Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP034597 | Mycoplasma hyopneumoniae strain F7.2C chromosome, complete genome | 1 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP034597_1 | 857833-857942 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP034597_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP034597_1
>1.1|857859|58|NZ_CP034597|CRISPRCasFinder GGTAAAAGAACAAGAAAAATCTGAGACTAAAAAGGTAGTTCCTATAAAAAAGCCAGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP034597_1
The CRISPR arrays of NZ_CP034597_1 >merge|NZ_CP034597|1|857833-857942|CRISPRCasFinder AAAATTGAAAAAATTGAAATTAAAACGGTAAAAGAACAAGAAAAATCTGAGACTAAAAAGGTAGTTCCTATAAAAAAGCCAGAAAAAGTTGAAAAAATTGAAATTAAAAC >NZ_CP034597|1|1|857833-857942|CRISPRCasFinder AAAATTGAAAAAATTGAAATTAAAAC GGTAAAAGAACAAGAAAAATCTGAGACTAAAAAGGTAGTTCCTATAAAAAAGCCAGAA AAAGTTGAAAAAATTGAAATTAAAAC
>NZ_CP034597.1|WP_146379762.1|856564_857602_+|M24-family-metallopeptidase MNRKYLEKAFFDNHLDVIISFSFQSRLWLTKIAASDGILFIEKDQAFLFVDGRYIEKAEKDAKNCQVFLTTKANLEDFFKKKPYQKIGIESEYLTIEQFDKIKSWFPNADFVKLQAQLFRIIKTEEEIKNIEKAVEISLAAYNKIFPKIKPGMTEKSIDVNLNYQMKLLGAEKESFDSIIATGSNSAMPHWRASETEILDNDLLKIDFGALFNGYCADITRTSYLGQISEKKLEILEIVKKTAEIGRKKVAPGVKACEIDLACRNFITEQGYGKYFIHSTGHGVGIDIHELPVVSSTSQTILEPGMVITVEPGIYIPGLGGARIEDVVLVTENGFRTLSRKSEKI >NZ_CP034597.1|WP_011206510.1|856410_856563_+|50S-ribosomal-protein-L33 MAREGLTLRCTDCKMENYITKKNKKTKPEKIEVKKHCHKCNKHTLHREKK >NZ_CP034597.1|WP_146379761.1|853349_856289_+|AAA-family-ATPase MKLIKIEIEGFKSFAEPVSIKFDGSIVGIIGPNGSGKSNINDAIKWVLGEKSVKQLRGQNMDDVIFAGSKTVMPVNKAMVKLTFLDETREDSAQIFTISRVIKRGQGTNEYFYNDQLVRYKDIRNLAIQAGISKSSLAIISQGTISEIAESSPEQRKQVIEEVAGTAKYKIDKTEALTKLDQTLIAIEKIEIRTKELEKQVKQLEKQAENAKIYLEKSKQLESVEVGLIVSDIKKYQTELDQVQEKLNDLKFQEPKFISEIEANEKIIITNTQKRSEIEAEINTKNREIHRLKEQINTLNLAYAKATQLQEMILSSEISVNFEQKMAALRQKYSLISAQKDNFAKLISQNKLKKLEIEEKLNTFRTQKGEIERNLYSLNSEKIISQTRISELKKSLESMSFLPKGTKIIIENSFLFPGYCGLVSDLIKIFPKYTGAIEAALGPTLKQIVVDQPETAVSAINFLKKNYAGSATFIPLSTLKPRFIPDLYLEHLNSQKGFINLASNLVDFEKKYKILADFLLGGIIVADTIDSANQIANFLNHKNMIVTLDGDVIRTSGIISGGHKIKNDSSFSIQYKIDELTNNLNFFEEKIQEFKVKSNEFEQLITRESVFLQQININLNDLEQKFSNSENELIEIKAQNEGLEESLNQKDDLNLSLNRTLKEKIELENVVLELENQCKILKTEKKQLDNQISELTVLVQELNQKQRKINADLNQNQNYKDKYEFLITNLRNNLSQKYSLTFEGAAQKYELEIQEKDAREFVNSLNLEIKALGNVNLDAINDFETTSQRLEKLKKSQNELETARSKILEVISDLDKIIIGKTQEIVDLVNSEFNLVFQNMFGGGSAKIYFSDKNDILNSGIEISAQPPGKTIKNIRLFSGGEKAIIAISLLFSIIKARPIPLCILDEVEAALDESNVIRYVEFLKQLKQKTQFLIITHRHGTMSRVDQLLGITMQKRGVSSIFSVELSKAKDLLKEQLQ >NZ_CP034597.1|WP_146379760.1|851268_853152_+|SGNH/GDSL-hydrolase-family-protein