Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP034169 | Enterococcus avium strain 352 chromosome, complete genome | 2 crisprs | RT,cas6,cas8b2,cas7,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2,WYL,cas14j,csa3,DEDDh,DinG | 2 | 3 | 13 | 2 |
NZ_CP034168 | Enterococcus avium strain 352 plasmid unnamed, complete sequence | 1 crisprs | NA | 0 | 1 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP034169_1 | 137433-138974 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP034169_1
|
23 spacers
spacers of NZ_CP034169_1
>1.1|137463|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAATCAAGGAGGAAATATTATGAATAAAACTTTAGC >1.2|137529|35|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTTTCTTGAACGAGTTAGATGTAGAGTGTGCCG >1.3|137594|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACGTAAGAAATAACAAATTGGCTAAAAGAGATACA >1.4|137660|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACGTTTTAAATCTGCAGAATGGCTAGATGCCGATA >1.5|137726|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAGAAACAGGACAAATTGAGACAGTAGAAATTACG >1.6|137792|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTCTAAGGAGGTGACACTTTGAATGATGATTTAA >1.7|137858|35|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGGTATTAAGACATCGATTCAAAATGCTAAAACT >1.8|137923|34|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGATGTGATAAACCTAAAATATCAATCACAATCG >1.9|137987|35|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATATATTTATCGACAATTTCTTTTAGTTCGTCAC >1.10|138052|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATGTTCATGCAGGCAAAGGATCAACAATCGGTACG >1.11|138118|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACCCATCTCGTTAATTATTGTTTCAGCCATTAATGA >1.12|138184|37|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTACGGCGTTAAAGTCGACGAGATCACGATAAAAC >1.13|138251|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCTGTTAAGTGACGTTGGATACCGCCGATCGATTG >1.14|138317|37|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAAATGCAAAGCTGCTTTACGGAGAAATTACAGCTC >1.15|138384|35|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCGTTGATTGTCTTTGATCCATAGGTTGTGATAT >1.16|138449|37|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTCTGAATACCGTTGCTAGTCATAGCTGTTCCCAC >1.17|138516|35|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACATAATTAACTAACTCCATGTCACCCTTATGGT >1.18|138581|37|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCGAAGTCTAAAACTGATGCGATCCGCATAGCATTT >1.19|138648|35|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCATCGGGAAAATGCAACGAGATTCTCGAAACGC >1.20|138713|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCATTATACTTCCGTTGGTGATATTACGGATTACAT >1.21|138779|34|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCTATGTTAGTAGAAATCTGATTACTGTAATTG >1.22|138843|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAGTTAGACGATTTTTGGGGAATCGGAAGTCGTATG >1.23|138909|36|NZ_CP034169|CRISPRCasFinder,CRT TCTTTAGCATACAATTTGTTTCCTGCAAAAATCACA |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6,RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP034169_1
The CRISPR arrays of NZ_CP034169_1 >merge|NZ_CP034169|1|137433-138974|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAATCAATCAAGGAGGAAATATTATGAATAAAACTTTAGCGTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAATTCTTTTCTTGAACGAGTTAGATGTAGAGTGTGCCGGTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAATTACGTAAGAAATAACAAATTGGCTAAAAGAGATACAGTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAATAACGTTTTAAATCTGCAGAATGGCTAGATGCCGATAGTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAATTTAGAAACAGGACAAATTGAGACAGTAGAAATTACGGTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAATAATTCTAAGGAGGTGACACTTTGAATGATGATTTAAGTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAATAAGGTATTAAGACATCGATTCAAAATGCTAAAACTGTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAATGGATGTGATAAACCTAAAATATCAATCACAATCGGTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAATCATATATTTATCGACAATTTCTTTTAGTTCGTCACGTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAATGATGTTCATGCAGGCAAAGGATCAACAATCGGTACGGTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAATACCCATCTCGTTAATTATTGTTTCAGCCATTAATGAGTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAATAATTACGGCGTTAAAGTCGACGAGATCACGATAAAACGTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAATTCCTGTTAAGTGACGTTGGATACCGCCGATCGATTGGTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAATGCAAATGCAAAGCTGCTTTACGGAGAAATTACAGCTCGTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAATCTCGTTGATTGTCTTTGATCCATAGGTTGTGATATGTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAATTCTTCTGAATACCGTTGCTAGTCATAGCTGTTCCCACGTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAATCACATAATTAACTAACTCCATGTCACCCTTATGGTGTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAATTTCGAAGTCTAAAACTGATGCGATCCGCATAGCATTTGTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAATGTCATCGGGAAAATGCAACGAGATTCTCGAAACGCGTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAATCCATTATACTTCCGTTGGTGATATTACGGATTACATGTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAATTTCTATGTTAGTAGAAATCTGATTACTGTAATTGGTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAATGAGTTAGACGATTTTTGGGGAATCGGAAGTCGTATGGTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAATTCTTTAGCATACAATTTGTTTCCTGCAAAAATCACAGTCTAAATCTAAAAATATTGGAGTACTAAT >NZ_CP034169|1|1|137433-138908|PILER-CR GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT CAATCAAGGAGGAAATATTATGAATAAAACTTTAGC GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT TCTTTTCTTGAACGAGTTAGATGTAGAGTGTGCCG GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT TACGTAAGAAATAACAAATTGGCTAAAAGAGATACA GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT AACGTTTTAAATCTGCAGAATGGCTAGATGCCGATA GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT TTAGAAACAGGACAAATTGAGACAGTAGAAATTACG GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT AATTCTAAGGAGGTGACACTTTGAATGATGATTTAA GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT AAGGTATTAAGACATCGATTCAAAATGCTAAAACT GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT GGATGTGATAAACCTAAAATATCAATCACAATCG GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT CATATATTTATCGACAATTTCTTTTAGTTCGTCAC GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT GATGTTCATGCAGGCAAAGGATCAACAATCGGTACG GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT ACCCATCTCGTTAATTATTGTTTCAGCCATTAATGA GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT AATTACGGCGTTAAAGTCGACGAGATCACGATAAAAC GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT TCCTGTTAAGTGACGTTGGATACCGCCGATCGATTG GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT GCAAATGCAAAGCTGCTTTACGGAGAAATTACAGCTC GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT CTCGTTGATTGTCTTTGATCCATAGGTTGTGATAT GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT TCTTCTGAATACCGTTGCTAGTCATAGCTGTTCCCAC GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT CACATAATTAACTAACTCCATGTCACCCTTATGGT GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT TTCGAAGTCTAAAACTGATGCGATCCGCATAGCATTT GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT GTCATCGGGAAAATGCAACGAGATTCTCGAAACGC GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT CCATTATACTTCCGTTGGTGATATTACGGATTACAT GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT TTCTATGTTAGTAGAAATCTGATTACTGTAATTG GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT GAGTTAGACGATTTTTGGGGAATCGGAAGTCGTATG GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT >NZ_CP034169|1|1|137433-138974|CRISPRCasFinder GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT CAATCAAGGAGGAAATATTATGAATAAAACTTTAGC GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT TCTTTTCTTGAACGAGTTAGATGTAGAGTGTGCCG GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT TACGTAAGAAATAACAAATTGGCTAAAAGAGATACA GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT AACGTTTTAAATCTGCAGAATGGCTAGATGCCGATA GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT TTAGAAACAGGACAAATTGAGACAGTAGAAATTACG GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT AATTCTAAGGAGGTGACACTTTGAATGATGATTTAA GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT AAGGTATTAAGACATCGATTCAAAATGCTAAAACT GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT GGATGTGATAAACCTAAAATATCAATCACAATCG GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT CATATATTTATCGACAATTTCTTTTAGTTCGTCAC GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT GATGTTCATGCAGGCAAAGGATCAACAATCGGTACG GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT ACCCATCTCGTTAATTATTGTTTCAGCCATTAATGA GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT AATTACGGCGTTAAAGTCGACGAGATCACGATAAAAC GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT TCCTGTTAAGTGACGTTGGATACCGCCGATCGATTG GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT GCAAATGCAAAGCTGCTTTACGGAGAAATTACAGCTC GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT CTCGTTGATTGTCTTTGATCCATAGGTTGTGATAT GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT TCTTCTGAATACCGTTGCTAGTCATAGCTGTTCCCAC GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT CACATAATTAACTAACTCCATGTCACCCTTATGGT GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT TTCGAAGTCTAAAACTGATGCGATCCGCATAGCATTT GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT GTCATCGGGAAAATGCAACGAGATTCTCGAAACGC GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT CCATTATACTTCCGTTGGTGATATTACGGATTACAT GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT TTCTATGTTAGTAGAAATCTGATTACTGTAATTG GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT GAGTTAGACGATTTTTGGGGAATCGGAAGTCGTATG GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT TCTTTAGCATACAATTTGTTTCCTGCAAAAATCACA GTCTAAATCTAAAAATATTGGAGTACTAAT >NZ_CP034169|1|1|137433-138974|CRT GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT CAATCAAGGAGGAAATATTATGAATAAAACTTTAGC GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT TCTTTTCTTGAACGAGTTAGATGTAGAGTGTGCCG GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT TACGTAAGAAATAACAAATTGGCTAAAAGAGATACA GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT AACGTTTTAAATCTGCAGAATGGCTAGATGCCGATA GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT TTAGAAACAGGACAAATTGAGACAGTAGAAATTACG GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT AATTCTAAGGAGGTGACACTTTGAATGATGATTTAA GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT AAGGTATTAAGACATCGATTCAAAATGCTAAAACT GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT GGATGTGATAAACCTAAAATATCAATCACAATCG GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT CATATATTTATCGACAATTTCTTTTAGTTCGTCAC GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT GATGTTCATGCAGGCAAAGGATCAACAATCGGTACG GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT ACCCATCTCGTTAATTATTGTTTCAGCCATTAATGA GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT AATTACGGCGTTAAAGTCGACGAGATCACGATAAAAC GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT TCCTGTTAAGTGACGTTGGATACCGCCGATCGATTG GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT GCAAATGCAAAGCTGCTTTACGGAGAAATTACAGCTC GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT CTCGTTGATTGTCTTTGATCCATAGGTTGTGATAT GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT TCTTCTGAATACCGTTGCTAGTCATAGCTGTTCCCAC GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT CACATAATTAACTAACTCCATGTCACCCTTATGGT GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT TTCGAAGTCTAAAACTGATGCGATCCGCATAGCATTT GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT GTCATCGGGAAAATGCAACGAGATTCTCGAAACGC GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT CCATTATACTTCCGTTGGTGATATTACGGATTACAT GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT TTCTATGTTAGTAGAAATCTGATTACTGTAATTG GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT GAGTTAGACGATTTTTGGGGAATCGGAAGTCGTATG GTCTAAATCTAAAAATAGTGGAATGTAAAT TCTTTAGCATACAATTTGTTTCCTGCAAAAATCACA GTCTAAATCTAAAAATATTGGAGTACTAAT
>NZ_CP034169.1|WP_137438868.1|136964_137246_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYVILVYDISLEEKGARVLNRVFKICKKYLSHVQKSVFEGEITPAKLKKLEQELKEYVREDLDSILIFKNSNKKWLKKEYIGIDGTELVSNFF >NZ_CP034169.1|WP_137440438.1|135969_136959_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MESYYLYSSGTLSRKDNVIRMETADGRKKDLKIEMTRDIYLFGEVTTNTKCLNYLSEMKIPVHFFNYYGYYTGTFYPREKNVSGKLLVQQVYHSAEEEKRIILARKFVDGATANCLRNLQYYRRRGKEVERQITEIEAVRKRIPRTNEVEELMGLEGNIHQIYYSAWETIFNDEIEFKQRVRRPPDNMVNTLISYLNMLTYSACLSEIYVSQLNPTISYLHSNSERRFSLSLDIAEIFKPLIVDRLIFSLINKKIITEKDFETGSNGNYLKQTGQQKVLRQFDERLNKTIRHRELKRNVSYRKLMRLECYKLIKHLMSDKEYEPFKIWW >NZ_CP034169.1|WP_137438867.1|135468_135957_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKITGNMINYYFVCERKLWLFAHGLQYEEENENVQLGKLLDTGTYKDKRKQIMLDGTVNIDFLEDWKVLHEVKKSRAIEPAAVWQLRYYLYYLQKKGVSVEKGYIDYPKLRERIEVTLDGEETRELEGIIESIEAIITQEDSPKVEKKKICTKCAYYDYCFI >NZ_CP034169.1|WP_137438866.1|133176_135459_+|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MEDRFWAKSTEETIVEHTQKLLERYTQLQKNYPEIPVNWDLLRIACQYHDLGKMNKLFQEKIREGVMKKDGEIPHGLLSITLLPFEQLEERYERKEIKALTYAVALHHERNLSEIEEEQYESEAEALMVLIEEFPFDELDLPKPDEIEVPSVIYYKLRHKISSQDDCFRESVMLKGLLNRIDYAASGDYQIEYPANFLNKNMPKVRESWRKKHSDPTINWNEMQKYVQTHQDESLVIIGQTGLGKTEAGLLWIGDNKGFFTLPLRTAINAIYERIRKDITDKTEDKYKEQVGILHSDSLAVLLAEQEENKEIELDQLEGYLTETRSWSLPLTVTTLDQTFDFVYHYAGFEQKLATFAYSKVVIDEIQMYSPDLLAYLIKGLKEIQDFGGKFLVMTATLPPYLLDLFEKRKLIWKSNDKPFLNHELLERHHLQILEEGISAEAVSDLYGSGKLLVICNTVRKAKEIYKELSELSVGVDIHLIHSQFIRKDRQAKEKEIQDFADSEEEGIWIATQVVEASLDIDFDLLITELSELNGLFQRMGRCYRKRSLVNREQPNVYVFDGGDQVTSGISTSEQAVVQKDIFDMSKLALRNVGSGIYSELDKMTIIDQTYTTENMKKTDYYKRIETMLQWLTAIEDDGKSAAEVRKLFRNIQSRNIIPEDVYKNYSEKIDEYLELLPLTNKELESRGYKNPKMYKQQIKSQLEDYMMSIPEWLFRNCLKGDQVRCEQIGRYDQVFFVKGIYESDVGFQVLKGEKEDNVW >NZ_CP034169.1|WP_137438865.1|132415_133168_+|CRISPR-associated-protein-Cas5 MKGIKLTVHQDMVNYRRPTSFQLRETYPLPPLSTVIGMVHNLCGYQHYEPMDVSIQGNYFSKTNDLFTRYEFKNGMKFEKARHQLKVNEFGVSRGIGYTELLVDVHLILHIVPDNQEKVEEIYQFLKYPAEFPSLGRREDLANFEKVSIVEINEQKLKKDKKIRDQWHAYIPIEKIEDESISIEAEGTGLSGTRFTLPKVYELYNFGTKNKPKFKRNWVERKEVLYSSVFVFPKRVNVLMDEEEDIVFLM >NZ_CP034169.1|WP_137438864.1|131535_132429_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MTMSKGLTMTMIFLAESANYGESLGNVATLKKITRGKGEQYTYISRQAIRYNIVEQLDEPLASLSAEGSGTKQVIQFDQHATIDKYPEVDLFGYMKTAKGDNALTRSAKVRLSNAVSLETYKGDTDFLTNMGLAKRLRENGDEKAMNSIAQSEIHRSFYRYTVTVDLDEIGIDRNVDIKLSNEEKSRRVQKLLDTIQYLYRDIRGRRENLQPLFIVGGVYERKNPLFENVVDVHQNKVDVEKIEGVLTDALWQDTFVGVVKDAFENTAEIQEVLQGQKIPQVFESLKQKVADYYEGD >NZ_CP034169.1|WP_137438863.1|129863_131549_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MDSIEKDDTLEFRLNSWMENAAICGLVNILEEDEDKIEIKPQSIVVKKEVFKNFEEDYFTYFAKQYEKLSSLTKVLSYEDEMNRHQREDFTHFDQKAYERLQKYLADLKRYGESNSYLAVYPLVDSSVDIVSLIKKAKIDKLKKGEFEHNNIEIIDRIKSIYELLTEIFAYYHQEDVQRYLAAKIQIYSVINNGYNDVSFLNRQESKGDFYEKYHDYFVESMLSYLEDNHEKDKLSCTNCGHPIKKGDISYSFINQAGYDANRKQSNAWSFTNDLFMCPVCRLLYTCIPAGFTYVYNQGLFVNDNHSVRALLNANTGIRLDVLSLNKTEVKAIDTYAALIRTLQDSMNRQHHRELQDIQVVRYENERYYFNLLPKHILKTIDQSKDKLPELFNAGFILNGDYQSLYREIITRLMNNTNLFSLIYQVLRTKGTGGQVYANTYHIMKMIEINQNFLKELIQMEKLEKDELEKIRRDGYFLKKEYANKNKADSIGLRLLNALKANNKDAFMDILLNSYMYLNKLVPKYFTDIFLDDERFKTIGYSFVAGIIGEAHNTEGGNDNE >NZ_CP034169.1|WP_137438862.1|129108_129861_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRFKINLKVHSSNEEIEIPIKYQSIFLSLLKRGLENAAPEVYKELYEKNKEKLFSQAIIFKGAMFEKEKIILKTPSITYLFSTPKADLAMAVYNAFIYLKEMKAVPFVGESTIKVKSVSSIYQETITEKQVIFQAISPILARDHNRETRKDWFLDFNDEKYEVVLKQNLINRLVPEMGRGVQYDIENLKMKPLNMKKTVTKAYEKFYQGAIGTIELTGEPYLLNVIRDVGLGSKTGLYFGYLNQVKQGGE >NZ_CP034169.1|WP_154059601.1|128527_129082_+|hypothetical-protein MILINQNLWLWIFKVLVFLGAVGYIHLFIKRIRKRNKYFKGNIFVSQSGELWLRFKGEEEVLKTITSKMRVIDEEPNNVNERLETDQANIHIEKTSGFVQVTTGNGISKQLIEGNSFSNKLEQYRSLMIGSGILEEDIDALILHAKDEDVKNSFLAKYGMELAKIMVNVAGTTISLISLLKKSI >NZ_CP034169.1|WP_137438860.1|126707_128024_-|ISL3-family-transposase MSSIKNIKYKDNCLDKTIKQILNIHDSNITFPKDAVSKEKVHDRMATVFTGRLSYPSPRCECCGYDSVIHHGYKDSWIQLLPYQEVSTYLHLYKQRFYCKQCHHTFSAKTYYVAENCYLSQALKFAIAVDLKKKISMKDIAQRYLVSAKTVERVLDSFFEEPRLKPNYLPKHLLIDEFKGTKDCQGAMCFILSDADTGKIFDILEDRRSFKLIAYFMRFTYHARKNVSHVVMDMNAGYDSVTKVVFPNARISIDRFHVIQQLNRAFNKQRIKTMNHLKKSDPQAMKKYRKLKKYWRTILKKNRKINYSSLKQYPLFQRKYLTESEVLDYLLSIDKHLRTSYDVYQNLLDAFDAKDYTDFYERIDHLPPMLDPAFKKAILYLNKHKQAIINALKYPYSNGKLEGKNNLIKVIKRVAFGFRTFRHLRMRILIQQNLCDII >NZ_CP034169.1|WP_137440439.1|139174_139513_+|hypothetical-protein MKGQFEKRMIIPLDRDLIWVWPDIQAYLYGRNNLDFSRYALFTFEIPAISYKNDILWSDFFSWHEVLNRLWEGKADESERYEEIFQLKKHEKAGRIQGITTRLHKDWIKRIT >NZ_CP034169.1|WP_137438869.1|139526_140351_+|SWIM-zinc-finger-family-protein MGDWERLFKPHILERGYEYFLEERVVDFWLKDDLIKASVAGTDDYEVVIEGIGYDFPRLYCDCPFADTDNNCKHMAAVLYEYEDGKIDGRWEEKTKLSKNVEEMVLNAEDSVVREFLIELLKKDQSLAHRFARLISPQITGRDIQQLNHKIDKIIKQHAGYENSLEYQEIENFVADLIEFINEEITPVIDKEAYLVAFQLINHIVLEVREVDIDDLEGELFELSAECRYTWESILNKATKQEREEMHSWFKTQLNQAKYYFDYGEIEQIYEDRF >NZ_CP034169.1|WP_137438870.1|141075_141777_+|response-regulator-transcription-factor MQEKTKVLIIDDDQELCSIIDRYLKNAGYETQLVHTGAGGLQLALSGDYHLIVLDIMLPQIDGMSILAEIRRQSVVPILMLTAKNEEADKIRGLQLGADDYLTKPFSMAELMARVESLVRRYMKFSRAAVDETALVLKHLTLDRQTRIVLLEGKSLELTGKEFELLYFLASHKGQIFTKRQIYQQVWGTEYAFDDNNIMSFISKLRKKIEPDVAQPFFIQTVRGVGYRFNQEG >NZ_CP034169.1|WP_137438871.1|141777_142686_+|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MMLVLSIICLLLAVVCLLLIVRLRQNRRQIAQAMVVLEDIGEGNLDRKIVVDENSDIAALCFRLNEIVSEIKQQLSRLRVSENEYRKLITSLSHDVRTPLASLIGYLEAITDGLVTEAEQQEYLRAAQAKAFELETYIDTLFEWVKLESGERHYHFEATDISELLREIVSEWIPRMEMRFSYDIQIPEKELRCTIDAAAFRRIIDNLLENCLKHSRGNRVTIRLFEQDQQVRLEISDNGRGISEQHLPRIFDRLYKGDEARGSKGNGLGLAIVQELVTAHHGEINVCSKLGEGTKFYVTLPK >NZ_CP034169.1|WP_137438872.1|142764_143685_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MEKFIVKTAALSKRYSDQIVVKDVSMSIPKGKIYGLLGRNGAGKTTIMKILLGLASASSGEVRLFNQSPKKHPEVYSRIGNMIETPSFYPYLSGPENLSVFSKLKGQIQKSSVEKALKLVDLSRAGHKRFANYSLGMKQRLGIANALMNDPELLILDEPTNGLDPIGIAEIRKLLKELAEVHGKTILISSHQLSEIEQIADIIGILHDGALLEECDMSQIAQHNQRFIHITVSDVHQATRLLEEEMQLTNYSVAENNTIKIFEFTYEPQEINHLFGKNGIEVSSLFFGSGNLEEHFREITGGVGIA >NZ_CP034169.1|WP_049221955.1|143677_144403_+|ABC-transporter-permease-subunit MLNVISAEWLKLRSNRIFTVCSLLTLLTSAFMVFRDLVIVDNPPESYQMWLPSIYIVVGMVLSIMSGFIITFLMQREYEDRTINNVLTAPTSRGRYLFGKLVIWFIWYLGTLIGVVTIYTIGGWLIYPDTFGLTGTKILVSTLLKYCLLGFVAAIPLLTISVVQRKLFYPTIMVALVFTGIQTFALNIPFKFARIIPWSAVVVQSLMELTLKDDLLTLGSIFLTGIVGLLAAYWLFKKQDL >NZ_CP034169.1|WP_167494422.1|144510_144894_+|MmcQ/YjbR-family-DNA-binding-protein MENKVLQQRIETFKVFGETLKGAKVYFREDWGVLYFDLQGKMFGMMSNQASEDAIITLKNLPEKNEELREIYVGIVIPGYYTNKNHWNSIKLTSEELTDDVIKQLIEVSYQLVYQKLTKKQKAEIEG >NZ_CP034169.1|WP_137438873.1|145366_146755_+|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MRRPQKTRKLGYHQRVSVEHEGYDEVRSTSCGEQRKQDGVENLFGRILERNNLNQAYLQVVRNKGAAGADGMTVDQLLPYLKEHREELLSNLRQGNYKPQPVLRVEIPKPNGGVRKLGIPTVIDRMLQQAINQVLQPLFEPEFSDNSYGFRPNRSAHDAVKKAKSYYEQGYRYVVDIDMKAYFDTVNHDKLMYFVERKVKDKQVLKLIRQYLMSGVMENGLITTTEEGTPQGGNLSPLLSNIYLNEFDQVLENLGHKFVRYADDCNIYVRSKRAGQRVMKKSIQFLEEQLKLTVNREKSAVGSPLKRKFLGFCILPTKKGSKIRPHAKAKQRVKSKLKQLTKRNRGRSIQLILKEIKQLMTGWINYYGIGEMKEFMRELNGWLKRRIRQYIWKQWKNPRTKRKNLIRLGIDKAKAYEWSNTRKGIWSISKSHILHRSLTDKELARQGYEDISLKYQFVHSTY >NZ_CP034169.1|WP_137438874.1|146821_147103_-|hypothetical-protein MDSIICIVLGMLFANGVPHFVKGITAEKWDVPWKKPASASTNVLWGIANWLVVVILYALFKPDVNSFDAACFLIGMGITGYYLALHWSEKTIE >NZ_CP034169.1|WP_137438875.1|147286_148126_+|aldo/keto-reductase MKAPLITMNDGHQIPAVGLGTYQIRGGEGLDQILTAIQDGYRLLDTSTNYDSEGIVGEAIRRSGIPRSEFFVTTKLPGKYHHYEDALMMIQESLFRMGLDYFDLYLIHWPLPKRGLYVEAWKAMVTAQKLGLIRSIGVSNFEPEHLDKIIDETGVTPAINQIEIHPYWVQERMVKANQERGILTEAWSPLGRGSDALKEAVITELAEKYGKTSAQVILRWHAQRGIIPIPKSRNIQHQRENLAIFDFELTQTEIERINLLEKADGRIEGQDPNEYEEFD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP034169_2 | 140636-140790 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP034169_2
|
2 spacers
spacers of NZ_CP034169_2
>2.1|140662|39|NZ_CP034169|CRISPRCasFinder CGGAAGGCAGTACACAGCAACGCGTATTGGCACTTGTTC >2.2|140727|38|NZ_CP034169|CRISPRCasFinder AAGGTAAAAATATCGGTAACAGCCAAGTCCTCCCGTTC |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6,RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP034169_2
The CRISPR arrays of NZ_CP034169_2 >merge|NZ_CP034169|2|140636-140790|CRISPRCasFinder AAATCTAAAATAGTGGAATGTAAATACGGAAGGCAGTACACAGCAACGCGTATTGGCACTTGTTCAAATCTAAAATAGTGGAATGTAAATAAAGGTAAAAATATCGGTAACAGCCAAGTCCTCCCGTTCAAATCTAAAATAATGGAGTATAAATA >NZ_CP034169|2|2|140636-140790|CRISPRCasFinder AAATCTAAAATAGTGGAATGTAAATA CGGAAGGCAGTACACAGCAACGCGTATTGGCACTTGTTC AAATCTAAAATAGTGGAATGTAAATA AAGGTAAAAATATCGGTAACAGCCAAGTCCTCCCGTTC AAATCTAAAATAATGGAGTATAAATA
>NZ_CP034169.1|WP_137438869.1|139526_140351_+|SWIM-zinc-finger-family-protein MGDWERLFKPHILERGYEYFLEERVVDFWLKDDLIKASVAGTDDYEVVIEGIGYDFPRLYCDCPFADTDNNCKHMAAVLYEYEDGKIDGRWEEKTKLSKNVEEMVLNAEDSVVREFLIELLKKDQSLAHRFARLISPQITGRDIQQLNHKIDKIIKQHAGYENSLEYQEIENFVADLIEFINEEITPVIDKEAYLVAFQLINHIVLEVREVDIDDLEGELFELSAECRYTWESILNKATKQEREEMHSWFKTQLNQAKYYFDYGEIEQIYEDRF >NZ_CP034169.1|WP_137440439.1|139174_139513_+|hypothetical-protein MKGQFEKRMIIPLDRDLIWVWPDIQAYLYGRNNLDFSRYALFTFEIPAISYKNDILWSDFFSWHEVLNRLWEGKADESERYEEIFQLKKHEKAGRIQGITTRLHKDWIKRIT >NZ_CP034169.1|WP_137438868.1|136964_137246_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYVILVYDISLEEKGARVLNRVFKICKKYLSHVQKSVFEGEITPAKLKKLEQELKEYVREDLDSILIFKNSNKKWLKKEYIGIDGTELVSNFF >NZ_CP034169.1|WP_137440438.1|135969_136959_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MESYYLYSSGTLSRKDNVIRMETADGRKKDLKIEMTRDIYLFGEVTTNTKCLNYLSEMKIPVHFFNYYGYYTGTFYPREKNVSGKLLVQQVYHSAEEEKRIILARKFVDGATANCLRNLQYYRRRGKEVERQITEIEAVRKRIPRTNEVEELMGLEGNIHQIYYSAWETIFNDEIEFKQRVRRPPDNMVNTLISYLNMLTYSACLSEIYVSQLNPTISYLHSNSERRFSLSLDIAEIFKPLIVDRLIFSLINKKIITEKDFETGSNGNYLKQTGQQKVLRQFDERLNKTIRHRELKRNVSYRKLMRLECYKLIKHLMSDKEYEPFKIWW >NZ_CP034169.1|WP_137438867.1|135468_135957_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKITGNMINYYFVCERKLWLFAHGLQYEEENENVQLGKLLDTGTYKDKRKQIMLDGTVNIDFLEDWKVLHEVKKSRAIEPAAVWQLRYYLYYLQKKGVSVEKGYIDYPKLRERIEVTLDGEETRELEGIIESIEAIITQEDSPKVEKKKICTKCAYYDYCFI >NZ_CP034169.1|WP_137438866.1|133176_135459_+|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MEDRFWAKSTEETIVEHTQKLLERYTQLQKNYPEIPVNWDLLRIACQYHDLGKMNKLFQEKIREGVMKKDGEIPHGLLSITLLPFEQLEERYERKEIKALTYAVALHHERNLSEIEEEQYESEAEALMVLIEEFPFDELDLPKPDEIEVPSVIYYKLRHKISSQDDCFRESVMLKGLLNRIDYAASGDYQIEYPANFLNKNMPKVRESWRKKHSDPTINWNEMQKYVQTHQDESLVIIGQTGLGKTEAGLLWIGDNKGFFTLPLRTAINAIYERIRKDITDKTEDKYKEQVGILHSDSLAVLLAEQEENKEIELDQLEGYLTETRSWSLPLTVTTLDQTFDFVYHYAGFEQKLATFAYSKVVIDEIQMYSPDLLAYLIKGLKEIQDFGGKFLVMTATLPPYLLDLFEKRKLIWKSNDKPFLNHELLERHHLQILEEGISAEAVSDLYGSGKLLVICNTVRKAKEIYKELSELSVGVDIHLIHSQFIRKDRQAKEKEIQDFADSEEEGIWIATQVVEASLDIDFDLLITELSELNGLFQRMGRCYRKRSLVNREQPNVYVFDGGDQVTSGISTSEQAVVQKDIFDMSKLALRNVGSGIYSELDKMTIIDQTYTTENMKKTDYYKRIETMLQWLTAIEDDGKSAAEVRKLFRNIQSRNIIPEDVYKNYSEKIDEYLELLPLTNKELESRGYKNPKMYKQQIKSQLEDYMMSIPEWLFRNCLKGDQVRCEQIGRYDQVFFVKGIYESDVGFQVLKGEKEDNVW >NZ_CP034169.1|WP_137438865.1|132415_133168_+|CRISPR-associated-protein-Cas5 MKGIKLTVHQDMVNYRRPTSFQLRETYPLPPLSTVIGMVHNLCGYQHYEPMDVSIQGNYFSKTNDLFTRYEFKNGMKFEKARHQLKVNEFGVSRGIGYTELLVDVHLILHIVPDNQEKVEEIYQFLKYPAEFPSLGRREDLANFEKVSIVEINEQKLKKDKKIRDQWHAYIPIEKIEDESISIEAEGTGLSGTRFTLPKVYELYNFGTKNKPKFKRNWVERKEVLYSSVFVFPKRVNVLMDEEEDIVFLM >NZ_CP034169.1|WP_137438864.1|131535_132429_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MTMSKGLTMTMIFLAESANYGESLGNVATLKKITRGKGEQYTYISRQAIRYNIVEQLDEPLASLSAEGSGTKQVIQFDQHATIDKYPEVDLFGYMKTAKGDNALTRSAKVRLSNAVSLETYKGDTDFLTNMGLAKRLRENGDEKAMNSIAQSEIHRSFYRYTVTVDLDEIGIDRNVDIKLSNEEKSRRVQKLLDTIQYLYRDIRGRRENLQPLFIVGGVYERKNPLFENVVDVHQNKVDVEKIEGVLTDALWQDTFVGVVKDAFENTAEIQEVLQGQKIPQVFESLKQKVADYYEGD >NZ_CP034169.1|WP_137438863.1|129863_131549_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MDSIEKDDTLEFRLNSWMENAAICGLVNILEEDEDKIEIKPQSIVVKKEVFKNFEEDYFTYFAKQYEKLSSLTKVLSYEDEMNRHQREDFTHFDQKAYERLQKYLADLKRYGESNSYLAVYPLVDSSVDIVSLIKKAKIDKLKKGEFEHNNIEIIDRIKSIYELLTEIFAYYHQEDVQRYLAAKIQIYSVINNGYNDVSFLNRQESKGDFYEKYHDYFVESMLSYLEDNHEKDKLSCTNCGHPIKKGDISYSFINQAGYDANRKQSNAWSFTNDLFMCPVCRLLYTCIPAGFTYVYNQGLFVNDNHSVRALLNANTGIRLDVLSLNKTEVKAIDTYAALIRTLQDSMNRQHHRELQDIQVVRYENERYYFNLLPKHILKTIDQSKDKLPELFNAGFILNGDYQSLYREIITRLMNNTNLFSLIYQVLRTKGTGGQVYANTYHIMKMIEINQNFLKELIQMEKLEKDELEKIRRDGYFLKKEYANKNKADSIGLRLLNALKANNKDAFMDILLNSYMYLNKLVPKYFTDIFLDDERFKTIGYSFVAGIIGEAHNTEGGNDNE >NZ_CP034169.1|WP_137438862.1|129108_129861_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRFKINLKVHSSNEEIEIPIKYQSIFLSLLKRGLENAAPEVYKELYEKNKEKLFSQAIIFKGAMFEKEKIILKTPSITYLFSTPKADLAMAVYNAFIYLKEMKAVPFVGESTIKVKSVSSIYQETITEKQVIFQAISPILARDHNRETRKDWFLDFNDEKYEVVLKQNLINRLVPEMGRGVQYDIENLKMKPLNMKKTVTKAYEKFYQGAIGTIELTGEPYLLNVIRDVGLGSKTGLYFGYLNQVKQGGE >NZ_CP034169.1|WP_137438870.1|141075_141777_+|response-regulator-transcription-factor MQEKTKVLIIDDDQELCSIIDRYLKNAGYETQLVHTGAGGLQLALSGDYHLIVLDIMLPQIDGMSILAEIRRQSVVPILMLTAKNEEADKIRGLQLGADDYLTKPFSMAELMARVESLVRRYMKFSRAAVDETALVLKHLTLDRQTRIVLLEGKSLELTGKEFELLYFLASHKGQIFTKRQIYQQVWGTEYAFDDNNIMSFISKLRKKIEPDVAQPFFIQTVRGVGYRFNQEG >NZ_CP034169.1|WP_137438871.1|141777_142686_+|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MMLVLSIICLLLAVVCLLLIVRLRQNRRQIAQAMVVLEDIGEGNLDRKIVVDENSDIAALCFRLNEIVSEIKQQLSRLRVSENEYRKLITSLSHDVRTPLASLIGYLEAITDGLVTEAEQQEYLRAAQAKAFELETYIDTLFEWVKLESGERHYHFEATDISELLREIVSEWIPRMEMRFSYDIQIPEKELRCTIDAAAFRRIIDNLLENCLKHSRGNRVTIRLFEQDQQVRLEISDNGRGISEQHLPRIFDRLYKGDEARGSKGNGLGLAIVQELVTAHHGEINVCSKLGEGTKFYVTLPK >NZ_CP034169.1|WP_137438872.1|142764_143685_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MEKFIVKTAALSKRYSDQIVVKDVSMSIPKGKIYGLLGRNGAGKTTIMKILLGLASASSGEVRLFNQSPKKHPEVYSRIGNMIETPSFYPYLSGPENLSVFSKLKGQIQKSSVEKALKLVDLSRAGHKRFANYSLGMKQRLGIANALMNDPELLILDEPTNGLDPIGIAEIRKLLKELAEVHGKTILISSHQLSEIEQIADIIGILHDGALLEECDMSQIAQHNQRFIHITVSDVHQATRLLEEEMQLTNYSVAENNTIKIFEFTYEPQEINHLFGKNGIEVSSLFFGSGNLEEHFREITGGVGIA >NZ_CP034169.1|WP_049221955.1|143677_144403_+|ABC-transporter-permease-subunit MLNVISAEWLKLRSNRIFTVCSLLTLLTSAFMVFRDLVIVDNPPESYQMWLPSIYIVVGMVLSIMSGFIITFLMQREYEDRTINNVLTAPTSRGRYLFGKLVIWFIWYLGTLIGVVTIYTIGGWLIYPDTFGLTGTKILVSTLLKYCLLGFVAAIPLLTISVVQRKLFYPTIMVALVFTGIQTFALNIPFKFARIIPWSAVVVQSLMELTLKDDLLTLGSIFLTGIVGLLAAYWLFKKQDL >NZ_CP034169.1|WP_167494422.1|144510_144894_+|MmcQ/YjbR-family-DNA-binding-protein MENKVLQQRIETFKVFGETLKGAKVYFREDWGVLYFDLQGKMFGMMSNQASEDAIITLKNLPEKNEELREIYVGIVIPGYYTNKNHWNSIKLTSEELTDDVIKQLIEVSYQLVYQKLTKKQKAEIEG >NZ_CP034169.1|WP_137438873.1|145366_146755_+|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MRRPQKTRKLGYHQRVSVEHEGYDEVRSTSCGEQRKQDGVENLFGRILERNNLNQAYLQVVRNKGAAGADGMTVDQLLPYLKEHREELLSNLRQGNYKPQPVLRVEIPKPNGGVRKLGIPTVIDRMLQQAINQVLQPLFEPEFSDNSYGFRPNRSAHDAVKKAKSYYEQGYRYVVDIDMKAYFDTVNHDKLMYFVERKVKDKQVLKLIRQYLMSGVMENGLITTTEEGTPQGGNLSPLLSNIYLNEFDQVLENLGHKFVRYADDCNIYVRSKRAGQRVMKKSIQFLEEQLKLTVNREKSAVGSPLKRKFLGFCILPTKKGSKIRPHAKAKQRVKSKLKQLTKRNRGRSIQLILKEIKQLMTGWINYYGIGEMKEFMRELNGWLKRRIRQYIWKQWKNPRTKRKNLIRLGIDKAKAYEWSNTRKGIWSISKSHILHRSLTDKELARQGYEDISLKYQFVHSTY >NZ_CP034169.1|WP_137438874.1|146821_147103_-|hypothetical-protein MDSIICIVLGMLFANGVPHFVKGITAEKWDVPWKKPASASTNVLWGIANWLVVVILYALFKPDVNSFDAACFLIGMGITGYYLALHWSEKTIE >NZ_CP034169.1|WP_137438875.1|147286_148126_+|aldo/keto-reductase MKAPLITMNDGHQIPAVGLGTYQIRGGEGLDQILTAIQDGYRLLDTSTNYDSEGIVGEAIRRSGIPRSEFFVTTKLPGKYHHYEDALMMIQESLFRMGLDYFDLYLIHWPLPKRGLYVEAWKAMVTAQKLGLIRSIGVSNFEPEHLDKIIDETGVTPAINQIEIHPYWVQERMVKANQERGILTEAWSPLGRGSDALKEAVITELAEKYGKTSAQVILRWHAQRGIIPIPKSRNIQHQRENLAIFDFELTQTEIERINLLEKADGRIEGQDPNEYEEFD >NZ_CP034169.1|WP_016179407.1|148289_148601_+|hypothetical-protein MKKVVALMGVLAAILLFFWFNQKGEVKEQTTADFSQPEQVEPSEDFFTNRDLNELEMVTYSRHQEMMDDLTGEGKLVRKSTHKEFVGAKANGEGLSWTAYFEK >NZ_CP034169.1|WP_137438876.1|148662_149307_-|ABC-2-transporter-permease MISNLLYKEIRLAAHPNLFVFTLMGPLVLIPGYPYTMVFLFSLIGNFVNLMYTRETNDIYYSTLLPLKKAEVVLGKWLVLLVSQLLTILISIPFAFLRLQLVSQPNPVGIEANTAFYGFGLMIFACFNLIFLTTYFKTGYKVGASFLKGLFPATLLAIILEVIVHFPAFKWLDSVTFNGQMQQLPILAAGILIYIVAMWAAYKISVQRFTQVNL |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP034169_1 | 1.5|137726|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 137726-137761 | 36 | NZ_CP034169.1 | 1416560-1416595 | 0 | 1.0 |
NZ_CP034169_1 | 1.16|138449|37|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 138449-138485 | 37 | NZ_CP034169.1 | 3326710-3326746 | 0 | 1.0 |
1. spacer 1.5|137726|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 1416560-1416595, mismatch: 0, identity: 1.0
ttagaaacaggacaaattgagacagtagaaattacg CRISPR spacer ttagaaacaggacaaattgagacagtagaaattacg Protospacer ************************************
2. spacer 1.16|138449|37|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 3326710-3326746, mismatch: 0, identity: 1.0
tcttctgaataccgttgctagtcatagctgttcccac CRISPR spacer tcttctgaataccgttgctagtcatagctgttcccac Protospacer *************************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP034169_1 | 1.19|138648|35|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 138648-138682 | 35 | NZ_CP019949 | Methylocystis bryophila strain S285 plasmid p1, complete sequence | 72441-72475 | 7 | 0.8 |
NZ_CP034169_1 | 1.1|137463|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 137463-137498 | 36 | NZ_CP029399 | Streptococcus suis strain HN105 plasmid unnamed1, complete sequence | 17466-17501 | 8 | 0.778 |
NZ_CP034169_1 | 1.1|137463|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 137463-137498 | 36 | NZ_CP013709 | Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_2, complete sequence | 194748-194783 | 9 | 0.75 |
NZ_CP034169_1 | 1.1|137463|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 137463-137498 | 36 | NZ_CP013682 | Clostridium botulinum strain 1169 plasmid pRSJ8_1, complete sequence | 196628-196663 | 9 | 0.75 |
NZ_CP034169_1 | 1.1|137463|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 137463-137498 | 36 | NZ_CP013295 | Clostridium botulinum strain CDC_54064 plasmid pNPD1_1, complete sequence | 10363-10398 | 9 | 0.75 |
NZ_CP034169_1 | 1.1|137463|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 137463-137498 | 36 | NZ_CP013844 | Clostridium botulinum strain A634 plasmid pRSJ19_2, complete sequence | 25194-25229 | 9 | 0.75 |
NZ_CP034169_1 | 1.4|137660|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 137660-137695 | 36 | NZ_CP042928 | Bacillus cereus strain G1-1 plasmid unnamed, complete sequence | 304407-304442 | 10 | 0.722 |
NZ_CP034169_1 | 1.4|137660|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 137660-137695 | 36 | NZ_CP040341 | Bacillus cereus strain DLOU-Tangshan plasmid unnamed1, complete sequence | 313264-313299 | 10 | 0.722 |
1. spacer 1.19|138648|35|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019949 (Methylocystis bryophila strain S285 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
gtcatcg--ggaaaatgcaacgagattctcgaaacgc CRISPR spacer --cttcgacgagaaatccaacgagattctcgaagcgc Protospacer * *** *..**** ****************.***
2. spacer 1.1|137463|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029399 (Streptococcus suis strain HN105 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
caatcaaggaggaaatattatgaataaaactttagc CRISPR spacer aaattaaggaggaaataatatgaataaatttgaaac Protospacer ***.************ ********** .* *.*
3. spacer 1.1|137463|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013709 (Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
caatcaaggaggaaatattatgaataaaactttagc CRISPR spacer ttaaataggaggaactaatatgaataaaactttaaa Protospacer . * ******** ** ****************.
