CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP022595	Mycoplasma bovis strain NADC62 chromosome, complete genome	2 crisprs	NA	0	0	9	0

1. NZ_CP022595

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP022595_1

• CRISPR_ID: NZ_CP022595_1
• CRISPR_location: 270241-270323
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP022595_1

Consensus_repeat	Method
TCTGTACGAGATGTGCTTGAAGA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP022595_1

>1.1|270264|37|NZ_CP022595|CRISPRCasFinder
GCTTGATGAATCAGGCGAATCGCTTTGAGTTCCAGAT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP022595_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP022595_1

>merge|NZ_CP022595|1|270241-270323|CRISPRCasFinder
TCTGTACGAGATGTGCTTGAAGAGCTTGATGAATCAGGCGAATCGCTTTGAGTTCCAGATTCTGTACGAGATGTGTTTGAAGA

>NZ_CP022595|1|1|270241-270323|CRISPRCasFinder
TCTGTACGAGATGTGCTTGAAGA	GCTTGATGAATCAGGCGAATCGCTTTGAGTTCCAGAT
TCTGTACGAGATGTGTTTGAAGA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP022595.1|WP_013954647.1|274922_276869_+|transketolase	unknown	unknown	gnl|CDD|223100
NZ_CP022595.1|WP_075271093.1|264250_264967_+|ribonuclease-HIII	unknown	unknown	gnl|CDD|260000
NZ_CP022595.1|WP_013954649.1|277947_278535_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP022595.1|WP_013954635.1|265154_266129_+|DNA-(cytosine-5-)-methyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|223348
NZ_CP022595.1|WP_013954630.1|257151_258549_+|CvpA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|367140
NZ_CP022595.1|WP_013954691.1|271103_272348_+|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|222853
NZ_CP022595.1|WP_013954648.1|276931_277486_-|inorganic-diphosphatase	unknown	unknown	gnl|CDD|179388
NZ_CP022595.1|WP_013954652.1|282190_282526_+|HIT-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223611
NZ_CP022595.1|WP_013954633.1|263319_264249_+|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|319818
NZ_CP022595.1|WP_013954636.1|266121_266829_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP022595.1|WP_014829885.1|268549_269536_-|ribose-phosphate-pyrophosphokinase	unknown	unknown	gnl|CDD|234929
NZ_CP022595.1|WP_013954631.1|258662_260579_+|DNA-topoisomerase-IV-subunit-B	unknown	unknown	gnl|CDD|223265
NZ_CP022595.1|WP_013456603.1|277564_277834_+|30S-ribosomal-protein-S20	unknown	unknown	gnl|CDD|178943
NZ_CP022595.1|WP_013954646.1|273879_274824_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|367881
NZ_CP022595.1|WP_013954651.1|280808_282191_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP022595.1|WP_013954638.1|267870_268566_-|16S-rRNA-(guanine(527)-N(7))-methyltransferase-RsmG	unknown	unknown	gnl|CDD|223434
NZ_CP022595.1|WP_038582854.1|272425_273193_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223039
NZ_CP022595.1|WP_013954632.1|260592_263178_+|DNA-topoisomerase-IV-subunit-A	unknown	unknown	gnl|CDD|235503
NZ_CP022595.1|WP_013456076.1|267298_267628_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP022595.1|WP_013954650.1|278628_280797_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP022595.1|WP_013954647.1|274922_276869_+|transketolase	gnl|CDD|223100	COG0021, TktA, Transketolase [Carbohydrate transport and metabolism].	0
NZ_CP022595.1|WP_013954648.1|276931_277486_-|inorganic-diphosphatase	gnl|CDD|179388	PRK02230, PRK02230, inorganic pyrophosphatase; Provisional.	6.84527e-119
NZ_CP022595.1|WP_013954635.1|265154_266129_+|DNA-(cytosine-5-)-methyltransferase	gnl|CDD|223348	COG0270, Dcm, Site-specific DNA methylase [DNA replication, recombination, and repair].	2.47396e-81
NZ_CP022595.1|WP_013954646.1|273879_274824_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|367881	pfam04231, Endonuclease_1, Endonuclease I. Bacterial periplasmic or secreted endonuclease I (EC:3.1.21.1) E. coli endonuclease I (EndoI) is a sequence independent endonuclease located in the periplasm. It is inhibited by different RNA species. It is thought to normally generate double strand breaks in DNA, except in the presence of high salt concentrations and RNA, when it generates single strand breaks in DNA. Its biological role is unknown. Other family members are known to be extracellular. This family also includes a non-specific, Mg2+ activated ribonuclease precursor.	5.57394e-50
NZ_CP022595.1|WP_013954691.1|271103_272348_+|IS3-family-transposase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	2.35927e-29
NZ_CP022595.1|WP_013954652.1|282190_282526_+|HIT-family-protein	gnl|CDD|223611	COG0537, Hit, Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases [Nucleotide transport and metabolism / Carbohydrate transport and metabolism / General function prediction only].	5.20672e-31
NZ_CP022595.1|WP_013954633.1|263319_264249_+|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase	gnl|CDD|319818	cd07516, HAD_Pase, phosphatase, similar to Escherichia coli Cof and Thermotoga maritima TM0651; belongs to the haloacid dehalogenase-like superfamily. Escherichia coli Cof is involved in the hydrolysis of HMP-PP (4-amino-2-methyl-5-hydroxymethylpyrimidine pyrophosphate, an intermediate in thiamin biosynthesis), Cof also has phosphatase activity against the coenzymes pyridoxal phosphate (PLP) and FMN. Thermotoga maritima TM0651 acts as a phosphatase with a phosphorylated carbohydrate molecule as a possible substrate. Escherichia coli YbhA is also a member of this family and catalyzes the dephosphorylation of PLP, YbhA can also hydrolyze erythrose-4-phosphate and fructose-1,6-bis-phosphate. Members of this family belong to the haloacid dehalogenase-like (HAD) hydrolases, a large superfamily of diverse enzymes that catalyze carbon or phosphoryl group transfer reactions on a range of substrates, using an active site aspartate in nucleophilic catalysis. Members of this superfamily include 2-L-haloalkanoic acid dehalogenase, azetidine hydrolase, phosphonoacetaldehyde hydrolase, phosphoserine phosphatase, phosphomannomutase, P-type ATPases and many others. HAD hydrolases are found in all three kingdoms of life, and most genomes are predicted to contain multiple HAD-like proteins. Members possess a highly conserved alpha/beta core domain, and many also possess a small cap domain, the fold and function of which is variable. HAD hydrolases are sometimes referred to as belonging to the DDDD superfamily of phosphohydrolases.	2.19348e-56
NZ_CP022595.1|WP_075271093.1|264250_264967_+|ribonuclease-HIII	gnl|CDD|260000	cd06590, RNase_HII_bacteria_HIII_like, Bacterial type 2 ribonuclease, HII and HIII-like. This family includes type 2 RNases H from several bacteria, such as Bacillus subtilis, which have two different RNases, HII and HIII. RNases HIII are distinguished by having a large (70-90 residues) N-terminal extension of unknown function. In addition, the active site of RNase HIII differs from that of other RNases H; replacing the fourth residue (aspartate) of the acidic "DEDD" motif with a glutamate. Most prokaryotic and eukaryotic genomes contain multiple RNase H genes; however, no prokaryotic genomes contain the combination of both RNase HI and HIII. This mutual exclusive gene inheritance might be the result of functional redundancy of RNase HI and HIII in prokaryotes. Ribonuclease (RNase) H is classified into two families, type I (prokaryotic RNase HI, eukaryotic RNase H1 and viral RNase H) and type II (prokaryotic RNase HII and HIII, archaeal RNase HII and eukaryotic RNase H2/HII). RNase H endonucleolytically hydrolyzes an RNA strand when it is annealed to a complementary DNA strand in the presence of divalent cations, in DNA replication or repair.	1.12092e-73
NZ_CP022595.1|WP_014829885.1|268549_269536_-|ribose-phosphate-pyrophosphokinase	gnl|CDD|234929	PRK01259, PRK01259, ribose-phosphate diphosphokinase.	2.84424e-164
NZ_CP022595.1|WP_013954631.1|258662_260579_+|DNA-topoisomerase-IV-subunit-B	gnl|CDD|223265	COG0187, GyrB, Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II, topoisomerase IV), B subunit [DNA replication, recombination, and repair].	0
NZ_CP022595.1|WP_013456603.1|277564_277834_+|30S-ribosomal-protein-S20	gnl|CDD|178943	PRK00239, rpsT, 30S ribosomal protein S20; Reviewed.	3.77072e-16
NZ_CP022595.1|WP_013954638.1|267870_268566_-|16S-rRNA-(guanine(527)-N(7))-methyltransferase-RsmG	gnl|CDD|223434	COG0357, GidB, Predicted S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in bacterial cell division [Cell envelope biogenesis, outer membrane].	1.24583e-40
NZ_CP022595.1|WP_013954630.1|257151_258549_+|CvpA-family-protein	gnl|CDD|367140	pfam02674, Colicin_V, Colicin V production protein. Colicin V production protein is required in E. Coli for colicin V production from plasmid pColV-K30. This protein is coded for in the purF operon.	5.9383e-07
NZ_CP022595.1|WP_013954632.1|260592_263178_+|DNA-topoisomerase-IV-subunit-A	gnl|CDD|235503	PRK05561, PRK05561, DNA topoisomerase 4 subunit A.	0
NZ_CP022595.1|WP_038582854.1|272425_273193_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|223039	PHA03307, PHA03307, transcriptional regulator ICP4; Provisional.	5.22796e-06

