Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP030083 | Acinetobacter baumannii strain Aba chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas3,DEDDh,WYL,csa3,RT | 0 | 0 | 6 | 0 |
NZ_CP030084 | Acinetobacter baumannii strain Aba plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP030083_1 | 2308587-2308672 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP030083_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP030083_1
>1.1|2308610|40|NZ_CP030083|CRISPRCasFinder GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP030083_1
The CRISPR arrays of NZ_CP030083_1 >merge|NZ_CP030083|1|2308587-2308672|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGAGGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGGCCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA >NZ_CP030083|1|1|2308587-2308672|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG CCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA
>NZ_CP030083.1|WP_000795915.1|2307349_2307586_+|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NZ_CP030083.1|WP_001124846.1|2306455_2307067_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NZ_CP030083.1|WP_000885229.1|2305773_2306385_+|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI >NZ_CP030083.1|WP_000376215.1|2305161_2305617_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG >NZ_CP030083.1|WP_001990047.1|2303456_2305103_+|allantoin-permease MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA >NZ_CP030083.1|WP_000115408.1|2299826_2303291_-|response-regulator MSVMPDTSRPQQAPQRVIKTRREYNIWVADESIEDYALRYAPTSVRKWSPWTVTNTAISTVSFLAMEAIGATMLWQYGFSNALWAAIVVCTIIFLTSWPISYYAAKYNVDVDLLTRGAGFGYIGSTITSLIYASFTFILLAFEAAIMAMALELALGIPQVIGYLISALVILPLVVKGIGFINKVQAVTQPIWLLLLLLPWFFVLWKQPQILSSSLHFVGAVSNSTDFNLYYFGAACTLIFSFVIQIGEQADYLRFLPQKEKNRTAWRFAVFLGGPSWIIFGFLKVLMGMLLMVLAFQLFIPVSELDNPTYLYWVAYQQFIPNPQLALILTLALVCLAQIKINMTNAYAGSLAWSNFFARLTHSHPGRIVWLLFNVFIAIVLMEMGISHAVERILGLYSNIALAWIGAVVADLIICKPLGLSPKGIEFRRAYLYDINPVGVGALLIASVLSMLSYLGFFGLMAKGLASFIALGSAVLCVPVIAYLTTGKYYIARQPEKIQATLVANCVVCERDYELADMAGCPAYNGTICSLCCSLEARCHDLCKPDARWSVQLKKAIWHYLPERWASRLNSRVSLYLLLTLGLSIVLAVSLSLVYIQEKTYLETINAAAVPQLFTLFVKIYTILFLLMSVAAWWLVLNDESRRNAEIETHQQTALLIDEIAAHEVTSKDLQDARIAAERANDAKSRYVIGISHELRTPLNSILGYSQLLQKQEQLSEQGKMALGVISRSGQHLTSLIDGLLDLARIETGKISLNVVDVHFPNFIEQIIQMFQPQFEQKNLQFVYEIGENLPHYVRTDKKRLEQVLINLLGNALKFTTSGTITLKVEYRFQTAYFEIRDTGCGIAEADLERIFNPFERGSNVVQGGFTGIGLGLPIVKLLVDLLGGQLSVTSQLNQGSQFKIKFYLPSKEVVHPISNVYSNQITGYQGERKRILVVDNEAVDRGLVANFLKPLGFMIEEAESGIDCLRRVPIFQPNLILMDLNMPLMGGWETARLLRQNNITNVPILIISANAGEREVNPQDAVLSEDFMLKPIDLNLLLSKIGDKLGLVWIDSKSETLLENNEVQALDLNIYKQEQVAVHTLIQQPENNELLDFPQSLQQLNDLIGQGYIRGIQQTLTQCRQNFPKHNELWEQLEQAIQKFDLKHAQRLIQDKQ >NZ_CP030083.1|WP_000107128.1|2298870_2299830_-|response-regulator-transcription-factor MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH >NZ_CP030083.1|WP_001025680.1|2298442_2298727_-|N-acetyltransferase MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK >NZ_CP030083.1|WP_002017921.1|2298219_2298333_+|hypothetical-protein MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS >NZ_CP030083.1|WP_000937460.1|2297495_2298131_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT >NZ_CP030083.1|WP_000983628.1|2309303_2309717_+|hypothetical-protein MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII >NZ_CP030083.1|WP_000432330.1|2309858_2310737_+|glucose-1-dehydrogenase MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLKEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFTMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG >NZ_CP030083.1|WP_001990041.1|2310793_2312938_-|catalase-HPII MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEHGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLSYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA >NZ_CP030083.1|WP_001145693.1|2312992_2314402_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLVKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPPEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNQYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN >NZ_CP030083.1|WP_000482091.1|2314717_2315197_+|CinA-family-protein MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR >NZ_CP030083.1|WP_000108365.1|2315481_2315703_+|hypothetical-protein MSTTNNQANQRNNQQQQQQQNDNRNQQQHGNQQQNDQQQQNNQQQQQNDNRGQQQGSNQKDSGQQNSNNNQQR >NZ_CP030083.1|WP_000132044.1|2315808_2316126_+|hypothetical-protein MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDI >NZ_CP030083.1|WP_000498477.1|2316210_2316432_-|hypothetical-protein MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF >NZ_CP030083.1|WP_001136759.1|2316519_2316948_-|hypothetical-protein MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS >NZ_CP030083.1|WP_000251637.1|2317217_2317361_-|hypothetical-protein MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSRNDGMHEASDPATSHDMNKNS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1151350 : 1166147
