Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP038851 | Staphylococcus aureus strain Lr2 plasmid pLr2-1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP038850 | Staphylococcus aureus strain Lr2 chromosome, complete genome | 6 crisprs | cas3,DEDDh,RT,DinG,csa3,WYL | 3 | 0 | 13 | 0 |
1. NZ_CP038850
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP038850_1 | 632775-632862 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038850_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038850_1
>1.1|632805|28|NZ_CP038850|CRISPRCasFinder GGTGTGGGCCCCAACACAGAGAATTTCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038850_1
The CRISPR arrays of NZ_CP038850_1 >merge|NZ_CP038850|1|632775-632862|CRISPRCasFinder AAAAGAAATTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACACAGAGAATTTCAAAAAGAAATTCTACAGGCAATGTAAGTTGG >NZ_CP038850|1|1|632775-632862|CRISPRCasFinder AAAAGAAATTCTACAGGCAATGCAAGTTGG GGTGTGGGCCCCAACACAGAGAATTTCA AAAAGAAATTCTACAGGCAATGTAAGTTGG
>NZ_CP038850.1|WP_000808893.1|631684_632623_+|aldo/keto-reductase MKQFVNLGKSDVEVFPIALGTNAVGGHNLYPNLDEEQGKDVVRQAINHGINLLDTAYIYGPERSEELVGEVVKEYPREQIKIATKGSHEFDENQEVHQNNQPEYLKQQVENSLKRLQTDYIDLYYIHFPDDNTPKDQAVAALQELKEQGKIKAIGVSNFTLDQLKEANKDGYVDVVQLEYNLLHRENEAVLQYCVDHQITFIPYFPLASGILAGKYDENTKFSDHRTTRRDFKPGVFEENVRRVKALESIAAAHQTSIANIVLAFYLTRPAIDVIIPGAKLAEQVVENIKAADIVLSDDEIQYIDELFPIED >NZ_CP038850.1|WP_000882191.1|630604_631237_+|DUF443-family-protein MLCEVIAIYKNPKYRIIKYNDEYLMVNIINNWLVLFIPLLNWLTPKRYIKISQEELESLNTFKPAKNNAFWPALGSSVLFSVTFRKYMPLFNVRLEKTIVIAIFFVVFLGILFFYLNLNRRLALSVFTMNKEKSQKMILLPNLKHFFFIIFAYLYFGGFSFFTLYALITIDVQNIIIFICWGAVTMFFFFINIVPIGIKKAHVILLKKAE >NZ_CP038850.1|WP_000882094.1|629844_630465_+|DUF443-domain-containing-protein MLCESKIINKNPKYRIIKYNDEYLMIDIISTWISLFFPFINWFITKRYVKISREEFENLNIVKPAKKNVFWPVAGSSALLGVALRKYTHLLDVQLDKKLVIAICCITFIGILIFYVRLIKKSSLNIYNTKNKRSKIFLIPTLKNVCFTLFGYILFGGLTMLFLDALLSMSYQNIIVYFAWITAIMGFFLVNIALIIDKNIHVILKN >NZ_CP038850.1|WP_100185067.1|629162_629798_+|DUF443-domain-containing-protein MLLCESKVINKNPKYRIIKYESEYLMIDLASNWIVFFFPFINWLIPKTYVKITKNDYEKLNIVKPVKNKSIGWTIFAGIVLLGGTVRRNTYLFDFQLEKLIVWSSCFISFLGVIFFYCYLNKKLTLNVYKENKNNELKLRLLPSFKNMCFTIFYYLFTGFMSYGAFYLLVFENVQNLILYISWLFMTMLFMLMNMHSIIDKKVHIFLKSNK >NZ_CP038850.1|WP_000020813.1|627767_629162_+|transposase MSIDMYLDRSRNQASSVGNLSQTMNSNYDALEKAITQFINDDALKGKAYTSAKQFFSTVLIPLSTSMKTLSDLTKQACDNFVSRYTSEVDSISLKESELEEDIRSLSQQITRYENLTNNLKKHASDNQQAISSNQQIIQTLGQQKHELEEKLRKLREFNQKSPEIFKEVEEFQKIVQQGLTQAQNFWNFSTNQFNIPSGKELDWAKASHEKYLKVAMGKIEHKAEKETLNKADFAVIKAYAKEHPEDDIPKSIMKYINDNKDSIKRDIGLDITSTLLEQGGINASKFGVFINTAGGVKGPAGPNSFVEVKRTSGNVFIENGSKFAKGGKYLGKGVAGVGFGIGMYDDLANDDKTFGEALSHNGMTLAAGSVAAFGVAALVSNPVGWAVVGILTAGIIGSIVSDYLYQNNYFGIKDKVDWAGHKIDEGIDAVNKTAEKAVDSVGNTIGDATKSISNHINPMKWSW >NZ_CP038850.1|WP_031789458.1|627201_627303_+|hypothetical-protein MCQYLCLKSVELGVVIVMIYCLKVVALTVRLHN >NZ_CP038850.1|WP_001047245.1|626703_627144_-|Rrf2-family-transcriptional-regulator MNLEFNIAVHVLAFLTKHHSEKFNSSSLAELTCLNPVQLRRVTTQLVDLKMINTIRGKDGGYLANDQSADVSLATLYKHFVLEKKHHTRLFTGDEGSHCQIARNIATTMSHYQQDEQNIIINFYNGKTIKDVIEDIQKEDLCHENI >NZ_CP038850.1|WP_000860590.1|625394_626717_-|FAD-containing-oxidoreductase MKTYDLIVIGFGKAGKTLAKYAASTGQHVAVIEQSSKMYGGTCINIGCIPSKTLVHDGLEGKSFEASYNRKNDVVNALNNKNYHLLADDNNIDVLDFKAQFKSNTEVNLLDQHGDIADSITAPHIIINTGATSVIPNIKDLDQAKHVFDSTGLLNINYQPKHLVIVGGGYIALEFASMFANLGSKVTVLERGESFMPREDQDVVAHAITDLENKGIALHTNVETTELSSDDHHTTVRTNVGNFEADAVLLAIGRKPNTDLALENTDIELGDRGEIKVNAHLQTTVPHIYAAGDVKGGLQFTYISLDDYRIIKSALYGNQSRTTDNRGSVPYTVFIDPPLSRVGLTSKEAAAQHYDYTEHQLLVSAIPRHKINNDPRGLFKVVINNENNMILGATLYGKQSEELINIIKLAIDQNIPYTVLRDNIYTHPTMAESFNDLFNF >NZ_CP038850.1|WP_000798969.1|625001_625343_+|DUF1450-domain-containing-protein MKNTFLICDECQAVNIRTLQKKLEKLDPDAEIVIGCQSYCGPGRRKTFTFVNNRPLAALTEEELIEKVSQQLKKPRDSEEEERLRKRHEERKRRKEEQDRKLKEKLEKRKAQQ >NZ_CP038850.1|WP_000616885.1|623748_624825_+|phosphomevalonate-kinase MIQVKAPGKLYIAGEYAVTEPGYKSVLIALDRFVTATIEEADQYKGTIHSKALHHNPVTFSRDEDSIVISDPHAAKQLNYVVTAIEIFEQYAKSCDIAMKHFHLTIDSNLDDSNGHKYGLGSSAAVLVSVIKVLNEFYDMKLSNLYIYKLAVIANMKLQSLSSCGDIAVSVYSGWLAYSTFDHEWVKHQIEDTTVEEVLIKNWPGLHIEPLQAPENMEVLIGWTGSPASSPHFVSEVKRLKSDPSFYGDFLEDSHRCVEKLIHAFKTNNIKGVQKMVRQNRTIIQRMDKEATVDIETEKLKYLCDIAEKYHGASKTSGAGGGDCGITIINKDVDKEKIYDEWTKHGIKPLKFNIYHGQ >NZ_CP038850.1|WP_000633782.1|633120_633657_+|flavodoxin-family-protein MITVLFGGSRPNGNTAQLTKFALQDLEYQWIDVTQHQFKPIRDVRHTAETITSYDDDYLPILDKILASDTIIFASPVYWYSISAPLKAFIEHWSETLQDKRYPNFKAQMAEKDFRVILVGGDCPKIKAKPAITQMKYSLDFLGATLNGYIIGTAEKPGDIMKDNYALARATEWNSILQ >NZ_CP038850.1|WP_000477504.1|633825_634302_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MFKVRQATEKDVVQIRDVATKAWFNTYLNIYAATTVNHLLEASYNEHHLKKRLQEQLFLVVEEGNDIVGFANFIYGEELYLSAHYVKPESQHTGYGTALLNEGLSRFEDKFEGVYLEVDNKNEEAVAYYKEQGFTILRSYEPEMYGEKLDLALMYKAF >NZ_CP038850.1|WP_000180230.1|634341_635637_+|HD-domain-containing-protein MTNAYVDLKLVEEKVFKDPIHRYIHVEDQLIWDLIKTKEFQRLRRIRQLGTLYLSFHTAEHSRFGHSLGVYEIVRRLIDESFIGHDAWDNKDRPLALCAALLHDLGHGPFSHSFEKIFNTDHEAYTQAIITGDTEVNAVLRKVAPEFPREVAEVINKTHHNKLVISMISSQIDADRMDYLQRDAYFTGVSYGAFDMERILRLMRPSKDEVLIKESGMHAVENFIMSRYQMYWQIYFHPVSRGGEVLLNNCLKRAKQLYNEGYEFKLHPHDFIPFFEETVTIEQYVELDEAVVTYYLEKWTKEDDAILSDLASRFINRDLFKYIPFDGSIITISELQELFEAGGINPDYYFVSEAFSDLPYDYDRPGSNRKPIHLLRQDGTIREISNQSLVIHSITGINRQDYKLYYPREMVAKIKDKTIREAIENLINELN >NZ_CP038850.1|WP_001788287.1|635664_636186_+|hypothetical-protein MEVISLSEKKGFNFNIIKNDPLDGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDVANKEAFIDIGGMHARAKVEKGVKWITDKAAVEGDEAKEYWLCWVTTERNEQGPYYAGLTACYLLVNKAIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHHIIIDQIGDENKAILKDFLMNHDEGMWKHSSDALHQAFN >NZ_CP038850.1|WP_001200743.1|636684_637695_+|alcohol-dehydrogenase-AdhP MRAAVVTKDHKVSIEDKKIRALKPGEALVQTEYCGVCHTDLHVKNADFGDVTGVTLGHEGIGKVIEVAEDVESLKIGDRVSIAWMFESCGRCEYCTTGRETLCRSVKNAGYTVDGAMAEQVIVTADYAVKVPEKLDPAAASSITCAGVTTYKAVKVSNVKPGQWLGVFGIGGLGNLALQYAKNVMGAKIVAFDINDDKLAFAKELGADAIINSKDVDPVAEVMKLTDNKGLDATVVTSVAKTPFNQAVDVVKAGARVVAVGLPVDKMNLDIPRLVLDGIEVVGSLVGTRQDLREAFEFAAENKVTPKVQLRKLEEINDIFEEMENGTITGRMVIKF >NZ_CP038850.1|WP_000655099.1|637771_637879_+|hypothetical-protein MKDSENLVFFGFEVLFVFYKMAYIYEALIKYGIVN >NZ_CP038850.1|WP_001819741.1|638004_638388_+|DUF1934-family-protein MLKQHNEKEKFEFTTEGTWQQRQSNFIRYVEQIEDATVNVTIKVDDDSVKLIRKGDINMNLHFVEGQTTTTFYDISAGRIPLEVKTLRILHFVSGDGGKLKIHYELYQDNEKMGSYQYEINYKEIGE >NZ_CP038850.1|WP_001021145.1|638384_640046_+|arginine--tRNA-ligase MNIIDQVKQTLVEEIAASINKAGLADEIPDIKIEVPKDTKNGDYATNIAMVLTKIAKRNPREIAQAIVDNLDTEKAHVKQIDIAGPGFINFYLDNQYLTAIIPEAIEKGDQFGHVNESKGQNVLLEYVSANPTGDLHIGHARNAAVGDALANILTAAGYNVTREYYINDAGNQITNLARSIETRFFEALGDNSYSMPEDGYNGKDIIEIGKDLAEKHPEIKDYSEEARLKEFRKLGVEYEMAKLKNDLAEFNTHFDNWFSETSLYEKGEILEVLAKMKELGYTYEADGATWLRTTDFKDDKDRVLIKNDGTYTYFLPDIAYHFDKVKRGNDILIDLFGADHHGYINRLKASLETFGVDSNRLEIQIMQMVRLMENGKEVKMSKRTGNAITLREIMDEVGVDAARYFLTMRSPDSHFDFDMELAKEQSQDNPVYYAQYAHARICSILKQAKEQGIEVTAANDFTTITNEKAIELLKKVADFEPTIESAAEHRSAHRITNYIQDLASHFHKFYNAEKVLTDDIEKTKAHVAMIEAVRITLKNALAMVGVSAPESM >NZ_CP038850.1|WP_000901762.1|640379_641015_+|endonuclease-III-domain-containing-protein MLGTDELYKLLYRHMGPQNWWPADNDIEMMLGAILVQNTRWRNAEIALNQIKEHTHFNPNHILELSIETLQSLIHSSGFYKSKSLTIKTLLTWLARHHFNYQEINERYKGELRKELLSLKGIGSETADVLLVYIFGRIVFIPDSYTRKIYDKLGYENTKSYDQLKKVVTLPNHFTNQDANEFHALLDVFGKHYFRDKDIKNYDFLEPYFKK >NZ_CP038850.1|WP_041498613.1|641447_642275_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKDNHKQGSDDNGSSKSPYHRIVSLMPSNTEILYELGLGKYIVGVSTVDDYPKDVKKGKKQFDALNLNKEELLKAKPDLILAHESQKATANKVLSSLEKQGIKVVYVKDAQSIDETYNTFKQIGKLTHHDKQAEQLVEETKDNIDKVIDSIPAHHKKSKVFIEVSSKPEIYTAGKHTFFNDMLEKLEAQNVYSDINGWNPVTKESIIKKNPDILISTEAKTRSDYMDIIKKRGGFNKINAVKNTRIEVVNGDEVSRPGPRIDEGLKELRDAIYRK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP038850_2 | 930588-930672 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038850_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038850_2
>2.1|930615|31|NZ_CP038850|CRISPRCasFinder GCTCCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAATTTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038850_2
The CRISPR arrays of NZ_CP038850_2 >merge|NZ_CP038850|2|930588-930672|CRISPRCasFinder TTTTCGAAATTCTCTGTGTTTGGGCCCGCTCCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTGTGTTTGGGCCC >NZ_CP038850|2|2|930588-930672|CRISPRCasFinder TTTTCGAAATTCTCTGTGTTTGGGCCC GCTCCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAATTTC TTTTTGAAATTCTCTGTGTTTGGGCCC
>NZ_CP038850.1|WP_000390575.1|930201_930510_+|metal-sulfur-cluster-assembly-factor MEEALKDSILGALEMVIDPELGIDIVNLGLVYKVNVDDEGVCTVDMTLTSMGCPMGPQIIDQVKTVLAEIPEIQDTEVNIVWSPPWTKDMMSRYAKIALGVS >NZ_CP038850.1|WP_001182436.1|929263_930088_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MQPHLICLDLDGTLLNDNKEISSYTKQVLNELQQRGHQIMIATGRPYRASQMYYHELNLTTPIVNFNGAYVHHPKDKNFKTCHEILDLGIAQNIIQGLQQYQVSNIIAEVKDYVFINNHDPRLFEGFSMGNPRIQTGNLLVHLKESPTSILIEAEESKIPEIKNMLTHFYADHIEHRRWGAPFPVIEIVKLGINKARGIEQVRQFLNIDRNNIIAFGDEDNDIEMIEYARHGVAMENGLQELKDVANNITFNNNEDGIGRYLNDFFNLNIRYYC >NZ_CP038850.1|WP_001124516.1|927895_929212_-|CoA-disulfide-reductase MPKIVVVGAVAGGATCASQIRRLDKESDIIIFEKDRDMSFANCALPYVIGEVVEDRKYALAYTPEKFYDRKQITVKTYHEVIAINDERQTVTVLNRKTNEQFEESYDKLILSPGASANSLGFESDITFTLRNLEDTDAIDQFIKANQVDKVLVVGAGYVSLEVLENLYERGLHPTLIHRSDKINKLMDTDMNQPILDELDKREIPYRLNEEIDAINGNEITFKSGKVEHYDMIIEGVGTHPNSKFIESSNIKLDRKGFIPVNDKFETNVPNIYAIGDIATSHYRHVDLTASVPLAWGAHRAASIVAEQIAGNDTIEFKGFLGNNIVKFFDYTFASVGVKPNELKQFDYKMVEVTQGAHANYYPGNSPLHLRVYYDTSNRQILRAAAVGKEGADKRIDVLSMAMMNQLTVDELTEFEVAYAPPYSHPKDLINMIGYKAK >NZ_CP038850.1|WP_000902807.1|927335_927725_+|YisL-family-protein MLHLHILSWVLAIILFIATYLNISKNQGGSPFFKPLHMILRLFMLLTLISGFWILIQSFMNGGANHMLLTLKMLCGVAVVGLMEVSIAKRKRHEQSHTMFWITIALIIITMVLGVILPLGPISKLFGIG >NZ_CP038850.1|WP_000670755.1|926108_927011_+|fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein MKFLSFKYNDKTSYGVKVKREDAVWDLTQVFADFAEGDFHPKTLLAGLQQNHTLDFQEQVRKAVVAAEDSGKAEDYKISFNDIEFLPPVTPPNNVIAFGRNYKDHANELNHEVERLYVFTKAASSLTGDNATIPNHKDITDQLDYEGELGIVIGKSGEKIPKALALDYVYGYTIINDITDRKAQSEQDQAFLSKSLTGGCPMGPYIVTKDELPLPENVNIVTKVNNEIRQDGNTGEMILKIDELIEEISKYVALHPGDIIATGTPAGVGAGMQPPKFLQPGDEVKVTIDNIGTLTTYIAK >NZ_CP038850.1|WP_138081360.1|922291_925945_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddA MTIPEKPQGVIWTDAQWQSIYATGQDVLVAAAAGSGKTAVLVERIIQKILRDGIDVDRLLVVTFTNLSAREMKHRVDQRIQEASIADPANAHLKNQRIKIHQAQISTLHSFCLKLIQQHYDVLNIDPNFRTSSEAENILLLEQTIDEVIEQHYDILDPAFIELTEQLSSDRSDDQFRMIIKQLYFFSVANPNPTNWLDQLVTPYEEEAQQAQLIQLLTDLSKVFITAAYDALNKANDLFSMMDGVDKHLAVIEDERRLMGRVLEGGFIDIPYLTGHEFGARLPNVTAKIKEANEMMVDALEDAKLQYKKYKSLIDKVKSDYFSREADDLKADMQQLAPRVKYLARIVKDVMSEFNRKKRSKNILDFSDYEHFTLQILTNEDGSPSEIAESYRQHFQEILVDEYQDTNRVQEKILSCIKTGAEHNGNLFMVGDVKQSIYKFRQADPSLFIEKYQRFTINGDGTGRRIDLSQNFRSRKEVLSTTNYIFKHMMDEQVGEVNYDESAQLYYGAPYDESDHPVNLKVLVEADQEHSDLTGSEQEAHFIVEQVKDILEHQKVYDMKTGSYRSATYKDIVILERSFGQARNLQQAFKNEDIPFHVNSREGYFEQTEVRLVLSFLRAIDNPLQDIYLVGLMRSVIYQFKEDELAQIRILSPNDDYFYQSIVNYINDEVADAILVDKLKMFLSDIQSYQQYSKDHPVYQLIDKFYNDHYVIQYFSGLIGGRGRRANLYGLFNKAIEFENSSFRGLYQFIRFIDELIERGKDFGEENVVGPNDNVVRMMTIHSSKGLEFPFVIYSGLSKDFNKRDLKQPVILNQQFGLGMDYFDVDKEMAFPSLASVAYKAVAEKELVSEEMRLVYVALTRAKEQLYLIGRVKNDKSLLELEQLSISGEHIAVNERLTSPNPFHLIYSILSKHQSASIPDDLKFEKDIAQVEDSSRPNVNISIIYFEDVSTETILDNNEYRSVNQLETMQNGNEDVKAQIKHQLDYQYPYVNDTKKPSKQSVSELKRQYETEESGTSYERVRQYRIGFSTYERPKFLSEQGKRKANEIGTLMHTVMQHLPFKKERISEVELHQYIDGLIDKHIIEADAKKDIRMDEIMTFINSELYSIIAEAEQVYRELPFVVNQALVDQLPQGDEDVSIIQGMIDLIFVKDGVHYFVDYKTDAFNRRRGMTDEEIGTQLKNKYKIQMKYYQNTLQTILNKEVKGYLYFFKFGTLQL >NZ_CP038850.1|WP_000172374.1|918814_922291_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddB MTLHAYLGRAGTGKSTKMLTEIKQKMKQDPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDPELNGSLRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAATEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFSEKLTEQIQDFKKYAVTPEHLEHFIADKNMQTRTKNKLEDIALIYREFEQRIQNEFITGEDSLQYFIDCMPKSEWLKRADIYIDGFHNFSTIEYLIIKGLIKYAKSVTIILTTDGNHDQFSLFRKPSEVLRHIEEIANELNISIERQYFKQLYRFNNQDLKHLEQEFDALQINRVACQGHINILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYQDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNIDTKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQVNPMLRLLKTDVLTASYLKSAYLVDLLENFVLERGIYGKRWLDDELFNVEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFKQVVKLKKDVIDKILHFEKQMSQAETVKDFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGNHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVFGDEPMSMERFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTMPQPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYVAMTRAKGDVTFSYSLMGSSGDDKEISPFLNQIQSLFNQLEITNIPQYHEVNPLSLMQHAKQTKITLFEALRAWLDDEIVADSWLDAYQVIRDSDHLNQGLDYLMSALTFDNETVKLGETLSKDLYGKEINASVSRFEGYQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLTNEALEQILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRRKPRTNDELIAQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSATLDLTKVYYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWADIDEDKLEQDLIKKFKLSGLVNADQTVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFIQHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETINPIEAIQNININDEFGGEQ >NZ_CP038850.1|WP_000711894.1|918079_918655_+|signal-peptidase-I MKKELLEWIISIAVAFVILFIVGKFIVTPYMIKGESMDPTLKDGERVAVNIIGYKTGGLEKGNVVVFHANKNDDYVKRVIGVPGDKVEYKNDTLYVNGKKQDEPYLNYNLKHKQGDYITGTFQVKDLPNANPKSNVIPKGKYLVLGDNREVSKDSRAFGLIDEDQIVGKVSFRFWPFSEFKHNFNPENTKN >NZ_CP038850.1|WP_000758216.1|917539_918064_+|signal-peptidase-I MKKVVKYLISLILAIIIVLFVQTFVIVGHVIPNNDMSPTLNKGDRVIVNKIKVTFNQLNNGDIITYRRGNEIYTSRIIAKPGQSMAFRQGQLYRDDRPVDASYAKNRKIKDFSLRNFKELDGDIIPPNNFVVLNDYDNNQHDSRQFGLIDKKDIIGNISLRYYPFSKWTIQFKS >NZ_CP038850.1|WP_000007970.1|916959_917535_+|TVP38/TMEM64-family-protein MSFHQVEEWFEIFRQFGYLPGFILLYIRAIIPVFPLALYILINIQAYGPILGILISWLGLISGTFTVYLICKRWVNTERMQRIKQRTAVQRLISFIDRQGLIPLFILLCFPFTPNTLINFVASLSHIRPKYYFIVLASSKLVSTIILGYLGKEITTILTQPLRGILMLVVLVVFWIVGKKLEQHFMGSKKE >NZ_CP038850.1|WP_001044218.1|931164_932979_+|acetyltransferase MNKTKGFTKYKKMRYMPGLDGLRAIAVLGIIIYHLNKQWLTGGFLGVDTFFVISGYLITSLLLKEYDDTGIIKLKSFWIRRLKRLLPAVIVLLMVVGTATLLLKSDNIIRVKHDIIAAIFYVSNWWYIAKDVNYFEQFSFMPLKHLWSLAIEEQFYIFFPVILVTLLLTIKKRYKIGFIFLGVSIISLGLMMFIYSINGDHSRVYFGTDTRLQTLLLGVILAFLWPPFKLKNDPPKVVKYVIDSIGSLSFIILILLFFIINDETNWIYDGGFYLISILTLFIIASVVHPSTWIAKIFSNPVLVFIGKRSYSLYLWHFAVISFVHSYYVDGQIPVYVYFIDISLTIIFAELSYRFIETPFRKEGIKALNWRPSYIPQFIRMAIVVTLLIPFMLILVGAFNKYGKDIIGEKANSFDTTIEDNYLMRIAPIDNIHIDGLVSEKKKESSDVYNNIKPLLIGDSVMVDIGESFKSSVPKSRIDGKVGRQLYQTLPLVKANYSQYKKSSDQVVLELGTNGDFTVKQLDDLLNQFGKAKIYLVNTRVPRIYEANVNRLLADAAKRKSNVTLIDWYKRSQGHSEYFAPDGVHLEYKGVLALKDEILKALKKK >NZ_CP038850.1|WP_000353955.1|933182_935792_+|ATP-dependent-chaperone-ClpB MDINKMTYAVQSALQQAVELSQQHKLQNIEIEAILSAALNESESLYKSILERANIEVDQLNKAYEDKLNTYASVEGDNIQYGQYISQQANQLITKAESYMKEYEDEYISMEHILRSAMDIDQTTKHYINNKVEVIKEIIKKVRGGNHVTSQNPEVNYEALAKYGRDLVEEVRQGKMDPVIGRDEEIRNTIRILSRKTKNNPVLIGEPGVGKTAIVEGLAQRIVKKDVPESLLDKTVFELDLSALVAGAKYRGEFEERLKAVLKEVKESDGRIILFIDEIHMLVGAGKTDGAMDAGNMLKPMLARGELHCIGATTLNEYREYIEKDSALERRFQKVAVSEPDVEDTISILRGLKERYEVYHGVRIQDRALVAAAELSDRYITDRFLPDKAIDLVDQACATIRTEMGSNPTELDQVNRRVMQLEIEESALKNESDNASKQRLQELQEELANEKEKQAALQSRVESEKEKIANLQEKRAQLDESRQALEDAQTNNNLEKAAELQYGTIPQLEKELRELEDNFQDEQGEDTDRMIREVVTDEEIGDIVSQWTGIPVSKLVETEREKLLHLSDILHKRVVGQDKAVDLVSDAVVRARAGIKDPNRPIGSFLFLGPTGVGKTELAKSLAASLFDSEKHMIRIDMSEYMEKHAVSRLIGAPPGYIGHDEGGQLTEAVRRNPYSVILLDEVEKAHTDVFNVLLQILDEGRLTDSKGRSVDFKNTIIIMTSNIGSQVLLENVKETGEITESTEKAVMTSLNAYFKPEILNRMDDIVLFKPLSIDDMSMIVDKILTQLNIRLLEQRISIEVSDDAKAWLGQEAYEPQYGARPLKRFVQRQIETPLARMMIKEGFPEGTTIKVNLNSDNNLTFNVEKIHE >NZ_CP038850.1|WP_001047062.1|935850_936720_-|LysR-family-transcriptional-regulator MNLDWYYTFVILAKTLNYRLASEEINLTIPSIHKQIKNLEQHLNVKLFETYKNQIILTEDGHTFLPIAQSFIEQYESGIKHIQLKKTMFQSKLNVVVSSYIATFIMPKFLKSFFNEHPFIDVSLHVKNENIEKDINNHTYDIGISRNQPKLREVHSEKVCEGKIVLIAPNKENNHLLTEASLFEKYKIISDNHPEYWSSLKNNILNIYEKAQFLSINDVHTSIKLIEMNQGISFLPIYITTDSDYNISVINTKILQAPISFTYIYSKKESPEILAFIRSFKKYIANEQL >NZ_CP038850.1|WP_000619353.1|936829_937975_+|2-isopropylmalate-synthase MIRIQDNTIRDGMQQSNVRKSIIVKKEVLQEINKISINSVEVGMCTTFEDEYNIHQYREILNNDKEIVVLTRLDENEINKILNLKIHNLAVKILLPISDLHIKEKLNFTSEYYNERINKCLNMIKVNQVAIDICFEDATRCSLEKLCEYMEMISKFPIRTVTFADTVGCSTPFEYGNIFKEFVKKYPNITFSAHCHNDLGLATANTFAAILNGAQQIETTFLGIGERAGNASIEEIIAILTKKQIVMTSLNLPDIYKTSMNISKILDIRLAENKPVIGKNIFKHESGIHQDGTNKNISMYQYILPSDLGLKNSKAVQFPISNISSKKILKNKFKSIVHPKDIEENISFYKLINKFIPEVVPEDTADLLQVIKGRSKDGNFK >NZ_CP038850.1|WP_000404426.1|937958_938600_+|L-threonylcarbamoyladenylate-synthase MEILNESVESFEKLYLQLQNSYPIIVPTDTNYNLCSLPNNKICIDRIFKYKKRSKDKPLSLFIDEPEDWKLYGENKNVELVDKLVNIFWPGPLNIILKNKTNYNYMLNNSDSIAIGCVQNKTMRNLISYIQSPIAITSANISGTADDILITENEAIKHMGNNVNYMLRSKNKSKYKSSSTIIKVTGNKIELLREGDIKFEEIKAKLGSGIQYE >NZ_CP038850.1|WP_001037456.1|938592_939714_+|MFS-transporter MNKLILGIYLYRILSRAYFYLPFLLIYFLAQNYSIMQLEILMATYGVAAFLFGLYKEKIFRIYQIKDAYKLIVSEVFKIIGLILLLYPSHFYILLVAQLLLGLSYSIMAGVDTSIIKMNIKNHKLIQNKSNGYMFLSLLISGIIGSYLYGINIKWPIYMTGLFSILTILVILLTLVENVDCNIKSESKRKRKKLLADEKFWVLHYSFLRALILGFFVGFIPINLYIDLKLNNVQFISVLTSYTIMGYISSRYLTRYLNYKFLSEICLVIFLIIYTFQNIIAITIAILFLGISSGLTRPQTINELSNSSNLAAILNYAETLYFIFNIAFLLIGGYLYSIGTIQYLMLFMSLLTFIYLLTLFYLRRDQHENQHRI >NZ_CP038850.1|WP_000700883.1|939691_940207_+|YbhB/YbcL-family-Raf-kinase-inhibitor-like-protein MKINTEFKGNNIPYEYAAGADISDLINGNPIKSFPFEITELPKDTKYLAWSLIDYDAIPVCGFAWIHWSVANVSVTRDSISIKPDLSRTKGDYVQGKNSFTSGLLADDFSEIENHYVGPTPPDQDHQYELTVYALDHSLNLKNGFYLNEFLKEVNQHKIDQTSINLIGRKI >NZ_CP038850.1|WP_000769692.1|940517_940952_+|MAP-domain-containing-protein MKLKSFITVTLALGMIATTGATVASNEVSAAEKDKQPATQKAKEMQNVPYTIAVDGIMAFNQSYLNLPKDSQLSYLDLGNKVKALLYDERGVTPEKIRNAKSAVYTITWKDSSKKEVDLKKDSYTANLFDSNSIKQIDINVKTK >NZ_CP038850.1|WP_000682088.1|941208_941394_-|YjzD-family-protein MKHLVTFFWALLLMQMVNFVLNSLVGGDSLNLVNPIIMAVLFTIFTAIFAAVIKPPKDSSQ >NZ_CP038850.1|WP_001100526.1|941688_942630_+|ketoacyl-ACP-synthase-III MNVGIKGFGAYAPEKIIDNAYFEQFLDTSDEWISKMTGIKERHWADDDQDTSDLAYEASVKAIADAGIQPEDIDMIIVATATGDMPFPTVANMLQERLGTGKVASMDQLAACSGFMYSMITAKQYVQSGDYHNILVVGADKLSKITDLTDRSTAVLFGDGAGAVIIGEVSEGRGIISYEMGSDGTGGKHLYLDKDTGKLKMNGREVFKFAVRIMGDASTRVVEKANLTSDDIDLFIPHQANIRIMESARERLGISKDKMSVSVNKYGNTSAASIPLSIDQELKNGKLKDDDTIVLVGFGGGLTWGAMTIKWGK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP038850_3 | 1941071-1941160 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038850_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038850_3
>3.1|1941103|26|NZ_CP038850|CRISPRCasFinder CGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACA |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038850_3
The CRISPR arrays of NZ_CP038850_3 >merge|NZ_CP038850|3|1941071-1941160|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTT >NZ_CP038850|3|3|1941071-1941160|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTT CGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACA CCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTT
>NZ_CP038850.1|WP_000636142.1|1940178_1940937_-|type-I-methionyl-aminopeptidase MIVKTEEELQALKEIGYICAKVRNTMQAATKPGITTKELDNIAKELFEEYGAISAPIHDENFPGQTCISVNEEVAHGIPSKRVIREGDLVNIDVSALKNGYYADTGISFVVGESDDPMKQKVCDVATMAFENAIAKVKPGTKLSNIGKAVHNTARQNDLKVIKNLTGHGVGLSLHEAPAHVLNYFDPKDKTLLTEGMVLAIEPFISSNASFVTEGKNEWAFETSDKSFVAQIEHTVIVTKDGPILTTKIEEE >NZ_CP038850.1|WP_001110179.1|1939575_1939962_-|hypothetical-protein MNYVERYIEQFLRATVRNNIKHYLLMLDEKMKNLDDYMRYLITKKEQLSKLIDSLMLTLENKYIDIAEAFQIQCAREINNQEIENIKSELNKVEAYYAQIETQIQQTSTEKIATEKTSYLINYMNAVA >NZ_CP038850.1|WP_000149064.1|1938859_1939561_-|cell-wall-active-antibiotics-response-protein MTHKYISTQMLIIFTALMIIANFYYIFFEKIGFLLVLLLGCVLVYVGYLYFHKIRGLLAFWIGALLIAFTLLSNKYTIIILFVFLLLLIVRYLIHKFKPKKVVATDEVMTSPSFIKQKWFGEQRTPVYVYKWEDVQIQHGIGDLHIDLTKAANIKENNTIVVRHILGKVQVILPVNYNINLHVAAFYGSTYVNEKSYKVENNNIHIEEMMKPDNYTVNIYVSTFIGDVEVIYR >NZ_CP038850.1|WP_001017131.1|1937819_1938863_-|sensor-histidine-kinase MNHYIRTIGSMLILVYSMLAAFLFIDKVFVNIIYFQGMFYTQIFGIPVFLFLNLIIILLCIIVGSVLAYKINQQNDWIKTQIERSMEGETVGINDQNIEIYSETLDLYHTLVPLNQELHKLRLKTQNLTNENYNINDVKVKKIIEDERQRLARELHDSVSQQLFAASMMLSAIKETKLEPPLDQQIPILEKMVQDSQLEMRALLLHLRPLGLKDKSLGEGIKDLVIDLQKKVPMKVVHEIQDFKVPKGIEDHLFRITQEAISNTLRHSNGTKVTVELFNKDDYLLLRIQDNGKGFNVDEKLEQSYGLKNMRERALEIGATFHIVSLPDSGTRIEVKAPLNKEDSYDD >NZ_CP038850.1|WP_000153535.1|1937200_1937830_-|response-regulator-transcription-factor MTIKVLFVDDHEMVRIGISSYLSTQSDIEVVGEGASGKEAIAKAHELKPDLILMDLLMEDMDGVEATTQIKKDLPQIKVLMLTSFIEDKEVYRALDAGVDSYILKTTSAKDIADAVRKTSRGESVFEPEVLVKMRNRMKKRAELYEMLTEREMEILLLIAKGYSNQEIASASHITIKTVKTHVSNILSKLEVQDRTQAVIYAFQHNLIQ >NZ_CP038850.1|WP_000037075.1|1935870_1937088_+|YihY/virulence-factor-BrkB-family-protein MSKKDHSSSKYLNSVKEAQEESKKKNKSNPKIDVDRTYIEPQQFQSKKPKKDDQVFFLSRLNKPAKYKKDSNFLSYLIYRIGKDDASGLAAQMTYHFVLAMFPMLLFLLTLLPFFNIKQSQITNMLSNAPAETSTLIKSVIGDITQNSSGGLLSIGLILAIWSASNGMTAIMNSFNVAYDVEDSRNGIVLKLLSVVFTVVMGVVFVVALALPTLGSVISHFLFGPLGFDEQVKWIFNLIRIVLPIIIIFIIFIVLYSVAPNVKTKLKSVLPGAVFTSIIWLAGSFGFGWYISNFGNYSKTYGSIAGIIILLLWLYITSFIIIVGAEINAIIHQRSVIKGKTPEEAALEHDDNNKNHYNENTRYEYDEDSNATHQRTYHVDEHPSDTYPEDDKNIKDKIVDKLKKD >NZ_CP038850.1|WP_000428172.1|1935317_1935593_+|hypothetical-protein MENKFVPGILIGAVIGGAISLADKSTRQALVQSVKDAKNGNRTRKPSKVSKIKDEVLYWKDVVEEIRRNNPELERSLKDAKETFVNRKNQR >NZ_CP038850.1|WP_000228666.1|1934846_1935311_+|low-molecular-weight-phosphotyrosine-protein-phosphatase MVDVAFVCLGNICRSPMAEAIMRQRLKDRNIHDIKVHSRGTGSWNLGEPPHEGTQKILNKHNIPFDGMISELFEATDDFDYIVAMDQSNVDNIKSINPNLKGQLFKLLEFSNMEESDVPDPYYTNNFEGVYDMVLSSCDNLIDYIVKDANLKEG >NZ_CP038850.1|WP_000180460.1|1934499_1934700_-|DUF1128-family-protein MTNEEKVLAIREKLNIVNQGLLDPEKYKNANEEELTDIYDFVQSRERLSPSEVTAIADALGQLRHD >NZ_CP038850.1|WP_075583716.1|1933240_1934497_-|aminopeptidase MGILTNYKEKLQQYAELLVKVGMNVQPKQPVFIRSSVETLELTHLIVEEAYHCGASDVRVVYSDPTLKRLKFENESVEHFANHELKSYDVEARMDYVKRGAANLALISEDPDLMDGIDSQKLQAFQQQNARAFKGYMESVQKNQFPWVVAAFPSKAWAKRVYPELSVEEAYIKFIDEVFDIVRIDGNDPVENWRQHIANLSVYAQKLQQKNYHALHYVSEGTDLTVGLAKNHIWEDATSYVNGKEQAFIANIPTEEVFTAPDRNRVDGYVTNKLPLSYNGTIIDQFKLMFKDGEIIDFSAEKGETVLKDLINTDEGSRRLGEVALVPDDSPISNRNTIFYNTLFDENAACHLAIGSAYAFNIQGGTEMTVEEKIASGLNDSNVHVDFMIGSSDLTIYGIFEDGSKELVFENGNWASTF >NZ_CP038850.1|WP_000999713.1|1941465_1942452_+|aromatic-acid-exporter-family-protein MNDQWYKHLIGARTIKTGIAIFLTAVFCMALDLTPIYAILTAVVTIEPTAKASLIKGYRRLPATVIGAGFAVLFTYLFGDQSPFTYALSATFTILFCTKLKLQVGTNVAVLTSLAMIPGIHDAYIFNFLSRTLTAIIGLVTSGLINFMVFPPKYYGQVEEKLSKTDALMYKLFYNRCQELILSRLQSDKSEKAYKNIFNLNNQVETLISYQRDELSYHKKKECDWKLLNQLTKRAYTNRLFITHLSNIIYLPKNTRVNFSGDEKMALLKISSSIKDIFYDGSFKREDDSVETLRSTIKALEISGENQIKSHILYEVLMIYRLLDSRYA >NZ_CP038850.1|WP_001670387.1|1942882_1943296_-|hypothetical-protein MKPTKVILRDASYLHSKTSITFILKDVVIEEDNKIYYFDTSATFEDQEVKFEFALFDSDMDNLKHMDYDNPVTEIYFIEPDLHFTIIDFNQELLCIYIDFDSGLRHSNMATESGISLRINVAKSDFTKFINELASLH >NZ_CP038850.1|WP_001790257.1|1943324_1943435_-|hypothetical-protein MDGNNQIDVCFFVLVNNYYTMSIYPRIINSNGDYAT >NZ_CP038850.1|WP_000544969.1|1943520_1944252_-|type-1-glutamine-amidotransferase MHELTIYHFMSDKLNLYSDIGNIIALRQRAKKRNIKVNVVEINETEGITFDECDIFFIGGGSDREQALATKELSKIKTPLKEAIEDGMPGLTICGGYQFLGKKYITPDGTELEGLGILDFYTESKTNRLTGDIVIESDTFGTIVGFENHGGRTYHDFGTLGHVTFGYGNNDEDKKEGIHYKNLLGTYLHGPILPKNYEITDYLLEKACERKGIPFEPKEIDNEAEIQAKQVLIDRANRQKKSR >NZ_CP038850.1|WP_001250329.1|1944253_1945567_-|Mur-ligase-family-protein MRQWTAIHLAKLARKASRAVGKRGTDLPGQIARKVDTDILRKLAEQVDDIVFISGTNGKTTTSNLIGHTLKANNIQIIHNNEGANMAAGITSAFIMQSTPKTKIAVIEIDEGSIPRVLKEVTPSMMVFTNFFRDQMDRFGEIDIMVNNIAETISNKGIKLLLNADDPFVSRLKIASDTIVYYGMKAHAHEFEQSTMNESRYCPNCGRLLQYDYIHYNQIGHYHCQCGFKREQAKYEISSFDVAPFLHLNINDEKYDMKIAGDFNAYNALAAYSVLRELGLNEQTIKNGFETYTSDNGRMQYFKKERKEAMINLAKNPAGMNASLSVGEQLEGEKVYVISLNDNAADGRDTSWIYDADFEKLSKQQIEAIIVTGTRAEELQLRLKLAEVEVPIIVERDIYKATAKTMDYKGFTVAIPNYTSLAPMLEQLNRSFEGGQS >NZ_CP038850.1|WP_000949467.1|1945858_1946359_+|H-type-ferritin-FtnA MLSKNLLEALNDQMNHEYFAAHAYMAMAAYCDKESYEGFANFFIQQAKEERFHGQKIYNYINDRGAHAEFRAVSAPKIDFSSILETFKDSLSQEQEVTRRFYNLSEIARQDKDYATISFLNWFLDEQVEEESMFETHINYLTRIGDDSNALYLYEKELGARTFDEE >NZ_CP038850.1|WP_001790679.1|1946440_1946533_-|hypothetical-protein MTKNTIISLENEKTQINDSENESSDLRKAK >NZ_CP038850.1|WP_000613738.1|1946748_1947303_+|3'-5'-exonuclease MIQDAFVALDFETANGKRTSICSVGMVKVIDSQITETFHTLVNPQDYFSQQNIKVHGIQPEDVENAPTFDYVFPYMMQFIADLPVVAHNAAFDMNVLHQSIQNIGLPTPNLTYFCSYQLAKRTVDSYRYGLKHMMEFYQLDFHGHHDALNDAKACAMITFRLLKNYENLTYVTNIYGKNLKDKG >NZ_CP038850.1|WP_000140172.1|1947370_1948441_-|DNA-polymerase-IV MTERRIIHIDMDYFFAQVEMRDNPKLKGKPVIVGGKASSRGVVSTASYEARKYGVHSAMPMSQAHKLCPNGYFVTSNFGAYRETSAQIMSIFRSYTDKVEPMSLDEAYLDITELVRPDLPASKIAQYIRKDILEQTHLTASAGVSYNKFLAKLASGMNKPDGLTVIDYQNVHDILMTLDIGDFPGVGKASKKVMHDNGIFNGRDLYEKTEFELIRLFGKRGRGLYNKARGIDHSEVKSSRVRKSVGTERTFATDVNDDEEILRKVWELSGKTAERLNKLQKSAKTVTVKIKTYQFETLSKQMSLRDSVSSEEDIYNIAYLLYNDLKDPDVPIRLIGVTVGNLEQSTYKNMTIYDFI >NZ_CP038850.1|WP_000548775.1|1948687_1949218_-|DUF3267-domain-containing-protein MHKIDLTTNNFQMRRFIILQLVIALFVILFTYKWALGVTAVVDQNIIINLVYGFAGFIILLILHELIHRALFLLFKKDSKPMFNIKKDRILFQTADACFNKWQFSIIMLSPLFLLSTGLLILIKVFGYSSLIFMFSMHTAYCFIDILLVALTISSSFKYVQQDEDSIYLYHQKPTQ |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP038850_4 | 2173359-2173461 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038850_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038850_4
>4.1|2173396|29|NZ_CP038850|CRISPRCasFinder TGTTAGGGGCTCTTATGCAGTTGATGCGC |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038850_4
The CRISPR arrays of NZ_CP038850_4 >merge|NZ_CP038850|4|2173359-2173461|CRISPRCasFinder AGCATCCAACTGTATTCCTCTATTTTTCAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCAGTTGATGCGCAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTCAACTTTAGT >NZ_CP038850|4|4|2173359-2173461|CRISPRCasFinder AGCATCCAACTGTATTCCTCTATTTTTCAACTTTAGT TGTTAGGGGCTCTTATGCAGTTGATGCGC AGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTCAACTTTAGT
>NZ_CP038850.1|WP_000495680.1|2172211_2173303_+|hypothetical-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYVQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKDKKVVTEPKNTKVENDKVATSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >NZ_CP038850.1|WP_000019744.1|2170965_2171946_+|CDF-family-zinc-efflux-transporter-CzrB MSHSHHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALVAFIYAEKNATTTKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >NZ_CP038850.1|WP_000003755.1|2170643_2170964_+|Zn(II)-responsive-metalloregulatory-transcriptional-repressor-CzrA MSEQYSEIHTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >NZ_CP038850.1|WP_001024097.1|2169826_2170492_-|SDR-family-oxidoreductase MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFDGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNYQEFQIISGEQDIKDALTQFEIEKD >NZ_CP038850.1|WP_001127960.1|2168452_2169391_-|class-I-mannose-6-phosphate-isomerase MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >NZ_CP038850.1|WP_000808817.1|2168191_2168422_-|hypothetical-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >NZ_CP038850.1|WP_000123402.1|2166144_2167518_-|EVE-domain-containing-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRMSNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVQKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >NZ_CP038850.1|WP_001123311.1|2165275_2165689_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYRFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIQLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >NZ_CP038850.1|WP_000070865.1|2164632_2165076_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLEKAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >NZ_CP038850.1|WP_000160303.1|2163800_2164511_+|purine-nucleoside-phosphorylase MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNAAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE >NZ_CP038850.1|WP_075583739.1|2173817_2173922_-|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISNQGHKK >NZ_CP038850.1|WP_024928151.1|2174598_2174757_+|hypothetical-protein MRKSSDALFNLLTQSFELIEGVHNELVTDNLKTVMYKPRKERTNGRINRRFK >NZ_CP038850.1|WP_000142674.1|2175203_2175296_+|hypothetical-protein MTFGSIVAILCALFVIFFIPYMEKKDKKKK >NZ_CP038850.1|WP_000370944.1|2175416_2176274_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINRLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQIINLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQDETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >NZ_CP038850.1|WP_000908181.1|2176341_2177124_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLIQLDQIGRMKQGKTILKNISWQIAKGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATTGGVNLFGEMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQDGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEVRNEAHQLLKLVGISAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLNILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITGNFTKILLLKDGESVQQGLIDDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >NZ_CP038850.1|WP_000334463.1|2177355_2179161_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEDGTPVVALATQENVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >NZ_CP038850.1|WP_000083799.1|2179841_2181380_+|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPIMKFIMHILSVAVESLVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVATLIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA >NZ_CP038850.1|WP_000927368.1|2181414_2183547_+|BglG-family-transcription-antiterminator MLLSTREKEMIALLIKYHGQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVESYLTSFSLTLERANKKGLRIAGADSDLNDLKQSIAQLQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLDQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDTPYLMVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMNDKDDVHVETKDIDGNTSFENEQTSNLTSVFEKHLSDEKSEQLMHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDAIKDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFIPDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRSKFLERIKKQFI >NZ_CP038850.1|WP_001292149.1|2183558_2183993_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >NZ_CP038850.1|WP_138081430.1|2183992_2185099_+|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFASFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGSELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVKDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAGYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTGDQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP038850_5 | 2250405-2250529 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038850_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038850_5
>5.1|2250442|51|NZ_CP038850|CRISPRCasFinder ATGATTTCCCATGATTTTTTAGTATTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038850_5
The CRISPR arrays of NZ_CP038850_5 >merge|NZ_CP038850|5|2250405-2250529|CRISPRCasFinder CCTCTTTACTCGAAAGCTCACAAAACCCTTGATATCAATGATTTCCCATGATTTTTTAGTATTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTATCCTCTTTACTCGAAAGCTCACAAAACGCTTGATATCA >NZ_CP038850|5|5|2250405-2250529|CRISPRCasFinder CCTCTTTACTCGAAAGCTCACAAAACCCTTGATATCA ATGATTTCCCATGATTTTTTAGTATTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTAT CCTCTTTACTCGAAAGCTCACAAAACGCTTGATATCA
>NZ_CP038850.1|WP_000136272.1|2250159_2250339_-|hypothetical-protein MTEIVEFLSDGKLASRLEIQETMGLQKSYTSELIAELKKLEIIGSEGRGPGTRYYLIRD >NZ_CP038850.1|WP_000655245.1|2249327_2249510_-|hypothetical-protein MKDSIFWKKAFIPVYFIVAMLVFLLFRFYIKTDNFSMYLMIIFLICLGTASIIYNYKNNR >NZ_CP038850.1|WP_101244954.1|2247168_2248833_-|acetolactate-synthase-AlsS MTGKKYTAADMVIDTLKNNGVEYVFGIPGAKIDYLFNALIDDGPELIVTRHEQNAAMMAQGIGRLTGKPGVVLVTSGPGVSNLTTGLLTATSEGDPVLALGGQVKRNDLLRLTHQSIDNAALLKYSSKYSEEVQDPESLSEVMTNAIRIATSGKNGASFISIPQDVISSPAESKAISLCQKPNLGVPSEQDINDVIEAIKNASFPVLLAGMRSSSADETNAIRKLVERTNLPVVETFQGAGLISRELENHFFGRVGLFRNQVGDELLRKSDLVVTIGYDPIEYEASNWNKELDTQIINIDEVQAEITNYMQPKKELIGNIAKTIEMISDKVDEPFINQQHLDELEQLRAHIDQETGIKATHEEGILHPVEIIESMQKVLTDETTVTVDVGSHYIWMARNFRSYNPRHLLFSNGMQTLGVALPWAISAALVRPNTQVVSVAGDGGFLFSSQDLETAVRKNLNIIQLIWNDGKYNMVEFQEEMKYKRSSGVDFGPVDFVKYAESFGAKGLRVTNQEELEAAIKEGYETDGPVLIDIPVNYKDNIKLSTNMLPDVFN >NZ_CP038850.1|WP_000179063.1|2246427_2247132_-|acetolactate-decarboxylase MASVLYQHGTLGTLMAGLLKGTASINELLQHGDLGIATLTGSNGEVIFLDGKAYHANEHKEFVELKGDELTPYATVTKFVADTSYETKDKSSEAVFAEIKEKMLSENLFSAVKISGLFKKMHVRMMPAQEPPYTRLIDSARRQPEQTETYVKGSVVGFFTPELFHGIGSAGFHVHFANDDRNFGGHVLDFEVEDVKVEIQNIETFEQHFPIHDEDFTNANIDYKDISDEIREAE >NZ_CP038850.1|WP_000769708.1|2245623_2246049_+|MAP-domain-containing-protein MKLKSFVTATLALGLLSTVGAALPSHEASADSNNGYKEMTMDGYHTVPYTISVDGITALHRTYFVFPENKKVLYQEIDSKVKNELASQRGVTTEKINNAQTATYTLTLNDGNKKVVNLKKNDDAKNSIDPSTIKQIQIVVK >NZ_CP038850.1|WP_000044360.1|2244513_2245329_-|HAD-IIB-family-hydrolase MSKRLLLFDFDETYFKHNTNEEDLSHLREMEKLLEKLTNNNEVITAVLTGSTFQSVMDKMDQVNMTFKPLHIFSDLSSKMFTWNNGEYVESETYKKKVLSEPFLFEDIEDILRHISAQYNVEFIPQRAFEGNETHYNFYFHSTGNHNNDRRILEALVRYANDQNYTARFSRSNPLAGDPENAYDIDFTPSNAGKLYATQFLMKKYNIPVKSILGFGDSGNDEAYLSYLEHAYLMSNSRDEALKQKFRLTKYPYYQGITLHVKEFVEGKYDY >NZ_CP038850.1|WP_001805736.1|2243132_2244281_+|glycosyltransferase MYKKWINGQLSHIDYFQNRKRFKRHVFQNKILRKEITFNDKNKMSEVKYLSNDGFCYLSYWYGDNENIVNIFYFDKNSKEVLNFKNNKAFHSYWLDKNLTSNDVLILDGIGTYHKVENMQNNDIKKIFTIHTNHFMSPYSYGAEIKPEFRNMLLNLKELDTLVVLTKEQKDDIIKQFGDYNNIKVIPNAISFEENLTQNIREKNSIIVLQRFVAMKNITHIISAINIVRKKVKDVKLHIYGTGTQKENYTKLIKKLKLQDNVFIHDYAFDIRALYTKTSLSVLTSDYEGLPMSLLEAMSYGVPVISYPINYGPKSIIQNNINGIITKKKDNINELAKKIIHVLKKETLISQFSENARTTIKTNFSYEAVSKKWIELIDEKSQ >NZ_CP038850.1|WP_001805738.1|2242764_2243133_+|hypothetical-protein MTTYMLMYSIPEKAGGITSVMLNRSKLLAEKGYSCALLTLDDKNYDPLRAKLTNSGRLHKQVKIVNLYEELKMLYDVENTEIENKNMQTFEKLNLLNQEGFYIQKDEYEEKNMLDTLKITIT >NZ_CP038850.1|WP_000174176.1|2242476_2242755_+|hypothetical-protein MTLNEYNYNNELILKLNKIEVQKNNEKISEVFKDYEILKPKIVFNGSNPYLALNHIIVAEIENYSSLETFSKIYVDEDYYYNYGELIIKCKK >NZ_CP038850.1|WP_001044438.1|2240749_2241604_-|M23-family-metallopeptidase MNKTNFGDYLNKSKSRKIYKIFDQNLKREFSYWHFRKLFKSYTRQSDVHELKVCTQNDGTMEQIWIDKANQFGVAVTWKDNSIIGFVMRPLINYDAIKNETTLKYAVPTTDCYEVFWGGDNELYNYHYLYPHQRYAIDLVIKENHKTYKNKGKVNTDYFYFGKDIIAPANGTVEKVANGVQDNSIGSTNESQFLGNYIVIKHAENEYSLIAHLQQYSIIVNEGQNVKYGDIIGKVGNSGNSTEPHIHFQVMNDKNIEACTSLKIRFINNRELIKGDVVCGLQGE >NZ_CP038850.1|WP_000170975.1|2250927_2251326_-|30S-ribosomal-protein-S9 MTLAQVEYRGTGRRKNSVARVRLVPGEGNITVNNRDVREYLPFESLILDLNQPFDVTETKGNYDVLVNVHGGGFTGQAQAIRHGIARALLEADPEYRGSLKRAGLLTRDPRMKERKKPGLKAARRSPQFSKR >NZ_CP038850.1|WP_001250036.1|2251339_2251777_-|50S-ribosomal-protein-L13 MRQTFMANESNIERKWYVIDAEGQTLGRLSSEVASILRGKNKATYTPHVDTGDYVIVINASKIEFTGNKETDKVYYRHSNHPGGIKSITAGELRRTNPERLIENSIKGMLPSTRLGEKQGKKLFVYGGAEHPHAAQQPENYELRG >NZ_CP038850.1|WP_001221857.1|2252016_2252820_-|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA MRILVEIAYQGNNFLGFQIQQNGRTVQQQFEKLLQRMHKRHVRIHPSSRTDRGVHAIQQYFHFDTELNIPMSQWQYAMNRTLPDDIYVNNVVTVDDDFHCRYDCVGKRYRYKVYQAQHRDPFQSGLKTFIPETLDLDKMNRAAQQFIGTHDFTGFCSQKTEVESKVRTLYQSEIVKTDDGFDYIVTGSGFLYNMVRVLVAFLIEVGKGRHEVSDVPKLLESKNRKNVPFTAPAEGLYLEKIYLDENELLKDFGNDIKIHRKKSLQND >NZ_CP038850.1|WP_000791618.1|2252824_2253631_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MKNKLIIGRYLPINSFVHHLDPRAKLMFVFLFIILIFFCHSPLTYLWVFALILFFMRLAKIQLWFLIKGLTPIFFFLIFTLMMHIFLTKGGYVLVEWHGITIETNGILEGLYISLRLIGIVMIATIMTLSTSPIDLTDAFERLLAPLKMFKLPVHQLSMIMSIALRFIPTLMDELDKIILAQKSRGSEISSGNIATRIKSFIPLLVPLFISAFQRAEELAVAMEVRGYDANVQRTSYRQLKWQLRDTLSLIMIIPFAIILFVLKYSGV >NZ_CP038850.1|WP_000155383.1|2253620_2254481_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MTIRFDNVSYTYQKGTPYQHQAIHDVNTEFEQGKYYAIVGQTGSGKSTLIQNINALLKPTTGTVTVDDITITHKTKDKYIRPVRKRIGMVFQFPESQLFEDTVEREMIFGPKNFKMNLDEAKNYAHRLLMDLGFSRDVMSQSPFQMSGGQMRKIAIVSILAMNPDIIVVDEPTAGLDPQSKRQVMRLLKSLQTDENKAIILISHDMNEVARYADEVIVMKEGSIVSQTSPKELFKDKEKLADWHIGLPEIVQLQYDFEQKHQTKLKDIALTEEAFVSLYKEWQHEK >NZ_CP038850.1|WP_000389655.1|2254477_2255287_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MEDKNSVIVFKNVSFQYQSDASFTLKDVSFNIPKGQWTSIVGHNGSGKSTIAKLMIGIEKVKSGEIFYNNQAITDDNFEKLRKDIGIVFQNPDNQFVGSIVKYDVAFGLENHAVPHDEMHRRVSEALKQVDMLERADYEPNALSGGQKQRVAIASVLALNPSVIILDEATSMLDPDARQNLLDLVRKVKSEHNITIISITHDLSEAMEADHVIVMNKGTVYKEGTAIEIFDHAEELTTIGLDLPFPIKINQMLGYQTSFLTYEGLVDQL >NZ_CP038850.1|WP_000542274.1|2255824_2256193_-|50S-ribosomal-protein-L17 MGYRKLGRTSDQRKAMLRDLATSLIISERIETTEARAKEVRSVVEKLITLGKKGDLASRRNAAKTLRNVEILNEDETTQTALQKLFGEIAERYTERQGGYTRILKQGPRRGDGAESVIIELV >NZ_CP038850.1|WP_000569649.1|2256209_2257154_-|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-alpha MIEIEKPRIETIEISEDAKFGKFVVEPLERGYGTTLGNSLRRILLSSLPGAAVKYIEIEGVLHEFSAVDNVVEDVSTIIMNIKQLALKIYSEEDKTLEIDVRDEGEVTASDITHDSDVEILNPELKIATVSKGGHLKIRLVANKGRGYALAEQNNTSDLPIGVIPVDSLYSPVERVNYTVENTRVGQSSDFDKLTLDVWTNGSITPQESVSLAAKIMTEHLNIFVGLTDEAQNAEIMIEKEEDQKEKVLEMSIEELDLSVRSYNCLKRAGINSVQELADKSEADMMKVRNLGRKSLEEVKYKLEDLGLGLRKED >NZ_CP038850.1|WP_000101625.1|2257228_2257618_-|30S-ribosomal-protein-S11 MARKQVSRKRRVKKNIENGVAHIRSTFNNTIVTITDEFGNALSWSSAGALGFKGSKKSTPFAAQMASETASKSAMEHGLKTVEVTVKGPGPGRESAIRALQSAGLEVTAIRDVTPVPHNGCRPPKRRRV >NZ_CP038850.1|WP_000090796.1|2257641_2258007_-|30S-ribosomal-protein-S13 MARIAGVDIPREKRVVISLTYIYGIGTSTAQKILEEANVSADTRVKDLTDDELGRIREVVDGYKVEGDLRRETNLNIKRLMEISSYRGIRHRRGLPVRGQKTKNNARTRKGPVKTVANKKK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP038850_6 | 2617234-2617315 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038850_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038850_6
>6.1|2617258|34|NZ_CP038850|CRISPRCasFinder ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038850_6
The CRISPR arrays of NZ_CP038850_6 >merge|NZ_CP038850|6|2617234-2617315|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG >NZ_CP038850|6|6|2617234-2617315|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGG ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG
>NZ_CP038850.1|WP_000697134.1|2616785_2617016_+|DUF896-domain-containing-protein MKILDRINELANKEKVQPLTVAEKQEQHALRQDYLSMIRGQVLTTFSTIKVVDPIGQDVTPDKVYDLRQQYGYIQN >NZ_CP038850.1|WP_078064756.1|2616065_2616566_+|hypothetical-protein MTSIFVFAYLNNTSDNMLFRQQMIYACLLANVRHSSIVCLNNTCRIVDIRCLNTKIGGIDVSETDESQGFERTHNILNINQSSLGVVTYITNKLKSTLKQHIIIACGKKRIDYRLSYNFYTTYYDNVEIKKINCEYTYAMPIAILIRHMMSFDNDYFFAQLRHPVL >NZ_CP038850.1|WP_000901514.1|2615280_2615868_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MLGSEQTMESKSIDPRIVRTKQLLVDAFLKISREKKLSQITVKDITDIATLNRATFYAHFTDKEDLLDYTLSVTILKDLNDNLSISNVINEKVLRNIFISIASYIKDAAKSCELNSEAFCNKAHQRINNELEDIFAIMLENSYPEHQRDIIVNSASFLAAGISGLALHWFNTSQETADVFIDRNLPFLIHHIAHF >NZ_CP038850.1|WP_001791985.1|2615015_2615144_-|hypothetical-protein MDFKNEDKIKVYCNNMFEKLPISLSKNSEFCDILFFIVLSYR >NZ_CP038850.1|WP_000200684.1|2613833_2614889_-|PTS-transporter-subunit-IIC MTSIKTITPKDFIFRVLSGVAIGIVAGLVPNAILGEIFKYFMDYHPIFKTLLGVVVAIQFTVPALIGALVAMKFDLSPLAIAVVASAAYVGSGAAQFKNGAWMITGIGDLINTMITAAIAVLFILLIQHRVGSMALIVFPTVVGGISGAIGVLILPYTKMITTAIGNMVNGFTELQPIVMSILISMVFSLIIISPLSTVAIAFAIGITGLAAGSASIGISATEAVLIIGTSKVNRLGVPLSVFFGGVKMMIPNMVKYPILMLPILTTAIVSGLVSALVGIHGTKESAGFGFIGMVGPINAFKFMEVDSAWLSVLLIVVAFFVVPFVTAWLADIIYRKVFRLYTNDIFKFMG >NZ_CP038850.1|WP_000751274.1|2612524_2613226_-|lytic-transglycosylase-IsaA MKKTIMASSLAVALGVTGYAASTGHEAHAAEVNVDQAHLVDLAHNHQDQLNAAPIKDGAYDIHFVKDGFQYNFTSNGTTWSWSYEAANGQTAGFSNVAGADYTTSYNQGSNVQSVSYNAQSSNSNVEAVSAPTYHNYSTSTTSSSVRLSNGNTAGATGSSAAQIMAQRTGVSASTWAAIIARESNGQVNAYNPSGASGLFQTMPGWGPTNTVDQQINAAVKAYKAQGLGAWGF >NZ_CP038850.1|WP_000154459.1|2611760_2612249_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MTINIIEYNRSYKEELIEFILSIQKNEFNIKIDRDDQPDLENIEHNYLNSGGQFWLAINNHQNIVGTIGLIRLDNNMSALKKMFVDEGYRNLKIGKKLLDKVIMTCKEQNIDGIYLGTIDKFISAQYFYSNNGFREIKRGDLPSSFPKLDVDNRFYYRNLKG >NZ_CP038850.1|WP_000379833.1|2609434_2611246_-|acetyltransferase MDTKDFKRLEKMYSPRYLPGLDGLRAFAVIGIIIYHLNAQWLSGGFLGVDTFFVISGYLITSLLISEYYRTQKIDLLEFWKRRLKRLIPAVLFLICVVLTFTLIFKPELIIQMKRDAIAAIFYVSNWWYISQNVDYFNQFAIEPLKHLWSLAIEEQFYLLFPLVITFLLHRFKPRNIIQTLFIVSLISLGLMIVIHFITGDNSRVYFGTDTRLQTLLLGCILAFIWPPFALKKDISKKIVVSLDIIGISGFAVLMTLFFIVGDQDQWIYNGGFYIISFATLFIIAIAVHPSSLFAKFLSMKPLLIIGKRSYSLYLWHYPIIVFVNSYYVQGQIPVYVYVIEIVLTALMAEISYRFIETPIRKKGFKAFAFLPKKKGQFARTVLVILLLVPSIVVLSGQFDALGKQHEAEKKEKKTEFKTTKKKVVKKDKQEDKQTANSKEDIKKSSPLLIGDSVMVDIGNVFTKKIPNAQIDGKVGRQLVDATPIVKSQYKDYAKKGQKVVVELGTNGAFTKDQLNELLDSFGKADIYLVSIRVPRDYEGRINKLIYEAAEKRSNVHLVDWYKASAGHPEYFAYDGIHLEYAGSKALTDLIVKTMETHATNKK >NZ_CP038850.1|WP_000725226.1|2608306_2609074_-|CHAP-domain-containing-protein MKKIVTATIATAGLATIAFAGHDAQAAEQNNNGYNSNDAQSYSYTYTIDAQGNYHYTWTGNWNPSQLTQNNTYYYNNYNTYSYNNASYNNYYNHSYQYNNYTNNSQTATNNYYTGGSGASYSTTSNNVHVTTTAAPSSNGRSISNGYASGSNLYTSGQCTYYVFDRVGGKIGSTWGNASNWASAAASSGYTVNNTPKAGAIMQTTQGYYGHVAYVEGVNSNGSVRVSEMNYGHGAGVVTSRTISANQAGSYNFIH >NZ_CP038850.1|WP_078064694.1|2607643_2608132_-|glycosyl-4,4'-diaponeurosporenoate-acyltransferase MKKYIKTAFFCSMYWLIVQLNIANLGTRIPDKYFRQKHIIFKSFNFEKHGKFWNKWFYVRKWKHKILDGHQLNQNIYDQRHLMTINTDEIEKMIIETKRAELIHWISILPVIIFNKGPRLVKYINIFYAMITNVPIIIVQRYNRPRLTQLLRILKRRGERHD >NZ_CP038850.1|WP_000616227.1|2617419_2617797_-|glyoxalase MIQSMWFNLHVQDLEKSAQFYKALGFKINRNPQMLDKMVGIQIGQTTVILIENKHFQNVSQQSLNTEPNEVMISLGVNTNEEVDQLVNKVKEAGGTVVQEPTVSQGFYGAMFKDLDGHHFNFLVC >NZ_CP038850.1|WP_000651839.1|2617813_2618635_-|NmrA/HSCARG-family-protein MKDILVIGATGKQGNAVVKQLLEDGWYVSALTRNKNNRKLSDIGHPHLSIVEGDLSDSDSLQSAMKGKYGLYSIQPIVKDDVSEELRQGMKIIEIAEQENIQHIVYSTAGGVNRNRTGPHFEVLAKIENRLMESNINATVIKPSFFMDNFLRIAKVEDERITLPEFINPNIKFTMISSIDIAKIASYIFAHPQSFTHQSIEIGSDEVTLSEAATIFSEVTGKSTVIEGEFVSSVAEKQWLEEKGYEVDFELMAEINPTRLSLSDWLKVQDYNK >NZ_CP038850.1|WP_000055844.1|2618653_2618953_-|DUF2316-family-protein