Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012212 | Campylobacter jejuni strain CJ017CCUA chromosome, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,WYL,cas14k | 0 | 1 | 2 | 0 |
1. NZ_CP012212
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012212_1 | 1347724-1347803 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012212_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012212_1
>1.1|1347747|34|NZ_CP012212|CRISPRCasFinder TTTTTTAGCTTTATACTCAGCCTTACTCATATAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012212_1
The CRISPR arrays of NZ_CP012212_1 >merge|NZ_CP012212|1|1347724-1347803|CRISPRCasFinder TCTTTTTGTTCTTTTAAAGCTTCTTTTTTAGCTTTATACTCAGCCTTACTCATATAATCTTTTTGTTCTTTTAAAGCATC >NZ_CP012212|1|1|1347724-1347803|CRISPRCasFinder TCTTTTTGTTCTTTTAAAGCTTC TTTTTTAGCTTTATACTCAGCCTTACTCATATAA TCTTTTTGTTCTTTTAAAGCATC
>NZ_CP012212.1|WP_002855339.1|1347323_1347650_+|ribosome-silencing-factor MQERIDLIVKILDEKKAEDIKTIDMSEQEYFVKYVIIAATLGERHALSLIDELKTQLKAKGEEFLNIDSSEEWSVIDLGDILIHLLTPEHRGIYNIEELLENLKKGRV >NZ_CP012212.1|WP_070298597.1|1346750_1347296_+|nicotinate-(nicotinamide)-nucleotide-adenylyltransferase MKIALFGGSFDPPHNGHNSVVLEALEKLDIDKLIIMPTYINPFKQSFSANEKQRFLWVKKLWGHLPKVEICDFETKQKRPVPSIESVKYLYKLYNPSKFYLLIGADHLEKLHLWHDFEKLNSLVEFVIANRNDIEIPKNFKDLKTDKKIASSFIRNTLNTNEVCEEIKDEVKKYYEKLQKN >NZ_CP012212.1|WP_052858274.1|1345692_1346691_-|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MAVKVAINGFGRIGRCVARIILERNDIELVAINDTTDIELTKYLFKYDTVHGEFKGSVDSEGDDLVVNGKKIKVFKSRNVKDLDFAKYGTQIVLECTGAHLTMAKCQEFIDMGVQKVIMSAPAKDDTPTYVLGVNSELYKGESIISNASCTTNCLGPVCRVLQDNFGIEKGLMTTIHAYTNGQSIIDAKAKDKRRSRAAAQNIIPTSTGAAKAMKLVMPELNGKLHGQSMRVPVIDVSSVDLTAQLSRKVSKDEINEAFRKAATTNLKGILMVDDDERVSSDFITCSYGAIVASDLTQVIADDFIKVIAWYDNEWGYSSRLVDMAVYIANKA >NZ_CP012212.1|WP_002875244.1|1344487_1345690_-|phosphoglycerate-kinase MSDIISIKDIDLAKKKVFIRCDFNVPQDDFLNITDDRRIRSAIPTIRYCLDNGCSVILASHLGRPKEISSKYSLEPVAKRLARLLDKEIIMAKDVIGEDAKTKAMNLKAGEILLLENLRFEKGETKNDENLAKELASMVQVYINDAFGVCHRAHSSVEAITNFFDEKHKGAGFLLQKEIDFASNLIKHPARPFVAVVGGSKVSGKLQALTNLLPKVDKLIIGGGMAFTFLKALGYDIGNSLLEEELLEEANKILTKGKNLGVKIYLPVDVVAAPACSQDAPMKFVPAQEIPNGWMGLDIGPASVRLFKEVISDAQTIWWNGPMGVFEIDKFSKGSIKMSHYISEGHATSVVGGGDTADVVARAGDADEMTFISTGGGASLELIEGKELPGVKALRSKENE >NZ_CP012212.1|WP_070298596.1|1343798_1344491_-|triose-phosphate-isomerase MIFAANLKCNHTRASFKIYAEILNKTMGAKCDDIIVFPPSVAFLENENNFIQGAQNFYPCVNGAFTGELGKEHLDEFGIKCVLIGHSERRVLGDEELIGTKFDFAKEHGYKIVFCIGENLDTKNSGKTLEFLKKQLEMIDLNYEKLIIAYEPIYSIGTGVSAQSTDIAKVLEFLASLTKAPLLYGGSVNENNIKEILSVKHCGGVLIGSAALKVENFIKLIKRIKDDYEG >NZ_CP012212.1|WP_002887956.1|1342990_1343815_-|enoyl-ACP-reductase-FabI