Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP039168 | Staphylococcus aureus strain R50 plasmid pR50, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP039167 | Staphylococcus aureus strain R50 chromosome, complete genome | 9 crisprs | cas3,DEDDh,DinG,csa3,WYL | 6 | 2 | 12 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP039167_1 | 230452-230585 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039167_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP039167_1
>1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder CAAAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGGTAA >1.2|230530|33|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder TAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCATACAATAATG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039167_1
The CRISPR arrays of NZ_CP039167_1 >merge|NZ_CP039167|1|230452-230585|CRISPRCasFinder TGTTATATTGGCGGGCCCCAACACAAAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGGTAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCATACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACA >NZ_CP039167|1|1|230452-230585|CRISPRCasFinder TGTTATATTGGCGGGCCCCAACA CAAAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGGTAA TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACA TAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCATACAATAATG TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACA
>NZ_CP039167.1|WP_000163981.1|228950_230387_+|6-phospho-beta-glucosidase MTKLPQNFMWGGALAANQFEGGYDKGGKGLSVIDVMTSGAHGKARQITEFIDPNHYYPNHEGIDFYHRYKEDIALFKEMGLKCLRTSIAWTRIFPNGDEDVPNEEGLAFYDRIFDELIAQGIEPVVTLSHFEMPLHLAKHYGGFRNREVVDYFVHFARVVFERYKDKVTYWMTFNEINNQMDTSNPIFLWTNSGVALTENDNPEEVLYQVAHHELLASALAVRLGKEINPKFKIGTMISHVPIYPYSCHPKDMMEAQIANRLRFFFPDVQVRGYYPSYAKKMLARKGYDVGWQEGDDSILQQGTVDYIGFSYYMSTAVKHDVDTTVENNIVNGGLNHSVENPHIATSDWGWAIDPDGLRYTLNVLYDRYQLPLFIVENGFGAVDEVVDGHIHDDYRIEYLKAHITAAIEAVDQDGVDLIGYTPWGIIDIVSFTTGEMKKRYGLIYVDRDNDGHGTMERLKKDSFYWYQQVIASNGDKL >NZ_CP039167.1|WP_000066934.1|228143_228935_+|hypothetical-protein MSNKYKEQAQDILTAVGGVENIVDATYDTKCITIHMQHTIPSTANEVKQIVDVTSVAENDAQLVIKLNGNVDEVYQQLQRLIKNANVEESENTDNINSQDTSYTPQVKVTTPILVKAPIAGRRILLKEVRDSIFREKMVGEGLAIKAHEESKVIAPFNGLVSMIVPTKHAVGIQSEDGVDIVIHIGVNTVDLEGKGFKCFVKQNDRVEAGQTLLQFDQQYIQQQGYNADVIVVISNSADLGKVELTMNEIITTEDVIFKIFKN >NZ_CP039167.1|WP_000922333.1|227290_227995_-|GntR-family-transcriptional-regulator MLKYEHIAKQLNAFIHQSNFKPGDKLPSVTQLKERYQVSKSTIIKALGLLEQDGLIYQAQGSGIYVRNIADANRINVFKTNGFSKSLGEHRMTSKVLVFKEMATPPKSVQDELQLNADDTVYYLERLRFVDDDVLCIEYSYYHKEIVKYLNDDIAKGSIFDYLESNMKLRIGFSDIFFNVDKLTSSEATLLQLSAGEPCLRYHQTFYTMTGKPFDSSDIVFHYRHAQFYIPSKK >NZ_CP039167.1|WP_000062632.1|224773_227065_+|nitric-oxide-reductase MSMQSSYKRLVKVLLTILVIVFSILLVGGWYIFKNEAPRPTKIVDQQGHTLVTKDELISGQAIYEKYGLTDYGSYLGNGSYLGPDYTAEALHHYLIGMRKYYAQDIYHKQLHKLNHAELAVVKDKVMKEIRINRYSEKEDQLVLTPGQVYGLKYLQDYYKEEFVNNPKQVGLNENMIKQFQNDDYMVAGNKVEHLSQFFFWGAWLSSTDRPGKTFSYTNNWPYDVDAGNTLPSAGILWTAISVTLLIAGLASIIYIQKRYQFDMKPTYESERELPKSEVDRKITDSQRKVGKYLVVVMLLFLVQILLGELLAHYYVENKFFGIEIQRLFPFNIAKTWHVQLVIFWVATTWLAAGIYIVPKVLGKEPKKQGVLVDILFWALIIVVMGSMIGEWGHILGWIDSHWWLFGHFGWEYIELGKFWQILFIVGMILWVIILCRGFLPAIRNKVQVNHDKRHLLTLLFVGAIAIPLFYLASLFIMPNSHVTFADYWRWWIVHLWVEGIFEAFAVVLIGFLMVNMKLTTIETTIRALYFQLILLLGTGIVGMGHHYYWQGDHSIWLALGSCFSALEVVPLCLLIWEAYTHYRLYKNSDIAFPYKGTFIFLASTGLWNAIGAGALGFLINTPAVNYFEHGTQWTAAHAHGSMAGVYGMFSIAIALYVFKNITKKEFWTPKVEKWIKISCWALNIGLAGMVFVTLMPVGYIQLKDALEHGYWHSRLTSFYEQPLVKAIMWGRMPWDIIFTVGVIILVVIFIRGYRHLKPKYRV >NZ_CP039167.1|WP_000607067.1|223732_224434_+|antiholin-like-protein-LrgB MINHLALNTPYFGILLSVIPFFLATILFEKTNRFFLFAPLFVSMVFGVAFLYLTGIPYKTYKIGGDIIYFFLEPATICFAIPLYKKREVLVKHWHRIIGGIGIGTVVALLIILTFAKLAQFANDVILSMLPQAATTAIALPVSAGIGGIKELTSLAVILNGVIIYALGNKFLKLFRITNPIARGLALGTSGHTLGVAPAKELGPVEESMASIALVLVGVVVVAVVPVFVAIFF >NZ_CP039167.1|WP_001792906.1|223296_223740_+|antiholin-like-murein-hydrolase-modulator-LrgA MVVKQQKDASKPAHFFHQVIVIALVLFVSKIIESFMPIPMPASVIGLVLLFVLLCTGAVKLGEVEKVGTTLTNNIGLLFVPAGISVVNSLGVISQAPFLIIGLIIVSTILLLICTGYVTQIIMKVTSRSKGDKVTKKIKIEEAQAHD >NZ_CP039167.1|WP_000645452.1|222443_223184_+|DNA-binding-response-regulator MKALIIDDEPLARNELTYLLNEIGGFEEINEAENVKETLEALLINQYDIIFLDVNLMDENGIELGAKIQKMKEPPAIIFATAHDQYAVQAFELNATDYILKPFGQKRIEQAVNKVRATKAKDDNNASAIANDMSANFDQSLPVEIDDKIHMLKQQNIIGIGTHNGITTIHTTNHKYETTEPLNRYEKRLNPTYFIRIHRSYIINTKHIKEVQQWFNYTYMVILTNGVKMQVGRSFMKDFKASIGLL >NZ_CP039167.1|WP_000925394.1|220701_222441_+|sensor-histidine-kinase MLLLERVGLIIILAYVLMNIPYFKNLMNRRRTWKARWQLCIIFSLFALMSNLTGIVIDHQHSLSGSVYFRLDDDVSLANTRVLTIGVAGLVGGPFVGLFVGVISGIFRVYMGGADAQVYLISSIFIGIIAGYFGLQAQRRKRYPSIAKSAMIGIVMEMIQMLSILTFSHDKAYAVDLISLIALPMIIVNSVGTAIFMSIIISTLKQEEQMKAVQTHDVLQLMNQTLPYFKEGLNRESAQQIAMIIKNLMKVSAVAITSKNEILSHVGAGSDHHIPTNEILTSLSKDVLKSGKLKEVHTKEEIGCSHPNCPLRAAIVIPLEMHGSIVGTLKMYFTNPNDLTFVERQLAEGLANIFSSQIELGEAETQSKLLKDAEIKSLQAQVSPHFFFNSINTISALVRINSEKARELLLELSYFFRANLQGSKQHTITLDKELSQVRAYLSLEQARYPGRFNININVEDKYRDVLVPPFLIQILVENAIKHAFTNRKQGNDIDVSVIKETATHVRIIVQDNGQGISKDKMHLLGETSVESESGTGSALENLNLRLKGLFGKSAALQFESTSSGTTFWCVLPYERQEEE >NZ_CP039167.1|WP_000608836.1|219767_220442_+|iron-sulfur-cluster-repair-di-iron-protein-ScdA MINKNDIVADVVTDYPKAADIFRSVGIDFCCGGQVSIEAASLEKKYVDLNELLQRLNDVEQTNTPGSLNPKFLNVSSLIQYIQAAYHEPLREEFKNLTPYVTKLSKVHGPNHPYLVELKETYDTFKNGMLEHMQKEDDVDFPKLIKYEQGEVVDDINTVIDDLVSDHIATGQLLVKMSDLTSSYEPPIEACGTWRLVYQRLKALEVLTHEHVHLENHVLFKKVS >NZ_CP039167.1|WP_000975345.1|217902_219624_+|glycosyltransferase-family-2-protein MMKFSVIVPTYNSEKYITELLNSLAKQDFPKTEFEVVVVDDCSTDQTLQIVEKYRNKLNLKVSQLETNSGGPGKPRNVALKQAEGEFVLFVDSDDYINKETLKDAAAFIDEHHSDVLLIKMKGVNGRGVPQSMFKETAPEVTLLNSRIIYTLSPTKIYRTALLKDNDIYFPEELKSAEDQLFTMKAYLNANRISVLSDKAYYYATKREGEHMSSAYVSPEDFYEVMRLIAVEILNADLEEAHKDQILAEFLNRHFSFSRTNGFSLKVKLEDQPQWINALGDFIQAVPERVDALVMSKLRPLLHYARAKDIDNYRTVEESYRQGQYYRFDIVDGKLNIQFNEGEPYFEGIDIAKPKVKMTAFKFDNHKIVTELTLNEFMIGEGHYDVRLKLHSRNKKHTMYVPLSVNANKQYRFNIMLEDIKAYLPKEKIWDVFLEVQIGTEVFEVRVGNQRNKYAYTAETSALIHLNNDFYRLTPYFTKDFNNISLYFTAITLTDSISMKLKGKNKIILTGLDRGYVFEEGMASVVLKDDMIMGMLSQTSENEVEILLSKDIKKRDFKNIVKLNTAHMTYSLK >NZ_CP039167.1|WP_000031256.1|230902_231664_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MSKEAGHTFLAKLGKTRLRPGGKAATDWLIQQGAFSQDKKVLEVACNMCTTSIYLAHTYGCHIQGVDINKKALEKAQENISAAGLESYIQVQQANAVKLPFDDNQFDIVLNEAMLTMLPIAIKEKALREYYRVLKPGGILLTHDIVIVNESHATHVVKSLSAAINVNVSPQTKLGWLDLYNQAGFNHVHYHTGPMSLMTPKGLIYDEGIVGTIKIINNALKKENRPMFCKMFKTMTKLRKDMNYITFVAKKEH >NZ_CP039167.1|WP_031867553.1|231682_231817_+|hypothetical-protein MIIIIINIAYLYAIIWKLERLQKIVTSFITKHESSSIGLVENYF >NZ_CP039167.1|WP_000182738.1|231914_232829_-|ribokinase MTNKVVILGSTNVDQFLTVERYAQPGETLHVEEAQKAFGGGKGANQAIATARMQADTTFITKIGTDGVADFILEDFKAAHIDTSYIIKSTEAKTGQAFITVNAEGQNTIYVYGGANMTMTPEDVINAKDAIINADFVVAQLEVPIPAIISAFEIAKAHGVTTVLNPAPAKALPNELLSLIDIIVPNETEAELLSGIKVTNEQSMKDNANYFLSLGIKTVLITLGKQGTYFATKNQSQHIEAYKVNAIDTTAAGDTFIGAFVSRLNKSQDNLADAIDFGNKASSLTVQKHGAQASIPLLEEVNQV >NZ_CP039167.1|WP_000750483.1|232856_233261_-|D-ribose-pyranase MKKTAVLNEHISKAIATIGHFDLLTINDAGMPIPNDHRRIDLAVTKNLPRFIDVLATVLEEMEIQKIYLAEEIKEHNPTQLQQIKQLISSEIEIIFIPHEEMKSNLAHPLNKGNIRTGETTPYSNIALESNVTF >NZ_CP039167.1|WP_000029204.1|233275_234157_-|ribose-transporter-RbsU MSIVALLIGLGPLIGWGFFPTVASKFGGKPVHQIIGATVGTLIFAIILAVVTSSGFPTGTNLLFALLSGAGWGFGQIITFKAFELVGSSRAMPVTTAFQLLGASLWGVFALGNWPGIGHKIIGFTALVVILIGARMTVWSERKEASNAKNLRRAVVLLLIGEFGYWLYSAAPQATSIDGLTAFLPQAMGMVIVAVIYGFMNMKAENPFRNKITWLQIISGFFFAFGALTYLISAQPNMNGLATGFILSQTSVVLATLTGIYFLKQHKTSKEMVITIIGLVLILVAASVTVFIK >NZ_CP039167.1|WP_000757884.1|234388_235387_-|LacI-family-transcriptional-regulator MKKVSIKDVAREAGVSVTTVSHILNHNDSRFSATTIKNVHAVSERLGYAPNKHAKQLRGSKIQTIGVILPSLTNPFFSALMQSIHDHKPSDVDLCFLTSTATDLYDNIKHLIDRGIDGLIIAQYISSPDALNNYLKKHHVPYVVLDQNDHQGYTDFVRTNEYQGGQLAAQHLIELGHNNMMIVAPYDMMANMSTRVAGFVDTLRANQLPEPQIVHTELSKRGGLTIVDDIMVQSATAIFAINDELAIGILRGLIEHGISIPKDISLIGYDDIDYAAYVSPPLTTVAQPITDIGKTSLTLLLQRLQHLDKSIDMIELPTTLKIRATTGYHLSN >NZ_CP039167.1|WP_001791651.1|235537_235717_+|NADH-dehydrogenase MRRENILLRLIPFNDYDNKNFKMFIVIKNTKVIILKNKIFVFEQSIKKHNEMMYIELCD >NZ_CP039167.1|WP_001159765.1|235766_236159_+|hypothetical-protein MQFKLKEEEIISFLELKYPEKEFEYGRLLVGQHKRDDLDVYYFGDTFLMCTIISFKTFEIKETVELSYDAVNRIVLKDGWLFRKMRIETMQKVLKYGTSKLMLTDFQKENYNKYIQGQKQRVIFENGHFV >NZ_CP039167.1|WP_001066538.1|236286_237663_-|MFS-transporter MNNTQSSPRSNIIIAIMLSALTYWLFAQSFINIGPLVGQTYQTSPAVLNLSISLTSFATGIFMVAAGDIADKIGQLRMTYMGLIISMFASLLLIISDITALLIIGRILQGLSAAILLPSTVGVLNNQFKGDHLRRAISYLMISTVGGIGLAGVIGGLIATNFGWQTNFIISIVIAFIAILLLKGTPEKVSQHSHRHPFDYKGMSIFAVMIGSFTLLLTQGFEQGWFSTFSFICLSIFIITTLIFIIIERRHEVPFIDFSVLRNRPFIGAFLNNFVLNSGLGVTVVFFIFAQTHLGLSAAQSGLVTLPYAIVAVAMIRLGEKATLRFGGKLMLIIGPLFPVIGITIISMTSLQPSQYIIAVVIGFVICAIGNGLVATPGLTIAIFSMPNEKVGLATGLYKMSGTLGGAFGIAISTTVFSMLQLNYTPSVAATVTFIVSIVLMILGSLSAYMIIPKTVKS >NZ_CP039167.1|WP_000337362.1|237896_238889_+|linear-amide-C-N-hydrolase MCTGFTIQTLNNQVLLGRTMDYDYPLDGSPAVTPRNYRWKSRTGTTGQTQYGFIGTGTDMEGFIYGDGVNEHGVAISTQYFRGYSSYGSTHKADAMNITQNEIVTWILGYTTSIEDMKQQASQIHVVAVYLNDIGEVPPLHYHVSDATGHSVEVSFKEGEVVIKDNPIGVLTNHPDLDWHYSNLRQYINITPYPATAKLLEGVTIEPLGNEAGTFGLPGGFTSTERFVRMAFMKANIAQNNDKEMDLMNAFYLLDAVNIPIGIVRPHDADNHYTMYQTVINLTTRTLYIKYYGSNELVALKLTDDLINRKDMTIFKPEKHITVRKLNDNQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP039167_2 | 344435-344535 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039167_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP039167_2
>2.1|344458|55|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder AAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039167_2
The CRISPR arrays of NZ_CP039167_2 >merge|NZ_CP039167|2|344435-344535|CRISPRCasFinder TTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTATATATGAATTGAGTATTAAATTTG >NZ_CP039167|2|2|344435-344535|CRISPRCasFinder TTATGAATTGAGTATTAAATTTG AAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTAT ATATGAATTGAGTATTAAATTTG
>NZ_CP039167.1|WP_001802787.1|343968_344226_-|hypothetical-protein MLVTDESHKCTLIFTFTTNAFLLKQKYLFTVAFELPPAHTNTQKMLILIRQNFLQRVCSKRLFKVDHLLSFHSINMRLAIFIKPP >NZ_CP039167.1|WP_001789518.1|343659_343761_+|hypothetical-protein MQLNVNMMKFDRWHKGICKQIVLNSVVIGGKGK >NZ_CP039167.1|WP_000991007.1|342186_343575_-|L-cystine-transporter MNAFLTLINIIVLVIFIVILHMMARKHISFAKRVFTALGIGIVFGVLLHLIYGTHSNVITSTSDWFNIVGQGYVALLQMIVMPLIFISIVAAFTKIQIGEKFAKIGSLIFIFLIGTVTIAAIVGVVYALVFGLDASTINLGNAEQARGSEIAKQAKDLTAHTLPQQILELLPKNPFLDFTGQRATSTIAVVIFASFIGFAYLRVARKQPDHGELLKRAIDAIYSLVMAIVTFVLRLTPYGVLAIMANTLSTSDFGAIWTLGKFLIASYAALITMYIIHLIILSLLGISPIRYVKKTLEVLIFAFTSRSSAGALPLNVQTQTRRLGVPEGIANFAATFGLSIGQNGCAGIYPAMLAIMVAPVANVEIDLQFIVTLIAVVIISSFGVAGVGGGATFASILVLSTLNLPVALAGVLISVEPLIDMGRTALNVNDSMLAGTGTAKLTKHWDKDTFDSNDNAALTSH >NZ_CP039167.1|WP_001289311.1|341350_342106_+|NADPH-dependent-oxidoreductase MSEHVYNLVKKHHSVRKFKNKPLSEDVVKKLVEAGQSASTSSFLQAYSIIGIDDEKIKENLREVSGQPYVVENGYLFVFVIDYYRHHLVDQHAETDMENAYGSTEGLLVGAIDAALVAENIAVTAEDMGYGIVFLGSLRNDVERVREILDLPDYVFPVFGMAVGEPADDENGAAKPRLPFDHVFHHNKYHADKETQYAQMADYDQTISEYYDQRTNGNRKETWSQQIEMFLGNKARLDMLEQLQKSGLIQR >NZ_CP039167.1|WP_000052781.1|340289_340859_-|peroxiredoxin MSLINKEILPFTAQAFDPKKDQFKEVTQEDLKGSWSVVCFYPADFSFVCPTELEDLQNQYEELQKLGVNVFSVSTDTHFVHKAWHDHSDAISKITYTMIGDPSQTITRNFDVLDEATGLAQRGTFIIDPDGVVQASEINADGIGRDASTLAHKIKAAQYVRKNPGEVCPAKWEEGAKTLQPGLDLVGKI >NZ_CP039167.1|WP_000930513.1|338750_340274_-|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F MLNADLKQQLKQLLELMEGNVEFVASLGSDEKSKELKELLTEISDMSPRLSLSEKSLKRTPSFSVNRPGEETGVTFAGIPLGHEFNSLVLAILQVSGRAPKEKQSIIDQIKNLEGSFHFETFISLTCQKCPDVVQALNLMSVINPNITHSMIDGAVFREESENIMAVPAVFLNGEEFGNGRMTIQDILSKLGSTADASEFENKEPYDVLIVGGGPASGSAAIYTARKGLRTGIVADRIGGQVNDTAGIENFITVKETTGSEFSSNLAAHIDQYDIDAMTGIRATDIEKTDEAIKVTLENGAVLESKTVIIATGAGWRKLNIPGEEQLINKGVAFCPHCDGPLFENKDVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVNHVTLFEFASELKADNVLQDRLRSLSNVDIKTNAKTTEVVGEDHVTGIRYEDMSTGEEHLLNLDGIFVQIGLLPNTSWLKDAVELNERGEIVIDRNNNTDVPGIFAAGDVTDQKNKQIIISMGAGANAALNAFDYIIRN >NZ_CP039167.1|WP_078064924.1|338378_338672_-|hypothetical-protein MINLIYTTRCAIMLKVCTSRKQINMKNDIEKEKYVNEIIMLLRTIPTSKLIQPIMQLFIDNAILNNVQNDALLIEKVTHARNHLRLWSLQGHRDIPN >NZ_CP039167.1|WP_000746687.1|337679_338306_-|NDxxF-motif-lipoprotein MKKRLLLSTFLASTLILTGCASDQSDNEDHHTSTGIHAPKSAKKLETKDIFNSDKKNSDISDAEMKQAIEKYLSVNSDILDNKYIMQHKLDKQIDSQTKVTEKQAETLSHLSNLAVKNDLHFKKFVTENNIPKEYKKPVELMMNYFKALNSTIANVDEDIEKLSYQPQNKINVVDVPTKYAGDVNKKQQDKIKDFLKSKGIKSDVIDK >NZ_CP039167.1|WP_000868252.1|337040_337424_-|hypothetical-protein MKVRITFIILAILSTIVCLFLAAMHPTGPNTVTFEQPYLFTLNIIIMVLVALPSLVLAIYDYMSFRISSAILQFLGAVSWFFLSLILSLTQFTPFTLASFITSIILFASTIITLAIGGKSVDKNDSH >NZ_CP039167.1|WP_000158379.1|336393_336975_+|histidine-phosphatase-family-protein MTIYLVRHGESKSNYDNKHFRSYFCGQLDVPLTDTGTKSADDLCDYFKEKQIKHVYVSDLLRTQQTFEHIFPYDIASTTTPLLRERSLGVFEGEYKDEISANPKYEKYFNDSNFKDFRHSFSQKAPEGESYEDVYQRVEHFMNHVVNEDTQKDDIVIVAHQVVIRCLMVYFNNVSREEAVDLKVENCKPYIIE >NZ_CP039167.1|WP_000956132.1|344551_345508_-|hypothetical-protein MLTKEFAQRVELSEKQVRKIVQHLEERGYQLSKTEYRGREATDFKEEDIELFKDIADKVKQTNSYDLAFDELEKEKDFLQVIVKNDDKNLPTNQNVAQLVEDLRLEIQKMREERHLLGQMMNQVHQQQQELKELQNQLTSKIDSNSESLKAIQTSQEAIQEAQASQAKALAESTNKVEKNAVTEDKADSKDSKVAGVNTSTDAKTDTKAENAGDGTATKVDKEDQISATEAIEKASVEQSKNDNAAETSNKEATVDAEAQHDAEQQVAEAHAEASKQATSNDSLEAKAENDSTASQSEMSEPKPQEEKKGFFARLFNL >NZ_CP039167.1|WP_000394698.1|345625_346288_-|hypothetical-protein MEFKTIQSVKDPHYNEALKLYDTKLNLSLTEDKRIIKRSLENNKTENDYVFIVGLENDVVVSLATAHYEATTNSAFLIYLFAKDLPNHDELMTQTLHQIEHELNLLSNLVHSRSINFLMMEVPKEPADLTQDNGLIIEHRRQFLYEHQFERQTEIDYIHPTNDGHTKKVDLFLKKNIKLTKDIYGTSVKSNYILKYVFANGIAREIIYALLEEMDLRKPF >NZ_CP039167.1|WP_000763768.1|346430_346838_-|hypothetical-protein MADITVVNDTGELYNVINQKKSEGYLESELTIISKSKLHLNDLHDSEISLISTSGTFSDRMTKLLTGEDGEHAVLSRYNLAPDELEKYKQLILDDKMLVVAVRDKSSHQEVHENNSAYEEIDITHFAEASKGPKA >NZ_CP039167.1|WP_000421414.1|347350_347929_+|xanthine-phosphoribosyltransferase MELLGQKVKEDGVVIDEKILKVDGFLNHQIDAKLMNEVGRTFYEQFKDKGITKILTIEASGIAPAIMAALHFDVPCLFAKKAKPSTLTDGYYETSIHSFTKNKTSTVIVSKEFLSEEDTVLIIDDFVANGDASLGLYDIAQQANAKTAGIGIVVEKSFQNGHQRLEEAGLTVSSLCKVASLEGNKVTLVGEE >NZ_CP039167.1|WP_000793023.1|347928_349197_+|purine-permease MKNLILSVQHLLAMYAGAILVPIIVGTSLKFTPEQIAYLVTVDIFMCGVATFLQANKVTGTGLPIVLGCTFTAVAPMILIGQTKGIDVLYGSLFLSGILVIIIAPFFSHLVKFFPPVVTGSVVTIIGINLMPVAMNYLAGGQGAKDYGDVKNILLGLMTLIIILVLQRFTTGFIKSIAILIGLVLGTIGAGLLGMVDINQVNHAGWLGIPVPFRFSGFSFDVTSTLVFFIVAIVSLIESTGVYHALSEITGKKLERKDFRKGYTAEGLAIVLGSIFNSFPYTAYSQNVGLVSLSGAKKNNVIYGMVVLLLICGCIPKLGALANIIPLPVLGGAMIAMFGMVMAYGVSILGHIDFKNQNNLLIIAVSVGLGTGISAVPQAFKGLGEQFAWLTQNGIVLGAISAIILNFFFNGIKYKQTEENVK >NZ_CP039167.1|WP_000264071.1|349234_350701_+|IMP-dehydrogenase MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF >NZ_CP039167.1|WP_000424963.1|350725_352267_+|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCDCKGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE >NZ_CP039167.1|WP_000361524.1|352778_353885_+|Abi-family-protein MDKSLEINLKELEGIMYKEKVIDVKEYDNLKVTFETLNDAPKSEIPTPFTIEQMLYKLETKNLYFPEIKSKEKCVELLHSVGYYNLKHFMYNEFGKDEPKNFDEVYILYKFDRYLLKQLFSLVNMLETHIRNIILEVYMLEIEYNNKPSTLFYLDKDLYFEKVNDEYKYSAKKLKEFNRLQNVFWRAIEKKKSNDNVKHNIKKYNIIPAWVLFQNFSFGDLSTFYRTTLPTYRNKVSKRIENLIEKNTGISIKLPEKLLCAWLNSIRFLRNRIAHTDIIYGINFTNTCAKHHSDEEMYVNIEKYKYQQRLVTFLLAMKKIFMSMPENNIIEWNETLTKIENKCSEHNFIKLSRLGVIENNLSYFKITK >NZ_CP039167.1|WP_000888767.1|354509_354902_-|hypothetical-protein MLEDSGDIRLLYQSIEELASVLGQSQFETKTVSLIFVQMDLRYSVFEKVQTDFMKYLAHKNSDEIKYIDLIKIIENALPEDKELSINVINSIIIGFANNYYPILQSLVPEIQSSYGITINKNFNINSIDF >NZ_CP039167.1|WP_000035496.1|354923_355145_-|hypothetical-protein MAPSVRLPSTAATIFDKGYSGIVKELKPLLKWSEVPANAVGDAVKRGAINAGLSIGDAGIISTVVKEAIAWLF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP039167_3 | 580458-580550 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039167_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP039167_3
>3.1|580490|29|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder AGGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039167_3
The CRISPR arrays of NZ_CP039167_3 >merge|NZ_CP039167|3|580458-580550|CRISPRCasFinder CTAAAGGTGAAGAGGAACGCAGTTGGATGCTAAGGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATCGCTAAAGATGAAGAGGAACGCAGTTGGATGCTA >NZ_CP039167|3|3|580458-580550|CRISPRCasFinder CTAAAGGTGAAGAGGAACGCAGTTGGATGCTA AGGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATCG CTAAAGATGAAGAGGAACGCAGTTGGATGCTA
>NZ_CP039167.1|WP_000901764.1|579670_580306_+|endonuclease-III-domain-containing-protein MLGTDELYKVLYEHLGPQFWWPADNDIEMMLGAILVQNTRWRNAEIALNQIKEHTHFNPNHILELPIETLQSLIHSSGFYKSKSLTIKTLLTWLARHHFNYQEINERYKGGLRKELLSLKGIGSETADVLLVYIFGRIEFIPDSYTRKIYDKLGYENTKNYDQLKKVVTLPNHFTNQDANEFHALLDVFGKHYFRDKDIKNYDFLEPYFKK >NZ_CP039167.1|WP_138079878.1|579286_579577_-|hypothetical-protein MGIQFLFVGAPPARLTRIEKSLLQANFRSVNYCHYNFVEHRTLIYVSGSLMQLCRASNCVPLNLIHILSIPQYVTYLIKKHSNTKYLSRNSTLECI >NZ_CP039167.1|WP_001021140.1|577618_579280_+|arginine--tRNA-ligase MNIIDQVKQTLVEEIAASINKAGLADEIPDIKIEVPKDTKNGDYATNIAMVLTKIAKRNPREIAQAIVDNLDTEKAHVKQIDIAGPGFINFYLDNQYLTAIIPEAIEKGDQFGHVNESKGQNVLLEYVSANPTGDLHIGHARNAAVGDALANILTAAGYNVTREYYINDAGNQITNLARSIETRFFEALGDNSYSMPEDGYNGKDIIEIGKDLAEKHPEIKDYSEEARLKEFRKLGVEYEMAKLKNDLAEFNTHFDNWFSETSLYEKGEILEVLAKMKELGYTYEADGATWLRTTDFKDDKDRVLIKNDGTYTYFLPDIAYHFDKVKRGNDILIDLFGADHHGYINRLKASLETFGVDSNRLEIQIMQMVRLMENGKEVKMSKRTGNAITLREIMDEVGVDAARYFLTMRSPDSHFDFDMELAKEQSQDNPVYYAQYAHARICSILKQAKEQGIEVAAANDFTTITNEKAIELLKKVADFEPTIESAAEHRSAHRITNYIQDLASHFHKFYNAEKVLTDDIEKTKAHVAMIEAVRITLKNALAMVGVSAPESM >NZ_CP039167.1|WP_001819741.1|577238_577622_+|DUF1934-family-protein MLKQHNEKEKFEFTTEGTWQQRQSNFIRYVEQIEDATVNVTIKVDDDSVKLIRKGDINMNLHFVEGQTTTTFYDISAGRIPLEVKTLRILHFVSGDGGKLKIHYELYQDNEKMGSYQYEINYKEIGE >NZ_CP039167.1|WP_001200753.1|575919_576930_+|alcohol-dehydrogenase-AdhP MRAAVVTKDHKVSIEDKKLRALKPGEALVQTEYCGVCHTDLHVKNADFGDVTGVTLGHEGIGKVIEVAEDVKSLKIGDRVSIAWMFESCGRCEYCTTGRETLCRSVKNAGYTVDGAMAEQVIVTADYAVKVPEKLDPAAASSITCAGVTTYKAVKVSNVKPGQWLGVFGIGGLGNLALQYAKNVMGAKIVAFDINDDKLTFAKELGADAIINSKDVDPVAEVMKLTDNKGLDATVVTSVAKTPFNQAVDVVKAGARVVAVGLPVDKMNLDIPRLVLDGIEVVGSLVGTRQDLREAFEFAAENKVTPKVQLRKLEEINDIFEEMENGTITGRMVIKF >NZ_CP039167.1|WP_001788287.1|574898_575420_+|hypothetical-protein MEVISLSEKKGFNFNIIKNDPLDGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDVANKEAFIDIGGMHARAKVEKGVKWITDKAAVEGDEAKEYWLCWVTTERNEQGPYYAGLTACYLLVNKAIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHHIIIDQIGDENKAILKDFLMNHDEGMWKHSSDALHQAFN >NZ_CP039167.1|WP_000180239.1|573575_574871_+|HD-domain-containing-protein MTNAYVGLKLVEEKVFKDPIHRYIHVEDQLIWDLIKTKEFQRLRRIRQLGTLYLSFHTAEHSRFGHSLGVYEIVRRLIDESFIGHDAWDNKDRPLALCAALLHDLGHGPFSHSFEKIFNTDHEAYTQAIITGDTEVNAVLRKVSPEFPREVAEVINKTHHNKLVISMISSQIDADRMDYLQRDAYFTGVSYGAFDMERILRLMRPSKDEVLIKESGMHAVENFIMSRYQMYWQIYFHPVSRGGEVLLNNCLKRAKQLYNEGYEFKLHPHDFIPFFEETVTIEQYVELDEAVVTYYLEKWTKEDDAILSDLASRFINRDLFKYIPFDGSIITISELQELFEAGGINPDYYFVSEAFSDLPYDYDRPGSNRKPIHLLRQDGTIREISNQSLVIHSITGINRQDYKLYYPREMVAKIKDKTIREAIENLINELN >NZ_CP039167.1|WP_000477505.1|573059_573536_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MFKVRQATEKDVVQIRDVATKAWFNTYLNIYAATTVNHLLEASYNEHHLKKRLQEQLFLVVEEGNDIVGFANFIYGEELYLSAHYVKPESQHTGYGTALLNEGLSRFEDKFEGVYLEVDNKNEEAVAYYKEQGFTILRSYQPEMYGEKLDLALMYKAF >NZ_CP039167.1|WP_000633782.1|572354_572891_+|flavodoxin-family-protein MITVLFGGSRPNGNTAQLTKFALQDLEYQWIDVTQHQFKPIRDVRHTAETITSYDDDYLPILDKILASDTIIFASPVYWYSISAPLKAFIEHWSETLQDKRYPNFKAQMAEKDFRVILVGGDCPKIKAKPAITQMKYSLDFLGATLNGYIIGTAEKPGDIMKDNYALARATEWNSILQ >NZ_CP039167.1|WP_000808902.1|571205_572144_+|aldo/keto-reductase MKQFVNLGKSDVEVFPIALGTNAVGGHNLYPNLDEEQGKDVVRQAINHGINLLDTAYIYGPERSEELVGEVVKEYPREQIKIATKGSHEFDENQEVHQNNQPEYLKQQVENSLKRLQTDYIDLYYIHFPDNNTPKDQAVAALQELKEQGKIKAIGVSNFTLDQLKEANKDGYVDVVQLEYNLLHRENEAVLQYCVDHQITFIPYFPLASGILAGKYDENTKFSDHRTTRRDFKPGVFEENVRRVKALESIAAAHQTSIANIVLAFYLTRPAIDVIIPGAKRAEQVVENIKAADIVLSDDEIQYIDELFPIED >NZ_CP039167.1|WP_001813976.1|580678_581506_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKDNDKQGSNDNGSSKSPYHRIVSLMPSNTEILYELGLGKYIVGVSTVDDYPKDVKKGKKQFDALNLNKEELLKAKPDLILAHESQKATANKVLSSLEKQGIKVVYVKDAQSIDETYNTFKQIGKLTHHDKQAEQLVEETKDNIDKVIDSIPAHHKKSKVFIEVSSKPEIYTAGKHTFFNDMLEKLEAQNVYSDINGWNPVTKESIIKKNPDILISTEAKTRSDYMDIIKKRGGFNKINAVKNTRIEVVNGDEVSRPGPRIDEGLKELRDAIYRK >NZ_CP039167.1|WP_078064929.1|581653_582604_+|iron-ABC-transporter-permease MTFNKVLLSWIVILIITTSIYLFWQLGDINDVFNQSILINVRLPRLLEALLTGMILTVAGLIFQTVLNNALADSFTLGLASGATFGSGLALFLGLTTLWIPVFSITFSFITLITVLVITSVLSQGYPVRILILSGLMIGALFNSLLYFLILLKPRKLNTIANYLFGGFGDAEYSNVSIIAITFIIALFGIFIILNQLKLLQLGELKSQSLGLNVQLITYIALCIASMITAINVAYVGIIGFIGMVIPQLIRKWQWKQSLGRQLALNIVIGGQIMVMADFIGSHILSPVQIPASIIITLIGIPVLFYMLISQSKRLH >NZ_CP039167.1|WP_000365354.1|582658_583378_+|HAD-family-hydrolase MDLNQIKAVVFDLEGTLLDRVKSREKFIEEQYERFHDYLIHVQLADFKKAFIELDDDEDNDKPDLYKEIIKRFHVDRLTWKDLFNDFEMHFYRYVFPYYDTLYTLEKLSQKGFQIGVIANGKSKIKQFRLHSLGLMHVINYLSTSETVGFRKPHPKIFEDMIDQLGVLPEQIMYVGDDALNDVAPARAMGMVSVWYKQEDAEIEPLEEEVDFTITTVEELLTILPIKNDNKGENYGSIY >NZ_CP039167.1|WP_000362969.1|583361_584162_+|alpha/beta-hydrolase MDLFTRKDGTSIHYSTLGEGYPIVLIHTVLDNYSVFNKLAAELAKSFQVVLIDLRGHGYSDKPRHIEIKDFSDDIVELLKYLYIEEVAFVCHEMGGIIGADISVRYPEFTSSLTLVNPTSIEGELPEERLFRKYAHIIRNWDPEKQDKFLNKRKYYRPRKMNRFLKHVVDTNEISTKEEIQAVKEVFKNADISQTYRNVVVPTKIIAGEFGERTTRLEAKEVADLIQNADFEVYQESSAFPFVEEQERFVEDTASFINKHHDEKHV >NZ_CP039167.1|WP_000735551.1|584297_584804_+|hypothetical-protein MKKLLTASIIACSVLMGVGIANTNAEAASGNSIDTVKQLIKGDQSLENVKIGESIKDVLTKYKNPMYSYNEDGTEHYYEFHTKKGMLLVTTDGKKNNGKVTHISMMYNDANGPTYQAVKNYVGKAVTHTEYSKVAGNFGYIEKGKTTYQFASAPKDKNIKLYRIDLEK >NZ_CP039167.1|WP_001222133.1|584965_585682_+|hypothetical-protein MRINDKILLENIEDYFNHKGLSPHLIDDIKEKVITDIKNSEKKDQDYIEYKRKSPAQIILMIQRNLFALQMNPVIFFIINFILISYLYDKQYVQFQAITGMSLFYCLVIFPMTIVVYLRVSQKNYLRSNKIEMIMGTIIAIISLLLIILQAFNITWGVIPITNFGHQFFFFIGIILVIAGIFYKRLEFSGIGLLFCQKTVDAMIHNPQSAQIFSLIIWILLVVLVIYFTIRLSSRTRL >NZ_CP039167.1|WP_001045423.1|585850_586639_+|alpha/beta-hydrolase MNKVTINPQIQLTYQIEGKGDPIILLHGLDGNLAGFEDLQHQLASSYKVLTYDLRGHGKSSKSESYDLNDHVEDLKILMEKLNIHEAHILGHDLGGVVAKLFTDKYAYRVKSLTTIASKKDDLIHSFTQLLIQYQDDIAGFNKSEAYILLFSKLFRNQEKTMKWYQKQRIYSIKSEDDSAVAIRSLILHKDEPMYLKKRTCVPTLLINGEHDPLIKDKNHFKLEAHFLNVTKKIFEHSGHAPHIEEPEAFMNYYLNFLKSVS >NZ_CP039167.1|WP_001018677.1|586889_587264_-|transcriptional-regulator MAITKINDCFELLSMVTYADKLKSLIKKEFSISFEEFAVLTYISENKEKEYYLKDIINHLNYKQPQVVKAVKILSQEDYFDKKRNEHDERTVLILVNAQQRKKIESLLSRVNKRITEANNEIEL >NZ_CP039167.1|WP_001829093.1|588211_589141_-|DMT-family-transporter MLLFYIIGVLVGMLIPIQTSVNSRLSLYTKSPFYTSFISFSVGTICLIILNIIINPEVFTIHFYNNQSFNYTWVVGGLLGVSFLTGNLLLLPKLGATLTVIATVAGQIIMGVIIDTLGLFGATIHDFNLIKAIGVLLLIIGIVIMNQFNKNNLLLTDQKYLLFWLLLGFIFGFFPPIQTTINSALASHTHSPAFASLVSFTIGSIALLILTAIFNRSLKLKTSHLKFGKLKPIYFTGGILGMAFVTANIILMPHMGAALTTLIGMFGQILMGILIDHFGLFGSPKIAMTSRKTIGLLCILTGIILLRLF >NZ_CP039167.1|WP_000169045.1|589335_589560_-|DUF2922-domain-containing-protein MTKTLELSFKSSLDKPVKLQLSQLNNVVTEQVARDSMNALVDLNIIKSNSGTITKVHSAQIIDKTTTVLFEDKK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP039167_4 | 801969-802050 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039167_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP039167_4
>4.1|801993|34|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder ATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039167_4
The CRISPR arrays of NZ_CP039167_4 >merge|NZ_CP039167|4|801969-802050|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCATCCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA >NZ_CP039167|4|4|801969-802050|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAA ATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCAT CCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA
>NZ_CP039167.1|WP_000932213.1|800986_801865_+|DUF1963-domain-containing-protein MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPVLPCIEMDLKEMKEETLNQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLDNLPEQQELFPVNEGILQFWISSEDQMYGMTENLKGNNINSRLVYIKEPITDLSLENIQAHLKSLDADNEDIPFSGAFSIKFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQELKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS >NZ_CP039167.1|WP_000662306.1|800871_800985_+|hypothetical-protein MKENLLGTIIWSIATFYYSRMMKIMNLAILKIKIGGS >NZ_CP039167.1|WP_000290489.1|800427_800808_+|glycine-cleavage-system-protein-GcvH MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVATIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEISDESQIEALLTAEKYSEMIGE >NZ_CP039167.1|WP_000589549.1|799913_800270_+|arsenate-reductase-family-protein MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA >NZ_CP039167.1|WP_001190695.1|799449_799770_-|thioredoxin-family-protein MQSIKSNESFKSVINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK >NZ_CP039167.1|WP_000422908.1|798760_799300_+|nitroreductase MELQQAIANRRSVKKFKRDMHIDDALLYQAIEKAADAPNHGMREPWRVVHVPKDRLGDMSKDISKFAFPNELDKQQCHYDAVTKLGGMLLLILKTDPRQRQNDENYFAFGAYAQNLMLLLYEAGIGTCWKSPLYIYDPKVRKTLGIKKDEVLAGFLYLTDLEEDMPKAPRKNRNLITLY >NZ_CP039167.1|WP_000150016.1|797961_798678_+|type-I-3-dehydroquinate-dehydratase MTHVEVVATIAPQLSIEETLIQKINHRIDAIDVLELRIDQIENVTVDQVAEMITKLKVMQDSFKLLVTYRTKLQGGYGQFTNDSYLNLISDLANINGIDMIDIEWQADIDIEKHQRIITHLQQYNKEVVISHHNFESTPPLDELQFIFFKMQKFNPEYVKLAVMPHNKNDVLNLLQAMSTFSDTMDCKVVGISMSKLGLISRTAQGVFGGALTYGCIGEPQAPGQIDVTDLKAQVTLY >NZ_CP039167.1|WP_000974460.1|797391_797814_-|organic-hydroperoxide-resistance-protein MAIHYETKATNVGGRKGHVYTDDRALDIDIVPPAQADGKATNPEQLFAAGYASCFNGAFDLILKQNKVRDAHPEVTLTVRLEDDSDSESPKLSVSIDATIKNVISQEEAEKYLQMAHEFCPYSKATQGNINVDLNVNVVD >NZ_CP039167.1|WP_000569884.1|796498_796993_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MIEIKTLTNNDFNEYKRLVSTVNEEFTQDSHYSQTMTDTLIHDILNQGSPKCIVFGCYENETLIATAALEQIRYVGKEHKSLIKYNFVTNNDKSINSELINFIINYARQNNYESLLTSIVSNNIGAKVFYSALGFDILGFEKNAIKIGNTYFDEHWLFYDLINK >NZ_CP039167.1|WP_000255557.1|795726_796344_-|amino-acid-transporter MVTAIIHGFILAIGLILPLGAQNVFIFNQGANQPKYRYVLPAIITAGLSDSLLIIIAVVGVSIIIMSLPVLQAIIYIVGLIFLMYMAWTIWHDKPSTDGEAQIMSPMKQVSFALSVSLLNPHAILDTIGVIGSSAALYSGSNKIAFTIACISVSWLWFFLLAILGKMVGSIDKTGKLLTIINKLSSIIIIIVALMILQKLIQLLF >NZ_CP039167.1|WP_001018964.1|802606_802993_+|topiosmerase MAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKLDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVSNCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPLLPNINNERLVLVNE >NZ_CP039167.1|WP_001065801.1|802985_803282_+|thioredoxin-family-protein MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFKSVTDLLENLK >NZ_CP039167.1|WP_000571218.1|803531_804557_+|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEQGPVTQVFENPQHTVTKRFVKDDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >NZ_CP039167.1|WP_000520233.1|804549_805245_+|ABC-transporter-permease MGKSFSEIINEMITMPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWTVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >NZ_CP039167.1|WP_000732326.1|805261_806083_+|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGNKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYELDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGDVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >NZ_CP039167.1|WP_000752917.1|806436_806631_+|CsbD-family-protein MADESKFEQAKGNVKETVGNVTDNKNLENEGKEDKASGKAKEFVENAKEKATDFIDKVKGNKGE >NZ_CP039167.1|WP_001183860.1|806864_807716_-|DUF368-domain-containing-protein MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYNQFIASISGIFSRRFWPSFTFLIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIVPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNGDKHAGETLTLSTSLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEVVKLNFTGLPILLAVGFGVLAGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWFVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE >NZ_CP039167.1|WP_000168845.1|808043_808805_+|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MASTLEIKDLHVSIEDKEILKGVNLTINTDEIHAIMGPNGTGKSTLSSAIMGHPSYEVTKGEVLLDGVNILELEVDERAKAGLFLAMQYPSEITGVTNADFMRSAINAKREEGQEINLMQFIKKLDKNMDFLDIDKDMAQRYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMLEPKFAILDEIDSGLDIDALKVVSKGINQMRGENFGALMITHYQRLLNYITPDKVHVMYAGKVVKSGGPELAKRLEEEGYEWVKEEFGSAE >NZ_CP039167.1|WP_000205579.1|808903_810211_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MTTDILNISEEQLVDYSKAHNEPSWMTELRKKALKLTETLEMPKPDKTKLRKWDFDSFKQHDVKGDVYQSLSQLPESVREIIDVDHSKNLVIQHNNTIAYTQVDDNASKDGVIVEGLADALMNHSDLVQKYFMKDAVTVDEHRITALHTALVNGGVFVYVPKNVVVEHPVQYVVLHDDKNASFYNHVIIVTEESAEVTYVENYLSNASGEGNQLNIISEVIAGANSNITYGSVDYMDKGFTGHIIRRGITEADASINWALGLMNEGSQIIDNTTNLFGDRSTSSLKSVVVGTGEQKINLTSKIVQYGKETDGYILKHGVMKEHASSVFNGIGYIKHGGTKSIANQESRVLMLSEHARGDANPILLIDEDDVQAGHAASVGRVDPDQLYYLMSRGISQREAERLVIHGFLDPVVRELPIEDVKRQLREVIERKVSK >NZ_CP039167.1|WP_000807670.1|810325_811567_+|cysteine-desulfurase MAEHSFDVNEVIKDFPILDQKVNGKRLAYLDSTATSQTPVQVLNVLEDYYKRYNSNVHRGVHTLGSLATDGYENARETVRRFINAKYFEEIIFTRGTTASINLVAHSYGDANVEEGDEIVVTEMEHHANIVPWQQLAKRKNATLKFIPMTADGELNIEDIKQTINDKTKIVAIAHISNVLGTINDVKTIAEIAHQHGAIISVDGAQAAPHMKLDMQEMNADFYSFSGHKMLGPTGIGVLFGKRELLQKMEPIEFGGDMIDFVSKYDATWADLPTKFEAGTPLIAQAIGLAEAIRYLERIGFDAIHKYEQELTIYAYEQMSAIEGIEIYGPPKDRRAGVITFNLQDVHPHDVATAVDTEGVAVRAGHHCAQPLMKWLNVSSTARASFYIYNTKEDIDQLINALKQTKEFFSYEF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP039167_5 | 1679773-1679856 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039167_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP039167_5
>5.1|1679797|36|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder GCACATTATTGAAAGCTGACTTTTGGTCAGCTTCTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039167_5
The CRISPR arrays of NZ_CP039167_5 >merge|NZ_CP039167|5|1679773-1679856|CRISPRCasFinder TGTTGGGGGCCCCATCCCCAACTTGCACATTATTGAAAGCTGACTTTTGGTCAGCTTCTATGTTGGGGGCCCCGTCCCCAACTT >NZ_CP039167|5|5|1679773-1679856|CRISPRCasFinder TGTTGGGGGCCCCATCCCCAACTT GCACATTATTGAAAGCTGACTTTTGGTCAGCTTCTA TGTTGGGGGCCCCGTCCCCAACTT
>NZ_CP039167.1|WP_000567017.1|1678788_1679457_-|tetratricopeptide-repeat-protein MIDQQTIYQYIQNGKIEEALQALFGNIEEDPTIIENYINAGIVLADANEIEKAERFFQKALTIDPKNGVVFYNLANVYYNQQRYQEAIKLYQQALQTEIEQVDCNYMIGMAFNQLESFKLALPYLMTAAELDKDKDAEVQFQYGLVLCQLEMFNEAITQLKHVLTIDKNHVDARYNLGLALFMKNEDIDEAITHFKEAVTIDPKHLLSQHALKTFTKMKEEE >NZ_CP039167.1|WP_001283312.1|1676309_1678787_-|ATP-dependent-RecD-like-DNA-helicase MSDPTLFDYSMIKGTVEAILFQNSDNFYTVLKVDTIETNEDFDTMPTVVGFLPNIVEGDVYTFKGQVVDHPRYGKQLKAETFEKEMPQTKEAIISYLSSDLFKGVGKKTAQNIVNTLGDNAINDILDDHSVLEKVSGLSKKKQKQIAEQISANQESEKIMIRLHDLGFGPKLSMAIYQFYLGDTLTILDRNPYQLIYDIKGIGFNKADQLARNIGIAYNDNERLKAALLYTLEEECIKQGHTYLPINVVIDLTVDVLNYQDEEVIEPEKLDEMLQYLNEEKRLIIDNEQVAIPSLYYSEIKSVQNLFRIKTHTNKLTEIEQSDLQMHIGEIEDANQVNYAASQKEALQTAINSKVMLLTGGPGTGKTTVIKGIVELYAEIHGLSLDYDDYVNDDYPVVLAAPTGRASKRLQESTGLEAMTIHRLIGWNQDTKPEDILENEINARLIIIDEMSMVDTWLFHQFLSAVPLDAQLIFVGDEDQLPSVGPGQVFKDLIESKAIPRVNLTEVYRQQDGSSIIELAHRMKLGQKIDITQRFHDRSFINCQANQIPTVVEKVVTSAVNKGYTMADIQVLAPMYKGNAGIKRLNQVLQDILNPKKKDTREIEFGDVVFRKGDKVLQLVNRPNDNIFNGDIGVIVGIFWAKENALNKDVLVVDFEGNEITFTKQDMMELTHAYCTSIHKSQGSEFPIVIMPIVKQYFRMLQRPILYTGLTRAKTSLVLLGDPEAFDIGLKTNGQARLTQLCTLLKNYFNSEDEEMLENTATNDTGASQTTIDDQVEAPMSSNDSGEVTSDSTKTDINVLTEATMFKIDPMINMGEITPYDFIER >NZ_CP039167.1|WP_000734075.1|1673336_1675967_-|alanine--tRNA-ligase MKKLKASEIRQKYLDFFVEKGHMVEPSAPLVPIDDDTLLWINSGVATLKKYFDGRETPKKPRIVNSQKAIRTNDIENVGFTARHHTFFEMLGNFSIGDYFKQEAIEFAWEFLTSDKWMGMEPDKLYVTIHPEDMEAYNIWHKDIGLEESRIIRIEGNFWDIGEGPSGPNTEIFYDRGEAYGQDDPAEEMYPGGENERYLEVWNLVFSEFNHNKDHSYTPLPNKNIDTGMGLERMASVSQNVRTNYETDLFMPIMNEIEKVSGKQYLVNNEQDVAFKVIADHIRTIAFAISDGALPANEGRGYVLRRLLRRAVRFSQTLGINEPFMYKLVDIVADIMEPYYPNVKEKADFIKRVIKSEEERFHETLEDGLAILNELIKKAKATTNEINGKDAFKLYDTYGFPIELTEEIAVQAGLKVDMTTFESEMQQQRDRARQARQNSQSMQVQSEVLKNITSASTFVGYDTATAQTTLTHLIYNGEEVSQVEAGETVYFMLTETPFYAVSGGQVADTGIVYNDNFEIAVSEVTKAPNGQNLHKGVVQFGQVNVGATVSAEVNQNDRRDIQKNHSATHLLHAALKSVLGDHVNQAGSLVEADRLRFDFSHFGPMTNDEIDQVERLVNEEIWKGIDVNIQEMDIASAKEMGAMALFGEKYGDVVRVVNMAPFSIELCGGIHVRNTSEIGLFKIVSESGTGAGVRRIEALTGKAAFLYLEDIQEKFNTMKSQMKVKSDDQVVEKLTQLQDEEKALLKQLEQRDKEITSLKMGNIEDQVEEINGYKVLVTEVDVPNAKAIRSTMDDFKSKLQDTIIILASNVDDKVSMVATVPKSLTNNVKAGDLIKQMAPIVGGKGGGRPDMAQGGGTQPENISKSLSFIKDYIKNL >NZ_CP039167.1|WP_000426912.1|1673013_1673274_-|IreB-family-regulatory-phosphoprotein MENFDKTMKFDYEELPTQDVRDVLNNVYRTLDERGYNAVNQIVGYLLSGDPAYIPRQNEARNQIRHIDRDVIMEELVSYYLKEQNK >NZ_CP039167.1|WP_000939059.1|1672581_1673010_-|Holliday-junction-resolvase-RuvX MLQHKILGLDVGSRTVGIAISDIMGWTAQGLDTLRINEENNELGIDQLVDIIKKHNVGTVVIGLPKNMNNSIGFRGEASLTYKEKLLEAYPSIEIVMWDERLSTMAAERSLLEADVSRQKRKQVIDKMAAVFILQGYLDSLH >NZ_CP039167.1|WP_000134779.1|1672258_1672567_-|DUF1292-domain-containing-protein MTEHNHDSQLEINNEEELLTLFDEEGNEVLYRKVLEFYHPEFKKEYVILAEEGAQSDEDDMIELVPMINEPDESGDGGKLVPIETDEEWDMIEEVVNTEMEE >NZ_CP039167.1|WP_000342258.1|1671335_1671974_-|O-methyltransferase MDDLNKKYLIDLHQHQNSSIEVLREFAEGNEVPIVDRLTLDLIKQLIRMNNVKNILEIGTAIGYSSMQFASISDDIHVTTIERNETMIQYAKQNLATYHFENQVRIIEGNALEQFENVNDKVYDMIFIDAAKAQSKKFFEIYTPLLKHQGLVITDNVLYHGFVSDIGIVRSRNVRQMVKKVQDYNEWLIKQPGYTTNFLNIDDGLAISIKGE >NZ_CP039167.1|WP_000137774.1|1670409_1671333_-|U32-family-peptidase MTELLVTPKSLSHMETLIDLGADAFVIGEQKFGLRLPGEFNRQQMTEAVALAHKNDKKVYAAVNGLFHNYHLDAVEDYINFLHEIRVDRIIFGDPAVVMYVKAQENPIPLHWNAETLVTNHFQCNYWGKRGASRAVLARELNLDEIINIKENSNVEIEVQVQGMTCMFQSKRMLLGNYYTFQDRQMKIERRNDEQSLLLYDEERQNNYPVYEDYNGTHIMSPNDICLIEELAPFFEAGIDSFKIDGILQTEEYINVVTEQYRQAIDLYNEDPEIYEDEKFMLIDPIEEIQPDHRPFDEGFLYKQTVY >NZ_CP039167.1|WP_000848304.1|1669129_1670398_-|U32-family-peptidase