Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017523 | Mannheimia haemolytica strain 1582 chromosome, complete genome | 3 crisprs | cas3,DEDDh,WYL,DinG,cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,c2c9_V-U4,PD-DExK,RT | 9 | 16 | 8 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP017523_1 | 890563-890637 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017523_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017523_1
>1.1|890586|29|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder AGACCTGATACTAATCTAGGGTATAAAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017523_1
The CRISPR arrays of NZ_CP017523_1 >merge|NZ_CP017523|1|890563-890637|CRISPRCasFinder CCTAGCGGTGGCAGGCACCAGAAAGACCTGATACTAATCTAGGGTATAAAGACCTAGCGGTGGCAGACACCAGAA >NZ_CP017523|1|1|890563-890637|CRISPRCasFinder CCTAGCGGTGGCAGGCACCAGAA AGACCTGATACTAATCTAGGGTATAAAGA CCTAGCGGTGGCAGACACCAGAA
>NZ_CP017523.1|WP_006248316.1|889204_890446_+|HipA-domain-containing-protein MMNKRIYVFADWETFSQPELVGVLSSDVVRGKENFRFSYDNEWLSSPYVQQIDPNLYLYPGEQYSTDTQNFHIFLDSCPDRWGRLLMKRREAALASQENRKPKLLIESDYLLGVHDMNRMGALRFKTELNGPFLDNNTRLAAPPLSSLRELEFAAIQLESSDNVDDPDYLKWLHMLISPGSSLGGARPKASVIDELNQLWIAKFPSRYDDYDIALWEYLAYRLAIQAKIEMATCRIERFNQEHHTFLTQRFDRHCGKRRHFTSALTQLGYYDGDYEASYLEIAQFLTESGSNTRIDLAQLWRRIVFNIAISNTDDHLRNHGFIYAQEGWILSPAYDLNPVPLSQGLHLNITDSDNRLDYQLAFDVADFFQLSKQQAVQIYDEVLKEINNWQNVAKEIGIPRQEQEQMKFAFNV >NZ_CP017523.1|WP_006250513.1|889001_889205_+|hypothetical-protein MFTQTLLAQRTGLSRVTVRKIMNGDPTVAIGYYLMVLGVLGLEQDFTDVGKDDELGRKLQDIELLRK >NZ_CP017523.1|WP_006248313.1|887945_888539_+|hypothetical-protein MKLKALSTLIASSMLYSQSFAVPPEKTAEEPQPFFNKTESGYDLVFNDQNYRLIETELNGEKIQFRAFERIVYVNNPIEPDYQTINLYVPEAYYNNGEINGYQADTAPIFLPNSVGGYMPAKAASYDKKRRDGSPGTILVALSKGYVVASVGARGRTLQKEGKYTGKAPSAIIDSKSAAHKACRFESDHWHHSLCKI >NZ_CP017523.1|WP_006248311.1|886958_887822_+|hypothetical-protein MLQLILAILCSVTVGVLIKFARQKGIRIDQSIAVNYIVTTTMTFLLLKPDYQGQSITDIIANNPTSYIFVILSITLPTIFLVQAKALEFAGIIRTDAAQRLSLFLPILAAFTIFGEQVTQNKLIALLLAFVALGCLLWKGNQGMEKGGKIAIISLALVWVGYGVNDILFKQIAKSGSAFPVTLSIAFIGAGCFMFIYLLLKRTQWHVPSVLTGLLLGVLNFGNILFYIQAHQAMKDDPTLVFTGMNLGVICLGTFVGAFFFKEKIHKVNYLGVAIAIVAIICLFYWR >NZ_CP017523.1|WP_006248309.1|886037_886787_-|alpha/beta-fold-hydrolase MEKRFEINEQGLSIRCKLFYEKELQQIENVVIVLHGFGSSKDLKSNTKFGERLSSKYKGYAALAFDFPCHGDDARKKLSVEESITYLQLVIDYAKTSLNAKNLYAYGTSFGGYLTLKYLAEKGNPFRKIALRAPAVQIYHSLMNRLSEEERQKLAKGREILWGFDRQMKISQAFFDELTDITQNDYLDYAEQILILHGTEDEMVALSTSQQFADNNVIELLPIEGADHAFSNPKLMDIAIGKIVEFFAP >NZ_CP017523.1|WP_006248308.1|885550_886036_+|YbaK/prolyl-tRNA-synthetase-associated-domain-containing-protein MSEQTFHQLTALLDSHRARYRVVGHPSAGKSEEVAKIRGTEIGQGAKALVCKVKGNGVKQAVLAILPADYQADLTKIAEHLGGLRASLASPAEVAELTDCVFGAIPPFSFHPDLLLVAEPSLFERYAELAFNAGTLERSIILNTEDYQKIVNPVLVQFAKS >NZ_CP017523.1|WP_006248307.1|884941_885487_+|endonuclease-SmrB MNDTLLDDEFALFREAAKGTKKLTQNTFVPKAEPRKKLQELRELKEKADTEFYFSDEYEPLLKEENEKVKYLREDVDPYILKQLRRGDFQPELFLDLHGLTREKAKKELAALILACEREKVYCASVMTGFGTRTLKDQIPRWLVQHPKVMALHQAPKEWGGDASILILVEQPENPEKMFGR >NZ_CP017523.1|WP_006248305.1|883904_884849_-|50S-ribosomal-protein-L3-N(5)-glutamine-methyltransferase MFKYNTELLDEISALPIVNDLVTIQDMMRWGYSYFNASDLYYGHGYDNAWDEAQQLVLAGLYLPFDVPETLYSSRLTRVEKERIINLICERLGSRKPVAYLTNSAWFCGGEYYVDERVIVPRSPIGELIKKGFKGIIKNEPHRILDMCTGSGCIAIACAERFPEAEVDAVDLSLDALDVAQINIERHQVSHRVFPICSDLFNNLPQDKYDLIVTNPPYVDEEDLGDMPEEFHHEPALALGSGKDGLDLTKRILAQAADYLNDDGVLVCEVGNSMVHLIEQFPSVPFNWLEFEHGGLGVFSLTKEELVKHRHLFA >NZ_CP017523.1|WP_006251360.1|882927_883821_+|N-acetylmuramic-acid-6-phosphate-etherase MNALGQMITEQRNPNSMNIDRLSALDIVQVINQEDKQVAIAVEQCLPQIAQAVEKIVQAFEKGGRLVYVGAGTSGRLGVLDASECPPTYGVKPEMVVGLIAGGERALRFPIEGAEDNREQGKVDLQAVNFSEKDVLVGIAASGRTPYVLGAMEYAKQLGATTVSIASNPNSAMAQIADIAIETVVGPEVLTGSSRMKSGTAQKLVLNMLTTASMILIGKCYQNLMVDVQATNEKLKARAIRIVMQATECEREVAEDTLKLAENNAKLAIMMILGNLDKQKAEDLLSQNQGRLQKALK >NZ_CP017523.1|WP_006248303.1|882453_882915_+|nuclear-transport-factor-2-family-protein MRKIKLLHVILSLILGLSAAAIGSYPAIKEIGEERAKKHQDILDLNRELYSAMVNRDFSALQTLLSDDFELYSSTGEVIDKQEWIKLIQKRVLEFDKVDLLSTDFQGNQSSGLLRVNGEFFGIERDNVVVEMNIRTIVRNTERQIKCIVIKEV >NZ_CP017523.1|WP_147009621.1|890849_891890_-|IS481-family-transposase MFYSNNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNLKNRVDEAIEQAVVKFALDNPAFGQVRVSNELRKQGIFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLIALEKLVAEQGIILSETQVQALERKKEDEIACGEIETVHPGYLGSQDTFYVGNLKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKAAISAADMLNDKVLPFFESQGLPMLRILTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHSKTKVKHPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKKIYTDLTTLQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMATLLDGKRIWVEKNLSSN >NZ_CP017523.1|WP_015587024.1|891888_892620_+|transposase MRVSFLFRLIFDTHILNGKLSLFRVNCQIKSDLLHLNTVLNTLQCDYVLFSSEDNYQVIINLKKADYPKNEANFITMTLNKKFGDAKFSGANHYLRCASFFNKKSTNNNEKSVLVDFTNTKTEEDNKCYFDNLLSSYKNNNVKLEPLDIKIIDELGDDKAVIAQKEIQAEIALCKRIFKQLDWSAVDFRIVKRLYRKGFSENEIAVALVRFTDFEDRHCDSHDYLTRTITKAIQNYQQCSKAC >NZ_CP017523.1|WP_006248322.1|892937_893492_+|hypothetical-protein MRKQAKLEKYIHLIEDAAKFFNSYFINKKVIYRTKTQEISIIFKRSNFMHLCGIKYTDGASEFFNAAISNNLDLAKMNVKSDGTTFLKLSLLNSVSFLLTPEMCLTEGGIYLNIRFDKSLKTKKQIFALTLINQNHVFIPNSLLNLKKMNDFPNGERVVSIKSIGLLTNEEIVFYGGCRRSDLI >NZ_CP017523.1|WP_006248324.1|893759_893990_-|hypothetical-protein MSLLKKAQTFISIFNEVRAKNEAQRQSSNNLNVALKNAAEMRAEMNGFSLKPQKRSTYFADHYGCGIHAVETYDNE >NZ_CP017523.1|WP_006248326.1|894110_894428_-|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MLSRKEVLMTRRASMNLQQIIRNVVEYTYSYESGDKLSAEIHNTLDNLSYFPRIGVIGSVENTRECFCRGYRIIYRETENQVQILAIIHCRQQYPTDYYRSAFKA >NZ_CP017523.1|WP_006248329.1|894925_895183_-|hypothetical-protein MICHADPEYVKYNYAGLWEKGSDGTFFYNYQQFMPEVEAKESLREQEPELDDGYNEEEYSEEEYSDENDASDENDNYDETYDDNF >NZ_CP017523.1|WP_006248332.1|895617_896706_-|AAA-family-ATPase MGIMSKSISIFNHKGGIAKTTTAFNVGWSLANQGYQVLLVDLDSQCNLTGLVLGYDQCKEDSDLALFYNNRHHLTMEGIVEALINGQSPDNYLSGNVGQITQTLNPNLFLLPGHLNVSELDSQISVSLKIAAGVPATRNIPGNLPTLIKKVAEQNNIDYILYDLSPNVGGLNEVILMSSDYFIVPTSPDFFCWQAVGSLAKNIRKWHNELKAFKELNGFNQSSYAIKNKPQFLGTIQQRYRPRKGQPAKSFEKWIERIRNEVITNFVPVLKTIDCAIDDTAIYAALKSTNSDLEPFDLAHIADFNSLIAISQELRVPVFSLTKEQIKNSGQFGHALNTMDESKENFDQEFQSLAERIIQLTN >NZ_CP017523.1|WP_006248333.1|896770_897202_-|hypothetical-protein MKKMAIVALSAFFSMNAFANNNVVYSCTTTDNQTLKVTKEGGNYVYSHGNTTFKNPVKEALKNPASEIAGGSQFTTISLELRNAGKSYIVGHIEADPKSPFEASVQIQDIKTGNDITSFECRSDKPIRHNFDRKLMRKSGFAA >NZ_CP017523.1|WP_006248334.1|897205_899308_-|integrating-conjugative-element-protein MKKAKSLKFLTACIMLTTMSGYANSNTVNVGNSISNFIENTTGYRTGNLGVSGNNALTEYYPVLSDYMHYSIGGGSAISAPASRGRPNQYGIGIGWKSNLTCGNFDIKLSIKNQLNGITEGFKDLYGNIIESATGAVASLPAMIIQRANPQLYDILSNGLYQGKLDFNNFKTSCEAMSNQLADLAMDSKLAKMAGLHRAAEIAETEPDAMAAKKKMDKKDAEKGIPWVGGEQRGGKNQKPMAIVADIVGAGYNLALGRGPLEKGDIPIASCDGMLCTEWKNPSEAAAYASEVIGETFLDACETCEQSSSGAKAGKGIAHFIEQTTIEKATKLEAALNHLDSLTPEQLNSLSTSTVSVTKGVLEAIAASPDAALLGARLSQELAISKEMEKLLLIRRAMLAGMREPNVIKSSLVEEAERNLKLLDREIEQVKLEMELQRSINGNTALAAITQQMNEQALAIDDNAMGDGNRRFANLSNQAGANNLNTSGIANSAQNAVGDRYIAIPKSDGSGMSDFYGAYKASPTNIVSNVNVGSYTQIAQMNGNANEQATALIKQFEGYLSHGKWDVNANRAGYGSDTYTTADGMVHRVQKGTYVSREDAERDLARRMPQFMNVARGNVGADVWAKLTPQAQAALTSVSYNYGSLSKLESVQKAAAVSAQSGDMTALANSIRNLQGHNNGVNARRRNQEADYIINAPKGN >NZ_CP017523.1|WP_006253298.1|899334_899613_-|hypothetical-protein MQAKTFYYLPLLLLSAMASASPANKPSDVTVKVFTSESYPKVFPHSGDWATHSDSFSNTENYSWALWRPYSCCKKQGQVFLGHVDWKSTHTH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP017523_2 | 1127083-1127157 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017523_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017523_2
>2.1|1127106|29|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder TCTTTATACCCTAGATTAGTATCAGGTCT |
DinG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017523_2
The CRISPR arrays of NZ_CP017523_2 >merge|NZ_CP017523|2|1127083-1127157|CRISPRCasFinder TTCTGGTGTCTGCCACCGCTAGGTCTTTATACCCTAGATTAGTATCAGGTCTTTCTGGTGCCTGCCACCGCTAGG >NZ_CP017523|2|2|1127083-1127157|CRISPRCasFinder TTCTGGTGTCTGCCACCGCTAGG TCTTTATACCCTAGATTAGTATCAGGTCT TTCTGGTGCCTGCCACCGCTAGG
>NZ_CP017523.1|WP_015587044.1|1125829_1126870_+|IS481-family-transposase MFYSNNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNLKNRVDEAIEQAVVKFALDNPAFGQVRVSNELRKQGIFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLIALEKLVAEQGIILSETQVQALERKKEDEIACGEIETVHPGYLGSQDTFYVGNLKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKTAISAADMLNDKVLPYFESQGLPMLRILTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHTKTKVKHPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKKIYTDLTTLQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMATLLDGKRIWVEKNLSSN >NZ_CP017523.1|WP_006252258.1|1124902_1125676_+|D-hexose-6-phosphate-mutarotase MNLSNALKLIKYNELDVLEVNHNKFKAKIALQGAQLLSWQPYNAEQDVLWLSEIEPFRIGSAIRGGIPICYPWFGSIKEPAHGTARIQEWRLVEHTCSDENVGLVFALENKAKMEMMLGETCELYFTHLDPEPAQLALHSYFNIGDIEKVEVQGLPTRCFDKLTDQEVEVPSPRKISENVDCIYPAQAVNFIQDFANQRTIKVEHINATETVLWNPWHNTVSAMTETAYQNMVCVETARINTLLQQNETLGVRVLVR >NZ_CP017523.1|WP_006248318.1|1120557_1124754_-|autotransporter-domain-containing-protein MKTKTFTRSYLASFVTIVLSLPAVASVVRNDVDYQYFRDFAENKGPFSVGSMNIDIKDNNGQLVGTMLHNLPMVDFSAMVRGGYSTLIAPQYLVSVAHNTGYKNVQFGAAGYNPDSHHYTYKIVDRNDYEKVQGGLHPDYHTPRLNKLVTEVVPAAVTNAGTSIKPYLNEERFPMFLRAGSGTQALRGKESNKTTGIAGAYEYLTGGTTLQLSKSSPDHWLDYSSNLYQVSYGPLSTYALPGDSGSGSYAYDMNEKRWVLVGVLNFYNGMDNQFNRSAIIRKDFHEKKFAEDIAGTINNTVQNAQFNWTAQGKSSSLSQSNNVQKLNVDLKDSSIANQNTSLPQENHGKTINFNGKDATIVLKQDIDQGAGALNLNANLTIRPETDQTWQGAGIIVGKDKKVNWQVKNPQGDRLSKLGEGTLYVNGRGQNLGDISVGDGIVILNQQADHQGRKQAFNTVGIVSGRPTVVLGSADQVNPDNIYFGFRGGRLDLNGNSIAFKRIQNSDKHARIVNHNRDHISTLIIQGQDPLTSNDLIWGKWASNSPADIYEYTNPYQNKRKDYFRLKGNSRVYYPTNATSNDHWEFLSSNREQAIQKILDAKNLRQRYDTFNGFIGEDASNKTNGILNVVFDTKTEVNTEQDKLKNIYTMSGGFNLNGELTLKGGTLLLSGHPTPHAYDIKNKHDVVRENDWQDSHFTAKNITVNKMAQLYIGRNVNEVNSHFTATDKAKLNLGFINRSTPSCYDSEYTGTTHCEVQAVISDNIFANLATTAIKGNVKLQNHSQLNLGKANLTGSVQADQTTHITLANHSHWLNNGTSQIGHLTMEKGSILSLNDKFATTEIPVRFNKMIIQGNLKGNGRINYTANLAKGESDHLQVDGIAEGNFVLAVRNSTTEANPKSSLNLLSLKNSNQEGNKASISLENNYVDLGTYRYVLENRNHNYHLFNPLIPNSTSKEMNATSVSSIPKKESVTNVPTLDKKETEQNLTQLQKDFSAHQLENQKAKQSMINAQSELRRLNSQLNVLQKYVNSRRLGYYTQQAVLEQISIIQNKIKQTQTIFNDANATVKLTDQKLEEAKLALGSVNDLVLIKASAPAMQATNQDTSMMNIIQADWISQYANTALSELSAQANSALQISNSLDRQLFKQSDKFNVWSSVEHQKTEHKSDLYRPYKQQTNLTQLGIQMPIDNGLMFGVALSKNHANAEFNEGVNGKSNLLMASLYGKWQSQQGTFISLDGSYGKAKNQLYLFGENHFTRRISSIGANIGHQFDLAGVQIQPTIGARYYHFSGQDYTLGGAKISSPNTHFMTYQAGLKASKTFSLDDWKVEPSITTHYVDASNKRLAVNVNNNNINQRFGRYLKTEAGIRFEHNQWQFDLHAGFINGNEIKKQHFAGVKLGYSW >NZ_CP017523.1|WP_006248319.1|1119408_1120503_+|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase MSKTIEERISAVILAGGLARRMNGVEKGLQLFEGKPLISHILARLSPQVSDIWLNVNRSIEQYQQLYPAFSYYQDSLPDFQGPLSGMLAGFEQIESDYLLFVPCDTPFMPELLLQKLKTALRINNVQIAYAHDGERPHPTFALIHRSVQEDLKAYLGSNQQQLLAFFQSQKSVAVDFSEQKSAFTNVNTLEDLSRVSQFPVKNLAITGYSGTGKTTLLEKLIPKLTACGIRVGLIKHSHHNVDVDKKGKDSYRLREAGANPTMIVCDERWALMTETKQAVEFSQLIAKFNPQEVDLVFVEGFKHETLPKIQLHRKGIEKPLPELDQWTIATATDYPLERENWLDINNIGGIADFIKNWLENKAS >NZ_CP017523.1|WP_006248320.1|1119052_1119322_-|DUF1040-family-protein MKCERLEELLELLGEHWRKNPDLHLIDILQQLSVEVGEPDNFKALSDEVLIYQLKMRNAGKFEPIPGIKKDYEDDFKTALLRARGILND >NZ_CP017523.1|WP_006248321.1|1118350_1118989_-|thioredoxin-domain-containing-protein MKKLALKTAFVALSALFTFNSTAIAADPTAGKEYIEVRKAPSAQKEVVEFFSFYCPHCYDFELSYKIPSQIKEKLPSDSKLVQYHVNFLGRQSEDLTRAWALAMALGAEDKVKTALFEGAQKDAFKSMDDIRSVFLANGITAEQFDSGINSFAVNGLVNKQVQLAEDFQIRGVPAFFVNGQYQLNLEGFADSSSTNDFIKRYVDAVVFLSKK >NZ_CP017523.1|WP_015484370.1|1117490_1118267_-|LLM-class-flavin-dependent-oxidoreductase MTKLSILNLVPIREGQTAKQAVDSMVKLAKHAESIGIERYWIAEHHNMKNLASSATQLLIQHALSHTEKLRVGSGGVMLPNHSPYIVAEQYGTLETLYPNRVELGLGRAPGTDMRTATALRRNAQSLPFPDEISELKGYFEGTNSVSAYPAQGLNVPFYILGSSPESAYLAAERGLPYAFASHFAPRFMDDAVRIYRTHFKPSEVLDKPYVILGVNAIAAETDQEAEQLATTQTQFFLNVVTNAQNYLQPPVESDDKV >NZ_CP017523.1|WP_015484369.1|1117226_1117481_-|luciferase MKAEIVPHFGPVSFQQNALYNQEKPVVRQMTACSLIGSRESIEQQLKSLKARIEIDEIMAVSYIFDEQKQHQSYTWLKEIADKV >NZ_CP017523.1|WP_006252261.1|1116931_1117225_-|YfcZ/YiiS-family-protein MSKTMQQKAADAHNMCKLKGDSMLDNSDRQIAFEAVYDSEEIAVQAVEFFTQKAKSVETEPCDIQSEITPIIDGFLMKMWITFSCQAEVILFQMAVR >NZ_CP017523.1|WP_147009621.1|1115824_1116865_+|IS481-family-transposase MFYSNNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNLKNRVDEAIEQAVVKFALDNPAFGQVRVSNELRKQGIFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLIALEKLVAEQGIILSETQVQALERKKEDEIACGEIETVHPGYLGSQDTFYVGNLKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKAAISAADMLNDKVLPFFESQGLPMLRILTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHSKTKVKHPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKKIYTDLTTLQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMATLLDGKRIWVEKNLSSN >NZ_CP017523.1|WP_006248316.1|1127273_1128515_-|HipA-domain-containing-protein MMNKRIYVFADWETFSQPELVGVLSSDVVRGKENFRFSYDNEWLSSPYVQQIDPNLYLYPGEQYSTDTQNFHIFLDSCPDRWGRLLMKRREAALASQENRKPKLLIESDYLLGVHDMNRMGALRFKTELNGPFLDNNTRLAAPPLSSLRELEFAAIQLESSDNVDDPDYLKWLHMLISPGSSLGGARPKASVIDELNQLWIAKFPSRYDDYDIALWEYLAYRLAIQAKIEMATCRIERFNQEHHTFLTQRFDRHCGKRRHFTSALTQLGYYDGDYEASYLEIAQFLTESGSNTRIDLAQLWRRIVFNIAISNTDDHLRNHGFIYAQEGWILSPAYDLNPVPLSQGLHLNITDSDNRLDYQLAFDVADFFQLSKQQAVQIYDEVLKEINNWQNVAKEIGIPRQEQEQMKFAFNV >NZ_CP017523.1|WP_006250513.1|1128514_1128718_-|hypothetical-protein MFTQTLLAQRTGLSRVTVRKIMNGDPTVAIGYYLMVLGVLGLEQDFTDVGKDDELGRKLQDIELLRK >NZ_CP017523.1|WP_006253491.1|1129526_1130042_-|single-stranded-DNA-binding-protein MAGINKVIIVGNLGNDPEMRTMPNGEAVANISVATSESWTDKNTGERREVTEWHRIVFYRRQAEVCGQYLRKGSQVYVEGRLKTRKWQDQNGQDRYTTEIQGDVLQMLGSRQGNDMGGQQGGWGNSAPAGNSYNQGNSNYGYNQTQSAAPQSKPAPQPEPAMNNFDDDIPF >NZ_CP017523.1|WP_006253492.1|1130196_1133025_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MQHIDIRGARTHNLKNINLTLPRDKFIVITGLSGSGKSSLAFDTLYAEGQRRYVESLSAYARQFLSLMEKPDVDHIEGLSPAISIEQKSTSHNPRSTVGTVTEIHDYLRLLFARVGEPRCPDHDVPLAAQTISQMVDRVLEEPEGKRLMLLAPVVKERKGEHVKLLENLTASGYLRARIDGEICDLSDPPALELQKKHTIEVVVDRFKVRADLATRLAESFETALDLSGSTAIIADMDDPNAEEIVFSSSFACPHCGYSLHELEPRLFSFNNPAGACPTCDGLGVEQFFDAKKVVQNEEVSLAAGAIKGWDRRSFYYFGLLKAVAEHYGFDLETPFGQLPKKYQNIILNGTKEEIEFVYVNDRGDKVKRKHAFEGVLNNMARRYKETESNSVREELAKYINNRPCMDCEGSRLRREARYVFLDKTNLPMVSEKSIGEALTFFEELKLAGQKEKIAEKILKEIRERLQFLVNVGLNYLSLSRSAETLSGGEAQRIRLASQIGAGLVGVMYVLDEPSIGLHQRDNERLLNTLVHLRNLGNTVIVVEHDEDAIRAADHIVDIGPGAGVHGGQVIAQGTAAEIMQIEESITGQFLSGKQKIEIPAQRVPYEPTKLLTLSGASGNNLKKVKLEIPVGLFTCITGVSGSGKSTLVNDTLFPLAQNALNRAENSDVAPYESIDGLSHFDKVIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGLFTPIREIFAGTQEARARGYNVGRFSFNVRGGRCEACQGDGVIKVEMHFLPDVYVPCDHCKGKRYNRETLEIRYKGKTIHQVLEMTVEEAREFFAPMPMIARKLQTLMDVGLSYIRLGQSSTTLSGGEAQRVKLATELSKRDTGKTLYILDEPTTGLHFADIKQLLGVLHRLRDQGNTIVVIEHNLDVIKTADWIVDLGPEGGSGGGEIIATGTPEEVAKDKRSHTARFLKEILAKG >NZ_CP017523.1|WP_006249416.1|1133116_1134850_-|C4-dicarboxylic-acid-transporter-DauA MLNKWFLTKNAFLAVKPFSALKDALNAGYGKQHLIRDIISGLTVGVIAIPLSMALAIASGVPPQHGLYTAIVAGIVIALTGGSRFNISGPTAAFVVILYPVTQQFGLSGLLMATMLSGGILVLMALLRLGRLIEYIPLPVTLGFTCGIGIVIATLQIKDFLGLSIEKMPEHYLGKLEAIFSALPTINWADTLVGVVTLLVLTRWHKLRLPIPGHLPAVFIGTLLSLLLIHFGQNVATIGSAFHYTLSDGTTGYGIPSVLPEFVLPWNLPNAEGNRIDWNLTTIQALLPAAFSMAMLGAIESLLCAVVCDNMTDTKHHSNNELLAQGLGNIASPFLGGITATAAIARSAANVRSGAVSPISSVVHALLVLFALLFLAKALSYLPLSSMAALLLVVAWNMADIPQIIQLTRRSGKNEIAVLLTCITLTVLFDMVIAITVGVLLASLLFIRTIAEMTKSFEMAHPTDLNDVLVYRISGPLFFAAADNLFADLHNKTVHTDHQIKHIVLQCDAVTVLDAGGIHALTRFVQHMLPHQQLHLCNVQFQPMRMLVRSQKTVNEIPQIQFSSDLESAFDKIRQAN >NZ_CP017523.1|WP_006249414.1|1135091_1136024_+|ABC-transporter-permease 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017523_3 | 1656919-1658084 | TypeI |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017523_3
