Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017527 | Mannheimia haemolytica strain 1563 chromosome, complete genome | 3 crisprs | cas3,DEDDh,WYL,DinG,c2c9_V-U4,cas5,cas8c,cas7,cas4,cas1,cas2,PD-DExK,RT | 7 | 18 | 11 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP017527_1 | 915040-915114 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017527_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017527_1
>1.1|915063|29|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder AGACCTGATACTAATCTAGGGTATAAAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017527_1
The CRISPR arrays of NZ_CP017527_1 >merge|NZ_CP017527|1|915040-915114|CRISPRCasFinder CCTAGCGGTGGCAGGCACCAGAAAGACCTGATACTAATCTAGGGTATAAAGACCTAGCGGTGGCAGACACCAGAA >NZ_CP017527|1|1|915040-915114|CRISPRCasFinder CCTAGCGGTGGCAGGCACCAGAA AGACCTGATACTAATCTAGGGTATAAAGA CCTAGCGGTGGCAGACACCAGAA
>NZ_CP017527.1|WP_006248316.1|913681_914923_+|HipA-domain-containing-protein MMNKRIYVFADWETFSQPELVGVLSSDVVRGKENFRFSYDNEWLSSPYVQQIDPNLYLYPGEQYSTDTQNFHIFLDSCPDRWGRLLMKRREAALASQENRKPKLLIESDYLLGVHDMNRMGALRFKTELNGPFLDNNTRLAAPPLSSLRELEFAAIQLESSDNVDDPDYLKWLHMLISPGSSLGGARPKASVIDELNQLWIAKFPSRYDDYDIALWEYLAYRLAIQAKIEMATCRIERFNQEHHTFLTQRFDRHCGKRRHFTSALTQLGYYDGDYEASYLEIAQFLTESGSNTRIDLAQLWRRIVFNIAISNTDDHLRNHGFIYAQEGWILSPAYDLNPVPLSQGLHLNITDSDNRLDYQLAFDVADFFQLSKQQAVQIYDEVLKEINNWQNVAKEIGIPRQEQEQMKFAFNV >NZ_CP017527.1|WP_006250513.1|913478_913682_+|hypothetical-protein MFTQTLLAQRTGLSRVTVRKIMNGDPTVAIGYYLMVLGVLGLEQDFTDVGKDDELGRKLQDIELLRK >NZ_CP017527.1|WP_006248313.1|912422_913016_+|hypothetical-protein MKLKALSTLIASSMLYSQSFAVPPEKTAEEPQPFFNKTESGYDLVFNDQNYRLIETELNGEKIQFRAFERIVYVNNPIEPDYQTINLYVPEAYYNNGEINGYQADTAPIFLPNSVGGYMPAKAASYDKKRRDGSPGTILVALSKGYVVASVGARGRTLQKEGKYTGKAPSAIIDSKSAAHKACRFESDHWHHSLCKI >NZ_CP017527.1|WP_006248311.1|911435_912299_+|hypothetical-protein MLQLILAILCSVTVGVLIKFARQKGIRIDQSIAVNYIVTTTMTFLLLKPDYQGQSITDIIANNPTSYIFVILSITLPTIFLVQAKALEFAGIIRTDAAQRLSLFLPILAAFTIFGEQVTQNKLIALLLAFVALGCLLWKGNQGMEKGGKIAIISLALVWVGYGVNDILFKQIAKSGSAFPVTLSIAFIGAGCFMFIYLLLKRTQWHVPSVLTGLLLGVLNFGNILFYIQAHQAMKDDPTLVFTGMNLGVICLGTFVGAFFFKEKIHKVNYLGVAIAIVAIICLFYWR >NZ_CP017527.1|WP_006248309.1|910514_911264_-|alpha/beta-fold-hydrolase MEKRFEINEQGLSIRCKLFYEKELQQIENVVIVLHGFGSSKDLKSNTKFGERLSSKYKGYAALAFDFPCHGDDARKKLSVEESITYLQLVIDYAKTSLNAKNLYAYGTSFGGYLTLKYLAEKGNPFRKIALRAPAVQIYHSLMNRLSEEERQKLAKGREILWGFDRQMKISQAFFDELTDITQNDYLDYAEQILILHGTEDEMVALSTSQQFADNNVIELLPIEGADHAFSNPKLMDIAIGKIVEFFAP >NZ_CP017527.1|WP_006248308.1|910027_910513_+|YbaK/prolyl-tRNA-synthetase-associated-domain-containing-protein MSEQTFHQLTALLDSHRARYRVVGHPSAGKSEEVAKIRGTEIGQGAKALVCKVKGNGVKQAVLAILPADYQADLTKIAEHLGGLRASLASPAEVAELTDCVFGAIPPFSFHPDLLLVAEPSLFERYAELAFNAGTLERSIILNTEDYQKIVNPVLVQFAKS >NZ_CP017527.1|WP_006248307.1|909418_909964_+|endonuclease-SmrB MNDTLLDDEFALFREAAKGTKKLTQNTFVPKAEPRKKLQELRELKEKADTEFYFSDEYEPLLKEENEKVKYLREDVDPYILKQLRRGDFQPELFLDLHGLTREKAKKELAALILACEREKVYCASVMTGFGTRTLKDQIPRWLVQHPKVMALHQAPKEWGGDASILILVEQPENPEKMFGR >NZ_CP017527.1|WP_006248305.1|908381_909326_-|50S-ribosomal-protein-L3-N(5)-glutamine-methyltransferase MFKYNTELLDEISALPIVNDLVTIQDMMRWGYSYFNASDLYYGHGYDNAWDEAQQLVLAGLYLPFDVPETLYSSRLTRVEKERIINLICERLGSRKPVAYLTNSAWFCGGEYYVDERVIVPRSPIGELIKKGFKGIIKNEPHRILDMCTGSGCIAIACAERFPEAEVDAVDLSLDALDVAQINIERHQVSHRVFPICSDLFNNLPQDKYDLIVTNPPYVDEEDLGDMPEEFHHEPALALGSGKDGLDLTKRILAQAADYLNDDGVLVCEVGNSMVHLIEQFPSVPFNWLEFEHGGLGVFSLTKEELVKHRHLFA >NZ_CP017527.1|WP_006251360.1|907404_908298_+|N-acetylmuramic-acid-6-phosphate-etherase MNALGQMITEQRNPNSMNIDRLSALDIVQVINQEDKQVAIAVEQCLPQIAQAVEKIVQAFEKGGRLVYVGAGTSGRLGVLDASECPPTYGVKPEMVVGLIAGGERALRFPIEGAEDNREQGKVDLQAVNFSEKDVLVGIAASGRTPYVLGAMEYAKQLGATTVSIASNPNSAMAQIADIAIETVVGPEVLTGSSRMKSGTAQKLVLNMLTTASMILIGKCYQNLMVDVQATNEKLKARAIRIVMQATECEREVAEDTLKLAENNAKLAIMMILGNLDKQKAEDLLSQNQGRLQKALK >NZ_CP017527.1|WP_006248303.1|906930_907392_+|nuclear-transport-factor-2-family-protein MRKIKLLHVILSLILGLSAAAIGSYPAIKEIGEERAKKHQDILDLNRELYSAMVNRDFSALQTLLSDDFELYSSTGEVIDKQEWIKLIQKRVLEFDKVDLLSTDFQGNQSSGLLRVNGEFFGIERDNVVVEMNIRTIVRNTERQIKCIVIKEV >NZ_CP017527.1|WP_015587023.1|915326_916367_-|IS481-family-transposase MFYSNNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNLKNRVDEAIEQAVVKFALDNPAFGQVRVSNELRKQGIFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLIALEKLVAEQGIILSETQVQALERKKEDEIACGEIETTHPGYLGSQDTFYVGNLKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKAAISAADMLNDKVLPFFESQGLPMLRILTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHSKTKVKHPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKKIYTDLTTLQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMATLLDGKRIWVEKNLSSN >NZ_CP017527.1|WP_006252258.1|916520_917294_-|D-hexose-6-phosphate-mutarotase MNLSNALKLIKYNELDVLEVNHNKFKAKIALQGAQLLSWQPYNAEQDVLWLSEIEPFRIGSAIRGGIPICYPWFGSIKEPAHGTARIQEWRLVEHTCSDENVGLVFALENKAKMEMMLGETCELYFTHLDPEPAQLALHSYFNIGDIEKVEVQGLPTRCFDKLTDQEVEVPSPRKISENVDCIYPAQAVNFIQDFANQRTIKVEHINATETVLWNPWHNTVSAMTETAYQNMVCVETARINTLLQQNETLGVRVLVR >NZ_CP017527.1|WP_006248318.1|917442_921639_+|autotransporter-domain-containing-protein MKTKTFTRSYLASFVTIVLSLPAVASVVRNDVDYQYFRDFAENKGPFSVGSMNIDIKDNNGQLVGTMLHNLPMVDFSAMVRGGYSTLIAPQYLVSVAHNTGYKNVQFGAAGYNPDSHHYTYKIVDRNDYEKVQGGLHPDYHTPRLNKLVTEVVPAAVTNAGTSIKPYLNEERFPMFLRAGSGTQALRGKESNKTTGIAGAYEYLTGGTTLQLSKSSPDHWLDYSSNLYQVSYGPLSTYALPGDSGSGSYAYDMNEKRWVLVGVLNFYNGMDNQFNRSAIIRKDFHEKKFAEDIAGTINNTVQNAQFNWTAQGKSSSLSQSNNVQKLNVDLKDSSIANQNTSLPQENHGKTINFNGKDATIVLKQDIDQGAGALNLNANLTIRPETDQTWQGAGIIVGKDKKVNWQVKNPQGDRLSKLGEGTLYVNGRGQNLGDISVGDGIVILNQQADHQGRKQAFNTVGIVSGRPTVVLGSADQVNPDNIYFGFRGGRLDLNGNSIAFKRIQNSDKHARIVNHNRDHISTLIIQGQDPLTSNDLIWGKWASNSPADIYEYTNPYQNKRKDYFRLKGNSRVYYPTNATSNDHWEFLSSNREQAIQKILDAKNLRQRYDTFNGFIGEDASNKTNGILNVVFDTKTEVNTEQDKLKNIYTMSGGFNLNGELTLKGGTLLLSGHPTPHAYDIKNKHDVVRENDWQDSHFTAKNITVNKMAQLYIGRNVNEVNSHFTATDKAKLNLGFINRSTPSCYDSEYTGTTHCEVQAVISDNIFANLATTAIKGNVKLQNHSQLNLGKANLTGSVQADQTTHITLANHSHWLNNGTSQIGHLTMEKGSILSLNDKFATTEIPVRFNKMIIQGNLKGNGRINYTANLAKGESDHLQVDGIAEGNFVLAVRNSTTEANPKSSLNLLSLKNSNQEGNKASISLENNYVDLGTYRYVLENRNHNYHLFNPLIPNSTSKEMNATSVSSIPKKESVTNVPTLDKKETEQNLTQLQKDFSAHQLENQKAKQSMINAQSELRRLNSQLNVLQKYVNSRRLGYYTQQAVLEQISIIQNKIKQTQTIFNDANATVKLTDQKLEEAKLALGSVNDLVLIKASAPAMQATNQDTSMMNIIQADWISQYANTALSELSAQANSALQISNSLDRQLFKQSDKFNVWSSVEHQKTEHKSDLYRPYKQQTNLTQLGIQMPIDNGLMFGVALSKNHANAEFNEGVNGKSNLLMASLYGKWQSQQGTFISLDGSYGKAKNQLYLFGENHFTRRISSIGANIGHQFDLAGVQIQPTIGARYYHFSGQDYTLGGAKISSPNTHFMTYQAGLKASKTFSLDDWKVEPSITTHYVDASNKRLAVNVNNNNINQRFGRYLKTEAGIRFEHNQWQFDLHAGFINGNEIKKQHFAGVKLGYSW >NZ_CP017527.1|WP_006248319.1|921693_922788_-|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase MSKTIEERISAVILAGGLARRMNGVEKGLQLFEGKPLISHILARLSPQVSDIWLNVNRSIEQYQQLYPAFSYYQDSLPDFQGPLSGMLAGFEQIESDYLLFVPCDTPFMPELLLQKLKTALRINNVQIAYAHDGERPHPTFALIHRSVQEDLKAYLGSNQQQLLAFFQSQKSVAVDFSEQKSAFTNVNTLEDLSRVSQFPVKNLAITGYSGTGKTTLLEKLIPKLTACGIRVGLIKHSHHNVDVDKKGKDSYRLREAGANPTMIVCDERWALMTETKQAVEFSQLIAKFNPQEVDLVFVEGFKHETLPKIQLHRKGIEKPLPELDQWTIATATDYPLERENWLDINNIGGIADFIKNWLENKAS >NZ_CP017527.1|WP_006248320.1|922874_923144_+|DUF1040-family-protein MKCERLEELLELLGEHWRKNPDLHLIDILQQLSVEVGEPDNFKALSDEVLIYQLKMRNAGKFEPIPGIKKDYEDDFKTALLRARGILND >NZ_CP017527.1|WP_006248321.1|923207_923846_+|thioredoxin-domain-containing-protein MKKLALKTAFVALSALFTFNSTAIAADPTAGKEYIEVRKAPSAQKEVVEFFSFYCPHCYDFELSYKIPSQIKEKLPSDSKLVQYHVNFLGRQSEDLTRAWALAMALGAEDKVKTALFEGAQKDAFKSMDDIRSVFLANGITAEQFDSGINSFAVNGLVNKQVQLAEDFQIRGVPAFFVNGQYQLNLEGFADSSSTNDFIKRYVDAVVFLSKK >NZ_CP017527.1|WP_015484370.1|923929_924706_+|LLM-class-flavin-dependent-oxidoreductase MTKLSILNLVPIREGQTAKQAVDSMVKLAKHAESIGIERYWIAEHHNMKNLASSATQLLIQHALSHTEKLRVGSGGVMLPNHSPYIVAEQYGTLETLYPNRVELGLGRAPGTDMRTATALRRNAQSLPFPDEISELKGYFEGTNSVSAYPAQGLNVPFYILGSSPESAYLAAERGLPYAFASHFAPRFMDDAVRIYRTHFKPSEVLDKPYVILGVNAIAAETDQEAEQLATTQTQFFLNVVTNAQNYLQPPVESDDKV >NZ_CP017527.1|WP_015484369.1|924715_924970_+|luciferase MKAEIVPHFGPVSFQQNALYNQEKPVVRQMTACSLIGSRESIEQQLKSLKARIEIDEIMAVSYIFDEQKQHQSYTWLKEIADKV >NZ_CP017527.1|WP_006252261.1|924971_925265_+|YfcZ/YiiS-family-protein MSKTMQQKAADAHNMCKLKGDSMLDNSDRQIAFEAVYDSEEIAVQAVEFFTQKAKSVETEPCDIQSEITPIIDGFLMKMWITFSCQAEVILFQMAVR >NZ_CP017527.1|WP_015587023.1|925331_926372_-|IS481-family-transposase MFYSNNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNLKNRVDEAIEQAVVKFALDNPAFGQVRVSNELRKQGIFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLIALEKLVAEQGIILSETQVQALERKKEDEIACGEIETTHPGYLGSQDTFYVGNLKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKAAISAADMLNDKVLPFFESQGLPMLRILTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHSKTKVKHPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKKIYTDLTTLQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMATLLDGKRIWVEKNLSSN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP017527_2 | 1332783-1332897 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017527_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017527_2
>2.1|1332811|59|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder ACCTAAAAAGCTCCCTGTTATTGTCATTAAAAGCAAAATGGATTTATTTAGTGCAACAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017527_2
The CRISPR arrays of NZ_CP017527_2 >merge|NZ_CP017527|2|1332783-1332897|CRISPRCasFinder ACAGTGGCGAAATTATTACGATTTATCCACCTAAAAAGCTCCCTGTTATTGTCATTAAAAGCAAAATGGATTTATTTAGTGCAACAAACAGTGGCGAAATTATTACGATTTATCC >NZ_CP017527|2|2|1332783-1332897|CRISPRCasFinder ACAGTGGCGAAATTATTACGATTTATCC ACCTAAAAAGCTCCCTGTTATTGTCATTAAAAGCAAAATGGATTTATTTAGTGCAACAA ACAGTGGCGAAATTATTACGATTTATCC
>NZ_CP017527.1|WP_006248186.1|1331373_1332291_+|baseplate-assembly-protein MSEIVDLSKLPAPKVLEELDYETLLAERKAKFLSLYPESERAVMAARLALESEPITKLLQENCYLQLLERQRINSAAQATMLAYATGTDLDVIAANFNVERLVVQAEDLTASPPIVEELEPDDDFRQRVQLKIESVSVAGPRKAYTFHALSANGKIADVSVISPQPAYVTVTLLSRDGNGAVASEIINAAKIALNDEEVRPIADRVTVQGASIVEYEINAVLHLYRGPEKEPILKAAKANLEAYINQTKRIGRDVTHSGIHAALHVAGVQNVEILQPRTDLVLTPYQAGYCVNYTLNVEVSDEYS >NZ_CP017527.1|WP_006248187.1|1331041_1331377_+|hypothetical-protein MNRETGEQLEDEVEHIKQSIKDILLTAKGSRVMRRTYGSNLYKLTDKPIAASLIMQLSAACVMALQQWEPRIAITRFKVEFAEDNYNKLICTLDFTLKHRKISIKGMRFTL >NZ_CP017527.1|WP_006248188.1|1330436_1331042_+|phage-baseplate-assembly-protein-V MSEPNHAEQIRRLDNIIRLGTIAEVDLTTATARVNSGGITTDFLPWLTFRAGTSQTWSAPTVGEQCVVLSVSGEFTTGVILFGIYTQNAPSQSADEHLFRFSDGAEISYNTASGQLTVKNCKVVIVQATESITLDTPTVKATKNVVIGGNLSVKGTTSSQGAISTQGAVTAKGDVSGAGISLGSHHHIEQGDGRPTSGAKP >NZ_CP017527.1|WP_020910232.1|1329116_1330157_-|IS481-family-transposase MFYSNNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNLKNRVDEAIEQAVVKFALDNPAFGQVRVSNELRKQGIFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLIALEKLVAEQGIILSETQVQALERKKEDEIACGEIETVHPGYLGSQDTFYVGNLKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKTAISAADMLNDKVLPYFESQGLPMLRILTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHSKTKVKHPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKKIYTDLTTLQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMATLLDGKRIWVEKNLSSN >NZ_CP017527.1|WP_021265529.1|1328812_1329082_+|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MAKITIKPQALSQFDEIVKSVIEFTGFETSGIRLQSDIFDKIEQIAFMPLSGRAREDGTRETFVRRYRIVYDYDRQADEVIICRRSNLI >NZ_CP017527.1|WP_006248191.1|1325349_1325628_-|hypothetical-protein MEILFILLGLIGFGALLAIGFTTFAAIFGVVTTVFLSLLSLLANMVGLSIIVILISLYVLLPLNTFILIALIFSAILGFLCWYHSDRQSVNQ >NZ_CP017527.1|WP_062716029.1|1324840_1325299_+|phage-virion-morphogenesis-protein MSEPIEQVKTAFDSLLNNISKPRRRLMYQQIGRELDRSQRRRIKAQQNPDGSAYEPRKKPKKGVKSKIKSGKMFDKITQPRFMRLRLESEGVSLGYEGGDAVIARIHQQGLIGRVRKDWDLKVKYASRELLGFTDDDLQMIEDYMINILAGS >NZ_CP017527.1|WP_006248193.1|1324362_1324848_+|phage-tail-protein MIKPDRLRAVLTQTIDIFQANPEKLILQYDKGKIKSKGSQSHSFEYHYDLELIVVDFPYHPDVLFVPVLNFVRNEQWELLQNPELQDKIEFEIDHNNHESYDIYIRLPLTERVIVKEQDGHLTATHADEPNLADVSPFTRLTEYEVYLKDELIYQWAEPNE >NZ_CP017527.1|WP_006248194.1|1324144_1324366_+|TraR/DksA-family-transcriptional-regulator MSDQIDRANELAEKAREAALAKILQNQTACTSLFECEDCGEPIPEKRREMVIGCTRCIECQTIYEHKQKGYRR >NZ_CP017527.1|WP_006248210.1|1323540_1323996_+|hypothetical-protein MIVKLCQMTNKHFSPLMIVLVLVGVLANFVQFRQNESLKADLQARTTQNQLIQADNRNLANQLENSQIQLEAYQKQVDDLNQKVLAKMKQAEQRSNEILNELEKHKKWADSAVPPSVGKLLNQRKRAVSHPQIEPDNLSEKAGVPNTGNRD >NZ_CP017527.1|WP_015981653.1|1332912_1335192_+|variable-tail-fiber-protein-H MEQKYKTILTHHGERVIVEALANKIPVPLKEMAIGDGNGSSITPSASQTTLVREVYRAEITDLLEDPQNRHQMIAELLIPENVGGFIVREIGLFDEQGGLVAVANCPENYKPVLEQGSGKVQYYRMILQVSSSDAVTLSINNNIVYATRTEFNEFVNNLSSPDGYKHIGRCKSVAELRTIRPTEHGQRILVDAYYEDGTTGGGEFVADLQDLVTPDDGGVCFVVNNNGGRWKRVDLSHLTLFDFGAVGDGVTNDESAFVNAMRYSQFFIENGTFRINNAVNSVRDNVQILGNKTGKLVLGAGIQQAEAEVFNINHSNYFISGFCIETPNKAIGIRFKSLDDAGVKNLHIDNVVFNGTFYGVRAGESIQADTNYPTDNVIVQNCQSYCGSGNAGHYLCTKVKGVRFFNNIAIGGRNVSAYGATSCSDIFILGNREQGMAVTTVDVEAGVQVEDVQTGECVVANNICSHDIWMSGAKNAIINSNLCRRLRVTSGNPTDTGSNNVEFSNNQAKSIAISKYGSFDNPSLFIDNINFINNILEPSEFNQDVYIDGTILKQCQFINNRCISKSKQYSVRLARNNPCLNLTFKSNKLSDNPAIISGKQGVIFCDDLSLGVNKHRLRLRFSSPINFTVNQEWQKMPFDRVLNDINGHVDIVSGQFIARTGGTFHLKGKITVTNSSEDVLNLYQLRLLINNEEKERLINQSVSPKNSKSNTNGMTTINFDTVVYLKVGDIVDLQYKTTHELTLLSDSFLSQIYVTQEF >NZ_CP017527.1|WP_006248181.1|1335192_1335435_+|hypothetical-protein MTKKHYCTGWRSAPANINSCCHQHDRDYGIRGTVTRADADKRLRECMIKNGNPIRAWLFWLVVRAFGWRFYKNKEIKIEK >NZ_CP017527.1|WP_006248179.1|1335864_1337046_+|phage-tail-sheath-protein MSILDTYLHGVEVVEVNAGGVTISTAATSVIGVVCTGDQADAETFPLNTPVLITNPLNYLEKAGSTGTLRRTLNSIGSIVKTPTVIVRVAESDDSDTLTANIVGTQENGKFTGIKALLTAQSTVFVKPKLLCVPQHDNQAVATELLSVAKKLNAFAFISDNGATTKEQAYTYRQNFSQREGMMIFGDWKSYNTDKKAYDTDYAVARACALQAYIDKTVGWHKNISNVELDGVTGITKAVEFDINESSTEANYLNEKGITICLNHNGFRYWGSRTLATDTRWAFQQSVRTAQIIKETIGAGLAWAVDMPLTPLRVKTMLEAINNKLRSWASGDDPRILGARVWVAEEITADIIKSGKFVIKYDYHWIPSLESLGLEQRVNDEYVVDLVNTLKAL >NZ_CP017527.1|WP_006248178.1|1337054_1337561_+|phage-major-tail-tube-protein MGLPAKLKNFNFSVDGTSYLGETTEVTQPKLAMQLEDYRAGGMIAPVGVNMGLEKLELEFKIGGHEEDLLKLFGGSISGNAFRFNGAYQHDDDDSVDAVELVCRGRIAEIDEGSSKAGDDTEHSYKASLTYYKKTVNGVDIIEIDTLNQIYIVDGKDRLAEIRKAMGL >NZ_CP017527.1|WP_006248177.1|1337639_1337954_+|phage-tail-assembly-protein MKKVTLKQGILRGEKRITEIEVRKPLTKQLRGTNLTSLMQLSVDEWCIVLPRITTPKLDKADFATMSAADLLKLSGKALDLMSEDFDEADEEDSEEQGKGEILA >NZ_CP017527.1|WP_075270712.1|1337977_1338094_+|GpE-family-phage-tail-protein MADIATVFHWTPNTFDEMTIVELGQWREKARLRNGVES >NZ_CP017527.1|WP_006253663.1|1338157_1338505_+|hypothetical-protein MEIKTVTFSKVITAFIFHIITLFVFTQLNEQAQATFMFFWWFFISLRFILVVGIMCVGIEELKIQEYRQTKAYACFSFISNFALCLQFVYFEHLIAAILFLISYIIYHSQTVTIK >NZ_CP017527.1|WP_006248175.1|1338506_1338944_+|phage-tail-protein MLQQFAMMSLGYFVFMRLTIPYQDTSREMNWSHVQNDVVGAMPKSQFTGKAGETMEISAELRPEITGGKMSILALEMMAEQGSAYPLISGSTFMVLGWFVIDRISEQETTFFADGTPRAISFSMSLKRVDDSLLANIIDEVAGFI >NZ_CP017527.1|WP_006248174.1|1338943_1340182_+|phage-late-control-D-family-protein MDFLTELTNHNHRTPAVSVTVRPKPSKDNEGEKAKDISTLITHRLIQLTLTDNRGFEADQLDLELDDTDGLLALPSRGAILSVGLGWQNSPLTYKGEYTVDELTHDGPPDKVTIRARSADLRGTLTNRHERSFHRTTIGKIVKQIAEENKLKPMVGKEFENEEVKHIDQTNESSINLLQRLAEQFDAIATVKNGNLIFIKAGNATTASGKLLPLFRITRSSGDSHSFSIAEGDNYKAVKAYWHNTQTGKRGEVTWDENSQVKKVTKPTMRKKTKVKRGADGKPIKGKDGKSIKETVFVKGKGRQVNAVVQSKPIESDSEAIKTLPHTYATAQSAINACKRNFEKLQRGVATFSLTLAEGNAELIPELPVQVSGFKAEIDSNEWIISQVTHSLNKGGGFTTALEMELKPKSED >NZ_CP017527.1|WP_006248173.1|1340364_1341171_-|DUF3800-domain-containing-protein MNNQSVWHLFCDESGISGKPFYAFGALWIREDKISLFEKEIQKLREKHYCTDEIKWQGTNSKRFSEFYRELVSFFFQADYLFFNCIVVQQAIVNKAFHNGDYEMAKQKHFNLLICNKIEQSLYKNRINRFVLSVDDLPFKYNKADEAMHIIANNIIRKKTAVANAILALNEVDSRKSSGVQLCDLLLGAILSSYQNDITSERKKELTKWIALHLGWDKLTYDTLQEEKKFNIWYFYDPTKGPRIVRTRETKLKYPLLKKKEQTFQPAR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP017527_3 | 1793502-1794404 | TypeI |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017527_3
|
13 spacers
spacers of NZ_CP017527_3
