Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP042904 | Wolbachia endosymbiont of Drosophila ananassae strain W2.1 chromosome, complete genome | 11 crisprs | DEDDh,RT,PD-DExK,cas3 | 2 | 1 | 15 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP042904_1 | 51700-51804 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP042904_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP042904_1
>1.1|51724|57|NZ_CP042904|CRISPRCasFinder CTGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTTCGTGGCGGCGTGACGATAAGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042904_1
The CRISPR arrays of NZ_CP042904_1 >merge|NZ_CP042904|1|51700-51804|CRISPRCasFinder CGTCATCCCGCTACTTGTTAGCGGCTGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTTCGTGGCGGCGTGACGATAAGCTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGG >NZ_CP042904|1|1|51700-51804|CRISPRCasFinder CGTCATCCCGCTACTTGTTAGCGG CTGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTTCGTGGCGGCGTGACGATAAGCT CGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGG
>NZ_CP042904.1|WP_007549110.1|50028_51567_+|leucyl-aminopeptidase MKNILLMFLLCFMYSLQLFATEIPAMKITISKISPDFKTIVMGLFEDNETVNDDGVLQGKQVIDNIKQFSDFNGSFGEFFSTALPEEKNVIVVGLGKKDEWNENKELNIGGKIYCELSRLKIKKAAVLIEGSAANVAYGAFLRSFKFDKYKTKKDEKITEVEEITVLVKDEQLSNAERSFEHLRQEGESIFLARSFITEPPNILYPESYADHIKKELTKLGLEIEVLDKKQMEEKKMGALLGVAQGSSKEPKLVVIKWNGASKEQKPIAFVGKGITFDTGGVSLKPSRGMESMKYDMAGSATVVGVMHALAGRKAKVNAIGVVALAENAVGGNAQRPSDVVTSMSGQTIEVLNTDAEGRLILADALWYTQDRFSPKFMIDLATLTGAIVVALGNNEYAGLFSNNDELANRLIDAGNEVNEKLWRFPMNETYDKIIDSPIADVQNIAPAGSGGDSIMAAQFLQRFVNETCWAHLDIAGTAWHEKGTDICPRGAVGFGVRLLNKLVEKYYEAND >NZ_CP042904.1|WP_006280163.1|49326_49968_+|dioxygenase MNVKNILLAFLVQMVFSLPLFAADPVLLNCIETPEIYDLDARPKNFNSSNNLRRKPGSPNSAIGELIHIVGKITDINCLPIQNAVVSIWHANSRGVNHYDKNIEDDLNFAGSGRFVVNNLGYYNFITIAPGKIGDRAPHINFLVQHPDFPEFTTQMFFADHNCDNCADPVLEDFVSNGLASLLITPFTYSDQVIKTYTFNITLGGYNKFSNKR >NZ_CP042904.1|WP_012673046.1|45107_46052_-|hypothetical-protein MVASYSVLKRYALAYIKKSGSNSDVKEFLQFCNTQNTTNWSEENFKNAYEKFTHPNSSNRHDTGSRNDQYNAGNNAQPTGSQITHIHVHNRGLDFWDYLLLQCWMDSLFGGRGHTTVNNITNINNGNTTHQGRKENKKESEDSRKLLALGIVAAVVCVAFHAGMCFWYNSSRKVARKKEKIDYLDSKFKTFRNIEFAVGVVSLAALVACAVYPVLPVWGLAILGVNSLVCFAGGLAFHMKHEEESENIEKAKGAVDSCLRQGHGYGDSSRYDAPPPYFSQDPNTTPTAPPQNAFDNPYLQQKFGNCKGFTRDKN >NZ_CP042904.1|WP_012673045.1|43762_44881_-|molecular-chaperone-DnaJ MSKKDYYDLLEVGRNASIDEIKKAYKKLALKYHPDRNPGNQEAEEKFKEVTAAYEVLSDSEKRAGYDRYGHEGASGGFQGFSSAGDFSDIFNDFFGGGFGGGASRSRAKRSTTGVSGADLRYDLEITLEDAFKGIQAPIHYVTNVKCDTCQGTGGEGAIKPVQCHTCQGSGRIRTQQGFFTIERTCTTCYGEGEIIQNKCKKCGGSGRRRDEVNISVSIPKGIEEGAKVRISGKGEAGTKGGKSGDLYVYVKIIFHKIFARNKADLHCKVPIRMTLAVLGGEIDIQSIDGAKIKVKVPEGTQTGTKLRCREKGMPYMNSHARGDLYVQVIVETLNPKNLTKKQIELLKALEEEENASVQQQSEGFFSKVKKK >NZ_CP042904.1|WP_012673044.1|41919_43554_-|ribonuclease-J MNINKNEFLFLPLGGVGRIGMNVSLYHYQGKWIMIDLGVGFADETMPGVELLIADIDFIAQRKKDLLGIIITHAHEDHCGAVPHLWEELQCSIYTTKFTVNFLKEKLKEFRLEGIVPVKEVDINGSINLGPFTVEFINVTHSIPEANSILISTEMGSALHTGDWKFDPKPVVGLTSNMERLKEIGDKGDLLAAICDSTNILSKHHPESEGEIYNNIYNIIKRSKKLVAVSLFASNVARIETISQAAKALNRKVVLLGRSLWRIVKVAQDSGYLTDSPQFLEAKEAVNFPREELVLLCTGCQGEPLAATARLAAKSHQAFKMQQGDTMIFSSKIIPGNETRAHNMLNAFIEMGVEVITEKTEHVHASGHPTREELKEMYSLIKPKMSIPVHGEYIHTHAHVKFAKECGVAKAIMIAPGDIVNLENGEKVDSIDVDYFGIDGMLLRHPESSVIKMRKRMRDAGVIVVTAVVNKKNKLLAKPKVFVPGVFEVLEDAATIQKIVKKVESLFSLQPTKKIKNKIESSILSILKEYLLKRPIIEVQIEQV >NZ_CP042904.1|WP_007548937.1|40651_41914_-|Tol-Pal-system-protein-TolB MKLFVHLVLFISLFIPYFTKAALYVDIKKSSVGNIGLVVSKCTCKTALESELSENIAKVIGTNLSNCGLFNVKRGAEAESKSWKSDTVVTVSLSEISGSALELSFRLFDTFTKRELLTQSVVFPAKDWRKIGHLVSDVIHDRLIGEKGHFNTKITYIAEEKDSNYKSVRKIAVMNQDGSNIKYLTNGDRFVSTPRFSPNGKGIVYISYANGKSYIILKNLKDNTESIISTFEGVVSAPRFSPDGKSLLISHSLGGETNILSLDLSSKRTKKITKGSAISTSPSFSPDQKYMAFSSDISGSQQLYVIDFTNKSKKPKRISFGSGRYATPVWSPKGDLIAFTKIQSGKFYIGVMKPDGKEERLLSEGHKIESPAWLPNGREIIFTRTESPSNSKLYLVDLVKKNQKMVSTPTNASLPDWSYF >NZ_CP042904.1|WP_006279727.1|40256_40610_+|Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln)-amidotransferase-subunit-GatC MPAKSTEDVITSLIEFANKRKITITKEEMLKIAQLVRIKLSNDEIDHYSKELTMLDWIHDTLLQVNTEGVSPMRYGSIDKDIHVRDDVINSQNIKEEILSNTKPEHGYFVVPKVISD >NZ_CP042904.1|WP_121721676.1|39340_40267_+|ribose-phosphate-diphosphokinase MKIIIGNASKELGESVVNRLDVQPSSAWISKFTDGEVNVEVANDLYNQEVYIIQSLSPPVNDNLMELLLIIDAVNRLGAKRIVVIIPYYGYSRQDRIIKNNNMQSALSAKLVANLIQTAGTSSVAVIDLHSSQIEGFFDVPITNLNCFEAFVDSIHTENLAIVAPDVGAIGRARAFAKTLEEKYKIGLSDKIIVVDKYREKAGTSQVMNIIGEVANKNCVIVDDIVDSGGTLCNAALALKSYGAKSVTSCITHGVLSGSAVEKISSSSLDKLVITDTILHKLEKTGKIEVVSVVNILTHFIQGGRNAS >NZ_CP042904.1|WP_006280296.1|38170_39037_+|ankyrin-repeat-domain-containing-protein MTEETKDGYASLYVAIQEGNIEAAELLIKCGTNVNDHYERNRTPLHIAIGRKQLEIAKLLIKNGANVNAKTQNHGKDDLTPMHFAVFANTPEFIELLASHGALINERESTEGYTPLHFAALYGNKNIIQALIDKGQDIEDVDNNGRTALFLAARQCTEAEDDSRIEIIKYLIDKLKADVTKKDNNNNAVLFPAANNCPGKVVEFIIEQYIKIFELENFINHKNNDGMDALDIALNSGNEKAIEVLRSYGADIKNKVDGSIQKITAEKPSSTLDRAESAEVAPPIKQRV >NZ_CP042904.1|WP_007548938.1|35591_37757_-|hypothetical-protein MLSLIRKTLRKKMTHQVNDSKLKEKDEKSILKLASKIKGKKSSIAEELEKISKKEKQRILTTEVSKHRGKEPTIISLAYAILRKDSIAVEKMLRVAKENGILKDILDATTTIKYPGGQEETCTPLTYAILCKNSKTIEETLKVSKENGILKDILNATTTIKYPDGRRATVTPLAYAILYEDSIAIEEILKVSKENGILKDILNTTATIRYPDNKEVTYAPLAYAMFWKDSKAIKEILVADEENSILKDILDATTTIKYLDGQEEIYTPLTYAISCKNSKTIEEILKVSKENDILKDILDATTTIKYLDGQEEIYTPLTYAISCKNSKTIEEILKISKENGILKDILDATTTIKCSDGHEETCAPLTYAILRKDSIAVEKMLRVAKENGILKDILDATTTIKHSDSREVTYTLLAYAILRKDSIAVEKMLRVAKENDILKDILDATTTIKYPDGQEETCTPLAYAILRKDSIAVEKMLRVAKENGILKDILNTTITIKHKNNQKVTDKLLAALHDRKVIQEILDIARENDILKDILNATITIKYPDSEEKIYTPLTYTISCKSNEAFNTTRAINQDGQEKTHIPFPTVSVLDERETELKLKEKRQSRRDEGLNFNNGSSDKNVEIKVNGDILLQHSSGTKNEINHTAVRNDVGGVKPLIESRVNVKVQNINAVIATSVTFKMIATSVTLELVASKITCVLSKPTTKLEEVAITYFQGLALYL >NZ_CP042904.1|WP_006279883.1|52261_53449_+|MFS-transporter MESRAKAWFIWLISNLVVIFSNMQIIYTFISVNLEKELGLTIAQVALANSVYTWTFAILQFFSGATFNVFSSKKIYFFSLSTMILGFFVLINSDNFSHLILSQVLIATGASFGFIGAAHTSSICFSAAQFGLMFSLVQTISSLSALVIQILFSNLLAEDAYWKNLIVCIILFGVLIFVLTLFCPNTLPESSSEKRTIKSSMKTVMCSILTVLKLRDIWITSVVGAITFGTFLALNTLWAPRLLGNSELNAMESGIATAILWLGLAVGAPIADRISNLFKNRKHVISAFALLQGVSIIILLYSHLTVHVVYFCMLMFGFFAGGHMLNFTVGSEIVKRKYISTSSSIINGFMFIGSGVIVSMLALFTDHKMALFAIFAILIVAGILNYATKETYSKK >NZ_CP042904.1|WP_007549337.1|53509_53815_+|integration-host-factor-subunit-alpha MDHVTTKDTTVTKATIVGDINQEIGLSKEDSASIIDDILDEIKTSLAKDGIVKISSFGTFLVKKKKERPGNIPNTSEKVMIQARNSVSFRPSKIIKKSINN >NZ_CP042904.1|WP_007549338.1|53814_54141_+|MerR-family-transcriptional-regulator MNKEKLFYTIGEVAEELHLEQHVLRFWEGQFHQIKPTKRKGRRLYDRKCIEAIKKVKYMLYDKGYTIKGVQKEFGNDIKVTKNLLQELTDLRDYLTSKINSEESNKQT >NZ_CP042904.1|WP_007549339.1|54186_54783_+|M23-family-metallopeptidase MWHIASFLMLLAILIGCGLQKPAPVLLKGEEFYGKRDLEYTREYHLIREPSVQKESRKAIINRIYRDNNNAQNVEVNCKFVMPVKGSATSSDETCKDGIKIAAQNGTNVIASAPGKVIYVGKGLRWYGNLIIVEHKDNYMTVYSYLKNIHVEIGDKVKQGQVIGSAGKSSTQDKDPQMCFTIRHNGQAVDPLAHTNCD >NZ_CP042904.1|WP_044471166.1|54795_57312_+|leucine--tRNA-ligase MKYDFKNVERFCQDKWDFSVSKSSKQEKCYVLEMFPYPSGKIHMGHLRNYAIGDVIARYKRARGFEVLHPIGWDAFGLPAENAARDNNISPEIWTKENIDNMRAQLKSIGLSYNWNRELSTCEPNYYTHEQKFFLDFLKHGLAYRKESWVNWDPVDQTVLANEQVVDGKGWRSGAVVEKRKLSQWFLKITDFAEDLLKCLQSLKNWPEKVKTMQERWIGKSEGATIEFEVVGLNKKLKVFTTYPHTLFGASFCAVAAEHPIVQDLKNGSSVVIPVLDTGIQEIKSKRENDEKIGVYTGLNVKHPFLDKELPLYIANFVLMEYGEGAIFGCPAHDQRDFEFAQKYNLPIIPVISSAHLGVIPARDQNSYNGSQCQATQMTKEAYTGDGVMFNSEFLNGLMVSEAKEVIIKKLKEKGIGKKTTNYRLHDWGVSRQRYWGCPIPIIYCKDCGTVPVPEKDLPVILPADVEFTSGGNPLDKHPTWKFVDCPKCGKQAERETDTFDTFFESSWYFAAFCSEDKSIDKDACNRFMPVDYYIGGIEHAILHLLYSRFFCRALTKCGYFDIKEPFSTLITQGMVCHATYKDENGKWLFPAEAKELIARGTKVQVGKVEKMSKSKKNTVDPNFIIEKYGADTARLFVLSDTPPEKDMEWSDDGVEGCSRYVNKLWRMVMQLKPVNMHYDNKSVTGGLLEYRKKIHKLLHGLTDDLENCRLNCVVAKFREMTNLIAEIDVAAGKSLIDEGICILIRVIEPFMPHLAESLWQEIGGQPWPKADESLLVDDTVTIAVQINGKLRATIEVAINLPQEELKKIAIDSVSSKIDQNKVRTVYAVPNKIVNIVI >NZ_CP042904.1|WP_012673050.1|57430_58036_+|membrane-protein MKMKRLCALAVLLTSSLAGTANNSASKSEDQYYAGLNFGAGWGGGLKIKPSVVFGYHHDKNSKFELEVLTDISDMFGKEEKKMGASLLANYRYYPDLDIDPVKLYVSGGLGGYLQVIPFGFGNSGTSEPASKDIEAAGEKASVVDKILGSISYKLKVGVDYEITPQIVGTVGITAGGQLSGFKPPVQIPDAILEVGIRYNF >NZ_CP042904.1|WP_094189578.1|58616_59449_+|IS5-like-element-ISWpi1-family-transposase MRKKYPTDLSEREWARIEKHFRVSYKKGGRPPKYSKREILEAIFYVLRTGCQWRYLPNDFPLWKTVYEQFRQWKKQGIFEKMNYEITKYSRRKIGRNEQPSACIVDSQSVKTTEKGGSKAMMEGKKVKGRKRHIITDTQGFILGCYVGAANENDRDGIKIALNNMRTKYTKVKKMWADMGYQGRNLKNHIKEEYDIDIEIVKRPPCRFWVHKDTPPELLPTREQGFKVQPRRWVVERTFAWVNRNRRLSKEYDLLTTSTENFIYLAMSRVMLKREYA >NZ_CP042904.1|WP_084741697.1|59473_59638_-|IS3-family-transposase MSNKGCCYDNSVAESFFSSLKREILIDTSQHSAQHTRTAIFEYIEIFYNKQRHY >NZ_CP042904.1|WP_010082071.1|59630_59792_-|hypothetical-protein MSSAINKQLVMNSLLMAINRRKPVKNLLLHSDQGSQYTAQGYQYLLAVKNIDE >NZ_CP042904.1|WP_144078574.1|59795_60230_-|IS3-family-transposase MFFYIVTAIKYRNYVGFSASGYYKWTTRKISSRESANKELLEAIQKIYQVSKCRYGAPKIHAELKALGKSCNLKTVQSIMQKNDIRAILRRKFKIKKQQTDNRAVAPNILDQNFIVDQPNKVWDYLHQNQGGMAIFGSNNSHVW |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP042904_2 | 293953-294051 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP042904_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP042904_2
>2.1|293983|39|NZ_CP042904|CRISPRCasFinder CGAGAAAATAAAAGATTTAGAGGCACAGTTAAGCAACCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042904_2
The CRISPR arrays of NZ_CP042904_2 >merge|NZ_CP042904|2|293953-294051|CRISPRCasFinder ACCAAATGCTGCTCAGTTAAAAGATAAAGACGAGAAAATAAAAGATTTAGAGGCACAGTTAAGCAACCGACCAGATGCTGCTCAGTTAAAAGATAAAGA >NZ_CP042904|2|2|293953-294051|CRISPRCasFinder ACCAAATGCTGCTCAGTTAAAAGATAAAGA CGAGAAAATAAAAGATTTAGAGGCACAGTTAAGCAACCG ACCAGATGCTGCTCAGTTAAAAGATAAAGA
