Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP023654 | Pediococcus acidilactici strain JQII-5 chromosome, complete genome | 3 crisprs | cas9,cas1,cas2,csn2,DEDDh,DinG,csa3,cas3 | 0 | 10 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP023654_1 | 446407-447169 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP023654_1
|
11 spacers
spacers of NZ_CP023654_1
>1.1|446443|30|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAAAGGGCGGAAGCTGGTATCCGGATGTC >1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCGCGTAACTATGCCAACCTTAACCAAGACC >1.3|446576|30|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTGACCATACTGACCCTTACGGCTATCTA >1.4|446642|30|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACCACAACAATAAAATCATTTCAATAAGCA >1.5|446708|30|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAATCGAAGATGGCTGGATGCCTTGGGTTC >1.6|446774|30|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGACATTACTAAAGGTACTAAGGGTTGGA >1.7|446840|30|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGATGATTTCAAGCCCCTATATTTCATGT >1.8|446906|30|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder,CRT ATTCCCTATTCCGACACAGTCATGTAAGGT >1.9|446972|30|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder,CRT CTTCAATGTCTAAAGCTTGCTTAGCTAACG >1.10|447038|30|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder,CRT AATTGTTTCTTGGACTGTTTGCCAATATTC >1.11|447104|29|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder ACGATTTACCGTTTTAGGAATGATTTAGA >1.12|447104|30|NZ_CP023654|CRT ACGATTTACCGTTTTAGGAATGATTTAGAT >1.13|446973|29|NZ_CP023654|PILER-CR TTCAATGTCTAAAGCTTGCTTAGCTAACG >1.14|447039|29|NZ_CP023654|PILER-CR ATTGTTTCTTGGACTGTTTGCCAATATTC |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP023654_1
The CRISPR arrays of NZ_CP023654_1 >merge|NZ_CP023654|1|446407-447169|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCCAAAAGGGCGGAAGCTGGTATCCGGATGTCGTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCGCGCGTAACTATGCCAACCTTAACCAAGACCGTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCGGTGACCATACTGACCCTTACGGCTATCTAGTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCACCACAACAATAAAATCATTTCAATAAGCAGTTTCAGAAGGATGTTAAAACAATAAGGTTAAGATCCAATCGAAGATGGCTGGATGCCTTGGGTTCGTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCATGACATTACTAAAGGTACTAAGGGTTGGAGTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCAAGATGATTTCAAGCCCCTATATTTCATGTGTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCATTCCCTATTCCGACACAGTCATGTAAGGTGTTTCAGAAGGATGTTAAATTAATAAGGTTAAGATCCTTCAATGTCTAAAGCTTGCTTAGCTAACGGTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGATTAAGATCAATTGTTTCTTGGACTGTTTGCCAATATTCGTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCACGATTTACCGTTTTAGGAATGATTTAGATGTTTCAGAGGATGTTAAATCAATAAGGTTGGCAATG >NZ_CP023654|1|1|446407-446905|PILER-CR GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC CAAAAGGGCGGAAGCTGGTATCCGGATGTC GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC GCGCGTAACTATGCCAACCTTAACCAAGACC GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC GGTGACCATACTGACCCTTACGGCTATCTA GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC ACCACAACAATAAAATCATTTCAATAAGCA GTTTCAGAAGGATGTTAAAACAATAAGGTTAAGATC CAATCGAAGATGGCTGGATGCCTTGGGTTC GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC ATGACATTACTAAAGGTACTAAGGGTTGGA GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC AAGATGATTTCAAGCCCCTATATTTCATGT GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCATTCCCTATTCCGACACAGTCATGTAAGGTGTTTCAGAAGGATGTTAAATTAATAAGGTTAAGATCC TTCAATGTCTAAAGCTTGCTTAGCTAACG GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGATTAAGATCA ATTGTTTCTTGGACTGTTTGCCAATATTC >NZ_CP023654|1|1|446407-447168|CRISPRCasFinder GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC CAAAAGGGCGGAAGCTGGTATCCGGATGTC GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC GCGCGTAACTATGCCAACCTTAACCAAGACC GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC GGTGACCATACTGACCCTTACGGCTATCTA GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC ACCACAACAATAAAATCATTTCAATAAGCA GTTTCAGAAGGATGTTAAAACAATAAGGTTAAGATC CAATCGAAGATGGCTGGATGCCTTGGGTTC GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC ATGACATTACTAAAGGTACTAAGGGTTGGA GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC AAGATGATTTCAAGCCCCTATATTTCATGT GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC ATTCCCTATTCCGACACAGTCATGTAAGGT GTTTCAGAAGGATGTTAAATTAATAAGGTTAAGATC CTTCAATGTCTAAAGCTTGCTTAGCTAACG GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGATTAAGATC AATTGTTTCTTGGACTGTTTGCCAATATTC GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC ACGATTTACCGTTTTAGGAATGATTTAGA TGTTTCAGAGGATGTTAAATCAATAAGGTTGGCAAT >NZ_CP023654|1|1|446407-447169|CRT GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC CAAAAGGGCGGAAGCTGGTATCCGGATGTC GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC GCGCGTAACTATGCCAACCTTAACCAAGACC GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC GGTGACCATACTGACCCTTACGGCTATCTA GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC ACCACAACAATAAAATCATTTCAATAAGCA GTTTCAGAAGGATGTTAAAACAATAAGGTTAAGATC CAATCGAAGATGGCTGGATGCCTTGGGTTC GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC ATGACATTACTAAAGGTACTAAGGGTTGGA GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC AAGATGATTTCAAGCCCCTATATTTCATGT GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC ATTCCCTATTCCGACACAGTCATGTAAGGT GTTTCAGAAGGATGTTAAATTAATAAGGTTAAGATC CTTCAATGTCTAAAGCTTGCTTAGCTAACG GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGATTAAGATC AATTGTTTCTTGGACTGTTTGCCAATATTC GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC ACGATTTACCGTTTTAGGAATGATTTAGAT GTTTCAGAGGATGTTAAATCAATAAGGTTGGCAATG >NZ_CP023654|1|2|446936-447104|PILER-CR CAAAAGGGCGGAAGCTGGTATCCGGATGTC GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC GCGCGTAACTATGCCAACCTTAACCAAGACC GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC GGTGACCATACTGACCCTTACGGCTATCTA GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC ACCACAACAATAAAATCATTTCAATAAGCA GTTTCAGAAGGATGTTAAAACAATAAGGTTAAGATC CAATCGAAGATGGCTGGATGCCTTGGGTTC GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC ATGACATTACTAAAGGTACTAAGGGTTGGA GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATC AAGATGATTTCAAGCCCCTATATTTCATGT GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCATTCCCTATTCCGACACAGTCATGTAAGGTGTTTCAGAAGGATGTTAAATTAATAAGGTTAAGATCC TTCAATGTCTAAAGCTTGCTTAGCTAACG GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGATTAAGATCA ATTGTTTCTTGGACTGTTTGCCAATATTC GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATAAGGTTAAGATCA
>NZ_CP023654.1|WP_081351860.1|445706_446378_+|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MKLTYRTHEPVEIKPHAITVLGTNNSTVYTDLVNGMQERNELILAFDENYKELEISKVFDWIGDVGTQNLVIQKYLIKIERVFAEGLVDEQRNQIHDQVNQLFNTVAEQLFMLDLPISVNYDFDLKKLLKYCGVHFDPLSVGNPYGIIEAILKIHEECAINSCVVLTNVAHYLTATQIEELTQLVSQTNQALLLIEFTEIGNQEAYGNSEFYYIDNDFVDWHQ >NZ_CP023654.1|WP_002831107.1|445404_445710_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRLMIMFDLPVETAVQRKQYRQFRKALINEGFLMIQYSVYVRVCVNKKSATFMENRIKTYLPENGTIQALTLTEKQYNDMHFLVGERVKDVRNTSDRTVIL >NZ_CP023654.1|WP_087116611.1|444521_445427_+|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGWRSVIITQHAKLSYSAHAMIVQTNDGINQIPVDDVSLLLISTTQAVITTALISELSKKNVKIVFTDEAREPISEIYGYYPANRTAQLLREQVNWDSELQQILWTKLVANKIINQINVLNLLDHSADELVAELEKLELNDLTNREAVVAHKYFPLLFESGFTRRDGSVINAALNYGYSILLSAVNQEIVANGYVTYLGIHHDSEENQFNLASDLMEPFRPVVDCWVANQKFNQLTPDIKYGLVELLSLELKYNGKKTILRNAITDHVRNCLKYLAGKANSFTIEMELSDEVPNNAINDNV >NZ_CP023654.1|WP_141782996.1|440205_444306_+|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MGDRKYNLGLDIGTSSIGFAAVDENNQPIRVKGKTAIGVRLFEEGKTAADRRGFRTTRRRLSRRRWRINLLNGIFDAHLAEVDPTFLARLKESNRSNLDPKKSFQGSLLFPQRKDYQFYKEYPTIYHLRKALMEKDRKFDIREIYLAVHHIIKYRGNFLNGTPMRSFKVENIELDTLFDRLNQLYEEIIPDNELAFDLEQVADVKEVLSSTTIYKMDKKKQLVKMMLLPASNKALQSENKKIVTQFVNAILNYKFKLDVLLQVETDADWSLKLNDEGADDKLEEFTGDLDENRLEIIDLLQRLHNWFSLNEITKDGNSLSAAMVEKYKDHRHHLELLKKVIEDHSDAKKAKALKETYTAYVGKTDDKTQNKDDFYKAVEKNLDDSPEAKEIKRLIQLDQFMPKQRTGQNGAIPHQLHQQELDQIIEKQSKYYPFLAEPNPNVKRRKDAPYKLDELIAFKIPYYVGPLVTPEEQAQNKENVFAWMKRKAAGPITPWNFDEKVDRMESANRFIRRMTTKDTYLFGEDVLPAESMIYEKFVVLNELNNLKINGRHLSLKDKQDIYNDLFKQQKTVSIKALQNYYVTKKKAATAPTVGGLADPKKFLSSLSTYIDFKNMFGERVNDPQFQENLEQIVEWSTIFEDRGIFKAKLQALGWLSEKQIQQLVAKRYKGWGRLSKKLLTGLKNAEGYSILDEMWRSTENFMQIQSRPEFAALIQQANEKQFEGNDPNNVWENIENILGDAYTSPQNKKAIRQVVKVVQDIEKAVGNPPEKIAIEFTREAAANPQRTQSRLRTLEKLYESAEEVVDAGLTAELAEFKENKHVLSDKYYLYFTQLGRDVYTGDRIRLDQLNDYDVDHILPQSFIKDDSLDNRVLTIRAVNNGKSDNVPVELFGKKMSSFWRRLLDNGMISKRKYNNLITDPDNISKYAQKGFINRQLVETSQVIKLTANILNGIYDKDTEIIEVPAKMNSQMRKMFDLVKVREVNDYHHAFDAYLTIFIGNYLYKCYPKLRPYFVYGKFKKFSDNEDIEVGDGRFNFLNRIERLKNVTDPETGEILWSNVAPNETIKRIKKVYNYKFMIVSREITTRRAELFNQTVYPKNYRGKLIPIKEDRPTDLYGGYSGNTDAYLAIVALEDKKKGKYFKVVGIPTRAAAKLEKLKQQDSQQYLQALHEVIAPQFTKSTKKGIKKAEFEIVLDKVHYRQLVQDGPVKMMLGSSTYKYNAKQLVLSEKALQVIKDDRKFDETQKDDNLIAVYDEILSIVNHSFDLYDINGFRKKLNDNRDQFIDLPAETKYEGRKVVAHGKREMILEILKGLHANASFGNLKPIGFATPFGQMQSKNGIELSENAFLIHQSPSGLFEHKIKLSDL >NZ_CP023654.1|WP_087116607.1|439446_440022_-|hypothetical-protein MKKIASIAILAVLPLTLASCGNHSTSNSDTSSNSSKTEKVAKSSSKSSVSKDAKSSSDDKATSSSASANSSKDSTNSSSSSNSASSSTSSATDSSSSADNQMSRSDLTKAEKKNGNRPLADEKIQNEQAAVALLTEKYGNQNWKVAFSSIGKSSPIYFHITSPKHGSYYVYANGDVQSADGDLSNHQIVNK >NZ_CP023654.1|WP_141782995.1|436684_439219_+|M1-family-metallopeptidase MANIERFYTKFHPTNYQIKLAISRETKEIKGTTTITGEALSSQIDIHQKDLQIEELRVDGTAGDFTVDQAAEAIHVKLPHTGTVTLEIKYTTKLTDTMMGIYPSYYEVNGETKQLVGTQFETTFARQAFPCVDEPEAKATFDLAIKFDEHPGEVVLSNMPETKVEDGYHYFARTVKMSTYLIAFAFGDLQSKQTKTKSGVQVGVFATKAHQPQELDFALDIAKRAIEFYEDFYQTPYPLPHSWQLALPDFSAGAMENWGLVTYREAYLLLDPKNTTLRTKQVVATVIAHELAHQWFGDLVTMQWWDDLWLNESFANMMEYVAVDALEPDWQIWELFQNSEAGAALQRDATDGVQSVHVQVNDPAEIDALFDGAIVYAKGARMLVMVRALIGDDALRQGLQKYFASHQYGNATGNDLWQALGEAANMPIGDIMHTWLDQPGYPVVTAQVENGDLVLEQQQFFIGEGQAQQRQWQIPLNGNYAEVPALLQTKTLNLGNYQDLRDRNQQPFRLNVGNSSHFIVRYDQRLLDDILADWEQLSAIDQLQLLQDLRLLAEGKQISYAEIVPLLPRFAKTDSALVTEMLYRVANDLKKFVAPQSSAEKQLKKFFGELSQATAQRLGWQAAAGETNDDQLMRPMVLKAALYAENPAVTAQAHQLFEENEAQLLKLPAAIRSLVIRNEVEHFGSPELFARLLKEYQRTSDASYKSDLCQALTATPSLPLIQQLVQQFENAQVIKPQDLRAWFRGVLANPQGQGPAWNWIRDEWQWLEDTVGGDMEFATYITVIAGIFQTPTRLAEFKAFFEPKLATPGLTREITMDIKVIETRVALIETERDAVQAAVAQAIK >NZ_CP023654.1|WP_087116602.1|435248_436658_+|MFS-transporter MEAQNTRHTNPMIVVAVVALMSFMGILTETSMNVTFPALMKEFHVPLNTVQWVTAGYLLMAALVMLTSAYMKRRFTNRQLFTAAAILFSSGDLICGLATNFWVLLAGRLIQAGCVGLCTPLMVNIILDVVPQHKLGTYIGMANLIILIAPALGPTFGGAVVAFNSWRMIFWSTLPVALVLMLLGMKVIKQYAPTDQHYAFDWTRFLLLGLALVSLIVGLNALGEMQLGTFVGLLIVSIGLTILFVKRSHTATKALFSLQVFKQPAFLYSFLPYIMLQFANVGINFLLPNYVQDVFQATSLVGGLILLPGSLFNGFGQPLYGWLLDRFGGKVPLYTGDILFTLALVGLMCWGPQLGVVGITIAYLIFAIGRSMAFGNSVAYGLKHIDKEFQNDANALYNTGQQVTGAIGTTVLALLMGSVKRPGYTHAQNVSAGSQLAFILLVIFGCVIFVFFHHLVNLKNLPEDKGVDL >NZ_CP023654.1|WP_087116600.1|434412_435057_+|SDR-family-oxidoreductase MAKIFIAGGSGRVATALIKNLVADGNEVVAGARHPENVVEMDHVSAVKLDLHDGVDAIADLMKGSDAVYFTAGSRGADLLQTDAMGAVKTMQAAEKLGIKRYVMLSSLYTLESERKWHEGGLADLLDYTTAKFFADNYLVHDTDLDYTIVQPTSLTEEAGTGQIYIGKDLPQKTNPIPDVAKVLADILKQPNTVKKVFMMSSGSQAIDQALANV >NZ_CP023654.1|WP_087116598.1|433189_433939_-|hypothetical-protein MKKSYGLVALLTIPLILGSCGSQAKTTQSSSVTSKTNKVAKQSRSSSSTTTKKTRKHSTQNIAVKTRDKEKIAVMLFQMCYPDDDIMQEINFGIWQNDGGNFVGNGGPVCIVSYQIEGNYVKYSRKANKHYPPFKTISLAELEQRYYSTPAQVKQVDDIIVKIHQGQKSPQSFDSTHGKVHLTTDAEAIAYATKKQGDQGWTVHVKNVEGNNTYWSLDNADGKNIGLKSDGTFASDTDGDGSYNVPAGW >NZ_CP023654.1|WP_087116596.1|432679_433123_-|hypothetical-protein MDKLKETLNGKNGKTIKLVGVIVIVLCAFFAFKTLNNPARDFNGHSYYVVTESEKPESYDDAKNDSEGYVRFHDDGTTSGFLASGDWKIKGHKLYIHFDSEEEESESESEDDSYYIDLSAKTKINGHVAYPEKSSTGETGEWWVQNK >NZ_CP023654.1|WP_087116613.1|447817_448465_-|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MKISKSSLLTLITYLAIFLLPSVINLFVRLGASFIWVETIDYLVGAALLVVINLKNSEINQIETRRISFFRAIAWGIIGTTLVIVLQFVVSYVTFILGQNPASANTATLVTLAKINPFFVLAITVGAPIMEELVFRKVLFGNLSTLFGMRSNLGLTIMAIISSLAFAFMHNDSHIFLYAAIGLLFCWLYHKTGRIQTSMIAHILMNGLVVLPLVM >NZ_CP023654.1|WP_002829962.1|448654_448939_+|co-chaperone-GroES MLKPLGDRVILEAKDEEEQTVGGIVLASNAKEKSQTGKVVAVGNGRVLDDGKTLPMNVKVGDTVVYDKYAGTEVTYEDQKYLVVHEKDLVAVVE >NZ_CP023654.1|WP_002829959.1|448961_450584_+|chaperonin-GroEL MAKEIKFSEDARTKMLKGVDKLADTVKSTIGPKGRNVVLEQSYGSPTITNDGVTIAKSIELEDHFENMGAKLVSEVASKTNDIAGDGTTTATVLTQAIVNEGMKNVTAGANPVGIRRGIEKATEKAVAALHNMSHEVKTKDDIAQIASISSANPEVGKLIADAMEKVGNDGVITIEESRGVDTTLDVVEGMQFDRGYMSQYMVTDNDKMEANLDNPYILITDKKIANIQDILPLLQSVVEQSRSLLIIADDITGEALPTLVLNKMRGTFNVVAVKAPGFGDRRKEQLEDIAILTGGTVITDDLGLNLKDVTIEQLGQANKVTVTKDDTTIVEGSGSQEQIAERVAMIKQQISETTSDFDKEKLQERLAKLAGGVAVIRVGAATETELKEKKYRIEDALNATRAAVEEGFVPGGGTALVNVIASLEDLDAEGDELTGINIVRRALEEPVRQIAENAGEEGSVIVTKLKTQKDGVGYNAATDEWVDMIEAGIVDPTKVTRSALQNAASVSALLLTTEAVVADLPEEKPAAPAAPNPGMGGMM >NZ_CP023654.1|WP_002829957.1|450883_452716_+|APC-family-permease MFSYLKRILIGKPLKTLDESGQALTKFKALALLSSDALSSIAYGTEEILSVLIVLSAAATWYSIPIAAIVLVLLFAITVSYRQIIKAYPSGGGAYVVASKNWGTSAGLVAGGSLLVDYMLTVAVSVTSGTEAITSAIPALQKYHVAIAVLIVLGIMALNLRGLRESASFLTIPVYLFVVVISIMIIVGLYNIVTGQVTYHAAAAIGSTVPGMTFVLFMRALSSGSSSLTGVEAISNAVPNFKKPRRKNAAATLAIMSLILASFFAGITFLAYYSGITPMSSQTVLSQIGVTVFGHGIFYYILQLSTALILAVAANTGFSAFPMLAYNLAKDKFMPHAYMDRGDRLGYSNGIISLAAGAIVLILIFGGQTGLLIPLYAIGVFVPFTLSQSGMIVHWKREGGAHWWINASANLLGALLSAVLVVCLLFLHFSNVWPYFVVMPLLLRMFYKIRKHYDEVADQLRVVEKGKVNLHDYDGSTVIVLVSNVTQVTSGAINYARSIGDYVIAMHVSFDANPEKEHKTAMEFKAEYPDVRFIDIHSSYRSITNPTLRFCDVIAKRAAERNYTTTVLVPQFVPRKPWQNILHNQTGLRLRAALNSRENIIVSTYNYHLK >NZ_CP023654.1|WP_002831110.1|452937_454113_+|undecaprenyl/decaprenyl-phosphate-alpha-N-acetylglucosaminyl-1-phosphate-transferase MRFEIVVSLFATMIISAILTPFVRRIAFKIGAVDKPNARRVNKVPMPTMGGLAIFLAFNFSLFFLLRNQIPNPQFYGIFFGECIIMLTGIIDDIFELKPSQKMIGILLAALAVYWFAEVQMTTLTLPFIGIVHLGWFSLPITLIWIAAITNAINLLDGLDGLATGVTIIALFTTGFTGLFFLPSTNIYIVIMIFTLVAAEVGFLPYNFFPARIYLGDTGALFIGFMIAVFSLSGLKNATFISVLIPVMILGVPLTDTIYAILRRLLNKQSIAHADKRHLHHRLMQMGLTHRQTVLVIYGISMIFSFIALLYPLSTLWGSVLLTIGILVGIELFVEAIGLVGENRTPMLSWIKRLVRTTTSKTASNEFKEEDTLKDRVRSRSERHQQKKHHD >NZ_CP023654.1|WP_075139709.1|454180_454819_-|YigZ-family-protein MKLILSVKEPVTTEQDIKKSRFISRIIPVQTEEEAQTKLQDIREIEAKATHNCFAYVLGDHQDIQRASDDGEPSGTAGAPILEVLKRENLTNVLVVVTRYFGGIKLGAGGLIRAYGSSTSLAVQSATLMESVDQELLAITIDYQNNDQLTYYLEQHQITQVNHEYTTQVITTIAVDQDQVADLKAELTGLFSGNVSFKDGGQQRVQVPYQPQ >NZ_CP023654.1|WP_087116615.1|454850_456170_+|DEAD/DEAH-box-helicase MEAKVKEKYYGRLVPVNQAEATDPTVNYFPAVIVKKRRIQCQRCGATTKLKEGSLPNQQYYCRHCINLGRMSTLVKLGNLPEPNHFPVGRSYLKWQGQLTPDQQRCANEIISSIKQQTDRLLWAVTGAGKTEMLFPGINFALKKALRVAIASPRIDVVLELHPRIQAAFPEIAIALLHGRTSTPYTYTQLVLCTTHQLLRFYHAFDVLIIDEVDSFPFAMNPALHYAAHQARKECGTTIYLTATPDGQLLKDSRSHRLPTSYLTRRFHGHPLPEIKMVSGCNWQKLIHRRRLPERLRQFLMAQAKTQRQFLVFVPRIDQLSSVLQAIQKQFPELDLATVYAEDPERIEKVSAMREGQLTGLITTTILERGVTFPGIDVAVLGADDEIFSMAALVQIAGRVGRSPKRPTGTVLFIGQMLTRRIKRAQRQVKFMNQQAFKQ >NZ_CP023654.1|WP_005916130.1|456454_456841_+|ComF-family-protein MRKAFCNDFINFIQSLVKEDEHLVPIPVDQGTIKVRGFNQVAGLIEGLEFEPVLISQRSEQARHQFQRSRRERLQRENPFRVVEPNKVAGAKWVIIDDIYTTGVTVRQAGRELSKHGARQVRSITLCR >NZ_CP023654.1|WP_002829951.1|456969_457524_+|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA MLDFNVRGENIEVTESIRDYVEKRIGKIEKYFDQGANPKAHVNLKVYQDRTAKVEVTIPLPYLVLRAEETSPDLYASVDLVTDKLERQIRKYKTKINRKSRETGYKGVEIPQEDAREDEEEASEFDIVRTKQVSLKPMGAEEAILQMDMLGHNFFIYEDADTGSVDIVYRRHDGRYGLIESANE >NZ_CP023654.1|WP_002829950.1|457672_460036_+|preprotein-translocase-subunit-SecA MANILKKWVESDAREIKRLGKKADKIDALKDEMAQLSDEELKAKTPEFKERLKNGETLDDILIEAFAVAREGAKRVLGLFPFRVQLIGGMVLHGGNIAEMKTGEGKTLTATLPVYLNALGGEGVHVVTVNEYLAERDSTEMGELYKWLGLTVGVNTAEMSPDEKREAYNCDITYSTNSEIGFDYLRDNMVVYKEDMVQRPLNFALIDEVDSVLIDEARTPLIISGQTEPSVTLYQRADRFVKTLTDGDYTIDWESKSISLTENGIRRGEKYFNTDNLYDVENSALNHHIDQALRANYIMTKDKDYVVSDDGEVLIVDSFTGRVMEGRRFSDGLHQAIEAKEHVEIQDGSKTMANITYQNLFRMYKKLSGMTGTAQTEAEEFREIYNMEVVSVPTNRPVVRDDRPDLLYPTLESKFKAVVKEIKKLHTKGQPVLVGTVAVETSEYLSRLLDRERIPHVVLNAKNHAREAEIVANAGQKGAVTIATNMAGRGTDIKLGPGVVELGGLAVIGTERHESRRIDNQLRGRSGRQGDVGMSQFYLSLEDDLMIRFGSERIKDLLSRMKVADEDAVIQSRLISRQVESAQKRVEGNNYDARKNVLQYDDVMRAQREVIYAERQQVIMEEHSLKDVLMPMVYRTIDRVVDAHTAKTKKSYDLDTIVEFARTTLVNENDINIEDLEGKSANEIKDYLKQLADQMYKQKEDALYAPEQILEFEKVVILRVVDQHWTDHIDAMDQLRQSVGLRGYGQLNPLVEYQQEGYRMFNEMVTDIEYETTRLFMKSEIRQNLER |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP023654_2 | 655948-656051 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP023654_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP023654_2
>2.1|655972|56|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder CCTTACAAGCAGGAGGTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCTCCATTATCTTGAGCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP023654_2
The CRISPR arrays of NZ_CP023654_2 >merge|NZ_CP023654|2|655948-656051|CRISPRCasFinder TTAGCTCAGTTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGGAGGTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCTCCATTATCTTGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTG >NZ_CP023654|2|2|655948-656051|CRISPRCasFinder TTAGCTCAGTTGGGAGAGCATCTG CCTTACAAGCAGGAGGTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCTCCATTATCTTGAGCCG TTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTG
>NZ_CP023654.1|WP_087115681.1|649366_650371_+|flippase-like-domain-containing-protein MILAGLVIFGYSLRGVNLHQVSHDILNLNVGWLLVALLCIILYLGFEAVATKVLVESNGDRLSWKDAIRIPLIEQLFNGLTPFSSGGQPAQLVALMQSGIEGGRASSVLLMKFVVFQSMVVLNFIFSLLIGFQYLEDKIKFLSWFVLFGFLIHLAVIIGLLMIMYWHNFTKKMFDLIFIPIKRFTKPERYLRWKTSIDAKVDTFYLESVRMKSQWRLLAKVALLTFLQLLFYYLIPYFILLALGKTHVHLIMVTCLHVLIFMVISLFPIPGGAGGAEYGFSVIFAQFIGNSSKLVLAMIIWRLLTYYFGMFAGMFATVIKPNRINRIVPKKMSE >NZ_CP023654.1|WP_141783014.1|648303_649317_+|glycosyltransferase MPIKVNMFSSASKVKGQGVGSAYEELIRLLKTHFPKEIDLSINRYTQADISHYHTIDPQFFASTFTKKRGVKVGYVHFLPETIEGSLKIPQPFRWLFYKYIIAFYKRMDQIVVVNPTFIDQLVKYGIKREIITYIPNFVRKDEFYQYDAEQRRQVRERLGVQNRFTILGIGQVQERKGVKDFIKLAQQHPEMYFIWAGGFSFGRLTDGYADLKKVVDNPPANLKFTGIVDRNKLVEYYNAADLFLLPSYNELFPMSVLEAFSCGTPVMLRDLDLYHSIIKGYYIAADNYAEMDQKLSALVKNPAQLRDYQQRADQASAEYSEDHLAEIWLKYYSSCA >NZ_CP023654.1|WP_141783013.1|647085_648273_+|glycosyltransferase MNIGLFTDTYFPQVSGVATSIKTLRDQLEKQGHQVYIFTTTDPKVDTNVYERNVFRFTSIPFVSFTDRRIAISGFIRATQIAKELNLDIVHTQTEFSLGWMGKFVAKALKIPVIHTYHTMYEDYLHYVANGKLLKPYHVKQMTRAFCYHIDRIVAPSERVQRTIQRYGIQVPTRIIPTGVNLEQYQKDSNPQQCREALGYDAKTPVLLSLSRLAYEKNIQEVIDCFPAILKEVPDAQLLIVGDGPARTSLENQVHDLGLEKHVKFTGEINNDQVYRYYQAADLFVSASDSESQGLTYIEAMASHLKVVAKSGPYTDELLDDPSLGKVFDTEAQLVQAIKRYIEHPDEFNDPRPREKKLYEISADYFGKRIVDYYNSAISAHADLEHGSKKESELE >NZ_CP023654.1|WP_008842202.1|646226_647000_+|alpha/beta-hydrolase MEFILKTGETIYYEDQGEGIPILFLTGFGGNTEIWSGQVNFFLQHGYRVIRLDYLNHGRSDRVDYDLKIGDLADEVLQLVDALEIKEPIGIGNSMGAAVLWNILSIRGWDFVSKAIFVDQSPRMMNDDQWHYGFKNLSEANFEQLMSEPILRPAYRRIEGYVYKNSKAIDSKYPFSQPKNRSLVKGHARKDWRPVLRAATKPVLFILGEKSPFFNPQMGDALKQLNSRIQVEVMPNVGHIPMAEEPAQFNQLVLRFL >NZ_CP023654.1|WP_008842201.1|644429_646154_+|phosphoenolpyruvate--protein-phosphotransferase MTGTLKGIAASDGIAIAKAYLMVDPDLSFEKKTITDVDAEINRLHDALEQSKKELTLIKAKAAENLGAEEAEVFEAHLTILSDPELIGNIEDKIKNDTINAEEATKEVTDNFIAMFEAMTDNAYMQERAADIRDVTKRLMSHLLGVELPNPALIDSEVIIVAHDLTPSDTAQLDRRYVKGFITDIGGRTSHSAIMSRTLEIPAVVGSEKATTSVKQGDMMIVDGLTGDALINPSDDEIKEYEQKSADFKAQKAEWEKLKNERTVSKDGVHFDLAANVGTPDDLQGVLDNGGEAVGLFRSEFLYMNASELPSEDQQFEAYKKVVEGMNGKQVVVRTMDIGGDKDLPYLPLPEEMNPFLGYRAIRISLDRTDLFRTQLRALLRASAYGKLAIMFPMIATVAEFKKARAIYDDERQKMIDAGTKVGEIQVGMMMEIPAAAMIADKLAKYVDFFSIGTNDLIQYSFAADRGNEKVSYLYQPYNPSLLRLIKQTIDASHAEGKWTGMCGEMAGDQIAVPILMGLGLDEFSMSATSILKTRSLMKKLSTDDMKKLAEKAITEAETNEDVIKLVEETVNNK >NZ_CP023654.1|WP_002829779.1|644163_644430_+|phosphocarrier-protein-HPr MEKRDFHVIAETGIHARPATLLVQAASKFNSDIQLTYKDKSVNLKSIMGVMSLGVGQGADVTISADGDDEADAIAALEDTMKKEGLSE >NZ_CP023654.1|WP_008842200.1|643832_644021_+|hypothetical-protein MRDYLKLLNDLKDGVLDELTITAEEFQDFQPVFMDFPERKQLIGEAQRGGTITYRYENNKKQ >NZ_CP023654.1|WP_002829782.1|641409_643617_-|ATP-dependent-Clp-protease-ATP-binding-subunit MLCQNCHKNEATIHLYTNVNGRRTEVNLCQNCYQLLKNQQLNNNNGNGGARMAQDPFGFGNLDDIFRAMQGGNVSRPEDMYGQQVPPTQAGRGGGNNPNGGNGSSLLGQYGLNLTDLAKQGKIDPVIGRDKEIERVIEILNRRTKNNPVLIGEAGVGKTAVVEGLAQRIVEGSVPQKLLNKQIIRLDVVSLVQGTGIRGQFEQRMQELMKEVQNNPDLIVFIDEIHEIVGAGNAEGGMDAGNVLKPALARGDFQLVGATTLKEFRDIEKDAALARRLQPVQVDEPSEEEAIKILKGIQKKYEDYHHVHYTDDAIVAAVKLSKRYIQDRYLPDKAIDLLDEAGSKKNLTINVADPETIQKKIDEAEAEKKKALESEDYEKAAYYRDQVSKLEKNKDGATNKEDEPTITAEDMEKIIESKTDIPVGDLQKQEQEQLQNLASNLKAHVIGQDEAVDKISRAIRRNRIGLNGTGRPIGSFLFVGPTGVGKTELAKQLADQLFGSKDAMIRFDMSEYMEPHSISKLIGSPPGYVGYEEAGQLTEQVRRHPYSLILLDEVEKAHPDVMHMFLQILDDGRLTDSQGRTVSFKDTIIIMTSNAGSGDVEADVGFGAAMQGKTHSVLDKLGNYFKPEFLNRFDDIVEFHALTKDNLMQIVDLMIADVNKMLATQGLHVNVTKPVEERLVELGYDPKMGARPLRRVIQEQIEDRIADFYLDHPSEKQLIARIKDDKIEVAPDDKK >NZ_CP023654.1|WP_005917413.1|640207_641185_+|GMP-reductase MKVFDYEDIQLIPAKCVVRSRSECDPTVELGKHTFKLPVVPANMQTIINEEIAEKLAADGYFYIMHRFEPETRLAFVKKMKAKGLISSISVGVKDGEYDFIDELAAKNLVPDYITIDVAHGHAQTVIDMIHYIKEKLPESFVIAGNVGTPEGVRELESAGADATKIGIGPGKVCITKLKTGFGTGGWQLSALRWCAKVARKPLIADGGIRNHGDIAKSIRFGATMVMIGSLFAGHIESPGETKVEDGVTYKEYFGSASQYQKGEAKNVEGKKIWIHQRGHLADTLKAMREDLQSAISYAGGRDLESIRKVDYVIVKNSIFNGDIL >NZ_CP023654.1|WP_002829785.1|639335_639590_+|hypothetical-protein MSKNLKIDLNTDELIGSREASLMWGKQKDYVRTIYNKYPERFPTGTIRKFGKQLIVTREGMESVTGIKYEDLDKKNIEKAKLPR >NZ_CP023654.1|WP_087115663.1|657981_658713_-|hypothetical-protein MNKIKIPKINYHVDRKSYLPAILAVILTSTIWYFSGHFSSEPFKHNLTVQIIFFLACFMANFITFDQLTNKTNLRLIAPLAVIPVAFFIILLVSKERYVSLLGLLTLVPFVSVFLPFQGKNGVGLISFAFSISVLSPIAFFYIRNAFVSSMFLKTCLLLCLVFLMILFSVFMAHPEQFIYLEIGLLVVITIFGFVLFKQWSAVLYPMIGILGWYLPRVKLPRNFILLVLIILICVTFLFTAGH >NZ_CP023654.1|WP_002830669.1|658884_660075_+|methionine-adenosyltransferase MSERHLFTSESVSEGHPDKIADQISDAILDELLKNDPDARVACETTVTTGLVVVVGEISTTAYIDIQKVVRKTIKDIGYVGGEYGFDGENCAVIVAIDEQSPDIAQGVDDSLETREGHEDRLNRIGAGDQGLMFGYATDETKELMPLPIMLSHHLMQRIAKLRKEQVISYLRPDAKAEVTVEYDDNDQPVRVDTVVLSTQHDPDVTLEQIRKDVIEKVIKEVIPAELLDEKTNFYINPTGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGAAHHGGGAFSGKDATKVDRSASYAARYIAKNIVAAGLAKKAEVQIAYAIGVAEPVSVMVDTFGTGKVSEEALTKAVRQIFDLRPAGIIEMLDLKRPIYKQTAAYGHFGRTDVDLPWEKTDKVAELKAFFQK >NZ_CP023654.1|WP_002830670.1|660250_661720_+|MFS-transporter MKKKQTNVALVTVAIFVATFMSAIEGTIVSTAMPTIVGDLHGVNLMNWVISIFLLTNAIFTPIYGKLSDIFGRKRVFIIGIIIFLIGSMLSGLAHSMTTLIIWRALQGIGAGSIMPVSNTIIADIYSLEKRAKVMGLNGSAWGIASIIAPLLGGFIVDNLSWHWIFFINVPIGIITIILIQLYLKEEVSVHRKKIDYWGSVWLMLSLLGLMYGFQLLGESTASKLILGLSFIIFVVAGALFIRQERRAEDPIIFLDLFNDRTFVIQNVATMLVSGLLIGFEVYLPTWTQGILGLPASLAGFAVTPSSVLWIFGSFLAGKMLVKLKANQILRISLTILAIGSFLLAVIPASTPFVAFFFIAAILGVGFGITITSTLVISQQLVSKDRIGVATSFNTLAKTLGQTIMMSVFGIIMNGTINMGIAHHPRINMTMMNQVINPQTAKQLPADLLPTLRDILYSALHNIYICGFILIIVAIVINAFSRPRTQKNK >NZ_CP023654.1|WP_053906516.1|661799_662363_-|methyltransferase-domain-containing-protein MLDNAMQYSHRLLAEVVQPGDHVVDATMGNGHDTLFLANLVQSQGRVFSFDIQAAALSATEARLEKQLPDHQHVQLIQDSHDQLAQYVDTPISGAVFNLGYLPGGNKQIITHSASTIVAVQQCLQLLKVGGRVVLVCYYGHPGGAAELAKLLEFTANLDQHQFTCLRYEFINQVHQPPILLAIERRK >NZ_CP023654.1|WP_087115665.1|662355_662991_-|phosphatase-PAP2-family-protein MRFKKFGWLILNWLPLLGLLTLVISVSNRWNWVHTYDRYLQKIIHGWQSPGLTPLVKIYTQLGNAKPFIFISIVILGMLLWRGYDRLAAFFLANVVLGNAINHLIKLWIRRPRPHFRLITIGGYSFPSGHSVAAMLLFGSLIFITTQTVRSPKWRISWILTCIILMLLLGLSRVYLNVHYPSDVTAGLLLGLVILQTTHWIFYRKKESQHA >NZ_CP023654.1|WP_087115666.1|663396_665814_+|leucine--tRNA-ligase MAYNHKEIEPKWQRYWQKHETFKTVESEQKPKYYALDMFPYPSGQGLHVGHPEGYTATDIMSRMKRMQGYKVLHPMGWDAFGLPAEQYAMKTGNNPKDFTAHNIKNFKRQIQSLGFSYDWSREVNTTDPEYYKWTQWIFEQLYKKGLAYEKETLVNWAPDLMGGTVVANEEVVNGKTERGGFPVYRKPMKQWILKITAYADRLIDDLDLVDWPDSIKEMQKNWIGRSIGASVFFDVEDSDQKIEIFTTRADTLYGATYLVISPEHPLVDQLTTLESKAAVEEYKQAVATKSDLERTDLNKDKTGVFTGSYAVNPVNGKKIPIWIADYVLASYGTGAVMAVPAHDPRDYEFARKFKIDIVPVIGGGNLDEEAYTGDGPHINSGFLDGLNKQEAIDKMLDWLEEHGAGHKKVNYRLRDWVFSRQRYWGEPIPVIHWEDGETTLVPEDELPLRLPATDNIKPSGTGESPLANLEDWLNVVDENGRKGRRETNTMPQWAGSSWYFLRYVDPKNQNKIADEDLLKEWLPVDLYVGGAEHAVLHLLYARFWHKVLYDLGVVPTKEPFQKLVNQGMILGSNHEKMSKSKGNVVNPDDIVERFGADTLRLYEMFMGPLTESVAWSEEGLNGSRKWIERVWRLMIDDNNHLRDRITMINDHKLDLIYNQTVKKVTEDYENMRFNTAISQMMVFVNEAYKADALPMVYMEGLVKLLSPIIPHVAEEIWQIMGHDETITYETWPTYDESKLVQDTVQVILQVNGKVRSKVEVEKDLDQAELEKIALADERIQQWTAEKDIKKVIVIPNKIVNIVAK >NZ_CP023654.1|WP_087115667.1|666070_667753_+|polysaccharide-biosynthesis-protein MDKPSEFDTAESQYLGSQPLRENNGNSSSKAKMLEGSAWMTAGSIFSRILGAIYIIPWVIWFGVYSDQANALYTKGYNIYSFFLIAAIAGIPSAISKQVAHYNAINEFALGQRLYKRGLLLSVGTGVVCAAILFFGAPFLNDGDPNVTTVLHALAWAVLVIPTMSLTRGFFQGYQEMGPSAVSQFIEQLARVAYMLVTAYLIMYKNHGDWVYGVAQSTFAAFIGALGGLLVLIGYFVKYRRRLRYLSQHSVNGLAISTTSLYKEIIAQAVPFIIIGSAITIFQLIDQYTFFRIMRSVSDYSATVLNNMFAIFAFNANKLVMIVISLASALAVTSVPILSEAKTRGDRAEISRQVADSILLFAFLMIPSALGMAAVAQPAYTLFYHLSDVGTAILQFNSYVAIVLGLFTVISAAMQGIGENVLAVKYFVVGMIVKFIFQFPMVAIFSAVGSLISTAIGFAVVNWLILRHINREYGLDYDKINGFIGKIITYSFGTFFIAFVVTNGLYLVMNPANKVQALIVILVAATLGGLFYVVCVLKSRLADEIIGGRAAGLRRMLKIK >NZ_CP023654.1|WP_024862473.1|667764_668484_+|rRNA-pseudouridine-synthase MRVDKFLHDMNVGTRSQIRKLIKEKAVFVNDVVAKSGRVKVDPVVDQVRLGEQVITYQQYFYFMMNKPLGVVTATEDRKQKTVMDLFNKVDFRKDLFPVGRLDKDTEGLLLITNNGPLAHQLLAPERHVQKTYEAVVTGQITDPAVKQFADGMVLKDGTQLKPADLTILNYSALDEQTLVHVTLKEGKYHQVRRMFGSLGERVVSLKRISFGPLQLEEGLLPGTYRELNDEEIEKLKTE >NZ_CP023654.1|WP_087115668.1|668590_669421_-|NAD(P)H-hydrate-dehydratase MLKINRQTLKSHWPVRQKQSHKGTYGHLLLIAGNAQYGGAGILAASAAVYAGGGLVTLATAKNNFTAVRATLAEIMLIDFTDFDQLSQSLANATGVVIGPGLGTDSTSLAVLNFTLAHIAEGVPLIIDGSAIDLVAQHDLRVSHHPTIYTPHQMEWQRLSGIKIADQSVGRNQAVVDQLNATVVLKHYHTEIYAPAAPVAQIMAGNPGMATGGSGDSLTGILLALIAQANSVNEGVRLGTFLHSYTADLIYEHEAVVLPHRLIRRLPAVLKQLAQP >NZ_CP023654.1|WP_005919128.1|669546_670008_+|universal-stress-protein MDYKKILFGYDGSPESMAAFNRAVEIAKSNHAKLIIASVMKKQHANTASVSLGFGVIETGIDLQDTLDQWKTTLEKLKQDAQQQGLPAEDIEVVFKQGSPKSMLSYTLPKEYDVDLIVLGATGMGTVAQVILGSTASYVVENAAPDVVIVKNN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP023654_3 | 1528424-1528580 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP023654_3
|
2 spacers
spacers of NZ_CP023654_3
>3.1|1528461|30|NZ_CP023654|PILER-CR ACTCTCAACGGTTCGGATCTTGCCAATCAC >3.2|1528528|36|NZ_CP023654|PILER-CR CTTCTTGGAGTCCTATCGCATGGAGCGTCTCTAGCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP023654_3
The CRISPR arrays of NZ_CP023654_3 >merge|NZ_CP023654|3|1528424-1528580|PILER-CR ATTTCTTCGTCGCCTAGCTCCTCGACATTACTGTGACACTCTCAACGGTTCGGATCTTGCCAATCACTCGTCGCCTTGCTCCTCCTTCTTGGAGTCCTATCGCATGGAGCGTCTCTAGCAATCTCTTCGTCGCCTAGCTCCTCGACATTACTGTGAC >NZ_CP023654|3|3|1528424-1528580|PILER-CR ATTTCTTCGTCGCCTAGCTCCTCGACATTACTGTGAC ACTCTCAACGGTTCGGATCTTGCCAATCAC TCGTCGCCTTGCTCCTCCTTCTTGGAGTCCTATCGCA TGGAGCGTCTCTAGCAATCTCTTCGTCGCCTAGCTC CTCGACATTACTGTGAC
>NZ_CP023654.1|WP_065124675.1|1527431_1528058_-|N-acetyltransferase MEKDYLIRLEQPADYQKTEAMVREAFWNVYRPGCYEHYVLHVLRKSSEFVPQLNLVMEKDHQIIGQICFVKAKLVDKNGNEVPVLTFGPLSIAPAYQRKGYGKKLLDYGIAQARKWGASALCIEGNLAFYKHAGFEIATTKGIRYASEPENGELPYFLAKELREGFFEQVQGALYYTPSAYYVSESDVNKFDQQFPPKEKRVLPGQLA >NZ_CP023654.1|WP_002832208.1|1526770_1527229_+|flavodoxin MPTAKVVFATITGNNEDCADIITEALEDLGVEVDETEISQTDAAELKDYDINVIVPYTYDEGALPEEGLDFYDDLADLDLSGKIYGVAGSGDTFYEEFYCVAVDKFSEALTKANATKGTADLKINLAPESQEDLDHLDQFAQDLVDAYNAQN >NZ_CP023654.1|WP_065124676.1|1525902_1526718_-|recombination-regulator-RecX MININSEETKKITKITAQKRAGRYNVFLDGEYAFPISEETFIHFRLGKGMAVNGTLLKEIGEYETNAEAYNIALTYITGQLRTENEVRQKLRQQDYEESIIEAVIAKLADLNLLDDQEYAKSYVRTMMRTGDKGPRYLINHLRQKGVLENDLQAGLQLFTDVEQVALAVRVGQKLQKRHQAQALRQQQLKIRQNLMQKGFTSEIIEKALAEIEFTVDSDAEYEKLRKLGERLLRRYQGQPEYQRTTKIKRSLYQKGFEMELIERFLNENDS >NZ_CP023654.1|WP_002832206.1|1525255_1525810_-|DUF402-domain-containing-protein MSQYSDGPKEGEYIAIKSYKHDGSLHRTWRETMVLKNSQDEFIGCNDHTVVIEDNDRRWVTREPALVYFNKHTWFNVVAMIRDNGVSYYCNIASPYVLDREALKYIDYDLDVKVFPNGERRLLDTDEFEQFSRQWHYSADTIQILLDSVRELTDWINKKRGPFSVEFINIWYKRYLNIAERNTR >NZ_CP023654.1|WP_008841091.1|1524044_1525175_-|AI-2E-family-transporter MFEKFRKTPLMYWSLELLIIATLLWVCTKIDFLFSPIGTFISTVFMPLILATFLYYMLHPLVKLLMKVHYKKFRISRTWAVVLVFVGFLLLIAWGISSFLPSLIDQISQMLGNLPMIAKKLQVAIPQLVDHSWLRKVDFDPYLKNLNSEIGQYAEQFLANMTNSIGNIIAALTNITVIVITVPIILFYMLKDGYKLIPTISRIVPEHNRKSVLDLFYSMSDTLSSYISGQVIECIFVGTFTVIGYMIIHQPYGLVLGVIAGICNIIPYVGPYFGIFPSLLVAIAQSPEQVISVIIVVLIVQQVDGNLIYPNVIGKSLQIHPLTIIILLLVAGKLAGILGMILAVPTYAIVKVLINFIHHIWVLDRDKIEEKVKPEK >NZ_CP023654.1|WP_002832202.1|1523564_1523969_-|glycerol-3-phosphate-cytidylyltransferase MTRVITYGTFDLLHKGHVRLLKRARELGDHLTVCLSTDEFNAVKGKKAYTPYEDRKYILEAIKYVDEVIPERGWDQKINDVKENDIDIFVMGDDWKGQFDFLKDYCKVIYLPRTEGISTTKIKRDLGLGDYKKD >NZ_CP023654.1|WP_024862999.1|1521929_1523498_-|peptide-chain-release-factor-3 MNQAELKAAVDKRRTFAIISHPDAGKTTITEQLLLFGGVVREAGTVKARKTGNYAKSDWMEIEKKRGISVTSSVMQFDYAGKRINILDTPGHEDFSEDTYRTLMAVDSAVMVIDSAKGIEPQTKKLFQICKMRGIPIFTFMNKLDRDGREPLDLVNELEEVLGIDAYPMNWPIGMGKGLAGLYDIYNNRIELHTDEPEYLALDSNGELKEPNPIEEESVFQDAMMEVDLMKEAGNQFDEAKIAKGELTPVFFGSALTNFGVKTFLDAYLQFAPAPSAHKVADGEQIQPTDEEFSGFVFKIQANMNPNHRDRIAFLRICSGEFDRGMDVTLKRTGKTLRLSNSTQFMADARENVERAVAGDIIGLYDTGNFQIGDTIYAGKQPVQFEKLPQFTPELFMGVSAKNVMKQKSFHKGIQQLVQEGAVQLYTNYTTGDYILGAVGQLQFEVFQFRMQNEYNSEVVMQPMGKKIARWINPEQLDEKMSSSRNLLVKDRAGQPLFLFENQFAERWFKGKYPDVELTAKL >NZ_CP023654.1|WP_005918921.1|1519657_1521826_-|LTA-synthase-family-protein MNRLWGKFRRGLNTKFGFFMLITGLFWLKSYIAYQTKFTLGVQGGMQELILAISPLGFAILLFGIGLYIRGKWAYWYMIVMDAILSTWLFANILYYREFSDFITFNLIKGSGAASDNLGKSLMGILRPTDFLVFVDVIFVIAILAFGFAKIDQQRFKLVNSLAVTILSIGVLAANLALAYSNRSGLLTRTFDNNYIVKYLGLQSFTLYDGVKTVQNSNKKKEAKSSQLKPINEFLKKNNVPANIEYKGVAKGKNVIIIHLESLQQFVINQKWKGKEITPNINKFYNDKNTLAYDNFFNQVGQGKTADAEMMLENSLFGLPEGSAMVTDGTTNTFQSMPAIMDQHGYTTAAFHGDVASFWNRDNAYKSFGYQYFFSKQYYSLKKGYVSGYGMKDKLFLQQSAKFLEELPQPFYAKLITVSNHYPYGIEKKNVSIDPWETGDSTVDPYVQTAHYLDQAVGELISYLKKTGLYDKSLIMMYGDHYGISNNHKPAIAKILGLKGVTNYDLAMFQKVPFMIHAPGLKGGVNHNYSGEIDVMPTLLNLLGIDTPGAYQFGHDINSKQYNQIVAFRNGDFVSKKYTKYGGDLYYTATGEQITDETASQKREVKQIQQYVNNELNYSDRIINGDLLRFADLDWFKKVNKADYSYTKKTALKNLKKAQKSKTSLLEQNHGRSTVDDYVTDAPELPENEDKAASSSSSSNSSSEDSSHSGSSSADPATQEDK >NZ_CP023654.1|WP_005918923.1|1518647_1519493_-|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein MASHLIILLLVGLLAGVFGAILGIGGGMIITPVLTIGMGLDIKYAIGASIIAVIATSSGATIAYLKDEMLNLRVAMFLEIATTVGAIVGAIMTGIFNSTVLYVLFGSFLVFSSWNMYRKLRQGGSEEGSAKNDRLANRLNLSGSYYDKALQKQINYQVENVPGGSAVMFGAGLASGLLGIGSGAFKVMAMDNIMKMPLKPSSATSNLMMGVTAAASAMVYFFNGSIHADIAGPLAIGILFGAQLGSRIMQRLRPRWIRLIFIPVLLYMGLQMVLKGFGVNF >NZ_CP023654.1|WP_005918925.1|1518284_1518647_-|DUF1634-domain-containing-protein MNAKQKEMNHVELLIGRILQVGVYISAIVIICGIGLWLVKNGSGYAGALPTRLGVIFQGAMQLKPYAVLMLGIFLLILTPVLRVVVSIYAFAKEGDRLYVAITTIVLIILIIGMTIGYQG >NZ_CP023654.1|WP_141783081.1|1529131_1529221_+|putative-holin-like-toxin MSVYQALMLMLAFATFVIALLTFVFTFCA >NZ_CP023654.1|WP_141783082.1|1529368_1529854_+|hypothetical-protein MLSIRYFVAWEQRKLGEITKTHSFKQYISEAFDHGKYMVIQQGENPIAGYANGDPFENFKDVTLFGDHTLSLFKPQEKFFVASDGIKILSPSLKMNGMFYYYLLEKYRPQSEGYKRHFTIMKKSTALFPIEIDEQIKISNFLEELDSLIALHQRKPNTLFS >NZ_CP023654.1|WP_141783083.1|1529850_1530780_-|tyrosine-type-recombinase/integrase MFKDNFTRDSLFKYYFSHWIKLYKEGAVRQVTLEKYRTNYQHLAQIMPDLKMKDFDRNVYQELLNKYAETHERQTVIDFHHQVKGAILDAVDDGLIDRDPTRKAIFKGKAPREKKKKYLNQFELHSLLEDLNLGTSINWDWLILLIAKTGLRFSEALGLTPADFDFARQTISISKTWDYKNNTGFQPTKNRSSIRKVQMDWQLGMRFQQLVNGLEVDKPIFVNGAVCNSTPNKWLAHHCKNCGIPEISLHGLRHTHASLLMFAGVSIASVSRRLGHSSITTTQKVYMHIINELENQDNDLVMRYLSSLS >NZ_CP023654.1|WP_141783084.1|1530797_1531262_-|restriction-endonuclease-subunit-S MVNRVNKSSNSDVLPKVEFEDIVSGEGRLNKDISSKLDSRKGTLFESENILYGKLRPYLKNWLFPDFEGVALGDFWVFEATDVSVPSFDYYLIQSDDYQKVANDTSGTKMPRSDWKNVSSTDFAIPSKDEQKQIGAFFKQLDDTITLHQRKPKW >NZ_CP023654.1|WP_141783085.1|1531327_1534423_-|HsdR-family-type-I-site-specific-deoxyribonuclease 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>NZ_CP023654.1|WP_141783086.1|1534485_1535643_-|restriction-endonuclease-subunit-S MSKDKKRLVPVRRFKEFENAPAWEQRKLGEVVEITMGQSPSSKNYTENPNDHILVQGNADMKNGHVVPRVWTTQITKQAEKGDLILSVRAPVGDIGKTDYDVVLGRGVAAIKGNSFIFQLLTKMKINGYWTRFSTGSTFESINSDNIKNAQISIPSLREQEKIGGLFNEFDSLIALHQRKLDKLKRVKSAYLTEMFPAEGEREPKRRFPGFTVAWEQRKLGDVVNRFDNLRIPVTASKRIHGEFPYYGANGIQDYVDGYTHNGEYILVAEDGASNVYDYPVNYVKGKVWVNNHAHVIQGKTNIADNLFLLNAIKSINIASFLVGGSRAKLNAEIMMELPIKIPSYNEQKKIGKYFANIDSLITLHQRKLDKLKKMKAAYLEEMFV >NZ_CP023654.1|WP_141783087.1|1535642_1538222_-|type-I-restriction-modification-system-subunit-M MITSEEIKRRLWDGANNLRGTMDASRYKDYMLGLMFYKFLSDKTLQTFKETAGLPDDANVLEEYRKAHEEYGEELETMIQQVLGYHVTPDHLYQTWEEDIENGDFELSEVMDSLNAFERSIAATDDSDDFKGLFSSSVIDLTNTALGSDLNKRSKNIRDLIGLFADLNMVDLQNGDVLGDAYEYLISQFASDSGKKAGEFYTPAQVSEVIAQIIARTTEIKSIYDPTVGSGSLLLTVGKHLSKDARKNLHYYGQEYITATFNLTRMNLLLHDVRPENMTIRNGNTMASDWPEDPSRPGEGVQFDAVVMNPPYSDKSWNKHEDKPLKVSDPRFSEFGALPPESKGDFAYLMHGLYHLGQQGTMGIVLPHGVLFRGDTEGEIRQRLIEKNYIDAIIGLPSNLFTNTGIPVAVLILKKNRKLTDPVLIIDASRDFIKVGKNNVLRERDTAKIVDTYVNKRELRGYSHLASRQEIIDNDYNLNIPRYVEAIDEEIPEDVDGHLLGGIPESNLARLTVLSSTTKQLLADSLEQVRPGYVKLKVSVDDLKKQALSNGNITGEQARLSETIRIYINKYYPQLKQINKDTNLAELKLSMVDEIKQVLSQFDNVDQYAGYQIVADLWESSLEEDAELIAANSFYEAGRTRKPNMVEKGSGAKKRTVQDGWLGAIVPNDLIADMLYQDDKAKISELEQKAADVESELGELVEAAKTEDTPEYDALFDVLKKNDDDEPQDSFESKKVKAALKESEESSDGTGYLKRVSDLMAAKTKVNRKIKNAKADLQEAIYDRIEKLTNEEIDQLMQEKWFGGFEEKMVKLVTQPLLADLQTLAILSDRYADTLDDIDSQISQAETDLNSFMQDLVVK >NZ_CP023654.1|WP_141783088.1|1538238_1538460_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein 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MGINRFQVLVDALRPLGEIDGSISNEDAVIAIFENYTKNWNENNYQNSNYKKLYYQGINPSVVQKLKSSTIDEDKFKQFVDTASDDQKYSISNYLFEELKLNEEISPEGLSYFCVNLMSELVEEARNKKRRKRKQKIPTKKSEDKLPFVKTVSDEMFSSVFHQVNVSEMDVVKNKNSIHAFVLKPELLPFRYKNLRKLAMSNITNYAIARGVEKTDITGLKAGQLLRRYAKSGIPSNLLGELLTYIFLEHEENALKLYTRAEISAIDRTIDSEGMYLKSDGERVQLILGASQLNNSLQEAVDNVVEKLSKFRNNQSDEMMLATDIVDMTILNAQLGEAESQAIIQTMIPNESGLEEVASYGLFIGYQFKTEQDLDNCTQDEAKKICRQTVNNDLQQAISQLGRAIQQHHWQKSSFYVYLLPFTSAEEDSHKIMNDLIGG |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP023654_1 | 1.3|446576|30|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 446576-446605 | 30 | MN856076 | Myoviridae sp. isolate 501, complete genome | 4692-4721 | 2 | 0.933 |
NZ_CP023654_1 | 1.11|447104|29|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder | 447104-447132 | 29 | JN700520 | Staphylococcus phage StB12, complete genome | 7255-7283 | 3 | 0.897 |
NZ_CP023654_1 | 1.9|446972|30|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder,CRT | 446972-447001 | 30 | JX409894 | Streptococcus phage LYGO9, complete genome | 17744-17773 | 4 | 0.867 |