>3.1|1793534|36|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder CCTATAACGAGCAATGGCATTTTGATCTACGGTAAA >3.2|1793602|34|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder TTCTTGAATACCTCCGGAGTCAGTTAAGATAAGG >3.3|1793668|36|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder CACCGCTGCTACTTCGGTTATCGGAGTAGTTTGCAC >3.4|1793736|35|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder GTGGCACAGTAACACGAGCAGATGCTGATAAACGC >3.5|1793803|34|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder CAGCAGCCGTTGTTACCGTGGTGCAATGCTTGCG >3.6|1793869|34|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder TCGTGGCTGGTTATACAAAGAAAAGCATTGTTGG >3.7|1793935|35|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder TTAAATCTAAAGCTAAAGCTATTTTATTAATTAAA >3.8|1794002|34|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder TTTACCGTTTACCGATTGGATTTTAATGCTAGAG >3.9|1794068|35|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder CCTAAATTGCCGTAAAAATCTGCCATTAGCTACGC >3.10|1794135|35|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder CTCATAACGAATCCAATCCTGTTCGGTTAATCCCC >3.11|1794202|37|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder AGGGGCGTGTACCGCAATCAATTTTAATTATAACCAA >3.12|1794271|35|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder TTTATCTGTTGCGGTCAATTGTATATCTTGAATTT >3.13|1794338|35|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder CTCGTCTTGAATTGGAAAATCAAGGGCGACAATAG >3.14|1793534|37|NZ_CP017527|PILER-CR CCTATAACGAGCAATGGCATTTTGATCTACGGTAAAC >3.15|1793602|35|NZ_CP017527|PILER-CR TTCTTGAATACCTCCGGAGTCAGTTAAGATAAGGC >3.16|1793668|37|NZ_CP017527|PILER-CR CACCGCTGCTACTTCGGTTATCGGAGTAGTTTGCACC >3.17|1793736|36|NZ_CP017527|PILER-CR GTGGCACAGTAACACGAGCAGATGCTGATAAACGCC >3.18|1793803|35|NZ_CP017527|PILER-CR CAGCAGCCGTTGTTACCGTGGTGCAATGCTTGCGC >3.19|1793869|35|NZ_CP017527|PILER-CR TCGTGGCTGGTTATACAAAGAAAAGCATTGTTGGG >3.20|1793935|36|NZ_CP017527|PILER-CR TTAAATCTAAAGCTAAAGCTATTTTATTAATTAAAG >3.21|1794002|35|NZ_CP017527|PILER-CR TTTACCGTTTACCGATTGGATTTTAATGCTAGAGG >3.22|1794068|36|NZ_CP017527|PILER-CR CCTAAATTGCCGTAAAAATCTGCCATTAGCTACGCG >3.23|1794135|36|NZ_CP017527|PILER-CR CTCATAACGAATCCAATCCTGTTCGGTTAATCCCCG >3.24|1794202|38|NZ_CP017527|PILER-CR AGGGGCGTGTACCGCAATCAATTTTAATTATAACCAAG >3.25|1794271|36|NZ_CP017527|PILER-CR TTTATCTGTTGCGGTCAATTGTATATCTTGAATTTG >3.26|1794338|36|NZ_CP017527|PILER-CR CTCGTCTTGAATTGGAAAATCAAGGGCGACAATAGG >3.27|1793523|48|NZ_CP017527|CRT CGAATTGAAACCCTATAACGAGCAATGGCATTTTGATCTACGGTAAAC >3.28|1793591|46|NZ_CP017527|CRT CGAATTGAAACTTCTTGAATACCTCCGGAGTCAGTTAAGATAAGGC >3.29|1793657|48|NZ_CP017527|CRT CGAATTGAAACCACCGCTGCTACTTCGGTTATCGGAGTAGTTTGCACC >3.30|1793725|47|NZ_CP017527|CRT CGAATTGAAACGTGGCACAGTAACACGAGCAGATGCTGATAAACGCC >3.31|1793792|46|NZ_CP017527|CRT CGAATTGAAACCAGCAGCCGTTGTTACCGTGGTGCAATGCTTGCGC >3.32|1793858|46|NZ_CP017527|CRT TGAATTGAAACTCGTGGCTGGTTATACAAAGAAAAGCATTGTTGGG >3.33|1793924|47|NZ_CP017527|CRT TGAATTGAAACTTAAATCTAAAGCTAAAGCTATTTTATTAATTAAAG >3.34|1793991|46|NZ_CP017527|CRT TGAATTGAAACTTTACCGTTTACCGATTGGATTTTAATGCTAGAGG >3.35|1794057|47|NZ_CP017527|CRT TGAATTGAAACCCTAAATTGCCGTAAAAATCTGCCATTAGCTACGCG >3.36|1794124|47|NZ_CP017527|CRT TGAATTGAAACCTCATAACGAATCCAATCCTGTTCGGTTAATCCCCG >3.37|1794191|49|NZ_CP017527|CRT TGAATTGAAACAGGGGCGTGTACCGCAATCAATTTTAATTATAACCAAG >3.38|1794260|47|NZ_CP017527|CRT TGAATTGAAACTTTATCTGTTGCGGTCAATTGTATATCTTGAATTTG >3.39|1794327|47|NZ_CP017527|CRT TGAATTGAAACCTCGTCTTGAATTGGAAAATCAAGGGCGACAATAGG |
cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,c2c9_V-U4 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017527_3
The CRISPR arrays of NZ_CP017527_3 >merge|NZ_CP017527|3|1793502-1794404|CRISPRCasFinder,PILER-CR,CRT CCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAACCCTATAACGAGCAATGGCATTTTGATCTACGGTAAACCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAACTTCTTGAATACCTCCGGAGTCAGTTAAGATAAGGCCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAACCACCGCTGCTACTTCGGTTATCGGAGTAGTTTGCACCCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAACGTGGCACAGTAACACGAGCAGATGCTGATAAACGCCCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAACCAGCAGCCGTTGTTACCGTGGTGCAATGCTTGCGCCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAACTCGTGGCTGGTTATACAAAGAAAAGCATTGTTGGGCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAACTTAAATCTAAAGCTAAAGCTATTTTATTAATTAAAGCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAACTTTACCGTTTACCGATTGGATTTTAATGCTAGAGGCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAACCCTAAATTGCCGTAAAAATCTGCCATTAGCTACGCGCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAACCTCATAACGAATCCAATCCTGTTCGGTTAATCCCCGCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAACAGGGGCGTGTACCGCAATCAATTTTAATTATAACCAAGCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAACTTTATCTGTTGCGGTCAATTGTATATCTTGAATTTGCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAACCTCGTCTTGAATTGGAAAATCAAGGGCGACAATAGGCAGCCACCTTCGCGTGGCTGTGTATTGAAAC >NZ_CP017527|3|3|1793502-1794404|CRISPRCasFinder CCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC CCTATAACGAGCAATGGCATTTTGATCTACGGTAAA CCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC TTCTTGAATACCTCCGGAGTCAGTTAAGATAAGG CCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC CACCGCTGCTACTTCGGTTATCGGAGTAGTTTGCAC CCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC GTGGCACAGTAACACGAGCAGATGCTGATAAACGC CCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC CAGCAGCCGTTGTTACCGTGGTGCAATGCTTGCG CCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC TCGTGGCTGGTTATACAAAGAAAAGCATTGTTGG GCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC TTAAATCTAAAGCTAAAGCTATTTTATTAATTAAA GCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC TTTACCGTTTACCGATTGGATTTTAATGCTAGAG GCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC CCTAAATTGCCGTAAAAATCTGCCATTAGCTACGC GCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC CTCATAACGAATCCAATCCTGTTCGGTTAATCCCC GCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC AGGGGCGTGTACCGCAATCAATTTTAATTATAACCAA GCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC TTTATCTGTTGCGGTCAATTGTATATCTTGAATTT GCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC CTCGTCTTGAATTGGAAAATCAAGGGCGACAATAG GCAGCCACCTTCGCGTGGCTGTGTATTGAAAC >NZ_CP017527|3|1|1793503-1794404|PILER-CR CAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC CCTATAACGAGCAATGGCATTTTGATCTACGGTAAAC CAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC TTCTTGAATACCTCCGGAGTCAGTTAAGATAAGGC CAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC CACCGCTGCTACTTCGGTTATCGGAGTAGTTTGCACC CAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC GTGGCACAGTAACACGAGCAGATGCTGATAAACGCC CAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC CAGCAGCCGTTGTTACCGTGGTGCAATGCTTGCGC CAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC TCGTGGCTGGTTATACAAAGAAAAGCATTGTTGGG CAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC TTAAATCTAAAGCTAAAGCTATTTTATTAATTAAAG CAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC TTTACCGTTTACCGATTGGATTTTAATGCTAGAGG CAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC CCTAAATTGCCGTAAAAATCTGCCATTAGCTACGCG CAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC CTCATAACGAATCCAATCCTGTTCGGTTAATCCCCG CAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC AGGGGCGTGTACCGCAATCAATTTTAATTATAACCAAG CAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC TTTATCTGTTGCGGTCAATTGTATATCTTGAATTTG CAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC CTCGTCTTGAATTGGAAAATCAAGGGCGACAATAGG CAGCCACCTTCGCGTGGCTGTGTATTGAAAC >NZ_CP017527|3|1|1793503-1794393|CRT CAGCCACCTACGCGTGGCTG CGAATTGAAACCCTATAACGAGCAATGGCATTTTGATCTACGGTAAAC CAGCCACCTACGCGTGGCTG CGAATTGAAACTTCTTGAATACCTCCGGAGTCAGTTAAGATAAGGC CAGCCACCTACGCGTGGCTG CGAATTGAAACCACCGCTGCTACTTCGGTTATCGGAGTAGTTTGCACC CAGCCACCTACGCGTGGCTG CGAATTGAAACGTGGCACAGTAACACGAGCAGATGCTGATAAACGCC CAGCCACCTACGCGTGGCTG CGAATTGAAACCAGCAGCCGTTGTTACCGTGGTGCAATGCTTGCGC CAGCCACCTACGCGTGGCTG TGAATTGAAACTCGTGGCTGGTTATACAAAGAAAAGCATTGTTGGG CAGCCACCTACGCGTGGCTG TGAATTGAAACTTAAATCTAAAGCTAAAGCTATTTTATTAATTAAAG CAGCCACCTACGCGTGGCTG TGAATTGAAACTTTACCGTTTACCGATTGGATTTTAATGCTAGAGG CAGCCACCTACGCGTGGCTG TGAATTGAAACCCTAAATTGCCGTAAAAATCTGCCATTAGCTACGCG CAGCCACCTACGCGTGGCTG TGAATTGAAACCTCATAACGAATCCAATCCTGTTCGGTTAATCCCCG CAGCCACCTACGCGTGGCTG TGAATTGAAACAGGGGCGTGTACCGCAATCAATTTTAATTATAACCAAG CAGCCACCTACGCGTGGCTG TGAATTGAAACTTTATCTGTTGCGGTCAATTGTATATCTTGAATTTG CAGCCACCTACGCGTGGCTG TGAATTGAAACCTCGTCTTGAATTGGAAAATCAAGGGCGACAATAGG CAGCCACCTTCGCGTGGCTG
>NZ_CP017527.1|WP_006248114.1|1793017_1793311_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MLMLITYDISFDDPEGQARLRRIAKHCLDYGVRAQYSVFECDVTPAQWVTLKNKLLATYNPDCDSLRFYHLGSKWRNKVEHHGAKPSVDIFKDTLIL >NZ_CP017527.1|WP_006248113.1|1791937_1792951_+|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MRKLQNTLYITTQGSYLHKERETLVVEQDRKKVAQLPIHSIGHIFCFGNVLVSPFLMGFCGENNVNLAFFTENGRYLGRLQGRQSGNVLLRRAQYKKSETNPVPVARNIIAAKIQASKRVLQRQIRNHGENADLQSTITALNYSLQQLKTADNLDLIRGIEGDAAARYFGVFSHLIKENSGFHFDGRNRRPPRDGVNALLSFLYSIVGKDISGALQGVGLDPQIGFLHADRSGRDSLAQDILEEFRAWWVDRMVLSLINRGQVKPDDFVTEASGAVTLKPEARKLLFQTLQAKKQEKIIHPFLEEEVEIGLLPYIQAMLLARHLRGDLAEYPPFLMR >NZ_CP017527.1|WP_134916814.1|1791541_1791835_+|DUF3800-domain-containing-protein MQHNKISFEDSVNNSLIQASDVIAGLLAGIGEQIQKYNEQEFYNEFISKLNPNHLENLKLLAQIYQNSIYKSNGLFTHFFAPLSFICRLQNFIFSYK >NZ_CP017527.1|WP_006248111.1|1790620_1791541_+|hypothetical-protein MITSNLERSFHGLNIAQHNYKIFLDESGGNIGKLKHTPNDKKGSNFNRTISSHIGVPPVFVLGGIAQISNANLIAPDWRKLLHLQNKELKFSKIGKNFFNKLGSKELRKVLEWINENNLCIHFALYDWVYFYDVDIIDSALIESDVCSVWKYLSEKIGNSNRYKEIKDYQRKVGLDKQSDDIIYLFYIKELLHDFIINNLQWFLSEIYNNHYKKIDNQEKTVFLDNLYNMIKGSEKYKVLEFFLEKIDRNKYLSFIYDKLDSEMNEDKTFIMLVEDMSPPYQNYLNTFPLSEFYFDKGMEHVFIDY >NZ_CP017527.1|WP_006253509.1|1789919_1790594_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MGDLQNSAEILPLVQPKFGDDKRSISLSALQHYAFCPRQCALIHNEQVWAENYLTAQGQALHERVDSGEPEVRKGIRFERTVHVAAEKLGISGILDLVERDLKTGELKPVEYKRGKPKLDPIDEIQLCAQALCLEEMTEQTINEGALWYMQTRHRLPIIFSTELRTKTLATIAEVRSLLDSGTTPPPEYSKRCKACSLIDLCQPKLLERDRSKGYVVGVFGSLL >NZ_CP017527.1|WP_006248109.1|1789056_1789920_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2 MSIQNRYEFVFFFDVTNGNPNGDPDAGNMPRLDPETSKGLVTDVCLKRKIRNFIEMSYENEAGYEIYVKEKSVLNLQNKRAYEALGIESEAKKLPKEEAKAREITAWMCKNFFDIRTFGAVMTTEVNSGQVRGPVQLAFAQSIDPIIPLEVSITRMAVTNEKDLEKERTMGRKYIVPYALYRVHGFISAKLAEKTGFSDEDVQKLWQALQLMFEHDRSAARGEMAARKLIVFKHDSELGNQPAHKLFDSVKVERINGEKDTPAKDYDDYCISVQTEGLTGVTVEELL >NZ_CP017527.1|WP_031192850.1|1787265_1789047_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 MITALTRYYYRLAAQEDRLTGEAKVPSYGFSEEKIGWVLELDSKGNLVNVISNLTEDKKPKPKLMSVPRPEKRTSGIKPNFLWDKTAYVLGIESNPDKATAKDQPINFAEKTFEAFKQYHLDLLADSNDEGLMAIRNFLQQWQPTHFAESICPREILDANVVFKLVGTSGYIHQREAAQTLWTSLLINQSDNAEKGLCLISGKLSPIQRTHPPIKGVFGGQSSGGSIISFNKESFTSFGKEQGSNAPVSEQAAFAYTTALNYLLRTEKHRLTIGDASTVFWAEADNTTQAEAAEGFFAALMTPPDDEQENQKIFEELQKISKGRPLAEISPELSENTRFYVLGLAPNAARISVRFWLDTTFGQLAKNLSEHWQDLALEPCPWKTPPSIWRLLLQTASLGKSENISPVLAGEMARAVISGHLYPMSLLSQLVTRIRADGDINGLRVALMKAVLQRKFRKGFIKEGVPMSLNKESDNQAYLLGRLFAVLERIQSQALGELNAGIADRYYGSASAVPFSVFPRLLSGAKHHLSRLRKDKGGMAVNLDKDLGEIIASLPENFPRHLSIDEQGRFAIGYYHQKQSYFAKKETTESIEN >NZ_CP017527.1|WP_006248107.1|1786566_1787244_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 MPNKIRLHIWGDYACFTRPEMKVERVSYDVITPSAARGILAAVHWKPAIRWVIDKIYVLQPIQFESVRRNELGSKISASKISGAMKRKTVADLYTVIEDDRQQRAATVLKNVGYVIEAHAVLTKMAGEAETVTKHIEMFKRRAKKGQCFQQPCMGVREFAANFALIDDDEPLPECFLAENERDRDLGWMLHDIDFEHGNQPRFFRAEMKNGVIDVPPFYAEEVKS >NZ_CP017527.1|WP_134983790.1|1784122_1784584_+|hypothetical-protein MFKPHGSLDWFMAGDVPMTSCIGKVEEPLIITPGVGKYKKGYGQPFDAHREKANEAIDSASSILCIGYGFNDDHLQTHLTGKIKSGVKTLLLTRGLSENARNVVKEAPNCKALIFDGDKAGTRVVSKQEETFIPNVHWWDVEFFVKEILENGK >NZ_CP017527.1|WP_006253506.1|1782827_1783964_+|transposase MLLRKAFKFEIRPNGEQVRKMKQFCGCSRFVFNKALAWQNEQYEQDNHHKFSYTKLANLLPQWKKELVWLKDCHSQVLQQSLKDLESAFKNFFQKRADLPKFKKKGVKESFRFPQGCKIEQKNDRLYLPKIGWVRYRNSREIVGEVKNVTVSMKCGRFFVSIQTEFKQEIPTHKGGEIGIDMGIARFATLSNGEFFEPLNAFKTHKGKLAKLQKQLKNKVKFSKNWQKLKDKIGKLHHKIANCRKDFLHKISTQISKNHAMIYVEDLQVANMSKSAKGTAEVHGKNVKQKSGLNRVILDQSWFEFRRQLDYKTQWLGGFLLAVPPQNTSRTCPCCNYTAKENRQTQENFECVECGYTENADVVGAMNVLTRGQAIVQA >NZ_CP017527.1|WP_006248118.1|1794653_1796129_+|ribonuclease-G 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>NZ_CP017527.1|WP_006249176.1|1805569_1806199_-|tail-assembly-protein MITVKFYGHLKTFGTDFKILVKDIAEAIRALCSQLKGLREALRDGVYKVRIGKQYLDPSALEKGLFYCLKKGQTIHFTPVVKGAKSGGIFQAVLGVALIGAAFALGPIGLGLVGSATAMTVGAMGASMLLGGVSQMLTKMPKAPTMGNETEKESSTAFSNLNNLVAQGKPVPLAYGLIRTGSLVISQGVETITIKENQPASNKKTGFRK >NZ_CP017527.1|WP_020828760.1|1806467_1807199_-|C40-family-peptidase MELEQQIIDYALQHEPHEMCGFVVFDGNKNRFIPCENQAEDKANYFEISDLDYIKAEEKGELVAVVHSHPEPNGKPILSVLDRKMQVQTGLDWWLVHNRQIHKFRNVPHLIGREFKHGTMDCYTLYRDAYMLAGYEMDEFERQDDWWHTGQNLYLDNIQGQGFERVETPQIGDVILMQVGADVPNHAAIYIGEQMVIHHSPNRLSKRDLYDGYWLRHTHSIWRHKLADKLDFDGILNDIAVNN >NZ_CP017527.1|WP_006249178.1|1807202_1807919_-|phage-minor-tail-protein-L MPVSISNQMKLDLAKLEQNAMLDLYEVDLRTLKDKSGNAGSVYRFYSGLNELKTSIVWQGRTYDPYPIEATGFERNSSGPSNRPTLTLSNLFGLVTGIANQFDECIGAIVRRHQVYAQYLDAVNFAGGNAKADPNQEIISHFVIEQLSSLTRETATFTLALPIETDNAKIPSRIIMADTCTWIYRSAECGYTGKQYFDEKDKATSDPKADKCSHCLNGCELRGNQRNFGGFVSVNKLG >NZ_CP017527.1|WP_006249179.1|1807918_1808248_-|phage-tail-protein 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|
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NZ_CP017527_3 | 3.4|1793736|35|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder | 1793736-1793770 | 35 | NZ_CP017527.1 | 1335284-1335318 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017527_3 | 3.5|1793803|34|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder | 1793803-1793836 | 34 | NZ_CP017527.1 | 1335587-1335620 | 0 | 1.0 |
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cctataacgagcaatggcattttgatctacggtaaa CRISPR spacer cctataacgagcaatggcattttgatctacggtaaa Protospacer ************************************
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caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcac CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcac Protospacer ************************************
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gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgc Protospacer ***********************************
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caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer *************************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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18. spacer 3.4|1793736|35|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgc Protospacer ***********************************
19. spacer 3.5|1793803|34|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg Protospacer **********************************
20. spacer 3.5|1793803|34|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg Protospacer **********************************
21. spacer 3.5|1793803|34|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg Protospacer **********************************
22. spacer 3.5|1793803|34|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg Protospacer **********************************
23. spacer 3.5|1793803|34|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg Protospacer **********************************
24. spacer 3.5|1793803|34|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg Protospacer **********************************
25. spacer 3.8|1794002|34|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tttaccgtttaccgattggattttaatgctagag CRISPR spacer tttaccgtttaccgattggattttaatgctagag Protospacer **********************************
26. spacer 3.8|1794002|34|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder matches to NC_028743 (Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tttaccgtttaccgattggattttaatgctagag CRISPR spacer tttaccgtttaccgattggattttaatgctagag Protospacer **********************************
27. spacer 3.11|1794202|37|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder matches to KP137439 (Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaa CRISPR spacer aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaa Protospacer *************************************
28. spacer 3.11|1794202|37|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaa CRISPR spacer aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaa Protospacer *************************************
29. spacer 3.16|1793668|37|NZ_CP017527|PILER-CR matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer *************************************
30. spacer 3.16|1793668|37|NZ_CP017527|PILER-CR matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer *************************************
31. spacer 3.16|1793668|37|NZ_CP017527|PILER-CR matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer *************************************
32. spacer 3.16|1793668|37|NZ_CP017527|PILER-CR matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer *************************************
33. spacer 3.16|1793668|37|NZ_CP017527|PILER-CR matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer *************************************
34. spacer 3.16|1793668|37|NZ_CP017527|PILER-CR matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer *************************************
35. spacer 3.17|1793736|36|NZ_CP017527|PILER-CR matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgcc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgct Protospacer ***********************************.
