Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP042445 | Wolbachia pipientis strain wMel_ZH26 chromosome, complete genome | 9 crisprs | DEDDh,PD-DExK,RT,cas3 | 3 | 0 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP042445_1 | 54484-54588 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP042445_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP042445_1
>1.1|54508|57|NZ_CP042445|CRISPRCasFinder CTGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTTCGTGGCGGCGTGACGATAAGCT |
RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042445_1
The CRISPR arrays of NZ_CP042445_1 >merge|NZ_CP042445|1|54484-54588|CRISPRCasFinder CGTCATCCCGCTACTTGTTAGCGGCTGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTTCGTGGCGGCGTGACGATAAGCTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGG >NZ_CP042445|1|1|54484-54588|CRISPRCasFinder CGTCATCCCGCTACTTGTTAGCGG CTGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTTCGTGGCGGCGTGACGATAAGCT CGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGG
>NZ_CP042445.1|WP_015588782.1|52812_54351_+|leucyl-aminopeptidase MKNILLMFLLCFMYSLQLFATEIPAMKITISKISPDFKTIVMGLFEDNETVNDGGVLQGKQVIDNIKQFSDFNGSFGEFFSTALPEEKNVIVVGLGKKDEWNENKELNIGGKIYCELSRLKIKKAAVLIEGSAANVAYGAFLRSFKFDKYKTKKDEKITEVEEITVLVKDEQLSNAERSFEHLRQEGESIFLARSFITEPPNILYPESYADHIKKELTKLGLEIEVLDKKQMEEKKMGALLGVAQGSSKEPKLVVIKWNGASKEQKPIAFVGKGITFDTGGVSLKPSRGMESMKYDMAGSATVVGVMHALAGRKAKVNAIGVVALAENAVGGNAQRPSDVVTSMSGQTIEVLNTDAEGRLILADALWYTQDRFSPKFMIDLATLTGAIVVALGNNEYAGLFSNNDELANRLIDAGNEVNEKLWRFPMNETYDKIIDSPIADVQNIAPAGSGGDSIMAAQFLQRFVNETCWAHLDIAGTAWHEKGTDICPRGAVGFGVRLLNKLVEKYYEAND >NZ_CP042445.1|WP_010962336.1|52110_52752_+|dioxygenase MNVKNILLALLVQMIFSLPLFAADPVLLNCIKTPEIYDLDARPKNFSSSNNLRRKPGSPNSAIGELIHIVGRITDINCLPIQNAVVSIWHANSRGVNHYDKNIEDDLNFAGSGRFVVNNLGYYNFITIAPGKIGDRAPHINFLVQHPDFPEFTTQMFFADHNCDNCADPVLEDFVSNGLASLLITPFTYSDQVIKTYTFNITLGGYNKFSNKR >NZ_CP042445.1|WP_010962335.1|51845_52043_-|hypothetical-protein MLDTLRQPPYHETEGIQLSSSVQIKQQENNVVGVLFLIFCTMCTLCLHNISRFLPTQAETRYLKH >NZ_CP042445.1|WP_099606205.1|47716_48118_-|hypothetical-protein MESFNPQNVVQFKEAPLLACVALHGLEQHVKKALTNELFQCMKRKYGRISHKNAQKSISVIFYCDDFVIIHENEEIILKAKILVEEWLETIGLKLKPSKTRISHTLRTIDETKPGFDFLGFSIRGCPETSKRL >NZ_CP042445.1|WP_099606204.1|46856_47689_-|IS5-like-element-ISWpi1-family-transposase MRKKYPTDLSEREWSRIEKHFRVSYKKGGRPPKYSKREILEAIFYVLRTGCQWRYLPNDFPLWKTVYEQFRQWKKQGIFEKMNYEITKYSRRKIGRNEQPSACIVDSQSVKTTEKGGSKAMMEGKKVKGRKRHIITDTQGFILGCYVGAANENDRDGIKIALNNMRTKYTKVKKMWADMGYQGRNLKNHIKEEYDIDIEIVKRPPCRFWVHKDTPPELLPTREQGFKVQPRRWVVERTFAWVNRNRRLSKEYDLLTTSTENFIYLAMSRVMLKREYA >NZ_CP042445.1|WP_010962329.1|46173_46860_-|reverse-transcriptase,-interruption-C MNLLVSGQPLRQYPTKESKKGYTLLIKPSRNSIKQHTFAIKHKLREMRGAPQEVIIRNLNPINRGWSQYYSSVVSCKIFSSLDNTIHRKLWKWAVFRHPNKGKCWIKRKYFKKYNNDNWRFMTSNKIHLIIHSDHVIKRHIKVQKTRSPYDGDWVYWGNRLREIPDKPSRVIKLLKLQQSKCGNCRLWFESDDIIEIHHKDRNRRSNMIKNLSLLHGHCHDELHRRCA >NZ_CP042445.1|WP_010962328.1|45766_46177_-|hypothetical-protein MTSTKLERSRMRRKVSRTVLKSSEEGRPSSLRQQYADETTDEDLRNIAEKSPIIKLAYDELDRFSWNEKDLVAYEERIMDLRKEEAILEYKLEEGIGKGKIEVAKNLLKAGVSVNLIAESTGLSQAEIVQLKQEVA >NZ_CP042445.1|WP_099606213.1|44605_45208_-|hypothetical-protein MVNNITNINNGNTTHQGRKENKKESEDSRKLLALGIVAAVVCVAFHAGMCFWYNSSRKVARKEEKIDYLDSKFKTFRNIEFAVGVVSLAALVACAVYPVLPVWGLAILGVNSLVCFAGGLAFHMKHEEELENIEKAKGAVDSCLRQGHGYGDSSRYDAPPPYFSQDPNTTPTAPPCSEFDNSNAKRQFENCEGFTYDRNQ >NZ_CP042445.1|WP_010962326.1|43263_44382_-|molecular-chaperone-DnaJ MSKKDYYDLLEVGRNASIDEIKKAYKKLALRYHPDRNPGNQEAEEKFKEVTAAYEVLSDSEKRAGYDRYGHEGASGGFQGFSSAGDFSDIFNDFFGGGFGGGASRSRAKRSTTGVSGADLRYDLEITLEDAFKGIQAPIHYVTNVKCDTCQGTGGEGAIKPVQCHTCQGSGRIRTQQGFFTIERTCTTCYGEGEIIQNKCKKCGGSGRRRDEVNISVSIPKGIEEGAKVRISGKGEAGTKGGKSGDLYVYVKIIFHKIFARNKADLHCKVPIRMTLAVLGGEIDIQSIDGAKIKVKVPEGTQTGTKLRCREKGMPYMNSHARGDLYVQVIVETLNPKNLTKKQIELLKALEEEENASVQQQSEGFFSKVKKK >NZ_CP042445.1|WP_010962325.1|41419_43054_-|ribonuclease-J MNINKNEFLFLPLGGVGRIGMNVSLYHYQGKWIMIDLGVGFADETMPGVELLIADIDFIAQRKKDLLGIIITHAHEDHCGAVPHLWEELQCSIYTTKFTVNFLKEKLKEFRLEGIVPVKEVDINGSINLGPFTVEFINVTHSIPEANSILISTEMGSALHTGDWKFDPKPVVGLTSNMERLKEIGDKGDLLAAICDSTNILSKHHPESEGEIYNNIYNIIKRSKKLVAVSLFASNVARIETISQAAKALNRKVVLLGRSLWRIVKVAQDSGYLTDSPQFLEAKEAVNFPREELVLLCTGCQGEPLAATARLAAKNHQAFKMQQGDTMIFSSKIIPGNETRAHNMLNAFIEMGVEVITEKTEHVHASGHPTREELKEMYSLIKPKMSIPVHGEYIHTHAHVKFAKECGVAKAIMIAPGDIVNLENGGKVDSIDVDYFGIDGMLLRHPESSVIKMRKRMRDAGVIVVTAVVNKKNKLLAKPKVFVPGVFEVLEDAATIQKIVKKVESLFSLQPTKKIKNKIESSILSILKEYLLKRPIIEVQIEQV >NZ_CP042445.1|WP_010962338.1|55044_56232_+|MFS-transporter MESRAKAWFIWLISNLVVIFSNMQIIYTFISVNLEKELGLTIAQVALANSAYTWTFAILQFFSGATFNVFSSKKIYFFSLSTMILGFFVLINSDNFSHLILSQVLIATGASFGFIGAAHTSSICFSAAQFGLMFSLVQTISSLSALVIQILFSNLLAEDAYWKNLIVCIILFGVLIFVLTLFCPNTLPKSSSEKRTIKSSMKTVMCSILTVLKLRDIWITSVVGAITFGTFLALNTLWAPRLLGNSELNAMESGIATAILWLGLAVGAPIADRISNLFKNRKHVISAFALLQGVSIIILLYSHLTVHVVYFCMLMFGFFAGGHMLNFTVGSEIVKRKYISTSSSIINGFMFIGSGVIVSMLALFTDHKMELFAIFAILIVAGILNYATKETYSKK >NZ_CP042445.1|WP_006279881.1|56292_56598_+|integration-host-factor-subunit-alpha MDHVTTKDTTVTKATIAGDINQEIGLSKEDSVSIIDDILDEIKTSLVKDGIVKISSFGTFLVKKKKERPGNIPNTSEKVMIQARNSVSFRPSKIIKKSINN >NZ_CP042445.1|WP_006279880.1|56597_56924_+|MerR-family-transcriptional-regulator MNKEKLFYTIGEVAEELHLEQHVLRFWEGQFHQIKPTKRKGRRLYDRKCIEAIKKVKYMLYDKGYTIKGVQKEFGNDIKVTKNLLQELTDLRDYLTSKINNEESNKQA >NZ_CP042445.1|WP_006279879.1|56969_57566_+|M23-family-metallopeptidase MWHIASFLMLLAILIGCGLQKPAPVLLKGEEFYGKRDLEYTREYHLIREPSVQKESRKAIINRIYKDNNNTQNVGVNCKFVMPVKGSATSSDEMCKDGIKIAAQNGTNVVSSAPGKVIYVGKGLRWYGNLIIVEHKDNYMTVYSYLKNIHVEIGDKVKQGQVIGSAGKSSTQDKDPQMCFTIRHNGQAVDPLMHMNCN >NZ_CP042445.1|WP_010962340.1|57578_60095_+|leucine--tRNA-ligase MKYDFKSVEKFYQDKWDFSVSKSGKQEKCYVLEMFPYPSGKIHMGHLRNYAIGDVIARYKRANGFEVLHPIGWDAFGLPAENAARDNNISPETWTKENIDNMRTQLKSIGLSYNWERELSTCEPDYYKHEQKFFLDFLKHGLAYRKESWVNWDPVDQTVLANEQVVDGKGWRSGAVVEKRKLSQWFLKITDFAEDLLKCLQSLKNWPEKVKTMQERWIGKSEGATIEFEVVGLNKKLKVFTTYPHTLFGASFCAVAAEHPIVQDLKNGSSVVIPVLDTGIQEIKSKRENDEKIGVYTGLNVKHPFLDKELPLYIANFVLMEYGEGAIFGCPAHDQRDFEFAQKYNLPIIPVISSAHLGVIPARDQNSYNGSQCQATQMTKEAYTGDGTMFNSEFLNGLMVSEAKEAIVKKFEEKKIGKKTINYRLHDWGVSRQRYWGCPIPIIYCKDCGTVPVPEKDLPVVLPIDVEFTSGGNPLDKHPTWKFVDCPKCGKQAERETDTFDTFFESSWYFAAFCSEDKSIDKDACNRFMPVDYYIGGIEHAILHLLYSRFFCRALTKCGYFDIKEPFSTLITQGMVCHATYKDENGKWLFPAEAKELIARGAKVQVGKVEKMSKSKKNTVDPNFIIEKYGADTARLFVLSDTPPEKDMEWSDDGVEGCSRYVNKLWRMVMQLRPVNIHYDNENVTGGLLEYRKKIHKLLHGLTDDLENCRLNCVVAKFREMTNLIAEIDVKTGKSLIDEGICILIRVIEPFIPHLAESLWQEIGGQPWPKADESLLVDDTVTIAVQINGKLRTTIKVAINLPQEELKKIAIDSVSSKIDQSKVRTVYAVPNKIVNIVI >NZ_CP042445.1|WP_010962341.1|60223_60859_+|membrane-protein MKIKRLCVLAVLLTSSLAGAASNSASKSEDKYYAGLNFGAGWGGGFKMKPGVVLGYHYDQNSKFELEVLSNIKSLKSIGASLLANYRFYPDLDIDPVKLYVSGGLGGYLQITPFGFGVSDTVDGDGNSSQEEKEKEEETQGAPESGGEAAGSSVVDKILSSISYKLKLGVDYEITPQIIGAVGMTMGGQLSGIKAKQIPDATLEIGVRYNF >NZ_CP042445.1|WP_010082072.1|61331_61496_-|IS3-family-transposase MSNKGCCYDNSVAESFFSSLKREILIDTSQHSAQQTRTAIFEYIEIFYNKQRHY >NZ_CP042445.1|WP_099606206.1|61653_62088_-|IS3-family-transposase MFFYIVTAIKYRNYVGFSASGYYKWTTRKISSRESANKELLAAIQKIYQVSKCRYGAPKIHAELKALGKSCNLKTVQSIMQKNDIRAILRRKFKIKKQQTDNRAVAPNILDQNFIVDQPNKVWDYLHQNQGGMAIFGSNNSHVW >NZ_CP042445.1|WP_081420799.1|62072_62366_-|transposase MAREYTAEFKLEAVKLANEQRKVGQTITKTAKDLGIKGGLLGKWIKKHNEKKSAANAFPDVAPYDKERFDLQSKSNKGKRHLKKSPGQSKRVKYFFI >NZ_CP042445.1|WP_006279877.1|62502_63210_+|pyridoxine-5'-phosphate-synthase MKLGVNIDHVATLRNARGTSYPDPLKAAEIAIDAGADFITVHLREDRRHIRDEDVFNLKKSISTELNLEIAATEEMLEIAKKVKPYSISIVPEKREELTTEGGLDIVNMHSKLSSIIEEMHSSSIKVSLFIDPNIDQLKYLEKLGTKPDIIEIHTGDYCDNPSEKKLQLITNAAEYVNKLGIECHAGHGITYKHAKKMTRIPHISALNIGHYLISEAVFYGLHSVVKTMKMTMSN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP042445_2 | 178437-178595 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP042445_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP042445_2
>2.1|178491|51|NZ_CP042445|CRISPRCasFinder AGATCCCGCTAACAAGCAGCGGGATGACGAGGTATAAACTTTATCGTCATG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042445_2
The CRISPR arrays of NZ_CP042445_2 >merge|NZ_CP042445|2|178437-178595|CRISPRCasFinder CCACCGCGAACCGTCATACCGCGATTCATTCGCGGTATCTCAGCCGCTAACAAGAGATCCCGCTAACAAGCAGCGGGATGACGAGGTATAAACTTTATCGTCATGCCACCGCGAACCGTCATACCGCGATTCATTCGCGGTATCTCGGCCGCTAACAAG >NZ_CP042445|2|2|178437-178595|CRISPRCasFinder CCACCGCGAACCGTCATACCGCGATTCATTCGCGGTATCTCAGCCGCTAACAAG AGATCCCGCTAACAAGCAGCGGGATGACGAGGTATAAACTTTATCGTCATG CCACCGCGAACCGTCATACCGCGATTCATTCGCGGTATCTCGGCCGCTAACAAG
>NZ_CP042445.1|WP_010962427.1|176631_178194_-|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase MSAIAIIDFGSQFTQLIARQVRGMGVYCEIFPSNISFETISKFNGFILSGGPQSVNDDCSETSRVVHEIIKLNEATSVPILGICYGQQLICHYFGAKVKESFKQEFGRTKIKILKESPIVKDTWDVNSEVDVLMNHADSVDTIPQGFTVIASGVINQTIAMIVNEQRKIYCTQFHPEVKPTTNGSKLLSNFLDIANCKRDWTMKSFIEEQKEKIKNVVGEKKVIAAVSGGVDSSVAAALTHKAIGKQLNCIFIDTGLLRKNQTIAMLKEIPINYVDKSNLFLSRLKGITDPEEKRKIIGNTFIEVFEEEAKKIGDVDFLMQGTIYSDVVESGHASDNTSTIKSHHNVGGLPEKMNLKLVEPLRYLFKDEVRLLGKEIGLSDEIIFQHPFPGPGLAVRIISEVDKEKVQILQEVDEIYINTMKNYDLYDKIWQAFAVLLPIKTVGVMGDGRTYGYVCALRAVTSSDGMTADAFPFEDKDQHLLVFWDFLRNVGSIIVNNVPGVNRVVYDITSKPPATIEWE >NZ_CP042445.1|WP_010082284.1|175891_176599_+|membrane-protein MLTDAWTLLTLTLLETILSVDNLIFISLAIDKVPNALRERVRLMGLGLALLMRFVILFFTSSILSMQKPIFHTASARDLLMIAGGLFLIVKSSMELRDDIFVCKKNKKKANVKSKFFLVVLQIILIDLVFSVDSILTAIALTYNMVIIATAFTFSMLAMLFLSSYTAQLIKSNPGLKIIAILFVLLVGVYLILHGFHIELPKGYLYSSFMFALLVEIISKIKKINRHTAIHSRYL >NZ_CP042445.1|WP_006279522.1|175311_175494_-|hypothetical-protein MVENLGVVFTTAQRAIVKLEDLGIVSQTSQGKRDRVYCATDILNILEEPTKITENFDSTL >NZ_CP042445.1|WP_010962425.1|174319_175126_-|ankyrin-repeat-domain-containing-protein MINNLDSIILGIKDGEKAIEDLRVVLKKRKEEVITTQTFNYALQCPQTTKEAIVHEILLHFIQNPGEQSLEQVIQYLDGAIQSRIYAKNNPIRNLDEEFRTHINFKDEEGNTLLHHAVIGNKTEEITTLLVTYSANPLIQNADNKVPSDLAQGKTKEVLIKSMKKQANTKKESAMVGSLVPGVIIGGFLGVVLGAGVCVAVSLSGGMILGVMIASSLVASIAIGLAMYFLSQDYEQAKAIEKTISTVSSEISVDDTTVANGKKGPQLT >NZ_CP042445.1|WP_041580618.1|171549_174045_-|DNA-mismatch-repair-protein-MutS MSFVKEKNTPVMEQYLNLKAQYKDHLLFYRLGDFYELFFDDAIKAAKLLNIVLTKRGNSCGQEIPMCGVPAHSSESYLHKLIDLGFKVAICDQLETADEAKKRGYKSIVKRDVVRVVTPGTIIEDSLLEDKSNNYLASIVEQNDEYAISWLELSTGKFFHTLTSLKALDSDLLRISPRELLISEKFTEDEKIRSILKNYKISITQHAQSFFEYSKSHRTLCEFYKIRELGSIGNFSKVEIMACGALLEYVRVTQRGSIPRLEFPKTYKQQNFMLIDTSARRNLELFSTQFGEKKGSLISVIDHTVTASGGRLLKQMLASPLACSKAINLRLSTAQFFVNNHDSRRKIREILSNIPDIERSLSRLILGRGSPKDMNLLKIGLGKTLELSEFLCKIESGENGSLPQQYVIQTEIQPASRAGITVKSDESELSTIHKSLGNHKDLFELLNSAILDNNLSSVKEGGFIHSKYNSELSELSYILNNSNKLVTKLRESYRDLTGIAALKILHNNILGYYVEVSANHKITSDIFIHRQSLANSMRYTTNELKELENKILTARDAAIGLEMKIFSELCSEVAKESEKIALAANALAKLDIRTAFAELAVQNNYVKPIIDDSKEFNICSGRHPVVEVNDKFIANSINLAGIHLITGPNMAGKSTFLRQNALIAILAHMGSFVPAESAHIGVIDKIFSRVGATDNITAGYSTFMVEMIETATIVNQATDRSLVILDEIGRGTGVYDGLSIAQAVIEHIHNVNKCRAIFATHYHELTKVSKYLKNVKCFCVKIREWNGEVIFLHEVIEGIADESYGIHVAKLAGFPDSVLNRASEVFEELKA >NZ_CP042445.1|WP_081420803.1|170963_171212_-|hypothetical-protein MSFFLLSKFLKHLQRKLVAIKSSLILLVKRLKHKKRQYFKADNNPRASFAFFFYLVNFLIFIAKRQSSSRYLLAGSRDTAAV >NZ_CP042445.1|WP_010962422.1|169486_170665_-|ribonuclease-D MLISTTSELENTCEELIAKKPKFIAVDTEFIRNNLIYYPKLSLIQISYGEKSFIVDALVPEIDLSFIKKIMLNQGITKVFHSCRQDIESLLTVFKCIPTPIFDTQVAAMFCHYYHDFIGYSKVVEQYQGIALDKIKAKNSDWLRRPLSEDQLDYAVNDVVHLYDLYQILCNKLEENNRMGWFQEEMESIVDINKYLHSPKDAWKRIKFNYEVNPRLILTVKAVSEWQETLAQRYNMNRNKIINNAVIADFIEKNVEHVDEILDDLKRNTKNIKDADLLEFVNIFNENERNWMQQNNTLSSNYDKSVLDILSIILDSKCKESNISRKLVSSKDELTGSISGQTDKLFKGWRYDFFGRSVESFLNTSSKFEISAVKSANNITKIQSNLVENNCC >NZ_CP042445.1|WP_006280338.1|168603_169191_-|dephospho-CoA-kinase MIISLTGGIGVGKSFVANCFQEFGAVVFDADSVVHQLYKVDKSIISYAEKNFPGVVVNGEIDRTVLSKYFLAYDENWKQFQSLVHSAVLRELEFFIAKEKKIDRKLLVLDVPLLLETKFYLYCDLIVFVHADSVVQAQRLNERNIDKEKLNLISDVQLSIEEKRKMSDFIIDTSVSKEYVFSQVKDIVDSLNLNT >NZ_CP042445.1|WP_146038202.1|168371_168449_-|hypothetical-protein MCTIATFLIKNWIPVSSTGMTPFRW >NZ_CP042445.1|WP_022626217.1|166848_168252_-|oxidoreductase-2-nitropropane-dioxygenase MKNKIKKIVISGKEVWPIIEGGKGIAVSDRRSSGAFAAADAVGTFSGANAKLIDDNGELVPLIYKGKTRNEKHSELIEYSIEAGISQARIANEISKGHGRIHMNVLWEMGAAERVLHGILEGAKGLIHGITCGAGMPYRLGEIAAKYQVYYYPIISSVRAFKALWKRAYQRISSYLLGGVVYEDPWLAGGHNGLSNSEDPELPQAPFERVAELRSFMNEIGLSETPIVMAGGVWHLKDWEHWFDNLQIGPIAFQFGTRPLLTKESPISAEWKKKLLTLEEGDVFLNKFSPTGFYSSAVRNNFIRELQERKLHQVNFSENASEESNSEFAMGSRGRKIYLTAKDKELANTWTKAGYTEAMKTPDSTVIFVTPDKFKQIREDQINCMGCLSHCLFSNWKDHGDHSTGRKPDPRSFCIQKTLQNVIHDGDIENELMFSGHNVYKFKQDPFYENGYVPAVKELVERILTGY >NZ_CP042445.1|WP_006280151.1|179172_180957_-|ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha MNNITINYAKDSKLTDFGKAVLSDRYLIENESYQDLFARIANYYSDNKEHAQRLYDYMSNLWFMPSTPILSNGGTKRGLPISCFLNETEDSLQGIVDLWNENVWLAARGGGIGSYWGNLRSIGESVKGSGKTSGIVPFIVVQNALTLAISQGSLRRGSSAVYLPVSHPEIEEFLDLRKPTGGDPNRKALNIHHAVIVTDKFMQAVENDQEWNLISPHNNKVISTVKARDIWIKILTARVETGEPYIIFLDATNNNKPESYKKLNLDIKMSNLCSEITLTTGYDHLNKSRTAVCCLSSVNLEYYEEWKDNKLFIEDIMRFLDNVLEDFINKAPNEMQRAKYSAARERSIGLGVMGFHSFLQSKMVPFESVTAQQWNKKIFKYLREQADIVSKKLAEEKGACSDAKEVDLMERFTHKLAIAPTASISIIAGNTSPGIEPYAANVFIQKTLTGSFVVRNKFLQKLLAEKNQDNDKIWSSISTNEGSVQHLDFLSEHEKLTFKTAYELDQRWIIEHASDRTSYICQSQSVNLFLPANVHKRYLHKIHMLAWKKGLKSLYYCRSQSMQRADKVSHDIFKKSEILQQKTDIDYDECLSCQ >NZ_CP042445.1|WP_010962429.1|181015_182092_-|methyltransferase-domain-containing-protein MKSNLSFIKNVALNCMSKLIGVLNIKKVKHFIVNKYNTLHKEMTVLLKKSKNLLNTNIEIGLYHFYKGSISDAKLRFWLISIFYPHLPIVWYNIGRCHFAVGNTNKAYNYLTRALKLDNDHEEASYYIKKMTNSAPITELPKNLIRQYFDYTGEYFVEHWLIAKQYRGHELVHMIITKIFNNSTSELNILDLGCGTGICGHFLKINSIGKHITGIDISSRMLNIARGCFIKGKPVYNELIHMEMKEFLKQEKNQQYDVIIFAEVLHYLHDFQEELELAKRSTSKKGVIVCLIRRKEGEGIDFVNKGDYFRHSESYVQHVAKEINMQISYMSYCKIYGSQVDGILFALQHQQKNPKNLT >NZ_CP042445.1|WP_010962430.1|185451_185715_-|hypothetical-protein MVEHIKEVNNTGFGQMYQFLFLPKGTGTDWRSAFRQQEELFKKVGSNVILPEVSNSPSKGNQLGKVGTMLNNVENDQEHIRKKRYRS >NZ_CP042445.1|WP_006279896.1|185800_185938_-|hypothetical-protein MLAKISILNISNIGHYYIILTHRNIMQASYKNLQKDLTICLKKIK >NZ_CP042445.1|WP_006279898.1|186143_186278_-|50S-ribosomal-protein-L34 MKRTFQPKNLIRKRRHGFRSRMATRAGRKILNRRRSLGCNKLCA >NZ_CP042445.1|WP_038228098.1|186385_187474_+|phosphate-ABC-transporter-permease-subunit-PstC MNSVIVIPVLLILLFCFSRFQEVNKVKSYLYLSCVWMLTWLLVFYNNCFVTFISIALLFFMLAFIFKNKRNKIIKLSLFVALAISFFITLFIMLSIFIQSISFFNKVAISEFLFCLKWGHNVVTINEEKIGCFGIAPLLVGTLLITIIAMLVVVPLGLFSAIYISEYASEKVCYIVNTTLQVLSAIPTVVYGYFAVVFLSFFIKQVANFFGLSIHSESALVAGLSIGIMILPFIISLLEDAIRSVPKSLRYGFMALGATPAETIWHITIPYAMPTILSAILLSISRVIGETMIVLMAVGINANLTFNPLNSVTTITVQIATLLTGDQDFNSVQTLAAYALSLVLFIITWLLNAFALFVMKRN >NZ_CP042445.1|WP_010962432.1|187575_189003_+|F0F1-ATP-synthase-subunit-beta MNIGRAIKVTQAVVDIKFEGELPKIFNALKSKLKYKDKELVLEVSQHIGDNIVRCIAMDSTDGMSRGDEFVDTGAPISVPIGRSTLGRIFNVVGELIDECGPLKGKYNLEPIHRAPPSFTEQRIQEEVLVTGIKVIDLLAPYLKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNIAKAHKGFSVFAGVGERTREGNDLYHEMITSNVININEHEKSQAVLVYGQMNEPPGARARVALTALTMAEYFRDRENQDVLFFVDNIFRFTQAGSEISALLGRIPSAVGYQPTLATDMGAMQERIASTTSGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFSHLDATTVLSRQIAEMGIYPAVDPLDSTSQSLSAEIIGEEHYNVASEVKRILQTYKSLQDIIAILGMDELSDEDKIIVDRARKIQKFLSQPFHVAEIFTGMPGKFVSLSDTVSSFKGIVEGKYDHLPEAAFYMVGNIDEAIKKAELIQAEAK >NZ_CP042445.1|WP_006279902.1|189015_189360_+|F0F1-ATP-synthase-subunit-epsilon MNTFKVQFFSPDDQISFSGVVSLSVTGLEGELMILAHHAPYLIYLLPGMITVKMSNQTEKKVVIDSGVLEVANNNCSIITSQIQVFDRAIHDEKSFKNKRISIYLSYLDEKFLS >NZ_CP042445.1|WP_010962434.1|189747_189966_+|ankyrin-repeat-domain-containing-protein MISNIIRSIVKYLMRKVIKYISIIGIACLVLLFFISNVETRVKTQEEQLFLAVEDGNAQEVKLLLKNGADPN >NZ_CP042445.1|WP_080717647.1|190142_190313_-|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MAVDKRKPDKNLLLHSDQGSQYTSQNYQFLLNTKNIISSMSHKGCCYDNSVAEKFT |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP042445_3 | 341228-341332 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP042445_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP042445_3
>3.1|341256|49|NZ_CP042445|CRISPRCasFinder TGGCTGAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTTGCGGTGGTATGACAGTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042445_3
The CRISPR arrays of NZ_CP042445_3 >merge|NZ_CP042445|3|341228-341332|CRISPRCasFinder AGTAATTCGTCATCCCGCTACTTGTTAGTGGCTGAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTTGCGGTGGTATGACAGTTAAGTAATTCGTCATCCCGCTACTTGTTAG >NZ_CP042445|3|3|341228-341332|CRISPRCasFinder AGTAATTCGTCATCCCGCTACTTGTTAG TGGCTGAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTTGCGGTGGTATGACAGTTA AGTAATTCGTCATCCCGCTACTTGTTAG
>NZ_CP042445.1|WP_010082530.1|340873_341164_+|GIY-YIG-nuclease-family-protein MKLSYIYILTNKANSTLYIGVTANLIKRIWEHKNKIVSGFTSRYNVNKLVYFEEFEDISLAIARERRLKEWPRQWKINLINQKNPSWIDLYYLALR >NZ_CP042445.1|WP_010962534.1|339921_340596_+|DNA-repair-protein-RadC MKNYKKGHRKRLREKIILDNGQSLLDYEVLEHILYSAYSRIDVKPVAKSLIESFGSLNKVFNADLEALQNVDDVSNAAISAIFCVKQAFVRSAREEIKNLPVIDNWEKLLDYLRISIGSLNKENFRVIYMNKKYRLIAEDLQNIGTVDQTPLYVREIIKRALLIGSTSIVISHNHPSGDTQPSNSDISLTRQLAEACQSIGIELIDHIIITFSSYFSFKENRLL >NZ_CP042445.1|WP_010962533.1|338514_339111_+|RDD-family-protein MLHKFFNRLFSIFSSINVIQKVKKDENGICYVTGLRRYISVLLDLIIIVLFLQFCGQAFNQLFTNSEDSKIFSQVAAKSPMQVPLSIEEKAMQSRLVKLMILNQIVQFIMLFCYVIYMWVKFATTPGKLLFGLRVVDAQTFEKMTLKQATKRFFSFILSVAPLFLGFLWSNFNKRCQTWHDKIAGTVVVTSKSLRRQS >NZ_CP042445.1|WP_010962532.1|336841_338293_-|replicative-DNA-helicase MNELANLLSSRSVDKEICKLPHNLEAEQMLIGAMIRDNRICDAVEDTITAENFYDPLHQSIFTQISKTRKHGIVANELSLKMFFENDQAFTECGGVEYLAKLAAKASIALDIYSLTRIIRDTYLRRCLIKLGQEIVGDSYNYDIENPAQAQIEQAMTKLFNLAVKKQGEKTYIKLASSIKDVVEKISTLKNNPEALGVTTGLQDLNQLLGGLQKSDLLILAARPSMGKTALALNIALNACKMLQKRADKQHYVAFFSLEMSAEQLTARLITIDSGISYYKALTGRISDFELHEFINTSTELSELPFIIDDTPALSISALRTRIRLLYQLYNVEVVFIDYLQLIRGTTKRSNENRVQEISEVTQGLKAIAKELNIPIVALSQLSRSVEQRDDKKPQLSDLRDSGSIEQDADIVMFLYREEYYELRKQPSEGNNKHREWQEKMEKIRNIAELVIAKQRNGPIGSVKLYFDSNRGAFKDYTERHSS >NZ_CP042445.1|WP_010962531.1|335569_336754_-|hypothetical-protein MVLYFIIREMMNKNNVPYYIAGTLAALTLLASGVFAAAPYIGFLAPVAALSVGLPFIIGGAVFSAVAIALSYQAISENKTNSELKNKMKAQEQTISGQKTQLAKKEAEVKAKEEENSKLKNKVEAQEEENSKLKDQVRTQKQKSSEQKTQLAEKNKKIEEDKLKVAIADGTVQLAKGTVNSAVWFAKEAVNGVLYSGKYAYDNYVPSTESTKGTLSGIGGGLKNTYDASIASVRGALNSVGSSLYSRIYGTKVSSPEEQFKREDGSKPSMQELTRLDYLNLEVLSSEQKQRANSLDYLNIDNVPKQPDHLNVDAAKSYLMSLSEDQDVFYDAESGDEKGTEISSPESQPTKEENGQGWFAWSLGKVKSAITEVVVIGADVTKPYCAKVTKALAT >NZ_CP042445.1|WP_010962530.1|333858_335496_+|methionine--tRNA-ligase MEQFENFYITTPVYYVNDKPHIGHAYTSLLCDVVARFMKLAGKNVKFTTGTDEHGQKIEKAAKAKEMQPKEFTDEVSVSFKELAKFMNFEYDDFIRTTEERHKKAVIALWNRLEERGQIYLDSYSGWYSVRDEAFYQESELIDGKAPTGAEVQWIKEESYFFRLSNWQEKLLELYKNQPSFIFPESRRNEVISFVRSGLIDLSISRTSFNWGIKVPGNGKHVIYVWIDALTNYLTSIGFPSTEGEEYKRFWAEPETQIPVSSTGMTPNQGKTQIPVSSAANLADNSFNVHVIGKDILRFHAVYWPAILLAADLPLPKQIAVHGWWLNEGEKISKSLGNVIDPIGLAQEFGVDQLRYFLLREASFGQDGNFSKKNMISRINSELANNIGNLVQRTISFLHKQCSGIVPTIDQSLLKGEESLPGCKAILDQVMNHLSKYEFNHIILLIINISSEANAYIDKSAPWTLSKTDRERMNLVIYKLLEYIRIIGILLQPIVPKSAEMILNQLQIPKEQRDLKSLCDACVSSGITLPKPTPVFLRVDAKEEK >NZ_CP042445.1|WP_010082521.1|333278_333719_-|TrbC/VirB2-family-protein MIIERTMRNFLVILFIVFYAFDAHADGATDVMCNVIGYVHGIGGPMITVVIIGSSLLAIFGRMPWPALFALGMFVAVFFGAPQIVTKVTEKEVCCLFKGQTLENGKCVAAPGYERVGTGYACRSGWALTNKGYCIKAGQDPSKYWK >NZ_CP042445.1|WP_010962529.1|332091_333267_+|multifunctional-ribose-5-phosphate-isomerase-B/3-demethylubiquinone-9-3-methyltransferase/2-octaprenyl-6-hydroxy-phenol-methylase MLGIVSIASDHAGYELKSEIKPYLEALGYRVVDQGCTAKQKCVDYPNYAVKVVEDITSKKANYGILICGTGLGMSTVANRFEGIYAALCNSVEIAKLAREHGNANVLCLGAGFTASGLAKDIVKQFLETEFSKESRHKKRLDKLSNITSKKKKTKTYNEDEISKFAKMAGQWWDENGKFKPLHIMNPVRVSYIIEKIKELKKCNLKELSLLDVGCGGGILSESMARVGINVVGIDVCEENIKVAHSHAKKVGLNIEYIHTSIEELSNDKKYDVVLLMEVVEHVDNLELFMKKAIELLKPEGLIFISTINRTIKSFCLAIIGAEYILNWLPKGTHNWNKFLKPSEIANHLRENNVTLQNMAGMEYNVIKREWNLTKGVDVNYILCGLLDLTL >NZ_CP042445.1|WP_080717604.1|331800_331857_-|hypothetical-protein MYNKNWIPVSSTGMTPSV >NZ_CP042445.1|WP_010082533.1|329442_331191_-|DNA-primase MDHIDIIKSKLLLSDLVGKKVRLIKRGDSFVGLCPFHNEKTPSFSVSNTKGLYYCFGCLASGDAFEFISQTEGLSFKEALEKLASVTGVELPKNLSITKEDNKLFLALDLAANWFAQKNQGVVDYLKQRKILPKIIDKFKIGYAPSSGLKEYLNSSGIEDKILIDIGLVNKNFHDYFYDRLIFPIQSIAGRVIGFGGRALSSEQQPKYLNSPESQLFKKRENLYGLNFALSEIRKKQHILVVEGYMDAIALHQAGISNAVAPLGTAISAEQIKNLWRFAKEISICMDGDSAGRHAATRVAELALLILEPGYTLKFVTLPSNKDPYDICNELEYKKEDVLTALDHSTKLHSEYLWHHIIDSNLQNYEKLAPEKYSILEHKFMEYVNTISNSSIRRYYRDYFYNKASELRSSFKKQIFNSKTRATKGEYLHNKSPELIEAEQNQAVILRIAVEFPEILNRPIFFEQFSHFEFTNEMKRLQQRIIDVISNKSNLDKEALLQELKQFNVIKYVFEKTSVLNSQLNERKSAEIVWNNIVLLKELNALRKERTEARLSGNLDLEERLIEQIKQIESSIQEMQMEFIEK >NZ_CP042445.1|WP_022626255.1|341470_344692_-|UvrD-helicase-domain-containing-protein MRSNAINPNFSVWVNASAGTGKTKILIDRVLRLLLENKRNILCLTFTNAAANEMENRIHSILSKWAICSDSVLAADLEQLDFFPMSSQCVTLGSRKNKDYLTRARRLFSELENLGLTIQTIHAFCYKLISSFPIEAGIAPNCTLSECKELHSIIFNKVLHNETVQDDINLIATEIDENKLRDLLYTLCVKRSASANDSKYIKDKLSAPDEIHDLQSETIEHVERLAEILSEGSKRDQSYSEILYSTVIPAGIQKKRTSVTRWNDTKVENLAKVFLKSESHEKKSISSIATKSILEKFKDAEQIIESVQNVVFTHIRDMNSYQIFKRTSSLLGVFKVYVDLYNSEKSKNALLDYNDIINLATNLLSNPNYKDWILFNLDQKIDHILVDEAQDNSISQWKIITNLCDEFFAGNDEKRTLFVVGDVKQSIYRFQGANPHLFNYMQQYFHTKTGGRDWISCQLEKSFRSTPEVLMLVDRIFNNFRAEISFNDNEIKHVPHRENDQGYIEIWPALPRRKEKEQQALQIPLTCRENYIIADRLLAQTIANRIHNWLNEGRILVAKDRHIEPRDIMILVRQRNVLVDYIISELKKANVPVVGRDYFRIMDYIAVQDLIALAEFLLLQANDLALANALKSPLFNFTEDDLFNIAYDRKEHSLWERIQDYSVVIYSELNYLINLSRIESPLALFTHILRTGKKKFAARLGLECFEVLDEFMNLVLQFENPSLQAFVQWIKENNPEIKNDMQSERNAVRIMTIHKSKGLQAPIVFLVDTNTVPRNSESIIFDGTEVPFWCGKNNNAYCDQVKREKKLEDYNEYLRLLYVALTRAEDELYILSKEPVQKGSWYDLITKYGEPYEKKQRDLQPIFKEKVEVLCVNANYPYIYKKRDYFDVPVISLPPALAHSSVSSQRVTLESSEKEGAEWIPVSATWMTDGYARGLIIHSILQYMPKIEKERRKNWVRKYLDNISEDKDEIYSKILAFNEKYGYLFDLEGKSEITLSGTIDGKSVLVRLDRLCITQDKAIIIDYKSHRNVSVSLLNEIKKQMLIYKTLVQEIYPNKQVECVVIWVEDLTIQSDF >NZ_CP042445.1|WP_010082535.1|344773_345640_+|4-(cytidine-5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol-kinase MKSFCVKAPAKINLFLHVVDKKETGYHLIEGLFVFANLSNFLEIKVGEKDSRYDNSTVEFINSESKINNQYNTVMKAVNLLLRHAPVRTKVTVKVVKNIPIAAGLGSGSSDAGAVVRTLGKLWEIDRTILNEIALNVGADVPASVDSKPVFVRGIGEELCHIKKFSLPTNVVLVKPKKRFLSTPEVFSKHEGKFSEPIKWSDDAEKDLLKFLKETRNDLQEIAISFVPEIKDVISTLKSQEGSILSRMSGSGVSCFGIFDSEENAKAAAVNIGKKQPEWWVCNTQLIV >NZ_CP042445.1|WP_010082536.1|345643_346009_+|membrane-protein MDITPLISENKNLINGYREGKFLVNNQEYCGSIIIFPEKVIKLKESDINSKEYFESFLTEEIEILLIGTGKTRNILSSSVKSYLMEQKGLNFEFMTTGSACRTHNILISEDRFVVSYLIAI >NZ_CP042445.1|WP_010962536.1|346010_346811_+|metal-ABC-transporter-permease MLTQDFFINSLVAVVVISLVTGALGSFMIWQRLSYLGDSLSHSSLLGVALALIFKISPSLSIMLIAITFAILLSLNFNRLYSADTILNIVTNVVLSSSLILMSFLPSGNNSIISSLFGDILTLDQSDIVLIFLTSAVVTLILIFRWRYWLMISINQDLAVVEKINVTFVRLEFLITLAIFIAIAAQLIGILLIAAFLLIPAASARLISKTPMQMIIVATVFSVISGISGLMLSASFDLLTGPAIILVAAVYLIIAYFIRLVLSRLA >NZ_CP042445.1|WP_010082539.1|346942_347122_+|hypothetical-protein MSEEGFFSKYISQPVKKFYNYITGKTEESDDVAGDVHNIAQGDSESLDTHVQSNENDII >NZ_CP042445.1|WP_010962537.1|347127_348120_+|DNA-polymerase-III-subunit-delta MRVTPSKVKKFLEKPDALRGVLIHGSDNSRVDFYVQEIIANLGEYSVQVMDFAIVNKSPSLLFSELANVSMFTSKKLIKLINVSGGISKELKNVLDYNASGHYVMMVANDLPYNSATKSYMESSKIFGVIACYKDSNSNLYDIISSYLKQNDIKCTNEIIYHLQSYFNHSKLPICSELEKLVLYLGERKDLKLTDIELCFSTSGNDYATLDDLCSAIASKDMSRFIRISDALISQENFSPIALIRIISNYFLRLENVLLSVQGGMSEQAAIDQLSPPLFFKQLQSFKSHLKSLQLSELKKILEKLISLEVTCKKTDLDHKMIFQHALTGS >NZ_CP042445.1|WP_010082541.1|348289_349336_+|Fic-family-protein MFDISKIVITPEMLKLVAEIDEFKGAWQLFGNLAPERLQMLKKIATIESIGSSTRIEGARLSDREVEQLLSKLDTRSFRSLDEREIAGYAYVCEEVFQNFNKMPFTENTIKQFHIWLLQFSYKDQRHMGEYKKFPNHVEAFDESGKSLGIVFETASPFETATQMQELIYWTSQQLEVKSLHPLLIIGIFIVTFLAIHPFQDGNGRLSRILTTFLLLKLGYIYVPYSSLESIIESNKESYYLALRRTQQSLKTSSYDFNPWLIFFLRSLQKQKFHLEQKVSHEKVLNLYLPPLSAKVLALLSKHGRLTIKDLENITKANCNTLKKHVSNLVKSNHITQHGKGKATWYVI >NZ_CP042445.1|WP_010962540.1|349681_349894_+|hypothetical-protein MTVVRVSSQCPDTGIQKSLLVSKQTSIEKRFRLDCRKARFQTGMTSFTMYHIAIVVVKALGSEIAVFVQL >NZ_CP042445.1|WP_010962542.1|349960_350746_+|4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate-reductase MKIRVGVIGCLGRMGKKILNELITNTKVEIAGAVARSGSKYIDSDIGPIIANLGIKVTSSISGIFESSDVVIDFTTKECMLDCLKAAVKFKTPLVSGTTGIEGVDLKEYAAEVPILWSANMSVGVNVLLKLVKKAAELLGNEYDVEIWEMHHNLKKDSPSGTAIELGKTIANASKVDFQSNQYLHSGSNIRKKGGIGFAVSRGGGVIGDHSVMFVNSDERIELNHKAIDRTTFARGAVQAAVWLYENKREIPGLYSMQDVI >NZ_CP042445.1|WP_010962543.1|350742_351501_+|phosphate-ABC-transporter-ATP-binding-protein MSNTRASVKDLNLWYGSKQVLFDINLNIYKRKVTTFIGPSGCGKSTFLRCFNRMNDYVPGCKTVGELDIDGLGDIYSRDMDVVLLRAKVGMVFQKPNPFPKSIYDNVACGPKLHGMAKDKQKLNEMVENSLTKVGLWEELKDRLQDSALNLSGGQQQRLCIARAIAVKPTILLMDEPCSALDPMATNAIENLIQELKLRFTIIMVTHSMKQAKKLSDSVIFFHNGRIVESGSTQEIFENAQSLLTKEYILDH |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP042445_4 | 403307-403411 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP042445_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP042445_4
>4.1|403331|57|NZ_CP042445|CRISPRCasFinder ATGGAAGCTGTTTCTAATGTAGAAGAAGGGAATAATTTAGGTCTTGCTACTTCAGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042445_4
The CRISPR arrays of NZ_CP042445_4 >merge|NZ_CP042445|4|403307-403411|CRISPRCasFinder GAGGAAGAAGAGTTTTTTGATGCTATGGAAGCTGTTTCTAATGTAGAAGAAGGGAATAATTTAGGTCTTGCTACTTCAGAAGAGGAAGAAGAATTTTTTGATGCT >NZ_CP042445|4|4|403307-403411|CRISPRCasFinder GAGGAAGAAGAGTTTTTTGATGCT ATGGAAGCTGTTTCTAATGTAGAAGAAGGGAATAATTTAGGTCTTGCTACTTCAGAA GAGGAAGAAGAATTTTTTGATGCT
>NZ_CP042445.1|WP_010962579.1|399815_403151_+|isoleucine--tRNA-ligase MKSKHYPDTVSSPDFLSLEKEIIKFWQENKVFERSVEERSKDNCFVFYDGPPFANGLPHYGHLLTGFIKDAFARYQTMLQKRVERRFGWDCHGLPAEMGAEKELGISGRTEIEKFGIDKFNDHCRTSVMKFSSEWEKYVNRQARWVDFHNDYKTMDKSFMESVMWAFKQLYDKGLVYESVRVVPYSWACETPLSNFETRLDNAYREKVSKAVTVAFELLENPQQFKSVKRKCKLLAWTTTPWTLPSNLALAIGKDIKYCAVSVHPLMSFQRVTLESISGSQCLGTGMTGSSEGSSMNGEIYIFAESYLEKFISHSEQNNIPYENCNIKLKANDLAGLSYKPLFDYFKDTKNAFRVFIADYVTEEDGTGVVHTAPGFGEEDFYLCQSHDIPVICPIDNSGKFTAEVSDLAGVHVFDANDTVIKKLKGQGSWFKTEQYIHNYPHCWRTDTPLIYRTMPSWYVAVTKFKSRMVELNKRVNWIPNHIRDGQFGKWLEGAHDWSISRNRFWGTPIPVWKSDDARYPRVDVYGSIEELERDFNVKIDDLHRPFIDTLTRLNPDDPTGKSVMRRVPDVFDCWFESGSMPFAQIHYPFENKEWFESADFITEYIAQTRGWFYTLFVLSTALFNREPFKNCICHGVVLDVKGQKLSKRLNNYADPMEVFDRYGSDALRFLMLSGSIICGGNLLLDKEGNSIRDVLKNVIKPIWNSYHFFTMYANADGIKAEVCKDYQSTIDRYMISKCFEAVESIQASMNSYSSQEACKILIDFFEVLNNWYIRRSRERFWKSDLDQDKTDAYNVLYTVFYYILRAAAPLLPLITENIWQGLKYEETSVHLANFPQLEKFDSQLIAKMDLVREVCNSALSIRNTFNIRIRQPLGSMIIYHQSSCSFLEGEPLSVIPEFFPVIQVADTGIQCAADSNEYQEMIKDEVNVKSLELVNRLEGIASLELKLNFPLLGKRIPDKIKKLVQYVKEGKWKQVENEQIFLGDESENYIIEKGEYELLLKANSEYSSVFDNNKGIVILNTELNDELILEGLARDVVRLIQETRKQADFHISDRIRVIIKTEEEKIKEAINTWFEYIKEQTLALSLDINTEIGTNFYSKEYQDLSVSIER >NZ_CP042445.1|WP_010962578.1|396714_398034_+|tRNA-(N6-isopentenyl-adenosine(37)-C2)-methylthiotransferase-MiaB MKGLYIKTYGCQMNVYDSVLMENVIKPLGFNVVSDAGKADLVILNTCHIREKAAEKLYSELGKIHSLRKEMTIVVAGCVAQAEGEEVFRRAPFVDIVVGPQSIATLPELIVKASRSKGHVINTDFPEVAKFDKLPDECYGNSQGSSAFLAIQEGCDKFCTFCVVPYTRGAEYSRPVNEIFREALKLVANGANEINLLGQNVNAYHGECEGEVWDLGKLISHIAKIEKLERIRYTTSHPRDMHESLYLAHAEEPKLMPFVHLPVQSGSNKILHAMNRKHTAEEYLEIIDRFRKLKPEIEFSSDFIVGFPGETEKDFEETMKLVEKVRYAQAYSFKYSPRPGTPGAERKDQVPEEVKTERLLRLQKLISKQQLEFNQSMVGKTIPVLFSDKKGKHQNQIIGKSPYMQSVCIDDSEDKYRDKIVNVKVLEARQSSLLGCAFH >NZ_CP042445.1|WP_147155099.1|395822_396101_+|hypothetical-protein MYNTEIKIPVLPFLSSQCLTLGSSFLYKFTKSASFYNAKPILTKLNALLAIKSPGCQCQATRMTPFFFLDPSVSYLHDTILFPGSQSALLHR >NZ_CP042445.1|WP_010962574.1|395340_395769_+|protoporphyrinogen-oxidase-HemJ MNYYHWLEAFHVISVIMWMAGMLYLPRLYVYHATVKPGSENDSLLQTMEKRLLRYIINPAMLFSLGLGITLMVIREAYREGWFHVKAFAILLMLIIHMLLAKYRKNFAMGSNKKSHIYFRVLNEAVTALIIVIVIMVVVKPF >NZ_CP042445.1|WP_006279887.1|394304_395285_-|pyruvate-dehydrogenase-(acetyl-transferring)-E1-component-subunit-alpha MKAENFTKEQIIGFYRKMLLIRRFEEKAGQLYGMGLIGGFCHLSIGQEAVAVGTQAASKLGDAFITSYRDHGLMLACDSDPNVVMAELTGKETGCSKGKGGSMHVFDVEKKFFGGHGIVGAQVPIGTGIAFANKYKKKDNVVFTYFGDGAANQGQVYESFNMASLWELPVVYIIENNEYAMGTSVQRSTLVTELYKRGESFGIPGKQVDGMDFFSVYEATSEAAEHTRSGKGPILLEMKTYRYRGHSMSDPATYRLKEEVEDMKQNHDPISTLKKYMTDNKMASEEECKVIDKEIRDLVKKSEDFAKNSKEPSVDELYTDVYKFVS >NZ_CP042445.1|WP_010962573.1|392990_393914_-|RluA-family-pseudouridine-synthase MLQSIKTILIEDDNVRLDRYIRRIFPDLKQSVIEKSLRKGLIKVNDCKAKSSDRVNSGQTITLKHLNYIENANSDRKYNEKLVNLLRENILYEDEYILAINKPAGVIVQGGVKVKISMSDLLDQIREGETFKIVHRLDRDTSGVIIFARNANVARYLMEEFKGRRVKKTYLALTSGIPSKDSGTIDYPLVKKYVSGQEKVVVDENSPQNATTHFSIIAKSKHNVAYLKLQPITGRTHQLRAHLAHINCPILGDGKYGGKKAFIDGIANKIHLHSHSLSLKLPNNKEITITAPITKHIEKSIEALFFD >NZ_CP042445.1|WP_006280528.1|391720_392983_+|MFS-transporter MNNIQKAILSGMICNMIVWYELTLFGVLTDTIINVFFPSEDHYLSTLKFLGVFAIGFAFRPIGAVIFGYMGDKYGRRKTLLTSVILISISSTIMGIIPGYKEIGLLSPVLLVFCRIVQGITAGGETSINTAFTIEHSKDKKNLGFLGSMKPFSGALGTLLCITMIFICKRVTGENYEIWGWKLLFYFCFFLGTIGFLTRYILKESLAYKTNKYANNLAHSPLLELVRNYKRPLIISINLGIAQNAIVYAAIMFYNISIKELVILSISVKDLMRIVIQVVFAASAVLFAILSDKVGRKRVMIPVLIMLSLIGTCVLPLLSSVNHYVVIITYLLITIPVGASFGIYGSVICELFPTKVRCTGVSLANNISAGIFGGLSPYICMWLIEKTETKLAAGIYLTACALISLISVLQIKAKDRKVDW >NZ_CP042445.1|WP_010962572.1|389856_391659_+|aspartate--tRNA-ligase MNCYKTHTCEELRKNDVEKEVTLSGWLYRKRDHGNLIFVDLRDFYGITQLVFNNDKDFFDEISNLKLESVITVTGIVEARTEDTVNSSISTGEIEVIVNNLRVESEVEFHFDEEIAKEERSILVSITGEQEYPENMRFKYRFLDLRREKVRNNIILRSQIIAELRKLMIERGFLEIQTPILTASSPEGARDYLVPSRLNPGKFYALPQAPQIFKQLLMVSGFDKYFQIAPCFRDEDARADRSPGEFYQLDLEMSFVTQEDIFQIIESTLYRVFAKFSRKSVDKDFPRITYKEAMLKYGSDKPDLRNPLLISDVTEIFRDSGFNIFKSNIERGMVVRAIPAPKTAEEPRSFFDKKIEHAQKEFGAKGLGYITFDKDGTAKGPIAKFLDENRLNHIREATNIEPGDSVFFASDKENEAANIAGKVRTLLGSELSLIDDNIFRFCWIIDFPYFVYDDKSKKIDFFHNPFSMPHGGLKDLEDKNPLDILAYQYDLVCNGIELSSGAIRNNKLDIMYKAFAIAGYSRGEVDTRFGALVRAFRFGVPPHGGIAPGVDRIVMLLADEPNIREVICFPMNQQGEDVLMGAPSKVEDKHLRELSLKVIE >NZ_CP042445.1|WP_010962571.1|389234_389666_-|hypothetical-protein MSFGQIIIYSIALLAIVKVFLFLRKIYKNRIRKIIFPRKVFKEEWEEDRKFNELYQKNKQKELMKQQEILREKQKDVQVYKEDPEIVDIAKPVGKWTKMVMMGNGLMQRFAQLIHREGGQKGFWKLFVKAQASTQGKHKGKGR >NZ_CP042445.1|WP_007548816.1|388607_389231_-|heme-ABC-exporter-ATP-binding-protein-CcmA MLECENLSCTRNNKVLFKNLSFKAELKSKILITGPNGSGKTSLIRSLSGLLPPVSGNIRHCGKDIYDDPKSYISSMVYIGHKNACKDSLTVAQNVEFWAGIRNTRELIVAAICCLQLQPVLNIRYGELSAGWKRRVALARLLISNANVWLIDEPFCNLDSATCELVLNLISIRSEQNGIVIITGHSSTEQLCDFTTIDIRNFNRLLV >NZ_CP042445.1|WP_010962581.1|405699_408039_-|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-beta MKFTLSWLLEYLETNASLEEITDKLTHIGLEVEDVIDNSRLTGFIVAEVLEVVPHPNADKLKLCKVDDGSKILQIVCGANNVREGMKTVLASLGSTLPESDFTIKPTKIRGVLSEGMLCSASELALVQEESEGIIELSDDYKVGDKFFNCDPVIDINVTPNRGDCLGIYGIARDLAATGIGTLKTLSIPQLTSSINSPIDVEVTDGESFISGIYIANVKNQESPKWLKDRLESIGMRSISAIVDITNYIMISFSRPMHAYDAKKIEGELTVRKANDGEKFAGLNGKEYLLNKDISVIAGDKNIHGIAGIIGGKCSECTLETTDIFLESAWFDPISITKSSRQLGISTDASYRFARSVDPEFTFDGLNLAAKMILDLCGGETSSVVSAGSLDSADTKVSFDYQDVNKFGSVSVSPDEVLDILTKLGFSIDKKTEGNWNVQVPSWRPDVTIPADLIEEVTRIYGYDKIKEEPLPNNVEEVDSTYDNLRILMTNRGFHEVLTWSFMSESTAEKFGYSNKLFIIDNPFNNSFNIMRPSIMPNLLQVTADNIAHGISDLAIFEIGPIYDGEAQSKYVLSGIRSGNNLPRNHYNTDRKVDVFDAKADCIAALEFFNVNCDNLTIEKAEKEHYHPGKSGTLSFKNKVAGYFGELHPNILDLFDIKQKVVGFEVILENIENLPVSRKKFIDYKYQSVKRDFAFIVNKDVEVGNIINVIKKSSELITEVLIFDVYHGNNIEPNKMSIALSVTFCSPIHTLTEKEIQKESSAIVNLVCENTGGTLRTYR >NZ_CP042445.1|WP_010962582.1|408151_408415_-|hypothetical-protein MNEIDFINTNHPLNLEQEFGNGYIESVDCFLDEDTRDYYIGLNNAIIHFFFDGNIDEDAWDYESLKFFLEIDLKGDIEKILSLRKKI >NZ_CP042445.1|WP_010962583.1|408644_409370_+|F0F1-ATP-synthase-subunit-A MALNPLEQFKVYTIIELPRLFGYDVSFTNSSFFTMISVILMILFLLFGIKKGSVIPGYLQAAVEYVYDFVISIIENNTGSKGLQHIPLIFTVFIFILSCNLVGVLPYSFTVTSHVIVTFALSMVVFIYITIVGFKEREVEFLRILLPKGTPSWLAPIIIIIKLFAYLVRPVSLSIRLAANMIAGHTIIKVIAGFIVNMNIFFTPAPFLFIIALIGFEVFVAILQAYIFTILTCVYLSDAVK >NZ_CP042445.1|WP_006014985.1|409429_409657_+|F0F1-ATP-synthase-subunit-C MDLVALKFIAIGLAVFGMLGAGLGIANIFSAMLNGIARNPESEGKMKSYVYIGAAMVEIMGLLAFVLAMLLIFAA >NZ_CP042445.1|WP_010962584.1|409660_410140_+|ATP-synthase-F0-subunit-B MPQLDVSTFFSQVFWFLIFFSSLFFVVSCLFLPKLDEIISTRSKEVLGSFNSSVHLLRLTEDQITKYNAALTQARIQAKKIIDDALAQVEEMRANVKNILEEEDKKKSKLIEKKVAEFKSEYTDQLKQMATSIALIYYTKLTNSEIEEEFIADLVSKEF >NZ_CP042445.1|WP_010962585.1|410148_410625_+|hypothetical-protein MSTSLIIGLAFLVSFVLSYKLLKKVIKNALNNKRNKSKFSSEETEKFRKDMLEYYKKSSKKYKELDAEVNKMMNEALDKANSIIKHNRQQLDQTLDDNAHSNLKKVTDQVEKALRDLQANTASIAADAVKKIMHERKDDKRSSEVISSFSRDLNKKLH >NZ_CP042445.1|WP_010962586.1|410630_412229_+|glycosyltransferase MPILQADNVEKIKFDSSLCKEQEKLFYYKFNIIPWQKLNDTTFFMVEDTSRDINRWVEAHYGIDYVLIKVDSEQILNLLNSHFGISEFASNYLYYKNPNFSAKSIKLSSIFFASFFIVTSILTLTEKYTYFALMLIFIIGCSSYLFKFIATVFSLCETSNQKVDYSKLNEEDFPIYTILLPAFKESAVIEQLIESIESLDYPKSKLDVKLQVESDDQETLAAIEKYTLPQYFEVIKVPHSLPRTKAKSCNYAMSFARGKYAVIYDADDKPDPLQLKKALIEFNKDDDKLACVQAKLNYYNCDYNFLTKFFSLEYMNWFQYLLPGFQKMNMPIPLGGSSNHFSVKILKEVFFWDTYSVTEDADLGLRLAQMGYKTRMIDSETLEESPIAVFAWIKQRARWIKGYMQTYIVHLKNIKSLYKHTGFKGILLLNLFVGSAAFIFFTTPFLLLSLILTKVLNELFLYYFVVVYVTNLILLVIAVKQQKMPFYFYIVSIFFPVYSLLHSVAAFLALWEFILYPERWNKTQHGLWKQNL >NZ_CP042445.1|WP_022626285.1|412210_413239_+|heme-A-synthase MEAKPVAIWLFLCSVMVILMVGIGGFTRLSKAGLSITEWKPITGTLPPLSEQDWLQEKLKYEATPEYKALNYGISMEEFRAIYLIEYVHRLVARLTGLVFVLPFIYFTLRRKISKKVVIKLFVALLFGALQAFAGWYMVKSGLVAKPHVSHYRLALHLLLALIIFALFSYQFFDYQIRPKQTKLKISCNTKYYVGIILVLIMIQIIFGAFVAGLNAGLIYNTFPLMDGQIVPEDLFFLQPTWLNIFENRATVQFIHRALALLILTLVVILTVKNASIKPVYIMLLSVIIQIILGVITLLLHIPIAIAIAHQVFSFILFGSSLYFLCYLRKQTTSPICTFFPS >NZ_CP042445.1|WP_010962588.1|413187_415263_-|acetyl-CoA-carboxylase-biotin-carboxylase-subunit MIEKKYSKILIANRGEIACRIIRTAHKMGISCVCIYSDADVNSVHVRQADESRYIGPSPSCLSYLNIEKICEVAVETGAEAVHPGYGFLAENPDFPRALQKHNIDFIGPSAETIEVTANKITAKEAARKAGVNVVPGYMGKISNAAHAAQVAKEVGFPVMLKAASGGGGKGMRIVNSKKEIELAFTSATNEAEKSFKDGSIFIEKYIELPRHIEIQIIADKYGNIVCLGERECSIQRNNQKIIEETPSPFISEEVRQKMYVQCVSLAKQVGYFSAGTVEFVVDQDQNFYFLEVNTRLQVEHPVTEFITGIDIVEEMIRTSCGEKLRFNQDDIKLTGSAIESRICAEDPSKKFFPSSGRIKYYDKPGENDYVRIDDGVAAGSEISMFYDSMIAKVITYGKDRVEAISRMQKALSECYIEGVTNNIEFLESIFHHPNFIAAKLHTRFIPDHYPSGFHGDFVTEEYIKIFIFTALYVHLENEERYHHKAVNETSQVSFQCVTLESSKKEGAPVSATRMAGDRARDLFIVNINDNEYSVNAKYQDNILITVYNHNKYSVIGKWKSSYRLLYITINDDTNIALKIERQGSKYFIRHAGMKAECCIFKPHVAELSRLMLNNETEGISADAVKSPISGLLVKLHVNVGDQVEIGQPLFVVEAMKMENIICAEAAMVIKNIPVQEGKNVQIGDVVCFLK >NZ_CP042445.1|WP_010962589.1|415335_416091_-|ankyrin-repeat-domain-containing-protein MDGLVDIAKLLSDNEANINWRYTGPFDKTKQRVQAGNLLHLAARIQNKGKFVDICKKNIASVTAHNEYGDNPFHEAARSGILLPAVQEIVNDLEKEANNKITKAEEAGDRKEVSRLKEELKCNKKYIKDALCSKGYAFNKKRETPLYYLNAAQQKEIKQIAGIKDSFICNQKFHLCLYIIGAIACIAALCLSLYFLFLVSQSFALSSMVAIASGGVTYLSVKACSEIHALHNESTLVENANVQLAGESLGV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP042445_5 | 522059-522169 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP042445_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP042445_5
