Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP040501 | Lactobacillus paragasseri JV-V03 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP040500 | Lactobacillus paragasseri JV-V03 chromosome, complete genome | 2 crisprs | cas3,DEDDh,DinG,WYL,csn2,cas2,cas1,cas9,csa3 | 1 | 8 | 2 | 0 |
NZ_CP040502 | Lactobacillus paragasseri JV-V03 plasmid unnamed2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP040500_1 | 1159404-1160693 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP040500_1
|
19 spacers
spacers of NZ_CP040500_1
>1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT AGATTCAGCAACTGATTTTTTCTTTTCTTC >1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGCCCTTCGAACTGGCTTATTTCTAAAATT >1.3|1159572|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCTGTATTGGCTTTTCCACTTTAGGCTTTT >1.4|1159638|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAGCCTCATTTGATTAATCCAGCTTCTTT >1.5|1159704|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGATGTTAATACACAAGGTTTTAAATATGT >1.6|1159770|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGACGATACCCCGCCATTGCTAATTCTCC >1.7|1159836|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGCCATGTAAGCTTGTCTTAATGTTGTAAG >1.8|1159902|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAGCGCCTCCATCTAGCTTATCTACTCTTG >1.9|1159968|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAGCGCCTCCATCTAGCTTATCTACTCTTG >1.10|1160034|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGCGCATCAAGTACAGAGCAAAAAAGATC >1.11|1160100|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAGCACGGGTAGCCTCAGTATCAATTTTC >1.12|1160166|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATGGGTGGGTTAATTTGGCAAGGTGCCAC >1.13|1160232|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTAAGGCATACTTAACCAATCCAGAACAAT >1.14|1160298|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTAAGACTGCATCATGCTTTGCAAGAGTAG >1.15|1160364|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAAACGGCCGATTAGTTATATGCTTAATAA >1.16|1160430|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGCAGTCTTTATGGCTAATCCGTTTATGG >1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGTGATTCTTCTCGTATTTTAATTTTCTAT >1.18|1160562|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTGGTTTGTATGGTACCTTTCATCAATTA >1.19|1160628|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTACCTGAATAGTAACATTTCGAAGCATTA |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP040500_1
The CRISPR arrays of NZ_CP040500_1 >merge|NZ_CP040500|1|1159404-1160693|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTAATAACTTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACAGATTCAGCAACTGATTTTTTCTTTTCTTCGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACAGCCCTTCGAACTGGCTTATTTCTAAAATTGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACCCTGTATTGGCTTTTCCACTTTAGGCTTTTGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTTAGCCTCATTTGATTAATCCAGCTTCTTTGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACAGATGTTAATACACAAGGTTTTAAATATGTGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACAGGACGATACCCCGCCATTGCTAATTCTCCGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACCGCCATGTAAGCTTGTCTTAATGTTGTAAGGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACCAGCGCCTCCATCTAGCTTATCTACTCTTGGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACCAGCGCCTCCATCTAGCTTATCTACTCTTGGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACGAGCGCATCAAGTACAGAGCAAAAAAGATCGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTTAGCACGGGTAGCCTCAGTATCAATTTTCGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTATGGGTGGGTTAATTTGGCAAGGTGCCACGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACCTAAGGCATACTTAACCAATCCAGAACAATGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACGTAAGACTGCATCATGCTTTGCAAGAGTAGGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACCAAACGGCCGATTAGTTATATGCTTAATAAGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACAAGCAGTCTTTATGGCTAATCCGTTTATGGGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACCGTGATTCTTCTCGTATTTTAATTTTCTATGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACATTGGTTTGTATGGTACCTTTCATCAATTAGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTTACCTGAATAGTAACATTTCGAAGCATTAGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC >NZ_CP040500|1|1|1159404-1160693|CRISPRCasFinder ACTAATAACTTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC AGATTCAGCAACTGATTTTTTCTTTTCTTC GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC AGCCCTTCGAACTGGCTTATTTCTAAAATT GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC CCTGTATTGGCTTTTCCACTTTAGGCTTTT GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC TTAGCCTCATTTGATTAATCCAGCTTCTTT GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC AGATGTTAATACACAAGGTTTTAAATATGT GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC AGGACGATACCCCGCCATTGCTAATTCTCC GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC CGCCATGTAAGCTTGTCTTAATGTTGTAAG GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC CAGCGCCTCCATCTAGCTTATCTACTCTTG GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC CAGCGCCTCCATCTAGCTTATCTACTCTTG GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC GAGCGCATCAAGTACAGAGCAAAAAAGATC GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC TTAGCACGGGTAGCCTCAGTATCAATTTTC GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC TATGGGTGGGTTAATTTGGCAAGGTGCCAC GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC CTAAGGCATACTTAACCAATCCAGAACAAT GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC GTAAGACTGCATCATGCTTTGCAAGAGTAG GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC CAAACGGCCGATTAGTTATATGCTTAATAA GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC AAGCAGTCTTTATGGCTAATCCGTTTATGG GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC CGTGATTCTTCTCGTATTTTAATTTTCTAT GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC ATTGGTTTGTATGGTACCTTTCATCAATTA GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC TTACCTGAATAGTAACATTTCGAAGCATTA GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC >NZ_CP040500|1|1|1159404-1160693|CRT ACTAATAACTTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC AGATTCAGCAACTGATTTTTTCTTTTCTTC GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC AGCCCTTCGAACTGGCTTATTTCTAAAATT GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC CCTGTATTGGCTTTTCCACTTTAGGCTTTT GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC TTAGCCTCATTTGATTAATCCAGCTTCTTT GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC AGATGTTAATACACAAGGTTTTAAATATGT GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC AGGACGATACCCCGCCATTGCTAATTCTCC GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC CGCCATGTAAGCTTGTCTTAATGTTGTAAG GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC CAGCGCCTCCATCTAGCTTATCTACTCTTG GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC CAGCGCCTCCATCTAGCTTATCTACTCTTG GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC GAGCGCATCAAGTACAGAGCAAAAAAGATC GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC TTAGCACGGGTAGCCTCAGTATCAATTTTC GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC TATGGGTGGGTTAATTTGGCAAGGTGCCAC GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC CTAAGGCATACTTAACCAATCCAGAACAAT GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC GTAAGACTGCATCATGCTTTGCAAGAGTAG GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC CAAACGGCCGATTAGTTATATGCTTAATAA GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC AAGCAGTCTTTATGGCTAATCCGTTTATGG GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC CGTGATTCTTCTCGTATTTTAATTTTCTAT GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC ATTGGTTTGTATGGTACCTTTCATCAATTA GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC TTACCTGAATAGTAACATTTCGAAGCATTA GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC >NZ_CP040500|1|1|1159470-1160693|PILER-CR GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC AGCCCTTCGAACTGGCTTATTTCTAAAATT GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC CCTGTATTGGCTTTTCCACTTTAGGCTTTT GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC TTAGCCTCATTTGATTAATCCAGCTTCTTT GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC AGATGTTAATACACAAGGTTTTAAATATGT GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC AGGACGATACCCCGCCATTGCTAATTCTCC GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC CGCCATGTAAGCTTGTCTTAATGTTGTAAG GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC CAGCGCCTCCATCTAGCTTATCTACTCTTG GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC CAGCGCCTCCATCTAGCTTATCTACTCTTG GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC GAGCGCATCAAGTACAGAGCAAAAAAGATC GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC TTAGCACGGGTAGCCTCAGTATCAATTTTC GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC TATGGGTGGGTTAATTTGGCAAGGTGCCAC GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC CTAAGGCATACTTAACCAATCCAGAACAAT GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC GTAAGACTGCATCATGCTTTGCAAGAGTAG GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC CAAACGGCCGATTAGTTATATGCTTAATAA GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC AAGCAGTCTTTATGGCTAATCCGTTTATGG GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC CGTGATTCTTCTCGTATTTTAATTTTCTAT GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC ATTGGTTTGTATGGTACCTTTCATCAATTA GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC TTACCTGAATAGTAACATTTCGAAGCATTA GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC
>NZ_CP040500.1|WP_003648679.1|1159018_1159261_-|PTS-family-oligomeric-beta-glucoside-porter-component-IIB MNNLKTTKNVLLVCGLSASSGFMAANMRKASKKVGLDYKIQVRSEAELGDYADQIAALMLVFLLKDGVGTIKLQVLDKVK >NZ_CP040500.1|WP_003648680.1|1158332_1158758_-|restriction-endonuclease MSIYRNDDILITDLMDRIDKLENQVTDLKKVFYKQSGESHSTFLYGCEVRGSDYLHLEDKVIPRLKENDPVLLIREADNKYDKNAISVATPAGLKLGYIPREHNLIFSRLIDSGNLLFGRVKNFHWDGKNLELVIKVYLAN >NZ_CP040500.1|WP_003648681.1|1157324_1158242_-|M48-family-metalloprotease MLYKQIEQNKRNTWIILGLYTALLLILSIFLGMIFTKYVGIGFFIIGLIYIAHVYFDATQHLMKVTNAVEITKESDPEIYELVEELCLAGGLPVPKIYITPDSDPNAFATGRDPEHASLALTQGLLSMMNKKEVQGVIGHELSHIRNYDTRITVLASALTSLITITGIGIVLFGWGVLTSESKGWLGLIIKFFAMFLIIVGGIISIIGIPLAKLLFLLVSRQREYLADIGSVDLTREPSGLISALSKLEKMEESESTPEINSQDLALEHLYFNLPHPGNWIDRLFSDHPPLAKRIERLKNSDKIE >NZ_CP040500.1|WP_003648682.1|1156325_1157165_+|hypothetical-protein MTLQINTRVDSITWPLNQNLTNQEIISQLELTVTENGQLISNDNLSINKKAVNRSEAGVYPVIITAIGSNNEYATKKIQAWVTDKNNVNSATRPPVQPTPAPQYKTPSQTPSPKKKSKKKVVYIVLGVLVLLIAIIFGISACQAHNDTVQNEQAQSNALNNTNSKLDNLSEQNKQLMQQNKELQNAINNYKQDQNKEELQNQLDQIKNENQQLKNNAANNQALQNQIDQLGSTIDQIKQNPNQADSLLNQMKNNQNEFMQNLNATFQKLVSDFQQLIGK >NZ_CP040500.1|WP_035429893.1|1155761_1156202_-|8-oxo-dGTP-diphosphatase MKRSEPVTLTNMCMIKKKDKILVLDRNDPVWPGLTFPGGHVESHESFHDSVVREIKEETGLLIKNPHLVGVKQFFDKNDERYLVFFYVATEFTGTVKASDEGKLTWMTKEELTSKKLAYNFDHDLPVFFDKNLSEHLLDGKIDQTY >NZ_CP040500.1|WP_003648684.1|1155083_1155731_+|hypothetical-protein MEEFNLKKLIVGALSCGLLLLAGCRNNLVEPKHKSSADDYAIIQSSSHKKSHKKVEQPKKKSEDKKKKDKSKDENKKMDDQIDTLNKNENNSSSEAQSSSSALPSLNNSKRENSTETNRSLKSNFGTSLYTLPRQNYSYYTPKSNYYYSNNWSTNNNTDSSYQNSAVSNSKSEPSTSTSSSSSNDASTSTEEKQSPTTQNNDSNSSESSEDVQND >NZ_CP040500.1|WP_003648685.1|1154489_1154894_-|hypothetical-protein MYDLEDVMMKSFRDDNGISSAFSIEPVDDNEYRVSTNVVDGLNDMIHFNLIVYPNGTYALNDRVFTARMIDDNIGSFSSIAADVARLASEFGVLLDDRGELTRDYINSRDLRSEVNNFTQLLNRVVEFAQFNRY >NZ_CP040500.1|WP_003648686.1|1154029_1154413_-|DUF1828-domain-containing-protein MEESELKLIKHASCDWLKQNIQFIQAGEDIEVATPLIGAYGDLVYCWIEKEKDGAYRITDDGGTLFKLDPAQENLDLLEEAADIVIGAGFEFDEDNSEIYQIVDLGNMAQTLSDLTQLQVALTYLAS >NZ_CP040500.1|WP_003648687.1|1153009_1153813_-|hypothetical-protein MMRQIKKRNIMTGLGAAALLASLSLNGTAFAASTDSANAGAEQAKTYQTQLEQHKNLQAYTNPLSVKTLTTTKGVLPDATSGISNWSTVPAGTVANWDKTPEINKVGTSYGTVYVTFPDGSRSRLAVYVTVKDTAVSQDSKASKKDLNSGSATSATDQQDNASKQTTSVKKDVAKENTSRNSSEKTNKDVVVKDLGSTTVTEKNVSVVNNTKDNKKNSKKSSNPVSVATQLPETEGRAVNPLVVIGGLLVAAIGAVAIFGKKIKNRL >NZ_CP040500.1|WP_003648688.1|1151588_1152941_+|APC-family-permease MTNNNSVPKKLSFISIYFLGINAVIGSGTFLLPSVIYRYMNLTAILVLLCTAVTVSMIALCYADLSSRFTQSGAAWLYSYNAFGRFAGYELGIFTWFLGCTTLSAEVVALLTVLKSFLPIFKNNAVYIGSIIFLILLFSVINFFGRSWVKIVNNISAAAKIITLIVFIIIGAFFIKKANFTPVIPHAALTGVTPFFKHFGDAFTPIFYLFTGFSFIPIAAKQMNNPEKNIPRVLVAVMTSVTILDCLMLLVAIGLSGQKLGSYSNPLASALKTGVGQWGFAFMIIGMLISIFGVAFSASFNTPSLIASLANEHGMLPKWIGKKNKHDAPWVGIIFTAILSAALATQSYLFLVSCTVLASFVQYVPSILAVIKFKHSNEYPTHGFSLPGKYTIPIIALIISCYMVTNFTPKTLLLGVVVAVLAAACYFFIDKDEKLEKEHENFLAKLRHIK >NZ_CP040500.1|WP_003648678.1|1160725_1161394_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MILSYLSHKKMVMKNSGIKVIATSSPIVYRDVVQSFQGKKDMLLSSDDDYNQLNIIKDFDFIADPVLNQNIFDKYMPVIIKEYIEGLNEADRNEILKMYHKLEGIIQDSLLLEDLPLELEFNEDLKKFLKLENLHLDTKFLEEPYAIIESILKIHQNYNLHSIPVACNIAHYLNLAQVGMLNDLLKEMKLKLILIEFTSADFLVFPKDVDYFYIDQDLVDWY >NZ_CP040500.1|WP_003648677.1|1161390_1161696_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRLMIMFDLPVDTASERREYRQFRKRLINEGFLMIQYSIYERVCVSRKTATFLENRIKSFLPTSGVVQSLMVTEKQYNDMHFLVGNPVDDVRNSSDRTVIL >NZ_CP040500.1|WP_003648676.1|1161673_1162582_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGWRSVIITQHAKLTYSMNMMIVQTRDGINQIPISDINLLLVSTSQAVITSALISKLAENQSKIIFVDDKYQPVSETIDYYPNSRSLAKLKSQFNWDEKRKELLWTKIVARKIQNQIKVLQNYNLVWDDVQNELDQMELNDSTNREAAAARKYFINMFGKDFIRRNSGVINAALDYGYAILLSAFNREIAVNGYLSYLGIHHHSQENQFNLGSDLMEPFRPFVDYWVKAHENIDEFTPDIKFGLVELLSLEIKFNGRKTLLSNAITVYVRDCLRFLSGEIDKVKIEMELTDEVPNDAINDNV >NZ_CP040500.1|WP_003648675.1|1162787_1166963_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MTKIKNEYIVGLDVGTNSCGWVAMDFQNTILRMHGKTAIGSHLFDAGNSAADRRAFRTTRRRIKRRKWRLKLLEEIFDPYMTEVDPYFFARLKESGLSPLDKRKNVSSIVFPTALEDKKFYCNYPTIYHLRYDLMSEDKKFDLREIYLAIHHIVKYRGNFLYNTPVKDFEASKIDVKDSLEKLNELYERLDSEFTVELDSSNALEIEKIIRDKKVFKINKVKSIHQLLSLKTENKERTKLIKDVSKQIINAILGYKTKFETILLKNISKDEADDWEFKLTDVDADNKFENLIGDLNENEQEILLEIRNLANAITLSNIVEEGKTLSESMIDKYNKHSDDLELLKQVISDHPDRDKAKKLALAYDLYVNNRHGKLLQAKDVLGSKKTLSKEDFYKEVKKNLDDSKASQEILDTIALDSFMPKQRTNENGVIPYQLHQLELDRIIKNQGKYYPFLKEVNPVSSHLKEAPYKLDELIRFRVPYYVGPLISPNESTKNKQTKKNQNFAWMIRKEQGQITPWNFDQKVDRMASANKFIKRMTTKDTYLLGEDVLPANSLLYQKFTVLNELNNIKINGKRISVPLKEELYNNLFKKNSTVTTNKLKSYLKENYNLINVEIKGLADEKKFNSGLTTYNKLRNLKIFDQQLDDLNYDKDFERIIEWSTIFEDKAIYKDKLKTIKWLSDRQIDKLSKIRMQGWGQLSKKLLSQLTDNNGQTIIEQLWDSQNNFMQIVNQSDFKDAIAVANQNLLVNTSVEDILNEAYTSPANKKAIRQVVKVVDDIVKAASGKVPKQIAIEFTRDADDKAKISQTRANKLRKVYKELSNELASETIRNELERVAKDQKLLKDKYYLYFMQLGRDAYTGEPINIDDLGQYDIDHILPQSFIKDDSLENRVLVKKAVNNGKSDNVPVKLYGNRMAADLGMTIRHMWEKWKDQGLITKTKYNNLIIDPDKINKYESSGFIHRQLVETSQIIKLVSTILQSKYPDTEIIVVKARYNHYLRKHLNLYKSREVNDYHHAIDAYLSAICGNLLYQVYPYLRPFFVYGQYKKFSSDPKKEKIIYDKTRKYNFISQIFENKSNDIISLETKKKVFDKKDIIEKLKHAYNYKYMLVSRETETHDQEMFKMTVYPRLSRDTKKSRNLISKKKDMPTEIYGGYTNNSDAYMVIARINKKKGTEYRVFGVPMRELVNLRKAEKNGRYNAYLKQVLEPEIMYSKNGKKNKTISSFEIVKAKVPYKQVILDGDKKFMLASSTYVQNAKQLTLSQNSMQAITDNCENDTEEEKALEEKALIEAYDEILTNIDKYLPLFDINKFREKLHAGREKFINLSLDVKKDTILQVLNGLHDNAVMPKIKSLGLSTPLGFMQFSSGVPLSENAKLIYQSPTGLFEKRVKISDL >NZ_CP040500.1|WP_003648674.1|1167292_1168279_-|dTDP-4-dehydrorhamnose-reductase MKVFVTGVNGQLGHDVMNELAKRGYEGVGSDLAPEYAGVADGSSVTKAPYVSLDITDAKAVNKVISEVNPDVIVHCAAWTAVDMAEDDDKVAAVRKVNVDGTQNIANVAKKLDAPMVYLSTDYVFDGQGTTPWEPDFKGYKPLNVYGETKLGGEEAVANTLDKYFIVRIAWVFGVNGSNFIKTMLKVGSNHDEVKVVSDQIGTPTYTFDLARLLVDMIETDKYGYYHATNSELPATESGYDKNGTKTGYISWYDFTKEIYRQAGYKTKVTPVTTEEYGLSKAVRPFNSRLDKSKLEENGFKPLPTWTDAISRYLDILKDDGFFDELKK >NZ_CP040500.1|WP_003647168.1|1168295_1168904_-|dTDP-4-dehydrorhamnose-3,5-epimerase