.1|1412285_1412585_+|hypothetical-protein MHEQDFRILEGQDITLPELGRELENITGRTIADSTGEIKRVIAHLPNFESDTDTFVATYRLNHQQDFIDATFTALKSDRARLKEVPVHVELISYISKSK >NZ_CP029084.1|WP_000638623.1|1412664_1413207_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIYCETERLILRDWHEDDLLPFQKMNATYDVRKYFPSLLSYRRSELDMRTMDAVIKDYGIGLFAVEDKESHQWIGFIGLNYIPETSEYPFKELPLYEIGWRLLPEFWGKGLATEGANATLKLAEQHQIYDVYSFTAEANKASQRVMEKIGMTVYDHFELPNLSKYHLLKRQVRYYINLRK >NZ_CP029084.1|WP_000820900.1|1413301_1413868_-|TIGR00730-family-Rossman-fold-protein MKRIAVYCGASKGHDPSYVQKAYNLGKYFAEQGYELVFGAGSIGIMGAIQDGVLDHGGKAIGVMPKMLDEHEITSQRLTELILVDSMHERKNKMAELADAFVMAPGGAGSLEEFFEMYSWAQIGIHEKPIAIYNINGFFNPLQTMIDHMIEEGFIDPKYRALAPLCDTKESLIESILNFKPLGTRSYD >NZ_CP029084.1|WP_000148819.1|1413869_1414328_-|YaiI/YqxD-family-protein MTHIIIDGDACPVVDSIIDLTTETGIFVTIIRSFSHFSNQLYPPHVSTLYVDDGPDAVDYKIVQLSTKDDIVITQDYGLASLLVDKVLIVMHHNGKIYNSKNIQQLLDKRYINAQIRKQGGRHKGPPPFTKQDQKVFEQSLLRVIHRIKELD >NZ_CP029084.1|WP_000358502.1|1414330_1415014_-|hypothetical-protein MDKKKVIKFMINVLPIVLVPLIVERKRIKQHPDVQKVTDATSKVASKTSAAISNTASDVKEYVGDKKQDFENKRELKKFAREHDPAYIEKKGEKLAKQNRKDADKMNKILQKNIEKRHKEEQKAREKNEIQRIKDMKKTQKYEEKAGLTPNKLDEKTEKKGDKLAEKNRKEIAKMNKKLQKNIEKRHKEEQKRQQEADKARIKSFKKYKDYVAKSASQQNKENNTEA |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP029084_4 | 1507307-1507390 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029084_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP029084_4
>4.1|1507332|34|NZ_CP029084|CRISPRCasFinder TTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCACATTATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029084_4
The CRISPR arrays of NZ_CP029084_4 >merge|NZ_CP029084|4|1507307-1507390|CRISPRCasFinder GTAAGCTGACTTTACGTTAGCTTCTTTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCACATTATCGTAAGCTGACTTTACGTCAGCTTCT >NZ_CP029084|4|4|1507307-1507390|CRISPRCasFinder GTAAGCTGACTTTACGTTAGCTTCT TTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCACATTATC GTAAGCTGACTTTACGTCAGCTTCT
>NZ_CP029084.1|WP_000134963.1|1505875_1506811_+|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >NZ_CP029084.1|WP_000057562.1|1504369_1505809_+|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMANQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >NZ_CP029084.1|WP_001224792.1|1503876_1504362_+|acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWHVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNISIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >NZ_CP029084.1|WP_000513297.1|1503029_1503869_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNFGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPGEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSFGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIIYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >NZ_CP029084.1|WP_000958224.1|1502091_1503024_+|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >NZ_CP029084.1|WP_000662699.1|1498886_1501715_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MKEPSIVVKGARAHNLKNIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHHIEIESQTVQQMVDRIMELETRTKIQLLAPVISHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNEVPELDKNKNHTIEVVVDRLVVKEGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGQRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNINLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIEVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGVDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDK >NZ_CP029084.1|WP_000229257.1|1496893_1498879_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVEGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKMKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDRGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >NZ_CP029084.1|WP_000638419.1|1496388_1496625_+|CsbA-family-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >NZ_CP029084.1|WP_000538142.1|1495741_1496392_+|HD-domain-containing-protein MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENG >NZ_CP029084.1|WP_042744219.1|1494728_1495568_+|CHAP-domain-containing-protein MKKSLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQQGTQVKTPVQHNYVSNVQAQKQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKTVKSPVRKASQAKRVVQQPVQQASKKVVVKQAPKQAVAKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEFGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH >NZ_CP029084.1|WP_000369722.1|1507638_1508550_+|RNase-adapter-RapZ MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >NZ_CP029084.1|WP_001248939.1|1508546_1509542_+|YvcK-family-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >NZ_CP029084.1|WP_000006551.1|1509652_1510597_+|DNA-binding-protein-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >NZ_CP029084.1|WP_001049165.1|1511159_1511747_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >NZ_CP029084.1|WP_000675904.1|1511928_1513563_+|NAD-dependent-malic-enzyme MKGIELLNNPFLNKGTAFTNEERKQLGLEGLLPANVRTLEQQAEQCYEQFKAKQTDFEKRLFLMAIFNRNRTLFYKLTSEHLVEFMPIIYDPVIAQSIEQYNENFSRPQDAVFLSVDRQDQIEQELRNVANDRDIRLIVVTDAEGILGIGDWGVDGVDIAIGKLIVYTGAAGINPSQVLPVSLDVGTNNEQLLNDDLYLGNRHKRVDDETYYAFVDKFVSAVRKEYPNALLHWEDFGRGHAKNILDKYEDTLPTFNDDIQGTGIVTLAGVLGALNISKVDYTNQTFLVYGGGTAGMGITNILKDELIKQGVSEEKANQHFYIMDKQGLLFDDMDDLTEAQQVFAKNRNEFSNTVNWKNLNEVIENIKPTVLIGTSTQTGAFTEDAVKEMFKHTERPVIFPLSNPTKLSEATAQDLLKWTNGKALIGTGIPYNDIEYNGVNYSIGQANNALMYPGLGLGLIASNAKKVNQQILSAASHALGGMVNPDEPGAAVLPPVEKIHQCSRAIAKAVAQSVIDQGLNAETIDDIDKAIEAEIWYPKYKSYI >NZ_CP029084.1|WP_000816297.1|1514009_1514912_-|TIGR01777-family-protein MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGIILSNEGGALQTMKLPYEYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINKESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLISK >NZ_CP029084.1|WP_000070822.1|1515614_1516244_+|DUF4887-domain-containing-protein MSNQNYDYKTNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQKQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQTNQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDKASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQASQQNSQSTTNKQNNANDK >NZ_CP029084.1|WP_000654030.1|1516852_1517866_+|sugar-binding-transcriptional-regulator MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE >NZ_CP029084.1|WP_000279414.1|1517918_1518929_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK >NZ_CP029084.1|WP_108720678.1|1519067_1520258_+|phosphoglycerate-kinase MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKEVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPELGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKKFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP029084_5 | 1513780-1513859 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029084_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP029084_5
>5.1|1513804|32|NZ_CP029084|CRISPRCasFinder AACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029084_5
The CRISPR arrays of NZ_CP029084_5 >merge|NZ_CP029084|5|1513780-1513859|CRISPRCasFinder CAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCC >NZ_CP029084|5|5|1513780-1513859|CRISPRCasFinder CAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCC AACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGC CAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCC
>NZ_CP029084.1|WP_000675904.1|1511928_1513563_+|NAD-dependent-malic-enzyme MKGIELLNNPFLNKGTAFTNEERKQLGLEGLLPANVRTLEQQAEQCYEQFKAKQTDFEKRLFLMAIFNRNRTLFYKLTSEHLVEFMPIIYDPVIAQSIEQYNENFSRPQDAVFLSVDRQDQIEQELRNVANDRDIRLIVVTDAEGILGIGDWGVDGVDIAIGKLIVYTGAAGINPSQVLPVSLDVGTNNEQLLNDDLYLGNRHKRVDDETYYAFVDKFVSAVRKEYPNALLHWEDFGRGHAKNILDKYEDTLPTFNDDIQGTGIVTLAGVLGALNISKVDYTNQTFLVYGGGTAGMGITNILKDELIKQGVSEEKANQHFYIMDKQGLLFDDMDDLTEAQQVFAKNRNEFSNTVNWKNLNEVIENIKPTVLIGTSTQTGAFTEDAVKEMFKHTERPVIFPLSNPTKLSEATAQDLLKWTNGKALIGTGIPYNDIEYNGVNYSIGQANNALMYPGLGLGLIASNAKKVNQQILSAASHALGGMVNPDEPGAAVLPPVEKIHQCSRAIAKAVAQSVIDQGLNAETIDDIDKAIEAEIWYPKYKSYI >NZ_CP029084.1|WP_001049165.1|1511159_1511747_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >NZ_CP029084.1|WP_000006551.1|1509652_1510597_+|DNA-binding-protein-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >NZ_CP029084.1|WP_001248939.1|1508546_1509542_+|YvcK-family-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >NZ_CP029084.1|WP_000369722.1|1507638_1508550_+|RNase-adapter-RapZ MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >NZ_CP029084.1|WP_000134963.1|1505875_1506811_+|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >NZ_CP029084.1|WP_000057562.1|1504369_1505809_+|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMANQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >NZ_CP029084.1|WP_001224792.1|1503876_1504362_+|acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWHVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNISIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >NZ_CP029084.1|WP_000513297.1|1503029_1503869_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNFGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPGEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSFGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIIYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >NZ_CP029084.1|WP_000958224.1|1502091_1503024_+|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >NZ_CP029084.1|WP_000816297.1|1514009_1514912_-|TIGR01777-family-protein MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGIILSNEGGALQTMKLPYEYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINKESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLISK >NZ_CP029084.1|WP_000070822.1|1515614_1516244_+|DUF4887-domain-containing-protein MSNQNYDYKTNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQKQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQTNQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDKASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQASQQNSQSTTNKQNNANDK >NZ_CP029084.1|WP_000654030.1|1516852_1517866_+|sugar-binding-transcriptional-regulator MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE >NZ_CP029084.1|WP_000279414.1|1517918_1518929_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK >NZ_CP029084.1|WP_108720678.1|1519067_1520258_+|phosphoglycerate-kinase MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKEVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPELGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKKFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK >NZ_CP029084.1|WP_001260089.1|1520379_1521141_+|triose-phosphate-isomerase MRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK >NZ_CP029084.1|WP_001085498.1|1521143_1522661_+|2,3-bisphosphoglycerate-independent-phosphoglycerate-mutase MAKKPTALIILDGFANRESEHGNAVKLANKPNFDRYYNKYPTTQIEASGLDVGLPEGQMGNSEVGHMNIGAGRIVYQSLTRINKSIEDGDFFENDVLNNAIAHVNSHDSALHIFGLLSDGGVHSHYKHLFALLELAKKQGVEKVYVHAFLDGRDVDQKSALKYIEETEAKFNELGIGQFASVSGRYYAMDRDKRWEREEKAYNAIRNFDAPTYATAKEGVEASYNEGLTDEFVVPFIVEDQNDGVNDGDAVIFYNFRPDRAAQLSEIFANRAFEGFKVEQVKDLFYATFTKYNDNIDAAIVFEKVDLNNTIGEIAQNNNLTQLRIAETEKYPHVTYFMSGGRNEEFKGERRRLIDSPKVATYDLKPEMSAYEVKDALLEELNKGDLDLIILNFANPDMVGHSGMLEPTIKAIEAVDECLGEVVDKILDMDGYAIITADHGNSDQVLTDDDQPMTTHTTNPVPVIVTKEGVTLRETGRLGDLAPTLLDLLNVEQPEDMTGESLIKH >NZ_CP029084.1|WP_001121760.1|1522790_1524095_+|phosphopyruvate-hydratase MPIITDVYAREVLDSRGNPTVEVEVLTESGAFGRALVPSGASTGEHEAVELRDGDKSRYLGKGVTKAVENVNEIIAPEIIEGEFSVLDQVSIDKMMIALDGTPNKGKLGANAILGVSIAVARAAADLLGQPLYKYLGGFNGKQLPVPMMNIVNGGSHSDAPIAFQEFMILPVGATTFKESLRWGTEIFHNLKSILSKRGLETAVGDEGGFAPKFEGTEDAVETIIQAIEAAGYKPGEEVFLGFDCASSEFYENGVYDYSKFEGEHGAKRTAAEQVDYLEQLVDKYPIITIEDGMDENDWDGWKQLTERIGDRVQLVGDDLFVTNTEILAKGIENGIGNSILIKVNQIGTLTETFDAIEMAQKAGYTAVVSHRSGETEDTTIADIAVATNAGQIKTGSLSRTDRIAKYNQLLRIEDELFETAKYDGIKSFYNLDK >NZ_CP029084.1|WP_000785252.1|1524433_1524892_+|hypothetical-protein MADRTNKEIKTGRFIATASIVFSILLIIHYFVSLDNATAKALLNLTNQNTSDKAIDYILNSFRFTGIMYILAYLAGFITFWNRHTYVWWFMFAVYVSNSLFTLINLSITIQAIKAAHGAYLTLPILIVIIGSVALAIYMLVVSIKRKSTFNR >NZ_CP029084.1|WP_000556760.1|1524958_1525192_+|preprotein-translocase-subunit-SecG MHTFLIVLLIIDCIALITVVLLQEGKSSGLSGAISGGAEQLFGKQKQRGVDLFLNRLTIILSILFFVLMICISYLGM |
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|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| NZ_CP029084_5 | 5.1|1513804|32|NZ_CP029084|CRISPRCasFinder | 1513804-1513835 | 32 | NZ_CP029084.1 | 253830-253861 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP029084_5 | 5.1|1513804|32|NZ_CP029084|CRISPRCasFinder | 1513804-1513835 | 32 | NZ_CP029084.1 | 412345-412376 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP029084_5 | 5.1|1513804|32|NZ_CP029084|CRISPRCasFinder | 1513804-1513835 | 32 | NZ_CP029084.1 | 949634-949665 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP029084_5 | 5.1|1513804|32|NZ_CP029084|CRISPRCasFinder | 1513804-1513835 | 32 | NZ_CP029084.1 | 1660965-1660996 | 1 | 0.969 |
| NZ_CP029084_1 | 1.1|180598|37|NZ_CP029084|CRISPRCasFinder | 180598-180634 | 37 | NZ_CP029084.1 | 180509-180545 | 2 | 0.946 |
| NZ_CP029084_5 | 5.1|1513804|32|NZ_CP029084|CRISPRCasFinder | 1513804-1513835 | 32 | NZ_CP029084.1 | 2622960-2622991 | 2 | 0.938 |
1. spacer 4.1|1507332|34|NZ_CP029084|CRISPRCasFinder matches to position: 1800396-1800429, mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 5.1|1513804|32|NZ_CP029084|CRISPRCasFinder matches to position: 253774-253805, mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 5.1|1513804|32|NZ_CP029084|CRISPRCasFinder matches to position: 253830-253861, mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 5.1|1513804|32|NZ_CP029084|CRISPRCasFinder matches to position: 412345-412376, mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 5.1|1513804|32|NZ_CP029084|CRISPRCasFinder matches to position: 949634-949665, mismatch: 0, identity: 1.0
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6. spacer 5.1|1513804|32|NZ_CP029084|CRISPRCasFinder matches to position: 1660965-1660996, mismatch: 1, identity: 0.969
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agctcacaaaacccttgatatcattggtttcccatga CRISPR spacer agctcacaaaacccttgatatcactggtttctcatga Protospacer ***********************.*******.*****
8. spacer 5.1|1513804|32|NZ_CP029084|CRISPRCasFinder matches to position: 2622960-2622991, mismatch: 2, identity: 0.938
aacttgcacattattgtaagctgactttccgc CRISPR spacer aacttgcacgttattgaaagctgactttccgc Protospacer *********.****** ***************
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
1439578 : 1447397