>5.1|522089|51|NZ_CP042445|CRISPRCasFinder TGGTATGACGGTTAAGTAATTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042445_5
The CRISPR arrays of NZ_CP042445_5 >merge|NZ_CP042445|5|522059-522169|CRISPRCasFinder GAGATACCGCGGCGGTATGAAGGTTCGCGGTGGTATGACGGTTAAGTAATTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTAGAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGG >NZ_CP042445|5|5|522059-522169|CRISPRCasFinder GAGATACCGCGGCGGTATGAAGGTTCGCGG TGGTATGACGGTTAAGTAATTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTA GAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGG
>NZ_CP042445.1|WP_010962662.1|520122_521943_+|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) MCGIFGVVSSGDSVIPTLLTGLQKLEYRGYDSSGIAIINNEGKIEVKKSEGKVERLCEVVDDSKMSHSTVGIAHTRWATHGVPGLKNAHPIRTNNVVVAHNGIIENYNLLKKGLEERGMSFHTDTDTEIIPNMLTLYLDEGLSPIDSLFKCLNNLHGSFALVLLFAEYPDALFVAKRNLPLAIGYNCNTVFAASDSNALSAFVERISHLEDDDIAVIKSSGVSIYNNGTQVKRSIENSSPSDFLISKNGYPSFMLKEIFEQPRALNKTINQFYKQYKEVIFANKKLFSELSYITIVGCGSSYFAGLIAKYWLENVAQVRVYLEISSEFRYSNVKLEEGSIGLFISQSGETADTIEALRYAKSQKQTIISITNTFSSSIEKISDIVLHTLAGPEIGVASTKTFSAQLATLACFAVELGKIKGVLGGERIKQLSNAINSIPEYVEHVLNVMKIQHISDSILEHNNVILIGRGSSYGVAMEGALKIKELSYINTTGIAAGEMKHGSIALIDSTVLVIAIIPYDDLFFKTLSNIQEIIARKGKVIAFSDKQGAPFLRGVCADVVQLPDTDNFISPIIYSVAMQFLAYFTAAKKGLDADCPRNLAKSVTVE >NZ_CP042445.1|WP_010081840.1|519670_520042_+|preprotein-translocase-subunit-YajC MLISEVFAADATSNTSSIGASFASFIPLILIFVVFYFLIIRPQQKKLKEHRKMIDQIKRGDTVITSGGIIGEVNKVDEANAQFIIEIAPKVEIKVLKSAISEVLSKETQKVAAKPIKKVKSKE >NZ_CP042445.1|WP_010962661.1|518416_519265_-|30S-ribosomal-protein-S2 MTNLPKVTVRDLAESGVHFGHKISRWNAKMAPYIYGVHQENRIHIIDLRKTLPLLQVAMKALYDVAFQGGRILFVGTKFQAFDIIASEAIRCGQYYVNHRWLGGMLTNWGTVSSSIKTLMQYEKILNDEDSILTKKELGNIEKKKQKLDKALGGIREMGAIPDILFIIDTNKEHIAVKEAKKLGIPIVAILDTNSDPDGITYLIPGNDDSRKSIELYCKLATDSILAGIESSLAKSGVKIDDIRGDEFIQEKEDGIVQTKRRRSKVYKEEEREVVTNEDESR >NZ_CP042445.1|WP_010962660.1|517575_518436_-|elongation-factor-Ts MKMNPDDIRELRDRTGLGLSDCKKALEECDGDIKKAVDKLRTIGLAKADKKSDRVASDGLVAMCLTENCGVLIELNCETDFVARNEKFIELVLNLASIAHQERCTSVDELKNAKYESIGTVQEAIMNGTSVLGEKLELSKLCYLEAKDGVIAGYVHGDVCGLGKIGALIALQSSGDKAKLQEIGKQIAMHVVAMKPEALSIDDLDQMKLNNERSIIEEQVRSLNKPEEVAKKIVDGRMAKYYEEVVLLEQKFIKDDKMKISDFIKSSELSAVKLSNYELLVLGDAD >NZ_CP042445.1|WP_010962659.1|516821_517565_-|UMP-kinase MFISTNEKSEIKYSRVLFKISGEALMGSKQFGHDMEAIGELSKGIVEVCNLGVQVCIVVGGGNIFRGTSASLSGCERASSDYIGMLATIINALILQNFLEKNLVASRVLSAIPMATVCEPYIRRKAIRHLEKGRVVIFAAGTGNPFFTTDTAAALRAVEMNCDVILKGTQVNGVYSADPKKNEDAVMYDRLSYTDLLTRDLKVMDASAISLARENSIPIIVFSLKGEKIVNIIKGQGTYTIVSDCKQ >NZ_CP042445.1|WP_010962658.1|516256_516814_-|ribosome-recycling-factor MLNEIKAKTKERMLKTIQSFHDDIKGVRTGRASASLLDGIVVNIYGGHQKLNQVAGVSVIDNKTLSIKVWDISVVGEVKNAILNANLNLNPVVEGSTIRIALPDLTQETREKLVKLLHQFAENARIAIRNIRRDIMEETEKMKENKEISEDDFHGAKKEIQNITDDNIKKIDGELSIKEKDILNH >NZ_CP042445.1|WP_006279327.1|515285_515981_-|di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase MLNQESLPKHLAIIMDGNGRWANNQGRVKIDGYKKGSEVAYDIAKYCTDLTIPYLTLYAFSMENWLRPKNETDCLFDLFYSVLTNEDKVNFIYNCNIKLNFIGNLSLLPSKILDQIKKAEEMTHKNDGLLLTVAVSYGAKQEITQAISNIIKENIAYVSEEEFEKFLYTKDLPKLDLLIRTGGEKRLSNFLLWQAAYAELYFCDTLWPDFSCQDLSKALEDYTKREKKYGR >NZ_CP042445.1|WP_010082212.1|514669_515296_-|phosphatidate-cytidylyltransferase MVDNNFIIRMLSSIVILFIFSFATYFSDLSFYLLIFSIAVLSSFEWYNLTQGNKILYVFALLLIALPSASLIYLYNLPQGKYALVWFVLTIWGIDVTAYLFGKNFGGAKICPIISPGKTWAGLLGAILAGVVCTIFGSIFFGLFSIFYSPIIGLAIAILAQLGDFTESLVKRAYGVKDSGNMIPGHGGVLDRMDSFIFTAPLIAIYIS >NZ_CP042445.1|WP_010962656.1|514461_514653_+|zinc-finger-domain-containing-protein MSKVRVNNRKVCCHGDENDEGSGHPLISLDMGEEEEIACPYCEKTFVHDCTVEAVGELTRDEL >NZ_CP042445.1|WP_006279325.1|513886_514393_+|pantetheine-phosphate-adenylyltransferase MNINDKIGIYPGTFDPITFGHLDIIKRACKLVDKLIIGVAENVNKHTAFDTKLRTSMAENEIKGLGIDADVISFNGLLVKFAKEQNASVIIRGLRAVSDFDYEFQMSWVNYKLLPEIETIFLPASEDTQFISSSFVKEIARLGEDVSKFVSKGVQNELINLNRIKNGE >NZ_CP042445.1|WP_010962663.1|522250_522694_+|hypothetical-protein MALSKFLDPKLDLTFKKIFGTEKNKNILIHFLNDILGFTEINTIQEVEFLSTIQDAEIASKKQSIVDVLCRDENGVQVIVEMVRPESLRSYCLKGEEFIQKETERILKLIEPDVLPSESTHQCELGNQLVPSDADNEPPLDKEDAQS >NZ_CP042445.1|WP_147158426.1|524667_525489_+|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MKDKPVREKKDLDKGLKRSVGKPACCVSKGGSSSNTTSLPNQVAKTKGFEKRAQLYAAKAYSRQADKSGKYVDLKKIFFIAISNCTLFPDKLDYISSHTIRDEKTNEHDLKDFQFIFIELPKFPKSREEQLESVVDRWLFFFKYADETTDEDLRKIAEKSPIIKLAYDELDKFHWNEKDLITYEERIMDLRKEEAILEYRLDLATEKGIQIGEERGIKIGKEEGKIEGKIEGKIEGKIEVAKAMLANNVDVNTIVKFTGLSISEIEELSVNGY >NZ_CP042445.1|WP_010962665.1|525603_525795_-|hypothetical-protein MVNLVELCKNLERKIAKLYQFSLLVNQISDIVELFNCGVRKKGNSMAFFLLLSIRLLCSGNWY >NZ_CP042445.1|WP_010082163.1|525891_526779_-|UDP-N-acetylmuramate-dehydrogenase MLISLPKVRGIYRYDVLMSKATWLNVGGRADVLFKPCDIEDLTYLIKNTELPVSVIGATSNIIVRDSGIRGITVKLGKEFAYIKSKGNNSIVAGGAVLLSNLAHFAGNQQISGLEFLVGIPGTVGGGIEMNAGAYGSDIASVVQSIKAVNLEDGNLYEFSSEEMGYFYRGHSLKGNWIFVEAEFKGVNSEYELILQRLKEVIERKNKSQPIRGKTAGCIFKNPKNYRAWELIDKSGCLRLNIGGARISKKHCNFLLNYDNATASDLENLGNKVKDAVKDKFNVELEWEIRVLGSY >NZ_CP042445.1|WP_010962666.1|526769_527648_-|hydroxymethylbilane-synthase MLVKIGTRGSKLAVAQALEAKQKLLDSFPNLSIEIVKIKTSGDKYANANLAEIGGKGLFIKEIETELLENNIDMAVHSLKDMPAFFSGGLTIPCVLERLSSCDAFISHKHNSLESLPQQATIATSSIRRKVQLLNVRPDLNIVPLRGNVTTRLQNQSFDGIILAEAGLIRLEKHHLITEVLPPKVMLSAVGQGAVCIQCRRNDVKIIDLLEKINNNMSFIGVKSERSFMKTVNGSCFTPLAALAEYVSENMLHLRCMLASGKNIYFTERTSFIEDAEKMGMDAGLELKSKCL >NZ_CP042445.1|WP_010962667.1|528603_529776_+|2-oxoglutarate-dehydrogenase-complex-dihydrolipoyllysine-residue-succinyltransferase MSKIIEIRAPKTLGGESVTEGIVKIKKGIGEAVKVDDLIFEIETDKTALELTAEASGQITEFLIKEDDVISPDQLLAKLSMGEVKEEARKEDKSESAAKKDAPSARKIMEENAISAESVKGTGMGGRITKADVIGHMNKAEQPAIKQYELPKSVVNGEQREERVKMSKIRQVIAARLKASQNTAAILTTFNEIDMKNVMDLRAKYKDAFEKKYGIKLGFMSFFIKAAVQALKEIAEINAEISGDEIIYKHYYDVGVAVGTDKGLVVPVIRGADQMSFAEIELTLVALGKKAREGKLQVSEMEGATFTISNGGVYGSLLSTPIINPPQSGILGMHSIQNRPVAVGNAVEIRPMMYIALSYDHRIVDGKGAVTFLVKIKNYIEDPNRLVLEV >NZ_CP042445.1|WP_022626293.1|529814_531773_-|tetratricopeptide-repeat-protein MITSRNQKWGDIKSLTLGAFTEPESIDFIRKALGIKDGSQENEIKNLAETLQHFPLALQQAVAYIKERDIALKNVGLKFEISDYLKRYKEEAEKLLDFKFPKDSDNSYTKTTFITWRITIDKIKDNPEYGQQAKEILDIIAYIAPDNIPAKMFLGVERNEEKLGDAIQLLKQYSMINPGEEQSSVNIHRLVQQVTRIELEKQGKDKVVKKTFELLEESFPYGSDKLEDYAKKRQLLPHLEAFLSHVDNWLTKNPSEKQTIEKDYLVNLLIWIGDGYFDLDPRRQKKSLERVLPIIKKHYGSDHFQAAITLANLGIAYGALGDPQKEKELLERALPILKTHYSPDHFEVAKLLANLGNAYGYLGNYKKQKELLERALLTFEKHYGTGHPEVARTLISLGTAYRALGDPQEEKELLERALPIFKEYYGYDHFEVAKLLANLGIAYGALGDPQKEKELLEQALTIKEKYYNSDHFEVAITLTNLGISHVDLGDYKKQKELLERALAIKKKHYRPDHFEVARTLVNLGNSYRVLGNPQKAKELLEQALAIRKKHYGLDHFEVVKLLATLGIVYGTFGDHQKAKELFERALPIFEKHYGSGHVQVAKLLANLGIAYGALGDHKKQEELLEQALPIFEKHYGPDHPEVAKLLAELDDI >NZ_CP042445.1|WP_050707712.1|531769_532222_-|ATP-binding-protein MRNPVGSFTGRTEELRELHKLIQKSQGVATVISQLVSISGLGGIGKTELAKKYIEEHSKDYDNNIIWIKAETHETMVQSFLRLARDPLGIPTEDRDIESIVRDIYAFFAKRKVSLFSIMQKNIEVKVKMLVLVNSYRPTFYHLMIINLVF >NZ_CP042445.1|WP_099606204.1|532302_533135_+|IS5-like-element-ISWpi1-family-transposase MRKKYPTDLSEREWSRIEKHFRVSYKKGGRPPKYSKREILEAIFYVLRTGCQWRYLPNDFPLWKTVYEQFRQWKKQGIFEKMNYEITKYSRRKIGRNEQPSACIVDSQSVKTTEKGGSKAMMEGKKVKGRKRHIITDTQGFILGCYVGAANENDRDGIKIALNNMRTKYTKVKKMWADMGYQGRNLKNHIKEEYDIDIEIVKRPPCRFWVHKDTPPELLPTREQGFKVQPRRWVVERTFAWVNRNRRLSKEYDLLTTSTENFIYLAMSRVMLKREYA >NZ_CP042445.1|WP_041580627.1|533114_534083_-|hypothetical-protein MHGNIYQLKVLMLFLHRGVLYQHSFRLGTEIEEARKFDDLVFECTQGSKKVYRFLQAKHTQDEDNKKIGVGNLLTKDKSGEFGLAKYFVSYLKIKNNQDFADGNLKDFIICTNIDFDLDQSTARNTVKKLRVKTLGPNEEIEILVEVIDTSDVFFKDGGTRYKFSYIHNNMISVVQPAFESAVEEAMEELEEEIKKLQNKPDQNSKRKLERNQTWQREFGRMMNEGRLEDNIKEFFDKLVFAVNQPNEIKLADIIKSELGEQFNDIDRQNVYACFQEKMLDWLKEKGRRFLTHEDGREFFRKMKEEILEVVRKLVNSSIFPL |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP042445_6 | 537309-537554 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP042445_6
|
2 spacers
spacers of NZ_CP042445_6
>6.1|537359|66|NZ_CP042445|PILER-CR TCCTCGATCTTGTATATTAACATCTGCTCCTTTTTTTAGTAAAACTTCTACTACTTGTGTGTGTCC >6.2|537475|53|NZ_CP042445|PILER-CR TAACATCTGCCCCTTTTTTTATAAGATGTTTTACTACCTCTATATGACCATTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042445_6
The CRISPR arrays of NZ_CP042445_6 >merge|NZ_CP042445|6|537309-537554|PILER-CR GCTGAACAGCGTAGTGTAAAGGAGTTCTTCCTCCTCGATCTTGTATATTAACATCTGCTCCTTTTTTTAGTAAAACTTCTACTACTTGTGTGTGTCCATGCTTAGCAGCATTATGTAAAGGAGTTCTTCCAACTTTACTTTGCACATTAACATCTGCCCCTTTTTTTATAAGATGTTTTACTACCTCTATATGACCATTATTAGCAGCATCATGTAAAGGAGTTCTTCCAACTTCACTTTGCACAT >NZ_CP042445|6|1|537309-537554|PILER-CR GCTGAACAGCGTAGTGTAAAGGAGTTCTTCCTCCTCGATCTTGTATATTA ACATCTGCTCCTTTTTTTAGTAAAACTTCTACTACTTGTGTGTGTCCATGCTTAGCAGCATTATGT AAAGGAGTTCTTCCAACTTTACTTTGCACATTAACATCTGCCCCTTTTTT TATAAGATGTTTTACTACCTCTATATGACCATTATTAGCAGCATCATGTAAAG GAGTTCTTCCAACTTCACTTTGCACAT
