Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017529 | Mannheimia haemolytica strain 1560 chromosome, complete genome | 3 crisprs | cas3,DEDDh,WYL,DinG,c2c9_V-U4,cas5,cas8c,cas7,cas4,cas1,cas2,PD-DExK,RT | 4 | 15 | 8 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP017529_1 | 904787-904861 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017529_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017529_1
>1.1|904810|29|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder AGACCTGATACTAATCTAGGGTATAAAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017529_1
The CRISPR arrays of NZ_CP017529_1 >merge|NZ_CP017529|1|904787-904861|CRISPRCasFinder CCTAGCGGTGGCAGGCACCAGAAAGACCTGATACTAATCTAGGGTATAAAGACCTAGCGGTGGCAGACACCAGAA >NZ_CP017529|1|1|904787-904861|CRISPRCasFinder CCTAGCGGTGGCAGGCACCAGAA AGACCTGATACTAATCTAGGGTATAAAGA CCTAGCGGTGGCAGACACCAGAA
>NZ_CP017529.1|WP_006248316.1|903428_904670_+|HipA-domain-containing-protein MMNKRIYVFADWETFSQPELVGVLSSDVVRGKENFRFSYDNEWLSSPYVQQIDPNLYLYPGEQYSTDTQNFHIFLDSCPDRWGRLLMKRREAALASQENRKPKLLIESDYLLGVHDMNRMGALRFKTELNGPFLDNNTRLAAPPLSSLRELEFAAIQLESSDNVDDPDYLKWLHMLISPGSSLGGARPKASVIDELNQLWIAKFPSRYDDYDIALWEYLAYRLAIQAKIEMATCRIERFNQEHHTFLTQRFDRHCGKRRHFTSALTQLGYYDGDYEASYLEIAQFLTESGSNTRIDLAQLWRRIVFNIAISNTDDHLRNHGFIYAQEGWILSPAYDLNPVPLSQGLHLNITDSDNRLDYQLAFDVADFFQLSKQQAVQIYDEVLKEINNWQNVAKEIGIPRQEQEQMKFAFNV >NZ_CP017529.1|WP_006250513.1|903225_903429_+|hypothetical-protein MFTQTLLAQRTGLSRVTVRKIMNGDPTVAIGYYLMVLGVLGLEQDFTDVGKDDELGRKLQDIELLRK >NZ_CP017529.1|WP_006248313.1|902169_902763_+|hypothetical-protein MKLKALSTLIASSMLYSQSFAVPPEKTAEEPQPFFNKTESGYDLVFNDQNYRLIETELNGEKIQFRAFERIVYVNNPIEPDYQTINLYVPEAYYNNGEINGYQADTAPIFLPNSVGGYMPAKAASYDKKRRDGSPGTILVALSKGYVVASVGARGRTLQKEGKYTGKAPSAIIDSKSAAHKACRFESDHWHHSLCKI >NZ_CP017529.1|WP_006248311.1|901182_902046_+|hypothetical-protein MLQLILAILCSVTVGVLIKFARQKGIRIDQSIAVNYIVTTTMTFLLLKPDYQGQSITDIIANNPTSYIFVILSITLPTIFLVQAKALEFAGIIRTDAAQRLSLFLPILAAFTIFGEQVTQNKLIALLLAFVALGCLLWKGNQGMEKGGKIAIISLALVWVGYGVNDILFKQIAKSGSAFPVTLSIAFIGAGCFMFIYLLLKRTQWHVPSVLTGLLLGVLNFGNILFYIQAHQAMKDDPTLVFTGMNLGVICLGTFVGAFFFKEKIHKVNYLGVAIAIVAIICLFYWR >NZ_CP017529.1|WP_006248309.1|900261_901011_-|alpha/beta-fold-hydrolase MEKRFEINEQGLSIRCKLFYEKELQQIENVVIVLHGFGSSKDLKSNTKFGERLSSKYKGYAALAFDFPCHGDDARKKLSVEESITYLQLVIDYAKTSLNAKNLYAYGTSFGGYLTLKYLAEKGNPFRKIALRAPAVQIYHSLMNRLSEEERQKLAKGREILWGFDRQMKISQAFFDELTDITQNDYLDYAEQILILHGTEDEMVALSTSQQFADNNVIELLPIEGADHAFSNPKLMDIAIGKIVEFFAP >NZ_CP017529.1|WP_006248308.1|899774_900260_+|YbaK/prolyl-tRNA-synthetase-associated-domain-containing-protein MSEQTFHQLTALLDSHRARYRVVGHPSAGKSEEVAKIRGTEIGQGAKALVCKVKGNGVKQAVLAILPADYQADLTKIAEHLGGLRASLASPAEVAELTDCVFGAIPPFSFHPDLLLVAEPSLFERYAELAFNAGTLERSIILNTEDYQKIVNPVLVQFAKS >NZ_CP017529.1|WP_006248307.1|899165_899711_+|endonuclease-SmrB MNDTLLDDEFALFREAAKGTKKLTQNTFVPKAEPRKKLQELRELKEKADTEFYFSDEYEPLLKEENEKVKYLREDVDPYILKQLRRGDFQPELFLDLHGLTREKAKKELAALILACEREKVYCASVMTGFGTRTLKDQIPRWLVQHPKVMALHQAPKEWGGDASILILVEQPENPEKMFGR >NZ_CP017529.1|WP_006248305.1|898128_899073_-|50S-ribosomal-protein-L3-N(5)-glutamine-methyltransferase MFKYNTELLDEISALPIVNDLVTIQDMMRWGYSYFNASDLYYGHGYDNAWDEAQQLVLAGLYLPFDVPETLYSSRLTRVEKERIINLICERLGSRKPVAYLTNSAWFCGGEYYVDERVIVPRSPIGELIKKGFKGIIKNEPHRILDMCTGSGCIAIACAERFPEAEVDAVDLSLDALDVAQINIERHQVSHRVFPICSDLFNNLPQDKYDLIVTNPPYVDEEDLGDMPEEFHHEPALALGSGKDGLDLTKRILAQAADYLNDDGVLVCEVGNSMVHLIEQFPSVPFNWLEFEHGGLGVFSLTKEELVKHRHLFA >NZ_CP017529.1|WP_006251360.1|897151_898045_+|N-acetylmuramic-acid-6-phosphate-etherase MNALGQMITEQRNPNSMNIDRLSALDIVQVINQEDKQVAIAVEQCLPQIAQAVEKIVQAFEKGGRLVYVGAGTSGRLGVLDASECPPTYGVKPEMVVGLIAGGERALRFPIEGAEDNREQGKVDLQAVNFSEKDVLVGIAASGRTPYVLGAMEYAKQLGATTVSIASNPNSAMAQIADIAIETVVGPEVLTGSSRMKSGTAQKLVLNMLTTASMILIGKCYQNLMVDVQATNEKLKARAIRIVMQATECEREVAEDTLKLAENNAKLAIMMILGNLDKQKAEDLLSQNQGRLQKALK >NZ_CP017529.1|WP_006248303.1|896677_897139_+|nuclear-transport-factor-2-family-protein MRKIKLLHVILSLILGLSAAAIGSYPAIKEIGEERAKKHQDILDLNRELYSAMVNRDFSALQTLLSDDFELYSSTGEVIDKQEWIKLIQKRVLEFDKVDLLSTDFQGNQSSGLLRVNGEFFGIERDNVVVEMNIRTIVRNTERQIKCIVIKEV >NZ_CP017529.1|WP_015587043.1|905073_906114_-|IS481-family-transposase MFYSNNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNLKNRVDEAIEQAVVKFALDNPAFGQVRVSNELRKQGIFISAGGVRSIWLRHNLANFKQRLNALEKAVAEKGIILSENQVQALERKKEDDVACGEIETAHPGYLGSQDTFYVGNLKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKTAISAADMLNDKVLPFFESQGLPMLRILTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHTKTKVKHPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKKIYTDLTTLQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMATLLDGKRIWVEKNLSSN >NZ_CP017529.1|WP_006252258.1|906267_907041_-|D-hexose-6-phosphate-mutarotase MNLSNALKLIKYNELDVLEVNHNKFKAKIALQGAQLLSWQPYNAEQDVLWLSEIEPFRIGSAIRGGIPICYPWFGSIKEPAHGTARIQEWRLVEHTCSDENVGLVFALENKAKMEMMLGETCELYFTHLDPEPAQLALHSYFNIGDIEKVEVQGLPTRCFDKLTDQEVEVPSPRKISENVDCIYPAQAVNFIQDFANQRTIKVEHINATETVLWNPWHNTVSAMTETAYQNMVCVETARINTLLQQNETLGVRVLVR >NZ_CP017529.1|WP_006248318.1|907189_911386_+|autotransporter-domain-containing-protein MKTKTFTRSYLASFVTIVLSLPAVASVVRNDVDYQYFRDFAENKGPFSVGSMNIDIKDNNGQLVGTMLHNLPMVDFSAMVRGGYSTLIAPQYLVSVAHNTGYKNVQFGAAGYNPDSHHYTYKIVDRNDYEKVQGGLHPDYHTPRLNKLVTEVVPAAVTNAGTSIKPYLNEERFPMFLRAGSGTQALRGKESNKTTGIAGAYEYLTGGTTLQLSKSSPDHWLDYSSNLYQVSYGPLSTYALPGDSGSGSYAYDMNEKRWVLVGVLNFYNGMDNQFNRSAIIRKDFHEKKFAEDIAGTINNTVQNAQFNWTAQGKSSSLSQSNNVQKLNVDLKDSSIANQNTSLPQENHGKTINFNGKDATIVLKQDIDQGAGALNLNANLTIRPETDQTWQGAGIIVGKDKKVNWQVKNPQGDRLSKLGEGTLYVNGRGQNLGDISVGDGIVILNQQADHQGRKQAFNTVGIVSGRPTVVLGSADQVNPDNIYFGFRGGRLDLNGNSIAFKRIQNSDKHARIVNHNRDHISTLIIQGQDPLTSNDLIWGKWASNSPADIYEYTNPYQNKRKDYFRLKGNSRVYYPTNATSNDHWEFLSSNREQAIQKILDAKNLRQRYDTFNGFIGEDASNKTNGILNVVFDTKTEVNTEQDKLKNIYTMSGGFNLNGELTLKGGTLLLSGHPTPHAYDIKNKHDVVRENDWQDSHFTAKNITVNKMAQLYIGRNVNEVNSHFTATDKAKLNLGFINRSTPSCYDSEYTGTTHCEVQAVISDNIFANLATTAIKGNVKLQNHSQLNLGKANLTGSVQADQTTHITLANHSHWLNNGTSQIGHLTMEKGSILSLNDKFATTEIPVRFNKMIIQGNLKGNGRINYTANLAKGESDHLQVDGIAEGNFVLAVRNSTTEANPKSSLNLLSLKNSNQEGNKASISLENNYVDLGTYRYVLENRNHNYHLFNPLIPNSTSKEMNATSVSSIPKKESVTNVPTLDKKETEQNLTQLQKDFSAHQLENQKAKQSMINAQSELRRLNSQLNVLQKYVNSRRLGYYTQQAVLEQISIIQNKIKQTQTIFNDANATVKLTDQKLEEAKLALGSVNDLVLIKASAPAMQATNQDTSMMNIIQADWISQYANTALSELSAQANSALQISNSLDRQLFKQSDKFNVWSSVEHQKTEHKSDLYRPYKQQTNLTQLGIQMPIDNGLMFGVALSKNHANAEFNEGVNGKSNLLMASLYGKWQSQQGTFISLDGSYGKAKNQLYLFGENHFTRRISSIGANIGHQFDLAGVQIQPTIGARYYHFSGQDYTLGGAKISSPNTHFMTYQAGLKASKTFSLDDWKVEPSITTHYVDASNKRLAVNVNNNNINQRFGRYLKTEAGIRFEHNQWQFDLHAGFINGNEIKKQHFAGVKLGYSW >NZ_CP017529.1|WP_006248319.1|911440_912535_-|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase MSKTIEERISAVILAGGLARRMNGVEKGLQLFEGKPLISHILARLSPQVSDIWLNVNRSIEQYQQLYPAFSYYQDSLPDFQGPLSGMLAGFEQIESDYLLFVPCDTPFMPELLLQKLKTALRINNVQIAYAHDGERPHPTFALIHRSVQEDLKAYLGSNQQQLLAFFQSQKSVAVDFSEQKSAFTNVNTLEDLSRVSQFPVKNLAITGYSGTGKTTLLEKLIPKLTACGIRVGLIKHSHHNVDVDKKGKDSYRLREAGANPTMIVCDERWALMTETKQAVEFSQLIAKFNPQEVDLVFVEGFKHETLPKIQLHRKGIEKPLPELDQWTIATATDYPLERENWLDINNIGGIADFIKNWLENKAS >NZ_CP017529.1|WP_006248320.1|912621_912891_+|DUF1040-family-protein MKCERLEELLELLGEHWRKNPDLHLIDILQQLSVEVGEPDNFKALSDEVLIYQLKMRNAGKFEPIPGIKKDYEDDFKTALLRARGILND >NZ_CP017529.1|WP_006248321.1|912954_913593_+|thioredoxin-domain-containing-protein MKKLALKTAFVALSALFTFNSTAIAADPTAGKEYIEVRKAPSAQKEVVEFFSFYCPHCYDFELSYKIPSQIKEKLPSDSKLVQYHVNFLGRQSEDLTRAWALAMALGAEDKVKTALFEGAQKDAFKSMDDIRSVFLANGITAEQFDSGINSFAVNGLVNKQVQLAEDFQIRGVPAFFVNGQYQLNLEGFADSSSTNDFIKRYVDAVVFLSKK >NZ_CP017529.1|WP_015484370.1|913676_914453_+|LLM-class-flavin-dependent-oxidoreductase MTKLSILNLVPIREGQTAKQAVDSMVKLAKHAESIGIERYWIAEHHNMKNLASSATQLLIQHALSHTEKLRVGSGGVMLPNHSPYIVAEQYGTLETLYPNRVELGLGRAPGTDMRTATALRRNAQSLPFPDEISELKGYFEGTNSVSAYPAQGLNVPFYILGSSPESAYLAAERGLPYAFASHFAPRFMDDAVRIYRTHFKPSEVLDKPYVILGVNAIAAETDQEAEQLATTQTQFFLNVVTNAQNYLQPPVESDDKV >NZ_CP017529.1|WP_015484369.1|914462_914717_+|luciferase MKAEIVPHFGPVSFQQNALYNQEKPVVRQMTACSLIGSRESIEQQLKSLKARIEIDEIMAVSYIFDEQKQHQSYTWLKEIADKV >NZ_CP017529.1|WP_006252261.1|914718_915012_+|YfcZ/YiiS-family-protein MSKTMQQKAADAHNMCKLKGDSMLDNSDRQIAFEAVYDSEEIAVQAVEFFTQKAKSVETEPCDIQSEITPIIDGFLMKMWITFSCQAEVILFQMAVR >NZ_CP017529.1|WP_041447934.1|915078_916119_-|IS481-family-transposase MFYSNNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNLKNRVDEAIEQAVVKFALDNPAFGQVRVSKELRKQGIFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLIALEKLVAEQGIILSETQVQALERKKEDEIACGEIETTHPGYLGSQDTFYVGNLKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKAAISAADMLNDKVLPFFESQGLPMLRILTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHSKTKVKHPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKKIYTDLTTLQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMATLLDGKRIWVEKNLSSN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP017529_2 | 1139434-1139508 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017529_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017529_2
>2.1|1139457|29|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder TCTTTATACCCTAGATTAGTATCAGGTCT |
DinG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017529_2
The CRISPR arrays of NZ_CP017529_2 >merge|NZ_CP017529|2|1139434-1139508|CRISPRCasFinder TTCTGGTGTCTGCCACCGCTAGGTCTTTATACCCTAGATTAGTATCAGGTCTTTCTGGTGCCTGCCACCGCTAGG >NZ_CP017529|2|2|1139434-1139508|CRISPRCasFinder TTCTGGTGTCTGCCACCGCTAGG TCTTTATACCCTAGATTAGTATCAGGTCT TTCTGGTGCCTGCCACCGCTAGG
>NZ_CP017529.1|WP_006253290.1|1138123_1139221_+|IS481-family-transposase MFYSSNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNIKNRVDESTEKAVVQFALDNPAFGQVRVSNELRKQGIFVSAGGFCLCRWFLSLQVVFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLTALEKLVAEQGIILSEPQIQALERKKEDEIACGEIETAHPGYLGSQDTFYVGNIKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKTAITAADMLNDKVLPFFESQRLPMLRVLTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHTKTKVKQPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKRIYMDLEALQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMETLVDGKRIWAEKNLSSN >NZ_CP017529.1|WP_006253291.1|1137077_1137794_-|DUF3800-domain-containing-protein MYLMYVDESGSTTDPTQKYFVLSGIAVFERNTHWIEKKMNVIASQFCQYSEGSDPYFYELHGSPMRSGKSEWRGIPMSERINAIQDCLKLVQSNNIRIFAAVIEQGYSSGQDTITECFEQISSRFDMYLSRLHAQGNTQRGISIFDKSSTEKSIQALARTFKNSGHTYGKLRNFSEVPLFLDSKSSRLIQLADLVSYAIFRHYEHNDSSFYDIIRNNFDYHNGRIHGLYLRNKEDIIS >NZ_CP017529.1|WP_006248925.1|1136270_1137035_+|site-specific-integrase MLIEWRNQIVGDKIKAVTWNNYVRHLKALYNFGISQGLLNINRNPFNQLFIRESKRRKKTYSTEQLHKIDHILNNNVVLPDFLKPSWFVLAIIMTLRCTGIRRGQLVKLKISDVDLSNRTIYISPEINKNHDYHIVPISDSLYIHIERLITELKIRKQTDNCQLFNLNLFSRCSRRRGQPMSQNQLTHIFRHISDLVGFTSSPHRFRHTVATQLMKKPENVYVVQKLLGHKDISVTLGYIEHDVEMLRETVNLL >NZ_CP017529.1|WP_006248924.1|1134129_1136115_+|DNA-binding-domain-containing-protein MHSILKKILGKSKSSSQSSVKSDNVFAIEQDSEGWLYPKNASQLLNTELRQKYLGLLWQQVSMNRQMFEALYQQPIERYAEMVQLLPASESHHHSHIGGMLDHGLEVIAFSAKVRQNYILPPNVAPEEQSKQRDAWTAAAIYLALVHDIGKVVVDIEITLKDGSRWFAWNGLPPQPYKFKYIKGRDYHLHPVLGGFLANQLIPKSAFDWLGQYPEVISSLMYAMSGHNDKAGLLSEIVQKADQHSVTLALGGDVNKLVQRPVNSLSKQLVLALRYLLEQKIKLNTPKGPADGWFTEEGLWLVSKTAADNIRAYLLGQGISVPKDNPKLFDEMQSLGIVEESPAGGAIWSCRIQADSGWTPANTFTLLRIKPEVAWENINDRPNYFAGKVKIVEQITEESNIETQSTLVDGTTKPAPLPSVQTGGIIASKEVEISQVETNSDNAPSSEIIINDENDLTSFVLDMFAPTESSEPSLDDISIGKGQEIASMPSKQEVQDKSTTKKLKVTQSAVETPETLTLSELQLQNKENSITGDNFVKWLKSGIATNKFAINKPTAKLHIVEDHLFLVTPVIFEMYLQETGQPYDKETINNLQYDFQGLGIHSPKNTMTNGKPDTINFWKCDVIGPRKTSSLTGYLIKNTRLFFGDKVLLNNHCLTLQKEET >NZ_CP017529.1|WP_006248922.1|1133414_1133657_+|hypothetical-protein MLNLNLFKRPIEISTLESWSKFCDDVGKVAFVAVPAMLYSNYEFWIKISSIIGLFIATYFCLVIGRNIRQFIEKEKSKWD >NZ_CP017529.1|WP_006248921.1|1132341_1133325_+|DUF1738-domain-containing-protein MNPQSNTQPKFDLYQEVTDKIIAALEQGTAPWLKPWDSVIPYGGMPCNAISGRLYSGINVLLLWLSAAEHGYIQRKWITAKAAIEAGGHVRKGEKATLAVSYRPYDREKTDDDGNLVLDDDGNPVIEHLASIKKHCLFNIEQCEKLPQDWYETVETPEQLTDENQYAIFEEIRLMLKGMDLQVMVKPSNQAYYHPRNDHIVMPEMKQFHSPQKFHSVLLHEMTHATGHQSRLARDGIVSGKARFGNKVYAFEELVAEMGCAFLCSHLGFADVPQNASYIESWIKVLREDKRAIFRASGKAREACQYMLDALNIAQLADKYEVFEEAA >NZ_CP017529.1|WP_006248919.1|1131679_1132093_+|hypothetical-protein MKNEHNLEQLKYIWDNRNLENKVYQYLFHICIEPMKKGDWNRYTIWLNFHGNLINVSDVVYRVVESQKLKDDIKIWYDKQYYCRPTKVETTGFISIFLHLFYEGIARILLEQGMITETEAAEKSYNFRAANCFQRLL >NZ_CP017529.1|WP_006248918.1|1130722_1131565_+|hypothetical-protein MSDSVLNTYFKHALVKAGFPDTLDMEYSLSHCQGDGVAFYGRLGTDDLIQLFNHLNPQKRKQKMFANLLTHIESWETHDDIGFEIIRNRFGYRYSHWNTMELYAKTADQLVFFNDSDARRNWYFPTSKVDKYKALWDGFIEDLEQYIKDISREMESVGYQIIEASPYQTETVFKFNTEKYLVELQRKPSEFYSELVDWAFGDMCDFEAAIEQICQGQLCYADFEATVTDKKSEIQLGLARLSGISYSPNDRSFSGYRQELIGEAIASARHNAARFAYLHA >NZ_CP017529.1|WP_006251599.1|1130216_1130459_+|hypothetical-protein MFGKLFYKMNPKVLAKIGEDFRKAGYLMGAGFVGMVISNDQISTSEGFVLFLWGLYIWIIGHIALHHSEKILNSKQGEPK >NZ_CP017529.1|WP_006248915.1|1129962_1130208_+|hypothetical-protein MSVHIKLSCVGDILPIKLNEWTPEHRALHHEISHKALEAWQNRDKGTQSVRFMQQMPARQGLHFRFLSVSEQDGKLIVSRS >NZ_CP017529.1|WP_006248316.1|1139624_1140866_-|HipA-domain-containing-protein MMNKRIYVFADWETFSQPELVGVLSSDVVRGKENFRFSYDNEWLSSPYVQQIDPNLYLYPGEQYSTDTQNFHIFLDSCPDRWGRLLMKRREAALASQENRKPKLLIESDYLLGVHDMNRMGALRFKTELNGPFLDNNTRLAAPPLSSLRELEFAAIQLESSDNVDDPDYLKWLHMLISPGSSLGGARPKASVIDELNQLWIAKFPSRYDDYDIALWEYLAYRLAIQAKIEMATCRIERFNQEHHTFLTQRFDRHCGKRRHFTSALTQLGYYDGDYEASYLEIAQFLTESGSNTRIDLAQLWRRIVFNIAISNTDDHLRNHGFIYAQEGWILSPAYDLNPVPLSQGLHLNITDSDNRLDYQLAFDVADFFQLSKQQAVQIYDEVLKEINNWQNVAKEIGIPRQEQEQMKFAFNV >NZ_CP017529.1|WP_006250513.1|1140865_1141069_-|hypothetical-protein MFTQTLLAQRTGLSRVTVRKIMNGDPTVAIGYYLMVLGVLGLEQDFTDVGKDDELGRKLQDIELLRK >NZ_CP017529.1|WP_006253491.1|1141877_1142393_-|single-stranded-DNA-binding-protein MAGINKVIIVGNLGNDPEMRTMPNGEAVANISVATSESWTDKNTGERREVTEWHRIVFYRRQAEVCGQYLRKGSQVYVEGRLKTRKWQDQNGQDRYTTEIQGDVLQMLGSRQGNDMGGQQGGWGNSAPAGNSYNQGNSNYGYNQTQSAAPQSKPAPQPEPAMNNFDDDIPF >NZ_CP017529.1|WP_006253492.1|1142547_1145376_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MQHIDIRGARTHNLKNINLTLPRDKFIVITGLSGSGKSSLAFDTLYAEGQRRYVESLSAYARQFLSLMEKPDVDHIEGLSPAISIEQKSTSHNPRSTVGTVTEIHDYLRLLFARVGEPRCPDHDVPLAAQTISQMVDRVLEEPEGKRLMLLAPVVKERKGEHVKLLENLTASGYLRARIDGEICDLSDPPALELQKKHTIEVVVDRFKVRADLATRLAESFETALDLSGSTAIIADMDDPNAEEIVFSSSFACPHCGYSLHELEPRLFSFNNPAGACPTCDGLGVEQFFDAKKVVQNEEVSLAAGAIKGWDRRSFYYFGLLKAVAEHYGFDLETPFGQLPKKYQNIILNGTKEEIEFVYVNDRGDKVKRKHAFEGVLNNMARRYKETESNSVREELAKYINNRPCMDCEGSRLRREARYVFLDKTNLPMVSEKSIGEALTFFEELKLAGQKEKIAEKILKEIRERLQFLVNVGLNYLSLSRSAETLSGGEAQRIRLASQIGAGLVGVMYVLDEPSIGLHQRDNERLLNTLVHLRNLGNTVIVVEHDEDAIRAADHIVDIGPGAGVHGGQVIAQGTAAEIMQIEESITGQFLSGKQKIEIPAQRVPYEPTKLLTLSGASGNNLKKVKLEIPVGLFTCITGVSGSGKSTLVNDTLFPLAQNALNRAENSDVAPYESIDGLSHFDKVIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGLFTPIREIFAGTQEARARGYNVGRFSFNVRGGRCEACQGDGVIKVEMHFLPDVYVPCDHCKGKRYNRETLEIRYKGKTIHQVLEMTVEEAREFFAPMPMIARKLQTLMDVGLSYIRLGQSSTTLSGGEAQRVKLATELSKRDTGKTLYILDEPTTGLHFADIKQLLGVLHRLRDQGNTIVVIEHNLDVIKTADWIVDLGPEGGSGGGEIIATGTPEEVAKDKRSHTARFLKEILAKG >NZ_CP017529.1|WP_006249416.1|1145467_1147201_-|C4-dicarboxylic-acid-transporter-DauA MLNKWFLTKNAFLAVKPFSALKDALNAGYGKQHLIRDIISGLTVGVIAIPLSMALAIASGVPPQHGLYTAIVAGIVIALTGGSRFNISGPTAAFVVILYPVTQQFGLSGLLMATMLSGGILVLMALLRLGRLIEYIPLPVTLGFTCGIGIVIATLQIKDFLGLSIEKMPEHYLGKLEAIFSALPTINWADTLVGVVTLLVLTRWHKLRLPIPGHLPAVFIGTLLSLLLIHFGQNVATIGSAFHYTLSDGTTGYGIPSVLPEFVLPWNLPNAEGNRIDWNLTTIQALLPAAFSMAMLGAIESLLCAVVCDNMTDTKHHSNNELLAQGLGNIASPFLGGITATAAIARSAANVRSGAVSPISSVVHALLVLFALLFLAKALSYLPLSSMAALLLVVAWNMADIPQIIQLTRRSGKNEIAVLLTCITLTVLFDMVIAITVGVLLASLLFIRTIAEMTKSFEMAHPTDLNDVLVYRISGPLFFAAADNLFADLHNKTVHTDHQIKHIVLQCDAVTVLDAGGIHALTRFVQHMLPHQQLHLCNVQFQPMRMLVRSQKTVNEIPQIQFSSDLESAFDKIRQAN >NZ_CP017529.1|WP_032849469.1|1147442_1148375_+|ABC-transporter-permease MDSLIHFLSAFLTNITWIGALELGLIYSLVALGVLISYKILDFPDLTADGSFPLGGAVCVISILNQVDPWLATLYGTLAGAVAGMVTASLHIGFKIEKLLASILMMIALYSINLRIMGMPNIAILGETTIYDVMPIESDLQLALVRLVMALLVVIIVKGLFDLFFATEIGLAVRATGTNSRMAKALGIAINKMTILGMAISNALIALGGALYVQSNGGVDISIGVGTIVIGLAAVIIGEAIFSVKRIIWLTFAVIIGSILYRFFIALALNNETLNGIGFGPQDLNLITALLVVIVLAVPRIKHKLLGKRG >NZ_CP017529.1|WP_006253494.1|1148376_1149174_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIELNNLFITFNKGTAIENPVLRGLSLKVEQGEFVSVIGSNGAGKSTLLNAISGDCAVDSGEILIQGNKVNQSTTWQRANQVARVFQDPMAGTCESLTIEENMALAYQRGRKRGLGFAIKRQMRELFKDKLALLGLGLENRLTDQMGRLSGGQRQAVSLLMASLQPSNILLLDEHTAALDPKTTDFVLELTNKIVREQKLTTLMVTHSMRQALDYGDRTVMLHQGQVAFDVSGEQRQKMDVPDLLQLFQQSRHEQLSDDGLLLGN >NZ_CP017529.1|WP_006250508.1|1149260_1149482_+|hypothetical-protein MLSIFKTPVEKETLDDWAKISVDVAKVAILAIPVILFGKEPTLIKLTNLALLVLSIYVFLTLGRKLRQLKEVL >NZ_CP017529.1|WP_006253495.1|1149664_1151590_+|ATP-dependent-DNA-helicase MTKYDDKIQHAFSENGLLSQNISGFRPRQAQLEMAQVVAKAVKFATPVVVEAGTGTGKTFAYLVPALLSGKKTILSTGSKNLQDQLFNRDLPTIQKALKYKGKIALLKGRANYLCLERLDQVTAMGVLGDKSVLTDLKKVSKWQNATKTGDLSECITIAEDSPILPQLVSTTESCLGSDCPHFKDCYVVQARRKAMEADVVVVNHHLFCADMAVKKTGFGELIPEAELVIFDEAHQLPDIASQYFGQSLSSRQLFDICKDTNIVYRTELKDLSQLGKAADHLTKVVQDFRLLMGGEGQIRGNLRELFRDKKVVDGLVKVAENIDFLSEVAKKSLGRSETLDKIFERLAEVKVQLKKLMDTSVTGYCYWYEANGRSFGLHITPLMVADKFGEQLKNQQIGWVFTSATLEVGGKFDHFCQRLGIENAEQLVLQSPFDYQHQSLLCVPRYLPDTNKSNTLTALGQLLKPVIEANKGRCFLLCTSYYMMRGLADFLREHSSLNVLLQGETSKSRLLEKFVKEDHSVLVATQSFWEGIDVRGDDLSLVIIDKLPFTSPDEPLLKARMEDCKIQGGDPFNDIQIPEAVITLKQGVGRLIRDVTDRGVVIICDSRLVMRNYGQTFLKSLPPSRRTRDLGNVIQFLKQK >NZ_CP017529.1|WP_006250186.1|1151663_1152029_+|CidA/LrgA-family-protein MLSTLLRMVASLALLFVMLYLGKLIVYLFPIGIPDSILGMLILFGCLVIGIVKVEWVIPSAKPLTRYITLFFLPICVELIEHLELLRQNLNTFVLATALSTLVSVVAIGVFAQWIFHYKRG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP017529_3 | 1755109-1756211 | TypeI |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017529_3
|
16 spacers
spacers of NZ_CP017529_3
>3.1|1755141|36|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder CCTATAACGAGCAATGGCATTTTGATCTACGGTAAA >3.2|1755209|34|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder TTCTTGAATACCTCCGGAGTCAGTTAAGATAAGG >3.3|1755275|35|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder CTTTTTCAAGAATCAAGATTAAGAGATCCAAACAA >3.4|1755342|36|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder CACCGCTGCTACTTCGGTTATCGGAGTAGTTTGCAC >3.5|1755410|35|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder GTGGCACAGTAACACGAGCAGATGCTGATAAACGC >3.6|1755477|34|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder CAGCAGCCGTTGTTACCGTGGTGCAATGCTTGCG >3.7|1755543|36|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder TACACTTATTGCCATAGGGTAGTAGTAATCTTTTAC >3.8|1755611|34|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder TCGTGGCTGGTTATACAAAGAAAAGCATTGTTGG >3.9|1755677|35|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder TTAAATCTAAAGCTAAAGCTATTTTATTAATTAAA >3.10|1755744|34|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder TTTACCGTTTACCGATTGGATTTTAATGCTAGAG >3.11|1755810|35|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder CCTAAATTGCCGTAAAAATCTGCCATTAGCTACGC >3.12|1755877|35|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder CTCATAACGAATCCAATCCTGTTCGGTTAATCCCC >3.13|1755944|37|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder AGGGGCGTGTACCGCAATCAATTTTAATTATAACCAA >3.14|1756013|35|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder TTTATCTGTTGCGGTCAATTGTATATCTTGAATTT >3.15|1756080|35|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder CTCGTCTTGAATTGGAAAATCAAGGGCGACAATAG >3.16|1755141|37|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT CCTATAACGAGCAATGGCATTTTGATCTACGGTAAAC >3.17|1755209|35|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT TTCTTGAATACCTCCGGAGTCAGTTAAGATAAGGC >3.18|1755275|36|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT CTTTTTCAAGAATCAAGATTAAGAGATCCAAACAAC >3.19|1755342|37|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT CACCGCTGCTACTTCGGTTATCGGAGTAGTTTGCACC >3.20|1755410|36|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT GTGGCACAGTAACACGAGCAGATGCTGATAAACGCC >3.21|1755477|35|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT CAGCAGCCGTTGTTACCGTGGTGCAATGCTTGCGC >3.22|1755543|37|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT TACACTTATTGCCATAGGGTAGTAGTAATCTTTTACC >3.23|1755611|35|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT TCGTGGCTGGTTATACAAAGAAAAGCATTGTTGGG >3.24|1755677|36|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT TTAAATCTAAAGCTAAAGCTATTTTATTAATTAAAG >3.25|1755744|35|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT TTTACCGTTTACCGATTGGATTTTAATGCTAGAGG >3.26|1755810|36|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT CCTAAATTGCCGTAAAAATCTGCCATTAGCTACGCG >3.27|1755877|36|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT CTCATAACGAATCCAATCCTGTTCGGTTAATCCCCG >3.28|1755944|38|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT AGGGGCGTGTACCGCAATCAATTTTAATTATAACCAAG >3.29|1756013|36|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT TTTATCTGTTGCGGTCAATTGTATATCTTGAATTTG >3.30|1756080|36|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT CTCGTCTTGAATTGGAAAATCAAGGGCGACAATAGG >3.31|1756147|34|NZ_CP017529|CRT GGTGTACCCACAAATCCTATGTTTTCGCCATTGG |
cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,c2c9_V-U4 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017529_3
The CRISPR arrays of NZ_CP017529_3 >merge|NZ_CP017529|3|1755109-1756211|CRISPRCasFinder,PILER-CR,CRT CCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAACCCTATAACGAGCAATGGCATTTTGATCTACGGTAAACCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAACTTCTTGAATACCTCCGGAGTCAGTTAAGATAAGGCCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAACCTTTTTCAAGAATCAAGATTAAGAGATCCAAACAACCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAACCACCGCTGCTACTTCGGTTATCGGAGTAGTTTGCACCCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAACGTGGCACAGTAACACGAGCAGATGCTGATAAACGCCCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAACCAGCAGCCGTTGTTACCGTGGTGCAATGCTTGCGCCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAACTACACTTATTGCCATAGGGTAGTAGTAATCTTTTACCCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAACTCGTGGCTGGTTATACAAAGAAAAGCATTGTTGGGCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAACTTAAATCTAAAGCTAAAGCTATTTTATTAATTAAAGCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAACTTTACCGTTTACCGATTGGATTTTAATGCTAGAGGCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAACCCTAAATTGCCGTAAAAATCTGCCATTAGCTACGCGCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAACCTCATAACGAATCCAATCCTGTTCGGTTAATCCCCGCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAACAGGGGCGTGTACCGCAATCAATTTTAATTATAACCAAGCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAACTTTATCTGTTGCGGTCAATTGTATATCTTGAATTTGCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAACCTCGTCTTGAATTGGAAAATCAAGGGCGACAATAGGCAGCCACCTTCGCGTGGCTGTGTATTGAAACGGTGTACCCACAAATCCTATGTTTTCGCCATTGGCTGCTACCTTCGCATCAATATATATTGAAAT >NZ_CP017529|3|3|1755109-1756146|CRISPRCasFinder CCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC CCTATAACGAGCAATGGCATTTTGATCTACGGTAAA CCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC TTCTTGAATACCTCCGGAGTCAGTTAAGATAAGG CCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC CTTTTTCAAGAATCAAGATTAAGAGATCCAAACAA CCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC CACCGCTGCTACTTCGGTTATCGGAGTAGTTTGCAC CCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC GTGGCACAGTAACACGAGCAGATGCTGATAAACGC CCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC CAGCAGCCGTTGTTACCGTGGTGCAATGCTTGCG CCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC TACACTTATTGCCATAGGGTAGTAGTAATCTTTTAC CCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC TCGTGGCTGGTTATACAAAGAAAAGCATTGTTGG GCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC TTAAATCTAAAGCTAAAGCTATTTTATTAATTAAA GCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC TTTACCGTTTACCGATTGGATTTTAATGCTAGAG GCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC CCTAAATTGCCGTAAAAATCTGCCATTAGCTACGC GCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC CTCATAACGAATCCAATCCTGTTCGGTTAATCCCC GCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC AGGGGCGTGTACCGCAATCAATTTTAATTATAACCAA GCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC TTTATCTGTTGCGGTCAATTGTATATCTTGAATTT GCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC CTCGTCTTGAATTGGAAAATCAAGGGCGACAATAG GCAGCCACCTTCGCGTGGCTGTGTATTGAAAC >NZ_CP017529|3|1|1755110-1756146|PILER-CR CAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC CCTATAACGAGCAATGGCATTTTGATCTACGGTAAAC CAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC TTCTTGAATACCTCCGGAGTCAGTTAAGATAAGGC CAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC CTTTTTCAAGAATCAAGATTAAGAGATCCAAACAAC CAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC CACCGCTGCTACTTCGGTTATCGGAGTAGTTTGCACC CAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC GTGGCACAGTAACACGAGCAGATGCTGATAAACGCC CAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC CAGCAGCCGTTGTTACCGTGGTGCAATGCTTGCGC CAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC TACACTTATTGCCATAGGGTAGTAGTAATCTTTTACC CAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC TCGTGGCTGGTTATACAAAGAAAAGCATTGTTGGG CAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC TTAAATCTAAAGCTAAAGCTATTTTATTAATTAAAG CAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC TTTACCGTTTACCGATTGGATTTTAATGCTAGAGG CAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC CCTAAATTGCCGTAAAAATCTGCCATTAGCTACGCG CAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC CTCATAACGAATCCAATCCTGTTCGGTTAATCCCCG CAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC AGGGGCGTGTACCGCAATCAATTTTAATTATAACCAAG CAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC TTTATCTGTTGCGGTCAATTGTATATCTTGAATTTG CAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC CTCGTCTTGAATTGGAAAATCAAGGGCGACAATAGG CAGCCACCTTCGCGTGGCTGTGTATTGAAAC >NZ_CP017529|3|1|1755110-1756211|CRT CAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC CCTATAACGAGCAATGGCATTTTGATCTACGGTAAAC CAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC TTCTTGAATACCTCCGGAGTCAGTTAAGATAAGGC CAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC CTTTTTCAAGAATCAAGATTAAGAGATCCAAACAAC CAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC CACCGCTGCTACTTCGGTTATCGGAGTAGTTTGCACC CAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC GTGGCACAGTAACACGAGCAGATGCTGATAAACGCC CAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC CAGCAGCCGTTGTTACCGTGGTGCAATGCTTGCGC CAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC TACACTTATTGCCATAGGGTAGTAGTAATCTTTTACC CAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC TCGTGGCTGGTTATACAAAGAAAAGCATTGTTGGG CAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC TTAAATCTAAAGCTAAAGCTATTTTATTAATTAAAG CAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC TTTACCGTTTACCGATTGGATTTTAATGCTAGAGG CAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC CCTAAATTGCCGTAAAAATCTGCCATTAGCTACGCG CAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC CTCATAACGAATCCAATCCTGTTCGGTTAATCCCCG CAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC AGGGGCGTGTACCGCAATCAATTTTAATTATAACCAAG CAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC TTTATCTGTTGCGGTCAATTGTATATCTTGAATTTG CAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC CTCGTCTTGAATTGGAAAATCAAGGGCGACAATAGG CAGCCACCTTCGCGTGGCTGTGTATTGAAAC GGTGTACCCACAAATCCTATGTTTTCGCCATTGG CTGCTACCTTCGCATCAATATATATTGAAAT
>NZ_CP017529.1|WP_006248114.1|1754624_1754918_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MLMLITYDISFDDPEGQARLRRIAKHCLDYGVRAQYSVFECDVTPAQWVTLKNKLLATYNPDCDSLRFYHLGSKWRNKVEHHGAKPSVDIFKDTLIL >NZ_CP017529.1|WP_006248113.1|1753544_1754558_+|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MRKLQNTLYITTQGSYLHKERETLVVEQDRKKVAQLPIHSIGHIFCFGNVLVSPFLMGFCGENNVNLAFFTENGRYLGRLQGRQSGNVLLRRAQYKKSETNPVPVARNIIAAKIQASKRVLQRQIRNHGENADLQSTITALNYSLQQLKTADNLDLIRGIEGDAAARYFGVFSHLIKENSGFHFDGRNRRPPRDGVNALLSFLYSIVGKDISGALQGVGLDPQIGFLHADRSGRDSLAQDILEEFRAWWVDRMVLSLINRGQVKPDDFVTEASGAVTLKPEARKLLFQTLQAKKQEKIIHPFLEEEVEIGLLPYIQAMLLARHLRGDLAEYPPFLMR >NZ_CP017529.1|WP_134916814.1|1753148_1753442_+|DUF3800-domain-containing-protein MQHNKISFEDSVNNSLIQASDVIAGLLAGIGEQIQKYNEQEFYNEFISKLNPNHLENLKLLAQIYQNSIYKSNGLFTHFFAPLSFICRLQNFIFSYK >NZ_CP017529.1|WP_006248111.1|1752227_1753148_+|hypothetical-protein MITSNLERSFHGLNIAQHNYKIFLDESGGNIGKLKHTPNDKKGSNFNRTISSHIGVPPVFVLGGIAQISNANLIAPDWRKLLHLQNKELKFSKIGKNFFNKLGSKELRKVLEWINENNLCIHFALYDWVYFYDVDIIDSALIESDVCSVWKYLSEKIGNSNRYKEIKDYQRKVGLDKQSDDIIYLFYIKELLHDFIINNLQWFLSEIYNNHYKKIDNQEKTVFLDNLYNMIKGSEKYKVLEFFLEKIDRNKYLSFIYDKLDSEMNEDKTFIMLVEDMSPPYQNYLNTFPLSEFYFDKGMEHVFIDY >NZ_CP017529.1|WP_006253509.1|1751526_1752201_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MGDLQNSAEILPLVQPKFGDDKRSISLSALQHYAFCPRQCALIHNEQVWAENYLTAQGQALHERVDSGEPEVRKGIRFERTVHVAAEKLGISGILDLVERDLKTGELKPVEYKRGKPKLDPIDEIQLCAQALCLEEMTEQTINEGALWYMQTRHRLPIIFSTELRTKTLATIAEVRSLLDSGTTPPPEYSKRCKACSLIDLCQPKLLERDRSKGYVVGVFGSLL >NZ_CP017529.1|WP_006248109.1|1750663_1751527_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2 MSIQNRYEFVFFFDVTNGNPNGDPDAGNMPRLDPETSKGLVTDVCLKRKIRNFIEMSYENEAGYEIYVKEKSVLNLQNKRAYEALGIESEAKKLPKEEAKAREITAWMCKNFFDIRTFGAVMTTEVNSGQVRGPVQLAFAQSIDPIIPLEVSITRMAVTNEKDLEKERTMGRKYIVPYALYRVHGFISAKLAEKTGFSDEDVQKLWQALQLMFEHDRSAARGEMAARKLIVFKHDSELGNQPAHKLFDSVKVERINGEKDTPAKDYDDYCISVQTEGLTGVTVEELL >NZ_CP017529.1|WP_031192850.1|1748872_1750654_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 MITALTRYYYRLAAQEDRLTGEAKVPSYGFSEEKIGWVLELDSKGNLVNVISNLTEDKKPKPKLMSVPRPEKRTSGIKPNFLWDKTAYVLGIESNPDKATAKDQPINFAEKTFEAFKQYHLDLLADSNDEGLMAIRNFLQQWQPTHFAESICPREILDANVVFKLVGTSGYIHQREAAQTLWTSLLINQSDNAEKGLCLISGKLSPIQRTHPPIKGVFGGQSSGGSIISFNKESFTSFGKEQGSNAPVSEQAAFAYTTALNYLLRTEKHRLTIGDASTVFWAEADNTTQAEAAEGFFAALMTPPDDEQENQKIFEELQKISKGRPLAEISPELSENTRFYVLGLAPNAARISVRFWLDTTFGQLAKNLSEHWQDLALEPCPWKTPPSIWRLLLQTASLGKSENISPVLAGEMARAVISGHLYPMSLLSQLVTRIRADGDINGLRVALMKAVLQRKFRKGFIKEGVPMSLNKESDNQAYLLGRLFAVLERIQSQALGELNAGIADRYYGSASAVPFSVFPRLLSGAKHHLSRLRKDKGGMAVNLDKDLGEIIASLPENFPRHLSIDEQGRFAIGYYHQKQSYFAKKETTESIEN >NZ_CP017529.1|WP_006248107.1|1748173_1748851_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 MPNKIRLHIWGDYACFTRPEMKVERVSYDVITPSAARGILAAVHWKPAIRWVIDKIYVLQPIQFESVRRNELGSKISASKISGAMKRKTVADLYTVIEDDRQQRAATVLKNVGYVIEAHAVLTKMAGEAETVTKHIEMFKRRAKKGQCFQQPCMGVREFAANFALIDDDEPLPECFLAENERDRDLGWMLHDIDFEHGNQPRFFRAEMKNGVIDVPPFYAEEVKS >NZ_CP017529.1|WP_134983790.1|1745729_1746191_+|hypothetical-protein MFKPHGSLDWFMAGDVPMTSCIGKVEEPLIITPGVGKYKKGYGQPFDAHREKANEAIDSASSILCIGYGFNDDHLQTHLTGKIKSGVKTLLLTRGLSENARNVVKEAPNCKALIFDGDKAGTRVVSKQEETFIPNVHWWDVEFFVKEILENGK >NZ_CP017529.1|WP_006253506.1|1744434_1745571_+|transposase MLLRKAFKFEIRPNGEQVRKMKQFCGCSRFVFNKALAWQNEQYEQDNHHKFSYTKLANLLPQWKKELVWLKDCHSQVLQQSLKDLESAFKNFFQKRADLPKFKKKGVKESFRFPQGCKIEQKNDRLYLPKIGWVRYRNSREIVGEVKNVTVSMKCGRFFVSIQTEFKQEIPTHKGGEIGIDMGIARFATLSNGEFFEPLNAFKTHKGKLAKLQKQLKNKVKFSKNWQKLKDKIGKLHHKIANCRKDFLHKISTQISKNHAMIYVEDLQVANMSKSAKGTAEVHGKNVKQKSGLNRVILDQSWFEFRRQLDYKTQWLGGFLLAVPPQNTSRTCPCCNYTAKENRQTQENFECVECGYTENADVVGAMNVLTRGQAIVQA >NZ_CP017529.1|WP_006248118.1|1756395_1757871_+|ribonuclease-G 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>NZ_CP017529.1|WP_006249181.1|1773613_1773841_-|hypothetical-protein MFEALDRFMINTIKIAIIVFLVACIFISMPNWWIASILVLFPTAYLLDKYWWRNTEMYRRKMDKLVEEMKNNRQI |
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---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_CP017529_3 | 3.13|1755944|37|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder | 1755944-1755980 | 37 | NZ_CP017529.1 | 1551063-1551099 | 0 | 1.0 |
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1. spacer 3.2|1755209|34|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to position: 2649201-2649234, mismatch: 0, identity: 1.0
ttcttgaatacctccggagtcagttaagataagg CRISPR spacer ttcttgaatacctccggagtcagttaagataagg Protospacer **********************************
2. spacer 3.3|1755275|35|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to position: 1288039-1288073, mismatch: 0, identity: 1.0
ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaa CRISPR spacer ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaa Protospacer ***********************************
3. spacer 3.13|1755944|37|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to position: 1551063-1551099, mismatch: 0, identity: 1.0
aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaa CRISPR spacer aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaa Protospacer *************************************
4. spacer 3.18|1755275|36|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to position: 1288039-1288074, mismatch: 0, identity: 1.0
ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaac CRISPR spacer ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaac Protospacer ************************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_CP017529_3 | 3.3|1755275|35|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder | 1755275-1755309 | 35 | NC_028743 | Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome | 11439-11473 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP017529_3 | 3.18|1755275|36|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT | 1755275-1755310 | 36 | KP137439 | Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome | 11457-11492 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017529_3 | 3.18|1755275|36|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT | 1755275-1755310 | 36 | NC_028743 | Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome | 11439-11474 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP017529_3 | 3.20|1755410|36|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT | 1755410-1755445 | 36 | JN255163 | Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome | 18336-18371 | 1 | 0.972 |
NZ_CP017529_3 | 3.20|1755410|36|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT | 1755410-1755445 | 36 | KP137438 | Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome | 18565-18600 | 1 | 0.972 |
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NZ_CP017529_3 | 3.21|1755477|35|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT | 1755477-1755511 | 35 | JN255163 | Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome | 18627-18661 | 1 | 0.971 |
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NZ_CP017529_3 | 3.21|1755477|35|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT | 1755477-1755511 | 35 | DQ426904 | Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome | 18391-18425 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017529_3 | 3.25|1755744|35|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT | 1755744-1755778 | 35 | NC_028956 | Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome | 19192-19226 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017529_3 | 3.25|1755744|35|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT | 1755744-1755778 | 35 | NC_028743 | Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome | 19017-19051 | 1 | 0.971 |
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NZ_CP017529_3 | 3.28|1755944|38|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT | 1755944-1755981 | 38 | NC_028956 | Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome | 27370-27407 | 1 | 0.974 |
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NZ_CP017529_3 | 3.6|1755477|34|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder | 1755477-1755510 | 34 | NC_047750 | Mannheimia phage vB_MhM_1127AP1, complete genome | 19383-19416 | 6 | 0.824 |
NZ_CP017529_3 | 3.6|1755477|34|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder | 1755477-1755510 | 34 | NC_028898 | Mannheimia phage vB_MhM_587AP1, complete genome | 19392-19425 | 6 | 0.824 |
