Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP031276 | Staphylococcus xylosus strain 2 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP031275 | Staphylococcus xylosus strain 2 chromosome, complete genome | 5 crisprs | csa3,WYL,DEDDh,cas3,DinG | 0 | 1 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP031275_1 | 200132-200232 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP031275_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP031275_1
>1.1|200158|49|NZ_CP031275|CRISPRCasFinder GAAACAGTTAGAACCTGCAGTAGGACAGCCTGCACAACAGTTGATTTCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP031275_1
The CRISPR arrays of NZ_CP031275_1 >merge|NZ_CP031275|1|200132-200232|CRISPRCasFinder GGAAATCAACAAGTTACAGATGGTTTGAAACAGTTAGAACCTGCAGTAGGACAGCCTGCACAACAGTTGATTTCAGGAAATCAACAAGTTACAGATGGTTT >NZ_CP031275|1|1|200132-200232|CRISPRCasFinder GGAAATCAACAAGTTACAGATGGTTT GAAACAGTTAGAACCTGCAGTAGGACAGCCTGCACAACAGTTGATTTCA GGAAATCAACAAGTTACAGATGGTTT
>NZ_CP031275.1|WP_047171713.1|197788_198940_-|ROK-family-transcriptional-regulator MENNFIVNENEKRVLKQIFNNSNISRTQISKNLELNKATISNILNNLKHKSLVNEVGEGNSTKSGGRKPILLEINQKYGYYISMDLTYDSVELMYNYFDATILKQDSYELNDKNVSSILQILKSNINVSEKYDTLYGLLGISISIHGIVDDEQNIINLPFHKNEKRTFTDELKSFTNVPVVIENEANLSALYEKSLYINSNINNLITLSIHKGIGAGIIINKKLYRGSNGEAGEIGKTLVLESINNNDNKYYKIEDICSQDALIQKINNRLGVTLTFTELIQYYNEGNSIVAHEIKQFINKMTVLIHNLNTQFNPDAIYINCPLINELPNILNEIKEQFSCFSQGSPIQLHLTTNVKQATLLGGTLAIMQKTLNINNIQMNIK >NZ_CP031275.1|WP_107542789.1|196255_197578_-|xylose-isomerase MSYFDINKVNYEGPKSNNAFSFKYYNPEEKIGNHSMSELLRFSVAYWHTFTADLSDPFGVGAAERDWDSLDEMEKAKARVEAIFEFMEKTRIDYFCFHDVDIAPEGASLKESNENLDIIVELIKEKMDQTGKKLLWNTTNNFTHERFVHGAATSSNAEVFAYAAAKVKKSLEIAKKLGSENFVFWGGREGYESLLNTNMKLELDNLATFFKMAKSYADEIGYTGQFLIEPKPKEPTTHQYDTDVATTHAFLQKYDLDKDFKFNIEANHATLAGHTFQHELRYARDNNMLGSVDANQGHPLLGWDTDEFPTDVYDTTLAMYEILKNGGLAPGGLNFDAKPRRTSFKQEDLILTHIAGMDTFALGLRVAYKMIEDNFFENIMDEKYKSFNEGIGKKIVEGETSFKELEDYAFNINTINNTSDHLEVIKSQINQYILNINNKD >NZ_CP031275.1|WP_069794646.1|194759_196250_-|xylulokinase MAYVIGIDIGTSALKTLVVNKSGDVVESYSVSYNTAHPKSGYSEIDPEIWYEATLESLKYILNHYTHNDITGISFSGQMHGLVVIDQEGNPIRPAILWNDTRTSQEVEDIKKNLGLNSLLQLTQNTVLEGFTLPKLMWLKNHEQDNYKRISKFMLPKDYIVYKLTGNVYTEPSDAAGTIMFSVKDENWSTELLHRLNIDSSICPEIIASHQKSGQLTEKVKNTLGIDSNINVYQGGADNACGALGSGITDEQKQLVSIGTSGVALSIENSTDYENDGNVHYFNHCVPNQKYIMGVTLSAGYSLEWLKQLISADENFTTFLKDINQSEVGANGLMYTPYLLGERTPHNDASVRGSFIGLDANTTQLDMKRAVIEGITYSINESIQIMKNNAININEIVSIGGGAKNNQWLQIQADIFNTTITTRTEEQGPAYGAAMIAAMGEQWFNTFNEMSEAWIAYHQKVYPIETNTKSYQNLFNIYKIIYDATQPVTQKLNKFK >NZ_CP031275.1|WP_107542790.1|191824_193159_+|2-keto-3-deoxygluconate-permease MDSNIYLLIITLLSIVIVILGVAWWKWHAFISLTVAGLFLAIMAGLSPEKIVTAYETGVGDVLGHLVGILALGTILGKLMSDSGAGMQISDYLVKALGYKKLPWAMMLSGFIIGIPVFFEVGIVILLPLVISIHKTTKTNILLIAIPLLAGLSIVHGIVPPHPGAMTAIGIYEANLGKVLLYSLLIALPTAIIAGPVFGKFISKRVIPEKEPNIIKVNNKTNGLPSVIVSFLVIILPVLLMLLSIVTPYLGDIPSILKNTLLFIGNPVIALLISCFAAFYLLGFKQGMTKNVIKDLVEECILPIGSIILIIGAGGGFKQILIETGVGDSIAQMTENLSLSPLLLAFLVAGLIRVATGSATVALTTAAGIVSPIIQHMSGVNLELLVISTGAGSLMLSHVNDAGFWMVKEYLGLNVKETFKTWTVMETLLSFVAFAIAFVIDGII >NZ_CP031275.1|WP_107542791.1|191049_191775_+|GntR-family-transcriptional-regulator MTKLSSDKGPLYLQIKEIIEDRIIHGIYTIGNYIPTEIEFEEEFNVSKVTVRAAIKELVTLGYLERKSGKGTTVINHKQVSNETNNKNFTEKLVEQGNKIHKLIKDIVVETHEKNSELFQMFGEKSYKITRVYLLNDKPYILFNHYLPYPLSSLDEYGELKQNNDLSIYKILEDEQIEIKDIEDNFSVGVNEQATAYLNLHTSDPLLVRERTSYSVNHQIVEYSIGYYNSKLKKYSISLKG >NZ_CP031275.1|WP_107542792.1|190025_191042_+|sugar-kinase MNKHIAAYGEIMMRLEVPDNLLLRQAENLKYSFTGTGVNVTGLLSQFGYETSLISAVPENSIGTAAIGAIRRLGIHSDFIIKNNDNLGMYFLEQGFGSRPSNVTYTNRQQSSFNTTDISEYDIVQSMKGVDVLHICGISLAMNNLTQNNILTIVKVAKEQGVKIVFDCNYRPSLWGENGNQRAKPYYETILREADIVIMSEKDAINTLNLTTTKESKEEQLEELLLVVAEKFSIDIIAGTIRTIQGSNQNKIKGYLFKNGTIYYSEAFEVNILDRIGTGDAYTCGVIHGELSNMAPQEMVTFSTASCVLAHTISGDTALFDTDDIIKIVNEEKIDIER >NZ_CP031275.1|WP_107542793.1|189283_190033_+|oxo-acid-lyase MKIHDRFYKDRVALNVLAKGEENIKAVYQAADENVVIGVLSKDYDDVNSAVTAMTQFGKEVDDAISIGLGAGDNRQAKVVAEIARYYQGAHINQVFTDVGQTSAKSDEQSWVNALVSPTGKPGFVNISTGPISSEGEEKAIIPIEAAINLIKDMGGSSIKFFPMKGLETVEEYKAVAEACGRAEFGLEPTGGITKDNFEEIVKIALDFKVPKIIPHVYSSIIDKDTGLTNINDVECLTSKIKKLVDLYE >NZ_CP031275.1|WP_107542794.1|188177_189284_+|DgaE-family-pyridoxal-phosphate-dependent-ammonia-lyase MENSLNYKYGLKQVINASGRMSILGVSSPTNSVMDAMKFGGQNYVEIADLVDKSGAYIANRINAEDAVVVNSASSGIALSIAGVVTEGNERKSQKLHNENIDKNEIILFKGHNVQYGAPIETMIYLGGGRIVEVGYANEGKENHIQEAINENTAAILYVKSHHAVQKNMASVEEIYQVAQKYNIPLIVDAAAEEELKKYIQCSDLAIYSGSKAIQGPTTGIVAGKKSLIESVKTQLHFIGRSMKVGKESTFGLLQALDEYFDKVDNSEAEKSELEKLSPINNYEGIRLEIVQDEAGREIYRTRVHVDSSILNMSAEEFVGKLKYADVAIYTRDYGVKQGFFDIDPRPLKQGEIKIIYETIVRILQGEI >NZ_CP031275.1|WP_107542795.1|187099_188200_+|amidohydrolase/deacetylase-family-metallohydrolase MKSTGIIKNIETLNKKRIDILLEEGVIKEISDGNTLQGKVIFNGSNSFVSTGWIDLHVHAFSDFSPYGDEIDEIGVKQGVTTIVDAGSCGADRVGELHERAQQSLTNVYSFLNISKIGLERIDELSNLSWINQQACIKAVQQFEDMIIGLKARISSSVVKDNGVVPLERAIKISEQLKLPIMTHIGSAPPKIEDVIPLLRKGDVITHFLNGKSNNLFDQNGKPLTVLREAISRGVKLDVGHGNASFSFEVAQKAQRNHIQFNSISSDIYKKNRIEGPVFSLSNVLTKFLYLGYTLEEIIKGVTQNPAQIINKPDLAKFKEGITANLTLFDVIDSQQNLIDSHGHEITITKVIKERGVVTNGKFIEL >NZ_CP031275.1|WP_029378561.1|186403_186955_+|phenolic-acid-decarboxylase MTNNFETLEDFLGTHLIYTYDNGWEYEMYVKNENTIDYRIHGGMVAGRWVRDQEANIVKLTEGVFKITWTEPTGTDVALDFLPNDQIMHGTIFFPKWVEEHPEITVTYQNDHIDLMEASREKYDTYPKLVVPEFAKISYIGNAGQNNETVVNVAPYEGILEDIRSGKFFDENYQHTNSNSLIK >NZ_CP031275.1|WP_029378555.1|201002_201455_+|winged-helix-DNA-binding-protein MENVDKTIEEAIIKFQIVMLHLNKEIVDIVKETGLSNLLSREQIEAMRIIKTEGKVTINELARLQNIFKTAASKRIAKLEEMGYVQRAHSDNKRIKLIKLSDEGEAFLKKATSVMTEAVKDRLGNKFTAEEVHHFVDQLTHIDNAFREHK >NZ_CP031275.1|WP_047171715.1|201760_202327_+|DUF4064-domain-containing-protein MKRTIERVLTWIGIALQLIAVIILAILIPTFGNNEIKDTFINQMMQEESSLTYGDANAFFSSLSGIVTAGLIIGIIILIIALIAAFLIGKKAKIAGVLLIIAGVISLLGNWINAVLWIVAGIMLLVRKPKAPVYSKDNDEDINPYIKDGSQINEHNNSFVLSEEQKENEKEAIKDEYTKSDEENKYKY >NZ_CP031275.1|WP_047171716.1|202419_203241_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MNYNLVIYKQHDKLNYLNTPNFANLYLVIAGEVSFQKLTSTYTFQQGEVFIVYDFEENLIISRQAIIACISINNITYHRFSLVYREGASDNYPPPKVITETYIETLKGILEEDFFNADIGVIKLINYLNHSKDNLYVNMSYSHNLIKNVVEYINTNYKKPLSLSYISKKFFVNSSYLSREFSKKMNISLLKYIKKVKIYSLSRELLLHGNWESTWREYGFRSYNTYLRDFKNIMHMSPKEFINQNPINQVNETIEQHELYKYLQQILDLIKSE >NZ_CP031275.1|WP_047171717.1|204133_205057_+|AEC-family-transporter MHEMLIILETVLLPIFIMIVIGYILQKKFSLDLKTLAKLNIYIFVPGFIFVKFYKTNFEIKLLLYIVLFFIIYIIILYGIGKLLTYFGTKDKGEATTLTNSILFFNSGNYGVPVNDLVFKGDPLAMSVQVIVLSLQNIFTFSYGIFSIQAVHIGKIKAMLGYFKMPVLYALIFAIILNYGNVTIPKFIWTPANYIADAMIAIALILLGAQIANIKFSFKWSSSYVFIFVRLIVGPVIALGIIKLMGLEDIIAQALFITSAMPTSVNSSVIAQEYDNHPELAAELVFLSTLLSAITVVIVIYMSKILF >NZ_CP031275.1|WP_047171718.1|205158_206646_+|xylulokinase MNEAVLGIDVGTSSVKVIAVNKEGEVLAKVSEELDIIQLQSGYNEQQPDEWFEATKSCIRQILSNDSLNDIYIRALSLSGQMHSLVALDSDNKPIRNAILWNDTRSTRQCATIEQHFGNYVLSNPVLEGFTLTKLLWIKDNEPNNWNKIATFLLPKDYVRYRLTGKINMEYSDASSTLLLDPKQKNWSKTIGSKFGIGDIYPTLVSSGDFIGYVESSLAKSLGLKEDVAVFAGGGDNACGALGAGVIKSNDTLCSIGTSGTLLTCEADEGKMYHHNLHYFNHVVENKSYVMGVTLAAGDSLNWLKNHVFPDLTFNQILSLASESTIGSEGLLFAPYLSGERTPHGDSQIRGSFIGLSTLHTNADIARSVIEGITYSLYETLVHLSEKGKDITHITSIGGGAKNDFWLQLQADIFNTKVSKLKYEEGPCMGAAMLAIIGLNWYESVEKIVDQFIIYDRTFHPNKAHHERYVKYFEVYQEVYRQTRPITARLLELSL >NZ_CP031275.1|WP_138406086.1|206974_207559_+|thiamine-phosphate-synthase MFVAITLYQDLSESHIKHYCEIEEVIDYLLIRTPMTTEEVIQWVHELIKNGFSKDKIIIHSDINVITQCDLSAIHFRENDPHIEEVQASYPDIQVSMSTHHKDGVANAKYLGLDFVLFGHVFETPSKPQQTPRAKSEVEGALQIDIPIIAIGGINQHTLPSLPNGFSGIAGISIFNQYSKQKLMNMKEVWDGHV >NZ_CP031275.1|WP_047173015.1|207551_208652_+|FAD-dependent-oxidoreductase MYDVIIIGSGVMGMSIARGLSQSFANIAVIDRDEAGKHASYKAGGMLGAQNEFTENSALFSLATTSQKMFEPLRYSLLEEVGVDIEYLNSGLIKLAANHYDNKKIEQQYQFLRQHFTSVERLSSTDVQHMSNGAITSKYTNGIYMPEDNQINANHYTKALLKSLSHRHIDRIYQTTVTHVEAIKGGYRVDTQSETYYTEKLIVTGGAWTSKLLQQYLPCEAVSGVKGEVLLVEQPNLNLDVTMFLTNGCYVVPKLKNRYLIGATSYFDDYSVGVSNSGKSWLKSQALRYIPDLKNGKIINQWSGIRPYCQNEHPIMDEVNKDLFVIAGHYRNGILLSPLIGELISQWIINGHRPKQLYDFRLAEVK >NZ_CP031275.1|WP_029379227.1|208652_208853_+|sulfur-carrier-protein-ThiS MKCKINGDVFNFEQPINIQEVIQSLGLDETRIIVEHNETLIKREQFTSRIVNDEDNLELLEFVGGG >NZ_CP031275.1|WP_047171720.1|208854_209622_+|thiazole-synthase MFKIGNFTLNSRLLLGTGKFENEKVQTQAIEASETEVLTFAVRRMNLYDKDLPNPLAKVDLSKFITFPNTAGAKTAKEAVRIAEIANHAGVCDMIKVEVIGDDETLLPDPLETYEACKVLLEKGYTVCPYISNDVVLAKRLEELGVHAIMPLASPIGTGRGINNPLNLRYIIERVNVPVIVDAGIGSPKDACHAMELGADGILLNTAISSATDPVKMAEAMNKGISAGRLSYEAGRIPVKYTAQASSPTEGIGFL >NZ_CP031275.1|WP_047171721.1|209618_210620_+|thiamine/molybdopterin-biosynthesis-protein MIERYNRQVRYHQFGEHGQSQLQKTHVMIMGAGALGSHSAEMLVRMGVGSLTIIDMDIVELSNLHRQALYDELDAEKMLPKVEALKHKLNQINSNVEVTIINREITNLNIENLLTTYHPHIVIDGMDQFKIRYLINESCNKQNIPWIYGAAVGSKGTVYGIDDQGPCLKCLLETMPSTGESCAINGVLPPVIYQVASMQVSELMRWVSGEAFSKKLITIDCFNMQYKSMDISALKQSDCNVCEKHEYALLNDKYDAKIEKQCGDMFLLRFNADIFNHTDYLPVTIKKSNDFVKLLAYGSHEITLFKDGRMNIYGVENEGEAKNIYRTIAKSLS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP031275_2 | 1125700-1125778 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP031275_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP031275_2
>2.1|1125725|29|NZ_CP031275|CRISPRCasFinder TACAGTCTCTTGTTCTTGATTGTTTACTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP031275_2
The CRISPR arrays of NZ_CP031275_2 >merge|NZ_CP031275|2|1125700-1125778|CRISPRCasFinder GTTCTTGTGATTCAACAGGTGCTTGTACAGTCTCTTGTTCTTGATTGTTTACTCGTTCTTGTGATTCAATAGGTGCTTG >NZ_CP031275|2|2|1125700-1125778|CRISPRCasFinder GTTCTTGTGATTCAACAGGTGCTTG TACAGTCTCTTGTTCTTGATTGTTTACTC GTTCTTGTGATTCAATAGGTGCTTG
>NZ_CP031275.1|WP_069794539.1|1122369_1122927_+|serine-hydrolase-family-protein MTDIVIVHSKYGDASNHWYDWLANNLTLEGYDVTLFNLPYEKDSKIEKWVSEMKQQIQINKYETYFVTHGFGTLASLKFIEEVDVDYIEGFFSISGFMEDAQVPNELVQTESFQVDYEQVKGKVESFYGLCAKDDKCISYEETKRLMDTLGGKCKVTEYGGHFMEDDGFTTFTRLQSKMQGIMSQ >NZ_CP031275.1|WP_107543215.1|1120809_1122204_+|protoporphyrinogen-oxidase MGKSIAIIGAGITGLSSAYFIKKLRPDVDVTIYESSNRTGGKIQTYRKDGYTIELGPESYLGRKQIMTDIAQEIGLENDLITNQTGQSYIYAKNKLFPIPGGSILGVPTDIKPFLKTKLISPKGKLRAGLDLFKKPTEMDEDISVGAFFRERLGDEVLENLIEPLMGGIYGTNIDDLSLMSTFPEFKHREEQFGSLIKGMRHEKIQRQKQRQLYPGAPKGQFKQFKHGISSFIECLTEYVVKQGVEIKYQTPIKDIITSQNNYEVISGENKDTYDSVLVTTPHQTFMQWFGNDPAFDYFDSMDCTTVATVVLAFDEKNIENTYDGTGFVIARTSETDITACTWTSKKWPFTTPAGKVLLRAYVGKPNDTVVDDHTDEELVNIVKKDLSQMMTFKGSPDFSIVNRLPKSMPQYHVGHINKIRSIQTHIKQNYPKLRITGASFEAVGLPDCIQQGKNAVEELLAEL >NZ_CP031275.1|WP_029376909.1|1119868_1120792_+|ferrochelatase MTKTIGLLVMAYGTPYKESDIEPYYTDIRRGKKPSDAELQDLKDRYQFIGGLSPLAGTTNRQAEALLDALNEAYDDVQFKLYIGLKHISPYIEDAVQSMHEDGIDEAVTVVLAPHYSSFSVGSYNTRAQKEADKFGIQFKHVAHYYQQPKFIQYWTEKINETLTKIPREEHDETVLVVSAHSLPKGLIEKNNDPYPNELHHTAQLLEEQSDIIHVAEGWQSEGNTGTPWLGPDVQDLTRSLYETHGYKHFIYTPVGFVCEHLEVLFDNDYECKVVCDELGVNYYRPSMPNTDPLFIGAIVDEVKNVY >NZ_CP031275.1|WP_042362452.1|1118748_1119783_+|uroporphyrinogen-decarboxylase MHNKNNTILNMINGEAVSHTPVWFMRQAGRSQPEYRKLKEKYSLFEITHQPELCAYVTHLPVDNYNTDAAVLYKDIMTPLQPIGVDVEIKSGIGPVIHNPIKNIQDVEKLGVIDPKRDVPYVLDTIKLLTEEKLNVPLIGFTGAPFTLASYMIEGGPSKNYNFTKAMMYRDEATWFALMDHLVDMSITYTAAQVEAGAQIIQVFDSWVGALNVQDYRYYIKPAMNKLISGIKAKYNVPVILFGVGASHLADEWNSLPIDVLGLDWRLSIKEANAMNINKTLQGNLDPSLLLAPWDVIEERLKVILDQGMEHGKHIFNLGHGVFPEVKPETLKRVTTFVHEYTQR >NZ_CP031275.1|WP_107543256.1|1117981_1118485_-|signal-transduction-protein-TRAP MKIFASYGTFGYLNQIRLNNPDHNLLQFSASDSSVILEETDEISVLKQPLIYNILESEGDLNENYFYSVIFVPTSEDHAYQLEKRLESLTTDFKQFAGYRCYRFLKPEHGLTYKIYFGFESRTAYEDFKASSVFKDNFDKLALSQFFGSSGQHSSYFERYLFPIDDN >NZ_CP031275.1|WP_145511705.1|1116679_1117903_+|ABC-transporter-permease MTQNAKQLFFSRKKEISKEKQYYNKFIFNGHFSVFLVILLGAFILGYGDWLKSIPQHINYALITSVIVAITSMFPLRTLLKDADRLFLLPFEKNMEIYMTQSLVYSYFSRIGLQLLILIVLFPLFFVINNRSFGFYILFAVLMLVMPYLGLLVKWQWYKYKLESWSLHLVLFIVYASGYYVALDAKHLSSLTSIFVLIGLAILLKYQNKNQLFPWERMIKSEQQHHMNYYKFVNMFTDVKHLKETAVRRSYLDPLLITPKNKKFNENYMYLYLFIRSFARGKDAFNIILRLVVLAMILMFWLDQPLVTLIIGSLFMYIILLQMAQFYTQQAYGLWPQVWPSPDTKVIKGYEQFLYRLMFIVGVLFVIVYAITLPMYSYYGLLFFLVGWLTIRNVVKKLKYQESLLKD >NZ_CP031275.1|WP_042362449.1|1115945_1116683_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MTVKVEHLTGGYGKRPVIKNINFELNQGEIVGLIGLNGAGKSTTIKHMLGLLTPMEGSLTISDININQDVETYRRKLSYIPESPVIYEELTLQEHIYMTAMAYNISREEAMERAHPLLKTFRLEDELDIFPSHFSKGMKQKVMIICAFIVDPELYIIDEPFLGLDPLGIQSMLDLMVEKKNENRTVLMSTHILATAERYCDRFLIMDEGEIVAFGNLEELRKQTGLEGKTLDEIYIHVTQGGNNS >NZ_CP031275.1|WP_029376904.1|1115391_1115817_-|HIT-family-protein MSETVFSKIIDGEIPSYKVYEDEHVYAFLDISQVTKGHTLLIPKKASANIFETDSETMTHIGVALPKVANAIKSAFNPDGLNIIQNNGEFADQSVFHLHFHLLPRYENDVDGFGYKWETHAESIDDEQKAKIAEEIAAHFD >NZ_CP031275.1|WP_042362448.1|1114940_1115312_-|YtxH-domain-containing-protein MKTAQILLGLGAGVATGLGVALMNRDKKDSNEYIEHAKKPVGAESEFNREINTIKQSINDITNYIAQIKSEGTEFGSSIGDEVKTMIGDFKSDIDPNIEKLQSHIENLQNRGDEITKAFEKDN >NZ_CP031275.1|WP_070051127.1|1114137_1114701_-|DUF3267-domain-containing-protein MYLCTRQIDINARFGLPRIAFLSLVTTIITFLIAYEILYFFSNTKLTDKYFLIFLLLVLVLYPIHKAIHLFFLFPYYKSFKKYKLLKQKNIPFYNTYVNTPVNKYYFCFDLMTPVIIITSVCAYLSTLFPQYGHYLMFLIALNMGYSVMDFLYLKIIIFSNEGTYIEEHQTGINILNKVESKHERHI >NZ_CP031275.1|WP_145511707.1|1126083_1126734_-|DUF4352-domain-containing-protein MSKESNEISNEEMLARQQQQFEDYKNEQKKSKKKKWLWGCGGCLGVVILIVIVFLVISSLFFKGVDEELNGSKEEQDQISKTASKTYKVGDTVKADGIEVTLDSVEEAGNVGEIGTEPENGKALKVNFKFKNNNDDQILMDSGDFTINVNGEVYEEWFGTDDTNADFSHQINKGKTASGYIYYDVPDSDKYMVEMETMPNLKDIKAKWEIEKSDIQ >NZ_CP031275.1|WP_107543234.1|1126822_1127287_-|ImmA/IrrE-family-metallo-endopeptidase MSLYEDLVIKNSHIPIGDNFKSNSNFRGLYDMGVIVIDKQLTETRKAEVLFEELAHHKLTWGDITDQSQFNNRKFENYARRAGYQAALPLRIIIEAYHYEISNLHELAEYVELSEEYIILVIEFYKKKYGLSTYYNGYVIKFEPLQVFEHHNWD >NZ_CP031275.1|WP_107543235.1|1127631_1127811_-|hypothetical-protein MNYKSEIKKIGWNKKEVANRVESLIEEEIIDTKDELTDDVSTVIEKEDNNPVLNEFLNK >NZ_CP031275.1|WP_047173041.1|1128096_1128870_+|acetoin-reductase MNKTAVITGSAGGLGKGIAERLANDGFNLIIQDLNEELLLETEKEFKNNGFNVAAFKSDVSVKKEQKELVQFAVTEFGQIDVFVNNAGVDAVSPFLEIDEEQLSKLFNVNVYGTVFGTQAAAEQFKKQNTGGKIINACSIAGHESYEMLGTYSATKHAVRSFTQTAAKELAQDGITVNAYCPGVAKTKMWDRIDEEMVKYNDDMEPGDAFEEFSSAIKLGRYQEPRDVANLVSFLASEGSGYITGQSILTDGGLVYR >NZ_CP031275.1|WP_145511709.1|1129475_1129994_+|hypothetical-protein MINIISAIGSLGTFIMALFYFVSVSVQLYQMKISFIPALGFNQILLEKEDNKNLRNTTSNSEENEDYLKLYNLGGGAAKNITVEVILGKDNVIQKKYINMLPSKESYMLPINKTVFDELDDTIQNNGYESDMNIRLTYYHNVSRKKQEVVLKGHIDSFNTYENKEIYELQFI >NZ_CP031275.1|WP_047172192.1|1130109_1130289_-|hypothetical-protein MDYKKEIEKIGWNTKEVANRVESLIEEKVIDVKEDVTEDLSVVVEKENNNPILNEFLNK >NZ_CP031275.1|WP_047172193.1|1130410_1130602_+|hypothetical-protein MELNLDWSKDFQEFQDILNSGIHPEWLYNAKANMVLNPAYTGEGKQFFFTKDIIKASKNIPFF >NZ_CP031275.1|WP_081326036.1|1131670_1132342_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MSGKGHHVILGARSLQDGQSIVKELESKGLSVSTVQLDVTDINSVQNAVQEINALDILINNAGIALEASSPSKLDVTKVKNEFDVNVFGVINVTSAILPLLQKEKEAKIINMSSMMGSLNSALDKDSIVYGASVAGYQSSKAALNMYSIQLSKELEKEGYDISIDLVDPGMVAIEFGGLDPETAKKMGARSVDEGIKRVIELVEQDKINKNITFTNNDGVVPW >NZ_CP031275.1|WP_107537843.1|1133779_1134343_-|PepSY-domain-containing-protein MKFKSLSAILLSSLLLASCGNGSSDSDSKSENKKDTTSDNQVISINKIKTSPDDAIKKAQETYNNQDLKGISYEKSNGEWAYKIEQQGDNKESEVIISDKNKKILNKEHENENSINNDEAFKYNEAIDYKDAIKKGQKEFDGDIKEWSLSKDDGKLVYDLDLKNDKEKHEITIDAKSGKVLNNEQDN >NZ_CP031275.1|WP_047172197.1|1134610_1135990_+|o-succinylbenzoate--CoA-ligase MDFWLKAQAEQNSKGIFIDDGVKQITFGKMYDSAKRLAYSLKQLELNRIGLYINNTIESIVLINAAWVAGIEIAMVNTRLTKKEMIAQMKSIDVSTIITMEQLHLRDIEVIDFQTLQTQEGYEFEAPFSNDRIASIMFTSGTTGPQKAVPQTFYNHYASALGCKESLGFSQSTKWLSVLPIYHISGLSVVLRALIEGFTLRLEAKFDADKMMKIIREETPTHISLVPQTLKWLMDKGWHQPFSIEKILLGGAKLTTSLINRALEYDLPIYNSFGMTETCSQFLTATPEMLKLRPDTVGKPSDNVEVKISQPNVNGHGELLIKGDNVMNGYLFPMNKHDTFVDGYFKTGDIAEIDEEGYVMVYDRRKDLIISGGENIYPYQIETVAKKHEFIEDAMCVGIEDDTWGEVPYLYYIASETITKKHLVAFFENHLAKYKVPKQFKRVTSLPYTSTGKLQRNHL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP031275_3 | 1159326-1159407 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP031275_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP031275_3
>3.1|1159352|30|NZ_CP031275|CRISPRCasFinder AAATCATTGCAATTTTCTATATACCCTGTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP031275_3
The CRISPR arrays of NZ_CP031275_3 >merge|NZ_CP031275|3|1159326-1159407|CRISPRCasFinder ATATTTAATTTGTGAAATAAATCACAAAATCATTGCAATTTTCTATATACCCTGTTATATTTAATTTGTGAAATAAATCACA >NZ_CP031275|3|3|1159326-1159407|CRISPRCasFinder ATATTTAATTTGTGAAATAAATCACA AAATCATTGCAATTTTCTATATACCCTGTT ATATTTAATTTGTGAAATAAATCACA
>NZ_CP031275.1|WP_107542521.1|1158396_1159221_+|alpha/beta-hydrolase MWKWETENEAKGIVVIAHNMLEHTGRYAYVITMLRRNGYHVIMGDLPGQGQTSRSNKGQIDNFDVYHEHILEWIRIANEYKLPTYVLGVGLGGLIVLNMLEKVEVPIEGLMLLSPLLEFKKSNKTRKDKIISNIGKLAKDTRFKVGITVEDLTRNSEVIDETNNDQLMLQKVTYHWYKQIIEIMKETVNHLKDVKSLPLLLMYGTEDKVSDVTAMDLIKEKITTEELYFKAWDGLYHEIHNEPERDEVMRYILAFLNNSSSNNGFIVHDENEVS >NZ_CP031275.1|WP_107542520.1|1157128_1158130_-|proline-dehydrogenase MPIVKNFFIGLSNNPLLNKTAKEIGPMLGANKVVAGNTITALVDTIERLNNKGITVTVDCLGEFVLTEGEAIQAKDQIIEVMYAIYNHNLDGHMSIKLSQLGSEFDIDLAYRNLREILLKANQFDNMHINIDTEKYDSLFDITQVLDRLKGEFKNVGTVIQAYLYKADALIDKYPELRLRMVKGAYKESDTIAYQTKEEIDKNYIRLMKKRLLNSKNVTSIATHDDEIIRHMKQFIKDNNIERSQYEFQMLYGFRTDLAEKIAGEGNNFCIYVPYGDDWFSYFMRRLAERPQNLNLMFKEFMKPDILKKVGIVSGAIASFALATTFLYRIFKK >NZ_CP031275.1|WP_039067036.1|1156472_1156931_+|6,7-dimethyl-8-ribityllumazine-synthase MNFEGKLIGSDLKVAIVVSRFNDFITNRLLDGAKDTLIRHEVPEENIDVAYVPGAFEIPLVAKKLAEKSDYDAVITLGCVIRGSTSHYDYVCNEVAKGISKANDVTDTPVIFGILTTENIEQAVERAGTKAGNKGSEAAVSAIEMANLLREI >NZ_CP031275.1|WP_069794525.1|1155277_1156459_+|bifunctional-3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate-synthase/GTP-cyclohydrolase-II MQLDSIDKALTALKNGDSIIVVDDENRENEGDLVAVTEWMHNDTVNFMATYGRGLICAPISSDIANKLDLNPMVSNNSDVYGTQFTVSIDHVDTTTGISADERTLTARALIDDRVSAADFNKPGHLFPLIAQDNGVLTRRGHTEASVDLAKLTGAKPAALICEIMNDDGTMAKGESLEMFKETHGLVMISIEDLEKYRKSAISKLEAKAKVKMPTEFGVFDMYGFTTSDSDEEIVAIVNGDIKQTENVRIHSACLTGDIFHSQRCDCGEQLEASMRYINEHGGIILYLPQEGRGIGLINKLKAYELIEQGYDTVTANIALGFEEDLRNYENAARILKYFGVESVNLLSNNPKKFESLENYGIDITKRIELVVPTNKYNQDYMDTKKEKMGHLI >NZ_CP031275.1|WP_042362478.1|1154634_1155267_+|riboflavin-synthase MFTGIVEEIGTIKKVSTQQSVVNLKIECQTILSDMHIGDSISVNGACLTVVEFDHQSFSVQVIKGTENKTYLNQLTQSAEVNLERAMSGQGRFGGHFVLGHVDEVAKITRIQASDNSKIVTIKPTTKLIKQMVSQGSITVDGVSLTIFQLKEAEFDIHLIPETRKSTILNQKRVGDPVHIETDMLFKYVERIINTNESELSPEKLRAFGF >NZ_CP031275.1|WP_069794527.1|1153584_1154628_+|bifunctional-diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine-deaminase/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil-reductase-RibD MSHYLNYAIQLAKMVEGQTGLNPPVGSVVVNDGRIVGMGAHLQKGGKHAEVQALDMAQDNARGGTIYISLEPCTHYGSTPPCVNKIIEAGIKKVVYAVKDTTLPSEGDDILEQAGIEVIFRSQSDAESLYRDFFMAKNESIPEVTVKVSCSLDGKQATDKGESKWITNKAVKNDVFHLRHKHDAVLTGRGTIHADNPQYTTRIEEGKHPIKVILSKTGEIDFNLDIFQLRNEPIWIYTQNKNLKTNIEHVEIIELTDCSIENILKDLYQRGIGSVLVEAGPTVTSEFLESKFTNELILYYAPKIIGGSGNYQFFQSESIFNLSEVPQFEIVNSQMLEQNIKLELRKK >NZ_CP031275.1|WP_042362476.1|1151557_1153021_+|pyridine-nucleotide-disulfide-oxidoreductase MRIAIIGMGTAGVTLLKELVKSDSFSKMNIDVYDNPINMGQGVPFQNDSAELLINLPAAQMSLNLDNHREFYEWYEKQSTFKFSNPEYLPRFIFGHYMKDYLQKFNHKYGNINTIEEEVTEVFIESEIGKTNVTYCVCTSKEIKNCKKYDVVFLTIGTLSYHDPYGLKGIRGYIKTPYPTYNTLDDVQDSDEIAIIGTGLASLDVIRYVTSHHPKLPITVASRKGRLPSVRGEMPDIDFKYITPEKFNEIKRKHFGNVPLDEVIKLFLKDCALHNIDVETLVHRSQDDPIKDLTYDLEHADELGKLQSILELTKENLNWIWNSLSREDQKRFLTNYQPILKENSNPMPPQTARLLIDHINHGTIKIKSELEDVRYNDNKFNFKYKDASVEQFDIVINATGSKTQLADLDGDDQLVLNLENRQVVQAHPLGGIQIVAETNQIISPRYGTLKHMYALGQLTNGINQSRNGVMMIVKQAVNVVDHLLSTK >NZ_CP031275.1|WP_107542519.1|1150460_1151387_-|osmoprotectant-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKHLKRFLFFILASTFLLTSCDLPGLGGGQSKNTVKISALATSESQIMAYMLKELIEHDTNGETSGTIINNLGSATIQHNALMNGDADISSTRYTGTDLVGVLEQEPITDTNKAMTITKKLFNQKFNQTFFNSYGFENTFAFMVTKETAEKYNLQTVSDLKKIKDKVNVGTDTTWIKRGGDGYAPFQKHYGFGFNSLKPMQIGLVYDALKNDKLDVALGYTTDGRIAAYDLVVLKDDKNFFPPYDASAVAPNKLLKEHPQIKKSISKLDDKISTEQMQKLNYEADGNGKEPAVVAETFLKKHNYFDEK >NZ_CP031275.1|WP_047172208.1|1149182_1150037_+|autolysin MTKYKKGSILSIIGLLIILGVAAVIVFAMISDQIFFKDVNEQEKVENLKVTLDKASKKQIDNYTSQQVSSKDNKSWRDASSTEIKAAMNSSEFIDSDTQKYQFLELDKYQGIDENRIKRMLIDNPILLKHSDDFINAAKNKHVNEVYLISHALLETGSAKSELASGVEIDGKKYYNFFGVGALDEDPIKTGSEYAKKHGWDTPEKAISGGANFIHDHFLSNKDQNTLYSMRWNPKNPGEHQYATDIKWAESNASLMANFYKDMKTEGKYYKYFVYKDDEKHKTR >NZ_CP031275.1|WP_017722196.1|1148793_1149018_+|hypothetical-protein MDYAHLNLEHFFAKHNDLDIIKDKSDFVMINNMTNEMMYRDGEIEGAIDLNRYYYKNRSQAASFIIMEYRKSQE >NZ_CP031275.1|WP_047172213.1|1159439_1160396_+|L-lactate-dehydrogenase MEYIKSNKVVLIGDGAVGSSYAFALVAQGVADELVIIDLAEEKVKGDVMDLNHAAPYGGSPIKIKAGSYKDCDNADIVVITAGAAQKKGETRLDLIEKNTKIFKNIVSEVMDSGFDGIFLVATNPVDVLTYVTREVSGLPKEKVIGSGTILDTARFKYELAEEFGVSDRSVHGQIIGEHGDSELAVWSQANIAGQPLYQLLKDDPERQHRIEEIFVNTRDAAYDIIQAKGATYYGIAMGLVHITKAILNNQNLVLTVSSYLEGEYDQKGVYVGVPTKINRQGAVKVFEIPLSEEEERLFNNSVNILKEMQNKISHLIA >NZ_CP031275.1|WP_029377004.1|1160546_1160948_+|MarR-family-transcriptional-regulator MGKTFADKVDGVLQLESVLKEIDDIFAKVQKQYKMSKEEILILLTLWKEGSMTLKEMDDFVHIKSYKRTRTYNDLVEKTWIIKERPQNDERTVIIHFNEDLKDQRESLLNFFKEEIDGKSTSIQNSLKSIINL >NZ_CP031275.1|WP_047172214.1|1161044_1161605_-|methyltransferase-domain-containing-protein MKLERILPFAKSLIKQHTHEESIVIDATCGNGNDTLFLAQQVTSGRVHAFDIQEAAILNTQQKTKDFDNVTLHHASHSEVKKYIPTESHGTVDAAIFNLGYLPKGDKSVVTLPNSTIAAIEAIFDILSAEGIIILVIYPGHEEGKIERDAVINYLKNFDQNKAHILQYQFINQQNDPPFICAIEKR >NZ_CP031275.1|WP_047172215.1|1161601_1162555_-|TIGR01212-family-radical-SAM-protein MGQFFPYAFENKRYHTWNYHLKNKFGQKIFKVAIDGGFDCPNRDGTVAHGGCTFCSAAGSGDFAGDRVDPIEVQFRQIKDRMHEKWHDGQYIAYFQAFTNTHAPVEVLREKYETALKEPGVVGLSIGTRPDCLPDDVVEYLAELNERTYLWVELGLQTIHQETSDLINRAHDMETYYEGIAKLRKHNINICTHIINGLPGEDYNMMMETAKEVAQMDVQGIKIHLLHLLKGTPMVKQYDKGMLEFMSQEEYTNLVCDQLEIIPKEMIVHRITGDGPIDLMVGPMWSVNKWEVLNEIDNELARRTSYQGKFFESTVKS >NZ_CP031275.1|WP_047172216.1|1162664_1163834_+|MFS-transporter MNMPKSVWWLVIGMALNITGSSFLWPLNTIYMNEQLDKSLTMAGLVLMINSFGMVIGNLLGGNLFDKLGGYRTIMIGTVICLMSTTLLNFYHGWPWYAVWLVALGFGGGMIIPAIYALAGAVWPNGGRQTFNAIYLAQNLGVAIGAASGGFVAELSFNYIFIANLLMYVAFAIVAVTQFNIKLDVKVKSNDAMSLLSKAYRPQFIALSLLCVMFSICWIAYIQWESTIASFTQEINVSMSQYSLLWTVNGIMILVAQPLISPVIRLLKGNLKYQMLVGIIIFILSFFVTSFAEQFSVFMVGMIILTLGEMFVWPAVPTIANQLAPSGKEGSFQGYVNSAATVGKAFGPLIGGVVVDTFNMQSMFLSMIFLLVIALIFLMIYDKKLSKEI >NZ_CP031275.1|WP_047172217.1|1164352_1166767_+|leucine--tRNA-ligase MNYNHNEIEKKWQGYWEEYKTFKTSDNLGQKKFYALDMFPYPSGAGLHVGHPEGYTATDIISRYKRMQGYNVLHPMGWDAFGLPAEQYALDTGNDPREFTKENIQTFKRQIKELGFSYDWDREVNTTDPEYYKWTQWIFIQLYNKGLAYVDEVAVNWCPALGTVLSNEEVVDGVSERGGHPVYRRPMKQWVLKITEYADRLLEDLDDLDWPESLKDMQRNWIGRSEGASVTFEVADLNEEIEVFTTRADTIYGASFLVLSPEHELVNKITTEDKREAIEAYQKEAAKKSDLERTGLSKEKSGVFTGAYAINPLSGEEVPVWIADYVLSTYGTGAVMAVPSGDQRDYEFAKAFDLPIIEVIEGGDMTQEAFTGDGPHINSGELNGLYNEAAIEKAVELLENKNAGSRKVNYKLRDWLFSRQRYWGEPIPVIHWEDGSMTTVPEDELPLLLPETDEIKPSGTGESPLANIDEFVNVVDEATGMKGRRETNTMPQWAGSCWYYLRYIDPNNDKMLADPEKLKHWLPVDLYIGGVEHAVLHLLYARFWHKVLFDLGVVPTKEPFQKLYNQGMILGEGNEKMSKSKGNVINPDDIVQSHGADTLRLYEMFMGPLDAAIAWSENGLDGSRRFLDRIWRLLVTENDLISSKVVNTNSKTLDKSYHQTVKKVTEDYNSLNFNTAISQLMVFINDCYKAEEIYKPYIEGFIKMLAPIAPHISEELWARLGHEETITYQPWPSYDESLLVDDEIEIVIQVNGKVRAKVNMPKDISKEAMEEVALGNENVKSEIAGKDIKKVIAVPKKLVNIVAK >NZ_CP031275.1|WP_029377008.1|1166786_1167098_+|rhodanese-like-domain-containing-protein MESITIDELKSEILDANPVNIVDVRTDEETAMGIIPGAKTIPMNKIPENLNQFNENDTYYIICKVGGRSAQVVQYLEQNGVNAVNVEGGMDAWGDEGLELKSV >NZ_CP031275.1|WP_042362488.1|1167445_1168720_-|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase MYQTIIIGGGPSGLMAAAAASQSSNSVLLIEKKKGLGRKLKISGGGRCNVTNRLPYDEIIKNIPGNGKFLYSPFSVFDNESIIHFFESRGVSLKEEDHGRMFPVSNKAQDVVDALIHTLQQNKVEVKEEATVASISYTDNQTFQVSLNDQQSFESQSLVIATGGTSVPQTGSTGDGYKFAEQLGHSITELFPTEVPITSAEPFIKNKRLKGLSLKDVALSVLKKNGKTRITHQMDMLFTHFGISGPAALRCSQFVYKEQKNQKRQEIQMQIDAFPELTKNELELKIRSLLEDTPDKYIKNSLHGLIEERYLLFIIEQADIPDDLTAHHISNAQINNIVALLKGFTFYVNGTLSIEKAFVTGGGVSLKEIQPKTMMSKIVPGLFLCGEVLDIHGYTGGYNITSALVTGHVAGTNASVFVSTTQTL >NZ_CP031275.1|WP_047172218.1|1168849_1170487_+|polysaccharide-biosynthesis-protein MSESKELVRGTFLITLSILITKVLGVIYIIPFYSIIGGEEKLAPFNYAYTPYNIAIAIATAGVPLAASKYVSKYNALGAYKVSEKLYKSSFIVMTITGFIGFFILYLLAPSIASITLAHESGAKGGWSVDDITWIIRIISMVVIFIPLLATWRGVFQGYKSMGPTAVSEVIEQIARILFILIGSYLVLNVFNGSVLQANGVATFAAAIGAVAGIFTLWYYWRKRKPNIEKMVATDVSGISVSYGKMYKEIISYSIPFVIVSLNFPLFNLVDQFTHNGALDLAGVPSRLHDYFFTILNMTTNKIVMIPTSLSAGFAVSLIPFITKTYESGELSEMHRQIRTSLGVLMYITVPASLGIMALALPLYTVFYSYNVDGSQLLFYYAPVAILIGLLSVTASMLQGIDKQKLTVFVILSAVVLKVVLNTPLIMAFHTAGAILSTAIALLFAVLCNFYILKKYAKFDFSETWLHFGKIFLYGLIMMIVVELSSFILQMMISPESKIGSLTILIISVVIGMIIYGSITMKTKLADQFLGEIPNKLRRKLGIIK >NZ_CP031275.1|WP_047172219.1|1170483_1171182_+|rRNA-pseudouridine-synthase MRLDKFLANMGVGTRTEVKQLLKKKQVTVNDDIETSPKRQLNPDVDVVKVNDTRIQYIDKVYLMLNKPKGYISATEDDKQQTVIDLVDEYKYLNVFPVGRLDKDTEGLLLITNDGQFNHDLMSPTKHVPKTYEVVSEKNITKNDINAFKVGIELNEGLAKPAELVKSDEMYKSFVTIHEGRYHQVKRMFHAINNEVIELKRISIGDLHLDLTLAPGEYRHLNQQDFKSLGLK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP031275_4 | 1937969-1938047 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP031275_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP031275_4
