Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017521 | Mannheimia haemolytica strain 1584 chromosome, complete genome | 3 crisprs | cas3,DEDDh,WYL,cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,c2c9_V-U4,PD-DExK,RT | 5 | 10 | 11 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP017521_1 | 917560-917634 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017521_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017521_1
>1.1|917583|29|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder AGACCTGATACTAATCTAGGGTATAAAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017521_1
The CRISPR arrays of NZ_CP017521_1 >merge|NZ_CP017521|1|917560-917634|CRISPRCasFinder CCTAGCGGTGGCAGGCACCAGAAAGACCTGATACTAATCTAGGGTATAAAGACCTAGCGGTGGCAGACACCAGAA >NZ_CP017521|1|1|917560-917634|CRISPRCasFinder CCTAGCGGTGGCAGGCACCAGAA AGACCTGATACTAATCTAGGGTATAAAGA CCTAGCGGTGGCAGACACCAGAA
>NZ_CP017521.1|WP_006248316.1|916201_917443_+|HipA-domain-containing-protein MMNKRIYVFADWETFSQPELVGVLSSDVVRGKENFRFSYDNEWLSSPYVQQIDPNLYLYPGEQYSTDTQNFHIFLDSCPDRWGRLLMKRREAALASQENRKPKLLIESDYLLGVHDMNRMGALRFKTELNGPFLDNNTRLAAPPLSSLRELEFAAIQLESSDNVDDPDYLKWLHMLISPGSSLGGARPKASVIDELNQLWIAKFPSRYDDYDIALWEYLAYRLAIQAKIEMATCRIERFNQEHHTFLTQRFDRHCGKRRHFTSALTQLGYYDGDYEASYLEIAQFLTESGSNTRIDLAQLWRRIVFNIAISNTDDHLRNHGFIYAQEGWILSPAYDLNPVPLSQGLHLNITDSDNRLDYQLAFDVADFFQLSKQQAVQIYDEVLKEINNWQNVAKEIGIPRQEQEQMKFAFNV >NZ_CP017521.1|WP_006250513.1|915998_916202_+|hypothetical-protein MFTQTLLAQRTGLSRVTVRKIMNGDPTVAIGYYLMVLGVLGLEQDFTDVGKDDELGRKLQDIELLRK >NZ_CP017521.1|WP_006248313.1|914942_915536_+|hypothetical-protein MKLKALSTLIASSMLYSQSFAVPPEKTAEEPQPFFNKTESGYDLVFNDQNYRLIETELNGEKIQFRAFERIVYVNNPIEPDYQTINLYVPEAYYNNGEINGYQADTAPIFLPNSVGGYMPAKAASYDKKRRDGSPGTILVALSKGYVVASVGARGRTLQKEGKYTGKAPSAIIDSKSAAHKACRFESDHWHHSLCKI >NZ_CP017521.1|WP_006248311.1|913955_914819_+|hypothetical-protein MLQLILAILCSVTVGVLIKFARQKGIRIDQSIAVNYIVTTTMTFLLLKPDYQGQSITDIIANNPTSYIFVILSITLPTIFLVQAKALEFAGIIRTDAAQRLSLFLPILAAFTIFGEQVTQNKLIALLLAFVALGCLLWKGNQGMEKGGKIAIISLALVWVGYGVNDILFKQIAKSGSAFPVTLSIAFIGAGCFMFIYLLLKRTQWHVPSVLTGLLLGVLNFGNILFYIQAHQAMKDDPTLVFTGMNLGVICLGTFVGAFFFKEKIHKVNYLGVAIAIVAIICLFYWR >NZ_CP017521.1|WP_006248309.1|913034_913784_-|alpha/beta-fold-hydrolase MEKRFEINEQGLSIRCKLFYEKELQQIENVVIVLHGFGSSKDLKSNTKFGERLSSKYKGYAALAFDFPCHGDDARKKLSVEESITYLQLVIDYAKTSLNAKNLYAYGTSFGGYLTLKYLAEKGNPFRKIALRAPAVQIYHSLMNRLSEEERQKLAKGREILWGFDRQMKISQAFFDELTDITQNDYLDYAEQILILHGTEDEMVALSTSQQFADNNVIELLPIEGADHAFSNPKLMDIAIGKIVEFFAP >NZ_CP017521.1|WP_006248308.1|912547_913033_+|YbaK/prolyl-tRNA-synthetase-associated-domain-containing-protein MSEQTFHQLTALLDSHRARYRVVGHPSAGKSEEVAKIRGTEIGQGAKALVCKVKGNGVKQAVLAILPADYQADLTKIAEHLGGLRASLASPAEVAELTDCVFGAIPPFSFHPDLLLVAEPSLFERYAELAFNAGTLERSIILNTEDYQKIVNPVLVQFAKS >NZ_CP017521.1|WP_006248307.1|911938_912484_+|endonuclease-SmrB MNDTLLDDEFALFREAAKGTKKLTQNTFVPKAEPRKKLQELRELKEKADTEFYFSDEYEPLLKEENEKVKYLREDVDPYILKQLRRGDFQPELFLDLHGLTREKAKKELAALILACEREKVYCASVMTGFGTRTLKDQIPRWLVQHPKVMALHQAPKEWGGDASILILVEQPENPEKMFGR >NZ_CP017521.1|WP_006248305.1|910901_911846_-|50S-ribosomal-protein-L3-N(5)-glutamine-methyltransferase MFKYNTELLDEISALPIVNDLVTIQDMMRWGYSYFNASDLYYGHGYDNAWDEAQQLVLAGLYLPFDVPETLYSSRLTRVEKERIINLICERLGSRKPVAYLTNSAWFCGGEYYVDERVIVPRSPIGELIKKGFKGIIKNEPHRILDMCTGSGCIAIACAERFPEAEVDAVDLSLDALDVAQINIERHQVSHRVFPICSDLFNNLPQDKYDLIVTNPPYVDEEDLGDMPEEFHHEPALALGSGKDGLDLTKRILAQAADYLNDDGVLVCEVGNSMVHLIEQFPSVPFNWLEFEHGGLGVFSLTKEELVKHRHLFA >NZ_CP017521.1|WP_006251360.1|909924_910818_+|N-acetylmuramic-acid-6-phosphate-etherase MNALGQMITEQRNPNSMNIDRLSALDIVQVINQEDKQVAIAVEQCLPQIAQAVEKIVQAFEKGGRLVYVGAGTSGRLGVLDASECPPTYGVKPEMVVGLIAGGERALRFPIEGAEDNREQGKVDLQAVNFSEKDVLVGIAASGRTPYVLGAMEYAKQLGATTVSIASNPNSAMAQIADIAIETVVGPEVLTGSSRMKSGTAQKLVLNMLTTASMILIGKCYQNLMVDVQATNEKLKARAIRIVMQATECEREVAEDTLKLAENNAKLAIMMILGNLDKQKAEDLLSQNQGRLQKALK >NZ_CP017521.1|WP_006248303.1|909450_909912_+|nuclear-transport-factor-2-family-protein MRKIKLLHVILSLILGLSAAAIGSYPAIKEIGEERAKKHQDILDLNRELYSAMVNRDFSALQTLLSDDFELYSSTGEVIDKQEWIKLIQKRVLEFDKVDLLSTDFQGNQSSGLLRVNGEFFGIERDNVVVEMNIRTIVRNTERQIKCIVIKEV >NZ_CP017521.1|WP_096864247.1|917846_918887_-|IS481-family-transposase MFYSNNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNLKNRVDEAIEQAVVKFALDNPAFGQVRVSNELRKQGIFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLIALEKLVAEQGIILSETQVQALERKKEDEIACGEIETTHPGYLGSQDTFYVGNLKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKTAISAADMLNDKVLPYFESQGLPMLRILTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHTKTKVKHPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKKIYTDLTTLQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMATLLDGKRIWVEKNLSSN >NZ_CP017521.1|WP_006252258.1|919040_919814_-|D-hexose-6-phosphate-mutarotase MNLSNALKLIKYNELDVLEVNHNKFKAKIALQGAQLLSWQPYNAEQDVLWLSEIEPFRIGSAIRGGIPICYPWFGSIKEPAHGTARIQEWRLVEHTCSDENVGLVFALENKAKMEMMLGETCELYFTHLDPEPAQLALHSYFNIGDIEKVEVQGLPTRCFDKLTDQEVEVPSPRKISENVDCIYPAQAVNFIQDFANQRTIKVEHINATETVLWNPWHNTVSAMTETAYQNMVCVETARINTLLQQNETLGVRVLVR >NZ_CP017521.1|WP_006248318.1|919962_924159_+|autotransporter-domain-containing-protein MKTKTFTRSYLASFVTIVLSLPAVASVVRNDVDYQYFRDFAENKGPFSVGSMNIDIKDNNGQLVGTMLHNLPMVDFSAMVRGGYSTLIAPQYLVSVAHNTGYKNVQFGAAGYNPDSHHYTYKIVDRNDYEKVQGGLHPDYHTPRLNKLVTEVVPAAVTNAGTSIKPYLNEERFPMFLRAGSGTQALRGKESNKTTGIAGAYEYLTGGTTLQLSKSSPDHWLDYSSNLYQVSYGPLSTYALPGDSGSGSYAYDMNEKRWVLVGVLNFYNGMDNQFNRSAIIRKDFHEKKFAEDIAGTINNTVQNAQFNWTAQGKSSSLSQSNNVQKLNVDLKDSSIANQNTSLPQENHGKTINFNGKDATIVLKQDIDQGAGALNLNANLTIRPETDQTWQGAGIIVGKDKKVNWQVKNPQGDRLSKLGEGTLYVNGRGQNLGDISVGDGIVILNQQADHQGRKQAFNTVGIVSGRPTVVLGSADQVNPDNIYFGFRGGRLDLNGNSIAFKRIQNSDKHARIVNHNRDHISTLIIQGQDPLTSNDLIWGKWASNSPADIYEYTNPYQNKRKDYFRLKGNSRVYYPTNATSNDHWEFLSSNREQAIQKILDAKNLRQRYDTFNGFIGEDASNKTNGILNVVFDTKTEVNTEQDKLKNIYTMSGGFNLNGELTLKGGTLLLSGHPTPHAYDIKNKHDVVRENDWQDSHFTAKNITVNKMAQLYIGRNVNEVNSHFTATDKAKLNLGFINRSTPSCYDSEYTGTTHCEVQAVISDNIFANLATTAIKGNVKLQNHSQLNLGKANLTGSVQADQTTHITLANHSHWLNNGTSQIGHLTMEKGSILSLNDKFATTEIPVRFNKMIIQGNLKGNGRINYTANLAKGESDHLQVDGIAEGNFVLAVRNSTTEANPKSSLNLLSLKNSNQEGNKASISLENNYVDLGTYRYVLENRNHNYHLFNPLIPNSTSKEMNATSVSSIPKKESVTNVPTLDKKETEQNLTQLQKDFSAHQLENQKAKQSMINAQSELRRLNSQLNVLQKYVNSRRLGYYTQQAVLEQISIIQNKIKQTQTIFNDANATVKLTDQKLEEAKLALGSVNDLVLIKASAPAMQATNQDTSMMNIIQADWISQYANTALSELSAQANSALQISNSLDRQLFKQSDKFNVWSSVEHQKTEHKSDLYRPYKQQTNLTQLGIQMPIDNGLMFGVALSKNHANAEFNEGVNGKSNLLMASLYGKWQSQQGTFISLDGSYGKAKNQLYLFGENHFTRRISSIGANIGHQFDLAGVQIQPTIGARYYHFSGQDYTLGGAKISSPNTHFMTYQAGLKASKTFSLDDWKVEPSITTHYVDASNKRLAVNVNNNNINQRFGRYLKTEAGIRFEHNQWQFDLHAGFINGNEIKKQHFAGVKLGYSW >NZ_CP017521.1|WP_006248319.1|924213_925308_-|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase MSKTIEERISAVILAGGLARRMNGVEKGLQLFEGKPLISHILARLSPQVSDIWLNVNRSIEQYQQLYPAFSYYQDSLPDFQGPLSGMLAGFEQIESDYLLFVPCDTPFMPELLLQKLKTALRINNVQIAYAHDGERPHPTFALIHRSVQEDLKAYLGSNQQQLLAFFQSQKSVAVDFSEQKSAFTNVNTLEDLSRVSQFPVKNLAITGYSGTGKTTLLEKLIPKLTACGIRVGLIKHSHHNVDVDKKGKDSYRLREAGANPTMIVCDERWALMTETKQAVEFSQLIAKFNPQEVDLVFVEGFKHETLPKIQLHRKGIEKPLPELDQWTIATATDYPLERENWLDINNIGGIADFIKNWLENKAS >NZ_CP017521.1|WP_006248320.1|925394_925664_+|DUF1040-family-protein MKCERLEELLELLGEHWRKNPDLHLIDILQQLSVEVGEPDNFKALSDEVLIYQLKMRNAGKFEPIPGIKKDYEDDFKTALLRARGILND >NZ_CP017521.1|WP_006248321.1|925727_926366_+|thioredoxin-domain-containing-protein MKKLALKTAFVALSALFTFNSTAIAADPTAGKEYIEVRKAPSAQKEVVEFFSFYCPHCYDFELSYKIPSQIKEKLPSDSKLVQYHVNFLGRQSEDLTRAWALAMALGAEDKVKTALFEGAQKDAFKSMDDIRSVFLANGITAEQFDSGINSFAVNGLVNKQVQLAEDFQIRGVPAFFVNGQYQLNLEGFADSSSTNDFIKRYVDAVVFLSKK >NZ_CP017521.1|WP_015484370.1|926449_927226_+|LLM-class-flavin-dependent-oxidoreductase MTKLSILNLVPIREGQTAKQAVDSMVKLAKHAESIGIERYWIAEHHNMKNLASSATQLLIQHALSHTEKLRVGSGGVMLPNHSPYIVAEQYGTLETLYPNRVELGLGRAPGTDMRTATALRRNAQSLPFPDEISELKGYFEGTNSVSAYPAQGLNVPFYILGSSPESAYLAAERGLPYAFASHFAPRFMDDAVRIYRTHFKPSEVLDKPYVILGVNAIAAETDQEAEQLATTQTQFFLNVVTNAQNYLQPPVESDDKV >NZ_CP017521.1|WP_015484369.1|927235_927490_+|luciferase MKAEIVPHFGPVSFQQNALYNQEKPVVRQMTACSLIGSRESIEQQLKSLKARIEIDEIMAVSYIFDEQKQHQSYTWLKEIADKV >NZ_CP017521.1|WP_006252261.1|927491_927785_+|YfcZ/YiiS-family-protein MSKTMQQKAADAHNMCKLKGDSMLDNSDRQIAFEAVYDSEEIAVQAVEFFTQKAKSVETEPCDIQSEITPIIDGFLMKMWITFSCQAEVILFQMAVR >NZ_CP017521.1|WP_015587023.1|927851_928892_-|IS481-family-transposase MFYSNNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNLKNRVDEAIEQAVVKFALDNPAFGQVRVSNELRKQGIFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLIALEKLVAEQGIILSETQVQALERKKEDEIACGEIETTHPGYLGSQDTFYVGNLKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKAAISAADMLNDKVLPFFESQGLPMLRILTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHSKTKVKHPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKKIYTDLTTLQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMATLLDGKRIWVEKNLSSN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017521_2 | 1568928-1569042 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017521_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017521_2
>2.1|1568956|59|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder TTGTTGCACTAAATAAATCCATTTTGCTTTTAATGACAATAACAGGGAGCTTTTTAGGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017521_2
The CRISPR arrays of NZ_CP017521_2 >merge|NZ_CP017521|2|1568928-1569042|CRISPRCasFinder GGATAAATCGTAATAATTTCGCCACTGTTTGTTGCACTAAATAAATCCATTTTGCTTTTAATGACAATAACAGGGAGCTTTTTAGGTGGATAAATCGTAATAATTTCGCCACTGT >NZ_CP017521|2|2|1568928-1569042|CRISPRCasFinder GGATAAATCGTAATAATTTCGCCACTGT TTGTTGCACTAAATAAATCCATTTTGCTTTTAATGACAATAACAGGGAGCTTTTTAGGT GGATAAATCGTAATAATTTCGCCACTGT
>NZ_CP017521.1|WP_015981653.1|1566632_1568912_-|variable-tail-fiber-protein-H MEQKYKTILTHHGERVIVEALANKIPVPLKEMAIGDGNGSSITPSASQTTLVREVYRAEITDLLEDPQNRHQMIAELLIPENVGGFIVREIGLFDEQGGLVAVANCPENYKPVLEQGSGKVQYYRMILQVSSSDAVTLSINNNIVYATRTEFNEFVNNLSSPDGYKHIGRCKSVAELRTIRPTEHGQRILVDAYYEDGTTGGGEFVADLQDLVTPDDGGVCFVVNNNGGRWKRVDLSHLTLFDFGAVGDGVTNDESAFVNAMRYSQFFIENGTFRINNAVNSVRDNVQILGNKTGKLVLGAGIQQAEAEVFNINHSNYFISGFCIETPNKAIGIRFKSLDDAGVKNLHIDNVVFNGTFYGVRAGESIQADTNYPTDNVIVQNCQSYCGSGNAGHYLCTKVKGVRFFNNIAIGGRNVSAYGATSCSDIFILGNREQGMAVTTVDVEAGVQVEDVQTGECVVANNICSHDIWMSGAKNAIINSNLCRRLRVTSGNPTDTGSNNVEFSNNQAKSIAISKYGSFDNPSLFIDNINFINNILEPSEFNQDVYIDGTILKQCQFINNRCISKSKQYSVRLARNNPCLNLTFKSNKLSDNPAIISGKQGVIFCDDLSLGVNKHRLRLRFSSPINFTVNQEWQKMPFDRVLNDINGHVDIVSGQFIARTGGTFHLKGKITVTNSSEDVLNLYQLRLLINNEEKERLINQSVSPKNSKSNTNGMTTINFDTVVYLKVGDIVDLQYKTTHELTLLSDSFLSQIYVTQEF >NZ_CP017521.1|WP_006248181.1|1566389_1566632_-|hypothetical-protein MTKKHYCTGWRSAPANINSCCHQHDRDYGIRGTVTRADADKRLRECMIKNGNPIRAWLFWLVVRAFGWRFYKNKEIKIEK >NZ_CP017521.1|WP_006248179.1|1564794_1565976_-|phage-tail-sheath-protein MSILDTYLHGVEVVEVNAGGVTISTAATSVIGVVCTGDQADAETFPLNTPVLITNPLNYLEKAGSTGTLRRTLNSIGSIVKTPTVIVRVAESDDSDTLTANIVGTQENGKFTGIKALLTAQSTVFVKPKLLCVPQHDNQAVATELLSVAKKLNAFAFISDNGATTKEQAYTYRQNFSQREGMMIFGDWKSYNTDKKAYDTDYAVARACALQAYIDKTVGWHKNISNVELDGVTGITKAVEFDINESSTEANYLNEKGITICLNHNGFRYWGSRTLATDTRWAFQQSVRTAQIIKETIGAGLAWAVDMPLTPLRVKTMLEAINNKLRSWASGDDPRILGARVWVAEEITADIIKSGKFVIKYDYHWIPSLESLGLEQRVNDEYVVDLVNTLKAL >NZ_CP017521.1|WP_006248178.1|1564279_1564786_-|phage-major-tail-tube-protein MGLPAKLKNFNFSVDGTSYLGETTEVTQPKLAMQLEDYRAGGMIAPVGVNMGLEKLELEFKIGGHEEDLLKLFGGSISGNAFRFNGAYQHDDDDSVDAVELVCRGRIAEIDEGSSKAGDDTEHSYKASLTYYKKTVNGVDIIEIDTLNQIYIVDGKDRLAEIRKAMGL >NZ_CP017521.1|WP_006248177.1|1563886_1564201_-|phage-tail-assembly-protein MKKVTLKQGILRGEKRITEIEVRKPLTKQLRGTNLTSLMQLSVDEWCIVLPRITTPKLDKADFATMSAADLLKLSGKALDLMSEDFDEADEEDSEEQGKGEILA >NZ_CP017521.1|WP_075270712.1|1563746_1563863_-|GpE-family-phage-tail-protein MADIATVFHWTPNTFDEMTIVELGQWREKARLRNGVES >NZ_CP017521.1|WP_006253663.1|1563335_1563683_-|hypothetical-protein MEIKTVTFSKVITAFIFHIITLFVFTQLNEQAQATFMFFWWFFISLRFILVVGIMCVGIEELKIQEYRQTKAYACFSFISNFALCLQFVYFEHLIAAILFLISYIIYHSQTVTIK >NZ_CP017521.1|WP_006248175.1|1562896_1563334_-|phage-tail-protein MLQQFAMMSLGYFVFMRLTIPYQDTSREMNWSHVQNDVVGAMPKSQFTGKAGETMEISAELRPEITGGKMSILALEMMAEQGSAYPLISGSTFMVLGWFVIDRISEQETTFFADGTPRAISFSMSLKRVDDSLLANIIDEVAGFI >NZ_CP017521.1|WP_006248174.1|1561658_1562897_-|phage-late-control-D-family-protein MDFLTELTNHNHRTPAVSVTVRPKPSKDNEGEKAKDISTLITHRLIQLTLTDNRGFEADQLDLELDDTDGLLALPSRGAILSVGLGWQNSPLTYKGEYTVDELTHDGPPDKVTIRARSADLRGTLTNRHERSFHRTTIGKIVKQIAEENKLKPMVGKEFENEEVKHIDQTNESSINLLQRLAEQFDAIATVKNGNLIFIKAGNATTASGKLLPLFRITRSSGDSHSFSIAEGDNYKAVKAYWHNTQTGKRGEVTWDENSQVKKVTKPTMRKKTKVKRGADGKPIKGKDGKSIKETVFVKGKGRQVNAVVQSKPIESDSEAIKTLPHTYATAQSAINACKRNFEKLQRGVATFSLTLAEGNAELIPELPVQVSGFKAEIDSNEWIISQVTHSLNKGGGFTTALEMELKPKSED >NZ_CP017521.1|WP_006248173.1|1560669_1561476_+|DUF3800-domain-containing-protein MNNQSVWHLFCDESGISGKPFYAFGALWIREDKISLFEKEIQKLREKHYCTDEIKWQGTNSKRFSEFYRELVSFFFQADYLFFNCIVVQQAIVNKAFHNGDYEMAKQKHFNLLICNKIEQSLYKNRINRFVLSVDDLPFKYNKADEAMHIIANNIIRKKTAVANAILALNEVDSRKSSGVQLCDLLLGAILSSYQNDITSERKKELTKWIALHLGWDKLTYDTLQEEKKFNIWYFYDPTKGPRIVRTRETKLKYPLLKKKEQTFQPAR >NZ_CP017521.1|WP_006248186.1|1569533_1570451_-|baseplate-assembly-protein