>NZ_CP042904.1|WP_012673116.1|290458_292930_-|valine--tRNA-ligase MLKEKYGFKEVEDKCNILWEGSKVYRWNGGKDNTFTIDTPPPTISGKLHIGHIFSYCHTDFIARFQRMLGKDVFYPIGFDDNGLPTERLVEQTYKTRAKEVGREKFIEMCHEVIEKSKQEFKELFKSVGISYDWDLEYHTISKETVTLSQMSFIDLYNKGYAYRKMQPILWDPVDKTAIAQAEIEDKVFESSLNTIVFSTQENEQINIATTRPELLPACVAVFCHPEDARYTHLIGKTAVVPITKEKVLIIADDKVKIDKGTGLVMCCTFGDELDIYWQQKHNLPMKIIIDQDGRMNLDDVIPPHPGVMKVADTGIYDEINGLKVTAARKRMIEILSGKGLLIESTSISHSVKCAERSGAPLEILPTYQWFIKTLEQKAQVLDKVKECNWHPATMRKRMEVWIEGLNWDWCISRQRYFGVPFPAWYSKRKGEEGKIILAEVKDLPIDPLKDLPKGYSKEEVIPDQDVMDTWATSSITPQLSALAVNSEFSLPNHRYDTIFPADLRSQSHEIIRTWAFYTILKAHYHANSLPWKNIMISGWCLADDKKKMSKSKGNIITPHVILETYGADVVRYWAANSRLGVDTVYSENIFKIGQRLVTKLWNASKFVSMFMEKHQTVSINSISETMDKWILSKLYKVIGRATNNLLQFEYCEALGAIEEFFWKDFCDNYLELVKKRAYGSSEATLSAKQSLAYVLNVILRLFAPFLPYITEEIYHQLYSYNSVHNQSNWPSKEELIYDKYSEEMGDNVIQILNIIRKIKADNNVSVKHLIKKLVIKADLREDKLNQSAQNDLQAVCNAEMIEWMQSELETENGKYIVNIDLY >NZ_CP042904.1|WP_095866562.1|289654_290380_-|hypothetical-protein MGNLYNKTNAPYLIAGTLATLALLASGTLAVAPYVAFLSSIAAFNVALPVALSLSILSTLILVLSCKMISRNKKLAAQGAELNEKTELAAEQENTIQSLEPQIKGLNKKVSDLETKLDEISRQANGAATKDEVEELKAGLNGAAKDAVKKLIEDAAEELKKELEVKIGNAATKDEVKKLIEDAVKEVEVKEELQMKFYEKGKKRYKTTFDDVILQNEKKQELKEIYESQKESDAALKKGEG >NZ_CP042904.1|WP_049749678.1|288919_289651_-|26S-protease-regulatory-subunit MYGLPGTGKTMIAKAIASETKDTSAFISVSGSSLFNIKNIDDLFKKAEENAPCIVFIDEIEGFGKAYSSDDNVQYLKHFLTKIDGADHVKGVTVIAATNHIGILDKALVRGGRLGNHIEIPTLGTDTRKKIINKYCQKENLQSIAHTILNNTSEGFSPANLISLLKEIEGCASKVRDKTKTAAICRSFKRTHNIKKVSNKQTNRKIENSIGESQQYTSRPSHKLNDALCDSGYTSICSTLINS >NZ_CP042904.1|WP_007548907.1|287618_288746_-|hypothetical-protein MSNLLSEANAFYFVASSLATLTLLTSLALIVTSNVPLPLILALATLSVLVLALSYKIISNNVELEAKVKGQLEHKEEMLSLEHQELRDENTRLNERVDSLMEELCQCKLESEKNKLCLKSEYEDELRLRLEYEDELNLELEHKSREASSLRTQLTMLRKKVEVEEVKQLKTLESEEQHESSESDIEELEKKLCQSEKEKKELEGKVSDERQKRTDLESKVDKLCTKEKEYLSKIKELEKESLSLQKEEKESDNTLTTVNDDRDNKVKELNSSLLKQSSQIEQLQKALLEKKKEEVLFLQRMIEYVTDEVEKLVRENEVIRDDDKKVILQVIQATKSVLVEEAAQYLPGETSVPSFMEDPGYTSGCSTPTNSCHTF >NZ_CP042904.1|WP_007548905.1|286056_287460_-|hypothetical-protein MSNLLSEANAFYFVASSLATLTLLTSLALIVTSNVPLPLILALATLSILVLALSCKIISNNKKIEVERNKFAQKEQELENKITLGKEAEKAANKEVEKLKHELTREKQNLDKRAKKLNQKVNESEVERESLLEEKESLEKKLETAKNHTFEINNELDKTRKEIGKLSEQEEKLKLEISCLKKQLEERSRFIAKLKMEVDDNKHLELENKGLNDRIETLREVQKALREKKHELSEKVEVLNKEKNKLSKEVKELREEQEKLYISLDKLQCKIKEVNKEKEDLRQVLSCSYSWQEFSEEMERCSSREKRMRESCSNELKRLEDLILEKSSEIEQLEKDLLREKEEKMSYVARITEYMLCKLEESIKRSKVIKNDDKTVILQEIPVMKSVLEEVVQDLRGKTSGKDSEYASLPDETSVPLHAGDPGYESEEDSGYNSRSSTPIKLPNSLLTESYERSQFNQSESICKTQQ >NZ_CP042904.1|WP_006280567.1|285351_286026_-|orotidine-5'-phosphate-decarboxylase MNPIICALDTQDLNKAISLANALRGKVGMVKLGLEFFAAQGLSGVQEVAKCNVPIFLDLKLHDIPNTVAKTVEVIKVLNIEMLTLHISGGTKMLEEALSVVQGTKIKLIGVTVLTSMSNEDLNELGVAREAKSQVILLAKLAKKIGLHGVVCSALEAQEVRRECGEDFKIITPGIRIDPGHDDQKRTATPKEAINSGADYIVIGRPITKTTSSAELILKSMKEF >NZ_CP042904.1|WP_007548904.1|284504_285302_-|hypothetical-protein MSNINRIIREVIKEFRSKLPDKEIEEYSGKLNKLHIYQCNKHIIENKKLYHYTINGKTHAMGQHGHNFVKSLEVILRNKPQISLEEVIDFMEKIINFGIDSCYGAFEMIFESRSGVTIDDAVNFVKDSLSSKFYGFHGSGIFKVILELNPESSLEEIEKQFSKVVDPYFLNAWSRESERAFAKICRLCREGHVENMQKFDFSNFNLDQDSAGALRALLQYCVDVSNQKALGDSHELHREEMEGIYKFDDNYDLNLDSDHNDSIWH >NZ_CP042904.1|WP_121692651.1|284039_284312_+|hypothetical-protein MVHSKRCHSSAPFLVIRVADTGIQLLCNLIKNVCFSVRQLPLAHQLSYKQNFWIPVSSTGMTSSVVQFTFKNEYPYSYVLGTEMASFFIC >NZ_CP042904.1|WP_012673115.1|281723_282365_+|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKMHNVCKLFNNIPVLNNINLIIEQSIVGLAGPSGSGKSTLLRCIQKLEVLDSGSIECNDSTGFVFQDFQLFPHMTVWENLTYAPKLKNKTQDQSYSLLESLGIASKKNDYPNNLSGGQKQRVALARSLMMNPKILLCDEPTSGLDVATIVDVVELLQSVRDMGITMIIASHNLDFLTKISDRIILLKNGKIIVDINPKEIDEPTNYLKNNY >NZ_CP042904.1|WP_007548901.1|281092_281740_+|amino-acid-ABC-transporter-permease MQELISNFLFVGTGLAFTLKLLIGGLLLGMSLGGLFSVLRYNKICIPLINGIISVIRGTPLILQLSVVYFMTPTIAGIKLNIFSAGIIAFGLNSCAYIAEILRAGIETISKNQFEAAKTLQIPSFYMWRDIILPQVIKNILPAMINEIIALLKETALISTIGGVDIMRSAQMLAAEQFTYFIPLCLAGAYYYALVLLIEYIGKKIEQKGIYDKNA >NZ_CP042904.1|WP_007548882.1|294491_295007_-|gamma-carbonic-anhydrase-family-protein MYHILKYKDYEPKIDESAFIAGGSHIIGKVEIGRDASIWFNCVIRGDVGSIKIGNGTNIQDGTVIHVDRNPGGDTIIGSMVTVGHFCVLHACTVHDKAFIGMGSTVMDHAVVEPEAMVAAGSLVTHGKVIKSGEIWAGRPAKFFKKMSNEEIKHIAQSAQNYIMLMKEYKN >NZ_CP042904.1|WP_007548880.1|295151_295472_+|preprotein-translocase-subunit-SecG MSVAVLSIFQIILVVVLVILVLLQPPGSSSLSGFSNTQQGVNSMIPVKSSENPLSRITAIVAGLFIINTLLLSGLCSKDVHKKSIAEKIILEKKQESESTSVPFEN >NZ_CP042904.1|WP_007548879.1|295471_297076_+|CTP-synthase MKEAKFIFVTGGVVSSLGKGLVASSVGALLQAHGFKIRIRKLDPYLNIDPGTMNPTQHGEVFVTEDGAETDLDLGHYERFTGIKATKDDNITTGKIYHELLKKERRGDYLGKTVQVIPHVTDLIKSFIFNGTEGLDFVICEIGGTVGDIESQPFLEAIRQVNYTLGKQRVILIHLTLIPYLTAAQELKTKPTQHSVRELNSAGLQPDIILCRSEKEIFDNQREKIAKLCNVSLSNVIPAPDVSHIYELPVLYSQCGLDTQILEHFHLSKPKPSLTEWDQIVHSIRHPTQEVTVSIVGKYTEFPDAYKSLVEALNHGAISNKVKVKINWVNSREKEEKPINEKLIGEKLQNSHAILVPGGFGDDGVEGKILAINYARTNNIPFFGICLGMQLAIIEFARNVVKLEDAHSEEFRNCKHPIVKLAGDQDDDLGGTMRLGAYKCNINANSKMMDAYSNTTISERHRHRYIINSDYKDDLEKNGLLCSGISEDGTCIEAVELESHPWFIGVQFHPEFQSKPFSPHPLFVSFIEAAIDKK >NZ_CP042904.1|WP_012673118.1|297101_297509_+|nucleoside-deaminase MELAIEQAKLAQKNDEVPIGAVIVSGDNIISSAHNISSDPTAHAEMLAIRQAFSTSTLCDTDMYVTLEPCPMCAQAISFARIKRLYFGAYNPKGGGIENGAKIFQFCSHIPEVYGGILETECSFLLKDFFEKLRT >NZ_CP042904.1|WP_007548562.1|297572_298955_-|IS66-like-element-ISWen3-family-transposase MVNLLELCKNLQQKIERLEAKIERLEKENESLKAENKALKIENAELRERLGLSSKNSSIPSSKELYKIKKNKPKSERNIGGQVGHKGSFRANMDADKVVKIELPNTCECGGEIAICEKPYIHQKVDLPEIKPYVVEYQLEHGRCRRCGKRRSSKLPEGVTPDTFGPRVKSIIAAFSGFYKNSKREIASVVNDIFNLNISVGSISNSEHRVASKCKKMYEQIEQEISRSKVLHIDETSHYNKGKLAWCWMFASNTASFVKFTESRGMKVLQNSKFCNRNSLVITDRYAAYNYFADKNRQICWAHLSRDFERLAHSWNIEVKVLGCYLRNVATELFALKKALLKSEIDVLRFVRRARKLRKRTKYYLKEISRLPEAIGASRVAKNVLRSERMMWKFLDDPENIPLTNNHAERQIRHYVVYRKNSYFTQSKRGNTFLERIISLYLTWKQRGLNPFQNLLSIVS >NZ_CP042904.1|WP_012673119.1|299070_300330_-|hypothetical-protein MFSLGMGAAATFTLIKMSPLVLVIVAVTFFLTAIASMSLFVLYKKVKGERKHEVIVNNAVFNISLEEAANDLFSGLSTIAERGAEAGALYLEVKEKTESVAKKMTSKKELIEARFQNIQENFINKLSNFEELQGARDSSTLKKFYAAVKDVLKIRSSIPISNLHLLSLVYHLSLEVSYAIFQAITDPILGSTILTAISERKLPEDKQWAKVLKNTVPNLIRNQEVVRNVIVPTLTDILKSLSESREERKFIIYTLVCLKEVIDEVYTTSVQESLYRILGVELANSLNGMVQAISNLLGCYGHKEVERARTANELDYRVGKLTPEETQQFVINLGERVGSLREFEGRVTNKQSISKLIDYCLDPKLNDREAAATLLNYILTCTEDGRYLAAEAGTNNNLSSNSNVVLITHVAANRSAQLD >NZ_CP042904.1|WP_007548876.1|300347_301823_-|hypothetical-protein MTTNTENNNRINIVREQAGNAVHSDIAYSERIQKSVENEALCDAWSNFEYFEDVLRIKNSTDRENRIKQLIKEDLDINATKNGKTILDVAIEKKCSSKVISSLISNGSRIDTINASDRTVLHRSVRNENRKVVELFLEANEKEVSQYLVARFLPLSMLYQKIEVNAKDNDGCTALDYAQYGSEMYSLLQKYGAQHSEKFLYSRNLNIGELDLNKLVSDHNYCFDVLTKALEIEDRCEKEEVIDWLLKNGANINVNKGDQALLSVAAEKGDVENAVLLLERGAHEGVNSQDAEGRTLLLNAIIQDKLGHAKYLIKQRVNVNIPDNNGNSSLHYAVVNFIKQRLIECDETYTANATFYDFLKNGADLYIKNHDNLTAFEYAFHARIAPREAVYLFKLYIERGDQSENMQLVKNFKLPSGETLLEYFFNNKLFDSAQSCIDLGANVSHNGSSLLIQALQNRDIEGIGFLYETEQTFQITQTFQIIRKTVSCISK >NZ_CP042904.1|WP_094189586.1|302072_303356_-|MFS-transporter MYKLNLVQTRVLISAILCRIAIWYDHMLFIDLVNIISREFCCAKDVYNRILQLFGIAGLGAMVRPLGAFIFGHIGDRYGRRMALTIAILLISIPSSLVAFIPSYSKIGITSTILLLAIHVTQGIALGAEQGGSSVYLIEHLPNKKKLGMFFGIISFGRSIGILLSVIVVIICKKNTDFNAWGWRLPFTFSFVLGLISAYSVYTLGETPAYEENRKQRNLSDLPIIELIKRYKRALILAILISVPVNVVVGFTIFLRTIAKEIVSVETYVTTYVNEIVLIITSILMPVSSIALGMLADKVGKERTTILFTVITMVLCCPVLSTAYYYKSYLIIMLGVMALSIIERGINPIGIVAAELFPTNVRFSGVSLSRNISYALHGGFTPMICTWFTITFPQVNFAAGLYVVFCLLVSLVAILQIKPQDKKFDWS >NZ_CP042904.1|WP_012673121.1|303467_304052_+|hypothetical-protein MVGVIYLAMLGVAAIIGAIIGTLIGLLLSFTSLSPLIIGGTVGAIYVVPLIAAFITILLYPIPYERHSGLTLKETACLAGLFIGSVAAGVGLVACGLTPIIKVDSLSTTVSSLLAMGATIPVLLIATAIGVAIVIELAKQAKEYISGKIMQAEKEPVTDTHEEPGSKMEEAKEEKTARNKQAVRECSKNSPQPG >NZ_CP042904.1|WP_167494748.1|304235_304376_+|hypothetical-protein MNLVNFGDILFLVFNKLKYVLDNFSERSNQAKIGKLDKIILSLKLV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP042904_3 | 315402-315500 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP042904_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP042904_3
>3.1|315426|51|NZ_CP042904|CRISPRCasFinder GCTTAAAGCGGACTTACAATCAAAAAATAGCTCGTTAAAAAAGGAAAATAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042904_3
The CRISPR arrays of NZ_CP042904_3 >merge|NZ_CP042904|3|315402-315500|CRISPRCasFinder AGAATTGCGATCTATAATCATAAGGCTTAAAGCGGACTTACAATCAAAAAATAGCTCGTTAAAAAAGGAAAATAGAGAATTGCAATCTATAATCATAAG >NZ_CP042904|3|3|315402-315500|CRISPRCasFinder AGAATTGCGATCTATAATCATAAG GCTTAAAGCGGACTTACAATCAAAAAATAGCTCGTTAAAAAAGGAAAATAG AGAATTGCAATCTATAATCATAAG
>NZ_CP042904.1|WP_006280514.1|314304_314838_+|HK97-family-phage-prohead-protease MNKKFLYSPLSIKSIGENGVFSGYASVFNIVDKQNDLILPGAFKENLNRNKIKLLWQHNPDEPIGSIIDIYENDVGLYITAHLLLGIQKAEEVYLMLKTGAINGLSIGYIPIEYDVDHKSGARVLKQVELWEVSLVTFPANLAAQVINVKNQNNEQEVLARAIEKANAVLADMYISA >NZ_CP042904.1|WP_007549291.1|313675_314053_+|hypothetical-protein MIPFIVGCITSFVSLMAINAIKGNYYNGPGSLTCIPVFHANMSNFSDFTTDRINTFASFIIGTIAYKAAQNISTLVRDVSSLLHNRLEVQKNESEIARYKKIQENVISILSEVKVGSNLSRDINC >NZ_CP042904.1|WP_007549284.1|311284_312688_-|malonyl-CoA-decarboxylase MTKESLVKTDIVKVEDKKAVRSFFKILGGVADAVRSWIGNISPDLSNSRDIDSLVLKMNECLNPKGGEVSARKNAVSLGNLYLSLSEKGKIKFLQTLAEKFNPNKAEIDEKIKEYKKNQDPELNYKFEQDLIKILESPRSKILKQFISLPEGLKFIVDMRSDVLKLKNQHRSLNPLENELKNILYTWVDVDLLDLRQITWDSPASLLEKLIKYEAVHKISSWGDLKNRLDSDRLCFAFFHYKIPNEPLIFVEVALVDKIADSIQHLLDESVPSNDPSNASTAIFYSISNTQAGLSGISLGNFLIKRVVEKLSQEFKSIKTYATLSPIPGFTKWLKNNLNQDVTLLGKLNIKQSSAEILESAEQLKTNVECTNETKQYMLKLCAYYLLKVNNSNGNTYDPVAHFHLSNGASIKQLNWMADTSEKGISQSAGMMVNYLYELPKIDNNHENYMVNKVISCSKKVSSMLKE >NZ_CP042904.1|WP_007549283.1|309408_311205_-|elongation-factor-4 MNNIRNFAIIAHIDHGKSTLADRLIEECNGLEAREMINQILDSMDIERERGITIKAQTVKLNYTANDGNQYCLNLMDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGSLLVVDSSQGVEAQTLANVYKAIDNNHEIIVVLNKVDLPAADPEKVKLQVEEVIGIDASESVLISAKTGLGIKDVLEAIVAKLPAPQGDVNAPLQAILVDSWYDTYLGVVILVRVKNGVLKKGMKIVMMSNNATYQIDNIGIFTPKKVMTGELSAGEVGFITASMKEVADCKVGDTITEEKRPCSEALPGFKEVHPVVFCSIFPHKTDDFKYLREALEKLHLNDASFTFEAETSNALGYGFRCGFLGMLHLEVIQERLEREFDLDLTATAPSVIYRVTTRSGEILNIHNPSDMPDPTKIEIVEEPWITATIMVPDQYLGEILSLCEERRGEQEDLSYIGNTTTALLRYKLPLSEVVFDFYDRLKSISKGYASLDWEISSYLVSQIDKLSFLINGEPVDALACIVHKSRAEKRGREICARLKDLIPRQQYKIAIQAAVGGKIIARETINPYRKDVTAKLYGGDVTRRMKLLEKQKKGKKRLHSIGNVNIPQNAFIQALKISD >NZ_CP042904.1|WP_007548562.1|307459_308842_-|IS66-like-element-ISWen3-family-transposase