Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP030881 | Lactiplantibacillus plantarum strain nF1 chromosome, complete genome | 1 crisprs | csa3,cas3,DEDDh,DinG,WYL | 0 | 0 | 6 | 0 |
NZ_CP030882 | Lactiplantibacillus plantarum strain nF1 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP030883 | Lactiplantibacillus plantarum strain nF1 plasmid unnamed2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP030881_1 | 429146-429343 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP030881_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP030881_1
>1.1|429194|102|NZ_CP030881|CRISPRCasFinder GGCTTGACTAGTACTGCTTTGGCTAGCGGCCGACGTTGCACTCTGGCTCGTCGTGCTAGTGACTGAACTAGCACTGGCTTGACTAGTACTACTTTGGCTAGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP030881_1
The CRISPR arrays of NZ_CP030881_1 >merge|NZ_CP030881|1|429146-429343|CRISPRCasFinder GGTTACCGTTGTACTTTGACTAGCCGCACTTTTTACTGAACTAGCACTGGCTTGACTAGTACTGCTTTGGCTAGCGGCCGACGTTGCACTCTGGCTCGTCGTGCTAGTGACTGAACTAGCACTGGCTTGACTAGTACTACTTTGGCTAGTGGCCGACGTTGCACTCTGGCTCGTCGTACTAGTGACTGAACTAGCACT >NZ_CP030881|1|1|429146-429343|CRISPRCasFinder GGTTACCGTTGTACTTTGACTAGCCGCACTTTTTACTGAACTAGCACT GGCTTGACTAGTACTGCTTTGGCTAGCGGCCGACGTTGCACTCTGGCTCGTCGTGCTAGTGACTGAACTAGCACTGGCTTGACTAGTACTACTTTGGCTAGT GGCCGACGTTGCACTCTGGCTCGTCGTACTAGTGACTGAACTAGCACT
>NZ_CP030881.1|WP_003642124.1|428109_428610_-|methylated-DNA--[protein]-cysteine-S-methyltransferase MHLTLTQTTINQQTYWLGTTPTGLAFVGRANGPRDEWQAFFKSANIHYDQQANQQACQELHDYLTGQRQHFDIPLDQTTGTPLQHQVWQALTRIPYGQTATYSQLATMINHPTAVRAVASAVGKNPLLIVIPCHRIRRKDGQLGGYRGGLPMKRALLALENARLPK >NZ_CP030881.1|WP_024971691.1|426288_427188_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLSIAHIQKRFGTVQALNDVSFDVHDGEIMGLIGQNGAGKSTTFHSILNFLSFDGQITWNGQPLTADDYDQIGYLPEERSLMSKLTITQQIVYLARLKNQPARVTKGKIAAWMKRFAVKGQPTDKIDKLSKGNQQKVQLICTLIHDPKLIILDEPFSGLDPVNADLLKQAILDAKQRGAAIIFSSHDMSNVEAICDSLVMLRNGEAVLKGTVEDVRAQFGRTRLFLTTDWSQAQLADLPGVTTVTQQGARRFRLELADTSVGPAIFDQVTAGHYIEEFSQQPPTLDEIFRTEAGGVNHE >NZ_CP030881.1|WP_003642127.1|425078_426296_-|ABC-transporter-permease MNKTWIVTFETYLRQIKSWSFLSLVFMPFLFFGFVAAFSYFAAPSASKNDIAVVSTSPQLRTSFIKQSHVATANKYQTLASAKAATKRNDIAGYLVLTTKNQQLQAQFTGPNAVSSGDKAKIQQFLATAQSQRNVQRAQLSAKQTQALAVQPKFTEQLQKHAASDKTAKTVSFYIVVFFVYLILTTYSAITAQEIAADKGTKIMEVIFSSTTPRKYFNGKIYGVLLVIVTQLLVYLVGGFAVMQFVKRSSLTIDFWQQNTDLINQVIHNLVSINLLFALLAVLLYTVASAFCGALVTRVADASKAAQPVIYLSMLAFFMALAFQNTPTNLFVKIFSYIPFFSSYFMPLRLINGMATMPAAIVSLLILIATIIGSMIYIGRIYGGLMLQTDELGFWGNLKRGLRLK >NZ_CP030881.1|WP_003642128.1|424187_424931_+|SDR-family-oxidoreductase MTVKNKVVVITGASSGIGATTAKQLASNGAKVVLGARREERLAALVDEIKAAGGQAAYQVTDVTKSADVQALVKLAQTQFGGLDVILNNAGIMPTSPISALHTDEWDQMVDINIKGVLNGVAAVMPIFTAQKSGQIITTSSVAGIKSFAGSGVYGATKFAVRNLMEVIRMESAQEGTNIRTVSLYPAAINTELLHTITDKTAKQNMTDFYQQVGISPAAVANVVNFAIDQPEDVNVNEFTIYPTKQA >NZ_CP030881.1|WP_024971692.1|423853_424174_+|carboxymuconolactone-decarboxylase-family-protein MTVKQTAGRDNLGKLAPQFAALNDDVLFGEVWARESALSLHDRSMITIACLMTSGDFPQLKAHFKMGKDHGISKDEAVEIVTHLAFYAGWPKAWSAMTLIKEVYGE >NZ_CP030881.1|WP_003642130.1|423421_423820_+|cupin-domain-containing-protein MTTTNNSGLFGLGVKNEAYQQYFIGQSYLNALAGDEQVDVNVSNVTFEPGCRNNWHIHHNGYQILLVTSGEGWYQEAGKPVQLLHPGDVVTIHPGVKHWHGATKDSWFAHIAITKGTSEWLEPVDDEAYAKL >NZ_CP030881.1|WP_021356835.1|422814_423249_-|MerR-family-transcriptional-regulator MVRTTTERYSIGDFAKAVGLSAPTLRYYEKAGLIEPHRLDNGRRYYETADINWVKFLLHLKGTGMSISELQQYVTWRAAGDNTIPQRLALLKHVKEDFLVQFNEVQHHLQILNDKINWYEEKEAGITQDHEDFSSYLQRFGHHE >NZ_CP030881.1|WP_003642132.1|421379_422642_+|ArgE/DapE-family-deacylase MNGMAETAQLEAAVQALSDIVKMNTVNNHEQLVADYLVTLLKQHGIEAQSIEYAPGRVNLVAEIGDGHGPVVALDGHEDTVALGDADKWHTDPLAATIKDNRLYGRGVTDMKAGLMAEVFAMIALHDQDAPLHGTVRLLATVGEEVDHLGAEQLTELGYADDIQTLICAEPSGADKQLLLTKSIQAMLGVDGDTAQRMADANPTTEQHFIELAHKGSLTYTIKAQGVAAHSSMPAIGQNAIDMLMTYYQKQTAYFDSFKTIVNPVLGPTVPVVTLISGGEQVNTVPASAEMSVKIRTIPELRNDRLIKDLEAIIAECNADGANLTMDIASSFYPVHTPEDSQLVQLAKKVGEQVLQQRLPYFGAPGGTDASSYIVKSPDMQVIVFGPGNITAHQVNEYVDLDMYGRFIEIYQKMITELLA >NZ_CP030881.1|WP_003642133.1|418707_421299_+|ABC-transporter-permease MVGAAMTAAYFKTIMREIWSSKARFASILLIIFLGVAFYTGIRATGPDMSQAANDYYAKQKLATNSVQSTMGLTKADTRVLNQHRSQLTYQATRYADVNQLNNSQVVRVMALPTTQRLNRLRIVKGRLPRHANEIVLDAQAQRLQPKLKVGSTYRISSTAKRNAQFTRRTFKVVGFVNSPTYVENTNRGVTNVGKGTLDYLVYVRPQVIKSSVITRIDVQFKNLRGVTPYTAKYRRLNRENTAQLKRWLKPQARKRQQALQAQAQAKLKPLQQATQQLASQVPAGTAQLVKLQSQLKRAQAQVAAITMPTYLYTDRTDNPGYTEYHENTQRVVALSTVFPLFFIAIAALICLTTMTRMVEELRLQMGTLKALGYTNTAVGSEFMIYGGLAALIGTALGVLFGVNFFPRFIAQAYGSMYNLPAINVQYIWMDIGIALAIALLCTLGTALVVLRVDLNSLPAQLLQPRSPKAGKTLLLERWQWLWHRLSFNHKITLRNLFRYKQRLLMTVLGIAGCMAMMITGFGLKDSIGDISVKQFNELWHYDAVVTRSGNETDQQRQALSRGQLYQASLKLQAKQVTVKQSGVAEQTATLGIPAPHQSLSKFVVLRHRQSHQAIHIGDRGAVIDEKLAKLYGVQAGDDLTIKLAGQTTKRIHISAVAENYVNHFIYMSPTYYRRVFKQAPVYNTNYVRFKQATKKQENAYADRLLKQAGVQNVTLMSTEKATNFKMLDSMNLVVLIFVISAGALALVVLYNLTNINVSERIRELSTIKVLGFYDGEVTMYIFRENLILTVLGIIAGCFLGNWLHAYILQTAETNALMFSPTIHPLSYVYAALLTLAFSLLVMGMMHRKLKRVNMLDALKSVD >NZ_CP030881.1|WP_003642134.1|418012_418714_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MAYIEVQQATRQFKNGEQVTVANRDISFEVDQGAVVVILGPSGAGKSTLLNILGGMDSPTSGRVLVDGVDIAQFNSRQLTTYRRQAVGFVFQFYNLVPNLTARENVELASQITKDARDVDETLTLVGLTHRSDNFPAQLSGGEQQRVAIARAVAKNPKLLLCDEPTGALDYQTGKQVLQVIQDAAKQTQTTVIIVTHNSAIAQLGDQVIRINDAQVQSVEHNAHPTPLAEIEW >NZ_CP030881.1|WP_003642122.1|430323_431268_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MKIKNALLTSLAATGLLALGTTVANADTVVVKAGDTVSEIALTHKTTIKAIQKANHLKNVNLIYIGDKLEVNGKHHATTVTTQVPTSAASSTASSTSTASSTANSTSTQSASSASVSSSTSTSAASTATSSSTTSVASSSAASSSSTSAASSSVTSTSTASAASSSAASSSTSSATSSSATSQASTASSSTATSASMTKLSNTTASSAASTSTAASSSATTSSSTTTSTSSSSSTTSTSSSAEAAAKAWIANKESGGSYTASNGNYYGKYQLSKSLLNGDYSASNQETVADEYVASRYGSWVAAKAFWEANGYY >NZ_CP030881.1|WP_024971690.1|431576_433121_+|glycosyltransferase MYYFVNTSINPKKSGIEHAEMKRLALFNQHHVPAKMVTRFFSLSLHQTLTAAGIAAENQINLFDFIQHSSERPTTKMTIEDLHLAPDFRVQSVGRHYEVYQNDQLLMKVNTFLNTQKQLNNVQYYDQNGKLVKTDWYDTRGFKGLEQFYAADGQVASEQVFNPDGEVVYQTFHMADRQNQVQNSLYRFINYEGQDWSFAGETAMTTFFLDELNRRTPHAVFVIDRTYELAYAALHMRTKAFKVMHLHSNHVNDPAHPKTASLNFNYAYALNNLDQWNGVIASTKQQTADFQARFGNQPAVYTIPVGIVDDATLNAPKPSFDQRTAGKIIFVARLAEEKQQDQVIRAFKKVLAQVPNATLDFWGYANGDTGKQLHQLVEQLGLKAAVTFNDYTTDLTAVYNDAQLAMLTSRAEGFALALLEGQAHGVPQIAYDVKYGPRDIIRDGHDGQLVPVNDENALATAMIDLLTQPKKLAMYSQQAYQDAQRFSTTAVWQQWQPLMKAAADFYQVEGATQR >NZ_CP030881.1|WP_003642120.1|433117_434626_+|accessory-Sec-system-glycosyltransferase-Asp1 MNFFVNQYLMALNSGVEHAEFKRLQLFKDHQAPAKLVTRQFDGLLHQNMRRFNIADDQMANLFDFFRETTSFSSRVIKMADLNWPTAYDIKPDPNVSEVRAGDRLVAKVHFVPSTVGHVYFIEIFDHFNNLVQRTDYDERGFKARDEFFSSAGEPITDIFYRPDGSRMAEQYYTHDNNGTNYVSLCHLINYHGRDYYFNGEQEWYRFFLDELNKQYDENNVFIADRPLAAQWPVVNMQTAAKKYLWLPTPHAVDPRDQVYSNLNNAYVYGLHEFLSAWDGVITSTEQQKQDLTQWLGGQPSVPILTISAAIVSKQQAQHAPISISERHAHEIIYTGRLDAERRVDQLVTAFDQVHHKITDATLVIYGYGGELDRLKQQVSQLHLETAVTFAGYQPNLTMAYDQAGAYVYTGESDAQPLSLIEALSHGVPAIAYDINYGPKDVLKDGKNGYLVTDGAVNQLVRALTRTLESPQRQQRLSKGAYRSSEQYSDEQVWQQWQPVVQ >NZ_CP030881.1|WP_003642119.1|434710_435538_-|LysR-family-transcriptional-regulator MFKQLETFCAVYETRNFSHAAEQLFISQPTVSTQIKQLEADLQTTLLTRNGRQEIVPTASGQLLYQQAQKLLTTWAATKTAVQSPRHLVKVPCRIGASHTTGRLILPTLLANLSAVSDRFDFQVTLANSAEILTAMSQHKLDFGLVEKPLVTDQLNRLPFGHDELVHAGDFASPLWLLREPNSGVRHYTNAFLKARNIQPAQVMVIHSNQIIADLLAHGIGQTIISRHVLSNEIPIEQLSAHYQRQFFLLTNTQPAAALRPVQTAITQYLTTWSD >NZ_CP030881.1|WP_003642118.1|435654_436665_+|putative-sulfate-exporter-family-transporter MKVKGILPGLVTSLVIAIISQGLAQFVPALGAATIAILLGIIGGNTFLKQPQLGRGTKFAESKLLEYSVMLLGATMTVQTIGKIGGFGVLFILCQMTITIVGALWLGRKLGFSQSVRMLMAGGNAVCGSSAIASIAPVIDADEDDKGTVITLVNLMGTVLMLTLPVLGMAVFGGSVILKGALIGGTLQSVGQVVAAASMINQTTVQFATIFKIMRIMMLVVVVLIFGRLHQRTIENELAEDAVVSGNGNGHWLPWYVAGFLILCALNSLISLPAIIGATAHTISSWFEIIALAAIGLRLNLVNFMKAGKRLALYGLGVGTIQVVSALILITLLLQH >NZ_CP030881.1|WP_003644754.1|436748_437312_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MFMLTYRVTPAIELREPLPQSDAPALLALLTADRAQYQYYLPWVAKIQTVADEQRFLTFAQAQLQQAQALNLVIVVEQRVAGMVSCDHFDDNDHSANIGYWLGRPFQGRGVMTAAVRGVCDLGFNQYHRQCLRIRAAVDNQASNAVAQRAGFDFLIQHPGGQHLLDGDHDENVYQVSAVDWLAKRHK >NZ_CP030881.1|WP_003642116.1|437371_437872_-|DUF4811-domain-containing-protein MIIVLLILATLVFAGTMIFSPAGRNRLIAIIISGLIIAASLIALVLNDNYHWGMHEVTRTQIQDLAPLKSKQAALRVQQLGTGSERVISYRVAAATKVSHTVTATTTTTKLTSGSPAQVQLKTTTWQFKNHLTHVLFSLGNTKTKIVQRQYLFTIPKTWQVVTVKN >NZ_CP030881.1|WP_041153292.1|437868_439353_-|multidrug-efflux-MFS-transporter MPTQNSTLPLDANGQPYHRTWLVLTLLVGTFTTFITQTLLTTAFPTLMADFHISATAVQWLTTGFMLIMGIMIPVSAWLLTRINSKYLYLTAMLIFGLGTTLAYFAVNFQMLLIARMIQAMGVGISAPVFQTIMSSVYPPEKRGSAMGTAGIVIGLAPAIGPTLSGWIIDNYSWRALFLFILPINILVIIVSFFTLRKVLPTSKQPIDWWSVLISTIGFGSMLYGFSSVGNAGWGDPVVLTTLVIGLIFIGLFVWRQLHMDQPLLELRVFKIPAFTLSAILTALAYMAMMGVEMILPMYIQTVLGRSAMDSGLILLPGAIMMGIMSPITGRIFDHIGARRLAMTGMLLLTLGTAFFLSISATTPILWIIVVYAIRMFGLTMVTMPVTTTGINALPFRLISHGTAANNTLRQVAASMGTAVLISVYSSVAKWQMPGHQLLTQAPLKYRQDGITATLTGYHMAFVVSLIFCAIGFGITFFLKTNHSKTISQEDGAA >NZ_CP030881.1|WP_003644753.1|439566_440229_+|HAD-family-hydrolase MTKKYLTFDCYGTLINTEPLYQWVANLGLAVGLDPLTVRKAYATYEDDPASVNPYLDYSTLVRADLKHLDRLFEQRHFFESHYVECLEVQRHLLPYADVIPTLTAWQQLGYQLIIMSNSSWDIMPANIAALKVSFTAVVTAEDIQAYKPALAFFETVQERFKLTADNHWHIARGYESDVVPASAMQWPMIWINRDQRQPTSSERPTHMVTDLAAVKQWVN >NZ_CP030881.1|WP_003644752.1|440347_441535_+|MFS-transporter MNSKSLNKSTVLLMAISAAIVVANINYIQPIEADIAQQFNLPNAVIGAVAMLTQLGYAFGLLLIVPMGDIMNRRMLIMRLLVLAIISALLAFVAPNIWVYALASLLIGITSVAPQVIIPYAGFLAPRNQRGQVLGNVLSGLLVGVLLSRTVSGVLASYLSWQMVYLIAAILIAGLWLVLWRKLPHDPVTTHTTNYKAMIQTVPQLVKRYPVLRASAVNGFVLFGVSNIFWATLVFYLQHQYGWGSREAGLLALLGVTGVLAAPLIGRLADRFRPRTIIGLGLVLSTLAYVVFWLSGTHLVGLIIGIVILDLGTQFGQVANQTRIQSIDVHASSRFNSVFMFGYFMGGALGSFCGNVLWYLAGWNGVCGLAVVVLMIGFYAHFVHYPRVVTRQVQH |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
535746 : 544257
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP030881|535746:544257|DBSCAN-SWA GATGGCGAAAGTTGGTTTGATTATGGGGTCAATTTCTGATTGGCCAACCATGCAATTAGCGGCAGAACAGTTAACGGCACTGGGAGTCTCTTATGAGCGTCACGTTATTTCGGCCCACCGAATGCCCCAGACATTACAATCCTATGGTGAAGAAGCAGCGTCACGGGGAATTCAAGTTATTATTGCGGGTGCGGGGGGCGCTGCCCATTTACCCGGGATGCTAGCTGCCAATACACTACTCCCGGTAATTGGGGTGCCCATTAAGACCCATACGTTGAACGGAGTTGATTCGTTATTGTCAATCGTACAGATGCCAGCTGGCGTACCCGTGGCGACGATGGCGATTGGTGATGCGGGGGCTAAGAATGGTGCGCTAATGGCCGCCCAAATTATCGGTTTACGGGAACCACAAGTACAACATGCAATTGGAGAATTTCGTGCTCGTCAACGTCAGGAGGCTGAACAAAGTGAACGCCAATTTTAAGGAAGCACTCTTACCACCCGCAACGATCGGAATCGTTGGTGGCGGTCAACTCGGTCAGATGATGACGCTTAGCGCGAAGGCGATGGGCTATCGGGTAGGTGTCCTTGACCCGACACCCAAAGCACCGGCAGCCCAGGTCGCAGATTTTCAGATTGTTGCGGCTTATGATGATCAGGCGGCTTTACTTGATCTAGCGCGCCGTAGTGATGTCTTGACCTACGAGTTTGAAAACGTTGATGAGAATGCTTTGATTGCTGCGCAAGCCTATGCAAAGTTACCGCAGGGCACTGCACTCCTGCATATTACTGGAGATCGTCTTAATGAGAAGCAATTTCTTCATGATCATGGCATCCCAGTCACATCTTTCGCACCGGTGACGGATTTACAGTCATTAAATTACGCCCTCAACCGTGTTGGTACGCCGGCAATTCTCAAAACGGCGGCAGGTGGCTACGATGGTCACGGACAAACGGATCTAGACACAGCAGTGGTGACAAAAGCCGCTAGTGTCTTATTGACACAGCCGTGCATTCTAGAGGCGCGGCAGAAATTTCGAACAGAAGTTTCCATGATGGTGACGCGTAGTGCTGCTGGTGTTGTTACGACTTTTCCGTTAGTTGAAAATCAGCATCAACATCATATCTTACACACAACGATTGCCCCAGCTAATGTTCAGCCCAGTGTTCATAGTGCGGCCCGCAAAATTGCGGTTTCGATTGCTGAATCTCTGGAACTACGCGGCGTGCTAGGAATCGAATTCTTTGTTTTACCGGATGATACTTTATTAGTCAATGAACTGGCACCACGCCCACATAATTCTGGTCACTATACGATTGAGGCCTGCAACATCTCGCAGTTTGAGGCCCATATTCGAAGTATCTGTGGCTTACCGATTCCGGCCATTACGCAGACCAGTCCGGCAGTGATGCGTAATCTGCTAGGTGATGACTTAACAGTGGCACGTCAACAGTTGGTTGAACACCCAGAATGGCATTTTCACGACTACGGTAAGGCGGCCATTAAGCCCCAGCGCAAGATGGGTCATGTCACCGTATTAAATCACGATATTGACGCAGCATTAGCGTCGGTGGCAAATTTGAAAGGGGAACAATAATAATGACGGCAGCGATTGAGAAACAAGCTTTGCTTTACACGGGTAAAGCGAAAGCGATGTATGCCACTAATGATCCTGAAATTCTATGGGTCGAATACTTAGATCAAGCAACAGCGCTAAATGGTAAGCGGAAGGTTCCCATTGACCAGAAAGGCCGATTGAATAATCGCATCGCGAGTTTGATTTTCAAAGACTTAGCCAATCACGGCATTGCCAACCATTTTATTGAGCAACCTTCAGACTATGTGCAACTTGTCCGTCGCGTGACCATGATTCCCTTGGAGACAGTTGTTCGGAATGCGGCTTCGGGTAGTTTTGAGCGTAAATTTGCCGTGCCACACTTAACCAAATTTGCAGAACCAGTACTGGAATTTTTCTATAAGAGTGATCAGCTGGATGATCCATTTATCAATGATTCACAAATCCACGCGCTAAATGTTGCAACACCGGCAATCGTGGCGGAAATTAAACGGCAGGCCTTACAGGTTAACCAGCGTTTGACGGCAATTTTTGCGGCGATGGGGGTACAGCTCGTTGATTTTAAAATCGAATTTGGGTTGACGACCACCGGTAAAGTCTTGCTGGCTGATGAAATCTCACCAGATAGTTGTCGGTTAGTCGACCTAAAGACCGGTGCATCGCTTGATAAGGATGTCTTCCGCAAGGATCTAGGCGACTTGACTAGTGTTTATCAGGAAGTATTGACGCGGCTAGCAACCGTTGAGGAGGCCTAACATGTACTTAGTTAAAATCTATGTGACTTATAAGCAATCAATTCTAGACCCCAAGGGTGAGGCGATTCATGATGCCTTACACCGACTTGGATATACGAATGTCGATGCCGTTGAATTAGGTAAGTATTTTGAGGTGAAAATTCACGCGGATGATCGGCCAGTTGCCGCTGAAATCGACGAGATGTGTGATCGCTTGTTAGCCAACGTTAATATGGAAACTTATCGTTACGAAATTACTGAGATGGAGGCTTTGTAATGATGAAATTTGCCGTACCAGTCTTTCCTGGTTCTAATTGTGATCATGACATGGTGAATGCCTTGCGCGATATTTTACACGTTACGGCTGATTTGATTCCGGCGACAGCGACCTCATTAGCAGGTTATGACGCGGTGGTGTTACCTGGTGGCTTTTCGTACGGTGATTATTTACGGAGTGGTGCGATTGCCCGCTTTGCGCCCATCATGCCGGCCGTTATTGCATTTGCTAACGCTGGTAAACCAGTCATCGGAATCTGCAATGGCTTTCAAGTCTTGACCGAAGCCGGATTATTACCTGGTGCATTGCAGGCCAATCGCTCAGCGAAGTTTATTTGTCAGGACAGCCCATTACGAATTGCCAATCATGAGACGATTTTTACCACCGCATACGGATCGACAGATCAAATTAGTTTACCGATTGCCCACGGCGAAGGCAATTATTATTGTGATGAGGCCACCTTGGCGCAATTACGTGCTAATCATCAAATCATCTTCGAATACGTCGAGAATCCAAATGGCAGCACGGCTAATATTGCTGGCATTACAAATGAAGCGGGAAATGTGCTTGGGATGATGCCCCATCCGGAACGGGCCGTGGAGATGATCTTAGGTTCCACGGACGGTCTCGGAATTTTTCAATCGGTCATTGCGAGTCAAGAGGAGGTCACCCATGCTTAAAAAGCAACCATTATCACCTACAGATGTTCGCGATTCTAAGGTCTATCGGGATTGGGGCTTAACCGATGCTGAGTATCAATTATTAACGGATAAGGTCCTTCAACGCTTACCTAACGAGACTGAAACCGGGTTGTTTTCCGGCATGTGGAGCGAACATTGCTCCTACAAGAATTCAAAACCAGTCTTGAAAAAATTTTGGACGCAGGGTGAACAGGTACTTGAAGGGCCTGGTGAAGGCGCCGGTATTATCGACATCGGTGATGGTCAGGCCGTGGTCTTTAAAGCTGAAAGTCATAATCATCCGTCTGCAGTTGAACCTTATGAGGGTGCGGCAACGGGTGTGGGTGGTATCATTCGGGACATCTTTTCGATGGGGGCCCGGCCGATTGCGCTGCTGGACAGTCTTCGCTTTGGGGAACCGACTGATGCTCATACGAAATACTTGATTTCGCAAGTAGTCGCCGGCATTGGCGGTTATGGCAACTGTATTGGAATTCCGACAATCGGTGGTGATACGGTATTTGATGCGAGTTATCAGAAGAACCCGTTGGTGAACGCCATGTGTGTTGGAATCTTGGATCAAGCTGATATTCAGAAGGGCCAAGCAACAGGAATTGGCAACGCCGTTATTTATGTCGGCGCAAAAACGGGGCGTGACGGCATTAACGGTGCGTCCTTTGCCTCTGCTGAATTTAATGACGCCAATGAAACCCAGCGTTCCGCGGTTCAAGTTGGTGATCCCTTTATGGAAAAATTATTGATGGAGGCGTGTCTCGAGGTTATTCATGAACATCGTGATGTTTTAATCGGGATTCAAGATATGGGCGCGGCGGGCCTAGTTTCCTCCTCAGCCGAAATGGCGTCCAAAGCAGGCAGTGGGTTGTCACTGAATCTTGACTTGGTACCACAACGTGAAACTGGCATGACGCCGTTTGAACTGATGCTCTCTGAATCACAGGAGCGGATGTTACTATGTGTCAAAGCTGGTGCCGAAGCAGAAATTTATCAAGTCTTTGAAAAGTACGGTCTTGATGCTGTCACAATTGGTAAAGTGACAGCCGGCCACCAGTATCAATTATTCCATCATGGTAAGTTAGTTGCAGATGTTCCCGTCGATGCACTTGCGACCAAAGCGCCGGTCTATGAACGCGAAAAGAAACGACCAACGCGCTTGAACCATCAGAGCCATCATCAATTTATGCCACGACTAGTTGATGCAACTGGCACATTGAAGAAGATGCTCCAACAGCCAACGATTGCTTCCAAAGCGTCGTTATATGGAACGTATGACTCGCAGGTCCAAACGAATACGGTCGTCAAGCCGGGTTCCGATGCGGGGGTCATACGGATTCGACATACGGATAAGGCGTTGGCGGTCACCACCGATGTTAACGGGCGATACTTATACTTAAACCCCCGTGTCGGTGGAGAAATCGCCGTTGCGGAAGCTGCTCGAAACATTGTCGCTTCCGGTGGGCAACCTTTAGGCATCACTGATTGCTTGAACTATGGTAATCCAGAGAAACCTGAACAATTTTACGATTTGGACGAATCGGCGATGGGCATCGCTCGTGCCTGCCAATTATTCAATACGCCCGTGATTTCTGGCAATGTCTCGTTGAACAATGAATCGAACGGGGAAGCCATCTATCCCACCCCAATGATTGGGATGGTCGGGTTAATTAAGCATCAGAAAGATATTACGACTAGCGATTTTAAACACGCTGGCGATGCAGTCTACGTGTTAGGTACCACAGAAGCCAATTTCAATGGTAGTGAGCTGCAAAAGATGTTGACGGGAACAATCAGTGGCGAGCTGTTTGATTTTGACCTTGTGACTGAAAATCGTAATCAGCGTCTATTGTTAACTGCGATTCAAAAAGGACTAGTTGCTAGTGCCCACGACGTTTCTGAAGGTGGCTTGATTACGACGATTGCCGAATCATGTTTTCCACAAAATATCGGGGTGGAACTGGCCAGTGACTTGCCCGCTGCCAACTTCTTTGCGGAAACGCAGTCACGATTTGTTATCTCGGTGACACCAGCACAGCAAGCCGCGTTTGAAAGTTTAATGGAACCATATGTGACCTATTTAGGACGAACAACTGCAACGGATCGGCTACACGTTCAAACTGCTGATCAGGCGTTTGATATTAAGGTTAGTTTCGCCAAACAGTTGTGGGAAGGGGCCTTACCATGCCTACTGAAGTAAGAAGTCTGAATGAAGAATGTGGCGTCTTTGGGGTTTGGGGCTCGCCGGACGCCGCCCAATTAACGTACTTTGGGCTCCATGCGTTACAACACCGGGGGCAAGAAGGAGCCGGTATCACGGCGAATGATCACGGCAAACTGCAGACGGAACGCGGACTAGGGTTGTTGGCTGATGTCTTTCGGGACCCACGGCGGTTGGCACGTTTGACGGGTCAAGCTGCAGTCGGCCATGTACGTTATGCCACGGCTGGTAATCATGGATTGGAAAACATTCAACCCTTGAGTTTTAATTTTAGCGACTCACAGTTTGCACTCGCACATAACGGCAATTTGACGAACGCGGTGACACTGCGGCGACGGTTGGAACAGCATGGTGCCATTTTTCATGCTAGTTCTGATAGTGAGATTTTAATGCATCTGATTCGACGCAGCCCCGCAGCAACGTTAACGGAACAGGTTAAGGATGCTTTACGTCAAGTCCACGGAGGCTTTGCTTACTTACTACTAACGAATGATTGTTTGATTGCCGCTTTGGATCCTAACGGGTTACGACCATTAGTCGTCGGTCAGTTACCCACGGGCGGGTACGTCGTTTGTAGTGAAACTTGCGCGCTTGATACGATTGGTGCGACGTTTGTTCAAGATGTTCAGCCGGGAGAATTGTTAACGATCGATGATCATGGTTTGACGATCGACCATTATACGACTGATACACAGTTGGCGATTTGTTCAATGGAGTTTATCTACTTTGCACGTCCAGATTCTGATATTCACGGCGTCAACGTCCATTCTGCACGTAAACGAATGGGTGCTCAGCTCGCTGTTGAACAGCCCGTGGACGCCGACATTGTTGTCGGGGTACCCAATTCATCTTTATCAGCGGCGACCGGCTATGCGGAAGCGAGTGGCCTGCCTTACGAGATGGGATTAATTAAAAATCAATATTCGTCACGGACCTTTATTCAGCCGACCCAAGCATTGCGAGAACAGGGGGTTCGGATGAAGCTTTCAGCGGTCAAAGGTGTTGTCGCTGGTAAACGAGTCGTCTTAATCGATGATTCGATTGTACGTGGTACCACCAGTCGGCGGATCGTCAAATTATTGAAAGATGCGGGTGCAAAGTCAGTTCATTTACGAATTGCATCGCCACCATTACGCTATCCATGTTTTTACGGTATCGATATTCAATCGACTAATGAATTGATTGCGGCTCAGCAAACGATTCGGGAGATGTGTCAGACGTTTGGTGCGGACTCACTTGGTTTTCTCAGTGAACAGGGCGTCGTTGATGCAGTTGGCTTGTCGACCACCGAACCGTATGGTGGACTATGCATGGCCTATTTTAATGGGGATTATCCAACGGCCCTGTATGATTACCAAGCCGAGTATGATGCGGAAATTGCGCAATTACAAGCCAATCATGAAGGGGTGATCAAGTGAGCGATGCGTATAAGCGGGCTGGCGTTGATATCAACGCTGGTTACGACGTCTTAAAGACGGTCAAACAAATGAGTGGCAATCAGCAATTAGGCGCGTTTGGGGGGGCGTTTCCACTTAGTTCGGATGCAACTGCCAACGATCCCGTGTTAGTAGCGGGGACGGATGGTGTGGGGACTAAGCTCTTAGTCGCAATCGCTGCTGATCAACATACCACGATTGGAATTGACTTGGTCGCAATGTGTGTGAATGATATTTTGGCACAAGGCGCGACCCCCCAGTTCTTTTTAGATTACTTAGGTCTTGGACATACGGATCAGAAGCGGGTCAAAGCCATTTTGACTGGCGTCGTCACGGGCTGTCAGCAGGCCCATACAGCGTTGATTGGTGGCGAGACTGCGGAGATGCCCGATATGTATGGTCAGGACCATTACGACCTCGCTGGTTTTGCGGTCGGAATTGCGAACCGCGCGGACCTGTTATCACCAGCAAATGTTCGGGCTGGGGACGTCTTGATTGGGTTGCCGTCTAATGGCCTCCACTCGAATGGGTTTAGTCTAGTTCGTGATATTTTATTCAAACAACACGACTACCAATTGACCACGGTTTTTGACGAACTTGGTCATGATTTACAAACGGAACTTTTACGACCAACGACCATTTACGTTGATGCAGTTCAACCATTATTACAGCAGAAATTAGTGACGAGTATCGCCCACATTACTGGGGGCGGCTTGATTGAGAACGTCGCCAGAGCGTTACCGGCGGGCTTGAGTGCGCACCTTGAATTGGGTCAATGGCCGGTGCCGCCAATTATGACGTTATTGGCCGAACTCGGTGGGCTGACTGCCACGGATCTTCGGTCGACCTTTAACTTAGGCCTGGGAATGGTTTTGGTCGTTCACCCCGACCAAGTGGCGGCTGTGACGGCTAATTTGACGGCCAACGCGCAGTCCTATTATCGCGTCGGAACAGTCCAAACTGGGACGGCCCCCGTCGTTTTCGAGGAGGCTGAACATGCCTAATAAGATTGCGGTATTTGCTTCGGGGAACGGCACCAACTTTGTTGCACTCCACCAAGCGATTATTGAACGGCAGTTACCGGTGGTGATTGGGTTACTCGTCTGTGATCAACCCACGGCGCCGGTCATTGATAAAGCCCGGGCAGCTAACATACCGATATTGATTGTTGATTTTCATGATTATGCGAATAAAGCGGCCGCGGAAGCCATCATTTTGACGGCCTTGCAAGCGCGACAAATTAAACTGGTCTTATTGGCCGGGTACATGCGTATTATCGGTCCGACCCTCTTGAATGCGTATTCGCATAAAATTATCAACATCCACCCAGCATTGTTACCGAAATTTCCAGGTCGTCACGGTATCGAGGATGCTTTTGACGCTGGTGTGACTGAGACGGGCGTTACCATTCACTATATCGATGCCGGAATCGATACCGGGCAAATTATTGCCCAGCGGGTCGTTCCGGTTGCACCAGACGATACGCTAGCCAGCCTGGCGACCCGGATTCATGATTGTGAACACCAATTTTATCCAGATGTATTACAGACACTCATTAATGAAGGAGCAATTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP030881|535746:544257|535746_536229_+|WP_003645861.1|DBSCAN-SWA MAKVGLIMGSISDWPTMQLAAEQLTALGVSYERHVISAHRMPQTLQSYGEEAASRGIQVIIAGAGGAAHLPGMLAANTLLPVIGVPIKTHTLNGVDSLLSIVQMPAGVPVATMAIGDAGAKNGALMAAQIIGLREPQVQHAIGEFRARQRQEAEQSERQF >NZ_CP030881|535746:544257|536212_537343_+|WP_003642586.1|DBSCAN-SWA MNANFKEALLPPATIGIVGGGQLGQMMTLSAKAMGYRVGVLDPTPKAPAAQVADFQIVAAYDDQAALLDLARRSDVLTYEFENVDENALIAAQAYAKLPQGTALLHITGDRLNEKQFLHDHGIPVTSFAPVTDLQSLNYALNRVGTPAILKTAAGGYDGHGQTDLDTAVVTKAASVLLTQPCILEARQKFRTEVSMMVTRSAAGVVTTFPLVENQHQHHILHTTIAPANVQPSVHSAARKIAVSIAESLELRGVLGIEFFVLPDDTLLVNELAPRPHNSGHYTIEACNISQFEAHIRSICGLPIPAITQTSPAVMRNLLGDDLTVARQQLVEHPEWHFHDYGKAAIKPQRKMGHVTVLNHDIDAALASVANLKGEQ >NZ_CP030881|535746:544257|537345_538077_+|WP_003642587.1|DBSCAN-SWA MTAAIEKQALLYTGKAKAMYATNDPEILWVEYLDQATALNGKRKVPIDQKGRLNNRIASLIFKDLANHGIANHFIEQPSDYVQLVRRVTMIPLETVVRNAASGSFERKFAVPHLTKFAEPVLEFFYKSDQLDDPFINDSQIHALNVATPAIVAEIKRQALQVNQRLTAIFAAMGVQLVDFKIEFGLTTTGKVLLADEISPDSCRLVDLKTGASLDKDVFRKDLGDLTSVYQEVLTRLATVEEA >NZ_CP030881|535746:544257|538332_539013_+|WP_011101895.1|DBSCAN-SWA MMKFAVPVFPGSNCDHDMVNALRDILHVTADLIPATATSLAGYDAVVLPGGFSYGDYLRSGAIARFAPIMPAVIAFANAGKPVIGICNGFQVLTEAGLLPGALQANRSAKFICQDSPLRIANHETIFTTAYGSTDQISLPIAHGEGNYYCDEATLAQLRANHQIIFEYVENPNGSTANIAGITNEAGNVLGMMPHPERAVEMILGSTDGLGIFQSVIASQEEVTHA >NZ_CP030881|535746:544257|538078_538333_+|WP_003642588.1|DBSCAN-SWA MYLVKIYVTYKQSILDPKGEAIHDALHRLGYTNVDAVELGKYFEVKIHADDRPVAAEIDEMCDRLLANVNMETYRYEITEMEAL >NZ_CP030881|535746:544257|543678_544257_+|WP_003642593.1|DBSCAN-SWA MPNKIAVFASGNGTNFVALHQAIIERQLPVVIGLLVCDQPTAPVIDKARAANIPILIVDFHDYANKAAAEAIILTALQARQIKLVLLAGYMRIIGPTLLNAYSHKIINIHPALLPKFPGRHGIEDAFDAGVTETGVTIHYIDAGIDTGQIIAQRVVPVAPDDTLASLATRIHDCEHQFYPDVLQTLINEGAI >NZ_CP030881|535746:544257|541209_542664_+|WP_003642591.1|DBSCAN-SWA MPTEVRSLNEECGVFGVWGSPDAAQLTYFGLHALQHRGQEGAGITANDHGKLQTERGLGLLADVFRDPRRLARLTGQAAVGHVRYATAGNHGLENIQPLSFNFSDSQFALAHNGNLTNAVTLRRRLEQHGAIFHASSDSEILMHLIRRSPAATLTEQVKDALRQVHGGFAYLLLTNDCLIAALDPNGLRPLVVGQLPTGGYVVCSETCALDTIGATFVQDVQPGELLTIDDHGLTIDHYTTDTQLAICSMEFIYFARPDSDIHGVNVHSARKRMGAQLAVEQPVDADIVVGVPNSSLSAATGYAEASGLPYEMGLIKNQYSSRTFIQPTQALREQGVRMKLSAVKGVVAGKRVVLIDDSIVRGTTSRRIVKLLKDAGAKSVHLRIASPPLRYPCFYGIDIQSTNELIAAQQTIREMCQTFGADSLGFLSEQGVVDAVGLSTTEPYGGLCMAYFNGDYPTALYDYQAEYDAEIAQLQANHEGVIK >NZ_CP030881|535746:544257|539005_541225_+|WP_003642590.1|DBSCAN-SWA MLKKQPLSPTDVRDSKVYRDWGLTDAEYQLLTDKVLQRLPNETETGLFSGMWSEHCSYKNSKPVLKKFWTQGEQVLEGPGEGAGIIDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGEPTDAHTKYLISQVVAGIGGYGNCIGIPTIGGDTVFDASYQKNPLVNAMCVGILDQADIQKGQATGIGNAVIYVGAKTGRDGINGASFASAEFNDANETQRSAVQVGDPFMEKLLMEACLEVIHEHRDVLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLSLNLDLVPQRETGMTPFELMLSESQERMLLCVKAGAEAEIYQVFEKYGLDAVTIGKVTAGHQYQLFHHGKLVADVPVDALATKAPVYEREKKRPTRLNHQSHHQFMPRLVDATGTLKKMLQQPTIASKASLYGTYDSQVQTNTVVKPGSDAGVIRIRHTDKALAVTTDVNGRYLYLNPRVGGEIAVAEAARNIVASGGQPLGITDCLNYGNPEKPEQFYDLDESAMGIARACQLFNTPVISGNVSLNNESNGEAIYPTPMIGMVGLIKHQKDITTSDFKHAGDAVYVLGTTEANFNGSELQKMLTGTISGELFDFDLVTENRNQRLLLTAIQKGLVASAHDVSEGGLITTIAESCFPQNIGVELASDLPAANFFAETQSRFVISVTPAQQAAFESLMEPYVTYLGRTTATDRLHVQTADQAFDIKVSFAKQLWEGALPCLLK >NZ_CP030881|535746:544257|542660_543686_+|WP_003642592.1|DBSCAN-SWA MSDAYKRAGVDINAGYDVLKTVKQMSGNQQLGAFGGAFPLSSDATANDPVLVAGTDGVGTKLLVAIAADQHTTIGIDLVAMCVNDILAQGATPQFFLDYLGLGHTDQKRVKAILTGVVTGCQQAHTALIGGETAEMPDMYGQDHYDLAGFAVGIANRADLLSPANVRAGDVLIGLPSNGLHSNGFSLVRDILFKQHDYQLTTVFDELGHDLQTELLRPTTIYVDAVQPLLQQKLVTSIAHITGGGLIENVARALPAGLSAHLELGQWPVPPIMTLLAELGGLTATDLRSTFNLGLGMVLVVHPDQVAAVTANLTANAQSYYRVGTVQTGTAPVVFEEAEHA |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