MKKKARKFLRLTSLTLAPFSVFTTLISAGCLQKNSLLSEVNYLALGDSLTAGFNEETYRDFQGTLDKDGNLSGQSYPAYFAYYLQKLNKNSLVSYDNLAISGTTTENWLYLLNPTKYPNGKMSDNPLVTNYSGNEKYNEIGSVFGDFNKDSYPGLVEKVKKANLLTMSVGANDPFLAIFNEFKKWASIIKPKSEEAKKLLDPNERANFLAEKGMLLKAEVNKKIEEINTNLDNLIKELKALNPKLSINLIGYKLPNSGFIKILKYLLYTYAKIETDFINEIPEKINKIIRETTIKNKVNYIDVYDKSIWNDSDKNLMAKNFDFHPSIQGYKKIAHQLLLKLTLDQEEKDDSNADELKNTTNFDDFDENKPTYSKVIDLSVFAKSNKEFLEKLNENKQTSEFIAQKSTFDTDQEAAIKDDKRTFGNIVREIVSLPIFDNFDFRELIPVKNPFVKAIINSYLGKPAGSLIKDIEQLENKVKDYARPNIKIFDTIIDSFIRKMVAFFAELNTDQEIKEFKMSPQILFLTLRNAILSPFDLTKLKDSATFKILMNLKPEQILTLLGLGKTPSVPKPEKPKDQGSMPQTDTSSQKQESGTGSTDSTKATTENQKPAEQTNSSEQSSTEPKSN >NZ_CP034597.1|WP_041361711.1|850522_851131_+|16S-rRNA-(guanine(527)-N(7))-methyltransferase-RsmG MYKRLVQEFLPKLDFENLEKYVNLIEFSNKNFNLTAFSGDILWKEGIFESIFTMNFIVGLVNNKENKKLKILDIGAGSGFPSIPFLITNPEIELTISESMQKRCQFLKDISEKLDLKFNLICKPVQEIDPQKFDIITARAVANLEKLEKITKKIHFPKTLLAFIKGPKVFNEVQNCKNCNYKIIKVNNNINKKIFIAFKQVS >NZ_CP034597.1|WP_020835917.1|849507_850500_+|ribose-phosphate-pyrophosphokinase MNIDAKKNIILFGMENSLDLAKKISKITGIPLSGIERIVYADGEVLLKSKETIRNSTVFVVANTSRPVNENIMELLIFIDSLKRGYAQEIIVILSYYGYARQDRKSSGRQPITAKLVANLLEKAGLTKLILVDIHNPSIQGFFDFSVDEIHGQYILANELVGKNKDYVVVSPDHGGAVRARILAEILGKQTNVAVIDKRRTGANKSEVLGLIGDVDGKDCIIIDDIIDTGGTIINAANVVREKGAKSVVLAATHGVFSHGFEKFQENPNIDKVIITDSIDNKKLAKKFPKLLITSLAEFLSKSILACIFSTSITSIYEETKQKLIKKNLN >NZ_CP034597.1|WP_146379759.1|848164_849412_-|TatD-family-deoxyribonuclease MYLKIQQFLPRYLELFQKTIKEFNLELNVVTKKGKNKISNFAYYQNFEKNYEFLVVDEHKQADFIFAFFVLSRKGQTFYLNLPFFSQFLDKNWINIIGEFILDFIEENYHFETFYVQISNLDTKINNFFQKFAISFDGNSNTFKFNLVKRYEFIDIHCHPFSEYFQDSKAQVDNWFKKNIGLIFVVGTSWEYLEEIKKIGNYSKKIYKIIGIHPTLVAENDNFSLLENHIDDKVLAIGEVGLDFYYENNPPKEVQIKALLGQIQIAKSKKIPVMLHIRDKSGENQAMKLISEIVTKFSEINFIFHNFSTNYEIFQKLVKKNNCFFSFSGVITFKKSIELRRIIKETPLEKIFTETDVPYLSPEPNRQLWPNVSPQIQWTYQTIANLKNLTKIELSEIIYRNVRKIFKVKNAKTGS >NZ_CP034597.1|WP_020835915.1|847404_848184_-|16S-rRNA-(adenine(1518)-N(6)/adenine(1519)-N(6))--dimethyltransferase-RsmA MQKPVPKKHLGQNFLKDRKIAEKIVENIDLKNKEIIEIGCGTGFLTNFLLERAKFVTCYEIDRNLIPILEKKFKNKNLRIINEDFLLAELEFKEKKTIIANLPYYITSKILFKIFANFEKFDKIILMVQNEVADRIVAKPKTPTYSKLSLASQYIADVKKLFVVGPDSFFPKPKVNSAVVLFDFRENLEAKKMEEFFWFTKKCFQFKRKTLYNNLIFFLNKQQIEKIYNFFQFAQNIRPQQLDLVTYIRLADFYFNNIF >NZ_CP034597.1|WP_146379758.1|846837_847272_-|50S-ribosomal-protein-L13 MRQTTFVKHQEVKQKWFVIDAESKILGRLAAFVASRLRGKHYPHFTPNVDMGDKIIIINAEKILLTAKKEEQKLYYNHSGYPGGLRVRTAREMRAKKPIALLERAIYGMIPHTKLGDRQRKNLYVYSGSEHPHLGQNPEKLEVK >NZ_CP034597.1|WP_146379757.1|846435_846834_-|30S-ribosomal-protein-S9 MNQPELSYYGTGRRKSSVARVTLKHGNGQFKINNRVAKEYLKSDILIKDALQPLSITNTVSEFNIRVNAHGGGISGQAGAIRLGIARALLKVSADYRPGLKFAGMLTRDARAKERKKFGLRKARRARQFSKR >NZ_CP034597.1|WP_146379764.1|859404_860970_+|LppA-family-lipoprotein