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP029084|1439578:1447397|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTTCGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTATTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTACGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCATTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCATAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCATAGCCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGTGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAAGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCAGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAGTTAATACAGCGGCAGCAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACGCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGGCGGTTTTTTAAGTGAGAAAATATTTATCTAAACTAGTTATCACTATAAAACACTTCTGATATATCGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTTATAGTTTTGATATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGTTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATAGTTATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCCACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGCAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGCGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGCGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGGTTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCTTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACGACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGACTAAAGTTCACTAAAAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACACGGAATGTGATGTGCAGCT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP029084|1439578:1447397|1440633_1441320_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_CP029084|1439578:1447397|1444228_1444648_-|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_CP029084|1439578:1447397|1446245_1447397_+|WP_001217805.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFKKAENINSIYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NZ_CP029084|1439578:1447397|1441294_1441768_-|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NZ_CP029084|1439578:1447397|1439578_1440634_-|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_CP029084|1439578:1447397|1442828_1443413_-|WP_000637683.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNNLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NZ_CP029084|1439578:1447397|1442108_1442549_-|WP_001093554.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAAAAVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NZ_CP029084|1439578:1447397|1443511_1444225_-|WP_001062976.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKSDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVIAQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP029084|1439578:1447397|1445668_1446262_+|WP_000604517.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKVTAKNDEAIIMAFEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_CP029084|1439578:1447397|1444649_1445318_-|WP_000446726.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKQFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1459373 : 1473649
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP029084|1459373:1473649|DBSCAN-SWA TATGAAAGAACAACTTAATCAACTATCAGCATATCAGCCTGGTTTATCTCCAAGGGCATTGAAAGAAAAGTATGGCATTGAAGGAGATTTATATAAACTTGCATCAAATGAAAACTTGTATGGACCATCGCCTAAAGTTAAAGAAGCGATATCAGCACACTTAGATGAGTTATATTATTATCCTGAAACAGGATCACCGACATTAAAAGCGGCGATTAGTAAACATTTAAATGTAGATCAATCACGCATTTTATTTGGTGCGGGATTAGATGAAGTTATATTAATGATTTCTAGAGCAGTATTAACGCCAGGGGATACTATTGTTACAAGTGAAGCGACATTCGGTCAATATTATCACAATGCGATTGTTGAATCAGCTAATGTGATACAGGTACCTTTAAAAGATGGTGGCTTCGACTTAGAAGGTATTTTAAAAGAAGTTAATGATGATACGTCATTGGTATGGTTATGTAATCCAAATAATCCTACAGGTACGTATTTTAATCATGAGAGCTTAGATTCGTTTTTATCTCAAGTACCATCACATGTTCCGGTACTCATAGATGAAGCTTATTTTGAATTTGTGACAGCAGAGGACTACCCGGATACACTTGCTTTGCAACAAAAATATGACAATGCATTCTTATTACGTACATTTTCAAAGGCGTATGGATTAGCGGGTTTACGTGTAGGATATGTGGTAGCAAGTGAACATGCGATTGAAAAATGGAACATCATTAGACCACCATTTAATGTGACACGTATATCTGAATACGCAGCAGTTGCAGCACTTGAAGATCAACAATATTTAAAAGAGGTAACACATAAAAATAGTGTTGAACGCGAAAGATTTTATCAATTACCTCAAAGTGAGCATTTCTTACCAAGTCAAACGAATTTTATATTTGTAAAAACAAAGCGGGTAAATGAACTTTATGAAGCACTTTTAAATGTAGGGTGTATTACGCGACCATTTCCAACTGGTGTTAGAATTACAATTGGTTTTAAAGAACAAAATGATAAAATGTTAGAAGTTTTATCAAACTTTAAATACGAATAGAAAAGGGCACCACATGGTATGAATATGTGCCAAAATGCGGTGTGAATGATGAGGTGAGAGCATTCAGTGTAAAAAGCAACAATAGATGATATTGTTTTGTATCAATTGCTTTTTTGCTATACTGAATTAATACTGATATTTTGAGGAGAAGATTAAAATGACCCGTAAATCAATCGCGATTGATATGGATGAAGTATTGGCAGATACATTAGGAGAAATCATTGATGCTGTCAATTTTAGAGCGGATTTAGGTATTAAAATGGAAGCTTTGAATGGTCAAAAACTTAAACATGTTATTCCTGAACATGATGGATTAATTACAGAAGTATTGAGAGAACCAGGCTTCTTCAGACATCTTAAAGTGATGCCGCATGCACAAGAAGTTGTGAAAAAATTAACTGAACATTATGATGTATATATTGCTACAGCAGCAATGGATGTACCAACATCATTTAGTGATAAATATGAATGGTTACTAGAGTTCTTTCCATTTTTAGATCCACAGCATTTTGTTTTTTGTGGTAGAAAAAACATCGTTAAAGCTGATTATTTAATAGATGACAATCCTAGACAGCTTGAAATTTTTACTGGTACACCGATTATGTTTACAGCAGTGCATAATATTAATGATGATCGATTTGAACGCGTAAATAGCTGGAAAGATGTAGAACAGTATTTTTTAGATAATATTGAGAAAGAAAAATAAATCACTTGAACCATTTTATGTAGCAAATAAAATGCATATACTGGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAAAGAAATACTTTTTCTTTAGAAATTAGTATTTCTTATGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCTCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCGGCAAGGTTGACTAGAATTGAAAAAAGCTTGTTACAAGCGCATTTTCGTTCAGTCAACTACTGCCAATATAACTTCGTAGAGCATAGAACATTGATTTATGTTCCAGCCTGAATCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTAAGTCTATCTCATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGTCAGATTACATGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGGCGCATAAACCACTATGATTTAAATTACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAGTTATATCTCTGTTTTTGAAAAAAGGTAATAGCTTAAAGCTAATAACAGCGAATATAATGTAAGTTGAATCTTATGATTACACTTTAAACCTAATATAATATCCCATTAAGATCATTCCGGATGCTTACAAATCATTGACAGTAAGTAACTGAATGGCATTTGGTATAACCTCAATATCAATAGGTGTTTCTAATGAAATTTCGCCATCAATATCAACTTTCATTGCTGGATCTGTTGTAAGTGAAATCTTTTTACCAGGTATATGCTCAATACCTTGAGTAATTTCATTCCAATTCATGCTATCACGCTTTTTAAAAATATCATTTAAAATACTGAAACTTTGTTCATTAAAAATGAAAGTGTTCAGTTCACCATCTTGAGGAGACAAATCAGTCAATGGTATACGACTACCACCAATGAATGGACCATTTGCTGATAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCAATTGTTAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATTAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAATTACATCGTATGTACCAACTTGTGCAGAAATCATTTGTTCACTAGCTTGTTTATGATTAGGTGCTATATTTAGCGTTTTTGTAAAATCATTAAAAGTACCGCCTGGTAAAATTCCAATAGGGAGTTGAAGGTCATGTGTCATAACACCATTTATAAGTTCGTTAACCGTGCCATCACCGCCAAGAATAAATAATATATCTACATCTTTTGCATAGTTTTTAGTTTTGATTTCTTGGCAATATTTAATAATGTCACCTTCGTTTTCACTCAATTGAATAGAAAGATGCTTACAAATTGAACTTAATGCTGTTGTAACTTCCCCAATACCTTGATTAATATTTTTTAATCCACTGTGTTCATGGTAAAAGAGGACACCATGTGTATATTTATTTTCCATAGCTTAGCCTACTTTCTAAAAATTGGTTCATTAAATATATATACCCACTTTTAATTGTTAATACCAAAAATATGTTTTTAAATAGAGAAAATGATAATAACTGACATTGATGTCTATAGAGTGGGGCGAGAAAATATAGTTATAGTTGTCTATAACGAGCATATTAAGTTTTTATTTATATTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGAATGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAATTTGTTTGACCTAGTGGTTCTATTAACTTAACTAAAGTACCATTGATTGCTTGTGCAGATGCGTTAGTTAAATACCAAATACTCATCATTTGAGCATTGAATGCTTTAGGTGCTAACTTAACAGCAGCACTATTACCTGTTGGTGATAAGCAAAGCTCACCGATAACACAAATAATGTACGATAAAATAACCCAGTTAACTGAGAAGTTTGATGTACCTGATGCATAACCTACAATACCAATTAGTATGTATGACGCACCTGCTAAGAACGTACCAATTGCAAATTTTACTGGCAGACTAGGTTGTTTAGTTCCAAGCTTTTGCCATAAAAGTGAAATAATTGGTGCTAATAATAAAATAAATAATGGGTTAATTGATTGGAAAATCGCTTCACCAAAGTTTGTTTTCCAACCAAATAAGTTTAATTTCATATCTGAATGTTCAATACCATAAATGTTTAATACATTAGAACCTTGTTCTTGAATAGCCCAGAACACCATTCCAAGAATGAATAATGGAATAAATGCTTTAACACGAGAACGTTCAGTATCAGTGACATCTTTACTTCTAATAATTAAAGTGAAGTAAATGATTGGTAATGCAATACCTAATACTAAAACAGTATTACTAACTAAGTTAAATGATAATGAGTTAGTTAATGCACCAATTACAATAATTAATACAATTGCTAACACAACACTTCCGATGATAAGACCATATTTTTTCTTTTCTGCTGGAGTCAATGGATTAGTAGGTTTCATACCCACACTACCTAAGTTTTTACGATTGAAAAGTACATACCAAACTAAACCTAGCGCCATACCAACAGCTGCAATTAAGAATCCGCCATGGAAGTTTTTAACATTAACAAAGTGTTGCAAAATAATAGGTGATAATAATGCACCCATATTAACTGACATATAGAAAATAACAAAACCTGCATCCATACGTCTATCATTTTCAGGATATAAGCGGCCAACAATATTTGAAATATTTGGCTTCATTAAACCTGAACCAATAATAATGAAGAACATTGATGTGAATAAGCCGATTAACGCAAACGGTAAGCTTAAACAAATATGTCCGATAATAATAAAGACTGCACCTAGTAAAGTAGCGCCTCTAGTGCCTGTAATTCTGTCAGCAATCCATCCACCTGGTATTGATGTCATATAGATTAATGAACCGTAAACTGACATGATTGACATAGCTGTTGTTTTATCAATTCCAAGGCCATTATCTGTTACGGCGAAGTACATGTAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP029084|1459373:1473649|1472887_1473649_+|WP_000616861.1|DBSCAN-SWA