Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP019845 | Leptotrichia trevisanii strain JMUB4039 | 8 crisprs | csa3,PD-DExK,DinG,cas13a,DEDDh,RT,cas6,cas8b2,cas7,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2,WYL,cas10,csx10gr5,csm3gr7,csx20,csx1 | 3 | 8 | 8 | 2 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_AP019845_1 | 618726-618901 | TypeVI-A |
NA
Consensus repeat of NZ_AP019845_1
|
2 spacers
spacers of NZ_AP019845_1
>1.1|618766|27|NZ_AP019845|PILER-CR TGATTCAAGGAACTCATAAGACGGGAT >1.2|618833|29|NZ_AP019845|PILER-CR AATAATATTCTAGAAATGTCATATTGCAC |
cas13a |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP019845_1
The CRISPR arrays of NZ_AP019845_1 >merge|NZ_AP019845|1|618726-618901|PILER-CR ATATATTTCAGTACTTTTCATTTTTGGGGTACTCTAAATCTGATTCAAGGAACTCATAAGACGGGATATAAGTTTTAGTCCCCTTCATTTTTGGGGTACTCTAAATCAATAATATTCTAGAAATGTCATATTGCACATATGTTTTAGTCCCCTTCATTTTTGGGGTACTCTAAATC >NZ_AP019845|1|1|618726-618901|PILER-CR ATATATTTCAGTACTTTTCATTTTTGGGGTACTCTAAATC TGATTCAAGGAACTCATAAGACGGGAT ATAAGTTTTAGTCCCCTTCATTTTTGGGGTACTCTAAATC AATAATATTCTAGAAATGTCATATTGCAC ATATGTTTTAGTCCCCTTCATTTTTGGGGTACTCTAAATC
>NZ_AP019845.1|WP_172618279.1|618203_618434_+|hypothetical-protein MPSETFVSHILIHLPPKNFKMVNRYGFYSRHISGRLKEAIDAFRKNIAVSRYSFYQRQMYRTFGMNPFTVQHARLK >NZ_AP019845.1|WP_172618365.1|617811_618237_+|transposase MKWNPHVHAIVSLGGFNKNLEFRKMRYFNVDTIAGQWKYHVLKIIENGSYPNRKIEKAAKNTAAKLYKENKRFFFNVGDGNINSTKGIIKYLGRYLARAPIAEYKITDITDKEVTFFFNDLANDKRKLALLCLLRHLFPIF >NZ_AP019845.1|WP_172618299.1|617269_617815_+|transposase-zinc-binding-domain-containing-protein MINITQNKLKYIFSNNNILLDSLKFCKKNNIGNSHLEYIKLSIDKFLACRDISKGFVKFKCPHCPVTHLFPITCKSKLCPSCGYKYSRTWTENIQKHILNIEHRHVLFTVPQECRKFFFYDRSLLSKLSAAVNQVFKFIFHNISRKRKRKNKISGHSRYYFTDSDIVHYGLISVIHTFGRT >NZ_AP019845.1|WP_146998207.1|613894_617005_-|PD-(D/E)XK-nuclease-family-protein MKISYKGIGSDLKNILFKEFEKNENTLFIFENSASFFEIKREFLQNEEIQQKLGIFQNFKMMNSYDFYENVFVTDKIVVKEEKQVVLFYNALTEKLKKDMKVNNYYDIIDVAYNYYNLFAELQEYKIDLEKIELEKWQVETFGTLVEIDNEMKKVVQRKGLILPYMLRNVENISDNFLNKFSKICFVNKVKITPFEKDLIGEIENRGIAVENILQLSENDFNEEKLKIKDSFSLPDKNEFWENFGTNIEIFEYENKFSQLLGLVKKLDEIEVLNNKTKNEIKENYDNKKEIKLKNDKYFQNEKITADTKIIQNMKNINRKKIEDLKKDENYVNYKIYDLQDNGEDGKKDYQLLRQEKISSNLELTMQKTKIYKILELICNILENVKIIGKKLENADFDSEIEKNNNNIEHTENENLKLSDIGMEENFENVKFIKNYGQSLKIRMKDLYTAFKSNDFLKIFGLKKSYDFFMEIVGQDYKYISRDEIFKIAEKLNSRIAGTADSEIAELINFIDEIEMIFDYQTLEEYGDYLEMIFDRSGEIDKDVRDKYFEALSEMVVLEDFSFDNLWKGFFNENEISASLLKLFLKYLDKKAISLNLEESDEQDSENISRYSINSFSAISETQKENLIFLNIQDTFPKININNYLFTKIQRAKIGLPVSDDEKQIEIFKFYQNILGAKNVYLSYVKNLDENIDSAGVVEEIKLKYGIETQKNKIEENDELDFIKKYFLENVEKPWESRKIGKFIPTKLKKDLDKIKAEKVSLGYYSFEEMQNFEYGYYLKKMIGNTEVEKIEDKVDNLMFGNIIHGLYERIVMENKELLEQKKFVINKEKIKETLKNILNSLEYKIPKEYLEFYKKVSFEEIVKSVEKILQKLMKTLENEEEIEIYSEERIKLKSEKEIYENIFINGMIDLHIKLKNKEILYDYKSGILKNKKGEEKKEKVVNAFKQLDYYSVMLPEKNGKEIERFVVDVWDGDIIGDTREKDEDFLNEEDIREVVKKYYETDYYDIGDVRDVQNYTYQTFKDVCRREDELNGESK >NZ_AP019845.1|WP_146998206.1|610629_613911_-|UvrD-helicase-domain-containing-protein MEKASNINNKEQNKIILKASAGTGKTYRLSLEYIANLIRGVNYKNIVVMTFTKKATAEIKERIYDFLYQIAFEKYDWIGLENSLKELYGFSDSKILKENLQDIYFEMIKNKDEIRIYTIDGFTNRIFKNTIAPYFGIYNYETIDKEEDEFYNDILIKIIGNSYYFEKFKFILNEEKDRKNISTYVKIVKSLLDMQEKFLLAGDNYKEANLILRNNKSSRSFVENFENIFENVKKIAEIKGKKVTEILNGKFTDIFKKFEELNQNNFDISAVQDKKIKLILEKSDDIFAKGNIWNGKKTGGKDVKELLDEMKEEQDILRETVSNYIFNEEVLPTDRKIKELAKIIFDIAEQTKLSTKRFTHTDISTYTYKFIFDKELGFVKTDNNNSNAVTEDFLELIGGQIDTIMIDEFQDTSILQWKILELLLSSAKNIICVGDEKQSIYNWRGGEKELFENLENLIGGNVQNLEKSYRSYKQIIENVNKIFTNYNENWKYTNSLYRDDEDYQRGYFGYYFQERKSRYGDEEEKPEKAYEEMIRNLREGKIQNFGKSCIICRGNRELSEITARLNEEKIPFTLESNSSILDYRAVKPLYKLIKFFVYHNFIYLLEFMRSDLIGCLNDHVKYLVENKELIEKYITKNIELSNKNLRNKNSFEYFVENLENFEEKENLLEYKNIDFMERNGLSFSETLKKIKELYKLSVNLNDKYLKDNFSKKIIQDFDVTSFYSTNSDIKNIFQFFNILKEFDNLYEFVVHIEDEKDNLRQISSSDGNAINLMTIHKSKGLEFDTIIYYRKGKTGGNNFKTFETYFDYDDNFASVTNFLITFSKYAKNVKNIKEYGIIAEKNVQKEKMEEINADYVALTRAKKNLLLYFEAYITKNGYSDDLVNKLIDVYDENTEFGIGKITETERKIHQISENSNENTELCENKINNKILKTYFSDDKFKIKKSSITLEKEFKRKKGLAMHYYFEHILNDLKNDKLIAKSALLSRYGNMLGKKIVEELIVRMEKFIEKNKNIYDKKYKVYTEFEIYDSDGKKRIIDRINIDEENKKIYIYDYKTGFEPETNEKYQEQINEYRDILSKKVSTDYEIDVKLLEV >NZ_AP019845.1|WP_146998205.1|609615_610536_-|manganese-dependent-inorganic-pyrophosphatase MSILVFGHKNPDTDTICSAIAYAELKNKLGKDVKAVRLGEINEETKYALNYFKAEKPELVENVAGKEIILVDHNERTQTAEGFEEAKILELIDHHRISNFNVDEPLYARVEPVGCTATIILKLFKENNLVPSKETAGLMLSAIISDTLLFKSPTCTECDVKAGKKLAEIAGINADEYGLEMLKAGTALGDKSEAELLNMDMKIFEIDGAKIGVAQVNTVNEAEVLERKEKLLAEIDNIITKDGLKFFMLAITNILSNDSVALVSGDGNDVIEKAFGEKVDSNLVTLKGVVSRKKQIIPPLTKAIQG >NZ_AP019845.1|WP_146998204.1|609227_609587_-|hypothetical-protein MAIVKFKKREELKILFAIKLPMIISELYKEVRNKKTANEIIRNSLNMTKNRVINTLELVDGFGNQFSVLVIYDNILEEKELLKYNMEIEDIDFRILEFDFNGKMEIEEMITHVKRLYNK >NZ_AP019845.1|WP_026749342.1|608513_609149_-|peptidylprolyl-isomerase MKKKMVVLVSILMLLMATVVNAKEKKSKEEKKFEKIMQSFQLEAVIKTTKGDISFYLYPEAAPKNVANFVFLAKNNFYNGLTFFRVIPNGLVQGGDPAGNGTGTTGYFLPDEFTKWLTFDVEGILAMANSGPNTNSSQFFITMQPMKNLNGKHTVIGGTKNREDLSVLRTLRQDDKILNIDIKGKKVDKFLDYFPDEVSEWESKLKKPENN >NZ_AP019845.1|WP_146998203.1|607632_608373_-|methyltransferase-domain-containing-protein MHKEFAEIYDIFMKYVNYDEWYKFLRMFIKKNGTVLDLGCGTGEFIWRFLRDEFSVVGVDLSEKMLEMSEKKLLKKNFANNYKLVKENIVNYENINENNDIQQVDYIICNFDTVNYLKNEKEFLKFIEKCNQNLKKNGYLIFDAVTEDIFEEIFENDIFLDEEPEYTSIWRHEQLSENKHLIEIDLFIRENENDNLFRKYNEVQHKFIYEPEWIVETVQNNGFEVFDTASNLEFGESRIFFVLKKL >NZ_AP019845.1|WP_146996106.1|607158_607527_-|AtpZ/AtpI-family-protein MELEDKKEIFEKENEIADEEKTAQTEEEKRKQKIFEIEKKLGRHNNEKELKNKRNNKLMKYFALATNMVYILALPILIMLGFYLLLKRYLFKTDQPLVLIIFLIIGAVSGYWSLIKQVNNIK >NZ_AP019845.1|WP_146998208.1|619156_622663_-|hypothetical-protein MKITKIDGISHKKYIKEGKLVKSTSEENKTDERLSELLTIRLDTYIKNPDNASEEENRIRRENLKEFFSNKVLHLKDGILYLKDRREKNQLQNKNYSEEDISEYDLKNKNSFLVLKKILLNGDINSEELEIFRNDFEKKLDKINSLKYSLEENKANYQKINENNIEKVEGKSKRNIFYNYYKDSAKRNDYINNIQEAFDKLYKKEDIENLFFLIENSKKNEKYKIRECYHKIIGRKNDKENFATIIYEEIQNVNNMKELIEKVPNVSELKKSQIFYKYYLNKEKLNDENIKYVFCHFVEIEMSKLLKNYVYKKPSNISNDKVKRIFEYQSLKKLIENKLLNKLDTYVRNCGKYSFYLQDGEIATSDFIVGNRQNEAFLRNIIGVSSTAYFSLRNILETENENDITGRIKGKTVKNKKGEEKYISGEIDKLYDNNKQNEVKKNLKMFYSYDFNMDSKNEIEDFFSNIDEAISSIRHGIVHFNLELEGKDIFTFKNIVPSQISKKMFHDEINEKKLKLKIFKQLNSANVFRYLEKYKILNYLNRTRFEFVNKNIPFVPSFTKLYSRIDDLKNSLCIYWKIPKANDNNKTKEITDAQIYLLKNIYYGEFLNYFMSNNGNFFEITKEIIELNKNDKRNLKTGFYKLQKFENLQEKTPKEYLANIQSLYMINAGNQDEEEKDTYIDFIQKIFLKGFMTYLANNGRLSLIYIGNDEQINTSLAGKKQEFDKFLKKYEQNNNIEIPHEINEFVREIKLGKILKYTESLNMFYLILKLLNHKELTNLKGSLEKYQSANKEEAFSDQLELINLLNLDNNRVTEDFELEADEIGKFLDFNGNKVKDNKELKKFDTNKIYFDGENIIKHRAFYNIKKYGMLNLLEKISDKAKYKISIEELKNYSNKKNEIEKNHTTQENLHRKYARPRKDEKFTDEDYKKYEKAIRNIQQYTHLKNKVEFNELNLLQSLLLRILHRLVGYTSIWERDLRFRLKGEFTENQYIEEIFNFDNSKNVKYKNGQIVEKYINFYKELYKDDTEKISIYSDKKVKELKKEKKDLYIRNYIAHFNYIPNAEISLLEMLENLRKLLSYDRKLKNAIMKSIVDILKEYGFVVTFKIEKDKKIRIESLKSEEVVHLKKLKLKDNDKKKEPIKTYRNSKELCKLVKVMFEYKMKEKKSEN >NZ_AP019845.1|WP_146998209.1|622692_623109_-|antitoxin-HicB MDVFYPAVITKEDGIYYSCLVDFDKFEDGSINYYATFGDNMEKAVSNLRETLGLHLADLLDVRKNFPEPSKVEDIKLKENQYLYIISVDPVYEVAKVTNALKKKTLTIPAWLDILAQEKNLNFSQILQKALKKELGIE >NZ_AP019845.1|WP_146998210.1|623470_623653_-|type-II-toxin-antitoxin-system-HicA-family-toxin MSYRKIEKRFRKLGGKVVRIRGSHYQWMIPGVKGVVTVQYSKDIPVGTLRSIEKQVGIKL >NZ_AP019845.1|WP_026749337.1|623893_624100_-|preprotein-translocase-subunit-SecG MLENLLIIALVILSIIMISVILLQPDRSQGLAKSSANILDEEKEGIEKFTEVVATLFLVVAILFQIVR >NZ_AP019845.1|WP_146998211.1|624163_624931_-|triose-phosphate-isomerase MRKVIVAGNWKMNKTAKEAAQFFNELKPLVADVKNAGIVIGAPFTALETATRETAGSNIKIAAENMNAKESGAYTGEVSPLMLKDLGVEYVILGHSERREYYHETDEIINEKVKSALAHDLKPILCFGETLEERESGTTNDVVKTQITGGLKDVTAAEMANVVLAYEPVWAIGTGKTATPEQAQEVHAFIRGLLTDLYGKEVAENVTVQYGGSMNDANAADLIAQTDIDGGLVGGASLIPEKFAVIIKAGDAAAK >NZ_AP019845.1|WP_026745616.1|625113_625524_+|DUF4870-domain-containing-protein MDNNIGEKKSIAGLRAYAAAFLINLSFFAGFRIEAASFPIKLSFSMGFSLLIPIIALILEQENGFVRAYAKQTLAVTVLLLISTFLNIIIVAGNILFFVIFVILSVFQIIATVSSALKKEFKIPFIEKITDLLFVD >NZ_AP019845.1|WP_146996110.1|626244_626439_-|twin-arginine-translocase-TatA/TatE-family-subunit MGIFRDIGAPGLIVLILGALLIFGPKRLPELGEAIGKMIREFKKSVSGIDLEKDDKTTEDKKRR >NZ_AP019845.1|WP_146998212.1|626441_627155_-|twin-arginine-translocase-subunit-TatC MSKIDEQTIIEHLSEFRKRLIVTIIFFIIAFLISLVFCSSIYKLLTASFNQKLVVLGPNDILSIYLMLAGICAFSLTLPFASYQIWAFVRPALEEREAKVVLSYVPTTFILFIAGLCFGFFFVTPALLNVLLSFGDDLFNIQLTANSYLTFIIHTSLPLGIIFELPVIVAFLTSLHILTPQYLIKNRRYGYFILLVLAVVLTPADFISDLTMAAPLILLYEASILVCKYIYNKRRND >NZ_AP019845.1|WP_146998213.1|627191_628883_-|FTR1-family-protein MGRNYLNKISIMLFLCFMIFFTNAIAKENYSELYIKITDTTTAIRNNNQNEAKKLFSEIKEEFKKAKNSDSTQGKKVQELLNREKSALSEDDLREVTTALLAFEKEQNPVNDNEEKKKFQSRMYPALEVLEKAIQSKDVELMKKEYLKFNGVWTRNESFIRSRSISYYGKVETAMSFLRSSMEVEPFDYDSTVNSFNELKSAIQDYLDGKKIENNISSTITLKETVDMLKDALDAFKTGDKAKGQLKVKQFIQVWPTVEGDVSTRNSALYTKVETQTPIIMVKGAEKKYQEQLQGLITELSQIDTKAQYTFVDAMFILLREGVEALLIVLALVSSLKAANQKKGLRWVYTGAATGILASVIIAFVLQALFPAVSSGTNREILEGFVGIFAVIMMIGIGFWLHSKSSLKSWKDYIDRKMDIVLSTGSFISMFALSFLAVFREGAETILFYAGILPLISLQNLIIGIVSAILILVVIAFVLIYASSKIKIHQIFLVLTWTIYFLAFKMLGTSIHMLQVVGILPLHVVNFIPTVEILGIYANMEVFICQLILITIIAFATFKRKDK >NZ_AP019845.1|WP_026748232.1|628860_630099_-|deferrochelatase/peroxidase-EfeB 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP019845_2 | 623331-623424 | TypeVI-A |
NA
Consensus repeat of NZ_AP019845_2
|
1 spacers
spacers of NZ_AP019845_2
>2.1|623357|42|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder AATATCATGGAACACTTTTTATATGATATTTGGTTTTAGTCC |
cas13a |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP019845_2
The CRISPR arrays of NZ_AP019845_2 >merge|NZ_AP019845|2|623331-623424|CRISPRCasFinder CCTTCATTTTTGGGGTGCTCTAAATCAATATCATGGAACACTTTTTATATGATATTTGGTTTTAGTCCCCTTCATTTTTGGGGTGCTCTAAATC >NZ_AP019845|2|1|623331-623424|CRISPRCasFinder CCTTCATTTTTGGGGTGCTCTAAATC AATATCATGGAACACTTTTTATATGATATTTGGTTTTAGTCC CCTTCATTTTTGGGGTGCTCTAAATC
>NZ_AP019845.1|WP_146998209.1|622692_623109_-|antitoxin-HicB MDVFYPAVITKEDGIYYSCLVDFDKFEDGSINYYATFGDNMEKAVSNLRETLGLHLADLLDVRKNFPEPSKVEDIKLKENQYLYIISVDPVYEVAKVTNALKKKTLTIPAWLDILAQEKNLNFSQILQKALKKELGIE >NZ_AP019845.1|WP_146998208.1|619156_622663_-|hypothetical-protein 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>NZ_AP019845.1|WP_172618279.1|618203_618434_+|hypothetical-protein MPSETFVSHILIHLPPKNFKMVNRYGFYSRHISGRLKEAIDAFRKNIAVSRYSFYQRQMYRTFGMNPFTVQHARLK >NZ_AP019845.1|WP_172618365.1|617811_618237_+|transposase MKWNPHVHAIVSLGGFNKNLEFRKMRYFNVDTIAGQWKYHVLKIIENGSYPNRKIEKAAKNTAAKLYKENKRFFFNVGDGNINSTKGIIKYLGRYLARAPIAEYKITDITDKEVTFFFNDLANDKRKLALLCLLRHLFPIF >NZ_AP019845.1|WP_172618299.1|617269_617815_+|transposase-zinc-binding-domain-containing-protein MINITQNKLKYIFSNNNILLDSLKFCKKNNIGNSHLEYIKLSIDKFLACRDISKGFVKFKCPHCPVTHLFPITCKSKLCPSCGYKYSRTWTENIQKHILNIEHRHVLFTVPQECRKFFFYDRSLLSKLSAAVNQVFKFIFHNISRKRKRKNKISGHSRYYFTDSDIVHYGLISVIHTFGRT >NZ_AP019845.1|WP_146998207.1|613894_617005_-|PD-(D/E)XK-nuclease-family-protein MKISYKGIGSDLKNILFKEFEKNENTLFIFENSASFFEIKREFLQNEEIQQKLGIFQNFKMMNSYDFYENVFVTDKIVVKEEKQVVLFYNALTEKLKKDMKVNNYYDIIDVAYNYYNLFAELQEYKIDLEKIELEKWQVETFGTLVEIDNEMKKVVQRKGLILPYMLRNVENISDNFLNKFSKICFVNKVKITPFEKDLIGEIENRGIAVENILQLSENDFNEEKLKIKDSFSLPDKNEFWENFGTNIEIFEYENKFSQLLGLVKKLDEIEVLNNKTKNEIKENYDNKKEIKLKNDKYFQNEKITADTKIIQNMKNINRKKIEDLKKDENYVNYKIYDLQDNGEDGKKDYQLLRQEKISSNLELTMQKTKIYKILELICNILENVKIIGKKLENADFDSEIEKNNNNIEHTENENLKLSDIGMEENFENVKFIKNYGQSLKIRMKDLYTAFKSNDFLKIFGLKKSYDFFMEIVGQDYKYISRDEIFKIAEKLNSRIAGTADSEIAELINFIDEIEMIFDYQTLEEYGDYLEMIFDRSGEIDKDVRDKYFEALSEMVVLEDFSFDNLWKGFFNENEISASLLKLFLKYLDKKAISLNLEESDEQDSENISRYSINSFSAISETQKENLIFLNIQDTFPKININNYLFTKIQRAKIGLPVSDDEKQIEIFKFYQNILGAKNVYLSYVKNLDENIDSAGVVEEIKLKYGIETQKNKIEENDELDFIKKYFLENVEKPWESRKIGKFIPTKLKKDLDKIKAEKVSLGYYSFEEMQNFEYGYYLKKMIGNTEVEKIEDKVDNLMFGNIIHGLYERIVMENKELLEQKKFVINKEKIKETLKNILNSLEYKIPKEYLEFYKKVSFEEIVKSVEKILQKLMKTLENEEEIEIYSEERIKLKSEKEIYENIFINGMIDLHIKLKNKEILYDYKSGILKNKKGEEKKEKVVNAFKQLDYYSVMLPEKNGKEIERFVVDVWDGDIIGDTREKDEDFLNEEDIREVVKKYYETDYYDIGDVRDVQNYTYQTFKDVCRREDELNGESK >NZ_AP019845.1|WP_146998206.1|610629_613911_-|UvrD-helicase-domain-containing-protein MEKASNINNKEQNKIILKASAGTGKTYRLSLEYIANLIRGVNYKNIVVMTFTKKATAEIKERIYDFLYQIAFEKYDWIGLENSLKELYGFSDSKILKENLQDIYFEMIKNKDEIRIYTIDGFTNRIFKNTIAPYFGIYNYETIDKEEDEFYNDILIKIIGNSYYFEKFKFILNEEKDRKNISTYVKIVKSLLDMQEKFLLAGDNYKEANLILRNNKSSRSFVENFENIFENVKKIAEIKGKKVTEILNGKFTDIFKKFEELNQNNFDISAVQDKKIKLILEKSDDIFAKGNIWNGKKTGGKDVKELLDEMKEEQDILRETVSNYIFNEEVLPTDRKIKELAKIIFDIAEQTKLSTKRFTHTDISTYTYKFIFDKELGFVKTDNNNSNAVTEDFLELIGGQIDTIMIDEFQDTSILQWKILELLLSSAKNIICVGDEKQSIYNWRGGEKELFENLENLIGGNVQNLEKSYRSYKQIIENVNKIFTNYNENWKYTNSLYRDDEDYQRGYFGYYFQERKSRYGDEEEKPEKAYEEMIRNLREGKIQNFGKSCIICRGNRELSEITARLNEEKIPFTLESNSSILDYRAVKPLYKLIKFFVYHNFIYLLEFMRSDLIGCLNDHVKYLVENKELIEKYITKNIELSNKNLRNKNSFEYFVENLENFEEKENLLEYKNIDFMERNGLSFSETLKKIKELYKLSVNLNDKYLKDNFSKKIIQDFDVTSFYSTNSDIKNIFQFFNILKEFDNLYEFVVHIEDEKDNLRQISSSDGNAINLMTIHKSKGLEFDTIIYYRKGKTGGNNFKTFETYFDYDDNFASVTNFLITFSKYAKNVKNIKEYGIIAEKNVQKEKMEEINADYVALTRAKKNLLLYFEAYITKNGYSDDLVNKLIDVYDENTEFGIGKITETERKIHQISENSNENTELCENKINNKILKTYFSDDKFKIKKSSITLEKEFKRKKGLAMHYYFEHILNDLKNDKLIAKSALLSRYGNMLGKKIVEELIVRMEKFIEKNKNIYDKKYKVYTEFEIYDSDGKKRIIDRINIDEENKKIYIYDYKTGFEPETNEKYQEQINEYRDILSKKVSTDYEIDVKLLEV >NZ_AP019845.1|WP_146998205.1|609615_610536_-|manganese-dependent-inorganic-pyrophosphatase MSILVFGHKNPDTDTICSAIAYAELKNKLGKDVKAVRLGEINEETKYALNYFKAEKPELVENVAGKEIILVDHNERTQTAEGFEEAKILELIDHHRISNFNVDEPLYARVEPVGCTATIILKLFKENNLVPSKETAGLMLSAIISDTLLFKSPTCTECDVKAGKKLAEIAGINADEYGLEMLKAGTALGDKSEAELLNMDMKIFEIDGAKIGVAQVNTVNEAEVLERKEKLLAEIDNIITKDGLKFFMLAITNILSNDSVALVSGDGNDVIEKAFGEKVDSNLVTLKGVVSRKKQIIPPLTKAIQG >NZ_AP019845.1|WP_146998204.1|609227_609587_-|hypothetical-protein MAIVKFKKREELKILFAIKLPMIISELYKEVRNKKTANEIIRNSLNMTKNRVINTLELVDGFGNQFSVLVIYDNILEEKELLKYNMEIEDIDFRILEFDFNGKMEIEEMITHVKRLYNK >NZ_AP019845.1|WP_026749342.1|608513_609149_-|peptidylprolyl-isomerase MKKKMVVLVSILMLLMATVVNAKEKKSKEEKKFEKIMQSFQLEAVIKTTKGDISFYLYPEAAPKNVANFVFLAKNNFYNGLTFFRVIPNGLVQGGDPAGNGTGTTGYFLPDEFTKWLTFDVEGILAMANSGPNTNSSQFFITMQPMKNLNGKHTVIGGTKNREDLSVLRTLRQDDKILNIDIKGKKVDKFLDYFPDEVSEWESKLKKPENN >NZ_AP019845.1|WP_146998210.1|623470_623653_-|type-II-toxin-antitoxin-system-HicA-family-toxin MSYRKIEKRFRKLGGKVVRIRGSHYQWMIPGVKGVVTVQYSKDIPVGTLRSIEKQVGIKL >NZ_AP019845.1|WP_026749337.1|623893_624100_-|preprotein-translocase-subunit-SecG MLENLLIIALVILSIIMISVILLQPDRSQGLAKSSANILDEEKEGIEKFTEVVATLFLVVAILFQIVR >NZ_AP019845.1|WP_146998211.1|624163_624931_-|triose-phosphate-isomerase MRKVIVAGNWKMNKTAKEAAQFFNELKPLVADVKNAGIVIGAPFTALETATRETAGSNIKIAAENMNAKESGAYTGEVSPLMLKDLGVEYVILGHSERREYYHETDEIINEKVKSALAHDLKPILCFGETLEERESGTTNDVVKTQITGGLKDVTAAEMANVVLAYEPVWAIGTGKTATPEQAQEVHAFIRGLLTDLYGKEVAENVTVQYGGSMNDANAADLIAQTDIDGGLVGGASLIPEKFAVIIKAGDAAAK >NZ_AP019845.1|WP_026745616.1|625113_625524_+|DUF4870-domain-containing-protein MDNNIGEKKSIAGLRAYAAAFLINLSFFAGFRIEAASFPIKLSFSMGFSLLIPIIALILEQENGFVRAYAKQTLAVTVLLLISTFLNIIIVAGNILFFVIFVILSVFQIIATVSSALKKEFKIPFIEKITDLLFVD >NZ_AP019845.1|WP_146996110.1|626244_626439_-|twin-arginine-translocase-TatA/TatE-family-subunit MGIFRDIGAPGLIVLILGALLIFGPKRLPELGEAIGKMIREFKKSVSGIDLEKDDKTTEDKKRR >NZ_AP019845.1|WP_146998212.1|626441_627155_-|twin-arginine-translocase-subunit-TatC MSKIDEQTIIEHLSEFRKRLIVTIIFFIIAFLISLVFCSSIYKLLTASFNQKLVVLGPNDILSIYLMLAGICAFSLTLPFASYQIWAFVRPALEEREAKVVLSYVPTTFILFIAGLCFGFFFVTPALLNVLLSFGDDLFNIQLTANSYLTFIIHTSLPLGIIFELPVIVAFLTSLHILTPQYLIKNRRYGYFILLVLAVVLTPADFISDLTMAAPLILLYEASILVCKYIYNKRRND >NZ_AP019845.1|WP_146998213.1|627191_628883_-|FTR1-family-protein MGRNYLNKISIMLFLCFMIFFTNAIAKENYSELYIKITDTTTAIRNNNQNEAKKLFSEIKEEFKKAKNSDSTQGKKVQELLNREKSALSEDDLREVTTALLAFEKEQNPVNDNEEKKKFQSRMYPALEVLEKAIQSKDVELMKKEYLKFNGVWTRNESFIRSRSISYYGKVETAMSFLRSSMEVEPFDYDSTVNSFNELKSAIQDYLDGKKIENNISSTITLKETVDMLKDALDAFKTGDKAKGQLKVKQFIQVWPTVEGDVSTRNSALYTKVETQTPIIMVKGAEKKYQEQLQGLITELSQIDTKAQYTFVDAMFILLREGVEALLIVLALVSSLKAANQKKGLRWVYTGAATGILASVIIAFVLQALFPAVSSGTNREILEGFVGIFAVIMMIGIGFWLHSKSSLKSWKDYIDRKMDIVLSTGSFISMFALSFLAVFREGAETILFYAGILPLISLQNLIIGIVSAILILVVIAFVLIYASSKIKIHQIFLVLTWTIYFLAFKMLGTSIHMLQVVGILPLHVVNFIPTVEILGIYANMEVFICQLILITIIAFATFKRKDK >NZ_AP019845.1|WP_026748232.1|628860_630099_-|deferrochelatase/peroxidase-EfeB MSDENDKKWFDKKISRRDFLKKAGMVGAGAAIGASGAGAIFANMFSGKTNQIVGNEEISFYGKHQPGIATPVQKNVYFAVLDLHSTDKEEIKQMFKDWTDYSEKLMKGELIAPELKNHLVPPIDTGETVGLNPYRLTVTFGISPSFLDKLKLDNKKLDEFKDLPHFPRDQIKDKYKGGDICIQACADDAQVAFHAVRNLVRKGRALINLKWTQAGFLPIGNGRETPRNLFGFKDGTENPKNNDDFKNVVWYDKNNWLKNGTFMIVRRIQMHLETWDRTNLQEQENTFGRYKESGAPFGETDEFATIDINKKGSDGKPILPIDSHVYLAKKADVKIARRAFSYSNGIDEVSGQFDAGLLFICFQKHPEQFIKIQNSLGNEDKLNEYITHVGTGIFACFGGIKKGEYIGQKLFE >NZ_AP019845.1|WP_026748233.1|630225_631107_-|EfeM/EfeO-family-lipoprotein MKKMGVLLLIGALVLISCGKSNGAKEDNKAGTTAGQTTNQEKTDLSKETAEYKKYVENQIDMLLKDTENFAQLLKDGKLDEAKKVYPLIRMAYERSEPIAESFGESDIKIDYRLVDFKEEFKKEDGWKGFHRIEKILWEQNTTKGTEKYADDLVNDIKELKAKIATIEVTPDLMVTGAIDLLNEVSTQKITGEEEVFSHTDLYDFRANIEGAQKIFELFKPKLEKKDAKLVATLDSEFKTVNELLDKYMTDDKHYKLYTELTKEDTKALAEAVTKLGEPLSQMGIVIDATPKK >NZ_AP019845.1|WP_172618300.1|631404_632571_-|transposase MINITQNKLKYIFSNNNILLDSLKFCKKNNIGNSHLEYIKLSIDKFLACRDISKGFVKFKCPHCPVTHLFPITCKSKLCPSCGYKYSRTWTENIQKHILNIEHRHVLFTVPQECRKFFFYDRSLLSKLSAAVNQVFKFIFHNISRKRKRKNKISGHSRYYFTDSDIVHYGLISVIHTFGRDLKWNPHVHAIVSLGGFNKNLEFRKMRYFNVDTIAGQWKYHVLKIIENGSYPNRKIEKAAKNTAAKLYKENKRFFFNVGDGNINSTKGIIKYLGRYLARAPIAEYKITDITDKEVTFFFNDLANDKKKTCITMPSETFVSHILIHLPPKNFKMVNRYGFYSRHISGRLKEAIDAFRKNIAVSRYSFYQRQMYRTFGMNPFTVQHARLK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP019845_3 | 1100013-1101343 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_AP019845_3
