Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP029673 | Staphylococcus aureus strain AR_0220 chromosome, complete genome | 8 crisprs | cas3,DEDDh,DinG,csa3,RT,WYL | 8 | 3 | 7 | 2 |
NZ_CP029672 | Staphylococcus aureus strain AR_0220 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP029673_1 | 426856-426957 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029673_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP029673_1
>1.1|426879|56|NZ_CP029673|CRISPRCasFinder AAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029673_1
The CRISPR arrays of NZ_CP029673_1 >merge|NZ_CP029673|1|426856-426957|CRISPRCasFinder TTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTATATATGAATTGAGTATTAAATTTG >NZ_CP029673|1|1|426856-426957|CRISPRCasFinder TTATGAATTGAGTATTAAATTTG AAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTAT ATATGAATTGAGTATTAAATTTG
>NZ_CP029673.1|WP_001792089.1|426080_426179_+|hypothetical-protein MQLNVNMMKFDRWHKGICKQIVLNLVEKGEKG >NZ_CP029673.1|WP_000991018.1|424607_425996_-|L-cystine-transporter MNAFLTLINIIVLVIFIVILHMMARKHISFAKRVFTALGIGIVFGVLLHLVYGTHSNVITSTSDWFNIVGQGYVALLQMIVMPLIFISIVAAFTKIQIGEKFAKIGSLIFIFLIGTVTIAAIVGVVYALVFGLDASTINLGNAEQARGSEIAKQAKDLTAHTLPQQILELLPKNPFLDFTGQRATSTIAVVIFASFIGFAYLRVARKQPDHGELLKRAIDAIYSLVMAIVTFVLRLTPYGVLAIMANTLSTSDFGAIWTLGKFLIASYAALITMYIIHLIILSLLGISPIRYVKKTLEVLIFAFTSRSSAGALPLNVQTQTRRLGVPEGIANFAATFGLSIGQNGCAGIYPAMLAIMVAPVANVEIDLQFIVTLIAVVIISSFGVAGVGGGATFASILVLSTLNLPVALAGVLISVEPLIDMGRTALNVNDSMLAGTGTAKLTKHWDKDTFESNDNAALTSH >NZ_CP029673.1|WP_001287099.1|423772_424528_+|NADPH-dependent-oxidoreductase MSDYVYNLVKKHHSVRKFKNKPLSEDVVKKLVEAGQSASTSSFLQAYSIIGIDDEKIKENLREVSGQPYVVENGYLFVFVIDYYRHHLVDQHAETDMENAYGSTEGLLVGAIDAALVAENIAVTAEDMGYGIVFLGSLRNDVERVREILDLPDYVFPVFGMAVGEPADDENGAAKPRLPFDHVFHHNKYHADKETQYAQMADYDQTISEYYDQRTNGNRKETWSQQIEMFLGNKARLDMLEQLQKSGLIQR >NZ_CP029673.1|WP_000052781.1|422711_423281_-|peroxiredoxin MSLINKEILPFTAQAFDPKKDQFKEVTQEDLKGSWSVVCFYPADFSFVCPTELEDLQNQYEELQKLGVNVFSVSTDTHFVHKAWHDHSDAISKITYTMIGDPSQTITRNFDVLDEATGLAQRGTFIIDPDGVVQASEINADGIGRDASTLAHKIKAAQYVRKNPGEVCPAKWEEGAKTLQPGLDLVGKI >NZ_CP029673.1|WP_000930514.1|421172_422696_-|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F MLNADLKQQLKQLLELMEGNVEFVASLGSDEKSKELKELLTEISDMSPRLSLSEKSLKRTPSFSVNRPGEETGVTFAGIPLGHEFNSLVLAILQVSGRAPKEKQSIIDQIKNLEGSFHFETFISLTCQKCPDVVQALNLMSVINPNITHSMIDGAVFREESENIMAVPAVFLNGEEFGNGRMTIQDILSKLGSTADASEFENKEPYDVLIVGGGPASGSAAIYTARKGLRTGIVADRIGGQVNDTAGIENFITVKETTGSEFSSNLAAHIDQYDIDAMTGIRATDIEKTDEAIKVTLENGAVLESKTVIIATGAGWRKLNIPGEEQLINKGVAFCPHCDGPLFENKDVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVNHVTLFEFASELKADNVLQDRLRSLSNVDIKTNAKTTEVVGEDHVTGIRYEDMSTGEEHLLNLDGIFVQIGLLPNTSWLKDAVELNERGEIVIDRNNNTNVPGIFAAGDVTDQKNKQIIISMGAGANAALNAFDYIIRN >NZ_CP029673.1|WP_000746679.1|420102_420729_-|NDxxF-motif-lipoprotein MKKRLLLSTFLASALILTGCASDQSDNEDHHTSTGIHAPKSAKKLETKDIFNSDKKNSDISDAEMKQAIEKYLSVNSDILDNKYIMQHKLDKQIDSQTKVTEKQAETLSHLSNLAVKNDLHFKKFVTENNIPKEYKKPVELMMNYFKALNSTIANVDEDIEKLSYQPQNKINVVDVPTKYAGDVNKKQQDKIKDFLKSKGIKSDVIDK >NZ_CP029673.1|WP_000868256.1|419449_419833_-|hypothetical-protein MKVRITFIILAILSTIVCLFLAAMHPTGPNTVTFEQPYLFTLNIILMVLVALPSLVLAIYDYMSFRISSAILQFLGAISWFFLSLILSLTQFTPFTLASFITSIILFISAIITLAIGGKSVDKNDSH >NZ_CP029673.1|WP_000158375.1|418802_419384_+|histidine-phosphatase-family-protein MTIYLVRHGESKSNYDNKHFRSYFCGQLDVPLTDTGTKSADDLCDYFKEKQIKHVYVSDLLRTQQTFEHIFPYDIASTTTPLLRERSLGVFEGEYKDEISANPKYEKYFNDPNFKDFRHSFSQKAPEGESYEDVYQRVEHFMNHVVNEDTQKDDIVIVAHQVVIRCLMVYFNKVSREEAVDLKVENCKPYIIE >NZ_CP029673.1|WP_000211677.1|418415_418625_-|hypothetical-protein MTTQSFIFMNIILLDGATQRHPFFICQILAFLFPKFPHINLLLFYPILSTFSNIIIHIDHFHANKKDDN >NZ_CP029673.1|WP_000466748.1|418125_418377_+|GlsB/YeaQ/YmgE-family-stress-response-membrane-protein MFGFIGMLIVGGLIGWAAGAIMGKDIPGGILGNIIAGIIGSWVGGKLFGQWGPELGSIYILPALIGSIILIAIVTLILRAMRK >NZ_CP029673.1|WP_000956137.1|426973_427930_-|hypothetical-protein MLTKEFAQRVELSEKQVRKIVQHLEERGYQLSKTEYRGREATDFKEEDIELFKDIADKVKQTNSYDLAFDELEKEKDFLQVIVKNDDKNLPTNQNVAQLVEDLRLEIQKMREERHLLGQMMNQVHQQQQELKELQNQLTSKIDSNSESLKAIQTSQEAIQEAQASQAKVLAESTNKVEKNAVTEDKADSKDSKVAGVNTSTDAKTDTKAENAGDGTATKVDKEDQISATEAIEKASVEQSKNENAAETSNKEATVDADAQHDAEQQVAEAHAEASKQATSNDSLEAKAENDSTASQSEMSEPKPQEEKKGFFARLFNL >NZ_CP029673.1|WP_000394698.1|428047_428710_-|hypothetical-protein MEFKTIQSVKDPHYNEALKLYDTKLNLSLTEDKRIIKRSLENNKTENDYVFIVGLENDVVVSLATAHYEATTNSAFLIYLFAKDLPNHDELMTQTLHQIEHELNLLSNLVHSRSINFLMMEVPKEPADLTQDNGLIIEHRRQFLYEHQFERQTEIDYIHPTNDGHTKKVDLFLKKNIKLTKDIYGTSVKSNYILKYVFANGIAREIIYALLEEMDLRKPF >NZ_CP029673.1|WP_000763767.1|428852_429260_-|hypothetical-protein MADITVVNDTGELYNVINQKKSEGYLESELTIISKSKLHLNDLHDSEISLISTSGTFSDRMTKLLTGEDGEHAVLSRYNLAPDELEKYKQLILDDKMLVVAVRDKSSHKEVQEHNSAYEEIDITHFAEASKGPKA >NZ_CP029673.1|WP_000421410.1|429772_430351_+|xanthine-phosphoribosyltransferase MELLGQKVKEDGVVIDEKILKVDGFLNHQIDAKLMNEVGRTFYEQFKDKGITKILTIEASGIAPAIMAALHFDVPCLFAKKAKPSTLTDGYYETSIHSFTKNKTSTVIVSKEFLSEEDTVLIIDDFLANGDASLGLYDIAQQANAKTAGIGIVVEKSFQNGHQRLEEAGLTVSSLCKVASLEGNKVTLVGEE >NZ_CP029673.1|WP_000793023.1|430350_431619_+|purine-permease MKNLILSVQHLLAMYAGAILVPIIVGTSLKFTPEQIAYLVTVDIFMCGVATFLQANKVTGTGLPIVLGCTFTAVAPMILIGQTKGIDVLYGSLFLSGILVIIIAPFFSHLVKFFPPVVTGSVVTIIGINLMPVAMNYLAGGQGAKDYGDVKNILLGLMTLIIILVLQRFTTGFIKSIAILIGLVLGTIGAGLLGMVDINQVNHAGWLGIPVPFRFSGFSFDVTSTLVFFIVAIVSLIESTGVYHALSEITGKKLERKDFRKGYTAEGLAIVLGSIFNSFPYTAYSQNVGLVSLSGAKKNNVIYGMVVLLLICGCIPKLGALANIIPLPVLGGAMIAMFGMVMAYGVSILGHIDFKNQNNLLIIAVSVGLGTGISAVPQAFKGLGEQFAWLTQNGIVLGAISAIILNFFFNGIKYKQTEENVK >NZ_CP029673.1|WP_000264071.1|431656_433123_+|IMP-dehydrogenase MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF >NZ_CP029673.1|WP_000424963.1|433147_434689_+|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCDCKGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE >NZ_CP029673.1|WP_000551643.1|434801_435338_-|hypothetical-protein MHNKNEFNKKLKDFIGSDKRMALVKGYINEYKLTTVLRALNNSDYTKGTIHTRSIGNLKQIVDNRIIPKNITQNKIFKLSNLTLEVNLYERNTIYHGDFAIYYPVESALIIETDTPRLINHINNNPVQKIFIITTNDWSFNTLELEKIVDETIIYDLKQEDPKQYEILYKNKHGKLPY >NZ_CP029673.1|WP_000041880.1|435729_436434_-|type-II-toxin-antitoxin-system-PemK/MazF-family-toxin MSKNINQANSKLNTSNKKLKQAYSKSDSKNMKVIYMPHWLEFYSIAIHSDVTSNKKRYYKSFSRGTVVYVKLGSNIGSEFSGNHFCVILDNKDNKGKETVTIVPLSSKGNKNYLKLNESVLNLTATDLKKQIIDISSKVQALTQKYRDIDIKLSTEDKKLLSNLNQKANELYRVIGVYSKHKGKDTYVNISAITTISKRRISKINDSDPTGTIIISEDDMNEIEKQLKIKFFSN >NZ_CP029673.1|WP_000159787.1|436832_437105_-|transposase MTKERRTFSSEFKLQMVRLYKNGKLKNEIIRKYDLKPSIISNSIKQHQNTGPFNHQDNLKSDEKELIKLRKEVQHLKMEHDVLKQILKLI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP029673_2 | 823154-823232 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029673_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP029673_2
>2.1|823178|31|NZ_CP029673|CRISPRCasFinder CTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029673_2
The CRISPR arrays of NZ_CP029673_2 >merge|NZ_CP029673|2|823154-823232|CRISPRCasFinder TGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCT >NZ_CP029673|2|2|823154-823232|CRISPRCasFinder TGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCT CTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGCC TGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCT
>NZ_CP029673.1|WP_000662677.1|819980_822827_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNIDLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIDVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGIDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK >NZ_CP029673.1|WP_000229241.1|817987_819973_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVDGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >NZ_CP029673.1|WP_000638419.1|817482_817719_+|CsbA-family-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >NZ_CP029673.1|WP_000538141.1|816835_817486_+|HD-domain-containing-protein MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE >NZ_CP029673.1|WP_000753319.1|815822_816662_+|CHAP-domain-containing-protein MKKTLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVAKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH >NZ_CP029673.1|WP_001792175.1|815567_815675_+|hypothetical-protein MCLLKQHMQCAFSNITYGDFQGIELIVENVLNYMV >NZ_CP029673.1|WP_010956549.1|814303_815414_+|peptide-chain-release-factor-2 MELSEIKRNIDKYNQDLTQIRGSLDLENKETNIQEYEEMMAEPNFWDNQTKAQDIIDKNNALKAIVNGYKTLQAEVDDMDATWDLLQEEFDEEMKEDLEQEVINFKAKVDEYELQLLLDGPHDANNAILELHPGAGGTESQDWANMLFRMYQRYCEKKGFKVETVDYLPGDEAGIKSVTLLIKGHNAYGYLKAEKGVHRLVRISPFDSSGRRHTSFASCDVIPDFNNDEIEIEINPDDITVDTFRASGAGGQHINKTESAIRITHHPSGIVVNNQNERSQIKNREAAMKMLKSKLYQLKLEEQAREMAEIRGEQKEIGWGSQIRSYVFHPYSMVKDHRTNEETGKVDAVMDGDIGPFIESYLRQTMSHD >NZ_CP029673.1|WP_001790092.1|814030_814135_+|hypothetical-protein MLWEESFYFTSVKYFKKCEEVVKRCYVLSFKKSV >NZ_CP029673.1|WP_000506531.1|811457_813989_+|preprotein-translocase-subunit-SecA MGFLSKILDGNNKEIKQLGKLADKVIALEEKTAILTDEEIRNKTKQFQTELADIDNVKKQNDYLDKILPEAYALVREGSKRVFNMTPYKVQIMGGIAIHKGDIAEMRTGEGKTLTATMPTYLNALAGRGVHVITVNEYLSSVQSEEMAELYNFLGLTVGLNLNSKTTEEKREAYAQDITYSTNNELGFDYLRDNMVNYSEDRVMRPLHFAIIDEVDSILIDEARTPLIISGEAEKSTSLYTQANVFAKMLKQDEDYKYDEKTKAVHLTEQGADKAERMFKVENLYDVQNVDVISHINTALRAHVTLQRDVDYMVVDGEVLIVDQFTGRTMPGRRFSEGLHQAIEAKEGVQIQNESKTMASITFQNYFRMYNKLAGMTGTAKTEEEEFRNIYNMTVTQIPTNKPVQRNDKSDLIYISQKGKFDAVVEDVVEKHKAGQPVLLGTVAVETSEYISNLLKKRGIRHDVLNAKNHEREAEIVAGAGQKGAVTIATNMAGRGTDIKLGEGVEELGGLAVIGTERHESRRIDDQLRGRSGRQGDKGDSRFYLSLQDELMIRFGSERLQKMMSRLGLDDSTPIESKMVSRAVESAQKRVEGNNFDARKRILEYDEVLRKQREIIYNERNSIIDEEDSSQVVDAMLRSTLQRSINYYINTADDEPEYQPFIDYINDIFLQEGDITEDDIKGKDAEDIFEVVWAKIEAAYQSQKDILEEQMNEFERMILLRSIDSHWTDHIDTMDQLRQGIHLRSYAQQNPLRDYQNEGHELFDIMMQNIEEDTCKFILKSVVQVEDNIEREKTTEFGEAKHVSAEDGKEKVKPKPIVKGDQVGRNDDCPCGSGKKFKNCHGK >NZ_CP029673.1|WP_000617735.1|810471_811044_+|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA MIRFEIHGDNLTITDAIRNYIEEKIGKLERYFNDVPNAVAHVKVKTYSNSATKIEVTIPLKNVTLRAEERNDDLYAGIDLINNKLERQVRKYKTRINRKSRDRGDQEVFVAELQEMQETQVDNDAYDDNEIEIIRSKEFSLKPMDSEEAVLQMNLLGHDFFVFTDRETDGTSIVYRRKDGKYGLIQTSEQ >NZ_CP029673.1|WP_000958224.1|823490_824423_+|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >NZ_CP029673.1|WP_000513305.1|824428_825268_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >NZ_CP029673.1|WP_001224793.1|825275_825761_+|acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >NZ_CP029673.1|WP_000057543.1|825768_827208_+|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYQNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >NZ_CP029673.1|WP_000134963.1|827274_828210_+|thioredoxin-disulfide-reductase 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You can click texts colored in the table to view more detailed information
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---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP029673_3 | 828608-828877 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029673_3
|
4 spacers
spacers of NZ_CP029673_3
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029673_3
The CRISPR arrays of NZ_CP029673_3 >merge|NZ_CP029673|3|828608-828877|CRT GCTTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGAAATCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGAAATCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCCTGACTAGAGTTGAAAAA >NZ_CP029673|3|1|828608-828877|CRT GCTTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTG CCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA TTCTCTTTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTG TCTGTAGAAATTGGAAATCCAAT TTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTG CCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA TTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTG TCTGTAGAAATTGGAAATCCAAT TTCTCTGTGTTGGGGCCCCTGACTAGAGTTGAAAAA
>NZ_CP029673.1|WP_000134963.1|827274_828210_+|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >NZ_CP029673.1|WP_000057543.1|825768_827208_+|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYQNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP029673_4 | 871794-871875 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029673_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP029673_4
>4.1|871818|34|NZ_CP029673|CRISPRCasFinder ATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029673_4
The CRISPR arrays of NZ_CP029673_4 >merge|NZ_CP029673|4|871794-871875|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCATCCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA >NZ_CP029673|4|3|871794-871875|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAA ATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCAT CCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA
>NZ_CP029673.1|WP_110417910.1|870811_871690_+|DUF1963-domain-containing-protein MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPVLPCIEMDLKEMQEKTLSQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLNDLPEQQELFPVNEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPITDLSLENIQVHLKSLDADNEDIPFSGAFSIEFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQELKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS >NZ_CP029673.1|WP_000662306.1|870696_870810_+|hypothetical-protein MKENLLGTIIWSIATFYYSRMMKIMNLAILKIKIGGS >NZ_CP029673.1|WP_000290491.1|870252_870633_+|glycine-cleavage-system-protein-GcvH MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVATIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEISDESQLEALLTAEKYSEMIGE >NZ_CP029673.1|WP_000589549.1|869738_870095_+|arsenate-reductase-family-protein MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA >NZ_CP029673.1|WP_001147952.1|869274_869595_-|thioredoxin-family-protein MQAIKSNESFKSIINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK >NZ_CP029673.1|WP_031871866.1|868584_869124_+|nitroreductase MELQQAIANRRSVKKFKRDMHIDDALLYQAIEKAADVPNHGMREPWRVVHVPKDRLGDMSKDISKFAFPNELDKQQCHYDAVTKLGGMLLLILKTDPRQRQNDENYFAFGAYAQNLMLLLYEAGIGTCWKSPLYIYDPKVRKTLGIKKDEVLAGFLYLTDLEEDMPKAPRKNRNLITLY >NZ_CP029673.1|WP_000150011.1|867785_868502_+|type-I-3-dehydroquinate-dehydratase MTHVEVVATIAPQLSIEETLIQKINHRIDAIDVLELRIDQIENVTVDQVAEMITKLKVMQDSFKLLVTYRTKLQGGYGQFINDLYLNLISDLANINGIDMIDIEWQADIDIEKHQRIIKHLQQYNKEVVISHHNFESTPPLDELQFIFFKMQKFNPEYVKLAVMPHNKNDVLNLLQAMSTFSDTMDCKVVGISMSKLGLISRTAQGVFGGALTYGCIGEPQAPGQIDVTDLKAQVTLY >NZ_CP029673.1|WP_000974460.1|867215_867638_-|organic-hydroperoxide-resistance-protein MAIHYETKATNVGGRKGHVYTDDRALDIDIVPPAQADGKATNPEQLFAAGYASCFNGAFDLILKQNKVRDAHPEVTLTVRLEDDSDSESPKLSVSIDATIKNVISQEEAEKYLQMAHEFCPYSKATQGNINVDLNVNVVD >NZ_CP029673.1|WP_000569884.1|866322_866817_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MIEIKTLTNNDFNEYKRLVSTVNEEFTQDSHYSQTMTDTLIHDILNQGSPKCIVFGCYENETLIATAALEQIRYVGKEHKSLIKYNFVTNNDKSINSELINFIINYARQNNYESLLTSIVSNNIGAKVFYSALGFDILGFEKNAIKIGNTYFDEHWLFYDLINK >NZ_CP029673.1|WP_000255551.1|865550_866168_-|amino-acid-transporter MVTAIIHGFILAIGLILPLGAQNVFIFNQGANQPKYRYVLPAIITAGLSDSLLIIIAVVGVSIIIMSLPVLQAIIYIVGLIFLMYMAWTIWHDKPSTDGEAQIISPMKQVSFALSVSLLNPHAILDTIGVIGSSAALYSGSNKIAFTIACISVSWLWFFLLAILGKMVGSIDKTGKLLTIINKISSIIIIIVALMILQKLIQLLF >NZ_CP029673.1|WP_001018962.1|872486_872873_+|topiosmerase MAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKLDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPLLPNINNERLVLVNE >NZ_CP029673.1|WP_001065801.1|872865_873162_+|thioredoxin-family-protein MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFKSVTDLLENLK >NZ_CP029673.1|WP_000571213.1|873411_874437_+|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEHGPVTQVFENPQHTVTKRFVKEDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >NZ_CP029673.1|WP_000520231.1|874429_875125_+|ABC-transporter-permease MGKSFSEIINEMITMPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWIVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >NZ_CP029673.1|WP_000732324.1|875142_875964_+|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGNKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYDLDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGDVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >NZ_CP029673.1|WP_000752917.1|876317_876512_+|CsbD-family-protein MADESKFEQAKGNVKETVGNVTDNKNLENEGKEDKASGKAKEFVENAKEKATDFIDKVKGNKGE >NZ_CP029673.1|WP_001183854.1|876745_877597_-|DUF368-domain-containing-protein MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYNQFIASISGIFSRRFWPSFTFLIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIVPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNGDKHAGETLTLSTGLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEVVKLNFTGLPILLAVGFGVLAGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWFVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE >NZ_CP029673.1|WP_000168845.1|877924_878686_+|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MASTLEIKDLHVSIEDKEILKGVNLTINTDEIHAIMGPNGTGKSTLSSAIMGHPSYEVTKGEVLLDGVNILELEVDERAKAGLFLAMQYPSEITGVTNADFMRSAINAKREEGQEINLMQFIKKLDKNMDFLDIDKDMAQRYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMLEPKFAILDEIDSGLDIDALKVVSKGINQMRGENFGALMITHYQRLLNYITPDKVHVMYAGKVVKSGGPELAKRLEEEGYEWVKEEFGSAE >NZ_CP029673.1|WP_000205567.1|878783_880091_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MTTDILNISEEQLVDYSKAHNEPSWMTELRKKALKLTETLEMPKPDKTKLRKWDFDSFKQHDVKGDVYQSLSQLPESVREIIDVDHSKNLVIQHNNTIAYTQVDDNASKDGVIVEGLADALMNHSDLVQKHFMKDAVTVDEHRITALHTALVNGGVFVYVPKNVVVEHPVQYVVLHDDKNASFYNHVIIVTEESAEVTYVENYLSNASGEGNQLNIISEVIAGANSNITYGSVDYMDKGFTGHIIRRGITEADASINWALGLMNEGSQIIDNTTNLFGDRSTSSLKSVVVGTGEQKINLTSKIVQYGKETDGYILKHGVMKEHASSVFNGIGYIKHGGTKSIANQESRVLMLSEHARGDANPILLIDEDDVQAGHAASVGRVDPDQLYYLMSRGISQREAERLVIHGFLDPVVRELPIEDVKRQLREVIERKVSK >NZ_CP029673.1|WP_001006450.1|880196_881447_+|cysteine-desulfurase MNEVAEHSFDVNEVIKDFPILDQKVNGKRLAYLDSTATSQTPMQVLNVLEDYYKRYNSNVHRGVHTLGSLATDGYENARETVRRFINAKYFEEIIFTRGTTASINLVAHSYGDANVEEGDEIVVTEMEHHANIVPWQQLAKRKNATLKFIPMTADGELNIEDIKQTINDKTKIVAIAHISNVLGTINDVKTIAEIAHQHGAIISVDGAQAAPHMKLDMQEMNADFYSFSGHKMLGPTGIGVLFGKRELLQKMEPIEFGGDMIDFVSKYDATWADLPTKFEAGTPLIAQAIGLAEAIRYLERIGFDAIHKYEQELTIYAYEQMSAIEGIEIYGPPKDRRAGVITFNLQDVHPHDVATAVDTEGVAVRAGHHCAQPLMKWLNVSSTARASFYIYNTKEDIDQLINALKQTKEFFSYEF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP029673_5 | 1664495-1664579 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029673_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP029673_5
>5.1|1664521|33|NZ_CP029673|CRISPRCasFinder ATTGGGAATCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029673_5
The CRISPR arrays of NZ_CP029673_5 >merge|NZ_CP029673|5|1664495-1664579|CRISPRCasFinder CACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGGAATCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA >NZ_CP029673|5|4|1664495-1664579|CRISPRCasFinder CACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAA ATTGGGAATCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCA CACCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA
>NZ_CP029673.1|WP_000218103.1|1663061_1664186_-|oxygen-independent-coproporphyrinogen-III-oxidase MTVQSAYIHIPFCVRICTYCDFNKYFIQNQPVDEYLDALITEMSTAKYRNLKTMYVGGGTPTALSINQLERLLKAIRDTFTITGEYTFEANPDELTKEKVQLLEKYGVNRISMGVQTFKPELLSVLGRTHNTEDIYTSVLNAKNAGIKSISLDLMYHLPKQTIEDFEQSLDLALDMDIQHISSYGLILEPKTQFYNMYRKGLLKLPNEDLGADMYQLLMSKIEQSPFHQYEISNFALDGHESEHNKVYWFNEEYYGFGAGASGYVDGVRYTNINPVNHYIKAINKESKAILVSNKPSLTERMEEEMFLGLRLNEGVSSSRFKKKFDQSIESVFGQTINNLKEKELIVEKNDAIALTKRGKVIGNEVFEAFLIND >NZ_CP029673.1|WP_000627144.1|1661983_1662961_-|heat-inducible-transcription-repressor-HrcA MITDRQLSILNAIVEDYVDFGQPVGSKTLIERHNLNVSPATIRNEMKQLEDLNYIEKTHSSSGRSPSQLGFRYYVNRLLEQTSHQKTNKLRRLNQLLVENQYDVSSALTYFADELSNISQYTTLVVHPNHKQDIINNVHLIRANPNLVIMVIVFSSGHVEHVHLASDIPFSNDKLNTISNFVTNKLTEFNQNLQDDIVSFVQSEQEEIFINKLINTMNNHISNQSNSIYMGGKVKLIDALNESNVSSIQPILQYIESNRIAELLQDISSPNINVKIGNEIDDSLSDISIVTSQYHFDETLKGQIAVIGPTAMHYQNVIQLLNRIW >NZ_CP029673.1|WP_000182211.1|1661325_1661952_-|nucleotide-exchange-factor-GrpE MTNKDESVEKNTESTVEETNIKQNIDDSVEQAEESKGHLQDEAIEETSDENVIEEIDPKDQKINELQQLADENEEKYLRLYAEFENYKRRIQKENEINKTYQAQRVLTDILPAIDNIERALQIEGDDETFKSLQKGVQMVHESLINALKDNGLEVIKTEGEAFDPNIHQAVVQDDNPDFESGEITQELQKGYKLKDRVLRPSMVKVNQ >NZ_CP029673.1|WP_000034716.1|1659424_1661257_-|molecular-chaperone-DnaK MSKIIGIDLGTTNSCVTVLEGDEPKVIQNPEGSRTTPSVVAFKNGETQVGEVAKRQAITNPNTVQSIKRHMGTDYKVDIEGKSYTPQEISAMILQNLKNTAESYLGEKVDKAVITVPAYFNDAERQATKDAGKIAGLEVERIINEPTAAALAYGLDKTDKDEKVLVFDLGGGTFDVSILELGDGVFEVLSTAGDNKLGGDDFDQVIIDYLVAEFKKENGVDLSQDKMALQRLKDAAEKAKKDLSGVSQTQISLPFISAGENGPLHLEVNLTRSKFEELSDSLIRRTMEPTRQAMKDAGLTNSDIDEVILVGGSTRIPAVQEAVKKEIGKEPNKGVNPDEVVAMGAAIQGGVITGDVKDVVLLDVTPLSLGIEILGGRMNTLIERNTTIPTSKSQIYSTAVDNQPSVDVHVLQGERPMAADNKTLGRFQLTDIPPAERGKPQIEVTFDIDKNGIVNVTAKDLGTNKEQRITIQSSSSLSDEEIDRMVKDAEVNAEADKKRREEVDLRNEADSLVFQVEKTLTDLGENIGEEDKKSAEEKKDALKTALEGQDIEDIKSKKEELEKVIQELSAKVYEQAAQQQQQAQGANAGQNNDSTVEDAEFKEVKDDDKK >NZ_CP029673.1|WP_001119021.1|1658149_1659289_-|molecular-chaperone-DnaJ MAKRDYYEVLGISKDASKDEIKKAYRKLSKKYHPDINKEEGADEKFKEISEAYEVLSDDNKRASYDQFGHDGPQGFGGQGFNGSDFGGFSGFGGGGFEDIFSSFFGGGRQRDPNAPQKGDDLQYTMTLTFEEAVFGTTKEISIRKDVTCETCHGDGAKPGTSKKTCSYCNGAGHVAVEQNTILGRVRTEQVCPKCNGSGQEFEEACPTCHGKGTENKTVKLEVKVPEGVDNEQQIRLAGEGSPGVNGGPAGDLYVVFRVKPSETFKRDGDDIYYKLNVSFPQAALGDEIKIPTLNNEVMLTIPAGTQTGKQFRLKEKGIKNVHGYGYGDLYVDIKVVTPTKLTDRQKELMKEFAQLNGEEINEQPSNFKDRAKRFFKGE >NZ_CP029673.1|WP_001104607.1|1657207_1658146_-|50S-ribosomal-protein-L11-methyltransferase MNWTELSIIINHEAVELATNILENHGSNGVVIEDSDDLINQPEDKYGEIYALKKEDYPDKGVRLKAYFNEMTYDDKLRQQIKDELLNLDELDQHNIQFSEQIIAETDWENEWKNYFHPFRASKKFTIVPSWETYAKEADEELCIELDPGMAFGTGDHPTTSMCLKAIETYVLPQHSVIDVGTGSGILSIASHLIGVKRIKALDIDEMAVSVAKENFRRNHCETLIEAVPGNLLKDETEKFDIVIANILAHIIDEMIEDAYNTLNEGGYFITSGIIKEKYEGIQSHMERVGFKIISEQHDNGWVCLVGQKVSE >NZ_CP029673.1|WP_001190120.1|1656453_1657206_-|16S-rRNA-(uracil(1498)-N(3))-methyltransferase MQRYFIDQNADVSQRFFITKKEDIHHITNVMRYDVGSKIILTFNDQTVYLCEIADITSDKIAVDLKEKQNINTELPVDVTICSGLIKADKYEWLLQKATELGASSFIAVSMERSIVKLNEAKVVKKIERWQKIIKEAAEQSYRLVIPSIQFESNLKLICDTIDNYDYILIAYEEEAKDGELSNFKQTLQQFKAQDKVLMIFGPEGGLSENEISLFSNTSTVVGLGPRILRAETAPLYALSAISYEKELMG >NZ_CP029673.1|WP_000108667.1|1655100_1656447_-|tRNA-(N(6)-L-threonylcarbamoyladenosine(37)-C(2))--methylthiotransferase-MtaB MSTVAFHTLGCKVNHYETEAIWQLFKEANYERVDFEANADVFVINTCTVTNTGDKKSRQIIRRAIRQNPDAVICVTGCYAQTSSAEIMEIPGVDVVVGTQDRHKLLGYIDEFRKERQPINGVGNIMKNRKYEELDVPYFTDRTRASLKIQEGCNNFCTFCIIPWARGLMRSRDPEKVVEQATQLVNSGYKEIVLTGIHTGGYGQDLKDYNLAQLLRDLETINGLERIRISSIEASQLTDEVIDVLERSTKVVRHLHIPLQSGSDTVLKRMRRKYTMDRFSERLTKLHKALPDLAVTSDVIVGFPGETEAEFQETYDFIVKHKFSELHVFPYSPRIGTPAARMDDQIDEEIKNERVHKLITLSNQLGKLYASKFDQDVLEVIPEEQGDTEGTLVGYADNYMKVQFEGDESLIGQIVKVKITQANYPLNEGQAIKVVDFATNKSDREVLV >NZ_CP029673.1|WP_001802667.1|1653705_1654389_-|hypothetical-protein MTTILESTAGDTWVEQVSNIIVQPIFTLILTCLTFLGFVYQLYSKKINAAGIIATLSLLILFLGFLIQGNVNMHSILIFSIGVILVVIELFVVGAVIGIIGMILITISITTLGDNLLFMLANVIVALILTIVEWVILVKIFNRKIPFLDKVILKDSTNSESGYNSHDNRSHLVGKTAQTVTDLRPAGIIFCENERIDAVSDGNFILRNKTVKILEVEGTRVVVREVD >NZ_CP029673.1|WP_000492108.1|1652698_1653688_-|flotillin-like-protein-FloA MFSLSFIVIAVIIIVALLILFSFVPIGLWISALAAGVHVGIGTLVGMRLRRVSPRKVIAPLIKAHKAGLALTTNQLESHYLAGGNVDRVVDANIAAQRADIDLPFERAAAIDLAGRDVLEAVQMSVNPKVIETPFIAGVAMNGIEVKAKARITVRANIARLVGGAGEETIIARVGEGIVSTIGSSKHHTEVLENPDNISKTVLSKGLDSGTAFEILSIDIADVDISKNIGADLQTEQALADKNIAQAKAEERRAMAVATEQEMKARVQEMHAKVVEAESEVPLAMAEALRSGNISVKDYYNLKNIEADTGMRNAINKRTDQSDDESPEH >NZ_CP029673.1|WP_000368338.1|1664751_1666575_-|elongation-factor-4 MDNEQRLKRRENIRNFSIIAHIDHGKSTLADRILENTKSVETRDMQDQLLDSMDLERERGITIKLNAVRLKYEAKDGNTYTFHLIDTPGHVDFTYEVSRSLAACEGAILVVDAAQGIEAQTLANVYLALDNELELLPVINKIDLPAAEPERVKQEIEDMIGLDQDDVVLASAKSNIGIEEILEKIVEVVPAPDGDPEAPLKALIFDSEYDPYRGVISSIRIVDGVVKAGDKIRMMATGKEFEVTEVGINTPKQLPVDELTVGDVGYIIASIKNVDDSRVGDTITLASRPASEPLQGYKKMNPMVYCGLFPIDNKNYNDLREALEKLQLNDASLEFEPESSQALGFGYRTGFLGMLHMEIIQERIEREFGIELIATAPSVIYQCILRDGSEVTVDNPAQMPDRDKIDKIFEPYVRATMMVPNDYVGAVMELCQRKRGQFINMDYLDDIRVNIVYELPLAEVVFDFFDQLKSNTKGYASFDYEFIENKESNLVKMDILLNGDKVDALSFIVHRDFAYERGKALVEKLKTLIPRQQFEVPVQAAIGQKIVARTNIKSMGKNVLAKCYGGDISRKRKLLEKQKAGKAKMKAVGNVEIPQDAFLAVLKMDDE >NZ_CP029673.1|WP_001274017.1|1666920_1667172_+|30S-ribosomal-protein-S20 MANIKSAIKRVKTTEKAEARNISQKSAMRTAVKNAKTAVSNNADNKNELVSLAVKLVDKAAQSNLIHSNKADRIKSQLMTANK >NZ_CP029673.1|WP_001282563.1|1667216_1668191_-|DNA-polymerase-III-subunit-delta MSDNIVAIYGDVPELVEKQSAEIISQFLKSDRDDFNFVKYNLYETEIAPIVEETLTLPFFSDKKAILVKNAYIFTGEKAPKDMAHNVDQLIEFIEKYDGENLIVFEIYQNKLDERKKLTKTLKKHARLKKIEQMSEEEIKKWIQSKLNENFKDIKRDALDLFIELTGINFNIVSQEIEKLILFLGDRPTINKQDVNQIINRSLEQNVFLLTEYIQKRKKEQAIHLVKDLITMKEEPIKLLALITSNYRLFYQCKILSQKGYSGQQIAKTIGVHPYRVKLALGQVRHYQLDELLNIVDACAETDYKLKSSYMDKQLILELFILSL >NZ_CP029673.1|WP_000953309.1|1668247_1670395_-|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2 