MSLNKEQRRITAEELQAHFEASTLSVQMIAEKLNVTTEDVEKALAMKAPLGIFSHQLQRFIHLVWDVRNVINDNIKENGQTPEPYTYLKGEKEDYWFLR >NZ_CP038850.1|WP_001224183.1|2619083_2619641_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MRKDAKENRQRIEEIAHKLFDEEGVENISMNRIAKELGIGMGTLYRHFKDKSDLCYYVIQRDLDIFITHFKQIKDDYHSDYEVMQVSLDYLLQFKIDNKALLQCIEAGNNKLRFYQSAFYQELFNFYYDLFKSDDDIYKKFKTDMLLQALSTSVFAFQIEHRHISIEAYRNYLLNIYLDEVERND >NZ_CP038850.1|WP_000161828.1|2619633_2620338_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MTKIVLITGGNKGLGYASAEALKALGYKVYIGSRNDVRGQQASQKLGVHYVQLDVTSDYSVKNAYNMIAEKEGRLDILINNAGISGQFSAPSKLTPRDVEEVYQTNVFGIVRMMNTFVPLLEKSEQPVVVNVSSGLGSFGMVTNPETAESKVNSLAYCSSKSAVTMLTLQYAKGLPNMQINAADPGATNTDLVGDFSNNSKHVSEGIKPIIQLATIDADGPTGTFINGDGEMPW >NZ_CP038850.1|WP_000836420.1|2620435_2621446_+|amidohydrolase MKSITFEEHYVIEDIQKETMNAISADPKGVPMKVMLEGLEKKTGFTNADELSHHDERIQFMNNQDVQIQVLSYGNGSPSNLVGQKAIELCQKANDQLANYIAQYPNRFVGFATLPINEPEAAAREFERCINDLGFKGALIMGRAQDGFLDQDKYDIIFKTAENLDVPIYLHPAPVNSDIYQSYYKGNYPEVTAATFACFGYGWHIDVGIHAIHLVLSGIFDRYPKLNMIIGHWGEFIPFFLERMDEALFAEHLNHPVSYYFKNNFYITPSGMLTKPQFDLVKKEVGIDRILYAADYPYIEPEKLGVFLDELGLTDEEKEKISYTNGAKLLGLSSNN >NZ_CP038850.1|WP_000448903.1|2621465_2622296_+|alpha/beta-hydrolase METLELQGAKLRYHQVGQGPVLIFIPGANGTGDIFLPLAEQLKDHFTVVAVDRRDYGESELTEPLPDSASNPDSDYRVKRDAQDIAELAKSLSDEPVYILGSSSGSIVAMHVLKDYPEVVKKIAFHEPPINTFLPDSTYWKDKNDDIVHQILTEGLEKGMKTFGETLNIAPIDAKMMSQPADTEEGRIEQYKRTMFWSEFEIRQYTHSDITLDDFTKYNDKITLLNGTDSRGSFPQDVNFYINNETGIPIVDIPGGHLGYIQKPEGFADVLLNMWS >NZ_CP038850.1|WP_000644427.1|2622436_2623462_+|NADP-dependent-oxidoreductase MKAIQIKKYNKNRDVQIRDITIPEIKSTEVLVKVAYAAINPLENLTINGSVKLIQNYKMPQTIGNELTGTIVKVGSKVEDYKLGDKIYSRLPIDRIGAFAEYVSIESNAIAKLPKNLNLKTGAAVPLTGLTAYQAITEELKAIPGKTLFIPGGSGSFGQMAVPIAKSLGLKVIVSGSPRLKDQFLAKGVDQYIDYKTENYCEVLSDIDYVIDTLGPNEFDKELSVMKPGGTIVSLINAPNKAFAVKNNFSPFKKLLFGLAGKKFDKKAQKKSIDYRFIFVRSDGEQLKILNKIIEQNNIIPDIDDHIFTIDEIDKALDYTFNHHTNGKVLIRIDNSDNTIY >NZ_CP038850.1|WP_000706527.1|2623682_2624573_-|GTP-binding-protein MKIVIIGGFLGGGKTTVLNHLLAESLKESLKPAVIMNEFGKMSVDGALVSEDIPLSELTEGCICCAMKADVSEQLHQLYLKEQPDIVFIECSGIAEPVSVLDACLTPILAPFTTITHMIGVVDASMYKHIKSFPKDIQGLFYEQLAYCSVLFVNKIDSADVETTSKLLKDLEVINPEADIQVGMHGSVTLPISVRQMTVTSDNKHESLHKTINHQFVQSPVKCTKAEFIKRLACLPSHIYRLKGFMTFEDTAHTYLIQFTQGQYELTPVAFSKKVPEYLVLIGKGISKEDYQCLEQ >NZ_CP038850.1|WP_000895186.1|2624672_2626013_-|ferrous-iron-transporter-B MLEVKYDMRTGHYTPIPNEPHYLVISHADKLNATEKAKLRLLIIKQKLDISLAESVVSSPIASEHVIEQLTLFQHERRHLRPKISATFLAWLLIFLMFALPIGIAYQFSDWFQNQYVSAWIEYLTQTTLLNHDILQHILFGDYGVLSLGTYSLVWALPVVILISLSTAIIDQTGFKSWMIWAIEPSMLRIGLQGNDIVPLLEGFGCNAAAISQAAHQCHTCTKTQCMSLISFGSSCSYQIGATLSIFSVAGKSWLFMPYLILVLLGGILHNRIWLKKNNQQLSVPLPYDRQLHMPNIRQMLLQMWQNIQMFIVQALPIFITICLIVSILSLTPILNVLSQIFTPILSLLGISSELSPGILFSMIRKDGMLLFNLHQGALLQGMTATQLLLLVFFSSTFTACSVTMTMLLKHLGGQSALKLIGKQMLTSLSLVIGVGIIVKIVMLII |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP038850_3 | 3.1|1941103|26|NZ_CP038850|CRISPRCasFinder | 1941103-1941128 | 26 | NZ_CP038850.1 | 802802-802827 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP038850_3 | 3.1|1941103|26|NZ_CP038850|CRISPRCasFinder | 1941103-1941128 | 26 | NZ_CP038850.1 | 1942563-1942588 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP038850_3 | 3.1|1941103|26|NZ_CP038850|CRISPRCasFinder | 1941103-1941128 | 26 | NZ_CP038850.1 | 2276727-2276752 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP038850_1 | 1.1|632805|28|NZ_CP038850|CRISPRCasFinder | 632805-632832 | 28 | NZ_CP038850.1 | 1941162-1941189 | 1 | 0.964 |
| NZ_CP038850_6 | 6.1|2617258|34|NZ_CP038850|CRISPRCasFinder | 2617258-2617291 | 34 | NZ_CP038850.1 | 1027850-1027883 | 2 | 0.941 |
1. spacer 3.1|1941103|26|NZ_CP038850|CRISPRCasFinder matches to position: 802802-802827, mismatch: 0, identity: 1.0
cgaaattctctgtgttggggcccaca CRISPR spacer cgaaattctctgtgttggggcccaca Protospacer **************************
2. spacer 3.1|1941103|26|NZ_CP038850|CRISPRCasFinder matches to position: 1942563-1942588, mismatch: 0, identity: 1.0
cgaaattctctgtgttggggcccaca CRISPR spacer cgaaattctctgtgttggggcccaca Protospacer **************************
3. spacer 3.1|1941103|26|NZ_CP038850|CRISPRCasFinder matches to position: 2276727-2276752, mismatch: 0, identity: 1.0
cgaaattctctgtgttggggcccaca CRISPR spacer cgaaattctctgtgttggggcccaca Protospacer **************************
4. spacer 1.1|632805|28|NZ_CP038850|CRISPRCasFinder matches to position: 1941162-1941189, mismatch: 1, identity: 0.964
ggtgtgggccccaacacagagaatttca CRISPR spacer ggtgtgggccccaacatagagaatttca Protospacer ****************.***********
5. spacer 6.1|2617258|34|NZ_CP038850|CRISPRCasFinder matches to position: 1027850-1027883, mismatch: 2, identity: 0.941
atgggccccaacaaagagaaattggattcccaat CRISPR spacer atgggccccaacaaagaggaattggatttccaat Protospacer ******************.*********.*****
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
59731 : 66738
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038850|59731:66738|DBSCAN-SWA CTTAACTTGCTAGCATGATGCTAATTTCGTGGCATGGCGAAAATCCGTAGATCTGAAGAGACCTGCGGTTCTTTTTATATAGAGCGTAAATACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAATGGCACGATATAAATAGCTCCATTTTCCTTTTATTTTGATGTACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCTCTTTTCTAGTATAATGTTTATTAATATAGTACATATTTTTATAAGGAGTTGTACGCATGTATAATCCATTCGACGAAGCTTATCATGGCTTATGCGAAGAGATATTAGAAATAGGGAATAGACGCGATGATCGCACACATACCGGGACAATTTCCAAATTTGGGCATCAATTGCGTTTCGATTTAACCAAAGGGTTTCCTTTACTTACAACCAAAAAGGTTTCTTTTAAATTAGTAGCAACTGAATTATTATGGTTTATTAAAGGAGATACAAACATTCAATACCTACTTAAATATAATAACAATATATGGAATGAATGGGCATTTGAAAATTATGTTCAGTCTGATGATTATCATGGACCAGACATGACAGATTTTGGACATCGTTCCCAGCAAGACCCTGAATTTAACGAGCAGTATAAAGAAGAAATGAAAAAATTTAAAGAACGTATTCTAAACGATGATGCATTTGCTAAAAAATATGGCAACTTAGGGAATGTTTATGGTAAACAATGGAGAGATTGGGAAGATAAAAATGGAAATCATTACGATCAATTAAAATCAGTTATACAACAAATTAAAACCAATCCAAACTCTCGACGTCACATTGTTTCAGCATGGAATCCTACTGAAATCGATTCAATGGCATTACCACCTTGCCACACAATGTTTCAATTTTACGTACAAGAGGGTAAATTAAATTGTCAATTATATCAAAGAAGTGCTGATATATTTTTAGGTGTTCCTTTCAATATTGCAAGTTATGCTTTACTGACACATCTTGTTGCAAAAGAATGTGGACTTGAGGTGGGTGAATTCATTCATACATTTGGAGATGCACATATTTATTCCAATCATATGGATGCAATACATACACAATTATCAAGAGATAGTTATCTACCACCTCAATTAAAAATTAATACAGATAAATCAATTTTTGATATTAATTATGAAGATTTAGAATTGATAAATTATGAATCACACCCTGCTATTAAAGCACCTATTGCGGTATAAAAAGATGCATTAATATTTCGCATACAGAAAGGAGGTATACCATGACATTATCAATAATTGTCGCTCACGATAAACAAAGAGTCATTGGGTACCAAAATCAATTACCTTGGCACTTACCAAATGATTTAAAGCATATTAAACAACTGACCACTGGGAATACACTTGTAATGGCACGGAAAACTTTTAATTCTATAGGGAAGCCATTGCCAAATAGACGTAACGTCGTACTCACTAACCAAGCTTCATTTCACCATGAAGGGGTAGATGTTATAAACTCTCTTGATGAAATTAAAGAGTTATCTGGTCATGTTTTTATATTTGGAGGACAAACGTTATACGAAGCAATGATTGACCAGGTAGATGATATGTATATCACAGTAATAGATGGAAAGTTTCAAGGAGACACATTCTTTCCACCATACACATTCGAAAACTGGGAAGTCGAATCTTCAGTAGAAGGTCAACTAGATGAAAAAAATACTATACCGCATACATTCTTACATTTAGTGCGTAGAAAAGGGAAATAGGAGGCAATTATGGCTAAACAAATTATCGTCACGGATTCAACCTCTGATTTATCACATGAATATTTAAAACAACATAACATTCATGTTATACCATTAAGCCTGACAATCGACGGGAAATCTTACACTGATCAAGTTGATATCTCTTCAAGTGAGTATATCGATCATATTGAAAATGATGCAGACGTCAAAACAAGTCAACCACCTATTGGTCGATTTATTGAAACATATGAGCAATTAGCTCAAGATGACGTTGAAATTATAAGTATTCATCTTTCGTCAGGCTTAAGTGGTACTTATAATACTGCTGTTCAAGCGAGCCATATGGTAGATGGTAATATTACAGTGATTGATTCTAAATCTATTTCGTTTGGGTTAGGTTATCAAATTAAGCAAATTGTTGAATTGGTTCTGTTGCAAAGTAAAAAAATATAGCTAACCACTAATTTATCATGTCAGTGTTCGCTTAACTTGCTAGCATGATGCTAATTTCGTGGCATGGCGAAAATCCGTAGATCTGAAGAGACCTGCGGTTCTTTTTATATAGAGCGTAAATACACTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTATCTCGTTGCTTACGCAACCAAATATCTAATGTATGTCCCTCTGCATCAATGGCACGATATAAATAGCTCCATTTTCCTTTTATTTTGATGTACGTCTCATCAATACGCCATTTGTAATAAGCTTTTTTATGCTTTTTCTTCCAAATTTGATATAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTCCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGAAAATCCTTCACCAACGTAAGTTGGCAAAGATGCCAAGTTCACTTCCTAAGAAATATCTTTACCACCATTCCTAAAAAAAATTCAAAATCTTTCAGAGAAGCTGTTAAAGGAATTTTTAAGTTCACAGATATTAACTTAGCGCGTGAGGCTAAAAATCGATTGATTCATGATTATATCGATCAACCAAAATATTCAAAAGCTTGCGCATCATTGGATGATGGATTCGAAGACGCCTTTCAATATACCGTACAAGGAAATTCCCACAATCGACTAAAGAGTACCAATCTAATTGAACGACTGAATCAAGAAGTACGCAGAAGAGAAAAGATTATTCGCATCTTCCCCAATCAAACATCAGCCAATCGCTTAATTGGAGCCGTTCTTATGGACCTACATGATGAATGGATTTATTCTTCAAGAAAATACATCAATTTTGATAAGTAGAAATGGTAAAAACATTGTATAGCATTTTACACAGGAGTCTGGACTTGACTGAGTTTATGGAAGAAGTTTTAATTGATGATAATATGGTTTTTGATATTGATAATTTAAAAGGATTTCTTAATGATACCAGTTCATTTGGGTTTATAGCTAAAGAAAATAATAAAATTATAGGATTTGCATATTGCTATACACTTTTAAGACCTGATGGAAAAACAATGTTTTATTTACACTCAATAGGAATGTTACCTAACTATCAAGACAAAGGTTATGGTTCAAAATTATTATCTTTTATTAAGGAATATTCTAAAGAGATTGGTTGTTCTGAAATGTTTTTAATAACTGATAAAGGTAATCCTAGAGCTTGCCATGTATATGAAAAATTAGGTGGTAAAAATGATTATAAAGATGAAATAGTATATGTATATGATTATGAAAAAGGTGATAAATAAATGAATATAGTTGAAAATGAAATATGTATAAGAACTTTAATAGATGATGATTTTCCTTTGATGTTAAAATGGTTAACTGATGAAAGAGTATTAGAATTTTATGGTGGTAGAGATAAAAAATATACATTAGAATCATTAAAAAAACATTATACAGAGCCTTGGGAAGATGAAGTTTTTAGAGTAATTATTGAATATAACAATGTTCCTATTGGATATGGACAAATATATAAAATGTATGATGAGTTATATACTGATTATCATTATCCAAAAACTGATGAGATAGTCTATGGTATGGATCAATTTATAGGAGAGCCAAATTATTGGAGTAAAGGAATTCGTACAAGATATATTAAATTGATTTTTGAATTTTTGAAAAAAGAAAGAAATGCTAATGCAGTTATTTTAGACCCTCATAAAAATAATCCAAGAGCAATAAGGGCATACCAAAAATCTGGTTTTAGAATTATTGAAGATTTGCCAGAACATGAATTACACGAGGGCAAAAAAGAAGATTGTTATTTAATGGAATATAGATATGATGATAATGCCACAAATGTTAAGGCAATGAAATATTTAATTGAGCATTACTTTGATAATTTCAAAGTAGATAGTATTGAAATAATCGGTAGTGGTTATGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038850|59731:66738|62466_63141_-|WP_001106022.1|transposase|DBSCAN-SWA MNYFRYKQFNKDVITVAVGYYLRYALSYRDISEILRGRGVNVHHSTVYRWVQEYAPILYQIWKKKHKKAYYKWRIDETYIKIKGKWSYLYRAIDAEGHTLDIWLRKQRDNHSAYAFIKRLIKQFGKPQKVITDQAPSTKVAMVKVIKAFKLKPDCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKTRYQSINTAKNTLKGIECIYALYKKNRRSLQIYGFSPCHEISIMLAS >NZ_CP038850|59731:66738|62012_62435_+|WP_001118605.1|DBSCAN-SWA MAKQIIVTDSTSDLSHEYLKQHNIHVIPLSLTIDGKSYTDQVDISSSEYIDHIENDADVKTSQPPIGRFIETYEQLAQDDVEIISIHLSSGLSGTYNTAVQASHMVDGNITVIDSKSISFGLGYQIKQIVELVLLQSKKI >NZ_CP038850|59731:66738|61517_62003_+|WP_000175735.1|DBSCAN-SWA MTLSIIVAHDKQRVIGYQNQLPWHLPNDLKHIKQLTTGNTLVMARKTFNSIGKPLPNRRNVVLTNQASFHHEGVDVINSLDEIKELSGHVFIFGGQTLYEAMIDQVDDMYITVIDGKFQGDTFFPPYTFENWEVESSVEGQLDEKNTIPHTFLHLVRRKGK >NZ_CP038850|59731:66738|59731_60406_-|WP_001106057.1|transposase|DBSCAN-SWA MNYFRYKQFNKDVITVAVGYYLRYTLSYRDISEILRERGVNVHHSTVYRWVQEYAPILYQIWKKKHKKAYYKWRIDETYIKIKGKWSYLYRAIDAEGHTLDIWLRKQRDNHSAYAFIKRLIKQFGKPQKVITDQAPSTKVAMAKVIKAFKLKPDCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKTRYQSINTAKNTLKGIECIYALYKKNRRSLQIYGFSPCHEISIMLAS >NZ_CP038850|59731:66738|65667_66738_-|WP_138081319.1|DBSCAN-SWA MDIVNIVIMLLIGVFGGFISGLVGVGGAIIIYPAILLLPPLFGAPAYSAYIASGLTSSQVFFSTLSGSLKARKKTEFSPQLVLYMGGGMIIGSMLGAFLANLFDATFVNTVYIIIALLALTLMFIKVKPSSEKSSFNKYLLVIIGLFIGIISGIVGAGGAFIIIPILLVQSGESEETWTTFFEYLKERGLQGTELVISDAHKGLVSAIRKSFTNVSWQRCQVHFLRNIFTTIPKKNSKSFREAVKGIFKFTDINLAREAKNRLIHDYIDQPKYSKACASLDDGFEDAFQYTVQGNSHNRLKSTNLIERLNQEVRRREKIIRIFPNQTSANRLIGAVLMDLHDEWIYSSRKYINFDK >NZ_CP038850|59731:66738|64092_65532_+|WP_138081316.1|DBSCAN-SWA MNIVENEICIRTLIDDDFPLMLKWLTDERVLEFYGGRDKKYTLESLKKHYTEPWEDEVFRVIIEYNNVPIGYGQIYKMYDELYTDYHYPKTDEIVYGMDQFIGEPNYWSKGIRTRYIKLIFEFLKKERNANAVILDPHKNNPRAIRAYQKSGFRIIEDLPEHELHEGKKEDCYLMEYRYDDNATNVKAMKYLIEHYFDNFKVDSIEIIGSGYDSVAYLVNNEYIFKTKFSTNKKKGYAKEKAIYNFLNTNLETNVKIPNIEYSYISDELSILGYKEIKGTFLTPEIYSTMSEEEQNLLKRDIASFLRQMHGLDYTDISECTIDNKQNVLEEYILLRETIYNDLTDIEKDYIESFMERLNATTVFEGKKCLCHNDFSCNHLLLDGNNRLTGIIDFGDSGIIDEYCDFIYLLEDSEEEIGTNFGEDILRMYGNIDIEKAKEYQDIVEEYYPIETIVYGIKNIKQEFIENGRKEIYKRTYKD >NZ_CP038850|59731:66738|63699_64092_+|WP_000393259.1|DBSCAN-SWA MEEVLIDDNMVFDIDNLKGFLNDTSSFGFIAKENNKIIGFAYCYTLLRPDGKTMFYLHSIGMLPNYQDKGYGSKLLSFIKEYSKEIGCSEMFLITDKGNPRACHVYEKLGGKNDYKDEIVYVYDYEKGDK >NZ_CP038850|59731:66738|60519_61476_+|WP_000282655.1|DBSCAN-SWA MYNPFDEAYHGLCEEILEIGNRRDDRTHTGTISKFGHQLRFDLTKGFPLLTTKKVSFKLVATELLWFIKGDTNIQYLLKYNNNIWNEWAFENYVQSDDYHGPDMTDFGHRSQQDPEFNEQYKEEMKKFKERILNDDAFAKKYGNLGNVYGKQWRDWEDKNGNHYDQLKSVIQQIKTNPNSRRHIVSAWNPTEIDSMALPPCHTMFQFYVQEGKLNCQLYQRSADIFLGVPFNIASYALLTHLVAKECGLEVGEFIHTFGDAHIYSNHMDAIHTQLSRDSYLPPQLKINTDKSIFDINYEDLELINYESHPAIKAPIAV |
8 | Staphylococcus_phage(87.5%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
735368 : 743190