NZ_CP023654_1 | 1.9|446972|30|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder,CRT | 446972-447001 | 30 | JX409895 | Streptococcus phage JX01, complete genome | 29591-29620 | 4 | 0.867 |
NZ_CP023654_1 | 1.9|446972|30|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder,CRT | 446972-447001 | 30 | MH853356 | Streptococcus phage LF2, partial genome | 32334-32363 | 4 | 0.867 |
NZ_CP023654_1 | 1.9|446972|30|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder,CRT | 446972-447001 | 30 | MK448749 | Streptococcus phage Javan39, complete genome | 30631-30660 | 4 | 0.867 |
NZ_CP023654_1 | 1.11|447104|29|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder | 447104-447132 | 29 | NZ_CP028882 | Borreliella bavariensis PBi plasmid lp28-3, complete sequence | 22440-22468 | 5 | 0.828 |
NZ_CP023654_1 | 1.11|447104|29|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder | 447104-447132 | 29 | NC_017804 | Borreliella garinii BgVir plasmid lp54, complete sequence | 58009-58037 | 5 | 0.828 |
NZ_CP023654_1 | 1.14|447039|29|NZ_CP023654|PILER-CR | 447039-447067 | 29 | FN997652 | Streptococcus phage phi-SsUD.1 complete sequence | 52079-52107 | 5 | 0.828 |
NZ_CP023654_1 | 1.4|446642|30|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 446642-446671 | 30 | NZ_CP006570 | Sodalis praecaptivus strain HS1 plasmid pHS1, complete sequence | 422124-422153 | 6 | 0.8 |
NZ_CP023654_1 | 1.10|447038|30|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder,CRT | 447038-447067 | 30 | FN997652 | Streptococcus phage phi-SsUD.1 complete sequence | 52079-52108 | 6 | 0.8 |
NZ_CP023654_1 | 1.12|447104|30|NZ_CP023654|CRT | 447104-447133 | 30 | NZ_CP028882 | Borreliella bavariensis PBi plasmid lp28-3, complete sequence | 22439-22468 | 6 | 0.8 |
NZ_CP023654_1 | 1.12|447104|30|NZ_CP023654|CRT | 447104-447133 | 30 | NC_017804 | Borreliella garinii BgVir plasmid lp54, complete sequence | 58008-58037 | 6 | 0.8 |
NZ_CP023654_1 | 1.13|446973|29|NZ_CP023654|PILER-CR | 446973-447001 | 29 | AP017992 | Planktothrix agardhii NIES-204 plasmid plasmid1 DNA, complete sequence | 106926-106954 | 6 | 0.793 |
NZ_CP023654_1 | 1.14|447039|29|NZ_CP023654|PILER-CR | 447039-447067 | 29 | MN694486 | Marine virus AFVG_250M318, complete genome | 18601-18629 | 6 | 0.793 |
NZ_CP023654_3 | 3.1|1528461|30|NZ_CP023654|PILER-CR | 1528461-1528490 | 30 | NC_031280 | Acinetobacter phage vB_AbaM_phiAbaA1, complete genome | 47055-47084 | 6 | 0.8 |
NZ_CP023654_1 | 1.3|446576|30|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 446576-446605 | 30 | MT952005 | Aeromonas phage BUCT551, complete genome | 52066-52095 | 7 | 0.767 |
NZ_CP023654_1 | 1.9|446972|30|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder,CRT | 446972-447001 | 30 | AP017992 | Planktothrix agardhii NIES-204 plasmid plasmid1 DNA, complete sequence | 106925-106954 | 7 | 0.767 |
NZ_CP023654_1 | 1.10|447038|30|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder,CRT | 447038-447067 | 30 | MN694486 | Marine virus AFVG_250M318, complete genome | 18601-18630 | 7 | 0.767 |
NZ_CP023654_1 | 1.9|446972|30|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder,CRT | 446972-447001 | 30 | NC_018689 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429, complete sequence | 353108-353137 | 8 | 0.733 |
NZ_CP023654_1 | 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 446509-446539 | 31 | CP033569 | Acinetobacter pittii strain 2014N21-145 plasmid p2014N21-145-1, complete sequence | 34755-34785 | 9 | 0.71 |
NZ_CP023654_1 | 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 446509-446539 | 31 | NZ_CP033130 | Acinetobacter wuhouensis strain WCHAW010062 plasmid pOXA23_010062, complete sequence | 134639-134669 | 9 | 0.71 |
NZ_CP023654_1 | 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 446509-446539 | 31 | NZ_CP042557 | Acinetobacter baumannii strain E47 plasmid pE47_001, complete sequence | 265702-265732 | 9 | 0.71 |
NZ_CP023654_1 | 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 446509-446539 | 31 | NZ_CP029396 | Acinetobacter defluvii strain WCHA30 plasmid pOXA58_010030, complete sequence | 178267-178297 | 9 | 0.71 |
NZ_CP023654_1 | 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 446509-446539 | 31 | NZ_CP048828 | Acinetobacter baumannii strain ABF9692 plasmid pABF9692, complete sequence | 43613-43643 | 9 | 0.71 |
NZ_CP023654_1 | 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 446509-446539 | 31 | NZ_CP042365 | Acinetobacter pittii strain C54 plasmid pC54_001, complete sequence | 192348-192378 | 9 | 0.71 |
NZ_CP023654_1 | 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 446509-446539 | 31 | NZ_MH220285 | Acinetobacter ursingii strain RIVM0002 plasmid pRIVM0002_IMP-4_171109_B03, complete sequence | 116615-116645 | 9 | 0.71 |
NZ_CP023654_1 | 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 446509-446539 | 31 | NZ_MH220287 | Acinetobacter ursingii strain RIVM0061 plasmid pRIVM0061_IMP-4_171109_B01, complete sequence | 123852-123882 | 9 | 0.71 |
NZ_CP023654_1 | 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 446509-446539 | 31 | NZ_MH220286 | Acinetobacter ursingii strain RIVM0051 plasmid pRIVM0051_IMP-4, complete sequence | 88417-88447 | 9 | 0.71 |
NZ_CP023654_1 | 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 446509-446539 | 31 | NZ_KX426227 | Acinetobacter lwoffii strain ED23-35 plasmid pALWED1.1, complete sequence | 258062-258092 | 9 | 0.71 |
NZ_CP023654_1 | 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 446509-446539 | 31 | CP033531 | Acinetobacter pittii strain 2014S07-126 plasmid p2014S07-126-1, complete sequence | 240946-240976 | 9 | 0.71 |
NZ_CP023654_1 | 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 446509-446539 | 31 | NZ_CP010351 | Acinetobacter johnsonii XBB1 plasmid pXBB1-9, complete sequence | 81526-81556 | 9 | 0.71 |
NZ_CP023654_1 | 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 446509-446539 | 31 | NZ_CP032285 | Acinetobacter sp. WCHA55 plasmid pOXA58_010055, complete sequence | 57400-57430 | 9 | 0.71 |
NZ_CP023654_1 | 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 446509-446539 | 31 | NZ_MK134375 | Acinetobacter baumannii strain 34AB plasmid p34AB, complete sequence | 212624-212654 | 9 | 0.71 |
NZ_CP023654_1 | 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 446509-446539 | 31 | NZ_CP038010 | Acinetobacter haemolyticus strain TJR01 plasmid pAHTJR1, complete sequence | 51782-51812 | 9 | 0.71 |
NZ_CP023654_1 | 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 446509-446539 | 31 | NZ_CP043053 | Acinetobacter pittii strain AP43 plasmid pAP43-OXA58-NDM1, complete sequence | 248550-248580 | 9 | 0.71 |
NZ_CP023654_1 | 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 446509-446539 | 31 | NZ_CP043309 | Acinetobacter johnsonii strain Acsw19 plasmid pAcsw19-2, complete sequence | 127317-127347 | 9 | 0.71 |
NZ_CP023654_1 | 1.4|446642|30|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 446642-446671 | 30 | NC_011737 | Gloeothece citriformis PCC 7424 plasmid pP742402, complete sequence | 49057-49086 | 9 | 0.7 |
1. spacer 1.3|446576|30|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN856076 (Myoviridae sp. isolate 501, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ggtgaccatactgacccttacggctatcta CRISPR spacer actgaccatactgacccttacggctatcta Protospacer . ****************************
2. spacer 1.11|447104|29|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder matches to JN700520 (Staphylococcus phage StB12, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.897
acgatttaccgttttaggaatgatttaga CRISPR spacer acgatttaccgttctaggagtgatttaaa Protospacer *************.*****.*******.*
3. spacer 1.9|446972|30|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder,CRT matches to JX409894 (Streptococcus phage LYGO9, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
cttcaatgtctaaagcttgcttagctaacg- CRISPR spacer ctgcaatgtctaaagcttgctcaa-taacgc Protospacer ** ******************.*. *****
4. spacer 1.9|446972|30|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder,CRT matches to JX409895 (Streptococcus phage JX01, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
cttcaatgtctaaagcttgcttagctaacg- CRISPR spacer ctgcaatgtctaaagcttgctcaa-taacgc Protospacer ** ******************.*. *****
5. spacer 1.9|446972|30|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH853356 (Streptococcus phage LF2, partial genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
cttcaatgtctaaagcttgcttagctaacg- CRISPR spacer ctgcaatgtctaaagcttgctcaa-taacgc Protospacer ** ******************.*. *****
6. spacer 1.9|446972|30|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448749 (Streptococcus phage Javan39, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
cttcaatgtctaaagcttgcttagctaacg- CRISPR spacer ctgcaatgtctaaagcttgctcaa-taacgc Protospacer ** ******************.*. *****
7. spacer 1.11|447104|29|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028882 (Borreliella bavariensis PBi plasmid lp28-3, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
acgatttaccgttttaggaatgatttaga CRISPR spacer agaaattagcgtattaggaatgatttaga Protospacer * .* *** *** ****************
8. spacer 1.11|447104|29|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder matches to NC_017804 (Borreliella garinii BgVir plasmid lp54, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
acgatttaccgttttaggaatgatttaga CRISPR spacer agaaattagcgtattaggaatgatttaga Protospacer * .* *** *** ****************
9. spacer 1.14|447039|29|NZ_CP023654|PILER-CR matches to FN997652 (Streptococcus phage phi-SsUD.1 complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
attgtttcttggactgtttgccaatattc CRISPR spacer aatttttcctggactgtttgccaatcctc Protospacer * * ****.**************** .**
10. spacer 1.4|446642|30|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP006570 (Sodalis praecaptivus strain HS1 plasmid pHS1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
-accacaacaataaaatcatttcaataagca CRISPR spacer aatcat-acaatcaaatcatttcaataaaaa Protospacer *.**. ***** ***************. *
11. spacer 1.10|447038|30|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder,CRT matches to FN997652 (Streptococcus phage phi-SsUD.1 complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
aattgtttcttggactgtttgccaatattc CRISPR spacer taatttttcctggactgtttgccaatcctc Protospacer * * ****.**************** .**
12. spacer 1.12|447104|30|NZ_CP023654|CRT matches to NZ_CP028882 (Borreliella bavariensis PBi plasmid lp28-3, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
acgatttaccgttttaggaatgatttagat CRISPR spacer agaaattagcgtattaggaatgatttagaa Protospacer * .* *** *** ****************
13. spacer 1.12|447104|30|NZ_CP023654|CRT matches to NC_017804 (Borreliella garinii BgVir plasmid lp54, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
acgatttaccgttttaggaatgatttagat CRISPR spacer agaaattagcgtattaggaatgatttagaa Protospacer * .* *** *** ****************
14. spacer 1.13|446973|29|NZ_CP023654|PILER-CR matches to AP017992 (Planktothrix agardhii NIES-204 plasmid plasmid1 DNA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
ttcaatgtctaaagcttgctta-gctaacg CRISPR spacer ctcaatgactaaagcttgcttatagtaat- Protospacer .****** ************** . ***.