|
17 spacers
spacers of NZ_CP017523_3
>3.1|1656950|34|NZ_CP017523|CRT CCAATGGCGAAAACATAGGATTTGTGGGTACACC >3.2|1657015|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR CCTATTGTCGCCCTTGATTTTCCAATTCAAGACGAG >3.3|1657082|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR CAAATTCAAGATATACAATTGACCGCAACAGATAAA >3.4|1657149|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR CGGGGATTAACCGAACAGGATTGGATTCGTTATGAG >3.5|1657216|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR CGCGTAGCTAATGGCAGATTTTTACGGCAATTTAGG >3.6|1657283|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR CCTCTAGCATTAAAATCCAATCGGTAAACGGTAAA >3.7|1657349|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR CTTTAATTAATAAAATAGCTTTAGCTTTAGATTTAA >3.8|1657416|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR CCCAACAATGCTTTTCTTTGTATAACCAGCCACGA >3.9|1657482|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR GTATCATTTATCGCCCGAAAAATCCAAAAATCGCA >3.10|1657548|37|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR GGTAAAAGATTACTACTACCCTATGGCAATAAGTGTA >3.11|1657616|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR GCGCAAGCATTGCACCACGGTAACAACGGCTGCTG >3.12|1657682|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR GGCGTTTATCAGCATCTGCTCGTGTTACTGTGCCAC >3.13|1657749|37|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR GGTGCAAACTACTCCGATAACCGAAGTAGCAGCGGTG >3.14|1657817|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR GGCACTAGGGCGAGTGCAGACGGGCAAGTGTCGGA >3.15|1657883|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR GTTGTTTGGATCTCTTAATCTTGATTCTTGAAAAAG >3.16|1657950|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR GCCTTATCTTAACTGACTCCGGAGGTATTCAAGAA >3.17|1658016|37|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR GTTTACCGTAGATCAAAATGCCATTGCTCGTTATAGG >3.18|1657016|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder CTATTGTCGCCCTTGATTTTCCAATTCAAGACGAG >3.19|1657083|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder AAATTCAAGATATACAATTGACCGCAACAGATAAA >3.20|1657150|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder GGGGATTAACCGAACAGGATTGGATTCGTTATGAG >3.21|1657217|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder GCGTAGCTAATGGCAGATTTTTACGGCAATTTAGG >3.22|1657284|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder CTCTAGCATTAAAATCCAATCGGTAAACGGTAAA >3.23|1657350|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder TTTAATTAATAAAATAGCTTTAGCTTTAGATTTAA >3.24|1657417|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder CCAACAATGCTTTTCTTTGTATAACCAGCCACGA >3.25|1657483|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder TATCATTTATCGCCCGAAAAATCCAAAAATCGCA >3.26|1657549|36|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder GTAAAAGATTACTACTACCCTATGGCAATAAGTGTA >3.27|1657617|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder CGCAAGCATTGCACCACGGTAACAACGGCTGCTG >3.28|1657683|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder GCGTTTATCAGCATCTGCTCGTGTTACTGTGCCAC >3.29|1657750|36|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder GTGCAAACTACTCCGATAACCGAAGTAGCAGCGGTG >3.30|1657818|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder GCACTAGGGCGAGTGCAGACGGGCAAGTGTCGGA >3.31|1657884|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder TTGTTTGGATCTCTTAATCTTGATTCTTGAAAAAG >3.32|1657951|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder CCTTATCTTAACTGACTCCGGAGGTATTCAAGAA >3.33|1658017|36|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder TTTACCGTAGATCAAAATGCCATTGCTCGTTATAGG |
cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,c2c9_V-U4 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017523_3
The CRISPR arrays of NZ_CP017523_3 >merge|NZ_CP017523|3|1656919-1658084|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTTCAATATATATTGATGCGAAGGTAGCAGCCAATGGCGAAAACATAGGATTTGTGGGTACACCGTTTCAATACACAGCCACGCGAAGGTGGCTGCCTATTGTCGCCCTTGATTTTCCAATTCAAGACGAGGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCAAATTCAAGATATACAATTGACCGCAACAGATAAAGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCGGGGATTAACCGAACAGGATTGGATTCGTTATGAGGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCGCGTAGCTAATGGCAGATTTTTACGGCAATTTAGGGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCCTCTAGCATTAAAATCCAATCGGTAAACGGTAAAGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCTTTAATTAATAAAATAGCTTTAGCTTTAGATTTAAGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCCCAACAATGCTTTTCTTTGTATAACCAGCCACGAGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGGTATCATTTATCGCCCGAAAAATCCAAAAATCGCAGTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGGGTAAAAGATTACTACTACCCTATGGCAATAAGTGTAGTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGGCGCAAGCATTGCACCACGGTAACAACGGCTGCTGGTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGGGCGTTTATCAGCATCTGCTCGTGTTACTGTGCCACGTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGGGTGCAAACTACTCCGATAACCGAAGTAGCAGCGGTGGTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGGGCACTAGGGCGAGTGCAGACGGGCAAGTGTCGGAGTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGGTTGTTTGGATCTCTTAATCTTGATTCTTGAAAAAGGTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGGCCTTATCTTAACTGACTCCGGAGGTATTCAAGAAGTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGGTTTACCGTAGATCAAAATGCCATTGCTCGTTATAGGGTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGG >NZ_CP017523|3|1|1656919-1658083|CRT ATTTCAATATATATTGATGCGAAGGTAGCAG CCAATGGCGAAAACATAGGATTTGTGGGTACACC GTTTCAATACACAGCCACGCGAAGGTGGCTG CCTATTGTCGCCCTTGATTTTCCAATTCAAGACGAG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CAAATTCAAGATATACAATTGACCGCAACAGATAAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CGGGGATTAACCGAACAGGATTGGATTCGTTATGAG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CGCGTAGCTAATGGCAGATTTTTACGGCAATTTAGG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CCTCTAGCATTAAAATCCAATCGGTAAACGGTAAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CTTTAATTAATAAAATAGCTTTAGCTTTAGATTTAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CCCAACAATGCTTTTCTTTGTATAACCAGCCACGA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG GTATCATTTATCGCCCGAAAAATCCAAAAATCGCA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GGTAAAAGATTACTACTACCCTATGGCAATAAGTGTA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GCGCAAGCATTGCACCACGGTAACAACGGCTGCTG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GGCGTTTATCAGCATCTGCTCGTGTTACTGTGCCAC GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GGTGCAAACTACTCCGATAACCGAAGTAGCAGCGGTG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GGCACTAGGGCGAGTGCAGACGGGCAAGTGTCGGA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GTTGTTTGGATCTCTTAATCTTGATTCTTGAAAAAG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GCCTTATCTTAACTGACTCCGGAGGTATTCAAGAA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GTTTACCGTAGATCAAAATGCCATTGCTCGTTATAGG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG >NZ_CP017523|3|1|1656984-1658083|PILER-CR GTTTCAATACACAGCCACGCGAAGGTGGCTG CCTATTGTCGCCCTTGATTTTCCAATTCAAGACGAG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CAAATTCAAGATATACAATTGACCGCAACAGATAAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CGGGGATTAACCGAACAGGATTGGATTCGTTATGAG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CGCGTAGCTAATGGCAGATTTTTACGGCAATTTAGG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CCTCTAGCATTAAAATCCAATCGGTAAACGGTAAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CTTTAATTAATAAAATAGCTTTAGCTTTAGATTTAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG CCCAACAATGCTTTTCTTTGTATAACCAGCCACGA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTG GTATCATTTATCGCCCGAAAAATCCAAAAATCGCA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GGTAAAAGATTACTACTACCCTATGGCAATAAGTGTA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GCGCAAGCATTGCACCACGGTAACAACGGCTGCTG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GGCGTTTATCAGCATCTGCTCGTGTTACTGTGCCAC GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GGTGCAAACTACTCCGATAACCGAAGTAGCAGCGGTG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GGCACTAGGGCGAGTGCAGACGGGCAAGTGTCGGA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GTTGTTTGGATCTCTTAATCTTGATTCTTGAAAAAG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GCCTTATCTTAACTGACTCCGGAGGTATTCAAGAA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG GTTTACCGTAGATCAAAATGCCATTGCTCGTTATAGG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTG >NZ_CP017523|3|3|1656984-1658084|CRISPRCasFinder GTTTCAATACACAGCCACGCGAAGGTGGCTGC CTATTGTCGCCCTTGATTTTCCAATTCAAGACGAG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC AAATTCAAGATATACAATTGACCGCAACAGATAAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC GGGGATTAACCGAACAGGATTGGATTCGTTATGAG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC GCGTAGCTAATGGCAGATTTTTACGGCAATTTAGG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC CTCTAGCATTAAAATCCAATCGGTAAACGGTAAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC TTTAATTAATAAAATAGCTTTAGCTTTAGATTTAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC CCAACAATGCTTTTCTTTGTATAACCAGCCACGA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGG TATCATTTATCGCCCGAAAAATCCAAAAATCGCA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGG GTAAAAGATTACTACTACCCTATGGCAATAAGTGTA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGG CGCAAGCATTGCACCACGGTAACAACGGCTGCTG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGG GCGTTTATCAGCATCTGCTCGTGTTACTGTGCCAC GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGG GTGCAAACTACTCCGATAACCGAAGTAGCAGCGGTG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGG GCACTAGGGCGAGTGCAGACGGGCAAGTGTCGGA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGG TTGTTTGGATCTCTTAATCTTGATTCTTGAAAAAG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGG CCTTATCTTAACTGACTCCGGAGGTATTCAAGAA GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGG TTTACCGTAGATCAAAATGCCATTGCTCGTTATAGG GTTTCAATTCGCAGCCACGCGTAGGTGGCTGG
>NZ_CP017523.1|WP_006248118.1|1655258_1656734_-|ribonuclease-G MSSTELLVNVTPSETRVALVENGILKELHIEREAKRGIVGNIYKGRVTRVLPGMQSAFVDIGLEKAAFLHASDIVSHTECVDENEKKQFLVKDISELVREGQDIVVQVVKDPIGTKGARLTTDITLPSRYLVFMPENSHVGVSQRIESEEERARLKSLVEPYCDELGGFIVRTAAEEATEESLKQDVEFLKRLWRKVLERKGKYSAKSMLYGELALAQRVLRDFIGTHINSVRIDSKLTYEQVREFLAEFMPELTDCVTLYTGQQTLFDAYGVEKAIQKALDKRVDLKSGGYLIIEQTEAMTTIDINTGAFVGHRNLAHTIFNTNIEAIQAIAHQLQLRNLGGIIIIDFIDMQEEEHRERVLQSLQEALKGDRVKTNVNGFTQLGLVEMTRKRTRESLERILCCDCQACQGRGTVKTVETVCYEIMREIVRVHHLFKTENIHVYAAKDVAEYLINEESHALLAELQAFIGKKIEIKLEPYYHQEQFDVVVM >NZ_CP017523.1|WP_006248119.1|1653602_1655105_-|lysine--tRNA-ligase MSEVENQELDLNGEMLARREKLNKIREQGNAFPNTFRRDALAKDLHAQYDAVEGETLKEQNIQVKVAGRIMLKRVMGKASFFTIQDVSGAIQLYVARDNLSDSVYEEKVSLWDLGDIVGVEGALFKTKTGELTVRCSEVQLLTKSLRPLPDKHHGLTDLETRYRQRYLDLISNEESRRTFMIRSQVVSGIRKFFLERDFIEVETPMLQVIPGGAAAKPFITHHNALDVDMYLRIAPELYLKRLVVGGFERVFELNRNFRNEGVSVRHNPEFTMIEYYQAYADYHDLMDNTEELLRQLALDILGTTDVPYGDYVFDFGKPFERITMHDAIVKYGNGIQREDLDSFEKSVEIAKGLGIEIQKSWGLGSVVNAIFEEVAEHQLIQPTFLMAHPAEISPLARRNDENPEVTDRFELFIGGREIGNGFSELNDAEDQAERFDAQVAAKDAGDDEAMFKDEDFIVALEHGLPPTAGEGLGIDRLVMIFANAPSIRDVILFPAMRQK >NZ_CP017523.1|WP_006248812.1|1652451_1653525_+|homoserine-O-acetyltransferase MAQQITLFEDVPLPLTLGGELSPITVAYQTYGRLNAEKSNAVLLCHALTGDAKPYYDSPTEKGWWQDFIGKGLAFDTDKYFFICSNVLGGCKGTTGPASINPKTNKPYGSLFPIITVQDIVNVQKALLDYLEIPQLHAVVGGSFGGMQATQWGISYPDKVRNIINLCSSLTLSAEAIGFNHVMRQAIINDPHFNGGNYYDGIAPDNGLKIARMLGMLTYRTDIQLAKAFGRETKQQGQIWGDHFQVESYLSYQGTKFLGRFDANTYLRLLRALDLYDPALGYENEETALKRIKANYTFVAVTSDQLFKQVDVYKSKQKLEQAGVNLEFHEFHSDFGHDAFLVDYDFFEPMIKAGLAK 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>NZ_CP017523.1|WP_006248113.1|1658634_1659648_-|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MRKLQNTLYITTQGSYLHKERETLVVEQDRKKVAQLPIHSIGHIFCFGNVLVSPFLMGFCGENNVNLAFFTENGRYLGRLQGRQSGNVLLRRAQYKKSETNPVPVARNIIAAKIQASKRVLQRQIRNHGENADLQSTITALNYSLQQLKTADNLDLIRGIEGDAAARYFGVFSHLIKENSGFHFDGRNRRPPRDGVNALLSFLYSIVGKDISGALQGVGLDPQIGFLHADRSGRDSLAQDILEEFRAWWVDRMVLSLINRGQVKPDDFVTEASGAVTLKPEARKLLFQTLQAKKQEKIIHPFLEEEVEIGLLPYIQAMLLARHLRGDLAEYPPFLMR >NZ_CP017523.1|WP_134916814.1|1659750_1660044_-|DUF3800-domain-containing-protein MQHNKISFEDSVNNSLIQASDVIAGLLAGIGEQIQKYNEQEFYNEFISKLNPNHLENLKLLAQIYQNSIYKSNGLFTHFFAPLSFICRLQNFIFSYK >NZ_CP017523.1|WP_006248111.1|1660044_1660965_-|hypothetical-protein MITSNLERSFHGLNIAQHNYKIFLDESGGNIGKLKHTPNDKKGSNFNRTISSHIGVPPVFVLGGIAQISNANLIAPDWRKLLHLQNKELKFSKIGKNFFNKLGSKELRKVLEWINENNLCIHFALYDWVYFYDVDIIDSALIESDVCSVWKYLSEKIGNSNRYKEIKDYQRKVGLDKQSDDIIYLFYIKELLHDFIINNLQWFLSEIYNNHYKKIDNQEKTVFLDNLYNMIKGSEKYKVLEFFLEKIDRNKYLSFIYDKLDSEMNEDKTFIMLVEDMSPPYQNYLNTFPLSEFYFDKGMEHVFIDY >NZ_CP017523.1|WP_006253509.1|1660991_1661666_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MGDLQNSAEILPLVQPKFGDDKRSISLSALQHYAFCPRQCALIHNEQVWAENYLTAQGQALHERVDSGEPEVRKGIRFERTVHVAAEKLGISGILDLVERDLKTGELKPVEYKRGKPKLDPIDEIQLCAQALCLEEMTEQTINEGALWYMQTRHRLPIIFSTELRTKTLATIAEVRSLLDSGTTPPPEYSKRCKACSLIDLCQPKLLERDRSKGYVVGVFGSLL >NZ_CP017523.1|WP_006248109.1|1661665_1662529_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2 MSIQNRYEFVFFFDVTNGNPNGDPDAGNMPRLDPETSKGLVTDVCLKRKIRNFIEMSYENEAGYEIYVKEKSVLNLQNKRAYEALGIESEAKKLPKEEAKAREITAWMCKNFFDIRTFGAVMTTEVNSGQVRGPVQLAFAQSIDPIIPLEVSITRMAVTNEKDLEKERTMGRKYIVPYALYRVHGFISAKLAEKTGFSDEDVQKLWQALQLMFEHDRSAARGEMAARKLIVFKHDSELGNQPAHKLFDSVKVERINGEKDTPAKDYDDYCISVQTEGLTGVTVEELL >NZ_CP017523.1|WP_031192850.1|1662538_1664320_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 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MFKPHGSLDWFMAGDVPMTSCIGKVEEPLIITPGVGKYKKGYGQPFDAHREKANEAIDSASSILCIGYGFNDDHLQTHLTGKIKSGVKTLLLTRGLSENARNVVKEAPNCKALIFDGDKAGTRVVSKQEETFIPNVHWWDVEFFVKEILENGK >NZ_CP017523.1|WP_006253506.1|1667621_1668758_-|transposase MLLRKAFKFEIRPNGEQVRKMKQFCGCSRFVFNKALAWQNEQYEQDNHHKFSYTKLANLLPQWKKELVWLKDCHSQVLQQSLKDLESAFKNFFQKRADLPKFKKKGVKESFRFPQGCKIEQKNDRLYLPKIGWVRYRNSREIVGEVKNVTVSMKCGRFFVSIQTEFKQEIPTHKGGEIGIDMGIARFATLSNGEFFEPLNAFKTHKGKLAKLQKQLKNKVKFSKNWQKLKDKIGKLHHKIANCRKDFLHKISTQISKNHAMIYVEDLQVANMSKSAKGTAEVHGKNVKQKSGLNRVILDQSWFEFRRQLDYKTQWLGGFLLAVPPQNTSRTCPCCNYTAKENRQTQENFECVECGYTENADVVGAMNVLTRGQAIVQA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_CP017523_3 | 3.15|1657883|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR | 1657883-1657918 | 36 | NZ_CP017523.1 | 1275662-1275697 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017523_3 | 3.22|1657284|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 1657284-1657317 | 34 | NZ_CP017523.1 | 1583035-1583068 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017523_3 | 3.27|1657617|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 1657617-1657650 | 34 | NZ_CP017523.1 | 1525064-1525097 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017523_3 | 3.28|1657683|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 1657683-1657717 | 35 | NZ_CP017523.1 | 1525318-1525352 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017523_3 | 3.29|1657750|36|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 1657750-1657785 | 36 | NZ_CP017523.1 | 1524713-1524748 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017523_3 | 3.30|1657818|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 1657818-1657851 | 34 | NZ_CP017523.1 | 1598260-1598293 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017523_3 | 3.31|1657884|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 1657884-1657918 | 35 | NZ_CP017523.1 | 1275662-1275696 | 0 | 1.0 |
