Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP029649 | Staphylococcus aureus strain AR_0472 chromosome, complete genome | 11 crisprs | DinG,DEDDh,cas3,cas6,csm6,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10,cas2,cas1,WYL,csa3 | 5 | 13 | 9 | 0 |
NZ_CP029648 | Staphylococcus aureus strain AR_0472 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP029649_1 | 649777-649862 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029649_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP029649_1
>1.1|649807|26|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder CCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029649_1
The CRISPR arrays of NZ_CP029649_1 >merge|NZ_CP029649|1|649777-649862|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT >NZ_CP029649|1|1|649777-649862|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT CCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCG CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT
>NZ_CP029649.1|WP_000335234.1|648884_649601_+|superantigen-like-protein-SSL12 MCKNITKNIILTTTLLLLGTVLPQNQKPVFSFYSEAKAYSIGQDETNINELIKYYTQPHFSFSNKWLYQYDNGNIYVELKRYSWSAHISLWGAESWGNINQLKDRYVDVFGLKDKDTDQLWWSYRETFTGGVTPAAKPSDKTYNLFVQYKDKLQTIIGAHKIYQGNKPVLTLKEIDFRAREALIKNKILYNENRNKGKLKITGGGNNYTIDLSKRLHSDLANVYVKNPNKITVDVLFD >NZ_CP029649.1|WP_001063558.1|648051_648777_+|superantigen-like-protein-SSL13 MNNNITKKIILSTTLLLLGTASTQFPNTPINSSSEAKAYYINQNETNVNELTKYYSQKYLTFSNSTLWQKDNGTIHATLLQFSWYSHIQVYGPESWGNINQLRNKSVDIFGIKDHETIDSFALSQETFTGGVTPAATSNDKHYKLNVTYKDKAETFTGGFPVYEGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKSKKLYNNSYNKGQIKITGADNNYTIDLSKRLPSTDANRYVKKPQNAKIEVILEKSN >NZ_CP029649.1|WP_000739541.1|647231_647957_+|superantigen-like-protein-SSL14 MKKNIMNKLVLSTALLLLGTTSTQLPKTPISFSSEAKAYNISENETNINELIKYYTQPHLSLSNKWLWQKPNGSIHATLQTWVWYSHIQVFGSESWGNINQLRNKYVDIFGTKDEDTVEGYWTYDETFTGGVTPAATSSDKPYRLFLKYSDKQQTIIGGHEFYKGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKNKKLYNGEFNKGQIKITADGNNYTIDLSKKLKLTDTNRYVKNPKNAQIEVILEKSN >NZ_CP029649.1|WP_000793607.1|645792_646794_-|ornithine-carbamoyltransferase MKNLRNRSFLTLLDFSRQEVEFLLTLSEDLKRAKYIGTEKPMLKNKNIALLFEKDSTRTRCAFEVAAHDQGANVTYLGPTGSQMGKKETTKDTARVLGGMYDGIEYRGFSQRTVETLAEYSGVPVWNGLTDEDHPTQVLADFLTAKEVLKKDYADINFTYVGDGRNNVANALMQGAAIMGMNFHLVCPKELNPTDELLNRCKNIAAENGGNILITDDIDQGVKGSDVIYTDVWVSMGEPDEVWKERLELLKPYQVNKEMMDKTGNPNVIFEHCLPSFHNADTKIGQQIFEKYGIREMEVTDEVFESKASVVFQEAENRMHTIKAVMVATLGEF >NZ_CP029649.1|WP_110179751.1|644837_645770_-|carbamate-kinase MAKIVVALGGNALGKSPQEQLELVKNTAKSLVGLITKGHEIVISHGNGPQVGSINLGLNYAAEHNQGPAFPFAECGAMSQAYIGYQLQESLQNELHSIGMDKQVVTLVTQVEVDENDPAFNNPSKPIGLFYNKEEAEQIQKEKGFIFVEDAGRGYRRVVPSPQPISIIELESIKTLIKNDTFVIAAGGGGIPVIREQHDGFKGIDAVIDKDKTSALLGANIQCDQLIILTAIDYVYINFNTENQQPLKTTNVDELKRYIDENQFAKGSMLPKIEAAISFIENNPKGSVLITSLNELDAALEGKVGTVIKK >NZ_CP029649.1|WP_072399251.1|643109_644600_-|YfcC-family-protein MILFILTVVAVIATWVIPAGAYSKLSYEPSSQELKIVNPHNQVKKVPGTQQELDKMGVKIKIEQFKSGAINKPVSIPNTYERLKQHPAGPEQITSSMVEGTIEAVDIMVFILVLGGLIGVVQASGSFESGLLALTKKTKGHEFMLIVFVSILMIIGGTLCGIEEEAVAFYPILVPIFIALGYDSIVSVGAIFLASSVGSTFSTINPFSVVIASNAAGTTFTDGLYWRIGACIVGAIFVISYLYWYCKKIKKDPKASYSYEDKDAFEQQWSVLKDDDSAHFTLRKKIILTLFVLPFPIMVWGVMTQGWWFPVMASAFLIFTIIIMFIAGTGKSGLGEKGTVDAFVNGASSLVGVSLIIGLARGINLVLNEGMISDTILHFSSSLVQHMSGPLFIIVLLFIFFCLGFIVPSSSGLAVLSMPIFAPLADTVGIPRFVIVTTYQFGQYAMLFLAPTGLVMATLQMLNMRYSHWFRFVWPVVAFVLIFGGGLLITQVLIYS >NZ_CP029649.1|WP_000149423.1|642575_642803_-|hypothetical-protein MTHLTKVLDTLTGICVVLLFSKYFVAYANMVFDWNLRWYLLENIPHLPIILFILMFIFGVPSEMIKDRQRKNNGV >NZ_CP029649.1|WP_001239286.1|641323_642271_+|TDT-family-transporter MRLQKAPLVTSGLVLGLLGLGNLLKDLSLTLNAVCGIFAFLIWIHLLCTMIKYFNNVKEQLNSPLVSSVFTTFFMSGFLGTTYLNTFFSNITFINSLITPIWILCLVGIMTHMIIFSIKYLKDFSLENVYPSWTVLFIGIAIAGLTAPVSGYFFIGQLTVIYGFVATCIVLPIVFKRLKAFPLQTSIKPNTSTICAPFSLVAAAYVIAFPKANAFIVIIFLLLAQIFYFYIIIQLPKLLKEPFSPVFSAFTFPLVISATALKNSLPVLMFPDIWKGLLFIEVLLATVIVLRVFIGYLHFFLKKENQDKFLRNASQ >NZ_CP029649.1|WP_001245802.1|640886_641075_-|hypothetical-protein MRNQIQKLLDSDLSSLHISKQTGVPQSTIHRMRKNERSLDNMSLKNAELLYKFANSIFSNEN >NZ_CP029649.1|WP_000398672.1|637870_638005_-|beta-class-phenol-soluble-modulin MEGLFNAIKDTVTAAINNDGAKLGTSIVSIVENGVGLLGKLFGF >NZ_CP029649.1|WP_001802045.1|650045_650270_-|hypothetical-protein MLIQERGLKMTELNNIINSLQSLFESESGYKISKNSGVPYQTVQDLRNGKTKLEDARFRTIIKLYSYYVSLKEH >NZ_CP029649.1|WP_000765708.1|650226_650373_-|hypothetical-protein MKLFYIVFLIIIWLNIFLGNEIIHTLTVLITTLYIVNSRKGIKNDRVE >NZ_CP029649.1|WP_000857488.1|651045_652005_+|beta-channel-forming-cytolysin MKTRIVSSVTTTLLLGSILMNPVANAADSDINIKTGTTDIGSNTTVKTGDLVTYDKENGMHKKVFYSFIDDKNHNKKLLVIRTKGTIAGQYRVYSEEGANKSGLAWPSAFKVQLQLPDNEVAQISDYYPRNSIDTKEYMSTLTYGFNGNVTGDDTGKIGGLIGANVSIGHTLKYVQPDFKTILESPTDKKVGWKVIFNNMVNQNWGPYDRDSWNPVYGNQLFMKTRNGSMKAAENFLDPNKASSLLSSGFSPDFATVITMDRKASKQQTNIDVIYERVRDDYQLHWTSTNWKGTNTKDKWTDRSSERYKIDWEKEEMTN >NZ_CP029649.1|WP_020978131.1|652481_652715_+|hypothetical-protein MVFNDWEINVVYSGEHEVVANEKSLFVIDEFYDVAIAIYYLDGKLKVAHVNYGSDFTIDVANKVFELNIKNPNVDEH >NZ_CP029649.1|WP_001032814.1|653336_653522_+|hypothetical-protein MNKHINKKAAKLLEDYKKVQQRKSKETDRGCLKSVIMLIVLFFLIIFGIVACSTNVNFFFQ >NZ_CP029649.1|WP_000669537.1|654061_654412_-|complement-inhibitor-SCIN-B MKFKKYILTGTLALLLSSTGIATIEGNKADASSLDKYLTESQFHDKRIAEELRTLLNKSNVYALAAGSLNPYYKRTIMMNEYRAKAALKKNDFVSMADAKVALEKIYKEIDEIINR >NZ_CP029649.1|WP_000791580.1|654565_655063_-|complement-convertase-inhibitor-Efb MKNKLIAKSLLTIAAIGITTTTIASTADASEGYGPREKKPVSINHNIVEYNDGTFKYQSRPKFNSTPKYIKFKHDYNILEFNDGTFEYGARPQFNKPAAKTDATIKKEQKLIQAQNLVREFEKTHTVSAHRKAQKAVNLVSFEYKVKKMVLQERIDNVLKQGLVK >NZ_CP029649.1|WP_000584398.1|655321_655828_-|hypothetical-protein MIIKILTILLLLCILSYLVTNRKKPFLFLKTLFMGVVFIFIGYISLAISAVIIYGIIQFITIDFGSFFLMGIILILISSIFQLFIVRLLFRKKNVDLTEVVVLEHLIQWFLVYFAIYQAVNEKMDINDINIDNFQSVFFDVSNLNLVILPTLIISWVTIFNYRMRSYK >NZ_CP029649.1|WP_000739572.1|656500_656896_+|formyl-peptide-receptor MKKNITKVIIASTVIATGLLTHSNDAKAFFSYEWKGLEIAKKLADDEKKDEERADRLIKDAEKERTYTGKTVEDLYVIAKKLGKGNTIAVVRIIDGGKNGYYTFDITRPLEEHRKNIKVVAKGEIDSITWY >NZ_CP029649.1|WP_031775077.1|656876_656948_+|hypothetical-protein MRLLGIKKHTELNSCTPNVRKQC |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP029649_2 | 672608-672699 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029649_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP029649_2
>2.1|672632|44|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder GGCTTTTATGCAGTGATGCGAAGCATCATCTGTATTCCGCTGTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029649_2
The CRISPR arrays of NZ_CP029649_2 >merge|NZ_CP029649|2|672608-672699|CRISPRCasFinder CCTCTTTGATTTTTAATCATTAGAGGCTTTTATGCAGTGATGCGAAGCATCATCTGTATTCCGCTGTTCCTCTTTGATTTTTAATCATTATG >NZ_CP029649|2|2|672608-672699|CRISPRCasFinder CCTCTTTGATTTTTAATCATTAGA GGCTTTTATGCAGTGATGCGAAGCATCATCTGTATTCCGCTGTT CCTCTTTGATTTTTAATCATTATG
>NZ_CP029649.1|WP_000046704.1|671041_671308_-|cell-division-protein-ZapA MAQFKNKVNVSINDQLFTIVGEDNPEHIRYVAHLVDDKIKELGYKAAGLDTSRKAILTAVNIMHEKVLLEEENRRLKQQIHKLQQREQ >NZ_CP029649.1|WP_000234068.1|670519_671041_-|CvpA-family-protein MVIDFIIIIFFVYFVIVGFRRGFWLSMIHLSATIVSLWIASQFYKSIVERLIVFIPYPKTTAFNTTFAFHFNHLQNRFEAIVAFLMITLFCKFILYLIIVTFDKIIAYQNIHIFSRAMGMIVGVFMTIIVLHFTLYLLALYPNEALQHQLKISIVSHSLIFHIPYLSAFTINL >NZ_CP029649.1|WP_000161940.1|668734_670447_-|DNA-polymerase/3'-5'-exonuclease-PolX MTKKDVIKLLEQIATYMELKGENTFKISAYRKAAQSLELDERPLDEISDVTELKGIGKGVAEVINDYRETGESQYLQQLQEEVPEGLIPLLKIQGLGSKKIAKLYKELNIVDKASLQVACENGKVSELSGFAKKTEQNILEAVKQLGAKKDRYPIDQMRRLNQEIIDYIDTLNYIDQYSSAGSFRRFKEMSKDLDFIISTDNPKAVQQQLLNIPNKVKEVAVGNTKVSLELAYDDETIGVDFRLIEPSAFYHTLQHFTGSKEHNIRIRQLAKARDEKVSEYGIEQADGTLIQYDSEAKIYEHFNVNFIPPAMREDGSEFDKDLSNIITIDDINGDIHMHTTYSDGAFSIRDMVEANIAKGYKFMVITDHSQSLRVANGLQVERLLRQNEEIKALDKEYSEIDIYSGTEMDILPDGSLDYDDEILAQLDYVIGAIHQSFNQSEEQIMERLANACRNPYVRHIAHPTGRIIGRRDGYKPNIEQLMALAEETNTVLEINANPHRLDLNADIVRKYPNVKLTINTDAHHTNHLDFMNYGVATAQKGFVTKDRVINALSREAFKDFIENNIKLKK >NZ_CP029649.1|WP_001249293.1|666376_668725_-|endonuclease-MutS2 MRQKTLDVLEFEKIKSLVANETISDLGLEKVNQMMPATNFETVVFQMEETDEIAQIYNKHRLPSLSGLSKVSAFIHRADIGGVLNVSELNLIKRLIQVQNQFKTFYNQLVEEDEGVKYPILDDKMNQLPVLTDLFQQINETCDTYDLYDNASYELQGIRSKISSTNQRIRQNLDRIVKSQANQKKLSDAIVTVRNERNVIPVKAEYRQDFNGIVHDQSASGQTLYIEPSSVVEMNNQISRLRHDEAIEKERILTQLTGYVAADKDALLVAEQVMGQLDFLIAKARYSRSIKGTKPIFKEERTVYLPKAYHPLLNRETVVANTIEFMEDIETVIITGPNTGGKTVTLKTLGLIIVMAQSGLLIPTLDGSQLSVFKNVYCDIGDEQSIEQSLSTFSSHMTNIVEILKHADKHSLVLFDELGAGTDPSEGAALAMSILDHVRKIGSLVMATTHYPELKAYSYNREGVMNASVEFDVDTLSPTYKLLMGVPGRSNAFDISKKLGLSLNIINKAKTMIGTDEKEINEMIESLERNYKRVETQRLELDRLVKEAEQVHDDLSKQYQQFQNYEKSLIEEAKEKANQKIKAATKEADDIIKDLRQLREQKGADVKEHELIDKKKRLDDHYEAKSIKQNVQKQKYDKIVAGDEVKVLSYGQKGEVLEIVNDEEAIVQMGIIKMKLPIEDLEKKQKEKVKPTKMVTRQNRQTIKTELDLRGYRYEDALIELDQYLDQAVLSNYEQVYIIHGKGTGALQKGVQQHLKKHKSVSDFRGGMPSEGGFGVTVATLK >NZ_CP029649.1|WP_001018928.1|665889_666204_-|thioredoxin MAIVKVTDADFDSKVESGVQLVDFWATWCGPCKMIAPVLEELAADYEGKADILKLDVDENPSTAAKYEVMSIPTLIVFKDGQPVDKVVGFQPKENLAEVLDKHL >NZ_CP029649.1|WP_001788625.1|665731_665827_+|hypothetical-protein MLDYHLTFIDLLIPPFSSRKQYDDLSFNFLY >NZ_CP029649.1|WP_000390524.1|663784_665566_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrC MEDYKQRIKNKLNVVPMEPGCYLMKDRNDQVIYVGKAKKLRNRLRSYFTGAHDAKTTRLVGEIRRFEFIVTSSETESLLLELNLIKQYQPRYNILLKDDKSYPFIKITKEKYPRLLVTRTVKQGTGKYFGPYPNAYSAQETKKLLDRIYPYRKCDKMPDKLCLYYHIGQCLGPCVYDVDLSKYAQMTKEITDFLNGEDKTILKSLEERMLTASESLDFERAKEYRDLIQHIQNLTNKQKIMSSDKTIRDVFGYCVDKGWMCIQVFFIRQGNMIKRDTTMIPLQQTEEEEFYTFIGQFYSLNQHILPKEVHVPRNLDKEMIQSVVDTKIVQPARGPKKDMVDLAAHNAKVSLNNKFELISRDESRTIKAIEELGTQMGIQTPIRIEAFDNSNIQGVDPVSAMVTFVDGKPDKKNYRKYKIKTVKGPDDYKSMREVVRRRYSRVLNEGLPLPDLIIVDGGKGHMNGVIDVLQNELGLDIPVAGLQKNDKHQTSELLYGASAEIVPLKKNSQAFYLLHRIQDEVHRFAITFHRQTRQKTGLKSILDDIDGIGNKRKTLLLRSFGSIKKMKEATLEDFKNIGIPENVAKNLHEQLHK >NZ_CP029649.1|WP_000079317.1|662846_663461_-|succinate-dehydrogenase-cytochrome-B558 MAQSKNEFYLRRIHSLLGIIPIGAFLVVHLLVNHQATQGAEAFNKASNFMESLPFLIIVEFLFIYIPLLYHGLFGIHIAFTAKENVGHYSIFRNWMFFFQRVSGILTFIFIGIHLWQTRLQKAFYGKEVNYDLMHETLQHPGWAIFYIICIIAVVFHFANGLWSFLVTWGGLQSPKSQRVFTWVSLIVFLVISYIGVTAIIAFM >NZ_CP029649.1|WP_000818276.1|661028_662795_-|succinate-dehydrogenase-flavoprotein-subunit MAEKHLIVVGGGLAGLMSTIKAAEKGAHVDLFSVVPVKRSHSVCAQGGINGAVNTKGEGDSPWIHFDDTVYGGDFLANQPPVKAMTEAAPKIIHLLDRMGVMFNRTNEGLLDFRRFGGTLHHRTAYAGATTGQQLLYALDEQVRAFEVDGLVTKYEGWEFLGIVKGDDDSARGIVAQNMTTAEIETFGSDAVIMATGGPGIIFGKTTNSMINTGSAASIVYQQGAIYANGEFIQIHPTAIPGDDKLRLMSESARGEGGRIWTYKDGKPWYFLEEKYPDYGNLVPRDIATREIFDVCINQKLGINGENMVYLDLSHKDPHELDVKLGGIIEIYEKFTGDDPRKVPMKIFPAVHYSMGGLYVDYDQMTNIKGLFAAGECDFSQHGGNRLGANSLLSAIYGGTVAGPNAIDYISNIDRSYTDMDESIFEKRKAEEQERFDKLLAMRGTENAYKLHRELGEIMTANVTVVRENEKLLETDKKIVELMKRYEDIDMEDTQTWSNQAVFFTRQLWNMLVLARVITIGAYNRNESRGAHYKPEFPERNDEEWLKTTMASFQGAFEKPQFTYDDVDVSLIPPRKRDYTSKSKGGKK >NZ_CP029649.1|WP_000139712.1|660213_661029_-|succinate-dehydrogenase-iron-sulfur-subunit MTEQSVKNTPQHETQSKPKQKTVKLIIKRQDTSDSKPYEETFEIPYRENLNVIACLMEIRRNPVNIKGEKTTPVVWDMNCLEEVCGACSMVINGRARQSCSAIVDQLEQPIRLEPMNTFPVIRDLQVDRSRMFDNLKRMKAWIPIDGTYDLGPGPRMPEKKRQTAYELSKCMTCGVCLEVCPNVTENNKFVGAQAISQVRLFNLHPTGSMTKDERLNALMGTGGLQQCGNSQNCVNACPKGIPLTTSIAAMNRETTFHMFKSFFGSDHEVE >NZ_CP029649.1|WP_000908978.1|673050_675453_-|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-beta MLISNEWLKEYVTIDDSVSNLAERITRTGIEVDDLIDYTKDIKNLVVGFVKSKEKHPDADKLNVCQVDIGEDEPVQIVCGAPNVDAGQYVIVAKVGGRLPGGIKIKRAKLRGERSEGMICSLQEIGISSNYIPKSFESGIYVFSEAQVPGTDALQALYLDDQVMEFDLTPNRADALSMIGTAYEVAALYNTKMTKPDTTSNELELSANNELTVTIENEDKVPYYSARVVHDVTIEPSPIWMQARLIKAGIRPINNVVDISNYVLLEYGQPLHMFDQDAIGSQQIVVRQANEGEKMTTLDGTERELLTSDIVITNGQTPIALAGVMGGDFSEVKEQTSNIVIEGAIFDPVSIRHTSRRLNLRSESSSRFEKGIATEFVDEAVDRACYLLQTYANGKVLKDRVSSGELGAFITPIDITADKINRTIGFDLSQNDIVTIFNQLGFDTEINDDVITVQVPSRRKDITIKEDLIEEVARIYGYDDIPSTLPVFEKVTSGQLTDRQYKTRMVKEVLEGAGLDQAITYSLVSKEDATAFSMQQRQTIDLLMPMSEAHASLRQSLLPHLIEAASYNVARKNKDVKLFEIGNVFFANGEGELPDQVEYLSGILTGDYVVNQWQGKKETVDFYLAKGIVDRVSEKLNLEFSYRRADIDGLHPGRTAEILLENKVVGFIGELHPTLAADNDLKRTYVFELNFDALMAVSVGYINYQPIPRFPGMSRDIALEVDQNIPAADLLSTIHAHGGNILKDTLVFDVYQGEHLEKGKKSIAIRLNYLDTEETLTDERVSKVQAEIEAALIEHGAVIR >NZ_CP029649.1|WP_000003566.1|675452_676511_-|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-alpha MSEQQTMSELKQQALVDINEANDERALQEVKVKYLGKKGSVSGLMKLMKDLPNEEKPAFGQKVNELRQTIQNELDERQQMLVKEKLNKQLAEETIDVSLPGRHIEIGSKHPLTRTIEEIEDLFLGLGYEIVNGYEVEQDHYNFEMLNLPKSHPARDMQDSFYITDEILLRTHTSPVQARTMESRHGQGPVKIICPGKVYRRDSDDATHSHQFTQIEGLVVDKNVKMSDLKGTLELLAKKLFGADREIRLRPSYFPFTEPSVEVDVSCFKCKGKGCNVCKHTGWIEILGAGMVHPNVLEMAGFDSSEYSGFAFGMGPDRIAMLKYGIEDIRHFYTNDVRFLDQFKAVEDRGDM >NZ_CP029649.1|WP_000435372.1|676890_677631_-|RNA-methyltransferase MEQITSAQNNRIKQANKLKKKRERDKTGLALIEGVHLIEEAYQSGIVITQLFAIEPARLDQQIIAYAQEVFEINMKVAESLSGTVTPQGFFAIIEKPHYDISKAQQVLLIDRVQDPGNLGTLIRTADAAGMDAVIMEKGTTDPYQDKVLRASQGSVFHLPVMIQDLDTFITQFNGPVYGTALENAVAYKEVTSSDSFALLLGNEGEGVNPELLAHTTQNLIIPIYGKAESLNVAIAGSILLYHLKG >NZ_CP029649.1|WP_001788617.1|677870_677978_-|hypothetical-protein MVLLAFVTTIHDTDDGRFFNEHKHANNKLLKHSLI >NZ_CP029649.1|WP_000670950.1|678014_678338_-|staphylobilin-forming-heme-oxygenase-IsdG MKFMAENRLTLTKGTAKDIIERFYTRHGIETLEGFDGMFVTQTLEQEDFDEVKILTVWKSKQAFTDWLKSDVFKAAHKHVRSKNEDESSPIINNKVITYDIGYSYMK >NZ_CP029649.1|WP_001242420.1|678356_679091_-|class-B-sortase MRMKRFLTIVQILLVVIIIIFGYKIVQTYIEDKQERANYEKLQQKFQMLMSKHQAHVRPQFESLEKINKDIVGWIKLSGTSLNYPVLQGKTNHDYLNLDFEREHRRKGSIFMDFRNELKNLNHNTILYGHHVGDNTMFDVLEDYLKQSFYEKHKIIEFDNKYGKYQLQVFSAYKTTTKDNYIRTDFENDQDYQQFLDETKRKSVINSDVNVTVKDRIMTLSTCEDAYSETTKRIVVVAKIIKVS >NZ_CP029649.1|WP_001792655.1|679152_680121_-|iron-ABC-transporter-permease MMIKNKKKLLFLCLLVILIATAYISFVTGTIKLSFNDLFTKFTTGSNEAVDSIIDLRLPRILIALMVGAMLAVSGALLQAALQNPLAEANIIGVSSGALIMRALCMLFIPQLYFYLPLLSFIGGLIPFLIIILLHSKFRFNAVSMILVGVALFVLLNGVLEILTQNPLMKIPQGLTMKIWSDVYILAVSALLGLILTLLLSPKLNLLNLDDIQARSIGFNIDRYRWLTGLLAVFLASATVAIVGQLAFLGIIVPHVVRKLVGGNYRVLIPFSTVIGAWLLLVADLLGRVIQPPLEIPANAILMIVGGPMLICLICQSQRNRI >NZ_CP029649.1|WP_001220199.1|680130_681009_-|heme-ABC-transporter-substrate-binding-protein-IsdE MRIIKYLTILVISVVILTSCQSSSSQESTKSGEFRIVPTTVALTMTLDKLDLPIVGKPTSYKTLPNRYKDVPEIGQPMEPNVEAVKKLKPTHVLSVSTIKDEMQPFYKQLNMKGYFYDFDSLKGMQKSITQLGDQFNRKAQAKELNDHLNSVKQKIENKAAKQKKHPKVLILMGVPGSYLVATDKSYIGDLVKIAGGENVIKVKDRQYISSNTENLLNINPDIILRLPHGMPEEVKKMFQKEFKQNDIWKHFKAVKNNHVYDLEEVPFGITANVDADKAMTQLYDLFYKDKK >NZ_CP029649.1|WP_001246696.1|681005_682082_-|hypothetical-protein MRNVKQIATKSIIAIISLGILTYTTMIGSVLADEIKYPSAKFNQPEAKDKTELTTSIFDEKIKENKALELLIFNQENKNVTEEQKLVDEKAQLISDMTGKIYLQVKLKGQIDKEQLVFQNDKNEEFPFVIKDEKDDTIVRILIEQHMDKINMHVKTLAEKKNLDNKEMVYSIHFKEKKVQHDDAKEVPSKHQNQENNQDQLKKDIDDKKDSQKSDTKERRTSLFTEKGLNDIPVQKDKVQQDSNKKIENERPKASGTLKVENSPPTIKKVENNHKEQPKHKDEKSKKEKKKVVEKEKALPAFNRDDDSKNSSQLSSDIKELDEPNHKKQYILFAAGIVLATILLISAHLYSRKRGNQV >NZ_CP029649.1|WP_000789821.1|682081_682765_-|heme-uptake-protein-IsdC MKNILKVFNTTILALIIIIATFSNSANAADSGTLNYEVYKYNTNDTSIANDYFNKPAKYIKKNGKLYVQITVNHSHWITGMSIEGHKENIISKNTAKDERTSEFEVSKLNGKIDGKIDVYIDEKVNGKPFKYDHHYNITYKFNGPTDVAGANAPGKDDKNSASGSDKGSDGTTTGQSESNSSNKDKVENPQTNAGTPAYIYAIPVASLALLIAITLFVRKKSKGNVE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP029649_3 | 869975-870053 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029649_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP029649_3
>3.1|869998|33|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029649_3
The CRISPR arrays of NZ_CP029649_3 >merge|NZ_CP029649|3|869975-870053|CRISPRCasFinder CCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTCCACCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG >NZ_CP029649|3|3|869975-870053|CRISPRCasFinder CCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG CCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTCCA CCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG
>NZ_CP029649.1|WP_000185319.1|868797_869727_+|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MTNSSKSFTKFMAASAVFTMGFLSVPTAGAEQTNQIANKPQAIQWHTNLTNERFTTIAHRGASGYAPEHTFQAYDKSHNELKASYIEIDLQRTKDGHLVAMHDETVNRTTNGHGKVEDYTLDELKQLDAGSWFNKKYPKYARASYKNAKVPTLDEILERYGPNANYYIETKSPDVYPGMEEQLLASLKKHHLLNNNKLKNGHVMIQSFSDESLKKIHRQNKHVPLVKLVDKGELQQFNDQRLKEIRSYAIGLGPDYTDLTEQNTHHLKDLGFIVHPYTVNEKADMLRLNKYGVDGVFTNFADKYKEVIK >NZ_CP029649.1|WP_000066053.1|867176_868556_+|argininosuccinate-lyase MSNKAWGGRFEVQPEEWVDDFNASITFDQTLIDQDIEGSIAHATMLANQGIISQQDSEQIIQGLKSIQHDYHQDQIQFSASLEDIHLNIEHELIKRIGDAGGKLHTGRSRNDQVATDMHLYTKKQVQDIIALIKSLQSVIVDIASNNVDTIMPGYTHLQRAQPISFAHHIMTYFWMLQRDQQRFEDSLKRIDINPLGAAALSGTTYPIDRHETTALLNFGSLYENSLDAVSDRDYIIETLHNISLTMVHLSRFAEEIIFWSTDEAKFITLSDAFSTGSSIMPQKKNPDMAELIRGKVGRTTGHLMSMLMTLKGLPLAYNKDMQEDKEGLFDAVHTIKGSLRIFEGMIQTMTINKERLNQTVKEDFSNATELADYLVTKNIPFRTAHEIVGKIVLECIQQGHYLLDVPLATYQQHHSSIDADIYDYLQPENCLKRRQSYGSTGQSSVKQQLDVAKQLLSQ >NZ_CP029649.1|WP_000660040.1|865981_867187_+|argininosuccinate-synthase MKEKIVLAYSGGLDTSVAVQWLIDKGYDVVACCLDVGEGKDLDIVYKKALDMGAVECHIIDATKEFSDEYVSYAIKGNLMYENAYPLVSALSRPLIAKKLVEIAEKTNSVGIAHGCTGKGNDQVRFEVAIKALNPSLKAFAPVREWAWSREEEIDYAIKHNIPVSINHDSPYSIDQNLWGRANECGILEDPYAAPPEDAFDLTNALEETPDAADEIILTFDKGIPVQIDGKTYELDDLILTLNALAGKHGIGRIDHVENRLVGIKSREIYEAPAAEVILKAHKALETITLTKDVAHFKPIIEKQFAEQLYNGLWFSPLTDSLKLFIDSTQQYVSGDVRIKLFKGNAIVNGRKSPYTLYDEKLATYTKEDAFNQDAAVGFIDIYGLPTQVNAMLHGGYSNEQ >NZ_CP029649.1|WP_000148852.1|864300_865632_-|glucose-6-phosphate-isomerase MTHIQLDFSKTLEFFGEHELKQQQEIVKSIHKTIHEGTGAGSDFLGWVDLPVDYDKEEFSRIVEASKRIKENSDVLVVIGIGGSYLGARAAIEMLTSSFRNSNEYPEIVFVGNHLSSTYTKELVDYLADKDFSVNVISKSGTTTEPAVAFRLFKQLVEERYGKEEAQKRIFATTDKEKGALKQLATNEGYETFIVPDDVGGRYSVLTAVGLLPIATAGINIEAMMIGAAKAREELSSDKLEDNIAYQYATIRNILYAKGYTTEMLINYEPSMQYFNEWWKQLFGESEGKDFKGIYPSSANYTTDLHSLGQYVQEGRRFLFETVVKVNHPKYDITIEKDSDDLDGLNYLAGKTIDEVNTKAFEGTLLAHTDGGVPNMVVNIPQLDEETFGYVVYFFELACAMSGYQLGVNPFNQPGVEAYKQNMFALLGKPGFEDLKKELEERL >NZ_CP029649.1|WP_000007967.1|863400_863976_-|TVP38/TMEM64-family-protein MSFHQVEEWFEIFRQFGYLPGFILLYIRAIIPVFPLALYILINIQAYGPILGILISWLGLISGTFTVYLICKRLVNTERMQRIKQRTAVQRLISFIDRQGLIPLFILLCFPFTPNTLINFVASLSHIRPKYYFIVLASSKLVSTIILGYLGKEITTILTHPLRGILMLVVLVVFWIVGKKLEQHFMGSKKE >NZ_CP029649.1|WP_000758204.1|862871_863396_-|signal-peptidase-I MKKVVKYLISLILAIIIVLFVQTFVIVGHVIPNNDMSPSLNKGDRVIVNKIKVTFNQLNNGDIITYRRGNEIYTSRIIAKPGQSMAFRQGQLYRDDRPVDASYAKNRKIKDFSLRNFKELDGDIIPPNNFVVLNDHDNNQHDSRQFGLIDKKDIIGNISLRYYPFSKWTIQFKS >NZ_CP029649.1|WP_000711893.1|862280_862856_-|signal-peptidase-I MKKELLEWIISIAIALVIFAIIGKFIVTPYTIKGESMDPTLKDGERVAVNIIGYKTGGLEKGNVVVFHANKNDDYVKRVIGVPGDKVEYKNDTLYVNGKKQDEPYLNYNLKHKQGDYITGTFQVKDLPNANPKSNVIPKGKYLVLGDNREVSKDSRAFGLIDEDQIVGKVSFRFWPFSEFKHNFNPENTKN >NZ_CP029649.1|WP_000172378.1|858644_862121_-|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddB MTLHAYLGRAGTGKSTKMLTETKQKMKADPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDPELNGSLRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAATEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFSEKLTEQIQDFKKYAVTPEHLEHFIADKNMQTRTKNKIEDIALIYREFEQRIQNEFITGEDSLQYFIDCMPKSEWLKRADIYIDGFHNFSTIEYLIIKGLIKYAKSVTIILTTDGNHDQFSLFRKPSEVLRHIEEIANELNISIERQYFKQLYRFNNQDLKHLEQEFDALQINRVACQGHINILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYQDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNIDTKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQVNPMLRLLKTDVLTASYLKSAYLVDLLENFVLERGIYGKRWLDDELFNVEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFEQVVKLKKDVIDKILHFEKQMSQAETVKDFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGNHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVFGDETMSMERFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTMPQPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYVAMTRAKGDVTFSYSLMGSSGDDKEISPFLNQIQSLFNQLEITNIPQYHEVNPLSLMQHAKQTKITLFEALRAWLYDEIVADSWLDAYQVIRDSDHLNQGLDYLMSALTFDNETVKLGETLSKDLYGKEINASVSRFEGYQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLTNEALEEILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRRKPRTNDELIAQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSATLDLTKVYYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWADIDEDKLEQDLIKKFKLSGLVNADQTVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFIQHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETINPIEAIQNININDEFGGEQ >NZ_CP029649.1|WP_000154922.1|854990_858644_-|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddA MTIPEKPQGVIWTDAQWQSIYATGQDVLVAAAAGSGKTAVLVERIIQKILRDGIDVDRLLVVTFTNLSAREMKHRVDQRIQEASIADPANAHLKNQRIKIHQAQISTLHSFCLKLIQQHYDVLNIDPNFRTSSEAENILLLEQTIDEVIEQHYDILDPAFIELTEQLSSDRSDDQFRMIIKQLYFFSVANPNPTNWLDQLVTPYEEEAQQAQLIQLLTDLSKVFITAAYDALNKAYDLFSMMDGVDKHLAVIEDERRLMGRVLEGGFIDIPYLTDHEFGARLPNVTAKIKEANEMMVDALEDAKLQYKKYKSLIDKVKSDYFSREADDLKADMQQLAPRVKYLARIVKDVMSEFNRKKRSKNILDFSDYEHFALQILTNEDGSPSEIAESYRQHFQEILVDEYQDTNRVQEKILSCIKTGDEHNGNLFMVGDVKQSIYKFRQADPSLFIEKYQRFTIDGDGTGRRIDLSQNFRSRKEVLSTTNYIFKHMMDEQVGEVKYDEAAQLYYGAPYDESDHPVNLKVLVEADQEHSDLTGSEQEAHFIVEQVKDILEHQKVYDMKTGSYRSATYKDIVILERSFGQAHNLQQAFKNEDIPFHVNSREGYFEQTEVRLVLSFLRAIDNPLQDIYLVGLMRSVIYQFKEDELAQIRILSPNDDYFYQSIVNYINDEAADAILVDKLKMFLSDIQSYQQYSKDHPVYQLIDKFYNDHYVIQYFSGLIGGRGRRANLYGLFNKAIEFENSSFRGLYQFIRFIDELIERGKDFGEENVVGPNDNVVRMMTIHSSKGLEFPFVIYSGLSKDFNKRDLKQPVILNQQFGLGMDYFDVDKEMAFPSLASVAYKAVAEKELVSEEMRLVYVALTRAKEQLYLIGRVKNDKSLLELEQLSISGEHIAVNERLTSPNPFHLIYSILSKHQSASIPDDLKFEKDIAQVEDSSRPNVNISIIYFEDVSTETILDNNEYRSVNQLETMQNGNEDVKAQIKHQLDYQYPYVNDTKKPSKQSVSELKRQYETEESGTSYERVRQYRIGFSTYERPKFLSEQGKRKANEIGTLMHTVMQHLPFKKERISEVELHQYIDGLIDKHIIEADAKKDIRMDEIMTFINSELYSIIAEAEQVYRELPFVVNQALVDQLPQGDEDVSIIQGMIDLIFVKDGVHYFVDYKTDAFNRRRGMTDEEIGTQLKNKYKIQMKYYQNTLQTILNKEVKGYLYFFKFGTLQL >NZ_CP029649.1|WP_000670755.1|853922_854825_-|fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein MKFLSFKYNDKTSYGVKVKREDAVWDLTQVFADFAEGDFHPKTLLAGLQQNHTLDFQEQVRKAVVAAEDSGKAEDYKISFNDIEFLPPVTPPNNVIAFGRNYKDHANELNHEVERLYVFTKAASSLTGDNATIPNHKDITDQLDYEGELGIVIGKSGEKIPKALALDYVYGYTIINDITDRKAQSEQDQAFLSKSLTGGCPMGPYIVTKDELPLPENVNIVTKVNNEIRQDGNTGEMILKIDELIEEISKYVALHPGDIIATGTPAGVGAGMQPPKFLQPGDEVKVTIDNIGTLTTYIAK >NZ_CP029649.1|WP_000138487.1|870177_871422_-|Glu/Leu/Phe/Val-dehydrogenase MTENNNLVTSTQGIIKEALHKLGFDEGMYDLIKEPLRMLQVRIPVRMDDGTVKTFTGYRAQHNDAVGPTKGGVRFHPDVDEEEVKALSMWMTLKCGIVNLPYGGGKGGIVCDPRQMSIHEVERLSRGYVRAISQFVGPNKDIPAPDVFTNSQIMAWMMDEYSALDKFNSPGFITGKPIVLGGSHGRDRSTALGVVIAIEQAAKRRNMQIEGAKVVIQGFGNAGSFLAKFLYDLGAKIVGISDAYGALHDPNGLDIDYLLDRRDSFGTVTNLFEETISNKELFELDCDILVPAAISNQITEDNAHDIKASIVVEAANGPTTPEATRILTERGILLVPDVLASAGGVTVSYFEWVQNNQGYYWSEEEVNEKLREKLEAAFDTIYELSQNRKIDMRLAAYIIGIKRTAEAARYRGWA >NZ_CP029649.1|WP_000167314.1|871530_872721_-|ornithine--oxo-acid-transaminase MTKSEKIIELTNHYGAHNYLPLPIVISEAEGVWVKDPEGNKYMDMLSAYSAVNQGHRHPKIIQALKDQADKVTLVSRAFHSDNLGEWYEKICKLAGKDKALPMNTGAEAVETALKAARRWAYDVKGIEPNKAEIIAFNGNFHGRTMAPVSLSSEAEYQRGYGPLLDGFRKVDFGDVDALKAAINENTAAVLVEPIQGEAGINIPPEGYLKAIRELCDEHNVLFIADEIQAGLGRSGKLFATDWDNVKPDVYILGKALGGGVFPISVVLADKEVLDVFTPGSHGSTFGGNPLACAASIAALDVIVDEDLPGRSLELGDYFKEQLKQIDHPSIKEVRGRGLFIGVELNESARPYCEALKEEGLLCKETHDTVIRFAPPLIITKEELDLALEKIRHVFQ >NZ_CP029649.1|WP_000838035.1|873028_874156_-|NADH-dependent-flavin-oxidoreductase MKSKYEPLFDKVELPNGVELRNRFVLAPLTHISSNDDGTISDVELPYIEKRSQDVGITINAASNVSDVGKAFPGQPSIAHDSDIEGLKRLATAMKKNGAKALVQIHHGGAQALPELTPGGDVVAPSPISLKSFGQKQEHSAREMTNEEIEQAIKDFGEATRRAIEAGFDGVEIHGANHYLIHQFVSPYYNRRNDVWVNQYKFPVAVIEEVLKAKEAYGNKDFIVGYRLSPEEAESPGITMEITEELVNKISHMPIDYIHVSMMDTHATTREGKYAGQERLPLIHKWINGRMPLIGIGSIFTADEALDAVENVGVDLVAIGRELLLDYQFVEKIKDGREDEIINYFDPEREDNHHLTPNLWHQFNEGFYPLPRKDK >NZ_CP029649.1|WP_001067294.1|874517_874895_-|S1-RNA-binding-domain-containing-protein MNNYKIGQHIKVRVTGIQPYGAFVETPNHTEGLIHISEIMDDYVHNLKKFLSEGQIVKAKILSIDDEGKLNLSLKDNDYFKNYERKKEKQSVLDEIRETEKYGFQTLKERLPIWIKQSKRAIRND >NZ_CP029649.1|WP_000035058.1|875309_875903_-|peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase MANYPQLNKEVQQGEIKVVMHTNKGDMTFKLFPNIAPKTVENFVTHAKNGYYDGITFHRVINDFMIQGGDPTATGMGGESIYGGAFEDEFSLNAFNLYGALSMANSGPNTNGSQFFIVQMKEVPQNMLSQLADGGWPQPIVDAYGEKGGTPWLDQKHTVFGQIIDGETTLEDIANTKVGPQDKPLHDVVIESIDVEE >NZ_CP029649.1|WP_000781162.1|875966_876350_+|kinase MKLYRFSHKTGSYGVTIVEENGDDVLVKVEQVIKHPKQGDLHNPTETEGVFFHERKALSHFEKRYTKRSQLRDFNVDVLRYEDSLQQAITDLETKLKAQQTKHAEMSLASLARLKEDYSLQYKENFK >NZ_CP029649.1|WP_000054608.1|876480_878886_+|Na+/H+-antiporter-subunit-A MSLLHIAVILPLIFALIIPILYRFFKRIHLGWFVLPVPIVIFIYMLTLIKTTMSGNTVMKTLNWMPHFGMNFDLYLDGLGLLFSLLISGIGSLVVLYSIGYLSKSEQLGNFYCYLLLFMGAMLGVVLSDNVIILYLFWELTSFSSFLLISFWRERQASIYGAQKSLIITVFGGLSLLGGIILLAIPTQSFSIQYMIQHASEIQNSPFFIFAMILIMIGAFTKSAQFPFYIWLPDAMEAPTPVSAYLHSATMVKAGLYLIARMTPIFAASQGWVWTVTLVGLITLFWASLNATKQQDLKGILAFSTVSQLGMIMAMLGIGAISYHYQGDDSKIYAAAFTAAIFHLINHATFKGALFMITGAVDHSTGTRDVKKLGGLLTIMPISFTITVITALSMAGVPPFNGFLSKESFLETTFTASQANLFSVDTLGYLFPIIGIVGSVFTFVYSIKFIMHIFFGQYKPEQLPKKAHEVSILMLLSPAILATLVIVFGLFPGILTNSIIEPATSSINHTVIDDVEFHMFHGLTPAFISTLVIYILGILLIVTFSYWVKLLQRQPGKLTFNYWYNRSANVIPNYSEKMTNSYVTDYSRNNLVIIFGALILLTFVTIFSVPFNINFKDVSPIRIFEVCIVILLLSAAFLILFAKSRLFSIIMLSAVGYAVSVLFIFFKAPDLALTQFVVESISTALFLLCFYHLPNLNRYNEKRSFQLTNALIAGGVGLSVIIIGLIAYGNRHFESISKFYQEHVYDLAHGKNMVNVILVDFRGMDTLFESSVLGIAGLAVYTMIKLRKKRQTQGNEVKNHE >NZ_CP029649.1|WP_001081626.1|878878_879307_+|Na(+)/H(+)-antiporter-subunit-B MNRQQNDLILQFAAVIIFFMVMVFGFSLFLAGHYTPGGGFVGGLLFASSLVIITIAFDIETMRKIFPLDFKILIGIGLVFCIATPIASWFLGKNFFTHVTFDIPLFILEPVHMTTAVFFDFGVLCAVVGTVMTIIISIGENE >NZ_CP029649.1|WP_011443624.1|879318_879648_+|Na(+)/H(+)-antiporter-subunit-C MIFVSGILTAISVYLVLSKSLIRIVMGTTLLTHAANLFLITMGGLKHGTVPIYEANVKSYVDPIPQALILTAIVIAFATTAFFLVLAFRTYKELGTDNVESMKGVPEDD >NZ_CP029649.1|WP_110179755.1|879640_881137_+|Na+/H+-antiporter-subunit-D MIESNMLVLTLVIPVITAILLVFIGKRPIIKRYVALGGTLLTLVAAIINLANVVKHGPIRVELGSWKAPYSIVFVLDIFSALLIITSIIITAIVILYSYQTIGIERERYYYYFSVLFMLIGIIGAFTTGDIFNLFVFFEVFLMSSYFLLVIGSTKIQLQETIKYLLVNVVSSSFFVMGVAILYSVVGTLNLADISNKLANLSAHDSGLVNIVFILFIFVFATKAGVFPMFVWLPSAYYAPPIPIIAFFGALLTKVGVYAIARTLSLFFSDNVSFSHYVILFLALLTIIFGCVGAVAYANIKKIILYNVMIAVGVILVGVAMMTESGMIGAIYYTLHDMLVKLALFLLIGIMIKITGTADLRQFGGLIKRYPVLGWSFFIAALSLAGIPPLSGFYGKFFIVQSTFERGFYLSGVIVLLSSLVVLYSVIRIFLQGFFGQPKGYDLNNKVDVKYLTTIAIVAVVITVLYGLSADYLYPMVKAGAETFYNPSTYVKAVLGGK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP029649_4 | 966475-966552 | Unclear |
NA
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|
1 spacers
spacers of NZ_CP029649_4
>4.1|966498|32|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder TTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029649_4
The CRISPR arrays of NZ_CP029649_4 >merge|NZ_CP029649|4|966475-966552|CRISPRCasFinder TGGCGGGGCCCCAACATAAAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAAAGAA >NZ_CP029649|4|4|966475-966552|CRISPRCasFinder TGGCGGGGCCCCAACATAAAGAA TTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGT TGGCGGGGCCCCAACATAAAGAA
>NZ_CP029649.1|WP_000958224.1|965302_966235_-|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >NZ_CP029649.1|WP_000513313.1|964457_965297_-|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYVENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >NZ_CP029649.1|WP_001224795.1|963964_964450_-|acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLVGANSIILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >NZ_CP029649.1|WP_000057543.1|962517_963957_-|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYQNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >NZ_CP029649.1|WP_000134961.1|961515_962451_-|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLKDQA >NZ_CP029649.1|WP_000369722.1|959605_960517_-|RNase-adapter-RapZ MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >NZ_CP029649.1|WP_001248939.1|958613_959609_-|YvcK-family-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >NZ_CP029649.1|WP_000006551.1|957558_958503_-|DNA-binding-protein-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >NZ_CP029649.1|WP_001049165.1|956407_956995_-|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >NZ_CP029649.1|WP_000816300.1|955262_956165_+|TIGR01777-family-protein MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGIILSNEGGALQTMKLPYEYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLIKE >NZ_CP029649.1|WP_000662681.1|966840_969687_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrA 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>NZ_CP029649.1|WP_000229238.1|969694_971680_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIEEIVEGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYRTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQIRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >NZ_CP029649.1|WP_000638419.1|971948_972185_-|CsbA-family-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >NZ_CP029649.1|WP_000538141.1|972181_972832_-|HD-domain-containing-protein 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NZ_CP029649_5 | 1383770-1383872 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029649_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP029649_5
>5.1|1383794|55|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder TAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029649_5
The CRISPR arrays of NZ_CP029649_5 >merge|NZ_CP029649|5|1383770-1383872|CRISPRCasFinder CAAATTTAATACTCAATTCATATATAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTTCAAATTTAATACTCAATTCATAAA >NZ_CP029649|5|5|1383770-1383872|CRISPRCasFinder CAAATTTAATACTCAATTCATATA TAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTT CAAATTTAATACTCAATTCATAAA
>NZ_CP029649.1|WP_020978012.1|1382796_1383753_+|hypothetical-protein MLTKEFAQRVELSEKQVRKIVQHLEERGYQLSKTEYRGREATDFKEEDIELFKDIADKVKQTNSYDLAFDELEKEKDFLQVIVKNDDKNLPTNQNVAQLVEDLRLEIQKMREERHLFGQMMNQVHQQQQELKELQNQLTSKIDSNSESLKAIQTSQEAIQEAQASQAKVLAESTNKVEKNAVTEDKADSKDSKVAGVTTSTDAKTDTKAENAGDGTATKVDKEDQISATEAIEKASVEQSKNENAAETSNKEATVDADAQHDAEQQVAEAHAEASKQATSNDSLEAKAENDSTASQSEMSEPKPQEEKKGFFARLFNL >NZ_CP029649.1|WP_000394698.1|1382016_1382679_+|hypothetical-protein MEFKTIQSVKDPHYNEALKLYDTKLNLSLTEDKRIIKRSLENNKTENDYVFIVGLENDVVVSLATAHYEATTNSAFLIYLFAKDLPNHDELMTQTLHQIEHELNLLSNLVHSRSINFLMMEVPKEPADLTQDNGLIIEHRRQFLYEHQFERQTEIDYIHPTNDGHTKKVDLFLKKNIKLTKDIYGTSVKSNYILKYVFANGIAREIIYALLEEMDLRKPF >NZ_CP029649.1|WP_000763767.1|1381466_1381874_+|hypothetical-protein MADITVVNDTGELYNVINQKKSEGYLESELTIISKSKLHLNDLHDSEISLISTSGTFSDRMTKLLTGEDGEHAVLSRYNLAPDELEKYKQLILDDKMLVVAVRDKSSHKEVQEHNSAYEEIDITHFAEASKGPKA >NZ_CP029649.1|WP_000421410.1|1380375_1380954_-|xanthine-phosphoribosyltransferase MELLGQKVKEDGVVIDEKILKVDGFLNHQIDAKLMNEVGRTFYEQFKDKGITKILTIEASGIAPAIMAALHFDVPCLFAKKAKPSTLTDGYYETSIHSFTKNKTSTVIVSKEFLSEEDTVLIIDDFLANGDASLGLYDIAQQANAKTAGIGIVVEKSFQNGHQRLEEAGLTVSSLCKVASLEGNKVTLVGEE >NZ_CP029649.1|WP_000793020.1|1379107_1380376_-|purine-permease MKNLILSVQHLLAMYAGAILVPIIVGTSLKFTPEQIAYLVTVDIFMCGVATFLQANKVTGTGLPIVLGCTFTAVAPMILIGQTKGIDVLYGSLFLSGILVIIIAPFFSHLVKFFPPVVTGSVVTIIGINLMPVAMNYLAGGQGAKDYGDVKNILLGLMTLIIILVLQRFTTGFIKSIAILIGLVLGTIGAGLLGMVDINQVNHAGWLGIPVPFRFSGFSFDVTSTLVFFIVAIVSLIESTGVYHALSEITGKKLERKDFRKGYTAEGLAIVLGSIFNSFPYTAYSQNVGLVSLSGAKKNNVIYGMVVLLIICGCIPKLGALANIIPLPVLGGAMIAMFGMVMAYGVSILGHIDFKNQNNLLIIAVSVGLGTGISAVPQAFKGLGEQFAWLTQNGIVLGAISAIILNFFFNGIKYKQTEENVK >NZ_CP029649.1|WP_000264071.1|1377603_1379070_-|IMP-dehydrogenase MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF >NZ_CP029649.1|WP_000424963.1|1376037_1377579_-|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCDCKGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE >NZ_CP029649.1|WP_000592973.1|1374807_1375944_+|site-specific-integrase MIKKYKKKDGTTAYMFVAYLGTDPITGKQKRTTRRGFKTEREAKIAEAKLQTEISRNGFLNNDITTFKEVYELWLEQYQNTVRESTYQRVLTLFDTAILEHFKDVPIKKITVPYCQKVINKWNEKYSDIKAIRIYTSNVFKYAVNLKIIADNPFTHTKAPRKKEAQQDASTKYYSSDELKQFLTFVEDDPLYYAIFRTLAFTGFRRGELMALTWNDIDFTKQTISINKTCARGANYKMVIQEPKTKSSHRTISIDDKTANVLKSWRTHQRVESLKYGHNTSDKYQYVFTTVRDNKQLYPEHCNKALNLICEKHNFKRIKVHGFRHTHCSLLFEAGLSIQEVQDRLGHGDIKTTMDIYAHVTEKQRDQVADKFAKYINF >NZ_CP029649.1|WP_000431539.1|1374088_1374712_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MENRIAELRKENNMTLKQLAKELNIRDNTLSQYETGKRNPQMGLLQEIANFFGVSMEYILKATNKRDYPIADSKSAIELLERMENEKGFNYLHISKNTALNLSLWIINNMDYIKEKHPNLLYTASFLVKNTVSENKILQHYSETRIKELQIVDEIDDILLEREFYGASAEQVLEFIHQSERIGHQQTEALMNYIRDLPTEEYDDEDI >NZ_CP029649.1|WP_000466891.1|1373747_1373945_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MFGIDENLSSKLREIRARKNITLQQASKEIGISSKTLSLIENEMLVKVKRTTYEKVTKWIINEVK >NZ_CP029649.1|WP_001792089.1|1384547_1384646_-|hypothetical-protein MQLNVNMMKFDRWHKGICKQIVLNLVEKGEKG >NZ_CP029649.1|WP_000991021.1|1384730_1386119_+|L-cystine-transporter MNAFLTLINIIVLVIFIVILHMMARKHISFAKRVFTALGIGIVFGVLLHLVYGTHSNVITSTSDWFNIVGQGYVALLQMIVMPLIFISIVAAFTKIQIGEKFAKIGSLIFIFLIGTVTIAAIVGVVYALVFGLDASTINLGNAEQARGSEIAKQAKDLTAHTLPQQILELLPKNPFLDFTGQRATSTIAVVIFASFIGFAYLRVARKQPDHGELLKSAIDAIYSLVMAIVTFVLRLTPYGVLAIMANTLSTSDFGAIWTLGKFLIASYAALITMYIIHLVILSLLGISPIRYVKKTLEVLIFAFTSRSSAGALPLNVQTQTRRLGVPEGIANFAATFGLSIGQNGCAGIYPAMLAIMVAPVANVEIDLQFIVTLIAVVIISSFGVAGVGGGATFASILVLSTLNLPVALAGVLISVEPLIDMGRTALNVNDSMLAGTGTAKLTKHWDKDTFESNDNAALTSH >NZ_CP029649.1|WP_001289311.1|1386198_1386954_-|NADPH-dependent-oxidoreductase MSEHVYNLVKKHHSVRKFKNKPLSEDVVKKLVEAGQSASTSSFLQAYSIIGIDDEKIKENLREVSGQPYVVENGYLFVFVIDYYRHHLVDQHAETDMENAYGSTEGLLVGAIDAALVAENIAVTAEDMGYGIVFLGSLRNDVERVREILDLPDYVFPVFGMAVGEPADDENGAAKPRLPFDHVFHHNKYHADKETQYAQMADYDQTISEYYDQRTNGNRKETWSQQIEMFLGNKARLDMLEQLQKSGLIQR >NZ_CP029649.1|WP_000052781.1|1387445_1388015_+|peroxiredoxin MSLINKEILPFTAQAFDPKKDQFKEVTQEDLKGSWSVVCFYPADFSFVCPTELEDLQNQYEELQKLGVNVFSVSTDTHFVHKAWHDHSDAISKITYTMIGDPSQTITRNFDVLDEATGLAQRGTFIIDPDGVVQASEINADGIGRDASTLAHKIKAAQYVRKNPGEVCPAKWEEGAKTLQPGLDLVGKI >NZ_CP029649.1|WP_000930514.1|1388030_1389554_+|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F MLNADLKQQLKQLLELMEGNVEFVASLGSDEKSKELKELLTEISDMSPRLSLSEKSLKRTPSFSVNRPGEETGVTFAGIPLGHEFNSLVLAILQVSGRAPKEKQSIIDQIKNLEGSFHFETFISLTCQKCPDVVQALNLMSVINPNITHSMIDGAVFREESENIMAVPAVFLNGEEFGNGRMTIQDILSKLGSTADASEFENKEPYDVLIVGGGPASGSAAIYTARKGLRTGIVADRIGGQVNDTAGIENFITVKETTGSEFSSNLAAHIDQYDIDAMTGIRATDIEKTDEAIKVTLENGAVLESKTVIIATGAGWRKLNIPGEEQLINKGVAFCPHCDGPLFENKDVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVNHVTLFEFASELKADNVLQDRLRSLSNVDIKTNAKTTEVVGEDHVTGIRYEDMSTGEEHLLNLDGIFVQIGLLPNTSWLKDAVELNERGEIVIDRNNNTNVPGIFAAGDVTDQKNKQIIISMGAGANAALNAFDYIIRN >NZ_CP029649.1|WP_064626855.1|1391009_1391288_+|hypothetical-protein MKSDQAIKEFTSYLRKQINMKNDIEKEKYVNEIIMLLRTIPTSKLIQPIMQLFIDNAILNNVQNDALLIEKATHARNHLRLWSLQGHRDIPN >NZ_CP029649.1|WP_000746679.1|1391360_1391987_+|NDxxF-motif-lipoprotein MKKRLLLSTFLASALILTGCASDQSDNEDHHTSTGIHAPKSAKKLETKDIFNSDKKNSDISDAEMKQAIEKYLSVNSDILDNKYIMQHKLDKQIDSQTKVTEKQAETLSHLSNLAVKNDLHFKKFVTENNIPKEYKKPVELMMNYFKALNSTIANVDEDIEKLSYQPQNKINVVDVPTKYAGDVNKKQQDKIKDFLKSKGIKSDVIDK >NZ_CP029649.1|WP_000868264.1|1392242_1392626_+|hypothetical-protein MKVRITFIILSILSTIVCLFLAAMHPTGPSTVTFEQPYLFTLNIIIMVLVALPSLVLAIYDYMSFRISSAILQFLGAISWFFLSLILSLTQFTPFTLASFITSIILFTSTIITLAIGGKSVDKNDSH >NZ_CP029649.1|WP_000158377.1|1392691_1393273_-|histidine-phosphatase-family-protein MTIYLVRHGESKSNYDNKHFRSYFCGQLDVPLTDTGTKSADDLCDYFKEKQIKHVYVSDLLRTQQTFEHIFPYDIASTTTPLLRERSLGVFEGEYKDEISANPKYEKYFNDPNFKDFRHSFSQKAPEGESYEDVYQRVEHFMNHVVNEDTQQDDIVIVAHQVVIRCLMVYFNNVSREEAVDLKVENCKPYIIE >NZ_CP029649.1|WP_000211678.1|1393450_1393660_+|hypothetical-protein MTTQSFIFMNIILLDGATQRHPFFICQILAFLFPTSPHVNLLLFNPILPTFLNIIIHIDHFHANKKDDN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP029649_6 | 1524210-1524300 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029649_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP029649_6