MGQIKVEKNVGGIEGLAVITPTVHGDDRGYFMETFNQRDMMDAGFSINFVQDNQSSSTKGVLRGLHFQKKYPQIKLVRAVRGSVFDVAVDLRSESKTYGKWYGVELTAENKKQFLIPQGFAHGFLVLSDVAEFCYKVNDFWHPNDEGGMAWNDPEIGIEWPHLKGDYPGSPDASGYTLDDGTKLNMAERDQEWKGLKDTFKF >NZ_CP040500.1|WP_003648673.1|1168936_1169821_-|glucose-1-phosphate-thymidylyltransferase-RfbA MKGIILAGGSGTRLYPLTLVTSKQLLPVYDKPMIYYPLSTLMLAGIKDILVISTPADTPRFKELLGDGSQFGINLSYKVQPTPDGLAQAFTLGEDFINGEPCAMVLGDNIFYGNGFTDLLKNAAEDTQKGKATVFGYYVNDPERFGVVDFDENGNAVSIEEKPEHPKSNYAVTGLYFYPAGVSEKAAQVKPSARGEVEITSLNDMYLQDGDLGVQLLGRGYAWLDTGTMQSLVDASNYVKMIEERQGVSVSAPEEIAYVHGWINKDQLLEAAKHYGKSPYGKHLKSVAEGKVRY >NZ_CP040500.1|WP_003647166.1|1169827_1170865_-|dTDP-glucose-4,6-dehydratase MKVIVTGGAGFIGSNFIFYMLKKHPDYEIICLDSLTYAGNLSTLKDVMDNPNFKFVKLDIRDREGVYKLFEEEKPDVVVNFAAESHVDRSIENPEIFLETNIIGTSVLMDACRKYGIKRFHQVSTDEVYGDLPLDRPDLFFHEDTPLHTSSPYSSSKASADLLVGAYGRTFHLPVTISRCSNNYGPYQFPEKLIPLMIQRALNNEKLPVYGDGKNVRDWLYVEDHCKAIDLILEKGTPGEVYNIGGHNEMHNIDIVKLICDYLDKPYSLIEHVTDRKGHDRRYAIDPEKIHNELGWLPETMFKDGIKKTIQWYLDNKEWWENIISGDYQNYYDEMYGKKQVLDKD >NZ_CP040500.1|WP_003648671.1|1170946_1172122_-|methyltransferase-domain-containing-protein MPKYYTSGEFAKKAHVSIRTIRYYDQKNLLKPSTHTASGARRYTDTDFAKLQQILLLKYIGFSLSDIREMTLGSGDRQLLLDSLQIQKRLVEERLKEMQNVATAIDSTSSTLKAGQEVDWSKMLNLIHLTSMNQSLSTQYQNASNISARIRLHRDYSLNKEGWFHWLFKQLDLKSGMKILELGAGNGALWSQNLEKLPKGLTIVLSDISEGILADAKNEIGDNSEFQYAVFDAQKIPFADNTFDLVIANHMLFYCDDIPKTLKEVRRVMKKGASFACATYSKRHMHEITDLVQEFNPEIVLSSTNLYDRFGLDNGAEILSKDFADISCHKYQDAIELSESTPVISYILSCHGNQNAILLDHYNEFKNYVDEKVSGGFHITKDVGYFICKKT >NZ_CP040500.1|WP_003648670.1|1172134_1173085_-|Abi-family-protein MKEFKNIDEQIEILKNRGLVFKDLNSAKRYLLTNNYYNIINGYGKYFQNNTDVFIKGTTFDEVCSLYFCDKQLKQAFFNSILNVEHHLKSIFAYRFAEKFKNKRYAYLDINSYDSNKILSVGRLISDLSRIINFYKDKSNNPIHHYVKKYNDVPIWIMVEFLDFGKLCAMIKNSKRSIQNKICKDLMTFIHENIGDLNEHFTPEIMISFIENVHELRNVCAHNNRLLDFRCKADSKYFSALHSKYNIEDNNSRRYAYSVFVSMQRFLSPTEFKILNNTIRKRLNLLKKHLNSIDIQEILNLLKFPTEWLTQPRLKQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP040500_2 | 1252341-1252442 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP040500_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP040500_2
>2.1|1252377|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder TAGCGGCAATTGTTTCTGGTATGGTTGGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP040500_2
The CRISPR arrays of NZ_CP040500_2 >merge|NZ_CP040500|2|1252341-1252442|CRISPRCasFinder GATATTTAGCAGTCATAATTGACTTACCTTCATGGGTAGCGGCAATTGTTTCTGGTATGGTTGGAAGATATTTAGCAGTCATAATTGACTTACCTTCATGGG >NZ_CP040500|2|2|1252341-1252442|CRISPRCasFinder GATATTTAGCAGTCATAATTGACTTACCTTCATGGG TAGCGGCAATTGTTTCTGGTATGGTTGGAA GATATTTAGCAGTCATAATTGACTTACCTTCATGGG
>NZ_CP040500.1|WP_003648588.1|1250563_1251823_-|bifunctional-folylpolyglutamate-synthase/dihydrofolate-synthase MKFTNVDQVINRIYSLPKLHPKNDLSYVKRILKQLNNPQDSVKTIHVTGTNGKGSTSYYLSNLLQKAGQKTGLFVSPYIYEFNERIQLNGKNISNRDLVEVANKIEAAIKELKKTDPDFSLVTFEYEVALAFQFFAQKKCDYAVIEVGIGGEHDKTNVITPEVSIITTIGLDHEKIIGPTLADIAKEKSGIIKQNKPVVLGNIPQDVLDILLDKAQAENSKSFLLGRDFKIKLSKTAIEYQDLENKYQFLKRPVVEAYDIGVAVRAVQLLNLQLNKQEIEASINKTQIPGRYDIVQTAPKIIVDGAHNLQAMTNLLHLIRKENQGQIYILLGMMKDKDLGPVTDLFEDEKVTLTRIDYPRAARLEDFPKEAQQKYNYEENFEVAYTNLKNKLKPHDILLVTGSFYLVGAVLNYCKRGKK >NZ_CP040500.1|WP_003648589.1|1249886_1250567_-|HAD-family-phosphatase MKVENIAEPIEGIIFDMDGLLVNSEKLYWDANIVAAKEANLNIPDDSYLKLVGSSVKEMEEFYHQHFKTEADRDKFIKRTDELVWEWTDQGKLKLQAGVRDALVEFKEKNIKLAIASSNYDEVVAHNLEVLKIKDYFDFYLSYKDVEAGKIKAKPAPDIYLLAAQKMQLPKDNLLVFEDSSTGVASASAAGLKCVMVPDLKQPTILDKKNATLICKDFYSFLKKIK >NZ_CP040500.1|WP_035429888.1|1249236_1249848_-|JAB-domain-containing-protein MKKEELLQTDVDLVKKLARSLKEKDIVTFDSLFKKLEEVGISSFKEMWQYAASPKCEDELAVVLQLMLERIKGVNNKEIESFYSSSQVGCYIADKLCGRPQEELYGIYLDSKNKIIAEKLIFQGTVNRAVAHPRDIFRWAVIYNSTAFFVAHNHPSGDEQPSQHDLRFTKKLVEASKCMGIDFLDHFIVTDNTYLSFREMELL >NZ_CP040500.1|WP_003648591.1|1248098_1249100_-|rod-shape-determining-protein MFGLGSKNIGIDLGTANTLVYIEGKGIVLREPSVVAKNTQTGEVIAVGSEAKEMIGRTPGSIVAIRPMKDGVIADYDTTAAMLKYFMEKTVGNSKPAAMICVPSGVTEVEKRAVIDAARVAGAREAYVIEEPFAAAIGAGLPVMDPTGSMVVDIGGGTTDVATISLGGIVSSRSTRMAGDKFNSAIATYIHQNYNLLIGERTAETIKIQIASASVEKAKEIESMNIRGRDLVTGLPKSIDIEAVDVSKAIQEVVQNIIVAIKETLEETSPEIAADVIDHGIVLTGGGALLKNLPEVISDATKVPVFIAQDPLDCVAIGTGESLKNIEVMRKRR >NZ_CP040500.1|WP_003648592.1|1247182_1248034_-|rod-shape-determining-protein-MreC MKKFLKNKKLLTIFVLVILVLSMLSISIRLRNKRETPFLVQKIGNDTVSIVTRVVNWPINLVSNGVANVEDLFNTQAENDHLKKQIDNLAQTKARNSSLEAENTQLKQALKLKKTLTDYTIINGSVISRAADTWSDLLVIDQGARAGVKKNMPVMSGKGVIGRVVEVNSTTSKVELITTTDKSTNKFAVEADAANGKKVHGVISVEGNSQLAFTQVVDGQKLKKGTRVYTSGMGGLSPKGLLIGTVTKTTRDTFGLSDVVEIQPAGNLNDPSVVSVIKRKVEE >NZ_CP040500.1|WP_003648593.1|1246649_1247183_-|rod-shape-determining-protein-MreD MAELRRWYVAIALFMALILDGVLAYNLQTFIFHRGFSGSCWLTVVGITLIALCDDKNDANIWLCLGLGLIADLYYLGVIGIYTVAFPLICFLIQQSARFLPEVFWFRLLICLVVYLCVSFYVYLTLNLVGIIQLSFASFLNSILPNLLWCFILVLCTYWFWVKLAEEYPFLKKEYYF >NZ_CP040500.1|WP_003648594.1|1246474_1246603_+|DUF4044-domain-containing-protein MRKRKKKSGFQKLTIVMAWFMAVITLLGVVATALIGTGVFQF >NZ_CP040500.1|WP_003648595.1|1246040_1246376_-|DUF3397-domain-containing-protein MNFLLIFLVPLCGIVVAAFLMKLFPKAQFSGYDILPFFFIAACQLLTQETKQPSFLPYGFLLYFILVVIVSVYTAVKNKNISVAKTLGTLWHYLAASSIVWYVGLLILLLL >NZ_CP040500.1|WP_003648596.1|1245428_1245860_-|division/cell-wall-cluster-transcriptional-repressor-MraZ MFMGEYHHNLDSKGRLIIPAKFRDEIGEKMVFTRGMEGCIFGYPIEEWQKIEAKLAKLPLTKRSARKFTRLFYSGAMESEFDKQGRVNLTMTLKEHAALTKECVIVGVSNRIEIWSAERWNDFSEEANENYDDIAEDLDDIEL >NZ_CP040500.1|WP_003648597.1|1244475_1245423_-|16S-rRNA-(cytosine(1402)-N(4))-methyltransferase-RsmH MKFKHKSVLLHETIDNLNPKDDGLYVDATFGGGGHARYLLSKLNRGTVIGFDQDEYAISMAKESFAEELKPGAEPKLILVHDNFCHLKKNLVELGISDGIDGIYYDLGVSSPQFDQPERGFSYRFDARLDMRMDQSQELDAYTIVNTWSQKELSDILYKYGDEKFSRQIARKIVDRRREKPIVTTFDLVDVIKDAIPAYARRSGGHPAKKSFQAIRVAVNNELGVLQESLEEAIKLLRPGGRISVITFQSHEDKIVKKIFKKYSEVEIPRGMPMVPADSKPTLRLISRKPIMASSDELEENNRSHSAKLRVAEKL >NZ_CP040500.1|WP_003648586.1|1254818_1257446_-|cation-translocating-P-type-ATPase MKAYYRESKEELIKELGANEKQGLTNKVAQEKLAQVGPNALIEGKKKSILEVFLEQFKDLMVIILIVAAVISAFTGNLESTAVIIVVLILNAILGTVQHVKAEKSLEALKSLSAPAAKVLRDGKKQEIAAKDVVPGDILLLEAGDLVTADGRILDNFSLQVNESSLTGESTNIDKLDTTFDKEVPLGDRVNMVYSSSLVTYGRANVLVTATGMDTEIGKIATLMNETKERRTPLQVSLDQFSSRLATAILIFCALILGLQMWRGQPLLDALLFAVALAVAAIPEALSSIVTIVQAMGTQKMAKKHAIIKNLAAVESLGSVSVICSDKTGTLTQNKMTVEDIYIGGEVLKPEELNLSNQLHRYLLYDVVLNNDASLSDGKKIGDPTESALLEMYRKVPGIDLGNGKLGLSESELRNHLDRLEEVPFDSDRKLMSTKHLIHTVPTIFVKGAIDVLLKRCINIRFGDEVRPLTEQDRKNILAQNNHFSENGLRVLAFAYKESDEELSADTEKDLTFIGLVSEMDPPREESVAAVARAKEAGIRTVMITGDHKVTAVAIAKKIGIFNDGDIALTGLELDALSDEELDQEIEKVAVYARVSPENKIRIVNAWQRKDHIVSMTGDGVNDAPALKKADVGVAMGITGTEVSKDAASMILTDDNFATIIKAVANGRTVYENIKNAIGYLLSGNLSAIITVLFASIAGLPVPFVAVQLLFINLVTDSLPALAIGMEPGNPDILKRKPRDPKASLLDKPFVTQISTQGFLISLSVIAAFLIGLKDSPAIACTMAFSTLTFARLLHGFNCRSQHSIFKIGFKNNWYSLAAFALGTALLALILFVPTLHGLFAVQPLSGQEVWLIVILAIIPTVLIQLVKVIRENRG >NZ_CP040500.1|WP_003648585.1|1257659_1258763_-|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MKKIIFVIFFILVFPFTCGFLNIAHRGDNEQGKFAEHSWMAYDRALCAQVDYLELDLQKTSDNVLVVSHDDNLSRVFGVDKIIADYPYQELLSYKNQNGESLHSLGDVFKRYQNSNVKFMIEPKDNSEEDIKLLLNLIRQYHLENRVLLESFSKTALMQISKINPQIPTMQLAGEFNLLPSTQYYANNFYSKKVADYLSEHDKKYLLWGVNKKVQMKQYLQLDKNVSGLLTDYPVELANILHSSDIFKRNYEASSFPSKSISGLMYLKNGSSVEVDQVKMKDNQLFYHVRPDLWLSDHNLKNSDHSAPKAQTGKIKLQKETLIYTDPSLKKYSGRKLPQNSTWNYFAVKKVHGKTVYNLGGAQWVKQ >NZ_CP040500.1|WP_035429635.1|1258775_1259477_-|rRNA-pseudouridine-synthase MRIDKYLANMNVGSRKEVHSLIKKKVVTVNGELVTAPKQQVKEDDLVVVDGNEIAYQQYHYFLLNKPKGVISATEDRSQQTVISLLKTKDRYQGIAPVGRLDKNTTGLLLLTNDGALAHELLAPNKHVTKVYRAKISGVASEETIKTFASGITLGDGTKLKPAKLEILAQDKVHDLSQIEIQIQEGKYHQIKRMFGAVGMKVLELDRISMGKLSLPTDLKRGQYQEITRDKIK >NZ_CP040500.1|WP_003648583.1|1259527_1260745_-|tRNA-4-thiouridine(8)-synthase-ThiI