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1. spacer 3.13|1657749|37|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to position: 1524712-1524748, mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 3.15|1657883|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to position: 1275662-1275697, mismatch: 0, identity: 1.0
gttgtttggatctcttaatcttgattcttgaaaaag CRISPR spacer gttgtttggatctcttaatcttgattcttgaaaaag Protospacer ************************************
3. spacer 3.22|1657284|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to position: 1583035-1583068, mismatch: 0, identity: 1.0
ctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa CRISPR spacer ctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa Protospacer **********************************
4. spacer 3.27|1657617|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to position: 1525064-1525097, mismatch: 0, identity: 1.0
cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
5. spacer 3.28|1657683|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to position: 1525318-1525352, mismatch: 0, identity: 1.0
gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer ***********************************
6. spacer 3.29|1657750|36|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to position: 1524713-1524748, mismatch: 0, identity: 1.0
gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************
7. spacer 3.30|1657818|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to position: 1598260-1598293, mismatch: 0, identity: 1.0
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8. spacer 3.31|1657884|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to position: 1275662-1275696, mismatch: 0, identity: 1.0
ttgtttggatctcttaatcttgattcttgaaaaag CRISPR spacer ttgtttggatctcttaatcttgattcttgaaaaag Protospacer ***********************************
9. spacer 3.32|1657951|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to position: 2627437-2627470, mismatch: 0, identity: 1.0
ccttatcttaactgactccggaggtattcaagaa CRISPR spacer ccttatcttaactgactccggaggtattcaagaa Protospacer **********************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_CP017523_3 | 3.13|1657749|37|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR | 1657749-1657785 | 37 | DQ426905 | Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome | 18815-18851 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017523_3 | 3.13|1657749|37|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR | 1657749-1657785 | 37 | KP137432 | Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome | 18780-18816 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017523_3 | 3.13|1657749|37|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR | 1657749-1657785 | 37 | JN255163 | Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome | 18976-19012 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017523_3 | 3.13|1657749|37|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR | 1657749-1657785 | 37 | KP137438 | Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome | 19141-19177 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017523_3 | 3.13|1657749|37|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR | 1657749-1657785 | 37 | DQ426904 | Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome | 18740-18776 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP017523_3 | 3.15|1657883|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR | 1657883-1657918 | 36 | KP137439 | Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome | 11457-11492 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017523_3 | 3.15|1657883|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR | 1657883-1657918 | 36 | NC_028743 | Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome | 11439-11474 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP017523_3 | 3.22|1657284|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 1657284-1657317 | 34 | NC_028743 | Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome | 19018-19051 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP017523_3 | 3.27|1657617|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 1657617-1657650 | 34 | DQ426905 | Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome | 18466-18499 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP017523_3 | 3.28|1657683|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 1657683-1657717 | 35 | KP137432 | Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome | 18136-18170 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017523_3 | 3.28|1657683|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 1657683-1657717 | 35 | JN255163 | Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome | 18336-18370 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP017523_3 | 3.28|1657683|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 1657683-1657717 | 35 | DQ426904 | Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome | 18136-18170 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP017523_3 | 3.29|1657750|36|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 1657750-1657785 | 36 | KP137432 | Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome | 18780-18815 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017523_3 | 3.29|1657750|36|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 1657750-1657785 | 36 | JN255163 | Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome | 18976-19011 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017523_3 | 3.29|1657750|36|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 1657750-1657785 | 36 | KP137438 | Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome | 19141-19176 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017523_3 | 3.29|1657750|36|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 1657750-1657785 | 36 | DQ426904 | Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome | 18740-18775 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017523_3 | 3.30|1657818|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 1657818-1657851 | 34 | NC_028956 | Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome | 3967-4000 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017523_3 | 3.31|1657884|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 1657884-1657918 | 35 | NC_028853 | Mannheimia phage vB_MhS_535AP2, complete genome | 11457-11491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017523_3 | 3.31|1657884|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 1657884-1657918 | 35 | KP137439 | Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome | 11457-11491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017523_3 | 3.31|1657884|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 1657884-1657918 | 35 | NC_028743 | Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome | 11439-11473 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017523_3 | 3.6|1657283|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR | 1657283-1657317 | 35 | NC_028956 | Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome | 19192-19226 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017523_3 | 3.6|1657283|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR | 1657283-1657317 | 35 | NC_028743 | Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome | 19017-19051 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017523_3 | 3.11|1657616|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR | 1657616-1657650 | 35 | NC_008201 | Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome | 18391-18425 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017523_3 | 3.11|1657616|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR | 1657616-1657650 | 35 | DQ426905 | Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome | 18466-18500 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017523_3 | 3.11|1657616|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR | 1657616-1657650 | 35 | KP137432 | Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome | 18431-18465 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017523_3 | 3.11|1657616|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR | 1657616-1657650 | 35 | JN255163 | Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome | 18627-18661 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017523_3 | 3.11|1657616|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR | 1657616-1657650 | 35 | KP137438 | Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome | 18792-18826 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017523_3 | 3.11|1657616|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR | 1657616-1657650 | 35 | DQ426904 | Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome | 18391-18425 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017523_3 | 3.12|1657682|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR | 1657682-1657717 | 36 | NC_008201 | Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome | 18136-18171 | 1 | 0.972 |
NZ_CP017523_3 | 3.12|1657682|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR | 1657682-1657717 | 36 | DQ426905 | Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome | 18136-18171 | 1 | 0.972 |
NZ_CP017523_3 | 3.12|1657682|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR | 1657682-1657717 | 36 | KP137432 | Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome | 18136-18171 | 1 | 0.972 |
NZ_CP017523_3 | 3.12|1657682|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR | 1657682-1657717 | 36 | JN255163 | Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome | 18336-18371 | 1 | 0.972 |
NZ_CP017523_3 | 3.12|1657682|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR | 1657682-1657717 | 36 | KP137438 | Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome | 18565-18600 | 1 | 0.972 |
NZ_CP017523_3 | 3.12|1657682|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR | 1657682-1657717 | 36 | DQ426904 | Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome | 18136-18171 | 1 | 0.972 |
NZ_CP017523_3 | 3.14|1657817|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR | 1657817-1657851 | 35 | NC_028956 | Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome | 3966-4000 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017523_1 | 1.1|890586|29|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 890586-890614 | 29 | MH791397 | UNVERIFIED: Enterococcus phage EfsSzw-1, complete genome | 22354-22382 | 5 | 0.828 |
NZ_CP017523_2 | 2.1|1127106|29|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 1127106-1127134 | 29 | MH791397 | UNVERIFIED: Enterococcus phage EfsSzw-1, complete genome | 22354-22382 | 5 | 0.828 |
NZ_CP017523_3 | 3.27|1657617|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 1657617-1657650 | 34 | NC_047750 | Mannheimia phage vB_MhM_1127AP1, complete genome | 19383-19416 | 6 | 0.824 |
NZ_CP017523_3 | 3.27|1657617|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 1657617-1657650 | 34 | NC_028898 | Mannheimia phage vB_MhM_587AP1, complete genome | 19392-19425 | 6 | 0.824 |
NZ_CP017523_3 | 3.11|1657616|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR | 1657616-1657650 | 35 | NC_047750 | Mannheimia phage vB_MhM_1127AP1, complete genome | 19383-19417 | 7 | 0.8 |
NZ_CP017523_3 | 3.11|1657616|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR | 1657616-1657650 | 35 | NC_028898 | Mannheimia phage vB_MhM_587AP1, complete genome | 19392-19426 | 7 | 0.8 |
NZ_CP017523_3 | 3.28|1657683|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 1657683-1657717 | 35 | HM144385 | Brochothrix phage NF5, complete genome | 32998-33032 | 10 | 0.714 |
NZ_CP017523_3 | 3.23|1657350|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 1657350-1657384 | 35 | NC_014534 | Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782202, complete sequence | 368774-368808 | 11 | 0.686 |
NZ_CP017523_3 | 3.25|1657483|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder | 1657483-1657516 | 34 | NC_014533 | Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782201, complete sequence | 710003-710036 | 11 | 0.676 |
1. spacer 3.13|1657749|37|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer *************************************
2. spacer 3.13|1657749|37|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer *************************************
3. spacer 3.13|1657749|37|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer *************************************
4. spacer 3.13|1657749|37|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer *************************************
5. spacer 3.13|1657749|37|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer *************************************
6. spacer 3.13|1657749|37|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer *************************************
7. spacer 3.15|1657883|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to NC_028853 (Mannheimia phage vB_MhS_535AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gttgtttggatctcttaatcttgattcttgaaaaag CRISPR spacer gttgtttggatctcttaatcttgattcttgaaaaag Protospacer ************************************
8. spacer 3.15|1657883|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to KP137439 (Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gttgtttggatctcttaatcttgattcttgaaaaag CRISPR spacer gttgtttggatctcttaatcttgattcttgaaaaag Protospacer ************************************