>6.1|1524243|25|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder CAACAAAGAGAATTTCGAAAAGAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029649_6
The CRISPR arrays of NZ_CP029649_6 >merge|NZ_CP029649|6|1524210-1524300|CRISPRCasFinder TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTGTGGGCCC >NZ_CP029649|6|6|1524210-1524300|CRISPRCasFinder TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTGTGGGCCC CAACAAAGAGAATTTCGAAAAGAAA TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTGTGGGCCC
>NZ_CP029649.1|WP_000598262.1|1522618_1523788_-|CDP-glycerol-glycerophosphotransferase-family-protein MIKTTIKKLIEHSIYTTFKLLSKLPNKNLIYFESFHGKQYSDNPKALYEYLTEHSDAQLIWGVKKGYEHIFQQHNVPYVTKFSMKWFLAMPRAKAWMINTRTPDWLYKSPRTTYLQTWHGTPLKKIGLDISNVKMLGTNTQNYQDGFKKESQRWDYLVSPNPYSTSIFQHAFHVSRDKILETGYPRNDKLSHKRNDTEYINGIKTRLNIPLDKKVIMYAPTWRDDEAIREGSYQFNVNFDIEALRQALDDDYVILLRMHYLVVTRIDEHDDFVKDVSDYEDISDLYLISDALVTDYSSVMFDFGVLKRPQIFYAYDLDKYGDELRGFYMDYKKELPGPIVENQTALIDALKQIDETTNEYIEARTVFYQKFCSLEDGHASQRICQTIFK >NZ_CP029649.1|WP_000872486.1|1521626_1522343_-|D-ribitol-5-phosphate-cytidylyltransferase MKYAGILAGGIGSRMGNVPLPKQFLDLDNKPILIHTLEKFILINDFEKIIIATPQQWMTHTKDTLRKFKISDERIEVIQGGSDRNDTIMNIVKHIESTNGINDDDVIVTHDAVRPFLTHRIIKENIQAALEYGAVDTVIDAIDTIVTSKDNQTIDAIPVRNEMYQGQTPQSFNINLLKESYAQLSDEQKSILSDACKIIVETNKPVRLVKGELYNIKVTTPYDLKVANAIIRGGIADD >NZ_CP029649.1|WP_000610207.1|1520608_1521634_-|alcohol-dehydrogenase-catalytic-domain-containing-protein MINQVYQLVAPRQFEVTYNNVDIYSDYVIVRPLYMSICAADQRYYTGSRDENVLSQKLPMSLIHEGVGEVVFDSKGVFNKGTKVVMVPNTPTETDDVIAENYLKSSYFRSSGHDGFMQDFVLLNHDRAVPLPDDIDLSIISYTELVTVSLHAIRRFEKKSISNKNTFGIWGDGNLGYITAILLRKLYPESKIYVFGKTDYKLSHFSFVDDVFFINKIPEGLTFDHAFECVGGRGSQSAINQMIDYISPEGSIALLGVSEFPVEVNTRLVLEKGLTLIGSSRSGSKDFQDVVDLYIQYPDIVDKLALLKGQEFEIATINDLTEAFEADLSTSWGKTVLKWIM >NZ_CP029649.1|WP_000240920.1|1518898_1520587_-|CDP-glycerol-glycerophosphotransferase-family-protein MVKSKIYIDKIYWERVQLFVEGHSENLDLEDSNFVLRNLTETRTMKANDVKIDGNQFVCRFNVAILDNGYYLPEDKYLLVNEQELDYIAQLNPDVINDAYQNLKPEQEEEYNELETQNGKINFLLQTYLKEFRKGGISKKTVYTVTPEISSDVNEFVLDVVVTTPEVKSIYIVRKYKELRKYFRKQSFNTRQFIFKAIFNTTKFFHLKKGNTVLFTSDSRPTMSGNFEYIYNEMLRQNLDKKYDIHTVFKANITDRRGIIDKFRLPYLLGKADYIFVDDFHPLIYTVRFRRSQEVIQVWHAVGAFKTVGFSRTGKKGGPFIDSLNHRSYTKAYVSSETDIPFYAEAFGIKEKNVVPTGVPRTDVLFDEAYATQIKQEMEDELPIIKGKKVILFAPTFRGSGHGTAHYPFFKIDFERLARYCEKNNAVVLFKMHPFVKNRLNIADKHKQYFVDVSDFREVNDILFITDLLISDYSSLIYEYAVFKKPMIFYAFDLEDYITTRDFYEPYESFVPGKIVQSFDALMDALDNEDYEGEKVIPFLDKHFKYQDGRSSERLVRNLFGS >NZ_CP029649.1|WP_000975365.1|1517144_1518866_-|glycosyltransferase-family-2-protein MMKFSVIVPTYNSEKYITELLNSLAKQDFPKTEFEVVVVDDCSTDQTLQIVEKYRNKLNLKVSQLETNSGGPGKPRNVALKQAEGEFVLFVDSDDYINKETLKDAAAFIDEHHSDVLLIKMKGVNGRGVPQSMFKETAPEVTLLNSRIIYTLSPTKIYRTTLLKDNDIYFPEELKSAEDQLFTMKAYLNANRISVLSDKAYYYATKREGEHMSSAYVSPEDFYEVMRLIAVEILNADLEEAHKDQILAEFLNRHFSFSRTNGFSLKVKLEDQPQWINALGDFIQAVPERVDALVMSKLRPLLHYARAKDIDNYRTVEESYRQGQYYRFDIVDGKLNIQFNEGEPYFEGIDIAKPKVKMTAFKFDNHKIVTELTLNEFMIGEGHYDVRLKLHSRNKKHTMYVPLSVNANKQYRFNIMLEDIKAYLPKEKIWDVFLEVQIGTEVFEVRVGNQRNKYAYTAETSALIHLNNDFYRLTPYFTKDFNNISLYFTAITLTDSISLKLKGKNKIILTGLDRGYVFEEGMASVVLKDDMIMGMLSQTSENEVEILLSKDIKKRDFKNIVKLNTAHMTYSLK >NZ_CP029649.1|WP_000608831.1|1516326_1517001_-|iron-sulfur-cluster-repair-di-iron-protein-ScdA MINKNDIVADVVTDYPKAADIFRSVGIDFCCGGQVSIEAASLEKKNVDLNELLQRLNDVEQTNTPGSLNPKFLNVSSLIQYIQAAYHEPLREEFKNLTPYVTKLSKVHGPNHPYLVELKETYDTFKNGMLEHMQKEDDVDFPKLIKYEQGEVVDDINTVIDDLVSDHIATGQLLVKMSDLTSSYEPPIEACGTWRLVYQRLKALEVLTHEHVHLENHVLFKKVS >NZ_CP029649.1|WP_000925394.1|1514328_1516068_-|sensor-histidine-kinase MLLLERVGLIIILAYVLMNIPYFKNLMNRRRTWKARWQLCIIFSLFALMSNLTGIVIDHQHSLSGSVYFRLDDDVSLANTRVLTIGVAGLVGGPFVGLFVGVISGIFRVYMGGADAQVYLISSIFIGIIAGYFGLQAQRRKRYPSIAKSAMIGIVMEMIQMLSILTFSHDKAYAVDLISLIALPMIIVNSVGTAIFMSIIISTLKQEEQMKAVQTHDVLQLMNQTLPYFKEGLNRESAQQIAMIIKNLMKVSAVAITSKNEILSHVGAGSDHHIPTNEILTSLSKDVLKSGKLKEVHTKEEIGCSHPNCPLRAAIVIPLEMHGSIVGTLKMYFTNPNDLTFVERQLAEGLANIFSSQIELGEAETQSKLLKDAEIKSLQAQVSPHFFFNSINTISALVRINSEKARELLLELSYFFRANLQGSKQHTITLDKELSQVRAYLSLEQARYPGRFNININVEDKYRDVLVPPFLIQILVENAIKHAFTNRKQGNDIDVSVIKETATHVRIIVQDNGQGISKDKMHLLGETSVESESGTGSALENLNLRLKGLFGKSAALQFESTSSGTTFWCVLPYERQEEE >NZ_CP029649.1|WP_000645456.1|1513585_1514326_-|DNA-binding-response-regulator MKALIIDDEPLARNELTYLLNEIGGFEEINEAENVKETLEALLINQYDIIFLDVNLMDENGIELGAKIQKMKEPPAIIFATAHDQYAVQAFELNATDYILKPFGQKRIEQAVNKVRATKAKDDNSASAIANDMSANFDQSLPVEIDDKIHMLKQQNIIGIGTHNGITTIHTTNHKYETTEPLNRYEKRLNPAYFIRIHRSYIINTKHIKEVQQWFNYTYMVILTNGVKMQVGRSFMKDFKASIGLL >NZ_CP029649.1|WP_001792906.1|1513029_1513473_-|antiholin-like-murein-hydrolase-modulator-LrgA MVVKQQKDASKPAHFFHQVIVIALVLFVSKIIESFMPIPMPASVIGLVLLFVLLCTGAVKLGEVEKVGTTLTNNIGLLFVPAGISVVNSLGVISQAPFLIIGLIIVSTILLLICTGYVTQIIMKVTSRSKGDKVTKKIKIEEAQAHD >NZ_CP029649.1|WP_000607067.1|1512335_1513037_-|antiholin-like-protein-LrgB MINHLALNTPYFGILLSVIPFFLATILFEKTNRFFLFAPLFVSMVFGVAFLYLTGIPYKTYKIGGDIIYFFLEPATICFAIPLYKKREVLVKHWHRIIGGIGIGTVVALLIILTFAKLAQFANDVILSMLPQAATTAIALPVSAGIGGIKELTSLAVILNGVIIYALGNKFLKLFRITNPIARGLALGTSGHTLGVAPAKELGPVEESMASIALVLVGVVVVAVVPVFVAIFF >NZ_CP029649.1|WP_000167984.1|1524838_1526533_-|CDP-glycerol-glycerophosphotransferase-family-protein MTKTKQAIHIDNIYWERVQLYIEGHSEGVDLTSGQFVLRNLTETKTLEANEMKIDGNTFICRFNVAILDDGYYLPMDKYLFVYHDQLEYIGQLNPNIIDQAYAALNEEQIEEYNELTTQNGKVNYLLAYDAKVFRKGGVSQHTVYTITPEIASDVNEFVFDIEITLPQEKSGVIATSAHWLHKQGHKASFESRSFLFKAIFNITKLLHIKRSKTILFTSDSRPNLSGNFKYVYDELLRQKVDFDYDIKTVFKANITDRRKWRDKFRLPYLLGKADYIFVDDFHPLIYTVRFRPSQEIIQVWHAVGAFKTVGFSRTGKKGGPFIDSLNHRSYTKAYVSSETDIPFYAEAFGIREENVVPTGVPRTDVLFDETYATQIKQEMEDELPIIKGKKVILFAPTFRGNGHGTAHYPFFKIDFERLARYCEKNNAVVLFKMHPFVKNRLNISREHRQYFIDVSDYREVNDILFVTDLLISDYSSLIYEYAVFKKPMIFYAFDLEDYITTRDFYEPYESFVPGKIVQSFDALMDALDNEDYEVEKVVPFLDKHFKYQDGRSSERLVKDLFRR >NZ_CP029649.1|WP_000610188.1|1526554_1527580_-|alcohol-dehydrogenase-catalytic-domain-containing-protein MINQVYQLVAPRQFDVTYNNVDIYGNHVIVRPLYLSICAADQRYYTGRRDENVLRKKLPMSLVHEAVGEVVFDSKGVFEKGTKVVMVPNTPTEQHHIIAENYLASSYFRSSGYDGFMQDYVVMAHDRIVPLPNDIDLSTISYTELVSVSYHAIQRFERKSIPLKTSFGIWGDGNLGYITAILLRKLYPEAKTYVFGKTDYKLSHFSFVDDIFTVNQIPDDLKIDHAFECVGGKGSQVALQQIVEHISPEGSIALLGVSELPVEVNTRLVLEKGLTLIGSSRSGSKDFEQVVDLYRKYPDIVEKLALLKGHEINVCTMQDIVQAFEKDLSTSWGKTVLKWTI >NZ_CP029649.1|WP_000638475.1|1527572_1528289_-|2-C-methyl-D-erythritol-4-phosphate-cytidylyltransferase MIYAGILAGGIGSRMGNVPLPKQFLDIDNKPILIHTIEKFILVSEFNEIIIATPAQWISHTQDILKKYNITDQRVKVVAGGTDRNETIMNIIDHIRNVNGINNDDVIVTHDAVRPFLTQRIIKENIEVAAKYGAVDTVIEAIDTIVMSKDKQNIHSIPVRNEMYQGQTPQSFNIKLLQDSYRALSSEQKEILSDACKIIVESGHAVKLVRGELYNIKVTTPYDLKVANAIIQGDIADD >NZ_CP029649.1|WP_000645601.1|1528816_1529860_-|galactitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKALKLYGVEDLRYEDNEKPVIESANDVIIKVRATGICGSDTSRYKKMGPYIKGMPFGHEFSGVVDAIGSDVTHVNVGDKVTGCPAIACYQCGYCLKGEYARCEKLFVIGSYEPGSFAEYVKLPAQNVLKVPDNVDYIEAAMVEPSAVVAHGFYKSNIQPGMTVAVMGCGSIGLLAIQWARIFGAAHIIAIDIDAHKLDIATSLGAHQTINSKEENLEKFIENHYANQIDLAIESSGAKVTIGQILTLPKKGGEVVLLGIPYDDIEIDRVHFEKILRNELTVCGSWNCLSSNFPGKEWTATLHYMKTKDINVKPIISHFLPLEKGPETFDKLVNKKERFDKVMFTIY >NZ_CP029649.1|WP_000230358.1|1529883_1530030_-|hypothetical-protein MVESMLTFMLGPLRQITDFYMEHLLVSNSIVIAGYFATGIFKKKKVVN >NZ_CP029649.1|WP_000646203.1|1530031_1531087_-|zinc-binding-dehydrogenase MKALVKTREGHGNLELLDKEVATPLDDKVKIKVHYAGICGTDIHTYEGHYKVNFPVTLGHEFSGEIVEVGADVKDFKVGDRVTSETTFYVCNECEYCKSKDYNLCNHRKGIGTQVDGAFTNYVIAREESLHHIPDEVSYQSAAMTEPLACAHHGVSKIQVNSGDVAVVMGPGPIGLLVAQVLKSKGATVVVTGLDNDKVRLDKAEALHMDYVVNLQQTDLKTYINGITDGYGADVVVECSGAVPAARQGLDILRKKGFYSQIGIFKDAEIPFDMEKVIQKEITVVGSRSQKPADWEPSLQLMADGLVNAEALVTKIYDISKWDEAYQHLKSGEGIKALLKPLDLDENEGEN >NZ_CP029649.1|WP_020977989.1|1531104_1532364_-|PTS-galactitol-IIC-component MSYFTDFVRGFLDLGATVILPVVIFLLGLFFRQKIGAAFRSGLTIGVAFVGIFLVIDLLVKNLGPAAQAMVKNLGVSLNVIDVGWPATSSIAWASSVAAFIIPLGIIVNVVLLVTKVTKTMNVDIWNFWHYTFTAAMVYAVSGSIWQALLAAVIFQVICLKVADWTAPMMSEFFDLPGVSIATGSTISYAPGIYLVKLLQKVPGLNKLDADPETIQKRFGAFGESIFVGLILGLGIGVLAGYKPGDIINLGMSMAAVMVLMPRMVKILMEGLMPVSESARTWLNKRFGEREIYIGLDAAVALGHPAVISTALILVPITVLLAVILPGNQVLPFDDLATIPFVVAFIVGAARGNIIHSVIVGTIMIAISLYIATDVAPIFTDMAKGTNVQMPKGSSEISSIDQGGNIVNYLIFKLFSLFN >NZ_CP029649.1|WP_000815795.1|1532590_1532869_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MKQVLVACGAGIATSTVVNNAIEEMAKEHNIKVDIKQIKITEVGPYEDTADLLVTTAMTKKEYKFPVINARNFLTGIGIEETKQQILTELQK >NZ_CP029649.1|WP_000531476.1|1532891_1533359_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MGQQLVHKENIMLNLSATDKESVLSQMSDVLFQNGFVKSTFKDAVIDREKEFATGLPTHLCSVAIPHTDVEHINHRTIGVAVLEKEVPFIEMGTLDQQTEVKIVFMLAMDKVDDQLKLLQQLMQIFQSEEKLEQILRTKDETILATLINDYLEYN >NZ_CP029649.1|WP_001012739.1|1533343_1535440_-|transcription-antiterminator 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP029649_7 | 1725199-1725450 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029649_7
|
3 spacers
spacers of NZ_CP029649_7
>7.1|1725236|32|NZ_CP029649|CRT GCATAAAGTTTTGATATACACGATCGAATATG >7.2|1725305|37|NZ_CP029649|CRT AGTGGTCCAGAATTAATACATGGTAAAGGAGTATATC >7.3|1725379|35|NZ_CP029649|CRT TGAAGACCAATTAGAATCATATCGCGTCTTAGAAG >7.4|1725236|36|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder GCATAAAGTTTTGATATACACGATCGAATATGAGTT >7.5|1725305|41|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder AGTGGTCCAGAATTAATACATGGTAAAGGAGTATATCAGTT >7.6|1725379|39|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder TGAAGACCAATTAGAATCATATCGCGTCTTAGAAGAGTT >7.7|1725306|36|NZ_CP029649|PILER-CR AGTGGTCCAGAATTAATACATGGTAAAGGAGTATAT >7.8|1725381|33|NZ_CP029649|PILER-CR GAAGACCAATTAGAATCATATCGCGTCTTAGAA |
cas6,csm6,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10,cas2,cas1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029649_7
The CRISPR arrays of NZ_CP029649_7 >merge|NZ_CP029649|7|1725199-1725450|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR GATCCTCGTCCCCTCTTCTACGGGGTAGTTATCGAATGCATAAAGTTTTGATATACACGATCGAATATGAGTTCTCGTCCCCTCTTCTACGGGGTAGTTATCGAATAGTGGTCCAGAATTAATACATGGTAAAGGAGTATATCAGTTCTCGTCCCCTCTTCTACGGGGGTAGTTATCGAATGAAGACCAATTAGAATCATATCGCGTCTTAGAAGAGTTCTCGTCCCCTCTTCTACGGGGTAGTTATCGAAT >NZ_CP029649|7|1|1725199-1725450|CRT GATCCTCGTCCCCTCTTCTACGGGGTAGTTATCGAAT GCATAAAGTTTTGATATACACGATCGAATATG AGTTCTCGTCCCCTCTTCTACGGGGTAGTTATCGAAT AGTGGTCCAGAATTAATACATGGTAAAGGAGTATATC AGTTCTCGTCCCCTCTTCTACGGGGGTAGTTATCGAA TGAAGACCAATTAGAATCATATCGCGTCTTAGAAG AGTTCTCGTCCCCTCTTCTACGGGGTAGTTATCGAAT >NZ_CP029649|7|7|1725203-1725450|CRISPRCasFinder CTCGTCCCCTCTTCTACGGGGTAGTTATCGAAT GCATAAAGTTTTGATATACACGATCGAATATGAGTT CTCGTCCCCTCTTCTACGGGGTAGTTATCGAAT AGTGGTCCAGAATTAATACATGGTAAAGGAGTATATCAGTT CTCGTCCCCTCTTCTACGGGGGTAGTTATCGAA TGAAGACCAATTAGAATCATATCGCGTCTTAGAAGAGTT CTCGTCCCCTCTTCTACGGGGTAGTTATCGAAT >NZ_CP029649|7|1|1725267-1725450|PILER-CR GAGTTCTCGTCCCCTCTTCTACGGGGTAGTTATCGAATA GTGGTCCAGAATTAATACATGGTAAAGGAGTATATC AGTTCTCGTCCCCTCTTCTACGGGGGTAGTTATCGAATG AAGACCAATTAGAATCATATCGCGTCTTAGAAG AGTTCTCGTCCCCTCTTCTACGGGGTAGTTATCGAAT
>NZ_CP029649.1|WP_000251226.1|1723121_1724057_-|DUF4297-domain-containing-protein MVRENGGANAQRGFNYQNCVISLVAIRNYKKPNFKIYVEADEDFEVNYGDDYHACIQVKGEKNLTFNKLLKGENGKLSIFEKNLSSGKSDSVYKIVVFSFSRKDMESMQEQTDEEELFSNSWLLSNDQKNKVNNDRVENFSLVKTAFDNDMKNARIYLKGELVQQNIVVEGRAEVILNELFQQILQKSEKKVQTEQDKELKKITSKELDLILQKITAKARFEKELKNLRFNSLKEEKIKKEEKKIILEYMAVKKAVIRFLKSDEEKLENNSISTLISETFNLSEMNCLSENTKYAIAISAYCDILEEIAYE >NZ_CP029649.1|WP_064138164.1|1721455_1723129_-|hypothetical-protein MNKLTIISLSILDNKEKKANKFEFSEKSNLIISERNGEGKSSLIKSIQYCLGSNLKAFPKGWDYKNYVFQLEIVIDKNKILIQRYNNIITVLDDGKIKKFGYLKDYSDWFQDKMEMNLKLVSKNKNTSSLASLEAILSPLYIDQDKSWDGILYKNSFEGLAQYKSQSFPKEVFEYYLGISNNIMNDKINKLNKYREKSKEKKVKIEQVDSVYKNYSSQKNISKTIPKEFEEFKKQVDFYIKETDRFSQMITQKTDKLSKEKMKLDILQQDREELRKLLTKTKKRLSEVSYECTYCHSVLTRGQSLTRMELDDNKIEILLRKDSINQEIIKIENNIQKKLIEIQNLENQFELYHERLSELKQLSNIDNYVNQKVLQELETLKIEEVIELKEIDQEIKSLRNEISKLKKSLKTDLENINQKFKKLKNKISLQMETTGLSEKKVLNFNKLNGSGTFLNKDLLTLYLVYMNLLDSMEDFGLPFAIDSFVKNETDSIALEKMFGAIDKYFLTLNNQTFFSIIKENLKFIENPVNEIKIERPLLKEKFFSDIEKELIQNLNIL >NZ_CP029649.1|WP_001822528.1|1720276_1721209_+|tRNA-dihydrouridine-synthase MEDVTDIVFRHVVSEAARPDVFFTEFTNTESFCHPEGIHSVRGRLTFSEDEHPMVAHIWGDKPEQFRETSIQLAKMGFKGIDLNMGCPVANVAKKGKGSGLILRPDVAAEIIQATKAGGLPVSVKTRLGYYEIDEWKDWLKHVFEQDIANLSIHLRTRKEMSKVDAHWELIEAIKNLRDEIAPNTLLTINGDIPDRKTGLELAEKYGIDGVMIGRGIFHNPFAFEKEPREHTSKELLDLLRLHLSLFNKYEKDEIRQFKSLRRFFKIYVRGIRGASELRHQLMNTQSIAEARALLDEFEAQMDEDVKIEL >NZ_CP029649.1|WP_000398680.1|1719710_1719914_-|hypothetical-protein MEGLKHSLKSLGWWDLFFAIPMFLLFAYLPNYNFITIFLNIVIIIFFSIGLILTTHIIIDKIKSNTK >NZ_CP029649.1|WP_000179888.1|1719365_1719662_-|TfoX/Sxy-family-protein MATEKDINDLFLNHVNSNAVKTRKMMGEYIIYYDGVVIGGLYDNRLLVKATKSAQQKLQDNTLVSPYPGAKEMILIPDFTEATNLTDLFKTIKNDLKN >NZ_CP029649.1|WP_000908959.1|1718554_1719157_-|hypothetical-protein MLISLVTPVFALLVIGGIIWVIIEGIVHISKKNKAIDNFLNQVNKVSETYKFATTFLFLILATAGISQFYLYYIVSAFLFWLVILTFGIAGIIFLMPYGLCFLPFYKQKKKKQTFKKYMVYTTIGLSICLGLSLVLVHTTKIYMDEGGVRYYYGSFVMKQAGGYAYLALAVLSTLLIVAKKATNKNKEIETVDNTNIMER >NZ_CP029649.1|WP_000814441.1|1717348_1718263_+|alpha/beta-hydrolase MKQSVNFKSKTNLLAANLYTPEQFDESKKYPAITVCHPGGGVKEQTAGMYAEKLAEFGYVTVVYDASHQGESEGSPRYLEDPFARTEDVRASVDYLTTLDFVDNDRIGALGVCAGGGYTVSAARTERRIKALATVSMVDIGALFRKGPGDVVSIDDQLAFMTQVADQRTAEANGADYGITGYVPEEIDDSMPENSTMVQGHDYYLTARGQHKNAPNKLLLRSFSEVLTFAPFTYIDELLTQPFLAIAGTEADTIEYSVDAVEKAAGDNNELYKIEGASHVDLYDIPEYVNQVLPKLESFYKETL >NZ_CP029649.1|WP_020977952.1|1716615_1717170_-|TetR-family-transcriptional-regulator MNVGDLRVVKTRASIKKAFITLLFEKDFDTISIKEITEFAQIGRKTFYLHYIDKYDLLDQIVSEKLTELEQISEAKKSLGIQEGTQLWFEFFENNRTFFMKIFNINNASNYKKKLLHFIEEEFKKKVPTRVATEKGLDYDLYINFISNGIIGLLDIYLNSSENTEEQEKITLQVSRLLSLYDLI >NZ_CP029649.1|WP_001181358.1|1715648_1716380_-|methyltransferase-domain-containing-protein MQNRNDFIEKLLDRAQIKDGMRVLDIGCATGEVTQLIAKRVGANGEVVGVDVNESLLKIANENNQYNNVSYQYSDIYQLPETMGHFDAIVGRRVLMYLPDAEKCLQILKSILKPEGILCFQESDAINTGVGADALPLHQSAIQWIWETVKQEGGNIHIGQNLYNLFNNNGMHVVDYFAEAVIQTSMDNDLAWLVDVMLPRMKAHGVINDDFSLDEFKSNLEQEAINNQCAFIRDMAFGIIGKA >NZ_CP029649.1|WP_000410569.1|1715010_1715493_-|hypothetical-protein MEKFNNWILNAISGSQTDKNETTKELKGSKFIILYAYSMLVLLALVVSNIFIHILEPKLSITTQIITVLILIEALIGLRFLKAYDVKRGKDKENKKNSKDFVKLKSILVAILFTSLALTAGTVADIYGFTDLGNTRSDLIVWSIGGIIFGLVCYTMEDKK >NZ_CP029649.1|WP_000608705.1|1725584_1726319_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MINKITVELDLPDSIRFQYLGSILHGVLMDYLPNDIADQLHHEFAYSPLKQRIYHKNKKVIWEIVCMSDRLFNEIAELFTSKNRLFLKYYQVYIEIYSFNIEKVNVQNIMNQLLETEELNRYVRINIQTPMSFKYQSNYMIFPEVKRFFRSIMIQFDAFFEEYKMYDKETLDFLEKNINIVDYKLKSTRFNLEKVKIPSFTGEIVFKIKGPLPFLQLTHFLLKFGEFSGSGMKTSLGMGKYSII >NZ_CP029649.1|WP_000865879.1|1726315_1727584_-|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm6 MKVLFSPIGNSDPWSNDRDGAMLHIVRHYKPDVVVLFFTESIWNGNRNIPGRKNFDWENIVSKVSSRTKVDIKVDSIKYENDFDSYKDIFHFYINEIRTKYSDAEILLNVTSGTPQMESTLCLEYISNPHNMKCIQVSTPAPIEGPKRSFAKLETVTEDLNKVNANEKMASNRSKSINIISFREVMVRSQIKSLVNNYDYEGALNLVSDQKSFRNGKLLRKRLLELTNQIKTHEVFPEINDKYRSVALKKSLFHYLLLNMRYNRLDVAETLIRVKSIAEFILKTYIVGHWPTLIIEKDDKPYLNAEDNLSFIYKYKLLLEKRRQNLDVSRILGLPAFIDILTVLEPNSKLLKEVNAVNDINGLRNSIAHNLETLDLDKNKNYKKIMLSVEAIKNMLHISFPEIEEKDYNYFERKNKEFRELL >NZ_CP029649.1|WP_000153149.1|1727583_1728606_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 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>NZ_CP029649.1|WP_000655859.1|1733193_1734099_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKDVIYVENHYFVTVKENSIKFRNVIDKSEKFYLFEEIEAIIFDHYKSYFSHKLVIKCIENDIAIIFCDKKHSPLTQLISSYGMTHRLQRIQSQFQLSGRTRDRIWKKIVVNKIINQSKCLENNLHNENVKLLVNLAKDVSSGDKSNKEAQAARIYFKDLYGKQFKRGRYNDIINSGLNYGYSILRSFIKKELALHGFEMSLGINHRSKENPFNLADDIIEVFRPFVDNIVYEIVFKKNINTFDVNEKKLLLNVLYEKCIIDKKVVRLLDSVKIVIQSLIRCYEENTPTYLLLPKMIEVGN >NZ_CP029649.1|WP_072093071.1|1735476_1735788_+|DUF3387-domain-containing-protein MLSDDFLKDVEGLKQKNVAVELLNRLLKGQVKSLMKTNATVSKRFSEMLRNSINKYNSRSIETSKVIEELIQLAKDIKQEQQRGNELGLNSDEIAFLRCFSFT |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP029649_8 | 1734173-1735063 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029649_8
|
12 spacers
spacers of NZ_CP029649_8
