Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP040507 | Arcobacter butzleri JV22 chromosome, complete genome | 1 crisprs | PrimPol,DEDDh,WYL,csa3 | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP040507_1 | 861379-861476 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP040507_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP040507_1
>1.1|861406|44|NZ_CP040507|CRISPRCasFinder ATTCTAAATTTAACACCACTTATTTGAAAGTTACCTCAAGATAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP040507_1
The CRISPR arrays of NZ_CP040507_1 >merge|NZ_CP040507|1|861379-861476|CRISPRCasFinder CGTGTCTACCATTCCACCATATCCGCAATTCTAAATTTAACACCACTTATTTGAAAGTTACCTCAAGATAGCGTGTCTACCATTCCACCATAACCGCA >NZ_CP040507|1|1|861379-861476|CRISPRCasFinder CGTGTCTACCATTCCACCATATCCGCA ATTCTAAATTTAACACCACTTATTTGAAAGTTACCTCAAGATAG CGTGTCTACCATTCCACCATAACCGCA
>NZ_CP040507.1|WP_004509929.1|860294_860966_-|hypothetical-protein MSYKKHFLTTYLLLSLNLFADGYEECSKLDKLNHNSIIQKEIIINCNDNIHKTSKDTSFDLEIKLINQKISIVENKVNDKLNDFEKNISQQYNIMDWWLKLTSLIVTIAAGLLIFLGFKTKKDITDDIISRTESKINIKMDNIRSETNVNISEIKSQLLQQDFRSFDNIRVDILKNIDETIINRFEAYDIMINEFQTKLEEIQNNKNTPMGNVDKSKHDDPFE >NZ_CP040507.1|WP_004509930.1|858956_860285_-|DGQHR-domain-containing-protein MNKKYFVIELNAIQQFESKVLFGSIKYSDVNLSSKLSARNKSEDEFQREPQQKDYTKIKSFIKERLSKKHKEKLPIFPTPLILDVNIETDFYINNNIIEIEKYFEDQYSTYLEFNELKKELKLLENKDENKEKIYELESKLASYPKFKGLIFEKNKGEKYDLYIPLFEENFELNPILIVDGQHRFLGLKEFFKETDLLTTNTKPDNFSFLVTYLITNDMYEQAIIFSDVNFNQKPVNKSLMYDILSVVPFEKNQALFSHFIVKRFNEDEEFKGIVKMLGIGNGIISLAFMVETIKDKLLTKSCPKLFDIYENDYIKENGNRHKHIPDIFIDYFKFIKRNFSKYFPNKNHKNEYNVKDYNSILFKTTGIYALLLLLKDLINNYNLNLLTYQEDEFNEILEKAFKEIIKKQTNLFNENSRYSKAGSAGLQRELYLELKELLILS >NZ_CP040507.1|WP_138625980.1|858143_858935_+|hypothetical-protein MKTELLKLIDLQDASYYVWKNKTKKKLIWFFHKYFLESDIKEFNERNQIIKLDFLYSSSVVGCYTFCEYFEELIDNEQHLETFVKYLISYKKEHDLDFLGGQIPVEIDFDYEEIIKLKNMFVLGVRQYQVDSNFHNEFSYLNHFITKCSISDFLFIHHNILNNFKLMIDILDKNVSFNVSEDILSFGNKRNPIIKDLLYKFLIKFYIRLYNLDENNFRFKSSEMKFKKIKSFCDKKFKSDRMIDILDITRNEEIIKEYNERRN >NZ_CP040507.1|WP_138625979.1|857065_857941_-|replication-endonuclease MEHIKQALYKYSLYKEKQQSNYLKNQQNLKNIKTGEILTLNYSLDLKQKEYVKTIEQKVNALVSLAIAQNLKPIFITLTVPSEFHPNKTLKNGVIVINKKYKFIKLDDAIVEAYEELKTIYRTFYKRLKNFSKNIYYIKITEPHQSLIPHMHILLFIQREQQKNTKKLFLKIYKEYKLQRVDYDESILNDNLKNVVGYIMKYILKTINSNDEFFKRWLDGWRKKYKIRACEMSNLPISIEIYKKLYYNLPQDIKESIQKEIALNKQSFFEYFIQNTEVHQIIYSEKEDKNM >NZ_CP040507.1|WP_134815791.1|856632_856884_-|hypothetical-protein MTKIIASGRIEHIQIKDFQGVKTTVVQMINKSEKKGFEIIKIKLTDESVIVKDGDLVNIPVSISAMNNSIFYTQNGKIEILKA >NZ_CP040507.1|WP_004509935.1|855361_856630_-|hypothetical-protein MFGAFYRYFVRFFILNLAFFLSIFSFEYYLNSESLSHYSGLKTIFHLKDIIENYQVNSILLDFYISIFFAINLYLLIWFIRYFKYLNLPYAINIYQDVKQIEGMQKKYKSSHDSFRKKVKTHNGYKLFYKNWVSISLDSYNEKKKEIIQYLGFDGEINIKPWDKRGVELTFYKLPTVIEASLLDYKQGNINYGFGRNGNYYIPFENLIHTICVGESGSGKSNMMHHLLQSIILNDGIIEKVELIDLKGTELYRYRDVDYMDFIDDINQIKEKFLYLKEVMNSRFQLMKEKNLQLFNGKFYCVFIDEVGTIGTFPNKKLRDEIFDLMIELFQKGRAARIIFFIFAQKIDSTNIPSNVLANIPTKVLMKTDSDFNINNSIGTKESLEKITLTDPDSFNKGRAILKDGYTSEKILLQIPFIRFKD >NZ_CP040507.1|WP_004509936.1|854951_855197_-|hypothetical-protein MNTNEYIELKQLLSELKNMIRILVPQTASISYLSDLTGKSRQSIRQLLINNFEPEVDYWNKGGKIFVSQRVAIIILTRSSK >NZ_CP040507.1|WP_138625978.1|853788_854955_-|site-specific-integrase MNNRIKGDGLFKIRNNVIYVHCSLNGVFYRKSTGKKVTPATKQWIKKANPLEELEKLLNKEKNMITTNNFEKFAKMVLDITSSRRQQYSQKELERLFEKRILPSFKGCNLEDIRPLDIVNLLEKQKKEVCNDRVKRIRNLLNIIFDYAYDNDLIQKNPVQSRSVKSINLSYSPKSTKAYTTEEISIILKNAKGWFKIFIELSFKLGLRTGECMALKWSDFNFETEKLFLQRSITKGVITEQDKNSLSNKNHFRIIQLFPDLVKLLKTYYEVRPSDEWLFINKDGRYYRESKTIVDYHLKPLLKKINVEYKTLYATRRSYASVMSYGGENLENIQMIMGHTKGSKITERHYIDPRILKLEHDKLNAQKQQDIFNMMIEVENENFQSKLS >NZ_CP040507.1|WP_004509939.1|853253_853637_+|hypothetical-protein MFKQVKSAVFWYYLYKFRKRVTLIFLLLIIALFANVIYADIVEYLKLKEKLEYLEIALISKWLIIIFNIGISIYLILTLFKKEETGSSKKEKIVEKETFKKEKFTQREKEFLNKKNIRSKADILLDK >NZ_CP040507.1|WP_004509940.1|852929_853244_+|hypothetical-protein MGIKDKLKENSNKLINIASENATKAFDYPKIKSQQLKDAINLKIREKAILSTKARLIENHKTFDDFSDEDLEIIIADEERKIIDDLKTKSLVVALAALGLNFFV >NZ_CP040507.1|WP_004509928.1|861603_861918_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-C MKKIVLLMLAIAGIAFAADEAVVNETLKAYSVVAAGIGLGLAALGGAIGMGNTAAATIAGTARNPGLGGKLMTTMFIALAMIEAQVIYALVVAMIALYANPFLG >NZ_CP040507.1|WP_138625981.1|862089_864168_+|hypothetical-protein MKKIIISTTFLIILIVVSIYGILFTKKGNGFISSYLENRVNEEQKDLNFKINNFTLTTKDVDFEATLNENSYINISGALSLFKKNVDLKYDIKIEDLSIFKDLISEDLKGTFFTNGIFKGSESESIIQGFSNIASSETKYYMNLVDFKLKDIYLDLKDARIDELLAIFNKPLYANGNLNLNANIKNIDKNSLDGLFIANISKGLINNDIFNKEFNQKINTKISFNGDINASLLGNIIEVKSDMTSSVADIFFDKTLIDIEKNTIQSDYKIDVKNLAKLEGLIGKKLQGEFLTTGNILKDNKNISVDGNSDIFDGFFTYKFELKDYEIQNLNLNIEKAKLEKIFFMLNEPIYAVGNLELHSDIKNSNIENLDGSSSIKISDAKIINEVVNTVFKKNLKDLITFKSEIKTSYISNQAISQIDVNSNIVQLNMNKAIYDFSKNTFNSDYNLNVFELEALESFTKVKMRGAIDVVGTIENSENYFKINGNSNLASGQMNFNLINHDLVLNLNNANLKDITYMMFQPEIFDSKTNLDLKYNLLDEKGTLNANLLGGRFLENNFTNIVNQLAKYDLTKDVYETAVLSSKIDSKKFITDLTMKNKNNQIEIKDSLVDFDKNIIDAKIDTKIKNNSFFVLVKGDMNKPTISLDVKNFLKNKIDKKIEDNKDKIEEKLNKVLKDKDSEKTKELIKNIKSLF >NZ_CP040507.1|WP_004509925.1|864265_865621_+|imelysin MIKSTKKVLLSVSVVASLALTSYAATNNNEVKKVEVAKQASILEAYANIALDNYTNALKDAKNLKVAIDKFAKAPTQENFDAAKKAWLDSRESYGSTEIFRLSNGPIDAEEGWIADAYGALEGQINAWPLDENMIDYTVDAEGKLTSGNIIDTVGKFNPGGEDSKEVDVTKITVDALTDLNENGGEANVSTGYHAIEFLLWGQDQDYANFMDDNVTKGPMTAGQRPLTDFTTDKNSQRRLAYLKASSEKLVKDLETVTSAWKKEIKGNQGLYQAALLGKLKGKDKDKNIDQKEALKQIIAGMGVFIKSELANERIAVAVLTPSEEDEHSCFSDNTHRDLVKNYEGFKNVLTATYNGKKYGKSLFDAVDKETKERIEKLMSSIEEKIESVDRIAKTEAHFDYQIRPDHEQSKVLIKLKNELRKLGDEMVNVASANGISLSTDDVTDPEETKI >NZ_CP040507.1|WP_004509924.1|865586_866987_+|thiol-oxidoreductase MMLQILKKQKFNDSLKRVIFIKSLVAIFATGLFAVNSSSDFLSTNKNSSLLTSPKKGLNNEEHDKFMLGRSFFSIPWVEAPSVTTARDGLGPLFNANSCISCHPKNGRGTLFTKNNLPSRALIARLSIKSDDSLEHKELLKYQGFVPEPVYGNQLAINGIFGVDFEGKIKIDFEEKEVVFPDGEKQVLLKPKYSLTDLNYGDLHKDVNISYRIAQTLNGMGLIALISDEDILANEDVDDKDGDGISGRANWVYSKITKKTELGKYTWKASVAFLKEQIANAASNDIGLTTSVNPSENCTDFQEACKNAPKAKDSIDLPDERLDSIAFYLKNIKSYTLKNTKEYNEGLALFEAVSCSKCHITSFNTKEGFKISPFSDFLLHDMGEDLSDGRVEFLASQNEWRTAPLWGLALHKKINKEEPRLLHDGRARSYQEAILWHGGEAQNSKESYMNLPKEKREKLIKFLEEL >NZ_CP040507.1|WP_004509923.1|866983_867928_+|imelysin MIKKFLFLMIFSICAFAQDSALFNIVKNVSIPDVETAIKDAKALKANYSDENFTNFIRAWKKVEALYFAGEIDDDYLDTPRYMDVFNNLKEDLNSQMQRVIDSNDDPKKALFKNSFKTVNALEYVLYSDKTITDRKKAIAGVIIDSLVSKLEDIKGAYEEFLTSKPKDEKFDTAIVINTLIASTYRLKEWRIGNASGSSSKFKNDPNNNRAEYFLSQNSFAAIDAILDAQKEILEDKNYYNFASLSKKLNAQKELKVALDKIIETKEKLSKLKKDDFSKAQDLFESARALHNAYYLSLIDKLGLKANVLDADGD >NZ_CP040507.1|WP_004509922.1|867935_868841_+|sterol-desaturase-family-protein MNDFFALEYLVNPSKRLFWIYLLSSIFLAIVYFYVTKKNSRLITSSKLWLHPSAKLDYYYFFLSYFINILLLVPFIVSAKTVALFVNKELYFYFDYYDNSFFSYKQIVLMYTISIFVVSDFTRYWLHRFLHTIPFLWEFHKIHHSAKVLTPITFYRVHPVENFLFGLRYSLSVGFVTGIFIYFFGAKVDIYMVFGVNIILFVFSLFGSNLRHSHIPFSYGEFIEKWLLSPKQHQIHHDKKHFNKNFGGYIAIWDRLFGSLTLSKDVKVLKFGLRREQMKDYLSLKYLIIRPFINLLKRRGI >NZ_CP040507.1|WP_004509921.1|868840_869977_+|c-type-cytochrome