CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP029725	Proteus mirabilis strain AR_0029 chromosome, complete genome	2 crisprs	csa3,cas3,c2c9_V-U4,DEDDh,RT,DinG,PD-DExK,WYL	0	0	8	0
NZ_CP029726	Proteus mirabilis strain AR_0029 plasmid unnamed, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0

1. NZ_CP029725

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP029725_1

• CRISPR_ID: NZ_CP029725_1
• CRISPR_location: 202372-202514
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 2 spacers

Consensus repeat of NZ_CP029725_1

Consensus_repeat	Method
CCACCTGTAAAATTGATATCACC	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP029725_1

>1.1|202395|37|NZ_CP029725|CRISPRCasFinder
ATAATTAGAGTTATGTTTTATTACATTTGCTATGCCG
>1.2|202455|37|NZ_CP029725|CRISPRCasFinder
TTGTGTAACATCAGATTTAATGACATTACCAGCGCCA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029725_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP029725_1

>merge|NZ_CP029725|1|202372-202514|CRISPRCasFinder
CCACCAGTAAAGTTGGTATTACCATAATTAGAGTTATGTTTTATTACATTTGCTATGCCGCCACCTGTAAAATTGATATCACCTTGTGTAACATCAGATTTAATGACATTACCAGCGCCACCACCTGTGAAATTGATATCACC

>NZ_CP029725|1|1|202372-202514|CRISPRCasFinder
CCACCAGTAAAGTTGGTATTACC	ATAATTAGAGTTATGTTTTATTACATTTGCTATGCCG
CCACCTGTAAAATTGATATCACC	TTGTGTAACATCAGATTTAATGACATTACCAGCGCCA
CCACCTGTGAAATTGATATCACC

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP029725.1|WP_004244066.1|208017_208389_+|YacL-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|235372
NZ_CP029725.1|WP_004250354.1|177242_177995_-|cell-division-protein-ZapD	unknown	unknown	gnl|CDD|235389
NZ_CP029725.1|WP_004244067.1|205249_207847_+|bifunctional-aconitate-hydratase-2/2-methylisocitrate-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|236424
NZ_CP029725.1|WP_004244058.1|214133_214790_+|ribose-5-phosphate-isomerase-RpiA	unknown	unknown	gnl|CDD|234816
NZ_CP029725.1|WP_049203012.1|180085_181189_-|Flp-pilus-assembly-complex-ATPase-component-TadA	unknown	unknown	gnl|CDD|236694
NZ_CP029725.1|WP_036905137.1|204201_204429_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP029725.1|WP_104459312.1|211180_211900_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP029725.1|WP_064506049.1|211896_212871_+|nucleotidyl-transferase-AbiEii/AbiGii-toxin-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378065
NZ_CP029725.1|WP_012368224.1|208480_209341_+|small-conductance-mechanosensitive-channel-MscS	unknown	unknown	gnl|CDD|182386
NZ_CP029725.1|WP_004244091.1|176974_177190_-|DNA-gyrase-inhibitor-YacG	unknown	unknown	gnl|CDD|234754
NZ_CP029725.1|WP_060558294.1|186423_188295_+|pyruvate-dehydrogenase-complex-dihydrolipoyllysine-residue-acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|236999
NZ_CP029725.1|WP_110706929.1|182810_183581_+|pyruvate-dehydrogenase-complex-transcriptional-repressor-PdhR	unknown	unknown	gnl|CDD|181879
NZ_CP029725.1|WP_060555638.1|181941_182484_+|1,6-anhydro-N-acetylmuramyl-L-alanine-amidase-AmpD	unknown	unknown	gnl|CDD|236984
NZ_CP029725.1|WP_104459310.1|209508_210132_+|arginine-exporter-ArgO	unknown	unknown	gnl|CDD|236463
NZ_CP029725.1|WP_004244080.1|183744_186411_+|pyruvate-dehydrogenase-(acetyl-transferring),-homodimeric-type	unknown	unknown	gnl|CDD|236500
NZ_CP029725.1|WP_004244077.1|188496_189924_+|dihydrolipoyl-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|180579
NZ_CP029725.1|WP_104459311.1|210222_210957_+|oxidative-stress-defense-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|236840
NZ_CP029725.1|WP_049203011.1|181287_181731_-|prepilin-peptidase-dependent-pilin	unknown	unknown	gnl|CDD|236718
NZ_CP029725.1|WP_060555640.1|177997_178612_-|dephospho-CoA-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|234620
NZ_CP029725.1|WP_004244059.1|213073_213973_-|LysR-family-transcriptional-regulator-ArgP	unknown	unknown	gnl|CDD|235144

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP029725.1|WP_004244066.1|208017_208389_+|YacL-family-protein	gnl|CDD|235372	PRK05248, PRK05248, hypothetical protein; Provisional.	9.00597e-61
NZ_CP029725.1|WP_004250354.1|177242_177995_-|cell-division-protein-ZapD	gnl|CDD|235389	PRK05287, PRK05287, cell division protein ZapD.	1.19728e-117
NZ_CP029725.1|WP_004244067.1|205249_207847_+|bifunctional-aconitate-hydratase-2/2-methylisocitrate-dehydratase	gnl|CDD|236424	PRK09238, PRK09238, bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase; Validated.	0
NZ_CP029725.1|WP_104459310.1|209508_210132_+|arginine-exporter-ArgO	gnl|CDD|236463	PRK09304, PRK09304, arginine exporter ArgO.	5.53506e-119
NZ_CP029725.1|WP_049203012.1|180085_181189_-|Flp-pilus-assembly-complex-ATPase-component-TadA	gnl|CDD|236694	PRK10436, PRK10436, hypothetical protein; Provisional.	1.61652e-179
NZ_CP029725.1|WP_004244058.1|214133_214790_+|ribose-5-phosphate-isomerase-RpiA	gnl|CDD|234816	PRK00702, PRK00702, ribose-5-phosphate isomerase RpiA.	5.44811e-141
NZ_CP029725.1|WP_064506049.1|211896_212871_+|nucleotidyl-transferase-AbiEii/AbiGii-toxin-family-protein	gnl|CDD|378065	pfam08843, AbiEii, Nucleotidyl transferase AbiEii toxin, Type IV TA system. This family was recently identified as belonging to the nucleotidyltransferase superfamily. AbiEii is the cognate toxin of the type IV toxin-antitoxin 'innate immunity' bacterial abortive infection (Abi) system that protects bacteria from the spread of a phage infection. The Abi system is activated upon infection with phage to abort the cell thus preventing the spread of phage through viral replication. There are some 20 or more Abis, and they are predominantly plasmid-encoded lactococcal systems. TA, toxin-antitoxin, systems on plasmids function by killing cells that lose the plasmid upon division. AbiE phage resistance systems function as novel Type IV TAs and are widespread in bacteria and archaea. The cognate antitoxin is pfam13338.	1.77496e-24
NZ_CP029725.1|WP_012368224.1|208480_209341_+|small-conductance-mechanosensitive-channel-MscS	gnl|CDD|182386	PRK10334, PRK10334, small-conductance mechanosensitive channel MscS.	3.21493e-120
NZ_CP029725.1|WP_004244091.1|176974_177190_-|DNA-gyrase-inhibitor-YacG	gnl|CDD|234754	PRK00418, PRK00418, DNA gyrase inhibitor YacG.	3.56265e-30
NZ_CP029725.1|WP_060558294.1|186423_188295_+|pyruvate-dehydrogenase-complex-dihydrolipoyllysine-residue-acetyltransferase	gnl|CDD|236999	PRK11854, aceF, pyruvate dehydrogenase dihydrolipoyltransacetylase; Validated.	0
NZ_CP029725.1|WP_110706929.1|182810_183581_+|pyruvate-dehydrogenase-complex-transcriptional-repressor-PdhR	gnl|CDD|181879	PRK09464, pdhR, pyruvate dehydrogenase complex transcriptional repressor PdhR.	8.44249e-168
NZ_CP029725.1|WP_060555638.1|181941_182484_+|1,6-anhydro-N-acetylmuramyl-L-alanine-amidase-AmpD	gnl|CDD|236984	PRK11789, PRK11789, 1,6-anhydro-N-acetylmuramyl-L-alanine amidase AmpD.	2.03006e-131
NZ_CP029725.1|WP_004244080.1|183744_186411_+|pyruvate-dehydrogenase-(acetyl-transferring),-homodimeric-type	gnl|CDD|236500	PRK09405, aceE, pyruvate dehydrogenase subunit E1; Reviewed.	0
NZ_CP029725.1|WP_004244077.1|188496_189924_+|dihydrolipoyl-dehydrogenase	gnl|CDD|180579	PRK06467, PRK06467, dihydrolipoamide dehydrogenase; Reviewed.	0
NZ_CP029725.1|WP_104459311.1|210222_210957_+|oxidative-stress-defense-protein	gnl|CDD|236840	PRK11087, PRK11087, oxidative stress defense protein; Provisional.	3.45973e-114
NZ_CP029725.1|WP_049203011.1|181287_181731_-|prepilin-peptidase-dependent-pilin	gnl|CDD|236718	PRK10574, PRK10574, putative major pilin subunit; Provisional.	1.09342e-54
NZ_CP029725.1|WP_060555640.1|177997_178612_-|dephospho-CoA-kinase	gnl|CDD|234620	PRK00081, coaE, dephospho-CoA kinase; Reviewed.	7.63102e-90
NZ_CP029725.1|WP_004244059.1|213073_213973_-|LysR-family-transcriptional-regulator-ArgP	gnl|CDD|235144	PRK03635, PRK03635, ArgP/LysG family DNA-binding transcriptional regulator.	1.29397e-161

Protein sequences

>NZ_CP029725.1|WP_004244077.1|188496_189924_+|dihydrolipoyl-dehydrogenase
MSTEIKAQVVVLGAGPAGYSAAFRCADLGLDTVLVERHSTLGGVCLNVGCIPSKALLHVAKVIEEAKALSEHGVVFDAPKTDIDKIRIWKDKVISQLTGGLAGMAKGRKVNVVNGEARFTGSHTLSVEGSEGTTTITFENAIVAAGSRPIELPFIPHEDPRVWDSTDALQLKTVPERLLVMGGGIIGLEMGTVYHALGSQIDVVEMFDQVIPAADKDVVKVFTKRISKKFNLMLETKVTAVEAKEDGIYVTMEGKKAPAEPQRYDAVLVAIGRVPNGKLLDAGKAGIEVDDRGFIHVDKQMRTNVPHIFAIGDIVGQPMLAHKGVHEGHVAAEVISGKKHYFDPKVIPSIAYTEPEVAWVGMTEKEAKEKGVSYEVATFPWAASGRAIASDCADGMTKLIFDKETNRVIGGAIVGSNGGELLGEIGLAIEMGCDAEDIALTIHAHPTLYESIGMAAEVFEGSITDLPNPKAKKKK
>NZ_CP029725.1|WP_060558294.1|186423_188295_+|pyruvate-dehydrogenase-complex-dihydrolipoyllysine-residue-acetyltransferase
MSIEIKVPDIGADEVEVTEVMVKVGDRIEEEQSLITVEGDKASMEVPSPQAGIVKEIKIAVGDKVETGSLIMIFDTEEGAQAPAQEAAPAPSAAAPAASELKEVHVPDIGGDEVEVTEVMVNVGDTISEEQSLITVEGDKASMEVPAPFAGVVKEIKIAVGDKVSTGSLIMVFEVAGSAPAPSASAPAPAASAPAASAIKDVNVPDIGGDEVEVTEVMVKVGDTIAEEQSLITVEGDKASMEVPAPFAGVVKEIKIAVGDKVKTGSLIMTFEVAGAAPAAQAPAAPAASTSAAPAPSAPAKAPASAPAAKEEFVENEAYVHATPVIRRLAREFGVNLAKVKGTGRKGRILREDVQSYVKELIKRAESAPANAGGGLPGMLPWPKVDFSKFGEIEEVELGRIQKISGANLSRNWVVIPHVNLFDEADITEVEEFRKQQNKEAEKKKLDVKITPLVFVMKAAAKALADMPRFNSSISEDGQKLILKKYINIGIAVDTPNGLVVPVFKDVNKKGILELSYELAEVSKKARAGKLTASDMQGGCFTISSLGGIGTTGFAPIVNAPEVAIMGLSRSSMKPVWNGKEFVPRLMLPMSLSFDHRVIDGADGARFITLINQYMSDLRRLVM
>NZ_CP029725.1|WP_004244080.1|183744_186411_+|pyruvate-dehydrogenase-(acetyl-transferring),-homodimeric-type
MSDMLKNDVDPIETRDWLQAIDSVIREEGVERAQFLIDQVLKQARNGGLDIALGGSVHSDYINTIPVEDEPAYPGNLELERRIRSAIRWNAVMMVLRASKKDLELGGHMASYQSSATLYEVCFNHFFRAHNDNDGGDLVYFQGHISPGIYARAFLEGRLTEEQLNNFRQEIGGKGLSSYPHPKLMPEFWQFPTVSMGLGPLSAIYQAKFLKYLDHRGLKDTTKQRVYAFLGDGEMDEPESKGAITIAVREKLDNLCFVVNCNLQRLDGPVTGNGKIVNELEGIFAGAGWNVIKVMWGDRWDALLRKDTSGKLIQLMNETLDGDYQTFKSRDGAYVREHFFNRYPETAALVKDMTDDEIWALNRGGHDPKKVFAAFQKAKETKDKPTVILAQTIKGYGMGETAEGKNIAHQVKKMNMDGVKHFRDRFNIPVSDEKVAELPYITFDKDSEEYKYLHARRQELEGYLPARRTRFDEKLEIPTLEDFSQLLEEQSKEISTTIAFVRALNVMLKNKSIKDRLVPIIADEARTFGMEGLFRQIGIYSPNGQQYTPQDREQVAYYKEDVKGQILQEGINELGAGASWLAAATSYSTNNLPMIPFYIYYSMFGFQRIGDLCWAAGDQQARGFLIGGTSGRTTLNGEGLQHEDGHSHIQSLTIPNCISYDPAFAYEVAVIMQDGLERMYGDKQENVYYYITTLNENYHMPAMPAGAEEGIRKGIYKLESLEGAKGKVQLLGSGSILRHVREAAQILSTEYGIGSDVYSVTSFTELARDGQDCERWNMLHPSEEPRVPYIAQIMNDAPAVASTDYMKLFAEQVRTYVPADDYRVLGTDGFGRSDSRENLRHHFEVDTSYVIVAALGELAKRGEIDVKVVEEAIKKYNINPEKVNPRLA
>NZ_CP029725.1|WP_110706929.1|182810_183581_+|pyruvate-dehydrogenase-complex-transcriptional-repressor-PdhR
MAYTKIRQPKLSDVIEQQLEHLILEGTLRPGEKLLPERELAKQFDVSRPSLREAIQKLEAKGFLLRRQGGGTFVQDNLWQSFSDPLAQLLSGHPESQFDLLETRHALEGIAAYYAALRGTDDDLERIKASHARIIDAHDKGDIAAESDAVLQYQLIVTEAAHNVVLLHLLRCMVPMLEQNIRQNFEFLYIRKEMLTAVSEHRTQIYQAIINREPEAAREASHRHLAFIEDVLLDMSREHTRRERSLRRLQQHPDLF
>NZ_CP029725.1|WP_060555638.1|181941_182484_+|1,6-anhydro-N-acetylmuramyl-L-alanine-amidase-AmpD
MEIKQGWLTGVKHVPSPNYDNRPEGEIPSLLIIHNISLPPGQFGGPYIDQLFTNTLAVDDHPFFNEIAHLRVSAHCLIRRDGEIVQYVPFTARAWHAGVSFYKGREKCNDFSIGIELEGTDECDFTLQQYQQLSTLTQQLIEHYPGIKENITGHSDVAPGRKTDPGPHFNWSYYRALLAK
>NZ_CP029725.1|WP_049203011.1|181287_181731_-|prepilin-peptidase-dependent-pilin
MNTLNYHSTENGFTLMELMIVIAIISILSSVALPAYHGYIQKAALTDVLQTLSPYRSAVELCHYEHQYNQCHADASFMPQQFRSRYLTDIHVANGVISAKGKAQLEGLTIVMTPAANSKETLPQWQINCTSTNTALQTLCHKVFKSH
>NZ_CP029725.1|WP_049203012.1|180085_181189_-|Flp-pilus-assembly-complex-ATPase-component-TadA
MNNTIHTATEFIEQLLRHSLAQRVSDLHLEPQQNSLRIRARIDNHLVLFSPPDNQLANEILTRLKILANINIAEKRLPQDGQFNWSYQKNNYSIRVATLPTLYGEKIVLRLMNNLQQPQLAQLGFQTIHLTLLKKYLTQPQGMILVTGPTGSGKTLTLYSCLQYLNKDNRNINSIEDPIELPLHGINQTQITEKAGITFATILRALLRQDPDVIMIGEIRDQQTAEIAIKAAQTGHLVLSTLHTNSTQATLARLANLGIAKDLIDSCVKLIISQRLVRCLCSDCKYQSPEQKNFIINNQQIILPNWQATGCQFCYSGYKGRTAIYDCFELAKQSLPSPYALFNSGIELIKKGITSLDEVYQVVGDIE
>NZ_CP029725.1|WP_060555640.1|177997_178612_-|dephospho-CoA-kinase
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>NZ_CP029725.1|WP_004250354.1|177242_177995_-|cell-division-protein-ZapD
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>NZ_CP029725.1|WP_004244091.1|176974_177190_-|DNA-gyrase-inhibitor-YacG
MSEKLIVKCPTCRTEVIWDESSPYRPFCCKRCQLIDLGEWAAEEKRIPSQSESNDSDEWSEMPEQDPKPFN
>NZ_CP029725.1|WP_036905137.1|204201_204429_-|hypothetical-protein
MIHIPASGFIYMASIIKSMLENPCINKEFEKLIAADLLPILQNETNMTENFTALHLIKKTNNRRIILYKNLFIIN
>NZ_CP029725.1|WP_004244067.1|205249_207847_+|bifunctional-aconitate-hydratase-2/2-methylisocitrate-dehydratase
MLEEYRKHVAERAAEGVVPKPLDATQTAALVELLKSPPKGEEEFLLDLIVNRVPPGVDEAAYVKAGFLTALAKGETTSPLITPEKAVELLGTMQGGYNIHALIEALDNDKLAPIAAKALSHTLLMFDSFYDVEEKAKAGNVYAKQIMQSWADGEWFTERPELAEKITVTVFKVTGETNTDDLSPAPDAWSRPDIPLHALAMLKNAREGIEPDQPGSVGPIKQIEALNKKGFPLAYVGDVVGTGSSRKSATNSVLWFMGDDIPYVPNKRGGGVVLGGKIAPIFFNTMEDAGALPIEVDVSKLNMGDVIDIYPYKGEIRNHETNELLETFALKTEVLIDEVRAGGRIPLIIGRGLTSKARSALGLPPSTLFRHAKAVEQSDRGFSLAQKMVGRACGRDGIRPGEYCEPKMTSVGSQDTTGPMTRDELKDLACLGFSADLVMQSFCHTAAYPKPVDVTTHHTLPDFIMNRGGVSLRPGDGIIHSWLNRMLLPDTVGTGGDSHTRFPIGISFPAGSGLVAFAAATGVMPLDMPESVLVRFKGKMQPGVTLRDLVHAIPLYAIKEGLLTVEKKGKKNIFSGRILEIEGLPELKVEQAFELADASAERSAAGCTIKLDKAPIIEYLQSNIVLLKWMIAEGYGDRRTLERRITAMENWLADPQLLEADADAEYAAVIEIDLNEIKEPILCAPNDPDDARLLSEVANSKIDEVFIGSCMTNIGHFRAAGKLLDQHKGQLPTRLWVAPPTKMDAAQLTEEGYYSVFGKSGARIEVPGCSLCMGNQARVADGATVVSTSTRNFPNRLGTGANVYLASAELAAVASLLGRLPEPQEYLDFINKVDETAEDTYRYLNFDQLEQYTDKATQVIFQTTV
>NZ_CP029725.1|WP_004244066.1|208017_208389_+|YacL-family-protein
MDYEFQRDLTGGILARFSMDHEAIGYWLNDEIQGDISLIDQILTEMDEVKGSEKQWQLIGKEYSLSIDDEEIMVRANTLHFETDDLEEGMSYYDNESIAFCGLDDFATMLQKYRLFILENRRS
>NZ_CP029725.1|WP_012368224.1|208480_209341_+|small-conductance-mechanosensitive-channel-MscS
MNELPASLDEATGWFVANQELFIQYAVNIVAAFLILFIGLFVAKMVSKGVARILTLRHIDATVVTFLSVLVRYTVIAFTLIAVLGRLGVQTASVIAVLGAAGLAVGLALQGSLSNFAAGVLIVIFRPIRAGEYVMIGAVEGTVRDVQIFSTTLRSADDRIIVIPNSKIISSEVINLSREPNRRTQIIVGVAYDADIDKVKQVLGDVVAQDKRIQHNQGVTIRLHEMAPSSLNFVVRVWTTNDDAWPVYWDLMENFKRALDANNIGIPFPQMDVYMHQAQNTVMKAE
>NZ_CP029725.1|WP_104459310.1|209508_210132_+|arginine-exporter-ArgO
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>NZ_CP029725.1|WP_104459311.1|210222_210957_+|oxidative-stress-defense-protein
MKVKEMVLASMLALGAPSIALAGAVPEGPHITTSGNATIKATPDMATLNIQVSEKAKDAAQAKKQVDERVAKYFAFLKENGVTKEDIDAANIRTQPNYEYDKKAERSVINGYTATRTVDVKIKKLDQLNTLLDGALAAGLNEINNVEFGVNDPEQYKAKAREVAIKNAIQQASSVAKGFGADLGAVYSVSYRAPEATPYPIARMKMDAMALSAPSPEAVKETYQQQSIEFKDYVDVVFELKTAK
>NZ_CP029725.1|WP_104459312.1|211180_211900_+|hypothetical-protein
MKIKPLVEKEINRFEFGKIFTYRDLTPYLSNPETTVKAVSRLVKNGDIKRFAKGQFYRPKKGIFGEMQLSDAEKLKTFMYQNGKRKGYITGMGLYNRLGLTTQIPKTITIASDKSPQRKDFGTVEVKLVKAKVPVSESNREYLEILDVLSNIKKIPDSNPSEVMKVIAKKLKNIKKDGLYELINLASFYSPVTRALLGLLIENININLALELKKQLNPTTHYRIGLDSYWDNAEEWNIE
>NZ_CP029725.1|WP_064506049.1|211896_212871_+|nucleotidyl-transferase-AbiEii/AbiGii-toxin-family-protein
MNLHNNPDVFLELINRTAEYFKIPEVYVEKDYWVTHVLLQLSLSEFRNDFIFKGGTALSKVFGLIKRFSEDVDLAMFNNRGLSSNQIKKCMKVAEETIATGLTYIQKPDESKGSQFRKVYYKFPRIVSGEFGHASDVILLETNSFTSPEPFSFMPTESLIAEFIKKAQIEGGNEIITHYGLEKFEVNVLDIKRTVAEKILGLVRASSEADPKQALADKIRHIYDLCMIKRNKHYSQFFDSDSLWKMMDIVIQADRDQFREAGQWLDQPLHKSVLFSKSSEIWESIRGIFHGEFSELVYDSDLPSDDEVFSLLSSVASLLQKWSD
>NZ_CP029725.1|WP_004244059.1|213073_213973_-|LysR-family-transcriptional-regulator-ArgP
MKRPDYRALQALDAVIRERGFERAAQKLCITQSAVSQRIKQLENLFGQPLLVRTVPPQPTEQGQKLLALLHQVEMLEEQWLGDENSGSTPLLLSLAVNADSLATWLLPALHPVLTQLPIRLNIQVEDETRTQERLRRGEVVGAISIQPQALPSCLVDQLGALDYLFVASPDFAQRYFANGVTKSSLLKAPAVAFDHLDDMHQAFLQQNFGLSPGSVPCHIVNSSEAFVQLAKQGSTCCMIPHLQIADELKSGELIDLTPGLCQRRMLYWHRFAPESRTMRKVTDALLDYGRKVLKQDEE
>NZ_CP029725.1|WP_004244058.1|214133_214790_+|ribose-5-phosphate-isomerase-RpiA
MTQDELKKAVGWAALEYVKPGTIVGVGTGSTASHFIDALATMKGQIEGAVSSSEASTAKLKSYGIPVFDCNEVDSLDIYVDGADEINHQMQMIKGGGAALTREKIIAAVAKTFVCIVDESKQVDVLGKFPLPVEVIPMARSYVARELVKLGGLPEYRENVVTDNGNVILDVYNLTILNPIELENKINSIAGVVTVGLFANRGADIVLMGTSEGVKTIK