>8.1|1734209|35|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT ACCGACGTTTTATTACCTATTGAGCAACTATTACC >8.2|1734280|33|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT TACAAATGAATTAATCAGTGACATGAAAGATGA >8.3|1734349|35|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT CCTAAAATATTTTTATTAGGTAATGCCGTTAACTT >8.4|1734420|36|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT TAGAAAAAAGGAGGGTGTTATTCATGGAAGAAATAT >8.5|1734492|36|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT TGATGTAAGAGAAATGATGAAAGATGACGAAGTTGT >8.6|1734564|35|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT CAAGAATTTAAAGATAACGAATTGAACGGGTTTAT >8.7|1734635|37|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT ACAGGATTGTATCTTTTAATAGAGAACAACACTATTA >8.8|1734708|36|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT GTAGACAGACACATAAAAAATTATGTAAATAGTATA >8.9|1734780|34|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT ATCGGAATTAATGAACTTATAGAATTAGAAAATT >8.10|1734850|34|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT CAAGATCATAGATGATCTGAAAGGGTGGAAAAAA >8.11|1734920|36|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT AGATAATCTAGGTATCGGAATTAATGAACTTATAGA >8.12|1734992|36|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT CAAAGTAGAACAATTAGCAGAAATGGCGAGAGAAGT >8.13|1734280|34|NZ_CP029649|PILER-CR TACAAATGAATTAATCAGTGACATGAAAGATGAG >8.14|1734349|36|NZ_CP029649|PILER-CR CCTAAAATATTTTTATTAGGTAATGCCGTTAACTTA >8.15|1734420|37|NZ_CP029649|PILER-CR TAGAAAAAAGGAGGGTGTTATTCATGGAAGAAATATA >8.16|1734492|37|NZ_CP029649|PILER-CR TGATGTAAGAGAAATGATGAAAGATGACGAAGTTGTA >8.17|1734564|36|NZ_CP029649|PILER-CR CAAGAATTTAAAGATAACGAATTGAACGGGTTTATA >8.18|1734635|38|NZ_CP029649|PILER-CR ACAGGATTGTATCTTTTAATAGAGAACAACACTATTAA |
cas1,cas2,cas10,csm2gr11,csm3gr7,csm4gr5,csm5gr7,csm6,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029649_8
The CRISPR arrays of NZ_CP029649_8 >merge|NZ_CP029649|8|1734173-1735063|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CACTCTGTCCCCTGTTATTCGGGATAGTTATCGATCACCGACGTTTTATTACCTATTGAGCAACTATTACCGTTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATCTACAAATGAATTAATCAGTGACATGAAAGATGAGTTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATCCCTAAAATATTTTTATTAGGTAATGCCGTTAACTTATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATCTAGAAAAAAGGAGGGTGTTATTCATGGAAGAAATATATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATCTGATGTAAGAGAAATGATGAAAGATGACGAAGTTGTATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATCCAAGAATTTAAAGATAACGAATTGAACGGGTTTATATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATCACAGGATTGTATCTTTTAATAGAGAACAACACTATTAATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATCGTAGACAGACACATAAAAAATTATGTAAATAGTATAATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATCATCGGAATTAATGAACTTATAGAATTAGAAAATTATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATCCAAGATCATAGATGATCTGAAAGGGTGGAAAAAAATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATCAGATAATCTAGGTATCGGAATTAATGAACTTATAGAATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATCCAAAGTAGAACAATTAGCAGAAATGGCGAGAGAAGTATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC >NZ_CP029649|8|8|1734173-1735063|CRISPRCasFinder CACTCTGTCCCCTGTTATTCGGGATAGTTATCGATC ACCGACGTTTTATTACCTATTGAGCAACTATTACC GTTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC TACAAATGAATTAATCAGTGACATGAAAGATGA GTTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC CCTAAAATATTTTTATTAGGTAATGCCGTTAACTT ATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC TAGAAAAAAGGAGGGTGTTATTCATGGAAGAAATAT ATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC TGATGTAAGAGAAATGATGAAAGATGACGAAGTTGT ATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC CAAGAATTTAAAGATAACGAATTGAACGGGTTTAT ATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC ACAGGATTGTATCTTTTAATAGAGAACAACACTATTA ATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC GTAGACAGACACATAAAAAATTATGTAAATAGTATA ATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC ATCGGAATTAATGAACTTATAGAATTAGAAAATT ATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC CAAGATCATAGATGATCTGAAAGGGTGGAAAAAA ATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC AGATAATCTAGGTATCGGAATTAATGAACTTATAGA ATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC CAAAGTAGAACAATTAGCAGAAATGGCGAGAGAAGT ATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC >NZ_CP029649|8|2|1734173-1735063|CRT CACTCTGTCCCCTGTTATTCGGGATAGTTATCGATC ACCGACGTTTTATTACCTATTGAGCAACTATTACC GTTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC TACAAATGAATTAATCAGTGACATGAAAGATGA GTTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC CCTAAAATATTTTTATTAGGTAATGCCGTTAACTT ATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC TAGAAAAAAGGAGGGTGTTATTCATGGAAGAAATAT ATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC TGATGTAAGAGAAATGATGAAAGATGACGAAGTTGT ATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC CAAGAATTTAAAGATAACGAATTGAACGGGTTTAT ATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC ACAGGATTGTATCTTTTAATAGAGAACAACACTATTA ATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC GTAGACAGACACATAAAAAATTATGTAAATAGTATA ATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC ATCGGAATTAATGAACTTATAGAATTAGAAAATT ATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC CAAGATCATAGATGATCTGAAAGGGTGGAAAAAA ATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC AGATAATCTAGGTATCGGAATTAATGAACTTATAGA ATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC CAAAGTAGAACAATTAGCAGAAATGGCGAGAGAAGT ATTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC >NZ_CP029649|8|2|1734245-1734707|PILER-CR TTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC TACAAATGAATTAATCAGTGACATGAAAGATGAG TTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC CCTAAAATATTTTTATTAGGTAATGCCGTTAACTTA TTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC TAGAAAAAAGGAGGGTGTTATTCATGGAAGAAATATA TTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC TGATGTAAGAGAAATGATGAAAGATGACGAAGTTGTA TTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC CAAGAATTTAAAGATAACGAATTGAACGGGTTTATA TTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC ACAGGATTGTATCTTTTAATAGAGAACAACACTATTAA TTCTCGTCCCCTGTTATTCGGGGTAGTTATCGATC
>NZ_CP029649.1|WP_000655859.1|1733193_1734099_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKDVIYVENHYFVTVKENSIKFRNVIDKSEKFYLFEEIEAIIFDHYKSYFSHKLVIKCIENDIAIIFCDKKHSPLTQLISSYGMTHRLQRIQSQFQLSGRTRDRIWKKIVVNKIINQSKCLENNLHNENVKLLVNLAKDVSSGDKSNKEAQAARIYFKDLYGKQFKRGRYNDIINSGLNYGYSILRSFIKKELALHGFEMSLGINHRSKENPFNLADDIIEVFRPFVDNIVYEIVFKKNINTFDVNEKKLLLNVLYEKCIIDKKVVRLLDSVKIVIQSLIRCYEENTPTYLLLPKMIEVGN >NZ_CP029649.1|WP_000281076.1|1732888_1733194_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYLLVSFDLPRDTKFERRVASKYRTRLLELGFSMKQFSLYERYVSDVQKKDKILEILQQEIPDTGSITLYVLPDEVNNSQITILGKEVKVVVRKEPKLIFL >NZ_CP029649.1|WP_000359017.1|1730601_1732875_-|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 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>NZ_CP029649.1|WP_000286998.1|1729527_1730172_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MYSKIKISGTIEVVTGLHIGGGGESSMIGAIDSPVVRDLQTKLPIIPGSSIKGKMRSLLAKHFGLKMKQENHNQDDESVLRLFGSSEKGNIQRARLQISDAFFSEKTKEHFAQNDIAYTETKFENTINRLTAVANPRQIERVTRGSEFDFVFIYNVDEESQVENDFENIEKAIHLLENDYLGGGGTRGNGRIQFNDITIETVVGEYDSTNLKIK >NZ_CP029649.1|WP_000208937.1|1728608_1729517_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm4 MTTKVFKLSFKTPVHFGKKRLSDGEMTITSDTLFSALFIEALQLGIETDWLLNDLIISDTFPYENEIYYLPKPLIKIESKEEGNHKAFKKLKYVPVHHYNQYLNGELSAEDATDLNDIFSIGHFSLQTKVSLSAQEIDSSADSEPYSVGTFTFEPEAGLYFIAKGSEETLDQLKDIMTSLQYSGLGGKRNAGYGQFEYEIINNQQLFKLLNQNGEHSILLSTAMAKEDEIKSALKEARYILNKRSGFIQSTNYSEMLVKKSDFYSFSSGSVFKNIFNGDVFNVGHNGKHPVYRYAKPLWLEV >NZ_CP029649.1|WP_000153149.1|1727583_1728606_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 MTIKNYEVVIKTLGPVHIGSGQVMKKQDYIYDFYNSKVYMINGNKLVKFLKRKNILDTYQNFLRYPPKNPRENGLKDYLDAQNVKQSEWKAFVSYSEKVNQGKKYGNIRPKPLNDLHLMVRDGQNKVYLPGSSIKGAIKTALVSKYNNEKNTDVYSKIKVSDSEPIDERHLAIYQKIDINKSEKPMPLYRECVDVDTEIKFKLTIEDEIYSINEIEQSIQDFYKNYYDKWLVGFKETKGGRRFALEGGMPDVLNQNILFLGAGAGFVSKTTHYQLKSREQAKRDSFDILTKKFRRTYGKMKEMPSNVPVALKGTTNQSLHVSYQQGMCKISFQELNNEVL >NZ_CP029649.1|WP_000865879.1|1726315_1727584_-|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm6 MKVLFSPIGNSDPWSNDRDGAMLHIVRHYKPDVVVLFFTESIWNGNRNIPGRKNFDWENIVSKVSSRTKVDIKVDSIKYENDFDSYKDIFHFYINEIRTKYSDAEILLNVTSGTPQMESTLCLEYISNPHNMKCIQVSTPAPIEGPKRSFAKLETVTEDLNKVNANEKMASNRSKSINIISFREVMVRSQIKSLVNNYDYEGALNLVSDQKSFRNGKLLRKRLLELTNQIKTHEVFPEINDKYRSVALKKSLFHYLLLNMRYNRLDVAETLIRVKSIAEFILKTYIVGHWPTLIIEKDDKPYLNAEDNLSFIYKYKLLLEKRRQNLDVSRILGLPAFIDILTVLEPNSKLLKEVNAVNDINGLRNSIAHNLETLDLDKNKNYKKIMLSVEAIKNMLHISFPEIEEKDYNYFERKNKEFRELL >NZ_CP029649.1|WP_000608705.1|1725584_1726319_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MINKITVELDLPDSIRFQYLGSILHGVLMDYLPNDIADQLHHEFAYSPLKQRIYHKNKKVIWEIVCMSDRLFNEIAELFTSKNRLFLKYYQVYIEIYSFNIEKVNVQNIMNQLLETEELNRYVRINIQTPMSFKYQSNYMIFPEVKRFFRSIMIQFDAFFEEYKMYDKETLDFLEKNINIVDYKLKSTRFNLEKVKIPSFTGEIVFKIKGPLPFLQLTHFLLKFGEFSGSGMKTSLGMGKYSII >NZ_CP029649.1|WP_000251226.1|1723121_1724057_-|DUF4297-domain-containing-protein MVRENGGANAQRGFNYQNCVISLVAIRNYKKPNFKIYVEADEDFEVNYGDDYHACIQVKGEKNLTFNKLLKGENGKLSIFEKNLSSGKSDSVYKIVVFSFSRKDMESMQEQTDEEELFSNSWLLSNDQKNKVNNDRVENFSLVKTAFDNDMKNARIYLKGELVQQNIVVEGRAEVILNELFQQILQKSEKKVQTEQDKELKKITSKELDLILQKITAKARFEKELKNLRFNSLKEEKIKKEEKKIILEYMAVKKAVIRFLKSDEEKLENNSISTLISETFNLSEMNCLSENTKYAIAISAYCDILEEIAYE >NZ_CP029649.1|WP_072093071.1|1735476_1735788_+|DUF3387-domain-containing-protein MLSDDFLKDVEGLKQKNVAVELLNRLLKGQVKSLMKTNATVSKRFSEMLRNSINKYNSRSIETSKVIEELIQLAKDIKQEQQRGNELGLNSDEIAFLRCFSFT >NZ_CP029649.1|WP_001015193.1|1736079_1736301_-|hypothetical-protein MNHETTHSDWRTVANCLASQNYISIVKGLVHHFTAIEDEEILDKIYEDFMNNGSITTVLNNDLQDIINYYLSK >NZ_CP029649.1|WP_001092190.1|1736315_1736819_-|DUF1643-domain-containing-protein MNTIKSTIHTEAIFSDDEQHRYLLKKTWDEKKPVCTVITMYPHLDGVLSLDLTTVLILNQLANSEQYGAVYLVNLFSNIKTPENLKHIKEPYDKHTDIHLMKAISESDTVILAYGAYAKRPVVVERVEQVMEMLKPHKKKVKKLINPATNDIMHPLNPKARQKWILK >NZ_CP029649.1|WP_001024805.1|1736833_1737145_-|hypothetical-protein MNINRYITRGISEQLSLDLQILLWHMVEEKDNQPHTDYLHIFKLQEDDNMLSITHEQEQPAYKLEYHYINYEKNQNALPKKVYVIREDDVDVFYYVMLLPEEY >NZ_CP029649.1|WP_000175888.1|1737238_1737577_-|hypothetical-protein MTLSKQLKTYITERFKLNYQETWACETIDAVAEDVLPEKYIKNSPLEHKILNTFTYYNDELHEISIYPFLCYLDKELVAIGYLDNFDLDFIFLNDTHQIIIDERYLLQKGGE >NZ_CP029649.1|WP_000676592.1|1737665_1739345_-|recombinase-family-protein MKGKIALYSRVSTSEQSEHGYSEKEQEQLLIKEVMKNFPGYDYETYTDSGISGKNIEGRPAMKRLLQDVKDNKIEMVLSWKLNRISRSMRDVFNIIHEFKEHDVGYKSISENIDTSNASGEVLVTMFGLIGSIERQTLISNVKLSMNAKARSGEAITGRVLGYKLSLNPLTQKNDLVIDENEAHIVREIFDLYLNHNKGFKAITTILNQKGYRTINQKPFSVFGVKYILNNPVYKGYVRFNNHQNWAVQRRSGKSDKNDVILVKGKHEAIISEDVFDQVHEKLASKSFKPGRPIGGDFYLRGLIKCPECGNNMVCRRTYYKTKKSKERTIKRYYICSLFNRSGSSACHSNAINAEVVERVINVHLNRILSQPNVIKQIASSVIEELKQKHSKQTEIKYDIDSLEKQKAKVKTQQERLLELFLDDEMDSEMLKAKQSEMNQQLEVLDQQIKEAKQANQSQDDIPNFDKLKARLILMITRFSVYLRKATPEAKNQLMKMLIDSIEITTDKQVKLVRYKIDESLIPQSLKKDWGSFFIPKFNFVINVTKKNRIENLSLLPLF >NZ_CP029649.1|WP_001015575.1|1739569_1741186_-|primase MNHILEMLIKLLKVGMEAIDRKGLIAILTSSIGNDEMDDSEQAVMVYNELIDKLQLNIPKDVDYRPNIYSYFGIQKKPNDTILVEMMICIFHIKRFDSELFVFKDKGWQKVSEDELQGLISKMIQVLLVDYKPSLSTLKNVVDGIQKSTDIEKLVEHRQYIGCGRNMFNLKTFKVVDNDLEIFPKTRLDLELDINDTITDKIPPNFKQYMLELANYDHDLQYFLFQHMAVLLTADTKLRRGLFLYGTAKNGKSVYIKLVKSFFYSNDIVSKTLNELGGRFDKESLIGKRIMASDEVGKANIDEATVNDFKKLLSVEPIHADRKGRTQVEVTLDLKLIFNTNAVLNFPSSHAKALERRIAVIPCEYYVEKADPDLIEKLQDEKKEIFLYLMYVYKQIVKNDIEYLQNDRVTEISHDWLNFGYEFVSSKSANIAHQKACINLLRKLIEIKPGSRIKVSRLNEVIRDEIKVSSQVINDLVQANFNVQSRLNNGYKYWVDLGWKETDKKDDMISFDKNENVTDDEFLYEDDLNLGWEDFDDE >NZ_CP029649.1|WP_001058155.1|1741185_1741554_-|hypothetical-protein MNNDRGKSLQIPQSTLLKEGSIYVATLHSVYEKNFSGDIKHQFTYEVELNQETHYVNRNITVKSMSHQLSIADWIKRHSNYNVNHINYDPYIDRKHLVLVGQYNGNYYIQDVAPLDEFGGVL >NZ_CP029649.1|WP_000283873.1|1741546_1742656_-|hypothetical-protein MYQANIRDLITKLPQSNKTEHFLMNKFSNQDKVQQLQRQISQQLDQQYNELLANEKAKLDQYVEVHHNLEPLKKEIESESINLDTDKLPDIKATMLEKAKNDEHFDKIEQLFDRLDQSLNGTNRLYTQLSLIGTRTHRITTKRFNVQGLPKLVQQMILPSQFKKVYTIDFKSFEPSVAAYMTQDEQLIDYLNHEEGLYDALLRDLSLSKEKRVSVKRAFIGSFLFGGRYSSSKFKINQEVSEINWLQVMSKFKKVIEFKEQVEKYKTMPTPYGIEHDMSAFQGSSIMAIYVQTVASYIFKHILLEVYKAQCEKKTFKIIVPIHDAIMIECNDKGIAQNVAQLMKDTANQLFNGEFAHVTVEALGGIDNE >NZ_CP029649.1|WP_001038847.1|1742850_1744839_-|hypothetical-protein MNKNITALKSTENTTYMQYTVHIDDQIINNIKECTKKFKILPMEDKIPLSPLLQPEYAGEVQDFISTYEQFMINFGKVILDSQGIKIQFESESLSSIQRGIQEHCYLNERTNDIDVTKEWYLCKFSNQILEEDKNQLYNALKQLMNDSKNKKQAFQEVFKVHIDIYLYNKEKSEYKYQVSSYFNLVKENPKITYKKRHLQEKQGVKGTTFTNKLKLLNKMYGVDVAKYQPFYNSNNPEYERGQFGERYISQRSNYEFNRLQYQIIDMLSKILDKHPLPKSDNNYKHIPTIEKAILSGDSHSFYEYFEDIMKEIISMENSSLKEKLLTDFTYQSQCRWYSESEKLKLQLESFMHKVLESNYYEGNKLYRMLSHAIEETINEADEDKVHFNYFKDYFLTDGGVKNWEQISEKITEFNGKVINDIQNEYNKIQFNNANRNQKLNFNYLYHCFEFSNNLVKARVNGNRGYILYFVDKYKIKMPFLDQLLINYLNQEIGQESINYNMQTLFEKERYDRSSTIEKLVATSKFKYEKDDSDLFKQLFNDVENSIDRLGIYLLNNGINSNDENARYYRSFLKELSRIKSKLTPFSLEISKSSGREQHYPDDAIDDKDERRKNKEETYHAFDDKSDIDSKLKNKINVSIDNLLSVKIKSNLYDISPNTKKQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP029649_9 | 2030966-2031099 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029649_9
|
2 spacers
spacers of NZ_CP029649_9
>9.1|2030983|46|NZ_CP029649|PILER-CR ATAAAGATAAACCAAATTATCAATTTGGTGGACACAACAGTGTTGA >9.2|2031046|37|NZ_CP029649|PILER-CR TTCCAAAAGTAAGCGGTCAAAATGAAGGTCAACAAAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029649_9
The CRISPR arrays of NZ_CP029649_9 >merge|NZ_CP029649|9|2030966-2031099|PILER-CR TATTGAAGAAGATACAAATAAAGATAAACCAAATTATCAATTTGGTGGACACAACAGTGTTGATTTTGAAGAAGATACACTTCCAAAAGTAAGCGGTCAAAATGAAGGTCAACAAACGATTGAAGAAGATACAA >NZ_CP029649|9|3|2030966-2031099|PILER-CR TATTGAAGAAGATACAA ATAAAGATAAACCAAATTATCAATTTGGTGGACACAACAGTGTTGA TTTTGAAGAAGATACAC TTCCAAAAGTAAGCGGTCAAAATGAAGGTCAACAAAC GATTGAAGAAGATACAA
>NZ_CP029649.1|WP_001790696.1|2028400_2028502_+|hypothetical-protein MLLKTEQYRLAFIKFKKLMNFAFKGRYYSEKQS >NZ_CP029649.1|WP_000679366.1|2028151_2028352_+|hypothetical-protein MKGVLRHVFVRIVQAIIMKRLVYCFKLDNDEFNLKNKYKKYKSCVTRVSDDLNTIYRYISNNKIIN >NZ_CP029649.1|WP_000481425.1|2026659_2028018_+|gluconate-permease MFNEIWPLISVVLGIVILLVLIIGFKLNTFISLIITSMITALMLGIPLTKIMETIEKGMGSTLGHIALIFGLGAILGKLLADGGGATRIADTLIQKFGQKHVQWAMLVAAFIVGIALFFEVGLVLLIPLVFTVAKRANVSVLKLGLPMVTALSVTHGFLPPHPGPVVIAKELKANVGDVLLYGMIIAIPVTLIAGPIFNKVAQKMIPSAYTREGDISALGAQKEFTDQEMPGFGMSLLTATLPVILMLVSTITQLVTGHDKPTNLFESIIYMIGTAGTAMLIAVLFAIVTMGLMRKRKMNHIMESVTNAIYPIGMMLLIIGGGGTFKQVLIDGGVGNTIAKMFEGTEMSPILLAWIVAAVLRIALGSATVAAISTTGIVLPLLQSSDVNVALVVLAIGAGSVILSHVNDAGFWMFKEYFGLTVKETFLTWSLLETIISVSGIIFILFISLFV >NZ_CP029649.1|WP_000876662.1|2024989_2026543_+|gluconokinase MKYMIGVDIGTTSTKSVLYDENGTFIMKHQIGYDLHTPNVDVSEENPDELFDAVLMTIKYVMRESKVNKDDIKFVSFSAQMHSLIAMDQKHQRLTNNITWADNRAAKYATVINEVHDGNAIYQRTGTPIHPMSPLVKIFWMKHEWQDVFQRTAKFADIKTYIFYHLFDTYIIDYSMASATGMFNLETLDWDVGALELLGISKEMLPELVPTTYVMKGMKERYATLMGLNEDTPFVIGASDGVLSNLGVNSVGKGEVAVTIGTSGAIRTVIDKPRTDYKGRIFCYVLTEDHYVIGGPVNNGGVVLRWLRDELLASEVETAKRLGVDPYDVLTQIAKRVKPGADGLIFHPYLAGERAPLWNANARGSFFGLTLSHKKEHMIRAALEGVLYNLYTVYLALIEVMNETPKMIKATGGFAKSEVWRQMMSDIFDTELVVPESYESSCLGACVLGLKAVGDIEDFSIVSSMVGATNNHTPFEENVAVYQELVSIFINLSRSLTENYEQIADFQRQHMAENKTQ >NZ_CP029649.1|WP_000990133.1|2024285_2024966_+|GntR-family-transcriptional-regulator MMYGYPEKWLEGMTTGEGIAAELRLGIVNGHIAEGTLLTENQMAKQFNVSRSPIRDAFKLLQQNQLIQLERMGAHVLPFGEQEKKEMYDLRLMLESFAFSRVKNQERLPIVKEMKKQLEMMKVAVKFEDAESFTKHDFEFHETLIKASNHQYLNSFWSHLKPVMMALVLTSMRQRMQQNPQDFERIHHNHQVFIDAVEQYDSQILKEAFHLNFDDVGKDIEGFWLN >NZ_CP029649.1|WP_000074005.1|2023367_2024132_+|MerR-family-transcriptional-regulator MSNYSTGELAKLCNVTTRTIQYYDRKGILKPQGFTEGKRRVYTEQQRQTLELILLLKDLGCALSDIDMLLKGEGTLKTLNTLLTMKQQEINQQVKQQQAVLNKIKNVQYYVNEASTSPITHLKDIEHVMSKSAEMKSIRRNIWISAGIIGIIQYSSIISAILMKNKWPFLIALPFMICYGIGVTFYYQQKVAYLCPNCQHIFSPSLWAVIKAKHTATTRRFECPNCHETHYCIEVPKAHMSTEQLEISRIQHNN >NZ_CP029649.1|WP_000289134.1|2022510_2023203_+|GTP-pyrophosphokinase-family-protein MYVDRKPSLYLEDLRHDFKNSLSKFENGDEAFDTLLGFVELDHIYSSALKEISTKLSILDDNFNHIYKHNPIHHMERRVKEMRSLIEKLNRKGLQISAETAKEHILDIAGIRVVCNYLDDIYLIEEMLLKQEDVQLIKRKDYIQHPKENGYRSLHIVVSIPVFLAERVEVLPVEIQIRTIGMDMWASLEHKIRYKNKAETEKYRDLLKECATEITEVENKLQQIHSEITE >NZ_CP029649.1|WP_001117047.1|2021863_2022280_+|DUF2188-domain-containing-protein MPFTMKGYPEKWKDFEVIKRQKAIEIANAMLKEGYLEKDVVPIAAKKAKDWYRALSKEEIKALEEENFVQFHTATMEKTEVDSEYATTDNEEHIQEQSNQDKSYFDSESIGNQSGGVRQREPLMDGPHPKVVESFKDV >NZ_CP029649.1|WP_000586384.1|2019901_2021725_+|FUSC-family-protein MIIPAIIGYLCGNFQFGLLVATGTLAHIYVFKGPSRSKLRTVIICNLAFAICMMLGTLTAKTPLVFGMTLLIVTVIPFYIFTALKIAGPSSTFFIVTFSLPINLPIAPEEALYRGFAILVGGILATMMVLITIVFSKNKAEEQAIQNDFKLISKLLHTYNDKSAFLQVAKTAVDNFKASDKLLITSTSSNDKLSRRFQKLLLLHTSAQGIYSELLELNAKQIRPLPDELIEMMDHIIAQLDNSEENVRYWRKEVTVTEEFQNLFNHILKIDEMVHANEARIAYEADMRKPLYSKRIYQNLTLDSIVFRNTLRYTAIMMIAIFIALMFDFEKAYWIPLSAHTILLGTSTIHAIERGMARGLGTILGVLVLSVILLFSIPTPVAVILMGIAALFTEALVGANYAIAVVFITIQVILMNGLASQNLTINIAFPRVIDVAMGIVIAIIGLFVLGQRTASALLPNVMAEVVRKEATLFHYLFSENQYKDDVYQKNTAMNLSVKLNNMTQVYNAANGELFSDKTLIQNYYPSLFALEEISFMLNRAMANEDRLTINEQLMGEYLATFENIAKHLELNTELEIKILPDLPQYNYIQSAMMNIQHNGFRERDKNV >NZ_CP029649.1|WP_000660709.1|2017714_2018992_+|MFS-transporter MKEKRTNVRWMFALAFFFIGVIAYMDRANISYIAKQMMDDLGMTKPQFGLLASFFSLGYALMQVPSGMLAEKFGPRKMITIALVWWSAFTILTGMIKNHGLIYLVRFLFGVGEAPMYPSNAVFNSFWFSKNEKGRASSALLAGSYFGPVLAPIVTIAIVNAFNWQAVFYIFGAVGILMAVLWAIIAKDLPEQHRMVNEAEKRFIMENRDIVATEKSSPPWNDFFKRFSFYAIAIQYFVVQFIITLFLIWLPTYLTEVFHVNFKEMSISSLPWLLMFFLILSAGAISDRVLGLGRSKFVARGVIAIAGFIVFAVSIIFAVRTGNLYVSIFWLSLGLGGIGISMGMSWAAATDLGRNFSGTVSGWMNLWGNIGALISPLLAGLFVEHLGWTMTFQLLIVPAVIAVIMWFYVKPDQPLIVSDDKAIEK >NZ_CP029649.1|WP_000841432.1|2032249_2035039_+|fibronectin-binding-protein-FnbB MKSNLRYGIRKHKLGAASVFLGTMIVVGMGQEKEAAASEQNNTTVEESGSSATESKASETQTTTNNVNTIDETQSYSATSTEQPSQSTQVTTEEAPTTVQAPKVETSRVDLASEKVADKKTTGTQVDTAQPSNVSEIKPRMKRSTDVAEVAEKEVVEEAKATGTDVTSKVTVENGSEIVGHKQDTNVVNPHNAERVTLKYKWKFGEGIKAGDYFDFTLSDNVETHGISTLRKVPEIKSSTEDKVMANGQVIGERKIRYTFTDYIDNKKDLTAELTLNLFIDPTTVTKQGMEKVEVSLGQNKVSKEFDIKYLDGVKDRMGVTVNGRIDTLNKADGKFSHFAYVKPNNQSLSSVTVTGQVTSGYKQNVKNPTVKVYKHIGSDELAESIYAKLDDVSKFEDVTGELTLQYTSNGGYSLNFNNLDQSKNYVIKYEGDYDSNASTLEFQTHLFGYYNYYYYNTSNLTWKNGVAFYSNNAQGDGKDKPNDPIIEKSEPIDLDIKSEPPVEKHELTGTIEESNDSKPIDFEYHTAVEGAEGHAEGIIETEEDSIHVDFEESTHENSKHHADVVEYEEDTNPGGGQVTTESNLVEFDEDSTKGIVTGAVSDHTTVEDTKEYTTESNLIELVDELPEEHGQAQGPIEEITENYQHISHSGLGTENGHGNYGVIEEIEENSHVDIKSELGYEGGQNSGNQSFEEDTEEDKPKYEQGGNIVDIDFDSVPQIQGQNNGDQSFEEDTEEDKPKYEQGGNIIDIDFDSVPHIHGFNKHTEIIEEDTNKDKPNYQFGGHSSVDFEEDTLPQVSGHNEGQQTIEEDTTPPIVPPTPPTPEVPSEPEVPTPPTSEIPSEPGKPVPPAKEEPKKPSKPVEQGKVVTPVIEINEKVKAVAPTKKAQSKKSELPETGGEESTNKGMLFGGLFSILGLALLRRNKKNHKA >NZ_CP029649.1|WP_000721337.1|2035218_2036085_+|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase-GalU MKKIKKAIIPAAGLGTRFLPATKAMPKEMLPILDKPTIQYIVEEAARAGIEDIIIVTGRHKRAIEDHFDSQKELEMVLKEKGKSELLEKVQYSTELANIFYVRQKEQKGLGHAISSARQFIGNEPFAVLLGDDIVESEVPAVKQLIDVYEETGHSVIGVQEVPEADTHRYGIIDPLTKNGRQYEVKKFVEKPAQGTAPSNLAIMGRYVLTPEIFDYLKTQKEGAGNEIQLTDAIERMNNDNQVYAYDFEGERYDVGEKLGFVKTTIEYALKDDSMREELTRFIKELGL >NZ_CP029649.1|WP_000386367.1|2036295_2037039_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarU MDYQTFEKVNKFINVEAYIFFLTQELKQQYKLSLKELLILAYFYYKNEHSISLKEIIGDILYKQSDVVKNIKSLSKKGFINKSRNEADERRIFVSVTPIQRKKIACVINELDKIIKGFNKERDYIKYQWAPKYSKEFFILFMNIMYSKDFLKYRFNLTFLDLSILYVISSRKNEILNLKDLFESIRFMYPQIVRSVNRLNNKGMLIKERSLADERIVLIKINKIQYNTIKSIFTDTSKILKPRKFFF >NZ_CP029649.1|WP_000998872.1|2037368_2037725_+|HTH-type-transcriptional-regulator-SarT MNDLKSKSNIKLMKRVLTTYELRKYLKKYFCLTLDNYLVLAYLDVFKNDEGKYFMRDIISYIGIDQSRIVKSVKELSKKGYLNKCRDPHDSRNVIIVVSVKQHNYIKNLLSEININET >NZ_CP029649.1|WP_110179771.1|2038029_2042145_+|YSIRK-type-signal-peptide-containing-protein MRDKKGPVNKRVDFLSNKLNKYSIRKFTVGTASILIGSLMYLGTQQEAEAAENNIENPTTLKDNVQSKEVKIEEVTNKDTAPQGVEAKSEVTSNKDTIEHEPSVKAEDISKKEDTPKEVADVAEVQPKSSVTHNAETPKVRKARSVDEGSFDITRDSKNVVESTPITIQGKEHFEGYGSVDIQSNPEDLKVSEVTRFNNKSIGKNELTGALQLKNKVSFKNDFEFNIRVANNHQSVTTGADGWGFLFSKGDGNEYLQKGGILGPKGMENSAGFKIDTGYNFKDPMDKEEKQAGQGFKGYGTFVKTGADGTTAKVGTNIPTRGKADNSFQYADNSIDTTDGKFHGQLLNNLKLAYNEKSGIMRAEYAGKVWEANISDLGLDKSEAYNFLITSSQRQGTSQGVYANGWMRTDLNNSTFKLTPNLVKKTEIKTVEIPFETKREFNPKLQPGEERVKQEGQPGSKTITTPITVNPLTGEKVGEGQPTEEITKQPVDKIVEFGGEKIPQGHKDIFDPNLPTDQTEKVPGKPGIKNPDTGKVIEEPVDDVIKHGPKTGTPETKTVEIPFETKREFNPKLQPGEERVKQEGQPGSKTITTPITVNPLTGEKVGEGQPTEEITKQPIDKIVEFGGEKIPQGHKDIFDPNLPTDQTEKVPGKPGIKNPDTGKVIEEPVDDVIKHGPKTGTPETKTVEIPFETKREFNPKLQPGEERVKQEGQPGSKTITTPITVNPLTGEKVGEGQPTEEITKQPVDKIVEFGGEKIPQGHKDIFDPNLPTDQTEKVPGKPGIKNPDTGKVIEEPVDDVIKHGPKTGTPETKTVEIPFETKREFNPKLQPGEERVKQEGQPGSKTITTPITVNPLTGEKVGEGQPTEEITKQPVDKIVEFGGEKIPQGHKDIFDPNLPTDQTEKVPGKPGIKNPDTGKVIEEPVDDVIKHGPKTGTPETKTVEIPFETKREFNPKLQPGEERVKQEGQPGSKTITTPITVNPLTGEKVGEGQPTEEITKQPVDKIVEFGGEKIPQGHKDIFDPNLPTDQTEKVPGKPGIKNPDTGKVIEEPVDDVIKHGPKTGTPETKTVEIPFETKREFNPKLQPGEERVKQEGQPGSKTITTPITVNPLTGEKVGEGQPTEEITKQPVDKIVEFGGEKIPQGHKDIFDPNLPTDQTEKVPGKPGIKNPDTGKVIEEPVDDVIKHGPKTGTPETKTVEIPFETKREFNPKLQPGEERVKQEGQPGSKTITTPITVNPLTGEKVGEGQPTEEITKQPVDKIVEFGGEKPKDPKGPENPEKPSRPTHPSGPVNPDNPGLSKDRAKPNEPVHSMDKNDKVKKSKIAKKSVANQEKKRAELPKTGAESTQKGLIFSSIIGIAGLMLLARRRKN >NZ_CP029649.1|WP_000966101.1|2042528_2043722_+|MFS-transporter MLYLEVLKNRNFTYLLIGNFLRRSCFVLFSLQIIWFTVELTNQSSLKLSMMVMSQTLPFIIFGIFGGAYSDKHNKKKILYLSDLILSLIIIIIPLLAITSNLNYLTLLTISTAITIINCYTDPAFRAILPEIIDEEHLATSNALIDSLQRGSNIILPALIGVIVILVGNVGVFFICSILLFLGFIFNALLKYTNNNMIDRHSKEDFSETWEFLKQSKEIPFIIIIQFACILINTGLWRVVLPLFISNILKEGVGVYGLATSCLGIASLLMSLIMGLLSEKRLIFKFSIGVLVWGIGLSIINVFPSVAILYIGATLLGLGQSIEGLTRSVAIQIKTPNHLMGKVFSISSTSNYAADTLSLGLISLIIPLLSLSNIFISGGAIISMLSLAGLKFVKKSM >NZ_CP029649.1|WP_010956661.1|2043702_2043936_+|hypothetical-protein MLRSLCKHNRILINAIKVGIEMKYKISLAYNLAIIIGSLIILCILISRGYDIYVILIPILTILASLINLFCDIKKHK >NZ_CP029649.1|WP_000217723.1|2044042_2044351_-|hypothetical-protein MTVNIVVSIVFCISMVILGIYVAITKDFTLISYINQTTIADKHKNQIAYIFALCISLSAVFLMSAILCFEYDFIALAFLFLTIALLLIALFYVCFYKITKYP >NZ_CP029649.1|WP_000678764.1|2044494_2044761_-|hypothetical-protein MKGSKQILLIMGIISLIVLFIFTLFIMAQYAKHYEQKSDSSNAHTLNSSSAIIEQHTMSNLASLDLYAPVRNITSSRDIHPIYFMTKD >NZ_CP029649.1|WP_001792493.1|2045044_2046853_-|phospho-sugar-mutase MHFHTHLLYNTCEKYCLGAVFFYFWDVFLYNSLHKCKGFSFHVLLSLTEILKGCLATMDKELWIERANDSLVKHFYEQQSDIEQREGFESKLTFGTAGIRGKFGLGEGRLNKFTIEKLALGLSRYLNAQTNNPTIVIHYDIRHLSTEFAQIIANVLANHQITVYLPDTYKTTPELSFAVRNLNTTAGIMITASHNPKDYNGIKVYGSDGAQLSTDASELASRYIEEVGDPLQIDIPSSKQNTSYIKPFPKSVTDDYMKHIQNMIGYIPKSDLQVVFTSLHGTSVPIVPELLKSLNFNQFNLVEAQCKPDPNFSSVQSANPEDHRAFDQAVELANKSHADLLISTDPDADRLGIAERDAHGHITYFNGNQIGALLLNYRIQQTSQLRHRLMIQSIVSSELTKSLARYNNVEYKEVLTGFKFIAQEIRQLDDHQNMIFAFEESYGFLSEPFVRDKDAVQIVPLIIKYASELKLYGKTLKDELEQIYQTVGRHEDTLFSHTLEGLEGKKKIESIMTHFRSNPPQEIQGLKVKAIEDYLTSEVYHLDKDTTSQINSPKSNVIRVLFDEGFIALRPSGTEPKIKLYVSLKCPNFDDVAQKINAMIFS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP029649_10 | 2127128-2127225 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029649_10
|
1 spacers
spacers of NZ_CP029649_10
>10.1|2127157|40|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder ATAAAGGAACGCATTAGATAGCTTCGCTACTAATGCATAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029649_10
The CRISPR arrays of NZ_CP029649_10 >merge|NZ_CP029649|10|2127128-2127225|CRISPRCasFinder GCCTTTCTAGCTCATAAAATTCGCAGAAAATAAAGGAACGCATTAGATAGCTTCGCTACTAATGCATAAGCCTTTCTAGCTCATAAAATTCGCAGAAA >NZ_CP029649|10|9|2127128-2127225|CRISPRCasFinder GCCTTTCTAGCTCATAAAATTCGCAGAAA ATAAAGGAACGCATTAGATAGCTTCGCTACTAATGCATAA GCCTTTCTAGCTCATAAAATTCGCAGAAA
>NZ_CP029649.1|WP_001789935.1|2126706_2126811_+|hypothetical-protein MLTNRLTSVNYVKKRLIQNIQRILSKEVLYGEMQ >NZ_CP029649.1|WP_000792552.1|2125301_2126612_-|hypothetical-protein MKNKYISKLLVGAATITLATMISNGEAKASENTQQTSTKHQTTQNNYVTDQQKAFYQVLHLKGITEEQRNQYIKTLREHPERAQEVFSESLKDSKNPDRRVAQQNAFYNVLKNDNLTEQEKNNYIAQIKENPDKSQQVWVESVQSSKAKERQNIENADKAIKDFQDNKAPHDKSAAYEANSKLPKDLRDKNNRFVEKVSIEKAIVRHDERVKSANDAITKLQKNDSIENRRLAQREVNKAPMDVKEHLQKQLDALVAQKDAEKKVAPKVEAPQIQSPQIEKPKAESPKVEVPQIQSPKVEVPQSKLLGYYQSLKDSFNYGYKYLTDTYKSYKEKYDTAKYYTDKYFKYKGTIDKTVLSVFGNGYKSYIQPLKVEDQKNYVSKSYAQVRNYVTETLNTGKVLYAFYQNPKVVKAAITTAETASSIKNTLSNLLSFWK >NZ_CP029649.1|WP_000594519.1|2123837_2124767_-|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB-subunit-A MIKNKILTATLAVGLIAPLANPFIEISKAENKIEDIGQGAEIIKRTQDITSKRLAITQNIQFDFVKDKKYNKDALVVKMQGFISSRTTYSDLKKYPYIKRMIWPFQYNISLKTKDSNVDLINYLPKNKIDSADVSQKLGYNIGGNFQSAPSIGGSGSFNYSKTISYNQKNYVTEVESQNSKGVKWGVKANSFVTPNGQVSAYDQYLFAQDPTGPAARDYFVPDNQLPPLIQSGFNPSFITTLSHERGKGDKSEFEITYGRNMDATYAYVTRHRLAVDRKHDAFKNRNVTVKYEVNWKTHEVKIKSITPK >NZ_CP029649.1|WP_000916704.1|2122322_2123270_-|bi-component-gamma-hemolysin-HlgCB-subunit-C MLKNKILATTLSVSLLAPLANPLLENAKAANDTEDIGKGSDIEIIKRTEDKTSNKWGVTQNIQFDFVKDKKYNKDALILKMQGFISSRTTYYNYKKTNHVKAMRWPFQYNIGLKTNDKYVSLINYLPKNKIESTNVSQTLGYNIGGNFQSAPSLGGNGSFNYSKSISYTQQNYVSEVEQQNSKSVLWGVKANSFATESGQKSAFDSDLFVGYKPHSKDPRDYFVPDSELPPLVQSGFNPSFIATVSHEKGSSDTSEFEITYGRNMDVTHAIKRSTHYGNSYLDGHRVHNAFVNRNYTVKYEVNWKTHEIKVKGQN >NZ_CP029649.1|WP_000783428.1|2121343_2122321_-|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB/HlgCB-subunit-B MKMNKLVKSSVATSMALLLLSGTANAEGKITPVSVKKVDDKVTLYKTTATADSDKFKISQILTFNFIKDKSYDKDTLVLKATGNINSGFVKPNPNDYDFSKLYWGAKYNVSISSQSNDSVNVVDYAPKNQNEEFQVQNTLGYTFGGDISISNGLSGGLNGNTAFSETINYKQESYRTTLSRNTNYKNVGWGVEAHKIMNNGWGPYGRDSFHPTYGNELFLAGRQSSAYAGQNFIAQHQMPLLSRSNFNPEFLSVLSHRQDGAKKSKITVTYQREMDLYQIRWNGFYWAGANYKNFKTRTFKSTYEIDWENHKVKLLDTKETENNK >NZ_CP029649.1|WP_000200946.1|2120824_2121292_+|hypothetical-protein MTSKDITQISVIAAILTILAVLKIPSIIPGLDFQLSAPAALLILAFFGIKKYFLGGLLSSLLLLIFGVFNPINVIISIIFRVIAIAVVYLLKINVLSLVLASVLGSLVSRLLLSIILNLPVWVVLLNAIPGVIFTLIVAIPLYLTMRKRMAVLLR >NZ_CP029649.1|WP_000286879.1|2120121_2120814_+|6-carboxyhexanoate--CoA-ligase MYSIKMRSSNQDVHISGAETICEFDKIEQTVQRFYNKGFFHENGQPDFLNIKIQKIMEPIQQIKALQIIEDDKANLQHLTQECGVTEQALNQGMTYIKNETVYTGAIILSAISGKRLDSFGQRGIRATHFSFEDINNKGDLNERVTDALAIASCINAHPYVKGELCVSDDLTYTTGYFASAKIGYHRLFDIKPVNTRYGGRIIFVDNRIDLNHYISFLESTPKQVVYETV >NZ_CP029649.1|WP_000971546.1|2118995_2120111_+|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase-family-protein MMFQEQIDLLQQKGLYRSLKSVGYIDRQYIEVENKRCTNYTSNDYLGLGQIAFDKDDFERFMRKYSYHLSSSRLISGSSTAYEEIETMLAGWLGYSACTILNSGYDANLALFNIFKNTNCVVFSDQENHASIIDGIKLSGLEKVIYKHLDIADLEKRLAEYPNQNIQKIIISDSVFSTNGDVVDIGQLVSLKHKYNATLILDVSHSFGIENYSNYQGIDILTSSLSKACGAYGGVILSSNDVKDMLINHGRPLIYSSSLPIYNLYFIKRNIEKLINADDRRTKLNSLSKYFNQKLKALNVNYNSSNSPIKFIEFDDIEAAENIHQTLLKHHVFTSYLRYPTVTKPMLRISLSYFHTEQDIDRLFEILHQED >NZ_CP029649.1|WP_001046645.1|2118010_2119018_+|biotin-synthase-BioB MNLAKRILQGEQLTKETVLKIYEDTNIDTLDLLNEAYILRKHYFGKKVKLNMILNAKSGICPENCGYCGQSRDIKQKQRYALIPEEQIIDGAKVAHDNHIGTYCIVMSGRGPSDKEVDHISNTVRTIKSQHPQLKICACLGLTNDEQAKKLKSAGVDRYNHNINTSENYHDNVVTTHSYKDRTDTIELMKANNISPCSGVICGMGESNQDIVDMAFALKEMDADSIPINFLHPIKGTKFGSMDDLTPMKCLRIVALFRLINPTKEIRIAGGREVNLRSLQPLALKAANSIFVGDYLITGGQPNQLDYDMINDLGFEIDYDTCENKENKNDVSRAN >NZ_CP029649.1|WP_001110069.1|2116650_2118009_+|adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate-transaminase MNYTQQLKQKDSEYVWHPFTQMGVYSKEEAIIIEKGKGSYLYDTNGNKYLDGYASLWVNVHGHNNKYLNKVIKKQLNKIAHSTLLGSSNIPSIELAEKLIEITPSNLRKVFYSDTGSASVEIAIKMAYQYWKNIDREKYAKKNKFITLNHGYHGDTIGAVSVGGIKTFHKIFKDLIFENIQVESPSFYRSNYDTENEMMTAILTNIEQILIERNDEIAGFILEPLIQGATGLFVHPKGFLKEVEKLCKKYDVLLICDEVAVGFGRTGKMFACNHEDVQPDIMCLGKAITGGYLPLAATLTSQKIYNAFLSDSHGVNTFFHGHTYTGNQIVCTVALENIRLYEKRKLLSHIESTSSTLEKQLHALKRHRNVGDVRGRGLMFGVELVTDKDSKTPLEIEKVERIVRKCKENGLMIRNLENVITFVPVLSMSNKEVKTMVRIFKKAVHNILDRKC >NZ_CP029649.1|WP_000019127.1|2127364_2128231_+|cation-transporter MSHNENLKLAQRGAYLSLIVYIILSIVKYVTGFVFNSAAVRADALNNMTDIIVSLAVIIGLKISIKPADRNHPYGHLKSENISSLLVSFVIMFVGIQVVIQNAPRLFKEDDVVPNAITIIVSLISGLVMLIVFAVNQRLAKRTKSSSLNSAAKDNLSDSLVSIGTAIGLIFTQIGFPIVDIILATLLGLLIVYTGFGIFKEAIFMLSDGFNETELEAYRNDILEVDEVQEVKSIKGRYHGSSVFIDVTIVVDANLSLVEAHQICDNVEHHLHKKGISSVYVHPEPDHL >NZ_CP029649.1|WP_001125208.1|2128557_2129244_+|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase MPKLILCRHGQSEWNAKNLFTGWEDVNLSEQGINEATRAGEKVRENNIAIDVAFTSLLTRALDTTHYILTESKQQWIPVYKSWRLNERHYGGLQGLNKDDARKEFGEEQVHIWRRSYDVKPPAETEEQREAYLADRRYNHLDKRMMPYSESLKDTLVRVIPFWTDHISQYLLDGQTVLVSAHGNSIRALIKYLEDVSDEDIINYEIKTGAPLVYELTDDLEVIDKYYL >NZ_CP029649.1|WP_000762708.1|2129397_2129502_-|putative-metal-homeostasis-protein MKLDLQTARRNLNSPNIKTRKRALKIIKQHKRAK >NZ_CP029649.1|WP_000038960.1|2129675_2131115_+|multidrug-efflux-MFS-transporter-MdeA MSKKQKLTMIITMLMGGFFGLLNETLLVTALPSIMKDFEISYTQVQWLTTAFLLTNGIVIPLSALVIQRYTTRQVFLVGISIFFLGTLLGGLSPHFATLLVARIIQALGAGIMMPLMMTTILDVFQPHERGKYMGIFGLVIGLAPAIGPTLSGYLVEYFNWRSLFHVVAPIAAVTFLIGFKTIKNVGTTIKVPIDFISVIFSVLGFGGLLYGTSSISEKGFDNPIVLVSMIGGVVLVALFVLRQYRLSTPLLNFAVFKNKQFTVGIIIMGVTMVSMIGSETILPIFVQNLLHRSALDSGLTLLPGAIVMAFMSMTSGALYEKFGPRKLALVGMAIVVITTAYFVVMDEQTSTIMLATVYAIRMVGIALGLIPVMTHTMNQLKPEMNAHGSSMTNTVQQIAGSIGTAALITILSHASKNFSPTMSDYNGMNKIDMMNQIKVDTMLHGYHAGFLFALLITVVSFFCSFMLQGKKKEVDSRQ >NZ_CP029649.1|WP_000825921.1|2131235_2132015_+|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MKRLLFVMIAFVFILAACGNNSSKDKEANKDSKTINVGTEGTYAPFSFHDKDGKLTGYDIDVIKAVAKEEGLKLKFNETSWDSMFAGLDAGRFDVIANQVGINPDREKKYKFSKPYTFSSAVLVIRENEKDIKDFDDVKGKKLAQTFTSNYGKLAKDKGADITKVDGFNQSMDLLLSKRVDGTFNDSLSYLDYKKQKPNAKIKAIKGNAEQSRSAFAFSKKADDETVQKFNDGLKKIEENGELAKIGKKWFGQDVSKSK >NZ_CP029649.1|WP_000479576.1|2131995_2132715_+|amino-acid-ABC-transporter-permease MFLNLNSEQQHALDAAKQAFGPMLEGLVKYSIPITLVTFVLGLIIALFTALMRISTSKILRSISRVYVSIIRGTPMIVQLFIIFYGIPELGRLLTNDADNQWTLAPVVAAIIGLSLNVGAYASEIIRGGIISIPKGQTEAAYSIGMTYGQTIQRIILPQAIRVSIPALGNTFLSLIKDTSLLGFILVAEMFRKAQEVASTTYEYLTIYVLVALMYWVVCFIISIIQGIYESYIERGYRS >NZ_CP029649.1|WP_000615461.1|2132711_2133443_+|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIQLNNIHKSFNDVEVIKGIDLSVEQGEVVTLIGRSGSGKTTLLRMINALEIPTEGTVYVNGKTYTSKDKKSQIEVRKQSGMVFQSYNLFPHKTALENVMEGLITVKKLKKDEARGKSLELLEKVGLTHVKDQRPHALSGGQQQRVAIARALAMNPKVMLFDEPTSALDPELVNDVLKVIKDLANEGMTMVIVTHEMRFAKEVSNNIVFIHEGMIGEQGAPEEMFNRPKTEELRRFLNVINEE >NZ_CP029649.1|WP_001012228.1|2133539_2134790_-|FemA/FemB-family-glycyltransferase-FmhA MNFVTLTSDEFNAFTTKHFSHYTQSAIHYNHRVDLKGDVHLVGVKDDNGQVIAGCLLTEARTLKFFKYFYTHRGPVMDYTNQSLVAFFFKALTSYLKKHNCLYVLVDPYLIENLRNADGEIVKSYDNRAFVRTMDTLGYKHQGFPVGYDSMSQIRWLSVLDLKDKTEDQLLKEMDYQTRRNIKKTYDIGVKTKTLTIDETQTFFDLFHMAEEKHGFKFRELPYFEEMQKLYDDHAMLKLAYIDLNEYLKTLQLKQQQLTAELSGVEEALKESPNSKKNKTKRTQLEQQLNSNKRKIDNTIEQIEQDGAVLNLASALFIYNEHEVYYLSSGSNPKYNAYMGAYHLQWEMIKFAKAHHIDRYNFYGITGDFSESSEDYGVQQFKKGFNAHVEEYIGDFIKPIKPMFYKIQQYLNHKRR >NZ_CP029649.1|WP_000819843.1|2135044_2135407_+|DUF4467-domain-containing-protein MKRFVATVLLLLVFISGCGNDKYVKEIDEAVKIQNQKQEQLAKKGNGDRVDHFERKDANIYVYDKDKIIILAYKPLSNDDEVHYYAYDFSDKRVSYKQDFDSRRYYQQHDADYHEENMTN >NZ_CP029649.1|WP_000162803.1|2135425_2136025_+|DsbA-family-protein MTKKLLTLFIVSMLILTACGKKESATTSSKNGKPLVVIYGDYKCPFCKELDEKVMPKLRKNYIDNHKVEYQFVNLAFLGKDSIVGSRASHAVLMYAPKSFLDFQKQLFAAQQDENKEWLTKELLDKHIKQLHLDKETENKIIKDYKTKDSKSWKAAEKDKKIAKDNHIKTTPTAFINGEKVEDPYDYESYEKLLKDKIK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP029649_11 | 2635817-2635948 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029649_11
|
2 spacers
spacers of NZ_CP029649_11
>11.1|2635845|28|NZ_CP029649|PILER-CR TTTCAAAAAAGAAATTCTACAGGCAATA >11.2|2635901|31|NZ_CP029649|PILER-CR AGCTGACGAAAAGTCAGCTTACGATAATGTG >11.3|2635890|31|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder AGCTGACGAAAAGTCAGCTTACGATAATGTG |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029649_11
The CRISPR arrays of NZ_CP029649_11 >merge|NZ_CP029649|11|2635817-2635948|PILER-CR,CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCAAAAAAGAAATTCTACAGGCAATACAGGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGACGAAAAGTCAGCTTACGATAATGTGCAGGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAGAA >NZ_CP029649|11|4|2635817-2635948|PILER-CR CGGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCAAAA AAGAAATTCTACAGGCAATACAGGTTGG CGGGGCCCCAACACAGAAGCTGACGAAA AGTCAGCTTACGATAATGTGCAGGTTGGCGG GGCCCCAACATAGAGAA >NZ_CP029649|11|10|2635865-2635945|CRISPRCasFinder CAGGTTGGCGGGGCCCCAACACAGA AGCTGACGAAAAGTCAGCTTACGATAATGTG CAGGTTGGCGGGGCCCCAACATAGA
>NZ_CP029649.1|WP_000999714.1|2634609_2635596_-|aromatic-acid-exporter-family-protein MNDQWYKHLIGARTIKTGIAIFLTAVFCMALDLTPIYAILTAVVTIEPTAKASLIKGYRRLPATVIGAGFAVLFTYLFGDQSPFTYALSATFTILFCTKLKLQVGTNVAVLTSLAMIPGIHDAYIFNFLSRTLTAIIGLVTSGLINFMVFPPKYYGQVEEKLSKTDALMYKLFYNRCQELILSRLQSDKSEKAYKNIFNLNNQVETLISYQRDELSYHKKKECDWKLLNQLTKRAYTNRLFITHLSNIIYLPKNTRVNFSGDEKMALLKISSSIKDIFYDGSFKREDDSVETLRSTIKALEISGENQIKSHLLYEVLMIYRLLDSRYA >NZ_CP029649.1|WP_025173836.1|2633765_2634179_+|hypothetical-protein MKPTKVILRDASYLHSKTSITFILKDVVIEEDNKIYYFDTSATFEDQEVKFEFALFDSDMDNLKHMDYDNPVTEIYFIEPDLHFTIIDFNQELLCIYIDFDSGLRHSNMATESGISLRINVAKSDFTKFINELASLY >NZ_CP029649.1|WP_001790257.1|2633626_2633737_+|hypothetical-protein MDGNNQIDVCFFVLVNNYYTMSIYPRIINSNGDYAT >NZ_CP029649.1|WP_000544965.1|2632809_2633541_+|type-1-glutamine-amidotransferase MHELTIYHFMSDKLNLYSDIGNIIALRQRAKKRNIKVNVVEINETEGITFDECDIFFIGGGSDREQALATKELSKIKTPLKEAIEDGMPGLTICGGYQFLGKKYITPDGTELEGLGILDFYTESKTNRLTGDIIIESDTFGTIVGFENHGGRTFHDFGTLGHVTFGYGNNDEDKKEGIHYKNLLGTYLHGPILPKNYEITDYLLEKACERKGIPFEPKEIDNEAEIQAKQVLIDRANRQKKSR >NZ_CP029649.1|WP_110179784.1|2631494_2632808_+|Mur-ligase-family-protein MRQWTAIHLAKLARKASRAVGKRGTDLPGQIARKVDTDILRKLAEQVDDIVFISGTNGKTTTSNLIGHTLKANNIQIIHNNEGANMAAGITSAFIMQSTPKTKIAVIEIDEGSIPRVLKEVTPSMMVFTNFFRDQMDRFGEIDIMVNNIAETISNKGIKLLLNADDPFVSRLKIASDTIVYYGMKAHAHEFEQSTMNESRYCPNCGRLLQYDYIHYNQIGHYHCQCGFKREQAKYEISSFDVAPFLHLNINDEKYDMKIAGDFNAYNALAAYSVLRELGLNEQTIKNGFETYTSDNGRMQYFKKEQKEAMINLAKNPAGMNASLSVGEQLEGEKVYVISLNDNAADGRDTSWIYDADFEKLSKQQIEAIIVTGTRAEELQLRLKLAEVEVPIIVERDIYKATAKTMDYKGFTVAIPNYTSLAPMLEQLNRSFEGGQS >NZ_CP029649.1|WP_000949467.1|2630702_2631203_-|H-type-ferritin-FtnA MLSKNLLEALNDQMNHEYFAAHAYMAMAAYCDKESYEGFANFFIQQAKEERFHGQKIYNYINDRGAHAEFRAVSAPKIDFSSILETFKDSLSQEQEVTRRFYNLSEIARQDKDYATISFLNWFLDEQVEEESMFETHINYLTRIGDDSNALYLYEKELGARTFDEE >NZ_CP029649.1|WP_110179783.1|2630528_2630621_+|hypothetical-protein MTKNTIISLENEKTQINDSENESSDLGKAK >NZ_CP029649.1|WP_000613738.1|2629758_2630313_-|3'-5'-exonuclease MIQDAFVALDFETANGKRTSICSVGMVKVIDSQITETFHTLVNPQDYFSQQNIKVHGIQPEDVENAPTFDYVFPYMMQFIADLPVVAHNAAFDMNVLHQSIQNIGLPTPNLTYFCSYQLAKRTVDSYRYGLKHMMEFYQLDFHGHHDALNDAKACAMITFRLLKNYENLTYVTNIYGKNLKDKG >NZ_CP029649.1|WP_000140181.1|2628621_2629692_+|DNA-polymerase-IV MTERRIIHIDMDYFFAQVEMRDNPKLKGKPVIVGGKASSRGVVSTASYEARKYGVYSAMPMSQAHKLCPNGYFVTSNFGAYRETSAQIMSIFRSYTDKVEPMSLDEAYLDITELVRPDLPASKIAQYIRKDILEKTHLTASAGVSYNKFLAKLASGMNKPDGMTVIDYQNVHDILMTLDIGEFPGVGKASKKVMHDNGIFNGRDLYEKTEFELIRLFGKRGRGLYNKARGIDHSEVKSSRVRKSVGTERTFATDVNDDEEILRKVWELSGKTAERLNKLQKSAKTVTVKIKTYQFETLSKQMSLRDSVSSEEDIYNIAYLLYNDLKDPDVPIRLIGVTVGNLEQSTYKNMTIYDFI >NZ_CP029649.1|WP_000548781.1|2627844_2628375_+|DUF3267-domain-containing-protein