Protein sequences

>NZ_CP022595.1|WP_014829885.1|268549_269536_-|ribose-phosphate-pyrophosphokinase
MNNNNALLFGMPNCIKLAERISKMINIPLSTLTLTKFADGETMPVSDEAVRGKDVYIIASTSRPVNDNLMILYLFIDSLKRASAKSINIALAYYGYARQDRKASGRQPIGAKLVADFLETAGASKIITVDLHNSAIQGFFNIPIDDLKASFTLAKAIKRSHEKFTVVSPDHGGTVRARSLAELISNDIKISIIDKRRTGINQTEVMGLIGDVKDQNAVIIDDIIDTGGTIIKAAETLKQYGAKKIVIAATHGIFSKGFDIFENNPAVEKVIITDSIDNDELLDKYKKLEIVSLDRFLGSVIDCSINGKSISMLYDKFAKEIKENESHK
>NZ_CP022595.1|WP_013954638.1|267870_268566_-|16S-rRNA-(guanine(527)-N(7))-methyltransferase-RsmG
MNHINKEYLLNKYSKQIPLLYRYAQMIYEKNKVMNICGFDSVDEIFNQGILGSILVFENAMNEYNHDFVNKKILDIGAGAGFPSVPLLIALDNKFELVIMESITKRCTFLESVKNEFNLNLTIINARAEEINDYNSYFDYICARAVGSVIKIYLMTNHHLAQNGYFILPKGKNYHAEIDEFKNKFTLEKDNISSFEYEDSINNENSSLVLIKKTKPTPRGWPWKWAKIKNY
>NZ_CP022595.1|WP_013456076.1|267298_267628_+|hypothetical-protein
MSRTKKLSISYLITYPIAFIVTVVLLVLYGRQLLDFAQQKEGFTGNLALWTVYLLYAVVIVVPFIMLIINILLIFFNVGTIARILLIVGLFVPWCSFVGALIALIRPGK
>NZ_CP022595.1|WP_013954636.1|266121_266829_+|hypothetical-protein
MNNYSEVAIELQSKLEEAINNIFEITNNEISINVEDVNILQRDNNSINSSTAIGYILEEYLIRKIEQYLSSPDCHFEFSMKPNNKANTSSYDFSLVYKDHLFYINLKANRNVNDAIAAINRLYSDYVEYEGKNPLHYLVFKTNYDIDKSKISNQNKIIIKGTYSFFLEQIDFSKGWKQDHRSWSPGGKLNSGRLIVSKNFFNENQIEISKISYEQTRAYLEEMFNKNFSVAEYEE
>NZ_CP022595.1|WP_013954635.1|265154_266129_+|DNA-(cytosine-5-)-methyltransferase
MGKRGIIDLFAGAGGLTLGFTQNNFDILDTIEFWQPAVDTYNFNFKKNVVAKDITDSEVRNELESNWKNKTDLVIGGFPCQGFSLAGRRSKDDERNQLYKYTIDVISRLQPYGFVLENVKGILSFRESDNELVVDKIQKMLAKENYYTKFILLDSSNFGVPQKRERVIFIGCKDKEKVDKVISLLSKHKEKIVTVFDAIGHLEKVTDDKEIPNHIFSKHSEEIKERFMKLKEGESLSKSFSDAFRKLSYDKPSPTVKENHGGVHVHPVLPRVLTPRELANLQSFPEDFIFLGTKSNVLKQIGNAVPVKLSYEIAKIVNKVFFNE
>NZ_CP022595.1|WP_075271093.1|264250_264967_+|ribonuclease-HIII
MQFLDLDVESSLLENKSIIGVDEVGVGDYFGPLCACAVFIDAQNVNKVAELGIKDSKKLSDKRIKELALKLKNSGLIHYSLAHLNPSGYNKLNKSYNANILKMFVHLKAINSVVFKLKNIKYDYIFIDKYASVDNMLKYYNELVINNNWANFQEINEDILIANKAESYSISVAAASILARDQFLTLVSKMNDEYNTVFPLGAGPKVNAFAKDFFAKHSYDEEVIKKTCKKSFKMNILN
>NZ_CP022595.1|WP_013954633.1|263319_264249_+|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase
MSTLTNNKKEKFLFAIDLDGTLLSSSRENIVPENCIKAIQRAKDEGHVVCIFTGRPWRSTKPIYDMLGLNTVVSNYNGAQIHNPKDDNFIPHIKYLNLNEMLYILGDQKVKKEISNLAIEGPGWVQLEHRDDDIEAVFGFSSAEKFTVGINLNKVPLSPTGIVFDVKETTDAEELRRYLRARYGDLGEFSYWSKGEGLTPVFDITNVTVNKGRALSLLSRYYGVDLDHTIAFGDGFNDVPMFKVATVSVVLGNAADLVKRHATVRLKKTNKEGGVGDYINKFLDNPEKEIAKSKAMALKMRKVSIQEEE
>NZ_CP022595.1|WP_013954632.1|260592_263178_+|DNA-topoisomerase-IV-subunit-A
MNKKKEQQLNDLLSKIVRENLDTVVADRFSRYSKYVIQQRALPDVRDGLKPVQRRILYSMYDLGLQHNKPFKKSARVVGDVIGKYHPHGDSSIYDAMVRMGQEWKMGHTLVEMHGNVGSIDDDPAAAMRYTEARLSEIADYVIGDIKKNTVKFAPNFDDSEKEPVVMPVLIPNLLINGSTGIASGFATEMPPHNLNEILDAAIAKIKNPAIELSKLAKIIQGPDFPTGGVIYGTDGIYEAFERGKGRITLASRYNVYSDNKYKYIEITEIPYGVIKSKLVHEIDLIVDSEEVAGLIEVKDQTDRNGINILITLDKNVNENVIVNYLFLKTQMRIYYNYNNVVIDNHTPKTMGISALLDAYLKHVKDVKVKTIEFDLIKHKARLEIVIGFLKVAKITDKVIEVIRKSEDSKQGVIDNLMSAFDFTLNQATAIAELRLYKLSKTDEHTFMFEKQELEEKIKQCELLLTNPDEFNNYLVSLFRDLKHKFGRIRRTSIEIEQINSSVNQEDLVKEEEVFLGISKFGYIKKVSKKTYESNLITTYGIKEDDNILFYDIASSLDKLLLFTNLGNYAYLPVFKVNESKWKEFGIHLSDFVDLSSGEEIVSVIKVSDFDVTNYVCMFTKKGQGKKVLLKDFDVSRFSKTFVAMKLKNDDELISAKLSNGLKDVLLITKNNFASLYSENDVPIYGLKSNGNKACYLANGDELVSFTVVKPNDSVALVSQSNKVRLINVSEISRVSKQNKGVSIFSKGRLNNAIVQCDPLLDETKLLLVNNQGQAHFEKIQNYVKQASTKFINFDADDIRTISLISNYSSTTNDNEFHSYEKESSDENQLMNKAIETKNSIDLSIDEILSKVDELLKKDKK
>NZ_CP022595.1|WP_013954631.1|258662_260579_+|DNA-topoisomerase-IV-subunit-B
MSNSNYDASSIQQLKGLEAVRKRPGMYIGSTDVNGLHHLIWEIVDNSIDEALAGEANEIAVILKNDGSVVVSDNGRGIPVGKTPSGKSAVELVFTELHAGGKFNEGAYKTSGGLHGVGSSVVNALSNKLKCLVYRDKHVYETIFENGDNIVQKTHIIGSTNKRGTLIQFWPNYEIFKKAKFNFETIAERLRESSFLISNLSIKLLDEQSGKSEEFKYSNGIKAFVEFINDSKTALFNVYSFKTVVNEIEIECGFQYTDGFNETILSFVNNVKTRDGGTHEIGLKSAITKTFNDFALDEKVLKGKNTFDGEDVREGLTVVLSVKIPEKFLEFVSQTKDKLGTPEAKSAVEEAVSKNLKTWITENKQIAKKILDKIKRASDSRESARKARLEARKTKSALKERQILSGKLTPAQTKNVKEKELFLVEGDSAGGSAKSGRDRKFQAILPLRGKVINTEKARLIDILKNEEINTIINAIGAGIGVDFDINKIQYDKVIIMTDADTDGAHIQILLLTFFFRHMRKLIEEGKVYIALPPLFKLSINKGQKKILYAWDEDELKELLQSKMKGAEVQRYKGLGEMNADQLWETTMNPETRTLIQVRIQDAALAERRVSTLMGDNVDSRKEWINKNVNFTMEDDFEI
>NZ_CP022595.1|WP_013954630.1|257151_258549_+|CvpA-family-protein
MKIIESLENIAFNSWSILIPIILVIFIVILAIVSGLRRGIYGGLIILLFGLSGWIIGIFAAKPLVDVIVIKTKITLPGNKQIDAEILRKMFYGIAMFVIQILFLIVGEIISLLLRKWIKKPLKNMRENKVSSVGSRSLGAVLSTAGIVPCAILTANVTGFLTTNNKVIDANDKMLNYISFKKAEGVSKYTPGLIASAKIGNDLLNASSGSKLDETVIGAFEWYLQQFANPDNYVLLSVSKDGQAKPIISTNALKNINRKEEQEKVLQGLIPFILGDSSVKKNGITLFFNFNTSSAGAFKYDSNSGKIEINTDNSENTQLKVKNIGKISNIFQLYTATPESFRILEYLSKLGLKDAKASEGFDEIYSLVDQTEPVWDILNAAQLKFNMNPSYRIKVYDREYVKRMKDILFDLFEKNTGGKFKYDRKELNEEKMKSWVTIQTIHQKIYWIVSSVIDNVFITPENVSN
>NZ_CP022595.1|WP_013954691.1|271103_272348_+|IS3-family-transposase
MAKQLSVNEWKYLFEKYEKYRSGELTKKCFLNEMMKIKNVEHISDDQWKRLVNKYKRYNLGMNIESMSGRSPKKGKGSGRPKKTKSNDEILDEFLNDLNKEDLIKIIKIISTDDEIKKIKKDKFKETVTKIKNSFPFKVSNKVIMSLLKIKKSTYYKKLKKLKMIKEKNLELENTVVQAFKETGGIFGRERLAAYISKNKQIKLNYRTLGRIMKKLGLVCRIRKAKRTKESKNVAVTFQNIASRDYDGIYNDIYATDVTYIPSPIDVDQNFVYMSAVIHHKTKKILGFNLSLYNDNSLVIDNIKKVNFPKNFVIHSDHGSQYSSKEYLQLIERLNGKVSMSRIGNSLDNREIEYFFSVLKTEMFENFEKSVKKMTLKEFERHLNRFIDWYNNERMLKKFNYKTPHELWVEFCKK
>NZ_CP022595.1|WP_038582854.1|272425_273193_-|hypothetical-protein
MPNKVVITGFKDSLINENIIIKPEPIPPINRENPIMKDAETSTNDESSSSSTSRTDSGTQSDSPASSSSSSTSRTDSGTQSDSPASSSSSSTSRTDSGTQSDSPASSEPEKANSELSNERKIKEKGYRLNELTAYPYDLIDVDDDANKDELAKKLNDVITHKNGAIAIVGGSFFSKCNNLQLTGLSINKSIKSETKSQISTHNKLIGFFEGSDGYGIKVGHHGEANSKKYLFKWRLVKEDGNFGPKVYEQIIDLS
>NZ_CP022595.1|WP_013954646.1|273879_274824_-|hypothetical-protein
MMNSKMIKHKFLVSLGLISAPVLSLTVLSSTGCNNKNSTTDDNYLIPEKSFYEKSNYYDSLEGLNGNKLYSELIKIQHNHLSGIKSYRYLKTIYKDAFKDLYYEKDGSLLDIYSENPIGKDPYNYSFNDSGSSAKSEGLGFNREHLVPQSWFKREKLARQDAHHVWPADILVNNKRDNYPFGKVTNAIFTSKNGTKIDSYLAEPIDEFKGDIARAHLYFAITHASRYKMHNKGNEVFKFFDNKPLVNKYFDTYTKWAKKDQINLFDIVRNNEIAKHQNGLRNPFSDYPELIDLIINPGNKVFVNKGILKSNIAV
>NZ_CP022595.1|WP_013954647.1|274922_276869_+|transketolase
MNINQKVVASMQAIALDSINNAGGGHIGSAIDISPIMYAVVAKHMKISADHPKWISRDRLILSAGHASMSFYSMMHFLGLLSLDEMKNHKRKHSKTPSHPETDAFDFVDASTGPLGQGIAMGVGMAIAEKKMSLKINKGNTKVIDNYTYVIAGDGCLQEGITHEALQIASVMKLNKFILIHDYNKIQLDTKVSDVSNVDLLAYFKALNFNVIEINEASYDNIDKAITEAKKSDRPTYIMVHNIIAPFTPFENTTKGHHGILNSEQTIEFKKAIGLENKAPFEYDSDVYEYGRTIMANKAKSYEEWLVELDNHKKQFPWIHSLLLETINNETNYDFSNILVKQDDLAIRDYFKAFSEIVDFSYPFLIGGGADVGSSTKVRFADSILDYGQRIDYGVREFAMTAINNGINLYGGLKTADSTFLAFSDYAKGALRLGGIMKLPAVHLYSHDSYLVGDDGPTHQPIEQVTVLRSIPNLLVIRPCDKYELVMGLNYAYNNTSTQVAIIGTRQPIKTMHSSKFSEFMAASLVYENKEFDISILSSGSEVELAYKTAVELKNHGIIANVISVPVLQKLVDNDELAIKLKLDKKPMFAIEASNDPLWYKLSKYNKIDGHFASEYGFSDKGNVVYDSMGFNVNSIVDKVKQFLSKNA
>NZ_CP022595.1|WP_013954648.1|276931_277486_-|inorganic-diphosphatase
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>NZ_CP022595.1|WP_013456603.1|277564_277834_+|30S-ribosomal-protein-S20
MANIKSKVKSIAKQEEFRQRNNAMKTRVRKAIRAAREAVLAKEEGFEKKVFEAHSIIATAVQKGIYHPNKGARKSSRLDHFVNEQKSKQ
>NZ_CP022595.1|WP_013954649.1|277947_278535_-|hypothetical-protein
MQMIIKTTAIEVLRELQKLLESENINYSLGLSNYYEYKNKPELFLINDIEVCLWHKDFYFLLKKYPNHFILPENLPFKSLAPYYKFQGSSIKINIIVGTSDEKINYWYKFRNYKRLIYWGNSKKHWFYYFLGHRTQRVYLHDLVNDLVVERYTKFIILNSEIDKFKAFDNLNFNKRFFVTEKGITIPFFEPFRSL
>NZ_CP022595.1|WP_013954650.1|278628_280797_+|hypothetical-protein
MGKKKTPFFERLLQKNAEQENKNKTTGKSKKSRSWKIATTSTVLVLAVATGITVPLVINSTKKNFIDGYASNTNVASAKIGDHNLDLNFGDFKDIYQNHNTSTSEERLKEIDKIILYYLYDQEQKASAEYQKLWNDSKRSDEKDNNSFRLPTLDELKTKFKNELVDIENNMKLQFGTANWQTEFNKHLVQKYNGAKNIDEAVKNKTFEHIKSDALRRFRLINGDSKKDEIERKGKDGKHVFGWWHKDNNENKFIELEDKSKLALATDSFVFKDSYKSIDPFIDSYIANEKPRIISEFTIPGIAPAKKNEKWKIDKNIFLRYLFYAKEGTFGLSKVTEGYNVVKEKFNSFDHYIKSVVDKANGKNILPDEAIQYSSILNMFSTSKEDIKKNWGTSGLTSISELVTGDNFQKFLANNPKLLFGENYSSGSTNGNKPKEIELFEKIKEISEKIAEVAKSSNGMSGSSSTGSSSNNNGALISNNTQATEYNTMLEKFFTEVNESQNKGLTEKVFEENILKKFVAIFEDKEKIQTVYKVKFNGNNIGAKNVTGILSPEGFKLLIFGDEIKKDELVKMIKNDFILNNKYKKQLGVRYNALQKLNKQLSRNEYILKMLQDNEFKEYLKTQNNNFATDQNGKKLENVKYNEQSIKDLITSSTAAIQFDKISNFIKLSKAAATWIETRAKNNYDELFELKDGKAYFKHNKDKTAASLVLEYLKKQFNLEAK
>NZ_CP022595.1|WP_013954651.1|280808_282191_+|hypothetical-protein
MKKISKKLLASLSLFTIPSVAIISAKCGNDVETTERLNQQKDLKDAKRVTELEEIWKNFALSYIYKIKPSNKHDAKSWKQNFEKEFQNQQSQLFKDSYDAYKIFALDQLSKNEYYFVEKSLEWKKNDVFKSNPFNWISTKNFPGETDQKDFIRIWMEDKTGIRKEINNMLLVKAYFDISELKKLQTIANNIANAGKADKDKSKDQKFEYFVGGKDAKFDLDHYNLVKYAFENKYIQLWKRTFDDKTTSNDVFTRKEIKNTISSKDDFNAFFKDTAEAEKKAKEWEIITKNNEDKELQGYAGIQKDPGTYGLNWNETDNKRRVTGSGTYGVYDALNSILISFNDLASKSSVGVKDKDGKSIVSYINQIVPVGKKIKLKTKEDYTKDKVEDSKLKETEVLSFEGTIYKEYLNKLAYLFYGKDSKNLLEKAIEAFAHLGVKIKVNKEIAPLYEQLKNKVWVEK
>NZ_CP022595.1|WP_013954652.1|282190_282526_+|HIT-family-protein
MDDLFLKIISGEEEGKIFYEDEYCVAFYDKFPIQPGHFLVVPRIKSKNIAEADDFTAGHLINTARKLGKQEVLDKGIAGFKILINTGRSADQSIFHTHVHVIPYKEKSKDN

Crispr_ID: NZ_CP022595_2

• CRISPR_ID: NZ_CP022595_2
• CRISPR_location: 724592-724698
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP022595_2

Consensus_repeat	Method
ATTTTTATCTTGTTGATTTAGGTTGCCTTGATCTT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP022595_2

>2.1|724627|37|NZ_CP022595|CRISPRCasFinder
TGTGGGGCATTGATTCATTTTTTTGATTTTCCTCATT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP022595_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP022595_2

>merge|NZ_CP022595|2|724592-724698|CRISPRCasFinder
ATTTTTATCTTGTTGATTTAGGTTGCCTTGATCTTTGTGGGGCATTGATTCATTTTTTTGATTTTCCTCATTATTTTTATCTTGTTGATTTAGGTTGCCTTGATCTT