36. spacer 3.17|1793736|36|NZ_CP017527|PILER-CR matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgcc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgct Protospacer ***********************************.
37. spacer 3.17|1793736|36|NZ_CP017527|PILER-CR matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgcc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgct Protospacer ***********************************.
38. spacer 3.17|1793736|36|NZ_CP017527|PILER-CR matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgcc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgct Protospacer ***********************************.
39. spacer 3.17|1793736|36|NZ_CP017527|PILER-CR matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgcc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgct Protospacer ***********************************.
40. spacer 3.17|1793736|36|NZ_CP017527|PILER-CR matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgcc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgct Protospacer ***********************************.
41. spacer 3.18|1793803|35|NZ_CP017527|PILER-CR matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgg Protospacer **********************************
42. spacer 3.18|1793803|35|NZ_CP017527|PILER-CR matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgg Protospacer **********************************
43. spacer 3.18|1793803|35|NZ_CP017527|PILER-CR matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgg Protospacer **********************************
44. spacer 3.18|1793803|35|NZ_CP017527|PILER-CR matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgg Protospacer **********************************
45. spacer 3.18|1793803|35|NZ_CP017527|PILER-CR matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgg Protospacer **********************************
46. spacer 3.18|1793803|35|NZ_CP017527|PILER-CR matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgg Protospacer **********************************
47. spacer 3.21|1794002|35|NZ_CP017527|PILER-CR matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tttaccgtttaccgattggattttaatgctagagg CRISPR spacer tttaccgtttaccgattggattttaatgctagagt Protospacer **********************************
48. spacer 3.21|1794002|35|NZ_CP017527|PILER-CR matches to NC_028743 (Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tttaccgtttaccgattggattttaatgctagagg CRISPR spacer tttaccgtttaccgattggattttaatgctagagt Protospacer **********************************
49. spacer 3.24|1794202|38|NZ_CP017527|PILER-CR matches to KP137439 (Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaag CRISPR spacer aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaat Protospacer *************************************
50. spacer 3.24|1794202|38|NZ_CP017527|PILER-CR matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaag CRISPR spacer aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaat Protospacer *************************************
51. spacer 1.1|915063|29|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder matches to MH791397 (UNVERIFIED: Enterococcus phage EfsSzw-1, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
agacctgatactaatctagggtataaaga CRISPR spacer aaacctcataataatctagggtataaggc Protospacer *.**** *** ***************.*
52. spacer 3.5|1793803|34|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder matches to NC_047750 (Mannheimia phage vB_MhM_1127AP1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.824
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer ttctagccgttgctaccgtggtgcagtgcttgcg Protospacer . .********.************.********
53. spacer 3.5|1793803|34|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder matches to NC_028898 (Mannheimia phage vB_MhM_587AP1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.824
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer ttctagccgttgctaccgtggtgcagtgcttgcg Protospacer . .********.************.********
54. spacer 3.29|1793657|48|NZ_CP017527|CRT matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.875
----cgaattgaaaccaccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer gtcaccattt----ccaccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer * * ** **************************************
55. spacer 3.29|1793657|48|NZ_CP017527|CRT matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.875
----cgaattgaaaccaccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer gtcaccattt----ccaccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer * * ** **************************************
56. spacer 3.29|1793657|48|NZ_CP017527|CRT matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.875
----cgaattgaaaccaccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer gtcaccattt----ccaccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer * * ** **************************************
57. spacer 3.29|1793657|48|NZ_CP017527|CRT matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.875
----cgaattgaaaccaccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer gtcaccattt----ccaccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer * * ** **************************************
58. spacer 3.29|1793657|48|NZ_CP017527|CRT matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.875
----cgaattgaaaccaccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer gtcaccattt----ccaccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer * * ** **************************************
59. spacer 3.29|1793657|48|NZ_CP017527|CRT matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.875
----cgaattgaaaccaccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer gtcaccattt----ccaccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer * * ** **************************************
60. spacer 3.34|1793991|46|NZ_CP017527|CRT matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.87
----tgaattgaaactttaccgtttaccgattggattttaatgctagagg CRISPR spacer agcgtgattt----ctttaccgtttaccgattggattttaatgctagagt Protospacer *** ** ***********************************
61. spacer 3.34|1793991|46|NZ_CP017527|CRT matches to NC_028743 (Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.87
----tgaattgaaactttaccgtttaccgattggattttaatgctagagg CRISPR spacer agcgtgattt----ctttaccgtttaccgattggattttaatgctagagt Protospacer *** ** ***********************************
62. spacer 3.18|1793803|35|NZ_CP017527|PILER-CR matches to NC_047750 (Mannheimia phage vB_MhM_1127AP1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer ttctagccgttgctaccgtggtgcagtgcttgcgg Protospacer . .********.************.********
63. spacer 3.18|1793803|35|NZ_CP017527|PILER-CR matches to NC_028898 (Mannheimia phage vB_MhM_587AP1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer ttctagccgttgctaccgtggtgcagtgcttgcgg Protospacer . .********.************.********
64. spacer 3.37|1794191|49|NZ_CP017527|CRT matches to KP137439 (Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.857
tgaattgaaacaggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaag CRISPR spacer ttaatattttcaggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaat Protospacer * *** **************************************
65. spacer 3.37|1794191|49|NZ_CP017527|CRT matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.857
tgaattgaaacaggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaag CRISPR spacer ttaatattttcaggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaat Protospacer * *** **************************************
66. spacer 3.30|1793725|47|NZ_CP017527|CRT matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.83
cgaattgaaacgtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgcc CRISPR spacer ctacggcattcgtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgct Protospacer * * * ************************************.
67. spacer 3.30|1793725|47|NZ_CP017527|CRT matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.83
cgaattgaaacgtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgcc CRISPR spacer ctacggcattcgtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgct Protospacer * * * ************************************.
68. spacer 3.30|1793725|47|NZ_CP017527|CRT matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.83
cgaattgaaacgtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgcc CRISPR spacer ctacggcattcgtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgct Protospacer * * * ************************************.
69. spacer 3.30|1793725|47|NZ_CP017527|CRT matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.83
cgaattgaaacgtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgcc CRISPR spacer ctacggcattcgtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgct Protospacer * * * ************************************.
70. spacer 3.30|1793725|47|NZ_CP017527|CRT matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.83
cgaattgaaacgtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgcc CRISPR spacer ctacggcattcgtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgct Protospacer * * * ************************************.
71. spacer 3.30|1793725|47|NZ_CP017527|CRT matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.83
cgaattgaaacgtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgcc CRISPR spacer ctacggcattcgtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgct Protospacer * * * ************************************.
72. spacer 3.4|1793736|35|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder matches to HM144385 (Brochothrix phage NF5, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgc CRISPR spacer atcgaccagtaacacgaccagatgttgataattat Protospacer .* * *********** ******.****** ...
73. spacer 3.31|1793792|46|NZ_CP017527|CRT matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.783
cgaattgaaaccagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer gctaccttttccagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgg Protospacer *.. ***********************************
74. spacer 3.31|1793792|46|NZ_CP017527|CRT matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.783
cgaattgaaaccagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer gctaccttttccagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgg Protospacer *.. ***********************************
75. spacer 3.31|1793792|46|NZ_CP017527|CRT matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.783
cgaattgaaaccagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer gctaccttttccagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgg Protospacer *.. ***********************************
76. spacer 3.31|1793792|46|NZ_CP017527|CRT matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.783
cgaattgaaaccagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer gctaccttttccagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgg Protospacer *.. ***********************************
77. spacer 3.31|1793792|46|NZ_CP017527|CRT matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.783
cgaattgaaaccagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer gctaccttttccagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgg Protospacer *.. ***********************************
78. spacer 3.31|1793792|46|NZ_CP017527|CRT matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.783
cgaattgaaaccagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer gctaccttttccagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgg Protospacer *.. ***********************************
79. spacer 3.7|1793935|35|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder matches to NC_014534 (Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782202, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
ttaaatctaaagctaaagctattttattaattaaa CRISPR spacer cccgatctaaagctaaaattattttattagattgg Protospacer .. .*************..**********. * ..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
44670 : 51997
