Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP029616 | Ligilactobacillus salivarius strain DJ-sa-01 chromosome, complete genome | 3 crisprs | c2c4_V-U1,cas3,DEDDh,WYL,c2c9_V-U4,csa3,cas14j,Cas14u_CAS-V,cas14k,c2c10_CAS-V-U3,DinG | 23 | 1 | 8 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP029616_1 | 656400-656609 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029616_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP029616_1
>1.1|656456|31|NZ_CP029616|PILER-CR TACTTGAGCATTAAGTTGCCCAAGTCCGCCT >1.2|656543|28|NZ_CP029616|PILER-CR TTGTGCATTCATTTGACCTAAACCACTA |
WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029616_1
The CRISPR arrays of NZ_CP029616_1 >merge|NZ_CP029616|1|656400-656609|PILER-CR ACCACTTGCTAATTGGTTTACACCATTTGTCAATGTTGGTACTTGAGCATTAAGTTGCCCAAGTCCGCCTGCTAATTGGTTACCACCGTTTGCTAATTGATTTACACCACCTGTTAATGCTGGAATTTGTGCATTCATTTGACCTAAACCACTAGCTAATTGGTTACCACCATTTGCTAATTGATTTACACCACTTGTTAATGCTGGAAT >NZ_CP029616|1|1|656400-656609|PILER-CR ACCACTTGCTAATTGGTTTACACCATTTGTCAATGTTGGTACTTGAGCATTAAGTT GCCCAAGTCCGCCTGCTAATTGGTTACCACC GTTTGCTAATTGATTTACACCACCTGTTAATGCTGGAATTTGTGCATTCATTTGAC CTAAACCACTAGCTAATTGGTTACCACC ATTTGCTAATTGATTTACACCACTTGTTAATGCTGGAAT
>NZ_CP029616.1|WP_113895848.1|654714_655542_+|exodeoxyribonuclease-III MKLISWNIDSLNAALTSDSARAKQSREVLATIINENPDIIAIQETKLSATGPTKKHQTILAEQFPDYEIAWRSSQEPARKGYAGTMFLYKNNLNPTVSYPEIDAPEPMDSEGRIITLEFDNFYVTQVYTPNAGDGLRRLAERQVWDEKYADYLVSLDQNKPLLSSGDFNVAHKEIDLAHPGNNHHSAGFTDEERAGFTNLLNKGFTDTFRYVHGDVKDVYSWWAQRSRTSKINNSGWRIDYWLASNRIADKIVRSEMLDSGERRDHTPIVLEINI >NZ_CP029616.1|WP_003701221.1|654381_654621_-|hypothetical-protein MAKATNEDKNIEVSEIGKKFVKGTHVEFKFHRHTFTGVVDKQLHNSAMIIFDDEYNKSITYQDAKGKIIISYSKMQIIK >NZ_CP029616.1|WP_004563843.1|653512_654292_-|AzlC-family-ABC-transporter-permease MEKTEARWVEVFKVSLPLCLSYVPIGLACGILLHAAGFNPLLTLLVSVLVFSGGAQFLIASMLTTNTPMQTIVIMLFFLELRYALLGSSLSQYIKGTSKKFLYFFAVSLNDENYAVNYLKFATDKSWTPKDALAVEHWSLLFWSVANFIGSLVGNLIPMENYLDIVDFALTAMFIYMIVMQIRNKLTILVSFISGVIAIVALVTLKSTMGLIVATLLASFIGFMIEHNIVKKGEAKGNFWLKKIKPKASRKVISKSGEK >NZ_CP029616.1|WP_003701691.1|653171_653513_-|AzlD-domain-containing-protein MQYSSMDHFILIICSMIAAFIPRFLPLKFFSTRKIPEWFNEWMKYVPVSLFTALVVRDLFVNTKTYTFVGLEYMAKLLAAIIVIVVAYRSRSMGLSVLFGLVAVAILATFLTV >NZ_CP029616.1|WP_113895847.1|652277_653099_-|alpha/beta-hydrolase MQKITEKITVAGHTAELMGYTIEKKNDWGVQDKHATIIICPGGGYHFVSDREADPVALKLITMGYNAFVLNYTCQVRYPVALEQLAQSVKLVRDNADEWNVREDKIIIMGMSAGGHLAASLGVKWNSDELKKMGYKPEEIKPNGLVLSYPVITTNKDFWHQGSFEQILGKDGIEDEKALANQSLEKLVTKDVPPVFMWHTFEDKAVPMENSLLFASALRKAGVSTEYHIFPHGPHGLALANEETARVGRPEDIEPQAAQWVDLFHSWMQALLK >NZ_CP029616.1|WP_191981185.1|651404_652226_-|hypothetical-protein MKRWMFWLMTAIVVALVFIGFGYTKKRETQKQFDNLMSQAITNAQAAEYKKAELNLQDALRKKPDDVVAKQRLEQVKLYQEGLAELKQDDYEQAQLTFRSTAKISPSLSILTQRAKKKDKLLESVLKQREKYDDLYNEAIRLTEIGAYSQSNENLVQILDGKNIDEKYYSQVRKDARELQERNNSILEQIRIQNQQAAIRRQHEQQRQEEARKAQQAATNSSSSAENQNGEPKKNDDKNDDRNSGQDNVKNSSESKPETNDSAAEPQPNNENK >NZ_CP029616.1|WP_003709622.1|650733_651360_+|phosphatase-PAP2-family-protein MFVPQNKYRPFIASIYLVLFLILLILVKTNSTIVTSFDKFVQNLLLPITNPTNTRIVEKITYLGGPRIAAILSIIVSLYMFIRHNFKAGIWSASTLVIGNLINVLAKNLIQRPRPSDKLVAIGGYSFPSGHTFGTALFIFFVVFLIVPQIKDVTLRRILTFLGFLWILIIALTRVYLHVHYPTDTIASVLLVLFLWESSLIIWRRISD >NZ_CP029616.1|WP_113895845.1|649773_650661_-|hypothetical-protein MGKDSSQEMRRTQAEKMLKQPKKLRAKWISRLFTLIMVVALSIATMGFLIKTTVLNADFTSKELAKDENIGKLYTEANQTLASSAQMYRIPASYADSLITKKQFRQDVEIAIKRIYDGQVTQIVDTNTLSSQIQTNVNKEIASSGVPIDASVFSGVVESLASVLNNYISQQIPSTQLQQVYDAASNISGYVTLMITAGSIITVVMLTLVLLLQRSLFGWLHYTGLAFLITGIIFCIIGYTSVPAEIFPSLINQSGILGSIVENYAYAIFKQIVNMGIIESVIGIVALLVSFFRKV >NZ_CP029616.1|WP_113895844.1|648880_649771_-|RluA-family-pseudouridine-synthase MKFTWNKESDEKMTLKKFLKNKGVSHRTLSSLKKGNGKVLVDGKKRSLSIEVGKGKITLILPPEKSDENVKMSKEPLDIIYEDSNWLVVDKPPLLSSVPGPSNRTDTLVNRVKFHLWQQKSKDLVPHVITRLDRDTSGLVLVAKHRFAQGLINKQVEEHSIDKRYLAVVEGIITEKHGIIDKPLGPRENGIGQTVTDTGKTAKTEYWVREYLGDKATLVGCKLHTGRTHQIRAHFSSINHALVGDELYGGRLDWGLERQALHAYQLAYVDPFTQEEKLFKSRMPKDLEDLIVKLKN >NZ_CP029616.1|WP_003701679.1|648106_648754_-|metal-dependent-transcriptional-regulator MTPKKEDYLKIIFELGGTKKKVSNKQIAMSLNVAAGSVTEMVNKLVKEGLAAHTPYAGISLTDEGIEVAEKLVRRHRLWETFLVEKLDYQLSEVHDEAEVLEHVASDKLMKKLDQFLNSPRECPHGGVIPTEAGEYEEESHEYLAEIKVGETVEVDRFIDNHELLTYLDDLELKLGDKIEVLEHLPFEGPIKVKRLADGAELSIGYKAAHYIFVK >NZ_CP029616.1|WP_113895850.1|658785_659397_-|zinc-ribbon-domain-containing-protein MKICQNCGTKNSKEAVFCENCGAKLPEVVVTGKIKKCRNCGYSNEEEATFCGNCGTKLPESVIDETNKCQNCGYLNEEGAAFCENCGNKLEKNSLEKMSNKCQNCGYSNKEDAIFCENCGSKLSEQVVDEGINKCQNCGHSNEEEATFCENCGTKLTEQISLAETDDDMDSEEKQDEQTEELEESEISTNETIDDQEITKTDE >NZ_CP029616.1|WP_113895851.1|659485_660088_-|hypothetical-protein MKKSGSIITIIIIVILAGVIVGVFGMPYIQQRKSSSSSSNVKVEKKESFKESSSSSSREERSSSSTLDSIESSSSTVARRDSEIVIPSFNQKRDQQDVDLANMTVPQCLLWALSERYSYQNADEQSWEELKDSIDSAKLIPATKSSDKYVHIYFKYGSQDCNYYIDGDYDLCDEEGYVISRYPTEFENEKANNYVMSRYQ >NZ_CP029616.1|WP_113895852.1|660101_660677_-|hypothetical-protein MKKINSILMILVIVIIAFLIVWKVGTPNLISKNKENITEKVSKKVEKESKKTKKKGTSKAKSSTTETSSSVESEPSSESSSESTSSVSSYQSNVRFPELQAYAGKTYYAIDRDSAEYPQMFPTSFTIASDTETIVVGGRQERIDKVSDDNGGIMLGGGPVFVFSFRPLGSSDEVEVVNQGQYLTYSTTMSE >NZ_CP029616.1|WP_113895853.1|660690_661287_-|hypothetical-protein MKKSNSILMILVIVIIASLIVWKIGIPNLNSRNKEVSSEKVSKKVKKESKKIKKKDTSESKSSSSTETSSSVESEPSSESSSESTSSVQPSVKYPALQKYAGKTYYAVDRESAEVPDMFPTFFTITSDTEIINIDGKQELIRDVSNDSGFIALTGETGHSMGTSLSFEFRPLGSSDSNTNTVEVLNQGQYLAYTTMPE >NZ_CP029616.1|WP_113895854.1|661301_662030_-|zinc-ribbon-domain-containing-protein MEKKFCTNCGSQLNEGAKFCPNCGNSVVSTNTSETTTNQAEKKKFCTNCGSQLRDGVKFCSNCGSSVGSSNRTVSRTTVVQGRTGSNNGNPFNQIQDYYEQTKEEYGNLTDQELGFVGSVKYALVHWNDFKGVESRKSVYWWLLLGMTVIGFGMYVLLLIIGALFSNVPGLDVIGSFIILVALMALGVIMSIAELSAVVRRMRYLNVQNIAMWMILTFVIPPILLYTFIYLMLIDDPINNQK >NZ_CP029616.1|WP_003701697.1|662243_662501_-|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MYEYNKVYQELADILNDKDVEKIYKNFRGMQVNFPMRLYSRDSVKKEIAKQKGNIDIKDLAVQTGYSVYTIRRMVNELKDDNIIQ >NZ_CP029616.1|WP_162917714.1|663246_663798_-|hypothetical-protein MVYINKLSVITRQDTLELKSSKKTTSNRTRERDSESAKKNKSSISSSVRLKKIETDSSSSSESNVSSTSSNSSSVLVKVSGSEDSEVLKTEEVKVPADKLTAKQCGEWALAAYVKSHNITVKQWNDGAIRDVNVSNGNDGYVHIKLVNSYGNTDRYYIDASGELLDENTNRLVSMKPIAIKFD >NZ_CP029616.1|WP_113895856.1|663904_664387_-|hypothetical-protein MGYLILLVVSVIVVLILGTSGTFNHLSFPLRLGIFLYLLLLMLWGINSLISDSTGSSRIIALDAVGSVLMLITVLIILNDVNKLFVDTSMGFLGKNFWKSVIFMSIFLVGSGIMYTINIDDMVKVFFIAVYGLVATVFLVIAIVMVFLLLIKMLFGTDTE >NZ_CP029616.1|WP_113895857.1|665017_665983_+|WYL-domain-containing-protein MTIATTSATRQLYIYQLLASGAHLSKKDIQCKFSVDARTVQRDFASIRNFMSEYLNEYELEYDTKDHTYYLKSNRLGLSKSQCLVLIKVLLASRSLSRKELDPLISSLLALLTKQDQKDIKPIIQSELDSYVELRNLKDKQLLDAIYTFSKIILQRETITIEYTTQRHKFVTRTIAPIALTFSDYYFYVVSYNHQFKKNTIYRLDRILNWKYATHKIPLNERLPFDLGDEKKKFHLMYPGKMITIQFEYTGIVEAALDKFPISRTIKKIDDHTFLLEVTTYDTGALMWFLSQKDMVTIVNPPEFRQQMKDTLQAMLSNYED >NZ_CP029616.1|WP_003701203.1|666133_666820_-|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase MPKLVFIRHGQSEWNLKNLFTGWEDVNLSEKGVEEAKEAGRKLKEAGIEFDQAYTSVLTRAIKTLHFALEESGQLWIPEMKTWRLNERHYGALQGKNKADAAEKYGDEQVHIWRRSYDVLPPLLSADDEGSAANDRRYADLDPRIIPGGENLKVTLERVIPFWEDHIAPDLLAGKNVIVAAHGNSLRALTKYIEQISDEDIMNVEMATGQPVVYDLDDKLNIVNKEKL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP029616_2 | 977482-977664 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029616_2