>NZ_CP022595|2|2|724592-724698|CRISPRCasFinder
ATTTTTATCTTGTTGATTTAGGTTGCCTTGATCTT	TGTGGGGCATTGATTCATTTTTTTGATTTTCCTCATT
ATTTTTATCTTGTTGATTTAGGTTGCCTTGATCTT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP022595.1|WP_013456269.1|725657_726716_-|site-specific-DNA-methyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|334588
NZ_CP022595.1|WP_080551570.1|728455_729484_-|IS30-like-element-ISMbov1-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
NZ_CP022595.1|WP_013954870.1|735563_737426_+|ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|224196
NZ_CP022595.1|WP_013456160.1|724942_725650_+|MjaI-family-restriction-endonuclease	unknown	unknown	gnl|CDD|370566
NZ_CP022595.1|WP_075270941.1|707003_707675_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP022595.1|WP_013456498.1|719758_721006_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP022595.1|WP_013456078.1|730352_730760_+|30S-ribosomal-protein-S9	unknown	unknown	gnl|CDD|178888
NZ_CP022595.1|WP_075271152.1|715262_717473_-|putative-immunoglobulin-blocking-virulence-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|275319
NZ_CP022595.1|WP_013456339.1|722415_723237_+|DNA-binding-protein-WhiA	unknown	unknown	gnl|CDD|224398
NZ_CP022595.1|WP_013456083.1|721139_722327_+|phosphopentomutase	unknown	unknown	gnl|CDD|235430
NZ_CP022595.1|WP_013456635.1|731319_732207_+|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|133021
NZ_CP022595.1|WP_013456157.1|729916_730351_+|50S-ribosomal-protein-L13	unknown	unknown	gnl|CDD|181703
NZ_CP022595.1|WP_075270942.1|708121_709135_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP022595.1|WP_013455983.1|726899_727862_+|DNA-polymerase-III-subunit-delta	unknown	unknown	gnl|CDD|224383
NZ_CP022595.1|WP_075271115.1|712620_715230_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|366776
NZ_CP022595.1|WP_013455970.1|717658_719623_-|DNA-ligase-(NAD(+))-LigA	unknown	unknown	gnl|CDD|223350
NZ_CP022595.1|WP_013456062.1|707687_708116_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239942
NZ_CP022595.1|WP_013455924.1|730985_731318_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|380386
NZ_CP022595.1|WP_115288229.1|732581_735314_+|cation-transporting-P-type-ATPase	unknown	unknown	gnl|CDD|223550
NZ_CP022595.1|WP_013455919.1|710333_711767_+|transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|227708

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP022595.1|WP_013456269.1|725657_726716_-|site-specific-DNA-methyltransferase	gnl|CDD|334588	pfam01555, N6_N4_Mtase, DNA methylase. Members of this family are DNA methylases. The family contains both N-4 cytosine-specific DNA methylases and N-6 Adenine-specific DNA methylases.	1.0519e-31
NZ_CP022595.1|WP_013954870.1|735563_737426_+|ABC-transporter-permease	gnl|CDD|224196	COG1277, NosY, ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component [General function prediction only].	1.22756e-09
NZ_CP022595.1|WP_013456339.1|722415_723237_+|DNA-binding-protein-WhiA	gnl|CDD|224398	COG1481, COG1481, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	1.9574e-40
NZ_CP022595.1|WP_013455919.1|710333_711767_+|transposase	gnl|CDD|227708	COG5421, COG5421, Transposase [DNA replication, recombination, and repair].	7.79198e-06
NZ_CP022595.1|WP_075271152.1|715262_717473_-|putative-immunoglobulin-blocking-virulence-protein	gnl|CDD|275319	TIGR04526, predic_Ig_block, putative immunoglobulin-blocking virulence protein. Members of this family are putative virulence proteins of Mycoplasma and Ureaplasma species. Members share a region of sequence similarity (see TIGR04524) with protein M, a Mycoplasma genitalium protein that binds a conserved light chain region of IgG and blocks its protective function of antigen-specific binding. The seed alignment for this model includes an N-terminal signal-anchor domain and a proline-rich linker domain, and a C-terminal extension, in addition to the protein M-like domain recognized by TIGR04524. [Cellular processes, Pathogenesis].	0
NZ_CP022595.1|WP_013456062.1|707687_708116_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|239942	cd04496, SSB_OBF, SSB_OBF: A subfamily of OB folds similar to the OB fold of ssDNA-binding protein (SSB). SSBs bind with high affinity to ssDNA. They bind to and protect ssDNA intermediates during DNA metabolic pathways. All bacterial and eukaryotic SSBs studied to date oligomerize to bring together four OB folds in their active state. The majority (e.g. Escherichia coli SSB) have a single OB fold per monomer, which oligomerize to form a homotetramer. However, Deinococcus and Thermus SSB proteins have two OB folds per monomer, which oligomerize to form a homodimer. Mycobacterium tuberculosis SSB varies in quaternary structure from E. coli SSB. It forms a dimer of dimers having a unique dimer interface, which lends the protein greater stability. Included in this group are OB folds similar to Escherichia coli PriB. E.coli PriB is homodimeric with each monomer having a single OB fold. It does not appear to form higher order oligomers. PriB is an essential protein for the replication restart at forks that have stalled at sites of DNA damage. It also plays a role in the assembly of primosome during replication initiation at the bacteriophage phiX174 origin. PriB physically interacts with SSB and binds ssDNA with high affinity.	0.000930954
NZ_CP022595.1|WP_013456160.1|724942_725650_+|MjaI-family-restriction-endonuclease	gnl|CDD|370566	pfam09568, RE_MjaI, MjaI restriction endonuclease. This family includes the MjaI (recognizes CTAG but cleavage site unknown) restriction endonuclease.	3.88844e-32
NZ_CP022595.1|WP_013456083.1|721139_722327_+|phosphopentomutase	gnl|CDD|235430	PRK05362, PRK05362, phosphopentomutase; Provisional.	0
NZ_CP022595.1|WP_013456635.1|731319_732207_+|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase	gnl|CDD|133021	cd02541, UGPase_prokaryotic, Prokaryotic UGPase catalyses the synthesis of UDP-glucose. Prokaryotic UDP-Glucose Pyrophosphorylase (UGPase) catalyzes a reversible production of UDP-Glucose and pyrophosphate (PPi) from glucose-1-phosphate and UTP. UDP-glucose plays pivotal roles in galactose utilization, in glycogen synthesis, and in the synthesis of the carbohydrate moieties of glycolipids , glycoproteins , and proteoglycans. UGPase is found in both prokaryotes and eukaryotes, although prokaryotic and eukaryotic forms of UGPase catalyze the same reaction, they share low sequence similarity.	5.35032e-119
NZ_CP022595.1|WP_013456157.1|729916_730351_+|50S-ribosomal-protein-L13	gnl|CDD|181703	PRK09216, rplM, 50S ribosomal protein L13; Reviewed.	3.78069e-82
NZ_CP022595.1|WP_115288229.1|732581_735314_+|cation-transporting-P-type-ATPase	gnl|CDD|223550	COG0474, MgtA, Cation transport ATPase [Inorganic ion transport and metabolism].	0
NZ_CP022595.1|WP_013455983.1|726899_727862_+|DNA-polymerase-III-subunit-delta	gnl|CDD|224383	COG1466, HolA, DNA polymerase III, delta subunit [DNA replication, recombination, and repair].	3.3171e-21
NZ_CP022595.1|WP_075271115.1|712620_715230_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|366776	pfam01732, DUF31, Putative peptidase (DUF31). This domain has no known function. It is found in various hypothetical proteins and putative lipoproteins from mycoplasmas. It appears to be related to the superfamily of trypsin peptidases and so may have a peptidase function.	1.79194e-50
NZ_CP022595.1|WP_013455970.1|717658_719623_-|DNA-ligase-(NAD(+))-LigA	gnl|CDD|223350	COG0272, Lig, NAD-dependent DNA ligase (contains BRCT domain type II) [DNA replication, recombination, and repair].	0
NZ_CP022595.1|WP_080551570.1|728455_729484_-|IS30-like-element-ISMbov1-family-transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	9.23257e-27
NZ_CP022595.1|WP_013455924.1|730985_731318_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|380386	cd06981, cupin_reut_a1446, Cupriavidus pinatubonensis reut_a1446 and related proteins, cupin domain. This family includes bacterial and some eukaryotic proteins homologous to reut_a1446, a Cupriavidus pinatubonensis protein of unknown function that may be related to mannose-6-phosphate isomerase. Proteins in this family belong to the cupin superfamily with a conserved "jelly roll-like" beta-barrel fold capable of homodimerization.	4.68782e-17
NZ_CP022595.1|WP_013456078.1|730352_730760_+|30S-ribosomal-protein-S9	gnl|CDD|178888	PRK00132, rpsI, 30S ribosomal protein S9; Reviewed.	1.79038e-70

Protein sequences

>NZ_CP022595.1|WP_013456339.1|722415_723237_+|DNA-binding-protein-WhiA
MNFTKEIKLEILSKKRNIDDASEFLRGYIYSKCIIDNDIIKLRIYDKSTKSTVLKSLNKIGIKYENKNTVILINKDNFSLIEDFSYPSSFFQGVFAGNGSISNLNNSSYHLQLASNYEEFIDIIINKLNEYDFNFVKIKHNNKFIAYIKKHEKISDFLKAISVTSSFFNFMDNTISRDFLNNTNRLRNIDASNINKIVTASNKYIKNIDLMYELELENKFNDDQLKLFQIMKENPNESLSSIADLYAYKENKSISKSGIYHWLKKLEKTVMKK
>NZ_CP022595.1|WP_013456083.1|721139_722327_+|phosphopentomutase
MAKFKRIFMIVTDGLGIGPDKDQKKFGDAGANTLYSASLSSMFFIDTWKKLGIGNVAQLEGNYHVKSPLAYVSRIQEVSNAKDTLAGHWEMMGIKTEVPFPTFTETGFPEDLITELEKAFDNRKIICNKAGSGTEIIDQYAEEQKQNGSIIVYTSNDSVLQIAAHEEWIGLENLYRYGKAAREICSSKPEWNVGRIIVRPFVGEDGKYTRTFNRHDYANAPEPMILNKLQEAGIEVIAIGKINDIFVGQGISRAIHSSGDADGMDKAIELAQLDEENKFIFVNLVQFDSHYGHRRDVDGFASNVATLDSKLGKLIQVMKKDDLLIMTSDHGNDPAYPGFNHTREMLPLTIYSKLFKEPRVLNDVTGLGTTGNIVARNFGVETVSLTGEDIFDKLV
>NZ_CP022595.1|WP_013456498.1|719758_721006_+|hypothetical-protein
MSNFNLILSREKFNHQQYASVKGIVKSKLNEYYSDKKNSRKINLATVGIYTSIPLFIIGAILLLSSITISFVVIFKTGKNEWLLNPDHFRPLLASLYSLSFVFLIAWCILYPIALRARIFLKKDIVASVNNRDLTDHLLDYINLKPRYENDENGNKIVNFGHISFFKNTSNFKNLSKFNVINNKYEMYEALSNKQFIKMQNIEYRNEEWLAINNLSNKEIKRLKKAKAKVYKGKIQRIEHNLYFGIATKLLNLNKSVSVTLFDEFNNYTPESFKKLDVKDEFSILNISSEDTELMQKWANDISNLSYLNDLKNEFDSIAINSSISLKNSRRDKSFAKDLSIFIKNQEAFIWFKTPTQLLDLSFKSPTLNKDEITELIVNKILDEFYLVYLSLMFLAPFGYDNVVSIDENETIVNQ
>NZ_CP022595.1|WP_013455970.1|717658_719623_-|DNA-ligase-(NAD(+))-LigA
MESKNAKELIKSLVDKINQWNYEYYQLNKPSVSDLEYDKALWELEKLEKEYPEFVLDDSPTFKLGSFASEKFTKFIHKKPMLSLAKAYSYDDIKSFINNISKIVPAERINFNIEPKVDGLSIALHYKKGKLVKAVTRGDGTEGEDVTENIYQIKSIPKLINYLNDLEVRGEVFISKDNFKKINESNNFANARNAASGTLRQLDSTIVAKRNLSAFLYEVVEPEMHNINYQNEALEFMKKLNIPTNPFSKVVEIEELEEAISDFAEIKNKLDYDSDGLVIKLNDLQMWEKLGKTSKFPKHSIAFKYDVEVASSTIVDILTSVGRTGKITYIANIHPVILNQTSVRAATLHNHNFIKDMNININDEVNIIKAGEIIPKVISLKNSKNYVDYYKKATNCPSCNSELIEFEGIVDQFCTNDECPEKNVNNIYHFASRNCMNIVGLGLSTVKDFYPKFIKKIKDIFSLYKYKSELILLPRYGEQKVDNILNSIESVKNKAFSKVLFALGIKHIGQRAAKLISDNYVNFAEILNDSELSKLKSTKNIGPKIIESLTEYINNPLNKDLLIYLDSIFNYEGKTKAISNIFSGYSFVITGTLSEPRSHFVKIIEENSGSVSASVSGRTSYVLAGSEAGSKLEKAYKLGVKVINEEQFYKLLEH
>NZ_CP022595.1|WP_075271152.1|715262_717473_-|putative-immunoglobulin-blocking-virulence-protein
MNLFRKKKNRVIILSLATGAVISASTGAFVYSSNSDSNLSKLLFNNSRDAELASNKNNISKSTDSIKDNNVIENTKPIAPKPVEEKVINVPDTTTENSSAPEVNRNTVTPERSEPLIAKPNVVTKQISIHGVIVNATIEVVPDRHISDYDKNKGISNINPYQNIIVSKVLNVEVTKELIDKSVSNALDGKDGTGLFAGTFFKTLENIFKSSSDLATAEEVVKQNMSVYRDNIHRYEKLLNSPNVINFLTEEGKQKYPTMKFDSPIQRNIWLINHLDKTKFTKLAKDAEAFLSQGLAISGRSAIINEDGTLSSLAFAPDDQFNTVTSRVSRDNRERRVFGYDSPYGRSPDSVWEGSYQGWNKEDVTDKPEYSRYNVSSADGIKLTKLTREKTDNSPGALNEGLVVEIDASNVSGYGKTLDLINKLKNDKVQVTSYRIKNMGSNDPSQAFKKILSALPDKIPQLELFFSAEATNNSSLIALENKHIKELSLYTLGNSLLHKWSFNPLALRKTEWINTVDYNVSRDFLPNTAIPTRITFDTIAFDKEDFKDKSFDRINDGLRMVYFARNNEPFFQAGLGPGLNPDHNEGNNSYPVGIDFSRIEGIKSLRNLVFNDVVNPNNTPRKIRRLTLFNNKPSFEISSDELTHASFEHFATDAMDRFSKPKIMFSNGDVTVSIRISDSNTLDSKAIWNLSKFFEYNEKLKSTKSIKVPENASALKEQLTKLGYRVESSDGNITYT
>NZ_CP022595.1|WP_075271115.1|712620_715230_-|hypothetical-protein
MRITKKLLLISSSASLFSSLLIAAKCNNDSSKNKSNDDKKIGLLSDDQFEKLINNTNNLNDIAQLTFSSNFGQSKSLDKTLPTEIEENPGNLKISVNNKYSDSITVTVNGAKTDKDASRNISNIKGEVSVYVGFKNKSTGKEIYKNFILKGLARNPVGADHNGRLSGDPLAAIGGQQGYLDYHKKTQTERFEKDNNEYVNRLKGMLSRDGGKEVDFKTFMGIKTTEEQIKKFNETAKLVNFDSYENAALKGFTIPVYENGSTSNPKLKVYDAPEVPKGPSPIDTIGRNIYRSNGLARTLLNETYKTIAEQTFQVSFTTLKDFEDEIKEAEKLKEDSKKWTTEQFQQFTFKDRAALKANYETNLYKLELEIKSQSPEALRGLEQSFAERKKKLKENYEAEDARLEKLDSSELAKEMDKRIAEYNKLKEEKRTYSSVSGTMWIMDFMLPENSGKGATKFYFGTNSHVAKGLTNKTTKFSVSRLNENVGVGSHFRLNDLDDRFTRFSFDNVEKDAINVIFQATDFLDSKPSDFLESSQKAKFGDVEEFMDFAVIEIDFEKILENKTKNFSAISNNKNHSSNYLNKSTEDIVKLITNNYESKKDKHIKFRSESYLKDYSKIDRPIILDTKKKEEVKKFNDLDSLYILGYPSATGDYFLENYIDEDQQKVVKTNFSMWINADEKYYKNVSAQEGAPSNHPKENLERGEFLSYEIGYRSFIDKPGLTDGFLAASRTGNDLYTINGKKYFNYGLHIMPRSYVPYGGASGSSVRNKNNELIAVFHTANNSAKTGLAATFRSYGYDYKGLFGDYKLPAYDLIYGGAPGQKNSYRDALEKKYKKNGKQYKTNLFQKGFSKDQIPQQFKFNETSSTTVDK
>NZ_CP022595.1|WP_013455919.1|710333_711767_+|transposase
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MNYFTKESIKNILNATIPRKLKSSEIINKFNEIARSINNKIGNRTIYVNIILAINERVPAMVETGVFSKLLGKILKELYEELTEVNRLAQIYQLICNWSLLNINNKDNVKLVNFSLNEYLEADQIFEHKYLMNKATKSIDELGVKSPEMNLYIQLVRDCNEYAMVQLDKKGRAREFLENNLLLYYLAWLSEKKLDELLPKVSYLDISSDIATHAFNNLLNKKI
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>NZ_CP022595.1|WP_013456269.1|725657_726716_-|site-specific-DNA-methyltransferase
MHTKHTILNIDALKMNSHIDDESVDLVITSPPYPMIKMWDEIFEINENEIKTEADVNSAFLKATQFLNNIWEKVDKSIKPGGIVCINIGDATRNLGGNFRLFSNSGQVINFFIKKGYLQLPSIIWRKQTNAPNKFMGSGMLPAGAYATLEHEWILIFRKGITKREFKNAKDKSLRNESAFFWEERNVWFSDLWDFKGIKQKNDIKNSRDRTAAYPIELPYRLISMFSVKNDIVFDPFLGTGTTTLASMLLQRNSIGVEIDKSLCNHFKEYLVKNDVKLVDNFNDKISKRISSHTEFVKKRVNEGKLLKHYNSILGTEVMTSQEKFISFNKVSSINKIDDKTFEVIYKTLQSE
>NZ_CP022595.1|WP_013455983.1|726899_727862_+|DNA-polymerase-III-subunit-delta
MIFIYGPEKFLIEQEVQRIRKEHNDKVLEIFRFDDQASINDLISSASSNNLFTGSKLFLIYALPFFDKSILKDDLKNADDLINAINVNNQDIFVFINENIISKDKISVNSWTKFIFENNNHEVTMIEAKEISESKLFSLAKSLANKHKLHIDDEAIKLLINKVNNDTLMLSAEIIKLSNLEKHISAEVIENSTDTMLGDDVFAFSNALETNDLGIIWSKYKEKMLEGTEISALIGQISQIFIIAHQIYAYKVCHLSIDQLSRDLKLNSYRIKKISYFLSKIGINKIKKMILSLSKLDKDIKNGLISEKIGFERFLITFFN
>NZ_CP022595.1|WP_080551570.1|728455_729484_-|IS30-like-element-ISMbov1-family-transposase
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>NZ_CP022595.1|WP_013456157.1|729916_730351_+|50S-ribosomal-protein-L13
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>NZ_CP022595.1|WP_013456078.1|730352_730760_+|30S-ribosomal-protein-S9
MAKSNSSMIEYRGLGRRKSSTARVILRPGSGKFTINNREAKNYLLSDLHIQDAEQPLVLTETKGQFDILVNVRGGGLKGQAGAIRLGIARALLLASDTYRAKLKPAGMLTRDARSVERKKPGLNKARRARQFSKR
>NZ_CP022595.1|WP_013455924.1|730985_731318_+|hypothetical-protein
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>NZ_CP022595.1|WP_013456635.1|731319_732207_+|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase
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>NZ_CP022595.1|WP_115288229.1|732581_735314_+|cation-transporting-P-type-ATPase
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>NZ_CP022595.1|WP_013954870.1|735563_737426_+|ABC-transporter-permease
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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
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DBSCAN-SWA_2	123906 : 288562	110	Faecalibacterium_phage(15.15%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_3	298439 : 360297	43	Enterobacteria_phage(33.33%)	transposase,integrase,tRNA	attL 307018:307077|attR 356455:357796
DBSCAN-SWA_4	380569 : 565426	117	Enterobacteria_phage(17.14%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_5	648832 : 729484	58	Enterobacteria_phage(25.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_6	763686 : 836580	48	Staphylococcus_phage(20.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_7	868693 : 906888	23	Staphylococcus_phage(44.44%)	transposase,integrase,tRNA	attL 869973:870001|attR 884622:884650
DBSCAN-SWA_8	926417 : 991733	39	Enterobacteria_phage(33.33%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_9	1083775 : 1134179	43	Staphylococcus_phage(28.57%)	transposase,integrase,tRNA	attL 1083442:1083493|attR 1114313:1114364