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017527|44670:51997|DBSCAN-SWA 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AATCTCCGAGCGTACTTTTGCCACAATACGGTGGGAGTTTTTCGCACGAGGGAAACGCAAACGCTGACGGGTTTGGATTGCCTTACGCACATAGTCAAGCGTACGAATGGTGGTTAAATCCAAATAGCTTGGGTCATCAGTATTCGTCACGTTTTTGGTGTATGTAGTAATCGCACGGGTAATCTGCACACGGCTTGCCACCACCTCAATCGGGCTTAAACCGTGATATAACGCTTGGTTTACTTCGCTAAATAACGGTTTCTGCGAGTCATCTACGACCGTTAAGCCTTTAACTTCAAGGGTATTTAACGGGCGAGCCGGATCTTCTTCACCGGCAATTTCCGCCCTTGTTGCACCACATAATCGGGCAACTGCTTCAAGGCATACCGAACTTGGCTCTCTGTAGGTAAATCTTCGCCCTCATACTGCATTGCAAATTGAGCATAAGCCTGTGTGAGTGCCACATTGCTAAAGGTTTGATAAAACGGCAGAAAGGCTTGCAACCAACCACACCGCTCGGGCACGGCACGTTTTTGTGTTTTCAGCGGTATCATCTGTTTTAACCGTTCCGCTGAATTTTCGCCTGCCTCATACGCCAGCACCCAACTATGCAAGGTGCGTTTAGATAGCTTTAACTTTCCACCGGCTTTACTATTGCCCGCCATAATCGCTTTGCAAATTTCAGCAGGAATTTCACTGCTTGCCACCGCTGCAATGACTTGGTCTAGCGTTTTTGTGCGGCTTAGCCCCAACTGCACTTCCTGCATCAAGAACCACCGCACCACCATAATGCGAGCATCTGCCGTAGAAAGTTGTTTATCGGTTATCTGCTCCAAATCAATGTTTTGTCGCACTACACTCAATTCGCCTTTGCTGATTTCAGCAGGAAGAAGTTTGAGTAACTTGGTGCGGATTTCCTGTTGGACTTCGGTGGGTAAACTGATTAATTCATATTCAACCCCGCCGCCTCTGCCTTTGCGTTTTTGAGATTGCCAGTTTTCCCTTATTGCTTTCTCAAGCACATTTTTATGAGCACTTGGTAGGCTAGATAACTTAAAACTTAACAATTCAGCCACTGAATAGTGCGTTTTTAAACTTAATTCGCTCATAAATGTTCTTCTCCTATATCTTTTACGTTAAAGATCATTTATGATTAAAACTTATTAGTTAAAGTTGGTCGCCGATTACGTTCAATGCGTTCTGCTGTTCGCCCAGCCCAAATCACTTCAGGGGCAACCCCTATGGCATTTGCAACTAAGCGTTCCATTTTGGGGTAAGGCTTGTCTAAAACAGACTTCAGCGTGTTATGGCTAACATTGCCTGCTTTAGCCAAAGAACGAAGTGACCAACCTTTTTTACGAAGTTCCGCAAGAATATCGGCTTTATGCCAATCTCTCTGTGCGGTTTTTTTAACATCGTTTAATACACTCATTCGATACACCTCTTTTTATCTATTTGATGCGTGTATTTAACCGTAAAACTTTAAACAAATCAACCGTAAAACATAAAAACATCTAAAATATTTTTGCTTTATTCATAAATAACTTAAAAATCAATGGTTTATGAGTATGTTTTGCGAGTAAAACTTTATTAATGGAAACGTAAAAGATGAGTAAACCAAACATTTACGATGAGAGCTTCTCAGAAAGAATGAAATGGATTGCAAAAAATAGCTTTAAGGACAATTACAGTGAGTTTGCAAGAGCAGTGGGGGTAGCCCAAGCATCACTATCTAGGTGGGTAAAAGGAGAGGCAGATCCATCTCGTTCAAATCTTGTAAAAATAGCAGAGGTGTCAAATGTGAGCCTTGAATGGCTGGCAACAGGTAAGGAAAGCAAACCACAATCAGAGAATACCAGTATTGTGGCAAGAGAGTTTGAGCGACTAGAAAAAATGGCTGATGATATTGTTTCAATGATTAACAGCTTCAGAACAATCAACGTTTCAGCAGGCTTTGGCAGCTTTAACGAGGGCGTAACGAAGCCAGACGGGCAAGAACCTTACGCCGACAGCCTGCTGCAAAGCCTCGGCGTAAAAGCCCACAACTGCGGCGTGTTTTGGGCAAATGGAACATCAATGCACCCTACCATTGCAGACAGTGACCAAATGCTGGTAGATTTCAGCAAACGAGAGCCTCGTGGTGATGATAAGATTTATCTTGTGCAGAATGGGGAAAGCGTATGGGTTAAACGGATTAGAAAAGAATGGGACTATATTGAATTAATTAGCGATAACGAGTCCTACCGCCCAATACAGATTACCGCCGAAGAAGCTCAAAACCTCCAAATCATCGGGCAGGTAGTCCACATCGGACACTCTTTAGTTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017527|44670:51997|48524_48713_-|WP_006251296.1|DBSCAN-SWA MILLSKFAITAEQVWQMPLLEVFAWIESYLESEGVKTPHSPMGANSEVKRESYVFTRCGKIE >NZ_CP017527|44670:51997|48742_49111_-|WP_006253443.1|DBSCAN-SWA MKITLNLGIEYNGKIRRDCTVRLLTMGGQCTAQEMIADLGFEENSEALSKREQTLVDMAYLSQQVTFDGIYQGNVTAQFLFDNLATEDYWQLIEATLTLRKKRLENGVSQSESESPANPDLA >NZ_CP017527|44670:51997|47476_48472_-|WP_006253442.1|tail|DBSCAN-SWA MAKNMKVQLELTAKDTASPVLNQAAKTAEKAFKNTERAAQKSGNAQTQAAQKAANATESSNRKIEQSYRNARRVAADVSRARETLGVRAENAIQREIEQTRAAYDRLKRSGVASQNELRRASEATKQRVRELNAELGKTSFGDKAKGFGRGLMSAGVGIAAGAAMARQPAKNQMEFDRQLAMASNTAFSDRDVKGRIEGKKELLAAVQEAVKVGGGTKEDALLTLDTLIASGTMKAETAMSLLPTLQKGAVATGASSEDMAKIAISSMQQFGIKEEDIGRALDMAVAAGQAGNFELADMARWLPQQMAAGNTARHWAVYYRLYRMTQTADG >NZ_CP017527|44670:51997|46970_47528_-|WP_006253441.1|DBSCAN-SWA MGGLLPPVSYDPNGRWLALSLEVEGRELDRIDARAKTLIDAVDVSTGIFIDDWERVCGLTANSSLPLETRIERVIAKLNQLGGLSIGYITQVAKELGYCIKISEPQPFIAGLSRAGDMLWHKDIMWTFFVDVCNPTDDYKRFRASVSMAGDALMGRYKDPILESLLEEVKPAFSRVWVRYLGDIE >NZ_CP017527|44670:51997|49110_49485_-|WP_006253444.1|DBSCAN-SWA MSIVYEGSCVLEVDGVEIEITKLDVKTVTGRKLVKTMNSSGRARGYSQGIAEYTLSVTAVEPQDGSVIDWDNIKNAKLTKYPLDNSEKRTSYLGCFTTDVSESYTVDGESVRDIQLNALRKVNE >NZ_CP017527|44670:51997|49974_50778_-|WP_006253446.1|transposase|DBSCAN-SWA MSELSLKTHYSVAELLSFKLSSLPSAHKNVLEKAIRENWQSQKRKGRGGGVEYELISLPTEVQQEIRTKLLKLLPAEISKGELSVVRQNIDLEQITDKQLSTADARIMVVRWFLMQEVQLGLSRTKTLDQVIAAVASSEIPAEICKAIMAGNSKAGGKLKLSKRTLHSWVLAYEAGENSAERLKQMIPLKTQKRAVPERCGWLQAFLPFYQTFSNVALTQAYAQFAMQYEGEDLPTESQVRYALKQLPDYVVQQGRKLPVKKIRLAR >NZ_CP017527|44670:51997|51277_51997_+|WP_006248970.1|DBSCAN-SWA MSKPNIYDESFSERMKWIAKNSFKDNYSEFARAVGVAQASLSRWVKGEADPSRSNLVKIAEVSNVSLEWLATGKESKPQSENTSIVAREFERLEKMADDIVSMINSFRTINVSAGFGSFNEGVTKPDGQEPYADSLLQSLGVKAHNCGVFWANGTSMHPTIADSDQMLVDFSKREPRGDDKIYLVQNGESVWVKRIRKEWDYIELISDNESYRPIQITAEEAQNLQIIGQVVHIGHSLV >NZ_CP017527|44670:51997|44913_46974_-|WP_134983781.1|tail|DBSCAN-SWA MKQVMNPINTPTQRFKDGNPATGEYGTIVTAEFLNNVQDSVINTQQELHSVLAEAGIEANDEQVNQVAKAIKKIAGDATRDNFNALANPDGYKHIGRCKSVAELRTIRPTEHGQRILVDAYYEDGTTGGGEFVADLQDLVTPDDGGVCFVVNNNGGRWKRVDLSHLTLFDFGAVGDGVTNDESAFVNAMRYSQFFIENGTFRINNAVNSVRDNVQILGNKTGKLVLGAGIQQAEAEVFNINHSNYFISGFCIETPNKAIGIRFKSLDDAGVKNLHIDNVVFNGTFYGVRAGESIQADTNYPTDNVIVQNCQSYCGSGNAGHYLCTKVKGVRFFNNIAIGGRNVSAYGATSCSDIFILGNREQGMAVTTVDVEAGVQVEDVQTGECVVANNICSHDIWMSGAKNAIINSNLCRRLRVTSGNPTDTGSNNVEFSNNQAKSIAISKYGSFDNPSLFIDNINFINNILEPSEFNQDVYIDGTILKQCQFINNRCISKSKQYSVRLARNNPCLNLTFKSNKLSDNPAIISGKQGVIFCDDLSLGVNKHRLRLRFSSPINFTVNQEWQKMPFDRVLNDINGHVDIVSGQFIARTGGTFHLKGKITVTNSSEDVLNLYQLRLLINNEEKERLINQSVSPKNSKSNTNGMTTINFDTVVYLKVGDIVDLQYKTTHELTLLSDSFLSQIYVTQEF >NZ_CP017527|44670:51997|50822_51101_-|WP_006248972.1|DBSCAN-SWA MSVLNDVKKTAQRDWHKADILAELRKKGWSLRSLAKAGNVSHNTLKSVLDKPYPKMERLVANAIGVAPEVIWAGRTAERIERNRRPTLTNKF >NZ_CP017527|44670:51997|44670_44913_-|WP_006248673.1|DBSCAN-SWA MTKKHYCTGWRNAPANINSCCHQHDRDYGIKGTVSRAEADKRLRHCLISQGNPIKAWVFWVVVRLFGWIYYKEKNINGKS |
10 | Mannheimia_phage(80.0%) | transposase,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
575271 : 659230
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017527|575271:659230|DBSCAN-SWA TTTAAATCATCTCGTGTCCAATGTACACAACCTGCCCGATAACCTCAAAATCTAACGTTTCATCAAAAATCACATCAATAGGGCTGTATAGCTCTTTATTATCGCTGATTAAGCGAATACCGCCCATAATGCCTTGCACACGTTTAACCCAAAGCTGCTCGCCTTGGCGGAACACATAAATTTTACCGTCTTTAGGCTGGGTGGTGGCTCGGTTTACCAATAGCATATCGCCATCACTGATGGTTGGGTACATTGAATCACCTGAAGCGGTAATAAATGCAAGATAGCTCAAATAGAAGCCACGCACATCTAGCCATCGTTTACTTAGCCCAATATAGTCATCAGGGGCATACACCTCGCTATTGAAAGCACCAAAGCCTGCTGAAGCCTGTACATTATAAAACGGCACACGTTCCATTTCATCTGCAGTTTGGGCTGCCACTAATGTTCTAGGCTCTTCTTTTACTGCCGTTTGAGCAAAGCCTAACTCTTGCTGCACGCTTATTGGGAGAGAGCTGTAGTGGTATTCAAAAGCAACCCCCCTTTTTCCCTCTATTTGTCTTTTGAGCCAATTATTTTTGGTAGCTCTTCTTGTTACATTTGATGGTTGTTCAGGTAAATTTCCCATTCCAGCTACTTCAGATGCCGTAAACCATTCCTTTCTAATTATAGAATTCATAAAACCCCTTTTGAATTCAAGTGGAATTCAAAAAAATTTACAAACAAATTCTCTTGAAAATCAATTAGTTAATTAAATAAAACCGAAAAACACTAAATTCTTTTGAATTCTCTTATTGAATTCATTTGGAATTCGCTATATTATTCGTTCTGTAGTTAAATGATTTACATCATTTAAGTAGTTTCTAAAACTAACTTTCAAGGATCTCACAAAATGGCAAGAAATAAAAGAGTTCGAGATATGAGTAATTTCGAAATTCGTGGTGAGCTGATGAAAATCGGTAAGTCCTTATCTCAGTTAGGTATTGAGAATGGATTAGCAAAAACCACAGTTCGTAATGCGTTAGATAAGCCATATCCCAAAGGGGAGCAAATTATTGCAAAAGCGATTGGTAAAACACCGCAGGAAATTTGGCCCTCTCGTTACGAATAAGGAGCTTTTATGAAGGAATGGTTTTTAGCCAAAGAAATCGCAGGATTATCTGGAGTTCCAGAATTACCGAATAGCGTTTCAAGATTGGCAACCAAAGAAGGATGGCAAAAACGACAAATTCAAGGTGTAAGAGGTGTTACTTACGAATACCACCTCACCAGCCTACCCATTGAAACCCAACAACAACTTAGACTAAACGCCGCCCTTGCGGTAATACCGCAAGCGGCAGAACTACAACCCAAACGAGACGACCCCGCACTTATCGCAAGGCTCAATAATGCCACCGATAAAGGCAGGGATAAAGCAAAAGGCAAGGCAGAAGCCTGTATGCAGTTGCAAGCCTTTCTCGACCAAGGGTTTAGTTATACGCAGGCAGAAGCGGGAGCGGCAACCGCTAAAAATGTGTCGCAAGGTTCTTTAAAAAATTGGTACTACAAAGTGAAAGGTCACCCCGTCCATTTATGGCAGGCGATCTTAATTTCCGAAAGCGGTAGGAGTAAAAAGCCGCAGCTGAAAGCCAAGATTACTGAAGAAGCGTGGGACTGCTTTTTGGCGGATTACCTCCGCCCTGAAAAGCCGGATTTACGGGCAAGTTACCGCCGAACCCAAGCCATCGCCAAGCAATACGGCTGGCAAATGGCAAGTTTACAGACTTTCCAACGCCGAGTGTTGGCGGAAGTGCCTTACGAGGTGATTTTGCTCAAACGGGAAGGAGCAAATGCGGTTGCCAAGTTAGTGCCGGCACTACAACGCACGGTGAAAGATATTCTCGCAGGAGAATGGATTAACGGCGATGGCTATCAACACAATGTGTTTGTGAAATGGCACACCGGCGAGATTGTCCGCCCTAAAACGTGGTTTTGGCAAGATGTTCGCACCCGCAAGATTTTAGGTTATCGAACATCGATTTCGGAGAATACTGACAGCATACGCCACGCATTAATGGATGTGATTTTTAACGTAGGCATACCGAAAACGCTCACGCTGGATAACACCCGAGCAGCAGCGAATAAGGCAATGACCGGTGGTATTGAAAACCGCTACCGCTTTAAACATACCGAGTTAGACCCGAAAGGCATTATGCCGATTTTAGGGATTGATGTGCATTTTACCTCAATTCTTTATGGTGAAGGACACGGGCAAGCCAAGCCGATTGAACGTGCTTTCGGGCGAGGCGGAATTGGCGAGAAAATAGATAAACGCCCTGAATTAAGTGGTTTCTATACGGGCAGAAATGCACAAGAAACCCCTGATAACTATAACGGCGGTAAAGACGGTGTGGATTACAACACATTCTTGAAAGCCATAGCAGCAGGGATAGAAGAGTACAACTCTCAAACCGAACGCCATACCGAAATGTGCCGAGGAGAATTGAGTTTTAACCAAGTTTGGGAGCGGGATTACCACCCAAGCAACGTAAGACAAGCCAGCCCTGAACAGTTGCGGTTACTGTTCTTACAGGCAGAAACGGTCAGCATTAAACGCAACGGCAGTTTTACGCTGAAAGCAGCCGGCAAACTTTACGGCTTAACTAACGTTTACTGGGCAGAAAGCCTGATAGGGATAACGGATAAGAAAGTAGTGGCACGGTTCGACCCCGATGACTTACACGGCAACGTGTATGTGTACAACCTAGAGGGGCAATTCTTAGCCGAAGCGGTTTGCCGAGAGGCGAAAGGATTTGGTGATACCAGTGCAAGCCGTGAGCAAGGTCGCTTATATCAGAAAGTAGTGAAAAGTGCCAAAGCTCAAGCCGAAGCCCTTGAATTACTGGAAGCTCACGAACTGGCAAGCCTCGCCCCACAAGTGGACGTGCCTGAGCCGATAGAGAAGAAGGTAAAAGAGGTGCTGGTGAAAGAAGATTTTATCGTGGATTTCAACACTGTGCGTAAAGCAACGGTGGTGGAAGAAACCGAAGAGATCAGTATTTTTGATGAAGTGTTACTGAAACAAGAGAAACAACTTCGCATAGTGGAATAACTAGCGGTCAGTTTTTGCAAAAAATTTGCAAATTTTTCTAAAAAAACGACCGCTTGAAATGAGATTTAAACAGGGTTTAAACGCCTTTAAGGAGTAAAAAATGACATTAACAGGGCAAGCTTACCGAGTGATTTTCAAGGAACTCAAAGAGCAACAAGAGAGTGAATTTGAACAGGCTTTCAAGAAAGGGATTGCCAAAATTCAGCAGAATCAAACTCAGGAATCCATTCTGGTAAACCGTGATATGTTTCAAGCTGAAAAGCTAACACTGCTTTCACAAAAGTTGGAAGCGGTTGAGCAATTACTTCGCCTTGAATTAAATCAGCCGAATTTTCAAGCAAAACTTGAAGACTACGCTGACGCATTACGAACAACCATTTTAAGTAAAGTAGCCAAATAAGAGCTTTAGACTCTTGAAGGCTTAACATCTGAGCCACTTTTTTTACTGTCGGCATTATACCGTCAAGATCATCAATAGAAGTTAAATGATGAAAAGAGGAATGGTATTCAGCTAAACAAAAATTGATTGTACTAAGTTTAAACAAAGTAATGCAATTTTTCATCACGATGGCATTTGCTCGTTTTAACTTAAAACCAGAGAAGGTTGCACGAGCAGAATCAAGGGCTATTTGATGAATTTCATCATCTGTTAAAGAACGAAAGAGCATAAAAACCTCCAAACAAAAACAGGACACCATTATGACATTAATCGACCAAATTAAACAACACATCGCCGAAAGCGGCAGTTCTCAGGGGAAAGTTGCCAAAGAAGCCGGGATTAATGCCGGGGCGTTATCGGCTTACCTGAATGAAAATTACAAAGGCAATAATGAAGAACTTGAAGCAAAGCTGATTGCTTATTTAGAGCGTATTGAGGCGAAGAAAAGAGAGTTTGTCGAAGCTCCGAGTTTTATTGAAACCAAAACCGCAAACCAAATTTTCGGTTCGTTACGATTTGCTCAAAATACTGGCGTGCTTGCCATTATTCACGGTGCGAGTGGCGTGGGTAAAACACAAGCGGCTAGAGAGTATCGTAAACGCTATGCGAATGTATGGTTGGTTACCGCAAGCCCTTCTCGTTCCTCATTAAGTGAGGTGTTATATGAAATTGCTCTTGAACTTGGAATGAACGATGCACCACGCCGCAAAGGGACATTGGCTCGTTTAATTGTTCGCAAAATGAAAGGCACAGCAGGTTTATTAATTATTGATGAAGCAGACCATTTACCTTACGAAGCCTTAGAAGAATTAAGGCTGTTACAAGAAGAAGTAGTGAATGAAAGTGACATCGGAGCTGGTGTTGGCTTAGTGCTGATTGGCAATGACAAAGTCTACACCCGAATGAAAGGCGGAATTAACCCTGCTCACGAATATGGGCGACTTTGGTCACGCAGTGCCAAACGCACCAGTATTCAGAAAACCAAAAAAGAAGATACCCAAGCGGTAGCCAAAGCGTGGGGGTTGAGTGAAAACCAAGAAGCACTCAAGGTAATGCAAGCCATTACTGAAACTGGTGGCGGATTACGGATTCTGACACACACCTTACGATTAGCAGCGATGGTAGCAAAAGACCGAATGATTCCCTTAACTGCCGATTTAATTCAGCTCGCACGTAAAGATTTACTCTCAACAGGAGATTAACAATGAGAACCCCAAAACCCAAACACAGTTTTAACCGCACCAACCAAGCAGCGTGCCGTTTTTTAAAACAAACCCAAAAGGCAATTATCCGCTTAAACAGTCTTGGCTTTACGGTGCTGAATATTGATTTTACCCGTATTAAGCCCCGCATTGAGGTGGAAATCGGCAATAACAAGCACATTGCTCAAGGCTTGATTTATGAGGGTAAAGCCTACCGCTACAGCTTCGGTAAAAGCGAAGATTTAGGCAGATGGGAAGGCTACTACAC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93 | Mannheimia_phage(17.02%) | transposase,tail,protease,plate,tRNA,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
915326 : 971291
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017527|915326:971291|DBSCAN-SWA 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59 | Mannheimia_phage(26.67%) | transposase,integrase | attL 938163:938178|attR 972192:972207 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1071137 : 1077922
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017527|1071137:1077922|DBSCAN-SWA TATGACAGAAAAATCGCAGTTAAACTTTAATTACCAACCTTCGAATAATCATGCTAATGCTCAGACGATGATCTTCTTACATGGATTGTTTGGAGATTTAAATAACCTAGGCGCAATAGCAAAACCATTCGCAGAACGTTACTCCATTTTAATGGTTGATCTCAGAAATCACGGGCGATCTTTTCATTCAGACGAAATGAATTATGCTTTGATTGCACAAGATTTAGCACAATTACTCACAGAATTAAATATCCAAAATGCTATTGTGGTTGGGCATTCAATGGGCGGAAAAAGTGCGATGGCATTGGCTGCATTTGCTCCTGAACTGGTGGAGAAATTGGTAGTGATTGATATTGCCCCGGTCACTTATACCCAAAATCGGCATCAGCAGGTTATGGCAGCCTTATTTGCGGTGAAAGAAGCTAAACCCCAGAATCGTCAGCAAGCTAAAGCGATAATGGCTGAATATATTCGAGATGAAGGCGTGCAACAGTTTATGTTGAAATCTTTTGATGCCCAAAGCGAGCAATCTTTCCGTTTTAATTTACAGGCGCTAAAAGATAATTATCAGAATGTGATGGGGTGGCAGCAGGTATTTGTGGATAAACCGACCTTGTTTATTAAAGGTGCATTATCGGATTATATTCAAGCAGAGCATACACAAACGATTTTGGCACAATTTCCGCAGGCCAAATCTTTCATTGTGGCAAACGCTGATCATTGGGTTCACGCAGAAAAAACAGGAACTGTTGTGAGAGCAATCAATAAATTTTTAGAAAAATAAGGGAGAAAAATGCAAAGAGATACATTATTTTCCGCTCCGATTGAGAAATTGGGCGATTTTACTTTTGATGAATCGGTTGCTGAAGTGTTTCCGGATATGATCCAACGCTCCGTGCCGGGCTATTCCAATATTATTACTGCTATTGGAATGTTGGCGGAGCGTTTTGTCACAGATAATTCAAATGTTTATGATTTAGGTTGTTCACGAGGCGCAGGGATTTTATCTATTCGCCGTAATGTGAATGCGAAGAATGTGCAGATTATCGGGGTAGATAATTCTCAGCCGATGGTTGAGCGTTGTAAAACCCATTTAAGTGCTTATCACTCTGAGATCCCGGTGACGATTTTACTTGATGATATTCGCCACATTGAAATTAAAAATGCTTCAATGGTGGTACTTAATTTCACCTTGCAATTTTTACCAAGAGAAGATCGCCTAGCATTATTACAGAAGATTTATCAAGGATTAAATTCCAATGGCATTTTAGTGTTATCGGAAAAATTTACCTTTGAGAGTGAGGAAATGAACGAGCTATTGATCGACCTTCATCACACATTCAAACGAGCAAATGGCTACAGTGAATTGGAAGTCAGCCAAAAGCGTAATGCTTTGGAAAATGTGATGCGAACAGATAGTATTGAAACCCATAAAAAACGTCTGCAAGAAGCTGGTTTTACACAAGTTGAACTTTGGTTTCAATGCTTTAATTTTGGCTCAATGATTGCAATTAAAGCCTAACAAGCGGTGATATTTGTAAAATTTTTTGCAAATTCTTGATAAAAAGCAACCGCTTGCATTCTATCTATTTCTTTATAATAAAAGTCAGTTAGAATCAGTTATAATGCACCACTACTTATTTAGGAGGAAAAAGGTATGGCAACGATAAAAGATGTCGCAAAATATGCTGGTGTATCGACTACAACGGTTTCTCACGTTATAAACAAAACCCGCTTTGTAGCAGAGGACACTACAAAAGCAGTTTGGGAGGCTATTAAAGCGCTGAACTATTCTCCTAGTGCTGTAGCGCGGAGTTTGAAAATTAATACGACTAAATCTATCGGTATGATCATTACAACCAGCGAATCACCGTTTTTCGCTGAAATTGTGTTAGCGGTAGAGGAATTTTGCTATAGCAAAGGGTATTCACTATTTTTGTGCAATACTCAAAACAAACTTGAGAAAATTCAAAATCATTTAGATATGCTCATCAAAAAACGGGTTGATGGCATTTTGGTGATGTGCTCCGAATATACAGCTAATTCATTTGATATCTTTGAAAACAGCAATATCCCAATGGTGATTATGGATTGGGGACGAAGTGATGAACGCAGTGATATTATTTTAGATCACGGTGTTGAAGGTGGCTATATTGCGACTCAGCATTTAATTGAAAACGGGCATCAAGATATTGCTGTAATTACCGGCAATAGAGATAAAGAAATTGCAAGAACCCGTTTTGAAGGTTTTAAAAAAGCGCTATCTGAGGCGGGTTTGTCTATTCGTGAAGAATGGATTCAAGAAGGCGATTTTGAACCTGAGGGGGGGTATGAGTGTATGAATAATTTGCTTAAGAGCAGTGAAAAATTACCAACCGCGGTTTTTTGTTTTAATGACTCAATGGCACTAGGGGCAATTTCAGCTATTACCGAAAAAGGGCTGAATGTGCCGCAAGATATTTCAGTGATCGGGTATGATAACGTGCATAGCTCACGCTTTTATGCACCGCCTCTTACGACAATCCATCAGTCAAAATCTCGCTTAGGCTCGGCAGCATTAGAATTATTATTAGAACGTATTGAAGATAACGAAAACGCAAAAGAGCCTAAAGTATTAGAGTTCTTTCCTGAATTGGTCAAACGTAAATCGGTTCGGAATTTAAACATTAAGGAGTAATATGGAAACATTGATTGAATTTTTTAGTAGCTATGGTTATTGGGCTGTTTTTCTTGTGCTACTTGCCTGTGGTTTCGGTGTGCCGATTCCTGAAGATATTACGTTAGTATCCGGTGGTGTTATTTCAGGATTAGGCTACACCAATGTGCATTGGATGCTGGTTGTTAGTATGTTAGGAGTATTAGTTGGCGATAGCACAATGTACTGGCTAGGTAGAATCTATGGCGAAAAAATTCTCAAATTTCCATTAATCAGGAATGTTGCGACACCTGAACGTTTTGCAACCGTGCAAGAACGTTTTGAAAAACAAGGATGGAAACTACTTTTTATGGCTCGTTTTTTACCTGGCTTGCGCGCGGTGGTTTACTTAGTTTCAGGTATTACCAGAAAAGTCAGCTTCGTAAAATTTTTATTAGTTGATTTCTGTGCCGCTATTATCTCTGTGCCAATTTGGGTTTATTTAGGCGACTATGGGGCATCTAATTTGGATTGGCTAAAAGAACAAGTAGCTAATGGGCAGCACCTCATTTTTGCCATTTTAGGCATTGTTATTCTATTTTTAGGCTGGAAATGGTATAAAAATAAAAAGCAGTATAAAAAGTGAAACAAAAGACGAGCATTTCATCTTAAAAAGATATAATAGCAAAACAGTTGGTAAGAATAATTATAAATATCCATTACCAACTGTTTTTTTGAACTATATTTTAACTTAAAAAATTAGGTTTAACTGTGTCACTTTTTCTTGAAGAAGAACGAAATAACAGTAAGTATTAAAAAGACAAAAAAGAGAATTTTGGCAATTTCAGTAGCACTTCCAGCAATACCACCAAATCCTAATAGCGCTGCGATTATAGCGATGACAAAAAATACGACTGCATAATGTAACATAGTTATACTCCTTACTGTGTAATAAACTGATTAAAAAACTAACATAGTTAATGTATGATTGCAAGGCATGTACTATATTAATCTTGATTAATCCGACTTGAAATGGCACTTTGCTGGTTCTTATATTTTGCATCTTTTCGCGCATTATAGGGTTTTGCAGCATCACCACTTAAAATCTCAAAGCTTAATGCGCCAATTGCCATATTAGGGCGTAAAGCTAGGGGTAATTTTCCAGCATTAAAAAATTCCAATACAATTTTGCCTTCCCAACCCGGATCGATTCTGTGGGCGGTAACGTGTACCATTAAGCCTAATCTAGCAAGTGACGAACGACCATCTAACCATCCAACGATATTGGCTGGTAAGGAAACCGATTCAAGGGTTGTTGCGAGTGCAAGGTCACCGGGATGAAGGAAAAATGCTTCATCATCACCGATGATAATTTCATCACTCATCACTTTATTTAACTGAGCGGCAACTTCTTCTCTAGGGCCACTTAAATCAATATAGGGCGTTTTATGTTCACGAAATACACGAAACGAATTACCTAAACGCACATCTGCAGTGGCGCCAGAAATTTTATCGTCTGAAGGTCGAGGCGTTATGGCAATAATACCTTCATCTAAGTAACGTTTAATATCTGTATCACATAAACGCATATTTAGCTCCTATTTTATTTTAGTAATTGCTTAATTTGTGCTTTAAGAATATCAATGGCAATACGGTTTTTGCCACCTTTTGGCACAATAATATCAGCATATTGTTTAGAGGGTTCGATAAATTGTAAGAACATTGGGCGAACGGTTTTGCGATATTGACTAATCACTGATTCCATCGAACGTCCACGTTCCACCATATCACGTTGTAAGCGGCGGATAAAGCAGATGTCCAGAGGAGCATCTACGAAAATAGAAACATTAATTTCATTGCGAATATTCTCATCTGTCAGCAATAAAATACCTTCTAAAATAATGATTTTCTTTGGTTCAAAGTGCTTCGTGGTCGTTTTACGATTATGTTCGGTATAGTCATATTCTGGAATTTCAATCGCATTACCTTGTTTTAATTGGCGTAAATGTTCAACCAATAAATGATGATCCATTGAATTAGGGTGATCGTAATTGGTTTTAATCCGTTCTTCCATTGTTAGATGAGATTGATCTCTATAATAAGCATCTTCGGAAATAATACCGATATTATCTGTTCCCAATTCATTTTTGAGTTCTTTATAGATGGTTGAGGCAATCAGGCTCTTACCTGAGGCAGATGCGCCGGCAATCGCAATGACAACGCAAGATGAAGTCTGGCTAGTATCAGTCATAAAAAATTTCCTATTCAGTCAAAAGAGTATTCGATAAATTATACCGAAGTTTTGCAAAATTTTTTGTATAATTGACCGCTTGTTATGCGATTTTGGAGAAAAAATGGATATTTTCATTCAAGGATTTATAGTGTGTTTTGGCTTAATTGTCTCTATTGGCGCACAAAATGCCTTTTTATTAAAGCAAGGGATTTTAAAACAACACATATTTTGGATTGCATTGCTCTGTTTTTTAGGTGATGTATTTTTAATGACGATAGGTGTGCTAGGCTTAGGCACGTTAATTGCGGAATTGCCTGTTGTAAGTTTCATTATTTCGCTTTTAGGGGCCATTTTTCTATTAAGCTACGGTAGCCGTTCATTTATCAGCGTATTTAAAAGTGGTGAATACCTTGTGGCAAGTGGAGAGAATGCAACGAGCTTAAAAAAGGCTTTACTGATTACCTTTGCGATTACATTCTTAAATCCTCACGTTTATATTGATACGGTTGTGATTGTAGGCAGTATCGGTGGGAAATTAGATTTTAACGGTAAAATATACTTTTTAGCAGGTGCATTACTTTGCTCATTTATTTGGTTTTTTGGCATAGGTTATGGAGCAAGCTTACTTTCCCCTTATTTTGCAAAGCGAAGAACTTGGCAAATTTTAGATGCTGTTACCGGGCTAATTATGTACTTTATCGCTTTTAGTTTACTGATTTATACTTATCAACTTGCTCTGCAAATTTTCTAGTGGAGTTTAAATTTTTTCATTGATGAATGACGGGCTTTTTTGCTATATTAGTAGCAATGTTCGCACTATAAAATGTGCTTATTTTTGAATAATTTTATTTTAACGGATTCTTTTATGTTTAAAAAATTTTTAGGATTATTTTCAAACGATCTTTCTATCGATCTCGGGACAGCAAATACACTGGTTTATGTTAAAGGTCAAGGTATTGTGCTAGATGAACCCTCAGTGGTTGCTGTACGTCAAGATCGTATGGGATCGCTAAAAAGTATTGCGGCGGTAGGCTCACATGCAAAATTAATGCTAGGCCGTACACCAAAAAGCATAATGGCGATTCGTCCAATGAAAGATGGTGTCATTGCGGATTTTTTTGTAACAGAAAAAATGTTGCAACACTTTATTAAACAAGTACATAGTAATAACTTTATGCGCCCAAGCCCTCGTGTATTAGTGTGCGTGCCAGCAGGTGCAACACAAGTGGAACGCCGTGCAATTAAAGAATCTGCAATTGGAGCAGGAGCGCGTGAAGTCTATTTAATTGAAGAGCCAATGGCGGCTGCAATCGGTGCAGGTTTGCCGGTTCACGAAGCAATGGGGTCAATGGTAATTGACATTGGTGGCGGTACAACCGAAGTGGCAGTGCTTTCTTTAAACGGCATTGTGTATTCAACTTCTGTGCGTATTGGTGGTGATAAGTTAGATGAAGCTATTATTGCTTATGTACGTCGTCATTTTGGTTCTGCTATTGGTGAAGCAACGGCAGAGCGAATTAAACAAGAAATTGCTAGTGCTAAGATTGAATCCGATGATGATGTTAAAACAATGGAAGTACACGGACACAATTTAGCTGAAGGCGCTCCTCGTACTTTCGAGCTTAACTCAAGACATGTATTAGAAGCAATTGAACAACCATTAAATGGTATTGTAGAGGCAGTTAAATCAGTCTTAGAGCAATGCCCACCTGAATTGGCAGCAGACATTTTTGAGCGCGGTATGGTGTTAACAGGAGGTGGTGCATTATTACATAATTTAGATCGTTTACTTTCTGATTCAACTGGCGTGCAAGTCGTAGTAGCAGAAGATCCATTAACTTGTGTAGCTCGTGGTGGTGGTAAAGCATTAGAAATGATCGATATGCACGGTGGTGATGTATTTAGTATTGATGATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017527|1071137:1077922|1076125_1076755_+|WP_006248954.1|DBSCAN-SWA MDIFIQGFIVCFGLIVSIGAQNAFLLKQGILKQHIFWIALLCFLGDVFLMTIGVLGLGTLIAELPVVSFIISLLGAIFLLSYGSRSFISVFKSGEYLVASGENATSLKKALLITFAITFLNPHVYIDTVVIVGSIGGKLDFNGKIYFLAGALLCSFIWFFGIGYGASLLSPYFAKRRTWQILDAVTGLIMYFIAFSLLIYTYQLALQIF >NZ_CP017527|1071137:1077922|1071137_1071920_+|WP_006253612.1|DBSCAN-SWA MTEKSQLNFNYQPSNNHANAQTMIFLHGLFGDLNNLGAIAKPFAERYSILMVDLRNHGRSFHSDEMNYALIAQDLAQLLTELNIQNAIVVGHSMGGKSAMALAAFAPELVEKLVVIDIAPVTYTQNRHQQVMAALFAVKEAKPQNRQQAKAIMAEYIRDEGVQQFMLKSFDAQSEQSFRFNLQALKDNYQNVMGWQQVFVDKPTLFIKGALSDYIQAEHTQTILAQFPQAKSFIVANADHWVHAEKTGTVVRAINKFLEK >NZ_CP017527|1071137:1077922|1074778_1075360_-|WP_006248952.1|DBSCAN-SWA MRLCDTDIKRYLDEGIIAITPRPSDDKISGATADVRLGNSFRVFREHKTPYIDLSGPREEVAAQLNKVMSDEIIIGDDEAFFLHPGDLALATTLESVSLPANIVGWLDGRSSLARLGLMVHVTAHRIDPGWEGKIVLEFFNAGKLPLALRPNMAIGALSFEILSGDAAKPYNARKDAKYKNQQSAISSRINQD >NZ_CP017527|1071137:1077922|1073814_1074417_+|WP_006248950.1|DBSCAN-SWA METLIEFFSSYGYWAVFLVLLACGFGVPIPEDITLVSGGVISGLGYTNVHWMLVVSMLGVLVGDSTMYWLGRIYGEKILKFPLIRNVATPERFATVQERFEKQGWKLLFMARFLPGLRAVVYLVSGITRKVSFVKFLLVDFCAAIISVPIWVYLGDYGASNLDWLKEQVANGQHLIFAILGIVILFLGWKWYKNKKQYKK >NZ_CP017527|1071137:1077922|1072793_1073813_+|WP_006248949.1|DBSCAN-SWA MATIKDVAKYAGVSTTTVSHVINKTRFVAEDTTKAVWEAIKALNYSPSAVARSLKINTTKSIGMIITTSESPFFAEIVLAVEEFCYSKGYSLFLCNTQNKLEKIQNHLDMLIKKRVDGILVMCSEYTANSFDIFENSNIPMVIMDWGRSDERSDIILDHGVEGGYIATQHLIENGHQDIAVITGNRDKEIARTRFEGFKKALSEAGLSIREEWIQEGDFEPEGGYECMNNLLKSSEKLPTAVFCFNDSMALGAISAITEKGLNVPQDISVIGYDNVHSSRFYAPPLTTIHQSKSRLGSAALELLLERIEDNENAKEPKVLEFFPELVKRKSVRNLNIKE >NZ_CP017527|1071137:1077922|1071929_1072658_+|WP_006248948.1|DBSCAN-SWA MQRDTLFSAPIEKLGDFTFDESVAEVFPDMIQRSVPGYSNIITAIGMLAERFVTDNSNVYDLGCSRGAGILSIRRNVNAKNVQIIGVDNSQPMVERCKTHLSAYHSEIPVTILLDDIRHIEIKNASMVVLNFTLQFLPREDRLALLQKIYQGLNSNGILVLSEKFTFESEEMNELLIDLHHTFKRANGYSELEVSQKRNALENVMRTDSIETHKKRLQEAGFTQVELWFQCFNFGSMIAIKA >NZ_CP017527|1071137:1077922|1075374_1076022_-|WP_006248953.1|DBSCAN-SWA MTDTSQTSSCVVIAIAGASASGKSLIASTIYKELKNELGTDNIGIISEDAYYRDQSHLTMEERIKTNYDHPNSMDHHLLVEHLRQLKQGNAIEIPEYDYTEHNRKTTTKHFEPKKIIILEGILLLTDENIRNEINVSIFVDAPLDICFIRRLQRDMVERGRSMESVISQYRKTVRPMFLQFIEPSKQYADIIVPKGGKNRIAIDILKAQIKQLLK >NZ_CP017527|1071137:1077922|1074545_1074701_-|WP_006248951.1|DBSCAN-SWA MLHYAVVFFVIAIIAALLGFGGIAGSATEIAKILFFVFLILTVISFFFKKK >NZ_CP017527|1071137:1077922|1076869_1077922_+|WP_006248955.1|DBSCAN-SWA MFKKFLGLFSNDLSIDLGTANTLVYVKGQGIVLDEPSVVAVRQDRMGSLKSIAAVGSHAKLMLGRTPKSIMAIRPMKDGVIADFFVTEKMLQHFIKQVHSNNFMRPSPRVLVCVPAGATQVERRAIKESAIGAGAREVYLIEEPMAAAIGAGLPVHEAMGSMVIDIGGGTTEVAVLSLNGIVYSTSVRIGGDKLDEAIIAYVRRHFGSAIGEATAERIKQEIASAKIESDDDVKTMEVHGHNLAEGAPRTFELNSRHVLEAIEQPLNGIVEAVKSVLEQCPPELAADIFERGMVLTGGGALLHNLDRLLSDSTGVQVVVAEDPLTCVARGGGKALEMIDMHGGDVFSIDD |
9 | Mycobacterium_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1269155 : 1360714
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP017527|1269155:1360714|DBSCAN-SWA ATTAGAAGTTCGCATTGCGTGGAGCACGTGGGAATGGGATTACATCACGAATGTTTTGTAACCCGGTTACATACACGATTAAACGCTCGAAACCTAAACCGAAACCTGAGTGTGGCACTGTACCGTATTTACGCAAATCACGATACCACCAGTAATCTTCAGGGTTTAAGCCCATTTCATTCATACGCTGATCTAACACTTCTAAACGTTCTTCACGTTGAGAACCACCGATAATTTCACCGATTCCCGGAGCTAAAACGTCCATTGCGGCAACCGTTTTGCCGTCATCATTTAAACGCATATAGAAGGCTTTAATGTCTTTTGGATAGTTTTTCACGACCACCGGCGATTTAAAGTGTTCTTCGGCTAAGAAACGCTCGTGTTCAGAGGAAAGATCGATTCCCCAAGACACCGGGAATTCAAATTCTTTGCCGGATTTCAATAAGATCTCAATCGCATCGGTGTAATCTACTTGAGCAAATGGCGAATTGATAAAGTTTTCTAAACGACTAATCGCTTCTTTATCAACGTGTTTAACGAAAAATTCCATATCATCTTTACGTTCTGCAAGCACCGCTTTAAACACATATTTCAGCATATCTTCGGCTAATTTTGCATTGTCGTTTAAGTCGGCAAAGGCAACTTCCGGCTCCATCATCCAGAATTCTGCAAGATGGCGAGTTGTGTTTGAGTTTTCTGCACGGAATGTCGGACCGAAAGTATAAACTTTACTTAAGGCACACGCATAGGTTTCCGCATTTAACTGGCCGGATACGGTTAAGAACGATTCTTTACCGAAGAAATCTTGGTTAAAATCCACTTTGCCGTTTTCGCCACGAGGTAGATTTTCTAAATCCAGCGTAGAAACACGGAACATTTCACCTGCACCTTCAGTATCTGAGGCGGTAATTACAGGTGTTGCTACCCAATAGAAACCTTGCTCGTGGAAGAAACGGTGGATAGCTTGAGCTAAACAGTGACGAACACGAGCAACTGCACCGATTAAGTTCGTACGAGGGCGTAAGTGAGCGACTTCACGCAGATATTCGATAGAGTGGCGTTTCGCTGCCATTGGGTAGGTATCAGGATCTTCCACCCAACCAAGCACTTCCACTTTACTTGCTTGTAATTCAACGGCTTGACCTTCAGCAGGGGATTCCACAACTTTACCGGTCACCACCACAGAGCAACCTGCGGTTAAATGTAATACTTCGGCATTATAATTTGGTAGATCGTTATTAATAATCGCTTGAATTGGGTCAAAGCAAGAACCATCGTAAACGCTCAAGAAAGATAAACCGGCTTTTGAATCACGGCGGGTACGCACCCAACCACGCACTGTCGCTTCTTCACCTACCGCTATCTTGCCGGATAGGATTTCCGAAACTGTTGGAAATTTAGACATTGAATACCTCAAATTCTTTGTTGTGAGTTTTAATATAAGAAACGTTCCGTATTCTACAAGAAAATAGGGGGAAATATAATAATTTTACGGAATTATTTGCAAATTTGTGAGTCTATATAAGCATTGCAAGTAGTTAAATCTGATTTTGCTTGGTGTTAAAAAATTTTTTATTTTTTAATGAACTTTCGTTCAGTTAGGCAGTCTGAGTATATGTAACAGATTTATGCAAGTTTTTTTCATATTTCCTTAGGTAAGACCTCCGCCCCTTTTCGCTTTTTTGATTAGGGGCTTTTTTTTATTTCCGTTTTTTGTCGGTTATTATCGTTTATTATAGTTATTTCAATAGGTTATCTTAAGTTTTTCCTCTCTTCTTTGCCTTAAGATGATTTCATAAAATCGGTTATTATCTGTTATTGTCGGTTATTGTATGGTATAAATTACGACAAATTTACGACAAAAGGCAGGTAAAAATATGGCGAGCATTCGCAAGCGGGGCAGTAAATATCAAGTCGAAATCTCGAAGAAAGGGGTGAGAAAATCAGCTACCTTCCGCACAAAAGCAGAGGCACAGGCATGGGCTTACGAAGAAGAGCGTAAAATAGAGATCATCTCGAAAGGTGGGGTAGTTGATATTTTATTTGCGGAAGCGTTAGAGCGGTATCAAAATGAAGTATCGATTAATAAGAGGACGTGGCGACGAGAGATAGGTCGAATCAATAACATATTGAAAGAGCCTATTGCGAATCGTTATGTACAAGATATTAAGCGAGATGATATTGAAGATTGGATCGAAGCTAGATTGAAGAGAGGGTTAAAAGGCTCAAGTGTTGAGAGGGATTTGTCTATTTTAAGCAATGTATTTACCTACTGCTTAAAACGCTGGGGCTATATTAGTGAAAATCCGATGATCGGTGTTATTCACCCAAACAAAGTGCCACCAAGAAAACAGCGTTATTCCCAGGAAGATATTGATAAAATCTTAGAAGTCAGCAAATACCGAGAAGATATTAAACGCTCTAATGCTCGATTGGCTGCGGCTATGTTATTTGCGATTGAAACGGCAATGCGTGCCGGTGAGATTTCGGGTTTAACGTGGGATAATGTGAATTTTGAGAAAAGAATAGCTCATTTGCCTATGACAAAAAACGGTTCATCAAGAGACGTTCCGTTATCATCAAAGGCAATCGAGATCTTGAAAAGACTGGAAACCATCAAAAAGGATAATTCCGTTTTTCAGCTTCCACAAGGGAATGGTTTAAGTGCTAGATTCTTTGAGTTAAAAGAAAAGGCTGGGCTTTCTTATTTGAATTTTCACGACACGAGGAGAGAGGCTCTTTCACGCTTGGCAAAAAAAGTCGATGTGATGACCTTAGCCAAAATTTCAGGGCATAAAGATGTGAAGATTTTGCTTAACACTTACTACGCCCCAAATATGGAAGAAGTCGCTCATTTGCTGGATTAATTTTTGCGTGTTCGTGCTTGACGGTTGACCCAACGGATAACATCGCCACTTTTGAAAAGAACTGATTTCCCGTTAATGCCTTGCACTGGCTCTGGGAAACCGGGCTTTTTACTGATCTTGGATTGCACATAGTCATATCCGCAATTCAAAATCAGGGCAACATCATCTAAATCAATAATCATTGCTGAATTTTCGTTGAGCTGAGAAAGAATTAAGGCTCTCTCCGCTTTTTCTGAAAGTTTAATTTGTTCCATATTCTCTCCAAAAATAAACCCCTCATTTAGAGGGATTGCTCAATTTTCACAAACGCCAGCCAATGTGTTTGGTTTAAGCGTCCGCTTTTGTGTCCATAAATCGGCTGACAATCAATAACTTTTAAAATTTCTGAAACGGGGATTTGTGTTTCATTCCACTTGAAAATAAGCGTGCCGTTTGGTTTTAGCACTCGCATACATTCGTCAAAGCCTTTCTTCAAGACTTCTCGCCAGTTGCAAGGTAATTTGCCGTATTTCTTTACAAGCCAGCTATTTTCTCCACCTTGAACTAAATGTGGCGGATCAAAAACAATGTGCCAAAAACTCTCGTTTTCGTATGGCATATTCGTGAAATCGTGTAAAACATCAGGTTTGATTTCTAAATGGCGGATTTTGTCTCGGTCTTTCATTGTGGTTTCTATTTGTCGATTATCAGCAAACAGGACGAGTGGATTTTGCTTGTCAAAATGAAACATACGGGAACCACAACACGCATCTAATATCGGTTTTGTTTGCATTTTTCCTCCAAAAAATAACCGCTTGCGGAACAAGCGGTTGGGTTAATTAGCGTTGAGCCATACAAATTTTGCCATCGCAGTCGTTGCGTAACTCTAGATGGTCAGCAGCAACTGCAAAGGCGGTTAAAAATAGAATGATTTTTGCGTATTTCATCGGCTTGTCCTCAAAATTTGGGTATGGAAATCCGCCGCTTGTTGTTTCACAAGCGGTCGGATTGTGTGATTTTTTTGCAAATTAAATTCGGACTAAGCCGCCTAAGCCTTTCGGCTGGTATTGCCTTAAGGTAGTTAGGGCTTTGTGGTAGTGAGCCTCTTCAAACGGATCGACCTCGAAGTCGGCTAACATCGGTTCAAGTATCCGCTTCATTACGCCAAGCGTGGTTTGATACTCGGTAGCGTGCGTGTAAACATAATCAACGCCAACGAAGAAGAAACCGAAACTCTTATAGAGTGGCGGAATGCTTTTCTGCAAGATGTTTCGGTTTTTATAGCTTAGGTACTATAAATCGTCTTCTTTAACCCAAATCCCAGCTTGCATTTCGCCCTTGCGATCTTTGATTTGGTCGTAGGCGTGAGCGAGGCAGTCATTAAGCGTAAATCTATTTATTAAGGCTAAATGGTGTAATATGCCAAAAAAACGGCTATATTTACCTCTGTCTTTAATGCGTTCAATATCATATAGACAATGAACAGCGACCGAAATATCAAATCTGTAACCATTTAATCTATGATTTTCAAATTGTACAGGGTAAATAGGTTGTTTTTCTTGTTTTGCTTTAATAATACAGACAACAATCAAATCCCCAATCGCATCTTTAATCATTTCAGGATTATTGCGGGCAATGCCTCCGCAGAGTTCGCCAAACTCTTCCATCAGTTTGAGCATTTGCTTTTGTGGGGTTGAGCCGTTAATTAAATTGCGGTCTTCCGCCCATTGTTCGATGTTTTTAATTAGTTGTTGCATTGTTTAGTCCTCTCATTTCTTTCATTGCTTCATCAATCGCCGTGCGTAAATCGGCATTTCTTGCCCAATGAAAATACTGCTCGTGCGGTTTGGTATAGCTAGCAATAATAAATTCGTCCACCAAATCAGAATATCGGACATCTAATTTGCGTTGGGCGATAAAGTCTAAGCGTTCGGTGTCGGTCATTTTTCCTCCTTTGGTGGTTCGGGAAGTGGTTGCCAGTGGGTTACTGCAATCACATCGTCATCAAGCCCATATTGATTTACACTAAGAAAATACCACTCGTTATCGGCAAGTTCTCTTGAAACTATTAAAATTAACTGCATTCCTGAAATATCGCATAACCCTAGCACATCCGTTTCAATAGGTGGTAATTTGTCCTCAATGGAAATCCAG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107 | Mannheimia_phage(88.46%) | portal,terminase,transposase,tail,integrase,capsid,plate,tRNA,head,holin | attL 1338095:1338111|attR 1363619:1363635 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1526123 : 1623278
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP017527|1526123:1623278|DBSCAN-SWA 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116 | Mannheimia_phage(89.16%) | terminase,transposase,tail,protease,integrase,tRNA | attL 1615325:1615343|attR 1632094:1632112 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1628851 : 1637261
