CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP040375	Lactobacillus plantarum subsp. plantarum strain BNH17 plasmid unnamed1, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP040377	Lactobacillus plantarum subsp. plantarum strain BNH17 plasmid unnamed3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP040376	Lactobacillus plantarum subsp. plantarum strain BNH17 plasmid unnamed2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP040374	Lactobacillus plantarum subsp. plantarum strain BNH17 chromosome, complete genome	1 crisprs	csa3,DinG,cas3,DEDDh	0	0	8	0

1. NZ_CP040374

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP040374_1

• CRISPR_ID: NZ_CP040374_1
• CRISPR_location: 2698767-2698852
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP040374_1

Consensus_repeat	Method
TAAGAAACTTAAAGTGTCTTATT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP040374_1

>1.1|2698790|40|NZ_CP040374|CRISPRCasFinder
CGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP040374_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP040374_1

>merge|NZ_CP040374|1|2698767-2698852|CRISPRCasFinder
TAAGAAACTTAAAGTGTCTTATTCGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAATAAGAAACTTAAAGTATCTTATT

>NZ_CP040374|1|1|2698767-2698852|CRISPRCasFinder
TAAGAAACTTAAAGTGTCTTATT	CGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAA
TAAGAAACTTAAAGTATCTTATT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP040374.1|WP_076636232.1|2694800_2695754_-|aldo/keto-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|381318
NZ_CP040374.1|WP_003642347.1|2697273_2698752_-|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|129794
NZ_CP040374.1|WP_021355888.1|2701547_2702546_+|iron-ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|376439
NZ_CP040374.1|WP_013355935.1|2702542_2703538_+|iron-ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|376439
NZ_CP040374.1|WP_013355936.1|2704275_2705169_-|SDR-family-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|187572
NZ_CP040374.1|WP_003643401.1|2703782_2704295_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|274100
NZ_CP040374.1|WP_003643398.1|2698869_2699469_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|224228
NZ_CP040374.1|WP_003643403.1|2706225_2706732_-|acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|100047
NZ_CP040374.1|WP_013355931.1|2696265_2696457_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP040374.1|WP_003642340.1|2690182_2690467_+|DUF1905-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378097
NZ_CP040374.1|WP_003642357.1|2706990_2707827_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|212492
NZ_CP040374.1|WP_016511871.1|2696703_2696943_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP040374.1|WP_003642344.1|2692828_2693866_+|aldehyde-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|187538
NZ_CP040374.1|WP_003642345.1|2694014_2694581_-|DUF1211-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226078
NZ_CP040374.1|WP_011102040.1|2692135_2692702_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|224228
NZ_CP040374.1|WP_003642342.1|2691248_2691977_+|SDR-family-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|226674
NZ_CP040374.1|WP_003642355.1|2705462_2706209_-|SDR-family-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|226674
NZ_CP040374.1|WP_011102039.1|2690750_2691116_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|224647
NZ_CP040374.1|WP_003642358.1|2707837_2708218_+|MerR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|133384
NZ_CP040374.1|WP_003642350.1|2700756_2701551_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224045

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP040374.1|WP_003642347.1|2697273_2698752_-|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit	gnl|CDD|129794	TIGR00711, Uncharacterized_MFS-type_transporter_YhcA, drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily. This subfamily of drug efflux proteins, a part of the major faciliator family, is predicted to have 14 potential membrane-spanning regions. Members with known activities include EmrB (multiple drug resistance efflux pump) in E. coli, FarB (antibacterial fatty acid resistance) in Neisseria gonorrhoeae, TcmA (tetracenomycin C resistance) in Streptomyces glaucescens, etc. In most cases, the efflux pump is described as having a second component encoded in the same operon, such as EmrA of E. coli. [Cellular processes, Toxin production and resistance, Transport and binding proteins, Other].	1.62212e-72
NZ_CP040374.1|WP_021355888.1|2701547_2702546_+|iron-ABC-transporter-permease	gnl|CDD|376439	pfam01032, FecCD, FecCD transport family. This is a sub-family of bacterial binding protein-dependent transport systems family. This Pfam entry contains the inner components of this multicomponent transport system.	1.40795e-80
NZ_CP040374.1|WP_013355935.1|2702542_2703538_+|iron-ABC-transporter-permease	gnl|CDD|376439	pfam01032, FecCD, FecCD transport family. This is a sub-family of bacterial binding protein-dependent transport systems family. This Pfam entry contains the inner components of this multicomponent transport system.	1.35687e-78
NZ_CP040374.1|WP_013355936.1|2704275_2705169_-|SDR-family-oxidoreductase	gnl|CDD|187572	cd05262, SDR_a7, atypical (a) SDRs, subgroup 7. This subgroup contains atypical SDRs of unknown function. Members of this subgroup have a glycine-rich NAD(P)-binding motif consensus that matches the extended SDRs, TGXXGXXG, but lacks the characteristic active site residues of the SDRs. This subgroup has basic residues (HXXXR) in place of the active site motif YXXXK, these may have a catalytic role. Atypical SDRs generally lack the catalytic residues characteristic of the SDRs, and their glycine-rich NAD(P)-binding motif is often different from the forms normally seen in classical or extended SDRs. Atypical SDRs include biliverdin IX beta reductase (BVR-B,aka flavin reductase), NMRa (a negative transcriptional regulator of various fungi), progesterone 5-beta-reductase like proteins, phenylcoumaran benzylic ether and pinoresinol-lariciresinol reductases, phenylpropene synthases, eugenol synthase, triphenylmethane reductase, isoflavone reductases, and others. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold, an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Sequence identity between different SDR enzymes is typically in the 15-30% range; they catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser and/or an Asn, contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. In addition to the Rossmann fold core region typical of all SDRs, extended SDRs have a less conserved C-terminal extension of approximately 100 amino acids, and typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif.	3.70513e-130
NZ_CP040374.1|WP_003643401.1|2703782_2704295_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|274100	TIGR02366, conserved_hypothetical_protein, probable dihydroxyacetone kinase regulator. The seed alignment for this family was built from a set of closely related uncharacterized proteins associated with operons for the type of bacterial dihydroxyacetone kinase that transfers PEP-derived phosphate from a phosphoprotein, as in phosphotransferase system transport, rather than from ATP. Members have a TetR transcriptional regulator domain (pfam00440) at the N-terminus and sequence homology throughout.	3.33884e-08
NZ_CP040374.1|WP_003643398.1|2698869_2699469_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224228	COG1309, AcrR, Transcriptional regulator [Transcription].	4.95133e-09
NZ_CP040374.1|WP_003643403.1|2706225_2706732_-|acetyltransferase	gnl|CDD|100047	cd03357, LbH_MAT_GAT, Maltose O-acetyltransferase (MAT) and Galactoside O-acetyltransferase (GAT): MAT and GAT catalyze the CoA-dependent acetylation of the 6-hydroxyl group of their respective sugar substrates. MAT acetylates maltose and glucose exclusively at the C6 position of the nonreducing end glucosyl moiety. GAT specifically acetylates galactopyranosides. Furthermore, MAT shows higher affinity toward artificial substrates containing an alkyl or hydrophobic chain as well as a glucosyl unit. Active MAT and GAT are homotrimers, with each subunit consisting of an N-terminal alpha-helical region and a C-terminal left-handed parallel alpha-helix (LbH) subdomain with 6 turns, each containing three imperfect tandem repeats of a hexapeptide repeat motif (X-[STAV]-X-[LIV]-[GAED]-X).	1.58107e-53
NZ_CP040374.1|WP_003642340.1|2690182_2690467_+|DUF1905-domain-containing-protein	gnl|CDD|378097	pfam08922, DUF1905, Domain of unknown function (DUF1905). This domain is found in a set of hypothetical bacterial proteins.	1.07383e-22
NZ_CP040374.1|WP_003642357.1|2706990_2707827_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase	gnl|CDD|212492	cd05327, retinol-DH_like_SDR_c_like, retinol dehydrogenase (retinol-DH), Light dependent Protochlorophyllide (Pchlide) OxidoReductase (LPOR) and related proteins, classical (c) SDRs. Classical SDR subgroup containing retinol-DHs, LPORs, and related proteins. Retinol is processed by a medium chain alcohol dehydrogenase followed by retinol-DHs. Pchlide reductases act in chlorophyll biosynthesis. There are distinct enzymes that catalyze Pchlide reduction in light or dark conditions. Light-dependent reduction is via an NADP-dependent SDR, LPOR. Proteins in this subfamily share the glycine-rich NAD-binding motif of the classical SDRs, have a partial match to the canonical active site tetrad, but lack the typical active site Ser. This subgroup includes the human proteins: retinol dehydrogenase -12, -13 ,and -14, dehydrogenase/reductase SDR family member (DHRS)-12 , -13 and -X (a DHRS on chromosome X), and WWOX (WW domain-containing oxidoreductase), as well as a Neurospora crassa SDR encoded by the blue light inducible bli-4 gene. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold (alpha/beta folding pattern with a central beta-sheet), an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Classical SDRs are typically about 250 residues long, while extended SDRs are approximately 350 residues. Sequence identity between different SDR enzymes are typically in the 15-30% range, but the enzymes share the Rossmann fold NAD-binding motif and characteristic NAD-binding and catalytic sequence patterns. These enzymes catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase (15-PGDH) numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser (Ser-138, 15-PGDH numbering) and/or an Asn (Asn-107, 15-PGDH numbering) contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. Extended SDRs have additional elements in the C-terminal region, and typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif. Some atypical SDRs have lost catalytic activity and/or have an unusual NAD(P)-binding motif and missing or unusual active site residues. Reactions catalyzed within the SDR family include isomerization, decarboxylation, epimerization, C=N bond reduction, dehydratase activity, dehalogenation, Enoyl-CoA reduction, and carbonyl-alcohol oxidoreduction.	4.07613e-56
NZ_CP040374.1|WP_076636232.1|2694800_2695754_-|aldo/keto-reductase	gnl|CDD|381318	cd19092, AKR_BsYcsN_EcYdhF-like, Bacillus subtilis YcsN, Escherichia coli YdhF and similar proteins. Bacillus subtilis YcsN and Escherichia coli YdhF are prototypes of this family. They are uncharacterized aldo/keto reductase family oxidoreductases.	1.57684e-129
NZ_CP040374.1|WP_003642344.1|2692828_2693866_+|aldehyde-reductase	gnl|CDD|187538	cd05227, AR_SDR_e, aldehyde reductase, extended (e) SDRs. This subgroup contains aldehyde reductase of the extended SDR-type and related proteins. Aldehyde reductase I (aka carbonyl reductase) is an NADP-binding SDR; it has an NADP-binding motif consensus that is slightly different from the canonical SDR form and lacks the Asn of the extended SDR active site tetrad. Aldehyde reductase I catalyzes the NADP-dependent reduction of ethyl 4-chloro-3-oxobutanoate to ethyl (R)-4-chloro-3-hydroxybutanoate. Extended SDRs are distinct from classical SDRs. In addition to the Rossmann fold (alpha/beta folding pattern with a central beta-sheet) core region typical of all SDRs, extended SDRs have a less conserved C-terminal extension of approximately 100 amino acids. Extended SDRs are a diverse collection of proteins, and include isomerases, epimerases, oxidoreductases, and lyases; they typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold, an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Sequence identity between different SDR enzymes is typically in the 15-30% range; they catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser and/or an Asn, contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. Atypical SDRs generally lack the catalytic residues characteristic of the SDRs, and their glycine-rich NAD(P)-binding motif is often different from the forms normally seen in classical or extended SDRs. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif.	7.62333e-95
NZ_CP040374.1|WP_003642345.1|2694014_2694581_-|DUF1211-domain-containing-protein	gnl|CDD|226078	COG3548, COG3548, Predicted integral membrane protein [Function unknown].	5.75015e-29
NZ_CP040374.1|WP_011102040.1|2692135_2692702_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224228	COG1309, AcrR, Transcriptional regulator [Transcription].	7.31502e-05
NZ_CP040374.1|WP_003642342.1|2691248_2691977_+|SDR-family-oxidoreductase	gnl|CDD|226674	COG4221, COG4221, Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity [General function prediction only].	1.6523e-89
NZ_CP040374.1|WP_003642355.1|2705462_2706209_-|SDR-family-oxidoreductase	gnl|CDD|226674	COG4221, COG4221, Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity [General function prediction only].	2.40011e-91
NZ_CP040374.1|WP_011102039.1|2690750_2691116_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224647	COG1733, COG1733, Predicted transcriptional regulators [Transcription].	1.16334e-31
NZ_CP040374.1|WP_003642358.1|2707837_2708218_+|MerR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|133384	cd01109, HTH_YyaN, Helix-Turn-Helix DNA binding domain of the MerR-like transcription regulators YyaN and YraB. Putative helix-turn-helix (HTH) MerR-like transcription regulators of Bacillus subtilis, YyaN and YraB, and related proteins; N-terminal domain. Based on sequence similarity, these proteins are predicted to function as transcription regulators that mediate responses to stress in eubacteria. They belong to the MerR superfamily of transcription regulators that promote transcription of various stress regulons by reconfiguring the operator sequence located between the -35 and -10 promoter elements. A typical MerR regulator is comprised of distinct domains that harbor the regulatory (effector-binding) site and the active (DNA-binding) site. Their N-terminal domains are homologous and contain a DNA-binding winged HTH motif, while the C-terminal domains are often dissimilar and bind specific coactivator molecules such as metal ions, drugs, and organic substrates.	8.88832e-19
NZ_CP040374.1|WP_003642350.1|2700756_2701551_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|224045	COG1120, FepC, ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components [Inorganic ion transport and metabolism / Coenzyme metabolism].	5.60764e-114

