Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019114 | Acinetobacter baumannii strain MDR-CQ chromosome, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,RT,csa3,cas3,WYL | 0 | 0 | 6 | 0 |
NZ_CP019115 | Acinetobacter baumannii strain MDR-CQ plasmid pMDR-CQ, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
944746 : 964306
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP019114|944746:964306|DBSCAN-SWA 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33 | Acinetobacter_phage(40.0%) | integrase | attL 942560:942574|attR 957586:957600 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1200117 : 1212465
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP019114|1200117:1212465|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP019114|1200117:1212465|1206957_1207173_-|WP_000370485.1|DBSCAN-SWA MDNSKRPINQIIARINDAAKHGEALVLTAEEVKILSKDIGDKVFIPVLTNEQVVQLVKEGKLGQKINNTKD >NZ_CP019114|1200117:1212465|1207187_1207940_-|WP_000052252.1|DBSCAN-SWA MSLHTRIRQKLEEKKLRAADLARATKKSPVAAKKWLDGTSVPTAENLKVIAKFLGVSDDWLLYGGSDEQESSNNLAQLNVIDIEAFKQKYNIPDSEDAVKFVQAPAKPFPIQKRYVPVKAYSKMGMDGYFTDMGYDGNAGDGYVPTHTAGPRAYGIKGTGDSMFPAIRNGWYVVCDPDADLVPNEFVQVCLKDGRCTIKEFVGINGGVLSLLSVNGGERFFFEMDEVESITAITDIVPPSQHRQEHPYSH >NZ_CP019114|1200117:1212465|1211590_1211992_+|WP_000100162.1|DBSCAN-SWA MSSVSIAEYRKLFPIKKNKKRRSAKQVARQPSVGEMVLATHLRACKIGFEQEYKFHPKRKWRADFLIIGTKILIEVEGGIWSGGRHTRGKGYIGDMEKYNSAAMMGFTVLRFSTEQVKAGVAIKQIEQLVGEK >NZ_CP019114|1200117:1212465|1209186_1210068_+|WP_000064627.1|DBSCAN-SWA 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24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1216423 : 1245096
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP019114|1216423:1245096|DBSCAN-SWA 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37 | Acinetobacter_phage(96.67%) | terminase,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1439132 : 1485895
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP019114|1439132:1485895|DBSCAN-SWA 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41 | Synechococcus_phage(20.0%) | plate,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2341090 : 2390587