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP017527|1628851:1637261|DBSCAN-SWA TTTAATGAGCTTCGTCCCAGTTTTCGCCTACGCCAACTTCGGCAATCAGTGGCACTTTGAGGCTAATCGCTTTTTCCATTTCGGTTTTGATTAATTGGCTGTAATGGTCGATTTTATCGGCTTTGACTTCAAACACCAATTCATCGTGAACCTGCATAATCATTTTGATTTCATCATTATCACGAATCGCATTATCAATACCAATCATCGCCACCTTAATAATATCGGCAGCCGTGCCTTGCATTGGGGCGTTGATTGCCACCCGTTCTGCTGCTTTACGCAAAATAGCATTGCCGGATTTAATATCAGGCAAGTACAAACGGCGACCAAATAGGGTTTCAACATAGCCTTTTTCAACTGCAACTTCACGAATATCGGTCATAAATTGTTGAACCGCCGGGTAACGTTGGAAGTAGAGATCCATATATTTTTGAGCCTCTGCACGCCCAATCCCTAATTGGTTTGAAAGCCCAAATGACGACATTCCGTAAATCAGCCCGAAGTTAATTGCTTTCGCACTGCGGCGTTGTTCGGAGGTGACTTCACCTAACTCCACCCCGAAAATTTCGGCAGCGGTAGCACGGTGAATATCTTTGCCCTCCGCAAAGGCGTTAATCATTCCCTCATCATTCGATAAATGAGCCATAATCCGTAGCTCAATTTGTGAATAGTCGGCAGCGACAATTTTATAACCTTCTCTCGCGACAAAAGCTTGGCGAATCCGTCTGCCCTCTTCATTGCGGATCGGAATGTTCTGCAAATTCGGATCGCTGGAAGAAAGGCGTCCGGTTGCGGTGACTGCTTGATTGTAAGAGGTATGCACCCGCCCTGTTTTTTTGTTAATCAGTTGTGGTAATTTATCGGTGTAGGTAGATTTCAACTTACTTAACCCACGATGCTCCATTAATAACTTCGGCACTAAATGCCCTTGTTGAGCCAACTCGTCTAACACTTCTTCGTTGGTTGAGGGTGCACCTTTTGGAGTTTTCTTCAACACCGGCAAGCCTAATTTTTCAAACAAAATCTCTTGTAATTGTTTAGTTGAGGCAAGATTGAAGGTTTGCCCTGCTTCTGCGTGTACTAATGTTTCAACTTCCTCCAAACGTTTTTCAATTTCAGCCGATTGGGTCAATAATTTTTTCGGGTCAATCAACACGCCATTGCGTTCAATTCGAGAAAGTACGCCCACAAGTGGCATTTCAATTTCATCGAATAACTTCACCAATTCAGGCTCTTGCTGTAGTTTTTCCCACAATACTTGGTGGAGTTTCATCGTCACATCGGCATCTTCTGCCGCATATTCAGCCGCTTTTGCTATCTCGATTTTATCGAAGGTCAGTTGATTTTTCCCCTTACCAGCAAGCTCTTCAAACGGAATCGTTTTATGCCCCAAATAACGGGCGGCTAAATCGTCCATATTATGACGACCGGTGCTGTTTTGGGTGTAAGATTCAATCATCGTATCAAAAGCAACACCTTGTAGCTCAATGCCGTAGTTCGCAAAAATGGTTAAATCATATTTAATATTCTGCCCGATCTTTTTAATCTCCGGGTTAAGCAAAATCGGCTTGAGTTTACTTAAACAAGCGGTCAAATTTAGCTGATTTTTTACCAATTCATCGGAAGACGGGCTTTCTGAACGCTCCTCATCACCGAACATATCGGCTTGTTGCGGTTGGGCTTTTTGCTTATGCCCAAGCGGAATATAGCACGCCTCGCCATTTTCCAGTGCAAAGGAAATACCGACCAAATTAGCCGACATTGCGTCAAGGCTGTCGGTTTCGGTATCCACCGCAATCAAACGAGCTGCGGTGAGTTTTTCGATCCAGGCTGATAATTTCTGTTCAGTATCAACGGTCTCATATTTGCTACGATCGATCTCGACCACATTTGCAACATTTTCCTCATTTCTGACCGCTTGTGTTACTTGGTAATTATTCGGTACTTTTTCAGCCGAAGTTTGAGTGACCGGATTGGCATTTTGATTCACTTCGTTCAGCCAGCGTTTAAATTCATAATGCTCAAATAATTGAGCAAGCTCAGCACGGTCTTGCGGCTGTGTTAAAAGTTGATCGTGAGTAACATCAAGTTCCACATCGGTTTTGATGGTAGCAAGCAAATAGGATAAATCGGCATTCGCTTTTTCCGCTTCCAATTTTGGGGCGAAATTTTTTGCCCCACGGAAAGAAAGGGTGGCAATTTGATCCAAATTAGCATAAATCTGTTCAAGTGAACCAATGCCTTGCAATAAAGCTAATGCGGTCTTTTCCCCCACACCTTTTACGCCCGGAATGTTATCGGCGGAATCGCCCATTAATGCCAGAAAGTCGATAATCAACTCAGGCGGAATGCCATATTTTTCAATCACGCCTTCACGATCTAACAAAGTATTGTTCATCGTGTTAATCAACATAATGTGATCGTTCACCAATTGTGCCATATCTTTATCGCCGGTGCTGATCAACACATCTTTGCCGTCTTTAGCGGCTTGCACAGCAAGCGTGCCGATCACATCATCAGCTTCCACACCTTCAATCGAAATCAGTGGAATGCCTAAGGCTTTGATAATGCGATGCAAAGGCTCAATTTGAGGGCGTAAATCATCGGGCATTGGTGGGCGGTGCGATTTATATTGCTTAAACAACTCATCACGGAAGGTTTTCCCTTTGGCATCAAACACCACAGCAATATGGCTTGGATTCACTTGTGAAATCAGGCTTTTTAACATATTCAGCACGCCATACATTGCCCCTGTCGGTTCGCCTAAGCGATTAGTGAGCGGAGGGAAAGCGTGAAATGCTCGATATAAATAGGAAGAACCATCCACCAATACCAGTGGATTTTTTGCGATAGTTGCCATAAAAATCTCTTTATAATCAAATAAATATTGGCGTTATTATACAAGAATATTTAAGAATTGAGTGTGTATAAGGCTTATTTTAAATAAAACGTTCCGAAAAAACATTGAATTTCATTAAAAAATTCCTTTATTTATCAAATAAATGCGATTTGTTTCGGAACGTTTTTTTAATGCTTATTTTGCAACATACGGATTATCAATGGAAAGCGTTGCTGTAGACATTGTGCCTCCTAGTACAAAAAAACCGCTTGGTTTCCCTAAGCGGTTCTAATCTATAAGAACTATTAAACTACAATCTGCCCCGTCTCTTTTAAGTACTTATAGATACGCCCTAACATAATCTGCGTTGGCGTTTTGCCAATATCCTCTTTTGTTAGCGGTGCATCAGTAATCGCTTTGGCTGATTGAGCATCAATATATTTGTACTCACTTGTGATGATTACAAAGTTTGTTACCTCGCCATCGGTATCATCACCTGTGCCAACAACATACTTAGCATTGAGTGAGCCGTCATCTTGCGTTGAGTAGCTTGCGATGGTGGAATACATTGGGTTTAAGATTTTGTTAAAAGTTGTCATAATTTTTCCTTTTGTGGATTGTTGATAAAAAAAGACCGCTTGTAGTCATACAAACGGCTTAGTAGGAAGAGTAAATTGCTTTACATAATATAACCTTTTATTTATACTTCATTTATAAATAGTAAGTTATAAAAGGTTCAAAAATGGCAGACCCTATAGAATGGTCTATTATCACGACTGACTGCTTTGATGAATGGTTCGGTCAACAAGATGGAAGTACTCAAGAACGTGTCTTGGCTTGTTTAATCTATCTGCGGAAATTCGGTTATAGTCTAGGCAGACCTTATGCTGATACAGTTTATCAGTCTAAATTCCCTAATATGAAAGAGTTACGCATTCAAAACAAAGGTAAGCCAATTCGAGCATTTTATGCTTTTGACCCTTTACGCCAAGCGATAGTACTTTGTGCTGGCGAGAAAGGTAAAGACAAAAGATTCTATGAAAAAATGATCGCTCTTGCTGATGCGGAATTTACCTCCTATTTAAATAATTTAGAGAAAGAAAATGAAAACGTTAGATCAAATGCTCAATGAACTCTCTCCTGAACGCCGCCAAAAAGTGGAAGATATGGCTCAAGAAATGATTAGAGAGATACAACTTTCAAAACTAAGAGAAGAGCTAAATCTCTCTCAACAACAATTAGCTACAGCTCTCGGTATTTCACAGCCTGCTATTGCTAAACTTGAACAGAAAGATAACGATCCAAGATTATCCACGCTCAAACGCTATATTGAAGCAATGGGCGGTAAGTTAAAACTTGCCGTTGAATTGCCTACAGGCGATGAGCGTGTAATTAGGATTTAATTACTTTGTTAACCTGAATGCCCTCCTGAGCCAATACAGTTTTTCCCCGGTAATTGCTCTTGAGGGGCTAGTTGATAACAAAAGGTTGGTTTTGTTGTATAGTCTTGCTTATATTGAGTTGTACAAGCTGAAACCATAATTGTTGTAAGTAGTATAATTTTTTTCATATTTGCCTCCTATAATTGATAAGATGAACCATTTGTAGATGATATAATTGCTCGAAAATTCACTTTAGCACTTCTCCCACGCCCTGCACACCACGCACGACACGTTACTACATATTGAGTATTAGCAATGAGTATTGCCCCAGAATCATTAAATGGGTTAGATACATTAGGTGAAATAGTATTGCTAATATCAATTACAGACGGTAATGTAATTGTTGTCGGTGTCCGATTACTACCACTACCATAAAAAGTTTCGCTTTTACTCTCTCCTGTTGGAGTGTGGACAACATACAATGTTCTCGTCGCTTTTGTAGCAGGTAGTACAAATTGACATACATACTCATAATATGTATCACTTAATGCAAAACTGTTTTTCGTTTCTGAATATGTTTTACTTTTCCCTGTTGCTTTTGATGTCCAAGTTTTAGCCTCATAGATATTACCTCCGATCAATTGGTTGATTTCAAGTTCTCCAGTAAATTTACCTGTTAATCCCTCAATTCTTGCTCCTTTAATTATTCCCCCTGTAATTGTTGTACCTGAAATTGTCCCACCACTAATTGTCGTCCCTGTAATTGTACCAGCAGTTAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP017527|1628851:1637261|1635573_1636293_-|WP_006247806.1|DBSCAN-SWA MKFSKYQLLVNKICFICGKKDCPQMKKSKDYKDFLDALEKGDVDKADKIYNTKFSQFSKSFGHEMEKNLEKNRIPPIYQGVPFDSFDLYQHYSYGNGEALNLSSVGLSNKIRPLVNKDKAFGKSNGSIESRFISQYKNEGRTSFSNAYDFTKEASGIADPLWALGTATISGELKDIQIFPGGIARGNIHYSIRDRFTDPFDTFNFTKGEWNPNGTPYIIQDSWIKSVRFSIDKKIKITP >NZ_CP017527|1628851:1637261|1633268_1633955_-|WP_006247808.1|DBSCAN-SWA MAANSINASHIVGSSITADKLNVNNLAAISANLGKVTAGTITGTTISGGTISGTTITGGIIKGARIEGLTGKFTGELEINQLIGGNIYEAKTWTSKATGKSKTYSETKNSFALSDTYYEYVCQFVLPATKATRTLYVVHTPTGESKSETFYGSGSNRTPTTITLPSVIDISNTISPNVSNPFNDSGAILIANTQYVVTCRAWCAGRGRSAKVNFRAIISSTNGSSYQL >NZ_CP017527|1628851:1637261|1628851_1631710_-|WP_006247813.1|DBSCAN-SWA MATIAKNPLVLVDGSSYLYRAFHAFPPLTNRLGEPTGAMYGVLNMLKSLISQVNPSHIAVVFDAKGKTFRDELFKQYKSHRPPMPDDLRPQIEPLHRIIKALGIPLISIEGVEADDVIGTLAVQAAKDGKDVLISTGDKDMAQLVNDHIMLINTMNNTLLDREGVIEKYGIPPELIIDFLALMGDSADNIPGVKGVGEKTALALLQGIGSLEQIYANLDQIATLSFRGAKNFAPKLEAEKANADLSYLLATIKTDVELDVTHDQLLTQPQDRAELAQLFEHYEFKRWLNEVNQNANPVTQTSAEKVPNNYQVTQAVRNEENVANVVEIDRSKYETVDTEQKLSAWIEKLTAARLIAVDTETDSLDAMSANLVGISFALENGEACYIPLGHKQKAQPQQADMFGDEERSESPSSDELVKNQLNLTACLSKLKPILLNPEIKKIGQNIKYDLTIFANYGIELQGVAFDTMIESYTQNSTGRHNMDDLAARYLGHKTIPFEELAGKGKNQLTFDKIEIAKAAEYAAEDADVTMKLHQVLWEKLQQEPELVKLFDEIEMPLVGVLSRIERNGVLIDPKKLLTQSAEIEKRLEEVETLVHAEAGQTFNLASTKQLQEILFEKLGLPVLKKTPKGAPSTNEEVLDELAQQGHLVPKLLMEHRGLSKLKSTYTDKLPQLINKKTGRVHTSYNQAVTATGRLSSSDPNLQNIPIRNEEGRRIRQAFVAREGYKIVAADYSQIELRIMAHLSNDEGMINAFAEGKDIHRATAAEIFGVELGEVTSEQRRSAKAINFGLIYGMSSFGLSNQLGIGRAEAQKYMDLYFQRYPAVQQFMTDIREVAVEKGYVETLFGRRLYLPDIKSGNAILRKAAERVAINAPMQGTAADIIKVAMIGIDNAIRDNDEIKMIMQVHDELVFEVKADKIDHYSQLIKTEMEKAISLKVPLIAEVGVGENWDEAH >NZ_CP017527|1628851:1637261|1631994_1632288_-|WP_006247812.1|DBSCAN-SWA MTTFNKILNPMYSTIASYSTQDDGSLNAKYVVGTGDDTDGEVTNFVIITSEYKYIDAQSAKAITDAPLTKEDIGKTPTQIMLGRIYKYLKETGQIVV >NZ_CP017527|1628851:1637261|1632792_1633092_+|WP_006247810.1|DBSCAN-SWA MKTLDQMLNELSPERRQKVEDMAQEMIREIQLSKLREELNLSQQQLATALGISQPAIAKLEQKDNDPRLSTLKRYIEAMGGKLKLAVELPTGDERVIRI >NZ_CP017527|1628851:1637261|1634725_1635352_-|WP_006247807.1|tail|DBSCAN-SWA MTKIKFYGNLKKFGSEFSLEVKDTAEAIRALCTQISGLREALRDGVYKVRIGKQYLDPSALEKGLFYCLKKGQTIHFTPVIKGAKSGGVFNFVLGAALIGAAFFTGGASIAAWGAGAKMMGMLGASMLLGGVSQMLTKMPKAPTMGNETEKESSTAFSNLNNLVTQGKPVPLAYGLIRTGSLVISQGVETITIKENQPASNKKTGFRK >NZ_CP017527|1628851:1637261|1634065_1634677_-|WP_006253310.1|DBSCAN-SWA MNLTKAESNLNAKITEEKKARVDADKVNADKLTDITSRVANAESTITNFQSTKANKSEVASLAQSSLQAVWKADAKSAVDSLSIGARNLLIDSTYNQHINYNTKMSSITRTVYRGNMLIRLGMLGGAGVAGIVQAPAAQVSNIRQGQEYTLSLNVQGTAGIQKTGLNYVFLMRADGANQRLATIPVIASLLNRPKIALGKMPV >NZ_CP017527|1628851:1637261|1636550_1637261_-|WP_006253312.1|DBSCAN-SWA MSGLGKLTVTLELENAKFQSAMTKSDYEAQKFAKNFIQNMDRARNHAKEFADRSTQYLKNIEQAAKNLNKNSEFSFLSTIGGHYQSMSSGILSAAKAYTDIQNKMKLVSGSSAEAAKRLTDVFDIATKTSQSTEAVSGVYQTFAQNAQSLGLAQKDVAELTKTVSQAVAASGASSSAASNALTQFGQSLLMGKMKAQEFNSLITQTPTIIQAMAKGLGMTMAEFKAAVYRAKSLLG >NZ_CP017527|1628851:1637261|1632431_1632821_+|WP_015484247.1|DBSCAN-SWA MADPIEWSIITTDCFDEWFGQQDGSTQERVLACLIYLRKFGYSLGRPYADTVYQSKFPNMKELRIQNKGKPIRAFYAFDPLRQAIVLCAGEKGKDKRFYEKMIALADAEFTSYLNNLEKENENVRSNAQ |
9 | Mannheimia_phage(60.0%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1640494 : 1650811
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP017527|1640494:1650811|DBSCAN-SWA AATGCACATAGAAGACAAAATCGCTTGGTGGCTTGCCAATGGAGAGACAGGGGTAAGCAGTAAAACAATGGCTTTTTACCTTGGTTACGGAATAAGACCAAAAATAGAAGGCTACCCACACGATGTATCGGATTTCAGGCGTTGCTTTCTGTTGTTGGAGACAGTCCCTTTTTTGCGAAATAGGATTGAAAAAATGGCTGAACTTGGGAAAGTTTGGGCTGCACTTGCAAAAGAATGGCACACATTAGAGGCTCTCTACAACGAAGAGGAATGTCAAATAAGATGCCCCAAAACCTATGCTAAGTTGAGAGAAATCCTAGAAGCCAACGAAGAAAATGTTGTCCGTATTGGGAATTTGAGTATTTCGATAGGATAGGTAAAAAATGCAATTCACCTACGGCTCAATTTGTAGCGGTATCGAAGCTACAAGTATAGCGTGGCACGGTTTAGGTAAGCCTTTGTGGTTCTCTGAAATTGAGCCATTCCCCTGTGCGGTATTAGCTCACCGTTTCCCCAATGTGCCAAATGGAAACGGTATGGCTGTGCCTTGATGCAGTGGATAAGGCAAAGACTTAACGATTATTTAGTACAATCCCTCGTTTAGAGGGATTTATTTTGGAGAAAGTAATGAATGGAACATCTTACTATTAATCAAGTGGCAAAAGAATTAAATTGCCATCCAAATACAGTCCGCCAACATTTGGCGGATTGGGGATTTTTTAAAATGGTAGGCTCGGAAGTTTGGCGGATCAACCGAGAAGATTTGGAAAGAGCAAAAAAGAGAGCCGGTATTGACCCAATAAGAAAACGATCTGATAATGACCGAGGGTTATCTCTGTCGGTCGAGGAGAATGAAAAATGTCGATCTACAGACGAAAAGCAAACGGTCCGTGGTGGGTTGATATCACAACCCCAAACGGCAAGAGAATTAAGAGAAGCACTCGCACGCTTGTAAAACGTGAAGCTCAGCAGTATCACGATAAACTCAAGCAAGAAATGTGGGCAGAGGATAAACTCGAGGAAAAGAGAAAATATATCTTTGAAGATGCTTTGCTCCATTACGTTCGTGCGGCCGAAGAATTAAAAGATAAAGCCACAAAAAAGCGACATGCTGAATACTGGTTATCCAAATTTGCCGGTCGTGAACTCAGCTCTTTAACAGCTCAGGAGATTATCCTAAATATCCCGAAAAAGAATGCAAATACGAAAAAGCCTCTATCTCATAGTACGCAAAATAAGTATGTGAAATCTTTATCGAGAGTATTAAATATCGCTCATAAACTTGGTATGTTGGATGCAGTCCCACACATACCGAAAAAGAAAGAGCCGCCAATTCGTGTACGCTGGATCACCAAAGAACAAGCAAAACAGCTAATAGATAAATTAAGTTCAGACTGGATGAAATCTATCTGTAAGTTTGCTTTGATGACTGGAGCCAGACGGACAGAAATTTTGACAATGACTTGGGATAAGATAGATCTTGTAAGAAAGGTAGCAATCGTGACTAATGATGTCGCTAAATCAGGTAAGGCACGATCGCTATTACTGAATCAAGAGGCAATTAAGCTGTAGAAGATCAGACTTGATCTGACAATTCACTCTAAAAAGTGAGAGTTTCCCGTTTAGAATATGAGTGTCAAAAATCAATCTAAACAAAAAGGAAACTCTCATGTTTTATTCTAACAACCCTCTCATTAAACACAAGACCGGTTTATTAAATTTAGCAGAAGAACTGGGTAATATTTCTCAAGCCTGCAAAGTAATGGGAATGAGCCGAGATACATTCTATCGTTATCAACAAGCGGTTGAGCAAGGTGGTGTTGAAGCATTGCTGAATCAAAATAGACGCGTTCCCAACTTAAAAAATCGTGTTGATGAGGCAATAGAGCAAGCTGTTGTGAAGTTTGCTCTTGATAACCCGGCATTTGGACAGGTAAGAGTGAGTAACGAACTCCGTAAACAAGGCATCTTTGTTTCAGCAGGAGGTGTACGTTCGATTTGGTTACGTCATCATCTTGCCAATTTTAAGCAAAGATTAATCGCCCTGGAAAAACTGGTTGCAGAACAAGGTATTATACTCAGTGAAACACAGGTACAAGCCTTAGAGCGTAAGAAAGAAGATGAGATTGCCTGTGGTGAAATTGAAACGGTACACCCTGGCTATCTTGGCTCACAAGATACTTTCTATGTGGGCAACCTCAAAGGAGTGGGTCGTATTTATCAACAAACGTTTATTGATACTTACAGTAAAGTGGCGTTTGCAAAACTTTATACAATGAAGACCGCTATCAGTGCTGCGGATATTACTTTCTTTGCTCACACCGCTATTATTCAGTGGTGGATAGCCGAGAAACTGCTGTAATGCCTTGCTGTCTAATTCATCAAGCAAACCTTTGATACTCGCAAACAACACTAAGTCCGCAAATTCAATAGCGGTAGATTGCGTTTTGCGTAAGGTTAAGCGGATTTGTTGGGCGATAAATTTTTCCCAGTTTTCATCCGCTAGTGCTTCTAATTTTTCATTCGGGATTTCACCGTCCATTCGCATTTTGTCGTGATGCCAACAAAGCTGTACCGCACCGTTTTTATTCTCTACCAGCACTTTTTCCGTGTGGCAATATTTGCCATCTCGGCATTGGCACGTCTGAATTGACTTTACAAACCGGATATAAGGCAAATCATTACTATATTTGTCACGCTGATTTAGCGTTGAACGAACTTTTGCCGATTTAGCAAACACCGCCAGCTCTTTACAAGCGGTCGAATTTGCCGAAAAATTTGCAACCTTGCCTGATTTAACCGTCGCTAAATCGGTCGGTGCAGGTTGCAACAAAGTTCGCTCACCGAAAGCAGCAGGAGAAACATCTTTAGGCACTTTGTAAAACACAATACCCACTTCGGTTTGAAAGTAAGGGGTAAGTAGCAAACCTTCCGCCATTATTGCCCCCATTTCTCGGTTTCATCATAGGCTTTCACGAATAGCATAAATACGCCAATACAGATTAAAAAAATCAGTACGCCAATTACTGCACCAATACCAATAAATAGTTCCCAATAATCCATTTTATTTACCCCATTCCTTGATTTTATCTAGTGGCATCTGACGAGTTACAATGCCCTCAATAAATGGGTCAAACACAACAATCATCGAGCCTTTATTATTACCTTGTGCCGGTTTACCTGTTACCGGGTTGATAAATTGAATCCGCCCTGTCCGCCAAGTGCCTTTTTCATCGTGATAGCCAATAATATCAATTACCTCATTAGCGTGTTGTTGAATGATGGTGTACCATTCTGTTGTTTTATCCGCTGGTAATAACATCACAACCAAATGACCTGCTTTTTTCAATTCTGCCGCTCGTTGAACAAAAGGCAGTGGATCAGAATATGGCGGATTAACGAAAATACGCAGTAATTCTCCCCAGTCTGAAACTTTATCTAGTAGCACATCAAATAAATCATCGGCTAAAAAATCATCGGCAATTTGGCAACTTAATTTATCATCATCTAAACCGTCTGCCGCTCTACCAATCCAATAGGTGTACAACGTATTTTGTCCGTTAGAGCAACCGTCAATATGAAACCAAGCATAACGATGATTTAGCCAATTACGCACATAATTAGGTGTTTGGTAAGTGTTTTTATCAAAATCTGTCATTGTCTAATCCTTACGAAAATGTTGGTACTCTCAAACGGTCGATACGCTCAACCGCATTTTTAATTTCTTGGCTGATAATCATCGGCAAATCACGTTCAAGTGGTCGCTTGTTTCTGGTGTTGATTGTGGCGTGGTACATCACTAAATTTCGTTTGTTGGTAAAGTCCAATGCCTTAAACGGATTGCCACTGAGTGATTTCTGGAACAAGGCTCGTACTTCGTCCACCGTTGGCATAATCAAGCGTTTTTCCAGCTCCGCCGGTGTAACCCACTTACCATTTACGCAAACAGGCTTTCCGTTATTAGCCCAAGCGGTCGATTTTGGAAAATAATCTGCAAAATTCGATTGGCGGAAAATCGTTTTCGGGCAGAGGTATTCACGCATTTTTTCATCTCGTCCCCATTTAGCGACAAGGTAATCCACCACTTGGCAACAGTCCGCCACCGAACTTTCACGAATGCGAGCAGTAATATTTTTTGCCCACGGCTTGAGCGAATACCCCACAGGCTTACGCTCACCAAGCTGTACCGCCAACGTTACCAAAGCCGAATTGAGATAATTCAACACAACTTCAGCCGGGGCAGGTTCCCCCGCTGGGGGATTAAGGGGGGTAGTATGATCATTATTATTTTTATAATTAGTATTATTATCTGTCGGATTTTTTTCCGAGCTTTCTCGGAAATTTTTCCGAGTTTGTTCGGAGTTATTTCCGATACTCGGATTTTTTTCCGACTCACGGATCGGCTCGAATTTATTCCATTCACAACCTTTTTCGGTTAAACGGACATAATCTTTACCGTCCATTTTGAAGTGGTCGATAATGCCTTTTTCTTTCAACACCTTATATTGGCGGTAAACTGTATCTTCTTTGCTAAAAACCGCAGGTAACTCTTCGCAAACCTTGCTAAATGACATCCAGTAATAGGTTATGCCGTCAATAACCACCGCTTTCGCCCAACTGGAGGCTTGATTGATTAAATCGACCAATGCCCCTTGTGTAATATTGATTTCCCATTCCACTAAGCGGACATTGTTTATGGTTGATGTAAATCTCATTGTCCTAACTCCGATGCGTAACGTTGAGCAATCCATTCAATCCCTTTGGCGGTTACTCTCGTTTGGGTAAAATTATGACCGTGTTCTGCCGTGCCGGTTTTTACTGCAAAAAGCTGTTTAGCTTGTTTATCTTGATAAGGGAGTAGGTTTCCTGATTGGCGATAAAGAACTCGATATCGTTCTAAACATTCAATCAACCGCTTTTCTGGAAAATTGAGTATCTTGGCGGTTTCTCGCAATGATTTAGTCGTTCCCACCTCAACATAATGCTCCACAAATGCGACT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TTACTTAATGATGATGCAATTGAATTATTACAAAAGCAGAGAGGGAAAAATCCTAAATATGTTTTTGTAGGAAGCAAAGGGCAGGCATTACAAGATATTAACCGCAAAATATTTAACAAAGCGACTGAAAAATGTTTATTGGTTGATTTCCATTTCCATGATTTAAGGCATACTTGGGCCAGTTGGCACGTTCAGGCCGGCACACCATTATTTACCTTAAAAGAATTGGGTGGCTGGGAAACATTAGAGATGGTAAAGAAATATGCCCATCTTAATGCAGACCATTTACTCAACCACGCTAACTCAGTTAAATTCTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP017527|1640494:1650811|1644161_1645208_-|WP_006247794.1|DBSCAN-SWA