688849 : 750031
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP030881|688849:750031|DBSCAN-SWA TATGGTGCAAGCACCTTGGCAACCCTGGGTTGCGGTTGTAACGCCACTATATCAACGTTATGTTTCCTGCAAAATTCGGCAAAGAAAGAATGCTAATCATGCCAAAATATCAGATGTAACTATCATGGCTTTGATGTGTTGGCAGGTATCACTTGGTATCACTAATCAATGTGCTTTTTATCGTCTGTTAGTTGGGTTAGGGCTGACTGGTTTGCCGGAACGATCTCGTTTTAATCGACGGTGCACAGCTATGGGCTGTCTGCTCCAAACCCTGCGGGTTGGCTTAGTTAAACACTGTTTACCATCAGTGACTTACACCATCATAGATAGTTTTCCAATCCCATTATGCCAATCAATTCGTAATCATCGAGCCAAAGTTTTACGCTCACTTGCTGACATTGGCTATAATGCCACCAAGAAACAATGGTTCTATGGTTTAAAGGGACATTTTCAGGTCACCAATCAAGGCATTGTAGTGGCCTATTCAATTTCGGCTGCTTCAATTCATGATATTCGTTTAGTGCCAGAATTGATTGACCAATACGCTTGCTCACATGTTTTGGCCGATGTTGGCTACCTTAGTCAACCACTAAAAGACCAATTAAAGCAACGACACATTGATTTCTGGACACCCAAACGCCGTAACATGCCCCAATCACGACTGAATAGCACCTTATTGAAGCGCCAAAGGCGCATGATCGAAACTTTATTCTCTAAATTGCAGGTTTTATTTCAGGTTGAACATAATCGGGCCCGATGTCTGCGTGGCTTCAAAAGTCGATTAGAACAACTTTTATTCGTAGATACCTGGCAGCTAATTAACTAGCACAACGGGTACTGTTTATAAAAAGCAACGACGAATTCATCAAAAGTTGAGTACATCTTTGTCCGCCATTCGAATACTATCCCGACTGGAAGACGTTCCGGCAATTGGCAGAAATGCCTGTAAGTTGGCTTAGGACGAACCAGCAAAGCATGTTTACGCTAACTCGCACGTTTTCCAGCGGGCCTAAGCTGGCTGCTTTTGATTTTAGTTATTCAGCAAGTTTTGAATAAGCATTCAAGTAAAACATAACGAAAAAACAATAAAATGAGTTGACAATGAATAAAGGTGGTGTTAAATTAGTTTTAAATTAAAAACAGATTAAGACGTTGAAGAGAAGAGTAATCGCATCACTGATTTGCAGAGAGCTTCGTAATGGTGAGAGAAGTATTCAGGAGTGCGGTGAAGATGAGCTTGGAGTCATGATGCGGGTCGTAGTGGCTACGCATGCGGTGGCAACCGATATATTGCGGGGTTTCCTAGATTTTTCAGGGTACTCGTCGAGGTTGTGATCGTGAGATGGCAGCGAACAACGGTGGTAACGCGAAAGCTTTCGTCCGTTAGTTTCTAACATATTAGAGACTAATGGATGGGAGCTTTTTTTTGTTTCAATACAGGTGAGAGGGAGCGGTTAGATGACAGTCACAGCAAATAATGGATTATTAGCGGCCCGTGGAGAATGGGCGAACGCAACGTGTCAAGAAAGTCATCAGGCACAACAGATTTTAATTTTAAACTTGATGCCGACTAAGGTAACGACGGAGCGGCAGTTCCTAAAGCGTTTTGCAGCCGGTAACACAGATGTGGCTGTGACGTTTATGTATCCCGCTAGTCACCATTTCAAGAGCCTGCCACAAGCAGTGGTCGCGGCACATTACGTGACGTTGGCTGATATTCAAGATCAGTATTTTGATGGCTTGATCGTCACCGGCGCGCCAGTTGAGACGTTACCGTTTGAAGCAGTCGATTACTGGAACGAATTGTTAACAATCATTGATTGGTCACGACAGCACGTTAGCCAGACTTTATTTGAATGCTGGGCAGCACAAGCAGGGCTATACGCACAGTTTGGAATCGCAAAGCGTGACGTTGCTCACAAGATATTCGGTATTTATAGTGCGACTAGTACTGATGTTAAGTCACCGCTGATTAGCGGACTGAATGCTGGAGGCTTACTAAAAATGCCACAGTCACGGCATACAGCACTAGTGATGCCGGAACGCTTACCCGCTGGATTGCAGGTTGTCGCTGACAATCCGAAGGTGGGACCGCTCGTCTTATCTGCCCCCAAGCTGCACGCGGTCTATGTGACCGGTCATCCTGAATACGAACGCCGCACACTTGCCGATGAATATTTGCGCGACCGACGTAAGCACTTGCCGATTCAGTTACCTGAACATTACTTTGCTACTGAACAATTAACAACAGTTGATTATAGTTGGCAAACTTCAAGCAATCAACTGTATCAAAACTGGTTAGCAACTTTGAATTTAACGAAAGTAGGTTATTAATTATGACAACAACGAATCCTGAAAATTATCACTTTGAAACGTTACAAGTCCATGCGGGCCAGACGGTTGATGAAACGGGCGCACGGGCCGTGCCAATCTATCAAACGACTTCATACGTCTTTAAGGATGCCAAGCAAGCCGCGGGTCGCTTTGCCCTGACTGATGCCGGCAATATTTATACACGACTGACGAACCCAACGACGGACGTGGTCGACAAACGAGTGGCCGCCTTGGAGCACGGGACGGCTGGGGTAACGCTCGCAACGGGTTCTGCTGCGATAACCGCGGCAATTTTAAACATTGCGCAACAGGGGGATGAAATTGTGGCGGCCAACACCTTGTATGGTGGGACCTATGACCTGTTTAGCGTGACGTTAAAGAAGTTGGGCATCACAACGCACTTTGTTGATCCTGACGAACCGGCAAATTTTGAGACGGCAATTAACGATCATACTAAGGCCTTGTACGTTGAAAGTATCGGTAATCCTGGCATTAACTTAGTTGATTTTGAAGCCATTGGAAAAATCGCTCATGATCATGGCATTATTTTTATTGTTGATAATACCTTTGGGACACCATACCTAGTTCGGCCACTTGAACATGGGGCCGACGTGGTCGTACATTCAGCAACTAAGTTTATCGGTGGTCACGGGACGACCATGGGTGGCGTTATTGTTGAAGGCGGCCAATTTGACTGGCGTGCGAGTGGCAAGTATCCAGATTTCACAACGCCAGATCCGCAATATAACGGCCTCGTTTTTGCCGATTTGGGCGGGGCAGCCTTTACGACTAAGGTCCGGGCGGAAACGCTGCGAGATACCGGTGCAACTATCAGTCCCTTTAATTCCTTCTTGTTGTTGCAAGGTCTAGAATCCTTGTCATTGCGAGTAGAACGACACGTGACCAATACACGCAAGATTGTTGCCTTCTTAAAAGCACATCCAAAAGTTGCCTGGATCAATTATCCAGAACTGGAAGATAGCCCGTACCATGACTTAGCAACTAAGTACTTCCCGAATGGGGTTGGTTCGATCTTCACCCTGGGCTTGACTGGTGGCGAGGCTGCTGGTAAGGCATTAATTGAACATCTACAACTCTTTTCATTGTTAGCAAACGTCGCTGATGCTAAATCATTAATTATCCATCCCGCTTCCACCACGCATGCGCAATTAAATGAACAGGAATTGTTAGCAGCTGGTGTAACGCCTGACTTGATTCGAATTTCAGTAGGTGTCGAAAATGCCGATGATTTAATTGCTGATTTGGATCAAGCATTGGCACAGGTTTAATAGGTCGGAATGGTCGATGATTGAAAGTATGTGAAACGGAGGGTGCGACAATGACAACGACAATTGAAGTGGGCATGTTAGGGTTAGGAACTGTGGGTAGTGGGGTGGTTGAACGGTTGACCCGCTCGGCTGCCAAAATTGAACAAACGCAGGGTATTCGGTTGCACCTAGCAGCAGTTGCCGTTAATCATTTGAACGCGCCTCGGACTGTTCAGTTACCGATTGGGACGCGCTTGACCGATTCATTAACGAACGTTGTTTGTGACCGAAAAATCCAACTAGTCATTGAAGTCATGGGGACGGTCGCAATTGCTAAAAAGGCCATTGTGGCAGCACTTAATCAGGGTAAGGCTGTCGTGACCGCTAATAAAGACTTAATTGCAACGGCGGGACCTGAATTGGCTGCGTTAGCCAAAAAACAGGGCTGTGATTTATTTTACGAGGCTAGTGTTGCGGGGGGGATTCCGATCTTGCGGACATTAACAGATAGTTACGTGACGGACAATGTGCAGGCGGTCAGCGGAATCATCAACGGGACGGCTAATTATATGCTAAGTGCAATGGCAACCGGGCAATCGTACGAACAAGCTTTAGCTACTGCACAAGCAGCCGGGTACGCCGAAGCTGATCCGACTAATGATGTTGCGGGCATTGATGCGGCATACAAATTGATGATCCTCAGTCGCTTTGCTTTTGGGCAAGAGTTGAGCCTGCCGCAGATTGCACCCACGGGAATCACGCATTTAAGCGCTTCGGTTTGTCGATTAGCAGCTGAAAATGGCTGGCAGATTAAATTGCTCGCGCAGATTCAGCGACACGGATCTGGTTTGTATTGTCGTGTGGCGCCAGTGGCCGTGCCGGTTGATCAACCCCTGAGTCAGATCAATGGGGTCCAAAACGCTGTAGCTGTTCAAAGTGAAGCCATTGGTACCAGCTTGTATACCGGACCGGGTGCGGGAAGTACGGCGACGGCTAATAGTGTTCTAAATGACGTCTTAGTAGCGGCCAAGCACCTTATCAATGGTTATCGAATGATTCGTAACCAGAAAAGAAGTGTCTCGTTAACGGTCACTCGATTTGACCAGTTACCACAAACATACTTAGGCATTGGTCCGGTCGCACCAGAAGCCGTGAAATATTACGCTAATGAAGCTGATTTCTCAGTAAAAACGATTGCCGATGATTGTTATCAGATTACTGGATTAAGTGCGGTGAAACGCAAAAAGCTGCGTGCGAACTTGCCACTGACTTTGATACCAATTGCCGGTACAACGGACTGGAAGCAAGTGACCGAAAATTCAATAACATCTCCCATAAATGTTGCAATTTGAAAAAGAATGCTCAGGTACAGTATACTGTATCTGAGCGTCTTTTTTT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56 | Lactobacillus_phage(20.0%) | terminase,integrase,transposase,head,capsid,portal | attL 737764:737785|attR 751715:751736 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1596081 : 1606721