Crispr_ID: NZ_CP029725_2

• CRISPR_ID: NZ_CP029725_2
• CRISPR_location: 2931684-2931779
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP029725_2

Consensus_repeat	Method
TTAGCACTTATTTTTCTAAGCTAT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP029725_2

>2.1|2931708|48|NZ_CP029725|CRISPRCasFinder
CTATTTCAAGATAATAAACTTATATTCTGTTTTATCTTTTAAAATATA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029725_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP029725_2

>merge|NZ_CP029725|2|2931684-2931779|CRISPRCasFinder
TTAGCACTTATTTTTCTAAGCTATCTATTTCAAGATAATAAACTTATATTCTGTTTTATCTTTTAAAATATATTAGTACTTATTTTTCTAAGCTAT

>NZ_CP029725|2|2|2931684-2931779|CRISPRCasFinder
TTAGCACTTATTTTTCTAAGCTAT	CTATTTCAAGATAATAAACTTATATTCTGTTTTATCTTTTAAAATATA
TTAGTACTTATTTTTCTAAGCTAT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP029725.1|WP_004246352.1|2922281_2923373_-|UDP-N-acetylglucosamine--undecaprenyl-phosphate-N-acetylglucosaminephosphotransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|237913
NZ_CP029725.1|WP_004246370.1|2943029_2943368_-|DUF413-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|236825
NZ_CP029725.1|WP_004246357.1|2927336_2928845_+|guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate-diphosphatase	unknown	unknown	gnl|CDD|236826
NZ_CP029725.1|WP_004249676.1|2935989_2937840_-|dihydroxy-acid-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|237104
NZ_CP029725.1|WP_004246360.1|2931362_2931632_+|type-II-toxin-antitoxin-system-mRNA-interferase-toxin,-RelE/StbE-family	unknown	unknown	gnl|CDD|379750
NZ_CP029725.1|WP_004246349.1|2919938_2921069_-|UDP-N-acetylglucosamine-2-epimerase-(non-hydrolyzing)	unknown	unknown	gnl|CDD|223458
NZ_CP029725.1|WP_004246355.1|2925588_2925915_-|thioredoxin-TrxA	unknown	unknown	gnl|CDD|181812
NZ_CP029725.1|WP_004246366.1|2938849_2939128_-|acetolactate-synthase-2-small-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|236862
NZ_CP029725.1|WP_036920151.1|2941449_2942982_+|YifB-family-Mg-chelatase-like-AAA-ATPase	unknown	unknown	gnl|CDD|182120
NZ_CP029725.1|WP_012368696.1|2931890_2933366_-|ketol-acid-reductoisomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|235368
NZ_CP029725.1|WP_004249672.1|2926034_2927333_+|ATP-dependent-RNA-helicase-RhlB	unknown	unknown	gnl|CDD|235314
NZ_CP029725.1|WP_004246362.1|2933538_2934426_+|HTH-type-transcriptional-activator-IlvY	unknown	unknown	gnl|CDD|236961
NZ_CP029725.1|WP_004249673.1|2928919_2930941_-|DNA-helicase-Rep	unknown	unknown	gnl|CDD|182838
NZ_CP029725.1|WP_004249670.1|2921199_2922258_-|ECA-polysaccharide-chain-length-modulation-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|236943
NZ_CP029725.1|WP_110706812.1|2934411_2935986_-|threonine-ammonia-lyase,-biosynthetic	unknown	unknown	gnl|CDD|236417
NZ_CP029725.1|WP_004246354.1|2923767_2925027_-|transcription-termination-factor-Rho	unknown	unknown	gnl|CDD|236490
NZ_CP029725.1|WP_004246367.1|2939124_2940774_-|acetolactate-synthase-2-catalytic-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|181601
NZ_CP029725.1|WP_004246365.1|2937912_2938839_-|branched-chain-amino-acid-transaminase	unknown	unknown	gnl|CDD|235841
NZ_CP029725.1|WP_017827031.1|2940903_2941005_-|ilv-operon-leader-peptide	unknown	unknown	gnl|CDD|170429
NZ_CP029725.1|WP_004253075.1|2931113_2931362_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP029725.1|WP_004246352.1|2922281_2923373_-|UDP-N-acetylglucosamine--undecaprenyl-phosphate-N-acetylglucosaminephosphotransferase	gnl|CDD|237913	PRK15119, PRK15119, UDP-N-acetylglucosamine--undecaprenyl-phosphate N-acetylglucosaminephosphotransferase.	0
NZ_CP029725.1|WP_004246370.1|2943029_2943368_-|DUF413-domain-containing-protein	gnl|CDD|236825	PRK11027, PRK11027, hypothetical protein; Provisional.	1.02914e-69
NZ_CP029725.1|WP_004246357.1|2927336_2928845_+|guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate-diphosphatase	gnl|CDD|236826	PRK11031, PRK11031, guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase.	0
NZ_CP029725.1|WP_004249676.1|2935989_2937840_-|dihydroxy-acid-dehydratase	gnl|CDD|237104	PRK12448, PRK12448, dihydroxy-acid dehydratase; Provisional.	0
NZ_CP029725.1|WP_004246360.1|2931362_2931632_+|type-II-toxin-antitoxin-system-mRNA-interferase-toxin,-RelE/StbE-family	gnl|CDD|379750	pfam15738, YafQ_toxin, Bacterial toxin of type II toxin-antitoxin system, YafQ. YafQ is a family of bacterial toxin ribonucleases of type II toxin-antitoxin systems. The E.coli gene is expressed from the dinB operon. The cognate antitoxin for the E. coli protein is DinJ, in family RelB_antitoxin, pfam02604.	1.15858e-41
NZ_CP029725.1|WP_004246349.1|2919938_2921069_-|UDP-N-acetylglucosamine-2-epimerase-(non-hydrolyzing)	gnl|CDD|223458	COG0381, WecB, UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase [Cell envelope biogenesis, outer membrane].	0
NZ_CP029725.1|WP_004246355.1|2925588_2925915_-|thioredoxin-TrxA	gnl|CDD|181812	PRK09381, trxA, thioredoxin TrxA.	1.85797e-62
NZ_CP029725.1|WP_036920151.1|2941449_2942982_+|YifB-family-Mg-chelatase-like-AAA-ATPase	gnl|CDD|182120	PRK09862, PRK09862, ATP-dependent protease.	0
NZ_CP029725.1|WP_012368696.1|2931890_2933366_-|ketol-acid-reductoisomerase	gnl|CDD|235368	PRK05225, PRK05225, ketol-acid reductoisomerase; Validated.	0
NZ_CP029725.1|WP_004249672.1|2926034_2927333_+|ATP-dependent-RNA-helicase-RhlB	gnl|CDD|235314	PRK04837, PRK04837, ATP-dependent RNA helicase RhlB; Provisional.	0
NZ_CP029725.1|WP_004246362.1|2933538_2934426_+|HTH-type-transcriptional-activator-IlvY	gnl|CDD|236961	PRK11716, PRK11716, HTH-type transcriptional activator IlvY.	0
NZ_CP029725.1|WP_004249673.1|2928919_2930941_-|DNA-helicase-Rep	gnl|CDD|182838	PRK10919, PRK10919, ATP-dependent DNA helicase Rep; Provisional.	0
NZ_CP029725.1|WP_004249670.1|2921199_2922258_-|ECA-polysaccharide-chain-length-modulation-protein	gnl|CDD|236943	PRK11638, PRK11638, ECA polysaccharide chain length modulation protein.	0
NZ_CP029725.1|WP_110706812.1|2934411_2935986_-|threonine-ammonia-lyase,-biosynthetic	gnl|CDD|236417	PRK09224, PRK09224, threonine ammonia-lyase IlvA.	0
NZ_CP029725.1|WP_004246354.1|2923767_2925027_-|transcription-termination-factor-Rho	gnl|CDD|236490	PRK09376, rho, transcription termination factor Rho; Provisional.	0
NZ_CP029725.1|WP_004246367.1|2939124_2940774_-|acetolactate-synthase-2-catalytic-subunit	gnl|CDD|181601	PRK08978, PRK08978, acetolactate synthase 2 catalytic subunit; Reviewed.	0
NZ_CP029725.1|WP_004246366.1|2938849_2939128_-|acetolactate-synthase-2-small-subunit	gnl|CDD|236862	PRK11152, ilvM, acetolactate synthase 2 small subunit.	3.08752e-35
NZ_CP029725.1|WP_017827031.1|2940903_2941005_-|ilv-operon-leader-peptide	gnl|CDD|170429	PRK10424, PRK10424, ilv operon leader peptide.	0.00197669
NZ_CP029725.1|WP_004246365.1|2937912_2938839_-|branched-chain-amino-acid-transaminase	gnl|CDD|235841	PRK06606, PRK06606, branched-chain amino acid transaminase.	0