|
2 spacers
spacers of NZ_CP029616_2
>2.1|977506|60|NZ_CP029616|CRISPRCasFinder GAAACAAGAAGCATACAATGCCGCAAAGACTGAAAATGATAAGGCAGTGGCAACTTTAAA >2.2|977590|51|NZ_CP029616|CRISPRCasFinder AGTAAGTAACGGAGCAACTTCTGATGTGGCAACATTACAAGCTAATTTAAA |
Cas14u_CAS-V |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029616_2
The CRISPR arrays of NZ_CP029616_2 >merge|NZ_CP029616|2|977482-977664|CRISPRCasFinder TGCAGCTAAAGCAGAATTAGCTAAGAAACAAGAAGCATACAATGCCGCAAAGACTGAAAATGATAAGGCAGTGGCAACTTTAAATACAGCTAAAGCAGAATTAGCTAAAGTAAGTAACGGAGCAACTTCTGATGTGGCAACATTACAAGCTAATTTAAATCAAGCTAAGCAAGAATTAGAAAA >NZ_CP029616|2|1|977482-977664|CRISPRCasFinder TGCAGCTAAAGCAGAATTAGCTAA GAAACAAGAAGCATACAATGCCGCAAAGACTGAAAATGATAAGGCAGTGGCAACTTTAAA TACAGCTAAAGCAGAATTAGCTAA AGTAAGTAACGGAGCAACTTCTGATGTGGCAACATTACAAGCTAATTTAAA TCAAGCTAAGCAAGAATTAGAAAA
>NZ_CP029616.1|WP_113895973.1|975140_975491_+|PLP-dependent-transferase MIVKSVYELIGQTPLIELDIPVAKGSRILAKLESFELKDGLDTKKFVESLKVISLAESLGGIESLIEVPAVMTHGSIPREIRLENGIKDELIRLSVGIEDEEDLINDLKQALDKIG >NZ_CP029616.1|WP_080563904.1|973644_974862_+|transposase MEQTVNIKVKLNILEPNTGIKFSKTMEQYRLACNYVSEYLFNNDFPLNKNEVQKVIYNTIREKFNLKSQMTISCIRGVIARYKTVKTQMARRSYKYQDQNTGEWYHEVRDLTWLHKPISFNRPQVDLQRNRDWSYLSSGQLSINTLDGRVKVDPICHGFSQYFDGTWKFGLARLLKSSGKWYLHISATKEVADFDKQTVKHVVGIDRGLRFLATSFDEQGKTTFFDSQAIMRKRAKYQKLRATLQAKGTKSAKRHLKKLSGRENRWISDVNHCLSKTLVQKYGANTLFVLENLNGVSFERTDLPKALRNQNKSWAFYQLEQFLTYKAHLHNSEVVEVSAKYTSQRCPKCGVVKKDNRNHEKHEYHCDNCGYRSNDDRIGAMNIQLLGTQYISGQEQPKFELTTNA >NZ_CP029616.1|WP_113895972.1|971551_973354_-|oligoendopeptidase-F MALPKRSEVPVNETWDLTAIYPDKKAWKADMVAVRELVTQFQNNYRSKLTEAKIIIAALHDLEIIYQKLSWIEHYAFLPQTTDMTNPEYNQMLVENDNLQAAITADLSFFKTEVLTNPVSLLEQVAEIEPQFAPVVRHWKVEKPHQLSPEVEKTLATLSPTLNSSERIYTTARAADWDMEDFEVDGKTYPMSFVLYENTYQYHPNPEVRHKAHQIFSDTLRKHKNTVAANYYTQVSKEKKLADLRGYDSVFDYLLSDQEVSRETFDRQIDVIIDELGPVMQKYVKLLQKERGLDKMLYSDLQIDLDPEFAPKADLESATGYISEAVSVLGEDYKNAILKAFPERWVDFPANAGKESGGFETTPYGLHPYILMSWTGVLPDVYTLIHELGHAGNFIKINENNSILTSEPSLYLIESPSTFNELLLTHSLEQKSDDPRMKRFAYTTMLTNTYFHNFITHLLEAAFQREVYTLVENGQTFDGDKLTQIKMDVQKRFWGDAVDIDENAGLTWMRQSHYYMGLYSYTYSAGLTIATQAYLKVLEEGQPAVDRWLEYISLGDQKAPMDAAKVAGVDVTTAEPLHNTIKFLNDTVDKVIALTEELNQ >NZ_CP029616.1|WP_098034302.1|970469_971384_+|EamA-family-transporter MSMKTKGILLAAGGASLWGGSGAAAQQLFMTHAVTTEWLVAVRLLGAGLLLLIWGLIKSSKQIDEIIHDRKNMAMVLAFAIFGVMNSQLSYFFAIKYSNAPTATVLQYLQPVLIVLWMAFGQKIRPRRVDGISIAVALMGTFLLVTGGRLDTLTLTPIALAWGLWSAVAATLYTLLPSGLLKKYDAMVVCGLAMFVSGIIMLPWFLTMEQPHLSLFNIVLVIYIVVFGTMFAYTLFLQSIRYIAPSVTGILSAFEPLIATILAVTLLGTKLSTAAIIGSLLIVLTTVIQAVPFNVIWRRFRRVK >NZ_CP029616.1|WP_113895971.1|969710_970268_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MVLKVEKISTKSQDFKQIKRVYEEVFPKVERIPLWLLKMRANEGKAEFCSLYDENEWVGFFYTILTKKLAYIFFLAVDPDRQGDGYGSQALEVIKERYQDYTMGLSSERPSPEAPNNEQRIRRQSFYERNGFTKAGFYSIEKGGVRYDFLSPQGKVKPNLYVDLMAEFFKQRQAYYLPLRVEKDD >NZ_CP029616.1|WP_113895970.1|968349_969696_+|threonine/serine-exporter-family-protein MSDEEANTMLQSVMKHHHMQMPWHNFTPDNSNTPAKRATLKEKATLVGRVGIMLLSYGTGAWRVRDSMNTIARELNISCSADVGLVSIEYTCVDEEGHGYTQALSLASTGVNTDKLSEMEQFVMDFNKGGSDLSAEQIHEILDEIERKPGHYNAIMAGLAAASACCAFVFLLGGGLVEMLCSFVGAGFGNYIRRKMIERRITLLACVSVSVAVACIFYLIAFKSLVAMMHVSLQHEAGYIGAMLFVIPGFPFITSGLDIAKLDMRSGLERMMYAIMIITVATLVGWVVAMAVHLKPVNFIPLDLGVIPMMLLRIPASFVGVFGFSIMFNSTIEMATWAGIIGAIANTLRLELVDLTNIPAGAAAFIAALVAGLLASLIKGYPRISLTVPSIVIMVPGLYMYRAVYNIGVASINVGATWLTEAALIVMFLPLGLITARILTDKKWRYKD >NZ_CP029616.1|WP_003707369.1|967306_968173_+|sugar-transporter MNIIIALIPAVCWGIFPLIASKTGGGPANQILGTGLGATLVGLIVFAIMHPTITASAFIWAFMAGACWTIGQIGQFISMKPERMGVTTTMPISAGFQLVGNSLIGMLFLGNWSGTTAKIIGLVALAIVVVGVVLTAVTDDNKSEAASVKDVLFLLVTTVGYWIYSSFPNLPAVRHVSPTALYLPEMLGILCGALIFVFATRETSALTARESWAGMIGGAIWGIAAFAYIFSAQENGTSSAFIYTQLSVVISTLGGMLFLHERKTSRELGFTLAGLVLLVVGSVITGFI >NZ_CP029616.1|WP_081508904.1|966620_967187_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MTQKRNLSTEKIIEAAKEIINKEGAEKLSFSKVAGVLGVHSQAMYPYFADKEELKIAVINDFLDSLTEQIKEELQGISGKEALRIYGRKLHELLLIQPRLTRLAFGGIDYSQKEEARNHFKDLVELLESLIEPFAKNDVDVINRARLYRAVIFGYAQNELWGLFKLALVPAQTSFEFTLEEAIATITA >NZ_CP029616.1|WP_109241560.1|965263_966487_-|MFS-transporter MDEAQREKSPWKRNLYILWVCTFIAGIAFSELMPFMSLYVSQLGHFSKAQVSFYSGLVYAATFLVTAIVSPLWGMLADIKGRKIMLIRASFGMAFAMFLMGLVTNVWELIALRALQGLFSGFISNAQALIASQTPRKHSGKALGTLVTGSTSGMLMGPIIGGVLAQFFSIRDTFFITASLLALAGILSATLVKEYFVPVKREKNSKEHRGLLSQFQNPRLIIVLLISTMMVQLGNISIAPIISLYIKELMHNQGPIALVAGIIAALPGISNIISAPRLGAYGDAHGSNKVLMAGYLFAVIMYFPQGFVSSIWLLGILRFFIGISDGALFPTIQTLLTKNSPASATSAVFSWNQSFQALGNMFGSLLGGSLAGLFDYNVVFISTATLLLLNFLILWFTEPSLRLKFNR >NZ_CP029616.1|WP_081533340.1|964514_965228_+|amino-acid-racemase MKNFFTIIGGMGTMATESYIHQLNLRTPANNDQEYLNYILVNHATVPDRTAYILDNSKPNPKIPLLEDFKQQAGLKPDFFTLPCNTAHYFYDELQAAVDVPVLHMPRLAVEQIKQDYPNTKRVGIVATNGTLHDGVYDKEILDAGYELVKPTAEIQAKTMELIYDDIKEKDYVDGKLFYELVEDMVKDEKCDAVILGCTELSLAQEREPITDLPIIDSQSVLVDKTLELALKTQKNK >NZ_CP029616.1|WP_113895975.1|978585_979677_+|iron-containing-alcohol-dehydrogenase-family-protein MTTNYMSNYSYGPDCFKEIPEVLDKYKVHKVVFIGGEKALKNSQADVKSVLENNGFAVTGSFVYGKDATQANIDRLVATPEVQDADIIFGFGGGRALDTVKMVAKDLDKTIFTFPTICSNCSAGTGISVLYKEDGSFDRYGYPDVPAHVFINTSVIAKAPKEYFWAGIGDGISKAPEVEHAVAAAVERGVELPHTAVLGAAIAASSKDAFYKYGEQGIKDVENRTVSRAIEEIALDILVSTGYASNLVNQDDFYYNSCHAHAFYNATTAIKKEKEPLHGQVVAFGVMVLHAYFNELEELKKVITFNKKLGLPVSLAEIGLKASDAEKITELAMQTNEYKHTPFDKEKYIEAIKLADRMGSENA >NZ_CP029616.1|WP_034997575.1|979779_980214_+|peptide-methionine-(R)-S-oxide-reductase-MsrB MKETKEELRQRIGEEAYQVTQNAATERAFTGKYDEFFEDGIYVDVVSGEPLFSSKDKYNSGCGWPAFTQPISNRMVTNHEDNSFGMHRVEVRSRQAQSHLGHVFNDGPQDRGGLRYCINSAALQFIPVDELDEKGYGEYKKLFE >NZ_CP029616.1|WP_003707351.1|980403_980571_+|hypothetical-protein MGLNINAYFTMAAKQLVLKKKIPFEISTSSNDIPNETTRKAMILAEALKNFRCME >NZ_CP029616.1|WP_034997573.1|980558_980759_+|type-II-toxin-antitoxin-system-YafQ-family-toxin MYGIVNEISKPHTLNNRGGNYNGNQEYHLSNGKVDVLVIYNPHKTNLTIRMIRIGTHKDLFQGELK >NZ_CP029616.1|WP_113895976.1|980849_982241_-|L,D-transpeptidase-family-protein MIFINKGTKWLAAGLGAVVLICGGSFFYQKQHFNRNIEINGVKVGGMSVAGATQKLKTTKLNNNVYLGEKLLVKGSDPTNSTNSVSQEKVQEIFDKQFSLFPSGRSYDYQAKGDSDYSYRKNELRAAVKSELERLNVSRTAPKDAYAELKNGSVHVINAKKGNQYDVNKIMQEYDKQFSDNQIKLTTTYTQPISADSKQVQADKAKLGKLADQKVNYTVQNKTYTLAAKDVINSAKIVDGKYEYDAANLKKKIDDINDSQSTLDKNLKFKTTGGSEITLDKGTYGWALSPIKATRSITTAFEKGDSNLNAKSDIYGEGYTENGLGYNTTSNSGIGNSYVEVSISQQHVWVYKNGTQVASLSVVTGTNDGNYNTPTGLYYIMYKQTNTTLRGKNADNSAYASPVSRWAPFTLDGCGFHDADWRKNWSSTAYLNDGSHGCVNVRPSQINQIYDNVEQYEPVVIYS >NZ_CP029616.1|WP_081533358.1|982437_982887_+|MarR-family-transcriptional-regulator MSITKDEVQKLTSRLDLLIAKGAREYKDWNQKHGLTDYRSVILYELLLHTRLTQKQIVERTNLPKQSINKGILQLRDEGYLTLEQDEKDNRVKYCFLTEEGEKYAKLKIQPLLDIEEKIIMKMGKKKIEQLNELLEEWNLNFKKYKDEE >NZ_CP029616.1|WP_113895977.1|982898_984632_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MQILMAHFKNYKKEVLSAIISIFIVAFVAVWQPRLLQYVLTAIVQDNQAEVRNYGIQLIILAFVGIIAGIVNVYSAARVAQGVTSDLREEVYTKIQNFSFGNIEKFSTGSLVVRLINDMNQVANMIMTIFMQVFRVPLILIGAFILGIITVPRLWWLEVLMVVLIMGITGIIFKKMGNLFNKVQSLMDKINTQAKENLQGVRVVKSFNQEGQEIDKFNQTSDNLNNVNLKIGYLFSTVIPSFELIAYVIIAAAIYLIGGSILDHPSDIAVISSYVTYIMQLLYAIMIGSFVMSIFARGGVSLKRIKEVLETQPDVVFKDDAPAEELDGDVEFDNVTFAYPDADKPILKNISFKVKSGEMVGIVGATGSGKSSLAQLLPRLYDPTEGTVRIGGHDLRDVNEKSLRDTVSYVLQRAILFSGTIASNLRQGKADATNYELERASQIAQAQEFISRYKDTFDHEVEERSSNYSGGQKQRLSIARGVVGKPKILILDDSTSALDAKSEKLVQEALEKELKDTTTFIIAEKIVSVMNADKIIVLDNGRLVAQGTHQELLKNSPIYQEIYATQKAREKAGDIIE >NZ_CP029616.1|WP_081533362.1|984624_986406_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein 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NZ_CP029616_3 | 1020478-1025840 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP029616_3