>4.1|1937994|29|NZ_CP031275|CRISPRCasFinder GAGTAAACAATCAAGAACAAGAGACTGTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP031275_4
The CRISPR arrays of NZ_CP031275_4 >merge|NZ_CP031275|4|1937969-1938047|CRISPRCasFinder CAAGCACCTATTGAATCACAAGAACGAGTAAACAATCAAGAACAAGAGACTGTACAAGCACCTGTTGAATCACAAGAAC >NZ_CP031275|4|4|1937969-1938047|CRISPRCasFinder CAAGCACCTATTGAATCACAAGAAC GAGTAAACAATCAAGAACAAGAGACTGTA CAAGCACCTGTTGAATCACAAGAAC
>NZ_CP031275.1|WP_145511737.1|1937303_1937663_+|DUF4352-domain-containing-protein MEVTLDSVEEAGNVGEIGTEPENGKALKVNFKFKNNNDDQILMDSGDFTINVNGEVYEEWFGTDDTNADFSHQINKGKTASGYIYYDVPDSDKYMVEMETMPNLKDIKAKWEIEKSDIQ >NZ_CP031275.1|WP_107543221.1|1935970_1937305_-|CHAP-domain-containing-protein MPSALNGQPYGAQCATFIIEFTKKYWGVHPTGDAKDFIDFKWPKGFQVIKGKKQIPQPGDIFVFGGEHGHTGIVTEANAKYFNSIDQNWYNESLTKGSPAAFVEDHEYSNFLGVIRPPYEDAEKGAVLKSTKIETINQTIKYKMPNRSGNVKGVVIHNTASSATAKQDYNNLKNASQARYEAGIAHYYIDRNTVWRAIDTYSVGWHVANAYGNNAFIGYEVNESMSANNKDFMANEQAVFKKAAADLLYYGLPVNRETVMLHCQFVPTACPHRSMALHTGFDPVRQGAAPTSIVNQLKDYFIKEIKKYYNNPALKAGSPASSDIPNRTTIPTEKEQSKPIKEHGSSVGNGWKKNSWGILWKKEAASFTCNVSEGIVTRYVGPSLHNPIAGGLEYGQTVNYNEIQDYEGYIWISWEVFSGDTVYMPIGKSDGKGSRVGDAWGTFS >NZ_CP031275.1|WP_107543220.1|1935034_1935895_-|hypothetical-protein MEVGEKYNKLECIKFIESDKRGKKFLFKCDCGNEVVYTGTYVKNNRYKSCGCMKYNKNKDEDILDNKYYRLKPIKRVENIRRGKAFLCNCDCGNTTVVPLADLKNGRIKSCGCLNSEVQSKFMKEYSTQHGKSKSPEYKVWKGMKERCYNTKSKGYKNYGGRGIKICDRWLDSFENFINDMGERPSTEHQIDRLDNDKGYSPLNCKWVTRSENALNKRHAKGVSGFRNIILDGQSYYALVKRKGHTRSSKYTDLETALNKRDLYIEEYKTDPQKWVEDTINKNYQK >NZ_CP031275.1|WP_107543219.1|1934465_1934897_-|hypothetical-protein MKKNIFILTLVVLLSTILTGCDNAKKDVRGEWEGKNNKYIITKDTITYQYSEDDKDVYNYEVVNDNGSTVTVDLRDEGDKKEESFAREKWTTYKKELKMYDEEGNVIEAYESEKPFDYKKWTVIICIIVAVVYGLYRLGNSEN >NZ_CP031275.1|WP_107543218.1|1933810_1934335_-|hypothetical-protein MKFFSRFLSKNQDSTLNEYFWVHLMSTRRKKAITLLIIAIVFLFSLSTHMGQTNTSNVFKSDEKVAKSKIEKYIDSNRELASLLSKGKKGKALELVYDNQSYYEETILKDDYIKDNYDTGDLENYLMEPLDTSTGGVMDAEATYGEHSGKTRDMMATAGNYLDERMDEAEEEYL >NZ_CP031275.1|WP_107543217.1|1933526_1933718_-|hypothetical-protein MEPNLDWSKNFQEFQDILNSGINPEWLYSAKANMFLNPAYTGEGKQFFFTKDIIEASKTIPFF >NZ_CP031275.1|WP_107543254.1|1932455_1932767_+|tyrosine-type-recombinase/integrase MILINSKLSNLPRRIDGKLFALSHTAVNKSFKHAKKVVGLDDDNVTPYSLRHTHTSYLLSKGLPIEYISKRLGHASISITLDTYSHLLEEHKKEQGRVRELFS >NZ_CP031275.1|WP_107543253.1|1931995_1932190_-|hypothetical-protein MFAHLPIYDNGEAYEDHQIDLGEKIYTQKNSAINYIKSESFTLEEAFPSYLDTDIEEYEGVRYY >NZ_CP031275.1|WP_107543232.1|1930214_1931423_+|MFS-transporter MNNLYNIHRIKGNWLILIAIIMVASTLRAPLTSVGPVINDIIQQFNINDGIAGSLITIPLFIFAIISPLVSKVTYYLTMSRTILLSTLLLVLSLILRVAGDFTLFILGTILLGVAIAFGNVLLPSYVKWYFPTQVGIVTGIYSSMMHFTAGLGGGLSIPISSVSQFGFRLSLSSWVIFAIVSIFLWIPIVTKNSKIERKTTSANQRNKANKTNIVKSRIAWIIAAAMGFQAMIIYSIVMWMPSILIDKGVDSSTAGFLFMLNQFSQVPMTFIVPIIAYKLSNQRILAIIITTLFLLGFSFLFSHSLILLFIGVIILGAAMGACFSFCMILFSIKARTDNGSVMLSGFGQSIGYLIGAIGPVLVGYLYDITHGWNSGIVALFIMSLLFLIFSYSASKNRVIED >NZ_CP031275.1|WP_069795865.1|1928381_1928873_-|hypothetical-protein MKKLSKIVLASSIIFGTVLGANVVNGEGIEKQAEAAQTPWYNYNGYTAPSSNFVLDKNFKTALKYDNVKINGYKLTSNKSAASNEVKVYDQIFYKVSNHKADQVAFNLDGRTVTPQKLINVYGQPVEKPVETAVGKVYKYKVGNKTVQFFVDKGHVYRVQINS >NZ_CP031275.1|WP_107543047.1|1938521_1939559_+|site-specific-integrase MNMPVNKDGKNWKYDFRINGKRYRKAGFPKKIDATIAMNEAFEKANKGFTLDNNIAFIDYFNKWITTHKEPYLTPRALQTYHNAKNIFEKYLGNIPIKELNRTNYQELINDYAKNHATESVRKLNNCLRAAIQDAVYEGILYKDPTHRVIVKGAIKEKPEEFKFMSLKNYYNLKDYAKSKNKLSYLFIYLAIVTGARFSEIQKMQYKDFNLNNETVHIRGTKNETSDRVIKITKEDIKHVRQVLNDFPINLDGDIFRTGANLITHNAVSKVLQRFCLNNQLGNYTLHSIRHTHCSMLLHEGISIHYISKRLGHADIATTLSTYSHLLEESQKQEEEKTLEVLRHM >NZ_CP031275.1|WP_017722273.1|1940051_1940615_-|competence-protein-ComK MIQPYIIKKGDMVLQPCNLATGQYEGSYLLRYKADSQIIKERVSKIIDRSCRFYGSSYVFKKEDTMRITGISSKPPILFTPLFPTYFFPTHSDRKADNTWINIHYVHNIRPLKEKKCKVTFVDNQSIVANISAHSMHHQYLNGIYYYYMMDRAARVATFDPDSPIDYTKPQLNIYEALAKYSLFESK >NZ_CP031275.1|WP_029379123.1|1940868_1941087_+|IDEAL-domain-containing-protein MKHNTHVKYNTLESFVSTINDLGIELIIDESLRNVRKQELERLIDNALKNKNENDFKRYTEEYRNLEEFLVG >NZ_CP031275.1|WP_042362968.1|1941186_1942173_-|lipoate--protein-ligase MKFISNNNITDPTLNLAMEEYVLKNMPKDDSYFLFYINRPSIIIGKNQNTIEEVNQSYIDEQGIDVVRRISGGGAVYHDTGNLNFSFVTDDDGNSFHNFQKFTEPIVEALKSLGVDAKLSGRNDIQVGEAKISGNAMVKVKDRMFSHGTLMLNSELDEVQNALKVNPAKIKSKGIKSVRSRVANISEFLDEPIDIDKFKEIILKSIFGETQVEEYKLTDEDWRKIEKLSNEKYRTWEWNYGRNPKYNFEREEKFEKGFVQIKLDVKKGRIEHAKIFGDFFGEGDITELENALEGTMHEFDSIEEALSNYDIYHYFGDIDRHELIRLMS >NZ_CP031275.1|WP_002483735.1|1942372_1942558_+|DUF2187-family-protein MTVAEVGNIVEFYDGLKGRVEKINDNSVIVDLTIMENFEELDLPEKTVINHKRYTIVEQEG >NZ_CP031275.1|WP_029379125.1|1942563_1943166_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MNRLSKALIWFIVSFLVFHIILYVMWGEKQEYWYLYTGIMLIAGVSYVFYQRDIESKRLLTSLGIGIITGIVLIVIQLIIAAIATDIKYAELIKELTRTGVYYKWQMLVTLVFVIPCHELYMRTVLQKELLKLNLPSWLGIIITAFCSASLFYYLDNLWIVFFVFIVQIVLSLSYFYTRRIATTVIAQIVAVVILLIFNA >NZ_CP031275.1|WP_069795866.1|1943232_1944741_-|bifunctional-metallophosphatase/5'-nucleotidase MKKSEKIAIDVITTSDMHSYFLNGDYSSNIYRAGTYVKSIREENDHVILLDSGGSLAGSLAAFYYAVVAPYKRHPMIKLMNAMHYDASGISPNEFKFGLSFFSRAVSLSRFPWLSANIEYKRTREPYFSTPYTIKEIEGVKIAIVGLTSDGLMEREHFEMEKDVQIEKTLLSSKRWIRFIHETEKPEFLIVIYHGGLNQLNKSANEHEQNVNEAEKLMQTLGVIDLLITGHQHQTFIGQNDKTVYVQAGQNAEQLIHVKINFKKRTTSYELEDIQSQIIDLNEYHEDKDLLDLTFYDRKTVEHWSKEVLTNTDIDAKVEGLGDVITKPHKFTQLLHDSIRLAFDYDISCIHLPISGEKGLSGTITNEELYNAHPHPDIPIDLTIKGQQIKDILEYCYGHIEFSQGELSLTIVDETLCTFWQGVDYIIDMNAEPFNRVALKNIRLDHMYRVSMTDYCYRNYRQYLEDAVIHETGEITMVELISRNLKNQDYQIQQKQTFEVLI >NZ_CP031275.1|WP_069793886.1|1945103_1946462_-|TrkH-family-potassium-uptake-protein MSIFNQLFKKSSPQQGIVMYYIIAIIVAFLLLNLPFVHKPGIKVDPIDSLFVAVSGVSVTGLSPVNIVETYTTFGQIIIMIILNIGGIGVMAIGTMLWVVLGKHIGMRERQLIMLDNNKDTMSGTVKLILDIVRTILIIEVVGAALLAFYFYRDTPDLQYAIMQGFFVAVSATTNGGLDITGQSLIPYANDYFVQTIVMFLIILGSIGFPVLIEVKAYIKNRIPNFRFSLFAKITTVTYLVLFVFGVIMILLLEYNHAFQNMSWHKSLFYALFQSATTRSAGLQTIDVSHFGEGTNVIMSILMFIGSSPSSVGGGIRTTTFAILILFLFNFSNNTEKLSIKAFNREIHTTDVQRSFAVFTMAGILTFASMIFILVVENGKITFLQAFFEVMSAFGTCGLSLGVTGDVNDMSKTALMVLMFIGRVGLISFIIMIGGRREPDKYHYPKERVQIG >NZ_CP031275.1|WP_107543049.1|1946480_1948268_-|serine-protease MKDNKKHVIPKEKYGRKRREYFHNEEREQRVQFERKARKQRAEKAEELAKNNEERVKENLRKARIEKLTQEEIQQQQQVMKARSNNNGITSSQNQIDESSNENQQKETNATVESAKTSDTSLNDTITETTDYSNDKVERNNEAKHDHSENKDEPKNAQDDHFYSEEAQQSRVNNYIEDENESKTQLNMGVSDESKPHRKTAYQHNDKQPQSFMDRVKYFFMEQWAQILIVVAVVLLLILIQAIFNNVDNNGNTKGHVFQNNSDKDKTYTATMKSANSAIHSVVTVENDTSNESSSAEKETQEAGKENELGSGVVYKKVGDSIFIMTNAHVVGDKKEQKITYGNNDYSIGKVIGTDRFSDIAVIKAKVKSDSDVKAIKMGDSSTLVLGEPIIVVGNPLGVDFKGSVSEGIVSGLNRHVPVDIDKDDKYDVLMSAFQMDAPVNPGNSGGGVIDKNGKLVGIASLKIDMDNVEGIAFAIPVNDAESIAKQLEAKGEVIYPNTGVELANIADIDDTTRQSINLPDDVNNGVLIGNVKDDSIGEKSGLQKNDVIVELDGKEVEDNLRYRQIIFSHKDDLKTLTAKVYRDGKVQDINIKLK >NZ_CP031275.1|WP_042362972.1|1948520_1949318_-|TerC-family-protein MDPSLILPYLWVLVVLVFLEGLLAADNAVVMAVMVKHLPPEQRKKALFYGLLGAFIFRFISLFLISVIAHFWWIQALGALYLLYMSIRNLISFFKEKDHDKNEGNDDHHFDESGKEIHASAKSFWGTVLKVEFADIAFAIDSMLAALAIAVTLPTVGIHFGGMDLGQFIVMFLGGMLGVIIMRFAATWFVNLLNKYPGLEGAAFAIVGWVGVKLVVMVLAHPDIGVLDEHFPHGVLWQSIFWSIMILLVLVGWLGSVRKNKQQEK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP031275_5 | 1944924-1945012 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP031275_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP031275_5
>5.1|1944950|37|NZ_CP031275|CRISPRCasFinder TGAGTGATGGTTCGTTCACCTGAGCTTTCGCTCATGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP031275_5
The CRISPR arrays of NZ_CP031275_5 >merge|NZ_CP031275|5|1944924-1945012|CRISPRCasFinder GTAAGAGTCACTAACTCAATTTATTGTGAGTGATGGTTCGTTCACCTGAGCTTTCGCTCATGCGTAAGAGTCACTAGCTCAATTTATTG >NZ_CP031275|5|5|1944924-1945012|CRISPRCasFinder GTAAGAGTCACTAACTCAATTTATTG TGAGTGATGGTTCGTTCACCTGAGCTTTCGCTCATGC GTAAGAGTCACTAGCTCAATTTATTG
>NZ_CP031275.1|WP_069795866.1|1943232_1944741_-|bifunctional-metallophosphatase/5'-nucleotidase MKKSEKIAIDVITTSDMHSYFLNGDYSSNIYRAGTYVKSIREENDHVILLDSGGSLAGSLAAFYYAVVAPYKRHPMIKLMNAMHYDASGISPNEFKFGLSFFSRAVSLSRFPWLSANIEYKRTREPYFSTPYTIKEIEGVKIAIVGLTSDGLMEREHFEMEKDVQIEKTLLSSKRWIRFIHETEKPEFLIVIYHGGLNQLNKSANEHEQNVNEAEKLMQTLGVIDLLITGHQHQTFIGQNDKTVYVQAGQNAEQLIHVKINFKKRTTSYELEDIQSQIIDLNEYHEDKDLLDLTFYDRKTVEHWSKEVLTNTDIDAKVEGLGDVITKPHKFTQLLHDSIRLAFDYDISCIHLPISGEKGLSGTITNEELYNAHPHPDIPIDLTIKGQQIKDILEYCYGHIEFSQGELSLTIVDETLCTFWQGVDYIIDMNAEPFNRVALKNIRLDHMYRVSMTDYCYRNYRQYLEDAVIHETGEITMVELISRNLKNQDYQIQQKQTFEVLI >NZ_CP031275.1|WP_029379125.1|1942563_1943166_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MNRLSKALIWFIVSFLVFHIILYVMWGEKQEYWYLYTGIMLIAGVSYVFYQRDIESKRLLTSLGIGIITGIVLIVIQLIIAAIATDIKYAELIKELTRTGVYYKWQMLVTLVFVIPCHELYMRTVLQKELLKLNLPSWLGIIITAFCSASLFYYLDNLWIVFFVFIVQIVLSLSYFYTRRIATTVIAQIVAVVILLIFNA >NZ_CP031275.1|WP_002483735.1|1942372_1942558_+|DUF2187-family-protein MTVAEVGNIVEFYDGLKGRVEKINDNSVIVDLTIMENFEELDLPEKTVINHKRYTIVEQEG >NZ_CP031275.1|WP_042362968.1|1941186_1942173_-|lipoate--protein-ligase MKFISNNNITDPTLNLAMEEYVLKNMPKDDSYFLFYINRPSIIIGKNQNTIEEVNQSYIDEQGIDVVRRISGGGAVYHDTGNLNFSFVTDDDGNSFHNFQKFTEPIVEALKSLGVDAKLSGRNDIQVGEAKISGNAMVKVKDRMFSHGTLMLNSELDEVQNALKVNPAKIKSKGIKSVRSRVANISEFLDEPIDIDKFKEIILKSIFGETQVEEYKLTDEDWRKIEKLSNEKYRTWEWNYGRNPKYNFEREEKFEKGFVQIKLDVKKGRIEHAKIFGDFFGEGDITELENALEGTMHEFDSIEEALSNYDIYHYFGDIDRHELIRLMS >NZ_CP031275.1|WP_029379123.1|1940868_1941087_+|IDEAL-domain-containing-protein MKHNTHVKYNTLESFVSTINDLGIELIIDESLRNVRKQELERLIDNALKNKNENDFKRYTEEYRNLEEFLVG >NZ_CP031275.1|WP_017722273.1|1940051_1940615_-|competence-protein-ComK MIQPYIIKKGDMVLQPCNLATGQYEGSYLLRYKADSQIIKERVSKIIDRSCRFYGSSYVFKKEDTMRITGISSKPPILFTPLFPTYFFPTHSDRKADNTWINIHYVHNIRPLKEKKCKVTFVDNQSIVANISAHSMHHQYLNGIYYYYMMDRAARVATFDPDSPIDYTKPQLNIYEALAKYSLFESK >NZ_CP031275.1|WP_107543047.1|1938521_1939559_+|site-specific-integrase MNMPVNKDGKNWKYDFRINGKRYRKAGFPKKIDATIAMNEAFEKANKGFTLDNNIAFIDYFNKWITTHKEPYLTPRALQTYHNAKNIFEKYLGNIPIKELNRTNYQELINDYAKNHATESVRKLNNCLRAAIQDAVYEGILYKDPTHRVIVKGAIKEKPEEFKFMSLKNYYNLKDYAKSKNKLSYLFIYLAIVTGARFSEIQKMQYKDFNLNNETVHIRGTKNETSDRVIKITKEDIKHVRQVLNDFPINLDGDIFRTGANLITHNAVSKVLQRFCLNNQLGNYTLHSIRHTHCSMLLHEGISIHYISKRLGHADIATTLSTYSHLLEESQKQEEEKTLEVLRHM >NZ_CP031275.1|WP_107543046.1|1937716_1938247_+|hypothetical-protein MKKLLFLLLASFLVLAACGQEESKSEGNKETKSTDKESKKDDKKSKDDKKEKLNKEDTDEQQTSNTDGNQQEVNIEQQTQESVSQAPIESQERVNNQEQETVQAPVESQEQATIEQEPQKQKIDLNQFPGGDFSTEGMSESAQKQIEELSRQKDYEGLPQKEYNDQVSEIMNNEMN >NZ_CP031275.1|WP_145511737.1|1937303_1937663_+|DUF4352-domain-containing-protein MEVTLDSVEEAGNVGEIGTEPENGKALKVNFKFKNNNDDQILMDSGDFTINVNGEVYEEWFGTDDTNADFSHQINKGKTASGYIYYDVPDSDKYMVEMETMPNLKDIKAKWEIEKSDIQ >NZ_CP031275.1|WP_107543221.1|1935970_1937305_-|CHAP-domain-containing-protein MPSALNGQPYGAQCATFIIEFTKKYWGVHPTGDAKDFIDFKWPKGFQVIKGKKQIPQPGDIFVFGGEHGHTGIVTEANAKYFNSIDQNWYNESLTKGSPAAFVEDHEYSNFLGVIRPPYEDAEKGAVLKSTKIETINQTIKYKMPNRSGNVKGVVIHNTASSATAKQDYNNLKNASQARYEAGIAHYYIDRNTVWRAIDTYSVGWHVANAYGNNAFIGYEVNESMSANNKDFMANEQAVFKKAAADLLYYGLPVNRETVMLHCQFVPTACPHRSMALHTGFDPVRQGAAPTSIVNQLKDYFIKEIKKYYNNPALKAGSPASSDIPNRTTIPTEKEQSKPIKEHGSSVGNGWKKNSWGILWKKEAASFTCNVSEGIVTRYVGPSLHNPIAGGLEYGQTVNYNEIQDYEGYIWISWEVFSGDTVYMPIGKSDGKGSRVGDAWGTFS >NZ_CP031275.1|WP_069793886.1|1945103_1946462_-|TrkH-family-potassium-uptake-protein MSIFNQLFKKSSPQQGIVMYYIIAIIVAFLLLNLPFVHKPGIKVDPIDSLFVAVSGVSVTGLSPVNIVETYTTFGQIIIMIILNIGGIGVMAIGTMLWVVLGKHIGMRERQLIMLDNNKDTMSGTVKLILDIVRTILIIEVVGAALLAFYFYRDTPDLQYAIMQGFFVAVSATTNGGLDITGQSLIPYANDYFVQTIVMFLIILGSIGFPVLIEVKAYIKNRIPNFRFSLFAKITTVTYLVLFVFGVIMILLLEYNHAFQNMSWHKSLFYALFQSATTRSAGLQTIDVSHFGEGTNVIMSILMFIGSSPSSVGGGIRTTTFAILILFLFNFSNNTEKLSIKAFNREIHTTDVQRSFAVFTMAGILTFASMIFILVVENGKITFLQAFFEVMSAFGTCGLSLGVTGDVNDMSKTALMVLMFIGRVGLISFIIMIGGRREPDKYHYPKERVQIG >NZ_CP031275.1|WP_107543049.1|1946480_1948268_-|serine-protease MKDNKKHVIPKEKYGRKRREYFHNEEREQRVQFERKARKQRAEKAEELAKNNEERVKENLRKARIEKLTQEEIQQQQQVMKARSNNNGITSSQNQIDESSNENQQKETNATVESAKTSDTSLNDTITETTDYSNDKVERNNEAKHDHSENKDEPKNAQDDHFYSEEAQQSRVNNYIEDENESKTQLNMGVSDESKPHRKTAYQHNDKQPQSFMDRVKYFFMEQWAQILIVVAVVLLLILIQAIFNNVDNNGNTKGHVFQNNSDKDKTYTATMKSANSAIHSVVTVENDTSNESSSAEKETQEAGKENELGSGVVYKKVGDSIFIMTNAHVVGDKKEQKITYGNNDYSIGKVIGTDRFSDIAVIKAKVKSDSDVKAIKMGDSSTLVLGEPIIVVGNPLGVDFKGSVSEGIVSGLNRHVPVDIDKDDKYDVLMSAFQMDAPVNPGNSGGGVIDKNGKLVGIASLKIDMDNVEGIAFAIPVNDAESIAKQLEAKGEVIYPNTGVELANIADIDDTTRQSINLPDDVNNGVLIGNVKDDSIGEKSGLQKNDVIVELDGKEVEDNLRYRQIIFSHKDDLKTLTAKVYRDGKVQDINIKLK >NZ_CP031275.1|WP_042362972.1|1948520_1949318_-|TerC-family-protein MDPSLILPYLWVLVVLVFLEGLLAADNAVVMAVMVKHLPPEQRKKALFYGLLGAFIFRFISLFLISVIAHFWWIQALGALYLLYMSIRNLISFFKEKDHDKNEGNDDHHFDESGKEIHASAKSFWGTVLKVEFADIAFAIDSMLAALAIAVTLPTVGIHFGGMDLGQFIVMFLGGMLGVIIMRFAATWFVNLLNKYPGLEGAAFAIVGWVGVKLVVMVLAHPDIGVLDEHFPHGVLWQSIFWSIMILLVLVGWLGSVRKNKQQEK >NZ_CP031275.1|WP_042362973.1|1949681_1951244_-|peptide-chain-release-factor-3 MNIKEEVESRKTFAIISHPDAGKTTLTEKLLLFGGAIREAGTVKGKKSGKFATSDWMKVEQERGISVTSSVMQFDYDHYKINILDTPGHEDFSEDTYRTLMAVDSAVMVIDCAKGIEAQTLKLFKVCKMRGIPIFTFINKLDRVGKEPFELLDEIESTLDIETYPMNWPIGMGQNFFGIIDRESHTIEPFRDEENILHLDDNYELKEDHAMKNDSAFAQAIDELMLVEEAGENFDNEALLKGDLTPVFFGSALANFGVQNFLNAYVDHAPMPNARQTKEDIEVSPFDLDFSGFIFKIQANMDPKHRDRIAFMRVVSGAFERGMDVNLQRTNKKQKITRSTSFMADDKETVNHAVAGDIIGLYDTGNYQIGDTLVGGNQKFSFQELPQFTPELFMKVSAKNVMKQKHFHKGIEQLVQEGAIQYYKALHTNQIIIGAVGQLQFEVFEHRLKNEYNVDVVMEPVGQKIARWIENEEDIKDKMSSTRSILVKDVYDNYVFLFENEFATRWFEEKFPEIKLYGLL >NZ_CP031275.1|WP_069793888.1|1951256_1951496_-|hypothetical-protein MKVKKINFNDIQANVYIYENVVEQLFLIAMPEINWSLEVESTLNEDDMKEELVIHLFTLLDESTASDFADDIVKWILEN >NZ_CP031275.1|WP_107543050.1|1951485_1952970_-|UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate--L--lysine-ligase MEANVLFEKIRVKQVFGTLDRNITDITTDSRTAQRGSIFVASKGYTVDSHRYCQDVVNQGCEVIIVNQKQQVLGDVTQVVVPDTLRVASLLANMLFNYPSKQLVTYGVTGTNGKTSIATMIHHIYRKLNKGSAYLGTNGFQINEVKSKGANTTPETVLLTKKINEAVEADAEAMTLEVSSHGLSLGRLRGVDFDVAIFSNLTQDHLDFHGTMESYGHAKSLLFSQLGEDLSQNKYVVLNNDDAFSEYLSSVTPYEVFTYGVNNDAQFTAEQIEESLQGVKFIFNTPEGKFHVQSPYVGLFNVSNIMAAMIAVWSKGIELGEIVKAVENLEPVEGRLEVLDPSLPIDLIIDYAHTADGMDKLIDAVKPFAKQKLIFLCGMAGERDLTKTPEMGRVACRADYVIYTPDNPADDDPKKLTQELAKGATHDNYIEFYDRAEGIRHAIDIAEPGDTVVLASKGREPYQIMPGHIKVPHRDDLIGLEAAYKKFGGGPHEG >NZ_CP031275.1|WP_070052671.1|1953411_1954587_+|diglucosyl-diacylglycerol-synthase MVTQNKKILIITGSFGNGHLQVTQSVVNQFNEMNLDNLTVIEHDLFLEAHPILTSICKKWYINSFKYFRNMYKAFYYSQPDQLDKCFYKYYGLNKLMNLLLKEKPDLILLTFPTPVMSVLTEQFDMNIPIATVMTDYRMQKNWITPHSHKYYLATEELKDEFASIGIPRNKLKVTGIPISDKFEADINQEDWLRQNKLDPNKPTILMSAGAFGVSKGFGQMIQEILNRSPHAQVVMICGKNKDLKRSLSSQFKANDNVLILGYTKHMNEWMASSHLMITKPGGITISEALTRQIPMIFLDPAPGQELENAVYFEEKGFGSIALTPEAAIEQVATLTNEPAKLAAMSQAMDSSRIPYSTYKLCKDLLNLLNHSSRYEEVYGKVPLYAKLFVK >NZ_CP031275.1|WP_107543048.1|1954564_1955752_+|MFS-transporter MQSSSLNNHGTNKNFIIMLIILFLMEFARGMYILSYLSLLPTATSIAVGITSIAISIHFISDAATNFVIGFLLKRLGAKLVLTLGFLLAFASLFLVVWFPTTPIVLIISAILLGIAVSPIWVIMLASVDEKNRGKQMGYVYFSWLLGLLVGMVGMNIIFKFHPTQFAFLMSLVVLIAWILYYFVKIRLTNYNTRPVKQQLGQIVNVTKRHLILFPGILLQGASITALVPILPTYATKVVGVSTVEYTMAIVFGGIGCAVSMLFLSKIIDNHGTLFMYSVIFGGFVLYTLMIFALSLITEITLVWILAVFIGLMYGILLPAWNTFMASHIHLDEQEETWGVFNSVQGFGSMIGPLVGGLITEFSNSVNNTFYFSSFVFLFLAVFYGIYFIKRKKHI >NZ_CP031275.1|WP_029379135.1|1956147_1956657_-|hypothetical-protein MILGLALIPSKAFQDEVNAYRKRYDAHYASIMPHITIKGQFKINDGDLESVKETIKSRIEGIPTVDVHATKASNFAPITNVIYFKVEKTETLENLFNQFNKGDFYGVADHSFVPHFTIAQGLTSQEFEDIYGQLKLAGIDYKETIEQLSLVYYDEKEDKWKVLEDFNLA >NZ_CP031275.1|WP_047172635.1|1956742_1957489_-|esterase-family-protein MYDFQPGNINKINFPSEILDRDVTLSIYLPKDFTELFKYKVVFCFDGADFFAFGRIHRTYEKLRETNEVERAIFVGFHYEDVDKRRAEFHPQGARTPLTVKAMANEILPFIDKTFPTFKVGNGRVLLGDSLAGSAALITALSYPRVFSQVGLLSPQHDEAIQTLIERCQFKDQLSIWHAIGLEEGDFKLPTTGKTADFLTPNRELNSIIKANGFTYHYLEFEGGHRWKSWQYLLDEMLKYFLSDNISF |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP031275_3 | 3.1|1159352|30|NZ_CP031275|CRISPRCasFinder | 1159352-1159381 | 30 | NZ_CP012101 | Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-2, complete sequence | 182767-182796 | 8 | 0.733 |
NZ_CP031275_3 | 3.1|1159352|30|NZ_CP031275|CRISPRCasFinder | 1159352-1159381 | 30 | NZ_CP013276 | Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain AM65-52 plasmid pAM65-52-1-360K, complete sequence | 116163-116192 | 8 | 0.733 |
NZ_CP031275_3 | 3.1|1159352|30|NZ_CP031275|CRISPRCasFinder | 1159352-1159381 | 30 | NZ_CP039722 | Bacillus thuringiensis strain BT-59 plasmid p1, complete sequence | 253501-253530 | 8 | 0.733 |
NZ_CP031275_3 | 3.1|1159352|30|NZ_CP031275|CRISPRCasFinder | 1159352-1159381 | 30 | NZ_CP009349 | Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 1, complete sequence | 192163-192192 | 8 | 0.733 |
NZ_CP031275_3 | 3.1|1159352|30|NZ_CP031275|CRISPRCasFinder | 1159352-1159381 | 30 | NZ_CP045023 | Bacillus thuringiensis strain JW-1 plasmid p1, complete sequence | 116164-116193 | 8 | 0.733 |
NZ_CP031275_3 | 3.1|1159352|30|NZ_CP031275|CRISPRCasFinder | 1159352-1159381 | 30 | NC_018689 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429, complete sequence | 23867-23896 | 8 | 0.733 |
NZ_CP031275_3 | 3.1|1159352|30|NZ_CP031275|CRISPRCasFinder | 1159352-1159381 | 30 | NZ_CP045608 | Bacillus cereus strain SB1 plasmid p2, complete sequence | 127271-127300 | 8 | 0.733 |
NZ_CP031275_3 | 3.1|1159352|30|NZ_CP031275|CRISPRCasFinder | 1159352-1159381 | 30 | MK448506 | Streptococcus satellite phage Javan462, complete genome | 11918-11947 | 9 | 0.7 |
1. spacer 3.1|1159352|30|NZ_CP031275|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012101 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaatcattgcaattttctatataccctgtt CRISPR spacer ttagcattacaattttttatatacccttaa Protospacer * ****.*******.**********
2. spacer 3.1|1159352|30|NZ_CP031275|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013276 (Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain AM65-52 plasmid pAM65-52-1-360K, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaatcattgcaattttctatataccctgtt CRISPR spacer ttagcattacaattttttatatacccttaa Protospacer * ****.*******.**********
3. spacer 3.1|1159352|30|NZ_CP031275|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039722 (Bacillus thuringiensis strain BT-59 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaatcattgcaattttctatataccctgtt CRISPR spacer ttagcattacaattttttatatacccttaa Protospacer * ****.*******.**********
4. spacer 3.1|1159352|30|NZ_CP031275|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009349 (Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaatcattgcaattttctatataccctgtt CRISPR spacer ttagcattacaattttttatatacccttaa Protospacer * ****.*******.**********
5. spacer 3.1|1159352|30|NZ_CP031275|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045023 (Bacillus thuringiensis strain JW-1 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaatcattgcaattttctatataccctgtt CRISPR spacer ttagcattacaattttttatatacccttaa Protospacer * ****.*******.**********
6. spacer 3.1|1159352|30|NZ_CP031275|CRISPRCasFinder matches to NC_018689 (Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaatcattgcaattttctatataccctgtt CRISPR spacer ttagcattacaattttttatatacccttaa Protospacer * ****.*******.**********
7. spacer 3.1|1159352|30|NZ_CP031275|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045608 (Bacillus cereus strain SB1 plasmid p2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaatcattgcaattttctatataccctgtt CRISPR spacer ttagcattacaattttttatatacccttaa Protospacer * ****.*******.**********
8. spacer 3.1|1159352|30|NZ_CP031275|CRISPRCasFinder matches to MK448506 (Streptococcus satellite phage Javan462, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aaatcattgcaattttctatataccctgtt CRISPR spacer caatcattgcaattttttatataaataaag Protospacer ***************.****** . .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1134610 : 1168720
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP031275|1134610:1168720|DBSCAN-SWA 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35 | Staphylococcus_phage(96.15%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
1291490 : 1300689
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP031275|1291490:1300689|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP031275|1291490:1300689|1292497_1293523_+|WP_042362562.1|tRNA|DBSCAN-SWA MDIEAFDYHLPESLIAQTPLKNRDESRLLILGRQSGDIEHQHFKDVIDYLESGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNRLTFGEGKIVAECIKELDQGGRIMRLHYDGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDQDRYQTVYAKASGSAAAPTAGLHFTDELLANIRDKGVNIAFITLHVGLGTFRPVSVDNIDDHEMHSEYYQMDSETADLLNETKERGNRIISVGTTSTRTLETIMQSNDKFVSQSGWTDIFIFPGFTFKAIDGLITNFHLPKSTLVMLVSAFSSRDNILNAYNQAVSSEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP031275|1291490:1300689|1294700_1294961_+|WP_017724668.1|DBSCAN-SWA MQFTSLILPILLLVLMWFFLIRPQQKKAKEHREMISQVTSGQRVTTIGGIKGTVRSVDETTVVLTLNGNGTEITLEKPAIKQVDPS >NZ_CP031275|1291490:1300689|1293543_1294683_+|WP_029377112.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELNQMEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKKSGGLHQFMNWNGPILTDSGGFQVFSLSNLRKISEKGVEFRHHTNGSKLFLSPEKAMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYKYVKDSIERTTRWAERCLQAHKRPDDQALFGIIQGGEYKDLRKQSAEELVALDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYDMVKHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSHGRVTIKNAKYAEDLGPLDENCDCYTCKNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTYHNLHFLLKLMENIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP031275|1291490:1300689|1295368_1297645_+|WP_069795642.1|DBSCAN-SWA MKKSNRIVAFILLVVLLFAGMGLTYKNVVKDVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLQKDDKIDDKAVKATAKTLENRVNVLGVSEPKIQVEDKNRIRVQLAGVKNQSQAREILSSQANLTIRDADDNIKLTGKDIQQGSAKQEFKQNTNQPAVTFKLKDSAKFKKVTEEISKKDENVMVVWLDHEKGDTYHKEMNKKDPKYVSAASVDKPINSDSVEISGGFNGEEGVEKAKQIADLLNSGSLPVDLNEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFAAAIGIAVIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTAYIYLTLLAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELKIGRTLKQAYKKANKSSFLTIVDAQLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRWLLTLLVSSNYFKKSNWLFGVSKKNIYDINDKKEIHDLKTPYERIDFMKLAKPLLSLSVLIIAVGAIILFVFKLNLGIDFTSGTRVDFESDNKVTETKVKNTLEDNDFKPDQVSLGENGKTATVQFKKDLSKDQVSKIQDTIDDQFGHKPTVNTVSPVIGQELAKNAMLALLYAAIGIIIYITFRFEWRMGLSSVLALLHDAFMIVAVFSLFRLEVDITFIAAILTIIGYSINDTIVTFDRVRENLHKVKVITTNAQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVVIVVIALLLFGAPSIFNFSLALLIGLITGVFSSVFIAVPLWGIMKKRQLKKSDNNKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_CP031275|1291490:1300689|1300170_1300689_+|WP_029377115.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVEDWPKPGVNFKDITTIMDNGEAYGYATDQIVEYAKDRDVDIIVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLIEQLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIRDYDVMSLISYDE >NZ_CP031275|1291490:1300689|1291490_1292495_+|WP_029377110.1|DBSCAN-SWA MDDRMVDQSMHDEESSFEFSLRPTKLRQYIGQSTIKSNLEVFIKAAKIRQEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMDVNIRTISGPSIERPGDLAAILSSLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIVIGKGEEARSIRIDLPPFTLIGATTRAGSLTAPLRDRFGVHLRLEYYKEHELKEIIVRTAEVLGTSIDDDSAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNDDESICIETTKASLQLLQVDDEGLDYIDHKMMNCILEQYKGGPVGLDTIAVSIGEERITIEDVYEPFLIQKGFIERTPRGRKATPYAFEHFSKKNEKRE >NZ_CP031275|1291490:1300689|1297878_1300158_+|WP_042362565.1|DBSCAN-SWA MIKSKYTWDVNLPEYEIAEADSSDLKLTPIVKKILESKGLADKNTINNLLNGTPVLHDPMLMSDMEKAIARINLAIDQNQKILVYGDYDADGVTSTTILVNTLKELGAHVGWYIPNRFSEGYGPNEMAFKNAHEEGISLIITVDNGIQGHDEIQMVQDLGVDVIVTDHHEIGRTMPNAYAIVHPMHPEFDYPFKYLCGAGVAYKLAQKLLDEPPAYFLGLVAIGTVADLVSLTDENRALVKKGLEVLNDHCPPSIKAILSQAGYSDSITEETIGFIIGPRLNAVGRLEDAGLAAELLMTDSDEEAEFLAEQVEFFNQERKDIVSQITEEALAAAEIQVNQGSKFLLLAQPDWHEGVLGIVASKIVETYSLPTLILNIDEGQDHAKGSARSIEQVSMFEILNAHTDLITKFGGHHMAAGITMPIENVDSLRNGLNDWMEQLASTTSLEPRKKVDVKIDESDITIKNIQDIQRLRPFGTDFSSPCFELEDITVNQSKAIGQDSKHLKLVMGDTKLQAIFWQHGHLVKELGEQQPINVIGTLQINEWNGFQSPQFMIQDLASNNLQILDYRSKRNISSFEQGADDVAYLIHNKNEKLGDNYYYYGETIQQQYNKYVFRDLPTSIQEIKDTLKSVNVSQIYLVLNHEQSIYFEGMPKMETFKKCFKALATKRETNLAKDGMQLSQFLNIQPGMLKFILKVFLDLEFIKEENGIIMMNSISTKREIESSKYYQGRLNRIEVEKILLYDDFSNLKKWIKSELIDK |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1430004 : 1442366