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP030083|1151350:1166147|DBSCAN-SWA 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10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1516161 : 1565658
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP030083|1516161:1565658|DBSCAN-SWA 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65 | Acinetobacter_phage(98.31%) | capsid,terminase,integrase,transposase | attL 1515984:1516001|attR 1566166:1566183 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2585164 : 2655120
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP030083|2585164:2655120|DBSCAN-SWA TATGACACATCTCAATGAGTTATATCTTATCTTAAACAAATATCTAAAATGGAACAAGTCACATTTAAAGTGCTTTGCGCTCATCATGCTTGTGATTATTTTAAAGCAAACATGTAATCTTTCTTCTGCATCTAAAGCCTTGCCCATCAAGTGCTTACCACAATCATTTTATCGACGTATGCAGCGCTTCTTTGCAGGTCAGTATTTTGATTATCGTCAAATTTCTCAGTTGATTTTCAATATGTTTTCATTCGACCAAGTGCAACTGACTTTAGATAGAACCAATTGGAAATGGGGAAAACGAAATATTAATATCCTGATGCTCGCAATCGTTTATCGTGGAATAGCGATACCTATCCTTTGGACATTGCTTAATAAACGTGGAAATTCAGATACGAAAGAGCGTATTGCTTTGATTCAACGCTTTATAGCCATTTTTGGTAAAGACCGTATTGTGAATGTGTTCGCAGACAGAGAGTTTATCGGTGAGCAGTGGTTTACATGGTTAATTGAACAAGACATCAACTTCTGCATTCGTGTTAAAAAAACTTCATTGTCACCAATCATTTAGGAAAGAATCATAAAATTAGTGATTTATTTCGCCATCTTAAAGTTGGTCAAATTGAATGTCGTAAACGACGGATTTTGGTTGGTCGGGTGAAACTATATATAAGTGCACTACAGTTAGAAAATGGAGAGCTTTTACTCGTCGTTTCTCCTCAGTTTAATGCCAATGCTATTCAGGATTATGCATTACGCTGGGAAATTGAAACCTTATTCAGTTGTCTCAAAGGACGCGGGTTTAATCTTGAAAATACGCGCTTGACAGACCCTAGACGAGTGAAAAAATTGATTGCGGTGTTAGCTATAAGCTTCTGTTGGTGTTACTTAACGGGTGAATGGCAACATGATCAAAAAAAAGCGATAAAAATAAAGAAGCATGGACGACTCTCAATGAGTTTATTTCGCTATGGTTTAGACTATGTTCAAATGGCGATTCAGCGTTTAATTGGTTTTGGGAAAAAAGAAGAGTTTAAGGAAATTTTGGCAATTTTAAGAAGGCAGAACCCTGATAGGATAAGGGTTCTGTGAAATTTGTCGTGTACAGAGCTAATTTTTGATACTTCATTAGAAGAAACTCCAGTCACTGATGAAGACTATGATGACGAAGAATAATTACTCGTAATTATTGAATAAAAAGCAAACTTCGGTTTGCTTTTTTTATATGCAACAATGAGTTAATACACAAAGCTTACAAACTATTCTGTTTTTATGATTTAAGTTGAATACATATTCTCCGTTAGGCTAACTTAAAATTTCTTAAGGATTTCGCAGTATGCAATTTAAACCACTTGGTCACACTGGCATTAACCTTCCTGAAATTTGCTTAGGTACCATGACATTTGGTGAGCAAAATACTCAACAAGAAGCTTTCGAACAACTCAATTACGCTTTAGAACACGGTTTATATTTTTGGGATACGGCAGAGATGTATTCCGTGCCTCCTAAGCCAGAAACATATGGAGCAACCGAAACCATCTTAGGCAATTGGTTTGCACAGCATGGTCAGCGCGATAAAGTATTCCTTGCTTCAAAAATTGCAGGTCCCGGCTTTGGTGGAACACATATTCGAGACGGCCATACCAAGTTTAATAGTGAACATATTTCACAAGCGATTGATGGCTCTCTCAAACGCTTAAAAACTGATTATATTGATCTTTATCAATTACATTGGCCTGAACGCCATACCAACTTCTTTGGAACGCTCGCTTATGGTAATCAGCAAGCCCAAAATGATTATGACACTACTCCCTTAGAAGAAACATTACTCGCTCTCCAAAAAGAGATTAATCGAGGCCGCATTCGTTACATCGGCTTATCTAATGAAACACCGTGGGGCACCATGAAGTTTCTTCAGCTTGCTGAAAATTTAGGTGTGAGTAAATTTGTGAGTGTGCAAAATCCGTATAGTCTGCTTAATCGCACCTATGAAATCGGTATGTCAGAAATTGCCAAATATGAAGGTGTAGGTTTACTTGCATACTCTCCTCTTGCTTTTGGTTATTTAACTGGCAAATTTAGAAATGGGGCTCGACCAGCCAATGCCCGCGTTACACTCTTCCCTCGCTTTAGCAGATACAGCAATCCGCAAAGTGAATGGGCAACTGAACAATATGCACAGCTTGCTGAAAAGCATGGTTTAAGCCTGACTCAATTGGCTCTGGCTTTTATTAAGCAGCAATTTTTTGTGACGAGTACAATTATTGGTGCAACCAATTTAGATCAGCTCAAAGAAAATATCCAAGCTTTTGAAATCGAGCTTTCACCAGAGATTTTACAAGGCATTGAGACTATTCATATACAACAGCCTAATCCTGCTCCTTAAAAAACAAAAACGGATGCTCAAGCATCCGTTTTTAACATCAGTTCTATAAGTGTTAAAACTTACTTACGACCATTATAAATAGCTAATGCCGCAGGTAAATTCTTACGCATGTCATTAATACGTTGAGCGTTTGATGGGTGAGTAGACAAGAAAGATGATCCACTGCCTTCAAGCTTGTTCATTTTTTCCCAAAGCGTAATCGCTGCATTCGGGTTATAACCTGCACGCGCCATTAGCATTAAACCACCTTGGTCAGCACGGCTTTCCAAACTACGAGAATATGGCAGACCCACACCTACTTGCGTGCCTAACTGAGCCGCAGCCGCGCCTAGTTGACTCACATTACCACCATTAATCTGACTTAAGCCAATATTTAACGCTAAATCAGTTAAAGCTTGTGCGCCAATTTTACTTTTTGCATGCTCTTCCAAGGCGTGAGTCATTTCATGGCCCATAACTGCTGCAATTTCAGCATCAGTCAAGTTCAGTTTATTTACAATACCTGTGTAGAACACGACCTTGCCACCAGGTGCAACGTAAGCGTTAATCGTATCTGACTTCAATACAGCCAATTGCCAACTAAATGGCTGGCCTGTCTGATTCATTTGATTCGCATAAGGTTTTAAACGGTTAAAAACCGCATTAATACGGTTATAGGTACTTGAACTTGTATCTAAAGCACCTTTACCACGCGCTTCCTGCACCATTTTATTGAAACTTTGTGCAGATTGAGCATTTAAGGTTGCAGTATCTGCACCTGCCATATCAGCCATTGTGGCACAACCAGAAATTGTTACTGCACCTGCTGCGCACAAGCTTAGAACGAACTTTTTATTCATTAACATGGGTCACCTAAATCGTTAAAAAACTGTTTATTCTTTTGCACTTATTATAAGAAATACCACTCACGCTTTAAATCTCTCATTTCTTCACGATCATAGTATTTATGTAACGGTCAATTAGATAAAGTCATCAAATAAATCCAGAATATTAAACATATTATGTTTAAACCAAGATAAACGTGACTTAAAGTCTTAACTTTCTCTTCAAGATTAGGATTTTTCCTCTTCCAGAGTAAATAACTGTTTTGTATGAGAACAACAGGGATGAGGACACAAGCAATCAGGACAGAAAGACTCATAAATGCCGTCATGAAGAAGTCCGGATTATAATTTTGACCATAAATAATCAGCATTGCTAATGTGGGTGAACCACCTATAGCAAATAAAAAAGAATAAAAAATGGTTTTTGAAATAGTGGGTTGCAGCTTCATCCTGAGCCTATGATTCCTGAACTATATATCATGTTTTAATCTGAATCGAACCAAACCAAAACTGCACTTTAGTAGGGTATAAAAAAAGCCCCCTTTTAGGAGGCTATTTTTATCTTTGCGAATTACGCAGAGAATGGATGACGTAAAATGATTGTTTCTGCACGGTCTGGACCAGTTGAAACGATATCAATCGGACATTCGATTAATTGTTCAATACGTTTTACATAAGCCAAAGCATTTGCAGGTAATTGGTCAATGCTCGTTAAACCAACAGTTGACTCGCTCCAACCTGGCATAGTTTCATAAATTGGTTTCAAGCATTCGAAAGAAACCGCATCAGAAGAACCTACACAACCTGAATCTGTATTTTCATAACCCACACAGATTTTCACTTCTTCTAAACCATCTAAAACGTCAAGTTTAGTTAAGCAAATACCTGAAAGTGAGTTTACATCTACAGAACGGCGTAAGATTTCAGCATCAAACCAACCACAACGACGTTGACGACCAGTAGAAGCACCGAACTCATGACCTACAGTACCCAAATGTTTACCAATTGGGTCACCAGAATCACTTGCAGCATCGTAAACCAATTCAGTTGGGAACGGACCAGCACCTACACGTGTTGTATAAGCTTTCGTAATACCTAATACATAATCAAGATGTAAAGGACCCATACCTGAACCAGAACTTACACCACCAGCAGTTGTATTTGAGCTGGTAACATACGGATAAGTACCGTGGTCGATGTCTAGAAGTGAACCTTGAGCGCCTTCAAACATTACAGCCTTACCTTCTTTGCGATAGTCATGTAATACTTTAGTTACGTCAATCACTAATGGAGCAAGAACTTCACGCCATTGGTTGCAAAGAGCTAATACGTCTTCAAATTTAACCGCTTCTACACCGTAGAACTGAGTCAATTGGAAGTTATGTAGCTCTAGCATTTCGGCTAGTTTTTCTTCTAACGCTGCACCACCACGAACAAGGTCAGCAACACGCACTGCACGGCGCGCAACTTTATCTTCGTACGCAGGGCCGATACCACGACCTGTAGTACCGATTTTAGCGTTACCACGTTTCTTCTCACGTGCCTGATCAAGAGCAATGTGGTTAGGCAAAATAAGTGGACAGTTTGGAGAAATGCGTAGACGCTCCTTAACCGGAACACCTTCAGCTTCCAAAATTCCCATTTCTTCAATTAATGCTGCTGGTGAAAGCACCACGCCATTGCCAATTAAGCACAATACGTTTTCACGTAAAATGCCTGATGGAATGAGGTGTAATACAGTCTTTTTACCACCTACGACAAGAGTATGACCTGCGTTATGTCCGCCTTGA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60 | Escherichia_phage(20.0%) | integrase,tRNA,transposase | attL 2619580:2619594|attR 2659114:2659128 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2660571 : 2689245
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP030083|2660571:2689245|DBSCAN-SWA 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38 | Acinetobacter_phage(93.55%) | terminase,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2693203 : 2705551
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP030083|2693203:2705551|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP030083|2693203:2705551|2694462_2694801_-|WP_000647826.1|DBSCAN-SWA MKASKLIRDKGLQYAKEIVDSAPSNATEWNEGFEFQCGQSVEISKADREKYFVDLSELKRLVESVDLVESWGGIDDVKLYDLSHCKNRPESAGYKLLQAIADYESIYGGGYV >NZ_CP030083|2693203:2705551|2698495_2698711_+|WP_000370485.1|DBSCAN-SWA MDNSKRPINQIIARINDAAKHGEALVLTAEEVKILSKDIGDKVFIPVLTNEQVVQLVKEGKLGQKINNTKD >NZ_CP030083|2693203:2705551|2704828_2705551_+|WP_000004579.1|DBSCAN-SWA MSESTLWAVAMRPEGYSPFKQTPAASKEIAERAVERYRKMHEKEGNNFFLEIFDDVIKVQKWHGSRKDHIKNLFYVESWFSEPMYQCFDLKTAERVFKFDEIVICYKKGSAPLVTKSFDEAKLFYGSSETGFKYQIQPIEPPENLFNWFHPDIELFDTIEEGAEAYTREQWAQLQMNLRVEIETQLLDYDEIPNIPEDAVVWPNWKPEPPEQGLFLIAAFDSEDGPVLWWANPKAESKEK >NZ_CP030083|2693203:2705551|2702120_2703242_+|WP_001207474.1|DBSCAN-SWA 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MFEQILKRRPKGATHWQAGYYYNSDECGIWSIWENGKWHGDFKFPDGVMTKLPEEKEPVMSEFEGKSGKWAWEIQKEQQANLVELRSSIENLVQKYKHDAHASSLFGDQDKARVYNCFANQLKNLLKGGA >NZ_CP030083|2693203:2705551|2693203_2693680_-|WP_001277128.1|DBSCAN-SWA MSAVLKTQQMDWSKYTIDGWLEQFGAWCETVRMKGGDLPDGLHINQIYWLMREAGKEVQKSKSYIRCEISDYEADQIQALLRSLLNSDKTDFTTKFALICLIKNKVENKGLLKVAQETNQSKAQVAIMVSCARFYLLGHDKRLRQNGGSNENIHCKTI >NZ_CP030083|2693203:2705551|2695600_2696482_-|WP_000064627.1|DBSCAN-SWA MSNFVPNSFQVPNAFVDEVLNKISDAACKIYLVICRKTRGWNKEMDSISLTQFEEITGKSRPTVVKCLNELIKVGLVVEQPSTIHGNTFKLGNDTSVGLVLKFPSKNFLLPEIYGQTSKNSLPLLVKNFNYTSKNFLPLLVKIFNTQSITIKNNSQSNKKINKKRGSVSEKPKTEKPNEFNPRSVELPACVDSELWNNFVDMRISIKKPLSENAVKLILKKLISFGPLANQSLENSIIGNYQGVFEPRQNQIQENPQSHNVPEEPGYFTQMYAESNRSNVIDVTPVSQDFGGY >NZ_CP030083|2693203:2705551|2697435_2697624_-|WP_000703023.1|DBSCAN-SWA MKISDLMTYHGCKNRKELSEKTGYSTVTLWKWENNGIPARTQAVLQVKTKGKLKADLQALTA >NZ_CP030083|2693203:2705551|2699771_2700275_+|WP_001129676.1|DBSCAN-SWA 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MSLHTRIRQKLEEKKLRAADLARATKKSPVAAKKWLDGTSVPTAENLKVIAKFLGVSDDWLLYGGSDEQESSNNLAQLNVIDIEAFKQKYNIPDSEDAVKFVQAPAKPFPIQKRYVPVKAYSKMGMDGYFTDMGYDGNAGDGYVPTHTAGPRAYGIKGTGDSMFPAIRNGWYVVCDPDADLVPNEFVQVCLKDGRCTIKEFVGINGGVLSLLSVNGGERFFFEMDEVESITAITDIVPPSQHRQEHPYSH >NZ_CP030083|2693203:2705551|2703238_2704171_+|WP_000698529.1|DBSCAN-SWA MKILNKVEAKLAWANGELLLVNNTERNGWEPFNPYDFGFDVFDKFEFQLKPRTIFIGEFEVPEPLRVAPEKGSTCSYPSPTVELGVQQFKWNGSKGQLRMLQHGQVHSSFDNAFAHCCAIIKISGGEFAEDILKLLNKPTEEVEEEKPSESHAESLKVKNSKPEVVEKAQTAEPAIESETADSEYQKKLDTLLQRVKDSKTPDEVNAVYRYTRTWSDKQMEPLLLATHKRLEELEKSKAQATEPPSLMVQIQNAPDLTTLDALEIDVAARDPQIQSRLMDFVKKRRFELENPTSTPLQEAEPDYLLGDGF >NZ_CP030083|2693203:2705551|2700413_2700617_+|WP_000845537.1|DBSCAN-SWA MKTEIIEALALELTKATIADTDPSTINIKSADLWVKTYQESLKAVEEALKELKPKPKATSKPISGMS >NZ_CP030083|2693203:2705551|2696474_2696699_-|WP_000602535.1|DBSCAN-SWA MILNELHDRNRKNLRAKGYDENNAAITREEFSQTMAQRFRTNQWLAGQIVNSLANADLVQKFGGYVKPKVGVHE >NZ_CP030083|2693203:2705551|2701502_2701793_+|WP_000656405.1|DBSCAN-SWA MKDYNCPTCKKMIPVDRSKIKAGDEVSFCRVTQSSKSARFSSKEGIVDCREGDVVLVKYRKEIIPLNIKDVSPVDAPSPLTYAFVGACECKEAEHV >NZ_CP030083|2693203:2705551|2701059_2701503_+|WP_001101038.1|DBSCAN-SWA MNVKATPFNSFAFVSMAALAISGGSLVACQLQPAFQTKDAPTLFTPKTQPSTYSVLTAKITGKHSGVAVIKLDSFRLNVSFDFEAHPDSYGVPGSEFTTVDITQLTVNEITDINGKSYNDFTEFEDIRNINSLLKGFIERNKLVEAA |
24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2933142 : 2952702
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP030083|2933142:2952702|DBSCAN-SWA