>NZ_CP042445.1|WP_022626296.1|534332_536993_+|preprotein-translocase-subunit-SecA MLDSPLILTAILIFFIFTLSFFFIRKIFGSTNKKIIKSFRKIVQQINALETEMQSLSDEELAGKTEEFKQELKNGKTLNDLLVPAFAVVREASRRFLNMRHFDVQLIGGMVLHNGMISEMKTGEGKTLVATLAAYLNSLEGKGVHVVTVNDYLAKRDTEWMSKLYNSLGVSVAFITNNLTDEERKEAYSADIVYSTNNELAFDYLRDNMKFSQEDMVQRGFHYGIVDEVDSILIDEARTPLIISGPVEENNQIYKHINKIVTKLVDSDYEVDEKGRTVFLTEDGISRVEELLRSYNLIPENSSLYDTDSMIMTHYIDQALRAYKLFTADKDYIVKDGKVVIIDEFTGRMMEGRRYSDGLHQALEAKENLEIQHENQTLASVTFQNYFRMYNKLSGMTGTAATEAEEFRDIYRLNVVKIPTNVPVKRVDIDDEIYGTEKEKFNAVLKFIEECYKRLQPVLVGTVSIENSEKLSALLQSHSLKHSVLNARYHEQEAYIIAQAGVPGSITIATNMAGRGTDIQLGGNAEMIAKVELKKIKNADEREKKYQEIVERVKKDKEIAIKAGGLCVVGTERHESRRIDDQLRGRSGRQGDPGLSKFFLSLEDDLMRIFGSDRMRSFLQKVGLKNNEAIHHPWINKALEKAQKKVEARNYDVRKSLLKFDDVINNQRKVIFKQRNNILGNEINDLLEVYSEVNESVVEGIIQSGYYEDYIENIVKEFHTRYGITLDKEDLAKFLNKQEALNYINDKIQEFFTEKEKYFNSQHTTDLWNTIVKQMMIMTLDHLWREHLSVLESLRQSISLRAMGQKDPLNEFKREAFLMFESMLEKWKELTIHRLAHFKLADNQEIGNRLHSARNSRLPKVSRNDKCPCNSGKKYKHCHGAVTVVS >NZ_CP042445.1|WP_041580627.1|533114_534083_-|hypothetical-protein MHGNIYQLKVLMLFLHRGVLYQHSFRLGTEIEEARKFDDLVFECTQGSKKVYRFLQAKHTQDEDNKKIGVGNLLTKDKSGEFGLAKYFVSYLKIKNNQDFADGNLKDFIICTNIDFDLDQSTARNTVKKLRVKTLGPNEEIEILVEVIDTSDVFFKDGGTRYKFSYIHNNMISVVQPAFESAVEEAMEELEEEIKKLQNKPDQNSKRKLERNQTWQREFGRMMNEGRLEDNIKEFFDKLVFAVNQPNEIKLADIIKSELGEQFNDIDRQNVYACFQEKMLDWLKEKGRRFLTHEDGREFFRKMKEEILEVVRKLVNSSIFPL >NZ_CP042445.1|WP_099606204.1|532302_533135_+|IS5-like-element-ISWpi1-family-transposase MRKKYPTDLSEREWSRIEKHFRVSYKKGGRPPKYSKREILEAIFYVLRTGCQWRYLPNDFPLWKTVYEQFRQWKKQGIFEKMNYEITKYSRRKIGRNEQPSACIVDSQSVKTTEKGGSKAMMEGKKVKGRKRHIITDTQGFILGCYVGAANENDRDGIKIALNNMRTKYTKVKKMWADMGYQGRNLKNHIKEEYDIDIEIVKRPPCRFWVHKDTPPELLPTREQGFKVQPRRWVVERTFAWVNRNRRLSKEYDLLTTSTENFIYLAMSRVMLKREYA >NZ_CP042445.1|WP_050707712.1|531769_532222_-|ATP-binding-protein MRNPVGSFTGRTEELRELHKLIQKSQGVATVISQLVSISGLGGIGKTELAKKYIEEHSKDYDNNIIWIKAETHETMVQSFLRLARDPLGIPTEDRDIESIVRDIYAFFAKRKVSLFSIMQKNIEVKVKMLVLVNSYRPTFYHLMIINLVF >NZ_CP042445.1|WP_022626293.1|529814_531773_-|tetratricopeptide-repeat-protein MITSRNQKWGDIKSLTLGAFTEPESIDFIRKALGIKDGSQENEIKNLAETLQHFPLALQQAVAYIKERDIALKNVGLKFEISDYLKRYKEEAEKLLDFKFPKDSDNSYTKTTFITWRITIDKIKDNPEYGQQAKEILDIIAYIAPDNIPAKMFLGVERNEEKLGDAIQLLKQYSMINPGEEQSSVNIHRLVQQVTRIELEKQGKDKVVKKTFELLEESFPYGSDKLEDYAKKRQLLPHLEAFLSHVDNWLTKNPSEKQTIEKDYLVNLLIWIGDGYFDLDPRRQKKSLERVLPIIKKHYGSDHFQAAITLANLGIAYGALGDPQKEKELLERALPILKTHYSPDHFEVAKLLANLGNAYGYLGNYKKQKELLERALLTFEKHYGTGHPEVARTLISLGTAYRALGDPQEEKELLERALPIFKEYYGYDHFEVAKLLANLGIAYGALGDPQKEKELLEQALTIKEKYYNSDHFEVAITLTNLGISHVDLGDYKKQKELLERALAIKKKHYRPDHFEVARTLVNLGNSYRVLGNPQKAKELLEQALAIRKKHYGLDHFEVVKLLATLGIVYGTFGDHQKAKELFERALPIFEKHYGSGHVQVAKLLANLGIAYGALGDHKKQEELLEQALPIFEKHYGPDHPEVAKLLAELDDI >NZ_CP042445.1|WP_010962667.1|528603_529776_+|2-oxoglutarate-dehydrogenase-complex-dihydrolipoyllysine-residue-succinyltransferase MSKIIEIRAPKTLGGESVTEGIVKIKKGIGEAVKVDDLIFEIETDKTALELTAEASGQITEFLIKEDDVISPDQLLAKLSMGEVKEEARKEDKSESAAKKDAPSARKIMEENAISAESVKGTGMGGRITKADVIGHMNKAEQPAIKQYELPKSVVNGEQREERVKMSKIRQVIAARLKASQNTAAILTTFNEIDMKNVMDLRAKYKDAFEKKYGIKLGFMSFFIKAAVQALKEIAEINAEISGDEIIYKHYYDVGVAVGTDKGLVVPVIRGADQMSFAEIELTLVALGKKAREGKLQVSEMEGATFTISNGGVYGSLLSTPIINPPQSGILGMHSIQNRPVAVGNAVEIRPMMYIALSYDHRIVDGKGAVTFLVKIKNYIEDPNRLVLEV >NZ_CP042445.1|WP_010962666.1|526769_527648_-|hydroxymethylbilane-synthase MLVKIGTRGSKLAVAQALEAKQKLLDSFPNLSIEIVKIKTSGDKYANANLAEIGGKGLFIKEIETELLENNIDMAVHSLKDMPAFFSGGLTIPCVLERLSSCDAFISHKHNSLESLPQQATIATSSIRRKVQLLNVRPDLNIVPLRGNVTTRLQNQSFDGIILAEAGLIRLEKHHLITEVLPPKVMLSAVGQGAVCIQCRRNDVKIIDLLEKINNNMSFIGVKSERSFMKTVNGSCFTPLAALAEYVSENMLHLRCMLASGKNIYFTERTSFIEDAEKMGMDAGLELKSKCL >NZ_CP042445.1|WP_010082163.1|525891_526779_-|UDP-N-acetylmuramate-dehydrogenase MLISLPKVRGIYRYDVLMSKATWLNVGGRADVLFKPCDIEDLTYLIKNTELPVSVIGATSNIIVRDSGIRGITVKLGKEFAYIKSKGNNSIVAGGAVLLSNLAHFAGNQQISGLEFLVGIPGTVGGGIEMNAGAYGSDIASVVQSIKAVNLEDGNLYEFSSEEMGYFYRGHSLKGNWIFVEAEFKGVNSEYELILQRLKEVIERKNKSQPIRGKTAGCIFKNPKNYRAWELIDKSGCLRLNIGGARISKKHCNFLLNYDNATASDLENLGNKVKDAVKDKFNVELEWEIRVLGSY >NZ_CP042445.1|WP_010962665.1|525603_525795_-|hypothetical-protein MVNLVELCKNLERKIAKLYQFSLLVNQISDIVELFNCGVRKKGNSMAFFLLLSIRLLCSGNWY >NZ_CP042445.1|WP_147158426.1|524667_525489_+|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MKDKPVREKKDLDKGLKRSVGKPACCVSKGGSSSNTTSLPNQVAKTKGFEKRAQLYAAKAYSRQADKSGKYVDLKKIFFIAISNCTLFPDKLDYISSHTIRDEKTNEHDLKDFQFIFIELPKFPKSREEQLESVVDRWLFFFKYADETTDEDLRKIAEKSPIIKLAYDELDKFHWNEKDLITYEERIMDLRKEEAILEYRLDLATEKGIQIGEERGIKIGKEEGKIEGKIEGKIEGKIEVAKAMLANNVDVNTIVKFTGLSISEIEELSVNGY >NZ_CP042445.1|WP_010962671.1|538408_539050_-|fructose-6-phosphate-aldolase MEIFLDSVDLNEIKGLKEFIDGITTNPSLIAKSGRKDKYEDLVREICSIIKGPVSVEVVADSHEEMITEGLNLAKIADNVVIKLPLTHEGLISCKKLWTEHKIPVNITLCFSPGQALLAAKVGACFISPFVGRLDDISYDGLSLIEDICTIYSNYGFDTKVLVASVRSPAHVIEAARLGADSITVPAKVLRQLVNHPLTDQGLAIFEKDWGVK >NZ_CP042445.1|WP_010082297.1|539089_539431_-|hypothetical-protein MNLITNSIKGFYSSVKSDLDWQAKRSLIRTLVKEVNIDLDKVDVVFKIKELENPAQNGQNQKMVHCLRGLGTGMTSFFLVQITLMSQYLYSCVIGCLMFTTQKVHKVVSQAVG >NZ_CP042445.1|WP_081420812.1|539701_540055_+|transposase MVREYTAEFKLEAVKLANEQRKVGQPVAKVARDLGIRDSVLGKWMKKYNEKKSAANAFPGRGNMAPYDKERFDLQSKSNKGKRHLKKSPGQSKRVKYFFIKEHSKHYKVQELCRVFC >NZ_CP042445.1|WP_095866567.1|540008_540350_+|IS3-family-transposase MVNTIKCRNYVGFSASGYYKWTTRKISSRESANKELLADIQKIYQASKCRYGAPKIHAELKALGKSCNLKTVQSIMQKNGIQAILRRKFKIKKQQTDSSSQYIRPKLYCRSTK >NZ_CP042445.1|WP_080717620.1|540588_540753_+|IS3-family-transposase MSYKGCCYDNSVVESFFSSLKRELPIDTSRHSKQHIKTAIFEYIEIFYNKQRHY >NZ_CP042445.1|WP_010082295.1|541276_542155_-|bifunctional-methylenetetrahydrofolate-dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate-cyclohydrolase-FolD MTIIIDGKKIANDLCERLSQKIDILKREYNIFPCLKVILIGSNPASQVYVRNKQKKAESIGISSETIVLPNNILEDELIEKINELNEDPSVHGILVQLPLPNHISASRVINTVSVEKDVDGFHDENVGKLVKGEKNCLIPCTPKGSLHLIKSIEENLSGKNAVVIGRSNIVGKPMFYLLLQENCTVTILHSQSKDLAEYCSKADIVVAAVGKPNFVQADWIKKGAIVIDVGINSVNVGKLVGDVDFEGIKGKAKAMTPVPGGVGPMTIAFLMMNTVIAACLQKGVDASDFIS >NZ_CP042445.1|WP_010962673.1|542138_542714_-|UbiX-family-flavin-prenyltransferase MNSRIVIGISGASGSIYGVRILEALKDVDYETHLVISRAGKVTLAHEIKEKLEDITSLADFYYSEEKIGEKIASGSFKTSGMIVAPCSMKTMSEIASGVTSNLLTRAADVMLKERRKLVLMVRESPLHLGHLQNMLKLTEMGAIIAPPVPAFYIKPKSLDDIINHSVGKVLDLFDIKLPDFKEWQGSDNYY >NZ_CP042445.1|WP_010082293.1|542706_542973_-|DUF2312-domain-containing-protein MEDTVKITAEELKGYIERIEKLEQEKRDVQDHIRDVYAKAADEGWDIKVMKQIIRLRKMDDDDREEQEILLDTYKRALGMSYEEELSE >NZ_CP042445.1|WP_010962674.1|542986_544270_-|HlyC/CorC-family-transporter MDWLLVLVSSAIFVLLVLSFLFSGAEIGLTSISRSRVNKLKLDGNKKARVIDRLLNRKELTIGTVLLGNTIINITCSALFTAIFINLFGNEGILLSTIIMTFCILLFCEVLPKTYAIQNPEKFASFSAYFVLFFVKIFSPLTLGIQFIVNLILKLCGLHKDKEVISAADAMRNMITLHRSEGTMLQQDLDMLSSILDLAETEISQIMTHRRNLFSLDIDRNKEELIREILTSSHSRVPLWQKEPDNIVGVIHVKALINALREKNNKAEEVDITQVMSRPWFIPESTPLSVQLHNFRKNRKHLAFVIDEYGALQGIVTLEDILEEIVGEISDEHDLITENFIKKISDNMYHIEGKSTIRDINRQLYWNLPDEEATTLAGMIVNEIERIPDEGEEFSMYGFRFKILKKDKNIITVVEVQVKIGNISGSN >NZ_CP042445.1|WP_010962675.1|544358_545537_-|aspartate-aminotransferase-family-protein MDHVVNAYNRLDTPIVRGEGAYLFDKDGKKYLDFAAGISTTSLGHCHPYITDKLKEQSSSLWHCSNIFTIPEQERLAEHLTTLTFADKVFFCSSGLEATEAAIKFIRRYFYSKGQAKRNRIITIEGGFHGRSIAAISAGGNEKSREGFAPLLSGFDKVPRNNIKALEEKINNEIAAVFLEPIQSEGGVYPLDVEYLQKVREITKAQGIILCFDEVQCGYGRIGSLFHYQNVGIEPDMLTCAKAMGNGFPVAACLVKDYIAEAITPGTHGSTYGGNPLAMTVGNAVLDIMLKEGFFDHVKRISKYLKEKLLLLAKEFPEMILEVRGEGLLMGIELATLVADKIISRSLDKGLIITRVLNNKVVRVTPPLIIEDEHVNAACNMLYDLFLKIKGI |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP042445_7 | 854838-854934 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP042445_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP042445_7
>7.1|854862|49|NZ_CP042445|CRISPRCasFinder TGACGGTATGACGGTTCGCGCGGTGGCATGACCTCGTCATCCCGCTACT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042445_7
The CRISPR arrays of NZ_CP042445_7 >merge|NZ_CP042445|7|854838-854934|CRISPRCasFinder TGTTAGCGGGATCTAGAGATACCGTGACGGTATGACGGTTCGCGCGGTGGCATGACCTCGTCATCCCGCTACTTGTTAGCGGGATCTAGAGATACCG >NZ_CP042445|7|6|854838-854934|CRISPRCasFinder TGTTAGCGGGATCTAGAGATACCG TGACGGTATGACGGTTCGCGCGGTGGCATGACCTCGTCATCCCGCTACT TGTTAGCGGGATCTAGAGATACCG
>NZ_CP042445.1|WP_081420822.1|854284_854467_+|hypothetical-protein MTPFASALIMIVKLLYLLSPICRLKGKDYLMYRRLMFNFLQYIDTVCLYKTSSTSRFLSK >NZ_CP042445.1|WP_010081866.1|853472_854210_+|putative-folate-metabolism-gamma-glutamate-ligase MHVEAIYTHRIECGEVLEQVLDRYVSELLREEVVLAITSKIISICQKQVVCKTACSKEELIKREADAIVDVDHNSYGIYLTIKDNILIPSAGIDESNGNEMYILYPKDVQKTALSIWNYLKTKHCIKHLGILITDSNITPMRLGVTGVALGWCGFEPFYSYIGKPDLYDQPLQVTQVNLLDALATSAVLVMGEGAEQTPMAIISGAPKIHFLTRPPTTEEEKSVKISMEEDLYSPLLMRARWLKS >NZ_CP042445.1|WP_010962904.1|852991_853471_+|dihydrofolate-reductase MIVIGIMAVDPKGVIGINNGLPWHYPSELDHFRQVTEKQVIVMGRKTFETMPQDILGNRIPVVFSRDKLNSCFNRGVKCTIISSMQEFLSIQSNSKVFMIGGAQIAYLFLEYDLISEFIITEIHKPYKGDVYFNLTLLDGWHKTILTKTKDYTICKLTR >NZ_CP042445.1|WP_022626367.1|850640_851297_+|CADD-family-putative-folate-metabolism-protein MEFTKSLNNKLDELHLLNHPFYQSWNTGSLSLQALQTYAKEYYHHVAAFPRYISGIHFLCPDLKMRQVLLGNLIEEEQGDENHPELWKRFAEGLGVARSDLRESAQIKETQELIDGYFDIVRSGFAAGLGALYAYERQTPEVSKSKIEGLKKHYSISDERSLQFFTVHMHADEWHSEECANLIEDLDEKEQDKVMQGAQKGARLLWGFLDGMMNASVC >NZ_CP042445.1|WP_010962901.1|850127_850451_+|thioredoxin MSDDITPVNDQNFKSEVTDYKGFVLVDFWAEWCGPCKSLMPRIEQLAKDRKGKIKICKFDIDEGTEVPSKYGVQSIPTLIIFQDGKEIARKIGATNDLLSWVDSEIS >NZ_CP042445.1|WP_010962900.1|849379_850000_+|3'-5'-exonuclease MGIFLYKDDLPASSIPDDIRSIAVDTEAMGLLHSRDRLCLVQLSFNDGNAHLVQLKNDYTAPNLRKILEDKNITKIFHFARFDVSIIRYYLETWALPCYCTKIASRLVRTYTDNHSLKELCLELLDTKLNKQQQSSDWGNENLTDKQKSYAASDVLYLHRIKEKLDLMLERENRKELAQKCFEFLPTRIELDLMGWENVDIFNHQM >NZ_CP042445.1|WP_081420821.1|848910_849093_-|hypothetical-protein MTNSASSLIMIVKLLYLLSPICRLKGKDYLMYRRLMFNFLQYIDTVCLYKTSSTSRFLSK >NZ_CP042445.1|WP_050707720.1|847770_848055_-|transposase MRVSNCHEYSKFLQERGSIFCYINDAIENWYENCPKMQGGNYIYSDKVVILVHIIVSFFRIGLRQTVGFIKGYLQQIGRDLQLFTSIKRNLILR >NZ_CP042445.1|WP_081420800.1|846613_846967_-|transposase MAREYTAEFKLEAVKLANEQRKAGQTITKIAKDLGIKGGLLGKWIKKHNEKKSAADAFPGRGNMAPYDKERFDLQSKSNKGKRHLKKSPGQSKRVKYFFIKEHSNCYKVQELCRIFC >NZ_CP042445.1|WP_081420820.1|846318_846660_-|IS3-family-transposase MVTAIKYRNYVGFSASGYYKWTTRKISSRESANKELLAAIQKIYQVSKCRYGAPKIHAELKALGKSCNLKTVQSIMQKNGIQAILRRKFKIKKQQTDSSSQYIRPKLYCRSTK >NZ_CP042445.1|WP_022626370.1|855044_856388_+|DNA-repair-protein-RadA MKTVYVCQSCGHSTGRWVGKCIACDNWDTIVEEIAVKTGKRSISAPILIKTLSGSEIITPSRFLTGIEELDRVFGGGIVQGASILIGGEPGIGKSTLLLRIAANVVQLSSFECLYVSGEESLEQVSLRAKRLKINEPKIKLLSTVSLTDVVATIKENKSIKFLVIDSIQTMYDSRITSAPGTVTQVRICAHELTILAKQYGVSLLIVGHITKDGQIAGPKTLEHMVDTVLYFEGENSNQYRILRTIKNRFGPANEIGVFEMSEAGLVPVDNPSSLFLMAHDREVVGSAVFAGIEGSRPILMEVQALIAGTNMATPRRAVVGWDINRLAMIIAVLNARCKMFLHDKEVYLNIAGGLKIQEPSADLAVAASLISSIVNLPLPTSSIICGEVALSGEIRNISHADLRLKEAQKLGFKKAIMPKNGNYSSHDIEIIKLGHVRELREVFNYN >NZ_CP042445.1|WP_010962907.1|856374_857286_-|signal-recognition-particle-docking-protein-FtsY MSLFSNLYQGLLKTSSRFSDGVKSIFSGKKKLDQSLLDELEELLISMDIGHKTSKLIIDRLTSIKFDKEVEYNTITQQLMSEIESILNPAVQPLILNKKPHIIMVCGVNGNGKTTTIGKLAYKYKEMGKSVMLVACDTFRAAASEQLNIWAERSDCLIVTGEYGSDSASVAYRAVSQAIKDNVDVVLIDTAGRLQNNVNLMEELSKIYRTIKKLDDTAPHDVILVLDATTGQNAYSQLEAFSKMVNVTGLIVTKLDGTAKGGVVIGLAEAYKIKLHAIGIGENIEDLREFTSKEFAEALFNCN >NZ_CP042445.1|WP_007548853.1|857477_857861_+|Fe-S-cluster-assembly-scaffold-IscU MSYNEKILDHYENPRNVGSLDKNDPNVGTGLVGAPSCGDVMKLQIKVNDKGVIEDAKFKTFGCGSAIASSSLLTEMIKGRTISDVTQIKNTQIVEELSLPPVKIHCSVLAEDAIKAAIHDYQSKQKN >NZ_CP042445.1|WP_010962908.1|857873_858287_+|iron-sulfur-cluster-assembly-accessory-protein MGEYQEVGRGETVKKNKKLITITAEAVERIRYLLDQKKHTNLEKPEEAIGIRVLIKQKGCSGLKYDIEYAYDTRPLESVIEENCSDGQKVKVLIDPKSVMFILGSEMDYVEEKFSSGFVFKNPNEKGKCGCGESFHV >NZ_CP042445.1|WP_010962909.1|858279_858738_+|molecular-chaperone-Hsc20 MSSNYFALFEIEPAFNISFDELEKKYIELSRTDINERQSQNMENINRAYQILKSPLKRAEHLLDFFNVKSQKDHLNSEILSESMEIREYLLDCDDLQFASRMIDEKIKGCIKNLINTFAVKNFDRAATQVLRLKYLYKSFEEMKKNATNSNF >NZ_CP042445.1|WP_010962910.1|858715_860464_+|Fe-S-protein-assembly-chaperone-HscA