Protein sequences

>NZ_CP029725.1|WP_004246360.1|2931362_2931632_+|type-II-toxin-antitoxin-system-mRNA-interferase-toxin,-RelE/StbE-family
MRKVSYSGQFKKDLKLAEKRGKDINKLKEIILLLVQGKRLPAQLKDHPLTGNWKPRRDLHIEPDWLLIYKIDNDTVHFDRTGSHSDLFK
>NZ_CP029725.1|WP_004253075.1|2931113_2931362_+|hypothetical-protein
MSIKSELIATKVDIELKEAFVAIARNKHRPASQILRDLIRVYVESNQTQPNEKTLNTFAKTDKGDDVFYAEDAHDLFKKLDI
>NZ_CP029725.1|WP_004249673.1|2928919_2930941_-|DNA-helicase-Rep
MRLNPGQQKAVEYVSGPCLVLAGAGSGKTRVITNKIAYLIRQCRYSAKQIAAVTFTNKAAREMKERVAQTLGKQEAKGLMISTFHTLGLEIIKREYKALGIKSNFSLFDDQDQSALLKELTVDLLEEDKDLLSQLKSQISNWKNDMLTPEQVIGRAQSQQDHTFAECFRRYEQHLLSCNVLDFDDLISKPTLLLRTNEEVRARWQQRIRYLLVDEYQDTNTSQYELVKWLVGERARFTVVGDDDQSIYSWRGARPQNLVLLQKDFPQLNVIKLEQNYRSSGRILKSANILIENNPHVFEKRLFSELGYGDELRVLTANNEEHEAERVAGELIAHHFINKTNYKDYAILYRGNHQSRIFEKYLMQNRIPYRISGETSFFSREEIKDILAYLRVITNPDDDAAFLRIVNKPRREIGPMTIQKLGEWAKVRDKSLFNACFDLGLSQTLTGRGLSALQAFSQWMARIVQQSEREPLLAVRDLLHEMDYESWLYETSSSAKAAEMRMKNINQLFSWMSEMLEGDELHEPMTLSQVVNRFTLRDMMERGETDEELDQVQLMTLHASKGLEFPHVFLVGMEEGILPHQSSIDEDNVEEERRLAYVGITRAQKTLTFTLCKERRQYGELIRPEPSRFLYELPQDDLHWDTNKKKVLSAQEKQEKGQKGVAGLKAMLARHKP
>NZ_CP029725.1|WP_004246357.1|2927336_2928845_+|guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate-diphosphatase
MLKSSSLYAAIDLGSNSFHMLVVREIAGSIQVLSRVKRKVRLAAGLNKENELSEQAMERGWQCLRLFSEYLRDIPAEQIRVVATATLRIAKNADIFVAKASEILGNTVHVISGEEEARLIYRGVAHTTGGAEQRLVVDIGGGSTELVTGTGAKTTQLMSLSMGCVTWLERYFSDRSLTEENFAQAQQAAKAILAPVAEKLIQQGWQVCVGASGTVQALQEIMIAQGMDELITLPKLERLKQKAIECGKLEELEIEGLTFERALVFPSGLAILIAIFETLHIENMILAGGALREGLVYGMLHLPIEQDIRQRTLRNIQRRFQIDIEQAHRVQQLAEHFFIQVSKSWQLDNRCRELLSSACALHEIGLSVDFRQAPSHASYLVSHLDLPGYTPAQRRLIASFLRNQKGIIDLAPLNQQNALPINQAYRLVRLLRLAIIFASRRRDDTLPALRLRTEDEKLIITLPHQWIAEHPLRAENLHEEIQLQSYVHWPLMLEEQNNSRIG
>NZ_CP029725.1|WP_004249672.1|2926034_2927333_+|ATP-dependent-RNA-helicase-RhlB
MSKTYLTEKKFSDFALHPKVIEALEKKGFSNCTQIQALTLPITVKGHDIAGQAQTGTGKTLAFLTSTFHYLLTHPAKEGHEKNQPRALIMAPTRELAVQIYTDAQPLAQSTGIKMGLAYGGDGYDEQLKVLNNGVDIVIGTTGRLIDYVKQGHINLNAIQVVVLDEADRMYDLGFIKDIRWLFRRMPNAAERMNMLFSATLSYRVRELAFEQMNNPEYVEVEPEQKTGFSIKEELFYPSNEEKMRLLQTLIEEEWPERCIIFANTKHRCDDIWAHLAADGHRVGLLTGDVPQKKRLRILEDFTQGNIDILVATDVAARGLHIPSVTHVFNYDLPDDCEDYVHRIGRTGRAGKSGNSISLACEEYALNLPAIETYIQHAIPVSKYNSDALLTDLPEPKRRHRPRQGQPRRNNSAPRRGNNTQRNNRNKRPSHS
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>NZ_CP029725.1|WP_004246352.1|2922281_2923373_-|UDP-N-acetylglucosamine--undecaprenyl-phosphate-N-acetylglucosaminephosphotransferase
MDILKMSTNVFYVFLFSFAFLFVARKVAKKIGLVDKPNYRKRHHGLIPLVGGISVYFGIVFAFYVSDIYIPHKELYLICAGILVFIGALDDRYDISVKIRATIQALVGIAMMVFGGLKLESLGHAFGPWDMHLGPFGYIVTLFAVWAAINAFNMVDGIDGLLGGLSCVSFGALGILLYQSGSSALAFWCFSFIAAILPYIMLNLGVCGKKFKVFMGDAGSTLIGFTIIWLLISSTQVDPHPINAVTALWIIAIPLMDMVAIMYRRLRKGMSPFSPDRQHIHHLIMRAGFTPRQAFVLITLAAAVLAAIGIIGENLSFVPEWVMLALFLLAFVMYGYCIKRAWRVARFIKRYKRRLRKATQLKH
>NZ_CP029725.1|WP_004249670.1|2921199_2922258_-|ECA-polysaccharide-chain-length-modulation-protein
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>NZ_CP029725.1|WP_004246362.1|2933538_2934426_+|HTH-type-transcriptional-activator-IlvY
MDIRDLKLFLHLAESCHFTKTAQAMHVSPSTLSRQIQRLEEQLGHPLFLRDNRQVTLTDAGEQLKRYAQHTLLQYKQLKHTLNQNSPSLSGELRLFCSVTAAYSHLPPILDRFRAENPLVEIKLTTGDAADAVDKVISDEADLGIAGKPEKLPENICFEKIGEIPLVLIAPALPGNVRHLATQEKPDWLNIPFIIPEHGPSRQRIALWFKRHRIQNPLIYATVSGHEAIVSMVALGCGIALIPQVVVDNCPEPVRNRISLLDNISLVEPFELGVCGLHKRLQEPVISAFWRLLHH
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>NZ_CP029725.1|WP_004249676.1|2935989_2937840_-|dihydroxy-acid-dehydratase
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>NZ_CP029725.1|WP_004246366.1|2938849_2939128_-|acetolactate-synthase-2-small-subunit
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>NZ_CP029725.1|WP_004246370.1|2943029_2943368_-|DUF413-domain-containing-protein
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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	551458 : 570326	22	Burkholderia_phage(26.67%)	holin,lysis	NA
DBSCAN-SWA_2	1094702 : 1104694	8	Escherichia_phage(66.67%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_3	1338798 : 1407894	78	Morganella_phage(22.22%)	lysis,tail,protease,head,integrase,portal,capsid,terminase,transposase	attL 1368315:1368329|attR 1416215:1416229
DBSCAN-SWA_4	1578187 : 1657179	58	Bacillus_phage(17.65%)	protease,plate,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_5	1831853 : 1878786	69	Cronobacter_phage(19.05%)	integrase,lysis,tail	attL 1824924:1824942|attR 1878855:1878873
DBSCAN-SWA_6	1918463 : 1926997	9	Mycobacterium_phage(28.57%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_7	2096181 : 2175081	60	Sodalis_phage(25.0%)	protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_8	3764282 : 3773150	9	Caulobacter_phage(50.0%)	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP029725|551458:570326|DBSCAN-SWA
TATGAGATTAGCTGACTTACCTAAGTATTTTTCTCCAAAAAGTGTTGTATTAAGTGATGTTAGGACGCCTAAAGCTGTTGATTCATTATCCATTACGGATGTAATGGCTTCAATAAGCTTAGCGACCCGTAAAGGGCGAATGGGAATAGAGCTATTTTTAGCTAAGCACCACATTAACCGTCCCGAAGAAGCGATAGAAAGCCTGTATCAATGTGCATTAACTCAAGTTAACCAATATAAGATGATTGATAAGTTAGCTGAACATGATAAAGCTAAAGTTTTACATATTATCGCTGAATATGCTTTTCAGGATTATGCCAGAAGTGCAGCCAGCAAGAGAGCATGTCCTGATTGTGATGATGGCTTTATCGAAGTTGAAGTTTTTACCACCAAATGCCATGGTCGAAAAACAACCCTGCAGGTTACTCAAAATGCCAAACCTCATCTAAAAACAACCTCATCAAATAAACCTTCTTTTCGAGAGGTAAGGGAAGTAACACGCGTTATTTGCCCTACATGCAAAGGTAAAGCGGAAATTCGTTTAGCATGCCGTTGCCATGGACGTGGAAAAATTGTTGATAAAAAACAGACTGAATTACAAGGAGTTGCCGTATTTAAACCTTGTCGCCAATGTGCTGGACGCGGTTATCCTCGCCTTAAATTCAGCGAAGTCTTACAACAATTGCAACATGTGGTGAGTATTTCAAAAACGGCTGCTTATAGTCATTATAAACCGCTATTTGATTTTTTAGTGGCGGAATGCTTTAAAGAAGAGTCTTTATCAGATAAATTTCTACAAGAAGTTACTGTAAAATAATAATTTTCTATTTTTATTTATTTTTATGAAAAAATATTGTTGACTTAAAGGAAAAATAAGCATACTATAACTCCACAGTGAGAGATTTGTATCTAACAAGCTCTCAGCAAAATCTAAGAAGCCTCACTTTTGAAGTGGGGCTTTTTTGTTTTCAATATTTATCACTATCACACTGACCATTATATAAGCTTGGCGAGTTAATCGATCTCACTGCCAATAGGTTTATGTTATGGCATTTTTTATACTACGCTTTTATCTAATTTATTAGATAAATAAAACCGTCAATATATTCATATTAGCCTTGTGATTAAAATTAGATATGAAGAATGAATATATTATTAATGACATTTCCTCTGATTGGAGGTAAGCCATAAGAAATAATGAAAGAAAATCCAGATCTATGGGAACAAATATGCATTGTTCTTTATTCAATGAAAGAGCAAGGTATATCAGCCTTACTCGCTGGGGGAATGGCTATTCTTCGAAGTTTATATAACGCAGGAGGATGGAAAAAAACTTTTTTAGATGGACTGATGTGTGCAATGTTTGCTTGGTTTATCAAAGATATTCTCCTTTTATTTAGTATTAATCATCAATTTGCTTACTTAGCCAGTGTCTTTATTGGTTATGTAGGCATTGAACCTGTAAGCAAACTTCTTATCAGGAAAAATAGGAGTTAAAAATGGCTAAAATAGCGCGGGGTGAACGTAATAATAACCCAGGTAATATACGCCATGGTGCAAAATGGCAAGGATTAGCAAGCACGCAAACAGATAAAGATTTTTGTCAATTTATTTCACCAGAATATGGCATCAGAGCAATTTATAAATTAATTCAAACCTATCAAAATAAATATGGTTTAAATACAATTAAATCTATTATTTATCGCTATGCACCACCTAATGAGAATAATACATTGGGTTATATTGAGCGCGTATCAAAAGAAATAGGGATTGAAAGTAATAAAACTATTGATACCCAAATAAAAAAAGTTTGTATATCTTTATCTATAGCCATTATTAATATTGAACTGGGTTATCAACCCTATGCCAAAAAAGTATTTGAAGATGCTTGGTTGTTATTATGAACTATCTTACAAAAATCATAATAATCATTATGTTATGTTTAATTGCTGGACTTTTTTGGGTTATTGATAGAAATAAAATATTAAAACAAAAATATGTGAAAATTAATGAAACACTGACGCAACAGATTGTAGAAAACAAAAACTATCAATTAAGAATAAAGCAATTATATCAAATGGATACTCAACGTTTACAGGAGTTAGCCAGTGCCAAGAGCGAAATTAACCGGTTGCGTAGTTATGCTGAGCGTGATCCTGAGCGGGTGTACATCAGAGCCAGTTGTGCAACAAACGACGCCAATTCCACCCCCCGCGTGGATGATGCAACCCGCGCCAGACCTACTGACGCCGCTATCCGAAATTATTGGATACTCAGAGAAAGAATTGCTCAGTCAGAGTCCATCATCTTAGGTCTACAAGGTTATATTCGCCAAGAGTGTATTAATTAAAGTGATTAAAAAGGAGTGTAAAATAAAGGAGATGAAATGAATGATAATGATATTAATAAAGCTATTCGAGAGCAATTAATAAAACAATTAATAAAAATAGATATCAATGCTGAAGTTATTACAGGATATCAACCGGAAGAAATCACTGATAATAATATTATTATGTTTTTTCCTATTAAGGAGGTGAGCCAAGGTTGGCAGAAAAGAAGTTATGATGTTCAAGGTAATAATGCCAATCACACTGAACAACAACTTGTTGAGTTAACTTATCAAGTTCAGAGCTTTACTAAAAAACAATCTGATTTTACTGAAGGTGATTTAATTAGAACAACGCGAATGATCATTCATTCGCTGCCTTTTATTGAATCAATGAGAAAAAAAGGAATAGGAATACAACGTGCGACAGAAATTAGGCGTGCGCCAATAATTAATGAAGGAAATAGCTATGAACATAATCCTTCATTTGATTTTAATGTCACTTTTCCCAGCTCGTTATCTCTAAACACTGCAGCTACACATTTACTTATATCTAATCTATCTCGTATTTAAGGATAAATATGTCTATTAAACAAACACGCTATGTTGATATTGCGAGTGCGGTGATTGGTGCCTCTACTGCACCAATGCGTAAACTGACCGCACGTATTTTTTCAACAAACCCTAAAATTCCAGCAGGGAAAGTACTCGAATTTACTTCTGGTCAAGTTGATGCGTTTCTGGGAGCTGATTCTCCAGAAGCGCAATTTGCCCGCCAATATTTTAGTTATGTGAGTCCGGCTCCCGTCAGCAAGCCTAAAGAGCTACAAATTGCCTCTTATGAGCCAATGGGACGAGCGCCAACACTCTTTGGTGGGCCGGTTGCCACACTGGATAAATTAAAGCTGATTGAAGAGGGTGAGTTAACGCTGGTGATTGGCGATGTGACCAAAAAAATCAGCAAGCTCTCTCTTCAAGACGTGACGTCCTATAGTGATATTGCATCTTTAATTCAAGCAAAACTCAATGCTGAAAGTGAGCCACAATTTGCCAGTTGTTATGTGACTTTTAATGCTATGGATAGTGCTTTCTTAATCAGCGGCGGTGTGCAAGAAAAAGCGCAGATTAGCGTCAACAACTCACCTCTCGCTGATGCCTTAGGGTTAAGTCAGGGACAAACTTCTGAGGGTAATGCATCACAGACTGCCCTTGAAGCCTTTATGGCTGCAGAAGCTATTTCTGACTCATTTGGTAGTGCAACATTTTTAACCGAACTATCTATTGAGCAAAGTGTGGAACTGGCTGAATACGTAGCAGGTGAAAATGTCAAATACCAACTTTATTTATCGGTGCCAGATCAACAAGCTGAAATGTACAGCAAGGCATTAATGAATACCGCATCGACAGGGTTGAATTTAAAAACCGAGGAAAACTTTTTTGTGCAAGCGTTGCCTATGGCGATTATGGCAGCAACAGATTTTGAGCGTACTAATGCCACCACCAATTACATGTATCGTCAATTTGGTATTACATTCCCATCGCAAGTTACCACAGATATGGCGGCCGATCGCTTAGATAAATTGCGCTTGAACTATTATGGTGAAACGGCGGTATCTGGCTCTGAGATCAGTTTCTATCAACGTGGCTTTTTATGTGGTAATGGTGCTAATCCAGTAGATATGAGCGTACATGCCAATGAGCAATGGCTAAAAGCGTATATTGCACAGCAGTGGCTTAGTTTACTACTGTCAACGCGCGGTATTCCTGCGAATAAAGATGGTGAAGCAAGAGCGATGATGATCATTGCTGGTGCAGTAACCAAGGCATTAAACAATGGCACTATTCAAACGGGTAAGGCATTAACAGAAGTACAAAAAATCGCAATTACAGATGCGGCAGGTGATGATTTAGCGTGGCACGATGTACAAAACAAAGGTTATTGGTACAACGCTGAAATCGTTGAACAAACAGGGCCAGGGAATTTACCGGAATACACCATGAAATATGTATTGATTTACGGTAAAGGCGATTGGGTTCGTAAAGTTGAAGGCTCACATAATTTAGTTTAAGGAACAAACAATGAACGATATTTCAGCAACAGGCTTAAGCCTTATTATTCAAGCAAGTAAAACATTTCCAGCGGGTATTCCGATCACCACCTTTTCTGATGAAGGTGATCCTTTAGATTTACCGACAGTTAATATTACGCAAACAGCGGTAGATATTAATGGTAATTTGGTCAGTTGGTCTTCACCAACACCTCAAACGGTCACCATTAATGTGTTAGCGGGAAGTGAAGAAGACGAAAATCTAGCTATTTTGTTTGATGCTAATACGGCAAGACGGGGACGACGTCCTGCCAGTGATGTGATTACTTTAGTCGCTTCTTATGGAGATGGCTCTATTACCACGGCACGTAATGGACGTATTACTGGCGGTTGCCGAGGTAATTCAGTCGCAGGGGTAGGGCGTCTTAAATCTAAGCAGTACACTTTTATTTTCCAAGATTTTGACCGTGTTAGAGCGCGTTAATTATTAATCTTACTTTTTATCATGGCGACTTCGGTCGCCTTTTTTTATGGAGTTTTTATATGTTGATTAAACCAAAAGAGATCACGGTGATTGATAGTGATCGTCAACAGCATACCTTTATTATTAGCCGGTTACCCGCCAC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MSIKQTRYVDIASAVIGASTAPMRKLTARIFSTNPKIPAGKVLEFTSGQVDAFLGADSPEAQFARQYFSYVSPAPVSKPKELQIASYEPMGRAPTLFGGPVATLDKLKLIEEGELTLVIGDVTKKISKLSLQDVTSYSDIASLIQAKLNAESEPQFASCYVTFNAMDSAFLISGGVQEKAQISVNNSPLADALGLSQGQTSEGNASQTALEAFMAAEAISDSFGSATFLTELSIEQSVELAEYVAGENVKYQLYLSVPDQQAEMYSKALMNTASTGLNLKTEENFFVQALPMAIMAATDFERTNATTNYMYRQFGITFPSQVTTDMAADRLDKLRLNYYGETAVSGSEISFYQRGFLCGNGANPVDMSVHANEQWLKAYIAQQWLSLLLSTRGIPANKDGEARAMMIIAGAVTKALNNGTIQTGKALTEVQKIAITDAAGDDLAWHDVQNKGYWYNAEIVEQTGPGNLPEYTMKYVLIYGKGDWVRKVEGSHNLV
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MQEIPLQAIPNQRFSVAIAGVNWQLTLKVANQTMFCDIEREGEILITGMRLVANTPIIPYRYLNQGINLMFLTEHDALPWYEEFTKTQSLVYWSEEDGSSTNKARN

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_110706590.1|552956_553361_+	structural protein	A0A0E3JJ20	Enterobacteria_phage	1.1e-24	45.8
WP_036918597.1|553357_553807_+|lysis	lysis protein	NA	NA	NA	NA
WP_110706591.1|553843_554356_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_107337175.1|554364_555852_+	DUF3383 domain-containing protein	A0A088C3U1	Shewanella_sp._phage	4.2e-77	35.5
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WP_004243627.1|556374_556833_+	hypothetical protein	Q6IWV4	Burkholderia_phage	1.9e-25	48.5
WP_107337176.1|556915_559219_+	hypothetical protein	A0A2H5BG44	Pseudoalteromonas_phage	2.0e-14	23.1
WP_036971128.1|559221_559716_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004243623.1|559721_560042_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004243622.1|560010_560823_+	hypothetical protein	Q6IWQ0	Burkholderia_phage	9.0e-42	39.2
WP_004243621.1|560825_561518_+	hypothetical protein	A0A2H4P6V3	Pseudomonas_phage	1.2e-29	35.7
WP_004243617.1|561514_561859_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017628010.1|561851_563039_+	hypothetical protein	A0A2H5BG53	Pseudoalteromonas_phage	1.9e-72	37.7
WP_004243615.1|563035_563692_+	DUF2612 domain-containing protein	Q6IWQ4	Burkholderia_phage	2.3e-35	39.9
WP_108716900.1|563697_564933_+	hypothetical protein	Q6IWQ6	Burkholderia_phage	2.4e-14	34.1
WP_017628013.1|565072_565252_-	GhoT/OrtT family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_004243612.1|565820_566363_+	DUF924 domain-containing protein	A0A1V0SIY0	Klosneuvirus	1.9e-19	34.7
WP_110706592.1|566478_567255_-	dimethyl sulfoxide reductase anchor subunit	A0A077SK59	Escherichia_phage	3.9e-42	40.2
WP_049213336.1|567258_567876_-	dimethylsulfoxide reductase subunit B	A0A077SL61	Escherichia_phage	4.4e-89	68.3
WP_012368081.1|567887_570326_-	molybdopterin-dependent oxidoreductase	A0A077SK27	Escherichia_phage	5.0e-261	54.5

