Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017542 | Mannheimia haemolytica strain 1405, complete genome | 3 crisprs | cas3,DEDDh,WYL,DinG,cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,c2c9_V-U4,PD-DExK,RT | 7 | 14 | 12 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP017542_1 | 915251-915325 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017542_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017542_1
>1.1|915274|29|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder AGACCTGATACTAATCTAGGGTATAAAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017542_1
The CRISPR arrays of NZ_CP017542_1 >merge|NZ_CP017542|1|915251-915325|CRISPRCasFinder CCTAGCGGTGGCAGGCACCAGAAAGACCTGATACTAATCTAGGGTATAAAGACCTAGCGGTGGCAGACACCAGAA >NZ_CP017542|1|1|915251-915325|CRISPRCasFinder CCTAGCGGTGGCAGGCACCAGAA AGACCTGATACTAATCTAGGGTATAAAGA CCTAGCGGTGGCAGACACCAGAA
>NZ_CP017542.1|WP_006248316.1|913892_915134_+|HipA-domain-containing-protein MMNKRIYVFADWETFSQPELVGVLSSDVVRGKENFRFSYDNEWLSSPYVQQIDPNLYLYPGEQYSTDTQNFHIFLDSCPDRWGRLLMKRREAALASQENRKPKLLIESDYLLGVHDMNRMGALRFKTELNGPFLDNNTRLAAPPLSSLRELEFAAIQLESSDNVDDPDYLKWLHMLISPGSSLGGARPKASVIDELNQLWIAKFPSRYDDYDIALWEYLAYRLAIQAKIEMATCRIERFNQEHHTFLTQRFDRHCGKRRHFTSALTQLGYYDGDYEASYLEIAQFLTESGSNTRIDLAQLWRRIVFNIAISNTDDHLRNHGFIYAQEGWILSPAYDLNPVPLSQGLHLNITDSDNRLDYQLAFDVADFFQLSKQQAVQIYDEVLKEINNWQNVAKEIGIPRQEQEQMKFAFNV >NZ_CP017542.1|WP_006250513.1|913689_913893_+|hypothetical-protein MFTQTLLAQRTGLSRVTVRKIMNGDPTVAIGYYLMVLGVLGLEQDFTDVGKDDELGRKLQDIELLRK >NZ_CP017542.1|WP_006248313.1|912633_913227_+|hypothetical-protein MKLKALSTLIASSMLYSQSFAVPPEKTAEEPQPFFNKTESGYDLVFNDQNYRLIETELNGEKIQFRAFERIVYVNNPIEPDYQTINLYVPEAYYNNGEINGYQADTAPIFLPNSVGGYMPAKAASYDKKRRDGSPGTILVALSKGYVVASVGARGRTLQKEGKYTGKAPSAIIDSKSAAHKACRFESDHWHHSLCKI >NZ_CP017542.1|WP_006248311.1|911646_912510_+|hypothetical-protein MLQLILAILCSVTVGVLIKFARQKGIRIDQSIAVNYIVTTTMTFLLLKPDYQGQSITDIIANNPTSYIFVILSITLPTIFLVQAKALEFAGIIRTDAAQRLSLFLPILAAFTIFGEQVTQNKLIALLLAFVALGCLLWKGNQGMEKGGKIAIISLALVWVGYGVNDILFKQIAKSGSAFPVTLSIAFIGAGCFMFIYLLLKRTQWHVPSVLTGLLLGVLNFGNILFYIQAHQAMKDDPTLVFTGMNLGVICLGTFVGAFFFKEKIHKVNYLGVAIAIVAIICLFYWR >NZ_CP017542.1|WP_006248309.1|910725_911475_-|alpha/beta-fold-hydrolase MEKRFEINEQGLSIRCKLFYEKELQQIENVVIVLHGFGSSKDLKSNTKFGERLSSKYKGYAALAFDFPCHGDDARKKLSVEESITYLQLVIDYAKTSLNAKNLYAYGTSFGGYLTLKYLAEKGNPFRKIALRAPAVQIYHSLMNRLSEEERQKLAKGREILWGFDRQMKISQAFFDELTDITQNDYLDYAEQILILHGTEDEMVALSTSQQFADNNVIELLPIEGADHAFSNPKLMDIAIGKIVEFFAP >NZ_CP017542.1|WP_006248308.1|910238_910724_+|YbaK/prolyl-tRNA-synthetase-associated-domain-containing-protein MSEQTFHQLTALLDSHRARYRVVGHPSAGKSEEVAKIRGTEIGQGAKALVCKVKGNGVKQAVLAILPADYQADLTKIAEHLGGLRASLASPAEVAELTDCVFGAIPPFSFHPDLLLVAEPSLFERYAELAFNAGTLERSIILNTEDYQKIVNPVLVQFAKS >NZ_CP017542.1|WP_006248307.1|909629_910175_+|endonuclease-SmrB MNDTLLDDEFALFREAAKGTKKLTQNTFVPKAEPRKKLQELRELKEKADTEFYFSDEYEPLLKEENEKVKYLREDVDPYILKQLRRGDFQPELFLDLHGLTREKAKKELAALILACEREKVYCASVMTGFGTRTLKDQIPRWLVQHPKVMALHQAPKEWGGDASILILVEQPENPEKMFGR >NZ_CP017542.1|WP_006248305.1|908592_909537_-|50S-ribosomal-protein-L3-N(5)-glutamine-methyltransferase MFKYNTELLDEISALPIVNDLVTIQDMMRWGYSYFNASDLYYGHGYDNAWDEAQQLVLAGLYLPFDVPETLYSSRLTRVEKERIINLICERLGSRKPVAYLTNSAWFCGGEYYVDERVIVPRSPIGELIKKGFKGIIKNEPHRILDMCTGSGCIAIACAERFPEAEVDAVDLSLDALDVAQINIERHQVSHRVFPICSDLFNNLPQDKYDLIVTNPPYVDEEDLGDMPEEFHHEPALALGSGKDGLDLTKRILAQAADYLNDDGVLVCEVGNSMVHLIEQFPSVPFNWLEFEHGGLGVFSLTKEELVKHRHLFA >NZ_CP017542.1|WP_006251360.1|907615_908509_+|N-acetylmuramic-acid-6-phosphate-etherase MNALGQMITEQRNPNSMNIDRLSALDIVQVINQEDKQVAIAVEQCLPQIAQAVEKIVQAFEKGGRLVYVGAGTSGRLGVLDASECPPTYGVKPEMVVGLIAGGERALRFPIEGAEDNREQGKVDLQAVNFSEKDVLVGIAASGRTPYVLGAMEYAKQLGATTVSIASNPNSAMAQIADIAIETVVGPEVLTGSSRMKSGTAQKLVLNMLTTASMILIGKCYQNLMVDVQATNEKLKARAIRIVMQATECEREVAEDTLKLAENNAKLAIMMILGNLDKQKAEDLLSQNQGRLQKALK >NZ_CP017542.1|WP_006248303.1|907141_907603_+|nuclear-transport-factor-2-family-protein MRKIKLLHVILSLILGLSAAAIGSYPAIKEIGEERAKKHQDILDLNRELYSAMVNRDFSALQTLLSDDFELYSSTGEVIDKQEWIKLIQKRVLEFDKVDLLSTDFQGNQSSGLLRVNGEFFGIERDNVVVEMNIRTIVRNTERQIKCIVIKEV >NZ_CP017542.1|WP_096864247.1|915537_916578_-|IS481-family-transposase MFYSNNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNLKNRVDEAIEQAVVKFALDNPAFGQVRVSNELRKQGIFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLIALEKLVAEQGIILSETQVQALERKKEDEIACGEIETTHPGYLGSQDTFYVGNLKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKTAISAADMLNDKVLPYFESQGLPMLRILTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHTKTKVKHPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKKIYTDLTTLQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMATLLDGKRIWVEKNLSSN >NZ_CP017542.1|WP_006252258.1|916731_917505_-|D-hexose-6-phosphate-mutarotase MNLSNALKLIKYNELDVLEVNHNKFKAKIALQGAQLLSWQPYNAEQDVLWLSEIEPFRIGSAIRGGIPICYPWFGSIKEPAHGTARIQEWRLVEHTCSDENVGLVFALENKAKMEMMLGETCELYFTHLDPEPAQLALHSYFNIGDIEKVEVQGLPTRCFDKLTDQEVEVPSPRKISENVDCIYPAQAVNFIQDFANQRTIKVEHINATETVLWNPWHNTVSAMTETAYQNMVCVETARINTLLQQNETLGVRVLVR >NZ_CP017542.1|WP_006248318.1|917653_921850_+|autotransporter-domain-containing-protein MKTKTFTRSYLASFVTIVLSLPAVASVVRNDVDYQYFRDFAENKGPFSVGSMNIDIKDNNGQLVGTMLHNLPMVDFSAMVRGGYSTLIAPQYLVSVAHNTGYKNVQFGAAGYNPDSHHYTYKIVDRNDYEKVQGGLHPDYHTPRLNKLVTEVVPAAVTNAGTSIKPYLNEERFPMFLRAGSGTQALRGKESNKTTGIAGAYEYLTGGTTLQLSKSSPDHWLDYSSNLYQVSYGPLSTYALPGDSGSGSYAYDMNEKRWVLVGVLNFYNGMDNQFNRSAIIRKDFHEKKFAEDIAGTINNTVQNAQFNWTAQGKSSSLSQSNNVQKLNVDLKDSSIANQNTSLPQENHGKTINFNGKDATIVLKQDIDQGAGALNLNANLTIRPETDQTWQGAGIIVGKDKKVNWQVKNPQGDRLSKLGEGTLYVNGRGQNLGDISVGDGIVILNQQADHQGRKQAFNTVGIVSGRPTVVLGSADQVNPDNIYFGFRGGRLDLNGNSIAFKRIQNSDKHARIVNHNRDHISTLIIQGQDPLTSNDLIWGKWASNSPADIYEYTNPYQNKRKDYFRLKGNSRVYYPTNATSNDHWEFLSSNREQAIQKILDAKNLRQRYDTFNGFIGEDASNKTNGILNVVFDTKTEVNTEQDKLKNIYTMSGGFNLNGELTLKGGTLLLSGHPTPHAYDIKNKHDVVRENDWQDSHFTAKNITVNKMAQLYIGRNVNEVNSHFTATDKAKLNLGFINRSTPSCYDSEYTGTTHCEVQAVISDNIFANLATTAIKGNVKLQNHSQLNLGKANLTGSVQADQTTHITLANHSHWLNNGTSQIGHLTMEKGSILSLNDKFATTEIPVRFNKMIIQGNLKGNGRINYTANLAKGESDHLQVDGIAEGNFVLAVRNSTTEANPKSSLNLLSLKNSNQEGNKASISLENNYVDLGTYRYVLENRNHNYHLFNPLIPNSTSKEMNATSVSSIPKKESVTNVPTLDKKETEQNLTQLQKDFSAHQLENQKAKQSMINAQSELRRLNSQLNVLQKYVNSRRLGYYTQQAVLEQISIIQNKIKQTQTIFNDANATVKLTDQKLEEAKLALGSVNDLVLIKASAPAMQATNQDTSMMNIIQADWISQYANTALSELSAQANSALQISNSLDRQLFKQSDKFNVWSSVEHQKTEHKSDLYRPYKQQTNLTQLGIQMPIDNGLMFGVALSKNHANAEFNEGVNGKSNLLMASLYGKWQSQQGTFISLDGSYGKAKNQLYLFGENHFTRRISSIGANIGHQFDLAGVQIQPTIGARYYHFSGQDYTLGGAKISSPNTHFMTYQAGLKASKTFSLDDWKVEPSITTHYVDASNKRLAVNVNNNNINQRFGRYLKTEAGIRFEHNQWQFDLHAGFINGNEIKKQHFAGVKLGYSW >NZ_CP017542.1|WP_006248319.1|921904_922999_-|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase MSKTIEERISAVILAGGLARRMNGVEKGLQLFEGKPLISHILARLSPQVSDIWLNVNRSIEQYQQLYPAFSYYQDSLPDFQGPLSGMLAGFEQIESDYLLFVPCDTPFMPELLLQKLKTALRINNVQIAYAHDGERPHPTFALIHRSVQEDLKAYLGSNQQQLLAFFQSQKSVAVDFSEQKSAFTNVNTLEDLSRVSQFPVKNLAITGYSGTGKTTLLEKLIPKLTACGIRVGLIKHSHHNVDVDKKGKDSYRLREAGANPTMIVCDERWALMTETKQAVEFSQLIAKFNPQEVDLVFVEGFKHETLPKIQLHRKGIEKPLPELDQWTIATATDYPLERENWLDINNIGGIADFIKNWLENKAS >NZ_CP017542.1|WP_006248320.1|923085_923355_+|DUF1040-family-protein MKCERLEELLELLGEHWRKNPDLHLIDILQQLSVEVGEPDNFKALSDEVLIYQLKMRNAGKFEPIPGIKKDYEDDFKTALLRARGILND >NZ_CP017542.1|WP_006248321.1|923418_924057_+|thioredoxin-domain-containing-protein MKKLALKTAFVALSALFTFNSTAIAADPTAGKEYIEVRKAPSAQKEVVEFFSFYCPHCYDFELSYKIPSQIKEKLPSDSKLVQYHVNFLGRQSEDLTRAWALAMALGAEDKVKTALFEGAQKDAFKSMDDIRSVFLANGITAEQFDSGINSFAVNGLVNKQVQLAEDFQIRGVPAFFVNGQYQLNLEGFADSSSTNDFIKRYVDAVVFLSKK >NZ_CP017542.1|WP_015484370.1|924140_924917_+|LLM-class-flavin-dependent-oxidoreductase MTKLSILNLVPIREGQTAKQAVDSMVKLAKHAESIGIERYWIAEHHNMKNLASSATQLLIQHALSHTEKLRVGSGGVMLPNHSPYIVAEQYGTLETLYPNRVELGLGRAPGTDMRTATALRRNAQSLPFPDEISELKGYFEGTNSVSAYPAQGLNVPFYILGSSPESAYLAAERGLPYAFASHFAPRFMDDAVRIYRTHFKPSEVLDKPYVILGVNAIAAETDQEAEQLATTQTQFFLNVVTNAQNYLQPPVESDDKV >NZ_CP017542.1|WP_015484369.1|924926_925181_+|luciferase MKAEIVPHFGPVSFQQNALYNQEKPVVRQMTACSLIGSRESIEQQLKSLKARIEIDEIMAVSYIFDEQKQHQSYTWLKEIADKV >NZ_CP017542.1|WP_006252261.1|925182_925476_+|YfcZ/YiiS-family-protein MSKTMQQKAADAHNMCKLKGDSMLDNSDRQIAFEAVYDSEEIAVQAVEFFTQKAKSVETEPCDIQSEITPIIDGFLMKMWITFSCQAEVILFQMAVR >NZ_CP017542.1|WP_015587023.1|925542_926583_-|IS481-family-transposase MFYSNNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNLKNRVDEAIEQAVVKFALDNPAFGQVRVSNELRKQGIFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLIALEKLVAEQGIILSETQVQALERKKEDEIACGEIETTHPGYLGSQDTFYVGNLKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKAAISAADMLNDKVLPFFESQGLPMLRILTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHSKTKVKHPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKKIYTDLTTLQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMATLLDGKRIWVEKNLSSN |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017542_2 | 1578372-1578486 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017542_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017542_2
>2.1|1578400|59|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder TTGTTGCACTAAATAAATCCATTTTGCTTTTAATGACAATAACAGGGAGCTTTTTAGGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017542_2
The CRISPR arrays of NZ_CP017542_2 >merge|NZ_CP017542|2|1578372-1578486|CRISPRCasFinder GGATAAATCGTAATAATTTCGCCACTGTTTGTTGCACTAAATAAATCCATTTTGCTTTTAATGACAATAACAGGGAGCTTTTTAGGTGGATAAATCGTAATAATTTCGCCACTGT >NZ_CP017542|2|2|1578372-1578486|CRISPRCasFinder GGATAAATCGTAATAATTTCGCCACTGT TTGTTGCACTAAATAAATCCATTTTGCTTTTAATGACAATAACAGGGAGCTTTTTAGGT GGATAAATCGTAATAATTTCGCCACTGT
>NZ_CP017542.1|WP_015981653.1|1576076_1578356_-|variable-tail-fiber-protein-H MEQKYKTILTHHGERVIVEALANKIPVPLKEMAIGDGNGSSITPSASQTTLVREVYRAEITDLLEDPQNRHQMIAELLIPENVGGFIVREIGLFDEQGGLVAVANCPENYKPVLEQGSGKVQYYRMILQVSSSDAVTLSINNNIVYATRTEFNEFVNNLSSPDGYKHIGRCKSVAELRTIRPTEHGQRILVDAYYEDGTTGGGEFVADLQDLVTPDDGGVCFVVNNNGGRWKRVDLSHLTLFDFGAVGDGVTNDESAFVNAMRYSQFFIENGTFRINNAVNSVRDNVQILGNKTGKLVLGAGIQQAEAEVFNINHSNYFISGFCIETPNKAIGIRFKSLDDAGVKNLHIDNVVFNGTFYGVRAGESIQADTNYPTDNVIVQNCQSYCGSGNAGHYLCTKVKGVRFFNNIAIGGRNVSAYGATSCSDIFILGNREQGMAVTTVDVEAGVQVEDVQTGECVVANNICSHDIWMSGAKNAIINSNLCRRLRVTSGNPTDTGSNNVEFSNNQAKSIAISKYGSFDNPSLFIDNINFINNILEPSEFNQDVYIDGTILKQCQFINNRCISKSKQYSVRLARNNPCLNLTFKSNKLSDNPAIISGKQGVIFCDDLSLGVNKHRLRLRFSSPINFTVNQEWQKMPFDRVLNDINGHVDIVSGQFIARTGGTFHLKGKITVTNSSEDVLNLYQLRLLINNEEKERLINQSVSPKNSKSNTNGMTTINFDTVVYLKVGDIVDLQYKTTHELTLLSDSFLSQIYVTQEF >NZ_CP017542.1|WP_006248181.1|1575833_1576076_-|hypothetical-protein MTKKHYCTGWRSAPANINSCCHQHDRDYGIRGTVTRADADKRLRECMIKNGNPIRAWLFWLVVRAFGWRFYKNKEIKIEK >NZ_CP017542.1|WP_147010110.1|1575589_1575844_-|hypothetical-protein MRNKDNTASKQASKQASKQASKQASKQASKQASKQASKQASKQASKQSVAQFKQAPLPFPAAVVTVVQCLRKSRKSVGVFGMRL >NZ_CP017542.1|WP_006248179.1|1574206_1575388_-|phage-tail-sheath-protein MSILDTYLHGVEVVEVNAGGVTISTAATSVIGVVCTGDQADAETFPLNTPVLITNPLNYLEKAGSTGTLRRTLNSIGSIVKTPTVIVRVAESDDSDTLTANIVGTQENGKFTGIKALLTAQSTVFVKPKLLCVPQHDNQAVATELLSVAKKLNAFAFISDNGATTKEQAYTYRQNFSQREGMMIFGDWKSYNTDKKAYDTDYAVARACALQAYIDKTVGWHKNISNVELDGVTGITKAVEFDINESSTEANYLNEKGITICLNHNGFRYWGSRTLATDTRWAFQQSVRTAQIIKETIGAGLAWAVDMPLTPLRVKTMLEAINNKLRSWASGDDPRILGARVWVAEEITADIIKSGKFVIKYDYHWIPSLESLGLEQRVNDEYVVDLVNTLKAL >NZ_CP017542.1|WP_006248178.1|1573691_1574198_-|phage-major-tail-tube-protein MGLPAKLKNFNFSVDGTSYLGETTEVTQPKLAMQLEDYRAGGMIAPVGVNMGLEKLELEFKIGGHEEDLLKLFGGSISGNAFRFNGAYQHDDDDSVDAVELVCRGRIAEIDEGSSKAGDDTEHSYKASLTYYKKTVNGVDIIEIDTLNQIYIVDGKDRLAEIRKAMGL >NZ_CP017542.1|WP_006248177.1|1573298_1573613_-|phage-tail-assembly-protein MKKVTLKQGILRGEKRITEIEVRKPLTKQLRGTNLTSLMQLSVDEWCIVLPRITTPKLDKADFATMSAADLLKLSGKALDLMSEDFDEADEEDSEEQGKGEILA >NZ_CP017542.1|WP_075270712.1|1573158_1573275_-|GpE-family-phage-tail-protein MADIATVFHWTPNTFDEMTIVELGQWREKARLRNGVES >NZ_CP017542.1|WP_006253663.1|1572747_1573095_-|hypothetical-protein MEIKTVTFSKVITAFIFHIITLFVFTQLNEQAQATFMFFWWFFISLRFILVVGIMCVGIEELKIQEYRQTKAYACFSFISNFALCLQFVYFEHLIAAILFLISYIIYHSQTVTIK >NZ_CP017542.1|WP_006248175.1|1572308_1572746_-|phage-tail-protein MLQQFAMMSLGYFVFMRLTIPYQDTSREMNWSHVQNDVVGAMPKSQFTGKAGETMEISAELRPEITGGKMSILALEMMAEQGSAYPLISGSTFMVLGWFVIDRISEQETTFFADGTPRAISFSMSLKRVDDSLLANIIDEVAGFI >NZ_CP017542.1|WP_006248174.1|1571070_1572309_-|phage-late-control-D-family-protein MDFLTELTNHNHRTPAVSVTVRPKPSKDNEGEKAKDISTLITHRLIQLTLTDNRGFEADQLDLELDDTDGLLALPSRGAILSVGLGWQNSPLTYKGEYTVDELTHDGPPDKVTIRARSADLRGTLTNRHERSFHRTTIGKIVKQIAEENKLKPMVGKEFENEEVKHIDQTNESSINLLQRLAEQFDAIATVKNGNLIFIKAGNATTASGKLLPLFRITRSSGDSHSFSIAEGDNYKAVKAYWHNTQTGKRGEVTWDENSQVKKVTKPTMRKKTKVKRGADGKPIKGKDGKSIKETVFVKGKGRQVNAVVQSKPIESDSEAIKTLPHTYATAQSAINACKRNFEKLQRGVATFSLTLAEGNAELIPELPVQVSGFKAEIDSNEWIISQVTHSLNKGGGFTTALEMELKPKSED >NZ_CP017542.1|WP_006248186.1|1578977_1579895_-|baseplate-assembly-protein MSEIVDLSKLPAPKVLEELDYETLLAERKAKFLSLYPESERAVMAARLALESEPITKLLQENCYLQLLERQRINSAAQATMLAYATGTDLDVIAANFNVERLVVQAEDLTASPPIVEELEPDDDFRQRVQLKIESVSVAGPRKAYTFHALSANGKIADVSVISPQPAYVTVTLLSRDGNGAVASEIINAAKIALNDEEVRPIADRVTVQGASIVEYEINAVLHLYRGPEKEPILKAAKANLEAYINQTKRIGRDVTHSGIHAALHVAGVQNVEILQPRTDLVLTPYQAGYCVNYTLNVEVSDEYS >NZ_CP017542.1|WP_006248187.1|1579891_1580227_-|hypothetical-protein MNRETGEQLEDEVEHIKQSIKDILLTAKGSRVMRRTYGSNLYKLTDKPIAASLIMQLSAACVMALQQWEPRIAITRFKVEFAEDNYNKLICTLDFTLKHRKISIKGMRFTL >NZ_CP017542.1|WP_006248188.1|1580226_1580832_-|phage-baseplate-assembly-protein-V MSEPNHAEQIRRLDNIIRLGTIAEVDLTTATARVNSGGITTDFLPWLTFRAGTSQTWSAPTVGEQCVVLSVSGEFTTGVILFGIYTQNAPSQSADEHLFRFSDGAEISYNTASGQLTVKNCKVVIVQATESITLDTPTVKATKNVVIGGNLSVKGTTSSQGAISTQGAVTAKGDVSGAGISLGSHHHIEQGDGRPTSGAKP >NZ_CP017542.1|WP_015587044.1|1581111_1582152_+|IS481-family-transposase MFYSNNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNLKNRVDEAIEQAVVKFALDNPAFGQVRVSNELRKQGIFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLIALEKLVAEQGIILSETQVQALERKKEDEIACGEIETVHPGYLGSQDTFYVGNLKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKTAISAADMLNDKVLPYFESQGLPMLRILTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHTKTKVKHPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKKIYTDLTTLQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMATLLDGKRIWVEKNLSSN >NZ_CP017542.1|WP_021265529.1|1582186_1582456_-|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MAKITIKPQALSQFDEIVKSVIEFTGFETSGIRLQSDIFDKIEQIAFMPLSGRAREDGTRETFVRRYRIVYDYDRQADEVIICRRSNLI >NZ_CP017542.1|WP_006250778.1|1582448_1582628_-|hypothetical-protein MMFKEKGYDEFVNECVRKGREEHKAGLGFTLEQSRLHIKKTIEQKSQELNEFQREVVYG >NZ_CP017542.1|WP_006248191.1|1585640_1585919_+|hypothetical-protein MEILFILLGLIGFGALLAIGFTTFAAIFGVVTTVFLSLLSLLANMVGLSIIVILISLYVLLPLNTFILIALIFSAILGFLCWYHSDRQSVNQ >NZ_CP017542.1|WP_062716029.1|1585969_1586428_-|phage-virion-morphogenesis-protein MSEPIEQVKTAFDSLLNNISKPRRRLMYQQIGRELDRSQRRRIKAQQNPDGSAYEPRKKPKKGVKSKIKSGKMFDKITQPRFMRLRLESEGVSLGYEGGDAVIARIHQQGLIGRVRKDWDLKVKYASRELLGFTDDDLQMIEDYMINILAGS >NZ_CP017542.1|WP_006248193.1|1586420_1586906_-|phage-tail-protein MIKPDRLRAVLTQTIDIFQANPEKLILQYDKGKIKSKGSQSHSFEYHYDLELIVVDFPYHPDVLFVPVLNFVRNEQWELLQNPELQDKIEFEIDHNNHESYDIYIRLPLTERVIVKEQDGHLTATHADEPNLADVSPFTRLTEYEVYLKDELIYQWAEPNE >NZ_CP017542.1|WP_006248194.1|1586902_1587124_-|TraR/DksA-family-transcriptional-regulator MSDQIDRANELAEKAREAALAKILQNQTACTSLFECEDCGEPIPEKRREMVIGCTRCIECQTIYEHKQKGYRR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP017542_3 | 1717754-1718855 | TypeI |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017542_3
|
16 spacers
spacers of NZ_CP017542_3
>3.1|1717785|34|NZ_CP017542|CRT CCAATGGCGAAAACATAGGATTTGTGGGTACACC >3.2|1717850|36|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR CCTATTGTCGCCCTTGATTTTCCAATTCAAGACGAG >3.3|1717917|36|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR CAAATTCAAGATATACAATTGACCGCAACAGATAAA >3.4|1717984|38|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR CTTGGTTATAATTAAAATTGATTGCGGTACACGCCCCT >3.5|1718053|36|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR CGGGGATTAACCGAACAGGATTGGATTCGTTATGAG >3.6|1718120|36|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR CGCGTAGCTAATGGCAGATTTTTACGGCAATTTAGG >3.7|1718187|35|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR CCTCTAGCATTAAAATCCAATCGGTAAACGGTAAA >3.8|1718253|36|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR CTTTAATTAATAAAATAGCTTTAGCTTTAGATTTAA >3.9|1718320|35|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR CCCAACAATGCTTTTCTTTGTATAACCAGCCACGA >3.10|1718386|35|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR GTATCATTTATCGCCCGAAAAATCCAAAAATCGCA >3.11|1718452|37|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR GGTAAAAGATTACTACTACCCTATGGCAATAAGTGTA >3.12|1718520|35|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR GCGCAAGCATTGCACCACGGTAACAACGGCTGCTG >3.13|1718586|36|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR GGCGTTTATCAGCATCTGCTCGTGTTACTGTGCCAC >3.14|1718653|37|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR GGTGCAAACTACTCCGATAACCGAAGTAGCAGCGGTG >3.15|1718721|35|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR GCCTTATCTTAACTGACTCCGGAGGTATTCAAGAA >3.16|1718787|37|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR GTTTACCGTAGATCAAAATGCCATTGCTCGTTATAGG >3.17|1717851|35|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder CTATTGTCGCCCTTGATTTTCCAATTCAAGACGAG >3.18|1717918|35|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder AAATTCAAGATATACAATTGACCGCAACAGATAAA >3.19|1717985|37|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder TTGGTTATAATTAAAATTGATTGCGGTACACGCCCCT >3.20|1718054|35|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder GGGGATTAACCGAACAGGATTGGATTCGTTATGAG >3.21|1718121|35|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder GCGTAGCTAATGGCAGATTTTTACGGCAATTTAGG >3.22|1718188|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder CTCTAGCATTAAAATCCAATCGGTAAACGGTAAA >3.23|1718254|35|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder TTTAATTAATAAAATAGCTTTAGCTTTAGATTTAA >3.24|1718321|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder CCAACAATGCTTTTCTTTGTATAACCAGCCACGA >3.25|1718387|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder TATCATTTATCGCCCGAAAAATCCAAAAATCGCA >3.26|1718453|36|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder GTAAAAGATTACTACTACCCTATGGCAATAAGTGTA >3.27|1718521|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder CGCAAGCATTGCACCACGGTAACAACGGCTGCTG >3.28|1718587|35|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder GCGTTTATCAGCATCTGCTCGTGTTACTGTGCCAC >3.29|1718654|36|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder GTGCAAACTACTCCGATAACCGAAGTAGCAGCGGTG >3.30|1718722|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder CCTTATCTTAACTGACTCCGGAGGTATTCAAGAA >3.31|1718788|36|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder TTTACCGTAGATCAAAATGCCATTGCTCGTTATAGG |
cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,c2c9_V-U4 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017542_3
