Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NZ_CP041661 | Catenovulum sediminis strain WS1-A chromosome 2, complete sequence | 0 crisprs | PD-DExK | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP041660 | Catenovulum sediminis strain WS1-A chromosome 1, complete sequence | 11 crisprs | WYL,cas3,csa3,DEDDh,DinG,RT | 2 | 2 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
409475 : 441871
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP041661|409475:441871|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP041661|409475:441871|425744_426014_+|WP_143873531.1|DBSCAN-SWA MLSTIDFGTNLNNEYQSTGNLSGTTLGYNSAKLATDIAMTYIGVFGGPVGAVVSIGYFAATNFGGDSWISPWDTETLKPYEPRLGTIER >NZ_CP041661|409475:441871|435637_437563_+|WP_143873557.1|DBSCAN-SWA MMPRSKFFRQQLPDKYQDINYWPYPAIDNGRFSDAQLSTFNMKAQAVSMYFRDVPLADIKSSTGIENAYVVRLVKKCLQVDDDGNIYGFCALLPYFRVKKYRRQSTTNIQPLVCRGLSGAFTKLLSNYPDIAELVDELVFRNVTKKNLSKKCLSNREIHLKFIAKCRELGLDNGLQYPFNTISLGYRSLCSYILSIKCNSSTPNLYKLVGKSAKQKLAITDGTGRKQLMLLDSVECDAHLIDAIFCVLVPNPFGGVEPYICKRLWLITIEDICSRAILGYHLSLNQEVTSSDVLKCIKHALTPWQKLEGKYQGYSQNAGFPSALSQCYAGLCWKEFKVDGALANTCATTANKLHRLMGITPKVGKRHNKDDRPFVERFFLTLEQTSFHKLPNTTGSKTSDPLRNLPEKAAIKYYIQVDDLNYLIDTIIAGYNASEHQGIGMRTPLEYFQFLMESANKLPEKVPENYGTVLSTQSQEVTVKGNLNKGVRPYINFCYTKYHSDVLRSSYKFLNKKITIEFDEEDLRVVSAYHNGEPIGKLKASFPWNNVPHSITLRKAIYSLIKQKKIILGNNTNPIEEYLKYIEKTSKQTLIENNNYLQARRYSELYVNELTNTKQAHDQLIKHNTKTLDKIEPNKPLPPPK >NZ_CP041661|409475:441871|434929_435238_+|WP_143873554.1|DBSCAN-SWA 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MSAEKDLTAAEQKAISDKANKLINLDKLGNIDEPMADIAKTTTAGAEKESTNSINKTGRAQRDKFDADFEVAQVVREQKESQRRSDTVSYKQSLDTDLGTKKVGVPLLDEWVYQNTFKPEIPLPDMLKNGFDLESSIFLGTDWTDMSYAATPGPWRDEFIFGGQKTNGWIGSAQQSVGGAGRLADFLEYGAPNSLYLGNIKVLGGLDINVTPMIEGWRFDASIASNSDKLMNSTPLVSGINNIADKTGKGLNFIAPVLSYVAAEDYGNATTGTGIQQSVYDNKVRVDAAMAFVALTPAAPLTAGYGVLDLAYSFLPVYTAKHGPYKGEAIEGGWHNAYQREVDQYVDLLDSGEELIRPNSIYHW >NZ_CP041661|409475:441871|412066_412726_-|WP_143873506.1|DBSCAN-SWA MLTSPQAATMLALQDKMNAKVNPDWVAVKSPFLRAVVIEAAEAIEHHGWKWWKKQDCDLEQLQMELVDIWHFILSAILIKHEGNQEKALQDVFADLETLSLQFDGQSYVYQELSLLQKLELMIGLAAAKRYDLGLFSALLADCQMQWDDLYAQYVSKNVLNFFRQDNGYKEGTYVKIWSGREDNEHLVEIMSKLDVKSENYQTDLYNELNARYQMLDMA >NZ_CP041661|409475:441871|428933_429587_+|WP_143873540.1|DBSCAN-SWA MFVKPKIESTTKSTNQYRLHRFTWWQCFFTDLPFTVMIIALFLFMVVVYVKTGYLEVFIGFIGILAFMLERTKFWYEGGKIRLEIDDNGVRLSNGKYYKWGEIDKVDIPPLPVSQYGMPVPKYKLHFKDGYKFSIDQRLMGYTDLYLKLYRRGIEGAGKALPIYFVDLSNGTAPGGLKPKPVAIYYPDKNIEVPTEPKNSANVRRKRRKPASRKKGR >NZ_CP041661|409475:441871|430827_431220_+|WP_143873545.1|DBSCAN-SWA MRDRRNLVDKNKKKHDGVMGIFVVSFLHISLQLLLIYDLYSYFFPTTATAFYEYLLHILGKIKTHKGIVNSGFVLLTLILSLVIAYGLCCFRVPKSSIPERLNKHSFLRNHSYWKEFALVIVYILFIRAI >NZ_CP041661|409475:441871|431281_431539_+|WP_143873546.1|DBSCAN-SWA MKSDSSSKAAAKIQEIQNSNADDTTKKLAIQKVYEEEGVVFGDISDDTGSSGGSGKRGFSGIHGAYDNDGHVHVTRTVLISLFDF >NZ_CP041661|409475:441871|417929_418763_+|WP_143873516.1|DBSCAN-SWA MEAQGRAIQDVIDTPIHKSVAYINGMNRGMASASYHARDRIAFQQNHNEALAIAIASRIQTPNAGMSRLVTIQMGLDAVGMSEVPVVSQLADIGSAGISLSKGDYLAAGLSLLAMIPLVGKAVDASRMARIADRATDLSTVGGVLHEINRNADIAMELTHRALARGRINNTAQAFGTRAHKYFERLNDRLNMRLSDADSPFSLQVEPFRDNNGALVGNNVRLPGTIGADIEIFDNGNIIKALDLKTHGGIEKLIAQNRQADLTKRIGVSVEEIFKRL >NZ_CP041661|409475:441871|419686_420040_+|WP_143873521.1|DBSCAN-SWA MAAGAAVLSGAAGFGVAVGAAAFVGGFMGSVASQVVGKEMGVVESFSLKNALSSGLTSVATAGMGAAMGVGADTADTFTKLNSAKKGAKASLDAYGAATMAAGSYVANIAANKLVGK >NZ_CP041661|409475:441871|431620_431857_+|WP_143873549.1|DBSCAN-SWA MDITIHGTAAEMIQNEMSLGGYKSPEDVIYEAFEALVKQKISDSIDEGLADIEAGRAMEITPDNIKSVLDKPLDAWQK >NZ_CP041661|409475:441871|413470_414187_-|WP_143873509.1|DBSCAN-SWA MSFILITGANRGIGLHLCRHYLSQGQNIIALARSHSSALEALQTHYQTDQQPDQSGQFKVYQCDLNQEESIQQVAESIKLQGIELELVIHNAGVSINESFGNWTQKAFIDNYRVNAVAPALLTQALFSQFAHKAKIILFSSGVASLSEAKDVRKSALDSYAMSKVALNMLAVKLSNACDGVNAICCAINPGWVRTDMGGQDATQSPEETVISLTQTIANLSEEKNASFLSLAGEPISW |
34 | uncultured_virus(40.0%) | integrase,transposase | attL 414525:414540|attR 444506:444521 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041660_1 | 602302-602401 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041660_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041660_1
>1.1|602325|54|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder TGTTTAGCTCGACATTTGTGCGTTCTGCTTTGACGGACTAAAGTCCGACCTACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041660_1
The CRISPR arrays of NZ_CP041660_1 >merge|NZ_CP041660|1|602302-602401|CRISPRCasFinder TTGTCGGGCTGAAGCCGCGACATTGTTTAGCTCGACATTTGTGCGTTCTGCTTTGACGGACTAAAGTCCGACCTACATTGTCGGGCTGAAGCCGCGACCT >NZ_CP041660|1|1|602302-602401|CRISPRCasFinder TTGTCGGGCTGAAGCCGCGACAT TGTTTAGCTCGACATTTGTGCGTTCTGCTTTGACGGACTAAAGTCCGACCTACA TTGTCGGGCTGAAGCCGCGACCT
>NZ_CP041660.1|WP_143870041.1|600757_601963_-|IS4-family-transposase MKLLLSNLLSENSIALDKRIKKALSDTVSCVQHGAKLSLTAIGRTLGEQSPSTTEKHCIKRVDRLLKNEKLQQNRTQFYKTLTAYLTGGIEDALPIIVDWSSVYDQSFVLLRASVAFDGRAFTIYEEVHAEGAMNNHKIHVKFLQNLKQILPDECCPVIVTDAGFKVPWFKAIDKLNWYWLARTRGTVKCKTDDNSEWTLVDAYHSQAKTKPTALKGLVLSKQHKWSCRGVLYKTSPPPKKHKKPTKRPNCNSYKKYSKGNSEPWFLVSNLPEDEFSALALVNIYKRRMTIEEAFRDTKNEYYGLGLRRSRSQSIERLQALLLIALLAQWQLYVIGKAAELQGYHRHFQANTEKRRRVLSYCYLAKRILLNSSFAITNSMLQEAFELLIMETRCHLNCGDP >NZ_CP041660.1|WP_143870040.1|597367_600286_-|RNA-polymerase-associated-protein-RapA MSDFALGQRWISDSESDLGLGTIVAINGRRISMLFPATGDQREYVAGSAPLTRVSFNPGDSVESAEGWTLNVHQVMAEDGLNIYIGERSDNGEKAQLLETRINHHIKFNKPQDRLFTAQIDRNDWYTLRYDARCMQHKYQTHPLVGLAGARTALIPHQLHIAKEAGSRVAPRILLSDEVGLGKTIEAGMIIHQQLLTGRASRVLILLPESLQYQWLVEMLRRFNLKFAIFDEERCGEYDESEENPFETEQLIIAPLTILSESDKRLEQACQASWDLVVVDEAHHLDWSEEAVSPQYSAVEKLAKICAGLLLLTATPDQLGHQSHFARLRLLDPERFYDYATFVKEEAGYKAVADLAKLLNSDEKIDADGLEKLKSLGEQEQGEGFEASVLSINDADKTVAQQARHKIIRSLIDRHGTGRVLFRNTRASVKGFPKRCVLPTELELPSEYRAAADWWLKRHPEDYSAKAVAPLLTPEFLYQNAISGDIEWWRIDPRIDWLAELIKENKQDKFLIICARASTALTLEQAVRVKFGLNAAVFHEGMTIVERDRAAAWFADQDEGCQLLICSEIGSEGRNFQFARQLVLFDIPLNPDLLEQRIGRLDRIGQRNDIQINIPYFADSAAETLFNWQHKGINAYAETCPAGVKVFEQQNDALLTALASNQFDETQIKPLIERAKAEIEQINLQLEEGRDILLELNSKGFDGERIAEDIEAMDDDTQLVAFMLQTFDVYGVSQDDKGEQCIAINPTEHMLEPHFPELGDEGMTISFDRETALSREDVRFISWDHPMVQGCFEMINAGEMGNNAVSILNNKALPEGTYLVELIFVVETSAPKQLQPGRFLPPTPVRILLDKAGNDLAAKVTFDGLNKQLKPVNKQVASQLATALQPQIHELIGQAETKANVERDNLIAQSIAKVDEELGDEIERLTALKAVNPSIRPIELESLIQQKTALHEHLKQARVKLDAVRLIVVSHN >NZ_CP041660.1|WP_143870039.1|596307_596772_+|hypothetical-protein MQKQYLIFPFLLACLISCSDNEVGDVSLGWFTTKDIKIDSLNDPIVTGVTCHISSIEADLDFADPSDSSISCRQTGQITPAMIAAIDKSKSGDIVFKKSKSIFFKNLKIRRIFDAENQTLLYVSYSTKETQGSYKHSMSTVPLWGTAAYETIQK >NZ_CP041660.1|WP_143870038.1|595293_596265_+|hypothetical-protein MKKFLLFFVLLILLSLVIVVLVLLWPNKAQQPSPAQTPADRYAAAEPPLSTQINIEKLNINEQPKIESLDDSDTPTDNSEKNKPHPSKPKITELQQIEALQQNIAHIDLDQYKKNATTEAYLAYLLALEKCLPFHRYINNAGKIEFTEQQINTTVEQHANNGFPKHVTQHMLDKINLCKNVKGEYLNRLYDEVTYVANHGNIQAMMLLSHMPSLNLALRKNIDKETRKNFYHKQVMWLEQARQQGSLNALFNLAVRYHHGVSPDAVAAASYYSALQHFMPEYEYTETVTVLTENMKTWQKAEVDKTTRLIIEEMQQLPELYNW >NZ_CP041660.1|WP_143870037.1|595008_595281_+|hypothetical-protein MKELARKIFAPVLRPFEAGAEPYHYKPLNRTILLVVGFLFLVLATTVYFLSPPGYGFLIPFTVFGAGGCLCLIIGLLGADRAVAKIWGNK >NZ_CP041660.1|WP_143870036.1|594256_594961_+|DUF445-domain-containing-protein MNMSLITNLLAASVTLIGYFTQQDIVFSVGLFALSGAFTNWLAVHMLFEKVPGLYGSGVIEAKFDNFRTAINNLIMTEFFNHENIDKFLTDQQGHASHFNFAPVIEQVDFEPAYDSLVATINESKFGSMLAMFGGSSAIEPLKEPFITKLKGKIIEISQTEEFNELVRDSLEKPDVIEELKDKVSNIVSTRLEELTPKTVKEIVQKMIREHLGWLVVWGGIFGGFFGLLAGLLG >NZ_CP041660.1|WP_143870035.1|592019_594047_-|EAL-domain-containing-protein MYAACYRLLKQFSLHSLKARVVLALVVSSLFATLLAVTGFSVVQYYKVHDQIQKDVEKNIELVSASLSEALWSFKEETVQYMASGLSQSQYIAATEVISETGERYLYGVKSGPPSLTQDLTHQQELVGNVDIWLDRKAINRYVIDSVLFVVSVYVVSAVLVSFIAIRVIGYMLSRHLSNIVSHMQSFKLDDSLRREIVLNRAPYIEDELSEIVNSYNRLGRETQDYFKAKRQYEKHLTYQANHDDLTGIANRRYGLHLLEEKIRSTSIDGKFALLFIDLDGFKDINDTHHHLVGDEILRIVSARLLDIGNVYGGFVARIGGDEFMLAVELDGIQLDALAKNLLQRIKEPYGIANDILNLSCSIGIAMYPEDADTATNLIANADTAMFQAKSSGKSQYKTFSAEMFEDLVVKSRLKAALKDALKNEQISVYFQPIFAIDDASIVGFEALCRWNHPEYGSIRPDIFIALAEETGDVVEIDRFVLEKVVKKLHKLEQTGARLFGTVNFCPLDFEQTDLIDHMAGLLERYPLTLNRLEVEVTERSMINESGNANIPLILQNMEKLGVKIAIDDFGTGYSALSYVKHYRSFISKIKVDRVFVRDIQHDTADVALVNSILSMAKGLGMTVVAEGIETEKQRDVLSSLGCQFGQGYLISKPLPIDEFCDLLNVQVDLARQTH >NZ_CP041660.1|WP_143870034.1|591242_592040_+|DTW-domain-containing-protein MPIDDYHLSINRAQDKIKCHFTVMSINLPTQNYQSVRQQRLARATRQFNARGIAVKRCPHCLVAQYACICSWKRTAPCNTEVILLMHSAEILKPTNTGRLISDVLADKCHVFEWSRTEPPAELVKMLNEPSRQCFIVFPTEASNRQVYSEKPDNQESKTPTLIILDGTWRQAKRMFNQSSWLKPFPCLQLNIAKVEDYGLRKAFSHEQFSTAQAAAFALAQLGEIPAAQVLQAFYSVFIWHYAESKMNRQPTLTDNHRLLVGLAR >NZ_CP041660.1|WP_143870033.1|590534_591137_-|DUF2726-domain-containing-protein MDLVVIIMMMVLVIVAAIAIRMTQTGSPFPYQKKNVLFSEPERAFLIKLEQAVGDKFRVVNRVKLVDLVQVENTVTKRAAQLAKTKASAKTLDFVLLDRKTLEPVAAIDLVNTESKQGYKARPDWFVRGALETVGIPHVRIKIRSGYKSAEIRECLSAKLGRGKLAPLNVKPVTPKGPTRPVKPLTARLADNVQQSQAVA >NZ_CP041660.1|WP_143870032.1|589780_590473_-|5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine-nucleosidase MKIGIIGAMQQEVEILLQKIENCRAEQHGPCTIYCGQLNGRDVVLVQSGVGKTAAAMSTTMLLDNHKPYIVLNTGSAGGFASELNVGDLVISSEVRHHDVDLTAFGFEMGQGYGFPAAFESDETLIRRAEQAAAKQHDLQTKVGLICSGDSFMACPERVAKARSDFPQMIAVEMEAAAIAQVCAQFNTPFVVVRALSDIAGKESHGSFETFLEQAARHSSQLVMDFIQLS >NZ_CP041660.1|WP_143870042.1|602578_603967_+|AAA-family-ATPase MTEKMTKIYILDTNILLHEPFAFLNFQEHDVFIPMTVLEELDAIKDRKKDVSRDARIAIRALEDSLKDATPEEIADGVSMKRYSTEHGSTGKLAIYPDHLLTQDRVTLPGPENDNRIINAALHLQQDKAPRTVILVTKDINMRLKAKGAGMERVEDYRTDQLISDIKYLSTGYAEIKGDFWSQITNCESETEGRDAIHTVERSVLPKTVFINQYIFDEAHSFAGKVIEHNDETVKLKDLGFDRMMGRHAWGISPKNFHQAMAMDALLDTHIDLVLLTGPAGSGKTLLALAAALEMVVEQGIYEKIIVTRNTPEIAESIGFLPGTEEEKMAPWLGAINDSLDFLHRHDECRESSMRYIMEKANIQFKSVNFMRGRSIQKSIVILDECQNMTSSQLKTIITRAGEGTKLICCGNLAQIDSNYLSPLTSGLTYIVECFKDFEGSATVHIAGVMRSRLASFAEKNL >NZ_CP041660.1|WP_143870043.1|604343_604559_-|DUF1289-domain-containing-protein MTDKDLWGQHVANPCIGYCVLNDQNVCEGCGRTRDERTDWIFMSDDDKRKVLVSAEKRMEEIKKKNSQLPN >NZ_CP041660.1|WP_143870044.1|604707_605028_+|Hpt-domain-containing-protein MVINKPEALERLAGNEQLFVMLVKKFANQYENAASELETLLKENNLKDAAVMAHSIKGAAGNLSMNNLYEEAKVLEAELRNGEYKAESFAKFSTALNDVIHESKSW >NZ_CP041660.1|WP_143870045.1|605041_605968_+|diguanylate-cyclase MTNAIDNQQSVLIVDDQNINTLVLENALSPLYTVYTANGGQAALNILHSQTSIDLVLLDIQMPDLDGYQVLLDIRQNDATKNIPVIFISAKDAAEDEAKGLEFGAMDYITKPFNITVVKARVRNQLSLKKKSDLLEKLANIDGLTEVPNRRRYDEKLDLEWRRCARSSSPLSMIMLDIDAFKPFNDNYGHSAGDEILKQVASTLSKKIRRSGDEAFRYGGEEFVILLPETSFESSIRVAEMMREAIEALDIPHEYSPVEKHITVSLGVSSIVPVATMSAKTLQEFTDLQLYKAKNAGRNQVQGELLQV >NZ_CP041660.1|WP_143870046.1|605984_606452_-|transcriptional-regulator-ArgR MNNNDKQDKLLKVFKTLLNEQTFSSQADIVEALKDEGFDSISQSKVSRLLSRFGAVRTRNAKQEMVYCLPPELGLPTAESPLKQLVLDVSHNQAMIIVRTTPGAAQLIARMLDSLNKSHGVLGTIAGDDTIFIAPVDTSEIDKTCEHIEIFFDTV >NZ_CP041660.1|WP_143870047.1|606890_607727_-|beta-lactamase-regulator-AmpE MTLLSLIVVVLLERLVQVTETFHYRHYFNWYQDKVQSVLKKSESVSAEVFLLIWLAIPAVSVAVVQLLLGTGVLGLLFSIFILFLCYGCPQHRVCYKQYLEAACRGDQEACYLYGEKLGQKFNKGSKETLGQTLVWINFRHYFAVIFWFVVLGAAGAVFYVFSRNLAKQSLQKDNLRWLARPSNRLLAILVWLPARITGFAFLFVGHFSRALPTWLNGLTRCDLDARTYITDIADKAEDVSCPEHDYLTEPCVLLKLAKRAFLFLLSIIAIFTITGIL >NZ_CP041660.1|WP_143870048.1|607723_608299_-|1,6-anhydro-N-acetylmuramyl-L-alanine-amidase-AmpD MKTPAYSKINNHHILPDAVFKASPHFNDRPNVNNINLLVIHCISLPAEQFGLKYIDDLFLGCLDCDADASFNALSGLRVSAHVLIRRTGEVVQFVPFDKRAWHAGVSCFKGLDNCNDFSIGIELEGADNIEYEAIQYQQLAKVVRQIQCQYPLILNDNIVGHCDIAPGRKTDPGPAFNWDYFFNLLDKEKQ >NZ_CP041660.1|WP_143872836.1|608336_608816_+|TIGR02281-family-clan-AA-aspartic-protease MSYAAWIIAFFLLTYFFEGYLNKKENPNQNPESYYTNQGAIEVKLERNQHGHYVTNGKINQQIVTFLLDTGATNVSVPENIAKRLNLPYGPSQRVGTANGSINVYQTRIDVLEIGDIKLRNVAANINPYMQGEQILLGMSVLKRIEFTQRGSTLTLKQY >NZ_CP041660.1|WP_143870049.1|609354_610218_+|DNA-ligase MRKPRIGIKFALTIITFSIFFTLFILNPKAHADPRSLLLAEVYSPEIDITDYYVSEKFDGIRAYWDGEKLWTRNGNSINAPKSFTQGFPNIPLDGELWLKRNAFAQTLSIIKTGTEQNWAKISYQVFDLPSEQGTFNQRLIKMRTLEQQTNAPQLKWVKQFKVPSHAELKKTLEEYIAQGAEGLMLHHQNSYYQGKRSSDLLKVKKYLDADATVIAYQAGKGKFKGQMGALIVKTPKGQTFKIGTGFTNQERANPPPIGSLISYKYLGFTKNGLPRFAVFLKVKEED >NZ_CP041660.1|WP_143870050.1|610224_611637_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MEYPNIQHHGAVDGVTGSCHRLCVSEQQHILIDCGLFQGAETSGKANQLIPEIDFPTEHIKGLIVTHCHIDHVGRIPWLIAAGFTGPIYCTPATAQLLPLVLEDAIKIGITKKKPFIEALLKRIKSQINAKPYKRWFNASGVQNVKIKFQPAGHILGSAYVEIEHQPTAHKYVFSGDLGAPHTPLLPAPRSPYRADTLVIESTYGDKKHTGRRQRRKQLQQVIEKCLQDRGAVLIPAFSIGRTQELLYEIEDIISRSKNNGLTNRNIWHSMQVILDSPLAAKFTEHYKSLSKLWDAEAQQKIVRHRHPLDFDDLYTIDSHEEHLNAINYIQKTATPCIIIAASGMCSGGRICNYLKALLPDKRTDVLFVGYQAKGTPGRDIQKYGPKGGYVVIDGEKIDIKAGVHTLSGYSAHADQKDLLNFVKRMRIKPKHIKIVHGDDDAKLALKKEYERILPEAKIEIASSESGSSL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041660_2 | 619100-619323 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041660_2
|
2 spacers
spacers of NZ_CP041660_2
>2.1|619144|32|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder GCCAACAATCCATAAATAAACGCCAATGTCGC >2.2|619220|60|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder ATTGTCGCCCTAAAGGACGACCTACATTTAAGCTGCGAGCTTCGAGCAACGAGTAAACAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041660_2
The CRISPR arrays of NZ_CP041660_2 >merge|NZ_CP041660|2|619100-619323|CRISPRCasFinder CCTGTGGGTCGTGGCTTTAGCCCGACATGTAGGTTGGCCTTTAGGCCAACAATCCATAAATAAACGCCAATGTCGCCCTGTAGGTCGTGGCTTTAGCCCGACAAATCTCGCAACATGCACATTGTCGCCCTAAAGGACGACCTACATTTAAGCTGCGAGCTTCGAGCAACGAGTAAACAACCTGTAGGCCGTGGCTTTAGCCCGACAAATCTCGCAACATGCAC >NZ_CP041660|2|2|619100-619323|CRISPRCasFinder CCTGTGGGTCGTGGCTTTAGCCCGACATGTAGGTTGGCCTTTAG GCCAACAATCCATAAATAAACGCCAATGTCGC CCTGTAGGTCGTGGCTTTAGCCCGACAAATCTCGCAACATGCAC ATTGTCGCCCTAAAGGACGACCTACATTTAAGCTGCGAGCTTCGAGCAACGAGTAAACAA CCTGTAGGCCGTGGCTTTAGCCCGACAAATCTCGCAACATGCAC
>NZ_CP041660.1|WP_143872837.1|618712_619093_-|nucleotidyltransferase-domain-containing-protein MCLLDKIKQLAAAHHDIDVLWLYGSRARNSADQNSDYDLAVLFSSFHHDVLERRLRPELLAMDWQQALGCSLSVIDITQVSVPLAYTVVQDNCVLLSKDDFKQLETERIIMSKWDIDYQHHLKHYA >NZ_CP041660.1|WP_143870056.1|618285_618720_-|DUF86-domain-containing-protein MLEAYARSIQEHIRENHQDLVELENVLNSRSWTRIERKAAERVLQILVESCIGISKHWLKLNKINVPSDTYQVFVKVCELGAISQDELVVWRKIVGMRNAIVHDYLNLEPAILVAIIKQQLYLDVVNYGLKMSERLCGSCRSSD >NZ_CP041660.1|WP_143870055.1|616989_618156_+|nucleotide-sugar-dehydrogenase MKIAVAGTGYVGISNAVLLAQHNEVVALDIVKEKVDLLNNKKSPIEDEYIQEYLANKPLNFRATLDKEEAYKDAQYVVIATPTDYDPETNYFNTRSVEAVIKDVMSINPDAVMIIKSTVPVGYTADIKQQLGCENIIFSPEFLREGKALYDNLYPSRIVLGEQSERAKVFADLLVQGAIKENVDVLFTDVTEAEAIKLFSNTYLAMRVAYFNELDTYAERHGLNTRQIIEGVGLDPRIGNHYNNPSFGYGGYCLPKDTKQLLANYHDVPNNLIAAIVDANTTRKDFIADSIIRRNPKKVGVYRLIMKAGSDNFRASSIQGIMKRIKAKGIEVVIYEPVLEEDTFFNSKVIKDLNEFKEMSDVIVSNRMSESLQDVADKVYTRDLFGSD >NZ_CP041660.1|WP_143870054.1|616583_616928_+|four-helix-bundle-protein MYYEKLAIWQRSKALTIDVYSTLSNLRDYGFKDQITRSILSVPSNIAEGMERYSDIDKARFLVIAKASIGEFKTQTDIGVEIGYIPLQTGTVWMNEAEQISKMIGSFIHTLKSN >NZ_CP041660.1|WP_143870053.1|615000_616365_+|phosphomannomutase-CpsG MNKLTCFKAYDIRGKLGEQLNEDIAYRIGRAYGEILKPKTVAVGGDVRETSETLKLAVAEGLTDAGVEVLDIGMSGTEEIYFATFHLKLDGGIEVTASHNPIDYNGMKLVKSGSQPISGDTGLFDIQKMAEENNFPPVTQKGSIKTVSIIEDYTAHLLGYINLNNIKPLKIVANSGNGAAGHVIDKIEAEFAAKQIPIEFIKVHHNPDPSFPNGIPNPLLPENRADTANAVKEHKADMGIAWDGDFDRCFLFDENGEFIEGYYIVGLLAEAFLQKHQGAKIIHDPRLAWNTVDIVKKSGGEPILCKTGHAFIKERMRKEDAIYGGEMSAHHYFKDFAYCDSGMIPWLLVAELLCVKGQSLSSLVKERIAAYPSSGEINSKLDDPKAAIERVKAKYSNDALEIDYTDGLTMVFENWRLNIRCSNTEPVLRLNIESRADITLMEQKTEEVLSLVRK >NZ_CP041660.1|WP_143870052.1|613338_614748_+|mannose-1-phosphate-guanylyltransferase/mannose-6-phosphate-isomerase MFLPVIMAGGSGSRLWPLSRSAYPKQYLPLTSDSTMLQETVLRLKGAQHRAPMVICNEDSRFMVAEQLRAINALQSPVILEPVGRNTAPAIALAALQAVADGDDPLLLVLAADHVIKNQQAFINAIAQAEKLAEQNAMVTFGIVPTHAETGYGYIKRGASQDDAYKVDAFVEKPNLETATEYLNSGEYYWNSGMFMFKASRYLSELEKYQPEILAACKKAIGNTSADLDFVRVDKAAFEACPDDSIDYAVMEKTDSAVVVPLDAGWNDVGSWSALWEVNDKDENGNAVRGDFIGENSKNCLVYGSVEGRLVATVGVEDLVIVDTKDAVMVAHKDKVQDVKTIVNKLKAEGRSESKFHREVYRPWGKYDSIDNGARYQVKRITVKPGAKLSVQMHHHRAEHWIVVSGTAKVTNGDKELLLTENQSTYIPVGVIHALENPGKVPLELIEVQSGSYLGEDDIVRFEDRYGRV >NZ_CP041660.1|WP_143870051.1|611878_612736_-|carboxylating-nicotinate-nucleotide-diphosphorylase MDSQLLQNTQKIVAQALFEDLNGDDANNDITAQLIPAEQVISANVICREEAVFCGKGWADETFKQLGATVDINWHCQDGDRLSENQLICTLHGPARAILTGERTALNFIQTLSATATATSIYADKIAHTNTRLLDTRKTIPCLRVAQKYAVACGGGVNHRVGLYDAFLIKENHIMAAGSIANAVTQAHKIAPGKKVEVEVENNDELKQALDAGADIVMLDNYSPAEIQSAVAVNKAHANTAKIEVSGDITIDTIVDYAQDGVDFISSGALTKHVRAIDLSLRVSG >NZ_CP041660.1|WP_143870050.1|610224_611637_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MEYPNIQHHGAVDGVTGSCHRLCVSEQQHILIDCGLFQGAETSGKANQLIPEIDFPTEHIKGLIVTHCHIDHVGRIPWLIAAGFTGPIYCTPATAQLLPLVLEDAIKIGITKKKPFIEALLKRIKSQINAKPYKRWFNASGVQNVKIKFQPAGHILGSAYVEIEHQPTAHKYVFSGDLGAPHTPLLPAPRSPYRADTLVIESTYGDKKHTGRRQRRKQLQQVIEKCLQDRGAVLIPAFSIGRTQELLYEIEDIISRSKNNGLTNRNIWHSMQVILDSPLAAKFTEHYKSLSKLWDAEAQQKIVRHRHPLDFDDLYTIDSHEEHLNAINYIQKTATPCIIIAASGMCSGGRICNYLKALLPDKRTDVLFVGYQAKGTPGRDIQKYGPKGGYVVIDGEKIDIKAGVHTLSGYSAHADQKDLLNFVKRMRIKPKHIKIVHGDDDAKLALKKEYERILPEAKIEIASSESGSSL >NZ_CP041660.1|WP_143870049.1|609354_610218_+|DNA-ligase MRKPRIGIKFALTIITFSIFFTLFILNPKAHADPRSLLLAEVYSPEIDITDYYVSEKFDGIRAYWDGEKLWTRNGNSINAPKSFTQGFPNIPLDGELWLKRNAFAQTLSIIKTGTEQNWAKISYQVFDLPSEQGTFNQRLIKMRTLEQQTNAPQLKWVKQFKVPSHAELKKTLEEYIAQGAEGLMLHHQNSYYQGKRSSDLLKVKKYLDADATVIAYQAGKGKFKGQMGALIVKTPKGQTFKIGTGFTNQERANPPPIGSLISYKYLGFTKNGLPRFAVFLKVKEED >NZ_CP041660.1|WP_143872836.1|608336_608816_+|TIGR02281-family-clan-AA-aspartic-protease MSYAAWIIAFFLLTYFFEGYLNKKENPNQNPESYYTNQGAIEVKLERNQHGHYVTNGKINQQIVTFLLDTGATNVSVPENIAKRLNLPYGPSQRVGTANGSINVYQTRIDVLEIGDIKLRNVAANINPYMQGEQILLGMSVLKRIEFTQRGSTLTLKQY >NZ_CP041660.1|WP_143870057.1|619409_621614_-|YjbH-domain-containing-protein MMTVRYLSLNNLCNLTSATSVFKLAVLCLPFAFNSWADESASTSTSSNASSSPYVTPSLQGFGGYFNTPSAYSFGGGQGVFMYSNQTERLGSYRTTPNFHFAAGLWDNLEVSGRNAAYEDTTSKSSDLSANIKFALPYIPENWFKLAVGIQDLGGAANHFDSKYVVLSRYFADYNFDASVGVGQSESRLGRLDGTFAAVKWQPYDWGAVLLEHDAISTNYGIELSTPKNWLGGHTRFFAKAMLGASEDALSDETYWGIGLNTNLYQARADIEPARIKYVAEPDYVKNNTANQDAFLLIRQALRARGFTDFKIGTAGYQADSQKQHLVIAVENNLYSGNHIDTFAVVLSIVSKMSPESVEHFTVQILQSGIQVDAVSGNLNDYRAFLQGADLKLAEQPNNAGDSVNWLKEDSSFFIKPKLTFYPHLVTTVGTELGMLDYSLAWATHLELPIPLWPGLTATAFHLKQLRETEDFRDGKFFAGSRQQTGIHNLMLHQTFELPFNTKLMLNYGEFSQDYRLSAVEAGWQSDNGQHHLFYYYGQYNHTGEKELGYDQACVKDPSKPLYDCYGVLPQYNDKTISVAKYRYYSPWLNTSFFTKYGKFWSGDEGLHLLVSRHFDDVEVNLQFKATKNADEGLMQGFVYEDEYQKTIGLGFTVALGPRKDFNSRYINIRGRADWSYIVNTLVGEEHNGLTYGLASEARTFYHLDNHFNNFGRKGLSYLYKHQDRLRAAYFELR >NZ_CP041660.1|WP_143870058.1|621902_622985_-|UDP-N-acetylglucosamine--undecaprenyl-phosphate-N-acetylglucosaminephosphotransferase MEIIAAIAISFASVFILQPFAEKIGLVDKPNARKLHKGSIPLIGGIAFYIATLTACLVAFPGDKLITLFLISSAFVVFLGVLDDYHNLSVRSRIVSQILIASIMVYGAGKYIHNLGDLVGLGVIDIGIAGTILTFIAVIGAINAFNMTDGIDGLAGSLALNTFASIGILFYLTEQGSLLALPVILVCAIIPYLAFNLSLVPGPVKKIFMGDAGSMFIGLSVIWLLTLGTQSDAPAFRTVTALWIIGIPLMDMAAIIYRRVRKGQSAFLPDRDHLHHIFLRAGFSSRQSLAIIFSLSLLYSGFGIAGEIYQLPEWFMFVSFLAVFVLYCYALMHVWKLVRFVRRATVKRLRKKQARLASAK >NZ_CP041660.1|WP_143870059.1|623169_623619_-|GDP-mannose-mannosyl-hydrolase MFLAKATFKTLVASAPLISIDIIVENDKQEILLGKRLNKPAQGYWFVPGGRVYKNESLESAFQRIAESELGSPLAIAKADFMNVYQHFYKDSFVDEHVSTHYVVLAYKVKSNLESLVLNSQHESYKWFSVEEALNSDLVHNYTKDYLNF >NZ_CP041660.1|WP_143870060.1|623621_624581_-|NAD-dependent-epimerase/dehydratase-family-protein MKKIFVAGHKGMVGSAIVRQLENQPDIEIIVRDRSELNLLDQAAVAEFFKTENIDQVYLAAAKVGGIIANNTYPAEFIYENLMMECNIVHSAHLAGVNDLLFLGSSCIYPKLAEQPMKEEALLTGTLEPTNEPYAIAKIAGIKLCESYNRQYGRNFRSAMPTNLYGENDNFHPENSHVIPALIRRFHEAKLNNASEVIAWGSGKPMREFLHVDDMAAACIHIMNLDDETYQANTQPMLSHINVGTGVDCTIRELVETVAKVVGFEGEIKFDATKPDGAPRKLMDSSRLEALGWKYTISLEDGLAQTYQWFLNNQNKFRG >NZ_CP041660.1|WP_143870061.1|624606_625359_-|glycosyltransferase MSLKVSIITATYNSANTVVDAIKSVNNQTYQNIEHIIIDGASKDNTVEVVKEVGERVGILVSEPDKGIYDALNKGINVATGDVIGFMHSDDIFSDENAVQNIVDAFEKSLADSVYADLDYVQKEDTSKVVRKWVSGDFKFEKLKSGWMPPHPTFYMRREKYQALGGFNLGYKIAADYDSILRYLWKGQVTTHYIPKVLVKMRVGGASNRSLKNIIRKSKEDKLALKTNGLPWLRALTFKNLSKIPQFLKK >NZ_CP041660.1|WP_143870062.1|625480_626599_-|GDP-mannose-4,6-dehydratase MKKALITGVTGQDGSYLAEFLLEKGYEVHGIKRRASLFNTERVDHIYQDPHESNPKFFLHYGDLTDSSNLTRILKEVQPDEVYNLGAQSHVAVSFECPEYTADVDAIGTLRLLEAIRFLGLEKKTKFYQASTSELYGEVQEIPQKETTPFHPRSPYAVAKMYAYWIAVNYRESYGMYACNGILFNHESPRRGETFVTRKITRGIANIAQGLEKCLYLGNMDALRDWGHAKDYVRMQWMMLQQDKPEDFVIATGKQISVREFVKLSAQNAGIEVEFSGEGVDEIATVAAITDAEKAPALNIGDVIVKVDPKYFRPAEVETLLGDPSKAKAKLGWVPEITVEEMCAEMVAHDLDKAKQHALLKSHGHSVSVSVE >NZ_CP041660.1|WP_143870063.1|626595_627579_-|NAD-dependent-epimerase/dehydratase-family-protein MSFKKVLVTGGSGFIGTNVVQYLMSKSDHFQVLSLDIEPPKNIAAVTVHKQVDLRNRSETFSAINEFKPDVVIHMAARTDLDGVSLDDYDSNTLGVKTLCEAIIECGTVSKFLVFSSMLVCGIGYYPKDDDDYSPTTIYGHSKVETELITKSFLQELPQTYIVRPTSIWGPWFGVPYRNFFDVVLAGKYFNPGIKSIKKTYGFIDNALTQVFNLVDSDGYETGKIFYLGDKKPINIVEWANIISRKAGKKAPFTMPKILCLGLAKFGDFLKIFGMHFPLTSFRLKNMTTENIIPANYLAPIDEEEVVSLEEGVSQTLNWINKGKDLK >NZ_CP041660.1|WP_143870064.1|627619_628711_-|glycosyltransferase MSKVIVLHDFDGSLYFKALESVAEVQYFNIQPFRFLVRDIVKHRKMQKSTVNSLLFILSMFFKRNATVIIGTAPFNFRFLIYAFILSGKNKVYLHTSWPYWVESPPVRYPSFLNKLAKKLWIKSLPKLNGVIAVTKATKNSVMNFLESNQCKVPYAVTQIYHVVDISKISDKLFSDKWQKPENVTFLGRLEAEKGISEFLELSKNFSERETLKFQVIGKGSLEKKVVHWAGSSGNNVYHGFISSRGKIKELLAKTNVLVLPSKRIPGWEELFGLVIIEAMSQGVIVLTTDHIGPKEIIENGYDSFFCPEERFITFASTILDQLSEQPVKYSQIAQKAIVKSQAFNMAAIGREWKEFLKVNKLD >NZ_CP041660.1|WP_143870065.1|628707_629748_-|glycosyltransferase MTTNKIALDCRLVSRNATGISRFSLKYTDFIIEKFGEKNIVLIVNEPIQGYEHIEQCLTDFKPFNFYHWLRFHKLVAKLKPTHYISFHYSGLSKKLSNIKTVVTVHDLMYELVPTFFGSKFISFLGRLYYRPIVSRSLKNSDLILTISETSKKDIKSIFNLDSVNTSEGVFLNAPEVESFLDSIGLVSKSYFLYAGNGRPHKNIEQLKRVFLKYRQSNQEACLVIVGHKGDSQGGIVYPGHVSDGELVNLYTNAKAFVFPSLYEGFGLPIVESLNYNTPVIASDIPAFREFQHNNIYYFDLNNDESLLRLLGSELSFDHATKHNILKQYDWDVIKQKLYKALEGLF >NZ_CP041660.1|WP_143870066.1|629734_630883_-|glycosyltransferase MKVFFIDESKIFGGHEIIFLGYLKGVLSTTSFHVRMLIDKDNLKLREALIQLEKDFVNFNFVELSFSKLKVRPLTNFLCIKDFFSIRQTIKHFSPDICVVVQGTIEIGSLSLLVSRFSGIKTLSYLPITKKSKDIGVFLGGIRDRINKAIYYKLPHEIITISKFNQQELLNNFDVPLSKSAIVYNFTDVIPSSEYPQKRGNDFNFAIIGRVDNLQKRQYDFFKEVLKHKIASNLFFHVIGDNESEESNELRHLCHDSERVIFHGWCSSDEVETLLDRMDGVIIPSNFEGVPLVMIDAINKNKIVIASAIDGMLECLPREFLFEKGDYRGALALLHDITGNPNLYFTLVEHCKKQFAVFNKEKNLQAFIKRINFHLGIMDDYK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP041660_3 | 844627-844773 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041660_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041660_3
>3.1|844675|51|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder AAAAGCTACAAGCTACAAGTTTCAAGTTTCAAGTTTCAAGTTTTAAGTTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041660_3
The CRISPR arrays of NZ_CP041660_3 >merge|NZ_CP041660|3|844627-844773|CRISPRCasFinder AAGTTTCGCCAGCATTGTAGGTCGTGGCTTTAGCCCGACAATCAGGCAAAAAGCTACAAGCTACAAGTTTCAAGTTTCAAGTTTCAAGTTTTAAGTTTTAAGTTTCGCCAACATTGTAGGTCGTGGCTTTAGCCCGACAATCAGGCA >NZ_CP041660|3|3|844627-844773|CRISPRCasFinder AAGTTTCGCCAGCATTGTAGGTCGTGGCTTTAGCCCGACAATCAGGCA AAAAGCTACAAGCTACAAGTTTCAAGTTTCAAGTTTCAAGTTTTAAGTTTT AAGTTTCGCCAACATTGTAGGTCGTGGCTTTAGCCCGACAATCAGGCA
>NZ_CP041660.1|WP_143870222.1|843345_844518_-|NAD(P)-binding-protein MNIGILGGGIGGLSSAIALKQRGFKVDVYERHAGPSEIGAGIVCWPNASFVLEQLGVLPQVAKVAGLISFMKRYSSEGEALGSMDIRKLNNLMAYPSYSILRKDLMRILTQRAYELGILIHYQHNVQSLSENITEHKQNTAVHFTNGRTIHPDVIIGADGRMNSMARLFVTGDHKPVFQKFINWIGVFESDSEIFQDKAVSDYWGVGQRFGVVPISKSKAYWAAGVVAEEIDDIKVDTFKPDLTNLFRGWPDPIFKIITQTPLASIGKIYVHDHDPINNWHKGNVLLLGDSAHAPLPTSGQGACQALEDAWHLARYLEEYSEELNLALSKFTAARMTKTQGITMAGRQLAASIFNEDKAYCQERNIRSKDTDYGLVVSGMAKNWSFGLPI >NZ_CP041660.1|WP_143870221.1|841233_843066_-|cyclic-nucleotide-binding-protein MKTTTHNNYLAYCISGILAACGASQVNAAEVAITNPGFESSWDGWNDTDPSAISGDAYTGNRSAKMTGSSGRAEQSVSVSTNTQYRLTAYIKGSGEIGAVAGGTTYSQSGGDSSWQQVSVEFNSGSNTSVTLFAQYNGGEGRFDEFKLESISTPTPTPTPTPTPSGVDCSGSSDLTIVDASDDGTHDGHGPDNTIDDDLSDGSRWSSNGSGKSITYDLGVLSKVKDIQLAWFKGNTRVSYFDIDTSANNNDWTSVLVNEQSSGSSAGFETYNFADTDARYVRVTGYGNSSNTWNSIIEANIRGCTDGNTPTPTPTPTPTPTPTPAGDLDPNLPPSGNFDLLDWTLGVPVDDNNDGKSDTIKENQLSSGYEHSQWFYTAADGGMVFRAPIDAPKTSTNTSYTRSELREMLRRGDTSISTQGVNGNNWVFSSYSSSDRNAAGGVDGELTATLKVDHVTSSGSSSQVGRVIIGQIHAKDDEPARLYYRLLPGHTKGSIYLAHEPGNGNSEQWYNMIGDRSSSASEPSDGIELGEVFSYSIKVTGNTLTVTIYRDGKSDVVQTVDMSNSGYHDGSDQYMYFKAGVYNQNNTGDGDDYVQATFYSLDNTHNGYNY >NZ_CP041660.1|WP_143870220.1|839143_841084_+|glycoside-hydrolase-family-97-protein MFKHTLTLLGATLITACSQSPNLTLQSPDHAIQVKLEFDENQQLFYSVYRNNVEVIESSELGLVFKDRVFASNLTLSEQSDVSKIIDTYQLYSAKVKNVAYQANEQTFTLQNENQQKLNIRFRVSNDGVAFQYQVLASQEDNADQQIELLDELTEFDFNMQTRAWLQPVAKAQTGWSNTNPSYEEHYLMDIAVDTPSPTGAGWVFPALFKSANTWVAISEAGIQAQHNAARLSSESPNGQYEIDKPMDAEVFTDGKLMSNGGLPFQTAWRIIALGDLKTVSESTLGTDLAEPNKIQNTDFIKPGIASWSWGLLKDDFTIFSVQKEFVDHAADMKWQYTLVDADWDQKIGNEKMQELTDYAASKGIGVLVWYNSSGEWNTTPYTPKHALLTQKQRRAEFKKLNEMGIKGVKIDFFAGDGQSMMQYYIDILQDAADYELLVNFHGATLPRGLNRTYPNLMTSEAVHGFEMITFSQKSADLAASHSAMLPFSRNLFDPMDFTPTTFNDIPNIERKTTNAFELAQSVLFVSGIQHIVETPAGMKNTPYYVKQVLQEIPASWDESVFVEGFPGKLAVFARRTDKQWYIAGINGEQKTKTLTLDLSQFTGKNAFIIKTGEGQANMVRSPIKLTDDTKVSLLANDGFLIQVKE >NZ_CP041660.1|WP_143870219.1|837882_839043_+|galactose-1-epimerase MFNSPIKKIKLLAVLTTVLAGCNTISEQQNNTDNKQLKPIKSQYYATLPNGEVVTEYTLTNPTGIEVSIISYGGIITSLKTPDRNGKLADIVLGYDSIDGYLTDSNFFGALIGRYGNRINKGQFTIDGIQYQLDTNDGENHLHGGDVGYDSKNWFVTPYVDGADVGLKMQLFSPDGDAGYPGNLTVQVDYRLAGNELKIDYKATTDKKTHVNLTQHSYFNLAGEGDILDHQLMIPAEYITPVNSSLIPTGDFMPVKGTPFDFRTATPIGQGINQKNQQLEYGLGYDHNWVLTTENNFEYKLAARLSEEKSGRVLEIYSEEPGIQFYSGNFLNGSAKGKGRTFEYRNGLCLEPQHFPDAPNQSRFQSTLLNPGEVYHTRMSYKFTTE >NZ_CP041660.1|WP_143870218.1|836956_837850_+|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MRNLYWKKWCLVFMSLVLTSQPCFALAEKLTIRHNKVEGIGAKEEYQFGLLKLALDYDAQNTYQYQPASRFLPQVTMMEQLKAGEIEVAWTGTSKELETELLPIRIPLYKGLLGHRIFIIREGNQAKFDAVDTFSDLQRLTAAQERTWADTKILRSAGIPVIGTRRYENLFYMLEGGRYDYFPRGVHEPWSEIAARPELPLTVEKHILLKYPMPAYFFVRKDNFNLANKIEAGLRQAIRDGSFDDYFFSNPMIKDVIEKAHLTERVMFEIDNPNIPDATPFEDPSLWLDINNLPLSK >NZ_CP041660.1|WP_143870217.1|832870_836338_-|family-43-glycosylhydrolase MKFKLTVLAGIVALSGCTESGEDKKDLPTTTLPNNSDYIAADPTASISDSSAYNDFAVHDPSVIKADGAYYVFGSHFGVAKTTNLMTWEAATRAPFDDYETEAAEGIAWSDGFVGNWAANVIQAPNGKFWFYYNHCAFDNPNTEERDEVCWHRSYMGLAEADSIEGPYVNKGLFLRTGHTDEEIQGDFPVYDPATGENLDSYNPAVHPNGIDPTAFYDKDGNLWMIYGSYSGGIYILAMDETSGMPEPDQGFGKHLVGGDFNAIEGSFMMYSPESDYYYLFWSYAGFAADGGYNIRVARAKTPDGPFLDAAGNDMVNARTANNMGNKLMGSHLWTSSYGDPSAQYGYNAPGHNSALYDAELGKHLLFTHTRFPQEEGRFENIEAHSIRIHEMWINSDGWLVASPHRYAPIEGENIADPEDIAGDYRLILQGNDSNNDEHESVYVTLTNQGRYIQGQVSGSYRLYPSEGGRVSLTIDDVTYKGHAKWQWNVEDQRLEVVISAMSSAGESVFAAQLPEKSVSQIVDDISLAIDQTFANPVTPGELLPVTKDLNFSTEGARGATISWSTSHPRFVSSTGKVTRPNVDEGDTVVTLTANVELKGQTATITKDVKLIARSTYNRTAHYSFDSSLTDGLMNFDNAIAIGANLTKPESADVEPVNADIGSETFVEGQVGQAVNLDGSYGILLPNNIIASDQYTVSFWMNERADMQFSPALFVGHTADPFERWISFLPSSWDANLMVWARHDEDDGAFPWFDAVTGVAYPDQEWHHVAYAYNQGSVEVFFNGESVGTGSGLEDFFTNKPASTTISLGVNYWNLPLNAYIDEFKVYDDALSAAEIKALDVDILPADQLLSIAEQDLDLGNLNSVIDNLILPHTGPFASALSWSSSDDSVINPQTGEVTRPERGQADVEVTLTATITLDGQSTTKEFVANVISKTPPAPVARFSFEDNVEDTTGNFAAGEAADKTETTPLITPSNQTLTYAPGVVGSALDFKGDEGPGVKLPNGLIQDYSYTISLWLNPTVKTQFTTAFFGYAASNSWVSLVPFGPGAGDTMLWSGEAWFDGTIGSQIPAGEWSHVVLVVNEGVFNAYLNGELVNTLNGFPDVFTPAGANSKFALATNLFPVDANYNGLMDELVIYDDPISVDDVQALYSERSAQ >NZ_CP041660.1|WP_143870216.1|829817_832733_-|TonB-dependent-receptor MFKPSLVSSAIATALFAFSHNAIAQEAQETEVDNDVEVIQVSGIRASMIKAVDLKREEIQVVDSIVAEDIGKFPDNNVVEALQRVPGIQVTDRASGEVNAVSIRGLSDVTTTINGRQIFISTGRGYTLADTPAALIAGVDVYKTRSASQVETGIAGQIDVHTQRPFNFDGFKLVAAARGIYQDQAKEFDPNVSLMLSNRWQSSIGEFGALVNVAYAETNWRDMNITSGAAVPFAGPEPQSPNLQPFQRINGGWQAGLLEGLPFAEGSTLTIDGVEEEYFLARDAVFASDFTGKRERPAANISLQFRPNDQSEYLFEAFYNGYRAQSFNSLFFTFVDSNADTNFNDDFKVFEGTNIIKERTVYGAGGFNSGDAGIGKTDSYVYALGGKWEITPDFKLESEIVMQNSTFESEFFATRWNPRFENSNGDWTPGYYGVEVDFNNGNGIPSLAFLDNPATERDDSVLTNPETYTMGTAWDSGGKDEGSSVTFTLDGQVYTDFAGITEVNFGVRYDVRKADGYGRGARAECADNEDLGFYCNDINGTDPDLAYYSSDFFDDRADFPTDWVIGDGNHLFAEREFYRDAYGFNGYPEGGLKLYDGGVPTVFTLEMFHGMSAEETSASVYTEAKFLYETNIGDIDGSFGLRYSDVKTDTLFRQRCRDPQVSPTADNAMDAETIVNCEGEGLHESSKLLPSAIVRYTFLDDWLMRFAYTETIRRPDFGAFNPLRSYSPDVTNVGYGTAWQGNPDLQPVESVNMDFSLEYYFGEGNALYATIFSRDIEGLIVDTTRSISLEGAEYPFVLAQPNNAGSAKLEGVELGLVYFPENLPGVLDGFGVQASYTALESSQTNPLFNSDGTFAGYEESEMFGISPDSFSFVLAYEKDDFSSRLSYVKREAFMHRYEARLFANPLPVWRRPETSVDFQVSYDVTEALTVTFDATNLTNELYQEYYQYDDIYNFYTGNYSRTFALGLRYSL >NZ_CP041660.1|WP_143870215.1|828079_829561_-|aldehyde-dehydrogenase-family-protein MSTIDWSVQADTFKPEVRSLINGQHFDADGELYKKTSPIDLRSLSDIAILNEKEVNIAVNAARKAYNSRCWAGLPLTKRKEILFKFSDLINQHVGTLALLDCLEMGKSIHNLMYDDIPTGAASIRWFAEALDKVYDHCAPARDGALGTITSEPLGVVGAIIPWNYPMIMLAWKIAPALAMGNSVVLKPAEQSTYSAIKVAELALEAGIPPGVFNVVTGDGRTGQALASHMDVDGIFFTGSTEVGKLIMQYAAQSNLKKVALECGGKSPFIVLNSSKQLEYAAQSMARHVYFNQGQICSAASRLIIQAECEAEFLALLKQQINQYQPANPLLTDTRVGAMVSHQQLDKVVNYVEMAVQSGAEVFAGGKAVEPVKNGAFYQPTILTGVRNDMPIAQEEIFGPVVSVIRVKDTAEAVQVANQTKYGLAAAVWTDDFNTAHQVASQLRAGTVHVNAYGEDDATVPFGGMKQSGLGKDKSIWSLQQYAEMKTTWFRYS >NZ_CP041660.1|WP_143870214.1|827235_827997_+|IS5-family-transposase MPRTMLTDKAWLKLKLLMEETGRVYNKFEHRNTLEGILYRMRTGIPWRDLPSDFGDWSTVYRRFNLWSKKGILDNIFKVLAYITDSEWLFIDGTIVRAHQHSSGAQSQNDESIGKSRGGLSTKIHLAVDSYGYPVHFELTGGQRNDFIMAEALIRNSPKSDYVVADKGYDSQSIRDFVTEQANSKAVIPRRKDNTKKNKDMDWCLYKYRHLVENAFARIKHFRAISTKYDKLERNYASMVSLAFAIMWLPMHY >NZ_CP041660.1|WP_143870213.1|825994_826795_-|PAS-domain-containing-protein MALGHELKNKAIIAAIDKSMGIVEFNMDGTIDDANLNFLNIVGYSLEELKGKHHRVLCEPEYAASEEYKAFWHELNQGQFRSGEYKRISKNGMAVYLQATYNPVFDENGQVIKVFKIAVDVSDKKRLELERAKQEAMLMELSTPVMKIWDKMLLLPIIGVVDSRRVQLIMEISLQNIMEFQAKIMILDIQGVPAVDSAVANHLIKVAKAAKLMGCTCIITGISPAISQALVNLGIELGDIVTQPSLKEGMNAALVSMGMEIGQSSK >NZ_CP041660.1|WP_143870223.1|844932_846369_-|sugar-porter-family-MFS-transporter MEGIANNQTNTNYGGENTLLILIVSCIATIGGFLFGFDSGVINGTVEGLQVAFNSDSAGTGFNVASMLLGCAIGAALAGRMADLYGRKTMLIISSIMFIVSAWGSGIATSSEEFIVYRVIGGIAVGAASVMTPAYISEVALARYRGRLTTIQQVAIISGLTGAFLSNYMLAEISGSALNTLWMGYDTWRWMFWVELIPASIFLFALFFIPESPRFLVAKNKTQKARSVLVRLYGQEQGQQKYLEIEKSLDQGNKHQPKISDLIDKTTKKVRPIIWIGIGLAVFQQFVGINVVFYYGAVLWQSVGFSESDSLFINVLSGSLSIGACIVAILLVDKLGRKPLLWFGSLGMAVSLAVAAYAFSTASLDANGALSLSEDMGTLALIFANLYVIFFNASWGPIMWVMLGEMFPNQIRGLGLAIAGFFQWVANFAITMTFPILLGSVGLAFAYGFYALCAVISAYFVYKYVYETKGKELEEMQG >NZ_CP041660.1|WP_143870224.1|846539_847712_+|substrate-binding-domain-containing-protein MRKVKKVAVLFNANKGYDRKIIKGISRYTREAAHWHICVEDDLVTRLDNLKSWQGDGIIADFDDPAIAEFVMNKGLPCVAVGSSYRDKTNYPKNIHYVATNNDEIAKIGAEHLFKLGFKQLAFYTGIVNKSCLWAGERAEAFIQHAKTISGRSSSIYTYQPQSQVLDRVENLNNLAEWIATLPKPIAIMAPSDMRAWQIFEACHQIDVSIPEEVAILGVDGDDLILDITGNQLSTVMQGSEHMGYLASSILNQIMSGVPPEEKLHIVDPIGLQVCHSTDVEVIADELVRRALSYIKANAAKGIKVVHVLNHLNVSRANLDKRFRKELNSTVHDFIFEEQLNLVADYLLNSKMTLAQIAESVGYKSPQYMMMVFKSRYDMTPSEFRKKHSS >NZ_CP041660.1|WP_143870225.1|847801_850387_-|glycoside-hydrolase-family-3-protein MKKLSFTPRSLVLTAFIASLSACSQQSEDKKATGQEQKTVEHQAENAQVTWPYANKNLKRDEKVEQKVAELLAGMTLEQKVAQMIQPEIGYLTLEQMRKYGFGSYLNGGNTAPYGNKTAAPQEWLKYADEMYEASVDDSVDGSRIPAIWGTDAMHGHSNVSGTTLFPHNIGLGAARNPELMQKIGDATAKEVAVTGIEWSFAPTVAVVRDDRWGRTYESYSEDPEVVASYAGEVVKGIQGEIGVDFLKGYRRIATAKHFVGDGGTLNGIDRGDTIASEDDLRDIHAAGYFTAIEAGVQSVMASFNSWKGVRLHGHKYLLTDVLKGQMGFDGFVVSDWNAHKFVDGCTLEHCAAAINAGVDILMVPEHYEAFYHNTVAQVKSGEIPMSRIDDAVSRFLRAKVRWGLFERGKPSERVLSNELSVFGAKAHRELARQAVRESLVLLKNNDQILPLNPKQNILVAGDAAHNMAKQAGGWSVSWQGTDNTNEDFPGATTIYQGLADAVKQAGGQITLSETGDYKTKPDVAVVVIGEKPYAEWFGDIQYIEYQKETKKDLKLLHKLKAQGIPVVTVFISGRPLWVNKELNASDAFVAAWLPGSEGQGVADVLLRKVSGEINYDFKGKLSFSWPKYDNQLVLNRHDENYDPLFAYGFGLRYQDDVNLAQLDISSRVKSQSDTDLGYALFYRQLAEGLNWTLGDMQDWNVIINGPAGTTAGSDNLTVQGINLAYQEDARRFVWAGDSLAIASLSYTDAKDMSELIDAQTVLEFDLRLDSAPQSAATMGLFCTANSCAAEIDLTEFLVQQKAGHWVHVSVDISCLANAKQVNAVTTPWSLKTEGKLGLAVSNLTLLKGDVEASQLSVCDN >NZ_CP041660.1|WP_143870226.1|850903_851635_+|NUDIX-domain-containing-protein MTHTETLMAAEMDKEEQLPENVMPSISVDNLIFAMQNGRLKVLLVKYKEGLAADKWGLIGHWVQYDESLEEAAHRVVTSTTGVVNLYLDQLGAFGKVNRYPGRRIITVVYYSLVRFEEAELQQGDNTHEVAWFDIREVPELIFDHKEILNACLEHLKYKVRHEPIGFSLLPEKFTLLQLQEIYEAILDTKLDKPNFRRKIQKMNLLINCKEKQQAVAHRAATLYRFDINVYEKLKEFGFNFEF >NZ_CP041660.1|WP_143870227.1|851751_852522_-|ThuA-domain-containing-protein MKVQNIFKGLLLFALFVSNSIMAKQFKALVFTKTNGWHHESILDGVQAMRRLAERHHFDMEWHEDPSRLNAENLKQFDVIVFLSTTGDIFNAEQKRAIEAFIQSGKGFVGIHSASDTEHNWQWYTKLVGHTFYIHPEIQTARLKVENKFFPGLEHLPEQFLWTDEYYEFSEGLNENLNYILTVDENSYSTDAQWGELSAKGMGDFHPIAWYQQYDGGRSFYTALGHMPAAYQQEIFLNHLYGGVYWAATGKGMLNQ >NZ_CP041660.1|WP_143870228.1|852711_853647_+|hypothetical-protein MTKLTQLDCIWRNNRHNAFTDLIEFNGRFYCCFREATNHISPDGIIRILVSDDLKRWQLISSVRHISADLRDPKLIKHHSGKMLLSFYRKRFDKNGQNIANENCISFSLTGYSWSSAKIIGHNNWWMWRIRNDLGIAYNRKQNTVRLYQGDPLRAFHLVNDALFSLKNNAKGYPNESDVLKLPDGRTICILRRDADSFSAQLGISNISNHNWKWYDLGLYLGGPCMLQLENGRILVAARRFQRPRCLTTWLFELDINTKSIKPVLQLPSAGDNSYPAMLAHDNKLHVSYYSQHQENRYSYASAIYLAEVTL >NZ_CP041660.1|WP_143870229.1|853683_855852_-|glycogen-debranching-protein-GlgX MSRRNLKVLPGRPYPLGASWDGKGVNFALFSENADYVELCLFDASGKKETHKFKLAEKTDQVWHAYIPQLKPGQLYGYRVHGPYKPKKGLRFNPSKLLIDPYAKSIVGDIRWHDAVFPYQVGDVSNPDLDLIADTQDSAPYMPKCAVTDAQFDWQDDQKPDIPWHKTVIYELHVKGFTQLNPHIPPHLRGTYAGLAQPQVIRYLKSLGVTAVELLPVHYFLNDRHLVEKGLCNYWGYNSINYFTPDMRYAKSGKIEEFKEMIKAFHAAGLEVILDVVYNHTAEGNHLGPMLSFKGIDNPAYYRLVEDNERYYMDYTGTGNTLNMMTPKVLQLVMDSLRYWIEEMHIDGFRFDLASALARELHDVDKLGAFFDIIHQDPVISQVKLIAEPWDIGEGGYQVGNFPVGWTEWNGKYRDTIRSFWKGDEGQIGELAYRLTGSSDLYEHSGRRPYASINFITAHDGFTLHDLVSYNDKHNHDNGENNQDGDNHNLSWNMGSEGPTRSAKINALRQKQKRNFLATLLLSQGVPMITAGDEYCRTQNGNNNAYCQDNKISWFNWRETEEKNALLAFTKMLLALRKAHPIFHQRHFFQGHPVRGSEAKDISWISVDGMEMSEAEWASAETKCIGMHLHGQALKECDEKGKPLRDTDFVILLNAHDCAVEFAMPNSLGEEYTWRLVFDTALTETKRQDKRKKYQAGDVYYLQSRSFVLLSKNRKQSVGRPV >NZ_CP041660.1|WP_143870230.1|856109_856553_+|zinc-uptake-transcriptional-repressor-Zur 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You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041660_4 | 865592-865678 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041660_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041660_4