MQYTEVMVRYGELSTKGKNRKDFIGRLAGNVTRALQDFPEIEIHPKHDRMHIVLNGAPFDKIDQRLKLVFGIQTYSPTIKVEKNLDAIKKASLELMQATFKDGMTFKVNTRRSDHEFEYDTNQLNAMIGDYLFDNMDNLKVKMKKPDLVLRIEVRQDAIYISNQLLHGAGGMPVGTAGRAVMMLSGGIDSPVASYLAMKRGVEIDMVHFFSPPYTTEKALAKAKELTGILANYSGKINFIAVPFTEIQEQIKEKLPEGYLMTIQRRFMLQLADHIRAMRGGLAIFNGESVGQVASQTLESMVAINDVTSTPVLRPVATMDKTEIIKLAEQIGTFDLSIEPFEDCCTIFAPPRPKTKPKLDEARKLENRLDAEGMIQRAIDGMEITPIYPNQKFLDDKAQEDADLL >NZ_CP040500.1|WP_003648582.1|1260754_1261909_-|cysteine-desulfurase MIYFDNSATTAVYPAVLETYDKVTKDIWGNPSSLHKMGDRSHQLLEASRKQIASLLNVKPHEIFFTSSGSESDNWAIKGTALAKKEFGNHIITSSVEHAAVSNSVRALEDLGFRVTVLPVDKNGQVDPADLKAALDKETILVSIMGVNNEIGTIQPIKEISKVLEDYPNVTFHVDNVQALGKDIWDEVFTNRVDLMSLSAHKFHAPRGVGILYKKEGKMIKPLIDGGGQEKGLRSSTENLPAIAATAKAMRLYLSDEKKNAAQELAVKKKIISYLDGKPGIHIFSPINDKFIPSVLCFSLEGIRGETLVHTLESKEIYVSTTSACSSRSGVESGTLNAMKVEDDLATGAIRLSFDPSNTIEEAEQFISVFDKIYKHFAEINHLK >NZ_CP040500.1|WP_035429630.1|1262007_1263726_-|septation-ring-formation-regulator-EzrA MSSGLSILIIVILIAIIAVIATVVILNKYFNHQIAELDALTDELKDLSVEEDIKRLQKMELAGKSLETFKRWQKVYQKVDTKDVGELKHLLEQAAGLNAKFNLIKTHQLIKEATELLQTNQDNVERSKQIFTNLLEANRDNQKHYAALSKDYQQLRKKILSQSFNYGNAIDQIEEDLATLESDFQTAKNLSGEGDHEEAKKVLTKIDTKLTSLKTDLPKIENFDQELKNVFPDQLNELSNTYRQMVKDKYKITEVDVLEEIKSLRELVDENKKSLNKLDLAKVEKSNKEVSTRIDSLYDILTKEFKARPFVDNNQDKIVQILSHMSNASNQLVAKLEHVDQSYELTHGELAEARQLKSQVSRMNADFDVDCQKIADGDGVYSQIENKWLTMLDSLKEIEKTEKRLSGDVDGLFDAEKIANDSIIHFKQEISLVYRKVERRRLPGKPESFIQMYTLVLNEVKHTDNELNQVRINMEKISSELIQIQEDIERLKKEADEILNSADLVELTMQYSNKYISNPEIKRARKEAYDLYQNKYEYKEALDVIATALEKVEPGSYQRIEKEYYSEQEEAE >NZ_CP040500.1|WP_035429627.1|1264006_1264618_+|30S-ribosomal-protein-S4 MSRYTGPSWKRSRRLGISLSGTGKEISRRNYAPGDHGPNNRAKVSEYGQQLKEKQKLRWMFGLNERQFQNLFIRAGKIREGKHGVNFMALLERRLDNIVYRLGLASTREQARQLVNHGHILVDGKRVDIPSYEVKVGQEISLRDKSKNLQQVKDALDAVVSRPPFVSFDDSKMTGTLVRLPGRDEMEPEVDEALIVEWYNKKL >NZ_CP040500.1|WP_003648578.1|1264736_1265201_+|YueI-family-protein MTEDLNTRLENAAKGITPQTCPDERRRYLGSLRERVLVRMTVEETNNPTLDTLFLKHINDFKGYTILINGKMPQNNFINKLMGLCSQQDIKFTLINDDTAKDEPNATGVLVVSKTAINHYRIEIDQVYAPEAPHEQLSEPKKESFWNRLFRKKD >NZ_CP040500.1|WP_003648577.1|1265203_1266502_+|replication-associated-recombination-protein-A MKPLAYRMRPKNLDEVVGQEHLVGNKKIIRRMVEAKLLSSMILYGPPGIGKTSIASAIAGSTKYAFRKLNAATDTKKDLQIVAEEGKMSGTVILLLDEIHRLDKTKQDFLLPLLESGNIILIGATTENPYISISPAIRSRCQIFELHRLKSTDISKAIDRALTDSENGLGKYNVELTKDARNLLIDKGNGDLRSTLNALELAVLSTDQEKKTKSPKDKLIIDKAEMQDSIQFKSQSYDASGDGHYDLVSAFQKSIRGSDTDAALYYLGNLCESGDLVAICRRLLVIAYEDIGLANPPACSRVVNAVQAAQMVGLPEARIILSNAVIELCLSPKSNSAIVAIDSAISDIQNKQNDPIPDSLKDAHYKGAQNLNHGVSYVYPHDYQGDWVAQQYLPDNLKNVSYFKPKGNSKIEDALKRQYLRLKKMQHDDLQK >NZ_CP040500.1|WP_003648576.1|1266787_1267072_+|hypothetical-protein MVLKVLMLIFILLVFITAWYLVRSKNKGQFIIFTFIGNSKINTLFTVTSLVLVLTGIIGIIILFTLPKIFNFITLIIAAMAISIFSFTFMNLNE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP040500_2 | 2.1|1252377|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder | 1252377-1252406 | 30 | NZ_CP040500.1 | 1858237-1858266 | 0 | 1.0 |
1. spacer 2.1|1252377|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder matches to position: 1858237-1858266, mismatch: 0, identity: 1.0
tagcggcaattgtttctggtatggttggaa CRISPR spacer tagcggcaattgtttctggtatggttggaa Protospacer ******************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP040500_1 | 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159506-1159535 | 30 | MN830257 | Lactobacillus phage JNU_P11, complete genome | 15531-15560 | 0 | 1.0 |
NZ_CP040500_1 | 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159506-1159535 | 30 | NC_024206 | Lactobacillus phage phi jlb1, complete genome | 6493-6522 | 0 | 1.0 |
NZ_CP040500_1 | 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159506-1159535 | 30 | DQ320509 | Lactobacillus phage KC5a, complete genome | 6354-6383 | 0 | 1.0 |
NZ_CP040500_1 | 1.16|1160430|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1160430-1160459 | 30 | MN830256 | Lactobacillus phage JNU_P7, complete genome | 10030-10059 | 0 | 1.0 |
NZ_CP040500_1 | 1.19|1160628|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1160628-1160657 | 30 | NZ_CP008840 | Lactobacillus gasseri DSM 14869 plasmid pEB01-2, complete sequence | 3475-3504 | 0 | 1.0 |
NZ_CP040500_1 | 1.19|1160628|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1160628-1160657 | 30 | NZ_CP011405 | Lactobacillus salivarius str. Ren plasmid pR2, complete sequence | 7395-7424 | 1 | 0.967 |
NZ_CP040500_1 | 1.19|1160628|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1160628-1160657 | 30 | NC_006530 | Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pSF118-44, complete sequence | 15081-15110 | 1 | 0.967 |
NZ_CP040500_1 | 1.19|1160628|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1160628-1160657 | 30 | NC_011352 | Lactobacillus paracasei plasmid plca36, complete sequence | 28461-28490 | 1 | 0.967 |
NZ_CP040500_1 | 1.19|1160628|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1160628-1160657 | 30 | CP002035 | Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN1, complete sequence | 15396-15425 | 1 | 0.967 |
NZ_CP040500_1 | 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT | 1159440-1159469 | 30 | NC_018878 | Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_502p, complete sequence | 453154-453183 | 5 | 0.833 |
NZ_CP040500_1 | 1.5|1159704|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159704-1159733 | 30 | MW117965 | Synechococcus phage S-H38, complete genome | 31696-31725 | 5 | 0.833 |
NZ_CP040500_1 | 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT | 1159440-1159469 | 30 | MN693441 | Marine virus AFVG_25M481, complete genome | 6968-6997 | 6 | 0.8 |
NZ_CP040500_1 | 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1160496-1160525 | 30 | NC_018983 | Borrelia burgdorferi 297 plasmid 297_cp26, complete sequence | 8220-8249 | 6 | 0.8 |
NZ_CP040500_1 | 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1160496-1160525 | 30 | NC_017401 | Borreliella burgdorferi N40 plasmid N40_cp26, complete sequence | 8220-8249 | 6 | 0.8 |
NZ_CP040500_1 | 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1160496-1160525 | 30 | NC_017395 | Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp26, complete sequence | 8225-8254 | 6 | 0.8 |
NZ_CP040500_1 | 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1160496-1160525 | 30 | NZ_CP031398 | Borreliella burgdorferi strain MM1 plasmid plsm_cp26, complete sequence | 8179-8208 | 6 | 0.8 |
NZ_CP040500_1 | 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1160496-1160525 | 30 | NC_011724 | Borreliella burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp26, complete sequence | 8223-8252 | 6 | 0.8 |
NZ_CP040500_1 | 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1160496-1160525 | 30 | NC_001903 | Borreliella burgdorferi B31 plasmid cp26, complete sequence | 8222-8251 | 6 | 0.8 |
NZ_CP040500_1 | 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1160496-1160525 | 30 | NZ_CP019755 | Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_cp26, complete sequence | 8222-8251 | 6 | 0.8 |
NZ_CP040500_1 | 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1160496-1160525 | 30 | NZ_CP017202 | Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_cp26, complete sequence | 8222-8251 | 6 | 0.8 |
NZ_CP040500_1 | 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1160496-1160525 | 30 | NC_019225 | Borrelia burgdorferi plasmid cp26, complete sequence | 8222-8251 | 6 | 0.8 |
NZ_CP040500_1 | 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT | 1159440-1159469 | 30 | NZ_LR214939 | Mycoplasma salivarium strain NCTC10113 plasmid 2 | 195269-195298 | 7 | 0.767 |
NZ_CP040500_1 | 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT | 1159440-1159469 | 30 | MK448700 | Streptococcus phage Javan191, complete genome | 41970-41999 | 7 | 0.767 |