MIQVGNLTKTIHNQTILEDISIVIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDEGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHEIVNDALDLLQLQDIRHRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLQMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGRLVKSDLKDNVIQSNVLSDLYDMDIQIEHIRNQRICLYFKD >NZ_CP029084|1459373:1473649|1463012_1464518_-|WP_000193753.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGTSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_CP029084|1459373:1473649|1462833_1462935_+|WP_031785486.1|DBSCAN-SWA MIITDIDVYRVGRENIVIVVYNEHIKFLFILIS >NZ_CP029084|1459373:1473649|1470976_1471948_+|WP_000876313.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGKILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDIFHLSDSQQNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSISGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINVALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRVIVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NZ_CP029084|1459373:1473649|1459373_1460432_+|WP_000663021.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNDDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPSHVPVLIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEHFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP029084|1459373:1473649|1461825_1462743_-|WP_000429016.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLTIDDKTYSGETTMILSANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP029084|1459373:1473649|1465378_1466245_-|WP_001068497.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP029084|1459373:1473649|1460589_1461138_+|WP_000197263.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEKEK >NZ_CP029084|1459373:1473649|1464858_1465359_-|WP_000930014.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP029084|1459373:1473649|1469630_1470602_+|WP_000562500.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDVWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_CP029084|1459373:1473649|1467046_1467445_+|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_CP029084|1459373:1473649|1471934_1472891_+|WP_001245581.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQSITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVIPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLVTMVLFALLLFQVIFKIGQFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVILVTLLIITIYLVPYLDVLLLGRAEAINLGISYEQLTRFLLVIVSILVSISTTLVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVKRRNAQ >NZ_CP029084|1459373:1473649|1467407_1469513_+|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI |
13 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1526094 : 1545369
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP029084|1526094:1545369|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP029084|1526094:1545369|1543679_1544480_+|WP_001043552.1|DBSCAN-SWA MNKSRFISCVILIFALILVLFTPNVLAESQPDPTPDELHKSSEFTGTMGNMKYLYDDHYVSATKVMSVDKFLAHDLIYNISDKKLKNYDKVKTELLNEDLAKKYKDEVVDVYGSNYYVNCYFSSKDNVGKVTGGKTCMYGGITKHEGNHFDNGNLQNVLIRVYENKRNTISFEVQTDKKSVTAQELDIKARNFLINKKNLYEFNSSPYETGYIKFIENNGNTFWYDMMPAPGDKFDQSKYLMMYNDNKTVDSKSVKIEVHLTTKNG >NZ_CP029084|1526094:1545369|1535759_1536044_+|WP_000998185.1|DBSCAN-SWA MNDKEKIYNQLHHDAPIQNIPAPENLFVEYIEADEVWYSPVVCMALSKAHNINFYDSDDVGCIDKAATCSIKKFNPETGEFEQFSKMAQKEITQ >NZ_CP029084|1526094:1545369|1541452_1542121_+|WP_001001286.1|DBSCAN-SWA MNEDIKFLMETLENVSFKDIDEQFVLDAEEYKTLVKDLSILEKPSVSTKEKGDRLERILINILSNSGLFNVTSNKRTSTNEIDIRVEKTTQLVLVENHYSFDVENVIYFECKNYSRKLGVTYIGKFFSILNVANIKLGVLITPYGLTGNGWYNGHGLCKKLHLKNDINIISITKEDLLKLNKISLLYLMQQKIHELQEDMDLELCFKQKHELVRNGDIVNEK >NZ_CP029084|1526094:1545369|1539235_1539448_+|WP_045181470.1|DBSCAN-SWA MADDNIDDHIVKNHLEMIVDRVANDKEFYIFDSLIQGRSFKDISNVLECSEQSVRLWYETLLDKIVEVIE 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24 | Staphylococcus_phage(68.42%) | coat,integrase | attL 1528756:1528771|attR 1543557:1543572 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1576809 : 1623057
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP029084|1576809:1623057|DBSCAN-SWA CGTGAATGAAGTGGCCGAACACTCATTTGACGTTAATGAAGTAATCAAGGATTTTCCGATATTAGATCAAAAAGTCAATGGCAAACGTTTAGCATATCTTGATTCAACAGCGACAAGTCAAACGCCTGTGCAAGTGTTAAATGTTTTAGAGGATTACTACAAGCGTTATAATTCAAACGTTCATCGTGGTGTTCATACATTAGGATCATTGGCAACTGATGGGTATGAAAATGCCCGTGAAACCGTTCGTCGTTTTATTAATGCGAAGTATTTTGAAGAAATCATTTTTACACGCGGAACAACTGCGTCGATTAACCTTGTAGCACATAGCTATGGTGATGCAAATGTTGAAGAGGGCGATGAAATTGTTGTCACTGAAATGGAACATCATGCCAATATTGTTCCTTGGCAACAGTTAGCAAAACGTAAAAATGCGACATTGAAATTTATACCAATGACAGCTGACGGTGAATTAAACATCGAAGATATTAAGCAAACGATTAATGATAAAACAAAGATCGTAGCTATTGCACATATTTCTAATGTACTCGGTACAATTAATGATGTTAAAACCATTGCAGAAATAGCTCATCAACATGGTGCAATTATCAGTGTTGATGGGGCACAAGCAGCACCACATATGAAACTTGATATGCAAGAAATGAATGCTGATTTTTATAGTTTTAGTGGTCATAAAATGCTTGGACCAACAGGTATTGGCGTATTATTTGGTAAACGTGAGTTACTACAAAAAATGGAACCGATTGAGTTCGGTGGCGACATGATTGATTTTGTAAGTAAGTATGATGCAACATGGGCTGATTTACCTACTAAATTTGAGGCGGGTACTCCATTAATTGCTCAAGCAATTGGGCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAATTATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGAATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGTTTAATTTACAAGATGTACATCCACACGATGTTGCTACAGCCGTAGATACAGAAGGTGTAGCAGTTAGAGCTGGGCATCATTGTGCGCAACCGTTAATGAAATGGTTAAATGTGTCTTCAACAGCTAGAGCGAGTTTTTATATATACAACACGAAAGAAGACATTGATCAGTTAATAAATGCCTTGAAACAAACGAAGGAGTTTTTCTCTTATGAATTTTAATAATCTAGATCAATTATATAGATCTGTCATTATGGATCATTATAAAAATCCTAGAAATAAAGGTGTATTAGATAACGGGTCTATGACAGTAGATATGAATAACCCGACATGCGGTGACCGTATACGACTAACATTTGATATAGAAGATGGCATTATAAAAGATGCTAAGTTTGAAGGTGAAGGTTGTTCGATTTCAATGGCAAGTGCATCGATGATGACACAAGCTGTTAAAGGTCATTCACTTGGAGAAGCAATGCAAATGAGCCAAGAATTTACGAAAATGATGCTTGGTGAAGACTATGTGATTACAGAAGAAATGGGAGATATTGAAGCATTGCAAGGTGTATCTCAATTCCCAGCTCGTATTAAATGTGCCACATTAGCTTGGAAAGCATTGGAAAAAGGTACTGTTGCTAAAGAAGGTAAAGCAGAAGGTACGACTGAAGAAGAATAGAATGCTGTTAATCATAGATGATTTTGATATTAGACATATAAAAGTATAAAAATTTTTATAAGATGTCATGTCATTGTTATAATATGGTTTACATCATGAATTAAAAACTTACGCACGCCGTTGTAAATATATTTTTAAGGAGTGATTGAAATGGCTAAAAAAGCACCTGATGTTGGGGATTATAAATATGGATTCCACGACGATGATGTGTCCATTTTCAGATCAGAACGTGGTTTAACTGAGAATATCGTTAGAGAAATTTCTAACATGAAAAATGAGCCGGAATGGATGTTAGATTTCCGTCTTAAATCATTAAAATTGTTTTATAAAATGCCAATGCCTCAATGGGGTGGCGACTTATCAGAATTGAATTTCGATGACATTACTTACTATGTAAAGCCTTCAGAACAAGCTGAACGTTCATGGGATGAAGTGCCAGAAGAAATTAAAAGAACTTTCGATAAATTAGGAATTCCTGAAGCTGAACAAAAATATTTAGCTGGCGTTTCTGCTCAATATGAATCTGAAGTTGTTTACCATAATATGGAAAAAGAACTTGAAGAAAAAGGTATTATCTTTAAAGATACAGATAGTGCTTTACAAGAAAATGAAGAATTATTCAAAAAATACTTTGCTTCTGTAGTACCTGCAGCAGATAACAAATTTGCGGCGTTAAACTCAGCAGTATGGTCAGGTGGTTCGTTCATTTATGTACCTAAAAATATCAAACTAGATACGCCACTACAAGCTTATTTCCGTATTAACTCTGAGAACATGGGTCAATTTGAACGTACATTAATCATTGCTGATGAAGGTGCTTCTGTACATTACGTAGAAGGTTGTACTGCACCAGTTTATACAACTAGTTCTTTACACTCTGCTGTTGTGGAAATCATTGTGCATAAAGATGCGCACGTTCGTTATACTACGATTCAAAACTGGGCGAACAATGTATACAACTTAGTTACGAAACGTACTTTTGTTTATGAAAACGGAAATATGGAATGGGTAGATGGTAACTTAGGTTCTAAGTTAACGATGAAATATCCAAACTGTGTTCTTTTAGGTGAAGGTGCAAAAGGTAGTACATTATCTATTGCATTTGCTGGTAAAGGACAAGTTCAAGATGCCGGTGCTAAAATGATTCATAAAGCGCCAAATACATCTTCAACGATTGTTTCTAAATCTATTTCTAAAAATGGTGGTAAAGTTATTTATCGTGGTATTGTACATTTTGGACGTAAAGCAAAAGGCGCTCGTTCAAATATTGAGTGTGATACATTAATCTTAGATAACGAATCAACATCAGATACAATTCCATATAACGAAGTATTCAACGATCAAATATCATTAGAACATGAAGCGAAGGTTTCAAAAGTTTCTGAAGAACAATTATTCTATCTAATGAGTCGTGGTATTTCTGAAGAAGAAGCGACAGAAATGATTGTTATGGGATTCATCGAACCATTCACAAAAGAACTTCCAATGGAATACGCGGTCGAAATGAACCGTTTAATCAAGTTCGAAATGGAAGGTAGTATTGGATAGCTTTAAACCGCGTTGTTAAGCCATTCTTAACTTCCAGAAATGGCCATTGATACCATTTTGATACCATTTACTTGTCAAAAATGGCTATTGCATCGTGTTTTTTCTGAGTATATAAATGGCTGTAAGTGCCCATCGTTTCAGTGATTTGAGCATGTCTCATGAGTGACTGTAAAACGAAAATATCTACACCATTATTTGCAAGATAAGATGCATAAGAATGTCTTAACGCGTGAATGTTATAATGGGGGAAAGCTTTTTGGAATTTCTTTTGAACATGACTGTAATGTTTGGGAGCCATTCCTCCGAAAATAAAATAACTACGTTCATCAAAATATTTGTTTAACTCTTTTTCACGTTGGTGTCGTTCAGTTAACATTGTATTGATGAATTTAGGTAAAGGAACAATATCCTCTGAACTATCTGTTTTTGGTCTCGGATATATAGTTCTATTAGAGATGTCCATTGTTTTATTTATGGATATCTCTTTTTTATATTTATTGTAGTCTGTCCAAACAAGCGCCATAGCTTCGCCAATCCTCAAACCTGTATAAAACATTAATGTAAATAACTCTCTGTAATCTTGCTCTTCAATGTCTTTGATTCTTTCTTCAAATTCTTCACGCATCATAAACTTAGGTTTTGGTTTTACACGCGGAATAGGTTTAATTGATATTGTTGGATCTGTACGTAATCCAAAGTATTTTTTAGCATAATTAATTACAACTTTAAAACCTGACCAAATTGTACGAGCAGAATTTGTTGATGCTACATTCTCTATTAGATATTTACGAAACTCTTGGCATTGATTTTGTGTTATCTTATTCATTTTTATGTGCCCGAACTTAGCTTTAAAGTGTTTATGATATTCATTTTGTTTGCGTCGTTTTGTTTTAGGTCTCAAATCGCTATTTTCTAAGTAGTGATGAAAAACATAATCAAATGTTTTCGAATCACTATATCCTTCGTTTACGTCATTCAAAAAAATAGCCTCTGCTCTCTTAGCTTCACGCTTAGTTGAAAAACCGCGTTGCATCTTACGTTTGTTATTACCGTATACATCTTTATATCTAATGGAAAAATACCATTTACCTGTATTATCATCCTTATATACTGGCATTTTGCTTCTCCCTCCTCAAAATTGGCAAAAAATAATAAGGGTAGGCGGGCTACCCGTGATTTTAGTACTAGGTACTAAATGTGATATAATAAAATAAAAAGTAGGTGATGTTATGACATTTAAAAACAATCATAATTTCAATGAATTAGTTTTAACGAATGAAGACATTAGAATTTTAAAAAATGTCTTAGAAGATGCAGTCAGTGTTTATGATGAATATTCGGTATGTAATGAAGAATCCGATTTTGCTTACTGTTTATTAAGAGACTTATATACATTAGACAGCTTAGCTATTTCGTCAAATAATGTTTGAATTATCGAATTGTACTCTTCGATTTTAATACCATGCATAATAGAGTTTCTGTGTTCAATAGCAGCTTTGACTGAATGTTTTAAATGTTCTTCTATTAAATCGTTGTTTTCCATTTCGTTTAAAAATGTTCTTATATTCCTCTTGTAATCAGGTGTTTGTTTAATTATATCTTTATCAAACTTGTTCAATATCAGCCTACACATTAGTTCTAGCGCTCTACCTAAAAGTAGTGATGTAGCTAGCCTTTTTTCAGACATAAAGCAATCATAAGCTTCAACTATATGAGTTTCAAAATCCTTGTCATTAACTGTTTCTA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>NZ_CP029084|1576809:1623057|1622536_1622689_+|WP_001788502.1|DBSCAN-SWA MCKEVKSLMLDIIKTLLEHQVLAVLIIPEVLKQLREWHLGYLDRKPNNKD |
67 | Staphylococcus_phage(66.15%) | tail,head,terminase,plate,holin,capsid,integrase,portal | attL 1572128:1572143|attR 1629945:1629960 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1775735 : 1784208
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP029084|1775735:1784208|DBSCAN-SWA AGTGAAAGTAGCAGTCATTATGGGCAGTTCTTCCGATTGGAAAATTATGCAAGAGAGTTGTAACATGTTGGATTATTTTGAAATTCCGTACGAAAAACAAGTAGTATCCGCACATCGTACGCCAAAAATGATGGTTCAATTTGCTTCTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAGACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACAACGCTACCAGTTATTGGAGTACCAATTGAAACAAAAAGTTTAAAGGGTCTAGATTCTTTATTATCTATTGTTCAAATGCCAGGAGGTATTCCGGTTGCAACGACTGCAATTGGTGCAGCAGGTGCTAAAAATGCAGGTATACTTGCAGCAAGAATGTTAAGTATTCAAAATCCTTCTTTAGTTGAAAAACTAAATCAATATGAATCTTCGTTAATTCAAAAAGTGGAGGACATGCAAAATGAACTTCAATAAATTAAAGTTTGGTGCGACTATTGGCATTATTGGTGGTGGTCAGCTTGGAAAGATGATGGCACAATCAGCTCAAAAAATGGGTTATAAAGTGGCTGTATTGGATCCTACTGAAGATTGTCCATGTAGATACGTTGCACACGAATTTATACAAGCCAAGTATGACGATGAAAAGGCACTCAATCAATTAGGACAAAAATGTGATGTGATTACTTATGAATTTGAAAACATTTCAGCCCAACAATTAAAACTATTATGTGAAAAGTACAATATTCCGCAAGGTTACCAAGCTATACAGTTATTACAAGACCGCTTAACTGAAAAAGAAACATTAAAAAGTGCTGGTACCAAAGTTGTCCCATTCATTTCAGTAAAAGAATCTACAGATATTGACAAAGCAATTGAAACATTAGGATATCCTTTTATTGTAAAAACTAGATTTGGTGGCTACGATGGCAAAGGTCAAGTTTTAATTAACAACGAAAAAGACTTACAAGAAGGTTTTAAATTAATTGAAACTAGTGAATGCGTAGCTGAAAAATATTTGAATATCAAGAAAGAAGTATCACTTACTGTTACAAGAGGAGACAACAATCAAATCACTTATTTCCCATTACAAGAAAATGAGCATAGAAATCAAATACTTTTCAAAACAATTGTTCCAGCGAGAATAGATAAAACAGCTGAGGCGAAAGAGCAAGTTAATAAAATTATCCAATCGATTCATTTCATTGGAACATTTACAGTTGAATTTTTTATAGATAGTAACAACCAATTGTATGTGAACGAGATTGCACCAAGGCCTCACAATTCCGGACATTATTCAATTGAAGCGTGTGATTATTCACAATTTGATACTCATATTTTAGCAGTTACCGGACAATCATTACCAAATTCAATTGAATTATTAAAGCCTGCAGTCATGATGAACTTACTAGGTAAAGACTTAGATTTATTGGAAAATGAATTTAATGAACATCCAGAGTGGCACTTACATATTTATGGTAAGTCTGAGCGTAAAGATAACAGAAAAATGGGTCATATGACTGTACTAACGAATGATGTAAACCAAACTGAACAAGATATGTACGCTAAATTTGAGGGGAGTAATTAAAGCATGACATTATTATATGAAGGAAAAGCGAAGCGCATTTTCTCAACAAATCAAGAAAATGAATTAAGAGTTGAATATAAAGATGAAGTTACTGCTGGAAACGGTGCTAAGAAAGACACAATGGCAGGTAAGGGGCGATTAAATAATCAAATTACTTCTATTATATTTAAATATTTACAAGAAAATGGAATAGAAAGTCACTTTATTAAGCAATTATCTGAAACAGAACAATTAGTTAAGCCTGTGAAAATAATTCCATTAGAAGTAGTTGTTCGTAATATTGCTAGCGGATCTATTACAAAGCGTTTAGGTTTTGAAAATGGTGAAGTTTTTAGAGAACCACTTGTGGAATTTTTCTATAAAAATGATGCATTAAATGATCCTTTGATTACAGATGATCACATCAAATTACTGAATATTGCGACAGATAAAGATATTGAAACATTAAAAACGAAAGCGCTAGAAATTAATCAAGTATTAAAACAATTAATGGATGCGATGAATTTAAAATTAGTAGATTTTAAAATCGAATTTGGAAAGACTGAGACTGATCAAATTTTGTTAGCGGATGAAATATCTCCAGATACATGTCGAATTTGGGATAAAGCTACCAATGCAAACTTTGATAAAGATGTATATAGAAATAACACTGGATCACTGATTGAAACATATCAAATATTTTTAAACAAATTGGAGGATTTAAAATAATGAAAACAATTGAACTACATATCACATTACAACCACAAGTATTAGATACGCAAGGACAAACGCTTACTCGAGCTGTACATGATTTAGGTTATGCACAAGTGAATGATATTCGTGTAGGAAAAGTATTATATATGACAGTGGATGAGGTTAGTGATGAAAAGGTACACAACATTATTACAACTCTAAGTGAAAAATTGTTTGCAAATACAGTGATTGAAGAATATAGCTATAAAGTGTTAGATGATGAAAAGGAGAATGCATAAAATGAAATTTGCGGTTCTTGTTTTTCCAGGTTCGAATTGTGATAGAGACATGTTTAATGCTGCTATTAAAAGTGGTGTTGAAGCGGAATATGTAGATTATAGAGAAACATCACTAAGTGGATTTGATGGCGTACTTATTCCTGGTGGATTTTCATTCGGGGATTACTTAAGATCTGGGGCAATGGCTAGTGTAGCGCCGATTATTTCTGAAGTTAAACGTCTTGCAGCTGAAGGTAAGCCAGTATTAGGTGTTTGTAATGGGTTTCAAATTTTAACTGAAATTGGCTTATTACCTGGTGCATTATTGCATAACGATTCACATTTATTTATTAGTAGAAATGAAGAGTTAGAAATAGTGAATAATCAAACGGCATTTACAAATCTTTATGAACAAGGTGAAAAAGTTATATATCCTGTAGCTCACGGTGAAGGTCATTATTATTGTACTGATGAAATATATCAACAATTAAAAACTAACAATCAAATTATTCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTGTGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTAAAAAGTTGGAGGGAACAACATGTCTAAATTTATCGAACCAAGCGTTGAAGAAATTAAACTTGAAAAAGTATATCAAGATATGGGATTAAGTGATCAAGAATATGAAAAAGTTTGCGATATTTTAGGCAGACAACCTAACTTTACAGAAACAGGTATCTTTTCTGTTATGTGGAGTGAACATTGTTCTTATAAACATTCTAAACCGTTTTTAAAGCAATTTCCTACGTCAGGTGAGCATGTGCTTATGGGTCCAGGTGAAGGTGCAGGGGTAGTCGATATCGGTGATAATCAAGCCGTAGTATTTAAAGTAGAATCTCACAATCATCCATCAGCAATTGAACCATACCAAGGGGCTGCTACAGGCGTTGGTGGAATCATTCGTGACATTGTCTCTATTGGGGCTAGACCTATTAATTTGTTAAACAGTCTTAGATTTGGAGAATTAGATAATAAGCAAAACCAACGATTACTTAAAGGTGTTGTTAAAGGGATAGGTGGCTACGGCAACTGTATTGGTATACCAACAACAGCTGGTGAAATTGAATTTGATGAACGATACGATGGCAATCCACTAGTTAATGCAATGTGCGTTGGTGTTATCAATCACGACATGATTCAAAAAGGCACAGCAAAAGGTGTAGGTAATTCGGTCATTTATGTTGGTTTGAAAACTGGTCGAGATGGTATTCATGGTGCTACTTTTGCATCTGAAGAATTGACGGAAGAAAGCGAAAGTAAACGACCTTCTGTACAAATCGGTGATCCATTTGTAGGTAAAAAATTAATGGAAGCAACACTTGAAGCAATTACATTTGATGAATTAGTTGGTATTCAAGATATGGGTGCTGCTGGTTTAACATCTTCATCTTCTGAAATGGCGGCAAAAGGTGGTAGTGGTTTACATTTGAGATTAGAACAAGTGCCAACACGTGAGCCAGGTATTTCTCCTTACGAAATGATGCTTTCAGAAACTCAAGAACGTATGTTACTAGTTGTTGAAAAAGGTACTGAACAAAAATTCTTAGATTTATTTGATAAGCACGAATTGGATAGTGCTGTTATAGGTGAAGTTACAGATACAAATCGTTTTGTTTTAACATATGAAGACGAAGTTTATGCTGACATTCCAGTTGAACCACTAGCTGATGAAGCACCTGTATATATTTTAGAAGGAGAAGAAAAAAATTATAATACTTCTAAAAATGATTATACACACATCGATGTTAAAGATACTTTCTTTAAATTACTTAAACATCCGACTATAGCATCTAAACACTATTTATATGATCAATACGACCAACAAGTTGGTGCCAATACGATAATTAAGCCAGGACTTCAAGCATCGGTAGTTCGTGTGGAAGGCACAAATAAGGCAATTGCTTCAACAATTGATGGTGAAGCGCGTTATGTATATAACAATCCATATGAAGGTGGAAAGATGGTAGTAGCTGAAGCTTATCGTAATTTAATTGCGGTTGGAGCCACACCATTAGCAATGACTGACTGCTTAAATTATGGTTCTCCTGAAAAGAAAGAAATTTATCAACAGCTGATAGATTCAACGAAGGGTATGGCAGAAGCATGCGAAATTCTTAAGACACCAGTAGTTTCTGGTAATGTATCTTTATATAACGAAACGAAAGGTACTTCTATTTTCCCAACACCAGTTGTTGGAATGGTAGGTTTGATTGAAAATGTAAATTATTTAAATGATTTTGAACCTCAAGTTGGAGATAAATTATATTTAATCGGTGATACTAAGGACGACTTTGGTGGTAGTCAACTTGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP029084|1775735:1784208|1783641_1784208_+|WP_000238657.