Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017484 | Mannheimia haemolytica strain 39433 chromosome, complete genome | 3 crisprs | cas3,DEDDh,WYL,DinG,cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,PD-DExK,RT | 1 | 5 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP017484_1 | 1045830-1045904 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017484_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017484_1
>1.1|1045853|29|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder TCTTTATACCCTAGATTAGTATCAGGTCT |
DinG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017484_1
The CRISPR arrays of NZ_CP017484_1 >merge|NZ_CP017484|1|1045830-1045904|CRISPRCasFinder TTCTGGTGTCTGCCACCGCTAGGTCTTTATACCCTAGATTAGTATCAGGTCTTTCTGGTGCCTGCCACCGCTAGG >NZ_CP017484|1|1|1045830-1045904|CRISPRCasFinder TTCTGGTGTCTGCCACCGCTAGG TCTTTATACCCTAGATTAGTATCAGGTCT TTCTGGTGCCTGCCACCGCTAGG
>NZ_CP017484.1|WP_020824044.1|1044592_1045633_+|IS481-family-transposase MFYSNNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNLKNRVDEAIEQAVVKFALDNPAFGQVRVSNELRKQGIFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLIALEKLVAEQGIILSETQVQALERKKEDEIACGEIETTHPGYLGSQDTFYVGNLKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKTAISAADMLNDKVLPYFESQGLPMLRILTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHSKTKVKHPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKKIYTDLTTLQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMATLLDGKRIWVEKNLSSN >NZ_CP017484.1|WP_006252258.1|1043665_1044439_+|D-hexose-6-phosphate-mutarotase MNLSNALKLIKYNELDVLEVNHNKFKAKIALQGAQLLSWQPYNAEQDVLWLSEIEPFRIGSAIRGGIPICYPWFGSIKEPAHGTARIQEWRLVEHTCSDENVGLVFALENKAKMEMMLGETCELYFTHLDPEPAQLALHSYFNIGDIEKVEVQGLPTRCFDKLTDQEVEVPSPRKISENVDCIYPAQAVNFIQDFANQRTIKVEHINATETVLWNPWHNTVSAMTETAYQNMVCVETARINTLLQQNETLGVRVLVR >NZ_CP017484.1|WP_006252259.1|1039320_1043517_-|autotransporter-domain-containing-protein MKTKTFTRSYLASFVTIVLSLPAVASVVRNDVDYQYFRDFAENKGPFSVGSMNIDIKDNNGQLVGTMLHNLPMVDFSAMVRGGYSTLIAPQYLVSVAHNTGYKNVQFGAAGYNPDSHHYTYKIVDRNDYEKVQGGLHPDYHTPRLNKLVTEVVPAAVTNAGTSIKPYLNEERFPMFLRAGSGTQALRGKESNKTTGIAGAYEYLTGGTTLQLSKSSPDHWLDYSSNLYQVSYGPLSTYALPGDSGSGSYAYDMNEKRWVLVGVLNFYNGMDNQFNRSAIIRKDFHEKKFAEDIAGTINNTVQNAQFNWTAQGKSSSLSQSNNVQKLNVDLKDSSIANQNTSLPQENHGKTINFNGKDATIVLKQDIDQGAGALNLNANLTIRPETDQTWQGAGIIVGKDKKVNWQVKNPQGDRLSKLGEGTLYVNGRGQNLGDISVGDGIVILNQQADHQGRKQAFNTVGIVSGRPTVVLGSADQVNPDNIYFGFRGGRLDLNGNSIAFKRIQNSDKHARIVNHNRDHISTLIIQGQDPLTSNDLIWGKWASNSPADIYEYTNPYQNKRKDYFRLKGNSRVYYPTNATSNDHWEFLSSNREQAIQKILDAKNLRQRYDTFNGFIGEDASNKTNGILNVVFDTKTEVNTEQDKLKNIYTMSGGFNLNGELTLKGGTLLLSGHPTPHAYDIKNKHDVVRENDWQDSHFTAKNITVNKMAQLYIGRNVNEVNSHFTATDKAKLNLGFINRSTPSCYDSEYTGTTHCEVQAVISDNIFANLATTAIKGNVKLQNHSQLNLGKANLTGSVQADQTTHITLANHSHWLNNGTSQIGHLTMEKGSILSLNDKFATTEIPVRFNKMIIQGNLKGNGRINYTANLAKGESDHLQVDGIAEGNFVLAVRNSTTEANPKSSLNLLSLKNSNQEGNKVSISLENNYVDLGTYRYVLENRNHNYHLFNPLIPNSTSKEMNATSVSSIPKKESVTNVPTLDKKETEQNLTQLQKDFSAHQLENQKAKQSMINAQSELRRLNSQLNVLQKYVNSRRLGYYTQQAVLEQISIIQNKIKQTQTIFNDANATVKLTDQKLEEAKLALGSVNDLVLIKASAPAMQATNQDTSMMNIIQADWISQYANTALSELSAQANSALQISNSLDRQLFKQSDKFNVWSSVEHQKTEHKSDLYRPYKQQTNLTQLGIQMPIDNGLMFGVALSKNHANAEFNEGVNGKSNLLMASLYGKWQSQQGTFISLDGSYGKAKNQLYLFGENHFTRRISSIGANIGHQFDLAGVQIQPTIGARYYHFSGQDYTLGGAKISSPNTHFMTYQAGLKASKTFSLDDWKVEPSITTHYVDASNKRLAVNVNNNNINQRFGRYLKTEAGIRFEHNQWQFDLHAGFINGNEIKKQHFAGVKLGYSW >NZ_CP017484.1|WP_006248319.1|1038171_1039266_+|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase MSKTIEERISAVILAGGLARRMNGVEKGLQLFEGKPLISHILARLSPQVSDIWLNVNRSIEQYQQLYPAFSYYQDSLPDFQGPLSGMLAGFEQIESDYLLFVPCDTPFMPELLLQKLKTALRINNVQIAYAHDGERPHPTFALIHRSVQEDLKAYLGSNQQQLLAFFQSQKSVAVDFSEQKSAFTNVNTLEDLSRVSQFPVKNLAITGYSGTGKTTLLEKLIPKLTACGIRVGLIKHSHHNVDVDKKGKDSYRLREAGANPTMIVCDERWALMTETKQAVEFSQLIAKFNPQEVDLVFVEGFKHETLPKIQLHRKGIEKPLPELDQWTIATATDYPLERENWLDINNIGGIADFIKNWLENKAS >NZ_CP017484.1|WP_006248320.1|1037815_1038085_-|DUF1040-family-protein MKCERLEELLELLGEHWRKNPDLHLIDILQQLSVEVGEPDNFKALSDEVLIYQLKMRNAGKFEPIPGIKKDYEDDFKTALLRARGILND >NZ_CP017484.1|WP_006248321.1|1037113_1037752_-|thioredoxin-domain-containing-protein MKKLALKTAFVALSALFTFNSTAIAADPTAGKEYIEVRKAPSAQKEVVEFFSFYCPHCYDFELSYKIPSQIKEKLPSDSKLVQYHVNFLGRQSEDLTRAWALAMALGAEDKVKTALFEGAQKDAFKSMDDIRSVFLANGITAEQFDSGINSFAVNGLVNKQVQLAEDFQIRGVPAFFVNGQYQLNLEGFADSSSTNDFIKRYVDAVVFLSKK >NZ_CP017484.1|WP_006252260.1|1035989_1037030_-|LLM-class-flavin-dependent-oxidoreductase MTKLSILNLVPIREGQTAKQAVDSMVKLAKHAESIGIERYWIAEHHNMKNLASSATQLLIQHALSHTEKLRVGSGGVMLPNHSPYIVAEQYGTLETLYPNRVELGLGRAPGTDMRTATALRRNAQSLPFPDEISELKGYFEGTNPVSAYPAQGLNVPFYILGSSPESAYLAAERGLPYAFASHFAPRFMDDAVRIYRTHFKPSEVLDKPYVILGVNAIAAETDQEAEQLATTQTQFFLNVVTNAQNYLQPPVESDDKVWENFVKAEIVPHFGPVSFQQNALYNQEKTVVRQMTACSLIGSRESVEQQLKSLKARIEIDEIMAVSYIFDEQKQHQSYTWLKEIADKV >NZ_CP017484.1|WP_006252261.1|1035694_1035988_-|YfcZ/YiiS-family-protein MSKTMQQKAADAHNMCKLKGDSMLDNSDRQIAFEAVYDSEEIAVQAVEFFTQKAKSVETEPCDIQSEITPIIDGFLMKMWITFSCQAEVILFQMAVR >NZ_CP017484.1|WP_020824074.1|1034463_1035504_-|IS481-family-transposase MFYSNNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNLKNRVDEAIEQAVVKFALDNPAFGQVRVSNELRKQGIFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLIALEKLVAEQGIILSETQVQALERKKEDEIACGEIETAHPGYLGSQDTFYVGNLKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKTAISAADMLNDKVLPYFESQGLPMLRILTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHSKTKVKHPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKKIYTDLTTLQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMATLLDGKRIWVEKNLSSN >NZ_CP017484.1|WP_006252489.1|1032653_1033211_+|DUF2857-domain-containing-protein MIKTITVNEALIGNALLNIKEGNIHPCLKMGFSEEQLKAINNLSLDEIMDISNSVVSFAKVEINHETFWKLLAIAQANTQQRQIIDRALLLGASIEMLHQYFGLSTSEVSARRQLLGIEEKMGRKAAASDEESTHIWEIWQKYKQKMESLDSQEGLELLCLIAEEGNMNLTVVWKLVSEWQSKHK >NZ_CP017484.1|WP_006250514.1|1046020_1047262_-|HipA-domain-containing-protein MMNKRIYVFADWETFSQPELVGVLSSDVVRGKENFRFSYDNEWLSSPYVQQIDPNLYLYPGEQYSTDTQNFHIFLDSCPDRWGRLLMKRREAALASQENRKPKLLIESDYLLGVHDMNRMGALRFKTELNGPFLDNNTRLAAPPLSSLRELEFAAIQLESSDNVDDPDYLKWLHMLISPGSSLGGARPKASVIDELNQLWIAKFPSRYDDYDIALWEYLAYRLAIQAKIEMATCRIERFNQEHHTFLTQRFDRHCGKRRHFTSALTQLGYYDGDYEASYLEIAQFLTESGSNTRIDLAQLWRRIVFNIAISNTDDHLRNHGFIYAQEGWILSPAYDLNPVPLSQGLHLNITDSDNRLDYQLAFDVADFFQLSKQQAVQIYDEVLKEVNNWQNVAKEIGIPRQEQEQMKFAFNV >NZ_CP017484.1|WP_006250513.1|1047261_1047465_-|hypothetical-protein MFTQTLLAQRTGLSRVTVRKIMNGDPTVAIGYYLMVLGVLGLEQDFTDVGKDDELGRKLQDIELLRK >NZ_CP017484.1|WP_006253491.1|1048264_1048780_-|single-stranded-DNA-binding-protein MAGINKVIIVGNLGNDPEMRTMPNGEAVANISVATSESWTDKNTGERREVTEWHRIVFYRRQAEVCGQYLRKGSQVYVEGRLKTRKWQDQNGQDRYTTEIQGDVLQMLGSRQGNDMGGQQGGWGNSAPAGNSYNQGNSNYGYNQTQSAAPQSKPAPQPEPAMNNFDDDIPF >NZ_CP017484.1|WP_020824046.1|1048934_1051763_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MQHIDIRGARTHNLKNINLTLPRDKFIVITGLSGSGKSSLAFDTLYAEGQRRYVESLSAYARQFLSLMEKPDVDHIEGLSPAISIEQKSTSHNPRSTVGTVTEIHDYLRLLFARVGEPRCPDHDVPLAAQTISQMVDRVLEEPEGKRMMLLAPVVKERKGEHVKLLENLTASGYLRARIDGEICDLSDPPALELQKKHTIEVVVDRFKVRADLATRLAESFETALDLSGSTAIIADMDDPNAEEIVFSSSFACPHCGYSLHELEPRLFSFNNPAGACPTCDGLGVEQFFDAKKVVQNEEVSLAAGAIKGWDRRSFYYFGLLKAVAEHYGFDLETPFGQLPKKYQNIILNGTKEEIEFVYVNDRGDKVKRKHAFEGVLNNMARRYKETESNAVREELAKYINNRPCMDCEGSRLRREARYVFLDKTNLPMVSEKSIGEALTFFEELKLAGQKEKIAEKILKEIRERLQFLVNVGLNYLSLSRSAETLSGGEAQRIRLASQIGAGLVGVMYVLDEPSIGLHQRDNERLLNTLVHLRNLGNTVIVVEHDEDAIRAADHIVDIGPGAGVHGGQVIAQGTAAEIMQIEESITGQFLSGKQKIEIPAQRVPYEPTKLLTLSGASGNNLKKVKLEIPVGLFTCITGVSGSGKSTLVNDTLFLLAQNALNRAENSDVAPYESIDGLSHFDKVIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGLFTPIRELFAGTQEARARGYNVGRFSFNVRGGRCEACQGDGVIKVEMHFLPDVYVPCDHCKGKRYNRETLEIRYKGKTIHQVLEMTVEEAREFFAPVPMIARKLQTLMDVGLSYIRLGQSSTTLSGGEAQRVKLATELSKRDTGKTLYILDEPTTGLHFADIKQLLGVLHRLRDQGNTIVVIEHNLDVIKTADWIVDLGPEGGSGGGEIIATGTPEEVAKDKRSHTARFLKEILAKG >NZ_CP017484.1|WP_006249416.1|1051854_1053588_-|C4-dicarboxylic-acid-transporter-DauA MLNKWFLTKNAFLAVKPFSALKDALNAGYGKQHLIRDIISGLTVGVIAIPLSMALAIASGVPPQHGLYTAIVAGIVIALTGGSRFNISGPTAAFVVILYPVTQQFGLSGLLMATMLSGGILVLMALLRLGRLIEYIPLPVTLGFTCGIGIVIATLQIKDFLGLSIEKMPEHYLGKLEAIFSALPTINWADTLVGVVTLLVLTRWHKLRLPIPGHLPAVFIGTLLSLLLIHFGQNVATIGSAFHYTLSDGTTGYGIPSVLPEFVLPWNLPNAEGNRIDWNLTTIQALLPAAFSMAMLGAIESLLCAVVCDNMTDTKHHSNNELLAQGLGNIASPFLGGITATAAIARSAANVRSGAVSPISSVVHALLVLFALLFLAKALSYLPLSSMAALLLVVAWNMADIPQIIQLTRRSGKNEIAVLLTCITLTVLFDMVIAITVGVLLASLLFIRTIAEMTKSFEMAHPTDLNDVLVYRISGPLFFAAADNLFADLHNKTVHTDHQIKHIVLQCDAVTVLDAGGIHALTRFVQHMLPHQQLHLCNVQFQPMRMLVRSQKTVNEIPQIQFSSDLESAFDKIRQAN >NZ_CP017484.1|WP_006253136.1|1053829_1054762_+|ABC-transporter-permease MDSLIHFLSAFLTNITWIGALELGLIYSLVALGVLISYKILDFPDLTADGSFPLGGAVCVISILNQVDPWLATLYGTLAGAVAGMVTASLHIGFKIEKLLASILMMIALYSINLRIMGMPNIAILGETTIYDVMPIESDLQLALVRLVMTLLVVIIVKGLFDLFFATEIGLAVRATGTNSRMAKAQGIAINKMTILGMAISNALIALGGALYVQSNGGVDISIGVGTIVIGLAAVIIGEAIFSVKRIIWLTFAVIIGSILYRFFIALALNNETLNGIGFGPQDLNLITALLVVIVLVVPRIKHKLLGKRG >NZ_CP017484.1|WP_006250509.1|1054763_1055561_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIELNNLFITFNKGTAIENPVLRGLSLKVEQGEFVSVIGSNGAGKSTLLNAISGDCAVDSGEILIQGNKVNQSTTWQRANQVARVFQDPMAGTCESLTIEENMALAYQRGRKRGLGFAIKRQMRELFKDKLALLGLGLENRLTDQMGRLSGGQRQAVSLLMASLQPSNVLLLDEHTAALDPKTTDFVLELTNKIVREQKLTTLMVTHSMRQALDYGDRTVMLHQGQVAFDVSGEQRQKMDVPDLLQLFQQSRHEQLSDDGLLLGN >NZ_CP017484.1|WP_006250508.1|1055647_1055869_+|hypothetical-protein MLSIFKTPVEKETLDDWAKISVDVAKVAILAIPVILFGKEPTLIKLTNLALLVLSIYVFLTLGRKLRQLKEVL >NZ_CP017484.1|WP_006250506.1|1056051_1057977_+|ATP-dependent-DNA-helicase MTKYDDKIQHAFSENGLLSQNISGFRPRQAQLEMAQVVAKAVKFATPVVVEAGTGTGKTFAYLVPALLSGKKTILSTGSKNLQDQLFNRDLPTIQKALKYKGKIALLKGRANYLCLERLDQVTAMGVLGDKSVLTDLKKVSKWQNATKTGDLSECITIAEDSPILPQLVSTTESCLGSDCPHFKDCYVVQARRKAMEADVVVVNHHLFCADMAVKETGFGELIPEAELVIFDEAHQLPDIASQYFGQSLSSRQLFDICKDTNIVYRTELKDLSQLGKAADHLTKVVQDFRLLMGGEGQIRGNLRELFRDKKVVDGLVKVAENIDFLSEVAKKSLGRSEMLDKIFERLAEVKVQLKKLMDTSVTGYCYWYEANGRSFGLHITPLMVADKFGEQLKNQQIGWVFTSATLEVGGKFDHFCQRLGIENAEQLVLQSPFDYQHQSLLCVPRYLPDTNKSNTLTALGQLLKPVIEANKGRCFLLCTSYYMMRGLADFLREHSSLNVLLQGETSKSRLLEKFVKEDHSVLVATQSFWEGIDVRGDDLSLVIIDKLPFTSPDEPLLKARMEDCKIQGGDPFNDIQIPEAVITLKQGVGRLIRDVTDRGVVIICDSRLVMRNYGQTFLKSLPPSRRTRDLGNVIQFLKQK >NZ_CP017484.1|WP_006250186.1|1058050_1058416_+|CidA/LrgA-family-protein MLSTLLRMVASLALLFVMLYLGKLIVYLFPIGIPDSILGMLILFGCLVIGIVKVEWVIPSAKPLTRYITLFFLPICVELIEHLELLRQNLNTFVLATALSTLVSVVAIGVFAQWIFHYKRG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017484_2 | 1503131-1503760 | TypeI |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017484_2
|
9 spacers
spacers of NZ_CP017484_2
>2.1|1503163|35|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder,CRT AATTGCCTGTACATCAACATAACCACAAACACGGA >2.2|1503230|35|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder,CRT TCGAAAATCTTCCACGCATTTACGCCGATGTCAGT >2.3|1503297|34|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTCAGCACTTGCTCGTCTGTCTAGATGTAAGC >2.4|1503363|35|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATGCAATGCAGCGAGGGCGAAGAGCTTATCCCT >2.5|1503430|33|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACGAATTTACCCCCGAAATGGCCGCCTTGATTG >2.6|1503495|35|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGGCGCAGATGAAGAGAGCGATAGCGATTTAAGA >2.7|1503562|34|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGGTGAGAGCCTAGAGCTTTACCGCAAGCGGGT >2.8|1503628|34|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATCCCCTTGCCTACCATCTCGGAGGAGGTGGT >2.9|1503694|35|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGCTATTCATTCATTGACAAAATTGCCTACAATGT |
cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017484_2
The CRISPR arrays of NZ_CP017484_2 >merge|NZ_CP017484|2|1503131-1503760|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTCAATACACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCAATTGCCTGTACATCAACATAACCACAAACACGGAGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCTCGAAAATCTTCCACGCATTTACGCCGATGTCAGTGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCGTTTCAGCACTTGCTCGTCTGTCTAGATGTAAGCGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCTAATGCAATGCAGCGAGGGCGAAGAGCTTATCCCTGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCACGAATTTACCCCCGAAATGGCCGCCTTGATTGGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCTTGGCGCAGATGAAGAGAGCGATAGCGATTTAAGAGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCAGGGTGAGAGCCTAGAGCTTTACCGCAAGCGGGTGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCTAATCCCCTTGCCTACCATCTCGGAGGAGGTGGTGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCAGCTATTCATTCATTGACAAAATTGCCTACAATGTGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC >NZ_CP017484|2|2|1503131-1503760|CRISPRCasFinder GTTTCAATACACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC AATTGCCTGTACATCAACATAACCACAAACACGGA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC TCGAAAATCTTCCACGCATTTACGCCGATGTCAGT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC GTTTCAGCACTTGCTCGTCTGTCTAGATGTAAGC GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC TAATGCAATGCAGCGAGGGCGAAGAGCTTATCCCT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC ACGAATTTACCCCCGAAATGGCCGCCTTGATTG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC TTGGCGCAGATGAAGAGAGCGATAGCGATTTAAGA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC AGGGTGAGAGCCTAGAGCTTTACCGCAAGCGGGT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC TAATCCCCTTGCCTACCATCTCGGAGGAGGTGGT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC AGCTATTCATTCATTGACAAAATTGCCTACAATGT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC >NZ_CP017484|2|1|1503131-1503760|CRT GTTTCAATACACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC AATTGCCTGTACATCAACATAACCACAAACACGGA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC TCGAAAATCTTCCACGCATTTACGCCGATGTCAGT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC GTTTCAGCACTTGCTCGTCTGTCTAGATGTAAGC GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC TAATGCAATGCAGCGAGGGCGAAGAGCTTATCCCT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC ACGAATTTACCCCCGAAATGGCCGCCTTGATTG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC TTGGCGCAGATGAAGAGAGCGATAGCGATTTAAGA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC AGGGTGAGAGCCTAGAGCTTTACCGCAAGCGGGT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC TAATCCCCTTGCCTACCATCTCGGAGGAGGTGGT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC AGCTATTCATTCATTGACAAAATTGCCTACAATGT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC >NZ_CP017484|2|1|1503265-1503760|PILER-CR GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC GTTTCAGCACTTGCTCGTCTGTCTAGATGTAAGC GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC TAATGCAATGCAGCGAGGGCGAAGAGCTTATCCCT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC ACGAATTTACCCCCGAAATGGCCGCCTTGATTG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC TTGGCGCAGATGAAGAGAGCGATAGCGATTTAAGA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC AGGGTGAGAGCCTAGAGCTTTACCGCAAGCGGGT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC TAATCCCCTTGCCTACCATCTCGGAGGAGGTGGT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC AGCTATTCATTCATTGACAAAATTGCCTACAATGT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC
>NZ_CP017484.1|WP_006248118.1|1501405_1502881_-|ribonuclease-G MSSTELLVNVTPSETRVALVENGILKELHIEREAKRGIVGNIYKGRVTRVLPGMQSAFVDIGLEKAAFLHASDIVSHTECVDENEKKQFLVKDISELVREGQDIVVQVVKDPIGTKGARLTTDITLPSRYLVFMPENSHVGVSQRIESEEERARLKSLVEPYCDELGGFIVRTAAEEATEESLKQDVEFLKRLWRKVLERKGKYSAKSMLYGELALAQRVLRDFIGTHINSVRIDSKLTYEQVREFLAEFMPELTDCVTLYTGQQTLFDAYGVEKAIQKALDKRVDLKSGGYLIIEQTEAMTTIDINTGAFVGHRNLAHTIFNTNIEAIQAIAHQLQLRNLGGIIIIDFIDMQEEEHRERVLQSLQEALKGDRVKTNVNGFTQLGLVEMTRKRTRESLERILCCDCQACQGRGTVKTVETVCYEIMREIVRVHHLFKTENIHVYAAKDVAEYLINEESHALLAELQAFIGKKIEIKLEPYYHQEQFDVVVM >NZ_CP017484.1|WP_006250676.1|1499749_1501252_-|lysine--tRNA-ligase MSEVENQELDLNGEMLARREKLNKIREQGNAFPNTFRRDALAKDLHAQYDAVEGETLKEQNIQVKVAGRIMLKRVMGKASFFTIQDVSGAIQLYVARDNLSDSVYEEKVSLWDLGDIVGVEGALFKTKTGELTVRCSEVQLLTKSLRPLPDKHHGLTDLETRYRQRYLDLISNEESRRTFMIRSQVVSGIRKFFLERDFIEVETPMLQVIPGGAAAKPFITHHNALDVDMYLRIAPELYLKRLVVGGFERVFELNRNFRNEGVSVRHNPEFTMIEYYQAYADYHDLMDNTEELLRQLALDILGTTDVPYGDYVFDFGKPFERITMHDAIVKYGNGIQREDLDSFEKSVEIAKGLGIEIQKSWGLGSVVNAIFEEVAEHQLIQPTFLMAHPAEISPLARRNDENPEVTDRFELFIGGREIGNGFSELNDAEDQAERFDAQVAAKDAGDDEAMFKDEDFIVALEHGLPPTAGEGLGIDRLAMIFANAPSIRDVILFPAMRQK >NZ_CP017484.1|WP_006248812.1|1498598_1499672_+|homoserine-O-acetyltransferase MAQQITLFEDVPLPLTLGGELSPITVAYQTYGRLNAEKSNAVLLCHALTGDAKPYYDSPTEKGWWQDFIGKGLAFDTDKYFFICSNVLGGCKGTTGPASINPKTNKPYGSLFPIITVQDIVNVQKALLDYLEIPQLHAVVGGSFGGMQATQWGISYPDKVRNIINLCSSLTLSAEAIGFNHVMRQAIINDPHFNGGNYYDGIAPDNGLKIARMLGMLTYRTDIQLAKAFGRETKQQGQIWGDHFQVESYLSYQGTKFLGRFDANTYLRLLRALDLYDPALGYENEETALKRIKANYTFVAVTSDQLFKQVDVYKSKQKLEQAGVNLEFHEFHSDFGHDAFLVDYDFFEPMIKAGLAK >NZ_CP017484.1|WP_006250677.1|1497647_1498331_-|DUF218-domain-containing-protein MNQTRDRLEKLPLFHKMQQFIIKALKIIAIFPLLGIAILLLVDSLTSYIVRDKIYTDSKQIPYREYAVVLGTAKFYSKDVINQYYKYRLEAAKQLVQEGKVNQLLLSGDNKTPYYNEPKTMTSDLLKMGIATSKIKQDYAGYTTFDSIIRAKKVYKLPPFTIISQKFHCERALFIAKFRDIDAICYAATYPEGAYQVRMREILARSAMVFSLLIGKEPESLEDIRSK >NZ_CP017484.1|WP_006248815.1|1496771_1497611_+|formyltetrahydrofolate-deformylase MLQQHKILLTECPDDTGLVAKITNICYKHQLNIIKNSEFVENETKRFFMRTELNGIFNDETLLTDLKFTLPEGSSYKLLPKQRKRIVILVTKEAHCLGDLLMKNYYGGLDVEIAAVIGNHETLKSLVERFDIPFHLVSHENLTRVEHDKLLAEKIDEYSPDYIVLAKYMRVLNPEFVARYPNRVVNIHHSFLPAFIGAKPYHRAYERGVKIIGATAHFVNDELDEGPIIMQNVINVDHTYTAEAMMRAGRDVEKTVLSQALELVLADKVFVYKNKTIIL >NZ_CP017484.1|WP_006250678.1|1496291_1496702_+|H-NS-histone-family-protein MSALKSLLNIRSLRALAKDLALEQLKSISEKLDIIIAEKEEEMKQEELEKLKQLESLNKYREMLKQDGLSIDELAELLADKVIKTRKARKALSPRPAKYKFVDANGNEKTWTGQGRTPKALQDALDSGKKLEDFAI >NZ_CP017484.1|WP_006250679.1|1494322_1495855_-|Na+/H+-antiporter-NhaC-family-protein