Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012217 | Campylobacter jejuni strain CJ071CC464 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,cas14j,cas2,cas1,csa3 | 0 | 1 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012217_1 | 1664925-1665030 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012217_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012217_1
>1.1|1664965|26|NZ_CP012217|CRISPRCasFinder AATGAAAAAAAAGTTTAAAGATAGCT |
cas2,cas1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012217_1
The CRISPR arrays of NZ_CP012217_1 >merge|NZ_CP012217|1|1664925-1665030|CRISPRCasFinder TTTATTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATAAATGAAAAAAAAGTTTAAAGATAGCTTTAGTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATA >NZ_CP012217|1|1|1664925-1665030|CRISPRCasFinder TTTATTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATA AATGAAAAAAAAGTTTAAAGATAGCT TTAGTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATA
>NZ_CP012217.1|WP_002887719.1|1663617_1664808_+|molybdopterin-molybdotransferase-MoeA MLMSYEESLKILHSHIKTYEKIEKIALTECLGRILAQDIKAPKNQPEFPTSAMDGYAIKFEDQDKPLKILGITPAGTMPQFSVQNGTCVKTFTGSLMSEGSDTLVPVENICIENDTLFIEKKVPQAFAVRAVGENYKKDEILLKKGTKLNYSEIALLAELGFFHISVFIKPIVGVLSSGSEIKDLGEALENPAQIRSSNHIAIANLAKNLNCDTRVFPLLKDDEKATFSTLESALQSCDILVTTGGVSMGDFDFLKKAIKEYEIIIDKADIKPGRHIKIAKANEKFIIALPGFPYSAMVMFNLYAREILNSWLLQPKDYICKAFLQGSYKKKTPYLEFVACNIKFENGRILANLEGKKEGSSAIINNLNNKAALMVAPKECEILENESLVDIIFMP >NZ_CP012217.1|WP_002934784.1|1663167_1663614_+|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaE MKHFTLYQGSLDISKIYSQWYEFSKDKNCGALLTFCGIVREEGGIEALSFDIYEPLLKKWFDEWQKRVDFDGISLLFAHSIGDVAIHESSYFAGILSKQRKLGLKLLNEFVEDFKASAPIWKYDVINKERIYAKERSTKLCGAGLLKG >NZ_CP012217.1|WP_002779488.1|1662945_1663167_+|MoaD/ThiS-family-protein MVKVEFLGPINKENLELEVKNLKELKEILQKDESLKEWLELCAVSLNDEIIFDENTKLKDGDKIALLPPVCGG >NZ_CP012217.1|WP_032584571.1|1661402_1662944_+|multicopper-oxidase-CueO MNRRNFLKFNALTLASMGVAYANPMHDMHSMHKNHSINYDLDTSFINFAPKNLKLLDPKQFPQGEILKALPLLKNESKEKNIFRATLEIKENHIELIKGKKTLFYTYNGLVPAPKIEVFEGDKLEILVKNKLKEATTIHWHGVPVPPDQDGSPHDPILAGEERIYRFKIPQDSAGTYWYHPHPHYTASKQVFMGLAGAFVIKAKKDALSHLKERDLMISDLRLDENAQIPNNNLNDWLNGREGEFVLINGQFKPQIKLATNERIRIYNATAARYLNLRIQGAKFILVGTDGGLIEKTIYKEELFLSPASRAEVLIDAPKDGNFKLESAYYDRDKMMVKEEPNTLFLANISLKKENVELPKNLKIFKPSEEPKEFKEIIMSEDHMQMHGMMGKSESELKIALASMFLINGKSYDLKRIDLSSKLGVVEDWIVINKSHMDHPFHIHGTQFELISSKLNGKVQKAEFRAFRDTINVRPNEELRLRMKQDFKGLRMYHCHILEHEDLGMMGNLEVKE >NZ_CP012217.1|WP_002858888.1|1660130_1661279_-|carboxynorspermidine-decarboxylase