MHKIDLTTNNFQMRRFIILQLVIALFVILFTYKWALGVTAVVDQNIIINLVYGFAGFIILLILHELIHRALFLLFKKDSKPMFNIKKDRILFQTADACFNKWQFSIIMLSPLILLSTGLLILIKVFGYSSLIFMFSMHTAYCFIDILLVALTISSSFKYVQQDEDSIYLYHQKPTQ >NZ_CP029649.1|WP_000636142.1|2636123_2636882_+|type-I-methionyl-aminopeptidase MIVKTEEELQALKEIGYICAKVRNTMQAATKPGITTKELDNIAKELFEEYGAISAPIHDENFPGQTCISVNEEVAHGIPSKRVIREGDLVNIDVSALKNGYYADTGISFVVGESDDPMKQKVCDVATMAFENAIAKVKPGTKLSNIGKAVHNTARQNDLKVIKNLTGHGVGLSLHEAPAHVLNYFDPKDKTLLTEGMVLAIEPFISSNASFVTEGKNEWAFETSDKSFVAQIEHTVIVTKDGPILTTKIEEE >NZ_CP029649.1|WP_001110179.1|2637098_2637485_+|hypothetical-protein MNYVERYIEQFLRATVRNNIKHYLLMLDEKMKNLDDYMRYLITKKEQLSKLIDSLMLTLENKYIDIAEAFQIQCAREINNQEIENIKSELNKVEAYYAQIETQIQQTSTEKIATEKTSYLINYMNAVA >NZ_CP029649.1|WP_000149064.1|2637499_2638201_+|cell-wall-active-antibiotics-response-protein MTHKYISTQMLIIFTALMIIANFYYIFFEKIGFLLVLLLGCVLVYVGYLYFHKIRGLLAFWIGALLIAFTLLSNKYTIIILFVFLLLLIVRYLIHKFKPKKVVATDEVMTSPSFIKQKWFGEQRTPVYVYKWEDVQIQHGIGDLHIDLTKAANIKENNTIVVRHILGKVQVILPVNYNINLHVAAFYGSTYVNEKSYKVENNNIHIEEMMKPDNYTVNIYVSTFIGDVEVIYR >NZ_CP029649.1|WP_001017131.1|2638197_2639241_+|sensor-histidine-kinase MNHYIRTIGSMLILVYSMLAAFLFIDKVFVNIIYFQGMFYTQIFGIPVFLFLNLIIILLCIIVGSVLAYKINQQNDWIKTQIERSMEGETVGINDQNIEIYSETLDLYHTLVPLNQELHKLRLKTQNLTNENYNINDVKVKKIIEDERQRLARELHDSVSQQLFAASMMLSAIKETKLEPPLDQQIPILEKMVQDSQLEMRALLLHLRPLGLKDKSLGEGIKDLVIDLQKKVPMKVVHEIQDFKVPKGIEDHLFRITQEAISNTLRHSNGTKVTVELFNKDDYLLLRIQDNGKGFNVDEKLEQSYGLKNMRERALEIGATFHIVSLPDSGTRIEVKAPLNKEDSYDD >NZ_CP029649.1|WP_000153530.1|2639230_2639860_+|response-regulator-transcription-factor MTIKVLFVDDHEMVRIGISSYLSTQSDIEVVGEGASGKEAIAKAHELKPDLILMDLLMDDMDGVEATTQIKKDLPQIKVLMLTSFIEDKEVYRALDAGVDSYILKTTSAKDIADAVRKTSRGESVFEPEVLVKMRNRMKKRAELYEMLTEREMEILLLIAKGYSNQEIASASHITIKTVKTHVSNILSKLEVQDRTQAVIYAFQHNLIQ >NZ_CP029649.1|WP_000037079.1|2639971_2641189_-|YihY/virulence-factor-BrkB-family-protein MSKKDHSSSKYLNSVKEAQEESKKKNKSNPKIDVDRTYIEPQQFQSKKPKKDDQVFFLSRLNKPAKYKKDSNFLSYLIYRIGKDDASGLAAQMTYHFVLAMFPMLLFLLTLLPFFNIKQSQITNMLSNAPAETSTLIKSVIGDITQNSSGGLLSIGLILAIWSASNGMTAIMNSFNVAYDVEDSRNGIVLKLLSVVFTVVMGVVFVVALALPTLGSVISHFLFGPLGFDEQVKWIFNLIRIVLPIIIIFIVFIVLYSVAPNVKTKLKSVLPGAVFTSIIWLAGSFGFGWYISNFGNYSKTYGSIAGIIILLLWLYITSFIIIVGAEINAIIHQRSVIKGKTPEEAALEHDDNNKNHYNENTRYEYDEDSNATHQRTYHVDEHPSDTYPEDDKNIKDKIVDKLKKD >NZ_CP029649.1|WP_000428172.1|2641466_2641742_-|hypothetical-protein MENKFVPGILIGAVIGGAISLADKSTRQALVQSVKDAKNGNRTRKPSKVSKIKDEVLYWKDVVEEIRRNNPELERSLKDAKETFVNRKNQR >NZ_CP029649.1|WP_000228666.1|2641748_2642213_-|low-molecular-weight-phosphotyrosine-protein-phosphatase MVDVAFVCLGNICRSPMAEAIMRQRLKDRNIHDIKVHSRGTGSWNLGEPPHEGTQKILNKHNIPFDGMISELFEATDDFDYIVAMDQSNVDNIKSINPNLKGQLFKLLEFSNMEESDVPDPYYTNNFEGVYDMVLSSCDNLIDYIVKDANLKEG >NZ_CP029649.1|WP_000180460.1|2642359_2642560_+|DUF1128-family-protein 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP029649_6 | 6.1|1524243|25|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder | 1524243-1524267 | 25 | LC371242 | Escherichia phage EcS1 DNA, complete sequence | 15447-15471 | 2 | 0.92 |
NZ_CP029649_8 | 8.2|1734280|33|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT | 1734280-1734312 | 33 | NC_013373 | Staphylococcus sp. CDC3 plasmid SAP020A, complete sequence | 26794-26826 | 2 | 0.939 |
NZ_CP029649_8 | 8.3|1734349|35|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT | 1734349-1734383 | 35 | MT926124 | Staphylococcus phage vB_SauP_EBHT, complete genome | 2846-2880 | 2 | 0.943 |
NZ_CP029649_8 | 8.3|1734349|35|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT | 1734349-1734383 | 35 | MK922548 | Staphylococcus phage SA46-CTH4, complete genome | 3204-3238 | 2 | 0.943 |
NZ_CP029649_8 | 8.3|1734349|35|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT | 1734349-1734383 | 35 | MK922547 | Staphylococcus phage SA30-CTH2, complete genome | 3197-3231 | 2 | 0.943 |
NZ_CP029649_8 | 8.3|1734349|35|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT | 1734349-1734383 | 35 | KJ210330 | Staphylococcus phage GRCS, complete genome | 3491-3525 | 2 | 0.943 |
NZ_CP029649_8 | 8.3|1734349|35|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT | 1734349-1734383 | 35 | MK936475 | Staphylococcus phage SA03-CTH2, complete genome | 14280-14314 | 2 | 0.943 |
NZ_CP029649_8 | 8.13|1734280|34|NZ_CP029649|PILER-CR | 1734280-1734313 | 34 | NC_013373 | Staphylococcus sp. CDC3 plasmid SAP020A, complete sequence | 26794-26827 | 2 | 0.941 |
NZ_CP029649_7 | 7.7|1725306|36|NZ_CP029649|PILER-CR | 1725306-1725341 | 36 | MF417907 | Uncultured Caudovirales phage clone 7F_7, partial genome | 31447-31482 | 3 | 0.917 |
NZ_CP029649_7 | 7.7|1725306|36|NZ_CP029649|PILER-CR | 1725306-1725341 | 36 | KY653129 | Staphylococcus phage IME1365_01, complete genome | 11951-11986 | 3 | 0.917 |
NZ_CP029649_8 | 8.14|1734349|36|NZ_CP029649|PILER-CR | 1734349-1734384 | 36 | MK936475 | Staphylococcus phage SA03-CTH2, complete genome | 14279-14314 | 3 | 0.917 |
NZ_CP029649_8 | 8.14|1734349|36|NZ_CP029649|PILER-CR | 1734349-1734384 | 36 | MT926124 | Staphylococcus phage vB_SauP_EBHT, complete genome | 2846-2881 | 3 | 0.917 |
NZ_CP029649_8 | 8.14|1734349|36|NZ_CP029649|PILER-CR | 1734349-1734384 | 36 | MK922548 | Staphylococcus phage SA46-CTH4, complete genome | 3204-3239 | 3 | 0.917 |
NZ_CP029649_8 | 8.14|1734349|36|NZ_CP029649|PILER-CR | 1734349-1734384 | 36 | MK922547 | Staphylococcus phage SA30-CTH2, complete genome | 3197-3232 | 3 | 0.917 |
NZ_CP029649_8 | 8.14|1734349|36|NZ_CP029649|PILER-CR | 1734349-1734384 | 36 | KJ210330 | Staphylococcus phage GRCS, complete genome | 3491-3526 | 3 | 0.917 |
NZ_CP029649_7 | 7.2|1725305|37|NZ_CP029649|CRT | 1725305-1725341 | 37 | MF417907 | Uncultured Caudovirales phage clone 7F_7, partial genome | 31446-31482 | 4 | 0.892 |
NZ_CP029649_7 | 7.2|1725305|37|NZ_CP029649|CRT | 1725305-1725341 | 37 | KY653129 | Staphylococcus phage IME1365_01, complete genome | 11951-11987 | 4 | 0.892 |
NZ_CP029649_7 | 7.5|1725305|41|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder | 1725305-1725345 | 41 | MF417907 | Uncultured Caudovirales phage clone 7F_7, partial genome | 31442-31482 | 6 | 0.854 |
NZ_CP029649_7 | 7.5|1725305|41|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder | 1725305-1725345 | 41 | KY653129 | Staphylococcus phage IME1365_01, complete genome | 11951-11991 | 6 | 0.854 |
NZ_CP029649_8 | 8.1|1734209|35|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT | 1734209-1734243 | 35 | NZ_CP043848 | Staphylococcus epidermidis strain NCCP 16828 plasmid unnamed, complete sequence | 50879-50913 | 6 | 0.829 |
NZ_CP029649_8 | 8.9|1734780|34|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT | 1734780-1734813 | 34 | MN694790 | Marine virus AFVG_250M551, complete genome | 33981-34014 | 8 | 0.765 |
NZ_CP029649_8 | 8.9|1734780|34|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT | 1734780-1734813 | 34 | NZ_LR214999 | Mycoplasma conjunctivae strain NCTC10147 plasmid 3 | 55978-56011 | 8 | 0.765 |
NZ_CP029649_8 | 8.9|1734780|34|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT | 1734780-1734813 | 34 | LR214965 | Mycoplasma fermentans strain NCTC10117 genome assembly, plasmid: 11 | 45570-45603 | 8 | 0.765 |
NZ_CP029649_11 | 11.2|2635901|31|NZ_CP029649|PILER-CR | 2635901-2635931 | 31 | NC_021536 | Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence | 159749-159779 | 8 | 0.742 |
NZ_CP029649_11 | 11.2|2635901|31|NZ_CP029649|PILER-CR | 2635901-2635931 | 31 | LN846932 | Carnobacterium maltaromaticum strain LMA28 LMA_pa plamid, complete genome | 10622-10652 | 8 | 0.742 |
NZ_CP029649_11 | 11.3|2635890|31|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder | 2635890-2635920 | 31 | NC_021536 | Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence | 159749-159779 | 8 | 0.742 |
NZ_CP029649_11 | 11.3|2635890|31|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder | 2635890-2635920 | 31 | LN846932 | Carnobacterium maltaromaticum strain LMA28 LMA_pa plamid, complete genome | 10622-10652 | 8 | 0.742 |
NZ_CP029649_4 | 4.1|966498|32|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder | 966498-966529 | 32 | MN693281 | Marine virus AFVG_25M371, complete genome | 6448-6479 | 9 | 0.719 |
NZ_CP029649_8 | 8.9|1734780|34|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT | 1734780-1734813 | 34 | NC_013940 | Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308, complete sequence | 123527-123560 | 9 | 0.735 |
NZ_CP029649_8 | 8.9|1734780|34|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT | 1734780-1734813 | 34 | NZ_CP028886 | Borrelia turcica IST7 plasmid lp32-A, complete sequence | 1427-1460 | 11 | 0.676 |
NZ_CP029649_8 | 8.9|1734780|34|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT | 1734780-1734813 | 34 | NZ_CP052077 | Ralstonia solanacearum strain FJAT445.F50 plasmid Plas1, complete sequence | 1264667-1264700 | 12 | 0.647 |
NZ_CP029649_8 | 8.9|1734780|34|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT | 1734780-1734813 | 34 | NZ_CP052079 | Ralstonia solanacearum strain FJAT445.F1 plasmid Plas1, complete sequence | 1264689-1264722 | 12 | 0.647 |
NZ_CP029649_8 | 8.9|1734780|34|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT | 1734780-1734813 | 34 | NZ_CP052125 | Ralstonia solanacearum strain FJAT1452.F1 plasmid Plas1, complete sequence | 1264689-1264722 | 12 | 0.647 |
NZ_CP029649_8 | 8.9|1734780|34|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT | 1734780-1734813 | 34 | NZ_CP052123 | Ralstonia solanacearum strain FJAT1452.F50 plasmid Plas1, complete sequence | 1264689-1264722 | 12 | 0.647 |
NZ_CP029649_8 | 8.9|1734780|34|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT | 1734780-1734813 | 34 | NZ_CP052081 | Ralstonia solanacearum strain FJAT442.F50 plasmid Plas1, complete sequence | 1264689-1264722 | 12 | 0.647 |
NZ_CP029649_8 | 8.9|1734780|34|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT | 1734780-1734813 | 34 | NZ_CP052083 | Ralstonia solanacearum strain FJAT442.F1 plasmid Plas1, complete sequence | 1264689-1264722 | 12 | 0.647 |
1. spacer 6.1|1524243|25|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder matches to LC371242 (Escherichia phage EcS1 DNA, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
caacaaagagaatttcgaaaagaaa CRISPR spacer caacaaaaagaatttcgtaaagaaa Protospacer *******.********* *******
2. spacer 8.2|1734280|33|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_013373 (Staphylococcus sp. CDC3 plasmid SAP020A, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tacaaatgaattaatcagtgacatgaaagatga CRISPR spacer tacaaatgaattaatcaatgatatgaaagatga Protospacer *****************.***.***********
3. spacer 8.3|1734349|35|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT926124 (Staphylococcus phage vB_SauP_EBHT, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
cctaaaatatttttattaggtaatgccgttaactt CRISPR spacer ccaaaaatatttttattaggtaatgctgttaactt Protospacer ** ***********************.********
4. spacer 8.3|1734349|35|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK922548 (Staphylococcus phage SA46-CTH4, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
cctaaaatatttttattaggtaatgccgttaactt CRISPR spacer cctaaaatattcttattaggtaatgctgttaactt Protospacer ***********.**************.********
5. spacer 8.3|1734349|35|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK922547 (Staphylococcus phage SA30-CTH2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
cctaaaatatttttattaggtaatgccgttaactt CRISPR spacer cctaaaatattcttattaggtaatgctgttaactt Protospacer ***********.**************.********
6. spacer 8.3|1734349|35|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ210330 (Staphylococcus phage GRCS, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
cctaaaatatttttattaggtaatgccgttaactt CRISPR spacer ccaaaaatatttttattaggtaatgctgttaactt Protospacer ** ***********************.********
7. spacer 8.3|1734349|35|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK936475 (Staphylococcus phage SA03-CTH2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
cctaaaatatttttattaggtaatgccgttaactt CRISPR spacer cctaaaatattcttattaggtaatgctgttaactt Protospacer ***********.**************.********
8. spacer 8.13|1734280|34|NZ_CP029649|PILER-CR matches to NC_013373 (Staphylococcus sp. CDC3 plasmid SAP020A, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
tacaaatgaattaatcagtgacatgaaagatgag CRISPR spacer tacaaatgaattaatcaatgatatgaaagatgag Protospacer *****************.***.************
9. spacer 7.7|1725306|36|NZ_CP029649|PILER-CR matches to MF417907 (Uncultured Caudovirales phage clone 7F_7, partial genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
agtggtccagaattaatacatggtaaaggagtatat CRISPR spacer cgtggtccagaattaatacatggcaagggagtatat Protospacer **********************.**.*********
10. spacer 7.7|1725306|36|NZ_CP029649|PILER-CR matches to KY653129 (Staphylococcus phage IME1365_01, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
agtggtccagaattaatacatggtaaaggagtatat CRISPR spacer cgtggtccagaattaatacatggcaaaggagtttat Protospacer **********************.******** ***
11. spacer 8.14|1734349|36|NZ_CP029649|PILER-CR matches to MK936475 (Staphylococcus phage SA03-CTH2, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
cctaaaatatttttattaggtaatgccgttaactta CRISPR spacer cctaaaatattcttattaggtaatgctgttaacttt Protospacer ***********.**************.********
12. spacer 8.14|1734349|36|NZ_CP029649|PILER-CR matches to MT926124 (Staphylococcus phage vB_SauP_EBHT, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
cctaaaatatttttattaggtaatgccgttaactta CRISPR spacer ccaaaaatatttttattaggtaatgctgttaacttt Protospacer ** ***********************.********
13. spacer 8.14|1734349|36|NZ_CP029649|PILER-CR matches to MK922548 (Staphylococcus phage SA46-CTH4, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
cctaaaatatttttattaggtaatgccgttaactta CRISPR spacer cctaaaatattcttattaggtaatgctgttaacttt Protospacer ***********.**************.********
14. spacer 8.14|1734349|36|NZ_CP029649|PILER-CR matches to MK922547 (Staphylococcus phage SA30-CTH2, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
cctaaaatatttttattaggtaatgccgttaactta CRISPR spacer cctaaaatattcttattaggtaatgctgttaacttt Protospacer ***********.**************.********
15. spacer 8.14|1734349|36|NZ_CP029649|PILER-CR matches to KJ210330 (Staphylococcus phage GRCS, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
cctaaaatatttttattaggtaatgccgttaactta CRISPR spacer ccaaaaatatttttattaggtaatgctgttaacttt Protospacer ** ***********************.********
16. spacer 7.2|1725305|37|NZ_CP029649|CRT matches to MF417907 (Uncultured Caudovirales phage clone 7F_7, partial genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.892
agtggtccagaattaatacatggtaaaggagtatatc CRISPR spacer cgtggtccagaattaatacatggcaagggagtatatg Protospacer **********************.**.*********
17. spacer 7.2|1725305|37|NZ_CP029649|CRT matches to KY653129 (Staphylococcus phage IME1365_01, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.892
agtggtccagaattaatacatggtaaaggagtatatc CRISPR spacer cgtggtccagaattaatacatggcaaaggagtttatg Protospacer **********************.******** ***
18. spacer 7.5|1725305|41|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder matches to MF417907 (Uncultured Caudovirales phage clone 7F_7, partial genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.854
agtggtccagaattaatacatggtaaaggagtatatcagtt CRISPR spacer cgtggtccagaattaatacatggcaagggagtatatgaata Protospacer **********************.**.********* *.*
19. spacer 7.5|1725305|41|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder matches to KY653129 (Staphylococcus phage IME1365_01, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.854
agtggtccagaattaatacatggtaaaggagtatatcagtt CRISPR spacer cgtggtccagaattaatacatggcaaaggagtttatgaata Protospacer **********************.******** *** *.*
20. spacer 8.1|1734209|35|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP043848 (Staphylococcus epidermidis strain NCCP 16828 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.829
accgacgttttattacctattgagcaactattacc CRISPR spacer gtaaacgttttattacctatcgagcaactattccc Protospacer .. .****************.*********** **
21. spacer 8.9|1734780|34|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694790 (Marine virus AFVG_250M551, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
atcggaattaatgaacttatagaattagaaaatt CRISPR spacer ctagagtgtaatgaaattatagaaatagaaaatt Protospacer * *.. ******* ******** *********
22. spacer 8.9|1734780|34|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR214999 (Mycoplasma conjunctivae strain NCTC10147 plasmid 3) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
atcggaattaatgaacttatagaattagaaaatt CRISPR spacer accagaaacaatgaacttatagaattagctaaac Protospacer *.*.*** .******************* ** .
23. spacer 8.9|1734780|34|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT matches to LR214965 (Mycoplasma fermentans strain NCTC10117 genome assembly, plasmid: 11) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
atcggaattaatgaacttatagaattagaaaatt CRISPR spacer accagaaacaatgaacttatagaattagctaaac Protospacer *.*.*** .******************* ** .