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038850|735368:743190|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTCACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTACGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTGTTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCAAGTGGAACAATAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCTATGACTGGGACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAGCCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGCTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAATATTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCTGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTGTCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAGTTAATACAGCGGCAACAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGGCAAAATAAGAAGAGGGCGGTTTTTTAAGTAAGAAAATATTTATCTAAACTAGTTATCACTATAAAACACTTCTGATATATCGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTTATAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGTTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGTGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATTGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTATGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCCACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATTTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCATCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACACATTGTGTAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCTGGTGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTTAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGGTTAAATAAATCGCCACCAATACGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGGCCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACGACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAGAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACATGGAATGTGATGTGCAGCTGAAAAATTAAAATCTTTATTTAATTCGAATTGATATGGATGCGTTGTACTAGGATAGATTTGTTGTAACATTTTAAAGCGCTCCTTTACTTTCAAGATATTGATTTAGTCCACGTTGACGTAAATGACAAGCTGGACATTCACCACAGCCATCCCCAATGATACCGTTATAGCATGTTAATGTTTTTGTACGAATATAATCTAAAACTTCGAGTTCATCACTTAATTTCCACGTTTCTGCTTTGTTTAACCACATTAAAGGAGTATGAATGACAAAATCTTTGTCCATAGCTAGGCTTAATGTTACGTTCATTGATTTTATAAAACTATCGCGACAGTCTGGGTAGCCTGAAAAGTCTGTTTCACATACGCCTGTAATAATATGCTTAGCCCCAATTTGATAAGCTAGAGCGCCTGCAAACGACAAGAAAAGTAAATTTCTAGCTGGAACAAATGTATTAGGTATACCATCTTCATTATTAGTAATTTCCATATCATGTTGTGTTAATGCGTTTGGAGTAAGTTGTGATAATAATGACATATCTAAAACGTGATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATGTTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCATTGATAAGCCCGTTTTTAATTTATAAAATAAAAAAAGCCTATCTCCATAAAAGATAGACGAAAGAAATGGGTTGCTCCTATAATATATATTAAAGGTTTACCAACGAATGTTTGAAATTTCAATGTCTAGTTTTTTATAGAGGGTTTCAGCTAGGAACCTCTGATATTCATTTATGTACGATGAATAGAATATACCATATATTAGTTAAAATCAAGGTCAGGATAATGACAATGCTTTTAAAGTTTTAGCTACATCCAATACATATTATAAAAATAAAACACATTTAGAACGGAGTATACAATGATTCTAGTCATAGATAATAATGATTCATTTACATATAATTTAATAGACTATATTAAGACTCAAACGAAACTAACAGTTCAAGTTGTTGGTATTGATAATCTGCTGATAGAAGACGTCATTAATATGAAGCCAAAAGCAATTGTTATTTCACCTGGGCCGGGTAATCCGGATGATTATCCTATCTTGAATGAAGTGTTAGAACAATTTTATCAGCGTGTACCTATACTAGGTGTATGTTTAGGATTTCAATGTATCGTGTCTTATTTTGGTGGAAATATCATTCACGGCTATCATCCTGTACACGGACATACTACACAGTTACGCCATACCAATGAAGGTATTTTTCAAGGACTGCCTCAAAATTTCAATGTAATGCGTTATCATTCATTAATTGCTGACGGAGCGACTTTTCCAAATTGCTTAAAGATTACAGCAAAAAACGATGCAGCGATTATTATGGCATTTGAGCATATTAGATTTCCGGTTTTTGGTGTGCAATATCATCCTGAATCTATTTTGAGTGAATACGGTTATCGACAAGTTGAATTATTTTTATCGAAGGTAGGTGATTACTGTGAGAATAGAATATAATTATCGCTACTATTTAACTGAAAATGAATATAAGCAATACCATATTCAATTAAAGGGATTTATAAAGAAGTATGTTGCTACTAAGTTGGCTGATGTGGGAGAAGTGATACACTTTGCACAAGCGCAGCAACGACAAGGTAGATATGTCTCGTTATATTTAAGTTACGAAGCGGCAAAGTATTTTAATCATGTTATGTGTACACATTCATTAGCTAAAGATGATATTTATGCAGTAGCTTATAGTTTTGAAAAAGCGGAAAGCATAAATTCAACATATGAACATCAAACTTCTTATGTATCAAAGCATCATTTTTCATTTGTTGAATCTTCTGAGGTTATGATGACTAATATTAAACGTGTCCAACAAGCAATTGTCGAAGGCGAAACGTATCAAGTGAACTATACGGCGCGCTTAACAGATAACATTTATTATCCTATTAGTACTTTATATGAACGATTAACTCAATTTAGTAATGGTAATTATACTGCGTTATTACAAACAGATGAAATCCAAGTAGCGTCTATCTCACCAGAATTATTTTTTCAAAAAGGACAATTTAACAATGTCGATAACGTTATCATAAGCAAACCGATGAAAGGGACAATGCCTAGAGGAAAAACGGAAGCTGAAGATCAACAGTATTATAAAACATTGCAAACTTCTTCGAAAGATCGTGCAGAAAATGTCATGATTGTTGATTTACTAAGAAACGATATAGGGAGAATATCACAGAGTGGCTCAATTAAGGTGTATAAACTATTTTTTATTGAGGCATATAAAACTGTATTTCAAATGACTTCGATGGTAAGTGGAACTTTAAAAAATAATACAGACTTAACTCAAATTTTAACATCGTTATTTCCTTGTGGTTCGATAACAGGTGCACCGAAACTGAATACAATGAAATATATTAAACAATTAGAAAGTTCACCTCGTGGTATATACTGCGGAGCAATTGGACTATTACTTCCAACTGAAGATGATAAAATGATTTTTAATATTCCAATTCGTACTATTGAGTATAAATATGGACAAGCGATTTATGGAGTCGGAGCAGGTATTACAATTGATTCTAAGCCAAAAGATGAAGTAAATGAATTTTACGCAAAAACCAAGATTTTGGAGATGTTATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038850|735368:743190|737901_738342_-|WP_001093556.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVAAVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NZ_CP038850|735368:743190|737084_737558_-|WP_001037805.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIIVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NZ_CP038850|735368:743190|741461_742055_+|WP_000604513.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDAAIIMAFEHIRFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_CP038850|735368:743190|740021_740441_-|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_CP038850|735368:743190|736423_737110_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_CP038850|735368:743190|739304_740018_-|WP_001062973.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVNLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPNIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP038850|735368:743190|738621_739206_-|WP_000637680.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVILITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNNLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NZ_CP038850|735368:743190|740442_741111_-|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NZ_CP038850|735368:743190|735368_736424_-|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_CP038850|735368:743190|742038_743190_+|WP_001217795.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKNNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
755163 : 769131
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP038850|755163:769131|DBSCAN-SWA TATGAAAGAACAACTTAATCAACTATCAGCATATCAGCCTGGTTTATCTCCAAGGGCATTGAAAGAAAAGTATGGCATTGAAGGAGATTTATATAAACTTGCATCAAATGAAAATTTGTATGGACCATCGCCAAAAGTTAAAGAAGCGATATCAGCACACTTAGATGAGTTATATTATTATCCTGAAACAGGATCACCGACATTAAAAGCGGCGATTAGTAAACATTTAAATGTAGATCAATCACGCATTTTATTTGGTGCGGGATTAGATGAAGTTATATTAATGATTTCTAGAGCTGTATTAACGCCAGGGGATACTATTGTTACAAGTGAAGCGACATTCGGTCAATATTATCACAATGCGATTGTTGAATCAGCTAATGTGATACAAGTACCTTTAAAAGATGGTGGCTTCGATTTAGAAGGTATTTTAAAAGAAGTTAATGAAGATACGTCATTGGTATGGTTATGTAATCCAAATAATCCTACAGGTACATATTTTAATCATGAGAGCTTAGATTCGTTTTTATCTCAAGTACCTCCACATGTACCAGTAATTATAGATGAAGCTTATTTTGAATTTGTGACAGCAGAGGACTACCCGGATACACTTGCTTTGCAACAAAAATATGACAATGCTTTCTTATTACGTACATTTTCAAAGGCGTATGGATTAGCGGGTTTACGTGTAGGATATGTGGTAGCAAGTGAACATGCGATTGAAAAATGGAACATCATTAGACCACCATTTAATGTGACACGTATATCTGAATACGCAGCAGTTGCAGCACTTGAAGATCAACAATATTTAAAAGAGGTAACACATAAAAATAGTGTTGAACGCGAAAGATTTTATCAATTACCTCAAAGTGAGCATTTCTTACCAAGTCAAACGAATTTTATATTTGTAAAAACAAAGCGGGTAAATGAACTTTATGAAGCGCTTTTAAATGTAGGGTGTATTACGCGACCATTTCCAACTGGTGTTAGAATTACAATTGGTTTTAAAGAACAAAATGATAAAATGCTAGAAGTTTTATCAAACTTTAAATACTAATAGAAAAGGGCACCACATGGTATGAATATGTGCCAAAATGCAGTGTGAATTATGAGGTGAGAGCATTTATTGTAAAAAGCAACAATAGATGATATTGTTTTGTATCAATTGCTTTTTTGCTATACTGAATTAATACTGATATTTTGAGGAGAAGATTAAAATGACCCGTAAATCAATCGCGATTGATATGGATGAAGTATTGGCAGATACATTAGGAGAAATCATTGATGCTGTCAATTTTAGAGCGGATTTAGGTATTAAAATGGAAGCTTTGAATGGTCAAAAACTTAAACATGTTATTCCTGAACATGATGGATTAATTACAGAAGTATTGAGAGAACCAGGCTTCTTCAGACATCTTAAAGTGATGCCGCATGCACAAGAAGTTGTAAAAAAATTAACTGAACATTATGATGTATATATTGCTACAGCAGCAATGGATGTACCAACATCATTTAGTGATAAATATGAATGGTTACTAGAGTTCTTTCCATTCTTAGATCCACAGCATTTTGTTTTTTGTGGTAGAAAAAACATTGTTAAAGCTGATTATTTAATAGATGACAATCCTAGACAGCTTGAAATTTTTACTGGTACACCGATTATGTTTACAGCAGTGCATAATATTAATGATGATCGATTTGAACGCGTAAATGGTTGGAAAGATGTAGAACAGTATTTTTTAGATAATATTGAGAAATAAAAATATATCACTTGAAGCATTTTATGTAGCAAAGATGATGGATATACTATTATGAAGTTGGGACTGGACGACGAAATAAATTTTGCGAAAATATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTCTATCTCATTATTATAAATCGGATGAATGTGTAAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGGATTTGAAAAAGGCGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAATTATATGTCTGTTTTTGAAACAGGGTAATAGCTTAAAGCTAATAAAAACGAATATAAGGTGCGTTGAATCTTATGATTACACTCTAAACCTAATATAATATCCCGTTAAGATCATTCCGGATGCTTACAAATCATTGACAGTAAGTAACTGAATGGCATTTGGTATAACCTCAATATCAATAGGTGTTTCTAATGAAATTTCGCCATCAATATCAACTTTCATTGCTGGATCTGTTGTAAGTGAAATCTTTTTACCAGGTATATGCTCAATACCTTGAGTAATTTCATTCCAATTCATGCTATCACGCTTTTTAAAAATATCATTTAAAATACTGAAACTTTGTTCATTAAAAATGAAAGTGTTCAGTTCACCATCTTGAGGAGACAAATCAGTCAATGGTATACGACTACCACCAATGAATGGACCATTTGCTGTAAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCAATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTAACAGTTGATCCAATATAACTTAATTTACCAAATATATCTTTTGACCCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATTAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTACTTTTATTACATCGTATGTACCAACTTGTGCAGAAATCATTTGTTCACTAGCTTGTTTATGATTAGGTGCAATATTTAGCGTTTTTGTAAAATCATTAAAAGTACCGCCTGGTAAAATGCCGATAGGGAGTTGAAGATTATGTGCCATAACACCATTTATAAGTTCGTTAACCGTGCCATCACCGCCAAGAATAAATAATATATCTACATCTTTTGCATAGTTTTTAGTTTTGATTTCTTGGCAATATTTAATAATGTCACCTTCGCTTTCACTCAATTGAATAGAAAGATGCTTACAAATTGAACTTAATGCTGTTGTAACTTCCCCAATACCTTGATTAATATTTTTTAATCCACTGTGTTCATGGTAAAAGAGGACACCATGTGTATATTTGTTTTCCATAGTTTAGCCTACTTTCTAAAAATTGGTTCATTAAATATATATACCCACTTTTAATTGCTAATACCAAAAATATGTTTTTAAATAGAGAAAATGGTAATAAATGAAATTAATCTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATAACTTGAATTTAATTAATGGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTAATTTAGGTCAACAATATTAACGAATACCTTTCATTGCTTTAATAATTAAAGGTGAGAATGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAAGAAAATAAAGTAATTTGTTTGACCTAGTGGTTCTATTAACTTAACTAATGTACCATTGATTGCTTGTGCAGAAGCGTTAGTTAAGTACCAAATACTCATCATTTGGGCATTAAATGCTTTAGGTGCTAACTTAACAGCAGCACTATTACCCGTTGGTGATAAGCATAGCTCACCGATAACACAAATAATGTACGATAAAATAACCCAGTTAACTGAGAAGTTTGATGAACCTGATGCATAACCTACAATACCAATTAGTATGTATGACGCACCTGCTAAGAACGTACCAATTGCAAATTTTACTGGCAGGCTAGGTTGTTTAGTTCCAAGCTTTTGCCATAAAAGTGAAATAATTGGAGCTAATAATAAAATAAATAATGGGTTAATTGATTGGAAGATCGCTTCACCAAAGTTTGTTTTCCAACCAAATAAGTTTAATTTCATATCTGAATGTTCAATTCCATAAATGTTTAATACATTAGACCCTTGTTCTTGAATAGCCCAGAACACCATTCCAAGAATAAATAATGGAATAAATGCTTTAACACGAGAACGTTCAGTATCAGTGACATCTTTACTTCTAATAATTAAAGTGAAGTAAATGATTGGTAATGCAATACCTAATACTAAAACAGTATTACTAACTAAGTTAAATGATAATGAGTTAGTTAATGCACCAATAACGATAATTAATACAATTGCTAAGACAACACTTCCGATAATAAGACCATACTTTTTCTTTTCAGCTGGTGTCAATGGGTTAGTAGGTTTCATACCAACGCTACCTAAGTTTTTGCGGTTGAAAAGTACATACCATACTAAACCTAATGCCATACCAACTGCTGCAATCAAGAATCCGCCGTGGAAGTTTTTAACATTAACAAAGTGTTGCAAAATAATAGGTGATAATAATGCACCCATATTAACTGACATATAGAAAATAACAAAACCTGCATCCATACGTCTATCATTTTCAGGATATAAACGGCCAACGATATTTGAAATATTTGGCTTCATTAAACCTGAACCAATAATGATGAAGAACATTGATGTGAATAAGCCGATTAATGCAAATGGTAAGCTTAAACAAATATGTCCGATAATAATAAAGACTGCACCTAATAAAGTAGCGCCTCTAGTACCTGTAATTCTGTCAGCAATCCATCCGCCTGGTATTGATGTCATATAGATTAATGAACCATAAACTGACATAATTGACATAGCTGTTGTTTTATCAATTCCAAGGCCATTATCTGTTACGGCAAAGTACATGTAGAAAATGAGTAGGGCACGCATGCCATAATAACTAAACCTTTCCCAGAACTCTACAAAGAAGAGTACACCTAGTCCTCGAGGATGCCCGAAAAATCCTGTTTGAGGTATGTCTTGAATTTGATTTCCATGGGAGTTTTGTTGTGTCATTTATACATCCCATCCTTTCTTCCCCTAATACAATAGTTTAAGTAAATTTGATTGTACCTTATCAACTAAATATTCCAATAAATCACAAAAAAATAAAAATATTGAGAATATTCTGTTATTAAGCGCGCACAATTAATTAGAGATAATATAAAAAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP038850|755163:769131|767416_768373_+|WP_001245585.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIVVTFLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVSFSAVLLVILLVITIFLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >NZ_CP038850|755163:769131|762892_764998_+|WP_000855510.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRVRRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMVIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP038850|755163:769131|766458_767430_+|WP_000876310.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGKILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDIFHLSDSQQNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSIGGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NZ_CP038850|755163:769131|760344_760845_-|WP_000930014.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP038850|755163:769131|756379_756922_+|WP_000197261.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNGWKDVEQYFLDNIEK >NZ_CP038850|755163:769131|757314_758232_-|WP_000429021.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSESEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMAHNLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKVNNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP038850|755163:769131|755163_756219_+|WP_000663028.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEHFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKY >NZ_CP038850|755163:769131|768369_769131_+|WP_000616864.1|DBSCAN-SWA MIQVGNLTKTINNQMILDDISIEIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDEGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHEIVNDALDLLQLQDIRKRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMDIQIEHIKNQRICLYFKD >NZ_CP038850|755163:769131|765117_766089_+|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_CP038850|755163:769131|758322_758424_+|WP_031789463.1|DBSCAN-SWA MVINEINLYRVGRENIVIAVYNEHIKFLFILIT >NZ_CP038850|755163:769131|758501_760007_-|WP_000193751.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_CP038850|755163:769131|760864_761731_-|WP_001068489.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGKLSSQPLLLTRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP038850|755163:769131|762115_762382_+|WP_075583674.1|DBSCAN-SWA MCLMYNETHNIVLVKQKRHNILCFVCKCFIYEEITFKSNLTQKFNSHYQLIVIFLENVLSKWKISNDVNTTYSDFYTFNPYKLLFSQI >NZ_CP038850|755163:769131|762531_762930_+|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY |
14 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
821426 : 840116
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP038850|821426:840116|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP038850|821426:840116|821426_823799_+|WP_001050044.1|DBSCAN-SWA MNLKQSIEEIINQPEYEPMSVSDFQDALGLSSADSFRDLIKVLVELEQSGLIERTKTDRYQKKHSSKGHSKLIKGTLSQNKKGFAFLRPEDEDMEDIFIPPTKINRALDGDTVIVEIHQSKGEHKGKIEGEVKSIEKHSVTQVVGTYSEARHFGFVIPDDKRIMQDIFIPKGQSLGAVDGHKVLVQITKYADGSDNPEGHISAILGHKNDPGVDILSIIYQHGIEIEFPDEVLQEAEAVPDHIENTEIKGRHDLRDELTITIDGADAKDLDDAISVKKLANGNTQLTVSIADVSYYVTEDSALDKEAYDRATSVYLVDRVIPMIPHRLSNGICSLNPHVDRLTLSCRMEIDASGRVVKHEIFDSVIHSDYRMTYDAVNQIITEKDPAIREQYNEITPMLDLAQDLSNRLIQMRKRRGEIDFDISEAKVLVNEDGIPTDVQLRQRGEGERLIESFMLIANETVAEHFSKLDVPFIYRVHEQPKSDRLRQFFDFITNFGIMIKGTGEDIHPTTLQKVQEEVEGRPEQMVISTMMLRSMQQAHYDDVNLGHFGLSAEYYTHFTSPIRRYPDLTVHRLIRKYLIEKSMDNKEVKRWEDKLPELAEHTSKRERRAIEAERDTDELKKAEYMIQHIGDEFEGIVSSVANFGMFIELPNTIEGMVHIANMTDDYYRFEERQMALIGERQAKVFRIGDTIKVKVTHVDVDERLIDFQIVGMPLPKNDRSQRPARGKTIQAKTRGKSLDKSKSDDKGHKKKGKQRKGKNERKNDKSGNSKHKPFYKDKSVKKKARRKKK >NZ_CP038850|821426:840116|827490_827700_+|WP_001058494.1|DBSCAN-SWA 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23 | Staphylococcus_phage(73.68%) | integrase,terminase,coat | attL 818310:818325|attR 839789:839804 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1029204 : 1037677