NZ_CP017529_3 | 3.21|1755477|35|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT | 1755477-1755511 | 35 | NC_047750 | Mannheimia phage vB_MhM_1127AP1, complete genome | 19383-19417 | 7 | 0.8 |
NZ_CP017529_3 | 3.21|1755477|35|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT | 1755477-1755511 | 35 | NC_028898 | Mannheimia phage vB_MhM_587AP1, complete genome | 19392-19426 | 7 | 0.8 |
NZ_CP017529_3 | 3.5|1755410|35|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder | 1755410-1755444 | 35 | HM144385 | Brochothrix phage NF5, complete genome | 32998-33032 | 10 | 0.714 |
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1. spacer 3.3|1755275|35|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to NC_028853 (Mannheimia phage vB_MhS_535AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaa CRISPR spacer ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaa Protospacer ***********************************
2. spacer 3.3|1755275|35|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to KP137439 (Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaa CRISPR spacer ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaa Protospacer ***********************************
3. spacer 3.3|1755275|35|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to NC_028743 (Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaa CRISPR spacer ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaa Protospacer ***********************************
4. spacer 3.4|1755342|36|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcac CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcac Protospacer ************************************
5. spacer 3.4|1755342|36|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcac CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcac Protospacer ************************************
6. spacer 3.4|1755342|36|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcac CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcac Protospacer ************************************
7. spacer 3.4|1755342|36|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcac CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcac Protospacer ************************************
8. spacer 3.4|1755342|36|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcac CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcac Protospacer ************************************
9. spacer 3.4|1755342|36|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcac CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcac Protospacer ************************************
10. spacer 3.5|1755410|35|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgc Protospacer ***********************************
11. spacer 3.5|1755410|35|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgc Protospacer ***********************************
12. spacer 3.5|1755410|35|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgc Protospacer ***********************************
13. spacer 3.5|1755410|35|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgc Protospacer ***********************************
14. spacer 3.5|1755410|35|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgc Protospacer ***********************************
15. spacer 3.5|1755410|35|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgc Protospacer ***********************************
16. spacer 3.6|1755477|34|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg Protospacer **********************************
17. spacer 3.6|1755477|34|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg Protospacer **********************************
18. spacer 3.6|1755477|34|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg Protospacer **********************************
19. spacer 3.6|1755477|34|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg Protospacer **********************************
20. spacer 3.6|1755477|34|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg Protospacer **********************************
21. spacer 3.6|1755477|34|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg Protospacer **********************************
22. spacer 3.10|1755744|34|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tttaccgtttaccgattggattttaatgctagag CRISPR spacer tttaccgtttaccgattggattttaatgctagag Protospacer **********************************
23. spacer 3.10|1755744|34|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to NC_028743 (Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tttaccgtttaccgattggattttaatgctagag CRISPR spacer tttaccgtttaccgattggattttaatgctagag Protospacer **********************************
24. spacer 3.13|1755944|37|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to KP137439 (Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaa CRISPR spacer aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaa Protospacer *************************************
25. spacer 3.13|1755944|37|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaa CRISPR spacer aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaa Protospacer *************************************
26. spacer 3.18|1755275|36|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to NC_028853 (Mannheimia phage vB_MhS_535AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaac CRISPR spacer ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaac Protospacer ************************************
27. spacer 3.18|1755275|36|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to KP137439 (Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaac CRISPR spacer ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaac Protospacer ************************************
28. spacer 3.18|1755275|36|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to NC_028743 (Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaac CRISPR spacer ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaac Protospacer ************************************
29. spacer 3.19|1755342|37|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer *************************************
30. spacer 3.19|1755342|37|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer *************************************
31. spacer 3.19|1755342|37|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer *************************************
32. spacer 3.19|1755342|37|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer *************************************
33. spacer 3.19|1755342|37|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer *************************************
34. spacer 3.19|1755342|37|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer *************************************
35. spacer 3.20|1755410|36|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgcc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgct Protospacer ***********************************.
36. spacer 3.20|1755410|36|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgcc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgct Protospacer ***********************************.
37. spacer 3.20|1755410|36|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgcc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgct Protospacer ***********************************.
38. spacer 3.20|1755410|36|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgcc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgct Protospacer ***********************************.
39. spacer 3.20|1755410|36|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgcc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgct Protospacer ***********************************.
40. spacer 3.20|1755410|36|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgcc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgct Protospacer ***********************************.
41. spacer 3.21|1755477|35|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgg Protospacer **********************************
42. spacer 3.21|1755477|35|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgg Protospacer **********************************
43. spacer 3.21|1755477|35|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgg Protospacer **********************************
44. spacer 3.21|1755477|35|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgg Protospacer **********************************
45. spacer 3.21|1755477|35|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgg Protospacer **********************************
46. spacer 3.21|1755477|35|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgg Protospacer **********************************
47. spacer 3.25|1755744|35|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tttaccgtttaccgattggattttaatgctagagg CRISPR spacer tttaccgtttaccgattggattttaatgctagagt Protospacer **********************************
48. spacer 3.25|1755744|35|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to NC_028743 (Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tttaccgtttaccgattggattttaatgctagagg CRISPR spacer tttaccgtttaccgattggattttaatgctagagt Protospacer **********************************
49. spacer 3.28|1755944|38|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to KP137439 (Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaag CRISPR spacer aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaat Protospacer *************************************
50. spacer 3.28|1755944|38|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaag CRISPR spacer aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaat Protospacer *************************************
51. spacer 1.1|904810|29|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to MH791397 (UNVERIFIED: Enterococcus phage EfsSzw-1, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
agacctgatactaatctagggtataaaga CRISPR spacer aaacctcataataatctagggtataaggc Protospacer *.**** *** ***************.*
52. spacer 2.1|1139457|29|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to MH791397 (UNVERIFIED: Enterococcus phage EfsSzw-1, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
tctttataccctagattagtatcaggtct CRISPR spacer gccttataccctagattattatgaggttt Protospacer *.*************** *** ****.*
53. spacer 3.6|1755477|34|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to NC_047750 (Mannheimia phage vB_MhM_1127AP1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.824
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer ttctagccgttgctaccgtggtgcagtgcttgcg Protospacer . .********.************.********
54. spacer 3.6|1755477|34|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to NC_028898 (Mannheimia phage vB_MhM_587AP1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.824
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer ttctagccgttgctaccgtggtgcagtgcttgcg Protospacer . .********.************.********
55. spacer 3.21|1755477|35|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to NC_047750 (Mannheimia phage vB_MhM_1127AP1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer ttctagccgttgctaccgtggtgcagtgcttgcgg Protospacer . .********.************.********
56. spacer 3.21|1755477|35|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to NC_028898 (Mannheimia phage vB_MhM_587AP1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer ttctagccgttgctaccgtggtgcagtgcttgcgg Protospacer . .********.************.********
57. spacer 3.5|1755410|35|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to HM144385 (Brochothrix phage NF5, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgc CRISPR spacer atcgaccagtaacacgaccagatgttgataattat Protospacer .* * *********** ******.****** ...
58. spacer 3.9|1755677|35|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to NC_014534 (Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782202, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
ttaaatctaaagctaaagctattttattaattaaa CRISPR spacer cccgatctaaagctaaaattattttattagattgg Protospacer .. .*************..**********. * ..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
43893 : 51220
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017529|43893:51220|DBSCAN-SWA TTTATGACTTTCCATTGATATTTTTCTCCTTGTAATAAATCCACCCAAACAACCTCACCACAACCCAAAACACCCACGCCTTAATCGGATTCCCTTGCGAAATTAAGCAATGTCTTAACCGCTTGTCGGCTTCGGCTCGGCTGACTGTGCCCTTGATACCGTAGTCTCGGTCATGCTGATGACAGCAACTATTGATATTGGCTGGCGCATTACGCCAGCCTGTGCAGTAGTGTTTTTTAGTCACTTAAAACTCCTGAGTCACATAAATTTGAGATAAAAATGAGTCTGACAGTAATGTCAACTCATGCGTTGTTTTATACTGCAAATCAACAATGTCACCTACTTTTAAATCAACTACAGTATCAAAATTGATTGTTGTCATACCATTTGTATTTGATTTGCTGTTTTTAGGTGAAACACTTTGATTAATCAGTCTTTCTTTCTCTTCGTTATTTATTAACAGCCTGAGTTGATATAAATTCAGCACATCTTCCGATGAATTTGTAACCGTTATTTTACCTTTTAAATGAAAAGTCCCGCCTGTCCTTGCAATAAATTGACCACTGACAATATCAACATGACCATTGATATCATTTAACACTCTGTCAAACGGCATTTTTTGCCATTCTTGATTAACAGTAAAATTAATCGGCGATGAAAATCGCAATCTTAATCTGTGCTTATTTACTCCTAAGCTCAAATCATCGCAGAAAATAACACCTTGCTTACCTGATATAATCGCAGGATTGTCCGATAATTTATTACTCTTAAATGTTAAATTTAAGCACGGATTATTGCGAGCAAGTCTGACAGAATATTGCTTAGACTTGCTAATACAACGATTATTAATAAATTGGCACTGTTTTAAAATTGTCCCGTCAATATACACATCTTGATTAAATTCACTGGGCTCCAAAATGTTATTAATAAAATTGATATTATCAATAAACAATGAAGGATTATCGAAAGAACCATATTTCGATATTGCAATAGATTTTGCTTGATTATTTGAAAATTCTACATTGTTGCTGCCTGTGTCAGTCGGATTACCTGATGTGACACGCAAGCGACGGCAGAGGTTACTGTTGATAATGGCATTTTTAGCACCAGACATCCAAATATCGTGTCTGAAAATATTATTCGCTACCACACATTCGCCAGTTTGTACATCTTCCACTTGTACGCCCGCTTCCACATCGACTGTCGTCACTGCCATCCCCTGTTCACGATTACCAAAAATGAAAATATCAGAGCAAGATGTTGCACCGTAAGCTGATACATTGCGACCTCCAATTGCTATATTGTTAAAAAATCGCACACCTTTAACTTTGGTGCAGAGATAATGTCCCGCATTACCTGAACCACAATACGATTGGCAGTTTTGTACAATCACATTATCAGTTGGGTAATTAGTATCCGCCTGAATACTTTCACCTGCCCTGACCCCGTAGAAGGTGCCATTAAACACAACATTGTCAATATGGAGATTTTTAACACCAGCATCATCCAAAGACTTAAATCGAATACCAATTGCTTTGTTCGGTGTTTCAATACAAAAACCCGAGATAAAATAATTGCTGTGATTAATATTAAAAACTTCGGCCCCTGCTTGCTGGATACCTGCACCTAATACTAATTTGCCGGTCTTATTGCCCAAAATTTTCACATTATCGCGAACAGAATTAACGGCATTGTTGATACGAAATGTACCGTTTTCGATAAAAAATTGAGAATATCTCATAGCATTTACAAATGCTGATTCATCATTTGTTACCCCGTCACCGACGGCCCAAAAATCAAATAATGTAAGATGTGAAAGGTCAACACGCTTCCACCGCCCCCCATTATTATTCACAACAAAACAAACCCCATCATCATCAGGCGTAACTAAATCCTGCAAATCAGCCACAAACTCCCCACCGCCTGTTGTGCCGTCCTCATAGTAAGCATCCACCAAAATACGCTGACCGTGTTCCGTTGGGCGGATAGTACGTAACTCCGCAACCGATTTGCAGCGACCGATGTGTTTGTAACCATCAGGGTTGGCTAATGCGTTAAAATTATCACGAGTAGCATCGCCCGCAATTTTCTTGATTGCTTTAGCCACCTGATTAACTTGTTCGTCATTTGCTTCGATTCCTGCTTCAGCAAGTACACTGTGCAATTCTTGTTGGGTGTTAATGACCGAATCTTGGACGTTATTCAAAAATTCAGCAGTCACAATCGTGCCATATTCACCAGTGGCAGGGTTGCCATCTTTAAAACGCTGTGTTGGGGTATTAATCGGATTCATCACTTGTTTCATTCAATATCTCCTAAATATCTTACCCACACACGGCTAAATGCAGGTTTTACCTCTTCAAGTAGACTTTCTAAAATTGGGTCTTTGTATCGTCCCATTAACGCATCGCCAGCCATTGACACGCTTGCTCTAAAACGCTTGTAATCATCTGTGGGGTTGCAAACATCCACAAAAAATGTCCACATAATGTCTTTATGCCATAACATATCCCCAGCTCGGCTTAGCCCAGCAATAAAGGGTTGTGGCTCACTAATTTTGATGCAATATCCAAGCTCTTTGGCCACTTGAGTGATATAGCCTATCGACAATCCACCCAACTGATTCAGCTTTGCAATCACACGCTCAATTCGGGTTTCAAGCGGTAGTGAGCTATTCGCCGTTAAGCCACAAACCCGCTCCCAATCATCAATAAAAATGCCTGTTGATACATCAACGGCATCGATTAAAGTCTTGGCTCTCGCATCAATGCGGTCTAGCTCTCTCCCCTCAACTTCAAGGGATAACGCTAGCCATCTGCCGTTTGGGTCATACGATACAGGCGGTAATAAACCGCCCAATGCCTTGCCGTGTTACCTGCGGCCATTTGTTGTGGTAGCCAGCGAGCCATATCTGCAAGCTCAAAGTTACCTGCTTGCCCGGCTGCAACTGCCATATCCAATGCCCGCCCAATATCCTCTTCTTTAATCCCAAATTGTTGCATTGAGGAGATCGCAATTTTTGCCATATCCTCGGAGCTTGCACCTGTTGCTACAGCACCTTTCTGCAAGGTTGGTAATAGGCTCATTGCAGTTTCAGCCTTCATCGTTCCTGAGGCAATTAGCGTATCAAGAGTTAAAAGAGCATCTTCTTTTGTTCCACCCCCAACCTTAACCGCCTCTTGCACCGCTGCTAATAACTCTTTCTTGCCCTCAATACGCCCTTTAACATCACGGTCGGAAAAGGCAGTGTTTGATGCCATCGCTAACTGTCGGTCAAACTCCATTTGGTTCTTGGCTGGCTGACGAGCCATTGCAGCACCTGCTGCAATACCGACACCGGCACTCATCAAACCACGCCCAAATCCTTTAGCCTTATCCCCAAAGCTTGTCTTACCCAATTCTGCATTCAGCTCTCGCACCCGTTGCTTAGTGGCTTCTGAGGCACGGCGTAGCTCATTTTGAGAGGCAACACCTGAGCGTTTTAAGCGGTCATAGGCTGCACGAGTTTGTTCAATTTCGCGTTGGATTGCATTTTCCGCCCGAACACCTAATGTTTCACGGGCTCGGCTCACATCGGCAGCCACTCGGCGGGCATTACGGTAACTCTGTTCTATTTTCCGATTTGAGCTTTCTGTAGCATTCGCTGCTTTCTGTGCTGCTTGCGTTTGAGCATTGCCACTTTTTTGTGCCGCTCGCTCTGTATTTTTAAAGGCTTTTTCGGCGGTTTTAGCGGCTTGGTTTAAAACTGGGGAGGCAGTATCTTTTGCCGTCAATTCCAGTTGCACTTTCATATTTTTTGCCATTTTTAAAGTCTCTTTAAACTAATTTTAAAGTACAAAAAAGGGGCTTTCGCCCCTATTCAATTTTGCCACACCGAGTAAAGACATAGCTTTCGCGTTTCACTTCGCTATTCGCACCCATTGGGCTATGCGGTGTTTTTACGCCCTCACTCTCCAAGTAGCTCTCAATCCACGCAAATACCTCAAGCAACGGCATTTGCCATACCTGCTCGGCGGTAATTGCAAATTTTGAGAGTAAAATCACCGCTTGTCGGTACTGCTTAAAGGCTTCTGCTACGCCAAATCGGGATTTGCCGGGCTTTCGCTCTCGCTTTGGCTCACCCCATTTTCTAACCGCTTTTTTCGGAGTGTGAGCGTTGCCTCAATCAACTGCCAGTAGTCTTCGGTAGCTAAATTGTCAAATAAAAATTGAGCCGTCACATTACCTTGATAAATACCATCAAAGGTAACTTGCTGCGAAAGGTAAGCCATATCGACCAAGGTTTGTTCACGCTTTGATAGGGCTTCCGAGTTTTCCTCAAACCCTAAATCCGCAATCATTTCTTGAGCCGTGCATTGACCGCCCATCGTCAGCAATCGCACCGTACAATCACGGCGAATTTTCCCGTTATATTCAATGCCAAGATTTAAAGTGATTTTCATTATTCATTCACCTTACGCAATGCGTTGAGTTGAATATCACGCACCGACTCACCATCAACGGTGTAAGACTCGCTCACATCGGTAGTAAAACAGCCTAAATAAGAGGTGCGTTTTTCGCTATTGTCTAACGGGTATTTAGTGAGCTTCGCATTTTTAATGTTATCCCAATCAATTACCGAACCGTCTTGAGGCTCAACTGCAGTCACCGAGAGGGTATATTCCGCAATGCCTTGCGAATAACCTCTTGCACGTCCGGAACTGTTCATCGTTTTAACCAGCTTGCGACCGGTTACGGTTTTTACATCAAGTTTGGTAATTTCAATCTCAACGCCATCTACCTCAAGCACGCAAGAGCCTTCATAAACAATTGACATCTAGCACCCCCTATAAAATTAACGTAATTTTGTTACGAATAACGTGCAAGCCATTAACCACATCCGCAGGGATTTCTAAATCCAAGTAAGTCGGGTCTTGATTACGCACCACTAATAAGCGATTTTTCCACGCTTCCACATTTTCGATTACCTCTTCGCCCTCAAGCTGATAAAGCACATCTAAAATCTCCGAGCGTACTTTTGCCACAATACGGTGGGAGTTTTTCGCACGAGGGAAACGCAAACGCTGACGGGTTTGGATTGCCTTACGCACATAGTCAAGCGTACGAATGGTGGTTAAATCCAAATAGCTTGGGTCATCAGTATTCGTCACGTTTTTGGTGTATGTAGTAATCGCACGGGTAATCTGCACACGGCTTGCCACCACCTCAATCGGGCTTAAACCGTGATATAACGCTTGGTTTACTTCGCTAAATAACGGTTTCTGCGAGTCATCTACGACCGTTAAGCCTTTAACTTCAAGGGTATTTAACGGGCGAGCCGGATCTTCTTCACCGGCAATTTCCGCCCTTGTTGCACCACATAATCGGGCAACTGCTTCAAGGCATACCGAACTTGGCTCTCTGTAGGTAAATCTTCGCCCTCATACTGCATTGCAAATTGAGCATAAGCCTGTGTGAGTGCCACATTGCTAAAGGTTTGATAAAACGGCAGAAAGGCTTGCAACCAACCACACCGCTCGGGCACGGCACGTTTTTGTGTTTTCAGCGGTATCATCTGTTTTAACCGTTCCGCTGAATTTTCGCCTGCCTCATACGCCAGCACCCAACTATGCAAGGTGCGTTTAGATAGCTTTAACTTTCCACCGGCTTTACTATTGCCCGCCATAATCGCTTTGCAAATTTCAGCAGGAATTTCACTGCTTGCCACCGCTGCAATGACTTGGTCTAGCGTTTTTGTGCGGCTTAGCCCCAACTGCACTTCCTGCATCAAGAACCACCGCACCACCATAATGCGAGCATCTGCCGTAGAAAGTTGTTTATCGGTTATCTGCTCCAAATCAATGTTTTGTCGCACTACACTCAATTCGCCTTTGCTGATTTCAGCAGGAAGAAGTTTGAGTAACTTGGTGCGGATTTCCTGTTGGACTTCGGTGGGTAAACTGATTAATTCATATTCAACCCCGCCGCCTCTGCCTTTGCGTTTTTGAGATTGCCAGTTTTCCCTTATTGCTTTCTCAAGCACATTTTTATGAGCACTTGGTAGGCTAGATAACTTAAAACTTAACAATTCAGCCACTGAATAGTGCGTTTTTAAACTTAATTCGCTCATAAATGTTCTTCTCCTATATCTTTTACGTTAAAGATCATTTATGATTAAAACTTATTAGTTAAAGTTGGTCGCCGATTACGTTCAATGCGTTCTGCTGTTCGCCCAGCCCAAATCACTTCAGGGGCAACCCCTATGGCATTTGCAACTAAGCGTTCCATTTTGGGGTAAGGCTTGTCTAAAACAGACTTCAGCGTGTTATGGCTAACATTGCCTGCTTTAGCCAAAGAACGAAGTGACCAACCTTTTTTACGAAGTTCCGCAAGAATATCGGCTTTATGCCAATCTCTCTGTGCGGTTTTTTTAACATCGTTTAATACACTCATTCGATACACCTCTTTTTATCTATTTGATGCGTGTATTTAACCGTAAAACTTTAAACAAATCAACCGTAAAACATAAAAACATCTAAAATATTTTTGCTTTATTCATAAATAACTTAAAAATCAATGGTTTATGAGTATGTTTTACGAGTAAAACTTTATTAATGGAAACGTAAAAGATGAGTAAACCAAACATTTACGATGAGAGCTTCTCAGAAAGAATGAAATGGATTGCAAAAAATAGCTTTAAGGACAATTACAGTGAGTTTGCAAGAGCAGTGGGGGTAGCCCAAGCATCACTATCTAGGTGGGTAAAAGGAGAGGCAGATCCATCTCGTTCAAATCTTGTAAAAATAGCAGAGGTGTCAAATGTGAGCCTTGAATGGCTGGCAACAGGTAAGGAAAGCAAACCACAATCAGAGAATACCAGTATTGTGGCAAGAGAGTTTGAGCGACTAGAAAAAATGGCTGATGATATTGTTTCAATGATTAACAGCTTCAGAACAATCAACGTTTCAGCAGGCTTTGGCAGCTTTAACGAGGGCGTAACGAAGCCAGACGGGCAAGAACCTTACGCCGACAGCCTGCTGCAAAGCCTCGGCGTAAAAGCCCACAACTGCGGCGTGTTTTGGGCAAATGGAACATCAATGCACCCTACCATTGCAGACAGTGACCAAATGCTGGTAGATTTCAGCAAACGAGAGCCTCGTGGTGATGATAAGATTTATCTTGTGCAGAATGGGGAAAGCGTATGGGTTAAACGGATTAGAAAAGAATGGGACTATATTGAATTAATTAGCGATAACGAGTCCTACCGCCCAATACAGATTACCGCCGAAGAAGCTCAAAACCTCCAAATCATCGGGCAGGTAGTCCACATCGGACACTCTTTAGTTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017529|43893:51220|49197_50001_-|WP_006253446.1|transposase|DBSCAN-SWA MSELSLKTHYSVAELLSFKLSSLPSAHKNVLEKAIRENWQSQKRKGRGGGVEYELISLPTEVQQEIRTKLLKLLPAEISKGELSVVRQNIDLEQITDKQLSTADARIMVVRWFLMQEVQLGLSRTKTLDQVIAAVASSEIPAEICKAIMAGNSKAGGKLKLSKRTLHSWVLAYEAGENSAERLKQMIPLKTQKRAVPERCGWLQAFLPFYQTFSNVALTQAYAQFAMQYEGEDLPTESQVRYALKQLPDYVVQQGRKLPVKKIRLAR >NZ_CP017529|43893:51220|43893_44136_-|WP_006248673.1|DBSCAN-SWA MTKKHYCTGWRNAPANINSCCHQHDRDYGIKGTVSRAEADKRLRHCLISQGNPIKAWVFWVVVRLFGWIYYKEKNINGKS >NZ_CP017529|43893:51220|47747_47936_-|WP_006251296.1|DBSCAN-SWA MILLSKFAITAEQVWQMPLLEVFAWIESYLESEGVKTPHSPMGANSEVKRESYVFTRCGKIE >NZ_CP017529|43893:51220|50045_50324_-|WP_006248972.1|DBSCAN-SWA MSVLNDVKKTAQRDWHKADILAELRKKGWSLRSLAKAGNVSHNTLKSVLDKPYPKMERLVANAIGVAPEVIWAGRTAERIERNRRPTLTNKF >NZ_CP017529|43893:51220|46193_46751_-|WP_006253441.1|DBSCAN-SWA MGGLLPPVSYDPNGRWLALSLEVEGRELDRIDARAKTLIDAVDVSTGIFIDDWERVCGLTANSSLPLETRIERVIAKLNQLGGLSIGYITQVAKELGYCIKISEPQPFIAGLSRAGDMLWHKDIMWTFFVDVCNPTDDYKRFRASVSMAGDALMGRYKDPILESLLEEVKPAFSRVWVRYLGDIE >NZ_CP017529|43893:51220|44136_46197_-|WP_147010789.1|tail|DBSCAN-SWA MKQVMNPINTPTQRFKDGNPATGEYGTIVTAEFLNNVQDSVINTQQELHSVLAEAGIEANDEQVNQVAKAIKKIAGDATRDNFNALANPDGYKHIGRCKSVAELRTIRPTEHGQRILVDAYYEDGTTGGGEFVADLQDLVTPDDDGVCFVVNNNGGRWKRVDLSHLTLFDFWAVGDGVTNDESAFVNAMRYSQFFIENGTFRINNAVNSVRDNVKILGNKTGKLVLGAGIQQAGAEVFNINHSNYFISGFCIETPNKAIGIRFKSLDDAGVKNLHIDNVVFNGTFYGVRAGESIQADTNYPTDNVIVQNCQSYCGSGNAGHYLCTKVKGVRFFNNIAIGGRNVSAYGATSCSDIFIFGNREQGMAVTTVDVEAGVQVEDVQTGECVVANNIFRHDIWMSGAKNAIINSNLCRRLRVTSGNPTDTGSNNVEFSNNQAKSIAISKYGSFDNPSLFIDNINFINNILEPSEFNQDVYIDGTILKQCQFINNRCISKSKQYSVRLARNNPCLNLTFKSNKLSDNPAIISGKQGVIFCDDLSLGVNKHRLRLRFSSPINFTVNQEWQKMPFDRVLNDINGHVDIVSGQFIARTGGTFHLKGKITVTNSSEDVLNLYQLRLLINNEEKERLINQSVSPKNSKSNTNGMTTINFDTVVDLKVGDIVDLQYKTTHELTLLSDSFLSQIYVTQEF >NZ_CP017529|43893:51220|47965_48334_-|WP_006253443.1|DBSCAN-SWA MKITLNLGIEYNGKIRRDCTVRLLTMGGQCTAQEMIADLGFEENSEALSKREQTLVDMAYLSQQVTFDGIYQGNVTAQFLFDNLATEDYWQLIEATLTLRKKRLENGVSQSESESPANPDLA >NZ_CP017529|43893:51220|46699_47695_-|WP_006253442.1|tail|DBSCAN-SWA MAKNMKVQLELTAKDTASPVLNQAAKTAEKAFKNTERAAQKSGNAQTQAAQKAANATESSNRKIEQSYRNARRVAADVSRARETLGVRAENAIQREIEQTRAAYDRLKRSGVASQNELRRASEATKQRVRELNAELGKTSFGDKAKGFGRGLMSAGVGIAAGAAMARQPAKNQMEFDRQLAMASNTAFSDRDVKGRIEGKKELLAAVQEAVKVGGGTKEDALLTLDTLIASGTMKAETAMSLLPTLQKGAVATGASSEDMAKIAISSMQQFGIKEEDIGRALDMAVAAGQAGNFELADMARWLPQQMAAGNTARHWAVYYRLYRMTQTADG >NZ_CP017529|43893:51220|48333_48708_-|WP_006253444.1|DBSCAN-SWA MSIVYEGSCVLEVDGVEIEITKLDVKTVTGRKLVKTMNSSGRARGYSQGIAEYTLSVTAVEPQDGSVIDWDNIKNAKLTKYPLDNSEKRTSYLGCFTTDVSESYTVDGESVRDIQLNALRKVNE >NZ_CP017529|43893:51220|50500_51220_+|WP_006248970.1|DBSCAN-SWA MSKPNIYDESFSERMKWIAKNSFKDNYSEFARAVGVAQASLSRWVKGEADPSRSNLVKIAEVSNVSLEWLATGKESKPQSENTSIVAREFERLEKMADDIVSMINSFRTINVSAGFGSFNEGVTKPDGQEPYADSLLQSLGVKAHNCGVFWANGTSMHPTIADSDQMLVDFSKREPRGDDKIYLVQNGESVWVKRIRKEWDYIELISDNESYRPIQITAEEAQNLQIIGQVVHIGHSLV |
10 | Mannheimia_phage(80.0%) | transposase,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
568786 : 648930
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017529|568786:648930|DBSCAN-SWA TTTAAATCATCTCGTGTCCAATGTACACAACCTGCCCGATAACCTCAAAATCTAACGTTTCATCAAAAATCACATCAATAGGGCTGTATAGCTCTTTATTATCGCTGATTAAGCGAATACCGCCCATAATGCCTTGCACACGTTTAACCCAAAGCTGCTCGCCTTGGCGGAACACATAAATTTTACCGTCTTTAGGCTGGGTGGTGGCTCGGTTTACCAATAGCATATCGCCATCACTGATGGTTGGGTACATTGAATCACCTGAAGCGGTAATAAATGCAAGATAGCTCAAATAGAAGCCACGCACATCTAGCCATCGTTTACTTAGCCCAATATAGTCATCAGGGGCATACACCTCGCTATTGAAAGCACCAAAGCCTGCTGAAGCCTGTACATTATAAAACGGCACACGTTCCATTTCATCTGCAGTTTGGGCTGCCACTAATGTTCTAGGCTCTTCTTTTACTGCCGTTTGAGCAAAGCCTAACTCTTGCTGCACGCTTATTGGGAGAGAGCTGTAGTGGTATTCAAAAGCAACCCCCCTTTTTCCCTCTATTTGTCTTTTGAGCCAATTATTTTTGGTAGCTCTTCTTGTTACATTTGATGGTTGTTCAGGTAAATTTCCCATTCCAGCTACTTCAGATGCCGTAAACCATTCCTTTCTAATTATAGAATTCATAAAACCCCTTTTGAATTCAAGTGGAATTCAAAAAAATTTACAAACAAATTCTCTTGAAAATCAATTAGTTAATTAAATAAAACCGAAAAACACTAAATTCTTTTGAATTCTCTTATTGAATTCATTTGGAATTCACTATATTATTCGTTCTGTAGTTAAATGATTTACATCATTTAAGTAGTTTCTAAAACTAACTTTCAAGGATCTCACAAAATGGCAAGAAATAAAAGAGTTCGAGATATGAGTAATTTCGAAATTCGTGGTGAGCTGATGAAAATCGGTAAGTCCTTATCTCAGTTAGGTATTGAGAATGGATTAGCAAAAACCACAGTTCGTAATGCGTTAGATAAGCCATATCCCAAAGGGGAGCAAATTATTGCAAAAGCGATTGGTAAAACACCGCAGGAAATTTGGCCCTCTCGTTACGAATAAGGAGCTTTTATGAAGGAATGGTTTTTAGCCAAAGAAATCGCAGGATTATCTGGAGTTCCAGAATTACCGAATAGCGTTTCAAGATTGGCAACCAAAGAAGGATGGCAAAAACGACAAATTCAAGGTGTAAGAGGTGTTACTTACGAATACCACCTCACCAGCCTACCCATTGAAACCCAACAACAACTTAGACTAAACGCCGCCCTTGCGGTAATACCGCAAGCGGCAGAACTACAACCCAAACGAGACGACCCCGCACTTATCGCAAGGCTCAATAATGCCACCGATAAAGGCAGGGATAAAGCAAAAGGCAAGGCAGAAGCCTGTATGCAGTTGCAAGCCTTTCTCGACCAAGGGTTTAGTTATACGCAGGCAGAAGCGGGAGCGGCAACCGCTAAAAATGTGTCGCAAGGTTCTTTAAAAAATTGGTACTACAAAGTGAAAGGTCACCCCGTCCATTTATGGCAGGCGATCTTAATTTCCGAAAGCGGTAGGAGTAAAAAGCCGCAGCTGAAAGCCAAGATTACTGAAGAAGCGTGGGACTGCTTTTTGGCGGATTACCTCCGCCCTGAAAAGCCGGATTTACGGGCAAGTTACCGCCGAACCCAAGCCATCGCCAAGCAATACGGCTGGCAAATAGCAAGTTTACAGACTTTCCAACGCCGAGTGTTGGCGGAAGTGCCTTACGAGGTGATTTTGCTCAAACGGGAAGGAGCAAATGCGGTTGCCAAGTTAGTGCCGGCACTACAACGCACGGTGAAAGATATTCTCGCAGGAGAATGGATTAACGGCGATGGCTATCAACACAATGTGTTTGTGAAATGGCACACCGGCGAGATTGTCCGCCCTAAAACGTGGTTTTGGCAAGATGTTCGCACCCGCAAGATTTTAGGTTATCGAACATCGATTTCGGAGAATACTGACAGCATACGCCACGCATTAATGGATGTGATTTTTAACGTAGGCATACCGAAAACGCTCACGCTGGATAACACCCGAGCAGCAGCGAATAAGGCAATGACCGGTGGTATTGAAAACCGCTACCGCTTTAAACATACCGAGTTAGACCCGAAAGGCATTATGCCGATTTTAGGGATTGATGTGCATTTTACCTCAATTCTTTATGGTGAAGGACACGGGCAAGCCAAGCCGATTGAACGTGCTTTCGGGCGAGGCGGAATTGGCGAGAAAATAGATAAACGCCCTGAATTAAGTGGTTTCTATACGGGCAGAAATGCACAAGAAACCCCTGATAACTATAACGGCGGTAAAGACGGTGTGGATTACAACACATTCTTGAAAGCCATAGCAGCAGGGATAGAAGAGTACAACTCTCAAACCGAACGCCATACCGAAATGTGCCGAGGAGAATTGAGTTTTAACCAAGTTTGGGAGCGGGATTACCACCCAAGCAACGTAAGACAAGCCAGCCCTGAACAGTTGCGGTTACTGTTCTTACAGGCAGAAACGGTCAGCATTAAACGCAACGGCAGTTTTACGCTGAAAGCAGCCGGCAAACTTTACGGCTTAACTAACGTTTACTGGGCAGAAAGCCTGATAGGGATAACGGATAAGAAAGTAGTGGCACGGTTCGACCCCGATGACTTACACGGCAACGTGTATGTGTACAACCTAGAGGGGCAATTCTTAGCCGAAGCGGTTTGCCGAGAGGCGAAAGGATTTGGTGATACCAGTGCAAGCCGTGAGCAAGGTCGCTTATATCAGAAAGTAGTGAAAAGTGCCAAAGCTCAAGCCGAAGCCCTTGAATTACTGGAAGCTCACGAACTGGCAAGCCTCGCCCCACAAGTGGACGTGCCTGAGCCGATAGAGAAGAAGGTAAAAGAGGTGCTGGTGAAAGAAGATTTTATCGTGGATTTCAACACTGTGCGTAAAGCAACGGTGGTGGAAGAAACCGAAGAGATCAGTATTTTTGATGAAGTGTTACTGAAACAAGAGAAACAACTTCGCATAGTGGAATAACTAGCGGTCAGTTTTTGCAAAAAATTTGCAAATTTTTCTAAAAAAACGACCGCTTGAAATGAGATTTAAACAGGGTTTAAACGCCTTTAAGGAGTAAAAAATGACATTAACAGGGCAAGCTTACCGAGTGATTTTCAAGGAACTCAAAGAGCAACAAGAGAGTGAATTTGAACAGGCTTTCAAGAAAGGGATTGCCAAAATTCAGCAGAATCAAACTCAGGAATCCATTCTGGTAAACCGTGATATGTTTCAAGCTGAAAAGCTAACACTGCTTTCACAAAAGTTGGAAGCGGTTGAGCAATTACTTCGCCTTGAATTAAATCAGCCGAATTTTCAAGCAAAACTTGAAGACTACGCTGACGCATTACGAACAACCATTTTAAGTAAAGTAGCCAAATAAGAGCTTTAGACTCTTGAAGGCTTAACATCTGAGCCACTTTTTTTACTGTCGGCATTATACCGTCAAGATCATCAATAGAAGTTAAATGATGAAAAGAGGAATGGTATTCAGCTAAACAAAAATTGATTGTACTAAGTTTAAACAAAGTAATGCAATTTTTCATCACGATGGCATTTGCTCGTTTTAACTTAAAACCAGAGAAGGTTGCACGAGCAGAATCAAGGGCTATTTGATGAATTTCATCATCTGTTAAAGAACGAAAGAGCATAAAAACCTCCAAACAAAAACAGGACACCATTATGACATTAATCGACCAAATTAAACAACACATCGCCGAAAGCGGCAGTTCTCAGGGGAAAGTTGCCAAAGAAGCCGGGATTAATGCCGGGGCGTTATCGGCTTACCTGAATGAAAATTACAAAGGCAATAATGAAGAACTTGAAGCAAAGCTGATTGCTTATTTAGAGCGTATTGAGGCGAAGAAAAGAGAGTTTGTCGAAGCTCCGAGTTTTATTGAAACCAAAACCGCAAACCAAATTTTCGGTTCGTTACGATTTGCTCAAAATACTGGCGTGCTTGCCATTATTCACGGTGCGAGTGGCGTGGGTAAAACACAAGCGGCTAGAGAGTATCGTAAACGCTATGCGAATGTATGGTTGGTTACCGCAAGCCCTTCTCGTTCCTCATTAAGTGAGGTGTTATATGAAATTGCTCTTGAACTTGGAATGAACGATGCACCACGCCGCAAAGGGACATTGGCTCGTTTAATTGTTCGCAAAATGAAAGGCACAGCAGGTTTATTAATTATTGATGAAGCAGACCATTTACCTTACGAAGCCTTAGAAGAATTAAGGCTGTTACAAGAAGAAGTAGTGAATGAAAGTGACATCGGAGCTGGTGTTGGCTTAGTGCTGATTGGCAATGACAAAGTCTACACCCGAATGAAAGGCGGAATTAACCCTGCTCACGAATATGGGCGACTTTGGTCACGCAGTGCCAAACGCACCAGTATTCAGAAAACCAAAAAAGAAGATACCCAAGCGGTAGCCAAAGCGTGGGGGTTGAGTGAAAACCAAGAAGCACTCAAGGTAATGCAAGCCATTACTGAAACTGGTGGCGGATTACGGATTCTGACACACACCTTACGATTAGCAGCGATGGTAGCAAAAGACCGAATGATTCCCTTAACTGCCGATTTAATTCAGCTCGCACGTAAAGATTTACTCTCAACAGGAGATTAACAATGAGAACCCCAAAACCCAAACACAGTTTTAACCGCACCAACCAAGCAGCGTGCCGTTTTTTAAAACAAACCCAAAAGGCAATTATCCGCTTAAACAGTCTTGGCTTTACGGTGCTGAATATTGATTTTACCCGTATTAAGCCCCGCATTGAGGTGGAAATCGGCAATAACAAGCACATTGCTCAAGGCTTGATTTATGAGGGTAAAGCCTACCGCTACAGCTTCGGTAAAAGCGAAGATTTAGGCAGATGGGAAGGCTACTACAC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84 | Mannheimia_phage(17.07%) | head,tail,tRNA,protease,transposase,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1060901 : 1067686
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017529|1060901:1067686|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017529|1060901:1067686|1061693_1062422_+|WP_006248948.1|DBSCAN-SWA MQRDTLFSAPIEKLGDFTFDESVAEVFPDMIQRSVPGYSNIITAIGMLAERFVTDNSNVYDLGCSRGAGILSIRRNVNAKNVQIIGVDNSQPMVERCKTHLSAYHSEIPVTILLDDIRHIEIKNASMVVLNFTLQFLPREDRLALLQKIYQGLNSNGILVLSEKFTFESEEMNELLIDLHHTFKRANGYSELEVSQKRNALENVMRTDSIETHKKRLQEAGFTQVELWFQCFNFGSMIAIKA >NZ_CP017529|1060901:1067686|1062557_1063577_+|WP_006248949.1|DBSCAN-SWA MATIKDVAKYAGVSTTTVSHVINKTRFVAEDTTKAVWEAIKALNYSPSAVARSLKINTTKSIGMIITTSESPFFAEIVLAVEEFCYSKGYSLFLCNTQNKLEKIQNHLDMLIKKRVDGILVMCSEYTANSFDIFENSNIPMVIMDWGRSDERSDIILDHGVEGGYIATQHLIENGHQDIAVITGNRDKEIARTRFEGFKKALSEAGLSIREEWIQEGDFEPEGGYECMNNLLKSSEKLPTAVFCFNDSMALGAISAITEKGLNVPQDISVIGYDNVHSSRFYAPPLTTIHQSKSRLGSAALELLLERIEDNENAKEPKVLEFFPELVKRKSVRNLNIKE >NZ_CP017529|1060901:1067686|1065889_1066519_+|WP_006248954.1|DBSCAN-SWA MDIFIQGFIVCFGLIVSIGAQNAFLLKQGILKQHIFWIALLCFLGDVFLMTIGVLGLGTLIAELPVVSFIISLLGAIFLLSYGSRSFISVFKSGEYLVASGENATSLKKALLITFAITFLNPHVYIDTVVIVGSIGGKLDFNGKIYFLAGALLCSFIWFFGIGYGASLLSPYFAKRRTWQILDAVTGLIMYFIAFSLLIYTYQLALQIF >NZ_CP017529|1060901:1067686|1064542_1065124_-|WP_006248952.1|DBSCAN-SWA MRLCDTDIKRYLDEGIIAITPRPSDDKISGATADVRLGNSFRVFREHKTPYIDLSGPREEVAAQLNKVMSDEIIIGDDEAFFLHPGDLALATTLESVSLPANIVGWLDGRSSLARLGLMVHVTAHRIDPGWEGKIVLEFFNAGKLPLALRPNMAIGALSFEILSGDAAKPYNARKDAKYKNQQSAISSRINQD >NZ_CP017529|1060901:1067686|1064309_1064465_-|WP_006248951.1|DBSCAN-SWA MLHYAVVFFVIAIIAALLGFGGIAGSATEIAKILFFVFLILTVISFFFKKK >NZ_CP017529|1060901:1067686|1063578_1064181_+|WP_006248950.1|DBSCAN-SWA METLIEFFSSYGYWAVFLVLLACGFGVPIPEDITLVSGGVISGLGYTNVHWMLVVSMLGVLVGDSTMYWLGRIYGEKILKFPLIRNVATPERFATVQERFEKQGWKLLFMARFLPGLRAVVYLVSGITRKVSFVKFLLVDFCAAIISVPIWVYLGDYGASNLDWLKEQVANGQHLIFAILGIVILFLGWKWYKNKKQYKK >NZ_CP017529|1060901:1067686|1065138_1065786_-|WP_006248953.1|DBSCAN-SWA MTDTSQTSSCVVIAIAGASASGKSLIASTIYKELKNELGTDNIGIISEDAYYRDQSHLTMEERIKTNYDHPNSMDHHLLVEHLRQLKQGNAIEIPEYDYTEHNRKTTTKHFEPKKIIILEGILLLTDENIRNEINVSIFVDAPLDICFIRRLQRDMVERGRSMESVISQYRKTVRPMFLQFIEPSKQYADIIVPKGGKNRIAIDILKAQIKQLLK >NZ_CP017529|1060901:1067686|1060901_1061684_+|WP_006253612.1|DBSCAN-SWA MTEKSQLNFNYQPSNNHANAQTMIFLHGLFGDLNNLGAIAKPFAERYSILMVDLRNHGRSFHSDEMNYALIAQDLAQLLTELNIQNAIVVGHSMGGKSAMALAAFAPELVEKLVVIDIAPVTYTQNRHQQVMAALFAVKEAKPQNRQQAKAIMAEYIRDEGVQQFMLKSFDAQSEQSFRFNLQALKDNYQNVMGWQQVFVDKPTLFIKGALSDYIQAEHTQTILAQFPQAKSFIVANADHWVHAEKTGTVVRAINKFLEK >NZ_CP017529|1060901:1067686|1066633_1067686_+|WP_006248955.1|DBSCAN-SWA MFKKFLGLFSNDLSIDLGTANTLVYVKGQGIVLDEPSVVAVRQDRMGSLKSIAAVGSHAKLMLGRTPKSIMAIRPMKDGVIADFFVTEKMLQHFIKQVHSNNFMRPSPRVLVCVPAGATQVERRAIKESAIGAGAREVYLIEEPMAAAIGAGLPVHEAMGSMVIDIGGGTTEVAVLSLNGIVYSTSVRIGGDKLDEAIIAYVRRHFGSAIGEATAERIKQEIASAKIESDDDVKTMEVHGHNLAEGAPRTFELNSRHVLEAIEQPLNGIVEAVKSVLEQCPPELAADIFERGMVLTGGGALLHNLDRLLSDSTGVQVVVAEDPLTCVARGGGKALEMIDMHGGDVFSIDD |
9 | Mycobacterium_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1208826 : 1304015
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017529|1208826:1304015|DBSCAN-SWA 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117 | Mannheimia_phage(87.5%) | terminase,integrase,capsid,tail,tRNA,protease,transposase | attL 1212115:1212174|attR 1265119:1265209 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1551342 : 1612567
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP017529|1551342:1612567|DBSCAN-SWA 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79 | Mannheimia_phage(94.52%) | terminase,transposase,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1689907 : 1805698
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP017529|1689907:1805698|DBSCAN-SWA 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110 | Mannheimia_phage(44.07%) | terminase,integrase,tail,tRNA,holin,transposase,portal | attL 1768195:1768212|attR 1814156:1814173 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1816819 : 1862427
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP017529|1816819:1862427|DBSCAN-SWA 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57 | Mannheimia_phage(50.0%) | tRNA,protease,integrase,tail | attL 1830052:1830068|attR 1836919:1836935 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2275538 : 2283693
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP017529|2275538:2283693|DBSCAN-SWA AATGTTAGATCTCACCAAGATTAAATTAGTGATTACCGATGTGGACGGCGTGCTAACCGATGGCGGAATGTACTACACCGACCAAGGCGAAGTAATGAAACGTTTCCACGTTCACGATGGTTTAGGCGTTAAGATGTTACAAAGTTGTGGCATTAAAGTGGCAGTACTCTCGGGCGGCGATACGGCTTTGCTCCGCAAACGGTTAGAGGTGCTGAAAATTGATCTCGCTTTGTTAGGCAAAATGGAAAAACGCTCCGCCTGCTTTGAGCTAATGCAGCAAGCCGGTGTTACCCCTGAGCAAACGGCTTACATTGGTGATGACACCTTAGATTTACCGGCTTTTGAAGTGTGTGGCATTGCGATTGCAACCCGTAACGCCCTCGATTACATCAAAGAAAAAGCAGATTGGGTATTGCAAAAAGCCGGTGGTGAAGGGGCGTTTCGTGAAGTCTCCGACCAAATTTTGGAGGCTCAAGGATTCGGTGAAATTTTTAAAACCGCAGATGGTTTTTTAACGGTAGCGGGGAAAATGGCTCAGTAGACTCTTCAAGCAGTTAAATTTCATTTTATTTTTGCGATCTGCATCGAAAAAATGTATTTCTAATCTGATTTTCAAATTACTGTTTGCTAAATTAAATTTAGTTCTTGTTAGATTTATTTTATGTATATACAATAATTATGAAAATTTATACTTGGGACGAAACTAAACGCAAAATCAATTTAGCCAAGCACGGATTAGATTTTGCCGATGCAGATGAAGTTCTCTCATCGCCCTATCGATTTGATGTTGAAGTTATTCGTAACAATGAATTTAGAATACAATCTTTTGCATATTCATTTGGACGTTTACTCGTATTATCACTTGCATATACAGAAAGGGAAGATTACATCAGAGTAATTAGCTTTCGGCGAGCATCTAAAGCAGAAAGAGAGGCATATTATGAATACTTACAACAATACTTTGAATAATAAAAATTTAGAGAAAAAACAGCTACTTATGGCTATTCAAGCTATTCCGGCAAGCCAAGATTTTATTTGGGACGGAAAAGATGACGATGAACGCCCGGTTACGCCATCAGAGTTTTCAATTGCAATGAAAAAACGTGGCAGACCAGCTGGTTCAAAGAAAGAATTGGTTTCGTTACGTCTTGATAAAAGCGTTCTTGAAGCCTTTAGAGCTTCAGGTAAAGGTTGGCAAAGTAGAATTAATCAAGTTTTAAGTGATTTTGTAAAACAAGTTTGACCACAAAACAAAGGCGGTTAATCCGCCTTTTTCCCTTCAATATATCGCTCGAAGTTTTGGATATATTCATCTAAATTTGCAGTGAGCATTTCTTTGTATTGCTCCACAAAATATTGAATAACTTCTTCTCTGGAATCGGCCAACTGCTGTTTATATTCCGCCTTGCTTGCCGCAACATAGGCGTTAAATCTGGCACAACCAAACAACATCGCATTGCTGACTTGGTTTGGGGCAATGTTTTTTAAATGAGCGTTGGCAACGTTAATAAAGCCGTCTGCTCGCTGGTAGACGCTGGTAGAAAGTTGGGTCAATTTGTTTATCGGTAATGTTAATCATAGTATCCTCATTTTTAGTCAAAATACAAGCGGTGCTTTTTGCGTAAAATTTTGCACAAACGCTTGCGTTTGAACGTTGGCTCTGCCGACGGCACGAAGTGCGAGCGTAGCGAGTAAAAAAATCACCGCTTGTAGGCATTTCTAGCCGTCTAATGAAATCGCTTCCTTGATTTTCTTCAATGCGGCATTTTCAAGCTGTCTTACCCGCTCTGCCGAGATGTTATATTTATCGGCTAAATCTTGCAGTGTGGCTTTATTGTCATCTAACCAGCGGGTTTTGATGATGTCTTGGCTACGTTCATCAAGGGTGGCTAACGCATAGGCAAGTTGAGCGGTTGCCTGCCCATTATGTTGTTCGTCTTCCAAGTCATCGGCGAAATTGGAGCTGCTATCTTCAATATACATAGAAGGAGCGTAGCTGTCTTCATCGTCATCACCGGCAGGCAGGTCAAAACCTAAATCTTGTCCGGTCATTCGAGATTCCATTTCTCGTACTTCTTCCACTGAAACCCCTAAATCATCGGCAACTTTTTTGATCTCTTCTTCATTAAACCACGCCAAGCGGTTTTTATTTTTGCGTAAATTAAAGAATAATTTACGTTGAGCTTTGGTGGTTGCCACTTTCACAATTCGCCAGTTTTTCAGCACATATTCGTGAATTTCCGCTTTCACCCAATGAACCGCAAAAGAAACCAACCGCACGCCGACATTCGGGTCAAACCGTTTTACCGCTTTCATCAAGCCGATATTACCCTCTTGGATCAGATCTGCCAGCGGTAAACCATAGCCCAAATAGCCACGAGCAATATGGATCACAAACCGCATATGGGAAAGGATCAGCTGTTTTGCCGCCTCAACGTCTTCATCATAATAATAACGCTCCGCCAGTTCTTTTTCTTGCTCGGCGGTGAGAATCGGATACTGATTTGCCATTCGGATGTAGCTATCCAAATTGCCCTGCGGCACAGGCATTGAGCCGGAAACCAAAGCCGGATGCATTGCTTCTACCGATGTTTCTTCTTCGTCTATCTCATCAACATCAATCGGCTCGGCATCTATAATTTCAGCATCTTCAATCTCGTTCTCGTTAAATTTTTTCATTCTATTTCTCTTCACTCTCAGCAAGGTTTACATTATAACAGAGTTAAATCTATCTGGTGTGGGATTTGTATGATTTTATTTCGAGCTATTCAATACCGCTAAGTTCCGCCACTTGCAAAACTTTTTGCAAATTCGACCGCTTTCCTTTAGAATACCGCTACTTTTGGGGCTGATTTTGGATTCGACGGGATTGGCGAAGCCCAAGGTGCATGTCGAGGTGCGGTAGGCCTCGTAAACAAACCGCAAAATAATAGTCGCAAACGACGAACAATACGCTTTAGCAGCTTAATAACCTGCTTTAAAGCCTTATCTCCTCAGCTTCCGCTCGTAAGACGAGGGCAAAGATAAGTCACCCAAAACGAGATCGTGTGGACGCCGCCGCTTTAGGATCGAAACACTAAATTAAATAAAGCTAGTTTATTCATTGCGTGTCTGTCCGCTGTGAATAAGCGAAATTAAAGACTAGACTAAACATGTAGTACTGAAGGTAGAGAAATTTCGGACGGGGGTTCAAATCCCCCCAGCTCCACCAAATTATAATCCTATACGGTTCAACCGATACCTAAAAAGCCTTGAAAATCAATGTTTCAAGGCTTTTTTATTGTCCGTTGCGTACCTATACGATACAATCAAATCCGAAGATTTTAGGAGTATATTTAGGAGTACGCCGGAATACCCCCAAAAATTCGTACTCCTAAAACCACTTTAGAGCCTTTTCAAATAAGGCTTTATCGCTTTTAGTTTTGTACTCCCAAACAAAAAATCATACTCCTAAGATTTAGGCTTTATACTCCTAAAGGTTTACTATGGCTAGAAAAATCACACCGTTAAACGATACCCAAATAAGAAAAGCGAAACCGGAAGACAGCCCATTAAGAGACGGTAACGGCTTACTACTTGTTATTACCTCAAATTCTAAATTGTGGCGGTTTAGGTATGAAAGACCGTTCACAAAAAAGCGGAATGATTTAAGCATTGGGGCTTACCCTGATATTTCTTTAGCACAAGCGAGAGAAATTAGAGAAGAATATAGGGCATTATTGGCTCAAAATATCGACCCTCAAACCCACCGCCAACAACAGGAACAGGCAAAGGCCAACGAAATCAGCAACACTTATGAAAATGTAGCGTGGGCGTGGCTGGAACACCGCAAGACCAAGAAGAATTTTTCAGACAACTACCAAAAAGATGTAATCGCCTTAATTAAAAATAACCTCTTGCCGCACTTTGGAAGAATGCCTATCACACAAATAACCGCACCAATGGCAATCAAGGCATTCAAGCAATACCAAGACGAGGGCAAACTAGAGAAGTTAAAACGGGCAATTCAAAAACATAATGAAATTATGATGTTTGCCGTACACCGTGAAATGATACCGTTTAACCCTACCGCCAATATTGCGAAAGAGTTTGATAGCCCAACGGTTGAACATTTCAAAACCATTAAGCCGGAAGATTTAGGCGAGTTTTTATACACCTTACAAAACGCCCAAATTCATTTACAGACACGCTATTTAATTCTGTGGCAGTTACTCACAATGACCCGCCCGAATGAAGCGGCTAAGGCAAAATGGGCGGATATAGACGAAAAAGCCAAACTGTGGACGATACCGGCGGAAAATATGAAGCGAGGCATTGAGCATAAAATCACACTCTCACGCCAAGCAATCGCACTTTTGCGAGAGATTAAAAAGCTAAGTGGCGGTAAAACGTATTTATTCCCTAGCGTGAAGAACCCACAAACGCACGTCAATACTCAAACCGCCAACGGTGCGATCAAACGAATGGGCTACAAGGGCAAATTAGTGGCTCACGGCTTGCGGGCCATCGCCTCCACTTATCTTAATGAGAAAGGCTACAATAGCGATTTAATCGAGGTTGCCTTATCGCATTTAAACAGCGACCGAATCAAAGCCGCCTATGATAGAGGCGAACGCCTAGAGCAACGTTTTAAACTGCTCCAAGTGTGGGCGGATTTTGTAGAGGAATGTTCGCAAGGTAGCTTACCGCAATATCATTTGAAAATAGCCTAGTAAATTTTCCGCCAAAAATGACCGCTTGTAATGCCGTTAGGTAAACCGCCTGACGGCTTTTTTATGCCCGTAATTCCCCTTGATGAAAATTCTGTAAACTTTTCGATTTTTACCCACTTTACCCACTTTTCACTATTATTTTTTTATAACTAACTGAAAAATAAAGAAAAAATGACAGTGGGTAAAGTGGGTTAAAAGTGGGTAAATGGCAAAAACCCTTGCTCACTGTATCTTAATGGATACAATAAGCAATAAATAGAATAAGAAGCCGGCAATGATGAGAGAGCAAACCACTAATCAAATTATTATTACCGATAATTTTTCAAAATGGCTTGAGAATTTAAAGAACCCTATCGCAAAAGCAACGGTAGCAAGACGGATAAAAAATGCGATTAATGGCAACTTTGGCGATCATAAATCTTTAGCCGGTACAGGCGGACTTTATGAAATGCGGATAGCAACAGGAGCCGGATATAGAATTTATTACGCATAACAAGGAAATGTAATTTATATCTTGTTACACGGCGGCGATAAATCAACACAGCAAGCCGATATAGAGAAAGCGAAAGCATTATGGGCTGAATTAAAAACTACAGGAGAAAGCAATGGAAACAATACAAATCAATGAACAGGCAGCAGAAAAGCACGGTTTACGCCCTTTTGACGTGGCGGAGTTTTTAACCGATGAGGCAACTATTCAAGCCTATTTAGCGGAAGTGTTAAAAGAGGGCGACCAAGACGAATTTTTAGAAGCCTTGAACGATGTAGCAAGAGCAAGAGGAATGGCGGAGCTGGCCAAGCAAACAGGGCTAGGCAGAGAGAGCCTATATAAAACCCTAGCCAAAGGCAGCAAACCACGCTTTGACACTATTCAAAAAATTCTAGGGGCATTCAATTTAGTGCTTATTCCACAAGTCAAAAATGGCTAAAACTTATCACTTGCTACCTGTCAAAACCTCACTTTTAAATAGCCGTTGATGGATATTGACGGCTTTTTATTTGCTCCTTGCGTGCGTACTGCTCCGAAAATTCCGCACTATTCGCAAAACCTTAATGAAATATGACCGCTTGAATGCTCTTTTTTATAGCGTCCGGAAACCCATCTTTAGCCTATTTTGATTTACTGTAATAAAACACAGCTTATTACTTGTAATTTATCTGAATAATTAGCAAAATACAACCTATCAAGTTCAATCCGTAACTATACGGATTTATTCAAATTAGCGTGGATAGTGGCGGAGTAATTAACCGGCACGAAAGGAGAAAGCCCTTTATTTCTCTTTCCACGCTCTCACAGTAAAGGGATACGTTAAAGGGGCGCTTATGGCAGATCACAGTCAATTTATTTCTAGGCTTGAAAATCGTATTGAGCCCAAAATCAGCTTTCAAGAACTGATACAAGAATTATCAAACTATACAAATAAACCTTTTTCACATATAGCGGATAAATTGAAAAGCCTCATTTTTTCCTTTCAGCAAAATGGAATATATACGAATGCTTTTGTAAATTGCACTCTCTTTGAAGATGGTGAAAGCTATGCTATTGAGCCCAAAACACTACATTTCAAAGACGCTTTCGATCAGCCTAAAGGCGTTTTAAGTGATGTTATTGCTCAAAATTCTATTGATGTTGAACATTTAAATGCTTATTACGTAACAGCAAGAGAAATAACACAGCTGATTAAAACACAATCGCCAACCTTGTTAGATAAATTAACCACCAAGCAAACACAATCAGAGATTAGCCAAATTCAAAATGATTATATTTCTGTTTATGACTTCATAGAATGGGCAAGTAAACATTACTCAAGTCTTAGTGAAACAGCTAACGATTTAAACCGCTTACTCAAAGATAAAAATATACAGCTTTATCGACAATATGGCGGAATAAGTCCAAGCATTGATAAAGATAATACTAATTTAAAAGCAGCCTTTGATTTTGTAGCAATTAATAACGGATATGAAAAACAATCAAGCAGCTTTAATTTTGATGATGATATTCCGTTCTAGGTGGCAGCAATGAATTTAAATGATTTCCAAAATTTACTTTTAAATAAACAAGAATTAGAAGCAGCACTAGGGAAAAAGCTCGATTTTTCTGAGATAACACCTGATTATTTAGCAGACTATTCACGTTTTTAAGCCTCTATTCTGAAACCGAGCTTACCCATTGCCCGAGCTTTTAATTGTGCTAGGCAACCGAATAGCGAAGCTGGAACAACAACATAACGCAATGCCAAGCGAAACCGATTCAATCACACTCGGCATTTTAAGAAAACAACTTAGCCAACTGTTAAAAGTGGCGGAAAGAATAAAGGAATAAACCAAAATGAAACACGAGCTTAATTTAGCGGGTATTACTGCTTTAATGAATGAACCTATCAAAGCAACCTTGAGCTTTTTAGATTTTCCGCATATCCGAATTGAACGACTGCACCACGATAACGGCAGACCGTTTTTTATCGGTGTGCTTTCTCTTGACCTTGAAGATCATATCAATATTGAAATGGCAGGGGCTACGGGCTTTTTAGAGGCTCTAGCGATTATTGCCTATCATCAACAGCTAACCGCCACGCCGCTATTAGTGAATGATGACTTATTGAGTGAAATCAACAAGCTCCCCCACCCACAACGAACAAACCCATTTATTGACCGACACGGCAACGAAATTACACGGGAGCAGATGAGCAAAGAATACCGAGAAAAAATCGATTATGCCTTTGCTGAAAAGCGAATGGCGGAGGGGAAAGAATGACCGAACTCACACCAAAACAAGAGGCTTTTTGCTTTGCTTATATTGAAACCGGCAATGCTAGCGAAGCCTACCGCCAAGCCTATGAAACCGAAGATATGAAGTCCGAAACCGTCCACCGAAAAGCTAAAGAGCTAATGGATAACGGCAAGATTACGGCAAGGATTGAGGAACTGAAAGCCGAACACGCAGAACGCCATAAATTAACCGTTGATGACCTTTTAAAGGAGCTGGAAGAGGCTCGTATACTGGCGAGAGAGAAAGAAAACCCTAACGCAATGACTCAAGCCACAATGGGCAAAGCGAAGTTGCTAGGGCTGGATAAGCAGGTTACCGATCCGTGCTTTGATGGTGAAACCGGTAAAGGAGATATGATTTTAAGTGTAAACTGCTCAAGCATTAAAGACGGGAAAGCACTTGATGAAACTTGTATTTTAAAGGCAGGAACACACGAATTTATCACACGGGACAGCTTTATTTTCTACCGCCATATAAGAATCGATTCGTTAGATGAGATTAAGGCAAATATAGAAGCCGGTTATTTCATTCAAAAAGCCCTAATTAATGATGAAGCCTATCAACAAATACTAAAAGGCGTACTATCGTCAAAATCAGTAACGCCTAGATATAAACGCTTCCTAAAAAATGCAATCCGCCAAAGTGCTTGCCCTGATATTCTAGCCGAACCTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP017529|2275538:2283693|2276477_2276780_+|WP_006250278.1|DBSCAN-SWA MNTYNNTLNNKNLEKKQLLMAIQAIPASQDFIWDGKDDDERPVTPSEFSIAMKKRGRPAGSKKELVSLRLDKSVLEAFRASGKGWQSRINQVLSDFVKQV >NZ_CP017529|2275538:2283693|2282578_2283004_+|WP_006250289.1|DBSCAN-SWA MKHELNLAGITALMNEPIKATLSFLDFPHIRIERLHHDNGRPFFIGVLSLDLEDHINIEMAGATGFLEALAIIAYHQQLTATPLLVNDDLLSEINKLPHPQRTNPFIDRHGNEITREQMSKEYREKIDYAFAEKRMAEGKE >NZ_CP017529|2275538:2283693|2276215_2276506_+|WP_006250894.1|DBSCAN-SWA MKIYTWDETKRKINLAKHGLDFADADEVLSSPYRFDVEVIRNNEFRIQSFAYSFGRLLVLSLAYTEREDYIRVISFRRASKAEREAYYEYLQQYFE >NZ_CP017529|2275538:2283693|2276797_2277091_-|WP_006253765.1|DBSCAN-SWA MTQLSTSVYQRADGFINVANAHLKNIAPNQVSNAMLFGCARFNAYVAASKAEYKQQLADSREEVIQYFVEQYKEMLTANLDEYIQNFERYIEGKKAD >NZ_CP017529|2275538:2283693|2281572_2282259_+|WP_006250286.1|DBSCAN-SWA MADHSQFISRLENRIEPKISFQELIQELSNYTNKPFSHIADKLKSLIFSFQQNGIYTNAFVNCTLFEDGESYAIEPKTLHFKDAFDQPKGVLSDVIAQNSIDVEHLNAYYVTAREITQLIKTQSPTLLDKLTTKQTQSEISQIQNDYISVYDFIEWASKHYSSLSETANDLNRLLKDKNIQLYRQYGGISPSIDKDNTNLKAAFDFVAINNGYEKQSSSFNFDDDIPF >NZ_CP017529|2275538:2283693|2275538_2276078_+|WP_006250276.1|DBSCAN-SWA MLDLTKIKLVITDVDGVLTDGGMYYTDQGEVMKRFHVHDGLGVKMLQSCGIKVAVLSGGDTALLRKRLEVLKIDLALLGKMEKRSACFELMQQAGVTPEQTAYIGDDTLDLPAFEVCGIAIATRNALDYIKEKADWVLQKAGGEGAFREVSDQILEAQGFGEIFKTADGFLTVAGKMAQ >NZ_CP017529|2275538:2283693|2283000_2283693_+|WP_006250290.1|terminase|DBSCAN-SWA MTELTPKQEAFCFAYIETGNASEAYRQAYETEDMKSETVHRKAKELMDNGKITARIEELKAEHAERHKLTVDDLLKELEEARILAREKENPNAMTQATMGKAKLLGLDKQVTDPCFDGETGKGDMILSVNCSSIKDGKALDETCILKAGTHEFITRDSFIFYRHIRIDSLDEIKANIEAGYFIQKALINDEAYQQILKGVLSSKSVTPRYKRFLKNAIRQSACPDILAEP >NZ_CP017529|2275538:2283693|2277256_2278216_-|WP_006250280.1|DBSCAN-SWA MKKFNENEIEDAEIIDAEPIDVDEIDEEETSVEAMHPALVSGSMPVPQGNLDSYIRMANQYPILTAEQEKELAERYYYDEDVEAAKQLILSHMRFVIHIARGYLGYGLPLADLIQEGNIGLMKAVKRFDPNVGVRLVSFAVHWVKAEIHEYVLKNWRIVKVATTKAQRKLFFNLRKNKNRLAWFNEEEIKKVADDLGVSVEEVREMESRMTGQDLGFDLPAGDDDEDSYAPSMYIEDSSSNFADDLEDEQHNGQATAQLAYALATLDERSQDIIKTRWLDDNKATLQDLADKYNISAERVRQLENAALKKIKEAISLDG >NZ_CP017529|2275538:2283693|2280854_2281178_+|WP_006250284.1|DBSCAN-SWA METIQINEQAAEKHGLRPFDVAEFLTDEATIQAYLAEVLKEGDQDEFLEALNDVARARGMAELAKQTGLGRESLYKTLAKGSKPRFDTIQKILGAFNLVLIPQVKNG >NZ_CP017529|2275538:2283693|2280523_2280742_+|WP_006253767.1|DBSCAN-SWA MMREQTTNQIIITDNFSKWLENLKNPIAKATVARRIKNAINGNFGDHKSLAGTGGLYEMRIATGAGYRIYYA >NZ_CP017529|2275538:2283693|2279022_2280249_+|WP_006250282.1|integrase|DBSCAN-SWA MARKITPLNDTQIRKAKPEDSPLRDGNGLLLVITSNSKLWRFRYERPFTKKRNDLSIGAYPDISLAQAREIREEYRALLAQNIDPQTHRQQQEQAKANEISNTYENVAWAWLEHRKTKKNFSDNYQKDVIALIKNNLLPHFGRMPITQITAPMAIKAFKQYQDEGKLEKLKRAIQKHNEIMMFAVHREMIPFNPTANIAKEFDSPTVEHFKTIKPEDLGEFLYTLQNAQIHLQTRYLILWQLLTMTRPNEAAKAKWADIDEKAKLWTIPAENMKRGIEHKITLSRQAIALLREIKKLSGGKTYLFPSVKNPQTHVNTQTANGAIKRMGYKGKLVAHGLRAIASTYLNEKGYNSDLIEVALSHLNSDRIKAAYDRGERLEQRFKLLQVWADFVEECSQGSLPQYHLKIA >NZ_CP017529|2275538:2283693|2277041_2277254_-|WP_015484067.1|DBSCAN-SWA MPTSGDFFTRYARTSCRRQSQRSNASVCAKFYAKSTACILTKNEDTMINITDKQIDPTFYQRLPASRRLY |
12 | Synechococcus_phage(16.67%) | terminase,integrase | attL 2278744:2278803|attR 2284109:2284182 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||
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NZ_CP017529.1|WP_006250250.1|1263897_1264128_-|hypothetical-protein |
1263897_1264128_-
Protein sequences of NZ_CP017529.1|WP_006250250.1|1263897_1264128_-|hypothetical-protein>NZ_CP017529.1|WP_006250250.1|1263897_1264128_-|hypothetical-protein MNAQATLNNHKDYILCGRKEKRTSDFINVFEVFENEATQEFVIERAMFRNGKLIDWNQSDKMNAEQAQQLWQAYIH |
76 aa aa | NA | NA | NA | 1208826-1304015 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.3|1755275|35|NZ_CP017529|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017529 position: 1288039-1288073, mismatch: 0 ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaa CRISPR spacer ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaa Protospacer *********************************** 2. spacer 3.18|1755275|36|NZ_CP017529|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP017529 position: 1288039-1288074, mismatch: 0 ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaac CRISPR spacer ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaac Protospacer ************************************ |