Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP030046 | Enterococcus faecalis strain C54 plasmid pC54, complete sequence | 1 crisprs | NA | 0 | 2 | 0 | 0 |
NZ_CP030045 | Enterococcus faecalis strain C54 chromosome, complete genome | 2 crisprs | csa3,cas3,cas14j,DinG,DEDDh | 0 | 3 | 10 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP030046_1 | 43865-43996 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP030046_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP030046_1
>1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder AAGTACTGGTATTATTGGATTCTTCTGGAC >1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder AAACGCCGATTTTATCATGTTTATCCGAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP030046_1
The CRISPR arrays of NZ_CP030046_1 >merge|NZ_CP030046|1|43865-43996|CRISPRCasFinder GTTGGTTTTTCCCACTTTCGAACAAAGTACTGGTATTATTGGATTCTTCTGGACGTTGGTTTTTCCCACTTTCGAAAGAAACGCCGATTTTATCATGTTTATCCGAAGGTTGGTTTTTCCCACTTTCGGGAA >NZ_CP030046|1|1|43865-43996|CRISPRCasFinder GTTGGTTTTTCCCACTTTCGAACA AAGTACTGGTATTATTGGATTCTTCTGGAC GTTGGTTTTTCCCACTTTCGAAAG AAACGCCGATTTTATCATGTTTATCCGAAG GTTGGTTTTTCCCACTTTCGGGAA
>NZ_CP030046.1|WP_000191454.1|42328_43009_+|IS6-like-element-ISEnfa1-family-transposase MTQFKGKQFQKDVIIVAVGYYLRYNLSYREVQEILYDRGIHVCHTTIYRWVQEYGKILYQIWKKKNKQSFYSWKMDETYIKIKGKWHYLYRAIDVDGLTLDIWLRKKRDTQAAYAFLKRLKNQFGEPKVLVTDKAPSIKSAFRKLQKNGLYITTEHRTIKYLNNLIEQDHRPIKRRNKFYQSLRTASTTIKGMEAIRGIYKKSRKEGSLFGFSVCTEIKGLLGIPA >NZ_CP030046.1|WP_001808810.1|42125_42290_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MYQDERKLDFKPLGIAIKKAREAKGWTQEYLAQLVDLTPRSIMGSVAKFPISSF >NZ_CP030046.1|WP_000384569.1|41762_41960_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MDYISVKAASEKWGISERRIQKLCEENRIDGTEKFGRAWMIPKDAEKPVDGRMKTRNKQEENHGI >NZ_CP030046.1|WP_000395511.1|41158_41773_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MEFNEKLQQLRTGKNLTQEQLAEQLYVSRTAISKWESGKGYPNIESLKCISKFFSVTIDELLSGEELITLAETENRSNLKKIYNYIYGILDMMAVAFIFLPLYGNSVGGYVYAVNLLSFTATTPFNLAVYWSAFAALIVIGIAKIILTHLDKETWGGIATKCSLGLTALAICFLAAAREPYITALMFLLFVAKIVVWIKQNGTK >NZ_CP030046.1|WP_104765562.1|40058_40976_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MDYIIETENLTKRYGTATVVDKVNLHVPTGKIYGLLGRNGAGKTTAMKMMLQLAFPTEGTVRLFGTNYKENIHTLYSKVGSIIETPGFYSNLTGYENLQILAKLRGGVSKSGVEKALEVVGLHKEKRKVFSDYSLGMKQRLGIAAAIMHEPELLILDEPINGLDPIGIVEIRSLLSELSHNHGITIFISSHVLSEIEQIADIIGVMHEGHLVEEVNISELHKRNRKYIQFDLSDSEIAGKILESHYHMTDFTVQDGTVRIYDFSQSVGEINREFARNGLLVTRIDDSEENLEDYFSKLIGGGGIA >NZ_CP030046.1|WP_000933358.1|39316_40066_-|ABC-transporter-permease-subunit MLNLISCELLKLKRSKMVLISVAGVLSTPLLMLIEALQTHFDKPEIIFTLSDIYSDSVLYIMLLVNIMIYVAIAAYLFSREYTESTLKTILPIPISRTKLLIGKFCTLLLWIVMLTLVTWAGIFIACGLYHAVFTLEGYSLLVAIVWLPKFLFGSILMFLTVSPFVFVAMKTKGFVAPMIGSAVIVMGSAALSNQEWGALYPWTATYFLVQGKLQSTGYPTLLSVSIIILVSAVGFLMTFHHFKKEDLK >NZ_CP030046.1|WP_128713131.1|38486_39317_-|undecaprenyl-diphosphate-phosphatase MVLDFIEILKVIFLGIVEGITEWLPISSTGHMILADKFITLNMSEAFKEMFFVVIQLGAILAVVVMFWNKMFPFQLKDKSQPLVKKDTFSLWFKVAVACVPSAIMGILFDDYLDAYLQTPIVISIMLIFYGLLFILIENWNKKRTPTTMALSDISYKTAILIGAFQVLSLIPGTSRSGATIIGALLLGVSRVAAAEFTFFLAVPTMLGASAFKLLKFGFDFTSAELLALVLGMAVAFAVSVLVIKFLMNFIKKHDFKVFGWYRIVLGILVVLTTVM >NZ_CP030046.1|WP_161978276.1|37609_38290_+|IS6-like-element-ISEnfa1-family-transposase MTQFKGKQFQKDVIIVAVGYYLRYNLSYREVQEILYDRGIHVCHTTIYRWVQEYGKILYQIWKKKNKQSFYSWKMDETYIKIKGKWHYLYRAIDVDGLTLDIWLRKKRDTQAAYAFLKRLKNQFGEPKVLVTDKAPSIKSAFRKLQKNGLYITTEHRTIKYLNNLIEQDHRSIKRRNKFYQSLRTASTTIKGMEAIRGIYKKSRKEGSLFGFSVCTEIKGLLGIPA >NZ_CP030046.1|WP_000084745.1|36759_37152_-|NimC/NimA-family-protein MSQVVDFLNEAKTFYFATVEGDQPRVRPFNAAMERNGKVYLGTTNQKKVYQQLLANSKVEVSGMAKGKWIRLTGEAVIDDTVEAREAMLEANPPLRDWYSADDGKFTVFYLKNMQAVLYSFTGDPEILDN >NZ_CP030046.1|WP_013646119.1|35891_36572_-|IS6-like-element-IS1216-family-transposase MNHFKGKQFQQDVIIVAVGYYLRYNLSYREVQEILYDRGINVSHTTIYRWVQEYGKLLYQIWKKKNKKSFYSWKMDETYIKIKGKWHYLYRAIDADGLTLDIWLRKKRDTQAAYAFLKRLVKQFDEPKVVVTDKAPSITSAFKKLKEYGFYQGTEHRTIKYLNNLIEQDHRPVKRRNKFYRSLRTASPTIKGMEAIRGLYKKTRKEGTLFGFSVCTEIKVLLGIPA >NZ_CP030046.1|WP_128713114.1|44679_45036_-|hypothetical-protein MSNNRGKSAAERLLGAGKEDPNPTKATTSNEKELKTTHEHIVMNKKNIEKLIKQQGNSKRNADSIRINPILANALKYWTSIGEPEKSKPDVIEETLLKSIPEEYLIKGYEMAKKQNKI >NZ_CP030046.1|WP_002360664.1|45028_45811_-|ParA-family-protein MARIISVANQKGGVSKTTTSINLGAALHFTFNKSVLVIDMDPQGNATDNFGFDIDGTNVPTIYEVLKDEASITEAILNYKGIDVIPADIALSSAEREFTQVGSEHRLKRVLQPIEENYDYIIIDCPPSLGILTVNAFTVSDEIIIPVEAAYFSLKGLVKLNETIETVKEYTNERLIIRGVLFTKYNERFNISKEMNKTANQISDALNVNIFDTYIRRTITVDEAQAAGSDLISFNKTSTAEDDYIQFTKEFLEKVGDLNE >NZ_CP030046.1|WP_002360665.1|46064_46361_-|replication-control-protein-PrgN MPRKTFVYPHPINAYIIKQLGITVEEFCELHAFSQGTVSSWITRNKKIETLPISFIYSLSLSASQTMDQVYSDLLKLQDDYLLHLERHRRTKKIIDEE >NZ_CP030046.1|WP_002360667.1|46601_46712_-|type-I-toxin-antitoxin-system-Fst-family-toxin MLFVKDLMSLVIAPIFVGLVLEMISRVLDEEDDNRK >NZ_CP030046.1|WP_002360672.1|46962_47313_-|hypothetical-protein MKQNRKEFSSYFSRSIKQNKPLYLLLMSSETNPFPRPVIGTFRGYAEENKIIIGEDSYSIEEIDFVCMYRHSSRIKQEERVNSNPFQGLVSPTLSKKEQKKLDEYFSDWGFRNEGI >NZ_CP030046.1|WP_138807346.1|47309_48638_-|Y-family-DNA-polymerase MNLTFDYTKEPSRDVLCIDVKSFYASVECVERGLDPLKTMLVVMSNSENSGGLVLAASPMAKKVLGISNVTRKNEVPDHPNLIIVSPRMKLYMKKNQEINNLYKRFVSDEDHSVFSVDESFLDVTASLTYFKCDTAYKLAKIIQRVIYNHMGLYVTIGIGENPLLAKLALDNEAKNAPGFVAEWRYEDVPKKVWPISPLTEFCGIGNRMAARLKKLGIRSIYDLAHIEPYMLKERFGIMGLQLYAHSWGIDRSFLGQKAGRPTEKSFGNSQVLPKDYANKEQIKLVLKELSDQVASRLRMASCQTTCVSLFVGYSKGQTDKYGQTGWRRQMKVKPSNNTKVLTEHVLRLFEENYAPGVDVRNLGVSYGRLVWNKNLQLDLFSVPEEQIHETDMYFLIDKIRQKFGFKALIHASSLMEGATAISRASLVGGHAGGTVGLGTTK >NZ_CP030046.1|WP_128713120.1|49066_49369_-|hypothetical-protein MPVNKNGLPFYLDRKLDVIRFGVDPYNHVKEQQLFNSPVKTEKPNKKEGFIEKESESLTQSGYKIVVDTVTGVNYLESHRGGITPLLDETGKVCIDKISK >NZ_CP030046.1|WP_002390466.1|49389_49590_-|hypothetical-protein MNFGYLNFGTKDAVLVIAIFIILILTVLFRWSALEFVFSSGAVGIAFFAGNMKQDKRIADRQNKKS >NZ_CP030046.1|WP_002358271.1|49658_49883_-|hypothetical-protein MVVRKTYDHWGIEISTWNKSNIVTFIDCDCGQLAKRELGKYNQYKCDSCNKEYKLYQGNYIAIDEKINEVAQND >NZ_CP030046.1|WP_002390465.1|49876_50191_-|hypothetical-protein MRNNSGVVIMENREKIIQLLKNPLVTGYGIEMMSNGRLYSANFQRYRNRMKKEENPMIIFDTMTEKVEKVFLELAEEVIRTNPKTKQEFKDMIKEYSYKEDNKW |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP030046_1 | 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43889-43918 | 30 | NZ_KY513281 | Enterococcus faecalis strain 6742 plasmid p6742_2, complete sequence | 5073-5102 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43889-43918 | 30 | NC_004671 | Enterococcus faecalis V583 plasmid pTEF2, complete sequence | 602-631 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43889-43918 | 30 | NZ_CP015885 | Enterococcus faecalis strain sorialis plasmid Efsorialis-p2, complete sequence | 515-544 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43889-43918 | 30 | NZ_CP040897 | Enterococcus faecalis strain HA-1 plasmid punnamed | 33709-33738 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43889-43918 | 30 | NZ_CP046109 | Enterococcus faecalis strain 133170041-3 plasmid pAD1, complete sequence | 503-532 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43889-43918 | 30 | NZ_CP049777 | Enterococcus faecalis strain ES-1 plasmid unnamed2, complete sequence | 503-532 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43889-43918 | 30 | NZ_CP028837 | Enterococcus faecalis strain FC plasmid unnamed2, complete sequence | 5526-5555 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43889-43918 | 30 | NC_011642 | Enterococcus faecalis plasmid pMG2200, complete sequence | 83505-83534 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43889-43918 | 30 | LC499744 | Enterococcus faecalis S7316 plasmid pS7316optrA DNA, complete sequence | 9536-9565 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43889-43918 | 30 | NZ_CP030043 | Enterococcus faecalis strain C25 plasmid pC25-1, complete sequence | 827-856 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43889-43918 | 30 | CP002494 | Enterococcus faecalis 62 plasmid EF62pC, complete sequence | 7643-7672 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43889-43918 | 30 | MH830362 | Enterococcus faecalis plasmid p4, complete sequence | 66171-66200 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43889-43918 | 30 | NZ_CP031028 | Enterococcus faecalis strain TY1 isolate flatfish plasmid pDEF-1, complete sequence | 12176-12205 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43889-43918 | 30 | NZ_CP019514 | Enterococcus faecalis strain CLB21560 plasmid pB, complete sequence | 60906-60935 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43889-43918 | 30 | NZ_CP036248 | Enterococcus faecalis R712 plasmid pR712_02, complete sequence | 92754-92783 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43889-43918 | 30 | NZ_CP030046 | Enterococcus faecalis strain C54 plasmid pC54, complete sequence | 43889-43918 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43889-43918 | 30 | NZ_CP028284 | Enterococcus faecalis strain FDAARGOS_324 plasmid unnamed2, complete sequence | 4944-4973 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43943-43972 | 30 | NZ_CP030046 | Enterococcus faecalis strain C54 plasmid pC54, complete sequence | 43943-43972 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43943-43972 | 30 | NZ_CP028284 | Enterococcus faecalis strain FDAARGOS_324 plasmid unnamed2, complete sequence | 4998-5027 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43943-43972 | 30 | NC_004671 | Enterococcus faecalis V583 plasmid pTEF2, complete sequence | 548-577 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43943-43972 | 30 | NZ_CP015885 | Enterococcus faecalis strain sorialis plasmid Efsorialis-p2, complete sequence | 461-490 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43943-43972 | 30 | NZ_CP040897 | Enterococcus faecalis strain HA-1 plasmid punnamed | 33655-33684 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43943-43972 | 30 | NZ_CP046109 | Enterococcus faecalis strain 133170041-3 plasmid pAD1, complete sequence | 449-478 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43943-43972 | 30 | NZ_CP028837 | Enterococcus faecalis strain FC plasmid unnamed2, complete sequence | 5472-5501 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43943-43972 | 30 | NC_011642 | Enterococcus faecalis plasmid pMG2200, complete sequence | 83451-83480 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43943-43972 | 30 | NZ_CP030043 | Enterococcus faecalis strain C25 plasmid pC25-1, complete sequence | 773-802 | 0 | 1.0 |
NZ_CP030046_1 | 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43889-43918 | 30 | NC_013533 | Enterococcus faecalis plasmid pBEE99, complete sequence | 748-777 | 1 | 0.967 |
NZ_CP030046_1 | 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43943-43972 | 30 | CP002494 | Enterococcus faecalis 62 plasmid EF62pC, complete sequence | 7697-7726 | 1 | 0.967 |
NZ_CP030046_1 | 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43943-43972 | 30 | MH830362 | Enterococcus faecalis plasmid p4, complete sequence | 66225-66254 | 1 | 0.967 |
NZ_CP030046_1 | 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43943-43972 | 30 | NZ_CP031028 | Enterococcus faecalis strain TY1 isolate flatfish plasmid pDEF-1, complete sequence | 12230-12259 | 1 | 0.967 |
NZ_CP030046_1 | 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43943-43972 | 30 | NZ_CP019514 | Enterococcus faecalis strain CLB21560 plasmid pB, complete sequence | 60960-60989 | 1 | 0.967 |
NZ_CP030046_1 | 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43943-43972 | 30 | NZ_CP036248 | Enterococcus faecalis R712 plasmid pR712_02, complete sequence | 92808-92837 | 1 | 0.967 |
NZ_CP030046_1 | 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43943-43972 | 30 | NZ_CP049777 | Enterococcus faecalis strain ES-1 plasmid unnamed2, complete sequence | 449-478 | 1 | 0.967 |
NZ_CP030046_1 | 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43943-43972 | 30 | NZ_KY513281 | Enterococcus faecalis strain 6742 plasmid p6742_2, complete sequence | 5019-5048 | 2 | 0.933 |
NZ_CP030046_1 | 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43943-43972 | 30 | NC_013533 | Enterococcus faecalis plasmid pBEE99, complete sequence | 694-723 | 2 | 0.933 |
NZ_CP030046_1 | 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43943-43972 | 30 | LC499744 | Enterococcus faecalis S7316 plasmid pS7316optrA DNA, complete sequence | 9482-9511 | 2 | 0.933 |
NZ_CP030046_1 | 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43889-43918 | 30 | NC_023573 | Staphylococcus phage phiSA012 DNA, complete genome | 31963-31992 | 6 | 0.8 |
NZ_CP030046_1 | 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43889-43918 | 30 | MT711976 | Streptomyces phage Coruscant, complete genome | 87401-87430 | 7 | 0.767 |
NZ_CP030046_1 | 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43943-43972 | 30 | NZ_CP022523 | Pseudoalteromonas sp. NC201 plasmid pNC201, complete sequence | 586542-586571 | 7 | 0.767 |
NZ_CP030046_1 | 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder | 43889-43918 | 30 | JQ660954 | Clostridium phage PhiS63, complete genome | 22890-22919 | 9 | 0.7 |
1. spacer 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NZ_KY513281 (Enterococcus faecalis strain 6742 plasmid p6742_2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagtactggtattattggattcttctggac CRISPR spacer aagtactggtattattggattcttctggac Protospacer ******************************
2. spacer 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NC_004671 (Enterococcus faecalis V583 plasmid pTEF2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagtactggtattattggattcttctggac CRISPR spacer aagtactggtattattggattcttctggac Protospacer ******************************
3. spacer 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015885 (Enterococcus faecalis strain sorialis plasmid Efsorialis-p2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagtactggtattattggattcttctggac CRISPR spacer aagtactggtattattggattcttctggac Protospacer ******************************
4. spacer 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040897 (Enterococcus faecalis strain HA-1 plasmid punnamed) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagtactggtattattggattcttctggac CRISPR spacer aagtactggtattattggattcttctggac Protospacer ******************************
5. spacer 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP046109 (Enterococcus faecalis strain 133170041-3 plasmid pAD1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagtactggtattattggattcttctggac CRISPR spacer aagtactggtattattggattcttctggac Protospacer ******************************
6. spacer 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP049777 (Enterococcus faecalis strain ES-1 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagtactggtattattggattcttctggac CRISPR spacer aagtactggtattattggattcttctggac Protospacer ******************************
7. spacer 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028837 (Enterococcus faecalis strain FC plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagtactggtattattggattcttctggac CRISPR spacer aagtactggtattattggattcttctggac Protospacer ******************************
8. spacer 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NC_011642 (Enterococcus faecalis plasmid pMG2200, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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9. spacer 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to LC499744 (Enterococcus faecalis S7316 plasmid pS7316optrA DNA, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagtactggtattattggattcttctggac CRISPR spacer aagtactggtattattggattcttctggac Protospacer ******************************
10. spacer 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP030043 (Enterococcus faecalis strain C25 plasmid pC25-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagtactggtattattggattcttctggac CRISPR spacer aagtactggtattattggattcttctggac Protospacer ******************************
11. spacer 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to CP002494 (Enterococcus faecalis 62 plasmid EF62pC, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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12. spacer 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to MH830362 (Enterococcus faecalis plasmid p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagtactggtattattggattcttctggac CRISPR spacer aagtactggtattattggattcttctggac Protospacer ******************************
13. spacer 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP031028 (Enterococcus faecalis strain TY1 isolate flatfish plasmid pDEF-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagtactggtattattggattcttctggac CRISPR spacer aagtactggtattattggattcttctggac Protospacer ******************************
14. spacer 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019514 (Enterococcus faecalis strain CLB21560 plasmid pB, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagtactggtattattggattcttctggac CRISPR spacer aagtactggtattattggattcttctggac Protospacer ******************************
15. spacer 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP036248 (Enterococcus faecalis R712 plasmid pR712_02, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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16. spacer 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP030046 (Enterococcus faecalis strain C54 plasmid pC54, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagtactggtattattggattcttctggac CRISPR spacer aagtactggtattattggattcttctggac Protospacer ******************************
17. spacer 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028284 (Enterococcus faecalis strain FDAARGOS_324 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagtactggtattattggattcttctggac CRISPR spacer aagtactggtattattggattcttctggac Protospacer ******************************
18. spacer 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP030046 (Enterococcus faecalis strain C54 plasmid pC54, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgccgattttatcatgtttatccgaag CRISPR spacer aaacgccgattttatcatgtttatccgaag Protospacer ******************************
19. spacer 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028284 (Enterococcus faecalis strain FDAARGOS_324 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgccgattttatcatgtttatccgaag CRISPR spacer aaacgccgattttatcatgtttatccgaag Protospacer ******************************
20. spacer 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NC_004671 (Enterococcus faecalis V583 plasmid pTEF2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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21. spacer 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015885 (Enterococcus faecalis strain sorialis plasmid Efsorialis-p2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgccgattttatcatgtttatccgaag CRISPR spacer aaacgccgattttatcatgtttatccgaag Protospacer ******************************
22. spacer 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040897 (Enterococcus faecalis strain HA-1 plasmid punnamed) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgccgattttatcatgtttatccgaag CRISPR spacer aaacgccgattttatcatgtttatccgaag Protospacer ******************************
23. spacer 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP046109 (Enterococcus faecalis strain 133170041-3 plasmid pAD1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgccgattttatcatgtttatccgaag CRISPR spacer aaacgccgattttatcatgtttatccgaag Protospacer ******************************
24. spacer 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028837 (Enterococcus faecalis strain FC plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgccgattttatcatgtttatccgaag CRISPR spacer aaacgccgattttatcatgtttatccgaag Protospacer ******************************
25. spacer 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NC_011642 (Enterococcus faecalis plasmid pMG2200, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgccgattttatcatgtttatccgaag CRISPR spacer aaacgccgattttatcatgtttatccgaag Protospacer ******************************
26. spacer 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP030043 (Enterococcus faecalis strain C25 plasmid pC25-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaacgccgattttatcatgtttatccgaag CRISPR spacer aaacgccgattttatcatgtttatccgaag Protospacer ******************************
27. spacer 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NC_013533 (Enterococcus faecalis plasmid pBEE99, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
aagtactggtattattggattcttctggac CRISPR spacer aagtcctggtattattggattcttctggac Protospacer **** *************************
28. spacer 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to CP002494 (Enterococcus faecalis 62 plasmid EF62pC, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
aaacgccgattttatcatgtttatccgaag CRISPR spacer aaatgccgattttatcatgtttatccgaag Protospacer ***.**************************
29. spacer 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to MH830362 (Enterococcus faecalis plasmid p4, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
aaacgccgattttatcatgtttatccgaag CRISPR spacer aaacgctgattttatcatgtttatccgaag Protospacer ******.***********************
30. spacer 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP031028 (Enterococcus faecalis strain TY1 isolate flatfish plasmid pDEF-1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
aaacgccgattttatcatgtttatccgaag CRISPR spacer aaatgccgattttatcatgtttatccgaag Protospacer ***.**************************
31. spacer 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019514 (Enterococcus faecalis strain CLB21560 plasmid pB, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
aaacgccgattttatcatgtttatccgaag CRISPR spacer aaatgccgattttatcatgtttatccgaag Protospacer ***.**************************
32. spacer 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP036248 (Enterococcus faecalis R712 plasmid pR712_02, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
aaacgccgattttatcatgtttatccgaag CRISPR spacer aaatgccgattttatcatgtttatccgaag Protospacer ***.**************************
33. spacer 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP049777 (Enterococcus faecalis strain ES-1 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
aaacgccgattttatcatgtttatccgaag CRISPR spacer aaacgctgattttatcatgtttatccgaag Protospacer ******.***********************
34. spacer 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NZ_KY513281 (Enterococcus faecalis strain 6742 plasmid p6742_2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
aaacgccgattttatcatgtttatccgaag CRISPR spacer aaacgttgattttatcatgtttatccgaag Protospacer *****..***********************
35. spacer 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NC_013533 (Enterococcus faecalis plasmid pBEE99, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
aaacgccgattttatcatgtttatccgaag CRISPR spacer aaacgttgattttatcatgtttatccgaag Protospacer *****..***********************
36. spacer 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to LC499744 (Enterococcus faecalis S7316 plasmid pS7316optrA DNA, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
aaacgccgattttatcatgtttatccgaag CRISPR spacer aaacgttgattttatcatgtttatccgaag Protospacer *****..***********************
37. spacer 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NC_023573 (Staphylococcus phage phiSA012 DNA, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
aagtactggtattattggattcttctggac CRISPR spacer aagtactggtattaaaggattcttcaaaat Protospacer ************** ********* ..*.