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP029725|1094702:1104694|DBSCAN-SWA
TATGAAAAACATCAAAGAGATGGCGTTACTTTCCACCCCCCTATCTCGCCGACGCTTTGTCAAAGTGGGAGCCGCTGGTGGATTAGTTGCAACGGCGGGTGGATTATCTCTCCCCTTTAGCCAAGCCATGGCTTCGGAGCAAACAGCGCCGACATCTACCAATAAAGAAAAAGTCGTCTGGAGTGCATGTACCGTCAATTGCGGTAGTCGTTGTCCATTGCGTATGCATGTCGTTGATGGCGAAATTAAGTACGTTGAAACAGACAATACCGGCAATGACGTTTACGACGAGTTCCATCAAGTACGAGCTTGCTTACGTGGTCGCTCTATGCGTCGACGTGTTTATAATCCAGATCGCTTACGTTATCCCATGAAACGCGTAGGTAAACGTGGTGAAGGTAAATTTGAACGTATCTCTTGGGATGAAGCCTTTGATACTATTTCCGACACCATGAAACGCCTGATAAAAGATTATGGCAATGAATCTATTTATCTAAATTACGGTACAGGCACCCTCGGTGGCACCATGACAAAATCTTGGCCACCAGGAGCAACCCTTATTGCCCGTTTAATGAATTGCTGTGGTGGTTATCTCAACCATTATGGCGATTATAGTACTGCGCAGATCGCTGCAGGCTTAAATTACACCTACGGGGGATGGGCTGATGGCAATAGTCCTTCAGACATCGAAAATACTAAATTGGTTGTTATGTTTGGTAATAATCCCGGCGAAACACGTATGAGTGGCGGTGGTGTAACTTATTATGTTGAGCAAGCTCGTGAAAAATCAGATGCTCGCATGATAATTATTGATCCTCGCTATACTGATACGGGTGCAGGTCGTGAGGATGAGTGGATCCCCATTCGTCCAGGTACTGATGCAGCTTTAGTTAATGCGTTAGCTTATGTCATGATCAAAGAAGATTTAGTCGATAAACCCTTCTTAGATAAATACTGCGTTGGTTACGACGAAACTACGATGCCAGAAGGGACACCTAAAAACGCCCACTATAAAGCCTATATTTTAGGTGATGGCGCAGATGGTCAACCCAAAACCCCAGAATGGGCAGCACAAATTACCGGCATTCCCGCGACACGTATTGTCAAATTAGCCCGTGAAATCGCCGGTGCTAAGCCGGCTTATATTACTCAAGGTTGGGGCCCACAACGCCGTTCAAATGGCGAATTAGCCTCTCGCGCTATTGCAATGCTCGCTATCTTAACAGGTAATGTGGGAATAAATGGGGGCAATACCGGTGCCCGTGAAGGCTCTTACAGCATTCCTTTTGTCCGTATGCCAACCTTAACTAACCCTGTCACGACCAGTATTTCTATGTTTATGTGGACAGATGCCATTTTACGTGGTCCTGAAATGACCGCTACACGTGATGGCGTGCGAGGTAAAGATAAACTGGATGTACCTATTAAAATGGTCTGGAACTATGCGGGGAACTGCTTAGTTAACCAACATTCAGAAATAAACCGTACTCATGAAATCCTACAAGATGATAAAAAATGCGAAATGATTGTGGTTATCGATAATCATATGACCGCATCGGCAAAATATGCAGATATCTTACTGCCAGATTGCACGGCATCAGAGCAAATGGATTTCTGTATGGATGCTTCTGCGGGGAATATGGCTTACGTGATTTTCGCTGACCAAGCGATTAAGCCACGTTTTGAAAGTCGCAATATCTATGAGATGACCAGCGAAATTGCTAAACGTATGGGGGTGGGTGAGAAATTTACCGAAAATCGTACCCAAGAAGAGTGGTTACGCCATCTTTATGAGCAATCTCGTCAAAATTTACCAGAACTGCCTACCTTTGAAGAATTTCGGGCACAAGGTATCTTTAAAAAACGTGATCCACAAGGCCATCATGTGGCTTACCGTGAATTCCGCGCTGATCCACTCAACAATCCACTGACAACGCCGTCAGGAAAAATTGAAATTTATTCTTCGCAATTAGCTGAAATTAAAGCGACATGGGAATTAGCAGCAGACGATGTGATTGATCCACTGCCAATCTACTCCGCAGGTTTTGAAAGCTATGGCGACCCTGCTATGGATAAATACCCATTACAAATGACGGGTTTTCACTATAAAGCTCGTACCCACTCAACTTATGGCAACGTGGATGTATTAAAAGCGGCTTGTCCACAAGAAATTTGGATAAACCCTGTTGATGCTACAAAACGTGGTATCAAACACGGCGATTTAGTCCGTATTTATAACGATCGCGGTGAAGTACGTATCAAGGCTAAAGTGACACCACGTATTTTGCCGGGCGTTGTGGGATTAAGTGAAGGGGCTTGGTATAACCCAGACAGTAACCGCATTGATCATGCAGGTTGCATTAACGTGTTAACGACCCAACGCCCTTCACCACTTGCTAAGGGTAATCCTTCTCACAGTAATCTTGTTGAAGTCGTCAAGGCGTAAGGAGTCTGGTTATGTCAACGCAATATGGTTTTTATATCGATTCAAGTCGTTGCACCGGCTGCAAAACCTGCGAACTCGCGTGCAAGGATTTTAAAAATTTATCCCCTGAGGTCAATTTCCGCCGTATTTATGAATATGCCGGTGGTGATTGGACCGAGCAAGATGGTGTGTATACGCAAAACGTTTTTGCTTACTACTTATCTATTTCATGTAACCACTGTGACGATCCGGCTTGCGTAAAAGTCTGTCCAAGTGGCGCCATGCACAAACGCGAAGATGGTTTTGTGGTGGTGAATGAAGAAGTGTGTATAGGCTGTCGTTATTGCCATATGGCATGTCCTTATGGTGCACCGCAGTTTGATGAAGTCAAAGGCCACATGACCAAATGTGATGGTTGTTATGAGCGTGTTGCTGAAGGCAAAAAGCCAATTTGTGTCGGATCTTGCCCATTGCGTGCATTAGATATGGCACCGATTGAAGAGTTACGCGCTAAATATGGTGATCTTGCTGAAATAGCCCCTCTTCCATCTGCGAAATACACTAAACCGAATATTGTTCTTAAATTAAATGCCAATAGCCGACCTGTAGGTGACACCACCGGGCATCTGGCTAACCCAGAGGAGGTTTAAGATGGGCATGGGATTACATGAATGGCCACTGATGTTCTTTACCGTTATTGGTCAAAGTGTGGCTGGCGCCTTTATTATTATGGGTTGCGCCATTCTTTCAGGCAAACTGCCTGAAGCGTTAAATCGCAAAGTGCATTACAGCATGTTTGGTTTGTGGTTATTAATGGGGATTGGTTTTTTACTCTCCATGATCCACATGGGAACCCCAATGCGTGCCTTTAACTCTTTTATCCGTTTTGGTCATTCATCATTAAGTAATGAAATTGCCAGTGGTGCCACATTCTTTGCTTTAGGTGGCTTATATTGGTTAATCAGTGTGTTAAATAAAATGCCTGCTGCATTAGGTAAATTGTGGCTAGTGGTTGTCATGATACTTGCAGTGCTATTTATCACGGCTATTTCGCGAGTTTATCAAATTGATACTGTACCTACTTGGTATAATGGCTATACCACAGTTAACTTCGTACTAACCGCATTTATTGGTGGCCCTATTTTAGCGGCACTGTTAATGCGTATTGCCGGTTTTAACTTAAATTGTATTAGTGCATTACCGCTATTAAGTGTCATCGCCATTATTATCAGTGCTATTGTGGCTACCTCTCAAGGCTTTGAATTGGGTTCAATTCAAACCTCCGTACAAAAAGCGGTTGATTTAGTTCCTGATTACGGTTTTTTAATGGGCATTAAATTGATTGCACTGACATTAGGGTTAGCTTGTTGGATAGCACCGTTATTACGCAAAAATAATCCTTCTGTTTCTTTAATGGTGTTAGGTTTTATTTTAGTGTTTGTTGGTGAATTTATTGGTCGTGGCGTATTCTATGGCTTACATATGACAGTAGGAATGGCTGTTGTAGGTTAATCAACCTATTTATCCTTAAAAACCGCCGTAATGGCGGTTTTCTTTTACTGTGTTACCCTTTTTTAATCTTAGTCATTATGTTTATATAGGGAATAACCTATTATAGATAATATACATTTCAGCGGATAATAAAAATATTATGGAACAACAAGTTATTACAGATATTTCTCTCTCTGCCCGTATTATTGGGGCTGCTTTCTATTACCCACCAACTGAAAAAAGTGACATTGTTGAGTTACTCTCAAGCGGCAAATGGTTAACTGAATGGCCTTATGGCTCTGAAGAAGAAAAACAACGCATTGCCTCATTATTGGCGCAAACTACCTATCAAGATGAAACATTAGCACAAGCCTATCAACGTTTATTTATTGGGCCTTATGCGCTACCTGCACCACCTTGGGGATCGGTGTATCTTGATCATGAGAATGTCTTATTTGGTGATTCAACCTTAGATTTACGTGAATGGATGCTGGAGAATGGTATTGATATTGCCTTGACTCAAAATGAACCTGAAGATCACTTTGGTTTAATGGTGATGATGGTGGCATGGGTTGCAGAAACACGCCCTGAAAAATTAACTGAACTACTTGCTGAACATTTATTACCTTGGGCTTATCGCTATCTAGAGAAATTGTCATTACAAGGAGCATTCCCTTATTATGAAGGTCTTGCCATGTTAGCAACGTTAACGCTTAAAAGCTGGCAATCCCTACTCTCGATTACTCCTGTTGAAAAACAGCTATTTTGCTAATCGACTGATTTGATCAAAAGAAGAACAGCCCTAATTGGGCTGTTATTTTTAGTTAAGATTGTTGAGACCAAAGCTGATAAAGTGCCGGTTGTTTTTCGTCTTCAGGTTTTATTTGCACAAATTGCAACCCTTCTTGTTGCTCCGGAGCGACTCTTAATGCCTTAGCAATATTGGCTGTCGATAATCCATAAGGCTGGGCATCATCATTAGAGTAAGCATAAAATATTTGTGAGATCCCCGCCATACGCATAGCCGCCAAACACATTGGACAAGGTTGACCACTGGCATAAACCACACAATCATCCAATTTTG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP029725|1094702:1104694|1097777_1098638_+|WP_004242891.1|DBSCAN-SWA
MGMGLHEWPLMFFTVIGQSVAGAFIIMGCAILSGKLPEALNRKVHYSMFGLWLLMGIGFLLSMIHMGTPMRAFNSFIRFGHSSLSNEIASGATFFALGGLYWLISVLNKMPAALGKLWLVVVMILAVLFITAISRVYQIDTVPTWYNGYTTVNFVLTAFIGGPILAALLMRIAGFNLNCISALPLLSVIAIIISAIVATSQGFELGSIQTSVQKAVDLVPDYGFLMGIKLIALTLGLACWIAPLLRKNNPSVSLMVLGFILVFVGEFIGRGVFYGLHMTVGMAVVG
>NZ_CP029725|1094702:1104694|1097158_1097776_+|WP_004242892.1|DBSCAN-SWA
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MSDKQFIQQAISLATENVKVGGRPFGAVIVKNGQVIAHAVNQITATNDPTAHAELLALREAGKVLGRAKLDDCVVYASGQPCPMCLAAMRMAGISQIFYAYSNDDAQPYGLSTANIAKALRVAPEQQEGLQFVQIKPEDEKQPALYQLWSQQS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_110706632.1|1094702_1097147_+	molybdopterin-dependent oxidoreductase	A0A077SK27	Escherichia_phage	1.2e-219	50.2
WP_004242892.1|1097158_1097776_+	dimethylsulfoxide reductase subunit B	A0A077SL61	Escherichia_phage	2.2e-72	58.6
WP_004242891.1|1097777_1098638_+	dimethyl sulfoxide reductase anchor subunit	A0A077SK59	Escherichia_phage	3.7e-25	35.5
WP_004242890.1|1098777_1099389_+	Tat proofreading chaperone DmsD	A0A077SLS7	Escherichia_phage	7.3e-28	39.1
WP_004242888.1|1099441_1099903_-	nucleoside deaminase	S4VYZ2	Pandoravirus	7.0e-15	34.6
WP_036918303.1|1099902_1100589_-	ankyrin repeat domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_004248043.1|1100924_1102625_+	potassium-transporting ATPase subunit KdpA	NA	NA	NA	NA
WP_049210313.1|1102636_1104694_+	potassium-transporting ATPase subunit KdpB	E4ZFI9	Streptococcus_phage	4.8e-31	26.1

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP029725|1338798:1407894|DBSCAN-SWA
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MFPEYRDLIAKLRQTDPHFRALFEQHNELDHKIVRLEHRDRRGYGEEVVELKKQKLRLKEEIHQILKNPPEDE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_110706656.1|1338798_1340007_-|transposase	IS200/IS605 family element transposase accessory protein TnpB	A0A1B0VCD8	Salmonella_phage	2.4e-187	80.8
WP_012367824.1|1340033_1340450_+|transposase	IS200/IS605 family transposase	A0A1S5RHE3	Helicobacter_phage	3.4e-45	62.8
WP_004247923.1|1340568_1341000_+	hypothetical protein	Q7Y3V7	Yersinia_phage	1.8e-20	38.1
WP_004242549.1|1341126_1341990_-	triacylglycerol lipase	NA	NA	NA	NA
WP_004242548.1|1342132_1342516_-	antitermination protein	A0A1W6JNX1	Morganella_phage	2.3e-24	47.8
WP_110706657.1|1342750_1343527_-	type I methionyl aminopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_004242542.1|1343544_1343742_-	ParD-like family protein	NA	NA	NA	NA
WP_004242541.1|1344117_1344678_+	AAA family ATPase	A0A219VHB7	Ochrobactrum_phage	1.9e-19	50.6
WP_004251481.1|1344740_1344983_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004242537.1|1345010_1345424_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_012367822.1|1349259_1349616_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_049208187.1|1350178_1350841_-	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_110706658.1|1351398_1352625_+	DUF3440 domain-containing protein	A0A220GKF8	Streptococcus_phage	2.0e-61	33.4
WP_004247912.1|1352637_1353279_+	ParB-like nuclease domain-containing protein	A0A0F7L444	uncultured_marine_virus	2.4e-50	47.8
WP_012367820.1|1353287_1353548_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_026090443.1|1353921_1354236_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_049203874.1|1355076_1355619_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004242521.1|1355642_1355840_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_012367816.1|1356080_1356929_-	SDR family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_036920088.1|1357018_1357393_+	winged helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_004247908.1|1357516_1357978_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_110706659.1|1358468_1358927_-	Hsp20 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_004247907.1|1359259_1359472_-	RNA chaperone/antiterminator CspA	A0A1W6JNX5	Morganella_phage	2.0e-25	78.6
WP_110706660.1|1359911_1361036_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_110706661.1|1362319_1363525_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_110706662.1|1364168_1364342_-	isocitrate dehydrogenase	Q77Z09	Phage_21	4.9e-22	90.7
WP_143475634.1|1364622_1366005_-	HD domain-containing protein	A0A2K9L4D0	Tupanvirus	1.2e-14	24.9
WP_049219712.1|1367579_1367780_-	hypothetical protein	Q77Z09	Phage_21	3.3e-22	92.6
1368315:1368329	attL	NA	NA	NA	NA
WP_081041966.1|1368336_1370646_+	hypothetical protein	A0A2L1IV32	Escherichia_phage	2.2e-16	60.3
WP_049219717.1|1370699_1370948_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_049219718.1|1371091_1371430_+	BON domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_049219720.1|1375836_1376235_-	hypothetical protein	A0A059VK01	Pseudomonas_phage	7.1e-32	46.2
WP_049219722.1|1376313_1376649_-	hypothetical protein	Q775B6	Bordetella_phage	3.7e-10	35.3
WP_017628351.1|1376665_1377247_-	hypothetical protein	Q7Y3Z7	Yersinia_phage	8.1e-53	50.5
WP_017628352.1|1377246_1377843_-	hypothetical protein	S4TSP7	Salmonella_phage	1.6e-51	52.3
WP_017628353.1|1377843_1381119_-|tail	phage tail tape measure protein	B7SE05	Pseudomonas_virus	2.9e-54	46.7
WP_004242485.1|1381245_1381437_+	YqaE/Pmp3 family membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_017628354.1|1381461_1381740_-	DUF4035 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017628355.1|1381736_1382153_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017628356.1|1382217_1382883_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017628357.1|1382892_1383234_-	DUF3168 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017628358.1|1383239_1383713_-	hypothetical protein	A0A0R6PHU8	Moraxella_phage	8.2e-11	30.2
WP_017628359.1|1383702_1384032_-|head	phage head closure protein	NA	NA	NA	NA
WP_017628360.1|1384031_1384331_-	hypothetical protein	K7PKV5	Enterobacterial_phage	5.7e-34	65.3
WP_017628361.1|1384369_1385536_-|capsid	phage major capsid protein	F1C582	Cronobacter_phage	1.6e-169	79.5
WP_004242476.1|1385539_1386208_-|head,protease	HK97 family phage prohead protease	K7PM91	Enterobacterial_phage	6.6e-83	65.8
WP_017628362.1|1386225_1387494_-|portal	phage portal protein	Q77W97	Enterobacteria_phage	1.8e-201	80.4
WP_017628363.1|1387493_1389227_-|terminase	terminase large subunit	A0A0U2C138	Paracoccus_phage	3.1e-148	46.6
WP_017628364.1|1389180_1389648_-|terminase	phage terminase small subunit P27 family	Q9B019	Phage_GMSE-1	1.6e-43	59.7
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WP_108716959.1|1390904_1391489_-	hypothetical protein	H6WRU8	Salmonella_phage	2.4e-20	41.0
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WP_110706666.1|1393595_1394018_-	hypothetical protein	J9Q7I1	Salmonella_phage	2.6e-08	31.7
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WP_110706668.1|1395828_1397373_+	RNA-directed DNA polymerase	Q2P9X0	Enterobacteria_phage	6.8e-232	76.3
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WP_006537195.1|1398481_1398694_-	RNA chaperone/antiterminator CspA	A0A1W6JNX5	Morganella_phage	6.8e-26	80.0
WP_110706669.1|1399034_1399433_-	antitermination protein	Q8W638	Enterobacteria_phage	1.6e-31	54.3
WP_110706670.1|1399460_1400486_-	DUF968 domain-containing protein	A0A1W6JP62	Morganella_phage	1.3e-85	46.8
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WP_110706931.1|1401310_1401826_-	hypothetical protein	U5P0A0	Shigella_phage	2.0e-23	44.2
WP_036908081.1|1402383_1402563_-	DUF4222 domain-containing protein	A0A1W6JP38	Morganella_phage	2.6e-10	55.2
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WP_110706673.1|1402824_1403301_-	hypothetical protein	A0A1W6JP72	Morganella_phage	3.0e-45	60.4
WP_006537203.1|1403338_1403545_-	cell division protein	H9C161	Pectobacterium_phage	8.5e-05	40.7
WP_017628378.1|1403645_1404278_+	LexA family transcriptional regulator	K7PLZ5	Enterobacterial_phage	1.5e-39	44.4
WP_110706674.1|1404562_1405087_+	HD family hydrolase	A0A1W6JP41	Morganella_phage	6.0e-55	61.6
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1416215:1416229	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

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MSEIKYIKEKQYLQKLFSEYADKAPHLASVLDPQDPQTSYLLEGFAFLSARLQDKIDDAFPEITLPLLQRLNSQAIKGLPSTTIIQIDQSEILPYPMEINEKHLVIGDNGAQFSFCHNFTIMPYSILDRKITQHPNHSCISLEILYRGDVELTQTNALNVFLGENKTTSDILLLAFSQYFEKIEVVHNGERYEGDPLNYAFEPKIGNDYKIFPQKNNSFSAPQRLLEGLYLPHVHHFIELDIPQIVAQLDWKQQQRFVVNIYFSQQLPLTQEECNQSFFLNCAPAIDSEAKHTLLIDFKKNKSSYLLPIPTHHYLADLDKIELSLEPHELARGIYCHFYPTTELTAASRLMPQFHKAIFYSLTMEKNITGHTLYYLNFFDNKGDPMVTPPSLHFACVYIGFEQYKRNELGLLNKHSEKMPDAVKTGNITLLSSCYPPIVNNHHFWKLLSHYSANGSMLMSLDTIKHMISDYILYRDTDRQITRKCERLLNGLVELKTHLYDYILKGKPYRCLSLSLFIDETQYENRGEAFVFTTHLYHFFPFCLSENMLLEMSVTLNDQKNTTWYLSPSPLRGYKSMI

