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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 107030
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>NZ_CP021327|0:107030|59031_59346_+|WP_001262280.1|DBSCAN-SWA MANARLEIRYPDNSIAYDSTTDHVITFVTTVTIQQSSYSKQNIAGINDGPRWAVPTDAIYTNGRYIIFNVEITFGKTTGGAPVIYAKHDWGLPPETNTFKIFHH >NZ_CP021327|0:107030|18892_19318_+|WP_000960557.1|DBSCAN-SWA MLVKRKMLKIRRLASKGKLAQWGFISANQAQKIGLDNGFVVILSLLQGKQVEPKFTRYKLSDDIGSEYGIETDADLSSIDQSIIDAIGVAVGDIYDAAVNYDEKTAYEDEREDFERTNLMFIDIETGHAYDSNLNEAVGWA |
110 | Pseudomonas_phage(29.41%) | portal,integrase,transposase,terminase,tail | attL 29383:29406|attR 94387:94410 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_2 |
110257 : 111121
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP021327|110257:111121|DBSCAN-SWA TATGAACGCAAAAGCTACTAATCAAGTAAAAGATGATGAATTACTTATATCTAATCTTTTTGATCAACTTGATATTGATGAATCAGAACTCGACATGGCTTTAGAGCCAACAGCCGAATCTGCTGCTGTTCAAGATGAAAAGCTAATCGATGAAGAGTTGCATGATGTTGAGTTATTAGACGACTTAAATAACACTGAACTTGAAACACTCATTAATGATGAAGAATTAGATTTAAGCCTTGAAGCAGAAGAAGTTGAAAATTCTGTTGTTTCAGATAAGAAAGTTACAGAGCCTGAGAAGTTAAAAACTGAGAATGTAACTGAAAAACAAGTACCTAAATCTACACAGCAACGTGTAACGCACTACAACTCTAAGAAGTCGGAAGTTTTACTAGACCGTCTAGGCGGTAGTGCAGACATGATTCTTCTTGAAGCGAGTGATATTGATTTACCAAATGACAAGCTTAAAGAAAAACAAGAAAACCTGTTACGTATCCTGAACAACCAACCGACGGTAATTGGTACACGAGGTAATGTTGAGACAGTTCAAAAGAAAGTAGCTGAGAAGGTCATTATCTTGTTCACCTATTTCAAGAACGGTGGAAACTTAAATAAGGTCATGAGAATCGCATTTGAGACGATTATTACAGATGGTTATATTACAACTGGTAAAGGTGGCAATCTATATAACAACCTGTTGAATGCACATTACTCAGAAGGTACAGCGCGAGCGCAGGCGGGACAGATGCTCCAAATGTTCCCCCTATTGAAAATTGCAACAAAAGAAGGAAATAAGCTAATTCCAAATGAGCAGTCGCTAATTTTAGCCAAGATGAAAGCTGATCTCTTTCCAAGTGAAAAGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP021327|110257:111121|110257_111121_+|WP_000991896.1|DBSCAN-SWA MNAKATNQVKDDELLISNLFDQLDIDESELDMALEPTAESAAVQDEKLIDEELHDVELLDDLNNTELETLINDEELDLSLEAEEVENSVVSDKKVTEPEKLKTENVTEKQVPKSTQQRVTHYNSKKSEVLLDRLGGSADMILLEASDIDLPNDKLKEKQENLLRILNNQPTVIGTRGNVETVQKKVAEKVIILFTYFKNGGNLNKVMRIAFETIITDGYITTGKGGNLYNNLLNAHYSEGTARAQAGQMLQMFPLLKIATKEGNKLIPNEQSLILAKMKADLFPSEK |
1 | Pseudomonas_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP021326_1 | 2403141-2403226 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP021326_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP021326_1
>1.1|2403164|40|NZ_CP021326|CRISPRCasFinder GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP021326_1
The CRISPR arrays of NZ_CP021326_1 >merge|NZ_CP021326|1|2403141-2403226|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGAGGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGGCCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA >NZ_CP021326|1|1|2403141-2403226|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG CCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA
>NZ_CP021326.1|WP_000795915.1|2401903_2402140_+|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NZ_CP021326.1|WP_001124846.1|2401009_2401621_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NZ_CP021326.1|WP_000885229.1|2400327_2400939_+|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI >NZ_CP021326.1|WP_000376215.1|2399715_2400171_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG >NZ_CP021326.1|WP_001990047.1|2398010_2399657_+|allantoin-permease MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA >NZ_CP021326.1|WP_000115408.1|2394380_2397845_-|response-regulator MSVMPDTSRPQQAPQRVIKTRREYNIWVADESIEDYALRYAPTSVRKWSPWTVTNTAISTVSFLAMEAIGATMLWQYGFSNALWAAIVVCTIIFLTSWPISYYAAKYNVDVDLLTRGAGFGYIGSTITSLIYASFTFILLAFEAAIMAMALELALGIPQVIGYLISALVILPLVVKGIGFINKVQAVTQPIWLLLLLLPWFFVLWKQPQILSSSLHFVGAVSNSTDFNLYYFGAACTLIFSFVIQIGEQADYLRFLPQKEKNRTAWRFAVFLGGPSWIIFGFLKVLMGMLLMVLAFQLFIPVSELDNPTYLYWVAYQQFIPNPQLALILTLALVCLAQIKINMTNAYAGSLAWSNFFARLTHSHPGRIVWLLFNVFIAIVLMEMGISHAVERILGLYSNIALAWIGAVVADLIICKPLGLSPKGIEFRRAYLYDINPVGVGALLIASVLSMLSYLGFFGLMAKGLASFIALGSAVLCVPVIAYLTTGKYYIARQPEKIQATLVANCVVCERDYELADMAGCPAYNGTICSLCCSLEARCHDLCKPDARWSVQLKKAIWHYLPERWASRLNSRVSLYLLLTLGLSIVLAVSLSLVYIQEKTYLETINAAAVPQLFTLFVKIYTILFLLMSVAAWWLVLNDESRRNAEIETHQQTALLIDEIAAHEVTSKDLQDARIAAERANDAKSRYVIGISHELRTPLNSILGYSQLLQKQEQLSEQGKMALGVISRSGQHLTSLIDGLLDLARIETGKISLNVVDVHFPNFIEQIIQMFQPQFEQKNLQFVYEIGENLPHYVRTDKKRLEQVLINLLGNALKFTTSGTITLKVEYRFQTAYFEIRDTGCGIAEADLERIFNPFERGSNVVQGGFTGIGLGLPIVKLLVDLLGGQLSVTSQLNQGSQFKIKFYLPSKEVVHPISNVYSNQITGYQGERKRILVVDNEAVDRGLVANFLKPLGFMIEEAESGIDCLRRVPIFQPNLILMDLNMPLMGGWETARLLRQNNITNVPILIISANAGEREVNPQDAVLSEDFMLKPIDLNLLLSKIGDKLGLVWIDSKSETLLENNEVQALDLNIYKQEQVAVHTLIQQPENNELLDFPQSLQQLNDLIGQGYIRGIQQTLTQCRQNFPKHNELWEQLEQAIQKFDLKHAQRLIQDKQ >NZ_CP021326.1|WP_000107128.1|2393424_2394384_-|response-regulator-transcription-factor MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH >NZ_CP021326.1|WP_001025680.1|2392996_2393281_-|N-acetyltransferase MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK >NZ_CP021326.1|WP_002017921.1|2392773_2392887_+|hypothetical-protein MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS >NZ_CP021326.1|WP_000937460.1|2392049_2392685_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT >NZ_CP021326.1|WP_000983628.1|2403857_2404271_+|hypothetical-protein MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII >NZ_CP021326.1|WP_000432330.1|2404412_2405291_+|glucose-1-dehydrogenase MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLKEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFTMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG >NZ_CP021326.1|WP_001990041.1|2405347_2407492_-|catalase-HPII MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEHGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLSYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA >NZ_CP021326.1|WP_001145693.1|2407546_2408956_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLVKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPPEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNQYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN >NZ_CP021326.1|WP_000482091.1|2409271_2409751_+|CinA-family-protein MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR >NZ_CP021326.1|WP_000108365.1|2410035_2410257_+|hypothetical-protein MSTTNNQANQRNNQQQQQQQNDNRNQQQHGNQQQNDQQQQNNQQQQQNDNRGQQQGSNQKDSGQQNSNNNQQR >NZ_CP021326.1|WP_000132044.1|2410362_2410680_+|hypothetical-protein MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDI >NZ_CP021326.1|WP_000498477.1|2410764_2410986_-|hypothetical-protein MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF >NZ_CP021326.1|WP_001136759.1|2411073_2411502_-|hypothetical-protein MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS >NZ_CP021326.1|WP_000251637.1|2411771_2411915_-|hypothetical-protein MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSRNDGMHEASDPATSHDMNKNS |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1153189 : 1167986
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP021326|1153189:1167986|DBSCAN-SWA 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10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1271512 : 1312026
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP021326|1271512:1312026|DBSCAN-SWA 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60 | Acinetobacter_phage(94.74%) | plate,capsid,integrase | attL 1271494:1271510|attR 1313289:1313305 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1372982 : 1393826
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP021326|1372982:1393826|DBSCAN-SWA 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19 | Escherichia_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1572382 : 1624854
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP021326|1572382:1624854|DBSCAN-SWA 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73 | Acinetobacter_phage(96.61%) | capsid,terminase,integrase,transposase | attL 1560947:1560962|attR 1597074:1597089 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2170343 : 2200146
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP021326|2170343:2200146|DBSCAN-SWA 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46 | uncultured_Caudovirales_phage(37.04%) | capsid,head,protease,terminase,tail,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2663460 : 2718678