38. spacer 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to MT711976 (Streptomyces phage Coruscant, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aagtactggtattattggattcttctggac CRISPR spacer acagagtggttttattggcttcttctggat Protospacer * . * **** ******* **********.
39. spacer 1.2|43943|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022523 (Pseudoalteromonas sp. NC201 plasmid pNC201, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aaacgccgattttatcatgtttatccgaag CRISPR spacer aaacgccgtttttatcatttttaatggtgg Protospacer ******** ********* **** . * .*
40. spacer 1.1|43889|30|NZ_CP030046|CRISPRCasFinder matches to JQ660954 (Clostridium phage PhiS63, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aagtactggtattattggattcttctggac CRISPR spacer ttgtactgatattattggtttcttcgtttt Protospacer ******.********* ****** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
---|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP030045_1 | 1820083-1820382 | Orphan |
II-A,II-B
Consensus repeat of NZ_CP030045_1
|
4 spacers
spacers of NZ_CP030045_1
>1.1|1820119|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT AAATTTTTTGAACTTAATGCAATTTCTTGA >1.2|1820185|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCTATTCTTGCCTTTGCCTTTAAATTAGC >1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGCATAATAATCTTTTCTCTTAATGTTTTT >1.4|1820317|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AACCCTCTTACTATGAGTTCCATTTATTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP030045_1
The CRISPR arrays of NZ_CP030045_1 >merge|NZ_CP030045|1|1820083-1820382|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTGATAGTTTGTTTTTTAACAACATGGCTCTAAAACAAATTTTTTGAACTTAATGCAATTTCTTGAGTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAACTTCTATTCTTGCCTTTGCCTTTAAATTAGCGTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAACTGCATAATAATCTTTTCTCTTAATGTTTTTGTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAACAACCCTCTTACTATGAGTTCCATTTATTTTGTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC >NZ_CP030045|1|1|1820083-1820382|CRISPRCasFinder GTGATAGTTTGTTTTTTAACAACATGGCTCTAAAAC AAATTTTTTGAACTTAATGCAATTTCTTGA GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC TTCTATTCTTGCCTTTGCCTTTAAATTAGC GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC TGCATAATAATCTTTTCTCTTAATGTTTTT GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC AACCCTCTTACTATGAGTTCCATTTATTTT GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC >NZ_CP030045|1|1|1820083-1820382|CRT GTGATAGTTTGTTTTTTAACAACATGGCTCTAAAAC AAATTTTTTGAACTTAATGCAATTTCTTGA GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC TTCTATTCTTGCCTTTGCCTTTAAATTAGC GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC TGCATAATAATCTTTTCTCTTAATGTTTTT GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC AACCCTCTTACTATGAGTTCCATTTATTTT GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC >NZ_CP030045|1|1|1820149-1820382|PILER-CR GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC TTCTATTCTTGCCTTTGCCTTTAAATTAGC GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC TGCATAATAATCTTTTCTCTTAATGTTTTT GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC AACCCTCTTACTATGAGTTCCATTTATTTT GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC
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>NZ_CP030045.1|WP_002360016.1|1811659_1812565_-|prenyltransferase MNREIFFELVELKAKTASVLPFLLGICFSWYQYGRLHVGYVLIFFIAMFIFNMAVDILDNYNDYHHATEVHDYKEKTNIIGRENLSLPLIRKMIFWMILVSALMGIGLSFIVGWPLLIMGLYCYLIGIFYSSGPKPLSSLPLGEVFSGFTMGFMITLICVYINTFEVFNWSAANLWGIFLVALPNTCYIANLMLANNICDLEEDENNKRYTLVHYLGKASSLKLFVGLNTIAMLAILLAVGLGLTPPTMLLMLLTLPFVRKQTQALLKEQVKSKTFVCAVKILAVGATAQVLFFAIGLWWL >NZ_CP030045.1|WP_002360017.1|1810419_1811631_-|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase MNKKHVVILGAGYAGLKTLRELQKGAKDVEITLVDRNNYHYEATDLHEVAAGTQPAEKITYNIMDVVDEKMTTFIQGTVKTIDAATQTVALEDGQTINYDYLVVSLGFESESFGIPGVQEHALQMVDVKTALNVYEHIQEQMRQYKATQNEEFLKIVVCGAGFTGIELLGSLVENKPKFAEIAGVSADQIQIYCVEAVTRLLPMFNEKLANYGVQLLKDSAIHLLLGKPIKEIKPGAVVYQDNEAGDLAELSAKTIIWTTGVSGSHVVGDSGFEARRGRVMVQPDLTDANHSNVYIIGDCSAVMDTETNRPYPTTAQIALKMGAHAAKNIQAQLKGEATKPFSFKSQGSVCSVGNTRALGIVGKTDIKGYPASFMKKIIMNKALFETGGTKEMMAKGRFDLYH >NZ_CP030045.1|WP_002364367.1|1807682_1810106_-|DNA-translocase-FtsK MAQKRATNKKKSTTKKKTKKQQQQQERLNYMFLGLIFILFGVFGLFRLGFLGTLLANCLRLVVGNTFPFAAILLILYGLLVMIYGKDFPLKRGRPIFGAVLIYISVLLFFHAFMFRNVSGSQPDILGNTWEFLQSDLKANQVTQNVGGGMIGALLYQGTYFLVAQFGSYLIATLLLLAGIFLMSMWDFQQIVDHFQSIQDRLSHVSAKSQARQEEKEAKRAAKKEAKAAERQAKIEAAAQQKLQERERMEQAAAERLTKTPVETHQPMVEEPAAPTPVQIDSFQQQNQAMPVPPIAATKPQREQEEEAADEAGVLEFEISEEAEDRDYQLPPTDLLDTIQATDQSGEYEKIEKNIGVLEQTFKSFGVDAKVVKASLGPSVTKFEVQPAVGVKVSKIVNLTDDIALALAAKDVRMEAPIPGKSLIGIEVPNSAISTVSFRDIVEAQPSHPDKLLEVPLGRDISGMVQTADLSKMPHLLIAGSTGSGKSVAINGIITGILMQAKPHEVKLMMIDPKMVELNVYNGIPHLLTPVVTNPRKAAQALQKVVQEMEFRYEKFAATGVRNITGYNQLIQQKNAEDGENRPILPFIVVIVDELADLMMVASNEVEDAIIRLAQMARAAGIHMILATQRPSVDVITGIIKANVPSRMAFAVSSGTDSRTIIDTNGAEKLLGRGDMLFLPMGENKPIRIQGAFISDQEVERVVAFVTDQQEAEYQESMMPTDEPTTSGGGEAPQDELFEEAKNLVVEMQTASISLLQRRFRIGYNRAARLVDELEAHGVIGPSEGSKPRKVFLQAESEEAATETPEQ >NZ_CP030045.1|WP_002356983.1|1806851_1807553_-|GntR-family-transcriptional-regulator MRRKSVLYLEVADQIKEDILSGKYPVGTFLPTETELEEMFNVSKITIRRAIEMLATEEFVEKKSGRGTTVLSNRPYNKLSKAGTFTEFLNESGQKVTKKVLQVENLTLSKEMPAYQFLGEEVVHLSRLYLIDEQPYIYFNYYLPAAMKDVSLTEYKEESLYRLMDRHAIEIYKFEDRFEVATLTEAEQKMLQTTETTGLKRIRRSLSPTGRCVEYSEAIYNTKIHPYVIEYEA >NZ_CP030045.1|WP_002381711.1|1805984_1806734_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLEVQNLKKVYGNEIKYEALKGINLTVQDGEFIGIMGPSGSGKSTLLNLLATIDSPTDGEILLNGKNPNNLNQEQIAKFRRTELGFVFQSFNLMPTLTVEENIILPLTLDGEKVSVMKRQLAELSERLGINHLLKKRIAEISGGQAQRVAVARAMIHHPQLLLADEPTGNLDTKSSKDVMGLLQQLNEEEAATILMVTHDPLAASYCKRIVFIKDGELIDEIVQNGNQKEFYDLIMVKLAEIEGVDNEF >NZ_CP030045.1|WP_002364371.1|1820539_1821403_-|AraC-family-transcriptional-regulator MLANLNQAMDYIEEHLTEEVSFDELAKKTGISVYHFKRTFSFITGMSLAEYIKKRRLAEANLALLAGEKVTDVAFKYGYQSIEGFSRAFRDWSGQAPSEVMKTQIQKTFPKFSFYIDIKGGQSMDVKLIEKPAFQIVGVSQKVPLQYQGENQAIMELAQRITPQQRAEMHTFDDIYPHQVVNASFDFQEGRTTEGGEMTHMIGFATSQENTYEDLEQLSVPAHTWAVFPNEGPFPQTLQETWARIFSEWLPSSGYQVVAAPEISFTQYQGPAEAKYSEIWLAVTATK >NZ_CP030045.1|WP_002356968.1|1821487_1823569_-|DNA-topoisomerase-III MVAKQLIIAEKPSVAKDLSRVLGANQKNKNYYEGPNVIVTWALGHLLGLKMPEDLNKEWQTWQMETLPMIPKNLGIKPLPKTGHQLKAIKQLANRKDVSEAVIATDAGREGELVARWILEYVRFNKPVKRLWISSQTDKAIKDGFKKIRPAKDYDNLYYSALARAKADWLVGLNVTRALTVKYQDNLSAGRVQTPTLAMVRQQEKTIEQFKPQTYFTISLTVESEKAKMTQKNPYALKERQEAEQLVKELSKQKGLVTDIQEKVKTENAPLPYDLTEIQREANQRFQFSAKKTLSLVQSLYETHKIVSYPRTDSKYLTTDMKGTMKERLQAIADFSPEVKGYLKNGAVVKQQKVFQNAKVTDHHGLIPTEQRPRYEKLSNDEQKIYQMIVQRFLGLFAEPNQTKQTKVTVAFGKETFVFHQNKVVVAGWKTTAEQPLSIVQWQKGMTVAPNFTINKELTSPPKPLTEGTLLGKMEKHSLGTPATRAEIIEKLIKSELMERTNSGLSVSAKGKQLLDLVNPSLVTPELTEKWEKSLEAIASGQQKSQLFLKDIEEDTKKLVREIKQSEKKYQDFSITQKKCPDCGSNLREKNTKDGKIYVCTNQECSYRRRKDPKVSNHRCPQCHKKMVIIEGKNGRSFKCKFCSITEKIPDKKERKQKMTKHEERRLMKKYSQPDEPEESALAQALKAAMNQE >NZ_CP030045.1|WP_002356966.1|1823699_1824065_-|DUF1033-family-protein MYQVITMYGDNEPWWFFDDWQEDIVQEKTFDNLTDAETYYVEVWQKLSQNYTYVNTKPNYLTAFWNDGEERWCEECDEDLQQYFGLALLENHHAVTFENKAEFTTISNHFGKTKFCKRKVI >NZ_CP030045.1|WP_002356965.1|1824162_1824732_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MAKKRNLTKAKILESARNLAEELGVQQLTFQNLAVDLGIKYPSLYNHFKNIAEVKNALVDLLIQELNDALRRALVGKSGAEAIRIYAETYQQFAFENSAVYELLISVPKTQNQQLIEGIHETNQIILQLLAFYPFNNEERLHKSRELRSLIHGYITLRFLGYFQREEATPEESYRRMIEDFIASLEVAG >NZ_CP030045.1|WP_002356963.1|1824864_1825380_+|YbhB/YbcL-family-Raf-kinase-inhibitor-like-protein MHITNRSHLADRYGKRTSAEFLLHERPILSFPISLAAIPKEARYLSWELIDYDTIPLIGFPFIHWLAANVPVTNEIPEDFSRTALKPTIQGKNSLASPLGKQMIPALATETLPELTERYLGLSPRSGVHTYTLYVYATKNPLNLKEGFFANELHQALNDQLLAKAKFEFLY >NZ_CP030045.1|WP_002356962.1|1825396_1826635_+|multidrug-efflux-MFS-transporter MYELIKSKIFRPRQPWEKNLLVLWFGTFMAGIGFSLVMPFMPLYINTLGTFTHQQLNFWSGITFSSTFLVTTIVSPWWGRLADRKGRKLMLLRASLGMAIVISLMGAVTSVYQLIGLRLLQGVFSGYISNATALVATGTPKEKSGQVLGTLATGSVTGTLLGPLLGGVTASIFGYRPTFFITGTILLLVFVLSLVFVHEEFVPIEKNQAASGKQILKKLEHPHVILGMFITTLIIQASNNSISPIISLYIQQLLGGHGNVTLISGVIASIPGIATLIAAPRFGRLGDRIGSERILTIGLILAIFVYLPMAFVQNVWQLAMLRFLVGISDACLLPAVQTLITRYSPSDAAGRIFSYNQSFQATGNVIGPMIGSSVSAAFGYRGVFISTSCLVLINLLWVRRSTAELKKEKNDD >NZ_CP030045.1|WP_002356960.1|1826814_1827939_-|tRNA-2-thiouridine(34)-synthase-MnmA MADNSKTRVVVGMSGGVDSSVTALLLKEQGYDVIGIFMKNWDDTDENGVCTATEDYKDVAKVADQIGIPYYSVNFEKEYWDRVFEYFLAEYRLGRTPNPDVMCNKEIKFKAFLDYAMQLGADYVATGHYAQVETDENGVVHMLRGIDNNKDQTYFLSQLSQAQLAKTMFPLGGMEKSEVRAIADRAGLATAKKKDSTGVCFIGEKNFKEFLSNYLPAKKGNMVTEDGEIKGQHDGLMYYTIGQRQGLGIGGGGKTQEPWFVIGKDLTTNTLYVGQGFHHEKLYATHLEASEVHFTVDTPMPKEFDCTAKFRYRQADIPVHVSLSEDGTKATVTFKEPARAVTPGQAVVFYDGMECLGGGLIDRAYQDEKELQYV >NZ_CP030045.1|WP_002356959.1|1828164_1828509_-|DUF1831-domain-containing-protein MAFTTTAAVEGSTVFYKVHPSAKRYTLKDNGFTETKSGNFQLIRSLDPTPQRNEGFKLKITITADLKELKMSITTANGLKPMNIFKNEQHEMSKEKYFFLMDGLISRGVLEKVE >NZ_CP030045.1|WP_002356958.1|1828576_1829722_-|cysteine-desulfurase MEPIYLDHAATTPLHPTVIQAMTENMQTTFGNPSSIHQFGRKAHGLLEEVRQTIAESLQAKPHEIIFNSGGTEGDNTAILAVAFSRQKEGKHIITTAIEHPAVLRTMEYLETLGFEVTYLPVNENGQISMDQFKKSLREETILVSMMYGNNEIGNRLPIAEVGAILKNHSAIFHTDAVQAYGSEVILPHELGIDLLSISAHKINGPKGVGFLFKSDAIQLPPLLHGGEQEEKRRAGTENLAGIIGMGTAVSLLTSAEKQARKTAYQSFQTIILKALEEANIDFSINGEPTNRLAHVLNLHLKGVPSDLLLMHLDLRGIAISTGSACTAGTVDPSHVLTAMYGENSSAIKESIRISFGYGNTPEEIATFSEVLVAVIQQLKK >NZ_CP030045.1|WP_002356957.1|1829878_1830853_-|ribose-phosphate-diphosphokinase MTENYQDDTLRIFSLNANRPLAEKIAASVGTELGKSTVRQFSDGEIQINIEESIRGDHVYIIQATNAPVNDHLMELLILIDALKRASAKTINVILPYYGYARQDRTAKPREPITAKLVANMLVEAGATRLLTLDLHTVQVQGFFDIPVDNLFTMPLFAHYYRQQALVGEEIVIVSPKNSGVQRARSLSEYLDATLAIVDHEEIDGVRQEGYVIGNVAGKKCILVDDILNTGQTLATAAEVLMKNGAQEVYACASHGLLSEGAKATLENAPIKEISITDSVYTTTDRQPATLNIISCAELMGEALLRIHENKPMSPLFRLEPKGE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP030045_2 | 2613095-2613168 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP030045_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP030045_2
>2.1|2613119|26|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder TCGATATAGAATTGGACGTAGAGCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP030045_2
The CRISPR arrays of NZ_CP030045_2 >merge|NZ_CP030045|2|2613095-2613168|CRISPRCasFinder ATAGTTGGCGAGCAACAGAAAAACTCGATATAGAATTGGACGTAGAGCCAATAGTTGGTGAGCAACAGAAAAAC >NZ_CP030045|2|2|2613095-2613168|CRISPRCasFinder ATAGTTGGCGAGCAACAGAAAAAC TCGATATAGAATTGGACGTAGAGCCA ATAGTTGGTGAGCAACAGAAAAAC
>NZ_CP030045.1|WP_002389419.1|2612164_2612815_+|beta-phosphoglucomutase MTIGFIFDLDGVITDTAKFHYQAWKALADSLGIPIDETFNETLKGISRMDSLDRILAHGHRENAFIPAEKEALAQQKNDHYVQLLEHLTTEDVLPGVVPLLQQAQARHIPCAVASASKNAPLILEKLGVRAYFATIVDPDSLSKGKPDPEIFLAAADSIGVLPQNAIGFEDAQSGIDGLKAAGIYAVGLSASQPLIGADMQVSEMTELSVDALLNR >NZ_CP030045.1|WP_002354877.1|2608431_2609145_-|trehalose-operon-repressor MNKFHDIFLELEQQIVQGDYQPGDLLPSENQLVETYNVSRETIRKALNLLINAGYIQKKQGKGSIVLNFKKFNFPISGVTSYKELQQTQHIESHTHVVSLEEIPVERNLAQLTGWTEGAPVWRLVRQREIEGEVDILDIDYLIKEIVPELPKHRAEDSIFDYLENDLGLAISYAQKEITVEPLTEMDKQLIGEVEGNHVVVVRSIMNLEDTRCFGYTESRHRLNKFKFVEFARRRKL >NZ_CP030045.1|WP_002389427.1|2607325_2608036_-|hypothetical-protein MKKKIMASLLVGSAVVGASLAPLSAQAVTTGNTPVQVEFGGGMLPDAGGDPNTVRPDPGATNSNFDLIFIPREYDFGKLSISDDLTKPIPNKNDAGRNGHTEAIGIGDLRGTKEGWHVTAQSDGMKLGDESLEGNITIGVNGFYALRYDESTNQYTNQGATIDMEARPEGVNPDLWNLPLAGDAVLVANATSGKGQGIWGLSMFDTALNITTSAYNIKAGAYTGNITWNLVAGPSI >NZ_CP030045.1|WP_002389463.1|2606513_2607230_-|hypothetical-protein MKKKIMASLLVSSAVVGASLAPLSAHAVTTGNTPVQAEFEAGVLPDQGDNTVGMGSVDPDPTQPNTDFDLVTIPRSFDFSPVKIGEDLTSIQAIFPSYETTRAVMVGDLRGTKEGWHVTGQLTKMNNEADELAGDINFGLEMNYAKHVTIPTDFYTVSPVLNGMNIADDPAAPSAIGTSIKIGGGATALMNATVGKGQGIWAGRFRNMTLNVTTPMQQLKKGAYTGNITWNLVAGPSI >NZ_CP030045.1|WP_002354883.1|2606023_2606473_+|large-conductance-mechanosensitive-channel-protein-MscL MIKEFKEFIMRGSVLDLAVGVVIGSAFTAIVTQVVEGLITPLISLIFVLTTGKKSADDALGALVYKVEGVEFNIGSVISALITFLITAFVLFLIVKAANKMKNRGKKEEAAEEEVVPTSEDYLKEIRDLLAAQTPPAETVKTDSTFTEK >NZ_CP030045.1|WP_002389502.1|2604546_2605815_-|insulinase-family-protein MSVQLVKGVNLHVIPTEKYKTVRLLVRFNTRLNHETITKRTLLSSLMETNSLNYPNQVKLSERLAELYGASFGIGVSKKGNQHWFNISMNIVNDHYLQDSQVLAEAVDFLKEIIFAPNIQAGQFEAETFQREKENLKAYLESIVEDKQTYASLALQSVYFNQSEDQKIPSFGTVAALAKETAASLAAYYQKMLAEDQVDIFVLGDVNEAELVPLFKQLPFTPREEGKAAIFYNQPIRNVIEERTEREVLAQSKLNLAYNTDIYYGDSYYFALQVFNGIFGGFPHSKLFMNVREKEHLAYYASSSIDTFRGFMTVQTGIDGKNRNQVLRLISTELENIRLGKISELEIEQTKAMLKNQYILALDNAGAWLEKEYLNQLMPQTMLTAEEWIARINAVTIPEIQEVAKRLELQAIFFLEGETEND >NZ_CP030045.1|WP_002411262.1|2603249_2604554_-|insulinase-family-protein MIKKDYAQIKETLYTETLENGLKVYLLPKNDFQKTYGLFTTDYGSIDNTFVPIGQEEMIEVPDGIAHFLEHKMFEKEDGDVFQKFGQQGASANAFTSFTKTSYLFSTTDQVTQNLETLLDFVQSPYFTKETVEKEKGIIGQEIQMYLDDPNWRLFFGILGNLYPKHPLHIDIAGTVASIAEITAEDLYTCYNTFYHPSNMTLFVVGKMDPEALMAFIRENQAAKEFPAAQPIRRHFPEETAADIVKESAIEMAVTRAKVLVGLKGLDEVPTTGRDLMKYQVTVNLLLQLLFGNTSQNYLALYDEGLLDDSFSYDFNLDRSFHFADIGGDSEQPEVLAERIEAILLSATTSPELTEENLSLLKKKMIGKYFQSLNSLEYIANQFSQSLFGETTLFDKIEVIESIQLADVRQVAETLIREEGLSRFYMYPKGETEQ >NZ_CP030045.1|WP_002359020.1|2602215_2603082_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MASVNIGETLKEARLQKNISIDELQQMTKIQKRYLEIIEQNDFESLPGTFYVRAFIRQYASAVGLDGNQLVDIYDGKEPAIVEEPKPVYEELEGSRKQLHDEEKQSSWLLRNLPAIAFSLIGLAIAVVVLYIMWQDQKAEPIIQTPATSASVEKPKESSQAPESSTQSSTPPSSSSEPEKKTAVAVVSDANNQVTATVKDANSPINITFKGTEGSCWIGVMVDGNYTYQHTLQAGETQTTALPANAANATLILGASNNVAIQVDGADLTLEKTPVLIRKDVTLGITYR >NZ_CP030045.1|WP_002359021.1|2601878_2602091_-|hypothetical-protein MLKIVNKKFNLITIFSIALLVMGFLIVGLQLYFYFIYGSKFLDSITLIGMINLGLGYYQLFLKKGKNISE >NZ_CP030045.1|WP_002365382.1|2601201_2601780_-|CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate-3-phosphatidyltransferase MNLPNKLTVLRIFMIPIFIIIVSVPMDWGTISFGDTTLAVTQLVGAIIFAVASFTDWLDGKIARAQGLVTNFGKFADPLADKMLVMTAFIVLVGQGKVPAWIVAIIVCRELAVTGLRLLLVEHGEVMAAAWPGKVKTATQMVAIILLFINNIPFSALHLPLDQIMLYACLIFTIYSGVDYFAKNKDVFKGSM >NZ_CP030045.1|WP_002389391.1|2613234_2613828_+|hypothetical-protein MIEKKDFDTIRKAFLIYDTNFNNHMFTYTYQHRKTKKLLEMNVQFEAGNFMHLCGVDYYQIDKQGSCKFRFKATQFYRALKNNKVSLRGIKPKDDGTTGQKLQVIPLLEMLISPGVRVCDGGKFYNLQYEKAIRSGKMIVALTCKENNKKYVPQSLLSLINQPRKSQSKSLTESHEVIKISKSELNSTSVIEVYDKF >NZ_CP030045.1|WP_002367458.1|2614067_2614211_-|putative-holin-like-toxin MSVLPKFTERRGLLSAYETIQTILGFGMFTIALIALIVKLLKNDKKK >NZ_CP030045.1|WP_002381060.1|2614442_2615414_-|ribose-phosphate-diphosphokinase MSKHYFDPRLKIFSLNSNRPLAEKIADAVGVELGKCSVTQFSDGEIQVNIEESIRGAHVYVIQSTSSPVNDNLMELLIMIDALKRASAKTINVVMPYYGYARQDRKARAREPITAKLVANMIEKAGATRMLTLDLHAVQIQGFFDIPVDHLMGAPLIADYFIEHGIQGDDVVVVSPDHGGVTRARKLAEFLKAPIAIIDKRRPKANVAEVMNIIGHVEGKTCVLIDDMIDTAGTISLAANALKEAGAKDVYASCTHPVLSGPALQRIEDSAIERLVVTDSIYLSDDRKIAKIDEVSVGELIGDAIKRIHENKPVSPLFETKNK >NZ_CP030045.1|WP_002389480.1|2615588_2616026_-|peptide-methionine-(R)-S-oxide-reductase-MsrB MTKPTEEELKQTLTDLQYAVTQENATERPFSGEYDDFYQDGIYVDIVSGEPLFSSLDKYDAGCGWPSFTKPIEKRGVKEKADFSHGMHRVEVRSQEADSHLGHVFTDGPLQEGDLRYCINAAALRFVPVADLEKEGYGEYLSLFK >NZ_CP030045.1|WP_002389433.1|2616158_2616713_-|septum-formation-protein-Maf MQIILASQSPRRQELLKRVVPTFTIAPADIDETVGKDGLPAEYVAQMAAQKAAAIAEQSPEALVIGCDTIVALAGEILGKPTSREDGYRMLRLLSGKTHDVYTSVTLKQGEKERSATVHSTVTFYPLTETEIHAYLDTAEYADKAGAYGIQGQGALLIEAIAGDYYAIMGLPIAKVARLLKEFN >NZ_CP030045.1|WP_138818642.1|2616737_2618870_-|DNA-mismatch-repair-endonuclease-MutL MGKIQELSEQLANQIAAGEVVERPASVVKELVENALDAGSTQIDIFIEEAGLKTIQIIDNGEGIAKEDVLNAFKRHATSKIHTRDDLFRIRSLGFRGEALPSIASVSEMIVETATAEEEEGSYVILKGGKVEENRPAALRKGTKMTVSNLFYNTPARLKYVKTIQTELANIGDIVNRLALSHPKVAFRLVHDGHKMMSTTGNGDLKQTIAGIYGISTAKKMLKIEGKDLDFTLTGYVSLPEVTRASRNYLSTIINGRYIKNFALNKAIVAGYGSKLMVGRFPIAVLEIEMDPLLVDVNVHPTKQEVRLSKEKDLMALIEQAIQEVLSQEQLIPNAADNLRFKKKLPPEPKAEQMEIPLSTEQPAVKQRPDSLSYNPATGRFYAEHATDETPASSAPESVNQTERAVDPMDDPFAPPVPESTSVAEETSAYETSSAAVDSANHWETASNEQQVIAEETKITEVSDSEPSLRSSEAADEVFQEEMKLHPEFDANSAASQRELKQALNKLEEERPTERFPELEYFGQMHGTYLFAQSKDGLFIIDQHAAQERIKYEYFREKIGEVSDDLQELLVPIVIDYPNSDALKIKEQKETLAEVGIHLEDFGQNSFIVRAHPTWYPAGEEESIVREMIDMLLTTGSVSVKKFREATAIMMSCKRSIKANHYLNEQQARVLLKDLALCENPFNCPHGRPVLIHFTNSDMERMFKRIQDPH >NZ_CP030045.1|WP_002354867.1|2618901_2621478_-|DNA-mismatch-repair-protein-MutS MPQKTKNTPMMEQYLSIKAQYKDAFLFYRLGDFYELFYEDAINAAQILELTLTSRNRNADDPIPMCGVPYHAAQGYIDTLIEQGYKVAICEQVEDPKTTKGMVKREVVQLVTPGTVMNSKGLEAKDNNYLTAVLTDGNQFGFAYVDLSTGELKTAVLADEEGVLNEASALQTKEMVLGSGIPESLKENLSLRLNIIFSTQETVEENAEFSFLTNELINPLEIEITGKLLSYLSVTQKRSLSHIQKAVEYQPDHFLKMDHYSKFNLELSQSIRTGQKKGTLLWLLDETKTAMGGRLLKQWLDRPLIQERQIKARQEMVQSLLNAYFERLDLQAALTNVYDLERLAGRVAFGSVNGRDLIQLRTSLEQVPTIRQLIVGINQGEWDDLLVDLNPVEDLVALIATAINEEAPLQITEGNVIKDGYNDQLDEYRDAMRNGKQWLAELEAKERQETGIKNLKIGYNRVFGYFIEITKSNLANLEEGKYERKQTLANAERFITPELKELERLILEAEEKSVELEYQLFLAVREQVKTNIDRLQTLAKTISAVDVLQSFATISERYQYVRPTLRSNTKNLAIVEGRHPVVEKVLGHQEYIPNSIRMNPETDILLITGPNMSGKSTYMRQLALTVVMAQIGCFVPAESAEMPIFDQIFTRIGASDDLIAGQSTFMVEMMEANQALRHATPNSLILFDELGRGTATYDGMALAQAIIEYIHREVQAKTLFSTHYHELTVLDETLKGLKNIHVGAVEKDGEVVFLHKMMEGPADKSYGIHVAKIAGLPSPLLERAATILSALEAEETTIPSSVHHEEVSEVHEETEQLSLFKEVSTEELSVIDTLKKMNLLEMTPLDALNMLHQLQKRI >NZ_CP030045.1|WP_002359008.1|2621478_2621865_-|hypothetical-protein MKVKKMEPLNLDAQSNKELEKLLHLIGQDEVIQRYQAIEEKVKKNKKLTELVEEIKAAQKDAVQFAHYGKPTAEKEAIQRADAKTKEFDEHPLVVAYREQLIEANDLVQHVTALIQYRVNEELEKEGN >NZ_CP030045.1|WP_002354864.1|2621938_2622736_-|TIGR00282-family-metallophosphoesterase MRILFIGDVVGSLGREALATYVPKLKKKYRPQVTIANGENAASGRGITGKIYKKFLQDGVDVVTMGNHTWDNKDIFEFIDDAKKMVRPANFPEDVPGQGMVFVKVNQLELAVINLQARTFMVPLEDPFKKAAELVAIARKRTPLIFVDFHGETTSEKQAMSWFLDGQVSAVVGTHTHVQTNDARILPKGTAFLSDVGMTGPYDGILGMKREPIIEKFMTALPKRFEVVETGRTILSACILEIDDQTGQAKMIEPIQISEDRPFQE >NZ_CP030045.1|WP_002354863.1|2622895_2624452_-|ribonuclease-Y MVLNILLAIVGLIVGLGLGFVIAKSRHDKAINGAKISASSILENARKESETLKKEALLEAKEENQKYRSEIESELKESRLELKSQENRLIQREQTLDRKDDSLEKREGSLEEKEEKLGARQQLIDEREKEVENLINQQHQELERIASLSKEEAKSIIMKSTEEELNHELTLMVKESEQRAKEESDRKAKNLLSLAIQRCAADSVSETTVSVVTLPNDEMKGRIIGREGRNIRTLETLTGIDLIIDDTPEAVVLSGFDPIRREIARMTLEKLIQDGRIHPARIEEMVEKSRKEMDERIREYGEQAAFEVGAHTLHPDLIKILGRLRFRTSYGQNVLNHSIEVAKLAGVLAAELGEDVQLAKRAGLLHDIGKALDHEIEGSHVEIGAELAAKYKENSVVINAIASHHGDVEATSVISVLVAAADALSAARPGARSESLENYIRRLENLENISNSFEGVDSSFAVQAGREVRVMVKPEEISDLESVRLVRDIRKKIEDDLDYPGHIKVTVIRETRAVDYAK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP030045_1 | 1.4|1820317|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820317-1820346 | 30 | CAJDKF010000002 | Enterococcus phage vB_EfaS_159 genome assembly, contig: phage159-genome, whole genome shotgun sequence | 25809-25838 | 1 | 0.967 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | LC547238 | Entercoccus phage phiM1EF2 DNA, nearly complete genome | 3565-3594 | 2 | 0.933 |
NZ_CP030045_1 | 1.1|1820119|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT | 1820119-1820148 | 30 | NZ_LR214986 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13 | 726854-726883 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_KT186230 | Bacillus anthracis strain P.NO2 plasmid pXO1, complete sequence | 124479-124508 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP036355 | Bacillus sp. SYJ plasmid unnamed1, complete sequence | 142643-142672 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NC_014331 | Bacillus cereus biovar anthracis str. CI plasmid pCI-XO1, complete sequence | 124704-124733 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP022045 | Bacillus anthracis strain FDAARGOS_341 plasmid unnamed1, complete sequence | 61365-61394 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NC_007322 | Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor' plasmid pXO1, complete sequence | 124456-124485 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NC_012579 | Bacillus anthracis str. CDC 684 plasmid pX01, complete sequence | 124779-124808 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP015777 | Bacillus anthracis strain Tangail-1 plasmid pXO1, complete sequence | 124456-124485 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP018904 | Bacillus anthracis strain Tyrol 4675 plasmid pXO1, complete sequence | 124147-124176 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP023002 | Bacillus anthracis strain 14RA5914 plasmid pX01, complete sequence | 81539-81568 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_AP019732 | Bacillus anthracis strain PCr plasmid PCr-pXO1 | 76013-76042 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_AP018444 | Bacillus anthracis strain CZC5 plasmid pXO1, complete sequence | 124378-124407 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP029324 | Bacillus anthracis strain 17OD930 plasmid pXO1, complete sequence | 99397-99426 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NC_012656 | Bacillus anthracis str. A0248 plasmid pXO1, complete sequence | 124720-124749 | 5 | 0.833 |
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NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP019589 | Bacillus anthracis strain SPV842_15 plasmid pX01, complete sequence | 124456-124485 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP010853 | Bacillus anthracis strain A1144 plasmid pXO1, complete sequence | 124438-124467 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP007665 | Bacillus anthracis str. Vollum plasmid unnamed, complete sequence | 77389-77418 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP008847 | Bacillus anthracis strain HYU01 plasmid pX01, complete sequence | 124701-124730 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP006743 | Bacillus anthracis str. SVA11 plasmid pXO1, complete sequence | 124613-124642 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_AP014834 | Bacillus anthracis strain Shikan-NIID plasmid pXO1 | 124540-124569 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP029806 | Bacillus anthracis strain London_499 plasmid pX01, complete sequence | 123443-123472 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NC_001496 | Bacillus anthracis virulence plasmid PX01, complete sequence | 154749-154778 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NC_017726 | Bacillus anthracis str. H9401 plasmid BAP1, complete sequence | 124481-124510 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP014177 | Bacillus anthracis strain Stendal plasmid pXO1, complete sequence | 124456-124485 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP009597 | Bacillus anthracis str. V770-NP-1R plasmid pXO1, complete sequence | 98113-98142 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP009901 | Bacillus anthracis strain 2002013094 plasmid pXO1, complete sequence | 95611-95640 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP009340 | Bacillus anthracis strain Ohio ACB plasmid 1, complete sequence | 134225-134254 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP009696 | Bacillus anthracis strain RA3 plasmid pXO1, complete sequence | 72482-72511 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP009463 | Bacillus anthracis strain SK-102 plasmid pXO1, complete sequence | 118525-118554 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP009699 | Bacillus anthracis strain BA1035 plasmid pXO1, complete sequence | 81411-81440 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP009592 | Bacillus cereus G9241 plasmid pBCX01, complete sequence | 63937-63966 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP009543 | Bacillus anthracis strain BA1015 plasmid pXO1, complete sequence | 29325-29354 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP010321 | Bacillus anthracis strain Canadian Bison isolate A0369 plasmid 1, complete sequence | 10903-10932 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP009540 | Bacillus anthracis str. Sterne plasmid pXO1, complete sequence | 50970-50999 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP009330 | Bacillus anthracis strain K3 plasmid 1, complete sequence | 162296-162325 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP009324 | Bacillus anthracis strain PAK-1 plasmid 1, complete sequence | 75599-75628 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP009327 | Bacillus anthracis strain Vollum 1B plasmid 1, complete sequence | 168267-168296 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP001975 | Bacillus anthracis str. A16R plasmid pXO1, complete sequence | 124510-124539 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP009317 | Bacillus cereus 03BB102 plasmid unnamed, complete sequence | 19532-19561 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP009980 | Bacillus anthracis strain Ames isolate BACI008 plasmid unnamed1, complete sequence | 164957-164986 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP001971 | Bacillus anthracis str. A16 plasmid pXO1, complete sequence | 124541-124570 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NC_012473 | Bacillus cereus 03BB102 plasmid p03BB102_179, complete sequence | 117362-117391 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP047132 | Bacillus anthracis str. BF1 plasmid pXO1, complete sequence | 98517-98546 | 5 | 0.833 |
NZ_CP030045_1 | 1.1|1820119|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT | 1820119-1820148 | 30 | NC_019526 | Enterobacteria phage vB_KleM-RaK2, complete genome | 41998-42027 | 6 | 0.8 |
NZ_CP030045_1 | 1.1|1820119|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT | 1820119-1820148 | 30 | MT708547 | Klebsiella phage Muenster, complete genome | 164106-164135 | 6 | 0.8 |
NZ_CP030045_1 | 1.1|1820119|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT | 1820119-1820148 | 30 | AB897757 | Klebsiella phage K64-1 DNA, complete genome | 42006-42035 | 6 | 0.8 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NC_010180 | Bacillus mycoides KBAB4 plasmid pBWB401, complete sequence | 315568-315597 | 7 | 0.767 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP020744 | Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed1, complete sequence | 380687-380716 | 7 | 0.767 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | CP037991 | Bacillus mycoides strain TH26 plasmid unnamed1, complete sequence | 268021-268050 | 7 | 0.767 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP049914 | Vibrio sp. HDW18 plasmid p_unnamed1, complete sequence | 287951-287980 | 7 | 0.767 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP012100 | Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-1, complete sequence | 397880-397909 | 7 | 0.767 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | DQ003638 | Listeria phage A511, complete genome | 124863-124892 | 7 | 0.767 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | KJ668717 | Listeria phage LMTA-34 hypothetical proteins, transposase domain-containing protein, and hypothetical proteins genes, complete cds | 4155-4184 | 7 | 0.767 |
NZ_CP030045_1 | 1.4|1820317|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820317-1820346 | 30 | NZ_CP046008 | Escherichia coli strain 1919D62 plasmid p1919D62-2, complete sequence | 85487-85516 | 7 | 0.767 |