MLSTFLFILLLYITYRKNKIVYAPISLFLIIFSSWYLHYSQQAIFNYINYIERNSQFNERAQVIQIQRQGSDTYKGRLSLKNEIYPFFLTDKKNFDLKKIESRNCIVKGQFKVNENKFVTLKLQSIVVQSCLESNRSNLIEKHKQFIMNRIYDSGIKFPDRIMALITGDVKEINEQFKERVKEIGIYHLLAVSGSHIAAIVFLIYQPLKRLNLPLFVIKGITIIVLTLYAQYTNYAPSAVRAIIMTTLVLLITKQIKIKGIQLLAFAFIIMFILNPLVVYDIGFQFSFIISFFIMLLFPFLQQLSKLQSLFIITFIAQLASFIVAIPNFHQLQWVGFLSNLIFVPYYSIILFPLSILFFITSHFIVGLTPLNYLVDLSFNFHDWLLDLFTRIKQSHFSVPKFNDWIFIIFIISVYYIFWLLAKRKYILVTFWTIIILTLLITFPTNSHHKITMLNVGQGDSILYEGGKNQNVLIDTGGKVIDDTKQPSYSISKYHILPTLNERGINELEYLILTHPHNDHIGEVEYIISHIKIKHIVIYNKGYSSNTLMLLSKLSHKYNIKLMDVRQVSSFKLGDSSFLFFDSFIPNSRDKNEYSIITMITYQNKKVLLMGDASKNNESLLLKKYNLPEIDILKVGHHGSKTSSSKEFIEMIKPKISLISSGKNNMYHLPNIEVVKRLQRIRSRIYNSQQNGQVTIDLDDNLKVDSNSYGNASGL >NZ_CP029673.1|WP_000439693.1|1670453_1670915_-|ComE-operon-protein-2 MERIKWEEYFMAQSHLLALRSTCQRLSVGATIVKDNRIIAGGYNGSVAGEVHCIDEGCLIEDGHCIRTIHAEMNALLQCAKQGVSTEGATIYVTHFPCLNCTKSIIQAGIKRIYYAEDYHNHEYATKLLKQSGIEFKKIPFSPEYVAKYLTKG >NZ_CP029673.1|WP_001802022.1|1671006_1671693_-|ComEA-family-DNA-binding-protein MVLLYQFLLRYKDFLTQWKLYIISAVVLIMVLIGFIFWRQDDYTSRNFENKDTALKQSTSENNSLSKLEDVQVKDGDNSKNKGPVYVDVKGAVKHPNVYKMTSKDRVVDLLDKAQLLDDADVSRINLSEKLTDQKMIFIPHKGQKNVEPQIEVNSVHVKNGNTNNTKVNLNTASVSELMSVPGVGQAKANAIVEYRNQQGAFQEIDDLKKVKGFGSKTFDKLKSYFTI >NZ_CP029673.1|WP_000084830.1|1671732_1672449_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MSQYAEMSLVYDQLTQDQPYEKWFEIVKNHCKDESNILDIGCGTGSLTVQLEALGNVTGMDLSVDMLTVAAQKSANVNWLEGDMTSFDLQQQFDIITIFCDSLNYLQDETAVIETFINVYHHLTDSGVFIFDVHTVYKMMTLFNNQSYIDDKGDIFLAWDAVQGDLPLSVYHDMTFFIRHEDETYSRFDESHFQRTFDEKTYLSWLAQVGFKHVETFTDFNIDEHNEDTERLFFIAKK >NZ_CP029673.1|WP_001088020.1|1672451_1672805_-|ribosome-silencing-factor MNSQELLAIAVDAIDNKKGEDTISLEMKGISDMTDYFVVTHGNNERQVQAIARAVKEVANEQNIEVKRMEGYNEARWILIDLADVVVHVFHKDERNYYNIEKLYQDAPLESYGQVAY >NZ_CP029673.1|WP_001019324.1|1672805_1673390_-|HD-domain-containing-protein MNIEKAKRLAKEKLPEKRYNHSLRVAETAIKLAEIYDGDTSKVELAGVLHDFCKYDDLGKMYQIVRQYELGNDLLSYGSEILHGPVCAAIMEHEYGINDEEVLMAIKYHTTGRQQMTKTEKLIFIADYIEPGRTIPGVDDIRDMAYNQGSLDKTIYEISKRTVLFLIQKDITVYNKTIDCLNYYNYSDERIKDD >NZ_CP029673.1|WP_000725167.1|1673379_1673949_-|nicotinate-(nicotinamide)-nucleotide-adenylyltransferase MKKIVLYGGQFNPIHTAHMIVASEVFHELQPDEFYFLPSFMSPLKKHNNFIDVQHRLTMIQMIIDELGFGDICDDEIKRGGQSYTYDTIKAFKEQHKDSELYFVIGTDQYNQLEKWYQIEYLKEMVTFVVVNRDKNSQNVENAMIAIQIPRVDISSTMIRQRVSEGKSIQVLVPKSVENYIKGEGLYEH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP029673_6 | 2228121-2228201 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029673_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP029673_6
>6.1|2228145|33|NZ_CP029673|CRISPRCasFinder ATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTT |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029673_6
The CRISPR arrays of NZ_CP029673_6 >merge|NZ_CP029673|6|2228121-2228201|CRISPRCasFinder CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTCAACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCT >NZ_CP029673|6|5|2228121-2228201|CRISPRCasFinder CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTT ATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTT CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCT
>NZ_CP029673.1|WP_000495669.1|2227012_2228104_+|hypothetical-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKDKKVVTEPKNTKVENGKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >NZ_CP029673.1|WP_000019734.1|2225769_2226747_+|CDF-family-zinc-efflux-transporter-CzrB MSHSHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALVAFIYAEKNATTTKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >NZ_CP029673.1|WP_000003759.1|2225447_2225768_+|Zn(II)-responsive-metalloregulatory-transcriptional-repressor-CzrA MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >NZ_CP029673.1|WP_001024095.1|2224630_2225296_-|SDR-family-oxidoreductase MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFDGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGEQDIKDALTQFEIEKD >NZ_CP029673.1|WP_001127960.1|2223256_2224195_-|class-I-mannose-6-phosphate-isomerase MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >NZ_CP029673.1|WP_000808817.1|2222995_2223226_-|hypothetical-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >NZ_CP029673.1|WP_000123398.1|2220950_2222324_-|EVE-domain-containing-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRMSNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVKKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >NZ_CP029673.1|WP_001123303.1|2220080_2220494_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIKLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >NZ_CP029673.1|WP_000070866.1|2219437_2219881_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein 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MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIIPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPLMKFIMHILSVAVEALVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA >NZ_CP029673.1|WP_000927371.1|2236134_2238267_+|BglG-family-transcription-antiterminator 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>NZ_CP029673.1|WP_110417926.1|2238712_2239819_+|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVFDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVKDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAGYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS >NZ_CP029673.1|WP_001048259.1|2240137_2247583_-|DUF1542-domain-containing-protein MNLFRQQKFSIRKFNVGIFSALIATVTFISTNPTTASAAEQNQPAQNQPAQPADANTQPNANAGAQANPAAQPANQGGQANPAGGAAQPAGQGNQADPNNAAQAQPGNQAAPANQAGQGNNQATPNNNATPANQTQPANAPAAAQPAAPVAANAQTQDPNASNTGEGSINTTLTFDDPAISTDENRQDPTVTVTDKVNGYSLINNGKIGFVNSELRRSDMFDKNNPQNYQAKGNVAALGRVNANDSTDHGNFNGITKTVNVKPDSELIINFTTMQTNSKQGATNLVIKDAKKNTELATVNVAKTGTAHLFKVPTDADRLDLQFIPDNTAVADASRITTNKDGYKYYSFIDNVGLFSGSHLYVKNRDLAPKATNNKEYTINTEIGNNGNFGASLKADQFKYEVTLPQGVTYVNDSLTTTFPNGNEDSTVLKNMTVNYDQTANKVTFTSQGVTTARGTHTKEVLFPDKSLKLSYKVNVANIDTPKNIDFNEKLTYRTASDVVINNAQPEVTLTADPFSVAVEMNKDALQQQVNSQVDNSHYTTASIAEYNKLKQQADTILNEDANHVETANRASQADIDGLVTKLQAALIDNQAAIAELDTKAQEKVTAAQQSKKVTQDEVAALVTKINNDKNNAIAEINKQITSQGVTTEKDNGIAVLEQDVITPTVKPQAKQDIIQAVTTRKQQIKKSNASLQDEKDVANDKIGKIETKAIKDIDAATTNAQVEAIKTKAINDINQTTPATTAKAAALEEFDEVVQAQIDQAPLNPDTTNEEVAEAIERINAAKVSGVKAIEATTTAQDLERVKNEEIFKIENITDSTQTKMDAYKEVRQAATARKAQNATVSNATDEEVAEANAAVDAAQTEGLHDIQVVKSQQEVADTKAKVLDKINAIQTQAKVKPAADTEVENAYNTRKQEIQNSNASTTEEKEAAYTELDAKKQEARTNLDAANTNSDVTTAKDNGIAAINQVQAATTKKSDAKAEIAQKASERKTAIEAMNDSTTEEQQAAKDKVDQAVVTANADIDNATANTDVDNAKTTNEATIAAITPDANVKPAAKQAIADKVQAQETAIDANNGSTTEEKEAAKQQVQTEKTAADAAIDAAHSNVEVEAAKNAEIAKIEAIQPATTTKDNAKQAIATKANERKTAIAQTQDITAEEIAAANADVDNAVTQANSNIEAANSQNDVDQAKTTGETSIDQVTPTVNKKATARNEITAILNNKLQEIQATPDATDEEKQAADAEANTENGKANQAISAATTNAQVDEAKANAEAAINAVTPKVVKKQAAKDEIDQLQATQTNVINNDQNATNEEKEAAIQQLATAVTDAKNNITAATDDNGVDTAKDAGKNSIQSTQPATAVKSNAKNEVDQAVTTQNQAIDNTTGATTEEKNAAKDLVLKAKEKAYQDILNAQTTNDVTQIKDQAVADIQGITADTTIKDVAKDELATKANEQKALIAQTADATTEEKEQANQQVDAQLTQGNQNIENAQSIDDVNTAKDNAIQAIDPIQASTDVKTNARAELLTEMQNKITEILNNNETTNEEKGNDIGPVRAAYEEGLNNINAATTTGDVTTAKDTAVQKVQQLHANPVKKPAGKKELDQAAADKKTQIEQTPNASQQEINDAKQEVDTELNQAKTNVDQSSTNEYVDNAVKEGKAKINAVKTFSEYKKDALAKIEDAYNAKVNEADNSNASTSSEIAEAKQKLAELKQTADQNVNQATSKDDIEVQIHNDLDNINDYTIPTGKKESATTDLYAYADQKKNNISADTNATQDEKQQAIKQVDQNVQTALENINNGVDNGDVDDALTQGKAAIDTIQVDATVKPKANQAIEAKAEDTKESIDHSDQLTAEEKTEALAMIKQITDQAKQGITDATTTAEVEKAKAQGLEAFDNIQIDSTEKQKAIEELETALDQIEAGVNVDADATTEEKEAFTNALEDILSKATEDISDQTTNAEIATVKNSALEQLKAQRINPVVKKNALEAIREVVNKQIEIIKNADADASAKEIARTDLGRYFDRFADKLDKTQTNTEVAELQNVTIPAIEAIVPQNDPDANDTNNGTDNNDATANSNANATPENTGQPNVSETTDNGKADASPTTPNNSDAATGETTVTSATDDAKDKPQANNNSSADASTNSPTMDNDVTSKPEVESTNNGTTDKPVTETDNATPAESTTNNNSTTTATNENAPTGSTATAPTTASTEAASSADSKDNASVNDSKQNAEVNNSAESQSTNGKVAQPKSENKAKAEKDGRDSTNQSMVESTTETLPSADITEPNVPSNTSKDKEESTTNQTDAGQLKSETNVASNEADKSPSKADTEVSNKPSTSASSEAKDKMTSTNVSQKDDTATADTNDTQKSVGPVANNKAKDMQTNDTQKSVGSAANNKATQNDGANASPATVSNGSHSMHQDMLNVTKPEENKANAKSDQQGKVNKPKQQAKTLPDTGMSHNDDLPYAELALGAGMAFLIRRFTKKDQQTEE 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You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP029673_7 | 2240442-2240527 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029673_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP029673_7