MKTIEEIKSTPKTVMKKPELLAPAGNLEKLKIAVHYGADAVFLGGQEYGLRSNADNFTMEEIAEGVEFANRYGAKIYVTTNIIAHDENIEGLESYLRNLEKTGATGIIVADPLIIETCKEVAPKLEIHLSTQQSLSNYKAVEYWKEEGLDRVVLARETGAMEMREMKEKVDIEIEAFIHGAMCIAYSGRCTLSNHMTARDSNRGGCCQSCRWDYELLEVDDNGELDVFYNQGEVTPFAMSPKDLKLIESIPQMMDIGVDSLKIEGRMKSIHYIATVVSVYRKVIDAYAADPDNFKINPEWLIELDKCANRDTAPAFFEGTPGYEEQMFGQQQSKKSPFDFCGLVLDYNEDTKIATIQQRNNFKPGQEIEFFGPEIETFTQVVEAIYDEEGNSLDAARHPLQIVQIKVDRPIYPNNMMRKEIG >NZ_CP039167.1|WP_000648617.1|1668506_1669130_-|uridine-kinase MKATTIIGIAGGSGSGKTTVTNEIMKNLEGHSVALLAQDYYYKDQKHLTFDERLETNYDHPFAFDNDLLIENLKDLKNGKAVEVPTYDYASHTRSDITIDFKPKDVIIVEGIFALENKVLRDMMDVKIYVDTDADLRILRRLTRDTKERGRSMDSVINQYLSVVRPMHDQFIEPTKKYADIIIPEGGSNKVAIDIMTTKIQSLVSKQ >NZ_CP039167.1|WP_000066097.1|1680037_1681156_-|tRNA-2-thiouridine(34)-synthase-MnmA MSNKDIRVVVGMSGGVDSSVTAHVLKEQGYDVIGIFMKNWDDTDENGVCTATEDYNDVIEVCNQIGIPYYAVNFEKEYWDKVFTYFLDEYKKGRTPNPDVMCNKEIKFKAFLDHAMNLGADYVATGHYARIHRHEDGHVEMLRGVDNNKDQTYFLNQLSQQQLSKVMFPIGDIEKSEVRRIAEEQGLVTAKKKDSTGICFIGEKNFKTFLSQYLPAQPGDMITLDGKKMGKHSGLMYYTIGQRHGLGIGGDGDPWFVVGKNLKDNVLYVEQGFHHDALYSDYLIASDYSFVNPEDNDLDQGFECTAKFRYRQKDTKVFVKRENDHALRVTFAEPVRAITPGQAVVFYQGDVCLGGATIDDVFKNEGQLNYVV >NZ_CP039167.1|WP_000409157.1|1681156_1682299_-|cysteine-desulfurase MEIYADYAATTPVKPEVVDAMMMIYNSHYGNPSSIHAKGRDARKYLDESRRQIAQLLGADTHEIIFTSGATESNNTAIKGIVKANEQLGNHIITSKIEHHSVLHVFEQLEREGFDVTYLDVDDTGAIDLDQLEETITDKTILVSIMFVNNEVGTVQQIYDIQDIIAETNAYFHVDAVQAIGHLDVKFDEFEIDAMSITAHKFGGPKGVGALLVKDHVTLDYPQLGGEQELKRRAGTENLAQIVGMAKALQLAEKNRDDNNIHLMNLKEQFLVKLQERAIPFELNGSMTDATGHIVNLYFPFVEVEMMLTLLDMAQIYVSSGSACTAGSTQPSHVLDAMFEDEERSNHSIRFSFNELTTENEINAIVAEIHKIYFKFKEES >NZ_CP039167.1|WP_000985878.1|1682610_1683624_+|LLM-class-flavin-dependent-oxidoreductase MAIKYSALNLVPIREGDDERTAINDMVKLAQHLDELSYERYWIAEHHNAPNLVSSATALLIQHTLEHTKHIRVGSGGIMLPNHAPLIVAEQFGTMATLFPNRVDLGLGRAPGTDMMTASALRRDQHDGVYKFPEEVSLLQQYFGPAHQQAYVRAYPAVGKNVPLYILGSSTDSAHLAARKGLPYVFAGHFAPQQMKEAIEIYKTLFEPSDVLDEPYVIVCLNTIVAENDDEAQYLASSMAQVMVSITRGRMQPVQPPTHDLQNILTPREYAMAMERQKISLIGSENTVQQKIQDFMETYGEVNEIMAISYIYDKDMQLDSYRRFKNVINQINEKNTL >NZ_CP039167.1|WP_000009238.1|1683860_1684007_-|hypothetical-protein MSFMDKAKDAVEKFKNSDNEQVKNVKDKINEYTGSNNEEKKENEDKEK >NZ_CP039167.1|WP_000752909.1|1684046_1684229_-|CsbD-family-protein MADESKFDQFKGNVKETVGNVTDNKELEKEGQQDKATGKAKEVVENAKNKITDAIDKLKK >NZ_CP039167.1|WP_000704122.1|1684328_1684751_-|Rrf2-family-transcriptional-regulator MKISTKGRYGLTLMISLAKKEGQGCISLKSIAEENNLSDLYLEQLVGPLRNAGLIRSVRGAKGGYQLRVPAEEISAGDIIRLLEGPITFVESIESEPPAQKQLWIRMRDAVRDVLDNTTLKYLAEYVDTSEDLDGYMFYI >NZ_CP039167.1|WP_000102728.1|1684835_1686110_+|replication-associated-recombination-protein-A MSTEPLASRMRPKNIDEIISQQHLVGPKGIIRRMVDTKKLTSMIFYGPPGIGKTSIAKAISGSTQYKFRQLNAVTNTKKDMQLVVEEAKMSGQVILLLDEIHRLDKAKQDFLLPHLENGKIVLIGATTSNPYHAINPAIRSRAQIFELYPLNDEDVRQALTRAIEDDENGLKTYQPKIDEDAMTYFSTQSQGDVRSALNALELAVLSADNDKDGYRHVTLQDAKDCLQKGAFVSDKDGDMHYDVMSAFQKSIRGSDVNAALHYLARLIEAGDLPTIVRRLLVISYEDIGLASPNAGQRTLAAIESAERLGLPEARIPLSQAVIELCLSPKSNSAMSAIDSALSDIRNGHVGQIPNHLKDGHYKGAKDLGRSIGYKYPHQYVNGYVSQQYLPDKLKNKIYYEPKTTSKSEQQLKEIYNNLLKQRP >NZ_CP039167.1|WP_000682646.1|1686270_1687044_-|tRNA-threonylcarbamoyladenosine-dehydratase MKHQFSRNELAIGQQGLDLLKQQTVVILGVGGVGSFAAEALARTNIGHIILIDKDDVDITNVNRQLHALTTTVGQSKVSLMEERIKLINPDCKVTPLHMFYTEETYEEIFDNYDIDYFVDASDTIMYKVHLMKECLDRGIKVISSMGAANKTDPTRFTISDISKTHTDPMAKIIRQKLKKLGIRKGIPVVFSDESPIVIREDVKDIVGDKNAINRKGQMPPSSNAFVPSVVGLICASYVVNDVLKDIPVRRIKDKGQ >NZ_CP039167.1|WP_001790559.1|1687043_1687172_-|hypothetical-protein MGFIAFNKCFLVEFWENNQSDNAKYKILSYYVLMYKSVKEVK >NZ_CP039167.1|WP_000044799.1|1687504_1689271_-|aspartate--tRNA-ligase MSKRTTYCGLVTEAFLGQEITLKGWVNNRRDLGGLIFVDLRDREGIVQVVFNPAFSEEALKIAETVRSEYVVEVQGTVTKRDPETVNPKIKTGQVEVQVTNIKVINKSETPPFSINEENVNVDENIRLKYRYLDLRRQELAQTFKMRHQITRSIRQYLDDEGFFDIETPVLTKSTPEGARDYLVPSRVHDGEFYALPQSPQLFKQLLMISGFDKYYQIVKCFRDEDLRADRQPEFTQVDIEMSFVDQEDVMQMGEEMLKKVVKEVKGVEINGAFPRMTYKEAMRRYGSDKPDTRFEMELIDVSQLGRDMDFKVFKDTVENDGEIKAIVAKGAAEQYTRKDMDALTEFVNIYGAKGLAWVKVVEDGLTGPIGRFFETENVETLLTLTGAEAGDLVMFVADKPNVVAQSLGALRVKLAKELGLIDETKLNFLWVTDWPLLEYDEDAKRYVAAHHPFTSPKEADIAKLGTAPEEAEANAYDIVLNGYELGGGSIRIHDGELQEKMFEVLGFTKEQAQEQFGFLLDAFKYGAPPHGGIALGLDRLVMLLTNRTNLRDTIAFPKTASATCLLTNAPGEVSDKQLEELSLRIRH |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP039167_6 | 2154975-2155055 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039167_6
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1 spacers
spacers of NZ_CP039167_6
>6.1|2154999|33|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder ATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTT |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039167_6
The CRISPR arrays of NZ_CP039167_6 >merge|NZ_CP039167|6|2154975-2155055|CRISPRCasFinder CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTCAACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCT >NZ_CP039167|6|6|2154975-2155055|CRISPRCasFinder CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTT ATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTT CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCT
>NZ_CP039167.1|WP_000495669.1|2153866_2154958_+|hypothetical-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKDKKVVTEPKNTKVENGKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >NZ_CP039167.1|WP_000019734.1|2152623_2153601_+|CDF-family-zinc-efflux-transporter-CzrB MSHSHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALVAFIYAEKNATTTKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >NZ_CP039167.1|WP_000003759.1|2152301_2152622_+|Zn(II)-responsive-metalloregulatory-transcriptional-repressor-CzrA MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >NZ_CP039167.1|WP_001024095.1|2151484_2152150_-|SDR-family-oxidoreductase MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFDGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGEQDIKDALTQFEIEKD >NZ_CP039167.1|WP_001127960.1|2150110_2151049_-|class-I-mannose-6-phosphate-isomerase MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >NZ_CP039167.1|WP_000808817.1|2149849_2150080_-|hypothetical-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >NZ_CP039167.1|WP_000123398.1|2147804_2149178_-|EVE-domain-containing-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRMSNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVKKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >NZ_CP039167.1|WP_001123303.1|2146934_2147348_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIKLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >NZ_CP039167.1|WP_000070866.1|2146291_2146735_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLENAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >NZ_CP039167.1|WP_000160304.1|2145460_2146171_+|purine-nucleoside-phosphorylase MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE >NZ_CP039167.1|WP_001802298.1|2155390_2155495_-|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >NZ_CP039167.1|WP_001792291.1|2155927_2156110_-|hypothetical-protein MIIFRFKVNAFFPVKLCLMIRFCLESCCIFRRHLLITFHNIRSKFIMFKYISSKCIICTG >NZ_CP039167.1|WP_001792784.1|2156174_2156333_+|hypothetical-protein MSKSSDALFNSLTQSFELIEGVYNELVTDNLKIVMYKPRKESTSGRINRRFK >NZ_CP039167.1|WP_001794441.1|2156769_2156862_+|hypothetical-protein MTYGSIVAILCALFVIFFIPYMEKKDKKKK >NZ_CP039167.1|WP_000370925.1|2156990_2157848_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >NZ_CP039167.1|WP_000908182.1|2157915_2158698_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLIQLDQIGRMKQGKTILKNISWQIAKGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATTGGVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEVRNEAHHLLKLVGISAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLNILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITGNFTKILLLKDGESVQQGLIDDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >NZ_CP039167.1|WP_000334463.1|2158929_2160735_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEDGTPVVALATQENVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >NZ_CP039167.1|WP_000083805.1|2161415_2162954_+|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPLMKFIMHILSVAVEALVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPKGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEKLLNNLKKDDQA >NZ_CP039167.1|WP_000927371.1|2162988_2165121_+|BglG-family-transcription-antiterminator MLLSTREKEMIALLIKYHSQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGADSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMIDKDDVHVETKDVDGNTSFENEQTSYLTSVFEKHLSDEKSEQLLHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFIPDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI >NZ_CP039167.1|WP_001292149.1|2165132_2165567_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP039167_7 | 2167296-2167381 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039167_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP039167_7
>7.1|2167322|34|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder TTGCATATCTTTAGCTTTATTGTTTGCAACTGGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039167_7
The CRISPR arrays of NZ_CP039167_7 >merge|NZ_CP039167|7|2167296-2167381|CRISPRCasFinder CCAACTGATTTTTGCGTATCATTAGTTTGCATATCTTTAGCTTTATTGTTTGCAACTGGGCCAACTGATTTTTGCGTATCATTAGT >NZ_CP039167|7|7|2167296-2167381|CRISPRCasFinder CCAACTGATTTTTGCGTATCATTAGT TTGCATATCTTTAGCTTTATTGTTTGCAACTGGG CCAACTGATTTTTGCGTATCATTAGT
>NZ_CP039167.1|WP_000648723.1|2165566_2166673_+|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVKDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAGYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS >NZ_CP039167.1|WP_001292149.1|2165132_2165567_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >NZ_CP039167.1|WP_000927371.1|2162988_2165121_+|BglG-family-transcription-antiterminator MLLSTREKEMIALLIKYHSQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGADSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMIDKDDVHVETKDVDGNTSFENEQTSYLTSVFEKHLSDEKSEQLLHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFIPDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI >NZ_CP039167.1|WP_000083805.1|2161415_2162954_+|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPLMKFIMHILSVAVEALVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPKGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEKLLNNLKKDDQA >NZ_CP039167.1|WP_000334463.1|2158929_2160735_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEDGTPVVALATQENVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >NZ_CP039167.1|WP_000908182.1|2157915_2158698_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLIQLDQIGRMKQGKTILKNISWQIAKGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATTGGVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEVRNEAHHLLKLVGISAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLNILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITGNFTKILLLKDGESVQQGLIDDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >NZ_CP039167.1|WP_000370925.1|2156990_2157848_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >NZ_CP039167.1|WP_001794441.1|2156769_2156862_+|hypothetical-protein MTYGSIVAILCALFVIFFIPYMEKKDKKKK >NZ_CP039167.1|WP_001792784.1|2156174_2156333_+|hypothetical-protein MSKSSDALFNSLTQSFELIEGVYNELVTDNLKIVMYKPRKESTSGRINRRFK >NZ_CP039167.1|WP_001792291.1|2155927_2156110_-|hypothetical-protein MIIFRFKVNAFFPVKLCLMIRFCLESCCIFRRHLLITFHNIRSKFIMFKYISSKCIICTG >NZ_CP039167.1|WP_000521495.1|2174714_2176070_-|phosphoglucosamine-mutase MGKYFGTDGVRGVANQELTPELAFKLGRYGGYVLAHNKGEKHPRVLVGRDTRVSGEMLESALIAGLISIGAEVMRLGIISTPGVAYLTRDMGAELGVMISASHNPVADNGIKFFGSDGFKLSDEQENEIEALLDQENPELPRPVGNDIVHYSDYFEGAQKYLSYLKSTVDVNFEGLKIVLDGANGSTSSLAPFLFGDLEADTETIGCSPDGYNINEKCGSTHPEKLAEKVVETESDFGLAFDGDGDRIIAVDENGQIVDGDQIMFIIGQEMHKNQELNNDMIVSTVMSNLGFYKALEQEGIKSNKTKVGDRYVVEEMRRGNYNLGGEQSGHIVMMDYNTTGDGLLTGIQLASVIKMTGKSLSELAGQMKKYPQSLINVRVTDKYRVEENVDVKEVMTKVEVEMNGEGRILVRPSGTEPLVRVMVEAATDEDAERFAQQIADVVQDKMGLDK >NZ_CP039167.1|WP_000894032.1|2176096_2177029_-|YbbR-like-domain-containing-protein MLESKWGLRFIAFLLALFFFLSVNNVFGNIFNTGNLGQKSSKTIQDVPVEILYNTKDLHLTKAPETVNVTISGPQSKIIKIENPEDLRVVIDLSNAKAGKYQEKYQVKGLADDIHYSVKPKLANITLENKVTKKMTVQPDVSQSDIDPLYKITKQEVSPQTVKVTGGEEQLNDIAYLKATFKTNKKINGDTKDVAEVTAFDKKLNKLNVSIQPNEVNLQVKVEPFSKKVKVNVKQKGSLADDKELSSIDLEDKEIEIFGSRDDLQNISEVDAEVDLDGISESTEKTVKINLPEHVTKAQPSETKAYINVK >NZ_CP039167.1|WP_000347896.1|2177030_2177840_-|TIGR00159-family-protein MDFSNFFQNLSTLKIVTSILDLLIVWYVLYLLITVFKGTKAIQLLKGILVIVIGQQISMILNLTATSKLFDIVIQWGVLALIVIFQPEIRRALEQLGRGSFLKRYTSNTYSKDEEKLIQSVSKAVQYMAKRRIGALIVFEKETGLQDYIETGIAMDSNISQELLINVFIPNTPLHDGAMIIQGTKIAAAASYLPLSDSPKISKSLGTRHRAAVGISEVSDAFTVIVSEETGDISVTFDGKLRRDISNEIFEELLAEHWFGTRFQKKGVK >NZ_CP039167.1|WP_000167867.1|2178028_2178937_-|arginase MTKTKAIDIIGAPSTFGQRKLGVDLGPTAIRYAGLISRLKQLDLDVYDKGDIKVPAVNIEKFHSEQKGLRNYDEIIDVNQKLNKEVSASIENNRFPLVLGGDHSIAVGSVSAISKHYNNLGVIWYDAHGDLNIPEESPSGNIHGMPLRILTGEGPKELLELNSNVIKPENIVLIGMRDLDKGERQFIKDHNIKTFTMSDIDKLGIKEVIENTIEYLKSRNVDGVHLSLDVDALDPLETPGTGTRVLGGLSYRESHFALELLHQSHLISSMDLVEVNPLIDSNNHTAEQAVSLVGTFFGETLL >NZ_CP039167.1|WP_000958531.1|2180163_2181228_-|P-loop-NTPase MLTVDQVKELVGEIKDPIIDVPLKETEGIVEVSIKEEKEHVSVKLAMAQLGGAPQLDLQMAVVNALKENGAKTVGIRFETLPEEKVNQFKPKEENKPKTIEGLLSQNNPVEFIAIASGKGGVGKSTVAVNLAVALAREGKKVGLVDADIYGFSVPDMMGIDEKPGIKGKEVIPVERHGVKVISMAFFVEENAPVIWRGPMLGKMLTNFFTEVKWGDIEYLILDLPPGTGDVALDVHTMLPSSKEIIVTTPHPTAAFVAARAGAMAKHTDHSILGVIENMSYFESKETGNKEYVFGKGGGTKLADELNTQLLGELPLEQPSWNPKDFAPSIYQSDDRLGKIYSSIAQKVIAATNK >NZ_CP039167.1|WP_001141007.1|2181375_2182818_-|multidrug-efflux-MFS-transporter-LmrS MAKVELTTRRRNFIVAVMLISAFVAILNQTLLNTALPSIMRELNINESTSQWLVTGFMLVNGVMIPLTAYLMDRIKTRPLYLAAMGTFLLGSIVAALAPNFGVLMLARVIQAMGAGVLMPLMQFTLFTLFSKEHRGFAMGLAGLVIQFAPAIGPTVTGLIIDQASWRVPFIIIVGIALVAFVFGLVSISSYNEVKYTKLDKRSVMYSTIGFGLMLYAFSSAGDLGFTSPIVIGALIISMVIIYLFIRRQFNITNVLLNLRVFKNRTFALCTISSMIIMMSMVGPALLIPLYVQNSLSLSALLSGLVIMPGAIINGIMSVFTGKFYDKYGPRPLIYTGFTILTITTIMLCFLHTDTSYTYLIVVYAIRMFSVSLLMMPINTTGINSLRNEEISHGTAIMNFGRVMAGSLGTALMVTLMSFGAKIFLSTSPSHLTATEIKQQSIAIGVDISFAFVAVLVMAAYVIALFIREPKEIESNRRKF >NZ_CP039167.1|WP_000636857.1|2183140_2183614_-|multidrug-efflux-transporter-SepA MIVNYLKHKFYNLLTTMIVLFIFVLSGAIFLTFLGFGLYGLSRILIYFRLGDFTYNRSMYDNLLYYGSYIIFGYFIIFAVEHLMDYFRKMLPENAYFRGATFHLISYTVATTLFYFIIHLNYVYINIDFWVIMVIIGFLYVCKLQFYPESKNLNNRK >NZ_CP039167.1|WP_001237506.1|2183712_2185056_-|MFS-transporter MRLKSIITVIALILIMFMSAIESSIISLALPTIKQDLNAGNLISLIFTAYFIALVIANPIVGELLSRFKIIYVAIAGLLLFSIGSFMCGLSTNFTMLIISRVIQGFGSGVLMSLSQIVPKLAFEIPLRYKIMGIVGSVWGISSIIGPLLGGGILEFATWHWLFYINIPIAIIAIILVIWTFHFPEEETVAKSKFDTKGLTLFYVFIGLIMFALLNQQLLLLNFLSFILAIVVAMCLFKVEKHVSSPFLPVVEFNRSITLVFITDLLTAICLMGFNLYIPVYLQEQLGLSPLQSGLVIFPLSVAWITLNFNLHRIEAKLSRKVIYLLSFTLLLVSSIIISFGIKLPVLIAFVLILAGLSFGYIYTKDSVIVQEETSPLQMKKMMSFYGLTKNLGASIGSTIMGYLYAIQSGIFGPNLHNVLSAVAVISIGLIVLWVVFFKEQSSQSKE >NZ_CP039167.1|WP_000047255.1|2185232_2185916_-|hemolysin-III-family-protein MSKSTKKSNDTIVETFKDIIPLSFGEEIGNAASHGVAALLTLLVLPYAAVHSYIAHGTLASVSMSIYVISIFMMFISSTIYHSMQNETPHKYILRIIDHSMIYVAISGTYTPILLTVVGGWIGWTVFILLWGTTLWGILYKSIAVKVNQKLSLIVYLVMGWVGIILLPIIFIRTSWIFILFIFLGGVSYTIGAWFYAQKNRPYFHMIWHIFIVIASLLHLIAILYFM >NZ_CP039167.1|WP_000884735.1|2185934_2187122_-|UDPGP-type-1-family-protein MLDKNQLAKYKQDHLCEYEKIMSNNEKEALEEKVASLDLDFIAKLYNDLYINKKTIDDVSAVSEVKYDIKSQMSDDEIKRLEEQGLQAIKEGQFAVLLMAGGQGTRLGYKGPKGSFEIEGVSLFELQANQLKTLNHQSGHTIQWYIMTSDINHEETLAYFEAHSYFGYDQEAIHFFKQDNIVALSEEGKLILNQQGRIMETPNGNGGVFKSLDKAGYLEEMSNNGVKYIFLNNIDNVLVKVLDPLFAGFTVEHDYDITSKTIQPKPGESVGRLVNVDCKDTVLEYSELDPEVANQFNNANIGIHAFKLGFILNAVNRELPYHLAIKNLKQLDENFGVIEQPTLKFELFYFDIFTYGTSFVTLQVPREEEFSPLKNKEGKDSVATATEDLRRMGLI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP039167_8 | 2263708-2263900 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039167_8
|
3 spacers
spacers of NZ_CP039167_8
>8.1|2263731|32|NZ_CP039167|CRT CATTATTGTATGCTGACTTTTGTCAGCTTCTG >8.2|2263786|36|NZ_CP039167|CRT TGCATTGTCTGTAGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTA >8.3|2263845|33|NZ_CP039167|CRT CATTATTGTATGCTGACTTTTCGTCAGCTTCTG >8.4|2263843|31|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder CACATTATTGTATGCTGACTTTTCGTCAGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039167_8
The CRISPR arrays of NZ_CP039167_8 >merge|NZ_CP039167|8|2263708-2263900|CRT,CRISPRCasFinder TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTATGCTGACTTTTGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGTTCCGCAACTTGCATTGTCTGTAGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTATGCTGACTTTTCGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGTA >NZ_CP039167|8|1|2263708-2263900|CRT TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCA CATTATTGTATGCTGACTTTTGTCAGCTTCTG TGTTGGGGCCCCGTTCCGCAACT TGCATTGTCTGTAGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTA TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCA CATTATTGTATGCTGACTTTTCGTCAGCTTCTG TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGTA >NZ_CP039167|8|8|2263818-2263898|CRISPRCasFinder TCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTG CACATTATTGTATGCTGACTTTTCGTCAGCT TCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTG
>NZ_CP039167.1|WP_103150518.1|2263477_2263663_+|hypothetical-protein MFRFISFGQLVVYSTTFIPKKEILQLNDLECDNNVKEPLKIYYVVIFGSGTEITFSQNLFR >NZ_CP039167.1|WP_000066900.1|2263001_2263352_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >NZ_CP039167.1|WP_000184419.1|2261688_2262900_+|MFS-transporter MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFLVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDGSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAIDLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETNVIDKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >NZ_CP039167.1|WP_000951065.1|2261255_2261696_+|winged-helix-DNA-binding-protein MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKYQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDAQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLKEAHND >NZ_CP039167.1|WP_000600967.1|2260329_2261094_-|VOC-family-protein MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIEAVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKVKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >NZ_CP039167.1|WP_001566779.1|2260086_2260338_+|hypothetical-protein MRTIILSLFIIMNIVAIIMTLSQPLTVNYFSLRVILIFFTFILSIFFILIKSSRLNNILTILSIVLAIIHMGILAHSTYVYLY >NZ_CP039167.1|WP_000413866.1|2258432_2259698_-|lipid-II:glycine-glycyltransferase-FemX MEKMHITNQEHDAFVKSHPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEVQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSAKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKNDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDREGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEITKWQQKMETSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYVLNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK >NZ_CP039167.1|WP_000592314.1|2255148_2258316_-|efflux-RND-transporter-permease-subunit MIKKLLQFSLGNKFAIFLMVVLVVLGGVYASAKLKLELLPNVQNPVISVTTTMPGATPQSTQDEISSKIDNQVRSLAYVKNVKTQSIQNASIVTVEYENNTDMDKAEEQLKKEIDKIKFKDEVGQPELRRNSMDAFPVLAYSFSNKENDLKKVTKVLNEQLIPKLQTVDGVQNAQLNGQTNREITLKFKQNELEKYGLTADDVENYLKTATRTTPLGLFQFGDKDKSIVVDGQYQSVDAFKNINIPLTLAGGQGQSQSQSDNKQNSAMSDVNQASPQQNSKASASNNISGMPTAKLGDLADITVGDVRTSISKTNGKDAVNLQITKAQDANTVQVAKDVQRKIDTFVDENKDFNVTKTMDTAKPVEKSLYTMVEKASLGTIVAIIVILLFLRNIRTTAISIISIPLSLLMALIALKLSDVSLNILTLGALTVAIGRVIDDSIVVVENIYRRLTDSEEQLKGENLIISATTEVFKPIMSSTLVTIIVFLPLVFVSGSVGEMFRPFALAIAFSLLASLLVSITLVPALAATLFKKGVKRRNKQHQEGLGVVSTTYKKVLHWSLNHKWIVIILSTLILVATIVFGGPRLGTSFISAGDDKFLAITYTPKPGETEQAVLNHAKDVEKYLKQKKHVKTIQYSVGGSSPVDPTGSTNSMAIMVEYDNDTPNFDVEADKVIKHADGFKHPGEWKNQDLGTGAGNKSVEVTVKGPSMDAIKSTVKDIEQKMKQVKGLANVKSDLSQTYDQYEIKVDQNKAAENGISASQLAMHLNENLPEKTVTTVKENGKTVDVKVKQNKQTDWSEDKLNNITLKKPTGGTIKLGDIATLVKTTTPSKLTQEQGDYATTVSAKVTNKDVGGTTRQVMSKINNLDKPNNVKVNIGGASDDINNAMTQLAFAMLAAIIIVYLILVITFKGGLAPFTILFSLPFTVIGVIIALLITGETISVPSLIGMLMLIGIVVTNAIVLIDRVINNEQQGMEMKEALIEAGGTRIRPILMTAIATIGALVPLLFGQDSSILISKGLAATVIGGLISSTLLTLVVVPVIYEILFTLKKRFTKR >NZ_CP039167.1|WP_001161085.1|2254644_2254962_+|hypothetical-protein MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVVFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKENWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF >NZ_CP039167.1|WP_000051206.1|2254235_2254400_+|hypothetical-protein MSLENQLAELKYDYVRLQGDIEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD >NZ_CP039167.1|WP_000230173.1|2264041_2265064_-|GTP-3',8-cyclase-MoaA MVEQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLDVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEQHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >NZ_CP039167.1|WP_000643985.1|2265083_2265683_-|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase-MobA MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYSRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSKLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNVYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL >NZ_CP039167.1|WP_000866971.1|2265689_2265923_-|molybdopterin-converting-factor-subunit-1 MKVLYFAEIKDILQKAQEDIVLEQALTVQQFEDLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG >NZ_CP039167.1|WP_000808500.1|2265928_2266375_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaE MKQFEIVTEPIQTEQYREFTINEYQGAVVVFTGHVREWTKGVKTEYLEYEAYIPMAEKKLAQIGDEINEKWPGTITSIVHRIGPLQISDIAVLIAVSSPHRKDAYRANEYAIERIKEIVPIWKKEIWEDGSKWQGHQKGNYEEAKREE >NZ_CP039167.1|WP_000602936.1|2266388_2266874_-|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B MILQIVGYKKSGKTTLMRHIVSFLKSHGYTVATIKHHGHGKEDIQLQDSDVDHMKHFEAGADQSIVQGFQYQQTVTRVDNQNLTQIIEKSVTIDTNIVLVEGFKNADFEKVVVYRNEEELQVLQQLSNVCYSINVKEHEDFTAFEQWLLNKIKNDCDTQLT >NZ_CP039167.1|WP_000259726.1|2266870_2268130_-|molybdopterin-molybdotransferase-MoeA MVVEKRNPIPVKEAIQRIVNQQSSMPAITVALEKSLNHILAEDIVATYDIPRFDKSPYDGFAIRSVDSQGASGQNRIEFKVIDHIGAGSVSDKLVGDHEAVRIMTGAQIPNGADAVVMFEQTIELEDTFTIRKPFSKNENISLKGEETTTGDVVLKKGQVINPGAIAVLATYGYAEVKVIKQPSVAVIATGSELLDVNDVLEDGKIRNSNGPMIRALAEKLGLEVGIYKTQQDDLDSGIQVVKEAMEKHDIVITTGGVSVGDFDYLPEIYKAVKAEVLFNKVAMRPGSVTTVAFADGKYLFGLSGNPSACFTGFELFVKPAVKHMCGALEVFPQIIKATLMEDFTKANPFTRFIRAKATLTSAGATVVPSGFNKSGAVVAIAHANCMVMLPGGSRGFKAGHTVDIILTESDAAEEELLL >NZ_CP039167.1|WP_000134527.1|2268192_2268687_+|cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-MoaC MTEFTHINQQGHAKMVDVSDKQITKRTAVAHSSITVNETIFKQISNNTNTKGNVLNTAQIAGIMAAKNTSTIIPMCHPLPLTGIDVHFSWDETNAPLYTLNIQTTVSTTGKTGVEMEALTAASATALTIYDMTKAVDKGMIIGETYLESKSGGKSGDFQRQSNQ >NZ_CP039167.1|WP_000503820.1|2268688_2269195_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaB MGEHQNVKLNRTVKAAVLTVSDTRDFDTDKGGQCVRQLLQADDVEVSDAHYTIVKDEKVAITTQVKKWLEEDIDVIITTGGTGIAQRDVTIEAVKPLLTKEIEGFGELFRYLSYVEDVGTRALLSRAVAGTVNNKLIFSIPGSTGAVKLALEKLIKPELNHLIHELTK >NZ_CP039167.1|WP_000076931.1|2269225_2270230_-|molybdopterin-biosynthesis-protein-MoeB MSQERYSRQILFKQIGEIGQSKISQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDDYIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKHRVPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSDCTTCGDVPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >NZ_CP039167.1|WP_000913019.1|2270399_2271005_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MLKINVKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTAKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSEHIDQLIQTLNIDHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP039167_9 | 2414209-2414306 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039167_9
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1 spacers
spacers of NZ_CP039167_9
>9.1|2414238|40|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder TTATGCATTAGTAGCGAAGCTAACTAATGCGTTCCTTTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039167_9
The CRISPR arrays of NZ_CP039167_9 >merge|NZ_CP039167|9|2414209-2414306|CRISPRCasFinder TTTCTGCGAATTTTATGAGCTAGAAAGGCTTATGCATTAGTAGCGAAGCTAACTAATGCGTTCCTTTATTTTCTGCGAATTTTATGAGCTAGAAAGGC >NZ_CP039167|9|9|2414209-2414306|CRISPRCasFinder TTTCTGCGAATTTTATGAGCTAGAAAGGC TTATGCATTAGTAGCGAAGCTAACTAATGCGTTCCTTTAT TTTCTGCGAATTTTATGAGCTAGAAAGGC
>NZ_CP039167.1|WP_000019127.1|2413202_2414069_-|cation-transporter MSHNENLKLAQRGAYLSLIVYIILSIVKYVTGFVFNSAAVRADALNNMTDIIVSLAVIIGLKISIKPADRNHPYGHLKSENISSLLVSFVIMFVGIQVVIQNAPRLFKEDDVVPNAITIIVSLISGLVMLIVFAVNQRLAKRTKSSSLNSAAKDNLSDSLVSIGTAIGLIFTQIGFPIVDIILATLLGLLIVYTGFGIFKEAIFMLSDGFNETELEAYRNDILEVDEVQEVKSIKGRYHGSSVFIDVTIVVDANLSLVEAHQICDNVEHHLHKKGISSVYVHPEPDHL >NZ_CP039167.1|WP_001125208.1|2412189_2412876_-|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase MPKLILCRHGQSEWNAKNLFTGWEDVNLSEQGINEATRAGEKVRENNIAIDVAFTSLLTRALDTTHYILTESKQQWIPVYKSWRLNERHYGGLQGLNKDDARKEFGEEQVHIWRRSYDVKPPAETEEQREAYLADRRYNHLDKRMMPYSESLKDTLVRVIPFWTDHISQYLLDGQTVLVSAHGNSIRALIKYLEDVSDEDIINYEIKTGAPLVYELTDDLEVIDKYYL >NZ_CP039167.1|WP_000762708.1|2411931_2412036_+|putative-metal-homeostasis-protein MKLDLQTARRNLNSPNIKTRKRALKIIKQHKRAK >NZ_CP039167.1|WP_000038959.1|2410318_2411758_-|multidrug-efflux-MFS-transporter-MdeA 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>NZ_CP039167.1|WP_000792580.1|2414698_2416012_+|immunoglobulin-binding-protein-Sbi MKNKYISKLLVGAATITLATMISNGEAKASENTQQTSTKHQTTQNNYVTDQQKAFYQVLHLKGITEEQRNQYIKTLREHPERAQEVFSESLKDSKNPDRRVAQQNTFYNVLKNDNLTEQEKNNYIAQIKENPDRSQQVWVESVQSSKAKERQNIENADKAIKDFQDNKAPHDKSAAYEANSKLPKDLRDKNNRFVEKVSIEKAIVRHDERVKSANDAISKLNVKDSIENRRLAQREVNKAPMDVKEHLQKQLDALVAQKDAEKKVAPKVEAPQIQSPQIEKPKAESPKVEVPQIQSPKVEVPQSKLLGYYQSLKDSFNYGYKYLTDTYKSYKEKYDTAKYYYNTYYKYKGAIDKAVLTLLGDGSKSYIQPLKVDDKNGYLAKSYAQVRNYVTESINTGKVLYTFYQNPTLVKTAIKAQETASSIKNTITGLFNSFWK >NZ_CP039167.1|WP_001792511.1|2416230_2416413_-|hypothetical-protein MMFLHYVMFKRFIGRRRLYSYITMFCKSYSIELLFNYGACSGRGMDCAIVCENLKLIKLS >NZ_CP039167.1|WP_000594519.1|2416547_2417477_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB-subunit-A 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MMFQEQIDLLQQKGLYRSLKSVGYIDRQYIEVENKRCTNYTSNDYLGLGQIAFDKDDFERFMRKYSYHLSSSRLISGSSTAYEEIETMLAGWLGYSACTILNSGYDANLALFNIFKNTNCVVFSDQENHASIIDGIKLSGLEKVIYKHLDIADLEKRLEKYPNQNIPKIIISDSAFSTNGDVVDIGQLVSLKHKYNATLILDVSHSFGIENYSNYQGVDILTSSLSKACGAYGGVILSSNDVKDMLINHGRPLIYSSSLPIYNLYFIKRNIEKLINADDRRTKLNSLSKYFNQKLKALNVNYNSSNSPIKFIEFDDIEAAENIHQTLLKHHVFTSYLRYPTVTKPMLRISLSYFHTEQDIDRLFEILHQED >NZ_CP039167.1|WP_001046645.1|2422295_2423303_-|biotin-synthase-BioB MNLAKRILQGEQLTKETVLKIYEDTNIDTLDLLNEAYILRKHYFGKKVKLNMILNAKSGICPENCGYCGQSRDIKQKQRYALIPEEQIIDGAKVAHDNHIGTYCIVMSGRGPSDKEVDHISNTVRTIKSQHPQLKICACLGLTNDEQAKKLKSAGVDRYNHNINTSENYHDNVVTTHSYKDRTDTIELMKANNISPCSGVICGMGESNQDIVDMAFALKEMDADSIPINFLHPIKGTKFGSMDDLTPMKCLRIVALFRLINPTKEIRIAGGREVNLRSLQPLALKAANSIFVGDYLITGGQPNQLDYDMINDLGFEIDYDTCENKENKNDVSRAN |
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---|---|---|---|---|---|---|---|
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tagaagctggcggaaagtcagcatacaataatg CRISPR spacer tagaagctggcggaaagtcaggttacaataatg Protospacer ********************* **********
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34. spacer 8.2|2263786|36|NZ_CP039167|CRT matches to position: 1645345-1645380, mismatch: 2, identity: 0.944
tgcattgtctgtagaatttctttttgaaattctcta CRISPR spacer tgcattgcctgtagaatttcttttcgaaattctcta Protospacer *******.****************.***********
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41. spacer 8.4|2263843|31|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to position: 750303-750333, mismatch: 2, identity: 0.935
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42. spacer 8.4|2263843|31|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to position: 750359-750389, mismatch: 2, identity: 0.935
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43. spacer 8.4|2263843|31|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to position: 802306-802336, mismatch: 2, identity: 0.935
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44. spacer 8.4|2263843|31|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to position: 1962728-1962758, mismatch: 2, identity: 0.935
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | NZ_KY270853 | Raoultella ornithinolytica strain YNKP001 plasmid pYNKP001-dfrA, complete sequence | 37339-37370 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | NZ_KX839207 | Klebsiella pneumoniae strain KP1814 plasmid pKP1814-1, complete sequence | 106205-106236 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | NZ_CP021328 | Raoultella ornithinolytica strain Ro24724 plasmid pRo24724, complete sequence | 319442-319473 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | NZ_CP025467 | Klebsiella pneumoniae strain JS187 plasmid p187-1, complete sequence | 229082-229113 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | NZ_CP019048 | Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain RJA166 plasmid pRJA166a, complete sequence | 17455-17486 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | NC_018107 | Klebsiella michiganensis E718 plasmid pKOX_R1, complete sequence | 206727-206758 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | NZ_CP022441 | Klebsiella sp. LY plasmid unnamed3, complete sequence | 191028-191059 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | KU318421 | Klebsiella pneumoniae strain KP04 plasmid pKP04VIM, complete sequence | 37881-37912 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | NC_023911 | Raoultella planticola strain KpNDM1 plasmid pKpNDM1, complete sequence | 256422-256453 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | NZ_CP025964 | Klebsiella pneumoniae strain WCHKP34 plasmid pIMP4_LL34, complete sequence | 172857-172888 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | NZ_CP038277 | Raoultella ornithinolytica strain WLK218 plasmid pWLK-238550, complete sequence | 221440-221471 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | NZ_CP024641 | Klebsiella michiganensis strain F107 plasmid unnamed1, complete sequence | 281239-281270 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | CP027603 | UNVERIFIED_ORG: Klebsiella pneumoniae strain AR_0080 plasmid unnamed, complete sequence | 71493-71524 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | NZ_CP046614 | Klebsiella pneumoniae strain WCGKP294 plasmid pWCGKP294-2, complete sequence | 37800-37831 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | NZ_CP026014 | Klebsiella variicola strain 13450 plasmid p13450-1, complete sequence | 118204-118235 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | NZ_CP026019 | Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-1, complete sequence | 275327-275358 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | NZ_MF344561 | Klebsiella pneumoniae strain 11219 plasmid p11219-IMP, complete sequence | 38947-38978 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | NZ_MF344566 | Klebsiella pneumoniae strain A324 plasmid pA324-IMP, complete sequence | 37553-37584 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | NZ_MF344562 | Klebsiella pneumoniae strain 12208 plasmid p12208-IMP, complete sequence | 40101-40132 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | NZ_MF344567 | Klebsiella pneumoniae strain A708 plasmid pA708-IMP, complete sequence | 37881-37912 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | NZ_MF344563 | Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-VIM, complete sequence | 37792-37823 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | NZ_MF344564 | Klebsiella pneumoniae strain 13450 plasmid p13450-IMP, complete sequence | 38947-38978 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | NZ_CP026369 | Klebsiella quasipneumoniae strain A708 plasmid pA708-1, complete sequence | 83124-83155 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | NZ_CP028952 | Klebsiella aerogenes strain AR_0161 plasmid unnamed, complete sequence | 436045-436076 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | MN661402 | Klebsiella quasipneumoniae strain KP18-31 plasmid pKP18-31-IMP,KPC, complete sequence | 222862-222893 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | MK599315 | Pseudomonas phage PA1C, complete genome | 261289-261320 | 7 | 0.781 |
NZ_CP039167_7 | 7.1|2167322|34|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 2167322-2167355 | 34 | JN882286 | Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome | 23034-23067 | 8 | 0.765 |
NZ_CP039167_7 | 7.1|2167322|34|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 2167322-2167355 | 34 | CP030544 | Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence | 7567-7600 | 8 | 0.765 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | NC_010371 | Finegoldia magna ATCC 29328 plasmid pFMC, complete sequence | 149144-149175 | 10 | 0.688 |
NZ_CP039167_1 | 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder | 230475-230506 | 32 | MN103543 | Pseudomonas phage vB_PaeM_PS119XW, complete genome | 261900-261931 | 10 | 0.688 |
1. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to NZ_KY270853 (Raoultella ornithinolytica strain YNKP001 plasmid pYNKP001-dfrA, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
caaagaatttcgaaaagaaattctacaggtaa- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-acagcagcg Protospacer ***.******** ********** **** .
2. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to NZ_KX839207 (Klebsiella pneumoniae strain KP1814 plasmid pKP1814-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
caaagaatttcgaaaagaaattctacaggtaa- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-acagcagcg Protospacer ***.******** ********** **** .
3. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021328 (Raoultella ornithinolytica strain Ro24724 plasmid pRo24724, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
caaagaatttcgaaaagaaattctacaggtaa- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-acagcagcg Protospacer ***.******** ********** **** .
4. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP025467 (Klebsiella pneumoniae strain JS187 plasmid p187-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
caaagaatttcgaaaagaaattctacaggtaa- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-acagcagcg Protospacer ***.******** ********** **** .
5. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019048 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain RJA166 plasmid pRJA166a, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
caaagaatttcgaaaagaaattctacaggtaa- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-acagcagcg Protospacer ***.******** ********** **** .
6. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to NC_018107 (Klebsiella michiganensis E718 plasmid pKOX_R1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
caaagaatttcgaaaagaaattctacaggtaa- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-acagcagcg Protospacer ***.******** ********** **** .
7. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022441 (Klebsiella sp. LY plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
caaagaatttcgaaaagaaattctacaggtaa- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-acagcagcg Protospacer ***.******** ********** **** .
8. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to KU318421 (Klebsiella pneumoniae strain KP04 plasmid pKP04VIM, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
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9. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to NC_023911 (Raoultella planticola strain KpNDM1 plasmid pKpNDM1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
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10. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP025964 (Klebsiella pneumoniae strain WCHKP34 plasmid pIMP4_LL34, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
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11. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038277 (Raoultella ornithinolytica strain WLK218 plasmid pWLK-238550, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
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12. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024641 (Klebsiella michiganensis strain F107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
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13. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to CP027603 (UNVERIFIED_ORG: Klebsiella pneumoniae strain AR_0080 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
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14. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP046614 (Klebsiella pneumoniae strain WCGKP294 plasmid pWCGKP294-2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
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15. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026014 (Klebsiella variicola strain 13450 plasmid p13450-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
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16. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026019 (Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
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17. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to NZ_MF344561 (Klebsiella pneumoniae strain 11219 plasmid p11219-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
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18. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to NZ_MF344566 (Klebsiella pneumoniae strain A324 plasmid pA324-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
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19. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to NZ_MF344562 (Klebsiella pneumoniae strain 12208 plasmid p12208-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
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20. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to NZ_MF344567 (Klebsiella pneumoniae strain A708 plasmid pA708-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
caaagaatttcgaaaagaaattctacaggtaa- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-acagcagcg Protospacer ***.******** ********** **** .
21. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to NZ_MF344563 (Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-VIM, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
caaagaatttcgaaaagaaattctacaggtaa- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-acagcagcg Protospacer ***.******** ********** **** .
22. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to NZ_MF344564 (Klebsiella pneumoniae strain 13450 plasmid p13450-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
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23. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026369 (Klebsiella quasipneumoniae strain A708 plasmid pA708-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
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24. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028952 (Klebsiella aerogenes strain AR_0161 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
caaagaatttcgaaaagaaattctacaggtaa- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-acagcagcg Protospacer ***.******** ********** **** .
25. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to MN661402 (Klebsiella quasipneumoniae strain KP18-31 plasmid pKP18-31-IMP,KPC, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
caaagaatttcgaaaagaaattctacaggtaa- CRISPR spacer caaggaatttcgtaaagaaattc-acagcagcg Protospacer ***.******** ********** **** .
26. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to MK599315 (Pseudomonas phage PA1C, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
caaagaatttcgaaaagaaattctacaggtaa-- CRISPR spacer gaaacaattgcgaaaagaaattct--gagtaata Protospacer *** **** ************** ..****
27. spacer 7.1|2167322|34|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to JN882286 (Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ttgcatatctttagctttattgtttgcaactggg CRISPR spacer ttgcatatctttagctttatagcttttatatgct Protospacer ******************** *.** .* **
28. spacer 7.1|2167322|34|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to CP030544 (Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ttgcatatctttagctttattgtttgcaactggg CRISPR spacer ttgaataactttagctttattgttataaacagta Protospacer *** *** **************** *** * .
29. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to NC_010371 (Finegoldia magna ATCC 29328 plasmid pFMC, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
caaagaatttcgaaaagaaattctacaggtaa CRISPR spacer gaaagaatttcaaaaagaaatactctttagca Protospacer **********.********* ** . . *
30. spacer 1.1|230475|32|NZ_CP039167|CRISPRCasFinder matches to MN103543 (Pseudomonas phage vB_PaeM_PS119XW, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
caaagaatttcgaaaagaaattctacaggtaa CRISPR spacer gaaacaattgcgaaaagaaattctgagcaata Protospacer *** **** **************. . . *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
675117 : 682937
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039167|675117:682937|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTACGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTGTTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTAGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAGCCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCTGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAGTTAATACAGAGGCAACAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCGAAATAAGAGGAGGGCATTTTTTTAGGTGAGAAAATATTTATCTGAACTAGATAACACTATAAAACACTTCTGATATTTTGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTTATAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGCTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTGCTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCCACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGTAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGTGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGATTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCTTCCTTCACCCTGAATGGTTGGGCCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACGACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTTAAATGGCTAAAGTTCACTAAAAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACACGGAATGTGATGTGCAGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039167|675117:682937|678368_678953_-|WP_000637687.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NZ_CP039167|675117:682937|680189_680858_-|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NZ_CP039167|675117:682937|675117_676173_-|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_CP039167|675117:682937|677648_678089_-|WP_001093562.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVASVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NZ_CP039167|675117:682937|681208_681802_+|WP_000604514.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHIRFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_CP039167|675117:682937|679768_680188_-|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_CP039167|675117:682937|679051_679765_-|WP_001062972.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP039167|675117:682937|676172_676859_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_CP039167|675117:682937|681785_682937_+|WP_001217802.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNINRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKNNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NZ_CP039167|675117:682937|676833_677307_-|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
694909 : 708493
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039167|694909:708493|DBSCAN-SWA TATGAAAGAACAACTTAATCAACTATCAGCATATCAGCCTGGTTTATCTCCAAGGGCATTGAAAGAAAAGTATGGCATTGAAGGAGATTTATATAAACTTGCATCAAATGAAAATTTGTATGGACCATCGCCTAAAGTTAAAGAAGCGATATCAGCACACTTAGATGAGTTATATTATTATCCTGAAACAGGATCACCGACATTAAAAGCGGCGATTAGTAAACATTTAAATGTAGATCAATCACGCATTTTATTTGGTGCGGGATTAGATGAAGTTATATTAATGATTTCTAGAGCTGTATTAACGCCAGGGGATACTATTGTTACAAGTGAAGCGACATTCGGTCAATATTATCACAATGCGATTGTTGAATCAGCTAATGTGATACAAGTACCTTTAAAAGGTGGTGGCTTCGATTTAGAAGGTATTTTAAAAGAAGTTAATGAAGATACGTCATTGGTATGGTTATGTAATCCAAATAATCCTACAGGTACATATTTTAATCATGAGAGCTTAGATTCGTTTTTATCTCAAGTACCTCCACATGTACCAGTAATTATAGATGAAGCTTATTTTGAATTTGTGACAGCAGAGGACTACCCGGATACACTTGCTTTGCAACAAAAATATGACAATGCTTTCTTATTACGTACATTTTCAAAGGCGTATGGATTAGCGGGTTTACGTGTGGGATATGTGGTAGCAAGTGAACATGCGATTGAAAAATGGAACATCATTAGACCACCATTTAATGTGACACGTATATCTGAATACGCAGCAGTTGCAGCACTTGAAGATCAACAATATTTAAAAGAGGTAACACATAAAAATAGTGTTGAACGCGAAAGATTTTATCAATTACCTCAAAGTGAGTATTTCTTGCCAAGTCAAACGAATTTTATATTTGTAAAAACAAAGCGGGTAAATGAACTTTATGAAGCACTTTTAAATGTAGGGTGTATTACGCGACCATTTCCAACTGGTGTTAGAATTACAATTGGTTTTAAAGAACAAAATGATAAAATGTTAGAAGTTTTATCAAATTTTAAATACGAATAGTAAGTGGGGAGTGGGACATAAATGATATTTTCTCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCTGGCAAGGTTGACTAGAATTGAAAAAAGCTTGTTACAAGCGCATTTTCGTTCAGTCAACTACTGCCAATATAACTTTGTAGAGCATTGAACATTGATTTATGTCTCAAGCTCAATGCAGTGTGAATGATGAGGTGAGAGTATTCAGTGTAAAAAGCAACAATAGATGATATTGTTTTGTATCAATTGCTTTTTTGCTATACTGAATCAATACTGATATTTTGAGGAGAAGATTAAAATGACCCGTAAATCAATCGCGATTGATATGGATGAAGTATTGGCAGATACATTAGGAGAAATCATTGATGCTGTCAATTTTAGAGCGGATTTAGGTATTAAAATGGAAGCTTTGAATGGTCAAAAACTTAAACATGTTATTCCTGAACATGATGGATTAATTACAGAAGTATTGAGAGAACCAGGCTTCTTCAGACATCTTAAAGTGATGCCGTATGCACAAGAAGTTGTGAAAAAATTAACTGAACATTATGATGTATATATTGCTACAGCAGCAATGGATGTACCAACATCATTTAGTGATAAATATGAATGGTTACTAGAGTTCTTTCCATTTTTAGATCCTCAGCATTTTGTTTTTTGTGGTAGAAAAAACATCGTTAAAGCTGATTATTTAATAGATGACAATCCTAGACAGCTTGAAATTTTTACTGGTACACCGATTATGTTTACAGCAGTGCATAATATTAATGATGATCGATTTGAACGCGTAAATAGCTGGAAAGATGTAGAACAGTATTTTTTAGATAATATTGAGAAATAAAAATATATCACTTGAAAAATTTCATGTAGAAAAGATGATGGATAGGCTATAAAGTAATTGTGACTGAGATGAACTTTTATGTCTTAGACACTACAACACTATATTGGCAGTAGTTGACTGCGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACATAAAGAAATACTTTTTCTTTAGAAATTAGTATTTCTTATGCATGAGTGTAACTCATGCATTCATATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTCTATCTCATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAATTATATGTCTGTTTTTGAAACAGGGTAATAGCTTAAAGCTAATAAAAACGAATATAAGGTGCGTTGAATCTTATGATTATACTCCAAACCTAATATAATATCGGGTTAAGATCATTCCGGATGCTTACAAATCATTGACAGTAAGTAACTGAATGGCATTTGGTATAACCTCAATATCAATAGGTGTTTCTAATGAAATTTCGCCATCAATATCAACTTTCATTGCTGGATCTGTTGTAAGTGAAATCTTTTTACCAGGTATATGCTCAATACCTTGAGTAATTTCATTCCAATTCATGCTATCACGCTTTTTAAAAATATCATTTAAAATACTGAAACTTTGTTCATTAAAAATGAAAGTGTTCAGTTCACCATCTTGAGGAGACAAATCAGTCAATGGTATACGACTACCACCAATGAATGGACCATTTGCTGTTAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCTATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATGAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAATTACATCGTATGTACCAACTTGTGCAGAAATCATTTGTTCACTAGCTTGTTTATGATTAGGTGCTATATTTAGCGTTTTTGTAAAATCATTAAAAGTACCGCCTGGTAAAATGCCAATAGGGAGTTGAAGGTCATGTGACATAACACCATTTATAAGTTCGTTAACCGTGCCATCACCGCCAAGAATAAATAATATATCTACATCTTTTGCATAGTTTTTAGTTTTGATTTCTTGGCAATATTTAATAATGTCACCTTCGTTTTCACTCAATTGAATAGAAAGATGCTTACAAATTGAACTTAATGCTGTTGTAACTTCCCCAATACCTTGATTAATATTTTTTAATCCACTGTGTTCATGGTAAAAGAGGACACCATGTGTATATTTATTTTCCATAGTTTAGCCTACTTTCTAAAAATTGGTTCATTAAATATATATACCCACTTTTAATTGTTAATACCAAAAATATGTTTTAAATAGAGAAAATGGTAATAACTGACATTGATGTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATATCGAGCATATTAAGCTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTAATTTAGGCCAACAATATTAACGAATACCTTTCATTGCTTTAATAATTAAAGGTGAGAATGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAATTTGTTTGACCTAGTGGTTCTATTAACTTAACTAAAGTACCATTGATTGCTTGTGCAGAAGCGTTAGTTAAGTACCAAATACTCATCATTTGGGCATTAAATGCTTTAGGTGCTAACTTAACAGCAGCACTATTACCCGTTGGTGATAAGCATAGCTCACCGATAACACAAATAATGTACGATAAAATAACCCAGTTAACTGAGAAGTTTGATGAACCTGATGCATAACCTACAATACCAATTAGTATGTATGACGCACCTGCTAAGAACGTACCAATTGCAAATTTTACTGGCAGGCTAGGTTGTTTAGTTCCAAGCTTTTGCCATAAAAGTGAAATAATTGGAGCTAGTAATAAAATAAATAATGGGTTAATTGATTGGAAGATCGCTTCACCAAAGTTTGTTTTCCAACCAAATAAGTTTAATTTCATATCTGAATGTTCAATTCCATATATGTTTAATACATTAGACCCTTGTTCTTGAATAGCCCAGAACACCATTCCAAGAATAAATAATGGAATAAATGCTTTAACACGAGAACGTTCAGTATCAGTGACATCTTTACTTCTAATAATTAAAGTGAAGTAAATGATTGGTAATGCAATACCTAATACTAAAACAGTATTACTAACTAAGTTAAATGATAATGAATTAGTTAATGCACCAATAACGATAATTAATACAATTGCTAAGACAACACTTCCGATAATAAGACCATACTTTTTCTTTTCAGCTGGTGTCAATGGGTTAGTAGGTTTCATACCAACGCTACCTAAGTTTTTGCGGTTGAAAAGTACATACCATACTAAACCTAATGCCATACCAACTGCTGCAATCAAGAATCCGCCGTGGAAGTTTTTAACATTAACAAAGTGTTGCAAAATAATAGGTGATAATAATGCACCCATATTAACTGACATATAGAAAATAACAAAACCTGCATCCATACGTCTATCATTTTCAGGATATAAACGGCCAACGATATTTGAAATGTTAGGCTTCATTAAACCTGAACCAATAATGATGAAGAACATTGATGTGAATAAGCCGATTAATGCAAATGGTAAGCTTAAACAAATATGTCCGATAATAATAAAGACTGCACCTAATAAAGTAGCGCCTCTAGTACCTGTAATTCTGTCAGCAATCCATCCGCCTGGTATTGATGTCATATAGATTAATGAACCATAAACTGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039167|694909:708493|706384_706540_+|WP_000499195.1|DBSCAN-SWA MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ >NZ_CP039167|694909:708493|707536_708493_+|WP_001245577.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >NZ_CP039167|694909:708493|694909_695968_+|WP_000663037.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKGGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP039167|694909:708493|702232_702499_+|WP_001790091.1|DBSCAN-SWA MCLMYNETHNIVLVKRKRHNILCFVCKCFIYEEITFKSNLTQKFNSYYQLIVIFLENVLSKWKISNDVNTTYSDFYTFNPYKLLFSQI >NZ_CP039167|694909:708493|700981_701848_-|WP_001068497.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP039167|694909:708493|703009_705115_+|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP039167|694909:708493|696262_696805_+|WP_000197271.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPYAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NZ_CP039167|694909:708493|705232_706204_+|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_CP039167|694909:708493|706578_707550_+|WP_000876318.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NZ_CP039167|694909:708493|700461_700962_-|WP_000930014.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP039167|694909:708493|698615_700121_-|WP_000193751.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_CP039167|694909:708493|697429_698347_-|WP_000429006.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMSHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP039167|694909:708493|702648_703047_+|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_CP039167|694909:708493|698436_698538_+|WP_031797439.1|DBSCAN-SWA MVITDIDVYRVGRENIVIAVYIEHIKLLFILIS >NZ_CP039167|694909:708493|700186_700432_-|WP_001837858.1|DBSCAN-SWA MIFLTYWCVFHLSYIIGYIKITFYTKVHQKNISTRIKQHFYRNLLHFNVNKYIFILSLINCARLITEYSQYFYFFVICWGI |