>4.1|865615|41|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder TTCGAGCTACCAGCTACAAGTTTCGCCAACATTGTAGGTCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041660_4
The CRISPR arrays of NZ_CP041660_4 >merge|NZ_CP041660|4|865592-865678|CRISPRCasFinder AGGCTTTAGCCCGACAATCAAGCTTCGAGCTACCAGCTACAAGTTTCGCCAACATTGTAGGTCGCGGCTTTAGCCCGACAATCAAGC >NZ_CP041660|4|4|865592-865678|CRISPRCasFinder AGGCTTTAGCCCGACAATCAAGC TTCGAGCTACCAGCTACAAGTTTCGCCAACATTGTAGGTCG CGGCTTTAGCCCGACAATCAAGC
>NZ_CP041660.1|WP_143870234.1|860552_863705_+|bifunctional-proline-dehydrogenase/L-glutamate-gamma-semialdehyde-dehydrogenase-PutA 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>NZ_CP041660.1|WP_143870233.1|859824_860430_+|TIGR04211-family-SH3-domain-containing-protein MKSRLFALALITLVPNFVFAQQTDKAYISDELTVFVHTGPTRNYRIVGTVVAGSQIEILAKSEDGSFSQIQYEDGKTGWIESQYVSQTASIQQQLKTLKSELAEKTESLSQLENELNTQKSEKMLIEGQLQRHTQSTQDLQNKLESAQKQLAVLQQQDVENQEKVKMDWLIKGGMLSLGSLIIGYILAMMPRRRKRSPDLF >NZ_CP041660.1|WP_143870232.1|858083_859613_-|CYTH-domain-containing-protein METEIELKFAVASSEEDEGEPILEQLQKLLTPILQNQGYSHKRLTNTYFDTAQQSLRALDAGLRVRTVDGESEQTLKTAGSSVGGLHKRPEYNIPTTANVPDLSLFPAEAWPDHVSIQDLQDALTPLFTTDFTRHKWRVLSQESLIEVVYDSGAVSAQENHTPIHEIEIELVDGDMRELFSLADILVDKLPLRLSNDSKAARGYRLFLNQPMQDKKSLGTVNLSADLDVETAFARAIEHGLAHWQHHEEIYCREGHIRSLKQLLRGIWLVRHTLWLFRDYVPKKASSEIRKELKWLNNEFEWLDGALHIKQLTSKKGNYRKRIGEDERLLNYLEQTFASTLKENATVPLFYSQRYNRVILKLMRWLTERGWRCYSEIDENLLSENIYSVATKLNQQSWVRIQKKMPSKEQFGMQDYIDVERSIGRGLLTGVCVGSLYNESDRMDFRSPWLDIMEGISDLKTLNLFLQCLDSYTEDNQQELQQWAENKITNLVKVMEQSRQSALKMVPYW >NZ_CP041660.1|WP_143870231.1|856562_858053_-|glycerol-kinase-GlpK 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>NZ_CP041660.1|WP_143870225.1|847801_850387_-|glycoside-hydrolase-family-3-protein MKKLSFTPRSLVLTAFIASLSACSQQSEDKKATGQEQKTVEHQAENAQVTWPYANKNLKRDEKVEQKVAELLAGMTLEQKVAQMIQPEIGYLTLEQMRKYGFGSYLNGGNTAPYGNKTAAPQEWLKYADEMYEASVDDSVDGSRIPAIWGTDAMHGHSNVSGTTLFPHNIGLGAARNPELMQKIGDATAKEVAVTGIEWSFAPTVAVVRDDRWGRTYESYSEDPEVVASYAGEVVKGIQGEIGVDFLKGYRRIATAKHFVGDGGTLNGIDRGDTIASEDDLRDIHAAGYFTAIEAGVQSVMASFNSWKGVRLHGHKYLLTDVLKGQMGFDGFVVSDWNAHKFVDGCTLEHCAAAINAGVDILMVPEHYEAFYHNTVAQVKSGEIPMSRIDDAVSRFLRAKVRWGLFERGKPSERVLSNELSVFGAKAHRELARQAVRESLVLLKNNDQILPLNPKQNILVAGDAAHNMAKQAGGWSVSWQGTDNTNEDFPGATTIYQGLADAVKQAGGQITLSETGDYKTKPDVAVVVIGEKPYAEWFGDIQYIEYQKETKKDLKLLHKLKAQGIPVVTVFISGRPLWVNKELNASDAFVAAWLPGSEGQGVADVLLRKVSGEINYDFKGKLSFSWPKYDNQLVLNRHDENYDPLFAYGFGLRYQDDVNLAQLDISSRVKSQSDTDLGYALFYRQLAEGLNWTLGDMQDWNVIINGPAGTTAGSDNLTVQGINLAYQEDARRFVWAGDSLAIASLSYTDAKDMSELIDAQTVLEFDLRLDSAPQSAATMGLFCTANSCAAEIDLTEFLVQQKAGHWVHVSVDISCLANAKQVNAVTTPWSLKTEGKLGLAVSNLTLLKGDVEASQLSVCDN 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>NZ_CP041660.1|WP_143870243.1|877460_878318_+|bifunctional-methylenetetrahydrofolate-dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate-cyclohydrolase-FolD MTAQIIDGKNIAQSVRANVKEAVDSRKAAGKRAPGLAVILVGADPASQVYVENKRRACEQVGFISKSYDMPANTTQEALLAKVEQLNNDDEIDGILVQLPLPEGLDSTLVIESIAPEKDVDGFHPYNIGRLVQRIPTLRPCTPYGIMTLIESTGKDPHGCEAVIVGASNIVGRPMSLELLLAGCTTTVTHRFTQDLESHVRRADILVVAVGKPEFIPGDWIKPGAIVIDVGINRMDSGKLVGDVEFAAASEKAAFITPVPGGVGPMTVATLIANTLQACEAREAI >NZ_CP041660.1|WP_143870244.1|878422_879157_-|redoxin-family-protein MLNNKEGQKVPSASFVVKTDDGFKTISSESIFDNRTVIVFSLPGAFTPTCSSTHLPRYNQLADVFKKQGVDEIVCLSVNDTFVMNAWAADQEAENITLIPDGNGEFTDKMGMLVDKADLGFGKRSWRYAMLVKNGVIEKMFIEPQVEGDPFEVSDADTMLNYICPDLEVPKSVSLFTKPGCPFCAKAKKLLTEKGFQYEEILLGEGIGLTSLKAVSGRDTVPQVFIDGQHIGGSDDLEAFFAQA |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041660_5 | 1187054-1187139 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041660_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041660_5
>5.1|1187082|30|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder GACTTACTTGAAACTTGTAGCTTGCTGCTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041660_5
The CRISPR arrays of NZ_CP041660_5 >merge|NZ_CP041660|5|1187054-1187139|CRISPRCasFinder TTTGTCGGCCTAAAGGCCCGACCTACACGACTTACTTGAAACTTGTAGCTTGCTGCTTTTTGTCGGCCTAAAGGCTCGACCTACAC >NZ_CP041660|5|5|1187054-1187139|CRISPRCasFinder TTTGTCGGCCTAAAGGCCCGACCTACAC GACTTACTTGAAACTTGTAGCTTGCTGCTT TTTGTCGGCCTAAAGGCTCGACCTACAC
>NZ_CP041660.1|WP_143870442.1|1186050_1186893_-|hypothetical-protein MKKKWVVLLFCLPLVTGCSLTFLYNNADWVASWYLDDYVDLTHEQSEIFEEKFDSWHQWHRTEQLPLYKTQVDALLAQIEMGIKPDVFKQHIDQVETHWRNLLFKITPELSEMLLMLSDRQKRELIDNLREKNTERREEWLAMDGTERYEQAWERRVEQNENWFGTLNKKQLKVLKMQGSEYENTFLMWLDYRDNWINAFENALFVKEKNIQREGLQKVLATPYLWRGDALQQALDVNRQKYSEHFVEMLDLLTTKQHKFFVAKLTDYQQDFLALHQKYD >NZ_CP041660.1|WP_143870441.1|1184544_1186038_+|guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate-diphosphatase MAEQNYPIYAAIDLGSNSFHMLIVRSVEGSVQTIGKIKRKVRLASGLQENGALEEAAIARGLDCLSLFAERLQDIPAKNVRIVGTAALRLATNSADFLERAESILNHRVDIISGEEEARLIYIGVAHTSGTSKTKLVIDIGGASTEMVAGERFTPKVVNSLNMGCVTYRKKFFKDDIINLRNFEMSINAAQVEMSGKMQPYMAFGWQACLGASGTPQAIQEILIAQGDSEMITLDKLLKLKETAIACGHIDNLNIVGLAEERRPVFVSGLAILIAIFQALHISYMVVAGGALREGIIYGMIPCLQQKDIRQRTLSSFIERYRLDKEHAYRVRDTALKLFDQLHVHWALEQHDSRAVLEAAAVLHEVGLTVDFKFAAKHAAYILSNTAIPGFSLAQRKLLIAIVHNYREDIDITQVKAQTMTSPILAGQLTRILRLSVILTMRRKDEVLPTVKLSSTGLDDLNLIFEANWLKSHPLMESELTQEQEYQRKAGWKFTFS >NZ_CP041660.1|WP_143872871.1|1183261_1184530_+|ATP-dependent-RNA-helicase-RhlB MTIQTHLSEVEFASLPMHAKVQQALKEANYKHCTPIQAQSLPIALKGGDVAGQAQTGTGKTMAFLVAVFNQLLSREAPQDRPASHIRAIILAPTRELVVQIHKDAALLAKHTGLKLALIYGGDGYQDQNEQLAAGADIVIGTTGRIIDYYKQGLINLSQIESVVLDEADRMFDLGFIKDIRFLFRRMPPASERLSMLYSATLSMRVQELAYEHMSSPTHVHIAPEQMTNTRITEELFYPANEDKMLLLLTLMEEEWPDKAIVFSNTKHGCEAVYQWLKADKHRVGLLTGDVPQKKRLSILQKFTDGQLDILVATDVAARGLHIPLVTHVFNYDLPDDCEDYVHRIGRTGRAGESGHAISFACEKYVYNLPAIEEYIGHSIAVTKYDSTQLLDDVKPPRPQAKRRMQHGRTENNRNYNKGRRN >NZ_CP041660.1|WP_143870440.1|1182824_1183154_-|thioredoxin-TrxA MSSDAILTLSDTSFESDVINAEKPVLVDFWAEWCGPCKMIAPILDEVATEYEGKVTVGKLNIDQNNASPAKYGVRGIPTLLLFKSGSVAATKVGALSKTQLKQWLDENL >NZ_CP041660.1|WP_143870439.1|1181371_1182640_-|transcription-termination-factor-Rho MNLTELKNKPINELVKLAESMGLDNMARLRKQDIIFAILKKHAKSGEDIFGDGVLEILQDGFGFLRSADSSFLAGPDDIYVSPSQIRRFNLRTGDSLAGKIRPPKEGERYFALLKINEVNFDKPENSRNKILFENLTPLHANERLRMERGNGSTEDITARVLDLASPIGKGQRALVVAPPKAGKTMLLQNIAQSISWNHPDCVLMVLLIDERPEEVTEMQRLVKGEVVASTFDEPASRHVQVAEMVIEKAKRLVEHKKDVVILLDSITRLARAYNTVIPSSGKVLTGGVDANALHKPKRFFGAARNVEEGGSLTIIATALIDTGSKMDEVIYEEFKGTGNSEIHLNRKIAEKRVFPAIDINRSGTRREELLTTTDELQKMWILRKIVHDMSEIDAMEFLIDKLGMTKTNDEFFDAMKRQKGS >NZ_CP041660.1|WP_143870438.1|1179237_1181196_-|hypothetical-protein MSLKFTYLQPIDRIKYFVERQLVKGAGYQLFVIVACIALVSLIGGMLLTPISTQEQSLADDIWWAFLRLTDPGYLGDDEGAWRRIVSTILTICGYVLFMGTLVAIMTRWLIAFMEKLEQGLTPVSVKDHIVLLGMSSRTVPIIRELLGVEANLNVHKKHYNGKMPTIILLAEEVNAIVHQQLLAEIALPHKLARQVILRSGKALQSEALHRVACLDASSVILTNQYQRTDSLVTTDVETIKSLLTINVLAQNTGHFPRLVVELDDVRHTKLAKKSYQGQANVVVTDETISRLMAQCAVAPNLLKVYTHLLNASSKGRFFLKEADEHQGKTVAEAKLFHSSAILVGYIDPQNQQFYLALGEHAKHKIVADDILVFIASNYNQLQSRQSPVRQLAYAKSEKGKTVATQHNNGRKKLLLLGWNRRVPNIIHELDDYQNESFDVTLVSTFSAQIRQQEIAKLGRFSNRINISLQEADYMMEAEIRQFKPEEQDIILLVYSDRLDSADEADARVLVGAMVLDEILDNYSKKPHVLIELSDPANENFLDQASTDTFITPLLMSHLLSQIALMPENQILFDTLTKADGIQIYLRSLKDYSDKEMLKSIDVAQLVEAHGEIFLGVFNGNSAEHPVQLNLPPEQRISTLANDLLIVIGNGL >NZ_CP041660.1|WP_143870437.1|1177539_1178349_-|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MPQLRKQNRIKTITGTLAIEGNTLTEEQITAIVEGKPVLGSVRELAEVKGAIAANDALPSFEPHAIDDLLTAHGLMADLARWLKDTKDPPLIASSVFHYEFEFIHPFADGNGRLGRLWQTLILSKWHPLFLSLPLESVIKEHQQDYYQALEQADQQADSTPFIHFMLSVINQTLAQNAPVNAPVNAPVNAPLNAPVKSRLDAKDKISELKTPDAILSLLAQTPDLTRQQLADIIGKDIRTIGRAITKLQREGKLARIGADKSGYWKVQP >NZ_CP041660.1|WP_143870436.1|1176464_1176836_-|hypothetical-protein MQDNAPHIGIFWLYKSTVVAKKTQLSQLLADHLAIYDSDFSHMTEWEDKLVFLPMFPELLGSEYQEIARGRIVYIEPKGVFRIYADKSIMQNANYRALVIDSFGLTGFNCLWLADPHYRVFKC >NZ_CP041660.1|WP_143870435.1|1175649_1176450_-|hypothetical-protein MNIFDVVNAKIIEFVSKSENENLQRGTGSYSVPFRGSLFNTINTVKLLTELQHQRVDVMWLGSNPNVPESLQTILDPSAPSHFAGFLEQQSNGNFSEAYADKDGDLQPCWNPINKPNYKWQFYSEILNKKFGEHTTLMANIVPWGSQNFNLFTSELRKLDAELLARALTFSCELNNLIVEYFKPKVILLPKSFITTAPKNWYLHSSKLTHIQHYVIKGKVAFKFSVGLADVGETKIKVVTAPHPSYIPRIGQAYREIAQQALFDVL >NZ_CP041660.1|WP_143872870.1|1175184_1175325_+|hypothetical-protein MGELCKRPNHCIGKRTIYRRSRNSDLVYQKPKQRCERLNSQRKGRH >NZ_CP041660.1|WP_143870443.1|1187285_1188215_+|hydroxymethylbilane-synthase MSKHLRIATRDSLLALWQAEYVQQKLQQAHPDLKVTLVKIKTKGDKILDTPLAKIGGKGLFVKELEVAMLSGDADIAVHSMKDVPMEFPEGLALSVICEREDPTDAFVSNHHATIDDLPKGAVVGTSSLRRQCQLLKHRPDLQVKWLRGNVQTRLRKLDEGQYDAIVLASAGLIRLKLEDRIRYRIPTEVMLPAVGQGAVGIECRAGDQATHNILSVLKDQDTTIRLTAERAFNTKLNGGCQVPIAGFAEFKGNELFFRGLVASVDGKKVFYTEKSGMIEEAQQIGEAAAQELLAAGAKTVLDEVYGQQ >NZ_CP041660.1|WP_143870444.1|1188192_1188984_+|uroporphyrinogen-III-synthase MRFMANNKTTVFHSRVADSAQELNHLLRAEHFLPLHCPIFELQKGSDLNLIDNDRFNSILLGSSSPLDTILIFTSQYAVEFLQHAIQHKKLLNPLLEMQCVAVGQTTAKKLVQAGFKNVLTPTAPTSEGILQLPVIQTSKQAILFKGEQGRDKLANAFRLANKPLTTYNVYKRQWVDLSETQLQQINRCDVFIFTSGEIAQHLYRLVVDKISPDFVHKLVLVPSERVAKQLTEYGFDQVINIGSASNHNIIAHLRKFKGSVLT >NZ_CP041660.1|WP_143870445.1|1188980_1190270_+|hypothetical-protein MTDKTDNTGKQTPESSVERAEQAQAQDKSAATEKKAEDAQNTEKAGQTDKTERTTDKEGATEKVVVEKNAKTPSQTTRSETVVVKEKGSKFSPLAFIAFLFALAALGACGWLYWQLEMQKNTFAKQQQSFTTQKSQLKSQLKQQSNELKQQQQAEQQNFSQQLNTQLNNQLSQFANEVEQKLQTQQQKMDKSIELINQSGEKARQQMLLTDIKNLINIASHKLFLQQDKQAALTALKMVQNRLAALSDSKFLAIKQSIAEDIGTLNALPSVNNQEIYYQLSELMGSLKKLPLNQAVMPTKTNSAEQTKPSSEISWDNLKLVWQDFLSLFRVQKRDTEIEPLLTPAQVQNIELNLLSKLNQAQWAALNAQSAVYQTALKQTAQWVSQYYDPTSPKVTLVIDRLILLANKQLVADYSQVTLNTPTLMDNTL >NZ_CP041660.1|WP_143870446.1|1190266_1191454_+|hypothetical-protein MIRILVLFILACALLAGGAVLVEEKGYVLIHVAGWSWEASFIGFLFIILVAYLVFKLIEKVLISLFSVRRSFSNWRKNRKQSTSLHALQQSIEALLSGQWQKAEQLSLKHAKYSPIASSHYLIAAEAAKNCGQHEESSLYLLRAQENGDESHKQLAMAQSLQQEGKTDKAIELTEKLYRENKKNTQTLLLLARLYETSEDFEKLRELLPDVKRYAEITDSELQLLALKAWQPIFTQAALDNSERTIEQAYKQLTKLVGTSGNARQNYFSALLAAGCHSTVEKKLIKLFDEDTHKNQTTINILKTLELNQPLKLIAWLEKKLKSNPQDDWLKIALAITAAKNRDWQLAQQAMESAIRQLPSAENYAILGDIYQENQQSEKAKQCYRKGLSLLLDAA >NZ_CP041660.1|WP_143870447.1|1191572_1193666_+|diguanylate-cyclase MNSVQQKRIIKMFNLSIKKSILDEHSKRLALKKNILSTNNSTIQYGVREELASALLSFVELQGGFYVLYDTNGVAILSSANLPPELSSVVNKMLNLNTQKKTINPVLRRHKSTSSQGFNISVDEVYYQDEMYLLLIGAPEKSLVVELYNAFPIGVIKTDAQLSLKYCNTHTYTLLGLGQDELQGNNWLNAFDDVSRERIFEFLSNEKNFEEKLRLITQVITPLGRTKVISVAIDQQYDLLGHLVSYYIMLQDITQEYKESSYLKHLATHDSLTQLHNRVSLLQEIETLYNTDKISSSALLFIDLDKFKYINDNLGHHIGDELLKIVGKRLLNTTRSSDIVARIGGDEFVVILTNVTNDIIALDRAQAIVEKLNRPCVIESHEINVHSSIGLTMGHIILTRHPKEKNADKIAELWLSASDSAMYQAKSNKVNDITLYTDELSNQLTSLLATQNAINDLETKKAFTSFFQPIYQGDKIYALEALTRFDSDALSDIESVFEQIREHKRGQTILYRIIQRNLLGYSLLMNENITDIPCLNINIDLHLMTNGNFANKFSNMLIDYNIPPNKVFIEITERDTSAHIDDNIYKNIAALKNIDVRMSLDDFGRGYSSIERLIKLGLDQVKIDKVFLSGDLTHQQKQSALMAAVNLGKALDLQLLLEGIENEHDQALAEQCGVPLRQGYFYNKPMPVEKIKKLLGK >NZ_CP041660.1|WP_143870448.1|1193675_1196198_+|chemotaxis-protein-CheR MSKNTKKPSHIVGIGASAGGLEALQALFLELPTDLDIAYVVIQHLSSDFKSMMAELLTKYTEMPIHQAVEGEEIQPNTVTLMPPGKLIRVVECKIYLSDLPPDNRVNLPINEFFRSLAEDLQNHAIGVILSGTGSDGSRGAQALKEVGAMVIAQAPDEAKFDGMPLNAINTGSVDFISNIDEMADQIRNFINHPLLSNHGKHFRYHLSENEDVLNQILDLVHEQTELDFKAYKESTVARRIEHRMSINNIKSLPEYYDYLIKNSKEIELIKQDLLIGVTQFFRDQEVWDFVYKKVIIPIVLSKTSEDPIRIWCACCSTGEEAFTIAMLFRAAMEELNVERAVKVFASDIDQSAVGFAANGVYPSSIATEIPSALFSPNFNQTADGNYQVSKELRSMVVFATHNLIQDPPFSNMDMVSCRNALIYLQNPAQQKAMAFFHFAIRLNGFLLLGSAETTGNFDSYFDAFDGRYRVYKKTKDIRIPVRAIANNGLKSKTYQPKALPQYIARNVKSLDSSRKVKIGYDALFEEFAPPTLIFNKKLALVYTYGDTSLFTKKIQAGLVTNDVADILEPDIVSHAISAAHQVLRENCSVLLQDTFKLPNEKGEQTPWSIKCFSFPDRDNDDEKLVALSFLSKETYVARRADAEYSLEQQVKNRVSELDYALIECQKLYRETLEDLDTTREELQSSNEELMAANEELQSTNEELQSVNEELYTVNSEYQQKILELTSINNDLENLLKATRLAVLFLDKDLRIRRFTDAVKDYLNVIEFDIDRKIFDLTFKFDFPGLNELISKVNETGKPNTKIYDITSDRHIEISISPYQLETYNNGVMVSIKERVMQSD >NZ_CP041660.1|WP_143870449.1|1196272_1197685_-|DASS-family-sodium-coupled-anion-symporter MKTETQSNFLMVLLAPLMATVTALLCAFVWQQPYIICATAAITMLTAVWWVTEALPIPVTSLIPFILFPMFGVLDHKVAASALGSHVILLLMGAFMLSKAMEKSGVHQRLALYLINLFGGNQPKKILFGLMISAAFLSMWISNTATTLMLLPMVLAIASNANDRRFGVVLLLGIAYAASVGGIGTLIGTPPNVIFAAVYQTHFAQEIGFLEWMKTSIPVVILAIPMMALWLGRGLNKSVEVQLPCVGQWRLSEKRVLYVFSLIVVLWIFRSEPFGGWSALLGNRTIGDSSIALFGVLLMFIVPSHNEVIEGQVQRKYLLDWQTATDIPWGMLLLFAGGICIAKAFQASGLSQLLGQSLTALTHWPTYLMILVVCLFVTFLTEITSNTATTTLLMPVLAAAGVAAGIDPKLLMIPAAMSASCAFMLPVATAPNAIVYGTDKFAIKTMVKEGVVLNMILAVTISGYVYYAIK >NZ_CP041660.1|WP_143870450.1|1197847_1198246_+|hypothetical-protein MIYAMFAMVMLTFLVGIITFKTRVNSVKKGEVSARYYKLMQGDEIPEAVIKTSRNFTNQFEIPVLFYVAASLFAALQIESDIALACAWIFVACRCAHAFIHLTYNHLLHRIIAFWAANFAVLSMWISLVSEI >NZ_CP041660.1|WP_143870451.1|1198298_1198865_+|PhnA-domain-protein MSIAEKVQQRSNGQCELCLAKENLALYQVTPDQGRAEDNHAMLCQTCLTQYTGEETTISAHWACLNDSMWSQVPAVQVLAWRMLKKLSAEAWAQDLLDMLYLDEETQAWAEAEIPQNDLEPTLDNNGTRLKAGDTVTLVKDLPVKGAGFTAKRGTVVRGISLCENPLHIEGKVNGVRVVLIADYLKKA >NZ_CP041660.1|WP_143870452.1|1198987_1199947_+|hypothetical-protein MKKGIIITAGAVCIVAGCVTFAQIKANEYAKTQLDSYLAKLKTQGVISQANYQTIDVSLFGSVELTNLALHSADLPESITLQKVTISDFDVQHDIPHSMKVRLEGVKLPINLQDEKFNHSGVFAEYVSNLGYTDQLPLTAEVQYQYDAQNAHTYTSSLDIGLTQLGNYHISATTKNIPLNVLMELTANKTPNQAQIASVLQTAALPNLAISFKDEGAVSTYINISAKETGMAQQKVKARVNEVLAMQADMLLPPQLDAFKVQLLAEIESFMDGNKTLKVSINPEHQGEVNKLQPEVIAALMKQDFANIIKLLKLEIKAS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041660_6 | 1210075-1210183 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041660_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041660_6
>6.1|1210104|51|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder TAAATCTTGTAACTTTCCACTCGCAGCTCGAAGCTCGAAGCTCATCGCTTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041660_6
The CRISPR arrays of NZ_CP041660_6 >merge|NZ_CP041660|6|1210075-1210183|CRISPRCasFinder AAATTGTCGGCCTAAAGGCGCGACCTACATAAATCTTGTAACTTTCCACTCGCAGCTCGAAGCTCGAAGCTCATCGCTTCAAATCGTCGGCCTAAAGGCGCGACCTACA >NZ_CP041660|6|6|1210075-1210183|CRISPRCasFinder AAATTGTCGGCCTAAAGGCGCGACCTACA TAAATCTTGTAACTTTCCACTCGCAGCTCGAAGCTCGAAGCTCATCGCTTC AAATCGTCGGCCTAAAGGCGCGACCTACA
>NZ_CP041660.1|WP_143870461.1|1208668_1210018_-|glutathione-disulfide-reductase MTQHFDFISIGGGSGGIASANRAAKLGKKAAVIEAKYVGGTCVNVGCVPKKAMWYAGQIADAMKYAADYGFDIEQKGLNWEKLVSNRQAYIERIHASYNRGFANNGVTLINGFAKFKDAHTVEVNGTLYTADHIVIATGGRPSIPNISGAELGITSDGFFELYEQPKSVAVIGAGYIAVELAGVMHALGSETHLVVRKDKPLRDFDDLMSDTLVDVMKEEGPKLHTHSTPKAIEKCSSGELIVQFENGQSLPPVECVIWAIGRAPAVDNINLEAAGVKLDEKGFIATDEYQNTNVQDIYAVGDNTGRIALTPVAVAAGRRLCERLFNGKSDLKLDYNNVATVVFSHPPIGTVGLTEIQAKEAFGEGAVKVYTSQFTALYQAMTQHRQPTKMKLVCVGPEEKIVGIHSIGFGSDELLQGFAVALKMGATKADFDNTVAIHPTSAEEFVTM >NZ_CP041660.1|WP_143870460.1|1207058_1208360_-|hypothetical-protein MIKFRLSQAVLIFLALSVCAVLINIFVVISSQNAANKNEEWLIHTYEVLDLTQLLLGSVKNGETGQRGFLLTSDEAYLEPYYQGYQQVFDTLQTLTQKTADNPRQQQRLAQLSELIREKFAELKLTIQLSEQGQSERALQLVNSHQGKQLMEKIRRQINAFEAEERQLLEKRRHAFEKSKKLSRNVILFADAILFSIVIISILVMKRRVIDPVVSLTRQAQLNTDRGQRNFRVQDSGTEVDMLAKTLQNMSDDLYRSIIELQEAKAKADSSAKIKSEFLANMSHEIRTPLNGIYGTLQLLSDEVDSEKGKDILDKAKFSAISLITIVNDTLDFSKMEAGKLEISNTEFSLSELMEYLLSDMGMQAHKKGLKITISNNVQHNYWIGDPVRIKQILINILSNAIKFTRDGSIEVNLTQDANRGGYSLRSKIQASE >NZ_CP041660.1|WP_143870459.1|1206450_1207062_-|response-regulator MNQEQLSRLFERFEQADQSTSRKYGGTGLGMSITKFLVGLMHGTIEVSSEEGKGTRCIISLPLKKAENLVQKDVFADIGHIDFNDKRILIAEDNEINRMIIEEMLIATGASLVLVENGLIALEKFKAELFDLVLMDIQMPEMDGVEACKKIKQYKAKVPVIALTANVMKEDRLLYEQTGFDNFLAKPIDRNALLRLLSNYLNN >NZ_CP041660.1|WP_143870458.1|1205082_1206285_-|trypsin-like-peptidase-domain-containing-protein MKRKISLLCVFMCTLLMITSCANTQKTKGKRYKINANVAVPNSTEIAVYIPQAFQDMEYWVAGSWHKPGLAMREALNKSFGQYFTSAKWFDRKSTEQARLFLDLNPDWDFEGGKVIFNTKYSLLDAAGNEIASGSYKESSGINYHQSEAGYYNAAYKAFQRLAVNILNSQQPSKEKFVNLLAMNKLDLNKLIDKEKPTSSGTGFFVNAEGDVVTANHVVDDCLIVKVKSENGLSDAHIENSSRLLDVATLRTAQATEHYVSFRKGHEIKLGEKITTVSYPLKGLLASSPNMTFGNVTSHKALSGSLGLFQFSAPIQPGSSGGAIVSDGSELLGVVTSTLNIKELAKEGVIPQNVNFALEAKYLKKFFDKYKVNYTELETPAVGNSSEKALNASAQIACYQ >NZ_CP041660.1|WP_143870457.1|1204485_1205070_-|hypothetical-protein MNIIYKLTSTVILSLGLSCNLFANEDAVDKMSESEVSAKLPEIRFISNLKDEDSFEPLKQQAILANLSQSAPGCPLSLVVSVETPSTSGGDAAAFTSIMLSASTLGVVPVVSNNDVIIRYQIKVNGETLSEYSYSNNFTDTDFFWAMDFGLSDEAKQWVVSTTETFAQDLSTDEKLAELLNEYAYYFSDLIKES >NZ_CP041660.1|WP_143870456.1|1203142_1204420_+|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MKTFKQKINLLSAFCLVFGLVACTLEINDDDPQDEPVATNKVMAQVGVRPLFLVDQMQDGTLKNKLQQCKSQTFYRTDWSIGHRGAAMQFPEHTQESYQAAIDSGAGIVECDVTFTQDKELVCRHSQCDLHTTTNILAIPELAAKCSTPFTPADPENGISASAQCCTSDITLAEFRTLCGKMDGANPNALTVDEYMDGTANWRTDAHSTCGTLMTHKESISLFKEAGVKMTPELKSPSVQMPFDGMTQEEYAQKMIDEYVEAGIPASDVYPQSFNLADVQYWIANNSEFGQQAVYLDDRYNDSSFDPNDTSSLTPSMQLLKNQGVEIIAPPLWVLVTLDNDNNIVPSEYAKAAKSAGLKIITWTLERSGLLTQGGGWYYQSITDVTDNEGVAFELLDVLAKDVGVIGVFSDWPATVTYYANCMDI >NZ_CP041660.1|WP_143870455.1|1202134_1202968_+|S-formylglutathione-hydrolase MLQLISENKSFGGWHKKFSHHSNKTNCTMQFAIYLPPQASENHKVPVLYWLSGLTCTDENFMQKAGAQKMAAQLGIAIVAPDTSPRGEQVANDDAYDLGQGAGFYLNATQAPWKEHYQMYDYIVHELPALIEQNFPVNQKRAISGHSMGGHGALTIALKNPQNYVSVSAFSPICNPVNCPWGEKAFSAYLGEDKSSWLQYDSCELLHGATAILPMRIEQGTQDNFLSDQLKPESLLNIAKNKPFDVQLNMQEGYDHSYYFIASFIDEHLVFHAQYLN >NZ_CP041660.1|WP_143870454.1|1201001_1202132_+|S-(hydroxymethyl)glutathione-dehydrogenase/class-III-alcohol-dehydrogenase MSEQFIKSRAAVAWKAGEPLKIEEIDVMLPKKGEVLVKIKSTGVCHTDAYTLSGDDPEGNFPCILGHEGGGIVEQVGEGVTSVKVGDHVIPLYTPECGECKFCLSGKTNLCQKIRSTQGKGLMPDGTTRFYKDGQPIFHYMGTSTFSEYTVLPEISLAKVNPEAPLEEVCLLGCGVTTGMGAVKNTAKVEEGATVAVFGLGGIGLAVIIGAVKAKASKIIAVDINPDKFELAKKLGATDCINPKDYDKAIQEVIVEQTDGGVDYSFECIGNVEVMRSALECCHKGWGESVIIGVAGSGQEISTRPFQLVTGRVWRGSAFGGVKGRSELPGYVERYLKGEFKLSDFITHNMPLQEINQAFDLLHQGKSIRTVIHFEE >NZ_CP041660.1|WP_143870453.1|1199926_1200793_-|LysR-family-transcriptional-regulator MLWHGVSEFVAVVDCGSFIGAAEKLGVSNAQVSRQVSALEERLNIKLLYRTTRKINVTQEGQVFYQHCRHVLDGLEEAERAVTNLQSKPKGKIKLTAPVTYGEQVILPKVTDFILQYPDIQVYAHLTNQNVNLVDEGYDLAVRLGKLADSSLMARKLASRINYICASADYIRANGQPQTISMLDKHACLLGSRDHWVLSDGGKEKIIKVSGKIRYNSGHALLDAALKGLGLVQLPDYYVAPYLASGDLVSVLDEYIVKGEGIWAIYPQNRHLSPKIRLLVDYLAGFDL >NZ_CP041660.1|WP_143870452.1|1198987_1199947_+|hypothetical-protein MKKGIIITAGAVCIVAGCVTFAQIKANEYAKTQLDSYLAKLKTQGVISQANYQTIDVSLFGSVELTNLALHSADLPESITLQKVTISDFDVQHDIPHSMKVRLEGVKLPINLQDEKFNHSGVFAEYVSNLGYTDQLPLTAEVQYQYDAQNAHTYTSSLDIGLTQLGNYHISATTKNIPLNVLMELTANKTPNQAQIASVLQTAALPNLAISFKDEGAVSTYINISAKETGMAQQKVKARVNEVLAMQADMLLPPQLDAFKVQLLAEIESFMDGNKTLKVSINPEHQGEVNKLQPEVIAALMKQDFANIIKLLKLEIKAS >NZ_CP041660.1|WP_143870462.1|1210376_1210742_+|HIT-domain-containing-protein MSQETIFTKIINREIPADIIYEDELTLAFKDINPQAPLHCLIIPKQPIATINDITEDKRELVGHLYVVAAKIAKQQGVADDGYRVVMNCNEHGGQSVYHIHLHMLAGKPLGWPPYTDKAKV >NZ_CP041660.1|WP_143870463.1|1211027_1211558_-|ribosome-associated-protein MNDEWQNPSDPDEEIIYVSKSELKRDSQESQHLADKILNLSASNLAKIPLDDDVQAAVNVALKIKNKHGAYRRQVNFVGKLLRMRDVEDIQLALSKIENQHLVANQHFHKLEKLRDRIINEGDEAINRLLELHPDMERSKLRQLARQAKKEQTQNKAPKAARQIFQYLKEFIPETK >NZ_CP041660.1|WP_143870464.1|1211655_1212987_+|metalloprotease-PmbA MLQEMNQVKQAVADAVALAKKLGASACEVSISKQQGISVGCRMQELETVEYDYGGALGIAVWMGKQKGSASTSDLSPEALKQTVEAACNIAKYTSEDPFTGMADPDLMVNAEQIPDLDLYHPSDISTEDAIAMTLACEKAGLEKSEKINNSDGASFSSHQGFKVYGNSTGLIAAYPSSRHSLSCSLIASDTDDMQRDYAYTVSRVMSHLEAPEIVGTRAAKDVLARLNARKINTAKVPVLFNSEIASSLFGHFIGAISGGNLYRKATFLLDAKGTQVFPEWLNIQEDPFILQGLSSRAFDSEGVATQKRDIVSNGVLNTWLLSSYAARKLKLASTGHAGGIHNWLVAAGGGNFDAMLKKLGTGLLVTEMMGQGVNLVTGDYSRGAAGFWVENGIIQYPVSEITIAGKLQDMFKNIVAIGDDIDQKGSIQCGSVLVEEMQIAGS >NZ_CP041660.1|WP_143870465.1|1213056_1213971_+|hypothetical-protein MVNLRLLLTGIIAVLLSVNHVLAIEAVYIPQPRSNLDIGHEYHTSLLKKALIHGAKGRAIPIIKTSLHMPEARANYEVTKGEKVDVYWFGTDAKKERDMRAIRIPTSKGLIGYRRFIIHKDSIEKFDNIASLQALKQQTACLGAHWPDIRILQASDLPVVVNTMYENIFKRVHAKRCDYFPRAYHDGYNEVSVRKNRYPNLVHYEKIVLHYPFAVYFFTPKSKETLAAWIEDGLNAMIENGEFLRHMQSHLLTAHIFPLEQSADVRYINIPNPSLPEDTDWKNKKYWFQPSDFGFAENKKPALN >NZ_CP041660.1|WP_143870466.1|1216448_1217534_-|DUF1624-domain-containing-protein MMRYQALDVLRGLTVAVMMLVNMPGAWQAVYTPLLHAHWHGWTLTDLVFPFFLFVIGSAMYFSLKKSESLANNNNVSRIFKRAFYLFSIGLMLNTLWMIPPNGVENLRIMGVMQRISLAYLIGGLLILCCRRSHLYIVSLLILVGYSSSLAWYSESPYSLQDNLVRFVDMSILGEAHMYQLRGIAFEPEGLLSTLPAVVNILFGFEITRVLNQATRPLVAVKKLTLICAITFFAAIILQNWIPINKYLWTSSYVLFTSAWATGVLLFLIWILDIKGRSKFAFPFIVFGLNPLFIYVFHWVLTVLYYKIPVADSNLYETMYQWILAGDTANKAASLLFAMLQLLLLWMTCYGLYRRNIIIKL >NZ_CP041660.1|WP_143870467.1|1217602_1218772_-|peptidoglycan-DD-metalloendopeptidase-family-protein MLTRTVNQRKTTASFIAGCVLFFTSSLLMVCANEEAKEKQQQLEKIQQQILARQAVLDKTQSELNQVEKSVAKTDRKIGQTSRILKQTEDELQRVKAQLNELKKQKSELESTRDQQLDILSAQVKSAYHVGRNDYLKLLLNQDSPAKLERVISYYQYLNKARMQAIENLKVTLQALQKTEQLLNKNQLRLAELIKVEAEKQAQLVALKKQQQAQIKQLAAVIVSESQRIENLKQNENALTRALEALAEAIDNLPQQVEFNGLAEIKGRLLWPVKGRVQNIFGRQKSGQLKWKGVRIDADSGDVVNNVHAGQVIFSDWLKGYGLVIVVEHGDGYMSLYGHNQALLKDVGDMVHSGEPIALVGQSGGQSRPGLYFEIRHQGQPLDPTDWCN >NZ_CP041660.1|WP_143870468.1|1218780_1220328_-|2,3-bisphosphoglycerate-independent-phosphoglycerate-mutase MTAAKKPLVLIIMDGWGYSENPENNAILAANTPNLDRLWKEYPSTLISGSGMDVGLPDGQMGNSEVGHVNLGAGRIVYQDFTRITKDIHEKTFNQNAVLSKAVDSAVSQGKAVHIMGLASPGGVHSHEDHIAAMIDMAVERGADKVYVHAFLDGRDTPPRSAQATLEKFDKQLADSGKGRVASLIGRYFALDRDKRWDRVKACYDLLTQGTAEFTAKNAVEGLTAAYERDENDEFVKATAIVDEQGQAATVNDGDAVIFMNFRADRAREITRAFVDVDFDGFAREKEPKLADFVMLTQYAADIKASCAYPPADLVNVMGEWLEKHNKTQLRISETEKYAHVTFFYSGGREDEFKGEKRVLVPSPQVATYDLQPEMNSVLLTDKLVEAIESQEFDVIICNYPNGDMVGHTGVFEAAVKACEAVDNAIGRVTDALAKVGGECLITADHGNAEQMKDPKTGQAHTAHTSEPVPFIYFGRNAEVAKPNGVLSDVAPTMLHLMGMEQPEEMTGQPIMKLI >NZ_CP041660.1|WP_143870469.1|1220515_1220944_+|rhodanese-like-domain-containing-protein MQQYIEFLANHPFLTGIWFVLFFAVIYTFVQAKFSPFNRVNTQQLTLLVNREDAVIVDIRATPDFNKGHIAGALNITTDQIKGGEHPKLEKHKETPIIIVCTAGMTAGKVATQLAQAGFAKVNILDGGMNAWFNANLPVVKG >NZ_CP041660.1|WP_143870470.1|1220950_1221205_+|glutaredoxin-3 MTKVTVYSKSWCPFCVRAKMLLQSKNIDFDEIDIGKQPEKRNEMIERSQRNTVPQIFINEHHVGGCDELLAAEAQGTLDQLLNT >NZ_CP041660.1|WP_143870471.1|1221226_1221742_+|protein-export-chaperone-SecB MAEQNPTQNAENTGNEQQNPQFAIQRIFAKNISFETPNSPEIFTVQWKPDVQMDIDTKSKKLEGDTYEVVLSITVTAKIEDKTAFLVEVEQAGIFAIANLPPQQMAHSIGSMCPGILFPYAREAISNLVNRGTFPPLNLAPVNFDALFASYMQQVAQQQAQDQESNQKLDS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041660_7 | 2795303-2795418 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041660_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041660_7
>7.1|2795345|32|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder ATCTACATGTCGGGCTAAAGCCACGACCTACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041660_7
The CRISPR arrays of NZ_CP041660_7 >merge|NZ_CP041660|7|2795303-2795418|CRISPRCasFinder TTAGGGCGACAATTTTTTATACACTTGTCGGCATAAATACAGATCTACATGTCGGGCTAAAGCCACGACCTACATTAGGGCGACAATTTTTTATACATTTGTCGGCATAAATACAG >NZ_CP041660|7|7|2795303-2795418|CRISPRCasFinder TTAGGGCGACAATTTTTTATACACTTGTCGGCATAAATACAG ATCTACATGTCGGGCTAAAGCCACGACCTACA TTAGGGCGACAATTTTTTATACATTTGTCGGCATAAATACAG
>NZ_CP041660.1|WP_143871745.1|2794044_2795136_+|UDP-2,4-diacetamido-2,4,-6-trideoxy-beta-L-altropyranose-hydrolase MTGHIYKMHIMPSKTNTHSKVVFLTQANSLLGSGHLMRCIALAQACEKARIAPVFALDKNSFIFAKQNPLFDYPVYLMDEQQGSQKSLEKLAQYCNQQTIGYLFIDGYNFNLEFRQQLFKALRQYACNCQLISIDDNADQAKMFTDWILNPSTDINAIPDYSKIAPGAKLMAGHHYRLLRKEFSQQQILPLDKRSEIIITMGGTDPFSYSVKVLNLLAQLNLTAPVRCIVANGFEDKTQLIAQIEKLPSNFSYTVAPHNIAAIFANAKLAISAAGTAQFELYAMQTPAILIILADNQYRNTQNAAQDGWAKVLDFRQTFDSDKMTRAIQECLNETTLLHMQSKIQPGSAEGAKNVVNTLLNGK >NZ_CP041660.1|WP_143871744.1|2793014_2794091_+|pseudaminic-acid-synthase MKEIKIGKCTLGPAHNPFIIAELSGNHNQDLNLAKDMVQAAANAGVDAIKLQTYTADSMTLPIDSDNFRIQEKDSLWYGAHLHELYQKASTPYEWHAELFSFANSLGLEAFSSPFDEAAVDFLETLNVPCYKIASFELTDLPLIEKAAATGKPLIMSTGMASEAEIQQAIDTAHQAGNAQIIILKCTSTYPASAENTNLLTIPDMRQKFNCPVGLSDHTRGIGVSVASVALGAVAIEKHFVLDRTAGGVDAEFSLEADEFSALVEASELAFKALGKVTYGGSPAERNSKYYRRSIFACSDIKAGEPFTRENVKVVRPALGLAPKHFKQVLQSNATQDIKAGTAIDWPHLQNAHNAEQN >NZ_CP041660.1|WP_143871743.1|2791945_2792980_+|glycosyltransferase-family-9-protein MSSTEKPLKILIIRLLNLADVAAIGVPALRYFKQQNPSAEFTFLTFSQGAEVIQLAEPDCRVMQLARDQWPEDFIPAMEAFLGLAEQIVGEAYDQIINLDTSFMACFLTRFLKDAGERAMGNYLSISVQELIEQFQKQALKPEYVNQPSAYLESTFSAMHKWFTPWWEAEYLPNEGYPEHFLVTCCGFDRLQMNMSIPVTADKKLTQAGQGKKTIALAGNALPNYPHMQVVKKRLLELGYQVWSEPFTDMPIKEKLEKLAACDLLITPPSELLWLAKTVNCKVLLISGATQPQMIMPDFATDPTGECAACLSQLTGQSPVSPCNCISADEIMKCVDEIFTKHDG >NZ_CP041660.1|WP_143871742.1|2791238_2791937_+|pseudaminic-acid-cytidylyltransferase MNIAIIPARGGSKRIPKKNIRPFAGKPLIAHSIQVAQQAKIFDHIMVSTDSDEIAEVAREYGAEVPFIRPENLADDFTGTRPVTNHAIQYYLKQGIDLNYACCIYATAPLLTAEYLMQGYQALQAQKDKAFAFSVCTFPFPVQRALKQHNTGVTAMFPESIGKRSQDLEEAFHDAGQFYWGRVEDYLSKKGMFSEHSVPIMMPRFLVQDIDTLEDWHTAELMYKAHQLKESE >NZ_CP041660.1|WP_143871741.1|2790072_2791242_+|UDP-4-amino-4,-6-dideoxy-N-acetyl-beta-L-altrosamine-transaminase MIPYGKHSIDQQDILAVVDVLENQFLTQGKQVPAFEEALCQYTGAQYALAVNSATSALHVACLALDVKAGDIVWTTPITFVATANCIRFCGADVDFVDINPRSRNLCPTALAQKLEIAQAEKRLPKAIIAVHFAGYSCEMQQIYTLCQQHGVKVIEDACHALGGDYQGKKIGNCRYSDFTVFSFHPVKSITTAEGGALLSNQQRLIERATLFAKHGVTREQAQMQDVVEGPWCYQQVELGFNYRMSDLQAALGITQLAKLDAFIARRRTLADNYFNHLENLPLQLPDKKQLAESAWHLYAVELKGQNRLQVYQLLQHAGVHANVHYSPVHLQPYYQKLGFNKGDFPAAEHYAEHTLTIPLFQSMTDEQQLHVVQALEQALEQALRDCTK >NZ_CP041660.1|WP_143871740.1|2789077_2790076_+|UDP-N-acetylglucosamine-4,6-dehydratase-(inverting) MFDGKSILVTGGTGSFGRCFIKHLLTHYKPHKLIVFSRDELKQFEMQQEFTSPVMRYFIGNVRDKDRLITAMRDVDYVVHAAALKQVPAAEYNPMECIKTNIMGAQNVIEAAIEANVRRVIALSTDKAANPVNLYGATKLASDKLFVAGNNISGAHGTRFAVVRYGNVVGSRGSVVPFFRKLINEGKLPLPVTHPEMTRFWLRLEQGVEFVVKSFQRMQGGEIFVPKIPSVRILDLVEAMSGTREYEAVGIRPGEKLHEIMVPEEVAHHSLEFDDHYVITPPIRFFEKKLEYSHNRLGEEGQKVSEKFEYHSGTNPEFLTLQQLIELDKNIL >NZ_CP041660.1|WP_143871739.1|2788694_2789066_+|hypothetical-protein MNYKDKDSKSKVQSSSVETLSIEGLNHAYTPPELALLNTQLVEIINEDELDSANLLKLIEQRDELIQGLLDTFKNLEQQKEFALAERDVNNRLITLCNQLFKQSESALMQLVKGQKAIKKYKK >NZ_CP041660.1|WP_143871738.1|2788300_2788738_+|flagellar-export-chaperone-FliS MFKRGINAYKQGNIKQQIAQADPHQITLMLMQGALDKMAYAKGCMERKEHENKSIHLSKASAILVNLRDTLDFSVESEVTDNLYALYDYMINRLTDAHVQNSTQIMDEIIALMLPIKTAWASIPEEAKQEAYELQRQRQQEQSAV >NZ_CP041660.1|WP_143871737.1|2786800_2788267_+|flagellar-filament-capping-protein-FliD MGIQSIGVGSGLDLSGLVQQLLEAERKPKQDRLDAREENLETVISAIGSLKSKMDDFQASVKDLRDSTNLQSRKAVVTHPDVAEDESGPFTAEASNSATQGSYKIYVEELASGSRLQTANAAFSSSSDVISSSAGSLTFKIGSTGDSFSVAVTAGMTLSQLRSAVNSATGNDFGINASLVDTGTANGTKLVFTSETTGTGNDLSIVNDNDIAELEQIATVDSTEVTTYGNVSIQSATNAKANIDGIDVESETNEFENVIQNVSFEVFEKSSKDSVGDFIPSTLEVGYDKDGLKNKITDFVDNYNAIQDELASLTKYGISELEDDGALAGDYMVRGIQSGLSSIITENVSASALGSLFQIGISFDDDGKLEISETDEFGFGSGQDLLDDALEDNFDDIASLFSDDDEGIANKLYDYVYEYTTFGGLLRTREQSFKDEKDLLSDERERFELRMADYEQLLRDKYINLDLTVAKLQRTGNALNASLASAFL >NZ_CP041660.1|WP_143871736.1|2786332_2786770_+|flagellar-protein-FlaG MDIDVSQSGNVFAYSGSNPASRRYSEENRQNTDDSFASKQSETKINIADFTKVDGEQADKASRAEQQDLDTAVADVADFIQAQNRQLDFSFDENSNKSIIKVTDSESGEIIRQIPSEEMLKLAERINELRSDAGEAIGVLVNRQV >NZ_CP041660.1|WP_143871746.1|2795526_2796072_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MKDYLSGYAVELNSVSQDNMMLLFEWRNQPEIRSQMVNTEKLELAQHQNWFAKLAARTEQKHYVIYYKQHAIGSINVRSTDGQAIKQTREAEVGLYIGEEKYRNNIVAFAPSLLINDYLFENLNIQQLRSKVRSQNKAALKYNQQLGYQLKPIDEDFTEIILTADNYKQTTQQIKAWLSRG >NZ_CP041660.1|WP_143871747.1|2796077_2796308_+|acyl-carrier-protein MFEDKLKQAFVNALSIEENEVTAELAYSQHPKWDSTAHMVLIAELESSFDIMLDTDDIIDMSSYQKAGEIIQKYIA >NZ_CP041660.1|WP_143871748.1|2796324_2797068_+|SDR-family-oxidoreductase MQQDKSILIVGATGGIGSHTAKALAKQGYGLIISARHLDKLESLKAQLLQLGAAGVECFVLDLQDSSAIKGLFQFIQKQVKHLYGLVNCAGTLHESPLMMIRPDDIQAQVNLHLTSSILLAQYASRLMVRNKQGVIVFLSSVVAAQGASGQALYAACKSSLFGLTKSLAKELGGQNIRVNLIEPGFIETELVAHYSDEQRAELKQQTALKSLGQADDVAQLISFLISSKARYITAQNIAVDGGLALS >NZ_CP041660.1|WP_143871749.1|2797067_2798543_+|AMP-binding-protein MMDFWSKSHFLQAPKTAYIVDSIAGEDSSAIAYSYQQVDSMIDTFINEQIKPDVYTGKKIIAIEANNQLGCLVAYLASLRLGYLVIFIDANLSTEQKNNLISEYAVDLVYQPKKTLIRHNNNKHGQTQKIAPQLALLLSTSGSTGSPKMVKLSYQNLSANCQSICQFLPIQQTDSVITTLPMHYSFGLSVIHTHLFRHSTLILSDFGVMEKSFWQLFKQYQVSCFYGVPFIYEMLQRLNYKRLPLKQVRFFAQAGGKMREAQIHHLHGFLTDKQQLFIMYGQTEATARIAYLEPAKLPAKAHCIGQAIPNGQLKLINENDLAADTTARTSGELCYRGDNVFCGYAHSSADLAELETIDWLKTGDIATRDTDGDYCIIGRTKRFIKIVGKRINLDEIQSWLDKRYPAICPVGKDDLLILTRCKRFESEIESEIESEIESELAEQLALFLGCHPRYIKQVQIPEMPINTNGKIDFMQLNKIALQALENQDANG >NZ_CP041660.1|WP_143871750.1|2798529_2799594_+|acyl-protein-synthetase MQMASLVNMPVYGLNKLEKKQFLTARLLELTQHHYQHCGEYKRLLHCIGETCMPKDAEHIPPVAARLFKEYQLKSIDEEEIFRLMRSSGTHGSQSSIYLDADSAKLQSQVLVKILQHWLGKARRPMLLIDAAQSVQNKNGMTARAAGLQGLSFFGRNHCYALNSDMQLDVARITEFFQRYEQENILIFGFTFIVWQQFIQQLEKLNLKFNLQNATLIHGGGWKKMQQQAVNDALFQQHIKNRLGDVTVHDYYGMVEQTGTIYMQCEHGYLHAPVWSDVMIRDTNDLHLLPFGEKGLIQVNSTLPTSYPGHCILTEDLGVVHGEDDCQCGRLGKYFTVHGRVPNAQVRGCSDTFS >NZ_CP041660.1|WP_143871751.1|2799577_2800774_+|hypothetical-protein MIHSLKFIEQVKWHLKSDVFIQPQTNLAWQDEIVDAVNGLSAFILKQPSLKAYPEIIALAFWFRGAHLKQLQQQGLQASDKNGNGKIAGKVFHIAPANVDTVFLYSALLSVLCGNQNIVRVSGRSGEVTHILIEIIKLYAESELGKTLARYLSIVEYSAQLNNVTAQLSRWCDLRVVWGGDTTIELISAIEPDTKQLSFPDRYSIALLTLPESNSIEATAQNFLTDILPFNQQACSSPKAIYWLNVDENKQQDFWQSVQQLLPKNKNQLTMSNKVEQHILLQKLAVSHGIELAQHSGKSFAKIQSVGPLGHCKVKNLTAEMLIEHSGNGLVLEMQIETPQQIENNDKLQSLLLDVEVKDVEVKECALNLGKRQAQLGKALEFDVYWDGINLIESFTLN >NZ_CP041660.1|WP_143871752.1|2800799_2804351_+|DUF115-domain-containing-protein MLKDIRLHIEQDEEKQSEIEAELAADIQRQHSRNIQAFSYHIPSLLSFVQNIRTSNISLFCNRFGQRNIVDYGNGRTLYGLDPKAEIHQQFNAFCRFPQYVALNETLENQSSNIALKKATKLEDLPHYQTYLERSALPKEIDVLVVLGLGMGQHIVELLNSRNIKHLAIYEPELQYFQCSVMAIDWELILDTAKSKGTAIYLQIGKDGRDLLADVSELNQHFPFDGFYLYPHYHHPVFDSLAVSLRDFGWQKCMAQGINYQQQQADNYLPIWTQSIDLTNLASIPDAGMPDTDRKTDGKTDSVFAKNIAAFKKYYPQIAKEFSDYQPNNWLPVVNQEQQINLIEKKSLTSWHGDNPKQECEQNFENFCRYPNKDGLVLGYKGTKLKHYLHYQFVAETEKILEEIEEEAGNLPQDIKSLIVFGVGTGYQLECLFNHHQVENLFICEPNRDFFYASLYSIDWAQYLKQIDESGGRLYLNIGDDGTHLFRDLLNQFYSIGPYILANTYFYQSYYNSNLVAAIAQLREQLQVVISMGEYYDHARYGIAHTTETIARGYPFLIQEADKKLSYQDKEVPIFLVGNGPSLDQSIETIKEWKAQAIIVSCGTALMPLYKNGIVPDFHAEIEQNRSTFDWICRIGDFDYLKQISLISCNGIHPDTCDLFKDVYLAFKEGESSTVSAIEVIGKGLYEELQFAFPTVANFALNIFTKMGFNQVYLFGIDLGFYDKTKHHSTQSGYYKENGEQMYDYEAKNNTSMVVPGNFRPTVFTKHEFKVSKTILEQTLAQRKVDCFNCSDGALIVGSVPLEAELVLLLLDSKYKKDCLLHIRFNAFSNSKCSGYDGKYQHKYSELILKMEIDALLAKSSDSSGIPDVDELIRFHKELLFSSYSRGQSLLFYYLYGTVNYMNSVLLKAMYSSEANVFIGHLLSIWHKYLNKIKKDLDIRYQAYDSSSSFATDREYKLIMHKKNLVDFKVEVLDCTYKSILKRFVEHNFSNSALNCEKVHLAYFGNRTTYNDYTQTFVSDSKTLVGFSNLTFGQDLKTLYYSCNPKDSYFWWLSYDNLQLNDVVTGKVPIASPHRSYFYAKFIHSMDNIFLFLPKYNFVEQEYLNADAVETLNYICNQLEFVKSFVEFFDYIAVPKKGIDTKDCVLDAVGNRGCIIESPIDIEVLIGKSVSLREAKNILDSIN >NZ_CP041660.1|WP_143871753.1|2804383_2806171_+|sulfatase-like-hydrolase/transferase MAIILYLTLTLIFLTIVKYLKSSRGAIYRFIGLSDVNWSAFLSLILWFVSDFIKSDTASLAILIMLLILGLILIIDAALFVQYKIEVNIQTVKWFMSGSKGILKGSGHFWNFFWGKPLSFGGFIFLFAIFLYVFFYDRFFSQSNVLIATGKECLDNILILPFTLALLLLNLVKMSFRPKSSFFNISSIISSLFVHPKLFKLPKVNNNDLNTLLRPSEQKKSAFFSSCSGANVILFTVESMGNYIATDNGKYIRSRLVERFQNGLWYSKAHYSLCPNTTVSTNQIYTGKYSNNPYNKADSVFYGGEPEHLTVLKRLGYKTMFLDSADIKLYNYDRLLKRIGFDRIWGTDDLPAKRNGDYRLLDMVEPIVKEIEGDKPFFLHVINDQTHMPYQIIDKKKFNRFKGDGKKSEYLNALDEVDFILSEFLKKLERKVDLSNTIMILTGDHGESFGEFGYYFHSNSVVPEQITVPFWLQHQKLPSRLLEHSSHFDLFPTIFDLLGIEYSHFSLGRSLGLNERERPCEYFFHSATLKGNTPANFSLIQNDTMIWLDKFYGKSRVFKHNNTQWNECISHGNSKDLENRLWLYLYENDLALKDV >NZ_CP041660.1|WP_143871754.1|2806163_2807078_+|glycosyltransferase MCSLSILMPVKNVEPYISECMDSILKQTYSKFEIIVVDDHSTDMTADIVKQYANNDARVKLVKAQESGFVAALNLGLEYCSCNLIARMDGDDIAREDRFQIQMDFMENNPDVDVCGSWIELFGQKTEVWHYRQFDSHIKSLMMFKRSGFGHNAVIVRKKVYDAFKYESAFEFCEDYRLWCQLATKSTFKFHNIQMPLVKYRIHSTQVIATKTAVQSTLREKILKDFIAELGWEMDPNEFILYQAIRELDFSRTKASLQEIRKMFERLREISNARFGDDCGLFDLHWQRLVECIDAKQFTQIVDN >NZ_CP041660.1|WP_143871755.1|2807105_2808311_+|hypothetical-protein MNFIDVDIAKLGVLKNKQYAIIGTGGYSKKLLQHIEKNNVTLPRCFCYIGENTPNHNNLSLPLIELNTAKHIKYFVIGSNVFQFEIIEKARKILPDSVKYFDLSSELTNNISYYEHKITLQKPYILFYSVDPNNHKKWLSGFERYLKSHDIELIFKHPLQQTSHEVLKQSRGIFLWNGTTSSFNYLKEKLIHLNKKFTYAECGFFPQKDYVYFDRHGINDESSLQHGNVSWLPNNYLEIIAQHKTEYFLDNYPKLSYGEYVFVPLQLESDSNVRKNSRFKYGMQEFIEYICTLYDQPIIFKAHPLDTKTDKYVLPKGRWATSSETTHQLIHWSDIVHGINSTVLFEATLMGKKVIAEGLCLLNRFENKQRLLAAMILRQKKINDANFSREYLQQFTNLEVI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP041660_8 | 2843833-2843942 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041660_8
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041660_8
>8.1|2843864|48|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder TTATTGTCGGTTTAGGGTGACAGTTTTTTCATTTAAAACCAGTGCACC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041660_8
The CRISPR arrays of NZ_CP041660_8 >merge|NZ_CP041660|8|2843833-2843942|CRISPRCasFinder CTTGCTTTGTTGGCCTAAAGACCAACCTACATTATTGTCGGTTTAGGGTGACAGTTTTTTCATTTAAAACCAGTGCACCTTGCTTTTGTTGGCCTAAAGACCAACCTACA >NZ_CP041660|8|8|2843833-2843942|CRISPRCasFinder CTTGCTTTGTTGGCCTAAAGACCAACCTACA TTATTGTCGGTTTAGGGTGACAGTTTTTTCATTTAAAACCAGTGCACC TTGCTTTTGTTGGCCTAAAGACCAACCTACA