24. spacer 11.2|2635901|31|NZ_CP029649|PILER-CR matches to NC_021536 (Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
agctgacgaaaagtcagcttacgataatgtg CRISPR spacer gcttgacgaaaactcaccttacgataaaatt Protospacer . .********* *** ********** .*
25. spacer 11.2|2635901|31|NZ_CP029649|PILER-CR matches to LN846932 (Carnobacterium maltaromaticum strain LMA28 LMA_pa plamid, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
agctgacgaaaagtcagcttacgataatgtg CRISPR spacer tgaagacgaaaaatcagattacgataaatta Protospacer * ********.**** ********* *.
26. spacer 11.3|2635890|31|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder matches to NC_021536 (Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
agctgacgaaaagtcagcttacgataatgtg CRISPR spacer gcttgacgaaaactcaccttacgataaaatt Protospacer . .********* *** ********** .*
27. spacer 11.3|2635890|31|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder matches to LN846932 (Carnobacterium maltaromaticum strain LMA28 LMA_pa plamid, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
agctgacgaaaagtcagcttacgataatgtg CRISPR spacer tgaagacgaaaaatcagattacgataaatta Protospacer * ********.**** ********* *.
28. spacer 4.1|966498|32|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder matches to MN693281 (Marine virus AFVG_25M371, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tttcgaaaagaaattctacaaacaatgcaagt CRISPR spacer cacttagaagaaatcctacaaacaatgcaaaa Protospacer . .. *.*******.***************.
29. spacer 8.9|1734780|34|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_013940 (Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
atcggaattaatgaacttatagaattagaaaatt CRISPR spacer aatagaataaatgaacttgtagaattagtcaaag Protospacer * ..**** *********.********* **
30. spacer 8.9|1734780|34|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028886 (Borrelia turcica IST7 plasmid lp32-A, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
atcggaattaatgaacttatagaattagaaaatt CRISPR spacer gaaaagaataataaacttaaagaattagaaaaga Protospacer . ...* ****.****** ************
31. spacer 8.9|1734780|34|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052077 (Ralstonia solanacearum strain FJAT445.F50 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.647
atcggaattaatgaacttatagaattagaaaatt CRISPR spacer tccggagttaatgaacttatagtattccgtctca Protospacer .****.*************** *** . .
32. spacer 8.9|1734780|34|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052079 (Ralstonia solanacearum strain FJAT445.F1 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.647
atcggaattaatgaacttatagaattagaaaatt CRISPR spacer tccggagttaatgaacttatagtattccgtctca Protospacer .****.*************** *** . .
33. spacer 8.9|1734780|34|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052125 (Ralstonia solanacearum strain FJAT1452.F1 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.647
atcggaattaatgaacttatagaattagaaaatt CRISPR spacer tccggagttaatgaacttatagtattccgtctca Protospacer .****.*************** *** . .
34. spacer 8.9|1734780|34|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052123 (Ralstonia solanacearum strain FJAT1452.F50 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.647
atcggaattaatgaacttatagaattagaaaatt CRISPR spacer tccggagttaatgaacttatagtattccgtctca Protospacer .****.*************** *** . .
35. spacer 8.9|1734780|34|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052081 (Ralstonia solanacearum strain FJAT442.F50 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.647
atcggaattaatgaacttatagaattagaaaatt CRISPR spacer tccggagttaatgaacttatagtattccgtctca Protospacer .****.*************** *** . .
36. spacer 8.9|1734780|34|NZ_CP029649|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052083 (Ralstonia solanacearum strain FJAT442.F1 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.647
atcggaattaatgaacttatagaattagaaaatt CRISPR spacer tccggagttaatgaacttatagtattccgtctca Protospacer .****.*************** *** . .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
70956 : 79996
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP029649|70956:79996|DBSCAN-SWA CATGAATGAGCGTATGGTTGATCAATCAATGCATAGTGAAGAAACTGATTTCGAATTGTCGCTTAGACCTACGAGATTACGACAATATATTGGTCAAAATTCAATAAAAAGTAATTTAGAAGTATTTATTAAAGCGGCTAAACTTCGTCATGAACCATTAGATCATGTATTGCTTTTTGGCCCCCCTGGATTAGGTAAGACAACATTATCTAATATCATTGCCAATGAAATGGAAGTTAATATACGTACAGTATCAGGGCCTTCATTAGAAAGACCTGGTGATTTGGCTGCAATTTTATCAGGACTTCAACCTGGAGATGTTTTGTTTATTGATGAAATACACAGACTGAGTAGTGTTGTTGAAGAAGTGTTATACCCTGCAATGGAAGATTTCTTTTTAGATATTATCATTGGTAAAGGCGATGAGGCTAGAAGTATCCGTATCGACTTACCTCCATTCACTTTGGTAGGTGCAACAACGCGAGCTGGCAGCTTAACAGGTCCACTAAGGGATCGATTTGGTGTGCACTTAAGATTAGAATATTATAATGAATCAGATTTAAAAGAAATCATTATTAGAACAGCTGAGGTTTTAGGCACAGGTATTGATGAAGAAAGTGCCATTGAACTTGCTAAACGTTCTAGAGGGACTCCAAGAGTAGCAAATCGACTATTGAAGCGGGTAAGAGACTTCCAGCAAGTGAATGAAGATGAACAAATATACATTGAAACAACGAAGCACGCATTAGGTTTACTTCAAGTTGATCAACACGGACTAGATTACATTGATCATAAAATGATGAACTGTATTATTAAGCAGTATAATGGTGGACCTGTTGGTTTAGATACGATTGCCGTAACAATTGGTGAAGAGCGTATTACAATTGAGGACGTTTATGAGCCATTTCTTATTCAGAAAGGCTTTTTAGAACGTACGCCACGTGGCAGAAAAGCAACACCATTAGCTTATGAACATTTTGCAAAGTCGAATGAGGAGAGAGAATAACGTGAATATTGAAGAATTTGACTATGACTTACCAGAATCATTAATTGCTCAAACGCCTTTAAAAGATCGTGATCATAGTCGTTTATTAGTCATGGATAGAGAAACTGGTGAAATGAAACATTTACATTTCAAAGATATCATTGAGTATTTTAGACCTGGTGATACATTAGTGCTTAACGATACGCGAGTAATGCCAGCTAGACTTTTTGGTTTAAAAGAAGAAACTGGTGCAAAAGTTGAAATGTTAATGCTAACTCAAATTGAAGGTAATGATTGGGAAGTCTTACTGAAACCAGCTAAGCGTATTAAAGTTGGTAATAAATTGAATTTTGGTAATGGCAAAATTATAGCTGAATGCATAAAAGAAATGGATCAAGGTGGACGCATCATGCGTTTACATTATGAAGGTATTTTACAAGAAAGATTAGATGAATTAGGGGAAATGCCACTGCCACCATACATCAAAGAACGTTTAGATGATCCAGATCGTTATCAAACAGTTTACGCTAAAGAAAGTGGTTCAGCGGCAGCACCAACAGCAGGATTACATTTTACTGATGAGTTATTAACTGAAATTAAAAATAAAGGTGTTAATATCGCATTTGTTACATTACATGTTGGGTTAGGTACGTTTAGACCGGTGAGCGTCGATGATGTGAATGACCACGAAATGCATAGTGAATATTATCAAATGACACAAGAAACAGCTGATTTATTAAATGATACTAAGTCCAAAGGACATCGCATTATATCAGTTGGTACAACTTCAACACGTACACTTGAAACAATTCGACGCGATCATGATAAATTTGTTGAAACGAGTGGCTGGACTAATATATTTATTTATCCAGGATTTGATTTTAAAGCAATTGATGGCCAGATTACTAATTTTCATTTACCAAAATCAACATTAGTTATGCTAGTATCAGCGTTTAGTACTCGTGAAAATGTTCTGAATGCTTATAAAACGGCAGTAAATTTAGAATATAGATTCTTTAGTTTTGGCGATGCAATGTTAATTATATAAAAAGAATGTGAGGATTTTGAATATGCCTGCAGTAACATATGAACACATTAAAACTTGTAAACAATCAGGTGCGCGTTTAGGTATCGTGCACACACCACACGGTTCATTTGAAACACCTATGTTTATGCCAGTTGGTACTAAAGCAACCGTTAAAACAATGAGTCCAGAAGAGTTAAGACAAATTGAAGCAAAAATCATTTTGGGCAACACATATCATTTGTGGTTACAACCCGGAAATGATATTATCAAACACGCTGGGGGATTACATAAATTCATGAATTGGGATGGTCCGATTCTTACAGATTCAGGCGGTTTCCAAGTGTTTAGTTTAAGTAATTTACGTAAAATTACAGAAGAAGGCGTGGAATTTAGACATCATACTAATGGGTCTAAATTATTTTTGAGTCCTGAGAAATCAATGCAAATTCAAAATGATTTAGGATCTGATATTATGATGGCATTTGATGAATGTCCACCGATGCCTGCTGAATATGATTATGTAAAAAAATCTATTGAACGTACAACACGTTGGGCGAAAAGATGTCTAGATGCACAACAAAGACCTGAAGATCAAGCATTGTTCGGCATTATACAAGGTGGCGAATATGAAGATTTAAGAGAACAAAGTGCAAAGGATTTAGTAGAATTAGATTTTCCTGGTTATGCAATCGGCGGTTTGTCAGTTGGTGAACCTAAACCGGTTATGTATAAAATGGTTGAACATACAGAGCAGTTTATGCCTAAAGATAAACCAAGATATTTAATGGGTGTAGGATCTCCAGATGCGTTAATCGAATGTAGTATTCGCGGCATGGATATGTTTGATTGTGTCTTACCGACACGTATTGCCAGAAATGGTACTTGTATGACATCGCAAGGTCGTTTAGTTATTAAAAATGCAAAATTTGCAGATGATTTAAGACCGTTAGATGAGAATTGTGACTGTTATACATGTCAAAACTATTCAAGAGCGTATATACGTCATTTAATCAAGGCAGAGGAAACTTTTGGTATTCGTCTTACTACTATTCATAATTTACATTTTCTGCTAAAATTAATGGAAGATATAAGACAAGCCATTCGAGAAGATCGTCTTTTAGATTTCAAAGAAGAATTCTTCGAGCAATATGGATTAAATGTTGAGAACCCAAAAAACTTTTAAGCAAGAGGAGCGTATAAAATGCAATTTTCATTACTAATATATATAGTCGTAATTTTTGCGGTTATGTATTTCTTGATGATCAGACCACAACAAAAACGTGCGAAACAGCATCGTGAGTTGATTAATAACATTCAATCTGGTCAAAGAATTACAACTATTGGTGGTATTAAAGGTACTGTTAAAGCAGTAGATGAAACAACTGTTGTTATTACAGTTAATGGTCATGGTACTGAATTAACTTTCGAAAAACCTGCTATTAAACAAGTTGACCCTTCATAATGAGAAGTGGTATTAAAAAGGATGAAACGAATAGCGTTTCATCCTTTTTAAGTTATAAGTAGTATGTAGAATAGCTTATTTTTATTCCAGAAAAAGAAATTGTGATACATAATAATTGTTAAATTTAAATTAAATATATCTATGACTATTTTTACTCCCTGCTCTAGTATGTTAATATGTATAAGGCTAATAAATTTTGTAAGAAAGATTTAACTTGCGTTATAAAATAGTATTCAAGTATTCTAAATACATACGTAAATAATGAGGTGTTCATGTGAAGAAAAGTAGTAGAATAATTGCGTTCTTGCTTTTAGTCGTATTGTTGTTTGCCGGAATGGCTGCAACTTATAAAAGTGTTATAAAGAATGTCAATTTAGGACTTGATTTGCAAGGTGGATTTGAGGTGCTTTATCAAGTCGATCCTTTAAATAAAGGCGACAAAATAGATAAAAAAGCCTTACAATCAACAGCGCAAACATTAGAAAATCGTGTTAACGTTTTAGGTGTTTCGGAACCTAAAATTCAAGTTGAAGAACCTAATAGAATTAGAGTACAACTTGCTGGTGTAACAGACCAGAATGAAGCACGTAAAATTTTATCTTCTCAAGCTAATTTAACAATTCGCGATGCAGAAGATAAAGTAAAATTAAGCGGTTCTGATATTAAACAGGGATCTGCCAAACAAGAATTTAAACAGGAAACAAACCAGCCTACAGTTACTTTTAAAGTAAAAGACAAAAACAAATTTAAAAAAGTAACGGAAGAAATCTCTAAGAAACGTGATAATGTCATGGTTGTTTGGTTAGATTTCAAAAAAGGTGACAGCTATAAAAAAGAAGCACAAAAGAAAAACCCTAAATTTATTTCTGCAGCAAGTGTTGATCAACCAATCAATTCTGATAGCGTAGAAATCTCGGGTGGATTTAAAGGACAAGAAGGCGTTAAAAAAGCAAAACAAATCGCCGAATTGTTAAATGCAGGTTCTTTACCAGTTGACTTGAAAGAAATTTATTCAAACTCAGTAGGTGCCCAATTTGGTCAAGATGCATTAGATAAAACTGTGTTTGCATCGTTTATTGGTGTAGCATTAATTTATTTATTCATGCTTGGATTCTACCGATTACCTGGTTTAGTAGCGATTATTGCATTGACAACTTATATCTATCTAACGTTAGTAGCATTTAATTTCATTTCCGGGGTTCTAACTTTACCAGGATTAGCGGCGTTGGTATTAGGTGTAGGTATGGCTGTAGATGCCAATATTATCATGTATGAGCGTATTAAGGATGAACTTCGAATAGGTAGAACGATAAAGCAAGCCTTTTCTAAAGCAAACAAAAGTTCATTCCTAACAATTTTTGATTCTAACTTAACAACAGTTATCGCCGCAGCAGTATTATTCTTCTTCGGTGAAAGTTCAGTTAAAGGTTTCGCGACAATGTTATTATTAGGTATTCTAATGATCTTTGTTACAGCCGTGTTCTTATCAAGATTCTTATTATCATTACTTGTTTCATCAAATATAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP029649|70956:79996|73010_74150_+|WP_001112049.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAQQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP029649|70956:79996|70956_71961_+|WP_001005767.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >NZ_CP029649|70956:79996|74168_74429_+|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP029649|70956:79996|77185_79456_+|WP_000595005.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKQVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NZ_CP029649|70956:79996|71962_72988_+|WP_001019178.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP029649|70956:79996|79477_79996_+|WP_000364542.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_CP029649|70956:79996|74703_76983_+|WP_000749795.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
211935 : 297373
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP029649|211935:297373|DBSCAN-SWA AATGATGAGCCGGCTAAATAGTGTCGTAATTAAACTGTGGTTAACTATTATTTTAATAGTGACGACAGTTTTAATTTTATTAAGTATTGCTTTAATTACCTTTATGCAATACTATTTCACACAAGAAACCGAAAATGCCATAAGAGAAGATGCTAGACGTATAAGTTCACTGGTCGAACAATCACATAATAAAGAAGAAGCAATAAAATATAGTCAAACATTAATTGAAAATCCTGGTGGGTTGATGATTATAAATAATAAACATCGTCAATCAACGGCTTCACTTTCTAATATTAAAAAGCAAATGTTGAATGAAGTAGTCAACAACGACCATTTTGACGATGTGTTTGATAAAGGTAAATCTGTTACTCGAAATGTAACGATTAAAGAAAAGGGCTCATCTCAAACATATATTTTGTTAGGCTATCCAACAAAAGCACAGAAGAATAGTCATAGCAAATATAGTGGAGTCTTTATATATAAAGACTTGAAATCAATCGAAGATACAAATAATGCTATTACGATTATCACTATAATTACGGCTGTTATTTTCTTAACAATTACAACAGTCTTTGCGTTTTTCTTATCATCAAGAATTACAAAACCTTTAAGACGTTTAAGAGACCAAGCTACACGTGTATCTGAAGGGGATTACTCTTATAAACCTTCTGTCACAACGAAAGATGAAATTGGTCAATTATCGCAGGCATTTAATCAGATGAGTACAGAAATCGAAGAGCATGTCGACGCATTATCCACATCTAAAAATATTAGAGACAGCTTAATTAACTCTATGGTAGAAGGTGTCCTAGGTATTAATGAGAGTCGACAAATTATCTTATCTAATAAGATGGCGAATGATATTATGGACAATATTGATGAAGATGCTAAAGCTTTCTTATTAAGACAAATTGAAGATACTTTTAAATCAAAACAAACGGAAATGCGTGATTTAGAAATGAATGCACGATTCTTTGTTGTGACCACAAGCTATATCGACAAGATTGAACAGGGAGGTAAAAGTGGTGTTGTTGTGACAGTTCGTGATATGACTAATGAGCACAATCTAGATCAAATGAAGAAAGATTTCATTGCTAATGTATCACATGAATTACGTACACCGATATCATTACTTCAAGGTTATACTGAATCAATTGTAGATGGTATTGTTACAGAACCGGATGAAATAAAAGAATCGCTTGCCATTGTCCTTGATGAATCGAAACGTTTAAATCGTTTAGTTAATGAATTGTTAAATGTCGCACGCATGGATGCTGAAGGGTTATCCGTAAATAAAGAAGTTCAGCCTATTGCAGCGTTACTAGATAAGATGAAAATTAAGTATCGCCAACAAGCTGATGATTTAGGTCTAAATATGACTTTTAATTATTGTAAGAAGCGTGTTTGGAGTTATGATATGGATCGCATGGACCAAGTACTAACGAACTTGATTGATAATGCATCACGTTATACGAAACCTGGAGATGAAATTGCAATTACTTGTGATGAAAATGAAAGCGAAGATATTTTATACATTAAAGATACAGGCACAGGCATTGCACCAGAACATTTACAACAAGTATTTGATCGTTTTTATAAAGTTGATGCAGCGAGAACGCGAGGTAAACAAGGTACCGGTTTAGGTTTGTTCATTTGTAAAATGATTATCGAAGAGCATGGTGGTTCCATAGATGTTAAAAGCGAATTAGGAAAAGGCACAACATTTATTATTAAACTACCAAAACCAGAATAAAACTGAATATAGTTATTTAAGAACGCATGTTATTGATTAGAGACTCTAATTTATAGCATGCGTTTTTTGATTGATGTGGGGAATTTTGTATGTGGATTACGATTTAGGATTTTTGTGAATAACAACTATTAAATATATTACTAATTTATACAAAAATATAAAGTTTGATAAAGTTATTTATTTGATTATAAAAATAGGGTAAAATATAGATATATTGCAATAATTAAATTATTCGAGGTGTCATATGAAAAAATTCATTGGATCAGTTTTAACCACGACATTAATTTTAGGGGGATGTTCCGCGATGGAAAATGAATCAAATAAAGACACAAACACAGAAACAAAATCTGTACCAGAAGAAATGGAAGCTTCAAAATATGTAGGCCAAGGCTTCCAACCGCCTGCAGAAAAAGATGCGATTGAATTTGCGAAGAAGCATCGTAAAGAATTTGAAAAAGTAGGTGAACAATTCTTTAAAGATAACTTTGGACTAAAAGTTAAAGCTACAAATGTTGTAGGTAAAGATGATGGTGTAGAAGTTTATGTGCATTGTGAAGATCATGGCATTGTATTTAATGCAAGTCTACCTTTGTACAAAGATGCCATCCATCAAAAAGGATCAATGCGCAGTAATGACAATGGTGATGATATGAGTATGATGGTGGGTACAGTGCTGAGTGGCTTTGAATATCGAGCGCAAAAAGAAAAGTATGATAACTTATATAAATTCTTCAAAGAAAATGAAAAGAAATATCAATATACAGGCTTTACAAAAGAGGCAATTAACAAGACACAAAACGTTGGATATCAAAATGAATACTTTTATATCACATATTTATCAAGAAACTTAAAAGAATATCGTAAATATTACGAACCGTTGATTCATAAAAATGATAAAGAATTTAAAGAAGGTATGCAACAAGCTAGAAAAGAGTTAGATTATACTGCCAATACTGATGCAGTTTCTACACTTTTTTCAACTAAGAAAAACTTTACTAAAGACAATACAGTAGATGATGTGATTGAATTGAGTAATAAATTAAAAGAAAAACCCAATATGCCTCAAAAATCTCAAGTTACTATTCAATTAGGAAAATCTAGTATAAATACTAAAAAACCATTTTATGACGATATAAATCCAATTGAAGGGTAAGTGAATATAAAGTGAATAAAATAAATGATAGGGACATAGCAGAATTGAGCAGTTATTGGGTTTATCAAGATATAAATGAAAAAAAGATTTTAAAGTAAATGGAAAACGGTTCAAACAAATAGATAATTATAATGATAATAGTAATGATAATATGAATGGTGCTGCTGATATTAAAACATACGAGTTACTTAATGATCAGGGGAATCCAACTGGTCAACAGACAATAATTTATCAAGGAACATCTAATGAGGCAATTAACCCAAATAATCCATTAAAATCATCGGGTTTTGGAGATGATTGGCTCCAAAATGCTAAATTAATGAATAATGATAATGAAAGCACAGATTATTTAAAGCAAGTAGAAGAATTCGCAAATAGTTATCGACAAAAAATTAAAGATGCTTCTGTTCTTGATGAAAATGAATTTAGAAGAAAATACAAAACTAAACCTTATAATTACAAAAACAAAACAATTGTGGCGGATGGTGGTAATTCGGAAGGTGGTGCAGGAGCAAAATATCAAGGAGCGAAACATCCGAATGAAAAAGTTGTTGCTACTGACTCAGCAATGATTCCTTATGCTGCTTGGCAGAAATTTGCTAGACCACGCTTTGATAATATGATTAGTTTTAATAGTACCAACGATTTATTAACATGGTTACAAGATCCATTCATCAAAGATATGCCAGGAAAACGCGTTAACATTAGTGATAGTGTGCCCAGGTTAGATGCTTTAATAGACAGCCATGTAGGTTATAAAAGGAAGTTAAATAGAAAAGATAACACATACGATACTGTACCACTAATCAAAATTAAGTCGGTAAAAGATACAGAAATTAAAAATGGAAAAAAAGTAAAAAAGACTATTAACATAACATTAGATATGGATGGGCGAATTCCAATAAATGTTTGGACAGGAGATTCGATTGCACGTTCCGGAAAAGGAACTTTAATTAAACTTAATTTAGAAAATCTTGATGCGTTGAGTAAACTGATTACTGGTGAAACAAGTGGTATGTTAGCAGAATGCGTAATCTTTTTAAATGAAAGTTTTAACATCTCAGAAAATGAAAATAAAAATTTTGCAGATAGAAAGAAACAATTATCAGAAGGATTTAAGGATAAGATTAACTTATTTCAATTAGAAGAAATGGAAAGAACTTTAATTAGTAAAATAAACGCACTTGAAGAAGTTGCAGATGAAACAATAGAAAGTATTAGTGCTGTTAAACACTTATTACCTGATTTTGCATTGGATGCATTAAAAGAAAGAATTAATGAGTTGTTTAAAGGTATAAAATCTTTTATAGAAAAAGTGTATGATAGTATAGATAATGAAATTTTAGAAATTTTCAAAAATATAGATCACGACTTCAGAGATGGAGTATCTGAAGAAATGATGAAACATTTGAAAGTAGTGAAACAGAATATAGAGCAAATAAAAAATCAAAATGATATTTATGGTAGGCAAATTGCAGATATTAGAAGTATTATGAAGCAACAAGATGCAACAATTTTAGATGGAAATTATCAAATTAATTATAGCGGTGAAAATATGGTGCAGGGTCTAGCTTTACCTTCTAATTATTTAGGAAGAAAAATGAAAATATTAAAAGACCATATCGATGATGGTATTAAAAAAATAGCAGACTATGTTCAAGGTATATATGATGAATATGCATCGAAAATTGTCGATGTAATAAAATATTTGATTAATACAATTCCCAAAATACGTAAGAATTTAAGACATGCAATTGAAATGTTAAATGTAAAAAAGAAAGAATTTTTGTCCCTGATTCCTAATGTAACTTGTAATTATATTAAAACTAAATTAGAAGAATTAGATAATACTTTAGGCAAATGGGAGCCTTTTCTTAATGATTTAAAAGCAGTGTCACCAATTTTAGATAACCATTTAGATGATATTGTTAAGAACATGAAGCCTTTGATTGTACAAATGATATTTGAACCATCACATTATGATGATATATTTATTTCAAGAAAAGCTTTAACGCCAGTGTTCTCAAGCGTTTTATAAAGCTTGTAAAAAATATAAGGGCAAAAAAAGGGCAGATTTAAGCTAACTTGGAATGT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>NZ_CP029649|211935:297373|228457_228715_+|WP_031790715.1|DBSCAN-SWA MSIISNRKVDMNETQDNVKQPAHYAYGDIEIIDFIEQVTAQYPPQLAFAIGNAIKYLSRAPLKNGHEDLAKAKFYVDRVFDLWEG |
102 | Staphylococcus_phage(80.26%) | integrase,tRNA,portal,holin,capsid,head,protease,plate,tail,terminase | attL 212696:212713|attR 258761:258778 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
740429 : 748902