Protein sequences

>NZ_CP040374.1|WP_003642347.1|2697273_2698752_-|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit
MQAKAKISKATMTIAWVVVFGAMAPLLDSTMINIAINNLVTSFHSSVTTVQWAVTGYLLATGVAVPFSSWLLNRFDGKAVFVAGEILFGLGSIFAAVAPNIQLLIIARLVQGFAGGLIMPLLTTLLVQTAGAAVMGQMMATVGLPMILGPLIGPVIGGIIIKFASWHWIFWINVPVVLISIALILWKMPNYPAQNRTAKMDFIGILLLIVSSSAIIYSLVNAAHTDRFNNATSIEMLILGAIALISYVVWAAWQKERAVVPLHLFKFASFDGAGLGLFIAGTVLNGAMLLLPLYFQNVRGMSVINAALALLPQGAGMLVSRTLTGRLTDQIGAKYVVLGSVVITFVGTLPFYWFGQQTSYWILALILFVRGIGAGGILMPLMADAYTGMQPGQVPAATIGTRIIQNIGSAFGSALITTIVTAYSTHQVNVFERHLKAGTYHVDAAHLQVFTTSHLQAIRLAAFQQGFLVIAIAAIVIILPTLLLTNKLKAAK
>NZ_CP040374.1|WP_016511871.1|2696703_2696943_-|hypothetical-protein
MKKVYLRYQKQVDSFININKIMLMLEFVLLFVVKGSIDRYNQLPYDWFAYLTTLIHYFLGTFTFFGIILVIECVWNKFK
>NZ_CP040374.1|WP_013355931.1|2696265_2696457_+|hypothetical-protein
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>NZ_CP040374.1|WP_076636232.1|2694800_2695754_-|aldo/keto-reductase
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>NZ_CP040374.1|WP_003642345.1|2694014_2694581_-|DUF1211-domain-containing-protein
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>NZ_CP040374.1|WP_003642344.1|2692828_2693866_+|aldehyde-reductase
MQKQLVVVTGGSGFIAIHIIRQLLQQGYAVRTTVRSLAKAPVIKEMLTNGGITDLSALEIVVADLAHDEHWSEAMAGATYAIDVASPTPKLNFKNKAEMIRPAVDGVRRVLTASRDAGVKRVVLTSAYGAIFAGHKNRTTPYTEADWSDLNWKAIHPYQESKTRAELAAWDFINHEGRGLELTTVNPVAVMGPVLSAKYSHSNIQIQQFLEGQVKAVPNVDSGYVDVRDVASLHLLAMTAPQANGERFLATTGETLSMLDVANVLRQAFPAFASQLPTKTIPNAAVKLAAKARPELRMVASLVGTYAETSNHKAQTLLDWHPRPAAESIIATAQSMIDLGIVTKP
>NZ_CP040374.1|WP_011102040.1|2692135_2692702_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator
MAATNHAQAIKKDSQTYLTTALLQLLRTHDLDTITVTQVVKRAGVSRMAFYRNFTTLEDLLTAYFAPAIAARFQDVLQHVPANRKLLAMGQFFSDFAPTLRLAEQRGFENIIQQLFNANMTNYYQATMTNGMLTAVQLKYWTRFMSAGVYAIWREWLLGGQLESLTTIHEILATLQTATMQALTQAQK
>NZ_CP040374.1|WP_003642342.1|2691248_2691977_+|SDR-family-oxidoreductase
MKPLVVITGASSGFGAEIAKLFAADNYPLLLLGRRQAKLAALSANFENAMIDTVDVTNYHQFETAVRKAEAKYGKTDLLVNNAGLMLLGNVQNQDPQEWQTMLNTNVMGVLNGTQIVLNDMRDREHGTILNMSSLAGKKTFVNHAAYVASKFGVHGLSETLREENAPKNVRVMLVAPGAAETELLTHVTSKSALSDYEAWKASMGGLTLDPKHVAATVKFMYDMPQNVNIREVDIAATAQDA
>NZ_CP040374.1|WP_011102039.1|2690750_2691116_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator
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>NZ_CP040374.1|WP_003643398.1|2698869_2699469_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator
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>NZ_CP040374.1|WP_003642350.1|2700756_2701551_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein
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>NZ_CP040374.1|WP_021355888.1|2701547_2702546_+|iron-ABC-transporter-permease
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>NZ_CP040374.1|WP_013355935.1|2702542_2703538_+|iron-ABC-transporter-permease
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>NZ_CP040374.1|WP_003643401.1|2703782_2704295_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator
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>NZ_CP040374.1|WP_013355936.1|2704275_2705169_-|SDR-family-oxidoreductase
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>NZ_CP040374.1|WP_003643403.1|2706225_2706732_-|acetyltransferase
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>NZ_CP040374.1|WP_003642357.1|2706990_2707827_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase
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>NZ_CP040374.1|WP_003642358.1|2707837_2708218_+|MerR-family-transcriptional-regulator
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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
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DBSCAN-SWA_2	328568 : 413742	84	Bacillus_virus(16.67%)	bacteriocin,protease,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_3	575699 : 584323	11	Streptococcus_phage(66.67%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_4	1204991 : 1217769	13	Lactobacillus_phage(70.0%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_5	1246154 : 1288632	50	Lactobacillus_phage(82.35%)	tRNA,holin,head,integrase,capsid,portal,protease,tail,terminase	attL 1238580:1238593|attR 1261435:1261448
DBSCAN-SWA_6	2109482 : 2148114	51	Lactobacillus_phage(44.74%)	holin,head,portal,protease,tail,terminase	NA
DBSCAN-SWA_7	2356624 : 2365138	9	Synechococcus_phage(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_8	2835361 : 2890636	65	Lactobacillus_phage(85.0%)	holin,head,bacteriocin,integrase,capsid,portal,protease,tail,terminase	attL 2842539:2842561|attR 2886341:2886363

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP040374|37663:50721|DBSCAN-SWA
TTTAAAAGCCTAAATAATTGGCTAACTTGTTGGCCGCCTGTTGATTTTGGCCCTTAGTGACGTGTGTGTAAACATTTAGGGTTGTTGCAACGTCCTCATGGCCTAATCGGGTTTGTACTTCTTTAATGGTAGCACCAGCGGCAAACAGAGCGGAGGCGTGACTGTGTCGAAAGCCATGTATGGTAATACTAGGGGTTAGGTGGTAGTCAGTGATGATCCGCTTTAACCACTTACCCGGAGTATTAAGCGATTTAAAACCGTTCTTAGTGTTAGCAAAAACTAACTGATCCGGCTGTAACGTATTAAAACCTAAAAACAAATAATATTCACGTTGCCGTTTATGCCAGCGCTGTAATATTTCTACCGTCGTATTGTCTAAGCTGACAGTGCGGCGGCCTTTTTTTGTCTTAGGGGCTTGAATAATCTGCTTGCCGCGTTTCCCTTGGGTGAGCGTTTTATTAACCCGCAAGGTCTTATGGACAAAGTCAATATCTTGCCATGTCAGGGCTAAACACTCACCGCGTCGCACGCCCGCAAACGCTAGTACCCGGAATAGGCAATACTTTTCGGGCTCTTTTTGTTGGTCAATGCAATTGAAGAACGTCTTGAGTTGATCACGATCCCAAAAGTTGTCGGGCTTGTCACCCCAACTATCAGGCTTAACTGGCATTGTAATCATTCTAGCTGGATTATGTGTGATATAGCCGTGTTTTAAGCCGTATTCAAAGACTGCTACCAGATAATTGTACCAACGCTTGTAATTGTACGTGACTTCTTTAAACCACAGATTAACAGCACGCTGGCACTGGTTGACGGTGATGGTTCGCAACCGCTTGTTACCAAACAACGGCAAGATGTGATTATCGAACATGCCAGCAGTCCGTGCCCAAGTGCTTTCACGAACGGTATTAATATACTGGTCGTACCATTCATGATAAACGTCAACGAAAAGAATATTATTATCAACTGGTAAAACCGGTTCTTGCTGTAACTCTACTTCAATTCTGGATAAAGCAATACGGGCAGCACTTTTTGATTTAAAACCCCGCCGCCGGGTTGACTTTTTTTTACCAGTTTGAGGATCAACACCTAAATAAACTTGAAACTGATAACGGGTATTCCCGTCCTTATCCTGATACTTCTTGATTGTTGCCATTTATAATTTCCTCCATAACGTACCGTGCGGGGGCAGTGTTATGTAGAGGATACTTAAAATGTACCAACTGTTAGGTATGTCAGTGACGTGTGTTTATTGTCTTTATTCTAATTATTTAGACTTTTCCGAATCATTCTTTCAAATCCTGTTTCAGGATTTATGTTTTTATCTTTAGCTAATTGTTCAAAAGCTGTTTTAGCCTGTTCTCTTATTTTCCTAATGCTGGGGAGTAGTTCATTGATGGTTTTTATTTGCTCTTCTGAAATTGTTGAGAAATCAAGTTCATCAGACTCGAATTCTTGACCTATTGAATCGGCGTCAATAATCAGCTGGTGAAAAATTCCTGAAGGATTAAAATTATCAGTGTCGGTTCGCAGTAACACCGCATTGGATATTAAGCGGATTGCTTCACTAATTCTCACATTCAGTGACTCATCGTCTATCCCGAGCTTTTCTTTATATGCATCACTTAACAAAAAGGTTATAAAGTTACTTTTCATCTCTTCCTCAATATAATTTTTCAACTTTTCAACTGGATATCCTCCCCTTTCTTCAGAGACCTTGAAATAAATTCGTTGCATTTTCACTCTATCAAGCACCCCATCTATTACTATGGATTTAATGGTTTTTGATCCATCTAAATAATCGGTGGGCACGCCAAATATATAGGCTAAACCTGACAATGTATTGCTCTGAGCTTTTCTATCGCCACGCTCGTATTTACTTAATAAGTCGGGAGATATTTTGATGGCAAACGTTTTAAACAATAAATCTGAAAGTTCAACTAATGTTAGATTTTTTCTCTCGCGTAGTTCTCTAATCCTGTTTTTCAATTTGATATCACCTCTAAAAAAGTATAAGCCATTAACAAGATTGAAACAAGACAAAAAGTATTTTTAGCTATTGACAAGACAAAAAGTATAATATATGATGAGCTTGTTGACAAGACAAAAAGTATTGTTAAGAGAGGCGAAATAGAATGAGGAAAGAATTGCCACGTTATATGACATATAAGCAAGCCATGGAGTGCTTGAACATTAAATCATACAACACGCTTTACAAATATATTAAGCAGGGTTTACGAGTAGTTGCAATCAACGGTACAAAGCGTATTGACCAACTAGACGCTGATAAGTTCATGGAAGCACATAAAATTTAATTGTACCGTGCGGGGGCAGAACAAATTTAAGGAGGTGGTTTCATGATAGCAACAGCAATCTTATGGGCAATCAAATTTATGATTGTGTCGTTTGTCGGCAACGTAGTGGTTAAGTTAATCAAGAACCCGCGTCGGTATTTTGGAATGTGAGGTCAGTCTCATGGGAAAGCATACAAAAAAGACCTACTTTGCTTTGGACAGCAGTAGGTCGAATGGAGTTACTTCAAAATATGCTTTCCCTTATTTTAACACGTTAGCACGGTTATATGAAGGGAATTTGTAATGAAGAAAACTAAAGATTTAGATGAACTAGCGTTTGAGGCTGGATCACTCGTAACTTCAATAGGGGCTTTAGATGATTTTGTCTATGAATACTTCGTTAATAACAATATAGATTATTCCGAAAAATTGAGTGGACTAATCACTGTCATAAAGCAATATGCAGAAAATCACTATACAGATATTGATGAGCTTAATACGTTTGGCGGTGTTGAAAAATGAAAGAGTTCGCAACGCTTGATAAAGCCATTGAGCTGGCCCAACAAGGCTATGCGGTTTACCCACTAATTGAGAATACGAAGAAGCCACCTAAAGGGGTGGCGGGCTACCAAGCCGCAACTAGTGACCAGAACACCATCTTTGCATGGTTCAAAAAGCACCCGACTTACAACTTAGGCTTGCGCCTAGATTTATCAGATTTATTAGTTGTTGACATTGATATGCACGATCCAACTAAAAACGGCCGGACTAGCTTGGCACAACTATTTAAGCAAGGACAGACGTTGCCGAATGATACCTACATTGAATGTACGGCTAACGGCGGCGTACATTATTTTTTGAAATACGCGGGTGCTAAGGTTCGTAAAATTGACGTTTGGCCCGGGATTGACTTGTTAAGTGACTTCACGGTGATTGCACCAAGTGAAATTAATGGTAAACAATATAAACCTTTAGATAGCCGAACATTGGCTGATATTAAGCCGGCTCCTCAATGGTTAGTCGATAAGTTGGCGGGCCAAAAAGTGAACTGGACTTCAGAACACGCCTATACCACACGCCAAAAGAAGTATACCGGTCACTTGTTAGATGAAATGGTAACCGGGACAACCCAAGGCAATCGTAACGCTTGGTTAACTAAAATTGCCGGTCGAATGTTTGGTGTCGGTGCCGATCCCAAGACAGTTTATAACATGCTGTCAGTGATTAATGATTCGTTCGTTGATCCGGCACTACCAAGCAAGGAGGTTAATGTAATTTTTCAATCTATTTTAAAACGAGAGAGTAAGGGGGTTCATTAATGGGTAAAGCAATGGATTTACCAGCAGAGACCCAAGAAGCGGCCAATAATGTTATCAAAATGCAACGTGCCGCTGATTGGCAGAATGAATTCAAAAAGAATTCGGACGATGGAATCAAAACACAGTCTCTTTACAATATCCGCTTAATTATGGAACATGATGAAATGCTGAAAGGGCTAGTTGTCTTTGACGAGTTCTCGGAACAAATCGTTAAAACACCACAAGCAGAAAATTCACCGTTCAAAAAAGGTTTTTGGAATGATAGTGATGACACGTTATTGAGAAGTTATATTGAAGATCATTATAACTTGTTATTCAGCAAGGAAAACATTACTGATGCGGTAGTTACAGAGGCACGCCGCAAGACAATCAATCCGGTTAAGGCTCGTATTGAAGCGGTAGAATGGGACGGCCAGCCACGTGCTGAACGTTATTTCATTGATTACTTAGGTGCCGAAGATAATCACTACACCCGTACCATCACTAAGAAATGGCTAACTGGTCTTATTGCCCGGGCCTATGTTCCCGGAGTTAAGTTTGAAATTGTCCCTATCTTAGAGGGAAGCCAAGGACTTGGCAAGAGTACGGCTGGTAAGAATCTATACCCGGATAAATTCAATGATTCGTTGAAAGGAATGGGTAAGCAGAAAGACGATTATCAACAGTTACAAGGTAGTTGGATTATTGAAGTTGCCGAGCTTTCCGCCATGAAGAAAACGGACGTTGAGGGAATTAAAAATTTTATTAGTGCACAATCCGACACATATCGGAATAGTTATGGCCGCTATGCGTTACCGCACCCACGTAAATGCGTATTTATTGGCACAACTAACCAAACCGACTATTTAAAGGACGCGACCGGTGAACGGCGCTTTTATCCAATTAAATGTGGGGTCAACAAGGCCAAATTAGATGTATGGCACCCGGACGAGAATTACATGCTTCAAGTATTGGCGGAAGCCATGTACTGGTTTAGGAATGGTGAACTGCTATATCTGGATCAGGCCACTATGAAAGAGGCTAAGGCGTATCAGATGGCTGCGGAAGCTGTTGACCCTATGCGAGATGCTATCGAAGCGTTTTTAGCAATGGAAGTTCCCACAGATTGGGAAAACATGAGTACCGGCTTAAAACAAAGCTATGTCAGTGACTACGGCCATCATTCTAAGTGGCTACAAGATCAAGTTAGTAATGAACGGAAACTACTCAATCAAACAACAACTCTGGAAATTATGGAAGTTGTCTTCCATAAAACAGTTGATCGTTATTTAACCGGGCGAACAAACTCGGAAGCTAAACGAATCAAGTTATTAATGGACAATATGGACGGCTGGGAAGCTAAAAGAATTAGAATGAATGGCAAGTTTCCACATGGATATGTTCGCGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP040374|37663:50721|40474_41275_+|WP_130851183.1|DBSCAN-SWA
MKEFATLDKAIELAQQGYAVYPLIENTKKPPKGVAGYQAATSDQNTIFAWFKKHPTYNLGLRLDLSDLLVVDIDMHDPTKNGRTSLAQLFKQGQTLPNDTYIECTANGGVHYFLKYAGAKVRKIDVWPGIDLLSDFTVIAPSEINGKQYKPLDSRTLADIKPAPQWLVDKLAGQKVNWTSEHAYTTRQKKYTGHLLDEMVTGTTQGNRNAWLTKIAGRMFGVGADPKTVYNMLSVINDSFVDPALPSKEVNVIFQSILKRESKGVH
>NZ_CP040374|37663:50721|50451_50721_+|WP_027823052.1|head,tail|DBSCAN-SWA
MSVTVDDIKLSLRIDVTEDDPMIQSYLDAAKDYVQTAVSKNEDLTVYKQYDFAVSLLTQFWYQNRVTDMTKTPYQVVSMIQQLRGKIEA
>NZ_CP040374|37663:50721|37663_38818_-|WP_130851187.1|integrase|DBSCAN-SWA
MATIKKYQDKDGNTRYQFQVYLGVDPQTGKKKSTRRRGFKSKSAARIALSRIEVELQQEPVLPVDNNILFVDVYHEWYDQYINTVRESTWARTAGMFDNHILPLFGNKRLRTITVNQCQRAVNLWFKEVTYNYKRWYNYLVAVFEYGLKHGYITHNPARMITMPVKPDSWGDKPDNFWDRDQLKTFFNCIDQQKEPEKYCLFRVLAFAGVRRGECLALTWQDIDFVHKTLRVNKTLTQGKRGKQIIQAPKTKKGRRTVSLDNTTVEILQRWHKRQREYYLFLGFNTLQPDQLVFANTKNGFKSLNTPGKWLKRIITDYHLTPSITIHGFRHSHASALFAAGATIKEVQTRLGHEDVATTLNVYTHVTKGQNQQAANKLANYLGF
>NZ_CP040374|37663:50721|43554_43896_+|WP_107787068.1|head|DBSCAN-SWA
MKNYNLSRLNKRVQFGVEKMSGFNPNTGENITKFSPTFSVWCGEYTLTISNTISLTGTTATTNQLIAVRHDDRITTTLEAILDGVMYRVAGVSSDSELNAYDVVTLTKVNGHG
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MKIRMIDCDNKMGQCELFVTREPNQHEHLYLRNGSEVVVLNIYQFVRNTKDNFAEEPDFVAIVQYQENGNPALTDLHKEASQAVLDWFNNPESGLLGGSNEEL
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MKVIYPSLVEQAFDICVKQYGPVVSNRVNELKSCIYRALIKDGVLDQNGDPTQKAKDKGLVGNFTPNEDGEYEPETVRDLKLMYPIYAQFSDDHFMKSSQGWLADAYVIRNVSNQVLNNPLSDEEQRKNSYKMLEQLDD
>NZ_CP040374|37663:50721|47365_48472_+|WP_138069444.1|portal|DBSCAN-SWA
MSFFVKSSTTSGTHDPVADALVSLSSNDPYTFVSAAVLRNSDIYAAINIIASDIASNPIVCDTAIFNTMINQTPNSQMDGYHFKYALAANLLLNGNSFAEILPNHTLKFVQNNQITVEQDDVSGVLTYTYTPIGGNSRQITPNNILHFKYFTKDGVSGISPLYALKDERQIQSAGNKLLTGFFTAGVHGTTIIKVHQSDLGPEAKGNIRNQFDEANTGDNAINTIVTDDTMDISNLSLNTDVLKLVNSNDWTTRQIAKAFGLPPERLGVENDHSNQKQSGVQYLQGTLQHYFDSFTSELSFKLGHDFTFNTDKLLSLDPQTQQAQAVAGYTGGIMSRNEARAKIGLPPTDDGNIFLNLQKNGVNTSEE
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MKNKQRFTLAAELKAEKRDAVPTKPENQDQSNSGEPATQAQQVDGKPIISGYAVVFNSPSLKMSTNDGTEFVEMIDPAALDGLDLSKLVLLNSHNWAQPLARADNGTLTTSVDDTGLKFTAELDPSVSYAMDTYNNIKNGVIGGCSFTFDLDNGDDTWTQDTASGQVTRTVNHIKDLYELTTTAIPSYGQSSVQQVIQIESRSYEKFINQEKEPNNMAKQTIIDPNSNDNGNESKTGIPAFEQYVRTHGETRDGLKTDGASAVIPKELITPVFQLKQSNYNLAQYATVKQVSSGSGTYPIATSQQSAVLATKEELADIADVDANMFTEVPFDVKTRAGKIALSNEVVEDAEVDIVSEVKTQLQQLVDNTDNTQIMSLLTGSNFTKATATSIDDLKKIFNVTLDPALSKMWLVNQSGFNYLDTLKDTEGRYLLQPNPTAPSGFTLLGAPVVMISDKLLANNADGTFPMIAGDLSQAVAVFRRNQVTAQWDKFDQFSQGLSVIVRNDYEVIDKTAVINVALGTATAGK
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MKKTKDLDELAFEAGSLVTSIGALDDFVYEYFVNNNIDYSEKLSGLITVIKQYAENHYTDIDELNTFGGVEK
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MSCFNLVNGLYFFRGDIKLKNRIRELRERKNLTLVELSDLLFKTFAIKISPDLLSKYERGDRKAQSNTLSGLAYIFGVPTDYLDGSKTIKSIVIDGVLDRVKMQRIYFKVSEERGGYPVEKLKNYIEEEMKSNFITFLLSDAYKEKLGIDDESLNVRISEAIRLISNAVLLRTDTDNFNPSGIFHQLIIDADSIGQEFESDELDFSTISEEQIKTINELLPSIRKIREQAKTAFEQLAKDKNINPETGFERMIRKSLNN
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MGKAMDLPAETQEAANNVIKMQRAADWQNEFKKNSDDGIKTQSLYNIRLIMEHDEMLKGLVVFDEFSEQIVKTPQAENSPFKKGFWNDSDDTLLRSYIEDHYNLLFSKENITDAVVTEARRKTINPVKARIEAVEWDGQPRAERYFIDYLGAEDNHYTRTITKKWLTGLIARAYVPGVKFEIVPILEGSQGLGKSTAGKNLYPDKFNDSLKGMGKQKDDYQQLQGSWIIEVAELSAMKKTDVEGIKNFISAQSDTYRNSYGRYALPHPRKCVFIGTTNQTDYLKDATGERRFYPIKCGVNKAKLDVWHPDENYMLQVLAEAMYWFRNGELLYLDQATMKEAKAYQMAAEAVDPMRDAIEAFLAMEVPTDWENMSTGLKQSYVSDYGHHSKWLQDQVSNERKLLNQTTTLEIMEVVFHKTVDRYLTGRTNSEAKRIKLLMDNMDGWEAKRIRMNGKFPHGYVRVQ