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_004244624.1|1578187_1578619_+|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssE	NA	NA	NA	NA
WP_046334530.1|1578626_1580402_+|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssF	NA	NA	NA	NA
WP_004244621.1|1580365_1581403_+|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssG	NA	NA	NA	NA
WP_004247648.1|1581407_1582676_+	type VI secretion system-associated FHA domain protein TagH	NA	NA	NA	NA
WP_004244619.1|1582677_1583229_+	type VI secretion system lipoprotein TssJ	NA	NA	NA	NA
WP_004244618.1|1583221_1584589_+|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssK	NA	NA	NA	NA
WP_004244617.1|1584581_1585337_+	DotU family type IV/VI secretion system protein	NA	NA	NA	NA
WP_104459791.1|1585345_1588069_+	type VI secretion system ATPase TssH	K4FB40	Cronobacter_phage	1.4e-83	30.5
WP_110706693.1|1588072_1588861_+	Fis family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_004244612.1|1588862_1589513_+	type VI secretion system-associated protein TagO	NA	NA	NA	NA
WP_110706694.1|1589518_1590982_+	type VI secretion system protein TssA	NA	NA	NA	NA
WP_004244610.1|1590984_1594533_+	type VI secretion system membrane subunit TssM	NA	NA	NA	NA
WP_004244609.1|1594570_1595926_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_004247642.1|1595918_1597655_+	type VI secretion protein	NA	NA	NA	NA
WP_004244607.1|1597745_1598219_+	Hcp family type VI secretion system effector	NA	NA	NA	NA
WP_004247640.1|1598311_1598962_-	MBL fold metallo-hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_004244605.1|1599011_1599560_-	YcbK family protein	NA	NA	NA	NA
WP_004247638.1|1599891_1601607_-	L,D-transpeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_004247637.1|1601949_1602663_-	acid phosphatase AphA	NA	NA	NA	NA
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WP_004247634.1|1608458_1609190_-	chromosome partition protein MukE	NA	NA	NA	NA
WP_004244597.1|1609170_1610493_-	chromosome partition protein MukF	NA	NA	NA	NA
WP_004247633.1|1610502_1611276_-|tRNA	tRNA uridine 5-oxyacetic acid(34) methyltransferase CmoM	NA	NA	NA	NA
WP_004247632.1|1611655_1612486_+	envelope biogenesis factor ElyC	NA	NA	NA	NA
WP_004244594.1|1612608_1613370_-	3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_004244593.1|1613374_1613554_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004247631.1|1613968_1614184_-	cold shock domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_004244590.1|1614679_1615681_-	tetraacyldisaccharide 4'-kinase	NA	NA	NA	NA
WP_004244589.1|1615677_1617423_-	lipid A ABC transporter ATP-binding protein/permease MsbA	W8CYL7	Bacillus_phage	8.4e-61	30.9
WP_110706695.1|1617459_1619829_-	DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2	Q0H255	Geobacillus_phage	3.6e-22	29.3
WP_004244587.1|1620274_1620562_-	integration host factor subunit beta	A7KV42	Bacillus_phage	8.4e-11	40.0
WP_004244586.1|1620626_1622300_-	30S ribosomal protein S1	NA	NA	NA	NA
WP_004244585.1|1622481_1623159_-	(d)CMP kinase	NA	NA	NA	NA
WP_004252010.1|1623447_1624734_-	3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_004244582.1|1624930_1626019_-	3-phosphoserine/phosphohydroxythreonine transaminase	M1Q1P2	Streptococcus_phage	5.7e-84	47.0
WP_104459796.1|1626155_1627586_+	MFS transporter	A0A0M3UL24	Mycobacterium_phage	1.5e-07	24.8
WP_108717050.1|1627722_1628976_+	filamentous hemagglutinin N-terminal domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_004244579.1|1629050_1630088_-	L-asparaginase 2	NA	NA	NA	NA
WP_036900836.1|1630315_1632073_+	30S ribosomal protein S12 methylthiotransferase accessory factor YcaO	NA	NA	NA	NA
WP_004244577.1|1632743_1633598_+	formate transporter FocA	NA	NA	NA	NA
WP_004244576.1|1633652_1635935_+	formate C-acetyltransferase	A0A2P0VNR5	Tetraselmis_virus	1.0e-159	41.6
WP_110706696.1|1636042_1636783_+	pyruvate formate lyase 1-activating protein	A0A2P0VNQ0	Tetraselmis_virus	4.0e-20	26.5
WP_004244574.1|1637140_1638046_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004247622.1|1638118_1639168_-	ureidoglycolate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_004244572.1|1639568_1639901_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004244571.1|1640080_1641370_-|tRNA	serine--tRNA ligase	A0A1B1IVT2	uncultured_Mediterranean_phage	4.1e-97	46.2
WP_110706932.1|1641503_1642853_-	replication-associated recombination protein A	G3MBE0	Bacillus_virus	4.0e-79	40.6
WP_004244569.1|1642863_1643469_-	outer membrane lipoprotein chaperone LolA	NA	NA	NA	NA
WP_110706697.1|1643581_1647403_-	DNA translocase FtsK	A0A218M9A2	Mycobacterium_phage	1.7e-90	49.3
WP_004244566.1|1647530_1648025_-	leucine-responsive transcriptional regulator Lrp	NA	NA	NA	NA
WP_004247618.1|1648567_1649527_+	thioredoxin-disulfide reductase	A0A2I2L5E1	Orpheovirus	1.2e-64	45.8
WP_017628444.1|1649665_1651435_+	cysteine/glutathione ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD	W8CYL7	Bacillus_phage	3.0e-21	23.5
WP_004244562.1|1651437_1653189_+	cysteine/glutathione ABC transporter ATP-binding protein/permease CydC	A0A2R8FG22	Brazilian_cedratvirus	1.4e-18	31.7
WP_004247616.1|1653190_1653883_+|tRNA	leucyl/phenylalanyl-tRNA--protein transferase	NA	NA	NA	NA
WP_004244560.1|1654202_1654421_+	translation initiation factor IF-1	NA	NA	NA	NA
WP_004244559.1|1654539_1656834_-|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA	A0A223W0B1	Agrobacterium_phage	1.3e-170	42.9
WP_004244558.1|1656864_1657179_-|protease	ATP-dependent Clp protease adapter ClpS	A0A1B1IT64	uncultured_Mediterranean_phage	1.5e-13	44.1

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP029725|1831853:1878786|DBSCAN-SWA
ACTACGTAATATCTGATGCAATAGCGGTCATACGATTATTAGCGTCGCTGTATGAGTTCGGCTCAGTGAGATTAATGCTGTAACTAGTGTTTTTTACGGTAAATGTAGCCGGTTGTGAAATGACTAATTCTGTATCGCTATTAACCCTGTCCACCATATAAATAAAATTAGCATTACCATTTTTAATTAAAATAATGGTACCTGTGCCAGAGACAATAGCAGACCCTGACACTGTGCTAACAGTGCCTGTTGTGTATATCATGATTTATTTCCTAAAATTTAGATACAAAAAAACCACATTAGTGCGGTATTTAATCTTCTAACATTGAAACGTCTATCATAAGCCCTTGTTCCATTAATCCAGAACCTTCTCGACTCGGAGGCATACTTATCCAGCCATCCTCTTCTCCTAAGAACTCGTATCGATACTCAAATGTTAACCCTCCCACATCATCAACCAAGACATAACGCTCGCTATATCTTTTGAATGTCCAAACTTCATCCCACGTGTCAGGGTCTATGTAGCTTCGTATGTTTGTATTATGAAAATACCCCATAGAGCGAGTCTTAATCATGCCATACCGATGACCACTTTTGCCTGCGATTCTTAATGAGCCTTTGCCAGCGCTCCCCGTATTGACATCATAATATTTCTCAAAGCAGACCAACTTAGCAAGAGATGAAAATTTCATTTTCCCTTGCTCATCATAAACTTCAAGACCAACTCCGTGTTGAGGTATGCTTACCTTGGAAATCGGAGCAACCATCCATTGGCTATTTAACGCATAGATTCTCGGATAGCTATCATGAGGGCCTGATGATGACGTTAGTTCATCAGGAGTTGCTTTTCTCAAAACACATATTGTTTCGAGTTTATCGGTTAATTGTATCAGCCTATTATTTGTGTAAATTTCTACACCAACCATTTCACACCACCCATACGACAACATGACTTGAGAATGAGTCATTCGCTTGTGTCTGCCCACCACCAGAGCCATTGTTCTCCCAGCGATAGATATTGTAATCAACGCGGTAATTTAACGTGTTCCCAGATATGGAGTACTCTGTTCTCTCATTAGGCTTATCTACATGAAATTCACCACTCCATCGAGAGCGATACCGTAGCCAGAAATGGCAAACAACCTCACCTCCTAAGGAAATCTCAGGAATAGTAAGAGATCCATATTGGGACAAAGGAAGGTCAAATTGCCCCAAGTGGCGCGGTATAATAGTGTCTTCTCCAATAATGAGTCGCCCTTTCTCATCATATATTTCTAAACCCATGCCCATTACCATATCCCCATTCTGATACGCATTGTGCCTTTTTTATCAAACAAACGTTTTAATATGTTTGTTTCAATCCAGTACCCCTGAGCGTTATTCCCATATTTAATTTCTTCACCAGTGCGCATATTAAGTTGATAGCCCACCTTGTTTGCATGGCTGAAATTGGTTGATTGCAATACATTAGCTATTTTTGCACTGGTAATAGTTGCATCACCAATAAAAGCTTCATTAACAACCACCTGTCCATTCTTCACGATAAACGGTGTCACCACTTTGCCATTTAATGACGATATCACTGCAAAGTTTTGGGCATTGACCAGAAATTGGCTATTTCCTTGTGCATTAAACCCTAAGCCAATGCCCGTAATGACTTTATTCCCTTTGCTATCTTGCTGAACTTTCATTGTCCATGATGCGGAAATTTTGCCATTTATGTCGGTGACCACTTTCGACGTTTGTTCGATTTTGGCTGAACTTGTACCCACTTGGCTTTCAAGGCGAGTGACTTGCTGGGCGGTAGAGGTCACTTTACCTGAGACCTCAGTCACCTTAGTTTCAAGTTGGTTTACCGCATTCGCCGTTGCATTGGCTTTCTGTTCGCTGGACTTAGGTACTTCATTCGCCACAAATCCTTTTGGTGCCACCGATTGTTTGTTATTGGTATAAGTGCGGGTGATAATTTGATGGTTAACACTTTTATGCTTAGTGAGCTGATATTTAGCCCCTCCTCGCAAATAGATATATTCCACAGAACCATTCGTTAATTGAGCTGGCCCCATCACAGGGGATTGATTTGTCCATCGCCAATCAAAATTATCAATGATGCGGTTTTCAGACTGGGTTCCCCATCCAGAACCACTCACTTGCCATTCCACAATCATGGCAAAACCTTTGGTATTGTGAGTCGCATAGCTCGGTTTATTGTCTCTATATTGCCCTAATGTCCTAAAAACCTTAAAGGCATAACGTCGAGAAGTTACTAATGGCAAAATAATCGGATAATAGGTGTTTTCATTGAGTTTAGATAAATCTAAATCCACCACCACAGACTCCGTTAAATCGGCTTTCACTGTATCTAATTTGCTGGATAACGTTTGTACCTGAGAGGTTGCAGACGTCACTTTGCCATCAATATTAGATACTCGCGTATTTAACGCATTCACCACACTGCTATCAGCTTTCCCCTTAAGATTTGAATTGAGCGTTGAAATCTCTTGCGTTTGTGCTTGCTGTTTCGAGGTGAGGGTTTCTAATGATTTATTAATCGCGGAAACATTCCCATTCATCCGTGTTTCCAGTGATTGTCGGGCTTTCGCTTCTGCTTGGTCGCCTGTAACACGTGCTTGTTTCTCTGCGGAAATGAGTCCTGCGGTGACTTTCGATAAATCATTACCGGTATAATCACCACGAAGTTGAGTGGCTAAGAATTGGCGTTGTTGTGCTTCGGTTTTATCAGTCTCAATACGTGCTTGTTGCTCTTGTTTAATTGCGGCTGCCTGTGCTTCTGTTGCCGTTGAAACTTGATTTATCCGCTCAGCCAGTAATTTTCCTGCCTCCTCCCATTTTTTTTCACTTTCTTCAATCGTTGCTCCATGCCTCATCAACTCAGATAAAATCTTGTCATGATTTATCCTCATCAACTCATGTAATTCAGTAATATCGATTTGGTTAGCTTTACTGTTAATTTCACCCAATAAGTCTTGTGCGAGTTGGTCTCGGCTGATTTGCCCCGCTAATTCATCAAGAATAATACTAGCATCAAACTCAGATTCTCCCAGAATAAACTCAGTCCATTCGGAATGATTACCTATTTTATCTACCAGTCTTGCTCTAAAATAAAACGTTAAACCTGCTGATAACCCTGCCATTTCATAGTTTTTTGAGGGATAAGGAACATCAGATAACAGCATCAGACCTTCACCATTATTGGTTTTGCTGTACTGAATTTCCGTTTTTAACGTATCACTGGTGTTTTCACCAAATTCCCAGCCTAACTTAATGCCAAATACGAGCGGTGAAGCTCTAAAGTTTACAGGTTTAGGCGGGCTCCCTACTTTTCCTGTCAGTGTTGTTTCTGGCGCATTAGTCCATACACTGGATATTTCAGACGCATTTATCGCACGAACTCTCACCTGATAACGACCAGCATAAATGCCATCAACTTCAAACCCACATGTTGATGTTCTTGGCATTGATACCCAGTTATTATTATCTCTCCGCCATTGAGCCTCATAGGTAATGGCATTATCAACTGCATCCCAATCAACACGCAGAGTAATAAATGAAATACCTTGATTAACCTGAGAATAGGATGATATACGAATGTTTTTAGGTGGTGCTTGCACACTCGGTGGAACAATGGTGATTGGACGCTCACCTATTCTTGCGCCAGAGTCAATGTGATCGTAATTGCTTGGGTTATGGATTGCGCCAGTAATAGTGTATGTATTATCGCCATTATCAGTAATATTAACGACCCGATAAAGTTGTAATGTTAAATCATCAGCATCAACTGTCCAAACTGCGTTTTTCTCTGGTTCCTGTGAGTACTCCGTTGAAATTGTAATGATATTATCAGCAACCAGTGATACGGTTCTTCCCTCTGAGCGCCCGTTTGGCAGATTAACAATCAACCTATCACCAGCTTTAATATTGGCTCTGCGATCAAGTGTTATTTTTCTGCCTTCTACACGCGATATACGTCCACCATTATCTCTTCCAGCCAATGTAGAATCGGCAACAGCAATGATATGACCAGGAGAAGGTATTGCCCCCTCTAATCCTGTCGCAAAACTAATAACTCTGTCGTTAGCATTGGTGAGTAACGCCCAGCGACCTCTACGGTTAGCCTCCGTCTGTCGAGTGCAACCTATCGCTGATATTTCAGTTTTGCGTACTCCGTAACGACGCTGTAGTTTAATATCGGCCACAGCCTCAATCGCATCATTACTGTGGTTATTGGTGTCTGTGTAGGAAACTAATGCTTGCGTATATCGATTTTGCTGACTACCTCCTGAATAGGTAGGCTTACCTCCAACAATATTGGCATTAGTAAACGTTCTAAAAATACTATCTGGCATATCAGCGACAACATTAACCTTGTTATCAGCCCAAAATGTCATACCACGAAAAATAGCCGCTATATCTCTCAGTACTTGGTATGCCGATTCTTGCGATTGAATATAAACATCACACAGGAATCGAGGCTCCTTACCATCACCACCATGCCCATCGGGTACCAATTCATCACAATATTGCGCAATCTTATACAGGTCCCACTTTTCAACCTGAGAAGACTGGATCCGGTCACCACAGCCGTAGCGATTATTGAGTACTAAATCATAAAATACCCATGCCGGGTTATTGGTTGCTGCAAGTTTAAAGGTGCCATCCCATACGCCTGAATAGGCCCGATTAATCGGGTCATAATTCGTGGGCACTTTGATAAGCAAGCCACCTTTTGGGCGAACGCTAATTTTAGGGATGCGGTTATTAAATTGACGCGCATTGAAAGTAATAAACAATAGGGCCGTATTTGGATAACGCAATTTAGCATCGATAACATCAGTAACAGCAGAGATAGTAACCTTATCAACAATTCTGGCTGTATTCTGATTCTTAGTTAATCGTCGGACACGGATCTGCCAACCTGTATTTGCCTTGGGTAAGTCAATGCGGTGTGTTCGCTGGTATTCGCTGGTCGTTTTACCATC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MNIEWIRERVSTALMNVCIIENGPLSAMEEQAILVTDRFKRNPIRYAGERKSRYRLPSHPLKIKQKHAKGKSKPLINEVTYRTSSWRRGIHQLPNEMRLWLLYCYGDYQYYREQILIVPYIWHEFQRLNSKKRITKKVKQRLQSLTLLAIQAVKAEINQTAKKYTDVKLAELLGVSADAWRKSYKLYWICLLDCCYQLDRDSLFKISALS
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MGRSRSAKNKGLPPNLYLRKGIYYYRDVRTKKEFSVGSNKSLAITEAIQANLAIYKPKEPLVDRINNVHCVTLHEWLDTYRGKVNSRGLKEKTLYDYESRIKLIKLHFNDCPIENVTPRDVATFISEYPKKAMAKLLRSTMLDAFNEAIADGVIKENPVSVTKPPKTSVQRSRLSLEEFKYALEHTNDKYRHMFLLAVLTAQRISDIINMKWDDIKNDRLYVTQIKTGSKVAIPLSLRLEPIGYSIKDVLNLMNRNSDKICGNTTAKTLRGKFIEALPEYLENKPTFHEIRSLSARLYEEEKSAEFAKKILGHKSMRMTDKYLDDRGNGYVEL
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MNEAIKTAIDIVGTQKKLGEACGITQQAVFKWLHNKAKVSPEHIPLIVKATNGQVKGKDIRPDLPHLWDLGNKYW
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MRMEKLTNVTYGTAGLTAFFASLSLYEWGFVIGMAFSMLLGLATYFMTRREQRKRTQLFEKLVRHVDPQNPTETLKKLAELMVKAPKDI
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MNSFTHYGQFMKFTLPEPDPKNVCNLCGGHVGKDNLIQGQAVNICFDCSDLAKEMADEKRKHIAKKEIERIAAVISAGNKGLIDLGMATAYMYAERLYKAGYRKVE
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MNTNKKTGKFQLRLTEVLKSKVVELSAKDGISQNSIVNQAIAWYVKEREKRVN
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MSSKESAEFERAFGFPPDIEDVEIWPDVWDSYQVFSAMNTQWRVGMNGITGLDYNPLNQIMDLLNIKDRATVFSDIRIMEAKALEVMHKRSQ
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MQISYSYSNGTRVVDGKTVMEFDDNSQLSIEAGSFAELAKLTEIDPVEALQWIMQFDKEEFDRIVNEASKDAPISKLALLRRVA
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MANAARLRLGFSPLTKKISLAKMKVVGDGLLVRVGNDERDVTNEAAQMVWQLVIAEGGEINWHREDGKIMKLKAELIDDDNSQGCNEEE
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MDKSRQQFEEFIKFHMDDAEINNKFETANNGLNYADQYVDLMWISWQASRESLINNLPESINCPTAPELIWLQIDPEPEEINKPEFPVNLRSDDVTWCADKIHPTDTLYIRADLIQK
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MEYGNTCKTVRDKRAIEFRTRHLVSSALQILRDGDQREIAQATSRSDSTISRRIQSIDGVCEMLATRRVIGFVREGERKISEEEYRFLWKQMGELSQMKIKENASIAATNEACCSMEFTI
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MKVFNIEPVPKPRMTQADKWKKRPPVLKYFAFKDEVKLNKITLPESHYHITFILPMPKSWSKTKRSEMNGKPHQQKPDKDNLEKALLDAIFDDDSRVWDGRVTKVWGKRGQIIIQEVR
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MKRITLSEWNNKYFANPRSQRQLSRYIKEGRLYPAPEKVGREYELEQWTILTNDKMVREPQYLMEKINGQKQKCKEQGFTA
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MMNLRNEAKGRECQIRIPSVCNGNSETVVLAHYRMSGLCGVGIKSHDLFGAWACSACHDEVDRRTRFTDMEYAKQCHLEGVLRTQAILIQEGKLNV
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MAINTITASGNLGKDCEQRWTPNGKAVASFSLPVKQGYGEHEKISWVICKMFGPKAEKLPPHLTKGIKVTVTGEFVMEEWTSQNGEKKSAPVIIVDQLDFGGNGGNQAGSQKPQQNQGWGQPQQPQAPKQASSNQTPQSEPPQDWDDPIPFAPIGLPYPRHAIYVI
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MEIWFKEFESHGRQILIKKAHNADESKIGMQYCWPEKLFEVDFGLWIDYDDDDEEGCNKAEEARNKLFDTIDQEAVDTTVSNLIQKLKLDN