15. spacer 1.14|447039|29|NZ_CP023654|PILER-CR matches to MN694486 (Marine virus AFVG_250M318, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
attgtttcttggactgtttgccaatattc CRISPR spacer aggatttcttggacagtttgcaaatattg Protospacer * .********** ****** ******
16. spacer 3.1|1528461|30|NZ_CP023654|PILER-CR matches to NC_031280 (Acinetobacter phage vB_AbaM_phiAbaA1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
actctcaacggttcggatcttgccaatcac CRISPR spacer attatcaacggttcagatcgtgccaatgat Protospacer *.* **********.**** ******* *.
17. spacer 1.3|446576|30|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT952005 (Aeromonas phage BUCT551, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggtgaccatactgacccttacggctatcta CRISPR spacer gaaaaccataatgaccctcacggctatcgt Protospacer *. .****** *******.*********
18. spacer 1.9|446972|30|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder,CRT matches to AP017992 (Planktothrix agardhii NIES-204 plasmid plasmid1 DNA, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cttcaatgtctaaagcttgctta-gctaacg CRISPR spacer gctcaatgactaaagcttgcttatagtaat- Protospacer .****** ************** . ***.
19. spacer 1.10|447038|30|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694486 (Marine virus AFVG_250M318, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aattgtttcttggactgtttgccaatattc CRISPR spacer caggatttcttggacagtttgcaaatattg Protospacer * .********** ****** ******
20. spacer 1.9|446972|30|NZ_CP023654|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018689 (Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cttcaatgtctaaagcttgcttagctaacg CRISPR spacer cttcaatgtctaaagctaccttactcatta Protospacer ***************** **** ..* ..
21. spacer 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP033569 (Acinetobacter pittii strain 2014N21-145 plasmid p2014N21-145-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gcgcgtaactatgccaaccttaaccaagacc CRISPR spacer tctgagaagtatgccaacattaaccaagatt Protospacer * . ** ********* **********..
22. spacer 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP033130 (Acinetobacter wuhouensis strain WCHAW010062 plasmid pOXA23_010062, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gcgcgtaactatgccaaccttaaccaagacc CRISPR spacer tctgagaagtatgccaacattaaccaagatt Protospacer * . ** ********* **********..
23. spacer 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP042557 (Acinetobacter baumannii strain E47 plasmid pE47_001, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gcgcgtaactatgccaaccttaaccaagacc CRISPR spacer tctgagaagtatgccaacattaaccaagatt Protospacer * . ** ********* **********..
24. spacer 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029396 (Acinetobacter defluvii strain WCHA30 plasmid pOXA58_010030, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gcgcgtaactatgccaaccttaaccaagacc CRISPR spacer tctgagaagtatgccaacattaaccaagatt Protospacer * . ** ********* **********..
25. spacer 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP048828 (Acinetobacter baumannii strain ABF9692 plasmid pABF9692, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gcgcgtaactatgccaaccttaaccaagacc CRISPR spacer tctgagaagtatgccaacattaaccaagatt Protospacer * . ** ********* **********..
26. spacer 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP042365 (Acinetobacter pittii strain C54 plasmid pC54_001, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gcgcgtaactatgccaaccttaaccaagacc CRISPR spacer tctgagaagtatgccaacattaaccaagatt Protospacer * . ** ********* **********..
27. spacer 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MH220285 (Acinetobacter ursingii strain RIVM0002 plasmid pRIVM0002_IMP-4_171109_B03, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gcgcgtaactatgccaaccttaaccaagacc CRISPR spacer tctgagaagtatgccaacattaaccaagatt Protospacer * . ** ********* **********..
28. spacer 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MH220287 (Acinetobacter ursingii strain RIVM0061 plasmid pRIVM0061_IMP-4_171109_B01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gcgcgtaactatgccaaccttaaccaagacc CRISPR spacer tctgagaagtatgccaacattaaccaagatt Protospacer * . ** ********* **********..
29. spacer 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MH220286 (Acinetobacter ursingii strain RIVM0051 plasmid pRIVM0051_IMP-4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gcgcgtaactatgccaaccttaaccaagacc CRISPR spacer tctgagaagtatgccaacattaaccaagatt Protospacer * . ** ********* **********..
30. spacer 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KX426227 (Acinetobacter lwoffii strain ED23-35 plasmid pALWED1.1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gcgcgtaactatgccaaccttaaccaagacc CRISPR spacer tctgagaagtatgccaacattaaccaagatt Protospacer * . ** ********* **********..
31. spacer 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP033531 (Acinetobacter pittii strain 2014S07-126 plasmid p2014S07-126-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gcgcgtaactatgccaaccttaaccaagacc CRISPR spacer tctgagaagtatgccaacattaaccaagatt Protospacer * . ** ********* **********..
32. spacer 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010351 (Acinetobacter johnsonii XBB1 plasmid pXBB1-9, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gcgcgtaactatgccaaccttaaccaagacc CRISPR spacer tctgagaagtatgccaacattaaccaagatt Protospacer * . ** ********* **********..
33. spacer 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032285 (Acinetobacter sp. WCHA55 plasmid pOXA58_010055, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gcgcgtaactatgccaaccttaaccaagacc CRISPR spacer tctgagaagtatgccaacattaaccaagatt Protospacer * . ** ********* **********..
34. spacer 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MK134375 (Acinetobacter baumannii strain 34AB plasmid p34AB, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gcgcgtaactatgccaaccttaaccaagacc CRISPR spacer tctgagaagtatgccaacattaaccaagatt Protospacer * . ** ********* **********..
35. spacer 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP038010 (Acinetobacter haemolyticus strain TJR01 plasmid pAHTJR1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gcgcgtaactatgccaaccttaaccaagacc CRISPR spacer tctgagaagtatgccaacattaaccaagatt Protospacer * . ** ********* **********..
36. spacer 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP043053 (Acinetobacter pittii strain AP43 plasmid pAP43-OXA58-NDM1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gcgcgtaactatgccaaccttaaccaagacc CRISPR spacer tctgagaagtatgccaacattaaccaagatt Protospacer * . ** ********* **********..
37. spacer 1.2|446509|31|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP043309 (Acinetobacter johnsonii strain Acsw19 plasmid pAcsw19-2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gcgcgtaactatgccaaccttaaccaagacc CRISPR spacer tctgagaagtatgccaacattaaccaagatt Protospacer * . ** ********* **********..
38. spacer 1.4|446642|30|NZ_CP023654|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011737 (Gloeothece citriformis PCC 7424 plasmid pP742402, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
accacaacaataaaatcatttcaataagca CRISPR spacer atattttcaataaaatcatttcattaagtt Protospacer *. . **************** ****.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1088648 : 1097213
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP023654|1088648:1097213|DBSCAN-SWA CTTATTTAATCAATTTTCGTTGTTTTAGAACTTCGCATAGGCTAACAAAATATAATTCATGCTCGACTTGGTGAATTCTTTGCGCTAATTTTGCCACATCATCATTGGGCAAAATAGGAACCGCCCGCTGCGCAATGATGGGGCCAGTATCAATTCCATCGTCAATCCAGTGCACGGTGACCCCGGTAACTTTTACACCGTATGCCAAAGCGTCTTCAATGCCGTGTCGTCCCGGAAAGGCAGGCAACAATGCGGGATGAATATTAATAATGGCCTGCGGGTAGGCTTCTAGTAGCACTTCCGTAATAATTTTCATGTAACCGGCTAATACAATTAGTTTTAAATCGTATTTTTGCAACTCGAGCAGAATTGCTTGTTCGTAAGCCGTTTTGTCGGCAAATTCGCCCAAACGGTGGGTCCAAACTGGAATCCCCAATCTGACCGCTTTTTCAACTACTGGTGCATCTGGTTGATCACAGACTAAACATGCAATGCGAATTGGTACGTTAGTTTCTTCGATGTGACGGGCAAGTGCAACAAAATTGGTGCCGGTCCCCGACGCAAATATTGCGATCTTAATCATTAATCAGCTCCTAAAAGTACGACGGCTGGTGCATTTTCTGGGCGCCTCTTCACTTGGCCAATCTTAAAATACGGTTCTTTTTGGCGGTCGAGTTCGTCCCTTACTTGCTGATATTGCTGAGGACTCACGGTTAACACCATGCCAATTCCCATATTGAAAGTTTGGTAACGGTCGGTTTGTGAAAGTTTTCCAAGCTTAGTGAGAACCTTAAAAATCGCTGGTTTAGGCCAACTAACCAATTTTATTTCAGCCTGTTGGTTAGGTTGTAACATCCGCGGTACGTTTTCTAGTAGTCCGCCACCCGTAATGTGGGCGATCCCGTTTAATAACCTTTTTTGTAATAGAGGTCGGATCGCGTTGCCGTATAACCGGGTCGGTTCCAAAAGTTCTTCGATTAATGGACGGGCAATCCCTGGCAAATAGTCGTCAAATTGGTAATGGTGATCCGTAAAGAGGATTTTACGCACCAATGAGTAACCGTTACTGTGTAATCCAGTCGAAGGTAAACCAATCAAATAATCCCCTTCACTTACCATGGCTGAACTGAGGAGATCTCTTTTAGCACCTAAACCAACCGCAAAGCCGGCTAAATCAAAATGCTGGTCTTGATAAAGTCCTGGCATCTCGGCCGTCTCTCCGCCTAATAACGGGATGGATTGGGCCTGGCAAGCTTTCAAAATCCCTTTTAAAATTGCATCTGTTTGGTCGCTTTCTAAATGTGAAAACGCCAAATAATCTAAAAAGAATAGCGGTAATGCGCCCTGTGCCAACAAATCGTTAACGCACATTGCTACCAAATCTTGCCCTAACGATTCGACTTTTCCAGTTTGGGCAGCTAACAGCACTTTAGTTCCCACTCCGTCAGCCCCCGCCACTAAAACTGGATCGTCTAATTGATCTTCGGAAAGTTGGTAACATCCGGCAAAATTGCCAATCCCATTTAGAATGTGGGGACCTTGTTCACCAATTGCTTGCTTTAAGCCTTCAATAATTTCTTCGCCCGCAGCAATGTTTACTCCCGCTTGTTCATAAGCATTTTTGGTCATTATTATTTCTCCTTTGCGACTCCCGTTGCCGATAACGTAGTGTCTTTTGCGGTTTTAGGAACTTCAAAACCGGCCGCGTAATCGTAAAGCGGCGTAGGATATTTTCCATCAAAGTACGCTACGCAAAGTCCATCATTAGGGACATCTTGGTGCAAACCGATGGCTTCAATCAAACCGGGCAAGCTCAAAAAGTGCAACGAGTCCGCCCCGATTGCAACGCGCATTTCCTTTACCGTGAGGTTTGCCGCCATTAATTCACGAGTATGTTCGATATCAATTCCGTAAAAGCAAGGGTATTTCAACGGTGGTGAACTGATCATCAAATGCACCGCTTTAGCCCCCGCTTTTTTCAACATTTTTACAATGTACTTGCTGGTGGTCCCCCGAACAAGCGAGTCGTCAACGAGGGCTACCTTTTTCCCCGCAACTACCGCGGATAACACTGTCAACTTCATCTCAACCCCCTGTTCACGTAACTTAAGGGTGGGTTGAATAAACGTGCGGCTGCTGTACTGATTTTTAATCAGGCCCATTTCATTTGGGACTCCCAACTGCTCCGCCACTCCTGCCGCTGCTGATAGCGAGGAATTGGGTACCCCAACGACAATGTCCACATCTAACGGATTTTCTTGGGCTAATCGCTTACCCATTCGTTGTCGCGCGAGATGGACATTCACCCCGTAAAGGTTCGAATCTGGACGGGCGAAATAAATAAATTCCATCGAACAAATTGCTAGCTGAGTCTCGGTCGTAAAATGGCTAATTTTAACTCCCTGGTCGTCAATTTGGACTAGTTCGCCAGGTTCTACGTCCCGAACAAACTCGGCACCCACCGCCGTTAACGCACAAGTTTCACTTGCGATCACGAATGCGCCATTAGCTAATTGTCCAATCACCAAAGGTCGGAAACCATTGGGGTCCAGTGCTGCGTATAAAGCATTTTCCGTAAGAATTAGGTACGCGAACCCACCCTTAATTTGTCGCAAACTAGCCTTTAATTTTTCACTAAAACTCGCCTGCTTTTGGTGCTGAATTAGGTGCATTAGAACTTCGGTATCCGAATTGGATTGAAAAATTGCGCCCTGCTCTTCTAACTGGTGGCGCAGCGTAATTGCATTTGTTAAATTTCCGTTATGGGCCATCGCCACGTCCCCTTGTAGATATTGAAAAAGCAGCGGCTGAACATTTTCAACCCCGCGGCTTCCAGCCGTACCATAACGGACATGGCCAATTGCACTGCGCCCAATTAAGTTCGTTAAGTCATCCGGGTTACTGAATACGTCCGCTAAAAGACCTAGGCCTTTGTGGATGGCAAATTTTCCCGTGGGAGTACGGGTTACGATGCCTGCCCCCTCTTGCCCGCGATGCTGTAAGCTGTGTAATCCGATATACGTTCGTTGAGCCGCATCTGGATCTTGCCAAACTCCAAAAATACCGCATTCTTCATTGAGTCCCTTTAATTCAGTTGCCATGCGAGTGCTTCCTTCCAACTAGTTTCGGCCGCCGTTAAATCAACGTCCAATATGTCATCAGTGGTTAAGATTTTAAGCCGATCACCCCCTACGCGCCCTAATAGCGTTGCTTTGCCAGCAGTTTTAGCTTCAAAATGCGCCCGATTTGCTGGCGTAACGGTTACGAGGAATCGCGATTGGTTTTCAGCAAATAATTCGGCGGCCGCTAAGTCAGTTTGCACGTTAAACCCAATTTCTCCTGCGAAGGCACTTTCTGCAAGGGCGATCGCTAATCCACCTTCTGCCAAATCGTGCGCACTAGCCAAAAGTCCTTCATGAATTAGGTCGCTTACTAAGCGTTGTTGGTCAATTTCGTATTGCAAATCAAAGTCGAACAGTTCACCTTCCACGTGACCTAATTGCATTTTTTGGAGTTCACTACCGTTTAAGGCATCCGTAGTTTCGCCTAAAACATAAATCAAATCACCCGTTTGTTTAAAATCTAAGGTGGTTATCCAAGCTGGATCTTCAATTATTCCGACCATGCCCACCATGGGCGTAGGGTAAATTGATTGCCGATTAAATTCGTTGTACAGTGAAACGTTGCCCGAAATCACGGGAGTATCAAAAACATCGCAGGCCGCGGCCATTCCATTAATGGCTTGGGCTAATTCGTAGTAACATTCTGGATCTTCTGGGCTCCCAAAATTCAGACAATCGGTAATTGCTAAAGGCTTTCCTCCCGTTGCCACCACGTTGCGGGCGGCTTCGCTAACGGCAATTTGTCCGCCAAGGTAAGGATCCAAGTATAAGTAACGGGGATTCGCGTCGGTAGTCATTGCGAGTGCTTTTTGGGTCCCGCGGATTCGAACTACTGCAGCGTCACTTTGGACGGTTGAAATCGTGTTAGTTTGTACCTGTGCATCGTAGCGTTCAAAGATTGCTTCTTTATTAGCAATCGTGGCTTGACGCAACATGGCATTAAAAGTTGCCGTCAAATCCTTAATTTGCGGTTGAAATTGCTTTCCATCGCCCTTGACACGTTGCGGTTTTTGGCTTGGTCGATGATAAGTCGGTGCTTCATCAACTAACGCATGAATTGGGACATCGGCTACGGTGGCCCCTTTAAAAACCAATTGATATCGCTGATCTTCGGTGACCTCCCCAATTTTTACAGCGGTGCTGTCATATTTTGCAAAAATTTCCTCTACTTCACGTTCGTGCCCTTGCTTAACGCAGAGCAGCATCCGTTCTTGGGATTCAGAAAGCATCAATTCGTAGGGAATCATGTCTGCTTCCCGTTGAGGAACCAAGTCAAGATCCAAGCGCATCCCAAATCCCGCTTTGGCCCCCATTTCTGTTGATGAGGAAACTAAGCCCGCCGCCCCCATATCTTGAATCCCTACCAACCATTCGGCATGGTCATGAATTAATTCTAAGCAAGCTTCCATTAACTGTTTTTCGGCAAACGGATCCCCAACCTGGACCGCCGACCGTTGTGTAGTCTGTGCATCATTAAATTCAGTGGAAGCAAAAATAGCGCCCTGAATCCCATCTCGACCAGTTTTAGCGCCCACATAATAGATTGAATTGCCGACCCCAGCGGCAGCTCCCCGCTGTTGGTCAGCGACGTTCAGCAAGCCCACGCACATGGCGTTCATCACCGGGTTATTCTGGTAAATCGCATCAAAAGTCGTTTCTCCGCCAACCGTGGGGATCCCCATGCAATTACCGTAGTCGCCAATCCCCGCTACGGTTTGGTCCACTAAGTATTTTGTCCGGGCGTCAGTCACTTCACCAAAATGCAGACTATCCATTAACGCGATTGGTCGGGCGCCCATGGAAAAAATGTCTCGAATAATGCCGCCCACGCCGGTTGCCGCACCTTGATAAGGTTCCACTGCCGTAGGATGATTATGACTTTCGGCTTTAAAAACTACCGCCTGCCCGTCGCCAATATCGACAATGCCAGCACCTTCTCCCGGTCCCTGTAATATCTGCTGACCCGTTGTGGGAAGTTGTTTTAAAAGTGGCTTAGAGTTTTTATACGCACAATGCTCGCTCCACATGGCAGCAAATAATCCTGTTTCAGTGAAGTTAGGGAGTCGACCCAACGTGTTCCTGATCTGGTTAAATTCGTCTTCGCTTAGTCCCCACTGGACATATAATTTTTGATCCCGAATTTCGGTCGGTGTTAATTCCGTCGTCATCGCAAAATCTCCCCTTATTAAACGTGCTGCGTGATACTAGCAACTAAACTTTGGAACAATATTTTTCCATCGGTCCCGCCTAAAACTGCTTCACTAGCTCGTTCCGGATGCGGGCATCAGCCCAAGGACGTTGCCCCCTTGGTTAGTAATTCCGGCAATGTTATCAGTACTGCCGTTAGGATTGTTTACGTAGCGCAGAACAATTTGGTTGTGTTCCTTTAAATCTTGTAAAGTTGTTTCATCGCAATAATAGTTTCCTTCACCGTGAGCAATAGGGAACGTTACGGTTTGCTTTAAACTAAATTGGCGGGTAAACGGCGTTTGGCAATTTTCAACAACCAATTTCTGGGGGCGGCAAATAAAATTCAAGCTCTCGTTAGGCCGCAATGCTCCGGGTAATAACCCGGCTTCGGTTAAAATTTGAAATCCATTGCAGACTCCGATCACTGGATTTCCAGCCTCCGCAAATTCCTTCACCGCGGACATGATGGGCGAAAAACGAGCAATTGCGCCGCTCCGGAGGTAATCACCGTACGAAAAGCCTCCCGGAATTAAGACGGCGCCGGTTTCAGCTGGTAAAGCAGTCTCGCGATAATCCACAAAACGCGGGGTGACCTTAAGGACGTCTCGTAAAACGTAATACATATCCCAGTCACAATTAGAGCCCGGAAAAACGAAGGATGCTATATATCATTTTTCGCCCTCCTGAACGTCTTGAATCTCAAACCGGTAAGTTTCCATGTTAACGTTGGCTAATAATTCATCACACATTTTTTGGACTTGTTCGTTAACGTTTTGTCCGCCATCGGCCACCTGGATTTCGAAATATTTTCCCACCGTCACTTTTTGGACCTCTTGGTAATTCAAATGATGAAGCGCTTTTTTAATGGCGGCTCCCTGAGGATCCAAAATAGATTCTTTATAAGTTACGTAAACTTTAACTTTGTACATGCGCTTCCTCCCGTGAATTTATTAAACGCCGGAGTACCTCTTGATAAACCATCACCAGATCACCCGTTTTTTTGCGGAAAACGTCCTTATCTAAGGAAGTCTTAGTGGTTAGGTCTACCAACCGGCAGGAATCAGGTGAAATTTCGTCCGCAAGCATAATTTTTCCATCTGCGGTTTTGCCAAATTCAACCTTAAAGTCCACCAGTTGCAAGCGAGCTTGCCGAAACCGTTCCTTTAACAACCGGTTAATTTGGAGCGCTAAGTTTTCAAGGATTTCACCTTCTGCGTAACTAATAATTTTCAGAGCAACGGCTTGATTAGTGTTGATGAATGGATCATCCAATTCGTCGGATTTATAAAAAAATTCCACAATCGGCTGGTCGAACTCTCGTAAATACGGCACCGCAAATTTTCGCTGAAAACTGCCCGCTGCTGCATTACGTACGACTACCTCTAGTGGAATAACGTCTACTTTGTAATTTAATTGTTCGGTATTGGAAATTTTTTTAATAAAGTCCGTATGAATCCCTTTTGCATCCAGCATTTTAAAAAGGATGCAATCGATTTGATTATTCAAAGCTCCCTTACCAATAACTTGGTCTTTTCGTTTACCATTTAACGCCGTTGCCTGATCCAGGTACTCAACCCACACCACGTCTGCCTCATCCGTATTATACAATCGTTTAGCTTTACCCTCTTTAATTAACGTCGTTTTCTTCATTGCTAATCTCCCAAATCTTTTCCGCTTGAATTGAATCTAAGCTTGGTTGTAGTTCGCCTAACAAGGTAATGTGCCCCATCTTCCGGTTCACCCGACTTTCCGCTTTGCCGTAATCATGAAAATGCCAATTCGGCCGTTGCGTTAGCTTTTTGCGGGCTAGTGTTAAATGTTGCCCGTGTAAATTGACCATCACTGCGGGGGCGTGTTGCGTAATTTTCGGTATTTCAAGTCCACAGATACTGCGAACGTGGGCTTCAAATTGTGAAATGTTACAGGCTTCAATTGAGTAATGTCCCGAATTATGGGGACGGGGTGCTAATTCATTCACTAACAAACGGTCATCAGCTAACATGAAGAATTCAATCCCCAATACCCCTCGTAAACATAAACCTTGCGCAATTTGCCGAGCAATTTTTTGTGCTTTTTGCTGAACCTCTTCCGTTACCCGTGCTGGGACAATGCTTTGATGGAGAATATGGTTGTGATGGATATTTTCCGCTACTGGAAAACATCGCACCTGGCCATCCCGACTTCGCGTCACCATTACCGATAATTCTTTGCTGAATTTCTGACGCTTTTCCAAAATGCACGGTGTTTGGGATACTAAACTCCGTCCCGCTGGCAAATCGGCCTCCGAATTAATATCTTGCTGACCATGTCCGTCATAACCGCCCTCACAAGATTTTAAAATGCAAGGGTACCCTAGCTTAGTAATCGCGTCATTTAGCTCGGTTGGATTGCTGACGGGTTGATAAGGCGTTACCGGGAGGTCGTGGCTAGCAAGAAAATGTTTTTCGCGAAGACGATCACTAGTTACGTATAGTAAATTAGTCCCTTGCGGAAGAGCCGCTAACTTTTGTGCAGCCTCTAAGCTAGCTAAATCGACATTTTCAAATTCATAAGTTAAAACGTCGCTACGTTCGGCCATCTTTAATAGGGCTTGCTGGTCGTTATAAGCGGCCACGATTTGAAAATCACTAACCTGACCAGCCGGACAGTTAGGGGTCGGATCTAAAATACCCACCTTATACCCCATTGCCTTGGCAGCCAGCGCGATCATCTGTCCTAATTGGCCGCCTCCAATAATTCCAATCGTTGCTGGCGGTAGGTATACACCCGCTTCACCACTGCTTTTCACTATTCTGGACCTCCTGTGTTTGTTCTTGCCGAAATTCAATCATTTTTTTAGCAAGCCGCGACTCGGTAACCGCTAAAATTTCGATTGCCAGTAAAGCTGCATTTTTAGCCCCGGCCTCTCCAATCGCCGTGGTTGCTACCGGTACTCCGCTGGGCATCTGCACAATTGACAATAAAGAGTCCAAGCCGTGCAACGCATGACTTTCAATCGGGACGCCCACCACCGGCAAAATGGTGTTAGCCGCTAACATTCCTGGTAAATGCGCAGCTCCACCAGCTCCCGCAATTATTACCCCATAACCATCCTTTTGGGCTTGCTTGCCAAATTTTTGAAGTTCACTAGGCATCCGATGCGCTGAAATTACGTGTCGCTCATAAGCCACCTCAAACTTATCAAGCATCGCCGCCGTTTCCTTCATCGTTGGCCAATCGGAAATTGATCCCATTACTACCGCAACTTTTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP023654|1088648:1097213|1089229_1090276_-|WP_008840997.1|DBSCAN-SWA MTKNAYEQAGVNIAAGEEIIEGLKQAIGEQGPHILNGIGNFAGCYQLSEDQLDDPVLVAGADGVGTKVLLAAQTGKVESLGQDLVAMCVNDLLAQGALPLFFLDYLAFSHLESDQTDAILKGILKACQAQSIPLLGGETAEMPGLYQDQHFDLAGFAVGLGAKRDLLSSAMVSEGDYLIGLPSTGLHSNGYSLVRKILFTDHHYQFDDYLPGIARPLIEELLEPTRLYGNAIRPLLQKRLLNGIAHITGGGLLENVPRMLQPNQQAEIKLVSWPKPAIFKVLTKLGKLSQTDRYQTFNMGIGMVLTVSPQQYQQVRDELDRQKEPYFKIGQVKRRPENAPAVVLLGAD >NZ_CP023654|1088648:1097213|1096730_1097213_-|WP_065124116.1|DBSCAN-SWA MKKVAVVMGSISDWPTMKETAAMLDKFEVAYERHVISAHRMPSELQKFGKQAQKDGYGVIIAGAGGAAHLPGMLAANTILPVVGVPIESHALHGLDSLLSIVQMPSGVPVATTAIGEAGAKNAALLAIEILAVTESRLAKKMIEFRQEQTQEVQNSEKQW >NZ_CP023654|1088648:1097213|1095586_1096750_-|WP_141783148.1|DBSCAN-SWA MVKSSGEAGVYLPPATIGIIGGGQLGQMIALAAKAMGYKVGILDPTPNCPAGQVSDFQIVAAYNDQQALLKMAERSDVLTYEFENVDLASLEAAQKLAALPQGTNLLYVTSDRLREKHFLASHDLPVTPYQPVSNPTELNDAITKLGYPCILKSCEGGYDGHGQQDINSEADLPAGRSLVSQTPCILEKRQKFSKELSVMVTRSRDGQVRCFPVAENIHHNHILHQSIVPARVTEEVQQKAQKIARQIAQGLCLRGVLGIEFFMLADDRLLVNELAPRPHNSGHYSIEACNISQFEAHVRSICGLEIPKITQHAPAVMVNLHGQHLTLARKKLTQRPNWHFHDYGKAESRVNRKMGHITLLGELQPSLDSIQAEKIWEISNEENDVN >NZ_CP023654|1088648:1097213|1088648_1089230_-|WP_008840996.1|DBSCAN-SWA MIKIAIFASGTGTNFVALARHIEETNVPIRIACLVCDQPDAPVVEKAVRLGIPVWTHRLGEFADKTAYEQAILLELQKYDLKLIVLAGYMKIITEVLLEAYPQAIINIHPALLPAFPGRHGIEDALAYGVKVTGVTVHWIDDGIDTGPIIAQRAVPILPNDDVAKLAQRIHQVEHELYFVSLCEVLKQRKLIK >NZ_CP023654|1088648:1097213|1094874_1095609_-|WP_065124114.1|DBSCAN-SWA MKKTTLIKEGKAKRLYNTDEADVVWVEYLDQATALNGKRKDQVIGKGALNNQIDCILFKMLDAKGIHTDFIKKISNTEQLNYKVDVIPLEVVVRNAAAGSFQRKFAVPYLREFDQPIVEFFYKSDELDDPFINTNQAVALKIISYAEGEILENLALQINRLLKERFRQARLQLVDFKVEFGKTADGKIMLADEISPDSCRLVDLTTKTSLDKDVFRKKTGDLVMVYQEVLRRLINSREEAHVQS >NZ_CP023654|1088648:1097213|1091732_1093937_-|WP_141783043.1|DBSCAN-SWA