MKNLRLFFIVGLMFSALMAEDMKKEDLGRILFFDVNLSKNRTQSCATCHNPNAGFVDDRDNGVKKMASLGDDGKSLGDRQAPTASYAKFSPTFHFDEKAKKYVGGQFWDGREATLEGQAGGPPLNPVEMGMSDKKAVVDRLKENTLYVDSFKKIFGADIFKNDDKAYEAMTIAIASFERTDEFSPFDSKYDRYLKGEYDLTPLEDLGKSIFFSNNNNSCANCHVLKGEDKEGETFTNYQYHNIGTPANNELRAKNGVKAIDEGLLANSNVSDVAQKGKHKVPTLRNVAVTGPYMHNGVFKDLKTVVEFYDKYNNKDRNIDPETNKPWDEPEVKDNISLQELKANKLTDRKVEALVAFMKLLTDKKYEHLLEEQEKKEK >NZ_CP040507.1|WP_004509920.1|869989_871180_-|Na+/H+-antiporter-NhaA MKNSLFLIKDFISKETLSGLILFVVTVLAVTIANSDFGSYYFELFSTQLGITFGQLNASMSLLHWINDVLMAIFFLVVGLEIKREMLIGELSSVKKASFPIIAAIGGMIVPAILYISLNPDHITGFGVPMATDIAFALGILMLLGNKVNPAIKLFLVTLAVVDDLGAIVVVAIFYTNELHFEYFLYAFAVYSIIWFLNYKNVQKLTPYIILGVFLWIFIHKTGIHSTIAGVLLAFAIPLNKKADLEESVENLSVDNPLVKLEHALHNFSAFIIMPLFAFANAGVIIDFSNVIEHQLIVLGVAIGLIIGKPIGIFSFTYLATKLKISVKPENVTWNDIFAVGFLGGIGFTMSIFISHLAFSDQTIVGAVKLGIFASSVIAAIIGSVLLILKAKKVQS >NZ_CP040507.1|WP_004509919.1|871169_871544_-|transcriptional-repressor MNITDFTHIKLTNARKAILEVLIDSNKPLSYEDIKDFISMDKATFYRNVAIFEEENLINSFESNDKKRYFEIKKNQHSHFICTNCSKIECIHEKLNLTLPEYKIENIIIKGICKECLKKEKNEK >NZ_CP040507.1|WP_004509918.1|871666_872593_+|zinc-ABC-transporter-solute-binding-protein MKKFLVLFLVFASFLYANKPQLTVNILPQKYFVEKIVKDKFDINVMVKPGSSPHNFEPKPSQMKSLASSKAYFLVGDPSEQAWIGKFKQNAKDTLFVDTTVGIERIPMVAHKHHDEEDEDEHEGHAHHEHEDEHEHEKHAEHDHDESGLDPHTWLDPISVKVQAKNIYETMLKIDQKNSDFYKANYEEFVKELDSLDTEIKNILAPYKDKAFMVFHPSWGYFAKRYDLEQISIEMEGKEPKPNELVKLVEEAKKHDIKIVFVAPQFSQKSAKTISQSIGANVVSIDPLSGDWKNDLLKTAKEIANSYK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
441081 : 448851
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP040507|441081:448851|DBSCAN-SWA CTTGAACTCACCAATTTCTGTATCAACTTTAAATCTTCAAATTAAATCTTTACTTGAAACTACATTTATTCAAGTTTATGTAGAAGGTGAGATTTCAAATCTTACTTATCATAATTCAGGACATATATATTTTTCAATAAAAGATGAAAATTCTACGCTTTCTTGTGTAATGTTTAAAGGGAATACAAAATATCTAAAATTTCAACTTGAAAATGGTCTAAAAATAGTAATTACAGGAAGTTTAACAGTTTATGCTCCAAGAGGAAATTATCAACTTTTATGTAATAAAATAGAACCTTCTGGAATAGGAAGTTTATCTTTAGCTTTTGAGCAATTAAAAACTAAACTTGAAGCAAAAGGTTACTTTGAAAGAAGTAGAAAAAAAGTTTTACCAAGATATCCTAAAAAAATAGCAATAGTAACTTCTCCAACAGGTGCTGCAATAGAAGATATGAAAAAAGTGGCAACTCATCGTTGGTCTTTAGTTGAATTTATATTAATCCCAACTTTAGTTCAAGGAGAAGGTGCAAGTTTAGATATAGCAAATTCTATAAAATATGCAGATAAATTAAACTGTGATATTATGATTGTTGGACGAGGTGGAGGAAGTATAGAAGACTTGTGGGCTTTTAATGAAGAGATTGTTGCAAATGCAATTTATGAAGCACAAACTCCAATTATTTCAGCAGTTGGACATGAAGTTGATTATTTAATTTCAGATTTTGTTGCTGATATTCGAGCTGCAACTCCATCAAATGCAATTGAAATAGCACTTCCAGATATAAATGAACATAGAATTTACCTTGATTCTTTAGAAAATGAAATTACAAATAGATTTAAAAATATTTTATTCAATAAAGAGCAAGAGTTAAAAAATATGAAAAAATTATTTGAACAAAACTCTATTGAAACAAAATTCAATTTCATACAAACTCAAATTAATTTTATAAAATCATCATTGAAAATAAATTTGAACCAAAAATTTTTAAGTTATCAAAATCAAATAGATTTATTAAAATCAAATTATTTATCAAATCATCCAGATAAAAAAGAGAAAAATGGTTTTGTACAAATTAGTAAAAGTAATAAAGTTATAAATTTAGCAGATTTAAAAATTGGAGATGAAATAGAGTTACAAACTCCAAAGTATATTGCAAGTTGTACTTTAAATAAATTAGTAAAACAATAGAATTTAAGTTTAGTATAGATAGAATAATGAAAATTCGTTTAATTTATACATATCTAATAGAGGGGGAATATTAATGGAAAATAATCGTGATAAAGCTGTAAGTTCTTCAAAGATTACTGAGTTTATGACATTTGAGTTAGGGGCAATGAAGTATGCAATTGAGTTGCCAAAGATTAAAGAAATTTTAACTTATCCAGATAATATTACAACTTTACCAAATACTTCAAAATGGGTAAAGGGTTTAATTAATTCAAGAGGAGAAGTTGTTCCTATTTTAGATATTAGAATAAAGTTCAACACAGGACCTGCTGTTTATGATGAAAATACTTCTATTATTACAGTTATTACTGAAGATAAAAGAATGATAGGAATAGTTGTAGATTTAGTTGATGATGTTCAAAAACTTGATACTAGTATGTTAGCACAAGTTGCTGAAATGGGTTCAGCAATTCCACCTAAATATTTAAAAGGTTATGTTAGACTTGATAATAACCAAATGCTTGTAATTATGGATATCGAAAGAGTTGTTGATAAAGAAGAGTTACAAGACTGATTTTAAGTAAATCAAGAATTTCTTGATTTACTCTTTTATAGATATAGAGATAATTTTTACATCTTCTAAAGGTTTATCTCCATTATATTTCCCATTTGTTTTTACGTTTTCTATTGCTTTTACTACATCAAATCCATTTATAACATATCCAAAAATAGTATGATAACCATTTAACCAATAAGTTGGAACAGTTGTTATGAAAAATTGACTATTGTTTGTATTTGGACCTTTATTTGCCATAGCTAAAATTCCAGGTTTATCAAAAACAGCATTTTTTGCAAATTCATCTGCAAAATCTTCTTTCCAAATAGATTCTCCTCCAGCTCCCGTTCCTGTTGGATCTCCACCTTGAATCATAAAGTTTTTAATAACTCTATGAAAAATTTGACCATTGTAATATCCATTTTTTGAATGAGTTACAAAATTTTCGACAGCTTTTGGAGCTAAGTCTGGTCTTAATTCAACTTCAATATCACCTTTTGAAGTTTTAAATGTAGCTATTGGATTAGCAGCATTTAAAAATAGTGTAAAACAACAAAGAATAAATAGAATTCTTTTCATAAAATTGCCTTTTTTGTAGATTTTTTAGTAAATTAGTATAGTGTATTAGATTTAAAAAAAGATAAAAAAGATATTTTATAATACTTTAAAAAAAAAGTGTTAAAATGCACAAAATTATTAACTATTAAATATAAAAAAATAAAAGGCTTATAAATGACATTTGAAATGTTATACAGCAAAATTCATAGAGCAACTGTAAGTGACGCAAATCTGAATTATGTTGGTTCGATTACAATAGATGAAGATTTGATGAAAGCAGCTAATTTAAGAGTTGGTCAAAAAGTTGATATTGTAAATATTAATAATGGTGAAAGATTTCAAACTTATATTATAAAAGGGAAAGCAGGCTCTAAAGATATGTGCTTAAATGGAGCAGCAGCTAGAAAAGTAGAAATTGGTGATAAAATTATCGTTATTGCTTATGCAACTTTTAGTGAAGCAGAACTTGAAAACTATAAACCAACAGTTGTTTTAGTTGATGATAAAAATAATATTGAATTAATAACTCATGAATTAGAAGGAGGTAAATATGTTTGATGGACTTGATTTAAAAAATTTGAATTTAGGTGATATGTTAAACCAATTTCAAGATATGGCAAAAAGTGCACAAAATGAAAATGCTTCAAGAATTTTTACTTCAAAAGCTGGTGGAGGAATGGTAGAAATATCAATCAATGGAAATTCAGAAGTTGTTGATTTAAAAATTGATGATTCTCTTTTAGAAGATAAAGACTCTTTACAAATTTTACTTATCTCTTGTATGAATGATGTAATTAAACAAAGCGATGAAAATAAAAAAATGATGGCTATGAACTTAATGGGTGGTTTAGGCTCATTTGGACAAAAGTGATTTGATGAAAGATTTATTAAATTCTTTTGAAGATTATTTACTAAAAAATCTTCCTATCTCAAAAACATTTCATCCTCACTTTGAAGATGCTTTAGCTGATATGTTAAAAGCAGGTGGGAAAAGATTTCGTCCGATGCTTTTATTATCTGTTGTAAAATCAAATAAATCTTTATTAGTTTCAAATGCAATGAGTGTAGCATTAGGAGTTGAATTTTTACATACATATTCTTTGATTCATGATGATTTACCAGCGATGGATAACTCTGATTTAAGAAGAGGATTTCAAACATTACATAAAAAATATGATGAAGTAACAGCTATTTTAGTTGGAGATGCTTTAAATACTGAAGCTTTTAATTTAATAGCAAATGCTTCTTTACATAATGATATAAAAGTTGAACTTATCAAATGTTTGGCACATAATGGTGGAATAAATGGTATGATTATAGGTCAAGCAATAGATTGTCATTTTGAAAAACAAAAAATACAATTAAATCAATTAGAGTTTTTACACATTCATAAAACGGCAAGACTAATTGCAGCTAGCCTTAAAATGGGTGCAATTATAAGTGAATATGATTTGCAAACACAAGAAAAACTTTATAATTTTGGTATAGATTTAGGACTGTTATTCCAAATTCAAGATGATATTATTGATGAAACTTGTACTGAAGAAGAAGCTGGTAAAACTACACAAAATGATGGATTTAAAAACTCTTTTGTAAATTTATTAGGACTTGATGGTGCAAAAAGAAGTGCTGATGATTTAGCTTTAAAATGTATAGATTCTCTTAATACTTTTGAAGAAAATTTAAAAAAATCTTTAGAAGAGTTACTTCTAAAATATATAAATAGACACAAATAATTTTAAACTCTTAGTTAATTTGACTCAAATATATTGACAAATAATTTAAAATTTATTAAAATTTAGCACTTATAAAATTAGAGTGCTAATTTATAAGTTCAAAAATATAAAATTAATTTAATAATAAGGAAATAGTATGAATTTTAAACCACTAGGTGAAAGAGTTCTTGTAAAAAGAACAGAAGTTGAGAACAAAACAGCAAGTGGAATCTATATTCCAGATAATGCAAAAGAGAAACCACAAACTGCAAAAGTTGTTGCAATTGGAAATAAAGTTGAAGATGTTAAAGTTGGTGATACAATTGTATTTGAACAATATAGAGGAACTGAATTCAAACTTGAGGGTGAAGAATATCTAATTTTAAATATTGAAAATGTTATAGGAGTTATGTAATGGCAAAAGAGATTTTATTTAGTGATAATGCAAGAAATAGATTATATTCAGGTGTTGAAAAATTAGCTGATGCAGTTAAAGTTACAATGGGACCAAGAGGAAGAAATGTTTTATTACAAAAATCTTTCGGTGCTCCTACAATTACAAAAGATGGTGTAAGTGTTGCTAGAGAAATTGAATTAAAAGATACTTTAGAAAATATGGGAGCACAACTTGTAAAAGAAGTAGCTTCAAAAACAAATGATGAAGCAGGAGATGGAACAACAACTGCAACTGTTTTAGCTCACTCTATTTTCAAAGAAGGGCTTAGAAATGTAACAGCAGGTGCAAATCCAATATCTTTAAAAAGAGGAATGGATAAAGCTTGCGAAGCTATTTTAGCTGAACTTAAAAAATCTTCAAAAGTTGTAGCAAACAAAACAGAGATTGAACAAGTTGCTACAATCTCAGCAAATTCAGATAGTGCTATTGGAAAAATGATAGCTGAAGCTATGGATAAAGTTGGAAAAGATGGTGTTATCACTGTTGAAGAAGCAAAAGGTATTTCTGATGAGTTAGATGTTGTTGAAGGTATGCAATTTGATAGAGGATATTTATCTCCATATTTTGTAACAAATCCTGAAAAAATGATTGCAGAGTTTAATAACCCATTCATTTTATTATATGACAAAAAAATCTCTTCATTAAAAGAGATGTTACCAATTTTAGAATCAGTAAATCAATCAGGAAGACCTTTAGTAATTATTGCTGAAGATGTAGATGGTGAAGCATTAGCAACACTGGTAGTAAATAGATTAAGAGGTTCATTACATATTGCTGCTGTTAAAGCTCCTGGATTTGGAGATAGAAGAAAAGCTATGTTAGAAGATATTGCAGTTTTAACTGGTGGAACTGTAATTTCAGAAGAGATGGGAATGAAACTTGAAACAGCTGAATTTAGTTGTTTAGGAACTGCTTCAAAAATCGTAATTGACAAAGATAATACAACAATCGTTGATGGAAATGGTGATAATGAAAGAGTTGTTGCAAGAGTAAATCAAATTAAAGCAGAAATATCAAATACAACAAGTGATTATGATAGAGAAAAATTACAAGAAAGATTAGCAAAACTTTCTGGTGGAGTTGCAGTTATTAAAGTTGGAGCTGCTACTGAGACTGAAATGAAAGAGAAAAAAGACAGAGTTGATGATGCTTTAAGTGCAACAAGAGCTGCTGTTGAAGAAGGTATTGTAATTGGTGGAGGAGCTGCTTTAATTAAAGCTTCTAAAAAAGTAAACCTTGATTTAACTGGTGATGAAAGAATTGGAGCAGATATTGTTTTAAGAGCTATTTCAGCACCATTAAAACAAATTGCAATTAATGCTGGATTTGATGCAGGAGTTGTTGCAAATGAAGTTGAAAAATCATCAAATGAAAATTTAGGATTTAATGCAGCAACAGGTGAATATGTAGATATGTTTGAAGCTGGAATTGTTGATCCTGCAAAAGTTGAAAGAGTTGCTATGCAAAATGCTGTTTCAGTAGCTTCACTATTACTTACAACTGAAGCAACTGTAAGTGATATAAAAGAAGATAAACCAGCAATGCCTTCTATGCCAGACATGGGTGGAATGGGAATGCCAGGAATGATGTAACAATTATCTAAAATTGTTAATTTTTCTTAACCGTACCTTTTTAAGGTGCGGTTTTTTAATTTATAATTAATAAAAATCTAAATGGTTATGAAATTAATAGGAAAATTATAAACGAAATAGATATTATTCTAAATAAAAAAAGAGCTCCGCGAAAGAGCTCTTTTAAAAATTATTTTTCGATAAATAAGACTTTTATTTATCAAGTTTACTTTGAAATAAACTTACAGTTTAAATTAAAAGTTAACAGTTATAAAAGGTGAAGTTTTCGTCAATTGAACCTCCTATAATCTTAAAGATAATGTAATTATAACATCTTTTTAAATTAAAACAAACTGAAATTTCATAAAATTATTTAATAGAAAAAGAGAGAGTTATTTTTGTTCCTATATTTTCTTGGCTCATTAAAGAAATTTTTCCTTTGTGAATATCTACAATTTTCTTCATAATCGACATTCCAAGACCAGTTCCTCCACTATTTTTATTTCTACTTTTATCTGTTCTATAAAACTTTTCATAAATTTTTTCTTGTTCATTTGTAGGAATTCCAATCCCAAAATCTTCAATAGAGATATTTAAAAAATCATCTTCTTTAAATATTTTTACTATAACTTCTTTATTTTCATAACTAAATTGAATAGCATTTTTCAAAATATTTTTTATTGCAATTTTTAATAAACTTGCAAATCCTTTCATCTCTAAGCTATCTTCTACTATCAAAGATATTTTTATTTTATGAAGTTTTGCAAAATTTTTAAGTTCATTTATTGCTTCATCTGCAAGTTCATCTAAATAAAACTCTTCTTGTTTATCTACAATTAACTCTTGTTCATTTTTAGCTAAAAATAGTAAATCATTTATTGTTTGTTCAATCCCTGATATCTCTTCTAAAGATGTTTTTAAAGCTTCTTTATATTCGTTTATTGTTCTATCTTTTCTTAAAGTTACTTCCATTTCACCTTTTATAATTGTAAGAGGAGTTTTTAGCTCGTGAGAGGCATCTGAACTAAATTGCGACATTCTTTCAAAAGAGTTTTCAAGTCTTGATAATAAAGAATTAATTTCATTTATTAGTTGGTTTATTTCATCTTTTGATTTTGTTGTTTTTAATCTTGCTGATAAATCATTTGCATTTATCTGTTTTAATTCAAGCAAAATATTTTCAATTGGTAAAAATGATTTATAAATCACAAAATTTCCACCAATAATAGCAAAGATAAGAATTATTGGGAGGATAAATCCTAAAATATAAAGAAGATTTTCCAAAGTTGAAGTTAAAATATCTTTTGTTGTAACTGCTTCAATAATAATGCTTTGTTCTCCATGAAAATCTATTTTTATTCTACTTACAAAATAGCTGTGTTGTTCTTCAAAAGTTATTATATTCTCTTTTAATTTATCTAAATAATCGTCGTTATGGTCAATGTTATTTGGGAAATTATCTGTTTTGATTATTTCTTTGTGAGTTTTAGCATCTAAAATTCTAATATAAAGAGGTTCAAAATTGTACTCTTTTTCTTCATCTAAAATATTATCTGTGATTTTTTTTCTTTCAAGTACATCATCTGTTATATCAAGAACTATTACTTTTAACGTTGCTTCAAGTTTATCAACAGTTGAAATTTCCAATGCTTTATATAAAGAAAAAGAAAAAATTACTAAAATAATAGTTTGAATAAAAAAACTATAAAATAGAAGTTTCTTTTTGATTGATAGATTAATCTTCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP040507|441081:448851|444237_445098_+|WP_004510494.1|DBSCAN-SWA MKDLLNSFEDYLLKNLPISKTFHPHFEDALADMLKAGGKRFRPMLLLSVVKSNKSLLVSNAMSVALGVEFLHTYSLIHDDLPAMDNSDLRRGFQTLHKKYDEVTAILVGDALNTEAFNLIANASLHNDIKVELIKCLAHNGGINGMIIGQAIDCHFEKQKIQLNQLEFLHIHKTARLIAASLKMGAIISEYDLQTQEKLYNFGIDLGLLFQIQDDIIDETCTEEEAGKTTQNDGFKNSFVNLLGLDGAKRSADDLALKCIDSLNTFEENLKKSLEELLLKYINRHK >NZ_CP040507|441081:448851|442849_443383_-|WP_004510491.1|DBSCAN-SWA MKRILFILCCFTLFLNAANPIATFKTSKGDIEVELRPDLAPKAVENFVTHSKNGYYNGQIFHRVIKNFMIQGGDPTGTGAGGESIWKEDFADEFAKNAVFDKPGILAMANKGPNTNNSQFFITTVPTYWLNGYHTIFGYVINGFDVVKAIENVKTNGKYNGDKPLEDVKIISISIKE >NZ_CP040507|441081:448851|442342_442822_+|WP_004510490.1|DBSCAN-SWA MENNRDKAVSSSKITEFMTFELGAMKYAIELPKIKEILTYPDNITTLPNTSKWVKGLINSRGEVVPILDIRIKFNTGPAVYDENTSIITVITEDKRMIGIVVDLVDDVQKLDTSMLAQVAEMGSAIPPKYLKGYVRLDNNQMLVIMDIERVVDKEELQD >NZ_CP040507|441081:448851|443912_444233_+|WP_004510493.1|DBSCAN-SWA MFDGLDLKNLNLGDMLNQFQDMAKSAQNENASRIFTSKAGGGMVEISINGNSEVVDLKIDDSLLEDKDSLQILLISCMNDVIKQSDENKKMMAMNLMGGLGSFGQK >NZ_CP040507|441081:448851|443536_443920_+|WP_004510492.1|DBSCAN-SWA