4. spacer 1.1|137463|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013682 (Clostridium botulinum strain 1169 plasmid pRSJ8_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
caatcaaggaggaaatattatgaataaaactttagc CRISPR spacer ttaaataggaggaactaatatgaataaaactttaaa Protospacer . * ******** ** ****************.
5. spacer 1.1|137463|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013295 (Clostridium botulinum strain CDC_54064 plasmid pNPD1_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
caatcaaggaggaaatattatgaataaaactttagc CRISPR spacer ttaaataggaggaactaatatgaataaaactttaaa Protospacer . * ******** ** ****************.
6. spacer 1.1|137463|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013844 (Clostridium botulinum strain A634 plasmid pRSJ19_2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
caatcaaggaggaaatattatgaataaaactttagc CRISPR spacer ttaaataggaggaactaatatgaataaaactttaaa Protospacer . * ******** ** ****************.
7. spacer 1.4|137660|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP042928 (Bacillus cereus strain G1-1 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
aacgttttaaatctgcagaatggctagatgccgata CRISPR spacer gctgttttaaatcttcagaatgactagatagccact Protospacer . .*********** *******.******. * *.
8. spacer 1.4|137660|36|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040341 (Bacillus cereus strain DLOU-Tangshan plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
aacgttttaaatctgcagaatggctagatgccgata CRISPR spacer gctgttttaaatcttcagaatgactagatagccact Protospacer . .*********** *******.******. * *.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
161937 : 226390
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP034169|161937:226390|DBSCAN-SWA TATGTCGAAAATTCGTGTGCGCTACGCACCAAGTCCAACAGGACACTTACACATCGGAAATGCCCGAACAGCCTTGTTCAATTATCTATTTGCTCGCCATAATGATGGAGAATTCATCATTCGGATCGAGGACACTGACTTAAAAAGAAATATCGAAGGCGGCGAAAAAAGCCAATTAGAAAACTTGGCTTGGTTAGGGATTGATTGGGATGAATCCCCTGAAAATCCTGGGAAATATGGTCCTTACCGTCAATCAGAACGACGCGACGTTTATCAGCCGTTAATTGATCAATTATTGATGAGCAATTTGGCATACAAATGCTACTGTACTTCTGAAGAGCTGGAGGCTGAGCGTGAAGCGCAACGTGCACGCGGCGAAATGCCTCATTATTCAGGCAAGTGTGCCAATCTAACACCTGAGGAACAAGCAGAAAAAGAAGCACAAGGCCTAGAACCAGTTATTCGCTTCCGTGTCCCTCGCAATACCAGCTTTACGTTTGATGATATGGTTAAAGGCGAGATCAGCTTTGAATCGGATAATGTCGGCGGCGACTTTATCATCCAAAAGCGTGATGGTATGCCAACATATAACTTTGCAGTAGCAGTAGATGATCATTTAATGAAAATCACGCATGTACTGCGTGGTGATGATCATATTGCCAATACACCAAAACAATTAATGATCTACGATGCCTTTGGTTGGCCGCGTCCAACATTTGGTCATATGACCTTGATTATCAATACTGAAACCGGCAAAAAACTAAGTAAACGTGATGAAAGCATTTTGCAATTTATCGAACAATATCGCGAATTAGGCTATTTGCCAGAAGCAATGTTCAACTTCATTGCTTTACTTGGCTGGTCGCCAGTTGGTGAAGACGAGATCTTCCCGCAAGATGAATTGATCAAGATTTTTGATACTGATCGTTTAAGTAAATCACCAGCAGCATTTGATCAGAAAAAATTAGAATGGGTCAATAACCATTACATCAAAGCGATGGATTTGGATAAATTAACTGAATTATGCTTGCCATATTTAATCAAGGCTGGTAAAGTCGAAGAAAATCCAACGCCTGAACGTAAGGATTGGGTGAAACGTGTAGTCAGCTTATATCAACCACAAATGAGCTACGCTGCGGAAATCACTGAAGTATCAAGTTTGTTCTTCCAAGATCATCTTGAACTAGACGATGCCGCAAAAGAAGTGTTAGCTGGCGAAGGTGTCCCAACTGTCTTAGCTGCCTTCAAAGCTCAGCTAGAAAGCTTAGAAACAGTTGACGCTGCTAACGTTTTGGCTTCAATTAAGGCTGTTCAAAAAGAAACAGGAATAAAAGGGAAAAACCTTTGGATGCCGATTCGTGTAGCTGTCAGTGGTGTGACACACGGACCAGAATTGCCAGAAACAGTTGAAATCTTAGGCAGAGAAAAAGCCCTAGCACATTTAGATCAAGTAATGTAAACACAAAGAAGAGAAGAAGTAGTAGGTGACGATTTTTCAGAGAGACTGCGGGTGGTGGAAGCAGTCAAATCAGCACTTATGAAATGCACCTCCGAGTGGTCTTAGCGATATGTAGCTAAGGACGTTTCACAGACGTTACCTGTTTGAGGCAGATACTGCAAACAAAAGTGGGACCACGTTAAAGCGTCTTTTGAGGAAACTCAAAAGACGCTTTTTTGCGAGTTACGCTTTTTGCAGTTTTGTGTTGTGCAAGGGTCAAATAAGGATTTTTAACTAAACTAACAGATGCGTAGTTTAGCGGAATCGTATGCGAAACGACTATAAGATCATTTTTCTGATTTTTGGAAAAATGAGTTCTTTAATTGGAGATAGCCTAATAGCAGGGAATTGGAAATGTGTTGAATGTTTTATGGATAAAAGTCTAAAAATAAAAAAGGAGTTGAGGTAAATGGGATGGTGGCAAGAAGCGATTGCAGCAGCGAAGAAAAATGATCCGGCAGTTAGGACTGGCTTAGAGGTTGTGCTTACATATCCAGGTGTTCACGCGTTGTTTTTTCATAAGTTTTCACATTTTCTCTATCGGCATCAGTGGTTTTTGTTGGCTCGAATCCATTCGCAATTTTGGCGTTTTTTAACGGGGATTGAGATTCATCCTGGTGCTAAGATCGCTCCTGGTGTTTTTATTGATCACGGAATGGGTGTGGTGATTGGTGAAACGGCAGAGGTTGAGCGAGATGTTGTGTTGTTTCATGGCGTAACATTAGGCGGAACAGGAAAAGATACTGGCAAGCGGCATCCCACTGTACGTCAAGGTGCTTTTATTTCGGCGAATGCTCAGATCTTGGGACCAATCGAAATCGGGGCAGGAAGTAAAATCGGTGCGGGGGCTGTTGTCTTAGAAGATATACCAGCGGATGCGACTGCAGTAGGTGTACCAGCAAAAGTAGCAAGATTACATGGAAAGAAGGTTCAACATGATTAAAATACACAATACGTTGACACGTGAAAAGGAAATTTTTAAACCAATCGAGGAAAATAAAGTCCGAATGTATGTCTGCGGACCAACTGTTTATAACTATATTCATATCGGGAATGCCCGTAGTACGATTGCATTTGATGTCATTCGTCGTTACTTTGAATATCGCGGCTATGAGGTGAATTTTGTATCGAACTTTACCGACGTTGATGACAAAATTATCAAAGCTGCGAAGGAATTATCCATTAGTGCACCAGAAGTAGCCGATCGTTTTATTGCAGCCTTTGAAGAGGATACTGCAGCGCTGAATGTAAAGCCAGCGACATTGCATCCGCGTGTAATCAATCATATTCCTGATATTTTAGCATTTATCGAGACCCTGATTGAAAAGGGCTACGCTTACGAAGCACACGGGGACGTCTATTACCGTACTCGGAAATTCGAACATTATGGCGAATTGAGTGATCAATCGATTGATGAATTAGAGGTTGGCGCGAGCCAACGGACTGGTGCGGAGCAAGCAATTAAAGAGGATCCATTGGATTTTGCCTTATGGAAAAGTGCGAAGCCGGATGAAATTTCTTGGGAGTCTCCTTGGGGTGAAGGACGACCAGGCTGGCACATCGAATGTTCAGTGATGGCGACAAAACACTTGGGAGACACGATTGATATTCATGGCGGTGGACAAGACTTGGAATTTCCTCATCATGAGAACGAAATTGCCCAAAGTGAAGCCAAAACAGGGCAACGTTTTGCGAACTATTGGATGCACAATGGCTATGTAACCATTGGAGAAGACGATGCGAAAATGAGCAAGTCGCTAGGAAACTTTGTAACTGTTCACGACTTAGTCAAAGAAATCGATCCTCAGGTTTTACGCTTCTTTATGGCAACGACACAATATCGTCGCCCGATTCGCTACAGTGAAGCAACCATGAAGGATGCTCAGGCCAATCTGCAAAAATTACGTACTGCCTTTGAAAATGCGGCCTTCCGTCAAGATACAGCGGAAGCAGCGTTGGCTGATGACCAAGAAAAAACGAGTGAGCTACAAGTGCTGAAGGATCGGTTTGTTGAAGAGATGGACGATGACTTCAATGCGGCCAATGGGATCACGGTTGTATATGAATTAGCAAAATGGCTGAATAATTATAGTGAGCAAGAAAGGGTTTCGGCAGCGGTCTTAGCGACAGCACTAGACGAGTACACAAAAATGTTGACTGTTTTTGGAATAGAATTCCAAACTGCTGGTTTATTGGATGAAGAGATTGATCAATTGATTGAAGAACGGAATCAGGCTCGTAAAGACAAAAATTTTGCTCGCAGTGATGAAATTCGCGACCAATTAAAAGAACAAGGAATTATTTTAGAAGACACCCCACAAGGCGTCCGCTGGAGACGAGCATAATGACAGACTATAAACAATTAAACGCATTGGCACTAGCATATGTTGGTGACGCAATCTATGAAACTTACGTACGGGATTATCTAGTCCGTGAGGGCCAGACACGTCCGAATAAGCTGCATCATATGGCGACTCATTTTGTTTCCGCCAAAGCCCAAGCAATGTTGATCCAAAAAATGCTCGATGATGGTATGCTGACAGAAGAAGAGCAGGGAATCTACCGACGTGGACGAAATGCCAAAAGTTACACATCAGCAAAAAATACCAACATCATGACCTACCGTATGTCTACGGGTTTTGAAGCATTAATGGGTTATCTACACTTATTGGAACGAAAAGAGCGATTAGAAGAATTAATCGCATGGTGTTTAGAGAAAGCGGGCGAAACAAATGAAGGATAAGAAGCAGCGTCGAGGAAATGATCGACGGAATCAGCGGAAAAATGATCGGTCTAAAGATCGCCGCAAAGAGACGGAAACAGTTGAAACAGAAGAGAATAATTTTGTTTTTGGTCATCACGCCAGTGTGGAGGCACTTCAAGCTGGTCGAGGCAATAAATTATTTATGCAAGAGGATGCGCGTGGAGACAAGATTGAGCAGTTGAAAGCTTTAGCGAAGGAACAAGCGGTTCCGGTGAAGTGGGTACCTAAACAAAAACTGGATACATTAAGCGACGGTGGTGTTCATCAGGGAATCGTTTTAGGAATTACTCCTTATGAATATTTGACCTTGGAGGACTTGTTAGCAAAAAATACTTCAGAAGCGGCGCCCTTCCTGTTGATTTTGGATAGTTTAGAAGACCCACATAATTTTGGCTCGATTTTGCGGACGGCCGATGCCAGTGGCGTGTCAGGCGTAATTATTCCAAAACATCGCTCAGTAGGTATTACACCAGTTGTGACGAAGGCTTCGACCGGTGCAGTAGAATACGTGCCGATTGCTCGAGTAACGAATTTGGCCCAAAGTATTAAGCAGTTAAAAGATGCAGGATATTGGATTTTCGGAACAGACATGGAAGGAACGGACTATCGTCAATGGAAGGTGGAAGGACCGATCGCTTTGATTATCGGTAATGAGGGCAAAGGGATGAGTGCTGGACTGAAAAAGGAAGTTGATGAGATGTTAACGATCCCTATGACAGGACATGTGCAGAGCTTAAA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81 | Enterococcus_phage(34.09%) | tRNA,portal,capsid,terminase,transposase,integrase,protease | attL 151283:151299|attR 202066:202082 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1058818 : 1116550
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP034169|1058818:1116550|DBSCAN-SWA 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53 | Bacillus_phage(23.08%) | transposase,integrase | attL 1071858:1071873|attR 1118359:1118374 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1371123 : 1443364
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP034169|1371123:1443364|DBSCAN-SWA 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76 | Enterococcus_phage(38.89%) | tRNA,portal,capsid,terminase,transposase,integrase,protease | attL 1377032:1377047|attR 1422724:1422739 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1905815 : 1971575
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP034169|1905815:1971575|DBSCAN-SWA 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80 | Streptococcus_phage(27.5%) | holin,head,tail,portal,capsid,terminase,transposase,integrase,protease | attL 1905710:1905740|attR 1949319:1949349 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
3124896 : 3133983
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP034169|3124896:3133983|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP034169|3124896:3133983|3131297_3132014_-|WP_137439952.1|DBSCAN-SWA MEKGTLIYEGKAKQLFQTDDPAIIWVEYLNQATALNGAKKDQISGKGELNNQITGLIFDFLKSKGITNHYIKQLSETEQLIQNVEIIPLEVVVRNIAAGSFSKRLAIPEGTPLKSPIVEFYYKNDELDDPMVIDAHILTLELATAEELTQLRQKALAVGEALTELFDSIDITLVDFKLEFGRQKDGSILLADEVSPDTCRLWDKQTNEHLDKDIYRRDLGDIIPVYQEVLNRLEKRGE >NZ_CP034169|3124896:3133983|3130358_3131039_-|WP_127979038.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDLDMYWAMKEIMGADCEYVRYDADSLEGFDGVLLPGGFSYGDYLRCGAIARFANIMSEVIRFAEEGKPVFGTCNGFQILTEAGLLPGALRRNESLKFISKITPLRVVNNQTKFTSEYQANEVIQIPVAHGEGNYYCDDETLAELKANNQIVFTYEGENINGSIENIAGITNKAGNVLGMMPHPERAMEKLLGSDDGKKFFASILTNFGKVTAN >NZ_CP034169|3124896:3133983|3128139_3130359_-|WP_137439951.1|DBSCAN-SWA MMKLEPTAQEIKDQRIYAGWGLTDEEYRLISEDILGRLPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTDGPQVLQGPGEGAGIVDIGDNQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIAVLDSLRFGELTTERTKYLLEEIVAGISGYGNCIGIPTVGGEVAFDPCYEGNPLVNAMCVGLIDHKDIQKGQAKGVGNSIMYVGAKTGRDGIHGATFASEEFVEGEEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLELILDHSDILVGIQDMGAAGLVSSSSEMASKAGSGLKLYLDDVPQRETHMTPYEMMLSESQERMLICVEQGHEDEVVELFKRYELDAVTIGEVTDDGLYRLYHHGEEVANLPVDALAEDAPVYENEKREPVRIQEFANMEDFKPEVADASETLLTLLQQPTIASKRMIYETYDSQVRTNTVVRPGSDAAVLRVRGTNKALAMTTDCNARYLYLNPEIGGQIAVAEAARNIVASGGQPLAITDCLNYGSPEKPEGFWELWTSADGISEACRTLNTPVISGNVSMYNETNGKAIYPTPMIGMVGLIEDLSHITTQEFKAVGDFVYLVGETKADFNGTEIQKMQKGLIEGKLMDFDLAVEKANQDLVLSAIKADLVASAHDCAEGGLAVAVAESAFTNQLGVDITVEMPVENLFAETQSRFVLSVKPEKQAEFEALAGDKAVKIGEVTNTGDLKLTALGGEINVATKKAEELWEEAIPCLMK >NZ_CP034169|3124896:3133983|3132687_3133983_-|WP_137439953.1|DBSCAN-SWA MIPRYSRDEMGNIWSDENRYKAWLEVEILADEAWAELGEIPKEDVEKIRANAGFDIDRILEIEQSTKHDVVAFTRAVSETLGEERKWVHYGLTSTDVVDTAYGYLYKQANDILRQDLQDFLTIIGEKALEHKDTVMMGRTHGVHAEPTTFGLKLATWYSEMKRNIDRFEHAAKGVEAGKISGAVGTFANIPPFVEEFVCEKLGIRPQEISTQVLPRDLHAEYFSSLALIATSIERFATEIRGLQKSETREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMTGLARVVRGHLITAFEDVALWHERDISHSSAERIITPDTTILVDYMLHRFGNIVKNLTVFPDNMKRNMEATFGLIYSQRVMLKLIDKGMTREEAYDLVQPKTAYAWDKQTQFRPLLDADEKITNVLSKADLDDAFDYNYHLKNVDTVFERVGIK >NZ_CP034169|3124896:3133983|3125474_3126518_-|WP_137439950.1|DBSCAN-SWA