MTTELTPTEIRDQKLYVQWGLSEDEFNQIRNTLGRLPNFTETGLFAAMWSEHCAYKNSKPLLKQLPTTGQQILQGPGEGAGIVDIGDGQAVVFKAESHNHPTAVEPYQGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALMDSLHFGEVTDARTKYLVDQTVAGIGDYGNCMGIPTVGGETTFDAIYQNNPVMNAMCVGLLNVADQQRGAAAGVGNSIYYVGAKTGRDGIQGAIFASTEFNDAQTTQRSAVQVGDPFAEKQLMEACLELIHDHAEWLVGIQDMGAAGLVSSSTEMGAKAGFGMRLDLDLVPQREADMIPYELMLSESQERMLLCVKQGHEREVEEIFAKYDSTAVKIGEVTEDQRYQLVFKGATVADVPIHALVDEAPTYHRPSQKPQRVKGDGKQFQPQIKDLTATFNAMLRQATIANKEAIFERYDAQVQTNTISTVQSDAAVVRIRGTQKALAMTTDANPRYLYLDPYLGGQIAVSEAARNVVATGGKPLAITDCLNFGSPEDPECYYELAQAINGMAAACDVFDTPVISGNVSLYNEFNRQSIYPTPMVGMVGIIEDPAWITTLDFKQTGDLIYVLGETTDALNGSELQKMQLGHVEGELFDFDLQYEIDQQRLVSDLIHEGLLASAHDLAEGGLAIALAESAFAGEIGFNVQTDLAAAELFAENQSRFLVTVTPANRAHFEAKTAGKATLLGRVGGDRLKILTTDDILDVDLTAAETSWKEALAWQLN >NZ_CP023654|1088648:1097213|1090278_1091748_-|WP_087116199.1|DBSCAN-SWA MATELKGLNEECGIFGVWQDPDAAQRTYIGLHSLQHRGQEGAGIVTRTPTGKFAIHKGLGLLADVFSNPDDLTNLIGRSAIGHVRYGTAGSRGVENVQPLLFQYLQGDVAMAHNGNLTNAITLRHQLEEQGAIFQSNSDTEVLMHLIQHQKQASFSEKLKASLRQIKGGFAYLILTENALYAALDPNGFRPLVIGQLANGAFVIASETCALTAVGAEFVRDVEPGELVQIDDQGVKISHFTTETQLAICSMEFIYFARPDSNLYGVNVHLARQRMGKRLAQENPLDVDIVVGVPNSSLSAAAGVAEQLGVPNEMGLIKNQYSSRTFIQPTLKLREQGVEMKLTVLSAVVAGKKVALVDDSLVRGTTSKYIVKMLKKAGAKAVHLMISSPPLKYPCFYGIDIEHTRELMAANLTVKEMRVAIGADSLHFLSLPGLIEAIGLHQDVPNDGLCVAYFDGKYPTPLYDYAAGFEVPKTAKDTTLSATGVAKEK >NZ_CP023654|1088648:1097213|1094627_1094888_-|WP_065124113.1|DBSCAN-SWA MYKVKVYVTYKESILDPQGAAIKKALHHLNYQEVQKVTVGKYFEIQVADGGQNVNEQVQKMCDELLANVNMETYRFEIQDVQEGEK |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1139153 : 1146464
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP023654|1139153:1146464|DBSCAN-SWA GTTAGTCTTCACTGTAATATAGTAAACAAAATGCGCCCATGCCAGTGTGGGTAGCAATGATTGGCACCGTTTCACGAACCACAATATCCTTCACAGGGAAAAGTTCGCCAACGTGCTTCTTCATATCTTCAACCATTTCATCAGCATGCACATGTGAAATCCCGACTGACTTAATTTTACCGCTTTGTTTCATTTCTTCGTAAATATCAAGCCAGATCTTCTTCATGGCCTTCATACCACGAACTTTGTTAGCAACGTCTAATTTACCATCTTTTACCTGCAAAAGCAGCTTGATATTTAACAATCCGCCAAGCATTCCACTAACCTTACTAAGTCGGCCACCCTTAACTAAGTTTTCAAGGTTAACGATACCTAAATAAAGTTTAGTGTGGTCGCGAATGTAGGCAGCTCGTTCTAGAATTTCTTCTTTGGTTGCTCCAGCCTGAGCCATCTTAGCCGCTTCAATAACTTGAAAGGCTAGTGCCCGATCGGTAAATTGGCTATCCACCACCGTCACGTCGGACTTACTTAGTTCAGCAGCTTGTTGCGCAGTGTGTACCGTCCCACTAATGGCCGCAAGCATATTAAAACTAATCACCTGGCTGCCATCCGCACCTAACCGATCAAACATCTCAACGAATTTACCTAGCGGTGGTTGGCTAGTTTTAGGGAGTGAATTTGACTCGGCCATCTTTTGAATAAATTCTTCGTTAGAAATGGTCTCCCTTTCCACGTATACGGTGTCATCAATCATCACGCTCAATGGTACGATTGAAATATTATATTTTTTGATTTCTTCATCCGTTACACCACAGGATGAATCGGTGACAATTTTAATTTGAGTCATATGCTTCCACTTTCCCTTGTATCATAATTATTACGAGCCAACCAACGTCAATTAACACTTTCAATTAAGTTAGTAAAACTCGCTTGCTTAATAATATTATTATAACAATCTCTGTTGATTTTTGGCTGAATAATGCCGTTTTTTAATAAAAAGGTTGGGAAAAAACTAATAAAATGCTTTTCAAGGATGAAAAGGATCTTAAAAAGTTGTCTTGGTGTTTTGACTTCAATAGAGCCAAAACGTGCGCCAAAAGTCAGTTTGTTCCGCTTAACCAAAAATTGACCATCATGCCCAATTCAGGCATCATGGTCAATTTTCAGTTAATGCTCGCAAATTACCCGACTTTTGTCCCACTCTCTTTCGTCATGGCTTTTTTCACCCAAAATTAATTACGCTTGATCCATTGCTGAAAAACGTGGTCTGGAACTCCAGGTACACTTTTTCCCGGACGTTCTTCCTGTAAAGTAAACTTTTGTTTATCCACCACGGGAGCAAATACGTCGCATTGAAAGTCGCCAGTTACTTTAGTGATCAATAACTCATCCGCAACCGGCATTAACTTATGATATACCGCTGACCCACCAATTACGAAATGCTTTTCCGTTTTCGTAAGGCTAGCTAACAGTTCTTCGTAAGAAGAAAATCCCCGAACTTCCGAGGGCAAATGTTCCGGATGGTGAGTTAGTACCAGATTTGTTCGACGCGGTAACGGACGGCCAATCGACTCAAAAGTCTTGCGCCCCATAATTACCGAATGGTCCAGCGTAGTTTGTCGGAAAAAAGCCATATCATCTGGTATGTGCCACGGGATGGATTGCTGCCGACCAATTCCATGACGGTCATCTTCCGCCCAAATCATCGTAATCATGCAAATCTCCTAATTTCTTAAACAGCTACCGGAGCCTTGATGGTAGGGTGTGGATCGTAGCCTTCTACCACAATGTCGGCTGGTTCGTAATCAAAGATATTTTCGTGAACTTGGTTAAACTTCAACCGCGGAGCCGGACGAGGATCCCGAGTTAATTGTTCCTTAACTTGGGCAATATGGTTGCTGTAAATGTGCGCGTCTCCAAGGGTATGCACAAATTCGCCAACTTCTAGACCACAAGTTTTAGCAATCATCGCCGTTAGCAATGCGTAACTAGCAATGTTAAACGGCACCCCGAGGAAAATATCCCCGCTACGTTGGTAAAGTTGACAACTCAGCTTGCCATCAGCCACGTAAAATTGGAATAACGAGTGACACGGTGGCAAAGCAGCCGTTGGGACATCCTCTGGATTCCAAGCGGTCACGATCATCCGGCGAGAGTCAGGATGGTTCTTAATCAAATCAATCACGTTTTCAATTTGGTCAATAGTTTCTCCAGTACTGGTTTTCCAAGCCCGCCATTGACTACCGTATACATTCCCCAAATCGCCGTACTTAGCAGCAAAGGCGTCGTCTTCCAAGATCAACTTGGTAAAACGATCCTTTTGCACTTGATACTGTGCGTTAAAATCTGGATCAATCAAGGTGCGGTGCCCAAAATTAGTCATATCTGGCCCATCGTATTCGGCGCTCTCTACCCATTTTTTAAAGGCCCATTCATCCCAAATGTGGTTCTTGTGTTGTAACAAATAGCGAATATTCGTATCACCCTTCAAAAACCACATCAACTCGCTTTTAATTAAGCCAAACGGCACCCGTTTGGTAGTCAGCAGGGGGAACCCTTCACTGAGGTCAAACCGCATTTGGTAGCCAAAGGTACTCAAGGTTCCCGTTTGTGTCCGGTCATTTTTTTGGTGACCATTTTCTAAGACGTATCTTTCTAGGTTCAGGTATTGTTCTTCGAGCATCCCGTTACTCCCCTTCTTCAAAACTTTCCAAATACTCCCAGCGCGCCATTTTATTCTCTAACTCATCGGATACCTGGTTGAGTTCAGCCTGAAGTTCCGATAGTTTGCCATAATCCGCAGCGTATTCGTTCATTTGTTCGGTAATTGTTTTAGATTTTTGTTCTAGTTTATCAATTTCTGCTTCAATTGTCTGCCATTCTTTTTCTTCGGCATAGGTTCTTTTTTTCTTCTTTTTTGGTTTGGCTACGGGAGTTGGTTCCGTCCGGGGCTTAGCCGTGGTAGCGCTAGTGGACGTGGTTTGCGCCCGCTGTTTAAGGTAGTCGCTAATTTGACCAGTGTATTGTTCAATCTGCCCGTTACCATCAAAAATCAACAATTGATCGCTAACCTTATCAAGGAAATAGCGGTCGTGAGAAACCGTTAAAACGGTCCCGTTGAAATGTTCAAGGTAGTTTTCTAATACGGTTAAGGTGGCAATGTCTAAGTCGTTCGTCGGTTCGTCTAGTAATAAGACGTTGGGTTGCTGCATGAGGACCTTAATTAAGTACAACCGGCGCTTTTCACCACCCGAAAGTTTTTTAATTAAACTTCCATGCATAAACTTTGGAAAGAGAAATTGCTCTAATAAACTGGTAACGCTAATTTTTTCACCGTCCCGGTTAACAACTTCTTGACCAATTTCCTTGATGTAATTAATTACCCGTTTGTCTTCTGGAATGGGCTCCATCTTCTGAGTATAATAGCCAATTTTAACCGTTTCACCAATGTCAATCGTCCCGTCTTGAATGGGGAGCTTTCCGGCAATCGCGTTCAAGAAGGAAGATTTACCCGCACCATTGGCCCCGGTAATTCCAATTCGATCGCCAGCTTGAATCAACTTGGTAAAGTCACGGGCAATCGGGTGGTCCCCTACCTGCAAATCAAGGTGCTTGATTTCAATAACTTTTTTACCTAATCGTTGTTGGGTTAGTCCAATCTCAACGTCTTGGTCAATTTCCTTAGGCGCATGCACGTCTTGGTCAAGTTTCTCAAACTTGTTAATTCGAGCCTGTTGCTTTGTTCCCCGGGCTTTAGGACCCCGCTTAATCCATTCCAGCTCTTGCTTATAAAGCTTGTACTTCTTTTCTTGGCTAGCTTCATTTTGCTGTTCGCGTAACGCCTTTTGTTCCACGTATTTAGCATAATTACCTTCATATTCGTACAGGTGACCGAAGCTTAGTTCCCAGATGTGGTTAGTTACCCGATCTAAGAAATACCGGTCGTGGGTGACTAGTAAAAGGGCACCCTTGTAATCGGCTAAATACTTTTCTAACCACTCAATTGAGTCAAAATCCAAGTGGTTAGTGGGTTCGTCCAGTAGCAATAAATCCGCGGGTTCTAATAAAGCCTGCGCTAGCGCAATTCGCTTTACCTGGCCCCCTGATAGTTGGTTAATTGGGGCATCCAGCATATCCACGTGGAGTTGCGTTAGGATTGTCTTGATATTGCTTTCGGTATTCCAGGCGTCCAGCCGGTTCATTTCATCTTCGGCTTTGGTAAACTTCTCAAAAATCGTACTTGAAGTGGGATTATCAGTATATTGAGCTAAAACTTGCTCGTAACGTTTGATTACCCGAAAAACTTCTTGGTCACCGCTATAAATAAAATCTCGAACCGTTTCATATTGGTTAATCTCCGAGCTTTGCTTTAAGTAGGCAATCCGGTAATCGTTGGGAGCTTCAAACTCGCCGCTATCGGCCGGATCAATCCCAACGACCGCGTTTAAGAGGTTAGTTTTTCCTGACCCGTTCGTCCCGATCAACCCAATCCGATCATTTTCGTTAATGGTGAAATTAATCGACTGAAAAAGTTGCTTTTCCCCATATGTTTTGGTTAAATTTTTAGCCTTTAATGTTTTCATTCTCAATCATCTTTTCCTAATTTTCGTGCTGCTGTAAACAATGCTTCTGGTTGGTTCGGTAATTGATCGTTAATCACCATAGTTTTTAAGGAGTTTAAAATCCGCCCCATTTGGGGTCCCGGAGTGACGATCTGGTTTGCAATCAAGTCCTTACCGGTCACCGCTAATTCTTTAGGTGATTTGATTTGGAGCGTTTGGTAAGTATCCAACCATCCCCGTACGTCATGGCCTAAAATTTGCGCCACTCGCACTGCGTTAGCAACATTATCAGCACCAGCTTCAAATAAAATTATCCGATCCACTCCGGTACTATCCAGCATGCTAAGTACCCGAACGGTTGCCGTAACGTGGCGAATCAATTCGTTAGAGGTCTTCCACTGTTTTAAAAAGCGGTTAATTTGTGCGCCGCGTAGCTGCAACATCCGCGCTAAAAGCGCCCAAACTTGGGTTTCGTTTTCTAACTGGCTTAGCGGATAAGCCAGTAATTCCTGCAGTACGGCTCCCTTACCGGCTAATCCTGGACAGTATTCATTGAGCCGCGTGGCAACCATATCAGCTAGCCCTCGGTTAGGGTTAGTTCCTAGCATCATCTTTTGAAACTCTACTAGGGTTCGTTCCACCGAGATTTTAGCCAACAAACTGCTATTCATTTTAATGGCCGCTAACGTTTGCGGTTCGATCACAAAATCTAATTGACTAGCAAACCGGACTCCGCGCATCATTCGCAAAGCATCTTCGTGAAAACGCGCCTTAGGGTCCCCAACCGCGCGAATTTTATGCTGTTTAAGGTCGGTTAAACCGTCAAAAACGTCAATAACGGTTCGATCTTCCCGTAAGGCAAAGGCATTAATGGTAAAATCGCGCCTCATTAAGTCTTCCTTTAGTGACCGGACAAACGTAACCTGATCAGGCCGCCGAAAATCTTGGTAACCACTTTCCGTTCGAAAAGTGGTGATTTCGTAACTATGTTCTCCAGTTAAAACCATTACGGTTCCGTGTTCGATTCCCGTATCAACGGTTCGTTTAAAAATTTGTTTAATTTCAGCAGGATAAGCACTCGTCGCAATGTCCACGTCGTGAATGGGCTTACCAAGCAACGTATCCCGGACGCTACCGCCCACAAAATAAGCTTCATATCCAGCTTCTTCGATTTGTTGTAACACGTTTCGTGCTTCTTCAAACTCTTGTGGCATTTTTTCTAACTGCACCATTCTCACATCCAATCCACATTTAATACTACCAGAAACCACCCTGATTTTGAAAAGGAAGTTCCACTTCTATGGTATGATATTTGCAAGTACTGCATAAGGAATAAGGAGGTTGTTTATGCAAAAAGATGAATCAATTCGGTTGTTAGATTTCGTCATGATTACGCTAGGCTGTTGTCTGTACGGGCTTGGCCTTGCCGTGGTTAACATCCCCAATCACCTCGCGGAGGGTGGGATCACCGGGGTAACTCTGATATTGCGGGCCTTGTTTGGGATTGATCCCGCGCTTTCCACGCTGTTAATCAACGTTCCCTTAATTTTAATTGGTTACCGCTTTTTGGGTAAGCGTTCCTTAATTTACACAATTTTTGGAACATTAGCACTTTCGTTTTGGTTGTACTTTTGGCAACGCATCCCCATTAGCTTGGATATTCATCACGACATGTTCATTGCCGGGATTCTCGCCGGGATCGCCGGTGGTTTCGGAAGCGGGGTCGTTTACCGTTTTGGTGGAACTACCGGTGGAACCGACGTCGTTGCCCGAATTTTGGAAAAGCGCCGTGGAATTGCAATGGGACACACCCTTTTCGCGCTTGATGCGGTTGTCTTAACCATTTCGCTTTGCTACATTGACGTCTTGCACATGATGTACACGTTACTAGCTGCCTACGTTTTCTCCCGCTTAGTTTCCCTGACCCAGGTCGGAGCTTACGCCGGCCACGGCTTAATCATTATCAGTGATCAAAATGAAGAAATTGCAGAAGCCCTTATGGACGAGCTCGGTCGTGGTGCCAGTTACATAAAAATGACGGGCGCGTATTCCAATAACCAACACCAGATGGTTTATTGCGTAATCGGTCCTAACGAACTCAACTTAGCTAAACGAATTATTGAACGCGTCGACCCCCGCGCGTTTACTTCCGTAATCGACGTTCACGAAGCCATTGGTGAAGGATTCACTTACGATTCCGATAAATAACCTGAATAATACAAAAAATGCAGAAGTCGCCAATTGGCAATTTCTGCATTTTTATTACCGCTGCCTAACCTTTAAAATACCGTTAAATCAGAATATTTCGGAGTTAACTCATTAAAATCATAGGTAGCTAAATTTTTAATATCTTCTCCATGGAAGAATGCTGCGTGACTACGAGCCAACATGAGGTTAATCTTGTCGGTGTCATCAAATTGAACTAAAATAACTGGTTTGCCATTTTCAAATGCGGCGCCAATTTCAAATACCGTTCCAGGATCTGAAATCACTTCTTCATCTTGCTTAGCATAATCAAGAATTGCAACCACCACGTCTGATTTACGAACTTGACGAACGTCAGCTTCAAATACGCCAACTTGCCACTTAAAAGTACCAAACTTTTCTGCTTCGTATTGGTGATCCATTGGAACGTAGATGTTATCACCGTCGATCGTCGAATTTTTCTTTAAAAGTTCTTCAACCTTCCGTACCCGTTCAATTTGTAAATCGCTGAAGAAAGGTGCTGCTAAATATACCGAATTTGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP023654|1139153:1146464|1140172_1140388_+|WP_087116156.1|DBSCAN-SWA