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP038850|1029204:1037677|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP038850|1029204:1037677|1031505_1031769_+|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >NZ_CP038850|1029204:1037677|1037110_1037677_+|WP_000238674.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHGIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFAGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRKCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP038850|1029204:1037677|1034602_1036087_+|WP_000483706.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKIKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_CP038850|1029204:1037677|1032434_1034624_+|WP_101244961.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYDLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP038850|1029204:1037677|1029204_1029687_+|WP_001670307.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARESGIDIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNHYESSLIQKVEDMQNELQ >NZ_CP038850|1029204:1037677|1030801_1031506_+|WP_000174043.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETDQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHIKLLNIATDKDIETLKTKALEINQVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_CP038850|1029204:1037677|1029673_1030798_+|WP_001010399.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVAVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITYFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_CP038850|1029204:1037677|1031770_1032442_+|WP_000666805.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEKLEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP038850|1029204:1037677|1036079_1037108_+|WP_000030811.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
1519815 : 1541695
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP038850|1519815:1541695|DBSCAN-SWA ATTAGTAAACTGCTAGTTTTTCTAATTGTTCTTTAACTTGAATTAAGTTTGAACGAATTAACGAGGCAGATTGATCCATTGTTTGAATAGCTTGTCCTTCATTTTCGTTCAAGCCATTACAAACAACTTCAAACTGTTGTGCCATTTGATCAAGACGAGCATGAGCTTGTGTGTTTAAAATAAACATATCGTCATAATGAGATGGTAAATTGACATTTCGTCGTTGTACGCAAATGTATAAAACCCTTGTTATACCAAGTTCTTTATTATTTTTAACCTTTTAAATTTTCCACAAGTGTTTGCCCTTATTTAAATAATCCGCCCTTTTTTTGCCCTGAAAAAATAACCACGTCAATTAAGACGTGGTTACCCTAATATAGAAAGAAAGTGTTTGTAAATTTTAACATATTTAAGATTTTTTGATTATCTATCTGTTTAGCTCATAGGATTTTTTTCCTTAGATTGAGTATCTATTAATTTAACTGTATGATTTTCCCAATCAACTTCATAAATTGATGTATGAGTTGCTCTATTTTCATCTTTATAATTATTACCTATCCAGTGAAGTTGATTCCAAAAGTTTGTATATCTATCCATTTCTCTTTGATAAGTAACAGTAATTTTTGATTTTTTTGCAGCGTTTTGTTTTCGAGATAGGACACCAATAAATTCTGGATTGAAGTTACCTCTGGATAACACTGGCATTTTGTGATATTCCAAGAAGTTTTGTCCAGCATTTAAGTTGCTTTGTCTTGAGCCTAAAAACATTTCATTACCATAAGTTGAATGATAACTATCTCTGCCATATGGTCCCCAACCATTATTCATAATTTTATGTGCTTCAACATCCCAACCAATTTTTTTGAAATTAGTTCTTTTATCTAAGCTAGTTCTATAGCTTTCTTGTTTATAGTTAATTGTCTCTGAAAAAGATTTTGAACCATTACCTCCACCTGACAAGCCGTTAGAGATATTAATATCTCCACCATAAGAATAACCTACCGTTTGTTGTACTTGAAATTCTTCATTTTGATTTTTAGGTGCATAATCTACAACGTTTACTGAGTCATTAGAATCTGAATTAATTGAAATGTTGTACTTAGAACCCCAATAAAATTGAGAACTAATAGTGTCTTTTGGATTTGGCTTTGTATAGCCAGAATAAATGTTTCCAGCAGCTTTGAGTATTAATGTATCTTTATCATAACTTTTATCTTTAATAAAATTAAAAGTTAAAATCTGAGAAATTTTTAACTTATCGGAATCTGATGTTGCAGTTGTTTTGTACAAAGTAATTTTATCATCAACCTTTTTCTCACTTACAGGTGTGATATGTTGAGCTGCATCAACTGTATTGGATAGCAAAAGCAATGCAATTGATGTAACAACTGATGATTTGACTATTTTTTTCATATCAATTATGTCCTTTCACTTTAATTTCATGAGTTTTCCAGTTCACTTCATATTTAACTGTGTAATTTCTGTTTACAAATGCGTTGTGTATTCTAGATCCTTCTAAATAACTATTGCCATAGTGTGTTGTTCTTCTAGTAGCATGAGTAACATCCATATTTCTGCCATACGTTATTTCAAATTCACTTGTATCTCCTGAGCCTTTTTCATGAGAAACAGTTGCAATAAATGAAGGATTGAAACCACTGTGTACTAATGGGGGTAATTCATTGTCTGGCACAAAATAGTCTCTCGGATTTTGACTATATGGTTTATATCCAACAAATAAATTTGGATCATGTCCAGACATTTTACCTAATGATGTGATAAATGAATTAGCTTTTATTCCCCATTGAACACTTTTTGAATTTTGATGTTCTACTTCACTGATATAGTTTTGTTGATTATAACTAATTGTTTTTGAATAATTAAATGAACCATTACCTCCTGTTGATGGACCACTATTAAAATTACCACCTATGTTATAACCTAATGTTTGACTAACATTTACTGAATCTATTTTATTTTTAGGTAGATAATTTATTAAATCTACATTGGGGTCATTTGTTTTGAGACCAATATTGTATTGGAAAGGCCACCTCATTGCTTTTATATGATCTGTGTTTTTGTAATTGTAATAAGTAGTCTTTGAATTGATAAAACCTTGCATTTTTAAAATCAAAGCGTCTTTGTTATACTTTTTATCTTTAACAAAATCAAACTGAATATTTTGTGTGACCCCCCACTTATCGCTACTTGTATCTTCTGTTCTTTTGACTACCTCAGCGCCATCACCAATATTCTCAATATTGTTATCAGCTTTAGATTCATGAAACGAAGTAGCAATAGGAGTGATTATTCCTAACGACAATGTTGCAGCTAATAGTCTTTTTTTGACCATAAAAATCATTTCCTTTCTTTATAAATTTTATTACATTTTTATATTAAACCTTTTTAACTTTTAATAAAATTAAATATTTATTAAAAGATTTACCGAGTTTAAAATATCTATAAATGTGTTTTTTTACTATTATTTCGAAAAAAACCCGTTCATTACCAAACAAATTATAAATAATTTATATTTTGATTGATAATAAACATAAAACCACGATATAGTTGACCATAACAACTTTTTAATCATAACACACAATACGAACACAAAATAATTTATATACTAAAAACGTTTGTTTTTTTAAAATTTAATATATTTATGTAAAAATTAACTGTTTATTAATTTTAAATAATAGGCAAATACCGAAGTACCTGCCTAAGATTCATCATATACAATTATCAAACTGCGCTAAACTTACCAAAACTACTTATCCTATTACCTGCTTTATCTACCTCTCCTGTCGCGATATAACGACGTTGTCCACTATTAGCGATATAAGTAATCCATCTATAGCCATTGATACAATATGCGCCGTCATATTTGATTGTTGCGTTATTAGGTAATACACCAGTAATTCTTGAATTAGTTGAATAGCCGTCCCTTACGTTATTACCTTTAACATTGGCAACTGTGTAATTACCAGCCTCTTTTTTATAAGGCACATTATTCTTATCAAGTGTATAACCTGCTGGCACTGGTGGATTTTTTTGGTTTTTAGCTGATGTTTTAACATTACCAGCTACCAAACCACCTATAGGCTTACCATGAATCGCACCAGCTATTAATTTAGAATACAAGTCATAATTCTTCTTAATCCAATCCATATCTTTTTTATTAGTAATAAAACCTAATTCAGATAAACGATAATTGATATTTATTTCTGCTGATACATTAACGTTCAGTAAATCATTACGAGGTGTTACACCTCTTATTTGTCCTAAGTTATTTTTAATAACATCTTGTATACTTTTATCAATAGTATCTGCATTGAATTGACTTGAAATAATAACATGCCCACCACTTGCACTTTCTCCTGCTGCGTCTAAATGAATCTCTAGAACAATGTCATACCCCTGTGATTTAACCCAATATAAGCCATAATCTTTATTATTTCCTACATTAACACCGTAAGCAGTATCTTGATACATATCTTGTGATTGACTTGAGCCACCATATAATGCAACTTCGTGACCTGCATGTCTTAAATACTTAGCGATATTTGGTGTTATATATTTACGGATAAAATCACGTTCATTTGTTCCGTTTCCGACTGCTCCAGGATCGTTATAACCATGACCGGCTACAAGCATAATTTTTTTAGGTTTAATTACTGCTTGCTTTTTGGCAGTTGCTTGCTTAATAACGCTTTTAGCTTTATCTCCAACACTTACTTTATCTGGGAAATTTAATCTAATAAAATACATTGGGTCATCGTAATAATGAACATGTCTTGTAACGGTTTCGGGACCCCAACCAGGTTGCGCAACGCCATTTGTCCAACCTTTACCATTCCAATTTTGGCCAAACGATGTGAAAGTGTTTAGATTAGCGCTCTCAACAATTTCAACATGTCCAGCTCCGCCACCATACTTTGACGGGAAAACGACAATGTCCAACTTTTGCGGTAAAAAGCTATCATAGTTTTTAATTATTTGCCCGTATTTTTCAATCCTTGCTTTATTATCAAATGGAATATTATAAGCGTATAAACCTTGTAACCTTTCGCCTGTTGCTATCATAAAAAACATATTTGCGTAATCGTAACACTGAAATCCATAAAACAAATCAGGATTGAACTGCTTCCCTAATGAATTATCAAACCATTTTTCTGCTTGGTTTTTTGTTATCAACATTGGTCAACACCTACCCTAAATCATTTGTGTCGTTCATATTCGTAGGTGTCATTACTTCTTTAATTGGCGCTTGCCCTGTTGCTTTTCTATACTTGTTTTCAGCTTTATATTTCTTTAGCTTTTGATTTGCCCATTTACCTTCTTGAGATGTTGGATTGTCTTTATACGTAGTATATAAAGCAACAACAGTAAGTATTATTGATGATATAGTCTCATCGTCTACTGGAATCGGGCTAATACCTTTGTTCGCTAAGAATTGATTTACTAATGCTAAGATCAATACGATGTATCTTGTTATTACTTTTGCATCCATTTGTTTGCTCCTTTTATCCAAAATAAAAAGCCAGTGCCGAAGCACTGACCAAAAACATTATTTACATTTACGACCATACAAATAGCATGACAACCATCTTGCCCAACTCATTTTGTCCACCTCCCTTAAGGTAATAACGCAGTAATTGATGCAGTAATGACTGCAATCATAACAATTGTTACAAGCGCCCATATGGCACCTACGAGCCATTTATTTTGGGCGAGTGTCTTTTCTTCATTTTTTTGTGCAACATCTACTTGCGTTTGATATCTTTCTTCAATTCTGTTTAATATCTTTGTTTGCTCTAAATTCTCATCTACAACTTTATCTTGCTTATCTTTAAGTTCTTTATGAGATTCTCTTAGTTCATTATGATGTTGCTTATGTTCCTCTCTAAGTTCAAGCACATGATCAGCTGTTTCGTTTGCTAGTATTTCAACATCATCAACACGTTCAACTAATTCAGAAAGCTCTTTTTTTATTTTCTGAA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MVKKRLLAATLSLGIITPIATSFHESKADNNIENIGDGAEVVKRTEDTSSDKWGVTQNIQFDFVKDKKYNKDALILKMQGFINSKTTYYNYKNTDHIKAMRWPFQYNIGLKTNDPNVDLINYLPKNKIDSVNVSQTLGYNIGGNFNSGPSTGGNGSFNYSKTISYNQQNYISEVEHQNSKSVQWGIKANSFITSLGKMSGHDPNLFVGYKPYSQNPRDYFVPDNELPPLVHSGFNPSFIATVSHEKGSGDTSEFEITYGRNMDVTHATRRTTHYGNSYLEGSRIHNAFVNRNYTVKYEVNWKTHEIKVKGHN >NZ_CP038850|1519815:1541695|1534345_1534492_+|WP_001013104.1|DBSCAN-SWA MNGGENFMADKNKKQEATRSNPINKSFEKPGASENLKSTLSEKAKKKD >NZ_CP038850|1519815:1541695|1524021_1524324_-|WP_000339141.1|holin|DBSCAN-SWA MDAKVITRYIVLILALVNQFLANKGISPIPVDDETISSIILTVVALYTTYKDNPTSQEGKWANQKLKKYKAENKYRKATGQAPIKEVMTPTNMNDTNDLG >NZ_CP038850|1519815:1541695|1525956_1526205_-|WP_001065062.1|DBSCAN-SWA MNNREQIEQSVISASAYNGNDTEGLLKEIEDVYKKAQAFDEILEGLPNAMQDALKEDIGLDEAVGIMTGQVVYKYEEEQEND >NZ_CP038850|1519815:1541695|1534488_1535103_-|WP_000191459.1|DBSCAN-SWA MTQFLGALLLTGVLGYIPYKYLTMIGLVSEKNKIINTPVLLIFSIETCLIWFYTFIIFNNVDLKNLSLLQLLTGLKANIWFLIIFVLTVLVFNPLIVKFIIWLINETRKFMNLDCISLLDKRDKLFNNNGKPVFIVIKDFENRIIEEGELKTYNSAGSDFDLLEVERQDFKVSDLPSNDELYIKHTLVDLKQQIKLDLYLMNEY >NZ_CP038850|1519815:1541695|1527401_1528181_-|WP_000139744.1|DBSCAN-SWA MTEQTNQDVDILTQLGVKDISKQNANKFYKFAIYGKFGTGKTTFLTKDNNALVLDINEDGTTVTEDGAVVQIKNYKHFSAVIKMLPKIIEQLRENGKQIDVVVIETIQKLSDITMDDIMDGKSKKPTFNDWGECATRIVSIYRYISKLQEHYQFHLAISGHEGINKDKDDEGSTINPTITIEAQDQIKKAVISQSDVLARMTIEEHEQDGEKTYQYVLNAEPSNLFETKIRHSSNIKINNKRFINPSINDVVQAIRNGN >NZ_CP038850|1519815:1541695|1525436_1525964_-|WP_000185638.1|DBSCAN-SWA MTNTLQVKLLSENARMPERNHKTDAGYDIFSAETVVLEPQEKAVIKTDVAVSIPEGYVGLLTSRSGVSSKTHLVIETGKIDAGYHGNLGINIKNDAQVYLTTNEQCFDIQGEMENSFVNNAKKKPFTINDYYEIYKGDKLAQLVIVPIWTPELKQVEEFESVSERGAKGFGSSGV >NZ_CP038850|1519815:1541695|1525163_1525400_-|WP_000195831.1|DBSCAN-SWA MTQYLVTTFKDSTGRKHTHITRAKSNQRFTVVEAESKEEAKEKYESQNTPIVYYTNNSKVTLFERPSEEVLGSLFEKK >NZ_CP038850|1519815:1541695|1530138_1530366_+|WP_000801108.1|DBSCAN-SWA MKNYYHLLSFDDDLANDAANDLLKEGWDIVHVGTKLVKILDNGQAYYNTEYVLGGTKNQYEKYLEDCQQSELDYF |
33 | Staphylococcus_phage(90.62%) | integrase,holin | attL 1517096:1517111|attR 1543308:1543323 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
1597521 : 1605851
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP038850|1597521:1605851|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCAATATCATGAGTAACTAAGATAATAGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTCGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAATCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTCTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATAAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTCAACATTTCAATTTCAAGTTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAACCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTGATTCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAACATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAACGAGCGACCAATCTCAGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGCGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTATTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGCTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAAAACAAAACCGCGATTTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTTATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGACCAGTTCGTCCGACTCTATGTGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCAATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAGTCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACGCCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAACGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAGTTCACACCATGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGGACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTTACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAATATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGGGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTGACTTTTGATATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGTGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTGATTATTGAAATGTTCTTCAAACCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATACGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATAATCAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAACCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTACTAAATGGCACATGATGATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCGTCATTAATTTGAGCTGAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGTGTAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAATTTTCAGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCGGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTATCTTCTAATTGATTTGCAGCTACATTTTTCACTGCAGCTTGAAAGGGGCCTTGAATAACTTCTCCTGCAATACCGCATTCGCATAAATGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTACCTTGTTTTAAAAATCGACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGTCTTTCAAACGTTTACTACGACTTGGATGTCTTAATTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCAATTTGTCGAATACGTTCACGTGTAACACCGAAAACTTTACCAACTTCTTCAAGTGTTCTTGTTCTGCCGTCATCAAGACCAAATCTTAATCGTAATACATTTTCTTCTCTATCAGTTAATGTATCAAGCACATCTTCTAATTGCTCTTTTAATAATTCATAAGCAGCATGATCTGAAGGACTTTGTGCTTCCTGATCCTCAATAAAGTCTCCTAAATGACTATCATCTTCTTCACCAATTGGTGTTTCTAATGAAACAGGTTCTTGCGCAATTTTTAAAATTTCACGAACTTTTTCTGCTGGTAAATCCATTTCTTCACCAATTTCTTCTGGTGCTGGATCTCGACCTAAGTCCTGTAATAATTGACGTTGAACACGAATTAATTTATTAATTGTTTCTACCATATGCACAGGGATACGAATCGTACGTGCTTGGTCAGCAATTGCACGAGTGATTGCTTGTCTAATCCACCATGTTGCATATGTTGAAAACTTAAATCCTTTGTTAAAGTCAAATTTTTCAACAGCTTTAATAAGACCCATATTACCTTCTTGGATTAAATCAAGGAATAACATACCACGACCTACGTATCTTTTAGCAATACTTACAACTAAACGTAAGTTCGCTTCTGCAAGTCTTGATTTTGCTACTTCATCACCTTGTTCAATACGTTTGGCTAATTCGATTTCTTCTTGTGCACTTAATAAGTTAACACGCCCAATTTCTTTAAGGTACATACGAACTGGGTCATTTATTTTAACACCTGGAGGGGCACTAAGATCACTTGGATTCAGTTTCTCGTCAGTATCTGAACTATCTTTTTCATTAACTAGTGAAATATCATTATCATTTAATTGATCAAAGAAATCATCCATTTGATCAGAGTCGATATCAAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTCGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAAATATGAACATTCGAAATTTATTCAATATTGCTATTTTAAACTAAATTCTTAATTAATTCATCCATATTTTTAATTTTATTTTACAAATTGGAACTAATCCCAATATTTATTTTTCAATAGTGTTGTTTAAATGCGGTAACTATCATTTACCCTTATACATTTTGACATAATCATTATTCGTATTATTCTTTAAAATCACATGCTACATGCGTTCTTTATTCTTAGCAACAATTTGCTGTAAATAGTATTTTTGTAATTCTACATCGCCAATCCTTGTAGCTTCCCTTAATTTATGATTCAATGACTCAATTGTTTCTTGTCCTTTTTCATTAATAACATTGACATAATCATCAATTTCATTTTCATATGGTTCGTCATTCAAATTATATTGTTCTAAGCTAATTAGTGTTTCTCTCAACTCATTTGAATTAACATACTGTACAGCATCACTGATATTATATTGATCATTTTCCGAATAAAAATCATGTAAGACTTCGAATACATATTTAAAATGCTGATTTGTGAAGTTATCCTTATCAACACTTTCATAATAATTTAAAAATGTATCTTTATCTCTCATTAAATGTTTTAAAAATGCTCGCTCCGCTTTTTCTTGACGGCTCAAATTGTCAAATTGTGCCATACCAATTGGCTCAGGTTCAATGTAACCTCCATACTCATCATAACCGCCATACTCATCTTCTGGATAATAATTGGCTGGTGCTTGATTGAATTGTATTTCGTTAGCTAACTGCTCAGGACTAACATTGAAAAATGGCGCAACATCATTTATAGCCTTTTGTTGCAGAATTGATGACTTCATAAGTGAAATGTCATGACTCAGTTCTTTCAAATAACGTTCATATGAAAGGTCATTATGTGCAATTTCATCTTTTAATATACTTACTTTATAATGTGCAAATGACTTTTTGTCATTTTTCACAAAAGTAGTAAATGCGTCGTTGCCATACTTACCAATGTATTCATCCGGATCCATGCCAGATGGCAATTGTATAACAAATACATTTAGCCCTTGCTGTAACAAATGTTGACCTGTTTTAAGTGTTGCTTCACTACCCGCAAAATCCCCATCAAACATTAATGTTATATTTGATGTTAACTTTCGTATAAAGGTGATATGTTCATCTGACAACTGTGTACCCATTGTTGCAACAACGTTTTTCAAGCCAGCAGTATCAGATTTTATAACATCCATAAAACCTTCTAGTAATACAATTTCATCTAATTTTCTAATTGATTTACGTGCTTTATCTAAGTTATATAACAACTTTCTTTTTTGAAAGATAGGCGTTTCAGGACTATTTAAGTATTTTGGTTCTTGACCGGTATATGTTCGACCTGAATATCCAACAATTCTTCCTTGCGCATTTTTCAAAGGAAACATAATTCGATTTCGAAATCTATCGTAATAACTGAAATTTTCTTCGTTACGTGATAATAATCCGGCTTCATATGCTAATTCAATATCGTAACCCTTTTTTTGAAGAAAATCATGACAAAAATGTGAGCTGTCGGGTGCAAAGCCAATGCCTCGCTCTTTAATAAGCGCATCTGTAAAACCACGTTCTTGTAAGTATGTTAATGCTTGTTCGCCTTCGACTGTCTTTGTTAAAGCGTAATAATAAAATTCTTGTATTAACTCATGCATTTCAATCATTTGTAAATCATCAGAAGCAATTTGAACATTTGAGTTAGATTGTGTTGCCTCAATATCTACAGCAACATTAACTCTATCACCTAATTCTTTAACCGCTTCAACAAATGATATGTCTTTAATTTCTTGAGTAAATTGAAAAACATTGCCACCTTTTTTACAACCAAAACAATGACAAATTTGTTTATCTTCAGAAACTGTAAATGAAGGTGTCTTTTCATCATGAAAAGGACACAAACCTATATAATTGCGTCCTCTCTTTTCTAATTTTACATATTCACTTACCAAGTCTAAAATGTCGGTTTTATCTTTTATTTCATTAATGATCGATTGATCTATTCGCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP038850|1597521:1605851|1601895_1602573_-|WP_138081389.