MSEIVDLSKLPAPKVLEELDYETLLAERKAKFLSLYPESERAVMAARLALESEPITKLLQENCYLQLLERQRINSAAQATMLAYATGTDLDVIAANFNVERLVVQAEDLTASPPIVEELEPDDDFRQRVQLKIESVSVAGPRKAYTFHALSANGKIADVSVISPQPAYVTVTLLSRDGNGAVASEIINAAKIALNDEEVRPIADRVTVQGASIVEYEINAVLHLYRGPEKEPILKAAKANLEAYINQTKRIGRDVTHSGIHAALHVAGVQNVEILQPRTDLVLTPYQAGYCVNYTLNVEVSDEYS >NZ_CP017521.1|WP_006248187.1|1570447_1570783_-|hypothetical-protein MNRETGEQLEDEVEHIKQSIKDILLTAKGSRVMRRTYGSNLYKLTDKPIAASLIMQLSAACVMALQQWEPRIAITRFKVEFAEDNYNKLICTLDFTLKHRKISIKGMRFTL >NZ_CP017521.1|WP_006248188.1|1570782_1571388_-|phage-baseplate-assembly-protein-V MSEPNHAEQIRRLDNIIRLGTIAEVDLTTATARVNSGGITTDFLPWLTFRAGTSQTWSAPTVGEQCVVLSVSGEFTTGVILFGIYTQNAPSQSADEHLFRFSDGAEISYNTASGQLTVKNCKVVIVQATESITLDTPTVKATKNVVIGGNLSVKGTTSSQGAISTQGAVTAKGDVSGAGISLGSHHHIEQGDGRPTSGAKP >NZ_CP017521.1|WP_015586960.1|1571667_1572708_+|IS481-family-transposase MFYSNNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNLKNRVDEAIEQAVVKFALDNPAFGQVRVSKELRKQGIFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLIALEKLVAEQGIILSETQVQALERKKEDEIACGEIETVHPGYLGSQDTFYVGNLKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKTAISAADMLNDKVLPYFESQGLPMLRILTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHSKTKVKHPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKKIYTDLTTLQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMATLLDGKRIWVEKNLSSN >NZ_CP017521.1|WP_021265529.1|1572742_1573012_-|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MAKITIKPQALSQFDEIVKSVIEFTGFETSGIRLQSDIFDKIEQIAFMPLSGRAREDGTRETFVRRYRIVYDYDRQADEVIICRRSNLI >NZ_CP017521.1|WP_006250778.1|1573004_1573184_-|hypothetical-protein MMFKEKGYDEFVNECVRKGREEHKAGLGFTLEQSRLHIKKTIEQKSQELNEFQREVVYG >NZ_CP017521.1|WP_006248191.1|1576196_1576475_+|hypothetical-protein MEILFILLGLIGFGALLAIGFTTFAAIFGVVTTVFLSLLSLLANMVGLSIIVILISLYVLLPLNTFILIALIFSAILGFLCWYHSDRQSVNQ >NZ_CP017521.1|WP_062716029.1|1576525_1576984_-|phage-virion-morphogenesis-protein MSEPIEQVKTAFDSLLNNISKPRRRLMYQQIGRELDRSQRRRIKAQQNPDGSAYEPRKKPKKGVKSKIKSGKMFDKITQPRFMRLRLESEGVSLGYEGGDAVIARIHQQGLIGRVRKDWDLKVKYASRELLGFTDDDLQMIEDYMINILAGS >NZ_CP017521.1|WP_006248193.1|1576976_1577462_-|phage-tail-protein MIKPDRLRAVLTQTIDIFQANPEKLILQYDKGKIKSKGSQSHSFEYHYDLELIVVDFPYHPDVLFVPVLNFVRNEQWELLQNPELQDKIEFEIDHNNHESYDIYIRLPLTERVIVKEQDGHLTATHADEPNLADVSPFTRLTEYEVYLKDELIYQWAEPNE >NZ_CP017521.1|WP_006248194.1|1577458_1577680_-|TraR/DksA-family-transcriptional-regulator MSDQIDRANELAEKAREAALAKILQNQTACTSLFECEDCGEPIPEKRREMVIGCTRCIECQTIYEHKQKGYRR |
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NZ_CP017521_3 | 1745522-1746422 | TypeI |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017521_3
|
13 spacers
spacers of NZ_CP017521_3
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cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,c2c9_V-U4 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017521_3
The CRISPR arrays of NZ_CP017521_3 >merge|NZ_CP017521|3|1745522-1746422|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTTCAATATATATTGATGCGAAGGTAGCAGCCAATGGCGAAAACATAGGATTTGTGGGTACACCGTTTCAATACACAGCCACGCGAAGGTGGCTGCCTATTGTCGCCCTTGATTTTCCAATTCAAGACGAGGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCAAATTCAAGATATACAATTGACCGCAACAGATAAAGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCTTGGTTATAATTAAAATTGATTGCGGTACACGCCCCTGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCGGGGATTAACCGAACAGGATTGGATTCGTTATGAGGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCGCGTAGCTAATGGCAGATTTTTACGGCAATTTAGGGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCCTCTAGCATTAAAATCCAATCGGTAAACGGTAAAGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCTTTAATTAATAAAATAGCTTTAGCTTTAGATTTAAGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCCCAACAATGCTTTTCTTTGTATAACCAGCCACGAGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGGTATCATTTATCGCCCGAAAAATCCAAAAATCGCAGTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGGGTGCAAACTACTCCGATAACCGAAGTAGCAGCGGTGGTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGGCCTTATCTTAACTGACTCCGGAGGTATTCAAGAAGTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGGTTTACCGTAGATCAAAATGCCATTGCTCGTTATAGGGTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGG >NZ_CP017521|3|1|1745522-1746421|CRT ATTTCAATATATATTGATGCGAAGGTAGCAG CCAATGGCGAAAACATAGGATTTGTGGGTACACC GTTTCAATACACAGCCACGCGAAGGTGGCTG CCTATTGTCGCCCTTGATTTTCCAATTCAAGACGAG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CAAATTCAAGATATACAATTGACCGCAACAGATAAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CTTGGTTATAATTAAAATTGATTGCGGTACACGCCCCT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CGGGGATTAACCGAACAGGATTGGATTCGTTATGAG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CGCGTAGCTAATGGCAGATTTTTACGGCAATTTAGG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CCTCTAGCATTAAAATCCAATCGGTAAACGGTAAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CTTTAATTAATAAAATAGCTTTAGCTTTAGATTTAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CCCAACAATGCTTTTCTTTGTATAACCAGCCACGA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG GTATCATTTATCGCCCGAAAAATCCAAAAATCGCA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GGTGCAAACTACTCCGATAACCGAAGTAGCAGCGGTG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GCCTTATCTTAACTGACTCCGGAGGTATTCAAGAA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GTTTACCGTAGATCAAAATGCCATTGCTCGTTATAGG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG >NZ_CP017521|3|1|1745587-1746421|PILER-CR GTTTCAATACACAGCCACGCGAAGGTGGCTG CCTATTGTCGCCCTTGATTTTCCAATTCAAGACGAG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CAAATTCAAGATATACAATTGACCGCAACAGATAAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CTTGGTTATAATTAAAATTGATTGCGGTACACGCCCCT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CGGGGATTAACCGAACAGGATTGGATTCGTTATGAG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CGCGTAGCTAATGGCAGATTTTTACGGCAATTTAGG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CCTCTAGCATTAAAATCCAATCGGTAAACGGTAAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CTTTAATTAATAAAATAGCTTTAGCTTTAGATTTAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CCCAACAATGCTTTTCTTTGTATAACCAGCCACGA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG GTATCATTTATCGCCCGAAAAATCCAAAAATCGCA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GGTGCAAACTACTCCGATAACCGAAGTAGCAGCGGTG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GCCTTATCTTAACTGACTCCGGAGGTATTCAAGAA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GTTTACCGTAGATCAAAATGCCATTGCTCGTTATAGG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG >NZ_CP017521|3|3|1745587-1746422|CRISPRCasFinder GTTTCAATACACAGCCACGCGAAGGTGGCTGC CTATTGTCGCCCTTGATTTTCCAATTCAAGACGAG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC AAATTCAAGATATACAATTGACCGCAACAGATAAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC TTGGTTATAATTAAAATTGATTGCGGTACACGCCCCT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC GGGGATTAACCGAACAGGATTGGATTCGTTATGAG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC GCGTAGCTAATGGCAGATTTTTACGGCAATTTAGG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC CTCTAGCATTAAAATCCAATCGGTAAACGGTAAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC TTTAATTAATAAAATAGCTTTAGCTTTAGATTTAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC CCAACAATGCTTTTCTTTGTATAACCAGCCACGA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGG TATCATTTATCGCCCGAAAAATCCAAAAATCGCA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGG GTGCAAACTACTCCGATAACCGAAGTAGCAGCGGTG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGG CCTTATCTTAACTGACTCCGGAGGTATTCAAGAA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGG TTTACCGTAGATCAAAATGCCATTGCTCGTTATAGG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGG
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MNADKLTDITSRVANAESTITNFQSTKANKSEVASIAQQNLQSIWRTDAQSAVDALKIGGANLLVDSEYLTTARWGGSSRVASSQYGDRRLTQVFVTQAGTGHFGVTQGTQKATTRIRQGETYTLSLNAQGTAGFTRTGLNYVYLIREDGGNFRLPTLPLTASLSQRPKVTFTAPWTSNQVRLLIGANGIFEATDWFAFHSVKLEMGNVATGWTPTAKDIDDKVSAVQSNLTAYQAAQAKADQAKATQISGLTTRMGAAESNLTRTERAVTELNQTTVTTLRDLTARTKTTEGSLSRLETAKASKTEVASIAQSSLQSIWKADAKSAVDSLSIGARNLLIDSTYNQHINYNTKMSSITRTVYRGNMLIRLGMLGGAGVAGIVQAPAAQVSNIRQGQEYTLSLNVQGTAGIQKTGLNYVFLMRADGANQRLATIPVIASLLNRPKITFTAEWTSERAYLLVGVNGTYETTDWLAFHSVKLEKGNVATDWTPAPEDVDSAVSAVSAKIDTIQETLANADSALSSRIDAVTASVGSNLAKITQVSNAVAGVDGKLSATHTIKTETIAGGRKAIAGIALGAAADNRNAESSVIVMADKFEVVKNAQDGQPVRLFGVAQNKVAINGDLIATGTIKGSHIDADSVRAGILTAGAIRTEHLAAGQISADKLAIGLGGNLLVNPIFATPDLSIAPFGWNYWRGEVGDRLNIDTRNIFNRNEQDNYGLKNGGLPNELVFSMRYSTTKETSDTGRIGWLSQDINVVPNKKYIASVWLACHRGQAKLVIENIEKPGGAYLGRIGNSEVITGYSAHQGEFKNMKRVKVVFTAPTSGCIRFALRLDNIQGKANPFLFARRPMLEEASDNVTDITQPSPWQNAGVTAIHGGSIVTNTVTAQQIAANTITANEIATGTIAARNMAANSINASHIVGSSITADKLNVNNLAAISANLGKVTAGTITGTTITGNTISGGSINGTTISGTTISGGTIKGARLEGATGKFTGELEVSQLIGGGVIEQVTGKLKYSHRNRIYEGQEHGENSSSPIYRHEYIYKATVTINAAPTRRYIEIIGSESFILEANQSITKTIEKSLNRNASGSSLDFIVLAYSISTAKYISIS 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>NZ_CP017521.1|WP_006249176.1|1733791_1734421_+|tail-assembly-protein MITVKFYGHLKTFGTDFKILVKDIAEAIRALCSQLKGLREALRDGVYKVRIGKQYLDPSALEKGLFYCLKKGQTIHFTPVVKGAKSGGIFQAVLGVALIGAAFALGPIGLGLVGSATAMTVGAMGASMLLGGVSQMLTKMPKAPTMGNETEKESSTAFSNLNNLVAQGKPVPLAYGLIRTGSLVISQGVETITIKENQPASNKKTGFRK >NZ_CP017521.1|WP_020828760.1|1732791_1733523_+|C40-family-peptidase MELEQQIIDYALQHEPHEMCGFVVFDGNKNRFIPCENQAEDKANYFEISDLDYIKAEEKGELVAVVHSHPEPNGKPILSVLDRKMQVQTGLDWWLVHNRQIHKFRNVPHLIGREFKHGTMDCYTLYRDAYMLAGYEMDEFERQDDWWHTGQNLYLDNIQGQGFERVETPQIGDVILMQVGADVPNHAAIYIGEQMVIHHSPNRLSKRDLYDGYWLRHTHSIWRHKLADKLDFDGILNDIAVNN >NZ_CP017521.1|WP_006249178.1|1732071_1732788_+|phage-minor-tail-protein-L MPVSISNQMKLDLAKLEQNAMLDLYEVDLRTLKDKSGNAGSVYRFYSGLNELKTSIVWQGRTYDPYPIEATGFERNSSGPSNRPTLTLSNLFGLVTGIANQFDECIGAIVRRHQVYAQYLDAVNFAGGNAKADPNQEIISHFVIEQLSSLTRETATFTLALPIETDNAKIPSRIIMADTCTWIYRSAECGYTGKQYFDEKDKATSDPKADKCSHCLNGCELRGNQRNFGGFVSVNKLG >NZ_CP017521.1|WP_006249179.1|1731742_1732072_+|phage-tail-protein 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>NZ_CP017521.1|WP_006248114.1|1746612_1746906_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MLMLITYDISFDDPEGQARLRRIAKHCLDYGVRAQYSVFECDVTPAQWVTLKNKLLATYNPDCDSLRFYHLGSKWRNKVEHHGAKPSVDIFKDTLIL >NZ_CP017521.1|WP_006248113.1|1746972_1747986_-|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MRKLQNTLYITTQGSYLHKERETLVVEQDRKKVAQLPIHSIGHIFCFGNVLVSPFLMGFCGENNVNLAFFTENGRYLGRLQGRQSGNVLLRRAQYKKSETNPVPVARNIIAAKIQASKRVLQRQIRNHGENADLQSTITALNYSLQQLKTADNLDLIRGIEGDAAARYFGVFSHLIKENSGFHFDGRNRRPPRDGVNALLSFLYSIVGKDISGALQGVGLDPQIGFLHADRSGRDSLAQDILEEFRAWWVDRMVLSLINRGQVKPDDFVTEASGAVTLKPEARKLLFQTLQAKKQEKIIHPFLEEEVEIGLLPYIQAMLLARHLRGDLAEYPPFLMR >NZ_CP017521.1|WP_134916814.1|1748088_1748382_-|DUF3800-domain-containing-protein MQHNKISFEDSVNNSLIQASDVIAGLLAGIGEQIQKYNEQEFYNEFISKLNPNHLENLKLLAQIYQNSIYKSNGLFTHFFAPLSFICRLQNFIFSYK >NZ_CP017521.1|WP_006248111.1|1748382_1749303_-|hypothetical-protein MITSNLERSFHGLNIAQHNYKIFLDESGGNIGKLKHTPNDKKGSNFNRTISSHIGVPPVFVLGGIAQISNANLIAPDWRKLLHLQNKELKFSKIGKNFFNKLGSKELRKVLEWINENNLCIHFALYDWVYFYDVDIIDSALIESDVCSVWKYLSEKIGNSNRYKEIKDYQRKVGLDKQSDDIIYLFYIKELLHDFIINNLQWFLSEIYNNHYKKIDNQEKTVFLDNLYNMIKGSEKYKVLEFFLEKIDRNKYLSFIYDKLDSEMNEDKTFIMLVEDMSPPYQNYLNTFPLSEFYFDKGMEHVFIDY >NZ_CP017521.1|WP_006253509.1|1749329_1750004_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MGDLQNSAEILPLVQPKFGDDKRSISLSALQHYAFCPRQCALIHNEQVWAENYLTAQGQALHERVDSGEPEVRKGIRFERTVHVAAEKLGISGILDLVERDLKTGELKPVEYKRGKPKLDPIDEIQLCAQALCLEEMTEQTINEGALWYMQTRHRLPIIFSTELRTKTLATIAEVRSLLDSGTTPPPEYSKRCKACSLIDLCQPKLLERDRSKGYVVGVFGSLL >NZ_CP017521.1|WP_006248109.1|1750003_1750867_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2 MSIQNRYEFVFFFDVTNGNPNGDPDAGNMPRLDPETSKGLVTDVCLKRKIRNFIEMSYENEAGYEIYVKEKSVLNLQNKRAYEALGIESEAKKLPKEEAKAREITAWMCKNFFDIRTFGAVMTTEVNSGQVRGPVQLAFAQSIDPIIPLEVSITRMAVTNEKDLEKERTMGRKYIVPYALYRVHGFISAKLAEKTGFSDEDVQKLWQALQLMFEHDRSAARGEMAARKLIVFKHDSELGNQPAHKLFDSVKVERINGEKDTPAKDYDDYCISVQTEGLTGVTVEELL >NZ_CP017521.1|WP_031192850.1|1750876_1752658_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 MITALTRYYYRLAAQEDRLTGEAKVPSYGFSEEKIGWVLELDSKGNLVNVISNLTEDKKPKPKLMSVPRPEKRTSGIKPNFLWDKTAYVLGIESNPDKATAKDQPINFAEKTFEAFKQYHLDLLADSNDEGLMAIRNFLQQWQPTHFAESICPREILDANVVFKLVGTSGYIHQREAAQTLWTSLLINQSDNAEKGLCLISGKLSPIQRTHPPIKGVFGGQSSGGSIISFNKESFTSFGKEQGSNAPVSEQAAFAYTTALNYLLRTEKHRLTIGDASTVFWAEADNTTQAEAAEGFFAALMTPPDDEQENQKIFEELQKISKGRPLAEISPELSENTRFYVLGLAPNAARISVRFWLDTTFGQLAKNLSEHWQDLALEPCPWKTPPSIWRLLLQTASLGKSENISPVLAGEMARAVISGHLYPMSLLSQLVTRIRADGDINGLRVALMKAVLQRKFRKGFIKEGVPMSLNKESDNQAYLLGRLFAVLERIQSQALGELNAGIADRYYGSASAVPFSVFPRLLSGAKHHLSRLRKDKGGMAVNLDKDLGEIIASLPENFPRHLSIDEQGRFAIGYYHQKQSYFAKKETTESIEN >NZ_CP017521.1|WP_006248107.1|1752679_1753357_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 MPNKIRLHIWGDYACFTRPEMKVERVSYDVITPSAARGILAAVHWKPAIRWVIDKIYVLQPIQFESVRRNELGSKISASKISGAMKRKTVADLYTVIEDDRQQRAATVLKNVGYVIEAHAVLTKMAGEAETVTKHIEMFKRRAKKGQCFQQPCMGVREFAANFALIDDDEPLPECFLAENERDRDLGWMLHDIDFEHGNQPRFFRAEMKNGVIDVPPFYAEEVKS >NZ_CP017521.1|WP_134983790.1|1755339_1755801_-|hypothetical-protein MFKPHGSLDWFMAGDVPMTSCIGKVEEPLIITPGVGKYKKGYGQPFDAHREKANEAIDSASSILCIGYGFNDDHLQTHLTGKIKSGVKTLLLTRGLSENARNVVKEAPNCKALIFDGDKAGTRVVSKQEETFIPNVHWWDVEFFVKEILENGK >NZ_CP017521.1|WP_006253506.1|1755959_1757096_-|transposase MLLRKAFKFEIRPNGEQVRKMKQFCGCSRFVFNKALAWQNEQYEQDNHHKFSYTKLANLLPQWKKELVWLKDCHSQVLQQSLKDLESAFKNFFQKRADLPKFKKKGVKESFRFPQGCKIEQKNDRLYLPKIGWVRYRNSREIVGEVKNVTVSMKCGRFFVSIQTEFKQEIPTHKGGEIGIDMGIARFATLSNGEFFEPLNAFKTHKGKLAKLQKQLKNKVKFSKNWQKLKDKIGKLHHKIANCRKDFLHKISTQISKNHAMIYVEDLQVANMSKSAKGTAEVHGKNVKQKSGLNRVILDQSWFEFRRQLDYKTQWLGGFLLAVPPQNTSRTCPCCNYTAKENRQTQENFECVECGYTENADVVGAMNVLTRGQAIVQA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017521_3 | 3.11|1746220|37|NZ_CP017521|CRT,PILER-CR | 1746220-1746256 | 37 | NZ_CP017521.1 | 1565869-1565905 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017521_3 | 3.16|1745753|37|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder | 1745753-1745789 | 37 | NZ_CP017521.1 | 1617340-1617376 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017521_3 | 3.19|1745956|34|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder | 1745956-1745989 | 34 | NZ_CP017521.1 | 1625520-1625553 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017521_3 | 3.23|1746221|36|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder | 1746221-1746256 | 36 | NZ_CP017521.1 | 1565870-1565905 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017521_3 | 3.24|1746289|34|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder | 1746289-1746322 | 34 | NZ_CP017521.1 | 2716684-2716717 | 0 | 1.0 |