MNLVDYSTSLWSVLPALIALILAIVTRKVIISLSIGILFGAFMLTNSNFLDALTYIKNSVVSLVYKGAEEGLNSNNVNIILFLLLLGVLTSLLSISGSNQAFANWAQKKVKGKRGAKLMAAGLVFFTFIDDYFHSLAVGAIARPVTDKFRVSRAKLAYILDSTAAPMCVLMPISSWGAYIITLIAGLLATHSITGYSPLGAFMTMSAMNFYAIFAMIMVFFVAYFSFDIGSMARFERQAAHLAELDDEQIETKGHVRDLILPIIALIVATVSMMMKTGADALAESGASFSILGAFENTTVGISLVVGGVAGLIVATICIITSGNISFKNYVRAYGLGVKMMSGAITILFFAWTINGVVSDMQTGKYLSGLVAESIGAEFLPAILFVLAAAMAFSTGTSWGTFGIMLPIGASMAVHSDPALIIPCLSAVMAGAVCGDHCSPVSDTTILSSTGAQCNHMDHVISQLPYALLVATASIVGYLVVGFTQSAVLGFIATAIVMAILILLFKEKKH >NZ_CP017484.1|WP_006250680.1|1493344_1494097_-|SDR-family-oxidoreductase MKIALVTGVTAGFGLAICKLLLQSGYKVIGTGRRAERLEELHLQFGDKFLPLAFDIQQPDEVEKALNSRPKAWQQIDLLVNNAGLALGLEPAQKADLNDWYQMIDTNIKGLVTMTRLVLPEMVERNSGHIINIGSIAGTYPYPGGNVYGGTKAFVKQFSLNLRADLAGTKVRVSNVEPGLCGGTEFSNVRFKGDDEKAAKVYENVQFVRPEDVANIVLWLNQQPEHVNINRVEVMPVAQTSSALNVARNI >NZ_CP017484.1|WP_006250681.1|1492142_1493333_-|tryptophan-synthase-subunit-beta MSDTLLNPYFGEFGGMYVPEILVPVLKELEQAFVDAQQDPTFQAEFADLLKNYAGRPTALTLCRNLTKGSKTKLYLKREDLLHGGAHKTNQVLGQILLAKRMGKTRIIAETGAGQHGVATALACAMLGMPCVVYMGAKDVERQSPNVFRMRLMGAEVIPVQKGSCSLKDACCEAMRDWAANYDTTHYLIGTAAGPHPFPTMVREFQKMIGEETKRQILAKEDRLPDAVIAAVGGGSNAIGMFADFIEEQSVKLIGVEPAGKGIETGEHGAPLKHGTTGIYFGMKSPIMQDKDGQIEESYSISAGLDFPSVGPQHAYLNATGRAEYVSITDAEALEAFQALAKNEGIIPALESSHALAYALKMIKQNPEKEQLLVVNLSGRGDKDIFTVDKILNGGE >NZ_CP017484.1|WP_020824138.1|1491334_1492141_-|tryptophan-synthase-subunit-alpha MSRFDTLFTALKAKNEGAFVPFVTLCDPGFERSFEIIDTMIKNGADALELGFPFSDPLLDGPVIQAANKRALDGGYSTDSCFELIAKIRAKYPDIPIGLLLCANLIFVPIAEVFFQRCQQSGVDAVLIADLPVFAAQEFVPTAEKYGIQPVFICPPNADQNTIERIAQLTQGYTYLVSRAGVTSAENQAHASNLDNLVESLKQTGAAPILQGFGIAKPEQVKEALRLGADGAISGSAIVKIIERNLSNQANLLKELAEFVQVMKAATK >NZ_CP017484.1|WP_006248114.1|1503949_1504243_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MLMLITYDISFDDPEGQARLRRIAKHCLDYGVRAQYSVFECDVTPAQWVTLKNKLLATYNPDCDSLRFYHLGSKWRNKVEHHGAKPSVDIFKDTLIL >NZ_CP017484.1|WP_006250674.1|1504309_1505323_-|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MRKLQNTLYITSQGSYLHKERETLVVEQDRKKVAQLPIHSIGHIFCFGNVLVSPFLMGFCGENNVNLAFFTENGRYLGRLQGRQSGNVLLRRAQYKKSETNPVPVARNIIAAKIQASKRVLQRQIRNHGENADIQLAITALNYSLQQLKIADNLNLIRGIEGDAAARYFGMFSHLIKENSGFHFDGRNRRPPRDGVNALLSFLYSILGKDISGALQGVGLDPQIGFLHADRPGRDSLAQDILEEFRAWWVDRMVLSLINRGQVKPDDFVTEASGAVTLKPEARKLLFQTLQAKKQEKIIHPFLEEEVEIGLLPYIQAMLLARHLRGDLAEYPPFLMR >NZ_CP017484.1|WP_006250673.1|1505440_1506121_+|hypothetical-protein MKRRFLFKNYGPDDQTIIQAIQHSVEISRKNNNSNIHIVFPRKSDFESTNLGKIIDQILGAGSAKKLTKGESIGSLDLLLPSRINSSNSSGTILAVYCTSHDMHLIDSNSSADDIIFVSWLPDEANHWENTWHNHGLIIMKGETSLNIPQIPEEIVQSLTNLTAIINLSTGLSHPSDKKHAEQIFKELSQKGYKADEEQIASWAIAHGWNASHLSDLKKLVRRYLS >NZ_CP017484.1|WP_006250672.1|1506222_1506888_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MDDLQNSTEILPLVQPKFGYDKRSISLSALQHYAFCPRQCALIHNEQVWAENYLTAQGQVLHERVDSGEPETRKGIRFERTVHVAAEKLGISGILDLVERDLKTGELKPVEYKRGKPKPEPMDEIQLCAQALCLEEMTGQTINEGALWYMQTRHRLPITFSTELRTKTLATISEVRSLLNSGTTPLPKYSKRCKACSLIDLCQPQLLDRDRSERYVEEIFK >NZ_CP017484.1|WP_006250671.1|1506887_1507751_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2 MSIQNRYEFVFFFDVTNGNPNGDPDAGNMPRLDPETSKGLVTDVCLKRKIRNFIEMSYENEAGYEIYVKEKSVLNLQNKRAYEALGIESEAKKLPKEEAKAREITAWMCKNFFDIRTFGAVMTTEVNSGQVRGPVQLAFAQSIDPIIPLEVSITRMAVTNEKDLEKERTMGRKYIVPYALYRVHGFISAKLAEKTGFSDEDVQKLWQALQLMFEHDRSAARGEMAARKLIVFKHDSELGNQPAHKLFDSVKVERINGEKDTPAKDYDDYRISVQAEGLTGVTVEELL >NZ_CP017484.1|WP_006250670.1|1507760_1509545_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 MILSALTRYYYRLAAQEDRLTGEAKVPSYGFSEEKIGWVLELDSKGNLVNVISNLTEDKKPKPKLMSVPRPEKRTSGIKPNFLWDKTAYVLGIESNPDKATAKDQPINFAEKTFEAFKQYHLDLLADSNDEGLMAIRNFLQQWQPTHFAESICPREILDANVVFKLVGTSGYIHQREAAQTLWTSLLINQSDNAEKGLCLISGKLSPIQRTHPPIKGVFGGQSSGGSIISFNKESFTSFGKEQGSNAPVSEQAAFAYTTALNYLLRTEKHRLTIGDASTVFWAEADNTTQAEAAEGFFAALMTPPDDEQENQKIFEELQKISKGRPLAEISPELSENTRFYVLGLAPNAARISVRFWLDTTFGQLAKNLSEHWQDLALEPCAWKTPPSIWRLLLQTASLGKSENISPVLAGEMARAVISGHLYPMSLLSQLVTRIRADGDINGLRVALMKAVLQRKFRKGFIKEGVPMSLNKESDNQAYLLGRLFAVLERIQTQALGELNAGIADRYYGSASAVPFSVFPRLLSGAKHHLSRLRKDKGGMAVNLDKDLGEIIASLPENFPRHLSIDEQGRFAIGYYHQKQSYFAKKETTESIEN >NZ_CP017484.1|WP_006248107.1|1509541_1510219_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 MPNKIRLHIWGDYACFTRPEMKVERVSYDVITPSAARGILAAVHWKPAIRWVIDKIYVLQPIQFESVRRNELGSKISASKISGAMKRKTVADLYTVIEDDRQQRAATVLKNVGYVIEAHAVLTKMAGEAETVTKHIEMFKRRAKKGQCFQQPCMGVREFAANFALIDDDEPLPECFLAENERDRDLGWMLHDIDFEHGNQPRFFRAEMKNGVIDVPPFYAEEVKS >NZ_CP017484.1|WP_006250669.1|1510456_1512208_-|DUF87-domain-containing-protein MANETLNFKDNARLGRVVTVDTSRVLISVEEHQQMTSIAVGNLIAIQGRTASEYLIGIIERVTRSISEKLLLEEISNEGEIPLGESQDDFIKAVLIGTYKAVDGSLSNTFKRGADCFPQIDRDCFHISGSNLQLFMNLLSANVKENERLTLGHFMADETAVAIANGDKFFQRHAAILGSTGSGKSWSVALILERAAALKAANLIVFDMHGEYSTLCEGKNAIAQQYRIAGPGDLDGSDERSLFIPYWLLNREEMLALILDRSDDNAPNQAARFTEHVRALKEQTLNKEERNDVLETFTVDSPIPYSIELLLARLDKDNSEMVPKEGGSGTKQGPWYSKLSRFMGRMKAKIDDRRCGFMFQPPVECNSYGWLENMLSKLFSASESEKGIKIIDFSEVPSDVLPIVTGVLARLLYNIQFWMDKDSRHPLTIICDEAHLYLPVRDSAEAAEKRALEAFERIAKEGRKYGVSLLVVSQRPSDVSRTILSQCNNFLVLRLTNDQDQSVVKRLLPESMVGITDILPLLDLGEALLLGDSILLPTRIKLAKPHIAPESATRQFWSDWANQEPKPNAVSNAVEALRRQVRS >NZ_CP017484.1|WP_020824140.1|1512197_1513253_-|hypothetical-protein MREPLLDEDELKKWLQTIFTDNLVIIVGSGLSCAEGLPGMGALADRLKERMPECLDDIDKVTWNTISDCLDSEGLEGALLKHQANETIEAAIIKITAEYVLSEEQKAINKCIAENQKLKFSYLLPHISASNPKIARVITTNYDRLIEFAAEYENWGIDSMMVGRYWGKHNPDLSRKLQIRDIRVKGKCPKLVYRDHIKIFKPHGSLDWFMAGDVPMTSCIGKVEEPLIITPGVGKYKKGYGQPFDAHREKANEAIDSASSILCIGYGFNDDHLQTHLTGKIKSGVKTLLLTRGLSENARNVVKEAPNCKALIFDGDKAGTRVVSKQEETFIPNVHWWDVEFFVKEILENGK >NZ_CP017484.1|WP_006250667.1|1513383_1515672_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MEEHTIQSLYAHSGKLSDHSDWQTLLSHANNVGLLAAEFAAPFASQEIARCTGLLHDLGKYSERYQKRLHGGERVNHSTAGAKIAVERWGPLGKMMAFCIAGHHAGLANGSGEGKNRSTLTQRLQEQFGYGHKDLPVLDAIWQQELNLPEKLPLPPLKPSKNEPFFSYAFFIRMLYSCLVDADFLDTEAFYANLEKRPLERGNSPNLTALHQQFNQFIAQFRERITIQTPNTQEAQRKAEVNRLRSEILDYAVSQVKQETGLFSLTVPTGGGKTFTSMAFALEHAKQYGLCRIIYVIPFTSIIEQNAAEFRKAFGELGEEAVLEHHSTFDHDSLPDKSSRDKLKLASENWDAPVVVTTAVQFFESLFADRSSRCRKLHNIAGSVIILDEAQMLPLNLLRPIMAAIDELARNYQCSVVLCTATQPAIHQANGFYKGFENVREIAPNPTALFEKLKRTTVKHIGIQTDVELQSKLADNPQMLIIVNNRRHARALYDSAKQLEGAYHLTTLMCAKHRSQTLTEIRLRLKQNLPCRVIATSLIEAGVDVDFPLVMRAEAGLDSVAQAAGRCNREGKRLSVESNVWVFQPEEQWKAPPELGLLSGCMRSTVQVHADDLLNPKAINHYFQAVYEAKGKELDKPNILKACHDAGQSLNFPFQKIAEDFRMITSHLIPVIIPFDQEAENLIDRLRYADQVGGILRKLQPYTVQVPEKALAELYNAGRVETINETNFGKQFYCLIGMDLYDEVAGLSWENVDFLESEKLVL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017484_3 | 2080256-2080361 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017484_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017484_3
>3.1|2080284|50|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder AAGCATTTAAGCTCAAATTAATCTGACAGGCACTATAATTTTAAACGGGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017484_3
The CRISPR arrays of NZ_CP017484_3 >merge|NZ_CP017484|3|2080256-2080361|CRISPRCasFinder ACTGTCAGATTAGGTTTGATCTTCTACAAAGCATTTAAGCTCAAATTAATCTGACAGGCACTATAATTTTAAACGGGAACTGTCAGATTAGGTTTGATCTTCTACA >NZ_CP017484|3|3|2080256-2080361|CRISPRCasFinder ACTGTCAGATTAGGTTTGATCTTCTACA AAGCATTTAAGCTCAAATTAATCTGACAGGCACTATAATTTTAAACGGGA ACTGTCAGATTAGGTTTGATCTTCTACA
>NZ_CP017484.1|WP_020824074.1|2079184_2080225_+|IS481-family-transposase MFYSNNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNLKNRVDEAIEQAVVKFALDNPAFGQVRVSNELRKQGIFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLIALEKLVAEQGIILSETQVQALERKKEDEIACGEIETAHPGYLGSQDTFYVGNLKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKTAISAADMLNDKVLPYFESQGLPMLRILTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHSKTKVKHPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKKIYTDLTTLQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMATLLDGKRIWVEKNLSSN >NZ_CP017484.1|WP_006249749.1|2078461_2079022_+|hypothetical-protein MKKSFLSLLVLGTTMALAACDQAKEAAQSTTDKAVEVKEAVAEKAAEVKSATEAKVEELKAAANDAAQATADKTEEAKKAVAEKATELKTTTEAKVEELKAAANDAAQATTDKTEEAKKAVAEKAAELKATTEAKVEELKAAASDATQATADKAEEAKKAVAEKAAEVKVETETKVEEMKKAIESK >NZ_CP017484.1|WP_006251629.1|2075373_2078316_+|ribonuclease-E MKRMLINATQKEELRVALVDGQRLFDLDIESPGHEQKKSNIYKGKITRVEPSLEAAFVDYGAERHGFLPLKEISREYFPSDYVFNGRPNIKDIIQEGQEVIVQVSKEERGNKGAALTTFISLAGSYLVLMPNNPRAGGISRRIEGDERLELKEALDCLDVPEDVGLIVRTAGVGKSPEELQWDLKVLLHHWEAIKKAAESRPAPFLIHQESDVIVRAIRDYLRRDIGEILIDNKKVFEKAKNHIRLVRPDFINRVKLYEGEVPLFSHYQIESQIESAFQREVRLPSGGSIVIDVTEALTAIDINSSRSTRGGDIEETALNTNLEAADEIARQLRLRDLGGLIVIDFIDMTPVRHQREVENRIREATRQDRARIQFARISRFGLLEMSRQRLSPSLSEASSHICPRCQGTGKVRDNESIALSILRLLEEEAIKENTAQVHTIVPVQIASYLLNEKRKAISSIEKRHDVQIVVVPSESMETPHFSVYRLRENEITPTLSYDLTKHYEARNEEEHPHHHHQEDVLVTRNEPVITVESVLQSSELNLQPSPTPTEPPKPSLLSRLIATIKGWFSEEKVEEKPKPKARNQRDRRQRRERPNRNTKAENQERKTVQAQATPAEEKPVRSEKKARRAVVEEVSGVTEQESRSNSREVQTERRQRRDLRKKVRVETQDVEAENLTPAVEETVAKQVENVQKNQQIQPLATQELPVETVPVVETTNEGRENNRQRRLPRHLRVGNQRRRDNQRNQIASPMPLTSAVASPELASGKVWVQVTSTVKVEEKASFLSVDQMLEQQENQLVETEKKSEEKKLHTVSPLGGFVAQATNRDLVKEKQEQLSKPKEEKVASEDVKPVEVKEHIAPFGSVVAQHSERDLVKEKNERVSKFQSQATVAPAIVEEVTNPIEVPKSTYESDYRFNGRLGTFSRVEHTQAAMTIASAPSDKLEVVEISQWQNSKYYFYGKGFGGYTSAVSQVQSAPRSTNG >NZ_CP017484.1|WP_006251630.1|2074071_2074917_+|cysteine-hydrolase MMSQEQFEEINQERRQALNHGSRIAMAASVLGALGIASTANAKQASAEKSPYAEPEQYGLKRHGMTIDPKRVALVVVDPQIDFLSPKGVMWGVLGDSIKENNTVANIESLFKAAKAVDMPTFVSSHYYYPTDHKWEFGSPGEHFMHDSGMFARKGQYTMEGFENSGADFMPEYKPYIFDGKTVIASPHKIFGPETNDLVLQLRKRKIDQVILAGMAANLCIDSHLRELIEQGFEVTVVKDATAGPRIPEGDGYLAALTNYRIIANDLWTTEEAVKKMTAKA >NZ_CP017484.1|WP_006251631.1|2073120_2073945_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MDSLTHLFTQFQFRTDLFHLGQLCQIGTFNEENKGYLHFVRQGRFILNQAAERPITIERPAIIFSPTNILHSLHPLDDSGLDIFCINFDFGKGIRNPLTHTLHNIVILELAQYPELGVLADQIFSEVNQKGCGYQAMIHHLCAYFTLKVARQCLEKGYIQTGLLKGLADKQLGKVLLAIHSAPERDWNVEELANVALMSRSRFAAYFKQIMGVSPMDYLTNWRVAVAQHLLQKGIPVALVAEQVGYSHNAALSRVFMRELGLSPTEWLAQNKES >NZ_CP017484.1|WP_147010284.1|2071573_2073037_+|4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate-decarboxylase MKYKNLREFLDFLESQGELVRIQQEIDPYLEMTEIADRTLRKGGPALLFENPKGYQMSVLCNLFGTPKRIALGMGQEDTKALRELGKLLAFLKEPEPPKGFKDLIGQLPQWKQILNMPPKVLSKADCQQVVISGDEVDLYKLPIMHCWPGDVAPLVTWGLTITQGPYKKRQNLGIYRQQLIGKNKLIMRWLSHRGGALDFQEWKAENPGKPFPVSVAIGADPATILAAVTPVPDTLSEYAFAGLLRGHKTEVVKSISNELEVPASSEIVLEGYIDLEETALEGPYGDHTGYYNEQEYFPVFTVTHITMRKDAIYHSTYTGRPPDEPAVLGEALNEVFIPILQKQFPEIVDFYLPPEGCSYRLAVVTMKKQYAGHAKRVMMGVWSFLRQFMYTKFVIVCDDDVNARDWKDVIWAITTRCDPARDTTLIENTPIDYLDFASPIAGLGSKMGIDATNKWAGETSREWGTPIKKDDNVVKRIDEIWDSLGI >NZ_CP017484.1|WP_006251634.1|2070462_2071437_-|zinc-ABC-transporter-substrate-binding-protein-ZnuA MFKRTLIGLAVLGASVAQADVLTSIKPLGFIASAITEGVTETKVLLPVTASPHDYSLKPSDVTQLQSAQLVVWVGDGLEGFLEKSIEKLPKEKVLTLEDVDAIDDIVDKASKKEDKDDDHDHKHEHKHEHKHEHKHEGHNHEGHNHDHHGHSHDEDWHIWLSSEASELAAEQIAARLSEQMPEHKAKIAENLAKFKANLTAKKAEIAKQLEPVKAKGYYTFHDAYGYFEREYGLNSLGSFTINPTVAPGAKTLTAIKKNIAKNKAQCLFAEPQFTPKVIETLAKETKVNVGQLDPLGAKVQLSATAYPEFLQVLADEFSQCLTK >NZ_CP017484.1|WP_006249742.1|2070090_2070411_+|hypothetical-protein MIYPTCPECKSENTYHDSIQFVCPDCAYEWTGEETDQDDDVLIVKDSNGNLLSDGDDVLLIKDLKLKGSSEVLKKGTKFKGIRLAQGDHNVDCGKIMLKSEFLKKA >NZ_CP017484.1|WP_006249741.1|2067586_2069950_-|ribonuclease-R MIVDPNYQQELEKYENPVPSREFILNTIREHNAPMSRDELLSAFHIDDEERMEGIRRRLRAMENDGELVFTKGKRYALPEKMDLIKGTVIGHRDGYGFLQVEGHEKGATKSEDWFIPNAQMVKVMHGDFVLAQPNGTDRRGRKEVRIVRVLEARKKQIVGRFFLESGIGFVVPDDSRVNQDILIPDEHRMGARMGQVVVVELQERKASFSRPVGIITEILGDNLAPGMEIEIALRNHDIPHIWPEGVEKQIRQFSSEEVPEEAKQGRVDLRDLPLITIDGEDARDFDDAVFAKKEGNGWRLWVAIADVSYYVRPKTALDLEALNRGNSVYFPNRVVPMLPEVLSNGLCSLNPQVDRLCLVAEMSVSSKGELQDYQFYEAVMNSHARLTYTKVWKMLEGDEALRERYAPLVPHIEELYAMFQTLMKARHKRGAIEFETIENQFIFNPQGRIERIEPLIRNDAHKLIEECMILANIAAARFVEKANEPALYRIHDKPSEEKLLSFKSFVRECGLTWDVGLDPTPKDYGVLLEQIAERADKELIQTMLLRSLKQAVYAADNIGHFGLALTEYAHFTSPIRRYPDLLLHRAIKYLIEKGKGNTRYYTDGGGYHYKLDDMDEFGDKCSATERRADEATREVADWLKCEFMQDHLGEEFDGVISSVTGFGLFVKLNELLIDGLVHISTLDNDYYHYDADRQRLIGGSGIIYRLGDAVRVKVINVNLDEKKIDFELLTGNKKTGKTAKKKAKATEVPVFKEPKTVKKAKKVAEKKPAKSAKKRTKTTASKSRKK >NZ_CP017484.1|WP_006251635.1|2067316_2067583_-|hypothetical-protein MDYKKQILFSLLFALVIAIISYFLFTYIPFDCSDLSKLNDSQRLECRTAEVLGVYYWLPHTTTLFFGSVLLYWAVYGMISLVQAVLKR >NZ_CP017484.1|WP_006250397.1|2080567_2080813_-|(Na+)-NQR-maturation-NqrM METVLLTFGFFVAVIFAMSIGFIVKGKTIKGSCGGITALGMKKMCDCEEPCDNLKSKIADGTADPEEVARFNKEPQFYEVK >NZ_CP017484.1|WP_020824242.1|2080825_2081860_-|FAD:protein-FMN-transferase MKKFFLLLIAFFTLSACEKAPEQITLSGKTMGTTYTVKYIDNGEVENLISPEKMKNELDGLLIEVNNQMSTYQQDSEISRFNQAKQANQAVEISQDFAKVVQEAIRLNKVTEGALDVTVGPLVNLWGFGPDKRLNKVPSDEQIAERSAYVGIDKILLEMSSKPKLTKSAANLYLDLSSIAKGFGVDKLAEHLETIGVSNYLVEIGGELRGKGKNLQGLDWRIAIEQPVMTQGQAAQITVPLHNLAMATSGNYRNYFEDEKGNRLSHIIDPKQLRPVNHNLASITVFAPTTMTADGLSTGLFVLGAEKALAVAEREKLAIFLIVKNGDKFETQMSSEFSKLIQSQ >NZ_CP017484.1|WP_006250395.1|2081908_2082202_-|nucleotidyltransferase-domain-containing-protein MIDLTESQRQQVLDIFKKYLPDTPVWVFGSRIKGTAKAYSDLDLALITKQPLTIRQQTELELAFTDSDLPFTVDLIDWASCNESFKQIILQRYEVLI >NZ_CP017484.1|WP_006253177.1|2082194_2082629_-|hypothetical-protein MEQLDITALENAFNSLEKTIVSLENQAWFNRQEAIIQDTLIAGAIQKFEFVYELSIKMLKRQLKNIESNDTDIDSTEFRDILRMAAQYGLIESPEVWLDYRKMRNITSHTYDQNKAQQVYNGISNFLESTYFLVKQLQKRNSYD >NZ_CP017484.1|WP_006250393.1|2082740_2083970_-|NADH:ubiquinone-reductase-(Na(+)-transporting)-subunit-F MDSNFIFGIIAFTALVLVLAVIILFAKSKLVDSGDITISINNDPEKGITLPAGGKLLGALASKGIFVSSACGGGGSCGQCKVQVKSGGGEILPTELSHISKKEAKEGWRLACQVNVKSSMDVELPEEIFGVKKWECTVISNDNKATFIKELKLQIPEGEEVPFRAGGYIQIEAEPHTVHYKDFDIPKEYHEDWDKFDLWRYTSKVDEHIIRAYSMASYPEEKGIIMLNVRIATPPPRNPDVPPGQMSSYIWSLKPGDKVTISGPFGEFFAKDTDAEMVFIGGGAGMAPMRSHIFDQLKRLKSKRKMSFWYGARSEREMFYVEDFDGLQAENDNFKWYVALSDPLPGDREDYFRGFIHNVLYENYLKNHEAPEDCEYYMCGPPVMNAAVIGMLKSLGVEDENILLDDFGG >NZ_CP017484.1|WP_020824243.1|2083980_2084577_-|NADH:ubiquinone-reductase-(Na(+)-transporting)-subunit-E MEHLLSIFVKSVFIENMALSFFLGMCTFLAVSKKVSTAFGLGIAVIVVLGIAVPANQLVYTHVLKEGALVEGVDLSFLNFITFIGVIAALVQILEMILDKFFPALYSALGIFLPLITVNCAIFGGVSFMVQREYNFVESVVYGVGAGTGWMLAIVALAGLTEKMKYSDVPAGLRGLGITFITVGLMALGFMSFSGIQL >NZ_CP017484.1|WP_006250391.1|2084578_2085205_-|NADH:ubiquinone-reductase-(Na(+)-transporting)-subunit-D MADNNNLKKLLLSPIVDNNPIALQILGICSALAVTTQLQTAVVMAIAVSLVTAFSSMFISMIRNYIPNSIRIIVQMAIIASLVILVDQILRAYAYDLSKQLSVFVGLIITNCIVMGRAEAFAMKSGPVESFVDGIGNGLGYGAMLIIVAFLRELIGSGKIFGITILETVQNGGWYQANGLFLLAPSAFFIIGFVIWAIRTWKPEQVEK >NZ_CP017484.1|WP_006250878.1|2085204_2085978_-|Na(+)-translocating-NADH-quinone-reductase-subunit-C MAKFNKDSVGGTLTVVVLLSLICSLIVAGAAVMLKPTQDIQKQLDKQKNILQAAGLLQKDTNVQETYTKFIEPKIVDLATGDYVEGVTGFDARAAAKDPAQNVVIAPEDDKANIKTRAKYAEVYLVKDESGKTTQVVLPMHGNGLWSIMYGFVAVQPDANTVNGITYYEQGETAGLGGEIVNPNWQKNFVGKKLYNEQNQVALRVGKGASADKDHGVDGLSGATLTSNGVDGSFKYWFGQNGFGPYLAKFKAAAGAN >NZ_CP017484.1|WP_147010286.1|2085970_2087206_-|NADH:ubiquinone-reductase-(Na(+)-transporting)-subunit-B MGLKNLFEKMEPAFHKGGKYEKWYTLFEAAYTIFYTPGTVTRKDAHVRDAIDSKRMMLIVWLALFPAMFYGMYNVGAQGILAALKMGTLTDLVANNWHYSLADSLGSVADAGWGTKMLLGATYFLPIYLTVFAVGGFWEVVFAMVRKHEINEGFFVTSILLALIVPPTLPLWQAALATTFGVVVVKEVFGGVGKNFMNPALAGRAFLFFAYPGQISGDAVWVAADGFSGATALSQWAVGGQGALQHVATGETITWMDAFLGNIPGSIGETSTLMLIIGAAIIVFARIASWRIIAGVMIGMAATATLFNVIGSDTNPLFSMPWHWHLVLGGFAIGMFFMATDPVSAAFTNKGKWAYGILIGFMCVLIRVVNPAYPEGMMLAILFANLFAPIFDYLVVQGNIKRRLARVANNG >NZ_CP017484.1|WP_006250388.1|2087208_2088567_-|Na(+)-translocating-NADH-quinone-reductase-subunit-A MITIKKGLDLPIAGKPEQVIHNGNTVTEVAMLGEEYVGMRPSMKVREGDVVKKGQVLFEDKKNPGVVFTAPASGTVTAINRGEKRVLQSVVIKVEGDEQITFARYEASQLASLTSEQVKQNLVESGLWTAFRTRPFSKVPALDAEPSSIFVNAMDTNPLAANPEVIIAEHQQAFFDGLTVLSRLFESKKVIHLCGSADSNILNAAQSRQINNVETNRFKGPHPAGLSGTHIHFIDPVGATKQVWYLNYQDVIAIGKLFTTGELFTDRVVALAGPQVKNPRLVRTRLGANLSQLTANELNAGENRVISGSVLSGAIATGVHDYLGRYALQVSALLEGREKAFFGMIAPYSDKYSITRTTLGHFAKKLFNFTTAVHGSERAMVPTGAYERVMPLDIIPTLLLRDLAAGDTDSAQALGCLELDEEDLALCTFVCSGKNNWGPLLRQALDKIEKDG |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017484_3 | 3.1|2080284|50|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder | 2080284-2080333 | 50 | NZ_CP017484.1 | 697669-697718 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017484_3 | 3.1|2080284|50|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder | 2080284-2080333 | 50 | NZ_CP017484.1 | 1706283-1706332 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017484_3 | 3.1|2080284|50|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder | 2080284-2080333 | 50 | NZ_CP017484.1 | 1240270-1240319 | 1 | 0.98 |
1. spacer 3.1|2080284|50|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder matches to position: 697669-697718, mismatch: 0, identity: 1.0
aagcatttaagctcaaattaatctgacaggcactataattttaaacggga CRISPR spacer aagcatttaagctcaaattaatctgacaggcactataattttaaacggga Protospacer **************************************************
2. spacer 3.1|2080284|50|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder matches to position: 1706283-1706332, mismatch: 0, identity: 1.0
aagcatttaagctcaaattaatctgacaggcactataattttaaacggga CRISPR spacer aagcatttaagctcaaattaatctgacaggcactataattttaaacggga Protospacer **************************************************
3. spacer 3.1|2080284|50|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder matches to position: 1240270-1240319, mismatch: 1, identity: 0.98
