Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP030323 | Staphylococcus aureus strain AR_475 chromosome, complete genome | 12 crisprs | WYL,csa3,DEDDh,cas3,DinG | 5 | 2 | 10 | 1 |
NZ_CP030324 | Staphylococcus aureus strain AR_475 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP030323_1 | 501411-501496 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP030323_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP030323_1
>1.1|501441|26|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP030323_1
The CRISPR arrays of NZ_CP030323_1 >merge|NZ_CP030323|1|501411-501496|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG >NZ_CP030323|1|1|501411-501496|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG CGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGG AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG
>NZ_CP030323.1|WP_000742837.1|500270_501110_+|nucleoid-occlusion-protein MKKPFSKLFGLKNKDDIIGHIEEDRNSNVESIQIERIVPNRYQPRQVFEPNKIKELAESIHEHGLLQPIVVRPIEEDMFEIIAGERRFRAIQSLNLPQADVIIRDMDDEETAVVALIENIQRENLSVVEEAEAYKKLLEIGDTTQSELAKSLGKSQSFIANKLRLLKLAPKVLLRLREGKITERHARAVLSLSDSEQEALIEQVIAQKLNVKQTEDRVRQKTGPEKVKAQNLRFAQDVTQARDEVGKSIQAIQQTGLHVEHKDKDHEDYYEIKIRIYKR >NZ_CP030323.1|WP_000215588.1|499508_500228_+|16S-rRNA-(guanine(527)-N(7))-methyltransferase-RsmG MTVEWLAEQLKEHNIELTETQKQQFQTYYRLLVEWNEKMNLTSITDEHDVYLKHFYDSIAPSFYFDFNQPISICDVGAGAGFPSIPLKIMFPQLKVTIVDSLNKRIQFLNHLASELQLQDVSFIHDRAETFGKGVYRESYDVVTARAVARLSVLSELCLPLVKKGGQFVALKSSKGEEELEEAKFAISVLGGNVTETHTFELPEDAGERQMFIIDKKRQTPKKYPRKPGTPNKTPLLEK >NZ_CP030323.1|WP_000249657.1|497631_499509_+|tRNA-uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34)-synthesis-enzyme-MnmG MVQEYDVIVIGAGHAGVEAGLASARRGAKTLMLTINLDNIAFMPCNPSVGGPAKGIVVREIDALGGQMAKTIDKTHIQMRMLNTGKGPAVRALRAQADKVLYQQEMKRVIEDEENLHIMQGMVDELIIEDNEVKGVRTNIGTEYLSKAVIITTGTFLRGEIILGNMKYSSGPNHQLPSITLSDNLRELGFDIVRFKTGTPPRVNSKTIDYSKTEIQPGDDVGRAFSFETTEYILDQLPCWLTYTNAETHKVIDDNLHLSAMYSGMIKGTGPRYCPSIEDKFVRFNDKPRHQLFLEPEGRNTNEVYVQGLSTSLPEHVQRQMLETIPGLEKADMMRAGYAIEYDAIVPTQLWPTLETKMIKNLYTAGQINGTSGYEEAAGQGLMAGINAAGKVLNTGEKILSRSDAYIGVLIDDLVTKGTNEPYRLLTSRAEYRLLLRHDNADLRLTDMGYELGMISEERYARFNEKRQQIDAEIKRLSDIRIKPNEHTQAIIEQHGGSRLKDGILAIDLLRRPEMTYDIILEILEEEHQLNADVEEQVEIQTKYEGYINKSLQQVEKVKRMEEKKIPEDLDYSKIDSLATEAREKLSEVKPLNIAQASRISGVNPADISILLIYLEQGKLQRVSD >NZ_CP030323.1|WP_000362507.1|496185_497565_+|tRNA-uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34)-synthesis-GTPase-MnmE MDLDTITSISTPMGEGAIGIVRLSGPQAVEIADKLYKGKHLLNDVPSHTINYGHIIDPESKEVVEEVMVSVLRAPKTFTREDIIEINCHGGILTINRVLELTMTYGARMAEPGEFTKRAFLNGRIDLSQAEAVMDFIRSKTDRASKVAMNQIEGRLSDLIKKQRQSILEILAQVEVNIDYPEYDDVEDATTEFLLEQSKEIKQEINHLLDTGAQGKIMREGLSTVIVGKPNVGKSSMLNNLIQDNKAIVTEVAGTTRDVLEEYVNVRGVPLRLVDTAGIRETEDIVEKIGVERSRKALSQADLILFVLNNNEALTQEDYTLYEVVKNEDVIVIVNKMDLEQNIDINEVKDMIGDTPLIQTSMLKQEGIDELEIQIRDLFFGGEVQNQDMTYVSNSRHISLLKQARQTIQDAIDAAESGVPMDMVQIDLTRTWEILGEIIGETASDELIDQLFSQFCLGK >NZ_CP030323.1|WP_001789343.1|495688_496042_+|ribonuclease-P-protein-component MLLEKAYRIKKNADFQRIYKKGHSVANRQFVVYTCNNKEIDHFRLGISVSKKLGNAVLRNKIKRAIRENFKVHKSHILAKDIIVIARQPAKDMTTLQIQNSLEHVLKIAKVFNKKIK >NZ_CP030323.1|WP_000240855.1|495430_495568_+|50S-ribosomal-protein-L34 MVKRTYQPNKRKHSKVHGFRKRMSTKNGRKVLARRRRKGRKVLSA >NZ_CP030323.1|WP_001290433.1|493338_494700_-|chromosomal-replication-initiator-protein-DnaA MSEKEIWEKVLEIAQEKLSAVSYSTFLKDTELYTIKDGEAIVLSSIPFNANWLNQQYAEIIQAILFDVVGYEVKPHFITTEELANYSNNETATPKETTKPSTETTEDNHVLGREQFNAHNTFDTFVIGPGNRFPHAASLAVAEAPAKAYNPLFIYGGVGLGKTHLMHAIGHHVLDNNPDAKVIYTSSEKFTNEFIKSIRDNEGEAFRERYRNIDVLLIDDIQFIQNKVQTQEEFFYTFNELHQNNKQIVISSDRPPKEIAQLEDRLRSRFEWGLIVDITPPDYETRMAILQKKIEEEKLDIPPEALNYIANQIQSNIRELEGALTRLLAYSQLLGKPITTELTAEALKDIIQAPKSKKITIQDIQKIVGQYYNVRIEDFSAKKRTKSIAYPRQIAMYLSRELTDFSLPKIGEEFGGRDHTTVIHAHEKISKDLKEDPIFKQEVENLEKEIRNV >NZ_CP030323.1|WP_000969811.1|491927_493061_-|DNA-polymerase-III-subunit-beta MMEFTIKRDYFITQLNDTLKAISPRTTLPILTGIKIDAKEHEVILTGSDSEISIEITIPKTVDGEDIVNISETGSVVLPGRFFVDIIKKLPGKDVKLSTNEQFQTLITSGHSEFNLSGLDPDQYPLLPQVSRDDAIQLSVKVLKNVIAQTNFAVSTSETRPVLTGVNWLIQENELICTATDSHRLAVRKLQLEDVSENKNVIIPGKALAELNKIMSDNEEDIDIFFASNQVLFKVGNVNFISRLLEGHYPDTTRLFPENYEIKLSIDNGEFYHAIDRASLLAREGGNNVIKLSTGDDVVELSSTSPEIGTVKEEVDANDVEGGSLKISFNSKYMMDALKAIDNDEVEVEFFGTMKPFILKPKGDDSVTQLILPIRTY >NZ_CP030323.1|WP_001789359.1|491301_491547_-|S4-domain-containing-protein-YaaA MIILVQEVVVEGDINLGQFLKTEGIIESGGQAKWFLQDVEVLINGVRETRRGKKLEHQDRIDIPELPEDAGSFLIIHQGEQ >NZ_CP030323.1|WP_000775117.1|490192_491305_-|DNA-replication/repair-protein-RecF MKLNTLQLENYRNYDEVTLKCHPDVNILIGENAQGKTNLLESIYTLALAKSHRTSNDKELIRFNADYAKIEGELSYRHGTMPLTMFITKKGKQVKVNHLEQSRLTQYIGHLNVVLFAPEDLNIVKGSPQIRRRFIDMELGQISAVYLNDLAQYQRILKQKNNYLKQLQLGQKKDLTMLEVLNQQFAEYAMKVTDKRAHFIQELESLAKPIHAGITNDKEALSLNYLPSLKFDYTQNEAARLEDIMSILSDNMQREKERGISLFGPHRDDISFDVNGMDAQTYGSQGQQRTTALSIKLAEIELMNIEVGEYPILLLDDVLSELDDSRQTHLLSTIQHKVQTFVTTTSVDGIDHEIMNNAKLYRINQGEIIK >NZ_CP030323.1|WP_000491384.1|501719_502073_+|DUF3147-family-protein MFSIGSAILHFVIGGIAVALASIIADKVGGKLGGIIATMPAVFLAAIIALALDHRGTQLVEMSMNLSTGAIVGILSCILTVFLTSLYINHKGYRKGAIFTVVCWFVISLAIFSIRHL >NZ_CP030323.1|WP_000779135.1|502140_502536_+|DUF3147-family-protein MKLTLMKFFVGGFAVLLSYIVSVTLPWKEFGGIFATFPAVFLVSMFITGMQYGDKVAVHVSRGAVFGMTGVLVCILVTWMMLHMTHMWLISIIVGLLSWFISAVCIFEAVEFIAQKRLEKHSWKAGKTNSK >NZ_CP030323.1|WP_001054123.1|502786_503356_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNLSKQIKKYRERDGYSQEYLAEKLYVSRQSISNWENDKSLPDIHNLLMMCELFNVTLDDLVKGTIPFVPDIKVQRSLNLWAYVMIIFMTLAAILTGPLIVYWNWAWGITVMVIYGIGYYASMKIEDFKKVHKMDNYDRIVAFMNGKDPSEVQTTKARNIKTSVLSFIAFVGAIILVALISMYLANKFL >NZ_CP030323.1|WP_001059079.1|503482_503683_-|cold-shock-protein MNNGTVKWFNAEKGFGFIEQENGGDVFVHFSGIASDGYKTLEEGQKVTFEITEGQRGDQAVNVQTV >NZ_CP030323.1|WP_000672036.1|504074_504266_-|peptide-resistance-ABC-transporter-activity-modulator-VraH MKFRELVKQSYEDLKNLTVTWYNVIALAMIVIVLSVVTTPIIGIPVGLLGGAYYLKRREEKGK >NZ_CP030323.1|WP_000586238.1|504722_505220_+|hypothetical-protein MIINLETQQIHFDLEHETPYFQSPEKNRIRLDIDVLNKKQISNIINVIFNNQSKTKCTFLSEYLYPVKFREKTRIGRFFNITNWYEEIHSTDEKYVIATIKNIKNKDLIDYSLYIKKGLVEPFIVFYNQENIFYISNTVIDIISVSKDTLGYIKSEFNDHCASPY >NZ_CP030323.1|WP_000672028.1|505826_506018_-|peptide-resistance-ABC-transporter-activity-modulator-VraH MKFRELVKQSYEDLKNLTVTWYNVIALAMIVIVLSSVTTPIIGIPAGLLGGAYYLKRREEKGK >NZ_CP030323.1|WP_000143679.1|506110_507991_-|peptide-resistance-ABC-transporter-permease-subunit-VraE MTFNHIVLKNLRQNLKHYAMYLFSLFFSIVLYFSFTTLQFTKGVNNDDSMAIIKKGALVGSIFLFIIIVIFLMYANHLFVKRRTREFALFQLIGLTRQNILKMLALEQMIVFLITGVVGVLCGIAGAQLLLSIVSKLMSLSINLSIHFEPMALVLTILMLIIAYILILFQSSLFLKRRSILSMMKDSIKTDVTTAKVTTAEVISGVLGIAMIALGYYMATEMFGTFKALTMAMTSPFIILFLTVVGAYLFFRSSVSLIFKTLKKSKNGRVSITDVVFTSSIMYRMKKNAMSLTIIAIISAVTVTVLCFAALSKSNTDQTLISMAPNEFNVVASQDAQQFESKLSQQHITFTKNYYETITVNNVKDQVITLENGSDSGRTNSILSANTKLTGNNAIITNTKSLPNIINIHLNKDLVVKGTKNETFRVTQEDKGKVYPLNLSFNSPVVEVSPEKYQQLKTQNNVHTFYGYDIKQTSQKEKAQAIAKQFGDKVITYDDMKKEVDATNGILIFVTSFLGLAFLVAAGCIIYIKQMDETEDELSNFRILKRIGFTHTDMLKGLLLKITFNFGLPLLIAILHAVFAAIAFMKLMGNISFMPVIIVIIVYTLIYIVFALIAFVHSNKLIKKTI >NZ_CP030323.1|WP_000154165.1|507980_508739_-|peptide-resistance-ABC-transporter-ATP-binding-subunit-VraD MTILSVQHVSKTYGKKHTFQALKDINFDIQKGEFVAIMGPSGSGKTTLLNVLSSIDQISSGSVIANGQELNKLNQKALAKFRKESLGFIFQDYSILPTLTVKENIMLPLSVQKMSKATMEENYKAITTALGIYDLGNKYTSELSGGQQQRTAAARAFVHKPQIIFADEPTGALDSKSANDLLQRLEEMNKSFDTTIVMVTHDPVAASFAERVIMLKDGQIHTQLYQEGRSKQAFYEDIVHLQSVLGGVSNDI >NZ_CP030323.1|WP_000410770.1|509028_509541_+|HdeD-family-acid-resistance-protein MEKGNQGIKWSSLIMGVLLLMLAVVIFTFPIENFYAITWLIGLFVLINGVIQIVYRRKAKALVGGNQNWILFMGIVDILFGLIVIFNVGASSAFFIYMFAFWFIFSSIAGLFTFSGSGSLKLISVIFNLLGIVFGVILLFNPLMGIVFISTMIAIAFVFVGVIYVVDALA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP030323_2 | 747975-748108 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP030323_2
|
2 spacers
spacers of NZ_CP030323_2
>2.1|747992|46|NZ_CP030323|PILER-CR ACAAAGATAAACCTAATTATCAATTTGGTGGACACAACAGTGTTGA >2.2|748055|37|NZ_CP030323|PILER-CR TTCCAAAAGTAAGCGGTCAAAATGAAGGTCAACAAAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP030323_2
The CRISPR arrays of NZ_CP030323_2 >merge|NZ_CP030323|2|747975-748108|PILER-CR TATTGAAGAAGATACAAACAAAGATAAACCTAATTATCAATTTGGTGGACACAACAGTGTTGATTTTGAAGAAGATACACTTCCAAAAGTAAGCGGTCAAAATGAAGGTCAACAAACGATTGAAGAAGATACAA >NZ_CP030323|2|1|747975-748108|PILER-CR TATTGAAGAAGATACAA ACAAAGATAAACCTAATTATCAATTTGGTGGACACAACAGTGTTGA TTTTGAAGAAGATACAC TTCCAAAAGTAAGCGGTCAAAATGAAGGTCAACAAAC GATTGAAGAAGATACAA
>NZ_CP030323.1|WP_078065154.1|745063_745249_+|hypothetical-protein MASKHVYFYAENRLKYLESERYKKYIGYFSVMKGVSRHIFVRIVQAIIMKRLVYCFKLDND >NZ_CP030323.1|WP_000481420.1|743664_745023_+|gluconate-permease MFNEIWPLISVVLGIVILLVLIIGFKLNTFISLIITSMITALMLGIPLTKIMETIEKGMGSTLGHIALIFGLGAILGKLLADGGGATRIADTLIQKFGQKHVQWAMLVAAFIVGIALFFEVGLVLLIPLVFTVAKRANVSVLKLGLPMVTALSVTHGFLPPHPGPVVIAKELKANVGDVLLYGMIIAIPVTLIAGPIFNKIAQKMIPSAYTREGDISALGAQKEFKDQEMPGFGMSLLTATLPVILMLVSTITQLVTGHDKPTNLFESIIYMIGTAGTAMLIAVLFAIVTMGLMRKRKMNHIMESVTNAIYPIGMMLLIIGGGGTFKQVLIDGGVGNTIAKMFEGTEMSPILLAWIVAAVLRIALGSATVAAISTTGIVLPLLQSSDVNVALVVLAIGAGSVILSHVNDAGFWMFKEYFGLTVKETFLTWSLLETIISVSGIIFILFISLFV >NZ_CP030323.1|WP_000876641.1|741994_743548_+|gluconokinase MKYMIGVDIGTTSTKSVLYDENGTFIMKHQIGYDLHTPNVDVSEENPDELFDAVLMTIKYIMRESKVNQDDIKFVSFSAQMHSLIAMDQQHQRLTNNITWADNRAAKYATVINEVHDGNAIYQRTGTPIHPMSPLAKIFWMKHEWQDVFQRTAKFADIKTYIFYHLFDRYIIDYSMASATGMFNLETLDWDVGALELLGISEEMLPELVPTAYVMKGMKERYATLMGLNEDTPFVIGASDGVLSNLGVNSVGKGEVAVTIGTSGAIRTVIDKPRTDYKGRIFCYVLTEDHYVIGGPVNNGGVVLRWLRDELLASEVETAKRLGVDPYDVLTQIAKRVKPGADGLIFHPYLAGERAPLWNANARGSFFGLTLSHKKEHMIRAALEGVLYNLYTVYLALIEVMNETPKMIKATGGFAKSEVWRQMMSDIFDTELVVPESYESSCLGACVLGLKAVGDIEDFSIVSSMVGATNNHTPIKENVAVYQELVSIFINLSRSLTENYEQIADFQRQHMAENKTQ >NZ_CP030323.1|WP_000990133.1|741290_741971_+|GntR-family-transcriptional-regulator MMYGYPEKWLEGMTTGEGIAAELRLGIVNGHIAEGTLLTENQMAKQFNVSRSPIRDAFKLLQQNQLIQLERMGAHVLPFGEQEKKEMYDLRLMLESFAFSRVKNQERLPIVKEMKKQLEMMKVAVKFEDAESFTKHDFEFHETLIKASNHQYLNSFWSHLKPVMMALVLTSMRQRMQQNPQDFERIHHNHQVFIDAVEQYDSQILKEAFHLNFDDVGKDIEGFWLN >NZ_CP030323.1|WP_000074020.1|740372_741137_+|MerR-family-transcriptional-regulator MSNYSTGELAKLCNVTTRTIQYYDRKGILKPQGFTEGKRRVYTEQQRQTLELILLLKDLGCALSDIDMLLKGEGTLKTLNTLLTMKQQEINQQVKQQQAVLYKIKNVQYYVNETSTSPITHLKDIEHVMSKSAEMKSIRRNIWISAGIIGIIQYSSIISAILMKNKWPFLIALPFMIGYGIGVTFYYQQKVAYLCPNCQHIFSPSLWAVIKAKHTATTRRFECPNCHETHYCIEVPKAHMSTEQLEISHIQHNN >NZ_CP030323.1|WP_000289136.1|739515_740208_+|GTP-pyrophosphokinase-family-protein MYVDRKPSLYLEDLRHDFKNSLSKFENGDEAFDTLLGFVELDHIYSSALKEISTKLSILDDNFNHIYKHNPIHHMERRVKEMRSLIEKLNRKGLQISAETAKEHILDIAGIRVVCNYLDDIYLIEEMLLKQEDVQLIKRKDYIQHPKENGYRSLHIVVSIPVFLAERVEVLPVEIQIRTIGMDMWASLEHKIRYKNNAETEKYRDLLKECATEITEVEDKLQQIHSEITE >NZ_CP030323.1|WP_001117054.1|738868_739285_+|DUF2188-domain-containing-protein MPFTMKGYPEKWKEFEVIKRQKAIEIANAMLKEGYLEKDVVPIAAKKAKDWYRALSKEEIKALEEENFVQFHTATMEKTEVDSEYATTDNEEHIQEQSNQDKSYFDSESIGNQSGGVRQREPLMDGPHPKVVESFKDV >NZ_CP030323.1|WP_014363480.1|736906_738730_+|FUSC-family-protein MIIPAIIGYLFGNFQFGLLVATGTLAHIYVFKGPSRSKLRTVIICNLAFAICMMLGTLTAKTPLVFGMTLLIVTVIPFYIFTALKIAGPSSTFFIVTFSLPINLPIAPEEALYRGFAILVGGILATMMVLITIVFSKNKAEEQAIQNDFKLITKLLHTYNDKSAFLQVAKTAVDSFKASDKLLITSTSSNDKLSRRFQKLLLLHTSAQGIYSELLELNAKQIRPLPDELIEMMDHIIAQLDNSDENVRYWRKEVTVTEEFQNLFNHILKIDEMVHANEARIAYEADMRKPLYSKRIYQNLTLDSIVFRNTLRYTAIMMIAIFIALMFNFEKAYWIPLSAHTILLGTSTIHAIERGMARGLGTILGVLVLSVILLFSIPTPVAVILMGIAALFTEALVGANYAIAVVFITIQVILMNGLASQNLTINIAFPRVIDVAMGIVIAIIGLFVLGQRTASALLPNVMAEVVRKEATLFHYLFSENQYKDDVYQKNTAMNLSVKLNNMTQVYNAANGELFSDKTLIQNYYPSLFALEEIIFMLNRAMANEDRLTINEQLMGEYLATFENIAKHLELNTELEIKILPDLPQYNYIQSAMMNIQHNGFRERDKNV >NZ_CP030323.1|WP_000777467.1|735145_736438_-|IS21-family-transposase MKLSLDINTDFEVTTLTDLPKLKIVMENLNMKINKSEIARHMDVDRRTVDKYLNGFEPTKKRNRQSIIDKYYPIIEKLLSDTSEQKFYYKRILWQYLKDKHGLTCAYSTFRAYILKHDEFNRYFMKGYQRMSPKGTTRFETKAGHQAQFDWKEGINFKTKDNQIVSLNIGVLLLPYSRFVIMQVTMNKSSDVLFNLLTQAFELMGGVPNELVTDNMKTVMDQPRTERTNGQINRRFKQFADDFNFKVKPCIAGRPRTKGKVESIMKILDEIHAYQGELYLEEIPKFISNLNERLNYSVHTSTGKIPIIALEKEKSFLQPLPNVNVRNSYKVKHKYLKVNHSNMITYKSNQYSVPAEYCGKIVEVQVYDQKLHVYYNTKSICEHLITQRKLNYQKEHYLETLSSSFGNREMDDINQIAIDNLNAIGELYDE >NZ_CP030323.1|WP_001066124.1|734391_735153_-|ATP-binding-protein MNNSTNYKRLKANLEYLKMNQMINHLDDVIDFSIKNNLSFIDTLIKLSDYEIEIKEKNLIESMVKVAAFPFKKEISDFDFNFQPSINQQEIWDFTDLRFIEKYQNIVFLGSSGVGKTHLATGIGMAAAKNRVSTYFIKCHHLIENLRKAKLENRLENRLKHYSKYKLLIIDEIGYLPIGSEDAKLFFQLIDLRYEKKSTIFTTNINFNLWNEIFDDPKIANAILDRILHHSSVVKITGKSYRLKDHSPKKEIT >NZ_CP030323.1|WP_000841440.1|749343_752208_+|fibronectin-binding-protein-FnbB MKSNLRYGIRKHKLGASSVFLGTMIVVGMGQENEAAASEQNNTTVEESGSSATERKASETQTTTNNVNTIDETQSYSATSTEQPSQSTQVTTEEAPTTVQAPKVETSRVDLPSEKVADKETTGTQVDTAQPSNASEIKPRMKRSTDVAAVAEKEVVGEAKTTGSDVTSKVTVENGSEIVGHNNKETNVVNPHNAERVTLKYKWKFGEDIKPGDYFDFTLSNNVETHGISTLRKVPEIKSTDGQVMAVGEVNEERKIRYTFKEYVQGKKDLKAELDLNLFIDPTTVTKRGNQNIEVTLGEKKISKQFDIKYLDGVKDNWGVTVNGRIHTLNKQEGRFSHFAYVKPNNQSLSSVTVSGQVTKGNKSGASNPTVKVYKHIGSDELAESVYGDILDETKFEDVTDKLSLTLTGNGGYTLDFSELDKTKNYVIKYEGDYDSSASDLNFQTKLSGYHNYYYSYYPVQLTWNNGVAFYSNKAQGDGKDKPNDPIIDKSEPIELDIKSEPPVEKHELTGTIEESNDSKPIDFEYHTAVEGAEGHAEGIVETEEDSIHVDFEESTHENSKHHADVVEYEEDTNPGGGQVTTESNLVEFDEDSTKGIVTGAVSDHTTVEDTKEYTTESNLIELVDELPEEHGQAQGPIEEITENNHHISHSGLGTENGHGNYGVIEEIEENTHVDIKSELGYEGGQNSGNQSFEEDTEEDKPKYEQGGNIVDIDFDSVPQIHGQNNGNQSFEEDTEKDKPKYEQGGNIIDIDFDSVPHIHGFNKHNEIIEEDTNKDKPNYQFGGHNSVDFEEDTLPKVSGQNEGQQTIEEDTTSPTPPTPEVPSEPETPTPPTPEVPSEPETPTPPTPEVPSEPETPTPPTPEVPTEPGKPVSPTKEEPKKPSKPVEQGKVVTPVIEINEKVKVVAPTKQKQSKKSELPETGGEESTNKGMLFGGLFSILGLALLRRNKKNNKA >NZ_CP030323.1|WP_000721337.1|752394_753261_+|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase-GalU MKKIKKAIIPAAGLGTRFLPATKAMPKEMLPILDKPTIQYIVEEAARAGIEDIIIVTGRHKRAIEDHFDSQKELEMVLKEKGKSELLEKVQYSTELANIFYVRQKEQKGLGHAISSARQFIGNEPFAVLLGDDIVESEVPAVKQLIDVYEETGHSVIGVQEVPEADTHRYGIIDPLTKNGRQYEVKKFVEKPAQGTAPSNLAIMGRYVLTPEIFDYLKTQKEGAGNEIQLTDAIERMNNDNQVYAYDFEGERYDVGEKLGFVKTTIEYALKDDSMREELTRFIKELGL >NZ_CP030323.1|WP_112380508.1|753471_754215_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarU MDYQTFEKVNKLINVEAYIFFLTQELKQQYKLSLKELLILAYFYYKNEHSISLKEIIGDILYKQSDVVKNIKSLSKKGFINKSRNETDERRIFVSVTPMQRKKIACIINELDKIIKGFNKDRDYIKFQWAPKYSKEFFILFMNIMYSKDFLKYRFNLTFIDLSILYVISSRKNEILNLKDLFESIRFMYPQIVRLVNRLNNKGMLIKERSLADERIVLIKINKIQDNTIKSIFTDTSKILKPRKFFF >NZ_CP030323.1|WP_000998872.1|754536_754893_+|HTH-type-transcriptional-regulator-SarT MNDLKSKSNIKLMKRVLTTYELRKYLKKYFCLTLDNYLVLAYLDVFKNDEGKYFMRDIISYIGIDQSRIVKSVKELSKKGYLNKCRDPHDSRNVIIVVSVKQHNYIKNLLSEININET >NZ_CP030323.1|WP_112380509.1|755198_760082_+|YSIRK-type-signal-peptide-containing-protein 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>NZ_CP030323.1|WP_000966103.1|760463_761639_+|MFS-transporter MLYLEVLKNRNFTYLLIGNFLRRSCFVLFSLQIIWFTVELTNQSSLKLSMMVMSQTLPFIIFGIFGGAYSDKHNKKKILYLSDLILSLIIIIIPLLAITSNLNYLTLLTISTAITIINCYTDPAFRAILPEIIEEEHLATSNALIDSLQRGSNIILPALIGVIVILVGNVGVFFICSILLFLGFIFNALLKYTNNNMIDRHSKKEFSETWEFLKQSKEIPFIIIIQFACIMINTGLWRVALPLFISNILKEDVGVYGLATSCLGIASLLMSLIMGLLSEKRLIFKFSIGVLVWGIGLSIINVFPSMAILYIGATLVGLGQSIEGLTRSVAIQIKTPNHLMGKVFSISSTSNYAADTLSLGLISLIIPLLSLSNIFISGGAIISMLSWVKVC >NZ_CP030323.1|WP_000946334.1|761632_761866_+|hypothetical-protein MLRSLCKHNRILINAIKVGIEMKYKISLAYNLAIIIGSLIILCILISRGYDIYVILIPILTILASLINLICDIKKHK >NZ_CP030323.1|WP_001838708.1|761973_762282_-|hypothetical-protein MTVNIIVSIVFCISIVIIGIYVAITKDFTLISFINQTTIADKHKNQIAYIFTLCISLSAVFLMSSILSFEYDFIALAFLFLTIALFLIALFYVCLYKITKYP >NZ_CP030323.1|WP_000678764.1|762425_762692_-|hypothetical-protein MKGSKQILLIMGIISLIVLFIFTLFIMAQYAKHYEQKSDSSNAHTLNSSSAIIEQHTMSNLASLDLYAPVRNITSSRDIHPIYFMTKD >NZ_CP030323.1|WP_000356869.1|762975_764613_-|phospho-sugar-mutase 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You can click texts colored in the table to view more detailed information
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NZ_CP030323_3 | 751648-751780 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP030323_3
|
2 spacers
spacers of NZ_CP030323_3
>3.1|751664|47|NZ_CP030323|PILER-CR ACAAAGATAAACCTAATTATCAATTTGGTGGACACAACAGTGTTGAT >3.2|751727|38|NZ_CP030323|PILER-CR TTCCAAAAGTAAGTGGTCAAAATGAAGGTCAACAAACG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP030323_3
The CRISPR arrays of NZ_CP030323_3 >merge|NZ_CP030323|3|751648-751780|PILER-CR ATTGAAGAAGATACAAACAAAGATAAACCTAATTATCAATTTGGTGGACACAACAGTGTTGATTTTGAAGAAGATACACTTCCAAAAGTAAGTGGTCAAAATGAAGGTCAACAAACGATTGAAGAAGATACAA >NZ_CP030323|3|2|751648-751780|PILER-CR ATTGAAGAAGATACAA ACAAAGATAAACCTAATTATCAATTTGGTGGACACAACAGTGTTGAT TTTGAAGAAGATACAC TTCCAAAAGTAAGTGGTCAAAATGAAGGTCAACAAACG ATTGAAGAAGATACAA
>NZ_CP030323.1|WP_112380507.1|745491_748662_+|fibronectin-binding-protein-FnbA 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>NZ_CP030323.1|WP_078065154.1|745063_745249_+|hypothetical-protein MASKHVYFYAENRLKYLESERYKKYIGYFSVMKGVSRHIFVRIVQAIIMKRLVYCFKLDND >NZ_CP030323.1|WP_000481420.1|743664_745023_+|gluconate-permease MFNEIWPLISVVLGIVILLVLIIGFKLNTFISLIITSMITALMLGIPLTKIMETIEKGMGSTLGHIALIFGLGAILGKLLADGGGATRIADTLIQKFGQKHVQWAMLVAAFIVGIALFFEVGLVLLIPLVFTVAKRANVSVLKLGLPMVTALSVTHGFLPPHPGPVVIAKELKANVGDVLLYGMIIAIPVTLIAGPIFNKIAQKMIPSAYTREGDISALGAQKEFKDQEMPGFGMSLLTATLPVILMLVSTITQLVTGHDKPTNLFESIIYMIGTAGTAMLIAVLFAIVTMGLMRKRKMNHIMESVTNAIYPIGMMLLIIGGGGTFKQVLIDGGVGNTIAKMFEGTEMSPILLAWIVAAVLRIALGSATVAAISTTGIVLPLLQSSDVNVALVVLAIGAGSVILSHVNDAGFWMFKEYFGLTVKETFLTWSLLETIISVSGIIFILFISLFV >NZ_CP030323.1|WP_000876641.1|741994_743548_+|gluconokinase 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MIIPAIIGYLFGNFQFGLLVATGTLAHIYVFKGPSRSKLRTVIICNLAFAICMMLGTLTAKTPLVFGMTLLIVTVIPFYIFTALKIAGPSSTFFIVTFSLPINLPIAPEEALYRGFAILVGGILATMMVLITIVFSKNKAEEQAIQNDFKLITKLLHTYNDKSAFLQVAKTAVDSFKASDKLLITSTSSNDKLSRRFQKLLLLHTSAQGIYSELLELNAKQIRPLPDELIEMMDHIIAQLDNSDENVRYWRKEVTVTEEFQNLFNHILKIDEMVHANEARIAYEADMRKPLYSKRIYQNLTLDSIVFRNTLRYTAIMMIAIFIALMFNFEKAYWIPLSAHTILLGTSTIHAIERGMARGLGTILGVLVLSVILLFSIPTPVAVILMGIAALFTEALVGANYAIAVVFITIQVILMNGLASQNLTINIAFPRVIDVAMGIVIAIIGLFVLGQRTASALLPNVMAEVVRKEATLFHYLFSENQYKDDVYQKNTAMNLSVKLNNMTQVYNAANGELFSDKTLIQNYYPSLFALEEIIFMLNRAMANEDRLTINEQLMGEYLATFENIAKHLELNTELEIKILPDLPQYNYIQSAMMNIQHNGFRERDKNV >NZ_CP030323.1|WP_000777467.1|735145_736438_-|IS21-family-transposase 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MDYQTFEKVNKLINVEAYIFFLTQELKQQYKLSLKELLILAYFYYKNEHSISLKEIIGDILYKQSDVVKNIKSLSKKGFINKSRNETDERRIFVSVTPMQRKKIACIINELDKIIKGFNKDRDYIKFQWAPKYSKEFFILFMNIMYSKDFLKYRFNLTFIDLSILYVISSRKNEILNLKDLFESIRFMYPQIVRLVNRLNNKGMLIKERSLADERIVLIKINKIQDNTIKSIFTDTSKILKPRKFFF >NZ_CP030323.1|WP_000998872.1|754536_754893_+|HTH-type-transcriptional-regulator-SarT MNDLKSKSNIKLMKRVLTTYELRKYLKKYFCLTLDNYLVLAYLDVFKNDEGKYFMRDIISYIGIDQSRIVKSVKELSKKGYLNKCRDPHDSRNVIIVVSVKQHNYIKNLLSEININET >NZ_CP030323.1|WP_112380509.1|755198_760082_+|YSIRK-type-signal-peptide-containing-protein MRDKKGPVNKRVDFLSNKLNKYSIRKFTVGTASILIGSLMYLGTQQEAEAAENNIENPTTLKDNVQSKEVKIEEVTNKDTAPQGIEAKSEVTSNKDTIEHEPSVKAEDISKKEDTPKEVANVAEVQPKSSVTHNAETPKVRKARSVDEGSFDITRDSKNVVESTPITIQGKEHFEGYGSVDIQSNPEDLKVSEVTRFNNKSIGRNELTGALQLKNKVSFKNDFEFNIRIANNHQSVTTGADGWGFLFSKGDGNEYLQKGGILGPKGMENSAGFKIDTGYNFKDPMDKEEKQAGQGFKGYGTFVKTGADGTTAKVGTNIPTRGKADNSFQYADNSIDTTDGKFHGQLLNNLKLAYNEKSGIMRAEYAGKIWEANISDLGLDKSEAYNFLITSSQRQGTSQGVYANGWMRTDLNNSTFKLTPNLVNKTETKTVEIPFETKREFNPKLQPGEERVKQEGQPGSKTITTPITVNPLTGEKVGEGQPTEEITKQPVDKIVEFGGEKIPQGHKDIFDPNLPTDQTEKVPGKPGIKNPDTGKVIEEPVDDVIKHGPKTGTPETKTVEIPFETKREFNPKLQPGEERVKQEGQPGSKTITTPITVNPLTGEKVGEGQPTEEITKQPVDKIVEFGGEKIPQGHKDIFDPNLPTDQTEKVPGKPGIKNPDTGKVIEEPVDDVIKHGPKTGTPETKTVEIPFETKREFNPKLQPGEERVKQEGQPGSKTITTPITVNPLTGEKVGEGQPTEEITKQPVDKIVEFGGEKIPQGHKDIFDPNLPTDQTEKVPGKPGIKNPDTGKVIEEPVDDVIRHGPKTGTPETKTVEIPFETKREFNPKLQPGEERVKQEGQPGSKTITTPITVNPLTGEKVGEGQPTEEITKQPVDKIVEFGGEKIPQGHKDIFDPNLPTDQTEKVPGKPGIKNPDTGKVIEEPVDDVIKHGPKTGTPETKTVEIPFETKREFNPKLQPGEERVKQEGQPGSKTITTPITVNPLTGEKVGEGQPTEEITKQPVDKIVEFGGEKIPQGHKDIFDPNLPTDQTEKVPGKPGIKNPDTGKVIEEPVDDVIKHGPKTGTPETKTVEIPFETKREFNPKLQPGEERVKQEGQPGSKTITTPITVNPLTGEKVGEGQPTEEITKQPVDKIVEFGGEKIPQGHKDIFDPNLPTDQTEKVPGKPGIKNPDTGKVIEEPVDDVIKHGPKTGTPETKTVEIPFETKREFNPKLQPGEERVKQEGQPGSKTITTPITVNPLTGEKVGEGQPTEEITKQPVDKIVEFGGEKIPQGHKDIFDPNLPTDQTEKVPGKPGIKNPDTGKVIEEPVDDVIRHGPKTGTPETKTVEIPFETKREFNPKLQPGEERVKQEGQPGSKTITTPITVNPLTGEKVGEGQPTEEITKQPVDKIVEFGGEKIPQGHKDIFDPNLPTDQTEKVPGKPGIKNPDTGKVIEEPVDDVIKHGPKTGTPETKTVEIPFETKREFNPKLQPGEERVKQEGQPGSKTITTPITVNPLTGEKVGEGQPTEEITKQPVDKIVEFGGEKPKDPKGPEKPEKPSRPTHPSGPVNPDNPGLSKDRAKPNDPVHSMDKNDKVKKSKIAKESVANQEKKRAELPKTGVESTQKGLIFSSIIGIAGLILLARRRKN >NZ_CP030323.1|WP_000966103.1|760463_761639_+|MFS-transporter MLYLEVLKNRNFTYLLIGNFLRRSCFVLFSLQIIWFTVELTNQSSLKLSMMVMSQTLPFIIFGIFGGAYSDKHNKKKILYLSDLILSLIIIIIPLLAITSNLNYLTLLTISTAITIINCYTDPAFRAILPEIIEEEHLATSNALIDSLQRGSNIILPALIGVIVILVGNVGVFFICSILLFLGFIFNALLKYTNNNMIDRHSKKEFSETWEFLKQSKEIPFIIIIQFACIMINTGLWRVALPLFISNILKEDVGVYGLATSCLGIASLLMSLIMGLLSEKRLIFKFSIGVLVWGIGLSIINVFPSMAILYIGATLVGLGQSIEGLTRSVAIQIKTPNHLMGKVFSISSTSNYAADTLSLGLISLIIPLLSLSNIFISGGAIISMLSWVKVC >NZ_CP030323.1|WP_000946334.1|761632_761866_+|hypothetical-protein MLRSLCKHNRILINAIKVGIEMKYKISLAYNLAIIIGSLIILCILISRGYDIYVILIPILTILASLINLICDIKKHK >NZ_CP030323.1|WP_001838708.1|761973_762282_-|hypothetical-protein MTVNIIVSIVFCISIVIIGIYVAITKDFTLISFINQTTIADKHKNQIAYIFTLCISLSAVFLMSSILSFEYDFIALAFLFLTIALFLIALFYVCLYKITKYP >NZ_CP030323.1|WP_000678764.1|762425_762692_-|hypothetical-protein MKGSKQILLIMGIISLIVLFIFTLFIMAQYAKHYEQKSDSSNAHTLNSSSAIIEQHTMSNLASLDLYAPVRNITSSRDIHPIYFMTKD >NZ_CP030323.1|WP_000356869.1|762975_764613_-|phospho-sugar-mutase MDKELWIERANDSLVKHFYEQQSDIEQREGFESKLTFGTAGIRGKFGLGEGRLNKFTIEKLALGLARYLNAQTNNPTIVIHYDIRHLSTEFAQIIANVLANHQITVYLPDTYKTTPELSFAVRNLNTTAGIMITASHNPKDYNGIKVYGSDGAQLSTDASELVSRYIEDVGNPLQIDISFSKHNSSYIKPLPKSVTENYIKHVQNMIGYIPKSDLQVVFTSLHGTSVPIVPKLLKSLNFNQFNLVEAQCKPDPNFSSVQSANPEDHRAFDQAVELANKSHADLLISTDPDADRLGIAERDAHGHITYFNGNQIGALLLNYRIQQTSQLRHRLMIQSIVSSELTKSLARYNNVEYKEVLTGFKFIAQEIRQLDDHQNMIFAFEESYGFLSEPFVRDKDAVQIVPLIIKYASELKLYGKTLKDELEQIYQTVGRHEDTLFSHTLEGLEGKKKIESIMTHFRSNPPQEIQGLKVKAIEDYLTSEVYQLDKDTTSQINSPKSNVIRVLFDEGFIALRPSGTEPKIKLYVSLKCPNFDDVAQKINAMIFS >NZ_CP030323.1|WP_000755953.1|764899_765292_+|(deoxy)nucleoside-triphosphate-pyrophosphohydrolase MKKVINVVGAIIFSDNKILCAQRSEKMSLPLMWEFPGGKVEKNETEKDALIREIREEMKCDLIVGDKVITTEHEYDFGIVKLTTYKCNLNKELPTLIEHKSIEWLPINELDKLNWAPADIPAVNKIMTEG |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP030323_4 | 844474-844566 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP030323_4