MIMKGKKGLIVGVANNKSIAYGIAKACFDQGAQLAFTFLNDALKKRVEPIAQEFNSNFVYELDVNNNEHLDSIAEKIKKDLGEIDFVVHAVAFAPKEALENSFLETSKEAFDIAMQTSVYSLLSLTRAVLPILKDKGSILTLSYLGGVKYVPHYNVMGVAKAALESSVRYLARDLGVKGIRVNAISAGPIKTLAASGIGDFRMILKYNEINSPLKRNVSIEDVGNSAMYLLSDLANGVTGEIHYVDAGYNIMGMGDVEKNEEGQTVLCWDNQKG >NZ_CP012212.1|WP_070298595.1|1341493_1342987_-|hydrogenase-small-subunit MAKLSNEELKNILEDRIKKLENSTLKEDKVINEESVKILARHLSLGNEIPALAQRFFQIAPKTKLVWLHLCECTGCSESLLRSELPSFDELIFDFFSLEYHETLMAANGTKAEELLEHVLEEDFILAVEGGVAAIDTFFLTIGAQGESGYEILEKLAAKAKAIFAVGTCSSYGGIQAAYPNPSKTCGISEVLSQKVVNIPGCPPSDINIIATLSFFALFGVLPELDEQNRPVWAYGKCLHDMCERKAKFESGIFAEHFDDEAAKNGACLFKIGCKGPYTYNNCPKVKFNAKTSWPVAAGHGCIACSEKNFWDEFGNYEKPMANIFSYAKLCNEELKQEFFLEEQIKILEQIDFEFESNIKLILQNIAKNKLGALLVENYKKSFEKNYTFIEQNFDENSMPSKDFWKYLEISFILVKGEFLKDKNDFLIAAKNYAFKHASPYDFKLNMNAEKPKLDVSKSFRMTLIYLCGGLDFEGITYSILKAFEDNIAKISSLKAS >NZ_CP012212.1|WP_070261100.1|1339655_1341497_+|ferrous-iron-transport-protein-B MKKIKIALVGQPNVGKSLLINALCKANMKVGNFSGVTIEKASAKTFYKNYEFEVIDLPGTYSLDGYSEEEKITRHFLNQNDYDVIVNVLDATNLERNLILSAELLSLNKKMLLALNMCDEAKKEGIELDTSVLSQEFQSQVVEISAKTKENLELLLQKIIILFENKFIPRSQFYTPLCEKSPEKEDLLYFINELSKKIITHKKEERNLTKKIDALLIHKFFGLPIFLFLMWLLFQLTFSLGQIPMDYIESGFNALGEFVKNNISNTFIASALADGIIAGVGAVILFLPNIMILFLGIALLETTGYMSRVAFLLDGILHKFGLHGKSFIPLITGFGCSVPAFMATRTLKNKRDRLLTLFVINFMSCGARLPVYVLFIGAFFPSEKAGNYLFGIYILGAILGLCAAKFLRMTAFRGLDEPFVMEMPKYRMPNWHLVWFMVYNKAKMYLKKAGTFILLASLLIWFASNFPKSEENLNDFNAQERAIEQSYLGQFGKGIEPIFKPLELDWKLSVSLISGLAAKEVMISTMGVLYSLGKDVDETNNDLKGIIAKNIPIPSAVAFILFVMIYNPCFAATIVFSKESGKLKYTLFLFLFTCTSAYIVAFIGLHIAKILLN >NZ_CP012212.1|WP_002779147.1|1339434_1339659_+|ferrous-iron-transport-protein-A MTLNELKDGQKAIIVNLNAHKELKNRLLSFGFIKNKNLKKIHSSLKNATIMVELDTSCVILRSDEAKTIEVNLI >NZ_CP012212.1|WP_070261099.1|1338013_1339354_+|MmgE/PrpD-family-protein MFYSEILADFIFNLKYENIPNTVVQRAKELMLDSLGTAIAASKEECVLNAFKAFENLSTEKNTPIWVNDQKLDPIYAAMLDGIASHALDFDDTHTEAILHASAILTPLCLNYGFHVSKDAKKIIKAFIVGWEIAARVGIASKGTFHKRGFHTTAIAGIFGSVSASAILLDLNKEQIINALGLAGSFASGINEFLSNGSNSKVLHIANAIKNGIMVAHFAKNNMSGPLSIFEGRDNIFKCFGIEEECDKTELSKALGEIWQTMQVSIKPYPSCHFAHGLIDCAIALKNDGLKADEIKSIHCFVDEVPISFICDPLEAKYTPNSAYEAKFSMPFLMALGFFDGKITLESYENLKREEVLEFAKKISYEKRKSQGFPKYFPGHLEASLQDGRIIQKDVFINKGNFDNPLSFEELKAKFLANAQIYLDNAKANKILDQIINLENLNRFSF >NZ_CP012212.1|WP_070298598.1|1348105_1349476_-|phosphoglucosamine-mutase-PgmL MLDVIFREYDIRGLYGKELNEKSVKAIGFCLGQTMLNKGCKNVSVGYDARYSANELFNYLVSGLNKAGIKIYDIGLVPTPLGYFSLYEGLKFDANVMITGSHNPKDYNGFKITINKESFFGVELKEFSKEVYKHLDDEIEENLEVEKYDILSLYVKFMCEQFSFLKDFNYKFGVDCTNGAAGVVIKPLIKALNLKAHVMFAEPDGQFPNHAPDPTEEENLSAIREFLNQNQDYSLAFAFDGDADRMVALSKTHVFCGDELCYLFAKNIPNPRILGEVKCSKNLFDEVAKFGTIFMGKTGHSNIKKMMKEKDIDLAAEVSGHIFFKHRYFGYDDGIYTFLRALELVYKGFDLESMIKALPKLYTTPEIKIPVNEEEKFKLVEEFQKEIEKGALKGVKSLCEIDGARIDFGDGWALLRASNTSPYLITRFEATSLERAKELESMVFTLFDDIKARLKN >NZ_CP012212.1|WP_002855429.1|1349597_1350134_+|flagellar-basal-body-associated-protein-FliL MDEELENEETKKKKGGSLVIIIVILLFVLLLSIMGVIAWLISSSSSDESEVKEAPKEEAKADKPKVSAPTQRGSDFANIGPMYPLDPFTLNLLSDSGSRYVKCTIELEQNSELLKPELDKKVPVIRDIIIRTLTAKTFEEVSTQKGKERLKDELVGKINEILTDGFIKNVYFTDFVVS >NZ_CP012212.1|WP_002866684.1|1350134_1350482_+|holo-ACP-synthase MRVGCDIIAISRIEKIHSRHGKNFLDKFLSPKEQILIKNPATLAGLWAAKEAASKALGVGICELCSFFDIEISKDEKNAPKLKYSQKITKNFNITQTSLSISHDNGFAIAIVAIV >NZ_CP012212.1|WP_002880391.1|1350482_1350902_-|hypothetical-protein MKRVRVKIRANFRRRVKRTLKGSLKEKLAGTILLCAIVPLAVLGYLFIVIIGTFFNTARARQGVRALDHFVNASLFNGYAWESVSSHAWRERNRKKWARIVIKITDFFQKDHCKRANKREQPVVDFILSRNLDKQTIGK >NZ_CP012212.1|WP_002936391.1|1350898_1352260_-|cytochrome-P450 MSECPFFPKPYKNKASTLLTFLLKRRSWLDGLYERSYKMQTGYVKMPNFDLYVINDTKEVKRMMVDEVREFPKSAFLHELLSPLLGESIFTTNGEVWKKQRELLRPSFEMTRINKVFNLMSEAVADMMDRFSKYPNHAVIEVDEAMTFITADVIFRTIMSSKLDEEKGKKILNAFVTFQEQSVHTAMRRMFRFPKWLSYVLGDRKRAKAGDVIRQVLSDIIKPRYDMADNAEFEDILGSLLLVVDADTNKRFSFEEILDQVAMLFLAGHETTASSLTWTLYLLSLYPKEQEKAYEEITQVLQGGAIEISHLRQFKYLTNIFKESLRLYPPVGFFAREAKKDTQVRDKLIKKGSGVVIAPWLIHRHEEFWTNPHGFNPSRFEGEYKKDAYLPFGVGERICIGQGFAMQEAILILANILKTYKLELEEGFVPDVVGRLTVRSANGMRIKFSKREL >NZ_CP012212.1|WP_070298599.1|1352256_1353378_-|DUF829-domain-containing-protein MNREVFYIAGYDPKSYRFYYDLFKKNLKDYSRAFNIKADLSKIEKNEPFPFFQISCDEVQTKYHFLTWNDIVKKNWSENYKDALADCYSFFRIYTITGLFIKFGKESIYQLITGYYPFFYVLFSLLFSLVLAFGSFAFLQNYMHFSLAIIIGCFLGFLLNHFLFKLGKKLAVFWIARICAFCATWQDKKIGIMQERIKLFANVIVDKLKQNESKQDYELILVAHSVGTIVCIEVLEYILRQNLDLSLLRKLKILTLGECIPLVSYQKKADEFRKKLEFVSRFDLKWYDYTSIIDGACFPQVDFFRTSGVNAKFTPPFLSTKFHTLYEKHEYKKIKRDKNKAHFLYLYSISVKGDYDFFSFIIMPKFLEEKVKI >NZ_CP012212.1|WP_070298600.1|1353449_1354634_-|capsule-polysaccharide-modification-protein-KpsS MRFSTKIKKEFSGKNVLLLQGPVGNFFHHLAMKMKKNQTKVFKLNFNGGDFFFYPSGTRCKCDEKDLENFYRDFFQSKKIDAILMYNDCRIIHAKAIKVAKELGIEVWIFEEGYLRPYCITLEKDGVNANSSLPRDKNFYLSQDIFTQESIKEIPGGFKFMAFDAFLYWLFAFILAPFFNNKLHHRTLYPFEFLFWFRSLYRKYLYKITEKKLNEKIYNLEKKYFLAILQVYSDTQIKYHYKKSIEHFIEEIILSFANHARAKSYLVFKHHPMDRGYKNYSKLINDLTQKYHVEGRVLYVHDTHLPVLLRKALGCITINSTVGLSAILEGCPTKVCGNAFYDFEGLSYPKKLQFFWREAHAYKPNPILVCNFKKYLLQTNQFNGNFYKNFFLDK >NZ_CP012212.1|WP_115801404.1|1354630_1356694_-|capsular-polysaccharide-biosynthesis-protein MSTYSTSKKLIKNVNNFIDIKDYKNSLLTSDFICGWGRKKSGLKAMNLAKKHKAKFILLEDGFIRSLNLGVENSPSFSMVKDDIGIYYDGTMPSKLENLLNTYEFKDEEIKQAKKAIEFIKKYKISKYNNNLDIPDDYFQKDEKRVLIITQTANDASLEFGLAKDFKTVDMIKDAIKENPDSKIYIKTHPDVLSGKKQSDLDINSLPKECILITENFNPIALLEFFDKVYTKTSGMGFEALMQECECICYGMPFYAGWGLTKDKLECKRRMQKRSLEEVFYAAYILYSEYFNPYLNQKSNIFDTIQTLAKYKDIEKSNSNRLFMLGFTLWKRYFIKPFFNAKDNEIIFLNSLKSLAGYKLKENDKFFIWGKRIDYNALKTTLIKKAQDEDLSNFTPKISLTEDGFIRSISLGSDLTRPFSLIVDDKGLYIDPNKPSKLEELLQNEIFDKNMLNRAKNIIKTLLENRFSKYNGLKHEDLKINAKIGQKIILIPAQVEDDASMILGGFGLSTLDLLKEVRAKNQDAYIIFKPHPDVLSGNRVGLKDETLILEFCDEIVKDCSIDSAIKIADEIHTITSTSGFDALLRAKKVFTYGMPFYAGWGLTKDKHKCERRTRKLSLEELVAGALITYPRYINPKTKTLCEIEVCLDIMLNLQKDYFSKKHIKLAIDFKTFMLRQIRRFYEFLAKK >NZ_CP012212.1|WP_115801405.1|1357945_1361032_-|glycosyltransferase MMSIVRKMRKLVKNPRLFVKDAFENKFGVIGTYQYTIISAVYNVEKYLEDYFNSIINQRLDFKRNIFMILVDDGSTDDSAEIIKKYQKKYPKNIVYLYKENGGQASARNLGLKYMREHDYKTPWVTFTDPDDFLDRNYFYEVDKFLTQHQNEDICMIGVNTQMYFEKDKSIQNHPFFKFKFEKGNKTTLISELKMEIQTSTVTLFLFEKIQKNYLYFDERIDIYEDVKFMLSYCSICLFNEKEIFLKDAKYFIRKRLDGSSTMSSSFYNKKYYLDVLEYGVLKSILLYNHSYSINCALSLLIPQIKLLINAKEKINFLTIAEKDKYLQLVDSIFLKITSDDILSFNVNGNVWFTKVGILNCFKKEKPPFQIAYIEDYDPYQEQILLTYYTGDAKDIESIKIDGQEVYADYEKIVQYDFLDRVFCYEKRFWVRISNEAKDSLEIFINGTKAMIGWQQYSHPIYKIRQCFVKMPNRWLFIDRDIEADDNAEHLYRYIMQNHPEQEMVFALKRESSDWNRLEKEGFNLVECYSEDFFKLAKSVRYFVTSHTPSSFGVSLQRGQYFLFLGHGVDAVDISSYFNMLKINLRFSSCFREYEALVQDYGKYKLTKKEVVLTGQPRHDSLLLKNKEVAKTILIMPTWRFYLAKDRVKKTFDRELKDDFFQSEYFVKWNSFLNNPILKQIVDKFAYKVIFVPHFNMKMMIDKCNFPKYIQIKYRNNNESFQNVFFNSALMITDYTSAAFEMGYLEKPVIYFQFDKEYFFSHHSYSQGWFNYDKDGFGPVVKTEHELLECLEKLLQGNCVPNPKHKKNMENLFCFRDYHCCRRTYEQILELGNYRSKVSFEYVKKKAFEAQNFGLYCLAYERWKYIINQWGELLDEKCYYHFLYCARKSNHSDHSILIVKQNNVLEKLIKKNMIMMEVIKNYLQIDDFSSILKILELFKIKDEYVVDFIRLKLKIYFYNSDFKNFIAMYYILLNDYGINSNEIFLELLMLETALSRSMHSNNNGKQNLQTVLKLEVLKIFKIGIDDEK >NZ_CP012212.1|WP_115801406.1|1361057_1363595_-|glycosyltransferase MIFNYKKIRKLKNNPRLFFKDAVEKNMFKLSCIYKKLFPKKYNSFAQYTIISAVYNVEKYLEDYFNSIINQRLDFKRNIFMILVDDGSTDDSAEIIKKYQKKYPKNIVYLYKENGGQASARNLGLKYMREHDYKTPWVTFTDPDDFLDRNYFYEVDKFLTQHQNEDICMIGCNIIFYYENKKLYKDNHPLNFKFNKGKQIISNFELNNFIQLSLPTAFIKIGLLGKLLFDENLKPNFEDAKLINQYLLNNIYSKSVFLPDVKYYYRKREDGSSTLDTSLNKDYFLLTTKLGTLNLLKENNIINIQNVCLYHLIWQIKSLINSPEKVLILNKNEKQRYLELLDQNFSYIDNDTIMEFNLADCRFFHKVGILNCFKKQKPPFQIVYIEDYNPCEEQILITYYTGDDKDIESIVVDGKIAYVDYEKIVKYDFLDRVFCYQKRLWVSISKSAEDKLEIFINNKLSMIGKYNEYSLNIKNIKKEFQKRLSESNIWILMDKDISADDNAEHLYRYIMQNHPEQEIVFALRRESSDWNRLEKEGFNLVEFGCFKFERIVKKASKIISSHIDTYLTKYITLRQQFIFLQHGVILNDLSSWLNSKKIDFFITSTKDEFNSMVNNYNRYKFSKKEVVLTGLSRHDALLRNNKTNTKQILIMPTWRKYLVGEVILNSGARGKNSKFMQSEYFQRYNSLLKNKTLKKLCEEYGYTLVFNPHPNIITYLEDFNIPSYIKMASQNESLQKLFCESSLMITDYSSVAFEMAYLKKPVIYYQFDKDMFFKQQWQKGYFDYEKNGFGPIVEDEENLLKELENLLQSDCKPFGAHKDNINSTFIFRDGKCCKRIYKVIKEKDV |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012212_1 | 1.1|1347747|34|NZ_CP012212|CRISPRCasFinder | 1347747-1347780 | 34 | MH752385 | Bacillus phage Ray17, complete genome | 8509-8542 | 10 | 0.706 |
1. spacer 1.1|1347747|34|NZ_CP012212|CRISPRCasFinder matches to MH752385 (Bacillus phage Ray17, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttttttagctttatactcagccttactcatataa CRISPR spacer cttacaagctttatactcagccttattgatcgtt Protospacer .** . *******************.* **