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MQKITTKQRLRRICSDYVQTILLVIGLICLVIGFGCWISWQAGLILAGIAMILLALLINYEKQRGD
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MRKELPRYMTYKQAMECLNIKSYNTLYKYIKQGLRVVAINGTKRIDQLDADKFMEAHKI
>NZ_CP040374|37663:50721|40019_40127_+|WP_021357487.1|DBSCAN-SWA
MIATAILWAIKFMIVSFVGNVVVKLIKNPRRYFGM
>NZ_CP040374|37663:50721|43888_44269_+|WP_063487667.1|DBSCAN-SWA
MAKPMKQCEHPGCRTLVAYDTRYCEKHHKATNKWRYHKRMYDSDESKYQQFYKSSAWRKLSRRFLESNPVCVQCYQDGVIRKADVVDHVIEIKDDWSRRLDESNLQPLCYRHHNRKTRLAREQREQ
>NZ_CP040374|37663:50721|45507_47211_+|WP_138069443.1|terminase|DBSCAN-SWA
MIEYVDQVLSGQVLVGQKIKWACERFKRDLSRSKDDSFPFYYDEDKAAQAVKFIELMPKTDGSQLTMQPFQKWLISELYGWREKATGNRRYDRAFISMARKNGKTYLASGMAANGLLRERQPARNRQVLFVSNALKQAKLGYDMLSSGLRQVRKQSKYMRQRIKVQKQAITDLETDSQALALASDTSTLDGYAGTTVILDEWHEAKDRKVYNVLKSGQAQEDNSLLAVISTSGLNLNVPMHAEYDMLTDVLKGKTEADRYFVAIWELDDREEVYDQANWIKANPLFSEPHVKQRMTEKIQADVDLAIKQNNLIPVLVKNFNMWLQASEDSYISADDWAAGKLAKVPDLHNRDAYIGIDLSKSNDLTAVSWLVPIGNGQFYCDSHSFVGTKYGLDSKIKRDGIDYRSMERAGECSITRLDSGVIDYDELFDYVQKLVGQYNWKVKAIAYDPYNAQTLITKFEKRNYPLFEVRQGTKTLNIPTRNFRDQLYDDKIKHNGNKILAYAVNNAILKVLNNGWQLDKARNSNRIDPIAALINAFVAGMDYYQESEDQQHAEDYYKTATAADLF
>NZ_CP040374|37663:50721|45037_45511_+|WP_138069442.1|terminase|DBSCAN-SWA
MSQKVKALASMKKHLTNDERDQRKDAERALFDYPVLDLTPPDWLHDRALTEWQRVAPYLKANTPISELDRAMLASYCRTYATVQTCENDIRKNGLVQTNQETGSRKPNPYVALQSQAMKDLKALANDLGMSLSSRARMELNKQKDNTPEDTFEAMLS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
37619:37638	attL	NA	NA	NA	NA
WP_130851187.1|37663_38818_-|integrase	site-specific integrase	A0A172LN96	Lactococcus_phage	2.3e-59	36.7
WP_130851186.1|38925_39705_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	L0P7E1	Lactobacillus_phage	5.0e-05	39.7
WP_130851185.1|39797_39977_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_021357487.1|40019_40127_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_130851184.1|40259_40478_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_130851183.1|40474_41275_+	DNA replication protein	NA	NA	NA	NA
WP_130851182.1|41274_42669_+	virulence protein	Q4ZD27	Staphylococcus_phage	6.0e-70	35.7
WP_130851181.1|42813_43233_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
42679:42698	attR	NA	NA	NA	NA
WP_057136939.1|43256_43568_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_107787068.1|43554_43896_+|head	phage head closure protein	NA	NA	NA	NA
WP_063487667.1|43888_44269_+	HNH endonuclease	A0A1J0MFT4	Staphylococcus_phage	2.9e-19	45.2
WP_138069442.1|45037_45511_+|terminase	phage terminase small subunit P27 family	NA	NA	NA	NA
WP_138069443.1|45507_47211_+|terminase	terminase large subunit	A0A2H4JBN3	uncultured_Caudovirales_phage	5.8e-123	41.1
WP_072535853.1|47164_47365_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_138069444.1|47365_48472_+|portal	phage portal protein	A0A2H4J9Q5	uncultured_Caudovirales_phage	3.2e-50	33.9
WP_138069445.1|48461_50042_+|capsid	phage major capsid protein	A0A1J0MFW8	Staphylococcus_phage	5.7e-40	35.0
WP_027823052.1|50451_50721_+|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP040374|328568:413742|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP040374|575699:584323|DBSCAN-SWA
CATGTATCGGGCACTATATCGGGTTTGGCGTCCCCAACGCTTTGATGAGATTGTCGGGCAACAGATGATTACCCAGACACTAAAAAATGCCATTATGACCCACCAGACGAGTCATGCGTATCTGTTTACCGGTCCCCGGGGAACTGGGAAAACGTCGGCAGCAAAGATTTTTGCTAAGGCAATTAACTGTCACCATCTTGTTGATGGGGAACCTTGCAATGAATGTGAGACTTGTACGGCGATTACCAAGGGGCAACTAAATGATGTCATCGAAATTGATGCGGCTTCTAATAATGGCGTGGAAGAGATTCGTGATATTCGGGACAAAGCGAAGTATGCTCCAACGCAAGCGGACTATAAAGTCTACATTATTGATGAAGTTCATATGTTATCGACTGGCGCGTTTAATGCGTTGCTCAAAACGCTAGAAGAACCCCCGGCTAACGTTATATTTATCTTAGCGACAACGGAGCCCCATAAGATTCCATTAACGATTATTTCACGGACGCAACGGTTTGATTTTCGGCGGATTACAGCTAAGGATAGCTACGATCGGATGGTGTACATCCTCAATGAGAAGGATGTGACCTATGATGAAAAAGCGCTACGCGTCATTGCAGCGGCTGCTGAAGGTGGAATGCGGGATGCTTTAAGTATTCTGGATCAAGTAATTTCGTTTGGAGATAACACGGTTACGTTGGATGATGCGTTAATGGTGACGGGAAGTGTGACCAAGCAGTTGCTGGCTAACTATGTCAGTGAGGTCACCGACCATGATACGAAGCCGGCACTAGAGACGATGCGACAAATCTTACAAGAAGGTAAAGATGCGAACCGTTTCATTGAAGATTTGATCAGTTATACGCGTGACGTGTTACTCTATCAACAGGCCCCTGAAATGGTCGATAGTGTGGCGATGGGCGAGGATGATCAACAATTTGAAGCATTTGCCAAGCAAATCGATGCTGAAGTCCTGTATCAAATGGTCAAGACGTTGAACGATATTCAACAACAAATGCGGTTCACGACGCACCCCGACGTTTATTTAGAAGTGTTGACGGTCAAGTTAGCTCAGTTGGATGGTCAAGCGGCCGTTCAACCGGTAGCTGCGGCAACGGTCAATCCTGAAGATCCCACTGTGCATAAACTGGCACAACAAGTTGAACAGTTGCAAAGCGAGGTCAAAACGTTACGTTCTCAAGGTGGTAGTGTCACTAAACCCGCACCGGCTAAGCCGCGGTCGAGTAATGGCCCGGTTGTTAAGAAGGTTAATGTCAGTCAGATTTATCCTATTCTGGGAGCGGCAACGAAGAATGATCTCATTAAGGTGCGCGATGTTTGGACTGATTTGATGAACATTTTGAGTGTGACGCAGCGGGCCCTAATGCACGTGGCCCAACCAGTTGCGGCCAGTTCAGAAGGTGTTGTGGTTGCGTTTGACTATGCGTTTGTTTATCAAAAAGCGATTGATGACCAGACCTTGATCGATGCACTCGGAAATGGTTTGGATCGGCTGATGGGACAGGCACCCAAGATTGTCTGTGTGCCTAAAGAACAGTGGCCACAAATTCGTAAGGATTATTTGGCCACTCACCAGCCAGGAGGTGCAACATCAGAGCAACAAGCACCGGCCAAAGAACCGGTCGTTGAAGAAGCTAAGAACATGTTCGGTGATTTAGTTGAAGTACAGCCGGACTAAAGACGAAAGGAACTGATAATTATGATGCGTGGAATGGGCAATATGCAAAGTATGATGAAACAAATGAAGAAGATGCAGGCGCAAATGACAGCCGAACAAGCGGCTTTAAATGAACAAACCTTTACGGGTGCGGCGCCAGACGACATGGTCAAAGTCACTTTTACTGGTGATAAGAAGATGAAGGATATTACGATTAACCCTGATGCTGTTGATCCTGATGATGTGGATATGTTACAGGACTTAGTCGTTGCTGCGGTGAACGACGCGTTGACTAAGGTCGATGAACAGACACAAAGTACGATGGGAAAATATACTAAGGGATTACAGTAAAAACGAGGTAAGTACATGCAGTATCCAGAACCAATTGCTAAGTTGATTGATAGTTATATGAAGTTGCCCGGCATTGGTGGCAAGACTGCGACGCGGCTGGCGTTTTATACAATTGATATGAACGGTGATGACGTCACCGAGTTCGCTAAGTCGCTGATTGCGGCCAAACGGGACCTGCATTTTTGTAGTATTTGCGGTAATATCACCGAAGATGATCCGTGTGTGATTTGTAAGGATAAGTCGCGTGATCAAAGCACCGTTCTGGTTGTTGAAGAGGCCAAGGATGTCATGGCAATGGAAAAGATTAAGGAATACAACGGGCTGTATCACGTCTTACATGGGGTATTGTCACCCATTGATGGCAAAGGTCCGGAAGATATCAACATTGCCAGTTTATTGAAACGGCTACAGCAAAATGAAGCCATCAAGGAAGTCATTATTGCCACCAACGCTACGCCTGAAGGTGAAGCAACAGCGATGTACATCTCGCGGTTAGTTAAGCCGGCGGGAATCAAAGTGACCCGATTGGCGCACGGCTTGTCGGTTGGTAGTGATATTCAATATGCGGATGAAATGACCTTATTCAAAGCCGTTGAAGGTCGCCAAGAAATGTAATTGGAGGTGCCACCATGTTTAAACGTAAACAGAAGATCAAGCATCCCAAGGAAGTTTTTGATGAACAGTTGTTGTCGACCCTGAATGCCGCTAAGTTGGACTGGGACCGTGCGAAGCAGAACCAAGAAGCGGTCTATGATAATAATACGAGTGAACTAGTTACGCAGACCGCCTTAGCGCGTGCTAAGTATTTATATCTGTATCGTGAAGCACGTTTACGTCAAGTTCATGGGCAGACGATTCAGCGCTCGGTCATTGATAAATAGACTGTTAGTGATTTAAGAGATAACTTGTTTCAAAATAAAGACGCACGTCGTTGATTTTTGTAAATCTACGGCGTGCGTTTTTGATTTAGAACCCTAGCATTATTTTACCAGTTAATCTGTCATGCATTGTGATTAAGACATGCTAGGTGCGGCAATTGGAATAGAAGATGTGTATCTACTAATGAATAACAAACTAAAATCGGTATTTATCAATCGTGGGTAGTACTACCTAATAACTTTTTAGCAATTCACCGAATAAATCATCAAAACCACAATTGGTAGTAGCCGACCCACGTAAAAATCGTGAAAAAGTACCCTCACTAGTGGTAACCGTATTAGACAGGTACTCAAAAATCAAGTACAATTGCTACATATAAGAAAATAGATGGGATTGGGAATGTTGACAGGAAAATTAGTTACTTTTGAAGGGCCAGACGGTGCCGGCAAAACGTCAGCTTTAAACGCGATTGTGGCCAAATTACAGCCACAATTAGGGGATCGCTTAGTTGTGACGCGTGAACCGGGCGGAAATCAAATCTCAGAAGCAATTCGAAAAATCATTTTAGACCGTCATAATACGGCGATGGACGACCGTACGGAAGCGTTACTCTATGCGGCAGCACGGCGACAACATATCGTCCAAACCATTCAACCAGCATTGCAGAACGACCAACTTGTCTTGTGTGATCGCTACATCGATAGCTCGGTCGCTTATCAGGGGGCCGGTCGTGGTATTGGGGAACAAGCGGTTTATGATATGAATCAGTTCGCGACCGCGGGGTTAACCGCAGATTTAACGTTGTATTTTGACGTAGATGCTGCCGTTGGATTAAACCGCATTCAACAACATCGCCAAAATGAAATTAATCGCTTGGACGTGGAAGCCTTAAGTTTTCATCACCGGGTGCAAGCAGCGTATTTGAGATTACTGGCTGATCATCCTGACCGTATCAAGCGCGTCGATGCAAGTCAGCCATTGGACCAAGTTGTGACGCAGGCCTTAGAGATTATGGCGTCACAGTTACCGACTTATGTGGCATCCAAGGGAGGGGAAGACCAATGAAATTAATTATTGCAATCGTTCAAGATAAGGACAGTAACCGGTTGAGCAGCCAGTTCATTGAAGCCAATGTTCGGGCCACGAAGCTCTCAACGACGGGGGGCTTCCTACGTTCAGGTAATACCACTTTTATGATCGGTATTGATGATGACCGTGTGGATGAAGTTTTAGCCATGATTAAAGAAACGAGTCATGCGCGGGAACAGTTTATGACACCACCAGTCAATCTAGACGTGACGATGGATGGCGCAGCTGCCTATCCAGTTGAAGTTCAAGTCGGTGGCGCCACGGTCTTTGTTCTACCAATTGAACAATTTCACCAATTTTAATGAAGGATGATTATTAATGGCAACAACCGAGTCATTTGCGCAAACGTTAGCGGCGAAACAGCCCCGCTTATTAGCGGCATTTAAACACATCATCGCCCAGAACCATCTGGCCCACGCGTACTTATTCGCGGGGATGGAAGGCGCTGGACAACCAGAACTGGCCCATTGGATTGCGCAACGGTTGTTCTGCCTGCATATTAATGATGGTGAACCAGATGGCACTTGTGAGGAGTGCGTCCGGATTGCTAATGGGTCGCACCCTGATATTGTGACAGTGGCTCCCGAGGGTCAGCGAATTCACGTTGATCAGGTTCGTTACTTAAAAGCTGAATTCTCTAAGAGTGCGGTCGAAGGTAACCGGAAACTGTTCATCATTAATGATGCGGAGAAGATGACAGCGAGTGCTGCCAATAGCTTATTGAAGTTTATTGAGGAGCCAAGTGGTAACGTCACGGCCTTGTTATTAACGACTAATAAGCAACTGATGCTACCAACGATTATTTCACGAACCCAGGTGATCGAATTCCCACCATTAAATGCGCAGGCGTTACAGCAGACGTTTGAACAGGCCGGGATTGCGCCAAACCAAGCACAGATGTTACGGGGCCTGACAAATAGCGTGACCCAGGCGCAGGCGTTGCTAGCGGATGATTGGTTACCACAAGCTGCGCAAGCATTGTGGCGGTGGTTTGACCAGGCTG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