|
1 spacers
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>4.1|844499|43|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder GACAAAGGAACGTAGTAGGACGTAAAACGTCAACTGCATAAGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP030323_4
The CRISPR arrays of NZ_CP030323_4 >merge|NZ_CP030323|4|844474-844566|CRISPRCasFinder CTTTCTAACAAATAAATTTGAAGAAGACAAAGGAACGTAGTAGGACGTAAAACGTCAACTGCATAAGCCTTTCTAACAAATAAATTTGAAGAA >NZ_CP030323|4|2|844474-844566|CRISPRCasFinder CTTTCTAACAAATAAATTTGAAGAA GACAAAGGAACGTAGTAGGACGTAAAACGTCAACTGCATAAGC CTTTCTAACAAATAAATTTGAAGAA
>NZ_CP030323.1|WP_014532694.1|844173_844269_+|hypothetical-protein MLTNRLTSVNYVKKRLIQNIQRILSKEVLYG >NZ_CP030323.1|WP_000792557.1|842768_844079_-|hypothetical-protein MKNKYISKLLVGAATITLATMISNGEAKASENTQQTSTKHQTTQNNYVTDQQKAFYQVLHLKGITEEQRNQYIKTLREHPERAQEVFSESLKDSKNPDRRVAQQNAFYNVLKNDNLTEQEKNNYIAQIKENPDRSQQVWVESVQSSKAKERQNIENADKAIKDFQDNKAPHDKSAAYEANSKLPKDLRDKNNRFVEKVSIEKAIVRHDERVKSANDAISKLNEKDSIENRRLAQREVNKAPMDVKEHLQKQLDALVAQKDAEKKVAPKVEAPQIQSPQIEKPKAESPKVEVPQIQSPKVEVPQSKLLGYYQSLKDSFNYGYKYLTDTYKSYKEKYDTAKYYTDKYFKYKGTIDKTVLSVFGNGYKSYIQPLKVEDQKNYVSKSYAQVRNYVTETLNTGKVLYAFYQNPNVVKAAITTAETAASIKNIFSSFTSFFK >NZ_CP030323.1|WP_031845052.1|841347_842277_-|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB-subunit-A MIKNKILTATLAVGLIAPLANPFIEISKAENKIEDIGQGAEIIKRTQDITSKRLAITQNIQFDFVKDKKYNKDALVVKMQGFISSRTTYSDLKKYPYIKRMIWPFQYNISLKTKDSNVDLINYLPKNKIDSADVSQKLGYNIGGNFHSAPSIGGSGSFNYSKTISYNQKNYVTEVESQNSKGVKWGVKANSFVTPNGQVSAYDQYLFAQDPTGPAARDYFVPDNQLPPLIQSGFNPSFITTLSHERGKGDKSEFEITYGRNMDATYAYVTRHRLAVDRKHDAFKNRNVTVKYEVNWKTHEVKIKSITPK >NZ_CP030323.1|WP_000916705.1|839832_840780_-|bi-component-gamma-hemolysin-HlgCB-subunit-C MLKNKILATTLSVSLLAPLANPLLENAKAANDTEDIGKGSDIEIIKRTEDKTSNKWGVTQNIQFDFVKDKKYNKDALILKMQGFISSRTTYYNYKNTNHIKSMRWPFQYNIGLKTNDKYVSLINYLPKNKIESTNVSQTLGYNIGGNFQSAPSLGGNGSFNYSKSISYTQQNYVSEVEQQNSKSVLWGVKANSFATESGQKSAFDSDLFVGYKPHSKDPRDYFVPDSDLPPLVQSGFNPSFIATVSHEKGSSDTSEFEITYGRNMDVTHAIKRSTHYGNSYLDGHRIHNAFVNRNYTVKYEVNWKTHEIKVKGQN >NZ_CP030323.1|WP_000783428.1|838853_839831_-|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB/HlgCB-subunit-B MKMNKLVKSSVATSMALLLLSGTANAEGKITPVSVKKVDDKVTLYKTTATADSDKFKISQILTFNFIKDKSYDKDTLVLKATGNINSGFVKPNPNDYDFSKLYWGAKYNVSISSQSNDSVNVVDYAPKNQNEEFQVQNTLGYTFGGDISISNGLSGGLNGNTAFSETINYKQESYRTTLSRNTNYKNVGWGVEAHKIMNNGWGPYGRDSFHPTYGNELFLAGRQSSAYAGQNFIAQHQMPLLSRSNFNPEFLSVLSHRQDGAKKSKITVTYQREMDLYQIRWNGFYWAGANYKNFKTRTFKSTYEIDWENHKVKLLDTKETENNK >NZ_CP030323.1|WP_000200957.1|838334_838802_+|hypothetical-protein MTSKDITQISVIAAILTILAVLKIPSIIPGLDFQLSAPVALLILAFFGIKKYFLGGLLSSVLLLIFGVFNPINVIISIIFRVIAIAVVYLLKINVLSLILASVLGSLISRLLLSIILNLPVWVVLLNAIPGVIFTLIVAIPLYLTLRKRMAVLLR >NZ_CP030323.1|WP_000286874.1|837631_838324_+|6-carboxyhexanoate--CoA-ligase MYSIKMRSSNQDVHISGAETICEFDKIEQTVQRFYNKGFFHENGQPDFLNIKIQKIMEPIQQIKALQIIEDDKANLQHLTQECGVTEQALNQGMTYIKNETVYTGAIILSAISGKRLDSFGQRGIRATHFSFEDINNKGDLNERVTDALAIASCINAHPYIKGELCVSDDLTYTTGYFASAKIGYHRLFDIKPVNTRYGGRIIFVDDRIDLNHYISFLESTPKQVVYETV >NZ_CP030323.1|WP_000971541.1|836505_837621_+|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase-family-protein MMFQEQIDLLQQKGLYRSLKSVGYIDRQYIEVENKRCTNYTSNDYLGLGQIAFDKDDFERFMRKYSYHLSSSRLISGSSTAYEEIETMLAGWLGYSACTILNSGYDANLALFNIFKNTNCVVFSDQENHASIIDGIKLSGLEKVIYKHLDIADLEKRLAECPNQNIQKIIISDSVFSTNGDVVDIGQLVSLKHKYNATLILDVSHSFGIENYSNYQGVDILTSSLSKACGAYGGVILSSNDVKDMLINHGRPLIYSSSLPIYNLYFIKRNIEKLINADDRRTKLNSLSKYFNQKLKALNVNYNSSNSPIKFIEFDDIEAAENIHQTLLKHHVFTSYLRYPTVTKPMLRISLSYFHTEQDVDRLFEILHQED >NZ_CP030323.1|WP_001046638.1|835520_836528_+|biotin-synthase-BioB MNLAKRILQGEQLTKETVLKIYEDTNIDTLDLLNEAYILRKHYFGKKVKLNMILNAKSGICPENCGYCGQSRDIKEKQRYALIPEEQIIDGAKVAHDNHIGTYCIVMSGRGPSDKEVDHISNTVRTIKSQHPQLKICACLGLTNDEQAKKLKSAGVDRYNHNINTSENYHDNVVTTHSYKDRTDTIELMKANNISPCSGVICGMGESNQDIVDMAFALKEMDADSIPINFLHPIKGTKFGSMDDLTPMKCLRIVALFRLINPTKEIRIAGGREVNLRSLQPLALKAANSIFVGDYLITGGQPNQLDYDMINDLGFEIDYDTCENKENKNDVSRAN >NZ_CP030323.1|WP_001110080.1|834160_835519_+|adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate-transaminase MNYTQQLKQKDSEYVWHPFTQMGVYSKEEAIVIEKGKGSYLYDTNGNKYLDGYASLWVNVHGHNNKYLNKVIKKQLNKIAHSTLLGSSNIPSIELAEKLIEITPSNLRKVFYSDTGSASVEIAIKMAYQYWKNIDREKYAKKNKFITLNHGYHGDTIGAVSVGGIKTFHKIFKDLIFENIQVESPSFYRSNYDTENEMMAAILTNIEQILIERNDEIAGFILEPLIQGATGLFVHPKGFLKEVEKLCKKYDVLLICDEVAVGFGRTGKMFACNHEDVQPDIMCLGKAITGGYLPLAATLTSQKIYDAFLSDSHGVNTFFHGHTYTGNQIVCTVALENIRLYEKRKLLSQIETTSSTLEKQLHALKRHRNVGDVRGRGLMFGVELVTDKDSKTPLEIEKVERIVRNCKENGLMIRNLENVITFVPVLSMSNKEVKTMVRIFKKAVHNILDRKC >NZ_CP030323.1|WP_000019124.1|844775_845642_+|cation-transporter MSHNENLKLAQRGAYLSLIVYIILSIVKYVTGFVFNSAAVRADALNNMTDIIVSLAVIIGLKISIKPADRNHPYGHLKSENISSLLVSFVIMFVGIQVVIQNAPRLFKEDDVVPNAITIIVSLISGLIMLIVFAVNQSLAKRTKSSSLNSAAKDNLSDSLVSIGTAIGLIFTQIGFPIVDIILATLLGLLIVYTGFGIFKEAIFMLSDGFNETELEAYRNDILEVDEVQKVKSIKGRYHGSSVFIDVTIVVDANLSLVEAHQICDNVEHHLHKKGISSVYVHPEPDHL >NZ_CP030323.1|WP_001125208.1|845967_846654_+|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase MPKLILCRHGQSEWNAKNLFTGWEDVNLSEQGINEATRAGEKVRENNIAIDVAFTSLLTRALDTTHYILTESKQQWIPVYKSWRLNERHYGGLQGLNKDDARKEFGEEQVHIWRRSYDVKPPAETEEQREAYLADRRYNHLDKRMMPYSESLKDTLVRVIPFWTDHISQYLLDGQTVLVSAHGNSIRALIKYLEDVSDEDIINYEIKTGAPLVYELTDDLEVIDKYYL >NZ_CP030323.1|WP_000762708.1|846807_846912_-|putative-metal-homeostasis-protein MKLDLQTARRNLNSPNIKTRKRALKIIKQHKRAK >NZ_CP030323.1|WP_000038954.1|847085_848525_+|multidrug-efflux-MFS-transporter-MdeA MSKKQKLTMIITMLMGGFFGLLNETLLVTALPSIMKDFEISYTQVQWLTTAFLLTNGIVIPLSALVIQRYTTRQVFLVGISIFFLGTLLGGLSPHFATLLVARIIQALGAGIMMPLMMTTILDVFQPHERGKYMGIFGLVIGLAPAIGPTLSGYLVEYFNWRSLFHVVAPIAAVTFLIGFKTIKNVGTTIKVPIDFISVIFSVLGFGGLLYGTSSISEKGFDNPIVLVSMIGGIVLVALFVLRQYRLSTPLLNFAVFKNKQFTVGIIIMGVTMVSMIGSETILPIFVQNLLHRSALDSGLTLLPGAIVMAFMSMTSGALYEKFGPRKLALVGMAIVVITTAYFVVMDEQTSTIMLATVYAIRMVGIALGLIPVMTHTMNQLKPEMNAHGSSMTNTVQQIAGSIGTAALITILAHASKNFSPTMSDYNGMNKIDMMNQIKVDTMLHGYHAGFLFALLITVVSFFCSFMLQGKKKEVDSRQ >NZ_CP030323.1|WP_000825921.1|848645_849425_+|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MKRLLFVMIAFVFILAACGNNSSKDKEANKDSKTINVGTEGTYAPFSFHDKDGKLTGYDIDVIKAVAKEEGLKLKFNETSWDSMFAGLDAGRFDVIANQVGINPDREKKYKFSKPYTFSSAVLVIRENEKDIKDFDDVKGKKLAQTFTSNYGKLAKDKGADITKVDGFNQSMDLLLSKRVDGTFNDSLSYLDYKKQKPNAKIKAIKGNAEQSRSAFAFSKKADDETVQKFNDGLKKIEENGELAKIGKKWFGQDVSKSK >NZ_CP030323.1|WP_000479576.1|849405_850125_+|amino-acid-ABC-transporter-permease MFLNLNSEQQHALDAAKQAFGPMLEGLVKYSIPITLVTFVLGLIIALFTALMRISTSKILRSISRVYVSIIRGTPMIVQLFIIFYGIPELGRLLTNDADNQWTLAPVVAAIIGLSLNVGAYASEIIRGGIISIPKGQTEAAYSIGMTYGQTIQRIILPQAIRVSIPALGNTFLSLIKDTSLLGFILVAEMFRKAQEVASTTYEYLTIYVLVALMYWVVCFIISIIQGIYESYIERGYRS >NZ_CP030323.1|WP_000615464.1|850121_850853_+|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIQLNNIHKSFNDVEVIKGIDLSVEQGEVVTLIGRSGSGKTTLLRMINALEIPTEGTVYVNGKTYTSKDKKSQIEVRKQSGMVFQSYNLFPHKTALENVMEGLITVKKLKKDEARGKSLELLEKVGLTLVKDQRPHALSGGQQQRVAIARALAMNPKVMLFDEPTSALDPELVNDVLKVIKDLANEGMTMVIVTHEMRFAKEVSNNIVFIHEGMIGEQGAPEEMFNRPKTEELRRFLNVINEE >NZ_CP030323.1|WP_001012236.1|850949_852200_-|FemA/FemB-family-glycyltransferase-FmhA MNFVTLTSDEFNAFTTKHFSHYTQSAIHYNHRVDLKGDVHLVGVKDDNGQVIAGCLLTEARTLKFFKYFYTHRGPVMDYTNQSLVAFFFKALTSYLKKQNCLYVLVDPYLIENLRNADGEIVKSYDNRAFVRTMDTLGYKHQGFPVGYDSMSQIRWLSVLDLKDKTEDQLLKEMDYQTRRNIKKTYDIGVKTKTLTIDETQTFFDLFHMAEEKHGFKFRELPYFEEMQKLYDDHAMLKLAYIDLNEYLKTLQLKQQQLTAELSGVEEALEENPNSKKNKTKRTQLEQQLNSNKRKIDNTIEQIEQDGAVLNLASALFIYNEHEVYYLSSGSNPKYNAYMGAYHLQWEMIKFAKAHHIDRYNFYGITGDFSESSEDYGVQQFKKGFNAHVEEYIGDFIKPIKPLLYKVQTYLNHKRR >NZ_CP030323.1|WP_000819839.1|852454_852817_+|DUF4467-domain-containing-protein MKRFVAMVLLLLVFISGCGNDKYVKEIDEAVKIQNQKQEQLAKKGNGDRVDHFERKDANIYVYDKDKIIILAYKPLSNDDEVHYYAYDFSDKRVSYKQDFDSRRYYQQHDADYHEENMTN >NZ_CP030323.1|WP_000162810.1|852835_853435_+|DsbA-family-protein MTKKLLTLFIVSMLILTACGKKESATTSSKNGKPLVVIYGDYKCPYCKELDEKVMPKLRKNYIDNHKVEYQFVNLAFLGKDSIVGSRASHAVLMYAPKSFLDFQKQLFAAQQDENKEWLTKELLDKHIKQLHLDKETENKIIKDYKTKDSKSWKAAEKDKKIAKDNHIKTTPTAFINGEKVEDPYDYESYEKLLKDKIK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP030323_5 | 999048-999132 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP030323_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP030323_5
>5.1|999078|25|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACACAGAAGCTGACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP030323_5
The CRISPR arrays of NZ_CP030323_5 >merge|NZ_CP030323|5|999048-999132|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGACAAAAGTCAGCATACAATAATGTGCAAGTTGG >NZ_CP030323|5|3|999048-999132|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG CGGGGCCCCAACACAGAAGCTGACA AAAGTCAGCATACAATAATGTGCAAGTTGG
>NZ_CP030323.1|WP_001824308.1|997847_998870_+|GTP-3',8-cyclase-MoaA MVEQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLNVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEEHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >NZ_CP030323.1|WP_000643988.1|997228_997828_+|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase-MobA MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYSRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNVYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL >NZ_CP030323.1|WP_000866974.1|996988_997222_+|molybdopterin-converting-factor-subunit-1 MKVLYFAEIKDILQKAQEDIVLEQGLTVQQFEDLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG >NZ_CP030323.1|WP_000808500.1|996536_996983_+|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaE MKQFEIVTEPIQTEQYREFTINEYQGAVVVFTGHVREWTKGVKTEYLEYEAYIPMAEKKLAQIGDEINEKWPGTITSIVHRIGPLQISDIAVLIAVSSPHRKDAYRANEYAIERIKEIVPIWKKEIWEDGSKWQGHQKGNYEEAKREE >NZ_CP030323.1|WP_000602934.1|996037_996523_+|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B MILQIVGYKKSGKTTLMRHIVSFLKSHGYTVATIKHHGHGKEDIQLQDSDVDHMKHFEAGADQSIVQGFQYQQTVTRVDNQNLTQIIEKSVTIDTNIVLVEGFKNADFEKVVVYRDEEELQVLQQLSNVCYSINVREHEDFTAFEQWLLNKIKNDCDTQLT >NZ_CP030323.1|WP_000259720.1|994781_996041_+|molybdopterin-molybdotransferase-MoeA MVVEKRNPIPVKEAIQRIVNQQSSMPAITVALEKSLNHILAEDIVATYDIPRFDKSPYDGFAIRSVDSQGASGQNRIEFKVIDHIGAGSVSDKLVGDHEAVRIMTGAQIPNGADAVVMFEQTIELEDTFTIRKPFSKNENISLKGEETKTGDVVLKKGQVINPGAIAVLATYGYAEVKVIKQPSVAVIATGSELLDVNDVLEDGKIRNSNGPMIRALAEKLGLEVGIYKTQQDDLDSGIQVVKEAMEKHDIVITTGGVSVGDFDYLPEIYKTVKAKVLFNKVAMRPGSVTTVAFADGKYLFGLSGNPSACFTGFELFVKPAVKHMCGALEVFPQIIKATLMEDFTKANPFTRFIRAKATLTSAGATVVPSGFNKSGAVVAIAHANCMVMLPGGSRGFKAGHTVDIILTESDAAEEELLL >NZ_CP030323.1|WP_000134534.1|994224_994719_-|cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-MoaC MTEFTHINQQGHAKMVDVSDKQITKRTAVAHSSITVNETIYKQISNNTNTKGNVLNTAQIAGIMAAKNTSTIIPMCHPLPLTGIDVHFSWDETNAPLYTLNIQTTVSTTGKTGVEMEALTAASATALTIYDMTKAVDKGMIIGETYLESKSGGKSGDFQRQSGQ >NZ_CP030323.1|WP_000503820.1|993716_994223_+|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaB MGEHQNVKLNRTVKAAVLTVSDTRDFDTDKGGQCVRQLLQADDVEVSDAHYTIVKDEKVAITTQVKKWLEEDIDVIITTGGTGIAQRDVTIEAVKPLLTKEIEGFGELFRYLSYVEDVGTRALLSRAVAGTVNNKLIFSIPGSTGAVKLALEKLIKPELNHLIHELTK >NZ_CP030323.1|WP_000076924.1|992681_993686_+|molybdopterin-biosynthesis-protein-MoeB MSQERYSRQILFKQIGEIGQSKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDDYIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKHRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSACTTCGDIPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >NZ_CP030323.1|WP_000913006.1|991907_992513_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MLKINLKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTAKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSEHIDQLIQTLNIDHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG >NZ_CP030323.1|WP_031844964.1|999210_999381_-|hypothetical-protein MFRFISFGQLVVYSTTFIPKKDILQLNDMECDINVKEPLKIYYVVILKSGIEMIFS >NZ_CP030323.1|WP_000066898.1|999506_999857_+|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSEMDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >NZ_CP030323.1|WP_000184412.1|999958_1001170_-|MFS-transporter MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFFVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDGSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAINLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETNVIDKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >NZ_CP030323.1|WP_000951066.1|1001162_1001603_-|winged-helix-DNA-binding-protein MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKYQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLKEAHND >NZ_CP030323.1|WP_000600972.1|1001765_1002530_+|VOC-family-protein MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIETVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKAKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >NZ_CP030323.1|WP_031844963.1|1002521_1002773_-|hypothetical-protein MRTIILSLFIIMNIVAIIMTLSQPLTVNYFSLRVILIFFTFILSIFFILIKSSRLNNTLTILSIVLAIIHMGILAHSTYVYLY >NZ_CP030323.1|WP_000413855.1|1003161_1004427_+|lipid-II:glycine-glycyltransferase-FemX MEKMHITNQEHDAFVKSHPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEIQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSAKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKNDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDREGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEIAKWQQKMETSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYVLNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK >NZ_CP030323.1|WP_000592327.1|1004543_1007711_+|efflux-RND-transporter-permease-subunit MIKKLLQFSLGNKFAIFLMVVLVVLGGVYASAKLKLELLPNVQNPVISVTTTMPGATPQSTQDEISSKIDNQVRSLAYVKNVKTQSVQNASIVTVEYENNTDMDKAEEQLKKEIDKIKFKDEVGQPELRRNSMDAFPVLAYSFSNKENDLKKVTKVLNEQLIPKLQTVDGVQNAQLNGQTNREITLKFKQNELEKYGLTADDVENYLKTATRTTPLGLFQFGDKDKSIVVDGQYQSVDAFKNINIPLTLAGGQGQSQSQSDNKQNSAMSDVNQASPQQNSKASASNNISGMPTAKLGDLADITVGDVRTSISKTNGKDAVNLQITKAQDANTVQVAKDVQRKIDTFVDENKDFNVTKTMDTAKPVEKSLYTMVEKASLGTIVAIIVILLFLRNIRTTAISIISIPLSLLMALIALKLSDVSLNILTLGALTVAIGRVIDDSIVVVENIYRRLTDSEEQLKGGNLIISATTEVFKPIMSSTLVTIIVFLPLVFVSGSVGEMFRPFALAIAFSLLASLLVSITLVPALAATLFKKGVKRRNKQYQEGLGVVSTTYKKVLHWSLNHKWIVIILSTLILVATIVFGGPRLGTSFISAGDDKFLAITYTPKPGETEQAVLNHAKDVEKYLKQKKHVKTIQYSVGGSSPVDPTGSTNSMAIMVEYDNDTPNFDVEADKVIKHADGFKHPGEWKNQDLGTGAGNKSVEVTVKGPSMDAIKSTVKDIEQKMKQVKGLANVKSDLSQTYDQYEIKVDQNKAAENGISASQLAMHLNENLPEKTVTTVKENGKTVDVKVKQNKQTDWSEDKLNNITLKKPTGGTIKLGDIATLVKTTTPSKLTQEQGDYATMVSAKVTNKDVGGTTRQVMSKINNLDKPNNVKVNIGGASDDINNAMTQLAFAMLAAIIIVYLILVITFKGGLAPFTILFSLPFTVIGVIIALLITGETISVPSLIGMLMLIGIVVTNAIVLIDRVINNEQQGMEMKEALIEAGGTRIRPILMTAIATIGALVPLLFGQDSSILISKGLAATVIGGLISSTLLTLVVVPVIYEILFTLKKRFTKR >NZ_CP030323.1|WP_001161085.1|1007897_1008215_-|hypothetical-protein MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVVFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKENWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF >NZ_CP030323.1|WP_000051210.1|1008459_1008624_-|hypothetical-protein MSLENQLAELKYDYVRLQGDLEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP030323_6 | 1246636-1246721 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP030323_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP030323_6
>6.1|1246665|28|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder TAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP030323_6
The CRISPR arrays of NZ_CP030323_6 >merge|NZ_CP030323|6|1246636-1246721|CRISPRCasFinder ACAATGTAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGTAAGTTGGGGTGGGGCCTCAACA >NZ_CP030323|6|4|1246636-1246721|CRISPRCasFinder ACAATGTAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACA TAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAA ACAATGTAAGTTGGGGTGGGGCCTCAACA
>NZ_CP030323.1|WP_001045084.1|1245187_1246495_-|TrkH-family-potassium-uptake-protein MNKVHKPLYFYLMLFFSTTIIGALLLYLPFTGKKPISFLDALFIASSAFTVTGLSPVDIGSQFNILGEIVILLLIQIGGLGIVTVTLLTLVFLNRKISMKNRFLIMVTWNIDEPGGVIKLIKHLAIYSLVTELIGMICLCLSFIPKFGIGKGLFLSLFTSVSAFNNAGFALFKNNLIDYSSDPIVIITTSILIIFGGIGHFVVIDFINCKKLSKLSLHSKLVLTTTSILIIIGAITFFLLEQFNTMQNMGLVEKIGNSFFQSVTTRTAGFNSIDIAIINKSTALMLMLLMFIGGAPLSAAGGIKITTFAVAFIFVLNYIRKENNVSVFNKEISDKHIKLSIVTINISFLFISIITFILSIINPNISLIKLLFEVVSAFGTVGLSMNLTTEYHGITKIIIIFVMLCGKVGLLTLLRTFIPPKSPKNYRYTKGQIYL >NZ_CP030323.1|WP_000240656.1|1243030_1244647_+|chaperonin-GroEL MVKQLKFSEDARQAMLRGVDQLANAVKVTIGPKGRNVVLDKEFTAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGANLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVKVAVEALHENSQKVENKNEIAQVGAISAADEEIGRYISEAMEKVGNDGVITIEESNGLNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMVAELERPYILVTDKKISSFQDILPLLEQVVQSNRPILIVADEVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVAVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLDLKDASIDMLGTASKVEVTKDNTTVVDGDGDENSIDARVSQLKSQIEETESDFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVNIYQKVSEIEAEGDIETGVNIVLKALTAPVRQIAENAGLEGSVIVERLKNAEPGVGFNAATNEWVNMLEAGIVDPTKVTRSALQHAASVAAMFLTTEAVVASIPEKNNDQPNMGGMPGMM >NZ_CP030323.1|WP_000917289.1|1242670_1242955_+|co-chaperone-GroES MLKPIGNRVIIEKKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGVIVAVGTGRLLNDGTRVTPEVKEGDRVVFQQYAGTEVKRDNETYLVLNEEDILAVIE >NZ_CP030323.1|WP_000197629.1|1241752_1242496_-|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MTRLWASLLTVIIYILSQFLPLLIVKKLPFVQYSGIELTKAVIYIQLVLFLIAATTIILINLKIKNPTKLELEVKEHKKYIIPWALLGFALVMIYQMVVSIVYTQIFGTQQTSPNTERLIVIARKIPLFIFFVSIVGPLLEEYVFRKVIFGELFNAIKGNRIVAFAIATTVSSLIFALAHNDYKFIPIYFGMGVIFSLAYVWTKRLAVPIIIHMLQNGFVVIFQLLNPEALKKATEQANFIYHIFIP >NZ_CP030323.1|WP_070869116.1|1240579_1241728_+|hypothetical-protein MSYHWFTKMLLSTSILILSSSSLGLATDTVEAKDNLNGEKPTTNLNHNVTSPSVNSEINNNETGTPPESNQTGNEGTDSNSRDANPDSNNVKPDSNNQNPSPDSKPDPNNPNPVPNPKPDPDKPKPNPEPKPDPDNPKPKPDPKPDPDKPKPNPNPSPDPNQPGDSNHSGGSKNGGTWNPNASDGSNQGQWQPNGNQGNSQNPTGNDFVSQRFLALANGAYKYNPYILNQINKLGKDYGEVTDEDIYNIIRKQNFSGNAYLNGLQQQSNYFRFQYFNPLKSERYYRNLDEQVLALITGEIGSMPDLKKPEDKPDSKQRSFEPHEKDDFTVVKKQEDNKKSASTAYSKSWLAIVCSMMVVFSIMLFLFVKRNKKKNKNESQRR >NZ_CP030323.1|WP_000522383.1|1239756_1240383_-|nitroreductase-family-protein MGLFKKDKKAMTFDNAMEERRSIYNLKDSISISDDELESMIAHAVKHVPSSFNSQSTRIVLLLNDNNNKFWDNTKAILKEVMGENRDFEPTEQKIDNFKHSYGTILFYEDQDVVSGLQEQMPNYYDNFAIWSTQTNAMHQFAIWTALATKGIGASLQHYNPLVDEMTSNEFNIPKSWKLIAQMPFGDIREAAGEKSFNPVEDRFVIKK >NZ_CP030323.1|WP_000867953.1|1238610_1239396_-|carbon-nitrogen-family-hydrolase MKVQIYQLPIIFGDSSKNETQITQWFEKNMNDEVDVVVLPEMWNNGYDLEHLNEKADNNLGQSFSFIKHLAEKYKVDIVAGSVSNIRNNQIFNTAFSVNKSGQLINEYDKVHLVPMLREHEFLTAGENVAEPFQLSDGTYVTQLICYDLRFPELLRYPARSGAKIAFYVAQWPMSRLQHWHSLLKARAIENNMFVIGTNSTGFDGNTEYAGHSIVINPNGDLVGELNESADILTVDLNLNEVEQQRENIPVFKSIKLDLYK >NZ_CP030323.1|WP_001823225.1|1237877_1238012_+|delta-lysin-family-phenol-soluble-modulin MSCLILRIFILIKEGVISMAQDIISTISDLVKWIIDTVNKFTKK >NZ_CP030323.1|WP_001105712.1|1237072_1237642_-|accessory-gene-regulator-AgrB MNYFDNKIDQFATYLQKRNNLDHIQFLQVRLGMQVLAKNIGKLIVMYTLAYILNIFLFTLITNLTFYLIRRHAHGAHAPSSFWCYVESILLFILLPLVILNFHINPLIMIILTVISLGVISVYAPAATKKKPIPVRLIKRKKYYAIIVSLTFFIITLIIKEPFAQFIQLGIIIEAITLLPIFFIKEDLK >NZ_CP030323.1|WP_001093929.1|1236935_1237076_-|cyclic-lactone-autoinducer-peptide MNTLFNLFFDFITGILKNIGNIAAYSTCDFIMDEVEVPKELTQLHE >NZ_CP030323.1|WP_000206634.1|1246935_1248159_-|ArgE/DapE-family-deacylase