|
20 spacers
spacers of NZ_AP019845_3
>3.1|1100042|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT CACTCCCATTGATTCTGCTATTTTTTGAGCCAAAAT >3.2|1100107|37|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCATTGTCATTCCAGCAACGGCTATTCTCTTTATGTA >3.3|1100173|37|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAGCAATACTTTGAATAAATAATTGATTTATTTCTG >3.4|1100239|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATATCTTATCCAAACCTACAACAGTAATTGTTAT >3.5|1100304|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAAATATTGCAAAAACTTTGAAACAATCAAACAAAA >3.6|1100369|37|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATACTAATTCAATTAGTGATATAATAAATCTTGCAAA >3.7|1100435|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTAGAGTGTACCTGTGGCGGTAAAATGTTTAAAAA >3.8|1100500|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTCAAAAGTTCTATATCAGAAGTCGGCACAGCAAA >3.9|1100565|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTAGAGTGTACCTGTGGCGGTAAAATGTTTAAAAA >3.10|1100630|34|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCAAGGCTTGGAAAAAAGCATTGGATAATCAAAT >3.11|1100693|37|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCCAATCTTATTCTAGTATGATATTAAAATATGAAAA >3.12|1100759|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAGACTTATTTTAAGAAAAGAATGGAGTGAAATAA >3.13|1100824|37|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAATAGTATATAGAATATACTAATTACTTATTATAA >3.14|1100890|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGCAAACAATAATGTAACATAGCAACAGAATTACAA >3.15|1100955|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGATAAAAATGATGTTGCTGATTTAAGTAATTTAA >3.16|1101020|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGTTAAAAAACAAGAAAAAATTGATTATAATAAATT >3.17|1101085|35|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATGTTGTCATGCTGTTAATCCCATCATCTATTAC >3.18|1101149|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT AATGATTACAAATAAGCAATCCCTACAAGTATGGCA >3.19|1101214|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT AATGATTACAAATAAGCAATCCCTACAAGTATGGCA >3.20|1101279|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT CAAATAAGAAGAAAAATATTTGAAAAATAAAAAGTA |
cas6,cas8b2,cas7,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP019845_3
The CRISPR arrays of NZ_AP019845_3 >merge|NZ_AP019845|3|1100013-1101343|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTTTAAATACAAAATGTTCTATTAAAATCACTCCCATTGATTCTGCTATTTTTTGAGCCAAAATATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAATCCATTGTCATTCCAGCAACGGCTATTCTCTTTATGTAATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAATTTAGCAATACTTTGAATAAATAATTGATTTATTTCTGATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAATTAATATCTTATCCAAACCTACAACAGTAATTGTTATATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAATGAAATATTGCAAAAACTTTGAAACAATCAAACAAAAATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAATATACTAATTCAATTAGTGATATAATAAATCTTGCAAAATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAATATTAGAGTGTACCTGTGGCGGTAAAATGTTTAAAAAATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAATTTTCAAAAGTTCTATATCAGAAGTCGGCACAGCAAAATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAATATTAGAGTGTACCTGTGGCGGTAAAATGTTTAAAAAATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAATGCAAGGCTTGGAAAAAAGCATTGGATAATCAAATATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAATTCCAATCTTATTCTAGTATGATATTAAAATATGAAAAATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAATAAAGACTTATTTTAAGAAAAGAATGGAGTGAAATAAATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAATTTAATAGTATATAGAATATACTAATTACTTATTATAAATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAATTGCAAACAATAATGTAACATAGCAACAGAATTACAAATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAATAAGATAAAAATGATGTTGCTGATTTAAGTAATTTAAATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAATGGTTAAAAAACAAGAAAAAATTGATTATAATAAATTATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAATGATGTTGTCATGCTGTTAATCCCATCATCTATTACATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAATAATGATTACAAATAAGCAATCCCTACAAGTATGGCAATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAATAATGATTACAAATAAGCAATCCCTACAAGTATGGCAATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAATCAAATAAGAAGAAAAATATTTGAAAAATAAAAAGTAATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT >NZ_AP019845|3|2|1100013-1101343|CRISPRCasFinder ACTTTAAATACAAAATGTTCTATTAAAAT CACTCCCATTGATTCTGCTATTTTTTGAGCCAAAAT ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT CCATTGTCATTCCAGCAACGGCTATTCTCTTTATGTA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT TTAGCAATACTTTGAATAAATAATTGATTTATTTCTG ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT TAATATCTTATCCAAACCTACAACAGTAATTGTTAT ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT GAAATATTGCAAAAACTTTGAAACAATCAAACAAAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT ATACTAATTCAATTAGTGATATAATAAATCTTGCAAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT ATTAGAGTGTACCTGTGGCGGTAAAATGTTTAAAAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT TTTCAAAAGTTCTATATCAGAAGTCGGCACAGCAAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT ATTAGAGTGTACCTGTGGCGGTAAAATGTTTAAAAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT GCAAGGCTTGGAAAAAAGCATTGGATAATCAAAT ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT TCCAATCTTATTCTAGTATGATATTAAAATATGAAAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT AAAGACTTATTTTAAGAAAAGAATGGAGTGAAATAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT TTAATAGTATATAGAATATACTAATTACTTATTATAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT TGCAAACAATAATGTAACATAGCAACAGAATTACAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT AAGATAAAAATGATGTTGCTGATTTAAGTAATTTAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT GGTTAAAAAACAAGAAAAAATTGATTATAATAAATT ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT GATGTTGTCATGCTGTTAATCCCATCATCTATTAC ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT AATGATTACAAATAAGCAATCCCTACAAGTATGGCA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT AATGATTACAAATAAGCAATCCCTACAAGTATGGCA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT CAAATAAGAAGAAAAATATTTGAAAAATAAAAAGTA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT >NZ_AP019845|3|1|1100013-1101343|CRT ACTTTAAATACAAAATGTTCTATTAAAAT CACTCCCATTGATTCTGCTATTTTTTGAGCCAAAAT ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT CCATTGTCATTCCAGCAACGGCTATTCTCTTTATGTA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT TTAGCAATACTTTGAATAAATAATTGATTTATTTCTG ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT TAATATCTTATCCAAACCTACAACAGTAATTGTTAT ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT GAAATATTGCAAAAACTTTGAAACAATCAAACAAAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT ATACTAATTCAATTAGTGATATAATAAATCTTGCAAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT ATTAGAGTGTACCTGTGGCGGTAAAATGTTTAAAAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT TTTCAAAAGTTCTATATCAGAAGTCGGCACAGCAAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT ATTAGAGTGTACCTGTGGCGGTAAAATGTTTAAAAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT GCAAGGCTTGGAAAAAAGCATTGGATAATCAAAT ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT TCCAATCTTATTCTAGTATGATATTAAAATATGAAAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT AAAGACTTATTTTAAGAAAAGAATGGAGTGAAATAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT TTAATAGTATATAGAATATACTAATTACTTATTATAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT TGCAAACAATAATGTAACATAGCAACAGAATTACAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT AAGATAAAAATGATGTTGCTGATTTAAGTAATTTAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT GGTTAAAAAACAAGAAAAAATTGATTATAATAAATT ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT GATGTTGTCATGCTGTTAATCCCATCATCTATTAC ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT AATGATTACAAATAAGCAATCCCTACAAGTATGGCA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT AATGATTACAAATAAGCAATCCCTACAAGTATGGCA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT CAAATAAGAAGAAAAATATTTGAAAAATAAAAAGTA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT >NZ_AP019845|3|2|1100078-1101148|PILER-CR ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT CCATTGTCATTCCAGCAACGGCTATTCTCTTTATGTA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT TTAGCAATACTTTGAATAAATAATTGATTTATTTCTG ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT TAATATCTTATCCAAACCTACAACAGTAATTGTTAT ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT GAAATATTGCAAAAACTTTGAAACAATCAAACAAAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT ATACTAATTCAATTAGTGATATAATAAATCTTGCAAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT ATTAGAGTGTACCTGTGGCGGTAAAATGTTTAAAAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT TTTCAAAAGTTCTATATCAGAAGTCGGCACAGCAAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT ATTAGAGTGTACCTGTGGCGGTAAAATGTTTAAAAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT GCAAGGCTTGGAAAAAAGCATTGGATAATCAAAT ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT TCCAATCTTATTCTAGTATGATATTAAAATATGAAAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT AAAGACTTATTTTAAGAAAAGAATGGAGTGAAATAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT TTAATAGTATATAGAATATACTAATTACTTATTATAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT TGCAAACAATAATGTAACATAGCAACAGAATTACAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT AAGATAAAAATGATGTTGCTGATTTAAGTAATTTAA ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT GGTTAAAAAACAAGAAAAAATTGATTATAATAAATT ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT GATGTTGTCATGCTGTTAATCCCATCATCTATTAC ATTTACAATACAAATTGTGCTATTAAAAT
>NZ_AP019845.1|WP_026749141.1|1099351_1099756_-|hypothetical-protein MRKIVIDKRKSVMLVMTCILFMMTYSSLLGTPSFSRKLSVFVDENNLSHEDIRDLIVKINQIESVNNRRLTQELKKIGKRKEKEKGKQKNSLFLLFEKNQNTVFYKNSDKIPKNIGNISAFLMKKDENNLRTRE >NZ_AP019845.1|WP_146998469.1|1096632_1099293_-|preprotein-translocase-subunit-SecA 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MGFLSNNFVPILIVLIIIFILSLVGFIRVPMDRAAFISGFKRRVVTGKLAFYLRYFERVDYLDLSLFSVDVNTSVFVPTNDFINIKADAIVKLQIAQEPEILNIASKNFLNKKSEYIGESVKEVLEGNLREIIGQMNLKDMVQNRKEFNVKVQENVSPDLREMGLVVVSFAVQSFMDEKGVIDNLGIENISKISKDASIAKAQAEKEIAIAKANADKEAKDIELKVAEEIAEKTNKLEIKKADLKIESDTKKASADMTYQLETERKRKELEEVQGESNFTRETQAIKTNQAKLEAEIKVDNQIKSDAELYRKTKQAESKLIEEQREAEAILYQKTKEAEALKIMAQQEGEALKIKAQADSESIKLKAQAEAESIKLKALAEAQSKREIGLAEAEAIKAKALAEAEGIDKKADAMKKYGNAAIMEMYFKALPEISKNVAAPLNNIDKITMYGDGNTSKLVGDITKSIAQINDGITDSTGIDLKSVLAGMLGGKIISDKERLDSETENDVDAKKNK >NZ_AP019845.1|WP_146998467.1|1093479_1094784_+|thymidine-phosphorylase MRIVDIIQKKRDNEKLSDKELEFLLNEYLAGNVPDYQMSAFLMAVYFNDMTQEELLKFTMLMRDSGDVIKFDEINRFLVDKHSTGGVGDKVTAVLSPILSALGMGNVKLSGKGLGHTGGTIDKFESIKGFKFSTTKEELIKITNKTGIGLMGYSDNIVPLDKKLYSLRDVTATVPSIPLIASSIMSKKLAIHSDVIILDVKVGDGAFMKDLGQAKKLAERMIEIGKGAGRKVKVVLSNMDEPLGHSIGNANEIIEAIEFLKGNCADDLKEVVYTIVSLALKEKGEARDFNEAKNKIDEVINNGSALKILGEFIETSGGNKELVNNYDLLPKAKSVMEVFSENYGYVKKIKTEEIGKAAMIIGAGRAKKEDKVDHAVGINIFRKVGEKVGKNEKIAEIYYNNDKNVQESRNMILDAFVLTKEEVEKPKAILEIIE >NZ_AP019845.1|WP_146998466.1|1092288_1093329_+|BMP-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKILTIFSVIFALMLVVACGNKPATGEQVKDGKTSADSTNSKKAVAVVYSTGGKGDKSFNDATFRGLERAQKELGISFKEYEPKDPSTEAKNALTQFAESGEFELIIAVGYSMKDSLVAVAQAFPDQKFAIIDETVDGLPNVASILFKEHEGSFLVGALAGMMDKTGTVGFVGANESELINRFYAGYAQGARYVKPDIKVISVYIGGSNSFNDQASAKAKTETLIQQGADVIYHAAGASGLGVFQAVKEKNVYGIGVDSNQDNLYPGIILTSMMKYVDNAVFDIVKSTADGKFEAKLQTFGIKENGVGTTNFEFTKDKIGEENIKRLEQIKQDIKDGKIQVKSAL >NZ_AP019845.1|WP_146998465.1|1090774_1091989_+|saccharopine-dehydrogenase-NADP-binding-domain-containing-protein MGKKALVIGAGGVSNVVCHKCAQNSEVFSSIMIASRTKAKCDEIKERIEKSKYAGRIEIQTAKVDANNVPELVALINEYKPDIVINVALPYQDLTIMDACLETKTDYLDTANYEPLDTAKFEYKWQWAYKEKFEKAGITAILGSGFDPGVTGVFSAYAQKHYFDEINYIDILDANAGDHGYPFATNFNPEINIREVTANGSYWEDGKWVETEPMEIKRVYNFPQIGEKDMYLLHHEELESLALNIKGIKRIRFFMTFGQSYLTHLKVLENVGMTSIEPIEFEGKQIVPLQFLTAVLPDPASLGPRTKGKTNIGNIFRGKKDGVEKTYYVYNVCDHQECYKEVSSQAISYTTGVPAMIGAAMVLTGEWKKPGVFNVEEMNPDPFMDALNKFGLPWVEDFNPTLVD >NZ_AP019845.1|WP_146998464.1|1089952_1090138_-|hypothetical-protein MSKSQVHTITYPTSEEDCDKTINSYRQQIMRAYDSEDEAEYKRLNDEAEKITNHCLNLMSN >NZ_AP019845.1|WP_146998463.1|1089145_1089925_-|hypothetical-protein MQEREVFKFEKSGMKSKGAWTFVGFGTIALFGGGIYSFIGILMLAYGIYLLTKKSKVIVYTTGFVISEGKDLKNISFDRVLGIKGELGQKVKILYLKKPFSVYNENELNNISNNLNTLSESIIFDDELLEKDFINVFNIIKEQFKNYVFEHYNNDLEKIITSPYLFEQISNDKLNFTRTKFWGGLADEIIQLQYGDAINVTTRKKAYVTNGRGDIRQAGQSFEPQWQFASTSTKCDTINLINATIIQEILSKKYNIKFI >NZ_AP019845.1|WP_146998462.1|1088372_1089134_-|YARHG-domain-containing-protein MKTIFFIFTVLLILTGCGTQSETQNEKKSLGLSENELSEYTNRLRNFLKTNKDQVNQQDLLNEDGTPKITCSQKDVLLEALLTSPDAVTNGNSIPLIAGMLYAQQLKIINEAACYNSDGTITAPKKETDTTEQATSNPSEYENQNTSENSDSTSSTNKNTNDLDLEDLNNLKHEVMDNGNESAFNKYSKYQLKILRNMMFAERGVAFKKGGEMRTYFENKSWYSPTIEDQSEIQLNDYDKEFVLKLKKYEGID >NZ_AP019845.1|WP_146998461.1|1086651_1088142_-|4-alpha-glucanotransferase MFERSSGILLHPTSLPGKYGIGSLGKEAYKFVDFLKKANQKLWQIFPLGPTGYGDSPYQCFSTFAGNPYLIDFDLLIEQNLLTEEDLKDVDFGENEESVDYGAIYNQKYPLLRKAYENFKTNGNDDLKGKLDAFKAENSDWLNDYSLFISLKNHFNGLPWTEWPHDIKVREEAAVNKYREELADEIEYNNFIQCLFFDQWNNVKKYANDNGIKVIGDIPIFVAVDSSDAWANPEIFLFDPELKPVKVAGVPPDYFSATGQLWGNPLYDWNKLKELNYKWWVDRVRANLSTCDIIRIDHFRGFDEYWAVPFGDDTAVNGQWVKGPGIDLFNKIKEELGSLPIIAEDLGFMTQGVIDLRESTGFPGMKILGFAFDSNEENEYLPHTYTKNCVVYTGTHDNDTLMGWFTKAKEEDRQFARDYLHSQSDDEIYWDALRGAWGSVANMAIAPIQDFLGLGSEARINTPGIASGNWQWRLKDGILTDELAERIAKLTKVYSR >NZ_AP019845.1|WP_146998470.1|1101679_1102462_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRFKINIELTEGNSFPINWRSKILCVLKTGLKKCDNEIFEEFFGSAKQKNYTWSAYFQNVKFEKDKVKFLGEEKKIIVNLSAYDNVDSLNIYNAFSGIRFKEIKISEETKVVVTNISILPRQIIKDNILIVKTMSPIVCRDHDQETKKDTYYTGTDDKFSKIIKRNLYLKLKELKGEYVKKDIEDLIIDSSQTKKVVVKHYDKTKKDKTLNYENKFNGKFLDTSVGILKLEGKSYILDYIYNAGIGSITGSGFGMLEKLK >NZ_AP019845.1|WP_146998471.1|1102486_1104283_+|CRISPR-associated-protein-Cst1 MSNEKIELKLKDWLFNAGLIGLINILGEEARNNGELEIDDKNRLIRFSPKVLENFEYKYFDFFIKRYGKTLTYGKILEFEKYIDEFEENGEKIRSINELKMINDKITFFKAKIKSASYKKAYDFIEKDGTNKILGLEKELKKIKEPKENIDEISKDDVKNNIKIMKEIIDFFKKKITDKNGNVKNYLAAKNIAYVIINNAWSSVSFLNQKNADKDIYKEYKSYFVEPALEYVNAKSKFKYKCAISNMSMKNYRNTLGFLNDTGFDVKRKPSHVWNFVNDIAVTPLVTLVYSCVPAGFIYGADKGIFVNANHNIDQLCKINNGIAYNILEDESEEKNINLYKNLLKEIKKEKDNTKYELSDIQIVKLEEGHYKFTLLSRDILKLLSKNKERLDNLLDKCYSIEKRYTYLYDTTITELLNNENLFSLINKLCYYKISKINNTSKTKTKIKLYYKLKSIEDLLKINLDYIRRLKKMDKQEIVEKKENKKTSEELTEKDIFYIRRDAMIFREEYIRKSGNDKKIGSLLYRLQNALRINNVDMFMDALISAHAYAGKNISSLFAKALLNDENFQTLGHGFLLGLLGEDKSKNENKTDKKEGNE >NZ_AP019845.1|WP_146998472.1|1104285_1105182_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MKKKGLTFTAIFLAQSANYGEGIGNVAALKKLSRNKGEQYTYISRQAIRYNIIEQLGEEKSPVKAEGSGDKKVVQFSADTTIKDYPELDFFGYMKTIKGENSKNRSAIVRLSNAISLETFKGDLEFLTNKGLADRIGEFPNIAQAEIHKSYYKYTVTIDLDRIGIDELDEIEVSNEEKSRRVRKLLDTISLLYRDIKGRREDLKPLFIIGGVYDIKNPFFENIVDVKNNKILADKLCSGIYDYIEKDTISGIVKEQFENDTEVEEKLKGKNINVLNVPEFFKQLKEKVDNYYTEKVDG >NZ_AP019845.1|WP_146998473.1|1105184_1105949_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKAVKLKLYQNMVNYKVPTSFQLKESYPLPPYSTVIGMIHSLCDFKEYKPMKISISGNYFSKVNDLYTRYEFKNGNPFEMGRHQLNVNGYGINRGVATAELLVDVNLTIHIIPEDQSEEFLDIIFEAFKYPREYPSLGRREDIVLIKDVKIVDVEKKKLEKDLSNGEDDFAYIPVNFIQEKLVNYGDKKNGMNIYGTRYELTKNYILNNIGTKSKPKMIRSWEKEEVIYSSNIKGFKRREVPVDTDNEIVFCEL >NZ_AP019845.1|WP_146998474.1|1105982_1108370_+|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MKNNFLAKSSGETILRHTENLFNNFMKIFMIYPKLNVEKRLLLLACIYHDLGKINQKFQSKLSGEKQSGEIPHGILSTSFINDDILIEYHHFSEDEIKILAHSVALHHERNLMEINDSDLSDEIYSMNNEVKNFSKELKILENIYFEYFKNTENYKDRKAIFNWEDGKVELAELSSLFYEIGSRVYSDVEGSETFQKYVMLKGLLNKIDYAASSYIPVEEKNDFLEEKMNAFLKNVLKKDNPENDWNELQKFMIHNRNKNVVVVAQTGYGKTEAGLLWIGNNKGFFTLPLRVAINAIFDRVKNQIVIEKLENRIGLLHSDFREIYIEDIKKKEKNNLEKMDNDELFMYMDKTKQLSLPLTVCTIDQLFDFVFRAPGFELKVATLSYSKVVIDEIQMYSTDLLAYLIYGLKYITDFGGKFAIMTATLPGIITDLLKKEEIEFVTTEPFINDKKRHNLKVLKEVINAKFIKENYKDNKILVVCNTVKKSKQIYEELKNLGIECKELNLLHSRFIKKDRAEKEKEISEFANPKRFKENVKNERELKNICENGIWIGTQVVEASLDLDFDILITELSDLNGLFQRMGRCYRNREVLDEKYNCYVFTEECSGIKSSKAVIDKEIHQKSKEVLINIDGLLTEKEKLELIDKVYSTESLKDTEYYEKLVKNIDVLKNYIQEYDNVQRIFRNIASEDVIPKIVYQENVEEIKKNIEILQKKAKGLDEEKRKNLRSEKIEARREINQFKVAIPEYEFDDISPEQVEKIEINDYETLIILDCDYSYEKGFEVKMKNQDFFEDNTF >NZ_AP019845.1|WP_146998475.1|1108388_1108877_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKITGLMINYYFVCKRKLWCQSKNINLEEENENVQLGKLIDENSYNLETKQVMIEETVNIDFIRKWQVIHEVKKSKAVEEAAIWQVKYYIYFLKRRGIKIEKGIIDYPVIRERKEIILTEEDENTLKEILTDIEKICQNEKAPPVINNKICKKCAYYEFCYV >NZ_AP019845.1|WP_146998476.1|1108913_1109906_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAESYFIFSNGELKRKDNVVRITAPDGRFKDIKIEVTRDIYLFGEVSLNTKCLNYLAQNKIPVHIFNYYGFYTGTFYPKESNVSGKLFVKQVENYTDNSKRIELAQLIIDAASTNILRNLRYYQERGKDLESVITEIKALKKGIFRTNEINELMGIEGSIRRTYYTAWNTIVNQEIDFEKRVKRPPDNMINTMISFLNTLVYTVCLSEIYVSQLNPTISYLHSVGDRRFSLSLDIAEVFKPLLADRIIFSLLNKKMITEKDFVKDSNYFYMKENAQKLILKTFNERLETSIKHRDLNRKVSYRHLMRLEAYKLVKHLLEDKKYEGFKIWW >NZ_AP019845.1|WP_146998477.1|1109907_1110186_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYIILVYDILTDDNGPRISRNVFKICKKYLTNVQKSVFEGEITPVLLKKLNLELKRYIRKDKDSLIIFKSRQEKWLEKEFWGIEDDKTSNFF >NZ_AP019845.1|WP_026749132.1|1111663_1112392_+|HAD-IB-family-hydrolase MKKNVAAFFDIDGTIYRDSLLIEHFKMLVQYEYIDMMTWEGKVKEKFSKWENRTGDYDDYLDELVQTYMEALKNFSKEDMDFIAKRVMKLKGDKVYRYTRERLKYHKEKNHKVIIISGSPDFLVSKMAERYGVKDYRASTYEVNENGIFTGKVTPMWDAKSKQKAIADFCKMYEIDLTKSYAYGDTTGDLTMFKNVGNAIAINPAKKLLQKIKRDKELKEKVMIVVERKDVIYKLKADVDII >NZ_AP019845.1|WP_146998478.1|1112495_1113476_+|3-phosphoglycerate-dehydrogenase MDKNLKIVYLDRIIAGPIDLKERFSKYGEYIEYGDTDSGEVDERIKDVDVVITTRIKLGREQFEKAKKLKLILITATGFNHIDVKSANEFGIKVANVSGYSTNSVAQLAITFLLNELTPVNRYYEEVRDGKWMDITVPDYQKYPIDDANGKILGIVGFGNIGKRVAQVAEILGMEVIVAKNTEKDNAKTDSAIEKGGFLRYDLDEVLEKCDVLTLHVPLTDSTRNLINLEKMKKMKKSAIILNLARGPVINQEDLYFALKNKIIKSAAIDVTSIEPIEKNSKLFELDNILVTPHIAWKSEKSMVKLMDDVEENLKLFLEGRLEGLK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP019845_4 | 1110391-1111506 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_AP019845_4
|
17 spacers
spacers of NZ_AP019845_4
>4.1|1110420|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT TATATTTATAAATATCTTGCTGTTTAAAAATACTGG >4.2|1110485|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTCATTATTCAAGGCCCGTATATCGTTTTTAAGAT >4.3|1110550|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATGTTTATAGTGCTAACTGATTTGAACGTGAATGAA >4.4|1110615|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTATCTGTAAACGACAAGGTTTTGGTAGCATTTTGT >4.5|1110680|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACATTTCGTGTTATAATATTATCGCCAAAACAACTT >4.6|1110745|37|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAATGATTTGCAAATTCACTTGCCAAGTCAATTCCAG >4.7|1110811|35|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTTTAATATATTTTCTTATTAATTTTGAAATACT >4.8|1110875|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATGTCAATAAAAATTTCGTTTTAGATAGATTTGAA >4.9|1110940|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCTTAATTTCATAATTTACTATTTTAAATTTATTTT >4.10|1111005|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATATAAGGGACGCCTATTTAATAAAATACGGAAAT >4.11|1111070|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATTTTATGGGAAGAAAAAACAGGTAGACGTGAAC >4.12|1111135|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTTTCAACACTTTTCATTTTTACCTCCTAATCCAA >4.13|1111200|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGCTGAATACTTCTTAAAAATTTTGACATAGCAACA >4.14|1111265|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCTAATGCTCTTAACTCCTCGGTAGTAAGTCCTGAA >4.15|1111330|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGCGTAGCGGACTAAGAACTGCTACACTAGATGTAG >4.16|1111395|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATTTTCTTTAGACAGCATTTCGTACATTTCCTCTA >4.17|1111460|18|NZ_AP019845|CRT TACATTTTGCCCTTGACT |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP019845_4
The CRISPR arrays of NZ_AP019845_4 >merge|NZ_AP019845|4|1110391-1111506|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAATTATATTTATAAATATCTTGCTGTTTAAAAATACTGGATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAATTTTCATTATTCAAGGCCCGTATATCGTTTTTAAGATATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAATATGTTTATAGTGCTAACTGATTTGAACGTGAATGAAATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAATTTATCTGTAAACGACAAGGTTTTGGTAGCATTTTGTATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAATACATTTCGTGTTATAATATTATCGCCAAAACAACTTATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAATGAATGATTTGCAAATTCACTTGCCAAGTCAATTCCAGATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAATTCTTTAATATATTTTCTTATTAATTTTGAAATACTATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAATAATGTCAATAAAAATTTCGTTTTAGATAGATTTGAAATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAATCCTTAATTTCATAATTTACTATTTTAAATTTATTTTATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAATTATATAAGGGACGCCTATTTAATAAAATACGGAAATATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAATTAATTTTATGGGAAGAAAAAACAGGTAGACGTGAACATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAATACTTTCAACACTTTTCATTTTTACCTCCTAATCCAAATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAATTGCTGAATACTTCTTAAAAATTTTGACATAGCAACAATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAATGCTAATGCTCTTAACTCCTCGGTAGTAAGTCCTGAAATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAATTGCGTAGCGGACTAAGAACTGCTACACTAGATGTAGATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAATAATTTTCTTTAGACAGCATTTCGTACATTTCCTCTAATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAATTACATTTTGCCCTTGACTATTGCAAGCATAATTTGTAAATTGTAAAA >NZ_AP019845|4|3|1110391-1111459|CRISPRCasFinder ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT TATATTTATAAATATCTTGCTGTTTAAAAATACTGG ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT TTTCATTATTCAAGGCCCGTATATCGTTTTTAAGAT ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT ATGTTTATAGTGCTAACTGATTTGAACGTGAATGAA ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT TTATCTGTAAACGACAAGGTTTTGGTAGCATTTTGT ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT ACATTTCGTGTTATAATATTATCGCCAAAACAACTT ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT GAATGATTTGCAAATTCACTTGCCAAGTCAATTCCAG ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT TCTTTAATATATTTTCTTATTAATTTTGAAATACT ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT AATGTCAATAAAAATTTCGTTTTAGATAGATTTGAA ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT CCTTAATTTCATAATTTACTATTTTAAATTTATTTT ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT TATATAAGGGACGCCTATTTAATAAAATACGGAAAT ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT TAATTTTATGGGAAGAAAAAACAGGTAGACGTGAAC ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT ACTTTCAACACTTTTCATTTTTACCTCCTAATCCAA ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT TGCTGAATACTTCTTAAAAATTTTGACATAGCAACA ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT GCTAATGCTCTTAACTCCTCGGTAGTAAGTCCTGAA ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT TGCGTAGCGGACTAAGAACTGCTACACTAGATGTAG ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT AATTTTCTTTAGACAGCATTTCGTACATTTCCTCTA ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT >NZ_AP019845|4|2|1110391-1111506|CRT ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT TATATTTATAAATATCTTGCTGTTTAAAAATACTGG ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT TTTCATTATTCAAGGCCCGTATATCGTTTTTAAGAT ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT ATGTTTATAGTGCTAACTGATTTGAACGTGAATGAA ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT TTATCTGTAAACGACAAGGTTTTGGTAGCATTTTGT ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT ACATTTCGTGTTATAATATTATCGCCAAAACAACTT ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT GAATGATTTGCAAATTCACTTGCCAAGTCAATTCCAG ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT TCTTTAATATATTTTCTTATTAATTTTGAAATACT ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT AATGTCAATAAAAATTTCGTTTTAGATAGATTTGAA ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT CCTTAATTTCATAATTTACTATTTTAAATTTATTTT ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT TATATAAGGGACGCCTATTTAATAAAATACGGAAAT ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT TAATTTTATGGGAAGAAAAAACAGGTAGACGTGAAC ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT ACTTTCAACACTTTTCATTTTTACCTCCTAATCCAA ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT TGCTGAATACTTCTTAAAAATTTTGACATAGCAACA ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT GCTAATGCTCTTAACTCCTCGGTAGTAAGTCCTGAA ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT TGCGTAGCGGACTAAGAACTGCTACACTAGATGTAG ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT AATTTTCTTTAGACAGCATTTCGTACATTTCCTCTA ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT TACATTTTGCCCTTGACT ATTGCAAGCATAATTTGTAAATTGTAAAA >NZ_AP019845|4|3|1110456-1111459|PILER-CR ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT TTTCATTATTCAAGGCCCGTATATCGTTTTTAAGAT ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT ATGTTTATAGTGCTAACTGATTTGAACGTGAATGAA ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT TTATCTGTAAACGACAAGGTTTTGGTAGCATTTTGT ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT ACATTTCGTGTTATAATATTATCGCCAAAACAACTT ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT GAATGATTTGCAAATTCACTTGCCAAGTCAATTCCAG ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT TCTTTAATATATTTTCTTATTAATTTTGAAATACT ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT AATGTCAATAAAAATTTCGTTTTAGATAGATTTGAA ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT CCTTAATTTCATAATTTACTATTTTAAATTTATTTT ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT TATATAAGGGACGCCTATTTAATAAAATACGGAAAT ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT TAATTTTATGGGAAGAAAAAACAGGTAGACGTGAAC ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT ACTTTCAACACTTTTCATTTTTACCTCCTAATCCAA ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT TGCTGAATACTTCTTAAAAATTTTGACATAGCAACA ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT GCTAATGCTCTTAACTCCTCGGTAGTAAGTCCTGAA ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT TGCGTAGCGGACTAAGAACTGCTACACTAGATGTAG ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT AATTTTCTTTAGACAGCATTTCGTACATTTCCTCTA ATTTTAATAGCACAATTTGTATTGTAAAT