MFYEKIQTPAYILEEDKLRKNCELLASVGEKSGAKVLLALKGFAFSGAMKIVGEYLKGCTCSGLWEAKFAKEYMDKEIHTYSPAFKEDEIGEIASLSHHIVFNSLAQFHKFQAKTQKNSLGLRCNVEFSLAPKELYNPCGRYSRLGIRAKDFENVDLNAIEGLHFHALCEESADALEAVLKAFEEKFGKWIGQMKWVNFGGGHHITKKGYDVEKLIALCKNFSDKYGVQVYLEPGEAVGWQTGNLVASVVDIIENEKQIAILDTSSEAHMPDTIIMPYTSEVLNARILATRENEKISDLKESEFSYLLTGNTCLAGDVMGEYAFDKKLKIGDKIVFLDQIHYTIVKNTTFNGIRLPNLMLLDRKNELQMIREFSYKDYSLRN >NZ_CP012217.1|WP_002851502.1|1659113_1659827_-|hypothetical-protein MGALMDLEKLRLARSLYYQCLGELFVFSFSEERLSKLQEYLKTMQECLFDENLKSNFDILLKHLDDENSIQAFFKEYDLLFLSLKNSIPTTFSYIEEGFENSNPLLCVRQILVKSKIRRNEKFFKESEDSVGFCLLLMSEFLRQNEDDLAKELFEKVINKSIDEFLGDVFMNKNANLYKEIASIASAFMEFERLCFEVEKPAKINSKKVQNDLSRSEFLRREANKQRRTREKSQGIS >NZ_CP012217.1|WP_002803269.1|1658947_1659139_-|twin-arginine-translocation-signal-domain-containing-protein MKNRREFLKKSAFALGAAGVLGSTTLALAKDEERKDLVKGKSKKKEVLFQRSANWEKYYIKAE >NZ_CP012217.1|WP_079254195.1|1656143_1658948_-|formate-dehydrogenase-subunit-alpha MSSVGENIKLTRRSFLKMAALSSLATPLLARSETLREASADELKEAYEGSKKVKTVCTACSVGCGIIAEVQNGVWVRQEIAQDHPVSSGGHCCKGSDMIDMVRSHVRLKYPMKKENGEWKRISYEQALSEIGEKLAAYRKENPESVMFLGSAKLNNEQAYYIRKFAAFFGTNNVDHQARIUHSATVAGVANTFGYGAMTNHLGDIQRSKCIIIIGANPAVNHPVGFRHFLKAKEKGAKLIVVDPRFTKSAAKADIYARIRPGTDIAFMYGMLKIIFDEGLEDTKYLDERVFGIDKIREEAAKWTAEEVENVTGISKELLVQITHEVAKNKPTTLIWAMGLTQHTVGTSNTRLAPIVQMVLGNIGKFGGGVNILRGHDNVQGASDMACLSENLPGYYPLNEATWRYYAKIWGVDYEWLLGNFVSKDWMHKTGLSLARWWAAALNGKDGNDAIDNAGTPLKALVVMGNGITSTAQQVKVKEGLEALELLVLADPFVNEAGIIAERKDGIYLLPAATQFETSGSVTATNRSGQWRFKVVDPLYESMEDQEILFELAKKLGFYEDFTKTLRDEKGEIVWPENATREIAKAVRSIGLNGWSPERLKKHTLYWDKFDEVTLEGKDEVAGEYYGLPWPCWSDKHPGSPVLYNTDIEVAKGGMGFRNNFGLEYEGESLLAKNAPLNSPIDTGYPQITKDNIEKVLGITLSAQEKEKMGSTWSYDDSNIIATKCIEKGIVPYGNAKARAVVWTFKDKIPLHREPLHSPRNDLVQKYPSFEDQKALYRVDTKFVSVQQAKDYSKEFPLNLVTARLVNLNGAGMENRASMYLTRLTPEMFCEINPELAKEQDIKAGDMIWVHSPEGTKIHVRVKVNPGVAKDMIFLPFHFTGVMQGVDLTHNFPEGTKPYASGESANTVTNYGYDIMCQIPETKGGLCRISKDGK >NZ_CP012217.1|WP_002851264.1|1655505_1656147_-|4Fe-4S-dicluster-domain-containing-protein MSKVNFANLEKERLKFFCDNERCIDCNGCAVACDEAHELPIHIRRRRVITLNEGIQGKEVSTSISCMHCDDAPCSIVCPVDCFYIRADGIVLHDKEICIGCGYCLYACPFGAPQFPKDSVFGNKGIMDKCTMCAGGPEATNSEKERELYGQNRIAEGKVPVCAAMCSTKALLVGESSKIEEIYHNRLMNRNYGIPNPSESLEWKIAYTGKERL >NZ_CP012217.1|WP_002867229.1|1654576_1655509_-|formate-dehydrogenase-subunit-gamma MRKVFVTLLLSVVSLFAYGSERMGQDTQIWDFHRITNIPNYDTFGKLWTTLQGEYIATIALIAVIAVLSAFALHYMVIGPKQFSHDGKKIYAFTLFERLFHFIAAISWVILVPTGFVMMFGATFGGGLFVRVCKNLHAFATVLFIISIIPMFLWWIKRMLPASYDIRWMMIVGGYLSKVKRPVPAGKFNFGQKSWYYIAVFGGFLMIITGGFMYFLDFNSTAIQGLFGLTQIELLRISAIVHNFLGIVCAVFFGVHIYMAVFAIKGSIHSMISGYKEEEEVYILHSYWYKELSNKKQIEPSFSYDPNVKI >NZ_CP012217.1|WP_002797817.1|1665173_1665605_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MIEDKFMRVLLMFDVPTKSKKEQKLASKFRNNLIKLGYFMLQFSVYMRICKGLSSAKSSIENVKKILPPYGNVRALIITEKQFDKMELLLGGIVFNEKVNNETNLTLFDIDSHGEFKYKNSNNEEIQINKKQEKYHQQNLFEF >NZ_CP012217.1|WP_032584575.1|1665597_1666488_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MSYDEAFKTLLISSNAKLNLELNHLVIKQDENIAKLFLKDINIIVLESLQASLSSALFNAFARHKIILLTCDETHSINGIFTPFLGHFQSAKIAKEQINVSAQKKAILWQKIIKNKILNQAFVLKKHNKIEQSNELINLAKKVSLNDSKNIEAVAAALYFKTLFGTSFSRDELCFKNSALNYGYAIIRACIIRAVCISGLLPWLGIKHDNIYNSFALCDDLIEVFRASVDDCVLKLKGESEFLSKDDKRALIGNLQSKINFDGQNYPLNRAINHYVANFKNALLYEDELKIVKFDD >NZ_CP012217.1|WP_032584578.1|1669981_1670194_+|hypothetical-protein MALKIVISSYAELLLLLLACMYPVLISLKIRPITTVCALSLIALDYDPKDGNSINMADMVGQSDNVVRLF >NZ_CP012217.1|WP_052775826.1|1670211_1670535_+|hypothetical-protein MITYVVIIAILIPFYFAWIDKRDKEKGVLNDEVEIPQIIDPKCPTFYTLFPWLPVIFLFIAYFFTIKLDVVIANFVRISLVFLVEFARHRNVRKLGEDMMVILKGYG >NZ_CP012217.1|WP_032584582.1|1670527_1670749_+|hypothetical-protein MAEIFISVVSIIIAAGVCAKGIKALGGVNILANAVSNLGTGNFAWFGILLSIAILSFLVYFANAILNRICIKI >NZ_CP012217.1|WP_032584584.1|1671192_1672416_-|hypothetical-protein MHNLNEALFQKKIKEIRLKAIASIICGFLGIIPYLGVLFVLASWILFFIVLYDLKIYGGAKNLFKNFLISVGIGFFGILVNTSILFAMLKPRTGIFGGLYFNQDNIFMAIAIFLVLHFAILALIFPFLKAFYYEIARTTKQKYFTYAFNTFYLGLLTLIIGIGLVFLLASLVFWILAWVKFKEFDEQELSNLEERLAKAQKKVFDFDLKWIKITMASFIILNLLVLTFSFILEVISFEDFRFYYTKKTLFYTAIILALLSVFLFCKKIKNYKLFIYFFIWQGLSVFGSHLLFIPDFMVDQPPEIIYGSLNIILSLCYIIFAFLFFKILIQITKEKLFYLIFAFYVCIKILIILIFFIFMMVDNYYIFTKSPIKMLIDNYKLLFQVVYFVSFLIVWLMLKGQKNVKIC >NZ_CP012217.1|WP_002860687.1|1672626_1673616_-|phosphoribosylformylglycinamidine-cyclo-ligase MKISYEDAGVSIDNGNAFVEAIKPLVKETFNDNVVGGIGSFAGAFRMPSGFKKPVILGATDGVGTKLRLAIDAKKYDTIGQDLVAMCVNDLICNFATPLFFLDYYATAKLEVEVAKAVVSGIAKGCKMANCALIGGETAEMPGMYAKDDFDLAGFAVGMAEEDEIDRSKFVKNGDILLALPSSGLHSNGYSLARKVLFESLKLKFDDKIGDKNLIDILLEPTRIYVRDFLTLKPYISALAHITGGGLVENLPRVLPRGMGATIRKHHLKTPEIFYTIGQAVEESEMYRSFNMGVGLVMVVDPSNVSKVLENSDAFIIGEICINEGIVLE >NZ_CP012217.1|WP_002860686.1|1673676_1674282_+|dephospho-CoA-kinase MKNAFFVTASIACGKSTFIEIANSLGFKSISADKIAHKILDENALELEKIFSPFNLKNLLTKEKKIDRKILGEIVFNNKEAKKTLENFTHPKIRAKILEQMQILDKENKAFFVEIPLFFESGAYENLGKVIVIYTPKELSLKRIMQRDKLSLEAAKVRLDSQIDIEEKLKKADFIIKNTNSYVDFRQECVKVIQEISKGKM >NZ_CP012217.1|WP_032584586.1|1674278_1675028_+|diaminopimelate-epimerase MKFYKYCASGNDFVITNADRKEDRSALAKELCNRYEGIGGDGFIVILPHEKYDFEWEFYNNDGSRAAMCGNGSRAAAHFVHHINKINPNMSFLTGAGIIKAKVNQDKVEVSLGKIKSVQNTFEELGKTWQLCDTGVPHLVHFCQNLDEFDTILCQKMRQKYNANVNFVKILDENHLKVRTYERGVEDETLACGTGMGACFYLAFLNKKVQNKVKITPKSGEEVGFTYKNEELFFEGKVKYCFEANYNFS >NZ_CP012217.1|WP_002855377.1|1675002_1675734_+|mannosyl-glycoprotein-endo-beta-N-acetylglucosamidase MKPIIIFLSLFLIPLFADDLKNGFGEEYYKLDIDQKRQIFFIKMNEMFDQSFKKIEQERAFIEAFFKDAYKTGFRTSNQTNLEKLITIKNKYRIENLYDFAEYKKRIQKIPKSMGIAQALVESATGTSRFAREANNLFGEWTWGEKGLIPDLRHPDKKHKIKIFDSLQDSVYSYVLNLNRHFAYEKFRDARAKFASEGKEITGLEAIKTLDSYSERKGYYINLITKIIKRYNLEKYDTNSNNT |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012217_1 | 1.1|1664965|26|NZ_CP012217|CRISPRCasFinder | 1664965-1664990 | 26 | MN530981 | Campylobacter phage DA10, complete genome | 14803-14828 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012217_1 | 1.1|1664965|26|NZ_CP012217|CRISPRCasFinder | 1664965-1664990 | 26 | NZ_CP045351 | Vibrio sp. THAF100 plasmid pTHAF100_a, complete sequence | 795123-795148 | 5 | 0.808 |
NZ_CP012217_1 | 1.1|1664965|26|NZ_CP012217|CRISPRCasFinder | 1664965-1664990 | 26 | NZ_CP040856 | Lactobacillus johnsonii strain G2A plasmid unnamed2, complete sequence | 90292-90317 | 5 | 0.808 |
NZ_CP012217_1 | 1.1|1664965|26|NZ_CP012217|CRISPRCasFinder | 1664965-1664990 | 26 | NZ_CP026733 | Shigella boydii strain ATCC 8700 plasmid unnamed2, complete sequence | 50101-50126 | 5 | 0.808 |
NZ_CP012217_1 | 1.1|1664965|26|NZ_CP012217|CRISPRCasFinder | 1664965-1664990 | 26 | NZ_CP026794 | Shigella flexneri strain 74-1170 plasmid unnamed | 250198-250223 | 5 | 0.808 |
NZ_CP012217_1 | 1.1|1664965|26|NZ_CP012217|CRISPRCasFinder | 1664965-1664990 | 26 | NC_014025 | Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM500, complete sequence | 13249-13274 | 5 | 0.808 |
NZ_CP012217_1 | 1.1|1664965|26|NZ_CP012217|CRISPRCasFinder | 1664965-1664990 | 26 | KF302034 | UNVERIFIED: Pseudoalteromonas phage HM1, complete genome | 58041-58066 | 5 | 0.808 |
1. spacer 1.1|1664965|26|NZ_CP012217|CRISPRCasFinder matches to MN530981 (Campylobacter phage DA10, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatgaaaaaaaagtttaaagatagct CRISPR spacer aatgaaaaaaaagtttaaagatagct Protospacer **************************
2. spacer 1.1|1664965|26|NZ_CP012217|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045351 (Vibrio sp. THAF100 plasmid pTHAF100_a, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
aatgaaaaaaaagtttaaagatagct CRISPR spacer catgagaaaaaagtttaaagataaag Protospacer ****.*****************.
3. spacer 1.1|1664965|26|NZ_CP012217|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040856 (Lactobacillus johnsonii strain G2A plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
aatgaaaaaaaagtttaaagatagct CRISPR spacer aatgaaaaaaaagtttaaatatccgc Protospacer ******************* ** .
4. spacer 1.1|1664965|26|NZ_CP012217|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026733 (Shigella boydii strain ATCC 8700 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
aatgaaaaaaaagtttaaagatagct CRISPR spacer gatgaaaaaaaatttaaaagatagtg Protospacer .*********** ** ********.
5. spacer 1.1|1664965|26|NZ_CP012217|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026794 (Shigella flexneri strain 74-1170 plasmid unnamed) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
aatgaaaaaaaagtttaaagatagct CRISPR spacer gatgaaaaaaaatttaaaagatagtg Protospacer .*********** ** ********.
6. spacer 1.1|1664965|26|NZ_CP012217|CRISPRCasFinder matches to NC_014025 (Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM500, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
aatgaaaaaaaagtttaaagatagct CRISPR spacer aatgaaaaaagagtttaaagacataa Protospacer **********.**********.*
7. spacer 1.1|1664965|26|NZ_CP012217|CRISPRCasFinder matches to KF302034 (UNVERIFIED: Pseudoalteromonas phage HM1, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
aatgaaaaaaaagtttaaagatagct CRISPR spacer catgaagaaaaagtttaaagatgaat Protospacer *****.***************.. *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
204441 : 256204
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012217|204441:256204|DBSCAN-SWA 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66 | Campylobacter_phage(58.06%) | protease,tail,plate,integrase,terminase,transposase | attL 229931:229947|attR 245073:245089 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1572663 : 1579299
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012217|1572663:1579299|DBSCAN-SWA TTCAATTATTGATTAGAAAATGATAATAATCCTCAGGCACACCAATATCTATAAAATAATCATCAAAAATACAAGCCCTAGCCTTTAGTTTTTTATAATTTTCTTGTAAAAACTCTTCAAAAGAAAATTTTTCCTGCAAAGCAAAATCATTAAAAATATCTTTAGTTAAAAGATAAATTCCACCATTGATTAAACCTTGCTTTTTAAATACCTTTTCCTCAAAAGAAATTACAAGATCTTGTTCATCAACATTTACTGTGCCGTATCTATCAAAATCATTCATTTGTTTTAAAGCAAGACAAATTTTACTTTCATTTAGCTTTAATTTACTTAAATCTATGTCAAAAAAAGTATCACCATTTAAAACATAAGCTTCATTTTTTACAAATTTCAAAGTCTCTTTTATGGCTCCGCCTGTTCCTAGAGGCTCTTTTTCGATGCTGTATTTTATTTTTATACCTAAAAACTCATCTTTAAAATACTCTTTTATCACTTCATATTTGTATGATACTGCTAAAATTACTTCTTTTATACCTTGCTTTTTAAGATACTCAAAAATAAATTCTAAAAAAGGCTTATCATTTATCGGTGCCATAGGCTTTGGAATGTCTTTTATAATACTTTTAAGTCTTGTTCCTAAGCCGCCACAAAGTATTATTGCTTGCAAGAAAAACCTTTACCAAAAAGCTCTTCTTCGACAATAGCACAAATAATATGTCCTATTAAAATATGCGCTTCTTGAATTCTTGGCGTGCAAGTTGAAGGCACTTTTATACAATAATCACAAAGTTCATTCATAGCCCCGCCACTAGCTCCACTTAAGCCTATACTTATGATTTCTTTTTGTTTGCAAAACTCTAAAGCTTTTAAGATATTTTTACTATTTCCACTTGTTGAAATGCCTATAAAAACATCTCCCTTAACACCTTGAGCTTGCACTTGTCTAGCAAACAAATTTTCATAACCATAGTCATTACCAATAGCTGTTAATATGCTAGTATCTGTAGTAAGTGCAATACTTGCGATACCGGGTCTATCAAAATAAAACCTACTTACAAATTCCCCTGCAATATGCTGTGCATCTGCAGCACTGCCACCATTTCCTGCTAATAAAGTTTTGTTACCATTTTTATAAGCTTTTATGACTTCTAATGAAGCATTTTTAATAAGAGTTATCAAATTCTCATCTTTTAAAATTTGTTCTTTTACTAAAATAGAATCTGCAAAATGTCCTTTTATATAGGAATTTAAATTCTCCATGATTTAACCCCCTCTTTTGTAAATGAAAAATCTTGCACATAACCTTGCTCTTTTCTTAAAGCTTTGATTAAGTTGTATTTTTTAGTAGGATCTACGAAGAAAAACATAAATCCACCAGCTCCTGCTCCGCTGGTTTTGCCACTATAGGCTCCGTTATCTATAGCAAGTTTATAAATTCTTTCAAGCTCATCATTACTAACGATTTCTGAAATGATTTTTTTTGACCGCCAAGATTTTCCTAAAATTTGCGCCAAAGTACCAAAATCGGCTCTAAATAAAGCTTCTTTCATCTTTATAGCATCTTGTTTTATCGCGTGCATGGCTTCTAAAGATTTTTCATCTCCAAGCTTTCCTTTTTTATGCTCTTCTATATCTTTTGCTTCTCTTGTGATATTTGTAAAATAAAGCACAGTTCTAGCTTCAAGCTCACTAGCTATCCAGTTTTTAATACGCAAAGGATTAACAATGACTCTTTTATTGTTATAAAATTCCATAAAATTAAAACCACCAAAAGTTGCGGCGTATTGATCTTGTGCTCCACCTACTATGCCTAAATCTTCTCTTTCTATCTCATAAGCAAGTTTAGCGATTTCATATTCTCCTAAAGGTAGATTAAGCCATTCTGCAAAGGCTTTTATAACCCCTACAACCAAAGTTGAGCTTCCGCCCAAGCCACTACCACTTGGTACATCCGAATAGGTATGCAAAGAAAAACTCAAAGGTTTTTTTGTAAAATCTTTTACAATGCGATTATAAATACTTTTAAAAATATCTAATTTTCCATCATTTCCTAAGAATTCTTTACTTTCGTACTCACAGTAAGAATTTGTATCAGGAGAATCAAAAATGATTTTTCCATCTTCTCTTTTGATCAAAGTACAATGTATGTATAAAGATATAGTCGCATTTAAAACATAACCTGTATATTTATCACAATATAAATTTATATCAGTCCCACCACCTGCTAGACCGAGACGAAGAGGAGTTTGTGTGCGTATGGTTTTCATAAATCTCCTAATTTATTTATCATATCCAATCAAGTAAAATATTTTGAATATTACATTTATTAATCAATTGCTTTAACTCCCCTATCTTTTTCTCTGAATCATCAAACATATATTCATGTGTTTCACAAGCAATATAATCAATTTTTTTATATATTTTTTTTTCAATAATTTTTTTCATTATCTCAAACTCCATTCCTTCAATATCAAGTTTTAGAAAATAAATCCTTTTATGTTGTGTTAAAATTTCATTTTCGATAAACTCGCATAAATCAATTACTTGAACTTTATATGTTTTTTCCGTCTGACTGTCTTGTACACTTTCAACTATACGATTGCCTTGAGATAGTATCCTATTTCCAAACATAATAAAATCTGTTTCATAATTTCTGTCCGATACTGCTTTTTGAAAAAGTTTTACATTTATATTATTTTCATATTTTTTTCTTAAAAAATAATTTAAATAAATATTTGGCTCAAAGATATAACTTTGCCCGCCACAATGTAAAATAATATCAGTAATTAAGCCTGCATGTCCACCACAATCAATACATACTGGACGATATCCATCCCCCCCCCCATATTTATCGACATAAAGCATCTTGTAAAAAATATCATAATATTGTTTTGGAATTCTGGCATTATCTAATAACAAATTTAATCTACCAAGCCCTTGTGGATCGGCTATAGCACCCTGAATTAAATGCAATGCATTATAAACATTTTCTTGCTTATTCCAATGGTTTAATACTTGCAACTCTGAAATTATCCTTTCTACATCAGCTATTGGTTTCCTAGCTTGCTGATGATTATCAATTTGATAAATCAAGCCATTTAGAGCCTCTTTTAATACTTCCAATTGTTCTTTTTTCATTATTTATCTCCTTTAATTTTAATTAAAATTTGCAAAGCGATTAACTTTCATCATTTTAAACGCTCTTAAAAGCTCTTTAATACCATCTTCTAAAGTATTATCTGGTTTCCAACCTGTAGCCTCTAATTTAGTATTTGAAACCAAATAATCTCTTTTATCTGGATCTTCACCTATGTTGGCTGAATGGATATAAAAATCAGGAATATACTTTTTAATTGTTTCAGCAAGCTGTCTTTTGGTCAAATTTGCAGAACTTAATCCCATGTTATAAGCCTGACCCTTCATCTTATCATAATTCTCAATTCCATGAATAAATCCTTTAACCACATCGCGAACATGAATATAATTGCGTCTAAAATGCTCTTCAAAAAGCACTATAAATTTATCTCTATATGCACGATAAGTAAAATCATTAACAAGTAAATCAAGTCTCATTCTAGGTGAAATTCCAAAAACAGTAGCTAAACGAAAAGTCACACAATTTCCTTTATCGAGCAAATATTGCTCCGCATGCACTTTATCGATCCCATATTCTGAGATAGGACGCAAGGGAGATTCTTCAGTACACATTGCATCTTTTTCTCCTATACCATAACCGCTGTTTGTATTGGGATAAATAAATATTTGAGAAGGACTTGCAAAATCACTTATCATTTTTACGGCTTCATAATTGATCATTTTAGCTAATTTTGGATTTCTTTTACAAAGTGGAGCTCCAACTAAAGCAGCTAGAGGAATAATAATATCAGCTTTTGCTACCTCTTGCCTAATAAGATTTTCATCCATAGCATCACCATTTATAAAAGTAAAATTTTTATTATGAAAACAAGATAAAAGAGAAATTTGATCAAACATCAAATTATCAATCACACAAACTTCATAACCTTTTTCAAGTAAAATCGGCGTTAAAACCGAACCTATATAACCTGCACCACCTGTAATTAAAACTTTTTTTGACATACTTTTCCTTTCGTCTTTGAAAATCAATTTTGTGTTTTATACCATTCATACATCATTTTAATACCATCTTTAAGTTCAATTTTATGCCTCCAACCTAAAGAATGAATTTTTGAGCAATCCATAAGTCTATCCATTGTGCTATCCGGTCTAGAAGTATTGAAAACTAGTTCTCCGCTAAACCCAACTATATTTTTTACCATCAAAGCAACTTCTTTGATTGAATAGTCAATACCTGTCCCTATATTAATATGGGTATTTTTACTTTTTCTATCTTTAATAAGATCTTTAAAATCAATATTTTGCATCGTATAGATAGCTACATCAGCTAGATCGTCACTATGAATAAATTCTCTCCTAACTTTTCCAGTGCCCCAAATTTCTACACTTTTTTTACTAATTCCAAAATTATGCAAATATTCTTTTGCTTCTTCAAAATTATTCATTTTCAAATCTTGAAGGATTTGAGTTATATTACCCTCGCTTAACAATTTTGCTAAATGAAATTTTCTAAGCAATGCGGGTAAGACTCTTGATTTTCCAAAATCAAAATTTGCTTTAGTTCCGTAAAGATTATTTAAAACAAGAGTAATGAAATTAGTACCATATTGAATATTATAACTTTCACACATTATAGCTCCAGCTATTTTGGCTGCACCAAAAGAATAAGCGCCATATTCTAAATCACCTTGAAATAAATATTCCTCTTTCAATGGGTTTTTAGCATTCTCAGGATACATATACCCAGAACCAAAAAATACCAATTTTTTAACATTATTAAGAAATGAATTGTGAATAACATTGTTTTGAATCATCAAATTTTCATAAATAAAATCAGCCCTTTGAGCGACATTTGCAGCACCACAAGGTAAGACTGCAGTCAAAAAAACATATTCTGGCTTTTC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012217|1572663:1579299|1575818_1576760_-|WP_002858299.1|DBSCAN-SWA MSKKVLITGGAGYIGSVLTPILLEKGYEVCVIDNLMFDQISLLSCFHNKNFTFINGDAMDENLIRQEVAKADIIIPLAALVGAPLCKRNPKLAKMINYEAVKMISDFASPSQIFIYPNTNSGYGIGEKDAMCTEESPLRPISEYGIDKVHAEQYLLDKGNCVTFRLATVFGISPRMRLDLLVNDFTYRAYRDKFIVLFEEHFRRNYIHVRDVVKGFIHGIENYDKMKGQAYNMGLSSANLTKRQLAETIKKYIPDFYIHSANIGEDPDKRDYLVSNTKLEATGWKPDNTLEDGIKELLRAFKMMKVNRFANFN >NZ_CP012217|1572663:1579299|1572663_1573329_-|WP_002857908.1|DBSCAN-SWA