Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP031381 | Acinetobacter baumannii ACICU plasmid pACICU1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP031380 | Acinetobacter baumannii ACICU chromosome, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,RT,csa3,cas3,WYL | 0 | 0 | 5 | 0 |
NZ_CP031382 | Acinetobacter baumannii ACICU plasmid pACICU2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP031380_1 | 1551722-1551807 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP031380_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP031380_1
>1.1|1551745|40|NZ_CP031380|CRISPRCasFinder CCGTGCTGCACATGCCAGTGGTAACGCACATGAATTTACC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP031380_1
The CRISPR arrays of NZ_CP031380_1 >merge|NZ_CP031380|1|1551722-1551807|CRISPRCasFinder TCAGAAGAAGCTCGTGAAGCTGGCCGTGCTGCACATGCCAGTGGTAACGCACATGAATTTACCTCAGAAGAGGCTCGTGAAGCTGG >NZ_CP031380|1|1|1551722-1551807|CRISPRCasFinder TCAGAAGAAGCTCGTGAAGCTGG CCGTGCTGCACATGCCAGTGGTAACGCACATGAATTTACC TCAGAAGAGGCTCGTGAAGCTGG
>NZ_CP031380.1|WP_000983628.1|1550676_1551090_-|hypothetical-protein MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII >NZ_CP031380.1|WP_000432330.1|1549656_1550535_-|glucose-1-dehydrogenase MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLKEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFTMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG >NZ_CP031380.1|WP_001990041.1|1547455_1549600_+|catalase-HPII MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEHGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLSYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA >NZ_CP031380.1|WP_001145693.1|1545991_1547401_+|iron-containing-redox-enzyme-family-protein MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLVKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPPEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNQYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN >NZ_CP031380.1|WP_000482091.1|1545196_1545676_-|CinA-family-protein MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR >NZ_CP031380.1|WP_000108365.1|1544690_1544912_-|hypothetical-protein MSTTNNQANQRNNQQQQQQQNDNRNQQQHGNQQQNDQQQQNNQQQQQNDNRGQQQGSNQKDSGQQNSNNNQQR >NZ_CP031380.1|WP_000132044.1|1544267_1544585_-|hypothetical-protein MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDI >NZ_CP031380.1|WP_000498477.1|1543961_1544183_+|hypothetical-protein MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF >NZ_CP031380.1|WP_001136759.1|1543445_1543874_+|hypothetical-protein MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS >NZ_CP031380.1|WP_000251637.1|1543032_1543176_+|hypothetical-protein MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSRNDGMHEASDPATSHDMNKNS >NZ_CP031380.1|WP_000795915.1|1552609_1552846_-|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NZ_CP031380.1|WP_001124846.1|1553128_1553740_+|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NZ_CP031380.1|WP_000885229.1|1553810_1554422_-|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI >NZ_CP031380.1|WP_000376215.1|1554578_1555034_+|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG >NZ_CP031380.1|WP_001990047.1|1555092_1556739_-|allantoin-permease MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA >NZ_CP031380.1|WP_000115408.1|1556904_1560369_+|response-regulator MSVMPDTSRPQQAPQRVIKTRREYNIWVADESIEDYALRYAPTSVRKWSPWTVTNTAISTVSFLAMEAIGATMLWQYGFSNALWAAIVVCTIIFLTSWPISYYAAKYNVDVDLLTRGAGFGYIGSTITSLIYASFTFILLAFEAAIMAMALELALGIPQVIGYLISALVILPLVVKGIGFINKVQAVTQPIWLLLLLLPWFFVLWKQPQILSSSLHFVGAVSNSTDFNLYYFGAACTLIFSFVIQIGEQADYLRFLPQKEKNRTAWRFAVFLGGPSWIIFGFLKVLMGMLLMVLAFQLFIPVSELDNPTYLYWVAYQQFIPNPQLALILTLALVCLAQIKINMTNAYAGSLAWSNFFARLTHSHPGRIVWLLFNVFIAIVLMEMGISHAVERILGLYSNIALAWIGAVVADLIICKPLGLSPKGIEFRRAYLYDINPVGVGALLIASVLSMLSYLGFFGLMAKGLASFIALGSAVLCVPVIAYLTTGKYYIARQPEKIQATLVANCVVCERDYELADMAGCPAYNGTICSLCCSLEARCHDLCKPDARWSVQLKKAIWHYLPERWASRLNSRVSLYLLLTLGLSIVLAVSLSLVYIQEKTYLETINAAAVPQLFTLFVKIYTILFLLMSVAAWWLVLNDESRRNAEIETHQQTALLIDEIAAHEVTSKDLQDARIAAERANDAKSRYVIGISHELRTPLNSILGYSQLLQKQEQLSEQGKMALGVISRSGQHLTSLIDGLLDLARIETGKISLNVVDVHFPNFIEQIIQMFQPQFEQKNLQFVYEIGENLPHYVRTDKKRLEQVLINLLGNALKFTTSGTITLKVEYRFQTAYFEIRDTGCGIAEADLERIFNPFERGSNVVQGGFTGIGLGLPIVKLLVDLLGGQLSVTSQLNQGSQFKIKFYLPSKEVVHPISNVYSNQITGYQGERKRILVVDNEAVDRGLVANFLKPLGFMIEEAESGIDCLRRVPIFQPNLILMDLNMPLMGGWETARLLRQNNITNVPILIISANAGEREVNPQDAVLSEDFMLKPIDLNLLLSKIGDKLGLVWIDSKSETLLENNEVQALDLNIYKQEQVAVHTLIQQPENNELLDFPQSLQQLNDLIGQGYIRGIQQTLTQCRQNFPKHNELWEQLEQAIQKFDLKHAQRLIQDKQ >NZ_CP031380.1|WP_000107128.1|1560365_1561325_+|response-regulator-transcription-factor MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH >NZ_CP031380.1|WP_001025680.1|1561468_1561753_+|N-acetyltransferase MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK >NZ_CP031380.1|WP_002017921.1|1561862_1561976_-|hypothetical-protein MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS >NZ_CP031380.1|WP_000937460.1|1562064_1562700_+|amino-acid-ABC-transporter-permease MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1127794 : 1140142