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MKLIIAIVQDKDSNRLSSQFIEANVRATKLSTTGGFLRSGNTTFMIGIDDDRVDEVLAMIKETSHAREQFMTPPVNLDVTMDGAAAYPVEVQVGGATVFVLPIEQFHQF

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_003640957.1|578356_578608_+	YaaL family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011101140.1|579005_579671_+	dTMP kinase	M1PSC7	Streptococcus_phage	1.4e-53	52.7
WP_003640965.1|579667_579997_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003640966.1|580013_581033_+	DNA polymerase III subunit delta'	M1NSC1	Streptococcus_phage	2.1e-32	33.5
WP_003640967.1|581057_581405_+	DNA replication initiation control protein YabA	M1PFV3	Streptococcus_phage	2.4e-12	33.3
WP_003643942.1|581503_582400_+	16S rRNA (cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase	M1PLC5	Streptococcus_phage	9.9e-82	55.7
WP_003640969.1|582403_583189_+	acyl-ACP thioesterase	NA	NA	NA	NA
WP_013355240.1|583327_584323_+	UDP-glucose 4-epimerase GalE	A0A2K9L5H6	Tupanvirus	2.0e-51	38.5

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP040374|1204991:1217769|DBSCAN-SWA
TGTGGCACGTGACGGGACCGTCACAGAGACAAATGATTTAAAATTGCACGCATTAGGGGAGATTATCGGGATGAACGAACACGAAGCATATGTAACGACATTTTATTGGCTCGCGGATTGTTGGTTGGAAACTAGCTATCTGGGACTTGAGGATGAATTTGACGACGATGAAATCGATGACGCCGTCAAGTCACTACTAAATCGGATGCAAGCCGGGGCAATTTATGAGGTAACGGCGGATGATCCAATGTGGCAAGCATGGACGCGGGCAGTTAGGGCCGTGCTTACGCCCAATGATCATGCTGAACATGAAGTTGATGAGACCGACGGAGATGACGAATTAGTGCTACCAGCTGGGGTACGACCAGAACGTCAATTAGAAGAAGTTCAAGCCTATGCAGCGATGAACGCGTTTTTGCAGGCACAAGATCAGGAATATCTGCAAGAAATTGGTAAACGGGCGGCCACTCAGGTCAGTGGTGCCGGGTGGCAAGTGTGGCGTGCACATCGTCAGAGCATGCATCCGGAGTCTGCCGCCCCGCTGACGTTGACTGCTGAACAATTACCAGCCGTGATGTGGGCCTTTTTCAATAAGTACCAGGATACTGAGGACTCTTTTGAGATTTTTGAATTGGTTAATCAACTTGAACAATGGCAAAAAAGTGCTGATCGAGATTTGGACGCGCAATGGTCACAGCTTGTGGCGAAAAGTCAGATTGATCCGGCCGCAATTACGCTCATGCAGGGCTTGTCGTTAGCTATTGAGTTCTTTGATCAGCTTGAGTGGGACGGTGATTTGACTGCCAAGGCAACTTTGCAGAATAAATTGATGCAACGCACGCTCGATGACACGCTCAATGATGAGACGACAGCCAACTGGACGGATGCCTGGCAACACTGGGATTTAGCAGATCCGTTGACAACTGAACAGTGGGCCCGACGGTTTGATCCGGCGGACGACTATGAAGACGATGAAGACGAGAGTGAAGAAGATGGCGCGGATCGGCCAGCTTGGCAACTTGGTGCGAGTTATAGTACCGTTTTGATTGCAATGCGCTTAGTCGCTTACGGTGTACTGCGGCCTGAGAGTGTGCCTGGTATGGCAACTGTGAAGATGGCGAACCGTGCACTGGCAGCTACCGTCAGTATTGGTATCGTGTTAGTTGCTTGGCTGGTCACAGCTATTCTGATTACAATTGTAATTTGGGGATGGCGGTGGCTGCGTAAGCTGATTTTTTAGTGCAGCTGAACGGCCAACTGAATCACAATAGTGCCGATTGACTAGGCTGAAGTTTGTGAATCCAGTAGTTGAAGCTGAAAGGACGGGGCGTCAGTGGTAGTGCTTCATGATGGTTCGTAACTCGGACAGAAAGTCGGCATCTAAATGGGGCGATTGTCCTAATTGTAATGGTGCCAATGGCTGATATAACGTTGGTATGTCTGGCTTTAACGGCTGGTTATTGAAGTATTGCTGACCATGGATTTTGACGGTCGCTTTGAGCGTTCCAATCGTCATGACGGCCACGGCGGTATTTAAAAAGACGCCACCATTGAGACTAGTATATCCAGCGGAAGAACGCCCAACTAAAGTAACGTGCGGGTTACGTTTTAGCGCCATGATGGTCACCTCCGCGGCACTCGCTGTCTGGTTACCAATAATGGCATAAATATGACGAAAGTGGGCCGCTGTTGGTTGCGAAAAGTTAAAGTCATCTTGACCGAGTCCACCAGTGATTCGGCCATGGTACATCATACGTGGCCGGTTGCGATGATGGTTCGTGATACCGGTGTAGAGGGTGCCGTCTGGAATGATGGCGGCCAGGCCAGCAATCATCGGTGCCGAACTACCACCAGTATTTGCTGCGAAGTTTAAGATTAAATCGGTTGTCGGCTTAGTTTGTTTAATCAGGTGCTGGAGTTGTGTCCAATACTGTTTTTGTAATTGGTGCTGACTGCTGTAAAATGCTGGCACATTGATGATGGTGAGGCCGGCACTCATTGTCTTGGTCGGACGGGTGGCATGTTCGACTTGGCGGAGATTGGCGACGGCGAATGAATGTAAATTTGCAGCGCGCAGAATTTGATTGAGTTGGGTCAGTGACGTGATTTTGCGACCATGATCAGTCGCATGTAGCATGGCTTGCCATTGCGTGCGATGGTTGATAATGCCATATTTTGACATGTAGGTGATAGCCGGCATAGCGTTGAAGGACGCACGGAGCCGATTAGAAGCGGAAAGACCAAACGTTAGGACTATCGAAATTAGACCTACCAGTCCGTAACGGCATTTATTCGTTATCATGATAAGCCATCCTTACTTTTCGTGACTAGATTAGCATGTATTGGTTAGCTAAAGTGTAGGCGTGGCGTCAAAATTTCGCAACGAAAAGCATATCTTAACTGGTGCGTCTTTGAAATAATGGTTACTGTTAAAATACCCATCTACATTGGCCGTCTTAACGGCTAAGCAGATGGGTATTTGTTGTATCATGAAATTGTTGACGATTGTGCCAGATCGGCTTCTAACTGGGTTAAGAAGATCGTCACCAAGTCTTTTTCCACCTGGTTCAGTGAATGCTCGGCTGGAAAGGCAATGAAATAATTCAGGGACATTAACGCTTGGGGCAAAGGTAAGATGTTATAGCGTTCTGGATCAGGTTGGGTATGCACACTGTCTGGTAAAAAGGTAATACCCAGTCCAGCAGTGGCTAGCTTGGTGATGGTGGCGGTATTCGTGCTCTCAATTACGATATTCGGTGTCACGTTGTGCTTTTGTAATAAGTAGTCAACTTGGCGTCGAATCGATGACCCGTGGGGAGACAAGACTAGAGGCGCTTGTAGCAGGTCGTTAAGGGGGAGCGCTCCCGGATTAATGAAGGCCTGATGTGGTTGGTACCAGTTGACGGTGTTCGGGATAATCGCGTAATACCCGTCCCGACCGCGGTCATAACTTTCAAGCCCCGGCGCGATGGTTTCCGGATTTTGACCAATTAAGAAGTCCAGTTCACCGTGGAGCACGCGCTGTTCGTTGCGACTAGCGATATCTTCGGTTAATTCGATCTTAGTGGCCGGGTGGGCTTTCAAAAAAGCAGGTAAAAATAGGGGCAATAAGTAATAGCCGAGGCTAGATAAGACGCCCAGCCGAATTACTTGCTGGTTGGCATGTGTGTATTGCCTAATTTGCTTATTAAAGTAATCCTTCTCGTTTTCGAGCGCCGTCAAATATTGATAATAAGTCCGCCCAGCCGTGGTCAGTCGCAGTGGCGTGACTTCACGATTGATGATGGTGACGCCCAATTCTTTTTCAACATTGCGGATGCTTTGGGTGAGGTAAGGTTGTGAAATGTAGAGATCTTTAGCCGCCCGAGTAAAATTGCCGTGCTTGAGCAACACATCTAAAAACCGTCGCATTTCGCTGGAATCTGATTTTGGCATAAAGCGCCTTCCTCTCGCATTGTGATTAGGTAAGTATTCGTTTGATTGCTGATTTGGTTATGTTGAGTTAGTTGCATCGCCATAAGGACGTTCAAAACATGTTCAATAAGTTCTGTCAACATCCTGGCGATAGTGGCAAATAGCATTATGACCAACCATTTTAACATAATTAATTTTAACGCGAATCGTCGACATAGTAAATTTGTTATCGGGGTATAGATAAATAAATATTTCACAAGCAGAGCGCTTTCACTTACACTAATCAGTATTAAGAGTGGCCAATCATTCAATAGCTACTCGTCGAAAACGACTGTTTAAATCATCCTGAAAGGATCTGAAATTATGAAATTTGTTGGGATTGTTGGGACGAATGCAACCAAATCGACCAACCGGCAGTTACTGCAATATATGCAACGGCATTTTCAGCAACAAGCCACGATTGAAATTTGTGAAATAAAAGATTTACCGGCTTTTAATGAACCGGAAGACCGAACAGCACCAGTAGCAATTCAACAGCTCAGTGATAAGATCACCGCAGCAGATGGCGTGATCTTTGCCACGCCGGAGTATGATCATTCAATTCCGGCCGTACTAAAAAGTGCAATCGAATGGCTGTCATATACCACGCGGCCGTTAATTAATAAACCAGTTATGATTGTTGGGGCCTCGAACGGCTCACTGGGAACCTCACGTGCTCAAGCGCACTTACGCCAGATTTTAGAAGCGCCGGAATTAAAAGCACTGGTGATGCCAAATATTGAATACTTACTAGGCCGTTCACTACAAGCTTTTGATGATCAGGGCGACCTGACTTATCCAGATAAAGTTCAGGAATTAGACAATGCGTTTGGCGAATTCATTGATTTTGTAGATTTAACGAATAAAATCATGCCGTCGAGTCAGTTTTTCGAAAAGAGTAAGCAGTTCTCGTGGCGGCAAGTGACTGGGGAGGAATAAACATGAAATTTGTTGGAATTGTTGGAACGAATGCTCAGCATTCGTACAATCGGATGTTGCTGGAATTTATGCAACGACATTTTGCGACACAAGCCGAAATCGAAATTTTAGAATTGACTGATGTCCCGATGTTTGATGAATCGAATGATCAAACTGACAGTACCATCATTCAAAACTTTGCCACTAAAATTGCGGCGGCTGACGGGGTTATCATTGCCTCACCGGAACACAATCATTCCGTGCCTTCCGCGTTGAAAAGCATTATTGAATGGTTATCATTCAAAATTCACCCATTAGATGGTCAAGCAGTAATGATTGTTGGGGCTTCATACAGTGTCCAAGGATCGTCACGCGCGCAACTACACCTGCGCCAGATTTTAGACGCTCCCGGTGTTAACGCCAGTGTCATGCCCGGTTCAGAATTCTTATTAGGTCGTGCCCAAACGGCTTTTGACGATCAAGGTAATTTAAAGGTGCAAGGGACGGTTGATTTTCTGGACAGTTGTTTTGCAAAGTTTCAGAAGTTTGCGACCATCGTCGCCGAGATGCGGGCACCAGAAGCGCTTAGCTTTGCCCCGGGTACTTATCAGGTGACGGCCACTGGACAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

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MLFATIARMLTELIEHVLNVLMAMQLTQHNQISNQTNTYLITMREEGALCQNQIPAKCDGF
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>NZ_CP040374|1204991:1217769|1212541_1212982_-|WP_021356350.1|DBSCAN-SWA
MAQIYLASPFFSPEQVTRVTQLEEALTKNPTVTDFYSPRLHQDAQAEQFTKTWATEIFHRDMAQIAAAQVIVTVLDFEAKNLDSGTAYELGVATMRDLPIIALQEKDEAVNLMITESLHWYTKQVSDFETYDFRQLPQGDFVGEIL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_138069480.1|1204991_1206230_+	hypothetical protein	A0A2P0ZL72	Lactobacillus_phage	9.7e-213	95.9
WP_015825455.1|1206320_1207292_-	peptidase S41	A0A2P0ZL68	Lactobacillus_phage	1.8e-182	99.4
WP_003643099.1|1207477_1208425_-	LysR family transcriptional regulator	A0A2P0ZL89	Lactobacillus_phage	2.7e-178	100.0
WP_131026895.1|1208385_1208571_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003643097.1|1208767_1209382_+	NAD(P)H-dependent oxidoreductase	A0A2P0ZL77	Lactobacillus_phage	6.3e-112	100.0
WP_021356348.1|1209384_1211823_+	flavocytochrome c	A0A2P0ZL82	Lactobacillus_phage	0.0e+00	99.4
WP_076641070.1|1211910_1212471_+	hypothetical protein	A0A2P0ZL75	Lactobacillus_phage	8.5e-100	98.9
WP_021356350.1|1212541_1212982_-	nucleoside 2-deoxyribosyltransferase	A0A2P0ZL88	Lactobacillus_phage	4.4e-75	95.9
WP_022638020.1|1213077_1213215_+	LPXTG cell wall anchor domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_080475280.1|1213372_1214749_-	HAMP domain-containing histidine kinase	W8CYF6	Bacillus_phage	2.0e-25	31.4
WP_021356352.1|1214732_1215425_-	response regulator transcription factor	W8CYM9	Bacillus_phage	5.3e-35	37.6
WP_013355473.1|1216134_1216800_+	phosphatase PAP2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_021356804.1|1216824_1217769_+	glycosyltransferase family 2 protein	V5USA4	Oenococcus_phage	6.7e-73	45.8

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP040374|1246154:1288632|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

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MSTLRIKNISIDYSKSIVRDGLYAFLGKMNPNEIKSELMPLMQDHHNKLVTIIFNNERIDVYAGGSFFDKFGNIEIAFIEKGIKEKAPVSANEPITITDKTISYQNILNLVMQQDKVIRKIINELPSLLNDSDIRNYNDSYPLPVDIKHEVPNLHEWIKSVNGIDFLKGLPSDV
>NZ_CP040374|1246154:1288632|1268256_1268910_+|WP_138069504.1|tail|DBSCAN-SWA
MSKHNIVKATFALLDDNGDLIKDATKGLSTDGIYVADHNGEGFSQINVTAIEAAGTPGWGNGQIKRTAYGKSMPTLALTALDLDFKINQMLKGFTQNTNTGAWVRQLPKPHVAMIAESQSLDGDISIYECFNNIEFVEEASNNSTDTNNEAAYSTALNGTVLTPLKPDIFLAANGVQQPYMIAKSNDANFDLDKLMAETFGGYTKSTSGTTGSTTGN
>NZ_CP040374|1246154:1288632|1252570_1252759_+|WP_138069488.1|DBSCAN-SWA
MTKTLSQLVHVLWAIEKDLHAIASNTEVLKNQMSIKEKIDQTIKNRKEDDTKKQKIRSMLDI
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MALNKLTPASFNRKLQIGITKTVQNPINGTSKQTFVVTVSLWCAPYTRSIASSYQLTAEQLDEVVVVIRHNSTVKEGVKCQYQGSLYSVVNDSMDDSNNYLAYDYLTLKLVTKGA
>NZ_CP040374|1246154:1288632|1253338_1253611_+|WP_076636550.1|DBSCAN-SWA
MVNTALVEHYDQIAKSEAVAMLAPMTEKVAQKYLFVDRKRAAEMLCISIAVFDDLKKLPQIRAIERRLPNCTKVLYKPKELEQAVLSVMQ
>NZ_CP040374|1246154:1288632|1246942_1247266_-|WP_003640256.1|DBSCAN-SWA
MNKQLQYGGLLAVGMAGIAGGFSVGGLFKRLRRPTPNQILSQVKRAFLKEAPIEGSWIEMKKSPLQKFALRTDVYYGGITRYEDGQLVQYEFLADANTGSILDIYRL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
1238580:1238593	attL	NA	NA	NA	NA
WP_003644279.1|1246154_1246799_+|tRNA	tRNA (guanosine(46)-N7)-methyltransferase TrmB	NA	NA	NA	NA
WP_003640256.1|1246942_1247266_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_138069481.1|1247486_1248629_-|integrase	site-specific integrase	A0A2H4JCB7	uncultured_Caudovirales_phage	1.8e-32	30.1
WP_138069482.1|1248862_1249474_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_138069483.1|1249908_1250109_-	hypothetical protein	E9LUS6	Lactobacillus_phage	4.2e-25	98.5
WP_138069484.1|1250114_1250690_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_138069485.1|1250746_1251025_-	hypothetical protein	D2KRD5	Lactobacillus_phage	2.3e-21	59.3
WP_138069486.1|1251034_1251373_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A059T6G1	Listeria_phage	9.3e-17	45.1
WP_044431044.1|1251635_1251824_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_138069487.1|1251849_1252557_+	phage regulatory protein	D2IYT0	Enterococcus_phage	2.3e-70	61.4
WP_138069488.1|1252570_1252759_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_138069489.1|1252755_1253280_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_076636550.1|1253338_1253611_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_118232119.1|1253781_1253970_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_022638745.1|1254004_1254244_+	hypothetical protein	E9LUT6	Lactobacillus_phage	5.9e-34	82.4
WP_118232118.1|1254697_1255003_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_118232117.1|1255100_1255898_+	replication protein	Q9AZA0	Lactobacillus_prophage	1.9e-52	69.7
WP_138069490.1|1255897_1256683_+	ATP-binding protein	E9LUN6	Lactobacillus_phage	1.3e-130	90.0
WP_096587664.1|1256818_1257127_+	hypothetical protein	E9LUN7	Lactobacillus_phage	1.1e-45	89.2
WP_138069491.1|1257119_1257287_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLB5	Lactobacillus_phage	2.5e-15	83.6
WP_138069492.1|1257486_1257813_+	hypothetical protein	O03921	Lactobacillus_phage	1.6e-29	59.0
WP_138069493.1|1257809_1258199_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_138069494.1|1258195_1258366_+	hypothetical protein	E9LUP4	Lactobacillus_phage	2.0e-20	92.9
WP_021732015.1|1258346_1258772_+	RinA family transcriptional regulator	E9LUP5	Lactobacillus_phage	7.2e-67	87.2
WP_138069495.1|1259448_1259757_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_138069496.1|1259740_1260394_+	HNH endonuclease	E9LUP6	Lactobacillus_phage	2.1e-17	95.7
WP_138069497.1|1260390_1260633_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_138069498.1|1260638_1260872_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_107787494.1|1261091_1261526_+|terminase	phage terminase small subunit P27 family	B8R648	Lactobacillus_phage	6.3e-18	38.5
1261435:1261448	attR	NA	NA	NA	NA
WP_138069571.1|1261512_1263429_+|terminase	terminase large subunit	A0A0M7RDK9	Lactobacillus_phage	3.3e-135	41.7
WP_138069499.1|1263650_1264775_+|portal	phage portal protein	Q9AZM4	Lactococcus_phage	3.5e-68	41.2
WP_027821274.1|1264740_1265346_+|head,protease	HK97 family phage prohead protease	B8R651	Lactobacillus_phage	3.1e-39	48.5
WP_138069500.1|1265352_1266735_+|capsid	phage major capsid protein	A0A0M7RF71	Lactobacillus_phage	5.2e-98	62.3
WP_053566532.1|1266823_1267102_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLF2	Lactobacillus_phage	5.4e-31	70.3
WP_138069501.1|1267102_1267450_+|head	phage head closure protein	A0A2P0ZLF0	Lactobacillus_phage	4.7e-56	93.9
WP_138069502.1|1267452_1267860_+	HK97 gp10 family phage protein	A0A2P0ZLE6	Lactobacillus_phage	2.2e-65	93.1
WP_138069503.1|1267859_1268240_+	DUF806 family protein	A0A2P0ZLF4	Lactobacillus_phage	8.5e-59	89.7
WP_138069504.1|1268256_1268910_+|tail	phage tail protein	A0A2P0ZLH1	Lactobacillus_phage	7.9e-113	94.5
WP_138069505.1|1268982_1269357_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLH4	Lactobacillus_phage	4.6e-57	93.5
WP_138069506.1|1269353_1269587_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_138069507.1|1269630_1274088_+	transglycosylase SLT domain-containing protein	A0A2P0ZLG0	Lactobacillus_phage	0.0e+00	76.0
WP_138069508.1|1274164_1275940_+|tail	phage tail protein	A0A2P0ZLH2	Lactobacillus_phage	1.7e-306	90.4
WP_138069509.1|1276006_1278418_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLF8	Lactobacillus_phage	0.0e+00	93.8
WP_138069510.1|1278435_1280976_+|tail	phage tail protein	A0A2K9VDD0	Lactobacillus_phage	6.9e-205	68.3
WP_138069511.1|1280968_1281232_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLG3	Lactobacillus_phage	2.7e-24	88.2
WP_138069512.1|1282320_1283493_+	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	E9LUR8	Lactobacillus_phage	1.1e-202	94.4
WP_003644510.1|1283492_1283756_+|holin	holin	E9LUR9	Lactobacillus_phage	2.0e-38	100.0
WP_118232104.1|1283768_1284302_+|holin	holin	E9LUS0	Lactobacillus_phage	8.0e-39	95.7
WP_013355484.1|1284964_1285606_+|tRNA	DUF4479 and tRNA-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_138069513.1|1285638_1288632_+	cell division protein FtsK	A0A218M9A2	Mycobacterium_phage	2.4e-87	49.7

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP040374|2109482:2148114|DBSCAN-SWA
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MQYDLNKKRGSNVAIDRELVGNIENPSFEVINYAIDQQRKRIGRYNMLEHYYEGNQHILNRNLEMAAKLDRADEKVMTNHAKYITDMITGFTTGNPVSISPANGKDIKAITDAQDQMDIDSHNTEMEKDLSVFGCAYELLYIKKVSDTTTELAIEKIDPRGCVLVTDDTLDKNPLFGIYYVEKKDLRGNADGYLITIYTAHWIIQYRTKTGRVLSDANLVSKPKAVQHYFSGVPLIGYRNNEERQGDFEQTISLINAYNELQSDRITDKKNFVDALLVVYGFTLDEGEDGEGANLKDGILEAPGKGDQGASVEWLTKSFDESQLQVLVKSIKDDIHQTSYVPNMNDENFAGTISGEAMKYKLFGLLQLLATKQRYLTRGIRQRLQLMQNILAFKGQSVDASGATINIVPDIPVNMADVISNIKNAEGVIPQLVSLGWLPGTNDPQELIKMLDQEKEKALKLQQKAMGGEPATDNEEVTADDSGNVSIKQKAGSELSDNGPRE
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MKTDGEFVSEHLMELITQQNLTINRVATLAGLNQSTVNAMFEGRSKRPTITTIRKVCGTLGISVHDFFDFPPYNEVEK
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MKLLVGLEFKEMKTMKFTFRIGNVLYKQLTIEELNNLFDKFKEVERIASTQSIAKA
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MTITNLYTSKQIDVMKTVLQRNDWRLLINYGAVRSGKTVIDNDIFLMELRRIRAVANKLDIDEPMYILAGYSSKSLQNNVLQELANKYGIDFQFDKHGSFKLFGVKVVQTFTGSIAGLGAIRGMTSFGAYVNEASLANEAVFNEILDRCSAPDARIICDTNPDVPTHYLKKNYIDNNDPKAGIVSYHFTIDDNTFLPKEYVERKKAGTPSGMFYDRSILGLWVSGEGMVYKDFNKDTMVIPRSKLPANLNYYCGVDWGYEHKGTIVVVADDQVGNTYLIEEHTRQFEEIDYWVAIAKDIQRRYGRNIKFWADSARPEHVARFQREGFKAFNAKKSVLSGIESVAKCMKQGHFFVIKEAIDAFLDEIYQYVWDETTGLPAKLNDDVMDALRYAIYNTHERLKARTIKKPKGLRG
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MAKPSPPDKAGQLTRLYTRLGVEKDTPDAAVVDDIFDDAVQTCLDYTRSSLSTPILIQAKRLAIIMYNEQGTEGEASRSEGGVSQSFELGLPNIIKTALAPYRVAKTRRF
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MVQVIANNRNRIDDMRMRAVMDHKQAEMMAFALNDPSKMPSVEEAYPFIKTATSTSSDSVPEWKRDQLLLMQQSQKIKTARKFKKTT