NZ_CP040500_1 | 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT | 1159440-1159469 | 30 | AP014363 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S41-C2, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 4165-4194 | 7 | 0.767 |
NZ_CP040500_1 | 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT | 1159440-1159469 | 30 | MN694760 | Marine virus AFVG_250M661, complete genome | 25340-25369 | 7 | 0.767 |
NZ_CP040500_1 | 1.5|1159704|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159704-1159733 | 30 | AY939844 | Prochlorococcus phage P-SSM2, complete genome | 3768-3797 | 7 | 0.767 |
NZ_CP040500_1 | 1.5|1159704|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159704-1159733 | 30 | HQ632825 | Prochlorococcus phage P-SSM5 genomic sequence | 83185-83214 | 7 | 0.767 |
NZ_CP040500_1 | 1.5|1159704|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159704-1159733 | 30 | MH319733 | Marine virus AG-345-E02 Ga0172268_13 genomic sequence | 8858-8887 | 7 | 0.767 |
NZ_CP040500_2 | 2.1|1252377|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder | 1252377-1252406 | 30 | JQ768459 | Pseudomonas phage Lu11, complete genome | 278143-278172 | 7 | 0.767 |
NZ_CP040500_1 | 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT | 1159440-1159469 | 30 | MK493321 | Cyanophage S-RIM4 isolate RW_11_0999, complete genome | 129964-129993 | 8 | 0.733 |
NZ_CP040500_1 | 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT | 1159440-1159469 | 30 | NC_047882 | Vibrio phage JSF12, complete genome | 35270-35299 | 8 | 0.733 |
NZ_CP040500_1 | 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT | 1159440-1159469 | 30 | MH107246 | Synechococcus phage S-B64, complete genome | 72909-72938 | 8 | 0.733 |
NZ_CP040500_1 | 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT | 1159440-1159469 | 30 | MT002874 | Pseudoalteromonas phage XC, complete genome | 11365-11394 | 8 | 0.733 |
NZ_CP040500_1 | 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT | 1159440-1159469 | 30 | KY883654 | Vibrio phage JSF10, complete genome | 110240-110269 | 8 | 0.733 |
NZ_CP040500_1 | 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT | 1159440-1159469 | 30 | KY945241 | Synechococcus phage S-H35, complete genome | 102206-102235 | 8 | 0.733 |
NZ_CP040500_1 | 1.11|1160100|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1160100-1160129 | 30 | NZ_CP023509 | Rothia mucilaginosa strain FDAARGOS_369 plasmid unnamed, complete sequence | 23239-23268 | 8 | 0.733 |
NZ_CP040500_1 | 1.16|1160430|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1160430-1160459 | 30 | NZ_CP036405 | Komagataeibacter saccharivorans strain JH1 plasmid p221732, complete sequence | 28424-28453 | 8 | 0.733 |
NZ_CP040500_1 | 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT | 1159440-1159469 | 30 | KY945241 | Synechococcus phage S-H35, complete genome | 9419-9448 | 9 | 0.7 |
NZ_CP040500_1 | 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159506-1159535 | 30 | NZ_CP040051 | Acinetobacter baumannii strain VB16141 plasmid unnamed1, complete sequence | 3418-3447 | 9 | 0.7 |
NZ_CP040500_1 | 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159506-1159535 | 30 | MK531540 | Acinetobacter baumannii strain MC75 plasmid pMC75.1, complete sequence | 119769-119798 | 9 | 0.7 |
NZ_CP040500_1 | 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159506-1159535 | 30 | NZ_CP012007 | Acinetobacter baumannii strain Ab04-mff plasmid pAB04-1, complete sequence | 162566-162595 | 9 | 0.7 |
NZ_CP040500_1 | 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159506-1159535 | 30 | MK531536 | Acinetobacter baumannii strain MC1 plasmid pMC1.1, complete sequence | 153985-154014 | 9 | 0.7 |
NZ_CP040500_1 | 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159506-1159535 | 30 | CP040054 | Acinetobacter baumannii strain VB35179 plasmid unnamed1, complete sequence | 225877-225906 | 9 | 0.7 |
NZ_CP040500_1 | 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159506-1159535 | 30 | NZ_CP050386 | Acinetobacter baumannii strain VB82 plasmid pVB82_1, complete sequence | 22925-22954 | 9 | 0.7 |
NZ_CP040500_1 | 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159506-1159535 | 30 | NZ_CP020596 | Acinetobacter baumannii strain HWBA8 plasmid pHWBA8_1, complete sequence | 63593-63622 | 9 | 0.7 |
NZ_CP040500_1 | 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159506-1159535 | 30 | NZ_CP012005 | Acinetobacter baumannii strain ATCC 17978-mff plasmid pAB3, complete sequence | 142498-142527 | 9 | 0.7 |
NZ_CP040500_1 | 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159506-1159535 | 30 | MF399199 | Acinetobacter baumannii strain D46 plasmid pD46-4, complete sequence | 31257-31286 | 9 | 0.7 |
NZ_CP040500_1 | 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159506-1159535 | 30 | NZ_AP014650 | Acinetobacter baumannii strain IOMTU433 plasmid pIOMTU433, complete sequence | 155675-155704 | 9 | 0.7 |
NZ_CP040500_1 | 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159506-1159535 | 30 | NZ_CP027531 | Acinetobacter baumannii strain AR_0088 plasmid unnamed1, complete sequence | 137970-137999 | 9 | 0.7 |
NZ_CP040500_1 | 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159506-1159535 | 30 | NZ_CP050416 | Acinetobacter baumannii strain PM193665 plasmid pPM193665_1, complete sequence | 105068-105097 | 9 | 0.7 |
NZ_CP040500_1 | 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159506-1159535 | 30 | NZ_CP050426 | Acinetobacter baumannii strain PM194188 plasmid pPM194122_1, complete sequence | 105068-105097 | 9 | 0.7 |
NZ_CP040500_1 | 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159506-1159535 | 30 | NZ_CP050433 | Acinetobacter baumannii strain PM194229 plasmid pPM194229_1, complete sequence | 181077-181106 | 9 | 0.7 |
NZ_CP040500_1 | 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159506-1159535 | 30 | LT605060 | Acinetobacter calcoaceticus strain NCTC7364 genome assembly, plasmid: 2 | 103919-103948 | 9 | 0.7 |
NZ_CP040500_1 | 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159506-1159535 | 30 | NZ_KU744946 | Acinetobacter baumannii strain A297 (RUH875) plasmid pA297-3 clone Global clone 1 (GC1), complete sequence | 31257-31286 | 9 | 0.7 |
NZ_CP040500_1 | 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159506-1159535 | 30 | NZ_CP040260 | Acinetobacter baumannii strain P7774 plasmid unnamed1, complete sequence | 27927-27956 | 9 | 0.7 |
NZ_CP040500_1 | 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159506-1159535 | 30 | NZ_KT779035 | Acinetobacter baumannii strain D4 plasmid pD4, complete sequence | 33753-33782 | 9 | 0.7 |
NZ_CP040500_1 | 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159506-1159535 | 30 | NZ_CP022285 | Acinetobacter baumannii strain 7804 plasmid pAba7804b, complete sequence | 34639-34668 | 9 | 0.7 |
NZ_CP040500_1 | 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159506-1159535 | 30 | NZ_MK323043 | Acinetobacter baumannii strain Acb-45063 plasmid pAb45063_b, complete sequence | 66180-66209 | 9 | 0.7 |
NZ_CP040500_1 | 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1159506-1159535 | 30 | CP033562 | Acinetobacter nosocomialis strain 2010S01-197 plasmid p2010S01-197-1, complete sequence | 122795-122824 | 9 | 0.7 |
NZ_CP040500_1 | 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1160496-1160525 | 30 | MK605244 | Nodularia phage vB_NspS-kac65v162, complete genome | 34049-34078 | 9 | 0.7 |
NZ_CP040500_1 | 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1160496-1160525 | 30 | KU230356 | Bacteriophage vB_NpeS-2AV2, complete genome | 33808-33837 | 9 | 0.7 |
