Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NZ_CP029804 | Erysipelothrix rhusiopathiae strain ML101 chromosome, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,cas3,WYL,csa3 | 0 | 0 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
623199 : 662717
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP029804|623199:662717|DBSCAN-SWA 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48 | Erysipelothrix_phage(21.74%) | tail,holin,capsid,portal,protease,integrase,terminase | attL 627116:627140|attR 663476:663500 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
668377 : 747171
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP029804|668377:747171|DBSCAN-SWA 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59 | Tupanvirus(15.38%) | transposase,bacteriocin,tRNA,protease,integrase | attL 727903:727919|attR 752333:752349 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1358277 : 1387456
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP029804|1358277:1387456|DBSCAN-SWA 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32 | Streptococcus_phage(96.3%) | integrase | attL 1360911:1360925|attR 1378959:1378973 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1391034 : 1404408
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP029804|1391034:1404408|DBSCAN-SWA 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8 | Streptococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1730600 : 1739448
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP029804|1730600:1739448|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP029804|1730600:1739448|1732667_1733123_-|WP_003774367.1|DBSCAN-SWA MIKIIAIGKIKEKPMQALIQEYEKRLKPIHSVEMIELTNSNKSDVTSIIEDECQRILEKIDDRDYVVLMDLSGKDLDSVSMSEKIMDLIDMGKPITFIIGGSHGVNQSIRERSNYRWKISNLTFPHQLVRLMLYEQVYRFFMISKNHPYHK >NZ_CP029804|1730600:1739448|1738077_1739448_-|WP_003774361.1|DBSCAN-SWA MRKLPYSQDAEMALLGTLLVFPESVAVVEEYDMQVDDFYNTEHQKIFSHMLEIIERGRVLDATTLITRLKDQHEIDSVGGVEYLFALTENSATPASVKHYIEVVQEKAQMRRLIDVGQSIAEKGFDSTTELTALLDEAEQRILEVTRVRRTTEMQRSREVVNEVMENLNRIRDNHDRITGLKTNYSHLDNVTNGLQRGDLIILAARPSVGKTAFALNLALNAARHNKDEKAGMAIFSLEMPATHLISRMLSAQSSVKSEYLRTGNLNDEQLNNVYAGANVLSKLNIFIDDSSTITVPEIFSKCRKLKSEGNLDMIVIDYIQLISGRGKTESRQQEVSEISRGLKQLAREMDCPVIALSQLSRLVERRDSKIPQLSDLRESGSIEQDADIVMFLYREDYYKDREGEEDDGPQMPKPEQQEVLLKMAKHRNGALADITLMFNASISKFYGVAGDGGRM >NZ_CP029804|1730600:1739448|1736567_1738076_-|WP_003774363.1|DBSCAN-SWA