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP022595|85107:95810|DBSCAN-SWA
TATGAAAACTGTTTCTAATATTGTGGGATTTAAATCAAGATCAATTTATAACTTATTTGACAGAATTACAATTGAAACAAAGCGTGGCTATGCTAAATACCAAAAGAAATGTAAATTGTGTGGTATGGACTTAAAAGGCAAAACGATATATGTAATTAGTGCTCTCAAATTTTTGAATTTAATTGAAACAAGACATGATTCAAAAAGATTAGAAAACAATTCTAAATTGCTTATGAAATACATTGACATTTTTAAGTTTTACAAACAGTTACTGTACTTTTATTTGAAGAATAGAAATAGTTTTAACTTAGATAGTAAAGCTGTTAAACAGTCTGTGGCAAGCATTATTTTTAAATACATAAGTGAACTAGAAGCACAGGGAAAACTTCAAAATTCATATATTCCATCAGTTCAAAACTTTTACCGTATATTGGCTAAACATAGTGCTTTTGGTCTAAAATTAGATATTCTTCCATATAAATCAAACGGCAAATATGGAAGCAGAACAACAGTAAAGCATGAGACAAAGAAAAAGACAATAGGTAAACTTATTACTGAACGTCCAGAATCAGTTAATTTAAGACTAAATGACAATGATTATGAAATGGACACTGTAATTGGTTTGAGATCAGACAATTATTGCATTCTTACATTAATCAACAGAAAATCTAGAATGTTTTATTGCACGCTCTCTAGAAGAAATGCAAAAGCAATAAAAGAAAATTTAGAGAAGTTGATTAAGGACAATAATCTTGTTATTGACACATTAACTATTGATAATGGAAGTGAAAATTACAAACTTCCAGAGATAGAATCAATCAAAGAAATTTTCCATTGTCATCCTTATTCATCATCAGAAAAAGGTAGCATTGAAAATGCTCACAGGCTTTTAAGAAGATACATTCCAAAGGGAAAATCTATAGATAAATATGTTGGTCAAGATCTAAAACCAATAGCCGATTTTATAAATTCACATCCAAGAATTTATAAAGGTGTCTCAGGCTTTAAATGCGCTAAGCAAATGCAATAAAAATTAACATCAACACAAAATTTTGCACTTTTGAGTACTCAAAAGTATCTTTTCTTTATTCTTTTTTTATGCTTTAGGTAATTTTCTTGTCAGAACCACCAAAAATTGGTATTATTTTTCCAATACTCAAATTAGGTGCTTTTTAATTTAAGAATTTATATTCTTGCTTTATTTTTTTACTATTATTTTTATAATATTTACTATGAATATAGATGCAATTTATAGTACCTTTTTTGTTAATGGATCAAACGTTATTTCGGCATGATTTGTGATAATATTTGGATTTTTAGGAATGTCAATGACTCTTATTTTAGGTCTTCCGCAAGCCATTCATCTATACAAGTGCAAGAAAACTGGAAATGTTAAGTATTATTCATACTGAATGTTTTTATTCGGAATCCTTTCATGGATATTTTTAGGTGCTTTTGATCCAGTTCAAAAAATGTTTGCTATTGTAATATCTAATTGCATTTGCTCTTTAATTTATGTTATTACGTTGTGACTTACTTATAGATATTCAAGCGATCCTAAACGTAAAAGAAATCAATGAATCGTATTATTTTCATCGCTTTTACTTTCAATTTTTGTAATTAGCTTGTCAATTTCAGCCTTAGTTTTAGAATGAAAACTACCCCAAATTGCACAAATGAGTATTGCTCAAATAGTGCCAATAATTACAACATTTGCATTCTTTCCTCAGGTATTGAAGGCAATAGATTCTAAAGATTATTCAGGAATGTCTGCTTCAATGGTTTGAACATTCATCTTAGCTAACGTGTTTTGAACATTATATTGAGTGTTTTTTATAATTAATGCCGGAATTGCCCCACAATTAATAAGTGCACTAATATGGCAAGTTTTATCATTACTTCTATATTCACTTTTGTTAATAAAAATGATGCATCAAGCAAAGCTAAATAAAATAAACAATACCAATGAAAATGTAGCGGAGAACAAATATGTATAAATCTAAACTGACTTTAAAAGAAACGCAACAAGCTATTCAAGATCTTAAATTTGCCTTTACAAAAAAACTTAATCAAGAGTTAAAATTAACAAGAGTTTCTGCCCCTTTATTTGTTACTTCAAGCTCTAAAATTAATGATGGCTTAAATGGTGATATCCCAGTTATTTTCTCACCAAATAAATGAAAAGAAAATATCGAAATTGTGCACTCACTTGCTAAGTGAAAAAGATCTGCACTATCAAGATACAAATTTTTACCTGGTGAAGGTTTATGGACGGATATGAATGCAATCCGCAAGGATGATGAAGTAGACTATAAGCATTCATTATATGTTGATCAATGAGACTGGGAATTAATTATTAACAAAGATGATCGAAACCTAGAATTTTTGAAAAGAATTGTCGGAACAATCTATAAATCAATTAGATATGTTGAAAACAAAATCAACTTTAAGTATCCTGTATTAGACCAAAAGTTGCCATCTGAAATAAAATTTATTAACTCTGAAGAGCTATACAGAGAGTTTCCTAATGTAAGTCCCGAGGAAAGGGAAAATATAGTTGCCAAAAAGTACAAAGCTGTTTTTATTTACAAAATAGGTCACACATTACCTGATGGCTTGCCTCATTCAAAAAGAGCGTTTGACTATGATGATTGGGAATTAAATGGCGACATCGTTTTTTATGATAAAGTTAATGATGCAGCCTTAGAAATTTCATCAATGGGTATAAGGGTTGATAGTGATTCGCTAACTAAACAAGCTAAAATTTCTAGAAAAAAAGATAGTGATATGGGCGAGTACCATAAGTTAGTATTAAATCAAAAATTACCTTACACTATTGGTGGCGGTATTGGGCAAAGCAGATTAAGTATGTTCTTATTAGAAAAGAAGCACATTGGCGAAGTTCAAGCAAGCGTTTGACCTGATGAGCATAGAGAATTTTTTGAGAAAGAAGGAGTTATTTTACTATAGGTGGATTTTCTAAAATATCTATAAAATAGTGTTTTTAGTAAATTAACTATCTAATAGATATATATTATTGGCAAAATTAAATAAATTAATTTATATATCTTATTAGTATTAATATAATATATGTATGAGTTCTGTAGGTTATAAAAGATTTCAGGCATTTTGCAAAGCTAATAACATAGAAATTAATAACGAGTTAGAAGGAACCGAACTGGTTCTTTTTAATCTTAATTATGATGAGAATTCAAATGATAAATTGAAGTTAGAATTCCGCTTTAAAAATTTTATTTCATTTGATACAGTAAGAAAATTAAAATCCTTCATAAGTTCTAACAGAGGCAAATGAGATGTTTCATTTGTTTTTTCTAGCGATTCATATAGCAAAGAAAATATCTTATGTTTTGTCAATAAAATAATTGATAAAACACGTTTTATGCCTTTAAAACAGATTAATTGGGAAAATAAATTTGTTGTAAAAGACAATAATGCCTATTTTGAAAACATTGATAGGGATTTCGAGAATCAATATGGAATGCTGATTGATAAGTTACTAAACAAACTTAAAGAATATGGTTTTGCAACGCTTGATTTTTCATATAACTATGCAGCAAACTTAACTTCTAATGATCAAAATTTATCATTAAATGCAGAAGAATCTGAAAAGATAAAAAGAGAACTTTTTAAAAAAATGATTGAATTAGACCAGTCATCTACATCATATGAAAGTAATAGTAACAGTCCACTAAGGATAAAGAGGAATCTTAACAAGAGTTATACAAGGTACTCTATCAAAGATTTAAATGATGCGCCAAGCAGAGTTAATGTAGAATTTGTTGGTATATTATTTGCTTCTAAAAAAACTTTTTCTAAAAACAAACGGTTAACTATCCAATTCAAAGTAAGTGACTTTGAGAGTGCTGTTAATTGTATGTGATTCTTAGACACTGACTGATTGAGTAATGAGCAAAAAAATTTAATTAACCCCGAAAATCAATCTTGGGTTAAGGTTAAAGGTTCAATTCCAAGTAGTGACAAGATTAAAGGAAACAACTTCTTTGTCTATGTTGATTCGCTTGAATTAACAGCTTGTCCACTAAATATAAATGAAGATAAAGCACCTGAAGATAGAAAAAGAGTTGAGTTCCATATTTCAACAAAAATGAACACAATGGATGGACTTTTTAATGCTGATGATTTTGTTGAAAGAGCTAAAAGATGAAAAATGCCAGCAATCGGCATTATGGACACCGATGGCGCACAGGGCTATCCCAAATTATTTAATAAAGCAAAAAAATCAGGAATTAAAGCCATATACGGAACTGCATTCACTACTATAAATAAGGCAAATGAGGCAATTTTAGGCGAAATTCCTGAAGGCAGTTTTAAAGACTATCCATATGTTTCATTTGACATTGAAACAACAGGATTAAGTCCAAAATTCCACGAAATAATTGAATTTGGTGCAGTTGATATTAATCAAGATTTAAAGGTGGGTAAAACAACTCAGTTTTTTATCAAGCCAAAAGATAAAATTGGTAGTTTTACTACTGAATTAACTGGAATTACACAGCAAATGCTTGATTCTAAGGGGCTTGATATAAAAGAAGGTCTAGAAAAAATTTATGATTGTTTAGACGGAAAAATAGCTATTGCACATAATGCAAAATTTGACTTTAACTTTTTAAAGGAACAATTTAGACTCAACAATATGCAATTCCCAAGAGTCACTGTTATTGACACTCTGGTAGCTTCTAGAATTGGCTTTCCGGGATATAAACGTCACAAATTAGAAGATGTTGCGTCAAGACTTGGTGTTGTTTATGATCCAAATGTTGCTCACCGTGGGGATTATGATGCCAAGGTTTTGGCAAATGTATGAGTTAATATTATTTCAGAATTGAATGCCAAGGGTATTTTCACTTTAGATGACCTTAGCAAGTATTCTTCTAACGAACTTTATGCAAAAATGCATGGGTATGAGGTTTCAACAATTGCTTTAAATAATCAAGGCTTAAAGAAGCAATTTGAGTTGATAACTGACTGCTTAACCAAAAAATATATTAATGGTCCAATAACATTCAAAGAAGACTTTGCTTCTTTGAATAGAACGGATATCTTAGTAGGTTCTGGAACATTAAAAGGCTTATTAATTGATAAGTATTTTTACTCATCCCATGATGATTTTATAAATGAGCTTAAACTTTATGATTTTATTGAAATTCCGGCACCTCAATGTTTTGAACACTGAATAAAATACGGATTTATAACCACAAAACAACTGCAAAAAGGCTTGAGCGAAATTATCTATGAAGCAAAAAAACATTCTAAGATTTTTATTGCAACTGCGGATGTTAAGTATTTAGACCCATGAGATCAAGAAATTTTTAAATCTCTTGTTTATGCAAAAGGAATAAAGAATGCTAGACATTATTTATTTGACTATAAAAAAGCCGAAGAAGGAAGATTAGTTATACCAAATCAACGCTTTTTAACTACTGAAGAAATGACTGAGCAATTTGCATTTTTACAAGATAACCAGCTAATAGAAGAATTAGTCATTGATAATACTCAGTTAATAGCTAATATGGCTGAAAATATTGAAGTAATTAAATCTGGTTTGTTTACACCTGAATTTGATGATTCTAAGAAAAAATTATATGACTTAGTCTATAAAAATGCATATGCAAAATATGGTGAGAAACTTCCTGAAATAATTCAAAAAAGAATTGATTCTGAACTTAACCCAATTATTAAGTATGGTTTTGATGTAATTTATTGAATAAGTTATAAACTTGTGAAACTTTCAATTGACCAAGGATTTATTGTTGGTAGCAGAGGTTCTATAGGTTCGTCATTTGTTGCATCATTAATTGGAATTTCTGAAGTTAATCCGTTAACTCCTCATTATTGTTGTCCTAATTGTAAATATTTTGAAGTAGCTAATGCTCCAGGCGTAACTAGCGGATACGATTTGCCTGATAAGCCTTGTCCTGAGTGTAATACGCTTATAAAAGGTGACGGGCAAAGCATACCTTTTGAAACATTTTTAGGATTTAATGCTGATAAAGTCCCTGATATTGATCTTAACTTTACAGGGGAATTTCAAGGTGTTGTGCATGAAGAAATCCGTAGACTTTTTGGTAAAAGTCATACATTTAGAGCTGGAACTATTTCCAAAGTGGCTGAAAAAACAGCATTTGGATATGTGAAGTCATATGCTGAGCAAACTAGACAAACTATTCCACAAATTTTTGTTGAATTTTTAGCGAACAGAATTAAAGATGTTAAAAGAACAACAGGTCAACACCCTGGTGGGATTATTATAATCCCTAAGCAATTTGATATTTTTGATTTTACCCCTATAAATTACCCAGCAAATGATCAAAGTTCATCTTGACTAACAACACACTTTGACTACAAAGCCATTCATGATAATGTATTAAAATTTGATATCCTAGGCCATGATAATCCTACATCTATAAAATTGCTAGAGCAGTACACTGGTATTAATATTTATGACGTTCCCAAGAATGATCAAAATGTTATAAAACTTTTTAGCTCAACTGAACCAATGGGCATAAGCCCTGATCAAATTTCTAATGAAAAAACAGGAGCAATAGGTTTACCTGAATTTGGTACGTCATTTGTTAGACAAATGCTTAATGACATAAAACCTAAAACTGTTGCAGATTTAATTTCTATTTCAGGTCTTAGTCACGGAACTAATGTTTGAATTAATAATGCTGATGAATTAGTTTTAGAAAAAGGGCGCAAACTAAATGAAGTTGTCTGTTGTAGAGATGACATTATGCCTATGTTAATTGCAAAAGGTATCGAGCCTTTGATGTCGTTTACACTAATGGAAAAAGTAAGAAAAGGCAAAGGTTTATCAAATGATGAAGTTGAACTACTAGAAAAACATAATGTTCCAAACTGGCTTATAAAAAGTATGCAAAAAATTGAATATTTATTCCCCAAAGCGCATGCAACAGCATATGTAACTATGGCACTATGAATTGCTTGATTTAAGCTATATGAACCATTGGCTTTTTATGCAAGTTACTTTACTGCCCATTCAAAAGCAGATGATATTAAAAATATGATTGATAAACCTAATGGAATTAAAGTTTCAAAAAGGCTTTATGAGTTAAAGAAAACCGAAGATAGAAGTAATAAAGAAAACGATCTTATTGGCGTTTTTGAAGTAGCTGAAGAATTGTACGCAAGAGGTTTTTATATATCAAATGTAGATATTGACAAATCCCAAGCTGAAAAGTGGCTTATTGATAAAGAAAAAGGATGCCTAATACCACCTTTTTCAACAATCGAAAGCTTGGGATCGGTTAAAGCAAATGATATAGTTAATGCAAGAGAAGAAAAGCCATTTTTATCTAAGGAAGACTTTAAAACTAGAACAGGTGTTTCAAAAACTGTTTTTGATACAATGAACCAAATGAAGATCTTAGATAGTCTAAACGATTCAGACCAACTAACTCTTTTTTAGCCAATATGTCTATAAAATAGGGATATTCAGATATCTCTATTTTTTATAATTATATTCTTACAAAAATAAAAAAATTTTCTATAATTAACTAAGTGGTCGCGTAGCTCAGCAGGATAGAGCACAAGCCTTCTAAGCTTGTTGTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGTGATCGCCATTTTTTTATTTTTTGATAATAAAACAAGCACTATGCTAAATTTATAATAAAATTTTATCACTGTGTGTTCACATAGCTCACCAGGTAGAGCACAAGCCTCCTAAGCTTGGGGTAACGGGTTCAATTCCCGTTGTGAACGCCATTTTTTTATTTAAAAATTCATAGTTTTTATACTATTTTGGGATTTTTTAAAAAAACATAAAAAGTAATTAAAAAACTTTAAAATTTATTAATATGAATAATTTGGCAAATGAACTAAGACCTAAGACATTAGATGACATTATTGGGCAAAAACAAGTGGTTGATTTACTTAAGAAAGTTGCAAAAGATAGAATTCATTCTAGCTTTATTTTCTTTGGAGAGTCAGGAACTGGTAAAACCTCATCGGCAGTGGCTTTGGCAAATGATTTAGGCTTAAAATATAATTATTTTAATGCATCAGTTAACTCCAAGGCTGAATTAACTAAAATGCTGTCTGAAAATGAAGTTTTGATTATTGATGAAATACACAGATTAAACAAAGACAAACAAGATATCTTGCTTTCATACTTAGAATTTGACAAAATTATAATTTATGCAACCACTACTGAAAATCCATATTTTAGAGTTAACCCGGCTCTGAGAAGCAGAATGCAAATATTGCAATTTACAAAGTTAAGCGAAGATGAAATGTTTGAAGGGGTGAAATTAAATCTAAAAAAACATTTTCCAAATTATGAAATGGATGACTCGACAATAAAAGTTTTTGTTAAGTTGTCAAATGGAGATTATAGATCTTGTCTTAATAACTTACAGATGTTGATTTTAATGACCAAAAATAAACAAATTAGCTTAGATGATATTAAAAAATTTGTGCCGAACATATCATTTTACAGTGACGAAAATTCATCCTCGCATTACAATAACCTTTCAGCATTTCATAAATCATTAAGAGGTTCTGATGTTGATGCATCGCTATATTATGGTGCGATAATACTAAAATCTGGTGATTTACAAGGTCTATTTAGAAGACTTATTGCTTGTAGCTATGAAGATGTTGGATTTGCTGATCCAAATTTGCAACTAAGAGTTAAAAATGCAATTGAATCGGCCGAAATGCTTGGCTTACCAGAAGCAAAACTACCTATTTTTTATGCAATTATTTCTGTGGCATTGGCTCCAAAAAGTAATTCTATGTATATAGCTATGCAAAATGTAGAAAATTATATTGATGCTGGCAATATATATGACGTTCCTAAGTTTTTGAGAGATGGACACTATGCTTCAGCTTCAAAATTAGGCGATTCCATAGGTTATAAATATCCGCACGATTTTCCTAATCATTTTGTAAAACAGGAATATTTGCCAAAGGAAGCTAAAGGCAAGAGGTTCTTTTTACCAATGGAAACAGATTCGAAAAGAATAACGGAATATTACAAATTTATTAAGCAATTAAAAGGAGAAAAAGATGAGTTCTAAAATAAATTGAGATGAAATTAAAACTTTTGAACAATACAAGCAGGCTAAGAATTTAGCTTTTGGACCTGGTAGTGAAATAGAAGAGCTTAAATCAAAGATAAAGAGCTCAAATCCTGAAGAAAGAAAATTAATAGGAATTAAAATTAGTGAAATTAAATCATTTTATGAACTTAAGTTTAAAGAAATTGAAGAAAAGTTAGAAAAAGACAAAATAAATAAGATTATTGAAAATGAATTTATTGATGTAACTAAACCTTTAAAGCAATTAGGATCGCTACATCCTATTAGCATTATTGAGCAAAGATTAAGAGATTGATTTACACAAAACGGCTATTTTGAAGCCGTTGGTGGCGAAATTACAAATGAGGAATATAACTTTGAAAGACTTAATATTCCAAATAATCATCCAGCCAGAGCTTCTCACGATTCACTTTATATAACAAACAATATTTTATTAAGAACCCATAACACTGGAATAACTGCTTATGAATTAGAAAAAAACGCCAATAAATGCGCCAATATTTTTTCAATTGGTAAAGTTTATAGAAATGATGAGGATGATGCAACGCACTCGCATCAATTTACACAGCTTGACTTTGTAAGTGTAGGACAACAAGTTAGTTTTCCAAATTTAATATGAACTCTTAAGTCACTTCTATCATATGTGTTTGAAGAAGAATTAGAAATCAGATTAAGACCAAGTTATTTCCCTTTTACTGAGCCTAGCGTTGAAGTTGACATTTTTTACAAAAATAAATGAATCGAAGTCCTAGGAGCAGGAATGTTACACTCTAATGTAATGAAAAAAGCAGGATATGATAGTAAAAAGTTTTATGGTTTTGCTGCTGGTTTAGGCTTAGAAAGACTCACAATGATCAAGTACGCAATAAGCGACATTAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP022595|85107:95810|95150_95810_+|WP_013954533.1|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP022595|85107:95810|87095_88076_+|WP_013954530.1|DBSCAN-SWA
MYKSKLTLKETQQAIQDLKFAFTKKLNQELKLTRVSAPLFVTSSSKINDGLNGDIPVIFSPNKWKENIEIVHSLAKWKRSALSRYKFLPGEGLWTDMNAIRKDDEVDYKHSLYVDQWDWELIINKDDRNLEFLKRIVGTIYKSIRYVENKINFKYPVLDQKLPSEIKFINSEELYREFPNVSPEERENIVAKKYKAVFIYKIGHTLPDGLPHSKRAFDYDDWELNGDIVFYDKVNDAALEISSMGIRVDSDSLTKQAKISRKKDSDMGEYHKLVLNQKLPYTIGGGIGQSRLSMFLLEKKHIGEVQASVWPDEHREFFEKEGVILL
>NZ_CP022595|85107:95810|94195_95161_+|WP_013456569.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MSSKINWDEIKTFEQYKQAKNLAFGPGSEIEELKSKIKSSNPEERKLIGIKISEIKSFYELKFKEIEEKLEKDKINKIIENEFIDVTKPLKQLGSLHPISIIEQRLRDWFTQNGYFEAVGGEITNEEYNFERLNIPNNHPARASHDSLYITNNILLRTHNTGITAYELEKNANKCANIFSIGKVYRNDEDDATHSHQFTQLDFVSVGQQVSFPNLIWTLKSLLSYVFEEELEIRLRPSYFPFTEPSVEVDIFYKNKWIEVLGAGMLHSNVMKKAGYDSKKFYGFAAGLGLERLTMIKYAISDIRYLYKNDLRTLLQFKNEK
>NZ_CP022595|85107:95810|85107_86136_+|WP_078086171.1|transposase|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP022595|85107:95810|86338_87103_+|WP_041309069.1|DBSCAN-SWA
MNIDAIYSTFFVNGSNVISAWFVIIFGFLGMSMTLILGLPQAIHLYKCKKTGNVKYYSYWMFLFGILSWIFLGAFDPVQKMFAIVISNCICSLIYVITLWLTYRYSSDPKRKRNQWIVLFSSLLLSIFVISLSISALVLEWKLPQIAQMSIAQIVPIITTFAFFPQVLKAIDSKDYSGMSASMVWTFILANVFWTLYWVFFIINAGIAPQLISALIWQVLSLLLYSLLLIKMMHQAKLNKINNTNENVAENKYV
>NZ_CP022595|85107:95810|88200_92577_+|WP_013954531.1|DBSCAN-SWA
MSSVGYKRFQAFCKANNIEINNELEGTELVLFNLNYDENSNDKLKLEFRFKNFISFDTVRKLKSFISSNRGKWDVSFVFSSDSYSKENILCFVNKIIDKTRFMPLKQINWENKFVVKDNNAYFENIDRDFENQYGMLIDKLLNKLKEYGFATLDFSYNYAANLTSNDQNLSLNAEESEKIKRELFKKMIELDQSSTSYESNSNSPLRIKRNLNKSYTRYSIKDLNDAPSRVNVEFVGILFASKKTFSKNKRLTIQFKVSDFESAVNCMWFLDTDWLSNEQKNLINPENQSWVKVKGSIPSSDKIKGNNFFVYVDSLELTACPLNINEDKAPEDRKRVEFHISTKMNTMDGLFNADDFVERAKRWKMPAIGIMDTDGAQGYPKLFNKAKKSGIKAIYGTAFTTINKANEAILGEIPEGSFKDYPYVSFDIETTGLSPKFHEIIEFGAVDINQDLKVGKTTQFFIKPKDKIGSFTTELTGITQQMLDSKGLDIKEGLEKIYDCLDGKIAIAHNAKFDFNFLKEQFRLNNMQFPRVTVIDTLVASRIGFPGYKRHKLEDVASRLGVVYDPNVAHRGDYDAKVLANVWVNIISELNAKGIFTLDDLSKYSSNELYAKMHGYEVSTIALNNQGLKKQFELITDCLTKKYINGPITFKEDFASLNRTDILVGSGTLKGLLIDKYFYSSHDDFINELKLYDFIEIPAPQCFEHWIKYGFITTKQLQKGLSEIIYEAKKHSKIFIATADVKYLDPWDQEIFKSLVYAKGIKNARHYLFDYKKAEEGRLVIPNQRFLTTEEMTEQFAFLQDNQLIEELVIDNTQLIANMAENIEVIKSGLFTPEFDDSKKKLYDLVYKNAYAKYGEKLPEIIQKRIDSELNPIIKYGFDVIYWISYKLVKLSIDQGFIVGSRGSIGSSFVASLIGISEVNPLTPHYCCPNCKYFEVANAPGVTSGYDLPDKPCPECNTLIKGDGQSIPFETFLGFNADKVPDIDLNFTGEFQGVVHEEIRRLFGKSHTFRAGTISKVAEKTAFGYVKSYAEQTRQTIPQIFVEFLANRIKDVKRTTGQHPGGIIIIPKQFDIFDFTPINYPANDQSSSWLTTHFDYKAIHDNVLKFDILGHDNPTSIKLLEQYTGINIYDVPKNDQNVIKLFSSTEPMGISPDQISNEKTGAIGLPEFGTSFVRQMLNDIKPKTVADLISISGLSHGTNVWINNADELVLEKGRKLNEVVCCRDDIMPMLIAKGIEPLMSFTLMEKVRKGKGLSNDEVELLEKHNVPNWLIKSMQKIEYLFPKAHATAYVTMALWIAWFKLYEPLAFYASYFTAHSKADDIKNMIDKPNGIKVSKRLYELKKTEDRSNKENDLIGVFEVAEELYARGFYISNVDIDKSQAEKWLIDKEKGCLIPPFSTIESLGSVKANDIVNAREEKPFLSKEDFKTRTGVSKTVFDTMNQMKILDSLNDSDQLTLF
>NZ_CP022595|85107:95810|92982_94206_+|WP_013954532.1|DBSCAN-SWA
MNNLANELRPKTLDDIIGQKQVVDLLKKVAKDRIHSSFIFFGESGTGKTSSAVALANDLGLKYNYFNASVNSKAELTKMLSENEVLIIDEIHRLNKDKQDILLSYLEFDKIIIYATTTENPYFRVNPALRSRMQILQFTKLSEDEMFEGVKLNLKKHFPNYEMDDSTIKVFVKLSNGDYRSCLNNLQMLILMTKNKQISLDDIKKFVPNISFYSDENSSSHYNNLSAFHKSLRGSDVDASLYYGAIILKSGDLQGLFRRLIACSYEDVGFADPNLQLRVKNAIESAEMLGLPEAKLPIFYAIISVALAPKSNSMYIAMQNVENYIDAGNIYDVPKFLRDGHYASASKLGDSIGYKYPHDFPNHFVKQEYLPKEAKGKRFFLPMETDSKRITEYYKFIKQLKGEKDEF