|
56 spacers
spacers of NZ_CP029616_3
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP029616_3
The CRISPR arrays of NZ_CP029616_3 >merge|NZ_CP029616|3|1020478-1025840|CRT 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>NZ_CP029616.1|WP_003705713.1|1017172_1017337_+|hypothetical-protein MSDKKKDLLEENINKRLDEARYEPVKKRKKSHLREWMMFIIFSLMLLGMLLRYI >NZ_CP029616.1|WP_113895985.1|1014801_1017153_+|accessory-Sec-system-translocase-SecA2 MSLRIVKKILKKVNSHAEEMSKLSDNQLKDKTQQFKKRLKQGETLDNILPEAFAAMREADKRVLGMFPYDVQVMGGIVLHQGNIAEMKTGEGKTLTATMPMYLNALSGESTILVTTNEYLANRDCEEMSQVYNWMGLSAASAVPENADDLKVEEKREIYNSDIVYTTNNALGFDYLIDNLASSKEEKFMPEFSYVIVDEVDAVLLDTATTPLVISGAPRVQSNMYKMTDEFVVSLEEEEDYRLDEEKKNVWLTRKGIEVAQEYFRVPNLYDGKHVELVRHITLALKAHNLFEKGKDYVIEDNKMYLLDSTEGRILENTKMQQGQQQAIEAAEGAEISDDMRSMASITYQNFFRLFKKIGGMTGTGKTANKEFIETYYMKVIQIPTNNPVIRKDYPDKIYPTLREKLMASLKLVKELHEKGQPILLTTADVELSEIYSEILLHEQIPHNLLNAHNAAKEAEIISEAGQWGSVTVATSMAGRGTDIKLGKGVKELGGLAVIGTELMPSKRTELQLRGRSGRQGDPGFSQFFVSLEDDVVIDSGPKWVHKYFKKHRNDNPDSPRELKSLRFRWAMKRTQKQHDNQGYNNRKQTMDFDESSKKQRNLIYSQRDELISENGRFKFNAEKFILKYLDGYLAKHKADFTRNELSRLIFDNLSYTYNGVPDNFPITDKVEIKKLLHQIVKEKLREKEAELENVEEIERFYRLSVLKAIDAGWVEEVDNLQQLRSVVESRSSAQRNPVYEYHKEASKSFERMQEYVNKLIVQNIMLSVIEIGADGKKDIYFA 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>NZ_CP029616.1|WP_113895983.1|1010725_1012327_+|accessory-Sec-system-protein-Asp1 MFYFIPTWNQSENDWSTAFPEWYFTTNKMEFDDTVNQLMMFRQSEEKLKAVILEYAPMLRDFLQRQDLYEIDYYSIFDDLQDTHLDNIRPVNPFEFAWPKNAVFIYNPFYILVRVDNQPYAQIISGNLGQLQKINFFKDNKLAKVYIFDDRGFLSSIITYADDEFEKQEFLNLAGEWRFRLDKDGVVVINPLFKQSFKQEKYNSMKDLISEKYFEFIEDNLTEKDVVVLAGEIRHNQRILDLPKSGKIIMSIFSNRLDIEQNFPSIEQLMKVDVIVADTPKNTELVQSKLAELNIQIPVLQIPPFDSRLRLGQSQRIRALKLFLLVDKTSTEELEIMVDEIIQLMQQDKRIELILSGYASNSKSMDKLNYLKDRILDTLRITENDVQTVGTAENQLQDEESQDTIQNIKLFKRIEFYRIDSENDLVSKLNFVRLIIDMGEDADLYLQIAGISAGIPQINSVPNPYVEHQKNGLIVSDSLELKQALEYYLVGLKHWNEALVYAAGKIVQYSSDNLVNLWKDALQLTKKGGKLRE >NZ_CP029616.1|WP_113895982.1|1009472_1010702_+|accessory-Sec-system-protein-translocase-subunit-SecY2 MRLRKKPKKDTLINFFVPKFLWTMFILITYMIGSAIPIPLGGTMAEAKSNYVLQLASNATGGDISNLTLLSLGLGPWMSSMIIWQVLVMIKPLGLGSLSERESGYLRNILILFLSIVQSIGIVLSFKMNVDYETKVGVVIMLIAGGFFTVWLAYLNAAKGVGGSMLIMLFKMITGVEQQLGETFKMLSKISNGKWIMALVALAILILVIMSVIMERSEYRIPVTRVMINNDLNKDSYIPIKVNNGGGMAIMFAMSLFMIVNYLLQIIAHHFPVGFLKTFAKGVSMYSFAGATLYVIVLFALAIMFGFVNIDAGQIAEGLRNSGDYIKNVKPGKDTKRYLTKYVAFFSIVGSIYITLVAGGPLYIGAIQPKYAKVVMIPGIAMMCFGMIFNVQEQIRAAKSLYSYKKWIK >NZ_CP029616.1|WP_191981179.1|1008200_1009328_-|endonuclease MLRKHPILRWGLIFILGLLGCLVVFIGAYVIYMQTHYYRIKDYQSLPIKQKLTHPNKLQTNTTYSAATYNVGFGAYNQKFSFFMDTGKMKDGTKTQGKYGKAENKAAVLQNTNGEINTMKKINADFMLFQEIDVDSSRSYHVNQVKKMSQNFANYEEIFANNFHSPYLLYPLNDPHGAVQSGLLSLSKYPVEQAIRRKYPVSTSFITKFTDLDRCFTVMKIPVTNGHKLILINSHMSAYDKGGKMRVKQLKLLNSVMESEYKKGNYVIVGGDFNHTFGRKMLTHFKSQQEIPDWVSVLSSKDLAPDIRMVHAKNENTVPTCRGTDIPYQKGKTYTTVIDGFLVSKNVQATSKNINTEFAYADHNPVKLSFKLLNQ >NZ_CP029616.1|WP_003705700.1|1006655_1008047_-|MFS-transporter MFKKLLAPPGKKPRLSDAEVARKYPRYRTQVIISIFVGYMGYYFVRNTTSILSGILKMSATEIGIITCASYIAYGVSKFVSGLISDESNSKIFLPLGLLLSGIINIFIGVIPSVITSVWLFTIFYLINGWLQGMGWPPGARTLVYWFGNKERITYGTIWNLSHNFGGAIAPLLAGAGLALAGNDPLAQARAAYWFPGVVVCIMAVIIYFIQEDTPESVGLPPIEEYKSEEYRESDNAKLEEDAAAVEMSMGEIVKKYILPNTKLMWSSLYAALVYILRYGIVSWTPKFLATSIQDGGKGITAAAGMGGFSFFELGGIAGMLIAGWVSAKLFKNSKPLTNVACLIITLILLVAYWFIPAGPEYMIWDFAILIGLGASIYGPVMMVGLYAMELVPKAAAGAAAGLSGTFSYVGGATVATLVIGIIVDHLGWGVAFIVFGISGIAAIICTLLSRDKSLEYWEDDKK >NZ_CP029616.1|WP_003705699.1|1005922_1006402_+|23S-rRNA-(pseudouridine(1915)-N(3))-methyltransferase-RlmH MNIKIIGVGKLKEKYLKQGIAEYAKRLGTFCKFQIVEVPDEKAPEKLSPAEMEGVKEKEGERILAKIKDKEYVYALAIEGKERSSEEFAKELADLGTYGTSDITFVIGGSLGLSPEVLKRANTKISFGRFTLPHQLMRMVLTEQIYRGFMINAGRPYHK >NZ_CP029616.1|WP_113895981.1|1004218_1005526_+|trypsin-like-peptidase-domain-containing-protein 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>NZ_CP029616.1|WP_087367967.1|1038162_1039059_+|glycosyltransferase-family-2-protein MVKVSIGVPVYNVDQWLRQCLDSIRQQSFQDFEVIMVDDGSTDNSFEICQEYVSKDERFKLYHQENKGLAGARNTCLKHMTGDFIAWLDSDDWLENDYLERLVSTQAKTGADIVCIGIKTFMNDEFYMGSHQDKYGAFPDHVIPKKIAMSDVFWGIYALISVWGNIMDAKLYKGVVFSEGLNYEDQGNKFKLYLNSKKIVGIPELGYVYRIRSGSITQDGAANFKKIFEGKVMQITNLEKFMYYIENADYEVDYFHSLYSEWLDKQLQSVDSSWDDNQQERYRSFISRHKKLFEKNRN >NZ_CP029616.1|WP_113895991.1|1039089_1039962_+|glycosyltransferase-family-2-protein MVKVSLGVPVYNANEYLRECLDSILNQTFQDFEVLLVDDGSTDGSYNICYEYAQKSDKIRYYHQNHKGIDDTRNLILREADGDFITWIEATDSVEPDYLQHLVDIQNKSNADIVISGFKEYREKEFSQSVNLKPYFEELEDNEYTNIDKYRALLLFLSHWTSFFYSWGKLVSMRTHLGVMYPKEFINKDMATTYKLYLHTNNIVVDGEELYNHHIIDERVTLGDRDILADYEDKQRVLDEMMMITGIMNFKVPEVKDLCRQYMNKVYQETKSQLSENWRPKLDQLRDELA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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NZ_CP029616_1 | 1.1|656456|31|NZ_CP029616|PILER-CR | 656456-656486 | 31 | NZ_CP021334 | Marinobacter salarius strain HL2708#2 plasmid pHL2708Z5, complete sequence | 86679-86709 | 10 | 0.677 |
1. spacer 1.1|656456|31|NZ_CP029616|PILER-CR matches to NZ_CP021334 (Marinobacter salarius strain HL2708#2 plasmid pHL2708Z5, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.677
tacttgagcattaagttgcccaagtccgcct CRISPR spacer agcttgagcattaatttgcccaaggagctga Protospacer .************ ********* .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
99139 : 158476
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP029616|99139:158476|DBSCAN-SWA 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56 | Bacillus_phage(14.29%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
362687 : 371710
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP029616|362687:371710|DBSCAN-SWA