>NZ_CP041660.1|WP_143871786.1|2842124_2843456_+|response-regulator MDNKILLVEDDENLREAISDTLLIGGFQCIEAENGEQALVLLNQHPISLIISDVQMPGINGLSLLKSVKTKFPEMPFLLMTAFANIKDAVDAMREGATDYLAKPFSPEVLLNLVGRYMPEDKSESYKPVVADEKSIQMLQLASRVAKSEASVMVLGPSGSGKEVLARFIHNESPRSENAFIAINCAAIPENMLEATLFGYEKGAFTGALQACPGKFEQAQQGTILLDEISEMDLVLQAKLLRVLQEREVERLGGRKTIKLDVRVIATSNQDLKQAVANGTFREDLYYRLNVFPLTWLPLSERKLDILPLAEHLIERHSVRAQKQAPKLTTAARSLLQQHSWPGNVRELDNVIQRALILCQHQIIDAADILIEADTAVPNNVPVENNDESLGKELRQQEHQIILDTLIACHGKRNKVADKLGISPRTLRYKIAKMKEMGIEIPV >NZ_CP041660.1|WP_143871785.1|2841029_2842112_+|PAS-domain-containing-sensor-histidine-kinase MQLNLQNLAQESYAGELNDLRSQAARLSHLVNILPAGVVILNENGFVEEANQIAIDLLGEPLLHARWIDVIDRAFNPQADDGHEVSLHDGRRVKLETTALTPESGQLILLTDMTHTRLLQERLSHFKQLSTLGKMMASLAHQIRTPLSAAMLYASNLANTSLAKVSQSNFQQKLIARLQDLDNQINDMLLFAKTGQKQVAETLSLGQLLSEVQAGSEAMILQNQGHLSTQLPEPDILIYGNKNALASAIQNLIHNSIQIIGAGARIQLLAKRSPENPDNVWVQVIDNGPGITKEIQEQIFEPFFTTRGKGTGLGLAVVKAVTEQHQGRVFVESQLNSGCTFTLELPVLVTKPVQLAAGQN >NZ_CP041660.1|WP_143871784.1|2839426_2840872_+|AAA-domain-containing-protein MPSERRILLIDSKNESLEQFKTILQFIDEDYDWVLPEEAAQHLKQHQNWKAVLLGAGVKNIDDSQKLINSAPELPFIVQESVSELTAFANVVAAINGSINYAQFTHALHHCESYLRNKPGRSVSSSKDLLHTLVGKSQEMQTVRKLIEQVSPTDANVLVLGESGTGKEVVAQSIHRLSKRAKGPFVPVNCGAIPGELLESELFGHEKGAFTGAISARKGRFELAQGGTLFLDEIGDMPLPMQVKLLRVLQERVFERVGSATQVKADVRVVAATHRELEQLVEDGKFREDLFYRLNVFPIETPALRERREDIPLLAQELINRLAEREGESVKLTDNAYQSLMEHKWSGNVRELANLLERLTILYPNQIVDVADLPAKYQHIEVEAFEPEYPESMLEREALNDLFGSSEEDYDEEDDFNDVGLMTSLPDEGINLKEYLAELEINLINQALDFHDGVVARAAEMLGMRRTTLVEKMRKYGLNQA >NZ_CP041660.1|WP_143872956.1|2838410_2839208_+|flagellin MNNISSGANANFLDQINRKQDTIFEQLSSGKKVNKAADAAAAQQIIERLSSESNAYQQSVRNAYDGISLSQVADGALQGINDDAQRIRELTQQAGSGILTDADRQAIQSEISGLQQNIQSTIENTEFNGQSLFTQDNEFSFQVGSGAGQSRSVNTSDLASQLSGLQNIDVTSGNIDTALESIDSAIEFVGSERGSLGATANAFESAINNLNTTNENVQAARSRLQDTDYAQATADQAANDILSQSSNIVAAQARQQQESVLSLLS >NZ_CP041660.1|WP_143871783.1|2837905_2838304_+|adenylyltransferase/cytidyltransferase-family-protein MKKIITFGTFDVFHVGHINILERAAALGNHLTVGVSTDALNYDKKQRYPIYEQSARVKIISSLQFVDAVFLEHSLDMKAEYLRQHQADILVMGDDWQGKFDCFKDICEVIYLPRTPSISTTEIIEVVHSLSK >NZ_CP041660.1|WP_143871782.1|2836648_2837629_-|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MKKILVTGADGFIGSHLAELLTQNGFQVKALCQYNSFNSWGWLDTSPLAKEMEIVSGDVRDPFFCKTISKDIDVIFHLAALIAIPFSYHAPQSYVETNVTGTLNICQAALENDISQVIHTSTSEVYGTAQYVPIDENHPLQAQSPYSASKIAADAMAVSYFNAFQLPITIARPFNTYGPRQSARAVIPSIITQIANGAEVLKLGDLAPTRDFNYVEDTCNAFISLLNKTNILGETINLGSNSEISISDTVKKIITLMNKNVTIEQDEQRLRPKNSEVFRLLCDNTKLKEKTGFEHSVTIDAGLQKTIEWFTNPDNLRQYKANIYNI >NZ_CP041660.1|WP_143871781.1|2835602_2836646_-|polyhydroxyalkanoate-biosynthesis-repressor-PhaR MNKKHMQIENLPIGPEFPPVVIVEIGINHNGSLEEAYKLVDAAYKAGAQIIKHQTHVVDDEMSPEAKKVIPAHTKESIYEIMENCALNEADEIKLKAYVESKGMIFISTPFSRAAADRLQKMGVSAYKIGSGECNNYPLIEHIAQFGKPIILSTGMNDIASITKAVEIIEKHKIDYALLHCTNIYPTPNKLVRLGAMQQMQHAFPNAIIGLSDHTTTNYACLGAVALGASILERHFTDSKSRVGPDISCSMDPSDLTDLITGSRLIYESLGGTKEAAQEEQATIDFAFATVVTIKDINAGETLDKTNVWVKRPGTGEILAKDFENVLGKTTIKNIPTGTHLSYRDFV >NZ_CP041660.1|WP_143871780.1|2834787_2835600_-|NAD-dependent-epimerase/dehydratase-family-protein MLYISGASGYIGSALCKHLNKQSIQYNTIRIRIDEPESTGSLLQINKEDTLIHLGECANITQANQLGERYIQQNLAALKKLLFLGFNKIIYVSSTAVYGETGNTPAMEADSDLVSSHIYTRNKITCEQFIQKHFPEYVICRLSNVYGGTMKQDCLFADILNQLSAPTVTLRNTAHTRDYIHITDVCTAITQALKINVNGLYNISAGQSYSVSEIANQLFKIHNATPILKGHSTTTSSQYICNKKAMQALNWIPQMDISAGLKTIKVNSHE >NZ_CP041660.1|WP_143871779.1|2833610_2834795_-|UDP-N-acetylglucosamine-2-epimerase-(hydrolyzing) MNKHIAVFTGNRAEFGLLKPVIEALNKRSTFKVSLIVSGAHVSHVFDASKNEIAQAGFNVACEIELAKITSCAASTPFAIGDGIQKFSHALEKLQPDFLIVYADRYEGFAAVIAASQMSIPVAHMEGGDLTEGGALDDSVRHAMTKLSHLHFTTNEEAKNRVLKLGEEAWRVFNVGFSAIDTINKKLFYSKTEIQNEFNLDANQPIIVFTQHSVTTEYQKSKEQIQSALTALQKVMAETNCKIFLTYPNDDIGCEAIIEKIEEFAKKSENTICLKSLGQKRYYGLLNLAKHDWKITCVGNSSSGIKETPAFNCPTVNIGTRQAGRLQASNVINTSYSPEDIYQAIKQCLFDKTFIKSCQKIKNPYGTGNAGENIADILANSFDKDQLLKKKMTY >NZ_CP041660.1|WP_143871778.1|2832539_2833595_-|CBS-domain-containing-protein MVKDWHKTLVSEDSTILDAMKVIDKSTLQVALVISSQQKLVGVVTDGDIRRGLINNHLLSDPVVNIMNTKPLALDTSSSETQRIEFLLQHGIRHLPILKDGKLVDLFIYPSLRKKTYNNPVFLMAGGFGKRLRPLTENCPKPLLKIGSKPILELILLRFINAGFYNFFISTHYLPEKIVAHFGDGRKWGVQITYVHEETPLGTAGGLSLVKQQNIQAPMIVMNGDLLTKVDFTKLIDFHAKSQAIATMCIKHETYQIPYGVVEYNDNTLTGITEKPTKSYFINAGIYVLNPALVKSIDENTYLDMPTLLEMNLNKGQEVAVFPIHEYWLDIGQHEEYSQAQIDFHTDDYES >NZ_CP041660.1|WP_143871787.1|2844244_2844583_+|flagellar-hook-basal-body-complex-protein-FliE MKIGADNLYAQMQSLAAQAGTPIQSEVAPVGPKVENANSSTFGKLLNQAVENVNELGHKSKEMTNRFEMGDQSVSLADVMIAKGKAGIAFEATVHVRNKVMEAYDKISNMPV >NZ_CP041660.1|WP_143872957.1|2844637_2846323_+|flagellar-basal-body-M-ring-protein-FliF MVNDNNTDVATSDMSTEEQKSGFMGSLGNVDILRQVTLILALAICLAIAIFIIVWAREPDFRPLGKMETEELISTLDFLDQQKIEYRLDGDVIYVIEDEYQDIKLKMTRSGLSSGPAKGDDILLTDMGFGVSQRVEAERLKYSREQTLARTIEELHSIQRAKVLLAIPKENVFARHEKKPSATVVLTMKRGKMLASEEVDSVVDIVSSAVQGLEPTRVTVTDQNGRLLNSGSQNDLSSRTRKEYEIEQKREAEYLEKIDSILIPVVGLGNYTAQVDVTMDFTSIEQTQKRYNPDLPAVRSEMTVETNSLGGIAAGIPGALTNQPPLESNIPEEARGGDGNASPSKSHREATRNYELDTTISHTRQQTGVIRRLSVSVAVDYLPNVNDETNETTYDPRTTAELANIRRLLQGGLGFDVQRGDTLEVVTVPFVRTDLGEIEETPLLEQPWFTKLVRLLLGTIIIVVLILAVVRPMLRKLIYPEEVVDEYSDDSISSGVDLGDETIDMLSADFDASSVGFNQDGTLMLPDLHKDEDVLKAVRALVANEPILSAQVVKAWLNEDA >NZ_CP041660.1|WP_143871788.1|2846315_2847356_+|flagellar-motor-switch-protein-FliG MPDQEVANTSEEYDISRLDGIEKAAVLLLSLSEEDAAQILKHLEPKEVQKVGMAMASLDDFSQGKITAIHKLFIDEIQRFSTIGFQSQEFVRKALTAALGEDKAGNLIEQIIMGSGAKGLDSLKWMDSKQVANIIRNEHPQIQTIVLAYLEPEQSAEIMSQFSEKVRLDLMMRIANLEEVQPAALQELNEIMEKQFAGQAGAQAAKMGGLKAAADIMNYLDTNIEGQLMDSIREHDEEMSQQIQDLMFVFDNLADVDDKGIQAILREVQQDVLMRAIKGADESLKEKILGNMSKRAAEMLADDLEAMGPIRISEVEAAQKEVLSIARRLADAGEVMLGGGGGEEFL >NZ_CP041660.1|WP_143871789.1|2847368_2848160_+|flagellar-assembly-protein-FliH MVDDFKFRKSIRSDDEILKELKTWNIPIVESEANNKADDYTNALGKPEGWTYEEPEPEPEAPKPLTIEELEAIRQAAYEEGFAEGKEEGFVKGEAEGKEQGYQAGFEAGKEAGHQEGLESGTSIMEEKADIWNQLIQQLDNPLQKMDENVEKELLQLAVALAKAVINTELQTNDSIILQSIKQAVEKLPFNTKQCQIFVNPEDYETVINQYTTAEIERRNWHVSADPNISRGSVEIQTELTSITYTIEDRVREVFAQLEDQTG >NZ_CP041660.1|WP_143871790.1|2848231_2849563_+|flagellar-protein-export-ATPase-FliI MALALSEKINSYQKLVGQSKPKVAGRLTRVIGLTLEAVGCQAAVGSHCKVETDSGYIDAEVVGFEGEKIYLMPSEEVTGILPGAKVIPASIQQKITFSMSLLGRVLDARGQPIDGLGRISDANEPSYQSKKLNPLNRKPIKQPLDVGIKAINSILTVGMGQRIGLFAGSGVGKSVLLGMMTRGTAADVIVVGLIGERGREVKEFIDEILGDEGRQRAVVIAAPADNAPLMRLKGCETALSVAEYFRDQGLNVLLLVDSITRYAQAQREIALAVGEPPATKGYPPSVFAKLPALVERAGNGGDGQGSITAFFTVLSEGDDMQDPIADASRAILDGHIVLSRDLADQGHYPAIDIAKSISRVMPAVTSEEHQMQARIVKQLYSSYQNSKDLISIGAYTKGSDAIVDAAIKLKPKMDKFLQQGMSDVINYDDCLNLLASVTSSMRA >NZ_CP041660.1|WP_143871791.1|2849566_2850007_+|flagellar-export-protein-FliJ MNKQLMLVADIEKKKEDQLAQKYAQATQDLTQQHEKLAGLEKYQRDYMNTVIESGKQGLSSSGFQRLQSFITQLDKACHQQRDNIQKAEKVVDQRRALWLQQQRKRKSIETVIERQRKIEQLRLDREEQKMFDEYATNQATRRLQG >NZ_CP041660.1|WP_143871792.1|2850199_2852749_+|hypothetical-protein MQYIANIPSNIAANVTIEQKRTAAEQTKKATQSTDKGFEAYIYQQHEKNLRQNETQNRKPQNTEKTVEPSASQLKSNNENSAARKADNQTQATKSQQIDAGAVNSEKTDKTATRKQPQNDVNDAKSDTKGIDKESNTKESHTRESSLKENTLKENRALENSLEQSLSTDRHIKNDAKVQGMDTRLIHSDVKKTAEAVATAAGQKQVNDGQKSEESFDLLSFLNKSNSAKVSSSKSAEKPLANEDKNSLDKVDLSTKAQSPAKEGKLGADDILQQVLINPDATQKNASTAAKEESLGGKTGVESLSNRQIKEGMSPKPQNGLDDLLGKGPLKSELNTQKENNGAVAGNPDKALAGGKANTAAIQTQAGEVKAKGQTLIDGKAVNAELAANEKVNSAAVADVAKDAGEKDQAALNANATHKQISEKSQQIAENGLAKASESKTNKKISDELMNQTGVNQTSLTAESKKASAVEAEKPVSTQPLVDKRVNSQTGTQHSLTEKADLGAVEKSLVEGITNDKGSPKGSQEAARSTTAIKETAAIKETTADKNKSAAATSPDVDKTVATAFASAEFQAESIVSEQPAADGKQEVQNKYSGNDKTLLTTKNNEGSDKTVVSKFAESQKLNKSETDAQQEHVKPLETESIIGEQVLGEQLHAEVTQKVNEQKAAADTRVQNTQFTHQQVQHKQESIQAEKVADKQNQMTQLKEQIQLHKPEGATALNDAVKYMMNGRIQAAEIRLDPPELGSMQIKISLNGDQASVSMLVQNPQAKEMLEQTMPKLKEMLEQQGLQMGEANVSQKQEGKEQNASQSGNGGAGGNGQGNGDADESGDEQLVGEQKITNGHLGAVDYYA >NZ_CP041660.1|WP_143871793.1|2852832_2853372_+|flagellar-basal-body-associated-protein-FliL MAAEQEELQVEEAGGGKKKLIIIIVAVVLVLVLGGVGYFMFMGGDDSAEAEVSLDEAPAAANNASGGGGNVEIGDAVYVAMPRPFVFNVPGADRDRLVQIKVQLLVRGSQNEETAKKHIPLIEGTLLRVFSGTSADSLGTSAGKEALKTSSLKAVQDELLSIAGRPVIEKVLFTGFVMQ >NZ_CP041660.1|WP_143871794.1|2853388_2854462_+|flagellar-motor-switch-protein-FliM MTDLLSQDEIDALLHGVDDVEEEDVEESASRSGSAVSMASEYDFSSQDRIVRGRMPTLEIVNERFARHMRISLFNMMRRTAEVSINGVQMIKFGEYIHTLFVPTSLNMVRFRPLKGTGLITMEARLVFILVDNFFGGDGRYHAKIEGREFTPTERRIIQMLLKLVFEDYKEAWAPVMDVSFEYLDSEVNPAMANIVSPTEVVVISSFHIELDGGGGDFHICLPYSMLEPIRELLDAGVQSDKEDTDLRWSKALRDEIMDVEVNIMAKLLEFELSLEQIMELQAGDVIPVEMPEHLTVFVEDLPTYRAKMGRSKDNLAIKVIEKIKRPASVKSELQMVTRGGRRIDAEAELRELEDFD >NZ_CP041660.1|WP_143871795.1|2854500_2854902_+|flagellar-motor-switch-protein-FliN MSDDMDDWAAAMAEQAEAEGAENPADEAQVAELEELTDEKPQITAEEKRKLDTILDIPVTIAMEVGRSKISIRNLLQLNQGSVVELDRVAGEPLDVLVNGTLIAHGEVVVVNDKFGIRLTDVISQIERIKKLK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041660_9 | 2904732-2904859 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041660_9
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041660_9
>9.1|2904768|56|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder AAAGCTCGTAGCTCAAAGCTCAGATGTGGGTCGTCCCTTTAGGGCGACAAATGTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041660_9
The CRISPR arrays of NZ_CP041660_9 >merge|NZ_CP041660|9|2904732-2904859|CRISPRCasFinder ATTGCAGAATTTGTCGGCGTAAACACCGACCTACCTAAAGCTCGTAGCTCAAAGCTCAGATGTGGGTCGTCCCTTTAGGGCGACAAATGTTAATTGCAGAATTTGTCGGCGTAAACACCGACCTACCT >NZ_CP041660|9|9|2904732-2904859|CRISPRCasFinder ATTGCAGAATTTGTCGGCGTAAACACCGACCTACCT AAAGCTCGTAGCTCAAAGCTCAGATGTGGGTCGTCCCTTTAGGGCGACAAATGTTA ATTGCAGAATTTGTCGGCGTAAACACCGACCTACCT
>NZ_CP041660.1|WP_143871842.1|2903795_2904530_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MSHIIENKVALVTGANRGIGKAIVESFIAHGAKKVYLAVRDPESTVELATQFKDKVVTLKADVSDADSIKTLAEQTKDVDILVNNAGIMQLGSPLDDNAQASLQQQFDVNVFGLMRVASAYEEILAQNKGVLVQLNSIASIKTFADIATYCASKSAAYSITQGLQQKFAAKGVDVLSVHPGPIGTDMGDSAGFEGAPEPSVVAEGIVESLKNGDYHLFPDPVAKQFESAYQGFSDAIITSELAL >NZ_CP041660.1|WP_143872961.1|2903061_2903628_-|TetR-family-transcriptional-regulator MDVFWRKGYTGASLSELTQSMGINKPSMYATFGNKEALFVKATSLYIEKIAKPHTQWLFEEGTRLEKRVKNYMLSIVKSQCESDDPKGCYVILCQSEIAGGDMPQAPTELLNEAGQYIQKLLTELFLNDPQAIRLGLNHQASSAALSIATTLRGTASMARAKVTFAELQTVIEHCLKGIGINSDGDKF >NZ_CP041660.1|WP_143871841.1|2901869_2903048_-|PQQ-dependent-sugar-dehydrogenase MSNKHRYIANSVFLPALTLLVSCLFSVSIFLKNADAAQSFSSQKHDFYLDEIASGFDTPWGLAFITPNKLILTERDSDIFLLDLKAKNQKQISGHPKIESSGQGGLLDVALPSVKPENYQDKIRLYFTYSKSTEAGLATTLASAELVGQHLINWQDILVTQSANDNTRHFGSRITFDGQGHLFFSIGDRAERDNAQNLSNHAGAIIRLTLDGKTPADNPFVDSKEVLAEIWSYGHRNPQGLVFDKTHKRLWSIEHGPRGGDEINLIEKGKNYGWPLVSQGKEYWGPISVGEEKMPGMQAAKKVYTPSIAPGGLTLYQGKAFPKWQGSLFSGAMKLKHLNRVEIDENGHITSEERLLESLEQRIRAVITGPDGYLYFSSDNGKIYRLRPQNTG >NZ_CP041660.1|WP_143871840.1|2901444_2901873_+|DUF4396-domain-containing-protein MGMNWNNKTNWIKSAHNTKWCLLGCAIGDFGTIAYFQFNEHNLSTLSVMLFAMFNGLLTSIMLETIILYRAHFTLKAALKTAFGMSFISMLAMEAAMNLTDYALTGGAILTWWVIPLALLAGFLTPWPYNYWRLERHGKCCH >NZ_CP041660.1|WP_143871839.1|2900769_2901357_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MKIYIKNMVCDRCILAVENILQEMQLSYVTVGLGVVDFSNHLGEQLPDLIHTQLSQRLEALGFSLLNNSKSKLIDAVKNSCIDYLKSTIEGEQAQTHVRLSEHINHHVAREYKYLSNLFSEVEGITIEQYFIKLRVEKTKELLVYGELSLAEIASLLGYSSVAHLSGQFKKVTGLTPSYFRSVKDQKLRNALDKL >NZ_CP041660.1|WP_143871838.1|2898963_2900355_+|hypothetical-protein MDINNIKRLFGMTYGLVMLAACDSSETIEAEYVGNYDTPPLIQALDAPLTECPERVWASASQNFKQSEVLVIDRPRGIKNAFHWQAIDKSVNNVELEFLDPQWFLLYNFGYYFGKKTVGLNALEISHHLRSDGSTYWKHDVHLLFHELFHYFAQENWLIDSHERGDVYPLHWQPRYLRTKLIYALQEALSNKSDLSEAKYWYRRYLQEHPEEAVVTNVFDNIEGTAEYAGYVMLALAEYGCNISEEQLIKNINDNIIAFDYTLTSNLESYRLGLLSGLLLRERSNENWQVQVENGVPLVGILLKNIPEKYVSYDTELANKISEDVAYENGLLHMKFSPAINTFKNPEYYRLSLSAESLNFFQMSGAYFINNEANINKITADFEGDLMLGGDVIIEANGIQLIEVKNTPCREGFDINQFIFPIHKDEIKFDELERVAFSNSALTFKDLKIDKVNVDGYQWLCIN >NZ_CP041660.1|WP_143871837.1|2898350_2898902_+|hypothetical-protein MYKFVSFFTLLFFSVTSSAQVILEDKTIYLSVLEGLEGKQRHYVAGIQFPNRKNLGYLEVGVLDSLNTETEFNGFITLGAGYNWNLYHHKYYDFYLGGGAIAAFQGKCNQNTVDIQKREFCADDKNKDGVYGDTDLLLYPELRLTFNMTKSFVIELNARKYFSVNKDFTPDNAFVGVSFTFEL >NZ_CP041660.1|WP_143871836.1|2896371_2898309_+|prolyl-oligopeptidase-family-serine-peptidase MMLLNIRLIIVLTLSSFILSCSTTSFPIFKRIDAPDSYELIPLRKLFANIDTKLGYKISPDGTKLAWVEVIEDRLELKIKDLSTDNTNIIKTPFIDQNFYWGDESRYILFPIYSQQVKESKIALIDTYEREKINTNLLLSNLSGSLRIHRIILQPSVTLVLKRNVLNELPEYYLMELSEGAPQKIDLNEKHIVDLIVKDKKIVARIRQKDNQRFIEKQSNSGFITISECSDINANIKLLSLDSDGFLNYTSNCESDKLQLIRAKNKLYKHYTCNAIEECNSDVAQVVVNPVNGIPYFSLYHEQNSITFNLQNDSAFQKLTNELQGKIKIISMDRDFNRLTLENSSHLGERYYLVDLERNNIAMLSKGQLFDYQSFIKPAQFIQIHNESNTPLYGYYYPAQVQFSEKKSAMILLHGGPEERSYPDYDREAILLSNRGYDVISLNYRGSKGFGHQYQQQAYNNIEVMLNDIESASQWLINVKNVDKSAIGLMGGSYGGYLALLASKYQQNKCIVSINGIYDLYQTALTFQDNPVNFFIRYYGGIDNIRQGKFDEYSPIKYSNYQDNHYLLVQSEYDSKVPFQTAVDFYDLVQANNDVEFIVIKDVHDIRKWYNRLESYRNIEVFLRQCLGGGDAGFEYYLLAKPFYE >NZ_CP041660.1|WP_143871835.1|2895470_2896391_+|hypothetical-protein MLAIINKLKCYINKIFSYIFLLPIQYSKKKKRRSKFAHLIVQFIAVALNIKNREACLIYKKGIKSAVTFHYNYSYLANLSVNDIAKEISKVKIINEEYVRTAEVEKRPIILVSIKSGDFYRGFLRLAEITTLNKELNIIKVSGKSDNEDKLYAKLKRYCKRLNIIRFDDDIAKKCFYQLRKNNIAIFMNDMEVRVNKRVTVDFMGKDTHFQCGIAELAVITKSVVVPVVNYKDDKNQHTLKIEEPIDVELLQHEGMAGKVHYITQRLASDMQDWLRSYPEQIHYWDEIADTFYASKDRKVNDVIKY >NZ_CP041660.1|WP_143871834.1|2895172_2895388_+|hypothetical-protein MQNLNLNIKKKALGPTLAKGGKTTVETDNPNPNSDIDICYGGSSRICAGGTYDPNTGNAGGAVTYKNDSCC >NZ_CP041660.1|WP_143871843.1|2906686_2907481_+|transglutaminase-family-protein MWLKTGCQIAFDINIPTPFMLMLRPRSGAQQWIELEKYILTPSTPIVEFTDIYGNLCQRLIAPVGLFSINTSVQVKTPEVIDIAPGAPFVPVQFLPDAVLSYLLPSRYCESDVLVNVACEITDGYLLGYDQVAAISQWINTNIRYETQINDYLVSATDVYQRRWGVCRDFAHLGIALCRSLCIPARMVVGYLHGLSPMDFHAWFEAYIDGRWYTFDATQQTLKPGYVVIAYGRDAADVAVFNQFGPAIFPISQNVFVEQLGNNC >NZ_CP041660.1|WP_143871844.1|2907480_2908338_+|transglutaminase-family-protein MKRYSITHSTHYQYSGFVELGLHYMLLRPREDHELRIESFSLNITPDYNLLWHRDVENNSVAEVSFKQNTAKLTVESEVIIQQFNESPLDFLVADYAVYYPFKYRQGDQVLLQPYMRLTQPEDKNIIQQWLASIWQADEKIQTYTLLKRLAESIHNQFTYRIREEAGVQSPSFTLTHKTGSCRDFAALFIEAARFLGLACRFVSGYLYAPALADMAGATHAWAEVYLPGAGWKGFDPTVGCIVGADHIAVAVARLPESVPPVQGCYTGNQSSVMDVGVWVKLIES >NZ_CP041660.1|WP_143871845.1|2908473_2909730_+|aminotransferase-class-I/II-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MLTRDMNIADFDPDLWQAIQQETVRQEEHIELIASENYASPRVLEAQGSQLTNKYAEGYPGKRYYGGCEHVDVVEQLAIDRANELFGSDYANVQPHSGSQANGAVFQALLQPGDTVLGMSLAHGGHLTHGAHVNFSGKTYNAVQYGLNEETGEIDYDQVEALALEHKPKMIIGGFSAYSLVVDWARFREIADKVGAYLLVDMAHVAGLIAAGVYPSPVPFADVVTTTTHKTLAGPRGGLIISAKGEETLYKKLNSAVFPGGQGGPLCHVIAAKAVAFKEAMQPEFKSYQEQVVKNAQAMVAVLQERGYKVVSGRTENHLFLVDLIDKDITGKDADAALGRANITVNKNSVPNDPRSPFVTSGLRIGTPSITRRGFKEGEAKELAGWICDVLDNLEDDSVIASVKQKVQDICKKLPVYA >NZ_CP041660.1|WP_143871846.1|2909807_2910269_+|transcriptional-regulator-NrdR MHCPFCAAQDTKVIDSRLVAVGHQVRRRRECFECHERFTTFETAELVMPRIIKNDGTREPYNEGKLRTGLMRALEKRPVSTEQIETLITQLQSELRATGEREVESKLLGNILMEKLKEVDEVAYVRFASVYRSFQDIREFGEAIAGLGDKSIK >NZ_CP041660.1|WP_143871847.1|2910311_2911415_+|bifunctional-diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine-deaminase/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil-reductase-RibD MSVCTQQDYQYMAQAIRLAEQGLYTTSPNPRVGCVIVYDDKVVGKGFHIKAGGPHAERHALVDAGELAKGACVYVTLEPCSHTGRTSPCADALIAAGVTRVVVGMVDPNPKVSGRGIEKLRQAGIQVVENCLTDACEKLNPGFIKRMQLGKPYVRLKLAASLDGRTAMQSGESQWITSADARRDVQTYRARSCAIISGAGTVLADNPSLNVRISDLNFEYLGEVRQPVRVVIDNQLRLSNELKLFSLPSPVYLVANKKRSGDWPPHVEMLELSQTGQHIDLEECLVELAKREINEVWVEGGAALAGAFMQAGLVDELIIYQAPIFMGENTRGLLDMPNITELKQAVRWQFESHTRVGQDLKLILRAL >NZ_CP041660.1|WP_143871848.1|2911418_2912069_+|riboflavin-synthase MFTGIIESVGKIKTINAKSGDFEIVIDTADLDLSDVKLGDSIAVSGVCLTVTQIQPQAFCADVSAETIKRTKLSQLNVGSDVNLEKACTPNTRLGGHIVSGHVDGVGHVVNVYANANATDYWIEAPDSLAHYIAEKGSITVDGISLTVNEVQGAQFRLTIIPHTTEKTAIHDWQSGARVNLEVDVIARYLERLMQAHTAPKGGVTLELLKNSGMIK >NZ_CP041660.1|WP_143871849.1|2912079_2913192_+|3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate-synthase MKLNSAAEIIDDIRQGKVVILMDDEDRENEGDLIVAAEHCTPQVINFMATHGRGLICLTLTRERCQQLDLPLMVDRNKAQFGTNFTLSIEAANGVTTGISAADRATTVRAAVARDAKPEDIVQPGHIFPIMAQDGGVLNRAGHTEAACDLARLAGLQAAGVIVEILNEDGTMARRPELEKFAEKHQLKIGTIADLIEYRNNTETTIEKIAECKLPTSFGEFDLMTFRDTIDGQVHFALKNTEIEHEKPTLVRVHVTNILSDLLRSAREPSKGWELSCALKRISEEGGVLVLLGKNETPEELIARVKAYQAEDEGKPARVTSNWRGTSRTVGVGSQILSALNVGKMRLLSSQKKYHSLSGFGLEVVEYVED >NZ_CP041660.1|WP_143871850.1|2913261_2913726_+|6,7-dimethyl-8-ribityllumazine-synthase MQVIEGAFPAQGKKFAIVVSRFNSFVVESLVEGAIDTLKRHGLVNDEDITIVRCPGAYELPLVAKKVAESKNYDAIIALGAVIRGGTPHFDFVANECNKGLAQVSLEYSIPLAFGVLTTDSIEQTIERAGTKMGNKGGEAALSALEMVNVLSQL >NZ_CP041660.1|WP_143871851.1|2913736_2914156_+|transcription-antitermination-factor-NusB MKPSHRRRARELATQSVYAWQASENRVDTIIDGTLEEVDNKSFDVNFYRQLVQGTVKNAKALDAAYSDYLDRNLEELDMVERAVLRVATYELTHCLEVPYRVVINEAIEIAKTFAADESHRFINGVLDKAVKKIRPHGK >NZ_CP041660.1|WP_143871852.1|2914159_2915137_+|thiamine-phosphate-kinase MAEFDIISRFFTFGEKPDSVVLDKGDDCALVRSGNATELLAITTDTLVCGTHFLQDIPPHALAYRCLATNLSDLAAMGAMPRWFSLALSLPKEIAQNQDWLAEFSQGLQVLSAEHNIYLIGGDTTSGPLSVTISAVGQVAENRCLLRKNAKVGDLICVSGTLGDAAGALKIMLDQSTPCDIETRDALFSRFNYPSARVQVGLALLAFSSCAIDISDGLLADLTHILKASNCCATIDIDKLPLSPALVRQFGQQAAQRMSLSGGDDYELCFTIKPSDIDKLRATAEKLDIPLHVIGQIVEGEGEGLKVVQQGQIIEISDMGYQHFA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP041660_10 | 2917075-2917167 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041660_10
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041660_10
>10.1|2917098|47|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder GCGGCTTTAGCCCGACAAAAGATACAAACGACAAGTTTCAAGTTACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041660_10