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP029649|740429:748902|DBSCAN-SWA CTTATTTTACAATTTTAGCAATAACACTTGGATATAATTCATATTCCAATTTTTTTACTTTCTCTTCTAATTGTTCTTTTGAATCGTCCGGTCTAATATCACATTGTCTCTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATACCACTATCAACATAATGTACTGTCGAACCAGTAATAGTATCGCCACTATGATATGCTTGGCCTATTGCGTCAATCCCCTTATATTTCGGCAATAGAGATGGATGTATATTCAATATTTTACCTTCAAATGATGCTAATAAGTCTGGACCTATTAGACGCATGTAGCCAGCTAAAATAATCCACTCTACCTTATCTTTATTTAATAGTGTTACTAAATGTTGTTCATACGCTGCTTTTGAATCAAATTGTTTTGGTTCATTAATATAAACAGGAATATCGTGCTTTTTTGCTCTATCTATACAAAACGCATTTTGATGATCCGTATATAGCGCCGTAACTTCAATATTTTCAAGTTTTCCTGATTCAACATGCTCAACTATATTTTCAAAGTTACTTCCTGAACCTGATGCAAAAATCGCAATTTTAACCATTGTTATACCCCCAACAATTCAATTGCAGTTGACTCATTTTTCACAATATGACCAATTTGATAGGCTTCCACATTTTGTTCTGCTAAAATCTTCAAAGCGCGTGATGCATCTTTTTCATCAACGATAACCGTATAGCCAATACCCATGTTAAAAATGTTATACATTTCATTTGTGTCTATATTGCCTTGTTGTTGTAACCAATCAAATATTTTTGGCGTTGGAAATGATGTAGTATCAATTCTAGCAGCATATCCGGCTGGCAATGCACGTGGAATATTTTCATAAAAGCCTCCACCAGTAATATGATTCATTGCCTTAATAGAAACTTCTTTTTTTAAAGCAAGTACAGGTTTGACATATAATTTAGTTGGTTCTAAAAAGACATCTATAAATGGACGATTATCGAAGTTTGATGCCAAATCAATGCCTGATTCATTAATTAATTTGCGCACTAAACTATATCCATTTGAATGAATGCCACTTGACGCAAGCCCTATAACAACTTGTCCCTCTTTCACTTCTGAACCATCTACATAGTCATCCTTTTCAACTGCTCCAACTGCAAATCCGGCTACATCATATTCACCTTCGTGATACATTTCACCCATTTCAGCAGTCTCTCCACCGATAAGTGCAGTATTCGTTTCAACGCATGCATCACTAATACCTTTAACAATTTGTTCAATAACTTCAGGAACAACTTTATTTGTAGCGATGTAATCTAAAAAATACAATGGTTCTGCACCTGTCGTTAAAATATCATTAACACACATTGCGACTGCATCGATACCTATCGAATCATGTTTCCCATAGTCGATAGCTAGTTTTAATTTCGTACCTACTCCGTCTGTTCCAGAAACTAAAACTGGTGCTGTCATATTTAATTGTGATAAATCAAATGTAGCACCGAATCCACCTAAACCACCGATAACTTCTTTACGCATCGTACGTTTAACATGACTAGACATTCTTTCTACAGCTTCATAACCAGCATGAATATTTACACCAGATTGTTCATATGCTTTAGACATTTAAATTTCCCTCGCTATCAAAAAAGTGTTTGTTTTTAGAAATATATTGCTTTTGTCGATGACTTAAACGCGCTTTATAATTTGCTTCATAATCATATAACCCTGCAGGATAATCTCCAGTGAAACTTTCTACACATAAGCCACTATATGGCGCGTCATAATCTAAACCAATTGATTCAATTAACCCATCTACAGATAGATATGCTAATGAATCAGCGCCAATATAATCTTTAATTTCTTCAGGTGATTTGCTTGCAGAAATTAATTCTGCCGTAGTTGAAACATCGATTCCATAAAAACTTGGGAACATAAATTCCGGTGATGCTATACGCACATGTACTTTATTTGCACCAGAATCTTTTAACATTTTCACAATGCGTCGAATTGTCGTACCGCGAACAATGGAATCATCAATAAGAATGATATTTTTCCCATCTACTATATCTTTTACCGCAGATAACTTCACTCTCACACCTTGCTCACGTAATTCTTGAGTTGGTTGAATAAATGTTCTTGCAACATATTGATTTTTAACTAGTCCCATTTCATATGGCAAACCTATTTCTTCAGCATAACCACTCGCAGCTGATAGCGATGAATTGGGTACACCGATGACCATATCAGCATTTACAGGGCTTTCTTGGGCTAATTTTTTACCAGAAGCTTTACGTACTGCATGGACATTTTTACCAGCTATTGTTGAGTCTGGTCTAGCAAAATAAATATATTCCATCGCAGAAATTGCAGTTGTCGTATGATGTGTATAAGATTTAACTGTAATACCTTTATCGTTAATCACGACATATTCACCTGCATGAATATCTTGAACAAATTCTGCACCTAACACATCTATTGCACATGTTTCACTTGCAAGGATGTATGTCCCATCTTTCATTTTACCTACAACAAGTGGTCTGATAGCATTTGGATCTACTGCGCCATATAACGCATCTTTAGTTAAAATCGCAAATGTAAAACCGCCTTTAACTTTTCGCAAACTTTCTTTCAACGCTTCCTCAAAAGTAGGAGCTTTACTTCGACGTATCAAATGCATAATGACTTCAGTATCAGAAGACGAATGGAAGATAGCACCTTGTTTTTCTAAATTCTGACGCAATGATTTAGCATTAATGAGGTTACCATTATGACAAATACCTACACTCATATCATAAAAGTGATACAGAAACGGTTGAATATTTTCAATACCTTTATTACCTGAAGTAGCATAACGGACGTGACCAATTGCATGTTGATATCCTTTTAATCGTTCCATTTGATCATCTTTAATCGCTTCAGTTAGTAAGCCTAATCCTCGCTCGCCTTTTAATTCATTTTGATCAGAAACAACTATACCTGCACCTTCTTGACCACGATGTTGCAAACTATGAAGTCCCATATATGTTAGTTGCGCTGCTTCAGGATGATTCCAAATACCAAACACGCCACATTCTTCGTTTAATCCTGAGTAGTTAAACATTGAGCAATTGCCCCTTCCCATATTTGTTTAATATCTGAAACATTTTCACTAATCTCTGTATATGGTGTTGTTACCTTGAAATTATCACTATCTGTTAAAAGTCCAATTTCTATTGCATTATCAATATTTAAAGTTTTACCTGATTTAACAGAAACAACATATCGGCCTTGCGTCTCACTAAACAATTGTGCATTTGTTATATCTATTGAAGATTTTAATCCTAAACCGTAATGCGCACTTAGTTTAGCTAAGGTAATCAGTAAGCCACCTTTACCAACTGTTTGAACATGTGATAATAGTCCTTCACGAATAGCGGTCTTGATTGATTCACCTTTTTCAACTTCTGAACTCAAATCTAATGACTCAAATTCATGATTAACTTTGCCATAAATTAACTTTTCAAGTTGACTACCACCAAAGTCGTCCTTAGTATCACCGATTAAATATAATTTATCTCCAACTTGAGGTTCAAAATCATTTAAATAATTTACATTTTCAATCAAACCTACCATTCCAACAACTGGTGTTGGGAAAATAGAAGTACCTTTCGTTTCGTTATATAAAGATACATTACCAGAAACTACTGGTGTCTTAAGAATGTCGCATGCTTCTGCCATACCTTTCGTTGAATCTATCAACTGTTGATAGATTTCTTTCTTTTCAGGAGAACCATAATTTAAACAATCTGTCATTGCTAATGGTGTTGCACCCACGGCAATTAAATTTCGATAAGCTTCAGCTACTACCATCTTTCCACCTTCATATGGATTGTTATATACATAACGCGCTTCACCATCAATTGTTGAAGCAATTGCCTTATTTGTGCCTTCCACACGTACTACCGATGCTTGAAGTCCTGGCTTAATTATCGTATTGGCACCAACTTGTTGGTCGTATTGATCATATAAATAGTGTTTAGATGCTATAGTCGGATGCTTAAGTAATTTAAAGAAAGTATCTTTAACATCGATGTGTGTATAATCATTTTTAGAAGTATTATAATCTTTTTCTTCTCCTTCTAAAATATATACAGGTGCTTCATCAGCTAGTGGTTCAACTGGAATGTCAGCATAAACTTCGTCATCATATGTTAAAACAAAACGATTTGTATCTGTAACTTCACCTATAACAGCACTATCCAATTCGTGCTTATCAAATAAATCTAAGAATTTTTGTTCAGTACCTTTTTCAACAACTAGTAACATACGTTCTTGAGTTTCTGAAAGCATCATTTCATAAGGAGAAATACCTGGCTCACGTGTTGGCACTTGTTCTAATCTCAAATGTAACCCACTACCACCTTTTGCCGCCATTTCAGACGATGAAGATGTTAAACCAGCAGCACCCATATCTTGAATACCAACTAATTCATCAAATGTAATTGCTTCAAGTGTTGCTTCCATTAATTTTTTACCTACAAATGGATCACCGATTTGTACAGAAGGTCGTTTACTTTCGCTTTCTTCCGTCAATTCTTCAGATGCAAAAGTAGCACCATGAATACCATCTCGACCAGTTTTCAAACCAACATAAATGACCGAATTACCTACACCTTTTGCTGTGCCTTTTTGAATCATGTCGTGATTGATAACACCAACACACATTGCATTAACAAGTGGATTGCCATCATAACGTTCATCAAATTCGATTTCACCAGCAGTTGTTGGAATACCAATGCAGTTACCATAACCTCCGATACCCTTTACAACACCTTTAAGTAATCTTTGGTTTTGTTTATTATCTAATTCTCCAAATCTAAGACTGTTTAACAAATTAATAGGTCTAGCCCCAATAGAGACAATGTCACGAATGATTCCACCAACGCCTGTAGCAGCCCCTTGATATGGTTCAATTGCTGATGGATGATTGTGAGACTCTACTTTAAATACTACGGCTTGATTATCACCTATATCGACTACCCCTGCACCTTCACCAGGCCCCATAAGCACATGGTCACCTGACGTAGGAAATTGCTTTAAAAACGGTTTAGAATGTTTATAAGAGCAATGTTCACTCCACATAACAGAAAAGATACCTGTTTCTGTAAAGTTAGGTTGTCTGCCTAAAATATCGCAAACTTTTTCATATTCTTGATCACTTAATCCCATATCTTGATATACTTTTTCAAGTTTAATTTCTTCAACGCTTGGTTCGATAAATTTAGACATGTTGTTCCCTCCAACTTTTTACCATCGCTTCAAATAATTTCACACCACTATCAGTACCTAACAACGTTTCTAAAGCTCTTTCAGGATGTGGCATCATGCCACATACATTGCCTTTTTCGTTAACAATTCCTGCAATATCATCATATGAACCGTTCGGATTATTCACATATTTCAGAATAATTTGATTGTTAGCTTTTAATTGTTGATATATTTCATCAGTACAATAATAATGACCTTCACCGTGAGCTACAGGATATATAACTTTTTCACCTTGTTCATAAAGATTTGTAAATGCCGTTTGATTATTCATTATTTCTAACTCTTCATTTCTACTAATAAATAAATGTGAATCGTTATGCAATAATGCACCAGGTAATAAGCCTATTTCAGTTAAAATTTGAAACCCATTACAAACACCTAATACTGGCTTACCTTCAGCTGCAAGACGTTTAACTTCCGAAATAATCGGCGCTACACTAGCCATTGCCCCAGATCTTAAGTAATCCCCGAATGAAAATCCACCAGGAATAAGTACGCCATCAAATCCACTTAGTGATGTTTCTCTATAATCTACATATTCCGCTTCAACACCACTTTTAATAGCAGCATTAAACATGTCTCTATCACAATTCGAACCTGGAAAAACAAGAACCGCAAATTTCATTTTATGCATTCTCCTTTTCATCATCTAACACTTTATAGCTATATTCTTCAATCACTGTATTTGCAAACAATTTTTCACTTAGAGTTGTAATAATGTTGTGTACCTTTTCATCACTAACCTCATCCACTGTCATATATAATACTTTTCCTACACGAATATCATTCACTTGTGCATAACCTAAGTCATGTACAGCTCGAGTAAGCGTTTGTCCTTGCGTATCTAATACTTGTGGTTGTAATGTGATATGTAGTTCAATTGTTTTCATTATTTTAAATCCTCCAATTTGTTTAAAAATATTTGATATGTTTCAATCAGTGATCCAGTGTTATTTCTATATACATCTTTATCAAAGTTTGCATTGGTAGCTTTATCCCAAATTCGACATGTATCTGGAGATATTTCATCCGCTAACAAAATTTGACCAGTCTCAGTCTTTCCAAATTCGATTTTAAAATCTACTAATTTTAAATTCATAGCATCCATTAATTGTTTCAACACATTATTAATCTTTAATGCTTTGGATTTTAGTATTTCAATATCTTCATCTGATGCTATATTGAGCAATTTAACATGGTCATCCGTTATCAACGGATCATTTAACGCATCATTTTTATAGAAAAATTCTACAAGTGGTTCTCTAAAAACTTCACCATTTTCAAAACCTAAACGCTTTGTAATAGATCCACTAGCAATATTACGAACAACTACTTCTAATGGAATTATTTTCACAGGCTTAACTAATTGTTCTGTTTCAGATAATTGTTTAATAAAGTGACTTTCTATTCCATTTTCTTGTAAATATTTAAATATAATAGAAGTAATTTGATTATTTAATCGCCCCTTACCTGCCATTGTGTCTTTCTTAGCCCCGTTTCCAGCAGTAACTTCATCTTTATATTCAACTCTTAATTCATTTTCTTGATTTGTTGAGAAAATGCGCTTCGCTTTTCCTTCATATAATAATGTCATGCTTTAATTACTCCCCTCAAATTTAGCGTACATATCTTGTTCAGTTTGGTTTACATCATTCGTTAGTACAGTCATATGCCCCATTTTTCTGCTATCTTTACGCTCAGACTTACCATAAATATGTAAGTGCCACTCTGGATGTTCATTAAATTCATTTTCCAATAAATCTAAATCTTTACCTAGTAAGTTCATCATGACTGCTGGCTTTAATAATTCAATTGAATTTGGTAATGATTGTCCGGTAACTGCTAAAATATGAGTATCAAATTGTGAATAATCACATGCTTCAATTGAATAATGTCCGGAATTGTGAGGCCTTGGTGCTATCTCGTTCACATACAATTGGTTGTTACTATCTATAAAAAATTCAACTGTAAATGTTCCAATGAAATGAATCGATTGGATAATTTTATTAACTTGCTCTTTCGCCTCAGCTGTTTTATCTATTCTCGCTGGAACAATTGTTTTGAAAAGTATTTGATTTCTATGCTCATTTTCTTGTAATGGGAAAAAAGTGATTTGATTGTTGTTTCCTCTTGTAACAGTAAGAGATACTTCTTTCTTGATATTCAAATATTTTTCAGCTACGCATTCACTAGTTTCAATTAATTTAAAACCTTCTTGTAAGTCTTTTTCGTTGTTAATTAAAACTTGACCTTTGCCATCGTAGCCACCAAATCTAGTTTTTACAATAAAAGGATATCCTAATGTTTCAATTGCTTTGTCAATATCTGTAGATTCTTTTACTGAAATGAACGGGACAACTTTGGTACCAGCACTTTTTAATGTTTCTTTTTCAGTTAAGCGATCTTGTAATAACTGTATAGCTTGGTAACCTTGCGGAATATTGTACTTTTCACATAATAGTTTTAATTGTTGGGCTGAAATGTTTTCAAATTCATAAGTAATCACATCACATTTTTGTCCTAATTGATTGAGTGCCTTTTCATCGTCATACTTGGCTTGTATAAATTCGTGTGCAACGTATCTACATGGACAATCTTCAGAAGGATCCAATACAACCACTTTATAACCCATTTTTTGAGCTGATTGTGCCATCATCTTTCCAAGCTGACCACCACCAATAATGCCAATAGTCGCACCAAACTTTAATTTATTGAAGTTCATTTTGCATGTCCTCCACTTTTTGAATTAACGAAGATTCATACTGATTTAGTTTTTCAACTAAAGAAGGATTTTGAATACTTAACATTCTTGCTGCAAGTATACCTGCGTTTTTAGCACCTGCTGCACCAATTGCAGTCGTTGCAACCGGAATACCTCCTGGCATTTGAACAATTGATAATAAAGAATCTATACCCTTTAAACTTTTTGTTTCAATCGGCACTCCAATAACTGGTAGCGTCGTTAATGATGCAACCATACCTGGTAAATGTGCCGCACCGCCAGCGCCTGCAATGATAATGTTTATACCTCTTTCTCTCGCTTCAGAAGCAAATTGAACCATCATTTTTGGCGTACGATGTGCGGATACTACTTGTTTTTCGTACGGAATTTCAAAATAATCCAACATGTTACAACTCTCTTGCATAATTTTCCAATCGGAAGAACTGCCCATAATGACTGCTACTTTCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP029649|740429:748902|743482_745672_-|WP_000032727.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGDHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP029649|740429:748902|745664_746336_-|WP_000666794.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIMNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP029649|740429:748902|746600_747305_-|WP_000174053.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINNVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_CP029649|740429:748902|740429_740996_-|WP_000238670.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP029649|740429:748902|746337_746601_-|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >NZ_CP029649|740429:748902|747308_748433_-|WP_001010412.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPSEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_CP029649|740429:748902|742019_743504_-|WP_031871549.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILIDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKARLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_CP029649|740429:748902|740998_742027_-|WP_000030811.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP029649|740429:748902|748419_748902_-|WP_000861572.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGINIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
994904 : 1009258
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP029649|994904:1009258|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP029649|994904:1009258|994904_995666_-|WP_000616840.1|DBSCAN-SWA MIQVENLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDNGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMNIQIEHIRNQRICLYFKD >NZ_CP029649|994904:1009258|995662_996619_-|WP_001245577.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >NZ_CP029649|994904:1009258|1004047_1005553_+|WP_000193751.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_CP029649|994904:1009258|997615_997771_-|WP_000499195.1|DBSCAN-SWA MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ >NZ_CP029649|994904:1009258|1008199_1009258_-|WP_000663030.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP029649|994904:1009258|1001108_1001507_-|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_CP029649|994904:1009258|999040_1001146_-|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP029649|994904:1009258|997951_998923_-|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_CP029649|994904:1009258|1007362_1007905_-|WP_000197271.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPYAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NZ_CP029649|994904:1009258|1003206_1003707_+|WP_000930012.1|DBSCAN-SWA MAHGRQKDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP029649|994904:1009258|1005630_1005732_-|WP_031760357.1|DBSCAN-SWA MVITDIDVYRVGRENIVIAVYNEHIKLLFILIS >NZ_CP029649|994904:1009258|996605_997577_-|WP_000876318.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NZ_CP029649|994904:1009258|1002320_1003187_+|WP_001068487.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNIVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP029649|994904:1009258|1005821_1006739_+|WP_000429008.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGKYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL |
14 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1021229 : 1029049
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP029649|1021229:1029049|DBSCAN-SWA ATTATAACATCTCCAAAATCTTGGTTTTTGCGTAAAATTCATTTACTTCATCTTTTGGCTTAGAATCAATTGTAATACCTGCTCCGACTCCATAAATCGCTTGTCCATATTTATACTCAATAGTGCGAATCGGAATATTAAAAATCATTTTATCATCTTCAGTTGGAAGTAATAGTCCAATTGTTCCGCAGTATATACCACGAGGTGAACTTTCTAATTGTTTAATATATTTCATTGTATTCAGTTTCGGTGCACCTGTAATCGAACCACAAGGAAATAACGATGTTAAAATTTGAGTTAGGTCTGTATTAGTTTTTAAAGTTCCACTTACCATCGAAGTCATTTGAAATACAGTTTTATATGCCTCAATAAAAAATAGTTTATACACCTTAATTGAGCCACTCTGTGATATTCTCCCTATATCGTTTCTTAGTAAATCAACAATCATGACATTTTCTGCACGCTCTTTCGAAGAAGTTTGCAATGTTTTATAATACTGTTGATCTTCAGCTTCCGTTTTACCTCTAGGCATTGTCCCTTTCATCGGTTTGCTTATGATAACGTTATCGACATTGTTAAACTGTCCTTTTTGAAAAAATAATTCTGGTGAGATAGACGCTACTTGGATTTCATCTGTTTGTAATAACGCAGTATAATTACCATTACTAAATTGAGTTAATCGTTCATATAAAGTACTAATAGGATAATAAATGTTATCTGTTAAGCGCGCCGTATAGTTCACTTGATACGTTTCGCCTTCAACAATTGCTTGTTGGACACGTTTAATATTAGTCATCATAACCTCAGAAGATTCAACAAATGAAAAATGATGCTTTGATACATAAGAAGTTTGATGTTCATATGTTGAATTTATGCTTTCCGCTTTTTCAAAACTATAAGCTACTGCATAAATATCATCTTTAGCTAATGAATGTGTACACATGACATGATTAAAATACTTTGCCGCTTCGTAACTTAAATATAACGAGACATATCTACCTTGTCGTTGCTGCGCTTGTGCAAAGTGTATCACTTCTCCCACATCAGCCAACTTAGTAGCAACATACTTCTTTATAAATCCCTTTAATTGAATATGGTATTGCTTATATTCATTTTCAGTTAAATAGTAGCGATAATTATATTCTATTCTCACAGTAATCACCTACCTTCGATAAAAATAATTCAACTTGTCGATAACCGTATTCACTCAAAATAGATTCAGGATGATATTGCACACCAAAAACCGGAAATCTAATATGCTCAAATGCCATAATAATCGCTTCATCGTTTTTCGCTGTAATCTTTAAGCAATTTGGAAAAGTCGCTCCGTCAGCAATTAATGAATGATAACGCATTACATTGAAATTTTGAGGCAGTCCTTGAAAAATACCTTCATTGGTATGGCGTAACTGTGTAGTATGTCCGTGTACAGGATGATAGCCGTGAATGATATTTCCACCAAAATAAGACACGATACATTGAAATCCTAAACATACACCTAGTATAGGTACACGCTGATAAAATTGTTCTAACACTTCATTCAAGATAGGATAATCATCCGGATTACCCGGCCCAGGTGAAATAACAATTGCTTTTGGCTTCATATTAATGACGTCTTCTATCAGCAGATTATCAATACCAACAACTTGAACTGTTAGTTTCGTTTGAGTCTTAATATAGTCTATTAAATTATATGTAAATGAATCATTATTATCTATGACTAGAATCATTGTATACTCCGTTCTAAATGTGTTTTATTTTTATAATATGTATTGGATGTAGCTAAAACTTTAAAAGCATTGTCATTATCCTGACCTTGATTTTAACTAATATATGGTATATTCTATTCATCGTACATAAATGAATATCAGAGGTTCCTAGCTGAAACCCTCTATAAAAAACTAGACATTGAAATTTCAAACATTCGTTGGTAAACCTTTAATATATATTATAGGAGCAACCCATTTCTTTCGTCTATCTTTTATGGAGATAGGCTTTTTTTATTTTATAAATTAAAAACGGGCTTATCAATGCCATTAACCTCTTTATTAATATTATTAATGATAGGAGCAATTACAAAATGGAAAGTGTATTAAATAATGAAAAAGCCATCGTTGTCTTTAGTGGTGGTCAAGACAGTACAACATGTCTCTTTTATGCAAAAAAACATTTCAAAGAAGTTGAACTCGTAACGTTTAATTATGGCCAAAGACATGATACTGAAATTGAAGTCGCAAAACAAATTGCACAAGATCAAGGAATGAAACATCACGTTTTAGATATGTCATTATTATCACAACTTACTCCAAACGCATTAACACAACATGATATGGAAATTACTAATAATGAAGATGGTATACCTAATACATTTGTTCCAGCTAGAAATTTACTTTTCTTGTCGTTTGCAGGCGCTCTAGCTTATCAAATTGGGGCTAAGCATATTATTACAGGCGTATGTGAAACAGACTTTTCAGGCTACCCAGACTGTCGTGATAGTTTTATAAAATCAATGAACGTAACATTAAGCCTAGCTATGGACAAAGATTTTGTCATTCATACTCCTTTAATGTGGTTAAACAAAGCAGAAACGTGGAAATTAAGTGATGAACTCGAAGTTTTAGATTATATTCGTACAAAAACATTAACATGCTATAACGGTATCATTGGGGATGGCTGTGGTGAATGTCCAGCTTGTCATTTACGTCAACGTGGACTAAATCAATATCTTGAAAGTAAAGGAGCGCTTTAAAATGTTACAACAAATCTATCCTAGTACAACGCATCCATATCAATTCGAATTAAATAAAGATTTTAATTTTTCAGCTGCACATCACATTCCTTGTGAAGAAGCAGGTATTTGTCAAAATGTCCATGGTCATACTTACTTTGTTAATTTAACAATTGTCGGTGATAAACTAGATAACACTGGCTTCTTAGTGAACTTTAGCCATTTGAAAAAGATGATACACGGTAAATTTGACCATCAACTGTTAAATAACTTACCTGCTTTTAAAAACAAAATCCCTTCAACTGAAATCGTAGCGGAAACAATTTATCAAATTGTTAAAGAAAATTTGGCATCGCTCGAACACCAACCAAAATGTATTCAAGTATTTGTAAGAGAAACACCAACAAGTTATGTTGTATTTAGACCAAAGGAACAGGTGTAACTAATGGCTAAAATTCCTGTACTCGAAATATTCGGTCCAACCATTCAGGGTGAAGGTCGAGTAATCGGTAGAAAAACGATGTTTGTGAGAACAGCTGGATGTGATTATCGCTGTAGCTGGTGTGATTCTGCATTTACTTGGGATGGTAGTGCTAAAGGCGATATAAAACTCATGACCGCTGAAGAAATTTATGATGAATTAAAACGAATTGGTGGCGATTTATTTAATCACGTTACAATTTCTGGTGGTAACCCAGCATTAATTAAAGGTATCCAAGAGTTAGTTGACTTATTTCAAGATAAAGGTATTTTCAGCGCACTGGAGACACAAGGCAGTAAATTCCAACCTTGGATGACACAAATTGATGATTTAACGATTAGTCCAAAACCACCAAGTTCAACTATGACACCTGATTTAAAAAAGTTAGATGAAGTGATTACACAATGCGTACCTTCCTCATTAAACTTAAAAGTAGTTGTATTCGACGATAAAGATTATGATTTTGCCAAAATGATACACCACCGTTATCCAGATATTCCCTTCTATTTACAAGTTGGTAACCCATATTTATCAGACAGCGTAGATAATCATACCGAAAAGTTGTTAGAACGCTACGAGCAGTTGGTGGATTTAGTTATGCAAAGTAATGATATGAATCACGTTTATGTGTTACCACAACTTCATACATTACTTTGGAGTAACAAAAAAGGTGTATAAAGGATAACTTATTTTACTTTTTACAAGTCATATCTAATGAATAACAATATATTAATTGATATAATAGTTGATTGAAGTATAACGAACAGGAGTCCATCATGATTGTATATATATTAATTAATATTGCTATCGTCGTACTTATAACTGGATTCAATTTATATAGGCATCAAATGCAACATTTATCATTAAGTGCAATGTTGTTATCTATTACGATAAACGCCTTTATAAATACATTCATAATTGATAAATATAACTTTATTACTCTGTGTACTATAACGATGTTTATCATTTGGACGATACTACAGTTTTACATTGATAAAAAATTAAAACCTGTATACATTACAGACCAAAAATTTATTGCTATCATATTAACGATTGTTGTCAGTTTAACGCAACGTGTTACCGACTTTTCAAGTACACAATCAATATATATGTCTATTCCATTTTTAGCCCCTGCCATTTTCATCATTGGTGGTATTATGTTGTTTATTTCAACATTTAATAGCTTAGATGAAACTGCTGAAAATAATAATAAAATAAAGAAACTAATGATTAAAGGACTTATCATTATTAACATTTCATTTATCGTTATGATGGTTTTAACACCATATTGGTACTTGTATTTAATCGTCTATCTTATTTTCTTGTTGTTTTTATTGTGGCAAAAGGTTTATAAATTTTAATACCAAAACTAAAAAACACTTCTGATATTCTTAGTTCAAAATATCAGAAGTGTTTTTTAGTGATAACTAGTTTAGATAAATATTTCCTTACTTAAAAAACCGCCCTCCTCTTATTTTGACTCCTATTTATTTAAATCAGACAATTATTTTCATTTTCAAATTATTCTTTCTTCAATATTAGTTAAGCGATATTTAAACGAAGTTAAGAATTAGTTAATGGCATATTATTTGCCTTCATTTTAAACTTAACTTATCAAATTGAAGAAATGAGGAGTTAGCATGAATACAAAATATTTTTTAGCAGTTGGTGCTGTTGCCTCTGTATTAATTTTAGGCGCTTGTGGTAATTCTAATTCACAAGATCAAGGTAACAAAACTGAACAAAAAACAAAATCAGAAGATAGCAATGTTAAAACTGATAAAACAAAAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP029649|1021229:1029049|1022364_1022958_-|WP_000604514.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHIRFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_CP029649|1021229:1029049|1027993_1029049_+|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_CP029649|1021229:1029049|1025213_1025798_+|WP_000637687.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NZ_CP029649|1021229:1029049|1023308_1023977_+|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NZ_CP029649|1021229:1029049|1023978_1024398_+|WP_000941340.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDNTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_CP029649|1021229:1029049|1021229_1022381_-|WP_001217801.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKERAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGTIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NZ_CP029649|1021229:1029049|1027307_1027994_+|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_CP029649|1021229:1029049|1026077_1026518_+|WP_001093557.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVASVLILGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NZ_CP029649|1021229:1029049|1026859_1027333_+|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NZ_CP029649|1021229:1029049|1024401_1025115_+|WP_001062972.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV |
10 | Pandoravirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1363049 : 1379070
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP029649|1363049:1379070|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP029649|1363049:1379070|1374807_1375944_+|WP_000592973.1|integrase|DBSCAN-SWA MIKKYKKKDGTTAYMFVAYLGTDPITGKQKRTTRRGFKTEREAKIAEAKLQTEISRNGFLNNDITTFKEVYELWLEQYQNTVRESTYQRVLTLFDTAILEHFKDVPIKKITVPYCQKVINKWNEKYSDIKAIRIYTSNVFKYAVNLKIIADNPFTHTKAPRKKEAQQDASTKYYSSDELKQFLTFVEDDPLYYAIFRTLAFTGFRRGELMALTWNDIDFTKQTISINKTCARGANYKMVIQEPKTKSSHRTISIDDKTANVLKSWRTHQRVESLKYGHNTSDKYQYVFTTVRDNKQLYPEHCNKALNLICEKHNFKRIKVHGFRHTHCSLLFEAGLSIQEVQDRLGHGDIKTTMDIYAHVTEKQRDQVADKFAKYINF >NZ_CP029649|1363049:1379070|1377603_1379070_-|WP_000264071.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP029649|1363049:1379070|1376037_1377579_-|WP_000424963.1|DBSCAN-SWA MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCDCKGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE >NZ_CP029649|1363049:1379070|1363814_1364954_-|WP_001670266.1|DBSCAN-SWA 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20 | Staphylococcus_phage(75.0%) | integrase,coat,terminase | attL 1354077:1354093|attR 1376033:1376049 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2517170 : 2591840
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP029649|2517170:2591840|DBSCAN-SWA 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93 | Staphylococcus_phage(94.37%) | integrase,portal,holin,capsid,head,transposase,protease,tail,terminase | attL 2529137:2529154|attR 2598504:2598521 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2674372 : 2728021
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP029649|2674372:2728021|DBSCAN-SWA 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55 | Staphylococcus_phage(90.48%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2733254 : 2765221
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP029649|2733254:2765221|DBSCAN-SWA 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34 | Staphylococcus_phage(93.33%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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