The CRISPR arrays of NZ_CP017542_3 >merge|NZ_CP017542|3|1717754-1718855|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTTCAATATATATTGATGCGAAGGTAGCAGCCAATGGCGAAAACATAGGATTTGTGGGTACACCGTTTCAATACACAGCCACGCGAAGGTGGCTGCCTATTGTCGCCCTTGATTTTCCAATTCAAGACGAGGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCAAATTCAAGATATACAATTGACCGCAACAGATAAAGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCTTGGTTATAATTAAAATTGATTGCGGTACACGCCCCTGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCGGGGATTAACCGAACAGGATTGGATTCGTTATGAGGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCGCGTAGCTAATGGCAGATTTTTACGGCAATTTAGGGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCCTCTAGCATTAAAATCCAATCGGTAAACGGTAAAGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCTTTAATTAATAAAATAGCTTTAGCTTTAGATTTAAGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCCCAACAATGCTTTTCTTTGTATAACCAGCCACGAGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGGTATCATTTATCGCCCGAAAAATCCAAAAATCGCAGTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGGGTAAAAGATTACTACTACCCTATGGCAATAAGTGTAGTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGGCGCAAGCATTGCACCACGGTAACAACGGCTGCTGGTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGGGCGTTTATCAGCATCTGCTCGTGTTACTGTGCCACGTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGGGTGCAAACTACTCCGATAACCGAAGTAGCAGCGGTGGTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGGCCTTATCTTAACTGACTCCGGAGGTATTCAAGAAGTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGGTTTACCGTAGATCAAAATGCCATTGCTCGTTATAGGGTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGG >NZ_CP017542|3|1|1717754-1718854|CRT ATTTCAATATATATTGATGCGAAGGTAGCAG CCAATGGCGAAAACATAGGATTTGTGGGTACACC GTTTCAATACACAGCCACGCGAAGGTGGCTG CCTATTGTCGCCCTTGATTTTCCAATTCAAGACGAG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CAAATTCAAGATATACAATTGACCGCAACAGATAAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CTTGGTTATAATTAAAATTGATTGCGGTACACGCCCCT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CGGGGATTAACCGAACAGGATTGGATTCGTTATGAG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CGCGTAGCTAATGGCAGATTTTTACGGCAATTTAGG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CCTCTAGCATTAAAATCCAATCGGTAAACGGTAAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CTTTAATTAATAAAATAGCTTTAGCTTTAGATTTAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CCCAACAATGCTTTTCTTTGTATAACCAGCCACGA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG GTATCATTTATCGCCCGAAAAATCCAAAAATCGCA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GGTAAAAGATTACTACTACCCTATGGCAATAAGTGTA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GCGCAAGCATTGCACCACGGTAACAACGGCTGCTG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GGCGTTTATCAGCATCTGCTCGTGTTACTGTGCCAC GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GGTGCAAACTACTCCGATAACCGAAGTAGCAGCGGTG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GCCTTATCTTAACTGACTCCGGAGGTATTCAAGAA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GTTTACCGTAGATCAAAATGCCATTGCTCGTTATAGG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG >NZ_CP017542|3|1|1717819-1718854|PILER-CR GTTTCAATACACAGCCACGCGAAGGTGGCTG CCTATTGTCGCCCTTGATTTTCCAATTCAAGACGAG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CAAATTCAAGATATACAATTGACCGCAACAGATAAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CTTGGTTATAATTAAAATTGATTGCGGTACACGCCCCT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CGGGGATTAACCGAACAGGATTGGATTCGTTATGAG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CGCGTAGCTAATGGCAGATTTTTACGGCAATTTAGG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CCTCTAGCATTAAAATCCAATCGGTAAACGGTAAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CTTTAATTAATAAAATAGCTTTAGCTTTAGATTTAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CCCAACAATGCTTTTCTTTGTATAACCAGCCACGA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG GTATCATTTATCGCCCGAAAAATCCAAAAATCGCA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GGTAAAAGATTACTACTACCCTATGGCAATAAGTGTA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GCGCAAGCATTGCACCACGGTAACAACGGCTGCTG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GGCGTTTATCAGCATCTGCTCGTGTTACTGTGCCAC GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GGTGCAAACTACTCCGATAACCGAAGTAGCAGCGGTG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GCCTTATCTTAACTGACTCCGGAGGTATTCAAGAA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GTTTACCGTAGATCAAAATGCCATTGCTCGTTATAGG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG >NZ_CP017542|3|3|1717819-1718855|CRISPRCasFinder GTTTCAATACACAGCCACGCGAAGGTGGCTGC CTATTGTCGCCCTTGATTTTCCAATTCAAGACGAG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC AAATTCAAGATATACAATTGACCGCAACAGATAAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC TTGGTTATAATTAAAATTGATTGCGGTACACGCCCCT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC GGGGATTAACCGAACAGGATTGGATTCGTTATGAG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC GCGTAGCTAATGGCAGATTTTTACGGCAATTTAGG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC CTCTAGCATTAAAATCCAATCGGTAAACGGTAAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC TTTAATTAATAAAATAGCTTTAGCTTTAGATTTAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC CCAACAATGCTTTTCTTTGTATAACCAGCCACGA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGG TATCATTTATCGCCCGAAAAATCCAAAAATCGCA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGG GTAAAAGATTACTACTACCCTATGGCAATAAGTGTA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGG CGCAAGCATTGCACCACGGTAACAACGGCTGCTG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGG GCGTTTATCAGCATCTGCTCGTGTTACTGTGCCAC GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGG GTGCAAACTACTCCGATAACCGAAGTAGCAGCGGTG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGG CCTTATCTTAACTGACTCCGGAGGTATTCAAGAA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGG TTTACCGTAGATCAAAATGCCATTGCTCGTTATAGG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGG
>NZ_CP017542.1|WP_006248118.1|1716093_1717569_-|ribonuclease-G MSSTELLVNVTPSETRVALVENGILKELHIEREAKRGIVGNIYKGRVTRVLPGMQSAFVDIGLEKAAFLHASDIVSHTECVDENEKKQFLVKDISELVREGQDIVVQVVKDPIGTKGARLTTDITLPSRYLVFMPENSHVGVSQRIESEEERARLKSLVEPYCDELGGFIVRTAAEEATEESLKQDVEFLKRLWRKVLERKGKYSAKSMLYGELALAQRVLRDFIGTHINSVRIDSKLTYEQVREFLAEFMPELTDCVTLYTGQQTLFDAYGVEKAIQKALDKRVDLKSGGYLIIEQTEAMTTIDINTGAFVGHRNLAHTIFNTNIEAIQAIAHQLQLRNLGGIIIIDFIDMQEEEHRERVLQSLQEALKGDRVKTNVNGFTQLGLVEMTRKRTRESLERILCCDCQACQGRGTVKTVETVCYEIMREIVRVHHLFKTENIHVYAAKDVAEYLINEESHALLAELQAFIGKKIEIKLEPYYHQEQFDVVVM >NZ_CP017542.1|WP_006248119.1|1714437_1715940_-|lysine--tRNA-ligase MSEVENQELDLNGEMLARREKLNKIREQGNAFPNTFRRDALAKDLHAQYDAVEGETLKEQNIQVKVAGRIMLKRVMGKASFFTIQDVSGAIQLYVARDNLSDSVYEEKVSLWDLGDIVGVEGALFKTKTGELTVRCSEVQLLTKSLRPLPDKHHGLTDLETRYRQRYLDLISNEESRRTFMIRSQVVSGIRKFFLERDFIEVETPMLQVIPGGAAAKPFITHHNALDVDMYLRIAPELYLKRLVVGGFERVFELNRNFRNEGVSVRHNPEFTMIEYYQAYADYHDLMDNTEELLRQLALDILGTTDVPYGDYVFDFGKPFERITMHDAIVKYGNGIQREDLDSFEKSVEIAKGLGIEIQKSWGLGSVVNAIFEEVAEHQLIQPTFLMAHPAEISPLARRNDENPEVTDRFELFIGGREIGNGFSELNDAEDQAERFDAQVAAKDAGDDEAMFKDEDFIVALEHGLPPTAGEGLGIDRLVMIFANAPSIRDVILFPAMRQK >NZ_CP017542.1|WP_006247812.1|1713839_1714133_+|hypothetical-protein MTTFNKILNPMYSTIASYSTQDDGSLNAKYVVGTGDDTDGEVTNFVIITSEYKYIDAQSAKAITDAPLTKEDIGKTPTQIMLGRIYKYLKETGQIVV >NZ_CP017542.1|WP_147008795.1|1710390_1713717_+|DUF1983-domain-containing-protein MNADKLTDITSRVANAESTITNFQSTKANKSEVASIAQQNLQSIWRTDAQSAVDALKIGGANLLVDSEYLTTARWGGSSRVASSQYGDRRLTQVFVTQAGTGHFGVTQGTQKATTRIRQGETYTLSLNAQGTAGFTRTGLNYVYLIREDGGNFRLPTLPLTASLSQRPKVTFTAPWTSNQVRLLIGANGIFEATDWFAFHSVKLEMGNVATGWTPTAKDIDDKVSAVQSNLTAYQAAQAKADQAKATQISGLTTRMGAAESNLTRTERAVTELNQTTVTTLRDLTARTKTTEGSLSRLETAKASKTEVASIAQSSLQSIWKADAKSAVDSLSIGARNLLIDSTYNQHINYNTKMSSITRTVYRGNMLIRLGMLGGAGVAGIVQAPAAQVSNIRQGQEYTLSLNVQGTAGIQKTGLNYVFLMRADGANQRLATIPVIASLLNRPKITFTAEWTSERAYLLVGVNGTYETTDWLAFHSVKLEKGNVATDWTPAPEDVDSAVSAVSAKIDTIQETLANADSALSSRIDAVTASVGSNLAKITQVSNAVAGVDGKLSATHTIKTETIAGGRKAIAGIALGAAADNRNAESSVIVMADKFEVVKNAQDGQPVRLFGVAQNKVAINGDLIATGTIKGSHIDADSVRAGILTAGAIRTEHLAAGQISADKLAIGLGGNLLVNPIFATPDLSIAPFGWNYWRGEVGDRLNIDTRNIFNRNEQDNYGLKNGGLPNELVFSMRYSTTKETSDTGRIGWLSQDINVVPNKKYIASVWLACHRGQAKLVIENIEKPGGAYLGRIGNSEVITGYSAHQGEFKNMKRVKVVFTAPTSGCIRFALRLDNIQGKANPFLFARRPMLEEASDNVTDITQPSPWQNAGVTAIHGGSIVTNTVTAQQIAANTITANEIATGTIAARNMAANSINASHIVGSSITADKLNVNNLAAISANLGKVTAGTITGTTITGNTISGGSINGTTISGTTISGGTIKGARLEGATGKFTGELEVSQLIGGGVIEQVTGKLKYSHRNRIYEGQEHGENSSSPIYRHEYIYKATVTINAAPTRRYIEIIGSESFILEANQSITKTIEKSLNRNASGSSLDFIVLAYSISTAKYISIS >NZ_CP017542.1|WP_075272501.1|1706662_1710394_+|host-specificity-protein-J MRIYGAKGGGGSSHTPIEAPETGRSKQIVNIVELLCEGEIEGLVDGFKSIYLDGTKIQNDDGTYNFNNVSGQLNVGTQDQDVLDGYDSSQNEVNVGVEIKKKNGAIVRTVTDERINRLRLTLGVRSLFHQNNQGDTNTTNVDLKITIGTRQYSHSFNGKYSSQYLESVVFDNLPPVPFNISVERLTEDSNSQRLQNGTIWSSYTEIIDTEFTYPNSAVAGISFDSEYFNNIPTRNYLIKAKKVKVPSNYDPVKRTYTGFWDGTFKVAWTNNPAWEIYDLAPILSKMLGVEISFDKWALYDVARYCDQLVPDGMGGMEPRFTCNVWLTEVKTAYDLLNDFCSVFRAIPIWTGTEVSVIIDRPRDPVWTYTNANVVGGFERSYSARKSRHNAVQVTYSDKTNGYESAIEYVSDDEEIKKHGLNLSQITAFGCTSRGQAHRTGKWILETEKREKETITFTVGREGLMHLPGDIIRVADSHYAGTEIGGRVLAINGRKVTLDREISIDNASYFTYINGEATHSSKIQSVNGKEITLDSTPTGLETYGVWSLSTKQISSGLYRSISIVENADGTNTITALQHEPQKEAIVDNSAHFVETARTLYKAPQINAVEVSTGYDGKLYITGDISSGDGKLTYDIKITKDGNLYQYKKGLSDPNIELSDLPNGDYTVIIYGKNAKGQIVTEKTQTFTIDRPPAPTGVVVTGGLGQITLEWDWVNEVTQTEIFAAETDNFALAKKIAKVTARTYAHTLKGNKVVRYYWLRHTRGINVGPFYQQQGVRGQTAVDLDARLTELNTQLSRNIVNEVFDVAAPARGLELVKTVANLTDKGTKLASSQVYNQADGKLYTWNGTAYSATVAAEDVTGKLSKSKIDTSLISQLTGADNTANLARRLAETAQSNINQEITNRQDAVTAEANNRTKAIQAESANLTKKIQAEATARGAAVTQLQNVDAQQAQLISAVTAKADNALSGLEEEKTARANGDKAESQAREALTARMGAAESNIVTIQRTVANNAQSISEVSQNLNAKIDNINIGGRNLLRDSEFNAYNKWGSPQIEFAENANRRTIKVTSTGTNGPVGIVSSNRHSTSYFQQGETYTLSLFARGSKALDYLYLMRQDGNNVRLPVINVASETEFNHYKLTFKAPFTTQQGYVLIGFRQTSTEQFVEFHSVKLEKGNVATDWTPAPEDVESAVSAVSADLTSYKQTQAATDSAQAQQLNQLSVNLTKAETNFNAKITEEKKLVLMQIK >NZ_CP017542.1|WP_006249176.1|1706023_1706653_+|tail-assembly-protein MITVKFYGHLKTFGTDFKILVKDIAEAIRALCSQLKGLREALRDGVYKVRIGKQYLDPSALEKGLFYCLKKGQTIHFTPVVKGAKSGGIFQAVLGVALIGAAFALGPIGLGLVGSATAMTVGAMGASMLLGGVSQMLTKMPKAPTMGNETEKESSTAFSNLNNLVAQGKPVPLAYGLIRTGSLVISQGVETITIKENQPASNKKTGFRK >NZ_CP017542.1|WP_020828760.1|1705023_1705755_+|C40-family-peptidase MELEQQIIDYALQHEPHEMCGFVVFDGNKNRFIPCENQAEDKANYFEISDLDYIKAEEKGELVAVVHSHPEPNGKPILSVLDRKMQVQTGLDWWLVHNRQIHKFRNVPHLIGREFKHGTMDCYTLYRDAYMLAGYEMDEFERQDDWWHTGQNLYLDNIQGQGFERVETPQIGDVILMQVGADVPNHAAIYIGEQMVIHHSPNRLSKRDLYDGYWLRHTHSIWRHKLADKLDFDGILNDIAVNN >NZ_CP017542.1|WP_006249178.1|1704303_1705020_+|phage-minor-tail-protein-L MPVSISNQMKLDLAKLEQNAMLDLYEVDLRTLKDKSGNAGSVYRFYSGLNELKTSIVWQGRTYDPYPIEATGFERNSSGPSNRPTLTLSNLFGLVTGIANQFDECIGAIVRRHQVYAQYLDAVNFAGGNAKADPNQEIISHFVIEQLSSLTRETATFTLALPIETDNAKIPSRIIMADTCTWIYRSAECGYTGKQYFDEKDKATSDPKADKCSHCLNGCELRGNQRNFGGFVSVNKLG >NZ_CP017542.1|WP_006249179.1|1703974_1704304_+|phage-tail-protein METLKWCVRTDLAVENTPEIMEVKFGDGYTQRSPKGLNNLLRAYTGTIKVKKGEHLAVEAFFAKHRGVSPFYFKDPYTQQNKKVVCSSWPAKMVGLNHWEFSVTFKEVP >NZ_CP017542.1|WP_006249180.1|1700408_1703975_+|tape-measure-protein 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>NZ_CP017542.1|WP_006248114.1|1719045_1719339_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MLMLITYDISFDDPEGQARLRRIAKHCLDYGVRAQYSVFECDVTPAQWVTLKNKLLATYNPDCDSLRFYHLGSKWRNKVEHHGAKPSVDIFKDTLIL >NZ_CP017542.1|WP_006248113.1|1719405_1720419_-|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MRKLQNTLYITTQGSYLHKERETLVVEQDRKKVAQLPIHSIGHIFCFGNVLVSPFLMGFCGENNVNLAFFTENGRYLGRLQGRQSGNVLLRRAQYKKSETNPVPVARNIIAAKIQASKRVLQRQIRNHGENADLQSTITALNYSLQQLKTADNLDLIRGIEGDAAARYFGVFSHLIKENSGFHFDGRNRRPPRDGVNALLSFLYSIVGKDISGALQGVGLDPQIGFLHADRSGRDSLAQDILEEFRAWWVDRMVLSLINRGQVKPDDFVTEASGAVTLKPEARKLLFQTLQAKKQEKIIHPFLEEEVEIGLLPYIQAMLLARHLRGDLAEYPPFLMR >NZ_CP017542.1|WP_134916814.1|1720521_1720815_-|DUF3800-domain-containing-protein MQHNKISFEDSVNNSLIQASDVIAGLLAGIGEQIQKYNEQEFYNEFISKLNPNHLENLKLLAQIYQNSIYKSNGLFTHFFAPLSFICRLQNFIFSYK >NZ_CP017542.1|WP_006248111.1|1720815_1721736_-|hypothetical-protein MITSNLERSFHGLNIAQHNYKIFLDESGGNIGKLKHTPNDKKGSNFNRTISSHIGVPPVFVLGGIAQISNANLIAPDWRKLLHLQNKELKFSKIGKNFFNKLGSKELRKVLEWINENNLCIHFALYDWVYFYDVDIIDSALIESDVCSVWKYLSEKIGNSNRYKEIKDYQRKVGLDKQSDDIIYLFYIKELLHDFIINNLQWFLSEIYNNHYKKIDNQEKTVFLDNLYNMIKGSEKYKVLEFFLEKIDRNKYLSFIYDKLDSEMNEDKTFIMLVEDMSPPYQNYLNTFPLSEFYFDKGMEHVFIDY >NZ_CP017542.1|WP_006253509.1|1721762_1722437_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MGDLQNSAEILPLVQPKFGDDKRSISLSALQHYAFCPRQCALIHNEQVWAENYLTAQGQALHERVDSGEPEVRKGIRFERTVHVAAEKLGISGILDLVERDLKTGELKPVEYKRGKPKLDPIDEIQLCAQALCLEEMTEQTINEGALWYMQTRHRLPIIFSTELRTKTLATIAEVRSLLDSGTTPPPEYSKRCKACSLIDLCQPKLLERDRSKGYVVGVFGSLL >NZ_CP017542.1|WP_006248109.1|1722436_1723300_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2 MSIQNRYEFVFFFDVTNGNPNGDPDAGNMPRLDPETSKGLVTDVCLKRKIRNFIEMSYENEAGYEIYVKEKSVLNLQNKRAYEALGIESEAKKLPKEEAKAREITAWMCKNFFDIRTFGAVMTTEVNSGQVRGPVQLAFAQSIDPIIPLEVSITRMAVTNEKDLEKERTMGRKYIVPYALYRVHGFISAKLAEKTGFSDEDVQKLWQALQLMFEHDRSAARGEMAARKLIVFKHDSELGNQPAHKLFDSVKVERINGEKDTPAKDYDDYCISVQTEGLTGVTVEELL >NZ_CP017542.1|WP_031192850.1|1723309_1725091_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 MITALTRYYYRLAAQEDRLTGEAKVPSYGFSEEKIGWVLELDSKGNLVNVISNLTEDKKPKPKLMSVPRPEKRTSGIKPNFLWDKTAYVLGIESNPDKATAKDQPINFAEKTFEAFKQYHLDLLADSNDEGLMAIRNFLQQWQPTHFAESICPREILDANVVFKLVGTSGYIHQREAAQTLWTSLLINQSDNAEKGLCLISGKLSPIQRTHPPIKGVFGGQSSGGSIISFNKESFTSFGKEQGSNAPVSEQAAFAYTTALNYLLRTEKHRLTIGDASTVFWAEADNTTQAEAAEGFFAALMTPPDDEQENQKIFEELQKISKGRPLAEISPELSENTRFYVLGLAPNAARISVRFWLDTTFGQLAKNLSEHWQDLALEPCPWKTPPSIWRLLLQTASLGKSENISPVLAGEMARAVISGHLYPMSLLSQLVTRIRADGDINGLRVALMKAVLQRKFRKGFIKEGVPMSLNKESDNQAYLLGRLFAVLERIQSQALGELNAGIADRYYGSASAVPFSVFPRLLSGAKHHLSRLRKDKGGMAVNLDKDLGEIIASLPENFPRHLSIDEQGRFAIGYYHQKQSYFAKKETTESIEN >NZ_CP017542.1|WP_006248107.1|1725112_1725790_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017542_3 | 3.14|1718653|37|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR | 1718653-1718689 | 37 | NZ_CP017542.1 | 1575281-1575317 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.19|1717985|37|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1717985-1718021 | 37 | NZ_CP017542.1 | 1626784-1626820 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.27|1718521|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718521-1718554 | 34 | NZ_CP017542.1 | 1575633-1575666 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.28|1718587|35|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718587-1718621 | 35 | NZ_CP017542.1 | 1575951-1575985 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.29|1718654|36|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718654-1718689 | 36 | NZ_CP017542.1 | 1575282-1575317 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.30|1718722|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718722-1718755 | 34 | NZ_CP017542.1 | 2696361-2696394 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.31|1718788|36|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718788-1718823 | 36 | NZ_CP017542.1 | 2702269-2702304 | 0 | 1.0 |
1. spacer 3.14|1718653|37|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to position: 1575281-1575317, mismatch: 0, identity: 1.0
ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer *************************************
2. spacer 3.19|1717985|37|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to position: 1626784-1626820, mismatch: 0, identity: 1.0
ttggttataattaaaattgattgcggtacacgcccct CRISPR spacer ttggttataattaaaattgattgcggtacacgcccct Protospacer *************************************
3. spacer 3.27|1718521|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to position: 1575633-1575666, mismatch: 0, identity: 1.0
cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
4. spacer 3.28|1718587|35|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to position: 1575951-1575985, mismatch: 0, identity: 1.0
gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer ***********************************
5. spacer 3.29|1718654|36|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to position: 1575282-1575317, mismatch: 0, identity: 1.0
gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************
6. spacer 3.30|1718722|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to position: 2696361-2696394, mismatch: 0, identity: 1.0
ccttatcttaactgactccggaggtattcaagaa CRISPR spacer ccttatcttaactgactccggaggtattcaagaa Protospacer **********************************
7. spacer 3.31|1718788|36|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to position: 2702269-2702304, mismatch: 0, identity: 1.0
tttaccgtagatcaaaatgccattgctcgttatagg CRISPR spacer tttaccgtagatcaaaatgccattgctcgttatagg Protospacer ************************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_CP017542_2 | 2.1|1578400|59|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1578400-1578458 | 59 | DQ426905 | Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome | 15663-15721 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_2 | 2.1|1578400|59|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1578400-1578458 | 59 | KP137432 | Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome | 15663-15721 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_2 | 2.1|1578400|59|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1578400-1578458 | 59 | JN255163 | Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome | 15863-15921 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_2 | 2.1|1578400|59|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1578400-1578458 | 59 | KP137438 | Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome | 16092-16150 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_2 | 2.1|1578400|59|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1578400-1578458 | 59 | DQ426904 | Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome | 15663-15721 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.14|1718653|37|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR | 1718653-1718689 | 37 | NC_008201 | Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome | 18740-18776 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.14|1718653|37|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR | 1718653-1718689 | 37 | DQ426905 | Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome | 18815-18851 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.14|1718653|37|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR | 1718653-1718689 | 37 | KP137432 | Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome | 18780-18816 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.14|1718653|37|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR | 1718653-1718689 | 37 | JN255163 | Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome | 18976-19012 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.14|1718653|37|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR | 1718653-1718689 | 37 | KP137438 | Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome | 19141-19177 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.14|1718653|37|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR | 1718653-1718689 | 37 | DQ426904 | Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome | 18740-18776 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.19|1717985|37|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1717985-1718021 | 37 | KP137439 | Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome | 27263-27299 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.19|1717985|37|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1717985-1718021 | 37 | NC_028956 | Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome | 27371-27407 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP017542_3 | 3.22|1718188|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718188-1718221 | 34 | NC_028743 | Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome | 19018-19051 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.27|1718521|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718521-1718554 | 34 | NC_008201 | Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome | 18391-18424 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.27|1718521|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718521-1718554 | 34 | DQ426905 | Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome | 18466-18499 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.27|1718521|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718521-1718554 | 34 | KP137432 | Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome | 18431-18464 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.27|1718521|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718521-1718554 | 34 | JN255163 | Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome | 18627-18660 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.27|1718521|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718521-1718554 | 34 | KP137438 | Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome | 18792-18825 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.27|1718521|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718521-1718554 | 34 | DQ426904 | Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome | 18391-18424 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP017542_3 | 3.28|1718587|35|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718587-1718621 | 35 | DQ426905 | Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome | 18136-18170 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.28|1718587|35|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718587-1718621 | 35 | KP137432 | Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome | 18136-18170 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.28|1718587|35|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718587-1718621 | 35 | JN255163 | Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome | 18336-18370 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.28|1718587|35|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718587-1718621 | 35 | KP137438 | Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome | 18565-18599 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.28|1718587|35|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718587-1718621 | 35 | DQ426904 | Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome | 18136-18170 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP017542_3 | 3.29|1718654|36|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718654-1718689 | 36 | DQ426905 | Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome | 18815-18850 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.29|1718654|36|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718654-1718689 | 36 | KP137432 | Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome | 18780-18815 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.29|1718654|36|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718654-1718689 | 36 | JN255163 | Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome | 18976-19011 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.29|1718654|36|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718654-1718689 | 36 | KP137438 | Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome | 19141-19176 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.29|1718654|36|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718654-1718689 | 36 | DQ426904 | Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome | 18740-18775 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017542_3 | 3.4|1717984|38|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR | 1717984-1718021 | 38 | KP137439 | Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome | 27262-27299 | 1 | 0.974 |
NZ_CP017542_3 | 3.4|1717984|38|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR | 1717984-1718021 | 38 | NC_028956 | Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome | 27370-27407 | 1 | 0.974 |
NZ_CP017542_3 | 3.7|1718187|35|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR | 1718187-1718221 | 35 | NC_028956 | Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome | 19192-19226 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017542_3 | 3.7|1718187|35|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR | 1718187-1718221 | 35 | NC_028743 | Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome | 19017-19051 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017542_3 | 3.12|1718520|35|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR | 1718520-1718554 | 35 | NC_008201 | Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome | 18391-18425 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017542_3 | 3.12|1718520|35|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR | 1718520-1718554 | 35 | DQ426905 | Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome | 18466-18500 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017542_3 | 3.12|1718520|35|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR | 1718520-1718554 | 35 | KP137432 | Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome | 18431-18465 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017542_3 | 3.12|1718520|35|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR | 1718520-1718554 | 35 | JN255163 | Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome | 18627-18661 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017542_3 | 3.12|1718520|35|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR | 1718520-1718554 | 35 | KP137438 | Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome | 18792-18826 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017542_3 | 3.12|1718520|35|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR | 1718520-1718554 | 35 | DQ426904 | Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome | 18391-18425 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017542_3 | 3.13|1718586|36|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR | 1718586-1718621 | 36 | NC_008201 | Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome | 18136-18171 | 1 | 0.972 |
NZ_CP017542_3 | 3.13|1718586|36|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR | 1718586-1718621 | 36 | DQ426905 | Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome | 18136-18171 | 1 | 0.972 |
NZ_CP017542_3 | 3.13|1718586|36|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR | 1718586-1718621 | 36 | KP137432 | Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome | 18136-18171 | 1 | 0.972 |
NZ_CP017542_3 | 3.13|1718586|36|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR | 1718586-1718621 | 36 | JN255163 | Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome | 18336-18371 | 1 | 0.972 |
NZ_CP017542_3 | 3.13|1718586|36|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR | 1718586-1718621 | 36 | KP137438 | Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome | 18565-18600 | 1 | 0.972 |
NZ_CP017542_3 | 3.13|1718586|36|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR | 1718586-1718621 | 36 | DQ426904 | Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome | 18136-18171 | 1 | 0.972 |
NZ_CP017542_1 | 1.1|915274|29|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 915274-915302 | 29 | MH791397 | UNVERIFIED: Enterococcus phage EfsSzw-1, complete genome | 22354-22382 | 5 | 0.828 |
NZ_CP017542_3 | 3.27|1718521|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718521-1718554 | 34 | NC_047750 | Mannheimia phage vB_MhM_1127AP1, complete genome | 19383-19416 | 6 | 0.824 |
NZ_CP017542_3 | 3.27|1718521|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718521-1718554 | 34 | NC_028898 | Mannheimia phage vB_MhM_587AP1, complete genome | 19392-19425 | 6 | 0.824 |
NZ_CP017542_3 | 3.12|1718520|35|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR | 1718520-1718554 | 35 | NC_047750 | Mannheimia phage vB_MhM_1127AP1, complete genome | 19383-19417 | 7 | 0.8 |
NZ_CP017542_3 | 3.12|1718520|35|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR | 1718520-1718554 | 35 | NC_028898 | Mannheimia phage vB_MhM_587AP1, complete genome | 19392-19426 | 7 | 0.8 |
NZ_CP017542_3 | 3.28|1718587|35|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718587-1718621 | 35 | HM144385 | Brochothrix phage NF5, complete genome | 32998-33032 | 10 | 0.714 |
NZ_CP017542_3 | 3.23|1718254|35|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718254-1718288 | 35 | NC_014534 | Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782202, complete sequence | 368774-368808 | 11 | 0.686 |
NZ_CP017542_3 | 3.25|1718387|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder | 1718387-1718420 | 34 | NC_014533 | Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782201, complete sequence | 710003-710036 | 11 | 0.676 |
1. spacer 2.1|1578400|59|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgttgcactaaataaatccattttgcttttaatgacaataacagggagctttttaggt CRISPR spacer ttgttgcactaaataaatccattttgcttttaatgacaataacagggagctttttaggt Protospacer ***********************************************************
2. spacer 2.1|1578400|59|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgttgcactaaataaatccattttgcttttaatgacaataacagggagctttttaggt CRISPR spacer ttgttgcactaaataaatccattttgcttttaatgacaataacagggagctttttaggt Protospacer ***********************************************************
3. spacer 2.1|1578400|59|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgttgcactaaataaatccattttgcttttaatgacaataacagggagctttttaggt CRISPR spacer ttgttgcactaaataaatccattttgcttttaatgacaataacagggagctttttaggt Protospacer ***********************************************************
4. spacer 2.1|1578400|59|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgttgcactaaataaatccattttgcttttaatgacaataacagggagctttttaggt CRISPR spacer ttgttgcactaaataaatccattttgcttttaatgacaataacagggagctttttaggt Protospacer ***********************************************************
5. spacer 2.1|1578400|59|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgttgcactaaataaatccattttgcttttaatgacaataacagggagctttttaggt CRISPR spacer ttgttgcactaaataaatccattttgcttttaatgacaataacagggagctttttaggt Protospacer ***********************************************************
6. spacer 2.1|1578400|59|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgttgcactaaataaatccattttgcttttaatgacaataacagggagctttttaggt CRISPR spacer ttgttgcactaaataaatccattttgcttttaatgacaataacagggagctttttaggt Protospacer ***********************************************************
7. spacer 3.14|1718653|37|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer *************************************
8. spacer 3.14|1718653|37|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer *************************************
9. spacer 3.14|1718653|37|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer *************************************
10. spacer 3.14|1718653|37|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer *************************************
11. spacer 3.14|1718653|37|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer *************************************
12. spacer 3.14|1718653|37|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer *************************************
13. spacer 3.19|1717985|37|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to KP137439 (Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttggttataattaaaattgattgcggtacacgcccct CRISPR spacer ttggttataattaaaattgattgcggtacacgcccct Protospacer *************************************
14. spacer 3.19|1717985|37|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttggttataattaaaattgattgcggtacacgcccct CRISPR spacer ttggttataattaaaattgattgcggtacacgcccct Protospacer *************************************
15. spacer 3.22|1718188|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa CRISPR spacer ctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa Protospacer **********************************
16. spacer 3.22|1718188|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to NC_028743 (Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa CRISPR spacer ctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa Protospacer **********************************
17. spacer 3.27|1718521|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
18. spacer 3.27|1718521|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
19. spacer 3.27|1718521|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
20. spacer 3.27|1718521|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
21. spacer 3.27|1718521|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
22. spacer 3.27|1718521|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
23. spacer 3.28|1718587|35|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer ***********************************
24. spacer 3.28|1718587|35|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer ***********************************
25. spacer 3.28|1718587|35|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer ***********************************
26. spacer 3.28|1718587|35|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer ***********************************
27. spacer 3.28|1718587|35|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer ***********************************
28. spacer 3.28|1718587|35|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer ***********************************
29. spacer 3.29|1718654|36|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************
30. spacer 3.29|1718654|36|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************
31. spacer 3.29|1718654|36|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************
32. spacer 3.29|1718654|36|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************
33. spacer 3.29|1718654|36|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************
34. spacer 3.29|1718654|36|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************
35. spacer 3.4|1717984|38|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to KP137439 (Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
cttggttataattaaaattgattgcggtacacgcccct CRISPR spacer attggttataattaaaattgattgcggtacacgcccct Protospacer *************************************
36. spacer 3.4|1717984|38|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
cttggttataattaaaattgattgcggtacacgcccct CRISPR spacer attggttataattaaaattgattgcggtacacgcccct Protospacer *************************************
37. spacer 3.7|1718187|35|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa CRISPR spacer actctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa Protospacer **********************************
38. spacer 3.7|1718187|35|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to NC_028743 (Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa CRISPR spacer actctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa Protospacer **********************************
39. spacer 3.12|1718520|35|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gcgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer ccgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
40. spacer 3.12|1718520|35|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gcgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer ccgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
41. spacer 3.12|1718520|35|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gcgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer ccgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
42. spacer 3.12|1718520|35|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gcgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer ccgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
43. spacer 3.12|1718520|35|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gcgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer ccgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
44. spacer 3.12|1718520|35|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gcgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer ccgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
45. spacer 3.13|1718586|36|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ggcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer agcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer .***********************************
46. spacer 3.13|1718586|36|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ggcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer agcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer .***********************************
47. spacer 3.13|1718586|36|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ggcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer agcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer .***********************************
48. spacer 3.13|1718586|36|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ggcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer agcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer .***********************************
49. spacer 3.13|1718586|36|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ggcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer agcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer .***********************************
50. spacer 3.13|1718586|36|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ggcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer agcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer .***********************************
51. spacer 1.1|915274|29|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to MH791397 (UNVERIFIED: Enterococcus phage EfsSzw-1, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
agacctgatactaatctagggtataaaga CRISPR spacer aaacctcataataatctagggtataaggc Protospacer *.**** *** ***************.*
52. spacer 3.27|1718521|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to NC_047750 (Mannheimia phage vB_MhM_1127AP1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.824
cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer cgcaagcactgcaccacggtagcaacggctagaa Protospacer ********.************.********. .
53. spacer 3.27|1718521|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to NC_028898 (Mannheimia phage vB_MhM_587AP1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.824
cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer cgcaagcactgcaccacggtagcaacggctagaa Protospacer ********.************.********. .
54. spacer 3.12|1718520|35|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to NC_047750 (Mannheimia phage vB_MhM_1127AP1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
gcgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer ccgcaagcactgcaccacggtagcaacggctagaa Protospacer ********.************.********. .
55. spacer 3.12|1718520|35|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to NC_028898 (Mannheimia phage vB_MhM_587AP1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
gcgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer ccgcaagcactgcaccacggtagcaacggctagaa Protospacer ********.************.********. .
56. spacer 3.28|1718587|35|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to HM144385 (Brochothrix phage NF5, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer ataattatcaacatctggtcgtgttactggtcgat Protospacer ... ******.****** *********** * *.
57. spacer 3.23|1718254|35|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to NC_014534 (Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782202, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tttaattaataaaatagctttagctttagatttaa CRISPR spacer ccaatctaataaaataattttagctttagatcggg Protospacer .. * .**********..*************. ..