NZ_CP040500_1 | 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1160496-1160525 | 30 | MK605242 | Nodularia phage vB_NspS-kac65v151, complete genome | 33596-33625 | 9 | 0.7 |
NZ_CP040500_1 | 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1160496-1160525 | 30 | MK605243 | Nodularia phage vB_NspS-kac65v161, complete genome | 33617-33646 | 9 | 0.7 |
1. spacer 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN830257 (Lactobacillus phage JNU_P11, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agcccttcgaactggcttatttctaaaatt CRISPR spacer agcccttcgaactggcttatttctaaaatt Protospacer ******************************
2. spacer 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_024206 (Lactobacillus phage phi jlb1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agcccttcgaactggcttatttctaaaatt CRISPR spacer agcccttcgaactggcttatttctaaaatt Protospacer ******************************
3. spacer 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to DQ320509 (Lactobacillus phage KC5a, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agcccttcgaactggcttatttctaaaatt CRISPR spacer agcccttcgaactggcttatttctaaaatt Protospacer ******************************
4. spacer 1.16|1160430|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN830256 (Lactobacillus phage JNU_P7, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagcagtctttatggctaatccgtttatgg CRISPR spacer aagcagtctttatggctaatccgtttatgg Protospacer ******************************
5. spacer 1.19|1160628|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP008840 (Lactobacillus gasseri DSM 14869 plasmid pEB01-2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttacctgaatagtaacatttcgaagcatta CRISPR spacer ttacctgaatagtaacatttcgaagcatta Protospacer ******************************
6. spacer 1.19|1160628|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP011405 (Lactobacillus salivarius str. Ren plasmid pR2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ttacctgaatagtaacatttcgaagcatta CRISPR spacer ttacctgaatagtaacattttgaagcatta Protospacer ********************.*********
7. spacer 1.19|1160628|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_006530 (Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pSF118-44, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ttacctgaatagtaacatttcgaagcatta CRISPR spacer ttacctgaatagtaacattttgaagcatta Protospacer ********************.*********
8. spacer 1.19|1160628|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011352 (Lactobacillus paracasei plasmid plca36, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ttacctgaatagtaacatttcgaagcatta CRISPR spacer ttacctgaatagtaacattttgaagcatta Protospacer ********************.*********
9. spacer 1.19|1160628|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP002035 (Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ttacctgaatagtaacatttcgaagcatta CRISPR spacer ttacctgaatagtaacattttgaagcatta Protospacer ********************.*********
10. spacer 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018878 (Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_502p, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
--agattcagcaactgattttttcttttcttc CRISPR spacer cttgatt--gcaaatgattttttcttttcatc Protospacer **** **** *************** **
11. spacer 1.5|1159704|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MW117965 (Synechococcus phage S-H38, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
agatgttaatacacaaggttttaaatatgt- CRISPR spacer agatgttaatacacatgg-tttgaatttata Protospacer *************** ** ***.*** *.*
12. spacer 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693441 (Marine virus AFVG_25M481, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
agattcagcaactgattttttcttttcttc CRISPR spacer ccatctagcaattgattgtttcttttcttc Protospacer **..*****.***** ************
13. spacer 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_018983 (Borrelia burgdorferi 297 plasmid 297_cp26, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cgtgattcttctcgtattttaattttctat CRISPR spacer tgagattcttctattattttaatttttttt Protospacer .* ********* ************.* *
14. spacer 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_017401 (Borreliella burgdorferi N40 plasmid N40_cp26, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cgtgattcttctcgtattttaattttctat CRISPR spacer tgagattcttctattattttaatttttttt Protospacer .* ********* ************.* *
15. spacer 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_017395 (Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp26, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cgtgattcttctcgtattttaattttctat CRISPR spacer tgagattcttctattattttaatttttttt Protospacer .* ********* ************.* *
16. spacer 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP031398 (Borreliella burgdorferi strain MM1 plasmid plsm_cp26, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cgtgattcttctcgtattttaattttctat CRISPR spacer tgagattcttctattattttaatttttttt Protospacer .* ********* ************.* *
17. spacer 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011724 (Borreliella burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp26, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cgtgattcttctcgtattttaattttctat CRISPR spacer tgagattcttctattattttaatttttttt Protospacer .* ********* ************.* *
18. spacer 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_001903 (Borreliella burgdorferi B31 plasmid cp26, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cgtgattcttctcgtattttaattttctat CRISPR spacer tgagattcttctattattttaatttttttt Protospacer .* ********* ************.* *
19. spacer 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019755 (Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_cp26, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cgtgattcttctcgtattttaattttctat CRISPR spacer tgagattcttctattattttaatttttttt Protospacer .* ********* ************.* *
20. spacer 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP017202 (Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_cp26, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cgtgattcttctcgtattttaattttctat CRISPR spacer tgagattcttctattattttaatttttttt Protospacer .* ********* ************.* *
21. spacer 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019225 (Borrelia burgdorferi plasmid cp26, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cgtgattcttctcgtattttaattttctat CRISPR spacer tgagattcttctattattttaatttttttt Protospacer .* ********* ************.* *
22. spacer 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR214939 (Mycoplasma salivarium strain NCTC10113 plasmid 2) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
agattcagcaactgattttttcttttcttc CRISPR spacer agattcagcaactgattttttaccatcaag Protospacer ********************* .. **
23. spacer 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448700 (Streptococcus phage Javan191, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
agattcagcaactgattttttcttttcttc CRISPR spacer aaattcatcaattgattttttctttctgta Protospacer *.***** ***.*************.. *
24. spacer 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT matches to AP014363 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S41-C2, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
agattcagcaactgattttttcttttcttc CRISPR spacer atcgactgcaactggttttttattttcttc Protospacer * * *******.****** ********
25. spacer 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694760 (Marine virus AFVG_250M661, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
agattcagcaactgattttttcttttcttc CRISPR spacer agtagcagctactgattttttctttcctgt Protospacer ** **** ***************.** .