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_076672571.1|2110236_2110533_-	hypothetical protein	A0A1I9KK55	Lactobacillus_phage	7.6e-39	76.5
WP_094339220.1|2110533_2111649_-	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	O03950	Lactobacillus_phage	7.5e-47	64.7
WP_021732622.1|2111827_2112262_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_076631606.1|2112264_2112714_-	DUF1617 family protein	A0A2P0ZLE0	Lactobacillus_phage	4.0e-23	39.2
WP_138069527.1|2112720_2117925_-	hypothetical protein	Q6SE68	Lactobacillus_prophage	3.1e-143	59.1
WP_138069528.1|2117939_2118302_-	hypothetical protein	V9QIZ3	Oenococcus_phage	8.6e-45	71.2
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WP_031275283.1|2124162_2124426_-	hypothetical protein	V9QKH3	Oenococcus_phage	2.3e-23	65.4
WP_003642826.1|2124533_2124932_-	hypothetical protein	V9QJA0	Oenococcus_phage	3.0e-46	74.8
WP_099447638.1|2125031_2125415_-|tail	phage tail protein	V5USQ9	Oenococcus_phage	1.8e-37	58.4
WP_003642824.1|2125516_2125882_-	hypothetical protein	V5UQS4	Oenococcus_phage	3.0e-29	53.4
WP_003642823.1|2125881_2126433_-	HK97 gp10 family phage protein	V5URV0	Oenococcus_phage	3.3e-64	61.7
WP_003642822.1|2126434_2126782_-	hypothetical protein	V5US85	Oenococcus_phage	3.2e-36	62.3
WP_024971556.1|2126781_2127114_-	hypothetical protein	V9QJ97	Oenococcus_phage	1.8e-12	45.3
WP_003642820.1|2127125_2127302_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642819.1|2127314_2128337_-	hypothetical protein	V5US24	Oenococcus_phage	3.7e-117	62.5
WP_003642818.1|2128356_2128707_-	hypothetical protein	V5UTH9	Oenococcus_phage	5.8e-30	62.9
WP_138069530.1|2128721_2129399_-	DUF4355 domain-containing protein	Q6SE80	Lactobacillus_prophage	4.9e-17	33.9
WP_003642816.1|2129571_2129778_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642815.1|2129829_2130108_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_138069531.1|2130082_2131768_-|head	phage head morphogenesis protein	V5US81	Oenococcus_phage	1.7e-119	58.3
WP_003642812.1|2131914_2132211_-|protease	ribosomal-processing cysteine protease Prp	D2J003	Enterococcus_phage	6.7e-11	40.2
WP_138069532.1|2132140_2133649_-|portal	phage portal protein	V9QKI8	Oenococcus_phage	6.9e-136	51.3
WP_076670076.1|2133660_2134902_-|terminase	PBSX family phage terminase large subunit	X2CYF4	Lactobacillus_phage	4.6e-138	58.1
WP_033608832.1|2134888_2135758_-|terminase	terminase	V5URT8	Oenococcus_phage	3.2e-53	48.9
WP_138069533.1|2135798_2136044_-	DUF2829 domain-containing protein	S5VZM6	Pseudomonas_phage	1.3e-15	50.6
WP_138069534.1|2136256_2136463_+	CsbD family protein	NA	NA	NA	NA
WP_104880268.1|2136419_2136626_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_102124400.1|2136995_2137265_+	DUF3892 domain-containing protein	A0A059NT53	Lactococcus_phage	7.2e-12	62.7
WP_003642805.1|2137795_2138257_-	transcriptional regulator	D6PSV8	Lactobacillus_phage	1.1e-39	57.0
WP_072534390.1|2138384_2138552_-	hypothetical protein	E9LUP4	Lactobacillus_phage	4.4e-12	84.8
WP_103420662.1|2138669_2139092_-	DUF1642 domain-containing protein	A0A2P0ZLB8	Lactobacillus_phage	1.9e-51	65.8
WP_138069535.1|2139156_2139582_-	hypothetical protein	O03921	Lactobacillus_phage	3.1e-33	88.5
WP_138069536.1|2139574_2140030_-	adenine methyltransferase	A0A2P0ZL79	Lactobacillus_phage	1.7e-69	82.2
WP_138069537.1|2140032_2140191_-	hypothetical protein	A0A2P0ZLB5	Lactobacillus_phage	1.9e-17	90.4
WP_138069538.1|2140183_2140564_-	RusA family crossover junction endodeoxyribonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_138069539.1|2140560_2141079_-	hypothetical protein	O03915	Lactobacillus_phage	1.7e-41	54.6
WP_050339755.1|2141083_2141806_-	oxidoreductase	Q8SDM9	Staphylococcus_phage	2.8e-50	45.6
WP_134902185.1|2141962_2142805_-	ATP-binding protein	O03914	Lactobacillus_phage	5.5e-151	95.7
WP_134902188.1|2142785_2143661_-	DUF4373 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_138069540.1|2143705_2144578_-	hypothetical protein	A0A0P0IZH9	Lactobacillus_phage	1.1e-72	49.2
WP_138069541.1|2144489_2145389_-	recombinase RecT	E9LUM3	Lactobacillus_phage	4.6e-63	47.7
WP_076670013.1|2145385_2145772_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_076670016.1|2145904_2146075_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_024971536.1|2146142_2146655_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	D6PST4	Lactobacillus_phage	2.1e-28	43.5
WP_076670019.1|2146722_2147028_-	DUF771 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_044431424.1|2147234_2147531_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP040374|2356624:2365138|DBSCAN-SWA
CTTAAATTGCTCCTTCATTAATGAGTGTCTGTAATACATCTGGATAAAATTGGTGTTCACAATCATGAATCCGGGTCGCCAGGCTGGCTAGCGTATCGTCTGGTGCAACCGGAACGACCCGCTGGGCAATAATTTGCCCGGTATCGATTCCGGCATCGATATAGTGAATGGTAACGCCCGTCTCAGTCACACCAGCGTCAAAAGCATCCTCGATACCGTGACGACCTGGAAATTTCGGTAACAATGCTGGGTGGATGTTGATAATTTTATGCGAATACGCATTCAAGAGGGTCGGACCGATAATACGCATGTACCCGGCCAATAAGACCAGTTTAATTTGTCGCGCTTGCAAGGCCGTCAAAATGATGGCTTCCGCGGCCGCTTTATTCGCATAATCATGAAAATCAACAATCAATATCGGTATGTTAGCTGCCCGGGCTTTATCAATGACCGGCGCCGTGGGTTGATCACAGACGAGTAACCCAATCACCACCGGTAACTGCCGTTCAATAATCGCTTGGTGGAGTGCAACAAAGTTGGTGCCGTTCCCCGAAGCAAATACCGCAATCTTATTAGGCATGTTCAGCCTCCTCGAAAACGACGGGGGCCGTCCCAGTTTGGACTGTTCCGACGCGATAATAGGACTGCGCGTTGGCCGTCAAATTAGCCGTCACAGCCGCCACTTGGTCGGGGTGAACGACCAAAACCATTCCCAGGCCTAAGTTAAAGGTCGACCGAAGATCCGTGGCAGTCAGCCCACCGAGTTCGGCCAATAACGTCATAATTGGCGGCACCGGCCATTGATCCAATTCAAGGTGCGCACTCAAGCCCGCCGGTAACGCTCTGGCGACGTTCTCAATCAAGCCGCCCCCAGTAATGTGGGCGATACTCGTCACTAATTTCTGCTGTAATAATGGTTGAACTGCATCAACGTAAATGGTCGTTGGTCGTAAAAGTTCCGTTTGTAAATCATGACCAAGTTCGCCAAAAACCGTGGTCAATTGGTAGTCGTGTTGTTTGAATAAAATATCACGAACTAGACTAAACCCATTCGAGTGGAGGCCATTAGACGGCAACCCAATCAAGACGTCCCCAGCCCGAACATTTGCTGGTGATAACAGGTCCGCGCGGTTCGCAATTCCGACCGCAAAACCAGCGAGGTCGTAATGGTCCTGACCATACATATCGGGCATCTCCGCAGTCTCGCCACCAATCAACGCTGTATGGGCCTGCTGACAGCCCGTGACGACGCCAGTCAAAATGGCTTTGACCCGCTTCTGATCCGTATGTCCAAGACCTAAGTAATCTAAAAAGAACTGGGGGGTCGCGCCTTGTGCCAAAATATCATTCACACACATTGCGACCAAGTCAATTCCAATCGTGGTATGTTGATCAGCAGCGATTGCGACTAAGAGCTTAGTCCCCACACCATCCGTCCCCGCTACTAACACGGGATCGTTGGCAGTTGCATCCGAACTAAGTGGAAACGCCCCCCCAAACGCGCCTAATTGCTGATTGCCACTCATTTGTTTGACCGTCTTTAAGACGTCGTAACCAGCGTTGATATCAACGCCAGCCCGCTTATACGCATCGCTCACTTGATCACCCCTTCATGATTGGCTTGTAATTGCGCAATTTCCGCATCATACTCGGCTTGGTAATCATACAGGGCCGTTGGATAATCCCCATTAAAATAGGCCATGCATAGTCCACCATACGGTTCGGTGGTCGACAAGCCAACTGCATCAACGACGCCCTGTTCACTGAGAAAACCAAGTGAGTCCGCACCAAACGTCTGACACATCTCCCGAATCGTTTGCTGAGCCGCAATCAATTCATTAGTCGATTGAATATCGATACCGTAAAAACATGGATAGCGTAATGGTGGCGATGCAATTCGTAAATGAACTGACTTTGCACCCGCATCTTTCAATAATTTGACGATCCGCCGACTGGTGGTACCACGTACAATCGAATCATCGATTAAGACGACTCGTTTACCAGCGACAACACCTTTGACCGCTGAAAGCTTCATCCGAACCCCCTGTTCTCGCAATGCTTGGGTCGGCTGAATAAAGGTCCGTGACGAATATTGATTTTTAATTAATCCCATCTCGTAAGGCAGGCCACTCGCTTCCGCATAGCCGGTCGCCGCTGATAAAGATGAATTGGGTACCCCGACAACAATGTCGGCGTCCACGGGCTGTTCAACAGCGAGCTGAGCACCCATTCGTTTACGTGCAGAATGGACGTTGACGCCGTGAATATCAGAATCTGGACGTGCAAAGTAGATAAACTCCATTGAACAAATCGCCAACTGTGTATCAGTCGTATAATGGTCGATCGTCAAACCATGATCATCGATCGTTAACAATTCTCCCGGCTGAACATCTTGAACAAACGTCGCACCAATCGTATCAAGCGCGCAAGTTTCACTACAAACGACGTACCCGCCCGTGGGTAACTGACCGACGACTAATGGTCGTAACCCGTTAGGATCCAAAGCGGCAATCAAACAATCATTCGTTAGTAGTAAGTAAGCAAAGCCTCCGTGGACTTGACGTAAAGCATCCTTAACCTGTTCCGTTAACGTTGCTGCGGGGCTGCGTCGAATCAGATGCATTAAAATCTCACTATCAGAACTAGCATGAAAAATGGCACCATGCTGTTCCAACCGTCGCCGCAGTGTCACCGCGTTCGTCAAATTGCCGTTATGTGCGAGTGCAAACTGTGAGTCGCTAAAATTAAAACTCAAGGGTTGAATGTTTTCCAATCCATGATTACCAGCCGTGGCATAACGTACATGGCCGACTGCAGCTTGACCCGTCAAACGTGCCAACCGCCGTGGGTCCCGAAAGACATCAGCCAACAACCCTAGTCCGCGTTCCGTCTGCAGTTTGCCGTGATCATTCGCCGTGATACCGGCTCCTTCTTGCCCCCGGTGTTGTAACGCATGGAGCCCAAAGTACGTTAATTGGGCGGCGTCCGGCGAGCCCCAAACCCCAAAGACGCCACATTCTTCATTCAGACTTCTTACTTCAGTAGGCATGGTAAGGCCCCTTCCCACAACTGTTTGGCGAAACTAACCTTAATATCAAACGCCTGATCAGCAGTTTGAACGTGTAGCCGATCCGTTGCAGTTGTTCGTCCTAAATAGGTCACATATGGTTCCATTAAACTTTCAAACGCGGCTTGCTGTGCTGGTGTCACCGAGATAACAAATCGTGACTGCGTTTCCGCAAAGAAGTTGGCAGCGGGCAAGTCACTGGCCAGTTCCACCCCGATATTTTGTGGAAAACATGATTCGGCAATCGTCGTAATCAAGCCACCTTCAGAAACGTCGTGGGCACTAGCAACTAGTCCTTTTTGAATCGCAGTTAACAATAGACGCTGATTACGATTTTCAGTCACAAGGTCAAAATCAAACAGCTCGCCACTGATTGTTCCCGTCAACATCTTTTGCAGCTCACTACCATTGAAATCGGCTTCTGTGGTACCTAACACGTAGACTGCATCGCCAGCGTGTTTAAAATCGCTAGTCGTAATATCTTTCTGATGCTTAATTAACCCGACCATCCCAATCATTGGGGTGGGATAGATGGCTTCCCCGTTCGATTCATTGTTCAACGAGACATTGCCAGAAATCACGGGCGTATTGAATAATTGGCAGGCACGAGCGATGCCCATCGCCGATTCGTCCAAATCGTAAAATTGTTCAGGTTTCTCTGGATTACCATAGTTCAAGCAATCAGTGATGCCTAAAGGTTGCCCACCGGAAGCGACAATGTTTCGAGCAGCTTCCGCAACGGCGATTTCTCCACCGACACGGGGGTTTAAGTATAAGTATCGCCCGTTAACATCGGTGGTGACCGCCAACGCCTTATCCGTATGTCGAATCCGTATGACCCCCGCATCGGAACCCGGCTTGACGACCGTATTCGTTTGGACCTGAGAGTCATACGTTCCATATAACGACGCTTTGGAAGCAATCGTTGGCTGTTGGAGCATCTTCTTCAATGTGCCAGTTGCATCAACTAGTCGTGGCATAAATTGATGATGGCTCTGATGGTTCAAGCGCGTTGGTCGTTTCTTTTCGCGTTCATAGACCGGCGCTTTGGTCGCAAGTGCATCGACGGGAACATCTGCAACTAACTTACCATGATGGAATAATTGATACTGGTGGCCGGCTGTCACTTTACCAATTGTGACAGCATCAAGACCGTACTTTTCAAAGACTTGATAAATTTCTGCTTCGGCACCAGCTTTGACACATAGTAACATCCGCTCCTGTGATTCAGAGAGCATCAGTTCAAACGGCGTCATGCCAGTTTCACGTTGTGGTACCAAGTCAAGATTCAGTGACAACCCACTGCCTGCTTTGGACGCCATTTCGGCTGAGGAGGAAACTAGGCCCGCCGCGCCCATATCTTGAATCCCGATTAAAACATCACGATGATCATGAATAACCTCGAGACACGCCTCCATCAATAATTTTTCCATAAAGGGATCACCAACTTGAACCGCGGAACGCTGGGTTTCATTGGCGTCATTAAATTCAGCAGAGGCGAAGGACGCACCGTTAATGCCGTCACGCCCCGTTTTTGCGCCGACATAAATAACGGCGTTGCCAATTCCTGTTGCTTGGCCCTTCTGAATATCAGCTTGATCCAAGATTCCAACACACATGGCGTTCACCAACGGGTTCTTCTGATAACTCGCATCAAATACCGTATCACCACCGATTGTCGGAATTCCAATACAGTTGCCATAACCGCCAATGCCGGCGACTACTTGCGAAATCAAGTATTTCGTATGAGCATCAGTCGGTTCCCCAAAGCGAAGACTGTCCAGCAGCGCAATCGGCCGGGCCCCCATCGAAAAGATGTCCCGAATGATACCACCCACACCCGTTGCCGCACCCTCATAAGGTTCAACTGCAGACGGATGATTATGACTTTCAGCTTTAAAGACCACGGCCTGACCATCACCGATGTCGATAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7