1. spacer 3.11|1746220|37|NZ_CP017521|CRT,PILER-CR matches to position: 1565869-1565905, mismatch: 0, identity: 1.0
ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer *************************************
2. spacer 3.16|1745753|37|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to position: 1617340-1617376, mismatch: 0, identity: 1.0
ttggttataattaaaattgattgcggtacacgcccct CRISPR spacer ttggttataattaaaattgattgcggtacacgcccct Protospacer *************************************
3. spacer 3.19|1745956|34|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to position: 1625520-1625553, mismatch: 0, identity: 1.0
ctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa CRISPR spacer ctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa Protospacer **********************************
4. spacer 3.23|1746221|36|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to position: 1565870-1565905, mismatch: 0, identity: 1.0
gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************
5. spacer 3.24|1746289|34|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to position: 2716684-2716717, mismatch: 0, identity: 1.0
ccttatcttaactgactccggaggtattcaagaa CRISPR spacer ccttatcttaactgactccggaggtattcaagaa Protospacer **********************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_CP017521_2 | 2.1|1568956|59|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder | 1568956-1569014 | 59 | DQ426905 | Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome | 15663-15721 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017521_2 | 2.1|1568956|59|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder | 1568956-1569014 | 59 | KP137432 | Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome | 15663-15721 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017521_2 | 2.1|1568956|59|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder | 1568956-1569014 | 59 | JN255163 | Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome | 15863-15921 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017521_2 | 2.1|1568956|59|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder | 1568956-1569014 | 59 | KP137438 | Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome | 16092-16150 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017521_2 | 2.1|1568956|59|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder | 1568956-1569014 | 59 | DQ426904 | Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome | 15663-15721 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017521_3 | 3.11|1746220|37|NZ_CP017521|CRT,PILER-CR | 1746220-1746256 | 37 | NC_008201 | Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome | 18740-18776 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017521_3 | 3.11|1746220|37|NZ_CP017521|CRT,PILER-CR | 1746220-1746256 | 37 | DQ426905 | Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome | 18815-18851 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017521_3 | 3.11|1746220|37|NZ_CP017521|CRT,PILER-CR | 1746220-1746256 | 37 | KP137432 | Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome | 18780-18816 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017521_3 | 3.11|1746220|37|NZ_CP017521|CRT,PILER-CR | 1746220-1746256 | 37 | JN255163 | Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome | 18976-19012 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017521_3 | 3.11|1746220|37|NZ_CP017521|CRT,PILER-CR | 1746220-1746256 | 37 | KP137438 | Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome | 19141-19177 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017521_3 | 3.11|1746220|37|NZ_CP017521|CRT,PILER-CR | 1746220-1746256 | 37 | DQ426904 | Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome | 18740-18776 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017521_3 | 3.16|1745753|37|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder | 1745753-1745789 | 37 | KP137439 | Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome | 27263-27299 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017521_3 | 3.16|1745753|37|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder | 1745753-1745789 | 37 | NC_028956 | Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome | 27371-27407 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017521_3 | 3.19|1745956|34|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder | 1745956-1745989 | 34 | NC_028956 | Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome | 19193-19226 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017521_3 | 3.19|1745956|34|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder | 1745956-1745989 | 34 | NC_028743 | Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome | 19018-19051 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017521_3 | 3.23|1746221|36|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder | 1746221-1746256 | 36 | NC_008201 | Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome | 18740-18775 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017521_3 | 3.23|1746221|36|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder | 1746221-1746256 | 36 | DQ426905 | Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome | 18815-18850 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017521_3 | 3.23|1746221|36|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder | 1746221-1746256 | 36 | KP137432 | Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome | 18780-18815 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017521_3 | 3.23|1746221|36|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder | 1746221-1746256 | 36 | JN255163 | Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome | 18976-19011 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017521_3 | 3.23|1746221|36|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder | 1746221-1746256 | 36 | KP137438 | Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome | 19141-19176 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017521_3 | 3.23|1746221|36|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder | 1746221-1746256 | 36 | DQ426904 | Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome | 18740-18775 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017521_3 | 3.4|1745752|38|NZ_CP017521|CRT,PILER-CR | 1745752-1745789 | 38 | KP137439 | Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome | 27262-27299 | 1 | 0.974 |
NZ_CP017521_3 | 3.4|1745752|38|NZ_CP017521|CRT,PILER-CR | 1745752-1745789 | 38 | NC_028956 | Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome | 27370-27407 | 1 | 0.974 |
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NZ_CP017521_3 | 3.7|1745955|35|NZ_CP017521|CRT,PILER-CR | 1745955-1745989 | 35 | NC_028743 | Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome | 19017-19051 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017521_1 | 1.1|917583|29|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder | 917583-917611 | 29 | MH791397 | UNVERIFIED: Enterococcus phage EfsSzw-1, complete genome | 22354-22382 | 5 | 0.828 |
NZ_CP017521_3 | 3.20|1746022|35|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder | 1746022-1746056 | 35 | NC_014534 | Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782202, complete sequence | 368774-368808 | 11 | 0.686 |
NZ_CP017521_3 | 3.22|1746155|34|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder | 1746155-1746188 | 34 | NC_014533 | Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782201, complete sequence | 710003-710036 | 11 | 0.676 |
1. spacer 2.1|1568956|59|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgttgcactaaataaatccattttgcttttaatgacaataacagggagctttttaggt CRISPR spacer ttgttgcactaaataaatccattttgcttttaatgacaataacagggagctttttaggt Protospacer ***********************************************************
2. spacer 2.1|1568956|59|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgttgcactaaataaatccattttgcttttaatgacaataacagggagctttttaggt CRISPR spacer ttgttgcactaaataaatccattttgcttttaatgacaataacagggagctttttaggt Protospacer ***********************************************************
3. spacer 2.1|1568956|59|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgttgcactaaataaatccattttgcttttaatgacaataacagggagctttttaggt CRISPR spacer ttgttgcactaaataaatccattttgcttttaatgacaataacagggagctttttaggt Protospacer ***********************************************************
4. spacer 2.1|1568956|59|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgttgcactaaataaatccattttgcttttaatgacaataacagggagctttttaggt CRISPR spacer ttgttgcactaaataaatccattttgcttttaatgacaataacagggagctttttaggt Protospacer ***********************************************************
5. spacer 2.1|1568956|59|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgttgcactaaataaatccattttgcttttaatgacaataacagggagctttttaggt CRISPR spacer ttgttgcactaaataaatccattttgcttttaatgacaataacagggagctttttaggt Protospacer ***********************************************************
6. spacer 2.1|1568956|59|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgttgcactaaataaatccattttgcttttaatgacaataacagggagctttttaggt CRISPR spacer ttgttgcactaaataaatccattttgcttttaatgacaataacagggagctttttaggt Protospacer ***********************************************************
7. spacer 3.11|1746220|37|NZ_CP017521|CRT,PILER-CR matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer *************************************
8. spacer 3.11|1746220|37|NZ_CP017521|CRT,PILER-CR matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer *************************************
9. spacer 3.11|1746220|37|NZ_CP017521|CRT,PILER-CR matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer *************************************
10. spacer 3.11|1746220|37|NZ_CP017521|CRT,PILER-CR matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer *************************************
11. spacer 3.11|1746220|37|NZ_CP017521|CRT,PILER-CR matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer *************************************
12. spacer 3.11|1746220|37|NZ_CP017521|CRT,PILER-CR matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer *************************************
13. spacer 3.16|1745753|37|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to KP137439 (Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttggttataattaaaattgattgcggtacacgcccct CRISPR spacer ttggttataattaaaattgattgcggtacacgcccct Protospacer *************************************
14. spacer 3.16|1745753|37|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttggttataattaaaattgattgcggtacacgcccct CRISPR spacer ttggttataattaaaattgattgcggtacacgcccct Protospacer *************************************
15. spacer 3.19|1745956|34|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa CRISPR spacer ctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa Protospacer **********************************
16. spacer 3.19|1745956|34|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to NC_028743 (Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa CRISPR spacer ctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa Protospacer **********************************
17. spacer 3.23|1746221|36|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************
18. spacer 3.23|1746221|36|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************