MTFEMLYSKIHRATVSDANLNYVGSITIDEDLMKAANLRVGQKVDIVNINNGERFQTYIIKGKAGSKDMCLNGAAARKVEIGDKIIVIAYATFSEAELENYKPTVVLVDDKNNIELITHELEGGKYV >NZ_CP040507|441081:448851|441081_442269_+|WP_004510489.1|DBSCAN-SWA MNSPISVSTLNLQIKSLLETTFIQVYVEGEISNLTYHNSGHIYFSIKDENSTLSCVMFKGNTKYLKFQLENGLKIVITGSLTVYAPRGNYQLLCNKIEPSGIGSLSLAFEQLKTKLEAKGYFERSRKKVLPRYPKKIAIVTSPTGAAIEDMKKVATHRWSLVEFILIPTLVQGEGASLDIANSIKYADKLNCDIMIVGRGGGSIEDLWAFNEEIVANAIYEAQTPIISAVGHEVDYLISDFVADIRAATPSNAIEIALPDINEHRIYLDSLENEITNRFKNILFNKEQELKNMKKLFEQNSIETKFNFIQTQINFIKSSLKINLNQKFLSYQNQIDLLKSNYLSNHPDKKEKNGFVQISKSNKVINLADLKIGDEIELQTPKYIASCTLNKLVKQ >NZ_CP040507|441081:448851|445234_445492_+|WP_004510495.1|DBSCAN-SWA MNFKPLGERVLVKRTEVENKTASGIYIPDNAKEKPQTAKVVAIGNKVEDVKVGDTIVFEQYRGTEFKLEGEEYLILNIENVIGVM >NZ_CP040507|441081:448851|445491_447126_+|WP_004510496.1|DBSCAN-SWA MAKEILFSDNARNRLYSGVEKLADAVKVTMGPRGRNVLLQKSFGAPTITKDGVSVAREIELKDTLENMGAQLVKEVASKTNDEAGDGTTTATVLAHSIFKEGLRNVTAGANPISLKRGMDKACEAILAELKKSSKVVANKTEIEQVATISANSDSAIGKMIAEAMDKVGKDGVITVEEAKGISDELDVVEGMQFDRGYLSPYFVTNPEKMIAEFNNPFILLYDKKISSLKEMLPILESVNQSGRPLVIIAEDVDGEALATLVVNRLRGSLHIAAVKAPGFGDRRKAMLEDIAVLTGGTVISEEMGMKLETAEFSCLGTASKIVIDKDNTTIVDGNGDNERVVARVNQIKAEISNTTSDYDREKLQERLAKLSGGVAVIKVGAATETEMKEKKDRVDDALSATRAAVEEGIVIGGGAALIKASKKVNLDLTGDERIGADIVLRAISAPLKQIAINAGFDAGVVANEVEKSSNENLGFNAATGEYVDMFEAGIVDPAKVERVAMQNAVSVASLLLTTEATVSDIKEDKPAMPSMPDMGGMGMPGMM >NZ_CP040507|441081:448851|447474_448851_-|WP_004510497.1|DBSCAN-SWA MKINLSIKKKLLFYSFFIQTIILVIFSFSLYKALEISTVDKLEATLKVIVLDITDDVLERKKITDNILDEEKEYNFEPLYIRILDAKTHKEIIKTDNFPNNIDHNDDYLDKLKENIITFEEQHSYFVSRIKIDFHGEQSIIIEAVTTKDILTSTLENLLYILGFILPIILIFAIIGGNFVIYKSFLPIENILLELKQINANDLSARLKTTKSKDEINQLINEINSLLSRLENSFERMSQFSSDASHELKTPLTIIKGEMEVTLRKDRTINEYKEALKTSLEEISGIEQTINDLLFLAKNEQELIVDKQEEFYLDELADEAINELKNFAKLHKIKISLIVEDSLEMKGFASLLKIAIKNILKNAIQFSYENKEVIVKIFKEDDFLNISIEDFGIGIPTNEQEKIYEKFYRTDKSRNKNSGGTGLGMSIMKKIVDIHKGKISLMSQENIGTKITLSFSIK |
9 | Indivirus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1273462 : 1318754
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP040507|1273462:1318754|DBSCAN-SWA ATTGAAAAAAGAATTTGAATTAGACTTAGATAGTGTCGATGTTGTCGTTGATGAATTAAAAAAAGTTATTAATAATAAAAATTGTGTTGTAATTTTAAGAGGTGATTTGGCTAGTGGAAAAACAACTCTTGTTAAAAATTATGTAAAATCTTTGGGATTAGATGATTTAGTTACATCTCCTACTTTTTCTATACAAGCAGTTTACTCAAATAATATTTTCCATTATGATGTTTATAATAAGACTTTACAACAATTTATTTGTCTTGGAATGATAGAAGAGTTTGAAGCTGAAGGTGTACATTTTGTAGAGTGGGGCGATGAAAAGTTAGAAGATATTTTAAAAGATTATGGATTTCAAGTTGTATTAGTTGAAATTAGAAAAAATGATGATAAAAGGTTGTATACAATAGATGCATAAATTAGAAATAAAAGATATTACAAAAACTATCAAAAAAACACAAATTTTAAATGGTGTTTCACTTGAAGTAAAATCAGGTGAGATTGTTGGACTTCTAGGACCAAATGGAGCAGGGAAAACAACAACTTTTTATACAGTTTGTGGCTTAGTAAAACCTACAAGTGGAACTGTATATTTTGATGATAAAGATATAACAGAATATCCATTACATAAAAGAGCACTAAAAGGAATAGGATATTTACCTCAAGAGTCTTCTATCTTTAAAGATTTATCAGTAGAAGACAATCTTATGCTTGCTGCTGAAATTATCACTGAAGATAAAGATGAACAACAAAAAAGAGTTGAGGAGTTATTAGAATTATTTAATATTGAACCTATTCGTCAAAGAAAAGGAGTTTCTTTATCAGGAGGTGAGAGAAGAAGAACAGAAATTGCAAGAGCATTAGTTTCTAAACCTAAATTTCTACTTTTAGATGAACCTTTTGCTGGAGTTGATCCAATTGCTGTTAAAGATATACAGGAGATAATTCACCAATTAACAAAAATAAATATTGGGGTTTTAATAACTGACCATAATGTAAGAGAAACTTTAGAGATTTGTGATAGAGCTTACGTTATGAAAGCTGGAAGTTTACTTGCAAGTGGAACAAGTACAGAGATAAAAAATAACCCAGAAGTTAGAAAACACTATTTAGGAAAGAGTTTTAATTTTTAAACTGCTCTTTTCTAAAATTCATTTATATTTGGTTTTTCAATTGGTGCAGAAAAATAATAACCTTGTGAATAATCAACTCCTAGATCTTTTGCCATATCAAAAATCTCTTTATTTTCTACAAATTCTGCGATAGTTTTTAAATTCAAACTTTTTGCAAATTCGACTATAGTTTTTGTTATTTTGCGAGAGTTTTCATCTTTTGTAATATTTTTTATCAAAGAAGCATCAATTTTCAAATAATTAACATTCATTTTTAAAAGGTGTTCAAAATTTGAGTATCCTGTTCCAAAATCATCAATTGCAACTTTGCAACCTAAAGTTTTTATCTCTTCTATAAAGTTGATTAATAAATCATAATTTTTGATACTTTCATCTTCTAAAATTTCAAAAACAACTCTATTTGTAATTTTATGTTTATTTAACATTGATTTTATAAATTCTAAAAAATCTGGTTCTATTATATCTTTGTAAGAGATATTTAGTGAAAACTCAAATGGCAAATTTTCAAATGTTTCAAAAGATTTTTTTATAACAGTTCTTGTAAGTTTTGAATACTGCCCTGATTTTTTTGCTACTTCTAAAAAGAAAAATGGTGAGATAACTTTTCCTTCTTCATCAATGAGCCTTACTAAACACTCATATTTGTCAACTTTTAAAGTTTTATTATCTATAATCGGTTGAAAATATACTGTTATTTTGTCATTTAAAAAAGCAGTCTTTAGCTTTTTTGTCCAAAGCATATTATTTTCATATTCATGAAGTTTATCAAGTTTTTCAAAAAATACTAAATAATCTTTGTGGTCTTTTTTTGCGCCTTGTAGTGCAATATCAGCAGTGATTAGTTTATTGTTTTTATCAGAAAAAGATATTCCAGCACACATTCTTATATATATTTCATTATGCTCATAAATCAAAACATTTTTATCTATTGATTCGAGTATTTTTTTAACTAATTCTATAAAATTTTCTTTAGATTCATCAGTTGTTGATATACAATATATATCTCCTGGAAATTTATATAGTTTTAGTTTATTATCATTTTCTATTATTTGAGAGATTAATTTTGAGACATCATTTAAAATAATATCTCCAACTTTGTGTCCAAAAAAATCATTTATTTCTTTAAAAGAGTTGATATTAAATAATGCAATTGCTTTTATATGTAATATATTATTTTGTAAATCTTCTATTAATTTTGTTCTATTTGGAAGTTTTGTTAGATTATCAATATAAAGAAGTTTTTGTAGCTCAATTCTATGTTCTATAACATGAGAAATATCTGTTAAAATGATGATATTTATATCTTTTGTAGATAGAAAAATTTTTTGTATAGAAAAAAACTTTTTATTTTGATAAACATCTTTTATACAAACTTTTGAATTTTCAGTGATTTCATCTAAATTTGTAATACAATCTTTCTCAATTTCAAACAGATTATTTATACTTTTATATTTTTTATTTAACTCTTCTATAGAACAAATATCTAAGAGTTTATAAAAATGATTATTTGAAAATATTAGATTATTTTTTGATATTACAAATATTGGACAATTAATGTTATTTATAAAAGATTCATAAAAATCTTCTTTTATTATCTCTTCTTTTAAATCTTTTTTACTTAACGAATTTTCAATTATTGAAACTAATTTGTCGTTATTATCAATGTAAATATAATTGATATTTATACCATTTCTTAAAACTTTTATTTTATCATTATTTGAAATATATATTATTTCTACGCTATTTTTAAGAAATTTTTTTATTTTTTCAAACTTTTCAAACAGATCAAAATTAACTATTATTATATCAACAGAATCAATTTCATCAAGAATATTATTAAAAGTTGAAAATATGTGAATATTTATGTCTTTAAGTCTATTAGAAAAATCTTTTTTTAATTCATCGAATTTCAAATTTTCATTAATGACAAAAACATCATAATTCATCTGTTATCTTTCATTTGAAAAAAGCTTGATAGCTCTATTTAAATCTTCTTGTGTATCAATACCAAAAGATTTTGAAGTAACTTTTACCATTGCTATTTTTTTTCCATTATCAATAGCTCTTAATTGCTCTAGTTTTTCAATATTTTCTAACTTTGAAGGATTTAATTTACAAAAATCATTTAATGATTTTTTTGTAAAACCATAAATTCCTAAATGTCCAAAATATGATGCATCTTTGTGATGGTCTCTATGGTATGGAATTTTAGCTCTTGAAAAATATATAGCATTTGAAAGTTCATCTAAGATTACTTTTACATGATTTGGATCATCTGCTAATTCTGAAGTTATCTCTTTAAAACAAGAAGTTATCATTATATCTTCATTTGAATCTTTTATTTGTTTTACTCTGTTTATTACGGCTTGTACAACTTCTGGTTCTATAAAAGGTTCATCAGCTTGTACATTTACTATAATTTCATCTTCACTTAAATTTAAAATATTTGCAGCTTCATTTATTCTGTCTGTTCCACTATTATGCGAAGTTGAAGTTAAAACAGCGTCAAATCCATATTGTGAAGCTAAATCTATAACTTCTAAACTATCTGTTGCAATTACGACTTTATCTAAGTTACTAACTTGTTTTGCAGTTTTTATTACCATAGGTAAACCTAAAATATCAACCATAATTTTATTAGCAAAGCGACTTGAGTTTAGTCTAGCAGGTATAATTATCATATTTCGTCCCCTTTTATTGACCTTAATTATATGATTTTAAATCTGAAATTAACATTCCATATATAAAACTATCTGTCCATTCATTTTTATTCCAAAAATCTTTTATAAAATGTGCTTCTTTTCTCATTCCAATTTTTTCACAAAGTTTGGCAGATGATAAATTTCTTGCATCCATATTTGCTTGTATTCTATGAATGCCTTTTTGTGTTAAAAGGTATTCAACTATAGCTTTTAAAGCTTCTGTTGCATAGCCATTGTTACTATATTTGGGATTAAAAGTATATCCGATTTCAACACTATCTTTCATTTGAGTATGCCAAATATTTATATCACCAATTACTACATTATCCAAAACACAAGCTAAATTGACAGCATAATCTTTTTCTAAATTTGCTTTTGATAATTTTAATTTAAATTCTTGATTTTTATTATTTTCATTCCAAGCATCGTGAAGTAAGTATTTACAGGTTTCATCGTCTTTATATATATCAAAAACATCGTTTAAATCATCAGTTTTAAAATTGCGTATTAACAATCTTTGAGTTTTTATGTACATTCCAGCTCTTATTTTAGTCTTTATTTAAATGAGTTTATTATATTATAAAATCTCTAAACTCACATTGAAAGAAGATTATGAAAAAAACAATCACTATTATTGATACTTTTGGCTTTTTATTTAGAAGTTATTTTGCTTTACCTCCTTTAAAATCAAGAGATGGTTTTCCAACAGGTTTATTAACAGGTTTTATAAATTTTATATCAAATATTGGAAAAGATTTTGAAACTGATTATATAGTTTTTGCACTTGATGCAAAAGGTGAAACATTTAGAAATAAACTTTATAGTCAATACAAAGCGCAAAGACCTGAAGCTCCTGAAGATTTACTAACTCAACTTCCCATTGCTATTTCTTGGATAGAAAAGATGGGATTTAAAACAGCAATTAGAACTGGTTATGAAGCTGATGATATGGTTGCATCTATTGCAAATGACGCTAAGCAAAAAGGTTTAGAAGTAAGAATTGTTTCTCATGATAAAGATTTATATCAATTAATTGATGATGCAAATAGTGTTTATTTATTTGATCCAACAAAAAAAGTTATTATAAATGAAGAAAAATGTATAGAAAAATATGGAGTAAAACCTTCTCAATTTACAGATTATCAATCTTTATTAGGTGATACAG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52 | Ralstonia_phage(13.33%) | tRNA,transposase,plate,integrase,tail,capsid | attL 1284761:1284778|attR 1297369:1297386 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2011274 : 2018199