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_078086171.1|85107_86136_+|transposase	IS30-like element ISMbov1 family transposase	A0A2K9V2S9	Faecalibacterium_phage	5.0e-21	33.0
WP_041309069.1|86338_87103_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013954530.1|87095_88076_+	aspartate--ammonia ligase	A0A1C9C5F0	Heterosigma_akashiwo_virus	8.1e-53	40.6
WP_013954531.1|88200_92577_+	PolC-type DNA polymerase III	A0A0K2SUJ2	Clostridium_phage	6.2e-12	31.8
WP_013954532.1|92982_94206_+	replication-associated recombination protein A	A0A127AWE7	Bacillus_phage	1.5e-61	35.1
WP_013456569.1|94195_95161_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit alpha	A0A2H4UW22	Bodo_saltans_virus	3.6e-29	40.9
WP_013954533.1|95150_95810_+	uracil-DNA glycosylase	A0A068EP41	Falconid_herpesvirus	1.6e-28	36.4

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP022595|123906:288562|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_078086165.1|123906_124935_-|transposase	IS30-like element ISMbov1 family transposase	A0A2K9V2S9	Faecalibacterium_phage	6.5e-21	33.3
WP_004024280.1|125354_125561_+	50S ribosomal protein L28	NA	NA	NA	NA
WP_013456035.1|125615_126161_-	DJ-1 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_115265533.1|126177_127086_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_101456646.1|127596_130482_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013455934.1|130513_131635_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_013456209.1|131634_132903_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_013456492.1|132917_134066_+	ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	4.1e-08	25.0
WP_013456036.1|134055_136458_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	2.2e-11	38.6
WP_075270998.1|136470_137454_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013456113.1|137524_138016_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_013456012.1|138102_139320_+	YitT family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075270997.1|139357_141298_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_115265535.1|141414_143088_+|transposase	IS1634 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_078086163.1|143309_144338_-|transposase	IS30-like element ISMbov1 family transposase	A0A2K9V2S9	Faecalibacterium_phage	6.5e-21	33.3
WP_013456546.1|144855_145302_-	ribose 5-phosphate isomerase B	NA	NA	NA	NA
WP_075271210.1|145457_147515_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A1V0SE00	Indivirus	7.2e-11	29.0
WP_013456267.1|147492_147879_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013456026.1|147907_148366_+	rRNA maturation RNase YbeY	NA	NA	NA	NA
WP_013455912.1|148368_148764_+	cytidine deaminase	NA	NA	NA	NA
WP_013456544.1|148775_149648_+	GTPase Era	NA	NA	NA	NA
WP_013456097.1|149681_150731_+	aminopeptidase P family protein	NA	NA	NA	NA
WP_013456141.1|150848_152285_+|tRNA	proline--tRNA ligase	A0A1V0SJ28	Klosneuvirus	1.1e-93	37.9
WP_013456293.1|152344_152713_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075271211.1|152828_154646_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013456555.1|154741_155440_+	LemA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_101456649.1|155622_158010_+	phosphoketolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_101456650.1|158068_159910_-	oligoendopeptidase F	A0A1X9I5X5	Streptococcus_phage	2.1e-17	19.1
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WP_013456016.1|160172_161585_+	ABC transporter ATP-binding protein	Q6GZ03	Mycoplasma_phage	1.2e-81	68.7
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WP_013456215.1|162397_163291_+	spermidine/putrescine ABC transporter permease	Q6GZ01	Mycoplasma_phage	2.1e-92	62.3
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WP_075271214.1|167297_168434_+|tRNA	tRNA 4-thiouridine(8) synthase ThiI	NA	NA	NA	NA
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WP_081375324.1|170509_171859_-	BspA family leucine-rich repeat surface protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075271217.1|176728_179218_+|tRNA	valine--tRNA ligase	A0A1V0S951	Catovirus	5.8e-140	39.9
WP_075271218.1|179220_180081_+	bifunctional 5,10-methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/5,10-methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase	A0A249XZQ2	Enterococcus_phage	1.3e-33	37.6
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WP_101456656.1|187749_189543_+	molecular chaperone DnaK	A0A0G2YAL1	Acanthamoeba_polyphaga_mimivirus	2.5e-129	45.8
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WP_013954995.1|192990_194235_+|transposase	IS3 family transposase	Q6H9S3	Enterobacteria_phage	4.1e-09	27.0
WP_101456658.1|194328_195612_-|tRNA	methylenetetrahydrofolate--tRNA-(uracil(54)- C(5))-methyltransferase (FADH(2)-oxidizing) TrmFO	NA	NA	NA	NA
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WP_115288220.1|196291_197281_-	lactate dehydrogenase	M1HKI4	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	1.8e-39	32.9
WP_013954606.1|198149_198602_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_115288221.1|205478_207131_-	site-specific DNA-methyltransferase	A0A2K5B2C1	Erysipelothrix_phage	6.8e-28	28.5
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WP_013954613.1|209417_210827_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_115265597.1|213601_214591_-|transposase	IS30 family transposase	A0A2K9V2S9	Faecalibacterium_phage	2.8e-21	33.8
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WP_101456648.1|221575_223009_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_013954619.1|223329_224247_-	5'-3' exonuclease	A0A0N7ACJ6	Bacillus_phage	1.3e-31	31.1
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WP_078086163.1|238029_239058_-|transposase	IS30-like element ISMbov1 family transposase	A0A2K9V2S9	Faecalibacterium_phage	6.5e-21	33.3
WP_013954995.1|239708_240953_+|transposase	IS3 family transposase	Q6H9S3	Enterobacteria_phage	4.1e-09	27.0
WP_013954995.1|242299_243544_+|transposase	IS3 family transposase	Q6H9S3	Enterobacteria_phage	4.1e-09	27.0
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WP_014829883.1|246106_247438_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_041323925.1|247431_249747_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
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WP_013954625.1|250692_252534_+|tRNA	tRNA uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34) synthesis enzyme MnmG	NA	NA	NA	NA
WP_013954626.1|252520_252973_+	23S rRNA (pseudouridine(1915)-N(3))-methyltransferase RlmH	NA	NA	NA	NA
WP_049773792.1|253083_254799_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013954628.1|254942_255962_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013954629.1|255962_256511_-	16S rRNA (guanine(966)-N(2))-methyltransferase RsmD	NA	NA	NA	NA
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WP_013954630.1|257151_258549_+	CvpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_013954631.1|258662_260579_+	DNA topoisomerase IV subunit B	G3M9Z3	Bacillus_virus	5.7e-119	41.9
WP_013954632.1|260592_263178_+	DNA topoisomerase IV subunit A	G3M9Z5	Bacillus_virus	9.8e-90	29.6
WP_013954633.1|263319_264249_+	Cof-type HAD-IIB family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_075271093.1|264250_264967_+	ribonuclease HIII	NA	NA	NA	NA
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WP_013456076.1|267298_267628_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013954638.1|267870_268566_-	16S rRNA (guanine(527)-N(7))-methyltransferase RsmG	NA	NA	NA	NA
WP_014829885.1|268549_269536_-	ribose-phosphate pyrophosphokinase	A0A2K9L2G2	Tupanvirus	2.2e-42	35.7
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WP_013954691.1|271103_272348_+|transposase	IS3 family transposase	Q6H9S3	Enterobacteria_phage	5.3e-09	27.0
WP_038582854.1|272425_273193_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013954646.1|273879_274824_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013954647.1|274922_276869_+	transketolase	NA	NA	NA	NA
WP_013954648.1|276931_277486_-	inorganic diphosphatase	A0A1B1ISK6	uncultured_Mediterranean_phage	2.1e-21	39.1
WP_013456603.1|277564_277834_+	30S ribosomal protein S20	NA	NA	NA	NA
WP_013954649.1|277947_278535_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013954650.1|278628_280797_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013954651.1|280808_282191_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013954652.1|282190_282526_+	HIT family protein	B5LJ12	Mycobacterium_phage	3.6e-05	33.8
WP_013954653.1|282644_283343_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_013954655.1|284763_285828_-	signal recognition particle-docking protein FtsY	NA	NA	NA	NA
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WP_014829889.1|286202_287753_-|tRNA	methionine--tRNA ligase	A0A1V0SEZ7	Hokovirus	1.9e-80	35.7
WP_013954658.1|287755_288562_-|tRNA	tRNA1(Val) (adenine(37)-N6)-methyltransferase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP022595|298439:360297|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