19. spacer 3.23|1746221|36|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************
20. spacer 3.23|1746221|36|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************
21. spacer 3.23|1746221|36|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************
22. spacer 3.23|1746221|36|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************
23. spacer 3.4|1745752|38|NZ_CP017521|CRT,PILER-CR matches to KP137439 (Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
cttggttataattaaaattgattgcggtacacgcccct CRISPR spacer attggttataattaaaattgattgcggtacacgcccct Protospacer *************************************
24. spacer 3.4|1745752|38|NZ_CP017521|CRT,PILER-CR matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
cttggttataattaaaattgattgcggtacacgcccct CRISPR spacer attggttataattaaaattgattgcggtacacgcccct Protospacer *************************************
25. spacer 3.7|1745955|35|NZ_CP017521|CRT,PILER-CR matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa CRISPR spacer actctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa Protospacer **********************************
26. spacer 3.7|1745955|35|NZ_CP017521|CRT,PILER-CR matches to NC_028743 (Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa CRISPR spacer actctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa Protospacer **********************************
27. spacer 1.1|917583|29|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to MH791397 (UNVERIFIED: Enterococcus phage EfsSzw-1, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
agacctgatactaatctagggtataaaga CRISPR spacer aaacctcataataatctagggtataaggc Protospacer *.**** *** ***************.*
28. spacer 3.20|1746022|35|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to NC_014534 (Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782202, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tttaattaataaaatagctttagctttagatttaa CRISPR spacer ccaatctaataaaataattttagctttagatcggg Protospacer .. * .**********..*************. ..
29. spacer 3.22|1746155|34|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to NC_014533 (Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782201, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
tatcatttatcgcccgaaaaatccaaaaatcgca CRISPR spacer acaagcttatcgcccaaaaaatccaacaataaaa Protospacer ..*********.********** *** . *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
43992 : 51536
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017521|43992:51536|DBSCAN-SWA ATTAAAAGTGTTTTAAAAACATCCGCTTTTGACCTGTAAAAGGTAGCGGAGCTTGTTTAAATTGAGCTACACTTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTCAGTAATGATATTTCCTGTTTTATGACTTTCCATTGATATTTTTCTCCTTGTAATAAATCCACCCAAACAACCTCACCACAACCCAAAACACCCACGCCTTAATCGGATTCCCTTGCGAAATTAAGCAATGTCTTAACCGCTTGTCGGCTTCGGCTCGGCTGACTGTGCCCTTGATACCGTAGTCTCGGTCATGCTGATGACAGCAACTATTGATATTGGCTGGCGCATTACGCCAGCCTGTGCAGTAGTGTTTTTTAGTCACTTAAAACTCCTGAGTCACATAAATTTGAGATAAAAATGAGTCTGACAGTAATGTCAACTCATGCGTTGTTTTATACTGCAAATCAACAATGTCACCTACTTTTAAATAAACTACAGTATCAAAATTGATTGTTGTCATACCATTTGTATTTGATTTGCTGTTTTTAGGTGAAACACTTTGATTAATCAGTCTTTCTTTCTCTTCGTTATTTATTAACAGCCTGAGTTGATATAAATTCAGCACATCTTCCGATGAATTTGTAACCGTTATTTTACCTTTTAAATGAAAAGTGCCGCCTGTCCTTGCAATAAATTGACCACTGACAATATCAACATGACCATTGATATCATTTAACACTCTGTCAAACGGCATTTTTTGCCATTCTTGATTAACAGTAAAATTAATCGGCGATGAAAATCGCAATCTTAATCTGTGCTTATTTACTCCTAAGCTCAAATCATCGCAGAAAATAACACCTTGCTTACCTGATATAATCGCAGGATTGTCCGATAATTTATTACTCTTAAATGTTAAATTTAAGCACGGATTATTGCGAGCAAGTCTGACAGAATATTGCTTAGACTTGCTAATACAACGATTATTAATAAATTGGCACTGTTTTAAAATTGTCCCGTCAATATACACATCTTGATTAAATTCACTGGGCTCCAAAATGTTATTAATAAAATTGATATTATCAATAAACAATGAAGGATTATCGAAAGAACCATATTTCGATATTGCAATAGATTTTGCTTGATTATTTGAAAATTCTACATTGTTGCTGCCTGTGTCAGTCGGATTACCTGATGTGACACGCAAGCGACGGCAGAGGTTGCTGTTGATAATGGCATTTTTAGCACCAGACATCCAAATATCGTGGCTGCAAATATTATTCGCTACCACACATTCGCCAGTTTGTACATCTTCCACTTGTACGCCCGCTTCCACATCAACTGTCGTCACTGCCATCCCCTGTTCACGATTACCCAAAATGAAAATATCAGAGCAAGATGTTGCACCGTAAGCTGATACATTGCGACCTCCAATTGCTATATTGTTAAAAAATCGCACACCTTTAACTTTGGTGCAGAGATAATGTCCAGCATTACCTGAACCACAATACGATTGGCAGTTTTGTACAATCACATTATCAGTTGGGTAATTAGTATCCGCCTGAATACTTTCACCTGCCCTGACCCCGTAGAAGGTGCCATTAAACACAACATTGTCAATATGGAGATTTTTAACACCAGCATCATCCAAAGACTTAAATCGAATACCAATTGCTTTGTTCGGTGTTTCAATACAAAAACCCGAGATAAAATAATTGCTGTGATTAATATTAAAAACTTCGGCCTCTGCTTGCTGGATACCTGCACCTAATACTAATTTGCCGGTCTTATTGCCCAAAATTTGCACATTATCGCGAACAGAATTAACGGCATTGTTGATACGAAATGTACCGTTTTCGATAAAAAATTGAGAATATCTCATAGCATTTACAAATGCTGATTCATCATTTGTTACCCCGTCACCGACGGCCCCAAAATCAAATAATGTAAGATGTGAAAGGTCAACACGCTTCCACCGCCCCCCATTATTATTCACAACAAAACAAACCCCACCATCATCAGGCGTAACTAAATCCTGCAAATCAGCCACAAACTCCCCACCGCCTGTTGTGCCGTCCTCATAGTAAGCATCCACCAAAATACGCTGACCGTGTTCCGTTGGGCGGATAGTACGTAACTCCGCAACCGATTTGCAGCGACCGATGTGTTTGTAACCATCAGGGTTGGCTAATGCGTTAAAATTATCACGAGTAGCATCGCCCGCAATTTTCTTGATTGCTTTAGCCACCTGATTAACTTGTTCGTCATTTGCTTCGATTCCTGCTTCAGCAAGTACACTGTGCAATTCTTGTTGGGTGTTAATGACCGAATCTTGGACGTTATTCAAAAATTCAGCAGTCACAATCGTGCCATATTCACCAGTGGCAGGGTTGCCATCTTTAAAACGCTGTGTTGGGGTATTAATCGGATTCATCACTTGTTTCATTCAATATCTCCTAAATATCTTACCCACACACGGCTAAATGCAGGTTTTACCTCTTCAAGTAGACTTTCTAAAATTGGGTCTTTGTATCGTCCCATTAACGCATCGCCAGCCATTGACACGCTTGCTCTAAAACGCTTGTAATCATCTGTGGGGTTGCAAACATCCACAAAAAATGTCCACATAATGTCTTTATGCCATAACATATCCCCAGCTCGGCTTAGCCCAGCAATAAAGGGTTGTGGCTCACTAATTTTGATGCAATATCCAAGCTCTTTGGCCACTTGAGTGATATAGCCTATCGACAATCCACCCAACTGATTCAGCTTTGCAATCACACGCTCAATTCGGGTTTCAAGCGGTAGTGAGCTATTCGCCGTTAAGCCACAAACCCGCTCCCAATCATCAATAAAAATGCCTGTTGATACATCAACGGCATCGATTAAAGTCTTGGCTCTCGCATCAATGCGGTCTAGCTCTCTCCCCTCAACTTCAAGGGATAACGCTAGCCATCTGCCGTTTGGGTCATACGATACAGGCGGTAATAAACCGCCCAATGCCTTGCCGTGTTACCTGCGGCCATTTGTTGTGGTAGCCAGCGAGCCATATCTGCAAGCTCAAAGTTACCTGCTTGCCCGGCTGCAACTGCCATATCCAATGCCCGCCCAATATCCTCTTCTTTAATCCCAAATTGTTGCATTGAGGAGATCGCAATTTTTGCCATATCCTCGGAGCTTGCACCTGTTGCTACAGCACCTTTCTGCAAGGTTGGTAATAGGCTCATTGCAGTTTCAGCCTTCATCGTTCCTGAGGCAATTAGCGTATCAAGAGTTAAAAGAGCATCTTCTTTTGTTCCACCCCCAACCTTAACCGCCTCTTGCACCGCTGCTAATAACTCTTTCTTGCCCTCAATACGCCCTTTAACATCACGGTCGGAAAAGGCAGTGTTTGATGCCATCGCTAACTGTCGGTCAAACTCCATTTGGTTCTTGGCTGGCTGACGAGCCATTGCAGCACCTGCTGCAATACCGACACCGGCACTCATCAAACCACGCCCAAATCCTTTAGCCTTATCCCCAAAGCTTGTCTTACCCAATTCTGCATTCAGCTCTCGCACCCGTTGCTTAGTGGCTTCTGAGGCACGGCGTAGCTCATTTTGAGAGGCAACACCTGAGCGTTTTAAGCGGTCATAGGCTGCACGAGTTTGTTCAATTTCGCGTTGGATTGCATTTTCCGCCCGAACACCTAATGTTTCACGGGCTCGGCTCACATCGGCAGCCACTCGGCGGGCATTACGGTAACTCTGTTCTATTTTCCGATTTGAGCTTTCTGTAGCATTCGCTGCTTTCTGTGCTGCTTGCGTTTGAGCATTGCCACTTTTTTGTGCCGCTCGCTCTGTATTTTTAAAGGCTTTTTCGGCGGTTTTAGCGGCTTGGTTTAAAACTGGGGAGGCAGTATCTTTTGCCGTCAATTCCAGTTGCACTTTCATATTTTTTGCCATTTTTAAAGTCTCTTTAAACTAATTTTAAAGTACAAAAAAGGGGCTTTCGCCCCTATTCAATTTTGCCACACCGAGTAAAGACATAGCTTTCGCGTTTCACTTCGCTATTCGCACCCATTGGGCTATGCGGTGTTTTTACGCCCTCACTCTCCAAGTAGCTCTCAATCCACGCAAATACCTCAAGCAACGGCATTTGCCATACCTGCTCGGCGGTAATTGCAAATTTTGAGAGTAAAATCACCGCTTGTCGGTACTGCTTAAAGGCTTCTGCTACGCCAAATCGGGATTTGCCGGGCTTTCGCTCTCGCTTTGGCTCACCCCATTTTCTAACCGCTTTTTTCGGAGTGTGAGCGTTGCCTCAATCAACTGCCAGTAGTCTTCGGTAGCTAAATTGTCAAATAAAAATTGAGCCGTCACATTACCTTGATAAATACCATCAAAGGTAACTTGCTGCGAAAGGTAAGCCATATCGACCAAGGTTTGTTCACGCTTTGATAGGGCTTCCGAGTTTTCCTCAAACCCTAAATCCGCAATCATTTCTTGAGCCGTGCATTGACCGCCCATCGTCAGCAATCGCACCGTACAATCACGGCGAATTTTCCCGTTATATTCAATGCCAAGATTTAAAGTGATTTTCATTATTCATTCACCTTACGCAATGCGTTGAGTTGAATATCACGCACCGACTCACCATCAACGGTGTAAGACTCGCTCACATCGGTAGTAAAACAGCCTAAATAAGAGGTGCGTTTTTCGCTATTGTCTAACGGGTATTTAGTGAGCTTCGCATTTTTAATGTTATCCCAATCAATTACCGAACCGTCTTGAGGCTCAACTGCAGTCACCGAGAGAGTATATTCCGCAATGCCTTGCGAATAACCTCTTGCACGTCCGGAACTGTTCATCGTTTTAACCAGCTTGCGACCGGTTACGGTTTTTACATCAAGTTTGGTAATTTCAATCTCAACGCCATCTACCTCAAGCACGCAAGAGCCTTCATAAACAATTGACATCTAGCACCCCCTATAAAATTAACGTAATTTTGTTACGAATAACGTGCAAGCCATTAACCACATCCGCAGGGATTTCTAAATCCAAGTAAGTCGGGTCTTGATTACGCACCACTAATAAGCGATTTTTCCACGCTTCCACATTTTCGATTACCTCTTCGCCCTCAAGCTGATAAAGCACATCTAAAATCTCCGAGCGTACTTTTGCCACAATACGGTGGGAGTTTTTCGCACGAGGGAAACGCAAACGCTGACGGGTTTGGATTGCCTTACGCACATAGTCAAGCGTACGAATGGTGGTTAAATCCAAATAGCTTGGGTCATCAGTATTCGTCACGTTTTTGGTGTATGTAGTAATCGCACGGGTAATCTGCACACGGCTTGCCACCACCTCAATCGGGCTTAAACCGTGATATAACGCTTGGTTTACTTCGCTAAATAACGGTTTCTGCGAGTCATCTACGACCGTTAAGCCTTTAACTTCAAGGGTATTTAACGGGCGAGCCGGATCTTCTTCACCGGCAATTTCCGCCCTTGTTGCACCACATAATCGGGCAACTGCTTCAAGGCATACCGAACTTGGCTCTCTGTAGGTAAATCTTCGCCCTCATACTGCATTGCAAATTGAGCATAAGCCTGTGTGAGTGCCACATTGCTAAAGGTTTGATAAAACGGCAGAAAGGCTTGCAACCAACCACACCGCTCGGGCACGGCACGTTTTTGTGTTTTCAGCGGTATCATCTGTTTTAACCGTTCCGCTGAATTTTCGCCTGCCTCATACGCCAGCACCCAACTATGCAAGGTGCGTTTAGATAGCTTTAACTTTCCACCGGCTTTACTATTGCCCGCCATAATCGCTTTGCAAATTTCAGCAGGAATTTCACTGCTTGCCACCGCTGCAATGACTTGGTCTAGCGTTTTTGTGCGGCTTAGCCCCAACTGCACTTCCTGCATCAAGAACCACCGCACCACCATAATGCGAGCATCTGCCGTAGAAAGTTGTTTATCGGTTATCTGCTCCAAATCAATGTTTTGTCGCACTACACTCAATTCGCCTTTGCTGATTTCAGCAGGAAGAAGTTTGAGTAACTTGGTGCGGATTTCCTGTTGGACTTCGGTGGGTAAACTGATTAATTCATATTCAACCCCGCCGCCTCTGCCTTTGCGTTTTTGAGATTGCCAGTTTTCCCTTATTGCTTTCTCAAGCACATTTTTATGAGCACTTGGTAGGCTAGATAACTTAAAACTTAACAATTCAGCCACTGAATAGTGCGTTTTTAAACTTAATTCGCTCATAAATGTTCTTCTCCTATATCTTTTACGTTAAAGATCATTTATGATTAAAACTTATTAGTTAAAGTTGGTCGCCGATTACGTTCAATGCGTTCTGCTGTTCGCCCAGCCCAAATCACTTCAGGGGCAACCCCTATGGCATTTGCAACTAAGCGTTCCATTTTGGGGTAAGGCTTGTCTAAAACAGACTTCAGCGTGTTATGGCTAACATTGCCTGCTTTAGCCAAAGAACGAAGTGACCAACCTTTTTTACGAAGTTCCGCAAGAATATCGGCTTTATGCCAATCTCTCTGTGCGGTTTTTTTAACATCGTTTAATACACTCATTCGATACACCTCTTTTTATCTATTTGATGCGTGTATTTAACCGTAAAACTTTAAACAAATCAACCGTAAAACATAAAAACATCTAAAATATTTTTGCTTTATTCATAAATAACTTAAAAATCAATGGTTTATGAGTATGTTTTGCGAGTAAAACTTTATTAATGGAAACGTAAAAGATGAGTAAACCAAACATTTACGATGAGAGCTTCTCAGAAAGAATGAAATGGATTGCAAAAAATAGCTTTAAGGACAATTACAGTGAGTTTGCAAGAGCAGTGGGGGTAGCCCAAGCATCACTATCTAGGTGGGTAAAAGGAGAGGCAGATCCATCTCGTTCAAATCTTGTAAAAATAGCAGAGGTGTCAAATGTGAGCCTTGAATGGCTGGCAACAGGTAAGGAAAGCAAACCACAATCAGAGAATACCAGTATTGTGGCAAGAGAGTTTGAGCGACTAGAAAAAATGGCTGATGATATTGTTTCAATGATTAACAGCTTCAGAACAATCAACGTTTCAGCAGGCTTTGGCAGCTTTAACGAGGGCGTAACGAAGCCAGACGGGCAAGAACCTTACGCCGACAGCCTGCTGCAAAGCCTCGGCGTAAAAGCCCACAACTGCGGCGTGTTTTGGGCAAATGGAACATCAATGCACCCTACCATTGCAGACAGTGACCAAATGCTGGTAGATTTCAGCAAACGAGAGCCTCGTGGTGATGATAAGATTTATCTTGTGCAGAATGGGGAAAGCGTATGGGTTAAACGGATTAGAAAAGAATGGGACTATATTGAATTAATTAGCGATAACGAGTCCTACCGCCCAATACAGATTACCGCCGAAGAAGCTCAAAACCTCCAAATCATCGGGCAGGTAGTCCACATCGGACACTCTTTAGTTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017521|43992:51536|47015_48011_-|WP_006253442.1|tail|DBSCAN-SWA MAKNMKVQLELTAKDTASPVLNQAAKTAEKAFKNTERAAQKSGNAQTQAAQKAANATESSNRKIEQSYRNARRVAADVSRARETLGVRAENAIQREIEQTRAAYDRLKRSGVASQNELRRASEATKQRVRELNAELGKTSFGDKAKGFGRGLMSAGVGIAAGAAMARQPAKNQMEFDRQLAMASNTAFSDRDVKGRIEGKKELLAAVQEAVKVGGGTKEDALLTLDTLIASGTMKAETAMSLLPTLQKGAVATGASSEDMAKIAISSMQQFGIKEEDIGRALDMAVAAGQAGNFELADMARWLPQQMAAGNTARHWAVYYRLYRMTQTADG >NZ_CP017521|43992:51536|48281_48650_-|WP_006253443.1|DBSCAN-SWA MKITLNLGIEYNGKIRRDCTVRLLTMGGQCTAQEMIADLGFEENSEALSKREQTLVDMAYLSQQVTFDGIYQGNVTAQFLFDNLATEDYWQLIEATLTLRKKRLENGVSQSESESPANPDLA >NZ_CP017521|43992:51536|49513_50317_-|WP_006253446.1|transposase|DBSCAN-SWA MSELSLKTHYSVAELLSFKLSSLPSAHKNVLEKAIRENWQSQKRKGRGGGVEYELISLPTEVQQEIRTKLLKLLPAEISKGELSVVRQNIDLEQITDKQLSTADARIMVVRWFLMQEVQLGLSRTKTLDQVIAAVASSEIPAEICKAIMAGNSKAGGKLKLSKRTLHSWVLAYEAGENSAERLKQMIPLKTQKRAVPERCGWLQAFLPFYQTFSNVALTQAYAQFAMQYEGEDLPTESQVRYALKQLPDYVVQQGRKLPVKKIRLAR >NZ_CP017521|43992:51536|43992_44223_-|WP_095586248.1|DBSCAN-SWA MESHKTGNIITEQASKQASKQASKQASKQASKQASKQASKQASKQASKQASKQSVAQFKQAPLPFTGQKRMFLKHF >NZ_CP017521|43992:51536|48649_49024_-|WP_006253444.1|DBSCAN-SWA MSIVYEGSCVLEVDGVEIEITKLDVKTVTGRKLVKTMNSSGRARGYSQGIAEYTLSVTAVEPQDGSVIDWDNIKNAKLTKYPLDNSEKRTSYLGCFTTDVSESYTVDGESVRDIQLNALRKVNE >NZ_CP017521|43992:51536|46509_47067_-|WP_006253441.1|DBSCAN-SWA MGGLLPPVSYDPNGRWLALSLEVEGRELDRIDARAKTLIDAVDVSTGIFIDDWERVCGLTANSSLPLETRIERVIAKLNQLGGLSIGYITQVAKELGYCIKISEPQPFIAGLSRAGDMLWHKDIMWTFFVDVCNPTDDYKRFRASVSMAGDALMGRYKDPILESLLEEVKPAFSRVWVRYLGDIE >NZ_CP017521|43992:51536|50361_50640_-|WP_006248972.1|DBSCAN-SWA MSVLNDVKKTAQRDWHKADILAELRKKGWSLRSLAKAGNVSHNTLKSVLDKPYPKMERLVANAIGVAPEVIWAGRTAERIERNRRPTLTNKF >NZ_CP017521|43992:51536|44209_44452_-|WP_006248673.1|DBSCAN-SWA MTKKHYCTGWRNAPANINSCCHQHDRDYGIKGTVSRAEADKRLRHCLISQGNPIKAWVFWVVVRLFGWIYYKEKNINGKS >NZ_CP017521|43992:51536|50816_51536_+|WP_006248970.1|DBSCAN-SWA MSKPNIYDESFSERMKWIAKNSFKDNYSEFARAVGVAQASLSRWVKGEADPSRSNLVKIAEVSNVSLEWLATGKESKPQSENTSIVAREFERLEKMADDIVSMINSFRTINVSAGFGSFNEGVTKPDGQEPYADSLLQSLGVKAHNCGVFWANGTSMHPTIADSDQMLVDFSKREPRGDDKIYLVQNGESVWVKRIRKEWDYIELISDNESYRPIQITAEEAQNLQIIGQVVHIGHSLV >NZ_CP017521|43992:51536|48063_48252_-|WP_006251296.1|DBSCAN-SWA MILLSKFAITAEQVWQMPLLEVFAWIESYLESEGVKTPHSPMGANSEVKRESYVFTRCGKIE >NZ_CP017521|43992:51536|44452_46513_-|WP_134983781.1|tail|DBSCAN-SWA MKQVMNPINTPTQRFKDGNPATGEYGTIVTAEFLNNVQDSVINTQQELHSVLAEAGIEANDEQVNQVAKAIKKIAGDATRDNFNALANPDGYKHIGRCKSVAELRTIRPTEHGQRILVDAYYEDGTTGGGEFVADLQDLVTPDDGGVCFVVNNNGGRWKRVDLSHLTLFDFGAVGDGVTNDESAFVNAMRYSQFFIENGTFRINNAVNSVRDNVQILGNKTGKLVLGAGIQQAEAEVFNINHSNYFISGFCIETPNKAIGIRFKSLDDAGVKNLHIDNVVFNGTFYGVRAGESIQADTNYPTDNVIVQNCQSYCGSGNAGHYLCTKVKGVRFFNNIAIGGRNVSAYGATSCSDIFILGNREQGMAVTTVDVEAGVQVEDVQTGECVVANNICSHDIWMSGAKNAIINSNLCRRLRVTSGNPTDTGSNNVEFSNNQAKSIAISKYGSFDNPSLFIDNINFINNILEPSEFNQDVYIDGTILKQCQFINNRCISKSKQYSVRLARNNPCLNLTFKSNKLSDNPAIISGKQGVIFCDDLSLGVNKHRLRLRFSSPINFTVNQEWQKMPFDRVLNDINGHVDIVSGQFIARTGGTFHLKGKITVTNSSEDVLNLYQLRLLINNEEKERLINQSVSPKNSKSNTNGMTTINFDTVVYLKVGDIVDLQYKTTHELTLLSDSFLSQIYVTQEF |