MQPIQISEPNSNEVVFGIDLGTTNSLIAMVNKAGNVEIFKDEQGRELLPSIISCENNTLKTGYDVGSNAIHSIKRLMGKSVKDLNKMGVYFEIDNESEKVIRVKCSEEKYLTPVEISAEILKALYERVKKSKGLEVKKAVITVPAYFDDSARNATKYAAKLAGIEVLRLVNEPTAAALSYSIEKNNNSGIYAVYDLGGGTFDISILKLHQGVFQVLAVGGDTKLGGDDFDHLLSSIVIDKYREKTAKQLNSLLIESRSVKEYLSNHTIGIFEFNVNGKPFECEITREEFEQAISSLVNKTINIVTRTISDIDLKIDDIKGVILVGGATRTPLVQNSLVKLFGNKVLNDVDPDKAVAIGAALQAHDLTSSSKDRNILLDVLPLSLGIETMGGIVEKIIPRNTPLPVSETKEFTTYIDGQTAMKIHVCQGEREMIEDNKSLAQFELKGIPPLPAGSARVEIEFTVNVDGILTVTAREKTTGIEQTVKVNSSFGLSEADVQNMVNQSINSFDEDMKARSLAGAKINGNKLIHLVENNNNLSTDQKLKNLLQNAKNALQVNDLNEINNTIAELENSSLELCELTNR >NZ_CP042445.1|WP_010962911.1|860471_861218_-|signal-peptidase-I MEELSKNWVIRTGRFLSSLFFLLLIALSIRSFLFEPFHIPSGSMKSTLLEGDYIFTSKYSYGYSKHSFPFSPNIFSGRIFYTPPKRGDIVVFKPTRNDSIRFVKRVIGTPGDKVQMIEGELYLNDQKVERRQIESFFDYESNRNIPRYIETLLSGKEHEILVDDISNKLSYNTPVYYVPNDQFFVMGDNRNNSLDSRFPEVGFVPMENIIGRVSIVGLSFKLGKVDWLPFNFRLPVALRLNRVLHKVV >NZ_CP042445.1|WP_006280416.1|862167_863055_-|aspartate-carbamoyltransferase-catalytic-subunit MNKRRNLLNISDLTVDDVENITKLANQYLKKEVANSHILENKTVINLFFEDSTRTLASFEIAAKSLGANVVTLPIRSSSINKGEDLKDMIKTLNAMNPDYIIIRHKSSGIINTLAKYVNCSLINAGDGSSEHPTQALADYLVISNHKKQIKDLKVVICGDILHSRVARSNIRLLKMFGAEINLVAPPTLICKHFPEVDSVHYSLIEGIKDADVIMLLRLQKERMNNSSSEKEYFYLYGLDSQKLSYAKPDAIVMHPGPINRGIEISSDVADCVILQQVEFGLAIRKAVLHYYRPC >NZ_CP042445.1|WP_010082338.1|863258_864284_-|Fe(3+)-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKAFIFTSLIAIILIVITYLYRNDGTNDSQVVNVYSSRKEELVRTLFDEFTKNTGIKVRYIIDDYSQLLSRMENGGEADLFLTADAINLILAKKRGLLSQVDSEVLKSVIPARFRDSEDYWFGLTKRARILVYNKESVDPKDLSTYEDLANEKWKGKILVRSSTSPYNRSLIAFMIANNGFEKTKEWVSGIVSNMARKPSGGDTDQIYAVAAGEGDVAIVNSYYFARILSSENKKNVADKLGAFFPNRNDHGVMVNISGAAVTKNAKNRENAIVLLEFLVSKQAQELYAKKNQEYPIIEGVETSDILKSWGNYSQSDLPLSELEKHLFEAVMIADECKWK >NZ_CP042445.1|WP_010962914.1|864591_864933_-|hypothetical-protein MSFFILYSSFELGRDEFFEFKPSLSFNSAFSIFKALFSAFKFSISAFSFSIFCCKFLQSSQRFTTLPHFCSMIILIILICLPYSTTPLNGYNLLNRKKGKRNPRVASYSLSIF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP042445_8 | 950528-950638 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP042445_8
|
1 spacers
spacers of NZ_CP042445_8
>8.1|950558|51|NZ_CP042445|CRISPRCasFinder TGGTATGACGGTTAAGTAATTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTA |
RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042445_8
The CRISPR arrays of NZ_CP042445_8 >merge|NZ_CP042445|8|950528-950638|CRISPRCasFinder GAGATACCGCGGCGGTATGAAGGTTCGCGGTGGTATGACGGTTAAGTAATTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTAGAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGG >NZ_CP042445|8|7|950528-950638|CRISPRCasFinder GAGATACCGCGGCGGTATGAAGGTTCGCGG TGGTATGACGGTTAAGTAATTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTA GAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGG
>NZ_CP042445.1|WP_010962970.1|949276_950440_+|1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate-reductoisomerase MKKVSVLGSTGSVGKKTVDLLSKRKEEYQVEALSAHSNFALLAHQAKLLNAKYVAISDERLYKDLKESLLGTDVKIAIGATNIATIPVDLSVVAIVGIAGLGPVMEVIESGTKVIALANKESIVCGGKLLLKKAKEKNVQIIPIDSEHNAIFQILQNDDKCVEKIILTASGGPFLNYSLEQLRNVMVDKALSHPTWNMGKKISVDSATMMNKALEIIEAHNLFNISPDKIEAIVHPESIVHGIVTYKDGFNFAVLAETDMAIPISYALSGPERSALNRKLDLTKQGKLTFQEPDHKRFPALKLSMAVLNSSAPQTNSIVLNAANEIAVNEFLKSRIGFLKIVEVVESTMESFGSYTDINSLSDIINIDYESRIIAHKIVESKVVAYS >NZ_CP042445.1|WP_010962969.1|948706_949204_+|hypothetical-protein MSEAQGPNIAEWQAQQQHQEAAGEKSGFGLGHSDSVSTVVDGMKWLFNFHEGAIAAYSNVFEGLVSGSSLVTLFGKSGNMFGIKLLEGLAEYFSGGGGEDMPSEEMDMAHGDDGHHSDDYPHANNEIAHNADGLQDMHDAGDHHDQSFSPGPSPSVGDDHGYELG >NZ_CP042445.1|WP_006279859.1|947684_948386_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MRNPIISILNLSLSFDDRTVLKDLNFDILKGESLVILGGSGSGKSVLTKTIIGLLAPDSGSVKINSKSKNKFGVLFQNSALFDYVTVWENISFNYKKRFNISKKEAKQLAIEKLNDVGLEESIADMFPIELSGGMKKRVALARAIAHNPEIIILDEPTSGLDPIMSDIVNEIIIKLSRDLNPTIITITHDIHSAFKIADKIAVLYEGEIISHGTVQEIQNTNNEYIKKFIHYI >NZ_CP042445.1|WP_010962968.1|946909_947692_+|ABC-transporter-permease MSFFDINSVRIIGRYFINFLLRLGSAFIFFIQSLYHCLVPPYYFSNIARQIIEIGFFSLPIVGLTGVFIGAAIVLQSSLSDPSINQEQIIPKLVTITIIKELGPVLISLIMVGKVGSSVAAEIGTMRITEQIDALTTLNINPFKYLIAPRILASIIVFPILTVCADLIGIFGGCITAVFEFNHNLNIYIKHTAQFFNTYDFITGLIKATAFGAIISVSSCYYGYHCKEGARGVGVATTSTVVLSSILIILANYMITLIHA >NZ_CP042445.1|WP_010962967.1|945816_945999_-|50S-ribosomal-protein-L32 MAVPKRKKSKSRRNMHRSHHAIEPKNVVVCSTTGEFMLPHNVAVDGSYKGKRVFIKQQAE >NZ_CP042445.1|WP_010962966.1|944768_945806_-|phosphate-acyltransferase-PlsX MLSTVNNNIVIALDAMGGDFAPLSVIHGAGFFLDNLVDPGIKVFFHIYGDKEEVSPLLLKYKKVSNNSEFTHCSDNVLANDKPSFALRHRKDSSMKAAIVAVKEGKAFGVVSSGNTGALMAISRFILGTLPNIYRPAIASICPTKTKSLALLDLGANVDCNADSLFQFALMGSIFAKIALKIDNPEVALLNIGTEEVKGNDSVRGAFELLKNAPGINFKGYIEASEFLEGNIDVIVADGFVGNVMLKTAEATASTFINLIKQEVFNSWIAKMLVGILLKSKLNKALTRFNPKIRSGAMFLGLNGIIIKSHGNSDAISFAHAIKFAVNAISENLNQKIINGVSHIE >NZ_CP042445.1|WP_010962965.1|943819_944776_-|ketoacyl-ACP-synthase-III MNKSFILSTGSYLPRKMLSNNEIASIVETSDEWIRQRTGIVQRHIADEGELTSDLAVNAAKSAIEKAKISVDEIDLIIVATTTPDKTFPSCATIVQSKLKCKNAFAFDVQAACSGFIYAVTVADSLIKSNNRIKYALVIGAEIMSRIVDWEDRSTCVLFGDGAGAVVMKSEMGRSGIISTNLYSDGNVDILCTNGGISSTGDSGKICMNGREVFKHAVDKLTASVEETLKCNNLKITDIDWLIPHQANIRIIEAVVKKLDFPIEKVINTVDKHANTSAASIPLALDYAIQESKIKSGNLVLLISIGAGLTWGSVLLHY >NZ_CP042445.1|WP_080717640.1|942931_943156_+|hypothetical-protein MFNLKGNSRKRKTSLTNLASSLIMKLKLLYLLSPICRLKGKDYLMYRRLMFNFLQYIDTVCLYKTSSTSRFLSK >NZ_CP042445.1|WP_010962962.1|941960_942977_+|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase MKTDIVIIGAGPVGIFTAFQAGMLDMRCHIIDVLDQAGGQCTALYPEKPIYDIPGYPVITAQKLIEQLMEQSSPFKPVYHLSQKVEKISNNEGESFTVITNIGTEVKCKAVIVAAGNGMFKPNRPPLSGILEYENKSVFYSVNKISDFQDKTIVIAGGGDSAADWTVELSKVAKKIYVIHRRKEFRCTPETRNKLESLEIDGKIELVVPYQLHELAGGNGQLSAVIVKNIASKEEKEISADFLLPFFGLSMNLGPINNWGIQLEHSRIVVDPATLKTSRDRIYAIGDIAIYSGKLKLILNGFAESAMACYDIYKVIHNSPVNFQYSTSKGIHGKEKLP >NZ_CP042445.1|WP_010082336.1|940130_941657_+|tRNA-uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34)-synthesis-GTPase-MnmE MTNTNETIFALSTVFGKSGVAVIRISGNYALKALNHFHIKKEIKPRFATLVDLYDDSSQLIDNGIIIYFPAPNSFTGEDVIELQVHGSKAVIKIILEELSKVFVMAKPGEFSLRAFLNGKFDLTQIEGIADLIDAETKMQAKQAIKQISGELERLYSNWRQRLITIQSKIEAYIDFPEDIWAEKSELEKINNEVQSLVQLIQEHLNDNRRGERLREGLHIVITGEPNVGKSTLFNFLAKRDIAIVSEYAGTTRDILEAHIDIGGYPIILSDTAGIRESSDPIELEGISRAKKRSFEADLRIELFPFEQRHDVNYQATGNIPSVVDTQLCKYCNQQTVSSQCLTLGSRYKNTCKLCNRQWILETCAENNVHSWIPVSATCMTSDQNDTIYVLSKADDVINNHNIKINGIDLLPISILKEIGTNKLISLIKEKAEEKFGHDRDTPVITRQRHRNHMKKALEHLQRFNIDNPIELISEDLRLAAFELGAVIGIIDVEEILSSVFSNFCVGK >NZ_CP042445.1|WP_010962971.1|950719_951163_+|hypothetical-protein MALSKFLDPKLDLTFKKIFGTEKNKNILIHFLNDILGFTEINTIQEVEFLSTIMDPEIASDKQSIVDVLCRDSSGARYVIEMVRPESLRSYCLKGEEFIQKETERILKLIEPDVLPSESTHQCELGNQLVPSDADNEPPLDKEDAQS >NZ_CP042445.1|WP_010962767.1|951592_953140_+|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MITSTTVSAPTNNSEAWNQLPWKKCQKVVMRLQRRIVKAVQQGRWGKVKTLQHLLTRSFSGKALAVKRVTENQGKNTAGVDRQIWSTCNTKFQGIKLLKQRGYKPSPLKRIYISKSNGKRRPLGIPTIKDRAMQALYLFALEPIAETISDRHSYGFRPKRSCADATVACHLLLASRNQLQWILKGDIKWCFDNINHEWLMKHIPMEKKILHSWLKAGFLESKTLYSTTAGTPQGSIISPILANLALNGLEKSLESQFGKLGSKRRSKIRSGVNVIRYADDFIISGITREVLENEVKPLVSSFLQERGLILSEEKTKITSITTGFDFLGCNVRRYNKKLIIKPSKESIKKLLNKARTLIKANIANTQAVLIKLLNSLLRGWGNYYSHVCAKRAFNKIDHEIMCALWKWAKKRHPRKGLRWIKNRYFKVMKQRQWVFAAPICKNKPKEIRYLRLLRLIDIPIRRHVKIRADANPLDLKWKKYFDERVKQTKMLASSFSREGSLLLVSPLRMMFSEES >NZ_CP042445.1|WP_010962972.1|953136_953937_+|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MKDKPVREKKDLDKGLKRSVGKPACCVSKGGSSSNTTSLPNQLTRDKGFEKRAQLYAAKAYSRQADKSGKYIDLKKVFFIAISNCNLFPDKLDYISSHTIRDEKTNEHDLKDFQFVFIELPKFPKNKEEQLESIVDRWLFFFKYADETTEEDLRKIAEKAPIIKLAYDELDRFSWNEKDLVAYEERIMDLRKEEAILEYRLDLATEKGIQIGEERGIKIGKEEGKIEGKIEVAKAMLANNVDVNTIVKFTGLSISEIEELSVNGTE >NZ_CP042445.1|WP_010962973.1|953971_955219_-|IscS-subfamily-cysteine-desulfurase MNVESKKIHDAKIKLPIFLDYQSTTKVDPRVLEVMIPYFGEFSNAHSRSHSFGWTAEEAVEKARKHIADLVNADSKEIIFTSGATESNNTAIKGVAHFYKNKGNHIITVCTEHKCVLDSCRHLENEGFKVTYLPVKQNGIIDLSKLEEAITDKTILISVMMVNNEIGVIQPVKEIGKICRKHNIFFHTDAAQSFGKVPIDVNEMCIDLMSLSSHKIYGPMGIGALYVRRKNPRVRLIPLISGGGQERGMRSGTVPTPLAVGFGEAARIAREEMKKETTGVEELRDILYNKIKEAFPDIVLNGDYENRIPGNLNLSFPYVEGESLIMAIKDLAVSSGSACTSASLEPSYVVRSLNNGHDLEHSSIRFGLGRFTTREEVLYAADLVAKNVGRLREMSPLWEMVQEGVDLNTVKWDSH >NZ_CP042445.1|WP_010962974.1|955505_956924_-|metalloprotease-TldD MPNLDQIFFAQNNVNINNVYKIVNNALSNSDGGELFLEFCQSESLVFEDNILKHMDLNTRRGFGLRSFCEDSTSFVCSSEISEKEISNAASMVKSSVSLNKTNSINLNEETKSLYSRINPINEMDLNSKIKLLNEVNEYVRSKNNCVKQVKITLSGEWQVVQIIKGDHRLSDIRPLVRFNVLVIVEKDGRTERGSAGHGGRDSYSKFISEKKWKEVANQALEQALVNLEAIPTPAGEMTVVLGPGWPGILLHEAVGHGLEGDFNRKKVSAFSNSVGKQVAASDITVVDDGTLPNLRGSISVDDEGTPPSYNILIEDGILKGYMQDHMNAKLMGVSPTGNGRRESYKEVIMPRMTNTYMLPGKYTPKEIISSVKKGLYAVNFGGGQVDITSGKFVFSSSEAYLIENGKITQPVKGATLIGDGPTVLKKVSMVGNDLKLDPGVGTCSKDGQNVPVGVGQPTLKVDAITVGGTEI >NZ_CP042445.1|WP_010962975.1|957141_957639_+|hypothetical-protein MYGEKDKLAYRKKVRTYSKRLVTTLSTISFIGYIAALVLNIPVLSLYFSIAGTIFSALSFALNIWSLNDHSRQQNLNKKSGIKNTPGQKKLTKIYLDIASSASFLIGGIASMSLFESSVIYFVSTPFFILGCVIMAANIVQTMISEPQTKNVLENLSSNTARVQA >NZ_CP042445.1|WP_010962976.1|957892_958600_+|uroporphyrinogen-III-synthase MKSILLTRPLLDSFNTRNILRKYGYKVYIEPVFTIKYLNPDISAHEFDVVISTSKNSVKAFSQICKVDDFPIITVGNSTMQAAKNLGFSDIISADSNVDGLISFIKAHYSSAIKFLYIRGQEVSCDLKKRLSEEDFNVREVVLYKTIIKRSLTNRCKNLLLDGKIGSVAFFSSQTARVFCSLVLKSGLSHVMNNTVAYTMSKNIADSLKLIKWKKIITSRLPTGESLIDIINKDC >NZ_CP042445.1|WP_010962977.1|958599_959379_+|exodeoxyribonuclease-III MLKIATWNVNSIRKRVNQLCSFIVDSQIDIVLLQEIKCTEEQFPYAEIEKLGYEYAIYGQVARNGVCVLSKYPILEKFKIDIVESHQEARYIECVIKYTNSKIRVGSVYVPNGQSPDSHAFEYKLKFFDNLYERMSTLLKNEELTIIAGDYNIAPDEIDVFDSNLLNGQVCFHIREREKLRAILNLGFKDAFRISHPNLQQFTWWHYQGNSLRNNQGMRIDYMLLSPQAVDKLETCYIDDRLRKLENPSDHTPVVCAIE >NZ_CP042445.1|WP_010962978.1|959405_960425_-|hypothetical-protein MTKMLTPQTKNLEPSNQVTNKDEKIFEKEEHQVIYDYFVKVLEVKAELKENKETTDYFISAYKDILLNNVNPKDIKPLSEENFSQFLLSMFKEIREQGLAREEKLNNDKIQQIITKCVADIRGTEAKDSSIKFVLEMLLLLIGGIKIDPKNISGSFMDGMKEKIPFLGKDKKEEDEPPLSDEEMVTTFLSKIFFPVLLSTIPMLIFGPTTLGVVLTAIGTIFAIKGGVEVLFSNNKKGTLYDPSSQDKDDTEKRAKLNGKILEGIDDILKTPVTEVEKGTSVSEQISQGKEKSEQQPVPEQISQVGNEKSEQHDQSWTGKENKRREKPQSSKGKTTQVC >NZ_CP042445.1|WP_010962979.1|960475_963052_-|DNA-polymerase-I MKEKTFTIIDGYGFLFRAYYVLPHLITTTGMPIGGVYGFLNMVLKYIAHSDYLTIALDAGKKNFRHNLYPEYKANRVTPPEDLTPQFTILREAVEAFNLSYEEIEGYEADDIIATLAAKYANHQDFKVVVVSSDKDLFQLLNHNILIFDPIKNIYIDEKQVIEKFGVNSHKLLDLFSLTGDASDNIPGVPGIGPKTAAKLLDEFDSLNNIIENIDNIEQTRIRNILAEHKEKALISRELLSLCEKVDLQHDIAKCEVRPPNMEKLLSFLKKYEFNSLIGKVEKLFSYSGSSTEEKIEYSSEELEKFLEHCRYEGKIAIHYHLENNVLSLSYSESNIFYIEQDSIQDALIIINLTLLSNGVLKIIHNIKEIRKIFPAIEKMLDSVDDLMIMSYSLDTGKHDHSIPNIVAHNLSENAEIFSAKTLIAIHEKLKQRLFQEKLLTIYERFDKPLMKVIFDMEKNGILLNIQKLQELSDKFQQVIAVLEDEIYNLAGERFNIASPKQLSDVLFNKMGLNKKKKSKKSGSYSTNYEVLEALEEEGVEIASKILNWRHLSKLKGTYTDALIKQVDPLDGRIHTSFSTTATATGRLSSSNPNLQNIPIRSEEGNLIRQAFIAPKGHKIISADYSQIELRLLAHVANVAAFKEAFANGQDIHEITARQVFGVQEIDEQLRRKAKSINFGIIYGISPFGLAKRLGITIAEAAEYINYYFSCYPEIKAYMEKAVSIARLHGYVETLFGRRCFVRDINNTIPYIRQFAERAAINAPLQGTAADIIKRATIQLFDQLKVGKIILQVHDELLVEVEDEKVQETAKLIKDIMENAIEISIPLEVEIKIGDNWGLNSLNYDLNIVNSRSIDYLN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP042445_9 | 1247588-1247666 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP042445_9