MKSKKTKKYIFLLLNPLALLFLSASCSNTVPATTKISKDQKEDKGTIRKEVENPKKSEEKPSTEKSEDSTKKSASSEEKIEENPKNKPVEKKDEIAKQKDEISKPKGENPQPELAKPQAEDDHQVEKIDIKPFNPKEDQKDDDIKLARLKGYLSTLPNTLYVTTSLQNYLPLTIIHSGKGEKKDFGYVNFVKPIQDFNDTEYEAKLDFSDAQQKENKIKNPIENVGLVLSLKDNKKITSSKKIRLLYTEEQENKSHLKAKSLPESFKHIFPSFLAFALLNKEKEVISLPFFNESGYVLNNQNFGAGLKSIFAEFNNSENNNQKDKFGFDVVSAQPDDEKGELKLNFQLWKINETNGDQKEIFPKIESLTFSNLAKNSDNNYEIKLDEATTNTNLSNEDFGLKNAGENLNTSKFKKNEFIKKIIDNIRVNIKTENINNKWLKVSEAKYKNWLIFPQIQYANLDSTKLINNLKLEKQQENKISWTLNLESYLLDNNQILTPDSDFIFGEQKKTITIKGEMQLS >NZ_CP034597.1|WP_146379492.1|861458_863117_-|IS1634-family-transposase MKKHNLILFNVWGSSKDKIYKYVGWTQGYGKAPKRWFSIGNVQTLEKINPNAIQIIKEKLKLFSNLDDKDKIKTTLLDSLKNSAIIEGSVFIGGELIEKLIEKHNIFESLPKSRHKNMRQIFNYLISKRITDPGSIINAFDKKDDYSNQINTSKNSFYRLLDLVYESQNQLLDSLNKMVISELGKRDNEFYFDSSTVYFETFERNGLRIPGYSKDAKFKEDQIVIALACDKNGIPFHIKVFKGNTADSSTLIPFVLDIESKYNIKNMTIIADRGMSTAANIRFLESKEYNFIISYRAKIGSQKFKNYLLDPSDYVDLNTDFKYKKEEFYSSYKNKRYTENIRRRIITYSKKRAIKDSKAREEQIQSFIKKQNKDGFIEVNKLFGKKPKYFREISNMKFELDQSKIDKDKQFDGYYVYETNILNLNVLDIVEKYQKQWNIEANFRSLKGLLNIRPVFLRIDEHILAHTFLCFISLVILKTIIFKINKHISDNKLFANSQLTEVGLVTMLQKLRQRVEFNTLDQQMIFKNRDGVPSDPNIWNRYDFYFDILINQ >NZ_CP034597.1|WP_146379765.1|863440_867073_-|hypothetical-protein MNQFDEKEKQHNKAKAILSTGFSVTSIATTVVAVPIGLTIFEKSFSSQVSGGVDKNKVVDLKSDSDLIFSEEDFIRAVENLKLFDKYRHLTARMALGLAREAANAFNFLDTYDYTPITKHSFKISLDISDAFAANKEVKAVVVSAYSQKYQVTYSRLTSLKGWKEEDDFGDDIIDYQINQELSGLSLSSLAPESAHLLASEMAFRLDNDFQVAYKKTGSRAEAFRQALIKNYLGYNLVNRQGLPTMLQKGYVLAPKTIENKNASEEKLVNINENDRARVNKLQKVENLAFKNLSDPNGTLSITFELWDPNGKLVSEYDFKIKGIKKLDFDLKKQEEKVLQKVTEFVEIKPYVQLGLIRDNLSLSEIIYKNDNNPEYLRKILAKLKEHNNNKSVDNNTSTTKFQEEDLKSDPNSNGSEQDSFEKAKENFLSFFDLRSRLIPIPDLPLYYLKVNSINFDRNIEENEKEKLLKNEQVVLKVDFSLKKVVSDIRAPYLVSSQVRSNYPPVLKASLAKIGKGSNSKVVLLDLGNLSSRFKVQLDYSAKQREIINTLLKENPEREKELQAKIESKTFSPIDLNNDDLLAIEFQYEDNPEGDWITLGRMEKLVKEVIQYKKEGKTFLDDEVAKTLYYLDFHHLPQSKKDLEEYKEKHKNKFISEIKPATPASQAKTSQAKNEKEVKPESAQAEASSSNSSDSSSKTTSSSSMMAGTTQTDNKSTETTNSNSTTTSSATTSTTSTTNSTSTTTTSTQAATTSASSAKVKTTKFQEQVKEQEQKQEKAKETNQLSDTKRNKEDSGLGLILWDFLVNSKYKILPGTSWDFHVEPDSFNDRLKITAILKENTSQAKSNPDSKNLTSLSRNLIIKGVMANKYIDYLVQEDPVLLVDYTRRNQIKTEREGQLIWSQLASPQMASPETSPEKNKLEITEEGLRVKKGGTKIKETRKSTTTGRGNTNTNSKPNKKLVLLKGSIKNPGTKKEWILVGSGNKNNNSGGSNNSNTQIWITRLGTSVGSLKTEGETVLGISNNNSQGEVLWTTIKSKLENENQSDNNQIQYSPSTHSLTTNSRSNTQQSGRNQIKITNTQRKTTTSPAQNPSQNPDPNQIDVRLGLLVQDKKLHLWWIANDSSDKPEHITIDFAEGTKFNYDDLNYVGGLLKNTTNNTNTQTQDDEGDGYLALKGLGIYEFPDDESIDQAATVEKAERLYKHFMGLFRE >NZ_CP034597.1|WP_146379766.1|867101_871049_-|oxidoreductase