58. spacer 3.25|1718387|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to NC_014533 (Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782201, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
tatcatttatcgcccgaaaaatccaaaaatcgca CRISPR spacer acaagcttatcgcccaaaaaatccaacaataaaa Protospacer ..*********.********** *** . *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
44690 : 52017
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017542|44690:52017|DBSCAN-SWA TTTATGACTTTCCATTGATATTTTTCTCCTTGTAATAAATCCACCCAAACAACCTCACCACAACCCAAAACACCCACGCCTTAATCGGATTCCCTTGCGAAATTAAGCAATGTCTTAACCGCTTGTCGGCTTCGGCTCGGCTGACTGTGCCCTTGATACCGTAGTCTCGGTCATGCTGATGACAGCAACTATTGATATTGGCTGGCGCATTACGCCAGCCTGTGCAGTAGTGTTTTTTAGTCACTTAAAACTCCTGAGTCACATAAATTTGAGATAAAAATGAGTCTGACAGTAATGTCAACTCATGCGTTGTTTTATACTGCAAATCAACAATGTCACCTACTTTTAAATAAACTACAGTATCAAAATTGATTGTTGTCATACCATTTGTATTTGATTTGCTGTTTTTAGGTGAAACACTTTGATTAATCAGTCTTTCTTTCTCTTCGTTATTTATTAACAGCCTGAGTTGATATAAATTCAGCACATCTTCCGATGAATTTGTAACCGTTATTTTACCTTTTAAATGAAAAGTGCCGCCTGTCCTTGCAATAAATTGACCACTGACAATATCAACATGACCATTGATATCATTTAACACTCTGTCAAACGGCATTTTTTGCCATTCTTGATTAACAGTAAAATTAATCGGCGATGAAAATCGCAATCTTAATCTGTGCTTATTTACTCCTAAGCTCAAATCATCGCAGAAAATAACACCTTGCTTACCTGATATAATCGCAGGATTGTCCGATAATTTATTACTCTTAAATGTTAAATTTAAGCACGGATTATTGCGAGCAAGTCTGACAGAATATTGCTTAGACTTGCTAATACAACGATTATTAATAAATTGGCACTGTTTTAAAATTGTCCCGTCAATATACACATCTTGATTAAATTCACTGGGCTCCAAAATGTTATTAATAAAATTGATATTATCAATAAACAATGAAGGATTATCGAAAGAACCATATTTCGATATTGCAATAGATTTTGCTTGATTATTTGAAAATTCTACATTGTTGCTGCCTGTGTCAGTCGGATTACCTGATGTGACACGCAAGCGACGGCAGAGGTTGCTGTTGATAATGGCATTTTTAGCACCAGACATCCAAATATCGTGGCTGCAAATATTATTCGCTACCACACATTCGCCAGTTTGTACATCTTCCACTTGTACGCCCGCTTCCACATCAACTGTCGTCACTGCCATCCCCTGTTCACGATTACCCAAAATGAAAATATCAGAGCAAGATGTTGCACCGTAAGCTGATACATTGCGACCTCCAATTGCTATATTGTTAAAAAATCGCACACCTTTAACTTTGGTGCAGAGATAATGTCCAGCATTACCTGAACCACAATACGATTGGCAGTTTTGTACAATCACATTATCAGTTGGGTAATTAGTATCCGCCTGAATACTTTCACCTGCCCTGACCCCGTAGAAGGTGCCATTAAACACAACATTGTCAATATGGAGATTTTTAACACCAGCATCATCCAAAGACTTAAATCGAATACCAATTGCTTTGTTCGGTGTTTCAATACAAAAACCCGAGATAAAATAATTGCTGTGATTAATATTAAAAACTTCGGCCTCTGCTTGCTGGATACCTGCACCTAATACTAATTTGCCGGTCTTATTGCCCAAAATTTGCACATTATCGCGAACAGAATTAACGGCATTGTTGATACGAAATGTACCGTTTTCGATAAAAAATTGAGAATATCTCATAGCATTTACAAATGCTGATTCATCATTTGTTACCCCGTCACCGACGGCCCCAAAATCAAATAATGTAAGATGTGAAAGGTCAACACGCTTCCACCGCCCCCCATTATTATTCACAACAAAACAAACCCCACCATCATCAGGCGTAACTAAATCCTGCAAATCAGCCACAAACTCCCCACCGCCTGTTGTGCCGTCCTCATAGTAAGCATCCACCAAAATACGCTGACCGTGTTCCGTTGGGCGGATAGTACGTAACTCCGCAACCGATTTGCAGCGACCGATGTGTTTGTAACCATCAGGGTTGGCTAATGCGTTAAAATTATCACGAGTAGCATCGCCCGCAATTTTCTTGATTGCTTTAGCCACCTGATTAACTTGTTCGTCATTTGCTTCGATTCCTGCTTCAGCAAGTACACTGTGCAATTCTTGTTGGGTGTTAATGACCGAATCTTGGACGTTATTCAAAAATTCAGCAGTCACAATCGTGCCATATTCACCAGTGGCAGGGTTGCCATCTTTAAAACGCTGTGTTGGGGTATTAATCGGATTCATCACTTGTTTCATTCAATATCTCCTAAATATCTTACCCACACACGGCTAAATGCAGGTTTTACCTCTTCAAGTAGACTTTCTAAAATTGGGTCTTTGTATCGTCCCATTAACGCATCGCCAGCCATTGACACGCTTGCTCTAAAACGCTTGTAATCATCTGTGGGGTTGCAAACATCCACAAAAAATGTCCACATAATGTCTTTATGCCATAACATATCCCCAGCTCGGCTTAGCCCAGCAATAAAGGGTTGTGGCTCACTAATTTTGATGCAATATCCAAGCTCTTTGGCCACTTGAGTGATATAGCCTATCGACAATCCACCCAACTGATTCAGCTTTGCAATCACACGCTCAATTCGGGTTTCAAGCGGTAGTGAGCTATTCGCCGTTAAGCCACAAACCCGCTCCCAATCATCAATAAAAATGCCTGTTGATACATCAACGGCATCGATTAAAGTCTTGGCTCTCGCATCAATGCGGTCTAGCTCTCTCCCCTCAACTTCAAGGGATAACGCTAGCCATCTGCCGTTTGGGTCATACGATACAGGCGGTAATAAACCGCCCAATGCCTTGCCGTGTTACCTGCGGCCATTTGTTGTGGTAGCCAGCGAGCCATATCTGCAAGCTCAAAGTTACCTGCTTGCCCGGCTGCAACTGCCATATCCAATGCCCGCCCAATATCCTCTTCTTTAATCCCAAATTGTTGCATTGAGGAGATCGCAATTTTTGCCATATCCTCGGAGCTTGCACCTGTTGCTACAGCACCTTTCTGCAAGGTTGGTAATAGGCTCATTGCAGTTTCAGCCTTCATCGTTCCTGAGGCAATTAGCGTATCAAGAGTTAAAAGAGCATCTTCTTTTGTTCCACCCCCAACCTTAACCGCCTCTTGCACCGCTGCTAATAACTCTTTCTTGCCCTCAATACGCCCTTTAACATCACGGTCGGAAAAGGCAGTGTTTGATGCCATCGCTAACTGTCGGTCAAACTCCATTTGGTTCTTGGCTGGCTGACGAGCCATTGCAGCACCTGCTGCAATACCGACACCGGCACTCATCAAACCACGCCCAAATCCTTTAGCCTTATCCCCAAAGCTTGTCTTACCCAATTCTGCATTCAGCTCTCGCACCCGTTGCTTAGTGGCTTCTGAGGCACGGCGTAGCTCATTTTGAGAGGCAACACCTGAGCGTTTTAAGCGGTCATAGGCTGCACGAGTTTGTTCAATTTCGCGTTGGATTGCATTTTCCGCCCGAACACCTAATGTTTCACGGGCTCGGCTCACATCGGCAGCCACTCGGCGGGCATTACGGTAACTCTGTTCTATTTTCCGATTTGAGCTTTCTGTAGCATTCGCTGCTTTCTGTGCTGCTTGCGTTTGAGCATTGCCACTTTTTTGTGCCGCTCGCTCTGTATTTTTAAAGGCTTTTTCGGCGGTTTTAGCGGCTTGGTTTAAAACTGGGGAGGCAGTATCTTTTGCCGTCAATTCCAGTTGCACTTTCATATTTTTTGCCATTTTTAAAGTCTCTTTAAACTAATTTTAAAGTACAAAAAAGGGGCTTTCGCCCCTATTCAATTTTGCCACACCGAGTAAAGACATAGCTTTCGCGTTTCACTTCGCTATTCGCACCCATTGGGCTATGCGGTGTTTTTACGCCCTCACTCTCCAAGTAGCTCTCAATCCACGCAAATACCTCAAGCAACGGCATTTGCCATACCTGCTCGGCGGTAATTGCAAATTTTGAGAGTAAAATCACCGCTTGTCGGTACTGCTTAAAGGCTTCTGCTACGCCAAATCGGGATTTGCCGGGCTTTCGCTCTCGCTTTGGCTCACCCCATTTTCTAACCGCTTTTTTCGGAGTGTGAGCGTTGCCTCAATCAACTGCCAGTAGTCTTCGGTAGCTAAATTGTCAAATAAAAATTGAGCCGTCACATTACCTTGATAAATACCATCAAAGGTAACTTGCTGCGAAAGGTAAGCCATATCGACCAAGGTTTGTTCACGCTTTGATAGGGCTTCCGAGTTTTCCTCAAACCCTAAATCCGCAATCATTTCTTGAGCCGTGCATTGACCGCCCATCGTCAGCAATCGCACCGTACAATCACGGCGAATTTTCCCGTTATATTCAATGCCAAGATTTAAAGTGATTTTCATTATTCATTCACCTTACGCAATGCGTTGAGTTGAATATCACGCACCGACTCACCATCAACGGTGTAAGACTCGCTCACATCGGTAGTAAAACAGCCTAAATAAGAGGTGCGTTTTTCGCTATTGTCTAACGGGTATTTAGTGAGCTTCGCATTTTTAATGTTATCCCAATCAATTACCGAACCGTCTTGAGGCTCAACTGCAGTCACCGAGAGAGTATATTCCGCAATGCCTTGCGAATAACCTCTTGCACGTCCGGAACTGTTCATCGTTTTAACCAGCTTGCGACCGGTTACGGTTTTTACATCAAGTTTGGTAATTTCAATCTCAACGCCATCTACCTCAAGCACGCAAGAGCCTTCATAAACAATTGACATCTAGCACCCCCTATAAAATTAACGTAATTTTGTTACGAATAACGTGCAAGCCATTAACCACATCCGCAGGGATTTCTAAATCCAAGTAAGTCGGGTCTTGATTACGCACCACTAATAAGCGATTTTTCCACGCTTCCACATTTTCGATTACCTCTTCGCCCTCAAGCTGATAAAGCACATCTAAAATCTCCGAGCGTACTTTTGCCACAATACGGTGGGAGTTTTTCGCACGAGGGAAACGCAAACGCTGACGGGTTTGGATTGCCTTACGCACATAGTCAAGCGTACGAATGGTGGTTAAATCCAAATAGCTTGGGTCATCAGTATTCGTCACGTTTTTGGTGTATGTAGTAATCGCACGGGTAATCTGCACACGGCTTGCCACCACCTCAATCGGGCTTAAACCGTGATATAACGCTTGGTTTACTTCGCTAAATAACGGTTTCTGCGAGTCATCTACGACCGTTAAGCCTTTAACTTCAAGGGTATTTAACGGGCGAGCCGGATCTTCTTCACCGGCAATTTCCGCCCTTGTTGCACCACATAATCGGGCAACTGCTTCAAGGCATACCGAACTTGGCTCTCTGTAGGTAAATCTTCGCCCTCATACTGCATTGCAAATTGAGCATAAGCCTGTGTGAGTGCCACATTGCTAAAGGTTTGATAAAACGGCAGAAAGGCTTGCAACCAACCACACCGCTCGGGCACGGCACGTTTTTGTGTTTTCAGCGGTATCATCTGTTTTAACCGTTCCGCTGAATTTTCGCCTGCCTCATACGCCAGCACCCAACTATGCAAGGTGCGTTTAGATAGCTTTAACTTTCCACCGGCTTTACTATTGCCCGCCATAATCGCTTTGCAAATTTCAGCAGGAATTTCACTGCTTGCCACCGCTGCAATGACTTGGTCTAGCGTTTTTGTGCGGCTTAGCCCCAACTGCACTTCCTGCATCAAGAACCACCGCACCACCATAATGCGAGCATCTGCCGTAGAAAGTTGTTTATCGGTTATCTGCTCCAAATCAATGTTTTGTCGCACTACACTCAATTCGCCTTTGCTGATTTCAGCAGGAAGAAGTTTGAGTAACTTGGTGCGGATTTCCTGTTGGACTTCGGTGGGTAAACTGATTAATTCATATTCAACCCCGCCGCCTCTGCCTTTGCGTTTTTGAGATTGCCAGTTTTCCCTTATTGCTTTCTCAAGCACATTTTTATGAGCACTTGGTAGGCTAGATAACTTAAAACTTAACAATTCAGCCACTGAATAGTGCGTTTTTAAACTTAATTCGCTCATAAATGTTCTTCTCCTATATCTTTTACGTTAAAGATCATTTATGATTAAAACTTATTAGTTAAAGTTGGTCGCCGATTACGTTCAATGCGTTCTGCTGTTCGCCCAGCCCAAATCACTTCAGGGGCAACCCCTATGGCATTTGCAACTAAGCGTTCCATTTTGGGGTAAGGCTTGTCTAAAACAGACTTCAGCGTGTTATGGCTAACATTGCCTGCTTTAGCCAAAGAACGAAGTGACCAACCTTTTTTACGAAGTTCCGCAAGAATATCGGCTTTATGCCAATCTCTCTGTGCGGTTTTTTTAACATCGTTTAATACACTCATTCGATACACCTCTTTTTATCTATTTGATGCGTGTATTTAACCGTAAAACTTTAAACAAATCAACCGTAAAACATAAAAACATCTAAAATATTTTTGCTTTATTCATAAATAACTTAAAAATCAATGGTTTATGAGTATGTTTTGCGAGTAAAACTTTATTAATGGAAACGTAAAAGATGAGTAAACCAAACATTTACGATGAGAGCTTCTCAGAAAGAATGAAATGGATTGCAAAAAATAGCTTTAAGGACAATTACAGTGAGTTTGCAAGAGCAGTGGGGGTAGCCCAAGCATCACTATCTAGGTGGGTAAAAGGAGAGGCAGATCCATCTCGTTCAAATCTTGTAAAAATAGCAGAGGTGTCAAATGTGAGCCTTGAATGGCTGGCAACAGGTAAGGAAAGCAAACCACAATCAGAGAATACCAGTATTGTGGCAAGAGAGTTTGAGCGACTAGAAAAAATGGCTGATGATATTGTTTCAATGATTAACAGCTTCAGAACAATCAACGTTTCAGCAGGCTTTGGCAGCTTTAACGAGGGCGTAACGAAGCCAGACGGGCAAGAACCTTACGCCGACAGCCTGCTGCAAAGCCTCGGCGTAAAAGCCCACAACTGCGGCGTGTTTTGGGCAAATGGAACATCAATGCACCCTACCATTGCAGACAGTGACCAAATGCTGGTAGATTTCAGCAAACGAGAGCCTCGTGGTGATGATAAGATTTATCTTGTGCAGAATGGGGAAAGCGTATGGGTTAAACGGATTAGAAAAGAATGGGACTATATTGAATTAATTAGCGATAACGAGTCCTACCGCCCAATACAGATTACCGCCGAAGAAGCTCAAAACCTCCAAATCATCGGGCAGGTAGTCCACATCGGACACTCTTTAGTTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017542|44690:52017|50842_51121_-|WP_006248972.1|DBSCAN-SWA MSVLNDVKKTAQRDWHKADILAELRKKGWSLRSLAKAGNVSHNTLKSVLDKPYPKMERLVANAIGVAPEVIWAGRTAERIERNRRPTLTNKF >NZ_CP017542|44690:52017|51297_52017_+|WP_006248970.1|DBSCAN-SWA MSKPNIYDESFSERMKWIAKNSFKDNYSEFARAVGVAQASLSRWVKGEADPSRSNLVKIAEVSNVSLEWLATGKESKPQSENTSIVAREFERLEKMADDIVSMINSFRTINVSAGFGSFNEGVTKPDGQEPYADSLLQSLGVKAHNCGVFWANGTSMHPTIADSDQMLVDFSKREPRGDDKIYLVQNGESVWVKRIRKEWDYIELISDNESYRPIQITAEEAQNLQIIGQVVHIGHSLV >NZ_CP017542|44690:52017|47496_48492_-|WP_006253442.1|tail|DBSCAN-SWA MAKNMKVQLELTAKDTASPVLNQAAKTAEKAFKNTERAAQKSGNAQTQAAQKAANATESSNRKIEQSYRNARRVAADVSRARETLGVRAENAIQREIEQTRAAYDRLKRSGVASQNELRRASEATKQRVRELNAELGKTSFGDKAKGFGRGLMSAGVGIAAGAAMARQPAKNQMEFDRQLAMASNTAFSDRDVKGRIEGKKELLAAVQEAVKVGGGTKEDALLTLDTLIASGTMKAETAMSLLPTLQKGAVATGASSEDMAKIAISSMQQFGIKEEDIGRALDMAVAAGQAGNFELADMARWLPQQMAAGNTARHWAVYYRLYRMTQTADG >NZ_CP017542|44690:52017|49130_49505_-|WP_006253444.1|DBSCAN-SWA MSIVYEGSCVLEVDGVEIEITKLDVKTVTGRKLVKTMNSSGRARGYSQGIAEYTLSVTAVEPQDGSVIDWDNIKNAKLTKYPLDNSEKRTSYLGCFTTDVSESYTVDGESVRDIQLNALRKVNE >NZ_CP017542|44690:52017|48762_49131_-|WP_006253443.1|DBSCAN-SWA MKITLNLGIEYNGKIRRDCTVRLLTMGGQCTAQEMIADLGFEENSEALSKREQTLVDMAYLSQQVTFDGIYQGNVTAQFLFDNLATEDYWQLIEATLTLRKKRLENGVSQSESESPANPDLA >NZ_CP017542|44690:52017|46990_47548_-|WP_006253441.1|DBSCAN-SWA MGGLLPPVSYDPNGRWLALSLEVEGRELDRIDARAKTLIDAVDVSTGIFIDDWERVCGLTANSSLPLETRIERVIAKLNQLGGLSIGYITQVAKELGYCIKISEPQPFIAGLSRAGDMLWHKDIMWTFFVDVCNPTDDYKRFRASVSMAGDALMGRYKDPILESLLEEVKPAFSRVWVRYLGDIE >NZ_CP017542|44690:52017|49994_50798_-|WP_006253446.1|transposase|DBSCAN-SWA MSELSLKTHYSVAELLSFKLSSLPSAHKNVLEKAIRENWQSQKRKGRGGGVEYELISLPTEVQQEIRTKLLKLLPAEISKGELSVVRQNIDLEQITDKQLSTADARIMVVRWFLMQEVQLGLSRTKTLDQVIAAVASSEIPAEICKAIMAGNSKAGGKLKLSKRTLHSWVLAYEAGENSAERLKQMIPLKTQKRAVPERCGWLQAFLPFYQTFSNVALTQAYAQFAMQYEGEDLPTESQVRYALKQLPDYVVQQGRKLPVKKIRLAR >NZ_CP017542|44690:52017|44690_44933_-|WP_006248673.1|DBSCAN-SWA MTKKHYCTGWRNAPANINSCCHQHDRDYGIKGTVSRAEADKRLRHCLISQGNPIKAWVFWVVVRLFGWIYYKEKNINGKS >NZ_CP017542|44690:52017|44933_46994_-|WP_134983781.1|tail|DBSCAN-SWA MKQVMNPINTPTQRFKDGNPATGEYGTIVTAEFLNNVQDSVINTQQELHSVLAEAGIEANDEQVNQVAKAIKKIAGDATRDNFNALANPDGYKHIGRCKSVAELRTIRPTEHGQRILVDAYYEDGTTGGGEFVADLQDLVTPDDGGVCFVVNNNGGRWKRVDLSHLTLFDFGAVGDGVTNDESAFVNAMRYSQFFIENGTFRINNAVNSVRDNVQILGNKTGKLVLGAGIQQAEAEVFNINHSNYFISGFCIETPNKAIGIRFKSLDDAGVKNLHIDNVVFNGTFYGVRAGESIQADTNYPTDNVIVQNCQSYCGSGNAGHYLCTKVKGVRFFNNIAIGGRNVSAYGATSCSDIFILGNREQGMAVTTVDVEAGVQVEDVQTGECVVANNICSHDIWMSGAKNAIINSNLCRRLRVTSGNPTDTGSNNVEFSNNQAKSIAISKYGSFDNPSLFIDNINFINNILEPSEFNQDVYIDGTILKQCQFINNRCISKSKQYSVRLARNNPCLNLTFKSNKLSDNPAIISGKQGVIFCDDLSLGVNKHRLRLRFSSPINFTVNQEWQKMPFDRVLNDINGHVDIVSGQFIARTGGTFHLKGKITVTNSSEDVLNLYQLRLLINNEEKERLINQSVSPKNSKSNTNGMTTINFDTVVYLKVGDIVDLQYKTTHELTLLSDSFLSQIYVTQEF >NZ_CP017542|44690:52017|48544_48733_-|WP_006251296.1|DBSCAN-SWA MILLSKFAITAEQVWQMPLLEVFAWIESYLESEGVKTPHSPMGANSEVKRESYVFTRCGKIE |
10 | Mannheimia_phage(80.0%) | transposase,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
575506 : 659439
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017542|575506:659439|DBSCAN-SWA 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92 | Mannheimia_phage(17.02%) | plate,transposase,tail,tRNA,head,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
915537 : 971502
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017542|915537:971502|DBSCAN-SWA 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59 | Mannheimia_phage(26.67%) | integrase,transposase | attL 938374:938389|attR 972403:972418 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1071348 : 1078133