MRFTSTINNVRLVEWEINITQGALVDLINQASSWAKAVVIDGITYYWMSFSKVCEELPAVFSKEDTVYRQYKVLKEKGIIDHFKMDGKDYVRLTEKGCEWNKFEPIRESEKNPSIGNNSEQTRKNFRESSEKNPTDNNTNYKNNNDHTTPLNPPAGEPAPAEVVLNYLNSALVTLAVQLGERKPVGYSLKPWAKNITARIRESSVADCCQVVDYLVAKWGRDEKMREYLCPKTIFRQSNFADYFPKSTAWANNGKPVCVNGKWVTPAELEKRLIMPTVDEVRALFQKSLSGNPFKALDFTNKRNLVMYHATINTRNKRPLERDLPMIISQEIKNAVERIDRLRVPTFS >NZ_CP017527|1640494:1650811|1648225_1648822_-|WP_006253352.1|DBSCAN-SWA MKKLLMTLCCLPAFALANETGESCSKIEDSAKRLECYDSVFVKKDTGKDEATDEKSNWEYEQKKDELRNATTYFAKIRSTNTIDFGFPYNSSSMNLMLRKDPKYGNDVIFSVHGQFNGCMIESCKITVKFDDGKLESYRMIGADGGSNDTLFIENAKAMKTFVDKLKKSKKLIVEASFYNYGKGQFTFDTQGLEWKHF >NZ_CP017527|1640494:1650811|1641124_1641448_+|WP_006253316.1|DBSCAN-SWA MEHLTINQVAKELNCHPNTVRQHLADWGFFKMVGSEVWRINREDLERAKKRAGIDPIRKRSDNDRGLSLSVEENEKCRSTDEKQTVRGGLISQPQTARELREALARL >NZ_CP017527|1640494:1650811|1647452_1648190_+|WP_006247789.1|DBSCAN-SWA MLSKQVLSISESRLSTYLFCFFRNDPTKQKEAIAIYTALQHRTGIYFSLIQEIEVALRNEVSQLLRFAAPNHNLYEFFHFLANDSNAPLNAESKRQLQKAISECGRNYNENDIISHISFGFWVNLFNYDIKRNQYVAYWQSVLKPIFGHRFSNFKDLYNTLKQIMRFRNRLYHQEVVWNKRIAKKPTHALENLEKTYKQFELALQKIAPERFAFRQLSQALIWQRQIFFDQQIFEAEIVILPQHI >NZ_CP017527|1640494:1650811|1640876_1641044_+|WP_006253314.1|DBSCAN-SWA MQFTYGSICSGIEATSIAWHGLGKPLWFSEIEPFPCAVLAHRFPNVPNGNGMAVP >NZ_CP017527|1640494:1650811|1649836_1650811_+|WP_006249218.1|DBSCAN-SWA MAGINKVIIVGRLGNDPELRTMPNGDSVAKISVATSTEWTDKTSGEKKQATEWHSIIAFRNLADIIGKYLKKGSQVYVEGKLRTRKWQAQDGTDRWTTEIIADQLQMLGSSNSGNSNNNWATEPAGNPPPTNPYNHVMTDSESRDFDDDIRVRWITKEQAKQFINNISTDWMKTICSFALLTGARRTEILSMTWDKIDFIRKVAIVSNDIAKSEKARSLLLNDDAIELLQKQRGKNPKYVFVGSKGQALQDINRKIFNKATEKCLLVDFHFHDLRHTWASWHVQAGTPLFTLKELGGWETLEMVKKYAHLNADHLLNHANSVKF >NZ_CP017527|1640494:1650811|1646926_1647301_+|WP_006247790.1|DBSCAN-SWA MTEFKDVKQAIVEAQLASTPKDKVVNDIMKGSAELLSANDIINRLGIGADEFQELVNLPNHYLRINGGLGAAVYNTRRMFDTHVELVNQELEKNISFPKPDLYILGKARWKKETFKKWLEEQCR >NZ_CP017527|1640494:1650811|1643557_1644151_-|WP_006247795.1|DBSCAN-SWA MTDFDKNTYQTPNYVRNWLNHRYAWFHIDGCSNGQNTLYTYWIGRAADGLDDDKLSCQIADDFLADDLFDVLLDKVSDWGELLRIFVNPPYSDPLPFVQRAAELKKAGHLVVMLLPADKTTEWYTIIQQHANEVIDIIGYHDEKGTWRTGRIQFINPVTGKPAQGNNKGSMIVVFDPFIEGIVTRQMPLDKIKEWGK >NZ_CP017527|1640494:1650811|1649636_1649834_+|WP_006249219.1|DBSCAN-SWA MARKIDAGVEIVEVDKRFIAKFFYDGKLQHTTYPQYNRQNAIMLINRKIERFNIGRDKPIKLYKE >NZ_CP017527|1640494:1650811|1649467_1649653_+|WP_006249220.1|DBSCAN-SWA MNKMKQLAPFALLILLLGIVGRMDYDDHIQMQRYKCERNQGFWQMESNGNQYCGGKYGTKN >NZ_CP017527|1640494:1650811|1640494_1640869_+|WP_006247798.1|DBSCAN-SWA MHIEDKIAWWLANGETGVSSKTMAFYLGYGIRPKIEGYPHDVSDFRRCFLLLETVPFLRNRIEKMAELGKVWAALAKEWHTLEALYNEEECQIRCPKTYAKLREILEANEENVVRIGNLSISIG >NZ_CP017527|1640494:1650811|1645945_1646134_-|WP_006247792.1|DBSCAN-SWA MKKDDVLEHFGTLEKVAATLGISVSAVSQWGEIIPEKNAYRLQEITAGKLKVKHSLYRNRSK >NZ_CP017527|1640494:1650811|1645204_1645888_-|WP_006247793.1|DBSCAN-SWA MNQLLNISAPKASITMSSREIAELCEKEHRHVTRDIEAMFSQLDIPAEGYAHFWTHPQNGQTYREFRLPYDLTLTLISGYSVILRKKIIDRWQELESRQGIPQSFSQALRLAAEQQEVIEQQNHQLAIQAPKVAFVEHYVEVGTTKSLRETAKILNFPEKRLIECLERYRVLYRQSGNLLPYQDKQAKQLFAVKTGTAEHGHNFTQTRVTAKGIEWIAQRYASELGQ >NZ_CP017527|1640494:1650811|1646258_1646915_+|WP_006247791.1|DBSCAN-SWA MNTQTLGDRIKSRRKELKLTQKDLATALKGVSHVAVSQWESSTTKPNSENILDLSTVLQCDISWLLRGNGESNVLPASLGMTKVPLISYIQAGQWTGIDDFRETCGDYEYILTDLEVSEDAFALEIKGDSMEPDFIEGDRVIIDPDVQPHAGEFVAAINGDYEATFKKYRPLEDLDEYGRQHFELIALNPDYHKLSTLKQEIRIIGTMVEHRIYRRKR |
14 | Mannheimia_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1728216 : 1843952
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP017527|1728216:1843952|DBSCAN-SWA 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112 | Mannheimia_phage(45.9%) | portal,terminase,transposase,tail,integrase,tRNA,holin | attL 1730275:1730333|attR 1853871:1853929 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1853929 : 1861181
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP017527|1853929:1861181|DBSCAN-SWA ATTAATTTGAGCTTAAATTCTTTTCCACCCAAATCCGTTTTCCATCAAGTAAGGTTGCCATCGGTGTTCTGCCACAGCACATTTTTCCTTGATGTGTTCGATGGTGATTATAATACATTAACCACTCATCTAAATCCGCTTGTAATGTCGTTAAATCCGTATAAATTTTCTTCCTGAATGCCACTTGGTAAAATTCTTGTAAGATTGTTTTATGGAACCGTTCGCAGATACCATTCGTCTGGGGATGCTTCACTTTCGTTTTCGTATGCTCTATGTCATTTATCGCTAAATAAAGCTCATAATCGTGATTTTCTACCTTGCCACAATATTCACTTCCTCGGTCAGTTAATATGCGTAACATCGGTAAACCTTGGCTTTCAAAGTATGGTAACACTTTATCATTCAGCATATCCGCAGCACTGATAGCGGTCTTCATTGTATAAAGTTTTGCAAACGCCACTTTACTGTAAGTATCAATAAACGTTTGTTGATAAATACGACCCACTCCTTTGAGGTTGCCCACATAGAAAGTATCTTGTGAGCCAAGATAGCCAGGGTGTACCGTTTCAATTTCACCACAGGCAATCTCATCTTCTTTCTTACGCTCTAAGGCTTGTACCTGTGTTTCACTGAGTATAATACCTTGTTCTGCAACCAGTTTTTCCAGGGCGATTAATCTTTGCTTAAAATTGGCAAGATGATGACGTAACCAAATCGAACGTACACCTCCTGCTGAAACAAAGATGCCTTGTTTACGGAGTTCGTTACTCACTCTTACCTGTCCAAATGCCGGGTTATCAAGAGCAAACTTCACAACAGCTTGCTCTATTGCCTCATCAACACGATTTTTTAAGTTGGGAACGCGTCTATTTTGATTCAGCAATGCTTCAACACCACCTTGCTCAACCGCTTGTTGATAACGATAGAATGTATCTCGGCTCATTCCCATTACTTTGCAGGCTTGAGAAATATTACCCAGTTCTTCTGCTAAATTTAATAAACCGGTCTTGTGTTTAATGAGAGGGTTGTTAGAATAAAACATGAGAGTTTCCTTTTTGTTTAGATTGATTTTTGACACTCATATTCTAAACGGGAAACTCTCACTTTTTAGAGTGAATTGTCAGATCAAGTCTGATCTTCTACATTCCGAAAAATTCTCAGATGTTCCGAAACTAGGTTTTAAGGTTTGTGTTTTTGGGAGGAAACGCTTTCTTGAATTGGGGTTACTATCGGGGCTTTTCGGATATAGACTTTTGTCATTTGAACGCTAGTATGACCTAATTGTTGGCGTGCAGCTTCTTCTCCTTGTGCAAGGGCTTTGTCTGTCCCTGACTTAGCCCTTAGATCTCTAAATTGGAATTCCTTTATTTCATTTGCGTATTCGGGATGTTTTTTTGCTGCTTGTTCTCGGATATAAGTAAAGCGTCTTCCTAATTTTACAGAGGTCATTTTTTCTCCTTTTGACGTTGTAAATAAGAAATTCCTTGTGGTTTTTTCTAACCTACTTTGAATTATATCAGCAAGTTTGCCAACTATCTCAATCCGCAGTTTGGCTTGTGTTTTTTGTTGCACAATATGGAGATATCCATCAAATATATGATCGCGTTGGATATTAACTAAATCTACAGGTCTTTGTCCTGTAAGGTAAGCGAGATCCATTAAATCTTTAATATCCTGATCTGCTACTTCATACACCATTTCAAAAATATTGTTCTCAACGTAAATTTCACGTTTTCTAATTGGAAAGCGTTTCATTCCTGTATTAGGACTAGCTAACGTTGTGTAACCCCACTCTCTTGCGTATTGCCAAATATGACCGAACATTGAAAAGGGCTTTGATAAAAATTCTTAGTGAATGTAGTCTTTGTGGTTGTTTAGCGTTGTTTGTGCGTTCATTTTGGTTTCCCCTTTGTCTGTGGCGTTGTTTGTTTTGATGGGTGTAGTTTAGTAAATATTAAACATTTAGTAAAGTGTTTATTTAGTGGAAAATAAATAAAGTTTAGTTCTGTTTAGTAATTTATTGATTTTAAAGAGAATTTATTTTTAGAAAGGTTGTTTGATTGCTTAATAAATAAACAGATTGAGTTGCAAGCGGTCGTTTTTGAAGAGAATTTTGCAGATTTTAGGAAAAAGAAAACCGCCCGTAGGCGGTTATTTTATTAGTGAGGGAGAATAGTAAAGTGTTGATTTAGCTTACCATAGGCTTTCTCAACAAATTCTACTTTTGTGGAATGATTAAAATCTAATAGGCGATCTATCTGTGGTAAGTGTACATCTAATCGTCTTGCCATTTCTGCTTTGCGTACACCTTGTTTAATCATTTCATTTAAGAGAAATACTTTCATTGATTGCAGCACGGTAAGATTAACCGTATGTTGTCCCTCTTTAATTGGGCTTGGCATTGGTATTTCTCGTCTATCATCAAAATAGAATTCAAGGGCTGTGGCTAAGCCATCTTGTGCTTCTAATAGGGCTTCTTCTAAGTCCTCACCTACGCTTGCCATTTCAGGAATATCAGGGCAAGTCACAAGATATGTGCCGTTATCATCAGGGGTAATTTCAACTGGGTAGCGTAACATATAAACTCCTAGAAAAGCCCCTCTTTCGAGGGACTTTGTTATTTAAGATCTAAGTCTTTCTTAATCTTATTTACTAAACCTGTACCAATCTCTTTGCTCCCGTGATAAGGAAAAACCGATTGTTTTCCGTTTAGTGTTACCTTTCGATGACTGCCTCGCCTATGGTTTTCAATTTCGCAACCTTGAGCAAGTAAGTACCTCAGGAACTCGCTGTATTTCATAAGATACCTCCTTATCAAAACAGCAAGGAAATAATACAACATTTTTGTTGGTATTACAACATTTTTGTTGTGTTTTTTTTGTAGCAGAAAAGAAAACCGCCACGAGGGCGGTTTATTCAAGGAATATTATTTTATCTTTTGAATTGTTGTAGTAACAGATCGAGTTTATTATCAACCCCATCTATTTTCTTCTCCATATTGCCTAGTCGCTGCTCAACATTGTCTAGTCGTTGTTCGACATTATCTAATCTAGATTCAACTTTAGTGAGGCGAATATCAAGATTTTTGATATTGGTCTCTACTTGGACAAACTTATCATCAATTTTCGAGAATCGAGCTTCAACTTTGGTGTCAAGGTGTGAATATACTGTCCATAATGCAATTCCAGCAGTAACTACTAATGCAATGAGTGTAGAGCCACCAGCTTTATAAAAAGCCTCTTTCGTCAAATAATTTGACTTGATTTCTCTTACATCGCCTTCAACTTGTCTTAATCGAGCATATAAATTCACTTCTTCCGTCTCCTGATAACTAATTTGTGAATTATTATGCCCGCCGTATACTGCATTTGCAAGTAAGGATAGTATGATTGCATCTCTAGGATCATTTTGAATCATTGGTCTATTCATTTTGTGAGCCCTTAATCCATTCTAAAATTCTCTCTCTGTCGAAAAAAAGCATATTATTACAGCAAACACAAGTGACAATAACGGCTGTTCTCGCTTTTTGGTCTAACCAATATTTTGTTCCTTCCCGTTCATTGAAATGCAAAGAATGAAATTCAGGAGCTGCAAATTTCATAACTTCATCAGGAGATGGCTCTATTCGGTATGGAATGGTTGGAACACCGATAATTTTCTCTCCGCATAATTCCGTAAAAGTGTCATAGCCATCGTGTAAATAATGTTCTTGGCTATTACAAATAGGGCAAGTTAAATTCCGCCCAGTACGTTGCGTGATAAAATCCGCAAACTGTTCAGGTTTAATGCGTTTATTATTCATTTTAACTTCCTTTCTACCCAATAAAACAACCGCTGGCTACAAATAGCTCCGATGCTCAACCGCTACGCTAATGCCTACAAGTCTTTAGGATTTATTGGCAATACTCGAATAAATTTCCCAAGGATAATAGCAGTATCTAAGGTTTCTCTCTTTATATCAAAAGGTTCGTAAGTCTTGTTGTCCGATAGGGCTCTATAAATACCACCTGGAATTTTTTGTAGTCTTTTTATATAAACTTCATCATCAATAACAAAAATATAAACACCCTCGTTATCGTAATAATTGATTGTAGTATCAATAAAAACAACATCCCCTTTGTTTATTGTTGGGCTCATACTATCAGTTGGAATGGTGATCATCTCAATGCCATTGCTTGATTTTCGCCCTACAATTTCAAGCAAGCCGTCTAAAGAGAAATAGATAGATTGAATAATTTCAGGATAGTTAGTATTGACAAAACCTGTTTCGCCCGCCTTAGCTTTGAAGTCAATTAGATGAATGGGGTATTGATGAGACTGTGTTTCTTGAATTGACATAGCAGACACAATCGCACTTTCTGTTTCTTCATCATAGTCCAAATAAAAGCTAGGCATTCCATATTCATTCTCTAATCTTCTTGCTGCACGCTCACCAAAAGATGATTTTCCTGATTTTAATTGTGATATGTAGCTTTTTTCCTTTTCTGGAATATCTCTTGTGTTGAACCATTCTGTAAGTTTTTTTCTGCGAATCTCTGGCAGGGTCATACCTTTAATCATAATTAACCTCACTTTTCATTTTTAAATTATTTTATTTAGAATTTCCTAAACAAGCAAAAGCTAAACTTTACTTGACTTTGTATTTAGTTAAATCTAAACTCAATCTAATTTTTACTTAACGGGAGTGTTAATGAACTTAACTAGTTATTTGTCAGATCGCCCTCGTGGTTTCAAAGCTGACTTTGCAAAAAAGCTTGGTATTTCCAAATCTTATTTACGACAAGTTGAAACAGGGTATTCACCAATGCCAGCCTATCTTGCTAAGAAAATTGAAGAAGTCACGAATGGCGAAGTAGCCAAATCTGAGCTTCGCCCCGATCTGTGGGATTAATTTACCCAAAGGAATGTGCAATGCCACGCAATGAATTAACAAAAAATGCAAGAGCAATCGGACTGAGTGAATTACAATTTAGCCGTACATTTGCAGATAATGTGGAAAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP017527|1853929:1861181|1856859_1857357_-|WP_006250077.1|DBSCAN-SWA MNRPMIQNDPRDAIILSLLANAVYGGHNNSQISYQETEEVNLYARLRQVEGDVREIKSNYLTKEAFYKAGGSTLIALVVTAGIALWTVYSHLDTKVEARFSKIDDKFVQVETNIKNLDIRLTKVESRLDNVEQRLDNVEQRLGNMEKKIDGVDNKLDLLLQQFKR >NZ_CP017527|1853929:1861181|1860354_1860744_-|WP_006247811.1|DBSCAN-SWA MADPIEWSIITTDCFDEWFGQQDESTQERVLACLIYLRKFGYSLGRPYADTVYQSKFPNMKELRIQNKGKPIRAFYAFDPLRQAIVLCAGEKGKDKRFYEKMIALADAEFTSYLNNLEKENENVRSNAQ >NZ_CP017527|1853929:1861181|1857804_1858488_-|WP_006248824.1|DBSCAN-SWA MIKGMTLPEIRRKKLTEWFNTRDIPEKEKSYISQLKSGKSSFGERAARRLENEYGMPSFYLDYDEETESAIVSAMSIQETQSHQYPIHLIDFKAKAGETGFVNTNYPEIIQSIYFSLDGLLEIVGRKSSNGIEMITIPTDSMSPTINKGDVVFIDTTINYYDNEGVYIFVIDDEVYIKRLQKIPGGIYRALSDNKTYEPFDIKRETLDTAIILGKFIRVLPINPKDL >NZ_CP017527|1853929:1861181|1853929_1854970_-|WP_015587044.1|transposase|DBSCAN-SWA MFYSNNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNLKNRVDEAIEQAVVKFALDNPAFGQVRVSNELRKQGIFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLIALEKLVAEQGIILSETQVQALERKKEDEIACGEIETVHPGYLGSQDTFYVGNLKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKTAISAADMLNDKVLPYFESQGLPMLRILTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHTKTKVKHPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKKIYTDLTTLQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMATLLDGKRIWVEKNLSSN >NZ_CP017527|1853929:1861181|1857349_1857730_-|WP_006248823.1|DBSCAN-SWA MNNKRIKPEQFADFITQRTGRNLTCPICNSQEHYLHDGYDTFTELCGEKIIGVPTIPYRIEPSPDEVMKFAAPEFHSLHFNEREGTKYWLDQKARTAVIVTCVCCNNMLFFDRERILEWIKGSQNE >NZ_CP017527|1853929:1861181|1859220_1859907_+|WP_006247808.1|DBSCAN-SWA MAANSINASHIVGSSITADKLNVNNLAAISANLGKVTAGTITGTTISGGTISGTTITGGIIKGARIEGLTGKFTGELEINQLIGGNIYEAKTWTSKATGKSKTYSETKNSFALSDTYYEYVCQFVLPATKATRTLYVVHTPTGESKSETFYGSGSNRTPTTITLPSVIDISNTISPNVSNPFNDSGAILIANTQYVVTCRAWCAGRGRSAKVNFRAIISSTNGSSYQL >NZ_CP017527|1853929:1861181|1858618_1858819_+|WP_006248825.1|DBSCAN-SWA MNLTSYLSDRPRGFKADFAKKLGISKSYLRQVETGYSPMPAYLAKKIEEVTNGEVAKSELRPDLWD >NZ_CP017527|1853929:1861181|1860887_1861181_+|WP_006250050.1|DBSCAN-SWA MTTFNKILNPMYSTIASYSTQDDGSLNAKYVVGTGDDTDGEVTNFVIITSEYKYIDAQSAKEITDAPLTKEDIGKTPTQIMLGRIYKYLKETGQIVV >NZ_CP017527|1853929:1861181|1856087_1856507_-|WP_006250074.1|DBSCAN-SWA MLRYPVEITPDDNGTYLVTCPDIPEMASVGEDLEEALLEAQDGLATALEFYFDDRREIPMPSPIKEGQHTVNLTVLQSMKVFLLNEMIKQGVRKAEMARRLDVHLPQIDRLLDFNHSTKVEFVEKAYGKLNQHFTILPH >NZ_CP017527|1853929:1861181|1860083_1860383_-|WP_006247810.1|DBSCAN-SWA MKTLDQMLNELSPERRQKVEDMAQEMIREIQLSKLREELNLSQQQLATALGISQPAIAKLEQKDNDPRLSTLKRYIEAMGGKLKLAVELPTGDERVIRI >NZ_CP017527|1853929:1861181|1856545_1856728_-|WP_006250075.1|DBSCAN-SWA MKYSEFLRYLLAQGCEIENHRRGSHRKVTLNGKQSVFPYHGSKEIGTGLVNKIKKDLDLK >NZ_CP017527|1853929:1861181|1855107_1855752_-|WP_006253274.1|integrase|DBSCAN-SWA MFGHIWQYAREWGYTTLASPNTGMKRFPIRKREIYVENNIFEMVYEVADQDIKDLMDLAYLTGQRPVDLVNIQRDHIFDGYLHIVQQKTQAKLRIEIVGKLADIIQSRLEKTTRNFLFTTSKGEKMTSVKLGRRFTYIREQAAKKHPEYANEIKEFQFRDLRAKSGTDKALAQGEEAARQQLGHTSVQMTKVYIRKAPIVTPIQESVSSQKHKP |
12 | Mannheimia_phage(75.0%) | transposase,integrase | attL 1846855:1846868|attR 1856134:1856147 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2296112 : 2304267