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MLKKQPLSPTDVRDSKVYRDWGLTDAEYQLLTDKVLQRLPNETETGLFSGMWSEHCSYKNSKPVLKKFWTQGEQVLEGPGEGAGIIDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGEPTDAHTKYLISQVVAGIGGYGNCIGIPTIGGDTVFDASYQKNPLVNAMCVGILDQADIQKGQATGIGNAVIYVGAKTGRDGINGASFASAEFNDANETQRSAVQVGDPFMEKLLMEACLEVIHDHRDVLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLSLNLDLVPQRETGMTPFELMLSESQERMLLCVKAGAEAEIYQVFEKYGLDAVTIGKVTAGHQYQLFHHGKLVADVPVDALATKAPVYEREKKRPTRLNHQSHHQFMPRLVDATGTLKKMLQQPTIASKASLYGTYDSQVQTNTVVKPGSDAGVIRIRHTDKALAVTTDVNGRYLYLNPRVGGEIAVAEAARNIVASGGQPLGITDCLNYGNPEKPEQFYDLDESAMGIARACQLFNTPVISGNVSLNNESNGEAIYPTPMIGMVGLIKHQKDITTSDFKHAGDAVYVLGTTEADFNGSELQKMLTGTISGELFDFDLVTENRNQRLLLTAIQKGLVASAHDVSEGGLITTIAESCFPQNIGVELASDLPAANFFAETQSRFVISVTPAQQAAFESLMEPYVTYLGRTTATDRLHVQTADQAFDIKVSFAKQLWEGALPCLLK
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MNANFKEALLPPATIGIVGGGQLGQMMTLSAKAMGYRVGVLDPTPKAPAAQVADFQIVAAYDDQAALLDLARRSDVLTYEFENVDENALIAAQAYAKLPQGTALLHITGDRLNEKQFLHDHGIPVTSFAPVADLQSLNYALNRVGTPAILKTAAGGYDGHGQTDLDTAVVTKAASALLTQPCILEARQKFRTEVSMMVTRSAAGVVTTFPLVENQHQHHILHTTIAPANVQPSVHSAARKIAVSIAESLKLRGVLGIEFFVLPDDTLLVNELAPRPHNSGHYTIEACNISQFEAHIRSICGLPIPAITQTSPAVMRNLLGDDLTVARQQLVEHPEWHFHDYGKAAIKPQRKMGHVTVLNHEIDAALASVANLKGEQ
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MMKFAVPVFPGSNCDHDMVNALRDILHVTADLIPATATSLAGYDAVVLPGGFSYGDYLRSGAIARFAPIMPAVIAFANAGKPVIGICNGFQVLTEAGLLPGALQANRSAKFICQDSPLRIANHETIFTTAYGSTDQISLPIAHGEGNYYCDEGTLAQLRANHQIIFEYVENPNGSTANIAGITNEAGNVLGMMPHPERAVEMILGSTDGLGIFQSVIASQEEVTHA

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_021356101.1|2357195_2358221_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	R9TMC7	Synechococcus_phage	1.4e-60	42.4
WP_003642591.1|2358217_2359672_-	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	2.5e-50	34.0
WP_021356102.1|2359656_2361876_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurL	A6N228	Microbacterium_phage	3.5e-144	39.1
WP_021356103.1|2361868_2362549_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurQ	NA	NA	NA	NA
WP_003642588.1|2362548_2362803_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurS	NA	NA	NA	NA
WP_021356104.1|2362804_2363536_-	phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase	M4SM18	Cyanophage	2.1e-37	37.3
WP_076636481.1|2363538_2364669_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_003642585.1|2364652_2365138_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	2.3e-16	41.0

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP040374|2835361:2890636|DBSCAN-SWA
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MFIRMETNNKAEAIKSWLANHRQLESQGTIADHFKKSITFVNLALNKKITTNGAERLVNEVYDYLVKKYKI
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MGLFRHHNQMPPRIKRKLKQRLLPVAAMEITATTIVVADVLTAKSFRRGHRLGWLLLAFVQPFGPWLYFAFGQER
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MATLGLNMLYTSIKNTDGSTVIDADKGLSATGVYQIDTSKANGNLGTKTANITGLSGTVSKITGNNEVVDVSNPPSAPSVAIDANEINFIVKQKLLGRVSDGKGGYIDSDTPVEAGLIIESRSPVTRTAVYFCFGRGIFNEAGQNIQTNTDTAETRDDDNLTFTALNYDKFSGQPYKVYAESDPKFDKQAMFDAVFPGQTFYKNASNGTSGQ
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MYEEDIEHALRARKYNAIRADERELINAIAYDTTGIIKRHPRLYYSEEFIAELQKHDINVCESDEENDDRWTFTLPPMYREE
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MQRESELRQQAQEAIKGLIVRLSGWSDQSGDLLDIIDVLMQVDKKITTTKNPEALVNRLVNYIRSVAIKGRLHFPDEEEKLMIDLGIIGQKAGLNGAYMADFSDKSQFYGMLEEVPQH

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_011102095.1|2837490_2838042_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_003642478.1|2838892_2839621_-|holin	antiholin	NA	NA	NA	NA
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WP_003642482.1|2841494_2842193_+	zinc metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
2842539:2842561	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_022638402.1|2864935_2865130_-	DUF1056 family protein	E9LUQ0	Lactobacillus_phage	5.3e-25	93.8
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WP_063486120.1|2869923_2870361_-	transcriptional regulator	E9LUP5	Lactobacillus_phage	2.1e-29	45.8
WP_080469393.1|2870425_2870593_-	hypothetical protein	E9LUP4	Lactobacillus_phage	3.1e-13	85.1
WP_063486126.1|2870589_2870913_-	hypothetical protein	Q9T1G9	Lactobacillus_phage	1.3e-15	48.5
WP_101494309.1|2871781_2871940_-	hypothetical protein	A0A2P0ZLB5	Lactobacillus_phage	1.3e-18	94.2
WP_063486118.1|2871932_2872241_-	hypothetical protein	E9LUN7	Lactobacillus_phage	2.4e-48	94.1
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WP_003641371.1|2874876_2875077_-	hypothetical protein	E9LUT7	Lactobacillus_phage	1.0e-26	89.4
WP_063486115.1|2875079_2875328_-	hypothetical protein	E9LUT6	Lactobacillus_phage	8.6e-28	73.9
WP_057137267.1|2875493_2875766_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_114619726.1|2877090_2877834_-	hypothetical protein	A0A1P8BM06	Lactococcus_phage	9.7e-51	44.9
WP_080382821.1|2878307_2878535_-	zinc ribbon domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003644552.1|2878620_2878836_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641361.1|2879091_2879418_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A1B0Y2R0	Lactobacillus_phage	6.9e-17	44.1
WP_003641360.1|2879448_2879838_+	ImmA/IrrE family metallo-endopeptidase	D6PSS8	Lactobacillus_phage	4.6e-36	54.3
WP_003641358.1|2879902_2880103_+	hypothetical protein	E9LUS6	Lactobacillus_phage	4.9e-26	100.0
WP_057137257.1|2880432_2880663_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016510999.1|2880832_2881021_+	hypothetical protein	E9LUS5	Lactobacillus_phage	8.2e-23	91.9
WP_057137256.1|2881453_2881711_+	hypothetical protein	A0A2P0ZL96	Lactobacillus_phage	5.0e-31	75.0
WP_003644558.1|2881893_2882208_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_063486111.1|2882383_2883523_+|integrase	site-specific integrase	A0A2H4JCB7	uncultured_Caudovirales_phage	4.0e-35	29.0
WP_003643471.1|2883802_2885299_+	phytoene desaturase	NA	NA	NA	NA
WP_003642485.1|2885279_2886161_+	phytoene/squalene synthase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642486.1|2886522_2887464_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
2886341:2886363	attR	NA	NA	NA	NA
WP_003642487.1|2887529_2888642_-	glycerate kinase	W6LM47	Streptococcus_phage	1.1e-34	35.0
WP_003642488.1|2888777_2890112_+	NAD(P)/FAD-dependent oxidoreductase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	7.9e-27	26.9
WP_003642489.1|2890306_2890636_+|bacteriocin	bacteriocin immunity protein	NA	NA	NA	NA

2. NZ_CP040376

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	11582 : 53675	32	uncultured_marine_virus(20.0%)	holin,transposase,protease	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP040376|11582:53675|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_138069583.1|13164_15318_+	type IA DNA topoisomerase	A0A1X9I6W8	Streptococcus_phage	1.2e-104	47.1
WP_138069584.1|15456_16422_+	DUF3991 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_138069585.1|16418_16613_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_138069586.1|17223_19008_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit	A0A223W0B1	Agrobacterium_phage	6.1e-83	34.0
WP_016526775.1|19074_19389_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_138069587.1|19484_21587_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_138069588.1|21596_22376_+	sortase	NA	NA	NA	NA
WP_138069589.1|22404_25344_+	isopeptide-forming domain-containing fimbrial protein	NA	NA	NA	NA
WP_046041437.1|25420_25717_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_138069590.1|26471_27455_+	LytR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_138069591.1|27466_28258_+	exopolysaccharide biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
WP_138069592.1|28273_29032_+	CpsD/CapB family tyrosine-protein kinase	NA	NA	NA	NA
WP_138069593.1|29031_29805_+	tyrosine protein phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_138069594.1|29829_30480_+	sugar transferase	NA	NA	NA	NA
WP_138069595.1|30495_31572_+	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_138069596.1|31571_32687_+	glycosyltransferase	A0A1V0SL50	Klosneuvirus	2.9e-06	23.7
WP_102197015.1|32688_33774_+	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_057717442.1|33905_34826_+|transposase	IS30-like element ISLsa1 family transposase	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	1.1e-51	38.6
WP_138069597.1|35353_36838_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_138069598.1|36861_37854_+	glycosyltransferase family 2 protein	A0A0F7L2F7	uncultured_marine_virus	3.6e-08	36.9
WP_138069599.1|38700_39684_+	capsule biosynthesis protein CapC	NA	NA	NA	NA
WP_138069597.1|40630_42115_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_138069598.1|42138_43131_+	glycosyltransferase family 2 protein	A0A0F7L2F7	uncultured_marine_virus	3.6e-08	36.9
WP_138069599.1|43977_44961_+	capsule biosynthesis protein CapC	NA	NA	NA	NA
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WP_057704853.1|52477_52948_+	CidA/LrgA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_138069603.1|52949_53675_+|holin	antiholin-like protein LrgB	NA	NA	NA	NA