MAKNNKNSLLVTATAIVGVAVFATTVGLVTRIRYKGENPRAELESLVSKVQNVAFKSDVFDNSTTYKQIKALLFDETGKLRPGIDLNKFISFYTAVNSKIQKFEVTFAPNKPFFEFINLIPDDKNQTFTLQFRAKHQLDNNYTAYSSILSKKIAYAQRSQFALADFNANHRKITKSFQTNIQNLRETDFSVDFSSSQTSLASQKIPFLTRVEDFAADINKSGNQEEAISRISKYFPDFQRYIHELKDDPNNVLPFKKGKIFDFSITRRAGTNDFISLSANSEPSFLIKARLTNEAKFELRGLNIEEAEMLEEIKLVPVDQFVVNLETDLKPGQAPEKSQKPQSEQTEIKKTYFAEIDKILSKITMRKLQLSDFKVAPQTSSSQPKQVKASVSAWSNLDQGQENRILVPVSQQSSNSQQQQQQQQQPQQPQPQSQPQAQTQPKAQTQSSPKAPVQKPATPDPSKSFKIRTKRARDFLKEFNKTFYRSNKLKSQKLEEKINSEYLSNKIGIDLGVLKKYISNNQGIEYTFDVANAKIGDAQDGITSHIEIPVTISLWSSFFGDSDNVLLKSKTETFIIPYFQKETTSESKDQKVGHTQKELDLNQKLVYQLSELPGTSIQGSSGSSAQTEQIKEVKLPTLTAFISKQELEALIDGDKNLASQPASQTVSVSQEVKTTEFQQQEANSTNSSPASPTSPSPSPSSASPASPSPASPSSPKNVDENIGVPNPRFEEIKKIISSEFTYKYNFRANEALLDAWVGKQNFPSLKDISQFRSDQRLANDYKLVNLKSNKFLKEDYDVLAFYANLVQKDPREVLQYLFEIAKANNLIGPEEKLDLNQIEEDGIFRRAKAIKLIDKSNNNQGIYGFSFNNQFLKFHERGWMSTLYLPNEAKTKLADYQSLLSAGISDTKIFSELNKIQPLDLNIKVQSTNSSDSSDSNTTAANQDLQSKLTNLKSQIEAIVKKYESESKNYLGTENGNNGSSSSGEQKGSSIPEENKKFILENTAKLDNLADLLLAFYYQAKRLNFASWSQLQDEDLDYQIQFEKEANTTESSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSETDTNKPENAVEYKLTYYYKIYNKTTKKVVYTTPKTIIKLYLASSNIGVKEKQERELMNKLVLSIPSAYSIFYLKQNEWDQVITNNGQQMGQTGSSQGFESLEPFKKIQEIVHKNNKDYDLKVVTIRDDAYAENAKIVHLRVVRKEEQQAEQKEKEKEKEKEKEQKETSSQGQAPQSAFFFQVRLIKDDYQEAEASSQQTSKQEMQMPNMESQNSGSSSSAPAAAAAKAAK >NZ_CP034597.1|WP_146379767.1|871571_873170_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MRFNRLFSLAKLKFTIIFLVIFIKEAGFLTHIFSYKFIFEYFTEKNPTFNLTWSLILLLMPLAIFIIFTFLKGWIFSYLEMEVRNKLSDIIIKKIQKSNYSDLKYNKNAMLSWFNYDLKLGLNAIENLLNIISPLVSIITGISLMIVLSPQWGWILIVTTLILSLILLIFQGKISNAASKPVMKLSSDSEAFSNYNLGLLNSFKSFFFHNKNEKFKQLFYKSYENLSKDQIKQYKKLTKLNVILTVLFSISIVIVLTELAVLTSFKFYSLAIFLSLLLYSNRFSTDMGNIVLGLFGYKQSSVLLDKILEKKNLTEQKTVLEEPINKIDFENVSFSYKDIKVLENFNFSFEKNKKYLVSAPNGTGKSTLIKLISGVYDNYLGKILINDSYDQKELDQKYLRKQIGFIDNQNLIFESSLKNNITLFDENPDYKKLNSILKSLKIEFDIEEEISASKLSEGQKQKIAFARLKYSPIKFWLIDEAFDNIQKEYSQILISQLLENPEFTVVFISHHISEWQKLKFDQIIELEEKKYE >NZ_CP034597.1|WP_146379797.1|873327_874776_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MISSFLSVIHNSLLTRIFGQAGALKLIKEKMQIFSNLTYKEYVKNTPGNYFSLFFNEGFNNGESFFAFLFHIISLIFPITAILGTIFYINPIIGAVIIGLTLIWITFPVFFRKFFSRKIAERLNLLENFNGEFSEKLNKFEAFLFFGKINLLKNFLSPTGKNASIGQKSYRFWNEFNANINLSIRKLFLILTDLAIILLGIYYENSVQTVIVLVTINSANQMFINDFNTFIVTLTNYLSFKTQFKNSKLNEKSEKNILNFQDFNEKIEKINIKNLSFNYQNNQVLKNVNLEIKKGKKYLLQGDNGTGKSTFLKILMGIEREYEGKINFNSRELKTISDQNIIENIAYIDNNPVLIPGNLAENISFYSDYDSKKIDELIELIDLSELKSKNLLTLDEKTDLSMGQKQLVNFASYFAEGKPIIILDEAFSNLDKKNLENLVSFLLDQQVTLLFILHNLDQELVAKFDFCLNFSENQIFLQPVTD >NZ_CP034597.1|WP_011290440.1|880548_881163_+|hypothetical-protein MQNWKIILLATGISALITSFVSIFWTRYRKNQLIKKYTSESEGEKIEKFPNLKEQVLELKSEIWLFESLEVVLYKISKEDYRKNLFLENDGLVACLIQKNIENTANTVAVEYLNQEKFDKNLEKLAVSGLNFASFFEPFFDFILISVKIEITEILKFLKILKTDGILIWKYQKNQRRKILRYLKSQKIVFDEYFYYDFLLIKKK >NZ_CP034597.1|WP_011284387.1|881202_881685_+|transcription-elongation-factor-GreA