MGNAYSRAGVDVEAGYEVVERIKKHVKRTERLGVMGAIGGFGGCFDLSQFDLKVPVLVSGTDGVGTKLMVAIQADKHDTIGIDCVAMCVNDIVAQGAEPLYFLDYIATGKNVPARLEQVVAGVAEGCVQAGAALIGGETAEMPGMYGEDDYDLAGFTVGIAEKRQMITGEKIQAGDVLVGLPSSGIHSNGYSLVRKVFFEINSFALDEKLPELSGKLSDEILTPTRIYVEAVLPLVKKELVNGIAHVTGGGFVENLPRMLPEKLACEIELGSWPVLPIFNALEKYGEIPEMEMYEIFNMGIGMVLAVAPEKLAELQADLKERNEASFVIGKVTEKKDTAIVFKGAKA >NZ_CP034169|3124896:3133983|3124896_3125478_-|WP_137439949.1|DBSCAN-SWA MRIAVLASGNGSNFEVIAQAIKDKEIEAELVLLFSDHHDAYVLERGKKFGVPCESFELKEFSDKKNYEAALLELLKRYKAELVVLAGYMRIIGKELLEAFPNRIVNIHPALLPNFPGLHGIKDAYEAGVKETGVTIHFVDSGVDTGPIITQGKVQVAESDRLEDLEKKIHQVEHQLYPQVLAEIVKEFHRDKE >NZ_CP034169|3124896:3133983|3126715_3128155_-|WP_016180331.1|DBSCAN-SWA MFNEVKSLNEECGVFGIWGHPDAARVTYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDAGKLNGHRGLGLLSEVFKNERQLSRLTGQAAIGHVRYATAGTSSVDNIQPFLFNFYDGAFALAHNGNLTNAKSLRKELEIDGAIFHSNSDTEILMHLIRRSQKETLCERMKEALNTVKGGFAYLMLTEDSMVAALDPNGFRPLSIGQMVNGAYVVASETCALEVVGAKFIQDVNPGEIITINDEGLKVESFTENTQHAICSMEYIYFARPDSNIAGVNVHSARKNMGRILANEAEIEADMVVGVPNSSLSAASGYAEESGIPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRMKLSAVRGVVEGKRVIMVDDSIVRGTTSRRIVNLLKEAGAKEVHVRIASPPLRYPCFYGIDIQTRKELIAANHSIEEIREMIGADSLSFLSEDGLINAIGLDFDAPYSGLCMAYFNGDYPTPLYDYEEHYQATLKEKISFY >NZ_CP034169|3124896:3133983|3132151_3132643_+|WP_016180336.1|DBSCAN-SWA MFVFITGGSISFLEATQRQRLHFVKMVLYLIRMIYMGESLMLDAPAAAKKFLDSMLETDKQHLLNALLGLDTTHSINCNTSFYSYRNLKKILHPRQSQAMQSLHFSNQSQDELIIRQLKDHSFLKNSYRIEIRLNSQTYDYQLISCLLERLHESCFVDVYSYA >NZ_CP034169|3124896:3133983|3131040_3131295_-|WP_016180334.1|DBSCAN-SWA MYFVKVYVTYKDSVLDPQGEAVKGAVHRMGYNEIEDVRIGKYFEIKVAKSDRPVEEMIEEVCDKLLANVNMETYRYEILTSEEV |
9 | Synechococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
3250503 : 3334562
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP034169|3250503:3334562|DBSCAN-SWA 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93 | Enterococcus_phage(33.33%) | holin,portal,capsid,plate,transposase,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3393100 : 3451515
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP034169|3393100:3451515|DBSCAN-SWA AATGTTTTTTCTCGGTATTGATATTGGTAAGCAACACCATGAAGTTGGATTGATTGATCAACACGGAAAATCGATCGGAAAAACCATCCGTATCTCCAATACCAAATTTGGCAGTGAACAACTGCTTGCTTTCTTCAATAAACACGCGTTACTTCCAGAAAACACCATGGTCGGAATGGAAGCCACTGGTCATTACTGGCTGTCCATCTACACTTTCGTGCATAAGCTAGGCTTTCATACCACTGTTTTCAATCCAATACAGTCCGATGTATTACGCGATTTTTACATTCGGAAAACAAAAACTGATACGATTGATGCTTTATTGATCGCCCAAGTCATTCGATTGGACTTGCCCGATAAAACCGAACTTCCCGCAGAAGATATTTTCCGATTGAAACAGCTGGAACGATTCCGCTATGGTTTAGTGGATCGGTGTTCTGACTTAAAAAGAAAAATTCTTGCTTGTTTAGATCAGGTCTTTCCTGAATACGATCAGATTTTTTCGGATGTGTTTGGTTGTTCTTCCACGCAAGTCTTACTAAATTCTCCTATTCCAGAAGATCTTCTTGAGATTGATGCCGAACGTCTCATTGAAACCATCAATACCGCAAGTGAGAAACGGTTAGGAATCGCTCGCTCAGAAGAAAAAGTGATGAAATTGAAAGAAGCTGCGGCACATTCTTTTGGCATTTCAATTGCTTCTGATGTCTTCAAGTTAGAGATTCAAATCATGTTGGAACAGATTCAGTTGCTTGATTCTCAAATCAAGATCATTGAAGCAGAAATTCAAGAAATCGTTTCAAAACAAGAAAACTATTTGACGACCATTACAGGGATTGGTGACATTACTGCCGCTGTCCTCATGGCAGAAGTCGGGGATATCAAACGTTTTGAACGCCCCAATCAGCTCCTTGCTTTTGCTGGACTGGATGCCTCTGTTCATCAGTCTGGAGATTTTACAGGAACCAAAAACAGACTTTCTAAGCGTGGTTCTCCTTATCTTAGAAGAGCCATTTGGCAAGCTGCTTTTGTCGCCGCATTTAAAGATCCTGCCCTTTCCTTGTATTATCAAAAATTGAGAAAACGAGGAAAGTCACATGGAACCGCCATTGGTGCAGTTGCCAGAAAACTCGTGAATATCATTTTTGCCGTTTGGACACAAAACAAACCTTACGAAGTTCATTTTCCCGAAGATATCTCCGAAAAATAAATTTTTCATTCGATTTTTGGAGGTCTATTTGGTGTGTTTTCTTAAAGATAAAAGAAATTCCTTTTTCACTTGACTAATTCATAGCTAGCTTTTTCTTCCATTGTAATAAAAATATCGTTTGCAAACTTGATCTCATTTGTCATTTTTTTGTTGAAGTTTGCGAATTTTCTTTTGACCAAGTAATAAGCTGATTAATAATATTAGGAATTTGTATTCCTTCATTTTCTAGTTTTCTCAACTCATAGAGCCATCGATCTCCGACTGAGAATAACTCGTCTTGTTCAGGTTGATGCAAAGAAACCACTACATTTGTTTCTTTGCTATGATCGAAATCACTCATACTTCGATGAATGGCTGAGATACTATAGCCTGCTTGACGCAGCATGTAGATAACATGAAACCTAACTAGCATTTTCTCCGAATAGTAAGTAGTCTTCGCTGATTCGCAATGATTTGCATGGACGAGCCCGTTTCTTTCCCAATTCCTCACCGCTTCAACAGTCACCCCAAAAATTTCAGCAACTTCTTTTCTGTTATATCTTTTCTCTTCTGTGTTGTCGTCTTGCGTGTTTGATGTATTGCTCCAATCCAATAGTATTTTACCTGCCTGCTCAGCAAGCTGGATTTCATTTCTGATAGCGGCAATATAGTCTTCATAACGTCTTTGACTCATTTGTCAGTCTTGTTTAGCGATCGCATGCAATAGAGCATCACCTGTTTTTTCTAATAGCTCTTTTTGTAAATGGATAGCCAAAGATTTTTCGGCATATTTGCAACTGCAGTACGTGAAGCTCAGTAAATTCTCGATAACCATTTTTACTTCGCTGGGCTTTGCTGATATACGACAATTTTTCATATAAACGGATGGTATTAGGATGAACAGCAAACATTCTTGCTAAATCGATTACTCTATAAATGTTTCCTTTAGTCATTTTACCCCTCCCGTTAGTCGTTTATCTTTGCATAGTAATGATCTTTTTTAAATAGCTTATCCCCATTATAACCAAAACAGCTCCTGTAATGAGTAATATCTGTTGAACACGCACAATATCTGCCAAAGGACCAAAGAAAAGAATAGCGATCGGCATTGCACTGGCTGTAATTACTTGAACTATTGAGAAAACCCTGCCCAAAAGCTTTGGATTTGCGGTTTGTTGAATTTTAACAGTTTGCAAGGTCACGATAATTGGTAGCAGAATTCCTGTGAGTCCTACTAAAATTTGATACAGCCAAAAGTTGGAGACTGCACCTTCTAAAATCAACAATAGACCAAAGGTTATCAGCAGGTAGGAAATTACTCTTGCTTTTTGTTTGACATCTCCAAAAAACGAGAGAGATAGACCGCCAATGATTGAACCAAGTCCCCAAATGATTTGGTTGAAACTTAAACGCCAAAGCTCATTTCCAAAACTGCGTTCAATTAGCAATGGAGCTAGCGTAGCAGCAGGTGTAAACAGCACAAATGAAAGTGCATAAGCCAACATGATTTGTCTCAATTGACGATGATGAAAGGTATAGGTTAGTCCCTTCTTTAAATCTGTTAAAATATCTGATCGCTGATCTTTAGAGATCTTTTTCTCTATTTTTAATCGAAACATAATCAGAACAGCTGCTGCAGCCGATAAAATATCAATAATAAATGTCCAAACAAGACCAAACTGATTTAACACTAGTCCGCCTAGTGCAGGAGCCAACAACATCATCGCGGAACCTAACGCTTGATTAATCCCTTGTACTCGAGCTAATTGATTCTCAGGTACTAATTCAGGAAAAAATGAGGTCACCGCAGGAGTCTGAACACCAGCGCCAATCGAGCGCAGCATCGAAACAATTAAAATCAAATAAAGGTTTTTAAACGCTGAAATAAAAGCAACGACTAAAATCAATGTTGCTATAGCAATGAATGTGTCAGAAAGTATGATCAGCGTTTTCTTGTTATATCGATCTGCTAAAACACCGCCCCATAAAGAAATCAAAGCCTGAGGCATCATCGAGCACACGGTAATCATTGTCAGCCATCCCCCCGATGAAGTCTCTAAAGTTATATACCAAATGATGGCGTAACTAACTAGCTGCGAGCCAAAGAGAGAAATATTTTGACTCGCTAAAAATAAGCCGATTACTTTATTCATAAATATATTCACTAAGCCACCTCCAATACTTTGATAAAAGATTAGCATGCCACTACGAGGTGGTGTATGACTGTAAGCTTTGTTTTTTTTTGCTTATTGATACAGGGTTTTAAAATGACTAACAACTGCAAAAAAACAAGGATATCTTATACATATCCTTGCTCACGTATCTATTTATTTTTTGATTGGCAACCAGATTTCTAAACAAGCTTGACCCTCTAAAGACACATAGGTCTCTAATTCCGGTCCATCGCATTTTTGATAGTTTGTTTGCGGCAACCATGTATTGAAGATTTGCTGCTGTAACTGATAATAGGCATTTGAGACATTTTCTGTCTTGTGATAATCATAGGGATCACTTACAAAAACAGCATACGTCTGATCAGGAATTTCCAACGTTACATATTCAGTTGAAATATCCTGATTTAAAACAAAGCCGGTAAAATAATTTAAGTATCCCGACTTTGCTGGGGCGGGATTAGCAATGGCAAAATAAGGTTCTCGCTTTAACCCAAAAAAATTCTTACGGATCGCATCACTTTCAGCAAACGTTCGTAATGCTTGATCTCTGAAAAACTGTTCCCACTGCTTTCCAGTATTTTTGAACAGCTCATCTTCTAAAAGAAGCTCCTTCATTTTCCCAACCACCGTAAAACTCGACAAATGCTCAATATGATAATTTAGTGTTTTACCACCGTTAACCTGGATATCCAAACGAATCGGCGGAAAGAAATTAATCGCTGCATGAATCGATTTTGTCTGGCTTGGTGTGAGACCATGAAATTTAGAAAAGGCACGATTAAAAGCAGAACGATTGGCATAACCGCATAAGTCAGACACTTCATCAATTGGAATTTCCTGACGTAATAAATCCACAGCTTCAGAAAGACGACGATTACGCAAATAAGTTGAAAAAGAAAAACCCGTTAAATAAGTAAAAAAGCGATGGAAAGTATATTCTGATAGTAATGCTTTTTTCGCTAAGTCCTTAAGGATGATATCTTCAAATAAATGATTTTCAATATACGCTAAAGTAGCCGAAAAACGTTCAAGGTCTTTTGACATGAAACTCCTCCTGTAATTCTCTTTAATCAGAATAGCATATCAAGGAAAAGTTACGAACCTCTACTTGTTTATTTCACCTATTTTTTTCGTACAGGCACCCAAATTTCAACCTCATCGCCTTGACCGTAAACTTCCAAATCCGGTCCAGCAGAAACCATCTCACCTGTTGCATAGCCTGTATTTAACAATTCATAGTCATTTGTCTGTGCTGCCCATTGGGTTACAATCGCAAACTGTGTCTTTCCAGAAGTTTTTCTGGTACATGGAAAAACGGCCCAACTATTTGCCGGTACTTCTACTTCTGTTAATTCTTCAGGTATCTCACTGGTGGTTGCGACTGCAATATAATAGTCGAACTTTTTAGCATCCGTAGTATCCACGTTATAAAAACTTGCACCAATCAAACCATAGGGTTCATGGTTGATCAACGGCAACAGTAGCTCATGCTTTCCAGAAGACATAACTTCATTCCAAAGAGCTGGACAATCCTTCATACCCTGCTGTTTTTCATTGGTGGAGGCTTTTTTAAATCCTGCTAACTTAAAATTGTCTAATTCTACGATTCGATAGTCCATAACTAATCCCTCTCTTTC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57 | Bacillus_phage(22.22%) | transposase,integrase | attL 3426376:3426392|attR 3454813:3454829 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
3454931 : 3487167
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP034169|3454931:3487167|DBSCAN-SWA TATGTTCAAAATCTTTCGTAAAAATTGTTGTGGCTTGGATGTCCACAAAACGTGGATCTATGCGTGTATCGGAATCACAGATGCGAATGGTCGTACAGTGTATAAGCAAGCTCGCTTCTCTTCCTTTACAAAAGGTCTCAATGAATTAGCTGAATGGCTTGCTAAATACAACTGTAAGGATGTGTGTTTGGAATCTTCCGGTAAATTTTGGATCCCTGTTTTTAATATTCTTGAAAAAACTTGTTTTGTCACACTGGCTCATCCGAAGTACACCAAACCCCAGAAAGGAAATAAAACAGATCGCAAAGATGCAAAATGGATTTGTGATCTCTTTATGTGCGACATGATCAAACCCAGTTTTATTCCTGGTCTTGAAATCCGCCAGCTTCGTGATCTAATGCGTTATCGGACGAAACTGACCAACATGAAAACAAGTGAAAAGAATCGTGCTTTAAACTGCTTAACCGTTTCTAATCTGAAACTAGATGATGTTTTTAGTGATGTGTTCGGAAAATCATCCACTTCTATCATCCAATACTTGTTAGAACATCCCGGTGAATCATTTGATGTTCGACCATTTATCCATGCCCGTTGTAAAACTCCCGTTGAAGAAATCCAAGCGGCAGTTGAGGGGGCGATTTCTGTACCTCAAGCGATTAAGCTTCGCCAATGCCTCAACCATATTAACGAGATTGAGAAGCATCGAGAAGAGATCAATCTAGAGATTCAAGCTCTTGCAGAACCCTTCTCCCCTGTTTTGGAACTACTTCGTACCATACCGGGCTTAGACACTCAGCCAATAACAGCGATTGCGATTCTTTCAGAAATAGGACCGGATATGTCCGTGTTTCCAACTTCGAAACACTTTATTTCTTGGGCTGGATGCTGTCCAAGAAACGATCGCAGTGCCCGACGAACAAAATCAACACGTATCTCTCGTGCAGGGCAGTCGTTGAAACCGCTACTTGTACAGATTGCCAATGCTCTTCTCAGATCCAAAGAACATCCAGAATTTAAAAATCGCTATCGTAGAATCAAAGCGAATCGTGGACACAAGAAAGCTATCATTGCTATTTGTAAGATGCTCCTGACCGCTATCTGGAATGTCTTATCAAAGGTGGAACCCTATTCTGCTAAAGGATATCTGGAGCCAAAACCTGCGAAAGAAGAGAAAGTTCTGACGCAATCCCAAGCTCTGGACCTTTTAAGAAAACGCGGATATACCATTATAGATAGTGCTTAAACCAAAGTTACGTTGATTCTTCCTAAATAGACTCGTTGTCTTCCATTTCAAAAATTTTGAAAACGGTAGGCTTATTTAGTGTACCGTTCTTCAGGTATCTTCAAATAGATTTATTTTCAAACTTATCACCTCCATAAAGAAGTGAGACTACAAGTCCCATTCTTACGATATGAGCTTAAAAATAAAAATTAAATCAAATATACAGTATGGTTTTTTCAAATATCATCCATAGTTAATTTATCATAATATCCCATATTTTAAAATAAAAGATAGCGTAAAATATTTTGTGTAAATAGAAATTTAGGGTAGAAAAAAAAGTCCATTCTGTAAAATTAAAGTTACCACACAGAAATTTTATAGGAGGACTTTCTCATGACTAAATTTACTATAGAAATTATGCAAACACTACTCAATAAAGGGGATTTAGATGAATTATTTCAGGATCATTTAGAGCGAGCGATTAATTCACTTCTACAAGCAGAGCTAACTGCTTTTTTAGATTACGAAAAATATGATTGAAATGGATTCAATTCAGGAAATTCCCGTAACGGGAATTATTCACGTACATTTAAAACAGAATATGGCGAGTTGAATTTAACTATTCCTAGAGATCGTAATGGCGAATTTTCTCAACAAACACTACCAGCATATAAGCGAACCAATGATTCATTAGAAACGACCATTATCCAATTATTTCAAAAAGGCATTACTATGGCTGAAATCTCCAAATTAATTGAAAAAATGTATGGTCACCACTATACGCCACAAACAATCTCCAACATGAGTAAATTGGTGGCTGAAGATGTTTTAGCTTTTAAAGAAAGAACGTTAGAAGCCAATTATTCCGTTATATTTATGGATGCGACGCATATCCCTGTGAAGCGACAGACTGTTTCGAAGGAAGCAGTGTATATTACGATTGGTATTCGTTTGGATGGAACCAAAGAAGTTCTTGGGTTTACTATTGCCCCAACTGAGTCTGCTTATATTTGGAAAGAAGTTCTTCAAGATCTTAGAAAACGTGGGTTAGAAGAAGTTTTATTAGTAGTGACAGACGGATTAAGCGGTATTGAAGAAAGTATCCATAGTGTGTATCCGAATGCCCAATTTCAACAATGTTGTGTGCATGTATCTAGAAATATCGCTCATAAAGTTCGTGTTCTAGATCGAAAAGAAATTTGTGAGGATTTCAAATTGGTTTACCAAGCGAATTCAAAAGAAGAGGCATTGGATCACATCGACTTTATGATTAGGAAATGGAAAAAGCAGTATCCAAGAGTCGTCAATTTACTCTTGAATCCTGCCCTATTAACCTTTTATAATTTCCCTCACGCCATCAGACGAACAATTTATTCGACGAACCTGATTGAAGGCTTTAATAAGCAGCTAAAACGATATACTCGAAGAAAAGAACAATTCCCTAATGAAGAATCTCTAGAGAGATTCTTCATTTCTCAATTTAATCAATATAACCAAAAATTTTTAGGTAGAATTCACAAGGGATTTAAAGAAATTCAGGATACATTAGAGTCGATGATTTAACTGTAATTAACAGAATGGATTTTCCATTTACACATAATTCTTGACGCTACCATAATCTAAATAACCATCATATTCATCTACTACTTATATAATTGAGTTTTATTAAACTTTTTAAGTTTCTATTCTATCAAATATTTAAACAATCTCTGCATCCGAAAAGACTACCTCGTATAGTTTTACTAACAATATTTTTATTAGCGTGTTCAAATCCTGATTTCTTGTATCAATTATTTTCTGTTCACTTTCAATAAGAAAAAAGTCTTTACTTCCATGGCTAATAATAAGTCTCTATTTTTCAATAACTATTGCAAAATTATATCTTAATTAAGAAAATATTTTTATTTTAAAGATAAAAAATTCTTCATCTTGCAATACTTTATATTCTATATTGTAATTATTCAGAATATTACTTACAATATATAAACCTAATCCATTACTATTTTCCTTATTTAAATCAAATTTAACATCAAATATTTTATCCATATTCGAAATTTTATTGTTACCGTATGAATTCTCTATATATAACCAATCATTAACTATCCCAATATTAATTACCCCATTTACATCAGTATATTTTACCGCATTACTAATCAAATTAGATAGAATAATCTTTAAAGCTGTTTTTCCTATATAAACATTCTCGTCTAATATATAATTATTGACAGTTATTTTCTTTTGATTTGCTAATATTTCATACTTTTTTAATATGTCTTCTAATGTATCATTTATTTTCAAATATTCTTCATCATTATTCAAATTTTCTATAGAATGAACTGATAATATTTGAGAAATATTTTTTGTTAAACTATCAACGATTTCAATACATTCATTAATATAAATATCTCTTTCTTTATATTTCCCAATATTGTATTTCATGTTTTCCAGTATTATTTTAAGACTAGCAAGAGGGGTTTTAAGTTCATGGGATGCACCTTTAAAAAAGTCATATTTTAACTTTTCTAATTTTAAAATTTCTTTATTTTTAAATTCCAAATCGTCAATTGTTCTTAATAAAGTAGAATACAAATCATTAATTTGTTGTTTTAATTCTCCAACTTCATCATTAGAGCTAACTTTTAAACTCATTTTTTTATCAAGTTTCATCATTTTATCAGTAACAATTTTTATTTCTTGTATATTATTTTTTATTGATTTTGCATAAATTAAAGAAATAATAGCAGAAAATAAAATTGATATTAATAAAGAATATGGTAAAAATTTAAGGCTTAAATCTTTCGCATCTTTTTGCATATCAGCTGTAGAAACAAATTGTAGATTTGTTTTTTTACCATCATTAAGCTTTATTTCTCTTTCTTCAATTATCAAAGAATTACTATCACTTTCTAAATTAACATTTATATTATCTTTGATTTGTATTTCATTCTTATTATTTTTTTCTTTTATGAATACTTTTATTTCACTACTCTTGGAATAAAACTCCAAAGTTTGTTCTATATATTTTATTTCTTTTCCATTCATATTACTAGAAATTTCATTTGCCATATTATGAATCTTTTCTTTTCTCGTCTCCAAATATGTTTTAGGAAAGATAAAAAAAACTAATGAATGAACTAATATAATTATTATTCCAAGAACAGAAAATATTTGTATGAACATTTTTGGAAATATCTTTAATTTTTTCATTTTCTCTCCAATTTATATCCTACATTTCTTATAGTAGTTATACAGTCTAATTGTAATTTTTTTCTAAGTTCTTTTATATATACATCTATTACTCGATCATAAGGAGTTTCTTCGCTATCTTTCCATACATAATCAATAATTTGCATTCTTGTTAACACTTGTCCATTATTATCCAATAAACATTTTAATACTTCTAGTTCTTTTGCATTTACATCTATTTCTTCACCATTTATTTTAGCTGTATAGCTATTAAAATTAACCGATAGATCCTTATATTCAAACTTCTCTAAATGTCCATAATTCTTCTTAATTAAAGAATCTATTCTAGCTTTTAAGACCGGCAATGAAAATGGCTTTTCTACATATCCGTCTACTAAATTAGTAAATGCATCAATTTTATATTCTTCATCACTAAATGCAGTCAAGATTAGAATTGGTAAATTGCTTTTCTTTCTAATTTCTTTCAACACTTCTAAACCATTTATAAAAGGTATCTGAATGTCTAAGATAACCAAATTTATATCGCTATTAAATTTTGACAAGGCTTCTCTTCCATCTTTAGCTTGAATAA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32 | Bacillus_phage(22.22%) | transposase,integrase | attL 3479672:3479687|attR 3492480:3492495 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3519393 : 3531886
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP034169|3519393:3531886|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP034169|3519393:3531886|3530341_3531484_-|WP_070504270.1|DBSCAN-SWA MTFLDLFAGIGGFRLGMEQAGHQCIGFCEIDEFARRSYKAIHDTRKEVEMHDITRVSDELVQSLGPVDIFCGGFPCQAFSIAGKRQGFSDTRGTLFFEIARFAALLQPKFLFLENVRGLLNHEGGTTFETILRTLDGLGYDVEWQVLNSKAYVPQSRERDFLIGHSRDACTEQVFPIIGSSSTSDQNIRNLVNINPSNRGMGGQVYGSDGVAPTLTGDEGIKIALPVKDGISVAGMLSGNFEQDNRVYEVTGTAPTLSTKQGGTKIMIRKNKTEYQEVKPGDSVNLAFPNSVSRRGRMGKQSVHTLLTGDQQAVVTDQYQIRKLTPRECWRLQGFPDWAFDRASQVNSDSQLYKQAGNSVTVPVIFDIARRLKEVEIHDL >NZ_CP034169|3519393:3531886|3522919_3525367_-|WP_137440028.1|DBSCAN-SWA MYPIKYIENNLVFNQEGECFAYYELVPYNYSFLSPEQKYQVHDNFRQLISQNREGKIHALQIATESSIRVTQERSKKEITGRLKEVAQQRIDLQTDALVSMIGDSQIDYRFFIGFKLIATDEEVNLKNLKKSFLSGLQEFVYGVNHHLMGDFVSLSNEEIRRYSKLEKLMESKLARRFKIRRMTPSDLTYLIEHIYGEKGTPFDEYEFQLPKKKLKSETLVNRYDLLRPTRCLIEEKTRYLRIEHENHESYVAYLTINTIVGEMEFPSSELFYYQQQQFTFPIDTSMNVEIVTNKKALATVRNKKKELKDLDNHAYQSNNETNSNVLDALDSVDELETTLDQSKESMYKLSYVVRVSAESVDELKRRCDEVFDFYDDANVKLVRPYGDMMGLHEEFLPSSKRYMSDYIQYVTSDFLAGLGFGATQMLGELEGIYFGYNVDTGRNVYLKPALASQGVKGSVTNALAAAFLGSLGGGKSFSNNLLVYYAVLFGGQAVIVDPKGERGGWKETLPEIADEINILNLTSKPENQGLLDPYVIMQKKKDSESLAIDILTFLTVISSRDGEKFPVLRKAIRTVTQSDQRGLLQVINELRNEGSPVAENIADHIESFTDYDFAHLLFSDGSITQSISLDKQLNIIQVADLVLPDAETTFEEYTTMELLSVSMLIVISTFALDFIHSNREIFKIVDLDEAWSFLQVAQGKTLSNKLVRAGRAMNAGVYFVTQNSDDLLDERLKNNIGLKFAFRSTDIHEIKKTLEFFGLDQEDESNQKRLRDLENGQCLMQDLYGRVGVVQVHPVFEELFHAFDTRPPVQERME >NZ_CP034169|3519393:3531886|3519393_3520581_+|WP_002297293.1|transposase|DBSCAN-SWA MYFLGIDIGKRTHVASIMNEEGKVLLKGFSFPNTTEGAESLIERMVDYSGAPSDFVIGMEATGHYWLSIFSYLHESDYLIHVVNPLQTDGWRKGTEIRKRKNDIIDSVLIADLMRYGSFVETVLSDENVFSLKQLSRYRTYLVGTASDFKRKIIAVLDQVFPEYATIFTKQGVFGKASKELLLAFSAPIDLENISSETLAQYLAELSRNRIKAEKADQLKQAASNSFGVKFAQEAFTFQLRSMIEQLKFIESQIKETEREIKHIMDTLNSVILTIPGIGPINGATILGEIGDIQKFSNPKKLVAYAGIDASVTQSGQYEATHNVMSKRGSPYLRKALFSAALVASQCDPVFSAFYQKKVSEGKHHLTALGAVSRKLCYVIHAILTKNEPYIIVSD >NZ_CP034169|3519393:3531886|3520791_3522915_-|WP_137440027.1|DBSCAN-SWA MRKKLFRIVGVIVISLYISLLLLSLIGTVAEATGLVDDTVKAGNLYSQYSLNNYQLDFFVDSSWDWLPWNWGDGLGKSVMYGLYAITNFIWTVSLYLSNATGYVVQEAYKLDFISDTAESIGKNIQTLAGITENGLQTSGFYFGFLLLMILALGVYVAYIGLLKRETTKAVRAVINFVMIFLLSGSFIAYAPTYITKINDFSSDVSEAALSLGTEIVVPNSESQGKDSVDLIRDSLFSIQVQQPWLLLQFDDSNIEEIGEDRVNKILSVSPDENKGKDREEAVKAEIEDNDNANLSITKTMNRLGTVVFLVLFNIGISFFVFLLTGIMLFSQILFIIFAMFLPISFLLSMLPTYESLGKKAIIRLFNTIMMRAGVTLVITTAFSISTMFFNISATYPFFMVAFLQIVTFAGIYFKLGNIMSMFNLQSNDSQSMGRRVMRKPQMLMNRKLRQLNRNVGRTLAFGGGAAVGNKLAKEQSKSKFKPSGSSLRKNSRLPNNHEAPSDSNKEKPISNNKKQSRMNLVGRKIGKVLDTQALVKDKAKQVRDQVRNTPTNLKYNLHKGIEKAKKSPEEFKRGFVQEKENRAELREKQRQSRDEKIAEKRKALNEVGNRYGKRRANIPIDKAAQPQKDRMPKKEAPKRSVKGKPNPKIKRKLASQEIISKEINQPSNKKNSFQQVKQRSTLPKRTNQKVQKRMNPRPKPRLGEKK >NZ_CP034169|3519393:3531886|3526918_3527713_-|WP_070504254.1|DBSCAN-SWA MFGGALVGNSEKMLFSKVVYLDEQAIMDFLELNNDGDESQVIKKVSESVAAIEAEASVGKGFLDFAKIKLSGNAAHKKNNLVETRITSTIISSFKAVIESHQTNILSLPKVKLFIYKDSPAYYRNLVPVLNMIDDISKMSTLSAEDKANFDGIKIQEMERTLDLLSGYYEFICEDQNGKKMITRFNISGLRNNYTLQDFTKMDLHLFGIQVGTANDANLEFGHMMDNIIQEKSKTMKSEDFDEDQRRENSDLRLPIIDILMAGV >NZ_CP034169|3519393:3531886|3528486_3528606_-|WP_070504260.1|DBSCAN-SWA MEIVKDILLVFGGSMLGVTVMCLMHASVAVDREMEKKGK >NZ_CP034169|3519393:3531886|3531529_3531886_-|WP_118368251.1|DBSCAN-SWA MILNKLKQIVMLGRQAGFFLILACQRPDAKYLGDGIRDQFNFRVALGRMSELGYSMMFGEVDKNFFMKRIKGRGYVDTGGSVISEFYTPLVPKGYDFLKKISNIAGLTVHMERENNSM >NZ_CP034169|3519393:3531886|3525353_3525743_-|WP_070504249.1|DBSCAN-SWA MKKIKSYTSIWAVEKVIYAINDFQLPFPVTFNQMAWFVLSLLFVIIFAHVPPLSMIEGAFLKYLGIPVVVTWFMSQKTFDGKKPLGFLRSFISYHLRFKVTFAGKKVKEQKKKWDEPITLVRSVNYVPD >NZ_CP034169|3519393:3531886|3528620_3529805_-|WP_070504264.1|DBSCAN-SWA MAQRNLDYRLLKGRRNEYGVSQNKLATACELSRPYLNQIENGGVTPSAKTMRKILDQLESFNPELPLTLLFDYVRIRFPTTDGRKIIQEILHLKFDYMLHEDYAFYSYQEQYVMGDIVVMLSHEKDKGVLLELKGRGCRQFETFLLAQKRSWYDFFEACLKAGGVMKRLDLAINDRVGLLDIPDLIKKCQKEECISLFRTFKSYHSGELLKPDEKDGMGNTLYIGSLKSEVYFCLYEKDYEQYIKLGIPLEQTETKNRFEIRLKNDRAYHAIQDLLKGRSIESTTFSIINRYVRFADKLEGKRRTNWPLNEQWGRFIGRNRKEIQLTSEPKPYTIERTLNWLGRQVAPTWKMAKELDRLNQTTYIRDMVNNARLSDRHKKILEQQSMAIENLIV >NZ_CP034169|3519393:3531886|3528260_3528482_-|WP_002298822.1|DBSCAN-SWA MNFGQNLYQWFLTNAQSLVLLAIVVIGLFLGFKREFSKLIGFLVIALIAVGLVFNASGVKDVLLNLFNRIVGA >NZ_CP034169|3519393:3531886|3530061_3530352_-|WP_070504267.1|DBSCAN-SWA MIYDELIGEIYWVIEKIQTDPELVEELRRLNFDIRKNGVKVPDDPYVVHEETDARIEVNQVIAEFERIAEHAKEPNIRQYLLEMKAELEADGITDE >NZ_CP034169|3519393:3531886|3527745_3528249_-|WP_070504257.1|DBSCAN-SWA MEQMRVYIANLGKYNEGELVGAWFTPPVDFDEVKERIGLNDEYEEYAIHDYELPFEIDEYTPIEEINRLCSLAEELEGMPIGEVALEIQHAFFNSFEEMVEHVDDIIYYPDCNDMSDVAYYLIVEAGDFGEVPEHLKTYIDFDACGRDLEIGGNYLVTNRGVFEYSS >NZ_CP034169|3519393:3531886|3525800_3526916_-|WP_070504252.1|protease|DBSCAN-SWA MNVEYKVFFEPVKKFNKRLESLDDVIHFSEMLRSWKPDSDLVDIINSMNNNKVCVIKTEDCSGTNSHVLENFDLLAKIFELSDVEHVLILNPPMFFYNKIQSYPEKISVKKYQYKKITEKKIQTIFENFDESILGQKDAKKSICRKLLAQLIRPSTKPLVLMFYGNPGIGKTETAKYLSRMLYGNDNIIREQMTMLGGESSVKYYKATAHSEDSFSKKLLNRSSNLILLDEFLLAPSFFHTTFFQMFDEGKYVDQNFDVDVSNSIIICTSNLLSIDDMDKNIDRALLSRFDGFIKFEDFTLDEKKDISEKVYSEITASNKMKKEYLDKIDKSAIFDKVNNKLNSLSNMRTIRKYMEDCIADSLLLDIIEKK |
13 | Streptococcus_phage(88.89%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
4026894 : 4035447
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP034169|4026894:4035447|DBSCAN-SWA TTTAAGAATCCATTCCCATAAATGTCGGATAAGCATTTTCATCATGCTCGATTTTATCCAACCCTAGTGCTTCTTCCTGTTGTGATACTCGAATAGGCATGAAGGCTCTAATTAATGAAATAATCAAATAGCTTGCTGCTCCAGCAAATACCAGCGTAAACAGCACACTTTCAATTTGAGCGATAAATAAATGAGTTTCACCATAAATTAGCCCAACTTTTCCACCAACTGAAGGATCAGCGAAAATTCCTGTTACGATTCCTCCAAAAATTCCGCCAACACCATGACAACCAAACGCATCCAAAGCATCATCAAACCCAAGCTTTTGCTTGATAACTGAAATGAAGAAGAAACAAAATGGACTTACTAAAGCACCAATTAACAGACTAGACCAAATTGATACAAAGCCAGCCCCAGGTGTAATAGCGACCAATCCTACCACAGCACCTGTACATGCCCCAACAACAGTTGGTTTACCATTTAAAATTTTCTCAATCAACATCCAAGATAGCATCGCACAGGCGGCCGCTGTATTCGTTGTAATCATTGCATGAATTGCCAAACCATCAGCAGCTAATGCTGAGCCGCCATTAAATCCGAACCAGCCAAACCATAAAAGCCCTGTTCCCAAAACAACAAAAGGAACATTATGTGGTCGATAATCACCAAGATGGTACTCGCGACGACGACCTAATACGATTGCTAAAACCAGCCCTGAAATTCCTGAACTAATATGCACGACATTTCCTCCGGCAAAGTCAATTGAGCCGATCTTATCAAGGAAGCCTCCGCCCCAAACCATGTGTGCCATTGGAAAGTAAACCACGATCAACCAAATCGCGATAAATAGAAAAATCGCAGAAAACCGCATCCGACCAGCAACTGATCCTGTTAAAATCGCTGTTGTAATCAAGGCAAACATCATTTGAAAGAAAGCAAACAATCCTTCGGGAATTCCATCACCTTTAGTCATAGAGACCCCATTGAAAAGTACTTTATCCAAATTTCCGATAAAATTTCCATCACCACTAAATGATAGCGAGTAGCCAATCACTATCCAAATCAAGGATGCTAGTCCCATTGTACAAATGACCATCATCATTGTGTTCAAAATATTTTTTCGTCGTTCTAGCCCACCATAGAAAAATGCTAATGCGGGAGTCATGAGAAAAACTAATCCTGAACAAATCAAAATAAATGCAATATTCGCTGCCATCAAACCACTCCATTTCTTTTTATGTTAAGTATTCTAACATCAATCTTAAATAAAAAAAGAGTTTTTACTCATTTTTTTCATTTTTTTCTAATTTAATCACTTTCCATGTCAGAAAACTTCACATAAAAAGAGCAGGGATAAATCCCTGCTCTTATAATTCGTGGTACTCTCTGTAAACATCTTGTTTCTTCAATCCATGTCGTTTGGCTACCGATTTAATTGCTTCTTTAGCTAGCTGTCCTTCTTCAACTAATGCTTCAACCTGCTCTTTCAACGTTCCTTGGAATACTTCCTCTTCCAATACCTCCGTTGTGCCAGAAACTAACAAGCAGCACTCCCCTTTTAAAGAATGCTCTGATAGATAATCCATCAATTCTGTTACCGTCCCCCGCAGATATTCCTCATATAGTTTGGTTAATTCCCGACAAATCACCACATCACGGTTTCCAAGAATTTCAGAAATATTTTTGAGTGTTTCTTTTACACGATGAGGCGACTCATAGAAAATCAATGTTGCTGTCTGATTTTTCAACTCTTCTAATTCTTTCTTCTGAGCGCTTTTCTTTCGTTGTAAAAAGCCATAAAAATAAAAGGGTTGAGGCAATAATCCAGAAGCAATCAAAGCTGTCATTCCGGCAGTGGCTCCAGGCAAGGCAACCACTGGAATATCCTCTTCTATGCAAGCTACCACTAATTCATGTCCCGGATCACTAATTGAAGGCATCCCAGCATCACTGACCTGAGCAATCGACTGACCTTTTTTCAAAAAAAGTAATAACTCAGGGATTCTTTCGTTATAGTTATGTTCATGTAGGCTCTTTTGTGGAACCTTCACATCAAAGTGATTCAGCAGCTTCTGGGTATTACGTGTATCCTCACTGGCGATTAAATCAACGGTTTGCAATGTCTTGACTGCACGAAAAGTCATATCCTCCAAATTACCGATCGGTGTCGGTACTAAATACAGTGTGCCAACTTCCTGTGAGAAACTTTTCTGGATCTTCACGATCATTCTCCTAACTCATTTTCATTTTTTATCTGTTAAAAATTACTATTTCTAATTCTTTCTCGTAAATCCAATCAAAAATTTGAAAAACTAGCGTTATCTTCGTGTACAGATCAATGCAACGATAGACTAAATCCAAAACTGATTAAAAAAGTGGGTGTGACGAACAGCGTCATACCCACTATTTCTAATTCATTTTATTTTTGTTTGCTTTCACGATAAATAACATCTAAACAAAAAGCACAGGGCTCATCTGCTTCACGCCTTGATCCATAAAGCAAGTTACATACGTGAAAGCCATCTTCATAAATTTTTTCAAGATTCAAACGAGATTCTGACAATTCTTGTCGCTCATCCAAGACTGGGGACTTCTTCTCATCAATCTCACGAATCCGCTCCCGCAATCGTTCATTTTCCATCTCTAATTTAGCATTTTTTTCAACGAGCTCCAGTAAGGTCTCTTTCATCGAGACTAAATCTTCGAGATTCTTTTGCATGTCAAGCTCTAATTGATTCAAGCCATCATACAAGGAACGTCGATCCATCATGACAGATCACCTGCTTCAACTAGTTCTTGATAATCAAAATCAATCGTCGCATCACGGCCAAACAAACGAACTTTAACTACTTTACTAAGTAAATTCAGGCCGATTACTTTTCCCCGACCTTCTGGTGTATTAATTTCCTTACCATAATCAGGCATTTCTTTTTTCGCAGCTTCATATTCACCGTTTTCATATTTTAAACAACACATTAAACGACCGCAAAGTCCAGAAATTTTCGTTGGATTCAACGATAATCCTTGATCTTTAGCCATCTTGATCGAAACCGGAATAAAATCACCTAAGAAGGTCGAACAACATAATGGTCGCCCGCATGGTCCGATTCCACCAAGTATTTTTGCTTCATCACGAACACCAATCTGCCTTAACTCAATTCGTGTACGGAAAACGCCTGCTAGATCTTTTACCAGCTCGCGAAAATCAATCCGTCCGTCTGCGGTAAAATAAAAAATCATTTTACTGCGATCAAAAGTATATTCTACTCGGATCAATTTCATTTCCAACTCATGAGCGCGAATTTTTTCCTTGGCAGTTTTGAAGGCCGCCTCTGCGTCCGCTTCGTTTTGAGCTACTTTTTTTAATTCCTTGTCTGATGCTTTATGTAAAATTGTTTTTAAATCATCGGACAAATCTTTTTTTTCAATCTCTATTTTTGGAATTGCCACTGTCGCAATCTGGTGCGCCTGCTGTGACTCGACCAAGACTTTATCATTATAAAAATATTCGTTTTTTCCTGGCGCGTAATAGTAAATATGCCCTGCGTCTCGAAAACGAACACCCACAACTTCAACCATGGTTCTCCCTACTCTCTTAAATAACGTTAAGCATAAACAATGTGTAACGTTATTTGTTCTGCGATATTTTGAAATGATACGTTTGCTTCTAGTTTCTGACTGGCGGATAAAACATCTTCCAATAGGTAATTGTATTTTTCTACACCTATTTGATTTTGTCTCATCACTTGATCACGTTTTTCCTTCACAAAATACGCCAACATCTCAAAGGCGAGCTGTTGCTGTGCTTTGTCCTTAAACGTCCTGACCATTTTTTTCTGAACATAGATAAACGCTTGCGGATCATTTTTTTCGAGATAATTAAACCATTGAATAACAACATCTCTAGCTTCATTAAACCATTCATCTTTTGAGATTTCAACAGCTTTTGTATAACTATTTGTTAAATTTGCTAAGAGTTTTGCAGTTTTTTCAGGGATTTGTTCTGCCTCTAAACGAGACTGCAAGCGTTCTGTGGACAACGCTTGGAAGTGGATGATCTGACAACGAGAGCGAATCGTAGGTAAAATTTTTCCTAGCGACTGGGTCTCTAGAATAATCATAAAGTTAGCTGGTGGTTCTTCCAAAAACTTTAGTAGGCTGTTAGCCGAGTTCATATTCATTTTTTCTGCTTGGTGAATAATCACGACTTTTTTCGCAGATTCAAAGCCGCTTTTGGTTAACTCACTTTGCAGTGCTCTTATTTGATCAACTTTGATGGATTGTCCATCAGGTTCGATTTCAACTACATCGGGATGATCTTTACTGGTTATCCTCAGACAATTGTTACATGTTTCGCAAGGCATTTCCTCTTGCAAATTTAAACAGAACTGATGCTTGGCAAACCATAATGCCAATTCTGCTTTGCCTGTTCCTTGGTCGCCTTCAAAAAGATAAGCATGGGCCAAACGCCCATGCTCAAAACTGTTTTGTAATTGGCGAAAAACAATGGGCTGAATTGTCTGGAGTTTTTTCGCTTCTTCCATCTTAATACTGGTGGAAGCCTTCGACTGGCAAGACAAATACTGTCGCACCGCCGACTTCAACTTCAACAGGATAAGGGACTTGTCCATCCAACGAAATGTCTAAAGTTACTGGTGTTGTAACGTATTGCGTCCGCGCTTGGCATGTTTCTTTGATTAAAGCCAAAGCATCTTCCACTCGTTCGTCTTCGATCCCAATAATAAAGGTACTGTTACCGGCTTTTAAGAAGCCTCCAGTAGAAGAAAGTTTAGTTGCTCGAATGTTCGCATCAATAAATTCATTGGCCAAACGGTTTGAGTCTTTGTCTTGAACGATCGCTAAAATAAGTTTCATAGTTTACACCTCTCATGATTGAAAATAGTCTGGATAACGTGTCAACAATTCGTAAAAACAAGCTCTCACGACTTCGTCTAAACGCTTCCGAGCATCAATTTTTATGATCCGATCTGGATTTTCTTCTGCTAATTTTAGATAAGCATGTCGGACCCTCTGATGAAATTGTAACCCTTCCGAGTCCAAACGGTCAATTTGATTGGTTCGGTTCTTCATGATTCGTTGCAAGCCAGTATCGGAATCAACATCCAGATACAGCGTAATGTCAGGAGTCGTCCCTTCAATCGCAAATTCATTAATCTTAGCAACTTCTTCTATACCAATACCACGACCGGCACCCTGATAAGCTAATGAGCTATCAACAAAACGATCACACAAGACAATTTTATCTTCATCAAGTGCAGGCCAGACCTTTTCAATCAGATGCTGACGGCGTGCTGCGGCATAAAGCAAAGCCTCCGTTCGATCATCCATTCGATCATTGCTAGGGTCAAGGATCACGTGACGAATTTTTTCTGCGATCGGAATGCCTCCAGGTTCTCTTGTTTTGACGATAGATCGTTTCGCCGTTAATTGTAATCTAGGATAGAGCTCATTCAAAACACTGGTTTTCCCAGCACCATCTGGCCCCTCAATCGTAATAAATAATCCGTTCACGTTCTTGTCCCCCAAAATAATTTTGATCTTCTCTCTCTAAAAAAACACCGCGAAATTTTTATAATTCACGGCGTCCTTCCACTGCTTTTAACAAAGTGATTTCGTCAGCATATTCGATGTCGCTGCCAACGGATAATCCGTGAGCAAGTCGAGTAACCTTGATACCTGCTGGTTTGATCAGACGCGATAGATACATCGCAGTTGCTTCGCCTTCTGTCGTTGCATTTGTTGCGATGATAACTTCCTTTACCTCATCGTCATGTAGACGTTTGATTAAAGGTGCGATATTGATGTCTTCAGGACCTGTCCCTTCCATCGGTGACAAAACACCGTGAAGGACATGATAAAGACCGTGATATTCACGAACCTTTTCCATTGACATCACATCTTTTGGTTCTTCCACAACTAGAATCGTGCCACGATCACGAGTTGTATCCGAACAAATCTCGCAAGGATCTTCTTCCGTGATATTCCCACAAACACTGCAAAAACGCAAATCCCTTTTAACACTGATCAACGAGCGTGCAAATTCATTTACCGATTCGTCTTTCATATCAATTGTAAAAAAGGCTAAACGTGTCGCTGTTTTTTGACCGATTCCCGGCAGCTTCATATAGCTTTCAATCAACTTTGCAATTGGTTCTGGATATTGCATTCTGTACTTCCTCTCTTCCAGAAAGTCTTCACGAACTCGTTCAGCTTTTGAGCACCAAGTAGGTACTGTTCCACATCAGCTCTGCAAGCAGTCACTGTATGCGTAGCTTGCGTAGAAAAGCTAGTTCGTTAAGCCGCACATGGATAATACTACTAGCAAAAACAATATATCTTTGAAAAAGTAATATTTTTTGCTGAGATCAAAGTCGCTTACATTCCAGGAAGTCCCTTTGTATATTTACCCATCGTTTGATCGGTTTCTTTTGTAATCTTAGTAATCGCATCATTAACTGCTAAAACAATCATATCTTGTAACATATCAGGATCTTCTGGATCAATTAATTCCGGATTGATTGTCATTGCTTTCATATTTTTATCCCCAGTAAATGTCACTGTGACTAAATCGTTGGTTGAACTTCCAGTGAATTCTTTCGCATTCAGTTCATCCTGAGCCTTTACCATTTCTTTTTGCATTTTTTGCATTTGTTTCATCATGCCTTGCATGTTTCCCATTCCGCGCATCATTGTATCTATTCGCTCCTTTAATTAATAAATTTATTTCATAAAACTACTTACCAATTGCCTTAAAGCTTAAAGTATGAAGAAAACCTAATACACTTTAATCATCTTTAATTGTTACAAGATCGCCAAACAGACTCTTTGCTTGCTCAACAACTTCATTCGTTTCCTCAGGTATTAAAGTAATTTCATCATCTGTCTCATTCGTTTCAGCTGCTACTGGGCGATCATGATGCTGACTGACAAAAGCTTGTCGTAATCGTGGCCAGCTTTCACGAGTAATAAAGACAAATTCTGGCGTGTACCCCTTGATCATCATACTCAAAGTGTTTTGCATATTCAAGCGAAGCTCATCGCTGCTATCAGCTCGTTGACAGACAATCTCATAATCAAAAGCGATTAACATCAGATCAGGTCCTGCCGCCATTGGTTCGCTAGCCTTCAACATCGCCCGTTGTGTAACTGGCAAAGCCATTAACAGGTCTTCCCAAACATTCTTCACACTTAGTAAATGATCTTTAGTTGCCTCACTTAACACTTGATACACACGTTCTGTCGGAACACGATAGGTGCTTGCAGTTTTCTTCGGTGCCGTTTTGCGCTCTTCTTTTTCAACCGTTGGCTGTTTTTTTAATTGTTGAACTTCTTTTTGAAGCTGCTGTATTTGAGTCTTCAAGGCAGTGAATTCTGCTTGATCTGCTGGTTGTGTCGCAGATGCTACTGCTATTTGATTGCTTGAAGAATCACCAATTGCAATATTAGCAGACGTTTGCGGTGTCGCCAATTTCACCGTCGCTACTTCTAAATAAACATTGGCATGATTGGTAAATCGAATCTCGTTTTGTGTCTCGCTCAAAATTTTAATCATGACATACAAACGGTCAGAAGGTGTAGAACCCGCTAATTGTTTAAACGTTTCAGTTAAATAAGCAGCACGATTTTCCAATAACTTGGGTGCTTGCTGGTAGATCAGTAAATCACGACAGTACAGTAACAAATCTTCCGTTAAGCGTCGAGCTTCTTTCCCCTCTGCTAAAATATTTTCCAGAACTTCTAGCGCTCCACTCACATCTTGCTGCAGACAAGCACCGATAAAACTGTCCATCATTTCTGTAGTCAAACTGCCAGTCACGGCTAACGCATCTTCTAAGGTAATTTTTTCATTACTGAAGGAAATCGCTTGATCCAAAATACTTAACGCATCTCGCATCCCGCCTTCAGCCGCTCGTGCGATTACGGACAGCGCCTGCTCTTCATAGGGTTGATTGCTTTGTTCAAGAATATAAGCCATCCGTCCAATAATTGCTTGAACATCAATGCGTTTAAAATCAAATCGTTGTGTTCGTGAAATAATCGTAGCTGGAATCTTATGCGGCTCAGTTGTTGCTAAGACGAAGATCACATGTTCCTTCGGTTCTTCTAACGTTTTTAATAAGGCATTGAAGGCACCCGTAGAAAGCATATGGACTTCATCGATAATGTAGACTTTATATTTCGCTGTCGTCGGCGCGTAGTTCGCTCGATCGCGAATAAAACGGATTTCTTCCACACCGTTGTTACTGGCCGCATCAATCTCGATCACGTCTTCTTGTCGTCCGTCTGTAATTGAACGGCACATCTCACACTCATTGCAAGGTTCCCCATCCACACTATTTGGACAATTGATGGCTTTGGCAAAAATTTTCGCCGCACTAGTTTTCCCTGTTCCGCGGGGACCGGTAAATAAATAGGCATGGGAAGTTTTCTGTTGTTGGATTGCATTTTTCAGCGTTTTGGTAATCGCTTCCTGTCCAACAAGGTCATCAAACCGTTGCGACCGCCAAACGCGGTAAAGTGCTTGATACGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP034169|4026894:4035447|4031438_4031768_-|WP_010740793.1|DBSCAN-SWA MKLILAIVQDKDSNRLANEFIDANIRATKLSSTGGFLKAGNSTFIIGIEDERVEDALALIKETCQARTQYVTTPVTLDISLDGQVPYPVEVEVGGATVFVLPVEGFHQY >NZ_CP034169|4026894:4035447|4030498_4031437_-|WP_137440160.1|DBSCAN-SWA MEEAKKLQTIQPIVFRQLQNSFEHGRLAHAYLFEGDQGTGKAELALWFAKHQFCLNLQEEMPCETCNNCLRITSKDHPDVVEIEPDGQSIKVDQIRALQSELTKSGFESAKKVVIIHQAEKMNMNSANSLLKFLEEPPANFMIILETQSLGKILPTIRSRCQIIHFQALSTERLQSRLEAEQIPEKTAKLLANLTNSYTKAVEISKDEWFNEARDVVIQWFNYLEKNDPQAFIYVQKKMVRTFKDKAQQQLAFEMLAYFVKEKRDQVMRQNQIGVEKYNYLLEDVLSASQKLEANVSFQNIAEQITLHIVYA >NZ_CP034169|4026894:4035447|4032483_4033080_-|WP_016180914.1|DBSCAN-SWA MQYPEPIAKLIESYMKLPGIGQKTATRLAFFTIDMKDESVNEFARSLISVKRDLRFCSVCGNITEEDPCEICSDTTRDRGTILVVEEPKDVMSMEKVREYHGLYHVLHGVLSPMEGTGPEDINIAPLIKRLHDDEVKEVIIATNATTEGEATAMYLSRLIKPAGIKVTRLAHGLSVGSDIEYADEITLLKAVEGRREL >NZ_CP034169|4026894:4035447|4031780_4032425_-|WP_016180913.1|DBSCAN-SWA MNGLFITIEGPDGAGKTSVLNELYPRLQLTAKRSIVKTREPGGIPIAEKIRHVILDPSNDRMDDRTEALLYAAARRQHLIEKVWPALDEDKIVLCDRFVDSSLAYQGAGRGIGIEEVAKINEFAIEGTTPDITLYLDVDSDTGLQRIMKNRTNQIDRLDSEGLQFHQRVRHAYLKLAEENPDRIIKIDARKRLDEVVRACFYELLTRYPDYFQS >NZ_CP034169|4026894:4035447|4028260_4029115_-|WP_137440159.1|DBSCAN-SWA MKIQKSFSQEVGTLYLVPTPIGNLEDMTFRAVKTLQTVDLIASEDTRNTQKLLNHFDVKVPQKSLHEHNYNERIPELLLFLKKGQSIAQVSDAGMPSISDPGHELVVACIEEDIPVVALPGATAGMTALIASGLLPQPFYFYGFLQRKKSAQKKELEELKNQTATLIFYESPHRVKETLKNISEILGNRDVVICRELTKLYEEYLRGTVTELMDYLSEHSLKGECCLLVSGTTEVLEEEVFQGTLKEQVEALVEEGQLAKEAIKSVAKRHGLKKQDVYREYHEL >NZ_CP034169|4026894:4035447|4029659_4030472_-|WP_016180911.1|DBSCAN-SWA MVEVVGVRFRDAGHIYYYAPGKNEYFYNDKVLVESQQAHQIATVAIPKIEIEKKDLSDDLKTILHKASDKELKKVAQNEADAEAAFKTAKEKIRAHELEMKLIRVEYTFDRSKMIFYFTADGRIDFRELVKDLAGVFRTRIELRQIGVRDEAKILGGIGPCGRPLCCSTFLGDFIPVSIKMAKDQGLSLNPTKISGLCGRLMCCLKYENGEYEAAKKEMPDYGKEINTPEGRGKVIGLNLLSKVVKVRLFGRDATIDFDYQELVEAGDLS >NZ_CP034169|4026894:4035447|4029312_4029660_-|WP_034876619.1|DBSCAN-SWA MDRRSLYDGLNQLELDMQKNLEDLVSMKETLLELVEKNAKLEMENERLRERIREIDEKKSPVLDERQELSESRLNLEKIYEDGFHVCNLLYGSRREADEPCAFCLDVIYRESKQK >NZ_CP034169|4026894:4035447|4026894_4028112_-|WP_137440158.1|DBSCAN-SWA MMAANIAFILICSGLVFLMTPALAFFYGGLERRKNILNTMMMVICTMGLASLIWIVIGYSLSFSGDGNFIGNLDKVLFNGVSMTKGDGIPEGLFAFFQMMFALITTAILTGSVAGRMRFSAIFLFIAIWLIVVYFPMAHMVWGGGFLDKIGSIDFAGGNVVHISSGISGLVLAIVLGRRREYHLGDYRPHNVPFVVLGTGLLWFGWFGFNGGSALAADGLAIHAMITTNTAAACAMLSWMLIEKILNGKPTVVGACTGAVVGLVAITPGAGFVSIWSSLLIGALVSPFCFFFISVIKQKLGFDDALDAFGCHGVGGIFGGIVTGIFADPSVGGKVGLIYGETHLFIAQIESVLFTLVFAGAASYLIISLIRAFMPIRVSQQEEALGLDKIEHDENAYPTFMGMDS >NZ_CP034169|4026894:4035447|4033698_4035447_-|WP_137440161.1|DBSCAN-SWA MAYQALYRVWRSQRFDDLVGQEAITKTLKNAIQQQKTSHAYLFTGPRGTGKTSAAKIFAKAINCPNSVDGEPCNECEMCRSITDGRQEDVIEIDAASNNGVEEIRFIRDRANYAPTTAKYKVYIIDEVHMLSTGAFNALLKTLEEPKEHVIFVLATTEPHKIPATIISRTQRFDFKRIDVQAIIGRMAYILEQSNQPYEEQALSVIARAAEGGMRDALSILDQAISFSNEKITLEDALAVTGSLTTEMMDSFIGACLQQDVSGALEVLENILAEGKEARRLTEDLLLYCRDLLIYQQAPKLLENRAAYLTETFKQLAGSTPSDRLYVMIKILSETQNEIRFTNHANVYLEVATVKLATPQTSANIAIGDSSSNQIAVASATQPADQAEFTALKTQIQQLQKEVQQLKKQPTVEKEERKTAPKKTASTYRVPTERVYQVLSEATKDHLLSVKNVWEDLLMALPVTQRAMLKASEPMAAGPDLMLIAFDYEIVCQRADSSDELRLNMQNTLSMMIKGYTPEFVFITRESWPRLRQAFVSQHHDRPVAAETNETDDEITLIPEETNEVVEQAKSLFGDLVTIKDD >NZ_CP034169|4026894:4035447|4033289_4033604_-|WP_016180915.1|DBSCAN-SWA MMRGMGNMQGMMKQMQKMQKEMVKAQDELNAKEFTGSSTNDLVTVTFTGDKNMKAMTINPELIDPEDPDMLQDMIVLAVNDAITKITKETDQTMGKYTKGLPGM |
10 | Streptococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
4152645 : 4215731
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP034169|4152645:4215731|DBSCAN-SWA 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50 | Bacillus_phage(45.45%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
4250538 : 4268400
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP034169|4250538:4268400|DBSCAN-SWA 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18 | Streptococcus_phage(94.12%) | integrase | attL 4249344:4249359|attR 4269755:4269770 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
4677943 : 4695395