NZ_CP030045_1 | 1.4|1820317|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820317-1820346 | 30 | NZ_CP046005 | Escherichia coli strain 1919D3 plasmid p1919D3-2, complete sequence | 66053-66082 | 7 | 0.767 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP045609 | Bacillus cereus strain SB1 plasmid p3, complete sequence | 6607-6636 | 8 | 0.733 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NC_015417 | Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p1BKT015925, complete sequence | 171856-171885 | 8 | 0.733 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP018939 | Bacteroides fragilis strain Q1F2 plasmid Q1F2-p2, complete sequence | 20089-20118 | 8 | 0.733 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP018939 | Bacteroides fragilis strain Q1F2 plasmid Q1F2-p2, complete sequence | 73792-73821 | 8 | 0.733 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NC_007581 | Clostridium phage c-st, complete genome | 153252-153281 | 8 | 0.733 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | ACSJ01000017 | Clostridium phage D-1873 CLG.Contig173, whole genome shotgun sequence | 19923-19952 | 8 | 0.733 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | AP008983 | Clostridium phage c-st genomic DNA, complete genome | 153252-153281 | 8 | 0.733 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP014152 | Clostridium botulinum strain BrDura plasmid pRSJ20_1, complete sequence | 64116-64145 | 9 | 0.7 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP013684 | Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence | 33249-33278 | 9 | 0.7 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP013710 | Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_3, complete sequence | 215240-215269 | 9 | 0.7 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP029455 | Bacillus cereus strain FORC087 plasmid pFORC087.1, complete sequence | 199858-199887 | 9 | 0.7 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NC_010379 | Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence | 8439-8468 | 9 | 0.7 |
NZ_CP030045_1 | 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1820251-1820280 | 30 | NZ_CP013700 | Clostridium botulinum strain AM1195 plasmid pRSJ11_1, complete sequence | 139454-139483 | 9 | 0.7 |
1. spacer 1.4|1820317|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CAJDKF010000002 (Enterococcus phage vB_EfaS_159 genome assembly, contig: phage159-genome, whole genome shotgun sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
aaccctcttactatgagttccatttatttt CRISPR spacer aaccctcttgctatgagttccatttatttt Protospacer *********.********************
2. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LC547238 (Entercoccus phage phiM1EF2 DNA, nearly complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
tgcataataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer tgtgtaataatcttttctcttaatgttttt Protospacer **..**************************
3. spacer 1.1|1820119|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
aaattttttgaacttaatgcaatttcttga CRISPR spacer aaattttttgctcttaatgcaattacatta Protospacer ********** ************ * * *
4. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KT186230 (Bacillus anthracis strain P.NO2 plasmid pXO1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgcat-aataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -atataaataatcttttcccgtaatgttttt Protospacer ..** ************.* **********
5. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP036355 (Bacillus sp. SYJ plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
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6. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_014331 (Bacillus cereus biovar anthracis str. CI plasmid pCI-XO1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
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7. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP022045 (Bacillus anthracis strain FDAARGOS_341 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
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8. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_007322 (Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor' plasmid pXO1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
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9. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_012579 (Bacillus anthracis str. CDC 684 plasmid pX01, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
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10. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP015777 (Bacillus anthracis strain Tangail-1 plasmid pXO1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
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11. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP018904 (Bacillus anthracis strain Tyrol 4675 plasmid pXO1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
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12. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP023002 (Bacillus anthracis strain 14RA5914 plasmid pX01, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
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13. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_AP019732 (Bacillus anthracis strain PCr plasmid PCr-pXO1) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
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14. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_AP018444 (Bacillus anthracis strain CZC5 plasmid pXO1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
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15. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP029324 (Bacillus anthracis strain 17OD930 plasmid pXO1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
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16. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_012656 (Bacillus anthracis str. A0248 plasmid pXO1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
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17. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_010934 (Bacillus cereus strain G9241 plasmid pBCXO1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
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18. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019589 (Bacillus anthracis strain SPV842_15 plasmid pX01, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
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19. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP010853 (Bacillus anthracis strain A1144 plasmid pXO1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
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20. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP007665 (Bacillus anthracis str. Vollum plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
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21. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP008847 (Bacillus anthracis strain HYU01 plasmid pX01, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
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22. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP006743 (Bacillus anthracis str. SVA11 plasmid pXO1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
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23. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_AP014834 (Bacillus anthracis strain Shikan-NIID plasmid pXO1) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgcat-aataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -atataaataatcttttcccgtaatgttttt Protospacer ..** ************.* **********
24. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP029806 (Bacillus anthracis strain London_499 plasmid pX01, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgcat-aataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -atataaataatcttttcccgtaatgttttt Protospacer ..** ************.* **********
25. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_001496 (Bacillus anthracis virulence plasmid PX01, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
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26. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_017726 (Bacillus anthracis str. H9401 plasmid BAP1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
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27. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP014177 (Bacillus anthracis strain Stendal plasmid pXO1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgcat-aataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -atataaataatcttttcccgtaatgttttt Protospacer ..** ************.* **********
28. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP009597 (Bacillus anthracis str. V770-NP-1R plasmid pXO1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgcat-aataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -atataaataatcttttcccgtaatgttttt Protospacer ..** ************.* **********
29. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP009901 (Bacillus anthracis strain 2002013094 plasmid pXO1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgcat-aataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -atataaataatcttttcccgtaatgttttt Protospacer ..** ************.* **********
30. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP009340 (Bacillus anthracis strain Ohio ACB plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgcat-aataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -atataaataatcttttcccgtaatgttttt Protospacer ..** ************.* **********
31. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP009696 (Bacillus anthracis strain RA3 plasmid pXO1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgcat-aataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -atataaataatcttttcccgtaatgttttt Protospacer ..** ************.* **********
32. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP009463 (Bacillus anthracis strain SK-102 plasmid pXO1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgcat-aataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -atataaataatcttttcccgtaatgttttt Protospacer ..** ************.* **********
33. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP009699 (Bacillus anthracis strain BA1035 plasmid pXO1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgcat-aataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -atataaataatcttttcccgtaatgttttt Protospacer ..** ************.* **********
34. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP009592 (Bacillus cereus G9241 plasmid pBCX01, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgcat-aataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -atataaataatcttttcccgtaatgttttt Protospacer ..** ************.* **********
35. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP009543 (Bacillus anthracis strain BA1015 plasmid pXO1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgcat-aataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -atataaataatcttttcccgtaatgttttt Protospacer ..** ************.* **********
36. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP010321 (Bacillus anthracis strain Canadian Bison isolate A0369 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgcat-aataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -atataaataatcttttcccgtaatgttttt Protospacer ..** ************.* **********
37. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP009540 (Bacillus anthracis str. Sterne plasmid pXO1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgcat-aataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -atataaataatcttttcccgtaatgttttt Protospacer ..** ************.* **********
38. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP009330 (Bacillus anthracis strain K3 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgcat-aataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -atataaataatcttttcccgtaatgttttt Protospacer ..** ************.* **********
39. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP009324 (Bacillus anthracis strain PAK-1 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgcat-aataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -atataaataatcttttcccgtaatgttttt Protospacer ..** ************.* **********
40. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP009327 (Bacillus anthracis strain Vollum 1B plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgcat-aataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -atataaataatcttttcccgtaatgttttt Protospacer ..** ************.* **********
41. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP001975 (Bacillus anthracis str. A16R plasmid pXO1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgcat-aataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -atataaataatcttttcccgtaatgttttt Protospacer ..** ************.* **********
42. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP009317 (Bacillus cereus 03BB102 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgcat-aataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -atataaataatcttttcccgtaatgttttt Protospacer ..** ************.* **********
43. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP009980 (Bacillus anthracis strain Ames isolate BACI008 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgcat-aataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -atataaataatcttttcccgtaatgttttt Protospacer ..** ************.* **********
44. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP001971 (Bacillus anthracis str. A16 plasmid pXO1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgcat-aataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -atataaataatcttttcccgtaatgttttt Protospacer ..** ************.* **********
45. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_012473 (Bacillus cereus 03BB102 plasmid p03BB102_179, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgcat-aataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -atataaataatcttttcccgtaatgttttt Protospacer ..** ************.* **********
46. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP047132 (Bacillus anthracis str. BF1 plasmid pXO1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tgcat-aataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -atataaataatcttttcccgtaatgttttt Protospacer ..** ************.* **********