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP021326|2663460:2718678|DBSCAN-SWA 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50 | Escherichia_phage(27.78%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2786380 : 2818416
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP021326|2786380:2818416|DBSCAN-SWA 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46 | Acinetobacter_phage(43.33%) | capsid,head,protease,terminase,tail,integrase,portal | attL 2786167:2786220|attR 2822253:2822306 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2829447 : 2858121
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP021326|2829447:2858121|DBSCAN-SWA 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38 | Acinetobacter_phage(93.55%) | capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2862079 : 2874427
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP021326|2862079:2874427|DBSCAN-SWA 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24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2992605 : 3044816
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP021326|2992605:3044816|DBSCAN-SWA 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45 | Vibrio_phage(33.33%) | holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3123726 : 3131823
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP021326|3123726:3131823|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP021326|3123726:3131823|3124961_3125990_+|WP_000805204.1|DBSCAN-SWA MKPTLFTPETWAEFTQQLKNSWEKDNAGTDSPIFVVQEKKIVWGLDPASDSVEITNIVDADDESTYKSIDDFFESLKATDKHALNGLAIEEEDELFLDVKASTQINILSDWNERNIHICHGKYFWEDVNCHLTRSAADAFIKRKSHDFGELRVFVKSLYWCEEFKNLLNAIISGEVGLTSIDDDNILNVLGPIEPKADKEINSTQAKKSAKKANNKEENWTRYHNDKPVESPLAGLIEKLKKTKTADAANSLIEETKDWASEDQKSFLTELNKHLVIIAGQSKENISISERVKRATDLTTLDAIEIDISEADERIQEPLMELVIKRRKELEVENNFLLESPQ >NZ_CP021326|3123726:3131823|3128231_3129224_-|WP_000527288.1|DBSCAN-SWA MGNKYYDQLVNNDSHFEITFNDFEEFITFIRPDKLHVKDLMTQLRLEFNPSAVNFPFFKIKDFKGYSTLDKSIIYRGHGESDWDLKPTFYRNKKNIGWVKTNWSVDQNYESEILLKFQDSCDLAGVQLPSDNDQLRRRQKNKLSKYRKSFGRDQLDWFDDDFFELAVYAQHYGVETRLLDWTKNPFVASYFACSHALKMNYDPNSKFCIWVLNSESITNELNQVLEVLDPPKGLNQHISHQQGVLTYTKNHIKIFNKFGTRPCLKDILKYYESGYRLLKITLGYELIVELFNYCNIHNFNACHLFRGANGAAMHTTDLLNFDDYKYPIED >NZ_CP021326|3123726:3131823|3126421_3126601_+|WP_000464381.1|DBSCAN-SWA MFEVKTAVQFDDDDVWIGSVLISKCGGNDEWTAYLDNDVEKEFETLEQAVTYCLEQAND >NZ_CP021326|3123726:3131823|3126593_3127130_+|WP_000609004.1|DBSCAN-SWA