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP034169|4677943:4695395|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP034169|4677943:4695395|4683632_4684817_+|WP_137440400.1|DBSCAN-SWA MAQRNLDYRLLKDRRNEYGVSQNKLATACGLSRPYLNQIENGGVTASTKTMRKIFDQLESFNPDLPLALLFDYVRIRFPTMDVRKIIQEILHLKFEHMLHEDYAFYSYQEQYVMGDIVVMLSHEEDKGVLLELKGRGCRQFETFLLAQKRSWYDFFEDCLKAGGVMKRLDLAINDRVGLLDIPELTKKCQKEECISLFRTFKSYRSGELLKADEKDGMGNTLYIGSLKSEVYFCLYEKDYEQYIKLGIPLDQTETKNRFEIRLKNDRAFHAIQDLLKDRSIESTTFSIINRYLRFADKVEGKRRTNWPLNERWGRFIGRNRKEIQLTSEPKPYTIERTLNWLGRQVAPTWKMAKELDRLNQTTYIQDMVQNARLSDRHKKILEQQSVAIENLII >NZ_CP034169|4677943:4695395|4684831_4684927_+|WP_164709457.1|DBSCAN-SWA MGIIKDILLVFGGSLLGVTVMCLMNASAAAD >NZ_CP034169|4677943:4695395|4683086_4683377_+|WP_137440399.1|DBSCAN-SWA MIYDELIGEIYWVIGKIQSDPELEEELRRLNFEIRKNGVKVPGDPYVMDEETDARIEVNQVIAEFERIADLTKEPDIRQYLFEIKAELEIEGITAE >NZ_CP034169|4677943:4695395|4693460_4694465_+|WP_137440404.1|DBSCAN-SWA 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MTQVTKGKSSSQIIIPRLYKALSTSENGGRFRKTLFHIHTPASYDYKLIDEETQNLLKIQKNNNWKTFTENDLMKIWNYLEISVFKDHSSEEICKIMPEIFCDIKEFLAYLIVGHTILMEKIEFCLVTDHNTIAGFEKLEEAIGILLHERKDYPVKTRLELGIEISCSDKNHIVVILDRRKNNQIRNLANWLEKNIISSKDGTIRTSLDVFNEINKINAIGYIAHINTSNIFNKDYLSGTYKKQLFNSGLFNIIGVTDIKQIAGTTERLFNLTHQKFNFVIDNDSHHINQLKQNFFYIKGDKLNFSTLQAAFRDFSLSVCYELPRLPDQYIKAIYVEGKEFLKGKDGGYLILKFSSMMNAFIGGRGTGKSTLLNILGFAISQYCETPQDLRKILLQGTCAVVYHYHGQDFYILSHSSDQENNEIFIHNYFNGTKNSLRNTEEDEENTRKIAINDRVQVFTYDGKNVEIYRRQNEILKKLLTRKFTVNDLVRVASSDYEITDFVDKILFENKDIRNRSNFYNIGKEFKGLFNKFDKRVNILERRKDNVGHLLDSYNESQEGKLRILFSQEEIDDQHFNWFDALGVTSYRSSEYFKKYAITYDDLTSYLSWRSEQVGGSIELLRIFYNKDYEILVSDDTSSKFFVDTSNKTTDLELKFLKNKEDILEFHKYLRQRLITPSCEQYAKRFLKNYFNHCEQFTLEFNINNKETTDTRGINYQNINTLSMGQKVVAILSFLLSYSQYIGDYSPFIIDQPEDNLDNQYIYKNLVADLRDLKQYRQVILATHNSTIVMNSGCEQVLVMSSDNQKGWCEISGYFSNPQIVNQVINILEGGKPAFTDKMFLYNEKLPKNVSNTISENIKELSKKNSIVDEIVLKLDGFISDNNMEAIQHFINLE >NZ_CP034169|4677943:4695395|4684955_4685177_+|WP_002298822.1|DBSCAN-SWA MNFGQNLYQWFLTNAQSLVLLAIVVIGLFLGFKREFSKLIGFLVIALIAVGLVFNASGVKDVLLNLFNRIVGA >NZ_CP034169|4677943:4695395|4694483_4695395_+|WP_137440405.1|DBSCAN-SWA MKIKIERNQKEKSPKKKKERVVSVGKHRKMVLALWLLLSCSLAFGVYKNFTAIDQHTTHEKVVIKEKVVNTSGVESFTEDFAKEYFSWKNNKEAIEKRMSNLEQYLTENGLALIQDMVRADIPTSSEVQSVKILDVEKHSEEFVVSFLVEQHITEGKKTQSISSAYRVTVFEDEKGNRIVTNLPTMIAKPEKAQHEEKQVESDSEIDTKTTEEITEFLETFFKLYPTASEKELEYYVENEAMRPINKILKFVELENLVFEKTDKNIQVVVDVKYLDNLSKITSIFEYSLRLRENGNWTIIDSE >NZ_CP034169|4677943:4695395|4688515_4688905_+|WP_002297349.1|DBSCAN-SWA MKKIKSYTSIWAVEKVIYAINDFQLPFPVTFNQMAWFVLSLLFVIVFAHVPPLSMIEGAFLKYLGIPVAVTWFMSQKTFDGKKPLGFLRSFISYHLRFKVTFAGKKVKEQKKRWDEPITLVRSVNYVPD >NZ_CP034169|4677943:4695395|4691343_4693464_+|WP_137440403.1|DBSCAN-SWA MRKKLFWIAGIIAISLCVMLLLLSLIGTVAEATGLVDDTVEAGNLYSQYSLNNYQLDFFVDSSWDWLPWNWGDGLGKSVMYGLYAITNFIWTVSLYLSNATGYVVQEAYKLDFISDTAESIGKNIQTLAGITENGLQTTGFYFGFLLLMILALGGYVAYTGLLKRETTKAVRAVLNFMMIFLLSGSFIAYAPTYITKINDFSSDVSEAALSLGTEIVVPNSESQGKDSVDLIRDSLFSIQVQQPWLLLQFDDSNIEEIGEDRVNKILSVSPDENKGKDREEAVKAEIEDNDNANLSITKTMNRLGTVVFLVLFNIGISFFVFLLTGIMLFSQILFIIFAMFLPISFLLSMLPTYESLGKKAIIRLFNTIMMRAGVTLVITTAFSISTMFFNISANYPFFMVAFLQIVTFSGIYFKLGDIMSMFNLQSSDSQSMGRRVMRKPQMLMNRKLRQLSRNVGRTLAFGGGAAVGNKLAKEQSKSKFKPSGSALRKNSRLPTDHELPSDLNKENPISNNKKQSRMNLAGRKVGKVLDTQALVKDKTKQVKDQVRNTPTNLKYNLHKGIEKTKKAPKEFKRGLVQEKANRAELREKQRQRRDEKMAEKRKVLGKANHQRERRTNVSIDKVTQPQKDRTTKKEAPKRIVRVNSNPEIKRNLTSQEIISKGKIQSASKKNSFQQVKQRSTLPKRTNQKVQKRMTSRPKPRSGEKK >NZ_CP034169|4677943:4695395|4677943_4678960_+|WP_137440397.1|DBSCAN-SWA MYKGHRIRAGDQHLIYHFVLGWLSALFIGWMGVFYFPELRQFGLSKVSFSTIEIAWSMKDLVCLLGSLALSGVMLLLSIRFFPDHWRSLWHRQKLARMILENHWYEVKQTQSDGFFKDLNRSRTKETISYFPKVYYRMKDGLLSIRVQISLGKYQDQLLKLEKKLESGLYCELVEKELKDSYVEYTLLYDMIANRIGIEEVVAENGTLRLMKNQVWAYDSLPHMLIAGGTGGGKTYFLLTIIQALLKSDAELFILDPKNADLADLGTVMPHVYSQKEEISKCVEDFYERMMARSRSMKEMPNYKTGENYAYLGLPPNFLIFDEYVAYMGANRFPTSIE >NZ_CP034169|4677943:4695395|4681553_4681910_+|WP_137440500.1|DBSCAN-SWA MILNKFKQIVMLGRQSGFFLILACQRPDAKYLGDGIRDQFNFRVALGRMSELGYSMMFGEVDKNFFMKRIKGRGYVDTGGSVISEFYTPLVPKGYDFLREISDIVGLSVNTERENNSM >NZ_CP034169|4677943:4695395|4685188_4685692_+|WP_137440401.1|DBSCAN-SWA MEQMRVYIANLGKYNEGELVGAWFTPPVDFDEVKERIGLNNEYEEYAIHDYELPFEIDEYTPIEEINRLCGLAEELEGTPIGEVALEIQHAFFNSFEEMVEHVDDIVYYPDCDDMSDVAYYLIVGAGDFGEVPEHLKTYIDFDACGRDLEIGGNYLVTSRGIFEYVG >NZ_CP034169|4677943:4695395|4679553_4681428_+|WP_083284937.1|DBSCAN-SWA MNVETDEVQGSGKNVGKSVMEVPRLNTKIRYWEYYDLQETFDQLFTQSRNGKKFYQLYELIISENNILLAYRTIKANKGSSTPGTDSFTIDNYKEMNQAEFIHLILSHLENYKPKSIKRVMIPKPNGEKRPLGIPCMIDRMIQQMFKQILEPICEAKFYEHSYGFRPLRSAKHALGRIMYLINISKMHYAVDIDIKGFFDNVNHRLLIKQLWNIGICDKQVLAILSKSLKSPIQGEGIPSKGTIQGGIISPLLSNVVLNDLDHWVSKQWHTFETKYPYTKGYNKFRALRDTNLKQGYIVRYADDFKIMTNDYPTALKWFHAVKLYLKDRLKLDISNEKSKIVNLRKCKSEFLGFAICVKQKGKKWVCNSRISNKKKDQIKEEIKQRIKDIQKSPTAQNALLFNALVLGVHNYFRYATHINLDLNRMNYVLSFTTYNRLSNCSTRCYPNKASPTYKKFYSTTMKTYKVAGVYLYPLCDVSTKTIYGFNTKDTPFTPFGRQRLEHKSLQSLVFQELRKLMESKIPNRTVEYLDSRISRYSMKSGKCEITKQFLPAKAVHCHHYLPKSLGGDDKFDNLRIIHKDIHLLIHTTNKMIIDHYVHELKLVPEQIAKINLYRKMCNLQNIQ >NZ_CP034169|4677943:4695395|4688891_4691339_+|WP_122646618.1|DBSCAN-SWA MYPIKYIENNLVFNQEGECFAYYELVPYNYSFLSPEQKYQVHDNFRQLIAQNREGKIHALQIATESSIRVTQERSKKEIIGRLKEVAKQRVDLQTDALVSMIGDSQIDYRFFIGFKLIVTDEEVNLKSLKKSFFSGFQEFVYGVNHHLMGDFVSLSNEEIRRYTKLERLMESKLARRFKVRRVTPSDLTYLIEHIYGEKGTPFEEYEFQLPKKKLKSETLVKRYDLLRPTRCLIEEKPRYLRIEHENHESYVAYLTINTIVGEMEFPSSELFYYQQQQFTFPIDTSMNVEIVTNKKALATVRNKKKELKDLDNHAYQSDNETNSNVLDALDSVDELETTLDQSKESMYKLSYVVRVSAESVDELKRRCDEVFDFYDDTNVKLVRPFGDMMGLHEEFLPSSKRYMNDYIQYVTSDFLAGLGFGATQMLGELEGIYFGYNVDTGRNVYLKPALASQGVKGSVTNALAAAFLGSLGGGKSFSNNLLVYYAVLFGGQAVIVDPKGERGGWKETLPEIAEEINILNLTSKPENQGLLDPYVIMKKKKDSESLAIDILTFLTGISSRDGEKFPVLRKAIRTVTQSEQRGLLQVIVELRKEGSSVAENIADHIESFTDYDFAHLLFSDGSITQSISLDKQLNIIQVADLVLPDAETTFEEYTTMELLSVSMLIVISTFALDFIHSNREIFKIVDLDEAWSFLQVAQGKTLSNKLVRAGRAMNAGVYFVTQNSDDLLDERLKNNIGLKFAFRSTDIHEIKKTLEFFGLNQEDESNQKRLRDLENGQCLMQDLYGRVGVVQVHPVFEELFHAFDTRPPVQERME >NZ_CP034169|4677943:4695395|4681954_4683097_+|WP_137440398.1|DBSCAN-SWA MTFLDLFAGIGGFRLGMEQAGHQCIGFCEIDEFARRSYKAIHDTRKEVEMHDITSVSDEFVQSLGPVDILCGGFPCQAFSIAGKRQGFSDTRGTLFFEIARFATLLQPKFLFLENVRGLLNHEGGATFETILRTLDGLGYDVEWQVLNSKAYVPQSRERVFLIGHSRDACTKQVFPIIGSSPPSDQNIKNLLNINPSNRGMGGQVYGSDGVAPTLTGDEGIKIALPTNEGISVVGMLPGNFEQGNRVYEVTGTAPTLSTKQGGTKIMIRKNKTEYQEVKPGDSVNLAFPNSTSRRGRLGKQSVHTLLTGDQQAVVTDQYQIRKLTPRECWRLQGFPDWAFDRAAQVNSDSQLYKQAGNSVTVPVIFDIARRLKEVEKHDL |
15 | Streptococcus_phage(91.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP034169.1|WP_137439994.1|3332439_3332973_-|hypothetical-protein |
3332439_3332973_-
Protein sequences of NZ_CP034169.1|WP_137439994.1|3332439_3332973_-|hypothetical-protein>NZ_CP034169.1|WP_137439994.1|3332439_3332973_-|hypothetical-protein MMRVNMKSELDSLMVRNNLSQKEAAGGSGIPFSTFNGYTKGSQEVPVNKAVEINNAVGDDLFASQVGNKYLGTLKALDGKIAEILTPTELDFLQEEETKQREERRQQAKLLLIKSKLEPLNNEDKTDLEKYVMEFLDEIVVELSIIFSILKILGMNVSTAFKKRMPHWVAKKYMKGD |
177 aa aa | NA | NA | NA | 3250503-3334562 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.16|138449|37|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034169 position: 3326710-3326746, mismatch: 0 tcttctgaataccgttgctagtcatagctgttcccac CRISPR spacer tcttctgaataccgttgctagtcatagctgttcccac Protospacer ************************************* |
||||||||||||||
NZ_CP034169.1|WP_167494439.1|3333157_3333322_-|hypothetical-protein |
3333157_3333322_-
Protein sequences of NZ_CP034169.1|WP_167494439.1|3333157_3333322_-|hypothetical-protein>NZ_CP034169.1|WP_167494439.1|3333157_3333322_-|hypothetical-protein MTKQEKIEFILKRLGDRLTKAYLETKPESFINNLFEIESQNDDRQMDSMVCEMF |
54 aa aa | NA | NA | NA | 3250503-3334562 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.16|138449|37|NZ_CP034169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034169 position: 3326710-3326746, mismatch: 0 tcttctgaataccgttgctagtcatagctgttcccac CRISPR spacer tcttctgaataccgttgctagtcatagctgttcccac Protospacer ************************************* |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP034168_1 | 54851-54980 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP034168_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP034168_1
>1.1|54876|17|NZ_CP034168|CRISPRCasFinder TCTGATTTATCAACGTT >1.2|54918|38|NZ_CP034168|CRISPRCasFinder TTTTGGGCATCAAGGGATTGAGGCTCATTTGAATTTTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP034168_1
The CRISPR arrays of NZ_CP034168_1 >merge|NZ_CP034168|1|54851-54980|CRISPRCasFinder TAATACCTGTTTGATTTTCATACCCTCTGATTTATCAACGTTTTGGCTGGGTATGATTTTCATACCCTTTTGGGCATCAAGGGATTGAGGCTCATTTGAATTTTGTTGGCTGGGTATGATGTTCATACCC >NZ_CP034168|1|1|54851-54980|CRISPRCasFinder TAATACCTGTTTGATTTTCATACCC TCTGATTTATCAACGTT TTGGCTGGGTATGATTTTCATACCC TTTTGGGCATCAAGGGATTGAGGCTCATTTGAATTTTG TTGGCTGGGTATGATGTTCATACCC
>NZ_CP034168.1|WP_070503194.1|53569_54295_-|hypothetical-protein MLARTVHAFLEDKKISGAVRKLGEKEYYFRIDTQKLSAPLKPGMLAFSSDGQLVYILEIIDDRTPEEEAAYTGVLTKIVADNPAIKSGGKGIERKILSAVEKVVYTGIVVELVDKKFRRTEKEMRFRSTERIDGKISKGDIVPIVLHTKNGRKERHYVLVQRIIKNASQKQRVMNTRRTPTKWFYKKTDKGYKKTRYAQDVIENGESKNKPTNNQSEKGIKEADKELNSTKRNFVIRQRKD >NZ_CP034168.1|WP_070504146.1|52104_52446_-|hypothetical-protein MGRRIGIEDIGYYADKITVYEKILVRRDSTGSPIYKTGVKEYRVKGLFAQKIQLYFVDGKAKEVLCDPVPLKQLYKRIRHVYDFNKVLIARRNTPNQPLLITGKGMSKFLKLG >NZ_CP034168.1|WP_137438795.1|51206_51413_-|hypothetical-protein MMNLFLIETKELKDVKKGWKTIAKTRIAAANVNEALKIVERRFTKYQYIHEVISEKESTLDSTVRRYF >NZ_CP034168.1|WP_070504141.1|50991_51189_-|hypothetical-protein MLESRGHHMTTKKKRKKFALRDETIEKLNYLIEQKQVRSTTKVYPCDVLEEVINNAYEIAKVFKS >NZ_CP034168.1|WP_070621550.1|50396_50657_-|toxin-antitoxin-system,-antitoxin-component,-AbrB-family-protein MLIKDTELKTWGNSKALRIGKDELAALGLSDKQLAITLIVENGKITIVPKTKYPQTLDELFAGYDGAALTPDDRYEWDEPVGREII >NZ_CP034168.1|WP_118368260.1|50055_50430_-|type-II-toxin-antitoxin-system-PemK/MazF-family-toxin MGRASREGNYLVVEKKIFSDLQQGDILFLDFDPTKGHEQRGYRPCIVLTKSIRFLNYMFGVAPITSNSRSFPLHIPLPETMEVKGNVLLEHHRMVDLETRTFKFVETAPPEFIEECVAKLKLLY >NZ_CP034168.1|WP_070503788.1|48683_50036_-|C39-family-peptidase MKKKCWKLLVIGLLTIPLGIGSVVQAEDSLEQSSQTVQTETSTSETSQVQVNKIEFSQTEISQEESNQDTESQPESPDLTNLNPAKRATPDQENMAPDPETSEIAEEDARSASLPVEVYAANSLKPIYRVYNPNSGEHLHTLNGGEKDNLMSLGWVYEGISMQIDGSGSNLYRAYNPNSGEHFYTKDSKEIDKIKRAGWRYEGVAWKVPNSGKNVYRLFNPNARDAGSHHYTLLESEKNDLVKRGWRYEGVSWAVTGGSVTVKSTNVINSVPYISQYTPVKAPWGCASASLAMLLGSKNIRPNLRTMQDRLPMYPSNPNGQKGNVYTGSGFGWVIKPNALAAYGRTYGGNTVDISGSNTVQIINRVLNGQPVLYYGYSSYQNNTDKNRNHCKVIAGYNGGKFLVYDPLYYSSNAGAGSGGKNMLYDRGARAWVTMGQYNAEKDGRAITIQ >NZ_CP034168.1|WP_070503791.1|47934_48660_-|hypothetical-protein MKMKFLGKVVVGLGVLLGVGGVALASGTDAEAAQLYRAYNPNTGEHLYTANASEIPFVVKAGWRNEGYAWEAPSKGAPVYRMFNPNNGGDHHYTLNASERDHLKKVGWRYEGISWQSGGSTPVYRLYNPNAKSGTHHFTTLASEKNHLVKVGWRYEGVAFYSGKDQPTTPPKPTEPSKPTEPTIVSGWVGNTGKVFATYEEANQYGRAECLKEGSQYSRWVNITIVYSDGSKKYSVSLYEE >NZ_CP034168.1|WP_070503595.1|44531_47759_-|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-containing-protein MNKLKKIAASLMLLFTLSGQIAPTAQVFAEEASKTEVSSSRTVEKEERENKETTESSQAKETTESTTTDESINAEKPEIGESQNSNDSPKVEEETDVNEQLAKVLKDYGYYMTTDGQFLSSTNESVRDNWSEFLSKVQDLRSESQMAKRALSIVPRAGLSIFVDQNYSIPTVSWDYSNGIHEIGFYAKRDAAGGLLWCVAPGNPLNFGENSGFTTEELNQQNLVIASLIAYWGYETQPSVENAFYTEHHIQNMGTGVTTSNIQDPSGRVSQAGFDAWIKETNRKINSYLTKPSFNNNSYTMKKGETLRIDDTNSSLWAYKVATNSANLNVSTDGNTLVLKATGDVKDGSIQLEYNVPESYKGATLVYRHPYSQELLHCSISDPNIVRLNIKIQKEGKLLLKKVDDTGKAIAGAEFNLIANGKTTKATTNSSGELSTPDYNVGTVVQYEETKAPSGHYIDPATSKGSVTLKEGTNTIKVTNPRFANLTLVKKNDKGKNLEGVTFKLNYGNKDYTVKTDKDGQIKVTNTLKNNDKVSYEEVATLKGHYIDPETSKGEITVKSGENTLNINNPTLNFGMTSQARNTDREQFINPAKDQELVDEVMIEAHQAPANAKLRLTTDFVEFGTGEQLGEASLKQSTEFEAEQARFVKAVALNFDATNLHGKKGVFTNVLEYFNPSTQEWEEVARHDDLNNEDEAIQIVEPKIHTEFFFYDQNGNESKLSDPLAKVKGYDRVHYENLISGKEYKFDLALMNKDGKTPFTDPDGKEVTGTLTVVAGKDGVVTTKVDAKEYYENLAKEEAEKEDSKGSDDTKEESDIKPLSDEESQEEATEGEEEPQEVQTEFSEVKSVELLTGYVDVPFEANLSVANGKVVVAYEQLSTNETPIAEHKDPDSEEQTGKIRNPEISTRAMVNGEKQVTTDGKIKFDDTVEYKDLTPGVEYEMEMTIMVKDENAPLKLQDKEVTGKAKFTPEKENGETTVTVDFDAKELFSKYGDSVDLVAFEKTITNGEVIAVHEDINDSGQTVKINKPVVPAKTTKTTLPQTAGMLTNPYVLIAALALVAGAIFLLKNRKEGQEK >NZ_CP034168.1|WP_070503593.1|43499_44459_-|class-A-sortase MRKLIKALPLIYFICGLCFAGACFVGYRQLLSSDDNAKQMTHQIQSKEKSQQQLKEKKKLANYDPNQIKPVTPREYAAAQLKYEDIVNHYGIGSIFIPSSNIRSKILAGLSNQNLMVAVGTYYSDQELGKGNYVLLAHNLVEGGGALGNLPNTKLDHIIYATDFTNIYEYKAIKNETVNQANGQLLEKPSDNEPAIITLFRCEGAINTPNRALVQGEFVRSYPANEAANDVKVGLGLGVMTNNSKHEGATEQATPQQSTQRKYSTNTSIKQFKQDKPTYSFLEKIAINCFSIVSEYPLYIGSGFLLILLLLQRVTKKYS >NZ_CP034168.1|WP_070503199.1|55886_56888_+|AAA-family-ATPase MNEELIVTGNRCRVLINANQKGGVGKTTSTTEEAAVATLPVPQFNKKVLIIDWDIQANATSLMGKTFDVSFPTSIFQAIKDAADGIKDALRKATVKLTDNLHMIAGGRDMADYGDLLEDLYPKEKDENGELIDPLFKKKRTFHFSKLLEEIKEDYDYIWIDVGPSTDIKVDNAMVCADYFIITQETKTYSFEGSLDIINEYLQTLIDDFGDDFKGEVLGLLPFLLQPKRELHESIIENTKEAFGENFTFNAIVNNQKRLEEYPEYGISVVDYHDRKVFAMFADIFTEIEERIALFERDGDIPDEYRYVPKYLNGNKLTKLSRELDLSQYELNK >NZ_CP034168.1|WP_070503201.1|56898_57222_+|hypothetical-protein MALTDRKKKDRPKVDRMVETPRIANEPTETSVKEISETVAKKEWTAKDRKTIKVDPDIKSLIEIFSDFDGTKEYNTIRQMAEFYLEKNYDERAQRIITNIQKNKFIK >NZ_CP034168.1|WP_070503203.1|57465_57681_-|hypothetical-protein MSEIRLKKIVDDKKSNLEKLSSETLVPYPTLKQWYETSHFDSSNVGVQELTNVAAALNVDITELIEFPKSK >NZ_CP034168.1|WP_118368257.1|58138_59494_-|hypothetical-protein MSKIKPNIRYLIIGWMITIFLVCLLFNLNIHLTGFKDDGDLFYKPLINKYNGNYLDFLVNRYNTWSSRSIIEIFTLLGVTQPIIWRCLNTLMMWIAAILPAYIIQKKDKVNIYGLILSAALFFTFPLTFFSETGWIATTTNYLWVFSMGLLSIYPLARYTRKEKKHLWLSIVGIIATLYATNQEQMALLILAFTIILGIFNWYKKRSIKPLLPTFIIGTLNLIYVLTARGNEIRYNQELTNWFPDFEKLSIPKKIELGYSSTLRHLFFDKQSTILLFLFLLFVFTLSSQIYRKKFSFIGIFGLLPLPISLLFSFNEYLQNGRVLEVLNNFNQYGTTINLLDPKTWIPDILLTILLMSILVAIIYLLDYQVTSYVPLLFICAAIVSRLIMGFSPTIWASATRTYLFTFGLFNLTFLYLFTNCQTFKFSKALVWFSCILVGCWSIIETIGSLR >NZ_CP034168.1|WP_137438797.1|59506_60022_-|recombinase-family-protein MSFKYKSYMSGKNTNRPALLEMLDYIREGDIVVVTELERLGRNSKELTDLMYQIQSKRATLEILNLPATQGIEDENLRNLINNLIIEIYKYQAESERIRILERQKQGIAIAKREGKYKGRKPLFNEADARLQHAFKLYKDGMSDKDVERNTGINRETFRRYRKKIGIERLK >NZ_CP034168.1|WP_137438798.1|60833_61475_+|histidine-phosphatase-family-protein 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP034168_1 | 1.2|54918|38|NZ_CP034168|CRISPRCasFinder | 54918-54955 | 38 | NZ_CP034168 | Enterococcus avium strain 352 plasmid unnamed, complete sequence | 54918-54955 | 0 | 1.0 |
1. spacer 1.2|54918|38|NZ_CP034168|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP034168 (Enterococcus avium strain 352 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttttgggcatcaagggattgaggctcatttgaattttg CRISPR spacer ttttgggcatcaagggattgaggctcatttgaattttg Protospacer **************************************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
2337 : 20036
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP034168|2337:20036|DBSCAN-SWA 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14 | Streptococcus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
71923 : 80361
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP034168|71923:80361|DBSCAN-SWA 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CACATCCTGCTGAAATTGCTTTCCTTTAAAATGATTCATCGTCATTCCTCCTGCTATCTTTTTCTATTATTCTACCTTATTTGATAGTAGATTTAAAACTTTGCAACAGAACCTTTTTCTATTATTCTACCTTATTTGATAGTAGATTTAAAACTTTGCAACAGAACCTTTTTCTATTATTCTACCTTATTTGATAGTAGATTTAAAACTTTGCAACAGAACCGGAATAACCAAAGATGGCGACCGTGAAATTATCGGCTTCATGATTCAAAGTGGCGAAAGCGAAGAGACCTGGACAACATTTTTTGAATACCTAAAAGAACGCGGTTTACAAGGTACGGAACTCGTTATTTCTGATGCGCACAAAGGATTAGTCTCTGCCATTAGAAAATCCTTCACCAACGTAAGTTGGCAAAGATGCCAAGTTCACTTCCTAAGAAATATCTTTACCACCATTCCTAAAAAAAATTCAAAATCTTTCAGAGAAGCTGTTAAAGGAATTTTTAAGTTCACAGATATTAACTTAGCGCGTGAGGCTAAAAATCGATTGATTCATGATTATATCGATCAACCAAAATATTCAAAAGCTTGCGCATCATTGGATGATGGATTCGAAGACGCCTTTCAATATACCGTACAAGGAAATTCCCACAATCGACTAAAGAGTACCAATCTAATTGAACGACTGAATCAAGAAGTACGCAGAAGAGAAAAGATTATTCGCATCTTCCCCAATCAAACATCAGCCAATCGCTTAATTGGAGCCGTTCTTATGGACCTACATGATGAATGGATTTATTCTTCAAGAAAATACATCAATTTTGATAAGTAGAAATGGTAAAAACATTGTATAGCATTTTACACAGGAGTCTGGACTTGACTCACTTCCTTTATTATTTTTCATTTTTTTAAACTATTTAATACTAATGTCTTTTATAATAGCTTTTCATATATTATATAATCAATCTTTATAAGTCCTTTTATAAATTTCTTTTCTACCATTTTCGATAAATTCCTGTTTAATATTTTTAATTCCATAAACAATAGTTTCAATAGGATAATATTCTTCAACTATATCTTGATATTCTTTTGCTTTCTCAATATCTATATTTCCATACATTCTTAATATATCTTCTCCAAAATTTGTTCCTATTTCTTCTTCACTATCTTCAAGTAAGTATATAAAATCACAATATTCATCTATAATTCCAGAATCTCCAAAATCAATTATTCCAGTTAATCTATTATTGCCATCTAACAATAGATGATTACAACTAAAATCATTATGGCATAAACACTTTTTACCCTCAAAAACTGTTGTTGCATTTAGTCTTTCCATAAAACTTTCTATATAATCTTTTTCTATATCAGTTAAATCATTATAAATAGTTTCACGCAACAATATATACTCTTCTAATACATTTTGTTTATTATCAATAGTACATTCACTAATATCTGTATAATCTAAACCGTGCATTTGTCTTAAAAAACTGGCAATATCTCGTTTTAACAAATTTTGTTCTTCTTCTGACATAGTAGAATAAATTTCTGGTGTTAAAAAAGTTCCTTTAATTTCTTTATAACCTAGTATAGATAATTCATCACTAATATACGAATATTCAATATTAGGAATTTTTACATTAGTTTCTAAATTTGTATTTAAAAAATTATATATTGCTTTTTCTTTTGCATAACCTTTTTTCTTATTAGTACTAAATTTTGTTTTAAAAATGTATTCATTATTAACTAAATATGCCACACTATCATAACCACTACCGATTATTTCAATACTATCTACTTTGAAATTATCAAAGTAATGCTCAATTAAATATTTCATTGCCTTAACATTTGTGGCATTATCATCATATCTATATTCCATTAAATAACAATCTTCTTTTTTGCCCTCGTGTAATTCATGTTCTGGCAAATCTTCAATAATTCTAAAACCAGATTTTTGGTATGCCCTTATTGCTCTTGGATTATTTTTATGAGGGTCTAAAATAACTGCATTAGCATTTCTTTCTTTTTTCAAAAATTCAAAAATCAATTTAATATATCTTGTACCAATTCCTTTACTCCAATAATTTGGCTCTCCTATAAATTGATCCATACCATAGACTATCTCATCAGTTTTTGGATAATGATAATCAGTATATAACTCATCATACATTTTATATATTTGTCCATATCCAATAGGAACATTGTTATATTCAATAATTACTCTAAAAACTTCATCTTCCCAAGGCTCTGTATAATGTTTTTTTAATGATTCTAATGTATATTTTTTATCTCTACCACCATAAAATTCTAATACTCTTTCATCAGTTAACCATTTTAACATCAAAGGAAAATCATCATCTATTAAAGTTCTTATACATATTTCATTTTCAACTATATTCATTTATTTATCACCTTTTTCATAATCATATACATATACTATTTCATCTTTATAATCATTTTTACCACCTAATTTTTCATATACATGGCAAGCTCTAGGATTACCTTTATCAGTTATTAAAAACATTTCAGAACAACCAATCTCTTTAGAATATTCCTTAATAAAAGATAATAATTTTGAACCATAACCTTTGTCTTGATAGTTAGGTAACATTCCTATTGAGTGTAAATAAAACATTGTTTTTCCATCAGGTCTTAAAAGTGTATAGCAATATGCAAATCCTATAATTTTATTATTTTCTTTAGCGGTTCTGTTGCAAAGTTTTAAATAAAGAATAAAATCCCTTACGGTATCTATGATTTAAGCTGGGATTCCCAATAATACCTTGATTTCAGTACAGACCGAAAACCCGAAGAGAGTGCCTTCTTTTCGGGTTTTCTTATATAATCCTCGGATGGCTTCCATGCCTTTAATCGTTGTAGAGGCAGTGCGTAAACTTCGATAGAATTTATTGCGTCTCTTTACTGGACGATGGTCTTGTTCAATCAAATTATTCAGGTATTTAATGGTACGATGTTCTGTCCCTTGATAAAAGCCGTATTCTTTTAGTTTCTTAAAGGCACTTGTAATAGAGGGGGCTTTATCTGTGACTACAACCTTCGGTTCATCAAACTGCTTCACTAACCGCTTAAGAAAAGCATAGGCTGCTTGTGTGTCCCGTTTTTTACGTAACCAAATATCCAAGGTTAAACCATCTGCATCGATGGCTCGATACAAATAATGCCATTTTCCTTTAATTTTGATGTACGTTTCATCCATTTTCCAGGAATAAAAGGATTTTTTATTTTTCTTTTTCCAAATTTGATAGAGTAGTTTGCCATATTCTTGCACCCAACGATAAATCGTCGTATGAGAAACGTTAATGCCACGATCATATAAGATTTCTTGAACTTCACGATAGCTAAGGTTATAACGAAGATAGTAGCCCACGGCTACAATAATCACATCCTGCTGAAATTGCTTTCCTTTAAAATGATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP034168|71923:80361|77883_79323_-|WP_001028144.1|DBSCAN-SWA MNIVENEICIRTLIDDDFPLMLKWLTDERVLEFYGGRDKKYTLESLKKHYTEPWEDEVFRVIIEYNNVPIGYGQIYKMYDELYTDYHYPKTDEIVYGMDQFIGEPNYWSKGIGTRYIKLIFEFLKKERNANAVILDPHKNNPRAIRAYQKSGFRIIEDLPEHELHEGKKEDCYLMEYRYDDNATNVKAMKYLIEHYFDNFKVDSIEIIGSGYDSVAYLVNNEYIFKTKFSTNKKKGYAKEKAIYNFLNTNLETNVKIPNIEYSYISDELSILGYKEIKGTFLTPEIYSTMSEEEQNLLKRDIASFLRQMHGLDYTDISECTIDNKQNVLEEYILLRETIYNDLTDIEKDYIESFMERLNATTVFEGKKCLCHNDFSCNHLLLDGNNRLTGIIDFGDSGIIDEYCDFIYLLEDSEEEIGTNFGEDILRMYGNIDIEKAKEYQDIVEEYYPIETIVYGIKNIKQEFIENGRKEIYKRTYKD >NZ_CP034168|71923:80361|71923_72604_+|WP_001015311.1|transposase|DBSCAN-SWA MNHFKGKQFQQDVIIVAVGYYLRYNLSYREVQEILYDRGINVSHTTIYRWVQEYGKLLYQIWKKKNKKSFYSWKMDETYIKIKGKWHYLYRAIDADGLTLDIWLRKKRDTQAAYAFLKRLVKQFDEPKVVVTDKAPSITSAFKKLKEYGFYQGTEHRTIKYLNNLIEQDHRPVKRRNKFYRSLRTASTTIKGMEAIRGLYKKTRKEGTLFGFSVCTEIKVLLGIPA >NZ_CP034168|71923:80361|74973_75837_+|WP_071621496.1|DBSCAN-SWA MANIVNFTDKQFENRLNDNLEELIQGKKAVESPTAFLLGGQPGSGKTSLRSAILEETQGNVIVIDNDTFKQQHPNFDELVKLYEKDVVKHVTPYSNRMTEAIISRLSDQGYNLVIEGTGRTTDVPIQTATMLQAKGYETKMYVMAVPKINSYLGTIERYETMYADDPMTARATPKQAHDIVVKNLPTNLETLHKTGLFSDIRLYNREGVKLYSSLETPSISPKETLERELNRKVSGKEIQPTLERIEQKMLQNQHQETPEFKAIQQKMESLQPPTPPIPKTPKLPGL >NZ_CP034168|71923:80361|76280_76961_-|WP_001015311.1|transposase|DBSCAN-SWA MNHFKGKQFQQDVIIVAVGYYLRYNLSYREVQEILYDRGINVSHTTIYRWVQEYGKLLYQIWKKKNKKSFYSWKMDETYIKIKGKWHYLYRAIDADGLTLDIWLRKKRDTQAAYAFLKRLVKQFDEPKVVVTDKAPSITSAFKKLKEYGFYQGTEHRTIKYLNNLIEQDHRPVKRRNKFYRSLRTASTTIKGMEAIRGLYKKTRKEGTLFGFSVCTEIKVLLGIPA >NZ_CP034168|71923:80361|73514_74369_+|WP_071621498.1|DBSCAN-SWA MEKEELKILEELRRILNSKNEAIVILNNYFKGGVGKSKLSTMFAYLTDKFNLKVLMIDKDLQATLTKDLAKTFKVELPRVNFYEGLKNGNLASSIIHLTDNLDLIPGTFDLMLLPKLTRSWTFENESRLLATLLAPLKSDYDLIIIDTVPTPSVYTNNAIVASDYVMIPLQAEEESTNNIQNYISYLIDLQEQFNPGLDMIGFVPYLVDTDSATIKSNLEELYKEHKEDNLVFQNIIKRSNKVSTWSKNGITEHKGYDKKVLSMYENVFFEMLERIIQLENEKE >NZ_CP034168|71923:80361|74467_74683_+|WP_002295735.1|DBSCAN-SWA MIVGNLGAQKAKRNDTPISAKKDIMGDKTVRVRADLHHIIKIETAKNGGNVKEVMDKALEEYIRKYLPDKL >NZ_CP034168|71923:80361|79680_80361_-|WP_001015311.1|transposase|DBSCAN-SWA MNHFKGKQFQQDVIIVAVGYYLRYNLSYREVQEILYDRGINVSHTTIYRWVQEYGKLLYQIWKKKNKKSFYSWKMDETYIKIKGKWHYLYRAIDADGLTLDIWLRKKRDTQAAYAFLKRLVKQFDEPKVVVTDKAPSITSAFKKLKEYGFYQGTEHRTIKYLNNLIEQDHRPVKRRNKFYRSLRTASTTIKGMEAIRGLYKKTRKEGTLFGFSVCTEIKVLLGIPA >NZ_CP034168|71923:80361|74699_74972_+|WP_000301765.1|DBSCAN-SWA MAVTYEKTFEIEIINELSASVYNRVLNYVLNHELNKNDSQLLEVNLLNQLKLAKRVNLFDYSLEELQAVHEYWRSMNRYSKQVLNKEKVA |
8 | Streptococcus_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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