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
893502 : 900464
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012212|893502:900464|DBSCAN-SWA AATGGCTTTACCTTCAATGGGACATACCCCACCCGCAACAGAAAATGTTAAGTTAAAACAATCAATATATGAAACGATTATTAAAATTGGAGCTACTGAAACACCAATTCTAAATAAAATAGGCACTTCAAAGGTTACAAATCCTTTAACTCATAGTTGGATTACTGATACTTTTGAAGAACCAAAAAAGAATGCAAATTTAGAGTTAAGTAAATTTGTAGGTGAGACAAAAAACACAGCTCAAAAAACTACAAATGCTACTCAAATATTCATTACCGAAGCCATGGTATCAAAAGCTTTATTAAAAGCAAATCAATATGGTGGCAATGAAATGGAGTATCAAATAGGCAAAAAAACCAAAGAACATAAAATGGATATGGAATATGCTTTATTTGGTCTAGGCAGAGATAGTGATGTAAAAAAATCAGTTTTCAAAGATTTTGTTCAAGCACAAGAAGCAACAAGTGGAGAAATGGCAGGAATTTTTCACTATATAGCCAAAGGAAAAGATAGCTTTGCTGATGGAAAGCGTGGAAATGTATTAGCTTTTGATGAAGCAGGAGATTGGAGTGGAGCTGCAACAGAACTTACAGAAGATAAACTTAATCAAATTTTGCAAACCATTTGGAATAGCGGAGTTACGCCTAAAGATGTCTTTTTAGGAGCTGACTTAAAAGGAGCTATCAATAAATTTGCTACAAGAATTTTAGGTAATGAAACAAAACTAGTAGGACAAGTAGTGAGCCTTGAAACAGATTTTGGAACGGTAAATTTCCATATGCATAGATTATTAAGCCCTAAATATGGTTTGGGTGATGTTTTAATTGCTGGGGATTTTGAGTACATGAAACATGGGCTTTATATTCCTACTATGATTGAAGATGTTCCAACTGATATTACTGCAAAAGCAAAAAGATTTTATACGCAAAGCACTTTAGAAGTAAGAAATGCTGATGCTTTTGCTATAGGAGTGGGATTAACTAGTACAAATAATGCAAAGGCTAAAGCGGTTTTAAAAGCAGCAAAAGGTGTGTAATGCTTTGTATTATGGCTAAAAAACTCGTTATCGCTAAAGTTAAAAATTCTTACAAAATGATAGAAGATGATGAAGTTTTGAAAGCCTATTTTATGGAAGCATTTTATTATATTTTATCAAAATGTGTTCCTAGCGTTCTTTTAAAAAATGTAGAGCAAGGTGAAAAAGTTTTTAGGCAAGTTAGAAATAATCATTTTTTGATTATTCCTGATGAGCCTGATTTTGACAATGAAAAAGAACATTTAATGATAGATGAAACACTTAGTTTTGCTGTGATTAATTATGTTTGTTATTTGATTACAAGATGCGAAGAAAAAGACTTTCTTGCATTATGTGACAAGATAATTTACGAGTATATAGCTAATGATGGCAAGGAGCTTGATGATGAAAGAACATGGTTGTAATTGTAATTTCACAAAAAAATTTAATAGAGCTTTGAGTTATAAAGACTATATACAAAGTATAAATAGTGCTGATTTTATAGCTTATTTAGATGATAAAAAATGGCTTTTAGCTATGGATGATCTGCTTTTCTTTTGTGAAAAGAGAATTAAAGACAGTGATTATTACGAAGGTTAAAAATGGGAACAAGTTTAAACGAGTTAAAAACAGGTAGAGAAAAACTTGAAATTATAAATCAAGTTTTAGCAAGAATTTCAGATGTTGCTACTGCTTTGGATAATACTAGAATAGAAGAAATTATAGGCTTAAAAGAACAAGTTAATAACTTTTATACTCAAACTTTAGAGCTTAAAAATTTAGTTATAGAAAATAGCGAACTTACGCAAAGCAATGCTGATTTTGTTAAAAACAAAAAAGATGAAATAGAAAAAATAAGCAATAAAATAAACGATACTTTAAATAATATAGAGCATATCTATAATAACATTATAGAGTCGGAAAAAAACATAAATAATGGTGTTAATATTGTTAAAGAAAAATATCCTGAACTTAACGCGTTTAATAAAAATTTTGAAATCATAAAAATAAAACTTGAAGAATATTATGATATAGCTGTTGATTTTAATGCAGGACTTGAAAAAGTAGAAGAAAATAAAAATCTTACTAAATCATATTTAGATTTATCAATAGAGCTTAAAGAGCAAATTTTACAAGAATTAGAACACGCTCAAAGTATTAAAGATGATTTGCATTCTAATATAGAGCTTGTAAATAAGCTTGTTTCAAATATTATAGCAACAAAGAATGAGATTATATCTATAACCAATGATTTTAAAAATGTAAAATCAGAAGTACAAGATATAGTTAATGATGCTGAAGCAACTATAAAACTTAAGATAAATACTATACTTTTTGAAAATCAAAGATTAAATCAAAATATGATTAATCTACTAAAGCGTTGCGAAAAATTAGAAGATGAAATAGTAGGAAAATATGAAGATGTCTTAGAAGCTATTGAAATTGTTAATAAAGCTGATGCAATGATAAACGATTTAAATAATGCAATTTTAGCTTCTAAAGAATTTGCAAATGATTTAAAAAGTTATACACAGATTATTAAAGATTTTAAAATTCAAATTGATAATTTAAAGCTTGATTTACAAAGTTATAATGATAGATTAAAAGGTGAGCTTGATTTAAAAGCCAATGAAATAGATATTAGTATTCAAGCAAAACTTAGCGATATAAATCTTTTAAAAGAGCAAATGCAAACTCTTTATGAAAATACTAAAAATACAACAGATACAGCTTTGGCTAATTTTATAGAAAGAGCAAAAATAGCTAATGAAGATTTAGGAAGATTAACAGAAGTAGCAAGAACTGAACTTGCTAACGATAAAACAGCTATTGAAAGCTATTTATTAGAGCTTAAAAAAAGTATTATTGATGAAATGAAGAAAGTATCAAGCGATATTACGGATGAAACAAGTGGAATACTAGCTCAAAAAAATCAAATAGAACTCATCATCGCACAGGGAAAATCAGCTTTAGATACTTTAATAAATGAGTTTAATTCAAATTATCAAAATAAACTTAATGAATTTAATTCTAATGCTAATGAAAAATTAAGAGCAATTAATTCTCTTAGCGAAGAAAGTATAGCAAACATACAAAGTAAAACAGATGAAAATATAGGTAAGTTAAATACTGCTAGCGAAGAAAAACTAGCTAAATTTGATGAAATTATAAAAGACAATTTAGGTGGAATTTATTCTCACATTTTTTCAATAGAAAATGTCTTACTTGATAAAAAAATAATTAAATTAAGTTATAAGGAGTAAATAATGGCAGACTTAGAACAAGTTGCAAGTGATTTAAATTCAGCATCACAAAGCTTACAAGAGTTAAGAGAAAAGTACGATGGTGCTTTGGATTTATTAGATAATAAAAACACAGAAATAACAGCTGCATTAGAGAGTGCAAAATCTAATGCCTTGCAAGAAGTGCAAACAGCAAGCAATACAGCTACAAGTCAAATTTCACAATTAAAAGATACATCGTTAAACGCTGTTAATGAAGCTAAAAATACAGCTATTGAAGAAGTTAATAATGCGGTTTCTGGCATAGATACAAGCAAGGAAGAAGCTTTATTAGCAATAGAACAAGCTAAAGCGGCACAAGAAGAAAAAATAACAGACTTAGAACAAGCCAAAGAAAATATAATAACAGAGCTTAGCGAAAAAGCCAAGATCTTAACACAAAAATTAGAATGGACTGTCGGAGAGGGAGGTAAATTTACAAATCTAAATGATGCTCTTAGCGAAGCACTTAAATATAATAAATCTAATATAATCACTATAAAATTAAAAAGTGGTTTTATTTTTAATGAAAAAATAGTTTTTAGTAATGCTAATTTTAATAATGTGATAATAAGTAGTGAGGATGACATTGTTAAGGTTAATCCAAATAATGCAGTTTTTAGCGACACATCGGTTAACTATTTATTTTTATCAAACTATGGTATTACTCCTATAATAGATATTAAAGTAGATTTAAATCCTTTGGAAAATTCAAATAGTACTAAAAAAATAGTATTCTTAGGATTATATCAAAATAGTAGAGGTTTTATAACATCAAATAAAGGCTGTATGAATGCTGTATGGGATGCAATAATGGTTGAACAAGCTTCTACACTTCTTGCAGATGCTTGCGTTGTAGAAAATTCAGGCTACGATGGCTTATTTTGCAATCAAGGTTCTATAGTTAGTGTTAATAAAGCAACTATTAAAGGTAGTGCTAGATATGGTATATTAACTAGATTTGGTGGCTATGTTAGTGCTAATAATGCTAAGCTAATAGACCAAGTTGCTAGTAGCACATATCCTTTATCAACAATGCTGCAATGTGAAAGTGGTATTATACAAGCCAAAGGACTTATTACAACAGGTTCTACTGCAAAATTATCAAATATCACACCTAATCAAATTACCAATAGCGGTATTATTTATAAATAAGGAGTTTATATGTTAGTAATAAAAAATAATGGTTCTATTTTAGAAAATATAAATATTGAAACTATAAAAGATATGATAGAAAAAAATCATATTTTAGCTATTGTTAATAGAGCTTTAAGTTATAAAGAAAACAGGGTTGAAATTGAAGGTAGTGATGATTATGTAGAAAATATATATCAAGATGATATTACACCTGAAGAAATACAAGAAGGAGCACAAGTAGTAAAAGGATACTGCTTAGCTATTAACGAATTAGAATTGCTTAAGCAATATCTACCATTAGTTTTAAGCGGTGCTGAGCTTTTAACCGAAATGAAAGCGATTAAACTAATTGAAATTAACAAAGATTATGAAAGTGCTATTTTAAAAGTTCAAAAAGATTATATCCCACAATCTGAAATGTTAAGCTTTGAAACACAGGAAAGAGAAAGCCTTGCTTACAAAAATTCAAACTATCAAGACACAAGCTTATGTCCATTTATGCAAGCAATAGCAACTGCAAGGGGTATGGATTTAAGAACCCTTTGTGATAAAGCAATAGAAAAAGCAACTCTTTACAGACAAGCAAGTGGAGCTTTAATAGGAAAAAGACAAGGGTTACAGGATAGAGTTGAATTAGTTCAAAGCTTAGAAGAATTAAATTTAATCACTTGAAAGAATGAAGAATGAGTACTGAAAATATAATAAAAGAAGGTGCCATACTTGGCTCTTTAAGCGGATCAGCATTGCTAGGATTAATGGTTTTTGTCTTAGCTGGTATTGCATGGCACCTATATCGAACTTTACACAAAGAAGCTGGGGAAAGAGCAAAAGAACTTATAAGTGAAACCAAAAATACTAATGTTCTTATTAGAGAACAAATTGCAGTATCTAAAGCAAGCAATGATAGTTTAATGAAGTTTATACAAACACATTGTTCTAAAACCAATGACAAGCTCGAAGCCATAGAAACAGATCTTATGAGAATGGATGAAAGGCTTGTTAGGCTTACTCAAATAAGAAATGATGAATTAAGAATGATTTACAAAAGAAAGGAAAACGAATGAAAATTGCATTTTATAAAGTTAAAGAAAATGACAAATCTACTTTTCTTGATAAAGCAATAGCTTTTTTTACTTCATCTTGGAAAGAAAGATTAAATGGAGATTTTTTAAAATCCTATTCTCACTGTGAAATAATCTTAGACAATTTAATGATTAGCTCAAGTCCTAGAGATAAAGGAGTAAGAATAAAAGAATTTAAAGACACTGGCAGATGGGATTTTATAGAAATTAATAATGCAAATGAAGCAAAAATAAAAGAATTTCTTTACTCTCAAATAGGGAAAAAATATGATTTTTTAGGAATTCTAGGATTTTTCACATTTACAAAGGATAGTGAAAATAAATGGTTTTGCTCTGAAATCATAGTTAGGGCTTTACAAATAGGTGGTTTGGTTAAGCTAGGAGATATGAATGCAGGAAGCTCAAATCCAAATAAATTGTATAAAAAATTAAAGGAATTATAATGAAAGTAACAATTAATAGAAGATATACTAGCAAAACTTGCGTTATTGGTAAATTTAAGGTTTTAAGTGATGATGATAAAATTCTTTTTGAATGCTTTTCTTTGGAAGAGGATAAAGAAGGAGTTGAAAGAAACAAGGATTTGAGAATACCAGAAGGCATTTACGATTTAAAAAGGCATTCTCCTTCAAGATTTGAAAACACTTTAAGAAGTATCACAAAAAAAGATGATGATACAATGATAAATGTTTATAATGATGAAGTTCCAGCAAGTCGTGCAATTTTAATACACTGGGGAAACACTGACAAAGACACACAAGGTTGTATCTTGCTGGGGCTTACTAAAGATAATAATAATGAAAGTGTCGGTCAAAGCAGACAAGCTTGTAAAGAATTTTATGATTTGGTGTATGGTAAAAATCTTGAAGACATTAAATTAGAAATAACAAATGAGTTAGCATGAGTTCTATATTTTCATATATCCTAGGAGATAAAAAACTTTACATTGCTTTAGTACTTATGACAATTTTAGCAGGATATTTTTATCTAAGACTTGATAGCACTCAAGCAAAATTAGAAAAAAGTCGAAGTGATTTAGCTTTGGCTTTAAAAGTCAATGAAAATAATCAAGAAAAATTAAAAGAATTAAATCAAATTCATAATGCTGAATTAAATGCTTTAAATGAAGCAAATAAGGAAAAAAATCAAGTACAAGAAAGGGTTCAATATGTTAAAAAGTATATTTACACTAGCAATGAAAATAATATTACTAAGCTTTTTAACGATGTCGTTGATAGGTTGTGGGATGCAAACTCAACAAGTAGTAACCAAAATAGAAATTCAAAAAGTTAGAATTCCGCAAGAATTACTAACACTAAGCCCACTTGAAAAGCCAATAGCAAAAAATGAACTTGATATTTTAAATGCTTATTCTATGCTTTTTTACAAATATAAACAGTGTGAAATACAAATCAATAAAATAAAGGAGTTAAATAATGGCAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012212|893502:900464|893502_894537_+|WP_070298924.1|DBSCAN-SWA MALPSMGHTPPATENVKLKQSIYETIIKIGATETPILNKIGTSKVTNPLTHSWITDTFEEPKKNANLELSKFVGETKNTAQKTTNATQIFITEAMVSKALLKANQYGGNEMEYQIGKKTKEHKMDMEYALFGLGRDSDVKKSVFKDFVQAQEATSGEMAGIFHYIAKGKDSFADGKRGNVLAFDEAGDWSGAATELTEDKLNQILQTIWNSGVTPKDVFLGADLKGAINKFATRILGNETKLVGQVVSLETDFGTVNFHMHRLLSPKYGLGDVLIAGDFEYMKHGLYIPTMIEDVPTDITAKAKRFYTQSTLEVRNADAFAIGVGLTSTNNAKAKAVLKAAKGV >NZ_CP012212|893502:900464|897962_898607_+|WP_070298927.1|DBSCAN-SWA MLVIKNNGSILENINIETIKDMIEKNHILAIVNRALSYKENRVEIEGSDDYVENIYQDDITPEEIQEGAQVVKGYCLAINELELLKQYLPLVLSGAELLTEMKAIKLIEINKDYESAILKVQKDYIPQSEMLSFETQERESLAYKNSNYQDTSLCPFMQAIATARGMDLRTLCDKAIEKATLYRQASGALIGKRQGLQDRVELVQSLEELNLIT >NZ_CP012212|893502:900464|895118_896780_+|WP_070298925.1|DBSCAN-SWA