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MNLDEVKKKDNLIEINDLIFKYYKKQKNESIKIDKLEIPKNQIIALLGPSGSGKTTLLNLLLGFLKPTSGKINIVNNPKIHEISYIMQENSIYENVSVFNNVFLSAKNYEKWVDSVRLAFFNEYFANANDPELVSKYNPYLEKIFKSKSSKISKKLNFFILVLKLFFDKKIKDKFGFFKSMKLKTLFKKEFEIVANKIGIGEFIHKNVNELSGGQKQRVAFAKGIIKKTNLVLMDEPFSALDAKIKESTIEWLINIKKEFNLSIIVVTHDQQDALKLSDSIILMDNGVIQQFSSGADMYEDPNNLFVAKFIGSPEINYIGTVDNISYYIRHNKLTIIKDQNGSFEIIDRKDFGDKIHYTAKFNDKVWSLVTKDWTISIGQRVNVSYKFDDVLAFDIYGNRVLRSK
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MFSCFMLKLGNVGKAVCHSQGLSNVGDEFKIITQMFLYKFINDKFGVLLKQKDENIKNSANWEQEYSRLSPEKRDRLLKRIANENPILFPEELLSYLVNNSNKDDFAKIFDSAMESISQRNSDLFSTRTTGRTNIEFMEPLTQCVVDPNKRNQFAKALVCKLVNFSFAEAFNEHYDFFSHIFEYLIRDYNANSGEAYAEYYTPRAIATIMARLLIGDSKDLKSVTIYDPSAGTGTLLMALSHIIGENKCTIYAQDISQKSSKMLKLNLILNGIISSLPNIIQGDTLLEPSHFDPGNKNKLRKFDFVVSNPPFKLNFEGSRDELAMMGERFWAGVPNIPKKRKKGMPIYTLFIQHVINSLNNETGKGAIVVPTGFVSALLGVENAIIRKIVDERLITGVINMPSNVFANTGTNVSVLFFDKANRYSDVVLIDASKLGIDDKSSKTKKTSLTDDDIEKIVNTFIKREKIDEFSAVVTYDEITQHKYSLSPGQYFDIKIEYVDISEEEFKKQINEYSEELRQLFKESDDLQREILDKLGKLKYEKS
>NZ_CP022595|298439:360297|303890_307025_+|WP_115265541.1|DBSCAN-SWA
MEAKFNELTRVQIPAMIHLTKLGYKYYGKVCKNQIKLDPKSNILVNVFEKQLKKLNPDFDDSIETIINKINSLLNNDDLGREFYKYLVGSSPRLVDFDNIENNEFGYLAELEYKSDGHSFIPDITLFINGLPLVFVEVKKPNNLDGIQSEKDRLLDRLKKRAYKKFFNITQFMIFSNNMDYEFNNEMMPYSGAFYATIANYGENVHFNCFREQPFKGDDHYFFNNFHYLSTRQEVVDNILDDFSARSIKQSPEFETNLNILSPTHKILTSMCSKGRILFLIKYGITYVDSQKEVDGDYEVIYQKHIMRYQQMFATLAIKERLETQLKNNAPKGGTIWHAQGSGKTALAFYLHKYLTDFLQTNNMIPKFYFIVDRLDLLNQAANEFEARGLKVIKVRDKTELMKQFEQLQIVQSNTGDPEIVVVNIHKFGDYETETKIPEYNNINLQRIFIVDEAHRSYDSDGVFLANLLSKDKNAIKIALTGTPLLKSGRETKTIFGNYIHTYYYDSSIQDGYTLKIIREDVKLHYEDKTGKSNTYANAKVKRKSTNIATIYESKKYLQEFIKYIINDFIKFREIQNDESLGGMIVCETIEQAEKIQELFQEILNSWNLENNKDIKLKTGLVISNLSTNQKTVFDFKISFEIDILIVVDMLLTGFDAPRLKKMYLNKTITKHTLLQALTRVNRPYKEMKYGYVADFANIKDEYDEIVAWYRNEQEEFNQSGSYINNSDFSNIIESPDQINEKLNNAINFLSKYDTENKENFSKQIRDKTISPADLEELLKSLKNLRSLSNVVKISNIDNTNKLLDYTLFKDLNWFIDEVRRRINTINALINPHSASARDKETLLNYIDSIEFSFFKSGEYELDFASSASYKIKELMKKEITELLYKNIDKNATEYVSVYVRFYELIKKCSDNSGTNNLLSYETMMKNLQDIYKQISIINRENERLLSKYDDEKYVRVHNHICKQFLDSKNPLDENKLISLLCEIKKLIDAKLFEQVQILEHREQFLSNLASYVYDVADKNDVSFSTNILNDIVQKLCNEYTELN
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MAKQLSVNEWKYLFEKYEKYRSGELTKKCFLNEMMKIKNVKHISDDQWKRLVNKYKRYNLGMNIESMSGRSPKKGKGSGRPKKTKSNDEILDEFLNDLNKEDLIKIIKIISTDDEIKKIKKDKFKETVTKIKNSFPFKVSNKVIMSLLKIKKSTYYKKLKKLKMIKEKNLELENTVVQAFKETGGIFGRERLAAYISKNKQIKLNYRTLGRIMKKLGLVCRIRKAKRTKESKNVAVTFQNIASRDYDGIYNDIYATDVTYIPSPIDVDQNFVYMSAVIHHKTKKILGFNLSLYNDNSLVIDNIKKVNFPKNFVIHSDHGSQYSSKEYLQLIERLNGKVSMSRIGNSLDNREIEYFFSVLKTEMFENFEKSVKKMTLKELERHLNKFIDWYNNERMLKKFNYKTPHELWVEFCKK
>NZ_CP022595|298439:360297|339738_340530_+|WP_075271192.1|DBSCAN-SWA
MEKVIYDYEYAFKDNNNKDGAIIYCHGHNSKPEIFEMFQNYWTKTNYYALQFPGNNLVKPVKDHKLSVYQFAQLLINFIVDNGLKNVTLIGHSMGGGTISLAYKLRPDLIGKLIYIAPINKTTSLSKGKYKRNFEPKTLSEYHDFLRPLYYDFDALIANSEFSEEVKKAFDPERFSNPYIKELTMSMDASLYDEIESSLDSITVPTLLILGEKDGVIDSESCLKYFKEYVKNLESVIVPKSSHIIYLENWPVFIDAMDKFLNK
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MSFNVYSFDKLPKFNNPIYLIGVFESFHLGHNFLYEKAKEIKKNSARDIVIVFFKDVEHMFKNKDGYIFTNFENRIQEFANLGFTNGIYLEFEKLWALDADSFLKKLLKNQDESIDVVVGKDFRFGLNAKGNIDTIMNFVGAERVHPVDIVKIGDNIKVSTTFLKSCIEIGDIELVNSLNLYIYSFSAQINAVDNENKVNLVTDSNIVPLKDGIYLCYIEINEMTYYAVLKANIDNLEIKFLDFELKSGVTDLKSRIRVLKSLRFISSIADDIFLDEDIIKAKKILFNRPNYDKM
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MAKQLSVNEWKYLFEKYEKYRSGELTKKCFLNEMMKIKNVKHISDDQWKRLVNKYKRYNLGMNIESMSGRSPKKGKGSGRPKKTKSNDEILDEFLNDLNKEDLIKIIKIISTDDEIKKIKKDKFKETVTKIKNSFPFKVSNKVIMSLLKIKKSTYYKKLKKLKMIKEKNLELENTVVQAFKETGGIFGRERLAAYISKNKQIKLNYRTLGRIMKKLGLVCRIRKAKRTKESKNVAVTFQNIASRDYDGIYNDIYATDVTYIPSPIDVDQNFVYMSAVIHHKTKKILGFNLSLYNDNSLVIDNIKKVNFPKNFVIHSDHGSQYSSKEYLQLIERLNGKVSMSRIGNSLDNREIEYFFSVLKTEMFENFEKSVKKMTLKELERHLNKFIDWYNNERMLKKFNYKTPHELWVEFCKK
>NZ_CP022595|298439:360297|342899_343724_+|WP_013456634.1|DBSCAN-SWA
MLLAKKIFFGILKFALIGLLCIMLLFPLYYLLLHSLVSPKTITDNKATLTIQEWNWSNYAEAYKKDFWVAFGYTSLFALFLMTLRIVTYSMAVAGLLKMNNRFQKIFQNFFLVISLVPEFSIYLSLKTFLIRLDLYGTAFSFVSNSIFSFFTFTYVWDLAKSAHNEKYKVMLNDNLKWNQKITYVYLPKLKLAYFLLIVFAFITAWNDYLWPTFVLPSTSNVKGFTNITIWFLNLGKESAEFENTAIQAAGAVISVLIPLTIYAIFSKKINRFN

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_013456112.1|298439_299873_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_013954662.1|300345_301389_+	AAA family ATPase	A0A2H4UTU5	Bodo_saltans_virus	9.9e-09	29.0
WP_013954663.1|301390_303661_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_115265541.1|303890_307025_+	type I restriction endonuclease subunit R	A0A220A398	Liberibacter_phage	2.3e-24	24.8
307018:307077	attL	NA	NA	NA	NA
WP_013954995.1|307050_308295_-|transposase	IS3 family transposase	Q6H9S3	Enterobacteria_phage	4.1e-09	27.0
WP_014829941.1|309027_310701_+|transposase	IS1634-like element ISMbov3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_115265543.1|310752_312384_+	SAM-dependent DNA methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_013954666.1|312370_312922_+	C-terminal truncated type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_013954667.1|312918_313611_-	restriction endonuclease subunit S	NA	NA	NA	NA
WP_013954660.1|313758_315147_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_115287299.1|315419_316595_+	restriction endonuclease subunit S	NA	NA	NA	NA
WP_013954669.1|316668_317637_+|integrase	integrase	A0A2H4JAA2	uncultured_Caudovirales_phage	3.8e-31	29.2
WP_013456559.1|318001_319675_-|transposase	IS1634 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081375095.1|320124_320586_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013954672.1|320900_322058_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_013954673.1|323003_324623_+	CTP synthase	A0A1J0FA14	Only_Syngen_Nebraska_virus	5.9e-109	39.8
WP_075271157.1|324862_327541_+|tRNA	isoleucine--tRNA ligase	A0A2I2L3Y0	Orpheovirus	4.3e-80	27.3
WP_075271156.1|327542_328253_+	signal peptidase II	NA	NA	NA	NA
WP_101456675.1|328447_330307_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_101456676.1|331257_331854_+	Holliday junction branch migration protein RuvA	NA	NA	NA	NA
WP_075271197.1|331834_332797_+	Holliday junction branch migration DNA helicase RuvB	B3GAM6	uncultured_virus	1.9e-06	26.5
WP_115288222.1|332833_335194_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075271195.1|335264_336131_+|tRNA	tRNA pseudouridine(55) synthase TruB	NA	NA	NA	NA
WP_075271194.1|336123_336966_+	HAD family phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_075271193.1|336997_337885_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013456065.1|337975_338242_+	30S ribosomal protein S15	NA	NA	NA	NA
WP_115265524.1|338291_339536_-|transposase	IS3 family transposase	Q6H9S3	Enterobacteria_phage	5.3e-09	27.0
WP_075271192.1|339738_340530_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_115265545.1|340655_341873_+	ABC transporter ATP-binding protein	Q6GZ03	Mycoplasma_phage	2.7e-13	32.5
WP_075271189.1|341938_342913_+	sugar ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_013456634.1|342899_343724_+	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_075271187.1|343872_345642_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013954682.1|345680_346748_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075271184.1|347037_349038_+	phosphoesterase	NA	NA	NA	NA
WP_013456489.1|349018_349474_+	50S ribosomal protein L9	NA	NA	NA	NA
WP_013954685.1|349463_350939_+	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	6.0e-52	33.5
WP_101456679.1|350938_352231_+	DUF21 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_101456680.1|352589_353612_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_101456681.1|354019_354394_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_101456747.1|354623_355541_+	BspA family leucine-rich repeat surface protein	NA	NA	NA	NA
WP_101456682.1|355697_355997_-	PTS sugar transporter subunit IIB	NA	NA	NA	NA
WP_013954995.1|356487_357732_-|transposase	IS3 family transposase	Q6H9S3	Enterobacteria_phage	4.1e-09	27.0
WP_013954995.1|359052_360297_+|transposase	IS3 family transposase	Q6H9S3	Enterobacteria_phage	4.1e-09	27.0
356455:357796	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP022595|380569:565426|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_013954705.1|386106_386892_-	Nif3-like dinuclear metal center hexameric protein	NA	NA	NA	NA
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WP_101456689.1|388418_390359_-	DNA primase	A0A1S5RFD7	Helicobacter_phage	5.7e-42	35.3
WP_013954708.1|390400_391777_-|tRNA	glycine--tRNA ligase	A0A2I2L3K8	Orpheovirus	3.9e-53	32.0
WP_013954709.1|391888_393676_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_013954710.1|394126_395482_+	alkylphosphonate ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_013456298.1|395484_396417_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.3e-07	30.0
WP_013456124.1|396380_398132_+	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_115276499.1|398238_398484_-	DUF2188 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_013954711.1|398564_401084_-	preprotein translocase subunit SecA	NA	NA	NA	NA
WP_038582866.1|401320_402367_+	alcohol dehydrogenase	A0A0K0KVL7	Prochlorococcus_phage	1.0e-13	26.9
WP_013954712.1|402515_404354_-	type I DNA topoisomerase	A0A2P1ELA0	Moumouvirus	4.8e-75	32.1
WP_013456432.1|404733_405171_+	30S ribosomal protein S6	NA	NA	NA	NA
WP_013456362.1|405212_405611_+	single-stranded DNA-binding protein	A0A0H3U4B5	Staphylococcus_phage	9.3e-08	30.3
WP_115265550.1|405630_405957_+	30S ribosomal protein S18	NA	NA	NA	NA
WP_013954713.1|406091_407420_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_078086163.1|407658_408687_-|transposase	IS30-like element ISMbov1 family transposase	A0A2K9V2S9	Faecalibacterium_phage	6.5e-21	33.3
WP_013456295.1|409030_409486_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013954715.1|409536_411207_-	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
WP_013954716.1|411445_412762_+|tRNA	histidine--tRNA ligase	A0A2K9L0H9	Tupanvirus	2.7e-11	25.1
WP_013456122.1|412830_414534_+|tRNA	aspartate--tRNA ligase	A0A2K9KZX5	Tupanvirus	2.0e-14	23.1
WP_013954691.1|414617_415862_-|transposase	IS3 family transposase	Q6H9S3	Enterobacteria_phage	5.3e-09	27.0
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WP_115265553.1|556343_556904_+	single-stranded DNA-binding protein	B8R683	Lactobacillus_phage	5.0e-15	41.0
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WP_013455919.1|563992_565426_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP022595|648832:729484|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_115288227.1|694989_695244_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_101456648.1|697828_699262_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_013456062.1|707687_708116_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075270942.1|708121_709135_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013455919.1|710333_711767_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075271115.1|712620_715230_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075271152.1|715262_717473_-	putative immunoglobulin-blocking virulence protein	NA	NA	NA	NA
WP_013455970.1|717658_719623_-	DNA ligase (NAD(+)) LigA	Q332J4	Clostridium_botulinum_C_phage	3.9e-83	31.7
WP_013456498.1|719758_721006_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013456083.1|721139_722327_+	phosphopentomutase	NA	NA	NA	NA
WP_013456339.1|722415_723237_+	DNA-binding protein WhiA	NA	NA	NA	NA
WP_115265600.1|723451_724636_-	BspA family leucine-rich repeat surface protein	NA	NA	NA	NA
WP_013456160.1|724942_725650_+	MjaI family restriction endonuclease	E3SIW0	Synechococcus_phage	2.6e-21	35.1
WP_013456269.1|725657_726716_-	site-specific DNA-methyltransferase	S4VS49	Pandoravirus	2.8e-19	29.4
WP_013455983.1|726899_727862_+	DNA polymerase III subunit delta	NA	NA	NA	NA
WP_080551570.1|728455_729484_-|transposase	IS30-like element ISMbov1 family transposase	A0A2K9V2S9	Faecalibacterium_phage	6.5e-21	33.3