>NZ_AP019845.1|WP_146998477.1|1109907_1110186_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYIILVYDILTDDNGPRISRNVFKICKKYLTNVQKSVFEGEITPVLLKKLNLELKRYIRKDKDSLIIFKSRQEKWLEKEFWGIEDDKTSNFF >NZ_AP019845.1|WP_146998476.1|1108913_1109906_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAESYFIFSNGELKRKDNVVRITAPDGRFKDIKIEVTRDIYLFGEVSLNTKCLNYLAQNKIPVHIFNYYGFYTGTFYPKESNVSGKLFVKQVENYTDNSKRIELAQLIIDAASTNILRNLRYYQERGKDLESVITEIKALKKGIFRTNEINELMGIEGSIRRTYYTAWNTIVNQEIDFEKRVKRPPDNMINTMISFLNTLVYTVCLSEIYVSQLNPTISYLHSVGDRRFSLSLDIAEVFKPLLADRIIFSLLNKKMITEKDFVKDSNYFYMKENAQKLILKTFNERLETSIKHRDLNRKVSYRHLMRLEAYKLVKHLLEDKKYEGFKIWW >NZ_AP019845.1|WP_146998475.1|1108388_1108877_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKITGLMINYYFVCKRKLWCQSKNINLEEENENVQLGKLIDENSYNLETKQVMIEETVNIDFIRKWQVIHEVKKSKAVEEAAIWQVKYYIYFLKRRGIKIEKGIIDYPVIRERKEIILTEEDENTLKEILTDIEKICQNEKAPPVINNKICKKCAYYEFCYV >NZ_AP019845.1|WP_146998474.1|1105982_1108370_+|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MKNNFLAKSSGETILRHTENLFNNFMKIFMIYPKLNVEKRLLLLACIYHDLGKINQKFQSKLSGEKQSGEIPHGILSTSFINDDILIEYHHFSEDEIKILAHSVALHHERNLMEINDSDLSDEIYSMNNEVKNFSKELKILENIYFEYFKNTENYKDRKAIFNWEDGKVELAELSSLFYEIGSRVYSDVEGSETFQKYVMLKGLLNKIDYAASSYIPVEEKNDFLEEKMNAFLKNVLKKDNPENDWNELQKFMIHNRNKNVVVVAQTGYGKTEAGLLWIGNNKGFFTLPLRVAINAIFDRVKNQIVIEKLENRIGLLHSDFREIYIEDIKKKEKNNLEKMDNDELFMYMDKTKQLSLPLTVCTIDQLFDFVFRAPGFELKVATLSYSKVVIDEIQMYSTDLLAYLIYGLKYITDFGGKFAIMTATLPGIITDLLKKEEIEFVTTEPFINDKKRHNLKVLKEVINAKFIKENYKDNKILVVCNTVKKSKQIYEELKNLGIECKELNLLHSRFIKKDRAEKEKEISEFANPKRFKENVKNERELKNICENGIWIGTQVVEASLDLDFDILITELSDLNGLFQRMGRCYRNREVLDEKYNCYVFTEECSGIKSSKAVIDKEIHQKSKEVLINIDGLLTEKEKLELIDKVYSTESLKDTEYYEKLVKNIDVLKNYIQEYDNVQRIFRNIASEDVIPKIVYQENVEEIKKNIEILQKKAKGLDEEKRKNLRSEKIEARREINQFKVAIPEYEFDDISPEQVEKIEINDYETLIILDCDYSYEKGFEVKMKNQDFFEDNTF >NZ_AP019845.1|WP_146998473.1|1105184_1105949_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKAVKLKLYQNMVNYKVPTSFQLKESYPLPPYSTVIGMIHSLCDFKEYKPMKISISGNYFSKVNDLYTRYEFKNGNPFEMGRHQLNVNGYGINRGVATAELLVDVNLTIHIIPEDQSEEFLDIIFEAFKYPREYPSLGRREDIVLIKDVKIVDVEKKKLEKDLSNGEDDFAYIPVNFIQEKLVNYGDKKNGMNIYGTRYELTKNYILNNIGTKSKPKMIRSWEKEEVIYSSNIKGFKRREVPVDTDNEIVFCEL >NZ_AP019845.1|WP_146998472.1|1104285_1105182_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MKKKGLTFTAIFLAQSANYGEGIGNVAALKKLSRNKGEQYTYISRQAIRYNIIEQLGEEKSPVKAEGSGDKKVVQFSADTTIKDYPELDFFGYMKTIKGENSKNRSAIVRLSNAISLETFKGDLEFLTNKGLADRIGEFPNIAQAEIHKSYYKYTVTIDLDRIGIDELDEIEVSNEEKSRRVRKLLDTISLLYRDIKGRREDLKPLFIIGGVYDIKNPFFENIVDVKNNKILADKLCSGIYDYIEKDTISGIVKEQFENDTEVEEKLKGKNINVLNVPEFFKQLKEKVDNYYTEKVDG >NZ_AP019845.1|WP_146998471.1|1102486_1104283_+|CRISPR-associated-protein-Cst1 MSNEKIELKLKDWLFNAGLIGLINILGEEARNNGELEIDDKNRLIRFSPKVLENFEYKYFDFFIKRYGKTLTYGKILEFEKYIDEFEENGEKIRSINELKMINDKITFFKAKIKSASYKKAYDFIEKDGTNKILGLEKELKKIKEPKENIDEISKDDVKNNIKIMKEIIDFFKKKITDKNGNVKNYLAAKNIAYVIINNAWSSVSFLNQKNADKDIYKEYKSYFVEPALEYVNAKSKFKYKCAISNMSMKNYRNTLGFLNDTGFDVKRKPSHVWNFVNDIAVTPLVTLVYSCVPAGFIYGADKGIFVNANHNIDQLCKINNGIAYNILEDESEEKNINLYKNLLKEIKKEKDNTKYELSDIQIVKLEEGHYKFTLLSRDILKLLSKNKERLDNLLDKCYSIEKRYTYLYDTTITELLNNENLFSLINKLCYYKISKINNTSKTKTKIKLYYKLKSIEDLLKINLDYIRRLKKMDKQEIVEKKENKKTSEELTEKDIFYIRRDAMIFREEYIRKSGNDKKIGSLLYRLQNALRINNVDMFMDALISAHAYAGKNISSLFAKALLNDENFQTLGHGFLLGLLGEDKSKNENKTDKKEGNE >NZ_AP019845.1|WP_146998470.1|1101679_1102462_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRFKINIELTEGNSFPINWRSKILCVLKTGLKKCDNEIFEEFFGSAKQKNYTWSAYFQNVKFEKDKVKFLGEEKKIIVNLSAYDNVDSLNIYNAFSGIRFKEIKISEETKVVVTNISILPRQIIKDNILIVKTMSPIVCRDHDQETKKDTYYTGTDDKFSKIIKRNLYLKLKELKGEYVKKDIEDLIIDSSQTKKVVVKHYDKTKKDKTLNYENKFNGKFLDTSVGILKLEGKSYILDYIYNAGIGSITGSGFGMLEKLK >NZ_AP019845.1|WP_026749141.1|1099351_1099756_-|hypothetical-protein MRKIVIDKRKSVMLVMTCILFMMTYSSLLGTPSFSRKLSVFVDENNLSHEDIRDLIVKINQIESVNNRRLTQELKKIGKRKEKEKGKQKNSLFLLFEKNQNTVFYKNSDKIPKNIGNISAFLMKKDENNLRTRE >NZ_AP019845.1|WP_146998469.1|1096632_1099293_-|preprotein-translocase-subunit-SecA MLKKIGEKIFGTSDEREIKKMQKLVDKINEVEPLFEKMTDEQLSHKTVEFKERLQKETLDDILVEAFATVREASKRLMGMRHYDVQLIGGMILHKGCIAEMKTGEGKTLMATLPIYLNALPGKGVHVVTVNDYLAKRDRDIMAGLFEFLGLTSGVVVGNITPDQRKTAYNCDITYGTNNEFGFDYLRDNMVGELNEKVQRGHNYVIVDEVDSILIDEARTPLIISGAAEETTEWYNTFSEVAKRLKRSYKTEEIKDKKNTVIPDEDWEDYEVDEKSHTVTITDKGIKNVERMLKIDNLYSPEYVELTHFLTQALKAKELFKLDRDYIINDDNEVIIVDEFTGRLMEGRRYSDGLHQAIEAKEKLEVAGENQTLATITLQNYFRMYEKLSGMTGTAKTEEDEFKQIYSLKVIVVPTNKPVARVDLPDVIYMNKKAKYKAIAKKIEELYHKGQPVLVGTASIQHSEEVSALLKKAKIPHEILNAKHHEREAEIIAQAGRFKTVTIATNMAGRGTDIKLGGDAESFATKVAVKGTPEYEDVHSAYVKECEEDKKKVLAAGGLFILGTERHESRRIDNQLRGRAGRQGDPGTSEFYLSLDDDLMRLFGGDRLKSMMKMLKIDEDEEIRHKQISKSVENAQKRIESRNFSSRKSLIEYDDVNNTQREVVYEQRDAILKNENLKELIINMISDTVDDIVNSAYVGEGNGEKDFNLLSDKLHETFEYEISEELQNASADEISNKVYDDLVRIYDEKEEAIGEEIFRRIERYIMLEVLDSKWRQHLKDLTELREGIRLRSYGQRNPIHDYKIVGYDIYNEMIDAIKRETSSFILKLRVRGEEDTNNLTHEEVSNVRYEHEENEMMGDDVSARTPNEPHRPLSRRERRERERRNV >NZ_AP019845.1|WP_026749132.1|1111663_1112392_+|HAD-IB-family-hydrolase MKKNVAAFFDIDGTIYRDSLLIEHFKMLVQYEYIDMMTWEGKVKEKFSKWENRTGDYDDYLDELVQTYMEALKNFSKEDMDFIAKRVMKLKGDKVYRYTRERLKYHKEKNHKVIIISGSPDFLVSKMAERYGVKDYRASTYEVNENGIFTGKVTPMWDAKSKQKAIADFCKMYEIDLTKSYAYGDTTGDLTMFKNVGNAIAINPAKKLLQKIKRDKELKEKVMIVVERKDVIYKLKADVDII >NZ_AP019845.1|WP_146998478.1|1112495_1113476_+|3-phosphoglycerate-dehydrogenase MDKNLKIVYLDRIIAGPIDLKERFSKYGEYIEYGDTDSGEVDERIKDVDVVITTRIKLGREQFEKAKKLKLILITATGFNHIDVKSANEFGIKVANVSGYSTNSVAQLAITFLLNELTPVNRYYEEVRDGKWMDITVPDYQKYPIDDANGKILGIVGFGNIGKRVAQVAEILGMEVIVAKNTEKDNAKTDSAIEKGGFLRYDLDEVLEKCDVLTLHVPLTDSTRNLINLEKMKKMKKSAIILNLARGPVINQEDLYFALKNKIIKSAAIDVTSIEPIEKNSKLFELDNILVTPHIAWKSEKSMVKLMDDVEENLKLFLEGRLEGLK >NZ_AP019845.1|WP_146996454.1|1113596_1114241_+|hypothetical-protein MLINNFSGIKLEFDGLYYGGNYEIEIFPDGRFYYSYIENTSVELKKGSFQINQKEIMIFEEMMDYFELLKNQSNYMINEFNFGNGVLVIQKNNGREEKIRLGKEMMFEYAKTLIDKYTKKSKRLFLLDTYLEGAKYIRNFAIKIKDEVQLDLFREFNGISLNAVAVYNSKKEKVGYLPKNQSEIIARMIDAGKKFVAVPIPYDEDIALKIYLVD >NZ_AP019845.1|WP_021743260.1|1114375_1114813_+|hypothetical-protein MGFRLSVKGQENEILLDKESILDVKYISETPDDSNARATDLGVILEIRGKILAAANGDTEDDTRKVAQWSLVPSEASDAYRQASLEIISAGQMVRKIDMTNVFVVDYIEEYGNQAGTGTFSLKIKQKKEKVKEVAIEGGYATQEA >NZ_AP019845.1|WP_146998479.1|1115426_1118567_+|DNA-polymerase-I MKRAVILDTSAIMYRSHFALMGMRNSNGMSTGATFGFINTLESVIREFRPDYLVACLDVKRSELDRTGELETYKAHRESMPEELVMQIDTIMKVLDGYRIPKYKKAGQEADDVIATFATKFSNDEDEQIEVFVITGDKDLAQLVDGKINIALLGKGDKNSAFKHIKTDEDVVEYLGVTPDKIPDLFGLMGDKSDGIPGVAGIGSKNGVKLITTYGNLEGIYENIDEIKGKQKEKLLTDKENAFISRELATIKRELDIEYDKKKLKFEEKDFDGLLKLYEELDFKRFSKAVEEEKERFLQNGNQKELTEEEKQILEKNKKINEEKLEKERLEREKIEKQELEYDKENTIFDGISHFYEHVEYEHNSEIDKKIDEIQVLKEKLVIEYEAQKKKAEEIALENQKTEKTKKTKDEKVYFEKNYGKVISWNDAYYVIEKMDKKVAIFENMLGISICDEKTNIAILDSELQDILQNGNQKNAESGAQINLFSLSNNADEKEENKKNVKNIYKLLSEKEIIAYNVKEYMKNGESEYFGYSVGGKTYGINNDRFGIKCTEYFDILLARYVLGTESLQEIEEIILDEFGVEIATFEEQFKKERRKKDFSDVSDDVICEFLSKRTFFIYKLETIFRNRLQNEQFLNIFDKLESRLIPVLAQMEETGIKIDKKYFNEFQNELEEKINMLQSDIYKLADGEFNIDSPQQLGEVLFEKLQIPSGKKTKTGYSTNVEVLEMIANNVELTEDKRMIGKKLLEYRAYKKLLSTYIEPIPKLADKEDRIHTTFNQNGTSTGRLSSANPNLQNIPVRTDDGIRIRTGFVAKEGHSLISFDYSQIELRVLAELSKDRHLVQAYQDNQDLHNLTARKIFFKTEEDEISRHERSIAKVINFSILYGKTPFGLSKELGITVQEASQYITTYFEEYPRVRKFLDIVTETAKLHGFVETFYGTRRYISGINATNKNVQAQAVRMAVNTVVQGTAANIIKKVMIELHEEFKNDENIKMLLQVHDELIFEVRDEFAKEYMKKIENIMENTVKFKKVPLKANGSVAKNWGLLK >NZ_AP019845.1|WP_146998480.1|1118667_1119399_+|AzlC-family-ABC-transporter-permease MAQIRKLENYLKGLKDGTGIGIAYIPFGVAIGLISAKSFSQILPMIGLTSFGMYAGGAHSLLLKVLYVMKSPPVEVILSIALINLRYLLLNIVIFRQLGEKTPVFQKFLVGVGLTDETVTYLTLKKATNAWYMMGVNTIPYFCYCFGTIFGAIFGEKLPESLMTSMNFVLYSIFFSMLIMALSQNFKYIRIVLLALIIKMAFSFLPILNKVSSGWVMILTMFLASFIYAQLYYNENPEKQEND >NZ_AP019845.1|WP_036069918.1|1119460_1119766_+|AzlD-domain-containing-protein MILMTLIIMTVILRTLPIFVKIPENNLKVNKFFEALPYTVLTVLVFPDIFTSTGSTNFDIIRVLIGMAIVAYLTFRKTNLGIIIIVSIAVIYFLGMLKGSF >NZ_AP019845.1|WP_006803784.1|1119826_1120174_+|inorganic-diphosphatase MSLDNYKKFLGQKIHVKMDRKMGERHPKYNFIYPVNYGYIPNTISEDGEEIDVYILGVFEPVDEFCGICRAIVYRYDDEENKLIVIPDGKNYTVSQMEVLVEFQERFFKHKILTE >NZ_AP019845.1|WP_146998481.1|1120190_1120700_-|DUF1439-domain-containing-protein MKLFKFLFFSIIILIAGLGYYIYTQNQLKIPDSMVKSAVASKFPIEKSYPLGKIKLFNPKVHFENDKLIIEAEYLNDALNDQISGTMTFATDIRYDPMKSNLYLEDFQIVRLTKENKEIDLDKKPIIRTGLNYAFSQLEKKEILNLSGVEKFQMIKDIKIENNKLTVVK >NZ_AP019845.1|WP_146996458.1|1120978_1121716_+|ABC-transporter-permease-subunit MEELEKTRKIVKTSFFIAVVTVAVLLAFPYDMKPKEWEIYAGSYFVTTLGLTVGGAAIGIFFGMLLAFFKFQKTKSEVVNMIKDVVIDEYVDIMRGTPMVLQLLILSVVVVIFNNYWIAVIALGLNSAAYVEETVRSGIESIDKGQMEAARATGMPYRMAMNEIIMPQAVKNILPALVNEFINLFKETSVVGYISVMDITMNSKSLQAVYYSVKPILFTGIVYYISVKLFSFIGKRLEMRLKEND |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_AP019845_5 | 1297505-1297764 | TypeIII |
I-B
Consensus repeat of NZ_AP019845_5
|
3 spacers
spacers of NZ_AP019845_5
>5.1|1297542|35|NZ_AP019845|PILER-CR TCTCCTATAAAGTTGTACTTAAAGGAAGGAGAGTG >5.2|1297614|39|NZ_AP019845|PILER-CR AATTAATAATCGCACCTTCTTGTACTAATGTTCTTAATA >5.3|1297690|37|NZ_AP019845|PILER-CR AATTTTAATATCCAGCATAGACAACAGAAGTCTCAGT >5.4|1297534|43|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder ATTGAAACTCTCCTATAAAGTTGTACTTAAAGGAAGGAGAGTG >5.5|1297606|47|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder ATTGAAACAATTAATAATCGCACCTTCTTGTACTAATGTTCTTAATA >5.6|1297682|45|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder ATTGAAACAATTTTAATATCCAGCATAGACAACAGAAGTCTCAGT >5.7|1297543|34|NZ_AP019845|CRT CTCCTATAAAGTTGTACTTAAAGGAAGGAGAGTG >5.8|1297615|38|NZ_AP019845|CRT ATTAATAATCGCACCTTCTTGTACTAATGTTCTTAATA >5.9|1297691|36|NZ_AP019845|CRT ATTTTAATATCCAGCATAGACAACAGAAGTCTCAGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP019845_5
The CRISPR arrays of NZ_AP019845_5 >merge|NZ_AP019845|5|1297505-1297764|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTAAAGTAAGTTATCCATTAAAACAAGGATTGAAACTCTCCTATAAAGTTGTACTTAAAGGAAGGAGAGTGGTTAAAGTAAGTTATCCATTAAAACAAGGATTGAAACAATTAATAATCGCACCTTCTTGTACTAATGTTCTTAATAGTTAAAGTAAGTTATCCATTAAAACAAGGATTGAAACAATTTTAATATCCAGCATAGACAACAGAAGTCTCAGTGTTAAAGTAAGTTATCCATTAAAACAAGGTTTAAAAAA >NZ_AP019845|5|4|1297505-1297763|PILER-CR GTTAAAGTAAGTTATCCATTAAAACAAGGATTGAAAC TCTCCTATAAAGTTGTACTTAAAGGAAGGAGAGTG GTTAAAGTAAGTTATCCATTAAAACAAGGATTGAAAC AATTAATAATCGCACCTTCTTGTACTAATGTTCTTAATA GTTAAAGTAAGTTATCCATTAAAACAAGGATTGAAAC AATTTTAATATCCAGCATAGACAACAGAAGTCTCAGT GTTAAAGTAAGTTATCCATTAAAACAAGGTTTAAAAA >NZ_AP019845|5|4|1297505-1297755|CRISPRCasFinder GTTAAAGTAAGTTATCCATTAAAACAAGG ATTGAAACTCTCCTATAAAGTTGTACTTAAAGGAAGGAGAGTG GTTAAAGTAAGTTATCCATTAAAACAAGG ATTGAAACAATTAATAATCGCACCTTCTTGTACTAATGTTCTTAATA GTTAAAGTAAGTTATCCATTAAAACAAGG ATTGAAACAATTTTAATATCCAGCATAGACAACAGAAGTCTCAGT GTTAAAGTAAGTTATCCATTAAAACAAGG >NZ_AP019845|5|3|1297505-1297764|CRT GTTAAAGTAAGTTATCCATTAAAACAAGGATTGAAACT CTCCTATAAAGTTGTACTTAAAGGAAGGAGAGTG GTTAAAGTAAGTTATCCATTAAAACAAGGATTGAAACA ATTAATAATCGCACCTTCTTGTACTAATGTTCTTAATA GTTAAAGTAAGTTATCCATTAAAACAAGGATTGAAACA ATTTTAATATCCAGCATAGACAACAGAAGTCTCAGT GTTAAAGTAAGTTATCCATTAAAACAAGGTTTAAAAAA
>NZ_AP019845.1|WP_172618337.1|1296998_1297163_+|hypothetical-protein MAIIVKKGELAKINKGMSQKGLAERCTYTVKEFPKSNLSKKAEEALNKIFSSMK >NZ_AP019845.1|WP_146998572.1|1296060_1296954_+|homoserine-kinase MGLKFKVKVPGTSANIGVGYDCLGVALDYFLELEVEESDKIEFLENGEPFSIPIEENLIFEAIKYTEKHLVKNIPSYKVNIVKNDIPISRGLGSSSSAIVAGILIANKFAGDVLDINEVAKLAVEMEGHPDNVVPAIFGGMVLTAHDKENLVYSSLINSDDLCFYVMIPDFKLSTEKARSVLPKMYLVSDAINNISKLGLLVNAFNKGKYDNLRFLLGDKIHQPYRFALINDSEKIFEASKKHGALGEYISGAGPTLISLNYDNEEFLENMKKELAELSDNWTIEKKKINLKGAEVY >NZ_AP019845.1|WP_146998571.1|1293672_1295970_+|autotransporter-protein MNKKEISYDFLEISNRCINRAVKEETFTKKIKKAGKKTNYSSAKYKLEIKKESKNRFNKKFGNIVNKKIVSDKRIIVTSLMTGIASLLNAESTETLKPSGYTVNYMANTGTDEKIDKKSNFENAENVLISQNLNKTVANNEKLDKIKVRAATKEDNIRFSFNTKFDMLLSKRNSKNGADSSNNLKSTGNTSLAPSNSSSGIGTSSTQLTPSTQTTRVINQQILIPMYKYPHLNDPYWQQVTNMGGSKIPYVVVNPASGPGTSVDSNYVRQISSNINSGIKNIAYVATGYQSRSTADIMADIDKYGSLYGISNFSGVFLDEVASGTDANARYMENVYKSIKSKYPNLMVVGNPGKSITDSIAPYSDIFVTKEVSANTYLNNYHAPTSAFENNPANANRIMHIIYGATSAQYDEIIRLSRERNVGWLYIVNDTNYNNLPTNFSSLVDNINTPLVVPVLSQNSNKLMTRVISPSASSTQVPLEAPRSKVNLDLVKNVKSSIFQNLQNTEEGKTDIDFTFIGNFSTDYKDKKSSVEYDSDSRGILISLMKNFGKFTVGGGMGYQDSKVNYKGNFEGIDEKIKSHQFILSGKYEFNENIDLTNVLTYSGNNHKFKTETGAGLMNNVKYKSRILDYTTKLGYKFSIDNGFVKPYIGLAAIRVFEDKMDKLNILESTKSGLEWLFGVYAEKTIGQFNIFGKAEYELRGKKGSYHGERKYGNYKIAPLSYSRGVFNAELGTNYRINDYVKASLGYGLADSKNSSIKLGLEASF >NZ_AP019845.1|WP_026748985.1|1291954_1293547_+|phosphoglycerate-dehydrogenase MYRVLVGEYIDDEAIAGLQEARDVKVDVKVGISREEILDIIGEYDALIVRSVIKVDKELLDKAKNLKIVGRAGNGTDNINIPEATAHGVIVANTPDSNTVSACEIAIGLMIASARNIVAANNFIKSGKWEREIFVGNELFEKTLGIIGLGRIGGLVATRMKAFGMKLVAYDPYISDERFKRYSCEKAKTLDELMEKADVITIHTPKTKETVDMINAENLHKLKDGVRLVNAARGGLFNEEAVAEGLRSGKITSFGYDVHTVEPRSECILYEFENAITTPHIGATTYEAQRNVGTQVVKQVLNGLRGEIVETAVNLPAIGREEFLIVKPFINLAEKLGKIYFQIEKTPITNVVLNYYGEIAEQETALVDSTAIKGILEPVLKEEVNYINSKPLAEKRGINISINKKERKYKNYSSAIEFVITNEEGKKIYVVGTIGMNNEERIISIKNHDVDMAISDNMIYLGNDDVPGVIGAVGATLGKENINIATMNVGRRENSAIMLLTVDSEVGGKSLKELRGLSQIKWAYYLDLTI >NZ_AP019845.1|WP_146998570.1|1291333_1291690_-|transcriptional-repressor MKLTKKRQKIFELVQASNNPVNAKFLKSQVDFDLSTVYRALEFLEKNNYIFSFDFENEKYYFKEENANFFICDSCKYIETVPEFSNEETEKEKSELKKRGFSLLSHLSIFKGKCSDCD >NZ_AP019845.1|WP_146998569.1|1290357_1291293_-|zinc-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLLSLLLLSALFIFSCGNKSESKKEQGTTTGAKEKIVTSVPPLRWLTQKIAGDDFEVISIVQPNMNHELFEPKPSDLKILENSKVFFTYNMLGFEETISDSLSDKNKIVNVLDGVDKNLFIKGDHDHEHEHGHEHGKKEEHEHHHEHEGHGGIDPHVWFSLDMMPKIAENIKNELSKLYPDKKETFEKNYNAFITELNQVKAELSQKMASKTKKSFMIYHPALNYFLKNYAIEEISIEQEGKEPSAQQIKEIIDEAKEHNVTTILVQPQFPKQSAEAISKEIPNSKVAEFNVDKENVFENLKQFVDYLN >NZ_AP019845.1|WP_146998568.1|1289608_1290307_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MTNGQNKKLVSVRNLNFKYNNDYILNDINLDIFKGKNVAILGRNGGGKSTLVKVMLGFLRKNSGSIEFFASENKIGYLPQIREFDTSFPINIFDLVISGLTNKNNLFRRFNNEEKKRAEILLKEFDIFHLKNKLINEVSGGQLQRALIARALISSPELIFLDEPESFLDKEFEFKLFEKIKELSDSTIVVISHKLEKIYDYIDSIFVVEGNIRVYEKKEDYVCSNPYLHSHK >NZ_AP019845.1|WP_146998567.1|1288723_1289566_-|metal-ABC-transporter-permease MEFIKIFEYAFMRNALIVGLLSSICCGIIGTYIVNKKMVFISSSISHASYGGIGIGIYLIYFFNLPIKDPLFFGLIFSILSGILILVLKDTLHVDGDLGIGIVMSMGMAIGIIFAFLTPGYQSDMSTYLFGNILLSNTLNIILLLILDTITVTFFIIFYKSIVYTSFDENFYKIHSVPVTFINYFMIILISSVIIINIKTIGIILIISILTIPQAIAASLARKYSTIIILSIIFSFIGILSGLYFSYTLNIPSGPSIIVLLTILLALVKVGGLVKGKFLN >NZ_AP019845.1|WP_026748989.1|1288460_1288655_+|hypothetical-protein MNKLILIFLLLGVLGFSKDKTVIRDKKISEEKRKFLLKLSEQAPYKTETENLADYNYISLHFNN >NZ_AP019845.1|WP_146998566.1|1287669_1288401_+|peroxide-stress-protein-YaaA MKIIISPSKTKKINSLPIKDSDSLTVKEPFYLEITNEIIEKIKTFSVEEIEKKFKLKNEKAQNLLEFYKNYENEKSGNALASYTGVAYKAIKVETFDKSDFEYLESHLVILSALYGILTPYTNVKEYRLDMTNSIFESKSLYEVWKSSVNEYFEKEDIVLNLASKEYSKLINSDKLIDFEFWEDSNGKLKQVSTNSKKMRGFTLNYIVKNKISDVKKLRNITLDGYVFDEDMSDERKFVYVKK >NZ_AP019845.1|WP_146999394.1|1297915_1298404_+|ribosome-maturation-factor-RimP MEQILDEFEKKIESHLKRMNLELADLEYVRDGGYNYLRVYVEKLDGTTTLDDCIDFSREIDGIADDLIEEKFFLEVSTPGVERRLRKPKDFVRFLGERINVQTKSNIEGAKRFLGKLEKFEDNTIFLLDDKLAKIVEIPLSKLKKANLIYELPNGILNSEEE >NZ_AP019845.1|WP_146998573.1|1298403_1299597_+|transcription-termination/antitermination-protein-NusA MKGRDQKIFLEALDELEKEKGILKEELLETIETALLAAYKKNYGEKDNVKVTINRNSGDVKVYSQRLIVENVENPDEEISLEDAISVKKRAKLGDILDLEINAESFKRNAIQNAKQIVVQKVRECEKRNIFNKFKEIENSIVSANVRKTDEKGNLYVDINGLEAIVPAKELSPVDIFRQGDRIKIYIGAVEESTKFTKTFVSRKSEELLRGLLELEVPEIYEEIIEIRNIAREAGSRSKVAVYSNDKNLDVKGACIGRNGMRIQNIIDELCGEKIDVVLWNEDITEFVKNALNPAEVLSVEIIEEGEENMKVARVLVAENQLSLAIGKKGQNSRLAARLCGVKIDIHTEAAEIEKYEENTAFNDSFEGEIENVGETSDSNDDYEVEESAFAGLHEEE >NZ_AP019845.1|WP_146999395.1|1299718_1300240_+|DUF448-domain-containing-protein MCICCRKKGEKSDFLRIAEQDGKYVFDKEMKMQARGFYVCKTNECIERLSKHKKYNIEMEQLVQMLEEVKKQKKNIIDILKPMKNSEYFVFGIDEVFEGIKREKIKLVIIPADIKAKYIDEFEKLKKNFNFEIIFIKKKEELIRLFSRDVNVIGIFNKKVIKGILSKVEVMNG >NZ_AP019845.1|WP_146998574.1|1300236_1303314_+|translation-initiation-factor-IF-2 MKVHELAKENGFTATKFMEEIRKFGIDKKHHMNVLSDEEVSLIRKKLQKGVQNNQNNGKTENLNKSENKTTESTKENIVKMVSSHSDSQKNNNAEHSKISEHKNINKNYEKPKQPLEKDIKLNVEKKSDNSNINKSNLNNTKNLDNNKNQKFEKPNRFDKKENNKKMEMKVNLSSQNNKANELNREKQSFQNRDSRDSKDNRENGGRNFQNRDNRNREDRKEGFRKEGRDNFRRDNRNFNKDGNNQTRDNRDNRGFQNRDRDNQSGSRNFQSRDNRNREDRKEGFRKEGRDNFRRDNRNFNKDGNNQARDSRDNRGFQNRDRDNQSGGRNFRDRQDNRGFSDRGGFNKDRDDFRKDSRNFSNAKKETSSEIPAATVAEKGKAGGKGKGKFDKKKYEKNRRDREQQEKELRSDFRKDDKKKKKNKKQEKVVKDEIVRIEGESIGMITIGEEIVIKDLAEKLGINVSDIIKKFFMEGKLLTANAILSFEEAEEVALEYEVIVEKEVIEEISYGEKYQLEQEDTADELVTRAPVITIMGHVDHGKTSLLDALRHTNVMSDEAGGITQKIGAYQVNWKGQRITFIDTPGHEAFTEMRARGANITDISILIVAADDGVKPQTVEAISHAKEAGVPIIVAINKIDKPGADPMKVRTELTEYGLMSPEWGGTTEFVEISAKQKINLEELLETILITAELEELKANPNKRPKAVVVESRLDPKMGAVADVLVQEGTLRIGDVFVAGEAHGRVRSMLDDRGKKINKAIVSQPVEITGFNVVPNAGDILYGVESDKQAKKIVEDFIREKKVNDQNKKKHISLESLSQELEEQELKELKCIIRADSKGSVEALRESLEKLNTEKVVINVIQGSAGAVSEGDVKLAEVSNAIIIAFNVRPTTPARIIAEKTGVEIRNYNVIYHATEEIEKAMKGMLDPEYKEVYYGRIEVKQVFKVSNVGNVAGASVVDGKVTKDSKIRVIRDGIIIFNGELGSLKRFKDDVKEVVTGQECGIGIQDFNDIKAGDIIESYIMEEIPR >NZ_AP019845.1|WP_146998575.1|1303336_1303705_+|30S-ribosome-binding-factor-RbfA MNDRRKRGLEKEISRIIGMTLLTDIKNDKIKNLVSIHKVELTKDGRYLDLTFSVLDLKDNINKEKIAEDLNKLKGFFRKKIGSQLSIRFVPEVRIHLDDSVEYGVKIASILNEIKKENDNIG >NZ_AP019845.1|WP_146998576.1|1303798_1305496_+|single-stranded-DNA-specific-exonuclease-RecJ MKWELKSYNEDYLTSKSSEFGESRLISRLLLNREINTKEKVSKFLNSDKGDIHNPFLFENMEKVVERIKKAGRNKEKIVIYGDYDVDGISGVAYLVIMLRKLGLNVDYYIPNRVHEGIGINKNLLNFLKKRDAKLFITVDISINNREEILMLKNSGIDIIITDHHRQIGVLEDKEQEKELGILTINPKTSETYPNKSLSGSGVAFKLADAVYERYGVNKKILYDYMDIIMIGTVADVVPMTDENRFIIKKGLNNLKKTKIKGLKYIINYLKINPRNITTSDIGFFIAPIFNALGRIDNSKIVVNFFIQEDDFKLFSIIEEMKRANKIRRYLENEIYNELEEKIQRLERPKYIFMKSRKWHSGVIGVVCSRISIKYNIPVILISIKNGYGKASCRSIEGINIFDILKSVSDKLERFGGHDLAAGFLVSEKYLGEIEKHLRQRLAKKNRENVQKTLHVDAWLNIEHLNKRKLHEINRLSPFGLDNQEPNFMDSDINFLNLTRFGINNRHFKGFVRKNNRIISVIGYNLGHKLKTNNFYKKKFKMVYTPIFKSVHSDLFIELKIKDFK >NZ_AP019845.1|WP_146996574.1|1305553_1306840_+|trigger-factor MAVKKLNESTYEVSAVREGEELKHLKEHVLVHFKDAKVDGFRPGHVPAKVIEKKFKKDIEGEILNHIISDEYRKAVAENELKPIADIKLEKYELNDDKVEVVFTIPVLPSFELGQYKGVEVEKEKVEITDEKVNEEIEKLRENAAKLKEVAENEEAKNDDVVNINFEGFIDGKAFDGGKAEGYDLTLGSHSFIDTFEDQIAGHKKGDEFDVNVTFPAEYHAESLKGKPALFKVKVNSIKRKEEAELNDDLAKELGFDSVEDMTAKTRENITKREEARAENEFKNKVVDAVVSATEVEVPEALVQREIDYQINRFAQQLQMQGINLNQYFQMTGQTMEAMRESSKENAEKAVKTELVLAEIAKAESIKATDEEVSKEIETLAAMYGLEKDALIADVRKNGNYERFIDETNYRLVNQKTIDLLVNEAKVK >NZ_AP019845.1|WP_146998577.1|1307150_1307726_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP MSVYSPVVIENDGRGERSYDIYSRLLKDRIIFVSGEVEDGMANAIVAQLLFLDAQDNEKDIVMYINSPGGVITAGLAIYDTMRHIKSDVSTVCVGQAASMGAVLLSAGAKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGARGQVTDIQIQAKEIERMKEITSKILSEATGKSVEEIYADTERDNFMSPEEAVNYGLIDKIL >NZ_AP019845.1|WP_146998578.1|1308116_1309346_+|ATP-dependent-Clp-protease-ATP-binding-subunit-ClpX MANKKKNYCSFCGREEHEVERLIQSPEEDDVFICNECIEDSAELLDSFREYDENEHNREITLLKPKEIKAKLDEYIIGQEQPKKVLSVAVYNHFKRIMHKQKNVDNDVELQKSNVLLVGPTGSGKTLLAQTLAKTLNVPLAIADATTLTEAGYVGDDVENVLLKLIKAADYDIEAAEHGIIYIDEIDKIARKSENMSITRDVSGEGVQQALLKIIEGTVASVPPQGGRKHPNQEMIEINTKDILFIVGGAFEGLEAKVKDRVNEKRVGFGLETNNTKLNDLTLFENVLPEDLIKFGLIPELIGRLPVITALHGLDEEAMIKILTEPKNSLVKQYKKYFEMENVDLEFEKDAIVEIAQLALKRKIGARGLRSIIESVMTDLMYEIPSKENVKKVIITKEAVTDKEKVIIE >NZ_AP019845.1|WP_146998579.1|1309413_1311780_+|endopeptidase-La MQNKPFIATRELVVFPGVVTPIFIGRQSSLKSLEEAISRFDSKLILSAQKDANVEEPKFPEDIYETGVLVHVIQTVKMPNGNVKVLVEAKHRVLINQFPKDDNSVVYAEYEEIFSKPIDESKAEALKRRVIDEFSNYAQKTNKVLPDIIYNIKEISNIDKVFDLICTNLMIAVETKQELLEILDVEARAYKILSILEREIEIFMLEREIENRVKEQMAEVQKNYYLREKIKVMREEMGEGTDSDEELEELDQRVRDAKIPQELKDKLVKELSRMKKMPDFSAESSVIRTYLETVLELPWEVSTNDEIDIEKAEKILNEDHYGLEEVKERILEFLAIKKLNKTLKGSIICLVGPPGVGKTSLAHSVARSMNRKFTRISLGGVRDEAEIRGHRRTYVGAMPGRIINSLKQVGVNNPVMLFDEIDKMASDFRGDPASAMLEVLDPAQNNSFEDHYIDHTFDLSNVFFICTANDLGGIPGPLRDRMEIISIESYTEFEKLNIAKKYLIPQTQEENGLKDYKISFSDKAVMKIINEYTREAGVRNLRREISKLFRKIAKEILVSKSESKKISVSEAKIKKYLGNAKFRVDKVKEKEGKIGVVNGLAWTAVGGTTLEVQAVKMEGKGVLQLTGKLGDVMQESARVAYSYVRHIKNELGIKEKFNETTDVHLHFPEGAVPKDGPSAGITITTAIISVLTDKEVRQDVAMTGEITITGEVLAVGGIKEKVIGAHRVGIRDVVLPYDNKVDTEELPKEIADQMKFYFAKTYDDVKKIVFVEKEAKKSKAVKKVAEKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP019845_6 | 1533795-1534577 | Unclear |
I-B
Consensus repeat of NZ_AP019845_6
|
10 spacers
spacers of NZ_AP019845_6
>6.1|1533832|38|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT ATACTAGATAATCTATTTAAATAAATTACACGATTATC >6.2|1533907|38|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CATCATGAAGTTATGAATGATATAAAAGTTAATCTAAT >6.3|1533982|38|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CATTCAATTTCTTTCCGTAAGTACTCATTTTTATTTCC >6.4|1534057|38|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTTAAGTCCTCTCTCATACCCAACAGAACTTCCAAA >6.5|1534132|40|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATCTAACTTAGTAACTTCTATAAAAATAGTCTTTTTATG >6.6|1534209|37|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATGATACGTCCATATATATTAATGGGAGATGATAGAG >6.7|1534283|37|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCATTTTTATACTTTTGTTACGGTAAGAGTCGTCATG >6.8|1534357|38|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTATTAGCATCAGTTTCCATAGAACTTATAGGAGATC >6.9|1534432|35|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCTTACGAGAATGGTTATAAGAAATTATTTAGTAA >6.10|1534504|37|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATGATGAAAGATACTATATCTCTTCCTATAATTCCT |
csx1,csx20,cas1,cas2,cas4 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP019845_6
The CRISPR arrays of NZ_AP019845_6 >merge|NZ_AP019845|6|1533795-1534577|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTTTATATTTATTTTACTGGATATACTACTTTTACATACTAGATAATCTATTTAAATAAATTACACGATTATCGTTTCAATCCTTATTTTACTGGATATACTACTTTTACCATCATGAAGTTATGAATGATATAAAAGTTAATCTAATGTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTACCATTCAATTTCTTTCCGTAAGTACTCATTTTTATTTCCGTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTACATTTTAAGTCCTCTCTCATACCCAACAGAACTTCCAAAGTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTACTATCTAACTTAGTAACTTCTATAAAAATAGTCTTTTTATGGTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTACATGATACGTCCATATATATTAATGGGAGATGATAGAGGTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTACCCATTTTTATACTTTTGTTACGGTAAGAGTCGTCATGGTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTACTTTATTAGCATCAGTTTCCATAGAACTTATAGGAGATCGTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTACCCTTACGAGAATGGTTATAAGAAATTATTTAGTAAGTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTACTATGATGAAAGATACTATATCTCTTCCTATAATTCCTGTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC >NZ_AP019845|6|5|1533795-1534577|CRISPRCasFinder TTTTTTATATTTATTTTACTGGATATACTACTTTTAC ATACTAGATAATCTATTTAAATAAATTACACGATTATC GTTTCAATCCTTATTTTACTGGATATACTACTTTTAC CATCATGAAGTTATGAATGATATAAAAGTTAATCTAAT GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC CATTCAATTTCTTTCCGTAAGTACTCATTTTTATTTCC GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC ATTTTAAGTCCTCTCTCATACCCAACAGAACTTCCAAA GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC TATCTAACTTAGTAACTTCTATAAAAATAGTCTTTTTATG GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC ATGATACGTCCATATATATTAATGGGAGATGATAGAG GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC CCATTTTTATACTTTTGTTACGGTAAGAGTCGTCATG GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC TTTATTAGCATCAGTTTCCATAGAACTTATAGGAGATC GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC CCTTACGAGAATGGTTATAAGAAATTATTTAGTAA GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC TATGATGAAAGATACTATATCTCTTCCTATAATTCCT GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC >NZ_AP019845|6|4|1533795-1534577|CRT TTTTTTATATTTATTTTACTGGATATACTACTTTTAC ATACTAGATAATCTATTTAAATAAATTACACGATTATC GTTTCAATCCTTATTTTACTGGATATACTACTTTTAC CATCATGAAGTTATGAATGATATAAAAGTTAATCTAAT GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC CATTCAATTTCTTTCCGTAAGTACTCATTTTTATTTCC GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC ATTTTAAGTCCTCTCTCATACCCAACAGAACTTCCAAA GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC TATCTAACTTAGTAACTTCTATAAAAATAGTCTTTTTATG GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC ATGATACGTCCATATATATTAATGGGAGATGATAGAG GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC CCATTTTTATACTTTTGTTACGGTAAGAGTCGTCATG GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC TTTATTAGCATCAGTTTCCATAGAACTTATAGGAGATC GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC CCTTACGAGAATGGTTATAAGAAATTATTTAGTAA GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC TATGATGAAAGATACTATATCTCTTCCTATAATTCCT GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC >NZ_AP019845|6|5|1533870-1534577|PILER-CR GTTTCAATCCTTATTTTACTGGATATACTACTTTTAC CATCATGAAGTTATGAATGATATAAAAGTTAATCTAAT GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC CATTCAATTTCTTTCCGTAAGTACTCATTTTTATTTCC GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC ATTTTAAGTCCTCTCTCATACCCAACAGAACTTCCAAA GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC TATCTAACTTAGTAACTTCTATAAAAATAGTCTTTTTATG GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC ATGATACGTCCATATATATTAATGGGAGATGATAGAG GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC CCATTTTTATACTTTTGTTACGGTAAGAGTCGTCATG GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC TTTATTAGCATCAGTTTCCATAGAACTTATAGGAGATC GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC CCTTACGAGAATGGTTATAAGAAATTATTTAGTAA GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC TATGATGAAAGATACTATATCTCTTCCTATAATTCCT GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATATACTACTTTTAC
>NZ_AP019845.1|WP_146998721.1|1532861_1533554_-|50S-ribosome-binding-GTPase MTSFKYYRKTDIEKKLEKARFMPLDVMITGVTGAGKSTTLNTIFKKNVATVGNGVDPETIDLEFYSLNDVFRLWDTPGLGDGIKNDEIHKRRLVNLLYKTYSLDGNVYGWVDLAIVVLEGLNRDMGSTYALLNEVIVPNIQADRILVVINQADMAMKGRHWNKETNKPDETLVEFLEKQASSIQDRVKEATGITIRKPVYYSAEYGYNIEKLLDFIIDNMILERRPLIKA >NZ_AP019845.1|WP_146998720.1|1532356_1532614_-|hypothetical-protein MKNMNKEEVMWTDNDDLKDYRKGILEKFVESVAKGAMLGGAIGEILGSFAGLGGIGRIVGSVVGVGLGIAGSLVSGVVDFLGGIF >NZ_AP019845.1|WP_146996967.1|1531965_1532187_-|hypothetical-protein MTGIEKVVGTAVVVTAGVVAVAEGINQTVKLMNETVNTADDMFTTMGNMAEDFGNSVNDFCNEVSSFFDSLSW >NZ_AP019845.1|WP_172618346.1|1530437_1531787_-|TIGR02221-family-CRISPR-associated-protein MAKILIAGLGKGIKKDGKYRETNYSIEKIDKENIIYKNESFITSALEKHFEIDKTIYIGTVGSMWDNLYSYYCNKYNLKEDEDYTFELLEASSNATQDSEFSEINIKKFNDIFEGKARIILTKFGMNTNEIFENFNLIMEIGNMLNDGDEIYLDITHSFRSNAMWMFLVINYITNVLDKNVEVKMISYGMFEAKYKKEVIENGETKEIEISPVVNLKAFFDLMKWIKGANELKNYGNSYTILEMIDDKDVNKKIRTFSDSLNLNYLGTIKRNLESIKRIMDKIDSIEGPGKLIIPNIVKDFIEIFGNIEKEYEFLFKIAEWNFNQKRYAMVAININEGLREFVAGILEIEDRVSDFNDENSGIFKYFKKIRQSIEYKPNNTKGTFDKKEEKIYKIFEHTRKIRNEIAHSKGEKDTAINDVESLKNYVKDIDTIISDKGFIKYLKLKYNV >NZ_AP019845.1|WP_146998718.1|1528345_1530247_-|hypothetical-protein 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MLEREMMNLLDSCYDKALEGVLPGERTVMELAEDYLGQSCSREKAIDNLIGYQTVLCGTNGFIAGLGGLLVLPVAIPANITSVIYVQLRMIAAIAYINGYDIYSDQVRTIAYACLTGSSATNILKNVGIKIGEKMAVNAVKKIPVAVLVKINQQVGFRLVTKFGQKGLVNIGKIMPFVGGLIGGAFDTGMTLTIGNITKKVFSEK >NZ_AP019845.1|WP_146998715.1|1525664_1526645_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MELYITDLGTMVKKRDDLFEITTSEKKVAVAPQKIKSLVLAKGIFLTTDVIRLAVENNIDIVIVDDFGNPYGRFWQSKFGSTANIRRKQLEIFGTQKGIEIAKQILIQKIKNCAEHLEDLKIKREAKKQFLDEKIKEMKKYIYQIKLVEGDVSAKRGTLMGYEGNAAKIYYQTLSELMPKEFKFEKRSMHPAEDEFNAMLNYAFGILYSKVEKACIIAGLDPYIGIIHTDNYGKKSLVFDIIEGYRHLASRTVFSLFTQKRVQKYFFKREGDGVTLIGDGKKVLVESFYNRLEKKVRYNNRNISNLDKLQFECHELANRLISKQNC >NZ_AP019845.1|WP_146998714.1|1525325_1525616_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MMTWFIYDITDDRNRSRLIKIAQKHGLYRVQKSVFLGNIEKDEIDQIIKESRKVIDLREDSVYIFPVCDADYKKATLLGLAFEKDIVQDEKPVLFF >NZ_AP019845.1|WP_146998713.1|1524687_1525311_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 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MATVNTSIKIDEETKKEAQKLFKDLGLSLSTAINIFLKQAIREKGIPFYINSLPENSELAQAFEEVKQIKKNPSNYKSYSSPEEMFKDVLGEDYEG >NZ_AP019845.1|WP_146998724.1|1537895_1539878_-|hypothetical-protein MSINKEDKVLYIIGNGFDLNLGLKTSYNNFFEYTGILTMRKVVEELKKNRNIENYDEVKLSEFIENLKKHILIDENDVYLLELKKNIKMQDTEKIRDSMYSFQRKIFITLKSEKTDNFIDDYGLFIIFLILMETEKDNEWQWVEEKILSYIEELIELLSNNFEETAMYIKNNLIEVEKKIENFINTIVKEKDVKKAKKIFLKNGDKKIYENLLKLFEKKIEKYFKNSQEKSEELKKDIKNIIYKIEYINFILQILFTDFEKKIVFELLNLKIVNINNGEKIDLKEQLHVFENEFGNYVKKINEIAKKIIETDFKYKEIENINDFIEIQKFSLKKMEKIFSNTKESKYVINFNYTDYLDKIAKKVNIIEIKYIHGDVKYTNNTILVNKDNNRSLRFQKTRDKMIVNNIRETLKYLRKFNNIINITKKIQKEIEMTLFLNVFRDKSKILKKLNLEIEINCNNLKKYIKKLYELGQYGLMMEVENSYILKMLNEEIKEKIKQILDYNNTRNITKFNMESILLECKESFEKNIESCTKKINDESVKKNSNIIFGIDKTQIKNFKNELKDFIKSNRRKNMELEWKQLLNEHKFTKIYFYGHSLADADYTFFEDLFNMIDITTNSTTKLIFLYSKGYSYEKNVKKLIGTYYFEKFKSEGKLELIEI >NZ_AP019845.1|WP_146998725.1|1539916_1540483_-|hypothetical-protein MSKLKVEIGTFEFQYNEILTDVIFDTRSSESWEIIFMKVGIGKTLTIPIKLGYKFTIDTSKKYKEFISFFNIKNGKGKFSIKSFKGYFNENIPDEYKLSDNAREKIIKYNRIDTGSEGIYPISLKNWELIHAKNNKLPKDKFHRRPENLAKTKQLYPDLYEAIKDKDISVKYSTEIGGQTEQIKKLNF >NZ_AP019845.1|WP_146998726.1|1540633_1542733_-|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha MVDKRAKKWIYLNNEIMVKKGEDFQLEKDKEAVYSYFVDYVNKNTVFFHNLEEKMRYLIKNDYYIDFYEMYSHDEIKEVFKLVYDKKFRFASFMSASKFYQSYALMDDTGEKFLERYEDRIATVSLYLAQGNAEKAKEYALMLINQEYQPATPTFLNSGKKRSGELVSCFLDEMGDNLSGIGYIFDSSMKLSSIGGGVSINLSKIRARGEAIKGVEGRASGVLPIMKILEDIFSYANQLGQRAGAGAVYLNVFHSDINEFLDSKKINVDEKIRIKSLSIGVIVPDKFMQLAMEDEVCYTFNPHTVFLEYGQYLDEMDMNEMYEKLVDNPNVKKKKINARELLVKISQTQKESGYPYLFFKDNANKEHALKEIGTVKFSNLCTEIMQLSEVSDINAYYEEDTIRRGISCNLGSLNIATVMENKRIKEATKAAIDSLTMVSDLTNIDIVPSIKKANDELHSVGLGAMNLHGYLAKNFIMYESKEALDFCNVFFMMVNFYSLERSMEIAKEKGETFKDFEKSEYANGNYFDKYITKEYMPQTEKIKQLFEGIHIPTKEDWANLKEQVMKYGVYNAYRMAIAPNQSTSYIMNSTASVMPVVDTIEVREYGDSTTFYPMPYLTNDNYFFYKSAYDMDQKNILKLISVIQRHVDQGISTILYTKSTDSTRDLARLYIYAHRLGLKSLYYTRTRKATIEECISCSV >NZ_AP019845.1|WP_146998727.1|1543370_1543742_-|class-Ib-ribonucleoside-diphosphate-reductase-assembly-flavoprotein-NrdI MYIYYDSKTGNVERFIKRMQVQRPDWHFIKIEPTMTIENEGHFLTFTTKIGEIPATTDEFLKNENNSKLLKSVSSSGNRNWGQFFALAADKIQEKYEIPVLMKFELSGTSTEVENYIDYLENN >NZ_AP019845.1|WP_026749268.1|1543918_1544158_-|thiol-reductase-thioredoxin MKKIIKFEKNDCNPCAMVSDLLDKKGVEYERINPFDNPEIAVKYKVRSVPTVILFEENEEIKRTIGFKPEEINEIISMM >NZ_AP019845.1|WP_146999404.1|1544524_1548034_+|methionine-synthase MLTNQYKNSYNLLQNDLKNRILLLDGAMGTMIQQENLTADDFGGEKYEGCNDYLVLQKPEIIKNIHKRYLEAGSDIIETNSFGALDIVLKDYDLEDKVFEMNKAAAELANEAIAEYKNEHPEVTRNLYVAGALGPSNKSISVTGGVTFEELIHTYYTAVSGLMAGGVDLILFETIQDTRNLKAAYLGLKKAMEENYTVPLMLSFTIESTGTTLAGQTADAFYYAVNHMNPFSVGLNCATGPEFMTQFLKTLNNISNTYISVYPNAGLPNEDGEYEETPDTLSAKVEPFFQNNYLNIVGGCCGTTPEHIQKIKEKSVNYSPRVIDKNKNFNDVSGLIALETPKDRPIYVGERTNVIGSRIFKNLIASEKFDEATEVARLQIKGRADVIDICLANPDRDEIADMKAFLDKVAKFAKVPLMIDSTDINVVKEGLTYLQGKGIINSINLEDGEKKFTDMAKVIKDFGASVVVGLIDEEGMAVSVERKLEIARRSYELLTKKYRIDERDIIFDTLVFPVATGDQKYIGSATATIEAIRQIKAEMPNVKTILGVSNISFGLPIAGREVLNTYYMQKAYEAGLDYAIVNTEKVIPMSEISDEEKKLSENILFHTDDENVSKFANFYREKKAVQKVVDTSNLTTEEKVSNLVVEGSKKDLTMHLDELLKKYSPIDIINGPLMTGMDEVGRLFNNNDLIVAEVLQSAEVMKASVSHLEQFMEKDESSVKGKVIMATVKGDVHDIGKNLVGIIIGNNGYEVIDLGINTPAEKIREAIIEHKADFLGLSGLLVKSATEMVNTMEVLHEAGIDIPIFVGGAALTEKFTVNKIEPAYKNNIVIYSRDAMTALADLNKMINEKKFEEFKEYLQKRRDLVTIKDAKKLEQLKVKPTVSDIKDADGTFDFSKVELPKYNFEKIYKPETLNKQIITNIKAKDVFPFVNLQMLIGKHLGMKWIVNNLIEKQDPRTIKLYNEILDIIENGDEYFDIKAIYKFFPVRRKVGERKDDFKIEVLSDDLSTVLETFDFPRQKYGQYLSLNDYVNPDRIDYIGFFVATAGEKSRLVSNELKEKGEFYRGHIVNSVGLELAEATSEYIHKMMRQDVGIIDKDITLNEILNAQYQGNRYSFGYPACPDLSDQRKLFNLLKPERYGISLTEEFMMYPEATVSAIVFSQPFCKYFNM >NZ_AP019845.1|WP_026749270.1|1548086_1548626_+|hypothetical-protein MYQIIKMILLSSVFIDYIDIQKLDKSGFTTHIIEIMLVLSLINSIVNLYDEKKFLIIEFLIIILFHLAGNKIILENFSFFWQSIKLIGVYILHLLITTDVGMDDNNINPFSKVEWTIVLVTVLIFLLLMLIFKIEINSLSILSLYCITLFELKGIFRNLTEYIETQKKIEKENKDKWQK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP019845_7 | 2425483-2425587 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP019845_7
|
1 spacers
spacers of NZ_AP019845_7
>7.1|2425507|57|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder TTTTTTTCTTCTTGGAACTCTTATAAAGATGTATCTTCTTCTTATTACTCTTCTTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP019845_7
The CRISPR arrays of NZ_AP019845_7 >merge|NZ_AP019845|7|2425483-2425587|CRISPRCasFinder TGGTTCTCTTTTCACATATACAACTTTTTTTCTTCTTGGAACTCTTATAAAGATGTATCTTCTTCTTATTACTCTTCTTTTTGGTTCTCTTTTTACATATACAAC >NZ_AP019845|7|6|2425483-2425587|CRISPRCasFinder TGGTTCTCTTTTCACATATACAAC TTTTTTTCTTCTTGGAACTCTTATAAAGATGTATCTTCTTCTTATTACTCTTCTTTT TGGTTCTCTTTTTACATATACAAC