MINLANQREALIAEVEVFKKDSMELWFVPDLAASYTNRDFFSYSIIEDNQVFFMIEQTRQLWEFWNKAKDHNLPKGSVLIVEDQIKTMWQDNEEPENCVNKEKDFNCLGDCLDIEDIISITKQRYAYISAEKVYGTWVAKFEAGELKKDYFFVGSQKECEEIVESNKALYSSRMGANS >NZ_CP021326|3123726:3131823|3129784_3130669_-|WP_001076477.1|DBSCAN-SWA MNQSLFVGFWNINLSPPIGNRWNKSKVDKKIKVSRVIQGLLKLDFDFLCLCEVSPEDMEFIDNSIQLIGMGYDYNIYRKNYGGLYFDTCVIFKNTFDFVQSKVEVDGEEKNKLKVFQKYEFLSGHLEERIIFYVTHWLSQLNDNKEKRRTVASFIKKDTNDEKKFFNKTKFVVLGDFNVEPYDSAILEGLRSTRDQKVISNNSSLFYNPFWKFLQIKEDQPSGTHHCTKNEFHHWHIYDQILVSGNFFRDGWNLDDNLVLVFDDKMISSLHNDSFSNPSDHLPICLKLEKTKCI >NZ_CP021326|3123726:3131823|3123726_3124098_+|WP_001260065.1|DBSCAN-SWA MRTNYLRGSKRYENNLNGQVNQKSTFREFVGKDEEHGLYKVRLGYTVYAANHTLTRVYTVNENNELTPVSQYTLNTKEWILRNLETEIKYRRGRELGQILQKTHIPSPDRKAYKIRRGFLGTR >NZ_CP021326|3123726:3131823|3130665_3131823_-|WP_000947475.1|integrase|DBSCAN-SWA MLSDAQVKSLKPKESRYSVADGEGLNISVFPNGKKKWVLSYRQNGKQNQKMLGEYPIMGCKEARQLARQLKLEYQGKVANSPPVHKVVEEWLSIMKSQWTSKKYYDTVEYRLAYLTEDFKNLPINEVERKHISKKIKEIVAKGTLETASRALRLGKQVFDFAIASDYTDRNPCTLVEDVIPEYESDSHPCLPVSEMPEFFKRMKASHSSSIVKMAMLLVCYTGTRITELLKARWDTGEIDFENKVWIIPAERMKKRKELMVPLVPQIYALFKELESVKTDDGYIFKKRGKPYEHMTSESVLTMIKRMGYTDKMVTHGFRSLFSTHANESKLFRGEVIDYQIAHVNKTTKADKTSKIYNRAEYWDERVELMTWYANEVENWIGTNS >NZ_CP021326|3123726:3131823|3124268_3124949_+|WP_000643997.1|DBSCAN-SWA MKAIILDTETNKLNGYPIEIAYAPFSLENGQLLVHKDEVFNRFYSCPEPIDLEAMAVHNIIEADIEGQPSCESFRLPEGVEFIVGHNIDYDIKALNKCGPAIKAKAICTLALARDVWPDLTSHKLAVLYYFVMSNREEARKHLRHAHSARADVYFTGIILIALIERLGIKDLNSLFLMSEAVRLPKIMTWGKHKGTPLKELPRPYISWLLNKEDLDPHLRKALQNI >NZ_CP021326|3123726:3131823|3127838_3128054_+|WP_001292077.1|DBSCAN-SWA MSELEILESAPKDATHYFLVPNGSGEPYYVLEKEKKFYWFHGQDEITKPHILSWIKSIESLKEVKAESQEI >NZ_CP021326|3123726:3131823|3127632_3127842_+|WP_000028957.1|DBSCAN-SWA MSITLSGHQLKSLLEFVNPDGEKDLDQLDTELTIKFFEDGHSGKGYYFWMTEYPEEGAMKLDIESGAEG >NZ_CP021326|3123726:3131823|3127126_3127636_+|WP_000578497.1|DBSCAN-SWA MIFYDRAFFEENFKKTETFKQESNIRKNDILVFSETMNGYFNIVTNKAWLLWKKEMQAHADWYKNDDPIAYKWAKDGSPEYEADFYTSAKAWAAAKAQAGPTWISVKDEEPPTDIMVLICWDDAPDVTPEQDYITIDEDLNSVWANYYNDPPSHWMHFHSVPNVSGAEQ >NZ_CP021326|3123726:3131823|3128054_3128225_+|WP_000119264.1|DBSCAN-SWA MSWYSLRQLAKELGMAPNTFKKYYLEKFPPDRESKTYKGWTSQSVAKIKVEIQGAK >NZ_CP021326|3123726:3131823|3129338_3129794_-|WP_000549863.1|DBSCAN-SWA MHLDLSLAVEEGMQSSVTRDKSIEEIDNVLFEVDQAVKKATNNKVEFGWRKKGFNTLGLLTGLTSLPITDVKIESQEPESRVLYVSATDDKTQRFDITILVISPDGFPCEMNVNGNKLISHDAESLLEQFKPLLSSAFVGDKIRKLMKKGA >NZ_CP021326|3123726:3131823|3126130_3126421_+|WP_000986115.1|DBSCAN-SWA MMRNIPDSMSFPFTVWMCENGYYPSHKNGFIILKRGKEVAKISMNETKDGYPMNDICQKKFASFCRAWMNRDKHFIEQLRLRGLARLNQKSYQMVA |
14 | Acinetobacter_phage(57.14%) | integrase | attL 3124571:3124585|attR 3136483:3136497 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
3796260 : 3853334