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP019114|2341090:2390587|DBSCAN-SWA 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66 | Acinetobacter_phage(98.31%) | integrase,terminase,capsid,transposase | attL 2340566:2340583|attR 2390748:2390765 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2741784 : 2756581
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP019114|2741784:2756581|DBSCAN-SWA 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10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
13046 : 19208
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP019115|13046:19208|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP019115|13046:19208|17558_17990_-|WP_001190813.1|DBSCAN-SWA MQSIVKHIFRHYLVALLSLGIFILSYFVGMVFGKLLFKNMNAVEIGSIFTALAVNFYLSLLLCTFTFVGQFFFNSLKKIADTPFQNLLILLTGSFWMVATRTPEVITNNIPLYNFNISLITLFAFMLFISNSKFIKAFISKQE >NZ_CP019115|13046:19208|13046_13820_-|WP_000844619.1|DBSCAN-SWA MKSYYQISFSGGRTSAYLTWYLLNNYSHLYNFIVTFANTGIEHEKTLEFVDKCDKYFNFNTVWLEAVIHPKKRVGTTHKVVNFKTATRGPVLFEQMIEKYGIPNKVYKHCTRELKIRPMDSYIRSIGMKPKDIPTAIGIRADESKRCAKDAEANNFIYPLVTEHPVDKQFILDWWSKQAFDLELNEWDGNCNMCFEKSFPKLLKQLESNPFALEFHLRMERIHGQTNNQPGRPDRVFFRQNTSAIDILNMFNQANVA >NZ_CP019115|13046:19208|15934_16624_-|WP_000389917.1|DBSCAN-SWA MEDMQTIIDKISKCLALSKSANEHEAAVALKQAQTLMQKYKISEKQILISDIKERIIQTKTQRTKDIERRLKVMIANVFECGSYSGFYTLEGVKYQQHVFYGVEPNVSIATYAYTVLLPILIKNKQSYLATLHGNTKLKSKRRLGISYHRGWILGVEKKCRNLNPDKELKEKLSEYEKTLNLIYCEVKSVKHYNKDMLNQARVKGYSDGSKVNLHHAIDPNETKKIFLS >NZ_CP019115|13046:19208|16902_17517_+|WP_001266386.1|DBSCAN-SWA MRVSTEKQDLERQEKVINDARNAGYYIAAVYREKASGITPDRPELNRMIHDLQAGEVVIAERIDRISRLPLPEAEKLIVAIKEKGAKLSIPGVIDLSEFSKDASGISKIVLDQVQDMLLKIALQMAHEDYLLIKKRREEGIELRKNKGLYNGRKADKKLHDKIVELRKQNISISKTALIANCSVSLVKLVWKRYSESNSSQALK >NZ_CP019115|13046:19208|18581_19208_+|WP_000568626.1|DBSCAN-SWA MIEAMQRAKTYNIHNSIIKLSAIVFGACVTSTTYAVCWDEAASMYGTDPILLKAIGWKESRGHVGAVGSLLKDGNRALGLMQINTIHLPALRKQGITRNDLFDPCTSQKIASWVLADCLKKFGEVWRAVGCYYGGPASKAYTAMNQYSADVRRYFEGYKRKAGLPAVYTPLQPQSIKAQSVNYNEDIPNYSSVNQTIKKTSNFQIIRF >NZ_CP019115|13046:19208|15481_15688_+|WP_000535991.1|DBSCAN-SWA MGSTVRLRDPTAQLVMDTALDMQQEQRQMVKTSDIVETLVQRYINTISFEDVQQTIENRKKNKKNKDK >NZ_CP019115|13046:19208|15693_15930_-|WP_000072937.1|DBSCAN-SWA MSNVDPQLEHVDPAHPAAPDAYMRVLNCKSNYVNILAGWFLKDGKKKFYIADVRGNEVEAGFNRLDWLTEFDTIYKGK >NZ_CP019115|13046:19208|18015_18351_-|WP_001074611.1|DBSCAN-SWA