>NZ_AP019845.1|WP_146999233.1|2424374_2425034_-|ABC-transporter-permease-subunit MDFNFIIENIPKYLEAMKLTVLIGIFGIVFSILIGIVCALVLYYRVPVARQIVEIYIELSRNTPLVIQLFFLYFGLPKIGITFNSHACAVIGLSFLGGSYMCEAFRSGLESITKGQRESGLSIGLTEFQLVTNVILPQAFTVSFPAIGANIIFLLKETSVIGILALMELMYLTRDLIGLYYKTNESLFMLVVAYLIIILPVSIILAVIERRMRYATVGN >NZ_AP019845.1|WP_146999232.1|2423716_2424394_-|ABC-transporter-permease-subunit MQLSGIDVIFKGVNLQRLMGGLAVTGQVALVSIVFSILFGIILGIVMTSKNKIIYGILKFYLESMRIIPLLVWLFIIYFGVAKGFGLHIDSETTTIIVFVIWGTAEMMDIVRGAIISLPKIQGESAKALGLDTSQVYRYVLLPQAVRRIAPAAVNLITRMIKTTSLAIFIEVAEVLKIGRQIIEFSSRKNPMAPFWVYLFIFFLYFIVCYPITMLSKKMEKKWVV >NZ_AP019845.1|WP_172618393.1|2422897_2423659_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MELSDIKKEYKKGVPALKGVSLSVNKSEVVVILGPSGCGKSTLLRCVNGLEEIQSGEIKLQGNVINKDKTKWHLIRQRIGMVFQSYELFDHMTVMQNLLLGPLKVQKRHKKEVTEQAEKLLERVGLLDKKNSYPRELSGGQKQRIAIIRSLCMNPEIMLFDEVTAALDPEMVREVLDVMLELAKEGMTMIIVTHEMEFAKAVADRIVFMDSGEVVETNYPLEFFRNPKTERAKKFLNIFNFEKKDKVESALLI >NZ_AP019845.1|WP_146999230.1|2421991_2422840_-|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MKKNFERFVKIIAILVLGVFAISCGKGEKGSAKPGSIEAIKKAGKIRIGVFGDKPPFGFVDENGKNQGYDVYLAKRLAKDLLGDENKIEFITLEAANRVEYLLSNKVDIILANFTVTDERKQKVDFAKPYMKVSLGIVSPEGAPIKDVKELKGKKLIVNKGTTAEIYFTKNHPDIELLKYDQNTETFNALLDKRGAALAHDNTLVFAWATENPGFVVDIKELGEQDYIAPAVRKGNKELLDWLNAEIDALTKEGFFEKAYKATLEPVYGNKVDPKTVIIEKK >NZ_AP019845.1|WP_146999229.1|2421689_2421908_+|hypothetical-protein MRLDKIIAEQEIINQRIDMLQEIINVSNEKLMNYQTKESQNMYGILNQLLLKDVLENYDGTLQELIKKHNSK >NZ_AP019845.1|WP_146999228.1|2420829_2421612_+|hypothetical-protein MGFWDLIENAIEGAADFVRNTGIIDKIVEIGEGIADWFKDVFNIGDAPSYDKDTATIDETKKVNEILQTYIEKCLNISEKYDNISKGEINKYFSQIKNSLTDINKISENNTENSDKVIEDYIFDSLELNRNTTLKSLDKIYSNEIKDAYSLSNFELLDILKMEQGREKKKKMNAFSVKTLTEANEFLFDELKNSINQQQNLVDKKLRDYMYSREEETRRSIEKINEILDSVKTGEKEKQELKNSYVELLDEVKLFDEIFA >NZ_AP019845.1|WP_146999227.1|2419299_2420829_+|dynamin-family-protein MLNLEQYIRNNNEELINIHWNETINEYVKKLNASKVLFKNLSEKEYFKSTDTLKGNTFFKEINTEISRYISDSKNPSYQIAIVGAVKAGKSTLINALIGYDLASTNVTPETATLTKIKTTDKNSITVKFYSREEWKKIWNDAQKSTNATIFKEEFDNLRAKEIESEMLGKSDIFKEFDNLDSMKDEIKKWTSSHAREHYFVKEIEIGVEKLNLPPQVCLVDTPGLNDPVQYRSNITSEYIHSANAVIICVNAKTLRNEEIATILDVLTKAQDKKDKVYILGTQIDIMNSQADWEQQQEEWLKHLKEKQFYGSLDMAKEQLIGVSSYFYSNAIKLSSDTDIDSLEDSIDDLVKKEKMTKQDRRELLRKDNITPEDIEQIKNMLIDYSNIEIVNDNIQNKLILGFNESLKNDFLNRYNYLKNKIETFKKEHIEKIQGNINSFEQSENELKQQILQNERQKEELETLNRRLRLKIRETTQAFNTDFEELNSNFRNLMREIKKVKFEEESEDR >NZ_AP019845.1|WP_146999226.1|2417786_2418605_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MNYKLIATDMDGTLLDEEHGITSENVEAIVKVQKEKGVKFVLASGRPSYAMFEYAKELQMDKYEGYVLAFNGGELIDMKTNEVIFHEGLGKKDIENVYKVSKEINVPMILYVGDTIYGTEATDGVMYETNQCKMKFQKFDSLEDLEKKGIEKTTKCMIIGTPEEVLMAEEHMNKVHGNDYFIAISKPIFLEIANKNVDKGKTLKKLGEIENIKPEEMIAVGDSANDKPLLEYVGMPVAVENAIPEIKSISKFISTSNVEHGLKTTIEEFFEF >NZ_AP019845.1|WP_146999225.1|2416846_2417707_-|GyrI-like-domain-containing-protein MIKAFNETMKYIEETLTDRIDVRKIALLSGYSYPLFSRMFSIMVDYPLSEYVRFRKLSCAAIDLRESDEKIIEIAFKYGYESQDSFSLAFKKFHGYTPKEVRKGSAFQIFSPIRLSLSIEGGKNMDIKVMKKSAFKIAGLVERIEEGGDFPNVWDKLFKKVSPEKLENLGNRQSYGACYEIEKNENCESKFTVNYMAGYDIQNVTEANDLGLNILEVPEAEYAIVKLKGIVPNCIHEGWKYVTGTFFPEQGYRHAETPDFEVYSEGDMYSPDYEMELWVPIVKDKN >NZ_AP019845.1|WP_146999224.1|2415493_2416447_+|ATPase MKLQEITEKFKNEINQDKISASYLFYGDKRVDLLSYALMFSKMIMTKDVQNDSEKEKIERLIDNFQHPDIEIINKNNENIKIDEVREIIYSSIESSFNSPKKIFILCGIENLRKESSNALLKILEEPPQNVYFILLSRTLNIISTIKSRTIKFHLSGMNNDELGVSKETYYFFDGNENDILEFKRQNLSLDDIKFKINTVEDILQIIFEMKNYATGELAIKNNLDLMIKYNKSIELLARRIRFWDIENVYFFINEIENKLKKEKEFLISFLSKFIINVKHSVEAEDLKKLINLKNSIRSNVNVKSVIFNFFDILQSS >NZ_AP019845.1|WP_146999235.1|2425985_2427776_+|NAD-nucleotidase MKKLLLLGLTLALFFTVNLEAKTNRKVNKQDSSGSFELNVAHINDHHSHLEEEKMPLKLNGKTVTVHIGGLPRVAQEIKNFRQNNKNTLVLHAGDAVTGTLYYTLFEGKADAELMNAINFDVYTLGNHEFDDGNKFLKAFLDVLKIPVVSANVVPDKGSILEGKWKPYIIKNIGGQKVGIIGLDVVKKTKESSSPGDDIKFFDEIETARKYVNELQSKGINKIILLSHAGYEKNVEIGQKVDGVDLIITGDTHYLLGKEFEQFGLVPEADSYPKKVNSPNGNPVYIAEAWNYSYLLGQMKAKFDKNGVITELTPTPKVLISDDFFEIKNAEGKAVQLNQKEKNEILNSIKNNKNIAAIKNDPALAKLLERYQKEKTELGKRTVGKITEEIPGGSDNRVPNEHNKDGSFATTLVAESVLHKLRNTGTGNVDFVIGNAGNVRITLNPGVFTYDLAYSLLPFTSNTVFITDITGAEVKQTLEDAIDYVLNGGSTGAFPYGAGIRYEATKEGKLGTRVKKIEVFDFKANKWVPIDAKKSYMLAVNSYIAKGKDGYTTLGKITAQKRGTDTHLSDTKIFIDYLKEKKEIGKPKSTNVIFKY >NZ_AP019845.1|WP_036095824.1|2428227_2428596_+|nucleotide-pyrophosphohydrolase MTLKEVQYLIKRIEKGTLDETKDDKSPQQKRENGQRLILKLIEEFGELAENIRKNVRYDGKNIKGTIEEEVFDVFYYIIAIANDYEIDLEKIFYIKDEVNEVKYDREFSIYEARNKWKSMKK >NZ_AP019845.1|WP_146999236.1|2428713_2430369_+|5'-nucleotidase-C-terminal-domain-containing-protein MTAKNTNTSFKKKEVSIKILGTSDVHGRVLAWNYAADEEDKSGSYAQISTLVKKIRKKNKNVILVEVGDAIQDNWIEKFAMTPKHPIPEILNYMGYDIFVPGNHEFNFGMPTLSNILRDMKFKKLTANLYYNENAENDTNFSKDKSRYLDATTIIEKDGVKIGIIGLSTPMSAQFEEDTGYLNDFYFVSPVKETQRQIKKLKEEGANAIVVVAHMGIENENGIPETGVKDLANAVPEIDVIVAGHMHQNIQKEIINGVLITEPHRYGTVISEVDLKFEVIGENIKLISKDSTTIPVKNEKPDKKIEEIYKPFHRRLCTIANEEIGETLNDMIPKEKHHGVSAAFGKDTGMSSFITDVELYYSGADVVSFAYNYENVKLDKGKIRRKDIVYNYRYTGGDVTIYEMTGKQLKDYMEWAADYFDTIQAGDTEYRYNPERANGKYVTFDIFGGVKYKIDLRNEKGNKITNLMLVNGIKITPNMKLKVGMNAYRFEQLARKGGIFDGQEIPVLWASKEAIGNIKGTIQNMMIDYIRNVKNGVIEGKSHNNWEIIGL >NZ_AP019845.1|WP_051354473.1|2430579_2431305_+|hypothetical-protein MSFGNDETVIGEKLNKLLAILKKDERNYIVSEDIITIYESKIGKDYEKYLDLFTKYTPYDYEKLFAKMVYYRGTGKKDKSDNYYKEIERKYSNTPIMEIIKIYNTANENDRQVQTKKVLNLLKSEEVKRQVGMTDEEVHSMNLTYTLAQVRKYYNNGEIEKSVSEYINNVANASVSNEVRDYNRRKETLLLLNALMVNEEITNKKLREQNKQKLENTYISKEIKKATVKDANYLDKYLNEM >NZ_AP019845.1|WP_146997579.1|2431531_2432842_+|phosphopyruvate-hydratase MTRIEDIYAREILDSRGNPTVEVEVYLEGGAMGRASVPSGASTGVHEAVELRDGDKSRYLGQGVLQAVENVNKVIAEHLIGFDALDQVAIDKAMIELDGTPNKGKLGANAILGVSLAVAKAAANQLGIPLYRYLGGVNAKELPVPMMNILNGGSHADSAVDVQEFMVQPVGAKTYKEALRMGSEIFHHLGKILKANGDSTNVGNEGGYAPSNINGTEGALDVISQAVEAAGYKLGDDITFAMDAASSEFATKNADGSYTYTFKREGGVVRNSDEMVEWYKHLTSKYPIVSIEDGLAEDDWDGFKKLTDAIGKDVQLVGDDLFVTNTQRLADGIEKGIANSILIKVNQIGTLTETLDAIEMAKKAGYTAVVSHRSGETEDDTIADIAVATNAGQIKTGSASRTDRMAKYNQLLRIEDDLAEEAVYEGKKAFYNINIK >NZ_AP019845.1|WP_026749440.1|2433005_2433413_+|adhesion-protein-FadA MKKVGILFVLLSALSFSAASSKSSKTTTNQTVTGRFNQLEAEYERLVNMENQEYSKLKANAEAASNKLAEKEAQKAQIEERIAKIEAAADSKAFKAQYSELAKQYKAVVKALDSEIKSLSTTVENFAAIEALKGN >NZ_AP019845.1|WP_026749441.1|2433493_2433907_+|adhesion-protein-FadA MKKKLAVLLGVLVLSSVSFAAPKAKAAAKPAAGGSIESSLSNLENQLVKLQQMEDAKFREQEAQANAAAQRLSNYTAMQAKIDERIAEIEANVDTSIFGKEFKAKVTEYKNLRNQLDKEIAKEQQVLDNFELIKSLR >NZ_AP019845.1|WP_026749442.1|2434235_2435126_+|EamA-family-transporter MQTQKKLHGMLLASLASSLWAISGISGEILFKKFNFSSDWLVSTRTLISGILLFAIVIFIEKKSVLKPLKNKKDCLGIILFGTAGMYLVQYTYFKTIELSNVSFATILQFTAPFFIFVYESAKNRKLPSVSTIILLFMTILGVVFIATKGNFSNLSVSMEALVFGLVSAIMIAFYSTYPKKLLKKYGSITVVGWGMIVGSIISNIIHPIWKIEGNVNAKSIIQVIIVVILGTSIAYLIYIASLNYISSSLAGILTAFEPVLAAILSVIIFGLKFSSVEIVGFVLVFVSIFILEKRL >NZ_AP019845.1|WP_146999237.1|2435225_2436014_+|META-domain-containing-protein MKKIFVLIGIFAMFVVNCFILSAAQTVNLNGTSWQLSRIRQNGVNLEIPRNTKITVSFSGNKISGFSGINRYNGTYRVRNNSTLSTDISTTLMGGSEELMNFEMAFLDILQSSPKINYNKETLTLRNSNGDTLSFNKSSNSNNQSDENSLSRLTKELSGTDWKLVNMNGKEVRNAGITISFSGNKINGNSGINSYFSDYIITAGNITIGTVGSTEMAGSDSLMKTERQYLELLQNAKKIELVNKTTLVLTTNRGKTLTFEKL >NZ_AP019845.1|WP_026749444.1|2436213_2436861_+|C40-family-peptidase MRKNKFLTAICMLSAFVGSNLHAKTSKTKKVSKPKTSHKPVNNKKSHSGSNTGIYGISSNNKNALIETKMTELRQRHAKAMASGSAQERRKAAVERKLLTSYSKWRGTKYAWGGDSKKGIDCSALTRRVYREAFNKELPRVSQQQIKKGTRVSAKNLKSGDIVYFTPENRTSHTAVYVGNSLFINASSSKGVVMSSLKSPYWRKYFKYGVRAHNT |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP019845_8 | 2502765-2503100 | Orphan |
I-B
Consensus repeat of NZ_AP019845_8
|
4 spacers
spacers of NZ_AP019845_8
>8.1|2502803|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder AAAGTTCAACGTAAAAAATAAAACACAGTATATTAT >8.2|2502877|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,PILER-CR ATATATTAATCATAGTATTACCTCTTCTAGGAGATT >8.3|2502951|37|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,PILER-CR TTGGCAAGTTTGCTTTTATCATTCCTGTGATAACATC >8.4|2503026|37|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,PILER-CR GTGAATTAGGTTCTGACAAAAGTGATTTTAATATAAA >8.5|2502802|37|NZ_AP019845|CRT AAAAGTTCAACGTAAAAAATAAAACACAGTATATTAT >8.6|2502876|37|NZ_AP019845|CRT AATATATTAATCATAGTATTACCTCTTCTAGGAGATT >8.7|2502950|38|NZ_AP019845|CRT CTTGGCAAGTTTGCTTTTATCATTCCTGTGATAACATC >8.8|2503025|38|NZ_AP019845|CRT CGTGAATTAGGTTCTGACAAAAGTGATTTTAATATAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP019845_8
The CRISPR arrays of NZ_AP019845_8 >merge|NZ_AP019845|8|2502765-2503100|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATTTAATCCTTATTTTAATGGATACTCTATTTTAACAAAAGTTCAACGTAAAAAATAAAACACAGTATATTATGTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATACTCTATTTTAACAATATATTAATCATAGTATTACCTCTTCTAGGAGATTGTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATACTCTATTTTAACCTTGGCAAGTTTGCTTTTATCATTCCTGTGATAACATCGTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATACTCTATTTTAACCGTGAATTAGGTTCTGACAAAAGTGATTTTAATATAAAGTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATACTCTATTTTAACC >NZ_AP019845|8|7|2502765-2503100|CRISPRCasFinder AATTTAATCCTTATTTTAATGGATACTCTATTTTAACA AAAGTTCAACGTAAAAAATAAAACACAGTATATTAT GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATACTCTATTTTAACA ATATATTAATCATAGTATTACCTCTTCTAGGAGATT GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATACTCTATTTTAACC TTGGCAAGTTTGCTTTTATCATTCCTGTGATAACATC GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATACTCTATTTTAACC GTGAATTAGGTTCTGACAAAAGTGATTTTAATATAAA GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATACTCTATTTTAACC >NZ_AP019845|8|5|2502765-2503099|CRT AATTTAATCCTTATTTTAATGGATACTCTATTTTAAC AAAAGTTCAACGTAAAAAATAAAACACAGTATATTAT GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATACTCTATTTTAAC AATATATTAATCATAGTATTACCTCTTCTAGGAGATT GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATACTCTATTTTAAC CTTGGCAAGTTTGCTTTTATCATTCCTGTGATAACATC GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATACTCTATTTTAAC CGTGAATTAGGTTCTGACAAAAGTGATTTTAATATAAA GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATACTCTATTTTAAC >NZ_AP019845|8|6|2502839-2503100|PILER-CR GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATACTCTATTTTAACA ATATATTAATCATAGTATTACCTCTTCTAGGAGATT GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATACTCTATTTTAACC TTGGCAAGTTTGCTTTTATCATTCCTGTGATAACATC GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATACTCTATTTTAACC GTGAATTAGGTTCTGACAAAAGTGATTTTAATATAAA GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATACTCTATTTTAACC
>NZ_AP019845.1|WP_146999273.1|2501802_2502567_-|site-2-protease-family-protein MKIVKNYYNRFKVLNPEYSEIKLGIIVAIIIYFIAKIFFAVEISRDMIISLVVFVISMTLHEVAHGYVAYKFGDDTAKREGRITLNPLKHIDLTGIILPILILLSGFKFLVGWAKPVPVNFYNLRPHRLGLFCVAIAGIVVNFTLSAISLVLLKFLGKHLEIENIFMTILLYIYSINLLLGLFNLIPITPLDGGRIVYSFSGEKIRAFYNKIERYGILIIFVIVYLGSSHLTNGFFAIVEFFLRLAGINISLIF >NZ_AP019845.1|WP_146997616.1|2500803_2501685_-|hypothetical-protein MKKLFLILGIFLMMNFGVYGFSQKEKIQETLSKLGVKQALIDETVALDYEIRDTQYFENDEKIIRERVEKLEKLLQKDERNYIVAQALITIFESKISGDYKKYLDLFVKYTPYEYEKTFSKMMYALDKGDMPSFEKYMDEIPKKYNDTVVVTLAKIFVAKDFEEKQMLTEKVLKLLKNESERRKVGVSDEEYYFMKLTYYLNKIRNLFDKGEVKQAVSEYLNNIVNESVSEEIQNYNLRAEVILYFNVVIMNEEIKEDLLKISNGAKLEDTWIAKKIQAETEKDKDFLSKMVN >NZ_AP019845.1|WP_146999272.1|2499667_2500786_-|hypothetical-protein MKKIFISLSLPFFLTLGCELSAYTRAELIQDRLSKIGIKQDVIDETIKFEYEIKDEKNFFTEDGQENDNLLKLKKIYEKDERNETLGAVLVGAYMVGEKKNFRKAREYMDKIAPYSTQFDKLSNEFTYYKLKGDEKKAKFYYNLIKRRYKNSIVMELVDTLSENLDMVMFIETLGDYLVEDEKKPNTEANDLPDGFSYDNKKGIIQNKDAADDSDKDAENVLEDTRTYGESVKEILDSGKETLENQKKEINKYQRIIDYFKIGKNQKDFGIPDDYVRGFELKIAEIKIAKNMMNYGIENAVKYYLDNVSTKDVSYEDVYFNEQSELALYLAVAQMLSVADENVMNKYRKEFENTRVIKLLDEILKNERKNNY >NZ_AP019845.1|WP_146999271.1|2498851_2499442_-|YigZ-family-protein MKTVQKETIIEFEEKKSKFIGYIKPVSTVNEAEKFIDSIKKMHSNATHNVPLYRVMENGQEYFKYNDDGEPSNTAGKPMAEILNILDVYNVAIVATRYFGGIKLGAGGLIRNYAKTAKLAVNEAEIVEYVEKSIFILDYDYEYTSEIETFLNANTLKFGIEILEKNYSNRVTMKISASDEIEHELNGLQKIIVIKM >NZ_AP019845.1|WP_026748112.1|2497842_2498202_-|YbaB/EbfC-family-nucleoid-associated-protein MVRKIKGAGSKSGGNQQDIIKKAQVMQQEMLKIQEGLKDKFVETSVAGGGITVKANGQKKIVDLSISLDVLKDAIEENDATIVSDLIVNAVNEILDKAEEMAEKEMEVVTGGVSIPGLF >NZ_AP019845.1|WP_051354388.1|2497505_2497793_-|TM2-domain-containing-protein MSETNLPENIENEKPKYNKVIYCLLAWFFGAFGIHSFYAGRKQEGIYFLIAGIIGVLTYILLVGMVILFVEFVICVIQIIKAVQKPADEFGRISD >NZ_AP019845.1|WP_146999270.1|2496132_2497302_-|MFS-transporter MKKNIDKMIILMFLCIIVYNLGHPATPALIELRGWKKSISGELLAFMSTAMFISSPYLGALADRVGMKRIFMFMPVCYGMSQLIFGFGTNLPLIFLARMISGFASGGTYAVAFGYVSQLSEKGEKAKNIAKVSSATVIGGAIGQKIGGFAATAMDDPRFSFALQFVGGSIVSIIILLIMKEIVKKDSNLVEEKSKKDLNPFATFRYIKELDGYSKFFCLIILLSGIGIYSYGSALNYFLKFYEKVSSDTIGTFVMCSSLLAFFGTAFLLGKLLKKFKEKSIYKFLIFVGIILMAGIFFRVKLGVTPYILMAVYTMTYEIVRSLGNTIIAQRYRENQGKILGVASAVGSLGTAIGSLLSGHLLNFNPFLPFIVNIIVMSFVLVLILVKKL >NZ_AP019845.1|WP_146997612.1|2494265_2495984_-|phospho-sugar-mutase MEYMKKYEYWLNSEAVDEKDKEELRSLSGNEKEIEDRFFKDLSFGTGGIRGVRGIGTNRINKYVIRKATQGLANYMLGFDEKLAKEKGIIIAHDCRIGSREYALNTARVMAANGIKAYIYEDLRSTPELSFGVRYKGTMAGIVVTASHNPVEYNGYKVYWDDGAQVVDPHAPAIVAEVNKIQTLEEIKVISEAEGREKGLIIQLDGKIDDDYLDAIKTQTLKTNVPGKENFKIVYTPLHGTGGRPMKRILSDFGYSYEVVKEQIEPDGNFPTVTYANPEEKAAFALGTKQADEIGAKLVMANDPDADRIGIAVKDDKNEWYYPNGNQVGLLLLQYLLNNKKDIPANAKVITTVVSTPMIDVVAPSKNVGVMKTLTGFKYIGEKIRQFENKELDGTYLFGFEESYGYLIGTHARDKDALVTSMVIAEMATYYDSIGSSIYEELQKLYKEFGYYLEGIKSVTLKGKDGIEQMAALMANLRENVKDELLGKKIKIKRDFFSHKEYNLETGAETEIKLPKENVLQFVLEDDTYITARPSGTEPKIKFYFSVNADSNENVKAKLDKTMKEFSEFLGL >NZ_AP019845.1|WP_146999269.1|2492594_2494100_-|radical-SAM-family-heme-chaperone-HemW MIEIKEKNIDAIYIHIPFCDKKCEYCDFCTFVRMEKEYRRYVNYLIREIRMYPKFKYDTIYFGGGTPSVLPVGMIKEVMDELEWTGNAEITLELNPTDMTLEKLRKIRETGINRLSIGIQSFQNHVLKFIGRQHSSEEAINVYKMARKAGFENITVDLMFGIPNQSIEDLQKDLEILKKLRPENVSIYSLIWEEGTVFWSKLQKGILSEIDQDVEAQMYEMIIEFFNENGYCHYEISNFCRINGNFEGNRNINKNYNLEKKIDFQNFSEIKNDEVYNFGLQNRIYENDISENVNFAKIRTENRILENNNLKNQKLENKLLENVENFEIIKGRQKNGGRHNLKYWRNKKFIGVGMSAAAYYGENRHSNVRTFKKYYNLIDSANLPIDESTIEVVDEIESEKLKKMLGLRLIQEGIEYFEDKRVEKLIKNGLLEKFVVKKMDFSEKKVEKIEKFIITKEKEIKNKVKNNEYFNEKVDGNPYEIRLRLTKKGMMLANDVFVEFI >NZ_AP019845.1|WP_146999268.1|2491839_2492523_-|YggS-family-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MELDSIKIHKNYGKILEDIKKYSPYPEKVKILFVSKYFNVEEHKALIEMGYDYFGENRAQLYRDKLNEFSDKKYKNIKWDFIGRLQKNKIKYIINSVNLIHSIDSYELLDEINKKAIENNRVINGLVQINVSKEESKTGVYIEDFKKDSGKYFSISNVKIAGFMTMAPLEASEDEINDYFSNMRKLKEEYQKQYDYVTEISMGMSNDYIEALKNGATIIRIGSKLFE >NZ_AP019845.1|WP_146999274.1|2503404_2503716_-|hypothetical-protein MNFDDLKKGAEDALKKTVDGAKDLADKAVDKTKEIAGSEVAQNIKKGTEDVLGKTVEGAKDLADKAANNKIVQDVKKGAEEAVDKTVEGAKGLADKVTGMFKK >NZ_AP019845.1|WP_146999275.1|2503764_2505594_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) MCGIVGYIGAKNAQEFVIDGLEKLEYRGYDSAGIAVNTGNEKFEIVKKVGRLQNLADELKKHPLSGTVAIGHTRWATHGKPSDENSHPHFNKDKTLVVVHNGIIENYLELKKDLVTKGYEFKSETDTEVVAHLLDELYTGDLLETVKKLLKVIKGAYALGIMSVNEPDRIIAARKESPLIVGLGDGENFIASDIPAILKYTRDVYLIENNEIVEIKKDSVKIMDVDGNEIKRDVTHIEWDLEAASKGGYEYFMEKEIFEQPEVLVKTLNSRVDENYNINFDDAGLTKEYLSGINDIYIVACGTAYHAGLAGKHIIEKKTRIRVDVDIASEFRYRNPVINDKALVVVLSQSGETLDTLEAMKEAKRHGARVVAITNVVGSSIAREADHVIYTWAGPEIAVASTKAYTTQMVILNLMAIDFAYKFGKITKDEAIKYIKKLYEVEQSIQKMLEYNEKIKDVADKIKDSESMFYLGRGLDYVIAVEGALKSKEISYIHSEAFASGELKHGTIALITDGVPVVVNVTQSDLFEKSVSNIKEVTSRGAYVIAIAKEGNTVVEEVADEVFYIPDVEDDYAGFPTIVIHQLLAYYLSKLKGNDVDKPRNLAKSVTVE >NZ_AP019845.1|WP_146999276.1|2506348_2507881_-|UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate--2,-6-diaminopimelate-ligase MYKMFKDVEYKVLKDGKNFEIKGIEYDSRKISKDFVFVAMSGSAVDGHSFIQKAIDGGAKMIIVERNVDMAEYKNAADITFVLVEDIRKKLGTIASNYYGYPQDKIKIIGITGTNGKTTSSFILENILEKTARIGTTGNRILDEEFETVNTTPESLELIKLIDKSVKKGADYFIMEVSSHALEIGRVDMLQFDSAIFTNLTQDHLDFHKTMENYFNAKKKLFSMLRNDKKNNGTGVINIDDEYGSKIYSEKKSSNYISIGVRNEEADIWGDIVNYTNNGMKVKIDLKNYLEKTNPRLKDINEEHKEEYKFEVDLVGEYNLYNILGCVASALSLGIEMSYIVKKLERMPAVPGRFETIKNDLEVRIVVDFAHTDDGLLNVGKTLKQITDNQVITIFGAGGDRDHEKRPKMAKAAAKFSDYIILTSDNPRTENPVKILADIEKGLIEEKYPFDKYLIIADRKRAIKHGMKLLQKGDSLLIAGKGHETYQIIGTEKTHFDDREVVRDILEEME >NZ_AP019845.1|WP_146997621.1|2508405_2508693_+|antibiotic-biosynthesis-monooxygenase MIHILASFQVKNDKLSDFIKLCNELIEESRKEEGCISYHLQQNTEKENQFVFVEEWKSNEAIKKHNSSEHFTRIVPLLVEMCENAPVIQTFNRII >NZ_AP019845.1|WP_146997622.1|2508918_2509812_+|peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase MKNKIKIGVLTLLCIFAMSCGNGGQNGKVLFESSDKKIKVYESEVNNELEKGLFSNGLTEKDLTPEQITQMKQSIIKNIAINRAIALKGKEQKLNKDKKYTESQNILQEQLLANLAIFNELNDKAKISDQDAKNIYDANAANFTRQEDSVRLQLIVFNTSDSAKANQVLKEAVANPANFTAYAQKYNASIQGVAENGETQEIPLSQLESRFGPLNEAIKNVAAGQIVNSVVTVGNDLYIVKVLEKNAKGLIPFEKVKEAIKTQLRNQKRQAEQQKFIKSITDEYKLSNIDEAIKNIK >NZ_AP019845.1|WP_146999277.1|2510052_2511555_+|hypothetical-protein MKILKYLLSLVLIVLIMLLFGVMFSSNIVSYMTKTKHSEFENVKFSIKNSEMNFDNFVVNGKSLGKGRATVGVVRTGLFNLVPKLTLSNLKLEDVNLDGIYKEKSSYIDTFTDKINSLTTQEKADKSTADFIKETTNKVTTLTTNTDNFINSKLRENIEKVNVLKQDYVGLTDLKSKAQKIVELNNEIKPLAKAINVEKENIEKNISEIEMERNIALTNISDNLTKLEKEISLNDFNNINSNNNAQNMNLYIFLDKGKDLETSLNTALKATALIKEIKDLNMRISDINVNDGKIVARGLDGSNAQVNGEVLLENNAKSLIKGLNNGYEITYNKDNFTSKTLFAANKISSVIEYAKNDLLEGKVIKLASELVLENNNFKNLNHTVLTDEEKTLLTQKIENLRNNNYQQIMTKYEEDNKNIEALIDNVYVQKNKLDKLQKDLLSLGTIIKFEQPTNNAAAENNNQTNNSTINILNNSNNNTDNNIKNQNENQNSNKINIGNR >NZ_AP019845.1|WP_146999278.1|2511680_2512433_+|phosphonate-ABC-transporter-ATP-binding-protein MLLSIKNVSKKYDNGTIALKNVSFDVEKGEFISVIGPSGSGKSTLLRSINKMIDISEGSILFEDKNIENLKKGEIELVRREIGMIFQNYNLVERLTVIENVLHGRLGYKSIIAGILGIYSEEEKKEAFNFLEKVNMTKYAYQKCNELSGGQKQRVGIARAIMQKPKLLLCDEPIASLDPKTAENIMDYLKKIVSELKITCIVNLHQVDIAKKYSDRIIALNKGEKIFDDKTGRLTDDMIEFIYKDEEQTQ >NZ_AP019845.1|WP_146999279.1|2512442_2513237_+|ABC-transporter-permease-subunit MNLNEKDIFKRRFYSKIIFLSIIILIYTISSIISGFQNGMAFSSIPAGIFWLLQKFIPTQNALQYFPEIMDSAIKTVLLAITSTTVSATFALFLAIIGSNSTGINIFTKITTKVIASFFRNIPIVAWALILVFSFKQSQFTGFLALFLITFGYLTRAFSETIDDVAGDVIEALKSVGASYFQIIFCGVIPSVSSQLLSWLLFFIETGVRESTLIGILTGTGIGFTFSLYYKSFRYDAAGLVILIVTVIVIGIELLSNKLRKEMM >NZ_AP019845.1|WP_146999280.1|2513257_2514076_+|ABC-transporter-permease-subunit MNFLLEKIRIKKLTKSKIYLYITLSLLSIITIYTLVTMDFGGVNITKATGHFFKDLGTMFFSPKLSERNTFNQILFSLAVTIALAALTTIIGSFIALFLSFFAAQNLSNRYISRTIKLGISFIRAIPTILWVMVFSVVANVGVEAAIIGMTFHSVAYLVKAYSESIEEIDNGIIEALRATGSSFWKIIFQAVLPSTITSLLSWTFIRFEINFTNAVLVGAAAGAGGIGYDMFMSGSMYFDIREIGVFVYLIFGVAIILELISYLLKRKYLKN >NZ_AP019845.1|WP_146997627.1|2514611_2514854_+|hypothetical-protein MKKLISIVIFLITCIFSFGNDWEFESRGEHLIPLQISNMAIKKEKLEFNLRDDNFMEVSVNFVFDSLSLQNLDMTFLKKS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP019845_6 | 6.4|1534057|38|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1534057-1534094 | 38 | NZ_AP019845.1 | 2308749-2308786 | 0 | 1.0 |
NZ_AP019845_6 | 6.4|1534057|38|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1534057-1534094 | 38 | NZ_AP019845.1 | 2327185-2327222 | 0 | 1.0 |
NZ_AP019845_8 | 8.3|2502951|37|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2502951-2502987 | 37 | NZ_AP019845.1 | 184050-184086 | 0 | 1.0 |
NZ_AP019845_8 | 8.7|2502950|38|NZ_AP019845|CRT | 2502950-2502987 | 38 | NZ_AP019845.1 | 184050-184087 | 0 | 1.0 |
1. spacer 6.4|1534057|38|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 2308749-2308786, mismatch: 0, identity: 1.0
attttaagtcctctctcatacccaacagaacttccaaa CRISPR spacer attttaagtcctctctcatacccaacagaacttccaaa Protospacer **************************************
2. spacer 6.4|1534057|38|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 2327185-2327222, mismatch: 0, identity: 1.0
attttaagtcctctctcatacccaacagaacttccaaa CRISPR spacer attttaagtcctctctcatacccaacagaacttccaaa Protospacer **************************************
3. spacer 8.3|2502951|37|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to position: 184050-184086, mismatch: 0, identity: 1.0
ttggcaagtttgcttttatcattcctgtgataacatc CRISPR spacer ttggcaagtttgcttttatcattcctgtgataacatc Protospacer *************************************
4. spacer 8.7|2502950|38|NZ_AP019845|CRT matches to position: 184050-184087, mismatch: 0, identity: 1.0
cttggcaagtttgcttttatcattcctgtgataacatc CRISPR spacer cttggcaagtttgcttttatcattcctgtgataacatc Protospacer **************************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP019845_6 | 6.4|1534057|38|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1534057-1534094 | 38 | NZ_AP019837 | Leptotrichia wadei strain JMUB3934 plasmid pJMUB3934p2, complete sequence | 21122-21159 | 0 | 1.0 |
NZ_AP019845_1 | 1.1|618766|27|NZ_AP019845|PILER-CR | 618766-618792 | 27 | NZ_CP010683 | Phaeobacter piscinae strain P14 plasmid pP14_b, complete sequence | 13192-13218 | 6 | 0.778 |
NZ_AP019845_1 | 1.1|618766|27|NZ_AP019845|PILER-CR | 618766-618792 | 27 | NZ_CP010718 | Phaeobacter piscinae strain P18 plasmid pP18_c, complete sequence | 13192-13218 | 6 | 0.778 |
NZ_AP019845_3 | 3.20|1101279|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT | 1101279-1101314 | 36 | MK448590 | Streptococcus satellite phage Javan634, complete genome | 9466-9501 | 7 | 0.806 |
NZ_AP019845_4 | 4.7|1110811|35|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1110811-1110845 | 35 | MN694674 | Marine virus AFVG_250M850, complete genome | 1157-1191 | 7 | 0.8 |
NZ_AP019845_3 | 3.20|1101279|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT | 1101279-1101314 | 36 | NC_022111 | Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence | 619567-619602 | 8 | 0.778 |
NZ_AP019845_4 | 4.7|1110811|35|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1110811-1110845 | 35 | MG592416 | Vibrio phage 1.032.O._10N.261.54.F5, partial genome | 15237-15271 | 8 | 0.771 |
NZ_AP019845_4 | 4.7|1110811|35|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1110811-1110845 | 35 | MG592492 | Vibrio phage 1.118.A._10N.261.49.F6, partial genome | 12278-12312 | 8 | 0.771 |
NZ_AP019845_4 | 4.7|1110811|35|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1110811-1110845 | 35 | MN693355 | Marine virus AFVG_25M40, complete genome | 5648-5682 | 8 | 0.771 |
NZ_AP019845_4 | 4.7|1110811|35|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1110811-1110845 | 35 | MG592493 | Vibrio phage 1.118.B._10N.261.49.F6, partial genome | 12278-12312 | 8 | 0.771 |
NZ_AP019845_3 | 3.16|1101020|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1101020-1101055 | 36 | AB897757 | Klebsiella phage K64-1 DNA, complete genome | 166138-166173 | 9 | 0.75 |
NZ_AP019845_4 | 4.7|1110811|35|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1110811-1110845 | 35 | MF360958 | Salicola phage SCTP-2, complete genome | 158015-158049 | 9 | 0.743 |
NZ_AP019845_4 | 4.7|1110811|35|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1110811-1110845 | 35 | MN692958 | Marine virus AFVG_117M8, complete genome | 49516-49550 | 9 | 0.743 |
NZ_AP019845_4 | 4.7|1110811|35|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1110811-1110845 | 35 | MN694278 | Marine virus AFVG_250M229, complete genome | 49504-49538 | 9 | 0.743 |
NZ_AP019845_8 | 8.1|2502803|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder | 2502803-2502838 | 36 | MN693989 | Marine virus AFVG_250M851, complete genome | 11207-11242 | 9 | 0.75 |
NZ_AP019845_8 | 8.1|2502803|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder | 2502803-2502838 | 36 | MN694758 | Marine virus AFVG_250M853, complete genome | 22604-22639 | 9 | 0.75 |
NZ_AP019845_8 | 8.1|2502803|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder | 2502803-2502838 | 36 | MN694077 | Marine virus AFVG_250M852, complete genome | 22610-22645 | 9 | 0.75 |
NZ_AP019845_4 | 4.1|1110420|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT | 1110420-1110455 | 36 | CP011076 | Brevibacillus laterosporus strain B9 plasmid unnamed2, complete sequence | 1368260-1368295 | 10 | 0.722 |
NZ_AP019845_4 | 4.7|1110811|35|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1110811-1110845 | 35 | MT121964 | Phage DP SC_6_H4_2017 DNA cytosine methyltransferase and putative helicase genes, complete cds | 48230-48264 | 10 | 0.714 |
NZ_AP019845_8 | 8.5|2502802|37|NZ_AP019845|CRT | 2502802-2502838 | 37 | MN693989 | Marine virus AFVG_250M851, complete genome | 11206-11242 | 10 | 0.73 |
NZ_AP019845_8 | 8.5|2502802|37|NZ_AP019845|CRT | 2502802-2502838 | 37 | MN694758 | Marine virus AFVG_250M853, complete genome | 22604-22640 | 10 | 0.73 |
NZ_AP019845_8 | 8.5|2502802|37|NZ_AP019845|CRT | 2502802-2502838 | 37 | MN694077 | Marine virus AFVG_250M852, complete genome | 22610-22646 | 10 | 0.73 |
1. spacer 6.4|1534057|38|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_AP019837 (Leptotrichia wadei strain JMUB3934 plasmid pJMUB3934p2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attttaagtcctctctcatacccaacagaacttccaaa CRISPR spacer attttaagtcctctctcatacccaacagaacttccaaa Protospacer **************************************
2. spacer 1.1|618766|27|NZ_AP019845|PILER-CR matches to NZ_CP010683 (Phaeobacter piscinae strain P14 plasmid pP14_b, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
tgattcaaggaactcataagacgggat CRISPR spacer ccattcaaggcattcataagacgggtc Protospacer . ******** *.************ .
3. spacer 1.1|618766|27|NZ_AP019845|PILER-CR matches to NZ_CP010718 (Phaeobacter piscinae strain P18 plasmid pP18_c, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
tgattcaaggaactcataagacgggat CRISPR spacer ccattcaaggcattcataagacgggtc Protospacer . ******** *.************ .
4. spacer 3.20|1101279|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448590 (Streptococcus satellite phage Javan634, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
caaataagaagaaaaatatttgaaaaataaaaagta CRISPR spacer catgagaaaagaaaaatatttgaaacataaaaagaa Protospacer ** . .*.***************** ******** *
5. spacer 4.7|1110811|35|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694674 (Marine virus AFVG_250M850, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
tctttaatatattttcttattaattttgaaatact----- CRISPR spacer tctttaatatattttattattaattt-----tatttgtga Protospacer *************** ********** **.*
6. spacer 3.20|1101279|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_022111 (Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
caaataagaagaaaaatatttgaaaaataaaaagta CRISPR spacer aagattcgaagaaaaatatttcagaaataaaaaatg Protospacer *.** ************** *.*********.*.
7. spacer 4.7|1110811|35|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG592416 (Vibrio phage 1.032.O._10N.261.54.F5, partial genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tctttaatatattttcttattaattttgaaatact CRISPR spacer tcttttatatattttcttattattttctatatttc Protospacer ***** **************** ***. * ** ..
8. spacer 4.7|1110811|35|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG592492 (Vibrio phage 1.118.A._10N.261.49.F6, partial genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tctttaatatattttcttattaattttgaaatact CRISPR spacer tcttttatatattttcttattattttctatatttc Protospacer ***** **************** ***. * ** ..
9. spacer 4.7|1110811|35|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693355 (Marine virus AFVG_25M40, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tctttaatatattttcttattaattttgaaatact CRISPR spacer ctttatagttattttcttattattttttaaatact Protospacer ..** * ************* **** *******
10. spacer 4.7|1110811|35|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG592493 (Vibrio phage 1.118.B._10N.261.49.F6, partial genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tctttaatatattttcttattaattttgaaatact CRISPR spacer tcttttatatattttcttattattttctatatttc Protospacer ***** **************** ***. * ** ..
11. spacer 3.16|1101020|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AB897757 (Klebsiella phage K64-1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ggttaaaaa---acaagaaaaaattgattataataaatt CRISPR spacer ---tacatgttcacaagaagaaattgattctaataaatc Protospacer ** * . *******.********* ********.
12. spacer 4.7|1110811|35|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF360958 (Salicola phage SCTP-2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tctttaatatattttcttattaattttgaaatact CRISPR spacer tctttaatatattttattaataattattgttatct Protospacer *************** *** ***** * . **
13. spacer 4.7|1110811|35|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN692958 (Marine virus AFVG_117M8, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tctttaatatattttcttattaatt-------ttgaaatact CRISPR spacer tctttaatattttttcttagtaattcattttcttg------- Protospacer ********** ******** ***** ***
14. spacer 4.7|1110811|35|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694278 (Marine virus AFVG_250M229, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tctttaatatattttcttattaatt-------ttgaaatact CRISPR spacer tctttaatattttttcttagtaattcattttcttg------- Protospacer ********** ******** ***** ***
15. spacer 8.1|2502803|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder matches to MN693989 (Marine virus AFVG_250M851, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aaagttcaacgtaaaaaataaaacacagtatattat CRISPR spacer taggaggaacataaaaaataaaacacaatatatagt Protospacer *.* ***.****************.***** .*
16. spacer 8.1|2502803|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder matches to MN694758 (Marine virus AFVG_250M853, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aaagttcaacgtaaaaaataaaacacagtatattat CRISPR spacer taggaggaacataaaaaataaaacacaatatatagt Protospacer *.* ***.****************.***** .*
17. spacer 8.1|2502803|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder matches to MN694077 (Marine virus AFVG_250M852, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aaagttcaacgtaaaaaataaaacacagtatattat CRISPR spacer taggaggaacataaaaaataaaacacaatatatagt Protospacer *.* ***.****************.***** .*
18. spacer 4.1|1110420|36|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP011076 (Brevibacillus laterosporus strain B9 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
tatatttataaatatcttgctgtttaaaaatactgg CRISPR spacer ataaaatataaatattttgttgtttaaaaatatttt Protospacer * *********.***.************.*
19. spacer 4.7|1110811|35|NZ_AP019845|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT121964 (Phage DP SC_6_H4_2017 DNA cytosine methyltransferase and putative helicase genes, complete cds) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tctttaatatattttcttattaattttgaaatact CRISPR spacer tttttaatatattttcttatagattttcgtagttc Protospacer *.****************** .***** . * ..