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017542|1071348:1078133|DBSCAN-SWA TATGACAGAAAAATCGCAGTTAAACTTTAATTACCAACCTTCGAATAATCATGCTAATGCTCAGACGATGATCTTCTTACATGGATTGTTTGGAGATTTAAATAACCTAGGCGCAATAGCAAAACCATTCGCAGAACGTTACTCCATTTTAATGGTTGATCTCAGAAATCACGGGCGATCTTTTCATTCAGACGAAATGAATTATGCTTTGATTGCACAAGATTTAGCACAATTACTCACAGAATTAAATATCCAAAATGCTATTGTGGTTGGGCATTCAATGGGCGGAAAAAGTGCGATGGCATTGGCTGCATTTGCTCCTGAACTGGTGGAGAAATTGGTAGTGATTGATATTGCCCCGGTCACTTATACCCAAAATCGGCATCAGCAGGTTATGGCAGCCTTATTTGCGGTGAAAGAAGCTAAACCCCAGAATCGTCAGCAAGCTAAAGCGATAATGGCTGAATATATTCGAGATGAAGGCGTGCAACAGTTTATGTTGAAATCTTTTGATGCCCAAAGCGAGCAATCTTTCCGTTTTAATTTACAGGCGCTAAAAGATAATTATCAGAATGTGATGGGGTGGCAGCAGGTATTTGTGGATAAACCGACCTTGTTTATTAAAGGTGCATTATCGGATTATATTCAAGCAGAGCATACACAAACGATTTTGGCACAATTTCCGCAGGCCAAATCTTTCATTGTGGCAAACGCTGATCATTGGGTTCACGCAGAAAAAACAGGAACTGTTGTGAGAGCAATCAATAAATTTTTAGAAAAATAAGGGAGAAAAATGCAAAGAGATACATTATTTTCCGCTCCGATTGAGAAATTGGGCGATTTTACTTTTGATGAATCGGTTGCTGAAGTGTTTCCGGATATGATCCAACGCTCCGTGCCGGGCTATTCCAATATTATTACTGCTATTGGAATGTTGGCGGAGCGTTTTGTCACAGATAATTCAAATGTTTATGATTTAGGTTGTTCACGAGGCGCAGGGATTTTATCTATTCGCCGTAATGTGAATGCGAAGAATGTGCAGATTATCGGGGTAGATAATTCTCAGCCGATGGTTGAGCGTTGTAAAACCCATTTAAGTGCTTATCACTCTGAGATCCCGGTGACGATTTTACTTGATGATATTCGCCACATTGAAATTAAAAATGCTTCAATGGTGGTACTTAATTTCACCTTGCAATTTTTACCAAGAGAAGATCGCCTAGCATTATTACAGAAGATTTATCAAGGATTAAATTCCAATGGCATTTTAGTGTTATCGGAAAAATTTACCTTTGAGAGTGAGGAAATGAACGAGCTATTGATCGACCTTCATCACACATTCAAACGAGCAAATGGCTACAGTGAATTGGAAGTCAGCCAAAAGCGTAATGCTTTGGAAAATGTGATGCGAACAGATAGTATTGAAACCCATAAAAAACGTCTGCAAGAAGCTGGTTTTACACAAGTTGAACTTTGGTTTCAATGCTTTAATTTTGGCTCAATGATTGCAATTAAAGCCTAACAAGCGGTGATATTTGTAAAATTTTTTGCAAATTCTTGATAAAAAGCAACCGCTTGCATTCTATCTATTTCTTTATAATAAAAGTCAGTTAGAATCAGTTATAATGCACCACTACTTATTTAGGAGGAAAAAGGTATGGCAACGATAAAAGATGTCGCAAAATATGCTGGTGTATCGACTACAACGGTTTCTCACGTTATAAACAAAACCCGCTTTGTAGCAGAGGACACTACAAAAGCAGTTTGGGAGGCTATTAAAGCGCTGAACTATTCTCCTAGTGCTGTAGCGCGGAGTTTGAAAATTAATACGACTAAATCTATCGGTATGATCATTACAACCAGCGAATCACCGTTTTTCGCTGAAATTGTGTTAGCGGTAGAGGAATTTTGCTATAGCAAAGGGTATTCACTATTTTTGTGCAATACTCAAAACAAACTTGAGAAAATTCAAAATCATTTAGATATGCTCATCAAAAAACGGGTTGATGGCATTTTGGTGATGTGCTCCGAATATACAGCTAATTCATTTGATATCTTTGAAAACAGCAATATCCCAATGGTGATTATGGATTGGGGACGAAGTGATGAACGCAGTGATATTATTTTAGATCACGGTGTTGAAGGTGGCTATATTGCGACTCAGCATTTAATTGAAAACGGGCATCAAGATATTGCTGTAATTACCGGCAATAGAGATAAAGAAATTGCAAGAACCCGTTTTGAAGGTTTTAAAAAAGCGCTATCTGAGGCGGGTTTGTCTATTCGTGAAGAATGGATTCAAGAAGGCGATTTTGAACCTGAGGGGGGGTATGAGTGTATGAATAATTTGCTTAAGAGCAGTGAAAAATTACCAACCGCGGTTTTTTGTTTTAATGACTCAATGGCACTAGGGGCAATTTCAGCTATTACCGAAAAAGGGCTGAATGTGCCGCAAGATATTTCAGTGATCGGGTATGATAACGTGCATAGCTCACGCTTTTATGCACCGCCTCTTACGACAATCCATCAGTCAAAATCTCGCTTAGGCTCGGCAGCATTAGAATTATTATTAGAACGTATTGAAGATAACGAAAACGCAAAAGAGCCTAAAGTATTAGAGTTCTTTCCTGAATTGGTCAAACGTAAATCGGTTCGGAATTTAAACATTAAGGAGTAATATGGAAACATTGATTGAATTTTTTAGTAGCTATGGTTATTGGGCTGTTTTTCTTGTGCTACTTGCCTGTGGTTTCGGTGTGCCGATTCCTGAAGATATTACGTTAGTATCCGGTGGTGTTATTTCAGGATTAGGCTACACCAATGTGCATTGGATGCTGGTTGTTAGTATGTTAGGAGTATTAGTTGGCGATAGCACAATGTACTGGCTAGGTAGAATCTATGGCGAAAAAATTCTCAAATTTCCATTAATCAGGAATGTTGCGACACCTGAACGTTTTGCAACCGTGCAAGAACGTTTTGAAAAACAAGGATGGAAACTACTTTTTATGGCTCGTTTTTTACCTGGCTTGCGCGCGGTGGTTTACTTAGTTTCAGGTATTACCAGAAAAGTCAGCTTCGTAAAATTTTTATTAGTTGATTTCTGTGCCGCTATTATCTCTGTGCCAATTTGGGTTTATTTAGGCGACTATGGGGCATCTAATTTGGATTGGCTAAAAGAACAAGTAGCTAATGGGCAGCACCTCATTTTTGCCATTTTAGGCATTGTTATTCTATTTTTAGGCTGGAAATGGTATAAAAATAAAAAGCAGTATAAAAAGTGAAACAAAAGACGAGCATTTCATCTTAAAAAGATATAATAGCAAAACAGTTGGTAAGAATAATTATAAATATCCATTACCAACTGTTTTTTTGAACTATATTTTAACTTAAAAAATTAGGTTTAACTGTGTCACTTTTTCTTGAAGAAGAACGAAATAACAGTAAGTATTAAAAAGACAAAAAAGAGAATTTTGGCAATTTCAGTAGCACTTCCAGCAATACCACCAAATCCTAATAGCGCTGCGATTATAGCGATGACAAAAAATACGACTGCATAATGTAACATAGTTATACTCCTTACTGTGTAATAAACTGATTAAAAAACTAACATAGTTAATGTATGATTGCAAGGCATGTACTATATTAATCTTGATTAATCCGACTTGAAATGGCACTTTGCTGGTTCTTATATTTTGCATCTTTTCGCGCATTATAGGGTTTTGCAGCATCACCACTTAAAATCTCAAAGCTTAATGCGCCAATTGCCATATTAGGGCGTAAAGCTAGGGGTAATTTTCCAGCATTAAAAAATTCCAATACAATTTTGCCTTCCCAACCCGGATCGATTCTGTGGGCGGTAACGTGTACCATTAAGCCTAATCTAGCAAGTGACGAACGACCATCTAACCATCCAACGATATTGGCTGGTAAGGAAACCGATTCAAGGGTTGTTGCGAGTGCAAGGTCACCGGGATGAAGGAAAAATGCTTCATCATCACCGATGATAATTTCATCACTCATCACTTTATTTAACTGAGCGGCAACTTCTTCTCTAGGGCCACTTAAATCAATATAGGGCGTTTTATGTTCACGAAATACACGAAACGAATTACCTAAACGCACATCTGCAGTGGCGCCAGAAATTTTATCGTCTGAAGGTCGAGGCGTTATGGCAATAATACCTTCATCTAAGTAACGTTTAATATCTGTATCACATAAACGCATATTTAGCTCCTATTTTATTTTAGTAATTGCTTAATTTGTGCTTTAAGAATATCAATGGCAATACGGTTTTTGCCACCTTTTGGCACAATAATATCAGCATATTGTTTAGAGGGTTCGATAAATTGTAAGAACATTGGGCGAACGGTTTTGCGATATTGACTAATCACTGATTCCATCGAACGTCCACGTTCCACCATATCACGTTGTAAGCGGCGGATAAAGCAGATGTCCAGAGGAGCATCTACGAAAATAGAAACATTAATTTCATTGCGAATATTCTCATCTGTCAGCAATAAAATACCTTCTAAAATAATGATTTTCTTTGGTTCAAAGTGCTTCGTGGTCGTTTTACGATTATGTTCGGTATAGTCATATTCTGGAATTTCAATCGCATTACCTTGTTTTAATTGGCGTAAATGTTCAACCAATAAATGATGATCCATTGAATTAGGGTGATCGTAATTGGTTTTAATCCGTTCTTCCATTGTTAGATGAGATTGATCTCTATAATAAGCATCTTCGGAAATAATACCGATATTATCTGTTCCCAATTCATTTTTGAGTTCTTTATAGATGGTTGAGGCAATCAGGCTCTTACCTGAGGCAGATGCGCCGGCAATCGCAATGACAACGCAAGATGAAGTCTGGCTAGTATCAGTCATAAAAAATTTCCTATTCAGTCAAAAGAGTATTCGATAAATTATACCGAAGTTTTGCAAAATTTTTTGTATAATTGACCGCTTGTTATGCGATTTTGGAGAAAAAATGGATATTTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017542|1071348:1078133|1071348_1072131_+|WP_006253612.1|DBSCAN-SWA MTEKSQLNFNYQPSNNHANAQTMIFLHGLFGDLNNLGAIAKPFAERYSILMVDLRNHGRSFHSDEMNYALIAQDLAQLLTELNIQNAIVVGHSMGGKSAMALAAFAPELVEKLVVIDIAPVTYTQNRHQQVMAALFAVKEAKPQNRQQAKAIMAEYIRDEGVQQFMLKSFDAQSEQSFRFNLQALKDNYQNVMGWQQVFVDKPTLFIKGALSDYIQAEHTQTILAQFPQAKSFIVANADHWVHAEKTGTVVRAINKFLEK >NZ_CP017542|1071348:1078133|1077080_1078133_+|WP_006248955.1|DBSCAN-SWA MFKKFLGLFSNDLSIDLGTANTLVYVKGQGIVLDEPSVVAVRQDRMGSLKSIAAVGSHAKLMLGRTPKSIMAIRPMKDGVIADFFVTEKMLQHFIKQVHSNNFMRPSPRVLVCVPAGATQVERRAIKESAIGAGAREVYLIEEPMAAAIGAGLPVHEAMGSMVIDIGGGTTEVAVLSLNGIVYSTSVRIGGDKLDEAIIAYVRRHFGSAIGEATAERIKQEIASAKIESDDDVKTMEVHGHNLAEGAPRTFELNSRHVLEAIEQPLNGIVEAVKSVLEQCPPELAADIFERGMVLTGGGALLHNLDRLLSDSTGVQVVVAEDPLTCVARGGGKALEMIDMHGGDVFSIDD >NZ_CP017542|1071348:1078133|1075585_1076233_-|WP_006248953.1|DBSCAN-SWA MTDTSQTSSCVVIAIAGASASGKSLIASTIYKELKNELGTDNIGIISEDAYYRDQSHLTMEERIKTNYDHPNSMDHHLLVEHLRQLKQGNAIEIPEYDYTEHNRKTTTKHFEPKKIIILEGILLLTDENIRNEINVSIFVDAPLDICFIRRLQRDMVERGRSMESVISQYRKTVRPMFLQFIEPSKQYADIIVPKGGKNRIAIDILKAQIKQLLK >NZ_CP017542|1071348:1078133|1072140_1072869_+|WP_006248948.1|DBSCAN-SWA MQRDTLFSAPIEKLGDFTFDESVAEVFPDMIQRSVPGYSNIITAIGMLAERFVTDNSNVYDLGCSRGAGILSIRRNVNAKNVQIIGVDNSQPMVERCKTHLSAYHSEIPVTILLDDIRHIEIKNASMVVLNFTLQFLPREDRLALLQKIYQGLNSNGILVLSEKFTFESEEMNELLIDLHHTFKRANGYSELEVSQKRNALENVMRTDSIETHKKRLQEAGFTQVELWFQCFNFGSMIAIKA >NZ_CP017542|1071348:1078133|1074756_1074912_-|WP_006248951.1|DBSCAN-SWA MLHYAVVFFVIAIIAALLGFGGIAGSATEIAKILFFVFLILTVISFFFKKK >NZ_CP017542|1071348:1078133|1074989_1075571_-|WP_006248952.1|DBSCAN-SWA MRLCDTDIKRYLDEGIIAITPRPSDDKISGATADVRLGNSFRVFREHKTPYIDLSGPREEVAAQLNKVMSDEIIIGDDEAFFLHPGDLALATTLESVSLPANIVGWLDGRSSLARLGLMVHVTAHRIDPGWEGKIVLEFFNAGKLPLALRPNMAIGALSFEILSGDAAKPYNARKDAKYKNQQSAISSRINQD >NZ_CP017542|1071348:1078133|1073004_1074024_+|WP_006248949.1|DBSCAN-SWA MATIKDVAKYAGVSTTTVSHVINKTRFVAEDTTKAVWEAIKALNYSPSAVARSLKINTTKSIGMIITTSESPFFAEIVLAVEEFCYSKGYSLFLCNTQNKLEKIQNHLDMLIKKRVDGILVMCSEYTANSFDIFENSNIPMVIMDWGRSDERSDIILDHGVEGGYIATQHLIENGHQDIAVITGNRDKEIARTRFEGFKKALSEAGLSIREEWIQEGDFEPEGGYECMNNLLKSSEKLPTAVFCFNDSMALGAISAITEKGLNVPQDISVIGYDNVHSSRFYAPPLTTIHQSKSRLGSAALELLLERIEDNENAKEPKVLEFFPELVKRKSVRNLNIKE >NZ_CP017542|1071348:1078133|1076336_1076966_+|WP_006248954.1|DBSCAN-SWA MDIFIQGFIVCFGLIVSIGAQNAFLLKQGILKQHIFWIALLCFLGDVFLMTIGVLGLGTLIAELPVVSFIISLLGAIFLLSYGSRSFISVFKSGEYLVASGENATSLKKALLITFAITFLNPHVYIDTVVIVGSIGGKLDFNGKIYFLAGALLCSFIWFFGIGYGASLLSPYFAKRRTWQILDAVTGLIMYFIAFSLLIYTYQLALQIF >NZ_CP017542|1071348:1078133|1074025_1074628_+|WP_006248950.1|DBSCAN-SWA METLIEFFSSYGYWAVFLVLLACGFGVPIPEDITLVSGGVISGLGYTNVHWMLVVSMLGVLVGDSTMYWLGRIYGEKILKFPLIRNVATPERFATVQERFEKQGWKLLFMARFLPGLRAVVYLVSGITRKVSFVKFLLVDFCAAIISVPIWVYLGDYGASNLDWLKEQVANGQHLIFAILGIVILFLGWKWYKNKKQYKK |
9 | Mycobacterium_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1158264 : 1175995
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP017542|1158264:1175995|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP017542|1158264:1175995|1171005_1171821_+|WP_000018321.1|DBSCAN-SWA MSHIQRETSCSRPRLNSNLDADLYGYKWARDNVGQSGATIYRLYGKPDAPELFLKHGKGSVANDVTDEMVRLNWLTAFMPLPTIKHFIRTPDDAWLLTTALPGKTAFQVLEEYPDSGENIVDALAAFLRRLHSIPVSNCPFNSDRVFRLAQAQSRMNNGLVDASDFDDERNGWPVEQVWKEMHKLLPFSPDSVVTHGDFSLDNLIFDEGKLIGCIDVGRVGIADRYQDLAILWNCLGEFSPSLQKRLFQKYGIDNPDMNKLQFHLMLDEFF >NZ_CP017542|1158264:1175995|1158264_1159029_+|WP_014325826.1|integrase|DBSCAN-SWA MLIEWRNQIVGDKIKAVTWNNYVRHLKSLYNFGLSQGVLNINQNPFNQLFIRESKRRKKTYSTEQLHKIDHILNNNILLPDFLKPSWFILAIIMTLRCTGIRRGQLVKLKIGDVNLSNRTIYISPEINKNHDYHIVPISDSLYLHIERLITELKIRKQTDNCQLFNLNLFSRCSRRRGQPMSQNQLTHIFRHISDLVGFTSSPHRFRHTVATQLMKKPENVYVVQKLLGHKDISVTLGYIEHDVEMLRETVNLL >NZ_CP017542|1158264:1175995|1161620_1163114_-|WP_001120888.1|transposase|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP017542|1158264:1175995|1160295_1161201_-|WP_014325825.1|DBSCAN-SWA MNKNTKIKNKNFNIKDSQNFLHNTKLVEDLLFKSNITKEDFVVEIGPGKGIITKALSKICKAVNAIEFDSVLADKLSHEFKSSNVSIIEADFLKYNLPDHNYKVFSNIPFNITASILNKLLDSENPPLDTFLIMQYEPFLKYAGAPSYKESYKSLLYKPFFKTNILHSFSKFDFKPAPNANIILGQFSYKDFTDINLEDRHAWKDFLAFVFLEKGVTFKEKTKRIFSYKQQKIILKESRINDDSNISNWSYEFWLKMFKLYNSNMVSKDKKVLVNNSYKRMLEHESSLEKIHRNRKQNNRK >NZ_CP017542|1158264:1175995|1169833_1170670_+|WP_000480968.1|DBSCAN-SWA MFMPPVFPAHWHVSQPVLIADTFSSLVWKVSLPDGTPAIVKGLKPIEDIADELRGADYLVWRNGRGAVRLLGRENNLMLLEYAGERMLSHIVAEHGDYQATEIAAELMAKLYAASEEPLPSALLPIRDRFAALFQRARDDQNAGCQTDYVHAAIIADQMMSNASELRGLHGDLHHENIMFSSRGWLVIDPVGLVGEVGFGAANMFYDPADRDDLCLDPRRIAQMADAFSRALDVDPRRLLDQAYAYGCLSAAWNADGEEEQRDLAIAAAIKQVRQTSY >NZ_CP017542|1158264:1175995|1166254_1166479_-|WP_075268008.1|DBSCAN-SWA MFELCRINANQGLTAEIDWNYTSWSRRCRKILIGLVVRGAKTVVVRGKNRILTRNRKKPEMTVPIIYLFGGVHL >NZ_CP017542|1158264:1175995|1166561_1167854_-|WP_014325823.1|transposase|DBSCAN-SWA MGTYIPHREGIIQTIVRNSLTQYQAYASPSQTILDRLEHFAECADWTKGVVRIRCHDCGHSYFRPFSCKVFHLCPSCDQKRTLLYAEYLAEDLLLDLPHRQFVFTIPKILRPYFKSDKRLFGEVSRLVFSLLSDFFSLAAGQELLCACVVSYQSFGEFARFHPHWHVLVLEGGFTKYDRFVYLPIGADEGMLKVWQAAIMALFLRKELIDQARVNMLRDWKHSGFSIESETRLFNKADREALGQYVVRGATCAEKIQYDPASDTIIWTASPKGFYKGKTETFKGFEFVDQLVAHLPPRRVQLLRRYGVYAGKVRKQWQERPNIYSLAPESWQKGHPRESKIVPAIPQEKPETVQVSDAWSKLRKQSWARLLQKVYEVDPFVCPKCQGTMSVVAIIEDPKELAKIINWAKQQEREQPVAVCARSPPELALV >NZ_CP017542|1158264:1175995|1163225_1163531_-|WP_001255015.1|DBSCAN-SWA MRRTNHRNLVNVGILSGRIPLISLVQFIAVAEHLNFRHAAKALGISQSSVSARVKALEDNLGVLLFERHARGVRLTDAGRHFMERVTAGVDQLDHAVKTAE >NZ_CP017542|1158264:1175995|1175095_1175995_-|WP_012340803.1|integrase|DBSCAN-SWA MSFEQLLHLFFLERNHRPATIRSYQNVIAQIVKFYPDKEPEQISKLDLLEWRKYCLNKMSPITWNSYIRHLKAIFNYAIDNELFEYPKNLFKGLMVRPDKPKKKLLTERQIHFLEISLENEEKLPHYLQPAYFTKALIYTLKYTAIRQSQLLQLKISDIDMTSKIINIRAETNKNHEHHEIPISDKLYPYLKRLILESRARSTSSDEQLFNINRFSLVTTSRNKKMTEGQLVHFFRHISEFIGFTVTSHRFRHTTATEVLKQSGDIYAVKQLLGHKDLTVTLTYIHNDPEMLRKHVNSL 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MLRSQRRGRDPPCWLSEKEPLVGKRRVNFQRCWLPVSRIGLHRRGVERVNCGPKLLDLGEKGVYSSYTLVFLMSVENILTV >NZ_CP017542|1158264:1175995|1168016_1168862_+|WP_025288851.1|DBSCAN-SWA MEYTSKSQIARNKSLIIFGIVNITSDSFSDGGRYLAPDAAIAQARKLMAEGADVIDLGPASSNPDAAPVSSDTEIARIAPVLDALKADGIPVSLDSYQPATQAYALSRGVAYLNDIRGFPDAAFYPQLAKSSAKLVVMHSVQDGQADRREAPAGDIMDHIAAFFDARIAALTGAGIKRNRLVLDPGMGFFLGAAPETSLSVLARFDELRLRFDLPVLLSVSRKSFLRALTGRGPGDVGAATLAAELAAAAGGADFIRTHEPRPLRDGLAVLAALKETARIR >NZ_CP017542|1158264:1175995|1159206_1160181_+|WP_075283441.1|transposase|DBSCAN-SWA MMSTSYRHLTINEREKIMILLAQGKKQAEIAKALGRSSSTISRELKRHALESYSATNAQNSYLKHRQNSKAQRKLEQPEYFNLVQEKFLTENWSPEQISARLKLEKSELSISYSTIYRGIYSGLFDIGERKASRKLRHKGKTRHTKNHHEKRGKIQISNHLNDRPISAQNRSRFGHWEADTVLGKAGGACLLTLTERKSRFELVKKIPAKKAEAVQKAMIELLDSHILRSITPDRGKEFAQHRLVTEALGVEFYFPEPHQPWTRGTNENTNGLLREYFPKHQDINQWSEVDIQQVVNKLNLRPRKCLGWKTPYEVYFKKTLHLV >NZ_CP017542|1158264:1175995|1173848_1174823_+|WP_075266381.1|transposase|DBSCAN-SWA MMSTSYRHLTINEREKIMILLAQGKKQAEIAKALGRSSSTISRELKRHALESYSATNAQNSYLKHRQNSKAQRKLEQPEYFNLVQEKFLTENWSPEQISARLKLEKSELSISYSTIYRGIYSGLFDIGERKASRKLRHKGKTRHTKNHHEKRGKIQISNHLNDRPISAQNRSRFGHWKADTVLGKAGGACLLTLTERKSRFELVKKIPAKKAEAVQKAMIELLDSHILRSITPDRGKEFAQHRLVTEALGVEFYFPEPHQPWTRGTNENTNGLLREYFPKHQDINQWSEVDIQQVVNKLNLRPRKCLGWKTPYEVYFKKTLHLV >NZ_CP017542|1158264:1175995|1165049_1165934_-|WP_001447541.1|DBSCAN-SWA MLRSQRRGRDPPCWLSEKEPLVGKRRVNFQRCWLPVSRIGLHRRGVERVNCGPKLLDLGEKGVYSSYTCRVPGGDYEGYVDAHVRRLEALRRAGIVERIDADQWRIPDDLVSRAAAHDAGRDSQASVRVLSPVDLNKQIGSDGATWLDRRLIHGETADLAPTGFGQQVREAMDQRREHHIEQGDATRSRDSRVFYRRNLLAILREREVAGVGSDMALSKGLPFRAATDGESVSGKFTGTVHLSSGKFAVVEKSHEFTLVPWRPIIDRQLGREVMGIVQGGSVSWQLGRQRGLER |
18 | Staphylococcus_phage(28.57%) | integrase,transposase | attL 1158997:1159011|attR 1176870:1176884 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1272277 : 1371870
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP017542|1272277:1371870|DBSCAN-SWA CTCATTCTTCAATAACCTCAATATTTTCAATTAAACAACAGGCGTTAAAATCTTCTACAATGTAATCCACATTGAGGGAGTAAAATGTCTCTACGCTGTCTTTTTGTGGCGTATCAAACGCTTTACGGCGGATATTGTTTAAATGAAGATATAGCGAAAGGTTATCTAATCGAGTGATTAAAATCGCATTGCTTGGGAAGTAGGGAATACTTACCGCTTTTAGTCCGCCTTTAGCTTGTTGGCATAAGGTTAATAAGTCGGCTAGGTTTTCGCTTAAATCGTTGTGTTCAAGCTGAATTACATCATCAGCGATAATATCCCGCCCACAAATGGCGATCATATCTCCGCCCATTGCATACGCTGGGCTAATTTTGCCTAATCCCTGCTTAATCAGAGCATTTAGGCTTTTGTATTGTTGCTCTTTGCCTATGGTTGCTCCATTAATTACCGCTTCGGGCTTGCCCTCTCTGATTTTTTGTAGCCAGCCTTTTTTCACGTCTTGGGCGAGTTGGTTGTTTGTCGCGTTTGATGTATCTGCACGGCTTACGCCTTGCCAGCCAACCATTAAAAGCCCTCTTAGAAGGTTGTCATCAAGTAACTGATTTAAGCGTTCTTCTAAGCTGTTTTCGAGGTTGTAAGCATCGATTTTTTCATAGCGAATATAGCTATCAATGTTGATTTGTTCGCAGTGGTATTTTTGAGCGGGTGCAAGGGCTTGTTTTGGCTCTCGTTCCTCTCCGCTTTCGGTGTTGGTTGTGCCGGCTATCGGTGTGAATAGCCCAATCGCTTCGCCCTTTGCGTGCTTGGTTTGCACTAAATTCAATAATTTAAAAAGGCGATTTTGTTTTAAGCGGCTAATTAGTTTTGCCTGTTCTTCGGGGCTATCGTCAAATAAAATAACGTTACCTTGTTTATCTAGTTTTAATGCGTGGGCGAAAGTGGATAAACTCATTTTTTACCTCTTATAAGTTATTAATTAATTCAGCTAAGCCGGTAGGTTTTGCTTCAAATTTTTCACGGTGTAATGCCATTGGCGATTTTTGTTCAAAACTTGCTAACTGTTCAGAATAAAGAATTAATGTTTTTTCAAGTGGCTGTTCCTTTTCAATTCTAGCCATTATATTTTCTGTTAGATATGCCAGAATAGCTTGCTCTTCACTTTCATCTGTGAGGTTTTTATTTTGTTTGAATTTTCCACTGTAGAATAAGTAAGTATAAATTTCTGCTAAATTTTCTTTATTTTGTTCAATAAATTGATTAAATAATACTTCTGCTTTTTCTAATAAAATTATACGTCTGATTTGTTTTAGTTCATTCTGCTGTTGGAATAATATTTCTTGCTCTGCGTAGCATTTATTTTCTAAATCAACAATCAACGCTTGATAATATTCTATGCGTGCTTGTAAACCACTATTTTTATTTTTGATTTCAACATATTCATCTGCTGAAAGCGTGCCGATATTGGCTAAATTCGTTTTTTGCCGTGCGACAAATTCCGCTTTTTCGTTTTGCAATGCCTCAAGAATATTTTTCGCTTTGTCTAATTCGGTCTGAATAGCTAAAACGGCTTTTTCTTGTTCGTGGAATTTAGCTTTTTGTTGGTTAAATGTTTCAAGTGTCATAATTTGCCCTTATTGGTTGCGGTGTTGTTCAATTTTGCGTTGAATCCATTGCTGGATTTCACTTTCTAGCCATACTTTGCTATTTGCCCCAATACTGATACTTTGGGGAAAATCGCCGGCTTTCATTTTGCGATAAATCTGCGTTTCTGAAAGCGTAGTTACGGCTGAAACTTCATCTATTTTCATAAATCGCTGTTTTGCTGGTGTGTTCTCCATTTTGTTTTACTCCGTAAAAATTTGCTTTGGCGTGCTATTGCCTGCTAACGTGTGAAAGAATAAATCATCTTGGATTTTTTGCTATTTGTTAGGGCTGTGAAAGGAGATTTTACAGATTAGAGGGGCTTAATTCTGATTTGGAAAACTTGCAAGCGGTTATTTTTCTCTGATTTTTTGCAAGTTTTCAGCGGTTCTTTCATCGTTCTGTCATCGAGTTTTTAAAAGTGGTGTTTCTGCCTGCGTAAATTTGCGTTTTCTTGCGTAAAATTGCGTAATAAAAAACGGCTATATGAAAGTTTTTCACGCTATACGGGGCAATGTTTGGGCTTAATTTTGCATTTGCGTAGAAATCGAGACTTTAAGTGTGCGGGCGAGGCGTGGGATAGACGGCACGGGCTGGGAGCTGATAGGAAAAAATGAAAATTTTTCATCAAGCAAAAAGAAAGGCGGATTGCTCCGCCTTTGTCATTTAAATGCTCTTGCATTGTTCTACAAAATCCGCCCATTCCTGCATTATTCCACGTCTGCGGTCTAGCCAGTTTTTACGGTGGTATGCACTCATTACGGTGTCTTTGTTCGTGTGGGATAAACAAGCCTCAATTACTAGCGTTTCAGTAGTAAAACGTTCGTGTAAATAGGTGCTGGCAATGCTTCTTAAACCGTGAGCCACTAAAAGCCCTTTATATTTTCCACCGCTTAAGCGTTTTATTGCATTATTCACGGTTTGGCTATTAGCCGGTTTGTTTCGGTCTGTTCGGTGTGTAAAAATATGTTTATGGTGTCCGTTATATTTCTTCATTTCCTCTAGGATTGCGATAGCTTGTTTTGTTAGCGGTACAGAATGCGGATTTTTTCCGCCTTTCATTCTATCTGCCGGAATGTTGAGCGTCTTAGTTTCCCAATCTATATCGCTCCATTGCACCGCTACGGCTTCAAACGGTCTAAGAATATTCAAGAGTTGCCATTCAACTAATAATTTAATTTGAGGCGTTCTATTTGATTTCTGCAAGTCTTGCATAAATTCGGCTAACTCTTCGGGCATTATTGCTGGCTGGTGTGTCGTGCTTACGCTGGAAAACGCCTTTTTAATGACGCTGATTGGGTTAAAATTAATTCTCCCACACAATACCGCATAATCAAGAATTTCTATTAAATTCCCTGCTATTCTGTGCAAAGTGTCGGGCATTATCCGATCTAAGTCCGTTAAGCGGTTGATTGTATCGGTTAAGGTAAAATCTTCCAGCGTATAGCCTTCAAAACGTGGGAATAAATGATTTTCTAACCGCTGTAAGCATTTTTCCATTGTTTTAGGCTTGCATTTTCCCTTTGATAGCTTCCAATCAGCCCATTTATAGGCGAAAGATTGAATAGATTCTTGCTTTTCCTTAGCTTCTCTTTGCATTTTGGCTAAATGCTCGAAAGGGTCTAAGCCTTGTAAAACAAGGGTATTTAGTTCGTCTCTCTTTAAGCGTGCTTCGGCTAAGCTCATTTGCGGATAGCTACCGATTCTATTTTTTGTGCTTCGCTTGCCTGTTTTGGGGCTGATATAGCTATAAATCCATACTTTCGCTTTTTTCTGTGCAAGAATAAATAGCCCGTTGCTGTCTGCGATAGGCTTCGCATTTGGGGAATATTTGAGATTTTTTAGTAATGTGTCTGAAAGTGTTTTTTTAGTTGCAGTCATTTCTTCTAATCCTTGATATATAAGGGTTTATCGAAGTTTATGATCCCTAAATTTTCCCGTTTTCAAAATAGGGATCATTTTAGGGATCATAAACACTAAGATACAATGCAACTAAAGAAGACAATAAGAGACTATAAAAGAATCTAAGTTCTTGATTTTATAGTAAATTTGAGACAATGAAAGACAATATGCAACGCTTAGATGGTCCCCCCAGCCGGACTTGAACCAGCGACCAAGCGATTATGAGTCGCCTGCTCTAACCACTGAGCTATGGGGGGATTTGAAAAGTGGTTGGAATTATAGAGAAAAACCGAGTAGTCGTCTAGAGGCAGAAGATTACTCGGTTAATTATTGAACGAGAGAAAATAGGGTTATTCTGTTCGCCAAATTAAGGTTGCCATTCGCCCGGTTTGTTTGTCTCGGCGGTAGGAAAAAAACAGTTCTGGTTGGCTGTAGGTGCAATATTCACCGCCTGAAATGGCGGTAATGCCTAATTTATTCAGACGTTGGGTGGCAATTTGGTAAAGATTTCCTAAAAATTTACCGCTTGTAGTGCTGTCTTCAATAAGGGCTTCTTTCGCTCTTGGGTCAAAAGCACAGAATTGGTCTGCCACTTCACTCCCGACTTGAAAAGCATTCGGTCCGATAGCCGGCCCTAGCCAAGCTGATATTTCGTGTGGCGGGCAGTTGAATTTCTCTACCGTCGCCTCTAATATGCCATCGCATAACCCACGCCAGCCGGCGTGTGCCGCCGCAATTTCCGACCCGTCTTGGCTGGCAAATAATACCGGCAAACAATCTGCAGTCATCACTAAGCAGACTTGGTTTGGTTGATTGGTGTAAATCGCATCGGCTTTAATATTATCACCTGAATAGGGAAGTTCAATCACTCGGGTGCTGTGAGTTTGGGTTAAAAACAGCGGAGCTTGTGGTAATTGAAATTTCTCAACCAATAAAGCACGATTTTGAGCGATATCTTGTGGCTCGTCATTAACGTGATCACCTAAGTTGAAACTGTCAAAAGGCGGTTTGCTTACTCCGCCTGTTCTTAAGGTCGTCAGTGCGTGAATATGTTTAGGCACATTCCAATTTGGAATAATTTTATCCATTTGCAAAAAATCTCAAGAAAATGACCGCTTGTTATCGGCGTACTGCAATCGCTTCGATCTCAATGCCAACATCTTTTGGTAAACGAGCCACTTCTACGCAAGAACGAGCCGGAAAATTAGGGTGTTCGTTTTCTTGGAAGAAGGCTTGGTATTCCGCATTTACCTTTGCGAAGTCGTTAAGATCTTTGACAAATACGGTGGTCTTTACAATATCGGCAACGGTTAAGCCGGCTTGTTCGATAATGGCTTTCACGTTGTTCAGAGATTGGCGGGTTTGTTGCACAATATCACTCGGGATTTCGCCGGTTTCAGGATTCACGGGAATTTGCCCAGAAGTTAAAACCATATTGCCTAAATCAACTGCTTGCA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117 | Mannheimia_phage(85.0%) | transposase,tail,tRNA,terminase,integrase,capsid,protease | attL 1272063:1272081|attR 1294208:1294226 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1550538 : 1642325
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP017542|1550538:1642325|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP017542|1550538:1642325|1605443_1605896_-|WP_006249152.1|DBSCAN-SWA MQFEQHFEANFWQNKSLLEMNDAEWEALCDGCGKCCYRKYIQGRGRRERLYYTSVACNLLDVNTGRCMNYSNRFKIESDCTKLTKKNLPDFGWLPKTCAYRLLYEGKPLFDWHPLISKDPDSVKNAGMLIANGIHEKDVIDWFEFVIDEV >NZ_CP017542|1550538:1642325|1611003_1612725_-|WP_006249159.1|DBSCAN-SWA MEKIIKRRPLLTTEIVSTNPLLNRIYQSRGIKNTQELEHNLKNLHRPQQLANIEQAVDLLLQAFREKSRIIIVGDFDADGATSTSLALIALRQLGFDKVDYLIPDRFSQGYGLSVAVAEMVLAKGADLVLTVDNGISSTEGIALLKSHQIQVLVTDHHLPPESLPNADALVNPNLAFCEFPSKSLAGVGVIFYVMMALRSRMREQHLFENKPEPNFAELLDLVALGTVADVVPLDQNNRILVHQGLQRIRSGHCRLGIKALAEVGKRDLSTLQAADLGFAIAPRLNAAGRLENMSLGVELLICENMELARRLALDLDSLNQTRKEFEQEMKAEALSICANLPSLAQSEQAHGIVLYQADWHQGVIGILASRIKDQFNRPVIAFAQESEESEYLKGSARSINGVHMRDLLEHIDMRHPDLIEKFGGHAMAAGLTIHQSKLDLFKQIFDQSINAIIEPEQLQGIIYTDGELNALEFTLANAEMIRQGGPWGQHFPEPSFEGEFSILQQKLLAGKHLKLMLQSEKGQLFDAIWFNVDVRAFPDLSIKKARLVYRLDINEFRGEKSLQLKVEYLKYI >NZ_CP017542|1550538:1642325|1633643_1634594_+|WP_006253370.1|DBSCAN-SWA 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111 | Mannheimia_phage(90.24%) | plate,portal,transposase,tail,holin,tRNA,head,integrase,terminase,capsid | attL 1634372:1634390|attR 1651141:1651159 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1647898 : 1736152
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP017542|1647898:1736152|DBSCAN-SWA 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99 | Mannheimia_phage(56.36%) | portal,transposase,tail,holin,tRNA,terminase,integrase | attL 1656434:1656467|attR 1679747:1679780 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1861515 : 1871832
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP017542|1861515:1871832|DBSCAN-SWA ACTAGAATTTAACTGAGTTAGCGTGGTTGAGTAAATGGTCTGCATTAAGATGGGCATATTTCTTTACCATCTCTAATGTTTCCCAGCCACCCAATTCTTTTAAGGTAAATAATGGTGTGCCGGCCTGAACGTGCCAACTGGCCCAAGTATGCCTTAAATCATGGAAATGGAAATCAACCAATAAACATTTTTCAGTCGCTTTGTTAAATATTTTGCGGTTAATATCTTGTAATGCCTGCCCTTTGCTTCCTACAAAAACATATTTAGGATTTTTCCCTCTCTGCTTTTGTAATAATTCAATTGCATCATCATTAAGTAAAAGCGATCTCGCTTTTTCAGATTTGGCAATATCATTCGAAACAATCGCTACTTTACGGATAAAATCTATTTTATCCCAAGTCATAGAAAGTATTTCTGTTCGCCTTGCTCCTGTTAATAAAGCAAAAGAGCAGATAGTTTTCATCCAATCAGTACTAATATTATTAATAAACTGCTTGGCTTGTTCTTTGGTAATCCAACGAACCCGGATATCATCATCAAAATCTCGTGATTCTGAATCCGTCATTACGTGGTTATATGGATTGGTTGGTGGTGGGTTTCCTGCCGGTTCGGTTGCCCAATTATTATTGCTGTTTCCGCTGTTTGAGCTACCGAGCATTTGTAGCTGATCGGCGATGATTTCGGTCGTCCAGCGGTCTGTGCCGTCTTGGGCTTGCCATTTGCGAGTGCGTAGCTTGCCTTCCACATACACTTGCGAGCCTTTTTTCAGGTATTTGCCGATAATGTCAGCTAAATTCCGAAAGGCGATAATGCTATGCCACTCTGTGGCTTGTTTTTTCTCGCCTGAGGTTTTATCCGTCCATTCGGTTGAAGTTGCTACACTGATTTTGGCGACTGAATCGCCATTTGGCATTGTTCGTAGTTCCGGGTCGTTACCTAGGCGACCGACAATAATCACTTTGTTAATTCCTGCCATTGTTATTCCTTATAAAGTTTGATTGGTTTGTCTCTGCCAATGTTGAACCGCTCAATTTTGCGGTTAATCAACATAATTGCGTTTTGGCGGTTGTATTGTGGATAGGTTGTGTGCTGTAATTTGCCGTCATAAAAAAACTTGGCGATAAATCGTTTATCTACCTCAACAATCTCAACACCGGCATCAATTTTTCGTGCCATATTTCCCTCCGCAGTATTGGTTGCCGTTGCTTTCCATTTGCCAAAAGCCTTGATTTCGTTCGCATTTGTAACGTTGCATTTGTATGTGGTCGTCATAATCCATTCGCCCGACAATGCCTAATAGCAAAATTAGCAAGGCAAATGGGGCAAGTTGTTTCATTTTGTTCATAGGATTGTCCTTTAGGGTTAAAAAAAGCCCACGTTTTACGGTGGGCAAATGGAGCGACTTGCGTCTAGTTGTGGGTATTCCGAAACACACTTGGTGAAATGAGCTTTGGAATAAATGCGTGTCTGCCCACGCCGTCGCCCGCCCGGCTTTCGCCATTCCGTCGGGTGCTGCTTGTATCCGTACTTACTCAAACTTGAGATAAGCGTGATTGCTTAGGACTGATACCAGTGTTGCCTTTTCAGCTCTCCACACCTTGCGAGTGTGTTGCCTAAACCTTGCCACCTCTTTTTGGCAAGTCGTTCAAATTTGTATGTCAGGGTCTAACCAACCTTACTGAGTTATAAAGCATTACTTTACAACTGCCCGAGGTTGTTAATATCGTCCGCACAAGCACCGAATTGTTAAAGAGCATTGAGCCGTAGCTCGTTTTGATGAATTAAGTTTAAGAAAACTTAAATTACAAGTCAATCAAAATTTAAGCTTATTTAATAAGTATTTTTAAGATTTCTTAAATTTCAATTAGTTATGATTTCTTAATTGATTGTTTTTTAAACCATTAAAATATAATTATTGAGATTGCGAGCTTGATCACAGACCGAAAACCACGCTTTTGAGAAAATAAGAAGGGATTTCTATGGAGGTTATATGAAAAAACTACTGATGACTTTATGTTGTTTGCCCGCTTTTGCTTTAGCTAACGAAACTGGAGAAAGTTGCTCTAAGATTGAAGATAGTGCAAAACGCTTAGAATGTTATGATAGTGTCTTTGTGAAAAAAGATACTGGTAAAGATGAAGCTACCGATGAAAAGTCTAATTGGGAATATGAACAAAAGAAAGATGAATTGCGTAATGCAACGACTTACTTTGCTAAAATTAGATCAACTAACACAATAGATTTTGGTTTCCCGTATAATTCATCATCAATGAATTTAATGTTACGCAAAGACCCTAAATATGGCAATGATGTAATTTTTAGCGTACACGGTCAATTTAATGGCTGTATGATTGAGAGCTGTAAAATTACTGTGAAGTTTGATGATGGTAAATTGGAAAGTTATCGAATGATTGGGGCGGATGGTGGCAGCAATGATACGCTTTTCATTGAAAATGCAAAAGCAATGAAAACCTTTGTAGATAAGTTGAAAAAGTCGAAAAAACTAATTGTAGAGGCGAGTTTTTACAATTATGGCAAAGGGCAATTTACCTTTGATACACAAGGGTTAGAGTGGAAACATTTTTAATTAAGAAAAAGCTACATAGATGCGTAGCTTTTTGCTTAGATATGTTGGGGCAAAATAACGATTTCAGCTTCAAAAATTTGTTGGTCGAAAAAGATTTGGCGTTGCCAAATAAGTGCTTGTGAAAGCTGACGAAACGCAAATCGTTCAGGTGCTATCTTTTGTAGTGCTAACTCAAATTGCTTGTAAGTTTTTTCTAAATTCTCTAGTGCGTGCGTTGGTTTCTTGGCAATTCGCTTATTCCAAACCACTTCTTGATGATACAGCCGATTTCTAAAACGCATAATTTGCTTTAATGTATTGTATAAATCCTTAAAATTACTAAATCTATGTCCAAAAATAGGCTTTAATACGCTTTGCCAGTAAGCAACATATTGATTACGCTTTATATCATAATTAAACAGATTTACCCAAAATCCAAAAGAAATATGAGAAATTATGTCATTTTCATTATAGTTACGTCCGCATTCACTAATGGCTTTTTGTAGCTGGCGTTTAGATTCTGCATTAAGAGGAGCATTACTATCGTTCGCTAGAAAATGAAAGAATTCGTATAAATTATGATTAGGTGCAGCAAAGCGTAACAACTGGCTGACTTCATTTCTTAGTGCCACCTCTATTTCTTGAATCAATGAAAAATAAATTCCTGTTCGATGTTGCAAGGCGGTATAAATTGCAATAGCTTCTTTCTGTTTTGTGGGATCATTTCGGAAAAAGCAAAATAAATATGTACTCAGCCGACTTTCTGAAATACTTAGCACTTGTTTGGACAACATATTTTCCTTTACTCAAGTTTAGTTTAATGTAATAATACTTGCACTGGCAACGGACCCGAAGCCCCAGACGTAGGAGCTGGATTGCTTTGTAAAGTGTGAGAATCGCTTATTTGCGGTTCAGAAAAGGTAGGTTTTTTAACCTACCTTTTCTTTATCTACACTGTTCTTCCAACCATTTCTTAAATGTTTCTTTTTTCCAACGAGCTTTCCCCAAAATATATAAATCAGGTTTAGGAAATGAAATATTCTTTTCTAACTCTTGATTGACTAACTCAACATGGGTATCAAACATTCTTCTTGTATTATACACAGCAGCACCTAACCCTCCATTTATACGCAAATAATGGTTAGGTAAATTAACCAACTCTTGAAACTCATCTGCCCCAATACCTAACCTATTGATAATATCATTTGCTGAAAGCAGTTCCGCACTTCCTTTCATTATGTCATTAACGACTTTATCTTTAGGTGTCGAAGCTAATTGAGCTTCTACAATCGCCTGTTTTACATCTTTAAATTCTGTCATATTATCAATTCCTATCTCTTTCTACGATAAATACGATGCTCTACCATTGTGCCGATAATTCTGATTTCTTGCTTTAGCGTTGATAATTTATGGTAATCCGGATTAAGAGCGATAAGCTCAAAATGTTGTCTTCCGTATTCGTCTAAGTCTTCTAACGGACGGTATTTTTTGAAAGTGGCTTCATAATCGCCATTAATTGCTGCCACAAACTCACCGGCGTGAGGTTGTACATCAGGATCAATAATTACTCGGTCTCCTTCAATAAAATCAGGCTCCATCGAGTCCCCTTTGATTTCTAGGGCAAAAGCATCTTCAGACACCTCAAGATCAGTTAGGATATATTCATAATCCCCACAGGTTTCACGAAAATCGTCAATTCCCGTCCATTGTCCGGCTTGAATATAGCTAATTAATGGGACTTTAGTCATACCGAGGCTAGCAGGTAGAACATTAGACTCTCCATTACCACGCAAGAGCCAACTAATATCGCATTGCAATACTGTAGATAAATCCAAAATATTCTCTGAATTTGGCTTAGTCGTACTACTTTCCCATTGAGATACTGCAACGTGTGAGACCCCTTTTAACGCAGTAGCAAGATCTTTCTGTGTCAATTTTAATTCTTTTCTACGGCTTTTAATTCTATCGCCCAAGGTCTGAGTATTCATAGTATCCCCTTAAAGGTAAAAATAAAGTTGCTGTTAAGTTATCTTAACATTTATTGACTTAAGTTTCCTTTAATTGTATATTTAAGAGGTCTTAAATAAAATTCAAGAAAGGAATTAAGAAAATATGAAAAAAGATGATGTGCTCGAACATTTCGGAACTCTAGAAAAAGTGGCGGCAACTTTAGGGATTAGTGTATCTGCTGTTTCTCAATGGGGCGAGATTATTCCTGAGAAAAATGCGTACAGATTACAAGAGATCACTGCCGGCAAGTTAAAGGTCAAACACTCACTTTATAGAAATAGAAGCAAATAAAAAACCACCGCTGTAACGGTGGCTTTCATACATAATTAAACACGAAAGGTATTTTCGATGAATCAATTATTAAACATTTCGGCACCAAAAGCAAGCATTACGATGAGTAGTCGTGAGATTGCTGAGTTGTGCG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TAGGATTTCTCTCAACTTAGCATAGGTTTTGGGGCATCTTATTTGACATTCCTCTTCGTTGTAGAGAGCCTCTAATGTGTGCCATTCTTTTGCAAGTGCAGCCCAAACTTTCCCAAGTTCAGCCATTTTTTCAATCCTATTTCGCAAAAAAGGGACTGTCTCCAACAACAGAAAGCAACGCCTGAAATCCGATACATCGTGTGGGTAGCCTTCTATTTTTGGTCTTATTCCGTAACCAAGGTAAAAAGCCATTGTTTTACTGCTTACCCCTGTCTCTCCATTGGCAAGCCACCAAGCGATTTTGTCTTCTATGTGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP017542|1861515:1871832|1868175_1868769_+|WP_006247795.1|DBSCAN-SWA MTDFDKNTYQTPNYVRNWLNHRYAWFHIDGCSNGQNTLYTYWIGRAADGLDDDKLSCQIADDFLADDLFDVLLDKVSDWGELLRIFVNPPYSDPLPFVQRAAELKKAGHLVVMLLPADKTTEWYTIIQQHANEVIDIIGYHDEKGTWRTGRIQFINPVTGKPAQGNNKGSMIVVFDPFIEGIVTRQMPLDKIKEWGK >NZ_CP017542|1861515:1871832|1870878_1871202_-|WP_006253316.1|DBSCAN-SWA MEHLTINQVAKELNCHPNTVRQHLADWGFFKMVGSEVWRINREDLERAKKRAGIDPIRKRSDNDRGLSLSVEENEKCRSTDEKQTVRGGLISQPQTARELREALARL >NZ_CP017542|1861515:1871832|1865411_1866068_-|WP_006247791.1|DBSCAN-SWA MNTQTLGDRIKSRRKELKLTQKDLATALKGVSHVAVSQWESSTTKPNSENILDLSTVLQCDISWLLRGNGESNVLPASLGMTKVPLISYIQAGQWTGIDDFRETCGDYEYILTDLEVSEDAFALEIKGDSMEPDFIEGDRVIIDPDVQPHAGEFVAAINGDYEATFKKYRPLEDLDEYGRQHFELIALNPDYHKLSTLKQEIRIIGTMVEHRIYRRKR >NZ_CP017542|1861515:1871832|1865025_1865400_-|WP_006247790.1|DBSCAN-SWA MTEFKDVKQAIVEAQLASTPKDKVVNDIMKGSAELLSANDIINRLGIGADEFQELVNLPNHYLRINGGLGAAVYNTRRMFDTHVELVNQELEKNISFPKPDLYILGKARWKKETFKKWLEEQCR >NZ_CP017542|1861515:1871832|1862673_1862859_-|WP_006249220.1|DBSCAN-SWA MNKMKQLAPFALLILLLGIVGRMDYDDHIQMQRYKCERNQGFWQMESNGNQYCGGKYGTKN >NZ_CP017542|1861515:1871832|1867118_1868165_+|WP_006247794.1|DBSCAN-SWA MRFTSTINNVRLVEWEINITQGALVDLINQASSWAKAVVIDGITYYWMSFSKVCEELPAVFSKEDTVYRQYKVLKEKGIIDHFKMDGKDYVRLTEKGCEWNKFEPIRESEKNPSIGNNSEQTRKNFRESSEKNPTDNNTNYKNNNDHTTPLNPPAGEPAPAEVVLNYLNSALVTLAVQLGERKPVGYSLKPWAKNITARIRESSVADCCQVVDYLVAKWGRDEKMREYLCPKTIFRQSNFADYFPKSTAWANNGKPVCVNGKWVTPAELEKRLIMPTVDEVRALFQKSLSGNPFKALDFTNKRNLVMYHATINTRNKRPLERDLPMIISQEIKNAVERIDRLRVPTFS >NZ_CP017542|1861515:1871832|1864136_1864874_-|WP_006247789.1|DBSCAN-SWA MLSKQVLSISESRLSTYLFCFFRNDPTKQKEAIAIYTALQHRTGIYFSLIQEIEVALRNEVSQLLRFAAPNHNLYEFFHFLANDSNAPLNAESKRQLQKAISECGRNYNENDIISHISFGFWVNLFNYDIKRNQYVAYWQSVLKPIFGHRFSNFKDLYNTLKQIMRFRNRLYHQEVVWNKRIAKKPTHALENLEKTYKQFELALQKIAPERFAFRQLSQALIWQRQIFFDQQIFEAEIVILPQHI >NZ_CP017542|1861515:1871832|1866192_1866381_+|WP_006247792.1|DBSCAN-SWA MKKDDVLEHFGTLEKVAATLGISVSAVSQWGEIIPEKNAYRLQEITAGKLKVKHSLYRNRSK >NZ_CP017542|1861515:1871832|1871457_1871832_-|WP_006247798.1|DBSCAN-SWA MHIEDKIAWWLANGETGVSSKTMAFYLGYGIRPKIEGYPHDVSDFRRCFLLLETVPFLRNRIEKMAELGKVWAALAKEWHTLEALYNEEECQIRCPKTYAKLREILEANEENVVRIGNLSISIG >NZ_CP017542|1861515:1871832|1861515_1862490_-|WP_006249218.1|DBSCAN-SWA MAGINKVIIVGRLGNDPELRTMPNGDSVAKISVATSTEWTDKTSGEKKQATEWHSIIAFRNLADIIGKYLKKGSQVYVEGKLRTRKWQAQDGTDRWTTEIIADQLQMLGSSNSGNSNNNWATEPAGNPPPTNPYNHVMTDSESRDFDDDIRVRWITKEQAKQFINNISTDWMKTICSFALLTGARRTEILSMTWDKIDFIRKVAIVSNDIAKSEKARSLLLNDDAIELLQKQRGKNPKYVFVGSKGQALQDINRKIFNKATEKCLLVDFHFHDLRHTWASWHVQAGTPLFTLKELGGWETLEMVKKYAHLNADHLLNHANSVKF >NZ_CP017542|1861515:1871832|1866438_1867122_+|WP_006247793.1|DBSCAN-SWA MNQLLNISAPKASITMSSREIAELCEKEHRHVTRDIEAMFSQLDIPAEGYAHFWTHPQNGQTYREFRLPYDLTLTLISGYSVILRKKIIDRWQELESRQGIPQSFSQALRLAAEQQEVIEQQNHQLAIQAPKVAFVEHYVEVGTTKSLRETAKILNFPEKRLIECLERYRVLYRQSGNLLPYQDKQAKQLFAVKTGTAEHGHNFTQTRVTAKGIEWIAQRYASELGQ >NZ_CP017542|1861515:1871832|1863504_1864101_+|WP_006253352.1|DBSCAN-SWA MKKLLMTLCCLPAFALANETGESCSKIEDSAKRLECYDSVFVKKDTGKDEATDEKSNWEYEQKKDELRNATTYFAKIRSTNTIDFGFPYNSSSMNLMLRKDPKYGNDVIFSVHGQFNGCMIESCKITVKFDDGKLESYRMIGADGGSNDTLFIENAKAMKTFVDKLKKSKKLIVEASFYNYGKGQFTFDTQGLEWKHF >NZ_CP017542|1861515:1871832|1871282_1871450_-|WP_006253314.1|DBSCAN-SWA MQFTYGSICSGIEATSIAWHGLGKPLWFSEIEPFPCAVLAHRFPNVPNGNGMAVP >NZ_CP017542|1861515:1871832|1862492_1862690_-|WP_006249219.1|DBSCAN-SWA MARKIDAGVEIVEVDKRFIAKFFYDGKLQHTTYPQYNRQNAIMLINRKIERFNIGRDKPIKLYKE |