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVDHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP029084|1775735:1784208|1778036_1778300_+|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >NZ_CP029084|1775735:1784208|1778965_1781155_+|WP_000032752.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYEDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACEILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEYEPLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP029084|1775735:1784208|1775735_1776218_+|WP_001622461.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGIDIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGLDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >NZ_CP029084|1775735:1784208|1782610_1783639_+|WP_000030827.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYESVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGVVEKDDYVDGSEVKERQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQDVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP029084|1775735:1784208|1778301_1778973_+|WP_000666803.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKTNNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP029084|1775735:1784208|1776204_1777329_+|WP_001010404.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVAVLDPTEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGDNNQITYFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDNRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_CP029084|1775735:1784208|1777332_1778037_+|WP_000174048.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHIKLLNIATDKDIETLKTKALEINQVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETDQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_CP029084|1775735:1784208|1781133_1782618_+|WP_000483713.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
2039442 : 2053926
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP029084|2039442:2053926|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP029084|2039442:2053926|2047769_2047877_+|WP_025174108.1|DBSCAN-SWA MAQYLVTTFKASTGRKHTYITRAKSNQRFNEVLQK >NZ_CP029084|2039442:2053926|2043504_2044041_+|WP_001004328.1|DBSCAN-SWA MNELQARELETFEQDDRFQVTDLNSANWVFKKLDAITTKENEVKELANSEIERINLWRDKEIEKLQSNKEYLQSLVIEYFRIEKEKDKKFKLNTPYGKVTSRKGAKVIQVSNENKVIEQLEQRGLNDYVKLTKKLSQSEIKKDFNVTENGTLIDVNGEILEGVRIIEKPTSYTVKVGE >NZ_CP029084|2039442:2053926|2039442_2040150_-|WP_000146714.1|integrase|DBSCAN-SWA MASIRKRGNKYQARVNYYDLYTHERKPITKTFNTKSEARKWAASVEADTENFVLLDNNITLEAWIELYLATFRLNNIAYSTYQNEIYTKRRIIKFFKNVYIKDITPIMYQQFLNWMKSENYSRSTAKQTRQLLNNVIEKAVLQGALSNNPCLICNIPDYKPPKSIEWLEAHEVKEFLQLIKKRNIYQYFVCYTAIELGCRVGEALALRISDFDLKNQTVHIYKSYDQKRAKAKLL >NZ_CP029084|2039442:2053926|2045409_2046324_+|WP_043859346.1|DBSCAN-SWA 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24 | Staphylococcus_phage(57.14%) | portal,capsid,terminase,integrase | attL 2033265:2033282|attR 2057730:2057747 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
2328163 : 2336475
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP029084|2328163:2336475|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCAATATCATGAGTAACTAAGATAATGGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTCGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAATCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATTAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGCTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAGCCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTAATTCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAGCATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAACGAGCGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGCGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAAAACAAAACCGCGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGGCCAGTTCGGCCGACTCTATGTGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCAATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAATCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACACCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAATGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAGTTCACACCCTGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGAACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTCACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAATATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGAGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTAACTTTTGACATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCCTTACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGTGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAATCCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATGAGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATAATCAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGCTGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAGCCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTTCTAAATGGCACATGATGATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCTTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGCGCAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAACTTTCGGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCAGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTATCTACTAATTGATTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGGCCTTGAATAACTTCTCCTGCAATACCGCAATCGCATAAATGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP029084|2328163:2336475|2329074_2329965_-|WP_000924214.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >NZ_CP029084|2328163:2336475|2332537_2333215_-|WP_000624564.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDCGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTESLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSAQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINEEIAVIERVL >NZ_CP029084|2328163:2336475|2328163_2328949_-|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >NZ_CP029084|2328163:2336475|2334675_2336475_-|WP_001217237.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEKALTYLLERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISFMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYSLNDEPYENEIDDYVNVINENGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NZ_CP029084|2328163:2336475|2333345_2334452_-|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >NZ_CP029084|2328163:2336475|2329974_2331321_-|WP_001062177.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >NZ_CP029084|2328163:2336475|2331434_2332535_-|WP_000683915.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFRTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTALKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPHGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESKGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDACQKLRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIQGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