47. spacer 1.1|1820119|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019526 (Enterobacteria phage vB_KleM-RaK2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
aaattttttgaacttaatgcaat--ttcttga CRISPR spacer aaattttttgaacgtaatgccataatcgtt-- Protospacer ************* ****** ** *. **
48. spacer 1.1|1820119|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT708547 (Klebsiella phage Muenster, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
aaattttttgaacttaatgcaat--ttcttga CRISPR spacer aaattttttgaacgtaatgccataatcgtt-- Protospacer ************* ****** ** *. **
49. spacer 1.1|1820119|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT matches to AB897757 (Klebsiella phage K64-1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
aaattttttgaacttaatgcaat--ttcttga CRISPR spacer aaattttttgaacgtaatgccataatcgtt-- Protospacer ************* ****** ** *. **
50. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_010180 (Bacillus mycoides KBAB4 plasmid pBWB401, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgca-taataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -acattaataagcttttctcttaatgtcgca Protospacer .** ****** ***************. .
51. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP020744 (Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgca-taataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -acattaataagcttttctcttaatgtcgca Protospacer .** ****** ***************. .
52. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP037991 (Bacillus mycoides strain TH26 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgca-taataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -acattaataagcttttctcttaatgtcgca Protospacer .** ****** ***************. .
53. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP049914 (Vibrio sp. HDW18 plasmid p_unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgcataataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer tctaacataatcttttctcttaaaatttta Protospacer * .* ***************** .****
54. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP012100 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgca-taataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer -acattaataagattttctcttaatgttgca Protospacer .** ****** *************** .
55. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to DQ003638 (Listeria phage A511, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgcataataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer tctagaatagtcttttctgttaatgtttca Protospacer * .* ****.******** *********.
56. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ668717 (Listeria phage LMTA-34 hypothetical proteins, transposase domain-containing protein, and hypothetical proteins genes, complete cds) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgcataataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer tctagaatagtcttttctgttaatgtttca Protospacer * .* ****.******** *********.
57. spacer 1.4|1820317|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP046008 (Escherichia coli strain 1919D62 plasmid p1919D62-2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aaccctcttactatgagttccatttatttt CRISPR spacer agtcatcttgctattagttccatttattac Protospacer *..* ****.**** ************* .
58. spacer 1.4|1820317|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP046005 (Escherichia coli strain 1919D3 plasmid p1919D3-2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aaccctcttactatgagttccatttatttt CRISPR spacer agtcatcttgctattagttccatttattac Protospacer *..* ****.**** ************* .
59. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP045609 (Bacillus cereus strain SB1 plasmid p3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgcataataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer aaataaataattttttctcttaatgtactt Protospacer . ******.************** .**
60. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_015417 (Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p1BKT015925, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgcataataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer ggtggcataatcttttctcttaattttaat Protospacer *.. ****************** ** *
61. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP018939 (Bacteroides fragilis strain Q1F2 plasmid Q1F2-p2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgcataataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer gcaattataatcttttcccttaatgtactc Protospacer ** ***********.******** .*.
62. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP018939 (Bacteroides fragilis strain Q1F2 plasmid Q1F2-p2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgcataataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer gcaattataatcttttcccttaatgtactc Protospacer ** ***********.******** .*.
63. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_007581 (Clostridium phage c-st, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgcataataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer ggtggcataatcttttctcttaattttaat Protospacer *.. ****************** ** *
64. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to ACSJ01000017 (Clostridium phage D-1873 CLG.Contig173, whole genome shotgun sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgcataataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer ggtggtataatcttttctcttaattttaat Protospacer *.. ****************** ** *
65. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AP008983 (Clostridium phage c-st genomic DNA, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgcataataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer ggtggcataatcttttctcttaattttaat Protospacer *.. ****************** ** *
66. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP014152 (Clostridium botulinum strain BrDura plasmid pRSJ20_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tgcataataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer acttctatattattttctcttaatgtttta Protospacer . . *** * *****************
67. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013684 (Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tgcataataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer acttctatattattttctcttaatgtttta Protospacer . . *** * *****************
68. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013710 (Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tgcataataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer acttctatattattttctcttaatgtttta Protospacer . . *** * *****************
69. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP029455 (Bacillus cereus strain FORC087 plasmid pFORC087.1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tgcataataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer atattaataagattttctcttaatgttgca Protospacer ****** *************** .
70. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_010379 (Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tgcataataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer acttctatattattttctcttaatgtttta Protospacer . . *** * *****************
71. spacer 1.3|1820251|30|NZ_CP030045|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013700 (Clostridium botulinum strain AM1195 plasmid pRSJ11_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tgcataataatcttttctcttaatgttttt CRISPR spacer acttctatattattttctcttaatgtttta Protospacer . . *** * *****************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
700617 : 708532
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP030045|700617:708532|DBSCAN-SWA TATGGAAAAAGTATTAGAAGTTAAAGACTTAAGAATCTCCTTTGATACATTTGCAGGTAAAGTCAACGCCATTCGTGGTGTGAGTTTTGATCTTTATAAAGGTGAAACGTTAGCCATCGTAGGTGAATCAGGGAGTGGTAAATCTGTTACAACTCGCAGTATTATGCGTTTGTTGAGTAGTAATGCCAATATTGATAACGGGGAAATTTTGTTTAAAGGGCAAGATATTGTTCATAAAACAGAAAAACAAATGCAAGCCATTCGTGGTAAAGAAATCGCAATGATTTTCCAAGATCCGATGACTTCATTAGACCCAACGATGCCAATTGGCAAACAAGTGGCGGAATCATTAATCAAACATAATAAAGTCTCAAAAAAAGAAGGCTTAGCGCAAGCATTAGAATTACTAAAATTAGTCGGCATTCCTAATGCTGAAAAACGTTTGAAAAACTATCCACACCAATTTTCTGGTGGACAACGTCAACGGATTGTCATTGCAATTGCTTTAATTTGTTATCCAGAAGTTCTAATTGCAGATGAACCAACTACAGCGTTGGATGTAACCATCCAGGCACAAATTTTAGAGTTATTAAAAGACTTACAAGAAAAAATTAGCACTTCGATTATTTTCATTACCCATGATTTAGGGGTAGTAGCAAACGTGGCTGATCGTGTCGCTGTCATGTACGGTGGACGTCTGGTTGAAGTGGGAACAGCAGAAGAAATTTTCTATAATCCACAACATCCATATACTTGGGGACTTTTAGGGTCAATGCCAACGATGGAAGGAACAGAAGACAAACTTTATGCGATTCCAGGTTCACCTCCAGATTTATTAGATCCACCAACTGGAGATGCCTTCTATCCACGGAATGAGTTTGCTTTAAAAATTGATACAGAAAAAGAACCACCTTATTTTGAAGTATCACCGACACACAAAGCAGCAACGTGGTTATTAGCACCACAAGCACCAAAAGTTACGCCTCCAGCAGAGATTGTTCGTCGTTGGGCAATTTATGCAGAGCGTCAAAAAAAACCAGGAGGTAGTAATTAATGGCAGAAGAGAAAAAAGTCCTATTAGAAGTCACTGGTTTGAAACAGTATTTCAATGTTGGTCGTAAAGACGAAGTAAAAGCCATTGATGACATTAGTTTTCATATTTTTGAAGGCGAAACCTTTGGATTAGTTGGCGAATCAGGAAGTGGAAAATCAACAACTGGTCGCAGTGTCATTCGTTTATATGATCCAACTGCTGGTGAAATTCTTTTCGATGGAAAAGACATTAGCAAAATTAAATCAAAAGCGGACATGCAAGCATTCCGCCGCGATGTTCAAATGATCTTCCAAGATCCATATGCTTCATTGAATCCAAGAATGAAAGTCAATGATATTATTGCTGAAGGAATCGATGTCAATGGATTAGCTAAAACACCAAAAGAGCGGGAAGAAAAAGTCAATGAACTTTTAAAAACGGTGGGATTAAATCCAAGTCACAGTACGCGTTATCCTCATGAGTTTTCTGGTGGGCAACGTCAACGGATCGGGATTGCTCGTGCTTTAGCGGTTAATCCACGTTTCATTATCTGTGATGAGCCAATTTCGGCTTTGGATGTGTCGATTCAAGCTCAAGTAGTAAACTTATTACAAGATTTACAAAAAGAACAAGGCTTAACTTACTTGTTTATCGCACATGACTTATCGATGGTAAAACATATCAGTGACCGAATTGGCGTAATGCACAGTGGGAAATTATTGGAAATGGGCACAAGTGATGATGTCTATAATTTCGGCGTTCATCCTTATACAGAAAGTTTGCTTTCTGCGATTCCATTACCAGATCCAGACTATGAACGCACACGTAAACGGATCGTTTACCAGCCTGCAGCGGCAGATGGGAAAGATCGTGAGCTCCGTGAAATTCTCAATGGACACTATGTTTATTGTGCTGAAGACGAAGTTGCAATGTACCGTGAAAAAATTGAAGAGAAGAAAAGAAAAGCTGGTTTATAACCAGCTTCTTTTCTAACTATCTTGGTAGGGTGGTTATGAGATGAAGGCTCTGAAAGCTTATAAATACAGACTTTATCCAACCTCAAAACAAGAAGAGTTTATTCAAAAAACATTTTCTTGTGTTCGCTTGGTGTATAATTTAATGTTACAAGACCGGATTGATATCTACAAAGAGATGCGAAAAAATCCTCAACAAACGTTTAAAATGCCAACGCCAGCTAAATATAAGAAACAATACCCTGTCCTCAGAGAAGTTGATAGTTTAGCCTTGGCAAATGCACAAGTTTATTTGGATCGAGCCTTTAAAAATTTTTATCGGGAAAAAGGGATGGGCTTTCCAAAAAAGAAAAAGAAAGAAACGGTGCATTCCTACACTACGAACAATCAACATGGCACGGTCAAAATTTTGGATAATCGTTATTTGAAAGTACCTAAATTGAAATCTTTAATTAAAATGAAGGTACACCGCCAACCGCTGGGGGAGATAAAATCTGTAACTATTTCTATGAGTACGAGTCACAATTATTATGTTTCCATTTTGTGTGAAGCGCCGATTGAAATGAAAACAAAGCAACAAAAAATGGTGGGAATTTGTAGCAGTAGGGAAAAATTTGCGCTGCTTTCGAATGGTGAAAGCTTCGAAAAAAGCTATTGTTCAAAGCATTTAAAGCAAAAACTACGTCAAGAAGAACGAAAATTAAACAAGCGTAAAATGATTGCTTTAGAAAAAGGTGTTGATCTTTCGCAAGCAAAAAATTATCAAAAACAAAAAATAAAAGTCGCAAAAATTCGCGAAAAAATAGCCAACCAACGAACGGATATTTTAAACAAAATTACAACGGAATTGGTTTCAAGTTACGATGTTATTTGTATTGAAAAAGCCCATCACAGTAATGAGCGGCCGCCAAAACATGATCGTTCTGAACTGGCTTGGTCTTTATTTTTAGCTAAACTGTTGTATAAAGCACAATGGTATGGCAAAGAACTCATTTGTATTGAGTCAGAGGAGATCGAAACAGAGTTGTCTTTTTCTGAAAGTACAGAAAATTCAGAGTATCTTAGAAGCCAAAAAATCTTAGAACGTGGCTTGTCTAAACGAGAAACCTTATAAATAGAAGAACTGTAGGGACTACAGGGATCGCCTAGGGGATAGAAAATGTACACCATGTGTTGAACCATTTGTTTCTAGGAAGTCACATTGGGACAGTCCACTAATTATTAATAATCAAAATACGAGTTCAAACGAATCTAGTGCTAGATTCGTTTTTTTTTTGAGGAAATATATTGACAACTAGGATAAACTAAGGTAAACTAGTGAAGTTGAGAAATGAAAGCAGAAGCACCCGCTTCTCGCCTTAGTTGAGTATATCGCTGGGCTAGATAAAGTATTCCTTATTTTTTAAGTAAGGCAGACTGTTGGCGGGTTCTGGATAGGAACCTGTTTTTTTATTGCATTTAGCAAACAAAGCAGACTTCCGTTAGGATTTTCTCTTAAAAATTTTGGAGGTGAATGACCATAGCAAAGGATATGATGGTTAACGACGGCATTCGTGCACGCGAGTTACGTTTGATCGGACAAGATGGTGAACAATTAGGTGTAAAAACCAAAGCAGAAGCATTACAAATCGCTGAATCTGCAAACTTGGATTTAGTACTTGTAGCGCCAGGAGCGAAACCACCAGTTGCGCGAATTATGGATTATGGAAAATTCCGTTTCGAACAACAAAAGAAAGAGCGTGAAGCTCGCAAGAAACAAAAAGTGATCAACGTCAAAGAAGTTCGTTTAAGTCCAACAATTGACGTAAATGACTTCAATACAAAACTTCGTAATGCGCGTAAGTTCTTAGAAAAAGGAGACAAAGTGAAAGCTTCTATCCGTTTCAAAGGCCGTGCCATTACCCATAAAGAGATTGGTCAGAAAGTTCTTGATCGCTTAGCTGAAGAAACTGCGGACATCGCCACAGTGGAACAAAAAGCGAAAATGGACGGACGCAGCATGTTTCTAACGCTGGCACCGAAAAACGACAAGTAAACGAAGAGACCGAGCATTCGGACTTTTGGTAATTTCTACAAGAAGGATATTCGACAGTTGTGACTGTTAGAGTCTTTCACTTGAAGCAAAGATTTTGAGGAGGAAAATTAGTCATGCCAAAACAAAAAACACACCGCGGATTAGCAAAACGTGTAAAACGTACTGGTGGAGGCGGCTTAAAACGTGGCCGTGCCTTTACATCTCACCGTTTCCACGGTAAAACTAAAAAACAACGCCGTCAATTGCGTAAAGCAAGCATGGTTGCAAAAGGCGATTACAAACGTATCCGCCAACAATTAGCAAGAATGAAATAAAACAACTCGGTGACTTTTAGATTACCGTCAAGAGAAACAAGATATTAGGAGGAATTCAACATGGCACGTGTTAAAGGTGGAACAGTAACCCGTAAACGTCGTAAAAAAGTCCTTAAGTTAGCGAAAGGCTACTACGGATCAAAACATACTTTATTTAAATCAGCAAAAGAACAAGTAATGAACTCTTATTACTATGCATTCAGAGACCGTCGTCAAAAGAAACGTGACTTCCGTAAATTATGGATTGCACGTATCAACGCGGCAGCTCGCATGAATGGCTTAAGCTATTCTAAATTAATGCACGGTTTGAAATTGGCAGAGATTGATATCAACCGCAAAATGTTAGCTGACTTAGCCGTTAACGATGCAGCAGCATTTACAGCGTTAGCTGAACAAGCAAAAGACGCTTTAAGCAAATAAGCTTAAATAATCTTTCACACCCTACTCAATGAGTAGGGTGTTTTTTTTAATAACTCCGTTGGTAACTTTCATCTATAAATGAAAAAACTTGTGAGAGCGGAATTTCTTCAGAAAGACTTAACCAATGCTCTTTATTCATATGATAGGCAGGAAAATAGCCAGGTTGGTTCTTTAATAAGGCAATCAATTCAGGCGCAAGTTTAACGGTTAAAATAGTGAGCTGCTTATTCTCGGTAGCGCCGAGCAGTTGTGCATCCAGTGGCATAATTAAAGCAAACCATTTTGCATTTCTAGGATGACGAAAGACGAGATAGTCTAGATGTTTTTTAAAAGGAAAATCGGGCGTTATCTGATAACGTTCTTGGATATAGGCGCTAATAGTTTCTTGAAAAGTCATAGGTTTCTTCCTTTCGTTAAGGCTAGGCATATCTATTTACATCATAGCAAAAATTACATAAAATTACTTCGTTCAAAGGAATGGGAGGAGGGAGCAGATGACATTAATTTCAACAATTTTAGTAACCTTGGTGGCTGTAGAATTTTTCTACATTATGTATTTAGAAACGATTGTACCAACATCTGAGACAACAAGCCGTGTTTTTAAAATGGATAAGCAAGAGTTACAAAGAAAATCAGTGACTACATTGTTTAAAAATCAAGGAATCTATAATGGACTAATCGGTGCAGGACTTATTTATAGTGTCTATTTTGCGCAAGCAACGATGGAGATGACAAAATTTTTATTGATTTATATTATTTTAGTGGCGGCGTACGGTAGCTTAACTAGTGATAAAAAAATCATTTTAACACAAGGCGGTTTAGCTATCGTGGCTTTGATTAGTTTACTTGTTTAGCCATCAGAGTTAATAGAGAGAGACAGTCAAATCGACAGAAAAAACACGGTTGATTTGACTATTTTTTATGGAATTGAGAGAGACAAAATGTGGTATACTTTGTTTATTAGATAGGGAGGAATTAAAAATGCTGAACCAAAAAGAAGTAAAAAAAACCGATTATCCTCAATTAATTTCTCTATGGCGTTCTTCAGTAGAACTACCCATTTGTTTTTGAGTCAGGCAGATATTGATAAAATCGAAGTGGTTTTACCTGGTTATTTTCAACAAGTTCAATTAAGTATGTGGTTAAATGAAGAACAGAAATGCGTGGGCTTTAGTGGAACAAATCAACAAACTTTGGAAATGTTATTTATTGACCCAGTCTATTTTCGTAAAGGCTATGGTGGAGAAATTATCAAAAAGTTAATAGAGCAAGAATCAATTGTCTTTGTTGATGCTAATAAACAAAATGAAGGGGCAGTGAAGTTCTATCAATCTCAAGGGTTTCAAGTAATTGGTGAATCAAAGGAAGATCCTCAAGGAAATCCGTTTCCTATTTTACATATGAAACGGATATAGAAAAGAAGGGAGAAGCCATGCGAGTAATCGTTACAGAATACCAACCAGCCTGGGTGGAACAGTTTGAAGAAGAAGCCCAAGCGTTGAAACAGATTCTAAAGGAAAATTGTCTTAAAGTTGAACATATCGGTAGTACCTCTGTGCCTAATTTAGCAGCCAAACCAATTATTGATTTTTTGGTCATTGTTGAAGAAATTGAAAAAGTAGACCTGTTACAAGGGGAATTTGAAAGAATCGGTTATGAATATATGGGGGAATTTGGGCTATCAGGACGTCGTTATTTACGAAAAGGCCCGATAAAAAGAACACATCATGTGCATATTTATCAGTTTGACAATACGCAAGAAATTTTGCGCCATCTTGCTTTTCGAAATTATTTACGAGAAAATCCGGCAATTGCTACAACCTATGGTACATTAAAAAAGCAATTGGCCCAAGCACACCCCGATAGCATTGATAAATATATGGATGGCAAAGATGCGTTCATTAAGAAAATAGAAAAAGAAGCGTTGAAGAAATATTGGGAAAAATAAAAAAAAGTTGCTAAAGCTAGCAACTTTTTTTTGGTTCTTTTTTGAAAAAATGATAAAGAAGACCACTTAAAAGAACACCTAGAATAATTCCAATCGCTAAATTATGCGTATAGACGATCACACCCACTGTCACGAGTAAAATAACAATTTCAGTAATTTCAAAAGTTCGGAAAAGCTGCAAACTTTCCCAATCAAAGGTGTCGACTGCCACTGTCATCATGATCCCAATCAATGCAGCTGTAGGAATGGCTACCATCACGGATTTAAAAACAAAAATGAATAGAAGGAGGGTAATACCTGAAATCAAAGTAGAAAGCCGTTTTCGTCCCCCTGATTTAACATTAATGACCGCTTGCCCGATCATCGCACAGCCAGCTTGGCCACCAAAAAAGCCGGTAATTATATTAGCGAATCCTTGCGCCTTAACTTCTCGTTGGCTATCACTTTGGCTCGCTGTCATTTTGTCCACAATGGGGATCGTCAATAAAGATTCAATTAACCCGACCATTGCTAAGGCAACAGAACTAGGTAAAATAATCCACAACGTTTCTAAGTTGACGGGTACATTAGGCCAACGGATCGCTGGATGAAACTGACTCATTTCACCAAGATCACCTACTGTTTGCAAATGACCTTTTAAAAAATAGGACAGGATAGTCATGAATAAAATAACAATTAAAGCAGGAGGCACAATTGTAATAAACTTAGGTAATAGATAAATAAGTAAGATACTACAGATAATCATACCGTAGGACCACAGTGTTTGATGGGGCAATTGTTGTACTTGCGCCATGAAAATTAAAATGGCTAACGCATTGACGAATCCGTACATCACTGTCTTGGGAATAAAGCGCATCAATTTGTGGATACCTAAATAACCTAAAATAAATTGTAGAAAGCCTGTTAAAATAGTCGCAGCAAGCATGTATGACAAACCATGTGCTTGAATTAAGCCTGCAAGGACTAAGGCCATTGAGCCAGCAGACGCCGAAACCATTGCCGGACGGCCGCCCGTAAAAGTAATCACAAGTAAAGTAACAGCTGAAGCAAACACTGCAGAAAGCGGGTGAACACCAGCAATAATCGCAAACCCGATTACTTCTGGTAAAATGGCGACAGAAGAAACGAGACCGGCAAAGAGATCATTTCGTTCATTGCCTAACCATTCGCTTTTTTTAATACTAAATAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP030045|700617:708532|704136_704658_+|WP_002355797.1|DBSCAN-SWA