14 | Mannheimia_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1875065 : 1882009
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP017542|1875065:1882009|DBSCAN-SWA AATGAGTGGCTTAGGAAAATTAACCGTTACCTTAGAGCTTGAAAATGCAAAATTTCAGTCCGCAATGACGAAATCTGATTATGAGGCACAAAAATTTGCCAAGAACTTTATCCAAAATATGGATAGAGCTAGAAATCACGCCAAAGAATTTGCCGATCGCTCAACCCAATATTTAAAAAACATTGAGCAAGCGGCAAAGAACCTCAATAAAAATTCTGAATTTTCATTTTTATCGACTATTGGTGGACATTATCAATCAATGTCTAGTGGCATATTGAGTGCGGCAAAAGCCTATACTGATATTCAAAATAAAATGAAATTAGTAAGCGGTAGTTCAGCAGAGGCAGCTAAACGATTAACTGATGTGTTTGATATTGCGACTAAAACAAGCCAAAGTACAGAGGCTGTTTCAGGTGTCTATCAAACATTTGCTCAAAATGCCCAATCTCTCGGACTGGCTCAAAAAGATGTAGCAGAATTAACTAAAACGGTCTCTCAAGCCGTTGCTGCAAGCGGCGCAAGCAGTTCTGCAGCAAGTAATGCCCTAACCCAATTTGGTCAATCACTTTTAATGGGCAAAATGAAAGCCCAAGAATTTAACTCGCTCATTACTCAAACCCCAACCATTATTCAAGCAATGGCAAAAGGTTTGGGAATGACAATGGCAGAATTTAAAGCAGCGGTATACCGGGCAAAATCTTTACTTGGATAACATTCAAGGGCAAGGTTTTGAGAGAGTGGATACACCCCAAATCGGCGATGTGATTTTAATACAGGTCGGTTCTGATGTGCCGAATCACGCAGCGATTTATATTGGTGAACAAATGGTAATCCACCATAGCCCGAACCGATTATCTAAGCGTGATTTATATGACGGTTATTGGTTACGCCATACCCACAGTATTTGGCGGCATAAACTGGCGGATAGATTGGATTTTGACGGCATATTTAATGATATAGGAGAACAATATGAAATTTAGTAAATATCAATTATTAGTTAATAAGATCTGCTTTATTTGTGGTAAAAAAGATTGTCCACAAATGAAAAAGAGTAAAGACTACAAAGACTTTTTGGATGCTTTAGAAAAAGGGGATGTTGATAAAGCAGATAAAATATACAATACGAAGTTTTCACAGTTTTCTAAATCTTTTGGTCATGAAATGGAAAAGAATTTAGAGAAAAATCGTATACCTCCTATTTATCAGGGAGTTCCATTTGATTCTTTTGACTTATATCAGCATTATTCTTATGGTAATGGAGAGGCATTAAATCTTTCATCCGTTGGATTAAGTAATAAAATTCGTCCTCTAGTGAATAAAGATAAAGCATTTGGTAAATCCAATGGAAGTATAGAAAGCCGATTTATTTCGCAATATAAAAATGAAGGACGCACATCTTTCTCCAATGCTTATGATTTTACAAAAGAAGCATCGGGTATTGCAGATCCGTTATGGGCGTTAGGAACAGCTACCATTAGTGGAGAATTGAAAGATATACAAATTTTTCCCGGTGGTATTGCTAGGGGAAATATCCATTATAGTATCAGGGACAGATTCACTGACCCATTTGATACATTCAATTTTACTAAAGGAGAATGGAACCCAAATGGAACACCTTATATTATTCAAGATAGCTGGATAAAATCGGTACGATTTTCGATAGACAAGAAGATAAAAATAACACCTTAATTATGATAGTAATATAAAACAATTGGCAATATTATTTTAAATAAAAAAATAAGTATTCCAATATAGATTGCTGATTTTATGGTGTATTTAATTTGTTTCTCGAAAATAAAAAAATAACTAGTAATTGCATATAAACAAATAAGTAATAATATGCTTATAGAGTTAAGAAAAATAAAGAACATAAATCCCCTTTATTTTGGCTATAATTGTAATGGTGAGTCATGACTAAAATTAAATTTTACGGCAATTTAAAAAAATTTGGTAGTGAATTTAGCTTAGAAGTTAAAGATACTGCCGAAGCTATCCGAGCCTTATGTACACAGATTAGCGGATTGCGTGAGGCATTACGAGACGGTGTTTATAAAGTCCGTATCGGCAAACAGTATTTAGACCCGTCAGCCCTTGAAAAAGGGCTTTTTTATTGTCTGAAGAAAGGGCAAACCATTCATTTTACCCCTGTTATCAAAGGAGCGAAAAGCGGTGGCGTGTTTAATTTTGTTTTAGGTGCAGCCTTGATCGGAGCCGCATTTTTTACTGGCGGTGCTTCTATTGCGGCTTGGGGAGCTGGAGCAAAAATGATGGGTATGTTAGGGGCTTCGATGTTACTAGGAGGAGTTTCCCAAATGCTCACCAAAATGCCAAAAGCCCCCACAATGGGTAATGAAACAGAAAAAGAAAGCTCAACGGCTTTTTCAAATTTAAATAACTTGGTGACTCAAGGCAAACCTGTGCCGTTGGCTTATGGCTTAATTCGGACCGGCTCGCTTGTGATATCGCAGGGAGTTGAGACGATCACCATTAAAGAAAACCAACCGGCAAGCAACAAGAAAACAGGCTTTAGAAAATAAGGGATAATTACCGATTCAGCACAAGCACAGCAACTTAATCAGTTATCTGTGAACTTGACCAAAGCAGAGAGCAATTTAAATGCCAAAATCACGGAAGAAAAAAAAGCTCGTGTTGATGCAGATAAAGTGAATGCAGATAAACTCACAGACATAACAAGCCGTGTTGCAAATGCGGAATCAACTATTACCAATTTCCAATCAACCAAAGCGAATAAAAGTGAGGTTGCGAGCCTTGCACAAAGTTCGTTGCAGGCAGTTTGGAAAGCTGATGCAAAATCTGCCGTTGATTCACTTTCTATCGGTGCAAGGAACTTACTGATAGACAGTACTTACAACCAACACATCAACTACAATACAAAAATGTCATCAATCACACGCACAGTCTATCGCGGCAATATGTTGATACGACTCGGAATGCTTGGTGGCGCAGGTGTGGCCGGTATTGTACAAGCACCAGCCGCTCAAGTAAGTAATATCAGACAGGGTCAAGAGTACACACTTAGCCTGAATGTACAGGGTACAGCCGGCATACAAAAAACGGGGCTCAACTATGTATTCTTGATGCGTGCTGATGGGGCTAATCAACGGTTAGCAACAATACCTGTTATAGCCAGCCTATTAAACAGACCTAAAATAGCCCTTGGCAAAATGCCGGTGTAACCGCTATCCACGGTGGCTCAATAGTTACTAATACCGTTACTGCTCAACAAATTGCAGCAAATACCATTACCGCCAACGAAATCGCAGCCGGCACGATTGCAGCTCGAAATATGGCAGCAAACTCGATTAATGCAAGTCATATTGTGGGGAGTTCGATCACTGCGGATAAGCTAAATGTAAACAATTTAGCGGCAATATCGGCAAATCTTGGTAAGGTAACTGCTGGTACAATTACAGGGACGACAATTAGTGGTGGGACAATTTCAGGTACAACAATTACAGGGGGAATAATTAAAGGAGCAAGAATTGAGGGATTAACAGGTAAATTTACTGGAGAACTTGAAATCAACCAATTGATCGGAGGTAATATCTATGAGGCTAAAACTTGGACATCAAAAGCAACAGGGAAAAGTAAAACATATTCAGAAACGAAAAACAGTTTTGCATTAAGTGATACATATTATGAGTATGTATGTCAATTTGTACTACCTGCTACAAAAGCGACGAGAACATTGTATGTTGTCCACACTCCAACAGGAGAGAGTAAAAGCGAAACTTTTTATGGTAGTGGTAGTAATCGGACACCGACAACAATTACATTACCGTCTGTAATTGATATTAGCAATACTATTTCACCTAATGTATCTAACCCATTTAATGATTCTGGGGCAATACTCATTGCTAATACTCAATATGTAGTAACGTGTCGTGCGTGGTGTGCAGGGCGTGGGAGAAGTGCTAAAGTGAATTTTCGAGCAATTATATCATCTACAAATGGTTCATCTTATCAATTATAGGAGGCAAATATGAAAAAAATTATACTACTTACAACAATTATGGTTTCAGCTTGTACAACTCAATATAAGCAAGACTATACAACAAAACCAACCTTTTGTTATCAACTAGCCCCTCAAGAGCAATTACCGGGGAAAAACTGTATTGGCTCAGGAGGGCATTCAGGTTAACAAAGTAATTAAATCCTAATTACACGCTCATCGCCTGTAGGCAATTCAACGGCAAGTTTTAACTTACCGCCCATTGCTTCAATATAGCGTTTGAGCGTGGATAATCTTGGATCGTTATCTTTCTGTTCAAGTTTAGCAATAGCAGGCTGTGAAATACCGAGAGCTGTAGCTAATTGTTGTTGAGAGAGATTTAGCTCTTCTCTTAGTTTTGAAAGTTGTATCTCTCTAATCATTTCTTGAGCCATATCTTCCACTTTTTGGCGGCGTTCAGGAGAGAGTTCATTGAGCATTTGATCTAACGTTTTCATTTTCTTTCTCTAAATTATTTAAATAGGAGGTAAATTCCGCATCAGCAAGAGCGATCATTTTTTCATAGAATCTTTTGTCTTTACCTTTCTCGCCAGCACAAAGTACTATCGCTTGGCGTAAAGGGTCAAAAGCATAAAATGCTCGAATTGGCTTACCTTTGTTTTGAATGCGTAACTCTTTCATATTAGGGAATTTAGACTGATAAACTGTATCAGCATAAGGTCTGCCTAGACTATAACCGAATTTCCGCAGATAGATTAAACAAGCCAAGACACGTTCTTGAGTACTTTCATCTTGTTGACCGAACCATTCATCAAAGCAGTCAGTCGTGATAATAGACCATTCTATAGGGTCTGCCATTTTTGAACCTTTTATAACTTACTATTTATAAATGAAGTATAAATAAAAGGTTATATTATGTAAAGCAATTTACTCTTCCTACTAAGCCGTTTGTATGACTACAAGCGGTCTTTTTTTATCAACAATCCACAAAAGGAAAAATTATGACAACTTTTAACAAAATCTTAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP017542|1875065:1882009|1880710_1882009_-|WP_006250049.1|DBSCAN-SWA MGKSVAILGAQWGDEGKGKIVDLLTDRVKYVVRYQGGHNAGHTLIINGEKTVLRLIPSGILRDNVTCLIGNGVVLSPEALMKEMGELEERGINVRERLKISEACPLILPYHVAMDHAREAALGKNKIGTTGRGIGPAYEDKVARRGLRVSDLFDKEHFAAKLKDILDYYNFQLVNYYKVEAVDYQKTLDDVFAIADVITGMVADVTTLLHEARENGDNILFEGAQGTMLDIDHGTYPFVTSSNTTAGGVATGSGYGPRHLDYVLGIIKAYCTRVGSGPFTTELFDDVGAEIARKGNEFGAVTGRPRRCGWFDAVAVRRAVQINSISGFCMTKLDVLDGFKELKICVAYKMPNGKIVEYAPLAAKDWEGVEPIYETMPGWSENTFRVTKREDLPQAALDYIKRIEELVGVPVDILSTGPDRVETMILRDPFAA >NZ_CP017542|1875065:1882009|1880038_1880332_+|WP_006250050.1|DBSCAN-SWA MTTFNKILNPMYSTIASYSTQDDGSLNAKYVVGTGDDTDGEVTNFVIITSEYKYIDAQSAKEITDAPLTKEDIGKTPTQIMLGRIYKYLKETGQIVV >NZ_CP017542|1875065:1882009|1879234_1879534_-|WP_006247810.1|DBSCAN-SWA MKTLDQMLNELSPERRQKVEDMAQEMIREIQLSKLREELNLSQQQLATALGISQPAIAKLEQKDNDPRLSTLKRYIEAMGGKLKLAVELPTGDERVIRI >NZ_CP017542|1875065:1882009|1877649_1878261_+|WP_006253310.1|DBSCAN-SWA MNLTKAESNLNAKITEEKKARVDADKVNADKLTDITSRVANAESTITNFQSTKANKSEVASLAQSSLQAVWKADAKSAVDSLSIGARNLLIDSTYNQHINYNTKMSSITRTVYRGNMLIRLGMLGGAGVAGIVQAPAAQVSNIRQGQEYTLSLNVQGTAGIQKTGLNYVFLMRADGANQRLATIPVIASLLNRPKIALGKMPV >NZ_CP017542|1875065:1882009|1875065_1875776_+|WP_006253312.1|DBSCAN-SWA MSGLGKLTVTLELENAKFQSAMTKSDYEAQKFAKNFIQNMDRARNHAKEFADRSTQYLKNIEQAAKNLNKNSEFSFLSTIGGHYQSMSSGILSAAKAYTDIQNKMKLVSGSSAEAAKRLTDVFDIATKTSQSTEAVSGVYQTFAQNAQSLGLAQKDVAELTKTVSQAVAASGASSSAASNALTQFGQSLLMGKMKAQEFNSLITQTPTIIQAMAKGLGMTMAEFKAAVYRAKSLLG >NZ_CP017542|1875065:1882009|1879505_1879895_-|WP_006247811.1|DBSCAN-SWA MADPIEWSIITTDCFDEWFGQQDESTQERVLACLIYLRKFGYSLGRPYADTVYQSKFPNMKELRIQNKGKPIRAFYAFDPLRQAIVLCAGEKGKDKRFYEKMIALADAEFTSYLNNLEKENENVRSNAQ >NZ_CP017542|1875065:1882009|1876033_1876753_+|WP_006247806.1|DBSCAN-SWA MKFSKYQLLVNKICFICGKKDCPQMKKSKDYKDFLDALEKGDVDKADKIYNTKFSQFSKSFGHEMEKNLEKNRIPPIYQGVPFDSFDLYQHYSYGNGEALNLSSVGLSNKIRPLVNKDKAFGKSNGSIESRFISQYKNEGRTSFSNAYDFTKEASGIADPLWALGTATISGELKDIQIFPGGIARGNIHYSIRDRFTDPFDTFNFTKGEWNPNGTPYIIQDSWIKSVRFSIDKKIKITP >NZ_CP017542|1875065:1882009|1876974_1877601_+|WP_006247807.1|tail|DBSCAN-SWA MTKIKFYGNLKKFGSEFSLEVKDTAEAIRALCTQISGLREALRDGVYKVRIGKQYLDPSALEKGLFYCLKKGQTIHFTPVIKGAKSGGVFNFVLGAALIGAAFFTGGASIAAWGAGAKMMGMLGASMLLGGVSQMLTKMPKAPTMGNETEKESSTAFSNLNNLVTQGKPVPLAYGLIRTGSLVISQGVETITIKENQPASNKKTGFRK >NZ_CP017542|1875065:1882009|1878371_1879058_+|WP_006247808.1|DBSCAN-SWA MAANSINASHIVGSSITADKLNVNNLAAISANLGKVTAGTITGTTISGGTISGTTITGGIIKGARIEGLTGKFTGELEINQLIGGNIYEAKTWTSKATGKSKTYSETKNSFALSDTYYEYVCQFVLPATKATRTLYVVHTPTGESKSETFYGSGSNRTPTTITLPSVIDISNTISPNVSNPFNDSGAILIANTQYVVTCRAWCAGRGRSAKVNFRAIISSTNGSSYQL |
9 | Mannheimia_phage(60.0%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2315221 : 2323376
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP017542|2315221:2323376|DBSCAN-SWA AATGTTAGATCTCACCAAGATTAAATTAGTGATTACCGATGTGGACGGCGTGCTAACCGATGGCGGAATGTACTACACCGACCAAGGCGAAGTAATGAAACGTTTCCACGTTCACGATGGTTTAGGCGTTAAGATGTTACAAAGTTGTGGCATTAAAGTGGCAGTACTCTCGGGCGGCGATACGGCTTTGCTCCGCAAACGGTTAGAGGTGCTGAAAATTGATCTCGCTTTGTTAGGCAAAATGGAAAAACGCTCCGCCTGCTTTGAGCTAATGCAGCAAGCCGGTGTTACCCCTGAGCAAACGGCTTACATTGGTGATGACACCTTAGATTTACCGGCTTTTGAAGTGTGTGGCATTGCGATTGCAACCCGTAACGCCCTCGATTACATCAAAGAAAAAGCAGATTGGGTATTGCAAAAAGCCGGTGGTGAAGGGGCGTTTCGTGAAGTCTCCGACCAAATTTTGGAGGCTCAAGGATTCGGTGAAATTTTTAAAACCGCAGATGGTTTTTTAACGGTAGCGGGGAAAATGGCTCAGTAGACTCTTCAAGCAGTTAAATTTCATTTTATTTTTGCGATCTGCATCGAAAAAATGTATTTCTAATCTGATTTTCAAATTACTGTTTGCTAAATTAAATTTAGTTCTTGTTAGATTTATTTTATGTATATACAATAATTATGAAAATTTATACTTGGGACGAAACTAAACGCAAAATCAATTTAGCCAAGCACGGATTAGATTTTGCCGATGCAGATGAAGTTCTCTCATCGCCCTATCGATTTGATGTTGAAGTTATTCGTAACAATGAATTTAGAATACAATCTTTTGCATATTCATTTGGACGTTTACTCGTATTATCACTTGCATATACAGAAAGGGAAGATTACATCAGAGTAATTAGCTTTCGGCGAGCATCTAAAGCAGAAAGAGAGGCATATTATGAATACTTACAACAATACTTTGAATAATAAAAATTTAGAGAAAAAACAGCTACTTATGGCTATTCAAGCTATTCCGGCAAGCCAAGATTTTATTTGGGACGGAAAAGATGACGATGAACGCCCGGTTACGCCATCAGAGTTTTCAATTGCAATGAAAAAACGTGGCAGACCAGCTGGTTCAAAGAAAGAATTGGTTTCGTTACGTCTTGATAAAAGCGTTCTTGAAGCCTTTAGAGCTTCAGGTAAAGGTTGGCAAAGTAGAATTAATCAAGTTTTAAGTGATTTTGTAAAACAAGTTTGACCACAAAACAAAGGCGGTTAATCCGCCTTTTTCCCTTCAATATATCGCTCGAAGTTTTGGATATATTCATCTAAATTTGCAGTGAGCATTTCTTTGTATTGCTCCACAAAATATTGAATAACTTCTTCTCTGGAATCGGCCAACTGCTGTTTATATTCCGCCTTGCTTGCCGCAACATAGGCGTTAAATCTGGCACAACCAAACAACATCGCATTGCTGACTTGGTTTGGGGCAATGTTTTTTAAATGAGCGTTGGCAACGTTAATAAAGCCGTCTGCTCGCTGGTAGACGCTGGTAGAAAGTTGGGTCAATTTGTTTATCGGTAATGTTAATCATAGTATCCTCATTTTTAGTCAAAATACAAGCGGTGCTTTTTGCGTAAAATTTTGCACAAACGCTTGCGTTTGAACGTTGGCTCTGCCGACGGCACGAAGTGCGAGCGTAGCGAGTAAAAAAATCACCGCTTGTAGGCATTTCTAGCCGTCTAATGAAATCGCTTCCTTGATTTTCTTCAATGCGGCATTTTCAAGCTGTCTTACCCGCTCTGCCGAGATGTTATATTTATCGGCTAAATCTTGCAGTGTGGCTTTATTGTCATCTAACCAGCGGGTTTTGATGATGTCTTGGCTACGTTCATCAAGGGTGGCTAACGCATAGGCAAGTTGAGCGGTTGCCTGCCCATTATGTTGTTCGTCTTCCAAGTCATCGGCGAAATTGGAGCTGCTATCTTCAATATACATAGAAGGAGCGTAGCTGTCTTCATCGTCATCACCGGCAGGCAGGTCAAAACCTAAATCTTGTCCGGTCATTCGAGATTCCATTTCTCGTACTTCTTCCACTGAAACCCCTAAATCATCGGCAACTTTTTTGATCTCTTCTTCATTAAACCACGCCAAGCGGTTTTTATTTTTGCGTAAATTAAAGAATAATTTACGTTGAGCTTTGGTGGTTGCCACTTTCACAATTCGCCAGTTTTTCAGCACATATTCGTGAATTTCCGCTTTCACCCAATGAACCGCAAAAGAAACCAACCGCACGCCGACATTCGGGTCAAACCGTTTTACCGCTTTCATCAAGCCGATATTACCCTCTTGGATCAGATCTGCCAGCGGTAAACCATAGCCCAAATAGCCACGAGCAATATGGATCACAAACCGCATATGGGAAAGGATCAGCTGTTTTGCCGCCTCAACGTCTTCATCATAATAATAACGCTCCGCCAGTTCTTTTTCTTGCTCGGCGGTGAGAATCGGATACTGATTTGCCATTCGGATGTAGCTATCCAAATTGCCCTGCGGCACAGGCATTGAGCCGGAAACCAAAGCCGGATGCATTGCTTCTACCGATGTTTCTTCTTCGTCTATCTCATCAACATCAATCGGCTCGGCATCTATAATTTCAGCATCTTCAATCTCGTTCTCGTTAAATTTTTTCATTCTATTTCTCTTCACTCTCAGCAAGGTTTACATTATAACAGAGTTAAATCTATCTGGTGTGGGATTTGTATGATTTTATTTCGAGCTATTCAATACCGCTAAGTTCCGCCACTTGCAAAACTTTTTGCAAATTCGACCGCTTTCCTTTAGAATACCGCTACTTTTGGGGCTGATTTTGGATTCGACGGGATTGGCGAAGCCCAAGGTGCATGTCGAGGTGCGGTAGGCCTCGTAAACAAACCGCAAAATAATAGTCGCAAACGACGAACAATACGCTTTAGCAGCTTAATAACCTGCTTTAAAGCCTTATCTCCTCAGCTTCCGCTCGTAAGACGAGGGCAAAGATAAGTCACCCAAAACGAGATCGTGTGGACGCCGCCGCTTTAGGATCGAAACACTAAATTAAATAAAGCTAGTTTATTCATTGCGTGTCTGTCCGCTGTGAATAAGCGAAATTAAAGACTAGACTAAACATGTAGTACTGAAGGTAGAGAAATTTCGGACGGGGGTTCAAATCCCCCCAGCTCCACCAAATTATAATCCTATACGGTTCAACCGATACCTAAAAAGCCTTGAAAATCAATGTTTCAAGGCTTTTTTATTGTCCGTTGCGTACCTATACGATACAATCAAATCCGAAGATTTTAGGAGTATATTTAGGAGTACGCCGGAATACCCCCAAAAATTCGTACTCCTAAAACCACTTTAGAGCCTTTTCAAATAAGGCTTTATCGCTTTTAGTTTTGTACTCCCAAACAAAAAATCATACTCCTAAGATTTAGGCTTTATACTCCTAAAGGTTTACTATGGCTAGAAAAATCACACCGTTAAACGATACCCAAATAAGAAAAGCGAAACCGGAAGACAGCCCATTAAGAGACGGTAACGGCTTACTACTTGTTATTACCTCAAATTCTAAATTGTGGCGGTTTAGGTATGAAAGACCGTTCACAAAAAAGCGGAATGATTTAAGCATTGGGGCTTACCCTGATATTTCTTTAGCACAAGCGAGAGAAATTAGAGAAGAATATAGGGCATTATTGGCTCAAAATATCGACCCTCAAACCCACCGCCAACAACAGGAACAGGCAAAGGCCAACGAAATCAGCAACACTTATGAAAATGTAGCGTGGGCGTGGCTGGAACACCGCAAGACCAAGAAGAATTTTTCAGACAACTACCAAAAAGATGTAATCGCCTTAATTAAAAATAACCTCTTGCCGCACTTTGGAAGAATGCCTATCACACAAATAACCGCACCAATGGCAATCAAGGCATTCAAGCAATACCAAGACGAGGGCAAACTAGAGAAGTTAAAACGGGCAATTCAAAAACATAATGAAATTATGATGTTTGCCGTACACCGTGAAATGATACCGTTTAACCCTACCGCCAATATTGCGAAAGAGTTTGATAGCCCAACGGTTGAACATTTCAAAACCATTAAGCCGGAAGATTTAGGCGAGTTTTTATACACCTTACAAAACGCCCAAATTCATTTACAGACACGCTATTTAATTCTGTGGCAGTTACTCACAATGACCCGCCCGAATGAAGCGGCTAAGGCAAAATGGGCGGATATAGACGAAAAAGCCAAACTGTGGACGATACCGGCGGAAAATATGAAGCGAGGCATTGAGCATAAAATCACACTCTCACGCCAAGCAATCGCACTTTTGCGAGAGATTAAAAAGCTAAGTGGCGGTAAAACGTATTTATTCCCTAGCGTGAAGAACCCACAAACGCACGTCAATACTCAAACCGCCAACGGTGCGATCAAACGAATGGGCTACAAGGGCAAATTAGTGGCTCACGGCTTGCGGGCCATCGCCTCCACTTATCTTAATGAGAAAGGCTACAATAGCGATTTAATCGAGGTTGCCTTATCGCATTTAAACAGCGACCGAATCAAAGCCGCCTATGATAGAGGCGAACGCCTAGAGCAACGTTTTAAACTGCTCCAAGTGTGGGCGGATTTTGTAGAGGAATGTTCGCAAGGTAGCTTACCGCAATATCATTTGAAAATAGCCTAGTAAATTTTCCGCCAAAAATGACCGCTTGTAATGCCGTTAGGTAAACCGCCTGACGGCTTTTTTATGCCCGTAATTCCCCTTGATGAAAATTCTGTAAACTTTTCGATTTTTACCCACTTTACCCACTTTTCACTATTATTTTTTTATAACTAACTGAAAAATAAAGAAAAAATGACAGTGGGTAAAGTGGGTTAAAAGTGGGTAAATGGCAAAAACCCTTGCTCACTGTATCTTAATGGATACAATAAGCAATAAATAGAATAAGAAGCCGGCAATGATGAGAGAGCAAACCACTAATCAAATTATTATTACCGATAATTTTTCAAAATGGCTTGAGAATTTAAAGAACCCTATCGCAAAAGCAACGGTAGCAAGACGGATAAAAAATGCGATTAATGGCAACTTTGGCGATCATAAATCTTTAGCCGGTACAGGCGGACTTTATGAAATGCGGATAGCAACAGGAGCCGGATATAGAATTTATTACGCATAACAAGGAAATGTAATTTATATCTTGTTACACGGCGGCGATAAATCAACACAGCAAGCCGATATAGAGAAAGCGAAAGCATTATGGGCTGAATTAAAAACTACAGGAGAAAGCAATGGAAACAATACAAATCAATGAACAGGCAGCAGAAAAGCACGGTTTACGCCCTTTTGACGTGGCGGAGTTTTTAACCGATGAGGCAACTATTCAAGCCTATTTAGCGGAAGTGTTAAAAGAGGGCGACCAAGACGAATTTTTAGAAGCCTTGAACGATGTAGCAAGAGCAAGAGGAATGGCGGAGCTGGCCAAGCAAACAGGGCTAGGCAGAGAGAGCCTATATAAAACCCTAGCCAAAGGCAGCAAACCACGCTTTGACACTATTCAAAAAATTCTAGGGGCATTCAATTTAGTGCTTATTCCACAAGTCAAAAATGGCTAAAACTTATCACTTGCTACCTGTCAAAACCTCACTTTTAAATAGCCGTTGATGGATATTGACGGCTTTTTATTTGCTCCTTGCGTGCGTACTGCTCCGAAAATTCCGCACTATTCGCAAAACCTTAATGAAATATGACCGCTTGAATGCTCTTTTTTATAGCGTCCGGAAACCCATCTTTAGCCTATTTTGATTTACTGTAATAAAACACAGCTTATTACTTGTAATTTATCTGAATAATTAGCAAAATACAACCTATCAAGTTCAATCCGTAACTATACGGATTTATTCAAATTAGCGTGGATAGTGGCGGAGTAATTAACCGGCACGAAAGGAGAAAGCCCTTTATTTCTCTTTCCACGCTCTCACAGTAAAGGGATACGTTAAAGGGGCGCTTATGGCAGATCACAGTCAATTTATTTCTAGGCTTGAAAATCGTATTGAGCCCAAAATCAGCTTTCAAGAACTGATACAAGAATTATCAAACTATACAAATAAACCTTTTTCACATATAGCGGATAAATTGAAAAGCCTCATTTTTTCCTTTCAGCAAAATGGAATATATACGAATGCTTTTGTAAATTGCACTCTCTTTGAAGATGGTGAAAGCTATGCTATTGAGCCCAAAACACTACATTTCAAAGACGCTTTCGATCAGCCTAAAGGCGTTTTAAGTGATGTTATTGCTCAAAATTCTATTGATGTTGAACATTTAAATGCTTATTACGTAACAGCAAGAGAAATAACACAGCTGATTAAAACACAATCGCCAACCTTGTTAGATAAATTAACCACCAAGCAAACACAATCAGAGATTAGCCAAATTCAAAATGATTATATTTCTGTTTATGACTTCATAGAATGGGCAAGTAAACATTACTCAAGTCTTAGTGAAACAGCTAACGATTTAAACCGCTTACTCAAAGATAAAAATATACAGCTTTATCGACAATATGGCGGAATAAGTCCAAGCATTGATAAAGATAATACTAATTTAAAAGCAGCCTTTGATTTTGTAGCAATTAATAACGGATATGAAAAACAATCAAGCAGCTTTAATTTTGATGATGATATTCCGTTCTAGGTGGCAGCAATGAATTTAAATGATTTCCAAAATTTACTTTTAAATAAACAAGAATTAGAAGCAGCACTAGGGAAAAAGCTCGATTTTTCTGAGATAACACCTGATTATTTAGCAGACTATTCACGTTTTTAAGCCTCTATTCTGAAACCGAGCTTACCCATTGCCCGAGCTTTTAATTGTGCTAGGCAACCGAATAGCGAAGCTGGAACAACAACATAACGCAATGCCAAGCGAAACCGATTCAATCACACTCGGCATTTTAAGAAAACAACTTAGCCAACTGTTAAAAGTGGCGGAAAGAATAAAGGAATAAACCAAAATGAAACACGAGCTTAATTTAGCGGGTATTACTGCTTTAATGAATGAACCTATCAAAGCAACCTTGAGCTTTTTAGATTTTCCGCATATCCGAATTGAACGACTGCACCACGATAACGGCAGACCGTTTTTTATCGGTGTGCTTTCTCTTGACCTTGAAGATCATATCAATATTGAAATGGCAGGGGCTACGGGCTTTTTAGAGGCTCTAGCGATTATTGCCTATCATCAACAGCTAACCGCCACGCCGCTATTAGTGAATGATGACTTATTGAGTGAAATCAACAAGCTCCCCCACCCACAACGAACAAACCCATTTATTGACCGACACGGCAACGAAATTACACGGGAGCAGATGAGCAAAGAATACCGAGAAAAAATCGATTATGCCTTTGCTGAAAAGCGAATGGCGGAGGGGAAAGAATGACCGAACTCACACCAAAACAAGAGGCTTTTTGCTTTGCTTATATTGAAACCGGCAATGCTAGCGAAGCCTACCGCCAAGCCTATGAAACCGAAGATATGAAGTCCGAAACCGTCCACCGAAAAGCTAAAGAGCTAATGGATAACGGCAAGATTACGGCAAGGATTGAGGAACTGAAAGCCGAACACGCAGAACGCCATAAATTAACCGTTGATGACCTTTTAAAGGAGCTGGAAGAGGCTCGTATACTGGCGAGAGAGAAAGAAAACCCTAACGCAATGACTCAAGCCACAATGGGCAAAGCGAAGTTGCTAGGGCTGGATAAGCAGGTTACCGATCCGTGCTTTGATGGTGAAACCGGTAAAGGAGATATGATTTTAAGTGTAAACTGCTCAAGCATTAAAGACGGGAAAGCACTTGATGAAACTTGTATTTTAAAGGCAGGAACACACGAATTTATCACACGGGACAGCTTTATTTTCTACCGCCATATAAGAATCGATTCGTTAGATGAGATTAAGGCAAATATAGAAGCCGGTTATTTCATTCAAAAAGCCCTAATTAATGATGAAGCCTATCAACAAATACTAAAAGGCGTACTATCGTCAAAATCAGTAACGCCTAGATATAAACGCTTCCTAAAAAATGCAATCCGCCAAAGTGCTTGCCCTGATATTCTAGCCGAACCTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP017542|2315221:2323376|2321255_2321942_+|WP_006250286.1|DBSCAN-SWA MADHSQFISRLENRIEPKISFQELIQELSNYTNKPFSHIADKLKSLIFSFQQNGIYTNAFVNCTLFEDGESYAIEPKTLHFKDAFDQPKGVLSDVIAQNSIDVEHLNAYYVTAREITQLIKTQSPTLLDKLTTKQTQSEISQIQNDYISVYDFIEWASKHYSSLSETANDLNRLLKDKNIQLYRQYGGISPSIDKDNTNLKAAFDFVAINNGYEKQSSSFNFDDDIPF >NZ_CP017542|2315221:2323376|2316939_2317899_-|WP_006250280.1|DBSCAN-SWA MKKFNENEIEDAEIIDAEPIDVDEIDEEETSVEAMHPALVSGSMPVPQGNLDSYIRMANQYPILTAEQEKELAERYYYDEDVEAAKQLILSHMRFVIHIARGYLGYGLPLADLIQEGNIGLMKAVKRFDPNVGVRLVSFAVHWVKAEIHEYVLKNWRIVKVATTKAQRKLFFNLRKNKNRLAWFNEEEIKKVADDLGVSVEEVREMESRMTGQDLGFDLPAGDDDEDSYAPSMYIEDSSSNFADDLEDEQHNGQATAQLAYALATLDERSQDIIKTRWLDDNKATLQDLADKYNISAERVRQLENAALKKIKEAISLDG >NZ_CP017542|2315221:2323376|2316160_2316463_+|WP_006250278.1|DBSCAN-SWA MNTYNNTLNNKNLEKKQLLMAIQAIPASQDFIWDGKDDDERPVTPSEFSIAMKKRGRPAGSKKELVSLRLDKSVLEAFRASGKGWQSRINQVLSDFVKQV >NZ_CP017542|2315221:2323376|2322261_2322687_+|WP_006250289.1|DBSCAN-SWA MKHELNLAGITALMNEPIKATLSFLDFPHIRIERLHHDNGRPFFIGVLSLDLEDHINIEMAGATGFLEALAIIAYHQQLTATPLLVNDDLLSEINKLPHPQRTNPFIDRHGNEITREQMSKEYREKIDYAFAEKRMAEGKE >NZ_CP017542|2315221:2323376|2315898_2316189_+|WP_006250894.1|DBSCAN-SWA MKIYTWDETKRKINLAKHGLDFADADEVLSSPYRFDVEVIRNNEFRIQSFAYSFGRLLVLSLAYTEREDYIRVISFRRASKAEREAYYEYLQQYFE >NZ_CP017542|2315221:2323376|2320206_2320425_+|WP_006253767.1|DBSCAN-SWA MMREQTTNQIIITDNFSKWLENLKNPIAKATVARRIKNAINGNFGDHKSLAGTGGLYEMRIATGAGYRIYYA >NZ_CP017542|2315221:2323376|2315221_2315761_+|WP_006250276.1|DBSCAN-SWA MLDLTKIKLVITDVDGVLTDGGMYYTDQGEVMKRFHVHDGLGVKMLQSCGIKVAVLSGGDTALLRKRLEVLKIDLALLGKMEKRSACFELMQQAGVTPEQTAYIGDDTLDLPAFEVCGIAIATRNALDYIKEKADWVLQKAGGEGAFREVSDQILEAQGFGEIFKTADGFLTVAGKMAQ >NZ_CP017542|2315221:2323376|2320537_2320861_+|WP_006250284.1|DBSCAN-SWA METIQINEQAAEKHGLRPFDVAEFLTDEATIQAYLAEVLKEGDQDEFLEALNDVARARGMAELAKQTGLGRESLYKTLAKGSKPRFDTIQKILGAFNLVLIPQVKNG >NZ_CP017542|2315221:2323376|2316724_2316937_-|WP_015484067.1|DBSCAN-SWA MPTSGDFFTRYARTSCRRQSQRSNASVCAKFYAKSTACILTKNEDTMINITDKQIDPTFYQRLPASRRLY >NZ_CP017542|2315221:2323376|2318705_2319932_+|WP_006250282.1|integrase|DBSCAN-SWA MARKITPLNDTQIRKAKPEDSPLRDGNGLLLVITSNSKLWRFRYERPFTKKRNDLSIGAYPDISLAQAREIREEYRALLAQNIDPQTHRQQQEQAKANEISNTYENVAWAWLEHRKTKKNFSDNYQKDVIALIKNNLLPHFGRMPITQITAPMAIKAFKQYQDEGKLEKLKRAIQKHNEIMMFAVHREMIPFNPTANIAKEFDSPTVEHFKTIKPEDLGEFLYTLQNAQIHLQTRYLILWQLLTMTRPNEAAKAKWADIDEKAKLWTIPAENMKRGIEHKITLSRQAIALLREIKKLSGGKTYLFPSVKNPQTHVNTQTANGAIKRMGYKGKLVAHGLRAIASTYLNEKGYNSDLIEVALSHLNSDRIKAAYDRGERLEQRFKLLQVWADFVEECSQGSLPQYHLKIA >NZ_CP017542|2315221:2323376|2316480_2316774_-|WP_006253765.1|DBSCAN-SWA MTQLSTSVYQRADGFINVANAHLKNIAPNQVSNAMLFGCARFNAYVAASKAEYKQQLADSREEVIQYFVEQYKEMLTANLDEYIQNFERYIEGKKAD >NZ_CP017542|2315221:2323376|2322683_2323376_+|WP_006250290.1|terminase|DBSCAN-SWA MTELTPKQEAFCFAYIETGNASEAYRQAYETEDMKSETVHRKAKELMDNGKITARIEELKAEHAERHKLTVDDLLKELEEARILAREKENPNAMTQATMGKAKLLGLDKQVTDPCFDGETGKGDMILSVNCSSIKDGKALDETCILKAGTHEFITRDSFIFYRHIRIDSLDEIKANIEAGYFIQKALINDEAYQQILKGVLSSKSVTPRYKRFLKNAIRQSACPDILAEP |
12 | Synechococcus_phage(16.67%) | terminase,integrase | attL 2318427:2318486|attR 2323792:2323865 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2514264 : 2559633
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP017542|2514264:2559633|DBSCAN-SWA ACTAACCTAAACTACCCTTAACCAATTGTTTTAAAAAGGATATTTGAGATTTTAAGTCACTGTGATTAAAACGCCATTCGCATTCTTTCAAATACAGCTCAAAATGCACTTTGGGAATGCCGTTAAACTTACGCAAATGGCGTTTTGCTTGGCTCCCAAAATTCTCAATTCCATTAATGTGATTTTGATTTTCAGCGAAGTGTGTGCTGTGATTAATGCGAAAATGGTTAAATTCACTCACATCAAGCACATCATAACTTCGATAGAAATCGGTGTAAACAATACTATCGGGTTTCACCTTTTCCCGAATAATCGGCAAAAGTGTGGCAAATTGCGTGTTTGGTACTACCACGGTATAAACCTTTCCGTCCCGCTTTAAAAGCCCGAACACGGCGGTTTTGCCTGCTGCACCACGTCCACGTTTACCTTTACGATGACCGCCTAAATAACTCTCATCAACCTCAATTTCTCCCTCAAACATTTCCAAATGAGGGCTATGTTGATAGATAAGCAACCGCAAGCGATGGAAGTAATACGCCGCCGTGTTTTTGTTTACATTGACCAACTCAGATGCTGTTCGGGCTGTTACCCCTGCAACAAACTGCTCAATGAGTTTGTTTTGTTTGTACTGACTTAGACGACTTTTTCTCATTTGGGTATCTTAACCTAAATGGAGTTTTTAGTCGTTATCTAGGACAGCCCCAAAGAAAAACACGCTTTGCATTGAAAAAAAGGCGGTGGTGGAAATAAAACGGCGTAGGAGTAATAGTTTTTCTAAAGACATTCAGAATGGTTGAATTGGTTAAATAAAGAGCGGTTATTCTACCTTTTAAGTCAACCCCAATCAATCGGCTTTTGTTTTACCTTTGGCGTGGGTTTCGGTATGATAAGCGATATGTAGTGGCGGGTCCTGTGCCCGCCTAAATACCAATGATAACTTGCGGGCGAGCACAGGACTCGCCCCTACGATAAACAAGAAAATGAAAGACACCATTGTTGCTCAAGCAACACCGATTGGCAGAGGCGGTGTGGGGATTCTGCGAGTTTCCGGTCCGCTTGCCGAAACCGTTGCTCAAGCCGTATTAGGCAAAACATTGCCACCCCGTATCGCAAATTATTTGCCGTTTAAAGACGAAGATGGCACTGTGTTGGATCAAGGCATCGCCTTATTTTTTAAAGCTCCCAACTCCTTTACCGGCGAAGATGTGCTTGAACTTCAAGGACACGGTGGGCAGGTTATTTTAGATTTACTGCTCAAACGCATTTTACAAGTTAAGGGGCTACGCATTGCCCGAGCAGGTGAATTTTCCGAACAGGCATTTTTAAACGATAAGCTCGACCTTGCCCAAGCTGAAGCGATTGCGGATTTAATCGACGCCACCAGCGAGCAAGCCGCTCGTTCAGCCCTGAAATCACTACAGGGTGAATTTTCTAATAAAATCAATGCGTTAGTTGATTCAGTAATTTATTTACGCACTTATGTGGAAGCGGCGATTGACTTCCCCGATGAGGAAATTGACTTTCTGGCAGACGGTAAAATCGAGGCAAAATTAAATGAGATTATCGCTCAATTAGACGGTGTTCGCCGTGAAGCGAAACAAGGCTCGATTCTGCGTGAAGGAATGAAAGTAGTGATCGCCGGTCGCCCGAATGCAGGGAAATCAAGCTTGCTTAACGCCTTAGCCGGACGAGAGGCGGCGATTGTAACCAATATTGCTGGCACAACCCGTGATGTGTTGCGTGAACATATTCACATTGACGGAATGCCGTTGCATATTATCGACACCGCCGGTCTCCGTGATGCCAGTGATGAGGTGGAACGTATCGGCATTCAGCGTGCTTGGGAAGAAATCGCCCAAGCCGACCACGTTTTATTAATGATTGACAGCACCGAGCAACAAGCCGATCAGTTCCGACAAGAGTGGGCGGAATTTCTAGCCAAACTGCCGGCAAATATGCCTGTGACCGTAATTCGCAACAAAGTCGATTTATCCGGCGAGCAGGAAGGCTTAATTCAGGTGGACGATTTCACGATGATTCGCCTCTCTGCCCAAACCAAAGTCGGCGTTGATTTATTGCGTGAACACTTGAAGAAATCAATGGGCTACCAAAGTTCTACGGAAGGCGGATTCTTGGCTCGCCGCCGTCATCTGCAAGCATTGGAAACCGCTGCCGAGCATTTAGAGCGAGGGCATATCCAGCTTACTCAATTCTTAGCCGGCGAATTGTTAGCGGAAGAGTTGCGTATGGTGCAAAATGCCTTAAGTGAAATTACCGGCCAGTTCACCTCTGATGACTTATTAGGCAACATTTTCAGCTCATTTTGCATCGGTAAATAAATGGCACTTTTTAACCGCTTTCAAACCCAGTGTGCAACGCATTTGCCGAACCAAACCGCCTTTTTAATCGGCTTAAGCGGTGGGGTGGATTCGGTGGTACTACTCCACCTTTTTGCCCGCACCTCATTTCACGTTAGGGCAATTTATGTCCACCACGGGCTAAGCCCAAATGCGGACGACTGGGCAGCCTTTTGCGAACAATATTGCAAGCGGTTAAATATTCCCTTTATTTTACAAAAGGTCAGAGTGGATAGCTCAAACGGCGTTGAAAACGGGGCGAGAGAAGCTCGTTACCAAGCCATTCAACAACAGCTTAAGCCCAATGAAGTGTTCGCCACCGCCCACCATTTAGATGACCAAGCCGAAACTTTTTTGCTCGCCCTCAAGCGAGGCAGTGGAGTCAAAGGATTATCGGCGATGCAAGCGGTCACTTTTTTGCAAAATTTTACCGTTTTTCGACCGCTACTCACTTTTACTAAGTCAGATTTGATAGGTTATGCCGTTCAACATCAGCTAGGTTGGATTGAGGACGAAAGCAATGCCGATAACCGTTACGACCGTAATTTCCTTCGCAATAGCATCTTGCCACTACTCAATCAACGTTGGCAGCACTTCAGCCAAATGGTTGCCCGTTCCGCTCAGCATTGTGCAGAACAGCAAGCCTTGATAGAAGAGCTATTAAGCAATGAACTCAAGTCAAGAACAGGGGAAAAACAACAACTCAACATTAACGGCTTTGGGCAATTTTCACTTGCCAAGCAACAGCAACTTAGCCGCCTTTGGCTGGAACAAAACGGAGTGAGAATGCCAAGCCAAGCCCAGCTACAAGCGGTCATTTCTGAACTGATTTTTGCAAAAGCCGATAAAAACCCACAGGTTAAAGTCGGCGAAAATATTATCAGACGCTATCAACAAGCTATTTACGTTACCGAAGAGATCGCCGACATTCCGCCGTTTGAGGTAGTACTTCCCACAGAAACCAAAGTGGAATTACCCTATCAGCTCGGTACTATTATTCGCCAACAACAAGAGATCATTTGCAAAAAAAACGGGAAAAATCACCGCTTGCAACTGCCCCAAGAGCTGGCTCAATCAACTATTTCTATTAAAATCGGGCAACTAGGCAAAGTAAAATGCTACGGCAAGGCTCAACGGGAAGAAATGAAAAAGATTTGGCAAAATCACGGCATACCTGTTTGGGAACGCAACCGTACACCGCTGATTTTTTGGCAAGACGAATTAGTTGGCCTATTACCTATCCTCTAGGGTGAAATTGCTGATGAAGCGATTTCAAACGGGCTTTTGCCACTTGAGTGTAAATCTGGGTGGTCGATAAATCACTATGCCCCAGCAACATCTGTACCACTCGCAAATCAGCCCCATGATTGACCAAATGGGTCGCAAAGGCGTGGCGAAGCACGTGAGGCGAGAGTTTATCTGCATCAATACCTGCAAGCACGGCATAGTGCTTAATCCGATGCCAAAACGTCTGCCTTGTCATCTGCTGACCTCGCCGGCTCGGAAATACAACATCAGACTGCTGATTATTCAGCAAAATAGGGCGACCGTACTGGAAAAACTCCTGTATCCAATAATTCGCCTCCTCGCCCAATGGCACTAACCGCTCTTTATCCCCTTTACCGATAATTCTCACCACCCCTTGTTTGAGGCTGATATTATCCATCGAAAGCGACACCAGCTCCGTTACCCGCAGACCGGTGGCATACAGCAGCTCCAGCATTGCTTTATCCCGTAACTCTATCGGATCTAACGTATTCGGGGCATCTAGCAAATCCATTACCTGATCTTCACTTAAGGATTTGGGTAAAGAAGCACCCCGTTTAGGGGAAGAAAGGGTTAAAGTCGGGTCATCTTGGCGATAATGCTCAAGGCATAAAAAACGGAAAAATTTCCTTAAACAACTCAACATTCTGGCAGAGCTTGTCGCCTTATAGCCTTGCTCCAAACGCTCGCCGAGAAAACCTTGTAAGTCGATATGATCGAGAGACAGAAATGCTTTAGGTTCAGAAAAATAATCGGAAAAACGCTCTAAGTCAGAACGATAAGAGGCAACGGTATTTTCAGACAAACCGTGTTCTTGCCATAGTGTATCGAGAAATTGTTCAATAATAGGGTCAAGCTCAGCCATACAAGCGGGTATATTTTCAGGAAATTTTGCAAATTTTAACAGAATTAAATCTATAAAAATACAAAAGCGATAGAAACGAAAAAACCGATTAGCTTATGCTAATCGGTTTAAATTATTGGCGGAACGGACGGGACTCGAACCCGCGACCCCCTGCGTGACAGGCAGGTATTCTAACCAGCTGAACTACCGCTCCTAAATTAATAGATTGATAATGCCCTACTCTCACATGGCGAATCACCACACTACCATCGGCGTTACTGCGTTTTACTTCTGAGTTCGGTATGGAGTCAGGTAGAGCCACAGCACTCTGGTTATCAATCAAATTCTTTCATTTAGTCAGTTTACTAAAATATAGTTTATACTTTCTAATAAACTCACTAAATAAATTAAAACCCGACGATGCTCTACTCTCACATGGCGAATCACCACACTACCATCGACGTTACTGCGTTTTACTTCTGAGTTCGGTATGGGGTCAGGTAGGACCACAGCACTCTTGTCGTCGGGAAAAT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36 | Mannheimia_phage(25.0%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017542.1|WP_006250250.1|1630522_1630753_+|hypothetical-protein |
1630522_1630753_+
Protein sequences of NZ_CP017542.1|WP_006250250.1|1630522_1630753_+|hypothetical-protein>NZ_CP017542.1|WP_006250250.1|1630522_1630753_+|hypothetical-protein MNAQATLNNHKDYILCGRKEKRTSDFINVFEVFENEATQEFVIERAMFRNGKLIDWNQSDKMNAEQAQQLWQAYIH |
76 aa aa | NA | NA | NA | 1550538-1642325 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.14|1718653|37|NZ_CP017542|CRT,PILER-CR matches to NZ_CP017542 position: 1575281-1575317, mismatch: 0 ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************* 2. spacer 3.19|1717985|37|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017542 position: 1626820-1626784, mismatch: 0 ttggttataattaaaattgattgcggtacacgcccct CRISPR spacer ttggttataattaaaattgattgcggtacacgcccct Protospacer ************************************* 3. spacer 3.27|1718521|34|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017542 position: 1575633-1575666, mismatch: 0 cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer ********************************** 4. spacer 3.28|1718587|35|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017542 position: 1575951-1575985, mismatch: 0 gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer *********************************** 5. spacer 3.29|1718654|36|NZ_CP017542|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017542 position: 1575282-1575317, mismatch: 0 gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************ |