>7.1|2240468|34|NZ_CP029673|CRISPRCasFinder TTGCATATCTTTAGCTTTATTGTTTGCAACTGGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029673_7
The CRISPR arrays of NZ_CP029673_7 >merge|NZ_CP029673|7|2240442-2240527|CRISPRCasFinder CCAACTGATTTTTGCGTATCATTAGTTTGCATATCTTTAGCTTTATTGTTTGCAACTGGGCCAACTGATTTTTGCGTATCATTAGT >NZ_CP029673|7|6|2240442-2240527|CRISPRCasFinder CCAACTGATTTTTGCGTATCATTAGT TTGCATATCTTTAGCTTTATTGTTTGCAACTGGG CCAACTGATTTTTGCGTATCATTAGT
>NZ_CP029673.1|WP_110417926.1|2238712_2239819_+|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVFDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVKDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAGYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS >NZ_CP029673.1|WP_001292149.1|2238278_2238713_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >NZ_CP029673.1|WP_000927371.1|2236134_2238267_+|BglG-family-transcription-antiterminator 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MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEDGTPVVALATQENVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >NZ_CP029673.1|WP_000908182.1|2231061_2231844_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLIQLDQIGRMKQGKTILKNISWQIAKGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATTGGVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEVRNEAHHLLKLVGISAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLNILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITGNFTKILLLKDGESVQQGLIDDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >NZ_CP029673.1|WP_000370923.1|2230136_2230994_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTLDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >NZ_CP029673.1|WP_001792784.1|2229320_2229479_+|hypothetical-protein MSKSSDALFNSLTQSFELIEGVYNELVTDNLKIVMYKPRKESTSGRINRRFK >NZ_CP029673.1|WP_001802298.1|2228536_2228641_-|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >NZ_CP029673.1|WP_000495669.1|2227012_2228104_+|hypothetical-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKDKKVVTEPKNTKVENGKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >NZ_CP029673.1|WP_000521495.1|2247860_2249216_-|phosphoglucosamine-mutase MGKYFGTDGVRGVANQELTPELAFKLGRYGGYVLAHNKGEKHPRVLVGRDTRVSGEMLESALIAGLISIGAEVMRLGIISTPGVAYLTRDMGAELGVMISASHNPVADNGIKFFGSDGFKLSDEQENEIEALLDQENPELPRPVGNDIVHYSDYFEGAQKYLSYLKSTVDVNFEGLKIVLDGANGSTSSLAPFLFGDLEADTETIGCSPDGYNINEKCGSTHPEKLAEKVVETESDFGLAFDGDGDRIIAVDENGQIVDGDQIMFIIGQEMHKNQELNNDMIVSTVMSNLGFYKALEQEGIKSNKTKVGDRYVVEEMRRGNYNLGGEQSGHIVMMDYNTTGDGLLTGIQLASVIKMTGKSLSELAGQMKKYPQSLINVRVTDKYRVEENVDVKEVMTKVEVEMNGEGRILVRPSGTEPLVRVMVEAATDEDAERFAQQIADVVQDKMGLDK >NZ_CP029673.1|WP_000894032.1|2249242_2250175_-|YbbR-like-domain-containing-protein MLESKWGLRFIAFLLALFFFLSVNNVFGNIFNTGNLGQKSSKTIQDVPVEILYNTKDLHLTKAPETVNVTISGPQSKIIKIENPEDLRVVIDLSNAKAGKYQEKYQVKGLADDIHYSVKPKLANITLENKVTKKMTVQPDVSQSDIDPLYKITKQEVSPQTVKVTGGEEQLNDIAYLKATFKTNKKINGDTKDVAEVTAFDKKLNKLNVSIQPNEVNLQVKVEPFSKKVKVNVKQKGSLADDKELSSIDLEDKEIEIFGSRDDLQNISEVDAEVDLDGISESTEKTVKINLPEHVTKAQPSETKAYINVK >NZ_CP029673.1|WP_000347896.1|2250176_2250986_-|TIGR00159-family-protein MDFSNFFQNLSTLKIVTSILDLLIVWYVLYLLITVFKGTKAIQLLKGILVIVIGQQISMILNLTATSKLFDIVIQWGVLALIVIFQPEIRRALEQLGRGSFLKRYTSNTYSKDEEKLIQSVSKAVQYMAKRRIGALIVFEKETGLQDYIETGIAMDSNISQELLINVFIPNTPLHDGAMIIQGTKIAAAASYLPLSDSPKISKSLGTRHRAAVGISEVSDAFTVIVSEETGDISVTFDGKLRRDISNEIFEELLAEHWFGTRFQKKGVK >NZ_CP029673.1|WP_000167867.1|2251174_2252083_-|arginase MTKTKAIDIIGAPSTFGQRKLGVDLGPTAIRYAGLISRLKQLDLDVYDKGDIKVPAVNIEKFHSEQKGLRNYDEIIDVNQKLNKEVSASIENNRFPLVLGGDHSIAVGSVSAISKHYNNLGVIWYDAHGDLNIPEESPSGNIHGMPLRILTGEGPKELLELNSNVIKPENIVLIGMRDLDKGERQFIKDHNIKTFTMSDIDKLGIKEVIENTIEYLKSRNVDGVHLSLDVDALDPLETPGTGTRVLGGLSYRESHFALELLHQSHLISSMDLVEVNPLIDSNNHTAEQAVSLVGTFFGETLL >NZ_CP029673.1|WP_000958531.1|2258323_2259388_-|P-loop-NTPase MLTVDQVKELVGEIKDPIIDVPLKETEGIVEVSIKEEKEHVSVKLAMAQLGGAPQLDLQMAVVNALKENGAKTVGIRFETLPEEKVNQFKPKEENKPKTIEGLLSQNNPVEFIAIASGKGGVGKSTVAVNLAVALAREGKKVGLVDADIYGFSVPDMMGIDEKPGIKGKEVIPVERHGVKVISMAFFVEENAPVIWRGPMLGKMLTNFFTEVKWGDIEYLILDLPPGTGDVALDVHTMLPSSKEIIVTTPHPTAAFVAARAGAMAKHTDHSILGVIENMSYFESKETGNKEYVFGKGGGTKLADELNTQLLGELPLEQPSWNPKDFAPSIYQSDDRLGKIYSSIAQKVIAATNK >NZ_CP029673.1|WP_001141007.1|2259535_2260978_-|multidrug-efflux-MFS-transporter-LmrS MAKVELTTRRRNFIVAVMLISAFVAILNQTLLNTALPSIMRELNINESTSQWLVTGFMLVNGVMIPLTAYLMDRIKTRPLYLAAMGTFLLGSIVAALAPNFGVLMLARVIQAMGAGVLMPLMQFTLFTLFSKEHRGFAMGLAGLVIQFAPAIGPTVTGLIIDQASWRVPFIIIVGIALVAFVFGLVSISSYNEVKYTKLDKRSVMYSTIGFGLMLYAFSSAGDLGFTSPIVIGALIISMVIIYLFIRRQFNITNVLLNLRVFKNRTFALCTISSMIIMMSMVGPALLIPLYVQNSLSLSALLSGLVIMPGAIINGIMSVFTGKFYDKYGPRPLIYTGFTILTITTIMLCFLHTDTSYTYLIVVYAIRMFSVSLLMMPINTTGINSLRNEEISHGTAIMNFGRVMAGSLGTALMVTLMSFGAKIFLSTSPSHLTATEIKQQSIAIGVDISFAFVAVLVMAAYVIALFIREPKEIESNRRKF >NZ_CP029673.1|WP_000636857.1|2261300_2261774_-|multidrug-efflux-transporter-SepA MIVNYLKHKFYNLLTTMIVLFIFVLSGAIFLTFLGFGLYGLSRILIYFRLGDFTYNRSMYDNLLYYGSYIIFGYFIIFAVEHLMDYFRKMLPENAYFRGATFHLISYTVATTLFYFIIHLNYVYINIDFWVIMVIIGFLYVCKLQFYPESKNLNNRK >NZ_CP029673.1|WP_001237506.1|2261872_2263216_-|MFS-transporter MRLKSIITVIALILIMFMSAIESSIISLALPTIKQDLNAGNLISLIFTAYFIALVIANPIVGELLSRFKIIYVAIAGLLLFSIGSFMCGLSTNFTMLIISRVIQGFGSGVLMSLSQIVPKLAFEIPLRYKIMGIVGSVWGISSIIGPLLGGGILEFATWHWLFYINIPIAIIAIILVIWTFHFPEEETVAKSKFDTKGLTLFYVFIGLIMFALLNQQLLLLNFLSFILAIVVAMCLFKVEKHVSSPFLPVVEFNRSITLVFITDLLTAICLMGFNLYIPVYLQEQLGLSPLQSGLVIFPLSVAWITLNFNLHRIEAKLSRKVIYLLSFTLLLVSSIIISFGIKLPVLIAFVLILAGLSFGYIYTKDSVIVQEETSPLQMKKMMSFYGLTKNLGASIGSTIMGYLYAIQSGIFGPNLHNVLSAVAVISIGLIVLWVVFFKEQSSQSKE >NZ_CP029673.1|WP_000047255.1|2263392_2264076_-|hemolysin-III-family-protein MSKSTKKSNDTIVETFKDIIPLSFGEEIGNAASHGVAALLTLLVLPYAAVHSYIAHGTLASVSMSIYVISIFMMFISSTIYHSMQNETPHKYILRIIDHSMIYVAISGTYTPILLTVVGGWIGWTVFILLWGTTLWGILYKSIAVKVNQKLSLIVYLVMGWVGIILLPIIFIRTSWIFILFIFLGGVSYTIGAWFYAQKNRPYFHMIWHIFIVIASLLHLIAILYFM >NZ_CP029673.1|WP_000884735.1|2264094_2265282_-|UDPGP-type-1-family-protein MLDKNQLAKYKQDHLCEYEKIMSNNEKEALEEKVASLDLDFIAKLYNDLYINKKTIDDVSAVSEVKYDIKSQMSDDEIKRLEEQGLQAIKEGQFAVLLMAGGQGTRLGYKGPKGSFEIEGVSLFELQANQLKTLNHQSGHTIQWYIMTSDINHEETLAYFEAHSYFGYDQEAIHFFKQDNIVALSEEGKLILNQQGRIMETPNGNGGVFKSLDKAGYLEEMSNNGVKYIFLNNIDNVLVKVLDPLFAGFTVEHDYDITSKTIQPKPGESVGRLVNVDCKDTVLEYSELDPEVANQFNNANIGIHAFKLGFILNAVNRELPYHLAIKNLKQLDENFGVIEQPTLKFELFYFDIFTYGTSFVTLQVPREEEFSPLKNKEGKDSVATATEDLRRMGLI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP029673_8 | 2348484-2348564 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029673_8
|
1 spacers
spacers of NZ_CP029673_8
>8.1|2348509|31|NZ_CP029673|CRISPRCasFinder CACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029673_8
The CRISPR arrays of NZ_CP029673_8 >merge|NZ_CP029673|8|2348484-2348564|CRISPRCasFinder TCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTG >NZ_CP029673|8|7|2348484-2348564|CRISPRCasFinder TCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTG CACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCT TCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTG
>NZ_CP029673.1|WP_001792132.1|2348256_2348442_+|hypothetical-protein MFRFISFGQLVVYSTTFIPKKDILQLNDLECDINVKEPLKINYVVIFGSGTEITFSQNLFR >NZ_CP029673.1|WP_000066900.1|2347780_2348131_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >NZ_CP029673.1|WP_000184404.1|2346467_2347679_+|MFS-transporter MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFFVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDGSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAIDLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETDVINKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >NZ_CP029673.1|WP_000951058.1|2346034_2346475_+|winged-helix-DNA-binding-protein MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKHQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLKEAHND >NZ_CP029673.1|WP_000600967.1|2345108_2345873_-|VOC-family-protein MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIEAVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKVKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >NZ_CP029673.1|WP_001549681.1|2344865_2345117_+|hypothetical-protein MRTIILSLFIIMNIVAIIMTLSQPLTVNYFSLRVILIFFTFILSIFFILIKSSRLNNILTILSIVLVIIHMGILAHSTYVYLY >NZ_CP029673.1|WP_000413862.1|2343211_2344477_-|lipid-II:glycine-glycyltransferase-FemX MEKMHITNQEHDAFVKSHPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEVQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSAKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKNDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDREGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEIAKWQQKMETSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYILNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK >NZ_CP029673.1|WP_000592307.1|2339927_2343095_-|efflux-RND-transporter-permease-subunit MIKKLLQFSLGNKFAIFLMVVLVVLGGVYASAKLKLELLPNVQNPVISVTTTMPGATPQSTQDEISSKIDNQVRSLAYVKNVKTQSIQNASIVTVEYENNTDMDKAEEQLKKEIDKIKFKDEVGQPELRRNSMDAFPVLAYSFSNKENDLKKVTKVLNEQLIPKLQTVDGVQNAQLNGQTNREITLKFKQNELEKYGLTADDVENYLKTATRTTPLGLFQFGDKDKSIVVDGQYQSVDAFKNINIPLTLAGGQGQSQSQSDNKQNSAMSDVNQASPQQNSKASAPNNISGMPTAKLGDLADITVGDVRTSISKTNGKDAVNLQITKAQDANTVQVAKDVQRKIDTFVDENKDFNVTKTMDTAKPVEKSLYTMVEKASLGTIVAIIVILLFLRNIRTTAISIISIPLSLLMALIALKLSDVSLNILTLGALTVAIGRVIDDSIVVVENIYRRLTDSEEQLKGENLIISATTEVFKPIMSSTLVTIIVFLPLVFVSGSVGEMFRPFALAIAFSLLASLLVSITLVPALAATLFKKGVKRRNKQHQEGLGVVSTTYKKVLHWSLNHKWIVIILSTLILVATIVFGGPRLGTSFISAGDDKFLAITYTPKPGETEQAVLNHAKDVEKYLKQKKHVKTIQYSVGGSSPVDPTGSTNSMAIMVEYDNDTPNFDVEADKVIKHVDGFKHPGEWKNQDLGTGAGNKSVEVTVKGPSMDAIKSTVKDIEQKMKQVKGLANVKSDLSQTYDQYEIKVDQNKAAENGISASQLAMHLNENLPEKTVTTVKENGKTVDVKVKQNKQTDWSEDKLNNITLKKPTGGTIKLGDIATLVKTTTPSKLTQEQGDYATTVSAKVTNKDVGGTTRQVMSKINNLDKPNNVKVNIGGASDDINNAMTQLAFAMLAAIIIVYLILVITFKGGLAPFTILFSLPFTVIGVIIALLITGETISVPSLIGMLMLIGIVVTNAIVLIDRVINNEQQGMEMKEALIEAGGTRIRPILMTAIATIGALVPLLFGQDSSILISKGLAATVIGGLISSTLLTLVVVPVIYEILFTLKKRFTKR >NZ_CP029673.1|WP_001161085.1|2339426_2339744_+|hypothetical-protein MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVVFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKENWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF >NZ_CP029673.1|WP_000051210.1|2339017_2339182_+|hypothetical-protein MSLENQLAELKYDYVRLQGDLEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD >NZ_CP029673.1|WP_000230173.1|2348707_2349730_-|GTP-3',8-cyclase-MoaA MVEQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLDVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEQHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >NZ_CP029673.1|WP_000643986.1|2349749_2350349_-|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase-MobA MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYSRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNIYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL >NZ_CP029673.1|WP_000866971.1|2350355_2350589_-|molybdopterin-converting-factor-subunit-1 MKVLYFAEIKDILQKAQEDIVLEQALTVQQFEDLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG >NZ_CP029673.1|WP_000808495.1|2350594_2351041_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaE MKQFEIVIEPIQTEQYREFTINEYQGAVVVFTGHVREWTKGVKTEYLEYEAYIPMAEKKLAQIGDEINEKWPGTITSIVHRIGPLQISDIAVLIAVSSPHRKDAYRANEYAIERIKEIVPIWKKEIWEDGSKWQGHQKGNYEEAKREE >NZ_CP029673.1|WP_000602950.1|2351054_2351540_-|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B MILQIVGYKKSGKTTLMRHIVSFLKTHGYTVATIKHHGHAKEDIQLQDSDVDHMKHFEAGADQSIVQGFQYQQTVTRVDNQNLTQIIEKSVTIDTNIVLVEGFKNADFEKVVVYRDEEELQVLQQLSNVCYSINVREHEDFTAFEQWLLNKIKNDCDTQLT >NZ_CP029673.1|WP_000259717.1|2351536_2352796_-|molybdopterin-molybdotransferase-MoeA MVVEKRNPIPVKEAIQRIVNQQSSMPAITVALEKSLNHILAEDIVATYDIPRFDKSPYDGFAIRSVDSQGASGQNRIEFKVIDHIGAGSVSDKLVGDHEAVRIMTGAQIPNGADAVVMFEQTIELEDTFTIRKPFSKNENISLKGEETKTGDVVLKKGQVINPGAIAVLATYGYAEVKVIKQPSVAVIATGSELLDVNDVLEDGKIRNSNGPMIRALAEKLGLEVGIYKTQKDDLDSGIQVVKEAMEKHDIVITTGGVSVGDFDYLPEIYKAVKAEVLFNKVAMRPGSVTTVAFADGKYLFGLSGNPSACFTGFELFVKPAVKHMCGALEVFPQIIKATLMEDFTKANPFTRFIRAKATLTSAGATVVPSGFNKSGAVVAIAHANCMVMLPGGSRGFKAGHTVDIILTESDAAEEELLL >NZ_CP029673.1|WP_000134526.1|2352858_2353353_+|cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-MoaC MTEFTHINQQGHAKMVDVSDKQITKRTAVAHSSITVNETIFKQISNNTNTKGNVLNTAQIAGIMAAKNTSTIIPMCHPLPLTGIDVHFSWDETNAPLYTLNIQTTVSTTGKTGVEMEALTAASATALTIYDMTKAVDKGMIIGETYLESKSGGKSGDFQRQSGQ >NZ_CP029673.1|WP_000503822.1|2353354_2353861_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaB MGEHQNVKLNRTVKAAVLTVSDTRDFVTDKGGQCVRQLLQADDVEVSDAHYTIVKDEKVAITTQVKKWLEEDIDVIITTGGTGIAQRDVTIEAVKPLLTKEIEGFGELFRYLSYVEDVGTRALLSRAVAGTVNNKLIFSIPGSTGAVKLALEKLIKPELNHLIHELTK >NZ_CP029673.1|WP_000076930.1|2353891_2354896_-|molybdopterin-biosynthesis-protein-MoeB MSQERYSRQILFKQIGEIGQSKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDGCIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKHRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSDCTTCGDVPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >NZ_CP029673.1|WP_000913024.1|2355065_2355671_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MLKINVKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTTKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSKHIDQLIQTLNINHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP029673_2 | 2.1|823178|31|NZ_CP029673|CRISPRCasFinder | 823178-823208 | 31 | NZ_CP029673.1 | 311784-311814 | 0 | 1.0 |
NZ_CP029673_3 | 3.1|828644|22|NZ_CP029673|CRT | 828644-828665 | 22 | NZ_CP029673.1 | 188575-188596 | 0 | 1.0 |
NZ_CP029673_3 | 3.1|828644|22|NZ_CP029673|CRT | 828644-828665 | 22 | NZ_CP029673.1 | 188633-188654 | 0 | 1.0 |
NZ_CP029673_3 | 3.1|828644|22|NZ_CP029673|CRT | 828644-828665 | 22 | NZ_CP029673.1 | 311709-311730 | 0 | 1.0 |
NZ_CP029673_3 | 3.1|828644|22|NZ_CP029673|CRT | 828644-828665 | 22 | NZ_CP029673.1 | 311819-311840 | 0 | 1.0 |
NZ_CP029673_3 | 3.1|828644|22|NZ_CP029673|CRT | 828644-828665 | 22 | NZ_CP029673.1 | 655280-655301 | 0 | 1.0 |
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59. spacer 8.1|2348509|31|NZ_CP029673|CRISPRCasFinder matches to position: 2337708-2337738, mismatch: 2, identity: 0.935
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60. spacer 8.1|2348509|31|NZ_CP029673|CRISPRCasFinder matches to position: 2513058-2513088, mismatch: 2, identity: 0.935
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP029673_3 | 3.2|828702|23|NZ_CP029673|CRT | 828702-828724 | 23 | AP014226 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S44-C3, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 28490-28512 | 3 | 0.87 |
NZ_CP029673_3 | 3.2|828702|23|NZ_CP029673|CRT | 828702-828724 | 23 | AP014225 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S41-C89, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 24653-24675 | 3 | 0.87 |
NZ_CP029673_3 | 3.4|828819|23|NZ_CP029673|CRT | 828819-828841 | 23 | AP014226 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S44-C3, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 28490-28512 | 3 | 0.87 |
NZ_CP029673_3 | 3.4|828819|23|NZ_CP029673|CRT | 828819-828841 | 23 | AP014225 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S41-C89, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 24653-24675 | 3 | 0.87 |
NZ_CP029673_7 | 7.1|2240468|34|NZ_CP029673|CRISPRCasFinder | 2240468-2240501 | 34 | JN882286 | Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome | 23034-23067 | 8 | 0.765 |
NZ_CP029673_7 | 7.1|2240468|34|NZ_CP029673|CRISPRCasFinder | 2240468-2240501 | 34 | CP030544 | Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence | 7567-7600 | 8 | 0.765 |
1. spacer 3.2|828702|23|NZ_CP029673|CRT matches to AP014226 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S44-C3, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer actgtagaaaatggaaatccaac Protospacer ********* ***********.
2. spacer 3.2|828702|23|NZ_CP029673|CRT matches to AP014225 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S41-C89, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer actgtagaaaatggaaatccaac Protospacer ********* ***********.
3. spacer 3.4|828819|23|NZ_CP029673|CRT matches to AP014226 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S44-C3, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer actgtagaaaatggaaatccaac Protospacer ********* ***********.
4. spacer 3.4|828819|23|NZ_CP029673|CRT matches to AP014225 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S41-C89, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer actgtagaaaatggaaatccaac Protospacer ********* ***********.