9. spacer 3.15|1657883|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to NC_028743 (Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gttgtttggatctcttaatcttgattcttgaaaaag CRISPR spacer gttgtttggatctcttaatcttgattcttgaaaaag Protospacer ************************************
10. spacer 3.22|1657284|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa CRISPR spacer ctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa Protospacer **********************************
11. spacer 3.22|1657284|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to NC_028743 (Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa CRISPR spacer ctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa Protospacer **********************************
12. spacer 3.27|1657617|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
13. spacer 3.27|1657617|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
14. spacer 3.27|1657617|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
15. spacer 3.27|1657617|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
16. spacer 3.27|1657617|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
17. spacer 3.27|1657617|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
18. spacer 3.28|1657683|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer ***********************************
19. spacer 3.28|1657683|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer ***********************************
20. spacer 3.28|1657683|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer ***********************************
21. spacer 3.28|1657683|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer ***********************************
22. spacer 3.28|1657683|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer ***********************************
23. spacer 3.28|1657683|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer ***********************************
24. spacer 3.29|1657750|36|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************
25. spacer 3.29|1657750|36|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************
26. spacer 3.29|1657750|36|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************
27. spacer 3.29|1657750|36|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************
28. spacer 3.29|1657750|36|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************
29. spacer 3.29|1657750|36|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************
30. spacer 3.30|1657818|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcactagggcgagtgcagacgggcaagtgtcgga CRISPR spacer gcactagggcgagtgcagacgggcaagtgtcgga Protospacer **********************************
31. spacer 3.31|1657884|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to NC_028853 (Mannheimia phage vB_MhS_535AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgtttggatctcttaatcttgattcttgaaaaag CRISPR spacer ttgtttggatctcttaatcttgattcttgaaaaag Protospacer ***********************************
32. spacer 3.31|1657884|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to KP137439 (Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgtttggatctcttaatcttgattcttgaaaaag CRISPR spacer ttgtttggatctcttaatcttgattcttgaaaaag Protospacer ***********************************
33. spacer 3.31|1657884|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to NC_028743 (Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgtttggatctcttaatcttgattcttgaaaaag CRISPR spacer ttgtttggatctcttaatcttgattcttgaaaaag Protospacer ***********************************
34. spacer 3.6|1657283|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa CRISPR spacer actctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa Protospacer **********************************
35. spacer 3.6|1657283|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to NC_028743 (Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa CRISPR spacer actctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa Protospacer **********************************
36. spacer 3.11|1657616|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gcgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer ccgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
37. spacer 3.11|1657616|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gcgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer ccgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
38. spacer 3.11|1657616|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gcgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer ccgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
39. spacer 3.11|1657616|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gcgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer ccgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
40. spacer 3.11|1657616|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gcgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer ccgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
41. spacer 3.11|1657616|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gcgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer ccgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer **********************************
42. spacer 3.12|1657682|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ggcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer agcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer .***********************************
43. spacer 3.12|1657682|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ggcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer agcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer .***********************************
44. spacer 3.12|1657682|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ggcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer agcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer .***********************************
45. spacer 3.12|1657682|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ggcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer agcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer .***********************************
46. spacer 3.12|1657682|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ggcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer agcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer .***********************************
47. spacer 3.12|1657682|36|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ggcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer agcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer .***********************************
48. spacer 3.14|1657817|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ggcactagggcgagtgcagacgggcaagtgtcgga CRISPR spacer agcactagggcgagtgcagacgggcaagtgtcgga Protospacer .**********************************
49. spacer 1.1|890586|29|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to MH791397 (UNVERIFIED: Enterococcus phage EfsSzw-1, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
agacctgatactaatctagggtataaaga CRISPR spacer aaacctcataataatctagggtataaggc Protospacer *.**** *** ***************.*
50. spacer 2.1|1127106|29|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to MH791397 (UNVERIFIED: Enterococcus phage EfsSzw-1, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
tctttataccctagattagtatcaggtct CRISPR spacer gccttataccctagattattatgaggttt Protospacer *.*************** *** ****.*
51. spacer 3.27|1657617|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to NC_047750 (Mannheimia phage vB_MhM_1127AP1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.824
cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer cgcaagcactgcaccacggtagcaacggctagaa Protospacer ********.************.********. .
52. spacer 3.27|1657617|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to NC_028898 (Mannheimia phage vB_MhM_587AP1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.824
cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer cgcaagcactgcaccacggtagcaacggctagaa Protospacer ********.************.********. .
53. spacer 3.11|1657616|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to NC_047750 (Mannheimia phage vB_MhM_1127AP1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
gcgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer ccgcaagcactgcaccacggtagcaacggctagaa Protospacer ********.************.********. .
54. spacer 3.11|1657616|35|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to NC_028898 (Mannheimia phage vB_MhM_587AP1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
gcgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer ccgcaagcactgcaccacggtagcaacggctagaa Protospacer ********.************.********. .
55. spacer 3.28|1657683|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to HM144385 (Brochothrix phage NF5, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer ataattatcaacatctggtcgtgttactggtcgat Protospacer ... ******.****** *********** * *.
56. spacer 3.23|1657350|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to NC_014534 (Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782202, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tttaattaataaaatagctttagctttagatttaa CRISPR spacer ccaatctaataaaataattttagctttagatcggg Protospacer .. * .**********..*************. ..
57. spacer 3.25|1657483|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to NC_014533 (Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782201, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
tatcatttatcgcccgaaaaatccaaaaatcgca CRISPR spacer acaagcttatcgcccaaaaaatccaacaataaaa Protospacer ..*********.********** *** . *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
43941 : 51268
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017523|43941:51268|DBSCAN-SWA TTTATGACTTTCCATTGATATTTTTCTCCTTGTAATAAATCCACCCAAACAACCTCACCACAACCCAAAACACCCACGCCTTAATCGGATTCCCTTGCGAAATTAAGCAATGTCTTAACCGCTTGTCGGCTTCGGCTCGGCTGACTGTGCCCTTGATACCGTAGTCTCGGTCATGCTGATGACAGCAACTATTGATATTGGCTGGCGCATTACGCCAGCCTGTGCAGTAGTGTTTTTTAGTCACTTAAAACTCCTGAGTCACATAAATTTGAGATAAAAATGAGTCTGACAGTAATGTCAACTCATGCGTTGTTTTATACTGCAAATCAACAATGTCACCTACTTTTAAATCAACTACAGTATCAAAATTGATTGTTGTCATACCATTTGTATTTGATTTGCTGTTTTTAGGTGAAACACTTTGATTAATCAGTCTTTCTTTCTCTTCGTTATTTATTAACAGCCTGAGTTGATATAAATTCAGCACATCTTCCGATGAATTTGTAACCGTTATTTTACCTTTTAAATGAAAAGTCCCGCCTGTCCTTGCAATAAATTGACCACTGACAATATCAACATGACCATTGATATCATTTAACACTCTGTCAAACGGCATTTTTTGCCATTCTTGATTAACAGTAAAATTAATCGGCGATGAAAATCGCAATCTTAATCTGTGCTTATTTACTCCTAAGCTCAAATCATCGCAGAAAATAACACCTTGCTTACCTGATATAATCGCAGGATTGTCCGATAATTTATTACTCTTAAATGTTAAATTTAAGAACGGATTATTGCGAGCAAGTCTGACAGAATATTGCTTAGACTTGCTAATACAACGATTATTAATAAATTGGCACTGTTTTAAAATTGTCCCGTCAATATACACATCTTGATTAAATTCACTGGGCTCCAAAATGTTATTAATAAAATTGATATTATCAATAAACAATGAAGGATTATCGAAAGAACCATATTTCGATATTGCAATAGATTTTGCTTGATTATTTGAAAATTCTACATTGTTGCTGCCTGTGTCAGTCGGATTACCTGATGTGACACGCAAGCGACGGCAGAGGTTACTGTTGATAATGGCATTTTTAGCACCAGACATCCAAATATCGTGTCTGAAAATATTATTCGCTACCACACATTCGCCAGTTTGTACATCTTCCACTTGTACGCCCGCTTCCACATCGACTGTCGTCACTGCCATCCCCTGTTCACGATTACCAAAAATGAAAATATCAGAGCAAGATGTTGCACCGTAAGCTGATACATTGCGACCTCCAATTGCTATATTGTTAAAAAATCGCACACCTTTAACTTTGGTGCAGAGATAATGTCCCGCATTACCTGAACCACAATACGATTGGCAGTTTTGTACAATCACATTATCAGTTGGGTAATTAGTATCCGCCTGAATACTTTCACCTGCCCTGACCCCGTAGAAGGTGCCATTAAACACAACATTGTCAATATGGAGATTTTTAACACCAGCATCATCCAAAGACTTAAATCGAATACCAATTGCTTTGTTCGGTGTTTCAATACAAAAACCCGAGATAAAATAATTGCTGTGATTAATATTAAAAACTTCGGCCCCTGCTTGCTGGATACCTGCACCTAATACTAATTTGCCGGTCTTATTGCCCAAAATTTTCACATTATCGCGAACAGAATTAACGGCATTGTTGATACGAAATGTACCGTTTTCGATAAAAAATTGAGAATATCTCATAGCATTTACAAATGCTGATTCATCATTTGTTACCCCGTCACCGACGGCCCAAAAATCAAATAATGTAAGATGTGAAAGGTCAACACGCTTCCACCGCCCCCCATTATTATTCACAACAAAACAAACCCCACCATCATCAGGCGTAACTAAATCCTGCAAATCAGCCACAAACTCCCCACCGCCTGTTGTGCCGTCCTCATAGTAAGCATCCACCAAAATACGCTGACCGTGTTCCGTTGGGCGGATAGTACGTAACTCCGCAACCGATTTGCAGCGACCGATGTGTTTGTAACCATCAGGGTTGGCTAATGCGTTAAAATTATCACGAGTAGCATCGCCCGCAATTTTCTTGATTGCTTTAGCCACCTGATTAACTTGTTCGTCATTTGCTTCGATTCCTGCTTCAGCAAGTACACTGTGCAATTCTTGTTGGGTGTTAATGACCGAATCTTGGACGTTATTCAAAAATTCAGCAGTCACAATCGTGCCATATTCACCAGTGGCAGGGTTGCCATCTTTAAAACGCTGTGTTGGGGTATTAATCGGATTCATCACTTGTTTCATTCAATATCTCCTAAATATCTTACCCACACACGGCTAAATGCAGGTTTTACCTCTTCAAGTAGACTTTCTAAAATTGGGTCTTTGTATCGTCCCATTAACGCATCGCCAGCCATTGACACGCTTGCTCTAAAACGCTTGTAATCATCTGTGGGGTTGCAAACATCCACAAAAAATGTCCACATAATGTCTTTATGCCATAACATATCCCCAGCTCGGCTTAGCCCAGCAATAAAGGGTTGTGGCTCACTAATTTTGATGCAATATCCAAGCTCTTTGGCCACTTGAGTGATATAGCCTATCGACAATCCACCCAACTGATTCAGCTTTGCAATCACACGCTCAATTCGGGTTTCAAGCGGTAGTGAGCTATTCGCCGTTAAGCCACAAACCCGCTCCCAATCATCAATAAAAATGCCTGTTGATACATCAACGGCATCGATTAAAGTCTTGGCTCTCGCATCAATGCGGTCTAGCTCTCTCCCCTCAACTTCAAGGGATAACGCTAGCCATCTGCCGTTTGGGTCATACGATACAGGCGGTAATAAACCGCCCAATGCCTTGCCGTGTTACCTGCGGCCATTTGTTGTGGTAGCCAGCGAGCCATATCTGCAAGCTCAAAGTTACCTGCTTGCCCGGCTGCAACTGCCATATCCAATGCCCGCCCAATATCCTCTTCTTTAATCCCAAATTGTTGCATTGAGGAGATCGCAATTTTTGCCATATCCTCGGAGCTTGCACCTGTTGCTACAGCACCTTTCTGCAAGGTTGGTAATAGGCTCATTGCAGTTTCAGCCTTCATCGTTCCTGAGGCAATTAGCGTATCAAGAGTTAAAAGAGCATCTTCTTTTGTTCCACCCCCAACCTTAACCGCCTCTTGCACCGCTGCTAATAACTCTTTCTTGCCCTCAATACGCCCTTTAACATCACGGTCGGAAAAGGCAGTGTTTGATGCCATCGCTAACTGTCGGTCAAACTCCATTTGGTTCTTGGCTGGCTGACGAGCCATTGCAGCACCTGCTGCAATACCGACACCGGCACTCATCAAACCACGCCCAAATCCTTTAGCCTTATCCCCAAAGCTTGTCTTACCCAATTCTGCATTCAGCTCTCGCACCCGTTGCTTAGTGGCTTCTGAGGCACGGCGTAGCTCATTTTGAGAGGCAACACCTGAGCGTTTTAAGCGGTCATAGGCTGCACGAGTTTGTTCAATTTCGCGTTGGATTGCATTTTCCGCCCGAACACCTAATGTTTCACGGGCTCGGCTCACATCGGCAGCCACTCGGCGGGCATTACGGTAACTCTGTTCTATTTTCCGATTTGAGCTTTCTGTAGCATTCGCTGCTTTCTGTGCTGCTTGCGTTTGAGCATTGCCACTTTTTTGTGCCGCTCGCTCTGTATTTTTAAAGGCTTTTTCGGCGGTTTTAGCGGCTTGGTTTAAAACTGGGGAGGCAGTATCTTTTGCCGTCAATTCCAGTTGCACTTTCATATTTTTTGCCATTTTTAAAGTCTCTTTAAACTAATTTTAAAGTACAAAAAAGGGGCTTTCGCCCCTATTCAATTTTGCCACACCGAGTAAAGACATAGCTTTCGCGTTTCACTTCGCTATTCGCACCCATTGGGCTATGCGGTGTTTTTACGCCCTCACTCTCCAAGTAGCTCTCAATCCACGCAAATACCTCAAGCAACGGCATTTGCCATACCTGCTCGGCGGTAATTGCAAATTTTGAGAGTAAAATCACCGCTTGTCGGTACTGCTTAAAGGCTTCTGCTACGCCAAATCGGGATTTGCCGGGCTTTCGCTCTCGCTTTGGCTCACCCCATTTTCTAACCGCTTTTTTCGGAGTGTGAGCGTTGCCTCAATCAACTGCCAGTAGTCTTCGGTAGCTAAATTGTCAAATAAAAATTGAGCCGTCACATTACCTTGATAAATACCATCAAAGGTAACTTGCTGCGAAAGGTAAGCCATATCGACCAAGGTTTGTTCACGCTTTGATAGGGCTTCCGAGTTTTCCTCAAACCCTAAATCCGCAATCATTTCTTGAGCCGTGCATTGACCGCCCATCGTCAGCAATCGCACCGTACAATCACGGCGAATTTTCCCGTTATATTCAATGCCAAGATTTAAAGTGATTTTCATTATTCATTCACCTTACGCAATGCGTTGAGTTGAATATCACGCACCGACTCACCATCAACGGTGTAAGACTCGCTCACATCGGTAGTAAAACAGCCTAAATAAGAGGTGCGTTTTTCGCTATTGTCTAACGGGTATTTAGTGAGCTTCGCATTTTTAATGTTATCCCAATCAATTACCGAACCGTCTTGAGGCTCAACTGCAGTCACCGAGAGAGTATATTCCGCAATGCCTTGCGAATAACCTCTTGCACGTCCGGAACTGTTCATCGTTTTAACCAGCTTGCGACCGGTTACGGTTTTTACATCAAGTTTGGTAATTTCAATCTCAACGCCATCTACCTCAAGCACGCAAGAGCCTTCATAAACAATTGACATCTAGCACCCCCTATAAAATTAACGTAATTTTGTTACGAATAACGTGCAAGCCATTAACCACATCCGCAGGGATTTCTAAATCCAAGTAAGTCGGGTCTTGATTACGCACCACTAATAAGCGATTTTTCCACGCTTCCACATTTTCGATTACCTCTTCGCCCTCAAGCTGATAAAGCACATCTAAAATCTCCGAGCGTACTTTTGCCACAATACGGTGGGAGTTTTTCGCACGAGGGAAACGCAAACGCTGACGGGTTTGGATTGCCTTACGCACATAGTCAAGCGTACGAATGGTGGTTAAATCCAAATAGCTTGGGTCATCAGTATTCGTCACGTTTTTGGTGTATGTAGTAATCGCACGGGTAATCTGCACACGGCTTGCCACCACCTCAATCGGGCTTAAACCGTGATATAACGCTTGGTTTACTTCGCTAAATAACGGTTTCTGCGAGTCATCTACGACCGTTAAGCCTTTAACTTCAAGGGTATTTAACGGGCGAGCCGGATCTTCTTCACCGGCAATTTCCGCCCTTGTTGCACCACATAATCGGGCAACTGCTTCAAGGCATACCGAACTTGGCTCTCTGTAGGTAAATCTTCGCCCTCATACTGCATTGCAAATTGAGCATAAGCCTGTGTGAGTGCCACATTGCTAAAGGTTTGATAAAACGGCAGAAAGGCTTGCAACCAACCACACCGCTCGGGCACGGCACGTTTTTGTGTTTTCAGCGGTATCATCTGTTTTAACCGTTCCGCTGAATTTTCGCCTGCCTCATACGCCAGCACCCAACTATGCAAGGTGCGTTTAGATAGCTTTAACTTTCCACCGGCTTTACTATTGCCCGCCATAATCGCTTTGCAAATTTCAGCAGGAATTTCACTGCTTGCCACCGCTGCAATGACTTGGTCTAGCGTTTTTGTGCGGCTTAGCCCCAACTGCACTTCCTGCATCAAGAACCACCGCACCACCATAATGCGAGCATCTGCCGTAGAAAGTTGTTTATCGGTTATCTGCTCCAAATCAATGTTTTGTCGCACTACACTCAATTCGCCTTTGCTGATTTCAGCAGGAAGAAGTTTGAGTAACTTGGTGCGGATTTCCTGTTGGACTTCGGTGGGTAAACTGATTAATTCATATTCAACCCCGCCGCCTCTGCCTTTGCGTTTTTGAGATTGCCAGTTTTCCCTTATTGCTTTCTCAAGCACATTTTTATGAGCACTTGGTAGGCTAGATAACTTAAAACTTAACAATTCAGCCACTGAATAGTGCGTTTTTAAACTTAATTCGCTCATAAATGTTCTTCTCCTATATCTTTTACGTTAAAGATCATTTATGATTAAAACTTATTAGTTAAAGTTGGTCGCCGATTACGTTCAATGCGTTCTGCTGTTCGCCCAGCCCAAATCACTTCAGGGGCAACCCCTATGGCATTTGCAACTAAGCGTTCCATTTTGGGGTAAGGCTTGTCTAAAACAGACTTCAGCGTGTTATGGCTAACATTGCCTGCTTTAGCCAAAGAACGAAGTGACCAACCTTTTTTACGAAGTTCCGCAAGAATATCGGCTTTATGCCAATCTCTCTGTGCGGTTTTTTTAACATCGTTTAATACACTCATTCGATACACCTCTTTTTATCTATTTGATGCGTGTATTTAACCGTAAAACTTTAAACAAATCAACCGTAAAACATAAAAACATCTAAAATATTTTTGCTTTATTCATAAATAACTTAAAAATCAATGGTTTATGAGTATGTTTTACGAGTAAAACTTTATTAATGGAAACGTAAAAGATGAGTAAACCAAACATTTACGATGAGAGCTTCTCAGAAAGAATGAAATGGATTGCAAAAAATAGCTTTAAGGACAATTACAGTGAGTTTGCAAGAGCAGTGGGGGTAGCCCAAGCATCACTATCTAGGTGGGTAAAAGGAGAGGCAGATCCATCTCGTTCAAATCTTGTAAAAATAGCAGAGGTGTCAAATGTGAGCCTTGAATGGCTGGCAACAGGTAAGGAAAGCAAACCACAATCAGAGAATACCAGTATTGTGGCAAGAGAGTTTGAGCGACTAGAAAAAATGGCTGATGATATTGTTTCAATGATTAACAGCTTCAGAACAATCAACGTTTCAGCAGGCTTTGGCAGCTTTAACGAGGGCGTAACGAAGCCAGACGGGCAAGAACCTTACGCCGACAGCCTGCTGCAAAGCCTCGGCGTAAAAGCCCACAACTGCGGCGTGTTTTGGGCAAATGGAACATCAATGCACCCTACCATTGCAGACAGTGACCAAATGCTGGTAGATTTCAGCAAACGAGAGCCTCGTGGTGATGATAAGATTTATCTTGTGCAGAATGGGGAAAGCGTATGGGTTAAACGGATTAGAAAAGAATGGGACTATATTGAATTAATTAGCGATAACGAGTCCTACCGCCCAATACAGATTACCGCCGAAGAAGCTCAAAACCTCCAAATCATCGGGCAGGTAGTCCACATCGGACACTCTTTAGTTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017523|43941:51268|46747_47743_-|WP_006253442.1|tail|DBSCAN-SWA MAKNMKVQLELTAKDTASPVLNQAAKTAEKAFKNTERAAQKSGNAQTQAAQKAANATESSNRKIEQSYRNARRVAADVSRARETLGVRAENAIQREIEQTRAAYDRLKRSGVASQNELRRASEATKQRVRELNAELGKTSFGDKAKGFGRGLMSAGVGIAAGAAMARQPAKNQMEFDRQLAMASNTAFSDRDVKGRIEGKKELLAAVQEAVKVGGGTKEDALLTLDTLIASGTMKAETAMSLLPTLQKGAVATGASSEDMAKIAISSMQQFGIKEEDIGRALDMAVAAGQAGNFELADMARWLPQQMAAGNTARHWAVYYRLYRMTQTADG >NZ_CP017523|43941:51268|48013_48382_-|WP_006253443.1|DBSCAN-SWA MKITLNLGIEYNGKIRRDCTVRLLTMGGQCTAQEMIADLGFEENSEALSKREQTLVDMAYLSQQVTFDGIYQGNVTAQFLFDNLATEDYWQLIEATLTLRKKRLENGVSQSESESPANPDLA >NZ_CP017523|43941:51268|49245_50049_-|WP_006253446.1|transposase|DBSCAN-SWA MSELSLKTHYSVAELLSFKLSSLPSAHKNVLEKAIRENWQSQKRKGRGGGVEYELISLPTEVQQEIRTKLLKLLPAEISKGELSVVRQNIDLEQITDKQLSTADARIMVVRWFLMQEVQLGLSRTKTLDQVIAAVASSEIPAEICKAIMAGNSKAGGKLKLSKRTLHSWVLAYEAGENSAERLKQMIPLKTQKRAVPERCGWLQAFLPFYQTFSNVALTQAYAQFAMQYEGEDLPTESQVRYALKQLPDYVVQQGRKLPVKKIRLAR >NZ_CP017523|43941:51268|50548_51268_+|WP_006248970.1|DBSCAN-SWA MSKPNIYDESFSERMKWIAKNSFKDNYSEFARAVGVAQASLSRWVKGEADPSRSNLVKIAEVSNVSLEWLATGKESKPQSENTSIVAREFERLEKMADDIVSMINSFRTINVSAGFGSFNEGVTKPDGQEPYADSLLQSLGVKAHNCGVFWANGTSMHPTIADSDQMLVDFSKREPRGDDKIYLVQNGESVWVKRIRKEWDYIELISDNESYRPIQITAEEAQNLQIIGQVVHIGHSLV >NZ_CP017523|43941:51268|50093_50372_-|WP_006248972.1|DBSCAN-SWA MSVLNDVKKTAQRDWHKADILAELRKKGWSLRSLAKAGNVSHNTLKSVLDKPYPKMERLVANAIGVAPEVIWAGRTAERIERNRRPTLTNKF >NZ_CP017523|43941:51268|43941_44184_-|WP_006248673.1|DBSCAN-SWA MTKKHYCTGWRNAPANINSCCHQHDRDYGIKGTVSRAEADKRLRHCLISQGNPIKAWVFWVVVRLFGWIYYKEKNINGKS >NZ_CP017523|43941:51268|48381_48756_-|WP_006253444.1|DBSCAN-SWA MSIVYEGSCVLEVDGVEIEITKLDVKTVTGRKLVKTMNSSGRARGYSQGIAEYTLSVTAVEPQDGSVIDWDNIKNAKLTKYPLDNSEKRTSYLGCFTTDVSESYTVDGESVRDIQLNALRKVNE >NZ_CP017523|43941:51268|44184_46245_-|WP_015483985.1|tail|DBSCAN-SWA MKQVMNPINTPTQRFKDGNPATGEYGTIVTAEFLNNVQDSVINTQQELHSVLAEAGIEANDEQVNQVAKAIKKIAGDATRDNFNALANPDGYKHIGRCKSVAELRTIRPTEHGQRILVDAYYEDGTTGGGEFVADLQDLVTPDDGGVCFVVNNNGGRWKRVDLSHLTLFDFWAVGDGVTNDESAFVNAMRYSQFFIENGTFRINNAVNSVRDNVKILGNKTGKLVLGAGIQQAGAEVFNINHSNYFISGFCIETPNKAIGIRFKSLDDAGVKNLHIDNVVFNGTFYGVRAGESIQADTNYPTDNVIVQNCQSYCGSGNAGHYLCTKVKGVRFFNNIAIGGRNVSAYGATSCSDIFIFGNREQGMAVTTVDVEAGVQVEDVQTGECVVANNIFRHDIWMSGAKNAIINSNLCRRLRVTSGNPTDTGSNNVEFSNNQAKSIAISKYGSFDNPSLFIDNINFINNILEPSEFNQDVYIDGTILKQCQFINNRCISKSKQYSVRLARNNPFLNLTFKSNKLSDNPAIISGKQGVIFCDDLSLGVNKHRLRLRFSSPINFTVNQEWQKMPFDRVLNDINGHVDIVSGQFIARTGGTFHLKGKITVTNSSEDVLNLYQLRLLINNEEKERLINQSVSPKNSKSNTNGMTTINFDTVVDLKVGDIVDLQYKTTHELTLLSDSFLSQIYVTQEF >NZ_CP017523|43941:51268|47795_47984_-|WP_006251296.1|DBSCAN-SWA MILLSKFAITAEQVWQMPLLEVFAWIESYLESEGVKTPHSPMGANSEVKRESYVFTRCGKIE >NZ_CP017523|43941:51268|46241_46799_-|WP_006253441.1|DBSCAN-SWA MGGLLPPVSYDPNGRWLALSLEVEGRELDRIDARAKTLIDAVDVSTGIFIDDWERVCGLTANSSLPLETRIERVIAKLNQLGGLSIGYITQVAKELGYCIKISEPQPFIAGLSRAGDMLWHKDIMWTFFVDVCNPTDDYKRFRASVSMAGDALMGRYKDPILESLLEEVKPAFSRVWVRYLGDIE |
10 | Mannheimia_phage(80.0%) | tail,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
533837 : 591633
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017523|533837:591633|DBSCAN-SWA TATGTCAGAACTGATTACCAATGCAGGCTGTGGGTCTGCTGAACAACCAAAAGAAAAAATCAATTTATTAAATCTTAATCGTCAAGAAATGCGAGAACTGTTTGCAGAAATGGGGGAAAAACCTTTCCGTGCCGACCAGCTAATGAAATGGATCTACCATTTTGGCGAAGAAAATTTCGATAATATGAGCAATATCAATAAAGTATTGCGTGAAAAATTAAAGCGTATTGCCGAAATTAAAGCCCCTGAAGTGGCGGTAGAACAACGTTCTGCAGACGGTACGATTAAATGGGCAATGCAAGTGGGCGATCAGCAAATCGAGACGGTATATATTCCTGAAGATGACCGTGCAACCCTGTGTGTTTCTTCACAAGTAGGCTGTGCCTTGGCTTGTACCTTCTGCTCAACCGCTCAACAAGGCTTTAACCGTAACTTAAGCGTGGCGGAAATTATCGGGCAAGTGTGGCGTGCTTCTAAAATTATCGGCAATTTTGGCGTGACCGGTGTTCGCCCGATTACCAATGTGGTCATGATGGGAATGGGTGAACCATTGCTGAATATGAATAACGTGATTCCGGCAATGGAAATCATGTTAGATGATTTTGCTTACGGCTTATCTAAACGTCGTGTCACGCTTTCCACTTCGGGTGTGGTGCCGGCATTAGACAAAATGCGTGAGCAAATTGATGTGGCGTTGGCAATTTCACTTCACGCTCCGAACGATGAACTGCGTGATGAATTAGTGCCGATTAATAAAAAGTACAACATCAAAATGTTGATGGATTCGGTGAATAAATACCGTGAAGTTTCTAACGCCAACCACGGCAAGGTCACGATTGAATATGTGATGTTAGATCATGTCAATGACAGCACAAACCACGCCCACCAACTTGCTGAAGTATTAAAAAACACGCCGTGTAAAATTAACTTGATTCCGTGGAACCCGTTCCCAGAAGCTCCTTATGGTAAAAGCTCTAACTCTCGGGTAGATCGTTTCCAAAAAACCTTGATGGAGTACGGTTTCACGGTAACAGTGCGTAAAACACGAGGTGATGATATTGATGCCGCTTGCGGACAGCTTGCTGGCGATGTGATTGACCGCACCAAACGCACCCTTGAAAAACGTAAATTCGGGCAAGGTATTGCGGTTAAAACCCATTAATCTGAATAGTGAAAAGGCAGAGGTTCCTGCCTTTTTGTTATTAGAAATCTAATTGCTCTTCATTTAAACCCAACGCATAGGCAATTTTTATGCGGGTCGTTTTTCGTAGATTTTTTGCATTTTCGTGTTGGCTATAAGCTGATTGCGAAATCCCCAAGCGTTGTGCCACCTCTTCTTGAGTTAAACCTAAATATTCCCGCCAAGCACGCAGAGCTGAGTAGTTATTATCTAATGCAATTCCAGCAACAGCAGATGGAATACCGGTCTCTATTGCGGTTTTAATATTTGCTTTCTGCTTAAGCCATTCAAGTGTTGCTATCGGAAGTACGGCAAAGGCAGGTTTTCCTTCTTCATTATTTAAATATTGAATATTAGTAAGTTCTTTCATCTCGTTTTTTAACCTCTTCGATAGACACAATATTCATCGTTTCGCCTTCAATATTGAAAAAAATACGGTAATTTCCGACCCGAAAGCGATAATCATATTGATGATTTGTTAATGCCTTAATATTGGCACAGTAGGGAAAGTAAGCTAAATCATCACATTTTCGGCGAATTTCTGCACCAGTTGGGATTTTTCGTAATTGCTTTAAGGCTTTACGCTGGAATACCACTATTTTCATTTTTGCCTCTATTTTATAAGTTTTATAAGTTTTTTCAATGAAATTCTTATATTAAATAGAGAGTGTATTCCTACCATTTACCCTAGCACAACACCCCATTATTATTTTTGCGATCTGCGTCGAAAAATGAAAACGAAAAATTTTTCTTCTTCGCAAAAAATCGCTAGTCTTAGCGAGGATGGAACAGTAAAATTAAGCCCTTTGTTGTAGGAGAACGTTATGTTTGCAAAATTTTTTCCAAAAATGACCGCTTGTATTCTGATTTTTTTATTAGCGGCTTGTTCTTCTCTTCCCCCTTCTTCCTCTGAAGTCGAATTTAACCGCTCGGAAGCGGTAAAAGCCCGTATTAATTTGGCTTTAGCTTATCTGGAGCAAAATGATTTCCCAAAAGCTAAGCAGAATATTGATAAAGCCTTGGCTCACGATGAAAAAGATTACCTCCCTTATTCGGTGCTTGCCTATTATTACCAACAAACAGGTGATGCTGAAAATGCCGAAAAAGCCTACCAAACGGCACTGAAATTGAGTCAAAACCGCCCTGATGTGCTGAATAATTACGGCACTTTTTTATGTAAACAGGGTCAATTTCAACAGGCTTATCAGCAATTTGAGCAGGCTGTCAAAAGCAAAGCACCCTACTATCACCAAGCGGATAGCTTAGAAAATATGGTGTTATGTGCGAAAAAAGAGCCGAATCTGCAAAAAATTGCCGAAACATTGACCGAGCTTGAGAAATTGGATAAACCTCGAGCAAATTTATTGAAGGAAAACTAATGACTGACTTAAATCTAAAAATCAGCCAAATTATTGCCGGCGAACTCAACGTTGGCTCACACCAAATTCTTGCAGCCATCACGCTATTAGGTGAGGGCAATACCATTCCATTTATTGCTCGTTACCGTAAAGAAGTGACCGGCGGGCTAGACGACACCCAACTTCGCCATTTTGAAACCCGCTTAATTTATTTGCGTGAAATGGACGAACGCCGCCAAACCATTTTGAAGTCGATTGAAGAACAAGGCAAATTAACCGATGAATTAAAAGCCAAAATTCTAAGCAGTGAAAGCAAGACCGAGCTGGAAGATCTCTATTTGCCGTATAAACCAAAACGTCGCACCAGAGGGCAAATTGCGATTGAAGCAGGGTTAGAGCCATTGGCGGACAGTTTATGGAATGATCCGAAACAAGATCCTGAAACCTTAGCGGCAAACTTTGTTGATGCGGAAAAAGGCGTTGCGGATACCAAGGCCGCATTAGACGGGGCAAGATATATTTTAATGGAGCGTTTTAGCGAAGATGCTGAGCTACTTGCAAAACTTCGCCAATATTTGACCGCTTACGCCACGTTGGAATCGAAAGTGATTGACGGCAAAGAGGAAGAGGGCGAGAAATTCCGTGATTATTTTGCTCATAGCGAGCCGTTTAACAGCGTGCCTTCCCACCGTGCTTTGGCGATGTTCCGTGGGCGAAATGAAGGGGTGTTATCACTTTCATTAAATGCCGATCCGACTGCAGAAGAAGGCACAAAATCCAGCCATTGTGAAGAAATTATTCGTGAGCATTTGGGCGTGATTTTTAATAATCAACCAGCAGATAAATGGCGTGAGCAAGTGATTGCTTGGACGTGGAAAATCAAAGCAGCTCTGCATTTAGAAACCGAATTAATGGCAACCCTGTGTGAAAAAGCTGAAGAAGAGGCGATTGATGTGTTTGCCCGCAATCTCTCGGCATTATTAATGGCAGCCCCTGCCGGTGCGAGAAATACAATGGGGCTAGACCCGGGCTTGCGTACCGGCGTGAAAGTGGCGGTGGTGGATAACACCGGTAAATTGCTGGATACCGCCACAATTTACCCTCACACTGGGCGAGAGGCGGAGGCACAGCTTGCGATTTTCAGCTTAATCAAACAACACAATGTGGAACTGATTGCGATTGGTAACGGTACGGCCTCTCGTGAAACCGAACGTTTTGCCAAAGCGGTGATTAAAGAAATCAAAGAGAATAAACCGCAAACGGTGGTGGTGAGTGAGGCTGGGGCATCGGTCTATTCTGCCTCTGAATTTGCGGCTAACGAGTTTCCAAATTTAGACGTTTCATTACGGGGAGCGGTTTCGATTGCCCGCCGTTTGCAAGATCCACTTGCCGAGTTGGTGAAAATCGAACCAAAAGCGATTGGTGTTGGGCAGTATCAACACGATGTAAACCAATCCCAACTTGCCCGTAAACTCGATGCGGTAGTAGAAGATTGTGTAAACGCAGTGGGCGTGGATCTGAATACAGCCTCCGCTCCGTTGCTGGCTCGGGTGGCGGGAATGACCAAAACATTGGCACAAAATATCGTGGCATTCCGTGACGAAAACGGCCGTTTTACCAGCCGCTCAGAGCTGAAAAAAGTGCCTCGTTTAGGGCCGAAAGCCTTTGAACAGTGTGCCGGTTTTATGCGAATTATCGGTGGGAAAAATGCCCTTGATGCCTCAAGCGTTCACCCGGAAGCTTACCCGGTGGTAGAAAAAATCTTACAGGCAACTACCTCAACACTTGCAGAATTAATGGGTAACAACAGCAAAATTCACTCGCTCAACGCCAAAGATTTTGTGGATGAGCAGTTTGGTTTACCAACGGTGAACGATATTTTCAAAGAGTTAGAAAAACCGGGGCGTGACCCTCGTGGAGAGTTTAAAACCGCCGTGTTTATGGACGGCGTGGAAGAAATTACCGACCTCAAAGCCGGTATGATTTTGGAGGGCACAGTGACCAATGTGGCAAACTTTGGGGCTTTTGTCGATATTGGCGTACACCAAGATGGCTTGGTGCATATTTCAATGCTCTCAAACTCTTTTGTTGAAGATCCGCACACGGTAGTGAAAGCTGGTGATGTGGTGAAAGTCAAAGTGCTTGAGGTGGACGCTGCCCGCAAACGTATTGCCCTTACGATGCGTTTAGACGACAAACCAACCGATAAAAAAGAGCCAACAAGCGGTCGAAATTCAGCAGAAATTTGCAAAAATACGCAGAAAAATGACCGCTTGCAAAGCAACAATCGCAACGCTTTTGGTAACAATGCCTTTGCCGATGCGTTAAAAGGCTGGAAGAAGTAAGGCGAAAACAGATAAAAGCAAGGGCGAAATATTTTTCGCCCTTATTACTAACTTTTATCTGTTAACCTGCTTACTTAAGATAACGTACAAACCCCTCTAAACTTTCACTTTCAGGGG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61 | Burkholderia_phage(19.05%) | plate,tail,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1035463 : 1042248
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017523|1035463:1042248|DBSCAN-SWA TATGACAGAAAAATCGCAGTTAAACTTTAATTACCAACCTTCGAATAATCATGCTAATGCTCAGACGATGATCTTCTTACATGGATTGTTTGGAGATTTAAATAACCTAGGCGCAATAGCAAAACCATTCGCAGAACGTTACTCCATTTTAATGGTTGATCTCAGAAATCACGGGCGATCTTTTCATTCAGACGAAATGAATTATGCTTTGATTGCACAAGATTTAGCACAATTACTCACAGAATTAAATATCCAAAATGCTATTGTGGTTGGGCATTCAATGGGCGGAAAAAGTGCGATGGCATTGGCTGCATTTGCTCCTGAACTGGTGGAGAAATTGGTAGTGATTGATATTGCCCCGGTCACTTATACCCAAAATCGGCATCAGCAGGTTATGGCAGCCTTATTTGCGGTGAAAGAAGCTAAACCCCAGAATCGTCAGCAAGCTAAAGCGATAATGGCTGAATATATTCGAGATGAAGGCGTGCAACAGTTTATGTTGAAATCTTTTGATGCCCAAAGCGAGCAATCTTTCCGTTTTAATTTACAGGCGCTAAAAGATAATTATCAGAATGTGATGGGGTGGCAGCAGGTATTTGTGGATAAACCGACCTTGTTTATTAAAGGTGCATTATCGGATTATATTCAAGCAGAGCATACACAAACGATTTTGGCACAATTTCCGCAGGCCAAATCTTTCATTGTGGCAAACGCTGATCATTGGGTTCACGCAGAAAAAACAGGAACTGTTGTGAGAGCAATCAATAAATTTTTAGAAAAATAAGGGAGAAAAATGCAAAGAGATACATTATTTTCCGCTCCGATTGAGAAATTGGGCGATTTTACTTTTGATGAATCGGTTGCTGAAGTGTTTCCGGATATGATCCAACGCTCCGTGCCGGGCTATTCCAATATTATTACTGCTATTGGAATGTTGGCGGAGCGTTTTGTCACAGATAATTCAAATGTTTATGATTTAGGTTGTTCACGAGGCGCAGGGATTTTATCTATTCGCCGTAATGTGAATGCGAAGAATGTGCAGATTATCGGGGTAGATAATTCTCAGCCGATGGTTGAGCGTTGTAAAACCCATTTAAGTGCTTATCACTCTGAGATCCCGGTGACGATTTTACTTGATGATATTCGCCACATTGAAATTAAAAATGCTTCAATGGTGGTACTTAATTTCACCTTGCAATTTTTACCAAGAGAAGATCGCCTAGCATTATTACAGAAGATTTATCAAGGATTAAATTCCAATGGCATTTTAGTGTTATCGGAAAAATTTACCTTTGAGAGTGAGGAAATGAACGAGCTATTGATCGACCTTCATCACACATTCAAACGAGCAAATGGCTACAGTGAATTGGAAGTCAGCCAAAAGCGTAATGCTTTGGAAAATGTGATGCGAACAGATAGTATTGAAACCCATAAAAAACGTCTGCAAGAAGCTGGTTTTACACAAGTTGAACTTTGGTTTCAATGCTTTAATTTTGGCTCAATGATTGCAATTAAAGCCTAACAAGCGGTGATATTTGTAAAATTTTTTGCAAATTCTTGATAAAAAGCAACCGCTTGCATTCTATCTATTTCTTTATAATAAAAGTCAGTTAGAATCAGTTATAATGCACCACTACTTATTTAGGAGGAAAAAGGTATGGCAACGATAAAAGATGTCGCAAAATATGCTGGTGTATCGACTACAACGGTTTCTCACGTTATAAACAAAACCCGCTTTGTAGCAGAGGACACTACAAAAGCAGTTTGGGAGGCTATTAAAGCGCTGAACTATTCTCCTAGTGCTGTAGCGCGGAGTTTGAAAATTAATACGACTAAATCTATCGGTATGATCATTACAACCAGCGAATCACCGTTTTTCGCTGAAATTGTGTTAGCGGTAGAGGAATTTTGCTATAGCAAAGGGTATTCACTATTTTTGTGCAATACTCAAAACAAACTTGAGAAAATTCAAAATCATTTAGATATGCTCATCAAAAAACGGGTTGATGGCATTTTGGTGATGTGCTCCGAATATACAGCTAATTCATTTGATATCTTTGAAAACAGCAATATCCCAATGGTGATTATGGATTGGGGACGAAGTGATGAACGCAGTGATATTATTTTAGATCACGGTGTTGAAGGTGGCTATATTGCGACTCAGCATTTAATTGAAAACGGGCATCAAGATATTGCTGTAATTACCGGCAATAGAGATAAAGAAATTGCAAGAACCCGTTTTGAAGGTTTTAAAAAAGCGCTATCTGAGGCGGGTTTGTCTATTCGTGAAGAATGGATTCAAGAAGGCGATTTTGAACCTGAGGGGGGGTATGAGTGTATGAATAATTTGCTTAAGAGCAGTGAAAAATTACCAACCGCGGTTTTTTGTTTTAATGACTCAATGGCACTAGGGGCAATTTCAGCTATTACCGAAAAAGGGCTGAATGTGCCGCAAGATATTTCAGTGATCGGGTATGATAACGTGCATAGCTCACGCTTTTATGCACCGCCTCTTACGACAATCCATCAGTCAAAATCTCGCTTAGGCTCGGCAGCATTAGAATTATTATTAGAACGTATTGAAGATAACGAAAACGCAAAAGAGCCTAAAGTATTAGAGTTCTTTCCTGAATTGGTCAAACGTAAATCGGTTCGGAATTTAAACATTAAGGAGTAATATGGAAACATTGATTGAATTTTTTAGTAGCTATGGTTATTGGGCTGTTTTTCTTGTGCTACTTGCCTGTGGTTTCGGTGTGCCGATTCCTGAAGATATTACGTTAGTATCCGGTGGTGTTATTTCAGGATTAGGCTACACCAATGTGCATTGGATGCTGGTTGTTAGTATGTTAGGAGTATTAGTTGGCGATAGCACAATGTACTGGCTAGGTAGAATCTATGGCGAAAAAATTCTCAAATTTCCATTAATCAGGAATGTTGCGACACCTGAACGTTTTGCAACCGTGCAAGAACGTTTTGAAAAACAAGGATGGAAACTACTTTTTATGGCTCGTTTTTTACCTGGCTTGCGCGCGGTGGTTTACTTAGTTTCAGGTATTACCAGAAAAGTCAGCTTCGTAAAATTTTTATTAGTTGATTTCTGTGCCGCTATTATCTCTGTGCCAATTTGGGTTTATTTAGGCGACTATGGGGCATCTAATTTGGATTGGCTAAAAGAACAAGTAGCTAATGGGCAGCACCTCATTTTTGCCATTTTAGGCATTGTTATTCTATTTTTAGGCTGGAAATGGTATAAAAATAAAAAGCAGTATAAAAAGTGAAACAAAAGACGAGCATTTCATCTTAAAAAGATATAATAGCAAAACAGTTGGTAAGAATAATTATAAATATCCATTACCAACTGTTTTTTTGAACTATATTTTAACTTAAAAAATTAGGTTTAACTGTGTCACTTTTTCTTGAAGAAGAACGAAATAACAGTAAGTATTAAAAAGACAAAAAAGAGAATTTTGGCAATTTCAGTAGCACTTCCAGCAATACCACCAAATCCTAATAGCGCTGCGATTATAGCGATGACAAAAAATACGACTGCATAATGTAACATAGTTATACTCCTTACTGTGTAATAAACTGATTAAAAAACTAACATAGTTAATGTATGATTGCAAGGCATGTACTATATTAATCTTGATTAATCCGACTTGAAATGGCACTTTGCTGGTTCTTATATTTTGCATCTTTTCGCGCATTATAGGGTTTTGCAGCATCACCACTTAAAATCTCAAAGCTTAATGCGCCAATTGCCATATTAGGGCGTAAAGCTAGGGGTAATTTTCCAGCATTAAAAAATTCCAATACAATTTTGCCTTCCCAACCCGGATCGATTCTGTGGGCGGTAACGTGTACCATTAAGCCTAATCTAGCAAGTGACGAACGACCATCTAACCATCCAACGATATTGGCTGGTAAGGAAACCGATTCAAGGGTTGTTGCGAGTGCAAGGTCACCGGGATGAAGGAAAAATGCTTCATCATCACCGATGATAATTTCATCACTCATCACTTTATTTAACTGAGCGGCAACTTCTTCTCTAGGGCCACTTAAATCAATATAGGGCGTTTTATGTTCACGAAATACACGAAACGAATTACCTAAACGCACATCTGCAGTGGCGCCAGAAATTTTATCGTCTGAAGGTCGAGGCGTTATGGCAATAATACCTTCATCTAAGTAACGTTTAATATCTGTATCACATAAACGCATATTTAGCTCCTATTTTATTTTAGTAATTGCTTAATTTGTGCTTTAAGAATATCAATGGCAATACGGTTTTTGCCACCTTTTGGCACAATAATATCAGCATATTGTTTAGAGGGTTCGATAAATTGTAAGAACATTGGGCGAACGGTTTTGCGATATTGACTAATCACTGATTCCATCGAACGTCCACGTTCCACCATATCACGTTGTAAGCGGCGGATAAAGCAGATGTCCAGAGGAGCATCTACGAAAATAGAAACATTAATTTCATTGCGAATATTCTCATCTGTCAGCAATAAAATACCTTCTAAAATAATGATTTTCTTTGGTTCAAAGTGCTTCGTGGTCGTTTTACGATTATGTTCGGTATAGTCATATTCTGGAATTTCAATCGCATTACCTTGTTTTAATTGGCGTAAATGTTCAACCAATAAATGATGATCCATTGAATTAGGGTGATCGTAATTGGTTTTAATCCGTTCTTCCATTGTTAGATGAGATTGATCTCTATAATAAGCATCTTCGGAAATAATACCGATATTATCTGTTCCCAATTCATTTTTGAGTTCTTTATAGATGGTTGAGGCAATCAGGCTCTTACCTGAGGCAGATGCGCCGGCAATCGCAATGACAACGCAAGATGAAGTCTGGCTAGTATCAGTCATAAAAAATTTCCTATTCAGTCAAAAGAGTATTCGATAAATTATACCGAAGTTTTGCAAAATTTTTTGTATAATTGACCGCTTGTTATGCGATTTTGGAGAAAAAATGGATATTTTCATTCAAGGATTTATAGTGTGTTTTGGCTTAATTGTCTCTATTGGCGCACAAAATGCCTTTTTATTAAAGCAAGGGATTTTAAAACAACACATATTTTGGATTGCATTGCTCTGTTTTTTAGGTGATGTATTTTTAATGACGATAGGTGTGCTAGGCTTAGGCACGTTAATTGCGGAATTGCCTGTTGTAAGTTTCATTATTTCGCTTTTAGGGGCCATTTTTCTATTAAGCTACGGTAGCCGTTCATTTATCAGCGTATTTAAAAGTGGTGAATACCTTGTGGCAAGTGGAGAGAATGCAACGAGCTTAAAAAAGGCTTTACTGATTACCTTTGCGATTACATTCTTAAATCCTCACGTTTATATTGATACGGTTGTGATTGTAGGCAGTATCGGTGGGAAATTAGATTTTAACGGTAAAATATACTTTTTAGCAGGTGCATTACTTTGCTCATTTATTTGGTTTTTTGGCATAGGTTATGGAGCAAGCTTACTTTCCCCTTATTTTGCAAAGCGAAGAACTTGGCAAATTTTAGATGCTGTTACCGGGCTAATTATGTACTTTATCGCTTTTAGTTTACTGATTTATACTTATCAACTTGCTCTGCAAATTTTCTAGTGGAGTTTAAATTTTTTCATTGATGAATGACGGGCTTTTTTGCTATATTAGTAGCAATGTTCGCACTATAAAATGTGCTTATTTTTGAATAATTTTATTTTAACGGATTCTTTTATGTTTAAAAAATTTTTAGGATTATTTTCAAACGATCTTTCTATCGATCTCGGGACAGCAAATACACTGGTTTATGTTAAAGGTCAAGGTATTGTGCTAGATGAACCCTCAGTGGTTGCTGTACGTCAAGATCGTATGGGATCGCTAAAAAGTATTGCGGCGGTAGGCTCACATGCAAAATTAATGCTAGGCCGTACACCAAAAAGCATAATGGCGATTCGTCCAATGAAAGATGGTGTCATTGCGGATTTTTTTGTAACAGAAAAAATGTTGCAACACTTTATTAAACAAGTACATAGTAATAACTTTATGCGCCCAAGCCCTCGTGTATTAGTGTGCGTGCCAGCAGGTGCAACACAAGTGGAACGCCGTGCAATTAAAGAATCTGCAATTGGAGCAGGAGCGCGTGAAGTCTATTTAATTGAAGAGCCAATGGCGGCTGCAATCGGTGCAGGTTTGCCGGTTCACGAAGCAATGGGGTCAATGGTAATTGACATTGGTGGCGGTACAACCGAAGTGGCAGTGCTTTCTTTAAACGGCATTGTGTATTCAACTTCTGTGCGTATTGGTGGTGATAAGTTAGATGAAGCTATTATTGCTTATGTACGTCGTCATTTTGGTTCTGCTATTGGTGAAGCAACGGCAGAGCGAATTAAACAAGAAATTGCTAGTGCTAAGATTGAATCCGATGATGATGTTAAAACAATGGAAGTACACGGACACAATTTAGCTGAAGGCGCTCCTCGTACTTTCGAGCTTAACTCAAGACATGTATTAGAAGCAATTGAACAACCATTAAATGGTATTGTAGAGGCAGTTAAATCAGTCTTAGAGCAATGCCCACCTGAATTGGCAGCAGACATTTTTGAGCGCGGTATGGTGTTAACAGGAGGTGGTGCATTATTACATAATTTAGATCGTTTACTTTCTGATTCAACTGGCGTGCAAGTCGTAGTAGCAGAAGATCCATTAACTTGTGTAGCTCGTGGTGGTGGTAAAGCATTAGAAATGATCGATATGCACGGTGGTGATGTATTTAGTATTGATGATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017523|1035463:1042248|1041195_1042248_+|WP_006248955.1|DBSCAN-SWA MFKKFLGLFSNDLSIDLGTANTLVYVKGQGIVLDEPSVVAVRQDRMGSLKSIAAVGSHAKLMLGRTPKSIMAIRPMKDGVIADFFVTEKMLQHFIKQVHSNNFMRPSPRVLVCVPAGATQVERRAIKESAIGAGAREVYLIEEPMAAAIGAGLPVHEAMGSMVIDIGGGTTEVAVLSLNGIVYSTSVRIGGDKLDEAIIAYVRRHFGSAIGEATAERIKQEIASAKIESDDDVKTMEVHGHNLAEGAPRTFELNSRHVLEAIEQPLNGIVEAVKSVLEQCPPELAADIFERGMVLTGGGALLHNLDRLLSDSTGVQVVVAEDPLTCVARGGGKALEMIDMHGGDVFSIDD >NZ_CP017523|1035463:1042248|1040451_1041081_+|WP_006248954.1|DBSCAN-SWA MDIFIQGFIVCFGLIVSIGAQNAFLLKQGILKQHIFWIALLCFLGDVFLMTIGVLGLGTLIAELPVVSFIISLLGAIFLLSYGSRSFISVFKSGEYLVASGENATSLKKALLITFAITFLNPHVYIDTVVIVGSIGGKLDFNGKIYFLAGALLCSFIWFFGIGYGASLLSPYFAKRRTWQILDAVTGLIMYFIAFSLLIYTYQLALQIF >NZ_CP017523|1035463:1042248|1036255_1036984_+|WP_006248948.1|DBSCAN-SWA MQRDTLFSAPIEKLGDFTFDESVAEVFPDMIQRSVPGYSNIITAIGMLAERFVTDNSNVYDLGCSRGAGILSIRRNVNAKNVQIIGVDNSQPMVERCKTHLSAYHSEIPVTILLDDIRHIEIKNASMVVLNFTLQFLPREDRLALLQKIYQGLNSNGILVLSEKFTFESEEMNELLIDLHHTFKRANGYSELEVSQKRNALENVMRTDSIETHKKRLQEAGFTQVELWFQCFNFGSMIAIKA >NZ_CP017523|1035463:1042248|1038140_1038743_+|WP_006248950.1|DBSCAN-SWA METLIEFFSSYGYWAVFLVLLACGFGVPIPEDITLVSGGVISGLGYTNVHWMLVVSMLGVLVGDSTMYWLGRIYGEKILKFPLIRNVATPERFATVQERFEKQGWKLLFMARFLPGLRAVVYLVSGITRKVSFVKFLLVDFCAAIISVPIWVYLGDYGASNLDWLKEQVANGQHLIFAILGIVILFLGWKWYKNKKQYKK >NZ_CP017523|1035463:1042248|1035463_1036246_+|WP_006253612.1|DBSCAN-SWA MTEKSQLNFNYQPSNNHANAQTMIFLHGLFGDLNNLGAIAKPFAERYSILMVDLRNHGRSFHSDEMNYALIAQDLAQLLTELNIQNAIVVGHSMGGKSAMALAAFAPELVEKLVVIDIAPVTYTQNRHQQVMAALFAVKEAKPQNRQQAKAIMAEYIRDEGVQQFMLKSFDAQSEQSFRFNLQALKDNYQNVMGWQQVFVDKPTLFIKGALSDYIQAEHTQTILAQFPQAKSFIVANADHWVHAEKTGTVVRAINKFLEK >NZ_CP017523|1035463:1042248|1038871_1039027_-|WP_006248951.1|DBSCAN-SWA MLHYAVVFFVIAIIAALLGFGGIAGSATEIAKILFFVFLILTVISFFFKKK >NZ_CP017523|1035463:1042248|1037119_1038139_+|WP_006248949.1|DBSCAN-SWA MATIKDVAKYAGVSTTTVSHVINKTRFVAEDTTKAVWEAIKALNYSPSAVARSLKINTTKSIGMIITTSESPFFAEIVLAVEEFCYSKGYSLFLCNTQNKLEKIQNHLDMLIKKRVDGILVMCSEYTANSFDIFENSNIPMVIMDWGRSDERSDIILDHGVEGGYIATQHLIENGHQDIAVITGNRDKEIARTRFEGFKKALSEAGLSIREEWIQEGDFEPEGGYECMNNLLKSSEKLPTAVFCFNDSMALGAISAITEKGLNVPQDISVIGYDNVHSSRFYAPPLTTIHQSKSRLGSAALELLLERIEDNENAKEPKVLEFFPELVKRKSVRNLNIKE >NZ_CP017523|1035463:1042248|1039700_1040348_-|WP_006248953.1|DBSCAN-SWA MTDTSQTSSCVVIAIAGASASGKSLIASTIYKELKNELGTDNIGIISEDAYYRDQSHLTMEERIKTNYDHPNSMDHHLLVEHLRQLKQGNAIEIPEYDYTEHNRKTTTKHFEPKKIIILEGILLLTDENIRNEINVSIFVDAPLDICFIRRLQRDMVERGRSMESVISQYRKTVRPMFLQFIEPSKQYADIIVPKGGKNRIAIDILKAQIKQLLK >NZ_CP017523|1035463:1042248|1039104_1039686_-|WP_006248952.1|DBSCAN-SWA MRLCDTDIKRYLDEGIIAITPRPSDDKISGATADVRLGNSFRVFREHKTPYIDLSGPREEVAAQLNKVMSDEIIIGDDEAFFLHPGDLALATTLESVSLPANIVGWLDGRSSLARLGLMVHVTAHRIDPGWEGKIVLEFFNAGKLPLALRPNMAIGALSFEILSGDAAKPYNARKDAKYKNQQSAISSRINQD |
9 | Mycobacterium_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1223103 : 1322654
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017523|1223103:1322654|DBSCAN-SWA CTCATTCTTCAATAACCTCAATATTTTCAATTAAACAACAGGCGTTAAAATCTTCTACAATGTAATCCACATTGAGGGAGTAAAATGTCTCTACGCTGTCTTTTTGTGGCGTATCAAACGCTTTACGGCGGATATTGTTTAAATGAAGATATAGCGAAAGGTTATCTAATCGAGTGATTAAAATCGCATTGCTTGGGAAGTAGGGAATACTTACCGCTTTTAGTCCGCCTTTAGCTTGTTGGCATAAGGTTAATAAGTCGGCTAGGTTTTCGCTTAAATCGTTGTGTTCAAGCTGAATTACATCATCAGCGATAATATCCCGCCCACAAATGGCGATCATATCTCCGCCCATTGCATACGCTGGGCTAATTTTGCCTAATCCCTGCTTAATCAGAGCATTTAGGCTTTTGTATTGTTGCTCTTTGCCTATGGTTGCTCCATTAATTACCGCTTCGGGCTTGCCCTCTCTGATTTTTTGTAGCCAGCCTTTTTTCACGTCTTGGGCGAGTTGGTTGTTTGTCGCGTTTGATGTATCTGCACGGCTTACGCCTTGCCAGCCAACCATTAAAAGCCCTCTTAGAAGGTTGTCATCAAGTAACTGATTTAAGCGTTCTTCTAAGCTGTTTTCGAGGTTGTAAGCATCGATTTTTTCATAGCGAATATAGCTATCAATGTTGATTTGTTCGCAGTGGTATTTTTGAGCGGGTGCAAGGGCTTGTTTTGGCTCTCGTTCCTCTCCGCTTTCGGTGTTGGTTGTGCCGGCTATCGGTGTGAATAGCCCAATCGCTTCGCCCTTTGCGTGCTTGGTTTGCACTAAATTCAATAATTTAAAAAGGCGATTTTGTTTTAAGCGGCTAATTAGTTTTGCCTGTTCTTCGGGGCTATCGTCAAATAAAATAACGTTACCTTGTTTATCTAGTTTTAATGCGTGGGCGAAAGTGGATAAACTCATTTTTTACCTCTTATAAGTTATTAATTAATTCAGCTAAGCCGGTAGGTTTTGCTTCAAATTTTTCACGGTGTAATGCCATTGGCGATTTTTGTTCAAAACTTGCTAACTGTTCAGAATAAAGAATTAATGTTTTTTCAAGTGGCTGTTCCTTTTCAATTCTAGCCATTATATTTTCTGTTAGATATGCCAGAATAGCTTGCTCTTCACTTTCATCTGTGAGGTTTTTATTTTGTTTGAATTTTCCACTGTAGAATAAGTAAGTATAAATTTCTGCTAAATTTTCTTTATTTTGTTCAATAAATTGATTAAATAATACTTCTGCTTTTTCTAATAAAATTATACGTCTGATTTGTTTTAGTTCATTCTGCTGTTGGAATAATATTTCTTGCTCTGCGTAGCATTTATTTTCTAAATCAACAATCAACGCTTGATAATATTCTATGCGTGCTTGTAAACCACTATTTTTATTTTTGATTTCAACATATTCATCTGCTGAAAGCGTGCCGATATTGGCTAAATTCGTTTTTTGCCGTGCGACAAATTCCGCTTTTTCGTTTTGCAATGCCTCAAGAATATTTTTCGCTTTGTCTAATTCGGTCTGAATAGCTAAAACGGCTTTTTCTTGTTCGTGGAATTTAGCTTTTTGTTGGTTAAATGTTTCAAGTGTCATAATTTGCCCTTATTGGTTGCGGTGTTGTTCAATTTTGCGTTGAATCCATTGCTGGATTTCACTTTCTAGCCATACTTTGCTATTTGCCCCAATACTGATACTTTGGGGAAAATCGCCGGCTTTCATTTTGCGATAAATCTGCGTTTCTGAAAGCGTAGTTACGGCTGAAACTTCATCTATTTTCATAAATCGCTGTTTTGCTGGTGTGTTCTCCATTTTGTTTTACTCCGTAAAAATTTGCTTTGGCGTGCTATTGCCTGCTAACGTGTGAAAGAATAAATCATCTTGGATTTTTTGCTATTTGTTAGGGCTGTGAAAGGAGATTTTACAGATTAGAGGGGCTTAATTCTGATTTGGAAAACTTGCAAGCGGTTATTTTTCTCTGATTTTTTGCAAGTTTTCAGCGGTTCTTTCATCGTTCTGTCATCGAGTTTTTAAAAGTGGTGTTTCTGCCTGCGTAAATTTGCGTTTTCTTGCGTAAAATTGCGTAATAAAAAACGGCTATATGAAAGTTTTTCACGCTATACGGGGCAATGTTTGGGCTTAATTTTGCATTTGCGTAGAAATCGAGACTTTAAGTGTGCGGGCGAGGCGTGGGATAGACGGCACGGGCTGGGAGCTGATAGGAAAAAATGAAAATTTTTCATCAAGCAAAAAGAAAGGCGGATTGCTCCGCCTTTGTCATTTAAATGCTCTTGCATTGTTCTACAAAATCCGCCCATTCCTGCATTATTCCACGTCTGCGGTCTAGCCAGTTTTTACGGTGGTATGCACTCATTACGGTGTCTTTGTTCGTGTGGGATAAACAAGCCTCAATTACTAGCGTTTCAGTAGTAAAACGTTCGTGTAAATAGGTGCTGGCAATGCTTCTTAAACCGTGAGCCACTAAAAGCCCTTTATATTTTCCACCGCTTAAGCGTTTTATTGCATTATTCACGGTTTGGCTATTAGCCGGTTTGTTTCGGTCTGTTCGGTGTGTAAAAATATGTTTATGGTGTCCGTTATATTTCTTCATTTCCTCTAGGATTGCGATAGCTTGTTTTGTTAGCGGTACAGAATGCGGATTTTTTCCGCCTTTCATTCTATCTGCCGGAATGTTGAGCGTCTTAGTTTCCCAATCTATATCGCTCCATTGCACCGCTACGGCTTCAAACGGTCTAAGAATATTCAAGAGTTGCCATTCAACTAATAATTTAATTTGAGGCGTTCTATTTGATTTCTGCAAGTCTTGCATAAATTCGGCTAACTCTTCGGGCATTATTGCTGGCTGGTGTGTCGTGCTTACGCTGGAAAACGCCTTTTTAATGACGCTGATTGGGTTAAAATTAATTCTCCCACACAATACCGCATAATCAAGAATTTCTATTAAATTCCCTGCTATTCTGTGCAAAGTGTCGGGCATTATCCGATCTAAGTCCGTTAAGCGGTTGATTGTATCGGTTAAGGTAAAATCTTCCAGCGTATAGCCTTCAAAACGTGGGAATAAATGATTTTCTAACCGCTGTAAGCATTTTTCCATTGTTTTAGGCTTGCATTTTCCCTTTGATAGCTTCCAATCAGCCCATTTATAGGCGAAAGATTGAATAGATTCTTGCTTTTCCTTAGCTTCTCTTTGCATTTTGGCTAAATGCTCGAAAGGGTCTAAGCCTTGTAAAACAAGGGTATTTAGTTCGTCTCTCTTTAAGCGTGCTTCGGCTAAGCTCATTTGCGGATAGCTACCGATTCTATTTTTTGTGCTTCGCTTGCCTGTTTTGGGGCTGATATAGCTATAAATCCATACTTTCGCTTTTTTCTGTGCAAGAATAAATAGCCCGTTGCTGTCTGCGATAGGCTTCGCATTTGGGGAATATTTGAGATTTTTTAGTAATGTGTCTGAAAGTGGTTTTTTAGTTGCAGTCATTTCTTCTAATCCTTGATATATAAGGGTTTATCGAAGTTTATGATCCCTAAATTTTCCCGTTTTCAAAATAGGGATCATTTTAGGGATCATAAACACTAAGATACAATGCAACTAAAGAAGACAATAAGAGACTATAAAAGAATCTAAGTTCTTGATTTTATAGTAAATTTGAGACAATGAAAGACAATATGCAACGCTTAGATGGTCCCCCCAGCCGGACTTGAACCAGCGACCAAGCGATTATGAGTCGCCTGCTCTAACCACTGAGCTATGGGGGGATTTGAAAAGTGGTTGGAATTATAGAGAAAAACCGAGTAGTCGTCTAGAGGCAGAAGATTACTCGGTTAATTATTGAACGAGAGAAAATAGGGTTATTCTGTTCGCCAAATTAAGGTTGCCATTCGCCCGGTTTGTTTGTCTCGGCGGTAGGAAAAAAACAGTTCTGGTTGGCTGTAGGTGCAATATTCACCGCCTGAAATGGCGGTAATGCCTAATTTATTCAGACGTTGGGTGGCAATTTGGTAAAGATTTCCTAAAAATTTACCGCTTGTAGTGCTGTCTTCAATAAGGGCTTCTTTCGCTCTTGGGTCAAAAGCACAGAATTGGTCTGCCACTTCACTCCCGACTTGAAAAGCATTCGGTCCGATAGCCGGCCCTAGCCAAGCTGATATTTCGTGTGGCGGGCAGTTGAATTTCTCTACCGTCGCCTCTAATATGCCATCGCATAACCCACGCCAGCCGGCGTGTGCCGCCGCAATTTCCGACCCGTCTTGGCTGGCAAATAATACCGGCAAACAATCTGCAGTCATCACTAAGCAGACTTGGTTTGGTTGATTGGTGTAAATCGCATCGGCTTTAATATTATCACCTGAATAGGGAAGTTCAATCACTCGGGTGCTGTGAGTTTGGGTTAAAAACAGCGGAGCTTGTGGTAATTGAAATTTCTCAACCAATAAAGCACGATTTTGAGCGATATCTTGTGGCTCGTCATTAACGTGATCACCTAAGTTGAAACTGTCAAAAGGCGGTTTGCTTACTCCGCCTGTTCTTAAGGTCGTCAGTGCGTGAATATGTTTAGGCACATTCCAATTTGGAATAATTTTATCCATTTGCAAAAAATCTCAAGAAAATGACCGCTTGTTATCGGCGTACTGCAATCGCTTCGATCTCAATGCCAACATCTTTTGGTAAACGAGCCACTTCTACGCAAGAACGAGCCGGAAAATTAGGGTGTTCGTTTTCTTGGAAGAAGGCTTGGTATTCCGCATTTACCTTTGCGAAGTCGTTAAGATCTTTGACAAATACGGTGGTCTTTACAATATCGGCAACGGTTAAGCCGGCTTGTTCGATAATGGCTTTCACGTTGTTCAGAGATTGGCGGGTTTGTTGCACAATATCACTCGGGATTTCGCCGGTTTCAGGATTCACGGGAATTTGCCCAGAAGTTAAAACCATATTGCCTAAATCAACTGCTTGCA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117 | Mannheimia_phage(85.0%) | integrase,tRNA,terminase,tail,protease,capsid,transposase | attL 1222889:1222907|attR 1245034:1245052 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1467134 : 1643674
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP017523|1467134:1643674|DBSCAN-SWA 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199 | Mannheimia_phage(89.93%) | transposase,integrase,tRNA,head,terminase,tail,portal,capsid,holin,plate | attL 1606390:1606449|attR 1643673:1644874 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1800864 : 1811182
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP017523|1800864:1811182|DBSCAN-SWA 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AAAAAGAACATCGACACGTTACTCGTGATATAGAAGCGATGTTTAGTCAATTAGATATTCCTGCCGAGGGGTATGCCCATTTTTGGACACACCCTCAAAATGGGCAAACATACCGGGAATTTCGATTGCCTTACGATTTAACCCTTACCCTAATTTCCGGCTATAGCGTGATACTTCGCAAGAAAATTATCGACCGTTGGCAAGAGCTAGAAAGCAGACAAGGTATTCCACAATCTTTCTCTCAAGCTCTACGGTTGGCGGCAGAACAGCAAGAAGTGATTGAGCAGCAGAATCATCAATTAGCCATTCAAGCCCCGAAAGTCGCATTTGTGGAGCATTATGTTGAGGTGGGAACGACTAAATCATTGCGAGAAACCGCCAAGATACTCAATTTTCCAGAAAAGCGGTTGATTGAATGTTTAGAACGATATCGAGTTCTTTATCGCCAATCAGGAAACCTACTCCCTTATCAAGATAAACAAGCTAAACAGCTTTTTGCAGTAAAAACCGGCACGGCAGAACACGGTCATAATTTTACCCAAACGAGAGTAACCGCCAAAGGGATTGAATGGATTGCTCAACGTTACGCATCGGAGTTAGGACAATGAGATTTACATCAACCATAAACAATGTCCGCTTAGTGGAATGGGAAATCAATATTACACAAGGGGCATTGGTCGATTTAATCAATCAAGCCTCCAGTTGGGCGAAAGCGGTGGTTATTGACGGCATAACCTATTACTGGATGTCATTTAGCAAGGTTTGCGAAGAGTTACCTGCGGTTTTTAGCAAAGAAGATACAGTTTACCGCCAATATAAGGTGTTGAAAGAAAAAGGCATTATCGACCACTTCAAAATGGACGGTAAAGATTATGTCCGTTTAACCGAAAAAGGTTGTGAATGGAATAAATTCGAGCCGATCCGTGAGTCGGAAAAAAATCCGAGTATCGGAAATAACTCCGAACAAACTCGGAAAAATTTCCGAGAAAGCTCGGAAAAAAATCCGACAGATAATAATACTAATTATAAAAATAATAATGATCATACTACCCCCCTTAATCCCCCAGCGGGGGAACCTGCCCCGGCTGAAGTTGTGTTGAATTATCTCAATTCGGCTTTGGTAACGTTGGCGGTACAGCTTGGTGAGCGTAAGCCTGTGGGGTATTCGCTCAAGCCGTGGGCAAAAAATATTACTGCTCGCATTCGTGAAAGTTCGGTGGCGGACTGTTGCCAAGTGGTGGATTACCTTGTCGCTAAATGGGGACGAGATGAAAAAATGCGTGAATACCTCTGCCCGAAAACGATTTTCCGCCAATCGAATTTTGCAGATTATTTTCCAAAATCGACCGCTTGGGCTAATAACGGAAAGCCTGTTTGCGTAAATGGTAAGTGGGTTACACCGGCGGAGCTGGAAAAACGCTTGATTATGCCAACGGTGGACGAAGTACGAGCCTTGTTCCAGAAATCACTCAGTGGCAATCCGTTTAAGGCATTGGACTTTACCAACAAACGAAATTTAGTGATGTACCACGCCACAATCAACACCAGAAACAAGCGACCACTTGAACGTGATTTGCCGATGATTATCAGCCAAGAAATTAAAAATGCGGTTGAGCGTATCGACCGTTTGAGAGTACCAACATTTTCGTAAGGATTAGACAATGACAGATTTTGATAAAAACACTTACCAAACACCTAATTATGTGCGTAATTGGCTAAATCATCGTTATGCTTGGTTTCATATTGACGGTTGCTCTAACGGACAAAATACGTTGTACACCTATTGGATTGGTAGAGCGGCAGACGGTTTAGATGATGATAAATTAAGTTGCCAAATTGCCGATGATTTTTTAGCCGATGATTTATTTGATGTGCTACTAGATAAAGTTTCAGACTGGGGAGAATTACTGCGTATTTTCGTTAATCCGCCATATTCTGATCCACTGCCTTTTGTTCAACGAGCGGCAGAATTGAAAAAAGCAGGTCATTTGGTTGTGATGTTATTACCAGCGGATAAAACAACAGAATGGTACACCATCATTCAACAACACGCTAATGAGGTAATTGATATTATTGGCTATCACGATGAAAAAGGCACTTGGCGGACAGGGCGGATTCAATTTATCAACCCGGTAACAGGTAAACCGGCACAAGGTAATAATAAAGGCTCGATGATTGTTGTGTTTGACCCATTTATTGAGGGCATTGTAACTCGTCAGATGCCACTAGATAAAATCAAGGAATGGGGTAAATAAAATGGATTATTGGGAACTATTTATTGGTATTGGTGCAGTAATTGGCGTACTGATTTTTTTAATCTGTATTGGCGTATTTATGCTATTCGTGAAAGCCTATGATGAAACCGAGAAATGGGGGCAATAATGGCGGAAGGTTTGCTACTTACCCCTTACTTTCAAACCGAAGTGGGTATTGTGTTTTACAAAGTGCCTAAAGATGTTTCTCCTGCTGCTTTCGGTGAGCGAACTTTGTTGCAACCTGCACCGACCGATTTAGCGACGGTTAAATCAGGCAAGGTTGCAAATTTTTCGGCAAATTCGACCGCTTGTAAAGAGCTGGCGGTGTTTGCTAAATCGGCAAAAGTTCGTTCAACGCTAAATCAGCGTGACAAATATAGTAATGATTTGCCTTATATCCGGTTTGTAAAGTCAATTCAGACGTGCCAATGCCGAGATGGCAAATATTGCCACACGGAAAAAGTGCTGGTAGAGAATAAAAACGGTGCGGTACAGCTTTGTTGGCATCACGACAAAATGCGAATGGACGGTGAAATCCCGAATGAAAAATTAGAAGCACTAGCGGATGAAAACTGGGAAAAATTTATCGCCCAACAAATCCGCTTAACCTTACGCAAAACGCAATCTACCGCTATTGAATTTGCGGACTTAGTGTTGTTTGCGAGTATCAAAGGTTTGCTTGATGAATTAGACAGCAAGGCATTACAGCAGTTTCTCGGCTATCCACCACTGAATAATAGCGGTGTGAGCAAAGAAAGTAATATCCGCAGCACTGATAGCGGTCTTCATTGTATAAAGTTTTGCAAACGCCACTTTACTGTAAGTATCAATAAACGTTTGTTGATAAATACGACCCACTCCTTTGAGGTTGCCCACATAGAAAGTATCTTGTGAGCCAAGATAGCCAGGGTGTACCGTTTCAATTTCACCACAGGCAATCTCATCTTCTTTCTTACGCTCTAAGGCTTGTACCTGTGTTTCACTGAGTATAATACCTTGTTCTGCAACCAGTTTTTCCAGGGCGATTAATCTTTGCTTAAAATTGGCAAGATGATGACGTAACCAAATCGAACGTACACCTCCTGCTGAAACAAAGATGCCTTGTTTACGGAGTTCCTTACTCACTCTTACCTGTCCAAATGCCGGGTTATCAAGAGCAAACTTCACAACAGCTTGCTCTATTGCCTCATCAACACGATTTTTTAAGTTGGGAACGCGTCTATTTTGATTCAGCAATGCTTCAACACCACCTTGCTCAACCGCTTGTTGATAACGATAGAATGTATCTCGGCTCATTCCCATTACTTTGCAGGCTTGAGAAATATTACCCAGTTCTTCTGCTAAATTTAATAAACCGGTCTTGTGTTTAATGAGAGGGTTGTTAGAATAAAACATGAGAGTTTCCTTTTTTGTTTAGATTGAATTTGGACACTCATATTCTAAACGGGAAACTCTCACTTTTTAGAGTGAATTGTCAGATCAAGTCTGATCTTCTACAGCTTAATTGCCTCTTGATTCAGTAATAGCGATCGTGCCTTACCTGATTTAGCGACATCATTAGTCACGATTGCTACCTTTCTTACAAGATCTATCTTATCCCAAGTCATTGTCAAAATTTCTGTCCGTCTGGCTCCAGTCATCAAAGCAAACTTACAGATAGATTTCATCCAGTCTGAACTTAATTTATCTATTAGCTGTTTTGCTTGTTCTTTGGTGATCCAGCGTACACGAATTGGCGGCTCTTTCTTTTTCGGTATGTGTGGGACTGCATCCAACATACCAAGTTTATGAGCGATATTTAATACTCTCGATAAAGATTTCACATACTTATTTTGCGTACTATGAGATAGAGGCTTTTTCGTATTTGCATTCTTTTTCGGGATATTTAGGATAATCTCCTGAGCTGTTAAAGAGCTGAGTTCACGACCGGCAAATTTGGATAACCAGTATTCAGCATGTCGCTTTTTTGTGGCTTTATCTTTTAATTCTTCGGCCGCACGAACGTAATGGAGCAAAGCATCTTCAAAGATATATTTTCTCTTTTCCTCGAGTTTATCCTCTGCCCACATTTCTTGCTTGAGTTTATCGTGATACTGCTGAGCTTCACGTTTTACAAGCGTGCGAGTGCTTCTCTTAATTCTCTTGCCGTTTGGGGTTGTGATATCAACCCACCACGGACCGTTTGCTTTTCGTCTGTAGATCGACATTTTTCATTCTCCTCGACCGACAGAGATAACCCTCGGTCATTATCAGATCGTTTTCTTATTGGGTCAATACCGGCTCTCTTTTTTGCTCTTTCCAAATCTTCTCGGTTGATCCGCCAAACTTCCGAGCCTACCATTTTAAAAAATCCCCAATCCGCCAAATGTTGGCGGACTGTATTTGGATGGCAATTTAATTCTTTTGCCACTTGATTAATAGTAAGATGTTCCATTCATTACTTTCTCCAAAATAAATCCCTCTAAACGAGGGATTGTACTAAATAATCGTTAAGTCTTTGCCTTATCCACTGCATCAAGGCACAGCCATACCGTTTCCATTTGGCACATTGGGGAAACGGTGAGCTAATACCGCACAGGGGAATGGCTCAATTTCAGAGAACCACAAAGGCTTACCTAAACCGTGCCACGCTATACTTGTAGCTTCGATACCGCTACAAATTGAGCCGTAGGTGAATTGCATTTTTTACCTATCCTATCGAAATACTCAAATTCCCAATACGGACAACATTTTCTTCGTTGGCTTCTAGGATTTCTCTCAACTTAGCATAGGTTTTGGGGCATCTTATTTGACATTCCTCTTCGTTGTAGAGAGCCTCTAATGTGTGCCATTCTTTTGCAAGTGCAGCCCAAACTTTCCCAAGTTCAGCCATTTTTTCAATCCTATTTCGCAAAAAAGGGACTGTCTCCAACAACAGAAAGCAACGCCTGAAATCCGATACATCGTGTGGGTAGCCTTCTATTTTTGGTCTTATTCCGTAACCAAGGTAAAAAGCCATTGTTTTACTGCTTACCCCTGTCTCTCCATTGGCAAGCCACCAAGCGATTTTGTCTTCTATGTGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP017523|1800864:1811182|1804374_1804749_-|WP_006247790.1|DBSCAN-SWA MTEFKDVKQAIVEAQLASTPKDKVVNDIMKGSAELLSANDIINRLGIGADEFQELVNLPNHYLRINGGLGAAVYNTRRMFDTHVELVNQELEKNISFPKPDLYILGKARWKKETFKKWLEEQCR >NZ_CP017523|1800864:1811182|1810632_1810800_-|WP_006253314.1|DBSCAN-SWA MQFTYGSICSGIEATSIAWHGLGKPLWFSEIEPFPCAVLAHRFPNVPNGNGMAVP >NZ_CP017523|1800864:1811182|1800864_1801839_-|WP_006249218.1|DBSCAN-SWA MAGINKVIIVGRLGNDPELRTMPNGDSVAKISVATSTEWTDKTSGEKKQATEWHSIIAFRNLADIIGKYLKKGSQVYVEGKLRTRKWQAQDGTDRWTTEIIADQLQMLGSSNSGNSNNNWATEPAGNPPPTNPYNHVMTDSESRDFDDDIRVRWITKEQAKQFINNISTDWMKTICSFALLTGARRTEILSMTWDKIDFIRKVAIVSNDIAKSEKARSLLLNDDAIELLQKQRGKNPKYVFVGSKGQALQDINRKIFNKATEKCLLVDFHFHDLRHTWASWHVQAGTPLFTLKELGGWETLEMVKKYAHLNADHLLNHANSVKF >NZ_CP017523|1800864:1811182|1807524_1808118_+|WP_006247795.1|DBSCAN-SWA MTDFDKNTYQTPNYVRNWLNHRYAWFHIDGCSNGQNTLYTYWIGRAADGLDDDKLSCQIADDFLADDLFDVLLDKVSDWGELLRIFVNPPYSDPLPFVQRAAELKKAGHLVVMLLPADKTTEWYTIIQQHANEVIDIIGYHDEKGTWRTGRIQFINPVTGKPAQGNNKGSMIVVFDPFIEGIVTRQMPLDKIKEWGK >NZ_CP017523|1800864:1811182|1803485_1804223_-|WP_006247789.1|DBSCAN-SWA MLSKQVLSISESRLSTYLFCFFRNDPTKQKEAIAIYTALQHRTGIYFSLIQEIEVALRNEVSQLLRFAAPNHNLYEFFHFLANDSNAPLNAESKRQLQKAISECGRNYNENDIISHISFGFWVNLFNYDIKRNQYVAYWQSVLKPIFGHRFSNFKDLYNTLKQIMRFRNRLYHQEVVWNKRIAKKPTHALENLEKTYKQFELALQKIAPERFAFRQLSQALIWQRQIFFDQQIFEAEIVILPQHI >NZ_CP017523|1800864:1811182|1802853_1803450_+|WP_006253352.1|DBSCAN-SWA MKKLLMTLCCLPAFALANETGESCSKIEDSAKRLECYDSVFVKKDTGKDEATDEKSNWEYEQKKDELRNATTYFAKIRSTNTIDFGFPYNSSSMNLMLRKDPKYGNDVIFSVHGQFNGCMIESCKITVKFDDGKLESYRMIGADGGSNDTLFIENAKAMKTFVDKLKKSKKLIVEASFYNYGKGQFTFDTQGLEWKHF >NZ_CP017523|1800864:1811182|1810228_1810552_-|WP_006253316.1|DBSCAN-SWA MEHLTINQVAKELNCHPNTVRQHLADWGFFKMVGSEVWRINREDLERAKKRAGIDPIRKRSDNDRGLSLSVEENEKCRSTDEKQTVRGGLISQPQTARELREALARL >NZ_CP017523|1800864:1811182|1804760_1805417_-|WP_006247791.1|DBSCAN-SWA MNTQTLGDRIKSRRKELKLTQKDLATALKGVSHVAVSQWESSTTKPNSENILDLSTVLQCDISWLLRGNGESNVLPASLGMTKVPLISYIQAGQWTGIDDFRETCGDYEYILTDLEVSEDAFALEIKGDSMEPDFIEGDRVIIDPDVQPHAGEFVAAINGDYEATFKKYRPLEDLDEYGRQHFELIALNPDYHKLSTLKQEIRIIGTMVEHRIYRRKR >NZ_CP017523|1800864:1811182|1802022_1802208_-|WP_006249220.1|DBSCAN-SWA MNKMKQLAPFALLILLLGIVGRMDYDDHIQMQRYKCERNQGFWQMESNGNQYCGGKYGTKN >NZ_CP017523|1800864:1811182|1805787_1806471_+|WP_006247793.1|DBSCAN-SWA MNQLLNISAPKASITMSSREIAELCEKEHRHVTRDIEAMFSQLDIPAEGYAHFWTHPQNGQTYREFRLPYDLTLTLISGYSVILRKKIIDRWQELESRQGIPQSFSQALRLAAEQQEVIEQQNHQLAIQAPKVAFVEHYVEVGTTKSLRETAKILNFPEKRLIECLERYRVLYRQSGNLLPYQDKQAKQLFAVKTGTAEHGHNFTQTRVTAKGIEWIAQRYASELGQ >NZ_CP017523|1800864:1811182|1810807_1811182_-|WP_006247798.1|DBSCAN-SWA MHIEDKIAWWLANGETGVSSKTMAFYLGYGIRPKIEGYPHDVSDFRRCFLLLETVPFLRNRIEKMAELGKVWAALAKEWHTLEALYNEEECQIRCPKTYAKLREILEANEENVVRIGNLSISIG >NZ_CP017523|1800864:1811182|1805541_1805730_+|WP_006247792.1|DBSCAN-SWA MKKDDVLEHFGTLEKVAATLGISVSAVSQWGEIIPEKNAYRLQEITAGKLKVKHSLYRNRSK >NZ_CP017523|1800864:1811182|1801841_1802039_-|WP_006249219.1|DBSCAN-SWA MARKIDAGVEIVEVDKRFIAKFFYDGKLQHTTYPQYNRQNAIMLINRKIERFNIGRDKPIKLYKE >NZ_CP017523|1800864:1811182|1806467_1807514_+|WP_006247794.1|DBSCAN-SWA MRFTSTINNVRLVEWEINITQGALVDLINQASSWAKAVVIDGITYYWMSFSKVCEELPAVFSKEDTVYRQYKVLKEKGIIDHFKMDGKDYVRLTEKGCEWNKFEPIRESEKNPSIGNNSEQTRKNFRESSEKNPTDNNTNYKNNNDHTTPLNPPAGEPAPAEVVLNYLNSALVTLAVQLGERKPVGYSLKPWAKNITARIRESSVADCCQVVDYLVAKWGRDEKMREYLCPKTIFRQSNFADYFPKSTAWANNGKPVCVNGKWVTPAELEKRLIMPTVDEVRALFQKSLSGNPFKALDFTNKRNLVMYHATINTRNKRPLERDLPMIISQEIKNAVERIDRLRVPTFS |
14 | Mannheimia_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1814415 : 1821359
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP017523|1814415:1821359|DBSCAN-SWA AATGAGTGGCTTAGGAAAATTAACCGTTACCTTAGAGCTTGAAAATGCAAAATTTCAGTCCGCAATGACGAAATCTGATTATGAGGCACAAAAATTTGCCAAGAACTTTATCCAAAATATGGATAGAGCTAGAAATCACGCCAAAGAATTTGCCGATCGCTCAACCCAATATTTAAAAAACATTGAGCAAGCGGCAAAGAACCTCAATAAAAATTCTGAATTTTCATTTTTATCGACTATTGGTGGACATTATCAATCAATGTCTAGTGGCATATTGAGTGCGGCAAAAGCCTATACTGATATTCAAAATAAAATGAAATTAGTAAGCGGTAGTTCAGCAGAGGCAGCTAAACGATTAACTGATGTGTTTGATATTGCGACTAAAACAAGCCAAAGTACAGAGGCTGTTTCAGGTGTCTATCAAACATTTGCTCAAAATGCCCAATCTCTCGGACTGGCTCAAAAAGATGTAGCAGAATTAACTAAAACGGTCTCTCAAGCCGTTGCTGCAAGCGGCGCAAGCAGTTCTGCAGCAAGTAATGCCCTAACCCAATTTGGTCAATCACTTTTAATGGGCAAAATGAAAGCCCAAGAATTTAACTCGCTCATTACTCAAACCCCAACCATTATTCAAGCAATGGCAAAAGGTTTGGGAATGACAATGGCAGAATTTAAAGCAGCGGTATACCGGGCAAAATCTTTACTTGGATAACATTCAAGGGCAAGGTTTTGAGAGAGTGGATACACCCCAAATCGGCGATGTGATTTTAATACAGGTCGGTTCTGATGTGCCGAATCACGCAGCGATTTATATTGGTGAACAAATGGTAATCCACCATAGCCCGAACCGATTATCTAAGCGTGATTTATATGACGGTTATTGGTTACGCCATACCCACAGTATTTGGCGGCATAAACTGGCGGATAGATTGGATTTTGACGGCATATTTAATGATATAGGAGAACAATATGAAATTTAGTAAATATCAATTATTAGTTAATAAGATCTGCTTTATTTGTGGTAAAAAAGATTGTCCACAAATGAAAAAGAGTAAAGACTACAAAGACTTTTTGGATGCTTTAGAAAAAGGGGATGTTGATAAAGCAGATAAAATATACAATACGAAGTTTTCACAGTTTTCTAAATCTTTTGGTCATGAAATGGAAAAGAATTTAGAGAAAAATCGTATACCTCCTATTTATCAGGGAGTTCCATTTGATTCTTTTGACTTATATCAGCATTATTCTTATGGTAATGGAGAGGCATTAAATCTTTCATCCGTTGGATTAAGTAATAAAATTCGTCCTCTAGTGAATAAAGATAAAGCATTTGGTAAATCCAATGGAAGTATAGAAAGCCGATTTATTTCGCAATATAAAAATGAAGGACGCACATCTTTCTCCAATGCTTATGATTTTACAAAAGAAGCATCGGGTATTGCAGATCCGTTATGGGCGTTAGGAACAGCTACCATTAGTGGAGAATTGAAAGATATACAAATTTTTCCCGGTGGTATTGCTAGGGGAAATATCCATTATAGTATCAGGGACAGATTCACTGACCCATTTGATACATTCAATTTTACTAAAGGAGAATGGAACCCAAATGGAACACCTTATATTATTCAAGATAGCTGGATAAAATCGGTACGATTTTCGATAGACAAGAAGATAAAAATAACACCTTAATTATGATAGTAATATAAAACAATTGGCAATATTATTTTAAATAAAAAAATAAGTATTCCAATATAGATTGCTGATTTTATGGTGTATTTAATTTGTTTCTCGAAAATAAAAAAATAACTAGTAATTGCATATAAACAAATAAGTAATAATATGCTTATAGAGTTAAGAAAAATAAAGAACATAAATCCCCTTTATTTTGGCTATAATTGTAATGGTGAGTCATGACTAAAATTAAATTTTACGGCAATTTAAAAAAATTTGGTAGTGAATTTAGCTTAGAAGTTAAAGATACTGCCGAAGCTATCCGAGCCTTATGTACACAGATTAGCGGATTGCGTGAGGCATTACGAGACGGTGTTTATAAAGTCCGTATCGGCAAACAGTATTTAGACCCGTCAGCCCTTGAAAAAGGGCTTTTTTATTGTCTGAAGAAAGGGCAAACCATTCATTTTACCCCTGTTATCAAAGGAGCGAAAAGCGGTGGCGTGTTTAATTTTGTTTTAGGTGCAGCCTTGATCGGAGCCGCATTTTTTACTGGCGGTGCTTCTATTGCGGCTTGGGGAGCTGGAGCAAAAATGATGGGTATGTTAGGGGCTTCGATGTTACTAGGAGGAGTTTCCCAAATGCTCACCAAAATGCCAAAAGCCCCCACAATGGGTAATGAAACAGAAAAAGAAAGCTCAACGGCTTTTTCAAATTTAAATAACTTGGTGACTCAAGGCAAACCTGTGCCGTTGGCTTATGGCTTAATTCGGACCGGCTCGCTTGTGATATCGCAGGGAGTTGAGACGATCACCATTAAAGAAAACCAACCGGCAAGCAACAAGAAAACAGGCTTTAGAAAATAAGGGATAATTACCGATTCAGCACAAGCACAGCAACTTAATCAGTTATCTGTGAACTTGACCAAAGCAGAGAGCAATTTAAATGCCAAAATCACGGAAGAAAAAAAAGCTCGTGTTGATGCAGATAAAGTGAATGCAGATAAACTCACAGACATAACAAGCCGTGTTGCAAATGCGGAATCAACTATTACCAATTTCCAATCAACCAAAGCGAATAAAAGTGAGGTTGCGAGCCTTGCACAAAGTTCGTTGCAGGCAGTTTGGAAAGCTGATGCAAAATCTGCCGTTGATTCACTTTCTATCGGTGCAAGGAACTTACTGATAGACAGTACTTACAACCAACACATCAACTACAATACAAAAATGTCATCAATCACACGCACAGTCTATCGCGGCAATATGTTGATACGACTCGGAATGCTTGGTGGCGCAGGTGTGGCCGGTATTGTACAAGCACCAGCCGCTCAAGTAAGTAATATCAGACAGGGTCAAGAGTACACACTTAGCCTGAATGTACAGGGTACAGCCGGCATACAAAAAACGGGGCTCAACTATGTATTCTTGATGCGTGCTGATGGGGCTAATCAACGGTTAGCAACAATACCTGTTATAGCCAGCCTATTAAACAGACCTAAAATAGCCCTTGGCAAAATGCCGGTGTAACCGCTATCCACGGTGGCTCAATAGTTACTAATACCGTTACTGCTCAACAAATTGCAGCAAATACCATTACCGCCAACGAAATCGCAGCCGGCACGATTGCAGCTCGAAATATGGCAGCAAACTCGATTAATGCAAGTCATATTGTGGGGAGTTCGATCACTGCGGATAAGCTAAATGTAAACAATTTAGCGGCAATATCGGCAAATCTTGGTAAGGTAACTGCTGGTACAATTACAGGGACGACAATTAGTGGTGGGACAATTTCAGGTACAACAATTACAGGGGGAATAATTAAAGGAGCAAGAATTGAGGGATTAACAGGTAAATTTACTGGAGAACTTGAAATCAACCAATTGATCGGAGGTAATATCTATGAGGCTAAAACTTGGACATCAAAAGCAACAGGGAAAAGTAAAACATATTCAGAAACGAAAAACAGTTTTGCATTAAGTGATACATATTATGAGTATGTATGTCAATTTGTACTACCTGCTACAAAAGCGACGAGAACATTGTATGTTGTCCACACTCCAACAGGAGAGAGTAAAAGCGAAACTTTTTATGGTAGTGGTAGTAATCGGACACCGACAACAATTACATTACCGTCTGTAATTGATATTAGCAATACTATTTCACCTAATGTATCTAACCCATTTAATGATTCTGGGGCAATACTCATTGCTAATACTCAATATGTAGTAACGTGTCGTGCGTGGTGTGCAGGGCGTGGGAGAAGTGCTAAAGTGAATTTTCGAGCAATTATATCATCTACAAATGGTTCATCTTATCAATTATAGGAGGCAAATATGAAAAAAATTATACTACTTACAACAATTATGGTTTCAGCTTGTACAACTCAATATAAGCAAGACTATACAACAAAACCAACCTTTTGTTATCAACTAGCCCCTCAAGAGCAATTACCGGGGAAAAACTGTATTGGCTCAGGAGGGCATTCAGGTTAACAAAGTAATTAAATCCTAATTACACGCTCATCGCCTGTAGGCAATTCAACGGCAAGTTTTAACTTACCGCCCATTGCTTCAATATAGCGTTTGAGCGTGGATAATCTTGGATCGTTATCTTTCTGTTCAAGTTTAGCAATAGCAGGCTGTGAAATACCGAGAGCTGTAGCTAATTGTTGTTGAGAGAGATTTAGCTCTTCTCTTAGTTTTGAAAGTTGTATCTCTCTAATCATTTCTTGAGCCATATCTTCCACTTTTTGGCGGCGTTCAGGAGAGAGTTCATTGAGCATTTGATCTAACGTTTTCATTTTCTTTCTCTAAATTATTTAAATAGGAGGTAAATTCCGCATCAGCAAGAGCGATCATTTTTTCATAGAATCTTTTGTCTTTACCTTTCTCGCCAGCACAAAGTACTATCGCTTGGCGTAAAGGGTCAAAAGCATAAAATGCTCGAATTGGCTTACCTTTGTTTTGAATGCGTAACTCTTTCATATTAGGGAATTTAGACTGATAAACTGTATCAGCATAAGGTCTGCCTAGACTATAACCGAATTTCCGCAGATAGATTAAACAAGCCAAGACACGTTCTTGAGTACTTTCATCTTGTTGACCGAACCATTCATCAAAGCAGTCAGTCGTGATAATAGACCATTCTATAGGGTCTGCCATTTTTGAACCTTTTATAACTTACTATTTATAAATGAAGTATAAATAAAAGGTTATATTATGTAAAGCAATTTACTCTTCCTACTAAGCCGTTTGTATGACTACAAGCGGTCTTTTTTTATCAACAATCCACAAAAGGAAAAATTATGACAACTTTTAACAAAATCTTAAACCCAATGTATTCCACCATCGCAAGCTACTCAACGCAAGATGACGGCTCGCTCAATGCTAAATATGTGGTCGGTACAGGCGATGATACCGATGGAGAAGTAACAAACTTTGTAATCATCACAAGTGAGTACAAATACATTGATGCACAGTCCGCCAAGGAGATTACTGATGCACCGCTAACAAAAGAGGATATTGGCAAAACGCCAACGCAGATTATGTTAGGGCGTATCTATAAGTACTTAAAAGAGACGGGGCAGATTGTAGTTTAATTTAGTAACTTTTGAAGACTAGCTCATCACCAACGTGTTCCATAAATGTACCGTAAATGGTGTTATTTAATGTAAAAAGATGTGAAATAATGGTAGGTAATATAGAGGGGTTATCTCTATAAGTCTTTGTTTTTATTAGTTAAAATAAACGCCTTTTATAAAATACCTATCGCCCTTCTAAGGCGTGGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTAGGGCGTGCCATTAAATTCTTTTAAATTCAAATACTTACACAGCCTCAAAAACTCACGCTAAAGAACTATTTTCTGTATTGTGACAAAATTGTGCCAAAGTAAAGTTTACTGGTTCAAACAAAAAAGCCATCTAGCTCTATCTCACTAAATGGCTTTATTTTATCTTTTATTAAGCTGCAAAAGGATCACGCAAAATCATCGTTTCGACACGATCCGGACCTGTAGAAAGAATATCTACCGGCACACCGACCAGCTCTTCGATACGTTTAATGTAATCTAATGCGGCTTGTGGTAAATCTTCACGTTTTGTCACACGGAAAGTATTTTCAGACCAACCCGGCATTGTTTCATAAATTGGTTCAACACCTTCCCAGTCTTTTGCTGCAAGAGGGGCATATTCGACAATTTTTCCGTTTGGCATTTTGTAGGCAACGCAGATTTTTAGCTCTTTGAATCCGTCTAAAACATCGAGTTTAGTCATACAGAAGCCTGAAATGGAGTTGATTTGCACTGCTCGGCGAACGGCTACGGCATCAAACCAGCCACAACGGCGAGGGCGACCGGTTACCGCTCCGAACTCATTACCTTTGCGAGCAATTTCAGCACCTACATCGTCAAATAGTTCGGTGGTGAACGGTCCACTACCTACACGGGTACAGTAGGCTTTGATAATCCCTAATACATAATCTAAATGACGAGGACCGTAGCCTGATCCGGTTGCCACACCGCCTGCTGTCGTATTCGAGCTGGTTACGAACGGGTAAGTACCGTGGTCGATATCTAACATCGTGCCTTGAGCCCCTTCAAATAAAATATTGTCGCCGTTTTCACGTGCTTCGTGAAGTAAAGTTGTCACATCGGCAACCATTCCGGTAATCACATCCGCAATCGCAAACACATCATCTAAGGTTTTTTGATAATCTACCGCTTCAACTTTGTAATAATTGACTAATTGGAAGTTGTAGTAATCTAAAATATCTTTTAATTTTGCGGCAAAATGTTCTTTGTCGAATAAATCGCTGACACGTAAACCACGGCGAGCGACTTTATCTTCATAAGCTGGGCCAATACCACGTCCTGTTGTACCAATTTTGTTTTTACCAAGTGCCGCTTCTCGAGCGTGATCCATCGCAACGTGATAAGGCAGAATTAACGGGCAAGCCTCAGAAATTTTTAAACGCTCACGCACATTAATGCCTCGTTCTTCTAGCTCCCCCATCTCTTTCATTAATGCCTCTGGAGAAAGCACTACACCATTACCGATTAAACAAGTCACGTTATCACGCAAAATACCCGATGGAATTAAACGCAGAACGGTTTTTTCACCATTAATGATTAAGGTATGCCCTGCATTATGTCCACCTTGATAACGTACTACATATTTCACACGATCTGTTAATAAATCAACAATTTTGCCTTTTCCCTCATCGCCCCACTGAGCGCCAAGAATAGCAACACTTTTACCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP017523|1814415:1821359|1816999_1817611_+|WP_006253310.1|DBSCAN-SWA MNLTKAESNLNAKITEEKKARVDADKVNADKLTDITSRVANAESTITNFQSTKANKSEVASLAQSSLQAVWKADAKSAVDSLSIGARNLLIDSTYNQHINYNTKMSSITRTVYRGNMLIRLGMLGGAGVAGIVQAPAAQVSNIRQGQEYTLSLNVQGTAGIQKTGLNYVFLMRADGANQRLATIPVIASLLNRPKIALGKMPV >NZ_CP017523|1814415:1821359|1819388_1819682_+|WP_006250050.1|DBSCAN-SWA MTTFNKILNPMYSTIASYSTQDDGSLNAKYVVGTGDDTDGEVTNFVIITSEYKYIDAQSAKEITDAPLTKEDIGKTPTQIMLGRIYKYLKETGQIVV >NZ_CP017523|1814415:1821359|1816324_1816951_+|WP_006247807.1|tail|DBSCAN-SWA MTKIKFYGNLKKFGSEFSLEVKDTAEAIRALCTQISGLREALRDGVYKVRIGKQYLDPSALEKGLFYCLKKGQTIHFTPVIKGAKSGGVFNFVLGAALIGAAFFTGGASIAAWGAGAKMMGMLGASMLLGGVSQMLTKMPKAPTMGNETEKESSTAFSNLNNLVTQGKPVPLAYGLIRTGSLVISQGVETITIKENQPASNKKTGFRK >NZ_CP017523|1814415:1821359|1814415_1815126_+|WP_006253312.1|DBSCAN-SWA MSGLGKLTVTLELENAKFQSAMTKSDYEAQKFAKNFIQNMDRARNHAKEFADRSTQYLKNIEQAAKNLNKNSEFSFLSTIGGHYQSMSSGILSAAKAYTDIQNKMKLVSGSSAEAAKRLTDVFDIATKTSQSTEAVSGVYQTFAQNAQSLGLAQKDVAELTKTVSQAVAASGASSSAASNALTQFGQSLLMGKMKAQEFNSLITQTPTIIQAMAKGLGMTMAEFKAAVYRAKSLLG >NZ_CP017523|1814415:1821359|1818584_1818884_-|WP_006247810.1|DBSCAN-SWA MKTLDQMLNELSPERRQKVEDMAQEMIREIQLSKLREELNLSQQQLATALGISQPAIAKLEQKDNDPRLSTLKRYIEAMGGKLKLAVELPTGDERVIRI >NZ_CP017523|1814415:1821359|1815383_1816103_+|WP_006247806.1|DBSCAN-SWA MKFSKYQLLVNKICFICGKKDCPQMKKSKDYKDFLDALEKGDVDKADKIYNTKFSQFSKSFGHEMEKNLEKNRIPPIYQGVPFDSFDLYQHYSYGNGEALNLSSVGLSNKIRPLVNKDKAFGKSNGSIESRFISQYKNEGRTSFSNAYDFTKEASGIADPLWALGTATISGELKDIQIFPGGIARGNIHYSIRDRFTDPFDTFNFTKGEWNPNGTPYIIQDSWIKSVRFSIDKKIKITP >NZ_CP017523|1814415:1821359|1817721_1818408_+|WP_006247808.1|DBSCAN-SWA MAANSINASHIVGSSITADKLNVNNLAAISANLGKVTAGTITGTTISGGTISGTTITGGIIKGARIEGLTGKFTGELEINQLIGGNIYEAKTWTSKATGKSKTYSETKNSFALSDTYYEYVCQFVLPATKATRTLYVVHTPTGESKSETFYGSGSNRTPTTITLPSVIDISNTISPNVSNPFNDSGAILIANTQYVVTCRAWCAGRGRSAKVNFRAIISSTNGSSYQL >NZ_CP017523|1814415:1821359|1820060_1821359_-|WP_006250049.1|DBSCAN-SWA MGKSVAILGAQWGDEGKGKIVDLLTDRVKYVVRYQGGHNAGHTLIINGEKTVLRLIPSGILRDNVTCLIGNGVVLSPEALMKEMGELEERGINVRERLKISEACPLILPYHVAMDHAREAALGKNKIGTTGRGIGPAYEDKVARRGLRVSDLFDKEHFAAKLKDILDYYNFQLVNYYKVEAVDYQKTLDDVFAIADVITGMVADVTTLLHEARENGDNILFEGAQGTMLDIDHGTYPFVTSSNTTAGGVATGSGYGPRHLDYVLGIIKAYCTRVGSGPFTTELFDDVGAEIARKGNEFGAVTGRPRRCGWFDAVAVRRAVQINSISGFCMTKLDVLDGFKELKICVAYKMPNGKIVEYAPLAAKDWEGVEPIYETMPGWSENTFRVTKREDLPQAALDYIKRIEELVGVPVDILSTGPDRVETMILRDPFAA >NZ_CP017523|1814415:1821359|1818855_1819245_-|WP_006247811.1|DBSCAN-SWA MADPIEWSIITTDCFDEWFGQQDESTQERVLACLIYLRKFGYSLGRPYADTVYQSKFPNMKELRIQNKGKPIRAFYAFDPLRQAIVLCAGEKGKDKRFYEKMIALADAEFTSYLNNLEKENENVRSNAQ |