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP031380|1127794:1140142|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP031380|1127794:1140142|1128921_1129173_-|WP_000654846.1|DBSCAN-SWA MKDQYKKVSQKHMLGFMYYLQLLGYVIVRQGMDQAMFLTKHYAVPVAWRRITIDYHNRLNKPAQQLYKEFVEWTKEEYAEMVA >NZ_CP031380|1127794:1140142|1128513_1128921_-|WP_000147323.1|DBSCAN-SWA MTGNERIPFESQFKTTEIFKRESAIRKNDILAFSETMNGYFNIVTNDAWQLWNKAKAETVPDTPTPSVTLTCAELKEAFDFGAPDGEKDQFQMETEMTIKWLQDGYDGEGYYCWYADLPEEGCIKLGVSESGAEG >NZ_CP031380|1127794:1140142|1134634_1134850_-|WP_000370485.1|DBSCAN-SWA MDNSKRPINQIIARINDAAKHGEALVLTAEEVKILSKDIGDKVFIPVLTNEQVVQLVKEGKLGQKINNTKD >NZ_CP031380|1127794:1140142|1136863_1137745_+|WP_000064627.1|DBSCAN-SWA MSNFVPNSFQVPNAFVDEVLNKISDAACKIYLVICRKTRGWNKEMDSISLTQFEEITGKSRPTVVKCLNELIKVGLVVEQPSTIHGNTFKLGNDTSVGLVLKFPSKNFLLPEIYGQTSKNSLPLLVKNFNYTSKNFLPLLVKIFNTQSITIKNNSQSNKKINKKRGSVSEKPKTEKPNEFNPRSVELPACVDSELWNNFVDMRISIKKPLSENAVKLILKKLISFGPLANQSLENSIIGNYQGVFEPRQNQIQENPQSHNVPEEPGYFTQMYAESNRSNVIDVTPVSQDFGGY >NZ_CP031380|1127794:1140142|1136302_1136575_+|WP_001180660.1|DBSCAN-SWA 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24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1144100 : 1173787
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP031380|1144100:1173787|DBSCAN-SWA 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39 | Acinetobacter_phage(96.97%) | capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2355839 : 2372082
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP031380|2355839:2372082|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP031380|2355839:2372082|2363356_2363557_-|WP_000290739.1|DBSCAN-SWA MAVQTLGRMNVSNLANHPCSGKCTDFKEEQCSTCLINQDAPHQIVNTQTDEEKFLNRAFNAQKEIS >NZ_CP031380|2355839:2372082|2369394_2369682_+|WP_000655910.1|DBSCAN-SWA MKDVNTEITPTLWCVNIPEEPESSPILHPVPTQKIGKQLVYRLKKEALQAFPTVGQCIADAITFEEWQGSKEDHEKYLQDNKNWWLETTFLGEGG >NZ_CP031380|2355839:2372082|2365107_2365392_+|WP_000794429.1|DBSCAN-SWA MKNNKENTADLIGRQAFLKTFVEEVVRSSPDMAASILMNIKELTNEHHPLVTQAFTMDHFENHDMAGNVIKNALHGFDMELARMLKLTVENLKI >NZ_CP031380|2355839:2372082|2370061_2370544_+|WP_000993699.1|DBSCAN-SWA MNAQILDPCCGSKMMWFDRNNPNVVYGDIRKEEHTLCDGRTLVIEPDVLMDFRKMPFNDEQFSLVVFDPLHLVQAGKKSWLAAKYGKLSQDWREDIQKGFSECFRVLVKGGVLIFKWNETQIKVSEILELTDQKPLFGHISGKRSNTHWITFMKAESKEG >NZ_CP031380|2355839:2372082|2355839_2356295_-|WP_001136753.1|DBSCAN-SWA MPQYLFLAETIYKKMKNEKLFSKDVLENMYILMKVIRKEIKGTEYKLKYNFIDFNEVLSKSKNDCKVKIDVSLIPSYNLREEYILWLAGFIQKITEGGPKPPPPIKEYIPEFINLESELDFLTLNLEKNQNNGEEIVNYFNSKHYKATFKK 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>NZ_CP031380|2355839:2372082|2369678_2370059_+|WP_000566307.1|DBSCAN-SWA