MVNLLELCKNLQQKIERLEAKIERLEKENESLKAENKALKIENAELRERLGLSSKNSSIPSSKELYKIKKNKPKSERNIGGQVGHKGSFRANMDADKVVKIELPNTCECGGEIAICEKPYIHQKVDLPEIKPYVVEYQLEHGRCRRCGKRRSSKLPEGVTPDTFGPRVKSIIAAFSGFYKNSKREIASVVNDIFNLNISVGSISNSEHRVASKCKKMYEQIEQEISRSKVLHIDETSHYNKGKLAWCWMFASNTASFVKFTESRGMKVLQNSKFCNRNSLVITDRYAAYNYFADKNRQICWAHLSRDFERLAHSWNIEVKVLGCYLRNVATELFALKKALLKSEIDVLRFVRRARKLRKRTKYYLKEISRLPEAIGASRVAKNVLRSERMMWKFLDDPENIPLTNNHAERQIRHYVVYRKNSYFTQSKRGNTFLERIISLYLTWKQRGLNPFQNLLSIVS >NZ_CP042904.1|WP_007550935.1|306697_307072_-|TrbC/VirB2-family-protein MNPRKVFNILFIVLFISFSHVGSAAADTNTDTTAQVICNIIGYVWGIGGPLMTVVIIGAALLAIFGRMPWPALFALGIFCAVFFGAKTIVIKVMGGIGSTGNTSLMDQCGTGDTKKNYFFLKQT >NZ_CP042904.1|WP_012673123.1|305723_306722_+|pyruvate-dehydrogenase-complex-E1-component-subunit-beta MATLSVREALCTAIREEMQNDSDVLIMGEEVAEYDGAYKVTKGLLKEFGENRVVDTPITEHGFAGLAVGAAFAGLKPIVEFMTFNFSMQAIDQIVNSAAKTNYMSGGQLGCPIVFRGPNGAAARVAAQHSQCFAAWYSHIPGLKVIAPYFASDCRGLLKAAIRDPNPVIFLENEIAYGHEHEVSDSELSNKDYLLEIGKAAVIREGKDVTITAFSLKLMDALNAADLLSSEGIEAEVIDLRTLRPLDTQTVINSIQKTNRLVSVEEGWPFAGIGAELSAVVMEQGFDYLDAPVVRVTGKDIPLPYAANLEKKALPQVEDIVEAVHQVCFRKK >NZ_CP042904.1|WP_012673122.1|304385_305483_+|AAA-family-ATPase MKKIEISELLKRISICLLCVATIISIAFLFAYMHTMLLSKGYELAAHYVSEAMPCVLLVVFFFIAWFIYDQIFSKLKEVELPISIELANSDDKRITFADAIIDDSLRQRLQMICCDQMTEEMRKLFGNKSINSLRGYILYGPPGNGKTLIARAIAGESNMNFISISGPELIGVYIGHGAHAVRELFKIAKKYSPCIVFIDEIDAVAQKRSTANNSAYHCRESLTQLLTEIDGFKSRKDIIVIGATNLIGGIDPALIRPGRLGQKVYVPNPNIEVRQKILALYMRGTKTDEKLSLQDIADKTEGYSGAELEQLVNEAKISAGAQRRLIVSEEDFSYALHRLSPEQERDRIRLVSNVKTPTEVSYSI >NZ_CP042904.1|WP_167494748.1|304235_304376_+|hypothetical-protein MNLVNFGDILFLVFNKLKYVLDNFSERSNQAKIGKLDKIILSLKLV >NZ_CP042904.1|WP_012673121.1|303467_304052_+|hypothetical-protein MVGVIYLAMLGVAAIIGAIIGTLIGLLLSFTSLSPLIIGGTVGAIYVVPLIAAFITILLYPIPYERHSGLTLKETACLAGLFIGSVAAGVGLVACGLTPIIKVDSLSTTVSSLLAMGATIPVLLIATAIGVAIVIELAKQAKEYISGKIMQAEKEPVTDTHEEPGSKMEEAKEEKTARNKQAVRECSKNSPQPG >NZ_CP042904.1|WP_007548562.1|316763_318146_+|IS66-like-element-ISWen3-family-transposase MVNLLELCKNLQQKIERLEAKIERLEKENESLKAENKALKIENAELRERLGLSSKNSSIPSSKELYKIKKNKPKSERNIGGQVGHKGSFRANMDADKVVKIELPNTCECGGEIAICEKPYIHQKVDLPEIKPYVVEYQLEHGRCRRCGKRRSSKLPEGVTPDTFGPRVKSIIAAFSGFYKNSKREIASVVNDIFNLNISVGSISNSEHRVASKCKKMYEQIEQEISRSKVLHIDETSHYNKGKLAWCWMFASNTASFVKFTESRGMKVLQNSKFCNRNSLVITDRYAAYNYFADKNRQICWAHLSRDFERLAHSWNIEVKVLGCYLRNVATELFALKKALLKSEIDVLRFVRRARKLRKRTKYYLKEISRLPEAIGASRVAKNVLRSERMMWKFLDDPENIPLTNNHAERQIRHYVVYRKNSYFTQSKRGNTFLERIISLYLTWKQRGLNPFQNLLSIVS >NZ_CP042904.1|WP_012673124.1|318171_319344_-|CCA-tRNA-nucleotidyltransferase MQVDQETSLIIDAIEEFGGEARLVGGCVRDSILQRDVHDIDLATNLLPNQTIKALKLRNIKTIPTGLNHGTITAILNQRSFEITTLRHDVKCDGRHAKVEFTNNWQADASRRDFTFNALYADKHGHIYDYFGGIEDLKVRRLNFIGNAEDRIKEDYLRILRAFRFHAKICVGDLSDEILNVCKKHSHMIQNLSGERIRDEILKLLECNDPFPTLKSMQESDVLQKIIPKEVKCEILSSSLLFGTDALVKLALLLRTTKNDRLSLGEYVSKFLRLSNKQKKKLLFLLSNDIKTELSEKEQKKYISLFGRELYCDLVKICGVESGENVDEYISFANTFNIPKFPLSGDDLISIGHQPGKSLGRNLELLKQHWEDSSYTLTKEELVLYAKSLF >NZ_CP042904.1|WP_012673125.1|319427_320372_-|hypothetical-protein MAEPRKRKLPSDFHDVEVGIKRPRISGQEITLLNSNPYPDNFYVGQAIGNGSCFFDSFRQSLEQQTGEQVTAEKLRNDCREFAQKNPPKWFTDAIANGYDNNGQHRSETVDDYTANIMRNDRWGDPDVEGRILCEKYKVKLHVIENQTVDNQDLFLHELIDNSGSKSAGEYNKVNYDDSSVLHVINKGHAHFEPLLDRNKSLAKQEQEETKLKQEQEQEDCLLAKKLQLDEILEYCNLSKDISERAEVEKRFDELLAENADGKICDVVEQCVSDIKQHIQRSEKQKSLSPSCSMEEAKIERLSHQQQQQQIPAQ >NZ_CP042904.1|WP_012673126.1|320490_321585_+|redox-regulated-ATPase-YchF MSFNCGIVGLPNIGKSTLFNALTESSAAEAANYPFCTIEPNIGKISIKDQRLKQIAAIAGSEKIIYNQLEVVDIAGLVKGASKGEGLGNKFLSHIREVDAIVHLLRCFTDDDISHVHSKIDPISDAEVVEMELILADIDSIEKRLPQLEKKAKQGDKELKRQLELMQEVLATLKLGKPARSLENIDEDEMKSLQLLTTKPVMYVCNVEDTNVITGNELSKKVERMAEENKSKFYCISAKLEADIANLDSEEEKQSFLSEFGLQESGLDGVARIMYEVLSMITFFTVGPKEARAWPVKIGSTADKAAGVIHTDFEKGFIKAETISFADYIKYGSESACKDAGKIRFEGRDYIMQDGDIMHFRFNV >NZ_CP042904.1|WP_012673127.1|321687_322890_+|hypothetical-protein MKNILYFILLAVVFGSLSLFAVEQFEEKKIESVHKNENVGVRKQDSTNQKDELKSNVDAKQTQEAESKRLDDTTDKEKLQHNENKASVVEKTTSEGERIDKGLPNDQLEGSTDKFAQNLPNVVNKEVNKDLKPEPLPLSADLNENTANPQKNLQADQKIDIKDNELSKSDASQLLEGKKEKVENQSEEKKVKETNSNSKDRNRVKPITKKDEEEQSEKKSLQKWTKLNREPIKEWGHKDIQSKSIYKRQYDSLNEHLPTTVFIDDYSKQFFYCIKKNNLTCLRGVISKLEKIGLTIQEILRFRNKLGDTPLIYSVKQGEVDIVRFLLLQGADLRVVNNNFQSPIDIAIERKQVKIINAIAEMMPHLLEDRKIDNKESSAMYDWAVKTKENNELQCDKQDD >NZ_CP042904.1|WP_007548775.1|322882_324688_+|pentapeptide-repeat-containing-protein MIRFLILILVGHLCYGNETNDEKNQISDFLNALHDVKYVSYSKKDFAEFLVQCHKEGVPEDFKKGFGSNLNGANFNQLYLSKSVFDGVSLIGADFSNTDLSDVSFIDVDLRGANFSNANLHGIKIKGTNLSFTKFVSANLTDIVFDQSNVSYADFISSDLKKVSMHNVIGLHTNFSNVKMNFSNLSNSNVSHVNFSDSEINDTVMQKNNLNNASFFGVDAYKLKIQFSSLKNANIYGAELKESDFTGSNLSDACLNSSIIIDSNFDETNLSNTQISYVNDDNSSFVQSILNGSKIKHAYVSEANLHDADLSNIDFSFSELHQVNVSNADIRHGKFHNTKVANSNMNGSFFDHSLFTSAKIEDSDLSTTSMYKIKIQDSQVYNSTLSRHNIDSSEIENSTFFNLLADNSSWSNLKVTNSNFIESDFRSSLLHANAFRKTSFFLSNLSNSTISDMSFLSSSIYKSSVVDAHLTGCKFDNSILIDNQGQEKLTGSENAITSIKDLQEKISQGEKFNVNYSYFEFKDMNLENADFSNSTLSRAKFVNVNLNKANFEKTDLRYTVFDNSSLIGTNLSNSNLEGSSFLNSDPKSTMLKNAKKNDRKK >NZ_CP042904.1|WP_012673128.1|324671_325277_+|guanylate-kinase MTVKSEGVLLVLSSPSGAGKTTISAKLLERSTNLVRSVSMTTRKPRPGEINGKDYFFVTEEKFHELCKAGQMLEYAKVFENFYGIPRNFIEQNLSNGISVLLSIDWQGAFHLFKLMRKKVVSVFILPPSMEELRLRLQKRNSDDASEIERRLAEAQKEISKRDKYDYVIINDDIDKSVEEISSILNKERLKKLKEKPSLED >NZ_CP042904.1|WP_007548772.1|325563_328353_+|ankyrin-repeat-domain-containing-protein MGIDITALTTNADKLGECIDKNKKQEQDRKDEQLYGIIERKVKKEEHKREKPRGQDGTLKKCKRLFEKDASPEVLTKLEESLREQEKYYRYYVQCFLPVLDKAIERSKKISNETKKQVISKITDNSRYCFTHNRRDSETESGYGSDVGDDHEVNGTTDNDALLLKAIKNGNNRKFRKYLKDCTDISSIKDEKGNNILHFIASLEKKQKCKFLGTLIKTVTKEDLAQLINSENQTPFQVALINKVTKEKHESNTIRSNDNTLKFLTKLLEHGASSDNLELSTEELQNLKEEQKTYYRNFLEKLAEQGKKSKLKPEIRINTEAKIKEIIPHTINTPDSNDNYLLHPVIKNSDKKLFKELLEKGADISLKDTDGNNALHLIVKPETKQKLKLLNILLETGQKEQFIKAVNDKKEGQTPLHQILQRIQEKSENRSLKKFEKTKRYETLKLLLKNGADITVQDKDGKNALHYIALLKGEQKVACLKLTLGKDEFSKAINAVNGKEQTPLHQVLQRIQEKSKEPSLKNKIKNVVKKEFKDTGRYKTLELFLQNGADITVQDKDGKNALHYIALLKGEQKVTCLELISNKDDAVNTTNKEGQTPLHQILQRIQEKSENRSLKKFEKTKRYETLELLLKNGADITVQDKDEKNALHHIALLKGEQKVTCLELILNSVEKEKFSKAANATNEKERTPLQVALITKTTKDKHNLVNPKSRDNTIKFCVKLLQNGVDPKQLILPERLWSKEYYKTIKGIEKSMGRALIPDDMRTELKCNFGRKLKARDIVKYINNVACKAVTTLVFAALACAAIFSASQGIITIATASSIIAVIGVCYLIYLNLENIYEGFGKIKGKFTEEKQLTLQDNAPKNDTQCNNSVKDIENKSNDLEEQEVQKSPNQSEHTESPPDTKMSAISIYELVEKLCRDSVTSKPSSLAL >NZ_CP042904.1|WP_012673129.1|328324_330124_-|succinate-dehydrogenase-flavoprotein-subunit MDKSAYEIIEHEYDVVVVGAGGAGLRATLGMAATNFSVACISKIFPTRSHTVAAQGGISAALGNIGEDDWRWHAYDTIKGSDWLGDQDAIEYMCKNAAKAVIELENFGVPFSRTEDGKIYQRSFGGMTTHFGKGKSAQRTCAAADKTGHAILHTLYQQCLKFNAEFFVEYFVIDLIMDSETCCGVLAWSLCDGTLHRFRAHRVVLATGGYGRVYFSATSAHTCTGDGNGMVVRAGLPLEDMEFVQFHPTGIYGSGCLMTEGCRGEGGYLVNSQGEKFMERYAPKAKDLASRDVVSRAITIEIREGRGVGPKKDYMYLTIAHLDPEVIKLRLPGISETARTFAGVDVTKDPIPVIPTVHYNMGGIPTNYYGEVITLKQGKEEVVDGLFAIGEAACVSVHGANRLGSNSLLDLVVFGRAAALRAKEKLKSGTPHKKLHSDCTDWIVDRFNKMRFASGGLKVAKIRSEMQNTMQKYASVFRVAEVLEEGKKAIKKVAKMMPDISLEDHSMMWNSDLVEALELANMIPQAVITMECAANREESRGAHAREDFPERDDKNWMKHTIAWLEEKKGQINVKIDYKKVAEKTLSGEIDFIAPEKRVY >NZ_CP042904.1|WP_012673130.1|330869_332300_-|glutamate--tRNA-ligase MLDVVTRFAPSPTGFLHIGGARTALFNWLYAKHHGGRFLLRIEDTDRKRSTKEAIDAIIEGLRWLGVSYDGEIVYQSKRIERHKEVANLLVEKGRAYHCYCPEDEVAEKKIKAREEGKIYKHKCTTKPPSCHPSSRHWDPEENMWSRAGMTSGVRSVIRFKVPDSQEIVIDDKIYGQIKVNSNQLDDIVILRSDNTPTYIFAVVIDDHDAGITDIIRGSDHLTNTFKHLLIYQALDFDIPRFAHVPLIHGEDGNKLSKRHGATSVCDYEKMGILPKAMRNYLLRLGWSHGNDEIISDEQAIEWFNLESIGRSPARLDFKKLEHLNNHYISNMSNEDILTLMLRENTLTDKKKGYLLQGLTELKKRANYLTELLDLAKFYIQDPPLDLSEEAEQIVKSNLDIIKLLASFLSEIGDENWNKGFLSSQIKECAKLHDMKISDVYHSLRAPITGVMDAPGIIDIMVILGKDECIRRLQAI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP042904_4 | 345080-345184 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP042904_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP042904_4
>4.1|345104|57|NZ_CP042904|CRISPRCasFinder TTCTGAAGTAGCAAGACCTAAATTATTCCCTTCTTCTACATTAGAAACAGCTTCCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042904_4
The CRISPR arrays of NZ_CP042904_4 >merge|NZ_CP042904|4|345080-345184|CRISPRCasFinder AGCATCAAAAAATTCTTCTTCCTCTTCTGAAGTAGCAAGACCTAAATTATTCCCTTCTTCTACATTAGAAACAGCTTCCATAGCATCAAAAAACTCTTCTTCCTC >NZ_CP042904|4|4|345080-345184|CRISPRCasFinder AGCATCAAAAAATTCTTCTTCCTC TTCTGAAGTAGCAAGACCTAAATTATTCCCTTCTTCTACATTAGAAACAGCTTCCAT AGCATCAAAAAACTCTTCTTCCTC
>NZ_CP042904.1|WP_012673135.1|340451_342791_+|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-beta MKFTLSWLLEYLETNASLEEITDKLTHIGLEVEDVIDNTKLAGFIVAEVLEVIQHPNADKLKLCKVDDGSKILQIVCGANNVREGMKTVLASLGSTLPESDFTIKPTKIRGVLSEGMLCSASELALVQEESEGIIELSDDYKVGDKFFNCDPVIDINVTPNRGDCLGIYGIARDLAATGIGTLKTLSIPQLTSFINSPIDVEVTDGESFISGIYIANVKNQESPKWLKDRLESIGMRSISAIVDITNYIMISFSRPMHAYDAKKIEGELTVRKANDGEKFAGLNGKEYLLNKDISVIAGDKNIHGIAGIIGGKCSECTLETTDIFLESAWFDPISITKSSRQLGISTDASYRFARSVDPGFTFDGLNLAAKMILDLCGGETSSVVSAGSLDSVDTKVSFDYQDVNKFGSVSVSPDEVLDILTKLGFSIDKKTEGNWNVQVPSWRPDVTIPADLIEEVTRIYGYDKIKEEPLPNNVEEVDSTYDNLRILMTNRGFHEVLTWSFMSESTAEKFGYSNKLFIIDNPFNNNFNIMRPSIMPNLLQVTADNIAHGISDLAIFEIGPIYDGEARSKHVLSGIRTGNNLPRNHYNTDRKVDVFDAKADCIAALEFFNVNCDNLTIEKAEKEHYHPGKSGTLSFKNKVAGYFGELHPNILDLFDIKQKVVGFEVILENIENLPVSRKKFIDYKYQSVKRDFAFIVNKDVEVGNIINVIKKSSELITEVLIFDVYHGNNIEPNKMSIALSVTFCSPIHTLTEKEIQKESSAIVNLVCENTGGTLRTYR >NZ_CP042904.1|WP_010962582.1|340075_340339_+|hypothetical-protein MNEIDFINTNHPLNLEQEFGNGYIESVDCFLDEDTRDYYIGLNNAIIHFFFDGNIDEDAWDYESLKFFLEIDLKGDIEKILSLRKKI >NZ_CP042904.1|WP_006280272.1|339120_339846_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-A MALNPLEQFKVYTVIELPRLFGYDVSFTNSSLFMMISVILVILFLLFGIKKGAVIPGYLQAAVEYVYDFVISIIENNTGSKGLQHIPLIFTVFIFILSCNLVGVLPYSFTVTSHVIVTFALSMVVFIYITIVGFKERGVEFLRILLPKGTPSWLAPIIIIIKLFAYLVRPVSLSIRLAANMIAGHTIIKVIAGFIVNMNIFFTPAPFLFIIALIGFEVFVAILQAYIFTILTCVYLSDAVK >NZ_CP042904.1|WP_006014985.1|338833_339061_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-C MDLVALKFIAIGLAVFGMLGAGLGIANIFSAMLNGIARNPESEGKMKSYVYIGAAMVEIMGLLAFVLAMLLIFAA >NZ_CP042904.1|WP_007548633.1|338350_338830_-|ATP-synthase-F0-subunit-B MPQLDVSTFFSQVFWFLIFFSSLFFVVSCLFLPKLDKIISTRSKEVLGSFNSSVHLLRLTEEQIAKYNAALNQARIQAKKIIDDALAQVEEMRANVKNILEEEDKKMSKLIEEKVAEFKSEYTDQLKQMATSIALIYYTKLTNSEIEEEFIADLVSKEF >NZ_CP042904.1|WP_006280273.1|337865_338342_-|hypothetical-protein