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP031275|1430004:1442366|DBSCAN-SWA ATTATTTCAAATGTTGTGTATACTCTAAATTTTTAACTCTTTCACGTGCAGCCTTTAATTGTTCTAAACTGATATCTTTTGAATGCTCATAATTCTTCACATTCTCATCTAATTGATCCACACTACTTGCACCAACTATAATTGAGCCTAAGGCATCATGCGAAGTAAGATAATTAAATGTCAAACCTGTTAAATTACTTTCTATCTCTTTAATAGAAGCAATCGTTTCTCCTAATTCTTGATAACTATAATCAAAAATACCTTCAGCAAACTTATCATCTAAAGCTTTATTACTATTAGAAGTTAATAACCCTTTAAATACGGGTCCGCGTGCAAGCACTTTAACCCTTTGTGCATGAATATCATCCAATAACGCTTCTGGTCTATTATCAACTAAGTTAAATTGTGACATTAGCGTTTCAATATCACTATGTTTCAAATAATAATCAATTACATTTGGACGTATGGATGAAATTCCGTACGCACGAACTAAACCTTCTTGCTTTAACTCATCAAATGCACTAATCGTTTCATCTAATGGGTCATCAATAGTACCGCCGTGCAATTGATATAAATCTAAATGATCTAATCCTAAACGCTTCAGCGAGTCTTTCACAGCTTCTTTAATATAAGATTTTGATGGGTCCCAGAAAGTAGAGCCATCTTCAGCTAAATGATTACCAACTTTTGTACCTATAACGATATCATCTCTATCTTGGTATTTTTTTAATGCCTTACCCACGATATCCTCATTAATACCTTTGTCATAAATATCTGCTGTATCAAAATAAGTGATGCCATGTTCTATCGCACGTTCAATAATAGGTTCTGCTTTATTATAATCAGTACCTAAACTCATACAACCCAAACCTAATTCCGAAACCTCGATACCACTTCTCAATACATTTTTTTGCATGTCGTTTCTCCTTTCGATACACTTAATTCATAGGGCGTAAAAATAATATACGCAATATTACTTAACTGGATATTTATATTAACTGTAATAGTTACTCCCTACATACTACCGTATATATCTTAACAATAACTTAAATCAAATAAAAGGAACGTGATTAAAATGAACCTATATGAAAAGACAATACATAAAACATCCATTTACCAAGGATCTATTATTGATTTAGAAGTACACGATGTTGAATTACCCGATGGTAAAACGTCTAAACGTGAACTTGTTTATCACAATGGAGCGGTAGCAGTCTGTGCATTAACTCCTGAGAATAAAGTATTACTCGTTAAACAATTTCGTAAACCAGCTGAAAAACCATTATTAGAAATCCCAGCAGGCAAACTAGAAATAGATGAAGTACGAACAGAAGCGGCTAAACGTGAACTAGAAGAAGAAACTGGCTATATTGCTAATGAGTTAGAATTAATAACTGAGATGTATGGGTCTCCTGGTTTTTCAAATGAAAAAATATCAATTTATTTAGCTAAAGACTTAAAAACAGGTCAAATGAATTTAGATGATGATGAATTTATTGAATTAGAACAGTATTCTTTATTAGAAGTCGAAGACATGCTGAAAAATAAAGAACTTGAGGATGCTAAAACCATTATTGCGATACAGCACTTACTTCTTAATTATAATGATTATAAATAAGAAACGAGTATACTTGCGTATTTTATCAATTACTGGTATTTTATATATAAATCATTATACAAATTAAAATGATTATAATTATTAGTAGGGGAGTGAGGCTTCCGTGGAAGAACGTCTAAATCGCGTGAAGCAACAATTACAACAATCTTCATATAAATTAACGCCACAACGTGAAGCGACGTTACGTGTATTAATTGAAAATGAGAAAGATCATTTAAGTGCTGAAGATGTATATTTAAAAGTAAAAGACAAAGCACCTGAAATAGGTCTAGCTACGGTGTATCGTACACTTGAGTTATTATCAGAACTTAAAGTAGTTGATAAAATTAATTTTGGAGATGGTGTTGCTCGATTTGATTTGCGTAAAGAAGGAGCTAAACATTTCCACCATCATCTTGTTTGTATGGAATGTGGTAAAGTTGAAGAAATTGAAGAAGATTTATTGCCTCAAGTAGAAGAACGTGTTGAACAAGATTTTGATTTTAGAATCTTAGACCACCGTTTAACCTTTCATGGTGTATGTTCAAATTGCCAAGCTAAAGGTAAATAATCATGTACGAACAAAAACCTTTTATGAATAGAGGTGTTAGGCTTGGATGACATAATTGAAGAATACTTGAAATTTATACAATTAGAAAAAGGTTTGAGCACGAATACAATTGGTGCATATCGTAGAGATTTAAAAAAATACAAGGATTTTATAGAACTTCAAAAAATTAGCCACATTGACTTTGTAGATAGACAAGCTGTGCAACTATGTCTTGGTCACTTACATGATGATGGGGCATCTGCAAAATCATTAGCACGTTTTATTTCAACGGTTAGAAGTTTTCACCAATTTGCTTTAAGAGAAAAATACGCAGCAAAAGATCCAACTGTACTAATTGAAACACCTAGGTATGATCGTAAATTACCTGATGTATTAGAAATCAATGAAGTCTTGGCATTATTAGAAACACCAGACCTATCAAAAAATAATGGTTACAGAGACCGTACAATGTTAGAACTTCTATATGCTACAGGTATGCGTGTTTCTGAATTAATTCATATTGAGCTTGAAGATATCAATTTAATTATGGGCTTTGTTAAAGTTTTCGGTAAAGGAAACAAGGAGCGTATAATTCCATTGGGAGATGCTGTTATCGATTATTTAACTAAATACATAGATACAGTGAGACCACAATTATTAAAAAAAACCGTAACTGACGTATTATTTTTAAATATGCACGGTAAACCTTTGTCTAGACAGGCGATATGGAAAATGATCAAATTAAATGGTGTCAAAGCAAATATTAACAAATCTTTAACACCACATACCTTAAGGCATTCATTCGCAACACATTTACTAGAAAATGGCGCAGACTTGCGAGCAGTTCAAGAGATGTTAGGACATTCCGACATTTCTACAACTCAACTGTACACGCACGTATCAAAATCACAAATTCGTAAAATGTATAATGAATTCCATCCACGTGCATAAACACAGACCAGTTTATTCGTAGAATAACTAGCCTGTGTTTTTATATGTCTAATATTCAAAATAGTAATTGCATTATTACATTTTGGCATTTCTTCTTTCGTGAAGTGCTTGTAAACGCGCAGCAGTCACTTCGGAACGATCTCTTTCTAAATGATGATTTACTATATAACTGTCCTTAATAGTATAATCGGTCATTGTATAATTAGGATAAGCCTTTAATATATCTTGGTGCATAGTTGGTGTTAACGGTAACTGAATCGGTACAAATTCATCGTTATTTTTAGCTGCTTCTATCAATTCTAAAAGTAATGTTTTATAAGATTCTAATTCAATGCCTAATTCTGTATCATTAGTATAAGCTTGGATTACATTTAATGCTTTACTAAATGATTTCATAGCACCTTTATGATTAGCTCGACGAAAATGATAACACCCTGTTGCTAACAGGATTAAACTTACAACAGCATCATCTTTGCGAAAGGGTTCGTTGTCTTTCCATGCTTCTTCTAATATGTCATGACATAAAAAGTAGTGCTGTTTAGTGTGAAAGTGAAAATAAAAATCTTTTAATGCTTTTTTCATATTAAAACCGCTCCAAATTTAAATGTTTACTATAAACATGCTATAATATTTTAGTGAATTACGCACTTAACTTGCGATACGAGGTAGATAAAATGTATGAAGTAAAGTTAGATGCCTTTAATGGTCCATTAGACTTATTATTGCATCTTATTCAAAAAATTGAAATTGATATTTATGATATTCCAATGAAGGAATTAACTGAGCAATATATGCAATATATTCATGCGATGAATCAGTTAGAAATAAATATTGCAAGTGAATATTTAGTAATGGCCTCTGAATTACTTGTGATTAAGAGTAAGTTGCTATTACCACAAACAGATGAAGAAGAAACTTTAGATGACGACCCTCGTGATGACTTAGTCGGTCGTTTAATAGAATATCAAAATTATAAAGCTTACACAGAAATTCTAAATGAAAAGAAATCAGAGCGCGCTTACTATTTTTCAAAGCACCCAACCGATTTATCACATTTAGAATCAACAGAAACATGGGATTCAGAAAATACAATTGATTTAACAGAATTAATCATTGCCTATCAGAAAGTGAAGAATAGGGTAGAATTTAATACACCTAAAACTGTTGATATACGCAAAGAAACATTTACTATTCAACAGGCAACAACTCAAGTTTCTGAACGTTTAAAGCAGCATGATTCTTTTAATTTCTTTAGTTTATTTAATTTTACTGAACCTGTAGAAATGGTTGTAACACATTTTCTAGCAATACTTGAAATGTCCAAATCTGGTATTGTTAACATTGAACAACCCAAAAGTTTTGATGATATCAATATTTTAAGAGGGGTAAACTATGGCATTGAACGTTAAAGGGATTTTAGAATCACTACTATATACAGCTGGTGATGAAGGATTAGACAAAAAACAAATACTTGAAATACTAGAAATAGATGAGGCTACATTAACAGAACTTGTAAATACATATCAATCCGATGGACTAATGATACAACAATTTGGACAAACTTATGTATTAACAACTAAAAAAGAAGCTTCAGAATATATTGAAAAATTAATTGAACAAAAATCAAAAATGAAGTTATCACAAGCAGCAATGGAATCTTTATCTATCATTGCCTATAATCAACCTTTATCTCGAAGTGATATAGAAATGATTAGAGGTATTAATTCTGATGGTGCTGTAAAAACTTTAATCGCTAGAGGACTCGTAGAAGCAAAAGAGCAAGCTGATTCAAGAAGTCAACAACTCTATACTACCGAATTGTTTCTAAATGTATTTGGTATTGAGCATTTGGACGATTTACCTACGACAGATGAAGAAGATGAAGAAATAGAAGCTTTCTTC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TTCGATTTATAAAAGTGAGGGAGCATCCATGTATAATTTAATTCATTTTGCATACACGAAGTCACATAATTACAAAACCGAAAAAAGTATATTTAATATTATCACAGGTAAAAAATCGCATCAAACCTTTTTTGATGCCTGTAGTCAACAACTCTTATCATTGTATCATAGTATGCCTAAACTAAAATATTCTTTATTCGAACAATATTCTAATAATTTTAACATCGAAGAACAACAATTTCAAAATATCATTAGTCACCCACGTCATACATATGACAGCTTATCAAATACTTTTAATGCGATACAATTGTTGACTCAAACATTGTCTAATGTCCAACATAACAATTATCAATTTGTACCTATTACACAACATAGAGCAGTTCATCAGAAAGTTAAACACTTATATAAAAAAATTTCTGACCACCATTTAGAAAACTTATTTATAGACGAACTTACATTACTTTTTCAATCTTTAACTAACCAAAACAGTGACCTATATATTCATTATTATTTACAAGGTTTCGAAGAAAGTATGTATACAAGACAACAAATTAGTTTAATAGAAGCGATATCACAGGAAATGCTTTTTGAATTAGAAATCAGAGATTTAGTTACTTTAATGTATGAAATAGAGAATGAGCAAAAGTATCCATTATTACATAGCTTAATTATTCTTCCAACATTATTAAACAAAACTGAAAAAACTTATTTAGGAATACAAAATGGGTTAAACTTTAAACAACTTGTAGCACAACAAAATGTTAAACCCAATACAATAGATGATCATATTTTAGAATTATTTATCAAGGGATACATAACCGATTACGATAATTATTTAAATCATATAGATTATACACCATTTATGACGTATTATATTTCTAATCGTAGCGAAAGACTGCGTAACTACAAGGACTCTTTCTCTGAACTCAGTTACTTTGAAATTAAATTAGTTATTGTTGGTGTCGAAAGAGGTGAATTAAATGTTACACGATGACTTAAAAAGATGGTTTGGATTTGAATCATTTAAGCCGGGGCAAGAGGAAATTATTAATAATGTACTTAATAATATTGACACTTTAGGCATTTTACCTACTGGTAGTGGCAAAAGCTTATGTTACCAATTGCCAACCTACATAAAACAAAAGCCAACATTAGTTATTTCACCGTTAATTTCACTGATGGATGACCAAGTTATGCAACTCAAGTTACAAGGAGAAAAAGATGTATGTTGCATACATTCGGGCATGGATGAAAATGAAAAACAACAAAATATAAATCACTTAAAGATGAGTAAATTTATATTTTTAAGTCCAGAGTTTATATTACAAAAACACAATTTCAAATTAATTAAAAATTTAAATATCGGTATGATCGTATTAGATGAAGCACACTGTTTATCAGAATGGGGGTATGATTTCAGACCACACTATGCGCTTGTAGGAGAAATTGCAAACCATTTCAATGAAGCTACCGTATTAGCATTAACTGCAACAGCACCTTCTTATTTAACTTTTGATTTAGAGCAGATATTAGGTAAGTCATTTTCAGTTATAAAAAATAGTATGAACAGAGATAACATTTCTCTGACACATAAAAATTTTGCTGATGATGATGAAAAATTAAACTGGCTTTTACCTACATTAGAGCAATCAGGACCGACAATTATTTATGTATCATCTAAAAAAATGTGTCTATCATTAGCTCAAAGTATTTATAATTATGGTTTTTTAACTGGTATTTACCACGGTGATTTATCATACCAAGAAAGACATACAGTACAACATCAGTTTATTAATAACGAAATCCCCATTATCGTTGCTACAAGCGCCTTTGGCATGGGAATTAATAAAAAGGATATTAGAACGATTATTCATTTCCATTTATCTACAAGTCCATCTAGTTATATGCAAGAAATAGGTAGAGCAGGGCGTGACGGTAATCAAAGCCAAGCAATAAGCCTTTATCAACCTGATGACAGCTTTCTGTTAGAAACTTTATTATTTACAGACATAATTAATATAGAAGATATAAATGCGTATGAATTATCTCAGTTTCTACCACCCGAAAAGACAGACATACTCGATGTACTCAGTACACAGTATACTTTTGAACAATTACGTAATATCTTTGATTTGGCTTATAAACGTAAAAAATTAGGTTATATACGTATGCTAGGTTATAAAAACCTTGATCAGTGCAGAAGATCTTATTTAGTTGAATTTTTTGATGAAATTTTGGTAGAAAAGCCTAAATTATGTTGCGATAATGATTGTGAATTAAATTTATTAAATATAATAAATAGAAAAAAAGTAAAAAGAAAAATGGATTTTAATGAAAAATTACAAAATATGTTTAAAAAATAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP031275|1430004:1442366|1436607_1438386_+|WP_107542770.1|DBSCAN-SWA MMNLLNSVVVKLWLTIIFIVTTVLILLSAALITFIQSYFTQETEDSLLKDAKRISQLVESSDDRATAIEHSRKLIEGPVGLIITNDKHKDNNDNDITKNEMFKEIKNNKDYDRVFDDGKQISEHVTVNFNDKQRTYVLIGYPTKNIETTNTPNGKYSGVFIYQDLKTIEETNNVITVIILIIAIIFLAITTVFAFFLSSRITKPLRNLRTQALKVSKGDYAQVVPVNSKDEIGELSRTFNTMSSEIQQHIDALSSSKNIRDSLINSMIEGVLGFNDKKEIIISNKLANTILEMLDEYALEKLDKQNELTFSSKKTQFEVYEINTRYFVIITSYIEQIQPDGRSGIVAIIRDMTNEHNIDQMKKDFIANVSHELRTPISLLQGYTESIVDGIVTEPDEIHESLSIVLDETKRLNRLVNELLNVARMDAEGLTVDKVIQPIDPLLNKMQQKYQKHAKDLELNMSLNPDTHQRLWYFDSDRIEQVLTNLIDNASRYTEPGDAINIEISETNSEQILYITDTGSGIAPEHLQQVFDRFYKVDTARKRGKQGTGLGLFICRMIIDSHGGTIDVKSKLGKGTTFIISLPKPETEDYNA >NZ_CP031275|1430004:1442366|1438852_1439398_+|WP_107542766.1|DBSCAN-SWA MQQQTKRLITISMLSAIAFILMFIKFPIPFLPPYLTLDFGDVPALLATFTLGPVAGLIVEFIKNLLNFLFNVGDPVGPVANFLAASSFLLTAYFVTKHKGVLKSQIIGLSMATLVMAIVLSILNYFVLLPLYGMIMNLSDVVENVKIVIVSGVIPFNIIKGVVISIVFILLYNRLKNVLPR >NZ_CP031275|1430004:1442366|1439672_1439921_-|WP_026113585.1|DBSCAN-SWA MAKYTIVDMDTCIACGACGAAAPDIYDYDDEGIAYVILDDNQGTAEVPEELYEDMEDAIDGCPTDSIKIEEEPFDGDALKFE >NZ_CP031275|1430004:1442366|1432213_1433101_+|WP_029377234.1|DBSCAN-SWA MDDIIEEYLKFIQLEKGLSTNTIGAYRRDLKKYKDFIELQKISHIDFVDRQAVQLCLGHLHDDGASAKSLARFISTVRSFHQFALREKYAAKDPTVLIETPRYDRKLPDVLEINEVLALLETPDLSKNNGYRDRTMLELLYATGMRVSELIHIELEDINLIMGFVKVFGKGNKERIIPLGDAVIDYLTKYIDTVRPQLLKKTVTDVLFLNMHGKPLSRQAIWKMIKLNGVKANINKSLTPHTLRHSFATHLLENGADLRAVQEMLGHSDISTTQLYTHVSKSQIRKMYNEFHPRA >NZ_CP031275|1430004:1442366|1440983_1442366_+|WP_042362656.1|DBSCAN-SWA MLHDDLKRWFGFESFKPGQEEIINNVLNNIDTLGILPTGSGKSLCYQLPTYIKQKPTLVISPLISLMDDQVMQLKLQGEKDVCCIHSGMDENEKQQNINHLKMSKFIFLSPEFILQKHNFKLIKNLNIGMIVLDEAHCLSEWGYDFRPHYALVGEIANHFNEATVLALTATAPSYLTFDLEQILGKSFSVIKNSMNRDNISLTHKNFADDDEKLNWLLPTLEQSGPTIIYVSSKKMCLSLAQSIYNYGFLTGIYHGDLSYQERHTVQHQFINNEIPIIVATSAFGMGINKKDIRTIIHFHLSTSPSSYMQEIGRAGRDGNQSQAISLYQPDDSFLLETLLFTDIINIEDINAYELSQFLPPEKTDILDVLSTQYTFEQLRNIFDLAYKRKKLGYIRMLGYKNLDQCRRSYLVEFFDEILVEKPKLCCDNDCELNLLNIINRKKVKRKMDFNEKLQNMFKK >NZ_CP031275|1430004:1442366|1430004_1430919_-|WP_047172340.1|DBSCAN-SWA MQKNVLRSGIEVSELGLGCMSLGTDYNKAEPIIERAIEHGITYFDTADIYDKGINEDIVGKALKKYQDRDDIVIGTKVGNHLAEDGSTFWDPSKSYIKEAVKDSLKRLGLDHLDLYQLHGGTIDDPLDETISAFDELKQEGLVRAYGISSIRPNVIDYYLKHSDIETLMSQFNLVDNRPEALLDDIHAQRVKVLARGPVFKGLLTSNSNKALDDKFAEGIFDYSYQELGETIASIKEIESNLTGLTFNYLTSHDALGSIIVGASSVDQLDENVKNYEHSKDISLEQLKAARERVKNLEYTQHLK >NZ_CP031275|1430004:1442366|1435034_1435772_+|WP_042362653.1|DBSCAN-SWA MNKETERLQKRIANSGYTSRRKAETLITEGKVKVNGSVVTELGTKVKNSDSIEVEGIKLEQEDKLYILFYKPAQVITSVSDDRGRKVVTDYFKEIKTRIYPVGRLDYDTSGLLLLTNDGEFTNLMTHPSYKIKKKYVVKLKGYLMREEVKALEQGIKLEDGVTQPAIVKVKNQDKDKNNTLVEITITEGRNRQVRRMFEHFGHQVSKLQRIEFGPLNLKGLNAGEGRVLTPHEVKTIRHLAEHGK >NZ_CP031275|1430004:1442366|1435901_1436624_+|WP_042362654.1|DBSCAN-SWA MSNEILIVDDEDRIRRLLKLYLERESFEIHEASDGNEAYKMAVEHDYACILLDLMLPEMDGITVASRLREHKETPIIMLTAKGEETNRVEGFESGADDYIVKPFSPREVVLRVKALLRRTQVASAEQSEPHARDLIEFDHLVIDNDAHRVLADGNQVNLTPKEYELLIFLAKTPNKVFDREQLLKEVWHYEFYGDLRTVDTHVKRLREKLNRVSEDAAHMIQTVWGVGYKFEIKSNNEPT >NZ_CP031275|1430004:1442366|1431078_1431621_+|WP_107542768.1|DBSCAN-SWA MNLYEKTIHKTSIYQGSIIDLEVHDVELPDGKTSKRELVYHNGAVAVCALTPENKVLLVKQFRKPAEKPLLEIPAGKLEIDEVRTEAAKRELEEETGYIANELELITEMYGSPGFSNEKISIYLAKDLKTGQMNLDDDEFIELEQYSLLEVEDMLKNKELEDAKTIIAIQHLLLNYNDYK >NZ_CP031275|1430004:1442366|1433176_1433683_-|WP_107542767.1|DBSCAN-SWA MKKALKDFYFHFHTKQHYFLCHDILEEAWKDNEPFRKDDAVVSLILLATGCYHFRRANHKGAMKSFSKALNVIQAYTNDTELGIELESYKTLLLELIEAAKNNDEFVPIQLPLTPTMHQDILKAYPNYTMTDYTIKDSYIVNHHLERDRSEVTAARLQALHERRNAKM >NZ_CP031275|1430004:1442366|1433775_1434510_+|WP_042362651.1|DBSCAN-SWA MYEVKLDAFNGPLDLLLHLIQKIEIDIYDIPMKELTEQYMQYIHAMNQLEINIASEYLVMASELLVIKSKLLLPQTDEEETLDDDPRDDLVGRLIEYQNYKAYTEILNEKKSERAYYFSKHPTDLSHLESTETWDSENTIDLTELIIAYQKVKNRVEFNTPKTVDIRKETFTIQQATTQVSERLKQHDSFNFFSLFNFTEPVEMVVTHFLAILEMSKSGIVNIEQPKSFDDINILRGVNYGIER >NZ_CP031275|1430004:1442366|1440031_1440997_+|WP_107542765.1|DBSCAN-SWA MYNLIHFAYTKSHNYKTEKSIFNIITGKKSHQTFFDACSQQLLSLYHSMPKLKYSLFEQYSNNFNIEEQQFQNIISHPRHTYDSLSNTFNAIQLLTQTLSNVQHNNYQFVPITQHRAVHQKVKHLYKKISDHHLENLFIDELTLLFQSLTNQNSDLYIHYYLQGFEESMYTRQQISLIEAISQEMLFELEIRDLVTLMYEIENEQKYPLLHSLIILPTLLNKTEKTYLGIQNGLNFKQLVAQQNVKPNTIDDHILELFIKGYITDYDNYLNHIDYTPFMTYYISNRSERLRNYKDSFSELSYFEIKLVIVGVERGELNVTR >NZ_CP031275|1430004:1442366|1434499_1435042_+|WP_101104620.1|DBSCAN-SWA MNVKGILESLLYTAGDEGLDKKQILEILEIDEATLTELVNTYQSDGLMIQQFGQTYVLTTKKEASEYIEKLIEQKSKMKLSQAAMESLSIIAYNQPLSRSDIEMIRGINSDGAVKTLIARGLVEAKEQADSRSQQLYTTELFLNVFGIEHLDDLPTTDEEDEEIEAFFSNLVNQKGENNE >NZ_CP031275|1430004:1442366|1431724_1432171_+|WP_029377233.1|DBSCAN-SWA MEERLNRVKQQLQQSSYKLTPQREATLRVLIENEKDHLSAEDVYLKVKDKAPEIGLATVYRTLELLSELKVVDKINFGDGVARFDLRKEGAKHFHHHLVCMECGKVEEIEEDLLPQVEERVEQDFDFRILDHRLTFHGVCSNCQAKGK |