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP030881|1596081:1606721|DBSCAN-SWA TATGCAAGATTATTATAACATGAATCAAACCACTTTGAGTATTGCCTTGGATTACCAACCAGAAGATCATCATTCTGCTCGTTACATCAACCAGCTTGTTGAGAGTTTAAAACTAAAATATGATTACCAGTTTGGCCGTCCGCGGGAATATAACCTCGGTGCCATGTTAAAACTGGTCCTTTTAGCGTACAGCTATGGCATTTTCAGCAGTCGTAAAATTGAACGGTTTGCCCGTGAAAACAAGCCAGCTGGGTGGTTAATTGCCGACCAAATTCCGTCCTACCGGACGATTTGTCGCTTTAGAATTTCTGATGAACTGGCCACTTTGACAACCGATAGCTTATCACAGCTAACCCAATATCTTCGTCAAAATGGCATGATTGATGATGTTTCATTTATTGATGGAACTAAGATCCTAGCCGACGCCAACAAGTATAGCTTTGTTTGGAAGAAGAATACGATACGATTTGACAAGATGAATCGCGAAAAACTCGTTGACCTGTTAGGCGAGCTTCATGAAGCTAAAATTGTCGGTGAAATTCCGGCAGGATCAGAGCTGACTCCCGAACTATTGGATATCATGATTAGCAAGGTTGAGGATCACTTAGTGGTCCTTAATGAAACCGTGGAAGCAACTAAGCAGGTTTCCCCGAACCCAGCCAAACAGCAACGCCGGACTGTTAAATCACAAAAACGTAAGTTGGATAAACGACGTGATAAAATGCGTGAACACCAAGCACAGCAAGCAATCTATGGTCAGCGTAACAGCTACTCTAAGACGGATCACGATGCCACCTTTATGCGGGTCAAGGAAGATCCGATGCAAAACGGTCAATTAAAACCTGCCTACAACGTTCAAATCGCCACGAGTAATCAGTTCATTACGGGATATCGGCTTTTCCAAAATCCAACCGACACACGAACCTTACAACCGTTTATTGAACATTTAAAGGCCAACAATGTGTTAGGTCACACCATCGTTACCGATGCCGGATACGGTTCCGAAAGTAATTATCGGTACTTGGAAGATGAATTCGGTCAGCATACCGTTTTGATTCCCTACGGCACAATGCTTAAAGAGAATAGTCGAAAATGGCAAAGTGATGACCGTAAGGTTATGAACTGGGACTATCATGAAAAAGATGATTATTTTATCAATCCGCAAAACGTCCGGTTTAATTTTAATGCTTATCGTCGACGGACTGATAAGTATGGTTTTACCCGTGACTTTAAAGAATACATTGCCGAAAAGTATGATGAAAATCATCAACTAATTGCCACGGCACTAACACCAAAAGGATATCTTAAAAGGATTTCCGTGAACGAAAATTGGGAATATTTCAAATCGAAACAACGAGAATTACTTTCAGCTCCAGAAACTGGTCAGATTTACGCTCAACGTAAGATCGATGTTGAGCCAGTTTTTGGCAAGATGAAGGCTTCTTTACATTTCAATCGATTCTCGGTGCGAGGTTTCGACAAGGTCACCAAGGAAGCCGGAATCGTAATACTGGCGTTAAACATTATGAAACTGGTCACGGTAGGGACCAACTTTAAAAATCAAAGGCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCCTTGTGGCACAATCGTCCCGACTGCACAAAATTACCGGCATCGTTGTAGGCGCCCGTTTGCGCAATTACTGAATCGGAGAGGTAACTTTGATTGGAACCCAATGTGTCATTGACAACAACTGTTCCAAGCTTCTTACCGCTTGGATTGAATGCAATATTCCATGTTAAAGTTGCAGGCAGGCCATGCTCATCATAGCTTCCAATCAAAATATACATCAGAATCAGCCGTGCCTTTCACGTAAAACTGGAGGGTACTCGCGCGATTCGTCCCCATTTGTGATAAGGCATCGTTGAAAGTAATCAGTCCAGCGGTTTCACCCGCTTTAATTTTAAAATGACCAGCAACTCGACCATTATCGTCTTTCAATGGAAACCCCAAATCAACGGGTGCAACCGTCCCATTCGGCAATTCTGTATCACCGGCCGCAATTGGTTGACCATTGCGAATAGCCCAGTCATACTCGACTGTAAAATCCTCCCATTTGCTTAATTGACTTGTATCTGTGATGACATTGCCATACCGATCAGTCACTCTGGCCTCATTCCCCGTTAGGCCAGCCGTCGACACATCATCCGCTTGTCCAATCCGTCCTAATACTATGACTGTCACTAAAACTGTTAACAGACCTAGTAGGACTGAAAACAATTTATTTCGCATAAAACTGCCCCCATTCTCTGCCAAACACAACCAACTTTGATACTTAGAATATCCATTGGAATTACCAATAGTTCTACGATCACTTTATAATAAGCCCATCTTTTTCATCAGTGTTATTAATAAGTTGTCATTGGTAGATTTACAAACAAGTTGATGATTAATCAATCGCTACCCACGTTACTTATTTAGCCTTCCAATGGCCAACGTCACCGTATTTTTTACCAACCTGACATGACACGTCTCCACTCAGACCATCCATTAAAAACTGTTTGACGTTAGCGCCTAAAATCTCTAAAATGAACCCATTGGTCTTTATTATCAAATTAATTTTAAGGAGTGTCTTCATGGCGCAAATCTATATTGCTAGTCCGTTTTTCAGTCCCGAACAAGTGACGCGGGTCACACAACTTGAGGAAGCTTTAGCAAAAAATCCAACGGTCACGGATTTTTATTCACCACGTCTACACCAGGACGCTCAAGCCGAACAGTTCACCAAAACTTGGGCGACCGAAATTTTCCACCGTGACATGGCCCAAATTGCGGCCGCGCAAGTCATCGTGACTGTCTTAGACTTTGAAGCCAAAAACTTAGATTCTGGTACCGCCTACGAGCTAGGTGTGGCTACCATGCGCGACTTGCCCATCATCGCCTTGCAGGAAAAAGATGAGGCCGTCAACCTGATGATTACCGAAAGCTTACACTGGTATACCAAACAAGTGAGTGATTTTGAAACTTACGACTTCCAACAATTACCTAAAGGCGACTTTATCGGTGAAATTTTATAATAAAAAACGAAGCCAGACTTTCGACTATTATCGAAAGTCTGGCTTCATATTTTGTAGTTCTTAATTTTACTTACCAGTGGGCCCCAATCGTCTGTTGCCAAGCAAAGTACGGGGTGCCCTTTGTCAATGCTTCAAATTGATCAGCCGTCAAATTGGGCCAGTCGATGTCACTGGTTGCCAATTGTAACGAATCGGTTAAGTGAAGATGAAAGTCGGTGATCCAAGCCAACAGCGGTTTCAACACTGACAAATCGGTATTTAACATCTGATAAGTAGCGGTATCGCTGGTCAACGTCACCGCCAATGTGTAACGGGCCTTCATTCGTACGCCATTACCAAGTTGCCGCACGATTGAGCGATACAATCCCAGCTCGACGTCCGTGATGACTGTGGGTATTGGCGCCAAGGTTTGAAAGACTGTGCCGCGCTCATCGGCCAAACTCAGCCGACTAGGCGTGATCGTCAAACGCCCATGAGCAGCCGCGCCCTCATTCAACGCTTTCAAGATAAACGGCGTCTTTTTGCGCGCGGTCGAATACTTGTGATCATTTAAAACAATCGTCATATAAGCTGGTTGGTGCGTAATATTGTCCGCAATGTTCGTCACCGCGACTGGCATTGGTTTTTGCATGTGATAATCTCCCTTGTCGATCTGCTTCTCTCTACGGTCGATTATACACTAACACGACTCAACCAACGTAGCGACTTAATAATTGCCTTAGGCCGTCACCGGATCAACGTGCTCAGCAACAGCATGAGCCGCCGCGATTCGACCGAACGTAAAGATATCACTAAGCGAGTTACCACCCAGCCGGTTACCCGCGTGAATTCCACCGGCTACTTCTCCCGCCGCGTATAGCCCGTCGATAATCTGACCGTCCGTATTTAAAACGTGAGCATCCGGATCAATCTTCAAGCCCCCCATCGTGTGGTGGGTTGCTGGTTTACGCGGCGTTGCGTAAAATGGTGCCACGGCAACTTTCAAATCAAAGGCCGTCTTATGAAATTCAGGATCCTCGCCAGCATCAACGTAACGATTGTAGTCCGCAATCGTCTTGGTCAGGGCTGCCGGGTCCATGCCAATTTGGTGCGCTAAATCTGTCAAAGTATCAGCACGGAACAAGGTCCCATTCGCCACCTGCTGGTCAATTTTAGCTTGTGTCGTGTTGTAAGCCGTCTTTTTAATTTCATCATCGGCAATTAGATAGAAGAGACTCCCATTATCAATGGCCGCCTGAGTTAACTCATCACGACTGCCGTACTCATTGACGAACCGTTTTCCTTGCTGGTTTACCATCACAAAGTTTGCCGGTGGCACTTGGAGCCCACTGAATAATTCGCCGGTCTCCGGATCAGATACCGGCATCATTTGTGAGAAGCCCATCCCAACTAATGCTGCACCAACACTAGTCCCTAGCCGAATTCCATCACCAGTCATTGCGGGTGAATTAGTCGTCTTGACATCATCGTCGATGGCCGCCCAGTACGTATTGTACTTTTGTAACATTTTAGTATTCGCTGCGAAACCACCAGAAGCTAAAATCACCGCATCAGCATGGACAATAACTTTCTCATGAGCCGCATTAGTCGCAATGACGCCACGAACTTGCCCATCCGTCACCAGTAATTCTTTTACCGGCGTTTCCGTCATAATCGTACCACCCTGTTGTTCAACAAAGGCCCGTAAAGTCTTGATGTAAGCAAACCCTAGATCGCCCATTGGCTTATGCCCGCGCCGCCAGATGGCTCCAACTGGCATTGTCACTTGGCTTTCATCAAATTTCACACCAATCGATTGTAACCACTTGACTGAATCCAGGGCGTTATCCGTCAATTCTTTTACCAAATCATACTGACCGTGAATCTCTTGACCGTTCAAATCAGTCCGTTGACCACCTAAATAAGTTTGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP030881|1596081:1606721|1602329_1602944_-|WP_003643097.1|DBSCAN-SWA