11 | Mannheimia_phage(81.82%) | tail,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
577791 : 661817
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017521|577791:661817|DBSCAN-SWA 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92 | Mannheimia_phage(17.02%) | head,tRNA,plate,tail,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
917846 : 973811
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017521|917846:973811|DBSCAN-SWA 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59 | Mannheimia_phage(26.67%) | integrase,transposase | attL 940683:940698|attR 974712:974727 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1073657 : 1080442
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017521|1073657:1080442|DBSCAN-SWA TATGACAGAAAAATCGCAGTTAAACTTTAATTACCAACCTTCGAATAATCATGCTAATGCTCAGACGATGATCTTCTTACATGGATTGTTTGGAGATTTAAATAACCTAGGCGCAATAGCAAAACCATTCGCAGAACGTTACTCCATTTTAATGGTTGATCTCAGAAATCACGGGCGATCTTTTCATTCAGACGAAATGAATTATGCTTTGATTGCACAAGATTTAGCACAATTACTCACAGAATTAAATATCCAAAATGCTATTGTGGTTGGGCATTCAATGGGCGGAAAAAGTGCGATGGCATTGGCTGCATTTGCTCCTGAACTGGTGGAGAAATTGGTAGTGATTGATATTGCCCCGGTCACTTATACCCAAAATCGGCATCAGCAGGTTATGGCAGCCTTATTTGCGGTGAAAGAAGCTAAACCCCAGAATCGTCAGCAAGCTAAAGCGATAATGGCTGAATATATTCGAGATGAAGGCGTGCAACAGTTTATGTTGAAATCTTTTGATGCCCAAAGCGAGCAATCTTTCCGTTTTAATTTACAGGCGCTAAAAGATAATTATCAGAATGTGATGGGGTGGCAGCAGGTATTTGTGGATAAACCGACCTTGTTTATTAAAGGTGCATTATCGGATTATATTCAAGCAGAGCATACACAAACGATTTTGGCACAATTTCCGCAGGCCAAATCTTTCATTGTGGCAAACGCTGATCATTGGGTTCACGCAGAAAAAACAGGAACTGTTGTGAGAGCAATCAATAAATTTTTAGAAAAATAAGGGAGAAAAATGCAAAGAGATACATTATTTTCCGCTCCGATTGAGAAATTGGGCGATTTTACTTTTGATGAATCGGTTGCTGAAGTGTTTCCGGATATGATCCAACGCTCCGTGCCGGGCTATTCCAATATTATTACTGCTATTGGAATGTTGGCGGAGCGTTTTGTCACAGATAATTCAAATGTTTATGATTTAGGTTGTTCACGAGGCGCAGGGATTTTATCTATTCGCCGTAATGTGAATGCGAAGAATGTGCAGATTATCGGGGTAGATAATTCTCAGCCGATGGTTGAGCGTTGTAAAACCCATTTAAGTGCTTATCACTCTGAGATCCCGGTGACGATTTTACTTGATGATATTCGCCACATTGAAATTAAAAATGCTTCAATGGTGGTACTTAATTTCACCTTGCAATTTTTACCAAGAGAAGATCGCCTAGCATTATTACAGAAGATTTATCAAGGATTAAATTCCAATGGCATTTTAGTGTTATCGGAAAAATTTACCTTTGAGAGTGAGGAAATGAACGAGCTATTGATCGACCTTCATCACACATTCAAACGAGCAAATGGCTACAGTGAATTGGAAGTCAGCCAAAAGCGTAATGCTTTGGAAAATGTGATGCGAACAGATAGTATTGAAACCCATAAAAAACGTCTGCAAGAAGCTGGTTTTACACAAGTTGAACTTTGGTTTCAATGCTTTAATTTTGGCTCAATGATTGCAATTAAAGCCTAACAAGCGGTGATATTTGTAAAATTTTTTGCAAATTCTTGATAAAAAGCAACCGCTTGCATTCTATCTATTTCTTTATAATAAAAGTCAGTTAGAATCAGTTATAATGCACCACTACTTATTTAGGAGGAAAAAGGTATGGCAACGATAAAAGATGTCGCAAAATATGCTGGTGTATCGACTACAACGGTTTCTCACGTTATAAACAAAACCCGCTTTGTAGCAGAGGACACTACAAAAGCAGTTTGGGAGGCTATTAAAGCGCTGAACTATTCTCCTAGTGCTGTAGCGCGGAGTTTGAAAATTAATACGACTAAATCTATCGGTATGATCATTACAACCAGCGAATCACCGTTTTTCGCTGAAATTGTGTTAGCGGTAGAGGAATTTTGCTATAGCAAAGGGTATTCACTATTTTTGTGCAATACTCAAAACAAACTTGAGAAAATTCAAAATCATTTAGATATGCTCATCAAAAAACGGGTTGATGGCATTTTGGTGATGTGCTCCGAATATACAGCTAATTCATTTGATATCTTTGAAAACAGCAATATCCCAATGGTGATTATGGATTGGGGACGAAGTGATGAACGCAGTGATATTATTTTAGATCACGGTGTTGAAGGTGGCTATATTGCGACTCAGCATTTAATTGAAAACGGGCATCAAGATATTGCTGTAATTACCGGCAATAGAGATAAAGAAATTGCAAGAACCCGTTTTGAAGGTTTTAAAAAAGCGCTATCTGAGGCGGGTTTGTCTATTCGTGAAGAATGGATTCAAGAAGGCGATTTTGAACCTGAGGGGGGGTATGAGTGTATGAATAATTTGCTTAAGAGCAGTGAAAAATTACCAACCGCGGTTTTTTGTTTTAATGACTCAATGGCACTAGGGGCAATTTCAGCTATTACCGAAAAAGGGCTGAATGTGCCGCAAGATATTTCAGTGATCGGGTATGATAACGTGCATAGCTCACGCTTTTATGCACCGCCTCTTACGACAATCCATCAGTCAAAATCTCGCTTAGGCTCGGCAGCATTAGAATTATTATTAGAACGTATTGAAGATAACGAAAACGCAAAAGAGCCTAAAGTATTAGAGTTCTTTCCTGAATTGGTCAAACGTAAATCGGTTCGGAATTTAAACATTAAGGAGTAATATGGAAACATTGATTGAATTTTTTAGTAGCTATGGTTATTGGGCTGTTTTTCTTGTGCTACTTGCCTGTGGTTTCGGTGTGCCGATTCCTGAAGATATTACGTTAGTATCCGGTGGTGTTATTTCAGGATTAGGCTACACCAATGTGCATTGGATGCTGGTTGTTAGTATGTTAGGAGTATTAGTTGGCGATAGCACAATGTACTGGCTAGGTAGAATCTATGGCGAAAAAATTCTCAAATTTCCATTAATCAGGAATGTTGCGACACCTGAACGTTTTGCAACCGTGCAAGAACGTTTTGAAAAACAAGGATGGAAACTACTTTTTATGGCTCGTTTTTTACCTGGCTTGCGCGCGGTGGTTTACTTAGTTTCAGGTATTACCAGAAAAGTCAGCTTCGTAAAATTTTTATTAGTTGATTTCTGTGCCGCTATTATCTCTGTGCCAATTTGGGTTTATTTAGGCGACTATGGGGCATCTAATTTGGATTGGCTAAAAGAACAAGTAGCTAATGGGCAGCACCTCATTTTTGCCATTTTAGGCATTGTTATTCTATTTTTAGGCTGGAAATGGTATAAAAATAAAAAGCAGTATAAAAAGTGAAACAAAAGACGAGCATTTCATCTTAAAAAGATATAATAGCAAAACAGTTGGTAAGAATAATTATAAATATCCATTACCAACTGTTTTTTTGAACTATATTTTAACTTAAAAAATTAGGTTTAACTGTGTCACTTTTTCTTGAAGAAGAACGAAATAACAGTAAGTATTAAAAAGACAAAAAAGAGAATTTTGGCAATTTCAGTAGCACTTCCAGCAATACCACCAAATCCTAATAGCGCTGCGATTATAGCGATGACAAAAAATACGACTGCATAATGTAACATAGTTATACTCCTTACTGTGTAATAAACTGATTAAAAAACTAACATAGTTAATGTATGATTGCAAGGCATGTACTATATTAATCTTGATTAATCCGACTTGAAATGGCACTTTGCTGGTTCTTATATTTTGCATCTTTTCGCGCATTATAGGGTTTTGCAGCATCACCACTTAAAATCTCAAAGCTTAATGCGCCAATTGCCATATTAGGGCGTAAAGCTAGGGGTAATTTTCCAGCATTAAAAAATTCCAATACAATTTTGCCTTCCCAACCCGGATCGATTCTGTGGGCGGTAACGTGTACCATTAAGCCTAATCTAGCAAGTGACGAACGACCATCTAACCATCCAACGATATTGGCTGGTAAGGAAACCGATTCAAGGGTTGTTGCGAGTGCAAGGTCACCGGGATGAAGGAAAAATGCTTCATCATCACCGATGATAATTTCATCACTCATCACTTTATTTAACTGAGCGGCAACTTCTTCTCTAGGGCCACTTAAATCAATATAGGGCGTTTTATGTTCACGAAATACACGAAACGAATTACCTAAACGCACATCTGCAGTGGCGCCAGAAATTTTATCGTCTGAAGGTCGAGGCGTTATGGCAATAATACCTTCATCTAAGTAACGTTTAATATCTGTATCACATAAACGCATATTTAGCTCCTATTTTATTTTAGTAATTGCTTAATTTGTGCTTTAAGAATATCAATGGCAATACGGTTTTTGCCACCTTTTGGCACAATAATATCAGCATATTGTTTAGAGGGTTCGATAAATTGTAAGAACATTGGGCGAACGGTTTTGCGATATTGACTAATCACTGATTCCATCGAACGTCCACGTTCCACCATATCACGTTGTAAGCGGCGGATAAAGCAGATGTCCAGAGGAGCATCTACGAAAATAGAAACATTAATTTCATTGCGAATATTCTCATCTGTCAGCAATAAAATACCTTCTAAAATAATGATTTTCTTTGGTTCAAAGTGCTTCGTGGTCGTTTTACGATTATGTTCGGTATAGTCATATTCTGGAATTTCAATCGCATTACCTTGTTTTAATTGGCGTAAATGTTCAACCAATAAATGATGATCCATTGAATTAGGGTGATCGTAATTGGTTTTAATCCGTTCTTCCATTGTTAGATGAGATTGATCTCTATAATAAGCATCTTCGGAAATAATACCGATATTATCTGTTCCCAATTCATTTTTGAGTTCTTTATAGATGGTTGAGGCAATCAGGCTCTTACCTGAGGCAGATGCGCCGGCAATCGCAATGACAACGCAAGATGAAGTCTGGCTAGTATCAGTCATAAAAAATTTCCTATTCAGTCAAAAGAGTATTCGATAAATTATACCGAAGTTTTGCAAAATTTTTTGTATAATTGACCGCTTGTTATGCGATTTTGGAGAAAAAATGGATATTTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017521|1073657:1080442|1077298_1077880_-|WP_006248952.1|DBSCAN-SWA MRLCDTDIKRYLDEGIIAITPRPSDDKISGATADVRLGNSFRVFREHKTPYIDLSGPREEVAAQLNKVMSDEIIIGDDEAFFLHPGDLALATTLESVSLPANIVGWLDGRSSLARLGLMVHVTAHRIDPGWEGKIVLEFFNAGKLPLALRPNMAIGALSFEILSGDAAKPYNARKDAKYKNQQSAISSRINQD >NZ_CP017521|1073657:1080442|1079389_1080442_+|WP_006248955.1|DBSCAN-SWA MFKKFLGLFSNDLSIDLGTANTLVYVKGQGIVLDEPSVVAVRQDRMGSLKSIAAVGSHAKLMLGRTPKSIMAIRPMKDGVIADFFVTEKMLQHFIKQVHSNNFMRPSPRVLVCVPAGATQVERRAIKESAIGAGAREVYLIEEPMAAAIGAGLPVHEAMGSMVIDIGGGTTEVAVLSLNGIVYSTSVRIGGDKLDEAIIAYVRRHFGSAIGEATAERIKQEIASAKIESDDDVKTMEVHGHNLAEGAPRTFELNSRHVLEAIEQPLNGIVEAVKSVLEQCPPELAADIFERGMVLTGGGALLHNLDRLLSDSTGVQVVVAEDPLTCVARGGGKALEMIDMHGGDVFSIDD >NZ_CP017521|1073657:1080442|1073657_1074440_+|WP_006253612.1|DBSCAN-SWA MTEKSQLNFNYQPSNNHANAQTMIFLHGLFGDLNNLGAIAKPFAERYSILMVDLRNHGRSFHSDEMNYALIAQDLAQLLTELNIQNAIVVGHSMGGKSAMALAAFAPELVEKLVVIDIAPVTYTQNRHQQVMAALFAVKEAKPQNRQQAKAIMAEYIRDEGVQQFMLKSFDAQSEQSFRFNLQALKDNYQNVMGWQQVFVDKPTLFIKGALSDYIQAEHTQTILAQFPQAKSFIVANADHWVHAEKTGTVVRAINKFLEK >NZ_CP017521|1073657:1080442|1074449_1075178_+|WP_006248948.1|DBSCAN-SWA MQRDTLFSAPIEKLGDFTFDESVAEVFPDMIQRSVPGYSNIITAIGMLAERFVTDNSNVYDLGCSRGAGILSIRRNVNAKNVQIIGVDNSQPMVERCKTHLSAYHSEIPVTILLDDIRHIEIKNASMVVLNFTLQFLPREDRLALLQKIYQGLNSNGILVLSEKFTFESEEMNELLIDLHHTFKRANGYSELEVSQKRNALENVMRTDSIETHKKRLQEAGFTQVELWFQCFNFGSMIAIKA >NZ_CP017521|1073657:1080442|1077065_1077221_-|WP_006248951.1|DBSCAN-SWA MLHYAVVFFVIAIIAALLGFGGIAGSATEIAKILFFVFLILTVISFFFKKK >NZ_CP017521|1073657:1080442|1075313_1076333_+|WP_006248949.1|DBSCAN-SWA MATIKDVAKYAGVSTTTVSHVINKTRFVAEDTTKAVWEAIKALNYSPSAVARSLKINTTKSIGMIITTSESPFFAEIVLAVEEFCYSKGYSLFLCNTQNKLEKIQNHLDMLIKKRVDGILVMCSEYTANSFDIFENSNIPMVIMDWGRSDERSDIILDHGVEGGYIATQHLIENGHQDIAVITGNRDKEIARTRFEGFKKALSEAGLSIREEWIQEGDFEPEGGYECMNNLLKSSEKLPTAVFCFNDSMALGAISAITEKGLNVPQDISVIGYDNVHSSRFYAPPLTTIHQSKSRLGSAALELLLERIEDNENAKEPKVLEFFPELVKRKSVRNLNIKE >NZ_CP017521|1073657:1080442|1078645_1079275_+|WP_006248954.1|DBSCAN-SWA MDIFIQGFIVCFGLIVSIGAQNAFLLKQGILKQHIFWIALLCFLGDVFLMTIGVLGLGTLIAELPVVSFIISLLGAIFLLSYGSRSFISVFKSGEYLVASGENATSLKKALLITFAITFLNPHVYIDTVVIVGSIGGKLDFNGKIYFLAGALLCSFIWFFGIGYGASLLSPYFAKRRTWQILDAVTGLIMYFIAFSLLIYTYQLALQIF >NZ_CP017521|1073657:1080442|1076334_1076937_+|WP_006248950.1|DBSCAN-SWA METLIEFFSSYGYWAVFLVLLACGFGVPIPEDITLVSGGVISGLGYTNVHWMLVVSMLGVLVGDSTMYWLGRIYGEKILKFPLIRNVATPERFATVQERFEKQGWKLLFMARFLPGLRAVVYLVSGITRKVSFVKFLLVDFCAAIISVPIWVYLGDYGASNLDWLKEQVANGQHLIFAILGIVILFLGWKWYKNKKQYKK >NZ_CP017521|1073657:1080442|1077894_1078542_-|WP_006248953.1|DBSCAN-SWA MTDTSQTSSCVVIAIAGASASGKSLIASTIYKELKNELGTDNIGIISEDAYYRDQSHLTMEERIKTNYDHPNSMDHHLLVEHLRQLKQGNAIEIPEYDYTEHNRKTTTKHFEPKKIIILEGILLLTDENIRNEINVSIFVDAPLDICFIRRLQRDMVERGRSMESVISQYRKTVRPMFLQFIEPSKQYADIIVPKGGKNRIAIDILKAQIKQLLK |
9 | Mycobacterium_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1156428 : 1174159
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP017521|1156428:1174159|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP017521|1156428:1174159|1161722_1162937_-|WP_014325824.1|DBSCAN-SWA MTTTRPAWAYTLPAALLLMAPFDILASLAMDIYLPVVPAMPGILNTTPAMIQLTLSLYMVMLGVGQVIFGPLSDRIGRRPILLAGATAFVIASLGAAWSSTAPAFVAFRLLQAVGASAMLVATFATVRDVYANRPEGVVIYGLFSSVLAFVPALGPIAGALIGEFLGWQAIFITLAILAMLALLNAGFRWHETRPLDQVKTRRSVLPIFASPAFWVYTVGFSAGMGTFFVFFSTAPRVLIGQAEYSEIGFSFAFATVALVMIVTTRFAKSFVARWGIAGCVARGMALLVCGAVLLGIGELYGSPSFLTFILPMWVVAVGIVFTVSVTANGALAEFDDIAGSAVAFYFCVQSLIVSIVGTLAVALLNSDTAWPVICYATAMAVLVSLGLVLLRLRGAATEKSPVV >NZ_CP017521|1156428:1174159|1166180_1167026_+|WP_025288851.1|DBSCAN-SWA MEYTSKSQIARNKSLIIFGIVNITSDSFSDGGRYLAPDAAIAQARKLMAEGADVIDLGPASSNPDAAPVSSDTEIARIAPVLDALKADGIPVSLDSYQPATQAYALSRGVAYLNDIRGFPDAAFYPQLAKSSAKLVVMHSVQDGQADRREAPAGDIMDHIAAFFDARIAALTGAGIKRNRLVLDPGMGFFLGAAPETSLSVLARFDELRLRFDLPVLLSVSRKSFLRALTGRGPGDVGAATLAAELAAAAGGADFIRTHEPRPLRDGLAVLAALKETARIR >NZ_CP017521|1156428:1174159|1158459_1159365_-|WP_075270677.1|DBSCAN-SWA 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MMSTSYRHLTINEREKIMILLAQGKKQAEIAKALGRSSSTISRELKRHALESYSATNAQNSYLKHRQNSKAQRKLEQPEYFNLVQEKFLTENWSPEQISARLKLEKSELSISYSTIYRGIYSGLFDIGERKASRKLRHKGKTRHTKNHHEKRGKIQISNHLNDRPISAQNRSRFGHWKADTVLGKAGGACLLTLTERKSRFELVKKIPAKKAEAVQKAMIELLDSHILRSITPDRGKEFAQHRLVTEALGVEFYFPEPHQPWTRGTNENTNGLLREYFPKHQDINQWSEVDIQQVVNKLNLRPRKCLGWKTPYEVYFKKTLHLV >NZ_CP017521|1156428:1174159|1164418_1164643_-|WP_075268008.1|DBSCAN-SWA MFELCRINANQGLTAEIDWNYTSWSRRCRKILIGLVVRGAKTVVVRGKNRILTRNRKKPEMTVPIIYLFGGVHL |
19 | Staphylococcus_phage(28.57%) | integrase,transposase | attL 1157161:1157175|attR 1175034:1175048 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1254581 : 1362521
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP017521|1254581:1362521|DBSCAN-SWA AATGTCAATTACAGATAAACAAACCTTGTTACAACAAGAACAGGAGCTACGACAAGCGGTCGAATTTGCCTTAAATTTTGCAAAACAGGCTGGGGCAGAGGCGGAAGTAGGCGTGACTAAAGTTGCCGGGCTTTCGGTTTCAAGCCGTTTAGAGCAAGTTGAAAACATCGAGTTCAATAACGATGGTTCTCTCGGTATTTCGGTTTATTTAGGCAAACGCAAAGGTAATGCTTCCACCTCCGATCTTCAGCCAGAGTCGATTCAAAAAACGGTTGAAGCAGCTCTTGCGATTGCAAAATATACCTCAGAAGATGCTTGTACCGGGCTTGCTGATAAAGAATTGCTTGCCTTTGAGGCAGAAGATTTGGAATTGTACCACCAAGCGGATATTTCAGTTGATCAAGCAGTCGAATTGGCGATTGAAGCGGAGCATTATGCCTTAAATGCAGACGAAAAAATTGTGAATAGTGACGGGGCAACTTTCAATTCTCACAGTGGCGTGCGTGTTTATGGCAATACGCACGGAATGTTGCAGAGTTACCTGTCGAGCCGATATTCACTCTCTTGTAGCGTGATTTCAGCTTATGAAGATCAGCTTGAGCGTGATTATGAATACACCATTTTCCGTGAGTTTGATAAATTACAAGCACCGAAATGGGTAGGGGAGCAAGCTGCAATTAAAGCGGTAGATAGATTGAATCCGCAACGAATTAAGACCGGCGAAATGTCTGTGATTTTCTATAACGATGTGGCAACCGGTTTAGTGGGGCATTTGGCCGGAGCTATTAGTGGCGGTGCATTATACCGCAAATCAAGTTTCTTATTAGATAAATTAGGCGAACAGATTCTGCCTGAATGGTTTGCGATTTCAGAGCGTCCGCATTTGTTGCGTCAATTAGCCTCTTCTGCGTTTGATAGTGAAGGTGTAATTACCCAAAACCGTGAAATTATTACTGATGGCGTGCTACAAACGTATTTAATGACTAGCTATTCAGGGCGTAAAATGGGGTTAAAAAGTACAGGACACGCAGGTGGTATTCATAACTGGTTAGTTAAACCAAATCGTCAAGGTGGTTTAAATACGTTACTTAAGGAAATGGGAACAGGATTATTAGTAACGGAAATGCTAGGTTCTGCGATTAATAGCGTAACAGGGGAATACTCTCGAGGTGCAGCAGGATTTTGGGTAGAAAACGGTGAAATTCAATACCCTGTAGCGGAAATTACCATTGCAGGGCAACTGCAAGATATGTATAAAAATTTAGTGGCGGTAGGCGATGATATTGAACACCGCTCAAATATCCAAACAGGTTCAATCTTATTAGAAAAAATGATGGTTTCAGGCGAGTAAAAACGGCCGCTTGTAATCAATTTTATTTGGAGAAATCAATGGAAAAACATCATATCGAAACGCTACATTCAAAAGAAGAAGTATTAAACCGAATCAATGAATTAGCAAAAGAAATCAATCAACACTATCACCAAAAACAGTGCCAAAACCTTGTAGTGGTTGGTTTATTGCGAGGCTCGTTTATGTTTATGGCAGATTTAGTAAGAAAGCTAGAGTTACCTGTAGAAGTGGATTTTCTAACCGCATCAAGCTATGGCAGCAGCACGGAATCCAGCCGTGATGTCAAAATTCTAAAAGATTTAGATGGCGAAATTCAAGGTAAAGATGTATTGATTGTAGAAGATATTATTGATACTGGCTTCACCTTAAGCAAGGTAGGGGAGATTCTCAAGTTACGTGAGCCAAATTCACTTGCTATTTGTACTTTATTAGATAAACCTTGCCGCCGCGAAGTTGATGTGCCCGTAAAATGGGTGGGATTTGAGATCCCCGATGAATTTGTGGTGGGTTATGGGATTGATTATGCCCAAAAATATCGTCATTTAGATTATATTGCTAAAGTAGTGATTGAATAAAAAAACTCAATCACTACTTAGATTTTCACGACTAATTACATTCTCGATTAAGGTTGAAATATAAAATATTCTTATCGAGAAAGAAAAATTAAAAGACTGAGCTCTATGGAATATAGAACTCAGTCTTGGGCTAGTCTAACTTTTAAATCGTAATCAGTTTACGGTATTACCAGTTATAACTTACATTTAGACCGAAATTACTTTCAGTAGTTTGAGAACCATAACGATGTAATTTGAAATCAGCCCCTAATGCCACACCATTTGCAAAGCGTTTTTTCAACCCTGTCGTGACAGAATACACGTTACTTTTATCCTTTATTTTGTATGTGTTTGTCATATCATTAGATTGAGATAAAGTTATATCACCATTGACAAAGCCTATACTTGGACGAATATAAGCATCAATATCATTTAGCTTATAATGGATATTCAATCCTACATCACTTGCATAGACCGTGCGGCTATTAATCGCAAGATCTTCATCTATTAATGAGCGAGAAGAACGTGAAACGTAAGCACCAACTGATGGGCTAATGCTTAATTTATCATCTAATTGAATACGATAAGCATAATTTAGGTAGCCATCAACACTGTTATTACGTGCTAGCATATCTTTATGTTTTACGCCACGATAGCGTAAGAAGCCAGAAAGTTGGTGATTATCCATTTCATATTTAGCTCTTGCACCAATTTGTACGCTATTACGATTTTTATTACTGTATTCAAAGAATAAGCCACCACGTAAATTCTCACTTAATTTTGTATTCAAGCCTAAGGATAGATTATTGTGTTTTACACCTGTGTCGTAATGGGCAAAGAAATTATCAAAGCTACGATATAAAATATCAGTGTTATATTCATTGAACTTTCTCGCTTTTTGGATGTAGCGAGTGAAGTCTAATTTAGTATTTAAAGCCAAATAGCTTTCATATAAATTAGCATAGGTATCCATAATACCATTATAATTTAAATAAGTGGTATCCGCTGTATTGGTGACTTTATTCACATAGGCTAAGGCTCTTTGATAAATATTCTGTTGAGACGGCAGTGCTTTAGTAATATTTTTTGCCAATTTATCCAGCTCATCACTATTGTTTTTCAGATTATACATTTCTTTGTTAATCACAAAAGATTGTGCAATCGCAGTATCATTAGCACGACGCATTTTTTCGACTAGCGTCTCTTTTTGAGCTTTATTGAGATAAGGCAGTGCATTGATTTTATCCAAAGCAGGAGTAAGTTCATCTGGTAATCCCCATTCGATAGCTTTTGCTTCCATTTCAGCAATATGTTCAGTTAAATTTTTTACTGAAATATCACCATCGTTTTCAAAAGCAACAAATAAATTCCCTTCTTTATAGGCTAAAGAGGAATAACCAGCACCAGCGGCATTACCTGAACCTGGACGAATAATATGCACCTTGTGTTTGTGCGATGGATCTTTTGCATCTAGCATCCAAAGTGTAATATCACCCCTTTTCCACCCATCATTCTTTCCATCTGGTTTAGAGATTAGTAGCACTTTTCGACCATTTGGTAGTGTTACATAGATAGAAGAGCCTTGAGTTGGTTGTGAGCTAGTTGGTAATAATCCATTAGTTGGAGTAAATAATTCCCAGGTCTTACCCATATCAGTAGAAGAGTATGCCCAGCGACTGTTTCCTCGTCCAGTCATCACTAGCTTACCCGGTTCGAGTTCAAACACCATATTTTCTAAAGAACTTTGGTTCGGTGCAACTGGGTTGTCAATTTCTGGCATTTCCCAAGTTTTCCCATTATCCTTAGAATACATAATAGTGGTCGCAATACCATTTTGATGTGCGGTTTGAATTGGGAAAACCAACGTACCATCTTGCATTACAATTCCAGATCCGACCCCGCCTAAAAAGCCTAAGGTAGGTTTTCCATTTTTGGTGACTTTAGAAAATACGTCTAAATTGCTGAATTTACTAAACTCAGTATTTTTCTCCCAATTTAAACCACCATCAGTAGATTTATAAATGGTAGCTGCCCAGCTGCCACTATTAAAGTGAGGAACACGCCCACCATACCATTGTTGATCCGACATAGACCAAGTTCCGTGCATTACATATAAACTATTATCAATAGGATTATGTAATAGCGTTGGATCCATTGAACGGCGTGCTGGGTGATTAGTTCTATCAAAAGACCAAGCGGTTTTCTTCGTCCAAGTATGGCCACCATCGGAAGAAATCGCAATACCAGGATCAATACGATCTTGGTCATACGCACGATTCCAGCGTAAATCAAACATAACAACTAATTTGTTATCTTCGGTAACTTGCATAGCTGGAATACGGCTATAATATAATGGCGCAGTACCTGCAGCTTCACCATTTGGACCAATACCAGCCCAAGGCTCGCCAGCTACTGGAGTGGTAAAGTTATCGACTCCGACACGCTTGGTAATATTTGTGAGATTAAAATTAAGGTCGCTTTTCCAAAAATCAGAGTTAGCGGAAGCAGATAAAATACTTAGGAAAAAGTATGGGGATATGATTAACTGATTGATTTTTCTCATCATTTTCTCCATTAGGGGGATAAAGTGCAAAGACTAATTTTTAGCTGAACAGCTATTATATGGTTCAATCTTATGTATAAAATACCAGATAGCAAGTAATTATAACGGCATTTTATGCTTAAGATTTAAGCACAAAAAAATAAAAAAATCTGAGAGATTTGTCACAATTATTGAAAAAAGTGATATTTTTTAAATATCACCGAAGCCCAAGCTTTGTATCAAGGTTTCATCTTAATGTTAGTGATAAAAGTGACTTTTTCTGAACTTTGGTGTAAAAAATATAAGAGCTGTAACAAAAAGGCCGCCAGGCAATAACCTAACGGCATTACAAGCGGTCATATTTGGCGGAAAATTTGCTAGGCTACTTAAAATTTGCGATATGAAATGTTTAGTGCCATTGAGCTAAAACAACAAAAAAGCCTGTAAACGTTGATTTTACAGGCTTTCTAAGGTTTTTTCGTTTAGCTCTGTTGAACTAAATTTAGTCAAATGGTGCCTGGTCGAGACTTGAACTTAATGGCTTCAAGTATTG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120 | Mannheimia_phage(81.58%) | terminase,tRNA,integrase,tail,protease,capsid,transposase | attL 1247101:1247160|attR 1301374:1301463 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1541126 : 1670093
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP017521|1541126:1670093|DBSCAN-SWA 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154 | Mannheimia_phage(92.8%) | portal,terminase,tRNA,head,plate,integrase,tail,holin,capsid,transposase | attL 1662140:1662158|attR 1678909:1678927 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1675666 : 1763719
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP017521|1675666:1763719|DBSCAN-SWA TTTAATGAGCTTCGTCCCAGTTTTCGCCTACGCCAACTTCGGCAATCAGTGGCACTTTGAGGCTAATCGCTTTTTCCATTTCGGTTTTGATTAATTGGCTGTAATGGTCGATTTTATCGGCTTTGACTTCAAACACCAATTCATCGTGAACCTGCATAATCATTTTGATTTCATCATTATCACGAATCGCATTATCAATACCAATCATCGCCACCTTAATAATATCGGCAGCCGTGCCTTGCATTGGGGCGTTGATTGCCACCCGTTCTGCTGCTTTACGCAAAATAGCATTGCCGGATTTAATATCAGGCAAGTACAAACGGCGACCAAATAGGGTTTCAACATAGCCTTTTTCAACTGCAACTTCACGAATATCGGTCATAAATTGTTGAACCGCCGGGTAACGTTGGAAGTAGAGATCCATATATTTTTGAGCCTCTGCACGCCCAATCCCTAATTGGTTTGAAAGCCCAAATGACGACATTCCGTAAATCAGCCCGAAGTTAATTGCTTTCGCACTGCGGCGTTGTTCGGAGGTGACTTCACCTAACTCCACCCCGAAAATTTCGGCAGCGGTAGCACGGTGAATATCTTTGCCCTCCGCAAAGGCGTTAATCATTCCCTCATCATTCGATAAATGAGCCATAATCCGTAGCTCAATTTGTGAATAGTCGGCAGCGACAATTTTATAACCTTCTCTCGCGACAAAAGCTTGGCGAATCCGTCTGCCCTCTTCATTGCGGATCGGAATGTTCTGCAAATTCGGATCGCTGGAAGAAAGGCGTCCGGTTGCGGTGACTGCTTGATTGTAAGAGGTATGCACCCGCCCTGTTTTTTTGTTAATCAGTTGTGGTAATTTATCGGTGTAGGTAGATTTCAACTTACTTAACCCACGATGCTCCATTAATAACTTCGGCACTAAATGCCCTTGTTGAGCCAACTCGTCTAACACTTCTTCGTTGGTTGAGGGTGCACCTTTTGGAGTTTTCTTCAACACCGGCAAGCCTAATTTTTCAAACAAAATCTCTTGTAATTGTTTAGTTGAGGCAAGATTGAAGGTTTGCCCTGCTTCTGCGTGTACTAATGTTTCAACTTCCTCCAAACGTTTTTCAATTTCAGCCGATTGGGTCAATAATTTTTTCGGGTCAATCAACACGCCATTGCGTTCAATTCGAGAAAGTACGCCCACAAGTGGCATTTCAATTTCATCGAATAACTTCACCAATTCAGGCTCTTGCTGTAGTTTTTCCCACAATACTTGGTGGAGTTTCATCGTCACATCGGCATCTTCTGCCGCATATTCAGCCGCTTTTGCTATCTCGATTTTATCGAAGGTCAGTTGATTTTTCCCCTTACCAGCAAGCTCTTCAAACGGAATCGTTTTATGCCCCAAATAACGGGCGGCTAAATCGTCCATATTATGACGACCGGTGCTGTTTTGGGTGTAAGATTCAATCATCGTATCAAAAGCAACACCTTGTAGCTCAATGCCGTAGTTCGCAAAAATGGTTAAATCATATTTAATATTCTGCCCGATCTTTTTAATCTCCGGGTTAAGCAAAATCGGCTTGAGTTTACTTAAACAAGCGGTCAAATTTAGCTGATTTTTTACCAATTCATCGGAAGACGGGCTTTCTGAACGCTCCTCATCACCGAACATATCGGCTTGTTGCGGTTGGGCTTTTTGCTTATGCCCAAGCGGAATATAGCACGCCTCGCCATTTTCCAGTGCAAAGGAAATACCGACCAAATTAGCCGACATTGCGTCAAGGCTGTCGGTTTCGGTATCCACCGCAATCAAACGAGCTGCGGTGAGTTTTTCGATCCAGGCTGATAATTTCTGTTCAGTATCAACGGTCTCATATTTGCTACGATCGATCTCGACCACATTTGCAACATTTTCCTCATTTCTGACCGCTTGTGTTACTTGGTAATTATTCGGTACTTTTTCAGCCGAAGTTTGAGTGACCGGATTGGCATTTTGATTCACTTCGTTCAGCCAGCGTTTAAATTCATAATGCTCAAATAATTGAGCAAGCTCAGCACGGTCTTGCGGCTGTGTTAAAAGTTGATCGTGAGTAACATCAAGTTCCACATCGGTTTTGATGGTAGCAAGCAAATAGGATAAATCGGCATTCGCTTTTTCCGCTTCCAATTTTGGGGCGAAATTTTTTGCCCCACGGAAAGAAAGGGTGGCAATTTGATCCAAATTAGCATAAATCTGTTCAAGTGAACCAATGCCTTGCAATAAAGCTAATGCGGTCTTTTCCCCCACACCTTTTACGCCCGGAATGTTATCGGCGGAATCGCCCATTAATGCCAGAAAGTCGATAATCAACTCAGGCGGAATGCCATATTTTTCAATCACGCCTTCACGATCTAACAAAGTATTGTTCATCGTGTTAATCAACATAATGTGATCGTTCACCAATTGTGCCATATCTTTATCGCCGGTGCTGATCAACACATCTTTGCCGTCTTTAGCGGCTTGCACAGCAAGCGTGCCGATCACATCATCAGCTTCCACACCTTCAATCGAAATCAGTGGAATGCCTAAGGCTTTGATAATGCGATGCAAAGGCTCAATTTGAGGGCGTAAATCATCGGGCATTGGTGGGCGGTGCGATTTATATTGCTTAAACAACTCATCACGGAAGGTTTTCCCTTTGGCATCAAACACCACAGCAATATGGCTTGGATTCACTTGTGAAATCAGGCTTTTTAACATATTCAGCACGCCATACATTGCCCCTGTCGGTTCGCCTAAGCGATTAGTGAGCGGAGGGAAAGCGTGAAATGCTCGATATAAATAGGAAGAACCATCCACCAATACCAGTGGATTTTTTGCGATAGTTGCCATAAAAATCTCTTTATAATCAAATAAATATTGGCGTTATTATACAAGAATATTTAAGAATTGAGTGTGTATAAGGCTTATTTTAAATAAAACGTTCCGAAAAAACATTGAATTTCATTAAAAAATTCCTTTATTTATCAAATAAATGCGATTTGTTTCGGAACGTTTTTTTAATGCTTATTTTGCAACATACGGATTATCAATGGAAAGCGTTGCTGTAGACATTGTGCCTCCTAGTACAAAAAAACCGCTTGGTTTCCCTAAGCGGTTCTAATCTATAAGAACTATTAAACTACAATCTGCCCCGTCTCTTTTAAGTACTTATAGATACGCCCTAACATAATCTGCGTTGGCGTTTTGCCAATATCCTCTTTTGTTAGCGGTGCATCAGTAATCGCTTTGGCTGATTGAGCATCAATATATTTGTACTCACTTGTGATGATTACAAAGTTTGTTACCTCGCCATCGGTATCATCACCTGTGCCAACAACATACTTAGCATTGAGTGAGCCGTCATCTTGCGTTGAGTAGCTTGCGATGGTGGAATACATTGGGTTTAAGATTTTGTTAAAAGTTGTCATAATTTTTCCTTTTGTGGATTGTTGATAAAAAAAGACCGCTTGTAGTCATACAAACGGCTTAGTAGGAAGAGTAAATTGCTTTACATAATATAACCTTTTATTTATACTTCATTTATAAATAGTAAGTTATAAAAGGTTCAAAAATGGCAGACCCTATAGAATGGTCTATTATCACGACTGACTGCTTTGATGAATGGTTCGGTCAACAAGATGGAAGTACTCAAGAACGTGTCTTGGCTTGTTTAATCTATCTGCGGAAATTCGGTTATAGTCTAGGCAGACCTTATGCTGATACAGTTTATCAGTCTAAATTCCCTAATATGAAAGAGTTACGCATTCAAAACAAAGGTAAGCCAATTCGAGCATTTTATGCTTTTGACCCTTTACGCCAAGCGATAGTACTTTGTGCTGGCGAGAAAGGTAAAGACAAAAGATTCTATGAAAAAATGATCGCTCTTGCTGATGCGGAATTTACCTCCTATTTAAATAATTTAGAGAAAGAAAATGAAAACGTTAGATCAAATGCTCAATGAACTCTCTCCTGAACGCCGCCAAAAAGTGGAAGATATGGCTCAAGAAATGATTAGAGAGATACAACTTTCAAAACTAAGAGAAGAGCTAAATCTCTCTCAACAACAATTAGCTACAGCTCTCGGTATTTCACAGCCTGCTATTGCTAAACTTGAACAGAAAGATAACGATCCAAGATTATCCACGCTCAAACGCTATATTGAAGCAATGGGCGGTAAGTTAAAACTTGCCGTTGAATTGCCTACAGGCGATGAGCGTGTAATTAGGATTTAATTACTTTGTTAACCTGAATGCCCTCCTGAGCCAATACAGTTTTTCCCCGGTAATTGCTCTTGAGGGGCTAGTTGATAACAAAAGGTTGGTTTTGTTGTATAGTCTTGCTTATATTGAGTTGTACAAGCTGAAACCATAATTGTTGTAAGTAGTATAATTTTTTTCATATTTGCCTCCTATAATTGATAAGATGAACCATTTGTAGATGATATAATTGCTCGAAAATTCACTTTAGCACTTCTCCCACGCCCTGCACACCACGCACGACACGTTACTACATATTGAGTATTAGCAATGAGTATTGCCCCAGAATCATTAAATGGGTTAGATACATTAGGTGAAATAGTATTGCTAATATCAATTACAGACGGTAATGTAATTGTTGTCGGTGTCCGATTACTACCACTACCATAAAAAGTTTCGCTTTTACTCTCTCCTGTTGGAGTGTGGACAACATACAATGTTCTCGTCGCTTTTGTAGCAGGTAGTACAAATTGACATACATACTCATAATATGTATCACTTAATGCAAAACTGTTTTTCGTTTCTGAATATGTTTTACTTTTCCCTGTTGCTTTTGATGTCCAAGTTTTAGCCTCATAGATATTACCTCCGATCAATTGGTTGATTTCAAGTTCTCCAGTAAATTTACCTGTTAATCCCTCAATTCTTGCTCCTTTAATTATTCCCCCTGTAATTGTTGTACCTGAAATTGTCCCACCACTAATTGTCGTCCCTGTAATTGTACCAGCAGTTAC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99 | Mannheimia_phage(56.36%) | portal,terminase,tRNA,integrase,tail,holin,transposase | attL 1684202:1684235|attR 1707515:1707548 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1889122 : 1899439
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP017521|1889122:1899439|DBSCAN-SWA ACTAGAATTTAACTGAGTTAGCGTGGTTGAGTAAATGGTCTGCATTAAGATGGGCATATTTCTTTACCATCTCTAATGTTTCCCAGCCACCCAATTCTTTTAAGGTAAATAATGGTGTGCCGGCCTGAACGTGCCAACTGGCCCAAGTATGCCTTAAATCATGGAAATGGAAATCAACCAATAAACATTTTTCAGTCGCTTTGTTAAATATTTTGCGGTTAATATCTTGTAATGCCTGCCCTTTGCTTCCTACAAAAACATATTTAGGATTTTTCCCTCTCTGCTTTTGTAATAATTCAATTGCATCATCATTAAGTAAAAGCGATCTCGCTTTTTCAGATTTGGCAATATCATTCGAAACAATCGCTACTTTACGGATAAAATCTATTTTATCCCAAGTCATAGAAAGTATTTCTGTTCGCCTTGCTCCTGTTAATAAAGCAAAAGAGCAGATAGTTTTCATCCAATCAGTACTAATATTATTAATAAACTGCTTGGCTTGTTCTTTGGTAATCCAACGAACCCGGATATCATCATCAAAATCTCGTGATTCTGAATCCGTCATTACGTGGTTATATGGATTGGTTGGTGGTGGGTTTCCTGCCGGTTCGGTTGCCCAATTATTATTGCTGTTTCCGCTGTTTGAGCTACCGAGCATTTGTAGCTGATCGGCGATGATTTCGGTCGTCCAGCGGTCTGTGCCGTCTTGGGCTTGCCATTTGCGAGTGCGTAGCTTGCCTTCCACATACACTTGCGAGCCTTTTTTCAGGTATTTGCCGATAATGTCAGCTAAATTCCGAAAGGCGATAATGCTATGCCACTCTGTGGCTTGTTTTTTCTCGCCTGAGGTTTTATCCGTCCATTCGGTTGAAGTTGCTACACTGATTTTGGCGACTGAATCGCCATTTGGCATTGTTCGTAGTTCCGGGTCGTTACCTAGGCGACCGACAATAATCACTTTGTTAATTCCTGCCATTGTTATTCCTTATAAAGTTTGATTGGTTTGTCTCTGCCAATGTTGAACCGCTCAATTTTGCGGTTAATCAACATAATTGCGTTTTGGCGGTTGTATTGTGGATAGGTTGTGTGCTGTAATTTGCCGTCATAAAAAAACTTGGCGATAAATCGTTTATCTACCTCAACAATCTCAACACCGGCATCAATTTTTCGTGCCATATTTCCCTCCGCAGTATTGGTTGCCGTTGCTTTCCATTTGCCAAAAGCCTTGATTTCGTTCGCATTTGTAACGTTGCATTTGTATGTGGTCGTCATAATCCATTCGCCCGACAATGCCTAATAGCAAAATTAGCAAGGCAAATGGGGCAAGTTGTTTCATTTTGTTCATAGGATTGTCCTTTAGGGTTAAAAAAAGCCCACGTTTTACGGTGGGCAAATGGAGCGACTTGCGTCTAGTTGTGGGTATTCCGAAACACACTTGGTGAAATGAGCTTTGGAATAAATGCGTGTCTGCCCACGCCGTCGCCCGCCCGGCTTTCGCCATTCCGTCGGGTGCTGCTTGTATCCGTACTTACTCAAACTTGAGATAAGCGTGATTGCTTAGGACTGATACCAGTGTTGCCTTTTCAGCTCTCCACACCTTGCGAGTGTGTTGCCTAAACCTTGCCACCTCTTTTTGGCAAGTCGTTCAAATTTGTATGTCAGGGTCTAACCAACCTTACTGAGTTATAAAGCATTACTTTACAACTGCCCGAGGTTGTTAATATCGTCCGCACAAGCACCGAATTGTTAAAGAGCATTGAGCCGTAGCTCGTTTTGATGAATTAAGTTTAAGAAAACTTAAATTACAAGTCAATCAAAATTTAAGCTTATTTAATAAGTATTTTTAAGATTTCTTAAATTTCAATTAGTTATGATTTCTTAATTGATTGTTTTTTAAACCATTAAAATATAATTATTGAGATTGCGAGCTTGATCACAGACCGAAAACCACGCTTTTGAGAAAATAAGAAGGGATTTCTATGGAGGTTATATGAAAAAACTACTGATGACTTTATGTTGTTTGCCCGCTTTTGCTTTAGCTAACGAAACTGGAGAAAGTTGCTCTAAGATTGAAGATAGTGCAAAACGCTTAGAATGTTATGATAGTGTCTTTGTGAAAAAAGATACTGGTAAAGATGAAGCTACCGATGAAAAGTCTAATTGGGAATATGAACAAAAGAAAGATGAATTGCGTAATGCAACGACTTACTTTGCTAAAATTAGATCAACTAACACAATAGATTTTGGTTTCCCGTATAATTCATCATCAATGAATTTAATGTTACGCAAAGACCCTAAATATGGCAATGATGTAATTTTTAGCGTACACGGTCAATTTAATGGCTGTATGATTGAGAGCTGTAAAATTACTGTGAAGTTTGATGATGGTAAATTGGAAAGTTATCGAATGATTGGGGCGGATGGTGGCAGCAATGATACGCTTTTCATTGAAAATGCAAAAGCAATGAAAACCTTTGTAGATAAGTTGAAAAAGTCGAAAAAACTAATTGTAGAGGCGAGTTTTTACAATTATGGCAAAGGGCAATTTACCTTTGATACACAAGGGTTAGAGTGGAAACATTTTTAATTAAGAAAAAGCTACATAGATGCGTAGCTTTTTGCTTAGATATGTTGGGGCAAAATAACGATTTCAGCTTCAAAAATTTGTTGGTCGAAAAAGATTTGGCGTTGCCAAATAAGTGCTTGTGAAAGCTGACGAAACGCAAATCGTTCAGGTGCTATCTTTTGTAGTGCTAACTCAAATTGCTTGTAAGTTTTTTCTAAATTCTCTAGTGCGTGCGTTGGTTTCTTGGCAATTCGCTTATTCCAAACCACTTCTTGATGATACAGCCGATTTCTAAAACGCATAATTTGCTTTAATGTATTGTATAAATCCTTAAAATTACTAAATCTATGTCCAAAAATAGGCTTTAATACGCTTTGCCAGTAAGCAACATATTGATTACGCTTTATATCATAATTAAACAGATTTACCCAAAATCCAAAAGAAATATGAGAAATTATGTCATTTTCATTATAGTTACGTCCGCATTCACTAATGGCTTTTTGTAGCTGGCGTTTAGATTCTGCATTAAGAGGAGCATTACTATCGTTCGCTAGAAAATGAAAGAATTCGTATAAATTATGATTAGGTGCAGCAAAGCGTAACAACTGGCTGACTTCATTTCTTAGTGCCACCTCTATTTCTTGAATCAATGAAAAATAAATTCCTGTTCGATGTTGCAAGGCGGTATAAATTGCAATAGCTTCTTTCTGTTTTGTGGGATCATTTCGGAAAAAGCAAAATAAATATGTACTCAGCCGACTTTCTGAAATACTTAGCACTTGTTTGGACAACATATTTTCCTTTACTCAAGTTTAGTTTAATGTAATAATACTTGCACTGGCAACGGACCCGAAGCCCCAGACGTAGGAGCTGGATTGCTTTGTAAAGTGTGAGAATCGCTTATTTGCGGTTCAGAAAAGGTAGGTTTTTTAACCTACCTTTTCTTTATCTACACTGTTCTTCCAACCATTTCTTAAATGTTTCTTTTTTCCAACGAGCTTTCCCCAAAATATATAAATCAGGTTTAGGAAATGAAATATTCTTTTCTAACTCTTGATTGACTAACTCAACATGGGTATCAAACATTCTTCTTGTATTATACACAGCAGCACCTAACCCTCCATTTATACGCAAATAATGGTTAGGTAAATTAACCAACTCTTGAAACTCATCTGCCCCAATACCTAACCTATTGATAATATCATTTGCTGAAAGCAGTTCCGCACTTCCTTTCATTATGTCATTAACGACTTTATCTTTAGGTGTCGAAGCTAATTGAGCTTCTACAATCGCCTGTTTTACATCTTTAAATTCTGTCATATTATCAATTCCTATCTCTTTCTACGATAAATACGATGCTCTACCATTGTGCCGATAATTCTGATTTCTTGCTTTAGCGTTGATAATTTATGGTAATCCGGATTAAGAGCGATAAGCTCAAAATGTTGTCTTCCGTATTCGTCTAAGTCTTCTAACGGACGGTATTTTTTGAAAGTGGCTTCATAATCGCCATTAATTGCTGCCACAAACTCACCGGCGTGAGGTTGTACATCAGGATCAATAATTACTCGGTCTCCTTCAATAAAATCAGGCTCCATCGAGTCCCCTTTGATTTCTAGGGCAAAAGCATCTTCAGACACCTCAAGATCAGTTAGGATATATTCATAATCCCCACAGGTTTCACGAAAATCGTCAATTCCCGTCCATTGTCCGGCTTGAATATAGCTAATTAATGGGACTTTAGTCATACCGAGGCTAGCAGGTAGAACATTAGACTCTCCATTACCACGCAAGAGCCAACTAATATCGCATTGCAATACTGTAGATAAATCCAAAATATTCTCTGAATTTGGCTTAGTCGTACTACTTTCCCATTGAGATACTGCAACGTGTGAGACCCCTTTTAACGCAGTAGCAAGATCTTTCTGTGTCAATTTTAATTCTTTTCTACGGCTTTTAATTCTATCGCCCAAGGTCTGAGTATTCATAGTATCCCCTTAAAGGTAAAAATAAAGTTGCTGTTAAGTTATCTTAACATTTATTGACTTAAGTTTCCTTTAATTGTATATTTAAGAGGTCTTAAATAAAATTCAAGAAAGGAATTAAGAAAATATGAAAAAAGATGATGTGCTCGAACATTTCGGAACTCTAGAAAAAGTGGCGGCAACTTTAGGGATTAGTGTATCTGCTGTTTCTCAATGGGGCGAGATTATTCCTGAGAAAAATGCGTACAGATTACAAGAGATCACTGCCGGCAAGTTAAAGGTCAAACACTCACTTTATAGAAATAGAAGCAAATAAAAAACCACCGCTGTAACGGTGGCTTTCATACATAATTAAACACGAAAGGTATTTTCGATGAATCAATTATTAAACATTTCGGCACCAAAAGCAAGCATTACGATGAGTAGTCGTGAGATTGCTGAGTTGTGCG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TAGGATTTCTCTCAACTTAGCATAGGTTTTGGGGCATCTTATTTGACATTCCTCTTCGTTGTAGAGAGCCTCTAATGTGTGCCATTCTTTTGCAAGTGCAGCCCAAACTTTCCCAAGTTCAGCCATTTTTTCAATCCTATTTCGCAAAAAAGGGACTGTCTCCAACAACAGAAAGCAACGCCTGAAATCCGATACATCGTGTGGGTAGCCTTCTATTTTTGGTCTTATTCCGTAACCAAGGTAAAAAGCCATTGTTTTACTGCTTACCCCTGTCTCTCCATTGGCAAGCCACCAAGCGATTTTGTCTTCTATGTGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP017521|1889122:1899439|1894045_1894729_+|WP_006247793.1|DBSCAN-SWA