MTTFSEKEKIQLLADIVELQTENNNEIDVCNYLKDLFDKYDIKSEILKVNEHRANIVAEIGNGSPILALSGHMDVVDAGNQDNWTYPPFQLTEKNGKLYGRGTTDMKGGLMALVITLIELKEQNQLPQGTIRLLATAGEEKEQEGAKLLADKGYLEDVDGLIIAEPTGSGIYYAHKGSMSCKVTATGKAVHSSVPFIGDNAIDTLLEFYNQFKEKYSELKKHDTKHELDVAPMFKSLIGKEISEEDANYASGLTAVCSIINGGKQFNSVPDEASLEFNVRPVPEYDNDFIESFFQNIINNVDSNKLSLDIPSNHRPVTSDKNNKLITTIKDVASSYVDKDDIFVSALVGATDASSFLGDNKDNVDLAIFGPGNPLMAHQIDEYIEKDMYLKYIDIFKEASIQYLKEK >NZ_CP030323.1|WP_000791403.1|1248594_1249650_+|bi-component-leukocidin-LukGH-subunit-H MKNKKRVLIASSLSCAILLLSAATTQANSAHKDSQDQNKKEHVDKSQQKDKRNVTNKDKNSPVPDDIGKNGKITKRTETVYDEKTNILQNLQFDFIDDPTYDKNVLLVKKQGSIHSNLKFESHKEEKNSNWLKYPSEYHVDFQVKRNRKTEILDQLPKNKISTAKVDSTFSYSSGGKFDSTKGIGRTSSNSYSKTISYNQQNYDTIASGKNNNWHVHWSVIANDLKYGGEVKNRNDELLFYRNTRIATVENPELSFASKYRYPALVRSGFNPEFLTYLSNEKSNEKTQFEVTYTRNQDILKNRPGIHYAPPILEKNKDGQRLIVTYEVDWKNKTVKVVDKYSDDNKPYKEG >NZ_CP030323.1|WP_000595398.1|1249671_1250688_+|bi-component-leukocidin-LukGH-subunit-G MIKQLYKNITICSLAISTVLTVFPATSYAKINSEIKAVSEKNLDGDTKMYTRTATTSDSQKNITQSLQFNFLTEPNYDKETVFIKAKGTIGSGLRILDPNGYWNSTLRWPGSYSVSIQNVDDNNNTNVTDFAPKNQDESREVKYTYGYKTGGDFSINRGGLTGNITKESNYSETISYQQPSYRTLLDQSTSHKGVGWKVEAHLINNMGHDHTRQLTNDSDNRTKSEIFSLTRNGNLWAKDNFTPKDKMPVTVSEGFNPEFLAVMSHDKKDEGKSKFVVHYKRSMDEFKIDWNRHGFWGYWSGENHVDKKEEKLSALYEVDWKTHDVKFVKVLNDNEKK >NZ_CP030323.1|WP_000239607.1|1251180_1252173_-|sphingomyelin-phosphodiesterase MVKKTKSNSLKKVATLALANLLLVGALTDNSAKAESKKDDTDLKLVSHNVYMLSTVLYPNWGQYKRADLIGQSSYIKNNDVVIFNEAFDNGASDKLLSNVKKEYPYQTPVLGRSQSGWDKTEGSYSSTVAEDGGVAIVSKYPIKEKIQHVFKSGCGFDNDSNKGFVYTKIEKNGKNVHVIGTHTQSEDSRCGAGHDRKIRAEQMKEISDFVKKKNIPKDETVYIGGDLNVNKGTPEFKDMLKNLNVNDVLYAGHNSTWDPQSNSIAKYNYPNGKPEHLDYIFTDKDHKQPKQLVNEVVTEKPKPWDVYAFPYYYVYNDFSDHYPIKAYSK >NZ_CP030323.1|WP_001068527.1|1254577_1255864_-|aminotransferase-class-I/II-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MNPLAQSLNEQLQQSNATAFAMLSDLGQNMFYPKGILSQSAEAKSTTYNATIGMATNKDGKMFASSLDAMFNDLTPDEIFPYAPPQGIEELRDLWQQKMLRDNPELSIDNMSRPIVTNALTHGLSLVGDLFVNQDDTILLPEHNWGNYKLVFNTRNGANLQTYPIFDKDGHYTTDSLVEALQSYNKDKVIMILNYPNNPTGYTPTHEEVTTIVNAIKALADKGTKVIAVVDDAYYGLFYEDVYTQSLFTALSNLNSNAILPVRLDGATKEFFAWGFRVGFMTFGTSDQTTKEVLEAKVKGLIRSNISSGPLPTQSAVKHVLKNNKQFDKEIEQNIQTLKERYEVTKEVVYADQYHSHWQAYDFNSGYFMAIKVHDVDPEELRKHLIEKYSIGVIALNATDIRIAFSCVEKEDIPHVFDSIAKAIDDLR >NZ_CP030323.1|WP_000990056.1|1256063_1256162_+|hypothetical-protein MMWWQEGMMTLITGGLLIIFRLWLELKWKNKK >NZ_CP030323.1|WP_000681969.1|1256403_1256580_+|hypothetical-protein MKHLTKIFVVLAIILFIVGYYLQATNHESQGIKLLLAAIMFMICAFISRSNDRRKNNK >NZ_CP030323.1|WP_000691584.1|1257120_1257501_+|GntR-family-transcriptional-regulator MKIILKNNSDFPIYEQIKQQVKQNILKGHVAPGEHLPSMRELAKDLQVSLITTKRAYEDLEKDGFVTTIRGKGTFVKEQDSSILKEKQFFTIENLVKELVNEAQAIEMSLEELQDILTFIYEEESS >NZ_CP030323.1|WP_000991298.1|1257497_1258394_+|phenol-soluble-modulin-export-ABC-transporter-ATP-binding-protein-PmtA MNAIELSNVNYSSDQFNLKNISFKVPQGFVTGFIGRNGAGKTTIIRLIMDLYQPQTGVIRVLEEDMALNPIELKNRIGFVYAENYFNERWTTKQLEKMIAPFYRKWDHQVFEFYLEKFDLPINKSIKTFSTGMKMKLSLAVAFSHHAELYIFDEPTSGLDPLARNELLEIIQQELIDENKTIFMSTHIISDLEKIADYIIHLSDGEVILNGSKEQLLQRYQVVSGAIEDLDDELASLLIFEEHKRTGFIGLTEHAQVFKEILGHKVNITTPSIENLMVYLEKRKPKYHENIKLMEEGF >NZ_CP030323.1|WP_000645729.1|1258394_1259075_+|phenol-soluble-modulin-export-ABC-transporter-permease-subunit-PmtB MKALLIRNFKLRRYTLIIYVLLLTLYPFYIMLDSTKFFYLLQSFISPTILIIWILDAGHLFRLNRRLGGNDSYYFYMSLPVSKKQLLNANYITCIVLTLIGTLVISLYAYEADVIEPNSIYFSTAYAFVISNFLSIPIAFSQFTELRRVKVPYGIYVFTIIILVPFLFSIAIVLVNYFVLSQSSFPDLYSYVLNIGFLIISIVILIVNYFKQLNKINTRKFKGGSR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP030323_7 | 1306355-1306436 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP030323_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP030323_7
>7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder TAGAGAATTTCGAAAAAAGAAATTCTACAGGT |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP030323_7
The CRISPR arrays of NZ_CP030323_7 >merge|NZ_CP030323|7|1306355-1306436|CRISPRCasFinder AATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAGAATTTCGAAAAAAGAAATTCTACAGGTAATGCAGGTTGGCGGGGCCCCAACA >NZ_CP030323|7|5|1306355-1306436|CRISPRCasFinder AATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACA TAGAGAATTTCGAAAAAAGAAATTCTACAGGT AATGCAGGTTGGCGGGGCCCCAACA
>NZ_CP030323.1|WP_000999708.1|1305103_1306090_-|aromatic-acid-exporter-family-protein MNDQWYKHLIGARTIKTGIAIFLTAVFCMALDLTPIYAILTAVVTIEPTAKASLIKGYRRLPATVIGAGFAVLFTYLFGDQSPFTYALSATFTILFCTKLKLQVGTNVAVLTSLAMIPGIHDAYIFNFLSRTLTAIIGLVTSGLINFMVFPPKYYGQVEEKLSKTDALMYKLFYDRCQELILSRLQSDKSEKAYKNIFNLNNQVETLISYQRDELSYHKKKECDWKLLNQLTKRAYTNRLFITHLSNIIYLPKNTRVNFSGDEKMALLKISSSIKDIFYDGSFKREDDSVETLRSTIKAHEISGENQIKSHILYEVLMIYRLLDSRYA >NZ_CP030323.1|WP_025174552.1|1304257_1304671_+|hypothetical-protein MKPTKVILRDASYVHSKTSITFILKDVVIEEDNKIYYFDTSATFEDQEIKFEFALFDSDMDNLKHMEYDNPVTEIYFIEPDLHFTIIDFNQELLCIYIDFDSGLRHSNMATESGISLRINVTKSDFNKFINELASLH >NZ_CP030323.1|WP_001790257.1|1304118_1304229_+|hypothetical-protein MDGNNQIDVCFFVLVNNYYTMSIYPRIINSNGDYAT >NZ_CP030323.1|WP_000544973.1|1303301_1304033_+|type-1-glutamine-amidotransferase MHELTIYHFMSDKLNLYSDIGNIIALRQRAKKRNIKVNVVEINETEGITFDECDIFFIGGGSDREQALATKELSKIKTPLKEAIEDGMPGLTICGGYQFLGKKYITPDGTELEGLGILDFYTESKTNRLTGDIVIESDTFGTIVGFENHGGRTYHNFGTLGHVTFGYGNNDEDKKEGIHYKNLLGTYLHGPILPKNYEITDYLLEKACERKGIPFEPKEIDNEAEKQAKQVLIDRANRQKKSR >NZ_CP030323.1|WP_001250333.1|1301986_1303300_+|Mur-ligase-family-protein MRQWTAIHLAKLARKASRAVGKRGTDLPGQIARKVDTDILRKLAEQVDDIVFISGTNGKTTTSNLIGHTLKANNIQIIHNNEGANMAAGITSAFIMQSTPKTKIAVIEIDEGSIPRVLKEVTPSMMVFTNFFRDQMDRFGEIDIMVNNIAETISNKGIKLLLNADDPFVSRLKIASDTIVYYGMKAHAHEFEQSTMNESRYCPNCGRLLQYDYIHYNQIGHYHCQCGFKREQAKYEISSFDVAPFLHLNINDEKYDMKIAGDFNAYNALAAYTVLRELGLNEQAIKNGFETYTSDNGRMQYFKKERKEAMINLAKNPAGMNASLSVGEQLEGEKVYVISLNDNAADGRDTSWIYDADFEKLSKQQIEAIIVTGTRAEELQLRLKLAEVEVPIIVERDIYKATAKTMDYKGFTVAIPNYTSLAPMLEQLNRSFEGGQS >NZ_CP030323.1|WP_000949467.1|1301194_1301695_-|H-type-ferritin-FtnA MLSKNLLEALNDQMNHEYFAAHAYMAMAAYCDKESYEGFANFFIQQAKEERFHGQKIYNYINDRGAHAEFRAVSAPKIDFSSILETFKDSLSQEQEVTRRFYNLSEIARQDKDYATISFLNWFLDEQVEEESMFETHINYLTRIGDDSNALYLYEKELGARTFDEE >NZ_CP030323.1|WP_001790679.1|1301020_1301113_+|hypothetical-protein MTKNTIISLENEKTQINDSENESSDLRKAK >NZ_CP030323.1|WP_000613738.1|1300249_1300804_-|3'-5'-exonuclease MIQDAFVALDFETANGKRTSICSVGMVKVIDSQITETFHTLVNPQDYFSQQNIKVHGIQPEDVENAPTFDYVFPYMMQFIADLPVVAHNAAFDMNVLHQSIQNIGLPTPNLTYFCSYQLAKRTVDSYRYGLKHMMEFYQLDFHGHHDALNDAKACAMITFRLLKNYENLTYVTNIYGKNLKDKG >NZ_CP030323.1|WP_000140176.1|1299112_1300183_+|DNA-polymerase-IV MTERRIIHIDMDYFFAQVEMRDNPKLKGKPVIVGGKASSRGVVSTASYEARKYGVHSAMPMSQAHKLCPNGYFVTSNFGAYRETSAQIMSIFRSYTDKVEPMSLDEAYLDITELVRPDLPASKIAQYIRKDILEQTHLTASAGVSYNKFLAKLASGMNKPDGMTVIDYQNVHDILMTLDIGDFPGVGKASKKVMHDNGIFNGRDLYEKTEFELIRLFGKRGRGLYNKARGIDHSEVKSSRVRKSVGTERTFATDVNDDEEILRKVWELSGKTAERLNKLQKSAKTVTVKIKTYQFETLSKQMSLRDSVSSEEDIYNIAYLLYNDLKDPDVPIRLIGVTVGNLEQSTYKNMTIYDFI >NZ_CP030323.1|WP_000548782.1|1298335_1298866_+|DUF3267-domain-containing-protein MHKIDLTTNNFQMRRFIILQLVIALFVILFTYKWALGVTAVVDQNIIINLVYGFAGFIILLILHELIHRALFLLFKKDSKPMFNIKKDRILFQTADAYFNKWQFSIIMLSPLILLSTGLLILIKVFGYSSLIFMFSMHTAYCFIDILLVALTISSSFKYVQQDEDSIYLYHQKPTQ >NZ_CP030323.1|WP_000636142.1|1306618_1307377_+|type-I-methionyl-aminopeptidase MIVKTEEELQALKEIGYICAKVRNTMQAATKPGITTKELDNIAKELFEEYGAISAPIHDENFPGQTCISVNEEVAHGIPSKRVIREGDLVNIDVSALKNGYYADTGISFVVGESDDPMKQKVCDVATMAFENAIAKVKPGTKLSNIGKAVHNTARQNDLKVIKNLTGHGVGLSLHEAPAHVLNYFDPKDKTLLTEGMVLAIEPFISSNASFVTEGKNEWAFETSDKSFVAQIEHTVIVTKDGPILTTKIEEE >NZ_CP030323.1|WP_001110179.1|1307593_1307980_+|hypothetical-protein MNYVERYIEQFLRATVRNNIKHYLLMLDEKMKNLDDYMRYLITKKEQLSKLIDSLMLTLENKYIDIAEAFQIQCAREINNQEIENIKSELNKVEAYYAQIETQIQQTSTEKIATEKTSYLINYMNAVA >NZ_CP030323.1|WP_000149064.1|1307994_1308696_+|cell-wall-active-antibiotics-response-protein MTHKYISTQMLIIFTALMIIANFYYIFFEKIGFLLVLLLGCVLVYVGYLYFHKIRGLLAFWIGALLIAFTLLSNKYTIIILFVFLLLLIVRYLIHKFKPKKVVATDEVMTSPSFIKQKWFGEQRTPVYVYKWEDVQIQHGIGDLHIDLTKAANIKENNTIVVRHILGKVQVILPVNYNINLHVAAFYGSTYVNEKSYKVENNNIHIEEMMKPDNYTVNIYVSTFIGDVEVIYR >NZ_CP030323.1|WP_001017131.1|1308692_1309736_+|sensor-histidine-kinase MNHYIRTIGSMLILVYSMLAAFLFIDKVFVNIIYFQGMFYTQIFGIPVFLFLNLIIILLCIIVGSVLAYKINQQNDWIKTQIERSMEGETVGINDQNIEIYSETLDLYHTLVPLNQELHKLRLKTQNLTNENYNINDVKVKKIIEDERQRLARELHDSVSQQLFAASMMLSAIKETKLEPPLDQQIPILEKMVQDSQLEMRALLLHLRPLGLKDKSLGEGIKDLVIDLQKKVPMKVVHEIQDFKVPKGIEDHLFRITQEAISNTLRHSNGTKVTVELFNKDDYLLLRIQDNGKGFNVDEKLEQSYGLKNMRERALEIGATFHIVSLPDSGTRIEVKAPLNKEDSYDD >NZ_CP030323.1|WP_000153526.1|1309725_1310355_+|response-regulator-transcription-factor MTIKVLFVDDHEMVRIGISSYLSTQRDIEVVGEGASGKEAIAKAHELKPDLILMDLLMEDMDGVEATTQIKKDLPQIKVLMLTSFIEDKEVYRALDAGVDSYILKTTSAKDIADAVRKTSRGESVFEPEVLVKMRNRMKKRAELYEMLTEREMEILLLIAKGYSNQEIASASHITIKTVKTHVSNILSKLEVQDRTQAVIYAFQHNLIQ >NZ_CP030323.1|WP_000037087.1|1310467_1311685_-|YihY/virulence-factor-BrkB-family-protein MSKKDHSSSKYLNSVKEAQEESKKKNKSNPKIDVDRTYIEPQQFQSKKPKKEDQVFFLSRLNKPAKYKKDSNFLSYLIYRIGKDDASGLAAQMTYHFVLAMFPMLLFLLTLLPFFNIKQSQITNMLSNAPAETSTLIKSVIGDITQNSSGGLLSIGLILAIWSASNGMTAIMNSFNVAYDVEDSRNGIVLKLLSVVFTVVMGVVFVVALALPTLGSVISHFLFGPLGFDEQVKWIFNLIRIVLPIIIIFIVFIVLYSVAPNVKTKLKSVLPGAVFTSIIWLAGSFGFGWYISNFGNYSKTYGSIAGIIILLLWLYITSFIIIVGAEINAIIHQRSVIKGKTPEEAALEHDDNNKNHYNENTRYEYAEDTNATHQRTYHVDEHPSDTYPEDDKNIKDKIVDKLKKD >NZ_CP030323.1|WP_000428172.1|1311962_1312238_-|hypothetical-protein MENKFVPGILIGAVIGGAISLADKSTRQALVQSVKDAKNGNRTRKPSKVSKIKDEVLYWKDVVEEIRRNNPELERSLKDAKETFVNRKNQR >NZ_CP030323.1|WP_000228666.1|1312244_1312709_-|low-molecular-weight-phosphotyrosine-protein-phosphatase MVDVAFVCLGNICRSPMAEAIMRQRLKDRNIHDIKVHSRGTGSWNLGEPPHEGTQKILNKHNIPFDGMISELFEATDDFDYIVAMDQSNVDNIKSINPNLKGQLFKLLEFSNMEESDVPDPYYTNNFEGVYDMVLSSCDNLIDYIVKDANLKEG >NZ_CP030323.1|WP_000180460.1|1312855_1313056_+|DUF1128-family-protein MTNEEKVLAIREKLNIVNQGLLDPEKYKNANEEELTDIYDFVQSRERLSPSEVTAIADALGQLRHD >NZ_CP030323.1|WP_000184381.1|1314403_1314934_+|acyl-CoA-thioesterase MTNQDRPMKSMSESKCYKNRQVFPQDTNHHHTMFGGTLMANIDEIAAITAMKHAGAQVVTASTDSVDFLKPIKTGDILQYVAMVSYAGTSSMEVVVQIRIDDVFNNKHDLAALSYLTFVALDDDGKPKHVPGVYPEDDVEKWFYDTAPQRVERRKARRIESKQTIEYLAQVQHIRD |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP030323_8 | 1500984-1501063 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP030323_8
|
1 spacers
spacers of NZ_CP030323_8
>8.1|1501008|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder CTATGTTGGGTCCCACCCCAACTTGCATTGTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP030323_8
The CRISPR arrays of NZ_CP030323_8 >merge|NZ_CP030323|8|1500984-1501063|CRISPRCasFinder TGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTATGTTGGGTCCCACCCCAACTTGCATTGTTTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCT >NZ_CP030323|8|6|1500984-1501063|CRISPRCasFinder TGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCT CTATGTTGGGTCCCACCCCAACTTGCATTGTT TGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCT
>NZ_CP030323.1|WP_000160435.1|1499617_1500916_+|CBS-domain-containing-protein MTKHEQILDYIESLSIGSKISVRKIAKFLNVSEGTAYRAIKDADKMGMVATIDRVGTVRIEKRNRNEIEHLTFNEIVNIIDGQVLGGNKGITKMVSKFAIGAMELKDILKYIGPKTLLIVGNREDVQIEALKRGTAILITGGFKPSNKVINFANEHDLPVLSSSYDTFLVANIINKALFNQKIRKDILIVQDIMTPLDDLSVLFDTMKIADYKRMANRTGHTRFPVVNESYKLVGIVTSREMINTKDDDEIDKVMTRNPIYVNAMSTVASCAHMMIWEGIELIPVVSSNKKTVGVINRQDVLKSMQLLGRQPQMGETINDQIAKYITMNQDGITVEVSPLLINHYGTVSKAAFVSIIEETIQYEMRKFKKGNVMIENLNIVYIKTVPIESHITVRFGILDVGRNFAKIEVNMHSQNDKVASALVICQMFDEV >NZ_CP030323.1|WP_000277602.1|1498999_1499413_-|universal-stress-protein MYKNILLGVDTQLKNEKALKEVSKLAGEGTVVTVLNAISEQDAQASIKAGVHLNKLTEERSKRLEKTRKALEDYGIDYDQIIVRGNAKEELLKHANSGKYEIVVLSNRKAEDKKKFVLGSVSHKVAKRATIPVLIVK >NZ_CP030323.1|WP_000777188.1|1497922_1498612_+|metal-dependent-hydrolase MKLSFHGQSTIYLEGNNKKVIVDPFISNNPKCDLNIETVQVDYIVLTHGHFDHFGDVVELAKKTGATVIGSAEMADYLSSYHGVENVHGMNIGGKANFDFGSVKFVQAFHSSSFTHENGIPVYLGMPMGIVFEVEGKTIYHTGDTGLFSDMSLIAKRHPVDVCFVPIGDNFTMGIDDASYAINEFIKPKISVPIHYDTFPLIEQDPQQFKDAVNVGDVQILKPGESVQF >NZ_CP030323.1|WP_000161673.1|1496692_1497748_-|aminopeptidase-P-family-protein MTKISKIIDELNNQQADAAWITTPLNVYYFTGYRSEPHERLFALLIKKDGKQVLFCPKMEVEEVKASPFTGEIVGYLDTENPFSLYPQTINKLLIESEHLTVARQKQLTSGFNVNSFGDVDLTIKQLRNIKSEDEISKIRKAAELADKCIEIGVSYLKEGVTEREVVNHIEQTIKQYGVNEMSFDTMVLFGDHAASPHGTPGDRRLKSNEYVLFDLGVIYEHYCSDMTRTIKFGEPNKEAQEIYNIVLEAETSAIQAIKPGIPLKDIDHIARNIISEKGYGEYFPHRLGHGLGLQEHEYQDVSSTNSNLLEAGMVITIEPGIYVPGVAGVRIEDDILVTNEGYEVLTHYEK >NZ_CP030323.1|WP_001824175.1|1496500_1496614_+|hypothetical-protein MNDIDLIHYMLLMNVPAYVFLACLLYIAVRLGQKFMF >NZ_CP030323.1|WP_000689998.1|1495258_1496377_+|alanine-dehydrogenase MKIGIPREIKNNENRVGLSPSGVHALVESGHTVLVETNAGSGSFFEDVDYKEAGAEIVAEQAKVWDVDMVIKVKEPLESEYPYFKEGLVLFTYLHLANEEKLTQALIDRKVISIAYETVQLPDRSLPLLSPMSEVAGRMSAQVGAEFLQKLNGGMGILLGGVPGVPKGKVTIIGGGQAGTNAAKIALGLGADVTILDVNPKRLQQLDDLFGGRVHTIMSNPLNIELYVKQSDLVIGAVLIPGAKAPRLVTEDMIKQMKNGSVIIDIAIDQGGIFETTDKITTHDDPTYIKHGVVHYAVANMPGAVPRTSTLALNNATLPYALMLANKGYREAFKSNQPLSLGLNTYKGHVTNKGVAEAFEMEYKSVEEALQL >NZ_CP030323.1|WP_000634175.1|1494617_1495118_-|universal-stress-protein MITYKNILIAVDGSHEAEWAFNRAVGVAKRNDAKLTIVNVIDSRTYSSYEVYDAQFTEKSKHFAEELLNGYKEVATNAGVKDVETRLEFGSPKSIIPKKLAHEINADLIMSGTSGLNAVERFIVGSVSESIVRHAPCDVLVVRTEELPADFQPQVATTQLREKYQN >NZ_CP030323.1|WP_000040069.1|1493169_1494372_+|acetate-kinase MSKLILAINAGSSSLKFQLIRMPEEELVTKGLVERIGLKDSIFTIEVNGEKVKTVQDIKDHVEAVDIMLDAFKAHNIINDINDIDGTGHRVVHGGEKFPESVAITDEVEKEIEELSELAPLHNPANLMGIRAFRKLLPNIPHVAIFDTAFHQTMPEKAYLYSLPYHYYKDYGIRKYGFHGTSHKFVSQRAAEMLDKPIEDLRIISCHIGNGASIAAIDGGKSIDTSMGFTPLAGVTMGTRSGNIDPALIPFIMEKTGKTAEQVLEILNKESGLLGLSGTSSDLRDLSEEAESGKARSQMALDVFASKIHKYIGSYAARMHGVDVIVFTAGIGENSVEIRAKVLEGLEFMGVYWDPKKNENLLRGKEGFINYPHSPVKVVVIPTDEESMIARDVMTFGGLK >NZ_CP030323.1|WP_000840587.1|1492134_1493082_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MAEQQTIMERLFHTLDEKAKTLNNENGQSFIENLGLAMEQVYTNERGLLEQSTLQDRRKAFQFAYLSLMQEEKIQANHQITPDSIGLILGFLVERFMNNQEELHIVDIASGVGHLSATVKEVLPEIAVMHHLIEVDPVLSRVSVHLANFLEIPFDVYPQDAIMPLPLEEADIVIGDFPVGYYPIDERSKEFKLGFEKGHSYSHYLLIEQAINALKDAGYAFLVVPSNIFTGEHVKQLEKYIATETEMQAFLNLPPTLFKNEKARKSILILQKKKSGETKPVEVLLANIPDFKNPSQFQGFMTELNQWMDTNRPKK >NZ_CP030323.1|WP_000136257.1|1491517_1492012_+|thiol-peroxidase MTEITFKGGPIHLKGQQINEGDFAPDFTVLDNDLNQVTLADYAGKKKLISVVPSIDTGVCDQQTRKFNSEASKEEGIVLTISADLPFAQKRWCASAGLDNVITLSDHRDLSFGENYGVVMEELRLLARAVFVLDADNKVVYKEIVSEGTDFPDFDAALAAYKNI >NZ_CP030323.1|WP_000626083.1|1501365_1502307_+|pApA-hydrolase-Pde2 MISTLNEIMKCIEDNDTIIIHRHVRPDPDAYGSQLGLKYYIQQKFPQKQVFAVGEAESSLSFIGELDNIDDKTYQDALVIVCDTANAPRIDDERYSTGSKLIKIDHHPAVDQYGDINLVNTNASSTSEIIYDLISHFNDEAIVNKDIASVLYLGIVGDTGRFLFNNTSEHTMEIAGKLIGHDIDHNVLLNKMMEKDPKMLPFQGYVLQHFELMDDGFCQVKITEDVLEQFGIQPNEASQFVNTIADIKGLKIWVFAVDEGSEIRCRLRSKGQLIINDIAQDFGGGGHPNASGVSVNSWDEFEQLATALRTKLN >NZ_CP030323.1|WP_000226897.1|1502327_1505525_+|DNA-polymerase-III-subunit-alpha MVAYLNIHTAYDLLNSSLKIEDAVRLAVSENVDALAITDTNVLYGFPKFYDACIANNIKPIFGMTIYVTNGLNTIETVVLAKDNNGLKDLYQLSSEIKMNALEHVSFELLKRFSNNMIIIFKKVGDQHRDIVQVFETHNDTYMDHLSISIQGIKHVWIQNVCYQTRQDADTISALAAIRDNTKLDLIHDQEDFGAHFLTEKEIKQLDINQEYLTQVDVIAQKCNAELKYHQSLLPQYQTPNDESAKKYLWRVLVTQLKKLELNYDVYLERLKYEYKVITNMGFEDYFLIVSDLIHYAKTNDVMVGPGRGSSAGSLVSYLLGITTIDPIKFNLLFERFLNPERVTMPDIDIDFEDTRRERVIQYVQEKYGELHVSGIVTFGHLLARAVARDVGRIMGFDEVTLNEISSLIPHKLGITLDEAYQIDDFKKFVHRNHRHERWFSICKKLEGLPRHTSTHAAGIIINDHPLYEYAPLTKGDTGLLTQWTMTEAERIGLLKIDFLGLRNLSIIHQILIQVKKDLGINIDIEKIPFDDQKVFELLSQGDTTGIFQLESDGVRSVLKKLKPEHFEDIVAVTSLYRPGPMEEIPTYITRRHDPSKVQYLHPHLEPILKNTYGVIIYQEQIMQIASTFANFSYGEADILRRAMSKKNRAVLESERQHFIEGAKENGYHEDISKQIFDLILKFADYGFPRAHAVSYSKIAYIMSFLKVHYPNYFYANILSNVIGSEKKTAQMIEEAKKQGITILPPNINESHWFYKPSHEGIYLSIGTIKGVGYQSVKVIVDERYQNGKFKDFFDFARRIPKRVKTRKLLEALILVGAFDAFGKTRSTLLQAIDQVLDGDLNIEQDGFLFDILTPKQMYEDKEELPDALISQYEKEYLGFYVSQHPVDKMFVAKQYLTIFKLSNAQNNKPILVQFDKVKQIRTKNGQNMAFVTLNDGIETLDGVIFPNQFKKYEELLSHNDLFIVSGKFDHRKQQRQLIINEIQTLATFEEQKLAFAKQIIIRNKSHIDTFEEMIKATKENANDVVLSFYDETIKQMTTLGYINQKDSMFNNFIQSFNPSDIRLI >NZ_CP030323.1|WP_000058390.1|1505974_1507204_+|NAD-dependent-malic-enzyme-4 MSLRDEALEMHKRNQGKLEVKPNVKVTNKEELSLAYSPGVAEPCKDIYEDKRKVYDYTIKGNTVAVITDGTAVLGLGNIGPEASIPVMEGKAVLFKSFAGINGVPIALNTTDTEEIIKTVKLLEPNYGGINLEDISAPRCFEIEERLKKETNIPVFHDDQHGTAIVTMAGLVNALRVVNKDIAKIKVVLNGAGAAGIAIVKLLYAYGVRNMVMCDSRGAIFEGRSYGMNPTKDVVAKWTNKDKIEGSLEEVVKDADVFIGVSVANALSQDMVKSMADNPIIFAMANPNPEIIPDDAKAAGARVVGTGRSDYPNQINNVLAFPGIFRGALEVEATHINEEMKKAAVEAIADLIDSSELNEDYCIPGPFDKRVAPSVARNVAKAAMESGVARIEVNPQDVYDKTMKLTDLQ >NZ_CP030323.1|WP_000471573.1|1507398_1508256_+|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-beta MFKDFFNRTKKKKYLTVQDSKNNDVPAGIMTKCPKCKKIMYTKELAENLNVCFNCDHHIPLTAYKRIEAISDEGSFTEFDKGMTSANPLDFPSYIEKIEKDQQKTGLKEAVVTGTAQLDGMKFGVAVMDSRFRMGSMGSVIGEKICRIIDYCTENRLPFILFSASGGARMQEGIISLMQMGKTSVSLKRHSDAGLLYISYLTHPTTGGVSASFASVGDINLSEPKALIGFAGRRVIEQTINEKLPDDFQTAEFLLEHGQLDKVVHRNDMRQTLSEILKIHQEVTK >NZ_CP030323.1|WP_000883646.1|1508255_1509200_+|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-alpha MLDFEKPLFEIRNKIESLKESQDKNDVDLQEEIDMLEASLERETKKIYTNLKPWDRVQIARLQERPTTLDYIPYIFDSFMELHGDRNFRDDPAMIGGIGFLNGRAVTVIGQQRGKDTKDNIYRNFGMAHPEGYRKALRLMKQAEKFNRPIFTFIDTKGAYPGKAAEERGQSESIATNLIEMASLKVPVIAIVIGEGGSGGALGIGIANKVLMLENSTYSVISPEGAAALLWKDSNLAKIAAETMKITAHDIKQLGIIDDVISEPLGGAHKDIEQQALAIKSAFVEQLDSLESLSRDEIANDRFEKFRNIGSYIE >NZ_CP030323.1|WP_000717561.1|1509468_1510437_+|6-phosphofructokinase MKKIAVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRTAIYNEIEVYGVYHGYQGLLNDDIHKLELGSVGDTIQRGGTFLYSARCPEFKEQEVRKVAIENLRKRGIEGLVVIGGDGSYRGAQRISEECKEIQTIGIPGTIDNDINGTDFTIGFDTALNTIIGLVDKIRDTASSHARTFIIEAMGRDCGDLALWAGLSVGAETIVVPEVKTDIKEIADKIEQGIKRGKKHSIVLVAEGCMTAQDCQKELSQYINVDNRVSVLGHVQRGGSPTGADRVLASRLGGYAVDLLMQGETAKGVGIKNNKIVATSFDEIFDGKDHKFDYSLYELANKLSI >NZ_CP030323.1|WP_001232650.1|1510458_1512216_+|pyruvate-kinase MRKTKIVCTIGPASESEEMIEKLINAGMNVARLNFSHGSHEEHKGRIDTIRKVAKRLDKIVAILLDTKGPEIRTHNMKDGIIELERGNEVIVSMNEVEGTPEKFSVTYENLINDVQVGSYILLDDGLIELQVKDIDHAKKEVKCDILNSGELKNKKGVNLPGVRVSLPGITEKDAEDIRFGIKENVDFIAASFVRRPSDVLEIREILEEQKANISVFPKIENQEGIDNIAEILEVSDGLMVARGDMGVEIPPEKVPMVQKDLIRQCNKLGKPVITATQMLDSMQRNPRATRAEASDVANAIYDGTDAVMLSGETAAGLYPEEAVKTMRNIAVSAEAAQDYKKLLSDRTKLVETSLVNAIGISVAHTALNLNVKAIVAATESGSTARTISKYRPHSDIIAVTPSEETARQCSIVWGVQPVVKKGRKSTDALLNNAVATAVETGRVTNGDLIIITAGVPTGETGTTNMMKIHLVGDEIANGQGIGRGSVVGTTLVAETVKDLEGKDLSDKVIVTNSIDETFVPYVEKALGLITEENGITSPSAIVGLEKGIPTVVGVEKAVKNISNNMLVTIDAAQGKIFEGYANVL >NZ_CP030323.1|WP_000818529.1|1512562_1513924_-|amino-acid-permease MAEKLQRELSNRHIQLIAIGGAIGTGLFLGAGQTIALTGPSILLTYIIIGFMLFMFMRGLGEIIIQNTEFKSFADVTNTYIGPFAGFVTGWTYWFCWIITGMAEVTAVAKYVSFWFPEIPNWISALFCVLLLMSFNLLSARLFGELEFWFSIIKIATIIGLIVVGFVMILFAFKTQFGHASFTNLYEHGIFAKGASGFFMSFQMALFSFVGIEMIGVTAGETKDPVKTIPKAINSVPIRILIFYVGALAVIMSIIPWQQVDPDNSPFVKLFALIGIPFAAGLINFVVLTAAASSCNSGIFSNSRMLFGLSSQQQAPPNFTKTNKYGVPHVAIFASSALLLVAALLNYIFPDATKVFTYVTTISTVLFLVVWGLIIIAYINYSRKNPDLHKNATYKLLGGKYMGYLIFVFFIFVFGLLFINVDTRRAIYFIPIWFILLGFMYLRYKRIAAKSNK >NZ_CP030323.1|WP_000829167.1|1514271_1515393_+|citrate-synthase MAELQRGLEGVIAAETKISSIIESQLTYAGYDIDDLAENAQFEEVIFLLWNYRLPNEEELAHLKGKLNQYMTLNPRVYTHFEEYVTDHVHPMTALRTSLSYIAHFDPDAENESDENRYERAMRIQAKVASLVTAFARVRQDKEPLKPNPDLSYAANFLYMLRGELPTDIEVEAFNKALILHADHELNASAFTARCAVSSLSDMYSGIVAAVGSLKGPLHGGANEQVMTMLSEIGSIENVDAYLDEKFANKDKVMGFGHRVYKDGDPRAKYLREMSRQITKDAGREELFEMSVKMEKRMAEEKGLIPNVDFYSASVYHCMEIPHDLFTPIFAVSRSAGWIAHILEQYKDNRIMRPRAKYIGETNRKYIPLEERK >NZ_CP030323.1|WP_000123175.1|1515441_1516710_+|NADP-dependent-isocitrate-dehydrogenase MTAEKITQGTEGLNVPNEPIIPFIIGDGIGPDIWKAASRVIDAAVEKAYNGEKRIEWKEVLAGQKAFDTTGEWLPQETLDTIKEYLIAVKGPLTTPIGGGIRSLNVALRQELDLFTCLRPVRWFKGVPSPVKRPQDVDMVIFRENTEDIYAGIEFKEGTTEVKKVIDFLQNEMGATNIRFPETSGIGIKPVSKEGTERLVRAAIQYAIDNNRKSVTLVHKGNIMKFTEGSFKQWGYDLALTEFGDQVFTWQQYDEIVENEGRDAANAAQEKAEKEGKIIIKDSIADIFLQQILTRPAEHDVVATMNLNGDYISDALAAQVGGIGIAPGANINYETGHAIFEATHGTAPKYAGLNKVNPSSVILSSVLMLEHLGWQEAADKITDSIEDTIASKVVTYDFARLMDGAEEVSTSAFADELIKNLK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP030323_9 | 1855927-1856006 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP030323_9
|
1 spacers
spacers of NZ_CP030323_9
>9.1|1855952|30|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder CGGGTCCCCAACATAGTAGCTGCGGAAAGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP030323_9
The CRISPR arrays of NZ_CP030323_9 >merge|NZ_CP030323|9|1855927-1856006|CRISPRCasFinder CAGCTTACAATAAAGTGCAAGTTGGCGGGTCCCCAACATAGTAGCTGCGGAAAGCCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG >NZ_CP030323|9|7|1855927-1856006|CRISPRCasFinder CAGCTTACAATAAAGTGCAAGTTGG CGGGTCCCCAACATAGTAGCTGCGGAAAGC CAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG
>NZ_CP030323.1|WP_000084773.1|1854767_1855382_+|phosphatase-PAP2-family-protein MSQWKRISLLIVFTLVFGIIAFFHESRLGKWIDNEVYEFIYSSESFITTSIMLGATKVGEVWAMLCISLLLVAYLMLKRHKIEALFFALTMALSGILNPALKNIFDRERPTLLRLIDITGFSFPSGHAMGSTAYFGSGIYLLNRLNQGNSKGILIGLCAAMILLISISRVYLGVHYPTDIIAGIIGGVFCIILSTLLLRNKLIN >NZ_CP030323.1|WP_000160908.1|1853680_1854751_+|undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide-beta-N-acetylglucosaminyltransferase MTKIAFTGGGTVGHVSVNLSLIPTALSQGYEALYIGSKNGIEREMIESQLPEIKYYPISSGKLRRYISLENAKDVFKVLKGILDARKVLKKEKPDLLFSKGGFVSVPVVIAAKSLNIPTIIHESDLTPGLANKIALKFAKKIYTTFEETLNYLPKEKADFIGATIREDLKNGNAHNGYQLTGFNENKKVLLVMGGSLGSKKLNSIIRENLDALLQQYQVIHLTGKGLKDDQVKKSGYIQYEFVKEDLTDLLAITDTVISRAGSNAIYEFLTLRIPMLLVPLGLDQSRGDQIDNANHFADKGYAKAIDEEQLTAQILLQELNEMEQERTRIINNMKSYEQSYTKEALFDKMIKDALN >NZ_CP030323.1|WP_000620194.1|1853159_1853669_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIRLGKMSDLDQILNLVEEAKELMKEHDNEQWDDQYPLLEHFEEDIAKDYLYVLEENDKIYGFIVVDQDQAEWYDDIDWPVNREGAFVIHRLTGSKEYKGAATELFNYVIDVVKARGAEVILTDTFALNKPAQGLFAKFGFHKVGEQLMEYPPYDKGEPFYAYYKNLKE >NZ_CP030323.1|WP_000342123.1|1851269_1852760_+|S41-family-peptidase MDDKQHKSSSDDERAEIATSNQDQQTNSSKRVHLKRWQFISILIGTILITAVITVVAYIFINQKISGLNKTDQANLNKIENVYKILNSDYFKKQNSDKLSKAAIDGMVKELKDPYSEYLTKEQTKSFNEGVSGDFVGIGAEMQKKNDQIMVTSPMKGSPAERAGIRPKDVITKVNGKSIKGKALDEVVKDVRGKENTEVTLTVQRGSEEKDVKIKREKIHVKSVEYKKKGKVGIITINKFQNDTSGELKDAVLKAHKDGLKKIVLDLRNNPGGLLDEAVKMANIFIDKGKTVVKLEKGKDTEAIQTSNDALKEAKDMDISILVNEGSASASEVFTGALKDYHKAKVYGSKTFGKGVVQTTREFKDGSLLKYTEMKWLTPDGHYIHGKGIKPDVTIDTPKYQSLNVIPNTKTFKVGDDDKNIKTIKIGLSALGYKVDNESTQFDQALENQVKAFQQANKLEVTGEFNKETNNKFTELLVEKANKHDDVLDKLINILK >NZ_CP030323.1|WP_000801007.1|1850856_1851078_+|hypothetical-protein MKNYSFYQFVMTVRGRHDDKGRLAEEIFDDLAFPKHDDDFNILSDYIETHGDFTLPMSVFDDLYEEYTEWLKF >NZ_CP030323.1|WP_000473654.1|1850356_1850857_+|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA MFKKLFGKGKEVQKDIAIYAPLTGEYVKIEDIPDPVFAQKMMGEGFGINPTEGEVVSPIAGRVDNVFPTKHAIGLKADNGLELLVHIGLDTVQLDGEGFEVLVSSGDEVNVGDPLVRFNLEYINNNAKSVISPIIITNTDQAASINIYDENAVIKGETKVIDVTMN >NZ_CP030323.1|WP_000913315.1|1849916_1850345_+|peptide-methionine-(R)-S-oxide-reductase-MsrB MLKKDKSELTDIEYIVTQENGTEPPFMNEYWNHFAKGIYVDKISGKPLFTSEEKFHSECGWPSFSKALDDDEIIELVDKSFGMLRTEVRSEESNSHLGHVFNDGPKESGGLRYCINSAAIQFIPYEKLEELGYGDLISHFDK >NZ_CP030323.1|WP_000159902.1|1849390_1849924_+|peptide-methionine-(S)-S-oxide-reductase-MsrA MTKEYATLAGGCFWCMVKPFTSYPGIKSVVSGYSGGHVDNPTYEQVCTNQTGHVEAVQITFDPEVTSFENILDIYFKTFDPTDDQGQFFDRGESYQPVIFYHDEHQKKAAEFKKQQLNEQGIFKKPVITPIKPYKNFYPAEDYHQDYYKKNPVHYYQYQRGSGRKAFIESHWGNQNA >NZ_CP030323.1|WP_000166052.1|1848457_1849297_+|fatty-acid-kinase-FakB2 MTKQIIVTDSTSDLSKEYLEANNIHVIPLSLTIEGASYVDQVDITSEEFINHIENDEDVKTSQPAIGEFISAYEELGKDGAEIISIHLSSGLSGTFNTAYQASQMVDANVTVIDSKSISFGLGYQIQHLVELVKEGVSTSEIVNKLNHLRENIKLFVVIGQLNQLIKGGRISKTKGLIGNLMKIKPIGTLDDGRLELVHNARTQNSSIQYLKKEIAEFIGDHEIKSVGVAHANVIEYVDKLKKVFNEAFHVNNYDINVTTPVISAHTGQGAIGLVVLKK >NZ_CP030323.1|WP_000175746.1|1847963_1848443_+|dihydrofolate-reductase MTLSILVAHDLQRVIGFENQLPWHLPNDLKHVKKLSTGHTLVMGRKTFESIGKPLPNRRNVVLTSDTSFNVEGVDVIHSIEDIYQLPGHVFIFGGQTLFEEMIDKVDDMYITVIEGKFRGDTFFPPYTFEDWEVASSVEGKLDEKNTIPHTFLHLIRKK >NZ_CP030323.1|WP_000192137.1|1856523_1857183_+|response-regulator-transcription-factor-ArlR MTQILIVEDEQNLARFLELELTHENYNVDTEYDGQDGLDKALSHYYDLIILDLMLPSINGLEICRKIRQQQSTPIIIITAKSDTYDKVAGLDYGADDYIVKPFDIEELLARIRAILRRQPQKDIIDVNGITIDKNAFKVTVNGAEIELTKTEYDLLYLLAENKNHVMQREQILNHVWGYNSEVETNVVDVYIRYLRNKLKPYDRDKMIETVRGVGYVIR >NZ_CP030323.1|WP_112380514.1|1857179_1858535_+|sensor-histidine-kinase-ArlS MTKRKLRNNWIIVTTMITFVTIFLFCLIIIFFLKDTLHNSELDDAERSSSDINNLFHSKPVKDISALDLNASLGNFQEIIIYDEHNNKLFETSNDNTVRVEPGYEHRYFDRVIKKRYKGIDYLIIKEPITTQDFKGYSLLIHSLENYDNIVKSLYIIALAFGVIATMITATISYVFSTQITKPLVSLSNKMIEIRRDGFQNKLQLNTNYEEIDNLANTFNEMMSQIEESFNQQRQFVEDASHELRTPLQIIQGHLNLIQRWGKKDPAVLEESLNISIEEMNRIIKLVEELLELTKGDVNDISSEAQTVHINDEIRSRIHSLKQLHPDYQFDTDLTSKNLEIKMKPHQFEQLFLIFIDNAIKYDVKNKKIKVKTRLKNKQKIIEITDNGIGIPEEDQDFIFDRFYRVDKSRSRSQGGNGLGLSIAQKIIQLNGGSIKIKSEINKGTTFKIIF >NZ_CP030323.1|WP_000180678.1|1858823_1861622_+|2-oxoglutarate-dehydrogenase-E1-component MTNERKEVSEAPVNFGANLGLMLDLYDDFLQDPSSVPEDLQVLFSTIKNDDSIVPALKSTSSQNSDGTIKRVMRLIDNIRQYGHLKADIYPVNPPKRKHVPKLEIEDFDLDQQTLEGISAGIVSDHFADIYDNAYEAILRMEKRYKGPIAFEYTHINNNTERGWLKRRIETPYKVTLNNNEKRALFKQLAYVEGFEKYLHKNFVGAKRFSIEGVDALVPMLQRTITIAAKEGIKNIQIGMAHRGRLNVLTHVLEKPYEMMISEFMHTDPMKFLPEDGSLQLTAGWTGDVKYHLGGIKTTDSYGTMQRIALANNPSHLEIVAPVVEGRTRAAQDDTQRAGAPTTDHHKAMPIIIHGDAAYPGQGINFETMNLGNLKGYSTGGSLHIITNNRIGFTTEPIDARSTTYSTDVAKGYDVPIFHVNADDVEATIEAIDIAMEFRKEFHKDVVIDLVGYRRFGHNEMDEPSITNPVPYQNIRKHDSVEYVFGKKLVNEGVISEDEMNSFIEQVQKELRQAHDKINKADKMDNPDMEKPADLALPLQADEQSFTFDHLKEINDALLTYPDGFNILKKLNKVLEKRHEPFNKEDGLVDWAQAEQLAFATILQDGTPIRLTGQDSERGTFSHRHAVLHDEQTGETYTPLHHVPDQKATFDIHNSPLSEAAVVGFEYGYNVENKKSFNIWEAQYGDFANMSQMIFDNFLFSSRSKWGERSGLTLFLPHAYEGQGPEHSSARLERFLQLAAENNCTVVNLSSSSNYFHLLRAQAASLDSEQMRPLVVMSPKSLLRNKTVAKPIDEFTSGGFEPILTESYQADKVTKVILATGKMFIDLKEALAKNPDESVLLVAIERLYPFPEEEIEALLAQLPNLEEVSWVQEEPKNQGAWLYVYPYVKVLVADKYDLSYHGRIQRAAPAEGDGEIHKLVQNKIIENALKNN >NZ_CP030323.1|WP_001115459.1|1861635_1862904_+|dihydrolipoyllysine-residue-succinyltransferase MPEVKVPELAESITEGTIAEWLKNVGDSVEKGEAILELETDKVNVEVVSEEAGVLTEQLASEGDTVEVGQAIAVIGEGSGNASKENSNDNTPQQNEETNNKKEETTNKSADKAEVNQTTDDNQQRVNATPSARRYARENGVNLAEVSPKTNDLVRKEDIDKKQQAPASTQTTQQAPAKEEKKYNQYPTKPVIREKMSRRKKTAAKKLLEVSNNTAMLTTFNEVDMTNVMELRKRKKDQFMKDHDGTKLGFMSFFTKASVAALKKYPEVNAEIDGDDMITKQYYDIGVAVSTDDGLLVPFVRDCDKKNFAEIEAEIANLAVKAREKKLGLDDMVNGSFTITNGGIFGSMMSTPIINGNQAAILGMHSIITRPIAIDQDTIENRPMMYIALSYDHRIIDGKEAVGFLKTIKELIENPEDLLLES >NZ_CP030323.1|WP_000334509.1|1863483_1864293_+|hypothetical-protein MCGLRSITLGTTNIEQTKHFMVDILGLNCEELLENSIRFGDADISPGTRLQFIQVPSEQLEESHFVGIGLRTPTDSGLEEYAEILSSKEIPFTTTKELNGNKYFSFEDNNGHIFSIYSNENNYGVGLGMPSFESAVNPLHQVQGLGPVILKVNHVDITGQILTNIFGLEVFAEYQPFDNADYHVQVFKIGTGGLGGEIHLMPVETEMTMPEYGAVDQVEFETKDADFFNQAKSRLDEVEIPYQTLEQDDIESIRITENSGLSFIFTLQK >NZ_CP030323.1|WP_000902174.1|1864321_1864525_+|hypothetical-protein MLHETWKERTPIKKVEVINTDAKKFTVSDMLTVGKQYDVINETEEYYQIIDNSGLIGGYYKTYFKEV >NZ_CP030323.1|WP_001185421.1|1864705_1865497_+|MoxR-family-ATPase MALKHYKNSDSTVFNDAKALFDLNKNILLKGPTGSGKTKLAETLSEVVDTPMHQVNCSVDLDTESLLGFKTIKTNAEGQQEIVFVDGPVIKAMKEGHILYIDEINMAKPETLPVLNGVLDYRRQITNPYTGEVIKAVPGFNVIAAINEGYVGTLPMNEALKNRFVVIHVDYIDGDILKNVIKEQSLLQDDKQIEQIIKFNEDLRTMSKQGQISEEAASIRALLDLCDLITVMPVERAIKRTIIDKLEDEREQQAIYNAVELNF >NZ_CP030323.1|WP_001283670.1|1865510_1867397_+|nitric-oxide-reductase-activation-protein-NorD MSDRFIKFNDEQLDAKQVMMLQDLARLLLKNEQTQVKIQKFPYYNPVQNVLITSWFWSHRPSHIEMAGLKTDVMLAAYGYHMMDVQIVNEVVQDKTFKHPKFYQQLFKLLEDMRVLNSIKVERPSTAKLIDLRLDTRISYTESQIKVYRTKTQYTDLLFLYLEHAFLSQDFFDIPSIHSDLDDILVNMFLYLPNFFQNQNSEDNMYLAQRIMYQVDDILKEDMLNEYYYLPKTLYNTLASPEFEDLKRTDASQVDGQDDTSEDDDNQSEKADSKSADSESKGGAYLEMELHEGQNSETLGNDEAREGDATDDMTDMMTKKGKGSNDTLNREEGDAVGQSQAFQLDGVNKNVEIKWQIPEIEPQYVLEYQESKQDVQYEIKDLIQIIKKTIEREQRDARFNLTKGRLQKDLINWFIDDQYKLFYKKQDLSKSFDATFTLLIDASASMHDKMAETKKGVVLFHETLKALNIKHEILSFSEDAFDSDEHAQPNIINEIINYDYSTFEKDGPRIMALEPQDDNRDGVAIRVASERLMRRNQHQRFLIVFSDGEPSAFNYSQDGIIDTYEAVEMSRKFGIEVFNVFLSQDPITEDVEQTIHNIYGQYAIFVEGVAHLPGHLSPLLKKLLLKSL >NZ_CP030323.1|WP_001039275.1|1867621_1868965_+|branched-chain-amino-acid-transport-system-II-carrier-protein MNKNTWVIGFTLFAMFFGAGNLIFPPNLGLDSGQFFWPAILAFVLTGIGLPLLGVIVGALDKEGYIGALNKISPKFSILFLIIIYLTIGPLFAIPRTASTSFEMTITPIIHSNSSIALFIFTIIYFIVVLYICLNPSKLIDRIGSLLTPLLLITILAMIIKGYLDFSGNSAGKGNEALYHSNFSSFAEGFTQGYLTMDAIAAIAFSMIVVNAVKLTGITKTNQIFKQTLTAGLIAAVALIFIYISLGYIGNHMPVSDMTLDQLKSKDRNIGTYLLTTMASTGFGSFGKYLLGIIVALACLTTACGLIVAVSEYFHRIVPKVSYKAFVLVFILMSFIIANQGLNAVISMSIPVLSIVYPVAITVVLLILIAKFIPTKRISQQIPVIIVFILSIFSVISKLGWLKINFIESLPLRAYSLEWFPVAIIATILGYLVGIFVKQDPIKYQQE >NZ_CP030323.1|WP_000138424.1|1869038_1870175_-|toxic-anion-resistance-protein MTENKSFKESHPLDDFISDKELSNTTIQKEKLTIEQQKQVDTISKQINPLDNEGLLAFGSGLQKQMSQFSHQMLDEVQSKDVGPIGDTLSDLMSKLKSVNPNELNTDKPSMLKRIFSRAKSSINEIFSRMQSVSAQVDRITIQLQKHQTHLTRDIELLDTLYDKNKQYFDDLSLHIIAAQQKKLQLENEKLPQLQQQAQQSTNQMDIQQVADMQQFIDRLDKRIYDLQLSRQIALQTAPQIRMIQNVNQALAEKIQSSILTSIPLWKNQMAIALTLMRQRNAVAAQRAVTDTTNDLLTANAEMLKQNAIETATENERGIVDLDTLKRTQRNIIETIEETLIIQQHGREERQLAEKELQQLEQDLKSHLVNIKGPNKQS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP030323_10 | 2065269-2065361 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP030323_10
|
1 spacers
spacers of NZ_CP030323_10
>10.1|2065299|33|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder TGCATGAGCTTTAGCTCAGGCGTTCCGCTTATT |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP030323_10
The CRISPR arrays of NZ_CP030323_10 >merge|NZ_CP030323|10|2065269-2065361|CRISPRCasFinder AGTTATCAATTTATTGATTACTGTTTCTTATGCATGAGCTTTAGCTCAGGCGTTCCGCTTATTAGTTATCAATTTATTGATTACTGTTTCTTA >NZ_CP030323|10|8|2065269-2065361|CRISPRCasFinder AGTTATCAATTTATTGATTACTGTTTCTTA TGCATGAGCTTTAGCTCAGGCGTTCCGCTTATT AGTTATCAATTTATTGATTACTGTTTCTTA
>NZ_CP030323.1|WP_000426914.1|2064945_2065179_-|acyl-carrier-protein MENFDKVKDIIVDRLGVDADKVTEDASFKDDLGADSLDIAELVMELEDEFGTEIPDEEAEKINTVGDAVKFINSLEK >NZ_CP030323.1|WP_000043237.1|2064098_2064830_-|ribonuclease-III MSKQKKSEIVNRFRKRFDTKMTELGFTYQNIDLYQQAFSHSSFINDFNMNRLDHNERLEFLGDAVLELTVSRYLFDKHPNLPEGNLTKMRATIVCEPSLVIFANKIGLNEMILLGKGEEKTGGRTRPSLISDAFEAFIGALYLDQGLDIVWKFAEKVIFPHVEQNELLGVVDFKTQFQEYVHQQNKGDVTYNLIKEEGPAHHRLFTSEVILQGEAIAEGKGKTKKESEQRAAESAYKQLKQIK >NZ_CP030323.1|WP_000262685.1|2060385_2063952_-|chromosome-segregation-protein-SMC MVYLKSIDAIGFKSFADQTNVQFDKGVTAIVGPNGSGKSNITDAIKWVLGEQSAKSLRGSKMEDIIFSGAEHRKAQNYAEVQLRLDNHSKKLSVDENEVIVTRRLYRSGESEYYINNDRARLKDIADLFLDSGLGKEAYSIISQGRVDEILNAKPIDRRQIIEESAGVLKYKKRKAESLNKLDQTEDNLTRVEDILYDLEGRVEPLKEEAAIAKEYKTLSHQMKHSDIVVTVHDIDQYTNDNRQLDQRLNDLQGQQANKEADKQRLSQQIQQYKGKRHQLDNDVESLNYQLVKATEAFEKYTGQLNVLEERKKNQSETNARYEEEQENLIELLENISNEISEAQDTYKSLKSKQKELNAVIRELEEQLYVSDEAHDEKLEEIKNEYYTLMSEQSDVNNDIRFLKHTIEENEAKKSRLDSRLVEVFEQLKDIQGQIKTTKKEYQQTNKELSAVDKEIKNIEKDLTDTKKAQNEYEEKLYQAYRYTEKMKTRIDSLATQEEEYTYFFNGVKHILKAKNKELKGIHGAVAEIIDVPSKLTQAIETALGASLQHVIVDSEKDGRQAIQFLKERNLGRATFLPLNVIKSRVVATDIKSIAKEANGFISIASEAVKVAPEYQNIIGNLLGNTIIVDHLKHANELARAIKYRTRIVTLEGDIVNPGGSMTGGGARKSKSILSQKDELTTMRHQLEDYLRQTESFEQQFKELKIKSDQLSELYFEKSQKHNTLKEQVHHFEMELDRLTTQETQIKNDHEEFEFEKNDGYTSDKSRQTLSEKETHLESIKSSLKRLEDEIERYTKLSKEGKESVTKTQQTLHQKQSDLAVVKERIKTQQQTIDRLNNQSQQTKHQLNDVKEKIAFFNSDEVMGEQAFQNIKDQINGQQETRTRLSDELDKLKQQRIELNEQIDAQEATLQVCHQDILAIENHYQDIKAEQSKLDVLIHHAIDHLNDEYQLTVERAKSEYTSDESIDALRKKVKLMKMSIDELGPVNLNAIEQFEELNERYTFLSEQRTDLRKAKETLEQIISEMDQEVTERFKETFHAIQGHFTAVFKQLFGGGDAELQLTEADYLTAGIDIVVQPPGKKLQHLSLLSGGERALTAIALLFAILKVRSAPFVILDEVEAALDEANVIRYAKYLNELSDETQFIVITHRKGTMEFADRLYGVTMQESGVTKLVSVNLNTIDDVLKEEQ >NZ_CP030323.1|WP_000007686.1|2059135_2060386_-|signal-recognition-particle-docking-protein-FtsY MSFFKRLKDKFATNKENEEVKSLTEEQGQDKLEDTHSEGSTQDVNDLAENAEVKKKPRKLSEADFDDDGLISIEDFEEIEAQKMGAKFKAGLEKSRQNFQEQLNNLIARYRKVDEDFFEALEEMLITADVGFNTVMTLTEELRMEAQRRNIQDTEDLREVIVEKIVEIYHQEDDNSEAMNLEDGRLNVILMVGVNGVGKTTTIGKLAYRYKMEGKKVMLAAGDTFRAGAIDQLKVWGERVGVDVISQSEGSDPAAVMYDAINAAKNKGVDILICDTAGRLQNKTNLMQELEKVKRVINRAVPDAPHEALLCLDATTGQNALSQARNFKEVTNVTGIVLTKLDGTAKGGIVLAIRNELHIPVKYVGLGEQLDDLQPFNPESYVYGLFADMIEQNEEITTVENDQIVTEEKDDNHGAK >NZ_CP030323.1|WP_000531320.1|2058816_2059149_-|putative-DNA-binding-protein MGQNDLVKTLRMNYLFDFYQSLLTNKQRNYLELFYLEDYSLSEIADTFNVSRQAVYDNIRRTGDLVEDYEKKLELYQKFEQRREIYDEMKQHLSNPEQIQRYIQQLEDLE >NZ_CP030323.1|WP_000863474.1|2057423_2058791_-|signal-recognition-particle-protein MAFEGLSERLQATMQKMRGKGKLTEADIKIMMREVRLALLEADVNFKVVKEFIKTVSERALGSDVMQSLTPGQQVIKIVQDELTKLMGGENTSINMSNKPPTVVMMVGLQGAGKTTTAGKLALLMRKKYNKKPMLVAADIYRPAAINQLQTVGKQIDIPVYSEGDQVKPQQIVTNALKHAKEEHLDFVIIDTAGRLHIDEALMNELKEVKDIAKPNEIMLVVDSMTGQDAVNVAESFDDQLDVTGVTLTKLDGDTRGGAALSIRSVTQKPIKFVGMSEKLDGLELFHPERMASRILGMGDVLSLIEKAQQDVDQEKAKDLEKKMRESSFTLDDFLEQLDQVKNLGPLDDIMKMIPGMNKMKGLDKLNMSEKQIDHIKAIIQSMTPAERNNPDTLNVSRKKRIAKGSGRSLQEVNRLMKQFNDMKKMMKQFTGGGKGKKGKRNQMQNMLKGMNLPF >NZ_CP030323.1|WP_000268754.1|2056802_2057078_-|30S-ribosomal-protein-S16 MAVKIRLTRLGSKRNPFYRIVVADARSPRDGRIIEQIGTYNPTSANAPEIKVDEALALKWLNDGAKPTDTVHNILSKEGIMKKFDEQKKAK >NZ_CP030323.1|WP_001261990.1|2056111_2056615_-|ribosome-maturation-factor-RimM MRVEVGQIVNTHGIKGEIKVKSNSDFTDVRFQPGQVLTVVHNNNDLEYTVKSHRVHKGLHMLTFEGINNINDIEHLKGSSIYQERDHEDIVLEENEYYYSDIIGCTVFDDQETPIGRVINIFETGANDVWVIKGSKEYLIPYIADVVKEVDVENKKIIITPMEGLLD >NZ_CP030323.1|WP_000687320.1|2055374_2056112_-|tRNA-(guanosine(37)-N1)-methyltransferase-TrmD MKIDYLTLFPEMFAGVLNHSIMKRAQENNKLQINTVNFRDYAINKHNQVDDYPYGGGQGMVLKPEPVFNAMEDLDVTEQTRVILMCPQGEPFSHQKAVELSKADHIVFICGHYEGYDERIRTHLVTDEISMGDYVLTGGELPAMTMTDAIVRLIPGVLGNEQSHQDDSFSDGLLEFPQYTRPREFKGLTVPDVLLSGNHANIDAWRHEQKLIRTYNKRPDLIEKYPLTNADKQILERYKIGLKKG >NZ_CP030323.1|WP_000181404.1|2054921_2055272_-|50S-ribosomal-protein-L19 MTNHKLIEAVTKSQLRTDLPSFRPGDTLRVHVRIIEGTRERIQVFEGVVIKRRGGGVSETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRSLRGKAARIQEIR >NZ_CP030323.1|WP_000167269.1|2065484_2066219_-|3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein]-reductase MTKSALVTGASRGIGRSIALQLAEEGYNVAVNYAGSKEKAEAVVEEIKAKGVDSFAIQANVADADEVKAMIKEVVSQFGSLDVLVNNAGITRDNLLMRMKEQEWDDVIDTNLKGVFNCIQKATPQMLRQRSGAIINLSSVVGAVGNPGQANYVATKAGVIGLTKSAARELASRGITVNAVAPGFIVSDMTDALSDELKEQMLTQIPLARFGQDTDIANTVAFLASDKAKYITGQTIHVNGGMYM >NZ_CP030323.1|WP_031845105.1|2066211_2067138_-|ACP-S-malonyltransferase MNKIAIIFPGQGAQKVGMAQDLYNNNDQATEILTSAANTLDFDILETMFTDEDGKLGETENTQPALLTHSSALLAALKNLNPDFTMGHSLGEYSSLVAADVLSFEDAVKIVRKRGQLMAQAFPTGVGSMAAVLGLDFDKVDEICKSLSSDDKIIEPANINCPGQIVVSGHKALIDELVEKGKSLGAKRVMPLAVSGPFHSSLMKVIEEDFSSYINQFEWRDAKFPVVQNVNAQGETDKEVIKSNMVKQLYSPVQFINSTEWLIDQGVDHFIEIGPGKVLSGLIKKINRDVKLTSIQTLEDVKGWNEND >NZ_CP030323.1|WP_000239738.1|2067130_2068117_-|phosphate-acyltransferase-PlsX MVKLAIDMMGGDNAPDIVLEAVQKAVEDFKDLEIILFGDEKKYKLNHERIEFRHCSEKIEMEDEPVRAIKRKKDSSMVKMAEAVKSGEADGCVSAGNTGALMSAGLFIVGRIKGVARPALVVTLPTIDGKGFVFLDVGANADAKPEHLLQYAQLGDIYAQKIRGIDNPKISLLNIGTEPAKGNSLTKKSYELLNQDHSLNFVGNIEAKTLMDGDTDVVVTDGYTGNMVLKNLEGTAKSIGKMLKDTIMSSTKNKLAGAILKKDLAEFAKKMDYSEYGGSVLLGLEGTVVKAHGSSNAKAFYSAIRQAKIAGEQNIVQTMKETVGESNE >NZ_CP030323.1|WP_001548538.1|2068121_2068694_-|transcription-factor-FapR MRGETLKLKKDKRREAIRQQIDSNPFITDHELSDLFQVSIQTIRLDRTYLNIPELRKRIKLVAEKNYDQISSIEEQEFIGDLIQVNPNVKAQSILDITSDSVFHKTGIARGHVLFAQANSLCVALIKQPTVLTHESSIQFIEKVKLNDTVRAEARVVNQTAKHYYVEVKSYVKHTLVFKGNFKMFYDKRG >NZ_CP030323.1|WP_001151491.1|2068895_2070956_-|ATP-dependent-DNA-helicase-RecG MAKVNLIESPYSLLQLKGIGPKKIEVLQQLNIHTVEDLVLYLPTRYEDNTVIDLNQAEDQSNVTIEGQVYTAPVVAFFGRNKSKLTVHLMVNNIAVKCIFFNQPYLKKKIELNQTITVKGKWNRVKQEITGNRVFFNSQGTQNQENADVQLEPVYRIKEGIKQKQIRDQIRQALNDVTIHEWLTDELREKYKLETLDFTLNTLHHPKSKEDLLRARRTYAFTELFLFELRMQWLNRLEKSSDEAIEIDYDLDQVKSFIDCLPFELTEAQKSSVNEIFRDLKAPIRMHRLLQGDVGSGKTVVAAICMYALKTAGYQSALMVPTEILAEQHAESLMALFGDSMNVALLTGSVKGKKRKILLEQLENGTIDCLIGTHALIQDDVIFHNVGLVITDEQHRFGVNQRQLLREKGAMTNVLFMTATPIPRTLAISVFGEMDVSSIKQLPKGRKPIITTWAKHEQYDNVLMQMTSELKKGRQAYVICPLIESSEHLEDVQNVVALYESLQQYYGVSRVGLLHGKLSADEKDEVMQKFSNHEIDVLVSTTVVEVGVNVPNATFMMIYDADRFGLSTLHQLRGRVGRSDQQSYCVLIASPKTETGIERMTIMTQTTDGFELSERDLEMRGPGDFFGVKQSGLPDFLVANLVEDYRMLEVARDEAAELIQSGVFFENTYQHLRHFVEENLLHRSFD >NZ_CP030323.1|WP_000623917.1|2071145_2072792_-|DAK2-domain-containing-protein 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MHINLLCSDRHLPQDIWAKSNEGKWGGVDRGALILLKHQIIPFFSVGDFDSVSKEERQLLTEQLQIKPVQAEKADTDLALAVDKAVALGFDSITIYGATGGRLDHFFGAIQLLLKKAYYKHDVHIEVIDQQNKIELLPKGQHTVEKDKSYPYISFIPMTDDVELSLAGFKYNLARQMLNIGSTLTISNEIESLQAKVTVHDGLILQIRSTDLN >NZ_CP030323.1|WP_000164340.1|2074841_2075486_-|ribulose-phosphate-3-epimerase MTKLYPSLLSVDFLVLQHELKRLEEAGVDGVHFDVMDGQFVPNISIGLPILDAVRKGTTLPIDVHLMIENPEKYIASFAEHGADMISIHVESTPHIHRAIQMIKHLDKKAGVVINPGTPISQIEPILDIVDYVLVMTVNPGFGGQSFIDQCVEKIAGLNAIKMERQLNFDIEVDGGVNTDTAKVCVENGATMLVTGSFFFKQEDYKKVTQALKG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP030323_11 | 2478131-2478216 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP030323_11
|
1 spacers
spacers of NZ_CP030323_11
>11.1|2478158|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder GGCAATGCGAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP030323_11
The CRISPR arrays of NZ_CP030323_11 >merge|NZ_CP030323|11|2478131-2478216|CRISPRCasFinder AGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGGCAATGCGAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACACAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACA >NZ_CP030323|11|9|2478131-2478216|CRISPRCasFinder AGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACA GGCAATGCGAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACAC AGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACA
>NZ_CP030323.1|WP_000369719.1|2476970_2477882_-|RNase-adapter-RapZ MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKKSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >NZ_CP030323.1|WP_001248941.1|2475978_2476974_-|YvcK-family-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNPQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >NZ_CP030323.1|WP_000006551.1|2474923_2475868_-|DNA-binding-protein-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >NZ_CP030323.1|WP_001049165.1|2473766_2474354_-|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >NZ_CP030323.1|WP_000675913.1|2471950_2473585_-|NAD-dependent-malic-enzyme MKGIELLNNPFLNKGTAFTNEERKQLGLEGLLPANVRTLEQQAEQCYEQFKAKQTDFEKRLFLMAIFNRNRTLFYKLTSEHLVEFMPIIYDPVIAQSIEQYNENFSRPQDAVFLSVDRQDQIEQELRNVANGRDIRLIVVTDAEGILGIGDWGVDGVDIAIGKLIVYTAAAGINPSQVLPVSLDVGTNNEQLLKDDLYLGNRHKRVDDETYYAFVDKFVSAVRKEYPNALLHWEDFGRGHAKNILDKYEDTLPTFNDDIQGTGIVTLAGVLGALNISKVDYTNQTFLVYGGGTAGMGITNILKDELIKQGVSEEKANQHFYIMDKQGLLFDDMDDLTEAQQVFAKNRNEFSNTVNWKNLKEVIENIKPTVLIGTSTQTGAFTEDAVKEMLKHTERPMIFPLSNPTKLAEATAQDLLKWTNGKALIGTGIPYNDIEYNGVNYSIGQANNALMYPGLGLGLIASKAKKVNQQILSAASHALGGMVNPDEPGAAVLPPVEKIHQCSRAIAKAVAQSVIDQGLNAETIDDIDKAIEAEIWYPEYKSYI >NZ_CP030323.1|WP_000816303.1|2470714_2471617_+|TIGR01777-family-protein MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGMILSNEGGALQTMKLPYEYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPNLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLISK >NZ_CP030323.1|WP_000070833.1|2469382_2470012_-|DUF4887-domain-containing-protein MSNQNYDYNKNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQKQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQANQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDETKDKDDKASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQSNQSNQQAKPQAPQQNSQSTTNKQNNANDK >NZ_CP030323.1|WP_000654030.1|2467478_2468492_-|sugar-binding-transcriptional-regulator MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE >NZ_CP030323.1|WP_000279414.1|2466415_2467426_-|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK >NZ_CP030323.1|WP_001074749.1|2465086_2466277_-|phosphoglycerate-kinase MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKEVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPELGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK >NZ_CP030323.1|WP_000134959.1|2478531_2479467_-|thioredoxin-disulfide-reductase 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MRKFLSKTYHHTNPLWHVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANAIILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >NZ_CP030323.1|WP_000513315.1|2481473_2482313_-|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIVARIYFVIFQWPYYAENPGEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >NZ_CP030323.1|WP_000958224.1|2482318_2483251_-|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >NZ_CP030323.1|WP_031844946.1|2483860_2486707_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNINLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGAPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIEVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGVDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKLKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDLFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK >NZ_CP030323.1|WP_000229251.1|2486714_2488700_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVEGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLIMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >NZ_CP030323.1|WP_000638418.1|2488968_2489205_-|CsbA-family-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWIGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >NZ_CP030323.1|WP_000538141.1|2489201_2489852_-|HD-domain-containing-protein MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE >NZ_CP030323.1|WP_000749391.1|2490025_2490865_-|CHAP-domain-containing-protein MKKSLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKVVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVNQAPKQAVAKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP030323_12 | 2524516-2524600 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP030323_12
|
1 spacers
spacers of NZ_CP030323_12
>12.1|2524543|31|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder CCTGTAGAAATTGGCGTTCCAATTTCTCTGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP030323_12