14 | uncultured_Mediterranean_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1889233 : 1897709
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP031275|1889233:1897709|DBSCAN-SWA CTTATTGAATGATTTTTGAAATGACTGCTGGGTATAATTCATGTTCTAATGCTTTTATTCGCTCTTCTAAATCAGCTTTAGTATCGTCCGGGTATATATCACATGTTCTTTGTTCGATAATTTCTCCTGTATCCATCCCACTATCGACATAATGTACCGTTGTACCCGTTATGTCATCACCACTTGCTAACGCTTGCCCCACCGCATCTTTACCTTTGTATTTAGGTAATAAGGATGGATGAATATTTAAAATCCTTTTATCATAGGCTTTCAAAATATTTTCGCCAATTAATTTCATATAGCCTGCTAAGACTATCCATTCAACTTTTTCTGAAGTAAGCCACTCTATAATTTTCCGTTCGTAGTCTGCTTTAGAATCAAAGTTTTTCAATTCGTTAATATGTACATCTAGATTGTATTTCCTAGCACGTTCAATACAATGTGCACTCACTTGATCTGTGTACAATGCTGTCACTTCAATATGAGGAAGATTACCTTGCTCAATTTGTGTCATTATACTCTCAAAATTACTACCTGACCCTGACGCAAAAATAGCTATTTTGGTCACTTTTATACCCCCGTTAATTGAATTGGTTCTTCGCCTTCAACGATTTCTCCAATTGCATAAGCATTTACATTTTGTTTTTTTAGTATATCTAAAGTCGTTTGTACTTGGGCCTCATCTACAACAAGCGTAAAACCAATACCCATATTAAAAATATTGTACATTTCTACAGTTTCAATTTCTCCTTGTTGTTGCAACCAATCAAAAATTGGTAATGTCGGGAATTTAGTTACGTCTATTTTGGCAGTGACACCCTCTGGTAATGCTCTAGGAATATTTTCATAAAATCCACCGCCTGTAATGTGTGTCATAGCATGAATGTTAACAGCTTCTTTAACAGCTAATACTGGAGTAACATATAATCTTGTTGGTTCTAAAAACGCTTCTAAATATGTTTGTTCATCATTGTAGTTATCTTGTAAATCAATTTTAGATTTTTCGATTAATTTTCTCACTAAGCTGTAACCATTTGAATGAATACCACTAGATTCAAGTCCTATGATAACTTGACCTGGTTTAACGGAAGAACCATCAATATATTCACTTTTTTCAACAGCACCTACAGCAAATCCTGCCAAATCATATTCACCTTCGTGATACATTTCACCCATCTCTGCAGTTTCTCCACCAATTAAAGCAGTATGTGTCTCTTCACAACCGTCACTTACCCCTTTGACAATTTGTTCGATGACTTCTGGGATAACTTTATGTGTTGCAATATAATCTAAGAAATACAGTGGCTCAGCACCTGTCGTTAAAATATCATTGACGCACATTGCAACGGCATCAATACCAATTGTGTCATGTTTATCGTTATCTATTGCTAATTTTAGTTTTGTACCTACTCCGTCTGTACCTGAAACAAGTAATGGTTCTTTCATATTTAATTGTGATAGGTCAAATGTTGCCCCAAAACCACCTAAACCACCAAGTACTTCTTTACGCATTGTTCTCTTAACGTGACTAGACATACGATTTACTGCTTCATAACCTGCATTAATATCTACACCGGCTTGTTGATATGCTTTAGACATTTAAATTACCCTCTCTATCAAAGAATTGTTTATGATCTGCTATATATGCTTTTTGGCGGTCACTTAGATGTGCTATATAATCTTCTTCATAGTCATAAAGTCCTGCTGGATAGTCACCAGTAAAACTTTCAACACATAATCCACTGTATGGTGCATCTACTTCAAGTCCGATGGAATCGATTAATCCATCAACCGATAGATAAGCTAACGAATCTGCACCAATATGTTCGCTTATTTCTTCTGGCGATTTGTTGGCAGAAATAAGTTCAGCTGTTGTCGAAACGTCGATACCATAAAAGCTCGGGAACATAAACTCAGGCGACGCGATGCGTACATGTACTTCTCTTGCACCAGCATCTTTCAACATTTGCACGATGCGTCTACTAGTTGTACCTCGAACAATTGAATCATCTACAAGTACAATATTTTTGTCTTGAACAATATCCTTAACCGCTGATAATTTTACGCGCACACCTTGTTCACGTAATTCTTGGGTCGGTTGTATAAATGTACGTGCAACGTATTGGTTTTTAACTAGGCCCATTTCATAAGGTAGCCCACTTTCTTCTGCGTAACCAGAAGCAGCAGATAATGAGGAGTTCGGCACTCCAATGACCATATCTGCGTTGTTAGCTGGACTTTCTTTAGCTAATTGCTTCCCAGATTGCTTTCTAACAGCGTGAACATTTTTACCAGCAATTGTAGAATCAGGTCTAGCAAAGTAAATATATTCCATAGCAGAAATAGCTGTCGTCGTGTGTCTCGTGTATGACTCTACTCTAATACCTTCGTCATTAATCACAACGTATTCTCCTGCATGAATATCGCGTACAAATTCAGCACCTAATACATCAATCGCACATGTTTCACTCGCAATCATGTAAGAACCGTTTTTCATTTTACCTACAGCTAATGGTCTAATTGCATTAGGATCAACTGCACCATATAATGCATCTTTAGTTAAAATAGCAAAAGTAAATCCACCTTTTATCTTTCTCAAGCTTTCTTGGAATGCGTCTTCAAAGGTCGGCGCTTTACTTCTTCTAATTAAATGCATGATAACTTCTGTATCCGATGATGAATGAAAAATAGACCCCTGGTGTTCTAATGAACGCTTTAAACTTTGTGCATTTATCAGATTTCCATTATGACAAACTGCAACACTCATATCATAAAAGTGGTATAAAAACGGTTGGATATTTTCAATACCTTTATTACCAGATGTTGCGTATCTCACATGACCAATAGCATGCTGGTATGATTTGAAAGTTTCAAGTTGAATATCAGAGATTGCTTCTGTTAACAATCCTAAACCACGTTCACCAATTAACTTTTCACCATCAGAGCATACTATACCAGCACCTTCTTGCCCACGATGTTGTAAACTGTGTAAGCCCATATAAGTTAATTGTGCAGATTCAGGATGATCCCAAATTCCAAATACACCACATTCTTCATTTAGTCCGTTGCTGTCATACATTTAGGTATTGCTCCTTCCCATATATCAGTAAGGTTTTGAACATCACGTGTTACTTGAACCTCATTATTAGCTACTTTAAATTGACCATCATTTGTTAATTGACCAATTTCTACAGCATTTTCAATTTCTAACGTTTGTCCTTCTTTTACTGCAACAATATAGCGCCCTTGTGTTTCACTAAATAATTGCGCGTTCGTTACGTTTAATTGTACGTTTAATCCAAGTTGGTAATGTGCGCTCATACGTGCTAACGTCAATAATAAACCGCCTTTTCCAACGGTTTGAACATGTGATGCAACACCATTACGAATCACTTGTTTAATAGATTCACCCTTTTGTACTTCATTAGATAAATCAATCGCTTCAAATTCATGATTTACTTTCTTATAAAGTAACTTCTCAACTTGGCTACCACCAAAGTCATCTTTTGTGTCACCTAATACATATAAAGTGTCGCCAGCACTTGGTTGGAAATCATTTAAATAATCGATGTCTTCGATTAATCCAACCATACCTACAACTGGCGTAGGGAAGATAGATGTCTCTCTAGTTTCATTATAAAGTGATACGTTACCTGATACGACTGGCGTACTTAATACTTCACACGCTTCTGACATACCTTTCGTTGAATCCGCTAGCTGTTGATAAATTTCTTTCTTTTCTGGTGAGCCATAGTTTAGGCAGTCAGTCATTGCTAAAGGCGTAGCACCTACAGAAATCAAATTACGGTATGCTTCTGCTACAACCATTTTTCCACCCTCATAAGGGTTGTTAAATACATAACGTGCTTCACCATCGATCGTAGAAGCGATTGCTTTATTCGTACCTTCTACTCGAACTACAGATGATTGTAACCCTGGTTTCACAATTGTATTAGCACCAACTTGTTGATCATATTGTTCATATAAATAACGTTTAGATGCAATAGTTGGATGTTGTAATAGTTCATCAAACACAGATTCTACATCCACTTTGCTATAATCATTTTTACTCTCATTATAGTTTGGCGCTTCACCTTCTAATACATAAACAGGCGCTTCATCTGATAAAGGTTGTACAGGAATATCAGCAAACACTTCATCTTCGTACGTTAATACAAAGCGATCTGTATCCGTTACTTCACCTATCACAGCACTATCTAATTCGTGTTTATCAAATAAGTCTAAGAATTTTTGTTCTGTACCTTTTTCAACAACAAGCAACATACGCTCTTGTGTTTCTGATAACATCATTTCATATGGTGATATGCCTTTTTCTCTAGTTGGAACTTGTTCTAAACGTAGATGTAAACCACTACCACCTTTTGCAGCCATCTCTGAAGAAGATGAAGTTAAACCAGCAGCTCCCATATCTTGTATACCTACAAGTTCATCAAACGTAATCGCTTCTAATGTTGCTTCCATAAGTTTCTTACCAACAAATGGGTCACCAATTTGTACTGATGGTCGTTTACTTTCACTATCTTCACTTAGTTCTTCAGAAGCAAAAGTAGCTCCATGAATACCATCACGGCCAGTTTTTAATCCTACGTATATCACTGAATTACCTACACCTTTTGCCGTACCTTTTTGAACCATATCATGATCGATGATACCAACACACATAGCATTTACTAAAGGATTTCCATCATATCTATCATCAAACTCTATCTCGCCAGCAGTTGTTGGAATACCTATACAGTTACCATAACCACCGATACCAGCAACCACACCACGTAATAAACGGCGATTTTGTTTTTCAGTTAATTCACCAAAGCGTAAGCTGTTTAATAAATTAATAGGTCTTGCGCCAATAGACACGATGTCTCTAATAATACCGCCGACACCAGTTGCTGCACCTTGATAAGGTTCTACAGCAGATGGATGGTTATGAGATTCTACTTTAAATACGACAGCTTGATTATCACCTATATCCACAACAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP031275|1889233:1897709|1889233_1889800_-|WP_029379090.1|DBSCAN-SWA MTKIAIFASGSGSNFESIMTQIEQGNLPHIEVTALYTDQVSAHCIERARKYNLDVHINELKNFDSKADYERKIIEWLTSEKVEWIVLAGYMKLIGENILKAYDKRILNIHPSLLPKYKGKDAVGQALASGDDITGTTVHYVDSGMDTGEIIEQRTCDIYPDDTKADLEERIKALEHELYPAVISKIIQ >NZ_CP031275|1889233:1897709|1897226_1897709_-|WP_107542903.1|DBSCAN-SWA MKVVVIMGSSSDWETMKESCSMLDQLEIPYDKKVVSAHRTPQLMVDFSKEARANGYDVIIAGAGGAAHLPGMVASMTTLPVIGVPIESKSLKGLDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGKAGAKNAGVLAARILSIANQSIQKNLENYEKSLVQKVSEMQDELQ >NZ_CP031275|1889233:1897709|1892289_1894479_-|WP_107542906.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSAEEIKLEQLYKDMGLSEKEYEKVCEILGKEPNFTEIGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLTQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAVEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELTEKQNRRLLRGVVAGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDDRYDGNPLVNAMCVGIIDHDMVQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELSEDSESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREKGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTDRFVLTYEDEVFADIPVQPLSDEAPVYVLEGEAPNYNESKNDYSKVDVESVFDELLQHPTIASKRYLYEQYDQQVGANTIVKPGLQSSVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVFNNPYEGGKMVVAEAYRNLISVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLADSTKGMSEACEVLSTPVVSGNVSLYNETRETSIFPTPVVGMVGLIEDIDYLNDFQPSAGDTLYVLGDTKDDFGGSQVEKLLYKKVNHEFEAIDLSNEVQKGESIKQVIRNGVASHVQTVGKGGLLLTLARMSAHYQLGLNVQLNVTNAQLFSETQGRYIVAVKEGQTLEIENAVEIGQLTNDGQFKVANNEVQVTRDVQNLTDIWEGAIPKCMTATD >NZ_CP031275|1889233:1897709|1896106_1897240_-|WP_107542904.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGSTIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVIVLDPDKSCPCQHVAHEFINADYDDQEALEQLGELSDVITYEFENISANQLKTLVSKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKQTLQEADCKIASFVQLSEPDDLNIAIETIGYPFIVKTRFGGYDGKGQILVKSTSDIDEAKALVEKQECVAEQYLQLEKEVSLTVTIGSDNQITYFPLQENEHQNQILFKTIVPARTKHEKEAEARNEVDKIIKKIHFVGTFTVEFFIDGENRLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDFSQFDTHILAITGQKLPPQIELLKPAIMMNLLGKDLDLLEDQFSDHAEWHVHIYGKTSRKPNRKMGHLTVLTTDINRYEQMLLDKFEGRSE >NZ_CP031275|1889233:1897709|1894471_1895143_-|WP_029379094.1|DBSCAN-SWA MKFAVLKFPGSNCDRDMYNAAIKSGVQAEYVDYRNTSLDGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPITEEVKRLASEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFVSRNESLKVVNNQTAFTNLYDENEVVVYPVAHGEGHYYCTPDTYEALDQNNQIILKYVDNPNGSFNDIAGIVNEQGNVCGMMPHPERAIESILGTDSGVKLFEAMVNSWREQNV >NZ_CP031275|1889233:1897709|1889802_1890831_-|WP_107542907.1|DBSCAN-SWA MSKAYQQAGVDINAGYEAVNRMSSHVKRTMRKEVLGGLGGFGATFDLSQLNMKEPLLVSGTDGVGTKLKLAIDNDKHDTIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATHKVIPEVIEQIVKGVSDGCEETHTALIGGETAEMGEMYHEGEYDLAGFAVGAVEKSEYIDGSSVKPGQVIIGLESSGIHSNGYSLVRKLIEKSKIDLQDNYNDEQTYLEAFLEPTRLYVTPVLAVKEAVNIHAMTHITGGGFYENIPRALPEGVTAKIDVTKFPTLPIFDWLQQQGEIETVEMYNIFNMGIGFTLVVDEAQVQTTLDILKKQNVNAYAIGEIVEGEEPIQLTGV >NZ_CP031275|1889233:1897709|1895142_1895403_-|WP_017724119.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQALNRAVHDLGYKQVNDIRVGKVLYMTVDEATDAEVHNVVTTLSEKLFANTVIEEYSYKVLEEGEKA >NZ_CP031275|1889233:1897709|1890823_1892311_-|WP_029379092.1|DBSCAN-SWA MYDSNGLNEECGVFGIWDHPESAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVCSDGEKLIGERGLGLLTEAISDIQLETFKSYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVAVCHNGNLINAQSLKRSLEHQGSIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEDAFQESLRKIKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLAVGKMKNGSYMIASETCAIDVLGAEFVRDIHAGEYVVINDEGIRVESYTRHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKQSGKQLAKESPANNADMVIGVPNSSLSAASGYAEESGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVQDKNIVLVDDSIVRGTTSRRIVQMLKDAGAREVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISANKSPEEISEHIGADSLAYLSVDGLIDSIGLEVDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEEDYIAHLSDRQKAYIADHKQFFDREGNLNV >NZ_CP031275|1889233:1897709|1895405_1896107_-|WP_107542905.1|DBSCAN-SWA MSLLYEGKAKRIFSTGENNVLRVEYKDEVTAGNGAKKDLIEGKGRLNNQITSHIFNYLKEKGVKSHFIEQISETEQLVQSVEIIPLEVVVRNIAAGSITKRLGFDKGHEFDEPLVEFFYKNDDLNDPLITEDHIKLLHLAEDNEINILKEAAKEVNAVLVQLMNEMNLRLVDFKIEFGRTTDGQILLADEISPDTCRIWDKDSDTNFDKDVYREDRGSIIETYQTFLNKLEAL |
9 | Prochlorococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1932455 : 1939559