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
1824924:1824942	attL	NA	NA	NA	NA
WP_004247524.1|1831853_1832114_-	hypothetical protein	A0A1P8DTJ0	Proteus_phage	1.9e-17	57.4
WP_004247523.1|1832163_1832778_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004245936.1|1832779_1833148_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_110706703.1|1833141_1837335_-	DUF1983 domain-containing protein	F1C571	Cronobacter_phage	1.7e-301	54.5
WP_110706704.1|1837386_1837992_-|tail	tail assembly protein	F1C572	Cronobacter_phage	1.9e-52	56.8
WP_004247518.1|1837988_1838699_-	C40 family peptidase	A0A1P8DTI6	Proteus_phage	8.9e-86	62.0
WP_004247517.1|1838695_1839439_-|tail	phage minor tail protein L	K7PJS0	Enterobacterial_phage	7.1e-86	58.6
WP_004247516.1|1839435_1839777_-|tail	phage tail protein	I6PBN7	Cronobacter_phage	9.0e-28	50.0
WP_004245945.1|1840138_1840429_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_063691630.1|1840440_1843371_-|tail	phage tail tape measure protein	A0A2P0WA05	Enterobacter_phage	3.1e-140	35.8
WP_049195350.1|1843438_1843672_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004245950.1|1843769_1844438_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_012367638.1|1844430_1844850_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004245953.1|1844836_1845682_-	AAA family ATPase	A0A1X9IGI7	Lactococcus_phage	1.2e-31	36.0
WP_049197582.1|1845782_1846040_-	Arc family DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_004245955.1|1846153_1846315_+	toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_046334559.1|1846384_1847218_+	antirepressor	I6S627	Salmonella_phage	3.7e-67	55.6
WP_049197581.1|1847477_1847975_-	DUF2335 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_049197580.1|1847949_1848153_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004247510.1|1848543_1848726_+	hypothetical protein	A0A192Y6A8	Salmonella_phage	3.7e-20	76.3
WP_080973792.1|1849202_1849481_-	hypothetical protein	A0A2H4J4F7	uncultured_Caudovirales_phage	3.9e-13	49.3
WP_049197577.1|1849507_1849813_-	hypothetical protein	I6PDG2	Cronobacter_phage	1.1e-21	54.5
WP_004247505.1|1849864_1850521_-	hypothetical protein	G8C7Q3	Escherichia_phage	8.6e-59	57.7
WP_046334555.1|1850566_1850968_-	DUF4128 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_046334553.1|1850964_1851546_-	hypothetical protein	G8C7Q1	Escherichia_phage	1.8e-47	51.6
WP_046334552.1|1851547_1851898_-	hypothetical protein	I6PD77	Cronobacter_phage	5.1e-18	41.6
WP_004245968.1|1851900_1852380_-	hypothetical protein	G8C7P9	Escherichia_phage	2.9e-32	47.7
WP_107033975.1|1852419_1852704_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_046334550.1|1852706_1853660_-	Ig domain-containing protein	A0A1B0VMF8	Pseudomonas_phage	2.4e-126	71.2
WP_036907977.1|1853673_1854435_-	hypothetical protein	A0A1B0VMG1	Pseudomonas_phage	1.5e-67	59.3
WP_012367629.1|1854546_1855668_-	hypothetical protein	I6PD76	Cronobacter_phage	6.7e-104	51.0
WP_012367628.1|1855664_1857035_-	DUF4055 domain-containing protein	A0A1B0VMH0	Pseudomonas_phage	9.0e-119	48.8
WP_058336162.1|1857034_1858522_-	hypothetical protein	A0A1W6JNY3	Morganella_phage	2.6e-265	89.3
WP_012367626.1|1858524_1859133_-	hypothetical protein	A0A077KBY7	Edwardsiella_phage	2.2e-64	68.5
WP_004245979.1|1859315_1859522_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004247494.1|1859518_1860103_-	Bro-N domain-containing protein	Q3LZN7	Bacteriophage	2.0e-22	48.2
WP_036907970.1|1860450_1860912_-|lysis	lysis protein	A0A1P8DTG0	Proteus_phage	5.7e-25	48.3
WP_017628809.1|1861054_1861525_-	lysozyme	A0A1W6JNW4	Morganella_phage	4.4e-49	62.5
WP_107336909.1|1861524_1861794_-	hypothetical protein	A0A2H4FNF0	Salmonella_phage	1.0e-18	53.5
WP_036976679.1|1861847_1862270_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004247148.1|1862428_1862950_-	DUF1440 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_004247487.1|1863260_1863893_-	antitermination protein	I6PDF8	Cronobacter_phage	7.3e-23	34.3
WP_004245983.1|1863892_1864249_-	RusA family crossover junction endodeoxyribonuclease	G8C7V6	Escherichia_phage	3.2e-44	71.6
WP_004245984.1|1864245_1864536_-	DUF1364 domain-containing protein	A0A2H4JIC4	uncultured_Caudovirales_phage	7.2e-34	68.1
WP_110706705.1|1864614_1865064_-	hypothetical protein	A0A2H4FNF5	Salmonella_phage	2.2e-13	32.2
WP_046335275.1|1865089_1866475_-	AAA family ATPase	Q716D2	Shigella_phage	1.0e-114	47.7
WP_104459722.1|1866474_1867242_-	helix-turn-helix domain-containing protein	A5LH71	Enterobacteria_phage	1.0e-23	52.8
WP_036895073.1|1867507_1867870_-	hypothetical protein	A0A1W6JNY4	Morganella_phage	2.6e-17	51.6
WP_036907955.1|1868012_1868240_-	helix-turn-helix domain-containing protein	E5AGE7	Erwinia_phage	6.0e-20	67.6
WP_049200757.1|1868345_1869071_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A2I6PIE7	Escherichia_phage	2.6e-40	42.0
WP_049200759.1|1869178_1869508_+	killer suppression protein HigA	NA	NA	NA	NA
WP_049200762.1|1869500_1870613_+	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A075BTZ7	Microcystis_phage	2.5e-10	46.1
WP_049200766.1|1871084_1871396_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017827446.1|1871404_1871611_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_049200769.1|1871607_1871820_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_012367609.1|1871987_1872263_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_012367608.1|1872385_1872613_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_110706706.1|1872864_1873119_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_110706707.1|1873115_1873337_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_110706708.1|1873333_1874260_+	recombinase RecT	F1C5B8	Cronobacter_phage	3.4e-109	66.2
WP_110706709.1|1874256_1874955_+	YqaJ viral recombinase family protein	A0A2R2Z325	Escherichia_phage	2.6e-74	57.3
WP_110706710.1|1874944_1875445_+	single-stranded DNA-binding protein	A0A1W6JNW8	Morganella_phage	3.2e-50	67.5
WP_153274246.1|1875460_1875622_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_063693443.1|1875694_1875964_+	hypothetical protein	A0A248SL63	Klebsiella_phage	3.5e-19	66.7
WP_070487054.1|1875966_1876287_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_110706711.1|1876286_1876580_+	hypothetical protein	A0A1B0UY37	Roseobacter_phage	4.4e-15	43.8
WP_110706712.1|1876572_1876926_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_104459770.1|1877582_1877828_+	excisionase	NA	NA	NA	NA
WP_004247453.1|1877784_1878786_+|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	Q9MCR4	Enterobacteria_phage	2.5e-70	44.3
1878855:1878873	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP029725|1918463:1926997|DBSCAN-SWA
TATGCTTAACATTGCAATAGCTGTATTTATCGGCGGTGGTTTAGGTAGCGTACTACGCTGGCTAATTAGCTACCGCCTTAATTCTCTTTTTCCCCATTTTGCAACGGGGACCTTGGTCGCTAACTGTATTGGTGCCTTTATTATCGCCTTTGGCATTGCTTGGTTTAGTAAAGCTCCCAATATTGACCCTATTTGGAAAATCATGCTTACCACAGGTTTTTGTGGTGGCTTAACCACCTTTTCTACTTTTTCTGTTGAGGTGGTCGCCTTATTTAATGAAGGACGAATAGGCTGGGCATTAGGCACCATGGGGGCAAACTTAGCGGGCTCGTTTCTGATGACGGCATTCGCATTCTGGCTACTCCGTGAAATGTAGTCTCTTTAACAAGATAAAAACCGTTAATCATAAAGTTGTACTCTTTTAGTTAAGCGATTTATAAGGCCTGAACTTAATATTCAACCAATGTCAGGCCTTTTAATTTGATTTTGTTCCCGGTGGTATTACTCAATAAATTAGCCAATTTTATCAATACATTCATTGATATTTTAAAATGATAGCTATGATGTATTCTTGATTTTAATAATTTAAAAAACTTTCAACCACGGTATTTATCCCGCAGCTAAATACGCAAGCTCCTCTTTAAATTTCTCAAGTCTTTTTTCATCATCAAAACGAGCGAGAGTTATGCAGTGTGGCAAGCATTGTCACCCTAAGTAGCAATGATGATGTTTAAATCCCCCCTGTATTTGACATAAAAAGACCCCCAATAATGGGTTGTCCAACTATTAGAGTATTTCAAATAGTATTTTTAAGAAAACAGTTTAATTTATTATTATCTATTTTCAATTTTTGTTATTTTTAGGTTTTTTATTATTGTTTTTGATGAGGGTTTTATATCTAATAAATGAAATTTTTTGTTGGTATCTTGATGATTTAATTGTTATTAAATTAATTCAATTATTTTTATAATAATGAGAAATTAAATGCCTCACCATTCACATTACATTTTACATGATGAGCTTATTGGTTTTGATATCTTTAAATATATAGATATTAAATTTATTTTTTCCAATAATAGGAAAAGGAGTGTTATTTACAGGCTTATTTTTTGCCGAGATGAAAATTATCATTCATTAATTAATAAGTTATATGCCGAAAATATAAAAAATTTAACTATTAGTGTTGTTAGTTTTTATAATATAGAGACTGAAAACTATCAAAATTGTGATATGTTTGATAAACCGCCAGATTCAATTAATTTGACATCATCAGAAACTCGGTATCTTTACATAACACTCATTGACATTATTCTTTTGATAGCACAAACTGAAAAAATAGATATTTTGACTTTCCAAGCATACAGTGAAGAGCTCAGAAGAGTTTATATTCGATTAATTAATAAGTACGCTGAATCGAAAAATTTAAATGTTTACGTTGAGGAGGCTTATTTTGTTATACAAACAAATATCTAAAAAGAAAAACGACAATGTTGACTATAACGCTATTAAAGTCCAGAAAAATGAGTTACTTCTTCGTTTTCAGCAGGCTAAAAAGAAGGCAGAACAAGATAGTCAGCTTTTAGTAAAATAGTTTTAATTTATTTTAATAAATACTGTTCAGAAAGTGTCTGAAATGCTTCATCCGCTGACCATTGATTGGCAATGATGATGTTTAAATCCCCCCTGTATTTGACATAAAAAGACCCCCAATAATTGGTTGTCCAACTATTGGGGGTCATTTCAAAAACGTTTTTTACTTTTGGAGAAGTCGTTAATTAGATAGCGACAACGTTTGCAGCAGATGGCCCTTTCGCGCCGTCAGTAACTTCAAACTCTACCTTTTGACCTTCAGCAAGTGTTTTAAAACCTTCTGAAACAATAGCGGAAAAGTGGACGAACACATCTTTACTGCCATCTTCTGGAGTGATAAAACCAAAACCTTTAGTTTCGTTAAACCACTTAACGTTACCTTTTAATTTAGACATCAAGTTTACCTTTAAAATAGAAAATAAACGCAAGCGTTTTGCGTTGGCTATAGTAAAACAAAAATGATGATTCGCTGTCCACAGTCTAGATCACGAAACGCGTATTTTTTTTCTGTTAAACGATTATTATTCAGACAAATCCCATAACTTAAGCCATTAATCACTTAAGAAATAGTGCTTAATACTTACAATATGAACTATTCATCAATATCCACTTTTTCATAGTGTAATAGCCAACGTTTGATATCAAGTCCCCCAGTATAGCCTACTAACTTACCATTATGACCAATGACGCGATGGCAAGGAATAATTAACGAGATTGGGTTACGTGAATTTGCCATTCCTACCGCTCTGCAATAGTTGACGGAACCTAATGTAAGTGCCAACTTTTTATAACTCCAAATTTCACCATAAGGAATAGACTGTAAAGTCTGCCAAACGCGTATTTGAAATTCGGTTCCTTTTGGCGCTAGTGGCACTGAAAATAGGGTTCGTTTACCCGAAAAATACTCTTTTAACTGTTTTATACACAGGTCAATTATGGCATTTGAATTAACTAACGCCTCTTTTTCACTAACAAAGTTAAGGCTGGTGATGCCATCATCATCTGCGGTAATGGATATATAAGGCTTTGGAAAACCTTTCGGCGTATTGAGATAATCTTGGTACATAATGTGTTCTCTATTGATTTGTCTGTATCATCAAGATTAAAACATGCTTTGTAAGTAAATCAATCATCTAATTTTCTACTATACCTAATAAAAATTGCTCAAATGAGCGATAAGAAAATAAAATAAATCTGCTAACTGCTTAATTTTAATAATAATCATTATCAAGAATAAAAAACACCATATCTAGTGTGGTTGAAAAAGAATAAACCTATATATAGTATTTAAGCACTTTTCATTGTGACTGTGAGCAGACACATTCACATTTTTATAAGGGTTATTCTATGTCTGTGATCCTCTATACCAAACCAAATTGTGTTCAATGCAGTGCAACCGAGCGCGCATTACAACAACAAAAAATTCCTTTCACTGCGGTTGATCTCACCCAAGACACTCAAGCATTAGCAAAAATAGTTTCTATGGGATATCGCCAAGTACCGGTTGTCGTTAATGGTGACGAACATTGGTCTGGCTTTTGCCCAGATAAAATTCGTCAAATAGCGCGCTAAAGGAGCAACTTATGCAATCGACTGCCCCTTTAATTTATTTCTCTAGTCGCTCAGAAAATTGTCACCGCTTCGTACAAAAACTTAATCTACAAGCGACAAGGATAAAAGAGGATGAACCACTACAAGCCACACAACCTTTTGTGTTGCTCTGCCCAACTTATGGTGGCGGTGGCGTTAAAGGCGCAGTGCCTAAAGCGGTGATCCAGTTTTTAAATATCCCTGAAAATCGCCAATTAATACGCGGTGTTATTGCTTCAGGAAATACCAATTTTGGCTCTGCTTACGGCTTAGCAGGTGACATTATTGCACAAAAATGCCAAGTCCCTTTTCTCTATCGTTTTGAGTTACTTGGTACGCCTGAAGATGTTAAACGTGTAAAAACCGGATTAAGCACATTTTGGTCAGCAAGCAAATAATGACTAAAAAGTGAATGAGATAAAAAACATGACCCACTCTATAGAACAACTCGATTATCACGCCTTAAATGCCATGCTCAATCTCTATGATGAGCAAGGCAATATCCAGTTTGATAAAGACAAATTAGCCACCCACCATTTTTTTCGTCAACACGTTAATCAAAATACGGTGTTTTTTCATGATCTAAAAGAAAAGCTCGATTTTCTGGTGCAACAACACTACTACGAAGCACAAGTATTAGAGCAGTACGATTTCCCGTTTATCAAACAGCTTTTTAAGCATGCCTATAGCAAAAAATTTCGCTTTCAATCGTTCCTAGGTGCATTTAAATACTACACCAGTTACACCTTAAAAACCTTTGATGGTGAGCGTTATCTCGAACGCTATGAAGATCGTGTTTGTATGGTTGCCTTAACCCTAGCACAGGGGAATACCAAACTCGCCACTCACCTTGTCGATGAGATAATTAGTGGCCGTTTCCAGCCTGCAACCCCTACTTTCTTAAATTGTGGAAAAAAACAGCGTGGCGAATTGGTCTCTTGTTTTTTATTACGTATCGAAGACAACATGGAGTCCATTGGCCGAGCAGTCAATTCTGCGTTGCAATTGTCGAAACGTGGCGGAGGTGTTGCTTTCTTACTGACTAATTTACGAGAAGCAGGAGCCCCCATAAAACGCATTGAAAACCAATCGTCTGGCGTAGTACCGGTAATGAAAATGCTTGAAGATGCCTTCTCATATGCCAATCAATTAGGCGCAAGACAAGGTGCTGGAGCGGTTTATCTCCATGCTCATCATCCTGATATCTATCATTTTCTAGATACAAAACGAGAAAATGCTGATGAAAAAATACGTATTAAGACGCTTTCATTAGGTGTCGTTATTCCCGACATCACCTTTGAATTAGCTAAACGCAACGAAGATATGTATCTATTTTCACCTTATGATGTAGAACGAGTATATGGCGTTCCTATGTCAGAAATCAGTATTAGCGAAAAATATACTGAAATGGTCAACAATGCAGAGATACGTAAGAAAAAAATTAAAGCACGGGCATTTTTTCAAACTTTAGCTGAAATTCAATTTGAATCAGGTTATCCCTATATTATGTTTGAAGATACCGTCAATCGCGCAAATCCGATTGCGGGCCGAATTAATATGAGCAATTTATGCTCAGAAATCTTACAAGTAAATAGTGCCAGTGAATACAATCCTGATTTAAGTTATCGACAAATTGGTCATGATATTAGCTGTAATCTCGGATCAATGAATATCGCCATGGCGATGGACTCACCAGATTTTGCACATACCGTAAATGTTGCCATCAGAGCACTGACGAGTGTGGCACAAATGACTAAAATAGAATCTGTACCTTCTATTGAAAAAGGCAACCAAGCATCTCATGCCATTGGCTTAGGGCAAATGAACTTACATGGTTATTTAGCCCGTGAAGGGATTTATTATGGTTCAGAAGAAGGACTTGATTTTACCAATATCTATTTCTATACCGTAACATACTATGCCCTTTTAGCCTCTAACCAATTAGCGATAGAGACTAAACAGCGCTTTAAAGGGTTTGAACAGTCAAAATATGCCACTGGGGAGTATTTTGATAAATATTTATCAAAACAGTGGTTACCTAAAACCCAAAAAGTCCACCAGCTATTTAGCCAATCCAATATTCATATTCCAACCCAAGAAGATTGGCAAAAACTTAAGCTCTCGATTATGACTCACGGTATTTATAATCAAAACTTACAAGCAATACCACCAACAGGATCAATCTCTTATATCAATCACTCTACATCGAGTATTCACCCCATTGTGGCACCGATTGAAATAAGAAAAGAAGGTAAAATCGGTCGGGTTTATTACCCCGCCCCTTTTATGACCAATGAAAACCGTCATTTTTATCAAGATGCTTATGAAATTGGCGCAGAAAAAATTATCGATACCTATGCCCAAGCATCACAACATATCGACCAAGGATTGTCGCTAACATTATTCTTTTCTGATGAAGCAACCACAAGGGATGTTAATAAAGCACAAATTTATGCATGGCGTAAAGGTATAAAGACCTTGTATTACATTCGTATTAGACAAACAGCATTAGCCGGCACAGAAATAAAAGGCTGTGTTTCATGCGCCCTTTAATAATAATGATAAGGAAAGTGTTACTATGTCTGCATCTTATTTAAGTCGTGTTAATGCGATAAATTGGAATCGTATTGAAGACGAAAAAGATTTAGAAGTTTGGAACCGTTTAACCATGAATTTTTGGTTACCCGAAAAAATTCCACTTTCTAATGATATACCTTCATGGAATACCTTAACCCAAGCTGAAAAACAGTTGACTATCCGTGTATTTACAGGGCTTACACTGCTCGATACGATACAAAATACGGTCGGGGCACCAACCTTAATGCCTGATGCTCAGACTCCTCATGAAGAGGCGGTATTATCGAATATCTGTTTTATGGAAGCGGTACATGCTCGCTCTTATAGCTCGATATTTTCGACACTCTGCTTAACAACAGATGTTGATGATGCTTATCGTTGGAGTGAAGAAAATACCTATTTGCAAAAGAAATCAGATATTATTCTGCGTTATTATCAAGATAGTGATCCATTAAAGAAAAAAATTGCCAGTGTATTTTTAGAGTCTTTTTTATTCTATTCTGGATTTTATTTACCAATGTATTGGTCAAGTCGAGGGAAATTAACCAATACAGCCGACTTAATTCGTTTAATTATTCGTGACGAAGCTGTGCATGGTTATTATATTGGCTATAAATTCCAAAATCAGTTATTAAATAAATCATCATTAGAGAAACAAGATATTAAAGACTTTGCTTTCTCATTATTATTAGATTTATATGATAATGAAGTTAAATATACAGAAGATCTCTACGACTCTGTCGGTTGGACAGAAGATGTAAAAAAATTCCTTCATTATAATGCGAATAAAGCGCTGATGAATTTAGGTTATGAAGCACTATTTCCAGATGAAATAACTAATGTTAGTCCAGCAATACTTTCATCACTATCGCCAGATGCAAATGAAAATCATGATTTCTTTTCTGGCTCAGGCTCTTCTTATGTTATCGGTAAAACGATCAATACCGAAGATGATGACTGGGATTTCTAGCTAACCCTCTATAGTAAAAAAACAGAATACATTCATATTAATTATGAATTAATCGATAAATATAATGCACTGAAAAATAAAACTTATTTTTTAGTGCCTTTTTATTTGCTTGAAAAACAACCTGATTGTGTGATTTTTACCGTCCCATTAACCAGAATTATCAATTTTTTACGAATGATTTTTATGACTAGTTATCGATAACTTAAGATCACCCTCATAAAACATAAGATTTTTTAATGTTAACGCGTTTTTTTCCATTTTTATTTTATCAGTATCTTTTTACATTTTTTTATTTTGTTGTTATTTCTATTGTGATGATAATTAAAATTAACATCTGATTAAAAATAATGTTATTTCATACAGTTAGTATGAATTTTTTGACGTTCTTCTTTTCTATAACTTTACTTTATTTAATTATTAATTATCAAAAAAAATCTGAAAAAATTACAAAATTATTTGTTTAATTATAATTAACATAGGGTTGTCAGGCTTGTTCATTATGATAGGGTAATTCCCCTACTAAAAATCTCAATTTAGGAAAAACAACAAACTAATTTATTAACATTTAATTTATTCCTTTCATATTTAAATAGGAAAATAGATATTGCATGGCAATTAAACTCGAAGTAAAAAACCTATATAAAATATTTGGTGAGCACCCTAAACGTGCCTTTGAATTATTAGGATCTGGTATGAACAAAGACCAAATCTTTGATAAAACAGGGTTAACCGTTGGTGTGCAAAATGCCAATCTGGCCATTGAAGAAGGCGAAATATTTGTCATCATGGGATTATCAGGCTCTGGTAAATCTACATTAGTGCGCCTTCTCAATCGTCTGATAGATCCCACTAAAGGCGAAGTCCTTATTGATGGTGAAAACATCACCACCATGTCTGATAAAGATTTACGACAAGTTCGACGTAAAAAAATCAGTATGGTGTTTCAATCATTCGCTTTAATGCCTCATATGAATGTACTCGATAATACAGCATTTGGTATGGAGCTTGCAGGCATTAGCAAAGAAGAGCGCTATGAAAAAGCCATGGCAGCATTAGAGCAAGTTAACTTAAGCTCTCATGCTCAATCTTGGCCGGATGAGTTATCCGGTGGGATGCGACAACGTATTGGGCTTGCTCGTGCACTGGCCAATGATCCTGATATCTTATTAATGGATGAGGCATTCTCCGCACTTGACCCATTAATCCGAACAGAAATGCAAGATGAGTTATTGAGCTTACAAGGTGATAAACAACGCACCATTGTATTTATTTCTCATGATCTGGATGAAGCCATGCGTATTGGCGATCGTATCGCGATTATGCAAGGTGGTGTGGTGGTACAAATCGGTACCCCTGATGAAATTCTTAATAATCCAGCCAATGATTATGTACGTACCTTCTTCCGTGGCGTTGATATCAGTCATGTATTTAGCGCTAAAGATATTGCTAAACGTCGCCCAGAAACACTACTGCATATTGCGCCAGGTTTTGGTCCCCGTTCAGCATTAAAAGTACTGGAAGATGAAGATAGAAACTTTGGTTATTTAATTGAGCGAGGACGGAAATTTGCAGGTATTGTTTCTGTCACTTCTCTTGAAGAAGCATTAAAAGCGAAGCAACCTATTGGATCCGCTATTTTAACTGAACCTTGTGCGATTAATGGTGATACACCATTAAATGAACTGATTTCTACTGTTGCGCAATCTCCCTGTGCGATCCCTGTTATTGATGAAAAAAACCGTTATATCGGTTTAATTTCGAAAGGAATGTTGTTACAAGCACTGGATAAGGAGACACCAAATGAGTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP029725|1918463:1926997|1918463_1918838_+|WP_004246058.1|DBSCAN-SWA
MLNIAIAVFIGGGLGSVLRWLISYRLNSLFPHFATGTLVANCIGAFIIAFGIAWFSKAPNIDPIWKIMLTTGFCGGLTTFSTFSVEVVALFNEGRIGWALGTMGANLAGSFLMTAFAFWLLREM
>NZ_CP029725|1918463:1926997|1920237_1920447_-|WP_004246068.1|DBSCAN-SWA
MSKLKGNVKWFNETKGFGFITPEDGSKDVFVHFSAIVSEGFKTLAEGQKVEFEVTDGAKGPSAANVVAI
>NZ_CP029725|1918463:1926997|1925797_1926997_+|WP_004246075.1|DBSCAN-SWA
MAIKLEVKNLYKIFGEHPKRAFELLGSGMNKDQIFDKTGLTVGVQNANLAIEEGEIFVIMGLSGSGKSTLVRLLNRLIDPTKGEVLIDGENITTMSDKDLRQVRRKKISMVFQSFALMPHMNVLDNTAFGMELAGISKEERYEKAMAALEQVNLSSHAQSWPDELSGGMRQRIGLARALANDPDILLMDEAFSALDPLIRTEMQDELLSLQGDKQRTIVFISHDLDEAMRIGDRIAIMQGGVVVQIGTPDEILNNPANDYVRTFFRGVDISHVFSAKDIAKRRPETLLHIAPGFGPRSALKVLEDEDRNFGYLIERGRKFAGIVSVTSLEEALKAKQPIGSAILTEPCAINGDTPLNELISTVAQSPCAIPVIDEKNRYIGLISKGMLLQALDKETPNE
>NZ_CP029725|1918463:1926997|1921399_1921624_+|WP_004246071.1|DBSCAN-SWA
MSVILYTKPNCVQCSATERALQQQKIPFTAVDLTQDTQALAKIVSMGYRQVPVVVNGDEHWSGFCPDKIRQIAR
>NZ_CP029725|1918463:1926997|1919446_1919935_+|WP_004246061.1|DBSCAN-SWA
MPHHSHYILHDELIGFDIFKYIDIKFIFSNNRKRSVIYRLIFCRDENYHSLINKLYAENIKNLTISVVSFYNIETENYQNCDMFDKPPDSINLTSSETRYLYITLIDIILLIAQTEKIDILTFQAYSEELRRVYIRLINKYAESKNLNVYVEEAYFVIQTNI
>NZ_CP029725|1918463:1926997|1921635_1922040_+|WP_004246072.1|DBSCAN-SWA
MQSTAPLIYFSSRSENCHRFVQKLNLQATRIKEDEPLQATQPFVLLCPTYGGGGVKGAVPKAVIQFLNIPENRQLIRGVIASGNTNFGSAYGLAGDIIAQKCQVPFLYRFELLGTPEDVKRVKTGLSTFWSASK
>NZ_CP029725|1918463:1926997|1920644_1921118_-|WP_004246069.1|DBSCAN-SWA
MYQDYLNTPKGFPKPYISITADDDGITSLNFVSEKEALVNSNAIIDLCIKQLKEYFSGKRTLFSVPLAPKGTEFQIRVWQTLQSIPYGEIWSYKKLALTLGSVNYCRAVGMANSRNPISLIIPCHRVIGHNGKLVGYTGGLDIKRWLLHYEKVDIDE
>NZ_CP029725|1918463:1926997|1924220_1925189_+|WP_004247427.1|DBSCAN-SWA
MSASYLSRVNAINWNRIEDEKDLEVWNRLTMNFWLPEKIPLSNDIPSWNTLTQAEKQLTIRVFTGLTLLDTIQNTVGAPTLMPDAQTPHEEAVLSNICFMEAVHARSYSSIFSTLCLTTDVDDAYRWSEENTYLQKKSDIILRYYQDSDPLKKKIASVFLESFLFYSGFYLPMYWSSRGKLTNTADLIRLIIRDEAVHGYYIGYKFQNQLLNKSSLEKQDIKDFAFSLLLDLYDNEVKYTEDLYDSVGWTEDVKKFLHYNANKALMNLGYEALFPDEITNVSPAILSSLSPDANENHDFFSGSGSSYVIGKTINTEDDDWDF
>NZ_CP029725|1918463:1926997|1922068_1924195_+|WP_004252248.1|DBSCAN-SWA
MTHSIEQLDYHALNAMLNLYDEQGNIQFDKDKLATHHFFRQHVNQNTVFFHDLKEKLDFLVQQHYYEAQVLEQYDFPFIKQLFKHAYSKKFRFQSFLGAFKYYTSYTLKTFDGERYLERYEDRVCMVALTLAQGNTKLATHLVDEIISGRFQPATPTFLNCGKKQRGELVSCFLLRIEDNMESIGRAVNSALQLSKRGGGVAFLLTNLREAGAPIKRIENQSSGVVPVMKMLEDAFSYANQLGARQGAGAVYLHAHHPDIYHFLDTKRENADEKIRIKTLSLGVVIPDITFELAKRNEDMYLFSPYDVERVYGVPMSEISISEKYTEMVNNAEIRKKKIKARAFFQTLAEIQFESGYPYIMFEDTVNRANPIAGRINMSNLCSEILQVNSASEYNPDLSYRQIGHDISCNLGSMNIAMAMDSPDFAHTVNVAIRALTSVAQMTKIESVPSIEKGNQASHAIGLGQMNLHGYLAREGIYYGSEEGLDFTNIYFYTVTYYALLASNQLAIETKQRFKGFEQSKYATGEYFDKYLSKQWLPKTQKVHQLFSQSNIHIPTQEDWQKLKLSIMTHGIYNQNLQAIPPTGSISYINHSTSSIHPIVAPIEIRKEGKIGRVYYPAPFMTNENRHFYQDAYEIGAEKIIDTYAQASQHIDQGLSLTLFFSDEATTRDVNKAQIYAWRKGIKTLYYIRIRQTALAGTEIKGCVSCAL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_004246058.1|1918463_1918838_+	fluoride efflux transporter CrcB	A0A2H4J148	uncultured_Caudovirales_phage	2.7e-25	52.0
WP_004246061.1|1919446_1919935_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004246068.1|1920237_1920447_-	transcription antiterminator/RNA stability regulator CspE	A0A1W6JNX5	Morganella_phage	5.9e-22	74.2
WP_004246069.1|1920644_1921118_-	methylated-DNA--[protein]-cysteine S-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_004246071.1|1921399_1921624_+	glutaredoxin-like protein NrdH	V5UN81	Mycobacterium_phage	1.4e-13	47.9
WP_004246072.1|1921635_1922040_+	class Ib ribonucleoside-diphosphate reductase assembly flavoprotein NrdI	R4JF54	Bacillus_phage	3.7e-12	38.5
WP_004252248.1|1922068_1924195_+	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit alpha	V9VI16	Lactococcus_phage	1.5e-205	51.3
WP_004247427.1|1924220_1925189_+	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit beta	R4TBI6	Mycobacterium_phage	3.5e-133	71.0
WP_004246075.1|1925797_1926997_+	glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein ProV	G3M9Y6	Bacillus_virus	3.8e-28	37.6