2405789 : 2414833
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP029084|2405789:2414833|DBSCAN-SWA TTTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCGCCTAATTTTTCGACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATTTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATATACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAATTTTAAGTCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTGACACAATAACATACCCTCTTTCTCGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAACATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAGGGAATTAGACAAATCTTCCATTGACGTAGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCGCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCGTTCATCGCAATATCTTGAATAATTAATTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGTTCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGTAACTCAGGTTCTAAGTGTCCATTTTGCCAAAATAGTGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCTATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGTATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACATCCACTGGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGGTGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCATTTTTAACTTTCGTTTCTGCCATAGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATTATTTAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAGTCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTGTACGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATGTACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAAGGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCGAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCCGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCACTATCGCTCTTTTAATTCTTTCAATAGCCTTGGTCATATCGCTCAATTGCAATGCATCATGATTGATATCTGTGTCTGAAATGATGGATTCAATTGCTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACAATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGCTGGTTTAGTTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATAATATATTTTGTTAAATTTAAACAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAACTCTTTATTGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCAAAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTATTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAGGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAAAATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCAGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAGGAACGAACTTTTGTTCGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCGGAAATGAAATTAAATGCTACTAACGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAATCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGGGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCAGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTAGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAGATTTCTTCTGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTAGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCTTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGAACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCGGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGGTCGACTTGATAAAGCACCTCAAATCCACCTTGCAAATCAAGTCCTAAATTGACATTCTTTATAACACTTTTATAAGTTGCAGCCATTCCGGCAAACAACAATACGACTAAAAGCAAGAACGCAATTATTCTACTACTTTTCTTCACATGAACACCTCATTATTTACGTATGTATTTAGAATACTTGAATACTATTTTATAACGCAAGTTAAATCTTTCTTACAAAATTTATTAGCCTTATACATATTAACATACTAGAGCAGGGAGTAAAAATAGTCATAGATATATTTAATTTAAATTTAACAATTATTATGTATCACAATTTCTTTTTTTGGAATAAAAATAAGCTATTCTACATACTACTTATAACTTAAAAAGGATGAAACGCTATTCGTTTCATCCTTTTTAATACCACTTCTTGTTATGAAGGGTCAACTTGTTTAATTGCAGGTTTTTCGAAAGTTAATTCAGTACCATGACCATTAACTGTAATAACAACAGTTGTTTCATCTACTGCTTTAACAGTACCTTTAATACCACCAATAGTTGTAATTCTTTGACCAGATTGTATGTTATTAATCAACTCACGATGCTGTTTCGCACGTTTTTGTTGTGGTCTGATCATCAAGAAATACATAACCGCAAAAATTACGACTATATATATTAGTAATGAAAATTGCATTTTATACGCTCCTCTTGCTTAAAAGTTTTTTGGGTTCTCAACATTTAATCCATATTGCTCGAAAAATTCTTCTTTGAAATCTAAAAGACGATCTTCTCGAATGGCTTGTCTTATATCTTCCATTAATTTTAGCAGAAAATGTAAATTATGAATAGTAGTAAGACGAATACCAAAAGTTTCCTCTGCCTTGATTAAATGACGTATATACGCTCTTGAGTAGTTTTGACATGTATAACAGTCACAATTCTCATCTAATGGTCTTAAATCATCTGCAAATTTTGCATTTTTAATAACTAAACGACCTTGCGATGTCATACAAGTACCATTTCTGGCAATACGTGTCGGTAAGACACAATCAAACATATCCATGCCGCGAATACTACATTCGATTAACGCATCTGGAGATCCTACACCCATTAAATATCTTGGTTTATCTTTAGGCATAAACTGCTCTGTATGTTCAACCATTTTATACATAACCGGTTTAGGTTCACCAACTGACAAACCGCCGATTGCATAACCAGGAAAATCTAATTCTACTAAATCCTTTGCACTTTGTTCTCTTAAATCTTCATATTCGCCACCTTGTATAATGCCGAACAATGCTTGATCTTCAGGTCGTTGGTGTGCATCTAGACATCTTTTCGCCCAACGTGTTGTACGTTCAATAGATTTTTTTACATAATCATATTCAGCAGGCATCGGTGGACATTCATCAAATGCCATCATAATATCAGAACCTAAATCATTTTGAATTTGCATTGATTTCTCAGGACTCAAAAATAATTTAGACCCATTAGTATGATGTCTAAATTCCACGCCTTCTTCTGTAATTTTACGTAAATTACTTAAACTAAACACTTGGAAACCGCCTGAATCTGTTAGAATCGGACCATCCCAATTCATGAATTTATGTAATCCCCCAGCGTGTTTGATAATATCATTTCCAGGTTGTAACCACAAATGATATGTGTTGCCCAAAATGATTTTTGCTTCAATTTGTCTTAACTCTTCTGGACTCATTGTTTTAACGGTTGCTTTAGTACCAACTGGCATAAACATAGGCGTTTCAAATGAACCGTGTGGTGTGTGCACGATACCTAAACGCGCACCTGATTGTTTACAAGTTTTAATGTGTTCGTATGTTACTGCAGGCATATTCAAAATCCTCACATTCTTTTTATATAATTAACATTGCATCGCCAAAACTAAAGAATCTATATTCTAAATTTACTGCCGTTTTATAAGCATTCAGAACATTTTCACGAGTACTAAACGCTGATACTAGCATAACTAATGTTGATTTTGGTAAATGAAAATTAGTAATCTGGCCATCAATTGCTTTAAAATCAAATCCTGGATAAATAAATATATTAGTCCAGCCACTCGTTTCAACAAATTTATCATAATCGCGTCGAATTGTTTCAAGTGTACGTGTTGAAGTTGTACCAACTGATATAATACGATGTCCTTTGGACTTAGTATCATTTAATAAATTAGCTATTTCTTGTGTCATTTGATAATATTCACTATGCATTTCGTGGTCATTCACATCGTCGACGCTCACCGGTCTAAACGTACCTAATCCAACATGTAATGTAACAAATGCGATATTAACACCTTTATTTTTAATTTCAGTTAATAACTCATCAGTAAAATGTAATCCGGCTGTTGGTGCTGCCGCTGAACCACTTTCTTTAGCGTAAACTGTTTGATAACGATCTGGATCATCTAAACGTTCTTTGATGTATGGTGGCAGTGGCATTTCCCCTAATTCATCTAATCTTTCTTGTAAAATACCTTCATAATGTAAACGCATGATGCGTCCACCTTGATCCATTTCTTTTATACATTCAGCTATAATTTTGCCATTACCAAAATTCAATTTATTACCAACTTTAATACGCTTAGCTGGTTTCAGTAAGACTTCCCAATCATTACCTTCAATTTGAGTTAGCATTAACATTTCAACTTTTGCACCAGTTTCTTCTTTTAAACCAAAAAGTCTAGCTGGCATTACTCGCGTATCGTTAAGCACTAATGTATCACCAGGTCTAAAATACTCAATGATATCTTTGAAATGTAAATGTTTCATTTCACCAGTTTCTCTATCCATGACTAATAAACGACTATGATCACGATCTTTTAAAGGCGTTTGAGCAATTAATGATTCTGGTAAGTCATAGTCAAATTCTTCAATATTCACGTTATTCTCTCTCCTCATTCGACTTTGCAAAATGTTCATAAGCTAATGGTGTTGCTTTTCTGCCACGTGGCGTACGTTCTAAAAAGCCTTTCTGAATAAGAAATGGCTCATAAACGTCCTCAATTGTAATACGTTCTTCGCCAATTGTTACGGCAATCGTATCTAAACCAACAGGCCCACCATTATACTGCTTAATAATACAGTTCATCATTTTATGATCAATGTAATCTAGTCCGTGTTGATCAACTTGAAGTAAACCTAATGCGTGCTTTGTTGTTTCAATGTATATTTGTTCATCTTCATTCACTTGCTGGAAGTCTCTTACCCGTTTCAATAGTCGATTTGCAACTCTTGGAGTCCCTCTAGAACGTTTAGCAAGTTCAATAGCACTTTCATCATCAATACCTGTGCCCAAAACCTCAGCTGTTCTAATAATGATTTCTTTTAAATCTGATTCATTATAATATTCTAATCTTAAGTGCACACCAAATCGATCCCTTAGTGGACCTGTTAAGCTACCAGCTCGAGTTGTTGCACCTACCAAAGTGAATGGAGGTAAGTCGATACGGATACTTCTAGCCTCATCGCCTTTACCAATGATAATATCTAAAAAGAAATCTTCCATTGCAGGGTATAACACTTCTTCAACAACACTACTCAGTCTGTGTATTTCATCAATAAACAAAACATCTCCAGGTTGAAGTCCTGATAAAATTGCAGCCAAATCACCAGGTCTTTCTAATGAAGGCCCTGATACTGTACGTATATTAACTTCCATTTCATTGGCAATGATATTAGATAATGTTGTCTTACCTAATCCAGGGGGGCCAAAAAGCAATACATGATCTAATGGTTCATGACGAAGTTTAGCCGCTTTAATAAATACTTCTAAATTACTTTTTATTGAATTTTGACCAATATATTGTCGTAATCTCGTAGGTCTAAGCGACAATTCGAAATCAGTTTCTTCACTATGCATTGATTGATCAACCATACGCTCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP029084|2405789:2414833|2408806_2411086_-|WP_000749795.