MKKHKNLIMISVVFLFAIGLGYLYKSPTSASEIKTAYEAIDSSSAIFPQEVVTVNDKPVVITKLYREQKLVGVLKDSTRLQKMFDEVYENEYKEEFPDSKLGFIDDLIQVDEMSFNVYEDRDNDIFDYLYKENLFAIEANKVTFSNGAIIYVKNSEDFDSARDKFIQNFTSESTFDAIKNNKKIPAITDYGTKDIDVKVKETVKVTRGLATKDKILKDETEILTFLSYGYNPKVETYKIKPFDTLEGIAYHSGMNVNQIQSINADKIKDVNQVLEVGSELRVSKFDSPFTVTVTKQRMTTEPVYPEKTVYQSDPELAEGKEVVDVVEQNGARDVIYEDVYENGASISTKEISSKETKKPVRGVIRYGTKVEPKVGSGAWRWPLDNAYVLCGYGCYPNHSGTDFSTHGSGYGPIYAIDRGVVTTNSYDPGGWGNYIVIDHGNGYRSLYAHMASPGYFQAGQTVAKGENIGYVGMTGRTSYPHVHLEIIVGGGTRVDACGVIGC >NZ_CP029804|1730600:1739448|1734219_1734948_-|WP_013853428.1|DBSCAN-SWA MKYSMLASGSKGNCCLVESQGVRIMIDCGTTKRYLKQSFESLALTFDDVDCVLITHDHGDHTSQLKHFAHHQIYCPSEIMFNHTKVEPYTPFHVGPFIITAVKTSHDADDSVGYIVDDGSRKLVYITDTGYIREQDFELIKDADYYILESNHDPELLMQTNRPYAIKRRILSDTGHLSNEEAGVLLSKVVSEKTKEILLAHLSSEANDEYLALSTVRELVDNEGIEFNVAKQFEIVIGGYQI >NZ_CP029804|1730600:1739448|1732330_1732597_-|WP_003774368.1|DBSCAN-SWA MKEITVTVIDPVGLHARPATVAVNAASKFKSEIKISYKGKAVNMKSIMGVMSLGIPTQSEIVISAEGEDQDDAIATIEEVLKAQKVIA >NZ_CP029804|1730600:1739448|1730600_1732268_-|WP_013853426.1|DBSCAN-SWA MSLDRWNELARDYSWIEEAMQTMDESTKHDAFYKSLEFGTAGMRGLLGIGPNRMNVYTVAKASVGFAKYLVETFKDQELKIAIAYDNRHMSKEFADVSAMVLSTYGIKSYIFSQPRPTPELSFAVRTLNCVGGIVITASHNPKEYNGYKVYDENGCQLVDHKIARVISLINEEPDETKVDINQGNRSMITYMEADFDETYKDAIHSIQLRPEEVKTLSVVFTSQHGTSYPLVPDILTNAGYNVIPVMEQSNYDPNFSNTKTPNPEEKASYDLAVEYAVKHDADLVLSCDPDADRMGIVVKHHDEYVYLTGNQGGSILQEYIYATRIEKETMPENPIMFNTVVTSDLGEKIAQSYGVNVEKTLTGFKYIGDSIENHNKVGDFNFVFGYEESYGYLLADFVRDKDALQACMMVAEAANYYKNHGLTLVDVLNGLYDRHGAYHETQVAITLSGQEGLNRIQEILTTFRESNIEAFAGIKVLYRDDYLTSSRSNGERLTLPKSNVIKYSLEDGSWIAIRPSGTEPKCKFYYCVVGKTIEESLLKFEALKKDINERAQLD >NZ_CP029804|1730600:1739448|1733119_1734223_-|WP_016357484.1|DBSCAN-SWA MRKDQGFKNTFIGILVILLAWNGFLTYQVYDLNNRPTVTEKTEDGKTVEKVVTEFETDPTKVVENVRDQVVSVLNVQSGQLAGSGSGVVYKNEGGKIHIITNNHVTEKGEQYYVQFSNGEKVEAKLLGADPFTDLALLQVETDSDVKPMKLGDSSVVKVGEFVLAIGSPVDLEFANSVTFGVISGKDRKVPVDLNGDRNPDWDMVVMQTDAAINPGNSGGALVNMNGELIGINSMKLSSAQVEGMGFSIPINEVVPIIKQIEETGKVQYPVIGISGVSVSEMNPFLKNYYKVPSDVNAGVFIAELTQNGPARKADIKEGDILTHINDKAISSYREFRRELYAHKVGDTVKLTINRNGEIHEVEVTLQ >NZ_CP029804|1730600:1739448|1734964_1736500_-|WP_003774364.1|DBSCAN-SWA MKQHKELKLILITFIVSVLITYAIETVSANTSVVDLYKLTDTSTSIFPQESEGKSDKPIEVTKLYRDEKLVGIISDGSKLNKMFDKVYEEEYKAEFPDSKLGFIDDLILVKELSFNHYEDRDDEIFQYLYDEKLFAIEVNQVTFSNGAIIYVKNIDDFNKARDTFIRNFTDDKTFDAMKNNRKIESIKDYGTHDVNVEVEETVQISKGLTSKENILMNESDVLTFLSYGYNPKVEIYEVQPYDTIAGIAWHKGMDANQIKYINSDIIKDVNQVLEVGSKLRVSKFNSPFTVKITRERMTSEVVYPESTIYESDPELSEGKEVVDVVEQNGKRDVVYEDVIVNGAPKSSEEIRTQVTKEPIRGKVRYGTKVEPRIGSGNYRWPLDNANISCVYGNSCYYNHNGTDFVLNGGGFGPIYAVDRGVVSETVSGCFEGNYGCGSGWGNHIVIDHGNGYTTLYAHMATGPYFNVGDLVKRGDNIGYMGMTGTTYGPHVHLEFRYHGVRVDPCTVMGC |
8 | Streptococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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