The CRISPR arrays of NZ_CP030323_12 >merge|NZ_CP030323|12|2524516-2524600|CRISPRCasFinder TGTTGGGGCCCACCCCAACTCGCATTGCCTGTAGAAATTGGCGTTCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCCACCCCAACTCGCATTG >NZ_CP030323|12|10|2524516-2524600|CRISPRCasFinder TGTTGGGGCCCACCCCAACTCGCATTG CCTGTAGAAATTGGCGTTCCAATTTCTCTGT GTTGGGGCCCCACCCCAACTCGCATTG
>NZ_CP030323.1|WP_000429011.1|2523163_2524081_+|diacylglycerol-kinase-family-lipid-kinase MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILSANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP030323.1|WP_031760357.1|2522969_2523071_-|hypothetical-protein MVITDIDVYRVGRENIVIAVYNEHIKLLFILIS >NZ_CP030323.1|WP_000193751.1|2521386_2522892_+|peptide-MFS-transporter MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_CP030323.1|WP_000930014.1|2520546_2521047_+|NADPH-dependent-7-cyano-7-deazaguanine-reductase-QueF MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP030323.1|WP_001068497.1|2519660_2520527_+|DMT-family-transporter MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP030323.1|WP_000692521.1|2518461_2518860_-|class-Ib-ribonucleoside-diphosphate-reductase-assembly-flavoprotein-NrdI MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_CP030323.1|WP_000855505.1|2516393_2518499_-|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP030323.1|WP_000562499.1|2515304_2516276_-|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEESEFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_CP030323.1|WP_000499195.1|2514649_2514805_-|hypothetical-protein MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ >NZ_CP030323.1|WP_000876318.1|2513639_2514611_-|ABC-transporter-permease MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NZ_CP030323.1|WP_000197262.1|2524688_2525231_-|5'-3'-deoxyribonucleotidase MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NZ_CP030323.1|WP_000663039.1|2525389_2526448_-|histidinol-phosphate-transaminase MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISSHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEHFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP030323.1|WP_000180997.1|2526687_2528202_-|ABC-transporter-permease/substrate-binding-protein MTNFFDILSERKGQLFSTMIEHIQISFIALLIATAIAVPLGILLTKTKTISEIVMNIAAILQTIPSLALLGLMIPLFGIGRVPAIIALVVYALLPILRNTYTGIKEVDPSLIEAAKGIGMKPFRRLTKVELPIAMPVIMAGVRTAMVLIIGTATLAALIGAGGLGDLILLGIDRNNASLILLGAIPAALLAIIFDLILRLMAKLSYKKLLMTLGVIVMIIILAIAIPMFAQKGDKITLAGKLGSEPSIITNMYKILIEEETKNTVEVKDGMGKTAFLFNALKSDDIDGYLEFTGTVLGELTKEPLKSKEEKKVYEQAKQSLEKKYQMTMLKPMKYNNTYALAVKRDFAKQHNIRTIGDLNKVKDQLKPGFTLEFNDRPDGYKAVQKAYNLNLDNIRTMEPKLRYQAINKGNINLIDAYSTDAELKQYDMVVLKDDKHVFPPYQGAPLFKESFLKKHPEIKKPLNKLENKISDEDMQMMNYKVTVKNEDPYTVAKDYLKAKGLIK >NZ_CP030323.1|WP_000589262.1|2528194_2529172_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKFKNVTKRYGKHVAVDNISFNINEGEFFVLIGPSGCGKTTTLKMINRLIHLSEGYIYFKDKPISDYPVYEMRWDIGYVLQQIALFPHMTIKENIAQVPQMKKWKEKDIDKRVDELLEMVGLEPEKYKNRKPDELSGGQRQRVGVIRALAADPPVILMDEPFSALDPISREKLQDDLIELQTKIKKTIIFVTHDIQEAMKLGDKICLLNEGHIEQIDTPEGFKNNPQSEFVKQFMGSHLEDDAPCVEENAIIRDLDIMKPIDEVTTMSAYPIVYDNQQIEVLYQHLSESERVIVMQEDSVGQYVIDRKDIFKYLSQKKEVAQHD >NZ_CP030323.1|WP_000983680.1|2529393_2531175_-|DNA-helicase-RecQ MMQQTLSHYFGYETFRPGQEEIISKVLDHRNVLGVLPTGGGKSICYQVPGLLLGGTTIVISPLISLMKDQVDQLKAMGIQAAFLNSSLTQKEQQRIEKALSNGEIQFLYVAPERFENRYFLNMLQRIKIHLVAFDEAHCISKWGHDFRPSYQNVISKVFTLPQDFTIIALTATATVEVQQDIREKLNIAQTDQIKTSTKRRNLIFKVNPTYQRQKFVLDYIKTHDEDAGIIYCSTRKQVEELQEALESQKIESVIYHAGLSNKEREEAQNDFLFDRVKVVVATNAFGMGIDKSNVRFVIHYNMPGDLESYYQEAGRAGRDGLKSECILLFSERDINLHEYFITVSQADDDYKDKMGEKLTKMIQYTKTKKCLEATIVHYFEPNEKLEECEQCSNCVQQDKSYNMTQEAKMIISCIARMKQQESYSVIIQVLRGESTDYIKYKGYDQISTHGLMKGYTTSELSHLIDELRFKGFLNENDEILMCDTSIKKLLSNEVEVFTTPFKQKATEKVFINTVEGVDRVLFSQLVEVRKKLSDKLTIAPVSIFSDYTLEEFAKRKPASKQDMINIDGVGSYKLKHYCPAFLETIQNYKAKV >NZ_CP030323.1|WP_000525113.1|2531186_2533070_-|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MGMEAYKIEHLNKSYADKTIFDNLDLSISEGEKIGLVGINGTGKSTLLKVIGGIDDDFTANVMHPNQYRIRYSSQKQDLNEDMTVFDAVLSSDTTTLRIIKQYEQAVQAYADDQSDKLFKRMMDAQEAMDQHDAWDYNAEIKTILSKLGIHDTTKYIKELSGGQQKRVVLAKTLIEQPDLLLLDEPTNHLDFESISWLINYVKQYPHTVLFVTHDRYFLNEVSTRIIELNRGKLASYPGNYESYIEMRAEREVTLQKQQQKQRALYKEELAWMRAGAKARTTKQQARINRFNDLENEVNQQYKDDKGELNLAYSRLGKQVFELEDLSKAINDKVLFEHLTEIIQKGERIGVVGPNGAGKTTLLNVLSGEDQQFEGKLKTGQTVKVAYFKQTDETLDRDIRMIDYLREESEIAKEKDGTSVSITQLLERFLFPSATHGKKVYKLSGGEQKRLYLLRLLVHQPNVLLLDEPTNDLDTETLTILEDYIHTFGGTVITVSHDRYFLNKVAQSYWFIHDGQMEKIIGTFEDYESYKKSLDKNKSTLKQQSKSSTTVRKKNGLSYKEKLEYEQLMKRIEQAEVRMEEIDVLMIEASADYGKIKELNEEKEQLEIQYDLDITRWSELEEIKEQQ >NZ_CP030323.1|WP_064128952.1|2533414_2533900_-|IS200/IS605-family-transposase MSSDTNSLAHTKWNCKYHIVFAPKYRRQVIYGKIKKDIGIILRQLCERKGVEIIEAEACKDHIHMLVSIPPKLGVSSFVGYLKGKSSLMIFDRHANLKYRYGNRNFWCKGFYVDTVGRNKKVIENYIRNQLQEDIVADQISMEEYLDPFTGEKNRKRKKKE >NZ_CP030323.1|WP_000098285.1|2534083_2536024_-|polyglycerol-phosphate-lipoteichoic-acid-synthase-LtaS 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MSIIIEKSGLFSSFQDFGRRGYEHDGVIPCGALDTLAHEIANRLVANDKNEATLEMTNKMATIRFTEPTLIALAGGNVKAYTEHMTISPYKLYLLDKGDVLKFRETSYTSRVYLAVGGGFELDAWLGSNSTDFNVKIGGFKGRTLQDGDEIKLKRDYTARHHKLFENLAHTKQTDWGIDGYALSFNYMSDVFHVVKNKGTEDFKEDAIQRFVKHDYKVTSKANRMGMMLEGEKIKAFYEDMPPYQTVKKGTIQIKRDGTPIILLNDHYTLGSYPQIGTIASYHLTKLAQKPQGSRLKFQFIDILTAEKNLVKYSNWLNQLFHGIEYRMQLEMMK >NZ_CP030323.1|WP_000708692.1|2537485_2538196_-|allophanate-hydrolase-subunit-1 MKIYSQGDQAIVVAIEKEVSKSLTEDLLTLRSYLIEQNYPFIIEIVPSESDMMIVYDARDMIKHHNIQSPFLYMKALIESIHLNIKHDFNQQDLIEIPIVYGSKYGPDLESLLKHYKIKLETFIELHSKAQYFVSMMGYSPGFPYLTGLNKKLYINHTSKQKKFIPAGSVVLEGKKCGIVTTDTINDWLVIGYTPLSLFNPKESDFARLKLGDNIKFRPINENELEVGAFKDVNHN |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_CP030323_1 | 1.1|501441|26|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 501441-501466 | 26 | NZ_CP030323.1 | 2139645-2139670 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030323_1 | 1.1|501441|26|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 501441-501466 | 26 | NZ_CP030323.1 | 2679170-2679195 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030323_11 | 11.1|2478158|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 2478158-2478189 | 32 | NZ_CP030323.1 | 964813-964844 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030323_1 | 1.1|501441|26|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 501441-501466 | 26 | NZ_CP030323.1 | 964746-964771 | 1 | 0.962 |
NZ_CP030323_1 | 1.1|501441|26|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 501441-501466 | 26 | NZ_CP030323.1 | 1081526-1081551 | 1 | 0.962 |
NZ_CP030323_1 | 1.1|501441|26|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 501441-501466 | 26 | NZ_CP030323.1 | 1256742-1256767 | 1 | 0.962 |
NZ_CP030323_1 | 1.1|501441|26|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 501441-501466 | 26 | NZ_CP030323.1 | 1441577-1441602 | 1 | 0.962 |
NZ_CP030323_1 | 1.1|501441|26|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 501441-501466 | 26 | NZ_CP030323.1 | 2469121-2469146 | 1 | 0.962 |
NZ_CP030323_1 | 1.1|501441|26|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 501441-501466 | 26 | NZ_CP030323.1 | 2515058-2515083 | 1 | 0.962 |
NZ_CP030323_1 | 1.1|501441|26|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 501441-501466 | 26 | NZ_CP030323.1 | 2515114-2515139 | 1 | 0.962 |
NZ_CP030323_5 | 5.1|999078|25|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 999078-999102 | 25 | NZ_CP030323.1 | 999022-999046 | 1 | 0.96 |
NZ_CP030323_5 | 5.1|999078|25|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 999078-999102 | 25 | NZ_CP030323.1 | 1412733-1412757 | 1 | 0.96 |
NZ_CP030323_5 | 5.1|999078|25|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 999078-999102 | 25 | NZ_CP030323.1 | 2139760-2139784 | 1 | 0.96 |
NZ_CP030323_8 | 8.1|1501008|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 1501008-1501039 | 32 | NZ_CP030323.1 | 2143903-2143934 | 1 | 0.969 |
NZ_CP030323_11 | 11.1|2478158|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 2478158-2478189 | 32 | NZ_CP030323.1 | 2002536-2002567 | 1 | 0.969 |
NZ_CP030323_11 | 11.1|2478158|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 2478158-2478189 | 32 | NZ_CP030323.1 | 2002594-2002625 | 1 | 0.969 |
NZ_CP030323_1 | 1.1|501441|26|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 501441-501466 | 26 | NZ_CP030323.1 | 1160540-1160565 | 2 | 0.923 |
NZ_CP030323_1 | 1.1|501441|26|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 501441-501466 | 26 | NZ_CP030323.1 | 1160878-1160903 | 2 | 0.923 |
NZ_CP030323_5 | 5.1|999078|25|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 999078-999102 | 25 | NZ_CP030323.1 | 2139816-2139840 | 2 | 0.92 |
NZ_CP030323_11 | 11.1|2478158|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 2478158-2478189 | 32 | NZ_CP030323.1 | 501367-501398 | 2 | 0.938 |
NZ_CP030323_12 | 12.1|2524543|31|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 2524543-2524573 | 31 | NZ_CP030323.1 | 2483506-2483536 | 2 | 0.935 |
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ctatgttgggtcccaccccaacttgcattgtt CRISPR spacer ctatgttggggcccaccccaacttgcattgtt Protospacer ********** *********************
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ggcaatgcgagttggggtgtgggccccaacac CRISPR spacer ggcaatgcaagttggggtgtgggccccaacac Protospacer ********.***********************
18. spacer 1.1|501441|26|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder matches to position: 1160540-1160565, mismatch: 2, identity: 0.923
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19. spacer 1.1|501441|26|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder matches to position: 1160878-1160903, mismatch: 2, identity: 0.923
cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaagacagaagctggcgg Protospacer *********** *.************
20. spacer 5.1|999078|25|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder matches to position: 2139816-2139840, mismatch: 2, identity: 0.92
cggggccccaacacagaagctgaca CRISPR spacer cggggccccaacatagaagctggca Protospacer *************.********.**
21. spacer 11.1|2478158|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder matches to position: 501367-501398, mismatch: 2, identity: 0.938
ggcaatgcgagttggggtgtgggccccaacac CRISPR spacer ggcaatgcgagttggggtgagggccctaacac Protospacer ******************* ******.*****
22. spacer 12.1|2524543|31|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder matches to position: 2483506-2483536, mismatch: 2, identity: 0.935
cctgtagaaattggcgttccaatttctctgt CRISPR spacer cctgtagaaattggtgttccaatttctttgt Protospacer **************.************.***
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP030323_12 | 12.1|2524543|31|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 2524543-2524573 | 31 | KC139649 | Salmonella phage FSL SP-069 hypothetical proteins, RdgC exonuclease, hypothetical proteins, TerL, hypothetical proteins, deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase, hypothetical proteins, NinH, head morphogenesis protein, hypothetical proteins, capsid related protein, hypothetical proteins, enolase-like protein, hypothetical proteins, tail fiber, hypothetical protein, putative endolysin, hypothetical proteins, and DNA polymerase genes, complete cds | 9668-9698 | 7 | 0.774 |
NZ_CP030323_12 | 12.1|2524543|31|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 2524543-2524573 | 31 | KC139636 | Salmonella phage FSL SP-062 hypothetical proteins, RdgC exonuclease, hypothetical proteins, TerL, and hypothetical proteins genes, complete cds | 9668-9698 | 7 | 0.774 |
NZ_CP030323_12 | 12.1|2524543|31|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 2524543-2524573 | 31 | NC_025443 | Salmonella phage 9NA, complete genome | 7834-7864 | 7 | 0.774 |
NZ_CP030323_7 | 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 1306380-1306411 | 32 | NZ_CP024776 | Bacillus thuringiensis LM1212 plasmid pLM8, complete sequence | 3826-3857 | 9 | 0.719 |
NZ_CP030323_7 | 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 1306380-1306411 | 32 | NZ_CP009062 | Borreliella afzelii K78 plasmid lp28-1, complete sequence | 16532-16563 | 10 | 0.688 |
NZ_CP030323_7 | 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 1306380-1306411 | 32 | NZ_CP018749 | Borreliella garinii strain CIP 103362 isolate 20047 plasmid lp28-7 | 15178-15209 | 10 | 0.688 |
NZ_CP030323_7 | 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 1306380-1306411 | 32 | NZ_CP028869 | Borreliella garinii strain 20047 plasmid lp28-7, complete sequence | 11910-11941 | 10 | 0.688 |
NZ_CP030323_7 | 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 1306380-1306411 | 32 | NZ_CP028878 | Borreliella bavariensis PBi plasmid lp28-7, complete sequence | 4741-4772 | 10 | 0.688 |
NZ_CP030323_7 | 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 1306380-1306411 | 32 | NZ_CP028879 | Borreliella bavariensis PBi plasmid lp28-9, complete sequence | 11876-11907 | 10 | 0.688 |
NZ_CP030323_7 | 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 1306380-1306411 | 32 | NC_018987 | Borrelia burgdorferi 297 plasmid 297_lp28-6, complete sequence | 12713-12744 | 10 | 0.688 |
NZ_CP030323_7 | 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 1306380-1306411 | 32 | NC_017412 | Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-7, complete sequence | 17252-17283 | 10 | 0.688 |
NZ_CP030323_7 | 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 1306380-1306411 | 32 | NC_017419 | Borreliella burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-2, complete sequence | 17030-17061 | 10 | 0.688 |
NZ_CP030323_7 | 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 1306380-1306411 | 32 | NC_017408 | Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-6, complete sequence | 14812-14843 | 10 | 0.688 |
NZ_CP030323_7 | 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 1306380-1306411 | 32 | NC_015920 | Borreliella bissettii DN127 plasmid lp56, complete sequence | 16601-16632 | 10 | 0.688 |
NZ_CP030323_7 | 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 1306380-1306411 | 32 | NC_011779 | Borreliella burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-2, complete sequence | 16934-16965 | 10 | 0.688 |
NZ_CP030323_7 | 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 1306380-1306411 | 32 | NC_001852 | Borreliella burgdorferi B31 plasmid lp28-2, complete sequence | 16891-16922 | 10 | 0.688 |
NZ_CP030323_7 | 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 1306380-1306411 | 32 | NZ_CP017219 | Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_lp56, complete sequence | 14876-14907 | 10 | 0.688 |
NZ_CP030323_7 | 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder | 1306380-1306411 | 32 | NZ_CP017215 | Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_lp28_6, complete sequence | 11994-12025 | 15 | 0.531 |
1. spacer 12.1|2524543|31|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder matches to KC139649 (Salmonella phage FSL SP-069 hypothetical proteins, RdgC exonuclease, hypothetical proteins, TerL, hypothetical proteins, deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase, hypothetical proteins, NinH, head morphogenesis protein, hypothetical proteins, capsid related protein, hypothetical proteins, enolase-like protein, hypothetical proteins, tail fiber, hypothetical protein, putative endolysin, hypothetical proteins, and DNA polymerase genes, complete cds) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
cctgtagaaattggcgttccaatt-tctctgt CRISPR spacer gatgtagaaattggcgtaccaattaaagctg- Protospacer *************** ****** ***
2. spacer 12.1|2524543|31|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder matches to KC139636 (Salmonella phage FSL SP-062 hypothetical proteins, RdgC exonuclease, hypothetical proteins, TerL, and hypothetical proteins genes, complete cds) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
cctgtagaaattggcgttccaatt-tctctgt CRISPR spacer gatgtagaaattggcgtaccaattaaagctg- Protospacer *************** ****** ***
3. spacer 12.1|2524543|31|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder matches to NC_025443 (Salmonella phage 9NA, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
cctgtagaaattggcgttccaatt-tctctgt CRISPR spacer gatgtagaaattggcgtaccaattaaagctg- Protospacer *************** ****** ***
4. spacer 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024776 (Bacillus thuringiensis LM1212 plasmid pLM8, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tagagaatttcgaaaaaagaaattctacaggt CRISPR spacer tcaaggatttcgaaaaaagaaatcctaatttg Protospacer * .**.*****************.***
5. spacer 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009062 (Borreliella afzelii K78 plasmid lp28-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tagagaatttcgaaaaaagaaattctacaggt CRISPR spacer acaagaatttctaaaaaacaaattctatttcc Protospacer .******** ****** ********. .
6. spacer 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018749 (Borreliella garinii strain CIP 103362 isolate 20047 plasmid lp28-7) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tagagaatttcgaaaaaagaaattctacaggt CRISPR spacer acaagaatttctaaaaaacaaattctatttcc Protospacer .******** ****** ********. .
7. spacer 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028869 (Borreliella garinii strain 20047 plasmid lp28-7, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tagagaatttcgaaaaaagaaattctacaggt CRISPR spacer acaagaatttctaaaaaacaaattctatttcc Protospacer .******** ****** ********. .
8. spacer 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028878 (Borreliella bavariensis PBi plasmid lp28-7, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tagagaatttcgaaaaaagaaattctacaggt CRISPR spacer acaagaatttctaaaaaacaaattctatttcc Protospacer .******** ****** ********. .
9. spacer 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028879 (Borreliella bavariensis PBi plasmid lp28-9, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tagagaatttcgaaaaaagaaattctacaggt CRISPR spacer acaagaatttctaaaaaacaaattctatttcc Protospacer .******** ****** ********. .
10. spacer 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder matches to NC_018987 (Borrelia burgdorferi 297 plasmid 297_lp28-6, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tagagaatttcgaaaaaagaaattctacaggt CRISPR spacer acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer .******** ****** *******.. * .
11. spacer 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder matches to NC_017412 (Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-7, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tagagaatttcgaaaaaagaaattctacaggt CRISPR spacer acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer .******** ****** *******.. * .
12. spacer 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder matches to NC_017419 (Borreliella burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tagagaatttcgaaaaaagaaattctacaggt CRISPR spacer acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer .******** ****** *******.. * .
13. spacer 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder matches to NC_017408 (Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-6, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tagagaatttcgaaaaaagaaattctacaggt CRISPR spacer acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer .******** ****** *******.. * .
14. spacer 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder matches to NC_015920 (Borreliella bissettii DN127 plasmid lp56, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tagagaatttcgaaaaaagaaattctacaggt CRISPR spacer acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer .******** ****** *******.. * .
15. spacer 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder matches to NC_011779 (Borreliella burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tagagaatttcgaaaaaagaaattctacaggt CRISPR spacer acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer .******** ****** *******.. * .
16. spacer 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder matches to NC_001852 (Borreliella burgdorferi B31 plasmid lp28-2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tagagaatttcgaaaaaagaaattctacaggt CRISPR spacer acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer .******** ****** *******.. * .
17. spacer 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017219 (Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_lp56, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tagagaatttcgaaaaaagaaattctacaggt CRISPR spacer acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer .******** ****** *******.. * .
18. spacer 7.1|1306380|32|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017215 (Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_lp28_6, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.531
---tagagaatttcgaaaaaagaaattctacaggt CRISPR spacer ggcaacagaatttgttttttagaaattcttgt--- Protospacer * ******* *********
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1374699 : 1385402
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP030323|1374699:1385402|DBSCAN-SWA TATGTATAAAAATTATAACATGACCCAACTTACACTACCAATAGAAACTTCTGTTAGAATTCCTCAAAATGATATTTCGCGATATGTTAATGAAATTGTTGAAACGATACCTGATAGCGAATTCGATGAATTCAGACATCATCGTGGCGCAACATCCTATCATCCAAAAATGATGTTAAAAATCATCTTATATGCATATACTCAATCTGTATTTTCTGGTCGTAGAATAGAGAAATTACTTCATGACAGTATTCGAATGATGTGGTTAGCTCAAGATCAAACACCTTCTTATAAAACTATTAATCGTTTTAGAGTGAATCCTAATACTGATGCGTTAATTGAATCTTTATTTATTCAGTTCCATAGTCAATGTTTAAAGCAAAATCTTATTGATGATAATTCAATTTTTATTGATGGTACAAAAGTAGAAGCTAGTGCCAATAGATATACATTTGTGTGGAAGAAAAGTATTCAAAATCACGAATCGAAATTGAACGAAAATTCAAAAGCATTATATCGTGACTTAGTTGAAGAAAAAATAATACCAGAGATAAAAGAAGATGGAGATAGCGATTTAACAATAGAAGAAATAGATTTAATTGGTAGTCATTTAGATAAAGAAATCGAAGATTTAAATCATTCTATTGAGAACGAAGATTGTACTCAAATTAGAAAACAGACCCGTAAAAAAAGAACTGAGATTAAGAAGTTCAAAAAGAAATTTGATGATTATTCCGAAAGAAAAAGTAAATATGAAGAACAAAAATCGATTCTTAAAGATAGAAATAGCTTTTCTAAAACTGATCATGATGCAACTTTTATGAGAATGAAGGAAGACCATATGAAAAATGGTCAACTTAAGCCAGGATACAATTTACAAATAGCGACAAATTCTCAATTTGTTTTATCCTATGACCTATTTCAAAACCCGACAGATACTAGAACTTTAATTCCATTTTTAACAATGATTCAAAATACCTTCGGTTATTTACCGGAGTATATTGTAGCTGATGCAGGTTATGGTAGTGAGCAAAACTATATGGCTATTATAGATGATTTTAATAAAACGCCACTTATTACGTATGGCATGTTTATTAAAGATAAAACTAGAAAGTTTAAAAGTGACATTTTTAACACTCAAAATTGGAAATATGACGAACTTAATGATGAATTTATATGTCCTAATAACAAAAGAATAGGTTTTAAAAGATATGCATACCGTAATGATAGATATGGTTTTAAACGTGACTTCAAGCTATATGAATGCGATGACTGTTCAGCATGTTCTTTGAGGCAACAATGCATGAAGCCAAATTCGAAATCCAATAAGAAAATCATGAAGAATTATAATTGGGAATACTTTAAAGCCCAAATTAATCAAAAGCTTTCTGAACCAGAAACGAAAAAAATCTATAGTCAAAGAAAAATTGATGTAGAGCCTGTTTTTGGATTTATGAAGGCTATTTTGGGTTTCACTCGAATGTCAGTTCGAGGAATAAATAAAGTTAAACGAGAGCTAGGTTTTGTATTAATGGCACTTAATATAAGGAAAATAGTAGCTCGACGAGCTGTATATTATCAAATACATTTAAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAACTTAATGTCCCAGCCTCTTTATTGCATTTGTAATTTATAGAATTGCGAACAGGGGACTACTGTTAGTTTATGTGATTAAAACTTCAATGTTATTAGATTTATTAGACCATTTCAAAATCGCAAGGTTCTCATGTTCTGCTACAGTTTGCGCTCTTTGGAAGATATATATCATTTACTATTACTAACATGATGTATTCTAATTTGTTTGTGGATGGGCTGTTTGGTTTGATATCGCGGTAAATATAAGCTGCATTAGTTATATTGTTGAAATCTAAGTTGAATTTATTATCATACAGCAATGTGCCAATTAGGGACATTTTTAATTTTGAACTCTACATTTTGTTAAGAGTATCTGGTTATATTTGCAAAATGGTATGAACATTTATCATCATTTATTAAGTTGTCTTGATGATTGAATGACCCAGTATTTATTCAGTTCGAGAAGATTGAGAGTGTTAAATCGTATTCGCGTATAATTTCGATTCTAGTCATACCATTTTTATAAAGTTTAACCATTTGTAATTTGAAATCCTTAATAGATGTTCTTCTGACTCTTGTCAAAATAAAATCGCCTATCCAAATAGTTTAACAATATCTATTCTCATAGAATTTGTTCAACTAAGTGTAGACGATTCTGCATTATCTATAAGACTATTCAAGTTGCTATCTTAAGCTGTTTCGAATTTTTCAAATTTCTCTCATTTAATAAAAAAATTGATATTATCACGTCCAGAAATATTAAATCAATAAACCTATCTTTTCGTCTAATTCACTATAATCTATAGTACTTATATAGTTTTCATGAAGAAGGTTTTTATTATGTTCATTTTTTTCTTTTTTTGAGTCATTTAAAATAAAAATAAACTCATTTTGCCTGTGTCTTTTTATTTTTTTTGCTTGCATAGCATCTGTTATTTTCGACTTAATAATCATAGAATTATTAGGATTAGAAATAGCATTGATAAATTTTTCTTTTTGGTTTTTCTTAGCGCTAATAAAAAAGTCAAAATTATGAACAACACCACTGCTTCCTATAATAGGTAAATCTCTTCCGTAATAAATGTTATGTTCATCAAATTTGTTTGCAACATCTTCTGAAAATATGTTTTGTGACTTAGGATTAGAAAGTAAGTACATATCACTAACAAATATAAGGCACTGTAATAAATTATGTTTAGATTTATTAAAATTTTTAAAGTTAGTTTGAACATAAATTTCGTGGGTCTTATCGTTGTATTTAGTACCGTAGGCTGAAAGATGCTCTTCAAAAATCTTTTTACGTTTTTTGAATTTATTTAAAGAAACACCGTTATTTTCTAAACCAAATGTAGTATAGCCGTCATCAGTCAGTGTAATCATGTCTCTGGACTGATCGTATAAAGCGTATATTTTTAAATTATCTAAAGAATTATCTTTAAAAGGGGTATCTATTTTTACAACATTGTTTGATAAATTAGAAAACTCTAAGATCTGGTTATACCAATCAAGATATTCTTTTTTTAATTTTTTAGCATCAAACGTAGTCATATTATCCCTCCTTTATTCAAGGTCTTTTATATTATTTTACTCTAAAAACGACATATACACATTATACAAGTTATAGATGTCGGGGAAATCTTTCAAGTTAATTTCATAAGCAAACCTATCCTTTTTATCACACTTATCATTATATATGTGAATATGACTTTTCGGAGCGATTGTTCCATCTGGATTATCGTGAGTATCACCGTTAATATCTATTCTAACTAGGGTGTGATAGGTATCTTTGAAAATGATTGAAATTGAAAACCTATCTTTTTCTATGTTCCCTCTTTTTATTGTTAATAAGTGGAAATGATAATTTAATAATGTACACTTTTGATTGTTTAAACATGTACAATTTTTAAAAACCTATAGATAATTTTATTGAGGTGAACAACAATGAAATTATCTTTAGACATAAATACTGATTTTGAAGTTACTACTCTTACAGATTTACCAAAATTAAAAATTGTTATGGAGAACTTAAACATGAAAATAAACAAAAGTGAAATAGCGAGACACATGGATGTTGATAGAAGAACAGTTGATAAATATTTAAATGGCTTTGAGCCAACCAAAAAGAGAAATCGTCAGTCTATTATTGACAAGTATTACCCTATCATAGAAAAATTACTTTCAGACACTAGTGAACAAAAGTTCTACTATAAGCGTATTCTTTGGCAATATTTGAAGGATAAACATGGGTTAACGTGTGCGTATTCTACATTTAGAGCTTATATCCTTAAACATGATGAGTTTAATCGTTATTTTATGAAAGGTTATCAACGGATGTCGCCTAAAGGCACAACGAGATTCGAAACAAAAGCCGGTCATCAAGCACAGTTTGACTGGAAAGAAGGCATTAACTTTAAAACGAAGGATAATCAAATCGTTTCACTAAATATAGGCGTACTACTACTTCCTTATTCCCGTTTTGTAATCATGCAAGTGACAATGAATAAATCAAGTGATGTCTTATTTAATTTATTGACACAAGCGTTTGAGCTAATGGGAGGTGTGCCTAATGAACTTGTAACGGATAACATGAAAACGGTCATGGATCAACCCAGAACAGAACGTACAAATGGTCAAATAAATCGTAGATTTAAACAATTCGCTGATGATTTTAATTTTAAAGTAAAACCTTGTATTGCCGGCCGTCCTAGAACAAAGGGTAAAGTAGAATCGATAATGAAAATATTAGATGAAATTCATGCTTATCAAGGCGAATTATATTTGGAAGAGATTCCTAAGTTTATTTCTAATCTTAATGAGCGACTGAACTACTCAGTTCATACGAGTACAGGTAAAATACCTATTATTGCTTTAGAAAAAGAAAAAAGTTTCTTACAACCACTACCGAATGTGAATGTAAGAAACTCATATAAAGTGAAACATAAATATTTGAAAGTCAACCACTCTAATATGATTACATATAAGTCCAATCAATATTCAGTACCAGCTGAATATTGTGGGAAAATAGTTGAAGTTCAAGTTTATGATCAAAAACTACACGTTTATTATAACACTAAATCGATTTGTGAACATCTCATCACACAACGTAAATTAAATTATCAAAAAGAACATTATTTAGAAACACTGTCATCTTCTTTTGGAAATAGAGAAATGGATGATATTAATCAGATTGCGATAGATAATTTGAATGCGATTGGAGAGTTGTATGATGAATAATTCGACGAATTATAAGCGCTTAAAAGCGAATTTAGAATATTTGAAAATGAATCAAATGATTAATCATCTTGATGATGTTATCGATTTTAGTATTAAAAACAACCTGTCATTTATAGATACACTAATTAAATTAAGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP030323|1374699:1385402|1381047_1381497_-|WP_000727649.1|DBSCAN-SWA MKKKLATTVLALSFLTAGISTHHHSAKAFTFEPFPTNEEIESNKKMLEKEKAYKESFKNSGLPTTLGKLDERLRNYLKKGTKNSAQFEKMVILTENKGYYTVYLNTPLAEDRKNVELLGKMYKTYFFKKGESKSSYVINGPGKTNEYAY >NZ_CP030323|1374699:1385402|1382181_1382532_+|WP_000702263.1|DBSCAN-SWA MKIRKSILAGTLAIVLASPLVTNLDKNEAQASTSLPTSNEYQNEKLANELKSLLDELNVNELATGSLNTYYKRTIKISGQKAMYALKSKDFKKMSEAKYQLQKIYNEIDEALKSKY >NZ_CP030323|1374699:1385402|1374699_1376346_+|WP_000277723.1|transposase|DBSCAN-SWA MYKNYNMTQLTLPIETSVRIPQNDISRYVNEIVETIPDSEFDEFRHHRGATSYHPKMMLKIILYAYTQSVFSGRRIEKLLHDSIRMMWLAQDQTPSYKTINRFRVNPNTDALIESLFIQFHSQCLKQNLIDDNSIFIDGTKVEASANRYTFVWKKSIQNHESKLNENSKALYRDLVEEKIIPEIKEDGDSDLTIEEIDLIGSHLDKEIEDLNHSIENEDCTQIRKQTRKKRTEIKKFKKKFDDYSERKSKYEEQKSILKDRNSFSKTDHDATFMRMKEDHMKNGQLKPGYNLQIATNSQFVLSYDLFQNPTDTRTLIPFLTMIQNTFGYLPEYIVADAGYGSEQNYMAIIDDFNKTPLITYGMFIKDKTRKFKSDIFNTQNWKYDELNDEFICPNNKRIGFKRYAYRNDRYGFKRDFKLYECDDCSACSLRQQCMKPNSKSNKKIMKNYNWEYFKAQINQKLSEPETKKIYSQRKIDVEPVFGFMKAILGFTRMSVRGINKVKRELGFVLMALNIRKIVARRAVYYQIHLKKADFYQIINRNQLFYIA >NZ_CP030323|1374699:1385402|1377087_1377876_-|WP_000206347.1|DBSCAN-SWA MTTFDAKKLKKEYLDWYNQILEFSNLSNNVVKIDTPFKDNSLDNLKIYALYDQSRDMITLTDDGYTTFGLENNGVSLNKFKKRKKIFEEHLSAYGTKYNDKTHEIYVQTNFKNFNKSKHNLLQCLIFVSDMYLLSNPKSQNIFSEDVANKFDEHNIYYGRDLPIIGSSGVVHNFDFFISAKKNQKEKFINAISNPNNSMIIKSKITDAMQAKKIKRHRQNEFIFILNDSKKEKNEHNKNLLHENYISTIDYSELDEKIGLLI >NZ_CP030323|1374699:1385402|1383155_1383335_-|WP_000669789.1|DBSCAN-SWA MKFKTTKECKSNNIFKRSQEINNRESEKGCLWGISMLILLFLLILFGITACSSSIHFIN >NZ_CP030323|1374699:1385402|1379554_1380316_+|WP_001066124.1|DBSCAN-SWA MNNSTNYKRLKANLEYLKMNQMINHLDDVIDFSIKNNLSFIDTLIKLSDYEIEIKEKNLIESMVKVAAFPFKKEISDFDFNFQPSINQQEIWDFTDLRFIEKYQNIVFLGSSGVGKTHLATGIGMAAAKNRVSTYFIKCHHLIENLRKAKLENRLENRLKHYSKYKLLIIDEIGYLPIGSEDAKLFFQLIDLRYEKKSTIFTTNINFNLWNEIFDDPKIANAILDRILHHSSVVKITGKSYRLKDHSPKKEIT >NZ_CP030323|1374699:1385402|1382584_1382845_-|WP_001791826.1|DBSCAN-SWA MCIVIYLIYSLIVYFICIINFFIMAAPFLMTNADYVWTPMTTVTLFILSLIIFLIFIKTKDVVHLTIFILNLLFSILYCLPILFYL >NZ_CP030323|1374699:1385402|1378269_1379562_+|WP_000777467.1|transposase|DBSCAN-SWA MKLSLDINTDFEVTTLTDLPKLKIVMENLNMKINKSEIARHMDVDRRTVDKYLNGFEPTKKRNRQSIIDKYYPIIEKLLSDTSEQKFYYKRILWQYLKDKHGLTCAYSTFRAYILKHDEFNRYFMKGYQRMSPKGTTRFETKAGHQAQFDWKEGINFKTKDNQIVSLNIGVLLLPYSRFVIMQVTMNKSSDVLFNLLTQAFELMGGVPNELVTDNMKTVMDQPRTERTNGQINRRFKQFADDFNFKVKPCIAGRPRTKGKVESIMKILDEIHAYQGELYLEEIPKFISNLNERLNYSVHTSTGKIPIIALEKEKSFLQPLPNVNVRNSYKVKHKYLKVNHSNMITYKSNQYSVPAEYCGKIVEVQVYDQKLHVYYNTKSICEHLITQRKLNYQKEHYLETLSSSFGNREMDDINQIAIDNLNAIGELYDE >NZ_CP030323|1374699:1385402|1384547_1385402_+|WP_001044434.1|DBSCAN-SWA MNKTNFGDYLNKSKSRKIYKIFDQNLKQEFSYWQFRKLFKSYTRQSDVHELKVCTQNDGTIEQIWIDKANQFGVSVTWKDNSIIGFVMRPLINYDAIKNETTLKYAVPTTDCYEVFWGGDNELYNYHYLYPHQRYAIDLVIKENHKTYKNLGKVNTDYFCFGKDIIAPANGTVEKVVSGVQDNSIGSTNESQFLGNYIVIKHAENEYSLIAHLQQYSIIVDEGQNVKYGDIIGKVGNSGNSTEPHIHFQVMNDKNIEACTSLKIRFINNRELIKGDVVCGLQGE >NZ_CP030323|1374699:1385402|1383751_1384297_+|WP_049280116.1|DBSCAN-SWA MTEQSMYGIGASATRFDSKNIYIRITDIDEKSRKLNYQNLTTPDELNNKYKLKRNDILFARTGASTGKSYIHKEEKDIYNYYFAGFLIKFEIDEQNNPLFIYQFTLTSKYNKWVKVMSVRSGQPGINSEEYAKLPLVLPNKLEQQKIAEFLDRFDQQIELEKQKIEILQQQKKGLLQSMFI >NZ_CP030323|1374699:1385402|1380494_1380953_+|WP_020444758.1|DBSCAN-SWA MDILFALHSIHISQQHRNITVATPHLKWCGYFYWKCVSGISNVKTPAKNEKNSPVPAGYTLDKNNVPYKKETGYYTVANVKGNNVRDGYSTNSRITGVLPNNATIKYDGAYCINGYRWITYIANSGQRRYIATGEVDKAGNRISSFGKFSAV |
11 | Staphylococcus_phage(63.64%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1390956 : 1425674
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP030323|1390956:1425674|DBSCAN-SWA 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40 | Staphylococcus_phage(93.75%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_3 |
1642550 : 1650862
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP030323|1642550:1650862|DBSCAN-SWA 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GAAGCATCTACAATTAATACAGATCCATTTCAATATATTTAAACTAAAATCTCGGGATTTCTAAATTTTGAAATTTCGAGGTTTTAATATTTTTATTTAAAATAGCACATTTATACTTTATAATAGTAAAGATGAACATAGAAGGAGGCCAAATCATGGCAAAACATCCATTCGAACAATTTAATCTAGAATCTAGTTTAATTGACGCTGTGAAAGACCTTAATTTTGAAAAACCAACTGAAATTCAGAATCGAATTATTCCAAGAATACTAAAGAGAACAAATTTAATTGGTCAATCTCAAACGGGTACAGGGAAATCTCATGCATTTTTATTACCATTAATGCAGTTAATTGATAGTGAAATAAAAGAACCACAAGCAATCGTAGTTGCACCAACAAGAGAACTTGCACAACAACTATACGATGCAGCGAACCATTTAAGCCAATTTAAAGCTGGCGTTTCAGTTAAAGTTTTTATTGGTGGTACAGATATAGAGAAAGATAGACAACGTTGTAATGCACAACCACAATTGATTATAGGCACCCCTACTAGAATTAATGACTTAGCTAAAACGGGACATTTACATGTGCACTTAGCATCATATTTAGTTATTGATGAAGCGGATCTTATGATTGACTTAGGATTAATTGAAGATGTAGATTACATTGCTGCAAGATTGGAAGATAATGCAAATATTGCGGTGTTTAGTGCTACAATTCCACAACAGTTACAACCATTTTTAAATAAATATTTAAGTCATCCAGAATATGTAGCTGTCGACAGTAAAAAACAAAATAAAAAGAACATCGAATTCTTTTTAATACCTACTAAAGGTGCAGCTAAAGTTGAAAAGACTTTAAATTTAATTGATATACTAAATCCATACTTATGTATTATTTTCTGTAATAGTAGAGATAATGCAAATGATTTAGCACGTTCACTAAATGAAGCTGGCATTAAAGTTGGTATGATTCATGGTGGTTTAACGCCACGTGAACGTAAACAACAAATGAAACGTATACGTAATTTAGAATTCCAATACGTTATTGCCAGCGATTTAGCATCTCGTGGTATTGATATTGAAGGTGTTAGTCATGTCATCAATTTTGATGTGCCAAATGATATTGACTTCTTTACACATAGAGTCGGCCGAACTGGCCGTGGGAATTATAAAGGTGTAGCAATTACGCTTTATAGTCCTGATGAAGAACACAATATTTCATTAATAGAAGATCGTGGTTTTGTTTTCAATACTGTTGATATTAAAGATGGTGAGTTAAAAGAAGTTAAAGCGCACAATCAGCGTCAAGCAAGAATGCGCAAAGATGACCATTTAACTAATCAAGTGAAGAACAAAGTTCGAAGTAAAATTAAAAACAAAGTTAAACCAGGTTATAAGAAGAAATTTAAACAAGAAGTTGAAAAAATGAAACGTCAAGAGCGTAAACAATTTAGTAAGCAGCAAAATAGACAAAAACGTAAGCAAAACAAAAAAGGTTAGGTGTGTTTTATGTTATTAGGATCACATGTTTCAATGAGTGGTAAAAAGATGTTAGAAGGTTCTGCTATAGAAGCGCATGAATATGGTGAAACAACATTTATGATTTATACTGGTGCACCTCAAAACACGCGCCGTAAAAGTATTGAAGATTTAAATATAACTAAAGGTCATGAAGTGATGGAAAAATATGGCTTATCTAATATTGTTGTTCATGCACCATACATCATTAATATTGCAAATACAACCAAACCAGAAACGTTTAATCTTGGTGTAGATTTCTTGCAACAAGAAATTGAAAGAACGCAAGCTATAGGCGCTAAAGATATTGTATTACATCCGGGTGCGCATGTTGGAGCTGGTGTTGATGCCGGAATTAATAAGATTATTGAAGGATTAAATGAAGTTTTAACGAATGACAATAATGTACGTATTGCGCTTGAAACGATGGCAGGTAAAGGTACAGAGATTGGTCGTTCGTTTGAAGAGTTAGCACGTATTATTGATGGAGTTCATAATAACGAACGTTTATCAGTATGTTTTGATACATGTCATACGCATGATGCTGGATATAATGTGAAAGAGGACTTTGATGGCGTATTAAATGAATTTGATAAAATCATTGGAGTCGACAGAATTAAAGTTGTTCATGTCAATGATTCTAAAAATGACCGTGGCGCTCAAAAAGACCGACATGAAAATATTGGCTTCGGTTACATTGGTTTTGATGCATTAAATTACATTGTGCATCATGATTGTTTTAAAGATATTCCGAAAATCTTAGAAACACCTTATGTTGGTGAAGATAAGAAAAATAAAAAACCGCCATATAAACTTGAAATTGAAATGTTAAAACAACAGCAATTTGACCCAGAATTAAAAAATAAAGTTATGCAACAATAAAATGATAATGCTCTCTTCAAGAAATGCGATAAATAATACTTGAAGGGGGCATATCTCTTTATTTTGTCTTGTTTTGAGTCGTAAACATTACTGTTTACATATGTTACTAGGAGTTGTATAGTTGAATGCGAGGTGAGAATACGATGACACCAGTCTTTGAATTGAAAAATGTCAATTACTACTATGATCATAAAAAAGTGTTAGAAAATATAAACATTAAAATAAATAAAGGTGAATTTTTAGCAATTGTTGGACCAAATGGTGCTGGTAAATCAACATTATTGAAGTTGATTCTAGGATTATTACCTTTACAAAGTGGTGAGATTTTTGTTGAAGGTATAGATTTTAAAAATAAGAAAACATCAATTAAATTAAGCTATGTATCACAAAAAGCAAATGCCTTTAATTCAGGTTTCCCAGCAAGTGTTAAAGAAGTTGTTTTAAGCGGATTAACAAAGACAAAACGTCTTTTCCAAACATTTAATAGCAAAGATAATGAAAAAGTGATTAAAGTACTAGAAAGACTGAATATAAGTGATTTAATTCATAAAAATATAACAGAATTATCAGGTGGTCAACAACAACGTGTAATGATTGCTCGAGCATTGATTTCAGAACCTGCAGTATTAGTACTTGATGAACCAACGAATGGTATTGATGCAAAACATGTAAGTGAATTTTATAATACTTTAGATCAATTAAAACAAGAAGGTATCACCATTATCTTAGTTACTCATGATATTGGTGTTGTAGCAGATACTGCTACTGAAGTAGCATGTTTAAATAAGCATTTGCATTTCCATGGTACAACTGATGAGTTTAAATCACTTGATGAAGTTGAAATTTCAAAAATTTATGGACATCCTGTACGTTTTGTCGATCATCAGCATAATCGAGAATGTTGTAATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP030323|1642550:1650862|1650076_1650862_+|WP_001213910.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNITELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >NZ_CP030323|1642550:1650862|1644573_1645680_+|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >NZ_CP030323|1642550:1650862|1642550_1644350_+|WP_001217251.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPASYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERSFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYSLNDEPYENEIDDYVNIINENGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NZ_CP030323|1642550:1650862|1649060_1649951_+|WP_000924210.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDCFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >NZ_CP030323|1642550:1650862|1646490_1647591_+|WP_000683914.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFRTAESWDNVGLLIGDEDVAVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPHGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDACQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGVSNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >NZ_CP030323|1642550:1650862|1645810_1646488_+|WP_000624567.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDCGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVERIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL >NZ_CP030323|1642550:1650862|1647704_1649051_+|WP_001062177.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG |
7 | Caulobacter_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1745211 : 1873311
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP030323|1745211:1873311|DBSCAN-SWA TATGAAAACAACGATTAAACAAGCGAAAGATCATTTAAACCAAGACGTTACAATTGGTGCTTGGCTAACAAATAAACGTTCAAGTGGTAAAATCGCCTTTTTACAATTACGTGATGGAACAGGTTTTATGCAAGGCGTAGTAGTTAAATCAGAAGTTGATGAAGAGGTATTCAAACTTGCGAAAGAAATTACTCAAGAATCATCTCTATATGTTACAGGCACAATTACAGAAGATAATCGTTCTGACTTAGGATACGAAATGCAAGTGAAATCAATTGAAGTTATTTCAGAAGCGCATGACTATCCGATTACACCTAAAAATCACGGTACAGAATTTTTAATGGATCACCGTCATTTATGGTTACGTTCTAAAAAACAACATGCTGTAATGAAAATTAGAAATGAAGTTATTCGTGCAACGTATGAATTTTTCAACAAAGATGGATTTACAAAGGTTGATCCACCAATTTTGACAGCAAGTGCACCAGAAGGTACAAGTGAATTATTCCATACTAAATACTTTGATCAAGATGCGTTTTTATCTCAAAGTGGTCAGTTATACTTAGAAGCTGCGGCAATGGCACACGGAAAAGTATTTTCATTTGGTCCAACTTTCAGAGCTGAAAAATCAAAAACACGTAGACACTTGATCGAGTTCTGGATGATTGAAGGGGAAATGGCTTTCACAAATCATGCTGAAAGTTTAGAAATTCAAGAACAATATGTAACACATGTAGTAAAATCAGTTTTAGAAAATTGTAAACTAGAGTTGAAAATTTTAGAGCGTGATACATCAAAACTTGAAAAAGTTGCGACACCATTCCCTAGAATTTCATACGATGATGCAATTGAATTCTTAAAAGCAGAAGGCTTTGATGATATTGAATGGGGCGAAGATTTTGGTGCGCCACATGAAACTGCCATTGCTAATCATTATGATTTACCGGTGTTTATTACTAATTATCCAACTAAAATTAAGCCTTTCTATATGCAACCAAATCCTGAGAATGAAGAAACTGTATTATGTGCAGACTTAATTGCACCTGAAGGATACGGTGAAATTATAGGTGGATCTGAACGTGTGGATGACTTAGAATTGTTAGAACAACGCGTTAAAGAACATGGATTAGACGAAGAAGCATATAGTTACTACTTAGACTTACGTCGTTATGGTAGTGTGCCACACTGTGGATTTGGTTTAGGTTTAGAGCGTACAGTAGCATGGATTTCTGGTGTTGAACACGTTCGTGAAACAGCGCCATTCCCAAGATTATTAAACCGTTTATATCCATAAGTTTTAGGATCGTTACTTAAAATTTATATTATGATAATAAAAAGAATCGTCCAGCCTATATTAATAGCTGGGCGATTTATGCTTGGAAAATGTAGATTGATAACGGCTTTCATTAAGCATGAACAAACTTTTGTTTAGTAATTATATTTGGAAAATAAATAGCTCATTTGATTATACATAAAGTTCATTGTTAAAAACTAGTTTTAAAAAAATACTGTTATTTAAAATTTGTTTGCTACTAGTTAAATATATTAAGCATTTTAGTCGAAAATTAAAGAAAATGATTTATACTATTAAGTAATGGTTAAATTTAAAAGGGGGCACGAACATGGATAAATATCAATTAAAAGCAAGACCTGTAGTGATACGAAGAGAATTATTAGACCATTACAGTGACTTAGGTTTAGATGAGCAAGATTTAGTCATTTTGCTTAAATTGATTTATGCTTCCGAAACATCAAATAAACAGCCTTCAATTGAATTACTTCAGAAGGGCTCAACTATGCAACCACGCGATATTACAATGGTTATTCAAAATTTGATACAACGTGAATTGCTAGAATTACAAGTTCAAAAAGATGAAGAAGGTAGATTTACCGAATATATGAATCTAGATCCTTTTTTCGAAAAATTAAGTCATATATTGAAGCAACAAAGTATGGAAACGAAAGAGCAAAATAGTAAAGAAAAATTTAAACAATTATTTAGAGTTTTAGAGGATACATTTGCAAGGCCGTTATCTCCATATGAAATAGAAACGTTAAATCAATGGATTGATGTTGATAAACACGATAGTGCAATTATACAAGCGGCATTAGACGAGGCGAATAGTTTGAATAAACTTAGCTTTAAATATATGGATCGTATTTTACTTAATTGGAAGAAAAACAATGTCAAAACAATTGACGATTCTAGAAAAATAAGAGAAAAATTTAATAAACCGAAAATGACGCACACAGTTAAAACGGTACCTAAATTTGATTGGTTAAACGGGGAGAACCTTGATGGTAAGTAAGAAAAAAGCATTAGAAATGATTGATGTTATAGCAAATATGTTTCCGGATGCAGAATGTGAATTAAAACATGATAATCCGTTCGAATTAACTATTGCTGTATTATTGTCAGCGCAATGTACAGACGTTCTAGTAAATAGAGTAACAACTGAGCTGTTTAAAAAATACAAAACGCCTGAAGATTATTTGGCAGTCAGTGATGAAGAACTTATGAATGATATTCGTTCCATCGGTCTGTATCGTAACAAAGCTAAGAATATTAAGAAACTTTGTCAATCTTTGATTGATCAATTTAATGGAGAAATACCACAAACACATAAGGAATTAGAAAGTTTAGCAGGTGTAGGACGTAAAACTGCTAATGTAGTCATGAGTGTAGCATTTGGTGAACCTTCATTAGCTGTTGATACGCATGTAGAACGTGTTTCTAAACGCTTAGGTATTAATCGTTGGAAAGATAATGTGAGACAGGTAGAAGACCGTTTATGTTCTGTTATACCTAGAGATAGATGGAATAGGAGCCATCATCAACTCATTTTCTTTGGAAGATACCACTGTTTAGCCCGAAAACCTAAATGCGATATTTGTCCACTATTAGAAGAGTGTAGAGAAGGACAAAAACGTTATAAAGCTAGTTTGAAAGAAGCGTGATAACATGACAAATATTACAAAAGAGGTATTTGATATTTTAGAACAAGAGATTGATGTATTTGCCAAAAATAAGACATTAGGTTCTAGTGAAGCAAAGCCCTACTTGGATGAATACCATAGTAAAATTATTGATTATTTTAATCAGATTAATGACATAACTGGCAATATTGATTTTGATAATTTAAATCAATATCCTGTTGTGCCAATGAATTTTAAAGAAAGATATGATTATATGATTGAACGTAAATATCATTTTATGGGCTATCGACAAATGAAGACCTTTAAAACTGAATTGATTAAAATGAATGCTAGTTATCAAACAAGGTTAAAGAATAAGCAGGTATAGACAAGTTTGATCATTTCCTAATGTTGAAAAGATGTAAAACTAATTCATGCACACATATTTGTATTTATGTTAGGTGTCGTGACATTACAACATTTTAATATAAAAACTGTCCATCTACATCATAATGGATATCTTGAGGTATGTTTTAAGATATCTATTTCGAATCGTAGGTGGATTTCTTATATCTATGAATGTGAAAATACGTTACAAACATGTTGATATTTCACTGATTAACGTACACAGGGAATTGATAAACATATCAATTTAAAACAGCGTCTAAGATGACTATGAGAAAATATAATCATAATTTTAAAAATGGGAACAACCATTTTTGTAATTTCAATAATTTAAAATAGCTAAAGATGTGAATATGAAAAACTATTTAGATGTTTCAAAATGAATGTGAATGACTGATTTTACGGTTTCTACTAATATAGCAATAGCTTATGAATACTTATAAAAAATCCTCAGCTACACCATAAATATGGTATAACTGAGGATTTTATGTTGAGTGGATTAGTTGAATATACCTGTTAATCCACCGCTGTTTCTAGATTGTTGAGATCTAGTATTGTTATTTGATTGTGCAGTACCACTGCTGTTTGCTGATGTGTCACTACCACCGTGTGTACTACGATTTGTAGTGTTGTTATCTTGACTACCAGAAACATTGATTGATGGGATACTACCACTTACTGAGCTAGGACGTTTAAAGTCTTCGCCATCTCTAGATGAAATTTTTGACATCACATTTTCATATAAGAACTGTGGATATTCTTGTTGGCTATGTCCCACAAATGAGTTTTCACCATATTGTTTAACTTTACTGAAGCCCATCCACACTGACATAGTGTATTGAGGTGTAAAGCCGTTAATCCACACGTCTTTCGCTGCATTATCAGGTAAATTATATTGTGAATAAGTTTCAGCACCGTAAGTACCAGTACCTGTCTTAGCACCCATATTTACTCCAGATACACCATGGCCATATGCAGAACCATATGGTTTAAATGTACCTTTTAGCATCTCAGCTAACATGTATGCAGTGTAATCACTCATCGCTTTATGGCTAGTATGATCGTATTCGATTGTTTCACCATCACGAGTAACTACTTTTTGAATTGAATGCGCGTTGTTATAAGTACCACCGTTAGCGATTGCAGCAAATGCTGATGCTAATTGTGTTGGTGAGAATTCTGAAGCAGAACCACCAAGTACTTCAGATGGACCAATATCGCCTTCGTAGTTTAAGCCAAGTTTGGCAGCGAATTTCTTAGGTGCATCATTACCAGCATTTTGCTTAACTGATTGCCAAGCTTTTAAAGCTGGGATATTGAAACTTTGTCGTAAAGCATCATAAATTGATACAGTACCGTGACTCTTCACATCGTAGTTTCTAAATGTAGATCCATCAACTTGATATGAAGATTCATCTTGAATCGCATGGTTTGTTGCCCATTTCATATTTTCAATGGCAGGTCCATACGCTAAGAAAGGTTTTAAAGATGAACCAGTAGGGTGAGGATCTGTTGCTTGGTTTCTGTTAACGACGTCTTTGAAATCACGTCCACCAGATATAGCAACTAAACCACCAGTTTTACTATCAAGAATCGTTGCACCAACTTGTTGGTCTTTATTCTTGTAGAAGCTACCATTATCAACATCATTTTGTAATGTTTTTTGAACATCTTTATCC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114 | Staphylococcus_phage(84.0%) | integrase,capsid,tail,holin,protease,portal,tRNA,lysis,terminase,head | attL 1779616:1779640|attR 1825014:1825038 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1963755 : 1972531