20. spacer 8.5|2502802|37|NZ_AP019845|CRT matches to MN693989 (Marine virus AFVG_250M851, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
aaaagttcaacgtaaaaaataaaacacagtatattat CRISPR spacer ctaggaggaacataaaaaataaaacacaatatatagt Protospacer *.* ***.****************.***** .*
21. spacer 8.5|2502802|37|NZ_AP019845|CRT matches to MN694758 (Marine virus AFVG_250M853, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
aaaagttcaacgtaaaaaataaaacacagtatattat CRISPR spacer ctaggaggaacataaaaaataaaacacaatatatagt Protospacer *.* ***.****************.***** .*
22. spacer 8.5|2502802|37|NZ_AP019845|CRT matches to MN694077 (Marine virus AFVG_250M852, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
aaaagttcaacgtaaaaaataaaacacagtatattat CRISPR spacer ctaggaggaacataaaaaataaaacacaatatatagt Protospacer *.* ***.****************.***** .*
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
136870 : 171164
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP019845|136870:171164|DBSCAN-SWA TTTAATCATAATTTGTAGTTGTATTTATTATTCCATCAAATATTACATTCATACATTTTTTCTTATATTCTAAATTTGGGTGTATGTATAAATTTAAGGTTGTATTAACGCAAGAATGTCCGAGTATTTCAGAAATAGTCTTGTAATCTATGTTGTTTTCTATTGCTTGAGTAGCAAAAGTGTGTCTTAATGAATGAAATTTTAATTTTGAGATATTTAAAATGGTTAATATTTTTTTAAAAAATTTTCGATATGTCCTAGGTTCAATGTATTTTTTACTTCCGGAAATAACATAAAAATCTTTATTTCTATCAAATTTTTCCAGAATCAGATTTAATTCGGAAGCAATTGGGATTTTTCGTCTGGAATTTTCTGTTTTTGGGGAAGAAATAACTATTTTGCTTTTTTTTATTTTGCTTGTGTAAATTCTCTGGATTGTGTGATTTATGTTAATGAATCCGTTTCTTAAATCTATATCTTCCCATTTTAATGCACATATTTCACCTATTCTAAGTCCCGTGCATAGACAAATTAAAATTCCTAAAGTTTTGCTATCTAAATGATTTTTTGCATATTTAAAAATTTTTAATCTTTCCTCAAAAGTAAATATATCTACTTTCTTTAATGTTTTATCCTGAGGAATTTTATAATCAAAATCTTTTCTTTTTATTATTTTTTGCTTCATTGCAAAATTTAGAACAGCTTTTAGGATAATTACCATATCTTTTACAGTTTTTCTCGATAATCCCCCTTTTCCGTCTAATCTTCCAAACTTTAATTTATTTAGTATAAAAGACTCAAAATCCTTGTTGGAAATTGTGTTAATTTTTCTGTTTTTAAAATAAACTTTTAAATGTTTTTCTATAATTGTCAGGTATAAGGCATAGCTGGATTCCTTTATATAGTTATGTTCATTTTTTATCCAAATATCCATACATTCTGCTATAGTCATCTGTTTTTTCTTCATTTTGTTGTCCTCCTAAATTAAATTAATCTTTATACTAAGGTTATCAAAACATATATAAATCTGAAATTTGAGTATTATGGAGTAAATCTTTGAGGTATGCAGCTCATTTAAAATTAAACAGATAAAATTTATATTCAAATTGTTATTTCATCCAAAATTTGATATACTAAAATAAATTATAAAAATTAAAAAATATACTAAAACTTTGATAAAATTGAATTGGTGAATTATATCCTGTTGAATTTTAAATTTTGTCAGTTTAGTTTTGAGTGTATTATGAGAAAATGGGAGGAAAAAATTATGAATTTTAATGACTACAAATATGAACATTTGGATTTGGAGAAAATAAAAGGAGAATTTTCAGAACTGATAGATAGTTTTGAAAAGGCAGAAAATGTGGAGGTGCAGATTGAGGCGTTTGATAAAATTATAAAGCTGAGAAATCATATTGAGACTATGCAGACGCTTGTTTCGATTCGGCATAGCATTGATACGAATGATGAGTTTTATGATAAGGAAAATGAGTATATGGATGAAATCAGTCCGATTCTGTTTGGATTTACGAATGATTTTTATAGAGTGCTTGTTAATTCAAGATTTAAAGATGAACTTGTTAAGAAATATGGAAAATTATTGTTTGATCTGGCAGAAAATACATTGAAAATTTTCTCGAATGAAATTATTCCAGATGCACAGGAGGAAAATAGATTGTCAAGCAAGTATTCAAAACTGATTGCCAGTGCTAAAATTAATTTTGATGGAAAAGAGCTTAATTTATCGCAAATGGTTCCCTATACTCAGTCGAAGGATAGAAATGTGAGAGTTGAGGCGGCAAGGAAAGTGGCTCAATTTTTTGCTGAAAATCAGGAAGAATTTGACAATATTTATGATTCACTTGTAAAAGTGAGAACTAAAATGGCACAGAAAATGGGATATAAAAATTATGTGGAATTTGGATACAAGCAATTGTCAAGACTTGAATATGATGCAAAAATGGTGGAAGGTTACAGAAAGCAGGTGCTTGAGAATATTGTGCCACTCCATACTGAGCTTCGTAAGAGACAGGAAAAAAGACTTGGGGTTGAAAAACTTAGGTTTTATGACGAAGCTATAAAATTTAATTTCGGGAATGCTGATCCGCATGGTTCACCTGAGTGGATTTTAAATCACGGGAAAACAATGTATAGGGAATTATCGAAGGAAACTGATGAATTTTTTAAATTTATGACTGAAAACAATTTGCTTGACTTGCTTTCTAAAAAGGGGAAAATGAGTGGCGGATATTGCACTTATATTCCAGAACATAAGGCTCCATTTATTTTTGCTAACTTTAATGGGACTGCACATGATATCGATGTCTTGACGCACGAAGCTGGACACGCTTTTCAAGTTTACCAGAGCAGAGGTTTTGATGTGCCTGAATATCTGTGGCCAACTTATGAGGCCTGTGAAATTCATTCGATGAGTATGGAATTTTTGACTTGGCCGTGGATGGGCTTGTTCTTTGAAAATGATACTGACAAGTACAAGTTTATTCATTTGTCAGAAGCTCTTTTATTCATTCCTTATGGAGTAACAGTTGACGAATTTCAACACTGGGTGTATGAAAATCCAGAAGTTACGCCACAGCAGCGTCATGAAAAATGGCTTGAAATTGAGAAAAAATACTTGCCGACTAGAGATTATGGGGAAGTTGAAGAATTGAAAAACGGAATTTTCTGGTTTAGACAGGGACATATTTTCAGTTCGCCATTTTACTACATTGACTACACATTAGCTCAGGTGTGTGCTTTCCAATTCTGGATAAAATCAAGGGAAGACAGGGAAAAGGCTTGGCAGGATTATCTGAATTTATGTAAACTTGGAGGAAGCAAATCGTTCTTTGAGCTTATGAAGTCTGCTAATTTGAAAAATCCGTTTAAGGAAGGGACAATAGCGGCTGTAATTCCAAAAATTAAGGAATATCTGGATAGTGTTGATGATATGAATTTGTAATTTAAGTCAGAATGGAAAATAAAATTTGAAAATATTTATGTTTTTCTATTGATTTTGAAAAAAATTAGTGATATAATAGTTGTAGATACAAATTTAAAGAAATAATATATTAAATATGGAGGTAATTTATAATGATTTATGAAAATATCTTGGACTTAATTGGAAATACGCCTGTAGTAAAACTAAAATTTTTAAATGAAAAAAATATTGCTGATATTTATGTAAAACTGGAAAAATATAATATTGGTGGAAGTGTAAAGGATAGGGCGGCACTTGGAATGATCGAGGCGGCTGAAAAAGAAGGAAAATTAAAACCGGGAGGGACAATTGTTGAGCCTACTTCGGGAAATACTGGAATTGCGTTGGCATTAATTGGGAAAGCAAAAGGATATAAAGTGGTAATTGTGATGCCTGATTCAATGAGTGTGGAAAGAAGAAGCATTTTGGCAGCTTATGGAGCTGAATTAATTTTAACTGAAGGGGCAAAGGGAATGAAAGGTGCAATTGCCGAAGCTGAAAAACTGGCAGCTGAAAACGGATACTTCTTGCCTCAGCAATTTGAAAACCCTGCAAATCCTGCAAAACATTATGAAACTACTGCTAAAGAAATTTTGGATGATTTTCCACAAATTGACGCCTTTGTTTCAGGAGTTGGAACTGCTGGAACTTTATCAGGAATTGGGAAAAGATTAAAGGAGGAACGTCCTGGAGTACAAGTGTTTGCGATAGAGCCTGCAACATCTGCCGTGTTATCTGGAGAGCAGCCTGGAAAACATTCGCAGCAGGGACTTGGTGCCGGATTTGTTCCTGGAAATTATAATCCTGAACTTGTAGATGGAATTATAAAAATAGAAAATGATGAAGCTATTGAATTTGCAACAAGAACTTCAAAGGAAAACGGACTGTTTGTAGGAATTTCTTCTGGAACCGCAATTGCAGCAGCTTACAAAGTGGCTAAAAAATTAGGAAAAGGAAAAAAAGTTTTAGCAATTTTACCTGATGGCGGTGAAAAATACTTATCAGTTGAAGCATTTAGAAATAGTTTATAAAAAATTATATGGCAAGAATTCTTTGATATTAAATATATTTAAGATGAATTGCCTTTTTATAATCCTTAAAAAATTTTTTTACATTAATGTATATAAAAAAGTTGTTTTTAAAACAGTTTTAGTATATAATAAGATATAATTTTTAAGGAGTGTGATTATTATTTTTAAATGGTTGCGAAATGAAATAAATAATATTGCAGAAAAGGATCCGGCAGTGAGGCACAAAATAGAAGTTTTCCTTTATCCATCATTACATGCCGTTATTAATCATAGGATTGCACATTTTTTTCAGAATCATAAATTATATTTTTTTGCAAGATTAATTTCGCAAATTTCCCGTTTTTTAACAGGGATAGAAATTCATCCAGGAGCAAAATTAGGAAATAAAATATTTTTTGATCATGGAATGGGAATTGTAATTGGAGAAACGGCGGAAATAGGAGATAATTGCGTTATTTACCACGGTGTAACTCTTGGAGGGGTAAGTGCTTCAAAAACTAAAAGACACCCTACTTTAAAGGAAAATGTAACAGTTGGTACAGGGGCAAAACTTTTGGGAAATATAGTAATTGGAAAAAATGTGAGAGTTGGAGCAAATTCGGTTGTTTTACGGGATGTGCCTGATGAAGCGGTTGCAGTGGGTATTCCCGCCAGAATTATTCCGAAAACGGAAGAAGATTATTATATGTGGTATATTTAGCAAAAATATACGCTGTACTTAAAGAGTTTTTTTGAAAAGTAGCTACATAAATTCAAAAATCAAAAAAATTTGACAATCAAAGTAAAATATGATATATTCTCTGTATAAAAATTTAATCAAAGAGAATTTATTTTATTAAATAATAAATAAATGTGGAGGTTCAATATGGCAAAAGTAGGAATTTTTTTCGGATCAACAACAGGTGTAACAGAAGATATAGCTCATAAAATCGGAGAAAAGATTGAAGGGGCAGAAGTTTTTAATATTGATGGAAATGAAGATAAGTTAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP019845|136870:171164|142732_145819_+|WP_146997964.1|DBSCAN-SWA 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MKKIEVIKRVKCLVPNIYKINGELQNIKAKGKIKIQEVDQNIIGIKFIKSKNINDKFSKLELQVFKELEEDNNIYIIDFNKWNNPQILNKELITENIDKNLFKYFKNRNEYATQIHLTIFNYKNLINSEDLESLLFTETPLSFLFLDIYDKQINDKNEFEVEYIIQSIPIDEKIPVKLIFKLDEKEKDVIKLNFRMDYYDNRMSRNVLVSKVRDLLKKEMFEKMDFELDLSGYYILDKENFKIREIKAEQRIKIDDKLYEREFFIKEETENIESEEKSDEAKEIIEKDEMLQIEIPKVENLNEKELIETEKTVFKKPKKPIEQTYDGIRDWLLPLLRKDDKIIFPKEEFLERVKIFDEAEKLRTFNVIKSAVEHDNYCVKFEKGKTIRKYEVIKAFGKMLGIAVEEEIVEKVEEKEEKKLTPQQLRKKKFLERMKRSEKEEH |
28 | Clostridioides_phage(25.0%) | integrase,head,tail,transposase,tRNA | attL 134377:134392|attR 169110:169125 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
502755 : 534836
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP019845|502755:534836|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP019845|502755:534836|522993_523761_-|WP_146998156.1|DBSCAN-SWA MIATLCYLEKDNKYLMLYRNKKEIDINKGKWIGVGGKMETGETPEQCLTREVFEETGYKLNNYKYKGLVIFNYNEDEPLFMYVYTSSDFTGIEKECDEGDLKWIPKNEILDLELWEGDKIFLKLLFKNSPFFYLTLNYENDNLISSKLEFKKQYSCFEVFVPENYVEKIVENLQKYSLLTEGFYADVYSTADVTGHWKTLEGGSPFDGEVGKASVANEKIIRFRVKRDFEELAYYLVKEVHPYETAVINVFRMEV >NZ_AP019845|502755:534836|506569_506737_+|WP_172618295.1|DBSCAN-SWA MEKANSSERAKAIIKAFEQLSVKEMEKLLIKLGIPTNRKLEEKNNGSIRKENAEC >NZ_AP019845|502755:534836|526458_527244_+|WP_146996058.1|DBSCAN-SWA MSIGVFDSGIGGLTVLKEIRKVLPSEKIYYLGDTARVPYGEKTKELIIRYSKEIVEFLLEKNVSAIVVACNTATALALNELKEIFKIPIIGVIEAGARTAINTTKNGKIGVIGTKATIKSGKYEEEIKLFNTKAEVLQKACPLFVPAVEEGILSGKLVNQIIKTYLDDFEGEIDTLILGCTHYPLLKDAISQIYPAIKIVDPAKETALDLKKILQKNEFLKNDARKNEEVKYYVTDGREKFKEIGIMFLEENINEVELIKL >NZ_AP019845|502755:534836|520909_521923_-|WP_146998154.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_AP019845|502755:534836|512879_513098_-|WP_012806491.1|DBSCAN-SWA MTLVEGKVGEKFLLKDIDERKLDTRLLSLGVCRGDACTIENIANGNILIKTVETKIVISTNLANHIQIEVVK >NZ_AP019845|502755:534836|521969_522950_-|WP_146998155.1|DBSCAN-SWA MKKIIYTITVFLTMCFGLNAYTLRENVKETLSKRGVKQNIIDETSDFLLDSRGEMSIIPQQDEIDSLIAKAEMLLKKDRNNIVVKQYLSTMYLKKGGNKNTLKAQKINEENLKDKGITDFERWSVTGLYYYQIGEKKKAQTYFNKIKEKYKDKPAVYNLIEIVTMDIDMLKDSKDFNEFMVNTATNEKKMTKMQEIAKKQVEKIKIVKDFFQTEENKREFGVVDELVYSFDLLLNLSKINEIMQKDLKQAGGFKTKTVKEATDYYLKNVANNEKMTEDSIKYSIILENMYLRIISTLVSADEKESTDFSNKLEKSKLYEIMRKLEE >NZ_AP019845|502755:534836|510690_512883_-|WP_146998151.1|DBSCAN-SWA MINVAFVGNPNVGKTALINQISHASLKIGNWPGVTIEKKEVSFKIGNEDIKLIDLPGIYNLSINTPEERVSRDFLLNEKVDVVINVMDSTSLEKNIYLTALLKELGIPIVMALNFEDEFKRIGYELDVERFQKQLGIPVVFTSGKSGHGVDKLMEKVVEISKQSPLENKQHRLLFDKEIESNIKNLKNKLKNEKSYEKVLKRYPVDWLVIKILENDTNILAIVKNEFGIDLSSIGNTEKKNLEEHYGIVPEDVLARARYGIVRGIISANLKRGTGNKFALTDKIDKILLNKFFGGLAFLAIIYAVFVVVFDGSSPFIDWIDGFFSDFVIKYVGHAIEGVPDWLSSFVLDGILAGVGSVLTFVPLMFFIYFFMAILEESGYMARVAFILNKIMTKVGLSGKAFIPMLIGFGCTVPAIYSTRTLEDEKTRRLTGVIATFMSCGARLPVYSLLAAAFFSKQAALVVVSIYLFGVFMALFVAFVLKRFNYFKGNNTELLIELPPYRLPSAKVVWNNMKVKTFAYVKKATTVILGILLIIWFFQYFPNKGDAENSYLGQAAKVVQPVFKPTGFGDRWEPVASIVPSIIAKETVVGFLGQILLSQEEDEKQEYNFMADLKDQGVALGGAVVDSLKSLGHVATFKISTLEMKNQEELDEDAGGNIVPAIRNLWNDKYGPIRAYSFMLYVLLVVPCAVAMGALKQEFGWKLLVFQVSMLLILPYVVSILFFNVARLFI >NZ_AP019845|502755:534836|510396_510570_-|WP_084533582.1|DBSCAN-SWA MGKTIIVGIIAVAIVITVFRKIYKDYKKNKNFCGTDCCSCSGVSTCNLHNKTENHNK |
34 | Fusobacterium_phage(100.0%) | integrase,transposase | attL 499626:499642|attR 533572:533588 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
617269 : 688889
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_AP019845|617269:688889|DBSCAN-SWA 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60 | Aeribacillus_phage(25.0%) | integrase,transposase | attL 623962:623980|attR 691378:691396 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
775390 : 892129
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_AP019845|775390:892129|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_AP019845|775390:892129|852667_853063_-|WP_146998084.1|transposase|DBSCAN-SWA MINITQNKLKYIFSNNNILLDSLKFCKKNNIGNSHLEYIKLSIDKFLACRDISKGFVKFKCPHCPVTHLFPITCKSKLCPSCGYKYSRTWTENIQNIFSILSTDMSFYCPSRMQKVLLLRQISSVKTFCRC >NZ_AP019845|775390:892129|810314_810467_+|WP_172618293.1|DBSCAN-SWA MNDRNEAVMYNIGVSKVISGMSRNFVFSFSFPADIVKDELEYLVNSGRKF >NZ_AP019845|775390:892129|809675_809846_-|WP_172618310.1|DBSCAN-SWA MVNRYGFYSRHISGRLKEAIDAFRKNIAVSRYSFYQRQMYRTFGMNPFTVQHARLK >NZ_AP019845|775390:892129|868771_869719_+|WP_146998339.1|DBSCAN-SWA MKKLLLIILVIFIIFSCSQKENQIQMAKEHIEKIGKNPTAKDISDMFYTAKIYYGNNPEVAIIYFEKVVNYKPESLKYLTDYYLKKKDYRNFEKWAKIAAEKGINDVTYNLAYYYETNGKIQEAIEYYMIAAKNGDKSSENNVVNLYVKRGNDEETKKILREFGKIKSLKYYKAQVLREEKKYDEAIKIFRQMIEEGDYDGYVGWGSLLEDLGKREESMEVYKKGSEKGNYTSIFILGTKYGQEKKYDEAKKYFLMAVKLAPNNEEKADSLELLGLVYERQENFKEAREYYKKAINLGNEPAKELLKNLENDKQF >NZ_AP019845|775390:892129|876399_877989_+|WP_172618318.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_AP019845|775390:892129|861624_862935_+|WP_146998331.1|DBSCAN-SWA MSGYKYVPDGVFLACNQGTETSNLKITHVKNAHLYNNQLYATDRDVEPVNIGCFGNCRELNTKCKYQKGIWQKVHPTLSVEGAAPILDEISYLECPYKGKITIHFDKASAEAIANKNATEKDGINWGRIGNHLLDKGKGLLQGALLGVAIVGGCALIGGVIGFFGGGGVGAVPGAVAGAKVGMAILTGLGIAATVKSVSDTYKSGERLIESTNKAEDGIIFAIDLSETIIMMLGLKKGIKNFKTTLTKIGQFVGNKINNVLNKNTIGPFGGKISKIIKNGELKNGTKYYVMEKLDGELNHPKELFMKDGKINTENLIKTNNMSGRQLYQRYKAEGIEVSEIIDANNKRGIKFDIMGDSKISHIRTNNGGGTHGEVPYKLFGTSENGKLKIVDGNPGQYKIRGNTPERATIIFTEEIHGKPLIPIFNIDNTDKEKKK >NZ_AP019845|775390:892129|804837_805755_+|WP_146996268.1|DBSCAN-SWA MSISFYVKNKKKFLGYEPVLNVETALSLLDKELYSYNTGNIDINDLLLSPVSNYQCLLIGDGKESARGFELYYDNKNKNYSIRVFTPSSREDWLLALEYIKALAKKFDSKIISETGEEYTVDNIDKFDYEGDILYGIEGISSRVKGEDSTLYSIFGINRIVSFNQEMIDKIENSNSPIDTFSNMIKEIQYLDAFSANQQFFRNKEDGKIIGAYTLTQNLRTILPYKPSVEFENSDMVKNEDIAFWNIGLVTIDGDENDRNSYNVAAHLDYDDFIKNLPENKYRFIDVSYIMVEPLNREELLGLVK >NZ_AP019845|775390:892129|885114_885876_-|WP_146998349.1|DBSCAN-SWA 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97 | Streptococcus_phage(30.0%) | integrase,tRNA,transposase | attL 768330:768348|attR 869314:869332 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1074503 : 1085304
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_AP019845|1074503:1085304|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_AP019845|1074503:1085304|1081924_1083376_+|WP_036095637.1|DBSCAN-SWA MIKSLNEECGVFGVYGHPDAARLTYYGLHSLQHRGQEAAGIVVSDGKRVNGHRGPGLVSEVFNDDRIFNRLEGSSAIGHVRYATSGSSSGRNIQPFLFQFFDGSIALAHNGNLINARTLKRELEEHGAIFHSSSDTEVLVHLIRRSKEKDFLSQLKDALRQVKGGFSFVIQTQTELYGAVDPFEFRPLILGKTKNGAYILASETCALEIVGADFIRNIRSGEVVIIDESGYRIEKYTENTSTAIAAMEYVYFARPDSDISGVNVHKSRKRCGRRLAQEAPVEHADIIIGVPNSSLSAASGYAEEIGKPYEMGLIKNQYVARTFIQPTQELREQGVRMKLSAVKSIVKDKVVVMIDDSIVRGTTSSRIVQLLKEAGAKEVHVRIASPEFKFPIFYGIDVSNSSELISANKTVEEIREYIGADSLAFLSIDGLIDSIGLDFDAPYTGLCMECFNGDYPAGLGDYEEEFYASLTPIQEEALEELKK >NZ_AP019845|1074503:1085304|1079913_1080420_+|WP_146999390.1|DBSCAN-SWA MKDKRDGKEKNKILFLKKENGNWNGNYTEEIENKIKEIPILYKNGKFYNAENDKVINNLKNFNFYFQIQSFKLDKFENIKILKSENTSVLGFKNEFDLVLQAEYSDNKNFYSYFSKNFNDIRNNKEKIIFYGKYIKNADRNIVNIVMETSDLKINEKCGYDILNRELK >NZ_AP019845|1074503:1085304|1083694_1084693_+|WP_146998458.1|DBSCAN-SWA MSISYKDSGVDKEEGYKSVEKIKNGAKSTYNANVMNDLGSFGALYKLGDYKKPVLVSGTDGVGTKLKVAFETGIYNTVGIDCVAMCINDILCHGAKPLFFLDYLACGKLDSNVSAEIVSGVVEGCLQSEAALIGGETAEMPGFYTPGEYDIAGFAVGAVEEDQIVNGSDVKENDVLIAIPSSGAHSNGFSLIRKLFTDFTEVYNGKTIGEHLLTPTKIYVKLVQAVMKEVKINGMAHITGGGLIENVPRTIPDGLCANIEKSKIQIHELFKHDAFSRVNEEEMWGTFNMGVGFVLIVDAKDKEKVIEILEKNGENAYEIGHIRKGDEKICLK >NZ_AP019845|1074503:1085304|1074503_1078310_+|WP_146998454.1|DBSCAN-SWA MNYRIFVEKKEDFRVEAQNLFSDLKENIGIDGLVDVRVLNIYDVFNLGENDLEKLEKTVFSEINVDNVFRSFDEVFKEKDSENVYFLVEFLPGQYDQRADSAIQCVNLLIDKDNNINVKSGKLIILYGKISPDELARIKKYYINEVEAREKDLNVLTENVETENTDDVIVYNGFTEKTKDEIASLKDKLELAMTVNDLLFIQEYFKNEEKRNPTETEIRVLDTYWSDHCRHTTFETIIDDIKIENETYKNIIEKAISEYLESREYVHADRISKKPMTLMDLATIFGKEQRKNGNLPDLEVSDEINACSIYIDVPIERIDEKGKKNTVTEKWILQFKNETHNHPTEIEPFGGASTCIGGAIRDPLSGRTYVYQAVRISGSADPTEKIEDTMAGKLPQKVITQVAAHGFSSYGNQIGLATTHVNEIYDEGYKAKRMELGLVVGAAPAENIIREKPENGDIVILLGGRTGRDGIGGATGSSKEHTTESSEKSSAEVQKGNAIVERKIQRLFRNKNVTKLIKKCNDFGAGGVSVAIGELADGLEIDLNKVRVKYIGLNGTELAISESQERMAVVIEKQNLDKFIEFANEENLEAYQVAEINDSNRLVMKYNGEKIVDISRDFLNTNGATSNINITIENTPKLNLNREIEGNDFRSKFINNLKDLNVASQRGLVETFDSTIGATTVLMPFGGKYQLTPAEVSVQKVSVINAETDVASMVGYGYNPYVAKQSTFHGGAYAVIESMAKVVAGGGNYKNIRFTFQEYFERLGQDSKKWGKPLSALLGALHIQKAFGLPSIGGKDSMSGTFNEISVPPTLVSFAVSVTDAENVISSEFKKAGNNVYLITTPNDENDLPKLDELKANFDFITENIRNKKIVSAMAVKNGGIAESLAKMTFGNKLGVDVLAQIDENDWFKVNYGAFIVETAENIEYKNAMLLGKVTDEAKITVNGITFELDELIGNWESKLEKIFPTKKEVSKEHEIAHCEGLKYEKLAKIEHENIISNISNTYAKPRVFIPVFPGTNSEYDLERAFNREGGISKIGVFNNLSHRNILDSIDNFVKEINNSQILMLPGGFSAGDEPDGSAKFMVAVLKNKKVKEAVENLLKRDGLILGICNGFQALIKSGLLPYGEIRELNETSPTLTFNAIDKHMSKIVQTKIITNNSPWLSDMNEGDIHSVAISHGEGRIIITEEEYKKLFKNNQIATKYVGLDGNSTMDSQFNPNGSYYAIEGMLAHNGRIFGKMGHSERKGKNVYKNIYGNKEQNIFRNGIKFFK >NZ_AP019845|1074503:1085304|1083385_1083673_+|WP_146998457.1|DBSCAN-SWA MYIVSLNYIKEVSEVEKHLEKHIKFLEKYYEMGKFICLGRKNPRTGGVILLNAESLSEVEKIISEDPFNVNKIAEYEITEFFPTKYNKNFKKFVE >NZ_AP019845|1074503:1085304|1078504_1079620_+|WP_146998455.1|DBSCAN-SWA MKKINKFLFLAILLSLVLSNCQKKEEKSTNTQNKKVENVSNQDVLREISLDEMLDFEHIPENWKEEFREIAENMPRYGNNVTKIILYFYEKDFFYDYKKIFLDDNNNFVKPDEKQINDFLKMASEKNFSDFDSIIQAMEKENKKDKLFGKLTGNWIESLKIWKLKADNLENYYQSGDYKKDNFAKGKTLNSEYLESIKQRKEKYRELNKIFIFKLKYLLKKTAVFYADQQYGNNTPIGDLFKESLLIDIFYYKLYDWNEIYNAEETFEVPVEEKDREKYLQDLKKIQSEIKKISDAMENKEYEFINSKTIINKEIYLLAKKENKSNLELINQIMSDMENKKYTDINAIGILLMKRNQEIEQVIRKQLARSR >NZ_AP019845|1074503:1085304|1081061_1081778_+|WP_026749155.1|DBSCAN-SWA MEKREQIYEGKAKSIFSTDKADEIIMYFKDDATAFNGVKKDQLEDKGILNNRISTLIYGYLIKNGVKTHWIETLNEREQLCKKVEIVPLEVIIRNRATGSFVKRYGAEEGKIFKKPTFELSYKNDDLGDPLLNDDHALALELVSEKELAEIKQQTFLINDLLSKLFDKMNLILVDYKIEFGRDKEGNILLADEISPDSMRLWDKDTLKKLDKDRFRQDLGDVMGAYREVLRRLEEVLK >NZ_AP019845|1074503:1085304|1084680_1085304_+|WP_146998459.1|DBSCAN-SWA MSKIIENSKNDTENKKTRIAVFISGSGSNLQSIIDNIENGNLNCEISYVIADRECFGLERAEKHGIKSIMLDKKLFGKNLSDEINAILENDTERTDYIVLAGYLSILSENFINKWTRKIINIHPSLLPKYGGKGMYGMKVHEAVIANKEKESGCTIHFVDNGIDTGEIIMNVKVPVYEDDTPEVLQKRVLEKEHILLIEGIKKLLEQ >NZ_AP019845|1074503:1085304|1080460_1080940_+|WP_146998456.1|DBSCAN-SWA MKVAIFFGSQSDTEKMRGAANCLKEFGIGYEAYVLSAHRVPEKLEEVLADVEKRGAEVIIAGAGLAAHLPGVIASKTILPVVGVPLNGAIGGLDALYSIVQMPKSIPVATVGIDNSYNAGMLAVQILAVKYPEIKEKLISFRKKMKAKFIADNEKKIEL |
9 | Synechococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1381336 : 1427571
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_AP019845|1381336:1427571|DBSCAN-SWA 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48 | Cyanophage(25.0%) | protease,transposase,integrase | attL 1389751:1389767|attR 1427598:1427614 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1628681 : 1683426
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_AP019845|1628681:1683426|DBSCAN-SWA 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58 | Bacillus_phage(50.0%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1836135 : 1899757
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_AP019845|1836135:1899757|DBSCAN-SWA 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50 | Staphylococcus_phage(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP019845.1|WP_146998694.1|1486923_1487508_-|GNAT-family-N-acetyltransferase |
1486923_1487508_-
Protein sequences of NZ_AP019845.1|WP_146998694.1|1486923_1487508_-|GNAT-family-N-acetyltransferase>NZ_AP019845.1|WP_146998694.1|1486923_1487508_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MENINLKNFVNTYEETDVNKMLKNFKSISISNKKNDIEIFLQEKAIKFEKSCISSTYLVYDDNIEEMLGYFTIANRSLILSKEELNVLSKTQQKKLSNSGSVLRNGDLMTSSFLLGQLGKNYSDDILKKITGKDLLTSAYNLLLKIKELINTKYVWLECQNESRLINFYRAFGFKLLEHIISDEGLKVMIMELK |
194 aa aa |
89
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|
NA | NA | No | NA | ||||||||
NZ_AP019845.1|WP_146998696.1|1487840_1488419_-|GNAT-family-N-acetyltransferase |
1487840_1488419_-
Protein sequences of NZ_AP019845.1|WP_146998696.1|1487840_1488419_-|GNAT-family-N-acetyltransferase>NZ_AP019845.1|WP_146998696.1|1487840_1488419_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MSIERVGLQKLLESENQIEKIEKFLKTFKSNFATTNEVEYFLHNNAIEFEKKTLLTTHLLINENNELVGYFSIANKKLNIPKEVVKTFSKTKLKKIGQSSNIKKDGSYEINSYLIGQLGINFSQEIKGEKITGKDLLNEIWILLLEAKKLVNVKYIWLECENNSKLINFYKEFGFDLIDGFENDLKVMFMKI |
192 aa aa |
89
gnl|BL_ORD_ID|89 information
|
NA | NA | No | NA |