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP040507|2011274:2018199|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP040507|2011274:2018199|2016991_2017516_-|WP_004510948.1|DBSCAN-SWA MKWEISKEFDFCYGHRVWSQTLNIDFSLDACLKCRHLHGHQGKVIVYLESNELNNSMVTDFKHLNWFKAFLDDVLDHKFILDINDPLFSTLVPNIKKEDLIKFDEGYFSINLTNFKNEELELYESYVVVDFVPTSENLSAWFLRIVQEKMNGLNIKVSKIEFLETPKSKSTFYA >NZ_CP040507|2011274:2018199|2011274_2012267_-|WP_004510940.1|tRNA|DBSCAN-SWA MTQWIEKINNAKSLEELENLRIDTLGKKGVLTLEFAKMKSVPNEDKKTFAENLNIQKTLITQALDTKKLVLEKDALNEKLEAEKIDVTKFNNELSCGATHPVVETMNKIITYFQNLNFAVEEGPLVEDDFHNFEALNLPKYHPAREMADTFYNKDFTLLRTHTSPVQIRTMLSQKSPIRMIAPGTVFRRDFDITHTPMFHQIEALVVDEADKVSFANLKHVLVEFLQHMFGEVEVRFRPSFFPFTEPSAEVDISCVFCKGEGCRVCSQTGWLEVLGCGVVDENVFKAVGYENKSGYAFGLGIERFAMLIHNIGDLRSLFESDTRLLGQFK >NZ_CP040507|2011274:2018199|2015106_2015337_-|WP_004510944.1|DBSCAN-SWA MALLDDVKAVVVEQLDCDPAEVKEDSKFIEDLGADSLDVVELVMALEEKFDIEIPDEDAEKILTVADAIKYIENNA >NZ_CP040507|2011274:2018199|2015433_2016177_-|WP_004510945.1|DBSCAN-SWA MKFTGSNVLVTGASRGIGAEIAKTLASFGLKVWINYRSGAQAAEAIKEEIEKAGGKAAIIKADVTNEEEFVNAIKTIIDADGELAYLVNNAGITKDKLALRMSVQDFTDVINANLTSAFIGCKEALKVMGKKRFGSVVNISSIVGEMGNPGQTNYSASKGGLNAMTKSFAKEAASRGIRYNAVTPGFIQTDMTDELKEEVKAEYEKNIPLSRFGQPSEIADAVAFLLSDHSSYITGEILKVNGGLYV >NZ_CP040507|2011274:2018199|2012737_2013673_-|WP_004510942.1|DBSCAN-SWA MATYLEFEEKIKKIEEDIIVAKTKADEPAVDILEKKLEKEVEKTFKNLNDYQKLQLARHPDRPYALDYISGLLKNAYEVHGDRHYVDDHAIVCYFGFIDNQKVLVIGEQKGRGTKEKLQRNFGMPSPEGYRKALRAAKMADKFQIPILMLVDTPGAYPGIGAEERNQSEAIAKNLFEFADLTTPTISVVIGEGGSGGALAISVADRLAMMRYSVYAVISPEGCSAILWNDPTKVETAANALKITAENLKELNLIDDVINEPLIGAHRQKEQAIFALKEYFIKSLAELKKLTPQERLDKKYQKLMNLGSFTK >NZ_CP040507|2011274:2018199|2012382_2012727_+|WP_004510941.1|DBSCAN-SWA MCIFCKIVKGEIPNQTVLEDENFLAFNDINPTRKIHVLIIPKEHYDSFQVTPTNIMSSMSEFIQKVATKLNIDESGYRLITNIGNHGGQEVHHLHFHMIGGESVGRLVRDKEDI >NZ_CP040507|2011274:2018199|2017512_2018199_-|WP_004510949.1|DBSCAN-SWA MNKISTKKAICILSGGMDSTLSSYIAKKDGFEIIAVHFNYGQRTQNRELKAFKDICNELDIKSKYEIDIPFFTQIGANALTDMSIDVPTSGLEAGVPITYVPFRNGIFLAITAAIAEKEGATAMYIGVVQEDSSGYPDCTEEFIQDMKKAINQGTKEDTKIEIITPLVHLSKAQIVQEAIKLNVPLELTWSCYKEEEEACGVCDSCRLRLNGFEQAGKKDPIKYKEFQ >NZ_CP040507|2011274:2018199|2013730_2014990_-|WP_004510943.1|DBSCAN-SWA MKRIVITGLGTINSTGHNVKESFEAVTNGVCGIDTITLFDASEFPVQIAGEVKNFDPETVMDKKEVKKADRFIQLGIKAALEAMIDSGYVTQEDKKVDSSIADRFGIISGSGIGGLSTIEKNSVTCENKGPRKISPFFIPSSLANMLSGFISIEHNLKGPSLGHVTACAASTHALNDAVKTIMLGGADRILVVGAESAVCGAGVGGFAAMKALSTRNDNPKKSSRPFDIDRDGFVMGEGAGALVVETLESALARNAKIYCEIIGFGESGDANHITSPVIDGPLRAMKAAFEMAKNITGEYPKIDYINVHGTSTPVGDKNETSAIKELFGGKEKCPPVSSTKGQIGHCLGAAGAIEAVFAIKALDEGIIPPTINVENQDPECDLDVVPNVARKLELTTVMSNNFGFGGTNGSVIFKKYTK >NZ_CP040507|2011274:2018199|2016234_2016999_-|WP_020848501.1|DBSCAN-SWA MLEINEIFGPTIQGEGKLVGTPSIFIRFGKCNFSCTGFGVIYETPSGIKKCACDSYYAVDKEFKDTWTKYQSYNDIVAEVDNLISTYNYNYKIDIVITGGEPLLYWNKKEFQKLLKHYIENGHKVTIETNASLNINFEFDYQKEILFSMSVKLSNSLEPLNKRINKNTLVKILENTKDSYMKFVIGKDFLNKAKAEIIEILKDIPKCEVYLMPLGDTADEINKNCEDVINMAIENGFKYCDRLHIRVWNNKRGV |
9 | Campylobacter_virus(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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