MSTSLIIGLAFLVGFVLSYKLLKKVIKNALNNKRNKSKFSSEETEKFRKDMLEYYKKSSEKYKKLDAEVNEMMNEALDKANSIIKHNRQQLDQTLDDNAHSNLKKVTDQVEKALGDLQANTASIAADAVKKIMHERKDDKRSSEVISSFSRDLNKKLH >NZ_CP042904.1|WP_012673134.1|336261_337860_-|glycosyltransferase MPILQADNVEKIKFDSSLCKEQEKLFYYKFNIIPWQKLNNTTFFMVEDTSRDINRWVEAHYGIDYVLIKVDSEQILNLLNSHFGISEFASNYLYYKNPNFSAKSIKLSSIFFASFFIVTSILTLTEKYTYFALMLIFIIGCSSYLFKFIATIFNLCETSNQKVDYSKLNEEDFPIYTILLPAFKESAVIEQLIESIESLDYPKSKLDVKLQVESDDQETLAAIEKYTLPQYFEVIKVPHSLPRTKAKSCNYAMSFARGKYAVIYDADDKPDPLQLKKALIEFNKGDDKLACVQAKLNYYNCDCNFLTKSFSLEYMNWFQYLLPGFQKMNMPMPLGGSSNHFSVKILRKMFFWDAYSVTEDADLGLRLAQMGYKTRMIDSETLEESPIAVFAWIKQRARWIKGYMQTYIVHLKNIKSLYKHTGFKGILLLNLFVGSAAFLFFTTPFLLLSLILTKVLNELFLYYFVVVYVTNLILLVIAVKQQKMPFYFYIVSIFFPVYSLLHSVAAFLALWEFILYPERWNKTQHGLWKQNL >NZ_CP042904.1|WP_012673133.1|335251_336280_-|COX15/CtaA-family-protein MEAKPVAIWLFLCSVMVILMVGIGGFTRLSKAGLSITEWKPITGTLPPLSEQDWLQEKLKYEATPEYKALNYGISMEEFRAIYLIEYIHRLVARLTGLVFVLPFIYFILRRKISKKVVIKLFVALLFGALQAFAGWYMVKSGLVAKPHVSHYRLALHLLLALVIFALLSYQFFDYQIRPQQTKLKVSGNTIYYARMILVLIVIQIIFGAFVAGLNAGLIYNTFPLMDGQIVPEDLFFLQPIWLNIFENRATVQFIHRALALLILTLVVILTVKNASIKPVYIMLLSVVIQIILGVITLLLHIPIAIAIAHQVFSFILFGSSLYFLCYLRKQTTSPICTFFPS >NZ_CP042904.1|WP_012673132.1|333227_335303_+|acetyl-CoA-carboxylase-biotin-carboxylase-subunit MTEKKYSKILIANRGEIACRIIRTAHKMGISCVCIYSDADVNSVHVRQADESRYIGPSPSCLSYLNIEKICEVAVETGAEAVHPGYGFLAENPDFPRALQKHNIDFIGPSAETIEVTANKITAKEAAKKAGVNVVPGYMGKISDAAHAAQVAEEIGFPVMLKAASGGGGKGMRIVNSKKEIELAFTSATNEAEKSFKDGSIFIEKYIELPRHIEIQIIADKYGNIVCLGERECSIQRNNQKIIEETPSPFISEEVRQKMYVQCVSLAKQVGYFSAGTVEFVVDKDQNFYFLEVNTRLQVEHPVTEFITGIDIVEEMIRTSCGEKLRFNQDDIKLTGSAIESRICAEDPSKKFFPSSGRIKYYDKPGENDYVRIDDGVAAGSEISMFYDSMIAKVITYGKDRVEAISRMQKALSECYIEGVTNNIEFLESIFHHPNFIAAKLHTRFIPDHYPSGFHGDFVTEEYIKIFIFTALYVHLENEERYHHKAVNETSQVSFQCVTLESSKKEGAPVSATRMAGDRARDLFIVNINDNEYSVNAKYQDNILITVYNHNKYSVIGKWKSSYRLLYITINDDTNIALKIERQGSKYFIRHAGMKAECCILKPHVAELSKLMLNNETEGISADAVKSPISGLLVKLHVNVGDQVEIGQPLFVVEAMKMENIICAEAAMVIKNIPVQEGKNVQIGDVVCFLK >NZ_CP042904.1|WP_012673131.1|332450_333164_+|hypothetical-protein MYELVDIAKLLSDNEANINWHYTGPFDKTKQRIRGDNLLHLAAKTGKVDKFLSIFKKSVESNVHLLEYNKDHENPFHIAAEVGILPSVVKGIFKHLESEKTNPNCDPKKLENVKNYVKEALCNRCALDQSKKTPLDWVSKTVKKEIKEIAGIKDSFICNQKFRLCLYIVGAIACIAALCLSLYFLFLVSQSLALASMAGIISGGAAYLSGKVFSEIHDLHDVSTPVETFSNEDLARI >NZ_CP042904.1|WP_007548628.1|345339_348651_-|isoleucine--tRNA-ligase MKSKHYPDTVSNPDFSSLEKEIIKFWQENKVFEQSVEERSKDNCFVFYDGPPFANGLPHYGHLLTGFIKDAFARYQTMLQKRVERRFGWDCHGLPAEMGAEKELGISGRTEIEKFGIEKFNNHCRTSVMKFSSEWEKYVNRQARWVDFHNDYKTMDKSFMESVMWAFKQLYDKGLVYESVRVVPYSWACETPLSNFETRLDNAYREKTSKAVTVAFELLENPQQFKNIEQKCKLLAWTTTPWTLPSNLALAIGKDIKYCAVSVHSLAAREAGIQEGNKCLHAEVTSNQPNEIYIFAESYLEKFISHSEQNNIPYENCNIKLKANDLAGLSYKPLFDYFKDTKNAFRVFIADYVTGEDGTGVVHTAPGFGEEDFYLCQSHDIPVICPIDNSGKFTAEVSDLAGVHVFDANDTVIKKLKGQGSWFKTEQYIHNYPHCWRTDTPLIYRTMPSWYVAVTKFKSRMVELNKRVNWIPNHIRDGQFGKWLEGAHDWSISRNRFWGTPIPVWKSDDARYPRVDVYGSIEELERDFNVKIDDLHRPFIDTLTRPNPDDPTGKSVMRRVPDVFDCWFESGSMPFAQIHYPFENKEWFESADFITEYIAQTRGWFYTLFVLSTALFDREPFKNCICHGVVLDVKGQKLSKRLNNYADPMEVFDRYGSDALRFLMLSGSIVCGGNLLLDKEGNSIRDVLKNVIKPIWNSYHFFTMYANADGIKAEVCKDYQSTIDRYMISKCFEAVEGIQASMNNYNSQEACKILMNFFEVLNNWYIRRSRERFWKSDLDQDKTDAYNVLYTVFYYILRAAAPLLPLITENIWQGLKYEETSVHLANFPQLEKFDSQLIAKMDLVREICNSALSIRNTFNIRIRQPLGSMIIYHQSSCSFLEGEPFSVIPEFSPVIQVADTGIQCAADSNEYQEMIKDEVNVKKLELVNRLEDIASLELKLSFPLLGKRIPDKIKKLVQYVKEGKWKQVENEQVFLGNESENYIIEKGEYELLLKANSGYSAVFDNNKGVVILNTELNDELILEGLARDVVRLIQETRKQADFHISDRIRVIIKTEDEKIKEAINTWFEYIKEQTLALSLDINTEIGTNFYSKEYQDLSVSIER >NZ_CP042904.1|WP_007548626.1|348827_350294_+|MFS-transporter MDQKTDKFPQFLKMLCFVEMWERFSYYGMRALLVLFLTSHLGFTDERAFTIYSLFAATGYAIPILGGFLADKLMGFRNMVLLGGIVMIAGHACMSLVKFEPGLLYLGLSLIAIGTGMFKGNVTNLLSSCYGKDDPERSRGFTLFYVGVNIGAILASISCGYVAHLFGWHYGFGLAGIGMSIGLIFFLKFQNLLGDSGLSPYPELMNKRILGIKIFGIVLIGSFLSSSIIAKMLIHSEFFTNMLIFIGITALGIFIYIISKLSAEQRRKLVALSILVVFFLCFFALEMQLGSLVNLFTERNVINNVLGITIPASVSQAINPLSIIIFGFLFGTYMKFKQKYATSMFTLGLLTMAMCFFTLYIGCLNSNIEGKVEYLYLIIAISFMGLGELCIAPLVQEQATTLAPKNLRGVVMGIVMLSLAFSNLAGVAISKFMSVPSVNGKINYLESLEIYKEGFLKVGIFNLMLVIVFLFFFNFIHKVVTNSSCTKN >NZ_CP042904.1|WP_010962578.1|350433_351753_-|tRNA-(N6-isopentenyl-adenosine(37)-C2)-methylthiotransferase-MiaB MKGLYIKTYGCQMNVYDSVLMENVIKPLGFNVVSDAGKADLVILNTCHIREKAAEKLYSELGKIHSLRKEMTIVVAGCVAQAEGEEVFRRAPFVDIVVGPQSIATLPELIVKASRSKGHVINTDFPEVAKFDKLPDECYGNSQGSSAFLAIQEGCDKFCTFCVVPYTRGAEYSRPVNEIFREALKLVANGANEINLLGQNVNAYHGECEGEVWDLGKLISHIAKIEKLERIRYTTSHPRDMHESLYLAHAEEPKLMPFVHLPVQSGSNKILHAMNRKHTAEEYLEIIDRFRKLKPEIEFSSDFIVGFPGETEKDFEETMKLVEKVRYAQAYSFKYSPRPGTPGAERKDQVPEEVKTERLLRLQKLISKQQLEFNQSMVGKTIPVLFSDKKGKHQNQIIGKSPYMQSVCIDDSEDKYRDKIVNVKVLEARQSSLLGCAFH >NZ_CP042904.1|WP_010082641.1|352364_352793_-|protoporphyrinogen-oxidase-HemJ MNYYHWLEAFHVISVIMWMAGMLYLPRLYVYHATVKPGSENDSLLQTMEKRLLRYIINPAMLFSLGLGITLMVIREAYREGWFHVKAFAILLMLIIHMLLAKYRKNFAMGSNKKSHIYFRVLNEAVTVLIIVIVIMVVVKPF >NZ_CP042904.1|WP_012673137.1|352848_353829_+|pyruvate-dehydrogenase-(acetyl-transferring)-E1-component-subunit-alpha MKAENFTKEQIIGFYRKMLLIRRFEEKAGQLYGMGLIGGFCHLSIGQEAVAVGTQAASKLGDAFITSYRDHGLMLACDSDPNVVMAELTGKETGCSKGKGGSMHVFDVEKKFFGGHGIVGAQVPIGTGIAFANKYKKKDNVVFTYFGDGAANQGQVYESFNMASLWELPVVYIIENNEYAMGTSVQRSTLVTELYKRGESFGIPGKQVDGMDFFSVYEATSEAAEHTRSGKGPILLEMKTYRYRGHSMSDPATYRLKEEVEDMKQNHDPISTLKKYMTDNKMASEEECKIIDKEIRDLVKKSEDFAKNSKEPSVDELYTDVYKFVS >NZ_CP042904.1|WP_006279888.1|354237_355161_+|RluA-family-pseudouridine-synthase MLQSIKTILIEDDNVRLDRYIRRIFPDLKQSVIEKSLRKGLIKVDDCKAKSSDRVNSGQTITLKHLNYIENANSDRKYNEKLVNLLRENILYEDEYILAINKPAGVIVQGGVKVKISMSDLLDQIREGETFKIVHRLDRDTSGVIIFARNANVARYLMEEFKGRRVKKTYLALTSGIPSKDSGTIDYPLVKKYVSGQEKVVVDENSPQNATTHFSIIAKSKHNVAYLKLQPITGRTHQLRAHLAHINCPILGDGKYGGKKAFIDGIANKIHLHSHSLSLKLPNNKEITITAPITKHIEKSIEALFFD >NZ_CP042904.1|WP_006280528.1|355168_356431_-|MFS-transporter MNNIQKAILSGMICNMIVWYELTLFGVLTDTIINVFFPSEDHYLSTLKFLGVFAIGFAFRPIGAVIFGYMGDKYGRRKTLLTSVILISISSTIMGIIPGYKEIGLLSPVLLVFCRIVQGITAGGETSINTAFTIEHSKDKKNLGFLGSMKPFSGALGTLLCITMIFICKRVTGENYEIWGWKLLFYFCFFLGTIGFLTRYILKESLAYKTNKYANNLAHSPLLELVRNYKRPLIISINLGIAQNAIVYAAIMFYNISIKELVILSISVKDLMRIVIQVVFAASAVLFAILSDKVGRKRVMIPVLIMLSLIGTCVLPLLSSVNHYVVIITYLLITIPVGASFGIYGSVICELFPTKVRCTGVSLANNISAGIFGGLSPYICMWLIEKTETKLAAGIYLTACALISLISVLQIKAKDRKVDW >NZ_CP042904.1|WP_007548818.1|356492_358295_-|aspartate--tRNA-ligase MNCYKTHTCNELRKNDVEKEVTLSGWLYRKRDHGNLIFVDLRDFYGITQLVFNNDKDFFDEISNLKLESVITVTGIVEARTEDTVNSSISTGEIEVIVNNLRVESEVEFHFDEEIAKEERSILASITGEQEYPENMRFKYRFLDLRREKVRNNIILRSQIIAELRKLMIERGFLEIQTPILTASSPEGARDYLVPSRLNPGKFYALPQAPQIFKQLLMVSGFDKYFQIAPCFRDEDARADRSPGEFYQLDLEMSFVTQEDIFQIIESTLYRVFAKFSRKSVDKDFPRITYKEAMLKYGSDKPDLRNPLLISDVTEIFRDSGFNIFKSNIERGMVVRAIPAPKTAEEPRSFFDKKIEHAQKEFGAKGLGYITFDKDGTAKGPIAKFLDENRLNHIREATNIEPGDSVFFASDKENEAANIAGKVRTLLGSELSLIDDNIFKFCWIIDFPYFVYDDKSKKIDFFHNPFSMPHGGLKDLEDKNPLDILAYQYDLVCNGIELSSGAIRNNKLDIMYKAFAIAGYSRGEVDTRFGALVRAFRFGVPPHGGIAPGVDRIVMLLADEPNIREVICFPMNQQGEDVLMGAPSKVEDKHLRELSLKVIE >NZ_CP042904.1|WP_007548817.1|358491_358923_+|hypothetical-protein MPLTQIILYSVTLLAVAAVFLFLRKIYKNRIRKIILPRKVFKEEWEEDRKFNELYQKNKQKELMKQQETLREKQKDVQVYKEDPEIVDIAKPVGKWTKMVMMGNGLMQRFAQLIHREGGQKGFWELFVKAQASTQGKHKGKGR >NZ_CP042904.1|WP_007548816.1|358926_359550_+|heme-ABC-exporter-ATP-binding-protein-CcmA MLECENLSCTRNNKVLFKNLSFKAELKSKILITGPNGSGKTSLIRSLSGLLPPVSGNIRHCGKDIYDDPKSYISSMVYIGHKNACKDSLTVAQNVEFWAGIRNTRELIVAAICCLQLQPVLNIRYGELSAGWKRRVALARLLISNANVWLIDEPFCNLDSATCELVLNLISIRSEQNGIVIITGHSSTEQLCDFTTIDIRNFNRLLV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP042904_5 | 373458-373568 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP042904_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP042904_5
>5.1|373488|51|NZ_CP042904|CRISPRCasFinder TGGTATGACGGTTAAGTAATTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTA |
RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042904_5
The CRISPR arrays of NZ_CP042904_5 >merge|NZ_CP042904|5|373458-373568|CRISPRCasFinder GAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGGTGGTATGACGGTTAAGTAATTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTAGAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGG >NZ_CP042904|5|5|373458-373568|CRISPRCasFinder GAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGG TGGTATGACGGTTAAGTAATTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTA GAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGG
>NZ_CP042904.1|WP_012673141.1|371531_373343_+|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) MCGIFGVVSSGDSVIPTLLTGLQKLEYRGYDSSGIAIINNEGKIEVKKSEGKVERLCEVVDDSKMSHSTVGIAHTRWATHGVPGLKNAHPIRTNNVVVAHNGIIENYNLLKKGLEERGMPFHTDTDTEIIPNMLTLYLDEGLSPIDSLFKCLNNLHGSFALVLLFAEYPDALFVAKRNLPLAIGYNCNTVFAASDSNALSAFVERISHLEDDDIAVIKSSGVSIYNNGTQVKRSIENSSPSDFLISKNGYPSFMLKEIFEQPCALNKTINQFYKQYKEVNKKLFSELNHITIVGCGSSYFAGLIAKYWLESVAQVRVYLEISSEFRYSNVKLEEGSIGLFISQSGETADTIEALRYAKSQKQTIISITNTFSSSIEKISDIVLHTLAGPEIGVASTKTFSAQLATLACFVVELGKIKGVLGGERIKQLSNAINSIPKHVEHVLNVMKIQHISGSILEHNNVILIGRGSSYGVAMEGALKIKELSYINTIGIAAGEMKHGSIALIDSTVLVIAIIPYDSLFFKTLSNIQEIIARKGKVIAFSDKQGAPFLREVCADVVQLPDADNFISPIIYSVAMQFLAYFTAAKKGLDVDCPRNLAKSVTVE >NZ_CP042904.1|WP_007549294.1|371079_371451_+|preprotein-translocase-subunit-YajC MLISEVFAADATSNTSSIGASFASFTPLILIFVVFYFLIIRPQQKKLKEHRRMIDQIKRGDTVITSGGIIGEVNKVDEANAQFIIEIAPKVEIKVLKSAISEVLSKETQKVAAKPIKKVKSKE >NZ_CP042904.1|WP_012673140.1|369825_370674_-|30S-ribosomal-protein-S2 MTNLPKVTVRDLAESGVHFGHKISRWNAKIAPYIYGVHQENRIHIIDLRKTLPLLQVAMKVLYDVAFQGGRILFVGTKFQAFDIIASEAIRCGQYYVNHRWLGGMLTNWGTVSSSIKTLMQYEKILNDEDSILTKKELGNIEKKKQKLDKALGGIREMGAIPDILFIIDTNKEHIAVKEAKKLGIPIVAILDTNSDPDGITYLIPGNDDSRKSIELYCKLATDSILAGIESSLAKSGVKIDDIRGDEFIQEKEDGIVQTKRRRSKVYKEEEREVVTNEDESR >NZ_CP042904.1|WP_007549205.1|368984_369845_-|elongation-factor-Ts MKMNPDDIRELRDRTGLGLSDCKKALEECDGDIKKAVDKLRTIGLAKADKKSDRVASDGLVAMCLTENCGVLIELNCETDFVARNEKFIELVLNLASIAHQERCTSVDELKNAKYESIGTVQEAIMNGTSVLGEKLELSKLCYLEAKDGVIAGYVHGDVCGLGKIGALIALQSPGDKAKLQEIGKQIAMHIVAMKPEALSIDDLDQMKLKNERSIIEEQVRSLNKPEEVAKKIVDGRMAKYYEEVVLLEQKFIKDDKMKVSDFIKSSEVSAVKLSNYKLLVLGGAN >NZ_CP042904.1|WP_007549204.1|368230_368974_-|UMP-kinase