The CRISPR arrays of NZ_CP041660_10 >merge|NZ_CP041660|10|2917075-2917167|CRISPRCasFinder AGCTTCGAGCTTAAATGTAGGTCGCGGCTTTAGCCCGACAAAAGATACAAACGACAAGTTTCAAGTTACAAGTTTCGAGCTTAAATGTAGGTC >NZ_CP041660|10|10|2917075-2917167|CRISPRCasFinder AGCTTCGAGCTTAAATGTAGGTC GCGGCTTTAGCCCGACAAAAGATACAAACGACAAGTTTCAAGTTACA AGTTTCGAGCTTAAATGTAGGTC
>NZ_CP041660.1|WP_143871855.1|2916556_2916982_-|hypothetical-protein MKTIISTDKYSKTHLLAVQNNSSEFEQRFWRSIAKLQESKRWLCIIAPSKMPSKSFLREMGVQLDKMLVIHQQKSSAYTTTKKALLAGKCSTVVAWLDSCSNAQHQEIKALATQAKSQIVLIKEEYKTTPIEKRAVRKLSA >NZ_CP041660.1|WP_143871854.1|2915644_2916481_+|isopenicillin-N-synthase-family-oxygenase MFEAIDFKAKDAAQAFVSSLKETGFAVLKNHPLNKTLVDNLYQAWLDFYRSAEKYQFAYTQDKQDGYFAKNKAEKAKNATQQDIKEYFHYYPWGQCPDVLKVQTQAYFEQASQLAQTLLNWVENQSPPEVAQAYSQKLSDMIKNSDMTMLRILHYPPMTGDEAPGSIRAAAHEDINLLTILPAASEGGLQVKTLNGEWLDVPAEFGYLIVNTGDMLQEASAHYFPSTTHRVINPSDRIQNTSRISMPLFLHARPDVVLSEQYTAHKYLIERLKELGVY >NZ_CP041660.1|WP_143871853.1|2915126_2915642_+|phosphatidylglycerophosphatase-A MLLKYFSIRPELKCLSLKNPIHFLSLGFGSGLAPIAPGTFGSLAAIPVYLLLMFAGMPIYIAATVLFAILGFWFCGYTAQALKTHDHPAIVWDEVVGMLITLFYFPLSYSTVIIGFLYFRVFDIIKPWPIKWLDQKVHGGIGIMLDDMLAGVFAWCALYLTHQYIYDLSSW >NZ_CP041660.1|WP_143871852.1|2914159_2915137_+|thiamine-phosphate-kinase MAEFDIISRFFTFGEKPDSVVLDKGDDCALVRSGNATELLAITTDTLVCGTHFLQDIPPHALAYRCLATNLSDLAAMGAMPRWFSLALSLPKEIAQNQDWLAEFSQGLQVLSAEHNIYLIGGDTTSGPLSVTISAVGQVAENRCLLRKNAKVGDLICVSGTLGDAAGALKIMLDQSTPCDIETRDALFSRFNYPSARVQVGLALLAFSSCAIDISDGLLADLTHILKASNCCATIDIDKLPLSPALVRQFGQQAAQRMSLSGGDDYELCFTIKPSDIDKLRATAEKLDIPLHVIGQIVEGEGEGLKVVQQGQIIEISDMGYQHFA >NZ_CP041660.1|WP_143871851.1|2913736_2914156_+|transcription-antitermination-factor-NusB MKPSHRRRARELATQSVYAWQASENRVDTIIDGTLEEVDNKSFDVNFYRQLVQGTVKNAKALDAAYSDYLDRNLEELDMVERAVLRVATYELTHCLEVPYRVVINEAIEIAKTFAADESHRFINGVLDKAVKKIRPHGK >NZ_CP041660.1|WP_143871850.1|2913261_2913726_+|6,7-dimethyl-8-ribityllumazine-synthase MQVIEGAFPAQGKKFAIVVSRFNSFVVESLVEGAIDTLKRHGLVNDEDITIVRCPGAYELPLVAKKVAESKNYDAIIALGAVIRGGTPHFDFVANECNKGLAQVSLEYSIPLAFGVLTTDSIEQTIERAGTKMGNKGGEAALSALEMVNVLSQL >NZ_CP041660.1|WP_143871849.1|2912079_2913192_+|3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate-synthase MKLNSAAEIIDDIRQGKVVILMDDEDRENEGDLIVAAEHCTPQVINFMATHGRGLICLTLTRERCQQLDLPLMVDRNKAQFGTNFTLSIEAANGVTTGISAADRATTVRAAVARDAKPEDIVQPGHIFPIMAQDGGVLNRAGHTEAACDLARLAGLQAAGVIVEILNEDGTMARRPELEKFAEKHQLKIGTIADLIEYRNNTETTIEKIAECKLPTSFGEFDLMTFRDTIDGQVHFALKNTEIEHEKPTLVRVHVTNILSDLLRSAREPSKGWELSCALKRISEEGGVLVLLGKNETPEELIARVKAYQAEDEGKPARVTSNWRGTSRTVGVGSQILSALNVGKMRLLSSQKKYHSLSGFGLEVVEYVED >NZ_CP041660.1|WP_143871848.1|2911418_2912069_+|riboflavin-synthase MFTGIIESVGKIKTINAKSGDFEIVIDTADLDLSDVKLGDSIAVSGVCLTVTQIQPQAFCADVSAETIKRTKLSQLNVGSDVNLEKACTPNTRLGGHIVSGHVDGVGHVVNVYANANATDYWIEAPDSLAHYIAEKGSITVDGISLTVNEVQGAQFRLTIIPHTTEKTAIHDWQSGARVNLEVDVIARYLERLMQAHTAPKGGVTLELLKNSGMIK >NZ_CP041660.1|WP_143871847.1|2910311_2911415_+|bifunctional-diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine-deaminase/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil-reductase-RibD MSVCTQQDYQYMAQAIRLAEQGLYTTSPNPRVGCVIVYDDKVVGKGFHIKAGGPHAERHALVDAGELAKGACVYVTLEPCSHTGRTSPCADALIAAGVTRVVVGMVDPNPKVSGRGIEKLRQAGIQVVENCLTDACEKLNPGFIKRMQLGKPYVRLKLAASLDGRTAMQSGESQWITSADARRDVQTYRARSCAIISGAGTVLADNPSLNVRISDLNFEYLGEVRQPVRVVIDNQLRLSNELKLFSLPSPVYLVANKKRSGDWPPHVEMLELSQTGQHIDLEECLVELAKREINEVWVEGGAALAGAFMQAGLVDELIIYQAPIFMGENTRGLLDMPNITELKQAVRWQFESHTRVGQDLKLILRAL >NZ_CP041660.1|WP_143871846.1|2909807_2910269_+|transcriptional-regulator-NrdR MHCPFCAAQDTKVIDSRLVAVGHQVRRRRECFECHERFTTFETAELVMPRIIKNDGTREPYNEGKLRTGLMRALEKRPVSTEQIETLITQLQSELRATGEREVESKLLGNILMEKLKEVDEVAYVRFASVYRSFQDIREFGEAIAGLGDKSIK >NZ_CP041660.1|WP_143871856.1|2917676_2918408_-|DUF3108-domain-containing-protein MLKKISGYSLVCLLSCLFTYNAYAQNAKPDVLTPFNAKYKVSKGRLNLGTAKRQLSQIGENRYTFSYFSDLSLLILSDHRRETSELTIQNNLVTPIRYLFKREGTGSDKSTTLEFTKNAVIDSENEKTLDIADGIHWFDEVSYQLQLKLDLAAGKTEMSYYLVNHKKRDKLYVFKVVAEEVLEVPAGKINTVKLQRIREDDSDRLTEFWLAPDLGYLLVRIRQERGGSEVADAQLEKFVFTPL >NZ_CP041660.1|WP_143871857.1|2918391_2919042_-|phosphoribosylglycinamide-formyltransferase MTKNLVVLISGSGSNLQAIIDATKSGQIDGRICAVISNKADVYGIERAKKAGIKTHVLNHKAYASREAYDQDLAQVIETYQPDLVILAGFMRILTANFVQKFVGKMLNIHPSLLPKYQGLNTHQRALDAKDTEHGVSVHFVTEELDGGPVVCQACIKVLSNDTAETLAQRIHAEEHIIYPKVVEWFCQDRLTMRNGNAWFDNELLPPTGIRYAEKN >NZ_CP041660.1|WP_143871858.1|2919044_2920085_-|phosphoribosylformylglycinamidine-cyclo-ligase MAEQKTTLSYKDAGVDIDAGNELVDRIKGVTKATRRPEVMGNLGGFGALCKLPEKYKKPLLVSGTDGVGTKLRLAIDLKYHDTVGIDLVAMCVNDLIVQGAEPLFFLDYYATGKLDVDIAASVVTGIGEGCRQSNCALIGGETAEMPGMYEANDYDLAGFCVGVVEEADVIDGSRVQPGNKLIALASSGPHSNGYSLIRKIIEVSNADLDQPLDGKPLKDHLMEPTRIYVKSVLKLLESVKVNAITHITGGGFWENIPRVLPKSTKAVIDDSSWQWPAVFNWLQQAGNVEKHEMLRTFNCGVGLILSVHEDDAEAALVSLRKSGEKAWIIGHVAEAAEQEAQVELV >NZ_CP041660.1|WP_143872962.1|2920642_2921761_+|hypothetical-protein MQLQAMPVYLFEEGHLKFNYLLFHAFYAVLEGAIMIFICTRMLRMGLIGDELKKDIEKRLEQPGRVKLSGSVNTFNNIKILNQYNKLFNAIRQLTDEFQKTSDLLHNESGDLKSSFSHLSAMQKQGQQHTDSIASATSQMSKTVNEIAHRAVEANDQVHATLDAVANAEQKVDKSKSTINEFERVVRKTSQEITALSESCSEISGVLESIQAIAEQTNLLALNAAIESARAGEHGRGFAVVADEVRQLSFRTKESTAKIAGIMEILLNKSRSSVEAMNSSLDKLDFILVSSDELAVEIKAAAGSVSQVAHNIDMVATATEEQATAAESVAHSANEVKTIADKETSELTNISTVAEHVSNLAEKLKKALAKFD >NZ_CP041660.1|WP_143871859.1|2921753_2922281_+|hypothetical-protein MINKLFTLLLLIWVCLTAGAFYYFSQPKLQLFDPNSRFQNIMHSDNYVSLLHKQLALNARPTVIHVTDSNCSCNVLTQAHIVDLDKQLAALNFQIHAVDIKELKSLIPAAPAVLIFSKMRDLLYAGPYSSGYLCNKDNSLVDLALQQANYAIENNLKLEPFIVSQGQGCFCYPEK >NZ_CP041660.1|WP_143871860.1|2922377_2923274_+|D-hexose-6-phosphate-mutarotase MSIHELIKPFSQVELTDANTLFGEKHEALPLIKIETEVCRAIIAIQGAHLIEFEVKGKAPLLWVSPKVAYKQNKAIRGGVPICFPWFGENQFDKSKPSHGFVRASNWQLKEVQASDQSAKLKFAFSSNEQTKALYPYDFDAEYTISLSDKVELELSCKNLSSEIMPVSFALHSYHPIEDLATVSVTGLHNTTFLDNTMNYQAHIQQGPVTFPSEIDRIYLNVASEQVIQTATPIALRSDSCNSAIVWNPGPAKAASMNDLGEENYTRFVCVERGNAFANSWYLQPAESKSAKLDICYA >NZ_CP041660.1|WP_143871861.1|2923273_2923939_+|HAD-IA-family-hydrolase MNKLQALLIDHDGTLVDSEPAQHQIWQRILRDFGIEFSFDEFIPRIGIPGEMTAAYLVDKYALGISPSELAVVKEKETQAYLEQQAFPLMPGILAILQWAKSADVNLRVAIVSGAERASVLRTIKQHALDEFVDLVVAGGDTERSKPHPEPYLKAINQLKVAVQNCCAIEDSCGGIQSAKGAGLRCLAIQHVFTDVQTLKRADRLFSSHQEILAALKRNMT >NZ_CP041660.1|WP_143871862.1|2923950_2924757_-|amino-acid-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKQVLDLFILLILFFSAPLSALPNFGEANVLKVPYLQNDYFSDVLKLALKKTRDTHGPYILIKKEWHGPKQRMRQLLAKNRYIRILWSTTSEQREKQLRPIKFSLLKKLNNYRFLLIHKGEQQRFNHVKTIADLRKFTAISGAHWQDTEIFKRNKLPVATSIDTDDLVKMFNSRRGDYFARGAYEVWHELTQPEYSAFELEQNLLLKYNSDYYFFVNHTDDELAQRLEAGLKKAAEDGSFDALFFSIPSFKQGWDAVQNNQRRIIELP >NZ_CP041660.1|WP_143871863.1|2925326_2926307_+|FAD-dependent-oxidoreductase MKVLVVGAGMAGAACAYTLTQAGCSVSVMEKNKHVGGRMASTQMAWSNFDLGAQYFTARDPVFIRQVTRWLKDSVVAAWDIQPHLIDKLGIHPSPDNTKRYFGTPLAQSPIESLLADCNVHLQQNIESLHKRSQGWFAQLSQHNQSGPYDYVVLAIPAPDVVSLLPQNIDLKVFPKFDAYATQVVVLSLQKAIRTEVEWSFVKDRAIDWLGQVNAKYNRNSQQQAWLMHFTPEATDMYRYNDDACFIRLAQLQLEQIFSQREPCQVVDSFSYLYPNARIKLLGYKEQYWLDAQQNLAACGDGFCGGRVEGAFVSGLALARKLLSVH >NZ_CP041660.1|WP_143871864.1|2926586_2927243_-|hypothetical-protein MNSENVKPNDPEQAKNWQTLYQKSCQQTSVPPQLKQQIIRNLQKKKTAQKNIKPWLALAASFVVAVLMLQVYQSKPMFQQIQPQVELIELELLQEITETQNKPEFIVNIEKRLANYQQQQIAINNAFKNQMLRLQSSYLNKPDALLYARYAVLKQENEQLILSLCDNKTLQVLKSSGLNKKAQKSWLNRLQPYQTVQILLSDAGQIAGILPSQIKNCS |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041660_11 | 3748443-3748597 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041660_11
|
2 spacers
spacers of NZ_CP041660_11
>11.1|3748466|43|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder CACTTTGCCGCATTACAAAAGTTTGGTTTGCTAAACTGCTTAG >11.2|3748532|43|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder GCGCCGGTTGTATAACAAGATCAAGCGGAGCTATTAGGGTTAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041660_11
The CRISPR arrays of NZ_CP041660_11 >merge|NZ_CP041660|11|3748443-3748597|CRISPRCasFinder TTGGGTAAATTGGTTTAGCTGCTCACTTTGCCGCATTACAAAAGTTTGGTTTGCTAAACTGCTTAGCTGGCTGGCTTGGTTTTGCTGCTGCGCCGGTTGTATAACAAGATCAAGCGGAGCTATTAGGGTTAACTGGCTGGCTTGGTTTTGCTGCT >NZ_CP041660|11|11|3748443-3748597|CRISPRCasFinder TTGGGTAAATTGGTTTAGCTGCT CACTTTGCCGCATTACAAAAGTTTGGTTTGCTAAACTGCTTAG CTGGCTGGCTTGGTTTTGCTGCT GCGCCGGTTGTATAACAAGATCAAGCGGAGCTATTAGGGTTAA CTGGCTGGCTTGGTTTTGCTGCT
>NZ_CP041660.1|WP_143872504.1|3747775_3748171_-|hypothetical-protein MAHYTHSKVKRNGYQYIKDNGDLVVILKGPLKADNWATTQSKILAQSAIATGDMFLTDVGDDLQFTSNPKSGVDPDLSAVNTDDIAAAILDTVNQEVLIVQDIVDKDILNADGDTITIPGLSVFSRELSLI >NZ_CP041660.1|WP_143872503.1|3747456_3747762_-|hypothetical-protein MALTINVYCGQADIAEIAVNDENGPLDFTAAGITKVSVVIPGLLTADSSTNAVNFKTGQVDLQLGLITETNCMWNGRLVEHRAENDEGRTLIDDIIFNFKY >NZ_CP041660.1|WP_143872502.1|3746668_3747100_+|thermonuclease-family-protein MRIFVTIMLIAICMDSFAKTYGNITVSRVTSIYDGDTFRVDIDSWPDVIGKRVPIRVNGVDTPEIRGKCENEKQLARKAKQFTVNQLRSAQKIELKNIRRGKYFRIVADVYVDSVNISELLISNNLAVRYDGKRTKKNWCEQQ >NZ_CP041660.1|WP_143872501.1|3745318_3746479_+|hypothetical-protein MPSRIKNFKLFKQALNLCKKPEFYFVVLLAISILLPFIELFQASIVFGFLSSIPALLFIYKRHGKLSGLISSFLVPLIYLPYILGLYSWFYTHTGLLYNQVQVHDFFSALYFSVVTWTTLGYGDFQPSEHIRLWAAGQAIFGYLFMSIYVAILFAAITKFSEEKTNNKAKLRGLMLMLKYTNKVYGFFITSIDPKISSPEINRITSPKIELLKKELQEFVLVHSMRLDLSFIEDFENLLLVLERLNKKSLVFCHLGHNSNGSYIVQPLAQQPVQINNGITDIAIDDPYTEVNETLDIIHRFEVRYPFAFKSGDLKKLYTPNLNKDNWYKYCNIVGIHEQEKYSGTAKNTVFVLDPIAFKKGFESDDILASMAKHKTKLKTFFEDRS >NZ_CP041660.1|WP_143872500.1|3743303_3744452_-|hypothetical-protein MKRNLYHYDAFGNALGNSIVEGMSAEKDLTAAEQKAIEDRANKLINLDKLGNIDEPMADIAKSTTAGAEKESTNSINKTGQAQRDKFDADFEVAQVVRSQKESQRRSDTVSYKQNLDADLSAKKVSVPLVDEWVYQNTFKPEIALPDMLSNGFDLEGSILLNTEWVRDPVLNDPRMLKTENLTSAGELYQKLNNTRYAETTSTSDFENVVLSMLGGAADSNVPATQLLNTGLVSKGDLTYYATLVDKRSFSSLFMEPASQLPNSWDINSETNMDSSRSLKRGVVSAVDALSTGAHKYANVSRQIALGNDRVTTIDFYRDSTGVNHADVSGHFKYSLNPAPGYYPKEHVNQAVYLSPLQAAYRIGIPESGNGNPYIRPRGLFE >NZ_CP041660.1|WP_143872499.1|3742437_3743301_-|hypothetical-protein 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>NZ_CP041660.1|WP_143872507.1|3750197_3750887_-|DUF4376-domain-containing-protein MVTLKCLARPLLRQNIGATNMQFISNLFQTQTEDGDVVEKQRPQCETQEALIAVINKHYGKKNHLVNLFAQFYINHLQWSVWDEYKAAFAEYEAEKLRIEQENADNIEDEEYQVQVPPVEPELQPVPNLSVEDVLAQAPFADVIQQKKKAIRSTEIENIVVVVDDMQFDGDETAQTRMARAIVALDAAGQTETNWKLADNQFALVSKTQLAQALALAGQAQTDIWLAHG >NZ_CP041660.1|WP_143872508.1|3750828_3752904_-|hypothetical-protein 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MADFWTILSIVSAVFSVHTSIKAKNAAKKAAKQNKSAGFQVNRFGTDEPIPVVVGKFKVAPIITYQSVVDVPGDKNGGIDNEVWYGSMVFSVGKCGRVEKIFFDDFDMANKFKYANWQEMDGNINEGVVSEINPGYWIRWYVGQHLNSNGDNWDEGDGTKYFYPTASEEFDITPDSGLPWWLGYDGTSQIYWSPIDKYIDPLVTPIDPGDDFSNMRYEGLRAAHAWLIMDGEYTRYPQGVPEFKVVMEGYEFMSLATDTPTHYPNFADVIYWYLTNEEVGMGRPESELDKAAFAEMSQFMNTLVPTPDGDMTLMRCNGVIDTGKPIFSNIETMLHNCHGRPVDGINGFRIEIMREKPVVMDLHIDDFKDGINVSSNSINDKYNQVIVRYRDEQLGWEVNEVVFPPENSELHEQWLAEDNNIHNRLEEDLDFVTNQHQALQWAETTARTSREFEIVEGAIGAKGWKLEELDVISITHPLRGWDKKPFYVDEITLADDSVELVLIEYQPTNYAWHDKTNAVVYPDTNFTPIEIETPENVSVNYNDKKELVVTWDKPNSLVNFYRFSLYDENDNVLKTERVFSNNYTLQNLNSGAYKIQLETVNPKGTSDTVTLSFEIGVPQAPTLELIAGNLEFTVIAHIQGGYLGTAFELLVNHENEFETAENLGTGSGHWIVSGRKSNTQYFVWVRVTTPAGQSDWANASVTTTHDPSDIIDLIENNGGLPFNAINPQTRDVINQLGVEVGTNIPNLITEINENLSAHDTLITDVDNKIDSQVAQMQTDLDNAIQTTNTDFSQQISLIDQKLEDEVLQIESALSGTNQFIVDETQRLDNAFQLTHSAIEETENALQTTLGAVSEAILTDRDNIARVLGLQADITNINNTLSVALTDIQQTASKIELTALRTELKGDINNALFGDLSEQLNVALGDIEGRIDLVELSVSADAIQSQVDAILLAKDYATVSHVSSVIDSLGITNFVTQTDFNNQISRINAAEEVLHSNLFKRSLTSFATVADETQSLGERLLAAEAAKTLFEAGTETALGSLAYANEQTKTATELNSAEIESTKELIALTNNGLALAYQAINVTSNDIKQAANELTQFKTETGDNLSTVTNSIQSVSNAQSATASELTQFKTETGDNLSTVTNSIQSVSDAQGATASELTQFKTETGDNLSTVTNSIQSVSDAQSSTATELTQFKTETGDNLSTVTNSIQSVSDAQSSTATELTQFKTETGNSFSTVNNSIQSVSDAQSATANELTQFKTETGDNLSTVSNSIQSVSDAQSATANELTQFKTETGDNLSTVNNSIQSVSNAQSATANELTQFKTETGNSFSTVNNSIQSVSNAQSSTASELTQFKTETGNSFSTVNNSIQSVSNAQSSTANELTQFKAETGDNFTAVNSSIQAASNAQSATANTLFTMALGVSGAETAQTTEQLLAKQAADILDQADQDAQMQAFAAVTDALNASVSENLAEIEKTSILFAQTQSGLSTAYERINIVSNAQQNTASALTQYKVEAQTSINEAQANAVSEAVEYTNASVGYCVIDDVISGHTDKSACEDAGGTWERLPLAEAQKKVTVSFEKPNGDIVTGSAGSFLQALTNDVGELSLRAFFGLDQNGRVSGLVVTDTEGNQSNASIELLGDRVSIVKPDTLEPIFVFDTETERAQFFGELVLGDNYPVRSEQDIRALDGEKGDKGDKGDKGDQGDPGQSVTVTENSPGVYTITGANGSVVVRDGQNAPVPELHDLGNGNYSMTVDGETIEWHDGEAGQDGQDGYTPQLGVDYFYNGRFYSVIYKAALSQPSTPSGGSFNGTNETMPTGWSDAPVYVNGQITYASRAIYTQNPNTGAWSHSGWSVPKAHVVKGDKGDKGDPGQSVTVTETSPGVYTITGANGSVVVRDGQNAPVPELYDFGNGNYAMTVDGETIEWHDGEAGQDGQDGYTPQLGVDYFYNGRFYSVIYKAALSQPSTPSGGGFNGTNETMPTGWSDAPVYVNGQITYASRAIYTQNPNTGVWSHSGWSVPKAHVVKGDKGDQGPSGQDGQNGQDGADGADGSRGAGRYETGTSTGVWSNTTATNATPNQTPVEGDVVTIYKTTEPDTQTTKIYQSGSWSNFALHIHGSALIEGTVVADEIRANSVVGENATFAGNFFADKITGDVVEMDAFQIPSGPTLNHTNEVLICEFEVDTESFDRTILASYPPINFLGFNEDKQNPRVLSELRYVEEGSATETTVSNSNMYSNSSKSHALTNIPADSTKRTYRWYSRKVDSGGSGTPYVFGVMHILSFKTANTVQENKIRFVNN >NZ_CP041660.1|WP_143872511.1|3760639_3761230_-|DUF2163-domain-containing-protein MKTYPQAVEDMIASGHVKHAYLLYVDFEIPLSFTNAGFDIEADGVTYYSSDILQGVDRLSKQASLTVTEIKLAFSLKNQQMVSIAFSKNWQNRNVQINRVFLGEQNEVIHNENVWKGKTTERSDSDQELLITYTAKNIFGAFETTNSWRTTLASHHRRHPTDDCFKYAHKAQEVQYWGGKGNRINKTESNDSLGVK >NZ_CP041660.1|WP_143872512.1|3761226_3761820_-|hypothetical-protein MSAILNQFCRSIELKSNTPNTFFESQSLHIETWSIPSHRWEVEYKSNPINGTENQRKMWVFLNSLKSGSVEFDWEIPIHSVPQGSAHSNAMVFQDYNAGVTEFRLLGTLGDNFLIAGDLLKFSNHNKVYMVVEDVSGTNPIVKVNCPLKHAVTSSTIVITRNVAFKMILKPNTQIVSYSRSVGSFSEPFSAQFIEKL >NZ_CP041660.1|WP_143872513.1|3761819_3763841_-|hypothetical-protein 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_CP041660_4 | 4.1|865615|41|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder | 865615-865655 | 41 | NZ_CP041660.1 | 864062-864102 | 0 | 1.0 |
NZ_CP041660_4 | 4.1|865615|41|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder | 865615-865655 | 41 | NZ_CP041660.1 | 864190-864230 | 0 | 1.0 |
NZ_CP041660_4 | 4.1|865615|41|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder | 865615-865655 | 41 | NZ_CP041660.1 | 864126-864166 | 1 | 0.976 |
NZ_CP041660_4 | 4.1|865615|41|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder | 865615-865655 | 41 | NZ_CP041660.1 | 864254-864294 | 1 | 0.976 |
NZ_CP041660_4 | 4.1|865615|41|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder | 865615-865655 | 41 | NZ_CP041660.1 | 863934-863974 | 2 | 0.951 |
NZ_CP041660_8 | 8.1|2843864|48|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder | 2843864-2843911 | 48 | NZ_CP041660.1 | 2843587-2843634 | 2 | 0.958 |
1. spacer 4.1|865615|41|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder matches to position: 863998-864038, mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 4.1|865615|41|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder matches to position: 864062-864102, mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 4.1|865615|41|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder matches to position: 864190-864230, mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 4.1|865615|41|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder matches to position: 864126-864166, mismatch: 1, identity: 0.976
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5. spacer 4.1|865615|41|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder matches to position: 864254-864294, mismatch: 1, identity: 0.976
ttcgagctaccagctacaagtttcgccaacattgtaggtcg CRISPR spacer ttcgagctatcagctacaagtttcgccaacattgtaggtcg Protospacer *********.*******************************
6. spacer 4.1|865615|41|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder matches to position: 863934-863974, mismatch: 2, identity: 0.951
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7. spacer 8.1|2843864|48|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder matches to position: 2843587-2843634, mismatch: 2, identity: 0.958
ttattgtcggtttagggtgacagttttttcatttaaaaccagtgcacc CRISPR spacer ttgttgtgggtttagggtgacagttttttcatttaaaaccagtgcacc Protospacer **.**** ****************************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041660_5 | 5.1|1187082|30|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder | 1187082-1187111 | 30 | MN693472 | Marine virus AFVG_25M86, complete genome | 618-647 | 7 | 0.767 |
NZ_CP041660_5 | 5.1|1187082|30|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder | 1187082-1187111 | 30 | MN693472 | Marine virus AFVG_25M86, complete genome | 57043-57072 | 7 | 0.767 |
NZ_CP041660_7 | 7.1|2795345|32|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder | 2795345-2795376 | 32 | NZ_CP026605 | Catenovulum sp. CCB-QB4 plasmid unnamed1, complete sequence | 15281-15312 | 7 | 0.781 |
1. spacer 5.1|1187082|30|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder matches to MN693472 (Marine virus AFVG_25M86, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gacttacttgaaacttgtagcttgctgctt CRISPR spacer ttggtgcttgaagcttgttgcttgctgctt Protospacer *.******.***** ***********