15 | uncultured_Caudovirales_phage(55.56%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
760071 : 777579
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP039167|760071:777579|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP039167|760071:777579|774275_775244_+|WP_000801979.1|DBSCAN-SWA MKPFESHNKQLKILRRRGMEVPSSAKRDLENENYYNIINGYKDLFLELDVNGNFLVPDKYKQGTHFKEVFSLYKLDRKFRNVLLEYLLVFETHIKSRISYYFSEKYREPHSYLYFKNYSSDTSKTDSIVKMVATFSSVMSNRKNKPLKHYINTHNGVPLWILVNYLTLGNVSKMYSNLDDDLRLEVAKDYKRKLERDYKTRVQITPSDVDSILQQAHMFRNVCAHEERLYDYKIDRAKSRANIFANYNKIYDKEYVPTMNGSYVFDLLISLCLFLNKHDYIKLMKNMDKLISNYSHSFYTITIDDLYTKMNFPDQTKILDML >NZ_CP039167|760071:777579|769743_770028_+|WP_000998185.1|DBSCAN-SWA MNDKEKIYNQLHHDAPIQNIPAPENLFVEYIEADEVWYSPVVCMALSKAHNINFYDSDDVGCIDKAATCSIKKFNPETGEFEQFSKMAQKEITQ >NZ_CP039167|760071:777579|769379_769742_+|WP_001039170.1|DBSCAN-SWA MNKNQLKSEILEYIKAHAGTSFVEIERVFEENNFDYKGDGAYTSGQHPNVVFWIGWSQEAFDVIAELKKDRRIEMDICEPIVYMVDGKGLDLPIVRSKNIKTDHWLPVTFTISKKETECV >NZ_CP039167|760071:777579|766135_766345_+|WP_001058492.1|DBSCAN-SWA MNNEQKEVIEHVVYQLELSVMNNLESYEHTEYVNGIEVVSEISREKHLELIMKWCAQELKNNFQLEKGE >NZ_CP039167|760071:777579|764588_765392_-|WP_000358990.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP039167|760071:777579|772561_773089_+|WP_000777464.1|coat|DBSCAN-SWA MKLSKSKNVLYYRNVDNKLSEYQLLTQFNPAFINKKIKMCEFQIESMYHMSASTTTCDEIMGVVSVSYPIEKLVIKIIETKAGLQNYKNRSINNMALLKKVLNHYTEKEQKQVVKYMRSNGRYKPYNVIERLQVDLYQASIKQRSERQKQRNTAIENSKIARVNEYHQSSYVKVV >NZ_CP039167|760071:777579|775440_775995_-|WP_001035612.1|DBSCAN-SWA MNKKLLTKTLIASALVLTTVGSGFHSSSNYNGINNVAKAAETTDGQLWKNVRDALKEANIIDGNENETIDVNYKLKNGSENKISANGNSNGDFSKQNIDIESLTTINIKKVNISNFNERIDANNTWKNLTNKLKGQKIIKDGDKVTIHSKDQKDPKISGIVGQDFTEHKNYMLYKKDIDKITIN >NZ_CP039167|760071:777579|765766_765985_+|WP_000163544.1|DBSCAN-SWA MTKLAYPMLYITRKEKGDTQKKVASKLGISPQRYQLKESGKAIFNLNECQILSEMYDMPIDELFSSKIKVGE >NZ_CP039167|760071:777579|763492_764599_-|WP_000149511.1|integrase|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP039167|760071:777579|767613_769071_+|WP_000390453.1|DBSCAN-SWA MEDVTNEEVFEMIDSRTGVLNANDWKSQLRRSATTQALKKTTTNAEIILCNDESLKGLVQYDAFEKVTKLKRLPYWRSKGDANYYWADIDTTHVISHIDRLYNVQFSRDLIDTVIEKEAYQNRFHPIKSMIESKSWDGIKRIETLFIDYLGAEDNHYNREVTKKWMMGAVARIYQPGIKYDSMIILYGGQGVGKSTAVSKLGGHWYNQSIKTFKGDEVYKKLQGSWICEIEELSAFQKSTIEDIKGFISAIVDIYRASYGKRTERHPRQCVFVGTTNNYEFLKDQTGNRRFFPITTDKNKATKSPFDDLTPDVVQQMFAEAKVYFDENPTDKALLLDKEASEMALKVQEAHSEKDALVGEIEEFLERPIPSDYWYRTLEEKRVSAHGVIDQDYIKLYGDGKLIELPNTKPGAYVWRDKVCSMEIWKVMMKRDDQPQQHHLRKIDKALRNTNYCDIVKKQTRYGEGIGKQYGFSVDLASYYQKLKV >NZ_CP039167|760071:777579|771754_772333_+|WP_000856046.1|DBSCAN-SWA MKTNHLFEKYSDEVKGYKEEINNLESKIENTTKTIEDLSSKYKEYIKVGNDNEADKTFNKISKLEDEKAKDNKRFEIKKELFNSIKREKLIDLLLNRKNIPELYQEEAQILARELEGTIKQFNNVIDKINNMNEEYREDMYKFDSLIDQNEMKKDNLFRQRYGEVIVLYLNNFLINTKSIRFNEHKKLEVKK >NZ_CP039167|760071:777579|770024_770666_+|WP_001019807.1|DBSCAN-SWA MNIETVVNEFETQAGTLLRYYTGLLEHSKVQPYCFKLYNDPFDMVYVMMNGKLFGHVYIKDCKVRQSFELASPKHTEGLIRSIEGHYVGYELHDGKQLSISDMMASQLFEDEYFMYGLQTYAESNNSDVFEYLENGFDTDTLEGIQSSNTDVISNIEMLYQIATGINEPAPELVEGLRLVTEFVQDEKAAQEDYTGLERKLNDLKASYYSISK >NZ_CP039167|760071:777579|762465_762930_+|WP_001085185.1|DBSCAN-SWA MAKKKSPGTLAENRKARHDYNIEDTIEAGIVLQGTEIKSIRRGSANLKDSYAQVKNGEMYLNNMHIAPYEEGNRFNHDPLRSRKLLLHKREIIKLGDQTREIGYSIVPLKLYLKHGHCKVLLGVARGKKKYDKRQALKEKAVKRDVARDMKARY >NZ_CP039167|760071:777579|765527_765731_+|WP_001045296.1|DBSCAN-SWA MNKVLGYRKMLNFTQQQMAKELKISEQSYRNKEKGKTEFKKEEMLTFKNILISKGMTNITLDDIFFN |
22 | Staphylococcus_phage(73.68%) | coat,terminase,integrase | attL 762733:762748|attR 776656:776671 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
810325 : 856427
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP039167|810325:856427|DBSCAN-SWA AGTGGCCGAACACTCATTTGACGTTAATGAAGTAATCAAGGATTTTCCGATATTAGATCAAAAAGTCAATGGCAAACGTTTAGCATATCTTGATTCAACAGCGACAAGTCAAACGCCTGTGCAAGTGTTAAATGTTTTAGAGGATTACTACAAGCGTTATAATTCAAACGTTCATCGTGGTGTTCATACATTAGGATCATTGGCAACTGATGGTTATGAAAATGCCCGTGAAACTGTTCGTCGTTTTATTAATGCGAAGTATTTTGAAGAAATCATTTTCACACGCGGAACAACTGCGTCGATTAACCTTGTAGCACATAGCTATGGTGATGCAAATGTTGAAGAGGGCGATGAAATTGTTGTCACTGAAATGGAACATCATGCCAATATTGTTCCTTGGCAACAGTTAGCAAAGCGTAAAAATGCGACATTGAAATTTATACCAATGACAGCTGACGGTGAATTAAACATCGAAGATATTAAGCAAACGATTAATGATAAAACAAAGATCGTTGCTATTGCACATATTTCTAATGTACTCGGTACAATTAATGATGTTAAAACCATTGCAGAAATAGCTCATCAACATGGTGCAATTATCAGTGTTGATGGGGCGCAAGCAGCACCACATATGAAACTTGATATGCAAGAAATGAATGCTGATTTTTATAGTTTTAGTGGTCATAAAATGCTTGGACCAACAGGTATTGGCGTATTATTTGGTAAACGTGAGTTACTACAAAAAATGGAACCGATTGAGTTCGGTGGCGACATGATTGATTTTGTAAGTAAGTATGATGCAACATGGGCTGATTTACCTACTAAATTTGAGGCGGGTACTCCATTAATTGCACAAGCAATTGGGCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGTTTAATTTACAAGATGTACATCCACACGATGTTGCTACAGCCGTAGATACAGAAGGTGTAGCGGTTAGAGCTGGGCATCATTGTGCGCAACCGTTAATGAAATGGTTAAATGTGTCTTCAACAGCTAGAGCGAGTTTTTATATATACAACACGAAAGAAGACATTGATCAGTTAATAAATGCCTTGAAACAAACGAAGGAGTTTTTCTCTTATGAATTTTAATAATCTAGATCAATTATATAGATCTGTCATTATGGATCATTATAAAAATCCTAGAAATAAAGGTGTATTAGATAACGGGTCTATGACAGTAGATATGAATAACCCGACATGCGGTGACCGTATACGACTAACATTTGATATAGAAGACGGCATTATAAAAGATGCTAAGTTTGAAGGTGAAGGTTGTTCGATTTCAATGGCAAGTGCATCGATGATGACACAAGCTGTTAAAGGTCATTCACTTGGAGAAGCAATGCAAATGAGCCAAGAATTTACGAAAATGATGCTTGGTGAAGACTATGTGATTACAGAAGAAATGGGAGATATTGAAGCATTGCAAGGTGTATCTCAATTCCCAGCTCGTATTAAATGTGCCACATTAGCTTGGAAAGCATTGGAAAAAGGTACTGTTGCTAAAGAAGGTAAAGCAGAAGGTACGACTGAAGAAGAATAGAATGCTGTTAATCATAGATAATTTTGATATTAGACATATAAAAGTATAAAAATTTTTATAAGATGTCATGTCATTGTTATAATATGGTTTACATCATGAATTAAAAACTTACGCACGCCGTTGTAAATATATTTTTAAGGAGTGATTGAAATGGCTAAAAAAGCACCTGATGTTGGGGATTATAAATATGGATTCCACGACGATGATGTGTCCATTTTCAGATCAGAACGTGGTTTAACTGAGAATATCGTTAGAGAAATTTCTAACATGAAAAATGAGCCGGAATGGATGTTAGATTTCCGTCTTAAATCATTAAAATTGTTTTATAAAATGCCAATGCCTCAATGGGGTGGCGACTTATCAGAATTGAATTTCGATGACATTACTTACTATGTAAAGCCTTCAGAACAAGCTGAACGTTCATGGGATGAAGTGCCAGAAGAAATTAAAAGAACTTTCGATAAATTAGGAATTCCTGAAGCTGAACAAAAATATTTAGCTGGTGTTTCTGCTCAATATGAATCTGAAGTTGTTTACCATAATATGGAAAAAGAACTTGAAGAAAAAGGTATTATCTTTAAAGATACAGATAGTGCTTTACAAGAAAATGAAGAATTATTCAAAAAATACTTTGCTTCTGTAGTACCTGCAGCAGATAACAAATTTGCGGCGTTAAACTCAGCAGTATGGTCAGGTGGTTCGTTCATTTATGTACCTAAAAATATCAAACTAGATACGCCACTACAAGCTTATTTCCGTATTAACTCTGAGAACATGGGTCAATTTGAACGTACATTAATCATTGCTGATGAAGGTGCTTCTGTACATTACGTAGAAGGTTGTACTGCACCAGTTTATACAACTAGTTCTTTACACTCTGCTGTTGTGGAAATCATTGTGCATAAAGATGCGCACGTTCGTTATACTACGATTCAAAACTGGGCGAACAATGTATACAATTTAGTTACAAAACGTACTTTTGTTTATGAAAACGGAAATATGGAATGGGTAGATGGTAACTTAGGTTCTAAGTTAACGATGAAATATCCAAACTGTGTTCTTTTAGGTGAAGGTGCAAAAGGTAGTACATTATCTATTGCATTTGCTGGTAAAGGACAAGTTCAAGATGCCGGTGCTAAAATGATTCATAAAGCACCAAATACATCTTCAACGATTGTTTCTAAATCTATTTCTAAAAATGGTGGTAAAGTTATTTATCGTGGTATTGTACATTTTGGACGTAAAGCAAAAGGCGCTCGTTCAAATATTGAGTGTGATACATTAATCTTAGATAACGAATCAACATCAGATACAATTCCATATAACGAAGTATTCAACGATCAAATATCATTAGAACATGAAGCAAAGGTTTCAAAAGTTTCTGAAGAACAATTATTCTATCTAATGAGTCGTGGTATTTCTGAAGAAGAAGCGACAGAAATGATTGTTATGGGATTCATCGAACCATTTACAAAAGAACTTCCAATGGAATACGCGGTCGAAATGAACCGTTTAATCAAGTTCGAAATGGAAGGTAGTATTGGATAGCTTTAAACCGCGTTGTTAAGCTATTCTTAACTGTCGAAAACGGTTATTGATACCATTTTGATACCATTTACTTGTCAAAAATGGCTATTGCATCGTGTTTTTTCTGAGTATATAAATGGCTGTAAGTGCCCATCGTTTCAGTGATTTGAGCATGTCTCATGAGTGACTGTAAAACGAAAATATCTACACCATTATTTGCAAGATAAGATGCATAAGAATGTCTTAACGCGTGAATGTTATAATGAGGGAAAGCTTTTTGAAATTTCTTTTGAACATGACTGTAATGTTTGGGAGCCATTCCTCCGAAAATAAAATAACTACGTTCATCAAAATATTTGTTTAACTCTTTTTCACGTTGATGTCGTTCAGTTAACATTGTATTGATGAATTTAGGTAAAGGAACAATATCCTCTGAACTATCTGTTTTTGGTCTCGGATATATAGTTCTATTAGAGATGTCCATTGTTTTATTTATGGATATCTCTTTTTTGTATTTATTGTAGTCTGTCCAAACAAGCGCCATAGCTTCGCCAATCCTCAAACCTGTATAAAACATTAATGTAAATAACTCTCTGTAATCTTGCTCTTCAATGTCTTTGATTCTTTCTTCAAATTCTTCACGCATCATAAACTTAGGTTTTGGCTTTACACGCGGAATAGGTTTAATTGATATTGTTGGATCTGTACGTAATCCAAAGTATTTTTTAGCATAATTAATTACAACTTTAAAACCTGACCAAATTGTACGAGCAGAATTTGTTGATGCTACATTCTCTATTAGATATTTACGAAACTCTTGGCATTGATTTTGTGTTATCTTATTCATTTTTATATGCCCGAACTTAGCTTTAAAGTGTTTATGATATTCATTTTGTTTGCGTCGTTTTGTTTTAGGTCTCAAATCGCTATTTTCTAAATAGTGATGAAAAACATAATCAAATGTTTTTGAATCGCTATATCCTTCGTTTACATCATTCAAAAAAATAGCCTCTGCACTCTTAGCTTCACGCTTAGTTGAAAAACCGCGTTGCATCTTACGTTTGTTATTACCGTATACATCTTTATATCTAATGGAAAAATACCATTTACCTGTATTATCATCCTTATATACTGGCATTTTACTTCTCCCTCCTCAAAATTGGCAAAAAATAATAAGGGTAGGCGGGCTACCCGATAAAAATGTATAAAAAAAGACCAGATGAATTAACATCTGGCCAGCCGGATTGGTTACCGGAAATATGATTTTAAGCCGGATTGGTTACCGGAAATTTATATCTTGATTATAATAGATTAACGATAAAAAGTAAAGATAATTATGATAAAATGTTAGCTTTCATAAAATCTTCTATAATTTTTAAAGTTTCTTCATTGAAAGATATATGGCCAGTTGGATCGTAATCATTAAGTGTGCTTATTCTTTTTTTACTGATAGTGATAACTTGAGATGGAATTGCATAAGTTTGTTTGCCTACAAACCTTTCGTAACGCTCAATTATTTTTGCGAGTTGCATATAATTATTTTCAATCTCATCAAGTTCTTTTTCGATTGCTGAATTTAAGTTTTTTACTTTTGTGGATCTTGCGTGCATTTCTTTTATTCTATCCAAATCGAATCGTAAAGTTTTGTGGTCAGTTTTCATTTTTTCTAAAGCTTTTAGTATTAAATTCTCTTGTAATTTTAAAGAAAATTTGGTGTCTTTTGAAGTAAGTGGAACTATAGTAATTAGCTCATTGCGTTTGTTGTCATTTTTATTT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70 | Staphylococcus_phage(76.12%) | tail,integrase,capsid,plate,portal,holin,head,terminase | attL 812137:812153|attR 820973:820989 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1011476 : 1019949
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP039167|1011476:1019949|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP039167|1011476:1019949|1016874_1018359_+|WP_000483713.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_CP039167|1011476:1019949|1013073_1013778_+|WP_000174053.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINNVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_CP039167|1011476:1019949|1018351_1019380_+|WP_000030811.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP039167|1011476:1019949|1011945_1013070_+|WP_001010413.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPSEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSGRKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_CP039167|1011476:1019949|1019382_1019949_+|WP_000238659.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHIESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHGIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRKCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP039167|1011476:1019949|1014706_1016896_+|WP_000032733.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDECYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGNEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP039167|1011476:1019949|1014042_1014714_+|WP_000666806.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLATEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP039167|1011476:1019949|1011476_1011959_+|WP_000861572.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGINIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >NZ_CP039167|1011476:1019949|1013777_1014041_+|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1477103 : 1560341
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP039167|1477103:1560341|DBSCAN-SWA 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103 | Staphylococcus_phage(83.12%) | tail,integrase,capsid,holin,portal,protease,head,terminase,tRNA | attL 1502914:1502929|attR 1564497:1564512 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1616966 : 1625278
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP039167|1616966:1625278|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCGATATCATGAGTAACTATGATAATGGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTTGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAACCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATTAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGTTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAACCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTGATTCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTAACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAACATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAATGAGCGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGCGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCCCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAACCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGCTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAATACAAAACCGCGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGACCAGTTCGTCCAACTCTATGCGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTTTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCAATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAGTCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACACCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAACGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAATTCACACCATGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGGACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTCACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAATATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGGGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTGACTTTTGATATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGCGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAAACCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATACGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATGATCAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAACCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTACTAAATGGCACATGATGATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCGTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGTGTAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAATTTTCAGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCAGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTTTCTACTAAATGATTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGGCCTTGAATAACTTCTCCTGCAATACCGTAATCGCATAAATGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTACCTTGTTTTAAAAATCGACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGTCTTTCAAACGTTTACTACGACTTGGATGTCTTAATTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCAATTTGTCGAATACGTTCACGTGTAACACCGAAAACTTTACCAACTTCTTCAAGTGTTCTTGTTCTGCCGTCATCAAGACCAAATCTTAATCGTAATACATTTTCTTCTCTATCAGTTAATGTATCAAGCACATCTTCTAATTGCTCTTTTAATAATTCATAAGCAGCATGATCTGAAGGACTTTGTGCTTCCTGATCCTCAATAAAGTCTCCTAAATGACTATCATCTTCTTCACCAATTGGTGTTTCTAATGAAACAGGTTCTTGCGCAATTTTTAAAATTTCACGAACTTTTTCTGCTGGTAAATCCATTTCTTCACCAATTTCTTCTGGTGCTGGATCTCGACCTAAGTCCTGTAATAATTGACGTTGAACACGAATTAATTTATTAATTGTTTCTACCATATGCACAGGGATACGAATCGTACGTGCTTGGTCAGCAATTGCACGAGTGATTGCTTGTCTAATCCACCATGTTGCATATGTTGAAAACTTAAATCCTTTGTTAAAGTCAAATTTTTCAACAGCTTTAATAAGACCCATATTACCTTCTTGGATTAAATCAAGGAATAACATACCACGACCTACGTATCTTTTAGCAATACTTACAACTAAACGTAAGTTCGCTTCTGCAAGTCTTGATTTTGCTACTTCATCACCTTGTTCAATACGTTTGGCTAATTCGATTTCTTCTTGTGCACTTAATAAGTTAACACGCCCAATTTCTTTAAGGTACATACGAACTGGGTCATTTATTTTAACACCTGGAGGGGCACTAAGATCACTTGGACTCAGTTTCTCGTCAGTATCTGAACTATCTTTTTCATTAACTAGTGAAATATCATTATCATTTAATTGATCAAAGAAATCATCCATTTGATCAGAGTCGATATCAAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTCGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAAATATGAACATTCGAAATTTATTCAATATTGCTATTTTAAACTAAATTCTTAATTAATTCATCCATATTTTTAATTTTATTTTACAAATTGGAACTAATCCCAATATTTATTTTTCAATAGTGTTGTTTAAATGCGGTAACTATCATTTACCCTTATACATTTTGACATAATCATTATTCGTATTATTCTTTAAAATCACATGCTACATGCGTTCTTTATTCTTAGCAACAATTTGCTGTAAATAGTATTTTTGTAATTCTACATCGCCAATCCTTGTAGCTTCCCTTAATTTATGATTCAATGACTCAATTGTTTCTTGTCCTTTTTCATTAATAACATTGACATAATCATCAATTTCATTTTCATATGGTTCGTCATTCAAATTATATTGTTCTAAGCTAATTAGTGTTTCTCTCAACTCATTTGAATTAACATACTGCACAGCATCACTGATATTATATTGATCATTTTCCGCATAAAAATCATGTAAGACTTCGAATACATATTTAAAATGCTGATTTGTGAAGTTATCCTTATCAACACTTTCATAATAATTTAAAAATGTATCTTTATCTCTCATTAAATGTTTTAAAAATGCTCGCTCCGCTTTTTCTTGACGGCTCAAATTGTCAAATTGTGCCATACCAATTGGCTCAGGTTCAATATAACCGCCATACTCATCTTCTGGATAATAATTGGCTGGTGCTTGATTGAATTGTATTTCGTTAGCTAACTGCTCAGGACTAACATTGAAAAATGGCGCAACATCATTTATAGCCTTTTGTTGCAAAATCGATGACTTCATAAGTGAAATGTCATGACTCAGTTCTTTCAAATAACGTTCATATGAAAGGTCATTATGTGCAATTTCATCTTTTAATATACTTACTTTATAATGTGCAAATGACTTTTTGTCATTTTTTACAAAAGTAGTAAATGCGTCGTTGCCATACTTACCAATGTATTCATCCGGATCCATGCCAGATGGCAATTGTATAACAAATACATTTAGCCCTTGCTGTAACAAATTTTGACCTGTTTTAAGTGTTGCTTCACTACCCGCAAAATCCCCATCAAACATTAATGTTATATTTGATGTTAACTTTCGTATAAAAGTAATATGTTCATCTGACAACTGTGTCCCCATTGTTGCAACAACGTTTTTCAAGCCAGCAGTATCAGATTTTATAACATCCATAAAACCTTCTAGTAATACGATTTCATCTAATTTTCTAATTGATTTACGCGCTTTATCTAAGTTGTATAACAACTTTCTTTTTTGAAAGATAGGTGTTTCAGGACTATTTAGGTATTTTGGTTCTTGACCGGTATATGTTCGACCTGAATATCCAACAATTCTTCCTTGCGCATTTTTCAAAGGAAACATAATACGATTTCGAAATCTATCGTAATAACTGAAATTTTCTTCGTTACGTGATAATAATCCGGCTTCATATGCTAATTCAATATCGTAACCCTTTTTTTGAAGAAAATCATGACAAAAATGTGAGCTATCGGGTGCAAAGCCAATGCCTCGCTCTTTAATAAGCGCATCTGTAAAACCACGTTCTTGTAAGTATGTTAATGCTTGTTCGCCTTCGACTGTCTTTGTTAAAGCGTAATAATAAAATTCTTGTATTAACTCATGCATTTCAATCATTTGTAAATCATCAGAAGCAATTTGAACATTTGAGTTAGATTGTGTTGCCTCAATATCTACAGCAACATTAACTCTATCACCTAATTCTTTAACCGCTTCAACAAATGATATGTCTTTAATTTCTTGAGTAAATTGAAAAACATTGCCACCTTTTTTACAACCAAAACAATGACAGATTTGTTTATCTTCAGAAACTGTAAATGAAGGTGTCTTTTCATCATGAAAAGGACACAAACCTATATAATTGCGTCCTCTCTTTTCTAGTTTTACATATTCACTTACCAAGTCTAAAATGTCGGTTTTATCTTTTATTTCATTAATGATCGATTGATCTATTCGCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP039167|1616966:1625278|1620237_1621338_-|WP_000683933.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFSTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPYGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDAYQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >NZ_CP039167|1616966:1625278|1623478_1625278_-|WP_001217262.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQNLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTTFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYNLNDEPYENEIDDYVNVINEKGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NZ_CP039167|1616966:1625278|1618777_1620124_-|WP_001062177.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >NZ_CP039167|1616966:1625278|1617877_1618768_-|WP_000924214.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >NZ_CP039167|1616966:1625278|1616966_1617752_-|WP_001213907.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIIIVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >NZ_CP039167|1616966:1625278|1622148_1623255_-|WP_138089184.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLSPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >NZ_CP039167|1616966:1625278|1621340_1622018_-|WP_000624568.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDYGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANHLVERIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1694962 : 1704005
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP039167|1694962:1704005|DBSCAN-SWA ATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCGCCTAATTTTTCAACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATATACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAATTTTAAGTCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTGACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAATATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAAGGAATTAGACAAGTCTTCCATTGACGTTGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCGCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCATTCATCGCAATATCTTGAATAATTAATTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGATCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGTAACTCAGGTTCTAAGTGTCCATTTTGCCAAAATAGCGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCGATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGAATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACGTCTACTGGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGATGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCCTTTTTAACTTTCGTTTCTGCCATAGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATCATTTAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAATCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTGTATGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATGTACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAATGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCTAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCGGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCGCTATCGCTCTTTTAATTCTTTCAATAGCCTTAGTCATATCGCTCAATTGCAATGCATCATGATTGACATCTGTGTCTGAAATGATGGATTCAATTGCTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGCTGGTTTAGTTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAACTCTTTATTGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAACGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTATTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATCTTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAAGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAAAATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCGGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAGGAATGAACTTTTGTTTGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCGGAAATGAAATTAAATGCTACTAACGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAATCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGGGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCCGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTAGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAGATTTCTTCCGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTAGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGAACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGATCGACTTGATAAAGCACCTCAAATCCACCTTGCAAATCAAGTCCTAAATTGACATTCTTTATAACACTTTTATAAGTTGCAGCCATTCCGGCAAACAACAATACGACTAAAAGCAAGAACGCAATTATTCTACTACTTTTCTTCACATGAACACCTCATTATTTACGTATGTATTTAGAATACTTGAATACTATTTTATAACGCAAGTTAAATCTTTCTTACAAAATTTATTAGCCTTATACATATTAACATACTAGAGCAGGGAGTAAAAATAGTCATAGATATATTTAATTTAAATTTAACAATTATTATGTATCACAATTTCTTTTTTTGGAATAAAAATAAGCTATTCTACATACTACTTATAACTTAAAAAGGATGAAACGCTATTCGTTTCATCCTTTTTAATACCACTTCTCGTTATGAAGGGTCAACTTGTTTAATAGCAGGTTTTTCGAAAGTTAATTCAGTACCATGACCATTAACTGTAATAACAACAGTTGTTTCATCTACTGCTTTAACAGTACCTTTAATACCACCAATAGTTGTAATTCTTTGACCAGATTGAATGTTATTAATCAACTCACGATGCTGTTTCGCACGTTTTTGTTGTGGTCTGATCATCAAGAAATACATAACCGCAAAAATTACGACTATATATATTAGTAATGAAAATTGCATTTTATACGCTCCTCTTGCTTAAAAGTTTTTTGGGTTCTCAACATTTAATCCATATTGCTCGAAGAATTCTTCTTTGAAATCTAAAAGACGATCTTCTCGAATGGCTTGTCTTATATCTTCCATTAATTTTAGCAGAAAATGTAAATTATGAATAGTAGTAAGACGAATACCAAAAGTTTCCTCTGCCTTGATTAAATGACGTATATACGCTCTTGAATAGTTTTGACATGTATAACAGTCACAATTCTCATCTAACGGTCTTAAATCATCTGCAAATTTTGCATTTTTAATAACTAAACGACCTTGCGATGTCATACAAGTACCATTTCTGGCAATACGTGTCGGTAAGACACAATCAAACATATCCATGCCGCGAATACTACATTCGATTAACGCATCTGGAGATCCTACACCCATTAAATATCTTGGTTTATCTTTAGGCATAAACTGCTCTGTATGTTCAACCATTTTATACATAACCGGTTTAGGTTCACCAACTGACAAACCGCCGATTGCATAACCAGGAAAATCTAATTCTACTAAATCCTTTGCACTTTGTTCTCTTAAATCTTCATATTCGCCACCTTGTATAATGCCGAACAATGCTTGATCTTCAGGTCTTTGGTGTGCATCTAGACATCTTTTCGCCCAACGTGTTGTACGTTCAATAGATTTTTTTACATAATCATATTCAGCAGGCATCGGTGGACATTCATCAAATGCCATCATAATATCAGATCCTAAATCATTTTGAATTTGCATTGATTTCTCAGGACTCAAAAATAATTTAGACCCATTAGTATGATGTCTAAATTCCACGCCTTCTTCTGTAATTTTACGTAAATTACTTAAACTAAACACTTGGAAACCGCCTGAATCTGTAAGAATCGGACCATCCCAATTCATGAATTTATGTAATCCCCCAGCGTGTTTGATAATATCATTTCCGGGTTGTAACCACAAATGATATGTGTTGCCCAAAATGATTTTTGCTTCAATTTGTCTTAACTCTTCTGGACTCATTGTTTTAACGGTTGCTTTAGTACCAACTGGCATAAACATAGGTGTTTCAAATGAACCGTGTGGTGTGTGCACGATACCTAAACGCGCACCTGATTGTTTACAAGTTTTAATGTGTTCGTATGTTACTGCAGGCATATTCAAAATCCTCACATTCTTTTTATATAATTAACATTGCATCGCCAAAACTAAAGAATCTATATTCTAAATTTACTGCTGTTTTATAAGCATTCAGAACATTTTCACGAGTACTAAACGCTGATACTAGCATAACTAATGTTGATTTTGGTAAATGAAAATTAGTAATCTGGCCATCAATTGCTTTAAAATCAAATCCTGGATAAATAAATATATTAGTCCAGCCACTCGTTTCAACAAATTTATCATGATCGCGTCGAATTGTTTCAAGTGTACGTGTTGAAGTTGTACCAACTGATATAATGCGATGTCCTTTGGACTTAGTATCATTTAATAAATCAGCTGTTTCTTGTGTCATTTGATAATATTCACTATGCATTTCGTGGTCATTCACATCATCGACGCTCACCGGTCTAAACGTACCTAACCCAACATGTAATGTAACAAATGCGATATTAACGCCTTTATTTTTAATTTCAGTTAATAACTCATCAGTAAAATGTAATCCTGCTGTTGGTGCTGCCGCTGAACCACTTTCTTTAGCGTAAACTGTTTGATAACGATCTGGATCATCTAAACGTTCTTTGATGTATGGTGGCAGTGGCATTTCCCCTAATTCATCTAATCTTTCTTGTAAAATACCTTCATAATGTAAACGCATGATGCGTCCACCTTGATCCATTTCTTTTATGCACTCAGCTATAATTTTGCCATTACCAAAATTCAATTTATTACCAACTTTAATACGCTTAGCTGGTTTCAGTAAGACTTCCCAATCATTACCTTCAATTTGAGTTAACATTAACATTTCAACTTTTGCACCAGTTTCTTCTTTTAAACCAAAAAGTCTAGCTGGCATTACTCGCGTATCGTTAAGCACTAATGTATCACCAGGTCTAAAATACTCAATGATATCTTTGAAATGTAAATGTTTCATTTCACCAGTTTCTCTATCCATGACTAATAAACGACTATGATCACGATCTTTTAAAGGCGTTTGAGCAATTAATGATTCTGGTAAGTCATAGTCAAATTCTTCAATATTCACGTTATCCTCTCTCCTCATTCGACTTTGCAAAATGTTCATAAGCTAATGGTGTTGCTTTTCTGCCACGTGGCGTACGTTCTAAAAAGCCTTTCTGAATAAGAAATGGCTCATAAACGTCCTCAATTGTAATACGTTCTTCACCAATTGTTACGGCAATCGTATCTAAACCAACAGGTCCGCCATTATACTGCTTAATAATACAGTTCATCATTTTATGATCAATGTAATCTAGTCCGTGTTGATCAACTTGAAGTAAACCTAATGCGTGCTTCGTTGTTTCAATGTATATTTGTTCATCTTCATTCACTTGCTGGAAGTCTCTTACCCGCTTCAATAGTCGATTTGCTACTCTTGGAGTCCCTCTAGAACGTTTAGCAAGTTCAATGGCACTTTCTTCATCAATACCTGTGCCTAAAACCTCAGCTGTTCTAATAATGATTTCTTTTAAATCTGATTCATTATAATATTCTAATCTTAAGTGCACACCAAATCGATCCCTTAGTGGACCTGTTAAGCTGCCAGCTCGCGTTGTTGCACCTACCAAAGTGAATGGAGGTAAGTCGATACGGATACTTCTAGCCTCATCGCCTTTACCAATGATAATATCTAAAAAGAAATCTTCCATTGCAGGGTATAACACTTCTTCAACAACACTACTCAGTCTGTGTATTTCATCAATAAACAAAACATCTCCAGGTTGAAGTCCTGATAAAATTGCAGCCAAATCACCAGGTCTTTCTAATGAAGGCCCTGATACTGTACGTATATTAACTTCCATTTCATTGGCAATGATATTAGATAATGTTGTCTTACCTAATCCAGGGGGGCCAAAAAGCAATACATGATCTAATGGTTCATGACGAAGTTTAGCCGCTTTAATAAATACTTCTAAATTACTTTTTATTGAATTTTGACCAATATATTGTCGTAATCTCGTAGGTCTAAGCGACAATTCGAAATCAGTTTCTTCACTATGCATTGATTGATCAACCATACGCTCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP039167|1694962:1704005|1703000_1704005_-|WP_001005768.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERG >NZ_CP039167|1694962:1704005|1700811_1701951_-|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP039167|1694962:1704005|1694962_1695481_-|WP_000364542.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_CP039167|1694962:1704005|1695502_1697776_-|WP_000595011.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDVNHDALQLSDMTKAIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NZ_CP039167|1694962:1704005|1700532_1700793_-|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP039167|1694962:1704005|1701973_1702999_-|WP_001019178.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP039167|1694962:1704005|1697978_1700258_-|WP_000749794.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDKIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1830169 : 1842904
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP039167|1830169:1842904|DBSCAN-SWA ATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCAATGGTAAATCCATTCCTTCAGAACCTGTATTTGGAAGTTCTTTTTCAACTTTGCGCGATTCATGTGTCTCTTCTTTTTTAATAGGCGTACAAACTTTTGGAGCTGGCTGAATTTCTTTTGGTGATACTTTCGTCGCTTCAGCTGGTAATTTAATTGCTAAAATTTCATCAACAATGAATTGCGTGTGTTGTTTGATGTCATTTAATGTCGCATCTTCATCAATCATTCTATTGCCATCTGCAACATATTGATCAATTAATACTTTTACTTTAGCTAATTGTTCTGGTGTTGCGATCGCTTTGAATTTCGCATATGTTTGTTGAGCAATGTTATCAATTCGCAGTAAGCTATTTTCTTTTTCAGTAATTACTGCTTCTATATCGCTTAATGCAACATTAAATCGTTTTAAAACTGCATCAACATCAGCATTAGTGCGTGCTGTTTTTAATTCTTCATCCATTTGTAATTTTAAAGCAGTTATAGCTTTTAATGCATCAGCCTTATTACGATTACTTACTTTTCGATAATTTTGCACTAAAGCAGTGACGCGTGCAAGATCATCATTAATCGTTTTTTCAGCATCTGGCTTTTTAATAGGATGTACATCTAAATCATGTATTGTTTGTAGATTTAATGATGCTGTTTTATCAACTTGTGCATTGCTACGATCTTGATCAATTTGTCCAATAGCAGTGTCATAAATATTTTGTAACTGTGCTAATATACTATTTCTTTCTTCTACCGTTGCTTGAATATTCGCTTCAATTGCTTGTTTTTTATCGTTGAATAATGTTGTCAATTGTTCTCGAGCAGACGCCTTTCTGTTAATAACAGGTTCGATTTCACGAATTTCGTTTTTCTCATCATGCAATAAATATGCCACATCAGCATTAGTCACTGCACTAGCAATTTGTTGTTTAGCTTTAATTAACTCTTTTTCAACTTGTGCTATTGCAATATTTTGTTCTTCATCTGTCGCTTCGTTATTTGCTTTAATTAAATTAATTTTATTTGTAGCGATATTTTGAATTTGTTGTAATGCTGTTGCTTTAACTGTTGTCGCTGGTTTAATTTTTGAAATAATATTTTGAGCATTTATACTATCTTGATTAACTTGGGCAGTCTTATCTGCATGATTGATCTGATCAATAGCCTGATTAAGTGCTTGTTCTACTAAATGTTTAGCAGCTAGTCTTTCTTCTTCAGTTGATAAATCGCTTTGATCGATTAGTGCATTTTGAGCTTCGGCTTTTACACCAACAGATTGACGCGCTGCTGGTTTAACTTGAACTTTAGGTAAAATCACTTTGATGTTGTCGTTGCCATCAGTCTCAGTTCGATCCACTTCTGCATTCGTTTTGTTTTGTGCAATGTCATTTTTAATTGTATTTACAATTTTATTTAAAGTATCAATAGCAACATCTCTTTCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCTATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAACAGCAGCATCTTGATTTGTATTTTCTATTTCTTGTTGCGCTTGTTTGAGTGTGTCGCTAATTAATTGATTCGCTTCATCTAATTCATCAACTGTTGCATGTGGTGTATCTTTTATTGATTCTACTTGATTTTCTGCACTTGCTTTTATTGCTTGTTGTGCTTCAGGCTTAATTACAATATGAGGTTGTACACCTTTTAGTGTAGCAATGCCATTTGTTTCAACACGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGCGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTATCTAGTGCTACTTGTCTTTCTTCTGCTGTTGCTTCTTTATCCTGATTAATCTTAGCACGTAATTCATTCGCTTTTTGATTGATTTTTTCACGTGCAGCTGGTTTAACTTTTGTTTCAGGTTGAATAATTTTAATCGCTGATACACCATTTGTTGCTGCTTGATTCACCTGACTATTCGTTTGAGCTTGGTCAATAGCTGCAAGTGCTTTTTCTTTTTCTTTTGCTAATGCTTGTGAAGCAACTTCTTTCTCATTATCTGTTGAATCAAGACTATTATCAATTTGCTGTTGCTTTTCTTTAACAGCTTTTTCAATATCTGCAATTGCCTTTGGTTTAATTACTACTTCAGCTTCAACATTATCTATAGCATTTACCGCTTGATTTGTAGTTGCGTCTACCTGATCATTTGTTTGGTTTTGATTAATTTGATTAAATGCTTGATCTTTAAGTTGATTGATTTGATTAACAGCAGCCTGCTTTTCTTCGTCAGTTGCATTAGGTGTTTGTTTAACCGCTTCAATACGCTTCGCCACTTCAGCAGTGATTTTATCTCGCGCTGCTTGTTTTTTTACTACGTCAACTTGAACAGCATCGATATTATTCTCTGCTACTGTCGCAGCTTGGTCTACTTCTGCATTTGTGTTAGCTTGTTTAATACTTTCAATAGCTTGTTGTCTGTCTTGATTTAAAGTATTGATCGCAGCATTTTTCTCATCATTCGTTGCATCTGGTGTAGCATTGATTTCAGCTAATTTAGCATTATAATGCTGATTGATTTGTGCTAATGCTGCAGGTTTTTTAACAATATTTGGCTGAATCGCATTAATTGCTTTTGTACCTAATTGTTGCGCTTGATCTACTTCCGCATTTGTATCAGCTTGATTTATATTATTAATTGCCGTTGCTAACTCTTGATCCACTTGATTTAAAGCCACTTGCTTTTCTTCAGTTGTTGCATTTGTGTTTTGATTAATTTCTTGCTTTTTAGCAGTTGCTAAATCATTTAATACACCTGTAGCAGTTTGTTTCTTCGTTACATGCGGTTGAACTGCGCCGATTTGATTGACTGCATCATCTCTAATACTATTGACCATCGCAGTAGTAGACGTCACACCAATATCAGTTAATGCTCTATTTTTAAGTGTATTGACACGATTTATCGCTTCTTGTTTCTCTTCTCGAGTCGCGCCAGGTGTTGCATTGATATTTGTTATCGCCTCTCGCGCTTTATCATTTACAACATTGCGAGCATCCGTTTTAACTTGTGTTGCCGGTTGAATCACAACTATATTTTGTGTGCCCTGATCTTTTGCTTGTGCAACTTCTTGATTCGTATCTGCTGCATTAATATTTTGCTTCGCTGTGGCTACAGCTTGATCAAGTAATTGTTGTGCTGCTTGTTGTTCTTCGAGCGTCGCATCATTATTATTAAATATCGTATTATGTTGCGTTTCCGCACTTTTATCAATGGCATTTTTTGCATCTGTTTTTACTTTTGTAGCTGGTGTAATTGCTTGTATTCCTTGTATCGCATTTGTCTTCACTTGTTCCACTTCAGCATTGGTATTAGCGTTTAAAATGTTTGTGTTTGCTGCAGTTACAGCAGCATTCACTTTGTCAATTGCTGCTTGTCTTTCTTCTTGAGTCGCATCAGGATTAGCATTGATCTCTGCGATATGTTGTTGTGCATCATGTGATACAGCATCCCTTGCAGCTTGCTTAACAACAGTTACAGGAGCAATTGGATTAATGGCATTTAGACCATCTCCTTTGGCGTTATCAACATCAGCATTTGTTGTTGCTTGATTGATTTGTTCTAAAGCATGGTTGGTTGCTTGAGTTAATTCGTTCAATGCTGCATTTTTCTCTTCCTGAGTTGCTTCTCTATTACTATTTATTTGTTGTCTTTTCGTTGCTGTTGCTTGGTTAATTGCATCTCTTGCAGCTTTTTTATGAGTTACTTGAGGAACAACTGCTCCAATAGTATTGATGCCATTATTTTTAGCTGTTTCAACGTCAGCATTTGTAGTAGCATTCGTAACATTATCAATAGCATCTGTTTCATCCGTAGCTAATTGATTTATTGCATCTTGAATCTCGTCTTCAGTAGCATCTGGTGTTGCATTGATAATTTCCCTTTGTTTCGTTGCTTTATCACGTATTGCTTTTTTAGCATTTGGTTTAACAACCGGTGTTGCAGTATCCCCACTTAAGGTCTGTATACCTTGATCTTTGATTCTAGTAACGCCATCATCAGTCGTTTGATCACCAATATCACCAATAATATTGCCTTTATGTTCCTCGATAACTTGTATTGCTGCTTGTTTTTCTTCATCTGTCAGTTCATCATTTTGATTAACTAAATCTTCCATTTGATCAGCTTTTTGATTTACTGCATTTTCAGCATCAACACTTCGAATTAAAGTATGTTGCATCTGATTAGTTAATGTATCAATATCTGCTTGAGATACTCTTTTATTTAATGGTACATTGTTACGATTTTCAGCTAAAATTGTTTGTGCACGTTTTTTAAGATCATTAAAGATATCTAATGATGCAAATGTATAATCAGCTTGTTGAATACGTCTGTCAACTTCGGCTTGTAATGCATCTTTATTCATGATGATATCGATAGTATATGGATTTGTACTTACAGTATGACTTTCTGCAGCTGAATTAATGAAATCTTGTGTATATGTTTTATACGTTAATGTATCATTAAATGTTACTGTTCTTGGTGTCGGTACATTATTAACACGCAACTTATACTTTAAATCCAATATTTTATCAGGCATTAGTCGTGCAGGTGAATTCGTTGTGCCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP039167|1830169:1842904|1830169_1836730_-|WP_001050540.1|DBSCAN-SWA