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCECGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLEDRIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRSAQINDEIAVIERVL >NZ_CP038850|1597521:1605851|1600792_1601893_-|WP_000683934.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFSTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPYGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDAYQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGKSNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >NZ_CP038850|1597521:1605851|1602703_1603810_-|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >NZ_CP038850|1597521:1605851|1597521_1598307_-|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >NZ_CP038850|1597521:1605851|1599332_1600679_-|WP_001062179.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIENRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >NZ_CP038850|1597521:1605851|1604033_1605851_-|WP_001217258.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTTFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYSENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYNLNDEPYENEIDDYVNVINEKGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NZ_CP038850|1597521:1605851|1598432_1599323_-|WP_000924214.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
1675445 : 1684488
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP038850|1675445:1684488|DBSCAN-SWA ATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCGCCTAATTTTTCAACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATATACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAATTTTAAATCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTGACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAATATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAAGGAATTAGACAAGTCTTCCATTGACGTTGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGATGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCGCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCATTCATCGCAATATCTTGAATAATTAATTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGATCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGTAACCCAGGTTCTAAGTGACCATTTTGCCAAAATAGCGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCGATCGCCTTAACTGAAGAAACTGACAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGAATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACGTCTACTGGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGATGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCCTTTTTAACTTTCGTTTCTGCCATAGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAACGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATCATTTAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAATCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTGTACGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATGTACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAATGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCTAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCGGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCGCTATCGCTCTTTTAATTCTTTCAATAGTCTTAGTCATATCGCTCAATTGCAGTGCATCATGATTGATATCTGTATCTGAGATGATGGCTTCTATTGTTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGCTGGTTTAGTTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATATTTTGTTAAATTTAAACAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAACTCTTTATTGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAGCTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTATTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAAGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAAAATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCGGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAGGAACGAACTTTTGTTTGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCGGAAATGAAATTAAATGCTACTAACGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAATCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGTGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCAGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTAGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAGATTTCTTCCGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTAGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCCTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGAACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCGGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGATCGACTTGATAAAGCACCTCAAATCCACCTTGCAAATCAAGTCCTAAATTGACATTCTTTATAACACTTTTATAAGTTGCAGCCATTCCGGCAAACAACAATACGACTAAAAGCAAGAACGCAATTATTCTACTACTTTTCTTCACATGAACACCTCATTATTTACGTATGTATTTAGAATACTTGAATACTATTTTATAACGCAAGTTAAATCTTTCTTACAAAATTTATTAGCCTTATACATATTAACATACTAGAGCAGGGAGTAAAAATAGTCATAGATATATTTAATTTAAATTTAACAATTATTATGTATCACAATTTCTTTTTTTGGAATAAAAATAAGCTATTCTACATACTACTTATAACTTAAAAAGGATGAAACGCTATTCGTTTCATCCTTTTTAATACCACTTCTCGTTATGAAGGGTCAACTTGTTTAATAGCAGGTTTTTCGAAAGTTAATTCAGTACCATGACCATTAACTGTAATAACAACAGTTGTTTCATCTACTGCTTTAACAGTACCTTTAATACCACCAATAGTTGTAATTCTTTGACCAGATTGAATGTTATTAATCAACTCACGATGCTGTTTCGCACGTTTTTGTTGTGGTCTAATCATCAAGAAATACATAACCGCAAAAATTACGACTATATATATTAGTAATGAAAATTGCATTTTATACGCTCCTCTTGCTTAAAAGTTTTTTGGGTTCTCAACATTTAATCCATATTGCTCGAAGAATTCTTCTTTGAAATCTAAAAGACGATCTTCTCGAATGGCTTGTCTTATATCTTCCATTAATTTTAGCAGAAAATGTAAATTATGAATAGTAGTAAGACGAATACCAAAAGTTTCCTCTGCCTTGATTAAATGACGTATATACGCTCTTGAATAGTTTTGACATGTATAACAGTCACAATTCTCATCTAACGGTCTTAAATCATCTGCAAATTTTGCATTTTTAATAACTAAACGACCTTGCGATGTCATACAAGTACCATTTCTGGCAATACGTGTCGGTAAGACACAATCAAACATATCCATGCCGCGAATACTACATTCGATTAACGCATCTGGAGATCCTACACCCATTAAATATCTTGGTTTATCTTTAGGCATAAACTGCTCTGTATGTTCAACCATTTTATACATAACCGGTTTAGGTTCACCAACTGACAAACCGCCGATTGCATAACCAGGAAAATCTAATTCTACTAAATCCTTTGCACTTTGTTCTCTTAAATCTTCATATTCGCCACCTTGTATAATGCCGAACAATGCTTGATCTTCAGGTCTTTGGTGTGCATCTAGACATCTTTTCGCCCAACGTGTTGTACGTTCAATAGATTTTTTTACATAATCATATTCAGCAGGCATTGGTGGACATTCATCAAATGCCATCATAATATCAGAACCTAAATCATTTTGAATTTGCATTGATTTCTCAGGACTCAAAAATAATTTAGACCCATTAGTATGATGTCTAAATTCCACGCCTTCTTCTGTAATTTTACGTAAATTACTTAAACTAAACACTTGGAAACCGCCTGAATCTGTTAGAATCGGACCATCCCAATTCATGAATTTATGTAATCCCCCAGCGTGTTTGATAATATCATTTCCGGGTTGTAACCACAAATGATATGTGTTGCCCAAAATGATTTTTGCTTCAATTTGTCTTAACTCTTCTGGACTCATTGTTTTAACGGTTGCTTTAGTACCAACTGGCATAAACATAGGTGTTTCAAATGAACCGTGTGGTGTGTGCACGATACCTAAACGCGCACCTGATTGTTTACAAGTTTTAATGTGTTCGTATGTTACTGCAGGCATATTCAAAATCCTCACATTCTTTTTATATAATTAACATTGCATCGCCAAAACTAAAGAATCTATATTCTAAATTTACTGCCGTTTTATAAGCATTCAGAACATTTTCACGAGTACTAAACGCTGATACTAGCATAACTAATGTTGATTTTGGTAAATGAAAATTAGTAATCTGGCCATCAATTGCTTTAAAATCAAATCCTGGATAAATAAATATATTAGTCCAGCCACTCGTTTCAACAAATTTATCATGATCGCGTCGAATTGTTTCAAGTGTACGTGTTGAAGTTGTACCAACTGATATAATGCGATGTCCTTTGGACTCAGTATCATTTAATAAATCAGCTGTTTCTTGTGTCATTTGATAATATTCACTATGCATTTCGTGGTCATTCACATCATCGACGCTCACCGGTCTAAACGTACCTAACCCAACATGTAATGTAACAAATGCGATATTAACACCTTTATTTTTAATTTCAGTTAATAACTCATCAGTAAAATGTAATCCTGCTGTTGGTGCTGCCGCTGAACCACTTTCTTTAGCGTAAACTGTTTGATAACGATCTGGATCATCTAAACGTTCTTTGATGTATGGTGGCAGTGGCATTTCCCCTAATTCATCTAATCTTTCTTGTAAAATACCTTCATAATGTAAACGCATGATGCGTCCACCTTGATCCATTTCTTTTATGCATTCAGCTATAATTTTGCCATTACCAAAATTCAATTTATTACCAACTTTAATACGCTTAGCTGGTTTCAGTAAGACTTCCCAATCATTACCTTCAATTTGAGTTAACATTAACATTTCAACTTTTGCACCAGTTTCTTCTTTTAAACCAAAAAGTCTAGCTGGCATTACTCGCGTATCGTTAAGCACTAATGTATCACCAGGTCTAAAATACTCAATGATATCTTTGAAATGTAAATGTTTCATTTCACCAGTTTCTCTATCCATGACTAATAAACGACTATGATCACGATCTTTTAAAGGCGTTTGAGCAATTAATGATTCTGGTAAGTCATAGTCAAATTCTTCAAAATTCACGTTATTCTCTCTCCTCATTCGACTTTGCAAAATGTTCATAAGCTAATGGTGTTGCTTTTCTGCCACGTGGCGTACGTTCTAAAAAGCCTTTCTGAATAAGAAATGGCTCATAAACGTCCTCAATTGTAATACGTTCTTCACCAATTGTTACGGCAATCGTATCTAAACCAACAGGTCCACCATTATACTGCTTAATAATACAGTTCATCATTTTATGATCAATGTAATCTAGTCCGTGTTGATCAACTTGAAGTAAACCTAATGCGTGCTTCGTTGTTTCAATGTATATTTGTTCATCTTCATTCACTTGCTGGAAGTCTCTTACCCGCTTCAATAGTCGATTTGCTACTCTTGGAGTCCCTCTAGAACGTTTAGCAAGTTCAATGGCACTTTCTTCATCAATACCTGTGCCTAAAACCTCAGCTGTTCTAATAATGATTTCTTTTAAATCTGATTCATTATAATATTCTAATCTTAAGTGCACACCAAATCGATCCCTTAGTGGACCTGTTAAGCTGCCAGCTCGCGTTGTTGCACCTACCAAAGTGAATGGAGGTAAGTCGATACGGATACTTCTAGCCTCATCGCCTTTACCAATGATAATATCTAAAAAGAAATCTTCCATTGCAGGGTATAACACTTCTTCAACAACACTACTCAGTCTGTGTATTTCATCAATAAACAAAACATCTCCAGGTTGAAGTCCTGATAAAATTGCAGCCAAATCACCAGGTCTTTCTAATGAAGGCCCTGATACTGTACGTATATTAACTTCCATTTCATTGGCAATGATATTAGATAATGTTGTCTTACCTAATCCAGGGGGGCCAAAAAGCAATACATGATCTAATGGTTCATGACGAAGTTTAGCCGCTTTAATAAATACTTCTAAATTACTTTTTATTGAATTTTGACCAATATATTGTCGTAATCTCGTAGGTCTAAGCGACAATTCGAAATCAGTTTCTTCACTATGCATTGATTGATCAACCATACGCTCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP038850|1675445:1684488|1682456_1683482_-|WP_001008435.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNFEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTESKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP038850|1675445:1684488|1683483_1684488_-|WP_001005767.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >NZ_CP038850|1675445:1684488|1681015_1681276_-|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP038850|1675445:1684488|1681294_1682434_-|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP038850|1675445:1684488|1675445_1675964_-|WP_000364542.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_CP038850|1675445:1684488|1678461_1680741_-|WP_000749795.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_CP038850|1675445:1684488|1675985_1678259_-|WP_138081396.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQTIEAIISDTDINHDALQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPGLQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKHQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
1807444 : 1831444
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP038850|1807444:1831444|DBSCAN-SWA ATTATGATTCTTTTTCATTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAATAATGCTGCGCCTGTAATTAGCGCTAATTCTTTTAATGGTAAATCCATTTCTTCAGAACCAGTATTTGGAAGTTCTTTTTCAACTTTGTGCACTTCTTGTTTATCTTCTTTTTTAATAGGCGTACAAACTTTTGGAGCAGGTTGCCCCACTTTTGGTGATACATTCGTCACTTCAGCTGGCAATTTAATTGCTAAAATTTCATCAACAATGAATTGCGTATGTTGTTTGATGTCATTTAATGTCGCATCTTCATCAATCATTCTATTGCCATCTGCAACATATTGATCAATTAATGCTTTTACTTTAGCTAATTGTTCTGGTGTTGCGATTGATTTGAATTTCGCATATGTTTGTTGAGCAATGTTATCAATGCGCAGTAAGCTATTTTCTTTTTCAGTAATTACTGCTTCTATATCGCCTAATGCAACTTTAAATCGTTTTAAAACTGCATCAACATCAGCATTAGTGCGTGCTATTTTTAATTCTTCATCCATTTGTAATTTTAATGCAGTTATAGCTTTTAATGCATCAGCCTTATTACGATCACTTACTTTTCGATAATTTTGCACTAAATGTGTAACACGTGCAAGATCATCATTAATCGTTTTTTCAGCATCTGGCTTTTTAATAGGATGTACATCTAAATCATGTATTGTTTGTAGATTTAATGATGCTGTTTTATCAACTTGTGCATTGCTACGATCTTGATCAATTTGTCCAATAGCAGTGTCATAAATGTTTTGTAACTGCGCTAAAATACTATTTCTTTCTTCTACCGTTGCTTGAACATTCGCTTCAATTGCTTGTTTTTTATCATTGAGCAATGTTGTTAATTGTTCTCGCGCAGTTGATTTTCTATTAATAACAGGTTCAATTTCACGAATTTCATTTTTACCATCATGCAATAGATATGCTACATCAGCATTCGTCACTGCACTTGCAATTTGTTGTTTCGCTTTTATTAATGCTTGTTCTACTTGTGCTATTGCAGCATTTTGTTCTTCATCTGTCGCTTCATTATTTGCTTTAATTAAATTTATTTTATTTGTAGCGATATTTTGAATTTGTTGTAGTGCTGTTGTTTTAACTGTTGTCGCTGGTTTAATTTGTGAAATTATCTTTTGAGCATCGATACTATTTTGATTAACTTGTGCAGTCTTATCAGCATGATTAATCTGATCAATAGCCTGATTAAGTGCTTGATCTACTAAATGTTTAGCAGCTAATCTTTCTTCTTCGGTAGATAAATCACTTTGATCAATAAGTGCATTTTGAGCTTCAGCTTTTGCGCTAACAGAATGACGCGCTGCTGGTTTAACTTGAACTTTAGGTAAAATCACTTTGATGTTATTGTTACCATCCGCCTCAGTTTGATCCACTTCTGCATTCGTTTTGTTTTGCGCAATGTCATTTTTGATAGTATTTACAATTTTATTTAACTCAGCAATAGCAATATTTCGTTCATCTTGCGTAGTATCTAGCGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGGTTATTATTACTTTCATCAATGTTATCCAACGCTGCACGTTTGCGTCTAACTTTCGGTTTAATTTGTTCGATTGCCTTAATCGTTTGATTTCTAACATCATTTACAGCTACATCTTGTGTTGTATTGTCTATATCTTGTTGACCTTGTTTAAGTGTGTCGTTTATTTGTTGGTTTGCTTCATCTAATTCATCAGTCGTAGCATGTGGTGTATCTTTTATAGATTCTACTTGATTATCTGCGCTCGCTTTTATGGCTTGTTGAGCTTCAGGTTTAACCACAATGTGCGGTTCTACGCCTTTTAACGTAGCAATACCATTTGATTCAACACGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCTATTTCTTGCTTTTTAGCCTCATATTGTTGCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAATAATATGGTCAGGCGTCACTAATGCAATGTCTCCAAGCGCTTGATTTGTTGAGTCGTTAACTTGCTGATCTGTTCTATCACTCGTGATATTTGTCATAGCTTGAGTAACTAAATCATTGATTTTATCTAACGCCGCTTGTCTTTCTTCTGCTGTCGCTTCTTTATCTTGATTGATTTGCGCACGTAATTCATTCGCTTTTTGATTGATTTTTTCACGTGCTGCTGGTTTAACTCGAGTTTCAGGTTGAATAATTTTTATCGCAGTTATACCATCTGTTGCCGCTTGATTCACTTGCTCGTTCGTTTGAGCTTGTTCAATTGCTACAAGGGCTTTTTCTTTTTCTCTAGCTAATGCTTGTGTAGCAACTTCTTTCTCATTATCTGTTGAATCAATACTATTATCAATTTGCTGTTGCTTTTCTTTAACAGCTTTTTCAATATCTGCAATTGCCTTTGGTTTAATTACTACTTCAGCTTCAACATTGTCTATAGCATTTATCGCTTGATTTGTAGTTGCGTCTACCTGATCATTTGTTTGGTTTTGATTAATTTGGTTAAATGCTTGATCTTTAAGTTGATTGATTTGATTAACAGCAGCCTGCTTTTCTTCATCAGTTGCATTAGGTGTTTGTTTAACCGCTTCAATACGTTTCGCCACTTCAGCAGTGATTTTATCTCGTGCTGCTTGCTTTTTCACTACGTCAACTTGAACAGCATCAATATTATTTTCTGCTGTTATCGCAGCTTGGTCTACTTCATTATTGGTATTCGCTTGATTAAGACTTTCAATAGCTTGTTGTCTGTCTTGATTCAACGTATTAATTGCAGCATTTTTCTCATCATCTGTTGCATCTGGTGTAGCATTGATTTCAGCTAATTTAGCATTATAATGCTGATTGATTTGTGCTAATGCTGCAGGTTTTTTTACAATATTTGGCTGAATCGCATTAATTGCTTGTGCACCTAATTGTTGCGCTTGATCTACTTCCGCGTTTGTATCAGCTTGATTTATATTATTAAGTGCAGCTGCTAATTCTTGGTCTACTTGATTTAATGCTATTTGCTTTTCTTCAGTTGTTGCATTTGTATTTTGATTAATTTCTTGCTTTTTAGCAGTTGCTAAATCGTTTAATACACCTGTAGCTGTTTGCTTCTTAGTTACATGCGGTTGAACAGCACCGATTTGATTGACTGCATCGTCTCTAATGCTATTGACCATCGCAGTAGTAGACGTCACACCGATATCAGTTAATGCTCTATTTTTAAGTGCATTGACACGATCTATCGCTTCTTGTTTCTCTTCTCGAGTCGCACCAGGTGTAGCATTGATATTTGTTATCACCTCACGTGCTTTTTCATTTACAGTATTACGAGCATCCGTTTTAACTTGTGTCGCTGGTTGAATCACAACTATATTTTGCATACCTTGATCTTTTGCTTGTGCAACTTCTTGATTCGTATCTGCTGCATTAATATTTTGCTTCGCTGTGGCTACAGCTTGATCAAGCAATTGTTGTGCTGCTTGTTGCTCTTCTAAGGTCGCATCATTATTATTAAATATCGCATTATGTTGCGTTTCAGCACTTTGATCAATAGCATTTTTAGCATCTGTTTTAACCTTTGTAGCTGGTTCAATGGCTTGTATACCTTGAATTGCATTTGTCTTCACTTGCTCCACATCTGCATTGGTATTAGCATTTAAAATGTTAGCATTCGCAGCAGCTACAGCAGCATTTACTTTGTCAATCGCTGCCTGTCTTTCTTCTTGAGTCGCATCAGGATTAGCATTGATCTCAGCGATATGTTGTTGTGCATCATGTGATACGGCATCTCTTGCTGCCTGCTTGACAACAGTTACAGGCGCAATAGGATTAATGGCATTCAGACCATCACCTTTGGCTGTATCCACATCATCATTGGTTGTCGCTTGATTGATTTGCTCTAAAGCGTGGTTCGTAGCTTGCGTTAATTCATTCAATGCTGCATTTTTCTCTTCTTGTGTTGCTTCTCTATTACTATTTATCTGTTGTCTTTTTGTTGCTGTTGCTTGGTTAATTGCATCTCTTGCTGCTTGTTTGTGTGTTACTTGAGGGACAACAGCTCCAATAGTATTAATACCATTATTTTTAGCTGTTTCAACATCAGCATTGGTAGTAGCATTCGTAACATTATCAATAGCATCTGTTTCATCCGTTGTTAATTGATTTAATGCATCTTGAATTTCATCTTGAGTAGCATCTGGTGTGTTATTGATAATTTCTCTTTGTTTCGCAGCTTTATCACGTATTGCTTGTTTAGCATTTGGTTTAACAACTGGTGTTGCAGTGTCTCTACTTAAAGTCTGTATACCTTGATCTTTAATTCTAGTAACACCATCATCAGTCGTTTGGTCACCAATATTTCCAATAATTTCATTTTTATGTTCCTCGATGACTTGAATCGCTGCTTGTTTTTCTTCATCTGTCAGTTCATCATTTTGGTTAACTAAATCTTCCATGTCATCAACTTTTCTATTAACGGCATTTTCAGCGTCAACACTTCGAATTAACGTATGTTGCATTTGATTTGCTAATGAATCGATATCTGCCTGAGAAACTCTTTTGTTTAAAGGTACATTGTTACGGTTTTCATCTAAAATTGTTTGTGCGCGTCTTTTAAGATCATTAAAAATATCTAATGATGCAAATGTATAATCCGCTTGTTGAATACGTCTATCAACTTCAGCTTGTAGTGCGTCTTTATTCATGATGATATCGATTGTATACGGTTCAGTGCTTACTGTATGACTTTCTGCAGGTGAATTAATAAAATCTTGTGAAAATGTTTTATACGTTAACGTATCGTTAAATGTTACTGTTCTTGGTGTTGGCACATTGTTCACACGTAGCTTATACTTCAAATCCAATATTTTATCAGGCATAAGTCGTGCCGGTGAATTCCCTGAACCT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>NZ_CP038850|1807444:1831444|1817377_1818559_-|WP_001025067.1|DBSCAN-SWA MNIPKSVWWLVIGMALNITGSSFLWPLNTIYMKQELGKSLTVAGLVLMINSFGMVIGNLLGGSLFDKLGGYKTILIGTFTCLCSTTLLNFFHGWPWYAVWLVMLGFGGGMIIPAIYAMAGAVWPNGGRQTFNAIYLAQNIGVAVGAAMGGFVAEFSFNYIFLANLIMYVVFALVAVTQFNIEINAKVKYPTHLDITGKKNKARFISLVLICAMFAICWVAYIQWESTIASFTQSINISMAQYSVLWTINGIMILVAQPLIKPVLYLLKGNLKKQMFVGIIIFMLSFFVTSFAENFTIFVVGMIILTFGEMFVWPAVPTIANQLAPDGKQGQYQGFVNSAATVGKAFGPFLGGVLVDAFNMRMMFIGMMLLLVFALILLMVFKENNTQPKKIDA >NZ_CP038850|1807444:1831444|1821379_1822207_-|WP_000266092.1|DBSCAN-SWA MWKWEAENDAKGVVVIAHNILEHTGRYAYVITMLRRNGYHVIMGDLPGQGQTSRANKGQIENFQTYHESLLDWLKIANEYKIPTYVLGVGLGGLILLNLLEKVELPIEGMMLISPMLELQKNGKNRKDKLVSNIGKISKDARFNVGVEPKDLTRNLEIVEETVNDGLMLKKATYHWYNTINETMKDTMAHIHDIQPMPTLLMYGTKDLIVDTRAIDEFKEKYQTPELYFKAWQGFYHEVHNEPERDEVMRYILTFLNNSVNTMGFIVEDDEIVEI |
19 | Staphylococcus_phage(100.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
1839833 : 1859874
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP038850|1839833:1859874|DBSCAN-SWA 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25 | Staphylococcus_phage(95.24%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_11 |
1866893 : 1877713
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP038850|1866893:1877713|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP038850|1866893:1877713|1875930_1876650_-|WP_000821657.1|DBSCAN-SWA MKRILIIVVLLFCYSQNHIATADVGVLNLRNYYGSYPIEDHQSINPENNHLSHQLVFSMDNSTVTAEFKNVDDVKKFKNHAVDVYGLSYSGYCLKNKYIYGGVTLAGDYLEKSRRIPINLWVNGEHQTISTDKVSTNKKLVTAQEIDTKLRRYLQEEYNIYGFNDTNKGRKYGNKSKFSSGFNAGKILFHLNDGSSFSYDLFDTGTGQAESFLKIYNDNKTVETEKFHLDVEISYKDES >NZ_CP038850|1866893:1877713|1870187_1870949_-|WP_103150125.1|DBSCAN-SWA MTDQPSYYSIITANVRYDNRLTDSEKLLFAEITSLSNKYGYCTASNGYFAKLYEVTKVTVSRRIANLKECGYLHVEIIRNGNEIKQRKLYPLTEMIRPINTNDNTPINNSVNTPIITNVKENNTSINNTSNNNINRIDILSGNPTRIPYKEIIDYLNEKTGKKFSHKSKANQKLIQARFNEDNSKEDFFTVIDNMTAQWKGNPKMDEYLRPKTLFSGNFDNYKNQTAKFNNESNQYVDAFQRASQSSIENLPF >NZ_CP038850|1866893:1877713|1869036_1869222_-|WP_138081409.1|DBSCAN-SWA MPKEKYYLYREDGTEDIKVIKYKDNVNEVYSLTGAHLSDEKKIMTDSDLKRFKGAHGLLYE >NZ_CP038850|1866893:1877713|1868396_1868582_-|WP_072472664.1|DBSCAN-SWA MQQQAYINATIDIRIPTEVEYQHFDDVDDEKDTLAKRLDDNPDELLKYDNITIRHAYIEVE >NZ_CP038850|1866893:1877713|1869234_1869393_-|WP_017804771.1|DBSCAN-SWA MITKEFLKTKLECSDMYAQKIIDEAQGDENKLYDLFIQKLAERHTRPAIVEY >NZ_CP038850|1866893:1877713|1873449_1874205_-|WP_101273946.1|DBSCAN-SWA MRLFYIAAIIITLLCLINNNYVNAEVDKKDLKKKSDLDSSKLFNLTSYYTDITWQLDESNKISTDQLLNNTIILKNIDISILKTSSLKVEFNSSDLANQFKGKNIDIYGLYFGNKCVGLTEEKTSCLYGGVTIHDGNQLDEEKVIGINVFKDGVQQEGFVIKTKKAKVTVQELDTKVRFKLENLYKIYNKDTGNIQKGCIFFHSHNHQDQSFYYDLYNVKGSVGAEFFQFYSDNRTVSSSNYHIDVFLYKD >NZ_CP038850|1866893:1877713|1866893_1867193_-|WP_138081403.1|DBSCAN-SWA MIQPTREELINFMKKHGAENVDSITDEQSAIRHFRAQSKVFKDERDEYKKQRDELIVDIAKLRERNEELENMWRTVKNELLGRYEHYCFKFRELHPESK >NZ_CP038850|1866893:1877713|1867192_1867384_-|WP_000983947.1|DBSCAN-SWA MMQTYKVCLCIKFFASKCDYKLKKHYFVKSTNEEKATNMVLKLIRKKLPFETASIEVEKVEAI >NZ_CP038850|1866893:1877713|1876930_1877713_-|WP_010922839.1|DBSCAN-SWA MKNSKVMLNVLLLILNLIAICSVNNAYANEEDPKIESLCKKSSVDPIALHNINDDYINNRFTTVKSIVSTTEKFLDFDLLFKSINWLDGISAEFKDLKVEFSSSAISKEFLGKTVDIYGVYYKAHCHGEHQVDTACTYGGVTPHENNKLSEPKNIGVAVYKDNVNVNTFIVTTDKKKVTAQELDIKVRTKLNNAYKLYDRMTSDVQKGYIKFHSHSEHKESFYYDLFYIKGNLPDQYLQIYNDNKTIDSSDYHIDVYLFT >NZ_CP038850|1866893:1877713|1874243_1875014_-|WP_000764690.1|DBSCAN-SWA MKLFAFIFICVKSCSLLFMLNGNPKPEQLNKASEFTGLMDNMRYLYDDKHVSETNIKSQEKFLQHDLLFKISGSKILKTEFNNKSLSDKYKNKNVDLFGTNYYNQCYFSSDNMELNDGRLIEKTCMYGGVTEHDGNQIDKNNSTDNSHNILIKVYENERNSLSFDIPTNKKNITAQEIDYKVRNYLLKHKNLYEFNSSPYETGYIKFIEGSGHSFWYDLMPESGKKFYPTKYLLIYNDNKTVESKSINVEVHLTKK >NZ_CP038850|1866893:1877713|1867380_1867773_-|WP_001062709.1|DBSCAN-SWA MAKIKRKKKMTLLELVEWAWNNPEQVESKVFQSDRMGTLGECSEVHFSTDGHGFYTKVVTDKDIFTVEITEEVTEDTEFDCLVELNDIEGFEIYENDSIRELIDGTSRAFYILNEDKTMTLIWKDGELVV >NZ_CP038850|1866893:1877713|1868036_1868396_-|WP_138081406.1|DBSCAN-SWA MSIVKINGKPYKFTEHENELIKKNGLTPGMVAKRVRGGWALLEALNAPYGMRLAEYKEIVLSKIMERESKERELARQRRKEAELRRKKPHLFNVPQKHSRDPYWFDVTYNQMFKKWQEV >NZ_CP038850|1866893:1877713|1875167_1875896_-|WP_000713843.1|DBSCAN-SWA MKKFKYSFILVFILLFNIKDHTYAQGDIGVGNLRNFYTKHDYIDLKGVTDKNLPIANQLEFSTGTNDLISESNNWDEISKFKGKKLDIFGIDYNGPCKSKYMYGGATLSGQYLNSARKIPINLWVNGKHKTISTDKIATNKKLVTAQEIDVKLRRYLQEEYNIYGHNNTGKGKEYGYKSKFYSGFNNGKVLFHLNNEKSFSYDLFYTGDGLPVSFLKIYEDNKIIESEKFHLDVEISYVDSN >NZ_CP038850|1866893:1877713|1868586_1868991_-|WP_000049798.1|DBSCAN-SWA MSKYNAKKVEYKGIVFDSKVECEYYQYLESNMNGTNYDRIEIQPKFELQPKFGKQRPITYIADFSLWKEGKLVEVIDVKGKATEVANIKAKIFRYQYRDVNLTWICKAPKYTGQEWMVYEDLVKVRRKRKREMK >NZ_CP038850|1866893:1877713|1869389_1870175_-|WP_138081412.1|DBSCAN-SWA MESFQNLAKKPTLKKQIIEQAFDLKCENCGRKYDYYKFDDGSEFKHGCDCEMIEYAKQSTENYHKRNRRRKAERIFKQSIMNEDLTKATFDNYNPTNSQLKYAKNLCERYANNFTLDNKQSLLIQGSFGTGKSHLSMSIVKSVKAKGYTVLYMNVPQLISTIKNTYNNQTAMTEQELAQIISDVDLMVFDDYGINMNEFATSKMFELIESRIGKHNIFTTNLDEKEMTRNKDLQRIFSRIMSNTTLIKMDGQDYRTRGLKI >NZ_CP038850|1866893:1877713|1871987_1872173_+|WP_001795217.1|DBSCAN-SWA MTLALLRKLTIHCISVKLTENSDYLDRFTSRVLKNCTFLNNHKCTLLNYHFHWRIMSTKRL >NZ_CP038850|1866893:1877713|1872390_1873167_-|WP_000736712.1|DBSCAN-SWA MKKLSTVIIILILEIVFHNMNYVNAQPDPKLDELNKVSDYKNNKGTMGNVMNLYTSPPVEGRGVINSRQFLSHDLIFPIEYKSYNEVKTELENTELANNYKDKKVDIFGVPYFYTCIIPKSEPDINQNFGGCCMYGGLTFNSSENERDKLITVQVTIDNRQSLGFTITTNKNMVTIQELDYKARHWLTKEKKLYEFDGSAFESGYIKFTEKNNTSFWFDLFPKKELVPFVPYKFLNIYGDNKVVDSKSIKMEVFLNTH >NZ_CP038850|1866893:1877713|1867787_1868036_-|WP_016528724.1|DBSCAN-SWA MPKTDSACKEYLNQFFGSKRYLYQDNEQVAHVHEVNGTYYFHGHYKTMFKGVKKTFDTAEELEIYIKQHDLEYEEQKQPTLF |
18 | Staphylococcus_phage(75.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_12 |
1955554 : 2055316
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP038850|1955554:2055316|DBSCAN-SWA CTTACGCGTCCTCCTCATTCATGATTGTAGGCACTTTAAATTGTCCATCTTCTGTTTCTTTGGCATTTTTCAAAGCTAATTCTTGCGGAATACCTTTAATTGCTTTATCTTCACGTAAAACGTTTTGTAAATCTAAAACGTGATATGTAGGTTCAACGCCTTCTGTATCAGCGCTATCATTTTGTTTTGCAAAATCTAAAATGCTTTCTAATGTGTTGGCCATTTCTTCCGTTTCTTCAGGAGAAATTTGAAGTCTTGCAAGATTCGCGATATGCTCAACTTCTTCACGTGTTACTTTTGTCATTAATAAAAGCCTCCTTTAAGTCATTCATCACTAAATTGTATCAAATTTCCAATTAAAAATCTAAGTATTTATGAGGTACTACTTTAATTTCATATAAACTGTATAAACATTATCATTCATTTATCAAATCATTTTTTATAAAAACAACACCCTTTAATATTAGACAACCCAATTCAATATTATGATTATGCAATTTTAATTATAAAAATTTGCCCATATCCAAAAAATACGAAAGCGTTTTCTATATTGATATACAAGTATTTCAAAAAGAATAAATTTAATTTTCCTACTTTTCTAAACATTTATCTTTATGTATAATGTTTTCAAGTAACTAAATTATAAATTAAATAAAGGGAGTGTTTATCATGCTTACAATGGGGACAGCATTAAGTCAACAAGTAGATGCCAATTGGCAAACTTATATTATGATTGCCGTCTACTTTTTGATACTAATCGTTATTGGCTTTTACGGTTACAAGCAAGCAACTGGTAACCTAAGCGAGTACATGTTAGGTGGACGTAGTATTGGACCGTATATTACTGCATTATCAGCTGGAGCTTCAGATATGAGTGGATGGATGATTATGGGTCTACCTGGCTCTGTCTATAGCACTGGTCTATCAGCTATGTGGATTACAATCGGTTTAACATTAGGTGCTTATATAAATTACTTTGTTGTTGCTCCTAGACTTCGTGTTTATACCGAATTAGCTGGAGATGCAATCACATTACCAGATTTCTTTAAAAATAGACTAAACGATAAAAATAATGTTCTAAAGATTATTTCTGGATTAATTATCGTTATATTCTTTACTTTATATACACATTCTGGTTTCGTATCTGGTGGTAAATTATTTGAAAGTGCTTTTGGATTAGATTATCATTTCGGTTTAATATTAGTTGCTTTCATTGTCATTTTCTATACTTTCTTTGGTGGATATTTAGCTGTATCAATTACAGATTTCTTCCAAGGTGTCATTATGTTAATTGCGATGGTTATGGTCCCTATTGTTGCTATGATGAATTTAAACGGCTGGGGAACGTTTCATGATGTAGCAGCTATGAAACCTACAAATTTAAATTTATTTAAAGGGTTATCATTTATAGGAATTATCTCTCTATTTTCATGGGGATTAGGTTATTTCGGTCAACCTCATATCATTGTAAGGTTTATGTCTATTAAATCACACAAGATGCTACCTAAAGCTAGACGTTTAGGTATTAGCTGGATGGCAGTTGGTTTGTTAGGCGCTGTGGCTGTTGGTTTAACAGGTATTGCATTCGTACCTGCTTATCATATTAAACTAGAAGATCCTGAGACATTATTCATCGTGATGAGTCAAGTACTCTTCCATCCTCTTGTAGGTGGTTTCTTACTTGCTGCGATTCTAGCTGCAATTATGAGCACGATTTCTTCACAATTACTTGTAACATCTAGTTCATTAACGGAAGACTTTTATAAATTAATTCGTGGTGAAGAAAAAGCTAAAACGCACCAAAAAGAATTTGTTATGATTGGACGTTTATCTGTATTAGCAGTAGCAATCGTTGCTATTGCAATTGCATGGAATCCAAATGACACAATACTAAACTTAGTAGGTAATGCTTGGGCCGGATTTGGTGCATCGTTCAGTCCACTTGTGCTATTTGCACTTTACTGGAAAGGTTTGACACGTGCCGGTGCTGTAAGTGGAATGGTTTCAGGTGCCTTAGTCGTTATCGTTTGGATTGCGTGGATTAAACCATTGGCACATATCAACGAAATATTCGGCTTATATGAAATTATTCCTGGATTTATTGTAAGTGTAATCGTTACATATGTTGTAAGTAAACTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTCTGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTATAAATGTGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCTCGTGGTTGGTTACCATCTTTAATACGAATTTCATAGTTATCGATTTTATCGAAATATTTATTCGCTTGTTCAGTAACGTACTGTGTAATACCAATTGTTTCAGCTTGTCCATAGTAATCGATTGGTAAATCTACTACTAATCGTTGTGGCTTTTTATCAACAAATTTAACTTTCCCTACTGCTTGTGTGAAATTAGAAAAATATGATTGCAAATTATCATTAAATTGCTTGAAATTATTATTTAAATTTTCATCATAATCTGCTGCTGTTGAAGAAGGTAATAAAGCTGATTTTTCATTGATATTATGCCATTCATTAAGCTTTGTTTGACTCTTTTCTGCAGTCGCTTGAGTGATAAATTCACCTGGTGTGATTGAATCTTCACTTGATTGCTTATAAATTGCAAAATGAATTGGTATATCTTTTAAATCATCATTTTCACGTAACCTTGATAATATCTCACTAGCCATTTGTTTACCTTGCTTTTTAACTTCGCTATCATCTAGTTTTTTACTAAAAGTCGGTCCATCTTTTTCTTTTTTATAGTAATAAACACTATTCATAGCTAAACCAATCGTCATACCTTTAATATTCTTACCTTTTGTATCTCCACCACCATAAAAATCTTGCTCTAAAATGTTAGATAAATAGGCTGGTGATTTTTCTGCAATCTTTTCAGGATCTGTTTCACCTTCGTGTGATGGATTAAGTCCTAAATTTTCATTCGCTTTCTTGTCTTTTTTATCTTTTTCAGACATTTTATCGATTTCACGTTTTGTATACTTAGGATTTAAATAGGCATTAATTGTTTTCTTGTCCAAAAATTGACCATCTTGATACAAATATTTATCTGTTGGAAATACTTCTTTACTTAAGTTCAATAAACCATCTTCAAAGTCGCCGCCATTATAACTATTTGCCATGTTATCTTGTAAAAGTCCTCTTGCCTGGCTTTCTTTAAATGGTAACAATGTACGATAGTTATCACCTTGTACATTTTTATCCGTAGCAATTTCTTTTACTTGATTTGAACTATTGTTATGTTTTTGATTATCTTTTCCAGCCTGGTCATCCTTATGGTTACCACAAGCAGCGAGTATAAAGATAGCTGTAATCAATAATACTAATGTACGCTTCATCGACATACCCCTCTAACTATTTAATTCATTTTGCTTATCTACAAATTGTTGCTCTGTCCAAATTTCAATACCTAAACTTTGTGCTTTTGTTAATTTTGAACCTGCATCTTCACCAGCAATAACGACATCTGTATTTTTAGTAACGCTACTTGTAACTTTAGCACCTTGTGATGCAAGCCATTTAGATGCTTCATTGCGTGTCATTTGATGTAGCTTACCAGTTAGTACTATCGTTTTACCACTAAATTCAGGATGTCCTTCAATATCTGATGTTTTGATACCTTTATAAATCATATTAACATGTTTATCTTTTAATTTTTGAATTAAAGCACGAATATCTTCATTTTCTAAGTAAGTAACTACAGATTGTGCTACTTTATCACCTATATCATGAATTTCTACTAATTCCGCTTCAGTTACCGTTAGTAATCGATCTATCGTTTCATATTTTTCTGCTAACACTTGGCTCGCTTTAACACCTAAATGCCTAATACCTAGACCAAATAATAAATTTTCTAAAGAGTTGTCCTTAGCTTGTTGAATGGCAGCTAATAAATTATCAACTTTTTTCTGCCCCATTCTGTCTAAAGGTAATAAATCTTCTTCTGTTAAATAGAAAATATCAGCAACATCTTTAATTAATTCACTTTGATAAAGCTGTTGAATAATTTTAGTGCCTAAACCATCAATATTCATGGCTTGTCTTGATACAAAGTGAATCAATCCTTCAACAAGTTGCGCTTGACATTTTGGATTAATGCAACGAAGTGCTACTTCGCCTTCAATACGTACTAATTCATGTCCACAACTTGGACAATGGGTTGGCATATGATATGTGACAGCATCCTCAGGTCTACGTTCTGGAATACTACGTACAACTTCAGGTATGATGTCACCTGCTTTTTTCACTACAACACTATCACCAATTCGAATATCTCTGTCATGAATTAAATCCTCATTGTGCAAAGATGCTCTTGATACAGTTGTACCAGCTACTTTTACTGGTTCTAAAATAGCAGTAGGTGTGACTACACCTGTTCGTCCAATACTTAATTCAATATCTAATAATTTAGTTACTACTTCCTCAGCTGGAAATTTATAAGCAATGGCCCATCTAGGAGATTTTTGTGTGAATCCCATCTCATCCTGTTGATCTAAATCATTAACCTTAATAACAATCCCATCAATATCATAAGGTAATGACTCTCTTTGGCTTGTCCATTTTTCAATATACTCTAAAACACCATCGATATTATTTACACGCGCTCTATTTTTATTCGTTGTAAAACCTAATTTATCTAACTCATCTAATGCTTCACTTTGCGAACGCGCATTGAAATCAGTGAAATCATTGACACTATATATAAATACGCTTAGCTTTCGTTTTGCCGTTAATTTAGAATCTAACTGTCTTAATGATCCCGCAGCAGCGTTTCTTGGATTTGCAAATAACTGCTCATCATTTTTTTCTTTTTCTTCATTTAATCGTAAAAATGAACGTCTC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113 | Staphylococcus_phage(78.08%) | integrase,tRNA,holin,terminase,capsid,head,protease,tail,portal | attL 1948984:1949000|attR 2056802:2056818 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_13 |
2747719 : 2827762
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP038850|2747719:2827762|DBSCAN-SWA 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MTKKYLNTQNEISAFWNTQKIFKKSIDNRKGQESFVFYDGPPTANTLRSVHKRIYSCNEYR |
70 | Staphylococcus_phage(70.27%) | tRNA,terminase,transposase,capsid,head,protease,tail,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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