2. spacer 5.1|1187082|30|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder matches to MN693472 (Marine virus AFVG_25M86, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gacttacttgaaacttgtagcttgctgctt CRISPR spacer ttggtgcttgaagcttgttgcttgctgctt Protospacer *.******.***** ***********
3. spacer 7.1|2795345|32|NZ_CP041660|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026605 (Catenovulum sp. CCB-QB4 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
atctacatgtcgggctaaagccacgacctaca CRISPR spacer gtttacccatcggcctaaaggcacgacctaca Protospacer .*.*** ..**** ****** ***********
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
370812 : 384634
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP041660|370812:384634|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP041660|370812:384634|375733_376627_-|WP_143869885.1|DBSCAN-SWA MDITKQTLSSLYTAVNAAFARGLAMHSPQWSSIATEMPSSTSQENYEWLGEFSALKKWIGDRQINKAKAHSYAIKNEKYEGTEGIPADYIEDNRYPALMKKFEDMGYAAQTHPDQLVFALLANGFTQTCYDGQNFFDTDHPVGKEGQEESVSNMQAGSNPAWFLLDTRRPLKPLIFQKRRDYRLQAKTDAGNSDHVFMTDEYLYGVDARVNAGFGFWQLAFGSKATLDEDNFNSAMETMMGYKSDQGRKLGVMPNLLVVGPKNRAKAKKVIEAENKAQGESNTNYKAVEVLVVPWLE >NZ_CP041660|370812:384634|373458_373692_-|WP_143869880.1|DBSCAN-SWA MAKNLALEIAIKAKNLASDAFDKVKSSLTSTSATAGKTEKSLDQLNSQLDEIGKGKAVIDEFKLLNTEINQSQTNLK >NZ_CP041660|370812:384634|378461_378908_-|WP_143869888.1|DBSCAN-SWA MAGANVSIDLNGDNKIVDVLQDMLDRSMNLEPAFNQIGEYLIESHQARFELEITPDGDLWEPLSPETLKAKTPENRILQDSGTLRDKLSYEISATSLNFGTNMEYGATHQFGREADGIPQREWLGLSTGQWNDETEILDILGDFLLDE >NZ_CP041660|370812:384634|379095_380556_-|WP_143869890.1|DBSCAN-SWA 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17 | Pseudomonas_phage(27.27%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
390883 : 398208
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP041660|390883:398208|DBSCAN-SWA CATGCCTAAACGAAATTGGAAGTATGTGTCGGGCCACGATCCAGTGGACGCCTTAGATAAATGCCTACAACACGCCAAAGAAAAGCACAATTTAAGCGTTGAACGCATTATGGACAGACTTGGGATGGCGAGTAAATCGCAAATGTATGGCTACCTGGCGGATGCCAAATTGCCGGTTAATCGCCTGATCGCGTTTGAGCAAACTTGTGGTATTCCGTTGTTTACCAAGTATAGCGCCGCTTCACAGGGGTTTATGCTTGTAAAAATTCCAACTGGGCGCAAGGCCGAAGCTAAAGAGTTAGCCGAGCTACAAGTCGCACTGGCTCAAGTGGGTAGTCAAATTATCAACTTTTACAACGGTGAATGTAGTGTTGATGAAACAACCAACATGATTATGGCAATGCTACAAGATTTGGCTTACCACAAGTCGGAATTAGAACATTTTAAGCAGCCAGATTTGCTAGGAGATCACAATGGCTAGTAATCAAATTATTAGAACCTTATCTGCTATTGAATTTTTGTCTGAGCACATTGCACACGGTATTAGCCAAGCAGAGTTAGCGAAGGCATTAAACGTTCAAAGCACCGAAGCGGGTCGCATTCTGAGCAACCTTGCTCAAGCTGAGTGGTTAGAGAAAACCCCTCACAATAATCGTTTATATCGTTTAACACCTAAAGTGGGTGGCATTTCACATAAAGTTGAACATTCGCTGCGTGTTGCGCGAGAGCAATTACGCCAAGACGCGTCTACATACGCTGGTTTTTAGGGGGTAATGATGACCACAAATAACAAAGATGTAATGGATATGACCACAGCAGAAGAAGCTGCGTTATACCAAAAATTAAACGATGGTTATGGTGAATCTCGTGACGAGTTGAATACGCTTGTTGGGCAAATACAAATGGCGAACTCTTTCGCTAAATTGGGCGACGCCATCTCTTTACAGAAACTGGAAGAAATCAGAGAACGCAAGCTATACAAGGCATACAAAGGCAAACGATTCATTTTACCAAACGGAGAAACGGCGGCGGCCGCCGATACTTGGGAAGGTTTCTGCCAATTTATAGGCTCCTCGAAAGGTGTAGTTAATGAAAGATTGGCAAATCTGAAACAGTTTGGCTTGGAGGCTGCCGAAGCGTTTGACAGATTAGGAGTAAATACCAAAACCCTACGCCTTGCTCGCAAGCTACCAGATGACGAGCAAGCGATTGTCGCTGAATATACGTCTAAACCTGAGGTGACAAAAGAAGACGTCCAGCAGTTGATTAACGAATTGGACGAAAAGCATCAAAAAGAATTAGACGATAAAGAGTCAGAGCTTGCGAACAAAACCAAAGAAATAGACAGCCTTAAAGCCAATTTGAACGCAAACCGCAGCTTGTACAGCAAAGCTCAAGAAGAGTCTGAATCGCTCAGAATCAAGTTGGAAGAGAAGCGCCTAAAACCGAACGACTATTCAGAGCTGACTAAAGATATTGAAGAAATATCTAAAAAAGCTTCTTTACGCGTGGTTGAGGCGGCTATGCAAATGTCTGACTTAGCACTACAGCTAAACACTAAGCTGATGGAATGCAACAACCCAGTGCAAGAAACGGCGTTAGAACGTGCTTTAGAAATTGCAATTCCGCAGGCCCACACCGCTTTTTTTGAAGCCTTGCAACGCGCGGCGGCGTTGTTTGATGAGTTTGATCACAGCATGGGCAACTTTGCCAATCAACCGAAAGCTAACTGGGAATTAATTAAACAGTTAGCTACGCCAGTAAATGCTGAATAAGGAGCGACCATGTCAGCCACTGTAAATCATGATTATTTTGATGCCTTGCGCAATTTTGCTTTGAAACTAGAAAAAGCTGCGCATGGCACCAAACAAAGCATCATTAGCGATGCGCTTGCTTATTTTGGCTGGTCGAATCACCACAAGCTGTACCGAGAAATGGATAGACATGGCTTGAAATATAGCAAGCGTAAAACCAGAAGTGACAAAGGAAAAACGGCTCAAGACGAAACTGCACTAGAAATGGTTGCCGCCACTTTACATACCGGCAATCGCAGCAACGGCAAGCAAATGATGGAAGTGCCCAACGCAATTTCAATACTCAGCCAAAACGGGTACGACTTTATGAGTAAAAGCACGGTAAATAGGTTACTACGCGAGCGTAAAATGAACGCTAAAGCAATGCAGCGCGATTCGGCAGCAACGCAATTACGCAGCTTACACCCGAATCACGTGCATCAAATTGACCCTTCGTTGTGCGTGATTTATTACGACCCTGAAAGCAAAAAAGTGAAAGGTTCTAACGTCTTTCAAAGCTTAGCGGATGAATCTGCTTTTTATAAAAATAAACCGGACTCATTTACTAAAACCGCTAAATTGCGTGTATGGCGTTATGTGTGTACCGACCACACTAGCGGGCATATTTGGGTTAAGTATTACAGTGCAGCGGGTGAAAGCATGCAGCTGGTTGCTGATTTTATACTTTGGTGTTGGATAAAACAGCAAGAACGTGAAGCACATGGTTTGCCATACATTTTATATGTAGACCGAGGCACCGCCAATATTGCGAAACCTGTTAAGCGTTTGTGTGATTCGCTGAATGTTGACCTGCGAACACACGACACGGGCAATTCACGTGCGAAAGGCCAAGTAGAAAACGCTAACAATATAGTCGAAAAACTTTTCGAAAGCCGTTTGTTGCTTGAGCCGGTTAAATCGGTAGATGAAATGAATGATGCGGTGTTTGCTTGGCAAAATGCTTACAACGCCGATCTTATTCCCAACTATGATGCAAAGCTAAGCCGAACCAATAAAAGTCGACTTGATGTTTGGCGCACTATTCATACAGCTGCGTATAGCAAGCATTTACGCATTTGCCCGCCTGAGCAAATTTGCCGCTATATGCTGAGTTATGAGCCGGTTGAGCGAAAGGTCAAAAACAATTATGTGATTACCTTTGTTCACCCTGCTATTGGTAAAAGCGCGCCTTATTTGCTTAAAAATTTGCTTGGTGTTTTGGTGGGCGAATCAGTAAAAGTTGCGCCGATTATTTTGGATGGCTCGACTGATATTTTAGTGTTCACCAAAGACCCACTATCCGGCAAAGATATTGTTCACCAAGTGCAAATTGATGAGCGCGACGAGTTTGGCTTTAGCTTACAAGGTGCAGTAATTGGCGAGGGTTATGCCGCTTTAGCGGATGACCAAATTGACAGTAATCAAAAAGCGGCCAATGCATTGGCTTACGCTGGCTTGAGCCAAGAAGATGCAGAGAAAGCGCGCAAGAAACACGAAACCCCATTTGATACCGAGATTAATGCCCATAGCCATTTGAAAGATATTCAGCATACCGCAGCGTTTGCAAGCAAAGGCCACGAAATTGATGTACCTGAAATGTTTACCCCTGAAAAAGGTGAAAAACGGTTGGATGCATTAGAGGCCCGTATGCAAATTAGCGACATTATTAACCGCCCACTGAGTGCTGCCGAGGCAGCGTGGATTAACCAGCAGGAGATTTACCCTTCAAAACTAGACGATATAGCAAACCACGTTAAATCGGGCGCGTTATCGCGACCTACATTAAAAGTAGTTGGAGAACACTAAATGTCTGCAATACCTAAGACCTGGCATTTAAGGCTCGGGCGATTATTGGCAGCACGTGGCATTAATCAAAAAAATATTTGCCCGTTTGCACAAACTAAAGGGGTGCAAGTTAGCCCCGCGGTTATTAACCGCATTATTAAAAACAATGAGTGGCCCAAGCGTGAAAACTTTTGTGCCCAAATTAAAAGCGTGTGTGAGCAGTTTGCTGTTGAAAAGCTTGAGTGTACTGCTGAAAACGTTAGCGATATTTGGGCTGAAGATACCAAAGGCGGCGTAACGGTAACTGAAGTTCACGAAGCCATGCATATGAAACGAACCAAGGCGCAAGCCGAGGAACCTACCACTGAATTTATAGCACCGGAGAATGAAATGCTGGAGCACAATACGATTAAACATTTTGGCTTAGCTGGACAGCCGTTTGATAACGAGATCAACTGTTTAGAGGATATTTATTTGAATCAAAGCTTGTTGATGAATAAAGAAGCCATGATTAACGCTGCAACCACGGGCGGTATGATTAGCATTATTGGCGAATGCGGCAGCGGTAAATCCATTTTAAAAGAGTTGTTTGTTGATGAATTGGAAGATGAACACCCGTACTGCCAAATTATTGAGCCAGCTACGTTGGATCGCCACCGCATTACCACTAGCTCGGTTACGGCTGCTGTGTTTGAAGCTTTGCATATTGATTCTATTCCACAGTCTATTGAACAGCGTGATCGTTTAATTCGACGCGAGGTTAAAAAGCTTGCAAAAGAAGGTAAGCGCTTTGTGTTTTTAGTGGATGAAGCGCACGCACTTCACTATTCAGTAATCAAGCAGCTTAAGTGTTTACGCGAGGCTGCTGGCAATTTAACAAAAGTGATAGGTGTTATTTTACTGGGCCAACCTGAGTTGCATGAGACGTTAAGCGGCAGTAATACCCGTGAATTTAGCTGGCGTTGTAAACGCATGGAAACCCGCGCCTTGGGCGACGAAACCCAAGCTTACATTGAGTTTAAATTAAAGCGCGCCCGCAAAGCTTTTGATGATGTGTTCTCGGACGATGCTGTGGCCGCCATAAAGCAGCGTTTGTGCGGTTCGCGCAGCAATGGCATTAATCGCAACAACTCAATTGTTGATATGACGTATCAATTACACGTTAACAATTTATGTAACGAAGCCATGAATGTTGCCGCCAGAGTTTCTGAACCTTTGGTAAGCGCTGCGATTATTAAAAAATGTAGGGGGGCAAGCTAATGACAATTGTGAATGAAAAATTTGAATGTATGTTGTGCGGTTGGAAAGGTGTTACAGCTGATTTAGCCATAGCTGAAGGGGCACTAACTTGCCCTAGTTGTTACGGCCAACCAGAAGACTTACCTGAGTTAGAGCAATCAGGAGAAAACCATGAACCAAAATAACGAAATACCGGCAGGTTATTGGCAAGATGCCAAAGGTTCACTCGTACCCGAAAGTATGATTAAACCAATTGATAAAGCTAGAAATGAGTTGGTTTATGAAGTGGTTGAAAAAGCCCTAGAACTGCGAGAAGCACTCGCTAAATTCAAAGCATCTACATTTGCTGATATTGATGCTTTTGTTGAGCTATCAGCCGAAGAGTACGACGTTAAATTAGGCGGTAAAAAAGGCAATGTGACGCTGCATTCATTCGATGGTCGGTACAAGATTGTTCGATCTATTCAGGAGCACATTGCGTTTGATGAACGTTTGCAAGCCGCACGAGAGTTAATTGACGCGTGCTTAAAGGAATGGACGAAAGACAGCGTGCCAGAGTTAAAAGCAATTATTGATCGCGCTTTCGATGTAGATAAAGAGGGCAAAATTAACACAGCGCGAGTTCTGGGATTACGTCGTTTAGATATAAAAGACGAACGCTGGTTAAAAGCGATGACCGCAGTATCCGAAGCTTTGCAAGTTGTCGGTAGCAAAAGTTACATCCGTTTATACAAGCGTGTTGGCGATAGTCAGCAGTATGTACCCATTTCACTAGATTTGGCTGGCGTTTAGTCAGCCTTCATTTTCAACATAAACAATAGAAGGTCATTATTATGAATAAATCTCAATTAGTAGAACAAATTGCAACACAGGCTGATATTACAAAAGCGGATGCAAATCGTGCTGTTGATGCATTGGTTGATGCGGTTAAAGCTGAATTGGCTGAAGGCGGTAAGGTTGATTTGGTTGGTTTTGGCTCGTTTAGTGTGAGTAAACGTGCTGCTCGCGAAGGACGCAATCCTGCCACTGGCGAAACGATTAAAATTGCTGCGGCAAATGTTCCGAAATTTAAGCCAGGTAAAGCGTTAAAAGAAGCTGTTAATTCTTAATTTTAACTAAATCAACAAGCCCCTGCGGGGGCTTTCACTTTATTAATGAATAAACGGTGGTTTGCATGACTACATTTTTGAAGCGACATAAACAATATATTCAATTAATTCATATTGCTAAGTCTCAGTTACGTATTGATAACGACGTCCATCAAATGAATTGCTTACACTTTTCTGGTCAGCGAACGAACTCTACAACTCAGATGACACGCTTAGAACTAGCCAATTATCTTGAACATTTAAAAAATCTTGGGTTTAAACCAACTAGCAAAAAGCGAACAGGCAATAAACCAGCAGGTTTTTACAGCCCTAAAGGACGCGGAACTGTTCACGATAAATTGCGCTCTGTATGGTTTGAAATGTGTGATGCAGGATTTATTCATTCTAGGTCTGAAGAGGCGATTTTTAATTATACGTGGAATCAGCTTAAAGCTGACTGGCCCGAGAAAGTAGCAGTACCTCGTACATTAAATAACATTCCAACAAAGTGCATTCACCCGGTAATTAATCGCCTTAAAAAATGGAAAGCGCGTTGTGTTAAGGAGGCTGCAAATGGCTGATACTGTTGTAAAAGAAAAACAAGGTACCGAGTTTTTAATGTGCATGTCGGCTCAATTAGCTGAGTCTTTGGTTAATGCGGGTGTTGATGAAACTATCGCAAACAAATGTGCCTGGGATGCAGTCGATTTTGTTCGCAAACAGCATGGTGGATTAGTTTTATATATACCAAAAGGTAAAAATTTAGACGCAGTGCTGCAACAAATGAAAATTTTTGAAGAGTTTACAGGAAATAACCAAGCTGAGTTGGCTAGAAAATATGGTTATTCAATCCAGCACATATACCGTATCTATAAACAAATTTTGCAGCATAAACGCGAAAATAACGATTTACCGCAAGCTGATATGTTCTATCAGGGGGACGCATGAAGCTTGCTCGTTGCCCTGTATGCCATACTCATATTGATTTACTTTCGTTAGTTGAAGATCAAGCAGGTCGTGATCTTTTAATCGCAGTGACAAAATTAGAAACTTGGTGTGCGCCACCTGTATTGGCGTACATTGGCCTATTCAAACCCGCTAAAAGCGACCTAAACAACGCCCGAGCACTTAAATTATTAAATGAAGTGCTTGGTTTTCATTCAAACCGAAAATTAATAGCCGAAGCTTGCGACGTAACTGTGCAACAAATCAGAGCTAAACGTGTTGAAAGTAAGGCAAAGCCACTTAAAGATCACGCATACCTAAAATCTGTAATTGAAACCCTCAAATCTAACTACCATACACCGGTTCAGCCAACAAAAACCACAATAAACCCTATAAATAGACAGTTCACAGCAGAAGAGTTAGCTAGACAGCAACAAGCGCATTTTGATAGATTGAAACCGATATTAACAAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP041660|390883:398208|396873_397368_+|WP_143869915.1|DBSCAN-SWA MTTFLKRHKQYIQLIHIAKSQLRIDNDVHQMNCLHFSGQRTNSTTQMTRLELANYLEHLKNLGFKPTSKKRTGNKPAGFYSPKGRGTVHDKLRSVWFEMCDAGFIHSRSEEAIFNYTWNQLKADWPEKVAVPRTLNNIPTKCIHPVINRLKKWKARCVKEAANG >NZ_CP041660|390883:398208|395870_396491_+|WP_143869913.1|DBSCAN-SWA MNQNNEIPAGYWQDAKGSLVPESMIKPIDKARNELVYEVVEKALELREALAKFKASTFADIDAFVELSAEEYDVKLGGKKGNVTLHSFDGRYKIVRSIQEHIAFDERLQAARELIDACLKEWTKDSVPELKAIIDRAFDVDKEGKINTARVLGLRRLDIKDERWLKAMTAVSEALQVVGSKSYIRLYKRVGDSQQYVPISLDLAGV >NZ_CP041660|390883:398208|394481_395720_+|WP_143869912.1|DBSCAN-SWA MSAIPKTWHLRLGRLLAARGINQKNICPFAQTKGVQVSPAVINRIIKNNEWPKRENFCAQIKSVCEQFAVEKLECTAENVSDIWAEDTKGGVTVTEVHEAMHMKRTKAQAEEPTTEFIAPENEMLEHNTIKHFGLAGQPFDNEINCLEDIYLNQSLLMNKEAMINAATTGGMISIIGECGSGKSILKELFVDELEDEHPYCQIIEPATLDRHRITTSSVTAAVFEALHIDSIPQSIEQRDRLIRREVKKLAKEGKRFVFLVDEAHALHYSVIKQLKCLREAAGNLTKVIGVILLGQPELHETLSGSNTREFSWRCKRMETRALGDETQAYIEFKLKRARKAFDDVFSDDAVAAIKQRLCGSRSNGINRNNSIVDMTYQLHVNNLCNEAMNVAARVSEPLVSAAIIKKCRGAS >NZ_CP041660|390883:398208|392666_394481_+|WP_143869911.1|integrase,transposase|DBSCAN-SWA MSATVNHDYFDALRNFALKLEKAAHGTKQSIISDALAYFGWSNHHKLYREMDRHGLKYSKRKTRSDKGKTAQDETALEMVAATLHTGNRSNGKQMMEVPNAISILSQNGYDFMSKSTVNRLLRERKMNAKAMQRDSAATQLRSLHPNHVHQIDPSLCVIYYDPESKKVKGSNVFQSLADESAFYKNKPDSFTKTAKLRVWRYVCTDHTSGHIWVKYYSAAGESMQLVADFILWCWIKQQEREAHGLPYILYVDRGTANIAKPVKRLCDSLNVDLRTHDTGNSRAKGQVENANNIVEKLFESRLLLEPVKSVDEMNDAVFAWQNAYNADLIPNYDAKLSRTNKSRLDVWRTIHTAAYSKHLRICPPEQICRYMLSYEPVERKVKNNYVITFVHPAIGKSAPYLLKNLLGVLVGESVKVAPIILDGSTDILVFTKDPLSGKDIVHQVQIDERDEFGFSLQGAVIGEGYAALADDQIDSNQKAANALAYAGLSQEDAEKARKKHETPFDTEINAHSHLKDIQHTAAFASKGHEIDVPEMFTPEKGEKRLDALEARMQISDIINRPLSAAEAAWINQQEIYPSKLDDIANHVKSGALSRPTLKVVGEH >NZ_CP041660|390883:398208|397731_398208_+|WP_143869917.1|DBSCAN-SWA MKLARCPVCHTHIDLLSLVEDQAGRDLLIAVTKLETWCAPPVLAYIGLFKPAKSDLNNARALKLLNEVLGFHSNRKLIAEACDVTVQQIRAKRVESKAKPLKDHAYLKSVIETLKSNYHTPVQPTKTTINPINRQFTAEELARQQQAHFDRLKPILTK >NZ_CP041660|390883:398208|397360_397735_+|WP_143869916.1|DBSCAN-SWA MADTVVKEKQGTEFLMCMSAQLAESLVNAGVDETIANKCAWDAVDFVRKQHGGLVLYIPKGKNLDAVLQQMKIFEEFTGNNQAELARKYGYSIQHIYRIYKQILQHKRENNDLPQADMFYQGDA >NZ_CP041660|390883:398208|391355_391649_+|WP_143869909.1|DBSCAN-SWA MASNQIIRTLSAIEFLSEHIAHGISQAELAKALNVQSTEAGRILSNLAQAEWLEKTPHNNRLYRLTPKVGGISHKVEHSLRVAREQLRQDASTYAGF >NZ_CP041660|390883:398208|391655_392657_+|WP_143869910.1|DBSCAN-SWA MMTTNNKDVMDMTTAEEAALYQKLNDGYGESRDELNTLVGQIQMANSFAKLGDAISLQKLEEIRERKLYKAYKGKRFILPNGETAAAADTWEGFCQFIGSSKGVVNERLANLKQFGLEAAEAFDRLGVNTKTLRLARKLPDDEQAIVAEYTSKPEVTKEDVQQLINELDEKHQKELDDKESELANKTKEIDSLKANLNANRSLYSKAQEESESLRIKLEEKRLKPNDYSELTKDIEEISKKASLRVVEAAMQMSDLALQLNTKLMECNNPVQETALERALEIAIPQAHTAFFEALQRAAALFDEFDHSMGNFANQPKANWELIKQLATPVNAE >NZ_CP041660|390883:398208|390883_391363_+|WP_143869908.1|DBSCAN-SWA MPKRNWKYVSGHDPVDALDKCLQHAKEKHNLSVERIMDRLGMASKSQMYGYLADAKLPVNRLIAFEQTCGIPLFTKYSAASQGFMLVKIPTGRKAEAKELAELQVALAQVGSQIINFYNGECSVDETTNMIMAMLQDLAYHKSELEHFKQPDLLGDHNG >NZ_CP041660|390883:398208|396532_396808_+|WP_143869914.1|DBSCAN-SWA MNKSQLVEQIATQADITKADANRAVDALVDAVKAELAEGGKVDLVGFGSFSVSKRAAREGRNPATGETIKIAAANVPKFKPGKALKEAVNS |
10 | Burkholderia_virus(42.86%) | transposase,integrase | attL 388391:388405|attR 396779:396793 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
871371 : 887803
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP041660|871371:887803|DBSCAN-SWA 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10 | Mycobacterium_phage(12.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2665179 : 2675162
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP041660|2665179:2675162|DBSCAN-SWA 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AATTTGTTTACTCGCTGTTTGGCTCGGTAGCAAATTAGCAAGCGTAAAAATTTAGTCTGAACGGGTACATAATGTTAGATCCAAAATATTTAAGAAACGAACTGGAAGCAACTGCCGAAAAACTGAAAAAACGTGGTTTTTCGTTGGATACTCAAACCGTTGCTCAATTAGAAGAAAAACGAAAAGCGCTGCAGGTTAAAACTGAACAATTACAAAACGAGCGTAATGCGCGCTCGAAATCCATTGGTAAAGCTAAAGCACAAGGTCAGGATATAGAACCATTACTGGCTGAAGTGAGTGAACTCGGTGGTGCATTAGATTCAGCTAAAGCAGAATTGGCTGAAGTGATGAATCAATGGGACAGTCTGGTGTTAGGTATACCTAATTTGCCAGATGAATCGGTACCCGTTGGCGAGAATGAAGATGATAATGTAGAAATTCGCAAGTGGGGGGAAATTCCACAATTTGATTTCGCCGTAAAAGACCATGTTGACGTCGCTGAAGCGTTACACCGTGGTTTAGATTTTGAATCTGGGGTTAAATTATCTGGCGCACGCTTTGTTGTCATGCGTGGCAAAATTGCCCGAATGCACCGTGCACTGGCGCAGTTTATGTTAGATTTACACACTGAGCAGCATGGTTATCAAGAAGCGTATGTACCTTATCTGGTCAATGCAGCGAGTTTATATGGAACAGGACAATTGCCAAAGTTTGGTGAAGACCTTTTTCACACTCAGCCTTTAACGGCAGACGGGCAAGGGATGTCGCTTATCCCAACAGCTGAAGTGCCTTTAACTAATTTGGCGCGTGACGAAATTTTTGATGAGGAACTGTTGCCGGTCAAATTAACGGCCCACACACCTTGTTTTCGTTCGGAAGCAGGTTCTTCAGGTCGCGATACCCGGGGGTTAATTCGTCAGCACCAGTTTGACAAAGTTGAACTCGTTCAGTTGGTTAAACCCGAAGATTCAATGCAGGCATTAGAAGAGCTAACTGCACATGCAGAAACTGTATTACAAAAGTTAGCGCTACCATACAGAGTCATGAGTTTGTGTACTGGAGATATGGGTTTTGGTGCAGCTAAAACATACGACTTGGAAGTTTGGTTACCGGCACAAAATTGTTATCGCGAAATTTCTTCCTGTTCTAATATGCAAGATTTTCAGGCGCGTCGCATGCAAGCTAGATTGCGCAGAAAAGGTGTCAAAAAACCAGAATTGCTCCATACTTTAAACGGCTCTGGATTAGCCGTCGGTCGCACCTTGGTCGCCATTCTTGAAAACTATCAGCAAGCAGACGGCTCGGTTGCCATTCCAACTGTATTGCAGCCTTATATGGGCGGAGAAACACATATATCATTAGCTGACTAAATGTCAGCTAAAAAACATTAAGGGCGAGTTAAAGATGACAGGCAAGAAAAAAACGGCAACACCGACGCCGGTAAAAATGTTTTTAAAGACTGTATATTGGCTATTAATTATTGCGATTTTTGGCTCAGTACTTGTGTTAGCGTATGACGCTTACTTAACCTACAGTAATGCAAGCAAAGGTTAAAAGGTTAAATACATTTAGCGGGTTTAGGTAAACCTGCTATCTTGGTTGCCTGTTTGGCTGGACCCTTGGGGAATAGTTTGTACAAGTATGGGCTATTCCCTTTTTCTTTACCTAGTTTTTGACCAATCGCTTTGACTAAAATTCGAATTGCCGGGCTAGTTTTGAACTCCAAATAGAAGTTTCTAACAAAGTTAATCACTTCCCAATGCGCTTCTGTGAGCACTATATTTTCTTGTTTCGCCATATATTCAGCAATTTCTTGATCCCAATCTTGCACATTTGCTAGATAACCATGTTTATCTACTGGGATTTGTTTATTTTTGATTTCAATTGTTTGCATTTTTATATCGTCAGTTGGCCAGATCGTCTTAAAAAGGAATAATGCACTTTCTACTGAGTTTTAGCTCAACCCATTCAGATTGAGATATTTGATTTATGTTGCCTGGTATTTTTTGAATACCTCTGGCTGATGCGTCCGTTGCATGGATGTACACATGGCTCAGCTCAGCTAAAGCTTCAAATTTAAGTATATTGTAACAACCCTCTAGAGCAAGCAATATGTCCAAACCTTGTTCAGCTTGCACTGTAAGGAGCTCGAATTCTGCTTGTGAAATGAGTCTATTGATTAAGATTAAACTAGGCATAACATTGGCTCAAAATTTTAAAATGACGTTGTAATTGGCTAATTGCAATAACCATTCACTTTTTGTTAAGGCTTGTGTTTCGATAAGAAGATCATTTTCATTTAAATGCAAATCAGCCAAGGACTGCTGTTCAATAAATACATCCTCAATATCGTACAGGTCTAATGCTTTGAATCCGTCGGTATAGTTTTTCAATTTTAGCAATTCTGCGTTTTGCGATTTGAGTAGTTGTAAAAGGCCACTCCCGCTGAAAAATAATGCGACAGCTTGTTCAAAAGTTGCCAAGGTTAAAGCGAGCTCAAGCGCTTCTTGTCCTTTAGCATTTTCAAATGGTGCGCTGGTGATAATAATTGCATGTGACGTATTATCCGATGTGTTAACGGGATTCAAAACTGTAATACCTTATCTGCTTGTGCTTGAAGTTCAACATATTCAGCTAAACCACCTAGCCGAAATGGGGTCGCTAAGTTATAACTGGATTTACCATGATAATTAGCTTCATCTAAATTTAATACACCACGTCTTTGTGCCGCAGCAGAGCAAATAATTAACTCTATTTTGTATTGTTCGGCTAATGTTTGCCATGCTTGGCACAAATCAAATTCGTCAGTGGGTGGGGATCTCAGTTCGTTGGCGATATAGACCCCATCGGAGTAAAAAAACACAGCGGGTAACTGATGTTTTTGACACGCTTGTTTTGCAAATTGAAAAGCAGAAAGCGCGCTTTGTTGTTCGGGTGAACTGGTCACAAATAATAAAAATCTAGCCATAGTTTAAGATATCACATACAAAAAAGGCCTCATCAGAGGCCTTTAGTATAACAGCTTGCAGGAGGATTAATCATCTCCGCCAGCAAATGACATTAAGATATGTAACAAGCTAACAAAAATATTGTAGATAGAAACGTATAAAGTGACAGTTGCAAGAATATAATTTGTTTCACCGCCACGCACAATTTCACTGGTTTGCATCAATATTGCGCCGGATGAAAATAAGATAAACATGGCACTGATAGCCAAAGCAATCGCCGGCATTTGTAAAAACAAGTTAGCAATAACGGCGACAATTAACACGACAAAACCAGCCATCATCATACCACCCAAAAATGACATGTCTTTCTTGGTGGTTAAAACGTAAGCAGATAGTGCAAAGAAAGTTAATGCCGTACCGCCTAACGCCAATACGATTAAATCAGAAGCACCTGCACTGACGACCATAGACAGAATTGGGCCTAAGGTGTATCCCATAAAGCCAGTTAAAGCAAAAACGCTTAATAAGCCTGCTGAGGAGTTTGCAGTTTTATGAACCAAAAACAACAAGCCATAAAAGCCAACTAGAATGACTAAAAAGTGTGGGCGGGGTAATCCCATCGCACCGGTTACGGCTGCCACAATAGCACTAAATGCTAAAGTTAATGCCAATAGAGAGTAGGTATTACGTAATACCTTATTCGTTTCGATGACCGAAGTACTGCTGTGTTCAGCATAAGTAGTCCGATTTTCCATAATGCACCTCTTTGCTTAAATAATTTAATTCAGTTACTTAGAATGTAATTGAGATATTTGGTTCGCTTTATAGTACAGAATATTGTTATTCAGTCCATAATTTTCAAGCTGATTAACGCTAATATTTGTTTATGACAAGGGGTCATTGTAAAGATGAGCCCTAAAATAGCATGAAGCTGTTGAATAATTGTTCGTTTAGAGCATTATCTGAGCGAACAGTAAAAAAATCAAAAAAATATCGTATTTATGCTTTACAAGTCCCTCATAAGTACTTAATATGCGCGCCGTTCCCAAGGGAACAGCAAGCAACAAAGCGGTGAGGTGGCTGAGTGGTTTAAAGCACCGGTCTTGAAAACCGGCGTACGTTAATAGCGTACCCAGGGTTCAAATCCCTGCCTCACCGCCACTTCTTTCCCAGCTCGACTCATATTCAATAACTTTCCATTATTAAAGCCATATTGGCTAGCTATCTATATTTTTAGTAAGCTGAATCTTTTATTTTTTCTAATTCTTTACTTTTCCTAATCTTTTTATAACAATCAGATATGTAGCATTTGCTATACCAGTTATTTTATTTGTGTCCATTAAGTGCATTGAATAACGTATGAAGATAAGCCAATTATTACGGAGTCCGAATTGATTAATATACTACTGGTTGATGACCATGAACTCGTTCGCACAGGGATCAGTCGTATTCTAAATGAAATTCGCGGCATTAAAGTTGTAGGAGAAGCGCAAACTGGCGAAGAAGCTGTTCAGTTTTGCCGCAAGAATAACCCAGATGTTGTATTGATGGACATGAATATGCCAGGTATTGGTGGTATGGAAGCAACAAAAAAAATTGTACGCTATTGTCCAGATACTAAAGTCATATTTTTAACGGTGCATACTGAAAACCCGTTGCCATATAAAGTAATGCAAATCGGCGCGTCTGGTTATTTAACAAAAGGTGCAGCGCCGGATGAAATGATTAAGGCGATCCGCCAAGTGCATTCAGGGCAAAGGTATATTGCACCCGATATAGCTCAGCAAATTGCGTTGTCTCAAGTTGGTGGCCAACAAGAGAATCCATTTGATATATTGTCAGAGCGTGAACTGCAGATCATGATGATGATAACCCGGGGTCAAAAAGTTCAGGATATTTCAGAGCAGCTTAATTTAAGTTCTAAAACTGTGAATAGTTATCGCTATCGTATGTTTGAAAAACTGAATATTGGTGGCGATGTTGAACTGACACACTTAGCAATAAAGTATCGGATGTTGGATACCAAAGACCTTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP041660|2665179:2675162|2672762_2673146_-|WP_143871630.1|DBSCAN-SWA