MIDLNKERVAFEEAYLSVGGKQRELEFEGGEYTNSKSQLGWDLWQIKAKVQEVALPETRAVTLTCAELKDAFDFGAPDGEKDQFQMETEMTIKWLQDGYDGEGYYCWYADLPEEGCIKLGVSESGA >NZ_CP031380|2355839:2372082|2368732_2369023_+|WP_000986112.1|DBSCAN-SWA MMRNIPDSLSLPFTVWMCENGFYPSHKNGFMVLKRGKEVAKISMNETKYGFPMNDICQKKFASFCRAWMNRDKHFIEQLRLRGLARLNQKSYQLVA >NZ_CP031380|2355839:2372082|2360955_2361516_-|WP_006581306.1|DBSCAN-SWA MEKFVFKKIGEYKSDWALAYVDPNNLYSAGGGRLTVVLSSFTGSAFFSHVGQPTFKEFIAQCYAPYLLNKLFPKIEKWVDVEDGNEVIEYIAINKLSELKDGRSSGAISKRDLRNFYEHLKEIEFECFSNFFDQLTFKDRSIMCELFGEDWLWESGPSKLNPDYVYLEKMLVDVISEFKKLIGLDG >NZ_CP031380|2355839:2372082|2364000_2364204_-|WP_000172739.1|DBSCAN-SWA MTLKEKILFLTVTRGYTQQEVSDETGIEQSSVSRILKNTQKSVGYQKGIALDAFVNREKEKMQSQTA >NZ_CP031380|2355839:2372082|2363590_2363965_-|WP_000818521.1|DBSCAN-SWA MAEKLLANASSKLTLEEKAKMEWIAKLEGKNSLSNLIRSMCKKKISEVEGEMAGKSSLEVIKNICTRKVSEAESEYQFLRNVFCGSKDNGYTRDTFELVPLRAEKSRHTNASDKSVQLDLLSWK >NZ_CP031380|2355839:2372082|2363174_2363360_-|WP_000200145.1|DBSCAN-SWA MTSEQKVWPLGTNHTDSEGTPWKRDEQNNWWFWQENFGWSRYVGPVNQAFLDLRFEVGTEQ >NZ_CP031380|2355839:2372082|2362096_2362726_-|WP_000218441.1|DBSCAN-SWA MTVRPILFNTEMVRAILSGNKTQTRRVIKPQPTLSQSSGFNWKGHSYGINSTYKGTIKNFVDSNQVCPFGKVGDQLFVQETYGTKIRSLGGTPHESFVYKADNPNEIAYYDCKGKGYPVRWKPSSRMPRKASRILLEIVDIRVERLHEISDVDAKAEGFDKPKTDSTMQSNNSHNPVLNFQKHWEAIKGKESWNENPWVWCISFRRIDQ >NZ_CP031380|2355839:2372082|2366873_2367554_+|WP_000644002.1|DBSCAN-SWA MKAIILDTETNKLNGYPIEIAYAPFSLENGQLLVHKDEVFNRFYSCPEPIDLEAMAVHNIIETDIEGQPSCESFRLPEGVEFIVGHNIDYDIKALNKCGPAIKVKTICTLALARDVWPDLTSHKLAVLYYFVMSNREEARKHLRHAHSARADVYFTGIILIALIERLGIKDLNSLYLMSEAVRLPKIMTWGKHKGTPLKELPRPYISWLLNKEDLDPHLRKALQNI >NZ_CP031380|2355839:2372082|2370819_2372082_-|WP_000773622.1|integrase|DBSCAN-SWA MKLNKSTVDAIPLTEKGQKIYRDAELIGFAVRVTNKSKTYIVERRHEGELYRVTIGKTTDIPATNARAKAQMILAKISNNEYEKPIKLKNVANPLDITVNEALQIYIDRNDFRPKTIRQYHKYFDLYLGWGNKKLFQISKQEVLDRFIEVSEVSESSANGAVSLLGTLWKYIHVLYSTDENPILKSNPVDIISVTRGWNKIASRDRHLHKDIIHKYYNAVLHYEDELNLENTARSNTHRDIVLMCMYTGCRKQEACCLKWADVDIKNGTLTFRDTKNGSDHTFPIGDHLHSILRERWLLRENDWVFPATKMPTSWNMHATKVDTLLNRVGKEVDYYVSMHDFRRTFATICNLLRFNIYVTKRLLNHTAKPRIDVTGGYVQIPDEELRASMNMIEAVYQGKIDCFNYQSVWTERLKEIKAV >NZ_CP031380|2355839:2372082|2359088_2360567_-|WP_001055558.1|DBSCAN-SWA MNMCLNLNLLPHELIVDNFAGGGGTSTGLEKAFGRPVDIAINHDPKAIAMHRANHPNTRHFCEDVWDVDPVKVTNNQPVGLVWLSPDCKHFSKAKGGKPVEKKIRGLAWIALRWADFTRPRIIMLENVEEFKTWGRLGKDGFPSKKHKGETFRCFVNALRHQGYKVEWRVMSARDYGSPTLRRRFFLVARRDNFPIVWPKPTHAAPDSKAVKTGKLKPWRITAECIDWSIPCPSIFTRKKPLVEATCRRIANGLVRYVINNPEPFIVPMDKVKSVAPVLTECANASSPRCMPIDEPLRTICAGVKGGHHALVTAFIAKHYTGVVGSDIREPLHTITAKDHNSLVVSNLVKLRNNNIGQPVDEPLHTITTSAGHFALVQAFLTAFYGSEKDGNSIHEPLRTIPTRDRFGLVMVKGELHQIVDIGFRMLQPRELFTAQGFEPTYIIDHGIDEHGKTIKLTKTEQGRMVGNSVPPQFSEALVRANFAHEHLYEAA >NZ_CP031380|2355839:2372082|2360563_2360950_-|WP_004708298.1|DBSCAN-SWA MKNKLIVDRNQAKNIRDRELCEIAVNMRIKEGENNQFRARKKFLNQVFWVAEPLCSIKCGPEKFYGHFSCDPIPEGWSRYTLDRPGSRVNFGEHRFLVECTEVKTFKYSAGQLFTVLLTLKKVNGGAL >NZ_CP031380|2355839:2372082|2361560_2362100_-|WP_000817336.1|DBSCAN-SWA MKRCPSFNSYSVTADGKVFTHRRKGRLAKGLNRVDFSYSKELSQFTTSKGYRTVSVYIGNGKSRPIGVHQLVADAFIGPVPENQEVRHLNGIPSDNRYENLAYGTKQDNANDRVQHGGYKQGASHINAKLNQGQVESVRKKRASGSKVKDLAKEFAVSTSTIESVLYGKSYKVNQGGAS >NZ_CP031380|2355839:2372082|2365586_2365925_+|WP_000183423.1|DBSCAN-SWA MTNLRPTDCEEFINDIDGGAFAEQLSYAVSKVASAAMETQKVGVITVQLKFSKSKGAGHNNITVEHKLISNAPLPKGKCVEEHRDKTPMYVNTGGDVSLFAKHTEQLFEVKA >NZ_CP031380|2355839:2372082|2367566_2368595_+|WP_000805209.1|DBSCAN-SWA 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MNAVPQKLEYKISHTNQICKIHKEQMINVHGRIVCQSCVEKIMKQSNEKYESDKNIRILNLKMARAGIPKRHVNSGFSNYAVTHKGQDKARKTCEKFTMDFNAGVFRNLLLVGRTGTGKTHLGSSILKNIIIKNWEAIYITSADLAEDIAGAYRRSGDSEDEALKRYVGKDLLIIDEYGLHDRAEKRPHLLESVHKVLLTRYDEMKPTVVISNLSLSEVRDDLGDRLWSRFQHDGLDIVECDWDDARIGGGKAQ >NZ_CP031380|2355839:2372082|2366005_2366335_+|WP_001072361.1|DBSCAN-SWA MNQKYIGSQSAPSTPICFVPELSGNKTNKPATSRLYQHPSAEDLKFKKDSKWPYVLCFLIFSALAIAFLYACDAEAQVREQKTQHWQQQFNSGEPVDVQVHVVKLGGAQ >NZ_CP031380|2355839:2372082|2356750_2357284_-|WP_000991091.1|DBSCAN-SWA MNAFVDMKKSEYALVAYSNVAAKSKERKALEKAVKKWLKHPGNKIRHVESIGRDLNMPHGTGPMYKRLCCRCETCVEWALSTGLIKSKPKPVVKRGPDARQLRILAQKSQLTPYATAFNEDWDLLALEVDYSVTAFQLERIYQGRSEIDHNFVWNRVKRVADRLVAEKLRAKGGGCK >NZ_CP031380|2355839:2372082|2369023_2369389_+|WP_000434519.1|DBSCAN-SWA MEQEYKGNMNYPFQDHIVLNMEENIVNFPSSNLRKCQHIQVEIDSKALELICMKCKAKVNPVIWIKDTLKYWSRQQTQITEQKKQIKEDLDELKKRARTKCQHCQKMTAINLKNYKFSIIG |
28 | Acinetobacter_phage(62.5%) | integrase | attL 2364175:2364189|attR 2382847:2382861 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2713459 : 2729395
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP031380|2713459:2729395|DBSCAN-SWA 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11 | Acinetobacter_phage(90.91%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2891352 : 2938952
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP031380|2891352:2938952|DBSCAN-SWA 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57 | Acinetobacter_phage(66.67%) | holin,capsid,tRNA,tail,terminase,integrase | attL 2882624:2882638|attR 2909258:2909272 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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