MNLLKKNKYSIRKYKVGIFSTLIGTVLLLSNPNGAQALTTDNNVQSDTNQATPVNSQDKDVANNRGLANSAQNTPNQSATTNQATNQALVNHNNGSIVNQATPTSVQSSTPSAQNNNHTDGNTTATETVSNANNNDVASNNTTLNVPNKTNENGSGGHLTLKEIQEDVRHSSDKPELVAIAEPASNRPKKRSRRAAPADPNATPADPGAAAAGNGGAPVAITAPYTPTTDPNANNAGQNAPNEVLSFDDNSIRPSTNRSVPSVTVVDNLPGFTLINGGKVGVLSHAMVRTSMFEAGSNRTYQAQGNVLALGRISGTDASNHGDFNGIEKSLTVNPNSELIFEFNTMPTKNGQGATNVIIKNADTNDTIAEKTVEGGPTLRLFKVPDNVRNLKIQFVPKNDAITDARGIYQLKDGYKYYSFVDSIGLHSGSHVYVERRTMEPTATNNKEFTVTTSLKNNGNSGASLDTDEFVYKIQLPEGVEYVNNSLTKDFPSNNSGVDVNDMNVTYDAANRVITIKSTGGGTTNSPARLMPDKILDLKYKLRVNNVPTPRTVTFNDTLTYKTYTQDFINSAAESHTVSTNPYTIDIIMNKDALQAEVDRRIQQADYTFASLDIFNDLKKRAQTILAENRNNVPLNKRVSQADIDTLTNQMQHTLIRSVDAENAVNQKADQMEDLVNQNDELTDEEKQAAIQVIEEHKGNIIGDIGDQTTDDGVTRIKDQGIQTLSGDTATPVVKPNAKKAIRDKATKQREIINATPDATEDEIQDAINQLATDETDAIDNVTNATTNADVETAKNNGINTIGAVVPQVTHKKAARDAINQATATKRQQINSNREATQEEKNAALNELTQATNHALEQINQATTNADVDNAKGDGLNAINPIAPVTVVKQAARDAVSHDAQQHIAEINANPDATQEERQAAIDKVNAAVTAANTNILNANTNAEVEQVKTNAIQGIQAITPATKVKTDAKNAIDKSAETQHNTIFNNNDATLEEQQAAQQLLDQAVATAKQNINAADTNQEVAQAKDQGTQNIVVIQPATQVKTDARNVVNDKAREAITNINATPGATREEKQEAINRVNTLKNRALTDIGVTSTTAMVNSIRDDAVNQIGAVQPHVTKKQTATGVLNDLATAKKQEINQNTNATTEEKQVALNQVDQELATAINNINQADTNAEVDQAQQLGTKAINAIQPNIVKKPAALAQINQHYNAKLAEINATPDATNDEKNAAINTLNQDRQQAIESIKQANTNAEVDQAATVAENNIDAVQVDVVKKQAARDKITAEVAKRIEAVKQTPNATDEEKQAAVNQINQLKDQAFNQINQNQTNDQVDATTNQAVNAIDNVEAEVVIKPKAIADIEKAVKEKQQQIDNSLDSTDNEKEVASQALAKEKEKALAAIDQAQTNSQVNQAATNGVSAIKIIQPETKVKPAAREKINQKANELRAKINQDKEATAEERQVALDKINEFVNQAMTDITNNRTNQQVDDTTSQALDSIALVTPDHIVRAAARDAVKQQYEAKKREIEQAEHATDEEKQVALNQLANNEKRALQNIDQAIANNDVKRVETNGIATLKGVQPHIVIKPEAQQAIKASAENQVESIKDTPHATVDELDEANQLISDTLKQAQQEIENTNQDAAVTDVRNQTIKAIEQIKPKVRRKRAALDSIEENNKNQLDAIRNTLDTTQDERDVAIDTLNKIVNTIKNDIAQNKTNAEVDRTETDGNDNIKVILPKVQVKPAARQSVGVKAEAQNALIDQSDLSTEEERLAAKHLVEQALNQAIDQINHADKTAQVNQDSINAQNIISKIKPATTVKATALQQIQNIATNKINLIKANNEATDEEQNIAIAQVEKELIKAKQQIASAVTNADVAYLLHDEKNEIREIEPVINRKASAREQLTTLFNDKKQAIEANIQATVEERNSILAQLQNIYDTAIGQIDQDRSNAQVDKTASLNLQTIHDLDVHPIKKPDAEKTINDDLARVTALVQNYRKVSNRNKADALKAITALKLQMDEELKTARTNADVDAVLKRFNVALSDIEAVITEKENSLLRIDNIAQQTYAKFKAIATPEQLAKVKVLIDQYVADGNRMIDEDATLNDIKQHTQFIVDEILAIKLPAEATKVSPKEIQPAPKVCTPIKKEETHESRKVEKELPNTGSEGMDLPLKEFALITGAALLARRRTKNEKES >NZ_CP039167|1830169:1842904|1840099_1841281_-|WP_001025061.1|DBSCAN-SWA MNIPKSVWWLVIGMALNITGSSFLWPLNTIYMKQELGKSLTVAGLVLMINSFGMVIGNLLGGSLFDKLGGYKTILIGTFTCLCSTTLLNFFHGWPWYAVWLVMLGFGGGMIIPAIYAMAGAVWPNGGRQTFNAIYLAQNIGVAVGAAMGGFVAEFSFNYIFLANLIMYVVFALVAVTQFNIEINAKVKYPTHLDITGKKNKARFISLVLICAMFAICWVAYIQWESTIASFTQSINISMAQYSVLWTINGIMILVAQPLIKPILYLLKGNLKKQMFVGIIIFMLSFFVTSFAENFTIFVVGMIILTFGEMFVWPAVPTIANQLAPDGKQGQYQGFVNSAATVGKAFGPFLGGVLVDAFNMRMMFIGMMLLLVFALILLMVFKENNTQPKKIDA >NZ_CP039167|1830169:1842904|1837388_1839812_-|WP_001789004.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLNYNHNQIEKKWQDYWDENKTFKTNDNLGQKKFYALDMFPYPSGAGLHVGHPEGYTATDIISRYKRMQGYNVLHPMGWDAFGLPAEQYALDTGNDPREFTKKNIQTFKRQIKELGFSYDWDREVNTTDPEYYKWTQWIFIQLYNKGLAYVDEVAVNWCPALGTVLSNEEVIDGVSERGGHPVYRKPMKQWVLKITEYADQLLADLDDLDWPESLKDMQRNWIGRSEGAKVSFDVDNTEAEGKVEVFTTRPDTIYGASFLVLSPEHALVNSITTDEYKEKVKAYQTEASKKSDLERTDLAKDKSGVFTGAYAINPLSGEKVQIWIADYVLSTYGTGAIMAVPAHDDRDYEFAKKFDLPIIEVIEGGNVEEAAYTGEGKHINSGELDGLENEAAITKAIQLLEQKGAGEKKVNYKLRDWLFSRQRYWGEPIPVIHWEDGTMTTVPEEELPLLLPETDEIKPSGTGESPLANIDSFVNVVDEKTGMKGRRETNTMPQWAGSCWYYLRYIDPKNENMLADPEKLKHWLPVDLYIGGVEHAVLHLLYARFWHKVLYDLGIVPTKEPFQKLFNQGMILGEGNEKMSKSKGNVINPDDIVQSHGADTLRLYEMFMGPLDAAIAWSEKGLDGSRRFLDRVWRLMVNEDGTLSSKIVTTNNKSLDKVYNQTVKKVTEDFETLGFNTAISQLMVFINECYKVDEVYKPYIEGFVKMLAPIAPHIGEELWSKLGHEESITYQPWPTYDEALLVDDEVEIVVQVNGKLRAKIKIAKDTSKEEMQEIALSNDNVKASIEGKDIMKVIAVPQKLVNIVAK >NZ_CP039167|1830169:1842904|1842340_1842904_+|WP_000764423.1|DBSCAN-SWA MKLERILPFSKTLIKQHITPESIVVDATCGNGNDTLFLAEQVPEGHVYGFDIQDLALENTRDKVKDFNHVSLIKDGHENIEHHINDTHKGHIDAAIFNLGYLPKGDKSIVTKPDTTIQAINSLLSLMSIEGIIVLVIYHGHSEGQIEKHALLDYLSTLDQKHAQVLQYQFLNQRNHAPFICAIEKIS >NZ_CP039167|1830169:1842904|1837055_1837367_-|WP_000836465.1|DBSCAN-SWA MKSITTDELKNKLLESKPVQIVDVRTDEETAMGYIPNAKLIPMDTIPDNLNSFNKNEIYYIVCAGGVRSAKVVEYLEANGIDAVNVEGGMHAWGDEGLEIKSI >NZ_CP039167|1830169:1842904|1841390_1842344_+|WP_000526544.1|DBSCAN-SWA MGNHFQYAFENNRYHTWNYHLKNKFGQKIFKVALDGGFDCPNRDGTVAHGGCTFCSAAGSGDFAGNRADSIAVQFKEIKEKMHEKWHEGKYIAYFQAFTNTHAPVEVLKEKFEPVLKEPGVVGLSIGTRPDCLPDDVVEYLADLNQRTYLWVELGLQTIHQSTSDLINRAHDMKTYYDGVAKLRKYNINVCTHIINGLPGEDYDMMMATAKEVAQMDVQGIKIHLLHLLKGTPMVKQYDKGLLTFMTQEEYTNLVVDQLEVIPPEMIVHRITGDGPIDIMVGPMWSVNKWEVLNGIDAELARRNSYQGLRYKSKVKQ |
6 | Staphylococcus_phage(100.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1846063 : 1877726
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP039167|1846063:1877726|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP039167|1846063:1877726|1860971_1861274_+|WP_000091445.1|DBSCAN-SWA MSRSKKYFYLSSLMIILSFFFNTNNVFLSGLFNSFIKLILFCSVINSIVLILSIIFADRSIKSLKPDADWIRIASKSLPWIILIVILVHIFSIVRTFGFI >NZ_CP039167|1846063:1877726|1876284_1877037_+|WP_000764922.1|DBSCAN-SWA MKLFFIFNFILNTIMSQTDYSDPTSNQLNKTSQYEGLMYNMKALYESDPVSFEKIKSYDQFLSFDLIYFYQTLQYNRIKTELTNDLSNYYKDKDVDLFGVKYFVNCYFSDNKDIKENSPSNDRVCMYGGVTEHEGNRTKLFGYTIVVSVYIDNRNSRSFTLSTNKDHITAQELDYNVRNQLIKDEQLYEFESSRFETGYIKFIENGKAVFWYDLMPPPNFTQSKYLMIYKDNKTLLSSKTAIEVHLTKKK >NZ_CP039167|1846063:1877726|1849494_1850526_-|WP_000384179.1|DBSCAN-SWA MDYAIQLANMVQGQTGVNPPVGAVVVKEGRIVGIGAHLRKGDKHAEVQALDMAQQNAEGATIYITLEPCSHFGSTPPCVNKIIDCKIAKVVYATKDNSLDTHGDETLRAHGIEVECVDDERASQLYQAFFKAKAKQLPQITVKVSASLDGKQANDNGQSQWITNKEVKQDVYKLRNRHDAVLTGRRTVELDDPQYTTRIQDGKNPIKVILSKSGNIHFNQQIYQDESTPIWIYTENPNLTTNQTHIEIIYLKSCDLTTILHNLYKRGVGTLLVEAGPTTTSEFLQSNYIDEFILYYAPKLIGGSGNYQFYQTNDVIEIPDANQFEIVHSELLNQNVKLTLRKK >NZ_CP039167|1846063:1877726|1848855_1849488_-|WP_000493888.1|DBSCAN-SWA 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MNFEGKLIGKDLKVAIVVSRFNDFITGRLLEGAKDTLIRHDVNEDNIDVAFVPGAFEIPLVAKKLASSGNYDAVITLGCVIRGATSHYDYVCNEVAKGVSKVNDQTNVPVIFGILTTESIEQAVERAGTKAGNKGAEAAVSAIEMANLLKSIKA >NZ_CP039167|1846063:1877726|1858185_1858629_-|WP_001030469.1|DBSCAN-SWA MNKASFDKKVKKQLWFLNKKEKQALDQRLSSISDDDSVNLNKPVTFANAYLRQNVFRNKETKSYSMFVTLVVMMFAYVALLGLFLFGLITSLSGVQFFVSPKVDLSTTVVILTIIGAILLMIVSIYFIKIVTSYFTKKLLEIKFNSK |
36 | Staphylococcus_phage(90.32%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2025736 : 2030655
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP039167|2025736:2030655|DBSCAN-SWA CGTGAAATTTAAAACAACTAAAGAATGTAAAAGTAATAATATCTTTAAAAGAAGTCAAGAAATTAATAATAGAGAAAGTGAAAAGGGTTGTTTATGGGGCATTAGCATGTTGATTCTACTTTTCTTATTGATTCTGTTTGGAATAACTGCTTGTTCATCAAGCATTCACTTTATTAATTAGATTTTTTTACTTGGAGGTATCATGTGAAGAACCATACAAATATAATTAATATCTTATTAGTTATAGTCAACTCATTAACTCATTTTCTAACTCTAAACACCTCATTTTTTAATAGTTCAGCATCGGATTTCTGTTTTATCATAGGGGCTATATTTTTCTTGATCGGAATTTTTGTTGCAATATACGGTATGAAGCGAGCAACATATTGGTTAAACTTATTGATTTTATTTACCAATATTTTTTATTTTCTACACTTCTGTGTTTTACTTTTGTTAAAATATATAGGATTTAAATTATTTATTTATGAAGGGTGTGTATTGTTATTTACCTAATTTATAGTCTAATTGTCTATTTCATCTGCATTATAAATTTTTTCATAATGGCTGCACCATTCTTAATGACTAATGCTGATTATGTATGGACGCCTATGACTACAGTTACGTTATTTATTTTGAGTTTGATTATTTTCTTGATATTTATAAAAACAAAAGATGTCGTTCATTTAACAATTTTCATATTAAACTTACTTTTTTCAATACTTTATTGTTTGCCTATACTGTTTTATTTATGAACACTTTTATATTATCTAGAAAATTAAAACCACCCGTAAAAGGGTGGTTTTTTTAATATTTACTTTTTAGTGCTTCGTCAATTTCGTTATAAATCTTTTGAAGTTGATATTTTGCTTCTGACATTTTCTTAAAGTCTTTTGACTTAAGAGCATACATTGCTTTTAGACCTGAAATTTTTATAGTTCGCTTATAATAAGTGTTTAAACTTCCAGTAGCTAATTCATTAACATTTAGTTCATCTAATAACGATTTTAATTCATTAGCTAACTTTTCGTTTTGATATTCATTCGATGTTGGCAAGCTTGTGCTAGCTTGTGCCTCATTTTTATCTAGATTAGTTACTAGTGGTGATGCTAAAACGATTGCTAAAGTTCCCGCAAGTATAGATTTTCTAATTTTCATTTTTTATTCTCCTTAGTAATTAGTACTAATTTATTTTAATGACTAACTAAAAAAAAGTACATTAATTATTCATTAACTATATAGATCTTCTTATTAAATGAAAATTAATAAATTATCAAATTGACATACCTTATTGTATTTATAGAAAAACAAAAAAAGGTAAGCACCGAAATGCTTACCTACTTCCCATAAACAATATAACACATATACATTGATTTGGAAAGCGCAAAAATAAATTTAATATACTAGCCCGAAGGGGAGCAATACATAAAAAATGAAAGGCGCTCCTTGAAAACGCCCAAGGTAATATTAACATAAAATGGCTACTATTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATAGCAAAAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAAATGATTATAGCATAATTTTAAACTATTCTATAATAAATTAATTAACTTCATATGAAACTTTACACACTTTTTTTCAAACTGCACTAAACTTACCAAAACTGCTTATTCGGTTGCCTGCTATGTCTACCTCTCCGGTCGCAATATAGCGACGTTGTCCACTATTAGCAATATAAGTAATCCATCTATGGGGGGCAATATAAACGCGCTGATTTAATCGGACAATCTTCTTATATTAAAAATAATGATGTCGTAATATTCAATGAAGCATTTGATAATGGTGCATCAGACAAATTATTAAGTAATGTGAAAAAAGAATATCCTTACCAAACACCTGTACTCGGTCGTTCTCAATCAGGGTGGGACAAAACTGAAGGTAGCTACTCATCAACTGTTGCAGAAGATGGTGGCGTAGCGATTGTAAGTAAATATCCTATTAAAGAAAAAATCCAGCATGTTTTCAAAAGCGGTTGTGGATTCGATAATGATAGCAACAAAGGCTTTGTTTATACAAAAATAGAAAAAAATGGTAAGAACGTTCACGTTATCGGTACACATACACAATCTGAAGATTCACGTTGTGGTGCTGGACATGATAGAAAAATTAGAGCTGAACAAATGAAAGAAATCAGTGACTTTGTTAAAAAGAAAAATATCCCTAAAGATGAAACGGTATATATAGGTGGCGACCTTAATGTTAATAAAGGCACTCCAGAGTTCAAAGATATGCTTAAAAACTTGAATGTAAATGATGTTCTATATGCAGGTCATAATAGCACATGGGACCCTCAATCAAATTCAATTGCGAAATATAATTACCCTAATGGTAAACCAGAACATTTAGACTATATATTTACAGATAAAGATCATAAACAACCAAAACAATTAGTCAATGAAGTTGTGACTGAAAAACCTAAGCCATGGGATGTATATGCGTTCCCATATTACTACGTTTACAATGATTTTTCAGATCATTACCCAATCAAAGCCTATAGTAAATAGTGCTCAACTAACTAATAACTCGCTTCGTTCTAAAAAGTCGAAGCGAGTTATATTGTTAAAATTTGAATTGACTTACATTTTAATAAAATCATCTTAACAATTTTAATTTTTCATTAATACAAGTCTTTACTCTACACTCAAACAAGATTCATACACTGCACATCATAATAAATCTATCTATTCAAATATAAATAAAAGTTACCTACTACATTCTATGTAGCAGGCAACTTTTATTACTTATTTCTTTTCATTATCATTAAGTACTTTTACAAACTTCACATTATGTGTCTTCCAATCAACTTCATATAATGCTGATAATTTTTCTTCTTTTTTATCTACATGGTTTTCACCAGACCAATAGCCCCAGAAACCATGACGATTCCAATCTATTTTAAACTCATCCATTGATCTTTTATAATGAACAACAAATTTTGATTTACCTTCATCTTTTTTATCATGTGACATAACAGCTAAAAATTCTGGATTAAACCCTTCAGAAACAGTTACAGGCATCTTATTCTTAGGCGTAAAATTATCTTTCGCCCATAAATTTCCATTTCGTGTTAAAGAAAAGATTTCACTTTTAGTTCTATTATCACTATCATTAGTTAATTGTCTCGTATGGTCATGTCCCATATTATTTATCAAATGTGCTTCTACTTTCCAACCTACACCTTTATGTGACGTAGATTGATCAAGTAATGTACGATACGATGGTTGTTGATAACTAATCGTCTCTGAATAATTACTCTCTTTTGTAATATTTCCAGTTAACCCTCCACGATTAATCGAAAAATCTCCACCTGTTTTATAACCATACGTATATTTAACTTCTCTTGATTCATCCTGATTTTTTGGTGCAAAGTCAGTCACATTTGTATTGTTGTTGTCATCAACATTTTGAATTGAAACTGAATAAGATCCAGGCCATCTTAATGTACTATTCCAATAACCATTTGGGTCTAGAATTCTTAAACCACTACCTATTGTTCCTTTCGCTTTAATAAATACTGTTTCTTTATCATAATTAGGTTCAGTTAAGAAGTTAAATTGTAAGCTTTGAGTAATATTTTTTTGACTATCACTTGTTGTAGCTGTACGTGTATACATTTTAGTATCACCATCAAGATTCTTCTCAGAAACAGCTTTAATTTCAGAATTAATTTTTGCATAAGAAGTAGCTGGTAATACAGTGAAAGTAGTCGATAGTGCTAACGTACAAATTGTGATATTTTTATATAGTTGTTTAATCATTTGTAATCCTTCCCTTCGATTTTATCCTTCTCTAAATGATTTATTATCAGAGTATTTATCAACGACTTTAACTGTTTTATTTTTCCAATCAACTTCATAAGTGACAATTAATCTTTGACCATCTTTATTTTTTTCTAAAATTGGAGGTGCATAATGTATTCCAGGTCTGTTTTTCAAAATATCTTGATTTCGTGTGTATGTTACTTCAAATTGCGTTTTCTCATTTGACTTTTCATTAGATAAATAAGTTAAAAATTCTGGATTAAAGCCACTTCTTACTAATGCTGGGTATCTATATTTTGAAGCAAAGCTTAGTTCAGGGTTTTCTACAGTAGCAATTCTCGTATTTCTATAGAATAATAATTCATCATTTCTATTTTTCACTTCTCCACCATACTTCAAGTCATTCGCAATAACTGACCAGTGTACATGCCAGTTATTATTTTTACCGCTGGCAATTGTGTCATAATTTTGCTGATTATAACTAATCGTTTTGGAGTAGCTATTTGATGAAGTTCGTCCAATACCTTTCGTTGAATCGAATTTACCACCTGAGCTATATGAAAATGTACTGTCTACTTTCGCAGTTGAAATTTTATTTTTCGGCAATTGGTCTAATATTTCAGTTTTACGATTTCTTTTTACTTGAAAATCTACATGGTACTCACTTGGATACTTTAACCAATTTGAATTTTTTTCTTCTTTATGAGATTCAAACTTTAAATTTGAATGAATTGAGCCTTGTTTTTTAACAAGTAATACATTCTTGTCATAAGTTGGATCATCGATAAAGTCGAATTGTAAATTTTGGAGTATATTTGTTTTCTCATCATATACTGTTTCAGTTCGTTTTGTGATTTTACCGTTTTTCCCAATATCATCAGGTACTGTTGAATTTTTATCTTTATTAGTAACATTACGTTTGTCTTTTTGTTGAGACTTATCAACATGTTCTTTCTTATTTTGATCTTGCGAGTCTTTATGAGCTGAATTTGCTTGAGTCGTTGCTGCTGATAACAATAAAATTGCACATGATAATGATGACGCTATTAAAACACGTTTTTTATTTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP039167|2025736:2030655|2028564_2029581_-|WP_000595401.1|DBSCAN-SWA MIKQLYKNITICTLALSTTFTVLPATSYAKINSEIKAVSEKNLDGDTKMYTRTATTSDSQKNITQSLQFNFLTEPNYDKETVFIKAKGTIGSGLRILDPNGYWNSTLRWPGSYSVSIQNVDDNNNTNVTDFAPKNQDESREVKYTYGYKTGGDFSINRGGLTGNITKESNYSETISYQQPSYRTLLDQSTSHKGVGWKVEAHLINNMGHDHTRQLTNDSDNRTKSEIFSLTRNGNLWAKDNFTPKNKMPVTVSEGFNPEFLAVMSHDKKDEGKSKFVVHYKRSMDEFKIDWNRHGFWGYWSGENHVDKKEEKLSALYEVDWKTHNVKFVKVLNDNEKK >NZ_CP039167|2025736:2030655|2026539_2026890_-|WP_000702262.1|DBSCAN-SWA MKIRKSILAGTLAIVLASPLVTNLDKNEAQASTSLPTSNEYQNEKLANELKSLLDELNVNELATGSLNTYYKRTIKISGLKAMYALKSKDFKKMSEAKYQLQKIYNEIDEALKSKY >NZ_CP039167|2025736:2030655|2025939_2026248_+|WP_001792927.1|DBSCAN-SWA MKNHTNIINILLVIVNSLTHFLTLNTSFFNSSASDFCFIIGAIFFLIGIFVAIYGMKRATYWLNLLILFTNIFYFLHFCVLLLLKYIGFKLFIYEGCVLLFT >NZ_CP039167|2025736:2030655|2029602_2030655_-|WP_000791412.1|DBSCAN-SWA MKNKKRVLIASSLSCAILLLSAATTQANSAHKDSQDQNKKEHVDKSQQKDKRNVTNKDKNSTVPDDIGKNGKITKRTETVYDEKTNILQNLQFDFIDDPTYDKNVLLVKKQGSIHSNLKFESHKEEKNSNWLKYPSEYHVDFQVKRNRKTEILDQLPKNKISTAKVDSTFSYSSGGKFDSTKGIGRTSSNSYSKTISYNQQNYDTIASGKNNNWHVHWSVIANDLKYGGEVKNRNDELLFYRNTRIATVENPELSFASKYRYPALVRSGFNPEFLTYLSNEKSNEKTQFEVTYTRNQDILKNRPGIHYAPPILEKNKDGQRLIVTYEVDWKNKTVKVVDKYSDNKSFREG >NZ_CP039167|2025736:2030655|2025736_2025916_+|WP_000669789.1|DBSCAN-SWA MKFKTTKECKSNNIFKRSQEINNRESEKGCLWGISMLILLFLLILFGITACSSSIHFIN >NZ_CP039167|2025736:2030655|2026226_2026487_+|WP_001791826.1|DBSCAN-SWA MCIVIYLIYSLIVYFICIINFFIMAAPFLMTNADYVWTPMTTVTLFILSLIIFLIFIKTKDVVHLTIFILNLLFSILYCLPILFYL |
6 | Staphylococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2760573 : 2825883
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP039167|2760573:2825883|DBSCAN-SWA 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50 | Staphylococcus_phage(33.33%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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