MLFKDEKDLKKLSWCFDFNRAKTCAKSQFVPLNQKLTIMPNSGIMVNFQLMLANYPTFVPLSFVMAFFTQN >NZ_CP023654|1139153:1146464|1139153_1139999_-|WP_008841054.1|DBSCAN-SWA MTQIKIVTDSSCGVTDEEIKKYNISIVPLSVMIDDTVYVERETISNEEFIQKMAESNSLPKTSQPPLGKFVEMFDRLGADGSQVISFNMLAAISGTVHTAQQAAELSKSDVTVVDSQFTDRALAFQVIEAAKMAQAGATKEEILERAAYIRDHTKLYLGIVNLENLVKGGRLSKVSGMLGGLLNIKLLLQVKDGKLDVANKVRGMKAMKKIWLDIYEEMKQSGKIKSVGISHVHADEMVEDMKKHVGELFPVKDIVVRETVPIIATHTGMGAFCLLYYSED >NZ_CP023654|1139153:1146464|1140884_1141835_-|WP_087116152.1|DBSCAN-SWA MLEEQYLNLERYVLENGHQKNDRTQTGTLSTFGYQMRFDLSEGFPLLTTKRVPFGLIKSELMWFLKGDTNIRYLLQHKNHIWDEWAFKKWVESAEYDGPDMTNFGHRTLIDPDFNAQYQVQKDRFTKLILEDDAFAAKYGDLGNVYGSQWRAWKTSTGETIDQIENVIDLIKNHPDSRRMIVTAWNPEDVPTAALPPCHSLFQFYVADGKLSCQLYQRSGDIFLGVPFNIASYALLTAMIAKTCGLEVGEFVHTLGDAHIYSNHIAQVKEQLTRDPRPAPRLKFNQVHENIFDYEPADIVVEGYDPHPTIKAPVAV >NZ_CP023654|1139153:1146464|1145061_1145922_+|WP_087116146.1|DBSCAN-SWA MQKDESIRLLDFVMITLGCCLYGLGLAVVNIPNHLAEGGITGVTLILRALFGIDPALSTLLINVPLILIGYRFLGKRSLIYTIFGTLALSFWLYFWQRIPISLDIHHDMFIAGILAGIAGGFGSGVVYRFGGTTGGTDVVARILEKRRGIAMGHTLFALDAVVLTISLCYIDVLHMMYTLLAAYVFSRLVSLTQVGAYAGHGLIIISDQNEEIAEALMDELGRGASYIKMTGAYSNNQHQMVYCVIGPNELNLAKRIIERVDPRAFTSVIDVHEAIGEGFTYDSDK >NZ_CP023654|1139153:1146464|1141839_1143735_-|WP_141783051.1|DBSCAN-SWA MKTLKAKNLTKTYGEKQLFQSINFTINENDRIGLIGTNGSGKTNLLNAVVGIDPADSGEFEAPNDYRIAYLKQSSEINQYETVRDFIYSGDQEVFRVIKRYEQVLAQYTDNPTSSTIFEKFTKAEDEMNRLDAWNTESNIKTILTQLHVDMLDAPINQLSGGQVKRIALAQALLEPADLLLLDEPTNHLDFDSIEWLEKYLADYKGALLLVTHDRYFLDRVTNHIWELSFGHLYEYEGNYAKYVEQKALREQQNEASQEKKYKLYKQELEWIKRGPKARGTKQQARINKFEKLDQDVHAPKEIDQDVEIGLTQQRLGKKVIEIKHLDLQVGDHPIARDFTKLIQAGDRIGITGANGAGKSSFLNAIAGKLPIQDGTIDIGETVKIGYYTQKMEPIPEDKRVINYIKEIGQEVVNRDGEKISVTSLLEQFLFPKFMHGSLIKKLSGGEKRRLYLIKVLMQQPNVLLLDEPTNDLDIATLTVLENYLEHFNGTVLTVSHDRYFLDKVSDQLLIFDGNGQIEQYTGQISDYLKQRAQTTSTSATTAKPRTEPTPVAKPKKKKKRTYAEEKEWQTIEAEIDKLEQKSKTITEQMNEYAADYGKLSELQAELNQVSDELENKMARWEYLESFEEGE >NZ_CP023654|1139153:1146464|1145993_1146464_-|WP_002830304.1|DBSCAN-SWA MANSVYLAAPFFSDLQIERVRKVEELLKKNSTIDGDNIYVPMDHQYEAEKFGTFKWQVGVFEADVRQVRKSDVVVAILDYAKQDEEVISDPGTVFEIGAAFENGKPVILVQFDDTDKINLMLARSHAAFFHGEDIKNLATYDFNELTPKYSDLTVF >NZ_CP023654|1139153:1146464|1143737_1144946_-|WP_087116148.1|tRNA|DBSCAN-SWA MVQLEKMPQEFEEARNVLQQIEEAGYEAYFVGGSVRDTLLGKPIHDVDIATSAYPAEIKQIFKRTVDTGIEHGTVMVLTGEHSYEITTFRTESGYQDFRRPDQVTFVRSLKEDLMRRDFTINAFALREDRTVIDVFDGLTDLKQHKIRAVGDPKARFHEDALRMMRGVRFASQLDFVIEPQTLAAIKMNSSLLAKISVERTLVEFQKMMLGTNPNRGLADMVATRLNEYCPGLAGKGAVLQELLAYPLSQLENETQVWALLARMLQLRGAQINRFLKQWKTSNELIRHVTATVRVLSMLDSTGVDRIILFEAGADNVANAVRVAQILGHDVRGWLDTYQTLQIKSPKELAVTGKDLIANQIVTPGPQMGRILNSLKTMVINDQLPNQPEALFTAARKLGKDD >NZ_CP023654|1139153:1146464|1140384_1140867_-|WP_087116154.1|DBSCAN-SWA MITMIWAEDDRHGIGRQQSIPWHIPDDMAFFRQTTLDHSVIMGRKTFESIGRPLPRRTNLVLTHHPEHLPSEVRGFSSYEELLASLTKTEKHFVIGGSAVYHKLMPVADELLITKVTGDFQCDVFAPVVDKQKFTLQEERPGKSVPGVPDHVFQQWIKRN |
8 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1174470 : 1291453
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP023654|1174470:1291453|DBSCAN-SWA TTTATTTAACCATTACCTTAGTCAAATCTCCAACACGAAGAACCAAGTTTGCTAAACGGCTCATCATGTTTAACCGGTTTGCTTTAATCTTTGCATCTTTATCCATTACCATGGTAGCGTCAAAATATTCGGTAATTGCTGGGGTCAAACTAGTCAATTCCTTAAAGAAGGCTGCCATGTCCGCATCATTCATCGCTTCAATCTTAGTGATCAAGTCAAAGAGCTTACCTTCAGTTTCGTTATTGAATAATTGCGAATCAACTGCTAAGTCACCGGCAGTGGTGTTTTTAGTAGCAATCCGTTGTACCCGGGTTAAGGCCTCGATTTCATCTTTGAAGGAATCCGCAGCCTTCGCGTTAGTTAGCACTTCGGCAGCCGCAATGATTGTCGTTACGTTGTGTTGGCTTCCGGCAAGCACGGCATCTTCAATATCATAACTAACCGAGTGGTGATCAAGGTATTGCTTAATTCGGTCATTGAAGAATTCTACCACTTCGGCAAAGTTTTTATCTACGTCTACCCCAAAGCTAGTTTGGTCGTCCGTCAACGCTTGCTTAACAGCTTCTTCAAATTTGTTCAAGTCTAGTGACCAATCGCGTTGAGCAAGGATTCGAACAATCCCGTATGCGTGACGCCGTAAAGCATACGGGTCATTTGAACCGCTTGGGATCATTCCTGCACTAAAGAAGCTAAAGATATTGTCAAACTTATCGGCTAAAGCTAATACTGTTCCCACAGTGCTTTCAGGAAGTTCACCTTCCGCACTATTTGGCATGTAGTGTTCCCGAATGGCTTGCGCTACGGCTGGTTTTTCGCCCTTCAATAGAGCATACTTTTCACCCATTACCCCTTGTAATTCAGGGAACTCACCTACCATCCCGGTAACCAAGTCAAACTTGTAAATTGCTGCCGCACGTTGCAAGTCTTCAGCTGCTTCTGCATCTAAACCGAGCATTTTAGCAATTACTTGAGCAATGGAGCCGACCCGCGTCATTTTTTCTGCCATAGTACCGATTTTATCGTGGAAGCTAACCTTTTTAAGTCGGTCAGCGTAGTAGTCAATCGAATTCTTTTGATCTTCGTCGTAGAAGAAGGCAGCATCTTCAAGTCGAGCTGTTAACACTTTTTCATTTCCACGAATAACGTTTTCTAGGTGTTCCTTGTTTCCATTCCGTACGGAAATAAAGTTTGGCAACAGCTTGCCGTCCTGATTCCGCACGAAGAAGAACCGTTGATGATCACGCATGGAAGTAATTAAAACTTCTTCGGGAATTGCCAAGTACTTAGGATCAAATTTTCCGCTAAATGCCGTTGGCCATTCTACCAGATTATTTACTTCTTCTAATAAGTCAGCGTTCGGCGTCACTTCCCAGTTTTCTTCTTGGGCGATTGCTTGAATTTGTTCACGAATCAACGCTTTGCGTTTTTCTGCGTCAACAATCACAAATTCAGCTTGTAGCTTTTCTTCGTACTCACTTGGATTAGCTAAGTCGACCGTTTTACCTAAGAAACGGTGGCCTTGGCTTTGCCGTCCGGCCTTAATGTCTAAAATTTGGAAAGGCAAAACCTCGTCGTCCAAGATGGAAACCAACCAGCGAATCGGTCTTACAAATTTAAAGTCGTAGTTCGCCCACTTCATCATGGTTGGGAAGTTCAATGATTCCACCACGTCTTTAATGCCTGGCAAAATTTCTTGGGTAGTTTTACCTTGAATTAACTTGTGTACGTATACGTATTCCGTGCCTTTAATGGTTTTAAAGGTAATGTCGTCAACTGTTAAGCCTTGTCCTTTAGTAAAACCAATCGCCGCTTTTGTCCAATTGCCATCCGCATCTTGGGCAATTTTCCGGGCAGGCCCCTTAGCATCTTCTTCAATATCTGGCTGACGATCGCCAAGTCCATTGATTCGAATTGCTAGACGACGAGGTGTCGAAAATTGCTCAATAGAATCATAGCTGAGCCGGTTTTCCTTCAAAAATTTAGTAACTTTTTGTGCTAATTGTTGGATGCTCGGTGTCACCACGTGTGCGGGAATTTCTTCTAAACCAATTTCTAATAAATAACTATGAGCCATTATTTTACCTCCTTGTCGTCATTTTTTAATAATGGGAAACCAAGTTTTTCACGTTCTTCAACAAATGCGCGGGCTACTTTACGCGCCATGTTGCGGATTCGAGATAGGAATCCTGCTCGTTCAGTAACTGAGACCGTCCCGCGAGCATCAAGTAAGTTGAAGGTGTGGCTACATTTCAAGATGTAGTCGTAAGCCGGGTGCACTAAGCCTTTTTCGATTAACCGGTTAGCTTCGGCTTCAAAATCGTTAAACATGGTTTCCAACATTGCTTGGTTAGATTCTTCAAATGAATACTTGGAATGTTCGTATTCAGGTTCTTTAAAAATGTCTCCGTAGGAAACGCCATTCCCCCACTCTAAATCAAAAACGGATTCTACGTCTTGGATATAGGAGGATAGCCGTTCTAGTCCGTAAGTTACTTCGCTGGTAACGGGGTGTACTTCGAGCCCCCCCACTTGTTGGAAGTACGTAAATTGGGTAACTTCCATTCCATCAAGCCAAACTTCCCAACCAACACCGGCACAACCCATTGAAGGATTTTCCCAGTTGTCTTCTACAAACCGAATATCGTGTTCGAGGGGATCAATCCCTAAAGCCTTTAAACTACCCAAATAAAGTTCTTGGATATTTTCCGGTGACGGCTTCATCACTACTTGGAATTGATGATGTTGGTAAAGCCGGTTAGGGTTTTCCCCGTAACGACCATCTGCTGGACGCCGAGATGGTTCTACGTAGGCAGCGTTCCATGGTTCGGGGCCAATTGCCCGTAAGAAAGTGTACGGACTCATCGTTCCCGCACCCTTTTCAGTATCGTAGGCTTCCATCAACATGCATCCTTGGTCTGCCCAATATTTTTGTAAAGTTAAAATAATTTCTTGGACCGAAAGCTTTTTATTCATAAGTTCCTCCTTTAAATTTTACGGACAAAAAAAGCCCCTACGTAGCATAAAATACACTACGTAGGGACGATAATTATCGCGGTTCCACCCTACTTCCGGTGAGTTAATTTCTCACCGACAGCTTAAAATATTTATCTCTTAAGGACTCCAAATGCCCCACGGAACCGTTCCTAACCAGCTTCCACTATCCTGGTTTCGCTAATAGTACGGAAAATCCGCTTTGTTCTTCACTGTCCAATTTAACAGAGATAATAATAAAAAACTTTTAATTGGTTGTCAATATAATTAATGCGCCCAATTTTGCATTTGATCAATAAAATGACGACTTTTAAGGTTAATCCCGACTTGATCTTGATAAATCCGCTCAGTTAACTGCCAGATTTCTCGCTTAGTTGCTGGTGAAACCGAAATCTGGCCTAATTTAAAAATACTGACCAAACTAAGCATTGCCATGGTTTTAGCTGCTTTAACGCTAAGGTGCCAGCGGTGTTCGTCTAAATGCCAGTGATTTTGACAAAGCATCCCGCCTCGCGACTCAGAATAATCTAATGCCAAATCGCGACGTCCGCAAACGACACAATGATCCCAAACGATTGCAATCCCAAAGGAATTTAGCAATTGAATCTGAATTAGATCCGTAATTACTTCCGCATCGTTACCAGCGTCAATCAGGGTCAGCGCCCGGGCTAGCCGGTCAAACCAAGCTTCAATTTTAAAATTATCATCAAATGCAGCGTCAACTAAATTTAATAAAAAAGTGGCGTAGGCATTTAATTCAATATCCTGAAAAATATTTTCAAACTGTTTAACGTCTAGGGCAGCGTTAATATACGACAGCCCGTTGCTCCGGATTAACCCCGAATAACGACCGTGGGTAAACGGCAAAATTGCCGAACGCAACTTAAAATCCTTCTTTTTGGCATTCTTGATGAAAAACATCCGTTTACCATATTCCCTGGTAAGAAATTTAACCAACAAATCGTTTTCCCGGTGATTTTTGGCAAACATCACCATGCCAGTAAAGTCCGCGTTCACCAATTGGCTCATATTTAATATTCGTCCTTTTTATAACCGAAGGATTGCAAAATTCCTTGTTTATCACGCCATCCTTCAGAAACTTTAACCCATAGTTCAAGATAAACCCGGCTACCTAGTAAATGTTCAATGTCCACTCGCGCCCGGCTGCCAATTTCTTTTAGCATCCGACCGCCTTTGCCAATGATGATTCCCTTTTGGGTGGGGCGGTCCACAATGATCGTTGCGCTAATATCCACGAGGTCATCCTTACCAGGTTTCATGGATTCAATAACTACGGCTACGGAATGGGGAACTTCTTGCCGAGTTAACTGCAATACTTTTTCCCGAATCAATTCAGAAACCACAAACCGTTCTGGATGATCGGTAACTTGGTCGCTTGGGTAATATTGCGGACCTTCGGGCATCTGTTTACTCAAGGTTGCTAAGAGCTCGTTAATGTTGTTACCTTGTAACGCTGAAATTGGGAAAACCTCGGTCCAATCCAAAGCATCCCGGTACGAATCAACAATCGGTAACAGCTCGTCTGGATGAACTAAGTCAATCTTATTAATCACCAAATAAATTGGCCGATTCTTAATTTTCTTCAACCGTTCGATAATGTAGTTATCCCCGGCACCCCGTTTTTGATCCGCATTGACCATAAACATTACCGCATCAACTTCGTTTAACGAAGATATGGCAGATTGAACCATAAAGTCCCCCAGTTTATTGTGAGCTTTATGAATACCTGGAGTGTCGATAAAGACAATTTGTTCGCGGTCCGTAGTGTAAATACCTTGGATCTTATTCCGGGTAGTTTGTGGGACGTCGCTCATAATCGCTACCTTTTGACCAACAACGTAGTTTAAAAAGGTCGATTTACCAACGTTAGGCCGGCCAACGATTGCCACAAAGCCCGAATGAAAAGCTTGTTTATTTTCTTCCATAATCACGATTCCGTTTCCTTAATTTTAAAAAAAGTGGTGTGCAAAAACCAATAATCCAATCAA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116 | Lactobacillus_phage(52.08%) | protease,integrase,tail,terminase,capsid,head,portal,tRNA,holin | attL 1218200:1218223|attR 1259842:1259865 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1529131 : 1568225
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP023654|1529131:1568225|DBSCAN-SWA 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40 | Erysipelothrix_phage(73.91%) | protease,integrase,tail,holin,capsid,portal,head,terminase | attL 1529393:1529419|attR 1535554:1535580 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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