MAKKGINSLNLINSYESKIMNVKLSTVEAALNTPLKPLELNSEVKCPKCKSRNLICSVRYQTADVIHFENGCFQLKESEASKIFKKIDLECKDCGNKFENEKVKTPNEVLF >NZ_CP019115|13046:19208|13877_14969_-|WP_000794252.1|DBSCAN-SWA MKNNALYKELDRHDDVNVIPNVLKNAIGQALASEGKLFSVSEIDLDIYDLIIVSMSGGKDSIASLLYLIEKGVDMSKVELWHNLVDGKSEPFMDWLFMDSYNKQLAKAFNLPIYNSWLMHGFEGEMLKNNSISHEYEIETPSGNIIIPRKRAKAGTRLRFPQQSADLRIRWCSSALKIEVGRRALSNQERFNNSKVLFVTGERREESPNRAKYFQLETHFCDNRNGKKGRLIDAYRPVLDFTERQVWEILERHNVAAPVPYRLGWSRSSCMTCIYNSPKVWATIKHYFPNRIDRIFKYEEQFATTISRKKINVINISEGIQPFNINDLVALDQAMRKEYTLPIFTKNWELPMGAFNKEGCGSD |
9 | Klebsiella_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
54311 : 64393
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP019115|54311:64393|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP019115|54311:64393|63277_63511_+|WP_000241706.1|DBSCAN-SWA MVKWVSAWFLVINIFSPNKHAVYTIPFQSEQECKKEVLKRLKHDAGNEIISVKFGSEVKERRSYSCEKGQLPVYPVK >NZ_CP019115|54311:64393|63514_64393_+|WP_134232923.1|DBSCAN-SWA MGELMTDITVKLKRTDFSIGSDKSNIPLIGGLLAKIGNSKDRLITKFKTVESQLNDNLLQVAEAQKGLQLNNDSLTKLFEHTISVYTQLGFAVIAGRYKKNELIGLIESLNSEGTDLAKQRANAYSQILERLDKRITDLELLRLSALQTLPQITFLQNNNIALIEKFQTISGLTIPAWQRQLMLALNILDQKKYSQLGEEIDNFTNETLLESAKDFKETSIHIAKQSNRQVIDIETLQKVQLDTLTAFEEVMAINKTSAQKRKETQLQAQQLNDQLKSLVVADPQQLKISAD >NZ_CP019115|54311:64393|54311_55001_+|WP_000389917.1|DBSCAN-SWA MEDMQTIIDKISKCLALSKSANEHEAAVALKQAQTLMQKYKISEKQILISDIKERIIQTKTQRTKDIERRLKVMIANVFECGSYSGFYTLEGVKYQQHVFYGVEPNVSIATYAYTVLLPILIKNKQSYLATLHGNTKLKSKRRLGISYHRGWILGVEKKCRNLNPDKELKEKLSEYEKTLNLIYCEVKSVKHYNKDMLNQARVKGYSDGSKVNLHHAIDPNETKKIFLS >NZ_CP019115|54311:64393|55005_55242_+|WP_000072937.1|DBSCAN-SWA MSNVDPQLEHVDPAHPAAPDAYMRVLNCKSNYVNILAGWFLKDGKKKFYIADVRGNEVEAGFNRLDWLTEFDTIYKGK >NZ_CP019115|54311:64393|62033_63263_+|WP_001024504.1|DBSCAN-SWA MNINFNTEEFLATAKQATHSPALFHKKSMHSPIYAEIQFDIPLNYISSKTVSLRKNCFKELNCATFKGIPDLVDSKVKQVSIPLKDLGPVAITPMPAIGIYYELNKRNKDYGNALLEVTVEDRERSFSDYNELIEISQGKINSFNTPEITLRPIEFSKSKLPDDEFCLTVFIDDANLSSNLIATGLPSVTSIASFFNYVELKTGQKVDFAIGISGTEKNQNVSVREKVIKYPRTRTNVGVGQVDQSNGKLALHLIISCESPSAANQVRNYILNEDIRIATGLVYQKSICDFVPENTYWLYEADPKTVDDDLRNRYVSGFPVFQPDTLDYAMQLYGTNIVDSRHKYTVTSNGYALLNTPTFSAYSRSETKLHCYAEILYAVCYLSEEYLPDNLFWKKKEVPGQLVYWSSL >NZ_CP019115|54311:64393|58369_58867_+|WP_001067229.1|DBSCAN-SWA