MKFVGIVGTNATKSTNRQLLQYMQRHFQQQATIEICEIKDLPAFNEPEDRTAPVAIQQLSDKITAADGVIFATPEYDHSIPAVLKSAIEWLSYTTRPLINKPVMIVGASNGSLGTSRAQAHLRQILEAPELKALVMPNIEYLLGRSLQAFDDQGDLTYPDKVQELDNAFGEFIDFVDLTNKIMPSSQFFEKSKQFSWRQVTGEE >NZ_CP030881|1596081:1606721|1597712_1597943_-|WP_003643091.1|DBSCAN-SWA MYILIGSYDEHGLPATLTWNIAFNPSGKKLGTVVVNDTLGSNQSYLSDSVIAQTGAYNDAGNFVQSGRLCHKEAVT >NZ_CP030881|1596081:1606721|1599240_1599801_-|WP_003643095.1|DBSCAN-SWA MQKPMPVAVTNIADNITHQPAYMTIVLNDHKYSTARKKTPFILKALNEGAAAHGRLTITPSRLSLADERGTVFQTLAPIPTVITDVELGLYRSIVRQLGNGVRMKARYTLAVTLTSDTATYQMLNTDLSVLKPLLAWITDFHLHLTDSLQLATSDIDWPNLTADQFEALTKGTPYFAWQQTIGAHW >NZ_CP030881|1596081:1606721|1599888_1602327_-|WP_063493310.1|DBSCAN-SWA MKFVGIVGTNAQHSYNRMLLEFMQRHFATQAEIEILELTDVPMFDESNDQTDSTIIQNFATKIATADGVIIASPEHNHSVPSALKSIIEWLSFKIHPLDGQAVMIVGASYSVQGSSRAQLHLRQILDAPGVNASVMPGSEFLLGRAQTAFDDQGNLKVQGTVDFLDSCFAKFQKFATIVAEMRAPEALSFAPGTYQVTATGHNGELPMRVTLSADRIENIEIDTSSETQGIADVAFERIPKEIIAGQTLAVDAISGASITSHGVIDGVARAVKEAGANPDDLKKRRATKQVAQPAVKEVTTDVVVVGAGGAGMTAAAKVLQAGHQAVVLEKFPAVGGNTVRAGGPMNAADPDWQRQFAALPGEKQTLKDLSERDESTIAPEYRADFRKLKQQIDAYLTANTNQKGTLFDSTLLHRIQTYLGGQRTDLNGQEIHGQYDLVKELTDNALDSVKWLQSIGVKFDESQVTMPVGAIWRRGHKPMGDLGFAYIKTLRAFVEQQGGTIMTETPVKELLVTDGQVRGVIATNAAHEKVIVHADAVILASGGFAANTKMLQKYNTYWAAIDDDVKTTNSPAMTGDGIRLGTSVGAALVGMGFSQMMPVSDPETGELFSGLQVPPANFVMVNQQGKRFVNEYGSRDELTQAAIDNGSLFYLIADDEIKKTAYNTTQAKIDQQVANGTLFRADTLTDLAHQIGMDPAALTKTIADYNRYVDAGEDPEFHKTAFDLKVAVAPFYATPRKPATHHTMGGLKIDPDAHVLNTDGQIIDGLYAAGEVAGGIHAGNRLGGNSLSDIFTFGRIAAAHAVAEHVDPVTA >NZ_CP030881|1596081:1606721|1597917_1598385_-|WP_003643092.1|DBSCAN-SWA MRNKLFSVLLGLLTVLVTVIVLGRIGQADDVSTAGLTGNEARVTDRYGNVITDTSQLSKWEDFTVEYDWAIRNGQPIAAGDTELPNGTVAPVDLGFPLKDDNGRVAGHFKIKAGETAGLITFNDALSQMGTNRASTLQFYVKGTADSDVYFDWKL >NZ_CP030881|1596081:1606721|1604420_1605392_+|WP_024971568.1|DBSCAN-SWA MITNKCRYGLVGLISIVLTFGLSASNRLRASFNAMPAITYMSKYGIINHRTQWQAMLHATDHGRKITSLTQPNQILRAANLHSFAVANLRQFEHATRPTKTMSAGLTIINVPAFYSSQHQLQKQYWTQLQHLIKQTKPTTDLILNFAANTGGSSAPMIAGLAAIIPDGTLYTGITNHHRNRPRMMYHGRITGGLGQDDFNFSQPTAAHFRHIYAIIGNQTASAAEVTIMALKRNPHVTLVGRSSAGYTSLNGGVFLNTAVAVMTIGTLKATVKIHGQQYFNNQPLKPDIPTLYQPLAPLQLGQSPHLDADFLSELQTIMKHYH >NZ_CP030881|1596081:1606721|1598729_1599170_+|WP_003643094.1|DBSCAN-SWA MAQIYIASPFFSPEQVTRVTQLEEALAKNPTVTDFYSPRLHQDAQAEQFTKTWATEIFHRDMAQIAAAQVIVTVLDFEAKNLDSGTAYELGVATMRDLPIIALQEKDEAVNLMITESLHWYTKQVSDFETYDFQQLPKGDFIGEIL >NZ_CP030881|1596081:1606721|1596081_1597776_+|WP_114071735.1|transposase|DBSCAN-SWA MQDYYNMNQTTLSIALDYQPEDHHSARYINQLVESLKLKYDYQFGRPREYNLGAMLKLVLLAYSYGIFSSRKIERFARENKPAGWLIADQIPSYRTICRFRISDELATLTTDSLSQLTQYLRQNGMIDDVSFIDGTKILADANKYSFVWKKNTIRFDKMNREKLVDLLGELHEAKIVGEIPAGSELTPELLDIMISKVEDHLVVLNETVEATKQVSPNPAKQQRRTVKSQKRKLDKRRDKMREHQAQQAIYGQRNSYSKTDHDATFMRVKEDPMQNGQLKPAYNVQIATSNQFITGYRLFQNPTDTRTLQPFIEHLKANNVLGHTIVTDAGYGSESNYRYLEDEFGQHTVLIPYGTMLKENSRKWQSDDRKVMNWDYHEKDDYFINPQNVRFNFNAYRRRTDKYGFTRDFKEYIAEKYDENHQLIATALTPKGYLKRISVNENWEYFKSKQRELLSAPETGQIYAQRKIDVEPVFGKMKASLHFNRFSVRGFDKVTKEAGIVILALNIMKLVTVGTNFKNQRRKQMGRETKIRFLVPFAYTEASYVTASLWHNRPDCTKLPASL >NZ_CP030881|1596081:1606721|1605482_1606721_-|WP_003644269.1|DBSCAN-SWA MARDGTVTETNDLKLHALGEIIGMNEQEAYVTTFYWLADCWLETSYLGLEDEFDDDEIDDAVKSLLNRMQAGAIYEVTADDPMWQAWKRAVRAVLTPNDHAEHEVDETDGEDELVLPAGVRPERQLEEVQAYAAMNAFLQAQDQEYLQEIGKRAATQVSGAGWQVWRAHRQSMHPESAAPLTLTAEQLPAVMWAFFDKYQDTEDSFEIFELVSQLEQWQKSADRDLDAQWSQLVAKSQIDPAAITLMQGLSLAIEFFDQLEWDGDLTAKATLQNKLMQRTLDDTLNDETTANWADAWQHWDLADPLTTEQWARRFDPADDYEEDEDESKEDGSARPAWQLGASYSTVLIAMRLVAYGVLRPESVPGMATVKMANRALAATVSIGIVLVAWLVTAILITIVIWGWRWLRKLIF >NZ_CP030881|1596081:1606721|1603287_1604235_+|WP_003643099.1|DBSCAN-SWA MPKSDSSEMRRFLDVLLKHGNFTRAAKDLYISQPYLTQSIRNVEKELGVTIINREVTPLRLTTAGRTYYQYLTALENEKDYFNKQIRQYTHANQQVIRLGVLSSLGYYLLPLFLPAFLKAHPATKIELTEDIASRNEQRVLHGELDFLIGQNPETIAPGLESYDRGRDGYYAIIPNTVNWYQPHQAFINPGALPLNDLLQAPLVLSPHGSSIRRQVDYLLQKHNVTPNIVIESTNTATITKLATAGLGITFLPDSVHTQPDPERYNILPLPQALMSLNYFIAFPAEHSLNQVEKDLVTIFLTQLEADLAQSSTIS |
10 | Lactobacillus_phage(90.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2218524 : 2316280
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP030881|2218524:2316280|DBSCAN-SWA 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115 | Lactobacillus_phage(30.43%) | terminase,tail,integrase,tRNA,head,holin,capsid,protease,plate,portal | attL 2284024:2284039|attR 2317972:2317987 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2420095 : 2479177
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP030881|2420095:2479177|DBSCAN-SWA 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55 | uncultured_Mediterranean_phage(22.22%) | bacteriocin,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2482606 : 2529390
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP030881|2482606:2529390|DBSCAN-SWA 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46 | Paramecium_bursaria_Chlorella_virus(50.0%) | bacteriocin,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