CCTATTTATTAAAATAGCAATCAAACAAATTTAACGTTAAAGTTTCTAGCATATTTTGCATAGAGATATTACTTGCCAACTTTCTATTGCTTTCTACCACCAAATTTAAGCCATTAACCAATTTATCGTTTGTTATCTGCGCAGTATTTTGTTGGATAAAATCTATATTCTCTTTAAAAACTATCTCTTCTGTCAATCCAAAACGTTCTAAAACTGTATCACGTACAGTTAATATTATAACTTGTAATACTAGATTTTGATCTTCTTTATTTTGAATAAGTCCGATAATTTTTGATTGAATCATTACAAATGATAATAAATCTTTTCTTAACAATTTTCGATACCAATTATTGACCGTTGCTAAAATCTTATCAAAATTCTCATTATCATTAATTTTTTTAGCTTCAACTACACTTTGAGCAAGATTGGCTAAAATATGACTATTTTTCTCAGAAATGCTTTCTGAAATTAATTCTTGCTCCAATTGTCCAGAAGTAAGTTGTTGCATTTCGACTTCTTGACACCTTGAAATAATAGTTGGTAACAATTTTTGTGGTTCAGATGTTAATAAAAAAGCTGTTATATTTCCAGATGGTTCTTCCAGGAATTTCAACAAACTATTTGCAGCTCCAATTGACATTTTCTGAGCATCTTGGATAATAAATACTTTCCTATCACTTTCTACCCCACTCTTATTAAATTCCGACTTCAAATATCTTATTTGCTCAACTTTTATTGATAATCCGTCCGGCATAATAGTAACTACATCTGGGTGATTATTATTCTCAATTCTATTACATTCAGAACACTTTAAACAAGGTACTCCATTTTGTGAATTTAAACAGAATATCCCCTTAGCAACCCACTTTGCTAATTCTATTTTTCCAGTGCCTTCAGCTCCTGATAGTAAATATGCATGTACCAGCTTGTTTTCTCTAATCAATTTTGCAAAATGTTTCGTTAAAAATGGTTGTCTTTCCGTTATAGACATTTTCATTTTAGTTGGATACCTCTAATTCTAACTATGGAAATTACATAAAATTATTTAAAATAGATAATGTATCATCTATAACCTTATCTAAATTTTGGCTTGCATCAATAACTTTAATTCTTTCTTTGTTGCTTTCAGCTAATGATAAATAAGCTTGTCTTACCTTATGATAAAAGTCCATAGATTCTTTATCTAATCTATCTACTTGATTTTGACGATTATTGCTAATTCTCTTCAAACTTATCTCTGGTTCAACATCATAGTATAAAGTTAAATCTGGTTTGAGATTTTCAGTAGCAAACTCATTTAATTTAATAACTGGCTCTACACCTATATCCCTAGCTACTCCTTGATATACTACAGAACTATCAACAAAACGATCACATAGGACTAACTTCCCTTCATTCAAAGCTGGTAGTACTGTATCAACTAAATGTTGTCGTCTAGCTGCCGCATATAGTAATGCCTCTGTTCTTGCATCCATTTCTGTATATTCAACATTTAAAATAATCTTTCTGATAGCTTCTGATATTCTATTTCCACCGGGTTCTCTGGTCCAAATATAATTATCTATTTTCTTACCATTTAGATGCTCTATAACACCCTTTAATACACTTGTTTTACCTGAACCATCAATACCTTCAAATGTTATAAATTTTCCTTCCAATAAAAAAACCTCATTGCATATAATATTAATTCAATTCTACTTTAATTTTTTCTTTATGTCTAATTGCAAAAAATAAAAAGAGGAACTGCTATTTTAAATTACAATTCCTCTTTCTTTAATTAATGATCTATTACAGAGGATTGAATATGTCCCCTGACATTTCGCAACTTAGCTTCTTGATATAAAAATTGATATTTAGCTTTTGCAAGCTGAGTTTCAGCCACTAATTCCTCATCTACTTCATATACAGCTTGTTCTGTTTGTCTAGCGTGATCCCAATTTTTTTTAGCCTGATCTATTAAATAAAGTAGTTCTTCATCGTATTCTTTGCGTAATTTCTTTTTATTTCTACCGAACAGAATACCCACCACCTTAAATTTCTTGTCGTCCTTCAATAGCTTTAAATAATGTCATCTCATCTGCATATTCAATATCACTACCTACAGCTAATCCATGTGCTAATCTAGTAACCTTTATATTAGCTGGTTTTACTAAACGAGCAATGTACATAGCAGTTGCTTCTCCTTCAGGGGTTGCATTAGTAGCAATGATAACTTCCTTTATTGCTTCATTTTTCTGCAGTCTTCTTAAAAGAGAAGCAATATTTATATCTTCAGGACCTTTTCCTTCAATTGGAGATAATACACCATGGAGTACATGATACAAACCATGATACTCATTCATTCTTTCTAATGACATTACATCCTTTGGTTGTTCAACAACAACAACCTTACTATTATCTCGCGATTTATCAGCGCAAATCATACAAGGATCACTTTCAGTAATATTGCCACAAATACTGCAATAACTTAAATCTCTTTTAGCAGAGATCAGAGATTGAGCAAATTCAGTCACATCATCCTCTTGCATATCAATTGTATAGAATGCTAATCTAGTTGCCGTTTTACTACCAATTCCTGGTAATTTCATATAACTATCAATTAATTTAGAAATAGGTTCTGGATATTGCATCTAATAACCCCTTCCTTCTAGAAAAATTATAGTCCTGGAATATTACGAGAATATTTACCCATTGTTTCTTGTGTTTGTTTATCAATCTTGTTCATAGCATCATTAACTGCCATAAGTACTAAATCTTGTAACATATCTACGTCATCTGGATCAACAGCTTCTTCCTTGATAGATATATCTGTCATCTTGTGATCACCAGTAAATTTTACTACTACAGCATCATCAGCTGCATGACCTTCAAAAATAGTTGCATTTAGCTCATCTTGATCCTTTTTCATATTCTTTTGTAGTTTTTGCATTTGTTTCATCATACTTTGCATGTTCATACCACGCATCATTATTCATCATATCCTTTCAATTAATCATTTTTTATTTCAACAATGTCTGTACCAAATAGTTCCTCAGCTTTTTGTATAATAGTTGGCTGAGTTGAAGCAGATTGATTATTATTATCCTGAGATTGTTCATTTGTATCGTCAGTAATAACTACTGCCCCATTTTTTCTTTGTTTAAGATAGTTACTTCTTATTTCAGGCCAATTTTCTACTGGAATCAATACTAAACTTGGAACCTTTCCAATTAGTCTATCTAATCCATTTTCCAGAGTATCTATCAACTCTTGGTCTTCAAGAGCCTTTTGGCATAAAAATGCATATTCAAAGCCAACAACAACACCATTTTCACTAGCTGCAACAGGCTCACTAACATGCATAATTGCTCTTTGAGTAACAGATAACATATTCATTAAATCTGGCCAAACTTGTTTCAATTCATTTAGTGATTGCCTTGTAGCATTATTTAATACACTATAAACTTGTGACAAATTAATTTTAACATTTTTTTGTCCCTTTGTTGTATTTTTTCTAACTTGCTTTCTAGGTTCATTATTCTTTTCAATTTGAATTGTATTACTGGATAAACTATCCACTTTACGTTGTAAGTTTTCTATTTTTTGCTTTAATAATTCAATTTGGCTCAAATCAACATTCGATACCCTATCAGCTTCACTGTTCGTACTTAATTGCGTTAGTTTGACAGTTAATACTTCCAAATAAATAGATTGGTGAGAACTGAATCTCATATTCTCTTGCTGTTTATTTAATTCATCTATGATTTGGTAAATTTGAGTAACATTTATTTGTTGAGATAATTCCTTAAATTTATCATCTAATAAACCTAATTCGCCATCAGAAACCATTTCTGGTGCTTGTTGGTATAATAGTAAATCCCTACAATAATTAATTAAGTCCTCAATTAAGCGATTGGCATCTTTACCTTGTTCTACAATCTGCTGAATTTCTTTTAAAGCATTAGTCGTATCTTTAGATAGTACAAATTTCAGATAATTAAATAGACTTTCTTGTGTAACACTCCCCGTTACTAATAATGCGTTATCTAAAGTAACATTATTATCACCAAAAGAGATTACTTGATCTAGTAAACTTAAAGCATCACGCATTCCACCTTCAGCAGCTTTAGCGATTACTTTTAAAGCTTTATCATCATAATCTACATTTTTTTGATCTAAAATATAAATCATTCTTTGTAAAATAGACTCAGCAGTTATTCTCTTAAAATCAAATCTCTGCGTTCTTGAGATGATAGTTGCTGGGATTTTATGCGGTTCCGTTGTAGCCAAGATAAAGACTACATTTGCTGGAGGTTCTTCAAGGGTCTTTAACAAAGCATTAAATGCACCAGTTGATAACATATGAACTTCATCAATAATGTATACTTTATAATCAGCTTCTGTGGGCGCATACTTTACTTTATCCCTAATATCTCTAATTTCCTCTACACCATTATTAGAAGCCGCGTCTATTTCAATAACGTCATTTAAACGCCCTTCCGTAATGGCCTTACATGTTTCACACTCGTTACAAGGCTCACCTTCTTTTGAAAAGCGACAATTTATAGCCTTGGCAAAAATCTTTGCTGCAGATGTCTTACCAGTTCCTCTAGGACCAGTAAATAAGTAAGCATGCGAGGTTTGGTGAGTTATAATTGCATTTTTCAGAGTTTTGGTCACCATTTCTTGACCAACTAGATCCATAAATCTTTGTGGACGCCAAACTCGATAAAGAGCCTGATAACTCAAAGAGACTCCTCCTTCCAAAATTCATCAAAAAAAATCTCTCGGTTGCTCCAAGAACAAAACCGAGAGTTAACATTTCATATTAACTTAAGGCACATGCGAACTCTGCTTAGTGCTGCTTCCTTCCGGACCTGACACGCTTCACAAAGACAACATTGCCTCAAGGCCTTGCGGCAAATACTATGATACACGAATTAGTCAAAAATATCTAGTCTTTCACTCGATTTTTTCTTTTTTTCTTCATTTTTTTCCTAATTGATTTAAAAAAATCTTTCAGAATAGAAGCACATTCATTTTCTAAAATTCCTTTTTCTACAAATGATTGATGATTAAATCTGCTATCTTCAAGTAAATTCATCAATGTTCCTACAGTTCCTGCTTTAGGATCAGATGCACCATAATATACTTCAGGAATTCTTGAATTAATAATCGCTCCACTGCACATTGGACAAGGTTCTAATGTTACAAAAAGTTGAGTATCGACTAACCTCCAACTATTAACTGTTTCATTTGCTTCCTCAATGGCTAACATTTCTGCATGTAGTGTAGAATTCTGACTATGTTCCCTTAAGTTATGCCCTCTCCCAATGATTTTTCCATCTTTTACAATTACACAGCCAATTGGCACCTCTCCAATCTTAGCTGCTAATTTTGCTTCAAATAAAGCTTCTTTCATAAATTTCACTTTTTGTTCATCAGTCAATGGCAAGAAAATCACCTCGCTATTTAATCATTTCACTTTGTAAAATAAAATATCCCTTCTTCTTATTTAAAGTTTGACAATTTTCAAATACTTCATTTAATTTCTTTATTGCAGAAGGAGCACCTTGTTTCTTTTGAATTACAGCTACAATACTGCCACCGAAATTTAAATGTTGCTTTGATCCTGCTAAAATCCCATGAACAACATCCTTTCCCGCTCTTATAGGTGGATTTGTAATTATCAAATCATAATCAGTTTCATTAATATCTTCATATTGACTAGATTTAAAAATCTTAACGTTATTTATATTGTTATTTGCTGCATTTTTCTTAGCTAATTCAAGAGCTAGTTCATTGACATCTACCATATCTACCTGACTATTTGGATATGCTTTTGCTATTGACAATCCAATAGGACCATAACCGCAACCCATATCTAGTATTTTTTTATTATCTAAATCTAAATTAGCATTAATAGTTTCTAATAGTACTCTTGTACCAAAATCAACCGTATTTTTTGAAAAAACTCCATTATCTGTTGTAAAATGTATGTTATTTCCCAGCAATTCGAAATTCCACTTTTTTTCTTTATGTTCTACGTCTGGGTTTGAAGAATAATAATAATTAGTCATTGTCTTTTTCTCCTGTAATTTATATCTATAATAATACGCATTTTTTTCTACCTTAGCAAATTATTGTTTTTACCAAAATTCCCATTAACACAACATGTCGGACACTATTATTAAAAATCCACAATATATGGTGTAGTTAGACTTGAATTTTTCTCTATATATTGTATACTAAATACACGAAGAAGTTACGGAGGTAGTTTTTATGAAATTAGATTTATTCACTAAAAACAATTGTATTCAATGTAAAATGACAAAAAAATTTTTAAAACAACATAACGTTGAGTTTGAAGAACACAACATTTCTGAAAATCCTGAATATATTGACTATTTAAAGAACAAGGGATTCCAAGCTGTACCTGTGTTGGAAGAAAATGATTCCCCTATCGTAAATGGTTTCCGTCCAGACTTATTGAAGAAGTTGATTGCTCAATGAAAATAGTTTACTTCACGGTAACTGGACAAACAAAAAGATTTATCAAAAAATTAGGCAGCAACTATGAATATTTTGAAATAGATGCTGCCAATCCTTTTTTTGAAGTAAGTGATCCCTTTGTATTAATTACACCTACTTATGATAAACAAATAACAGAACCCATAAATGAATTTTTAGAGTATCAAAATAATAGTCATTATCTTAAAGGAATTGTTGGAACTGGTAATCGTAACTTTGCTGAATTATTTATCTTTACAGCAAAGAATCTATCTTACGAATATCACGTTCCATTAATTTATGCATTTGAATTTAATGGAACCCCTACTGATGTTTCAAATTTTAAGAAAGCGGTGAAGGAACTTGAGTCTAAAGGACATTGATATTAGTAAAGTTACTTATTTTGATTTAAATAATGAAATAAATATTCCTGTAAATGGTCAAATCCAATTAGGAAAAGATAAAGAGGCTCTTAAAGCCTTTTTAAATGAAAATGTTAAGCCTAATACTAAACAATTTTCTTCAATTAAGGAACGAATTAATTATTTAATTCAAAATAACTACTATGAAGAAGAGTTTATTTCTAAATATTCATTTGAATTTATCGAAAAATTATATGATTACCTAAAAAAAGAAGATTTTCATTTTAAAACTTTTATGGCAGCATATAAATTTTATGCTCAGTACGCTTTAAAAACTGACGATAATGCCTACTATTTAGAAAACTTTATAGATAGAGTTGCTACTAACGCTCTTTATTTTGGTGATGGAGATGAAAAATTAGCTTTAGAATTAGCTGATGAATTAATCCATCAAAGATATCAACCTGCTACTCCAAGTTTCTTGAATGCCGGTCGTAAACGCCGTGGAGAACTGGTATCTTGTTTCTTAATCCAAATGACTGATGACATGAATTCAATCGGAAGAAATATTAATTCTGCCCTACAATTATCACGTATTGGCGGTGGTGTTGGTATTAATCTTTCCAATTTACGCGGTGCTGGTGCTCCTATTAAAGGAATTCATGGAGCTGCATCTGGTGTCGTTCCTGTTATGAAGTTACTTGAAGATAGCTTTACATATTCAAACCAACTTGGTCAACGTCAAGGTGCTGGTGCTGTTTATTTAAATGTCTTCCATCCTGATATAGAAGCATTTTTATCTGCTAAAAAAGAAAATGCTGATGAAAAAATTCGTGTAAAGACCCTTTCATTAGGATTAGTAGTTCCAGATAAATACTACGAATTAGTAGCTAAAAATGAAGACATGTATCTTTTTGATCCTTGGGGAGTTGAACGTGTTTACCACAAACCATTTTCTTATGTGGATATCACTAAAGAATATGATAATATGGTTGCTAATCCAAATATTCCTAAGAAAGTTATTAAAGCTCGTGATTTAGAAGAACAAATTTCTAAGTTACAACAAGAATCTGGATATCCTTATGTTATTAACATAGATACTGCTAATAGAGTAAATCCTATTTCTGGAAAAATTGTTATGAGTAATTTATGTTCCGAAATTTTACAAGTCCAACGTGCTTCAGTAATTAATAATCGTCAAGAATATGAAGTTCTAGGGACAGATATTAGCTGTAACTTAGGTTCTACTAATATTGTTAACCTTATGGCATCACCTAACTTCGGTAAATCTGTTGAAGTTATGACTAGAGCTTTAACTTTTGTTACTGATAAATCGGATATTGATGTTGTTCCATCAATCCAACACGGAAATCGATTAGCTCATACTATCGGTTTAGGTGCTATGGGGTTACATGCTTACCTTGCTAAAAATCAAATTGAATATGGATCACCTGAAGCTCTTGAATTTACTAGTGTATATTTCATGTTACTAAACTATTGGACTTTAGTAGCTTCAAACAAAATTGCAAAAGAAAGAAAAGTTACTTTTGATAATTTTGAAAATAGTAAATATGCTGACGGTAGTTACTTTGATACTTATTTAAATCAAGAATTTGCACCAAAAAATGCACGTGTTAAAGAATTATTTGATGGTATCTTTATACCTACAAAATCTGACTGGACTAGTCTTAAAGAAAATGTTATGAAATACGGCTTATATCATCAAAACAGATTAGCTGTAGCACCTAATGGCTCTATTTCATATATCAATGACACAACAGCTAGTCTACACCCTATCATCAATAGAATTGAAGAACGTCAAGAAAGAAAAATTGGAAAGATTTACTATCCTGCACCTTACTTGTCAAATGAAACTTTACCTTATTACAAATCAGCATACGATACTGATATGCGTAAAGTTATCGATACTTATGCAGCAGCTCAACAACATGTTGATCAAGGTATGAGTTTAACATTATTTATGCGTTCAACAATTCCAGCAGGTTTATATGAGTGGAAGAATGGAAGAACTGATAAAATGACAACTAGAGATTTATCTATTCTTCGCAATTATGCACATTATAAAGGTGTTAAATCTATTTACTATGTACGTACTTTTACTGATGATGCATCTGAAGTTGGTGCAAATGAATGTGAAAGTTGTTCAATTTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP029616|362687:371710|362687_363683_-|WP_003706523.1|DBSCAN-SWA MKMSITERQPFLTKHFAKLIRENKLVHAYLLSGAEGTGKIELAKWVAKGIFCLNSQNGVPCLKCSECNRIENNNHPDVVTIMPDGLSIKVEQIRYLKSEFNKSGVESDRKVFIIQDAQKMSIGAANSLLKFLEEPSGNITAFLLTSEPQKLLPTIISRCQEVEMQQLTSGQLEQELISESISEKNSHILANLAQSVVEAKKINDNENFDKILATVNNWYRKLLRKDLLSFVMIQSKIIGLIQNKEDQNLVLQVIILTVRDTVLERFGLTEEIVFKENIDFIQQNTAQITNDKLVNGLNLVVESNRKLASNISMQNMLETLTLNLFDCYFNK >NZ_CP029616|362687:371710|367619_368087_-|WP_191981183.1|DBSCAN-SWA MKEALFEAKLAAKIGEVPIGCVIVKDGKIIGRGHNLREHSQNSTLHAEMLAIEEANETVNSWRLVDTQLFVTLEPCPMCSGAIINSRIPEVYYGASDPKAGTVGTLMNLLEDSRFNHQSFVEKGILENECASILKDFFKSIRKKMKKKRKNRVKD >NZ_CP029616|362687:371710|368133_368745_-|WP_069469117.1|DBSCAN-SWA MTNYYYSSNPDVEHKEKKWNFELLGNNIHFTTDNGVFSKNTVDFGTRVLLETINANLDLDNKKILDMGCGYGPIGLSIAKAYPNSQVDMVDVNELALELAKKNAANNNINNVKIFKSSQYEDINETDYDLIITNPPIRAGKDVVHGILAGSKQHLNFGGSIVAVIQKKQGAPSAIKKLNEVFENCQTLNKKKGYFILQSEMIK >NZ_CP029616|362687:371710|365342_365657_-|WP_080550229.1|DBSCAN-SWA MMMRGMNMQSMMKQMQKLQKNMKKDQDELNATIFEGHAADDAVVVKFTGDHKMTDISIKEEAVDPDDVDMLQDLVLMAVNDAMNKIDKQTQETMGKYSRNIPGL >NZ_CP029616|362687:371710|369174_369558_+|WP_081534847.1|DBSCAN-SWA MKIVYFTVTGQTKRFIKKLGSNYEYFEIDAANPFFEVSDPFVLITPTYDKQITEPINEFLEYQNNSHYLKGIVGTGNRNFAELFIFTAKNLSYEYHVPLIYAFEFNGTPTDVSNFKKAVKELESKGH >NZ_CP029616|362687:371710|368947_369178_+|WP_003700670.1|DBSCAN-SWA MKLDLFTKNNCIQCKMTKKFLKQHNVEFEEHNISENPEYIDYLKNKGFQAVPVLEENDSPIVNGFRPDLLKKLIAQ >NZ_CP029616|362687:371710|364463_364703_-|WP_011476227.1|DBSCAN-SWA MFGRNKKKLRKEYDEELLYLIDQAKKNWDHARQTEQAVYEVDEELVAETQLAKAKYQFLYQEAKLRNVRGHIQSSVIDH >NZ_CP029616|362687:371710|365674_367414_-|WP_003706519.1|DBSCAN-SWA MSYQALYRVWRPQRFMDLVGQEMVTKTLKNAIITHQTSHAYLFTGPRGTGKTSAAKIFAKAINCRFSKEGEPCNECETCKAITEGRLNDVIEIDAASNNGVEEIRDIRDKVKYAPTEADYKVYIIDEVHMLSTGAFNALLKTLEEPPANVVFILATTEPHKIPATIISRTQRFDFKRITAESILQRMIYILDQKNVDYDDKALKVIAKAAEGGMRDALSLLDQVISFGDNNVTLDNALLVTGSVTQESLFNYLKFVLSKDTTNALKEIQQIVEQGKDANRLIEDLINYCRDLLLYQQAPEMVSDGELGLLDDKFKELSQQINVTQIYQIIDELNKQQENMRFSSHQSIYLEVLTVKLTQLSTNSEADRVSNVDLSQIELLKQKIENLQRKVDSLSSNTIQIEKNNEPRKQVRKNTTKGQKNVKINLSQVYSVLNNATRQSLNELKQVWPDLMNMLSVTQRAIMHVSEPVAASENGVVVGFEYAFLCQKALEDQELIDTLENGLDRLIGKVPSLVLIPVENWPEIRSNYLKQRKNGAVVITDDTNEQSQDNNNQSASTQPTIIQKAEELFGTDIVEIKND >NZ_CP029616|362687:371710|364716_365316_-|WP_003700665.1|DBSCAN-SWA MQYPEPISKLIDSYMKLPGIGSKTATRLAFYTIDMQEDDVTEFAQSLISAKRDLSYCSICGNITESDPCMICADKSRDNSKVVVVEQPKDVMSLERMNEYHGLYHVLHGVLSPIEGKGPEDINIASLLRRLQKNEAIKEVIIATNATPEGEATAMYIARLVKPANIKVTRLAHGLAVGSDIEYADEMTLFKAIEGRQEI >NZ_CP029616|362687:371710|369538_371710_+|WP_081534849.1|DBSCAN-SWA MSLKDIDISKVTYFDLNNEINIPVNGQIQLGKDKEALKAFLNENVKPNTKQFSSIKERINYLIQNNYYEEEFISKYSFEFIEKLYDYLKKEDFHFKTFMAAYKFYAQYALKTDDNAYYLENFIDRVATNALYFGDGDEKLALELADELIHQRYQPATPSFLNAGRKRRGELVSCFLIQMTDDMNSIGRNINSALQLSRIGGGVGINLSNLRGAGAPIKGIHGAASGVVPVMKLLEDSFTYSNQLGQRQGAGAVYLNVFHPDIEAFLSAKKENADEKIRVKTLSLGLVVPDKYYELVAKNEDMYLFDPWGVERVYHKPFSYVDITKEYDNMVANPNIPKKVIKARDLEEQISKLQQESGYPYVINIDTANRVNPISGKIVMSNLCSEILQVQRASVINNRQEYEVLGTDISCNLGSTNIVNLMASPNFGKSVEVMTRALTFVTDKSDIDVVPSIQHGNRLAHTIGLGAMGLHAYLAKNQIEYGSPEALEFTSVYFMLLNYWTLVASNKIAKERKVTFDNFENSKYADGSYFDTYLNQEFAPKNARVKELFDGIFIPTKSDWTSLKENVMKYGLYHQNRLAVAPNGSISYINDTTASLHPIINRIEERQERKIGKIYYPAPYLSNETLPYYKSAYDTDMRKVIDTYAAAQQHVDQGMSLTLFMRSTIPAGLYEWKNGRTDKMTTRDLSILRNYAHYKGVKSIYYVRTFTDDASEVGANECESCSI >NZ_CP029616|362687:371710|363717_364344_-|WP_003703369.1|DBSCAN-SWA MEGKFITFEGIDGSGKTSVLKGVIEHLNGKKIDNYIWTREPGGNRISEAIRKIILNVEYTEMDARTEALLYAAARRQHLVDTVLPALNEGKLVLCDRFVDSSVVYQGVARDIGVEPVIKLNEFATENLKPDLTLYYDVEPEISLKRISNNRQNQVDRLDKESMDFYHKVRQAYLSLAESNKERIKVIDASQNLDKVIDDTLSILNNFM |
11 | Streptococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
638512 : 644100
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP029616|638512:644100|DBSCAN-SWA TATGCAAAATCGAGTTTTTGTCATCAATAAACATGGTAAAGCACTAATGCCATGTAAACCTAGAAAAGCTAGAATCTTGTTAAGAGATGGTAAAGCTAAGGTGCTTAAAAAAGAACCTTTTACTATTCAGCTCTTATATGGTTCAACTGGTTATAAACAAGATATAAGTGTTGGTATTGATAGTGGTCAACGGTATATTGGACTAGCTGTTACAAGCCAAAATAAAGTTTTATTTCAAGGCGAAGTAGAGTTAAGGCAAGATGTTAAAAAACTAATAGATACTAGAAGAACATATCGTAGAAGTCGACGCAATCGTAAAACACGTTATCGTAAATCTAGGTTTTTAAACCGTATAGCTAAGAAAAAAGATAACTGGTTGCCACCATCAGTGGCAAGTAAAGTTAACCATAATATCAACTGGATAAAACGTTTATTATCAGTCTTACCTAAAGCTGATTTACATATCGAAGTAGGTAAGTTTGATATGCAAAAAATGAAGAATCCAGAAATAAATGGTGAGGGGTATCAACAAGGTGATTTATATGGTTATCAAACTGTTAAACAATTTGTTTTGGCTAGAGATAACTATACTTGTCAAGTATGTAAGAAAAAAGGTGGTAAATTTAAGATCCACCATATTATCTACCGTTCTTTAGGTGGAACTAACACTGTAGATAATCTAATTACTGTATGCTCTAATTGCCATACAACTAAAAATCACCAAACTGGAATCTTAGCTAAATGGTGTAAGGATAAAATGAAAGTTAACAAATCATATAAAGGTGCGACTTTCATGAATATTCTTAAAAGAAGGCTATTTTTAGCTTTTCCTCAAGCTAAATTTCAGTATGGAGCATGGACGACACTACAACGAGTTGACTTAGACTTAACTAAATCCCACTATAATGACGCTGTAGCAATTAGTGGTATTAGAAAAGTCAAAGCAAAACCAACTAGCATTATGATGTTTAAACAATTTAGAAAGAAAAAGCGTTCCTTACATGAGGCTACGGCACGTAAGGGTCGTAAAACACCTAATATAACAAGTAAAAGAAACGCTAAAAATACTAAATATGCCAAAGGTTTTTGGCTTAATGATTATGTCAAAATCAAGGATAGTAACAAAAAAGGCTATATTAGTGGATTTATGTCTAAAGGAACGAACGTAAGGTTAAGAGATATTTTTGGTGAGTATGTAAGCAATAGTGATAAAAGTTATACATCAACTAAAAATATCAGCTTAATTAATCATAGTAATAATTGGCAAAAACAAGTAATTACTGAAAAACAATATATTATGGGATAGCGTATTAATAATATTATGTAAGAAAGGAGTATGGCGAGATTAGCTTGCTTTAAGCAAGCTACGGCTATTCCTCCCCTACTAAAGTAGGGGATTCTCGCCGAATTATCATTGAAAAATAGTTAACTAAAATCCCTACTAGGTTACTTTAATTGCAACTTAGTAGGGATTTTTCTAGTCATTAATAAAAAAGATAGCAATCGATTCATGATCAATCACTATCTTTTCAAATCTATTTAACTGTCCATCCACCATCAATCGTAAAAACAGTTCCGTGAACATAATCAGCTCTTGGACTTGCCAAGTAAAGTGTCATTTCTGCTACTTCTTTAGGTTTTGCCCATCGTTTAGCTGGTGTGAGTCTGGCTACTTCTTTAGCCATCGCCCCATCTCCAGCAAAATCAGCTGCATTCATCGGTGTATTAATTGCTCCTGGAGCTATACAATTAACTCGAATTCCCTTATCAGCGTAATCATAAGCCAATTGTTTAGTGTATCCAATAATTCCGTGTTTCGCCGCTGTATAAGCTGCTCCACCACCACCAGCAACCAATCCCGCAATAGAAGCCATATTTACAATAACTCCATGTTTCTGTTTCAACATTATTGGTAAAATTTCATTAGTCAACAAGAACATACTTTTTAAATTGGTATTAAAAATATTGTCCCATTGTTCTTCACTAGTATCTAAAGTTGGTGCATAATTATCTAGAATACCAGCTGTATTTAATAAAATATCCACAGTTGATAATTCTTTTTTTATTTTTCCTGTCCACATGTGAATATCTTTTTTCTTTCTTATATCCACTTGTTGAAAACTTAAAGTCGGAAATTTTTGCTCTACTTCCTTAATTTCTACACTTTCTTTAATATCAGCTCCATAAACTATTGCTCCTGCTTGTAAAAATGCTTTAGTTTGTTCTAGTCCTATTCCAGAGCTGACACCTGTCATAACAACTACTTTTCCTTCAAATTCTGGATAAAGGTTCATTATTCTACAATCTTCCAATCATCAGCTAATACATCGCAAGAAGTTGGCATAAATTGTGATAAAGCTGGTTCTTCTTTTGTTCTAATCATCAAATATGGGTTAACTTTTTCTCCATTAAGAGTATCATTATCAACTACGAAAATGTATTCCTCAGAGCCACCCCAACCTTCAGTACGAACAGCTTTTTTACCTTTTTTTAATTCTGGTAATACTTCTTCAAAAGTCATAATCTTCCCTCGCTTATCTAGTTAAATCAATACGTTTACTTAAAATCCACATTAAAATTGCACCAATTAACATTGAACCAAATTCACCGATTGCTACAGTGAAATATGTTGGCCAAAATGGTAGCTTACTTACATAATATAATTCCAATGCTACACTCCATGTCATAACAGTACAAATTATAACTGTAATTAAGAGCTTTAATGGGACTGATTTTACATGTTTACTTAATAAATAACTTAGCCCCGTCATAACTAATGTTCCTAATGAACCAAAAATGACATCAACGATTCCCATTGGAGACCAAAGATTTGCAATTGCACATCCAATTGTCAATGCCCATATATAACGTTTATTGAAGACTACCAAGTTATTAAATACTTCTGATAGTCTGAATTGAATTGCTCCAAAACTTAAAGGAGCTAAACCTAGTGTTACTGCTGCATATAAAGCTGCCACTAAAGCACCTTTAATCACCGCAATAAGTTTTTCGTGTGATTGTGTATCAACCATATAAATTACCTGCTTTCTAGTTTTTTTAACTGGGATGTTTACGAACCAGTGTGGAAAAGCCACGAAATACAGTATAACAAACTTTTTTGAATAACAAAAGCGACCACAAGAACTATTTAAATTCTCGCAGTCGCTTTTTCTTATGGGTTAATTTTATTTTTTGCAACGTTCTAGGCTCCAATTATTCATTTGACTTTTCTTCAGCTTCTTGAACAGAGGAAGCCTTTACAATTGTATTAGTTACGTGACCATCTTTAACAGTTTCAACTAAATACCACTTCATATGCTTCACCTCCTAAAAATTTAGTAATACTATCTACAATCAATATGATAACACTTTCACAAGCAATGTTCAAATATTTTTATACCGTTTTCATAACTTTTATTAAATACTTAATAAATTTACTTATCCATTACTTGATTTTAGCTATTCTATATCTTTTGCAATTTAATTTCAACAAAAAAACACTAAAACTTAGGAGTTTTAATGTTTCTTAAGAGTTATTCAGATATAACGGTTTTCCAATCTAAACCAAAACTTATCCCAATACTTTTCTTTCCTGTATAAATAGCTAAAGATATTGGAAGCTCATCTTTTTCAATTTTAGCAGTTGGAAAATTTTCTTGTAACAATTCATATAATTCGCCAAATTGACTATTATTCTCAGCACCCATTAGGGTAATCCGCATCTGATCATTCATGCTATGATACTGAGAAATAATTAGCTCTAATACCTCACTATAGGCTTTCTTCTCTCGATAGTGTGTATTTACCATCGCTAATTTTCCGTTCTCATTAAATTTCATCATTGTTAATGGACGCAAAAATAGATTCGACATTGAATTTACACCGTTCGATACATATCCCGTCTTCATTAGTTGATAGATATCAGAAATAAGCATATAAGTGCGATTATTATTTCTTAAATTAATAAGTTGATCTACAACTTGACTAACTGTTTTTCCGGATAAAAGCATTTCACCAGCCAACTCAACCATTTGTCCTTGTAAGGCTCCACTAGAGTAAGAATCAAATACAGTTATCTTTCTATCCGAAGTTTTAGCATATGATGATACTACTTTAGGTAGGCTACTGATCCCGTTAGCTAAAGAAATATACAAGAACTCATCATAACCTTCTTTTTCTAGACTTTCAAAATATTCTTCTAGATAAGCCGTTGATATTGGTTCTAAAACCGGAGTATCAGTCCTTTTGTCTAACATTTTATCTCTTAAATAAGGCGTCATCCCTGTTTTTTCTGGATATCTACTACCTTCAAATTCAATAGACAATTCAATTTGATGAATATTAAGTTCTTTTATCTTATCAACTGTCAGACAAGCTGAAGTATCAGTTAAAATTGCAACTTTCATTTATTTATCCTTTAAATTATTCTATTCAAAAACGACACTACTATTTCATTTTATCATACTTTTTGTTTGTCTTATAACTTTCCTAACCAAGATCCACAATATGCGGCTAGTATTCCACATATCACTGTTAATGATAAATATATAAGCATCATTTTTTGCTTGCGATTATTAACAAGTGTTACTAATTCTACTTGAAATGTGGAAAAGGTTGTATATCCACCTAAAAAACCAGTCCCTAATAGTAACAATATGTGACTACTTGTGATTTTGCTGTGTAAAAATCCTAATAATAGGGCTCCAGTTATGTTGATAATAAAAGTTGCCCAAGGAAATACTCTAGTTCTGCTCTTCAATGCTTGTGTCATTAGATACCGCACAGATGCACCTAATCCAGCTCCTAAAGCTACTTCTATCATCTTCGATCACCGACTTTTCCTAATTTTATTCCTAAAATCATTCCTGTATATGCTAATAGGAAACCACCTACTACACTTATCAACAAGTAAAAGGTAGCATCAGTAAATGTAGACAAGCCTAAAATATCCACTGTAAATGTGGAAAAAGTTGTGAAAGCTCCTACCATTCCTGTCCCTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP029616|638512:644100|638512_639817_+|WP_003705370.1|DBSCAN-SWA MQNRVFVINKHGKALMPCKPRKARILLRDGKAKVLKKEPFTIQLLYGSTGYKQDISVGIDSGQRYIGLAVTSQNKVLFQGEVELRQDVKKLIDTRRTYRRSRRNRKTRYRKSRFLNRIAKKKDNWLPPSVASKVNHNINWIKRLLSVLPKADLHIEVGKFDMQKMKNPEINGEGYQQGDLYGYQTVKQFVLARDNYTCQVCKKKGGKFKIHHIIYRSLGGTNTVDNLITVCSNCHTTKNHQTGILAKWCKDKMKVNKSYKGATFMNILKRRLFLAFPQAKFQYGAWTTLQRVDLDLTKSHYNDAVAISGIRKVKAKPTSIMMFKQFRKKKRSLHEATARKGRKTPNITSKRNAKNTKYAKGFWLNDYVKIKDSNKKGYISGFMSKGTNVRLRDIFGEYVSNSDKSYTSTKNISLINHSNNWQKQVITEKQYIMG >NZ_CP029616|638512:644100|643776_644100_-|WP_081535002.1|DBSCAN-SWA MAKNITPEDLADVTKEGLTLVDFWAEWCGPCKMMNPVLEELEKDYQGKVKFAKVDVDKYQDLAMEYKIMSIPAMILFKDGVAKEKVVGFHPKKDMANYLDEKLAEVE >NZ_CP029616|638512:644100|640046_640805_-|WP_003705371.1|DBSCAN-SWA MNLYPEFEGKVVVMTGVSSGIGLEQTKAFLQAGAIVYGADIKESVEIKEVEQKFPTLSFQQVDIRKKKDIHMWTGKIKKELSTVDILLNTAGILDNYAPTLDTSEEQWDNIFNTNLKSMFLLTNEILPIMLKQKHGVIVNMASIAGLVAGGGGAAYTAAKHGIIGYTKQLAYDYADKGIRVNCIAPGAINTPMNAADFAGDGAMAKEVARLTPAKRWAKPKEVAEMTLYLASPRADYVHGTVFTIDGGWTVK >NZ_CP029616|638512:644100|640804_641032_-|WP_003701248.1|DBSCAN-SWA MTFEEVLPELKKGKKAVRTEGWGGSEEYIFVVDNDTLNGEKVNPYLMIRTKEEPALSQFMPTSCDVLADDWKIVE >NZ_CP029616|638512:644100|642044_642917_-|WP_069469010.1|DBSCAN-SWA MKVAILTDTSACLTVDKIKELNIHQIELSIEFEGSRYPEKTGMTPYLRDKMLDKRTDTPVLEPISTAYLEEYFESLEKEGYDEFLYISLANGISSLPKVVSSYAKTSDRKITVFDSYSSGALQGQMVELAGEMLLSGKTVSQVVDQLINLRNNNRTYMLISDIYQLMKTGYVSNGVNSMSNLFLRPLTMMKFNENGKLAMVNTHYREKKAYSEVLELIISQYHSMNDQMRITLMGAENNSQFGELYELLQENFPTAKIEKDELPISLAIYTGKKSIGISFGLDWKTVISE >NZ_CP029616|638512:644100|641045_641543_-|WP_003701672.1|DBSCAN-SWA MVDTQSHEKLIAVIKGALVAALYAAVTLGLAPLSFGAIQFRLSEVFNNLVVFNKRYIWALTIGCAIANLWSPMGIVDVIFGSLGTLVMTGLSYLLSKHVKSVPLKLLITVIICTVMTWSVALELYYVSKLPFWPTYFTVAIGEFGSMLIGAILMWILSKRIDLTR >NZ_CP029616|638512:644100|642988_643333_-|WP_069469009.1|DBSCAN-SWA MIEVALGAGLGASVRYLMTQALKSRTRVFPWATFIINITGALLLGFLHSKITSSHILLLLGTGFLGGYTTFSTFQVELVTLVNNRKQKMMLIYLSLTVICGILAAYCGSWLGKL >NZ_CP029616|638512:644100|643329_643719_-|WP_069469495.1|DBSCAN-SWA MIEVQNVKLGTLISVFFFGMIGGTLRYLLGLKLASTGTILVNLIGSFCLAFLTYYVIERQKLPAWLSTGLGTGMVGAFTTFSTFTVDILGLSTFTDATFYLLISVVGGFLLAYTGMILGIKLGKVGDRR |
8 | Staphylococcus_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
781766 : 836242
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP029616|781766:836242|DBSCAN-SWA TATGCGAAATTTTTTATCATTAATTGGTAAGATATGTTTATTTATTATTTTTATCTTGCTATCACAATTACCATTATTACCACTCATTAGTGGTCAAATTGTTGCACGTTATCCAATATGGATAATTGCACCACTTATTATTGTATGTTATTTAATACTAATTGGAATATTATTTTACACCGTTAAACGAACAACTGGTAAATCTCCATTTAAAAAAGTTACTGGAAAAAATATAAGATTCATTCTTGCGGCTTATGTTGTCATGATTCTCGCTAAGGGTATTCTATTGACTTTAATGACGAAGTTTTATCATCAAACAATTAGTGCTAATGATCAAGCTATCAATTCATTAGTTACTGATAAAACCGCCTTATTAATGACTATATTAGTAGTTGTACTTGTACCAATTACCGAAGAATTGCTTTATCGTGGTGTATTTACTAGTTTCTTCTTCAAAAACCAACCATTTTGGCAAGTTACTATTAGTGGTGTTATCTTTGGTTTAATGCATTCTAGTACAAACTTCATCTCTGCTTTAATTTACGTTACAATGGGCTGGATTTTAGCTTATGTCTATGTACATACTAAAAATCTTTCTAATAGTTTAACCCTTCATATTTTAAATAACGCTCCGTTTATTGCGGTATTATTCAATTAAAAATGAGGCTGGGACTCAAATCCCAACCTCATTTTTATTTATATAGTTCATATGGCACTTCGACATATTTTTCCTGTCCCTCTTCTACTTCAACCTGTCCATTCATCAAATCAACAATTGTAGCAGTAAAAGATTCAACTTCTGGCGTATCAACATAAACTACTGCTGTGACATCAGTCATAAATACCGTATCACTTACATTTACCTGATTATTTTCAAGATAGTTTTGCAGTTTACCCCAGGCAGAATAACTTACCTTCAATGATAATTCTGTTTGAACTACCTTTCTTACTACACCAACCTTTTCGATGGCATTAGAAGTCGCATTACTATAAGCTCTAATTAGACCACCGGCACCGAGTTTGATGCCACCGAAGTAGCGAGTAACCACTGCTGTTACATTGTGCAATTCAAGATTTTTCAACACTTCTAGAATCGGTACTCCTGCAGTTCCAGAAGGCTCACCATTATCACTTTCACGTTGAATTTCATCATTCAATCCAATCATATAAGCAAAACAATTATGTGTAGCTTTACGATGTTCAGTCTTAATCTTATCTATAAATGCTCTTGCTTCTTCTTCAGTCTCCGTTCGAGCTAAGGAACAGATAAATTCTGACTTTTTTATTTCAATTGTTGCTTCACCGTTTTCTTTAATTGTTAGATATGGTTTCTTCAAAGTTGACTCCCTTTTCTAATAATTATTTTTTAGATATTCACGCACAGAAATCAAGTCATCCAAAACAGCCACTGTCTTCTTTCTTTGTTCTTCTGTTGGTTGGATGATATCGGGAACCATGATTACTGGAATTTCAGCGTTATTAGCAGCTTTAATTCCATTAAAAGAGTCTTCTATTACTATCGTTTTTTCTTTAGCAGGTGCGCCACTCTTCTTCCAAGCTTTATTAAATATATCTGGTGCTGGTTTAGCCTCAGCTACATCATCAGCAGAAATAATCGTCTCAAAAGAAGCTGGGTCAACATCTGTATGTTCTAAGAAAAATTCGATTTCACTCTTGTAGTTACTTGAAGCTAAAGTATAAGCAATATCATTTGCTTGAAGATATTGTGACAGTTCTACAAAACCTGGTTTTAATTTCAATTCTCCCGCTTCAACTAAAGGATGCACATTTTCTTCACTAATACGTAAAAAGTCATCAATAAGTTGAGCATCGCCACCATAATCTTCAATCATTTGTGCTCTCATCGCATCTGTTCCAGCACCAATAAACTGCTTGTAATAAGCCAATGAGTAATCCATGCCAAGCTTATCAGCAGCTATTTGATTAGCTTCATAATAAACCTTTTCTGAATCAAAAATAACGCCGTCCATGTCAAATATTACTAAATCCAAATTCATAGTCCTACCCTTCCGTGTTTAATATCTAAAAGTTACTATTATCATTCTAACAAATTTCACTAGAAAGGTCGCAGGATATGTTCTATTCGTTATTTTTTACTGTCGTCACGCAAGATAATTGCCAAAATTAATCCTACAATTTCTAAGATGCAGAAGAATCCAAAGGCATAGTGATAACCAATTATTTCACTTAATGTGTGTCCGCCAGCTACTATAATAATCATCGCCAAAGCTACCCCTAGACTACCTAACAGTTGACGCACAGTCGTAGTTATCGCAGTTCCATGAGGAATCATATTTTCAGGAAGTGAGTTGGCTCCCATAGTTGTTGCTGGCATCATGACAAAGGCATTTCCCCCTTCAATGATGCAAGCAATTAGAATCATTCCTAGTACATTTAAATGGTAGCTGAAGATAAATAGAATTGCCCAACCTACAACTAACATCACCATACCTATCAATAAAGTGATTTTAAATCCTACTTTGTCAGCTAAACGACCAGAAACTAGGTTTAAAATACTCAATAAAGCTGCTGGTGGGACTAATGCTAAACCTGACACTAATGGATTAACATGCAAAATTCTTTGATAATACAATGGATATACGATTGTTACTACAATTAATGAAATATAAGCAAAACCTGTTAATAGAACGCCAATATCAAAGTTAACTACTTTCAAAACTCGTAATTGAAGTAAGGGATCTTTAACTCTAAATTGACGCAAAATAAAGGCTATAAACAAGATTACACTAACAATTAAAATTAAATATAATGGCAAAGTTAACTGCTTAGTGCCTAATTCATTTACAAAATACAACAATCCGATAAAGCTAAGTGAATAGATAACGGAGATGAAGTCTAACTGGCTTTCTTTACGTTCCATTACATCGCGCATATTAAAGATCGCACTAATAAAGATTAACGCAATTACTAACAAGAAAAACCAGAACAAGCCTTGCCAACTAATATAATTTAAAATAATACCAGAAATAATTGGACCACAAGCTAAGGCTGATCCCATAACTAAACCAGCCAATCCCATGACTTCAGCGCGACCTTCTCTAGCGGTGATCGTCATTAAGACTGATTGATAAGATGGAAATAAAATACCTACCGCAACTGCTTCTAGACCTCTTCCTAGTAAAGCGATTGGAAAATTAGGAGCCAAAATAATCATCAATGTTCCTAATTCGAAGATTGCTAGTACCGTTAAGTACATTTTCTTAAAAGATAGATTATTCAACAACCAAGGACTAACTGGCATCATGATACACATAATCAGCATAAAACCGGTTGTTAGCCATTGAATCGTTGGTGCATCTACATTGAAAAACTTCATTAAAGTAGGATAAGCTGTCGATAAAGAGGATTGACTAATCGACATGGTAAAAGTTCCTAACAATAAAGTAAATACAAAAGCTTTTCTTTGGGCTTTAGTCATCATATATTCTCAACTCTCTTCAATAAATTTTACACTATTATCATAGTTCTATTTAGAATTTTTGTAAATAAAATCTTTTTTATTCTTATTTTTAAATGTAAACGGTTCCCAGCGACGATAATTTTATGCTATAATTTATATGAATAGAATAGCTTTTTAAGGATGGTGATAATTATGAACGGTAAGACTTTACGATTATTATTTTCAGTTGGTATTATGGCTTTTGTCCTATTTTCTGGTTATCTGGGCGAGTACGATGCTAAAAAATACATCGATATTATCCTTCTAATCATCGCCTTGCTTATTATTCCTAGACCTAAGCTTTCTTTCAGATTATAATAAACACGTGGAAGTTGGATATAAATTCAACTTCTTTTTTTGGCTACAATATTTCCTAGGAAAGAAGTGATTCATTAAATGGATGAATTTAACAAATTATCCCAAATTAAAACATATACTAAATCAAAATTAGGAACTGATAAAACCGGACACGGCTATGATCATATCAAGCGTGTTGTAACTATGGCAGAAAAAATTCTAGAAAGTGAACCTGCTGATAAGTTAATTACACTAACTGCTGCCTATCTACATGATATTATTGATGATAAACTTGTCTCTGATCCAAAATCTGCTTTGGCCGAACTTCAAGAATTTCTAGCATCTTTAGAATTTACTTCAGCACAGATTGAAGAAATTAGTTTTATCATCACACATATGTCTTTTGCACATTCACTACAAGATGATGACTTCCAACTTCCCCTATCCGGACAAATTGTACAGGATGCTGACTGGTTGGATGCGATTGGCGCAATTGGCATTACTCGAGCTATTTATTATGGTGGACACCACGGAGAAAAAATTTATAATCCTAAGTTACTTCCACGTACTAATATGACGAAGGAAGAATATCGTAATCTTGATGACGAAACCATTATTAATCACTTTTATGAAAAACTATTGAACCTAAAAGATATGTTAAATACTCAAACTGCCAAGAATATTGCTGAACATCGCCAACAAGTCATGCTTGATTTTCTAGATGAGTTCAAAAACGAATGGAATTCTGTAGTCTAACCTCTTGCCTTAGAGTATACTCCAAGGTGTAAACTCTGATTATCAATAATTTTAACGAGGTATTGCTATGAATATTAAAAAAGTTAGTGAACAGTTGGGGATTTCGTCTGATACTATCCGCTACTATGAACGTATTGGACTTGTTCCTGCTATTAGTCGAGACAAAAATGGTGTACGTGATTTTACCGACTTAGACATCCAAAGATTAAACTTCATCAAATGTATGCGTCATGCTGGTTTATCTATCGAAAGTCTACATGAATACATGCATCTTTACTCATTGAATGATGATCGTACCATTCCAGCACGTAAAAGAATCTTAGAAGAAGAGGCTGAAAAATTAGATGAAAGAATTGCTAGTCTTCAAGAAACTAGAGCCTATTTACAACATAAAATTGATGTCTATGATTCACAGCTTACCCAAGCAACCAATGATTTGAAACTATCAGAAGAGTAACAAATAGCC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53 | Streptococcus_phage(27.27%) | holin,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
944310 : 1003076
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP029616|944310:1003076|DBSCAN-SWA 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46 | Bacillus_phage(26.32%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1074084 : 1132186
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP029616|1074084:1132186|DBSCAN-SWA 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58 | Streptococcus_phage(33.33%) | bacteriocin,tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1240314 : 1354736
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP029616|1240314:1354736|DBSCAN-SWA 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91 | Lactobacillus_phage(13.89%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1660394 : 1669167
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP029616|1660394:1669167|DBSCAN-SWA AATGAAAGTTATTTTTCCAGGAAGTTTTGATCCTATTACAAATGGTCATATGGATTTAATTAGTCGTGCAAGTAAGTTATTTGATCAAGTTGTAGTAGTTATTTCCAATAATACTAGTAAACACTCATTATTTACTCCCAAAGAAAAATATCATCTTGTCACTGAAGCATTATCAAAATTTAGTAATGTATCAGTTGAGCTTATTCAAACTGACTTAACTATCAATGTAGTAAAAAAATTTAATGCGGATGCGATTATTCGTGGAATTAGAAATACAAGAGATTTCACGTATGAACAAGAAATAGCATTAATGAATAAAAAGTTAGATAGTGATATTGAAACAATTACTTTATTTTCAAATCCAGAAGTAAGTTTTATTTCTTCAACCTTAGTTAGAGAAATTTCACAGTTTAATTTAGACAAATTGGTTGGGACGGTGCCAGATAATGTTATTGAGGCATTAAGAAAGAAGGTTAAGAATTGAAAAAAGCAAATAAATACATTGTTACTTTAACTATATTGGTAATAGTAGCTATTTTAATGTTTTTACCAATTCCCATTTACTTAGAGCAGCCAGGTGCAGCTGAAAGTATTAATCAATATGTAACGGTTAATGGTAAGACTAATAAGCAAAAAGGTGATTTCATGCTAGTTTATGTTGCTGTTCAAAAAGCAACACCACTAACATACTTATGGAGTTTTTCGCAAAAACATATTGATAGAGTATCAGCTGAAGAAATGACAGGTGGCAGTTCAGATGCAGAATTTGATAGAATTCAAGAATATTATATGCAAGATGCAGTGAACTCTGCCAAATATGTAGCTTTGAAACATGCAGGGAAAGAAGTTAGCCAAAAATATATTGGAATATATGTTATGTCTGTCTTAGATAAATCTGATTTTAAGAATAAAATTCAAGTTGGCGATACAATAACAAATGTTAATGGAAAACATTATAGTAATGCCACAGGATATCAAAATGCTTTAGCAAAAATTAAAGCCGGAGAAAAAGTAACTATTACTTATCAACGTGATGGAAAGAATCATAAGGCTATTGGTAAGACAATGAAATTACCACAAACTAAGAGAACAGGTATAGGGATAACACTGGCTAACCGTTCGAAAGTAAAAACCAATGAAAAGATATCCGCTAATATGGAAGGGATAGGAGGACCATCTGCAGGTTTAATGTTGTCTTTACAAATGTATTCGCAATTGTCGAAAAAAGACTTATTAAAAGGTAGAGATGTTGCAGGTACAGGTACTATTGATGCAGATGGAAAAGTTGGAGATATTGGTGGAATTGACAAGAAGGTTATCTCCGCTTCTAAAGCACATGCTAAAATATTCTTTGCTCCTGATAATCCTGTAAGTAAAGTGGTTAAGAAGTATGACCCGAATGCTAAATCAAATTATGAAGAAGCAGTTGAGACTGCAAAAGAAATTCATACAAAAATGAAAATTGTTCCAGTAAGATCATTTAATGATGCAGTTAATTATTTGGAAAATAATTAGTATAAATGGCGTTATAAAGATTGAAGAAATCTTTATAACGCCATTTTTTTGCGAACTATCATATTATATATGTTTGTTAATTAAAAAACGTATTATAAGTCTTTATATAAACTTAATTATACGTAATATATAAAAGATGGAGTTTATATAATAGACTCAATTATTGTATTTTTCGTTAAAAATGAAATCGTTTTTTAAAAATAAAGTTCATTTTATTTGTTGCATTATTCGTGTTTAATTGATAATATATGGTTTGTAAGGTTTATAAAATATATTTTTTGTTTAAAAGACGAACAATAAGGAGATAGAATAATGTCTGAACTGTTATATGAAGGTAAAGCTAAGCAAATGTGGAGTACAGAAGATGAAAATGTATTAAGAGTAGTGTATATGGACCAGGCTACTGCACTCAATGGTAAGAAAAAGGATGTCATTAAAGGTAAGGGTCATGTTAACAATCAAATTTCAAGCTTAATCTTTGAATATTTGATAAAGAATGACATTCCTACACACTTTATAAAGAAGATTTCTGAGAATGAAGAATTAGTAAAAAAAGTTAAAATTTTTCCACTTGAGATAGTTACACGAAATGTTGCGGCAGGACATTTTTCAACTAGATATGGAGTAGAAGAAGGAAAGAAATTCAATAAACCTGTAGAAGAAATGTACTTCAAGAGTGATGAATTAGATGATCCATTCATTAACGAATCACAGGCATTAGCGTTAGAAATTGCTACTAAGGAAGATTTAAATAGAATCTGGGATTTATCTAGAAAAGTAAATACATTATTGACAGATTTATTTAAACAAGCAGGAATGAAATTAGTTGATTTTAAGCTTGAATTTGGAACTTTAGCAGATGGTACATTAGTTTTAGCTGATGAATTTTCCCCAGATAATTGTCGTTTATGGGATTTAGAGGATAATCGTCATTTAGACAAAGATGTCTACCGTAGAGATATTGGTGATTTAACACCTGTATATGAAGAAGTATTAAATCGTTTGAAGAAAGTGTTAAACAAATAATAGGAGGAACACAACACCATGACAAAGGTACGTATTTTCGTAACATATAAGCAATCTGTTTTTGATCCACAAGGAGAAACAATTACTGAAGCTGTTCATTCTTTAGGACATAATGAAGTAAAAGAAATTAAAGTGGGAAAATTTTTCGATGTAACTATTGATAGTAGAGAAAAAGAAGTTGAAGAATCTGTAAAAGAAATTTCAGAACAATTATTGGTGAACTTTAATCTTGAAACATATCGTTATGAAATTATGGAGGAAGATTAATGAAAATAGCAGTTATTGTTTTTCCTGGCTCAAATTGTGATATAGACTTATACGAAGCATTACACACTGTATGTGATGCAGATGTTGAATATGTTTCATATAAGCAAGATAACTTAGATGGTTTTGATGCTGTAATGTTACCAGGGGGATTCTCTTATGGTGATTATCTTCGTTGTGGTGCAATAGCACGGTTCTCACCTATTATGCCAGCAGTAATAGAATTTGCAAAAAATGGTAAGCCAGTTTTTGGTACTTGCAATGGATTCCAAATTTTAACAGAGGTTGGTCTATTACCAGGAGCTTTGAAGCGAAATAACAGTTTGAAGTTTGTATGTAAAACAGTCGAATTAACTGTTGAAAATACTAATACACCATTTACTTCCTTATATAAAAAAGGAGAAAAAATAAACTTACCTATTGCTCATGCTGATGGAAGTTATTATGCAGACGAAGAATTATTAGCAGAGCTTGAAGAAAATGGACAAGTTGTTTTTAGATATTCAAAAGAAAATCCTAATGGTAGTTTGAATGATATTGCTGGGATTACAAATAAGCAAGGAAATGTTTTAGGAATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTGTTGAAATGTTATTAGGCAATGAAGATGGATTAAGAGTATTCAAATCATTACTAGAAGAAGGAAAGGTAAAAGGCTAATATGAATAAGGAATTAACACCTGAACAAATAAAAGAACAAAAGGTTTATCTAGAATGGGGATTAACACAAAAAGAATATGAATATATTTGTGATAAATTATTAGGTCGCTTACCTAATTATACAGAAACTGGTCTTTTTTCTGTAATGTGGTCAGAACATTGCTCATATAAGAAATCTAAACCAGTGCTTAAACTATTTCCAAATAAAAATGAACGTGTTTTGCAAGGCCCTGGTGAAGGTGCTGGTATCGTAGATATTGGTGATAATCAAGCAGTAGTTTTCAAAGCTGAAAGTCATAATCATCCCTCAGCTGTAGAACCTTATGAAGGTGCAGCAACAGGTGTTGGGGGAATTTTGCGTGATATTTTCAGTATGGGAGCTAGACCAATAGCATCTTTAGATTCATTGCATTTTGGTGAAATTGATAATGCTAGAACTAAGTATCTTATCAATGAAGTTGTAGCTGGGATCGGTGGTTATGGTAACTGTATGGGTATTCCAACTGTTGCTGGAGAAATAACTTTTGATGGTTGCTATGCTGGAAATCCTTTAGTAAATGCAATGAGTGTTGGTATTTTAGACCAAAGTCATATTCAAAAAGGACAAGCTAAAGGTATTGGTAATGCAGTTATGTATGTGGGGGCTAAAACTGGTCGTGATGGTATTCATGGTGCAACATTTGCCTCTGCAGATTTTGCTGATGATAAGGAAACTCAACGTTCAGCTGTTCAGGTAGGTGATCCATTTATGGAAAAACTACTTATGGAAGCATGTATTGAATTAACAAATAATCACCAAGACTGGTTAGTTGGTATTCAAGATATGGGAGCTGCAGGTATTGTTTCATCTAGTTGTGAAATGGCTTCAAAAGCTAACAGTGGTATGGAATTAAACTTAGATATGGTTCCACAACGTGAAGAAGGAATGTCTGCTTATGAAATCATGTTGAGTGAGTCCCAGGAAAGAATGTTATTATGTGTCAAAAAAGGTCATGAAAATGATGTTAAAAAGTTATTTGAAGACTACAATTTAGAAGCTGTAGTTATAGGTAGAGTAACAGAAGGACATGATTACATATTACATCATAAAGGCGAAGTAGTTACAAATATACCAGTATCTACTCTAACGGATGATGTTTTAGAAGAACCTAGTGAAGAAAGAGTTCCTCAACGTATTTTAGATAATAAAAATAAAGATGCTTGGGTACCACAGTTATCTAATGCAAAAGAAACATTAAAAGCTTTATTGCAACAACCAACAATTGCTTCAAAGAAGATGTTTACAGAAACTTATGATTCACAAGTACGAACAAGTACAGTTGTAGGACCAGGAAGCGATGCTGGTGTAATTCGTATTCGTGGAACTAAAAAAGCTTTAGCAATGACAACTGATGGAAATGGTCGCTTCATTTATTTAAATCCAGAAGTTGGTGGAAAAATAGCTGTTTTAGAAGCTGCAACAAATATTATTTCAAGTGGTGCTTTGCCATTAGCTATAACTGACTGTTTGAATTATGG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP029616|1660394:1669167|1667529_1668567_+|WP_113896142.1|DBSCAN-SWA MSRYQEAGVDIHAGYELVNKIKKDVKSTQRMGTTGNIGSFGGTFDLSVLNVKEPVLVSGTDGVGTKLLIAQKMDKHDTIGIDCVAMCVNDILAQGAEPLYFLDYIATGKNDPDKIAQIIAGVAEGCRQAGTALIGGETAEMPDMYAKDEYDLAGFSSGVVEKSKLLTDANPQENDILVGLASSGIHSNGFSLVRQILFKDNKIDLFEKRGEFGGKTIGEVILEPTKIYIDSVLPLVKENLVNGIAHITGGGLIENLPRMFADDLTAEIDASSWKVLPIFEYLKKLGNLSQDDCYETFNMGIGMVLAVSEDKLESVKKLLSDKNEDFYIIGNLRKRKGNEEKIIVH >NZ_CP029616|1660394:1669167|1662952_1663201_+|WP_003703354.1|DBSCAN-SWA MTKVRIFVTYKQSVFDPQGETITEAVHSLGHNEVKEIKVGKFFDVTIDSREKEVEESVKEISEQLLVNFNLETYRYEIMEED >NZ_CP029616|1660394:1669167|1660394_1660877_+|WP_003706099.1|DBSCAN-SWA MKVIFPGSFDPITNGHMDLISRASKLFDQVVVVISNNTSKHSLFTPKEKYHLVTEALSKFSNVSVELIQTDLTINVVKKFNADAIIRGIRNTRDFTYEQEIALMNKKLDSDIETITLFSNPEVSFISSTLVREISQFNLDKLVGTVPDNVIEALRKKVKN >NZ_CP029616|1660394:1669167|1663200_1663875_+|WP_003700039.1|DBSCAN-SWA MKIAVIVFPGSNCDIDLYEALHTVCDADVEYVSYKQDNLDGFDAVMLPGGFSYGDYLRCGAIARFSPIMPAVIEFAKNGKPVFGTCNGFQILTEVGLLPGALKRNNSLKFVCKTVELTVENTNTPFTSLYKKGEKINLPIAHADGSYYADEELLAELEENGQVVFRYSKENPNGSLNDIAGITNKQGNVLGMMPHPERAVEMLLGNEDGLRVFKSLLEEGKVKG >NZ_CP029616|1660394:1669167|1663876_1666102_+|WP_113896141.1|DBSCAN-SWA MNKELTPEQIKEQKVYLEWGLTQKEYEYICDKLLGRLPNYTETGLFSVMWSEHCSYKKSKPVLKLFPNKNERVLQGPGEGAGIVDIGDNQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGILRDIFSMGARPIASLDSLHFGEIDNARTKYLINEVVAGIGGYGNCMGIPTVAGEITFDGCYAGNPLVNAMSVGILDQSHIQKGQAKGIGNAVMYVGAKTGRDGIHGATFASADFADDKETQRSAVQVGDPFMEKLLMEACIELTNNHQDWLVGIQDMGAAGIVSSSCEMASKANSGMELNLDMVPQREEGMSAYEIMLSESQERMLLCVKKGHENDVKKLFEDYNLEAVVIGRVTEGHDYILHHKGEVVTNIPVSTLTDDVLEEPSEERVPQRILDNKNKDAWVPQLSNAKETLKALLQQPTIASKKMFTETYDSQVRTSTVVGPGSDAGVIRIRGTKKALAMTTDGNGRFIYLNPEVGGKIAVLEAATNIISSGALPLAITDCLNYGDPNDPEIYWELHQSINGMAEACRTLDTPVISGNVSLYNENNGEAIYPTAMIGMVGLIKDVYRTVPSFVQNVGDKLYLVGKTGSDFNGSELQKLLNNKISGDLNDFDLEKVNSYLKNLLAAMEQGLVSSSHDLSEGGLGVSLAEMVFGTDKGIKVSLDMKKELLFSETPGRLVVSVSKGNVAAFEEIMGEDITEIGEVQADHQLDITLTDENFVAEVSELEKLWEEAIPCLMKSKD >NZ_CP029616|1660394:1669167|1668579_1669167_+|WP_003709972.1|DBSCAN-SWA MRVAIFASGNGTNFEVLADKFAKKEITGNLVLLFCDHPNAPVIKRAEKFNIPYETFTVKECGNKLDYEKRIVEVLKAHQIDFIALAGYMRIIGKPILDEYEGSIINLHPAYLPEYQGLHAIERAFADHKEHNKDQTGVTLHYIDSGLDSGPVIYQEHVPIYQDDTCETLEERIHECEHRIYPKVLNEVLLSKSNN >NZ_CP029616|1660394:1669167|1660873_1661908_+|WP_069469421.1|DBSCAN-SWA MKKANKYIVTLTILVIVAILMFLPIPIYLEQPGAAESINQYVTVNGKTNKQKGDFMLVYVAVQKATPLTYLWSFSQKHIDRVSAEEMTGGSSDAEFDRIQEYYMQDAVNSAKYVALKHAGKEVSQKYIGIYVMSVLDKSDFKNKIQVGDTITNVNGKHYSNATGYQNALAKIKAGEKVTITYQRDGKNHKAIGKTMKLPQTKRTGIGITLANRSKVKTNEKISANMEGIGGPSAGLMLSLQMYSQLSKKDLLKGRDVAGTGTIDADGKVGDIGGIDKKVISASKAHAKIFFAPDNPVSKVVKKYDPNAKSNYEEAVETAKEIHTKMKIVPVRSFNDAVNYLENN >NZ_CP029616|1660394:1669167|1662220_1662934_+|WP_014568323.1|DBSCAN-SWA MSELLYEGKAKQMWSTEDENVLRVVYMDQATALNGKKKDVIKGKGHVNNQISSLIFEYLIKNDIPTHFIKKISENEELVKKVKIFPLEIVTRNVAAGHFSTRYGVEEGKKFNKPVEEMYFKSDELDDPFINESQALALEIATKEDLNRIWDLSRKVNTLLTDLFKQAGMKLVDFKLEFGTLADGTLVLADEFSPDNCRLWDLEDNRHLDKDVYRRDIGDLTPVYEEVLNRLKKVLNK >NZ_CP029616|1660394:1669167|1666077_1667529_+|WP_087309692.1|DBSCAN-SWA MSYEIKGLNEECGVFGVFGAENASQLTYFGLHSLQHRGQEGAGIVSSDGNRLHQHRDRGLLAKVFADEKDLLRLTGDSAIGHVRYGTSGNNSINNIQPFLFRFHDGDVALAHNGNLTNAVTLKRDLEDRGAVFQSNSDTEILIHLIRQKQNCTFIEALKQSLNEVKGGFAFLLLRKDSLIAALDPNGFRPLSIGQLDNGAYVVASETCALDTVGAKFVRDVQPGELIVINKDGMKIDRYTDKTQLSICSMEYIYFARPDSIIHGVTVHNARKRMGKLLAKEQPADADMVIGVPNSSLSAASGYAEELGLPYEMGLIKNQYIARTFIQPTQELRERGVKMKLSAVRGVVEGKRVVVVDDSIVRGTTSKQLVKLLREAGAKEVHMRISSPPFKFPCFYGIDISTRSELMAANHTVEEMSDLIGADSLGFLSIPSLIKAISVKGGADYPNGGLTVAYFDGKYPTPLYDYEEAYLTSLKSQQEREEK |
9 | Prochlorococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP029616.1|WP_113896084.1|1350176_1350425_+|antitoxin |
1350176_1350425_+
Protein sequences of NZ_CP029616.1|WP_113896084.1|1350176_1350425_+|antitoxin>NZ_CP029616.1|WP_113896084.1|1350176_1350425_+|antitoxin MIKKSIKAIIENENFIEYCSFYSVDSNEVVNDVNLINHIQENQSNLEKLIAGYMEMGALNQEICGEFWNCECSSDHADELKE |
82 aa aa | NA | NA | NA | 1240314-1354736 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.1|1020501|37|NZ_CP029616|CRT matches to NZ_CP029616 position: 1330081-1330117, mismatch: 0 gttgagtgaatccttgagcgcaagcacatcgttgagt CRISPR spacer gttgagtgaatccttgagcgcaagcacatcgttgagt Protospacer ************************************* 2. spacer 3.2|1020561|37|NZ_CP029616|CRT matches to NZ_CP029616 position: 1330081-1330117, mismatch: 0 gttgagtgaatccttgagcgcaagcacatcgttgagt CRISPR spacer gttgagtgaatccttgagcgcaagcacatcgttgagt Protospacer ************************************* 3. spacer 3.8|1020891|37|NZ_CP029616|CRT matches to NZ_CP029616 position: 1330081-1330117, mismatch: 2 gttgagtgaatccttgagcgcaagtacatccttgagt CRISPR spacer gttgagtgaatccttgagcgcaagcacatcgttgagt Protospacer ************************.***** ****** 4. spacer 3.45|1024881|37|NZ_CP029616|CRT matches to NZ_CP029616 position: 1330081-1330117, mismatch: 2 gttgagtgaatccttgagcgcaagcacatccttaagt CRISPR spacer gttgagtgaatccttgagcgcaagcacatcgttgagt Protospacer ****************************** **.*** 5. spacer 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