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP031275|1932455:1939559|DBSCAN-SWA CATAATTTTAATTAATTCTAAGTTGTCTAACTTACCTCGCAGAATTGATGGAAAGTTATTTGCTTTAAGTCATACCGCAGTAAATAAATCTTTTAAGCACGCGAAAAAAGTTGTTGGTTTAGATGATGACAATGTAACCCCCTACTCACTTAGACACACTCACACATCTTATTTACTTTCTAAAGGCTTACCGATTGAATATATTAGTAAACGTTTAGGACATGCAAGCATATCAATAACTTTAGACACATACTCTCACTTGTTAGAAGAACATAAAAAAGAACAAGGACGTGTCAGAGAATTATTCTCTTGACACATATTTGACACTCACTCTCCGTACATAAAGCTTGATATGATAAGCTTTATGTACGGAGAGTGAGGGATTTTAGGAAGTCCACAACGCCACTGTTTACGCTATTATGTTGGCATACCGTTAGCGTAAAACAACCCACCTTGATTGGTGGGCTTATTTTATCTCCACAATATCTTTCAAATTAACTTTACTTAATCTAGTTTCTCCATATAAATATAGTTTTTATTCACACACCAAAACACCCTCGATTATTATTAAAAGTTGAGGAGCCTAAAATAATAAAGAGGGCGTGGAGGTTTGAATGAGTATATTTTTGGGAATGCAGTTATAATATAGCCTTTTATTCATTTATTAAACTTATTAAAATAAAATTATAAACAAAAAATATACCAATATGAATATGCAAGTAAAAGTAATAACAGTCCCAAATGTTATAAATGCTCTTTTAAGAGTCTCATTATTACGTTTAATATAACTGATCAAATAACAAACTAAGCCAATGATTAAACCAATAATTACATAGTTGATAATTTAACACCTTCTTCATTAAAGAAGCCCCCTCTAGTTATAGGAAGATACCTAAAGTAACAGAGGGGGCCGAAATATGAATGAGAATAAGATTCAGACTATATTTATAATATATCCCTTTAAATTCTTTCTAAACATAATACTTATAATATTTTTATAAAAATCATCAATATCAGTTTCGTATTTATATTCATCTGGTGCATCTGGATTTATTACTTTCATATTATCACCTCAAAAAAATGGAATTGTTTTACTTGCTTCTATAATATCTTTTGTGAAGAAAAATTGTTTACCTTCTCCAGTATAAGCAGGGTTTAAAAACATGTTTGCTTTAGCACTATATAGCCATTCAGGGTTTATTCCAGAATTTAAAATATCTTGAAATTCTTGAAAATTTTTACTCCAATCTAAATTGGGTTCCATATTATCACCTCATGAATATAATAGAACACTTGTTCTTATATGTAAATAAAAAAAAGAGTTAACTGCAGAAACAGCTAACCCAAAAACAATTATCACAAATACTCTTCTTCTGCTTCATCCATTCTTTCATCAAGATAATTTCCTGCAGTAGCCATCATATCTCTAGTTTTACCGCTATGTTCACCGTAAGTTGCTTCAGCGTCCATTACACCACCTGTTGATGTATCTAAAGGCTCCATTAAGTAATTTTCTAAATCACCTGTATCATAATTATCCTTAATATAGTCGTCTTTTAAAATAGTTTCTTCATAATAAGATTGGTTATCATAAACTAATTCTAAAGCTTTACCCTTTTTCCCTTTACTTAATAAACTTGCTAACTCTCTATTGCTGTCTATGTATTTCTCTATTTTACTTTTAGCTACTTTTTCGTCACTTTTAAAGACATTTGAAGTGTTAGTTTGCCCCATGTGAGTTGATAAACTAAATAAAAAAACTATAGCAATAATCAATAAAGTAATTGCTTTCTTTCTTCTAGTTGACATTAAATGAACCCAAAAGTATTCATTTAACGTTGAATCTTGATTTTTACTTAAGAACCTTGAAAAAAACTTCATTATGAAACCTCCGATTTAATAATATCATTGAAAATATATCACATTATTTTAATTGTACAACGCTATTTAAAAATGAAAAAACACCCAATCTCTAGTGTGGGTGGTTAAAATCAAAATAGATTATATAATTTTAATTTTCGCTGTTACCCAGTCTATATAATCCATAAACAACAGCAACTATAATACAAATTATTACAGTCCATTTTTTATAATCAAAAGGTTTTTCTGATTCATAAGCTTCGATTACATTTCCTTCTTCATCGTACATTTTCAATTCTTTTTTATATGTAGTCCATTTTTCTCTTGCAAAGCTTTCTTCCTTTTTATCTCCTTCATCACGTAAATCAACTGTTACAGTTGACCCATTATCATTTACCACTTCATAATTATATACATCTTTATCATCTTCGCTATACTGATATGTAATGGTATCTTTAGTTATTATGTACTTGTTATTTTTCCCTTCCCATTCTCCTCGTACATCTTTTTTGGCATTATCACACCCAGTCAAAATTGTACTTAAGAGAACAACTAAAGTTAATATAAAAATATTCTTTTTCATTTTAGCCTCCTTAATATTGCGCAATAGAGCATATTGTTTTTTTAATTGTACTATATATTCACACAAAAAAATAGGGCAAACACATAAGTGCGTACCCTTATAATATGATCACGTGGTAAGTTGATTATAACATATATTTATTTTTGATAATTCTTATTTATAGTATCTTCAACCCATTTTTGAGGGTCTGTTTTATATTCTTCGATATATAAATCACGTTTGTTTAAAGCTGTTTCTAGGTCGGTATACTTAGAACTACGTGTATGTCCTTTTCTTTTAACTAAAGCGTAATAACTTTGCCCATCCAAAATTATATTTCTGAACCCGGACACACCTTTTGCATGCCTTTTATTTAATGCGTTTTCAGAACGAGTAACCCACTTACAATTAAGAGGACTATATCCTTTATCATTGTCCAATCTATCGATTTGATGTTCTGTACTGGGCCTTTCACCCATATCATTTATAAAATTTTCAAAGGAGTCTAACCATCTGTCACAGATTTTTATCCCTCGTCCACCATAGTTTTTATAACCTTTACTTTTTGTGTTATAGCATCTTTCTTTCATACCTTTCCACACTTTATATTCAGGGCTTTTGGATTTGCCGTGTTGAGTACTATATTCTTTCATGAATTTAGACTGAACTTCACTATTTAAACAACCGCACGATTTTATTCTACCGTTTTTTAAGTCTGCTAGTGGTACTACTGTTGTATTACCACAATCACAATTACACAAAAACGCCTTACCTCTTCGAATGTTTTCAACTCTTTTTATAGGTTTTAATCTATAATATTTATTGTCTAAAATATCTTCATCTTTGTTTTTGTTATATTTCATACATCCGCATGATTTGTATCTGTTGTTCTTCACATATGTACCAGTGTAAACCACTTCATTACCACAGTCGCATTTAAACAAAAACTTTTTACCCCTTTTATCACTTTCAATGAATTTAATACATTCTAATTTATTATATTTTTCTCCAACTTCCATAATGAAAACCACCTTGTTTAATTACTTCATCGTAATTATAACAAAAAAATGAAACGGGCGTAAGCCCGTATCAATTTAACTAAATGTACCCCATGCATCACCTACTCTACTCCCTTTACCATCTGATTTGCCGATAGGCATGTAGACTGTATCACCACTGAATACTTCCCAACTAATCCAGATGTAACCTTCATAGTCTTGAATTTCATTATAGTTAACTGTTTGCCCATACTCTAAACCACCAGCTATAGGGTTGTGTAAACTTGGACCAACGTATCTAGTTACGATACCTTCAGAAACATTACATGTGAACGAAGCTGCTTCTTTTTTCCATAAAATACCCCAACTATTCTTTTTCCAACCATTACCAACTGATGAACCATGTTCTTTAATAGGTTTAGACTGTTCTTTTTCTGTTGGAATAGTCGTTCTATTTGGAATATCAGAACTAGCTGGACTACCTGCTTTTAATGCTGGATTGTTATAATACTTTTTAATTTCTTTAATAAAGTAATCTTTCAATTGATTCACAATAGATGTCGGTGCTGCGCCTTGTCTGACTGGGTCAAAACCAGTGTGCAATGCCATGCTACGATGCGGACAAGCTGTAGGAACAAACTGACAATGTAACATAACAGTTTCTCTATTTACTGGTAACCCATAATAAAGTAAATCAGCTGCAGCTTTTTTAAATACTGCTTGTTCATTAGCCATGAAATCTTTATTATTAGCACTCATTGATTCATTGACCTCATATCCAATAAAAGCATTATTACCATAAGCATTCGCTACATGCCAACCAACGCTGTATGTGTCAATTGCACGCCATACTGTATTTCTATCAATATAATAATGGGCTATACCTGCTTCATATCTTGCTTGTGATGCATTTTTTAAATTATTGTAATCTTGTTTAGCTGTAGCACTACTTGCTGTATTGTGAATGACTACACCTTTCACATTACCTGAGCGATTAGGCATTTTATACTTGATTGTTTGATTGATTGTTTCAATTTTAGTTGATTTTAAAACTGCACCTTTTTCAGCATCTTCATAAGGTGGTCTAATAACACCTAAGAAATTACTATATTCATGATCTTCAACAAAAGCTGCTGGACTACCTTTAGTTAAGCTTTCGTTATACCAATTCTGGTCTATACTATTAAAATATTTCGCGTTAGCTTCAGTAACAATACCTGTATGACCATGCTCTCCACCAAATACAAAAATATCCCCAGGTTGAGGTATTTGTTTTTTGCCCTTAATAACTTGAAAGCCTTTTGGCCATTTAAAATCAATAAAATCTTTTGCGTCACCTGTCGGATGAACACCCCAATATTTTTTAGTGAATTCAATAATAAATGTCGCACATTGTGCCCCGTAAGGTTGCCCGTTTAAAGCGGATGGTATTGAAGTTACTTTAGATAGCGTTGAAGAAGCTGGAAATGTTGGAGAAATTGGCACAGAGCCAGAAAATGGAAAAGCTTTAAAAGTTAATTTCAAATTTAAAAATAATAATGATGATCAAATATTAATGGATTCGGGAGATTTCACTATAAATGTTAATGGCGAAGTTTATGAAGAATGGTTTGGCACAGATGATACAAATGCTGATTTTAGCCATCAAATAAACAAAGGTAAAACCGCAAGTGGTTATATTTATTATGATGTACCTGATTCAGATAAATATATGGTCGAAATGGAAACTATGCCTAACTTAAAAGACATAAAAGCTAAGTGGGAAATAGAAAAATCTGATATTCAATAATTTTAAGGGCAGAAATTACTGCCCTATTTTAATAAACTAAAGGAGAATATTGAATGAAAAAACTATTATTTTTATTATTAGCAAGTTTCTTAGTATTGGCTGCATGTGGTCAAGAAGAAAGTAAATCAGAAGGTAATAAGGAAACAAAATCGACTGATAAAGAAAGTAAAAAAGATGACAAGAAATCTAAGGATGATAAAAAAGAAAAATTAAATAAAGAAGATACTGATGAACAACAAACTTCTAACACAGACGGTAATCAACAAGAAGTAAATATAGAGCAACAAACCCAAGAATCTGTGTCTCAAGCACCTATTGAATCACAAGAACGAGTAAACAATCAAGAACAAGAGACTGTACAAGCACCTGTTGAATCACAAGAACAGGCAACTATAGAACAAGAACCACAAAAACAAAAAATTGATTTGAACCAATTTCCTGGTGGTGATTTTTCTACGGAAGGCATGTCTGAAAGCGCACAAAAACAAATCGAAGAATTAAGTAGACAAAAAGACTATGAAGGTTTACCACAAAAAGAATACAACGATCAAGTATCTGAAATTATGAATAATGAAATGAATTAATTATAACAGGGCACCCTACTATGCCCTATATATTTTTATCTAATTTAAAGGAGGGATATATATGAGAGTTATAAGTTGCAGGATTAAAAGGAGTAACATTATTTATGAAGTTGAATCAGATAACGGAAATGTCTTTTATAAATCTCTACCAAAAAAAAGTAACTGCAAATGAAGCAAGTAAACGTTTAAGAAAAGTATCGGATAAAGTCGATAAAAAATAATGAAGTTATAGGGCCTTTCTACGCCCTATATATTTTTATCTTTTTTAGGAGGAATGAATATGCCAGTAAATAAAGATGGTAAAAATTGGAAGTACGACTTTAGAATAAATGGTAAAAGATATAGGAAAGCAGGATTTCCAAAGAAAATAGATGCAACGATTGCTATGAATGAAGCTTTTGAAAAAGCAAATAAAGGTTTCACACTTGATAACAACATCGCTTTTATTGATTACTTTAACAAGTGGATTACAACGCACAAAGAACCTTATTTGACACCTAGAGCATTACAAACATATCATAACGCTAAAAATATTTTTGAAAAGTATCTAGGTAATATACCTATAAAAGAGTTAAATAGAACAAATTACCAAGAGTTGATCAACGATTATGCAAAGAACCATGCTACAGAGTCAGTAAGAAAATTGAATAATTGCTTACGTGCAGCCATTCAAGATGCAGTATATGAAGGAATATTGTATAAAGACCCGACACATCGTGTAATCGTAAAGGGAGCCATTAAAGAAAAACCAGAAGAATTTAAATTCATGAGTTTGAAGAATTATTATAATCTTAAAGATTATGCGAAAAGTAAAAATAAACTATCTTATTTGTTCATTTATTTAGCAATTGTCACAGGTGCAAGATTTAGCGAAATACAAAAAATGCAATATAAAGATTTCAATCTAAATAATGAAACTGTTCATATACGTGGTACAAAAAATGAAACATCAGATCGTGTAATTAAAATTACAAAAGAAGATATTAAACATGTAAGACAAGTTTTAAACGACTTCCCTATTAATTTAGACGGAGATATATTCAGAACTGGTGCAAACTTAATTACTCACAATGCTGTAAGTAAAGTTTTACAAAGGTTTTGTTTGAATAATCAATTAGGCAATTATACTCTACACTCAATTAGACACACACATTGTTCAATGTTATTGCATGAAGGCATTTCTATTCATTATATTTCTAAAAGATTAGGTCATGCAGATATTGCCACTACACTATCTACGTACAGTCATCTGTTGGAAGAGAGTCAAAAACAAGAAGAGGAAAAAACGCTGGAAGTCTTGCGCCACATGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP031275|1932455:1939559|1937716_1938247_+|WP_107543046.1|DBSCAN-SWA MKKLLFLLLASFLVLAACGQEESKSEGNKETKSTDKESKKDDKKSKDDKKEKLNKEDTDEQQTSNTDGNQQEVNIEQQTQESVSQAPIESQERVNNQEQETVQAPVESQEQATIEQEPQKQKIDLNQFPGGDFSTEGMSESAQKQIEELSRQKDYEGLPQKEYNDQVSEIMNNEMN >NZ_CP031275|1932455:1939559|1933810_1934335_-|WP_107543218.1|DBSCAN-SWA MKFFSRFLSKNQDSTLNEYFWVHLMSTRRKKAITLLIIAIVFLFSLSTHMGQTNTSNVFKSDEKVAKSKIEKYIDSNRELASLLSKGKKGKALELVYDNQSYYEETILKDDYIKDNYDTGDLENYLMEPLDTSTGGVMDAEATYGEHSGKTRDMMATAGNYLDERMDEAEEEYL >NZ_CP031275|1932455:1939559|1933526_1933718_-|WP_107543217.1|DBSCAN-SWA MEPNLDWSKNFQEFQDILNSGINPEWLYSAKANMFLNPAYTGEGKQFFFTKDIIEASKTIPFF >NZ_CP031275|1932455:1939559|1932455_1932767_+|WP_107543254.1|integrase|DBSCAN-SWA MILINSKLSNLPRRIDGKLFALSHTAVNKSFKHAKKVVGLDDDNVTPYSLRHTHTSYLLSKGLPIEYISKRLGHASISITLDTYSHLLEEHKKEQGRVRELFS >NZ_CP031275|1932455:1939559|1937303_1937663_+|WP_145511737.1|DBSCAN-SWA MEVTLDSVEEAGNVGEIGTEPENGKALKVNFKFKNNNDDQILMDSGDFTINVNGEVYEEWFGTDDTNADFSHQINKGKTASGYIYYDVPDSDKYMVEMETMPNLKDIKAKWEIEKSDIQ >NZ_CP031275|1932455:1939559|1935034_1935895_-|WP_107543220.1|DBSCAN-SWA MEVGEKYNKLECIKFIESDKRGKKFLFKCDCGNEVVYTGTYVKNNRYKSCGCMKYNKNKDEDILDNKYYRLKPIKRVENIRRGKAFLCNCDCGNTTVVPLADLKNGRIKSCGCLNSEVQSKFMKEYSTQHGKSKSPEYKVWKGMKERCYNTKSKGYKNYGGRGIKICDRWLDSFENFINDMGERPSTEHQIDRLDNDKGYSPLNCKWVTRSENALNKRHAKGVSGFRNIILDGQSYYALVKRKGHTRSSKYTDLETALNKRDLYIEEYKTDPQKWVEDTINKNYQK >NZ_CP031275|1932455:1939559|1938521_1939559_+|WP_107543047.1|integrase|DBSCAN-SWA MNMPVNKDGKNWKYDFRINGKRYRKAGFPKKIDATIAMNEAFEKANKGFTLDNNIAFIDYFNKWITTHKEPYLTPRALQTYHNAKNIFEKYLGNIPIKELNRTNYQELINDYAKNHATESVRKLNNCLRAAIQDAVYEGILYKDPTHRVIVKGAIKEKPEEFKFMSLKNYYNLKDYAKSKNKLSYLFIYLAIVTGARFSEIQKMQYKDFNLNNETVHIRGTKNETSDRVIKITKEDIKHVRQVLNDFPINLDGDIFRTGANLITHNAVSKVLQRFCLNNQLGNYTLHSIRHTHCSMLLHEGISIHYISKRLGHADIATTLSTYSHLLEESQKQEEEKTLEVLRHM >NZ_CP031275|1932455:1939559|1934465_1934897_-|WP_107543219.1|DBSCAN-SWA MKKNIFILTLVVLLSTILTGCDNAKKDVRGEWEGKNNKYIITKDTITYQYSEDDKDVYNYEVVNDNGSTVTVDLRDEGDKKEESFAREKWTTYKKELKMYDEEGNVIEAYESEKPFDYKKWTVIICIIVAVVYGLYRLGNSEN >NZ_CP031275|1932455:1939559|1935970_1937305_-|WP_107543221.1|DBSCAN-SWA MPSALNGQPYGAQCATFIIEFTKKYWGVHPTGDAKDFIDFKWPKGFQVIKGKKQIPQPGDIFVFGGEHGHTGIVTEANAKYFNSIDQNWYNESLTKGSPAAFVEDHEYSNFLGVIRPPYEDAEKGAVLKSTKIETINQTIKYKMPNRSGNVKGVVIHNTASSATAKQDYNNLKNASQARYEAGIAHYYIDRNTVWRAIDTYSVGWHVANAYGNNAFIGYEVNESMSANNKDFMANEQAVFKKAAADLLYYGLPVNRETVMLHCQFVPTACPHRSMALHTGFDPVRQGAAPTSIVNQLKDYFIKEIKKYYNNPALKAGSPASSDIPNRTTIPTEKEQSKPIKEHGSSVGNGWKKNSWGILWKKEAASFTCNVSEGIVTRYVGPSLHNPIAGGLEYGQTVNYNEIQDYEGYIWISWEVFSGDTVYMPIGKSDGKGSRVGDAWGTFS |
9 | Staphylococcus_phage(66.67%) | integrase | attL 1929907:1929930|attR 1939725:1939748 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2099685 : 2115880
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP031275|2099685:2115880|DBSCAN-SWA 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20 | Staphylococcus_phage(30.0%) | integrase,coat | attL 2103595:2103610|attR 2119995:2120010 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2164721 : 2180682
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP031275|2164721:2180682|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP031275|2164721:2180682|2170969_2171368_-|WP_017722526.1|DBSCAN-SWA MKVVYFSFSGNVRRFIKKTELTNVMEITQSNCSEKIEEPFILVTGTIGFGEVPQPVQSFLDVNKNLLKGVAASGNRNWGQNFAKAGRSISEKYQVPLLMKFEVQGTQNDISEFKDKVGHFNEDYGREEIQSY >NZ_CP031275|2164721:2180682|2179626_2180682_-|WP_107542959.1|DBSCAN-SWA MKKQIEQLSAYEPGLSPRALKEQYGIEGELYKLASNENLYGPTPKVNEAIQAHLDELQFYPETGSPLLKEAISKHLNVDASRILFGAGLDEVILMISRAVLTAGDKIVTSEMTFGQYYHNAIVESANVTQVPLQEGHFDLEGILAEIDKDTKLVWLCNPNNPTGTYFSHDELQRFLERVPSDIPVIIDEAYVEFVTAADFPDTLALQQQFANAFLLRTFSKAYGLAGMRIGYVVAAKEAIDKYNIIRPPFNVGRLSEYAALAALEDQDYLASIRDRNAQERAKFFELSQSDAFYPSQTNFIYVRTDKPHELYEALLNVGCITREFPRGVRITIGFPEQNEKMIEVLKASNF >NZ_CP031275|2164721:2180682|2164721_2165522_-|WP_047172717.1|DBSCAN-SWA MIKVQGLNKTIQDKAILQNINVEINKGKLTTMIGPNGAGKSTLLSAITRLIDFETGTIEIEGKLISDYKSNELAKKLAILKQSNHTELNITVEELVKFGRFPHSKGRLKQEDRDQVEYALDLLQLNEIRDRYLKTLSGGQRQRAYVAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHSVQIMQTLRRLAQDLNKTIVVVIHDINFASCYSDDIIALKDGQLVKASTKNDVIQTDVLKTLYDMDVRIEEIRGQRICVYYDELTAHQDLALAHSM >NZ_CP031275|2164721:2180682|2173679_2175194_+|WP_107542958.1|DBSCAN-SWA MKKIDYTHEEIMKSIPNKGFFGHPKGLSTLFFTEFWERFSYYGMKAILIFYLYYSVAEGGFGLSQAVAMQIVAIYGTLIYMSGVIGGWIADRITGTQNAVFYGGILIMLGHLLLSLPNNLTLVMVALAVIIAGTGLLKPNISTTVGELYDRNDVRRDSAFTLFYMGINLGSLLAPLLTGFLQTRISFHAGFLAAAIGMFCGLVVYAIKRKKNLGFAGRNVPNPLTRPELKKFGFISGGFILLFLMYLLVLQLFNALTLENFSFLITILGIVLPIYIFINMIVSKDVTKDERSRVYSYVPLYITSVAFWMIQEQGSTILATFADKKTQLEMSVLTNGLFDFTIPAAWAQSLNPIFIVVLAPLFATLWMKLGKHNPPTVYKFAFGAIIAGLSYLVMIIPLATGNELINPLWLVLSFLLITIGELCISPVGLSTTTKLAPITFTARMMSLWMLSNATAQGLNAQLVVVYTKMDQSDYFMYSGLLAVVIGVLLLLISPKVKRAMKGVY >NZ_CP031275|2164721:2180682|2177711_2178662_+|WP_080706872.1|DBSCAN-SWA MTKTKYKHGVLFYHEHSGIKDIYRGLGDVASSLTTFCKHLSIQLSENEGDIITFCKEIKNQSYSDDVDIIFILGGDGTVNELINGLMQSELDIPIGIIPGGTFNDFVKTLNLNPRHKVASQQLINSELQAYDVMKINDQYALNFAGLGLIVQNAENVQNGNKDVFGKLSYVGSTVKTLLNPEHFDYKMTADGKEINGNTAMIVVANGPFIGGSRIPLTDLSPSDGYLNIFIFEEHSSSVITDIFKQRDSMNWNNMTDGIKHILAKEITIETDPQMKVDIDGEIALNTPLNIEIVPSAINILTLPDSNIDTQQTEEE >NZ_CP031275|2164721:2180682|2168901_2171007_-|WP_047172719.1|DBSCAN-SWA MKIMDEKKYNHIELNNEVTKRKDNGFFNLEKDQEALAVYLEEIEDKTIYFDTEIERLHYLVDNDFYFDLFAKYSEEDLVEITDYAKSIPFEFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYKQHVAIVALYLANGHKATAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLETDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPVAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFHMFAPHTIYKEYGVTLDDINLDEYYDELVANPNVDKKKKDAREMLNMIAQTQLQSGYPYLMFKDNANKVHANSDIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGTEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFKDSVHTGMDALTVVSDEADIQNAPGVRKANRELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNYYSIERSMEIAKERQEVYKDFEKSDYANGKYFEFYTTQNFEAKYEKVRKLFEGFEVPTAEDWKALQKEVEAHGLFHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPETMWYYKSAFNTDQMKLIDLISTIQTHVDQGISTILYVNSEISTRELSRLYVYAHHKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP031275|2164721:2180682|2166467_2167436_-|WP_029377693.1|DBSCAN-SWA 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13 | uncultured_Caudovirales_phage(41.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2193952 : 2201342