5. spacer 7.1|2240468|34|NZ_CP029673|CRISPRCasFinder matches to JN882286 (Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ttgcatatctttagctttattgtttgcaactggg CRISPR spacer ttgcatatctttagctttatagcttttatatgct Protospacer ******************** *.** .* **
6. spacer 7.1|2240468|34|NZ_CP029673|CRISPRCasFinder matches to CP030544 (Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ttgcatatctttagctttattgtttgcaactggg CRISPR spacer ttgaataactttagctttattgttataaacagta Protospacer *** *** **************** *** * .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
760382 : 768203
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP029673|760382:768203|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTACGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTGTTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAGCCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTATATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCTGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAGTTAATACAGAGGCAACAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGGCATTTTTTTAGGTGAGAAAATATTTATCTGAACTAGATAACACTATAAAACACTTCTGATATTTTGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTTATAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGCTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATTGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATAAAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCCACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGTAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGTGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGATTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACAACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAGAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACAAGGAATGTGATGTGCAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP029673|760382:768203|762098_762572_-|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NZ_CP029673|760382:768203|761437_762124_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_CP029673|760382:768203|767051_768203_+|WP_001217796.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQFESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NZ_CP029673|760382:768203|762914_763355_-|WP_001093562.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVASVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NZ_CP029673|760382:768203|763634_764219_-|WP_000604990.1|DBSCAN-SWA MILYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NZ_CP029673|760382:768203|766474_767068_+|WP_000604514.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHIRFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_CP029673|760382:768203|765034_765454_-|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_CP029673|760382:768203|765455_766124_-|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NZ_CP029673|760382:768203|760382_761438_-|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_CP029673|760382:768203|764317_765031_-|WP_001062972.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
780174 : 794759
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP029673|780174:794759|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP029673|780174:794759|783944_784046_+|WP_031760357.1|DBSCAN-SWA MVITDIDVYRVGRENIVIAVYNEHIKLLFILIS >NZ_CP029673|780174:794759|785969_786470_-|WP_000930014.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP029673|780174:794759|791892_792048_+|WP_000499195.1|DBSCAN-SWA MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ >NZ_CP029673|780174:794759|788517_790623_+|WP_000855514.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSISFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP029673|780174:794759|793044_794001_+|WP_001245577.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >NZ_CP029673|780174:794759|793997_794759_+|WP_000616840.1|DBSCAN-SWA MIQVENLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDNGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMNIQIEHIRNQRICLYFKD >NZ_CP029673|780174:794759|780174_781233_+|WP_000663030.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP029673|780174:794759|784123_785629_-|WP_000193751.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_CP029673|780174:794759|788156_788555_+|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_CP029673|780174:794759|781571_782114_+|WP_000197262.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NZ_CP029673|780174:794759|786489_787356_-|WP_001068501.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFLYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSSREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFVLFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP029673|780174:794759|790740_791712_+|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_CP029673|780174:794759|792086_793058_+|WP_000876318.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NZ_CP029673|780174:794759|782936_783854_-|WP_000429006.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMSHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL |
14 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1039604 : 1048077
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP029673|1039604:1048077|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP029673|1039604:1048077|1042834_1045024_+|WP_000032740.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGNEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP029673|1039604:1048077|1042170_1042842_+|WP_000666806.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLATEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP029673|1039604:1048077|1047510_1048077_+|WP_000238669.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDCGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP029673|1039604:1048077|1041201_1041906_+|WP_000174053.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINNVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_CP029673|1039604:1048077|1046479_1047508_+|WP_000030811.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP029673|1039604:1048077|1041905_1042169_+|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >NZ_CP029673|1039604:1048077|1040073_1041198_+|WP_001010413.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPSEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSGRKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_CP029673|1039604:1048077|1039604_1040087_+|WP_000861573.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGINIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKSIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >NZ_CP029673|1039604:1048077|1045002_1046487_+|WP_000483720.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAINDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1101403 : 1183195
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP029673|1101403:1183195|DBSCAN-SWA 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100 | Staphylococcus_phage(68.18%) | tRNA,head,tail,capsid,transposase,portal,holin,terminase,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1714164 : 1723207
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP029673|1714164:1723207|DBSCAN-SWA ATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCGCCTAATTTTTCAACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATATACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAATTTTAAGTCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTGACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAATATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAAGGAATTAGACAAGTCTTCCATTGACGTTGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCGCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCATTCATCGCAATATCTTGAATAATTAATTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGATCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGTAACTCAGGTTCTAAGTGTCCATTTTGCCAAAATAGCGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCGATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGAATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACGTCTACTGGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGATGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCCTTTTTAACTTTCGTTTCTGCCATAGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATCATTTAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAATCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTGTATGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATGTACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAATGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCTAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCGGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCGCTATCGCTCTTTTAATTCTTTCAATAGCCTTAGTCATATCGCTCAATTGCAATGCATCATGATTGACATCTGTGTCTGAAATGATGGATTCAATTGCTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGCTGGTTTAGTTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAACTCTTTATTGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTATTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAAGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAAAATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCGGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAGGAATGAACTTTTGTTTGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCGGAAATGAAATTAAATGCTACTAACGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAATCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGGGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCCGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTAGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAGATTTCTTCCGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTAGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGAACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGATCGACTTGATAAAGCACCTCAAATCCACCTTGCAAATCAAGTCCTAAATTGACATTCTTTATAACACTTTTATAAGTTGCAGCCATTCCGGCAAACAACAATACGACTAAAAGCAAGAACGCAATTATTCTACTACTTTTCTTCACATGAACACCTCATTATTTACGTATGTATTTAGAATACTTGAATACTATTTTATAACGCAAGTTAAATCTTTCTTACAAAATTTATTAGCCTTATACATATTAACATACTAGAGCAGGGAGTAAAAATAGTCATAGATATATTTAATTTAAATTTAACAATTATTATGTATCACAATTTCTTTTTTTGGAATAAAAATAAGCTATTCTACATACTACTTATAACTTAAAAAGGATGAAACGCTATTCGTTTCATCCTTTTTAATACCACTTCTCGTTATGAAGGGTCAACTTGTTTAATAGCAGGTTTTTCGAAAGTTAATTCAGTACCATGACCATTAACTGTAATAACAACAGTTGTTTCATCTACTGCTTTAACAGTACCTTTAATACCACCAATAGTTGTAATTCTTTGACCAGATTGAATGTTATTAATCAACTCACGATGCTGTTTCGCACGTTTTTGTTGTGGTCTGATCATCAAGAAATACATAACCGCAAAAATTACGACTATATATATTAGTAATGAAAATTGCATTTTATACGCTCCTCTTGCTTAAAAGTTTTTTGGGTTCTCAACATTTAATCCATATTGCTCGAAGAATTCTTCTTTGAAATCTAAAAGACGATCTTCTCGAATGGCTTGTCTTATATCTTCCATTAATTTTAGCAGAAAATGTAAATTATGAATAGTAGTAAGACGAATACCAAAAGTTTCCTCTGCCTTGATTAAATGACGTATATACGCTCTTGAATAGTTTTGACATGTATAACAGTCACAATTCTCATCTAACGGTCTTAAATCATCTGCAAATTTTGCATTTTTAATAACTAAACGACCTTGCGATGTCATACAAGTACCATTTCTGGCAATACGTGTCGGTAAGACACAATCAAACATATCCATGCCGCGAATACTACATTCGATTAACGCATCTGGAGATCCTACACCCATTAAATATCTTGGTTTATCTTTAGGCATAAACTGCTCTGTATGTTCAACCATTTTATACATAACCGGTTTAGGTTCACCAACTGACAAACCGCCGATTGCATAACCAGGAAAATCTAATTCTACTAAATCCTTTGCACTTTGTTCTCTTAAATCTTCATATTCGCCACCTTGTATAATGCCGAACAATGCTTGATCTTCAGGTCTTTGGTGTGCATCTAGACATCTTTTCGCCCAACGTGTTGTACGTTCAATAGATTTTTTTACATAATCATATTCAGCAGGCATCGGTGGACATTCATCAAATGCCATCATAATATCAGATCCTAAATCATTTTGAATTTGCATTGATTTCTCAGGACTCAAAAATAATTTAGACCCATTAGTATGATGTCTAAATTCCACGCCTTCTTCTGTAATTTTACGTAAATTACTTAAACTAAACACTTGGAAACCGCCTGAATCTGTAAGAATCGGACCATCCCAATTCATGAATTTATGTAATCCCCCAGCGTGTTTGATAATATCATTTCCGGGTTGTAACCACAAATGATATGTGTTGCCCAAAATGATTTTTGCTTCAATTTGTCTTAACTCTTCTGGACTCATTGTTTTAACGGTTGCTTTAGTACCAACTGGCATAAACATAGGTGTTTCAAATGAACCGTGTGGTGTGTGCACGATACCTAAACGCGCACCTGATTGTTTACAAGTTTTAATGTGTTCGTATGTTACTGCAGGCATATTCAAAATCCTCACATTCTTTTTATATAATTAACATTGCATCGCCAAAACTAAAGAATCTATATTCTAAATTTACTGCTGTTTTATAAGCATTCAGAACATTTTCACGAGTACTAAACGCTGATACTAGCATAACTAATGTTGATTTTGGTAAATGAAAATTAGTAATCTGGCCATCAATTGCTTTAAAATCAAATCCTGGATAAATAAATATATTAGTCCAGCCACTCGTTTCAACAAATTTATCATGATCGCGTCGAATTGTTTCAAGTGTACGTGTTGAAGTTGTACCAACTGATATAATGCGATGTCCTTTGGACTTAGTATCATTTAATAAATCAGCTGTTTCTTGTGTCATTTGATAATATTCACTATGCATTTCGTGGTCATTCACATCATCGACGCTCACCGGTCTAAACGTACCTAACCCAACATGTAATGTAACAAATGCGATATTAACGCCTTTATTTTTAATTTCAGTTAATAACTCATCAGTAAAATGTAATCCTGCTGTTGGTGCTGCCGCTGAACCACTTTCTTTAGCGTAAACTGTTTGATAACGATCTGGATCATCTAAACGTTCTTTGATGTATGGTGGCAGTGGCATTTCCCCTAATTCATCTAATCTTTCTTGTAAAATACCTTCATAATGTAAACGCATGATGCGTCCACCTTGATCCATTTCTTTTATGCACTCAGCTATAATTTTGCCATTACCAAAATTCAATTTATTACCAACTTTAATACGCTTAGCTGGTTTCAGTAAGACTTCCCAATCATTACCTTCAATTTGAGTTAACATTAACATTTCAACTTTTGCACCAGTTTCTTCTTTTAAACCAAAAAGTCTAGCTGGCATTACTCGCGTATCGTTAAGCACTAATGTATCACCAGGTCTAAAATACTCAATGATATCTTTGAAATGTAAATGTTTCATTTCACCAGTTTCTCTATCCATGACTAATAAACGACTATGATCACGATCTTTTAAAGGCGTTTGAGCAATTAATGATTCTGGTAAGTCATAGTCAAATTCTTCAATATTCACGTTATCCTCTCTCCTCATTCGACTTTGCAAAATGTTCATAAGCTAATGGTGTTGCTTTTCTGCCACGTGGCGTACGTTCTAAAAAGCCTTTCTGAATAAGAAATGGCTCATAAACGTCCTCAATTGTAATACGTTCTTCACCAATTGTTACGGCAATCGTATCTAAACCAACAGGTCCACCATTATACTGCTTAATAATACAGTTCATCATTTTATGATCAATGTAATCTAGTCCGTGTTGATCAACTTGAAGTAAACCTAATGCGTGCTTCGTTGTTTCAATGTATATTTGTTCATCTTCATTCACTTGCTGGAAGTCTCTTACCCGCTTCAATAGTCGATTTGCTACTCTTGGAGTCCCTCTAGAACGTTTAGCAAGTTCAATGGCACTTTCTTCATCAATACCTGTGCCTAAAACCTCAGCTGTTCTAATAATGATTTCTTTTAAATCTGATTCATTATAATATTCTAATCTTAAGTGCACACCAAATCGATCCCTTAGTGGACCTGTTAAGCTGCCAGCTCGCGTTGTTGCACCTACCAAAGTGAATGGAGGTAAGTCGATACGGATACTTCTAGCCTCATCGCCTTTACCAATGATAATATCTAAAAAGAAATCTTCCATTGCAGGGTATAACACTTCTTCAACAACACTACTCAGTCTGTGTATTTCATCAATAAACAATACATCTCCAGGTTGAAGTCCTGATAAAATTGCAGCCAAATCACCAGGTCTTTCTAATGAAGGCCCTGATACTGTACGTATATTAACTTCCATTTCATTGGCAATGATATTAGATAATGTTGTCTTACCTAATCCAGGGGGGCCAAAAAGCAATACATGATCTAATGGTTCATGACGAAGTTTAGCCGCTTTAATAAATACTTCTAAATTACTTTTTATTGAATTTTGACCAATATATTGTCGTAATCTCGTAGGTCTAAGCGACAATTCGAAATCAGTTTCTTCACTATGCATTGATTGATCAACCATACGCTCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP029673|1714164:1723207|1714164_1714683_-|WP_000364542.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_CP029673|1714164:1723207|1717180_1719460_-|WP_000749795.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_CP029673|1714164:1723207|1721175_1722201_-|WP_001019178.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP029673|1714164:1723207|1720013_1721153_-|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP029673|1714164:1723207|1714704_1716978_-|WP_000595011.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDVNHDALQLSDMTKAIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NZ_CP029673|1714164:1723207|1719734_1719995_-|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP029673|1714164:1723207|1722202_1723207_-|WP_001005768.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERG |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1853349 : 1915558
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP029673|1853349:1915558|DBSCAN-SWA 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59 | Staphylococcus_phage(95.65%) | protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2009302 : 2103835
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP029673|2009302:2103835|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP029673|2009302:2103835|2057800_2061583_-|WP_070813582.1|DBSCAN-SWA MIHVLDFNDKIIDFLSTDDPSLVRAIHKRNVNDNSEMLELLISSERAEKFRERHRVIIRDSNKQWREFIINWVQDTMDGYTEIECIASYLADITTAKPYAPGKFEKKTTSEALKDVLSDTGWEVSEQTEYDGLRTTSWTSYQTRYEVLKQLCTTYKMVLDFYIELSSNTVKGRYVVLKKKNSLFKGKEIEYGKDLVGLTRKIDMSEIKTALIAVGPENDKGKRLELVVTDDEAQSQFNLPMRYIWGIYEPQSDDQNMNETRLSSLAKTELNKRKSAVMSYEITSTDLEVTYPHEIISIGDTVRVKHRDFNPPLYVEAEVIAEEYNIISENSTYTFDQPKEFKESELREEFNKRLNLIHQKLNDNISNINTIVKDVVDGELEYFERKIHKSDTPPENPVNDMLWYDTSNPDVAVLRRYWNGRWIEATPNDVEKLGGITREKALFSELNNIFINLSIQHASLLSEATELLNSEYLVDNDLKADLQASLDAVIDVYNQIKNNLESMTPETATIGRLVDTQALFLEYRKKLQDVYTDVEDVKIAISDRFKLLQSQYTDEKYKEALEIIATKFGLTVNEDLQLVGEPNVVKSAIEAARESTKEQLRDYVKTSDYKTDKDGIVERLDTAEAERTTLKGEIKDKVTLNEYRNGLEEQKQYTDDQLSDLSNNPEIKASIEQANQEAQEALKSYIDAQDDLKEKESQAYADGKISEEEQRAIQDAQAKLEEAKQNAELKARNAEKKANAYTDNKVKESTDAQRKTLTRYGSQIIQNGKEIKLRTTKEEFNASKRTLSRLLADITVNAMKGIYLRYDENGAITSHTIDKDGVKISGDKVDITANREFNVVANNINNKVGKNDIVNSLNLSNEGLDINVNRIGIKGGNANRYVQVQNDFIELGGIVQRTWKGKRSTDDIFTRLKDGHLRFRNNTAGGSLYMSHFGISTYIDGEGEDGGSSGTIQWWDKTYSDSGMNGITINSYGGVVALTSDYNRIIIDSYASANIESREAPIYLSPNTKNKPGLNRFAFTLSNADSAYETDGYIMFGSDENYKYGAGLRFSKRSNKGLVQVVNGDYATGGDTTIESGMGKFNLVKRRDGNSYVSIQSYDLLAVGSDNAGDRVASNSIYKRTYSAPANLHITSAGTIGRATSAKKYKISIENQYINEDDQFSHSKEILKLPIRTWFDKYESEIMAKELESGKKLSDDTFKLSRHTGLIAEEVEELGFNEFVIYDDNGEIEGIAYDRLWVHLIPIIKNQQSKIEKLEELINE >NZ_CP029673|2009302:2103835|2070315_2070600_-|WP_000150936.1|head,tail|DBSCAN-SWA MTIDDLLVKFKSLEKIDHNSEDEYLKQLLKMSYERIKNQCGVFELENLIGQELILIRARYAYQDLLEHFNDNYRPEIIDFSLSLMEVSEDEESV >NZ_CP029673|2009302:2103835|2079603_2080008_-|WP_000401969.1|DBSCAN-SWA MEIEIKFNEVFNAPMGSPRPRFRNTGRFVQTYMPTSYTKHKAYIQGQMPKLNLERALKIELDFYFPLLKSWSKKKKSEMVGQYKVTKPDIDNLIKTVLDACNGHVWKDDNQITEITSSKRYGIEPKIIIRIEEI >NZ_CP029673|2009302:2103835|2078457_2078703_-|WP_001065108.1|DBSCAN-SWA MNNREQIEQSVISASAYNGNDTEGLLKEIEDVYKKARAFDEILDGMTNAIQHSVKEGIELDEAVGIMAGQVIYKYEEEQGK >NZ_CP029673|2009302:2103835|2076649_2077066_-|WP_000590122.1|DBSCAN-SWA MIKIEKHDIKKLEEYIQHIDNYRRELKMREYELLESHEPDNAGAGKSNLPGNPIERCAIKKFSDNRYNTLRNIVNGVDRLIDESDEDTLELLRFRYWDCPIGCYEWEDIAHYFGTSKTSILRRRNALIDKLAKYIGYV >NZ_CP029673|2009302:2103835|2068253_2068478_-|WP_071621395.1|DBSCAN-SWA MPDSIKTLKVGDTYDLNVVVEPSNQSKLLKYTTDQTNIVSINSDGQVTAEAQGIATVKATVGNMSDTITINVEA >NZ_CP029673|2009302:2103835|2009302_2009605_-|WP_000170162.1|tRNA|DBSCAN-SWA MTKVTREEVEHIANLARLQISPEETEEMANTLESILDFAKQNDSADTEGVEPTYHVLDLQNVLREDKAIKGIPQELALKNAKETEDGQFKVPTIMNEEDA >NZ_CP029673|2009302:2103835|2067853_2068204_-|WP_001096355.1|DBSCAN-SWA MAKLKRNIIQLVEDPKANEIKLQTYLTPHFISFEIVYEAMDLIDDIEDENSTMKPREIADRLMDMVVKIYDNQFTVKDLKERMHAPDGMNALREQVIFITQGQQTEETRNFIQNMK >NZ_CP029673|2009302:2103835|2089006_2089720_+|WP_001031454.1|DBSCAN-SWA MNKERNIIIAKNIRKFLNDSNMSQKKLAELINIKPSTLSDYLNLRSNPSHGVIQRIADVFEVGKSDIDTTYKDDNDITSIYNKLTPPRQENVLNYANEQLEEQNSKGDNVVDINSYKQEKTPVNVNGCVSAGVGERLHDETLFTEMVKGPIPTHDLALKVNGDSMEPMFKDGEIIFVEKTHNIKNGQIGIFIIEEEAYVKKVFVEDDRLTLVSLNKDYDDLHFYRNESVRLIGKVIL >NZ_CP029673|2009302:2103835|2086141_2086303_-|WP_000048129.1|DBSCAN-SWA MSKTYKSYLVAVLCFTVLAIVLMPFLYFTTAWSIAGFASIATFIFYKEYFYEE >NZ_CP029673|2009302:2103835|2078717_2078966_-|WP_000178985.1|DBSCAN-SWA MTMTYNARKEHLNQFFGSKRYLYQDNERVAHIHVVNGTYYFHGHIVPGWQSVKKTFDTAEELEIYIKQHGLEYEEQKQLTLF >NZ_CP029673|2009302:2103835|2047648_2049079_-|WP_001557458.1|DBSCAN-SWA MKFKSLITTTLALGVIASTGANFNTNEASAAAKPLDKSSSTLHHGHSNIQIPYTITVNGTSQNILSSLTFNKNQNISYKDIENKVKSVLYFNRGISDIDLRLSKQAEYTVHFKNGTKRVIDLKSGIYTADLINTSDIKAISVNVDTKKQPKDKAKANVQVPYTITVNGTSQNILSNLTFNKNQNISYKDLEGKVKSVLESNRGITDVDLRLSKQAKYTVNFKNGTKKVIDLKSGIYTANLINSSDIKSININVDTKKHIENKAKRNYQVPYSINLNGTSTNILSNLSFSNKPWTNYKNLTSQIKSVLKHDRGISEQDLKYAKKAYYTVYFKNGGKRILQLNSKNYTANLVHAKDVKRIEITVKTGTKAKADRYVPYTIAVNGTSTPILSKLKISNKQLISYKYLNDKVKSVLKSERGISDLDLKFAKQAKYTVYFKNGKKQVVNLKSDIFTPNLFSAKDIKKIDIDVKQYTKSKKK >NZ_CP029673|2009302:2103835|2050533_2050794_+|WP_001791826.1|DBSCAN-SWA MCIVIYLIYSLIVYFICIINFFIMAAPFLMTNADYVWTPMTTVTLFILSLIIFLIFIKTKDVVHLTIFILNLLFSILYCLPILFYL |
112 | Staphylococcus_phage(86.67%) | tRNA,integrase,head,tail,capsid,protease,portal,holin,terminase | attL 2005739:2005763|attR 2106121:2106145 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP029673.1|WP_000681968.1|2045061_2045238_-|hypothetical-protein |
2045061_2045238_-
Protein sequences of NZ_CP029673.1|WP_000681968.1|2045061_2045238_-|hypothetical-protein>NZ_CP029673.1|WP_000681968.1|2045061_2045238_-|hypothetical-protein MKHLTKIFVVLAIILFIIGYYLQATNHESQGIKLLLAAIMFMICAFISRSNDRRKNSK |
58 aa aa | NA | NA | NA | 2009302-2103835 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.2|828702|23|NZ_CP029673|CRT matches to NZ_CP029673 position: 2098952-2098974, mismatch: 2 tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgttgaaattgggaatccaat Protospacer ***** ********.******** 2. spacer 3.4|828819|23|NZ_CP029673|CRT matches to NZ_CP029673 position: 2098952-2098974, mismatch: 2 tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgttgaaattgggaatccaat Protospacer ***** ********.******** |
|||||||||||||||||||||
NZ_CP029673.1|WP_000990056.1|2045480_2045579_-|hypothetical-protein |
2045480_2045579_-
Protein sequences of NZ_CP029673.1|WP_000990056.1|2045480_2045579_-|hypothetical-protein>NZ_CP029673.1|WP_000990056.1|2045480_2045579_-|hypothetical-protein MMWWQEGMMTLITGGLLIIFRLWLELKWKNKK |
32 aa aa | NA | NA | NA | 2009302-2103835 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.2|828702|23|NZ_CP029673|CRT matches to NZ_CP029673 position: 2098952-2098974, mismatch: 2 tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgttgaaattgggaatccaat Protospacer ***** ********.******** 2. spacer 3.4|828819|23|NZ_CP029673|CRT matches to NZ_CP029673 position: 2098952-2098974, mismatch: 2 tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgttgaaattgggaatccaat Protospacer ***** ********.******** |