MNNYFNVLIITDLKIGRLKTPSHCACAVGHIDIMKPSFEYNTGLVALSTTMYDCKDFNVYTLSTKESFNKFISTLKVLEELIGIPCPFLTAIQETYEFYGDFIFECLTWFNNNADILFRPDHLGEFTKTADESLNFQLMYFKVLETFRKAGLNGFIQFNTLKTIN >NZ_CP019115|54311:64393|55966_57058_+|WP_000794252.1|DBSCAN-SWA MKNNALYKELDRHDDVNVIPNVLKNAIGQALASEGKLFSVSEIDLDIYDLIIVSMSGGKDSIASLLYLIEKGVDMSKVELWHNLVDGKSEPFMDWLFMDSYNKQLAKAFNLPIYNSWLMHGFEGEMLKNNSISHEYEIETPSGNIIIPRKRAKAGTRLRFPQQSADLRIRWCSSALKIEVGRRALSNQERFNNSKVLFVTGERREESPNRAKYFQLETHFCDNRNGKKGRLIDAYRPVLDFTERQVWEILERHNVAAPVPYRLGWSRSSCMTCIYNSPKVWATIKHYFPNRIDRIFKYEEQFATTISRKKINVINISEGIQPFNINDLVALDQAMRKEYTLPIFTKNWELPMGAFNKEGCGSD >NZ_CP019115|54311:64393|57115_57889_+|WP_000844619.1|DBSCAN-SWA MKSYYQISFSGGRTSAYLTWYLLNNYSHLYNFIVTFANTGIEHEKTLEFVDKCDKYFNFNTVWLEAVIHPKKRVGTTHKVVNFKTATRGPVLFEQMIEKYGIPNKVYKHCTRELKIRPMDSYIRSIGMKPKDIPTAIGIRADESKRCAKDAEANNFIYPLVTEHPVDKQFILDWWSKQAFDLELNEWDGNCNMCFEKSFPKLLKQLESNPFALEFHLRMERIHGQTNNQPGRPDRVFFRQNTSAIDILNMFNQANVA >NZ_CP019115|54311:64393|55247_55454_-|WP_000535991.1|DBSCAN-SWA MGSTVRLRDPTAQLVMDTALDMQQEQRQMVKTSDIVETLVQRYINTISFEDVQQTIENRKKNKKNKDK >NZ_CP019115|54311:64393|58895_59672_+|WP_001086346.1|DBSCAN-SWA MNSKVNIGKTYSVLKSEFIHTLKSIDQSKNIYEIFHDFVFCSAAALRNSIGHRYQNLFNHNIENEYLQRINRYDVSGRLKIKKLFYLLVDLCEAKGEPYDVLGSIYMELEIGNDHIGQYFTPSEVSNLCAQVVMTDLKKQLEEEGVISISDPACGAGSTLLSTVKLCLESKIQVQDHLYIEAADIDRNVALMCYIQLSLWAVPCRIFVGDTLKLKYRECWCSLMYYVKGWDIKLHSQKLKEIVHKAEDYVPNFILIND >NZ_CP019115|54311:64393|60641_61898_+|WP_000096599.1|DBSCAN-SWA MSSLLGDLNAVDSSLTSANLNANNNSDRTILKLPLNRVKLDPQNVRLEYDQDYVKELANTILRDGLLQPISVRADSDNPGEYIINMGHYRYLAHKHLNLDTIEATIDNKLGSRRVKMSENLFRKDMSLLEVATNLKLMLEEGVAENPKYSYDDLANEINKSKTWVSRRLQLLESDDYLKSLMANKMVNDAETGTIIKNLLAEYPEEVKALVADHEGAISSKLARVWSKELKGEIITSSTSEVTQSSLELQNSPKAGEKDEDSKVDNTQELITETKETLQQPAKVQESVENTEAVKDEKSFTTTTQKQTKEIVKQANEKAFSELETAYFNGILESYVSILDLTESEDEDLVSVACGFLRSFNDENTANLFSWKSLIQYPVLVNELATILDSMAQLHVFVPSSNVEDSRMQVILNQQDLI >NZ_CP019115|54311:64393|59864_60638_+|WP_000724905.1|DBSCAN-SWA MKKIVITNEKGGIGKTSVAVHLAHYCYERGMRVLFVDMDKQGNSGFSLSKVAVEIKDTHSLFADIQNFETLDKYFVLFKGNKSLKSLFDPTEQEFKLDKVEEYQRNFKSNIAKANEFFDICIFDTPPTDGPFQRLPLLVSEFALSPFLLDKYSILGLRGIIDTTQEIKEVNPKIQFLGLLPNMVSANSVTQKTTLNELQKQLSHLMLDKTAFIPNRSAIADASEQQVPVWKIDKTSAKDVGRKIKKINQLVLEKMGV |
12 | Alteromonadaceae_phage(12.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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