MQAIILCGGLGTRLKSIIKDIPKPMAPINDKPFLEFIFEYLKKQGIKEVILAVSYKYEVIKEYFKDEFLGIKIKYSIEKEPLGTGGAIKETLKFVKNEAYVLNGDTFFDIDLSKLKLNESKICLALKQMNDFDRYGTVNVDEQDLVISFEEKVFKKQGLINGGIYLLTKDIFNDFALQEKFSFEEFLQENYKKLKARACIFDDYFIDIGVPEDYYHFLINN >NZ_CP012217|1572663:1579299|1576783_1577824_-|WP_002934842.1|DBSCAN-SWA MQTNSKIYIAGHKGTAGTALVENLQKRGFNNLVLKTRQELDLVNQQAVAKFFKEEKPEYVFLTAVLPCGAANVAQRADFIYENLMIQNNVIHNSFLNNVKKLVFFGSGYMYPENAKNPLKEEYLFQGDLEYGAYSFGAAKIAGAIMCESYNIQYGTNFITLVLNNLYGTKANFDFGKSRVLPALLRKFHLAKLLSEGNITQILQDLKMNNFEEAKEYLHNFGISKKSVEIWGTGKVRREFIHSDDLADVAIYTMQNIDFKDLIKDRKSKNTHINIGTGIDYSIKEVALMVKNIVGFSGELVFNTSRPDSTMDRLMDCSKIHSLGWRHKIELKDGIKMMYEWYKTQN >NZ_CP012217|1572663:1579299|1573909_1574929_-|WP_002858413.1|DBSCAN-SWA MKTIRTQTPLRLGLAGGGTDINLYCDKYTGYVLNATISLYIHCTLIKREDGKIIFDSPDTNSYCEYESKEFLGNDGKLDIFKSIYNRIVKDFTKKPLSFSLHTYSDVPSGSGLGGSSTLVVGVIKAFAEWLNLPLGEYEIAKLAYEIEREDLGIVGGAQDQYAATFGGFNFMEFYNNKRVIVNPLRIKNWIASELEARTVLYFTNITREAKDIEEHKKGKLGDEKSLEAMHAIKQDAIKMKEALFRADFGTLAQILGKSWRSKKIISEIVSNDELERIYKLAIDNGAYSGKTSGAGAGGFMFFFVDPTKKYNLIKALRKEQGYVQDFSFTKEGVKSWRI >NZ_CP012217|1572663:1579299|1578753_1579299_-|WP_002858190.1|DBSCAN-SWA MAIEFDIQESKILKGVYIITPNKFRDLRGEIWTAFTDEYLSKLVPDGIKFKHDKFINSHFNVLRGIHGDVKTYKLVTCVYGEVHQVVVDCRKDSPTYLKWEKFIISYKNQQLILLPPNMGNSHYVSSKEAVYYYKLAYEGEYMDAPDQFTYAWNDERIGIDWPTNTPILSDRDILATKNKG >NZ_CP012217|1572663:1579299|1573316_1573922_-|WP_002857991.1|DBSCAN-SWA MENLNSYIKGHFADSILVKEQILKDENLITLIKNASLEVIKAYKNGNKTLLAGNGGSAADAQHIAGEFVSRFYFDRPGIASIALTTDTSILTAIGNDYGYENLFARQVQAQGVKGDVFIGISTSGNSKNILKALEFCKQKEIISIGLSGASGGAMNELCDYCIKVPSTCTPRIQEAHILIGHIICAIVEEELFGKGFSCKQ >NZ_CP012217|1572663:1579299|1574948_1575800_-|WP_002857889.1|DBSCAN-SWA MKKEQLEVLKEALNGLIYQIDNHQQARKPIADVERIISELQVLNHWNKQENVYNALHLIQGAIADPQGLGRLNLLLDNARIPKQYYDIFYKMLYVDKYGGGDGYRPVCIDCGGHAGLITDIILHCGGQSYIFEPNIYLNYFLRKKYENNINVKLFQKAVSDRNYETDFIMFGNRILSQGNRIVESVQDSQTEKTYKVQVIDLCEFIENEILTQHKRIYFLKLDIEGMEFEIMKKIIEKKIYKKIDYIACETHEYMFDDSEKKIGELKQLINKCNIQNILLDWI >NZ_CP012217|1572663:1579299|1577823_1578750_-|WP_002852387.1|DBSCAN-SWA MEKLLKELNNNIKLSNQLSYQILMSNIISNLDIDKKDKEILLLLLQARDRNYIRINNNEQCYQNIINYLNLIRPLELPLCDLLRIGGNGDGGYVMYNGGGDMSDINAKALSLGVSDSSPWDLEMAQRGFKVIEYDASIEKCPYDHENIVFHKKFIGNVNNENTITLVQALKDNNLDESKPNILQCDIENCEWDMLENIDISILNKYFSQVIFEFHGCNPEEQDGVEKRISLLKKLNEYFVPMHTHFHNHGKIFYSQGLFFSTTLEVSYLRKNLINLDIMKYRDVAGGFKNLDFPWISNPEIPIRFRGY |
8 | Tupanvirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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