|
1 spacers
spacers of NZ_CP042445_9
>9.1|1247611|33|NZ_CP042445|CRISPRCasFinder CTAAGAGATACCGCGGCATGACGTAGGATTGTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042445_9
The CRISPR arrays of NZ_CP042445_9 >merge|NZ_CP042445|9|1247588-1247666|CRISPRCasFinder GTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGCTAAGAGATACCGCGGCATGACGTAGGATTGTTGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGG >NZ_CP042445|9|8|1247588-1247666|CRISPRCasFinder GTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGG CTAAGAGATACCGCGGCATGACGTAGGATTGTT GTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGG
>NZ_CP042445.1|WP_010963168.1|1245156_1246983_+|DNA-mismatch-repair-endonuclease-MutL MAIILLDTKTINRIAAGEVIERPASVVKELVENAIDAGSLEIEIKIESGGRNLIIVTDDGNGVEKNDLELAFMRHATSKLSDNELIEIKHLGFRGEALPSIAAVSRIKLSSKAREANEAWSISYEGGEKIGEQTPYSLSQGTHIEVRDLFFATPNRLKFLKTERAETQSIVDIVNNLAMINYHIGFTLTSGNKKLLKYAKQTSLFHRLCEVEEEFQGNSLEINEEEDGIKLTGHICKPTVNRGKSTQIYTFVNGRPIKDNLLIGAVRYAYHDFIPSDRYPFAALHLEIPYDQVDVNVHPNKSEVRFQNKKLIYEIMTRGLIKALSRRIGTFPAHDQKMDSTLPDPFDKPNVQKEFYEKRPSPFKNQLIKEFASPNEKAKGLSEQSKSFDYTGIQKFPSQAETMVLEKKVLEQVDLIESHPLGFARCQVYNTYIIAEVRDKLIIVDQHAAHERLVYECLKQKSSVKRQKLLLPETVEIKNQAGMEMIEIYKDKLFEMGFDIEIKPENKVIVKEIPAILGAIDVKEMLINIVDRLTEIEDTLPVEDKVNKILATIACYGSIRAGRKMRFEEMNVLLRQMEKTPYSGQCNHGRPTYIEMKLSDIEKLFERR >NZ_CP042445.1|WP_010963167.1|1244648_1245149_+|5-(carboxyamino)imidazole-ribonucleotide-mutase MLNMTKIKKDVAVIMGSESDYTTMVHTVDMLKALEVSHDIFIISAHRTPERLFNFAKSAQEEGFKVIIAGAGGAAHLPGMVASLTCLPVIGVPVHSKQLNGLDSLLSIVQMPKGVPVATMSIGGNGAHNAAITAVSILSISNSEIAGRLKKWREKQTKEVKEKPIS >NZ_CP042445.1|WP_010081926.1|1243931_1244228_-|XRE-family-transcriptional-regulator MEIISLNNLDSAGIKTKLLYIINKIIEKNAWTQAFAAEKLGIDQPKVSQIKNGKIDGFSLERLLGFLKKLDHEITITMTESQEIKSEAEKVKHEVESQ >NZ_CP042445.1|WP_007548528.1|1243463_1243871_-|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-omega MAESIVEKCIERVSNRFKLVLLASQRTHDLNTGASNPIQAAKFKGHKNTIVSLHEIAGKQVDTHELFSLLVGRCKEYMKGNMNNVYSSNTSKLANLLNFSDNTDLDASQESQDYEVDGEIDDEINDQDGDEEVSV >NZ_CP042445.1|WP_007548527.1|1243189_1243435_-|Multiple-resistance-and-pH-regulation-protein-F-(MrpF-/-PhaF)-superfamily MICIAIYTLLFCMSVMLCCIVSKSNDVYNKVLAFNNFSTQVVVLITAISIILNNFFLIDIALLYASVSFISTIALMRLMLF >NZ_CP042445.1|WP_006279703.1|1242895_1243183_-|cation:proton-antiporter MIGSIFIFLGICLIIISNIGVIRFPDFYTRLHAAGITDSSGATLLLIGFALQNGFSINTVKIVLLIFIIWVANSTNSYILARTHYKVKKKTVKEG >NZ_CP042445.1|WP_015589497.1|1242366_1242894_-|DUF4040-domain-containing-protein MLEILNVVLLLLLLTVTVFIVFSRHLVVSAVLMCVFSSLIALIYLIMNAPDVAITEASVGAGLSTVFTFAALSLIKNHKVNLSHNPITLFFMLFLAVCLSYFMIQLPDFGSHNAPIHLHVAPYYVENTEKATGIPNIVTAILASFRGYDTFGETIVVFTAALCITLILKEEKEND >NZ_CP042445.1|WP_006279705.1|1241954_1242374_-|Na(+)/H(+)-antiporter-subunit-B MIKDPILNAVTFLMIPFIILFGLYIQFHGDYTPGGGFQAGIIIASGIILYSMLFGVSTTLKAIPYSVIRLTNVLGILIYGGTGVATTLLGQNFLSYDILLTNNRTGQKLGIFLVELGVAFTVCSSMLIIYINFARRKKQ >NZ_CP042445.1|WP_006279706.1|1241646_1241958_-|cation:proton-antiporter-subunit-C MTLYNYTIIIVLMVLGLYIIINDKNLIKKMIGVSVFQASVLLFYISLGYIKSSLPPILVSNFYSYSNPIPHVLMLTAIVVGIATFSVGLSIAVKMEEKYGTID >NZ_CP042445.1|WP_041580664.1|1239582_1241508_-|RNA-polymerase-sigma-factor-RpoD MSTINDAEDKKKIIKDLVTKSIKKGGFITFDDINDKLSDENFSSDFIDDAISLLQDSGINVLESSEDEEDIPSNSDDSKLDDDDTSPNVTATLVQNDDPVRIYLQDMSSVKLLSRADEIEIAKKIESGKHNMLRAIIETSVTLKVIKVWRDDLSNGALLLREIIDLDAMYNSDFNVVPKEESEESEESAEDVEDSEDVSEDAEYCSDDEKDGNNEDISSVNLNVSILEMESDLLPKVIVALDEIITLTNEALILRKNSKNFSNELENLYNQIWSIALQIKLSDAAVARITQELYKINRSITLEEANLIAEARKYDIDRESFYKVYDDVLLKHELKKISLLKINENQSSFTGELKNKFLRFIDDKSEHIASTLNGIKQHIQEDNVQEFKELIKRIQKHEREVSEAKQEMIKANLRLVVSIAKKYSKRGLDLLDLIQEGNIGLMKAVDKFDYKRGYKFSTYGTWWVRQSITRAIPEQSKVVRIPVHMVEIISKINRALRKMTHEMGREPTLEELSVELTMPLERIRKVMKIARDPVSLEAPTGKDDSSTFGDCIEDKRVSRPEDAAILADLRGITTNVLATLTPKEERILRMRFGLGKDGKEHTLEEVGKIFNVTRERIRQIEAKALRKLKHPSRARKLRGFF >NZ_CP042445.1|WP_010963171.1|1248087_1250742_+|2-oxoglutarate-dehydrogenase-E1-component MSSSSCLYGDNAEFVEEMYSRYLQGDKSIGEDWYRIFSSNLEVNKAETCGAQHVTKVDDSVSSLANFFRSYGHFFADLNPLLPNVNKEVDYQKYSNLYPASDAGIYRDIYCKNIGFEFMHISSYEERMWLQEKIENQTYTLSSQDKKEILRHLIESEMFEQFLHMKFPGYKRFSIEGGESAIVAIEKIISDSTVFGIEEIVLGMAHRGRLNVLTKVMGKEYAAMLSEFQGNLAYPSGLEVSGDVKYHLGYSSDRALSGGKKIHLSLCPNPSHLEAVNPVLAGRIRAKQNIRSVLGISIHGDAAFIGQGVVAETLTLSNIEGYKVDGIVHIVINNQVGFTANPCCARSSFYCTDIAKSIEAPVFHVNGDNPEAVSFATSLAMEYRQKFKKDVVIDIMCYRKYGHNEGDEPNFTQPLMYKAISKHKTPGTLYEEKLTAEKVLDGDEVNKLRSEFRAKLDKSLAESAAYTPKKADWFGGVWSKLRRAKLNDLSEYYTDSGVPPDELKKLGVRINSNIPSNFNINNKVRKILDGRIDSINFGSNIDWATAESLAFASLLTERIGVRLSGQDSGRGTFSHRHSRLVDQVTEEAFIPLNNINEKQAHFEVIDSALSEYAVMGFEYGYSLDSPYSLVLWEGQFGDFANGAQIMIDQFIASAETKWLRSSGLVLLLPHGYEGQGPEHSSARIERFLQLCAEDNMQVVNCSTPANYFHVLRRQMHRDFRKPLVVFTPKSLLRHKRAVSNLSDFEGKFLTVIPECRTGLVSNDKIRKVVICSGKVYYDICEAQKINDIAVIRLEQFYPFPADKLSNELEKYKNAEIIWCQEEPKNMGGWFFVNPLIEEVLSNLDIQAKRPKCIARPAAASPACGYVSVHTQQQEEILKQVMQGI >NZ_CP042445.1|WP_010963172.1|1250986_1251775_+|hypothetical-protein MNTKIFEMLIRRTGLRRDSKAEIIQLNRNEKAFVDEDKESIELAEAIFEENNMFRFRKSGPAMDYILHKLINDRKLFEEMKDRGTSIIRLFSLFSMYHGRLNCCVIRKGGCITECGILDYAGTYPELVPLEDFILIEPSSYLEYIVFDNENIRNRLAEDLTEDKTKLDIFLNGILATKNSDLVLSCINKIEVLNEEDRYFVNLLQKNGMLDYILNKDDTTLAKSTLKELLKLSILQEEKSTELESPQASSVNVSKAQQHCSI >NZ_CP042445.1|WP_010963173.1|1251905_1252502_-|TIGR02217-family-protein MSFTEIRFPENISYGSTGGPEFSTDVVTTHNGCEQRNINWSHARTRYNIAYGVRSNEQLLELITFFHARKGKAIGFRFKDWSDFIAINQEIGIGDNKKTTFQLIKTYVSGEDKHIRMIKKPVYGTVKIYLNGKEESEYSVNYSTGEITFMKPPVKDAIITASFEFDVPVRFDTDYLNASIDDYGSNSWNNIPLVEVKF >NZ_CP042445.1|WP_010963174.1|1252692_1253451_-|DsbA-family-protein MSRISFLLILIIAIASLPIINNWLSNRSQMLNDDYIGEKLDNYISRNFDKIVKTLKEESIKSSYAARDNVTKSKISQYKDQIFDLTYPYSGNENSSVIAVGFLDYSCGHCKAIKNDIKQLINDGKIKYIFRDAPILGNASLKAAKSALAVYFLDKEKYFDFHHAALSHKGEFSDESILDIVKNIGIDEDDFNDSIKDNADKIEQMINNSRLLVRDLGVGGTPFLIIGDSLFVGATDLNVLRKKVDELSHKQG >NZ_CP042445.1|WP_010963175.1|1253870_1254950_+|Fic-family-protein MPMPNYTITSKIASCLIRIEAAKEKVLHLPLTVSMLLSLRETARLYTTHYSTMIEGNRLEPKQIEEVLSGKSHFPKYRRDENEVKGYYAALTQVEQWAARRIPITEKAVQTLHALVIASGKSKIKSTPYRDGQNVIRDSLTRAIIYMPPEAKDVPKLMSSMIDWIRNSEQVPCPIIAGIAHYQFVTIHPYYDGNGRTARLLTTLILHLGGYDLKGLYSLEEYYAKNLGAYYEAISVGPSHNYYMGRAEADITKWVEYFVEGMANSFENVLQRINEEEYHTDQTDLIRKLDPKQRKALELFQEFSAITASQVGELFNFKPRTSAQLCKKWVEMGFIKIVDFSNRGRKYKLSKQYEDLISN >NZ_CP042445.1|WP_010963176.1|1255037_1256516_+|UbiD-family-decarboxylase MYNNLRDFIKALEEKKDLIRIKEEVSTVLEMTEIHRRVLSSKGPAIIFENVITENGKNSIPVLVNLFGTIKRIALGLNINPDELRDLGKLLAFLQSPEPPKNFKDAIKMFPLLKVVLSMRSKVVSKAPCQEVVLTGDEVDLSLLPIQTCWPNEPAPLITWPIVVTKGPTKEKQDNFNLGIYRMQVIDKKTTLMRWLAQRGGATHHKRWKEEGRDMKFPAAAVIGSDPATIIAAVTPVPETLSEYQFAGLLRKKPLELVNCKTIPLQVPAHAEIVLEGYVSLDSYQDEGPYGDHTGYYNSVEQFPEFNITAITMRKNPIYLSTFTGKPPDEPSILGEALNEIFVPILINQFPEIVDFYLPPEGCSYRIAVVSIKKSYPGQAKRIVMGILSFLKQFLYTKFIIVVDDDINVRDWKEVMWAMSTRMEPVRDTIMIENAPIDYLDFASPESGLGGKMGFDATNKIPPETKREWGRKIEMSEEIVRKVAEKWEEYMD >NZ_CP042445.1|WP_080717593.1|1257048_1257273_-|hypothetical-protein MKSINSGTRRNENCLTNSASPLIMKLKLLYLLSPICRLKGKDYLMYRRLMFNFLQYIDTVCLYKTSSTSRFLSK >NZ_CP042445.1|WP_010963177.1|1257294_1258152_-|4-hydroxybenzoate-octaprenyltransferase MYFNHYFSLMRLHSLTGLWLVLFPSLSGILLASTSLSYQVLFLLVLFTIGAFLMRPAGCIINDIFDRKIDAHVERTKYRPLASGALNIKQALALLSLLLSIALVILLLTNKTTLILGIISMCMIATYPLLKRYVWWPQLFLGFTFNMGSLMGSAAITNQISIESLLFYIGCVFWTLSYDTIYAHQDKKDDEKLGMKSTALYFGDTTKSWLKRFYLISLMTWLYAGILSSLNNIFYIALLAVGFIFHRQYKNFNPDDPSQCMSIFKNNSYVGLLLFFGILLDRIIT >NZ_CP042445.1|WP_006279769.1|1258155_1258554_-|ribosome-binding-factor-A MKKEIRNLKIASVLHRAISRVLMEGKVFNKNVAVSDVKLSKDLKKADVYIVLSSLNIQVADYLDPEKRRTGDPSENNCDINTVVNEMNQSAWSIRKSILCYVDLRFIPELVFKPDLAFDNFVNVSKILHNHT >NZ_CP042445.1|WP_010963178.1|1258563_1260888_-|translation-initiation-factor-IF-2 MNNEDISDKKLTLQGLSKLKLDLNLNSSASPSTGATVVKKRRKKSHDAEEHNLFDESKLCSLTEKEQIFRINAVQNAALLKERNQREEKEKTAKEDSNKEIDEKNEADALSKEINKQVLSNTHLVEPKEDSIDHEDNDKKSFKVNKDIYSKHSKLVIAQAIDEKTEQPPVFKQRFGIRGRKSKFTKGKNISREVIIPDKITIRELSIRMAEDSKSVLKMFKEEVGESYRVDDLVDPDIACEIVEKFNHTAKRVSDTNREKDLFFIEGRESLPKKPKPPIVTFMGHVDHGKTSLLDAFRESNVAERESGGITQHIGAYQITTKDKQKITFIDTPGHEAFTAMRARGANITNIVVIVVAADDGIMKQTVEAINHAKAANVSIIVAINKIDKSEPGDVEKIINSLPQYDLIPEGLGGDVMIMPVSAKKKTNLDKLEEAILLIAELMKLEAIEDCRALGWVIESKIDKAKGISATLIVEEGTLKVGDILVVGTTYSKVRSMVNHLGQREKAALPSAPIEITGLNGVPNAGDKFVVVNSEKQAREIVEYRLELIKKKKEDLGDNNLDIFSRNNSETEELSVVLKCDVTGSIEAISSSIDKLGKDQVKLNILHKAVGGITDSDVLLAEASSAVILAFNVKVDSKIRDLAKQKGIEIHTYNIIYELIDDMRMYLTKMLKPVTREVRVGFASVRQIFNVSKAGNIIGCYVSDGVIRKDSLIKVMRGGKLVHEGKLKALRRFKDDIKEVGVNFECGVSLEGNVDIKVGDILEAYQLVQEERVL |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP042445_7 | 7.1|854862|49|NZ_CP042445|CRISPRCasFinder | 854862-854910 | 49 | NZ_CP042445.1 | 379989-380037 | 0 | 1.0 |
NZ_CP042445_5 | 5.1|522089|51|NZ_CP042445|CRISPRCasFinder | 522089-522139 | 51 | NZ_CP042445.1 | 341291-341341 | 2 | 0.961 |
NZ_CP042445_8 | 8.1|950558|51|NZ_CP042445|CRISPRCasFinder | 950558-950608 | 51 | NZ_CP042445.1 | 341291-341341 | 2 | 0.961 |
1. spacer 7.1|854862|49|NZ_CP042445|CRISPRCasFinder matches to position: 379989-380037, mismatch: 0, identity: 1.0
tgacggtatgacggttcgcgcggtggcatgacctcgtcatcccgctact CRISPR spacer tgacggtatgacggttcgcgcggtggcatgacctcgtcatcccgctact Protospacer *************************************************
2. spacer 5.1|522089|51|NZ_CP042445|CRISPRCasFinder matches to position: 341291-341341, mismatch: 2, identity: 0.961
tggtatgacggttaagtaattcgtcatcccgctgcttgttagcgggatcta CRISPR spacer tggtatgacagttaagtaattcgtcatcccgctacttgttagcgggatcta Protospacer *********.***********************.*****************
3. spacer 8.1|950558|51|NZ_CP042445|CRISPRCasFinder matches to position: 341291-341341, mismatch: 2, identity: 0.961
tggtatgacggttaagtaattcgtcatcccgctgcttgttagcgggatcta CRISPR spacer tggtatgacagttaagtaattcgtcatcccgctacttgttagcgggatcta Protospacer *********.***********************.*****************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
29212 : 137929