MGTSLNELKTGREKLEIINQVLARISDVATALDNTRIEEIIGLKEQVNNFYTQTLELKNLVIENSELTQSNADFVKNKKDEIEKISNKINDTLNNIEHIYNNIIESEKNINNGVNIVKEKYPELNAFNKNFEIIKIKLEEYYDIAVDFNAGLEKVEENKNLTKSYLDLSIELKEQILQELEHAQSIKDDLHSNIELVNKLVSNIIATKNEIISITNDFKNVKSEVQDIVNDAEATIKLKINTILFENQRLNQNMINLLKRCEKLEDEIVGKYEDVLEAIEIVNKADAMINDLNNAILASKEFANDLKSYTQIIKDFKIQIDNLKLDLQSYNDRLKGELDLKANEIDISIQAKLSDINLLKEQMQTLYENTKNTTDTALANFIERAKIANEDLGRLTEVARTELANDKTAIESYLLELKKSIIDEMKKVSSDITDETSGILAQKNQIELIIAQGKSALDTLINEFNSNYQNKLNEFNSNANEKLRAINSLSEESIANIQSKTDENIGKLNTASEEKLAKFDEIIKDNLGGIYSHIFSIENVLLDKKIIKLSYKE >NZ_CP012212|893502:900464|896783_897953_+|WP_070298926.1|DBSCAN-SWA MADLEQVASDLNSASQSLQELREKYDGALDLLDNKNTEITAALESAKSNALQEVQTASNTATSQISQLKDTSLNAVNEAKNTAIEEVNNAVSGIDTSKEEALLAIEQAKAAQEEKITDLEQAKENIITELSEKAKILTQKLEWTVGEGGKFTNLNDALSEALKYNKSNIITIKLKSGFIFNEKIVFSNANFNNVIISSEDDIVKVNPNNAVFSDTSVNYLFLSNYGITPIIDIKVDLNPLENSNSTKKIVFLGLYQNSRGFITSNKGCMNAVWDAIMVEQASTLLADACVVENSGYDGLFCNQGSIVSVNKATIKGSARYGILTRFGGYVSANNAKLIDQVASSTYPLSTMLQCESGIIQAKGLITTGSTAKLSNITPNQITNSGIIYK >NZ_CP012212|893502:900464|899459_899921_+|WP_115801367.1|DBSCAN-SWA MKVTINRRYTSKTCVIGKFKVLSDDDKILFECFSLEEDKEGVERNKDLRIPEGIYDLKRHSPSRFENTLRSITKKDDDTMINVYNDEVPASRAILIHWGNTDKDTQGCILLGLTKDNNNESVGQSRQACKEFYDLVYGKNLEDIKLEITNELA >NZ_CP012212|893502:900464|900263_900464_+|WP_115801368.1|DBSCAN-SWA MQTQQVVTKIEIQKVRIPQELLTLSPLEKPIAKNELDILNAYSMLFYKYKQCEIQINKIKELNNGK >NZ_CP012212|893502:900464|898995_899460_+|WP_070298929.1|DBSCAN-SWA MKIAFYKVKENDKSTFLDKAIAFFTSSWKERLNGDFLKSYSHCEIILDNLMISSSPRDKGVRIKEFKDTGRWDFIEINNANEAKIKEFLYSQIGKKYDFLGILGFFTFTKDSENKWFCSEIIVRALQIGGLVKLGDMNAGSSNPNKLYKKLKEL >NZ_CP012212|893502:900464|899926_900310_+|WP_115801428.1|DBSCAN-SWA MFSYILGDKKLYIALVLMTILAGYFYLRLDSTQAKLEKSRSDLALALKVNENNQEKLKELNQIHNAELNALNEANKEKNQVQERVQYVKKYIYTSNENNITKLFNDVVDRLWDANSTSSNQNRNSKS >NZ_CP012212|893502:900464|898618_898999_+|WP_070298928.1|DBSCAN-SWA MSTENIIKEGAILGSLSGSALLGLMVFVLAGIAWHLYRTLHKEAGERAKELISETKNTNVLIREQIAVSKASNDSLMKFIQTHCSKTNDKLEAIETDLMRMDERLVRLTQIRNDELRMIYKRKENE >NZ_CP012212|893502:900464|894536_894941_+|WP_070252223.1|DBSCAN-SWA MLCIMAKKLVIAKVKNSYKMIEDDEVLKAYFMEAFYYILSKCVPSVLLKNVEQGEKVFRQVRNNHFLIIPDEPDFDNEKEHLMIDETLSFAVINYVCYLITRCEEKDFLALCDKIIYEYIANDGKELDDERTWL >NZ_CP012212|893502:900464|894921_895116_+|WP_002861676.1|DBSCAN-SWA MKEHGCNCNFTKKFNRALSYKDYIQSINSADFIAYLDDKKWLLAMDDLLFFCEKRIKDSDYYEG |
11 | Campylobacter_phage(71.43%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1383517 : 1397687
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012212|1383517:1397687|DBSCAN-SWA 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17 | Synechococcus_phage(41.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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