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP022595|763686:836580|DBSCAN-SWA
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MKSRKIKALFISQAIGFSALIPVLSARCNDPKNNSEVIIYQRNANSDKTNEQFEKYNQVNLLSNIKDYFDKHEHLDLIKFKGGGKPETVEYSLMMQNNYMSKYINFDTEAFKAIVKKELKLSDKLLSRLKFSYDYNNVTRDPGNNYDVLFKVKVGLPLESNDKSKYESGLYSQQIIDFRIKNVKVKDNEKPFADALKPYDQKIQALTSQDFEVKLENIDDELKQAITKYGIHQLSSKQYEKLLKFSSAKLDEIFKDNDKKIEIPVGSKKEKYTLKFNKFIEDVVLNDGTLSSAKAKIRIATSLFDDKRKSTVWESGKTVYGLFTVPKEQKLINNLQLAELIDVHTIGNIEHNSDLSTLTKGNLFINVKDANIEKVEIDKITTSEQDFRNATVTLNVKLKNSQELVKVEKHLGVGRYSLLFDKQFTKQNIKAPAFATEGITTKNLPSIDKTFFGHYNSQLFSGGYASARAFYADNVVVPRFVHIGEDYIAPDFQPVLAPYDGQIVAAYELTTKVVATGVGTVVVIKIPVANLDWSPKEKEIYLNDNDKHIYMSFLHLDAGKTLNNTSLGWQSETVTLGENRTIKVAPTVSADTPTEVKKGQIIGFLGTQDTNGGWMAHAHVNLYTNRNFWLSPNHFNKESKQSNIDKRVKDYKKTNKGKIKYTQVGNIGVEGVTDKRVVEVDPKTGEAIKTKVKTNNGKEKLMNKSLKELPVYLNNISMLSKEQSKGYADPNLVYKLRDSKTFAFGIEDLFELNK
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MNDQIKKILVINAGSSSLKWALYADKDLELIGTGICERIALDGNLILKDKANKYEHKEDLPNHLVAVEKLLKYWKEHNFISELDEIEAIGFRIPYAGFKFLSPVFYSPEVRESIVTYAEKFIPLHTPPFLATLDGFIEYLPNVPKIVAQDTAFHTDIPKINKQFSINKEWATKYNIEKFGYHGLSHDYITGRMKQILGKDKINIVVAHLGSGSSLCAIKDGKSFDISVGFSSTDGLMMGTRSGAIDPGIVDYLVRIEHKDPQEVFDMLVKNSGLLGVSGISSDIRDLHKLSNENEDAKFAIELYAQRVVDYMAMYLNKIHYPDAIVFTAGMGENDAVLRKMIIDKVKSYKLFLDKESNLANYEDYMLISSQESEIPIYKMRTNEEIVIAKYVKELVNSHN
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MKIDYNKMIDHTFLKAEATKADIDKLITEAKQYNFKTVCVNSSYVPYVKEQLKGTDIGITSVIGFPLGAMLTNCKAYEASEAIKAGADEIDMVINIGKLKDKDYDYVLKDIMVVKHACGKHILKVIVETALLTKEEIEKVTKIVMQSGAEFIKTSTGFSTRGASLEDVKIMKSVCGEKLLIKAAGGISNKDDMIKMYQAGATRFGTSRSVAIVEGKESHGGY
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MQITVKDLVHTFLAKTPYELNAINHVNVEIKQGEFIGVIGQTGSGKTTFIEHLNALLLPSNGEIEWVFENEKLDRKTGKKEKFIDSFIVKPTRRKKVKKAKDIRKRVGVVFQFAEYQLFEETIEKDIAFGPRSFGISKQEAFERAAKYIKLVGLNESFLKRSPFELSGGQKRRVALAGILAMEPDFIIADEPTAGLDPAGVIEILNIFKELHNQGKTVIIVTHDLDNVLEYTQRVLAFKDGQIVKDGDTHDVLRDTEFLKNNYMEPPKLLDFVSKLEANGIKVPRVTSIDELADFINKHMSNKNKSRVKYEQ
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MAKDAIKIRAKVKEIYSTDEYLVTLESGQDIKANISGKMRVNRIRILPGDEVDVELSPYNLQRGRITYRHNR
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MVGDKKIKNLVFMGPPGVGKGTVASIIAQEYGLVHLSTGNIFRAEIASASELGKKVSSIVESGGYVPDDITNEIVARALENYNKSGKIVILDGYPRTLSQVEFLDSLPYFKYEVIELRASEELILKRLSGRRFCPNCKASFHIDFMPSSKGNICDKCGTPLITRKDDSPESIKNRLMVYKEQTGPLLDYYKNKVYVFEANNDPKALADLIVNSLTK
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MKVRASVKRMCKDCRIIKRKGVIRVICSIPKHKQRQG
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MKKIIVVGLGNVGFTYINTSVARGLEAEWVLVDKNVQIAEAHAHDFEDMVSLMPRNGSTFRPGTLLEDSKDADVVVITASIPADKTFSDRMALAGANAKLMQSFAKDLDAAGFKGIVVVAANPCDVMAAAVHYGSKIPANRVISAGTNLETGRLKKMLAAKFKTSPDAIRASVLGEHGATAMIAWSTVKVGETTLEGLVESGKITKEDYEEVLKQVIAEAFYIWSRKGNTQFGIATSLFEITKAILDNRRTVMNLGVKIPEGYKHAGIYVSIPVIIGENGYEYLPFKPSLTKEEWIKFEASTEAVAKVHTDILKSIGVDIKFE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_014829956.1|776047_777667_-|tRNA	arginine--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
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WP_013954897.1|779256_780228_-	lactate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_004023902.1|780434_780671_-	biotin/lipoyl-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_013954898.1|780987_781962_+	phosphate acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_013954899.1|781981_783184_+	acetate/propionate family kinase	NA	NA	NA	NA
WP_013954900.1|783192_784098_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013954901.1|784154_786419_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013954902.1|786716_788183_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_013455927.1|788334_789351_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	8.4e-37	33.6
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WP_013954904.1|792241_793078_+	deoxyribonuclease IV	A0A1V0SHV6	Klosneuvirus	1.1e-29	33.1
WP_013954905.1|793109_794816_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_013456450.1|794830_795172_+	thioredoxin	NA	NA	NA	NA
WP_013456570.1|795177_796893_+	excinuclease ABC subunit C	NA	NA	NA	NA
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WP_013954908.1|797606_799793_+	P80, lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_014829957.1|799857_801027_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_115265569.1|801035_803138_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	Q6GZ03	Mycoplasma_phage	1.6e-18	28.8
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WP_013456037.1|804127_805111_+	carbohydrate ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
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WP_013456467.1|805412_806951_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013456486.1|807020_808289_-	GTPase ObgE	NA	NA	NA	NA
WP_013456545.1|808400_809225_-	Cof-type HAD-IIB family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_013456427.1|809510_810212_+	purine-nucleoside phosphorylase	NA	NA	NA	NA
WP_115265570.1|810230_811526_+	pyrimidine-nucleoside phosphorylase	A0A0H3UZD4	Geobacillus_virus	5.7e-115	55.0
WP_115265571.1|811535_812204_+	deoxyribose-phosphate aldolase	NA	NA	NA	NA
WP_013954919.1|812248_813031_-	triose-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_115265572.1|813149_814202_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013456562.1|814245_815151_-	energy-coupling factor transporter transmembrane protein EcfT	NA	NA	NA	NA
WP_013954921.1|815140_816079_-	energy-coupling factor transporter ATPase	G9BWD6	Planktothrix_phage	2.5e-19	30.5
WP_013954922.1|816069_816867_-	energy-coupling factor transporter ATPase	G9BWD6	Planktothrix_phage	3.9e-21	33.5
WP_013456394.1|817041_817407_-	50S ribosomal protein L17	NA	NA	NA	NA
WP_013456482.1|817406_818417_-	DNA-directed RNA polymerase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
WP_004023933.1|818436_818838_-	30S ribosomal protein S11	NA	NA	NA	NA
WP_004023934.1|818857_819229_-	30S ribosomal protein S13	NA	NA	NA	NA
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WP_004023936.1|819364_819583_-	translation initiation factor IF-1	NA	NA	NA	NA
WP_013954923.1|819589_820339_-	type I methionyl aminopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_013456188.1|820377_821028_-	nucleoside monophosphate kinase	A0A2K9L7B8	Tupanvirus	1.4e-08	33.6
WP_013456323.1|821021_822500_-	preprotein translocase subunit SecY	NA	NA	NA	NA
WP_013456001.1|827861_829295_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_078086178.1|835551_836580_+|transposase	IS30 family transposase	A0A2K9V2S9	Faecalibacterium_phage	3.8e-21	33.8

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP022595|868693:906888|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_115276532.1|878956_880045_-	restriction endonuclease subunit S	A0A2H4PQP5	Staphylococcus_phage	7.4e-07	25.9
WP_013954952.1|880148_882827_-	type I restriction-modification system subunit M	A0A2H4PQP4	Staphylococcus_phage	7.0e-91	39.6
WP_115265601.1|886116_886857_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_013954954.1|886913_887402_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_115288230.1|887886_888171_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_115276518.1|891205_893248_-	peptidase S41	NA	NA	NA	NA
WP_101456648.1|893477_894911_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075271178.1|895193_896585_+|tRNA	glutamate--tRNA ligase	A0A222YZ70	Escherichia_phage	6.6e-08	25.2
WP_013456580.1|896575_896977_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013456621.1|897239_898388_-	methionine adenosyltransferase	A0A2H4PQS6	Staphylococcus_phage	3.8e-102	52.4
WP_013456411.1|899588_900947_-	signal recognition particle protein	D6PHS7	uncultured_phage	8.7e-05	29.0
WP_013456099.1|900965_901790_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_013456213.1|901861_902101_-	hypothetical protein	A0A172JI00	Bacillus_phage	4.6e-10	40.9
WP_101456714.1|902194_903607_-|transposase	IS1634-like element ISMbov2 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_101456648.1|904211_905645_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_013455927.1|905871_906888_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	8.4e-37	33.6

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP022595|926417:991733|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_013954990.1|935299_936190_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_013954985.1|960391_961861_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_038582898.1|962084_963869_+	ABC transporter ATP-binding protein	W8CYL7	Bacillus_phage	1.0e-29	26.3
WP_013954983.1|963879_965712_+	ABC transporter ATP-binding protein	W8CYL7	Bacillus_phage	3.4e-28	25.3
WP_013954995.1|965757_967002_-|transposase	IS3 family transposase	Q6H9S3	Enterobacteria_phage	4.1e-09	27.0
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WP_075270941.1|971085_971757_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075271143.1|972227_972824_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075271028.1|972872_973550_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_013456390.1|975662_976652_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013456280.1|976815_977055_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075271144.1|988098_989814_+	DUF2326 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_115288233.1|989917_990370_+	DUF4065 domain-containing protein	A0A0N9SGM1	Paenibacillus_phage	1.5e-22	44.3
WP_078086178.1|990704_991733_-|transposase	IS30 family transposase	A0A2K9V2S9	Faecalibacterium_phage	3.8e-21	33.8

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP022595|1083775:1134179|DBSCAN-SWA
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MNLSINIKSSEFILKIKASTILACYIFVDIKRTILHLRTCWYFYAPCPGLVPAPCPGLVPAPCCELVPAPCPGLVPAPCCVLVPAPCCVLVPAPCCELVPAPCPGLAGALSKEPGSSCGILGFISESDSPPGFLFSSGFLFSPGVLFSPGVLFSPGVLFSPGVLFSPGVLFSPGVLFSPGVLFSPGVLFSPGVLFSPGVLFSPGVLFSPGFLSPPGFLSGSGLFSSLVSPHLAATKGIEANEATDPSSKNFDFFINLSSPFKAIN
>NZ_CP022595|1083775:1134179|1107937_1108243_-|WP_013955069.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MKSNIKEELKEIALSLMFKIDDKVLDDIMELWTDLNTRIEWLKEIDTSNVEPLSHINENRFIDFLRDDVEDNSLVSIKKHDLLSNAADYDENYILTNKVVK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
1083442:1083493	attL	NA	NA	NA	NA
WP_078086180.1|1083775_1084804_+|transposase	IS30-like element ISMbov1 family transposase	A0A2K9V2S9	Faecalibacterium_phage	6.5e-21	33.3
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WP_101456648.1|1094203_1095637_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_013955063.1|1098849_1100694_+	RNase J family beta-CASP ribonuclease	NA	NA	NA	NA
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WP_014829996.1|1102169_1104587_+	DUF2779 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075271049.1|1105210_1106632_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatB	NA	NA	NA	NA
WP_013955068.1|1106624_1107938_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatA	NA	NA	NA	NA
WP_013955069.1|1107937_1108243_-|tRNA	glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_013955070.1|1108248_1109103_-	RluA family pseudouridine synthase	NA	NA	NA	NA
WP_013456616.1|1109114_1109693_-	segregation/condensation protein B	A0A1B1IVT7	uncultured_Mediterranean_phage	1.2e-11	29.7
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WP_013456430.1|1110436_1111177_-	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_013456382.1|1111674_1112985_-	ribosome biogenesis GTPase Der	NA	NA	NA	NA
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WP_014829997.1|1113723_1114185_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013955073.1|1114472_1115606_-	molecular chaperone DnaJ	A0A1V0SBY2	Catovirus	3.0e-27	32.2
1114313:1114364	attR	NA	NA	NA	NA
WP_013955074.1|1115843_1116185_+	30S ribosome-binding factor RbfA	NA	NA	NA	NA
WP_013955075.1|1116358_1117594_-|tRNA	tyrosine--tRNA ligase	K4F5T3	Cronobacter_phage	3.3e-59	33.2
WP_013955076.1|1117604_1118207_-|tRNA	tRNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_013456246.1|1118268_1119171_+	DegV domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_014829999.1|1119331_1119565_-	acyl carrier protein	NA	NA	NA	NA
WP_013955078.1|1119604_1120327_-	peptide chain release factor N(5)-glutamine methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_013456073.1|1120326_1121403_-	peptide chain release factor 1	NA	NA	NA	NA
WP_013955080.1|1121528_1122101_-	cell division protein Fic	NA	NA	NA	NA
WP_013955081.1|1122122_1123544_-	YitT family protein	NA	NA	NA	NA
WP_013954660.1|1124998_1126387_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_013955084.1|1126701_1128669_+	type IIA DNA topoisomerase subunit B	G3M9Z3	Bacillus_virus	8.7e-131	41.5
WP_013955085.1|1128791_1129106_+	thioredoxin	A0A1X9I9P5	Staphylococcus_phage	1.7e-12	39.0
WP_013955086.1|1129158_1129605_+	SsrA-binding protein	W5RAM5	Staphylococcus_phage	1.8e-12	37.4
WP_115276526.1|1130094_1131483_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_013955088.1|1132505_1134179_+|transposase	IS1634-like element ISMbov3 family transposase	NA	NA	NA	NA