ACTATTTTTTAAAAGTTGCTTTATAATGTTTGGAATTAAAATAATTTACAATCTCTTCCCCATTATTTTGATTTTTTTCTAAATTTAAGGTTAAAAAATCTAATTCCGATTCCAAATTTATAAACTCGGGAATATATTCTTTGATAGGAGGGGGTGGCTTAGGGCCCCCTTCAGTAATTTTTTGAATAAACCCAGCTAACCATAAAATGTATTCTTCTCTTAAATTATAAGAAGGAATCAAACTTACATCAATCTTTACCTTACAATCATTTTTACTTTTACTCAGTACTTCATTGAAATCAATAAAATTATATTTCAGCTTATATTCTGTACCCTTAATTTCTTTTCGAATCACCTTCATAAGAATATACATATTTTCTAAAACATCTTTAGAAAATAGTTTTTCATTTTTCATTTTTTTGTAAATAGTCTCAGCAAGAAAAAGATATTGTGGCATGTTACAAATTCCATTTCATAATTTCCTCTTATTCTATAATATAGAATTATTAAATTAATATTACAAGAATTTACTCAAAGTTTTTTATTTTAAATTTTGAAGTAATATCAAAATATTAAGATAGTAATTCCTAATAAAAAGGTCTATTTCTTTTTTAAGAAATAGACCTAGCGAAAAAAGCGCTCAAACCTAAAAATGGCTGATTTAGTATTAGCTGCCCTTATTCAAGTTGGTACTATTAAGTAATTTAGAAAATGCTCAATTAACCTCTCTCTTTAAATTTCTCTGCTTCCATCTAGTCCCTACATCTTATGAAATGGACCCCATATTGCATTCATATTCTTGAGCTGCTTCTCTTCGTAGTTAAGCCTTTTTCTGATTAGCTTGAACTTGGGTCGGGGTTAGCTTGTTTGGATTGTATTTTTTTGAGCGTTTTTTGCTGGTTGCTTTAGATTTCATTTGCACCCACCCCCTTTAGCTCTTAACTTTTCAGCAACTAAACGATCAGCTACACGCTTAACTCGATTCCAAACAAAGTTGTGATCAATTTCAGAACGACCTTGATAAATACGTTCAAGTTGAAATGCCGTAACTGAATAATCCACTTCTAAGGCCAGTAAATCCCAATCTTCATTAAAAGCTGTAGCGTAGGGAGTCAATTGGCTTTTCTGTGCCAAAATACGCAATTGGCGAGCATCTGGACCACGCTTTACAACTGGTTTTGGCTTAGATTTGATTAAACCAGTGGAAAGCGCCCATTCAACACAAGTTTCGCAACGACAACATAAACGCTTGTACATAGGGCCGGTGCCGTGAGGCATATTGAGATCACGCCCTAAAGACTCAACCTGTCGGATTTTATTACCAGGATGTTTCAGCCATTTCTTAACTGCTTTTTCTAATGCTTTTCGCTCATCAGATTTAGCTGCTACGTTTGAGTAAGCAACTAATGCGTATTCAGATTTTTTCATATCAATAAATGCGTTCACTGTGCTTTACCTCCACCTATACGAGCATCATCCCAATCACATTCCACAATATCTAAGCCATCATGTTGAAATCTTGACCATAGACGGTCCCCAAGATCTTCGCGGACCTCAGAAAGACTTAGGTTTGAAATCACAACTGTTGGCTTCAACTCGTCATAACGAGTGAGTAGAACCTTATGAACACTTTCAAGAAGTTGAGGACGTTTTTCAGCACGGTCATGTAAACCGTATTCATCAATAATTAATAAATCTTTTTTTACATAGCGTTTTAGCGCTTCATCTTCACTATCACCACTACGGCGATAGGCACCCGCGATATCTTCAGCTAGATCTGCAGACGTAATGTAAATAGCTTCCCAGTTCTTAATGATGATATTTTTCAGAATTGATGAACCTAGATGTGTTTTACCCGTACCAGTACGGCCGACAAGAAGTAAATTTCGAAAAACACCTGAATTGAAATCCATAGTGAACTTTTCACAAGTTTTACGAGCTTTGTCTTGTCCTTTGTGAGTTACTGCATAGTTGCTAAAGCCGCTATTTACATGTCTTTTAGGGATACCAGCTCGAGCCATTTTCAAATTTAAAATACGATTGTTCTTATCGCTTTCATATTTTTCATTTGACTGCTTCATGATTTTTTCAACACAAGACTGACAAACGATTCGACCATGTACATTGATCATTTGTTCTTTGTGGATCTTACAGATCTGGTTTGTATGGGAAATTTTATATTCCAATTTTTGAGGCACTGCGTTCATATCAATTCACCCTTCACAGCTGTGTGAGCAACCGGTTCATATTTCTTTGGCGCGCCCCATTGATCATTTACATTGCGTGGTAACGATTGATGGTTTGACTGTTGACCGGTAGTCATTTCGGGTTTTTCGTTTAGGTACCAAGATGCTTTGAAGGCACCCCAAGGATTTTGTCTTTTCAAACAATATTCGACGGCTTGCTGCAGTGTGATTCCTGCTTTTTGGGCTTCATTCAAAAGTGCTTCAAAAGCGTTTTCGGTGTTTTGAGCTTTCTTGGCTTTACGAACTTGTAAGAACTCAGCAGCGTCTTTCTCAGGTACACCATTTTTTTTCAAAGCACTCTTGAAACTAAATTTTGTTTGAGTCGATGAATCAACTTCGCCAACGGCGGAGTTGTTATTACCTTCTGGATTCTGATTAAAGGTTTCAGGATTCAGTGAATCAGGATTCAGATTAAAGGATTCAGGATTCAGGGCGTTTTGGTCTGAGATAGAAACAGTTTTAGAACCGTTATCTAACTGTTCTTGTTTGTTCCCACTACTGTTTGCTTGATTCGATTCGTTATCTTGATAACTGTTTTCAACAGCAGAACCAGTATTTTGAGGGGCAAACGGTCCTGTTTTATCGTAAAAATGCTTTAAATCAGCTTTATTTAACTGAATTGGTTTTCCAACAATTGTTTTGTTTTTCGGGTTACGTTCATAGACAGTGTAGATACCATTACGGTCAGGTAATTCACTGTCTTTCTCTAGCCCGTGCGGGTTTTGATGTTTAACAAAGTTAACGATATGGATAACATCAATACCATCAGCGTTATATAACTCGATAAAACCGAACTTAGAAATGTTCTCTAACTGTTCTGCAACGTTTATATCGTCTGCAGGAAATAAAGACATTTTGATTTTCTTAGGTCGATTTTCGAGTCGGCCTTCGCGATCTGCTAAAGTCCAAAGACCAATAAATAGCAATCGTGCTTCATAAGGTAATTCAATAATGTCTTCATTCATAAAGAATGAGGGCTTAATATTTCTAGATCTTGCCATTTCTTAAGCTGCCTCATATAAGTGTTCATGTGCAAAATTTGCACGTACTAAAGCTTCAGAGAATTGAGGAGGTACGGAATTACCTACCATTCTTCCCTGTTCTGTCTTAGTTAATTTGATAGTGTTTCCATGTTCATCGATCCCATGATCAATGATGTAAGTAGGTTCAAAACCTTGTGCTGTGAATAGTTCTCTTGGCTGAAGCATACGGAAGCCAATATCAACAATTTGGTGCAGCTCACCTTTAACCATTACAAGACCAAAACGATCACGTGTTGGTATCGTACGAAGTGGCTCATGAATGCTATTTCCGTCTTTCTCACTACCGTAGAAGGCAGTTAGAAATGCTTGTACTAAAGCAAAATGACCCGCACTTGTGGTAATGGTATGTAATGGTTCATCAACAGGTTGACCAATGTTGTTTTTGCGCAGTTTCACCAGGTTGCTAACGACTAAACTGTTATGATCTTTTGCAGTAATCGTATGGAGCGGTTCGCGAATATCACTACCAACAACACCCGTATAATGCTTAGCAATGAACGCAGTAACCAACGCATGATGTCCACCTTTCACCCCTGCGCAAATTGTGCGTAAAGGTTCATCAACAGGCATACATCTTGGGCTTGAAGCATTTGCACACTCAGTAAGTACTGGGGCAACGCTTTTAACCTTATCCATTGGAACAATAAATGGTTCTGGATTATTGATTACATAACGGACTAAACCATTTGCTATACGGCGACAAGTTGCCTCAACTAGAGGTTTCTTACGAGTAAAAATACTTGGGCAAGGAATTGACCAATCTATGCATTCTGCAGTGATGCGCCATGGTTTTAATTTCCCAGTTTTAACTGCTTTGCTATCTGGTGCAGCATGCGTAGGCTTGGGCCAAACAATAGGAAAGTTGTCACGACGAGCAACTAGAAAAAACCGTCTTCTTAGAGTTGGAGAGCCGTAATCCCGAGCACTCATTACTCGCCATTCAACTTTATAACCTTGATGACGTAATGCATTAACAAAGCACCTGAAGGTTTCACCTTTGTGCTTTTTACTCGGGAATCCATCTTTTCCTAGTCTGCCCCAAGTTTTGAACTCTTCAACGTTCTCGAGCATAATTATACGTGGTCGTGTAAGGTCAGCCCATCTAAGAGCAATCCAAGCTAAACCACGTATTTTCTTTTCAACCGGTTTTCCACCTTTTGCTTTAGAAAAGTGTTTGCAATCAGGACTAAGCCAAACCAATCCTACAGGCTGATTGTTTGTTACTTTTACTGGGTCAACATCCCAAACATCCTCACAGAAATGACGAGTATTTGGATGATTAGCACGATGCATTGCAATTGCTTTAGGATCGTGGTTAATAGCAATATCAACTGGACGGCCAAAGGCTTTTTCTAAGCCAGTTGATGTTCCACCACCACCTGCAAAATTATCAACAATCAATTCATGAGGTAATAAGTTAAGGTTGAGGCACATATTCATAATGCACCACCATTAACTTTTTTAAGCGTTAGTAAAACAGTGAATAATTGACCTGCAGAATATTTAAATGTCTTAACTTCAGTGCACTCAACTAAAAAGCGATGTTCACCAAAATTAACCCTACTTCCTGGTCTATCAAGTGTATAACGGCTCCAACCTTCAGGAATCGGATCACAGGAAAAATGGCCGTAGAATTTTTCAGGTCCACATTTAATGCTACAAAGGGGTTCAGCTACCCAAAAAACTTGATTGAGAAATTTTTTTCTCGCAC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33 | Acinetobacter_phage(40.0%) | integrase | attL 2939849:2939863|attR 2954875:2954889 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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