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP021326|3796260:3853334|DBSCAN-SWA TGTGACGGTTAAGAATTCTCCAGCCGAGCTTAGTTCGGCTCTTGCGAATCAGCGAAACGATGTTCCACTGATTCGCTACTCAGGCCGGTTTGCGCCCTCGCCAACCGGCCCTTTACATTTCGGATCACTCATTACTGCTGTTGCCAGTTACTGTGATGCCAGAGCCCATCAAGGTCGATGGTTAGTTCGTGTTGAAGACACCGATATTCCCCGCATCTACCCCGGTAGTGAAGACCATATACTCGCATCACTTGAAGCTTTTCAGTTCGATCCGGATGCCGAGATCATTTTTCAAAAAGACCGCCTAGATATTTACGAAAGTGTATTAGACCAACTTAAAAAAGAGGGTCTGGTTTACGCCTGTCAATGTACCCGTAAAATGCTCGGTTCAAACGCTATCTATGCAGGCACATGTCGAGATTTGCATCTCGACTTCCAACATCAAGCCATTCGGGTAAAAGTTCAAGATCAGCCAATCTGTTTCGATGACCGCCTACAAGGGCTTCATTGTTCTAATCTAGAGCATGACCTTGGTGATTTTGTCCTTAAACGCCGTGATGGAATTATTAACTACCAGCTTGCTGTCGTCGTAGATGATTACCTACAAGGCATTACTCATGTTGTGCGAGGTGCAGACCTGTTAGATAACACTGAGCGTCAAATCTGGCTTGGTCAGCTCCTCGGCTACCCTAAGCTGAGTTACATGCATCTTCCGCTCGCCATGAACGACCAAGGGCAAAAACTTTCAAAGCAAAACCTTGCCCATGCACTTGATTTAACTAAAGCTCCTGAGTTACTACAACAAGCCATACAAGCCTTAGGTCAACCACAGGTTGATTTAGATCGCCCCGAAGTGATGCTCAAGCAAGCGGTAGCCCAGTGGAATGTAGATTTGATTCCTCATGGACAACAACTTTGCGGAACATATCTATAAATAATAAAAAGCCCGATTTGATATCGGGCTTTTTATAACGCTTCATGGTTTAGAAGTTTGATTCTTCCCTCTCAGGGTTCACTTCTTGAGTTGAAGCATCAATCTTTAAGATCAAGCTAATCATAGCTGCACACATCATTAAAGACGTACCACCATAACTAATAAATGGCAGAGTTAAACCTTTGGTTGGCATTAAGCCCATGTTCATACCCGCATTTACCAAAATCTGGAGTAAGAAAATAATACTAATACCGTAAGCCAAATAGCCTGCGCGAAGATAATGATGTTTCAAGGCACGGTGGCCGATTTTGATACAACATGCCAGCATCAAGAAAGATAAGCCAATGACAATCGAAATACCAAAGAAACCAAATTCTTCACCTAACACAGCCAACATAAAGTCAGTATGCGCTTCTGGTAAATAGGAAAGCTTTTGAACACTATGCCCCAAGCCTGTACCAAACCACTCACCACGACCAAAAGCCATTAACGCATTTGATAACTGATAACCCACACCTAATGGGTCTGCCCAAGGGTCAGTAAACGAAATCAAACGTTGGAAACGGTAAGGTTCAAATAAAATCAAAAACACAATACCCGTGACAATTGCACCAAGCATGATTAAGAATTGTGTTGGAGGCGCACCCGCTAGAAAGAACACACCGACCATCATCATGACAATAACCACCGTCGCACCCAAGTCAGGCTCGGCAATAATTAAACCTACCGTAATTGCCATAACGCCACTTAAACGAAGTAAGCCTTTCCAGTGGGTACGGACTTCTTTGGCACGGCGTACTACGTAATCTGCGGTAAAGATGGCCATCATAACCTTGGCAACCTCTGTTGGCTGCAAGGTAAAACCACCAATTTTAATCCAACGTGTGGAACCGTTAACTTCCGAACCTACAGCCAAAGCCGCAAGTAACAAAACCATAGTTAATAACCACAGTGGAAAGGTATTTTTAAACCATGTATTGAGTGATATTCGATAGGTTAAATAAGCCACCACGCCAGCAGCAACGATTGAGATCCCATGACGAATCACATAGTGAAATGGGTTTTCATGCATATATTCAGCATAAGGCATGGAAGCAGATGCGACCATCACTGAACCGATACATAACAATGCAACCACACAGAAAATCAAGACATTACGTGGCGTCACTTCCGCTGGCCATTTCGGCAATATCCGTTCATACCAATGATTGATTTTCTGGATTGTGGTCTGAGCTAAGCCTGCCATACTACATTCCTAATCATATTTTCTTTAAACCAACGAATTGACGCAGGCAACAAACTGCTGACCACGGTCATTATAACTTTTAAACATATCAAAACTTGCACATGCTGGTGATAGCAATACCACATCTTCAGCTTGTGTTTCACGTTGACACAGCTCGACAGCTTCTTTAAGCGTTGCTGCATGTAAAATTTTAGTTGCGCCTTGAATGGCTTGCTCGATGACCGGCGCATCTTCACCAATCAATACCACAACTTTGGCATATTTTTCGATAGAAGAACGTAAAGGAGAAAAATCTTGCCCTTTGCCCTGTCCACCTAAAATAAGTGCAACCTTACCTTTTTTCACTTCAATGGCAGCACCTAAGCCATCAATTGCTGCAAGTGTAGCACCAACATTGGTACCTTTAGAGTCATTATAATAACGGACATCACGCACAGTTTTAACGTACTCACAGCGATGCTCTAATCCTTTAAATCGTTTTAAAGTTTCAAGCATTGACTCCATAGGTAAACCAATTGCCTCCCCCAATGCTAAACACGCTAAAGCATTGGCTACGTTGTGCATACCTTGAATATATAAATCCGAGCTTTTAATTAACCGCTGTAAACCACGAGCAAGCCAAAGCGTACCGTCGGCATCTCTTAAAACGCCATATTGATTTAAATCTGGTGCGTTTAAACCAAAGCTTTGCATTGGTGTCGTATCTGGAACAAGTGGGCGGCTTAAAGCATCGTCTCGGTTAAATACAACTTTTTTAGCGCCTTGGAAAATACGATGTTTTGCTTGGTGATACCCCAGCATATTTCCATGACGGTCTAAATGGTCTTCACTCATATTGAGAACCACTGCTACCTCAGCGTTTAAGTGAGAGGTGGTTTCTAACTGAAAGCTTGATAACTCAAGGACTAGTAGCTCTGGTTGATCTTTAAGTAAATCTAACGCTGGTCGACCAAGATTGCCGCCTACTGCAACTTTCTTACCTGCATCCTTAGCCATTAAGCCAATTAAAGTCGTTACAGTACTTTTTGCATTGGAACCTGTAATCGCCACAATCGGCACATCAGTGGCACGACGCAATAATTGGATATCACCCACCACAGAAATACCTTTAGCAATAGCTGCCTGAATTTCCGGTAATTGTGGTGCAAGGCCTGGGCTTAAAATAATCTCTTCTGCTTGTAATAATAATTCTTGATCAAGCTGACCAAAACTGGTTTTAACGCCAGCCGGAATCTGATCGTGTCCGGGAGGTGTGGGGCGGGAGTCCGTTACAGCAACTTGGTAGCCTTGTTCATGCAGGAAATTTACAGCAGAAACACCTGATATTCCCAAGCCTGCTACAACTTTTAATCCACCACGTTGTATTAACATTTTTGCCCCACAATTTATCAATCGACAGAATGGCAAAAATGTTAGCACTTTGCTGTTTTGAATGCTTTTTCAGATTGAACTTTATTCATCTTTTTTTGTGTCAGTGCGTAAAAAAGCCATCAATATGATGGCTTTTTATACGAAACAGGAATGGCTGAATTTATTGCCATTTAACTGGTTTAATTTCTTGAATTGTATTAGTTGGTTTATCTTCACTTGAGCAGCCACAGCCACCTGCACAACCAAAAGTCATTTTTGGTTTTAGCCATTTTGCTAAAGTTGCCCAACCCTGCTTTTCACAAAAAACGGATAGTGCTGAAAAGGCCGAGTTTGCTGTTTTTGGAAATACTTTCTTAAAAACAACAATAGCACTCCAAATCACTAAAACCGCAATAATCAGATATTGAAGCATATACAACCTCCTTTACTGCTTTAACCCCAATAGTGGGAAGCAATTTGATAGGTAACAAACGATGCAAAATAAGCTAAACCAAACAGATATGCAGTCATAGCTGCAACATGTTTCCATGAACCTGTTTCACGACGTACTGTTGCCAATGTTGCCAAACAATGCGGCGCATAAATGAACCACACTAAAAGCGATAAACCTGTTGCCAACGACCACCCTGTACCATCTGCACTAATTAAATGAGACAAACCTTGTGCTACTGCATCTTCATCAGTTGCCGACAAGGCATATACGGTACCTAATGCAGCGACCACAACTTCACGAGCTGCCATAGCCGGGATTAAGGCAATACAGATTTGCCAGTTAAAACCAACTGGAGCGAATAAAGGCTGGATAAGGTGTCCAAGCATACCTGCGAAGCTGTAATCTATAGCAGGCAATGTTGCCCCTTCTGGTGGCTGTGGGAAAGTACACAAGAACCAGAGCAAAATAGAAAGCGCAAAAATAATGCCGCCGACACGCTTCAAGAAGATCTTCGCACGATCTAACAAACCGATTCCCACACTTTTTAAATCAGGGAAACGATAACTCGGCAGCTCTAGCAGTAAAGCGTGTTGAGACTTATCTTTTTGGAAAAATTTCATTAAGAATGAAACACACAGTGCACTCACAATCCCAGCCATATACAGACCGAAAAGCACCAGTCCTTGTAGGTTAAAAATACCCCAGACCATTTTCTCTGGAATAAATGCAGCAATCAGCAAGGCATATACGGGTAAACGTGCCGAACAAGTCATTAGTGGCGCAACCATAATCGTTGTAAAACGGTCACGAGGGTCACTAATACTACGCGTTGCCATAATTCCCGGTACTGCACAAGCAAAGCTTGAAAGTAACGGAATGAAAGCACGTCCACTTAAACCAGCTTGAAACATTAATTTATCAAGTAAAAATGCTGCACGCGGTAAATAGCCCGATTCTTCTAGTACTAAAATGAAGAAGAACAAAATTAGAATTTGTGGCAAGAAAACAACTACGCC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54 | Staphylococcus_phage(14.29%) | integrase,tRNA,transposase | attL 3835669:3835728|attR 3859694:3861885 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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