26. spacer 1.5|1159704|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AY939844 (Prochlorococcus phage P-SSM2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
agatgttaatacacaaggttttaaatatgt CRISPR spacer tgatgttaatgcacaaggtttaaatgaatt Protospacer *********.********** ** * *
27. spacer 1.5|1159704|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to HQ632825 (Prochlorococcus phage P-SSM5 genomic sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
agatgttaatacacaaggttttaaatatgt CRISPR spacer tgatgttaatgcacaaggtttaaatgaatt Protospacer *********.********** ** * *
28. spacer 1.5|1159704|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH319733 (Marine virus AG-345-E02 Ga0172268_13 genomic sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
agatgttaatacacaaggttttaaatatgt CRISPR spacer tgatgttaatgcacaaggtttaaatgaatt Protospacer *********.********** ** * *
29. spacer 2.1|1252377|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder matches to JQ768459 (Pseudomonas phage Lu11, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tagcggcaattgtttctggtatggttggaa CRISPR spacer aaacggcaattatttctggtatggtggagc Protospacer *.********.************* *..
30. spacer 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK493321 (Cyanophage S-RIM4 isolate RW_11_0999, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
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31. spacer 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_047882 (Vibrio phage JSF12, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
agattcagcaactgattttttcttttcttc CRISPR spacer gtttgttgctactgattttttcatttcttc Protospacer . * . ** ************ *******
32. spacer 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH107246 (Synechococcus phage S-B64, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
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33. spacer 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT002874 (Pseudoalteromonas phage XC, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
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34. spacer 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT matches to KY883654 (Vibrio phage JSF10, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
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35. spacer 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT matches to KY945241 (Synechococcus phage S-H35, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
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36. spacer 1.11|1160100|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP023509 (Rothia mucilaginosa strain FDAARGOS_369 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
-ttagcacgggtagcctcagtatcaattttc CRISPR spacer actggtg-aggtggcctcagtatcaatttta Protospacer .*.*.. .***.*****************
37. spacer 1.16|1160430|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP036405 (Komagataeibacter saccharivorans strain JH1 plasmid p221732, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
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38. spacer 1.1|1159440|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT matches to KY945241 (Synechococcus phage S-H35, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
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39. spacer 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP040051 (Acinetobacter baumannii strain VB16141 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
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40. spacer 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK531540 (Acinetobacter baumannii strain MC75 plasmid pMC75.1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
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41. spacer 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP012007 (Acinetobacter baumannii strain Ab04-mff plasmid pAB04-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
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42. spacer 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK531536 (Acinetobacter baumannii strain MC1 plasmid pMC1.1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
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43. spacer 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP040054 (Acinetobacter baumannii strain VB35179 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
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44. spacer 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP050386 (Acinetobacter baumannii strain VB82 plasmid pVB82_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
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45. spacer 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP020596 (Acinetobacter baumannii strain HWBA8 plasmid pHWBA8_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
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46. spacer 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP012005 (Acinetobacter baumannii strain ATCC 17978-mff plasmid pAB3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
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47. spacer 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF399199 (Acinetobacter baumannii strain D46 plasmid pD46-4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
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48. spacer 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_AP014650 (Acinetobacter baumannii strain IOMTU433 plasmid pIOMTU433, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
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49. spacer 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP027531 (Acinetobacter baumannii strain AR_0088 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
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50. spacer 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP050416 (Acinetobacter baumannii strain PM193665 plasmid pPM193665_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
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51. spacer 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP050426 (Acinetobacter baumannii strain PM194188 plasmid pPM194122_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
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52. spacer 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP050433 (Acinetobacter baumannii strain PM194229 plasmid pPM194229_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
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53. spacer 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LT605060 (Acinetobacter calcoaceticus strain NCTC7364 genome assembly, plasmid: 2) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
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54. spacer 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KU744946 (Acinetobacter baumannii strain A297 (RUH875) plasmid pA297-3 clone Global clone 1 (GC1), complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
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55. spacer 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP040260 (Acinetobacter baumannii strain P7774 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
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56. spacer 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KT779035 (Acinetobacter baumannii strain D4 plasmid pD4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