MKNIVDDKILLTQQKLEEIEKELEHLINVERVNVIQEIKDARSQGDLSENAEYDVAREKQGIIESRIRELETIISKAKIIKADLGSSRVSIGSKVSLENVESGEIQTFQIVSSIDADPFKSKISNFSPIAQALLGQHQGDEVEVDVNEKYSVRILEVINE >NZ_CP034597.1|WP_146379768.1|881684_883247_+|MATE-family-efflux-transporter MRLSVRQFFPDSAEKWKKFAKIVIPVIFATLFISINNFIDNFMVSQISGGITAVGIANVWTAIIFSFIVSINSIGSIIFSQYWGKKQRKLARQVNNIRYILAVTTVLIFAIFAWIIPDQMLSAVQRNKNLTNLDKNIFEEAKSYLFIIAFSWILFAYIVTSSAILREIGIMKIALFFTLLTLISNVSLNLVLIPKMGVAGSALATVISRCISAILMTFYIFFYKKEIRISILKLFKIEKKIWKQYFRRFFGMNLVIITSLIISIRSILWAQSLPPGSIGSDDGTGFYKYWGIGFLTISGIVMTIVNILLATFTSIQTSVSIVVSRNLGQDKIEKARKNAAMLKGFLFIVSLAMSILALIVVIIITKTNLITKGLEIQVQKGMENYFTEHNLAINLEIIQKQQGLATNFYLSQIFWICLLIVFLNPIWVQINSSLNIIQAGGRANFASLCDFFIGISQFLWQLLVIFVFLPLLKDVKTKLFFSMLIFYFSDIIKWIIYEILYLKTNWAINLTLEKTAKKIL >NZ_CP034597.1|WP_011290443.1|883327_884293_+|ECF-transporter-S-component MPRLTNMKISFVAIFISIAVIMLIIGVRLAPFAILPNFRLSIIGLPIKITGFIFGPIVGFLTGLLADLITFLFIPGVYSWYYTLHLSLAGFIPGIFFWFFVIKGKKWFEKKSILTRLDQKIFEQKQKIFDFTYYRIANNQKDENLERKMKQKLLFLQKKVKKVESWQEEKSLLNFYWIASNLILISIVITTIYVVMFSSSIDFSQSRFISSKLSFLILTLFGTVSMIIFLLLARFINFFRKNERYLTIAPIVVFSALHEPIASIIGARGDVQSGALNNFDTAFLSHIIVSPVKIWINLSVIYFTAKAVVPLVYKKFSYSIT |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
319289 : 329927
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP034597|319289:329927|DBSCAN-SWA TGTGGAAATAAGAAAAGATTATATTGCTTTCTATCGGAAATATCGGCCAAAAAAATTTTCTGATATTGTCGGTCAAAAATTTTTGCTTGAAAGTTTAAAAAATATCATCAAATCAGGTAATTTTTTTCATGCCTACCTTTTTTCAGGACCTCATGGCACTGGAAAGACAACAGTTGCAAAAATTTTTGCAAACGCTATAAATTGCACCCACAAAACGGATTTAATTGAACCTTGTCAAAACTGCATTAAAAATTTTAATAATTCACTTGATATTATTGAAATGGATGCCGCATCGCATAATGGCGTGAAGGAAATTAGAGAAATTATCGAAAATTCAATCAATTTTCCCCAAATTAGCCCCTATAAAATTTATATTTTAGATGAAGTTCATATGCTTTCAACTTCTGCTTTTAATGCTTTTTTAAAAACCTTAGAAGAACCACCAAAACATATGATTTTTATTCTAGCAACAACAGAAGTCCACAAAATTCCTTTAACAATTCTCTCCCGTGTCCAAAGGTATAATTTTCTAGCGCTAAAAGAAGACGAAATTTGTCACCGATTAGAATTTATTCTTGAAAAAGAAAAAATAAAATACGAAAAAAATGCTTTAAAATCAGTCTTTTTATTAAGTCAGGGTAGTCTTCGCGATGCAATTTCAATTCTAGAGCAAGTAGCAACATTTGGATCAGGGTATGTTAATCAAAAAAATATTAATGAACTTTTTGGTCTAGTAAATAAGGAAATTCTTGTCAATTTTGTTAATGCCTTATTTTTAGCTGATTCTAAAATTTCTTATGAAATTTTAGAACAAATTTCATTTCAAAGTAAAAATTTCCAATTATTTTTAGAATCATTAATTAACCTTGTAAAAGAATGAATTATTTGAAAGTCAACCAAAACAAATGAACTACTTGAATTTTATAGCAATTTTGATTTAGAAAATCTAAAAATAAGCCAGGATTTTGCTTTTAAATTTTTAGAAATTGCATTTTCAAGTCTAAAAGATATAAATTTTGCTGATTTCCAAAATTTAACTCTTGAAATTTTTATTATGCGCATATTATCGCTAAGTAATTTAGAAATTAGTGATCAAAATAATATTAAATTTAAAAAATTAGAAGAAAATAAAGTCGATAAAAGTGATATCCCCGAAAAAATTACTGAGAAAGTTAGTGAGATTAAGTCTAGCCCTACTAATTTTTATAAAATTGAGGATCGACTTGAAAAGTTAGGAAAATTGGATCTAAAAAATTTAGAAGAAGATATGCAAACAAAGCAAAATAAAAACTATTCATCAATTTTTAATCGAAAATTAGAACAAAATTTGGAAAAATCACCTTTAAAAACAGGGGTTTTTTCCAAATCAACAACTGAATTTAACCAATTTGGACAAATAGGTAATCCATTTATTGAAACTGAAAATCATAAAAAAATTGAAAATCAAAATCTGAAAAATAATGGTGAATTTGATGGTGAAATTGATTTTTCTAATTCTTTTATGCCTAAAAATGGTACTAAAATTGATGAAAATATAAATTCTGTGTCTGATTTTAGTGATATTTCGGCTAATTTATCAGAAAATAAGACAAATTTTGCCCAATCCTTTAATAACAAGGATACTAATTTAATAAATTTAGATACAAATTTTGGTAATAATTCTAGTAAATTTTTAAAAAAAATTGATTCAAAAGACTATTTGAGTGCTGAAGAAGTTTTGAATTTTATATGATTAGGTAAAAATTTTCGTAGTCAAAATCAGGTGGAATATGAAAATTTAGTTCAAAATTGAAAAAAAAATTTGCCACTTTTCGAGTATAATGTTGAATTTATGGAAATTGTTAGCGTTTTAAAATATGCTAAAATTCTCTCATTAGGTGCAAATTTTGTTTTTTTTATGGCCGATCGTGATGAATATGAAGATTTATTAATTGAAACTATAAAGGAAAAATATCAAGTCAATGAGTTATTATTACAAATTTTTAACGTGGAAATGCATCCATTAGTTGCAAGCAAAAACCTTATTAATAAAACTAAAATTTTGCCTAACAAAATGCGGAATGAGGGCAAACGAATTGTTGCAAAACCTTTTGAAATCCCCAAAAAAACGACTATTTCAAAGGAGGATTTGGAAAAACTTTTGTTTGATAAGTAAAATTTCTAATAAATTTATATAATTTATTTTTGTAATTTTTAAAATTATCGAAAGGACCAATTATGAATTTTCAAAAATTATTAAAACAAGCACAAAAAATCCAAAAAGATCAAAAAGTTAAAAAAAATGCACTTGCAAAAATGGACTTTGACTTTGAAAATCAAGGAATTTCATTAACAATTACCGGTGATTTTGAACTAAAAAAAATAAAAATTTCACCAATTTTAGTAGATAAAGACGATATTGAAACATTAGAAGATTTACTATCAATTACATTAAATCAAGCATTATTGAAAATTAAAGAAGAAAACGAAAAAATAAGCGATTATCCAAATCAAGTTTAATTATGATCAAAGAAACATTTAAAAATCTTGCTGAGGATCTAAGAAAAATCCCGGGAATTTCCAAAAAACAAGCAATGCGAATTTTGTCTTTTTTGGTTGATGTTCCAATTGAAAAAGTTGAAAATTTTGTTAGAGCAATTTATGATTTAAAAAAAAACACACAATATTGTGAAAAATGTGGGTATTTAAATACTAATCCAGTTTGTGAAATATGCCTTGATTTCCAACGGTCTTTTAAAATTTTAGTAGTTGAAAATACCGAAATGATTGCTAAATTTGAAGAATATGGAAAATATGATGGTCAATATTTTGTTTTTGGTAAATATGATATTAAAAATTTAGAAAATCATAATGCCCAAATTAAAAAATTAGCTGATTTAGCCGCTAATAAAAGTGAGATAATTCTTGGTTTATCTTCGACAATGGAGGGACTGATTTTTGCAAATTATCTCGCAAAACACGAGTTTTTATCCGGCCTTAAAATTACTCGGCTTGCAACTGGAATTCCATTTGGAGCAATAATTGATTATATCGATAATATCACCTTAGATCAAGCGCTTAAAAATCGACAAGAAATGGAAAAATAAATATGTTTATTAGTTTTGAAGGAATTGATGCAAGCGGAAAATCAACCGTGATGGACTTATTTGCAAAGTATTTAAAAATCAAATTTCCCGAAAGAGAGATTGTTACTACTTTTGAACCAGGAGGCAAAAATTTAAAAGAGGCGCTGCTGATCCGTGAATTTTTACTAAGTAAAAATAATCAAATCAGCCCTTATGTGGAAATGCTTTTATTTGCAACCGCAAGACGAATTCATCTAGAAAGACTAATTTGGCCCGCACTAAAAGCAGGAAAAATTGTTCTTTGTGATCGCTATATTGATTCCTCGATTGCCTATCAAGGTTTTGGAAATGGTCTTGATATTGATTTAGTTACTAGTTTAAATAGTTTAATATCTGAGAATACTTTTCCTGATTTGACAATTTTTTTAGATATTAAAATTTCAAAAGCCTTTGAAAGAATGGGCATTTTTCGCGATCATAATCGTGATCGCCTGGAGAATAAAGGTGTTGAATTCTATGAAAAGGTGATTAATGGTTATGAATTTTTGGCTAAAAAAAATAAAAATTTTTTTAAAATTGATGGAAATGGTACTTATGATGAAGTTTTAGACCTCATAATTGATTTTTTTGAGAAATATTATGCTAGCTGACCAAAATAATTGAAGTAGTTTTCTTTATAATCTTGATAAAAACGGTAAAATTCCTCATGCCATTTTACTAATTTCAAATTATCCTAACTTATTAGATAGTAAAATTAACGAGTTTCTTGAAATTTTTGAGCATAAATACGAAATTTTCCTATATGATATTTTCGATAAAAATCTTTCAAAACAAGAATTTCTTGAAGATATTAATAAATTATATTTTAGCACTTTTGCAGATTCTCAGTCAAAAATTTTCATCCTAAAAAATATTGAAAAAACACATATATCCTTGTTAAATTCGCTTTTGAAAATTCTTGAAGATCCACCAAAGTCGACTTATTTTTTATTAATTGCCAAGTCACAAAATTTAGTTATTCCAACAATTGTTTCGCGTTGTCAAGTTTTTTGATTTACTGAATTTGACCGCCAAAAAGATCTTAAAAAAAAATTAGATCAGTGGAAAAAAACGCCATACAATTCGGTTTATGCAAAAATTTTTTCAAATTTTGAAACTGCAATTACTTCAATTGCGAAAATTAGTGAAAATGATTTGGTAAAATTTGAGTCCTTATTTAATAATCTGGCTAAAAAAAAATTTGAATTTTTAATTTTTCTGAATAACATTTTAACAAAAGAAAATGCGCTGATTTTGGTTAAAATGTTAATTTTTTATTCTAAATCAATTTTTTTGAATAAACCGGAAAAAAATTCAAAAAATTCAAAAAAAGAAACATTTATGCCAGAAAATTTCAAAAAAATAACTAAAGTAATGCAATCCTCACACAAATTTTTAACTACCTTAGATCAGAACGAAAATTTTAATGTTCAAAAATCCGCATTTTTAGTGCGGTTGAACATTATTTTATAAAAAATGTCAGCAAAAATTACTGTTTTAGCCACCCCAATTGGAAATTTAAAGGACATCAGTCTCCGCGGAATTGAGGCCTTACGTGAAGCCGAGCTAATTTTATGTGAGGATTCACGGGTTTCGCGAAAATTATTAAATTTTTTAGAAATTTATGATAAAAAACTTATTTCTTATCATAAATTTAACGAAAATTCTGTTATTTCAAAAATTTCGCCGTTAATTTTTTCGGGAAAGAATGTCTTATTAATTTCAGATGCAGGTTCTCCCTTAGTTAGTGATCCAGGGCAATTTTTAATAAATTGAGCACATAAAAATGAAATTGATGTTGATTTTTTGCCAGGACCTTGCGCATTTGTTTCTGCTTTTGTCCTTTCCGGTTTTGATTCACCTCTGATTTTTATGGGTTTTTTTAATTCACGAAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP034597|319289:329927|326882_327845_+|WP_011205952.1|DBSCAN-SWA MQISVAKYVAQNTIIHKMDPRLKIAFNILFAVLFFVTSHLITILILLFAALVFFYITTKKIKQIFTLMKLPLIIFLIMIIIYGFIIDQKNINIILGITAPDKAPQYRVLGLNEQQTNDFISWYLVKPTVLFSNLKFSIGTVSIIRSFVLAIRIYAMIISTTILTYSTKPFLLTRAIEDLILPLKLLFIPTHIIAMIISIAIRFIPTLLLEATRIMKAQSSRGVDFKHGKIKDKVKSLITLIIPLFVLAFSRAEDLSNAMDVRNYDVYAKRSRYRRLVFNKMDYLFALIFISLIILTVLMELNIIPISHLPKWWLYTNQKI >NZ_CP034597|319289:329927|321505_321787_+|WP_020835642.1|DBSCAN-SWA MNFQKLLKQAQKIQKDQKVKKNALAKMDFDFENQGISLTITGDFELKKIKISPILVDKDDIETLEDLLSITLNQALLKIKEENEKISDYPNQV >NZ_CP034597|319289:329927|324634_325171_+|WP_011205955.1|DBSCAN-SWA MINKHISQILYNRDQIKARIAEIGKWINETYKDSNEIVFIGVLKGSLIFLTELIQSVDVDSMVDFVIAKSYFGGSESTGELKVITDIDIQIQNKDVILIDDILDSGITLSKIRDHLKLKNPKSLRVITLFDKKVKRKYDIQADVSGFVVPDAFLVGYGLDYQDKYRNWPFVAIFDPNK >NZ_CP034597|319289:329927|323868_324603_+|WP_020835645.1|DBSCAN-SWA MSAKITVLATPIGNLKDISLRGIEALREAELILCEDSRVSRKLLNFLEIYDKKLISYHKFNENSVISKISPLIFSGKNVLLISDAGSPLVSDPGQFLINWAHKNEIDVDFLPGPCAFVSAFVLSGFDSPLIFMGFFNSRKQQIIKQITIFKPNFSYIFYISPHKLINILEVIKEIYGDNIEIFLVKEMTKLHQKYFFGTPISIINQLKDSLKGEFTMVLRLKNEKDLQIKKKKNKYQKFSKNNV >NZ_CP034597|319289:329927|327848_329927_+|WP_146379559.1|DBSCAN-SWA MKKNSQIRAKIIELREKIEKWNHHYYQLQNPLVDDLVYDKTLRELEKLERENFFLFSLEELNQSPSQKVGSKITSKFEKVAHSSPMLSLNKAYSNEELEKWAKKAREILKTVTFFVEPKIDGIALSLFYQNGNLIKALTRGDGVFGENVLVNALKINDEFIPKKINYLEDLEVRGEIYIDNSTFASLQLETKKFKNPRNAASGILRRYKNHKPKIDAKSIKFLEEESDFRYLKSFFYTLVNPEKHKINSQFDSINFLRNLGFQVNPFQKKCSDLKDVFNFISIIKQKRDFLNYNIDGVVVKVNEFSIYEKLGSTSKFPHSAIAFKFEDDIAKTKLLAIFATIGRTGKVTYNAKIEPVTLAGSKISSAILPNYSYIENLKLNLNTEVYIKKAGEIIPQIIGSVHNYPKTNFSIVKNCPKCNSELVNSESGLDQFCQNQFCPEIILQKIVHFCSKNALNIESLAQKRIEKFLEKGLISSACDIFYLKDKLELIYERLSNKNQLLTKQNASQSMQIKSIMKLLNEIERAKNIDFYRLIFGLGIRNVGLKAAKILSRYASNLSELRNLDFNLLKNQHDFGPVIIESLIDYFNNQKNSEQLNCLETVGFNFKTTFLTNQSNSWASFAISGKLSKPRDEYVRIIEESGASFHESVTKKTDFLLLGQSAGSKIEKAKKAGIKIINEVQFFDLIKNSKKT >NZ_CP034597|319289:329927|322376_323012_+|WP_020835643.1|DBSCAN-SWA MFISFEGIDASGKSTVMDLFAKYLKIKFPEREIVTTFEPGGKNLKEALLIREFLLSKNNQISPYVEMLLFATARRIHLERLIWPALKAGKIVLCDRYIDSSIAYQGFGNGLDIDLVTSLNSLISENTFPDLTIFLDIKISKAFERMGIFRDHNRDRLENKGVEFYEKVINGYEFLAKKNKNFFKIDGNGTYDEVLDLIIDFFEKYYASWPK >NZ_CP034597|319289:329927|319289_321443_+|WP_146379556.1|DBSCAN-SWA MEIRKDYIAFYRKYRPKKFSDIVGQKFLLESLKNIIKSGNFFHAYLFSGPHGTGKTTVAKIFANAINCTHKTDLIEPCQNCIKNFNNSLDIIEMDAASHNGVKEIREIIENSINFPQISPYKIYILDEVHMLSTSAFNAFLKTLEEPPKHMIFILATTEVHKIPLTILSRVQRYNFLALKEDEICHRLEFILEKEKIKYEKNALKSVFLLSQGSLRDAISILEQVATFGSGYVNQKNINELFGLVNKEILVNFVNALFLADSKISYEILEQISFQSKNFQLFLESLINLVKEWIIWKSTKTNELLEFYSNFDLENLKISQDFAFKFLEIAFSSLKDINFADFQNLTLEIFIMRILSLSNLEISDQNNIKFKKLEENKVDKSDIPEKITEKVSEIKSSPTNFYKIEDRLEKLGKLDLKNLEEDMQTKQNKNYSSIFNRKLEQNLEKSPLKTGVFSKSTTEFNQFGQIGNPFIETENHKKIENQNLKNNGEFDGEIDFSNSFMPKNGTKIDENINSVSDFSDISANLSENKTNFAQSFNNKDTNLINLDTNFGNNSSKFLKKIDSKDYLSAEEVLNFIWLGKNFRSQNQVEYENLVQNWKKNLPLFEYNVEFMEIVSVLKYAKILSLGANFVFFMADRDEYEDLLIETIKEKYQVNELLLQIFNVEMHPLVASKNLINKTKILPNKMRNEGKRIVAKPFEIPKKTTISKEDLEKLLFDK >NZ_CP034597|319289:329927|325199_326018_+|WP_011205954.1|DBSCAN-SWA MIKVSDVCFSYTNNMDQLVLKNINVVFEKGKYYAILGHNGSGKSTFSKILSGIFKPQKGSIEVDGVLLNKENLTKIRKKIGIIFQNPDNQFVGATVEDDIAFSLENINEDPKKMSQIIANLAAKVQMESYLDREPQFLSGGQKQRVAIASVLALNPEIIIFDEITSMLDPRGKYDVVKILDDLRKDKTKTLISITHNMNEAILADEIIVFANGGIIAQGDPKLILNDKNIIEKAKIDSPFIYKISSALKLVSPTYDENELLEQLWKLKQKTS >NZ_CP034597|319289:329927|322992_323865_+|WP_146379558.1|DBSCAN-SWA MLADQNNWSSFLYNLDKNGKIPHAILLISNYPNLLDSKINEFLEIFEHKYEIFLYDIFDKNLSKQEFLEDINKLYFSTFADSQSKIFILKNIEKTHISLLNSLLKILEDPPKSTYFLLIAKSQNLVIPTIVSRCQVFWFTEFDRQKDLKKKLDQWKKTPYNSVYAKIFSNFETAITSIAKISENDLVKFESLFNNLAKKKFEFLIFLNNILTKENALILVKMLIFYSKSIFLNKPEKNSKNSKKETFMPENFKKITKVMQSSHKFLTTLDQNENFNVQKSAFLVRLNIIL >NZ_CP034597|319289:329927|325990_326893_+|WP_011205953.1|DBSCAN-SWA MKIKAKNIVKIYDQKLPSELKALDKVTTEINQGEFIAIIGQTGSGKTTFIQHMNALLLPDQGEIEYLYFDSKNQEKKLVVQKPRFFRKKLKFINEIRRRVGVVFQFAEYQLFEQTIEKDIIFGAVSMGTPKNEAKKIAAEIIELVGLDQSFLQKSPFELSGGQKRRVAIAGILAMDPDIIFFDEPTAGLDPQGTLKMLEILDTLYKKGKTIILATHDLDSVLEWTKRCIFFKDGRIIYDGDTYSILANNKFLIENKMLPTNLLNFREKLIKIGYPISNVRSVSELISEINMLIQKETNAD >NZ_CP034597|319289:329927|321789_322374_+|WP_146379557.1|DBSCAN-SWA MIKETFKNLAEDLRKIPGISKKQAMRILSFLVDVPIEKVENFVRAIYDLKKNTQYCEKCGYLNTNPVCEICLDFQRSFKILVVENTEMIAKFEEYGKYDGQYFVFGKYDIKNLENHNAQIKKLADLAANKSEIILGLSSTMEGLIFANYLAKHEFLSGLKITRLATGIPFGAIIDYIDNITLDQALKNRQEMEK |
11 | Streptococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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