9 | Mannheimia_phage(60.0%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2254624 : 2262779
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP017523|2254624:2262779|DBSCAN-SWA AATGTTAGATCTCACCAAGATTAAATTAGTGATTACCGATGTGGACGGCGTGCTAACCGATGGCGGAATGTACTACACCGACCAAGGCGAAGTAATGAAACGTTTCCACGTTCACGATGGTTTAGGCGTTAAGATGTTACAAAGTTGTGGCATTAAAGTGGCAGTACTCTCGGGCGGCGATACGGCTTTGCTCCGCAAACGGTTAGAGGTGCTGAAAATTGATCTCGCTTTGTTAGGCAAAATGGAAAAACGCTCCGCCTGCTTTGAGCTAATGCAGCAAGCCGGTGTTACCCCTGAGCAAACGGCTTACATTGGTGATGACACCTTAGATTTACCGGCTTTTGAAGTGTGTGGCATTGCGATTGCAACCCGTAACGCCCTCGATTACATCAAAGAAAAAGCAGATTGGGTATTGCAAAAAGCCGGTGGTGAAGGGGCGTTTCGTGAAGTCTCCGACCAAATTTTGGAGGCTCAAGGATTCGGTGAAATTTTTAAAACCGCAGATGGTTTTTTAACGGTAGCGGGGAAAATGGCTCAGTAGACTCTTCAAGCAGTTAAATTTCATTTTATTTTTGCGATCTGCATCGAAAAAATGTATTTCTAATCTGATTTTCAAATTACTGTTTGCTAAATTAAATTTAGTTCTTGTTAGATTTATTTTATGTATATACAATAATTATGAAAATTTATACTTGGGACGAAACTAAACGCAAAATCAATTTAGCCAAGCACGGATTAGATTTTGCCGATGCAGATGAAGTTCTCTCATCGCCCTATCGATTTGATGTTGAAGTTATTCGTAACAATGAATTTAGAATACAATCTTTTGCATATTCATTTGGACGTTTACTCGTATTATCACTTGCATATACAGAAAGGGAAGATTACATCAGAGTAATTAGCTTTCGGCGAGCATCTAAAGCAGAAAGAGAGGCATATTATGAATACTTACAACAATACTTTGAATAATAAAAATTTAGAGAAAAAACAGCTACTTATGGCTATTCAAGCTATTCCGGCAAGCCAAGATTTTATTTGGGACGGAAAAGATGACGATGAACGCCCGGTTACGCCATCAGAGTTTTCAATTGCAATGAAAAAACGTGGCAGACCAGCTGGTTCAAAGAAAGAATTGGTTTCGTTACGTCTTGATAAAAGCGTTCTTGAAGCCTTTAGAGCTTCAGGTAAAGGTTGGCAAAGTAGAATTAATCAAGTTTTAAGTGATTTTGTAAAACAAGTTTGACCACAAAACAAAGGCGGTTAATCCGCCTTTTTCCCTTCAATATATCGCTCGAAGTTTTGGATATATTCATCTAAATTTGCAGTGAGCATTTCTTTGTATTGCTCCACAAAATATTGAATAACTTCTTCTCTGGAATCGGCCAACTGCTGTTTATATTCCGCCTTGCTTGCCGCAACATAGGCGTTAAATCTGGCACAACCAAACAACATCGCATTGCTGACTTGGTTTGGGGCAATGTTTTTTAAATGAGCGTTGGCAACGTTAATAAAGCCGTCTGCTCGCTGGTAGACGCTGGTAGAAAGTTGGGTCAATTTGTTTATCGGTAATGTTAATCATAGTATCCTCATTTTTAGTCAAAATACAAGCGGTGCTTTTTGCGTAAAATTTTGCACAAACGCTTGCGTTTGAACGTTGGCTCTGCCGACGGCACGAAGTGCGAGCGTAGCGAGTAAAAAAATCACCGCTTGTAGGCATTTCTAGCCGTCTAATGAAATCGCTTCCTTGATTTTCTTCAATGCGGCATTTTCAAGCTGTCTTACCCGCTCTGCCGAGATGTTATATTTATCGGCTAAATCTTGCAGTGTGGCTTTATTGTCATCTAACCAGCGGGTTTTGATGATGTCTTGGCTACGTTCATCAAGGGTGGCTAACGCATAGGCAAGTTGAGCGGTTGCCTGCCCATTATGTTGTTCGTCTTCCAAGTCATCGGCGAAATTGGAGCTGCTATCTTCAATATACATAGAAGGAGCGTAGCTGTCTTCATCGTCATCACCGGCAGGCAGGTCAAAACCTAAATCTTGTCCGGTCATTCGAGATTCCATTTCTCGTACTTCTTCCACTGAAACCCCTAAATCATCGGCAACTTTTTTGATCTCTTCTTCATTAAACCACGCCAAGCGGTTTTTATTTTTGCGTAAATTAAAGAATAATTTACGTTGAGCTTTGGTGGTTGCCACTTTCACAATTCGCCAGTTTTTCAGCACATATTCGTGAATTTCCGCTTTCACCCAATGAACCGCAAAAGAAACCAACCGCACGCCGACATTCGGGTCAAACCGTTTTACCGCTTTCATCAAGCCGATATTACCCTCTTGGATCAGATCTGCCAGCGGTAAACCATAGCCCAAATAGCCACGAGCAATATGGATCACAAACCGCATATGGGAAAGGATCAGCTGTTTTGCCGCCTCAACGTCTTCATCATAATAATAACGCTCCGCCAGTTCTTTTTCTTGCTCGGCGGTGAGAATCGGATACTGATTTGCCATTCGGATGTAGCTATCCAAATTGCCCTGCGGCACAGGCATTGAGCCGGAAACCAAAGCCGGATGCATTGCTTCTACCGATGTTTCTTCTTCGTCTATCTCATCAACATCAATCGGCTCGGCATCTATAATTTCAGCATCTTCAATCTCGTTCTCGTTAAATTTTTTCATTCTATTTCTCTTCACTCTCAGCAAGGTTTACATTATAACAGAGTTAAATCTATCTGGTGTGGGATTTGTATGATTTTATTTCGAGCTATTCAATACCGCTAAGTTCCGCCACTTGCAAAACTTTTTGCAAATTCGACCGCTTTCCTTTAGAATACCGCTACTTTTGGGGCTGATTTTGGATTCGACGGGATTGGCGAAGCCCAAGGTGCATGTCGAGGTGCGGTAGGCCTCGTAAACAAACCGCAAAATAATAGTCGCAAACGACGAACAATACGCTTTAGCAGCTTAATAACCTGCTTTAAAGCCTTATCTCCTCAGCTTCCGCTCGTAAGACGAGGGCAAAGATAAGTCACCCAAAACGAGATCGTGTGGACGCCGCCGCTTTAGGATCGAAACACTAAATTAAATAAAGCTAGTTTATTCATTGCGTGTCTGTCCGCTGTGAATAAGCGAAATTAAAGACTAGACTAAACATGTAGTACTGAAGGTAGAGAAATTTCGGACGGGGGTTCAAATCCCCCCAGCTCCACCAAATTATAATCCTATACGGTTCAACCGATACCTAAAAAGCCTTGAAAATCAATGTTTCAAGGCTTTTTTATTGTCCGTTGCGTACCTATACGATACAATCAAATCCGAAGATTTTAGGAGTATATTTAGGAGTACGCCGGAATACCCCCAAAAATTCGTACTCCTAAAACCACTTTAGAGCCTTTTCAAATAAGGCTTTATCGCTTTTAGTTTTGTACTCCCAAACAAAAAATCATACTCCTAAGATTTAGGCTTTATACTCCTAAAGGTTTACTATGGCTAGAAAAATCACACCGTTAAACGATACCCAAATAAGAAAAGCGAAACCGGAAGACAGCCCATTAAGAGACGGTAACGGCTTACTACTTGTTATTACCTCAAATTCTAAATTGTGGCGGTTTAGGTATGAAAGACCGTTCACAAAAAAGCGGAATGATTTAAGCATTGGGGCTTACCCTGATATTTCTTTAGCACAAGCGAGAGAAATTAGAGAAGAATATAGGGCATTATTGGCTCAAAATATCGACCCTCAAACCCACCGCCAACAACAGGAACAGGCAAAGGCCAACGAAATCAGCAACACTTATGAAAATGTAGCGTGGGCGTGGCTGGAACACCGCAAGACCAAGAAGAATTTTTCAGACAACTACCAAAAAGATGTAATCGCCTTAATTAAAAATAACCTCTTGCCGCACTTTGGAAGAATGCCTATCACACAAATAACCGCACCAATGGCAATCAAGGCATTCAAGCAATACCAAGACGAGGGCAAACTAGAGAAGTTAAAACGGGCAATTCAAAAACATAATGAAATTATGATGTTTGCCGTACACCGTGAAATGATACCGTTTAACCCTACCGCCAATATTGCGAAAGAGTTTGATAGCCCAACGGTTGAACATTTCAAAACCATTAAGCCGGAAGATTTAGGCGAGTTTTTATACACCTTACAAAACGCCCAAATTCATTTACAGACACGCTATTTAATTCTGTGGCAGTTACTCACAATGACCCGCCCGAATGAAGCGGCTAAGGCAAAATGGGCGGATATAGACGAAAAAGCCAAACTGTGGACGATACCGGCGGAAAATATGAAGCGAGGCATTGAGCATAAAATCACACTCTCACGCCAAGCAATCGCACTTTTGCGAGAGATTAAAAAGCTAAGTGGCGGTAAAACGTATTTATTCCCTAGCGTGAAGAACCCACAAACGCACGTCAATACTCAAACCGCCAACGGTGCGATCAAACGAATGGGCTACAAGGGCAAATTAGTGGCTCACGGCTTGCGGGCCATCGCCTCCACTTATCTTAATGAGAAAGGCTACAATAGCGATTTAATCGAGGTTGCCTTATCGCATTTAAACAGCGACCGAATCAAAGCCGCCTATGATAGAGGCGAACGCCTAGAGCAACGTTTTAAACTGCTCCAAGTGTGGGCGGATTTTGTAGAGGAATGTTCGCAAGGTAGCTTACCGCAATATCATTTGAAAATAGCCTAGTAAATTTTCCGCCAAAAATGACCGCTTGTAATGCCGTTAGGTAAACCGCCTGACGGCTTTTTTATGCCCGTAATTCCCCTTGATGAAAATTCTGTAAACTTTTCGATTTTTACCCACTTTACCCACTTTTCACTATTATTTTTTTATAACTAACTGAAAAATAAAGAAAAAATGACAGTGGGTAAAGTGGGTTAAAAGTGGGTAAATGGCAAAAACCCTTGCTCACTGTATCTTAATGGATACAATAAGCAATAAATAGAATAAGAAGCCGGCAATGATGAGAGAGCAAACCACTAATCAAATTATTATTACCGATAATTTTTCAAAATGGCTTGAGAATTTAAAGAACCCTATCGCAAAAGCAACGGTAGCAAGACGGATAAAAAATGCGATTAATGGCAACTTTGGCGATCATAAATCTTTAGCCGGTACAGGCGGACTTTATGAAATGCGGATAGCAACAGGAGCCGGATATAGAATTTATTACGCATAACAAGGAAATGTAATTTATATCTTGTTACACGGCGGCGATAAATCAACACAGCAAGCCGATATAGAGAAAGCGAAAGCATTATGGGCTGAATTAAAAACTACAGGAGAAAGCAATGGAAACAATACAAATCAATGAACAGGCAGCAGAAAAGCACGGTTTACGCCCTTTTGACGTGGCGGAGTTTTTAACCGATGAGGCAACTATTCAAGCCTATTTAGCGGAAGTGTTAAAAGAGGGCGACCAAGACGAATTTTTAGAAGCCTTGAACGATGTAGCAAGAGCAAGAGGAATGGCGGAGCTGGCCAAGCAAACAGGGCTAGGCAGAGAGAGCCTATATAAAACCCTAGCCAAAGGCAGCAAACCACGCTTTGACACTATTCAAAAAATTCTAGGGGCATTCAATTTAGTGCTTATTCCACAAGTCAAAAATGGCTAAAACTTATCACTTGCTACCTGTCAAAACCTCACTTTTAAATAGCCGTTGATGGATATTGACGGCTTTTTATTTGCTCCTTGCGTGCGTACTGCTCCGAAAATTCCGCACTATTCGCAAAACCTTAATGAAATATGACCGCTTGAATGCTCTTTTTTATAGCGTCCGGAAACCCATCTTTAGCCTATTTTGATTTACTGTAATAAAACACAGCTTATTACTTGTAATTTATCTGAATAATTAGCAAAATACAACCTATCAAGTTCAATCCGTAACTATACGGATTTATTCAAATTAGCGTGGATAGTGGCGGAGTAATTAACCGGCACGAAAGGAGAAAGCCCTTTATTTCTCTTTCCACGCTCTCACAGTAAAGGGATACGTTAAAGGGGCGCTTATGGCAGATCACAGTCAATTTATTTCTAGGCTTGAAAATCGTATTGAGCCCAAAATCAGCTTTCAAGAACTGATACAAGAATTATCAAACTATACAAATAAACCTTTTTCACATATAGCGGATAAATTGAAAAGCCTCATTTTTTCCTTTCAGCAAAATGGAATATATACGAATGCTTTTGTAAATTGCACTCTCTTTGAAGATGGTGAAAGCTATGCTATTGAGCCCAAAACACTACATTTCAAAGACGCTTTCGATCAGCCTAAAGGCGTTTTAAGTGATGTTATTGCTCAAAATTCTATTGATGTTGAACATTTAAATGCTTATTACGTAACAGCAAGAGAAATAACACAGCTGATTAAAACACAATCGCCAACCTTGTTAGATAAATTAACCACCAAGCAAACACAATCAGAGATTAGCCAAATTCAAAATGATTATATTTCTGTTTATGACTTCATAGAATGGGCAAGTAAACATTACTCAAGTCTTAGTGAAACAGCTAACGATTTAAACCGCTTACTCAAAGATAAAAATATACAGCTTTATCGACAATATGGCGGAATAAGTCCAAGCATTGATAAAGATAATACTAATTTAAAAGCAGCCTTTGATTTTGTAGCAATTAATAACGGATATGAAAAACAATCAAGCAGCTTTAATTTTGATGATGATATTCCGTTCTAGGTGGCAGCAATGAATTTAAATGATTTCCAAAATTTACTTTTAAATAAACAAGAATTAGAAGCAGCACTAGGGAAAAAGCTCGATTTTTCTGAGATAACACCTGATTATTTAGCAGACTATTCACGTTTTTAAGCCTCTATTCTGAAACCGAGCTTACCCATTGCCCGAGCTTTTAATTGTGCTAGGCAACCGAATAGCGAAGCTGGAACAACAACATAACGCAATGCCAAGCGAAACCGATTCAATCACACTCGGCATTTTAAGAAAACAACTTAGCCAACTGTTAAAAGTGGCGGAAAGAATAAAGGAATAAACCAAAATGAAACACGAGCTTAATTTAGCGGGTATTACTGCTTTAATGAATGAACCTATCAAAGCAACCTTGAGCTTTTTAGATTTTCCGCATATCCGAATTGAACGACTGCACCACGATAACGGCAGACCGTTTTTTATCGGTGTGCTTTCTCTTGACCTTGAAGATCATATCAATATTGAAATGGCAGGGGCTACGGGCTTTTTAGAGGCTCTAGCGATTATTGCCTATCATCAACAGCTAACCGCCACGCCGCTATTAGTGAATGATGACTTATTGAGTGAAATCAACAAGCTCCCCCACCCACAACGAACAAACCCATTTATTGACCGACACGGCAACGAAATTACACGGGAGCAGATGAGCAAAGAATACCGAGAAAAAATCGATTATGCCTTTGCTGAAAAGCGAATGGCGGAGGGGAAAGAATGACCGAACTCACACCAAAACAAGAGGCTTTTTGCTTTGCTTATATTGAAACCGGCAATGCTAGCGAAGCCTACCGCCAAGCCTATGAAACCGAAGATATGAAGTCCGAAACCGTCCACCGAAAAGCTAAAGAGCTAATGGATAACGGCAAGATTACGGCAAGGATTGAGGAACTGAAAGCCGAACACGCAGAACGCCATAAATTAACCGTTGATGACCTTTTAAAGGAGCTGGAAGAGGCTCGTATACTGGCGAGAGAGAAAGAAAACCCTAACGCAATGACTCAAGCCACAATGGGCAAAGCGAAGTTGCTAGGGCTGGATAAGCAGGTTACCGATCCGTGCTTTGATGGTGAAACCGGTAAAGGAGATATGATTTTAAGTGTAAACTGCTCAAGCATTAAAGACGGGAAAGCACTTGATGAAACTTGTATTTTAAAGGCAGGAACACACGAATTTATCACACGGGACAGCTTTATTTTCTACCGCCATATAAGAATCGATTCGTTAGATGAGATTAAGGCAAATATAGAAGCCGGTTATTTCATTCAAAAAGCCCTAATTAATGATGAAGCCTATCAACAAATACTAAAAGGCGTACTATCGTCAAAATCAGTAACGCCTAGATATAAACGCTTCCTAAAAAATGCAATCCGCCAAAGTGCTTGCCCTGATATTCTAGCCGAACCTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP017523|2254624:2262779|2259940_2260264_+|WP_006250284.1|DBSCAN-SWA METIQINEQAAEKHGLRPFDVAEFLTDEATIQAYLAEVLKEGDQDEFLEALNDVARARGMAELAKQTGLGRESLYKTLAKGSKPRFDTIQKILGAFNLVLIPQVKNG >NZ_CP017523|2254624:2262779|2254624_2255164_+|WP_006250276.1|DBSCAN-SWA MLDLTKIKLVITDVDGVLTDGGMYYTDQGEVMKRFHVHDGLGVKMLQSCGIKVAVLSGGDTALLRKRLEVLKIDLALLGKMEKRSACFELMQQAGVTPEQTAYIGDDTLDLPAFEVCGIAIATRNALDYIKEKADWVLQKAGGEGAFREVSDQILEAQGFGEIFKTADGFLTVAGKMAQ >NZ_CP017523|2254624:2262779|2258108_2259335_+|WP_006250282.1|integrase|DBSCAN-SWA MARKITPLNDTQIRKAKPEDSPLRDGNGLLLVITSNSKLWRFRYERPFTKKRNDLSIGAYPDISLAQAREIREEYRALLAQNIDPQTHRQQQEQAKANEISNTYENVAWAWLEHRKTKKNFSDNYQKDVIALIKNNLLPHFGRMPITQITAPMAIKAFKQYQDEGKLEKLKRAIQKHNEIMMFAVHREMIPFNPTANIAKEFDSPTVEHFKTIKPEDLGEFLYTLQNAQIHLQTRYLILWQLLTMTRPNEAAKAKWADIDEKAKLWTIPAENMKRGIEHKITLSRQAIALLREIKKLSGGKTYLFPSVKNPQTHVNTQTANGAIKRMGYKGKLVAHGLRAIASTYLNEKGYNSDLIEVALSHLNSDRIKAAYDRGERLEQRFKLLQVWADFVEECSQGSLPQYHLKIA >NZ_CP017523|2254624:2262779|2255563_2255866_+|WP_006250278.1|DBSCAN-SWA MNTYNNTLNNKNLEKKQLLMAIQAIPASQDFIWDGKDDDERPVTPSEFSIAMKKRGRPAGSKKELVSLRLDKSVLEAFRASGKGWQSRINQVLSDFVKQV >NZ_CP017523|2254624:2262779|2256342_2257302_-|WP_006250280.1|DBSCAN-SWA MKKFNENEIEDAEIIDAEPIDVDEIDEEETSVEAMHPALVSGSMPVPQGNLDSYIRMANQYPILTAEQEKELAERYYYDEDVEAAKQLILSHMRFVIHIARGYLGYGLPLADLIQEGNIGLMKAVKRFDPNVGVRLVSFAVHWVKAEIHEYVLKNWRIVKVATTKAQRKLFFNLRKNKNRLAWFNEEEIKKVADDLGVSVEEVREMESRMTGQDLGFDLPAGDDDEDSYAPSMYIEDSSSNFADDLEDEQHNGQATAQLAYALATLDERSQDIIKTRWLDDNKATLQDLADKYNISAERVRQLENAALKKIKEAISLDG >NZ_CP017523|2254624:2262779|2255301_2255592_+|WP_006250894.1|DBSCAN-SWA MKIYTWDETKRKINLAKHGLDFADADEVLSSPYRFDVEVIRNNEFRIQSFAYSFGRLLVLSLAYTEREDYIRVISFRRASKAEREAYYEYLQQYFE >NZ_CP017523|2254624:2262779|2256127_2256340_-|WP_015484067.1|DBSCAN-SWA MPTSGDFFTRYARTSCRRQSQRSNASVCAKFYAKSTACILTKNEDTMINITDKQIDPTFYQRLPASRRLY >NZ_CP017523|2254624:2262779|2259609_2259828_+|WP_006253767.1|DBSCAN-SWA MMREQTTNQIIITDNFSKWLENLKNPIAKATVARRIKNAINGNFGDHKSLAGTGGLYEMRIATGAGYRIYYA >NZ_CP017523|2254624:2262779|2262086_2262779_+|WP_006250290.1|terminase|DBSCAN-SWA MTELTPKQEAFCFAYIETGNASEAYRQAYETEDMKSETVHRKAKELMDNGKITARIEELKAEHAERHKLTVDDLLKELEEARILAREKENPNAMTQATMGKAKLLGLDKQVTDPCFDGETGKGDMILSVNCSSIKDGKALDETCILKAGTHEFITRDSFIFYRHIRIDSLDEIKANIEAGYFIQKALINDEAYQQILKGVLSSKSVTPRYKRFLKNAIRQSACPDILAEP >NZ_CP017523|2254624:2262779|2260658_2261345_+|WP_006250286.1|DBSCAN-SWA MADHSQFISRLENRIEPKISFQELIQELSNYTNKPFSHIADKLKSLIFSFQQNGIYTNAFVNCTLFEDGESYAIEPKTLHFKDAFDQPKGVLSDVIAQNSIDVEHLNAYYVTAREITQLIKTQSPTLLDKLTTKQTQSEISQIQNDYISVYDFIEWASKHYSSLSETANDLNRLLKDKNIQLYRQYGGISPSIDKDNTNLKAAFDFVAINNGYEKQSSSFNFDDDIPF >NZ_CP017523|2254624:2262779|2261664_2262090_+|WP_006250289.1|DBSCAN-SWA MKHELNLAGITALMNEPIKATLSFLDFPHIRIERLHHDNGRPFFIGVLSLDLEDHINIEMAGATGFLEALAIIAYHQQLTATPLLVNDDLLSEINKLPHPQRTNPFIDRHGNEITREQMSKEYREKIDYAFAEKRMAEGKE >NZ_CP017523|2254624:2262779|2255883_2256177_-|WP_006253765.1|DBSCAN-SWA MTQLSTSVYQRADGFINVANAHLKNIAPNQVSNAMLFGCARFNAYVAASKAEYKQQLADSREEVIQYFVEQYKEMLTANLDEYIQNFERYIEGKKAD |
12 | Synechococcus_phage(16.67%) | integrase,terminase | attL 2257830:2257889|attR 2263195:2263268 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP017523.1|WP_006250250.1|1633987_1634218_-|hypothetical-protein |
1633987_1634218_-
Protein sequences of NZ_CP017523.1|WP_006250250.1|1633987_1634218_-|hypothetical-protein>NZ_CP017523.1|WP_006250250.1|1633987_1634218_-|hypothetical-protein MNAQATLNNHKDYILCGRKEKRTSDFINVFEVFENEATQEFVIERAMFRNGKLIDWNQSDKMNAEQAQQLWQAYIH |
76 aa aa | NA | NA | NA | 1467134-1643674 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.13|1657749|37|NZ_CP017523|CRT,PILER-CR matches to NZ_CP017523 position: 1524712-1524748, mismatch: 0 ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer ggtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************* 2. spacer 3.22|1657284|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017523 position: 1583068-1583035, mismatch: 0 ctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa CRISPR spacer ctctagcattaaaatccaatcggtaaacggtaaa Protospacer ********************************** 3. spacer 3.27|1657617|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017523 position: 1525064-1525097, mismatch: 0 cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg CRISPR spacer cgcaagcattgcaccacggtaacaacggctgctg Protospacer ********************************** 4. spacer 3.28|1657683|35|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017523 position: 1525318-1525352, mismatch: 0 gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac CRISPR spacer gcgtttatcagcatctgctcgtgttactgtgccac Protospacer *********************************** 5. spacer 3.29|1657750|36|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017523 position: 1524713-1524748, mismatch: 0 gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg CRISPR spacer gtgcaaactactccgataaccgaagtagcagcggtg Protospacer ************************************ 6. spacer 3.30|1657818|34|NZ_CP017523|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017523 position: 1598293-1598260, mismatch: 0 gcactagggcgagtgcagacgggcaagtgtcgga CRISPR spacer gcactagggcgagtgcagacgggcaagtgtcgga Protospacer ********************************** |