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_CP029084|2405789:2414833|2411360_2411621_-|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP029084|2405789:2414833|2406329_2408603_-|WP_000594987.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKAIERIKRAIVNDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNNQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKNGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGTVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDVFKKCYKALITKQETNIEKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NZ_CP029084|2405789:2414833|2413828_2414833_-|WP_001005764.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDDESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >NZ_CP029084|2405789:2414833|2411639_2412779_-|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP029084|2405789:2414833|2405789_2406308_-|WP_000364543.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATNKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_CP029084|2405789:2414833|2412801_2413827_-|WP_031928192.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQEIANLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDYDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
2538218 : 2584597
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP029084|2538218:2584597|DBSCAN-SWA ATTATGATTCTTTTTCATTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAATAATGCTGCGCCTGTAATTAGTGCTAATTCTTTTAATGGTAAATCCATTTCTTCAGAACCAGTATTTGGAAGTTCTTTTTCAACTTTGCGCACTTCTTGTTTATCTTCTTTTTTAATAGGCGTACAAACTTTTGGAGCAGGTTGCCCCACTTTTGGTGACGCTTTTATCACTTCAGCAGGTAATTTAATTGCTAAAATTTCATCAATAATGAATTGCGTATGTTGTTTGATGTCATTTAATGTCGCATCTTCATCGATCATTCTATTACCATCTGCAACATATTGATCTATTAACGCTTTCACTTTAGCCAATTGTTCTGGTGTTGCAATCGCTTTGAATTTCGCATAGGTTTGTTGCGCAATATTTTCAATGCGCATTAAGCTATGTTCTTTTTCAGTAATTACTGCTTCTATATCGCCTAATGCAACATTAAATCGTTTTAAAACCGCATCAACATCAGCATTAGTGCGTGCTGTTTTTAATTCTTCATCCATTTGTAATTTTAATGCAGTTATAGCTTTTAATGCATCTGCCTTATTACGATCACTTACTTTTCGATAATTTTGTACTAAATGCGTAACACGTGCAATATCTTGGTTGATTGTTTTTTCGGCCTCCGGTTTTTTAACAGGATGCACATCTAAACCTTGTATTGTTTGAAGATTAAATGATGCTGTTTTATCCACTTGTGCATTGCTACGGTCATGATCAAGTTGTCCGATTGCTGCGTCATAAATATTTTGTAACTGTGCTAAAACACTATTTCTTTCTTCTACCGTTGCTTGAACATTCGCTTCAATTGCTTGTTTTTTATCATTGAGCAATGTTGTCAATTGTTCTCGAGCAGACGCCTTTCTGTTAATAACAGGTTCGATTTCACGAATTTCGTTTTTCCCATCATGCAATAAATATGCCACATCAGCATTAGTCACTGCACTAGCAATGTGTTGTTTCGCTTTTATTAATGCTTGTTCTACTTGTGCTATTGCAGCATTTTGTTCTTCATCTGTCGCTTCATTATTTGATTTGATTAAATTAATTTTATGAGTAGCGATATTTTGAATTTGTTGTAACGCTGTTGTTTTAACTGTTGTTGCTGGTTTAATTTTTGAAATAATATTTTGAGCATCAATACTATTTTGATTAACTTGCGCAGTCTTATCTGCATGATTGATCTGATCAATAGCCTGATTAAGTGCTTGTTCTACTAAATGTTTAGCAGCTAATCTTTCTTCTTCGGTAGATAAATCACTTTGATCAATAAGTGCATTTTGAGCTTCAGCTTTTGCGCTGACAGATTGACGCGCTGCTGGTTTAACTTGAACTTTAGGTAAAATCACTTTGATGTTGTTGTTACCATCAGCCTCAGTTTGATCCACTTCTGCATTCGTTTTGTTTTGTGCAATATCATTTTTAATTGCATTAACAATTTTATTTAACGCAGCAATAGCAACATTTCGTTCATCTTGCGTTGTATCTAGCGTATTTCGTATTGCAGCGAGTTGATTATTATTACTTTCATCAATGTTATCCAACGCTGCACGTTTGCGTCTAACTTTCGGTTTAATTTGTTCGATTGCCTTAATCGTTTGATTTCTAACATCATTGACAGCTGCATCTTGTGTCGTATTGTCTATATTTTGTTGACCTTGTTTAAGTGTGTCATTAATTTGTTGGTTTGCTTCATCTAATTCATCAGTCGTAGCATGTGGTGTATCTTTTATAGATTCTACTTGGTTATCTGCGCTCGCTTTTATGGCTTCTTGAGCTTCAGGTTTAACCACAATGTGCGGTTCTACGCCTTTTAACGTAGCAATACCATTTGATTCAACACGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGTGCTTTTTAACCTCATATTGTTGCTTTACTGCATCTCTAGCAGTTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAATGCAATGTCGTCAAGCGCTTGATTTGTTGAGTCATTAACTTGCTGATTTGTTCTATCATTTGTGATATTTGTCATAGCTTTAGCAACTAAATCATTGATTTTATCTAACGCCGCTTGTCTTTCTTCTGCTGTCGCTTCTTTATCTTGATTAATTTGCGCACGTAATTCATTCGCTTTTTGATTGATTTTTTCACGTGCTGCTGGTTTAACTTTTGTTTCAGGTTGAATCATTTTTATCGCAGTTATACCATCTGTTGCTGCTTGATTCACCTGACTATTCGTTTGAGCTTGGTCAATAGCTGCAAGTGCTTTTTCTTTTTCTTTAGCTAATGCTTGTAAAGCAACTTCTTTCTCATTATCTGTTGAATCAAGACTATTATCAATTTGCTGTTGCTTTTCTTTAACAGCTTTTTCAATATCTGCAATTGCCTTTGGTTTAATTACTACTTCAGCTTCAACATTATCTATAGCATTAATCGCTTGATTTGTAGTTGCGTCTACCTGATCATTTGTTTGGTTTTGATTAATTTGATTAAATGCTTGATCTTTAAGTTGATTGATTTGATTAACTGCAGCCTGCTTTTCTTCGTCAGTTGCATTAGGTGTTTGTTTAACCGCTTCAATACGCTTCGCCACTTCAGCAGTGATTTTATCTCGCGCTGCTTGTTTTTTTACTACGTCAACTTGAACAGCATCGATATTATTCTCTGCCACTGTCGCAGCTTGGTCTACTTCTGCATTTGTATTAGCTAGTTTAATACTTTCAATAGCTTGTTGTCTGTCTTGATTTAAAATGTTGATTGCAGCATTCTTCTCATCATCTGTTGCATCTGGTGTAGCATTGATTTCAGCTAATTTAGCATTATAATGCTGATTGATTTGTGCTAATACTGCAGGTTTTTTAACAATATTTGGCTGAATCGCATTCATTGCTTGTTTACCTGCTTGTAATGCTTGATCTACTTCTGCATTTGTATCAGCTTGATTTATATTATTAATTGCCGTTGCTAAATCTTGATCTACTTGATTTAATGCTACTTGCTTTTCTTCATCAGTTGCATTTGTGTTTTGATTAATTTCTTGCTTTTTAGCAGTTGCTAAGTCCGTTAATACACCTGTGGCTGATTGTTTCTTCGTTACATGCGGTTGAACTGTACCGATTTGATTGACTGCATCGTCTCTAATACTATTGACCATCGCAGTAGTAGACGTCACACCAATATCAGTTAATGCTCTATTTTTAAGTGTATTGACACGATCTATTGCTTCTTGTTTCTCTTCTCGAGTCGCGCCAGGTGTAGCATTGATATTTGATATCGCCTCACGTGCTTTTTCATTTACAGTATTACGAGCATCCGTTTTAACTTGTGTCGCCGGTTGAATCGCAAGTATATTTTGTGTGCCCTGATCTTTTGCTTGTGCAACTTCTTGATTCGTATCTGCTGCATTAATATTTTGCTTCGCTGTGGCTACAGCTTGATCAAGCAATTGTTGTGCTGCTTGTTGCTCTTCTAAGGTCGCATCATTATTATTAAATATCGCATTATGTTGCGTTTCTGCACTTTGATCAATAGCGTTTTTAGCATCTGTTTTAACCTTTGTAGCTGGCTCAATGGCCTGTATTCCTTGAATCGCATTTGTCTTCACTTGCTCAACATCAGCATTGCTATTAGCATTTAAAATATTAGTATTCGCAGCAGCTACAGCAGCATTTACTTTCTCAATTGCTGCTTGTCTTTCTTCTTGAGTTGCATCAGGATTAGCATTGATCTCTGCGATATGCTGTTGTGCATCATGTGATACGGCATCTCTTGCAGCTTGCTTAACAACAGTTACAGGAGCAATTGGATTAATGACATTTAGACCATCACCTTTGGCAGTATCTACATCATCATTGGTTGTCGCTTGATTGATTTGTTCTAATGCGTGGTTTGTGGCTTGCGTTAATTCATTCAATGCTGCATTTTTCTCTTCTTGTGTTGCTTCTCTATTGCTATTTATTTGTTGTCGTTTCGTTGCTGTCGCTTGGTTAATTGCATCTCTTGCTGCTTGTTTGTGTGTCACTTGTGGCACAACTGCACCAATTGTATTAATACCATTATTTTTAGCTGTTTCAACATCAGCATTGGTAGTAGCATTCGTAACATTATCAATAGCATCTGTTTCATCCGTTGTTAATTGATTTAATGCATCTTGAATTTCGTCTTGAGTAGCATCTGGTGTGTTATTGATAATTTCTCTTTGTTTCGCTGCTTTATCACGTATAGCTTGTTTAGCATTTGGTTTAACAACCGGTGTTGCAGTATCACCACTTAAGGTCTGTATACCTTGATCCTTAATTCTAGTAACGCCATCATCAGTCGTTTGGTCACCAATATTCCCAATAATTTCATTTTTATGTTCCTCGATAACTTGAATCGCTGCTTGTTTTTCTTCATCTGTCAGTTCATCATTTTGGTTAACTAAATCTTCCATGTCATCAACTTTTCTATTAACGGCATTTTCAGCGTCAACACTACGAATTAACGTATGTTGCATCTGATTTGCTAATGAATCGATATCTGCTTGAGAAACTCTTTTGTTTAAAGGTACATTGTTACGGTTTTCATCTAAAATTGTTTGTGCGCGTCTTTTAAGATCATTAAAAATATCTAATGATGCAAATGTATAATCCGCCTGTTGAATTCGTCTATCGACTTCAGCTTGTAATGCGTCTTTATTCATGATGATATCAATTGTATATGGATTTGTACTTACAGTATGACTTTCAGCAGGTGAATTAATAAAATCTTGTGAAAATGTTTTATACGTTAATGTATCGTTAAATGTTACTGTTCTTGGTGTTGGCACATTGTTCACACGTAGCTTATACTTCAAATCCAATATTTTATCAGGCATAAGTCGTGCCGGTGAATTCCCTGAACCT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43 | Staphylococcus_phage(91.43%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
2676952 : 2771003
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP029084|2676952:2771003|DBSCAN-SWA 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113 | Staphylococcus_phage(87.01%) | tail,head,terminase,capsid,integrase,tRNA,portal,protease,holin | attL 2737798:2737815|attR 2762144:2762161 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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