MARFLLFVTSSPEQQSALSAFQFAKQACQKHQLPAVFFYSDGVYIANELRSPPTDEFDLCQAWQTLAEQYKIELIICSAAAQRRGVLNLDEANYHGKSSYNLATPFRLGGLAEYVELQAQADKVLQF >NZ_CP041660|2665179:2675162|2673212_2673881_-|WP_143871631.1|DBSCAN-SWA MENRTTYAEHSSTSVIETNKVLRNTYSLLALTLAFSAIVAAVTGAMGLPRPHFLVILVGFYGLLFLVHKTANSSAGLLSVFALTGFMGYTLGPILSMVVSAGASDLIVLALGGTALTFFALSAYVLTTKKDMSFLGGMMMAGFVVLIVAVIANLFLQMPAIALAISAMFILFSSGAILMQTSEIVRGGETNYILATVTLYVSIYNIFVSLLHILMSFAGGDD >NZ_CP041660|2665179:2675162|2668525_2669854_+|WP_143871624.1|DBSCAN-SWA MLFESAHKPLAARMRPSKLEDYIGQQHILAAGKPLYRTIKSGNVHSLILWGPPGTGKTTLAELIAQYANAHIERLSAVNSGVKDIRLAIENAQQIAQQGGQKTVLFVDEVHRFNKSQQDAFLPFIEDGTVIFVGATTENPGFELNRALLSRARVYLLQKHEKQDLKKLLRLVKERPDLSGESAKIVLTEQQADLLIDQAGGDARQLLNLIEVLTDMVELDAQKQARVSNEHIQTLVQHRIVAGDKGGDLFYDMISAFHKSVRGSDPDAALYWYARMLKAGVDPLYVARRLLAIASEDIGNADPRAMQLALNAWDCYHRVGPAEGERAIAQACVYLACAAKSNAVYSAFKAALKDAAEQPSYDVPYHLRNAPTQVNKNLGHGAEYRYAHNEANAYAAGECYFPPELQGRQYYYPENRGLESKIAQKLDYLKHQDLMSDKKRYE >NZ_CP041660|2665179:2675162|2667899_2668526_+|WP_143871623.1|DBSCAN-SWA MKKIVSSLVLLILSFAVSAEQTVSQQLKEKLSEIAGFSAQFKQKVLDSKKQVVQLSEGNIELIQPNKFRWETLPPNDSLLMSDGVSVWFYDPFVEQATVYNFADTVNSNPILLLLQPDASAWQEYIIEKPSASVFKVTSKSQRNQIEYIEISFTQDNAVEWLTIKDRQQQTSHYQFFQFKQTQLSDFGKEYFVFKLPEGADLDDQRQQ >NZ_CP041660|2665179:2675162|2671736_2672072_-|WP_143871627.1|DBSCAN-SWA MQTIEIKNKQIPVDKHGYLANVQDWDQEIAEYMAKQENIVLTEAHWEVINFVRNFYLEFKTSPAIRILVKAIGQKLGKEKGNSPYLYKLFPKGPAKQATKIAGLPKPAKCI >NZ_CP041660|2665179:2675162|2670249_2671548_+|WP_143871626.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLDPKYLRNELEATAEKLKKRGFSLDTQTVAQLEEKRKALQVKTEQLQNERNARSKSIGKAKAQGQDIEPLLAEVSELGGALDSAKAELAEVMNQWDSLVLGIPNLPDESVPVGENEDDNVEIRKWGEIPQFDFAVKDHVDVAEALHRGLDFESGVKLSGARFVVMRGKIARMHRALAQFMLDLHTEQHGYQEAYVPYLVNAASLYGTGQLPKFGEDLFHTQPLTADGQGMSLIPTAEVPLTNLARDEIFDEELLPVKLTAHTPCFRSEAGSSGRDTRGLIRQHQFDKVELVQLVKPEDSMQALEELTAHAETVLQKLALPYRVMSLCTGDMGFGAAKTYDLEVWLPAQNCYREISSCSNMQDFQARRMQARLRRKGVKKPELLHTLNGSGLAVGRTLVAILENYQQADGSVAIPTVLQPYMGGETHISLAD >NZ_CP041660|2665179:2675162|2669846_2670233_+|WP_143871625.1|DBSCAN-SWA MNSPLVYVFIALGGAFGASLRYFLSQQALIWFGKSFPFGTLIVNIIGSLLIGFLYTLIAQGQLQIIPWRTFIGIGFLGALTTFSTFSMDTLLLMQQGDWLKAVLNILFNVLICLLAVWLGSKLASVKI >NZ_CP041660|2665179:2675162|2665179_2667897_+|WP_143871622.1|DBSCAN-SWA MVVLSESAESKSLTGIQRLLEVGLITFAGGALFILLALVSFDPLDPSWSQSGYQVPIRNMAGAAGAWLSDLLLFFFGAVAYLVPFAVAFIGWALFQKRPNFFEIDFLALGLRIIGLFLLLIATTSLSSMNFSDLFVYSSGGLLGDVVSQSLIPYFNFIGTTLLLLCFFCTGITLLFGISWLYIIDKTGESVIGVSLFVWRQINRLCNKLKDKDDVKASSVDSAVTGKDKNKVDATTQSNTPVVEAQSDIKDSEQATSKMPSLSALFGSKDEADVQTQKSSDTLTPLTKPASTAAAQTATQASEQMASHTGVAPAEEPALHDASDMDDVVETETRKEPVLGDLAEVDDDDMQTMLPLGENCDVEPEKMAKKSAPNKAHIRVSSSQTQFSEFLAQQEAADAEKASVEMTPLPSFELLDRPDKKENPITQEEMDQVAALVEAKLADFGVDAKVVGMYPGPVITRLELDLAPGVKVSKITNLSKDIARSLSAVSVRVVEVIPGKSFVGLELPNKHREVVKLSEVISGSEFADAKSPLTMVLGQDIAGKPVVVDLARMPHLLVAGTTGSGKSVGVNVMILSLLYKSTPEEVRLIMIDPKMLELSVYEGIPHLLCEVVTDMKEASNALRWCVGEMERRYKLMSAMGVRNVKGFNTKVSEAIERGEPLKDPLWKPGDSMDEEAPELEKLPSIVVVIDEFADMMMIVGKKVEELIARIAQKARAAGIHLILATQRPSVDVITGLIKANIPTRIAFQVSSKIDSRTILDQQGAETLLGMGDMLYLPAGKGVPTRVHGAFVDDHEVHAVVADWQARGTPVYIDDILNGDSSEDVLLPGEQAEAAADEESDALYDEAVAFVTETRKVSVSSVQRKFRIGYNRAARIVEQMEATGVVSSAGHNGAREVLAPPPPRMD >NZ_CP041660|2665179:2675162|2672100_2672376_-|WP_143871628.1|DBSCAN-SWA MPSLILINRLISQAEFELLTVQAEQGLDILLALEGCYNILKFEALAELSHVYIHATDASARGIQKIPGNINQISQSEWVELKLSRKCIIPF >NZ_CP041660|2665179:2675162|2672385_2672766_-|WP_143871629.1|DBSCAN-SWA MNPVNTSDNTSHAIIITSAPFENAKGQEALELALTLATFEQAVALFFSGSGLLQLLKSQNAELLKLKNYTDGFKALDLYDIEDVFIEQQSLADLHLNENDLLIETQALTKSEWLLQLANYNVILKF >NZ_CP041660|2665179:2675162|2674517_2675162_+|WP_143871632.1|DBSCAN-SWA MINILLVDDHELVRTGISRILNEIRGIKVVGEAQTGEEAVQFCRKNNPDVVLMDMNMPGIGGMEATKKIVRYCPDTKVIFLTVHTENPLPYKVMQIGASGYLTKGAAPDEMIKAIRQVHSGQRYIAPDIAQQIALSQVGGQQENPFDILSERELQIMMMITRGQKVQDISEQLNLSSKTVNSYRYRMFEKLNIGGDVELTHLAIKYRMLDTKDL |
11 | Mycobacterium_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
3036285 : 3090447
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP041660|3036285:3090447|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP041660|3036285:3090447|3070420_3071935_+|WP_143871978.1|DBSCAN-SWA MCGVVGIVAHSPVNQSLYDALTVLQHRGQDAAGIMTINNGMFKLRKANGLVRDVFEQKHMERLAGDWGIGHVRYPTAGSSTSAEAQPFYTNSPYGIAFVHNGNLTNAEELQQNLISEARRHVNTSSDSELLMNLFAHELCESGGDWNLKADDVFAAVTTLHTKARGAYAVVASIIGYGIAAFRDVYGIRPLVLGKRDTEQGTEYMVASESVAIDAVGFTVVRDVEPGEAVYITKEGELFSKQCAPSSELVPCLFEYVYFARPDSTLDNISVYASRVRMGKKLGEKIKRVWSDLDIDVVIPIPETSCDIALEIANTLEIPYRQGYVKNRYIGRTFIMPGQQQRRRSVRRKLNAISSEFKGKNVLLVDDSVVRGTTSEQIIEMAREAGAKKVYFASAAPEIRFPNVYGIDMPSANELIAYGREVDEICDLIKADGLIFQDLEDLIEAVGEGNPHIKRFETSVFDGNYVTNDVSQAYLDHLDALRKDSAKNEGSQNQSSSLEIHNFS >NZ_CP041660|3036285:3090447|3039733_3040438_+|WP_143871960.1|DBSCAN-SWA MKQQLTINFTHELEASFDYFYQQGNEMLLANLQEFVTANVNVHSQQLMYIHGPKGSGKTHLLQATCHYADLNKQNAQYLPCSQLIAMPVAFTHGLEMNHLLLIDDIQEIAADDEWQTSIFDLINRTLEQGHKIVFSGSLPADDIPFTLPDLVSRLNWGQKWLVKPLDEAQRKEMLIMRSQSRGMPMTEELANFIVMRSQQDNASIMRCLEILDTQSLAEKRKLTIPFVKSVMAW 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45 | uncultured_Mediterranean_phage(18.18%) | protease,tRNA,bacteriocin,integrase,transposase | attL 3086555:3086569|attR 3091067:3091081 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
3726725 : 3773404
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP041660|3726725:3773404|DBSCAN-SWA 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44 | Salmonella_phage(23.08%) | protease,integrase,capsid,terminase,transposase,head,portal,tail | attL 3728056:3728072|attR 3730647:3730663 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3796290 : 3806542
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP041660|3796290:3806542|DBSCAN-SWA CTTAGTCATCTAGATTCTCGTTATTATCTGCATCAGGTGTATTGTCATCTGCCGATGAAGCTTCGTTTTCACCGCTATCACCTTCGATGACAATACCTTCTTCAATCAGTTCACTTTCTTCAATTTCATCAATACGCTCTAAACCAACAACCAGTTCATTTTCGCCAGTTCTGATCAATCTAACACCTTGCGTATTTCGACCCACGCTGGAAACTTCACTGACACGTGTACGAACCAAAGTGCCTTTATTACTGATTAACATGATTTCGTCACCATCGTTAACCTGGACAGCACCAACAACCAAGCCATTTCGCTCGCTCACTTTAATTGAAACAACCCCAAGTGTAGCTCGGCTCTTGGCTGGATACTCTTCTAAAGGCGTACGTTTACCAAAACCATTTTCGGTTACAGTTAAGACTTGACCATCTCCATGCGGCACTATCATGGAAACGACTTTTTGCTCATCCCCTAGTTTGATGCCGCGAACACCTGTTGCGGTCCGTCCCATAGAGCGTACTTGTTGCTCGTTAAAGCGCACAACTTTACCTTCATTCGAGAACAATAAAATATCACTATCACCATGTGTGATATCAACACCAATAACATGGTCACCATCATTTAGGTTTAATGCAATGATACCGTTACTACGTGGACGCGAATACTCTGTTAAGGCTGTCTTTTTAACCGTACCATTAGCCGTAGCCATGATAATAAACTTATCTTCTTCGTATTCACGAACCGGTAATACCGCACTAATACGCTCACCTTCTTCTAGTGGCAATAAGTTAACAATTGGGCGACCTCTTGCAGTACGCGTAGCAAGTGGTAATTGATAAACTTTCAACCAATACAAACGGCCTAAATCAGAGAAACATAAAATCGTGTCATGCGTGTTTGCAACCAATAATTTCTCAATGAAATCATCATCTTTCATTTTGGTTGCAGCTTTACCTTTACCACCACGTCGCTGCGCTTCATATTCTGTCAGTGGTTGATATTTGACATAACCCGCATGTGATAAAGTAACGACTACATCTTCTTCTGCGATCAAATCTTCCATATTGATATCGTGCGCTGCGGCTGTAATTTCGGTGCGGCGCTCGTCACCAAACTCTTCCTTAATCGCCAATAACTCGTCGTGAATAACTTCCATCAAACGTGTTGCGCTAGATAATATATGTAGTAGCGCAGCAATTTCATCCAATAATGTCTTATATTCGTCCAGAATTTTTTCGTGTTCAAGACCTGTTAACTTGTGCAAACGAAGGTCTAGAATGGCTTGAGCCTGTTGCTCTGTCAGATGGTACATACCATCATGAATGCCATACTGATCTTCTAACCACTCTGGACGAGCCGCGTGTGTACCTGCACGCTCTAGCATATCCGCCACGTCACCTAAAGCCCAAGGCTGTGCGAGTAACCCTTTCTTCGCATCGGCAGGCGATGCTGAACGTTTGATAAGTTCGATGATAGGGTCGATATTAACCAACGCAATCGCCAAACCCTCTAAGATATGTGCACGCTCGCGTGCTTTTCTCAGTTCAAAAATGGTTCTACGGGTAACAACTTCACGGCGGTGATTAAGGAATGCTTTGAGCATATCCGGCAAGTTGAAAATTTTAGGTTGGTTATTTTCTAAAGCAACCATATTCATGCCAAATACAACCTGCATTTGAGTCAATGAATATAAGTGGTTTAATAAAACCTCACCCGACTCGCCGCGCTTAACTTCAATTACGATACGCATCCCATCTTTATCGGATTCATCTCGCAGCGCAGAAATCGAATCAATACGCTTTTCTTTAACGAGCTCGGCTATTTTTTCAATTAATCGTGCTTTATTTACCTGATAAGGGATCTCGTTTACGATAATGGTTTCACGACCATTGTCAGCAACTTCAATTTCAGCTCTAGCGCGAATATATACTTTGCCACGCCCTGTGCGATAAGCCTGCTCTATACCCGCTCTGCCACTGATAATCGCAGCTGTTGGAAAGTCTGGACCCGGAATAATTTCGATCAGCTCTTCGATGCTAATATCCGGATTGGCTATCATAGCTAAACAGCCAGATATCACTTCATTTAAATTATGAGGTGGGATGTTTGTTGCCATACCAACCGCAATACCTGAAGAGCCATTGACCAATAAATTGGGAACGCGAGTCGGTAAAACTTCTGGAATTTGCTCAGTGCCGTCATAGTTATCAACAAAGTCGACTGTTTCTTTTTCTAAATCAGCCAGTAAAGAATGTGCAATTTTTGCCATTCTAATTTCGGTATAACGCATTGCAGCCGCAGAATCACCATCGACCGAACCAAAGTTACCTTGTCCATCCACTAGCATATATCGCAAAGAGAATGGCTGAGCCATACGGACTATAGTGTCATAAACAGCACTATCACCATGTGGGTGATATTTACCGATTACGTCACCAACAATACGTGCTGATTTTTTGTAAGGCTTGTTGAAGTCATTTTTTAGTTCGTTCATCGCGAACAAAACGCGGCGGTGCACTGGCTTTAAACCATCTCGCACATCCGGTAAAGCACGCCCGACAATTACGCTCATTGCATAAGCAAGGTAAGATTCTTTTAATTCATCTTCTATATTGATTGGAAGAATTTCTTTCGCCAAATCGCTCATAAACAGGACAATTCCCTAATTTGTAATACTTGTTATTGCATCACGATTTTTTGCATAACCGTTTTTTAGCCAGCAATTCTACCACAAACCCAGTTTCATACCATTGAAAAAATACGCTTTAGCTTGTCGAAGCGCTGTATCTTTTTATAATGGGTATAAAAATGCATTATCAATTGGCAAAAGAGAGTAAATTTTGAGCAATTCAATTCACAACGTAGATGATGGTGAAATAGAAAAATTTAACAGCATCGCTGGTAAATGGTGGGACCTAACTGGCGAGTTTAAACCTTTGCATAAAATGAACCCCCACCGAGTGAATTATATTGAAATGCAAAGCCAAGGTTTATTTGCTAAAAAAGTTTTAGATGTGGGTTGTGGCGGCGGTATTTTAACAGAAGCTCTTGCTCAAAAAGGCGCATTGGCCGAAGGCATTGATGCGGCTCCTGACTCTATAATCGTCGCCCAAGAACACGCTCAACAACAATCACTTGAAATTTCGTACACACAAATCACCGCAGAAGAACATGCATTAAAAAAGGCTCAAGCTTATGATGTTGTATGTTGTTTGGAGATGTTAGAGCATGTCCCTGACCCAAACTCTGTTATCGCTGCCAGTATCAAAATGTTAAAACCCGGCGGCTTTTTGTTTGCATCCACATTAAACCGAAATATGCGAAGCTACCTTTTAGGTATTGTCGCTGCTGAATACATTTTAAATATTGTCCCCAAAGGCACCCATCAGCACGAAAAATTTATTCGGCCATCCGAGTTAATCGATATGATTGAATCTAAAGGTTGTAAAGTACAAAATGCAAGCGGCATTCATTACAATCCAATCTTCGACACATTCAAGCTAAATTCCGACCTAGGTGTAAACTATATTTTATGTGCACAAAAACTGTAACTAAACCAAAAGCAATCTTGTTCGATTTAGATGGCACTTTGCTCGACACAGCCAAAGATTTGGGCGAAACACTCAATCTAATATTGAAAAAGTTAGATTTACCGGCCGTCAGCTATGATGATTATCGTCCAGTTGCATCTCATGGCGCAATGGGGCTACTTAAGCTCGGGCTTGGTGATAATATTAAAGCCTATGATATCGAAGTTTTGAGAAAAGAGTTTCTCAGTACGTATCAGGCTAATATTAACTTACATACACGTTTCTTTGACGGTATGCGTGAGTGTTTAAAGCAATTACAGCAAGATCAGCTCCGCTGGGGCGTAGTTACCAACAAACCGGAATTTTTAACGACTCAACTTTTAGCTCATTATCCTGAATTTTCATTGTCGGGTGCCAATATAAGCGGAGATACACTCCCAGTGCGTAAACCTGATCCTGCACCATTAACTCACGCGTGTAAATTAATGGATATAGATGCCAAAGATTGTTGGTATATTGGCGATGCACAACGAGATATCGAAGCAGGTAACCGAGCAGGAATGACCACTTTGGTTGCCAACTGGGGTTATACATATGACCCTATCCCAGTTTCTGAGTGGCAGGCTGATTATATCATCGAGCACCCGTTAGAAATTATAGACAAATACAAATAACCGCCAACTGCATTAAATTCAAGCAATATGCACAGCAATTAATCGCAATTGAGAAGGCAACAAATTTCATATATTTTTTTTAAATAAAGCAGCTCAAGATAAAATATACAAATTTCTGAATATAAACTAAACAGCAAAACTGATTGAAAAAAATTAATTGTAAGTCTCGTTAGATTCGACAAAGTGAGCAGGCACTAACAAGCCTTGTTTGCGATAAAATTTTCATACAGAATAAGTAAAATCACAACTTGCTTTCAGGAACAAACCTCATTATCTTGTGTTGATTCTGAAATCAGCCCCAATATGTAGTGTATGACATTTAAACAATGTCCACTGGGCAATAATTAAAAGAACAGGATAATAGACTCGCATGACTGACCAGCTTTTTGTTACTAAGCGAAACGGATCTAAAGAACCTCTTGATTTAGAGAAACTGCATAAAGTTGTCTCTTGGGCTGCTAAAGGGCTAAATAATGTTTCCGTCTCTCAAGTAGAGATGAAGTCACATATACAGTTTTATGATGGCATTAAAACTGAAGATATTCATGAAACAATTATTAAATCTGCTGCCGACCTTATTTCGGAAGAATCTCCGGATTACCAATATTTAGCGGCTCGCTTATCCATTTTCCACTTACGTAAAAAAGCGTATGGTCAATTTGAGCCGCCGCAATTATACAATCACGTAGTCAAGTTATGTGAAGCTGGAAAATATGACCAGCATTTATTAGCGGATTATAGCAAAGAAGAAATTGATGCAATGAATGATTTTGTCGATCATTCCCGCGATTTAAATTTC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP041660|3796290:3806542|3799818_3800490_+|WP_143872562.1|DBSCAN-SWA MCTKTVTKPKAILFDLDGTLLDTAKDLGETLNLILKKLDLPAVSYDDYRPVASHGAMGLLKLGLGDNIKAYDIEVLRKEFLSTYQANINLHTRFFDGMRECLKQLQQDQLRWGVVTNKPEFLTTQLLAHYPEFSLSGANISGDTLPVRKPDPAPLTHACKLMDIDAKDCWYIGDAQRDIEAGNRAGMTTLVANWGYTYDPIPVSEWQADYIIEHPLEIIDKYK >NZ_CP041660|3796290:3806542|3803229_3804360_+|WP_143872564.1|DBSCAN-SWA MSYTTFNKNNTNYLSEPMFFGSLVNVARYDKQKHPIFERLIEKQLSFFWRPEEVDVSRDRADFQKLSEHERHVFLSNLKYQTLLDSIQGRSPNVALLPIVSLPELETWIETWAFSETIHSRSYTHIIRNIVNEPSLVFDDIVVNEHILKRAKDISQYYDNLIQCCQLYHTRGEGEFEVGDQIVTVTVRELKRLTYLCIAAVNVLEAIRFYVSFACSFAFAERELMEGNAKIIKLIARDEALHLTGTQHMLNIMADGQDDPVMAEIALECREEIIEIFRSAAEQEKEWAQYLFKDGSMIGLNVEILSQYVEYITNTRMMAIGLPAIFSQTQNPIPWINAWLISDNVQVAPQEAEISSYLVGQIDSEVNTDDFGEFEL >NZ_CP041660|3796290:3806542|3804371_3804638_+|WP_143872565.1|DBSCAN-SWA MSQPIKCRIDYSDYQSSGKNSLLEYFEAQNLEVHYHCRDGYCGACRTVLCEGQVSYPKEPLAFIRRGEFLPCCSEPSSDLVIEAEKRK >NZ_CP041660|3796290:3806542|3799138_3799837_+|WP_143872996.1|DBSCAN-SWA MHNVDDGEIEKFNSIAGKWWDLTGEFKPLHKMNPHRVNYIEMQSQGLFAKKVLDVGCGGGILTEALAQKGALAEGIDAAPDSIIVAQEHAQQQSLEISYTQITAEEHALKKAQAYDVVCCLEMLEHVPDPNSVIAASIKMLKPGGFLFASTLNRNMRSYLLGIVAAEYILNIVPKGTHQHEKFIRPSELIDMIESKGCKVQNASGIHYNPIFDTFKLNSDLGVNYILCAQKL >NZ_CP041660|3796290:3806542|3804669_3805575_+|WP_143872566.1|DBSCAN-SWA MWFKNALYYKFSQKFEFTAEQLEEKLQEFCFKPVSKTEMHTIGWSPALSPKANALVHSAGEFHLVCLKKQERVLPASVVKEMLEEKLEEIEQAEGRKVKGKEKQNIKEELIHTLLPQAFTKSSFIKAYIAAESGWIIVEASSPNKAEELTAYLRKCLGTLPVVPPEAEQPLMLTFDEWMRGNHPSDFILGTEVELKDFAEDEGILRCKNLALDSEDLQNHLDNGKHVTKIAVDWGETLSCILCEDNSIKRIKFSDVMKEQNEDITDEDKLARLDADFALMAGELTRFIERLTEVLELTTPE >NZ_CP041660|3796290:3806542|3796290_3798933_-|WP_143872561.1|DBSCAN-SWA MSDLAKEILPINIEDELKESYLAYAMSVIVGRALPDVRDGLKPVHRRVLFAMNELKNDFNKPYKKSARIVGDVIGKYHPHGDSAVYDTIVRMAQPFSLRYMLVDGQGNFGSVDGDSAAAMRYTEIRMAKIAHSLLADLEKETVDFVDNYDGTEQIPEVLPTRVPNLLVNGSSGIAVGMATNIPPHNLNEVISGCLAMIANPDISIEELIEIIPGPDFPTAAIISGRAGIEQAYRTGRGKVYIRARAEIEVADNGRETIIVNEIPYQVNKARLIEKIAELVKEKRIDSISALRDESDKDGMRIVIEVKRGESGEVLLNHLYSLTQMQVVFGMNMVALENNQPKIFNLPDMLKAFLNHRREVVTRRTIFELRKARERAHILEGLAIALVNIDPIIELIKRSASPADAKKGLLAQPWALGDVADMLERAGTHAARPEWLEDQYGIHDGMYHLTEQQAQAILDLRLHKLTGLEHEKILDEYKTLLDEIAALLHILSSATRLMEVIHDELLAIKEEFGDERRTEITAAAHDINMEDLIAEEDVVVTLSHAGYVKYQPLTEYEAQRRGGKGKAATKMKDDDFIEKLLVANTHDTILCFSDLGRLYWLKVYQLPLATRTARGRPIVNLLPLEEGERISAVLPVREYEEDKFIIMATANGTVKKTALTEYSRPRSNGIIALNLNDGDHVIGVDITHGDSDILLFSNEGKVVRFNEQQVRSMGRTATGVRGIKLGDEQKVVSMIVPHGDGQVLTVTENGFGKRTPLEEYPAKSRATLGVVSIKVSERNGLVVGAVQVNDGDEIMLISNKGTLVRTRVSEVSSVGRNTQGVRLIRTGENELVVGLERIDEIEESELIEEGIVIEGDSGENEASSADDNTPDADNNENLDD >NZ_CP041660|3796290:3806542|3800860_3803146_+|WP_143872563.1|DBSCAN-SWA MTDQLFVTKRNGSKEPLDLEKLHKVVSWAAKGLNNVSVSQVEMKSHIQFYDGIKTEDIHETIIKSAADLISEESPDYQYLAARLSIFHLRKKAYGQFEPPQLYNHVVKLCEAGKYDQHLLADYSKEEIDAMNDFVDHSRDLNFSYAAVKQLEGKYLVQNRVTGQIYESPQYLYVLVSACLFANYPKETRLDYVQRFYDAISQFKISLPTPIMSGVRTPTRQFSSCVLIECGDSLDSINATSSAIVKYVSQRAGIGVNAGRIRALGSEIRGGEAFHTGCIPFYKHFQTAVKSCSQGGVRGGAATLFYPLWHLEVESLIVLKNNRGVDDNRVRHLDYGVQFNRMMYHRLIKNENITLFSPSDVPGLYDAFFADQAEFETLYVKYENDPSIRKKSIKATELFGLFAQERASTGRIYLQNVDHCNTHSPFDPKVAPIKQSNLCLEIALPTKPLHDINDEDAEIALCTLSAFNLGAIKSLDELEELSRLAVRALDCLLDYQDYPVPAARNSSLNRRTLGIGVINYAYYLAKNGVRYSDGSANDLTHRTFEAIQYYLLKASNELAKEQGACPKFNETTYAQGILPIDTYKKDLDAVCSESLKLDWEALRQSIQQFGLRNSTLSALMPSETSSQISNATNGIEPPRGYISIKASKDGILKQVVPEFETLKNQYELLWNIPSNKGYLELVAVMQKFVDQTISANTNYDPNKFPSGKVPMQQLLKDLLYAYKLGVKTLYYHNTRDGAEDPQKEAKAAAQDDDCAGGACKI >NZ_CP041660|3796290:3806542|3805696_3806542_-|WP_143872567.1|DBSCAN-SWA MSTENALLTILAEKIKNDSLVLPTLPEVAIRVREAADDPDVNLHQMADVISHDPALSARMLKIANSAYMGRSVKVATLNQAVTRIGLRQIKNIATALAMEQLFVSKNDTVKAALDKVWGLTVEVSSVAMALLKHYISRNKHTSLNLDTITLAAMVHNIGVLPILTEAERHPDVFANPAFLEGAISRLAGRVGGSIMRAWDFGPEFVTVAERWNDKRYEPESIAYIDFVRVAAIYADVMPVDGEKSEVYASYVAKGVIPDVEYMESEEFIEQYTIAKSIFAD |
8 | Bacillus_virus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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