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP029725|2096181:2175081|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_000437242.1|2114044_2114749_-	TIGR03761 family integrating conjugative element protein	NA	NA	NA	NA
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WP_004239737.1|2117221_2117506_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_104459493.1|2124518_2125289_+	phosphoribosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_107034653.1|2126404_2126512_+	DUF2618 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_110706728.1|2126886_2129049_+	ornithine decarboxylase SpeF	NA	NA	NA	NA
WP_094959648.1|2129112_2130441_+	putrescine-ornithine antiporter	NA	NA	NA	NA
WP_104731526.1|2130570_2131248_+	TetR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_001985443.1|2131515_2132775_-	HlyD family type I secretion periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_110706729.1|2132794_2134957_-	type I secretion system permease/ATPase	F2Y302	Organic_Lake_phycodnavirus	8.0e-29	31.5
WP_001985440.1|2134981_2136235_-	TolC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_026090475.1|2136339_2138277_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004244870.1|2143345_2143651_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_004244871.1|2144292_2145084_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_004244872.1|2145057_2145915_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036919891.1|2146252_2147404_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_052124582.1|2147416_2147953_-	type 1 fimbrial protein	NA	NA	NA	NA
WP_036919888.1|2147952_2148486_-	type 1 fimbrial protein	NA	NA	NA	NA
WP_036919887.1|2148478_2148907_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036919885.1|2148938_2149670_-	fimbria/pilus periplasmic chaperone	NA	NA	NA	NA
WP_036972201.1|2149705_2152228_-	fimbria/pilus outer membrane usher protein	NA	NA	NA	NA
WP_036919880.1|2152288_2152861_-	type 1 fimbrial protein	NA	NA	NA	NA
WP_110706731.1|2153050_2153611_-	type 1 fimbrial protein	NA	NA	NA	NA
WP_004247348.1|2153755_2154040_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_104459489.1|2154684_2155509_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036969813.1|2155505_2155958_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036969810.1|2156120_2157089_+	HTH-type transcriptional regulator TreR	NA	NA	NA	NA
WP_036969808.1|2157207_2158629_+	PTS trehalose transporter subunit IIBC	NA	NA	NA	NA
WP_110706732.1|2158654_2161372_+	glycoside hydrolase family 65 protein	NA	NA	NA	NA
WP_004252426.1|2161364_2162009_+	beta-phosphoglucomutase	NA	NA	NA	NA
WP_004247343.1|2162063_2163449_+	carbohydrate porin	NA	NA	NA	NA
WP_110706733.1|2163817_2165074_+	Zn-dependent hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_110706734.1|2165067_2165952_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_107337182.1|2166419_2168384_+|protease	metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_036919866.1|2168690_2170655_+|protease	metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_107337183.1|2170883_2172947_+|protease	matrixin family metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_004247335.1|2173605_2175081_+|protease	serralysin family metalloprotease	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP029725|3764282:3773150|DBSCAN-SWA
GTTAGTCATAGCTAATTACTTCAACAATAGGGGCAACTTTATAGAGAGCCTCAATAAGTTGACTATCAATACTTTCGGCAGGGGTTTCACAACAAAGCAGAATGCGATCAAATTGCTGATGAGCCACGTTATAGACAAAGTTAGGAATGCCTAATCCGTAATTATCAGTAAAAGTTATCGCTGATTGGATAGCAAAATTAGTGGCAATAGGTGAGCGAGTCGTCGAGCTATATTTTACAATAGCCCCTTGTTTTTCTAAGCGTTCTGCTAATAAAAAGGGTTCCCAGACAAATTCACCAGAGCCTAAAACCAATATTTTTTCACCCTCAGAAACATGAATAAATAGGCCAAGATCATTAGCAGGGGTTGTCATGCCTAAGCGTCCCCAGCTTTGTTTTCCTGTGATAGCAACCTGTCCTGAAGCAGTAATATTGACATTTGGCATAACAGGTAATGGTGCATCGGGATTGGCTTGCCATTGCCATTTTCCCTGCACTAAAGAGAAGGTTGTTATGGGTAATGGTGAACGCTTTTGCAGAGCATCACCACTCCAATCGGTTAATGTGACAGCAATAATCTGCTTAATTTGTGTTAACTTACCTTCTTCACGTAATGCAGACAGCAAGTTAAGAAAGGTATTACCTGTGGTTGCTTCATCATCAATTAACACAATGGTTTTCGCTTGCTGGATCCATTGGCGTTGTTCTAGGTTATGAGGCAAATAAAGTAGGTGATCAGTTGCATGACTGTGATTTTCTTTAAATTTACAGAATAATTCACCATCAGCAATAGGATGGCGCGTTGAAGTAAGGTAGAGGGCTTGAGGATAGCGATCTCTTACTTCATCAAAAATCCCCGCACCTAAACCGACCGCAGTTTCTGCCATACCAATAAAAAGAATAGGGCCTTCGAGTGATTGAGGAAATTGTTTGGCCATTTGTTGATAAGTTTCACGCATTTTCTTAGGTGAAACAGGAATATGGCGCCCTAATACTTTACTGACAAACAAAAAAGCGCGCTTAGGGTTGCGTCTTTCCGCAATATCAAAAAGTTCATCAAGATGTTCTAATGAGCAATTTGGCGTTACGCTTAATGTGCCACAAGTGAGTTGGCGACGATAAACAGAAGAGCCAATCAAACTATTCATTATTCTTTATTATCCGTACTAATTAGTTTTTTAAGTGCATTTATCTGGGTATAAGCTAAGCCGTGTTGAACATAACGTCACATACTGTGAATGTTTAAGCTAAAACCTGTTTTCTCATCATGAAGTTTCTATTTTATCATGTCAATCATAATGTGATCTATTTTACTTTAATTTAAAATAATTAGGTTAATGCGGTATTTTTTGTTTTTAACTTAAGTTTTAATTGTGTTTATCTATAAAAATTTCTTTTATTTCAATATGTTTACAATCTCTTGAAGTAAGTTGATAAAAATAGACTTGCCGAACTACTTCATCATGATATGATGATTTATAATTTGTATTTATATGCAAGTGATATTGTTGTTTCATTCTACCTTTGAAGGGAGTTAATTATGGTTTCATTACGCAAGGATCAGACAGTCTCTCTCAGTAAACAAGCCCCTGCACTGAGTCACCTAATGTTTGGTTTAGGCTGGGATCCTATTAAGAAAAAGGGATTTCTCGGTGGACTCTTTGGTGGTAATAATTCGATAGATTTAGATGCAAGTTGTGTATTACTCGATGTAAATGGTAAACAAATCGATACTATTTGGTTTCGTAAACTAAAATCAACTTGTCAGTCCGTTATTCACTCAGGAGATAACTTAACAGGAGAGGGTGATGGTGATGATGAAACTATTTTTGTTGATTTAAATCGTCTTCCTTCATTGGTTGAATATTTGGTTTTCACTGTCAATAGTTTCCGTGGGCAGACCTTTAATGAAGTTGAAAATGCGTTTTGTCGAGTTGTCGATAAAACAACCAATAAAGAGCTTGCTCATTACAAATTAACGGAACAAGGCGCTCATACTGGGATCGTGATTGCCGCTTTACAACGTAATCACGGACAATGGGATTTCACGGCTTTTGGCTCACCTTGTAAAGGGCTTGTCATTGACGAGATGATGCCAGATATTTTGGCGACGGTGGTGCGATAAATGACCCTAACACCTGGCGGAAATATATCCGTACCTGATCAAACGTTAATGGTGCGTATTCACTCAGGCTCACCTGTTGATGTATCTGCATTTAGGCTTTATGCCTCAGGAAAAGTGAACGGTGATGCTGATATGGTGTTTTATGGTCAAACCACTAATGATGACCGTACTATTATTTATGCAACAGCAGGTAATAGCACGTCGTTTACGGTTGACTTAACTCGCTTACGTCCTGATGTCGATAGAATTGCTTTTACAGCTACTTGTGAGGGGCAACAAACCATTGCTCATCTACAACATTTGTCTATTCAAGTTGATGCTAACAATAATGTCGTTGCGAACGGCCATGTTGATATCAATGGACGCACTGAAGCGGCATTAATTTTAGGTGAGCTATACCGTCGCAATGGAAGCTGGAAATTTCGGTTTATTGCACAAGGATTTAACGGTGGATTAAAACCATTGGCGGAATATTTTGGTGTTGATATTGCTGATCCTGAACCAGCACCAGCACCAGCACCAGCACCAGCACCAGCACCGAGCTCAGTGAACTTAAGCAAGGTTTCGCTAACTAAAGAGAAACCTGCAATTAGCTTAACTAAAAAGGATGATTTCGGCAAAATCCGCATTAACCTCGATTGGCATCGAGAAAGTAAAAGCGGTGGTTCCGGGTTATTAGGTGGATTATTTGGTGGTAACAAAGGTATTGATTTAGATATTGGCGCCTTTGTTGAACTACAAGATGGTTATAAGTCAGTGATCCAAGCCTTAGGAAATGGATTCGGTGATTTTAATCGCATGCCTTATGTTGAGTTACAAGGTGATGATCGCACTGGTGATGTAGCGGGTGGCGAGTGGATTTTTATCAATGGACGTGAATGGAAAAATATCAAGCAAGTGCTTATTTTTACTTTTATTTATGAAGGGGTTCCTAACTGGAGTAAAACAGATGGTGTGGTCACTATTCATGTTCCCGAGCAACCACCTATCGAAACACGTTTAACGGATGGTAATAATGGTCGAGCTATGTGTGCCATCGCACGACTTATTAATGAAAACGGATCAATCAAAGTTGAACGTCTCAATGAATTTTTTAAAGGCCATCGCGATATGGATAATGCCTACGGATGGGGATTTCGCTGGACTGCTGGATCTAAGTGAATACACGAAATAAGGAGAATAAAAATGAGTTTTTTCAATAAATTAAAAGAAGGTTTTAATTCCGGGCGAGCGGAGTTAACTAAGCAAGTCAGTCGTTTTAAAAACAAAAAATTTATGCAAGGTACGGTCGCAGTTTGTGCTCGTATCGCTATTGCCAGCGATGGTGTGAGTTCTGAAGAAAAGCAGAAGATGCTAGGTTTTTTAAAAGCATCAGAAGAGCTTAAAGTCTTTGATACCTCCGAGGTGATCGAATTCTTTAATAAGCTAATTAGCAGTTTTGAATTTGATACTGAAGTCGGTAAAGGTGAAACGATGAAGTATATTCTGGCAATGAAAGATCAGCCAGAAGCTGCACAATTAGCGATCCGTGTCGGTATTGCTGTTGCGAAAAGTGATGGTGATTTTGACAATGACGAAAAAGAGGCGGTGCGTGCTATTGCCGTTGCATTAGGCTTTGAGCCCGCAGAGTTTGATTTGTAATTAATTTTATATAGGGAACCGTTTAGGAATAATTATGGTATCCACACATATTGGTTTTCCGACAGAAACTGTCATTGTTTTTGTTGTACTTGCGATAGGCGCTATTTTTATCGATTTATTTATGCATCGTGCAGATAAGCCGATAACGTTAAAGAATGCTGTTTTTTGGTCAATATTCTGGGTAGTCGTTGCCATGGCATTCGCGGGTTTTTTATACGTCCACCATGGTGCAGAAGTTGCAAGCTTATTCGTGACGGGTTATGCATTAGAGAAAGTGCTGTCTGTCGATAACCTATTTGTCATGATGGCGATTTTCTCTTGGTTTGCGGTTCCTGATCGTTTCCGTCACCGCATTCTGTATTGGGGGATCATTGGTGCCATTGTATTCCGTGCGATCTTTGTTGCTATTGGTACCGGCTTATTAAGTTTAGGGCCTTACGTTGAGATAGTCTTTGCTCTGATTGTTGCTTGGACAGCCGTAATGATGCTGAGAAGTGGGAATGATAGTGAAGAAATTGAAGACTATTCACAGCATCTTGCTTATCGCTTAGTAAAACGATTTTTCCCTATATGGCCAAAAATTACTGGACATGCCTTCTTATTAACACAAAAAGAGGTTGATGTAGAGTTAGCAAAACCGGAAAACAAAGACATAACTATCGGGCGAGGTACAAAAGCTGCGTTATATGCGACACCGCTTATGTTGTGTGTGGCGGTGGTAGAGCTTTCTGATGTGATGTTTGCTTTCGATTCGGTGCCTGCAATCATTGCCGTTAGTCGTGAGCCACTGATTGTTTATAGTGCAATGATGTTCGCTATTTTGGGCTTACGTACTCTCTACTTTGTGTTAGAGGCATTAAAACAGTATCTGATTCACCTTGAAAAAGCGGTTATTGCATTGCTGTTCTTTATTGCTGTAAAGCTGGGGCTTAATGCAACAGATCATATTTGGCAGCATGGATATAGCATTTCCGCGACAACCAGCCTATTCGTAGTGCTTGGTGTTCTTGCTCTGGGTATTCTGGCAAGTTTTGTATTCCCAGAAAAAAAGAATAAATAAGGTAAATAATGATAACCGATATTCTTGGGAAATTAGAATATCGCAACATAAATTGAAGAGGTTGAAGATGAGCGTTTCTCTTTCTAAAGGTGGTAATGTTTCTTTAAGCAAAGCAGCCCCAACGATGAAAAACGTCCTAGTCGGACTTGGTTGGGATGCCCGTTCTACAGATGGTCAAGATTTTGACTTAGATGCATCTGCATTTCTGTTAGCCGCTAATGGAAAAGTACGTAGCGATGCCGATTTCATTTTTTATAACAACTTAAGATCTGCCGACGGCTCTGTTGTTCACACTGGTGATAACCGAACAGGTGAAGGTGATGGTGATGATGAAGCACTAAAAATCAAACTAGATACCATCCCCAGTGATGTCGAAAAAATTATCTTTGTAGTGACTATCCATGAAGCGCAAGCGCGTCGTCAAAGCTTTGGTCAGGTATCTGGTGCGTTTATTCGTTTAGTTAATGATGACAACCAAATTGAAGTTGCTCGTTATGATTTAACGGAAGATGCATCAACGGAAACGGCGATGTTATTTGGTGAGTTATATCGTCATAACGGTGAGTGGAAATTCCGTGCTGTAGGCCAAGGATATGCAGGGGGCTTAGGCTCAGTATGTGCGCAATATGGTATTAACGCCTCTTAATCGTATGTTATGAAATCACAAATTACTGGCAGTTATTCCTAATTGTCAGTTTATTCAACACAGTAGGAGCTTTGATATGGCTGTTTCCCTTGTTAAAGGTGGTAATGTTTCGCTAACTAAAGAAGCACCAACCATGACGGTGGCTATGGTTGGTTTAGGATGGGATGCCCGCGTGACAGATGGCGCTGAATTTGATTTAGATGCGTCAGTATTCATGGTCGGTGAAGATGGAAAAGTGCTTTCAGATGCAAGTTTTATCTTCTTTAATAATAAAGTGAGCCAATGTGGTAGTGTTGAACACCAAGGCGATAATCGTACTGGAGAAGGCGAAGGTGATGATGAACAAGTCAAAATCACTTTATCCAAAGTTCCTGCTGAAGTGAAAAAACTGGTTTTTGCTGTCACTATTTACGATGCTGAAAACCGCAAACAAAACTTTGGTATGGTGAGCAACAGTTTTATGCGCGTTTATAATAACGACAATAACACTGAAATTGCACGTTTTGATCTTTCTGAAGATGCCTCTACGGAGACGGCGATGATCTTTGGTGAACTCTATCGTCATGGTTCAGATTGGAAATTTAAAGCAGTAGGCCAAGGTTTTGCGGGTGGTTTAGGCGCACTAGCCGCACAACATGGCGTCAATATTTAATCTTTCGCTAATAAAAGCGCCAAGATGGCTAGATAAATAGTTAGTTTATGGATAAAGCGGGAAAATACGTTTCCCGCTTTATTTTTATATAATCACTTATGAGTCTTTTTTAAGCGTTATTTTAATAGGTGATTTTTTTGACTTATTACTTCCTGTGTGGAAATAGCGCCAATGTGGATCTTGTGCAGCATAGAGTAATTCATGATCACCACGTGAATCGCCCCACGCCCTTAAGTGGTATTGAGTAAGATCGCCATAGACACGCTCTAATCGTTTGATTTTTTCGCCACAACGGCAGTTATTGCCAATGATTTTTCCTGTCAGCACACCATCAACCACTTCAAGTGTTGTTCCTATTAACTTTATACCAAGTCGATCCGCAAAAGGTTGCAACACCATAGCTGGAGAAGCTGAACAAATGGTCACTTCAGCATGACGGTTAATCTCTTCAGCAACGGCTAATAAACCTGCAGGACGCATTAACTTACTCCAGTAGGCTTTACAAAAGGCTTCGGCTTTTTCTTTGAGCCATTCTTCTTTGATATCGGTTAAAAAAGTTTTAATCAGCACTTCTTTTAATTCATCACGAGTCAGTTTACGTCTAAAACAACGTAATGTGGGGAATACCATTTTGATAATACGACGAGCAAATTTACGACGCCCAAAGGCAAACTTTAGAAAAGGGATAAAGCTATCGTGATAGGTTAAAGTACCATCAAAATCAAACACTGATAATGTTTTTACGGTGTTTTTTGCGTTTTCAAATTGTGGTTGCATAAATATTGAGCTCCGTAAATCATCAGAGTTTATGAGGTAAAGCGCCTATTATATCATTGTTCTCAAAATGAGATAGTATCATCAGTATCTTATTGAAAAAATAAGGTTTTTATTTTTAATCGTTGATGATATTAGTCATATAAAATGAAAATTGATATTGAGCATAAAGAAGAATGCACTAATTGATAGCGGATTATGTTTTAAAAGAATTGGTTTGTTTTATTTTATAATATACCAATAATTATAGCAGTTATTAAAAATAACTTATTTTGTTTATGATATAAAAATTTATTTAAAATAAAAATCAATGACCTAGTGTTATCTCTAATAATTAAATAAAAATATCATTGTGTCGATAAAAAATAAATCTTATCGATATGCGCATATAGGTATTTTTATCATGAGTATTAAACGAACCGTAAAATTAGGCTCTTCTTTACTGTTATTGATTTTTATTCTATCGTCTGCCTTATCTTCATTTTTTATTTATAAAATGCAAAACAATTTTACTCAAGTTGATGTCTTATCTGCACGTTATGACGATGTGTTGATGGCTCGTTATCAACTGGCTATTATGCGTTCTAATGTCAATTATCTATTACAAGACAAAGATAGTCGTGTCGCAGATCGTAACAAAATTATTCAGCAAAATAAAAAGCTAGCTATCATGGCTAAAAACACCATGGAAACATGGGTGAAAGAGAAGAAAATGACTGTTGCAGCACAAAAAAATGCTGATGATATTTCGACGTTATTTTATAATCTGATAGATAAATTAGTTTTAGATCCTAATAAATTAGCGACAATAAAGATAAAAGCTAATCAATTTGATCAAGATTTTGAACATCTTGATCAATTATTTGAAAAATATATTCAGACTAGAAATAAAAATAGTCTCTACCTTACTCATAAACAAGATTCAATGGTTGAGTTTTCTATCTACTCAACAATTATCTCATTAATTATTTTATTAATTGTTTTGTACTTTGTGCTTCATTGGATCAATAAAACCTTTGTCTCTAATCTTAATACATTGTCTGAGATATTAAATAAAGTAGGTAATGCTGACTTGGTTTTTTCTGTACCACAAGTAAAAAATGATGAGTTTGGTAAACTTTTTTCTCGTGTCAGTGATATGCAAAAAGCATTAACCTCGACAATCTTTTCTGTCAAAAAAGAGGCTATGGATATAAAAGGGGGCGCATTTAAAATTGCTTCTGGTAATCAAGAGCTTTCATCTCGTACAGAAGAACAATCCAGTGCGTTACAACAAACCGCTGCCAGTATGGAGCAGATCAAAATAGCCGTTGCTAACAATACCGATAATACAATTGAAGCAAATAATATTATTAATCAATCTACTGACATTGTTATGGATGGCGCTAATGTCATGAAAGAAGCTGTATTATCGATGAAGAAAATAGAACAAGGTGCAGTGAAAGTTGGGGAAATTAATGATGTTATTAATAAATTAGCCAATCAAACTAATATTTTGGCCTTAAATGCTGCCGTAGAAGCAGCAAGAGCTGGCGAGCAAGGGCGTGGGTTCACCGTTGTGGCCGCTGAGGTACGGAACTTAGCCGCAAAAAGTGCTGAAGCAGCAAAAGAGATTAGCCAAGTTCTTAAAGCATCTATCAATGATGTTACCTATGGTACAAATTTAGTGAATAAAAGCGGTGAGTGCATGCAAGAGATTGTCTCTTCCATTTCAAAAGTAAACAAGATCATGCAAGGGATTAGTTTAGCGTCGGAAGAGCAACGTCTTGGTGTCGAACAAATTGCAGTAGCAATTAATCAAATGGATACGGTAGTACAACAAAATGCCTCTTTGGTCGATCTCGCCGCCTCTTCTACCATGATGTTAAACGATAAAGCACAAGTGCTGATGGATAATGTCGCAGTCTTTAATATTGACGATCTTGAAAAAGAGCCAGAGCAGAAACAAGAGTTAATCAATGAACAAGAATAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP029725|3764282:3773150|3766405_3767566_+|WP_110706916.1|DBSCAN-SWA
MTLTPGGNISVPDQTLMVRIHSGSPVDVSAFRLYASGKVNGDADMVFYGQTTNDDRTIIYATAGNSTSFTVDLTRLRPDVDRIAFTATCEGQQTIAHLQHLSIQVDANNNVVANGHVDINGRTEAALILGELYRRNGSWKFRFIAQGFNGGLKPLAEYFGVDIADPEPAPAPAPAPAPAPSSVNLSKVSLTKEKPAISLTKKDDFGKIRINLDWHRESKSGGSGLLGGLFGGNKGIDLDIGAFVELQDGYKSVIQALGNGFGDFNRMPYVELQGDDRTGDVAGGEWIFINGREWKNIKQVLIFTFIYEGVPNWSKTDGVVTIHVPEQPPIETRLTDGNNGRAMCAIARLINENGSIKVERLNEFFKGHRDMDNAYGWGFRWTAGSK
>NZ_CP029725|3764282:3773150|3771581_3773150_+|WP_004245601.1|DBSCAN-SWA
MSIKRTVKLGSSLLLLIFILSSALSSFFIYKMQNNFTQVDVLSARYDDVLMARYQLAIMRSNVNYLLQDKDSRVADRNKIIQQNKKLAIMAKNTMETWVKEKKMTVAAQKNADDISTLFYNLIDKLVLDPNKLATIKIKANQFDQDFEHLDQLFEKYIQTRNKNSLYLTHKQDSMVEFSIYSTIISLIILLIVLYFVLHWINKTFVSNLNTLSEILNKVGNADLVFSVPQVKNDEFGKLFSRVSDMQKALTSTIFSVKKEAMDIKGGAFKIASGNQELSSRTEEQSSALQQTAASMEQIKIAVANNTDNTIEANNIINQSTDIVMDGANVMKEAVLSMKKIEQGAVKVGEINDVINKLANQTNILALNAAVEAARAGEQGRGFTVVAAEVRNLAAKSAEAAKEISQVLKASINDVTYGTNLVNKSGECMQEIVSSISKVNKIMQGISLASEEQRLGVEQIAVAINQMDTVVQQNASLVDLAASSTMMLNDKAQVLMDNVAVFNIDDLEKEPEQKQELINEQE
>NZ_CP029725|3764282:3773150|3770500_3771181_-|WP_012368337.1|DBSCAN-SWA
MQPQFENAKNTVKTLSVFDFDGTLTYHDSFIPFLKFAFGRRKFARRIIKMVFPTLRCFRRKLTRDELKEVLIKTFLTDIKEEWLKEKAEAFCKAYWSKLMRPAGLLAVAEEINRHAEVTICSASPAMVLQPFADRLGIKLIGTTLEVVDGVLTGKIIGNNCRCGEKIKRLERVYGDLTQYHLRAWGDSRGDHELLYAAQDPHWRYFHTGSNKSKKSPIKITLKKDS
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MSVSLSKGGNVSLSKAAPTMKNVLVGLGWDARSTDGQDFDLDASAFLLAANGKVRSDADFIFYNNLRSADGSVVHTGDNRTGEGDGDDEALKIKLDTIPSDVEKIIFVVTIHEAQARRQSFGQVSGAFIRLVNDDNQIEVARYDLTEDASTETAMLFGELYRHNGEWKFRAVGQGYAGGLGSVCAQYGINAS
>NZ_CP029725|3764282:3773150|3765820_3766405_+|WP_004245609.1|DBSCAN-SWA
MVSLRKDQTVSLSKQAPALSHLMFGLGWDPIKKKGFLGGLFGGNNSIDLDASCVLLDVNGKQIDTIWFRKLKSTCQSVIHSGDNLTGEGDGDDETIFVDLNRLPSLVEYLVFTVNSFRGQTFNEVENAFCRVVDKTTNKELAHYKLTEQGAHTGIVIAALQRNHGQWDFTAFGSPCKGLVIDEMMPDILATVVR
>NZ_CP029725|3764282:3773150|3768080_3769106_+|WP_004245605.1|DBSCAN-SWA
MVSTHIGFPTETVIVFVVLAIGAIFIDLFMHRADKPITLKNAVFWSIFWVVVAMAFAGFLYVHHGAEVASLFVTGYALEKVLSVDNLFVMMAIFSWFAVPDRFRHRILYWGIIGAIVFRAIFVAIGTGLLSLGPYVEIVFALIVAWTAVMMLRSGNDSEEIEDYSQHLAYRLVKRFFPIWPKITGHAFLLTQKEVDVELAKPENKDITIGRGTKAALYATPLMLCVAVVELSDVMFAFDSVPAIIAVSREPLIVYSAMMFAILGLRTLYFVLEALKQYLIHLEKAVIALLFFIAVKLGLNATDHIWQHGYSISATTSLFVVLGVLALGILASFVFPEKKNK
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MAVSLVKGGNVSLTKEAPTMTVAMVGLGWDARVTDGAEFDLDASVFMVGEDGKVLSDASFIFFNNKVSQCGSVEHQGDNRTGEGEGDDEQVKITLSKVPAEVKKLVFAVTIYDAENRKQNFGMVSNSFMRVYNNDNNTEIARFDLSEDASTETAMIFGELYRHGSDWKFKAVGQGFAGGLGALAAQHGVNI
>NZ_CP029725|3764282:3773150|3767590_3768046_+|WP_004245607.1|DBSCAN-SWA
MSFFNKLKEGFNSGRAELTKQVSRFKNKKFMQGTVAVCARIAIASDGVSSEEKQKMLGFLKASEELKVFDTSEVIEFFNKLISSFEFDTEVGKGETMKYILAMKDQPEAAQLAIRVGIAVAKSDGDFDNDEKEAVRAIAVALGFEPAEFDL
>NZ_CP029725|3764282:3773150|3764282_3765428_-|WP_017827550.1|DBSCAN-SWA
MNSLIGSSVYRRQLTCGTLSVTPNCSLEHLDELFDIAERRNPKRAFLFVSKVLGRHIPVSPKKMRETYQQMAKQFPQSLEGPILFIGMAETAVGLGAGIFDEVRDRYPQALYLTSTRHPIADGELFCKFKENHSHATDHLLYLPHNLEQRQWIQQAKTIVLIDDEATTGNTFLNLLSALREEGKLTQIKQIIAVTLTDWSGDALQKRSPLPITTFSLVQGKWQWQANPDAPLPVMPNVNITASGQVAITGKQSWGRLGMTTPANDLGLFIHVSEGEKILVLGSGEFVWEPFLLAERLEKQGAIVKYSSTTRSPIATNFAIQSAITFTDNYGLGIPNFVYNVAHQQFDRILLCCETPAESIDSQLIEALYKVAPIVEVISYD

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_017827550.1|3764282_3765428_-	hypothetical protein	A0A172Q0Y1	Acinetobacter_phage	1.2e-31	27.2
WP_004245609.1|3765820_3766405_+	tellurium resistance protein TerZ	K4JRX3	Caulobacter_phage	4.2e-17	30.2
WP_110706916.1|3766405_3767566_+	tellurium resistance protein TerA	NA	NA	NA	NA
WP_004245607.1|3767590_3768046_+	tellurite resistance TerB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_004245605.1|3768080_3769106_+	TerC/Alx family metal homeostasis membrane protein	K7QKE8	Escherichia_phage	1.3e-74	47.9
WP_004249446.1|3769173_3769752_+	tellurium resistance membrane protein TerD	K4JRX3	Caulobacter_phage	2.4e-33	41.5
WP_004245603.1|3769828_3770404_+	TerD family protein	K4JRX3	Caulobacter_phage	1.2e-27	40.3
WP_012368337.1|3770500_3771181_-	HAD-IB family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_004245601.1|3771581_3773150_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	7.2e-11	33.7