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP042445|29212:137929|DBSCAN-SWA GCTAGTGTGTCTCTTGACCAAAAAAGCCAATAATATTTTCTTTCACTTCTGTGCTATCTGTCATGTTATTTACTCTCACACGAAATTCAGATGAGCCTTGAAGCCCGCTACTGTACCAACCTATGTGTTTGCGGGCCATCTTTATTCCTGTGTCATTTCCATAGTACTCAAGAATATTGTCGTAATGCTCGAGTATGATGCTTAATCTCTCTGAAGCTGTTGGCTCAGAAGTTTCACTTCCACTGAGAAAGTTCATTGCTTGATTAATCAGCCAAGGTTTACCGTAGGCACCACGACCTATCATCACTCCGTCTGCTCCAGATTCTTTGAGAGCATTCTGAATATCATTTAAATTTTTAATATCGCCATTTACTATAACTGGAATTTTCACTTGCTCTTTAACATTTCTAACGAATTTCCAATCTGCTTGACCATTATAAAGCTGCGCTCTTGTTCTTCCATGCACAGTGATCATTTTTGCTCCTAAGTCTTCGGCAATTTTCGCAAGTCTCGGGGCATTGCGATTTTCATCGTTCCATCCAGTGCGCATTTTTACCGTAACTGGCATATTCACTGCTTTGACCACAGCTTCAATTATCTCAGCGGCTTTTTTCTCATCACGCATTAGCGCTGATCCTGCATAACCGTTTACAACTTTTTTAACAGGGCAACCAAAGTTTATGTCTATAATTTTTGCTCCCATGTCCTCGTTTAATTTTGCAGCCTCCGCCATAACATCTGGCTCACACCCAGCAAGCTGCACAGCAGTTAATGCATCGACTTTTGCTTTTTGCAAACTCTGGCGAGTTTGCATAATCATAGCTCTGCTTGCGATCATCTCTGAAACTAACAAACTTGCACCAAGTTTCTTCACAATACTTCTAAACGGATAATCAGTCACTCCAGACATTGGAGCTAAAATAACTGGAGAATCAATTGTCAAATTTCCTATTTGGAGGGGCATAAGGTCAATGGTAATTTTTCATTGATTACATAATGCAACACAAACTTGCATTCTCCCTTGAAATAGAAGACTGAGATGTTTTCGTCCTTGGCGGACGCTTACGATTTCTTAGATCTTCCTTACATTTCTCATCTTCCATAAGCGCTCTTGTAAATTCTTCTCTTTTCTCGTTCAAATCAAATTTATATTCTGATAACTTTTTGTCAATTTCGTCAAATGATTTGTCTTCGTTAAGCATTTGTTTAATTTTATGAGCATTTTCTAACGCAAATATTCCACAGTTATACCCGTCACTTTGCTGCTTAGTTGGGGAAATTCTTATGTCTAATACCCATTCCTCTTTTTGCAGTTCTCTTTTAACAATATTTAGCACATTATCTGGCAATTGATTACCAAATGAGTCACAGTAATAAGCTCTAAATTTTTTATCACCTGCATCAGGTTTAATAACCAAAGTTACCCAATGATTGTTGTTAATATGAAGAACCGAAGTAAATATCAATTTAGAATTTTGTTTTAATTCACCTCTATAATTCTGAAGAAATTCTTTGTGAGTTCGTCCCAACCATTAGAATAGCTAGGAGCAAGAAAATAGACATTATTATTACTATGTTCACTTTGTGAGTACCCATACACAACTCTTGCAATATGTGTAATGTCATCATCACATAACCAGTAAGCATAATTTCCTCTGTTTGTCTGATGCACAAGAGTGTCCAAATTTTCATGAAACTCTTTACCACCCAAACCACTATCTTTTGAAGCAATAGAACTTCTGCGACTACTGTTCTCTGAAACAGTTGACCCATCTTCATTATCTGGTCCAGGAAAAATACCACTATCCTCATCTGGAGTTTTTTGCTCACCTTGACTTGCTCTTTTTCCATTAATATAACCCTTCGCTAAGTAAAATAAAGGTTCAACAACCATTTTGTATGCTACTGTAAGAATTGTTCCCATTAAAACCCAAACTACGGGGTTAGAGATGAGCATAGCAAGTGGAAAGGTCAATAGAGGGGTCCTATTACCGCCCCTAAACAGCCAGCAGCGAATGTGGCTGCTAGGCATACACAAGTAGCGTAGATAACGAATTCCTCACCAGCAAAGTAAGTGCTCTCTTTCTGATTATTTTTTGTAATGCCCAACATACTACACCCTATGAACGCTAAGTTAATTAAATTTAAACAAATTCTAACAAAAAAATCAACTATAATAATTTTAGTAGTATGAGAATATATTGAATATTAAGAGCTTTTGGAGTACAGTAACAATGTTAGTAATAGCACAATATATGCACGATATAGAATATATACGCAAAAACCCTGAAGGATTTGAAAAGGCAATGAAAAGCAGGGGAATTAGAGAATCTACTGCGGAAGAGATATTAGAAATCGATCACGAGAAAAGATCATTAACCACTAAACTGCAGGATTTGAATAGGCAGCGCAATGAAATCACAGAGGAAATAAAAAAGCTTAAAATGAGCAAGAGCCCCTGTGAAGAGCAAATAGAGTTGTCAAAAAGCATCACAAATGAGATAGAGGCAATCAGCTTAAAAGAACAAGCAGAAAAGGATAAGTTAGTGAATGTTTTATCTAACTTGCCGAATATTCCTGCGCAAGATGTGCCAATAGGCGCAGATGAGAACTCTAATTTAGAGGTGAGAAGATATGGAGGAAAAAGACAGTTTGATTTTGTACCAGAATCTCATTATGAACTCGGAGAAAAATTAGGTTTAATGGACTTCGAACAAGCGGCGAGAATTTCCGGATCAAGATTTACGATATTAAAAGGACAGTTAGCTAAGCTTGGACGAGCGCTAATAAATTGTATGCTTGAAATGCATGTTAATGAATTTGGCTATACTGAGGTGTACCACCCGGCTTTGGTGAAAAACGAAGCTATGTATAATGTTGGTCAGCTACCGAAATTTTCTGACGATTCGTATTTAACTACCGACGAATTGAGGTTGATTCCCACAAGTGAAGTGTTTTTAACAAATTTAGTTGCTGACAAAATAATGGAAGAAAAAGAACTGCCTATTCGCTTTACTGCATATTCGGAGTGCTTTCGTAAAGAAGCAGGTAGTGCAGGTCGCGATACCAGGGGCATGATAAGGCAACACCAATTTGGTAAAGTGGAGTTGGTAAGCATCACAACTGAAGACCAATCAAATGATGAGCTTGAGCGTATGACGAGTGTTGCTGAAGAGATATTAAAAAAATTAGAATTGCCATACAGAGTAATGCTGCTTTGCAGTGGCGATATGGGTTTTGCTGCACAAAGGACTTATGACATAGAGGTATGGTTACCTGGGCAAAATAAATATAGAGAAATATCAAGCTGCTCAAATTGTGGTGCATTTCAAGCAAGAAGGATGAACACTAAATACTCTTCAGAAACTGATAAAAAGATGAAAAAATATATTCACACTTTAAACGGCTCAGCTTTAGCTATAGGAAGAACGATTATTGCCATAATGGAGAATTATCAAAATTCTGACGGGTCGATTGCAATACCAAACGTGTTGCAAAAATACATGAGTAATGATACTGTTATAAGCAAATAATAATTTTGACATATAGAAAAGCGAGGAAATAAAGATGAAGGTTCTGGTTATAGGTTCTGGTGGGCGTGAGCACGCTCTACTTTGGGCTCTAAAAAAATCTCCTATCTTGACTGAGTTATATGTAACTCCTGGTCGCCAAGCTATGAAAGATCTTGGGGCTCTTGTGGATGTAAATATTCAAAATTCAGTGGATGTTACACAATTTTGCAAGAGAGAAAATATAGAGTTGGTTGTTATTGCTCCAGAACAACCAATAATTGATGGGCTTGCTGATGATTTAGTTGCAGAGGGAATAAATGTTTTTGCTCCAAGTCAAGCAACTGCAAAACTTGAGGGATCGAAGTCTTTCACCAAGGGACTATGTAAGCGATATGGTATACCAACTGCCAAGTACGAGTGTTTTGTTGATGAAGGGTTAGCTAAAGATTTTGTACGTAGCAATAAAATAAAGTTTCCACTTGTAGTGAAAGCAAATGGAATTGCAGCAGGAAAAGGGGTGGTTATATGTAATACAGAAAGCGAAGCTTTTTCAGCAATAAATTCAATGCTAGTGGAGAAAAAATTTGGTGAATCAGGTGAAGAAATAATCATAGAAGAGTTTTTAGTTGGAGAAGAAGTAAGTTTTTTTGCTCTTATTGATGGGTTGAAAGTAGTAACTCTTGGGTGTGCAAAAGATTATAAGAGAGTTGATGAAAGTAATGAAAGCCAAAATACTGGAGGTATGGGGTCGTACTCATCACCTTCAATTATAAGTAAGGACATGGAGCAAAAAATTATCCAAAAAATAATATACCCTACAGCTCAAGCATTGGTTAACATGGGTACGTCTTATAAAGGAGTACTCTTTGCTGGTTTAATGATTTGCAAAGATAGCCCAAAACTTCTCGAGTATAACGTTAGATTCGGTGATCCAGAAACGCAATCTATATTACCTAGATTTGATTCAAATTGCGATTTGTTAAAATTGATGTTGTCAGTTGCAGAAGGAAAGTTAAATGTCAAAATGGTGGAACTTAACAACAAATCTACAGTTTGTGTAGTTGTTGCAAGTAAAGGCTATCCGGGTGATTATCAAAAGGGAGAAGTAATTAAAGGATTAGATAAGATTGAAAGCATTCCTGGTGTGTTGGTGTTTCATGCTGGTACTAAATTCGATGAAAGTGGTAACTTAGTTTCCGATGGCGGAAGAGTGCTAAATATAGTAGCAGAAGGGAGCACTATAGAGGAAGCCAAAAGTAAGGTGTACTCAGCATTAAATTTTTTAGAATGGCCAGGGGGCTTCTTCAGATACGATATCGGTAGTTAATGTTAGCTGTCGGTTAGCAGGTGGTTCACAGAAACGAAAAACTTCCTTGACAAACTCCGCCAGCCCCCTTATCATGAAACTGAAGCTATTGTATTTGCTTTCGCCAATCTGCAGATTAAAAGGTAAGGATTACTTAATGTATCGGCGTCTTATGTTCAATT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103 | Staphylococcus_phage(12.5%) | tRNA,integrase,transposase | attL 46830:46889|attR 127090:128011 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
142687 : 193330
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP042445|142687:193330|DBSCAN-SWA 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52 | Bacillus_phage(20.0%) | tRNA,integrase,transposase | attL 189964:190006|attR 191069:191111 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
197425 : 268811
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP042445|197425:268811|DBSCAN-SWA 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57 | Wolbachia_phage(60.0%) | head,integrase,terminase,plate,transposase,tail,capsid,protease | attL 189964:190023|attR 236238:236416 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
276457 : 335496
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP042445|276457:335496|DBSCAN-SWA 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53 | Wolbachia_phage(15.79%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
431427 : 641015
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP042445|431427:641015|DBSCAN-SWA TTTAAGCAGAAATGTACATGTCTGCAAGTACAGCATTTGCTTTTTCTATCGCTCTTGCTAACACTCCCTGTTCATTGTTCTGATTTTTCACATTGATTACCTGAGCAGCCAAGTTTGCAGGAAAAGTGACCAAACTGACTTTCCATAATTCCACTTGTTTTAACACTCTAGCTCCACTTTTATGATCAACATCATACTCTATAGGTATATAGCCGATGGAAAGTCCGTTAATTGTCCCAGTTTTGAGCATCAAATACACTTCTTCTGCTTTCTGAATACCCAAAAGTAAATGTGCGGTTATATACAGGCCAACATCATTTTCATAAATATCTATGATACTACCTATAGGTTCGTCAGGATTATGCTGCCAAAGGAGTTTTATTTTATTTCTGTTTAAATTTTCCTTAAATGCTCCGGGCAATATCAGATCATTTTGTTTATCAACTATGTTAAAAACGCTCGCATAACCAGAAAATACACCGTTTTCTCCTATACTTTTTATTGACAATGGTGAATAGAGAAATTTCTTATTCATAAAGCCTCCTGTAGTATTGGGAATTTTGTTTCGCAATGCACTGCGATATAATTCTATTATATGCAGTGCTCTAAAAGGGGGAAGCACTTTCTTAGTTACTAAAAACGCTAAATTGTAATATGGTACAATGTTACAACGATGTCATGAAAGTAGCTGAAACTGGTTCCTTTATGACGGCAGTACCTTCTTCTGTCATCCGAGTAGCCTCCTTTTTTTGTCATCCCAGTGCTTGACACTGGGATGGCTTTGTTGCATCGCTACTTATGAAAGGCTAACTATAGTTAGGATTATAAGCAACCTATTGAAAATCTTGTTTTTTTGCAATCAATCTGATCAAATTTAAGAATAGTAATTTGTTATTTATATTAATAAATTTAATTCTATTGAAAATAGCTAAAGCATTGAAATTCTTGAATTTTAGCCGGATTGGTAAATGGTAGTGAAATTTCTTTTACTCAAATTTAGGTATTCATTGACCGTTCTTGTTATAAATACCAGAATAATAAGCTACTGATATTCCCTATCTTTTTTATCTTTAATCCATCATAGCTAGCGATGCAACAAAGCCCACTGGGATCCAGAAGACTTAATTTCAACCAAGTGGCTGCATAATAAAGGCTGGATTCCAGTGTCAAGCACTGGAATGACATCACAGGGGCATTGACCTCTCTTGGGCTCTTTTAGCTATAAACATTAAGAAATTTACCAAATGAAAAAAAGGCAAAAGAAGCCCTGGGGTTATTATCTGCTTTAAAATATTGGCGTTTTTTATGTTTTAAACGTTTGACAAGCAAGATTGAGCTGCTTTTAATTGCAACTAACCTACGCTGCAAATGTTTAAGAAATTTACCAAGTAGAAAAAAAGACAAAGAATCCCCGAGTTAGCTAGTCTTTTACTATCTCTGTCAAGTATTGGCATTTTTTGATGTCTTGTAACGCTTTATAAGCGCGTTCAGCTTATTTAGATAAAAATCTAGATGTAGATGAAGTTTTGTAAAGACATACAGTATCTATATACTGCAAAAAATTAAACATAAGACGCCGATACATTAAGTAATCCTTACCTTTTAATCTGCAGATTGGCGAAAGCAAATACAATAGCTTCAGTTTCATGATAAGGGAGCTGGCGGAGTTTGTCAAGCAAGTTTTTAGCCCTGTCTCCTTGCTATAATGTTCATATCGATAGAAAAGCAAAAGAATAAAATGAAATATCAAGTGATATCCTCTATAATTAAATTTTTTGAATGAAGAGATGACGATTCGTGTAGGAATTAATGGTCTGGGTAGAATAGGCAGAGGCGTATTGCGTGCTATTTTCGAAATAGAAGAATATAGCAAACAAATAGAAGTTGTAGCTGTCAATGGATCGCTCAGTGCAAAGCAGCATGCACATTTGATTAAATATGATTCTGTTCATGGCAAATTCAGTGGTGATATTGATTTTAATGAGTCTCAAAATTGGATTTCTATAAATGGCAAAAAGTTTTCTTTATATAGAGAACGGAATCCTGAAAATATTCCTTGGAATGTTGATGTAATACTTGAATGTACTGGTGCATTCAATAAACGTGAAGAAGCAATAAGGCACAATGCAGAGAAAGTAATTGTCTCTGCTCCAGTTCCGGATGCTGATGTCACTATAGTTTATGGTGTGAATGACGATATGCTCGAAAAAGAGCATAAAGTGATATCAGCAGGTTCTTGCACTACAAATTGCCTTGCTCCGATTGTGAAAGTCCTACACTCCAGTTTAGGTATAAAAAGCGGTTTTATGACTACTATACATGCCTACACGAATGATCAAAATGTTCTTGATGGTAATCATAAAGATTTGCGTAGAGCAAGGGCTTGCGGATTATCTATGGTGCCAACTACAACCGGGGCAGCAAAAACAATTGGTTCTATAATTCCTGAATTAAAGGGCAAGCTAGATGGCACTGCCGTCAGAGTTCCGGTTAGCAATGTTTCTATGGTTGATTTTACATTTACGACTGATAAGAAAGCGACCGTTAAAGAAATCAATGAAATGTTTAAGGATGCAGCTCTCTCCTCTACGTCATTCCAGCGCGTGACGCTGGAATCTAATTTCTGGATCCCAGTGTCAGCTACTCGGATGACATCAGAGGGTACTAGGATGACAGAGGGTTATCCAATGTCAAATGTACTTTCTATATGCGAGGAACCTTTAGTCTCAATAGATTTTGTGCATAACCCTTATAGTGCAATTGTGGATTTAACTGGTACATATGTTACAGGTGATATATGCAGGGTTGCAGCGTGGTATGACAATGAGTGGGCTTTTTCGCTGAGAATGTTAGACATAGCATTATTGAGCTATAGTAAAGTATGAACTGGAACTCAAGCAAATACGCCTCATTTTATGAGCACTTTGCGGAACTCAGAAAAAGAGTTATCTTTTGCTTTCTATTTTTTTGCGTTGCTTTTGGTTTTTGTTATTACTTTAAGGAAAATATATACCGTTTTTTACTCGCACCTTTAATAGAAGCAACAAAAGGTAGCGAAGGTTTTTCTTTAATTTACACAGACTTAACAGAGGCATTTTTTGTGTATCTCCAAGTTGCAATAATGAGCGCACTTTTGTTTTCTTTTCCTGTGTTTGCATGGCAATTTTATATGTTCTTAGCACCTGGGTTATATAAAAGTGAAAGGGCAGTGTTGTTGCCATACTTGATTGCAACACCGGTTTTATTTGTAACGGGAGCTACTGTAGTCTATTACTATATATTTCCTTTAGCCTGGAAGTTTTTCATCACTTTTGAACATAGTGGGAAATCTTTCGGTATACCAATAGAGTTTATGCCATCAGTTAGCGAATATTTAGACCTCGTTCTCCAATTTATGTTTGCTTTTGGCACTGCATTTCAAATTCCAGTAATACTCACATTAATGGTGAGAGTAGGGTTACTCACTACACAAAGTTTGTCAAATAAACGCAGAATCGCGATAGTGGTAATTTTTATTATCGCTGCAATCTTAACTCCACCTGATGTATTAAGCCAAGTAGGGCTTGCAATACCTATGCTGATTCTATATGAATTGTCCATTCTGATATGTAGGTATATTGAAAAAAAGAAGACAAAGATTTAAACAAAGAAATCCCTCTTATCTCCTTTATATCACATTTTTAACTTACAACATTCTTATTCAGGACTTAAATATGGAAATGTTTCATAAATTGATTGTAATACTTTGTTAAGTTCAGCCTTACTTTTGATGATCAATAATACTGTATCATCACCTGCTATAGTTCCTATAATTCCTATGTTTTTGCTATTATTTAATGAATAAATAACATACTTCTGATCTAGAAAGTAAGCTAGGCTGCTAGCTTGTCCTGGTTGAGTGTGTAGTACTATTAAACCAAAATCCGAAATTTGCATATTAAGTATTAATGGTAATCGATATTGGTTGATGTCAATTACTTTATACATACCAGCAACTTTGGCAATTTTAAGTTTTTTTAATTTTCTTGATAAAGTAGCCTGAGGAATGTTGTGCCCTCTTTCTTTAAGCAAGGTCTGTAAATCGCTCTGCTCTAAAATTTCGTGATTTTGAATAATATTTAAAATATGTTCACCTAGTGTGTTGTCATGCATTATGCATTTTCCTCATATTGAATATGTAATAAGTATATTTGAAATTATATTCATTATTTCTTGACTATTCAATTTTTAATGTCTATATTCATAAGATGAATAAAATATGAATATAAATTAGTAATATGAAAAAATATATTTTAAATGCTATTATAGTGATAAGTATTCTATTAACAGGATGCAAGGAAAATAAACACGATAATATCATTAGATTTGCAATTTCTGCAGATTATCCACCTTTTGAATATTATGAAAATGGTAAATTTACTGGCTTTGACATTGAGCTTGCTCAATTAGTAGCAAAAGAGTTAGGTAAAGAAGCGATATTTAAAGATATGCAGTTTAGTGCTATATTTGCAGCATTGCAAAGTAATTCTGTAGATGCTGCTATATCTACTATTGGTAGCACAGAAGAGCGTGAAAAAAATTTTGATTTTTCAAATAGTTATTATACAGGGGAATTTGGTATTCTATATCACAAAAATAAACCCATAGCCGGTATAAACAACTTAACTCACAAGAAGATAGCCGTTCAACTAGGAACTGTCATGGAAATTTGGCTAAAAGAGCATGTTCCTACAACAGCTCAAATTATTGCTATAGACAATAATAATCAAGCTGTAGAAACATTAAAGTCTGGTCATGTTGATGGCGTCCTAATTGATGAATTCCAAGGTAAAGTATTTAGCAAAAAAAATCCTGGTCTATCATGGTCAGCCACTGCCAAGTTAGATGGTGGTTATGTTATTGCTGTGAATAAAGGATCTGCTTTAAAGGATAAAATAAACGAGGCATCAAAAAGTTTAGAAAGTAAAGGTGTAATACAAAAAATAGCAGAAAAATGGCTA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171 | Wolbachia_phage(58.54%) | head,terminase,plate,transposase,tail,tRNA,capsid,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
921223 : 980545
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP042445|921223:980545|DBSCAN-SWA 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54 | Bacillus_phage(13.33%) | portal,terminase,transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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