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP031275|2193952:2201342|DBSCAN-SWA ATTATAATCGCTCCAATATCTTTGTTTTGTCTATAAATTCTTGAACTTCCTGCTCAGGTTGAGAGTCGATCGTAATACCTGCACCGACTCCATAAATGGCTTGGTTATCTAAGTATTGTATTGTTCGAATCGGCACATTAAAGATTGATTTCCCATTTGGAAGTAATAAGCCAATCGCACCACAGTAAATATTTCGTGGCGTTTGTTCTAACGCTGTTATATATTTCATTGTATTGAGTTTTGGGGCGCCTGTAATTGAACCACAAGGAAATAATGCGCTTAGTATCTGATTTAAATCTGTATCTTTACGTAAAGTGGCAGTAATCATTGATGTCATTTGGAATACTGTCCTGTATGGTTCTATATGAAACGGCTTATATACTTTAACAGTGCCAGTTTTTGCAATTCGACTCATGTCATTACGTAGTAAATCTACAATCATTACATTTTCTGCTCTATCTTTGCTTGAGCGACTTAAAGTGTTTAGATTTTGCTTATCTTCTGTTTCATTACTACCTCTTGGCATCGTACCTTTCATAGGTTTACTTAACAATACATCTTCCCCTGCTTTAAATGGCCCTCGTTGGAAAAATAATTCTGGTGATAATGAAGCAACCTGTAGCTCATCTGTTTCAATAAGCGCAGAATAAAAGCCATGATTATCATTTAATAGATGATAATATAGTGTCACTATAGAATGATGAATCGAATCTACTAATCTCGTTGTATAATTTACTTGATACGTATTCCCCTCCACAATAGCTGATTGTATCGTCCGAATATGTTTAATAAGTTCGGCTCGATTTAATTGAAATTGAAAATTACATTGTTGTTGATATGTCTTATCCTCAAGGTCATTTTCAGTTTCTGATGTATTTTCAAAAACATATGCTGCCGCGTATACATAGCCTTCGTCTGTCGGCACTGTTGCCATGTCTTTATTGAAGTAAGTTGCCGCTTCATAAGGTAAATATATGGCTACATAATAGCCATCATTTTGATAACTTTCTGCAAAGCACACGACATCACCAACTTCTTCTATTGAATATGCAATTTTCTTAGCAATGCAATGTGTGAATAAATAACGATGCGTCTCATGCGTTGTTTCATCAGTTATGTAACAATAATTAAAATGTATTTGCATGGTAGGCCTCCACTATATCTATAAATATTTGAATTTGTTTAAGACCATATTCACTTAATATGGATTCTGGGTGGTATTGTACTCCATAAATTGGTAATAATTTATGTTCCAAAGCCATTATAATATTTTCATGATTTGTTGCTGTCACAGTTAATGCTTCTGGAAAGGATGATTGCTCCGCCTTTAAAGAATGATAGCGCATCACATCGAATGATTCTGGCAATCCATCAAAGATACCTGTGCCACTATGTTTTATGCGCGTTGTGTGGCCATGAATAGGCTTATCACTTTTCACTATATTCCCACCGAAATATGTCACAATTTGTTGAAACCCTAAACAAACACCTAATATAGGTACCTGTGTTGAAAATGTTTGAATTACTTCATTTAATACTGGGTAGTCCTCGGGAGAACCTGGCCCTGGTGAAATTACAATTGCATTAGGTTTATATAAATGAATTCGTTCATTAGTTACCATTTCTACATCAATAACCTCAACTTGTCCTCGATAACTTTGCTTAATATAATCTACAATGTTATAAGTGAACGAATCTTTATTATCTATAATTAGTATCATTTCGTCGCCTCTTTTTAAATATCTTCGTTATTCTGTTATACTTATTATCACAAATATTAACTTGATTTTACAGTTTAAATGTATTATTCTAAATCACGTTATAAATGAATACAAAGAGGTTCCTAGCTGATACCCTCTATAAAAAACTAGACACATGATTTTCGTCTGTCTTTTTTATAGAGATGGACGTTTTTTTATGCCGTCATAGCATGAGTTATAACAGCTAGTTTGACAATATGAAGGAGTGCAAGCAATATGACGCAACAATCATTAGACAATAACAAGGCTATCGTAGTATTTAGTGGTGGACAAGATAGTACGACTTGTTTATTTTGGGCTAAGAAACATTTTGAAAGTGTAGAACTAGTTACATTTGCCTATGGCCAAAGACACGATACAGAAATCGAAGTAGCAAAACGCATTGCAGAAGAACAACATGTTAAGCACCACATCTTAGATATGTCTTTACTTTCACAACTAACACCTAATGCCCTTACGCAACACGACATGGAAATCGAAGTAGGAGAAGATGGTATCCCTAATACATTTGTTCCTGCAAGAAATTTACTTTTCTTATCTTTTGCTGGCGCCTTAGCATACCAGACAAACACTAAAAATATTATCACTGGTGTATGTGAGACGGATTTTTCAGGGTACCCTGATTGCAGAGATAGTTTTATTAAATCAATGAATGTAACGTTATCACTATCAATGGATAAAGATTTTGTAATTCATACGCCTTTAATGTGGTTAGATAAAAAAGCAACCTGGGCATTAAGTGATGAACTTGGAGCGCTAGACTACATTCGTTACAATACGCTTACTTGCTATAACGGTATCGTTGGTGAAGGCTGTGGAGAATGTCCTGCTTGCGAATTAAGAGCCCACGGTTTAAATACGTATTTAGCTGAAAAAGGAGAGAATTAATTATGTTCCAACAAAATTATCCTAGTGTACAACATCCATATACTTTCGAACTAAATAAAGACTTTAATTTTTCTGCAGCGCATTATATACCAAGTGAAGATGCAGGCAAATGCATGCGCACACATGGTCATACTTATTTTGTGAATTTAACAATCGTTGGCGATTCATTAGATCACAATGGTTTTTTAGTCAACTTTAGCGAGCTAAAGAAATTAGTTCACGGCCAATTCGATCACCATTTACTCAATGATTTACCACAATTCGAAGGAAAAAGTCCTTCTACTGAAATCGTAGCTCAAACTATATATGAAATGGTTCAAACATCTTTAAACCAACGCAGTAATCAACCTAAATGTGTACAAGTCTATGTAAGAGAAACACCGACAAGCTATGTCGTATATAGACCAAAGGAGCAACGTAATCATGAGTAAAATACCTGTACTAGAAATTTTCGGTCCAACAATTCAAGGTGAAGGTCGAGTCATAGGCCGTAAGACTATGTTTGTACGAACTGCCGGTTGCGATTATCGTTGCAGTTGGTGTGATTCAAGCTTTACTTGGGACGGTAGCGCTAAAGAAGATATTCGCATGATGACTGCTGAAGAAATTTATAACGCTTTATATGAGATTGCTGGAGACTCTTTTAACCACGTTACAATATCTGGTGGTAACCCTGCCCTAATTAAAGGGATTCAACAATTAGTTGATTTATTTGATGAAAAACACATACAAAGTGCATTAGAAACTCAAGGTAGTAAGTTCCAACCGTGGATGACTCAAATAGATGACTTAACAATCAGTCCAAAACCACCAAGTTCGAAAATGAAACCAAACTTGCCTATATTAGATGAAGTCATTGAACAATGTGTACCAAAATCACTAAATCTGAAAGTTGTTATTTTCGATGATGAAGATTATGAATTTGCGAAAAAGATCCATCACAGATACCCTGATATTCCTTTTTACTTACAAGTAGGTAACCCTTATTTAGATGGTGAATACGTAGAATCACACACTAAAAAGTTATTAACGTTGTATGAAACGTTAGTAGACCGCGTAATGGTCAGTAGTGATATGAACAATGTATATGTTCTACCTCAATTACACACATTACTTTGGAGTAACAAAAAAGGTGTTTAAATTGTGTAATCTATGCGATCCGTTGTATAATGCTCTTTGTCTATATAACGAATCGCTTTTTAGTGATGCAAAAATATATAGTTGGTCATCACTGTAAAATTATTTTTATTATACATTTAACATCATTTTTAATCTCATTTTAATGATGATGCTTTGAAGAAATTATGTAATTAAATGATTAAGTTTCACTTAATTGATATAATGTTGCAGTGAAGTATCTAGGTTAGGAGAGCATCATGCTAATTAATATAATTATAAATATAGCTACGGTATTAATTGTGCTCGGCATTGATTTATATCGTCAGAATTTCAAACAACTAAAGTTTAGCTCTATACTGATTGCAATAACACTCAACGGTATTATTAATTTATTTCTAGTCGGTGAATATGATTACATCGCCTTTTATACAATTACACAATTACTTATTTGGACTTTATTACAACTTTATTTAAATCGTAAGCTAACTGCTTATAAAATTACAGATCAAAAATTCATTGCAGTTATTTTGACAATTATCATGAGTACATCATTAATTCTTACATATAGCACTAGTCATGACTCGTATTATATGTCTATTCCATACTTAGCCCCTGCTATTTTCTTAATTGGCGCAATCCTACTGTTCTATAGTACTTTTCAGCCAAAGGAAAAAGAGCAACTTAAGCTATTACAACGTATCAAGCATCCAATTTTAATAGGTCAAATATGTATGATTGGTGCTTTAACGATAATGATGTTATTAACGCCTTATTGGTATGCCTTTATTATAGTTCATTTACTATTTATATTTTTCTTATTATGGCAGAATATATTTTTTTCACATAAATGATTAACATATTATATTTTGTGGTATAAATAAACAGTTAAATGATTTCTTAAAGGAGGTTAAATTATGTTTGGCTTTATACTTATGTTAATTGTCGGTGGCTTAATTGGCTGGATAGCTGGTGGCATCGTTGGTAAAGATATCCCAGGTGGGATTTTAGGTAACATTATTGCTGGTATCGTAGGTGCAGCAGTAGGTTCATGGATCTTTGGTGACTGGGGTTGGCACTTAGGTGGCATCGCAATCTTCCCAGCATTAATTGGTACAATTATTTTAGTTGCAGTCGTTTCATTCATTTTCGGTAAATTACGTAAAAAATAATCAACCATAATGAAACGCAATGATTTACTAAAATTAATATGGGGTAGCTCACAGAAGTCTAATTGAGATTTTGTGAGTACCAAAACTAAAGCGTCCGAGACATAACGATTGTCTCGGACGCTTACTTATTACGTTGCATTTTATAAATTTGCTATTTTTATTTTAATCAAGGAGTAATTAAAACTCATCTGCTTTTAATTAGTTCTTTTTTCTTTTTATCTTGTATTTTCGAAGACTTTCTACGCTCACTACTTCCTACATCATCATTGATATCTTGGGTGATATTTTGATGATTTGTTTCATCAGCACATTTGAAATTAGAAGCCTGTACAATATATTTTGGACGTTGCTTCACTTCGTAGTAAATACGTCCGATATATTCACCGACAATCCCTATTGAAATGAGTTGTATACCACCAAGTAATAATATAGCAGCAATTGTAGAGAAATAACCAGGTGTTTCAACGCCTTTGATCATAATACCTATCGATATATAACCGATATATAACAAACTAATAAAGAATACAATTAAACCGAGATAAATCATCGCACGTAAAGGTTTGTTATTGAATGAAATTAGACCATCAATGCCATAGTTTAATAATTTACTAAATGACCATTTAGATTCTCCATCCTCACGCTCAACATTTTCATAACTAAAGACTTTAGTATTGTAACCTATCCATTCATACAATCCTTTGGAAAATCTATTATATTCATCTAATTGAGTCAACGATTTTACGGCACGTTGGCTTAACAATCTAAAATCTCCGACGCCATCTTCTAATTTAATATCTTCTACAAAATGATTTATTAATTTATAATAAATTTTTGTCATCATTTTTCTAGATTGATTTTCACCCGTTCTGTCTCTTTTGGCTATAACTTGATCATAACCATCCATATACCCTTCTATCATTTGTGGTATTAATTCAGGTGGATGTTGCAAATCTGCATCAATCATAATGACGCCATCACAATTTTCACTATGTTGATATCCAGCAATCATTGCTGATTCTTTACCAAAATTGCGGCTAAAGGATATAAATTTAACATGTTTATCTTTCGTGGCCATCTCTTGAATATAATTAATGGTCTTATCTTTACTTCCGTCATCTACAAATAATAAATCATAGTCATAATGATGATTCTGACTATCTTTTGATAAAATTTCAGTCAATCGTTCATACGTTTTTACTATTACTTCACCTTCATTATAACAAGGTACTATAACTCTTATTTGCATATATAAACACCTTCATTTCAATTACTTCAATTTTTACTTTATCAATTCCCACCATCATTATGCTATATAAATCATTTAGATTTACATAATCTTTATATAGCCTTAATACTAAATATTAAAACTTAACTTTTAAGCGAAGATTTTTAAAAATGAATTAATTTTAAGATGATTTTTAAAAATACAAAATCATTCATTCATTGAATTTTTAATCAAAATGCTAATATTGACTGAAACATAAACTTATAAAAGTTATAAATTGTTACTTTAAGTCTATCAATTATTTCCATTATTTGAAAATAAAAACCATCAACACAATAAAGAAGAGACTATCTATTCAAAAATCAATTGAATACATAGTCTCGTTCAAAGTTATTTTAATGTCCCTATACGAACCTTATCAGGATCATTGCCTTGGCGCTCATCTTTATTTAAGCTATCAATTTCAGCAATATCAGTGAGTTCTAAACTAAAATCAAAGATATCATAATTTTCTTTAATACGTTCAGGCGTCTTAGACTTTGGAATCACTAATCTATTATGCGCTAGATGCCAACGTAGAACAATTTGAGCTGGTGTTTTATTATAACGTTCAGCTAATTTTGTAATAACATCATATTCAAGCAAGCCTCTATTTCTCATTAAGGGCATCCAAGCAGTAACTGCAATATCATGGCTATCACAATATTCTTGTAATGCTTGTTGATTGAAGTTAGGGTGCACTTCTATCTGGTTCACAGCAGGTACAACTTCAGTTGCTTCCATAAGCTTTTCTAAATGATGTTGATTAAAGTTACATACGCCAATAGCACGGATACGTCCCTCTTCATATAATTTCTCCATTGCTTTATAACTCTCAATAAATAATCCATCCGCTTCACATGGCCAATGTATTAAGAATAGATCTAAGTAATCAGTACCAAGGTTTTCAATAGATTTGGTAAAGAATTCAATCGTTCGATCATACCCTTGATAGTCATTCCATAATTTAGATGTAATAAATAGGTCTTCTCTAGGTACGTCTGATTTTTTCAATGCATTGCCTAATGCAATTTCATTTTTATAAAAATAAGCTGTATCAAATGCACGGTATCCTGCTCCTAACGCTGCTGTCACAGCTTGTTCCATCTCTTCCTCCGTAATTTTATAAACACCTAAACCAACTTTAGGCATTGGGTAACCATTATTTAAATAATATACGTCTTCTATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP031275|2193952:2201342|2199071_2200133_-|WP_069796239.1|DBSCAN-SWA MQIRVIVPCYNEGEVIVKTYERLTEILSKDSQNHHYDYDLLFVDDGSKDKTINYIQEMATKDKHVKFISFSRNFGKESAMIAGYQHSENCDGVIMIDADLQHPPELIPQMIEGYMDGYDQVIAKRDRTGENQSRKMMTKIYYKLINHFVEDIKLEDGVGDFRLLSQRAVKSLTQLDEYNRFSKGLYEWIGYNTKVFSYENVEREDGESKWSFSKLLNYGIDGLISFNNKPLRAMIYLGLIVFFISLLYIGYISIGIMIKGVETPGYFSTIAAILLLGGIQLISIGIVGEYIGRIYYEVKQRPKYIVQASNFKCADETNHQNITQDINDDVGSSERRKSSKIQDKKKKELIKSR >NZ_CP031275|2193952:2201342|2195078_2195672_-|WP_069793934.1|DBSCAN-SWA MILIIDNKDSFTYNIVDYIKQSYRGQVEVIDVEMVTNERIHLYKPNAIVISPGPGSPEDYPVLNEVIQTFSTQVPILGVCLGFQQIVTYFGGNIVKSDKPIHGHTTRIKHSGTGIFDGLPESFDVMRYHSLKAEQSSFPEALTVTATNHENIIMALEHKLLPIYGVQYHPESILSEYGLKQIQIFIDIVEAYHANTF >NZ_CP031275|2193952:2201342|2195927_2196599_+|WP_029377712.1|DBSCAN-SWA MTQQSLDNNKAIVVFSGGQDSTTCLFWAKKHFESVELVTFAYGQRHDTEIEVAKRIAEEQHVKHHILDMSLLSQLTPNALTQHDMEIEVGEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQTNTKNIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLSMDKDFVIHTPLMWLDKKATWALSDELGALDYIRYNTLTCYNGIVGEGCGECPACELRAHGLNTYLAEKGEN >NZ_CP031275|2193952:2201342|2196601_2197030_+|WP_042363122.1|DBSCAN-SWA MFQQNYPSVQHPYTFELNKDFNFSAAHYIPSEDAGKCMRTHGHTYFVNLTIVGDSLDHNGFLVNFSELKKLVHGQFDHHLLNDLPQFEGKSPSTEIVAQTIYEMVQTSLNQRSNQPKCVQVYVRETPTSYVVYRPKEQRNHE >NZ_CP031275|2193952:2201342|2197975_2198569_+|WP_042363123.1|DBSCAN-SWA MLINIIINIATVLIVLGIDLYRQNFKQLKFSSILIAITLNGIINLFLVGEYDYIAFYTITQLLIWTLLQLYLNRKLTAYKITDQKFIAVILTIIMSTSLILTYSTSHDSYYMSIPYLAPAIFLIGAILLFYSTFQPKEKEQLKLLQRIKHPILIGQICMIGALTIMMLLTPYWYAFIIVHLLFIFFLLWQNIFFSHK >NZ_CP031275|2193952:2201342|2197022_2197739_+|WP_107542961.1|DBSCAN-SWA MSKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSSFTWDGSAKEDIRMMTAEEIYNALYEIAGDSFNHVTISGGNPALIKGIQQLVDLFDEKHIQSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSKMKPNLPILDEVIEQCVPKSLNLKVVIFDDEDYEFAKKIHHRYPDIPFYLQVGNPYLDGEYVESHTKKLLTLYETLVDRVMVSSDMNNVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP031275|2193952:2201342|2200502_2201342_-|WP_107537878.1|DBSCAN-SWA MIEDVYYLNNGYPMPKVGLGVYKITEEEMEQAVTAALGAGYRAFDTAYFYKNEIALGNALKKSDVPREDLFITSKLWNDYQGYDRTIEFFTKSIENLGTDYLDLFLIHWPCEADGLFIESYKAMEKLYEEGRIRAIGVCNFNQHHLEKLMEATEVVPAVNQIEVHPNFNQQALQEYCDSHDIAVTAWMPLMRNRGLLEYDVITKLAERYNKTPAQIVLRWHLAHNRLVIPKSKTPERIKENYDIFDFSLELTDIAEIDSLNKDERQGNDPDKVRIGTLK >NZ_CP031275|2193952:2201342|2198632_2198887_+|WP_042363124.1|DBSCAN-SWA MFGFILMLIVGGLIGWIAGGIVGKDIPGGILGNIIAGIVGAAVGSWIFGDWGWHLGGIAIFPALIGTIILVAVVSFIFGKLRKK >NZ_CP031275|2193952:2201342|2193952_2195095_-|WP_107542960.1|DBSCAN-SWA MQIHFNYCYITDETTHETHRYLFTHCIAKKIAYSIEEVGDVVCFAESYQNDGYYVAIYLPYEAATYFNKDMATVPTDEGYVYAAAYVFENTSETENDLEDKTYQQQCNFQFQLNRAELIKHIRTIQSAIVEGNTYQVNYTTRLVDSIHHSIVTLYYHLLNDNHGFYSALIETDELQVASLSPELFFQRGPFKAGEDVLLSKPMKGTMPRGSNETEDKQNLNTLSRSSKDRAENVMIVDLLRNDMSRIAKTGTVKVYKPFHIEPYRTVFQMTSMITATLRKDTDLNQILSALFPCGSITGAPKLNTMKYITALEQTPRNIYCGAIGLLLPNGKSIFNVPIRTIQYLDNQAIYGVGAGITIDSQPEQEVQEFIDKTKILERL |
9 | Pandoravirus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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