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP030323|1963755:1972531|DBSCAN-SWA TCTAATTAATTAAAATACTATAATTATATTTTATTTCTGTAAGTTTATGTGCCTCTATATAGTTCAAATTATACTTATTCATTAGATAGTGTTCAAGAGCTTCATGTTTCAACATTATTATATCCATTTTTTTAATATTTTTCCCTTCTCTTAAACGTTGCCAACTTTGAGCCATATAAAAGTCAGGATCAAATTGTTTAAATCCACTTTCCAATAAATACTTATTTTCAAATATATGTTCATAAACTCTTTGAATTGTATTTTTATTTATATTAGTATTTTTAGCAATTTTAGAAATCTCTATCTGTTTATCTCGATTTCTAACTGAATTATAATAAATTTGGGCATGTCTGTTCCTTTTGATACCGTATTCATCACTTTTATTATTAAGTGCACCCGATTCAATAAAAGAACCTTCTACCTGATATTTACCTTCACGCTCTTTAAAGAACTTGTCTCGCCAATTGCCGACATGTGACACTGTGGTACTTCTACACCAAGGATGCATAGGTGGCGCATTCACACCTGGTATCATATCTTTAACTTTAAATATTTTTCCGTTAAGTGAATGACATAATTTAGATGTTTTACTATCTATTTTTGCAACATATTTATATTCGCCATCTTCACCAAGTTCTTTTAAATATGTTAATTTTTGTGATTTTGATATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGTGTATAAAAATAGCACCGCTTTCTCTTTATCTGTGTAGAAAGGATGCTATTGATATTTAGACTTTGATTGATTAATTTCTTTTTCTAATTCTTCTTTCTTCGATAATTCTTCCATATGCTTAAAAAAATCTTCTATAGAAATGTAACCATCTAAATGTTGAATTGACATAATGTATTACTCCTATTTGTACTTTCGTTTTATATATCTTTTATTATAAAGTTGCTTTAGAATATTATCAACTATCGCTTCATTATTTCTTATAGTTATAGATTGTTTTATATCTTTCATTATTTTATAAACTTGAGACTGATTATATAATGGAGTTTTACTTATATATTTTACTACAATGTAGTTAGTAACAATAGTCAATGTTCGGATAGATTTATTTTCAATAAACATCTCTAAATTATTCAATGAAAATCCTGACTGTCCAGGATGGTTATGTAACATAACAATTGAATTCGGTTTACTGTTAAATAATAATTCGGTTGCTTTTTACCTTAGCATATAAGATACACTACCTTGATCACCATATACTTTTGTAACTTTACCACCTTTTAATAAATAAGCTACTTCATTGCTATCATTGTTTTCTTTGGCATCTTTAATACGTTCATCTGATTTTTTGCGCTCTCTAGCTATACGCTCTTTAATCAATTGTGATACTTCTTCTTGAGAAAATGTTTTCTCATTCTGTTGTGATTGTTCATCACTGTTGTCTAGTTGCTCTTCGTTCTGAGTTACATCAGTAATATTACTTTCATTTCTTTCCATGAGATATACCTCCGTTTATAGTCTGTCGACTGATATTCCATACTTGCTTTTAAAATGTCATCAGCACGTTTTGGACAATAAAAAATAACCTTCACATTGAAAGGTTAAAAAAATGTATAAAAATAGTAACACATTCGTTTCTTACAAAAGTATACTTATTTTAAAACTTCAATATATTTGATTTGGCTTTCATCAAAATCATATAAATCTATTCCGTCATCTAAATGTATAGAATCTTCTCCACTTTCGTTATCTATTTCATCGTCATAATTTGTAACTTCTCCAATAAATTTTTGCCCATTAGTTAACTCGATCATTACTTTTTTACCAATGTAAGTCCATAACTTCATTACTTACCTTCCTTTCCATTTGGAATAATATGACTACCAGTTTTGGAATAATGAACAGTACCCCATTTAGTTTCTATAAATTTTCCATCTATGTAATATTTTCCTATAATTTGACCAAAATTAATTATTTCTTTATTTTTCCATTTTCTTTCATTTTCAATAATCAACCGTCCAGTGCCAAATTTTTGATTTAGCATTTTATTTAATTCATCATTTTTTAGTAGTGTATAACTCGGTGTTTGTTTTCCTTTCAACAAATTCTTTTTTTATATTCTTCGTATAGTCTATGACCTAAAGAATGTCTATTCTGTTTTTCAGGATTTATTTCTATTTTTATTTTACCACTTTCAATCATTTCTTTCATCTGGTTTTTAGCTTTTTCCTGTAATTTTGCTTCTTTTACTTCTACCTGATATTTACCTTCACGCTCTTTAAAGAACTTGTCTCGCCATTTGCCGACATATGGCACTGCGGTACTTCTACACCAAGGATGCATAGGTGGCGCATTCACACCTGGTATCATATCTTTAACTTTAAATAGTTTTCCGTTGAGTGAATGACATAATTTAGATGTTTCACTATCTATTTTGGCAACATATTTATATTCACCATCTTCACCAAGTTCTTTTAAATATGTTAACTTTTGTGATTCTGCTATTTCAGTAAATAGTTAAAAAAGTGTATAAAAATAGCACCACTTTCTCTTTATCTGTGTAGAAAGGATGCTTTAATACCAAGCTATTTTATAATTTTCGGGAAATTCTTGCTTCTCGATAAAGTCTCTTACTACAGAAAAAGACTTATTACGATATAACATAAAATATTCTTCATTTTCTATTTCAGATAATGAAAAATCTATAACCTCTGCATCTTTTTTATTAAAAGTTACTGAACCTTTACCGTTACTTATATCATCTTCAGGTATATATTCATATATTATAACCTGTTCATCTTCTTTCAATTTTATTAATGTAAGCATTTAATCCACCTTATTTTTATAAAAATTGAATAATCGTATTTTTTGATACAATTTTATGTGCATAATCATAGTTGTAATTATACTTATTCATCAAATAATGTTCAAGCGCCTCATGACGCAGCAGTATTAAATCTTGTTTTTTATTATTTTTCCTTCTCTTAAACGTTGCCAACTTACTGCGATATTATATTCTGGATAATAACTTAAAATCGAATAATTCACTTTGAACATAACAAATCACTCCTTGTACAGTGGTGAAGCAAGTATTATTATTAAATTGTAGGAGTGAAATTCCCTCCTGACTGATTAACGCTCGAATGTCCATTCAATCTTTATAAAGTAGAGATTTATTAAGATTAACAATTTGGTACATTTGAGCTTTTTTATTTCCTTCACTCGCATCTTCTTAAACTTATATGTTCATTATACAAATATAAAAAGCTATAACAATTTAATGGAAATGCCCCCTTCGAAGTAGACATTGAAAAAATGAAAACTTTGAAGGGAGCATTTCAAGACGATCCATTCCAATCTTTTTTATCATTTAAAACTTAACACTTATTTTCCCTTATTCGATGCTAATTTCGTGCAATAAATTCTAAATGAAACAACATACTCCTTTTTCACAAATTGGAATCTACTATTTTTGTATTTTAATTATTATAATATCCATTCACCATATGATTTTTATTAATAGTTAAATCAAATAAACATAGCTTGATTAATTTATACAGTAGTTATATTACAAAACTTTATTGGCATATTCATATAATTTTTCTGTTGTATTCAGGGTTAGATTATCTACTTCGCGTTTGCCCTGTCTTAATTGTGAAAGTACGTATTGAGAAACTCCAGTTTTTTTAGAAATTTCATATCCTGTTAAATTACTTTCAATTAATTCAATTATCTTTTTCTTGTATTCTGACATTTTTTTCATCTCCATATCTGTACAATGTTTACTGCTTTTTTTCGAAATTCTGTGAACTTAACGTATTTTTTATTTATAAATGATTTTATTATTTTTCTATTCATTAATGGCTATCATCACTTCATAATAGTTAAATTTCATATTTTCAATTTTTGTTTCTACATATTAACGACTTTACATCATCAATTACTTTGTCAAAGACAAACGATTTGTCTTGTATACCTTACGCCTTTTACTAAACTGGAAATGATAATTTAATAATGTACACTTTTGATTGTTTAAACATGTACAATTTTTAAAAACCTATAGATAATTTTATTGAGGTGAACAACAATGAAATTATCTTTAGACATAAATACTGATTTTGAAGTTACTACTCTTACAGATTTACCAAAATTAAAAATTGTTATGGAGAACTTAAACATGAAAATAAACAAAAGTGAAATAGCGAGACACATGGATGTTGATAGAAGAACAGTTGATAAATATTTAAATGGCTTTGAGCCAACCAAAAAGAGAAATCGTCAGTCTATTATTGACAAGTATTACCCTATCATAGAAAAATTACTTTCAGACACTAGTGAACAAAAGTTCTACTATAAGCGTATTCTTTGGCAATATTTGAAGGATAAACATGGGTTAACGTGTGCGTATTCTACATTTAGAGCTTATATCCTTAAACATGATGAGTTTAATCGTTATTTTATGAAAGGTTATCAACGGATGTCGCCTAAAGGCACAACGAGATTCGAAACAAAAGCCGGTCATCAAGCACAGTTTGACTGGAAAGAAGGCATTAACTTTAAAACGAAGGATAATCAAATCGTTTCACTAAATATAGGCGTACTACTACTTCCTTATTCCCGTTTTGTAATCATGCAAGTGACAATGAATAAATCAAGTGATGTCTTATTTAATTTATTGACACAAGCGTTTGAGCTAATGGGAGGTGTGCCTAATGAACTTGTAACGGATAACATGAAAACGGTCATGGATCAACCCAGAACAGAACGTACAAATGGTCAAATAAATCGTAGATTTAAACAATTCGCTGATGATTTTAATTTTAAAGTAAAACCTTGTATTGCCGGCCGTCCTAGAACAAAGGGTAAAGTAGAATCGATAATGAAAATATTAGATGAAATTCATGCTTATCAAGGCGAATTATATTTGGAAGAGATTCCTAAGTTTATTTCTAATCTTAATGAGCGACTGAACTACTCAGTTCATACGAGTACAGGTAAAATACCTATTATTGCTTTAGAAAAAGAAAAAAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP030323|1963755:1972531|1970917_1971124_-|WP_001002343.1|DBSCAN-SWA MNEIETIISEIEKLLTNNTPYSISKNSGVPRQTVTDLKVGNTKIKDAKFKTIIKLYEYQKSSENNSEC >NZ_CP030323|1963755:1972531|1971419_1971644_-|WP_078065144.1|DBSCAN-SWA MTKIMNQFKEIYNTIEKLLNDKSISNYRINQDTGVSYGGISESRSGKRKVNNLTLETAEKLYNYQKQLEIMIED >NZ_CP030323|1963755:1972531|1965186_1965315_-|WP_031786973.1|DBSCAN-SWA MKVIFYCPKRADDILKASMEYQSTDYKRRYISWKEMKVILLM >NZ_CP030323|1963755:1972531|1970111_1970222_-|WP_001788716.1|DBSCAN-SWA MKMTIKVRKTNKKEKIEFLIGTFIIILVILGFKIMK >NZ_CP030323|1963755:1972531|1964941_1965220_-|WP_000440735.1|DBSCAN-SWA MERNESNITDVTQNEEQLDNSDEQSQQNEKTFSQEEVSQLIKERIARERKKSDERIKDAKENNDSNEVAYLLKGGKVTKVYGDQGSVSYMLR >NZ_CP030323|1963755:1972531|1966675_1966780_-|WP_000477491.1|DBSCAN-SWA MFKVNYSILSYYPEYNIAVSWQRLREGKIIKNKI >NZ_CP030323|1963755:1972531|1972333_1972531_-|WP_001659797.1|DBSCAN-SWA MNCYDEIYNTIKKLIENKEITSYQINKDTGISYGNINAMRRGERRIENLSLKNAKILYEYAKKVL >NZ_CP030323|1963755:1972531|1965569_1965824_-|WP_001813273.1|DBSCAN-SWA MKGKQTPSYTLLKNDELNKMLNQKFGTGRLIIENERKWKNKEIINFGQIIGKYYIDGKFIETKWGTVHYSKTGSHIIPNGKEGK >NZ_CP030323|1963755:1972531|1967810_1969103_+|WP_000777467.1|transposase|DBSCAN-SWA MKLSLDINTDFEVTTLTDLPKLKIVMENLNMKINKSEIARHMDVDRRTVDKYLNGFEPTKKRNRQSIIDKYYPIIEKLLSDTSEQKFYYKRILWQYLKDKHGLTCAYSTFRAYILKHDEFNRYFMKGYQRMSPKGTTRFETKAGHQAQFDWKEGINFKTKDNQIVSLNIGVLLLPYSRFVIMQVTMNKSSDVLFNLLTQAFELMGGVPNELVTDNMKTVMDQPRTERTNGQINRRFKQFADDFNFKVKPCIAGRPRTKGKVESIMKILDEIHAYQGELYLEEIPKFISNLNERLNYSVHTSTGKIPIIALEKEKSFLQPLPNVNVRNSYKVKHKYLKVNHSNMITYKSNQYSVPAEYCGKIVEVQVYDQKLHVYYNTKSICEHLITQRKLNYQKEHYLETLSSSFGNREMDDINQIAIDNLNAIGELYDE >NZ_CP030323|1963755:1972531|1967291_1967477_-|WP_000006110.1|DBSCAN-SWA MSEYKKKIIELIESNLTGYEISKKTGVSQYVLSQLRQGKREVDNLTLNTTEKLYEYANKVL >NZ_CP030323|1963755:1972531|1965375_1965570_-|WP_000780597.1|DBSCAN-SWA MKLWTYIGKKVMIELTNGQKFIGEVTNYDDEIDNESGEDSIHLDDGIDLYDFDESQIKYIEVLK >NZ_CP030323|1963755:1972531|1966297_1966549_-|WP_000956747.1|DBSCAN-SWA MLTLIKLKEDEQVIIYEYIPEDDISNGKGSVTFNKKDAEVIDFSLSEIENEEYFMLYRNKSFSVVRDFIEKQEFPENYKIAWY >NZ_CP030323|1963755:1972531|1969095_1969857_+|WP_001066124.1|DBSCAN-SWA MNNSTNYKRLKANLEYLKMNQMINHLDDVIDFSIKNNLSFIDTLIKLSDYEIEIKEKNLIESMVKVAAFPFKKEISDFDFNFQPSINQQEIWDFTDLRFIEKYQNIVFLGSSGVGKTHLATGIGMAAAKNRVSTYFIKCHHLIENLRKAKLENRLENRLKHYSKYKLLIIDEIGYLPIGSEDAKLFFQLIDLRYEKKSTIFTTNINFNLWNEIFDDPKIANAILDRILHHSSVVKITGKSYRLKDHSPKKEIT >NZ_CP030323|1963755:1972531|1963755_1964424_-|WP_078237844.1|capsid|DBSCAN-SWA MSKSQKLTYLKELGEDGEYKYVAKIDSKTSKLCHSLNGKIFKVKDMIPGVNAPPMHPWCRSTTVSHVGNWRDKFFKEREGKYQVEGSFIESGALNNKSDEYGIKRNRHAQIYYNSVRNRDKQIEISKIAKNTNINKNTIQRVYEHIFENKYLLESGFKQFDPDFYMAQSWQRLREGKNIKKMDIIMLKHEALEHYLMNKYNLNYIEAHKLTEIKYNYSILIN |
14 | Staphylococcus_phage(66.67%) | transposase,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2233092 : 2241565
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP030323|2233092:2241565|DBSCAN-SWA CTTATTTTACAATTTTAGCAATAACACTTGGATATAACTCATATTCCAATTTTTTTACTTTCTCTTCTAATTGTTCTTTTGAATCGTCCGGTCTAATATCACATTGTCTCTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATACCACTATCAACATAATGTACTGTCGAACCAGTAATAGTATCGCCACTATGATATGCTTGGCCTATTGCGTCAATCCCCTTATATTTCGGCAATAGAGATGGATGTATATTCAATATTTTACCTTCAAATGAAGCTAATAAGTCTGGACCAATTAGACGCATGTAGCCAGCTAAAATAATCCACTCTACCTTATCTTTATTTAATAATGTTACTAAATGTTGTTCATACGCTGCTTTTGAATCAAATTGTTTTGGTTCATTAATATAAACAGGAATATCGTGCTTTTTTGCTCTATCTATACAAAACGCATTTTGATGATCCGTATATAGCGCCGTAACTTCAATATTTTCAAGTTTTCCTGATTCAACATGCTCAACTATATTTTCAAAGTTACTTCCTGAACCTGATGCAAAAATCGCAATTTTAACCATTGTTATACCCCCAACAATTCGATTGCAGTTGACTCATTTTTCACAATATGACCAATTTGATAGGCTTCCACATTTTGTTCTGCTAAAATCTTCAAAGCGCGTGATGCATCTTTTTCATCAACGATAACCGTATAGCCAATACCCATATTAAAAATGTTATACATTTCATTTGTGTCTATATCGCCTTGTTGTTGTAACCAATCAAATATTTTTGGCGTTGGAAATGATGTTGTATCAATTCTAGCAGCATATCCGGCTGGCAATGCACGTGGAATATTTTCATAAAAACCTCCACCAGTAATATGATTCATTGCCTTAATAGAAACTTCTTTTTTCAAAGTAAGTACAGGTTTGACATACAATTTAGTTGGTTCTAAAAAGACATCTATAAATGGACGATTATCGAAGTTTGATGCCAAATCAATGCCTGATTCATTAATTAATTTGCGCACTAAACTGTATCCATTTGAATGAATGCCACTTGACGCAAGCCCTATAACAACTTGTCCCTCTTTCACTTCTGAACCATCTACATAGTCATCCTTTTCAACTGCTCCAACAGCAAATCCGGCTACATCATATTCGCCTTCGTGATACATTTCACCCATTTCAGCAGTCTCTCCACCGATAAGTGCAGTATTCGTTTCAACACATGCATCACTAATACCTTTAACAATTTGTTCAATAACTTCAGGAACAACTTTGTTTGTAGCGATGTAATCTAAAAAATATAATGGTTCTGCACCTGTCGTTAAAATATCATTAACACACATTGCAACTGCATCGATACCTATCGAATCATGTTTACCATAGTCGATAGCTAGTTTTAATTTCGTTCCTACTCCGTCTGTTCCAGAAACTAAAACTGGTGCTGTCATATTTAATTGTGATAAATCAAATGTAGCACCGAATCCACCTAAACCACCGATAACTTCTTTACGCATCGTACGTTTAACATGACTAGACATTCTTTCTACAGCTTCATAACCAGCATGAATATTTACACCAGATTGTTCATATGCTTTAGACATTTAAATTTCCCTCGCTATCAAAAAAGTGTTTGTTTTTAGAAATATATTGCTTTTGTCGATGACTTAAATGTGCTTTATAATTTGCTTCATAATCATATAACCCTGCAGGATAATCTCCAGTGAAACTTTCTACACATAAGCCACTATATGGCGCGTCATAATCTAAACCAATTGATTCAATTAACCCATCTACAGATAGATATGCTAATGAATCAGCGCCAATATAATCTTTAATTTCTTCAGGTGATTTGCTTGCAGAAATTAATTCTGCCGTAGTTGAAACATCGATTCCATAAAAACTTGGGAACATAAATTCCGGTGATGCTATACGCACATGCACTTTATTTGCACCAGAATCTTTTAATATTTTCACAATGCGTCTAATTGTCGTACCGCGAACAATGGAATCATCAACAAGAATGATATTTTTCCCATCTACTATATCTTTTACCGCAGATAACTTCACTCTCACACCTTGCTCACGTAATTCTTGAGTTGGTTGAATAAATGTTCTTGCAACATATTGATTTTTAACTAGTCCCATTTCATATGGCAAACCTATTTCTTCAGCATAACCACTCGCAGCTGATAGCGATGAATTGGGTACACCGATGACCATATCAGCATTTACAGGGCTTTCTTGGGCTAATTTTTTACCAGAAGCTTTACGTACTGCATGGACATTTTTACCAGCTATTGTTGAATCTGGTCTAGCAAAATAAATATATTCCATCGCAGAAATTGCAGTTGTCGTATGATGTGTATAAGATTTAACTGTAATACCTTTATCGTTAATCACGACATATTCACCTGCATGAATATCTTGAACAAATTCTGCACCTAACACATCTATTGCACATGTTTCACTTGCAAGGATGTATGTACCATCTTTCATTTTACCTACAACAAGAGGTCTGATAGCATTTGGATCTACTGCGCCATATAACGCATCTTTAGTTAAAATCGCAAATGTAAAACCGCCTTTAACTTTTCGCAAACTTTCTTTCAACGCTTCCTCAAAAGTAGGAGCTTTACTTCGACGTATCAAATGCATAATGACTTCAGTATCAGAAGACGAATGGAAGATAGCACCTTGTTTTTCTAAATTCTGACGCAATGATTTAGCATTAATGAGGTTACCATTATGACAAATACCTACACTCATATCATAAAAGTGATACAGAAACGGTTGAATATTTTCAATACCTTTATTACCTGAAGTAGCATAACGGACGTGACCAATTGCATGTTGATATCCTTTTAATCGTTCCATTTGGTCATCTTTAATCGCTTCAGTTAGTAAGCCTAATCCTCGCTCGCCTTTTAATTCATTTTGATTAGAAACAACTATACCTGCACCTTCTTGACCACGATGTTGCAAACTATGAAGTCCCATATATGTTAGTTGCGCTGCTTCAGGATGATTCCAAATACCAAACACGCCACATTCTTCGTTTAATCCTGAGTAGTTAAACATTGAGCAATTGCCCCTTCCCATATTTGTTTAATATCTGAAACATTTTCACTAATCTCTGTATATGGTGTTGTTACTTTGAAATTATCACTATCTGTTAAAAGTCCAATTTCTATTGCATTATCAATATTTAAAGTTTTACCTGATTTAACAGAAACAACATATCGGCCTTGTGTCTCACTAAACAATTGTGCATTTGTTATATCTATTGAAGACTTTAATCCTAAACCGTAATGCGCACTTAGTTTAGCTAAGGTAATCAGTAAGCCACCTTTACCAACCGTTTGAACATGTGATAATACCCCTTCACGAATAGCAGTCTTGATTGATTCACCTTTTTCAACTTCTGAACTCAAATCTAATGACTCAAATTCATGATTAACTTTGCCATAAATTAACTTTTCAAGTTGACTACCACCAAAGTCGTCCTTAGTATCACCGATTAAATATAATTTATCTCCAACTTGAGGTTCAAAATCATTTAAATAATTTACATTTTCAATTAAACCTACCATTCCAACAACTGGTGTTGGGAAAATAGAAGTACCTTTCGTTTCGTTATATAAAGATACATTACCAGAAACTACTGGTGTCTTAAGAATGTCGCATGCTTCTGCCATACCTTTCGTTGAATCTATCAACTGTTGATAGATTTCTTTCTTTTCAGGAGAACCATAATTTAAACAATCTGTCATTGCTAATGGTGTTGCACCCACGGCAATTAAATTTCGATAAGCTTCAGCTACTACCATCTTTCCACCTTCATATGGATTGTTATATACATAACGCGCTTCACCATCAATTGTTGAAGCAATTGCCTTATTTGTGCCTTCCACACGTACTACCGATGCTTGAAGTCCTGGCTTAATTATCGTATTGGCACCAACTTGTTGGTCGTATTGATCATATAAATAGTGTTTAGATGCTATAGTCGGATGTTTAAGTAATTTAAAGAAAGTATCTTTAACATCGATGTGTGTATAATCATTTTTAGAAGTATTATAATTTTTTTCTTCTCCTTCTAAAATATATACAGGTGCTTCATCAGCTAGTGGTTCAACTGGAATGTCAGCATAAACTTCGTCATCATATGTTAAAACAAAACGATTTGTATCTGTAACTTCACCTATAACAGCACTATCCAATTCGTGCTTATCAAATAAATCTAAGAATTTTTGTTCAGTACCTTTTTCAACAACTAGTAACATACGTTCTTGAGTTTCTGAAAGCATCATTTCATAAGGAGAAATACCTGGCTCACGTGTTGGCACTTGTTCTAATCTCAAATGTAAACCACTACCACCTTTTGCCGCCATTTCAGAAGATGAAGATGTTAAACCAGCAGCACCCATATCTTGAATACCAACTAATTCATCAAATGTAATTGCTTCAAGTGTTGCTTCCATTAATTTTTTACCTACAAATGGATCACCGATTTGTACAGAAGGTCGTTTACTTTCGCTTTCTTCCGTCAATTCTTCAGATGCAAAAGTAGCACCATGAATACCATCTCGACCAGTTTTCAAACCAACATAAATGACCGAATTACCTACACCTTTTGCTGTGCCTTTTTGAATCATGTCGTGATTGATAACACCAACACACATTGCATTAACAAGTGGATTGCCATCATAACGTTCATCAAATTCGATTTCACCGGCAGTTGTTGGAATACCAATGCAGTTACCATAACCTCCGATACCCTTTACAACCCCTTTAAGTAATCTTTGGTTTTGTTTATTATCTAATTCTCCAAATCTAAGACTGTTTAACAAATTAATAGGTCTAGCCCCAATAGAGACAATGTCACGAATGATTCCGCCAACGCCTGTAGCAGCCCCTTGATATGGTTCAATTGCTGATGGATGATTGTGAGACTCTACTTTAAATACTACGGCTTGATTATCACCTATATCGACTACCCCTGCACCTTCACCTGGCCCCATAAGCACATGCTCACCTGACGTAGGAAATTGCTTTAAAAACGGTTTAGAATGTTTATAAGAGCAATGTTCACTCCACATAACAGAAAAGATACCTGTTTCTGTAAAGTTAGGTTGTCTGCCTAAAATATCGCAAACTTTTTCATATTCTTGATCACTTAATCCCATATCTTGATATACTTTTTCAAGTTTAATTTCTTCAACGCTTGGTTCGATAAATTTAGACATGTTGTTCCCTCCAACTTTTTACCATCGCTTCAAATAATTTCACACCACTATCAGTACCTAACAACGTTTCTAAAGCTCTTTCAGGATGTGGCATCATGCCACATACATTGCCTTTTTCGTTAACAATTCCTGCAATATCATCATATGAACCGTTCGGATTATTCACATATTTCAGAATAATTTGATTGTTAGCTTTTAATTGTTGATATATTTCATCAGTACAATAATAATGACCTTCGCCGTGAGCTACAGGATATATAACTTTTTCACCTTGTTCATAAAGATTTGTAAATGCTGTTTGATTATTCACTATTTCTAACTCTTCATTTCTACTAATAAATAAATGTGAATCGTTATGCAATAATGCACCAGGTAATAAACCTATTTCAGTTAAAATTTGAAATCCATTACAAACACCTAATACTGGCTTACCTTCAGCTGCAAGACGTTTAACTTCAGAAATAATCGGCGCTACACTAGCCATTGCCCCAGATCTTAAGTAATCCCCGAATGAAAATCCACCAGGAATAAGTACGCCATCAAATCCACTTAGTGATGTTTCTCTATAATCTACATATTCCGCTTCAACACCACTTTTAATAGCAGCATTAAACATGTCTCTATCACAATTCGAACCTGGAAAAACAAGAACCGCAAATTTCATTTTATGCATTCTCCTTTTCATCATCTAACACTTTATAGCTATATTCTTCAATCACTGTATTTGCAAACAATTTTTCACTTAGAGTTGTAATAATGTTGTGTACCTTTTCATCACTAACCTCATCCACTGTCATATATAATACTTTTCCTACACGAATATCATTCACTTGTGCATAACCTAAATCATGTACAGCTCGAGTAAGCGTTTGTCCTTGCGTATCTAATACTTGTGGTTGTAATGTGATATGTAGTTCAATTGTTTTCATTATTTTAAATCCTCCAATTTGTTTAAAAATATTTGATATGTTTCAATCAGTGATCCAGTGTTATTTCTATATACATCTTTATCAAAGTTTGCACTGGTAGCTTTATCCCAAATTCGACATGTATCTGGAGATATTTCATCCGCTAACAAAATTTGACCAGTCTCAGTCTTTCCAAATTCGATTTTAAAATCTACTAATTTTAAATTCATAGCATCCATTAAATTTTTTAATACTTGATTAATTTCTAGCGCTTTCGTTTTTAATGTTTCAATATCTTTATCTGTCGCAATATTCAGTAATTTGATGTGATCATCTGTAATCAACGGATCATTTAATGCATCATTTTTATAGAAAAATTCCACAAGTGGTTCTCTAAAAACTTCACCATTTTCAAAACCTAAACGCTTTGTAATAGATCCACTAGCAATATTACGAACAACTACTTCTAATGGAATTATTTTCACAGGCTTAACTAATTGTTCTGTTTCAGATAATTGCTTAATAAAGTGACTTTCTATTCCATTTTCTTGTAAATATTTAAATATAATAGAAGTAATTTGATTATTTAATCGCCCCTTACCTGCCATCGTGTCTTTCTTAGCCCCGTTTCCAGCAGTAACTTCATCTTTATATTCAACTCTTAATTCATTTTCTTGATTTGTTGAGAAAATGCGCTTCGCTTTTCCTTCATATAATAATGTCATGCTTTAATTACTCCCCTCAAATTTAGCGTACATATCTTGTTCAGTTTGGTTAACATCATTCGTTAGTACAGTCATATGCCCCATTTTTCTGCTATCTTTACGCTCAGACTTACCATAAATATGTAAGTGCCACTCTGGATGTTCATTAAATTCATTTTCCAATAAATCTAAGTCTTTACCTAGTAAGTTCATCATGACTGCAGGCTTTAATAATTCAATTGAATTTGGTAATGATTGTCCGGTAACTGCTAAAATATGAGTATCAAATTGTGAATAATCACATGCTTCAATTGAATAATGTCCGGAATTGTGAGGCCTTGGTGCAATCTCGTTCACATACAATTGGTTGTTACTATCTATAAAAAATTCAACTGTAAATGTTCCAATGAAATGAATCGATTGGATAATTTTATTAACTTGCTCTTTCGCCTCAGCTGTTTTATCTATTCTCGCTGGAACAATTGTTTTGAAAAGTATTTGATTTCTATGCTCATTTTCTTGTAATGGGAAATAAGTGATTTGATTGTTGTTTCCTCTTGTAACAGTAAGTGATACTTCTTTCTTGATATTCAAATATTTTTCAGCTACGCATTCACAAGTTTCAATTAATTTAAAACCTTCTTGTAAGTCTTTTTCGTTGTTAATTAAAACTTGACCTTTGCCATCGTAGCCACCAAATCTAGTTTTTACAATAAAAGGATATCCTAATGTTTCAATTGCTTTGTCAATATCTGTAGATTCTTTTACTGAAATGAATGGGACAACCTTGGTACCAGCACTTTTTAATGTTTCTTTTTCAGTTAAGCGGTCTTGTAATAACTGTATAGCTTGGTAACCTTGCGGAATATTGTACTTTTCACATAATAGTTTTAATTGTTGGGATGAAATGTTTTCAAATTCATAAGTAATCACATCACATTTTTGTCCTAATTGATTGAGTGCCTTTTCATCGTCATACTTGGCTTGTATAAATTCGTGTGCAACGTATCTACATGGACAATCTTCAGCAGGATCCAATACAGCCACTTTATAACCCATTTTTTGAGCTGATTGTGCCATCATCTTTCCAAGCTGACCACCACCAATAATGCCAATAGTCGCACCAAACTTTAATTTATTGAAGTTCATTTTGCATGTCCTCCACTTTTTGAATTAACGAAGATTCATACTGATTTAGTTTTTCAACTAAAGAAGGATTTTGAATACTTAACATTCTTGCTGCAAGTATACCTGCGTTTTTAGCACCTGCTGCACCAATTGCAGTCGTTGCAACCGGAATACCTCCTGGCATTTGAACAATTGATAATAAAGAATCTATACCCTTTAAACTTTTTGTTTCAATCGGCACTCCAATAACTGGTAGCGTCGTTAATGATGCAACCATACCTGGTAAATGTGCCGCACCGCCAGCGCCTGCAATGATAATGTCTATACCTCTTTCTCTCGCTTCAGAAGCAAATTGAACCATCATTTTTGGCGTACGATGTGCGGATACTACTTGTTTTTCGTACGGAATTTCAAAATAATCCAACATGTTACAACTCTCTTGCATAATTTTCCAATCGGAAGAACTGCCCATAATGACTGCTACTTTCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP030323|2233092:2241565|2239971_2241096_-|WP_001010401.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVAVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISSQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETCECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITYFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_CP030323|2233092:2241565|2233661_2234690_-|WP_000030818.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLTLKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGDIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP030323|2233092:2241565|2239263_2239968_-|WP_000174047.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHIKLLNIATDKDIETLKTKALEINQVLKNLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATSANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_CP030323|2233092:2241565|2238327_2238999_-|WP_000666799.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP030323|2233092:2241565|2234682_2236167_-|WP_000483726.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSNQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKILKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_CP030323|2233092:2241565|2233092_2233659_-|WP_000238670.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP030323|2233092:2241565|2241082_2241565_-|WP_000861570.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGIDIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >NZ_CP030323|2233092:2241565|2236145_2238335_-|WP_000032747.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGVLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP030323|2233092:2241565|2239000_2239264_-|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2261474 : 2279668
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP030323|2261474:2279668|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP030323|2261474:2279668|2266525_2267737_-|WP_001804449.1|DBSCAN-SWA MRLNDNRTSYFGYKAIQLFKNNSKNKQSIFKDWEKLKHNITFIHPQSEKHHLRVVGGFQFSSHKSDDEWREFGLNHFVLPEVLISTDNNGTFLTYTVKRESFTVEALNDLMDLFNNISDIDVDEQIGEITRNEDIYKDDWRQLVVEAIESINNEEKIVLARRRLIKFDKDISIPYILKQAYSKEKNSYIFLLESQDSIFFSQTPEQLIKVNNKILSTKAVAGTIKRSQDEDEDTKNVEAFLKDNKNLIEHRFVVDSILHDIKPYITELHYDKTPKILKNDHLYHLYTEIKAPLKDDSYISLIDNLHPTPALGGYPKEFAMDFIEQKEFGTRGLYGAPVGYIDIYDDCEFIVAIRSMLIKKAQATLFAGCGIVKDSDPDSELAETNLKFTPMMNALGVDMNGKS >NZ_CP030323|2261474:2279668|2270052_2270184_+|WP_020978112.1|DBSCAN-SWA MRYVTMRQFIKRIVKTILVGYVIKFIRNKLSGKSSHPTDNKHN >NZ_CP030323|2261474:2279668|2267840_2267918_-|WP_072357920.1|DBSCAN-SWA MKKDEERSEMDGYGRIRGRYCQRDI >NZ_CP030323|2261474:2279668|2269057_2269609_-|WP_000620942.1|DBSCAN-SWA MIRQARPEDRFDIAKLVYMVWDDMELELVKHLPKDIVLDAIEKSCVDATYRTFYQHILVYEVENKVAGCIISYSGENELKYEKAWELLDLPEEIKQYGTPLPVKEAKDDEYYIETIATFEAYRGRGIATKLLTSLLESNTHVKWSLNCDINNEAALKLYKKVGFISDGQIELYKHMYHHLIVK 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MNSSCKSRVFNIISIIMVSMLILSLGAFANSNKAKADSHSKQLEINVKSDKVPQKVKDLAQQQFAGYAKALDKQSNAKTGKYELGEAFKIYKFNGEEDNSYYYPVIKDGKIVYTLTLSPKNKDDLNKSKEDMNYSVKISNFIAKDLDQIKDKNSNITVLTDEKGFYFEEDGKVRLVKATPLPGNVKEKESAKTVSAKLKQELKNTVTPTKVEENEAIQEDQVQYENTLKNFKIREQQFDNSWCAGFSMAALLNATKNTDTYNAHDIMRTLYPEVSEQDLPNCATFPNQMIEYGKSQGRDIHYQEGVPSYEQVDQLTKDNVGIMILAQSVSQNPNDPHLGHALAVVGNAKINDQEKLIYWNPWDTELSIQDADSSLLHLSFNRDYNWYGSMIGY >NZ_CP030323|2261474:2279668|2275746_2276013_-|WP_029656376.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MYGAILYLSLALGLSTAAFASTEYAEGGTWSHGVGSKYVWSYYYHGHKGHGATASGKYRSFSGYTRAGVKASTTKHNWWVNRAYYNIY |
22 | Enterococcus_phage(33.33%) | transposase,holin,bacteriocin,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2407865 : 2429368
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP030323|2407865:2429368|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP030323|2407865:2429368|2423883_2424612_+|WP_001033316.1|DBSCAN-SWA MNKIFRILTVSLFFFTFLIKNNLAYADVGVINLRNFYANYEPEKLQGVSSGNFSTSHQLEYIDGKYTLYSQFHNEYEAKRLKDHKVDIFGISYSGLCNTKYMYGGITLANQNLDKPRNIPINLWVNGKQNTISTDKVSTQKKEVTAQEIDIKLRKYLQNEYNIYGFNKTKKGQEYGYQSKFNSGFNKGKITFHLNNEPSFTYDLFYTGTGQAESFLKIYDDNKTIDTENFHLDVEISYEKTE >NZ_CP030323|2407865:2429368|2423382_2423814_+|WP_001228759.1|DBSCAN-SWA MRKLLGLALASTLILGACGSNDGDKKEESKSYTTNDIVKGFKDNKLNVINEKEMTREDFGLAPMKTDEAKMFVVQDDKNARVMKFKNSDDLKQTKKYYDELGKESAAFYSHTHSKGKFLIQMNGDIDDATFNKYKNSMDKTLK >NZ_CP030323|2407865:2429368|2420226_2421096_-|WP_001002732.1|DBSCAN-SWA MNEIKLKYDTQVSVVHYESLDSRSFKSFSMPKWSKLVNKLSVPIEANYKYARGVAVYGDIKDNTNDHGEIIKKHRNDKNVIYRNVIVLDYDEINDVKQLHDAISSVLSSVAWYWHTSFSHTTEQARIRLYIPLNERISADDYRKYTKVLANKIGHKVDEGSYQPSRCFALPVIQKGHIFIKRVNDCPIMDVDMLEQWSKEYKQSNGSPNIKGYTRRDSAYWRDIAFGVSEGERNSTLASITGYLLRRYVDPNLVYGLVSAWASVCKPPINQSEVNNTFKSILKKDSKNS >NZ_CP030323|2407865:2429368|2424635_2425364_+|WP_000733774.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP030323|2407865:2429368|2408955_2409807_+|WP_001183851.1|DBSCAN-SWA MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYNQFIASISGIFSRRFWPSFTFLIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIVPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNGDKHAGETLTLSTGLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEVVKLNFAGLPILLAVGFGVLAGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWFVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE >NZ_CP030323|2407865:2429368|2415484_2415703_-|WP_000448773.1|DBSCAN-SWA METKYELNNTKKVANAFGLNEEDTNLLINAVDLDIKNNMQEISSELQQSEQSKQKQLGTTLQNLAKQNRIIK >NZ_CP030323|2407865:2429368|2411359_2411560_-|WP_000382163.1|DBSCAN-SWA MDVDNMSDYKLKIIELIKSDITGYQIHKQTGVAQYVISQLRQGKREVDNLTLNTTEKLYSYARQVL |
33 | Staphylococcus_phage(77.78%) | coat,integrase,terminase | attL 2410377:2410398|attR 2431041:2431062 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2511938 : 2536024