MNQLLNISAPKASITMSSREIAELCEKEHRHVTRDIEAMFSQLDIPAEGYAHFWTHPQNGQTYREFRLPYDLTLTLISGYSVILRKKIIDRWQELESRQGIPQSFSQALRLAAEQQEVIEQQNHQLAIQAPKVAFVEHYVEVGTTKSLRETAKILNFPEKRLIECLERYRVLYRQSGNLLPYQDKQAKQLFAVKTGTAEHGHNFTQTRVTAKGIEWIAQRYASELGQ >NZ_CP017521|1889122:1899439|1898485_1898809_-|WP_006253316.1|DBSCAN-SWA MEHLTINQVAKELNCHPNTVRQHLADWGFFKMVGSEVWRINREDLERAKKRAGIDPIRKRSDNDRGLSLSVEENEKCRSTDEKQTVRGGLISQPQTARELREALARL >NZ_CP017521|1889122:1899439|1889122_1890097_-|WP_006249218.1|DBSCAN-SWA MAGINKVIIVGRLGNDPELRTMPNGDSVAKISVATSTEWTDKTSGEKKQATEWHSIIAFRNLADIIGKYLKKGSQVYVEGKLRTRKWQAQDGTDRWTTEIIADQLQMLGSSNSGNSNNNWATEPAGNPPPTNPYNHVMTDSESRDFDDDIRVRWITKEQAKQFINNISTDWMKTICSFALLTGARRTEILSMTWDKIDFIRKVAIVSNDIAKSEKARSLLLNDDAIELLQKQRGKNPKYVFVGSKGQALQDINRKIFNKATEKCLLVDFHFHDLRHTWASWHVQAGTPLFTLKELGGWETLEMVKKYAHLNADHLLNHANSVKF >NZ_CP017521|1889122:1899439|1893799_1893988_+|WP_006247792.1|DBSCAN-SWA MKKDDVLEHFGTLEKVAATLGISVSAVSQWGEIIPEKNAYRLQEITAGKLKVKHSLYRNRSK >NZ_CP017521|1889122:1899439|1894725_1895772_+|WP_006247794.1|DBSCAN-SWA MRFTSTINNVRLVEWEINITQGALVDLINQASSWAKAVVIDGITYYWMSFSKVCEELPAVFSKEDTVYRQYKVLKEKGIIDHFKMDGKDYVRLTEKGCEWNKFEPIRESEKNPSIGNNSEQTRKNFRESSEKNPTDNNTNYKNNNDHTTPLNPPAGEPAPAEVVLNYLNSALVTLAVQLGERKPVGYSLKPWAKNITARIRESSVADCCQVVDYLVAKWGRDEKMREYLCPKTIFRQSNFADYFPKSTAWANNGKPVCVNGKWVTPAELEKRLIMPTVDEVRALFQKSLSGNPFKALDFTNKRNLVMYHATINTRNKRPLERDLPMIISQEIKNAVERIDRLRVPTFS >NZ_CP017521|1889122:1899439|1892632_1893007_-|WP_006247790.1|DBSCAN-SWA MTEFKDVKQAIVEAQLASTPKDKVVNDIMKGSAELLSANDIINRLGIGADEFQELVNLPNHYLRINGGLGAAVYNTRRMFDTHVELVNQELEKNISFPKPDLYILGKARWKKETFKKWLEEQCR >NZ_CP017521|1889122:1899439|1891743_1892481_-|WP_006247789.1|DBSCAN-SWA MLSKQVLSISESRLSTYLFCFFRNDPTKQKEAIAIYTALQHRTGIYFSLIQEIEVALRNEVSQLLRFAAPNHNLYEFFHFLANDSNAPLNAESKRQLQKAISECGRNYNENDIISHISFGFWVNLFNYDIKRNQYVAYWQSVLKPIFGHRFSNFKDLYNTLKQIMRFRNRLYHQEVVWNKRIAKKPTHALENLEKTYKQFELALQKIAPERFAFRQLSQALIWQRQIFFDQQIFEAEIVILPQHI >NZ_CP017521|1889122:1899439|1890099_1890297_-|WP_006249219.1|DBSCAN-SWA MARKIDAGVEIVEVDKRFIAKFFYDGKLQHTTYPQYNRQNAIMLINRKIERFNIGRDKPIKLYKE >NZ_CP017521|1889122:1899439|1899064_1899439_-|WP_006247798.1|DBSCAN-SWA MHIEDKIAWWLANGETGVSSKTMAFYLGYGIRPKIEGYPHDVSDFRRCFLLLETVPFLRNRIEKMAELGKVWAALAKEWHTLEALYNEEECQIRCPKTYAKLREILEANEENVVRIGNLSISIG >NZ_CP017521|1889122:1899439|1891111_1891708_+|WP_006253352.1|DBSCAN-SWA MKKLLMTLCCLPAFALANETGESCSKIEDSAKRLECYDSVFVKKDTGKDEATDEKSNWEYEQKKDELRNATTYFAKIRSTNTIDFGFPYNSSSMNLMLRKDPKYGNDVIFSVHGQFNGCMIESCKITVKFDDGKLESYRMIGADGGSNDTLFIENAKAMKTFVDKLKKSKKLIVEASFYNYGKGQFTFDTQGLEWKHF >NZ_CP017521|1889122:1899439|1898889_1899057_-|WP_006253314.1|DBSCAN-SWA MQFTYGSICSGIEATSIAWHGLGKPLWFSEIEPFPCAVLAHRFPNVPNGNGMAVP >NZ_CP017521|1889122:1899439|1895782_1896376_+|WP_006247795.1|DBSCAN-SWA MTDFDKNTYQTPNYVRNWLNHRYAWFHIDGCSNGQNTLYTYWIGRAADGLDDDKLSCQIADDFLADDLFDVLLDKVSDWGELLRIFVNPPYSDPLPFVQRAAELKKAGHLVVMLLPADKTTEWYTIIQQHANEVIDIIGYHDEKGTWRTGRIQFINPVTGKPAQGNNKGSMIVVFDPFIEGIVTRQMPLDKIKEWGK >NZ_CP017521|1889122:1899439|1893018_1893675_-|WP_006247791.1|DBSCAN-SWA MNTQTLGDRIKSRRKELKLTQKDLATALKGVSHVAVSQWESSTTKPNSENILDLSTVLQCDISWLLRGNGESNVLPASLGMTKVPLISYIQAGQWTGIDDFRETCGDYEYILTDLEVSEDAFALEIKGDSMEPDFIEGDRVIIDPDVQPHAGEFVAAINGDYEATFKKYRPLEDLDEYGRQHFELIALNPDYHKLSTLKQEIRIIGTMVEHRIYRRKR >NZ_CP017521|1889122:1899439|1890280_1890466_-|WP_006249220.1|DBSCAN-SWA MNKMKQLAPFALLILLLGIVGRMDYDDHIQMQRYKCERNQGFWQMESNGNQYCGGKYGTKN |
14 | Mannheimia_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1902672 : 1909616
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP017521|1902672:1909616|DBSCAN-SWA AATGAGTGGCTTAGGAAAATTAACCGTTACCTTAGAGCTTGAAAATGCAAAATTTCAGTCCGCAATGACGAAATCTGATTATGAGGCACAAAAATTTGCCAAGAACTTTATCCAAAATATGGATAGAGCTAGAAATCACGCCAAAGAATTTGCCGATCGCTCAACCCAATATTTAAAAAACATTGAGCAAGCGGCAAAGAACCTCAATAAAAATTCTGAATTTTCATTTTTATCGACTATTGGTGGACATTATCAATCAATGTCTAGTGGCATATTGAGTGCGGCAAAAGCCTATACTGATATTCAAAATAAAATGAAATTAGTAAGCGGTAGTTCAGCAGAGGCAGCTAAACGATTAACTGATGTGTTTGATATTGCGACTAAAACAAGCCAAAGTACAGAGGCTGTTTCAGGTGTCTATCAAACATTTGCTCAAAATGCCCAATCTCTCGGACTGGCTCAAAAAGATGTAGCAGAATTAACTAAAACGGTCTCTCAAGCCGTTGCTGCAAGCGGCGCAAGCAGTTCTGCAGCAAGTAATGCCCTAACCCAATTTGGTCAATCACTTTTAATGGGCAAAATGAAAGCCCAAGAATTTAACTCGCTCATTACTCAAACCCCAACCATTATTCAAGCAATGGCAAAAGGTTTGGGAATGACAATGGCAGAATTTAAAGCAGCGGTATACCGGGCAAAATCTTTACTTGGATAACATTCAAGGGCAAGGTTTTGAGAGAGTGGATACACCCCAAATCGGCGATGTGATTTTAATACAGGTCGGTTCTGATGTGCCGAATCACGCAGCGATTTATATTGGTGAACAAATGGTAATCCACCATAGCCCGAACCGATTATCTAAGCGTGATTTATATGACGGTTATTGGTTACGCCATACCCACAGTATTTGGCGGCATAAACTGGCGGATAGATTGGATTTTGACGGCATATTTAATGATATAGGAGAACAATATGAAATTTAGTAAATATCAATTATTAGTTAATAAGATCTGCTTTATTTGTGGTAAAAAAGATTGTCCACAAATGAAAAAGAGTAAAGACTACAAAGACTTTTTGGATGCTTTAGAAAAAGGGGATGTTGATAAAGCAGATAAAATATACAATACGAAGTTTTCACAGTTTTCTAAATCTTTTGGTCATGAAATGGAAAAGAATTTAGAGAAAAATCGTATACCTCCTATTTATCAGGGAGTTCCATTTGATTCTTTTGACTTATATCAGCATTATTCTTATGGTAATGGAGAGGCATTAAATCTTTCATCCGTTGGATTAAGTAATAAAATTCGTCCTCTAGTGAATAAAGATAAAGCATTTGGTAAATCCAATGGAAGTATAGAAAGCCGATTTATTTCGCAATATAAAAATGAAGGACGCACATCTTTCTCCAATGCTTATGATTTTACAAAAGAAGCATCGGGTATTGCAGATCCGTTATGGGCGTTAGGAACAGCTACCATTAGTGGAGAATTGAAAGATATACAAATTTTTCCCGGTGGTATTGCTAGGGGAAATATCCATTATAGTATCAGGGACAGATTCACTGACCCATTTGATACATTCAATTTTACTAAAGGAGAATGGAACCCAAATGGAACACCTTATATTATTCAAGATAGCTGGATAAAATCGGTACGATTTTCGATAGACAAGAAGATAAAAATAACACCTTAATTATGATAGTAATATAAAACAATTGGCAATATTATTTTAAATAAAAAAATAAGTATTCCAATATAGATTGCTGATTTTATGGTGTATTTAATTTGTTTCTCGAAAATAAAAAAATAACTAGTAATTGCATATAAACAAATAAGTAATAATATGCTTATAGAGTTAAGAAAAATAAAGAACATAAATCCCCTTTATTTTGGCTATAATTGTAATGGTGAGTCATGACTAAAATTAAATTTTACGGCAATTTAAAAAAATTTGGTAGTGAATTTAGCTTAGAAGTTAAAGATACTGCCGAAGCTATCCGAGCCTTATGTACACAGATTAGCGGATTGCGTGAGGCATTACGAGACGGTGTTTATAAAGTCCGTATCGGCAAACAGTATTTAGACCCGTCAGCCCTTGAAAAAGGGCTTTTTTATTGTCTGAAGAAAGGGCAAACCATTCATTTTACCCCTGTTATCAAAGGAGCGAAAAGCGGTGGCGTGTTTAATTTTGTTTTAGGTGCAGCCTTGATCGGAGCCGCATTTTTTACTGGCGGTGCTTCTATTGCGGCTTGGGGAGCTGGAGCAAAAATGATGGGTATGTTAGGGGCTTCGATGTTACTAGGAGGAGTTTCCCAAATGCTCACCAAAATGCCAAAAGCCCCCACAATGGGTAATGAAACAGAAAAAGAAAGCTCAACGGCTTTTTCAAATTTAAATAACTTGGTGACTCAAGGCAAACCTGTGCCGTTGGCTTATGGCTTAATTCGGACCGGCTCGCTTGTGATATCGCAGGGAGTTGAGACGATCACCATTAAAGAAAACCAACCGGCAAGCAACAAGAAAACAGGCTTTAGAAAATAAGGGATAATTACCGATTCAGCACAAGCACAGCAACTTAATCAGTTATCTGTGAACTTGACCAAAGCAGAGAGCAATTTAAATGCCAAAATCACGGAAGAAAAAAAAGCTCGTGTTGATGCAGATAAAGTGAATGCAGATAAACTCACAGACATAACAAGCCGTGTTGCAAATGCGGAATCAACTATTACCAATTTCCAATCAACCAAAGCGAATAAAAGTGAGGTTGCGAGCCTTGCACAAAGTTCGTTGCAGGCAGTTTGGAAAGCTGATGCAAAATCTGCCGTTGATTCACTTTCTATCGGTGCAAGGAACTTACTGATAGACAGTACTTACAACCAACACATCAACTACAATACAAAAATGTCATCAATCACACGCACAGTCTATCGCGGCAATATGTTGATACGACTCGGAATGCTTGGTGGCGCAGGTGTGGCCGGTATTGTACAAGCACCAGCCGCTCAAGTAAGTAATATCAGACAGGGTCAAGAGTACACACTTAGCCTGAATGTACAGGGTACAGCCGGCATACAAAAAACGGGGCTCAACTATGTATTCTTGATGCGTGCTGATGGGGCTAATCAACGGTTAGCAACAATACCTGTTATAGCCAGCCTATTAAACAGACCTAAAATAGCCCTTGGCAAAATGCCGGTGTAACCGCTATCCACGGTGGCTCAATAGTTACTAATACCGTTACTGCTCAACAAATTGCAGCAAATACCATTACCGCCAACGAAATCGCAGCCGGCACGATTGCAGCTCGAAATATGGCAGCAAACTCGATTAATGCAAGTCATATTGTGGGGAGTTCGATCACTGCGGATAAGCTAAATGTAAACAATTTAGCGGCAATATCGGCAAATCTTGGTAAGGTAACTGCTGGTACAATTACAGGGACGACAATTAGTGGTGGGACAATTTCAGGTACAACAATTACAGGGGGAATAATTAAAGGAGCAAGAATTGAGGGATTAACAGGTAAATTTACTGGAGAACTTGAAATCAACCAATTGATCGGAGGTAATATCTATGAGGCTAAAACTTGGACATCAAAAGCAACAGGGAAAAGTAAAACATATTCAGAAACGAAAAACAGTTTTGCATTAAGTGATACATATTATGAGTATGTATGTCAATTTGTACTACCTGCTACAAAAGCGACGAGAACATTGTATGTTGTCCACACTCCAACAGGAGAGAGTAAAAGCGAAACTTTTTATGGTAGTGGTAGTAATCGGACACCGACAACAATTACATTACCGTCTGTAATTGATATTAGCAATACTATTTCACCTAATGTATCTAACCCATTTAATGATTCTGGGGCAATACTCATTGCTAATACTCAATATGTAGTAACGTGTCGTGCGTGGTGTGCAGGGCGTGGGAGAAGTGCTAAAGTGAATTTTCGAGCAATTATATCATCTACAAATGGTTCATCTTATCAATTATAGGAGGCAAATATGAAAAAAATTATACTACTTACAACAATTATGGTTTCAGCTTGTACAACTCAATATAAGCAAGACTATACAACAAAACCAACCTTTTGTTATCAACTAGCCCCTCAAGAGCAATTACCGGGGAAAAACTGTATTGGCTCAGGAGGGCATTCAGGTTAACAAAGTAATTAAATCCTAATTACACGCTCATCGCCTGTAGGCAATTCAACGGCAAGTTTTAACTTACCGCCCATTGCTTCAATATAGCGTTTGAGCGTGGATAATCTTGGATCGTTATCTTTCTGTTCAAGTTTAGCAATAGCAGGCTGTGAAATACCGAGAGCTGTAGCTAATTGTTGTTGAGAGAGATTTAGCTCTTCTCTTAGTTTTGAAAGTTGTATCTCTCTAATCATTTCTTGAGCCATATCTTCCACTTTTTGGCGGCGTTCAGGAGAGAGTTCATTGAGCATTTGATCTAACGTTTTCATTTTCTTTCTCTAAATTATTTAAATAGGAGGTAAATTCCGCATCAGCAAGAGCGATCATTTTTTCATAGAATCTTTTGTCTTTACCTTTCTCGCCAGCACAAAGTACTATCGCTTGGCGTAAAGGGTCAAAAGCATAAAATGCTCGAATTGGCTTACCTTTGTTTTGAATGCGTAACTCTTTCATATTAGGGAATTTAGACTGATAAACTGTATCAGCATAAGGTCTGCCTAGACTATAACCGAATTTCCGCAGATAGATTAAACAAGCCAAGACACGTTCTTGAGTACTTTCATCTTGTTGACCGAACCATTCATCAAAGCAGTCAGTCGTGATAATAGACCATTCTATAGGGTCTGCCATTTTTGAACCTTTTATAACTTACTATTTATAAATGAAGTATAAATAAAAGGTTATATTATGTAAAGCAATTTACTCTTCCTACTAAGCCGTTTGTATGACTACAAGCGGTCTTTTTTTATCAACAATCCACAAAAGGAAAAATTATGACAACTTTTAACAAAATCTTAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP017521|1902672:1909616|1903640_1904360_+|WP_006247806.1|DBSCAN-SWA MKFSKYQLLVNKICFICGKKDCPQMKKSKDYKDFLDALEKGDVDKADKIYNTKFSQFSKSFGHEMEKNLEKNRIPPIYQGVPFDSFDLYQHYSYGNGEALNLSSVGLSNKIRPLVNKDKAFGKSNGSIESRFISQYKNEGRTSFSNAYDFTKEASGIADPLWALGTATISGELKDIQIFPGGIARGNIHYSIRDRFTDPFDTFNFTKGEWNPNGTPYIIQDSWIKSVRFSIDKKIKITP >NZ_CP017521|1902672:1909616|1907112_1907502_-|WP_006247811.1|DBSCAN-SWA MADPIEWSIITTDCFDEWFGQQDESTQERVLACLIYLRKFGYSLGRPYADTVYQSKFPNMKELRIQNKGKPIRAFYAFDPLRQAIVLCAGEKGKDKRFYEKMIALADAEFTSYLNNLEKENENVRSNAQ >NZ_CP017521|1902672:1909616|1902672_1903383_+|WP_006253312.1|DBSCAN-SWA MSGLGKLTVTLELENAKFQSAMTKSDYEAQKFAKNFIQNMDRARNHAKEFADRSTQYLKNIEQAAKNLNKNSEFSFLSTIGGHYQSMSSGILSAAKAYTDIQNKMKLVSGSSAEAAKRLTDVFDIATKTSQSTEAVSGVYQTFAQNAQSLGLAQKDVAELTKTVSQAVAASGASSSAASNALTQFGQSLLMGKMKAQEFNSLITQTPTIIQAMAKGLGMTMAEFKAAVYRAKSLLG >NZ_CP017521|1902672:1909616|1906841_1907141_-|WP_006247810.1|DBSCAN-SWA MKTLDQMLNELSPERRQKVEDMAQEMIREIQLSKLREELNLSQQQLATALGISQPAIAKLEQKDNDPRLSTLKRYIEAMGGKLKLAVELPTGDERVIRI >NZ_CP017521|1902672:1909616|1904581_1905208_+|WP_006247807.1|tail|DBSCAN-SWA MTKIKFYGNLKKFGSEFSLEVKDTAEAIRALCTQISGLREALRDGVYKVRIGKQYLDPSALEKGLFYCLKKGQTIHFTPVIKGAKSGGVFNFVLGAALIGAAFFTGGASIAAWGAGAKMMGMLGASMLLGGVSQMLTKMPKAPTMGNETEKESSTAFSNLNNLVTQGKPVPLAYGLIRTGSLVISQGVETITIKENQPASNKKTGFRK >NZ_CP017521|1902672:1909616|1907645_1907939_+|WP_006250050.1|DBSCAN-SWA MTTFNKILNPMYSTIASYSTQDDGSLNAKYVVGTGDDTDGEVTNFVIITSEYKYIDAQSAKEITDAPLTKEDIGKTPTQIMLGRIYKYLKETGQIVV >NZ_CP017521|1902672:1909616|1905256_1905868_+|WP_006253310.1|DBSCAN-SWA MNLTKAESNLNAKITEEKKARVDADKVNADKLTDITSRVANAESTITNFQSTKANKSEVASLAQSSLQAVWKADAKSAVDSLSIGARNLLIDSTYNQHINYNTKMSSITRTVYRGNMLIRLGMLGGAGVAGIVQAPAAQVSNIRQGQEYTLSLNVQGTAGIQKTGLNYVFLMRADGANQRLATIPVIASLLNRPKIALGKMPV >NZ_CP017521|1902672:1909616|1908317_1909616_-|WP_006250049.1|DBSCAN-SWA MGKSVAILGAQWGDEGKGKIVDLLTDRVKYVVRYQGGHNAGHTLIINGEKTVLRLIPSGILRDNVTCLIGNGVVLSPEALMKEMGELEERGINVRERLKISEACPLILPYHVAMDHAREAALGKNKIGTTGRGIGPAYEDKVARRGLRVSDLFDKEHFAAKLKDILDYYNFQLVNYYKVEAVDYQKTLDDVFAIADVITGMVADVTTLLHEARENGDNILFEGAQGTMLDIDHGTYPFVTSSNTTAGGVATGSGYGPRHLDYVLGIIKAYCTRVGSGPFTTELFDDVGAEIARKGNEFGAVTGRPRRCGWFDAVAVRRAVQINSISGFCMTKLDVLDGFKELKICVAYKMPNGKIVEYAPLAAKDWEGVEPIYETMPGWSENTFRVTKREDLPQAALDYIKRIEELVGVPVDILSTGPDRVETMILRDPFAA >NZ_CP017521|1902672:1909616|1905978_1906665_+|WP_006247808.1|DBSCAN-SWA MAANSINASHIVGSSITADKLNVNNLAAISANLGKVTAGTITGTTISGGTISGTTITGGIIKGARIEGLTGKFTGELEINQLIGGNIYEAKTWTSKATGKSKTYSETKNSFALSDTYYEYVCQFVLPATKATRTLYVVHTPTGESKSETFYGSGSNRTPTTITLPSVIDISNTISPNVSNPFNDSGAILIANTQYVVTCRAWCAGRGRSAKVNFRAIISSTNGSSYQL |
9 | Mannheimia_phage(60.0%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2342839 : 2350994