MTIAKDMMVNDGIRARELRLIGQDGEQLGVKTKAEALQIAESANLDLVLVAPGAKPPVARIMDYGKFRFEQQKKEREARKKQKVINVKEVRLSPTIDVNDFNTKLRNARKFLEKGDKVKASIRFKGRAITHKEIGQKVLDRLAEETADIATVEQKAKMDGRSMFLTLAPKNDK >NZ_CP030045|700617:708532|705032_705392_+|WP_002355799.1|DBSCAN-SWA MARVKGGTVTRKRRKKVLKLAKGYYGSKHTLFKSAKEQVMNSYYYAFRDRRQKKRDFRKLWIARINAAARMNGLSYSKLMHGLKLAEIDINRKMLADLAVNDAAAFTALAEQAKDALSK >NZ_CP030045|700617:708532|701669_702626_+|WP_002361357.1|DBSCAN-SWA MAEEKKVLLEVTGLKQYFNVGRKDEVKAIDDISFHIFEGETFGLVGESGSGKSTTGRSVIRLYDPTAGEILFDGKDISKIKSKADMQAFRRDVQMIFQDPYASLNPRMKVNDIIAEGIDVNGLAKTPKEREEKVNELLKTVGLNPSHSTRYPHEFSGGQRQRIGIARALAVNPRFIICDEPISALDVSIQAQVVNLLQDLQKEQGLTYLFIAHDLSMVKHISDRIGVMHSGKLLEMGTSDDVYNFGVHPYTESLLSAIPLPDPDYERTRKRIVYQPAAADGKDRELREILNGHYVYCAEDEVAMYREKIEEKKRKAGL >NZ_CP030045|700617:708532|700617_701670_+|WP_161978249.1|DBSCAN-SWA MEKVLEVKDLRISFDTFAGKVNAIRGVSFDLYKGETLAIVGESGSGKSVTTRSIMRLLSSNANIDNGEILFKGQDIVHKTEKQMQAIRGKEIAMIFQDPMTSLDPTMPIGKQVAESLIKHNKVSKKEGLAQALELLKLVGIPNAEKRLKNYPHQFSGGQRQRIVIAIALICYPEVLIADEPTTALDVTIQAQILELLKDLQEKISTSIIFITHDLGVVANVADRVAVMYGGRLVEVGTAEEIFYNPQHPYTWGLLGSMPTMEGTEDKLYAIPGSPPDLLDPPTGDAFYPRNEFALKIDTEKEPPYFEVSPTHKAATWLLAPQAPKVTPPAEIVRRWAIYAERQKKPGGSN >NZ_CP030045|700617:708532|702666_703737_+|WP_104890592.1|DBSCAN-SWA MKALKAYKYRLYPTSKQEEFIQKTFSCVRLVYNLMLQDRIDIYKEMRKNPQQTFKMPTPAKYKKQYPVLREVDSLALANAQVYLDRAFKNFYREKGMGFPKKKKKETVHSYTTNNQHGTVKILDNRYLKVPKLKSLIKMKVHRQPLGEIKSVTISMSTSHNYYVSILCEAPIEMKTKQQKMVGICSSREKFALLSNGESFEKSYCSKHLKQKLRQEERKLNKRKMIALEKGVDLSQAKNYQKQKIKVAKIREKIANQRTDILNKITTELVSSYDVICIEKAHHSNERPPKHDRSELAWSLFLAKLLYKAQWYGKELICIESEEIETELSFSESTENSEYLRSQKILERGLSKRETL >NZ_CP030045|700617:708532|707356_708532_-|WP_002380126.1|DBSCAN-SWA MLFSIKKSEWLGNERNDLFAGLVSSVAILPEVIGFAIIAGVHPLSAVFASAVTLLVITFTGGRPAMVSASAGSMALVLAGLIQAHGLSYMLAATILTGFLQFILGYLGIHKLMRFIPKTVMYGFVNALAILIFMAQVQQLPHQTLWSYGMIICSILLIYLLPKFITIVPPALIVILFMTILSYFLKGHLQTVGDLGEMSQFHPAIRWPNVPVNLETLWIILPSSVALAMVGLIESLLTIPIVDKMTASQSDSQREVKAQGFANIITGFFGGQAGCAMIGQAVINVKSGGRKRLSTLISGITLLLFIFVFKSVMVAIPTAALIGIMMTVAVDTFDWESLQLFRTFEITEIVILLVTVGVIVYTHNLAIGIILGVLLSGLLYHFFKKEPKKSC >NZ_CP030045|700617:708532|705886_706246_+|WP_002358829.1|DBSCAN-SWA MTLISTILVTLVAVEFFYIMYLETIVPTSETTSRVFKMDKQELQRKSVTTLFKNQGIYNGLIGAGLIYSVYFAQATMEMTKFLLIYIILVAAYGSLTSDKKIILTQGGLAIVALISLLV >NZ_CP030045|700617:708532|706824_707340_+|WP_002361365.1|DBSCAN-SWA MRVIVTEYQPAWVEQFEEEAQALKQILKENCLKVEHIGSTSVPNLAAKPIIDFLVIVEEIEKVDLLQGEFERIGYEYMGEFGLSGRRYLRKGPIKRTHHVHIYQFDNTQEILRHLAFRNYLRENPAIATTYGTLKKQLAQAHPDSIDKYMDGKDAFIKKIEKEALKKYWEK >NZ_CP030045|700617:708532|704771_704972_+|WP_002355798.1|DBSCAN-SWA MPKQKTHRGLAKRVKRTGGGGLKRGRAFTSHRFHGKTKKQRRQLRKASMVAKGDYKRIRQQLARMK >NZ_CP030045|700617:708532|705438_705819_-|WP_161978250.1|DBSCAN-SWA MPSLNERKKPMTFQETISAYIQERYQITPDFPFKKHLDYLVFRHPRNAKWFALIMPLDAQLLGATENKQLTILTVKLAPELIALLKNQPGYFPAYHMNKEHWLSLSEEIPLSQVFSFIDESYQRSY |
10 | Planktothrix_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
716600 : 773648
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP030045|716600:773648|DBSCAN-SWA 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56 | Bacillus_phage(26.67%) | tRNA,protease,transposase,integrase | attL 750848:750907|attR 768547:769608 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1100523 : 1121989
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP030045|1100523:1121989|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP030045|1100523:1121989|1120864_1121989_+|WP_002384639.1|DBSCAN-SWA MAFLRKEHAMFKKLMIQLALVIGLSLTIPMTTCAYTIEADPINFAYFPGSASNELIVLHESGNERNLGPHSLDNEVAYMKRNWSNAYVSYFVGSGGRVKQLAPAGQIQYGAGSLANQKAYAQIELARTNNATTFKKDYAAYVNLARDLAQNIGADFSLDDGTGYGIVTHDWITKNWWGDHTDPYGYLARWGISKAQLAQDLQTGVSETGETVIIQPGKPNAPKYQVGQAIRFTSIYPTPDALINEHLSAEALWTQVGTITAKLPDRQNLYRIENSGHLLGYVNDGDIAELWRPQTKKSFLIGVDEGIVLRAGQPSLSAPIYGIWPQNTRFYYDTFYIADGYVFIGGTDTTGARIYLPIGPNDGNAQNTWGSFAS >NZ_CP030045|1100523:1121989|1116128_1117055_+|WP_002360484.1|tail|DBSCAN-SWA MYKFVDTNQATHSTPLPSEALNFNGQFLEKVIPGYQTLSVSGRELVPSEIESYQLGIRDGKRHVYARIPERELTVKYRLSAVNNEAFRDAFNHLNVALFTEKDVSIWFNDEPEMLWFGSKSSVSDVPEGVNQVTGTFTLLLSDPYKYTRSDATSVMWGSPTITFQANYLMGNTGSGAVDFPILIEGGAYWGSTMITFQNRAYTMGDLGKEVRPIEIYPTVEGLKVKPTIILIGTGRGVWIKTRNDTINLGDFDRSEIIIDTENFYLTKNGAPMIRPMNDFYLYPNEPLYIQAKDSDFRLTIRYPNRFV >NZ_CP030045|1100523:1121989|1100523_1101483_-|WP_002360751.1|transposase|DBSCAN-SWA MTYTHLTSNELAMIEAYYNNHQSVAKTAVLLNRSRQTIHKVYQFFKTGHNALDYFNQYKKNKTRCGRRPIVLSDEQTEYIQKRVVQGWTPDVIVGRAEFSISCSMRTLYRMFKQGVFEVTHLPMKGKRKANGHKETRGKQSFRRSLRDRGNDYSKFNQEFGHLEGDTIVGKKHKSAVITLVERLSKVIITLQPEGRRAIDIENRLNQWMQSVPKHLFKSMTFDCGKEFSNWKSISNINDIDIYFADPGTPSQRGLNENSNGLLRKDGLPKQMDFNEVDESFIQSIASKRNNIPRKSLNYKTPIEVFLSHICKEELSNLI |
24 | Enterococcus_phage(42.86%) | holin,tail,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1269119 : 1314213
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP030045|1269119:1314213|DBSCAN-SWA 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62 | Listeria_phage(47.37%) | tail,plate,terminase,capsid,integrase | attL 1269080:1269097|attR 1317188:1317205 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1608059 : 1616703
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP030045|1608059:1616703|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP030045|1608059:1616703|1611076_1613296_-|WP_002365762.1|DBSCAN-SWA MMNEPTPKEIKETRLYAEWGLTDEEYHQIETILQREPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLKKFPTEGPQVLQGPGEGAGIVDIGDGLAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGELTDARTRYLFQEVVAGISGYGNCIGIPTVGGEIAFEPCYQGNPLVNAMCVGLIRHDEIQKGQAKGVGNSILYVGAKTGRDGIHGATFASEEFSEGEEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLDLIKNHQDILIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLILELDKVPQRETQMSPYEMLLSESQERMLICVEKGAEQQVCELFQTYDLEAVTIGSVTDDGQYRVFHSGKIVADVPVDALAEEAPVYQKAYQEPERIRAFKKLAPFIPEITNSTELLKRLLQQPTIASKKSVYETYDSQVQTNTVVQPGSDAAVLRVRGTNKALAMTTDCNSRYLYLNPEIGGQIAVAEAARNIVASGAQPLAITDCLNYGSPDKPESFWELWTSADGIAAACRQLGTPVISGNVSLYNETDGQAIYPTPMIGMVGVIEDVSQITTQAFKQVDDLIYLIGETQADFNGSEIQKMQLGRIEGQLRSFDLKEEKANQELVLKAIQAGLVASAHDCAEGGVAVALAESAFANELGLQVTLPLTKEYLFAETQSRFILSVSPQHQEAFETLIGRKAQHIGKVTETGLVIHALDDVINCSTKEAKALWEDAIPCLMKQKA >NZ_CP030045|1608059:1616703|1615097_1616222_-|WP_002399033.1|DBSCAN-SWA MNKPLKVGATIGIIGGGQLGRMLVMSGKKMGFQMIVLDPTLNSPAGQVADRQIVAAFDQTSALTELAELCDVITYEFENIEVASLEKAIPLEKLPQGTELLKITQNRLLEKTFLQSIGCKIAPFAEVKSQKELPQAIEKIGFPCVLKTIQGGYDGKGQVVLKCEEDFSQATKLLANATCELEKWVPFTKELSIIVAGNKHGYQSFPVSENIHRKNILHESIVPARISENVQQKAAELAQYIAEELNLSGVLAIEMFLTDSEELYVNELAPRPHNSGHYSIEACSFSQFDAHIRGISNWGIGLPQLLQSVVMVNLLGEHLEKSYQLCTSKPTWQVHYYGKAESKVGRKMGHVTITTPCLSETLKEIETVGIWNVT >NZ_CP030045|1608059:1616703|1613967_1614219_-|WP_002365764.1|DBSCAN-SWA MYFIKVYVTYKESILDPQGEAVKEAVHRLGFTEVAEIRVGKYFEMHVQQTEAIEEKIEQICDQLLANVNMESYRFEILSLEEI >NZ_CP030045|1608059:1616703|1614232_1614946_-|WP_002357270.1|DBSCAN-SWA MEKKALVYTGKAKKLYQTENAAVLFVEYLDQATALNGQKKDKVLGKGALNNQITSLIFEHLQQQKIPNHFIKKVSEHEQLIQAVEMIPLEVVVRNYAAGSFSKRLAIEEGTKLVTPIIEFYYKEDRLDDPFINEDHIQFLKVATPAEIVEIKALALQINQALSQLFQRLNICLIDFKIEIGRTKANQLLLADEISPDTCRLWDLNTNEHLDKDVYRRELGEIVPVYEEVLQRLLTAN >NZ_CP030045|1608059:1616703|1613292_1613967_-|WP_002357272.1|DBSCAN-SWA MKLAVIVFPGSNCDADLLWAVKEVMGVDAEFVRHDATSLAKFDGVLLPGGFSYGDYLRCGAIARFSPIINEVIRFATEGKMVFGTCNGFQILTEIGLLPGTLLRNDSLRFICKSVPLKVNTHTKFTSEYPENVSIHLPVAHGEGNYYCDEKTLQELKEKNQIVFTYQEKVNGSLANIAGICNEQGNVLGMMPHPERAMEELLGSTDGRSFFASIIKNFGKELSQ >NZ_CP030045|1608059:1616703|1616214_1616703_-|WP_002365766.1|DBSCAN-SWA MKPLVAVIMGSTSDWATMKAACLVLEELKIPYEKRVISAHRTPDLMFRFAEESRTKGLKVIIAGAGGAAHLPGMVAAKTTLPVIGVPVKTRTLNGIDSLLSIVQMPGGVPVATTAIGSAGATNAGLLAAEILSIDDLQLAERIQARRQSLEKAVMESGEQLE >NZ_CP030045|1608059:1616703|1608628_1609660_-|WP_002365760.1|DBSCAN-SWA MENAYSKAGVNVEAGYEVVERIQKHSQKTQRTGTLGMLGGFGGCFDLSSYKLKEPVLVSGTDGVGTKLLLAIEEQKHETIGIDCVAMCVNDVVAQGAEPLYFLDYLALGTVNPAKVEAIVAGVAAGCCEANAALIGGETAEMPDMYEADAYDVAGFAVGIAEKSQLLTPSNVKEGDFLIGLPSSGLHSNGYSLVRNVFFKKHSFKTTDKLPELAPKTLGEELLTPTKIYVKELLPLLKAGLVHGAAHITGGGFLENLPRMFSSSLAAEIQLNSWPVLPIFKLLQKYGEIPSEEMYEIFNMGLGMILAVSPEHVKKVQELLPEAFEIGRLVPRKTKAVIFKEAL >NZ_CP030045|1608059:1616703|1609661_1611101_-|WP_002389355.1|DBSCAN-SWA MSYEAKSLNEECGIFGIWGHPDAAQVTYFGLHSLQHRGQEGAGIVANNSGKLDGHRDLGLLAEVFQKQEQLNALEGTAAIGHVRYATAGTGSVDNIQPFLFKFYDSQIGLAHNGNLTNAKRLRKQLEREGAIFHSNSDTEILMHLIRKSTAASFLDKLKESLNLVKGGFAYLLLTETMMIAALDPNGFRPLSIGQMNNGAYVVASETCALETVGARFIQDVAPGEVVIISDEGLKIEVFTTEVQPAICAMEYIYFARPDSNIAGVNVHTARKRMGKNLAIESPVAADMVIGVPNSSLSAASGYAEEAQIPYELGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRMKLSAVRGVVKGKKVVLVDDSIVRGTTIRRIIHLLKEAEAQEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRDELIAANYSIEEIKEQIGADSLAFLSESGLIDGIQLNYDAPYSGLCMAYFNGDYPTPLYDYEEQYQASLKKETRRN >NZ_CP030045|1608059:1616703|1608059_1608632_-|WP_002389224.1|DBSCAN-SWA MKIAVFASGNGSNFEAIAAAFSQKKIAGQLSLVFCDQPEAYVLTRAKKRKIPVVCFSPSDFPSRGQYEEQVLKHLKEHQIDLIVLAGYLRIIGKTLLEAYPKRIVNIHPSLLPSFPGLHGIEEAFHYGVKITGITIHYVDSGVDTGPIIFQTTTKIDTEDTLDTLTEKIHALEHEWYPKIISQIVKETTK |
9 | Synechococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1641938 : 1710834
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP030045|1641938:1710834|DBSCAN-SWA TATGGTAGACAAACGTAAATCTCCACGAAAATTTGACGAAGAGTTCAAAAAATCAATCGTAAAACTTTATGAAGGTGGCAAATCGCAAAACGCTTTAGCTAATGAATATGGAGTCGCCCTGTCCTCCGTAGCTCGCTGGGTGAAGCAATATTCTGAAGTCCAAATTGATGATGATACGATCCTCACGGCTCGACAGATCAAACAGTTACAGAAAAGAAACCTTCAGCTAGAAGAGGAAAATTTAATCTTAAAAAAAGCGATTGCCATATTCACGCCACACTCGACAAACGACTAAATGCGATTCGTATTTTACGTCATGAACACTCTGTTGTTACGCTTTGCAGGGTTCTTAAGGTTAATCGTTCAACTTACTACAAACGTTTTTCTGGAAAAATTGCTCCTAGAACAGCAGAAAACCAACAGTTGAGAAAGATGATCTTAGAAATCTATACAACCTCTAAAAAACGAGTAGGTCCTGCAAAAGTACGACGCATGCTTCTACGTGACTATGGCATTTCTATTAGTATTGGACGAGTTTATCGCCTAATGAGTACAATGAACTTACCTAAAATGTCTACAGTAAAACCTGTCTTTAAACCGACCGCAGGTCAGGTTTCTTTGAAACGCCCTAATCATTTGAAACAAGCGTTTAACCCTCCTGCACCAAATCAAGTATGGACGAGTGATTTTTCTTATATTCCTGTTGGAAAAAAATCATTTGTTTATCTTTGTGTGATTTTAGATTTATTTTCTAGAAAAATCATTGCTTGGACTGTCAGCAAAAATATTGATACTACTTTAGCTATTACAACACTAGAAAAAGCAATTCAAGTCAGAAAGCCTAAGGCTTCCGTTCTTTTTCACACAGATCAAGGTTCCCAGTATACTTCATTTGAATTCAGAAAGTTTTTAGAAAATCATTCTATTGTTCAGTCCCTATCGAAACCTGGGTATCCCTGGGACAACGCCGTTACAGAAGCTTTCTTCAAATATATGAAGAAAGAAGAACTCAACAGAAGAACCTTTTCTTCTCTTCAAGAAGTCCAACTTGCTTGCTTTGAGTATATCGAAGGATTCTACAACTCACAGCGTCCTCACGGAACCTTAGGTATGCTTACACCAAATGAAATGGAGGATAAATACTTTGATTCTCACTAAGTATCTGCTCTTTTTGTGTCTACTTTATTGACATTTATCCACATTGAAATGCGGTCATTATTGTACCAGCGGATATAGCTGTCAATTCCGACAATTGCTTCGTCTAGTAATTGAAAATTTTGAAAATTAACATACTCTCTCTTCAGAATAGAATGAAAGCTCTCAATTCTCGCATTGTCTCCAGGACATCCTTTACGGGAATAAGAATGCTTGATATTTAGCTGAGCTAAGCTGTTTTCAAATAAATCGCTCGTGTATTGGCTTCCCATATCACTATGAATTATTTTTGTTCCTAATGATTCTAGAATAGGTTGATTAATCACACTAGTAGCGAGTTCTTTTGTCATGTTAGCGCGTATTTTATGTGCTTCAACCCGACGGGTTTCAGGATTATAAAGGCTGGCTAAGTAGACCCACTTACGTTTCACGGGAATATAGCTAATATCCGTTAACAAGACACTTGATTTATCTTTTAATTTTTTTATCAAGTTAGGACGTTGAGCTATTTCGGTATAACTTTTAGGTTTTTTCATTTTTCGAACCATTCTTGATTTGATTCCTAATTCCCGCATGAGTTGATAACTAAGGTAGCGACTGATTTTGAGATTTAACGTCTCTTTAAAGTATTTCATTATCCGTGGATAGCCGTACATGGGGTATTTCAACCAACAATCTAATACTTGTTGCTTAAGAAGTTGGCGTCTCTGTGCTGATTTACTCGACTTCCACTTCAAAAAGTCGTAGTAAGTGGATCTTGAAATATTCAAAACCTGTAAAATTCGGGTAATGCGGTGTCCTGCGTCTAAACTACGGTGAACGACTCGTAGCACGGTCGCTCGTCCCTTTTTCATTAATTTTTTGCCAGAAGCACCGCTGCTCGCTTTAAAATCTCGAGTTCCTCTTTCAATCGCTTATTTTCTTTTACTAACTCACGTTCTCTTAAAGAGAGAACCGCCCTATCGTTAGGATCTGCTTGACGAATCCATTTGCTAATCGTTGAGACACTGACATTATATTCTTTAGACAGTGAGTTGGCAGATCGACCGGTATGGCTCAGAGCTACCATGGATTCTCTAAATTCTCGTGAATATCTTGTGGCTGAATTTTTTGTTTGCATAATAAAAAAACTCCTTTAATCGATTATAGCGAACAACTTGTCGGTAATCATATTATAGGAGCCATACTCGATTACTTCCCGCTTACGACTGACTAGAAAAATATAGATTATTGAGGGATAGAAAGATAAAAGACAACCTTCCCTGATTAGAAACAGTTCAGGCTATATGCTCATGATTAAAAAAGGGCTCTTCGTCAAATAGTGTTGGTGAGTTCAAATTGAATGAGTGAATGAGCTCAGGCAGGAAAAAATTCTTGCCTGAGCGCTTTCTTATTTTTCGCTCTTTCTTAAACAAAGATCAGTCCTTGGATGATGTAGATTCTTGAGCGAAAATTCAGGAAGTTCCGATATCCATAAGCGATACGCTTGATTATTTTTATCTTGTTATTCGTTCCTTCTACGAAGCCATTACTGTAAGTAAGTTCAAATGCATTTTGAATCCCTTGCCGATACTTTTTGAAGAAAGTTAGTTTCTTACGAAACTCTTCTGGTAAGCGCTGATCAAGTTCTTCAATAAGTTCAAAGAAAAGCGTTGCGTTTTTTCTGTGGTAATGACAAAGAAGCAGCTGACACGTCTCATATGCTAATTTCAAAGTTTCATCATAAGATAAGAGCTCATCAATAATGGCTTTTTCTGTCATCGGACGCTTGAAAGAGCGCTCATAGTGGTAGTTAGCGCTATTCACGTTGAAGTCATTTTTCAAAAGAAGCTTCCAATATCGTTTTAAGCGTCGATAGTTCACCTTGTCAGTTCCTTTAAACTGTTTCATCGTCTTTATCCGTAATTGATTGAAGGTACGATTAATCTGTTGGACGATATGAAAACGATCCGTTACGATTTGAGCATTTGGAAAGACATGCTTAATCAGTTGGGCATAAGGTGCATTCATGTCCATGACTAGATACTTGACCTTACATCGTATATGACGTGGATAGCGTAAAAAATGAGCCTTCAAATAGGTAAGCCGACGGCTTTCCAAGATACTGATGAGCCGTTTAGTATGGCCATCCATGCAGATGAAGCTCATTGCATTACTACAAGAGTTCATTGAGCGAAACTCATCAATGCAAAGAACTGACGGTAAATAGTTAAAATTGGTCCTGAAGCTTTGCACGCAGTCTCGCATAATACGCATAACTGTCATGTCAGAGACAAAATATTCTTGAGCAATCTCCTTCAGGCTAATATTCTTTTTCAGATCTAAGGTGATCTTGAGTTGTAATTCGGTTGAAATGTGGCATTTTTCTCTAACAAGTGCTGTTTGAGCGTTGAAGGTCGCTCCGCAGTCTTTACATAAAAAGCGTGACCGTTTCAGTTCTAATAAAGTCTTCTTTCCCCTGAAGGGGACTAATTGGGTTTTTGTCTGGTGCGTCCCGTTTTTGATGATTTGCCATCATTCTTAACGCCACATTTTGTACAGGTCAAAGGTGTATAGACAAACTATATTGAGTCAAGCATAAATTCTTTGCTTTTAATAACATAGATTTCATATGATTCAAAGCATGACAAATAAGCTATACTTAAACATAATTTTAAAAATAGTTAGTTGACAATCATCTTCCGCTCGTCATAAATCTCGTTTCTTTTTAATAGTTGGAAAATAATTCGGACCAGCTTTCTCACAACATGACTAATCGCAACATTGTATTGCTTGCCTTCATCCAATTTTTTCGCGAGGTAGACACGCATAGACGGTGACCATATTGACATTAGCCTCGCTCCTTCATGCAATGCCCAAGGAAGATATGAAGAACCGCGTTTAACCATTTTTCCAGACTCTAACTTGTTCATTCCCGAAGTTGATACTGAAGGTTCTGCACCTGCATAAGCGAGCAATTGATTTGGTGATCTGAAATTTTTAATGTCTCGTATTTCTGCTAAAATAACACTGCCTAAGCCGTTCACGATGCCTGGTATCGTTATAATAGGGGAATCAATTTCACTCATTAAACGAGTGACTTCTTCTTCGGCTTTTGAACGCATTTTTGTAAAGTACTGAATAGCGTCAATGGTTTGAATCAGTTCAAATTCTAGTGCTGGTGATTCCTGACCAATTGATGTTTGAGCCAAACGTTTAAGCTCCACAGCCTGTTCTTTTCCTAACCGTCCTCTTGAATACTTCGTTATAAGATTGGTTAATTTAGTTAAATGCGCACTGCCCATTTTTTTAGCAGATGGATACTCTTTTAAAACCTCATACATGTACGACTGATGTTTCGCAGCAGAAGCACCTAAAGATACCGCTAGTTCGGGGAATAAAATATCTAAAATTCTTGTATAATTAATTTTCTTTTTGGTGCAATCCTCTTTAATTCTAGCAACATGACGTGTCGCGTATTTCAGTTCAATCATGTTCGATTGGGTATCAAAAATTTGTTTATCCAAATCTTCCCTTAGTTTACGAGCAATTGTCATTACATCCTTCTTGTCCGTCTTTGTTTTTCGTAAGCTTTGATTTTTCGCAAACTCTTTAATTTAGAATGGATTATAGCTGAATGTCGGATAGCCTTGTGTCCGAAGAAAACGCAAAATATTAAAACAATAATGACCGGTATCTTCTAGCGCAACCTGAATCTCTTCACCTGTTGTTTCTTGTAGATTAGCTAGCGTCATCTGAAGCTTTGTAAAACCTTCGCGATTATTTTTAATCTGAAGATGACGAATGAAGATCGTTCCTGCAGTATCAATTACCGCCAAATCGTGTTTATTCTTTGCGACATCAAT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55 | Streptococcus_phage(27.27%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1741441 : 1781551
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP030045|1741441:1781551|DBSCAN-SWA 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45 | Lactococcus_phage(20.0%) | tRNA,plate,tail,holin,transposase,head,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1786799 : 1798395
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP030045|1786799:1798395|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP030045|1786799:1798395|1792914_1793109_-|WP_002364223.1|DBSCAN-SWA MKAIRETRLVGAFLLMIVLGVLLKSHFSMPILATLSAPFFIHWFFNWDEAKYQYSKKGGDKKCM >NZ_CP030045|1786799:1798395|1792144_1792372_-|WP_002364220.1|DBSCAN-SWA MIEVRGLGNDIYELMLANAQNNIIQSVRTSASYGNTSCVVSSKGATKPFLDQLQMQGVDYIELEDEKIKLFWEGL >NZ_CP030045|1786799:1798395|1788122_1788548_-|WP_002389212.1|DBSCAN-SWA MRIILPIEPKPQSRPRFARRGNYVQTYEDSAMRAYKQKVKAYLRKAKPELIEKGAIFAHVTFYVPAPKYLLSSKKKRLEVELERKYCDKKSDLDNYFKAVTDAAEGILYKNDGQIAVMVCQKLYSMRPRTELEITSLEEQV >NZ_CP030045|1786799:1798395|1789171_1790173_-|WP_002389256.1|DBSCAN-SWA MARPYKQGVDYYSLDVDFLKDIKYRKIRKSCGPQTCEILLCLLSYIYGDMGYFLRWDEDSAFLVADDVGAKEGLVEEVVNKAVQVGFFDHDKYQKYKILTSNGIQKRYKLMTSKRKEVVLQEEYLIIDGNNSLPTVVNDVNNSPSTVVNGVNNTQREKERESKVNKSKVNKKETESSINPSLPETSVEKAFFEEPLGEEKLTELIRYYSQNVSPATPVNITDLQYDLSDFDGDLELLKEAVNICARNNERRYSYFAGILKNWRANGVKTYADYLNNERERADKKTQNKQYQNKPVRQEKVPEWMNQANGEEEKLSPEEQAEFERQMQELLGGE >NZ_CP030045|1786799:1798395|1788565_1788865_-|WP_002389080.1|DBSCAN-SWA MNELVKLVEEWAKEKRLDKAEPEKQMLKVIEEVGEVGAALARNNENDLRDGIGDVVVTLIILAMQKNMDLYECLNQAYSEIKNRQGEMVNGVFVKEADL >NZ_CP030045|1786799:1798395|1792371_1792695_-|WP_002369793.1|DBSCAN-SWA MNDKIQNLLMELVKECRKGKVAIVLSTVDSEMMEASSVLLAGSLPEQAIAFSELFEKFKEEALAHDCDCPQCKQIKESFIGAESSSTKQNNEEKLDILLKDFLRGEL >NZ_CP030045|1786799:1798395|1795298_1795946_+|WP_002409785.1|DBSCAN-SWA MTPMYLDYDTYFEYHDQTYIIIEKVANYYGIELKELRWKHYKDYMIDVENVDIIPYSFGDVSRKIFSGNIIRFHDKCGISYNSTMVKGRQNFSILHESAHYFFDMNKECKSQSFSDLITGKGYTSEDEPKEIRANIFASLALINNEALKECLQKQMSFRQICEEFEMSAAALYVRLYDFLTKIFLLNTCLARSAINQYRYNYDSTKLISYVKMVL >NZ_CP030045|1786799:1798395|1786799_1787216_-|WP_002389289.1|DBSCAN-SWA MILLLKEVDFRQTKANARNVLKSFRRLERIAGRSLIDLKSPIITDMPKSQSHGNKAEDALVQLADAEAERDAILSALMALSLTSRQILHYSFCVQDHYSNYKIAREVGYSERSIQRMKSEALIEFAEAYRNGKIIAYK >NZ_CP030045|1786799:1798395|1797246_1798395_+|WP_002389015.1|integrase|DBSCAN-SWA MAKLNWSKKYKYVFSYSNKKGTFWGYRYPYYNSLKHRKEASKRGFESERAANKALLKIQYDLETQNTSFIENKQLTIDEWIKVWIPYAQDNWSVSTKQNIESAIKFHISPLIGNQKLSSLNKITYKREFIDKLRQENKYTESTIQTWHKIVMRMINAAVHNQIIPSNTLTGFKFDLSNNVRSFSKKELQRFIAVLENEDIQTQVIFLTLLKSGMRKGELMGLRWSDIDLNEKYFDINSTRGDYGENKPKTKTSIRKVYFDNSLLTLIKKYKNHEKERLFREGIILSDKDYFILSSRNLPIKQSRITYMFRLLCEKAEVQNITVHGLRHTHATFLIEAGANIKYVSTRLGHKNINITLDVYSDVLKEEEKETADMMDKLIENL >NZ_CP030045|1786799:1798395|1792738_1792924_-|WP_002364222.1|DBSCAN-SWA MYVAIGEASRETYVIGETQAEVMRKLFEEYPYVSADKNVYPERLSIVQKEPRTSANEQGKY >NZ_CP030045|1786799:1798395|1794467_1794659_-|WP_002356998.1|DBSCAN-SWA MPDTSVSRQKIRDYFESKGISLVSVATYFDIPRQDLIDYLNGKNKSKKAHETLLAIIDFYKIR >NZ_CP030045|1786799:1798395|1796842_1797172_+|WP_002369911.1|DBSCAN-SWA MKKIKYFIYTLLLLIVFTACGTKEVKPDYTSKEAETALNNGEDLTGKTVQFTVDKYVPDGSLGYTIQTGDHLNFVSSKNPDVRTGDKVIAKIKKVENLMGSWIITFDKK >NZ_CP030045|1786799:1798395|1791102_1792047_-|WP_002389314.1|DBSCAN-SWA MIQSTLSMSHQEWLEDRRKGIGGSDVATILGLNQYKSAYQLWLEKTGQVELKDTESEPAYWGNVLEEVVAKEFQERTGKKVRRRNQVFEHSLHPFLRANIDREVVRENAILECKTANQFLAKEWAGDEVPLSYLCQVQHYMNVLNKDYCYIAVLIGGQKFIWKRVERDQELIDVLTEQLVDFWENNVIKGVEPIIDGSKATADFLKDKYSDIEETQTTLPASFDELLDQKNEMKKTKKELDVAIRKIENEIKSELGKRNASIGITKKHIVEWKEIPTKRLNSKKFAEKYPQIAEDEEIYMVTTPRRLIEKEIKQ >NZ_CP030045|1786799:1798395|1796045_1796828_+|WP_002364232.1|DBSCAN-SWA MRINLKMKKIVTLSLSLLLLTACSNETKQVSKQNSSSTTITSEKKDISDSKKINSSSSESSTIHYSSTQTDETTQMELGGSTYSQILETYTQKLTTTTPILIEELRNEGEPIKGNVSALAEVLNSKIGKLADISNAGISEMASIQLSNKDDYSLYESWANKLTDVYTAEANKLTDLYTELAAVNTEISTSQQPLPSTQSSSAIEQPQSSEVEQPVYDKVRSGEGARQVAERNGLTLEQLFALNPGIDTSVFYPGQPLRIK >NZ_CP030045|1786799:1798395|1794144_1794462_-|WP_002364228.1|DBSCAN-SWA MKMENFLDTSSKNFLYNIIEKILRKMFEQVINEASQGLNERAEYLDIKQLSSRYSMSVPEVEQNFVKDKRMQIIEKRKPGTSKGKRYWPAKEAIKICNDIMNHWD >NZ_CP030045|1786799:1798395|1793161_1793344_+|WP_002364224.1|DBSCAN-SWA MFFVIKRASDKKYYFLIKTEENEIIASSKTYYYKSSVLEIIESIKNDMNPKAIIVDTTFN >NZ_CP030045|1786799:1798395|1793383_1794106_-|WP_002389018.1|DBSCAN-SWA MDNLVIMKNQQAVTTSLQVAATFNKNHRDVLAAIDDLKEGVAENYADLFYEDSYIHPQNKQKYRQIIMNRDGFTLLAMGFTGQKALKFKLKYIEAFNQMEELLKTQSNLPINNTELLLEAALKHERGLTLVNQRLDKLETETTINRSQQRKIQGLVSSTVIKVLGGKKTVAYRDSSIKQSAFSNCYKQLKALFDVASYVDIPKVRYKEALTLIPKWKPDLELQARIDMANGNGDMFKEVS >NZ_CP030045|1786799:1798395|1790209_1791103_-|WP_002369907.1|DBSCAN-SWA MATNETLKNQLSQQNQKQVPANQLGLKGLMNTPTMKRKFEEVLHENANAFMSNVMTLVSNDSYLAESEPMSILSGALTAATLNLGLDKNLGYAYLVPFNTKNKQTGKWERKAQFILGYKGYIQLAQRSGKYKALNVIEVYEGELLSWNRLTEEFEFDPNGRQSDDVIGYVGYFELLNGFKKTVYWTKQEIEAHRIANSKDKEKTKLSGVWATDYNAMARKTVLRNMLSKWGILSIEMQEATTSDEKVQQMQEDGNIISETEVEENTTMKTAEVINEADSDSLNQTDLFDTKNPPLDK >NZ_CP030045|1786799:1798395|1788865_1789168_-|WP_002389299.1|DBSCAN-SWA MIEMRVLDYRITSDDRQVIVNKARRNEHGELTILTDKDGTEKESLALIGYYGNLSKALVAIERDYVLSSGKTIQTVKEYKKELESIHSKLKRELDFGEEF >NZ_CP030045|1786799:1798395|1794949_1795294_+|WP_002385819.1|DBSCAN-SWA MTTFERIKNLAKQKDKSLQQVARELKYGENYFYSLNAGKQPTAEKLQEIANYFNVSVDYLLGRTDNPNSDNLEEDEIATFFRVNTEDLTESEKDQLREELKEYLEFMKSRLKNK |
20 | Enterococcus_phage(80.0%) | integrase | attL 1777281:1777294|attR 1800196:1800209 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2316570 : 2326310
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP030045|2316570:2326310|DBSCAN-SWA AATGATGAAGATTACTGATGAAAAAGCCGAGGATGTTAATCTCTCAACAATTAAAGTTGTCAAACGAGATGGTCGTTTAGTGACTTTCGATGATCAAAAAATATACGATGCTTTGATCAAAGCTGAACAAAAAATACATGACCAAGTCACTCCTTTGACACATCAAAAAGTCCAATCGATTGTTGCCGATGTCAATCGAGAAATTGCCGAACGTTTTACCAATAACGTAAAAATTTATGAAATTCAAAATATTGTGGAACATACTCTGCTATCCAACAACGAATATGCCTTAGCCGAAGAATACATTCATTACAGAACCCAACGTGATTTTGAGCGTAGTAAAGCGACTGATATTAATGTATCTATCGGCAAATTAATTAATAAAGATCAGACTGTCGTGAACGAAAATGCCAACAAAGACAGTGACGTTTTTAATACGCAACGTGATCTAACCGCTGGGATTGTTGGAAAATCAATTGGTTTAAAGATGTTGCCTTCACACGTGGCTAATGCCCATCAAAAAGGCGACATTCATTACCACGATTTAGATTATCATCCATATACGCCCATGACAAACTGCTGTTTAATTGATTTTAAAGGCATGCTAAACAATGGCTTTAAAATTGGGAACGCTGATGTCGAATCACCAAAATCAATTCAAACGGCCACTGCACAAATTTCTCAAATTATTGCCAATGTAGCTTCCAGTCAATATGGTGGATGCTCTGCCGATCGGATTGATGAATTATTAGCGCCTTTTGCAGAACGTAATTATGAAAAACATTTAGCAGATGCGCAAGAATGGATTGAAGGAGAAGAACGCCAAAAAGCATTCGCTCGGAAGAAAACGAAAAAAGATATTTTTGATGCCATGCAAAGTCTTGAGTATGAAATTAATACTTTATTTACTTCCAATGGACAAACCCCTTTTACTTCTCTGGGATTTGGTTTAGGTACCAACTGGTTTGAGCGAGAAATTCAACGGGCGATTTTACAAATCCGAATTAATGGCTTAGGGATTGAAAAACGAACAGCTATTTTCCCAAAACTGATTTTCACAATTAAACGAGGCGTCAATGCGCAACCTACTGATCCAAACTACGATATTAAACAGCTGGCACTGGAATGCGCAACGAAACGCATGTATCCTGATGTTTTAAACTATGATAAAATCGTTGAACTAACAGGTAGTTTTAAGGTACCAATGGGCTGTCGTTCCTTTTTACAAGGCTGGAAAGACGAACAAGGTGAAGAAGTAAATGTTGGCCGAATGAATTTAGGCGTTGTGACCTTGAACTTACCAAGAATCGCTTTAGAAGCGCAAGGAAGCCAAGAAAAGTTCTGGCAAATTTTAAATGAACGTTTAGCGATCGTTAAAGATGCTTTGGTTTATCGGGTTGAACGTGTTAAAGAAGCTAAACCAGCGAATGCACCGATTTTATACATGTATGGTGCATTTGGAAAACGTTTAGCTACACAGGATGCCGTAGATGAACTGTTTAAAAACAAACGTGCCACGGTTTCACTTGGCTATATTGGCTTGTATGAAGTGGCTTCTGCCTTTTACGGCGGTGCTTGGGAGGACAATCAAGAGGCCAAAAACTTTACACTGGATATTTTAAAAGAACTGAAAAAAAATGCCGACAACTGGGGCAACGAATACGGCTATCATTTTAGTGTCTACTCTACACCGAGCGAAAGCTTGACTGACCGTTTTTGCCGTTTAGATACTGAAAAATTTGGCATCGTCGAAAATATTACAGATAAAGAATATTACACAAATAGTTTCCATTATGATGTACGCAAAAATCCAACGCCTTTTGAAAAACTTGATTTTGAAAAGGATTATCCAAAATACTGTTCTGGTGGTTTTATCCACTACTGTGAATACCCCATGTTACAGCAAAATCCCAAAGCACTTGAAGCTGTCTGGGATTACGCTTATGACAAAGTTGGCTATTTAGGAACCAATACGCCAATTGATCATTGTTATGCCTGTGGTTTTGAAGGGGACTTCCATCCAACTGAACGTGGCTTTGAATGTCCAGAATGTGGCAATCATGATCCTAAGACTTGTGATGTCGTTAAACGGACTTGTGGTTATTTAGGTAACCCGCAAGCTCGTCCAATGGTACATGGTCGTCACAAAGAAATTTCCTCTCGTGTGAAACATTTAAAAAATTAAACTCGATTATTCTATAGAAAGAAGTTTTGCTGATGCGTAATCCGAAACCACAAGAATGGAAAACCGAAGACTACAGCCAAAAAAAGATTGCCGATTACAAAGCGTTCAACTTTGTTGATGGCGAAGGTGTACGCAATAGTTTATATGTGAGTGGCTGTCTCTTTGCTTGTGAAGGTTGTTTTAACAAAGCTGTCCAAAATTTCAATTACGGTACGCCGTTTACAGAATCTTTAATGAATCAAATTATTGAAGATTTGTCCCATGACTATGTCCAAGGTTTGACTCTTTTGGGTGGTGAACCTTTTCTGAATACAGATGTTTGTCTTAGTGTGGTCAAACGTGTGCGGGAAACATTTGGCTCAGCCAAAGATATCTGGTCTTGGTCTGGGTATACCTTTGAAGAACTACTTTTAGAAACGCCTGATAAGCTTGAACTACTCCATTCAATTGACATTTTAGTTGATGGGCGCTTTGAACTGGCAAAACGTAATTTAAATTTACAATTTCGTGGCAGTAGTAATCAACGGATTATTGATGTACCCAAATCACTTGCTGCTGGCAAAGCTGTTATTTGGGTAAAATGTCATGACGCCGAAACGTCTTATGAACAAATCAAAAAATCAATTTAAAAAAGTTAGCCCTTTAGCCATCTCTTGAGGATGTGTCTAAAGGGCTAACTTTTTTCCCATAAAGGTAAAACAATGTTTTCATACGCTAGTGGATCTAAATTCGTTAAAGTAATGCCTAATAAACGGATTCCTTGTTCTAAACCTAAAATATCTTCCCAAATTAAATTCGCTTGATAGAAAAGTTCTTCTTTTTTAGAAATATATTCAGGTAATGTCACACGTTTCGTAATCGTCGTATAGTCAGTATAACGAACTTTCAGGACTACTGTTTTGCCATGTTTTTGCACTCGTTGCAATGCACGCTCAACACCTGCTGCTAATTGTCTCAATTGAGCCGTAACCTGCTCTTCCGTCGTTAAAGGGGTGCCGTAAGTATGTTCCTTGCCTACCGACTTACGATCTCTAGTCACTTGAACTGGCGCATCATGGATACCACGGACTTTACGATACAATGAATAACCCATTTTACCGAATAACCGAATCAACGTCATCTCATCTTGCTTGTATAAATCTGCTCCAGTAAAAATCCCTAGTTCATGCATTTTAGGCACTGTTTTTTTCCCGATTCCGTGGAAATCTTCAATCGGTAATGCTTTCAAAAAATCTTCGGCCTCTTCTGGTAAGACAACCGTCAGGCCCTTTGGTTTCTGAAAATCTGATGCTAACTTGGCTAAAAACTTATTGTAACTAACACCTGCCGAGCAAGTTAACTGCAATTCATGCCAAATATCATATTGGATCATTTTCGCAATTTTAATAGCCGACTTACTGTTGACCTTATTTTCAGTTACATCTAAATACGCTTCGTCAATAGATACTGGTTCAATCACATCTGTATAGCGGCGAAAAATTTCACGGATTTCTTGAGAAATTTCACTATATTTCTGATAATTACCTGGCTTAAAAATGGCACTTGGACATAGTTCATACGCCTTTTGAGCACTCATAGCCGAGTGAATACCGTACTGTCGAGCAATATAATTCGCTGTGGTCACCACTCCTTTGCCCCCAGTATCACTTGGATGGCGCGCAATAACTAACGGATGTCCTACTAGCTCTGGATGATCTCGTTCTTCAACTGAAGCAAAAAACGCATCCATATCTATATGTATAATTTTTCTCGACGTATCTTTTTTTAAGGGAAAACGTAATTCGCTCATCATTTTGATTCGCCTCCTCCCTCCATTATATACGAACGTCCGTTCTTTTTCAAATTGAAACTTCTTTATTTCAACCAGAAAAAGCTAAAAATCCGTGAAGTTATAAACACAGATTTCCAGCTTTTTAATTAAACAACCAATTGTTTTTGTTGATTATAGTAGCCTTTATAGGCAAGATAAGTTGCAATCACTGAACCAATACTTGTTGCTGATAGCAACATAAAAGTCACCATAATCTGATATTTTATCGCATGGACAGGATCAACGCCCGCAAAAATCAAGCCTGACATCATCCCAGGCAAACTAACAATTCCGACAGTTTTGGCAGAATCAATCGTCGGCGCCATCCCGGTTTTCACACTTTGTTGGATAATTGGTAAAGAGGCGAGTTTGATAGTTGCACCTAATGCTAGTTTCTCCATTACCGCTTGCCGTTGGTTTTGAAAAAGAGTATCTAAATTGCGATAGCATAAACCAATTGCCACCATCGAATTGCTGGCAATCATCCCACTGATAGGAATGATTTGAGAAGGAACAAATTTGATAGAACCAGAAAAAATCAAAATACCAATGGTAATTCCTGTACTACAACCAATTGCAATGAAAGAAATCAAAAAGCCCTTTTGTAATTGCTGGCTGCGTTTTTTTGCATTAAAGGCTGCGTTGGAAACAATCACCAAAACCATGATGAGCGTTAAAATCAGGTTATTGACTTGAAAAACATATTTTAATAAATAGCCGACTGCGACTAATTGAATGACTGCTCGAATCACACTAATAATAATATCTTTGGTAAAACCTAATTTTTCTTTAGTACTAATAATTAATGCGACCACCACTAGCATGGCTGAAAAAAATAAGGATAAATTATTAACTGCTAAATCCATCTGTCGGCGCCACCTTTCCTGCTACAATACGAATCACTTGCTGTGCTTGCTGAATTTCTTCGGTATCATGCGTGACACGAACCAGCGTGACTCCTTGCTCTTTGTTTAATTGGTTTAACAATTGATTGACAATCTGTTTGCTTTCTTCATCTAATCCCGTTGTAACTTCGTCTAATAATAAAACATCTGGTACAAAAATAATGTTTCGTAGCAAAGCAACCCGTTGTCGCTCACCACCAGAGAGTTCGGCTATTTTCTTTTCAAGATAAGCAGCGGGCAATTTCACTTGTTGGAGTAATGCCACGACTTTTTCCTGATTAAACGCTTCTTGTCTGACGGTAAATGGAAATAACAAATTATCATACACGGTTTCACCAAATAAAGTTGGCTGCTGAAAACAATAAGAAACCTTTTGGCGGTATGTTTCGATTGGCATTGTAGTAATTGGCGCTTCTTGATAAAAAATTTCGCCTTCTGTAGGACTTAATAATGAAGATAAAATTTTTAAAAATGTACTTTTCCCGCTACCTGAAGGACCAACAATTGTTGTATTGCTGCCTGTTTCAAATGACAAATCAATATCAGAAAGAATGCTACGACCATTTACTTGATAAGACACGCCTTCTGCTCGCAATAAATTACTCATGTTTCTCTCCTTTTTTAAATGGAATGATATTCTTTATATACTTCTTGTTTTTTTACATTTCTCAATTTGGCCACTTCTTTGATCGCCTCTTTGGAACTCCGTCCCTCTTCCTCCATTAAAACTTGTACATGTTCTTTGAGGGAAATAGCTGGCATTGCTGCTATTGTCTCTTTCTCACCAGTAAATCCGCTAACTAATAAACAACACTCGCCTTTTAGCGTATTTTCTGCTAAATATTCTGTTAGTTCTCCTAAGGTACCACGCAAATACTCTTCATGAAGTTTCGTTAATTCTCGACAAATCACAGCGGGGCGTTCTTGACCATAGACTTCAGCAAACGTTGCGACCGTTTTAGCAATCCGATAGGGGGACTCATAAAAAATCTGTGTCGGCCGTTCTTCTTTTAATGCTGATAACACGTCTTTCTGTTCTTTTTTCTTTCTTGGTAAAAAACCATAAAACGTAAATGGCTGTGGTAAAAGACCCGAGGCAATCAAGGCGGTCATTCCTGCCGTAGGTCCTGGCAAGGCAATCACTGCCAGTTCTTCTTCAAGACATGCTGTAACCAATTCATGACCAGGATCACTAATTGAAGGCATACCTGCATCGCTAACTTGGGCAATCGTTTCACCACTCAGCAATCGTGTAATCAGTTGAGGAATTCGCTCTTTGTAATTATGTTCGTGTAAACTAATTTGTGGTGTTGTAATCTCAAAATGATTTAGCAATTTTTGTGTGTTTCTTGTGTCCTCACTAGCAATCACCGTTGCTTCTTTCAATATGTTTAAACAACGAATACTCATATCTTCTAAATTGCCGATCGGTGTTGGGACAAGATACAATTTTCCTTTTGTTGTTTGCTTATCAAAACTTTTCTGTTTTTGCATAGCGCATCCCTCATTTCCCTTTTTCGTTCTATAAATAGATAAAGGTTTGATTTGACAATCGATTGACTGTCAAACCAAACCTTTCCTTTTTATTTGCAGTGTCCACTAGACTTAACGCGTACGTTCCCCATAAATAACATCAAGACAAAAGGCACATTCTTCATCATTTTCACGTCTTGAACCATATAAAATATTGCAGACATGGAAGCCCTCTTCATAAAGTTTTTCCAAATTCATACGTGATTTTGATAGCTCTTGTTTTTCAGTTTCAGTTGTATTTCCTGCTAACTTATTCAGTTCTTGGAGATGCTCCCGTAAGCGTTGGTTTTCGATTTCCAACGTGGTATTTTTTTCTACCAACTCATGGAGTGCTGCTTTAATTTCTCTTAATTGTGTCACTGAACTGTCTAAATCAGTTTCCAACGAATTTAATCCATCATAGAGCGAACGTTTATCCATTTTGATCACCTTTTTCAGCAGCAACTTTCGCAGTAGCTTCTTTGATTTCTTCGTAATCATAATCCGCTGCGATTTCACGACCATGCAGACGAACTTTGACAATCCGACTTAATAGATTCAACCCGACGACTTTGCCTTTGCCATCTGGTGTTATTACTTCTTTTCCATAATCTGGTAATTCTTTTTTAGCGGCTTCATATTCGTCGTTTTCGTATTTCAAACAACACATTAAGCGGCCACATAATCCCGAAATTTTGACAGGATTTAAAGATAACCCTTGATCTTTAGCCATTTTGATTGAAACTGGCATAAAATCTCCTAGAAATGTTGAGCAACATAGTTGTCTGCCACAAGGGCCAATGCCACCTAATATTTTCGCTTCATCTCGGACACCAATTTGACGTAACTCAATTCGCGTCCGGAAAATAGCCGCTAAGTCTTTGACTAATTCACGAAAATCAATTCGCCCATCTGCCGTAAAGTAAAAAATCATTTTGCTACGATCGAAGGTATATTCTACTCGCACTAATTTCATTTTTAAGTCATGAGCTCGAATTTTTTCATTGGCAATGCTTTTGGCAGCTTCTGCATCAGCCAAATTTTTTTGTTCTTTTTCTAAATCATTGGCTGTTGCTTTATTTAAAATGGGTTTTAGGTCCTCTGGTAAATCGTCTGAATCGACTGTTTTTTTAGGAATAGCAACAGTAGCTAATTGTTTTGACTGTTGAGATTCAACGAGTACTTTCTCATTATAAATATACTCAGATTTTCCAGGAGCAAAATAATAGATATGACCGGCTTCACGGAAGCGAACTCCTACTACTTCTACCATTTTATTCCTCCTAATCTAGTTCAAGTGAACGTCGCTTCAATCGGTTAAGGAACTTGCTGAAACAACTAAGTTCCTACTATATTATGAAACTGAATGCCACTTGGCACTTTTTTCCTTTATGATTTAGGGTGAATCATTTGGATAACTAATTGTTCACAAACATTTTGCCAACTAACATTGGCAGTCCATTTTTGGCGTGCTTTCAAAATTAGCGCCAACCGTTCCGCCTGCTCTTCCGTTACTTTTTTGGCTTGCTGTGTCGCAACACTTTCTTCCAATAATTGACGGTAATAAACCATGAGCAAGTCAAAGCTAAGCGCTTGTTGTTCTTTTTCCTTAAATACTTTGACCATTTTCTTCTGAACGTAGATAAATGCCTGTAAATCATTACTTTTTAGATAATTAAACCATTGCAAAATGATTTCCCTAGCTTCATTAAACCATTCATCTTGAGAGATTTCAACTGCTTTCTCAAAACTATTTGTCAGCTCAGCTAAAAGGGTTGCAGTCTTTTCACCAATCCCCTGTTTGATTAAGCGATCAATTAATGTTTTTTTGACTAATGGTTGAAAATGTAAGGTTTGGCATCGTGATTGAATCGTTGGTAAAATTCGAGAAAGCGAAGTGGTTTCTAAAATAGCTAAAATTTGTCCTTCTGGTTCTTCTAAAAATTTTAAGAGACTATTAGCTGCGCCGGTACTCATTTTATCTGCTTCTTGAATTAAGAAAACTTTTTTAGCAGTCTCGACCCCACTTTTAGAAAACTCCGCTTTTAATTCACGGATTTGGTTCACTTTGATGGTTTGCCCATCTGGCGCAATTCTTAAAACATCTGGATGTTCATTTTCATTAATCCGCACACAATTATGGCATTCGTTACAAGGCTGTTGATTTACTAAATTCGTACAAAAGACATGTTTCGCCATCCATAAGCCAAATTCTTGTTTTCCAGTTCCTGTATCTCCTTCAAAAAGATAAGCATGGGCAAGACGACCATGCTCAAAACTTTTTTGGAGTTGCTTGTACAGCAAAGGTTGCATTTGCTGTAGCTGTTGTGCTTCATTCATCTTAATATTGATGGAATCCTTCAACTGGTAAGACGAAGCAAGTAGCGCCGCCTACTTCAACTTCCACAGGATAAGGAATTTGGCCATCCATTGTGATATCTAAAGTCACAGGTGTTGAAACATATTGTTTTCTTGATTGACATGTTTCTTTAATTAAAGCTAATGTTTCGTCGACACGTTCATCATCAATCCCAATAATAAATGTGCTGTTTCCCGCTTTTAAGAACCCACCTGTTGAGGATAATTTTGTAGCACGAATATTGGCATCAATAAATTCGTTGGCTAATCGGTTACTATCTTTGTCTTGTACAATGGCTAAAATAATCTTCATGGTCTACACCTTCCTATAATTAAAAGTTTTCTGGATAACGTTCAATAATCGCCTGATACGTTGCTTCTACGACAAGTTCTAAACTCATCCGTGCATCAATCTTTTTGATACGTTGTGGATTTTCTTCTGCTAATTTCAAATATTCATGACGAACACGTTGATGAAATTCTAATCCTTCTGAATCTAAGCGATCAATTTGCTGTGTTCGATTTTCTTGAATCCGCCGTAAGCCAGTATCTGAGTCAACGTCTAAATAAATTGTAAAATCTGGTGAGACACCTTCTGTCGCAAACGCATTAATTGAAGCAATGGGGGCAATCCCAATTCTACGCCCAGCGCCTTGGTAGGCTAATGAGCTGTCAACAAAACGATCACATAGGACTAAATGACCCGCTTCCAAAGCTGGCAAGATTTTTTCCACTAAATGTTGACGACGAGCAGCTGCGTAAAGTAAAGCTTCTGTTCGCTCATCCATTCTGTCATTTCTTGGATCTAAAATAACTGTTCGAATCTTTTCGGCAATCGGTATGCCGCCTGGTTCTCTTGTAGTGACAATTTTTCGTTTTGACTCTTTAGCTAATCTTTCAGAAACTTCCTTCAAAACACTGGTTTTACCAGCACCATCTGGACCTTCAAATGTGATAAAAATACCCTGCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP030045|2316570:2326310|2316570_2318754_+|WP_002385686.1|DBSCAN-SWA MMKITDEKAEDVNLSTIKVVKRDGRLVTFDDQKIYDALIKAEQKIHDQVTPLTHQKVQSIVADVNREIAERFTNNVKIYEIQNIVEHTLLSNNEYALAEEYIHYRTQRDFERSKATDINVSIGKLINKDQTVVNENANKDSDVFNTQRDLTAGIVGKSIGLKMLPSHVANAHQKGDIHYHDLDYHPYTPMTNCCLIDFKGMLNNGFKIGNADVESPKSIQTATAQISQIIANVASSQYGGCSADRIDELLAPFAERNYEKHLADAQEWIEGEERQKAFARKKTKKDIFDAMQSLEYEINTLFTSNGQTPFTSLGFGLGTNWFEREIQRAILQIRINGLGIEKRTAIFPKLIFTIKRGVNAQPTDPNYDIKQLALECATKRMYPDVLNYDKIVELTGSFKVPMGCRSFLQGWKDEQGEEVNVGRMNLGVVTLNLPRIALEAQGSQEKFWQILNERLAIVKDALVYRVERVKEAKPANAPILYMYGAFGKRLATQDAVDELFKNKRATVSLGYIGLYEVASAFYGGAWEDNQEAKNFTLDILKELKKNADNWGNEYGYHFSVYSTPSESLTDRFCRLDTEKFGIVENITDKEYYTNSFHYDVRKNPTPFEKLDFEKDYPKYCSGGFIHYCEYPMLQQNPKALEAVWDYAYDKVGYLGTNTPIDHCYACGFEGDFHPTERGFECPECGNHDPKTCDVVKRTCGYLGNPQARPMVHGRHKEISSRVKHLKN >NZ_CP030045|2316570:2326310|2325322_2325652_-|WP_002356367.1|DBSCAN-SWA MKIILAIVQDKDSNRLANEFIDANIRATKLSSTGGFLKAGNSTFIIGIDDERVDETLALIKETCQSRKQYVSTPVTLDITMDGQIPYPVEVEVGGATCFVLPVEGFHQY >NZ_CP030045|2316570:2326310|2321413_2322076_-|WP_002356375.1|DBSCAN-SWA MSNLLRAEGVSYQVNGRSILSDIDLSFETGSNTTIVGPSGSGKSTFLKILSSLLSPTEGEIFYQEAPITTMPIETYRQKVSYCFQQPTLFGETVYDNLLFPFTVRQEAFNQEKVVALLQQVKLPAAYLEKKIAELSGGERQRVALLRNIIFVPDVLLLDEVTTGLDEESKQIVNQLLNQLNKEQGVTLVRVTHDTEEIQQAQQVIRIVAGKVAPTDGFSS >NZ_CP030045|2316570:2326310|2325671_2326310_-|WP_002356366.1|DBSCAN-SWA MQGIFITFEGPDGAGKTSVLKEVSERLAKESKRKIVTTREPGGIPIAEKIRTVILDPRNDRMDERTEALLYAAARRQHLVEKILPALEAGHLVLCDRFVDSSLAYQGAGRRIGIAPIASINAFATEGVSPDFTIYLDVDSDTGLRRIQENRTQQIDRLDSEGLEFHQRVRHEYLKLAEENPQRIKKIDARMSLELVVEATYQAIIERYPENF >NZ_CP030045|2316570:2326310|2318786_2319383_+|WP_002365065.1|DBSCAN-SWA MRNPKPQEWKTEDYSQKKIADYKAFNFVDGEGVRNSLYVSGCLFACEGCFNKAVQNFNYGTPFTESLMNQIIEDLSHDYVQGLTLLGGEPFLNTDVCLSVVKRVRETFGSAKDIWSWSGYTFEELLLETPDKLELLHSIDILVDGRFELAKRNLNLQFRGSSNQRIIDVPKSLAAGKAVIWVKCHDAETSYEQIKKSI >NZ_CP030045|2316570:2326310|2323414_2324254_-|WP_002356371.1|DBSCAN-SWA MVEVVGVRFREAGHIYYFAPGKSEYIYNEKVLVESQQSKQLATVAIPKKTVDSDDLPEDLKPILNKATANDLEKEQKNLADAEAAKSIANEKIRAHDLKMKLVRVEYTFDRSKMIFYFTADGRIDFRELVKDLAAIFRTRIELRQIGVRDEAKILGGIGPCGRQLCCSTFLGDFMPVSIKMAKDQGLSLNPVKISGLCGRLMCCLKYENDEYEAAKKELPDYGKEVITPDGKGKVVGLNLLSRIVKVRLHGREIAADYDYEEIKEATAKVAAEKGDQNG >NZ_CP030045|2316570:2326310|2319427_2320546_-|WP_002362328.1|DBSCAN-SWA MMSELRFPLKKDTSRKIIHIDMDAFFASVEERDHPELVGHPLVIARHPSDTGGKGVVTTANYIARQYGIHSAMSAQKAYELCPSAIFKPGNYQKYSEISQEIREIFRRYTDVIEPVSIDEAYLDVTENKVNSKSAIKIAKMIQYDIWHELQLTCSAGVSYNKFLAKLASDFQKPKGLTVVLPEEAEDFLKALPIEDFHGIGKKTVPKMHELGIFTGADLYKQDEMTLIRLFGKMGYSLYRKVRGIHDAPVQVTRDRKSVGKEHTYGTPLTTEEQVTAQLRQLAAGVERALQRVQKHGKTVVLKVRYTDYTTITKRVTLPEYISKKEELFYQANLIWEDILGLEQGIRLLGITLTNLDPLAYENIVLPLWEKS >NZ_CP030045|2316570:2326310|2324370_2325321_-|WP_002384059.1|DBSCAN-SWA MNEAQQLQQMQPLLYKQLQKSFEHGRLAHAYLFEGDTGTGKQEFGLWMAKHVFCTNLVNQQPCNECHNCVRINENEHPDVLRIAPDGQTIKVNQIRELKAEFSKSGVETAKKVFLIQEADKMSTGAANSLLKFLEEPEGQILAILETTSLSRILPTIQSRCQTLHFQPLVKKTLIDRLIKQGIGEKTATLLAELTNSFEKAVEISQDEWFNEAREIILQWFNYLKSNDLQAFIYVQKKMVKVFKEKEQQALSFDLLMVYYRQLLEESVATQQAKKVTEEQAERLALILKARQKWTANVSWQNVCEQLVIQMIHPKS >NZ_CP030045|2316570:2326310|2320671_2321430_-|WP_002365066.1|DBSCAN-SWA MDLAVNNLSLFFSAMLVVVALIISTKEKLGFTKDIIISVIRAVIQLVAVGYLLKYVFQVNNLILTLIMVLVIVSNAAFNAKKRSQQLQKGFLISFIAIGCSTGITIGILIFSGSIKFVPSQIIPISGMIASNSMVAIGLCYRNLDTLFQNQRQAVMEKLALGATIKLASLPIIQQSVKTGMAPTIDSAKTVGIVSLPGMMSGLIFAGVDPVHAIKYQIMVTFMLLSATSIGSVIATYLAYKGYYNQQKQLVV >NZ_CP030045|2316570:2326310|2322090_2322963_-|WP_002356373.1|DBSCAN-SWA MQKQKSFDKQTTKGKLYLVPTPIGNLEDMSIRCLNILKEATVIASEDTRNTQKLLNHFEITTPQISLHEHNYKERIPQLITRLLSGETIAQVSDAGMPSISDPGHELVTACLEEELAVIALPGPTAGMTALIASGLLPQPFTFYGFLPRKKKEQKDVLSALKEERPTQIFYESPYRIAKTVATFAEVYGQERPAVICRELTKLHEEYLRGTLGELTEYLAENTLKGECCLLVSGFTGEKETIAAMPAISLKEHVQVLMEEEGRSSKEAIKEVAKLRNVKKQEVYKEYHSI >NZ_CP030045|2316570:2326310|2323074_2323422_-|WP_002356372.1|DBSCAN-SWA MDKRSLYDGLNSLETDLDSSVTQLREIKAALHELVEKNTTLEIENQRLREHLQELNKLAGNTTETEKQELSKSRMNLEKLYEEGFHVCNILYGSRRENDEECAFCLDVIYGERTR |
11 | Streptococcus_phage(57.14%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2645034 : 2714047
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP030045|2645034:2714047|DBSCAN-SWA AATGACCTATACCCATCTTACATCAAATGAACTTGCAATGATAGAGGCGTATTATAATAATCATCAATCTGTAGCCAAAACCGCAGTACTATTGAATAGATCTAGACAAACGATTCATAAAGTTTACCAATTTTTCAAAACAGGGCACAATGCTCTAGATTATTTCAATCAATACAAGAAGAATAAAACTCGCTGTGGCAGACGTCCTATTGTCTTATCAGATGAACAAACAGAATATATTCAAAAGAGGGTTGTTCAAGGTTGGACACCTGATGTGATTGTTGGCCGTGCAGAGTTTTCTATTTCTTGTTCTATGCGTACACTTTATCGTATGTTTAAACAAGGCGTATTTGAAGTGACTCACCTACCTATGAAAGGAAAACGTAAAGCCAACGGACACAAAGAAACTCGGGGAAAACAATCTTTTCGTCGATCACTTCGTGACAGAGGAAATGATTATTCTAAATTCAATCAAGAATTTGGCCACCTTGAAGGGGATACTATTGTAGGTAAAAAGCACAAAAGTGCTGTTATTACCCTCGTTGAGCGATTATCTAAAGTAATCATCACTCTTCAGCCAGAAGGCAGACGAGCTATAGATATTGAAAATCGTTTGAACCAATGGATGCAATCTGTACCTAAGTATCTATTCAAATCAATGACTTTTGATTGTGGAAAGGAATTTTCAAATTGGAAATCAATCAGTAATATCAATGATATTGATATCTATTTTGCAGATCCTGGTACACCATCACAAAGAGGTTTAAATGAAAACTCTAATGGTTTATTACGTAAAGATGGTTTACCAAAGCAAATGGACTTCAACGAAGTTGATGAATCTTTTATCCAATCTATTGCATCGAAAAGAAATAATATCCCTCGAAAATCATTAAACTATAAAACACCAATAGAAGTATTCTTGAGTCACATATGCAAAGAGGAATTGTCTAACTTAATTTGACAATTAATAATTTCAAAAAAAAAATTTATTTTTTAATTTTCTTTTTGTTAACTAAACGAATTTTTTGCTGTTTTTGTAAGATAAAAATGTTAATTTGTTCACAAAAATAACAAAAACGTTGTTTTTAACATTAAAATTAACAAACGAGTTCGTAGTATAGCACGGATTTTTTCTCATGTAAACATCATTAAATAAACATTTTTGTTTAATTTATACATATTTCTCAGCTGAAAAAATGACAAAAATAAATAAACAGAGGCCTTAGAAATATTTCTAAGGCCTCTGTTTATTTATACGTATTCACAAACTGGACTGTTTCTTGGTAACATTGTTTAGCTTCTTTTGTTTGATAGTCGAATTGATATTCGTGGGTGATCGTTGCTTTCTTATCTTTGAAAAAGAGAGCTGAAACTGGAACATTTAAAGTTTTTAACCGCTGAACCAAGGCTAGTCCTTGCTCTTGGAATGAAAAGCTATTGCCATCTGTTAGATACGTCGGGGGAAATTCTTTGGTGACTTTATCCACTAAACTCACTTCTTGCAGTTCTGCACTCGTCTGCCAGTCTTTAGTGCCGAGCAAGGACCAAGCCACTGTTTTAACGAAAAATTTCATAAAACGATTATCACTTTGTTGGTTGGCCATTTGTTTCAAATCCACCGGACCACAATACGAGAGCGTGCCTTTTAAATGGCTAGCCGGCAATGCTGCAGTCATCCCTAGTTCTTTGGCATAGTTGGCATTGGTTTGAACTGTTGCATATTGTAGAGCAATCTGTGCACCCGCACTGTCCCCGCCAATAAAAAGCTTAGATAAATCTAACATGGGATACGCTTGTTTCTTTTCTAATAAAAATTGAACAAGTTCATTGACCTGCTGGAGCTGGCTTGGATAAGGTGCGTCTGGTGCTAATTCATAATTCATTGAAATAAAGGCAACTGAGGAATCAGCCACTAAACGTGTCGCAAACTCTTTCATCCCAGACTTATCTCCTCCCACATAGCCACCACCATGGACCCATAAAACGACTGGTACCGCTTGTTTTGACGTTTGGGGATAATACAAATCAAAGGTATTCTTTTTTCTTGAAGAAGGGTATGTTTGATTTTCTTGCAATTGGACATTGGGCAATGCTTTATCATAGGAAGCTGAATCTTTTATTTCAACTTCACCTGCGAATAACTGGTTGATGACCCAAGCGCCTGGCTTAGGAGATAATTGAAAGGCGAGAAACACGCCTAAGCAAATAACCACAAGGATTCCTAACAACCAAAGGATAAAACGTACGATTTTTCTTTTCACTCTATTCACCTGCTTTAATTTGTAGCAAAATTATAGCATGTTTTTTAGCCAAAGCGTTTATTTTGAAACAGCTTTTTTAGAATTTGATGTACTTTTATCATTTGAAATGCCCTCTTAAAAGCTGTAAAATGAACAAAATGACTTTAACCTTTAGGAGGTTGCCAAATGAAAGCTCTGATTTCCATTGATTATACGAATGATTTTGTCGCCACAGACGGAAAACTAACCACTGGTGCCGCTGGGCAAGCCATTGAAACGGCCCTTGTTCAACAAACAAAGCACTATTTTGACAATGGCGATTTTGTGGTTTTTGCCATTGATGGGCATGACCCCCTAGATCGCTATCATCCTGAAAATAAACTTTTCCCGCCCCACAATGTCTTAGGAACTGACGGGCGTAATCTGTTTGGCTCGCTAGCTGATTTTTATCAAGCTCACAAAAATGAGGCAACCGTTTATTGGATGGACAAACGGCACTATTCTGCTTTTAGTGGTACAGATTTGGACATTCGATTACGAGAACGAGGAATTACAGAGCTTTGTTTAACTGGTGTTTGTACAGATATTTGCGTGTTGCATACGGCTGTCGATGCCTATAATTTAGGCTATCAATTAATGATTCCTGAACGCGCCGTTGCTAGTTTTGATGAACAAGGACACGAATGGGCGTTACGCCACTTTAAACAAACTTTAGGAGCAACCATTCTATAAAAAGACTGGTCAATCCGACCTATCTATATTCAAAAAATCCTGTAAACAACGCAAAAGCCAACCTTACTATGGATAAGGTTGGCTTTTTTACACTCATTTTAACTCCGAGCCTACGGATTAGTGATAACTAGCATTCACAGAATAAGCAGAGACTGTTAGCTGATAGAAATTAGCTACTCATAAAAGAGTGGGGAAGCCCACTTTTTTATAGACCAATGACCGTTGCAAAGAAAGGAACCACTAAAACAGTAACTACACCAACCACTACGACAGAAATACTAGCCATAGCAGCCTCTGTTTCGCCCATTTCAATGCCTACTGCCACACCTAGGGCATGTCCGGCCGCACCTAAAGCTAAACCTTTGGCGATTGGATTGTTAATTTTAAACCATTTCAATGCAATTCGGCCCAAGGCATAGGTTAGTACACCATTGAAGATTACAGTAAACGCCGTAATGGAAGCAATGCCGCCAACAGTTTGAGAAATAGGTACGGCAATCGCTGTTGTAGCTGCTTGTGGTAAGATTGAGGCCACTAAATGATTATCCATGCCAATCACTTTTCCTGCAAAATAAACAGCCACTAGCGAACCAAAAGAACCAATTGTTAACGCCGTTAAAATTTCTAACCAATATTTTTTCAACACGTCTCTCTTTTTATATAAAGGAATCGCAAACGCTACTGTCGCAGGCTCTAGAAAGAAGCTGATATATTTGCCACCTTCATTGTATTGCTCGTAACTAATTCCTGTTACTTTTAAAACGACAACGCCTAAAATCATCGCAACGAATAATGGCGTAAATAAGAAGAAACCTTTGCTTTTTTTAAACAACCAAGTACCTATGCCAAATACAGCTAATGAAATAATAATACCAACATACGGATTCATGCGCGAACCTCTCCTTTCGCTTTCTTCGTTGCTGCGGGTTCTTTTTCTTTTCGAGCATCTTTCATATGCAATAAAAAGGCGCCCGTCCAACCAGTTGTTGCTAGTAACGCTAGTGTCGCTACTAAAATAACAAAAACAATTTGAACGCCAAATTGTTGCATAATCCCTAAAGAATTAACTAAGGAAATCCCTGAAGGAACAAATAAAAATGTAATAACCGTTGATAAGCTATTACCTAGCCCTTCCACTTGCTCCAATTTAACAACTTTTGTACATAAACCAATGAACAATAACACCATGCCAATTACTGAAGCAGGCATTGGTATTGGGGAAATGAACGCCAAGCCGTTGGCGATTAACATAATAATGGCAAAAACTGCTGCTTGTTGTAAAAATGAATATACTTTCTTTTCCATTCTTCTTCGCTCCCTTTTGTCTGTTTTCTATGGGTTAAGTATATAAAGAAAACGTTTTTTTAAGGGCTTTTTTTCATGAAATGCCAGGATTTCTTCACCAAATGCAAAAATCACCACTTGAAATGCATTCGACATTTCAAGTGGTGATTTTTTAACTTAAGCCAAGTTTTTCTTTAAATTCTTTGACGTATGAACGGCTAACAGGTACTTTTGAGCCGTTGGTTAAAATTACTTGCAACGTGTTATTAAACCACGGCTGAATTTCTTGAATTTTTGTTCGATTCAAGATGAAACTTCGATGCGTTTTAATAAAGAGCGTGGCAGGTAATTTTTGTTCGATACTGTTGAGGGTCCCTGTCATCTTGTAGACCTGTTGATCCACAAAAATGCTCAGTTGCCGTTCTTCGACAGAAACGAGGTAAATATCTTCTGGCGCCACAAGATAAATGCGGTCTTCCCCTTGAATAGGTATTGCTTCAGATTTTGGTCCTTTTTCAGCAGTGTTTTCTGGGACAGCTTGAGCCATTTCTTTCGATGCTTTTTCAATGACTTGTGTTATTTTTTCTTCTTCAAAAGGTTTCAAAATATAATCTTTTGCATTCACTTGAAAGGCCTTTAACGCATATTGATCATAGGCGGTTGCAAAGACCAAGTAGGGCGCTTTTTTAAGATGGGTTAATTTTTCCGCTAAATCAAACCCGCTTTCATCGGTCAAATGAATAT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60 | Enterobacteria_phage(14.29%) | tRNA,holin,transposase,integrase | attL 2664389:2664409|attR 2708800:2708820 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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