aagcatttaagctcaaattaatctgacaggcactataattttaaacggga CRISPR spacer aagcatttaagctcaaattaatctgacagacactataattttaaacggga Protospacer *****************************.********************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017484_2 | 2.1|1503163|35|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder,CRT | 1503163-1503197 | 35 | NC_028853 | Mannheimia phage vB_MhS_535AP2, complete genome | 31900-31934 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017484_2 | 2.1|1503163|35|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder,CRT | 1503163-1503197 | 35 | KP137439 | Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome | 33856-33890 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017484_2 | 2.1|1503163|35|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder,CRT | 1503163-1503197 | 35 | NC_028956 | Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome | 33963-33997 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017484_2 | 2.3|1503297|34|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1503297-1503330 | 34 | NC_028853 | Mannheimia phage vB_MhS_535AP2, complete genome | 34963-34996 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017484_2 | 2.3|1503297|34|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1503297-1503330 | 34 | KP137439 | Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome | 36919-36952 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017484_2 | 2.3|1503297|34|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1503297-1503330 | 34 | NC_028956 | Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome | 37026-37059 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017484_3 | 3.1|2080284|50|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder | 2080284-2080333 | 50 | NC_007800 | Bibersteinia trehalosi plasmid pCCK13698, complete sequence | 913-962 | 1 | 0.98 |
NZ_CP017484_3 | 3.1|2080284|50|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder | 2080284-2080333 | 50 | NZ_CP018033 | Glaesserella parasuis D74 plasmid pD74, complete sequence | 6036-6085 | 2 | 0.96 |
NZ_CP017484_3 | 3.1|2080284|50|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder | 2080284-2080333 | 50 | NZ_CP054196 | Glaesserella parasuis strain YHP170504 plasmid unnamed2, complete sequence | 1676-1725 | 2 | 0.96 |
NZ_CP017484_3 | 3.1|2080284|50|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder | 2080284-2080333 | 50 | NC_006829 | Haemophilus parasuis plasmid pHS-Rec, complete sequence | 8881-8930 | 2 | 0.96 |
NZ_CP017484_1 | 1.1|1045853|29|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder | 1045853-1045881 | 29 | MH791397 | UNVERIFIED: Enterococcus phage EfsSzw-1, complete genome | 22354-22382 | 5 | 0.828 |
NZ_CP017484_2 | 2.1|1503163|35|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder,CRT | 1503163-1503197 | 35 | NZ_CP020003 | Bacillus thuringiensis strain Bacillus thuringiensis L-7601 plasmid unnamed1, complete sequence | 42539-42573 | 10 | 0.714 |
NZ_CP017484_2 | 2.2|1503230|35|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder,CRT | 1503230-1503264 | 35 | NZ_CP054028 | Rhizobium sp. JKLM19E plasmid pPR19E01, complete sequence | 627317-627351 | 10 | 0.714 |
1. spacer 2.1|1503163|35|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028853 (Mannheimia phage vB_MhS_535AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aattgcctgtacatcaacataaccacaaacacgga CRISPR spacer aattgcctgtacatcaacataaccacaaacacgga Protospacer ***********************************
2. spacer 2.1|1503163|35|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder,CRT matches to KP137439 (Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aattgcctgtacatcaacataaccacaaacacgga CRISPR spacer aattgcctgtacatcaacataaccacaaacacgga Protospacer ***********************************
3. spacer 2.1|1503163|35|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aattgcctgtacatcaacataaccacaaacacgga CRISPR spacer aattgcctgtacatcaacataaccacaaacacgga Protospacer ***********************************
4. spacer 2.3|1503297|34|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_028853 (Mannheimia phage vB_MhS_535AP2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gtttcagcacttgctcgtctgtctagatgtaagc CRISPR spacer gtttcggcacttgctcgtctgtctagatgtaagc Protospacer *****.****************************
5. spacer 2.3|1503297|34|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KP137439 (Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gtttcagcacttgctcgtctgtctagatgtaagc CRISPR spacer gtttcggcacttgctcgtctgtctagatgtaagc Protospacer *****.****************************
6. spacer 2.3|1503297|34|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gtttcagcacttgctcgtctgtctagatgtaagc CRISPR spacer gtttcggcacttgctcgtctgtctagatgtaagc Protospacer *****.****************************
7. spacer 3.1|2080284|50|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder matches to NC_007800 (Bibersteinia trehalosi plasmid pCCK13698, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.98
aagcatttaagctcaaattaatctgacaggcactataattttaaacggga CRISPR spacer aagcatttaagctcaaattaatctgacagacactataattttaaacggga Protospacer *****************************.********************
8. spacer 3.1|2080284|50|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018033 (Glaesserella parasuis D74 plasmid pD74, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.96
aagcatttaagctcaaattaatctgacaggcactataattttaaacggga CRISPR spacer aagtatttaagctcaaattaatctgacagacactataattttaaacggga Protospacer ***.*************************.********************
9. spacer 3.1|2080284|50|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP054196 (Glaesserella parasuis strain YHP170504 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.96
aagcatttaagctcaaattaatctgacaggcactataattttaaacggga CRISPR spacer aagtatttaagctcaaattaatctgacagacactataattttaaacggga Protospacer ***.*************************.********************
10. spacer 3.1|2080284|50|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder matches to NC_006829 (Haemophilus parasuis plasmid pHS-Rec, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.96
aagcatttaagctcaaattaatctgacaggcactataattttaaacggga CRISPR spacer aagtatttaagctcaaattaatctgacagacactataattttaaacggga Protospacer ***.*************************.********************
11. spacer 1.1|1045853|29|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder matches to MH791397 (UNVERIFIED: Enterococcus phage EfsSzw-1, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
tctttataccctagattagtatcaggtct CRISPR spacer gccttataccctagattattatgaggttt Protospacer *.*************** *** ****.*
12. spacer 2.1|1503163|35|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020003 (Bacillus thuringiensis strain Bacillus thuringiensis L-7601 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
aattgcctgtacatcaacataaccacaaacacgga CRISPR spacer tctcttttgttcatcaacataaccataaacacgat Protospacer *. ..*** **************.*******.
13. spacer 2.2|1503230|35|NZ_CP017484|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP054028 (Rhizobium sp. JKLM19E plasmid pPR19E01, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tcgaaaatcttccacgcatttacgccgatgtcagt CRISPR spacer aagaaaatcttccacccatttacgctgatcctttg Protospacer ************* *********.*** ..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
696648 : 746829
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017484|696648:746829|DBSCAN-SWA CATGTTTTATTCTAACAATCCCCTTATTAAACACAAGACCGGTTTATTAAATTTAGCAGAAGAACTGGGCAATATCTCTCAAGCCTGTAAGGTGATGGGGATGAGTCGAGATACATTCTATCGTTATCAACAAGCGGTTGAGCAAGGTGGTGTTGAAGCATTGCTGAATCAAAATAGACGCGTTCCCAACTTAAAAAATCGTGTTGATGAGGCAATAGAGCAAGCTGTTGTGAAGTTTGCTCTTGATAACCCGGCATTTGGACAGGTAAGAGTGAGTAACGAACTCCGTAAACAAGGCATCTTTGTTTCAGCAGGAGGTGTACGTTCGATTTGGTTATGTCATCATCTTGCCAATTTTAAGCAAAGATTAATCGCCCTGGAAAAACTGGTTGTAGAACAAGGTATTATACTCAGTGAAACACAGGTACAAGCCTTAGAGCGTAAGAAAGAAGATGAGATTGCCTGTGGTGAAATTGAAACAGCACACCCTGGCTATCTTGGCTCACAAGATACTTTCTATGTGGGCAACCTCAAAGGAGTGGGCCGTATTTATCAACAAACGTTTATTGATACTTACAGTAAAGTGGCATTTGCAAAACTTTATACAATGAAGACCGCTATCAGTGCTGCGGATATGCTGAATGATAAAGTGTTACCATACTTTGAAAGCCAAGGTTTACCGATGTTACGCATATTAACTGACCGAGGAAGTGAATATTGTGGCAAGGTGGAAAATCACGATTATGAGCTTTATTTAGCGATAAATGACATAGAGCATACGAAAACGAAAGTGAAGCATCCCCAGACGAATGGTATCTGCGAACGCTTCCATAAGACGATTTTACAAGAGTTTTACCAAGTCGTATTTAGGAAGACAATTTATATGGATTTAGTGACATTACAAGCGGATTTAGATGAATGGTTAATGTATTATAATCATCATCGAACTCATCAAGGAAAAATGTGCTGCGGCAGAACACCGATGGAAACATTACTTGATGGAAAACGGATTTGGGCGGAAAAGCATTTAAGCTCAAATTAATCTGACAGGCACTATAATTTTAAACGGGAACTGTCAGATTAGGTTTGATCTTCTACAAATTATCCTTATATCACACAACAACTTGCAAGTTTTAATTTATATAAAATGTATCAGGCTTTCCCTATGTTAATGGATAGTCGATTTAATCAAATTCACTTTCAATCGACTCAACCTATTGTAAATGGAGAACTCTTTTTCCGTTATATTGAGCATTATAGAGAAAGCTATATTTTCTTATTTGATAAGCAGAAAGGTTTTTTGACAAATTCTAAGATTTTTTCAGGGAAATTGAGAGACTATGATAATAATTTGTTAAGGTATATTGATGAATATACCGGAGCTTATCGAATCGGTGATAAATATATTAAAAATTTATTTAAATGTTTGATAATTCTCTACTATGATAAATTTGGTACGGAAAATCTCATTCAAGCCGTAGAAAAATGCTTTAAGTGGAGCTATCGGATTCGTTTAATGCAAAGTAGGATATTATATCGAACTATAGAAAATGAAGTTCATTATATGCATAGCTTATTTACTCATCTTGTCAGAAGTGATAATTCACGAGAATTTCTAGAATTTATGATAGATAGATTTAAGTTTGAGTGCTATCAAGATCAGAAAATTGGACTAAGTAACTTACTGGAAGATTTGGAGAAAAAAGATGAACAAAAAACAAGTTAAAACACTATATGTAAAAGATCTATGTAATATTGATAAATATATTGTACCTATCTATCAGCGTAACTATGCTTGGGGAAGAGGTGAAATTGAATTACTGATTCAAGATATTGAAGAAGCTCAGAAAAAAGAAGAAATTCAGAAAGAATCAGAAAAGCACCGTTACTATATTGGTAGTTTAGTAGTATCTAAACGATCTGATGGCTACGAAGTTATTGATGGACAACAACGATTAACGACTTTAAAACTATTGTTAAGTTATTACAATCTAAAATATTCAGAACAAAAGCATATTAATCTGACTTTTGAACATCGTGAAGCATCTAACTACAGCTTATCAAACCTCACAAATAGTTCAAAAGAGAGTGATAGCATCAGGTTGGGTTATCAAATTATCTCCAATATACTGGAACAGAAAGCTAACCTATCTGGAAAAGAAAATTTAGATATTAAAGAGTTCTTCACATTCTTGCTAAATAATGTTGTTATTCTCAGAACAGAAGTACCAGAAGATACGGATCTTAATCATTATTTTGAAATTATGAATAATCGTGGTGAACAGTTAGAACATCACGAGGTTTTAAAAGCAACGCTGATGTCCTCATTGAAGGATTATAAAGAAAAGAAACTGTTTGCTTTAATTTGGGATGCTTGCTCGGATATGAGTGTTTATGCGATTAAACGCTTTCCTAGTGATATTAGAACAAGCAATGAATTTTTTGGAGAACATTGTCATCAAATACCATTATGTTTTGATAATATGAGAAATAAATTATCGGAAGTTTTAGAGAGGAAATCTGATGAAGGTAATGGAGAAAATACGAATAAAGATGAAGATGATAAGAAAAAGATTATTTCGTTATTAAATAGAAAGTATGTTGAAAATAAAAATGAAGATAATAAAAAAGGTTATGATGAAATTAAAGATGGAAAATTTAACTCTATTATTGACTTCCCTAATTTTCTAATGATTGTTTTAAAGATTTATAAAAAAGGAAGTGATGTAAAGCTTAATGACAAAGAGATGATAAGTGAGTTTAGAAGTCTAGAGAAAGATGAAATAATTGAATTTTCTTTATGCTTGCTAAGATGTCGTTTGCTCTTTGATAGATATATCATCAAGACTAAGGATGATGAAGATGATTGGCTATTATTAGGTTTAAAAAAATATGATGATGGGAACTTTAAAGAAATAAGTTCTTTCAGTAGAGCATTTAGAAAAGATGATGGTTCGGATAATGATGAACCTGCAAGTGATGTAAAAGAATACAAGTTAGATAATTATTATCAGTATATCATTCATATTTTGTCTATGTTTCATACTTCGTTCAGGTCAAAAATTTATAAAAATTGGCTTTTTGATGTGTTGTATAAGATTAGTGAACATCCGTCCATTAAAGGTAGTTATAACTTAAAGGATGATGTGTATTTAACTATTTTAGAGGAAATAGCTGATAAACATTATAAAAAGAATAAATCTGATGCTCCTAATTTTTTTGAGAATGGTCAATCAACTCCTCACTATATTTTTAATTATTTAGATTATCTTTTATGGAAAAATTGGGATAAATATCTAGATAAGAAGGAGAATATATTTATAGAAAAGAATCAGTTTAGATTTTCTTTGTCACGAACATCAATAGAACATTACCTTGCTCAAAATAGAACAAGTGATTCAATAGTTCACAATTTTGGTAATCTTTGTTTGATTTCTCCACATCAGAATTCAGCATTAAGTGATTATGAAACGACTACAAAGAGAAGTTTTTATGAGGGAGCAAGTAAACGTTTCGATTGTATGAGTTTAAAACAAGCTATTATGCTTTCAAAAGAAAACTGGACAGAGAAGGATATAGAAGAACATTGCGAGGATATGAAAAAACTTTTAGATACTAAGCCTTCTCAGAATAAATAAATTTTCACAAGCGGTGCAACTTTGCAAAAACTTCGGTATTATGTAGCAGTTGCACAAAACCCCAAATTCATTAAAACCGCTTAAAAATGAAATGCCCTAAACTGATTTTTCAGTCTAGGGCATTTATTATCACATATTATGGTTAATAGGGAAAACTCACATCATTGTTATGCTGGTGATATTTTTGCCAAAATGCGTGATATTGTTTTTTCACCGATGTGTTTAATAAAAACGGGATTATCAAGACATAGGTCGGGCAATTCCATAGCATTGCACGTTGTGTATCCGTGCCGATTTTGGTGCGTAAGTAACCAAACTGATACATTAGACCCAATCCAACCGTCACCCATTCTAATAGCATAATAACTAAGGTCGCATCATTAAATTAAAAGCTCATTTTTTGCAAAAAATTTCCCAAATTCCACCGCTTGTTGGCGTACAATAGGCATAATTTTGATTTACGATGGAGGCAGAATGTCTGAACCGATAAAACTTACGCAGTTCAGCCACGGGGCGGGTTGAGGCTGTAAAATTTCGCCTAAGGTGTTAGGGACAATTTTACAAACTCAATTAGAACAATTTGTCGATCCGAATTTATTGGTAGGCAATGAAACGGCGGACGATGCTGCCGTCTATGATTTAGGGAACGGGCAGGCCATTATCAGCACCACCGATTTCTTTATGCCGATTGTGGACGCCCCGTTTGATTTCGGGCGAATTGCTGCTGCCAATGCGATTAGCGATATTTATGCGATGGGTGGCAAGCCGATTATGGCGATTGCGATTCTGGGCTTTCCGGTGAATAAATTGCCGGCTGAAGTGGCTCAACAAATTGTCGAAGGTGGGCGTTTTGCGTGCCAGCAAGCCGGTATTGCCTTGGCGGGCGGGCATTCGATTGATTCGCCCGATCCGATTTTCGGCTTGGCTGTTACCGGCATTGTGCCGACCGAACGGGTGAAACGCAATGCCTCTGCGGTGGCTGGGTGTGAGCTGTTTTTAACCAAGCCTTTGGGGATTGGCATTCTAACCACGGCAGAGAAAAAAGGTTTGTTGAAGCCTGAACATCAACATCTGGCAAGCGAGGTAATGTGCCAAATCAACTTGATTGGTTCAGCGTTTTCCGAACTGCCTGAAGTCACGGCAATGACTGATGTAACCGGTTTTGGCTTACTCGGGCATTTAAGCGAGGTGTGTCAAGGCTCGGGCTTACGGGCGGAGGTTGATTTTGAGGATATTCAAGTCCTTGATGGCACTAAGGAGTATATTGCATTGGGAGCAGTTCCGGGTGGGACAAATCGCAATTTCGACAGCTATGGGCATTTGATTTCGGCAATGACGGACGAGCAAAAAGCGATTTTGTGC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61 | Mannheimia_phage(79.17%) | terminase,head,integrase,plate,transposase,tail | attL 745648:745707|attR 751732:752147 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
999509 : 1006294
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017484|999509:1006294|DBSCAN-SWA 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CATTCAAGGATTTATAGTGTGTTTTGGCTTAATTGTCTCTATTGGCGCACAAAATGCCTTTTTATTAAAGCAAGGGATTTTAAAACAACACATATTTTGGATTGCATTGCTCTGTTTTTTAGGTGATGTATTTTTAATGACGATAGGTGTGCTAGGCTTAGGCACGTTAATTGCGGAATTGCCTGTTGTAAGTTTCATTATTTCGCTTTTAGGGGCCATTTTTCTATTAAGCTACGGTAGCCGTTCATTTATCAGCGTATTTAAAAGTGGTGAATACCTTGTGGCAAGTGGAGAGAATGCAACGAGCTTAAAAAAGGCTTTACTGATTACCTTTGCGATTACATTCTTAAATCCTCACGTTTATATTGATACGGTTGTGATTGTAGGCAGTATCGGTGGGAAATTAGATTTTAACGGTAAAATATACTTTTTAGCAGGTGCATTACTTTGCTCATTTATTTGGTTTTTTGGCATAGGTTATGGAGCAAGCTTACTTTCCCCTTATTTTGCAAAGCGAAGAACTTGGCAAATTTTAGATGCTGTTACCGGGCTAATTATGTACTTTATCGCTTTTAGTTTACTGATTTATACTTATCAACTTGCTCTGCAAATTTTCTAGTGGAGTTTAAATTTTTTCATTGATGAATGACGGGCTTTTTTGCTATATTAGTAGCAATGTTCGAACTATAAAATGTGCTTATTTTTGAATAATTTTATTTTAACGGATTCTTTTATGTTTAAAAAATTTTTAGGATTATTTTCAAACGATCTTTCTATCGATCTCGGGACAGCAAATACACTGGTTTATGTTAAAGGTCAAGGTATTGTGCTAGATGAACCCTCAGTGGTTGCTGTACGTCAAGATCGTATGGGATCGCTAAAAAGTATTGCGGCGGTAGGCTCACATGCAAAATTAATGCTAGGCCGTACACCAAAAAGCATAATGGCGATTCGTCCAATGAAAGATGGTGTCATTGCGGATTTTTTTGTAACAGAAAAAATGTTGCAACACTTTATTAAACAAGTACATAGTAATAACTTTATGCGCCCAAGCCCTCGTGTATTAGTGTGCGTGCCAGCAGGTGCAACACAAGTGGAACGCCGTGCAATTAAAGAATCTGCAATTGGAGCAGGAGCGCGTGAAGTCTATTTAATTGAAGAGCCAATGGCGGCTGCAATCGGTGCAGGTTTGCCGGTTCACGAAGCAATGGGATCAATGGTAATTGACATTGGTGGCGGTACAACCGAAGTGGCAGTGCTTTCTTTAAACGGCATTGTGTATTCAACTTCTGTGCGTATTGGTGGTGATAAGTTAGATGAAGCTATTATTGCTTATGTACGTCGTCATTTTGGTTCTGCTATTGGTGAAGCAACGGCAGAGCGAATTAAACAAGAAATTGCTAGTGCTAAGATTGAATCCGATGATGATGTTAAAACAATGGAAGTACACGGACACAATTTAGCTGAAGGCGCTCCTCGTACTTTCGAGCTTAACTCAAGACATGTATTAGAAGCAATTGAACAACCATTAAATGGTATTGTAGAGGCAGTTAAATCAGTCTTAGAGCAATGCCCACCTGAATTGGCAGCAGACATTTTTGAGCGCGGTATGGTGTTAACAGGAGGTGGTGCATTATTACATAATTTAGATCGTTTACTTTCTGATTCAACTGGCGTGCAAGTCGTAGTAGCAGAAGATCCATTAACTTGTGTAGCTCGTGGTGGTGGTAAAGCATTAGAAATGATCGATATGCACGGTGGTGATGTATTTAGTATTGATGATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017484|999509:1006294|1002186_1002789_+|WP_006248950.1|DBSCAN-SWA METLIEFFSSYGYWAVFLVLLACGFGVPIPEDITLVSGGVISGLGYTNVHWMLVVSMLGVLVGDSTMYWLGRIYGEKILKFPLIRNVATPERFATVQERFEKQGWKLLFMARFLPGLRAVVYLVSGITRKVSFVKFLLVDFCAAIISVPIWVYLGDYGASNLDWLKEQVANGQHLIFAILGIVILFLGWKWYKNKKQYKK >NZ_CP017484|999509:1006294|1003150_1003732_-|WP_006248952.1|DBSCAN-SWA MRLCDTDIKRYLDEGIIAITPRPSDDKISGATADVRLGNSFRVFREHKTPYIDLSGPREEVAAQLNKVMSDEIIIGDDEAFFLHPGDLALATTLESVSLPANIVGWLDGRSSLARLGLMVHVTAHRIDPGWEGKIVLEFFNAGKLPLALRPNMAIGALSFEILSGDAAKPYNARKDAKYKNQQSAISSRINQD >NZ_CP017484|999509:1006294|1004497_1005127_+|WP_006248954.1|DBSCAN-SWA MDIFIQGFIVCFGLIVSIGAQNAFLLKQGILKQHIFWIALLCFLGDVFLMTIGVLGLGTLIAELPVVSFIISLLGAIFLLSYGSRSFISVFKSGEYLVASGENATSLKKALLITFAITFLNPHVYIDTVVIVGSIGGKLDFNGKIYFLAGALLCSFIWFFGIGYGASLLSPYFAKRRTWQILDAVTGLIMYFIAFSLLIYTYQLALQIF >NZ_CP017484|999509:1006294|1003746_1004394_-|WP_006248953.1|DBSCAN-SWA MTDTSQTSSCVVIAIAGASASGKSLIASTIYKELKNELGTDNIGIISEDAYYRDQSHLTMEERIKTNYDHPNSMDHHLLVEHLRQLKQGNAIEIPEYDYTEHNRKTTTKHFEPKKIIILEGILLLTDENIRNEINVSIFVDAPLDICFIRRLQRDMVERGRSMESVISQYRKTVRPMFLQFIEPSKQYADIIVPKGGKNRIAIDILKAQIKQLLK >NZ_CP017484|999509:1006294|1002917_1003073_-|WP_006248951.1|DBSCAN-SWA MLHYAVVFFVIAIIAALLGFGGIAGSATEIAKILFFVFLILTVISFFFKKK >NZ_CP017484|999509:1006294|1000301_1001030_+|WP_006252001.1|DBSCAN-SWA MQRDTLFSAPIEKLGDFTFDESVAEVFSDMIQRSVPGYSNIITAIGMLAERFVTDNSNVYDLGCSRGAGILSIRRNVNAKNVQIIGVDNSQPMVERCKTHLSAYHSEIPVTILLDDIRHIEIKNASMVVLNFTLQFLPREDRLALLQKIYQGLNANGILVLSEKFTFESEEMNELLIDLHHTFKRANGYSELEVSQKRNALENVMRTDSIETHKKRLQEAGFTQVELWFQCFNFGSMIAIKA >NZ_CP017484|999509:1006294|1005241_1006294_+|WP_006248955.1|DBSCAN-SWA MFKKFLGLFSNDLSIDLGTANTLVYVKGQGIVLDEPSVVAVRQDRMGSLKSIAAVGSHAKLMLGRTPKSIMAIRPMKDGVIADFFVTEKMLQHFIKQVHSNNFMRPSPRVLVCVPAGATQVERRAIKESAIGAGAREVYLIEEPMAAAIGAGLPVHEAMGSMVIDIGGGTTEVAVLSLNGIVYSTSVRIGGDKLDEAIIAYVRRHFGSAIGEATAERIKQEIASAKIESDDDVKTMEVHGHNLAEGAPRTFELNSRHVLEAIEQPLNGIVEAVKSVLEQCPPELAADIFERGMVLTGGGALLHNLDRLLSDSTGVQVVVAEDPLTCVARGGGKALEMIDMHGGDVFSIDD >NZ_CP017484|999509:1006294|999509_1000292_+|WP_031200389.1|DBSCAN-SWA MTEKSQLNFNYQPSNNHANAQTMIFLHGLFGDLNNLGAIAKPFAERYSILMVDLRNHGRSFHSDEMNYALIAQDLAQLLTELNIQNAIVVGHSMGGKSAMALAAFAPELVEKLVVIDIAPVTYTQNRHQQVMAALFAVKEAKPQNRQQAKAIMAEYIRDEGVQQFMLKSFDAQSEQSFRFNLQALKDNYQNVMGWQQVFVDKPTLFIKGALSDYIQAEHTQTILAQFPQAKSFIVANADHWVHAEKTETVVRAINKFLEK >NZ_CP017484|999509:1006294|1001165_1002185_+|WP_006248949.1|DBSCAN-SWA MATIKDVAKYAGVSTTTVSHVINKTRFVAEDTTKAVWEAIKALNYSPSAVARSLKINTTKSIGMIITTSESPFFAEIVLAVEEFCYSKGYSLFLCNTQNKLEKIQNHLDMLIKKRVDGILVMCSEYTANSFDIFENSNIPMVIMDWGRSDERSDIILDHGVEGGYIATQHLIENGHQDIAVITGNRDKEIARTRFEGFKKALSEAGLSIREEWIQEGDFEPEGGYECMNNLLKSSEKLPTAVFCFNDSMALGAISAITEKGLNVPQDISVIGYDNVHSSRFYAPPLTTIHQSKSRLGSAALELLLERIEDNENAKEPKVLEFFPELVKRKSVRNLNIKE |
9 | Mycobacterium_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1316042 : 1393529