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP017521|2342839:2350994|DBSCAN-SWA AATGTTAGATCTCACCAAGATTAAATTAGTGATTACCGATGTGGACGGCGTGCTAACCGATGGCGGAATGTACTACACCGACCAAGGCGAAGTAATGAAACGTTTCCACGTTCACGATGGTTTAGGCGTTAAGATGTTACAAAGTTGTGGCATTAAAGTGGCAGTACTCTCGGGCGGCGATACGGCTTTGCTCCGCAAACGGTTAGAGGTGCTGAAAATTGATCTCGCTTTGTTAGGCAAAATGGAAAAACGCTCCGCCTGCTTTGAGCTAATGCAGCAAGCCGGTGTTACCCCTGAGCAAACGGCTTACATTGGTGATGACACCTTAGATTTACCGGCTTTTGAAGTGTGTGGCATTGCGATTGCAACCCGTAACGCCCTCGATTACATCAAAGAAAAAGCAGATTGGGTATTGCAAAAAGCCGGTGGTGAAGGGGCGTTTCGTGAAGTCTCCGACCAAATTTTGGAGGCTCAAGGATTCGGTGAAATTTTTAAAACCGCAGATGGTTTTTTAACGGTAGCGGGGAAAATGGCTCAGTAGACTCTTCAAGCAGTTAAATTTCATTTTATTTTTGCGATCTGCATCGAAAAAATGTATTTCTAATCTGATTTTCAAATTACTGTTTGCTAAATTAAATTTAGTTCTTGTTAGATTTATTTTATGTATATACAATAATTATGAAAATTTATACTTGGGACGAAACTAAACGCAAAATCAATTTAGCCAAGCACGGATTAGATTTTGCCGATGCAGATGAAGTTCTCTCATCGCCCTATCGATTTGATGTTGAAGTTATTCGTAACAATGAATTTAGAATACAATCTTTTGCATATTCATTTGGACGTTTACTCGTATTATCACTTGCATATACAGAAAGGGAAGATTACATCAGAGTAATTAGCTTTCGGCGAGCATCTAAAGCAGAAAGAGAGGCATATTATGAATACTTACAACAATACTTTGAATAATAAAAATTTAGAGAAAAAACAGCTACTTATGGCTATTCAAGCTATTCCGGCAAGCCAAGATTTTATTTGGGACGGAAAAGATGACGATGAACGCCCGGTTACGCCATCAGAGTTTTCAATTGCAATGAAAAAACGTGGCAGACCAGCTGGTTCAAAGAAAGAATTGGTTTCGTTACGTCTTGATAAAAGCGTTCTTGAAGCCTTTAGAGCTTCAGGTAAAGGTTGGCAAAGTAGAATTAATCAAGTTTTAAGTGATTTTGTAAAACAAGTTTGACCACAAAACAAAGGCGGTTAATCCGCCTTTTTCCCTTCAATATATCGCTCGAAGTTTTGGATATATTCATCTAAATTTGCAGTGAGCATTTCTTTGTATTGCTCCACAAAATATTGAATAACTTCTTCTCTGGAATCGGCCAACTGCTGTTTATATTCCGCCTTGCTTGCCGCAACATAGGCGTTAAATCTGGCACAACCAAACAACATCGCATTGCTGACTTGGTTTGGGGCAATGTTTTTTAAATGAGCGTTGGCAACGTTAATAAAGCCGTCTGCTCGCTGGTAGACGCTGGTAGAAAGTTGGGTCAATTTGTTTATCGGTAATGTTAATCATAGTATCCTCATTTTTAGTCAAAATACAAGCGGTGCTTTTTGCGTAAAATTTTGCACAAACGCTTGCGTTTGAACGTTGGCTCTGCCGACGGCACGAAGTGCGAGCGTAGCGAGTAAAAAAATCACCGCTTGTAGGCATTTCTAGCCGTCTAATGAAATCGCTTCCTTGATTTTCTTCAATGCGGCATTTTCAAGCTGTCTTACCCGCTCTGCCGAGATGTTATATTTATCGGCTAAATCTTGCAGTGTGGCTTTATTGTCATCTAACCAGCGGGTTTTGATGATGTCTTGGCTACGTTCATCAAGGGTGGCTAACGCATAGGCAAGTTGAGCGGTTGCCTGCCCATTATGTTGTTCGTCTTCCAAGTCATCGGCGAAATTGGAGCTGCTATCTTCAATATACATAGAAGGAGCGTAGCTGTCTTCATCGTCATCACCGGCAGGCAGGTCAAAACCTAAATCTTGTCCGGTCATTCGAGATTCCATTTCTCGTACTTCTTCCACTGAAACCCCTAAATCATCGGCAACTTTTTTGATCTCTTCTTCATTAAACCACGCCAAGCGGTTTTTATTTTTGCGTAAATTAAAGAATAATTTACGTTGAGCTTTGGTGGTTGCCACTTTCACAATTCGCCAGTTTTTCAGCACATATTCGTGAATTTCCGCTTTCACCCAATGAACCGCAAAAGAAACCAACCGCACGCCGACATTCGGGTCAAACCGTTTTACCGCTTTCATCAAGCCGATATTACCCTCTTGGATCAGATCTGCCAGCGGTAAACCATAGCCCAAATAGCCACGAGCAATATGGATCACAAACCGCATATGGGAAAGGATCAGCTGTTTTGCCGCCTCAACGTCTTCATCATAATAATAACGCTCCGCCAGTTCTTTTTCTTGCTCGGCGGTGAGAATCGGATACTGATTTGCCATTCGGATGTAGCTATCCAAATTGCCCTGCGGCACAGGCATTGAGCCGGAAACCAAAGCCGGATGCATTGCTTCTACCGATGTTTCTTCTTCGTCTATCTCATCAACATCAATCGGCTCGGCATCTATAATTTCAGCATCTTCAATCTCGTTCTCGTTAAATTTTTTCATTCTATTTCTCTTCACTCTCAGCAAGGTTTACATTATAACAGAGTTAAATCTATCTGGTGTGGGATTTGTATGATTTTATTTCGAGCTATTCAATACCGCTAAGTTCCGCCACTTGCAAAACTTTTTGCAAATTCGACCGCTTTCCTTTAGAATACCGCTACTTTTGGGGCTGATTTTGGATTCGACGGGATTGGCGAAGCCCAAGGTGCATGTCGAGGTGCGGTAGGCCTCGTAAACAAACCGCAAAATAATAGTCGCAAACGACGAACAATACGCTTTAGCAGCTTAATAACCTGCTTTAAAGCCTTATCTCCTCAGCTTCCGCTCGTAAGACGAGGGCAAAGATAAGTCACCCAAAACGAGATCGTGTGGACGCCGCCGCTTTAGGATCGAAACACTAAATTAAATAAAGCTAGTTTATTCATTGCGTGTCTGTCCGCTGTGAATAAGCGAAATTAAAGACTAGACTAAACATGTAGTACTGAAGGTAGAGAAATTTCGGACGGGGGTTCAAATCCCCCCAGCTCCACCAAATTATAATCCTATACGGTTCAACCGATACCTAAAAAGCCTTGAAAATCAATGTTTCAAGGCTTTTTTATTGTCCGTTGCGTACCTATACGATACAATCAAATCCGAAGATTTTAGGAGTATATTTAGGAGTACGCCGGAATACCCCCAAAAATTCGTACTCCTAAAACCACTTTAGAGCCTTTTCAAATAAGGCTTTATCGCTTTTAGTTTTGTACTCCCAAACAAAAAATCATACTCCTAAGATTTAGGCTTTATACTCCTAAAGGTTTACTATGGCTAGAAAAATCACACCGTTAAACGATACCCAAATAAGAAAAGCGAAACCGGAAGACAGCCCATTAAGAGACGGTAACGGCTTACTACTTGTTATTACCTCAAATTCTAAATTGTGGCGGTTTAGGTATGAAAGACCGTTCACAAAAAAGCGGAATGATTTAAGCATTGGGGCTTACCCTGATATTTCTTTAGCACAAGCGAGAGAAATTAGAGAAGAATATAGGGCATTATTGGCTCAAAATATCGACCCTCAAACCCACCGCCAACAACAGGAACAGGCAAAGGCCAACGAAATCAGCAACACTTATGAAAATGTAGCGTGGGCGTGGCTGGAACACCGCAAGACCAAGAAGAATTTTTCAGACAACTACCAAAAAGATGTAATCGCCTTAATTAAAAATAACCTCTTGCCGCACTTTGGAAGAATGCCTATCACACAAATAACCGCACCAATGGCAATCAAGGCATTCAAGCAATACCAAGACGAGGGCAAACTAGAGAAGTTAAAACGGGCAATTCAAAAACATAATGAAATTATGATGTTTGCCGTACACCGTGAAATGATACCGTTTAACCCTACCGCCAATATTGCGAAAGAGTTTGATAGCCCAACGGTTGAACATTTCAAAACCATTAAGCCGGAAGATTTAGGCGAGTTTTTATACACCTTACAAAACGCCCAAATTCATTTACAGACACGCTATTTAATTCTGTGGCAGTTACTCACAATGACCCGCCCGAATGAAGCGGCTAAGGCAAAATGGGCGGATATAGACGAAAAAGCCAAACTGTGGACGATACCGGCGGAAAATATGAAGCGAGGCATTGAGCATAAAATCACACTCTCACGCCAAGCAATCGCACTTTTGCGAGAGATTAAAAAGCTAAGTGGCGGTAAAACGTATTTATTCCCTAGCGTGAAGAACCCACAAACGCACGTCAATACTCAAACCGCCAACGGTGCGATCAAACGAATGGGCTACAAGGGCAAATTAGTGGCTCACGGCTTGCGGGCCATCGCCTCCACTTATCTTAATGAGAAAGGCTACAATAGCGATTTAATCGAGGTTGCCTTATCGCATTTAAACAGCGACCGAATCAAAGCCGCCTATGATAGAGGCGAACGCCTAGAGCAACGTTTTAAACTGCTCCAAGTGTGGGCGGATTTTGTAGAGGAATGTTCGCAAGGTAGCTTACCGCAATATCATTTGAAAATAGCCTAGTAAATTTTCCGCCAAAAATGACCGCTTGTAATGCCGTTAGGTAAACCGCCTGACGGCTTTTTTATGCCCGTAATTCCCCTTGATGAAAATTCTGTAAACTTTTCGATTTTTACCCACTTTACCCACTTTTCACTATTATTTTTTTATAACTAACTGAAAAATAAAGAAAAAATGACAGTGGGTAAAGTGGGTTAAAAGTGGGTAAATGGCAAAAACCCTTGCTCACTGTATCTTAATGGATACAATAAGCAATAAATAGAATAAGAAGCCGGCAATGATGAGAGAGCAAACCACTAATCAAATTATTATTACCGATAATTTTTCAAAATGGCTTGAGAATTTAAAGAACCCTATCGCAAAAGCAACGGTAGCAAGACGGATAAAAAATGCGATTAATGGCAACTTTGGCGATCATAAATCTTTAGCCGGTACAGGCGGACTTTATGAAATGCGGATAGCAACAGGAGCCGGATATAGAATTTATTACGCATAACAAGGAAATGTAATTTATATCTTGTTACACGGCGGCGATAAATCAACACAGCAAGCCGATATAGAGAAAGCGAAAGCATTATGGGCTGAATTAAAAACTACAGGAGAAAGCAATGGAAACAATACAAATCAATGAACAGGCAGCAGAAAAGCACGGTTTACGCCCTTTTGACGTGGCGGAGTTTTTAACCGATGAGGCAACTATTCAAGCCTATTTAGCGGAAGTGTTAAAAGAGGGCGACCAAGACGAATTTTTAGAAGCCTTGAACGATGTAGCAAGAGCAAGAGGAATGGCGGAGCTGGCCAAGCAAACAGGGCTAGGCAGAGAGAGCCTATATAAAACCCTAGCCAAAGGCAGCAAACCACGCTTTGACACTATTCAAAAAATTCTAGGGGCATTCAATTTAGTGCTTATTCCACAAGTCAAAAATGGCTAAAACTTATCACTTGCTACCTGTCAAAACCTCACTTTTAAATAGCCGTTGATGGATATTGACGGCTTTTTATTTGCTCCTTGCGTGCGTACTGCTCCGAAAATTCCGCACTATTCGCAAAACCTTAATGAAATATGACCGCTTGAATGCTCTTTTTTATAGCGTCCGGAAACCCATCTTTAGCCTATTTTGATTTACTGTAATAAAACACAGCTTATTACTTGTAATTTATCTGAATAATTAGCAAAATACAACCTATCAAGTTCAATCCGTAACTATACGGATTTATTCAAATTAGCGTGGATAGTGGCGGAGTAATTAACCGGCACGAAAGGAGAAAGCCCTTTATTTCTCTTTCCACGCTCTCACAGTAAAGGGATACGTTAAAGGGGCGCTTATGGCAGATCACAGTCAATTTATTTCTAGGCTTGAAAATCGTATTGAGCCCAAAATCAGCTTTCAAGAACTGATACAAGAATTATCAAACTATACAAATAAACCTTTTTCACATATAGCGGATAAATTGAAAAGCCTCATTTTTTCCTTTCAGCAAAATGGAATATATACGAATGCTTTTGTAAATTGCACTCTCTTTGAAGATGGTGAAAGCTATGCTATTGAGCCCAAAACACTACATTTCAAAGACGCTTTCGATCAGCCTAAAGGCGTTTTAAGTGATGTTATTGCTCAAAATTCTATTGATGTTGAACATTTAAATGCTTATTACGTAACAGCAAGAGAAATAACACAGCTGATTAAAACACAATCGCCAACCTTGTTAGATAAATTAACCACCAAGCAAACACAATCAGAGATTAGCCAAATTCAAAATGATTATATTTCTGTTTATGACTTCATAGAATGGGCAAGTAAACATTACTCAAGTCTTAGTGAAACAGCTAACGATTTAAACCGCTTACTCAAAGATAAAAATATACAGCTTTATCGACAATATGGCGGAATAAGTCCAAGCATTGATAAAGATAATACTAATTTAAAAGCAGCCTTTGATTTTGTAGCAATTAATAACGGATATGAAAAACAATCAAGCAGCTTTAATTTTGATGATGATATTCCGTTCTAGGTGGCAGCAATGAATTTAAATGATTTCCAAAATTTACTTTTAAATAAACAAGAATTAGAAGCAGCACTAGGGAAAAAGCTCGATTTTTCTGAGATAACACCTGATTATTTAGCAGACTATTCACGTTTTTAAGCCTCTATTCTGAAACCGAGCTTACCCATTGCCCGAGCTTTTAATTGTGCTAGGCAACCGAATAGCGAAGCTGGAACAACAACATAACGCAATGCCAAGCGAAACCGATTCAATCACACTCGGCATTTTAAGAAAACAACTTAGCCAACTGTTAAAAGTGGCGGAAAGAATAAAGGAATAAACCAAAATGAAACACGAGCTTAATTTAGCGGGTATTACTGCTTTAATGAATGAACCTATCAAAGCAACCTTGAGCTTTTTAGATTTTCCGCATATCCGAATTGAACGACTGCACCACGATAACGGCAGACCGTTTTTTATCGGTGTGCTTTCTCTTGACCTTGAAGATCATATCAATATTGAAATGGCAGGGGCTACGGGCTTTTTAGAGGCTCTAGCGATTATTGCCTATCATCAACAGCTAACCGCCACGCCGCTATTAGTGAATGATGACTTATTGAGTGAAATCAACAAGCTCCCCCACCCACAACGAACAAACCCATTTATTGACCGACACGGCAACGAAATTACACGGGAGCAGATGAGCAAAGAATACCGAGAAAAAATCGATTATGCCTTTGCTGAAAAGCGAATGGCGGAGGGGAAAGAATGACCGAACTCACACCAAAACAAGAGGCTTTTTGCTTTGCTTATATTGAAACCGGCAATGCTAGCGAAGCCTACCGCCAAGCCTATGAAACCGAAGATATGAAGTCCGAAACCGTCCACCGAAAAGCTAAAGAGCTAATGGATAACGGCAAGATTACGGCAAGGATTGAGGAACTGAAAGCCGAACACGCAGAACGCCATAAATTAACCGTTGATGACCTTTTAAAGGAGCTGGAAGAGGCTCGTATACTGGCGAGAGAGAAAGAAAACCCTAACGCAATGACTCAAGCCACAATGGGCAAAGCGAAGTTGCTAGGGCTGGATAAGCAGGTTACCGATCCGTGCTTTGATGGTGAAACCGGTAAAGGAGATATGATTTTAAGTGTAAACTGCTCAAGCATTAAAGACGGGAAAGCACTTGATGAAACTTGTATTTTAAAGGCAGGAACACACGAATTTATCACACGGGACAGCTTTATTTTCTACCGCCATATAAGAATCGATTCGTTAGATGAGATTAAGGCAAATATAGAAGCCGGTTATTTCATTCAAAAAGCCCTAATTAATGATGAAGCCTATCAACAAATACTAAAAGGCGTACTATCGTCAAAATCAGTAACGCCTAGATATAAACGCTTCCTAAAAAATGCAATCCGCCAAAGTGCTTGCCCTGATATTCTAGCCGAACCTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP017521|2342839:2350994|2346323_2347550_+|WP_006250282.1|integrase|DBSCAN-SWA MARKITPLNDTQIRKAKPEDSPLRDGNGLLLVITSNSKLWRFRYERPFTKKRNDLSIGAYPDISLAQAREIREEYRALLAQNIDPQTHRQQQEQAKANEISNTYENVAWAWLEHRKTKKNFSDNYQKDVIALIKNNLLPHFGRMPITQITAPMAIKAFKQYQDEGKLEKLKRAIQKHNEIMMFAVHREMIPFNPTANIAKEFDSPTVEHFKTIKPEDLGEFLYTLQNAQIHLQTRYLILWQLLTMTRPNEAAKAKWADIDEKAKLWTIPAENMKRGIEHKITLSRQAIALLREIKKLSGGKTYLFPSVKNPQTHVNTQTANGAIKRMGYKGKLVAHGLRAIASTYLNEKGYNSDLIEVALSHLNSDRIKAAYDRGERLEQRFKLLQVWADFVEECSQGSLPQYHLKIA >NZ_CP017521|2342839:2350994|2344557_2345517_-|WP_006250280.1|DBSCAN-SWA MKKFNENEIEDAEIIDAEPIDVDEIDEEETSVEAMHPALVSGSMPVPQGNLDSYIRMANQYPILTAEQEKELAERYYYDEDVEAAKQLILSHMRFVIHIARGYLGYGLPLADLIQEGNIGLMKAVKRFDPNVGVRLVSFAVHWVKAEIHEYVLKNWRIVKVATTKAQRKLFFNLRKNKNRLAWFNEEEIKKVADDLGVSVEEVREMESRMTGQDLGFDLPAGDDDEDSYAPSMYIEDSSSNFADDLEDEQHNGQATAQLAYALATLDERSQDIIKTRWLDDNKATLQDLADKYNISAERVRQLENAALKKIKEAISLDG >NZ_CP017521|2342839:2350994|2349879_2350305_+|WP_006250289.1|DBSCAN-SWA MKHELNLAGITALMNEPIKATLSFLDFPHIRIERLHHDNGRPFFIGVLSLDLEDHINIEMAGATGFLEALAIIAYHQQLTATPLLVNDDLLSEINKLPHPQRTNPFIDRHGNEITREQMSKEYREKIDYAFAEKRMAEGKE >NZ_CP017521|2342839:2350994|2342839_2343379_+|WP_006250276.1|DBSCAN-SWA MLDLTKIKLVITDVDGVLTDGGMYYTDQGEVMKRFHVHDGLGVKMLQSCGIKVAVLSGGDTALLRKRLEVLKIDLALLGKMEKRSACFELMQQAGVTPEQTAYIGDDTLDLPAFEVCGIAIATRNALDYIKEKADWVLQKAGGEGAFREVSDQILEAQGFGEIFKTADGFLTVAGKMAQ >NZ_CP017521|2342839:2350994|2343516_2343807_+|WP_006250894.1|DBSCAN-SWA MKIYTWDETKRKINLAKHGLDFADADEVLSSPYRFDVEVIRNNEFRIQSFAYSFGRLLVLSLAYTEREDYIRVISFRRASKAEREAYYEYLQQYFE >NZ_CP017521|2342839:2350994|2350301_2350994_+|WP_006250290.1|terminase|DBSCAN-SWA MTELTPKQEAFCFAYIETGNASEAYRQAYETEDMKSETVHRKAKELMDNGKITARIEELKAEHAERHKLTVDDLLKELEEARILAREKENPNAMTQATMGKAKLLGLDKQVTDPCFDGETGKGDMILSVNCSSIKDGKALDETCILKAGTHEFITRDSFIFYRHIRIDSLDEIKANIEAGYFIQKALINDEAYQQILKGVLSSKSVTPRYKRFLKNAIRQSACPDILAEP >NZ_CP017521|2342839:2350994|2347824_2348043_+|WP_006253767.1|DBSCAN-SWA MMREQTTNQIIITDNFSKWLENLKNPIAKATVARRIKNAINGNFGDHKSLAGTGGLYEMRIATGAGYRIYYA >NZ_CP017521|2342839:2350994|2348155_2348479_+|WP_006250284.1|DBSCAN-SWA METIQINEQAAEKHGLRPFDVAEFLTDEATIQAYLAEVLKEGDQDEFLEALNDVARARGMAELAKQTGLGRESLYKTLAKGSKPRFDTIQKILGAFNLVLIPQVKNG >NZ_CP017521|2342839:2350994|2344098_2344392_-|WP_006253765.1|DBSCAN-SWA MTQLSTSVYQRADGFINVANAHLKNIAPNQVSNAMLFGCARFNAYVAASKAEYKQQLADSREEVIQYFVEQYKEMLTANLDEYIQNFERYIEGKKAD >NZ_CP017521|2342839:2350994|2348873_2349560_+|WP_006250286.1|DBSCAN-SWA MADHSQFISRLENRIEPKISFQELIQELSNYTNKPFSHIADKLKSLIFSFQQNGIYTNAFVNCTLFEDGESYAIEPKTLHFKDAFDQPKGVLSDVIAQNSIDVEHLNAYYVTAREITQLIKTQSPTLLDKLTTKQTQSEISQIQNDYISVYDFIEWASKHYSSLSETANDLNRLLKDKNIQLYRQYGGISPSIDKDNTNLKAAFDFVAINNGYEKQSSSFNFDDDIPF >NZ_CP017521|2342839:2350994|2343778_2344081_+|WP_006250278.1|DBSCAN-SWA MNTYNNTLNNKNLEKKQLLMAIQAIPASQDFIWDGKDDDERPVTPSEFSIAMKKRGRPAGSKKELVSLRLDKSVLEAFRASGKGWQSRINQVLSDFVKQV >NZ_CP017521|2342839:2350994|2344342_2344555_-|WP_015484067.1|DBSCAN-SWA MPTSGDFFTRYARTSCRRQSQRSNASVCAKFYAKSTACILTKNEDTMINITDKQIDPTFYQRLPASRRLY |
12 | Synechococcus_phage(16.67%) | integrase,terminase | attL 2346045:2346104|attR 2351410:2351483 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017521.1|WP_006250250.1|1658290_1658521_+|hypothetical-protein |
1658290_1658521_+
Protein sequences of NZ_CP017521.1|WP_006250250.1|1658290_1658521_+|hypothetical-protein>NZ_CP017521.1|WP_006250250.1|1658290_1658521_+|hypothetical-protein MNAQATLNNHKDYILCGRKEKRTSDFINVFEVFENEATQEFVIERAMFRNGKLIDWNQSDKMNAEQAQQLWQAYIH |
76 aa aa | NA | NA | NA | 1541126-1670093 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.11|1746220|37|NZ_CP017521|CRT,PILER-CR matches to NZ_CP017521 position: 1565869-1565905, mismatch: 0 ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************* 2. spacer 3.16|1745753|37|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017521 position: 1617376-1617340, mismatch: 0 ttggttataattaaaattgattgcggtacacgcccct CRISPR spacer ttggttataattaaaattgattgcggtacacgcccct Protospacer ************************************* 3. spacer 3.19|1745956|34|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017521 position: 1625553-1625520, mismatch: 0 ctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa CRISPR spacer ctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa Protospacer ********************************** 4. spacer 3.23|1746221|36|NZ_CP017521|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017521 position: 1565870-1565905, mismatch: 0 gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************ |