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP030323|2511938:2536024|DBSCAN-SWA ATCAATCCTTGAAGTATAAACAAATCCTTTGATTTCTTATATGTTCAATTTGAATATCCATGTCATATAAATCACTTAAAACACTGCTTTGAATGACATTGTCTTTCAAATCAGATTTAACTAGTTGTCCGTTTTTCAATGCTACAATCTGATCTGAATAACAGGACGCAAAGTTAATATCATGTAATACAATGACAATCGCTTTATTCATTTTATGTGCTAACATTTTTAACGTTTGCATAATTTGAACAGCATGCTTCATATCTAAATTATTTAATGGTTCATCTAGCAAAATATATTCAGTATCTTGTGCTATTGTCATTGCAATGTATGCACGCTGACGTTGCCCACCAGATAATGACTTAATATTACGATTTCTGATATCTTGTAGTTGCAACAAATCTAGCGCATCATTGACAATATCATGATCCTCTTTCGTCAAACGACCTTTAGAATAAGGGAATCGTCCAAAGTTTACCAACTGCTCTACCGTAATATTCATTTCTGTATGGTTTGTTTGTTTTAATATAGATATTTTTTTCGACAAGTCATTATTTTTATAATCAGACATGAGCTGTCCATCTATTTTCACTTCACCGTTATCAAAACGAATTAACCTACATATCGCTGAAAGTAACGTACTCTTACCCGCACCATTAGGTCCAATTAAAGAAGTCAATTTACCTTTTTCGATATCTATGCTAATATCTTCCAATATCGTTTGATTATTTATAGTTTTAGTTAAATTTCCAACTTGAATCATTGCGCATTTCTCCTTCTAACTAATAGATAAATGAAATAACTTCCACCAATCAAATCAATAAGTATACTCATTTCTGTCGTAGCTTCAAACACATTTTCAACTACCCATTGCGCACTAAATAAACTAATCCAACTCAAGCAAATTGTCGCAATTAAAATATACTTATGTTCATACGTCTTCATTAGTTCATGCGCTAGATTTACAGTTAATAAACCTAAAAATGTAATTGGTCCTACTAATGCAGTTGACACAGAAACTAAAACTGAGACTATTACAAGTAGAATTCGCGTTAATTTTTCATACGATATCCCAAGATTAATTGCTTCAGCACGACCTAAAAGCAATACATCTAAATAAGGCAATAGAAAAATTGTAATGACTAATAAGATTACTAATAGCACTGCTGAGAAAGTAACTAAATTCGAATTAGAAGCATTAAAATTTGCAAACATACTACTTTGTATTGCTAAAAATGACTCAGGATCCATAATCAATTGAATAAAACCTGTAATACTTCTAAAAAATGTTCCTAAAAGGACACCAATAAGTAAGATAAAATAAATTGAAAAATGTCCAATTTTAAAGATACCTTGGAATAGGATTAGTGCGAATAACACCATCGTTATAAGTGTTATTATAAAGTTCAAATATACATTAGTAACCCATACCGATTGAATTCCAAATAAAAAGACTGGCAATACTTTGATAAATAAATAAACTGCATCTAAGCCCATTATTGATGGTGTCAATAGACGGTTGTTTGTAATCGCTTGAAAAATCACCACTGAAGTTGCAATGGCAGCACCTACTAAAATAATTAATATGAACTTTCTTAAACGACTTGAAAATTGATATTCAAATATTTCAAAATCAATACCTACAAATAAGTACAGCATACTAATTAATAACGTTACTGCAATTAAAAGCATTATTTTTTTATTATTGTTGCGCATAATTTTTCCTACCTTTCATAAGCAAGATAAGGAAAATGATTGTTCCAAATACACCTATTGTTAAACCAATATTTATTTCATATGGATAAACAACAATTCTGCCAACTATATCAGAAAATAATACAAAGATGGCACCTAACATCATCGTATGAGGGATAGCATTTTTCAAATGATCACCTCGATAAATTGAAATAATATTTGGTATTACTAGTCCTAAGAACGGTAATGTTCCAACAGTCACTACTACTAATGCTGTAATAGTTGCAGTAATAAACAATGCGATGTTAATTAATTTTTCGTAACTCAAACCTAAATTATTAGTAAAGTCTTTACCCATTCCTACAATCGTGAAATGATTAGCAAAAAGATATGTCAATGCTAAAAGAGGAATACTTAAATATAAAATTTCATAGCGTCCACTTGTGATAATGGCAAAGTTCCCGTTAAGCCAGTTACCAATGCTTTGAACAGCATTCGTGCGCAATGAGATGAAGGTTGTGAAACTTGCAACAATCCCCCCCATCATAATTCCTAAAAGCGGCACAAAAATGACATCTTTCACTTTTATAAAATCAATGATTTTAACAAATAAAAACGTACCGCAAATACTGCAAATAACAGCAAATACTAGTTTTAATAAAATATGACCGGTTGGAAAGAACAATAAAGCAATTAAAATACCTAGTTTAGCCCATTCCATCGTTCCAGCTGTAGTCGGACTAACAAACTTATTTTGCATCATTTGTTGCATTATCAAGCCTGCTAAAGCCAACGAACTTCCAGCAATTAAAATACTCATCGTCCTTGGTATTCGGCTTGAGAATAAAATATTCCGCTGTGACTCAGTTAAATGTAGTAAATCTTTAATTGATAGTTCACTCACACCTATAAACAACGAAATAATTGTCAACAATATTAGTAATAGAAGCAAAATATTTCCCTTTAATAAATACTTCATTACAAATTTTTCTCCCTTTAAATTAATGATAACCATTATCATTGATAATATTTCTCATTAATAGTAGCGTTTTTTGACCATAATTTCAATAGCCTTTCAAATAATTTAGTGTCAATTTTATTGATATTTGCAATTAAACTGAAATTTAATTTTTCAGAATGTGTATTTTGTTTACTTAAAGTAAAATAGAACACTTAAGATTTTGATATCTGGGAATAGAGGAAATGATGTAAACTACTAATGATTGATTATGTAGTGATTCTTAACATTAGCCTCAGCTAATGTGTACTTAAAAAGGAATACATGAGTGGAAATGATAATTTCTAAAGAAAAAGTTTTTCTTTATGTTGAGACCCACACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAATTTCATTTCGAAATTCTCAGTGTTGGGGCCCCACCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACGTTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTACTGCCAATATAAATAACATTGTATATCTTAGAACATTGATTTCTGACTCAGTCTCATAATGATTTAAATACACATAAAAAAAGACCTTCAACATGTAGGAGTCAAGACGAAACGAATCGCTATTTCCCTTTACATGTGAAGGTCTTTTAATTTAATTGTTATTTGTTGTCAAATACAAAGTCATCATCTTGTAATGCTTCTACGTTTAATGCTAATACATAACCATCACCTTTTACTGAGAAGAAGTCATGGTTTTTAGTTGTTGTATCTAAGGCATTCTCAATGATTGGGTTAAATTCACTTTCCTCAAAATAAGGTTCAAAGCCTAAGTTTGAAAGTGCTTTGTTTCCATTATATTTAACATAGTTTAGCACATCTTCAGTGATTCCAAGATCATCGTATAACATTTTTGTGTATGACTCTTCATTTAAATACAAGTCATTTAGCAATTTATACATTTCTTGGTCTGCTTTTTGTTTCTCACTTTCAGATAGTTCATTTCGTAAATGCTGTGCATCTAAACCGGTAAATACACCATGAATAGATTCATCTAAAAGAATTTTACGAATGATTTCACCTGATGTCGTCATTTTTCCTTGACCAGCTAGATATAGTGGATAATAGAAACCTGAGAAGAATAAGAATGTTTCTAAAAATACACTCGTAACTCTGGCCATATATTGGTCGTATATCGAAGCTTCTTTACCCCAAAGTTTGTGATAATTAGCAACAATTTTATCAGATTTATATTTTAAATGAGGTTCCTCTAAAACCCATTCATCTAATAAGTAGTTTGTTTCACTAGATGGTAATAGTGTTGTGAAAATATGTGAATAGCTTTTCGCGTGTATTTGCTCCATCATCGCCATAAATGAATAAACTGCTTTTTTCCTTAAGTCAGTCGTATGTAGCATAACTAAAGGCATACCATCATCTGCTTGATGTGTATCTAAGCCTGTTAAACCAGCTAATGCTTTTTTAAATGTGTCTTGTTCAGCTTCAGATAAAGTCTTCCAACTTGCAATGTCTTTTGATACTTTAAATTCTGTTTCAACCCACATTTGAGATATATTTTGTCTCCAAAACATATTCGTCATATCTTCTTGTGTGTTCCAATTAACAGCTATCATGAATATAATTTCCTCCTGTAATGTTACTCAATAATTGACAAATACAGACATAGCAGTCTAATCATCTGCTAATTCAGACCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAATTTATTTCTAGTATAGTAAAGAGATTTTAATCCTTTATAGTGCGCATATACATATAATCTTGCTAACTCACGTGTAGAAATTTCAGAATTAACATAAAGTATCGTTGAGATACCTTGGTCAATATGCGTTTGAATTGTCGCTATTAAATCGATTAATTTCATCTGATCAGTATTGAATGCTGATTTGTAGTACCACATTGTTTGTGGTGATAAGAATGGCATAGGGTAAAATGTTTCCGCATTACCATAAGTACGACGTTCAATTTGGTCAACGATTGGCATTACAGAGCTTGTTGCATTTTGAACATAAGAAATACTTTGTGTTGGAGCAATTGCTAATCTATATGCATGATATAAACCATATTGTTCAACATCTTGTTGTAGTTTCTTCCAATCCTCAGAAGTAGGAATAGCCATACCGTCGAATAATTCACGTACTTTTTCGAATTGAGGTTCAAATTCTTGAGTTGTATAGAACTCGAAATATTTGCCATTAGCATAATCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP030323|2511938:2536024|2523163_2524081_+|WP_000429011.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILSANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP030323|2511938:2536024|2515304_2516276_-|WP_000562499.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEESEFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_CP030323|2511938:2536024|2516393_2518499_-|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA 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20 | uncultured_Caudovirales_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_10 |
2539172 : 2546992
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP030323|2539172:2546992|DBSCAN-SWA ATTATAACATCTCCAAAATCTTGGTTTTTGCGTAAAATTCATTTACTTCATCTTTTGGCTTAGAATCAATTGTAATACCTGCTCCGACTCCATAAATCGCTTGTCCATATTTATACTCAATAGTACGAATCGGAATATTAAAAATCATTTTATCATCTTCAGTTGGAAGTAATAGTCCAATTGCTCCGCAGTATATACCACGAGGTGAACTTTCTAATTGTTTAATATATTTCATTGTATTCAGTTTCGGTGCACCTGTAATCGAACCACAAGGAAATAACGATGTTAAAATTTGAGTTAAGTCTGTATTAGTTTTTAAAGTTCCACTCACCATCGAAGTCATTTGAAATACAGTTTTATATGCCTCAATGAAAAATAGTTTATATACCTTAATTGAGCCACTCTGTGATATTCTCCCTATATCGTTTCTTAGTAAATCAACAATCATGACATTTTCTGCACGATCTTTCGAAGAAGTTTGCAATGTTTTATAATACTGTTGATCTTCAGCTTCCGTTTTACCTCTAGGCATTGTCCCTTTCATCGGTTTGCTTATGATAACGTTATCGACATTGTTAAACTGTCCTTTTTGAAAAAATAATTCTGGTGAGATAGACGCTACTTGGATTTCATCTGTTTGTAATAACGCAGTATAATTACCATTACTAAATTGAGTTAATCGTTCATATAAAGTACTAATAGGATAATAAATGTTATCCGTTAAGCGCGCCGTATAGTTCACTTGATACGTTTCCCCTTCAACAATTGCTTGTTGGACACGTTTAATATTAGTCATCATAACCTCAGAAGATTCAACAAATGAAAAATGATGCTTTGATACATAAGAAGTTTGATGTTCATATGTTGAATTTATGCTTTCCGCTTTTTCAAAACTATAAGCTACTGCATAAATATCATCTTTAGCTAATGAATGTGTACACATAACATGATTAAAATACTTTGCCGCTTCGTAACTTAAATATAACGAGACATATCTACCTTGTCGTTGCTGCGCTTGTGCAAAGTGTATCACTTCTCCCACATCAGCCAACTTAGTGGCAACATACTTCTTTATAAATCCCTTTAATTGAATATGGTATTGCTTATATTCATTTTCAGTTAAATAGTAGCGATAATTATATTCTATTCTCACAGTAATCACCTACCTTCGATAAAAATAATTCAACTTGTCGATAACCGTATTCACTCAAAATAGATTCAGGATGATATTGCACACCAAAAACCGGAAATGTAATATGCTCAAATGCCATAATAATCGCTTCATCGTTTTTTGCTGTAATCTTTAAGCAATTTGGAAAAGTCGCTCCGTCAGCAATTAATGAATGATAACGCATTACATTGAAATTTTGAGGCAGTCCTTGAAAAATACCTTCATTGGTATGACGTAACTGTGTAGTATGTCCGTGTACAGGATGATAGCCGTGAATGATATTTCCACCAAAATAAGACACGATACATTGAAATCCTAAACATACACCTAGGATAGGTACACGCTGATAAAATTGTTCTAACACTTCATTCAAGATAGGATAATCATCCGGATTACCCGGCCCAGGTGAAATAACAATTGCTTTTGGCTTCATATTAATGATGTCTTCTATCAGCAGATTATCAATACCAACAACTTGAACTGTTAGTTTCGTTTGAGTCTTAATATAGTCTATTAAATTATATGTAAATGAATCATTATTATCTATGACTAGAATCATTGTATACTCCGTTCTAAATGTGTTTTATTTTTATAATATGTATTGGATGTAGCTAAAACTTTAAAAGCATTGTCATTATCCTGACCTTGATTTTAACTAATATATGGTATATTCTATTCATCGTACATAAATGAATATCAGAGGTTCCTAGCTGAAACCCTCTATAAAAAACTAGACATTGAAATTTCAAACATTCCTTGGTAAACCTTTAATATATATTATAGGAGCAACCCATTTCTTTCGTCTATCTTTTATGGAGATAGGCTTTTTTTATTTTATAAATTAAAAACGGGCTTATCAATGCCATTAACCTCTTTATTAATATTATTAATGATAGGAGCAATTACAAAATGGAAAGTGTATTAAATAATGAAAAAGCCATCGTTGTCTTTAGTGGTGGTCAAGACAGTACAACATGTCTCTTTTATGCAAAAAAACATTTCAAAGAAGTTGAACTCGTAACGTTTAATTATGGCCAAAGACATGATACTGAAATTGAAGTCGCAAAACAAATTGCACAAGATCAAGGAATGAAACATCACGTTTTAGATATGTCATTATTATCACAACTTACTCCAAACGCATTAACACAACATGATATGGAAATTACTAATAATGAAGATGGTATACCTAATACATTTGTTCCAGCTAGAAATTTACTTTTCTTGTCGTTTGCAGGCGCTCTAGCTTATCAAATTGGGGCTAAGCATATTATTACAGGCGTATGTGAAACAGACTTTTCAGGCTACCCAGACTGTCGCGATAGTTTTATAAAATCAATGAACGTAACATTAAGCCTAGCTATGGACAAAGATTTTGTTATTCATACTCCTTTAATGTGGTTAAACAAAGCAGAAACGTGGAAATTAAGTGATGAACTCGAAGTTTTAGATTATATTCGTACAAAAACATTAACATGCTATAACGGTATCATCGGGGATGGCTGTGGTGAATGTCCAGCTTGTCATTTACGTCAACGTGGACTAAATCAATATCTTGAAAGTAAAGGAGCGCTTTAAAATGTTACAACAAATCTATCCTAGTACAACGCATCCATATCAATTCGAATTAAATAAAGATTTTAATTTTTCAGCTGCACATCACATTCCGTGTGAAGAAGCAGGTATTTGTCAAAATGTCCATGGTCATACTTACTTTGTTAATTTAACAATTGTCGGTGATAAACTAGATGACACTGGCTTTTTAGTGAACTTTAGCCATTTGAAAAAGATGATACACGGTAAATTTGACCATCAACTGTTAAATAACTTACCTGCTTTTAAAAACAAAATCCCTTCAACTGAAATCGTAGCGGAAACAATTTATCAAATTGTTAAAGAAAATTTGGCATCGCTCGAACACCAACCAAAATGTATTCAAGTATTTGTAAGAGAAACACCAACAAGTTATGTCGTATTTAGACCAAAGGAACAGGTGTAACTAATGGCTAAAATTCCTGTACTCGAAATATTCGGTCCAACCATTCAGGGTGAAGGTCGAGTAATCGGTAGAAAAACGATGTTTGTGAGAACAGCTGGATGTGATTATCGCTGTAGCTGGTGTGATTCTGCATTTACTTGGGATGGTAGTGCTAAAAGCGATATAAAACTCATGACTGCTGAAGAAATTTATGATGAATTAAAACGAATTGGTGGCGATTTATTTAACCACGTTACAATTTCTGGTGGTAACCCAGCATTAATTAAAGGTATCCAAGAGTTAGTTGACTTATTTCAAGATAAAGGTATTTTCAGCGCACTGGAGACACAAGGCAGTAAATTCCAACCTTGGATGACACAAATTGATGATTTAACGATTAGTCCAAAACCACCAAGTTCAACTATGACACCTGATTTAAAAAAGTTAGATGAAGTGATTGCACAATGCGTACCTTCCTCATTAAACTTAAAAGTAGTTGTATTCGACGATAAAGATTATGATTTTGCCAAAATGATACACCACCGTTATCCAGATATTCCGTTCTATTTACAAGTTGGTAACCCATATTTATCAGACAGCGTAGATAATCATACCGAAAAGTTGTTAGAACGCTACGAGCAGTTGGTAGATTTAGTTATGCAAAGTAATGATATGAATCACGTTTATGTGTTACCACAACTTCATACATTACTTTGGAGTAATAAAAAAGGTGTATAAAGGATAACTTATTTTACTTTTTACAAGTCATATCTAATGAATAACAATATATAAATTGATATAATAGTTGATTGAAGTATAACGAACAGGAGTCCATCATGATTGTATATATATTAATTAATATTGCTATCGTCGTACTTATAACTGGATTCAATTTATATAGGCATCAAATGCAACATTTATCATTAAGTGCAATGTTGTTATCTATTACTATAAACGCCTTTATAAATACATTCATAATTGATAAATATAACTTTATTACTCTGTGTACTATAACGATGTTTATCATTTGGACGATACTACAGTTTTACATTGATAAAAAATTAAAACCTGTATACATTACAGACCAAAAATTTATTGCTATCATATTAACGATTGTTGTCAGTTTAACGCAACGTGTTACCGACTTTTCAAGTACACAATCAATATATATGTCTATTCCATTTTTAGCCCCTGCCATTTTTATCATTGGTGGTATTATGTTGTTTATTTCAACATTTAATAACTTAGATGAAACTGCTGAAAATAATAACAAAATAAAGAAACTAATGATTAAAGGACTTATCATTATTAACATTTCATTTATCGTTATGATGGTTTTAACACCATATTGGTACTTGTATTTAATCGTCTATCTTATTTTCTTGTTGTTTTTATTGTGGCAAAAGGTTTATAAATTTTAATACCAATACTATAAAACACTTCTGATATTCTTAGTTCGATATATCAGAAGTGTTTTATAGTGATAACTAGTTTAGATAAATATTTTCTTACTAAAAAAACCGCCCTCCTCTTATTTTGACTCCTATTTATTTAAATCAGACAATTATTTTCATTTTCAAATTATTCTTTCTTCAATATTAGTTAAGCGATATTTAAACGAAGTTAAGAATTAGTTAATGGCATATTATTTGCCTTCATTTTAAACTTAACTTATCAAATTGAAGAAATGAGGAGTTAGCATGAATACAAAATATTTTTTAGCAGCTGGTGCTGTTATCACAACATTAGCTTTAGGTGCTTGTGGTAATTCTAATTCACAAGATCAAGGTAACAAAACTGAACAAAAAACAAAGTCAGAAGATAGCAATGTTAAAACTGATAAAACAAAACACCTAACAGGTACATTCAGTTCTAAAAACGGTGAAACTGTTGAAGGTAAAGCTGAGATTAAAAATGGTAAATTAATGCTTACTAACTACAAATCATCAAAAGGTCCAGATTTATACGTCTATCTAACAAAAAATGGCGACATTAAAAACGGTAAAGAAATCGCAATGGTTGACTACGATAAAGAAAAACAAACATTTGATCTTAAAAATGTAGATTTAAGCAAATATGATGAAGTAACAATCTATTGTAAAAAAGCTCACGTCATCTTCGGCGGCGCTAAATTAAAATAATCAATTTCTGAGTTAAACTTTTATTTACAACATACTATTACTATACATTACAAATTTTAAAAATATACATTACACTCATTACTCAATGGAAAGCGTATGATTTCACAGCCCCCCTAGCTTGTAGAAATCATACTTTCCTTTTTTCAATATATATATAACTATTAAATCCCATAAGATTGTAGAGCACATAAGTAAATTTTTTTAGAGCTTGAGGTTTGTTTAGCTTAAGCAACCCATGAGCTCAAACACTTCCTGTTCACATAACACTACAAATCGCATTATGTTGCTTAATCTTATGTTTATATAAATTACACACAATAAATAGAAAGAATGTGAACATCATGAATAAATTATTGCTACTCGTTACATTTATCATTCGTGTGGGTTCAGGTATTGTTATGTTAATGCAAGGTTACGAAAAATTAACGGGCGGATTTACGCTGAAAGGTTTAGTACCAGTCATCGCTAACAATACTGATTCACCAGAGTGGTATAAGTGGTTTTTCGCAAATATAGTTGCACATACGACGTCATTATTTGATATTGTTGTCCCACTCGGAGAGATTGCAATTGGATTAGGTTTAATTTTTGGAGTTTTTGCATATGCTGCTAGTTTCTTTGGAGCCTTTGTTATGATAAATTATATCTTAGCAGATATGATATTTACGTATCCTCTTCAATTAACTTTCTTTATCCTTTTACTAATGAGTCACTCATTGTTAAAACAGATTTCACTTAAAGAAATCATTAATTACTTTAGAGGTCGTAAGAACAGAGGTGAAAAAATAGATGACCCACTTACTGATCGTGGATGATGAACAAGACATTGTAGACATTTGTCAAACCTATTTTGAATATGAAGGTTACAAAGTAACAACGACAACTAGCGGTAAAGAAGCAATTTCTTTACTATCAAATGATATTGATATCATGGTACTTGATATCATGATGCCAGAAGTTAATGGTTACGACATTGTCAAAGAAATGAAAAGGCAAAAATTAGATATCCCCTTTATCTATTTAACTGCCAAAACACAAGAACATGATACCATTTACGCCTTAACTTTAGGTGCAGATGACTATGTCAAAAAACCATTTAGTCCAAGGGAACTCGTTTTACGTATTAATAATTTACTTACAAGAATGAAGAAATACCATCATCAACCAGTTGAACAACTGTCGTTTGATGAATTAACACTTATTAACTTAAGTAAAGTTGTGACTGTAAATGGTCACGAAGTCCCTATGCGTATTAAGGAATTTGAGTTATTGTGGTATTTAGCTTCTAGAGAAAATGAAGTTATTTCTAAATCAGAATTACTTGAAAAAGTTTGGGGATATGACTATTACGAAGATGCTAATACCGTGAATGTCCATATACACCGTATTAGAGAAAAATTAGAAAAAGAGAGCTTTACAACATATACCATCACAACTGTATGGGGATTAGGATATAAATTTGAAAGGAGCCGATAATGGTGTTATCAATTAGAAGTCAAATCATTATTGGCGTCGTATCGAGTATACTATTAACTTCAACTATTTTAGCAATTGCATATATTTTAATGTGGTTTAACGGCCATATGACACTAACTTTGACCTTAACGACAATAATTACAAGCTGTTTAACCTTATTAATATGTAGTATTTTTATTAATCCACTTATACAAAAAATTAAGCAGTTTAATATAAAAACTAAGCAATTTGCTAACGGAAATTACGCAAGCAATGATAAAACGTTTAATTCACCAAAAGAAATTTATGAATTAAATCAATCTTTTAATAAAATGGCTTCTGAAATTACGCAACAAATGAATCAAATTAAATCCGAACAACAAGAAAAAACAGAACTGATTCAAAACTTAGCCCATGATTTAAAAACACCTTTAGCAAGCATTATTTCATATTCTGAAGGACTACGTGATGGTATAATCACAAAGGATCATGAGATTAAAGAGTCATACGACATATTAATTAAACAAGCAAACAGATTATCAACATTATTTGATGATATGACTCATATTATCACTTTAAATACAGGTAAAACATATCCCCCAGAATTAATACAACTAGACCAATTACTTGTATCAATATTGCAACCATATGAGCAACGTATCAAACATGAAAACCGCACATTAGAAGTGAATTTCTGTAGCGAAATTGATGCATTTTATCAATATCGAACGCCACTTGAGCGTATTTTAACAAACTTACTTGATAATGCGCTAAAATTTTCAAATGTTGGTAGTCGCATTGATATTAATATTAGTGAAAATAAAGATCAAGATACTATCGACATTGCTATTAGCGATGAAGGTATTGGCATTATACCAGAACTACAAGAACGTATATTCGAACGTACATTCAGAGTAGAAAACTCTCGTAATACAAAAACGGGTGGTTCTGGATTAGGCTTATATATAGCTAATGAACTCGCGCAACAAAATAACGCAAAAATCAGTGTAAGCAGTGATATAGATGTAGGAACTACGATGACTGTGACATTACACAAATTAGACATTACGTCATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP030323|2539172:2546992|2544020_2544461_+|WP_001093553.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAAGAVITTLALGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NZ_CP030323|2539172:2546992|2539172_2540324_-|WP_001217797.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NZ_CP030323|2539172:2546992|2541251_2541920_+|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NZ_CP030323|2539172:2546992|2545936_2546992_+|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_CP030323|2539172:2546992|2544802_2545276_+|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NZ_CP030323|2539172:2546992|2541921_2542341_+|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_CP030323|2539172:2546992|2540307_2540901_-|WP_000604508.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDIINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_CP030323|2539172:2546992|2545250_2545937_+|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_CP030323|2539172:2546992|2542344_2543058_+|WP_001062976.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKSDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVIAQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP030323|2539172:2546992|2543156_2543741_+|WP_000637683.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNNLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF |
10 | Pandoravirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP030323.1|WP_000384171.1|1411252_1411477_+|hypothetical-protein |
1411252_1411477_+
Protein sequences of NZ_CP030323.1|WP_000384171.1|1411252_1411477_+|hypothetical-protein>NZ_CP030323.1|WP_000384171.1|1411252_1411477_+|hypothetical-protein MDYAHLNLEHFFARNDDLDVIRDRADFVMINNFTNEMMYRDGQIEGTIDLNQYYYKNRSNAASFIMMDYKKETK |
74 aa aa | NA |
HTH_LUXR
HTH_LUXR HTH domain information
|
NA | 1390956-1425674 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 5.1|999078|25|NZ_CP030323|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP030323 position: 1412733-1412757, mismatch: 1 cggggccccaacacagaagctgaca CRISPR spacer cggggccccaacatagaagctgaca Protospacer *************.*********** |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
5583 : 13012
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP030324|5583:13012|DBSCAN-SWA GGTGAAAAATTTGAATAATATAATTGAAATAAATAACTTAACAAAGCAATATGGAAGTCAGATAGCAGTTAATAATTTGAGTATAACTGTTGAAAGTGGACAAATTTATGGTTTTTTAGGAAGAAATGGTGCAGGCAAAACAACTACTATAAGAATGCTTTTAGGCTTAATTAAACCTACGAAAGGTAATATTAAAATATTTGAAAAAGAGTTCGAAAGTAATAAAACTGAAATTTTAAAAAATATTGGTGCTATGGTTGAAACGCCAGGTTTTTATAGTAATTTGACAGCTAAAGAGAACTTAACTATAAATGCTAAAATATTAGGTATACAAAAAGAAAATGCAATTGAAGAAGTGTTAGAAATAGTAGGACTAGCTTCTGAAAAAGTAAAATTGTTTAAAAATTATTCTTTAGGTATGAAGCAACGTTTAGGGATTGCGAGAGCTTTATTGCACAATCCCGAATTATTGATACTTGATGAGCCGACGAATGGATTAGATCCTATTGGCATAAAAGAAATTAGAAAGTTGATTAAGGATCTGGCTCAATCTAGAAATATAACCATTTTAATTTCAAGTCATATATTGTCAGAAATAGAGCAGTTAGTAGACAAGGTGGGTATTATTCATAACGGAGTTTTGTTAGAAGAAATTATGTATGAAGATTTAAAAAAAAAGAACAGACAATTTATAAGTATATCAGTATCAGATGAAGAAAAAGTTGCATGTTTGTTGGAAACTAACTTCGGAATTTATGACTATAAAATTAAAGAAAATGGCGAATTTAAAATTTATTCACATATTGATAGACAACAAGAAATTAATAGATTATTAGTATTAAACAATATTGATGTTTTCCAGATGAGAGTGATAGAAGATAATCTAGAAACTTATTTCGAAGACTTAGTAGGAGGTGGCACAATTGGATAATCTACTCCGTACAGAATTTATTAAGTTAAAAAGATCATATATGTTTCTAATAAGTATTTTAGGTACATGCGTAGCACCTTTTATGGTGGTTGTAGCTTCTTTTATTAGTATGCGGACGAAAGTACCGACTCCTAATATTGTATTTAAACAGTTATTTGAAGAAGTCAGTTTATATCATATGCTAATTATTGGACCTCCTCTATATGGGGTTATAATAGCCTATTTGTTTGGAAGAGAATATATAGAAGATACTTTAAAAAACTTATTAATTATACCTATATCTAGAGAAAGTTTTTTAGTAAGTAAAATAATATTATTATTCTTGTGGATTCAAACACTATCTGTTATTGCATGGTTGCTAACTTTAATGCTAGGTATGCTATTGCATTTTCAAGGGTTAAGCCAGAGTTTAATAATTGATTCATTCTTTACATTTGTTATTGGCGGAGTGTTATTATGGATATTATCTCCACCAATAATTATTTTGTCGATATATTTTAAAAATTATGTTCCCACAATTGTTTTAACCATAATAATTACTTTGATAAATTTAATGACTGCTAATTCTGAACATAGAGGATTATTTCCTTGGGCTGCAGTTGGAGACATATCTAGAGGAACATTACCTAATACTTATCCATTTCTATTATCTTTAATTATCATAATTGTTACATCTATATTCAGTGTAATTATATTATTCTCATACTTTAAAAAAACTGATATAAGTTAAAAGGAGGAGAAAAATGGGTTTTATAGAGCAGATTAAAGCATTTATTTTAGGTGTAGTTGAAGGGTTGACAGAATTTGCTCCAGTATCATCAACAGGTCATATGATTATTGTTGATGATATGTGGTTAAACACTGCTGACGATTTAGGAAGTGCGTCTGCAACTACTTTTAAGGTGGTAATACAGTTAGGAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATTTATAATATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAAGCTTATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTATATCAAAATAAAAGGAAAATGGAGCTATTTATATCGTGCCATTGATACAGAGGGACATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGCAGCAATGGCTAAAATAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTCATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACCGTCATATTAAAGTAAGAAAGACAAGATATCAAAGTATCAATACGGCAAAGAATACTTTAAAAGGTATTGAATGTATTTACGCTCTATATAAAAAGAACCGTAGGTCTCTTCAGATCTACGGATTTTCCCCATGCCACGAAATTAGCATCATGCTAGCAAGTTAAACGAACACTGACATGATATATTAGTGATTAGCTATATTTTTTACTTTGCAACAGAACCATCATTTTTATTAAAATACTCTTTTGTAAAATCTTTCTGCTCTTCAATGTATTTAATTTCTTTACCTCTAAATCTATTATAGCTATTTGATGATTACAATAAAATTGATCTTACCTTATTGCCCTTGGAAGAGTTAGATAATTACCTAAAGGGCGATAAATTAATAAAGGTTCTAATTGATAAAGATTGTAGAATTAAAAGGGACATAGTTCCGACTGATATAGATTATCATGTAAGAAAGCCAAGCGCAAGGGAGTATGATGATTGCTGCAATGAATTTTGGAATGTAACACCTTATGTTATTAAAGGATTGTGCCGTAAGGAAATTTTATTTGCTATTGATCATTTTAATCAGATTGTTCGCCATGAGCTGCTGAGAATGATATCATGGAAGGTCGGCATCGAAACAGGCTTTAAATTAAGTGTAGGCAAGAACTATAAGTTTATTGAAAGGTATATATCCGAGGATTTGTGGGAGAAACTTTTGTCCACCTACCGGATGGATTCCTATGAAAACATATGGGAAGCATTATTTCTATGCCATCAATTGTTCAGGGCGGTATCCGGTGAGGTGGCGGAAAGGCTTCATTATGCCTATCCGGAGTATGATAGGAATATAACAAAATATACCAGGGACATGTATAAAAAATACACTGGTAAAACCGGCTGCCTGGATAGCACATATGCCGCTGATATAGAAGAGAGGCGGGAACAGTGATTACAGAAATGAAAGCAGGGCACCTGAAAGATATCGATAAACCCAGCGAACCATTTGAGGTGATAGGTAAGATTATACCGAGGTATGAAAACGAGAATTGGACCTTTACAGAATTACTCTATGAAGCGCCATATTTAAAAAGCTACCAAGACGAAGAGGATGAAGAGGATGAGGAGGCAGATTGCCTTGAATATATTGACAATACTGATAAGATAATATATCTTTACTACCAAGACGATAAATGCGTCGGAAAAGTTAAACTGCGAAAAAATTGGAACCGGTACGCTTATATAGAAGATATCGCCGTATGTAAGGATTTCAGGGGGCAAGGCATAGGCAGCGCGCTTATCAATATATCTATAGAATGGGCAAAGCATAAAAACTTGCATGGACTAATGCTTGAAACCCAGGACAATAACCTTATAGCTTGTAAATTCTATCATAATTGTGGTTTCAAAATCGGCTCCGTCGATACTATGTTATACGCCAACTTTGAAAACAACTTTGAAAAAGCTGTTTTCTGGTATTTAAGGTTTTAGAATGCAAGGAACAGTGAATTGGAGTTCGTCTTGTTATAATTAGCTTCTTGGGGTATCTTTAAATACTGTAGAAAAGAGGAAGGAAATAATAAATGGCTAAAATGAGAATATCACCGGAATTGAAAAAACTGATCGAAAAATACCGCTGCGTAAAAGATACGGAAGGAATGTCTCCTGCTAAGGTATATAAGCTGGTGGGAGAAAATGAAAACCTATATTTAAAAATGACGGACAGCCGGTATAAAGGGACCACCTATGATGTGGAACGGGAAAAGGACATGATGCTATGGCTGGAAGGAAAGCTGCCTGTTCCAAAGGTCCTGCACTTTGAACGGCATGATGGCTGGAGCAATCTGCTCATGAGTGAGGCCGATGGCGTCCTTTGCTCGGAAGAGTATGAAGATGAACAAAGCCCTGAAAAGATTATCGAGCTGTATGCGGAGTGCATCAGGCTCTTTCACTCCATCGACATATCGGATTGTCCCTATACGAATAGCTTAGACAGCCGCTTAGCCGAATTGGATTACTTACTGAATAACGATCTGGCCGATGTGGATTGCGAAAACTGGGAAGAAGACACTCCATTTAAAGATCCGCGCGAGCTGTATGATTTTTTAAAGACGGAAAAGCCCGAAGAGGAACTTGTCTTTTCCCACGGCGACCTGGGAGACAGCAACATCTTTGTGAAAGATGGCAAAGTAAGTGGCTTTATTGATCTTGGGAGAAGCGGCAGGGCGGACAAGTGGTATGACATTGCCTTCTGCGTCCGGTCGATCAGGGAGGATATCGGGGAAGAACAGTATGTCGAGCTATTTTTTGACTTACTGGGGATCAAGCCTGATTGGGAGAAAATAAAATATTATATTTTACTGGATGAATTGTTTTAGTACCTAGATTTAGATGTCTAAAAAGCTTTAACTACAAGCTTTTTAGACATCTAATCTTTTCTGAAGTACATCCGCAACTGTCCATACTCTGATGTTTTATATCTTTTCTAAAAGTTCGCTAGATAGAGTTCTATATTAGAGATGTAAAGAGTTTTGGTGAAGAGGTTTGTGAGTATGGCTTTTATAACCAGGGTGCAATGAGAAGCACTAACAGCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP030324|5583:13012|7489_8164_+|WP_001105960.1|transposase|DBSCAN-SWA MNYFRYKQFNKDVITVAVGYYLRYALSYRDISEILRERGVNVHHSTIYRWVQEYAPILYQIWKKKHKKAYYKWRIDETYIKIKGKWSYLYRAIDTEGHTLDIWLRKQRDNHSAYAFIKRLIKQFGKPQKVVTDQAPSTKAAMAKIIKAFKLKPDCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKTRYQSINTAKNTLKGIECIYALYKKNRRSLQIYGFSPCHEISIMLAS >NZ_CP030324|5583:13012|9571_10366_+|WP_001096887.1|DBSCAN-SWA MAKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLKMTDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEYEDEQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWEEDTPFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKWYDIAFCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF >NZ_CP030324|5583:13012|11018_11693_-|WP_001105991.1|transposase|DBSCAN-SWA MNYFRYKQFNKDVITVAVGYYLRYALSYRDISEILRERGVNVHHSTVYRWVQEYAPILYQIWKKKHKKAYYKWRIDETYIKIKGKWSYLYRAIDAEGHTLDIWLRKQRDNHSAYAFIKRLIKQFGKPQKVITDQAPSTKVAMVKVIKAFKLKPDCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKTRYQSINTAKNTLKGIECIYALYKKNRRSLQIYGFSPCHEISIMLAS >NZ_CP030324|5583:13012|11772_12033_+|WP_032603369.1|DBSCAN-SWA MNTAIMNSVSDEYTGRSFTIWASLSLLIQSFVSPILGKGVNELGDTIGFNIILIVSLIMIIFLFFINRSKNISYDYIKVQRGEANE >NZ_CP030324|5583:13012|6505_7243_+|WP_000369394.1|DBSCAN-SWA MDNLLRTEFIKLKRSYMFLISILGTCVAPFMVVVASFISMRTKVPTPNIVFKQLFEEVSLYHMLIIGPPLYGVIIAYLFGREYIEDTLKNLLIIPISRESFLVSKIILLFLWIQTLSVIAWLLTLMLGMLLHFQGLSQSLIIDSFFTFVIGGVLLWILSPPIIILSIYFKNYVPTIVLTIIITLINLMTANSEHRGLFPWAAVGDISRGTLPNTYPFLLSLIIIIVTSIFSVIILFSYFKKTDIS >NZ_CP030324|5583:13012|5583_6513_+|WP_000793446.1|DBSCAN-SWA MKNLNNIIEINNLTKQYGSQIAVNNLSITVESGQIYGFLGRNGAGKTTTIRMLLGLIKPTKGNIKIFEKEFESNKTEILKNIGAMVETPGFYSNLTAKENLTINAKILGIQKENAIEEVLEIVGLASEKVKLFKNYSLGMKQRLGIARALLHNPELLILDEPTNGLDPIGIKEIRKLIKDLAQSRNITILISSHILSEIEQLVDKVGIIHNGVLLEEIMYEDLKKKNRQFISISVSDEEKVACLLETNFGIYDYKIKENGEFKIYSHIDRQQEINRLLVLNNIDVFQMRVIEDNLETYFEDLVGGGTIG >NZ_CP030324|5583:13012|8936_9479_+|WP_000627290.1|DBSCAN-SWA MITEMKAGHLKDIDKPSEPFEVIGKIIPRYENENWTFTELLYEAPYLKSYQDEEDEEDEEADCLEYIDNTDKIIYLYYQDDKCVGKVKLRKNWNRYAYIEDIAVCKDFRGQGIGSALINISIEWAKHKNLHGLMLETQDNNLIACKFYHNCGFKIGSVDTMLYANFENNFEKAVFWYLRF >NZ_CP030324|5583:13012|12433_13012_-|WP_000690637.1|DBSCAN-SWA MKIGYARVSTGLQNLNLQEDRLNTYGCEKIFNDHMSGSKSKRPGLDKAIEFARSGDTIVVWRLDRLGRNMEDLITLVNELNERGVSFHSLEENITMDKSSSTGQLLFHLFAAFAEFERNLILERSSAGRIAARARGRYGGRPEKLNKQDLNLLKTLYDNGTPIKTIAEQWQVSRTTIYRYLNKLEAKENKNK >NZ_CP030324|5583:13012|7256_7460_+|WP_000505741.1|DBSCAN-SWA MGFIEQIKAFILGVVEGLTEFAPVSSTGHMIIVDDMWLNTADDLGSASATTFKVVIQLGGSVAKLNL >NZ_CP030324|5583:13012|12025_12211_+|WP_001037130.1|DBSCAN-SWA MNKLEKWSLVFIIFTFLSSLALLYFKYNFSSVMPVLSLSILTILILLTSIITVVSVNDEDT |
10 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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