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57. spacer 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP022285 (Acinetobacter baumannii strain 7804 plasmid pAba7804b, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
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58. spacer 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MK323043 (Acinetobacter baumannii strain Acb-45063 plasmid pAb45063_b, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
agcccttcgaactggcttatttctaaaatt CRISPR spacer catttttcgaaccggcttatttccaaaaag Protospacer ....*******.**********.****
59. spacer 1.2|1159506|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP033562 (Acinetobacter nosocomialis strain 2010S01-197 plasmid p2010S01-197-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
agcccttcgaactggcttatttctaaaatt CRISPR spacer catttttcgaaccggcttatttccaaaaag Protospacer ....*******.**********.****
60. spacer 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK605244 (Nodularia phage vB_NspS-kac65v162, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
cgtgattcttctcgtattttaattttctat CRISPR spacer ttaagttcttctagtattttaagtttcttg Protospacer . ..******* ********* *****
61. spacer 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KU230356 (Bacteriophage vB_NpeS-2AV2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
cgtgattcttctcgtattttaattttctat CRISPR spacer ttaagttcttctagtattttaagtttcttg Protospacer . ..******* ********* *****
62. spacer 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK605242 (Nodularia phage vB_NspS-kac65v151, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
cgtgattcttctcgtattttaattttctat CRISPR spacer ttaagttcttctagtattttaagtttcttg Protospacer . ..******* ********* *****
63. spacer 1.17|1160496|30|NZ_CP040500|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK605243 (Nodularia phage vB_NspS-kac65v161, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
605225 : 699073
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP040500|605225:699073|DBSCAN-SWA TATGAAAAATTTTAATACATTATCATTTGAAACATTGGCTAACATAGTTGGTGGGAGAAATAATTGGGCTGCTAATATAGGTGGAGTAGGTGGAGCGACAGTCGCTGGATGGGCTCTTGGAAATGCAGTTTGCGGTCCTGCTTGTGGCTTTGTTGGAGAACACTATGTTCCAATAGCATGGGCTGGCGTAACGGCAGCTACTGGTGGATTCGGAAAGATAAGAAAGTAGGGAATTAATATGGCTTTAAAAACATTAGAAAAACATGAATTAAGAAATGTAATGGGTGGAAACAAGTGGGGGAATGCTGTAATAGGAGCTGCTACGGGAGCTACTCGCGGAGTAAGTTGGTGCAGAGGATTCGGACCATGGGGAATGACTGCCTGTGGCTTAGGAGGTGCTGCAATTGGAGGATATCTGGGATATAAGAGTAATTAATTTATATAGAGATTTATGTTATTCTTTGTAACTATTATTAATGTAATACTTTTTTTAGGTAACTTGTATCAAACGGGCTTTAATTATTTTAACTTTAATCAATTGCAAGCACTTTTACTAACTATTTTTCTTATTGTTACTGTAATAGTTATCGCTATTAATAAAAAATTAGAAAGAGGTTATGATCTTTCTTTTTTTGCACTTTATTTGTATTGGCCAATTTATGTTTTTGAAGTTAAATTATATAATTCAACAAATTATAAAGATGGAATAGAATTTTGGGTTTATTTCGTACTAATTTTGGCCATATCGTTTGTAATAGGAAAAATATTAAAAAGAATCATAAGAAAGTAATAATAAAACTGAAAGTACTAAATTAGTTTTTGAATGACTGATTTAGTGCTTTTTCTACTTTCTCCTTTATTTAAGTAAATATGAAAATCTAATAGATTTACTTAATGTTAAGCTTATTTTATAAAATTTTGAAAGAGATGGGATTACATGGAATTAAATAAGAAAATCACTACATTAATGTATCTGGGAAAAACTCAGAAATTAAGAAATGCTATTAAATCTTGATATTAATAAACCTTGGTTTAATAACGTTTTTCTTTTGAGTAAAAGTCCAGAATTAACTAAAAATAGACTTCTTTCCCAGACACTACTTATCGTTTTGTTTGCTAAGCCAGTAAATGCGCAAGAAGTATAAAATACATAACTTCAAGAAATAAAAATAGAAAAGTATGCTGATGTATCACCTCAGAAATATGAAAACAATGTTTGAGATCAAATATGACTCAAGTTAAGGATTTAATTAGTAAACGCGATAATAAAGAATATTTGCTTTATATTGGACGTCCAACTTGTTATTACTGTCGTGAATTTTTTCAGCATTAAAGGAATTTAATCGGGTAACAGGTGAAAGTCATTATATTTTGATATTTGATGCAAGGTAATGCCACAATAGTGACAGTACGCAGTACATATTTTGAATATTTTTTAGATAAGGTATTGAATAAGCGGTAAATTTGATAGAATAAAACGACATTAAATTATATTATGTGAGGATAAAAAGATGAACGAAACCAAATTAAAAGAGATGTTAGATAAGATTAAAGCAAACTCTGATATTGCAACTGATCCAGAAGCTCAAAAATTGATTGACACCGCTATTGAAAAATTGGATAAGGAAATTAATTTACAAAAGGTAGTATTTAATCTAAAGCAAGATATTAATTTGTATTCTGTAGCACATGGATTCAAATTGCCTGAAACTTTGACCAAGTTGCAACTTTTATTAGATAAAGATCTCGACAAGTGGGCTGGGGCTGGTGAAACTTTGTCATTGACTAATTTTTAGATAAATCAGTATTCAAGCACTAGGCACTATTGAACTTGGCACGTAGTAAATAAATACCAAATTTGTCATAAAAAAGACCAAATAGGTCTTTTTTATTTTTTGCCAATTTTTAAATGCTAAAATCATAGCAAGATCTTTACAGGAGAAGAAAGAAAATGAATGATAAACAGCTTATTTTTTATTCTATTCTTAGCGGAATTTTAATTAGTATTCTTGCTAGCTTGGGTGATCTTGCAGTTGGAAGTCAGCTAACTTTTTGCATAATTTTAGGGAATATCCTATGGGGAATAATCTTTGCCTATTTAGTATTTGAATTTATAAAAAGAATGAAAAATAAGAAATTAAAAGTATAAAGGAAGACTACCAATGAAATGGATTGAAACAATTAAAAATAAGGAAACAAATACGGAAGAATGGATAGTGGTTGTACTAAGCTTAATCTTTGCAATTTTTGTAAGAAAAATATTCTTCTATTTCGTAAATATTGATAGTGTAGTCCTAAACTTTGCAATCGGAATTACTAGTATGTGGATTTTCTCAATTACTTATTATTATATGAAAGACAAGTTGCAACAACGCTTAAAGAATAGAAAATAAGAAATATAGGTATGAGCAAAAGAAGAACTTATTAAAAAAAGTAAATAATTTATATATCTAAATACCAAATTGGTAATATATTAGGTCAAATCAGTCATTTTCAAGTTTTACAAAAAATGATAGTAAAATTAATGAATAAATGATAATATTTGGAAACAAAACTACTCTTTGGAGGACAGAAATATGAAAAATGAATTGGAACAAGTGCTGAATTACTTTATCTCACTTGCTAAGACTCATTATGATAGGAAAGGCAATGAATACTTACTAGAACAACTTGAAGTTGCCTTAGACAAGTTAGAACATAATGTTCAAGATGAAGTAGATGAAGCCCGTGCAACTTATCAAAATATAAATACTATTTGTCTTACTAACCATCTTCACTTGGAAACAGATGAAGAAGCATTACTTGAAAAGATTAAAAAAATTTCAATGAGTAAAGGCTGGCTTGGTGGCTTAAACAGCTGGAATACAACTAATACTTGGCCTGGAAGATAAGAAAAACATAAATATCAAAAGAAAAATTTAACAAAGAATGAAGAGTAGTCGAAGGCTACTCTTTTTTTAATATATTAACTTTATGTGCATATTTTTTAAAAGTGAACTAAAATGGATCTGTAAAAAGGAATAGAAGTGATAACTTTGACTAAAAATGATGAAAACGATGAGATAATTAAGGTTGCTCAATTATCTGTTGAAGATGCACTGAAGGAATTAAATACTAGTCAAAGCGGCTTAACAATTGATGAAGTTCATACATTGCAGCAAAAATATGGAAAGAATATTTTTGCTAAAGCAAAACAGGAGCCACTTTGGAAGAAATTTTTAGCTAATTTTACTAATTTAATGGCGATTCTGCTTTGGGTAGCAGGTATTATTGCTTTTTGTGCTGATTTAGTGCAATTAGGAATTGCTATTTGGGCAGTAAATATCATTAATGGTATTTTTAGTTTTTGGCAAGAATTTCAAGCTGATAAGGCAACTGAGGCCTTAGCGAATATGCTTCCCTCTTATACTCGTGTTATAAGAAATGGTAAGGAAGAGAAGATTTTAGCTAAAGACTTAGTTCCTGGCGATATCGTTAAGCTTGAAGAGGGAGACGATATTCCAGCTGATATTCGTGTAATTGCAGCTACAACGGCTCAAGCAGATCAGTCCTCACTGACTGGTGAAGTGAACCCAGTTCATAAAGGGGCACATGCTGTTGAAGACGTTAAGAAGAAAAATCATGCTGATCTTAATAACATGATTTTTTCTGGTACTAATATGATGAAGGGCAACATTACCGGTGTTGTGGTTAAAACAGGTATGAATACTGATTTCGGTAAGATTGCTGAATTAACTCAAAACGTTGCTCAACAAAAGAGTCCGCTTGAAAAGGAACTAGATACTTTAACTAAGCAGATTTCAATTTTGGCAATTTCAATTGGAATTATTTTCTTCCTAATTGCTACTTTCTTTGTTCACTATCCTTTAGTAAAGGGTTTTGTTTTTGCCTTAGGAATGATTGTAGCCTTTATTCCAGAAGGATTAGAGCCAACAGTTACTTTATCTTTAGCTGGTGCGGTTCAAAGAATGGCAAAAAAGCACGCTCTAATTAAGCGTTTATCTAGCGTAGAAACGTTAGGTTCGACATCAGTGATTTGTTCTGATAAAACAGGAACTTTAACTAAGAATGAAATGACAGTTAAGGAACTTTGGACACTAGAAAATAGCTATCATGTGTCTGGTGAAGGCTATGCTGTTCGAGGCCATATTAAAGAAGGACCAAAGCATGTTTTTGCTAAAGATAACGATACTTTAAAAGAAGTATTACTTGGTGGCGTTTTTGCAGACAACGCGAGAATTCAAGCACCAGATAAAAAGCATGTCCGTTATCAAATCTTGGGCGATCCAACTGAAGCATGCCTTGAAGTGGTTGCTCGAAAAGGTAAAGTGGATGTTGAAGCTGAATTAAAAAATACGCCGCGAGTTAAAGAACTACCATTTGATTCAAGTAGAAAAATGATGACGGTAATTCAAAGCTCTGATGGCACACACCGTTTTAATACCTATACTAAGGGTGCTCCAAATTGTGTGGTTGATAAGTGTACTTCTTATTTAGAACACGGTGAGATAAAACCTATTACCCAGGAAATAAAAGATAAGATTATGCGAGCTAATGATGGCTATGCGAAGGATGGACTGCGTGTTTTAGCAGTTGCGGGACGTAATCTTGATCAAAAGATGATGAACAATTTAGACTCAGCAACGATTGAGACAGTTGAAGAAAATCTTACTTTCTTAGGTTTAACAGTCATGATGGATCCACCAAGAGCAGAAGTATATAAAGCTGCTCGTGAGTGTCGCAAAGCTGGAATTAAGGTAACGATGGTTACCGGTGATTATGGTTTAACTGCTAAAAGTATTGCGCGCCAGATTGGTTTGACCGATCCAGATAAGCCTTTAACTGTAATTACAGGGGATGCTTTAAAGACAATGCCAGATGATGAATTAAGACATTATCTTGAAGGTGAGGTTGTCTTTGCTAGAATGGCACCTGAGCAAAAATACCGTGTCGTTTCTATGTATGAAAAAATGGGCAATATTGTTGCTGCTACCGGTGAC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109 | Lactobacillus_phage(62.07%) | terminase,plate,integrase,transposase,tail,holin,portal,protease,bacteriocin | attL 659376:659435|attR 697037:697126 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1298077 : 1334700
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP040500|1298077:1334700|DBSCAN-SWA 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47 | Lactobacillus_phage(50.0%) | terminase,integrase,tail,head,holin,portal | attL 1297857:1297875|attR 1334785:1334803 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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