8275 : 23138
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP030882|8275:23138|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP030882|8275:23138|11353_12040_-|WP_003646115.1|transposase|DBSCAN-SWA MENYFKGRHFQKDIILVAVGYYFRFSLSYRDVVEILRDRGIIIHHTTVMRWVHHYGPLFKLLWRKQRDTHSQSWRVDETYIKIKARWHYFYRAIDSHGLTLDFELRKHRDYQSAYHFLKRLLTTYGRPDCLVTDQYAGTLKAIKQVIKDGLLVKANHQCSKYRNNLIEQDHRLIKHVLVKSSGFQSLRTALKTLSGIEVMHQLHKVSQREPSLFGFSSSQSLIELLVQ >NZ_CP030882|8275:23138|19425_20442_-|WP_003645576.1|transposase|DBSCAN-SWA MTHSQTNTHKHYQQLSFSDRATIQALQAAGDTATVIAQKLHRSKATISREITRGSVTQLDSKRHSHQVYLAETAQAMHDRKRDRTGHYAFLKTGRAFFKALARKLTRKPRVHSVDSFVHFYRDQGKACPSTTTVYRYIDAGLLELDNMTLPKKLRRRIKGYKNAHKRKNKKIYGDSIELRPAAVNDRTGVGHWKGDLVKGIRLADEPALMTLTERYSQTEIIVKIPDYHAGTCLKALQDTIDDYGAKEFESITFDNGSEFAKLSEIVGTQIYFAHPYSPWERGTNENANGLLREFFPKGKSLRAVTLVEIQAVQSALNHRPRRILNYLRPCDYYRCMA >NZ_CP030882|8275:23138|20647_21016_+|WP_101494317.1|DBSCAN-SWA MSNKDTCEIYCYDEKKVNRIREELQKEDISSVSQLFKALADENRAKITYALCQDGELCVCDVANIIGSTVATASHHLRTLHKQGIVKYRKEGKLAFYSLDNEYIKQLILIALAHKNEVKANV >NZ_CP030882|8275:23138|15794_17513_-|WP_041153657.1|transposase|DBSCAN-SWA MQDYYNMNQTTLSIALDYQPEEHHSARYINQLVESLKLKYDYQFGRPREYNLGSMLKLVLLAYCYGIFSSRKIERFARENKPAGWLIADQIPSYRTICRFRISDELATLTTDSLSQLTQYLRQNGMIDDVSFIDGTKILADANKYSFVWKKNTIRFDKMNREKLVDLLGELHEAKIVGEIPAGSELTPELLDIMISKVEDHLVVLNETVEATKQVSPNPAKQQRRTVKSQKRKLDKRRDKMREHQAQQAIYGQRNSYSKTDYDATFMRVKEDPMQNGQLKPAYNVQIATSNQFITGYRLFQNPTDTRTLQPFIEHLKANNVLGHTIVADAGYGSESNYRYLEDEFGQHTVLIPYGTMLKENSRKWQSDDRKVMNWDYHEKDDYFINPQNVRFNFNAYRQRTDKYGFTRDFKEYIAEKYDENHQLIAAALTPKGYFKRIYVNENWEYFKSKQRELLSAPETGQIYAQRKIDVEPVFGKMKASLHFNRFSVRGFDKVTKEAGIVILALNIMKLVTVGTSFKNQRRKQMGRETKIRFLVPFTYTEASYVTASLFIMVLCRFVFVDFSYYFECFFF >NZ_CP030882|8275:23138|17875_18493_+|WP_003645574.1|DBSCAN-SWA MKIGYARVSSTDQNLARQIKALKKAECEKIFEEKQSGKSTENRPELQAAIAYVRQGDTLVIASLDRLSRNYDDASDIIKQIRDKQVKMEVLDAPFLSMRTGDSDMDKFMFDLLTKLLAYMAQTERKKIRERQRQGIEIAKANGKYRGTRPAYAADAPNPQKRFIYRRIVDQLRNKATGAPISYRAIAAETGVSVQTVINIKNRLV >NZ_CP030882|8275:23138|15109_15712_+|WP_050557824.1|DBSCAN-SWA MTTPNIHIKNPKPTKIKQFANPEPKEWLAKDLSKGLYADWKFPSVSDGNGVRGSLFVSGCMFHCHNCFNASIWNFNNGKPFTKDVQDKIIQDLSHSYVQGLTLLGGEPFLNTNILIPLIDRVRKELPTKDIWSWSGYTWEELLKDSDDKLEMLSKLDVLVDGRFDERLKAGDHPFRGSSNQRIIDVPASLKQHKLIKLME >NZ_CP030882|8275:23138|10450_10903_-|WP_072535998.1|DBSCAN-SWA MLYISLSGNTKYFIGKLTKYFEEERHIQVNSINVKEHPEFTTLDQPFVAFLPAFLKGGNGVNNGYTEILTTILGDYLEHEDNYRRCYGIIGSGNRNFNKQFALTAKQYAERFGFPYITDFELRGTAHDFPRIADAILTYRDQFSSQTTKE >NZ_CP030882|8275:23138|18956_19301_-|WP_126043855.1|DBSCAN-SWA MKADSCKAYVKPIDFTKLFTECFFVTASQINPRIKAQHGYFMFQPFLETTSISTIQNMITQQYEPQKIIVPATYKDLIQKELRHLGYSRETLFPDEEALGVKYSETINSINNSH >NZ_CP030882|8275:23138|8275_10423_-|WP_033615749.1|DBSCAN-SWA MENTYFYLNNLVNIPVDGEIPLYYDQEALKAYFEETVEPKTKQFDSLDAKLNYLVNEDYIDPDILNQYSHEFVRSLFDRMKDHHFHFRSFLGAYKFYTQYAMKTNDGQQFLESFIDRVVFNALYLANGDEQLANDVADELISQRYQPATPTFLNAGKKRRGEMVSCFLIDMADSMLSIGRGVNSALQLSRIGGGVGVNLSNLRASGDSIKKIANASSGVVPVMKLLEDSFSYSNQLGQRNGAGVVYLNVFHPDILHFLDTKKENADEKIRVKTLSLGLIVPDKYYELLKTNEPMYLFSPYDVEREYHTPFAYIDITKEYDNMVANPNIKKSVFNARKLEQKISQLQQESGYPYILNIDTANRTNPVDGKIIMSNLCSEILQPQEPSELDDDLSYKTIGTDISCNLGSTNIMNMIDSPDFGRSVAVAVRALTLVTDTTNVKEVPTVKHGNELYHTIGLGAMGLHTALARHQIEYGSPEALEFTDAYFLALNYYSLVTSNQIARERHETFAKFEQSKYADGSYFDQYLNADFEFKSTKVAEVFKNIKLPSVADWEALKQAVMADGLYHRNRLAVAPNGSISYVNETSASLHPITQLVEQRQENKVGSIFYPAPYLSNETLPYYTPAYDIDQRKIIDTYAVAQKHIDQGMSLTLFMRSVLKPDLYEWKDNDNLKMTTRDLNRLRNYAWTKGIKSLYYIRTFTEDDEIKTANECESCMI >NZ_CP030882|8275:23138|12596_15020_+|WP_003646551.1|DBSCAN-SWA MQLKDVVNELSLSEMQITRLANDKKIVRYHKNHSKMWEYDDESVFVYKHYLEEKQRLAQRYNTQKTVIKRNKSIAKFHRENITNAVTKAFEDVYSNIEDHITKIDQIVDLTINKLLRQNKMQFDITEIQSAVEQSLVDVEEFKVAEAYTAYRLQHDIDRKKQTSVDYQINKLLKKDDDVVNENANKDADVYATKRDLTAGAVSKAIGLKILPKKIADANIKGLIHWHDLDYSPANQYHNCGLIDLEDMLKNGFTLGNADVESPHTLTTAVAQASQILSAISSSQYGGCSYDRIDEVLAPYAKKSFKKHLKIAKSLNIEDQKNYAEIMTRREIQQAMQSFEYEINTLYSSNGQTPFVTLGFGLGTSWFEREIQIGILHQRIAGLGKDHRTAIFPKLLFTIKPGVNMHPKDPNYDIKKLALKSVIKRMSPEILNYDNVIDITGSFKASMGCRSFLSAMSPEDLKARGETHDYSSGRLNLGVVSLNLPRIALDSNGDKEKFWKLLDERLNLQRDALLFRIENVKQALPKYNPAGFMYGGYGRLDPDGNVDELFNHNRASVSMGYVGLYEMTARFYGDWQHDHTYNQEAHDFAYSVIKHMNEKAAAWKKQYGYGFSVYGTPAESLNSTFEEIDHKLYPNVPFVTDHDFYTNSFHYFVERKPTPFEKLDFEAPFQKLSNGGFISYVELPCMKDNLDALEAIWDYSYKAGIGYFEINTAIDHCLECDFHGEYTADEKGYHCPNCGNSNPETSDVTRRICGYLGNPMKRPPKHGRQAEIIHRVKHMSGTLGRLDNGEFLESDIADKNKVRKLNN >NZ_CP030882|8275:23138|21008_23138_+|WP_003645578.1|DBSCAN-SWA MSDQQAKLSEEEMKTYRVQGFTCTNCAGIFENNVKQLPGVKDAKVNFGASKVYVQGNTTIEELEKAGAFENLKVRDEKEQKVEREPFWKQKENIKVYISALLLVISWFLGEQLGEEHLLPMIGYAASILIGGYTLFIKGLKNLSRLKFDMNTLMTIAIIGAAIIGKWGEGATVVILFAISEALERYSTDKARQSIGSLMDIAPKEALIRRGNEEMMIHVEDIQVGDIMIVKPGQKLAMDGLVIKGTSTLNQAAITGESVPVTKTIDDEVFAGTLNEEGLLEVKVTKRDEDTTISKIIHLVEEAQAERSPSQAFVDKFAKYYTPAIVLLALLIAVVPPLFGGDWSQWLYQGLAVLVVGCPCALVVSTPVAVVTAIGNAAKNGVLIKGGIHLEEAGHLKAIAFDKTGTLTKGIPAITDIVTYGGNENELLTVTAAIEKGSQHPLASAIVRKAEENGLNLNGVSVEEFQSITGKGVKAKVNNEMYYVGSPNLFEELHQTIESTIKERITRMQTEGKTVMVLGTEKEILSLIAVADEMRETSKEVISKLNHIGIETVMLTGDNQRTAEAIGKQVGVSDIKADLLPEDKLNFIKELLGKHQSVGMVGDGVNDAPALAASSVGVAMGGAGTDTALETADIALMADDLSKLPYTIKLSRKALAIIKQNITFSLAVKLVALLLVMPGWLTLWIAIFADMGATLLVTLNSLRLLKVKG |
11 | Enterococcus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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