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017484|1316042:1393529|DBSCAN-SWA ATTAATCACGAAGTACCGCATTGAAACGTGTTGCTAATTCAGCTAATACCGCTTGAATTACCGCATTGATTTCATTTTCTTCTAATGTTTTTTCATTATCTTGAACCGTTAAGCTAATGGCTAAACTCTTCTTACCACTTTCTAAATTCGAACCACGGTAAACGTCAAATAAATTTACTGCCACTAATTTATTACCACCAGCTTTACGACAAGCCTCTAACACCTCACCTGCAGGAACAGATTCATCAACCACTACCGCAATATCACGGTTATTTGCAGGAAATTTAGAAATTTCGCCCGCTTGTGTAACCGGACGCTCTGCAATAGCTGATGCTAGAATTTCACATACAATCGGTTTGCCTTTAATGCCAAACTTTTGCACAATTGACGGGTGAACAGTTCCGATAAAACCAATTTCTTTGCCATCAAGCATAATCGCAGCCGATTGCCCCGGGTGTAATGCTGGGAACTGTTTTGCGACAAATTGCAGATCGTGGCGGATAGCGGTTAAAGAAAGAATACGCTCAATATCGCCTTTTAAATCAAAGAAATCGGCTGCTTCTGATTTGTTTTCCCAATGTACCGGACGTTTATCGCCTACAATCGCCGCACCAAAAACAAATTCTTGACGCACGCCTGATTCCGCATTGCTATCCGGAATAAAACGTAGACCTGCTTCAAAAATACGCACACGGTTTTGCTGACGGCTTTGGTTATACACGATAGTGTCCAACAAACCGGTTAAAAGAGAAACACGCATTGCCGACATTTCACTTGAAATCGGGTTTGGTAAAATCAAGGCTTCTTGCTGTGGGTGCAATAATGATTGTTTTTTCGGATCAACAAAGCTATAAGTAATCACTTCTTGGTAATCACTATCTACCAATGCCATACGAATACGGTTTGCTTCCAGTAATTTTTCCGGCGTACCTTTCATCGTTAAATGAGCAAGTGGCGAATTATTTGGGATACTGTTGTAGCCATAAATTCGCGCGATTTCTTCAATTAAATCTTCTTCAATTTCAATATCAAAACGCCAACTTGGAGCAATTGCCGTCCAACTATTATCCGCAAATGTTACGTTCAAGCCTAAGCGGGTTAAAATATCGGTTACCGTTGCATCGTCAATATGATGACCAATCACCGAATCTAATTTACTGCGTCTAAGCGTGACAGTATTGCGTTTTGGTAGGTTTTCTTGGCTCACGGCTTCCACAATTTCACTTGCTTCACCGCCGCAAATTTCCAGTAATAATGCCGTTGCACGCTCCATTGCTTGACGAGTTAATTCTGGATCAACCCCACGCTCAAAACGGTGTGATGCGTCGGTATGTAACCCATATTGACGAGCGCGACCGGTAATCGCTAATGAAGCAAAAAATGCAGACTCTAACACCACATCTTTCGTATTCTCGCTCACCCCGCTGGCTTCGCCACCGAAAATACCTGCCATAGCCAATGCCCCTTTGCTATCAGCAATCACTAAGGTATTCGATTGTAATTTAGCGTTTGTGCCATCTAGCAATACCAATTCTTCGCCTTCTTTTGCCATACGCACTTGAATGCCACCTTCAATTTTCGCTGCATCAAAGGCGTGCATTGGCTGCCCTAATTCTAAAAGGCTCAAGTTAGTAATATCAACGATTGGATCGATTGAGCGAATCCCACAACGGCGTAATTTCTCTTGTAACCAAAGTGGCGATGTCGCTTTGACATTCACATTTTTCACCACACGGGCTAAATAGCGAGGGCAAGCCTCCGGTGCTTGTAATTCCACTGAAACTTTATCTGAAATCGTGGCTTTTACATCTGTAATAGTTGGAGCTTTCACATCGACACGGTTAATCACCCCCACTTCACGAGCAATGCCGGCAATGCTTAAGCAGTCGGCACGGTTTGGCGTAAGGCTGATTTCAATCGCCACATCATTTAAATTTAAATATTCACGGAAATCTTGACCAATAGGTGCATCAGCAGGTAATTCAATAATACCGCTATGATCTTCTTTAATCCCAAGTTCTGAGTAAGAACATAACATCCCCTCTGAAGGCTGACCACGCAATTTGGTTTTCTTAATTTTGAAATCGCCCGGTAGCACTGCACCTTCAACAGCGCAAGCCACTTTTAAACCTTGACGGCAGTTTGGTGCACCACAAACAATATCTAATAAACGTTCGCCACCAACATTCACTTTAGTGACACGCAATTTGTCAGCATCCGGGTGCTGGGCGCATTCCACCACTTCACCCACAACTACACCCGAAAACGCACCAGCTACCGGCTCTACATCGTCAACTTCTAACCCTAACATTGTAATTTGGTCGCATAACTGTTCTGTGCTAATTGCTGGGTTTACCCATTCACGCAACCAAGATTCATTGAATTTCATTATTTCTATCCTATTTGTAAAATTTTCTAAATTTTTAACCGCTTGTATTACTTAAATTGTTTTAAGAAACGTAAGTCATTTTCAAAGAATGAACGTAAATCCGTGACATTGTAGCGTAACATCGTTAAACGCTCGACGCCCATTCCCACAGCAAAACCGCTATATTCTTCAGGGTCAATCCCTACATTGCGTAACACATTCGGGTGTACCATACCGCAACCTAACACTTCTAACCATTTGCCGTTTTGACGCATTACATCTACTTCTGCAGAAGGCTCAGTGAATGGGAAGAATGACGGGCGGAAACGCACTTGTAAATCTTCTTCAAAGAATGCTTTGAGAAAATCGTGAATTAAGCCTTTTAACTCGGTAAAGTTTGCTTTTTTATCCACATATAACAATTCGATTTGGTGGAACATCGGTGTGTGGGTTTGGTCGTAGTCATTACGATATACACGCCCCGGTGCCACAATACGGATAGGCGGTTTTACATTTTCCATTGTACGGATTTGCACACCCGAGGTTTGGGTTCTTAATAAACGATTGGCATCAAACCAAAACGTATCGTGATCCGCTCGAGCCGGATGATGATCCGGAATGTTTAACGCATCGAAGTTATAGTAATCGGTTTCAATTTCAGGTCCGTTTGCTACGGTAAAACCTAATTCAGAGAAAAATTTCACCACACGCTCAATAGTGATAGAAACAGGGTGCAAACCACCTAATTCAGTTTTACGCCCCGGCAGTGAAACATCAATGCTCTCATTAGCTAATTTTGCATTTAATACAGCTTGTTCCCATTCTTCTTTTTTGGCATTTAACACATCAAGCACAACTTGCTTTGCTTCATTAATTTTTGCTCCGATTGCCGGTCTTTCTTCCGCTGCAATATTGCGTAATTCTTGCATTAACGTTGTAAAATGCCCTTTTTTACCAAAATATTCGACTCTAAACTCTTCTAAAGCCTCTAAATTTTGATCAATCTTATCTAAAGCTTCACGTGCTTTATTAGTTAAATCTTTTAGGTGTTGCATTACCTATCCTCTAAACTCAATGAAATAAAAAATTTCATGAATAATAATACTTTAGCCAGAAAAAGTAAATCAACCGATTCGTTAAATGATTGATTTTTAAGGTAAAGCAATTTTAAACAAGCGGTCATTTTTTCCTAATTTTTTGCAAATTAACAGGCGTGAAATTCGCATTCTGCTCTAAATCAAGTTATCATTAATCTACTTATTTCACTTATAAAAGGAAAAACGATGTTTAATATTAGCAAACAGCAAGTTTTAGACGCTTTTCACTTCCGTTCGGCCTGTCGCAGTTACGATCCAAACAAAAAAATCAACAAAGAAGATATGGATTATATTTTGGAACTCGGGCGTCTCTCACCAAGCTCTGTCGGTTCTGAACCGTGGAAATTTTTAGTGCTACAAAACCCGGAAACCCGTCAGAAAATCGCCCCGGTTTCGTGGGGAATTAAACACCCAATGGAAGAAATGAGCCATTTAGTGGTGATTTTAACCAAAAAGAATGTCCGTTATGATTCTGTCTATATGCGTGATATGTTAGCCAAACGAGGCTTAACCTATGAGCAGATTGAAGCCTCGCTGGTACGCTATAAGTCGTTCCAAGAAGAGGATATGAAATTGCTTAGTGAACGTGAATTATTCGATTGGAGTACCAAGCAAACCTATATTGCATTAGGCAATATGATGACCGGTGCGGCTCTGATTGGTATTGACTCTTGCCCGATTGAAGGTTTTCATTACGATACCGTAAACCAAATTTTATCGGACGAAGGCTTATTTGACCTAAACGAATATGGTGTGTCTTGTATGATAACTTTTGGCTATCGCAACAAAGAAATTAAGAAAAAATCCCGCAAACCTACCGAAGAAGTGATTGCGTGGATTGAATAATCACCTTAACTTATAAAAACGGGCGAATTAATCGCCCATTTTTATATCTTTAGTTTTGACTACTCGGCTTTCACCCATTTATTGGTTAATGTGCCCGCCACCATTGCACCATTCACGTTTAAGGCGGTGCGAGCCATATCAATAATCGGCTCAACTGAAATGAGCAAGCCTACTAACTCAATCGGCAGATTCAAGGTTGATAGCACCACAATCGCCGCAAAAGTTGCACCACCACCTACACCGGCAATGCCAAATGAGGAAATTGCCACCACCAAAATCAAGGTTAAAATATAGTTTAAGATAAACGGATCCATTCCCACTGTTGGAGCGACCATCACCGCCAACATTGCCGGATAAATTCCCGCACAGCCATTTTGCCCGATGGTTGCCCCAAAGGTTGCAGAAAAGTTGGCAATCACACTGTTATTACCTAATTATTGGTTTGCGTCTCAATATTCAACGGAATGGTTGCCGCACTGGAACGAGACGTAAAAGCAAAACTTAATGTCGGCAACACTTTTTTGTAGTAATCCAACGGGTTGATTTTAGCCACAAAGAGTAAAATACCGTGCACAATAAACATCAAACCAATCGCAATGTATGATGCCACAATAAAGCTACCTAAATTTACAATATCGCTCCATTGAGAAGTTGCCGCCATTTTGATCATCAACGCAAATACGCCATAA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>NZ_CP017484|1316042:1393529|1368470_1369511_+|WP_020824074.1|transposase|DBSCAN-SWA MFYSNNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNLKNRVDEAIEQAVVKFALDNPAFGQVRVSNELRKQGIFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLIALEKLVAEQGIILSETQVQALERKKEDEIACGEIETAHPGYLGSQDTFYVGNLKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKTAISAADMLNDKVLPYFESQGLPMLRILTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHSKTKVKHPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKKIYTDLTTLQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMATLLDGKRIWVEKNLSSN >NZ_CP017484|1316042:1393529|1326630_1328202_-|WP_006251541.1|DBSCAN-SWA 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83 | Mannheimia_phage(86.44%) | tRNA,terminase,head,holin,portal,capsid,integrase,plate,transposase,tail | attL 1318459:1318475|attR 1361927:1361943 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1425579 : 1481324
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017484|1425579:1481324|DBSCAN-SWA TTTATCCTTTTTTGAAAATTGCAACCAACTGATTAGGGCTAAATCTCCATCCCTCATCGCTTTGCTTAATTAAGTTAAAGCACCACTCCGAACAAAAGTACTTATCCCGCTTTTGTTTAATCCCCAATACAATCCCAAACACGCCTCGCCAGTCATAAGGCTTGCCTTTTGTGCCGGCGAAATAGGCTTTAATTTGTTGCTCGTGTACGTTTGGCAGCTCAATTAAATCCCATTTGCCATCGTCAAGGTTAATCACAGTTTGTCTTACTCCACCGTCACGAGGACTGGAGCTGTAGCACTCATACCACACTTCTCTGTGATAGTGGTCTTTAATCTCACTCTTTTGTACTGCTATTTCGCAATGCGAATATTTGCCTTTAGTGGCTTTGCGAATTAACCAATCTGTGAAATAGTCATATAGGCTACCACCCGAGCCTTTGTAAAGTGCTAAATAGACTTTATACATTAGCTTGCTCCTCTAAATAATCAGCATAAGTTTTCGTCCACCCCGCCGAATAATCATATTCAAGCGGATTTTCAGCTTGCTCTAAAGCCGCCTTGTGCTGGCGAGCAATGGTATGATTGTGGTTTTCGGCTTGCAGAATTGCAGCAATGACAGCAGTTAAATGAGCTTTGCCGAATCCCTCAAAATCGGTATTATCGGCACAAGTCCAATCGACAGTCATCTCTGTGCCAATTAAATCCATTGTCGCTTTTAAGCCTAACAGCTTTTTCTGGGCTTTGTCGTCTGAATCAAACCATTTGCCTAGTTGCTCAACAAACACGCCGCCTGCCGATTTCTCATCACGCAAGGCGTTGATACGCTCTCGCATTATTGCAATTTCTTCGTTTTTTTTGATCGCTTGTTGCTCTGGGCTGATTATCCATTCTGTCCCGCTCCACTTGTGATAACTGGTTGGAGCTGACTCTACCAATACAATCCCATTTTTTGTTTTTACCGCTGTTTTGCCATATAAATCACTCTCGCTATCCACCTCGACTTGATAATAGTCTTTAGTATTAGTTGGCACAGGCCAAATCACATATTCTTTAAGATTTGACTTTTTAAAGTAAACTCTCATTTATGCTCCTAGGTGTATAATTTTTTTAATTGTTGGCAAATATGTTGAGGTTGGGGTTAGCGTTAAGGTTCTGTCGTTAATATTAACTCTAATTAATGAGCCATAGTCTCTATCTGCATTTTCGCCCCCATATTCTGATGCTCCGATATAGGTATTATTGCTGCTCCAGAGGCTAAAGCTATCCCAACGTTTTACGCCTCTAATACTTGCCAACACGTGGATTTCGCCTCGCAAACTACTTACCTGCACCGACACAGGCTCTTGTGTAGAGCCACTAAATAACACCTTTTCGGTGTTATTTTTTTCGATTTGCGAGTTAACCCACTTAGCATTGACAATTTCTGTGTTTCCCGCTGATTCGGGCGGAGTATTAATCACCCCTGTGTTAATATGCACACCTCCCAAAAATTTATGGGCAGTTGCTCTATAGTCAATAATGCTACCCTCTTCGCTTTTATCATTGTGTAGCGTGATTGTTGAGCCGTTCTGACTATTTGCCTTATGTGTACTAGACAAATAAAGGCGGTTTACGCCATTTAGATAATCTGTGCCGTACATACCATAATCATCGCCTGTAGCTAAGATTTTTTGGACTTGCATAGACACAAAAGAGGCTAACTTGTTAAAGAGTGTTGTTTCGTCAAATTCTATGGGGCTTTGAATTGTCCGCACGCCATTTACGCCACGGAAAACGGGTAAATGTAAATTATCCGCTCCTTTTAACGGTCTATCAGTTAAACCTGATAGCGTTTTATCTAACACAATACGTAAAGCATAAATCTCTGGCTGGTAGCCGCTATCAATGTGGGCGTTGTTAGCTCTTCTAGCGTTTTCCGTGAGTGAGTGGCTGTTGCGGTAATCCTCATCGCCGAACAAGCAATAAAGCACCCCATCTTTATACACAACCGACCCCACACCGCACGCACTGTTAGCTACTTCGCCGGAATAAATGCCTTGCGAAATAACCTGAACTTCTGTTTTTTCCGGTTTGCCCCAGTCGCTTAATCTATGCTTAAGCAAAAACATTCGTGGACGATTTGCTCGATAGCGGTTGCCACTTTTATCGCTTTGCCCTGTTTCCCATTCATTTTCCGCTCGTTCGGCGGCGAACATATAAATCACATCATTCTCAATATGAAATGGCATATTGGTGTAGTGAATCTTTTCCGCGGAAATATTGAATGAACTGATATTTTCCCCGTTTAAGTCACAACGAATTAGAAGTGACCCTACATTCGGATTTTGTGACCGGGTCGTTAAAAATAATTTGTTTTTGTAATATCGTAAACAAGGCTCAGCGGCAGCCCGACTTAACGTTTCAGGGAGAATAATCTTATCCGTTGTCACTCTACCTGTTGCCCAGTTGATGCTACATTTCACAAAGCCGATTTCACGAGGTGAAGCATCACCATTATGAAACCCGAAGGCGAACTGTGAACGATTCACTGGGCAAAAACTATGCAAGTGCGTAGCGGCAACGCCAGCACTATTGGCAAACGTGCTTAATTCTTGAATTTGCCATTGGTTATCTTCAAAGTAGGTTGCACAAAGCCAGCTATCGTTGTTGGTAATAGTCTGTTCTTTGCTATTCATCACCGTAAAACGGTTTGCGTCTAATACGGAGGTGACTGTCATTTTGCCACTCACACCGGAAATTCCGCTATTGGAAAACGAAATGGAATCGCCTACAAATAACCCGTGTTCTTCTAATTCTACGGTTACTACATTACCGGATTGCGAAATGCCACCTGTTACAAAAAAATTCTTAGTCATTACTCGGCTATACAAGAATGACCGAACCATTTTCTTACTCGCCACATCACGCTCTTCTACAAGCATAAATAACCGATTTCCAACAATGCCCATAGAAAAACAGTGCCAACCCAATGTTGGATTTTGCGGATGATAGTCCATTAAAATTTCTGGCGTCGTCCAAGTATTGCCATTATCAAAGGATTTGACCCAAGCAATACGCAAGTCATCATAGCCGTGGCGGAAAGCCAACATAAAGGGGGCATAAATCACTCCATTATGAACAAATGCTTTATCTTGAGTCCAAGCTGTGTAATAACCTGTTCGGGTAATTTGTGATAAGTCCGCCTTATAATAATCCTCAGACAAGTAATCAATACCGTTAAATCTATAAGCTACTTGTGAGATATGGCTAGCCGGCACAATTCTTGAACTTGCCGGAATCACATTCCCCAACCCTAAAACCGGCTCTTGCCACGCTTGCAAGCGCTTGATGGCATCGTTATTCACGCTGTCTAAGCTGACTCCAAAGTCAAAGATATTGAGTGTTGAATAAACTCGTTTCCATCGTTTGCCACCAGCCGTCACAATCACCGTGCCGGCATTGTCTGCGGTTGTGGTATCCGCAAAATCAGCATAAAACTCTCCACCGCCTAAATTTTTCCCAGCGTAGTAGGATTTAACCAAAATGCGTTGTTGGTCTTCTGTTGGCTCGATGGTGCGTAATTGAGCAATAGATTCACATTGACCGATGAACTTAAATCCGTCAGGAGAATTAAGTAAATCCTGAGTAGAAATGCAATCCCACTTCCCGAAGTAATTTTCGGAATTGAAATCAGTTGTATTGTTGTCTATCAAGCTAATAAATAGCTTTCCTTTATCATTGCTAATTAATAGTGAACCTTTTGGATATCCTCCTATAGCATTACAAAAGTCCATTTCAAATGGATAAAGGCAACCTTTATTAAGGTGGACAATATGTGTCGATAACTCATATAACACTCCGTTCATATCCTTACCCGAAGGTGCTTTTCCTCCTTCATGAATAGGCTTCATAGTTACATCCGGGAAACCATCTTCGTAAGTCGCCGTGGCGGATGTAACTCCTGAACCTTCTCGATTCAGTGGTATTTCATTTTTTAATCCCTTTTCAGCCCAAGGATGCGTGAGTAGCTTTAAGTTTTCCATGATTTCTCCAACAAAAAACCGTTTATGGAATAAGAACCATAAACGGTTAAGTTAATGAATAATTTAATTTGTTTAGTTTTTATCGCCAATATAAAAAGCAGCTTGCCCGAATGGAGCTAACTCATTTTCATTAAATCCCCAAGTATATAATTGCTCTGGCTCATAAAAGTCACAAAGCACACCGGTTGGACGAGGTAGTAATGTCATAACTATTGCCTTTTCTACATCCAGCAGTTTGAATTCAAAAACATACCTAGCCGTCATTGTTCCCGACTTAACAAAGTAAGCTCGACCTCTTTCTTTAAATAGTATCTGCAGGATCTTATTGATATTCGGTGCTGTTGCATACACAATATTCGTCATTGCTTTAACAAAAAGCATTGACTTATACATTGCATCATTCATCCTGTAGCTAGTTGGGTTAACTTTATCCTTTAGCTCAGTCGAGGCTATACTGGAACCTTGAAAGGTAGTTTGGTCATTAATTTCTACAAAACGAGATAACCCAAGCACCACTCCCCAAAAGTCAAGTCCAACACCTTCAGCAGTATCAATGTCCCAATAAATATTATAGAACTGCCTGAAGCAATCTTTTGTCTCAAGATATTCATCAGCAAATTGAATGATACGGTTCATAATTGGACTGTTTGCATACTGACTAATGATTGTTTTTTGTAGATGAGGTTTATTCATTCTTCCACCAAAATTATATTTTCCGAAAAAAGAATGGGGTATTGATCTATCCCCAGCTGAACCTTATTCTCAAAATTAACACCATCACTACTTACTTCAACATCAAGCAAGTAATCCTTAGGAAAAGATTTAATGATCGAAGAAACGTAATTCATTGCATAAAAAATTCTACCAATCTTGCGATGAGAAGATTGATCAAATTGCATTTTAATTGCTTCTTTCATCTCATTGAGATAATCGCCAACCAGCCCAGACTTAATTTTTACCCTAAAGAAAATTGGCGTA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>NZ_CP017484|1425579:1481324|1429672_1430293_-|WP_006252064.1|DBSCAN-SWA MNKPHLQKTIISQYANSPIMNRIIQFADEYLETKDCFRQFYNIYWDIDTAEGVGLDFWGVVLGLSRFVEINDQTTFQGSSIASTELKDKVNPTSYRMNDAMYKSMLFVKAMTNIVYATAPNINKILQILFKERGRAYFVKSGTMTARYVFEFKLLDVEKAIVMTLLPRPTGVLCDFYEPEQLYTWGFNENELAPFGQAAFYIGDKN >NZ_CP017484|1425579:1481324|1471646_1472006_+|WP_006250254.1|DBSCAN-SWA MTTFSIYTSVWHDSSTKGFRHNIKHKRHDCWRADIRIKQKINDVWVQISRIRKRFKCPEQAKSFVEQWKQIDSPAFMQHQINRQALREELSNLEQRKQKQDGILEVIEYRISQIKELLK >NZ_CP017484|1425579:1481324|1459808_1460237_-|WP_032844507.1|DBSCAN-SWA MADHNLPRMYLVNEAVRKRAIEMILALPLDDKNPLVIEIKPKTRSMEQNDKFHAMLGDISNQAEWQGDRYDLYGWKNLIVSGHTIATKLPYKLVTGLEGELVNVREQTSKMGVKRMTSLIEYTTAWGVSNGVRFNDRFGFWG >NZ_CP017484|1425579:1481324|1480283_1481324_+|WP_020824135.1|integrase|DBSCAN-SWA 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74 | Mannheimia_phage(46.55%) | head,integrase,terminase,holin | attL 1428154:1428173|attR 1481476:1481495 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1634616 : 1683983
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP017484|1634616:1683983|DBSCAN-SWA 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44 | Mannheimia_phage(25.0%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1925368 : 1968080
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP017484|1925368:1968080|DBSCAN-SWA 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60 | Mannheimia_phage(57.78%) | terminase,holin,portal,protease,integrase,transposase,tail | attL 1926482:1926497|attR 1966695:1966710 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2233553 : 2335484
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP017484|2233553:2335484|DBSCAN-SWA ATTAATTTGAGCTTAAATTCTTTTCCACCCAAATCCGTTTTCCATCAAGTAAGGTTGCCATCGGTGTTCTGCCACAGCACATTTTTCCTTGATGTGTTCGATGGTGATTATAATACATTAACCACTCATCTAAATCCGCTTGTAATGTCGTTAAATCCGTATAAATTTTCTTCCTAAATGCCACTTGGTAAAATTCTTGTAAGATTGTTTTATGGAACCGTTCGCAGATGCCGTTAGTCTGCGGATGTTTTACCTTGGTTTTACTGTGTTCAATATCATTTATTGCTAAATAAAGCTCATAATCGTGATTTTCTACCTTGCCACAATATTCACTTCCTCGGTCAGTTAATATGCGTAACATCGGTAAACCTTGGCTTTCAAAGTATGGTAACACTTTATCATTCAGCATATCCGCAGCACTGATAGCGGTCTTCATTGTATAAAGTTTTGCAAACGCCACTTTACTGTAAGTATCAATAAACGTTTGTTGATAAATACGACCCACTCCTTTGAGGTTGCCCACATAGAAAGTATCTTGTGAGCCAAGATAGCCAGGGTGTGTCGTTTCAATTTCACCACAGGCAATCTCATCTTCTTTCTTACGCTCTAAGGCTTGTACCTGTGTTTCACTGAGTATAATACCTTGTTCTGCAACCAGTTTTTCCAGGGCGATTAATCTTTGCTTAAAATTGGCAAGATGATGACGTAACCAAATCGAACGTACACCTCCTGCTGAAACAAAGATGCCTTGTTTACGGAGTTCGTTACTCACTCTTACCTGTCCAAATGCCGGGTTATCAAGAGCAAACTTCACAACAGCTTGCTCTATTGCCTCATCAACACGATTTTTTAAGTTGGGAACGCGTCTATTTTGATTCAGCAATGCTTCAACACCACCTTGCTCAACCGCTTGTTGATAACGATAGAATGTATCTCGGCTCATTCCCATTACTTTGCAGGCTTGAGAAATATTACCCAGTTCTTCTGCTAAATTTAATAAACCGGTCTTGTGTTTAATGAGAGGGTTGTTAGAATAAAACATGAGAGTTTCCTTTTTGTTTAGATTGATTTTTGACACTCATATTCTAAACGGGAAACTCTCACTTTTTAGAGTGAATTGTCAGATCAAGTCTGATCTTCTACACCTAACATTAATTCAGATTATTGATTGTTTTGAACGTAATCAATTGCTGATTGAACTGTAGTAATTTTTTCAGCTTCTTCATCTGGAATTTCGATATCGAATTCTTCTTCTAAAGCCATTACTAATTCAACAGTGTCTAAAGAATCTGCACCTAAATCTTCAATGAATGAAGCTTCTGGTTTTACATCTTCTGCTTTCGCGCCAAGTTGATCAACAATGATTTTTTTTACGCGTTCTTCAATGCTCATTTTGTTTTTCCTATAGTGAATATCGCATAAGTGCGAGAGTTAAATAGTGTAATCGAAATAAGTTTAAATACAACCTTTTATAAAAAGGTCAAACCAGACTATTCCTATACACCAGAATATATCTGTTTTTCCATTCTATCATTATGTTTGTGTTTAATCTATAGAGATAAATCAAATTTCATTTGATTACCCTACTTTCCGTAATTCATCTCGCATTTGTGCAATCACTGCTTGATAATCTGGCTGGTCAAAAATCGCAGAACCTGCCACAAACATATCTGCTCCTGCGGCTGCAATGTCGGCAATGTTATTTATTTTCATACCACCATCAACCTCTAAGCGAATGTTATAACCGCTCTCATCAATACGACGACGGACTTCTTTCAATTTATCTAAGGTGGACGGAATAAATGATTGTCCGCCAAAGCCCGGATTCACAGACATCAATAAAACCACGTCAACTTTATCCATCACATAATCTAAATAGCTCAATGGCGTTGCCGGGTTAAACACCAAGCCTGATTTACAACCTAAATCACGGATAAGCTGTAAATTTCGATCTATATGTTCCGTTGCTTCAGGGTGGAATGTAATATAATCCGCTCCGGCTTTGGCAAAATCCGGAATCAAACGCTCAACCGGTTTTACCATTAAATGCACATCAATCGGGCATTGAATGCCGTAATCACGTAAGGCTTTGCAGATCGCCGGCCCGAAGGTCAAATTCGGCACGTAGTGGTTGTCCATTACATCAAAGTGAATTAAGTCTGCACCGGCTTTTAACACCTCTGCCACATCATCACCCAAGCGAGCTAAATCGGCAGATAAAATAGACGGTGCAATTAAATAAGGATTCTTACTCATATTTCCTCACTATCAAAAAATAAATCTACGTTAGATTACCATAATTTTAACAGCGAAAAGAGTCTCTCTTCCTAAAAATCCGTTTTTTTACAAAACACCATAAAAAAGTTATGGAATTGTATTTAAAGTTCGTATATTATGTATCCCATATTTTAATTATGGTTAATGACCTTATCTAAATTCTGGAGAAAATATGAAAAAAGGGATTCATCCTGAAAATTATCGTGAAGTGTTGTTCTATGATGCCTCAGTGCAACAAGGCTGGGTTATCCGTTCTTGTGCGGCAACCAACAAAACAATGGTATGGGAAGATGGCAAAGAATACCCACTTTACACCTTAGACACCTCATCGGCGTCTCACCCTGTTTACACAGGTAAACGCCGTGAAGTGAATACAGAAGGTCGTGCAAGTCAATTTAAAGATAGATTTAAAGGCTTTGCTTCAACGCTTTCAAATCAAAAATAGAGGATAAAATGAAAATCTTAAACTCACTTAAAACCGCAAAATCACGCCACCCGGATTGCCAAATTGTCAGACGCAAAGGCAAACTTTATGTGATTTGCAAAACCAACCCGAGATTTAAAGCTCGTCAGCGTTAAAAACCAGCACCTTAATAAGCTAATTTATTAAGGTGTTTTTTATTTCATCTTCTCAATATTACCTATTTTAACCACATCAACGATTTTATTATTTCTTATTCCATTTAGTTATTTGCAAGCGGTCAATTTTCCCCTTAAATTTGCAAAAAATTTATTTTACCAATTAAAAGGAAATGATTATGTTGAAAAAATTATCAATTGCTGCATTAGCTCTTACCCTTTCTGTTTCTGCATTTGCTAAAGAGAGCCTACTTGAGCGTATAAACAACAAAGGGACTATTACTGTGGGTACGGAAGGAACTTATGCCCCTTACACCTATCACGATGCGAGCGGTAAATTAACCGGTTACGATGTAGAAGTAACCCGTGCGGTGGCTGAAAAATTAGACGTAAAAGTGGAATTTAAAGAGACACAATGGGACGCTATGTTAGCCGGTTTAAAAGGTGAGCGTTTTGACTTAGTGGCAAACCAAGTGGCTTTAACCAGCCCGGAACGTCGAGCGACATTTGATAAATCCGAATCTTACAGCTGGGACGGTGCCGCCTTATTAGTGCGTGAAGATGAAACTAAAATCAAAACCCCTGCTGATGTAAAAGGCGTGAAAACTGCCCAAACCTTGAGCTCAAACTATGGCGAGATTGCCCGTGAAAACGGTGCAGACATCGTGCCAATTGACGGTATGGCTCAAGGCTTACTGTTAATTCAACAAAAACGCGCCGATGCAACTTTCAATAGCCACTTGTCGCTATTAGATTACTTGAAAAAGAACCCGAATTCCGGCTTAAAAATTGTGTGGGAAAAAGAAGAAAAAGTGGGTGCAGGCTTAATTGCGAATAAAGGCAATGACGAAGCATTAGCGAAAATCAGCAAAGCAATCGTAGAATTACGTGAAGACGGCACGTTAAAAAAATTGGGCGAGCAGTTCTTCGGTAAAGATATTAGTGTACAATAATCCATATTGGATTAGGCTTGGGGCGAATTCGCCCCTTTTATTTTTAAATCTCCCTCAAAACGGGAGATTTTAGGTTTTTCAGATGTTAAACGATCTACTTCTCTCAATCCCCTTTATGACCCAAGCTCGGGTCGATTTAGTGCTAAGCGGTTTTTGGCCGATGGTACAAGCGGCATTTTTAGTCTCTATTCCGCTGGCAATCGCCTCATTTATTATCGGTATGTTAATTGCCGTTGCAGTTGCATTAGTGCGAATTAGCCCTGCAACAGGCTTTTTTCACCGCTTGCTACTGTGGCTGGTAAAAGGTTATATCTCGATTATTCGCGGCACGCCGATGTTGGTTCAGATCTGTATTGTGTTTTATGGTTTGCCTGCAATCGGCATTTTTATCGATCCGATTCCGGCGGCAATTATCGGGTTTTCACTCAATATCGGGGCTTATGGCTCGGAAACGATCCGTGCTGCGATCTCCTCCGTGCCAAAAGGACAATGGGAAGCCGGTTATACTATCGGTATGACTTATATGCAAACTTTTCGCCGTATCATTGCCCCGCAAGCGTTTCGAGTTGCTGTTCCGCCACTTAGCAACACCTTTATCGGTCTGTTTAAAGATACCTCTCTTGCCTCCGTTGTTACCGTAACCGAAATGTTCCGGGTTGCTCAACAGGTAGCGAATATGTCTTATGACTTCCTACCTGTTTATATTGAAGCCGGTTTGATTTATTGGTGCTTCTGCTGGGTGCTATTTTTAATTCAGGCGAGATTGGAAGTCCGCTTTAACCGATTTGTGGCGAAATAAGGAGGAATTGTGCTTAAAATTCGCAATATTCATAAAACCTTTGGCAACAACGCTATTCTACGCGGCATTGATTTAGATATTCAAAAAGGGCAAGTGGTAGTAATTTTAGGCCCTTCCGGTTCAGGCAAAACCACCTTTCTTCGTTGCTTAAATGCACTGGAAATGCCCGAGCAAGGCACATTGGAATTTAGTGGTAATGCTCCGCTGAAAATTGATTTTGCCGTAAAACAGAGCAAAAAAGAGATTTTAGCGCTACGCCGCAAATCCGGTATGGTGTTCCAAAACTACAACCTGTTCCCGCATAAAACCGCATTGGAAAATGTGATGGAAGGACCGGTATTTGTGCAACAACAAGCGGTCGAAATTGCTCAAAAAAATGCAAAAGCCCTGTT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120 | Mannheimia_phage(86.42%) | tRNA,terminase,holin,integrase,transposase,tail | attL 2273587:2273603|attR 2333269:2333285 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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