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP017527|2296112:2304267|DBSCAN-SWA AATGTTAGATCTCACCAAGATTAAATTAGTGATTACCGATGTGGACGGCGTGCTAACCGATGGCGGAATGTACTACACCGACCAAGGCGAAGTAATGAAACGTTTCCACGTTCACGATGGTTTAGGCGTTAAGATGTTACAAAGTTGTGGCATTAAAGTGGCAGTACTCTCGGGCGGCGATACGGCTTTGCTCCGCAAACGGTTAGAGGTGCTGAAAATTGATCTCGCTTTGTTAGGCAAAATGGAAAAACGCTCCGCCTGCTTTGAGCTAATGCAGCAAGCCGGTGTTACCCCTGAGCAAACGGCTTACATTGGTGATGACACCTTAGATTTACCGGCTTTTGAAGTGTGTGGCATTGCGATTGCAACCCGTAACGCCCTCGATTACATCAAAGAAAAAGCAGATTGGGTATTGCAAAAAGCCGGTGGTGAAGGGGCGTTTCGTGAAGTCTCCGACCAAATTTTGGAGGCTCAAGGATTCGGTGAAATTTTTAAAACCGCAGATGGTTTTTTAACGGTAGCGGGGAAAATGGCTCAGTAGACTCTTCAAGCAGTTAAATTTCATTTTATTTTTGCGATCTGCATCGAAAAAATGTATTTCTAATCTGATTTTCAAATTACTGTTTGCTAAATTAAATTTAGTTCTTGTTAGATTTATTTTATGTATATACAATAATTATGAAAATTTATACTTGGGACGAAACTAAACGCAAAATCAATTTAGCCAAGCACGGATTAGATTTTGCCGATGCAGATGAAGTTCTCTCATCGCCCTATCGATTTGATGTTGAAGTTATTCGTAACAATGAATTTAGAATACAATCTTTTGCATATTCATTTGGACGTTTACTCGTATTATCACTTGCATATACAGAAAGGGAAGATTACATCAGAGTAATTAGCTTTCGGCGAGCATCTAAAGCAGAAAGAGAGGCATATTATGAATACTTACAACAATACTTTGAATAATAAAAATTTAGAGAAAAAACAGCTACTTATGGCTATTCAAGCTATTCCGGCAAGCCAAGATTTTATTTGGGACGGAAAAGATGACGATGAACGCCCGGTTACGCCATCAGAGTTTTCAATTGCAATGAAAAAACGTGGCAGACCAGCTGGTTCAAAGAAAGAATTGGTTTCGTTACGTCTTGATAAAAGCGTTCTTGAAGCCTTTAGAGCTTCAGGTAAAGGTTGGCAAAGTAGAATTAATCAAGTTTTAAGTGATTTTGTAAAACAAGTTTGACCACAAAACAAAGGCGGTTAATCCGCCTTTTTCCCTTCAATATATCGCTCGAAGTTTTGGATATATTCATCTAAATTTGCAGTGAGCATTTCTTTGTATTGCTCCACAAAATATTGAATAACTTCTTCTCTGGAATCGGCCAACTGCTGTTTATATTCCGCCTTGCTTGCCGCAACATAGGCGTTAAATCTGGCACAACCAAACAACATCGCATTGCTGACTTGGTTTGGGGCAATGTTTTTTAAATGAGCGTTGGCAACGTTAATAAAGCCGTCTGCTCGCTGGTAGACGCTGGTAGAAAGTTGGGTCAATTTGTTTATCGGTAATGTTAATCATAGTATCCTCATTTTTAGTCAAAATACAAGCGGTGCTTTTTGCGTAAAATTTTGCACAAACGCTTGCGTTTGAACGTTGGCTCTGCCGACGGCACGAAGTGCGAGCGTAGCGAGTAAAAAAATCACCGCTTGTAGGCATTTCTAGCCGTCTAATGAAATCGCTTCCTTGATTTTCTTCAATGCGGCATTTTCAAGCTGTCTTACCCGCTCTGCCGAGATGTTATATTTATCGGCTAAATCTTGCAGTGTGGCTTTATTGTCATCTAACCAGCGGGTTTTGATGATGTCTTGGCTACGTTCATCAAGGGTGGCTAACGCATAGGCAAGTTGAGCGGTTGCCTGCCCATTATGTTGTTCGTCTTCCAAGTCATCGGCGAAATTGGAGCTGCTATCTTCAATATACATAGAAGGAGCGTAGCTGTCTTCATCGTCATCACCGGCAGGCAGGTCAAAACCTAAATCTTGTCCGGTCATTCGAGATTCCATTTCTCGTACTTCTTCCACTGAAACCCCTAAATCATCGGCAACTTTTTTGATCTCTTCTTCATTAAACCACGCCAAGCGGTTTTTATTTTTGCGTAAATTAAAGAATAATTTACGTTGAGCTTTGGTGGTTGCCACTTTCACAATTCGCCAGTTTTTCAGCACATATTCGTGAATTTCCGCTTTCACCCAATGAACCGCAAAAGAAACCAACCGCACGCCGACATTCGGGTCAAACCGTTTTACCGCTTTCATCAAGCCGATATTACCCTCTTGGATCAGATCTGCCAGCGGTAAACCATAGCCCAAATAGCCACGAGCAATATGGATCACAAACCGCATATGGGAAAGGATCAGCTGTTTTGCCGCCTCAACGTCTTCATCATAATAATAACGCTCCGCCAGTTCTTTTTCTTGCTCGGCGGTGAGAATCGGATACTGATTTGCCATTCGGATGTAGCTATCCAAATTGCCCTGCGGCACAGGCATTGAGCCGGAAACCAAAGCCGGATGCATTGCTTCTACCGATGTTTCTTCTTCGTCTATCTCATCAACATCAATCGGCTCGGCATCTATAATTTCAGCATCTTCAATCTCGTTCTCGTTAAATTTTTTCATTCTATTTCTCTTCACTCTCAGCAAGGTTTACATTATAACAGAGTTAAATCTATCTGGTGTGGGATTTGTATGATTTTATTTCGAGCTATTCAATACCGCTAAGTTCCGCCACTTGCAAAACTTTTTGCAAATTCGACCGCTTTCCTTTAGAATACCGCTACTTTTGGGGCTGATTTTGGATTCGACGGGATTGGCGAAGCCCAAGGTGCATGTCGAGGTGCGGTAGGCCTCGTAAACAAACCGCAAAATAATAGTCGCAAACGACGAACAATACGCTTTAGCAGCTTAATAACCTGCTTTAAAGCCTTATCTCCTCAGCTTCCGCTCGTAAGACGAGGGCAAAGATAAGTCACCCAAAACGAGATCGTGTGGACGCCGCCGCTTTAGGATCGAAACACTAAATTAAATAAAGCTAGTTTATTCATTGCGTGTCTGTCCGCTGTGAATAAGCGAAATTAAAGACTAGACTAAACATGTAGTACTGAAGGTAGAGAAATTTCGGACGGGGGTTCAAATCCCCCCAGCTCCACCAAATTATAATCCTATACGGTTCAACCGATACCTAAAAAGCCTTGAAAATCAATGTTTCAAGGCTTTTTTATTGTCCGTTGCGTACCTATACGATACAATCAAATCCGAAGATTTTAGGAGTATATTTAGGAGTACGCCGGAATACCCCCAAAAATTCGTACTCCTAAAACCACTTTAGAGCCTTTTCAAATAAGGCTTTATCGCTTTTAGTTTTGTACTCCCAAACAAAAAATCATACTCCTAAGATTTAGGCTTTATACTCCTAAAGGTTTACTATGGCTAGAAAAATCACACCGTTAAACGATACCCAAATAAGAAAAGCGAAACCGGAAGACAGCCCATTAAGAGACGGTAACGGCTTACTACTTGTTATTACCTCAAATTCTAAATTGTGGCGGTTTAGGTATGAAAGACCGTTCACAAAAAAGCGGAATGATTTAAGCATTGGGGCTTACCCTGATATTTCTTTAGCACAAGCGAGAGAAATTAGAGAAGAATATAGGGCATTATTGGCTCAAAATATCGACCCTCAAACCCACCGCCAACAACAGGAACAGGCAAAGGCCAACGAAATCAGCAACACTTATGAAAATGTAGCGTGGGCGTGGCTGGAACACCGCAAGACCAAGAAGAATTTTTCAGACAACTACCAAAAAGATGTAATCGCCTTAATTAAAAATAACCTCTTGCCGCACTTTGGAAGAATGCCTATCACACAAATAACCGCACCAATGGCAATCAAGGCATTCAAGCAATACCAAGACGAGGGCAAACTAGAGAAGTTAAAACGGGCAATTCAAAAACATAATGAAATTATGATGTTTGCCGTACACCGTGAAATGATACCGTTTAACCCTACCGCCAATATTGCGAAAGAGTTTGATAGCCCAACGGTTGAACATTTCAAAACCATTAAGCCGGAAGATTTAGGCGAGTTTTTATACACCTTACAAAACGCCCAAATTCATTTACAGACACGCTATTTAATTCTGTGGCAGTTACTCACAATGACCCGCCCGAATGAAGCGGCTAAGGCAAAATGGGCGGATATAGACGAAAAAGCCAAACTGTGGACGATACCGGCGGAAAATATGAAGCGAGGCATTGAGCATAAAATCACACTCTCACGCCAAGCAATCGCACTTTTGCGAGAGATTAAAAAGCTAAGTGGCGGTAAAACGTATTTATTCCCTAGCGTGAAGAACCCACAAACGCACGTCAATACTCAAACCGCCAACGGTGCGATCAAACGAATGGGCTACAAGGGCAAATTAGTGGCTCACGGCTTGCGGGCCATCGCCTCCACTTATCTTAATGAGAAAGGCTACAATAGCGATTTAATCGAGGTTGCCTTATCGCATTTAAACAGCGACCGAATCAAAGCCGCCTATGATAGAGGCGAACGCCTAGAGCAACGTTTTAAACTGCTCCAAGTGTGGGCGGATTTTGTAGAGGAATGTTCGCAAGGTAGCTTACCGCAATATCATTTGAAAATAGCCTAGTAAATTTTCCGCCAAAAATGACCGCTTGTAATGCCGTTAGGTAAACCGCCTGACGGCTTTTTTATGCCCGTAATTCCCCTTGATGAAAATTCTGTAAACTTTTCGATTTTTACCCACTTTACCCACTTTTCACTATTATTTTTTTATAACTAACTGAAAAATAAAGAAAAAATGACAGTGGGTAAAGTGGGTTAAAAGTGGGTAAATGGCAAAAACCCTTGCTCACTGTATCTTAATGGATACAATAAGCAATAAATAGAATAAGAAGCCGGCAATGATGAGAGAGCAAACCACTAATCAAATTATTATTACCGATAATTTTTCAAAATGGCTTGAGAATTTAAAGAACCCTATCGCAAAAGCAACGGTAGCAAGACGGATAAAAAATGCGATTAATGGCAACTTTGGCGATCATAAATCTTTAGCCGGTACAGGCGGACTTTATGAAATGCGGATAGCAACAGGAGCCGGATATAGAATTTATTACGCATAACAAGGAAATGTAATTTATATCTTGTTACACGGCGGCGATAAATCAACACAGCAAGCCGATATAGAGAAAGCGAAAGCATTATGGGCTGAATTAAAAACTACAGGAGAAAGCAATGGAAACAATACAAATCAATGAACAGGCAGCAGAAAAGCACGGTTTACGCCCTTTTGACGTGGCGGAGTTTTTAACCGATGAGGCAACTATTCAAGCCTATTTAGCGGAAGTGTTAAAAGAGGGCGACCAAGACGAATTTTTAGAAGCCTTGAACGATGTAGCAAGAGCAAGAGGAATGGCGGAGCTGGCCAAGCAAACAGGGCTAGGCAGAGAGAGCCTATATAAAACCCTAGCCAAAGGCAGCAAACCACGCTTTGACACTATTCAAAAAATTCTAGGGGCATTCAATTTAGTGCTTATTCCACAAGTCAAAAATGGCTAAAACTTATCACTTGCTACCTGTCAAAACCTCACTTTTAAATAGCCGTTGATGGATATTGACGGCTTTTTATTTGCTCCTTGCGTGCGTACTGCTCCGAAAATTCCGCACTATTCGCAAAACCTTAATGAAATATGACCGCTTGAATGCTCTTTTTTATAGCGTCCGGAAACCCATCTTTAGCCTATTTTGATTTACTGTAATAAAACACAGCTTATTACTTGTAATTTATCTGAATAATTAGCAAAATACAACCTATCAAGTTCAATCCGTAACTATACGGATTTATTCAAATTAGCGTGGATAGTGGCGGAGTAATTAACCGGCACGAAAGGAGAAAGCCCTTTATTTCTCTTTCCACGCTCTCACAGTAAAGGGATACGTTAAAGGGGCGCTTATGGCAGATCACAGTCAATTTATTTCTAGGCTTGAAAATCGTATTGAGCCCAAAATCAGCTTTCAAGAACTGATACAAGAATTATCAAACTATACAAATAAACCTTTTTCACATATAGCGGATAAATTGAAAAGCCTCATTTTTTCCTTTCAGCAAAATGGAATATATACGAATGCTTTTGTAAATTGCACTCTCTTTGAAGATGGTGAAAGCTATGCTATTGAGCCCAAAACACTACATTTCAAAGACGCTTTCGATCAGCCTAAAGGCGTTTTAAGTGATGTTATTGCTCAAAATTCTATTGATGTTGAACATTTAAATGCTTATTACGTAACAGCAAGAGAAATAACACAGCTGATTAAAACACAATCGCCAACCTTGTTAGATAAATTAACCACCAAGCAAACACAATCAGAGATTAGCCAAATTCAAAATGATTATATTTCTGTTTATGACTTCATAGAATGGGCAAGTAAACATTACTCAAGTCTTAGTGAAACAGCTAACGATTTAAACCGCTTACTCAAAGATAAAAATATACAGCTTTATCGACAATATGGCGGAATAAGTCCAAGCATTGATAAAGATAATACTAATTTAAAAGCAGCCTTTGATTTTGTAGCAATTAATAACGGATATGAAAAACAATCAAGCAGCTTTAATTTTGATGATGATATTCCGTTCTAGGTGGCAGCAATGAATTTAAATGATTTCCAAAATTTACTTTTAAATAAACAAGAATTAGAAGCAGCACTAGGGAAAAAGCTCGATTTTTCTGAGATAACACCTGATTATTTAGCAGACTATTCACGTTTTTAAGCCTCTATTCTGAAACCGAGCTTACCCATTGCCCGAGCTTTTAATTGTGCTAGGCAACCGAATAGCGAAGCTGGAACAACAACATAACGCAATGCCAAGCGAAACCGATTCAATCACACTCGGCATTTTAAGAAAACAACTTAGCCAACTGTTAAAAGTGGCGGAAAGAATAAAGGAATAAACCAAAATGAAACACGAGCTTAATTTAGCGGGTATTACTGCTTTAATGAATGAACCTATCAAAGCAACCTTGAGCTTTTTAGATTTTCCGCATATCCGAATTGAACGACTGCACCACGATAACGGCAGACCGTTTTTTATCGGTGTGCTTTCTCTTGACCTTGAAGATCATATCAATATTGAAATGGCAGGGGCTACGGGCTTTTTAGAGGCTCTAGCGATTATTGCCTATCATCAACAGCTAACCGCCACGCCGCTATTAGTGAATGATGACTTATTGAGTGAAATCAACAAGCTCCCCCACCCACAACGAACAAACCCATTTATTGACCGACACGGCAACGAAATTACACGGGAGCAGATGAGCAAAGAATACCGAGAAAAAATCGATTATGCCTTTGCTGAAAAGCGAATGGCGGAGGGGAAAGAATGACCGAACTCACACCAAAACAAGAGGCTTTTTGCTTTGCTTATATTGAAACCGGCAATGCTAGCGAAGCCTACCGCCAAGCCTATGAAACCGAAGATATGAAGTCCGAAACCGTCCACCGAAAAGCTAAAGAGCTAATGGATAACGGCAAGATTACGGCAAGGATTGAGGAACTGAAAGCCGAACACGCAGAACGCCATAAATTAACCGTTGATGACCTTTTAAAGGAGCTGGAAGAGGCTCGTATACTGGCGAGAGAGAAAGAAAACCCTAACGCAATGACTCAAGCCACAATGGGCAAAGCGAAGTTGCTAGGGCTGGATAAGCAGGTTACCGATCCGTGCTTTGATGGTGAAACCGGTAAAGGAGATATGATTTTAAGTGTAAACTGCTCAAGCATTAAAGACGGGAAAGCACTTGATGAAACTTGTATTTTAAAGGCAGGAACACACGAATTTATCACACGGGACAGCTTTATTTTCTACCGCCATATAAGAATCGATTCGTTAGATGAGATTAAGGCAAATATAGAAGCCGGTTATTTCATTCAAAAAGCCCTAATTAATGATGAAGCCTATCAACAAATACTAAAAGGCGTACTATCGTCAAAATCAGTAACGCCTAGATATAAACGCTTCCTAAAAAATGCAATCCGCCAAAGTGCTTGCCCTGATATTCTAGCCGAACCTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP017527|2296112:2304267|2297830_2298790_-|WP_006250280.1|DBSCAN-SWA MKKFNENEIEDAEIIDAEPIDVDEIDEEETSVEAMHPALVSGSMPVPQGNLDSYIRMANQYPILTAEQEKELAERYYYDEDVEAAKQLILSHMRFVIHIARGYLGYGLPLADLIQEGNIGLMKAVKRFDPNVGVRLVSFAVHWVKAEIHEYVLKNWRIVKVATTKAQRKLFFNLRKNKNRLAWFNEEEIKKVADDLGVSVEEVREMESRMTGQDLGFDLPAGDDDEDSYAPSMYIEDSSSNFADDLEDEQHNGQATAQLAYALATLDERSQDIIKTRWLDDNKATLQDLADKYNISAERVRQLENAALKKIKEAISLDG >NZ_CP017527|2296112:2304267|2297615_2297828_-|WP_015484067.1|DBSCAN-SWA MPTSGDFFTRYARTSCRRQSQRSNASVCAKFYAKSTACILTKNEDTMINITDKQIDPTFYQRLPASRRLY >NZ_CP017527|2296112:2304267|2297051_2297354_+|WP_006250278.1|DBSCAN-SWA MNTYNNTLNNKNLEKKQLLMAIQAIPASQDFIWDGKDDDERPVTPSEFSIAMKKRGRPAGSKKELVSLRLDKSVLEAFRASGKGWQSRINQVLSDFVKQV >NZ_CP017527|2296112:2304267|2301428_2301752_+|WP_006250284.1|DBSCAN-SWA METIQINEQAAEKHGLRPFDVAEFLTDEATIQAYLAEVLKEGDQDEFLEALNDVARARGMAELAKQTGLGRESLYKTLAKGSKPRFDTIQKILGAFNLVLIPQVKNG >NZ_CP017527|2296112:2304267|2301097_2301316_+|WP_006253767.1|DBSCAN-SWA MMREQTTNQIIITDNFSKWLENLKNPIAKATVARRIKNAINGNFGDHKSLAGTGGLYEMRIATGAGYRIYYA >NZ_CP017527|2296112:2304267|2296112_2296652_+|WP_006250276.1|DBSCAN-SWA MLDLTKIKLVITDVDGVLTDGGMYYTDQGEVMKRFHVHDGLGVKMLQSCGIKVAVLSGGDTALLRKRLEVLKIDLALLGKMEKRSACFELMQQAGVTPEQTAYIGDDTLDLPAFEVCGIAIATRNALDYIKEKADWVLQKAGGEGAFREVSDQILEAQGFGEIFKTADGFLTVAGKMAQ >NZ_CP017527|2296112:2304267|2303152_2303578_+|WP_006250289.1|DBSCAN-SWA MKHELNLAGITALMNEPIKATLSFLDFPHIRIERLHHDNGRPFFIGVLSLDLEDHINIEMAGATGFLEALAIIAYHQQLTATPLLVNDDLLSEINKLPHPQRTNPFIDRHGNEITREQMSKEYREKIDYAFAEKRMAEGKE >NZ_CP017527|2296112:2304267|2296789_2297080_+|WP_006250894.1|DBSCAN-SWA MKIYTWDETKRKINLAKHGLDFADADEVLSSPYRFDVEVIRNNEFRIQSFAYSFGRLLVLSLAYTEREDYIRVISFRRASKAEREAYYEYLQQYFE >NZ_CP017527|2296112:2304267|2303574_2304267_+|WP_006250290.1|terminase|DBSCAN-SWA MTELTPKQEAFCFAYIETGNASEAYRQAYETEDMKSETVHRKAKELMDNGKITARIEELKAEHAERHKLTVDDLLKELEEARILAREKENPNAMTQATMGKAKLLGLDKQVTDPCFDGETGKGDMILSVNCSSIKDGKALDETCILKAGTHEFITRDSFIFYRHIRIDSLDEIKANIEAGYFIQKALINDEAYQQILKGVLSSKSVTPRYKRFLKNAIRQSACPDILAEP >NZ_CP017527|2296112:2304267|2299596_2300823_+|WP_006250282.1|integrase|DBSCAN-SWA MARKITPLNDTQIRKAKPEDSPLRDGNGLLLVITSNSKLWRFRYERPFTKKRNDLSIGAYPDISLAQAREIREEYRALLAQNIDPQTHRQQQEQAKANEISNTYENVAWAWLEHRKTKKNFSDNYQKDVIALIKNNLLPHFGRMPITQITAPMAIKAFKQYQDEGKLEKLKRAIQKHNEIMMFAVHREMIPFNPTANIAKEFDSPTVEHFKTIKPEDLGEFLYTLQNAQIHLQTRYLILWQLLTMTRPNEAAKAKWADIDEKAKLWTIPAENMKRGIEHKITLSRQAIALLREIKKLSGGKTYLFPSVKNPQTHVNTQTANGAIKRMGYKGKLVAHGLRAIASTYLNEKGYNSDLIEVALSHLNSDRIKAAYDRGERLEQRFKLLQVWADFVEECSQGSLPQYHLKIA >NZ_CP017527|2296112:2304267|2302146_2302833_+|WP_006250286.1|DBSCAN-SWA MADHSQFISRLENRIEPKISFQELIQELSNYTNKPFSHIADKLKSLIFSFQQNGIYTNAFVNCTLFEDGESYAIEPKTLHFKDAFDQPKGVLSDVIAQNSIDVEHLNAYYVTAREITQLIKTQSPTLLDKLTTKQTQSEISQIQNDYISVYDFIEWASKHYSSLSETANDLNRLLKDKNIQLYRQYGGISPSIDKDNTNLKAAFDFVAINNGYEKQSSSFNFDDDIPF >NZ_CP017527|2296112:2304267|2297371_2297665_-|WP_006253765.1|DBSCAN-SWA MTQLSTSVYQRADGFINVANAHLKNIAPNQVSNAMLFGCARFNAYVAASKAEYKQQLADSREEVIQYFVEQYKEMLTANLDEYIQNFERYIEGKKAD |
12 | Synechococcus_phage(16.67%) | terminase,integrase | attL 2299318:2299377|attR 2304683:2304756 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017527.1|WP_006250250.1|1280515_1280746_-|hypothetical-protein |
1280515_1280746_-
Protein sequences of NZ_CP017527.1|WP_006250250.1|1280515_1280746_-|hypothetical-protein>NZ_CP017527.1|WP_006250250.1|1280515_1280746_-|hypothetical-protein MNAQATLNNHKDYILCGRKEKRTSDFINVFEVFENEATQEFVIERAMFRNGKLIDWNQSDKMNAEQAQQLWQAYIH |
76 aa aa | NA | NA | NA | 1269155-1360714 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.3|1793668|36|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017527 position: 1335936-1335971, mismatch: 0 caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcac CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcac Protospacer ************************************ 2. spacer 3.4|1793736|35|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017527 position: 1335284-1335318, mismatch: 0 gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgc Protospacer *********************************** 3. spacer 3.5|1793803|34|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017527 position: 1335587-1335620, mismatch: 0 cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg Protospacer ********************************** 4. spacer 3.11|1794202|37|NZ_CP017527|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017527 position: 1284485-1284449, mismatch: 0 aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaa CRISPR spacer aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaa Protospacer ************************************* 5. spacer 3.16|1793668|37|NZ_CP017527|PILER-CR matches to NZ_CP017527 position: 1335936-1335972, mismatch: 0 caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer ************************************* |