MFPSINEKSEIKYSRVLFKISGEALMGSQSFGYDMGIISQLCKDIADINRLGVQVCIVVGGGNIFRGTSASLSGCERASSDYIGMLATIINALILQNFLEKNLIASRVLSAIPMATVCEPYIRRKAIRHLEKGRVVIFAAGTGNPFFTTDTAAALRAVEMNCDVILKGTQVNGVYSADPKKNEDAVMYDRLSYTDLLTRDLKVMDASAISLARENSIPIIVFSLKGEKIVNIIKGQGTYTIVSDCKH >NZ_CP042904.1|WP_007549203.1|367665_368223_-|ribosome-recycling-factor MLNEIKAKTKERMLKTIQSFHDDIKGVRTGRASASLLDGIVVNIYGGHQKLNQVAGVSVIDNKTLSIKIWDINVVGEVKNAILNANLNLNPVVEGNTIRIALPDLTQETREKLVKLLHQFAENARIAIRNIRRDIMEETEKMKENKEISEDDFHGAKKEIQNITDNNIKKIDGELSIKEKDILNH >NZ_CP042904.1|WP_006280511.1|366694_367390_-|di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase MLNQESLPKHLAIIMDGNGRWANNQGRVKIDGYKKGSEVAYDIAKYCTDLTIPYLTLYAFSMENWLRPKNETDCLFDLFYSVLTNEDKVNFICNCNIKLNFIGNLSLLPSKILDQIKKAEEMTHKNDGLLLTVAVSYGAKQEITQAISNIIKENIAYVSEEEFEKFLYTKDLPKLDLLIRTGGEKRLSNFLLWQAAYAELYFCDTLWPDFSCQDLSKALEDYTKREKKYGR >NZ_CP042904.1|WP_006280510.1|366078_366705_-|phosphatidate-cytidylyltransferase MVDNNFIVRMLSSIVILFIFSFATYFSDLSFYLLIFSIAVLSSFEWYNLTQGNKILYVFALLLIALPSASLIYLYNLPQGKYALVWFVLTIWGIDITAYLFGKNFGGAKICPILSPGKTWTGLLGAILAGVVCTIFGSIFFGLFSIFYSPIIGLAIAILAQLGDFTESLVKRAYGVKDSGNMIPGHGGVLDRMDSFIFTAPLIAIYIS >NZ_CP042904.1|WP_006279326.1|365870_366062_+|zinc-finger-domain-containing-protein MSKVRVNNRKVCCHGDENDEGSGHPLIYLDMGEEEEIACPYCEKTFVHDCTVEAVGELTRDEL >NZ_CP042904.1|WP_012673139.1|365295_365802_+|pantetheine-phosphate-adenylyltransferase MNINDKIGIYPGTFDPITFGHLDIIKRACKLVDKLIIGVAENVNKHTAFDTKLRTSMAENEIKGLGIDADVISFNGLLVKFAKEQNASVIIRGLRAVSDFDYEFQMSWVNYKLLPEIETIFLPASEDTQFISSGFVKEIARLGEDVSKFVSKGVQNELINLNRIKNGE >NZ_CP042904.1|WP_010962971.1|373649_374093_+|hypothetical-protein MALSKFLDPKLDLTFKKIFGTEKNKNILIHFLNDILGFTEINTIQEVEFLSTIMDPEIASDKQSIVDVLCRDSSGARYVIEMVRPESLRSYCLKGEEFIQKETERILKLIEPDVLPSESTHQCELGNQLVPSDADNEPPLDKEDAQS >NZ_CP042904.1|WP_006280223.1|374530_376078_+|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MITSTTVSAPTNNSEAWNQLPWKKCQKVVMRLQRRIVKAVQQGRWGKVKTLQHLLTRSFSGKALAVKRVTENQGKNTAGVDRQIWSTCNTKFQGIKLLKQRGYKPSPLKRIYISKSNGKRRPLGIPTIKDRAMQALYLFALEPIAETISDRHSYGFRPKRSCADATVACHLLLASRNQLQWILEGDIKGCFDNINHEWLMKHIPMEKKILHSWLKAGFLESKTLYSTTAGTPQGSIISPILANLALNGLEKSLESQFGKLGSKRRSKIRSGVNVIRYADDFIISGITREVLENEVKPLVSSFLQERGLILSEEKTKITSITTGFDFLGCNVRRYNKKLIIKPSKESIKKLLNKARTLIKANIANTQAVLIKLLNSLLRGWGNYYSHVCAKRAFNKIDHEIMCALWKWAKKRHPRKGLRWIKNRYFKVMKQRQWVFAAPICKNKPKEIRYLRLLRLIDIPIRRHVKIRADANPLDLKWKKYFDERVKQTKMLASSFSREGSLLLVSPLRMMFSEES >NZ_CP042904.1|WP_007551350.1|376074_376884_+|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MKDKPVREKKDLDKGLKRSVGKPACCVSKGGSSSNTTSLPNQLTRDKGFEKRAQLYAAKAYSRQADKSGKYIDLKKVFFIAISNCNLFPDKLDYISSHTIRDEKTNEHDLKDFQFVFIELPKFPKNKEEQLESIVDRWLFFFKYADETTEEDLRKIAEKAPIIKLAYDELDRFSWNEKDLVAYEERIMDLRKEEAILEYRLDLATEKGIQIGEERGIKIGKEEGKIEGKIEGKIEVAKAMLANNVDVNTIVKFTGLSISEIEELSVNGY >NZ_CP042904.1|WP_094745766.1|377061_377894_+|IS5-like-element-ISWpi1-family-transposase MRKKYPTDLSEREWARIEKHFRVSYKKGGRPPKYNKREILEAIFYVLRTGCQWRYLPNDFPLWKTVYEQFRQWKKQGIFEKMNYEITKYSRRKIGRNEQPSACIVDSQSVKTTEKGGSKAMMEGKKVKGRKRHIITDTQGFILGCYVGAANENDRDGIKIALNNMRTKYTKVKKMWADMGYQGRNLKNHIKEEYDIDIEIVKRPPCRFWVHKDTPPELLPTREQGFKVQPRRWVVERTFAWVNRNRRLSKEYDLLTTSTENFIYLAMSRVMLKREYA >NZ_CP042904.1|WP_006280574.1|378068_378956_-|UDP-N-acetylmuramate-dehydrogenase MLISLPKVRGIYRYDILMSKATWLNVGGRADILFKPRDIEDLTCLIKNTELPVSVIGATSNIIVRDSGIRGITVKLGKEFAYIKSKGNNSIVAGGAVLLSNLAHFAGNQQISGLEFLVGIPGTVGGGIEMNAGAYGSDIASVVQSIKAVNLEDGNLYEFSSEEMGYFYRGHSLKGNWIFVEAEFKGVNSEYELILQRLKEVIERKNKSQPIRGKTAGCIFKNPKNYRAWELIDKSGCLGLNIGGARISKKHCNFLLNYDNATASDLENLGNKVKDAVKDKFNVELEWEIRVLGSY >NZ_CP042904.1|WP_012673143.1|378946_379825_-|hydroxymethylbilane-synthase MLVKIGTRGSKLAVVQALEAKQKLLDSFPNLSIEIVKIKTSGDKYANANLAEIGGKGLFIKEIEAELLENNIDMAVHSLKDVPAFFSWGLTIPCVLERLSPCDAFISHKHNSLESLPQQATIATSAIRRKVQLLNFRPDLNIVPLRGNVTTRLQNQSFDGIILAEAGLIRLEKHHLITEVLPPKVMLSAVGQGAICIQCRRNDVKIIDLLEKINNNMSFIGVKSERSFMKTVNGSCFTPLAALAEYVSENMLYLRCMLADGKNIYFTERTSFIEDAEKMGMDAGLELKSKCL >NZ_CP042904.1|WP_007549255.1|380778_381951_+|2-oxoglutarate-dehydrogenase-complex-dihydrolipoyllysine-residue-succinyltransferase MSKIIEIRAPKTLGGESVTEGIVKIKKGIGEAVKVDDLIFEIETDKTALELTAEASGQITEFLVKEDDVISPDQLLAKLSVGEVKEEAKKEDKSESAAKKDAPSARKIMEENAISAESVKGTGMGGRITKADVIGHMNKAEQPAIKQYELPKSVVNGEQREERVKMSKIRQVIAARLKASQNTAAILTTFNEIDMKNVMDLRTKYKDAFEKKYGIKLGFMSFFIKAAVQALKEIPEINAEISGDEIIYKHYYDIGVAVGTDKGLVVPVIRSADQMSFAEIELTLVALGKKAREGKLQVSEMEGATFTISNGGVYGSLLSTPIINPPQSGILGMHSIQNRPVAVGNAVEIRPMMYIALSYDHRIVDGKGAVTFLVKIKNYIEDPNRLVLEV >NZ_CP042904.1|WP_084741728.1|381989_385058_-|tetratricopeptide-repeat-protein MAFFLLLSIRYLCSGNWYDDEIEDFLLRIRFVVNQPNHSKLDDIIKKEIGNIYKISGKKDIDMVFDFACGKVEKWWEQQGSEVSYLTRKDDYFKEAIEHLYSLKPRENLFERWNIPPKIAGRNFIERKYLNEKILDYLKTENEPVILTALQGLGGVGKTQSVLDFIQKHGEKYKGICWLNAKDEDQLISEYVKLGRALNIIYGEDKIPAAQQACYVRNWLEDSKREGWLLIYDNVSNYEVISKLRPTKGGKIIVTSRNTEWPQGSIGVDVFTPPESELYVKKILGQVSESDRPNIGILAEKLGRLPLALAQACAYIKENKMTISRYLEIYAERKLYLLSHKTLPKDSNHEPVFITWDITMDAICNESNLASRLLIACAYLGNDIPKDLLRIFPEIVENNSEEKPFEEVLGILLRYSMLVSNEQSGSVSIHCLVQDVIRLKSEESGETKENIETVFQLLQESFPYGSDKLEDYAKKRQLLLHLEAFLSHIDDWLEKNPLEKQTIEKYYLMDLLIWMDNGYYDLGNPRRQKELLERALAIKEKHYESDHCEVAITLVNLGNAYYALDYPQKAKELFEQALAIKEKHYGPDHFEIATVLGNLGTAYRALGNPQKAKELLEWALPILKKHYGSDHFEVAKLLTNLGIAYGALGDPQRARELLERALAIQEKYYGFDHFEFAITLANLGTVYGALGDPQKAKELLEQALVIDKEHYGPDHCKVAITLTNLGNIYRALGDCQKARELLERALVIKEKHYESDHCEVAITLVNLGNAYYALDYPQKAKELFERALAIKEKHYGFGHFQVAIILGSLGTAYYALGDPQKAKELFEQALAIKEKHYESGHFQVAKLLTNLGAAYRALGNLQKAKELLERALVIDKEHYGPDHCEVAITLTNLGATYRALGNPQRAKELLEQALTIQEKHYGPDHCEVAKILINLGITCYALGDPQKAQVSFTRALPIFKKHYGPDHPEVAKLLVNLSDAYGALGNHKKQKELFARASSIFTKHYGPDHPEVVKLLAELDDV >NZ_CP042904.1|WP_094745767.1|386153_386986_+|IS5-like-element-ISWpi1-family-transposase MRKKYPTDLSEREWARIEKHFRVSYKKGGRPPKYSKREILEAIFYVLRTGCQWRYLPNDFPLWKTVYEQFRQWKKQGIFEKMNYEITKYSRRKIGRNEQPSACIVDSQSVKTTEKGGSKAMMEGKKVKGRKRHIITDTQGFILGCYVGAANENDRDGIKITLNNMRTKYTKVKKMWADMGYQGRNLKNHIKEEYDIDIEIVKRPPCRFWVHKDTPPELLPTREQGFKVQPRRWVVERTFAWVNRNRRLSKEYDLLTTSTENFIYLAMSRVMLKREYA >NZ_CP042904.1|WP_012673145.1|387868_390529_+|preprotein-translocase-subunit-SecA MLDSPLILTAILIFFIFTLSFFFIRKIFGSTNKKIIKSFRKIVQQINALETEMQSLSDEELAGKTEEFKRELKNGKTLNDLLVPAFAVVREASRRFLNMRHFDVQLIGGMVLHNGMISEMKTGEGKTLVATLAAYLNSLEGKGVHVVTVNDYLAKRDTEWMSKLYNSLGVSVAFITNNLTDEERKEAYSADIVYSTNNELAFDYLRDNMKFSQEDMVQRGFHYGIVDEVDSILIDEARTPLIISGQIEENNQIYKHINKIVTKLVDYDYEVDEKGRTVFLTEDGISRVEELLRSYNLIPENSSLYDTDSMIMTHYIDQALRAHKLFTADKDYIVKDGKVVIIDEFTGRMMEGRRYSDGLHQALEAKENLEIQHENQTLASVTFQNYFRMYNKLSGMTGTAATEAEEFSDIYRLNVVKIPTNVSVKRVDIDDEIYGTGKEKFNAVLKFIEECHKRLQPVLVGTVSIENSEKLSALLQSHSLKHSVLNARYHEQEAYIIAQAGVPGSVTIATNMAGRGTDIQLGGNAEMIAKVELKKIKNADEREKKYQEIVERVKKDKEIAIKAGGLCVVGTERHESRRIDDQLRGRSGRQGDPGLSKFFLSLEDDLMRIFGSDRMRSFLQKVGLKNNEAIHHPWINKALEKAQKKVEARNYDVRKSLLKFDDVINNQRKVIFKQRNNILGNEINDIFEVYSEVNESVVEGIIQSGYYEDYIENIVKEFHTRYGITLDKEDLAKFLNKQEALNYINDKIQEFFTEKEKYFNSQHTTDLWNTIVKQMMIMTLDHLWREHLSVLESLRQSISLRAMGQKDPLNEFKREAFLMFESMLEKWKELTIHRLAHFKLADNQEIGNRLHSARNSRLPKVSRNDKCPCNSGKKYKHCHGAVTVVS |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP042904_6 | 805643-805957 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP042904_6
|
4 spacers
spacers of NZ_CP042904_6
>6.1|805667|57|NZ_CP042904|CRT GATCTATGCCGAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGGTGGCATGACGATAAGCT >6.2|805748|44|NZ_CP042904|CRT ATGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGTAACGACAAATT >6.3|805816|50|NZ_CP042904|CRT GATCTATGCTAAGAGATACCGTGACGGTTCGCGGTGGCATGACGATAACC >6.4|805890|44|NZ_CP042904|CRT ATGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGTAACGACAAATT |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042904_6
The CRISPR arrays of NZ_CP042904_6 >merge|NZ_CP042904|6|805643-805957|CRT CGTCATCCCGCTACGTGTTAGCGGGATCTATGCCGAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGGTGGCATGACGATAAGCTCGTCATCCCGCTACGTGTTAGCGGATGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGTAACGACAAATTCGTCATCCCGCTACGTGTTAGCGGGATCTATGCTAAGAGATACCGTGACGGTTCGCGGTGGCATGACGATAACCTCATATCCCGCTACTAGTTAGCGGATGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGTAACGACAAATTCGTCATCCCGCTACGTGTTAGCGG >NZ_CP042904|6|1|805643-805957|CRT CGTCATCCCGCTACGTGTTAGCGG GATCTATGCCGAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGGTGGCATGACGATAAGCT CGTCATCCCGCTACGTGTTAGCGG ATGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGTAACGACAAATT CGTCATCCCGCTACGTGTTAGCGG GATCTATGCTAAGAGATACCGTGACGGTTCGCGGTGGCATGACGATAACC TCATATCCCGCTACTAGTTAGCGG ATGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGTAACGACAAATT CGTCATCCCGCTACGTGTTAGCGG
>NZ_CP042904.1|WP_007549151.1|805209_805566_+|holo-[acyl-carrier-protein]-synthase MIHGIGTDIVYIPRVSRILQKYGEKFLNRIYTEKEIELSRKYNSQEMRARYFAKRFAAKEAFVKARGSGQGIIMKDIEIYNDVRGKPYLTVSKDFISKIHLSLSDDGDYATAFVVICV >NZ_CP042904.1|WP_007549149.1|803944_805213_+|proline--tRNA-ligase MRLSKYYLPTLKEKPAHAKIISHQYSLRAGLIKQIASGIYSWLPLGLLVLKNIEDIIRDEMDKSGAIEVLMPCVQPANLWRESGRYDDYGKEMLRIKDRHEEDMLFGPTHEEVATDLIRDVVKSYKDLPLCLYQIQWKFRDEVRPRYGVMRGREFLMKDAYSFDVDYEGALNSYNLMYKTYIKIFKRMGLTPIGVRADTGPIGGNLSHEFHILANTGESTLYYDNKFSELLESEDVESLKSIYAVADDMHDPETCPISQEQLNVSKGIEIGHIFYFGDKYSKPMKASVTSQDGKNVNIHMGSYGIGVSRLVGAIIEAFHDDKGIIWPESVAPFRIGLINLQTKVTEAADKIYKALKSDEVLYDDTEGSVGVKFSRMDLIGLPWQIIVGKKAIDEKIVEVKNRATGEVKEMQIEEAINHFSTK >NZ_CP042904.1|WP_007549148.1|803306_803843_+|hypothetical-protein MKAKLESSGGTDKKERPEEFAARIDREQAERKKSDDNDSEWTKRLKERAAVMRFSDSESEHSDSISDSDWTTGESKDTQKEIEQEKEEQTKHTNPPSSKEERSKSSDSGIESRATSPIHPEQKTEESPSSCVDSPQVNNVDPVDNEVQDPPPLSVEDCIAQFGGKALPWQKQFVARRQ >NZ_CP042904.1|WP_007549147.1|802656_803310_+|hypothetical-protein MMTSNNSSLLKDSQELTKTKGTIWKPLIAVSLLSVFSFTSGQYLPYVIAAVSGSGAIAAVPLAIFAVSTVVALISVTYLVKLAISRDDNKKEVGLNGQKFGHTPSQEPQKFVCKNCTNLENKSNVPTPQSPPVTLGTQPNPSVSVPPPPPPPLPQDAALPPPPPHFFTASKRTEQPKNDAPKKAGEPENNNHSTLFEQIRGGTTLKRVSSNKILQMN >NZ_CP042904.1|WP_162829040.1|802079_802244_+|hypothetical-protein MSGCNPSVPMMSSQCPDTGIQESLLVSKQTSTESGYNIFDEIIWKTGSQCQALG >NZ_CP042904.1|WP_010082469.1|799674_800202_-|cytochrome-c-family-protein MELNKIAASILLSGLIIMIVSNVVDMLYSPEEYKIEHQTIVAAGSNEFQQKIEQVALDIGALMQNASFEKGKSAAKKCIACHSFEKGGMNKVGPNLWNIVGNKKAHLGNSFNYSKAVLERGGKWGYEELFAFLKNPKAYIKGTRMAFAGISNPQEIADLVSYLHQLSDSPVALPK >NZ_CP042904.1|WP_012673268.1|798911_799673_-|alpha/beta-hydrolase MDYCKLFDGNNGHIAYRKLQGKKASVVFFGGFASNMDGTKATAIYKFCQENDVALVLFDYFGHGHSSGNFIDYTISDWQKNCAKVMSELTSDKQIIIGSSMGGWLMLLTALQFPEKIAALIGISSAPDFTEDLIFKQLSGKQKEELDSKGVIDFTSEHCTYKITKNLIEDGRKNLLLNKKTIDINCPVRLLHSINDKDVPYQTSLNLAEKIKSTDVEVHLIKSAEHNMSDNHSLEVLFKTIREFCNQTAFCDF >NZ_CP042904.1|WP_006280207.1|797737_798736_+|tryptophan--tRNA-ligase MTSIVFSGIQPSGVLHLGNYLGAIKQWIDLQDKYKSLFCIVDLHAITANKLPASELKSNIFKTAAAYIACGIDTEKSIIFSQSTVSGHAELGWLLGCYTPIGWLNRMTQFKDKAGSDKQKASLGLYSYPVLMAADILLYQTKYVPVGDDQKQHLELARDIASAFNNHYKLDYFIVPEILTLDCTSRIMSLRDGTSKMSKSDPSEHSCINLDDTDDLIVKKIEKAKTDSILGFATLKCRPEISNLINIYSVLSNVNAEKVCEEVNKHDMKHFKKELADLIISVISPIREKMNDLLKDQFHLHEILKKGTKKAAEIATHNIKEIKDIIGFAQYL >NZ_CP042904.1|WP_012673267.1|797150_797720_+|nucleotide-exchange-factor-GrpE MSDSSKEKKKKFADMVSRQKGDDQQSDNHKQTDDLNEDLNTLKERAVQLEDHLRRAVADNENVKRIMQKQISDASDYAVTKLARDMIDSCDNLKRVMEILKDGDPVHEGIKVAYQKIINDLKKHGIEEVDPLGELFDSNLHQAVVEREDNEKKPGTIVEVLQTGYTIKNRLLRPAMVILSKKSADCGSD >NZ_CP042904.1|WP_006280205.1|796111_797089_+|polyprenyl-synthetase-family-protein MLITNSDKLDDIVSSDLSAMNDFVFKNVNDEDAKLATDIISHLVRSGGKKIRPKLVFIICKMLNYSGENRINVAASVEFIHNATLLHDDVLDESEARHGVKTANKIWGNKSSILVGDLLLTLAFRWLIECGNLNILSILSKASHLLVKGEIKQMTARFDPHTVRENYFDIIGEKTASLFSACCEAASTVSGATNDETERLKNFGFNFGMAFQIVDDMLDYTANQGTSGKQVGKDFFEGKVTLPAIIAYEKGSPAEQKFWEKCFSSARHNFDQALHYINHHNAIQLSMEKARHYINMAQNDISTFSDSFYKTTLINFLNASIERRM >NZ_CP042904.1|WP_006280400.1|806076_807573_+|cation:proton-antiporter MDCVLTSLSLPFSITENYLLITALIPLLSALVIFFTGKWPRVNNSITVTSSVLLFTYTCLCTLYWVYGDHSQFILMDFGNNLHISLKLESTGVIFSLLISFLWILTSIYAICYMQNNYADSNHSSFLCFFSISISCAMFIAFSGDLLTTFVFYELLTISTYPLVTYNSTNESMIAGRYYFGVLFFSSLVLFFPAIGLLYNEFHTLDFVSGGIFKFDTSLITFIAVCFAMLIYGIGKAALMPMHFWLPKAMVAPTPVSALLHAVAVVKSGVFIIIKVILYTFGVDNMQRFVQQNWFTGGWLPYVAGFTIITASLIALKQKELKKLLAYSTISQLSYIILFASIFSELSMRVAIFQLVCHAFAKITLFFIAGAIITRAGEKYIDKIYGIGRSMPISMTAFAIGALSMIGVPPAPTFWGKFLIFQAVFNSGNVILSVFVTLVLIVSTILNALYFLPIIYNAFFLKPSQNYFIKKTPILLVLPPVITAMCTLVIFFSYQVIF >NZ_CP042904.1|WP_006280401.1|807569_808232_-|hypothetical-protein MEDKLLESVKNKSYFSKAVEWYCHRYLFCVAERSWMALIVSLLLVCLCLLTLNIYLLFPVKKDLNFVKYMNHTEDEFSAMHKLSFSKKEDEYTSTARYLISKYIEIYESIKTVEPKYQENFIRNNSIHKIYQGFQEKTNNEAGNLSLSKRKIANINVITLSIDRSTKDLVTFAGNATVVFTTEQNKEDTVEISFTLSNIKATLAGIIPFKFIVNGYKYRF >NZ_CP042904.1|WP_012673269.1|808290_809085_-|hypothetical-protein MTDNKLTVWQSIEVLTKAILNMQKKLSLIKNIASDQDITLEKGKELLSGIYEANFKLNKTINIATLPKIGYHMLNGELVVRNHITEEEVKIPGDFHYLKVVKSDHDNYKLTFCNFLGNEFFEYKKYDPQYSGISDEYKFVDFGSVKKTHNLKFKEYIGHAPKFFAAEGPIEPGSQNHVIDLFELVKSGKGSKVGTFADEFGYFDDQNKLHYYNYHKSVESNTYDPENFSVKMINIDVSKIDKFYLIAEQGDIIIHPILENLDIF >NZ_CP042904.1|WP_012673270.1|809158_809980_-|DNA-polymerase-III-subunit-delta' MKKVIGHNQAKKKIMNNLSVQSWLICGKKGIGKATLAKSFSNWLLIKNYNEVALDLHIVEGDTIGIEKVREMKNFLHLSPIQSEHKIAIIDSLEAMTNNAKNAILKILEEPPKNSKIFIISHKPYDIQTTILCRCFQLNLLPLTYDETKQVVSSQCKFDNQTFDEMITLFPGMPGMIINTISSDAYEAYKCFYKFLHDLKNPNMINKVINSEIELELASYIIQAFILESIKREVNGVEILLSQWKKIDELFVAAKQLHLDKKHVLANVVNIMT >NZ_CP042904.1|WP_006280292.1|809997_810585_-|threonylcarbamoyl-AMP-synthase MVSKIINAIQNNLLVCFPTETVYALACNALDNESIGKIYQIKKRSQNKPLSIFVSDIYNLTKIAKVKERYIDLINHFSPGPITYILPLKNNNILPNEFFKDSIGIRIPEHPIAISILNKLKVPIVATSTNISGKESVCKANDIPQSIKQHLSVVIEDDELVSGIESTIIDLTEDKIKVLREGAISLQTVNNAFSN >NZ_CP042904.1|WP_010082479.1|810703_811174_-|hypothetical-protein MAENNDNNSFTKRFTNRTPGGTGEGFSSKYSSQNTKERALGEKGKISELAGKKTESKEAFSESGGIKSKSRTVNERSFADATKRSRSDLIYLVRGKDRGKSAWHYVLVDKEKREMFLAKSRTGSIDVADYGEILYSGWGEDPPQAIIDKVNEEFGL >NZ_CP042904.1|WP_006280293.1|811249_812134_+|tRNA-(adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase-MiaA MKNNIVIITGITASGKSELCDNLIEKYGNISIINCDSKQVYEEIPIITAQPPKQEVFYKLYGYVSAKENYSVGLWLEDLEKEVNHALENAQIPIITGGSGLYISSLIKGLSSMPQISQKVRKNVSELRKNLSKEEFYKLALSKDPRIQGKVFMNDSHRLSRALEVITETGKSIFVWQENRQPPLFNNFKIYTILPKREDVYRKINSRFITMIENGAIDEVKKLLSMNLAPHLPAMKAHGVPEIIKYLKGEITLDEAIQIAQTNTRHYAKRQYTWFKKQFLNAEVIDCANKLKIF >NZ_CP042904.1|WP_012673271.1|812130_813078_-|hypothetical-protein MSSPISEEKENPIVTLRAQAEKFDFSKLRADEKDISANSGKQMYEDFDRMNFVINKKNIDTILIKALINRDKEEFDKFWEKYCEGLKVSNDKETDRYKEEVEKFYNIGKGYTNLLTKEEDENKSYRAFAKEVFKEIFKYAEAQVPSDSILEELVINCNQAGYVGALYAEDKPLFHVAMAYELVFGSSHTTHINCSDPSHATIRIEEKIAVCTLAKSEEELCKLDSSLEFTLKSQGDKNVTYEDGKLSLTVPKRLKDYNIGDKNLFDVIKECFQKFCERLGFFKIKIEHGLGDPLEVSDHLENMEPPIRSNEHGLN >NZ_CP042904.1|WP_012673272.1|813382_815404_+|ATP-dependent-DNA-helicase-RecG MSNQIFLNSRLENIPKFHSTILPKLCGGDRVMDLLFYRPLSYVDRSKSLPDAQVGEFITFIAKVYEHQSPTFRGRPYKIVVESESQYIFIVFFNYSVKYLYKLFPIGASVIISGKLEKFAEHWQITHPDYVSLDINQFKKIACIEPVYQLCRGITNKRIGNIISSNLKELPDLPEWIDDTLIKQKKWLSWRESIIKLHRPSSLAEAEVCRKRLAYDELFAYQLALKLARKNHVKERGREFIILSKYKEQVLNELSFQLTNDQTRAIDEISERQKSKYRMISLLQGDVGSGKTVVALFAMINVVENNMQAALMAPTTILAEQHYNWIEEVLSCTDIKVALLTGKTSRKERKIIMNELASGVLNIVIGTHALFQANVTFKNLGLAVIDEQQRFGVMQRNRLVGKGENADILFVTATPIPRTLQQAMYGDVECSILKEKPKSRLPIKTVTMNISRVPDVIEKLKGAINRGEKAYWICPYIEENEETNIAAAEMRFQELQKTFLDKVGIIHGKLTQEQKDQVMFSFKRNEFSLLVATTVIEVGIDVPDATIMIIENAEQFGLSQLHQLRGRVGRGNKPSFCVLLYDNLSKSSSSKLKIMCESQDGFYIAERDMMLRGSGDILGTKQSGCMEFKFADLYQDKELLNLAYNNAKGAMADFELLLDIFEYRSRLHFSKFQ >NZ_CP042904.1|WP_010962861.1|815999_816200_+|hypothetical-protein MLLFLSSKQPPMVSSQCPDTGIQHFTQSHQERCILHNTFMLTNPVSNQNSWIPVSGHWDDIIGTLG |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP042904_7 | 816279-816375 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP042904_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP042904_7
>7.1|816302|51|NZ_CP042904|CRISPRCasFinder AGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTGTAATGACGGTTAAGTAATT |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042904_7
The CRISPR arrays of NZ_CP042904_7 >merge|NZ_CP042904|7|816279-816375|CRISPRCasFinder CGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTGTAATGACGGTTAAGTAATTCGTTATCCCGCTGCTTGTTAGCG >NZ_CP042904|7|6|816279-816375|CRISPRCasFinder CGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCG AGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTGTAATGACGGTTAAGTAATT CGTTATCCCGCTGCTTGTTAGCG
>NZ_CP042904.1|WP_010962861.1|815999_816200_+|hypothetical-protein MLLFLSSKQPPMVSSQCPDTGIQHFTQSHQERCILHNTFMLTNPVSNQNSWIPVSGHWDDIIGTLG >NZ_CP042904.1|WP_012673272.1|813382_815404_+|ATP-dependent-DNA-helicase-RecG MSNQIFLNSRLENIPKFHSTILPKLCGGDRVMDLLFYRPLSYVDRSKSLPDAQVGEFITFIAKVYEHQSPTFRGRPYKIVVESESQYIFIVFFNYSVKYLYKLFPIGASVIISGKLEKFAEHWQITHPDYVSLDINQFKKIACIEPVYQLCRGITNKRIGNIISSNLKELPDLPEWIDDTLIKQKKWLSWRESIIKLHRPSSLAEAEVCRKRLAYDELFAYQLALKLARKNHVKERGREFIILSKYKEQVLNELSFQLTNDQTRAIDEISERQKSKYRMISLLQGDVGSGKTVVALFAMINVVENNMQAALMAPTTILAEQHYNWIEEVLSCTDIKVALLTGKTSRKERKIIMNELASGVLNIVIGTHALFQANVTFKNLGLAVIDEQQRFGVMQRNRLVGKGENADILFVTATPIPRTLQQAMYGDVECSILKEKPKSRLPIKTVTMNISRVPDVIEKLKGAINRGEKAYWICPYIEENEETNIAAAEMRFQELQKTFLDKVGIIHGKLTQEQKDQVMFSFKRNEFSLLVATTVIEVGIDVPDATIMIIENAEQFGLSQLHQLRGRVGRGNKPSFCVLLYDNLSKSSSSKLKIMCESQDGFYIAERDMMLRGSGDILGTKQSGCMEFKFADLYQDKELLNLAYNNAKGAMADFELLLDIFEYRSRLHFSKFQ >NZ_CP042904.1|WP_012673271.1|812130_813078_-|hypothetical-protein MSSPISEEKENPIVTLRAQAEKFDFSKLRADEKDISANSGKQMYEDFDRMNFVINKKNIDTILIKALINRDKEEFDKFWEKYCEGLKVSNDKETDRYKEEVEKFYNIGKGYTNLLTKEEDENKSYRAFAKEVFKEIFKYAEAQVPSDSILEELVINCNQAGYVGALYAEDKPLFHVAMAYELVFGSSHTTHINCSDPSHATIRIEEKIAVCTLAKSEEELCKLDSSLEFTLKSQGDKNVTYEDGKLSLTVPKRLKDYNIGDKNLFDVIKECFQKFCERLGFFKIKIEHGLGDPLEVSDHLENMEPPIRSNEHGLN >NZ_CP042904.1|WP_006280293.1|811249_812134_+|tRNA-(adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase-MiaA MKNNIVIITGITASGKSELCDNLIEKYGNISIINCDSKQVYEEIPIITAQPPKQEVFYKLYGYVSAKENYSVGLWLEDLEKEVNHALENAQIPIITGGSGLYISSLIKGLSSMPQISQKVRKNVSELRKNLSKEEFYKLALSKDPRIQGKVFMNDSHRLSRALEVITETGKSIFVWQENRQPPLFNNFKIYTILPKREDVYRKINSRFITMIENGAIDEVKKLLSMNLAPHLPAMKAHGVPEIIKYLKGEITLDEAIQIAQTNTRHYAKRQYTWFKKQFLNAEVIDCANKLKIF >NZ_CP042904.1|WP_010082479.1|810703_811174_-|hypothetical-protein MAENNDNNSFTKRFTNRTPGGTGEGFSSKYSSQNTKERALGEKGKISELAGKKTESKEAFSESGGIKSKSRTVNERSFADATKRSRSDLIYLVRGKDRGKSAWHYVLVDKEKREMFLAKSRTGSIDVADYGEILYSGWGEDPPQAIIDKVNEEFGL >NZ_CP042904.1|WP_006280292.1|809997_810585_-|threonylcarbamoyl-AMP-synthase MVSKIINAIQNNLLVCFPTETVYALACNALDNESIGKIYQIKKRSQNKPLSIFVSDIYNLTKIAKVKERYIDLINHFSPGPITYILPLKNNNILPNEFFKDSIGIRIPEHPIAISILNKLKVPIVATSTNISGKESVCKANDIPQSIKQHLSVVIEDDELVSGIESTIIDLTEDKIKVLREGAISLQTVNNAFSN >NZ_CP042904.1|WP_012673270.1|809158_809980_-|DNA-polymerase-III-subunit-delta' MKKVIGHNQAKKKIMNNLSVQSWLICGKKGIGKATLAKSFSNWLLIKNYNEVALDLHIVEGDTIGIEKVREMKNFLHLSPIQSEHKIAIIDSLEAMTNNAKNAILKILEEPPKNSKIFIISHKPYDIQTTILCRCFQLNLLPLTYDETKQVVSSQCKFDNQTFDEMITLFPGMPGMIINTISSDAYEAYKCFYKFLHDLKNPNMINKVINSEIELELASYIIQAFILESIKREVNGVEILLSQWKKIDELFVAAKQLHLDKKHVLANVVNIMT >NZ_CP042904.1|WP_012673269.1|808290_809085_-|hypothetical-protein MTDNKLTVWQSIEVLTKAILNMQKKLSLIKNIASDQDITLEKGKELLSGIYEANFKLNKTINIATLPKIGYHMLNGELVVRNHITEEEVKIPGDFHYLKVVKSDHDNYKLTFCNFLGNEFFEYKKYDPQYSGISDEYKFVDFGSVKKTHNLKFKEYIGHAPKFFAAEGPIEPGSQNHVIDLFELVKSGKGSKVGTFADEFGYFDDQNKLHYYNYHKSVESNTYDPENFSVKMINIDVSKIDKFYLIAEQGDIIIHPILENLDIF >NZ_CP042904.1|WP_006280401.1|807569_808232_-|hypothetical-protein MEDKLLESVKNKSYFSKAVEWYCHRYLFCVAERSWMALIVSLLLVCLCLLTLNIYLLFPVKKDLNFVKYMNHTEDEFSAMHKLSFSKKEDEYTSTARYLISKYIEIYESIKTVEPKYQENFIRNNSIHKIYQGFQEKTNNEAGNLSLSKRKIANINVITLSIDRSTKDLVTFAGNATVVFTTEQNKEDTVEISFTLSNIKATLAGIIPFKFIVNGYKYRF >NZ_CP042904.1|WP_006280400.1|806076_807573_+|cation:proton-antiporter MDCVLTSLSLPFSITENYLLITALIPLLSALVIFFTGKWPRVNNSITVTSSVLLFTYTCLCTLYWVYGDHSQFILMDFGNNLHISLKLESTGVIFSLLISFLWILTSIYAICYMQNNYADSNHSSFLCFFSISISCAMFIAFSGDLLTTFVFYELLTISTYPLVTYNSTNESMIAGRYYFGVLFFSSLVLFFPAIGLLYNEFHTLDFVSGGIFKFDTSLITFIAVCFAMLIYGIGKAALMPMHFWLPKAMVAPTPVSALLHAVAVVKSGVFIIIKVILYTFGVDNMQRFVQQNWFTGGWLPYVAGFTIITASLIALKQKELKKLLAYSTISQLSYIILFASIFSELSMRVAIFQLVCHAFAKITLFFIAGAIITRAGEKYIDKIYGIGRSMPISMTAFAIGALSMIGVPPAPTFWGKFLIFQAVFNSGNVILSVFVTLVLIVSTILNALYFLPIIYNAFFLKPSQNYFIKKTPILLVLPPVITAMCTLVIFFSYQVIF >NZ_CP042904.1|WP_007549783.1|816436_816724_+|hypothetical-protein MSNNFNFKEFFNHYETNSTSDDIQRYYLLWKSVIAQAMIDAASHCKKTESLVEKRKAISWLSDFSQDFVHTCILADCDPVYVKNKIQPTLKSLTR >NZ_CP042904.1|WP_006280734.1|816739_817315_-|hypothetical-protein MISLFYKLRLLNYILGSLKDIIVKLFLFTMYLYTFSIVLMFLSNGFWYAVEFCSFKNAFYRLFQYCKWYYENREDLGYGISIRILVAFLTPHFLYKLLLGTGWKSFLKEKIIQILNTRRKKGSEFSNSSKPSGSSYSNKNNYSNSSGNNERQAQDAKRKVNMIKQLLIKDIEATIDRRLNYIFFGKRSKPH >NZ_CP042904.1|WP_147737887.1|818155_819445_-|hypothetical-protein MKTEEKIRNFNSVKEMFIKEVLEDKAVNNAALTKEIFSKLGEKILEKAYSVDGQQSAKKDQLINRLRQQVDFVNKLDAKKLQNLLSKDNNSLYEIFSEHHNEIKEIIKKCKTEHKLSNSIENLNEVAGKYGIRKGSMQSFENSSSRSSSMSFLNSVSTDSTISSEAELLNPANHKEVKTATSLWDKVSSPFKSGKKSEKTSEVKYQVLSESDTLPRKIGNSTFYVDTPTPIENTNKTATIGGRPGVARRNSTSNLTRVETPEVPTRSASLTNLNGQSSFSEDVLSDPKVNQYLGNSNKGTLTRSNSFDSARGSSGPSTPTSSLERLFQSFSKDEVGAAMEKDLKEFSLSAKTESTLHNSFSNRNGSDSGFNSPTSSPTHTMFTENGKAKTQADLRKTGHLDKLVGQPSTKVAVDTDVQQQAAQTAVKTN >NZ_CP042904.1|WP_094189578.1|819552_820385_+|IS5-like-element-ISWpi1-family-transposase MRKKYPTDLSEREWARIEKHFRVSYKKGGRPPKYSKREILEAIFYVLRTGCQWRYLPNDFPLWKTVYEQFRQWKKQGIFEKMNYEITKYSRRKIGRNEQPSACIVDSQSVKTTEKGGSKAMMEGKKVKGRKRHIITDTQGFILGCYVGAANENDRDGIKIALNNMRTKYTKVKKMWADMGYQGRNLKNHIKEEYDIDIEIVKRPPCRFWVHKDTPPELLPTREQGFKVQPRRWVVERTFAWVNRNRRLSKEYDLLTTSTENFIYLAMSRVMLKREYA >NZ_CP042904.1|WP_012673274.1|821409_822444_+|FtsH-protease-activity-modulator-HflK MFDENNPWNLGKKPVGNKTPNNEDILSKAVSDIGFFLNGLTKNRGKKPYFIIFIILLLYACTGFYIVHPSEEGIELTFGKYSNTEMSGLRYHFPYPIGKVFKVNVKEVNREEIGVSSSYGRDTDRGEGVMLTGDENIVNVNFEVQWRVRDAKDYLFKVRDYKPGFSVKNAAESAMREIIGKNTISFALGQGRPEISRDTRILLQQILDGYQMGIEILSVQMKKIDPPEKVISSFRDVQSARADKERTINEAYAYNNDIIPRAKGEAIKIKLDAQAYENEVINEAKGNANRFLSLYEEYRQNPSLVKNRIYLETMENIFSKVDKVVVTDDLKGMFSYLPLTNLGK >NZ_CP042904.1|WP_012673275.1|822446_823319_+|protease-modulator-HflC MSSNIKIVFVSVFVVLLIVLSNSIFVVQETKQAIVIQLGKVVRDVRESGLYFKLPFINSVEFLDKRVLDLSPDKIPREVITADQKRIIVDAYAKYKITNPVTFYQAVRNESGLVRRLYPVIEAHIRENIGRFSLISLLNEKRSEVMQLIQRGVYSEAEKFGIEIIDVRIKRADLPEENSSAIFRRMQTEREKEAKEIRAEGEQAGQEVRSKADKLKREIISSAVKESYEIRGRGYAEATRIYNEAFKVDEEFFNFYRSMSAYSKSFAENNTKFVLSPNNNFLDILNKGWK >NZ_CP042904.1|WP_012673276.1|823322_824807_+|DegQ-family-serine-endoprotease MKSKAFILSIFAYFLIAFSSYANMFDWNAKKVVDASTTACNCNQGLADLVEELIPAVVNISSEQIIKQENNSRTRVPSMPGNNFFDDFREFFEHFDQFFMDRGPSVNKEVVLLGSGFIIDKGGTIVTNYHVIKNAKDITVTMNDNTYFKAEVLGYDARTDLAVLKINSDKDLSSVAFGDSDKARVGDTVMAIGNPFGLGGSVSTGIISARSRDISIGTMNEFIQTDAAINRGNSGGPLFDLNGKVIGINTAIYSPSESGGNVGIGFAIPSNLAMSIIDTLKSGKKIKHGWLGVQVQPITKEFAESLGLKDIKGALVASIVKDSPAEKGGIKVGDILLEFDGKKIDRMTQLPQMVSRAGPEKKVQVKLLRKSKEVNIKVVIGESTNDGQDNNQEENKSTSDYVTGLTVSNLPKESKESNPTKGVIVTNVDSNSNATLRGIKKGDIIIQLDGTDIENTNDFQKQVDSAVKKNGKDSIMLLIYRNGNQFFTSIKLKK >NZ_CP042904.1|WP_012673277.1|826148_827453_+|hypothetical-protein MVESFSGNNKGSNFIEEAKIMENFSDNNGNGSSIFQGKLREQDFSAEQKLNELKAAIEELTRQDLLRRLECERQASSCIDEISSQAELHIGEGDDEDYFTGEKGRVLGDFWNFFESLFTLFEVDVDDPKIYQMLKEKKEKNLIAAIMKFLRDKLKELIKKIFARDLSFNQRLDKEIKELQEKLGSGELSEEEFTRALERLTALQDLKLRLQMAVVGWIVTMFAEMFGVELAAAVAASTEKEDKKAEKTSLKEENKEVCENVEMKVDEREKPKVPVFLFDVSPGFVRPVPLSKPELDLLPKPIMPSIFKEVINNENREVKETKPKVEEEKKAKQEEPKKTEPALKQKAPKKEPVIFRDTGQSSERGQWENDASRQEIPTIGSVGEQNMRNSGNIGKETIDIDKICGELFAGQDQISPESELNSINVQPKGGYKGK >NZ_CP042904.1|WP_007549698.1|827546_827777_+|hypothetical-protein MDKKQQASSSSQGDPRFKVGSGGYDSAAWMAANRGTGGGGPDMHKDPSKFDRCYNYPYTGMSDAKVESAQGSNKKK >NZ_CP042904.1|WP_007548562.1|830081_831464_+|IS66-like-element-ISWen3-family-transposase MVNLLELCKNLQQKIERLEAKIERLEKENESLKAENKALKIENAELRERLGLSSKNSSIPSSKELYKIKKNKPKSERNIGGQVGHKGSFRANMDADKVVKIELPNTCECGGEIAICEKPYIHQKVDLPEIKPYVVEYQLEHGRCRRCGKRRSSKLPEGVTPDTFGPRVKSIIAAFSGFYKNSKREIASVVNDIFNLNISVGSISNSEHRVASKCKKMYEQIEQEISRSKVLHIDETSHYNKGKLAWCWMFASNTASFVKFTESRGMKVLQNSKFCNRNSLVITDRYAAYNYFADKNRQICWAHLSRDFERLAHSWNIEVKVLGCYLRNVATELFALKKALLKSEIDVLRFVRRARKLRKRTKYYLKEISRLPEAIGASRVAKNVLRSERMMWKFLDDPENIPLTNNHAERQIRHYVVYRKNSYFTQSKRGNTFLERIISLYLTWKQRGLNPFQNLLSIVS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP042904_8 | 974240-974350 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP042904_8
|
1 spacers
spacers of NZ_CP042904_8
>8.1|974270|51|NZ_CP042904|CRISPRCasFinder TGGTATGACGGTTAAGTAATTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTA |
RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042904_8
The CRISPR arrays of NZ_CP042904_8 >merge|NZ_CP042904|8|974240-974350|CRISPRCasFinder GAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGGTGGTATGACGGTTAAGTAATTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTAGAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGG >NZ_CP042904|8|7|974240-974350|CRISPRCasFinder GAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGG TGGTATGACGGTTAAGTAATTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTA GAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGG
>NZ_CP042904.1|WP_007548967.1|972988_974152_+|1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate-reductoisomerase MKKVSVLGSTGSVGKKTVDLLSKRKEEYQVEALSAHSNFALLAHQAKLLNAKYVAISDERLYKDLKESLLGTDVKIAIGATNVAAIPVDLSVVAIVGIAGLGPVMEVIESGTKVIALANKESIVCGGKLLLKKAKEKNVQIIPIDSEHNAIFQILQNDDKCVEKIILTASGGPFLNYSLEQLRNIMVDQALSHPTWNMGKKISVDSATMMNKALEIIEAHNLFNISPDKIEAVVHPESIVHGIVTYKDGFNFAVLAETDMAIPISYALSWPERLVLNYKLDLTKQGKLTFQEPDHKHFPVLKLSMEVLNSSTPQTNSIVLNAANEIAVNEFLKSRIGFLEIVEVVESTMESFGSYTDINSLSDIINIDCESRIIAHKIVESKVVAYS >NZ_CP042904.1|WP_007548965.1|972425_972923_+|hypothetical-protein MSEAQGPNIAEWQAQQQHQEAAGEKSGFGLGHSDSVSTVVDGMKWLFNFHEGAIAAYSNVFEGLVSGSSLVTLFGKSGNMFGIKFLEGLAEYFSGGGGEDMPSEGMDMAHGDDGHHSDDYPHANNEIAHNADGLQDMHDAGDHHGQSFSPGPSPSVGDDHGHELG >NZ_CP042904.1|WP_007548963.1|969823_972199_+|hypothetical-protein MAVKHIRKRLYQAIMLPLIALFFIAAAPFVALSLLVFNIWNTESINKALKYIIIAPLVVLYLPCAMLALVLHLSISTLLTVAKITLFPEFFLSLRIKEGIKFSRVFSLSITQFHNMDFYAYIKDSKTFFKIKDSNRKLLVALLKDNDFSIQDDTPFHFYETHLEFVTDVTTKISDKEKSKIIFDYLGLSNLKPLIQKDSYGERRLYEIYNTHEKLIKVVNDIDIGLLKTLLKLNESSVRNPKYMCISRLSNVIDLFDNNDLVKNMSDAFRNKQILAVQMAEYLSIFLGHEYNGYYSKKVMQDNLKKLFLKKDLIDNLSSNLGAQSSLMLIIKYFLRKEMSEREFDNLTSMLEDKNMIDNLKHIDDINNVLPHTLECNGYSTFLGLREIFDLKTAASDISNLHLLLANNRLFYKFRGIPIGVLRKICSTELYENCANVDEVLAFFDCLGDKSKNKNILDNLIVAFEKDPEATHALLNSKLFNSRNEILRVLSDEKFDGNKVREILNHINLLWTLRKNSMFNNDMDLEDKLFYTFRPRFINSEFRGCAQDYALLSGIHNNQRAERVFSKSVNLFQIFLKEAIKDRYELMFPIIEDTKVEHLVDGRFISKVRDKINRYLSNLLIFKGNLFSDVSNILRLQVIIILFFPLFEFEEGLHTTLEERWEKILKRKFTELFVAQKYQQITPESLAKIQDLTIQDLSAIPETEEIEEFLRKKGITNSDDLSLLAKLIEDSIHIANVIGERVSLTQNITQTICDTFKDISVNHNTKQTPPSLLDLCKTNIIGSSLTEQISC >NZ_CP042904.1|WP_007548961.1|969014_969716_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MRNPIISILNLSLSFDDRTVLKDLNFDILKGESLVILGGSGSGKSVLTKTIIGLLAPDSGSVKINSKSKNKFGVLFQNSALFDYVTVWENISFNYKKRFNISKKEAKQLAIEKLNDVGLEESIADMFPIELSGGMKKRVALARAIAHNPEIIILDEPTSGLDPIMSDIVNEIIIKLSRDLNPTIITITHDIHSAFKIADKIAVLYEGEIISHGTVQEIQNTNNQYIKKFIRYI >NZ_CP042904.1|WP_006280452.1|968239_969022_+|ABC-transporter-permease MSFFDINSVRIIGRYFINFLLRLGSAFIFFIQSLYHCLVPPYYFSNVARQIIEIGFFSLPIVGLTGVFIGAAIVLQSSLSDPLINQEQIIPKLVTITIIKELGPVLISLIMVGKVGSSVAAEIGTMRITEQIDALTTLNINPFKYLIAPRILASIIVFPILTVCADLIGIFGGCITAVFEFNHNLNIYIKHTAQFFNTYDFITGLIKATVFGAIISVSSCYYGYHCKEGARGVGVATTSTVVLSSILIILANYMITLIHA >NZ_CP042904.1|WP_010962967.1|967718_967901_-|50S-ribosomal-protein-L32 MAVPKRKKSKSRRNMHRSHHAIEPKNVVVCSTTGEFMLPHNVAVDGSYKGKRVFIKQQAE >NZ_CP042904.1|WP_007548959.1|966670_967708_-|phosphate-acyltransferase-PlsX MLSTVNNNIVIALDAMGGDFAPLSVIHGAGFFLDNLVDPGIKVFFHIYGDKEEVSPLLLKYKKVSNNSEFTHCSDNVLANDKPSFALRHRKDSSMKAAIVAVKEGKAFGVVSSGNTGALMAISRFVLGTLPNIYRPAIASICPTKTKSFALLDLGANVDCNADSLFQFALMGSIFAKIALKIDNPEVALLNIGTEEVKGNDSVRGAFELLKNAPGINFKGYIEASEFLEGNIDVIVADGFVGNVMLKTAEATASTFINLIKQEVFNSWIAKMLVGILLKSKLNKALTRFNPKIRSGAMFLGLNGIIIKSHGNSDAISFAHAIKFAVNAISENLNQKIINGVSHIE >NZ_CP042904.1|WP_010962965.1|965721_966678_-|ketoacyl-ACP-synthase-III MNKSFILSTGSYLPRKMLSNNEIASIVETSDEWIRQRTGIVQRHIADEGELTSDLAVNAAKSAIEKAKISVDEIDLIIVATTTPDKTFPSCATIVQSKLKCKNAFAFDVQAACSGFIYAVTVADSLIKSNNRIKYALVIGAEIMSRIVDWEDRSTCVLFGDGAGAVVMKSEMGRSGIISTNLYSDGNVDILCTNGGISSTGDSGKICMNGREVFKHAVDKLTASVEETLKCNNLKITDIDWLIPHQANIRIIEAVVKKLDFPIEKVINTVDKHANTSAASIPLALDYAIQESKIKSGNLVLLISIGAGLTWGSVLLHY >NZ_CP042904.1|WP_012673326.1|963958_964975_+|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase MKTDIVIIGAGPVGIFTAFQAGMLDMGCHIIDVLDQAGGQCTALYPEKPIYDIPGYPVITAQKLIEQLMEQASPFKPIYHLSQKVEKISNNEGENFTIITSIGTEVKCKAVIVAAGNGMFEPNRPPLSGILEYENKSVFYSVNKISDFQDKTIVIAGGGDSAADWTVELSKVAKKIYVIHRRKEFRCTPETRNKLESLESDGKIELVVPYQLHELAGGNGQLSTVIVKNIASKEEKEISADFLLPFFGLSMNLGPINNWGIQLEHSRIVVDPATLKTSRDRIYAIGDIAIYSGKLKLILSGFAESAMACYDIYKVIHNSPVNFQYSTSKGIHGKEKLP >NZ_CP042904.1|WP_012673325.1|962326_963655_+|tRNA-uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34)-synthesis-GTPase-MnmE MTNTNETIFALSTVFGKSGVAVIRISGNYALKALNHFHIKKEIKPRFATLVDLYDDSSQLIDNGIIIYFPAPNSFTGEDVIELQVHGSKAVIKIILEELSKVFVMAKPGEFSLRAFLNGKFDLTQIEGIADLIDAETKMQAKQAIKQISGELERLYSNWRQRLITIQSKIEAYIDFPEDIWAEKSELEKINNEVQSLVRLIQEHLNDNRRGERLREGLHIVITGEPNVGKSTLFNFLAKRDIAIVSEYAGTTRDILEAHIDIGGYPIILSDTAGIRESSDPIELEGISRAKKRSFEADLRIELFPFEQRPNINCNVVNSDTIYVLSKADDVINNHDIKINGIDLLPVSILKGIGTNKLISLIKEKAEEKFGHDRDTPVITRQRHRNHMQKALEHLQRFNIDNPIELISEDLRLAAFELGAVIGIIDVEEILSSVFSNFCVGK >NZ_CP042904.1|WP_012673327.1|974431_974875_+|hypothetical-protein MALSKFLDPKLDLTFKKIFGTEKNKNILIHFLNDILGFTEINTIQEVEFLSTIMDPEIASDKQSIVDVLCRDSSGARYVIEMVRPESLRSYCLKGEEFLQKETERILKLIKPDVLPSESTHQCESGNRLVPSDADNEPPLEKEDAQS >NZ_CP042904.1|WP_007548399.1|975035_975302_+|hypothetical-protein MYANNNSTGIEKSPNPLLYDRRNRVSLYFRLHGKQTARNADGSAGKGEWRKRMPFCNEMDRICNINSRENEQTSVWSLVTRNFVNHLR >NZ_CP042904.1|WP_007548398.1|975310_976858_+|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MITSKPVSASTESFEAWKQLPWKKCQKVIVRLQRRIVKAVQKGRWGKVKALQHLLTRSFSGKALAVKRVTENQGKNTAGVDRQLWSTCNAKFQGIKQLKQRGYKPSPLKRIYISKSNGKRRPLGIPSIKDRAMQALYLFALEPIAETISDRHSYGFRPKRSCADATVACHLLLASRNQLQWILEGDIKGCFDNINHEWLMKHIPMEKKILHSWLKAGFLESKTLYPTTAGTPQGGIISPILANLALNGLEKLLESRFGKLGSRRRNKIRSGVNVIRYADDFIISGFTHEVLENEVKPLVSSFLHERGLILSEEKTKITSITTGFDFLGCNVRRYNKKLIIKPSKESIKRLLNKARTLIKANIENTQAIVIKSLNSLLRGWGNYYHHVCAKKAFRKIDNEIWHSLWKWAKKRHPRKGLRWIKNRYFKVMGQRQWVFAAPICKNKPKEIRYLRLLKLIDIPIRRHVKIRADANPLDLKWKKYFDERVKRTRMLASSFSREGSLLLVSPLRMMFPEES >NZ_CP042904.1|WP_006280130.1|976854_977643_+|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MKDKPVLEKKNLDKGLKRSVGKPACCVSKGGGSSNTASLPDQLTRDKGFEKRAQLYAAKAYSRQADKSGKYIDLKKVFFIAISNCNLFPDKLDYISSHTIRDEKTNEHDLKDFQFVFIELPKFPKNKEEQLESIVDRWLFFFKYADETTEEDLRKIAEKAPIIKLAYDELDRFSWNEKDLVAYEERIMDLRKEEAILEYRLDLATEKGIQIGEERGIKIGKEEGKIEVAKAMLANNVDVNTIVKFTGLSISEIEELSVNGTE >NZ_CP042904.1|WP_006280131.1|977677_978925_-|IscS-subfamily-cysteine-desulfurase MNVESKKIHDAKIKLPIFLDYQSTTKVDPRVLEVMIPYFGEFSNAHSRSHSFGWTAEEAVEKARKHIADLVNADSKEIIFTSGATESNNTAIKGVAHFYKNKGNHIITVCTEHKCVLDSCRHLENEGFKVTYLPVKQNGIIDLSKLEEAITDQTILVSVMMVNNEIGVIQPVKEIGVICRKHNIFFHTDAAQSFGKVPIDVNEMCIDLMSLSSHKIYGPMGIGALYVRRKNPRVRLIPLISGGGQERGMRSGTVPTPLAVGFGEAARIAREEMKKETTRVEELRDILYNKIKEAFPDIVLNGDYENRIPGNLNLSFPYIEGESLIMAIKDLAVSSGSACTSASLEPSYVVRSLNNGHDLEHSSIRFGLGRFTTKEEVLYAADLVAKNVGRLREMSPLWEMVQEGVDLNTVKWDSH >NZ_CP042904.1|WP_153296798.1|979015_979156_-|hypothetical-protein MEAIATNRVSSQCLGTAFVFEAKLAITFNTLLSQINVRTVMCQLLG >NZ_CP042904.1|WP_012673328.1|979211_980630_-|metalloprotease-TldD MPNLDQIFFAQNNVNINNVYKIVNNALSNSDGGELFLEFCQSESLVFEDNILKHMDLNTRRGFGLRSFCEDSTSFVCSSEISEKEISNAASMVKSSVSLNKTNSINLNEETKSLYSRINPINEMDLNSKIKLLNEVNEYVRSKNNCVKQVKITLSGEWQVVQIIKGDHRLSDIRPLVRFNVLVIVEKDGRTERGSAGHGGRDSYSKFISEKKWKEVANQALEQALVNLEAIPTPAGEMTVVLGPGWPGILLHEAVGHGLEGDFNRKKVSAFSNSVGKQVAASDITVVDDGTLPNLRGSISVDDEGTPPSYNILIEDGILKGYMQDHMNAKLMGVSPTGNGRRDSYKEVIMPRMTNTYMLPGKYTPKEIISSVKKGLYAVNFGGGQVDITSGKFVFSSSEAYLIENGKITQPVKGATLIGDGPTVLKKVSMVGNDLKLDPGVGTCSKDGQNVPVGVGQPTLKVDAITVGGTEI >NZ_CP042904.1|WP_012673329.1|980847_981345_+|hypothetical-protein MYGEKDKLAYRKKVRTYSKRLVTTLSTISFIGYIAALVLNIPVLSLYFSIAGTIFSALSFALNIWSLNDHSRQQNLNKKSGIKNTPGQKKLTKIYLDIASSASFLIGGIASMSLFESSVIYFVSTPFFILGCVIMAANIVQTMISEPQTKNALENLSSNTARVQA >NZ_CP042904.1|WP_006280372.1|981589_982297_+|uroporphyrinogen-III-synthase MKSILLTRPLLDSFNTRNILRKYGYKVYIEPVFTIKYLNPDISAYEFDVVISTSKNSVKAFSQICKEDDFPIITVGNSTMQAAKNLGFSDIISADSNVDGLISFIKAHYSNAIKFLYIRGQEVSCDLKKRLSEEDFNVREVVLYKTIIKRSLTNRCKNLLLDGKIDSVAFFSSQTARVFCSLVLKSGLSHVMNNTVAYTMSKNIADSLKLIKWKKIITSRLPTGESLIDIINKDC >NZ_CP042904.1|WP_006280373.1|982296_983076_+|exodeoxyribonuclease-III MLKIATWNVNSIRKRVNQLCSFIVDSQIDIVLLQEIKCTEEQFPYAEIEKLGYEYAIYGQVARNGVCVLSKYPILEKFKIDIVEGYQEARYIECIIKHNNQKVRVGSVYVPNGQSPDSQAFEYKLKFFDNLYERMSTLLKNEELTIIAGDYNVAPDEIDVFDSNLLNGQVCFHIREREKLRAILNLGFKDAFRISHPNLQQFTWWHYQGNSLRNNQGMRIDYMLLSPQAVDKLETCYIDDRLRKLENPSDHTPVVCAIE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP042904_9 | 999290-999430 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP042904_9
|
1 spacers
spacers of NZ_CP042904_9
>9.1|999338|45|NZ_CP042904|CRISPRCasFinder AGTGATGTAGAAGTTAGCCCTATAAAAGAAACAGTGACTCTTGTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042904_9
The CRISPR arrays of NZ_CP042904_9 >merge|NZ_CP042904|9|999290-999430|CRISPRCasFinder GATATTGATGAGGGTTTTGAGGAGATTGATCTTGCAGAAATTGATGAGAGTGATGTAGAAGTTAGCCCTATAAAAGAAACAGTGACTCTTGTAGATATTGATGAGGGTTTTGAGGAGATTGATCTTGCAGAAATTGATGAG >NZ_CP042904|9|8|999290-999430|CRISPRCasFinder GATATTGATGAGGGTTTTGAGGAGATTGATCTTGCAGAAATTGATGAG AGTGATGTAGAAGTTAGCCCTATAAAAGAAACAGTGACTCTTGTA GATATTGATGAGGGTTTTGAGGAGATTGATCTTGCAGAAATTGATGAG
>NZ_CP042904.1|WP_007548930.1|996553_999097_+|hypothetical-protein MKLSLYAILSISLVLVLLHVAATFKDWSGYRQYIIKELEKTYDAKVHIGGKVEVSLITPKLTIYNVYVQYNENKEQKLSDLISVRKIEIRPSFLSLFLFSLQPKSITLFGMKSNKENLINIINTKASGNTVDIVIKDSQVSFKSDFADIVNIKEVAVKKNRQFSGKVKVGDNNYDFSGKVDITKKNVHISVESNFVNLLFTGNRNQEELQGNLTLTINNSSGSVSDLAKIINLSFLSHVIPSENIKISSNISLNESEFTATDLKIDSKSMQASGTIQNDRKGNHTNFNISFSKVDLDSIQNDSQRTMNMKDLLECFRAVVPKNLSLNFNMEASNIQYQNKILDNFRAVLKSTDGKVKVNTLLKFPGINNISYLSGEISNNNVLSEFNGDLLVEGNDFGSFISCFFPSIKMKENQKNQFTLSSKLHLAPRILSISDIRLLNNKESLQGSIRVSHTKKRSVVDGEFSMHNLDADKYDHSLFSSLPKMQWLKNFQYDANIKARVNNLTLNDTKIKNLDFLLKMEKGKLVADKIKLSGEDFDITGNAKILADQKYAKPLLDVNLTGSKFNGKIITLPNLVETKRNSRNEIDQIQWSTKQLDFLDDKEGFDANVQINTAEFKTKQNVLKDFNLDAVMRNNTITIRQASYVLEHGQVFFQGYLRSDSINTRFSIVNLDTKKIGKVIGIDNVNGQVSLNGEIKTQGKSFHDWASNLSGDVNLQAQGIEVTNVDFNSFITNLLSSKNKSEISTLAYIDIYNGKTFFENISGKASIKSGICSTSLQFGIDQASGSISSNLTLSNFALASIFRFFFIPPNYSNPIYIDMHLDGPIWRPKMSFDVDQIFTALVGKKNS >NZ_CP042904.1|WP_084741758.1|996143_996557_+|hypothetical-protein MYKPDLLLKEQQTVSSQCLTLGSRNFVDCMIWKTLFKSHWISVSHIQLYECCDLKAISTGKGVIPVLDYLDPASHATSSKMLCFNIRLATFLLTNLMSNQIFWIPVSSTGMTGVGAGMTGIGTGMTRRRDAGMRGLL >NZ_CP042904.1|WP_006280233.1|994654_996151_+|murein-biosynthesis-integral-membrane-protein-MurJ MFKSIFTFSFFTAISRISGLIRDVLIATVIGANSLADIFFSSFRFANLFRAFFAEGAFTTSFIPLYSTESYDNKKAFNFASSVISITFIILVIFCLIMQTFSPYMIQIFAPGFDQSKFTLTVTLSRIMMPYIIFVSIASLIGGMLQVKQHFASTAIAPIVLNLCLIISLFVPYVKTPAHNLSIAVLIGGIFQLLLILFSAYKLKAAFSFSLELSNEVRLFFKRVIPAIINNCVTQISLWIDTIMASFIPNAVSYIYYADRLNQLPQGIIGTAIGTVLLPLISKQVNNTENIVKIQNKALNIGLMLIMPTTAAFIIIPDIILLTLFSYGRFDHYAVQQTVPTLIAFSLSLPAFIINKVLLPTFFAKGNLKIPTIFSLMCLGINVVLNLLLMNKYQHTGIAIATSVSTWINSILLISYLTINKMYKVSQALLLNIMKIFVATAVMSIALYIFNSLLAGLFFDKMLARIVYLATLIALSVIVYFGTLYLTFRGSLNNLKYV >NZ_CP042904.1|WP_007548926.1|992305_994240_-|tRNA-uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34)-synthesis-enzyme-MnmG MHKYDVVVVGGGHAGCEAAAAAARLGTNTLLITHKISTIGEMSCNPAIGGVAKGVVVREVDALDGIMGRAIDRASIHSVILNSSRGAAVWGPRAQADRKLYKQAIQEIILNYNNLTVKEESVDDFLIESNNNGELCIKAVITSSGEHILTGKVVLTTGTFLQGVIHIGEQTTPSGRMGDKPAVELANTLNKYDFRLGRLRTGTPPRLDRGTINWSILQEQVGDNPPVPFSYLTEKINQPQVSCFITHTNENTHKIIRENLHRSASSYLSDVVAPRYCPSIEVKVKKFAEKSSHQIFLEPEGLDDDTVYPNGISNSLPIEVQREMIKSIKGLENAEILRPGYAVEYDYIDPRELFHTLETKKVKGLYFAGQINGTTGYEEAAGQGIIAGINAALSAFEKKESFVLHRTDSYIGVMIDDLVTKGVIEPYRLFTSRAEYRLAIRSDNADRRLTQKGYDISLVSHERYSVLQNKLESIKQLEEKLGSLTITPEQLRSYGIKISYDGIRKTALDLLSYPNIDWNKLQEIWPELSSVTRWNDKMGHTKADNRAKNEICEAVEIEAKYKPYLIRQEADMKFLREEINTQIPIDFNYSQVKGLSSEVIEKLQTIKPATIGIAKQIQGITPAAIVSILVYLRNRKTKVAANFV >NZ_CP042904.1|WP_007549330.1|990629_992297_-|aminopeptidase-P-family-protein MSKIEEFRSFMHEINVDAFMLHTKDEYLNEYSEELTKLCGFTGTNGLLIVTKDNKCPFFTDGRYITQARNQLDRGNFQVYNIQEEDPREWIKANLTSTASLGYYLQYFTIEDIRKYENICKLIPCLAGKKSDYRKQAVVLHSIEHAGESSKDKCEKVAKSIDKEAEAVLLTDPNSISWLLNLRNENAKYTPCILGRAILYKSGNVDLFIQDKEHSTIEANLGNHINIFDISELENSLHKLNSIVMDPSTTPMSIMAVIKDKQVAEREDPCLIYKAAKNQTEIAGAINAHIRDGVAVTNFLYWLENNVGTELEAEEKILEYRKEQNLFKQLSFPTISAFNENGAIIHYRASSKTNKVIQKDGLYLIDSGGQYLDGTTDVTKTVAIGNPTDEQITHYTIVLKAHIAIASVIFPPGTTGGELDILARTHLWKFGMDYMHGTGHGVGSYLSVHEGPQAISKGNKVKLTPGMILSNEPGYYIPGEYGIRIENLMYVDKHKNGFLGFKQLTSIPYDRRLISVQMLTKDEIEWINGYHQFVYKNLENSVKDKEWLKKVCDPL >NZ_CP042904.1|WP_012673332.1|990142_990508_-|hypothetical-protein MIDKGQEDEFMKQYMDTCKEQIEKLAKDPELLNQALKPFMQMSQQLMAGGMLEGAMPGMIPDLGSMDVNKMIAQMKEMIDYIRGNYKELMKERSSQIQELNESSKKLRGLVKKLIEKIESK >NZ_CP042904.1|WP_167376004.1|989888_990068_-|hypothetical-protein MKVADTGSFMTAVPRGVIPVLDTGIQFLLPGVKLSFLDSSVKHWNDSNPTSYRDSFAVS >NZ_CP042904.1|WP_006280463.1|989088_989733_-|prolyl-oligopeptidase-family-serine-peptidase MIELRGPEICAGGNKKNLIVFLHGWGSSGDNFIHLAKVMSKFLLGSYFAVPNAPFEREIGDGYQWFSLEDRSEEALYNGVKNATSIVNHFIDTKLKELNLKDTQLSLVGFSQGAMLAIHTALTRSQSCASVVAYSGRFLSPSKTAPEIKSKPNICVIHGDADDVVPFSSLDLAVKALKENGVNVEGHPIHALGHIINEEGIKLGVEFIKKNFKN >NZ_CP042904.1|WP_006280462.1|988276_989083_-|SDR-family-oxidoreductase MHLFCFGYGYVAKFLSKKLLNLGWKVSGTSRSKNIQDVILFNYEKVSQDLLKSATHVLISIPPDGDDVVERYGDCLQNVKWLGYLSATSVYGDHSGNWVDEESETRPIEIRGEKRLKSEKKWLNSKLPVHIFRLAGIYGPGRNVLIDLQLGKARNVKKEGHFFSRIHVEDISNILFSSMQNIKPGEIYNCADDLPTTQSEVVIYATKLLNVSPPEPIELPDYAQSFYLGSKRVSNVKIKKDLNVSLIYPNYKVGLESLHVNKTEITSE >NZ_CP042904.1|WP_084741701.1|987750_988044_-|transposase MAREYTAEFKLEAVKLANEQRKVGQPVAKVARDLGIRDSVLGKWMKKYNEKKSAANAFPDVAPYDKERFDLQSKSNKGKRHLKKSPGQSKRVKYFFI >NZ_CP042904.1|WP_007549262.1|1000186_1001380_-|phage-portal-protein MNFNIFQRKKSAVFTKYSALQLMMEPSWSKRDYVSFAEEGYIKNVIAFRAINMIASAASSVPLTLCQLTDQGKSQLKAHPLLKLLYSPNPMTSKSEFIEGIVTYRLVNGNSYILMVESQNNRKPPTELYLLRPDRVEIVPGRNNVPYIYRYAINNNSYDFKVDKLTGCSAVLHLKTFNPLNDWYGLSPIEAAAYSIDQHNQAGAWNQAMLQNGARPSGAIVVKSAKDGSGGSLSQEQYQRLKAQINDHYSGSINAGRPILLEGGLEWKEMSLSPRDMDFIESKHSSARDIALAFGVPPQLLGIPGDNTYSNLVEARLSLWEQTVLPTLENIICHLNSWLIPRFGEDLCLSYDKDTIEILMEKRQKLWKYVENASFMTLNEKREAFGLPPQPGGDKLS >NZ_CP042904.1|WP_080717643.1|1001615_1001879_-|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MEYNIIFIESVLEKDLPALPKTIRLRIINAINKRLTVDPINLGEPLYYRFKGQRRLRVGDYRVIYSVNIIKYEVVITEIGHRKDIYK >NZ_CP042904.1|WP_012673333.1|1001854_1002088_-|hypothetical-protein MANSKFSITFNNEISECLAGLAKIRNKSIKELAEKLIQEAIENEEDKILIERAARRNVSGVKKIRSEDVDWNTILSS >NZ_CP042904.1|WP_007549260.1|1002341_1002959_+|lipoyl(octanoyl)-transferase-LipB MTEWLISNQLIDYNCAVKSMEEKIQQIHNNSADELVWLLQHPPLYTAGISATDDDVVEKLFPIYKTGRGGKYTYHGPGQRIIYLMLNLKKRNKCDIKLYIRDLSKWIINVLKQFNILGEFKEDRIGVWVNNNGVEKKIAAFGIRLRKWVTYHGIALNVFPDLSHYKGIIPCGLQDYGVTSMEELGVKVPLSELDDILKKEFYKIF >NZ_CP042904.1|WP_007549259.1|1002958_1003942_+|LD-carboxypeptidase MIVYLLYFILTLCANTSIHAIDQVDIIAPSSKGKESDLTTIKEYVEALDFNPHISEKIYSNDNPFYSNSDEFRANDLVSALTGDSKIIWCIRGGEGASRLIPYLEKLPNDKKERIAQNKKILIGYSDITALHIHLQAKYDWQTLHGTMLEMIVNNSVSESSVEKLKELILNKRDSIRFDNLKTINNGIRLKDGRLKSKIIGGNMTLVENSIGTVWQINAKGKILFLEDIRVYPYAIERSLDHLKQAHIFDGVHAVIFGDFVNCYNDNLVEVVKERFAKSVNFPVFTMKGVGHGHTNDPLPFNTHAIISVQDEKEGLFFMDVQNVSYT >NZ_CP042904.1|WP_121721691.1|1004266_1005730_-|phage-terminase-large-subunit MNFLKFIELCFQTVVPGCEYNDYQYIKVIADRLEAANVGKMRRIIFNMPPRSMKSLCISVAWPAWILGNQPTARIIVASYSRLLSEKHSLDTRCIMQSSWYRELFPEVELSKDQNTKYKFQTVQRGYRIATSVGGTLTGEGGDFIIVDDPLSPAQALSETFRKRATNWFDQTLVAKLNNRKKGVIVLVMHRLHQEDLTGHLLSKPKNIWNHTCLPMISENKEIIYSIKKPAPPFLVPVTRVTTNEYKSWITASSARMTPPVILYSREEGQLLYPLDGGKEEVEMIKVELGSYAFAAQYQQNPLPLSSGIIKREWLKRYRNFSDSLSYVTQSWDTAVSTSSMSNFSVCTTWTKVGNKFYLLDVYRAKLEYPKLKEQVFSLAARWTPHAILIEAKTSGQQLVQELKTNSDLPIIEIVPHDDKLTRFYQIVPIIESGKVFLPHQAVWLNDFEYEILMFPETRHDDQVDSTVQYLQWVRDSSSRVAALRAL >NZ_CP042904.1|WP_006280324.1|1006509_1007307_-|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-subunit-PurQ MKITVLSGYGLNCEKETAFAFMECSRKLGIGNIEVKIVHINDIIDNPGELKLSNILAIPGGFSYGDDTGAGNAFALRIKNNLLDEFQEFLSQDKLIIGICNGCQILVKLIPEFSNLALIHNDIGNYQCRWIRVRVNPQSNSVWLRGLSELYLPIAHGEGKFFMDQDILNQLIESNSTALRYIDKNGNYANLQFPYNPNGSTYDLAALSDKSGRVLALMPHPERGIFFTQQDNWSLEKEKSKRLGVAVPKYGDGMLIFENALKYFC >NZ_CP042904.1|WP_007549491.1|1007313_1008564_-|phosphate-ABC-transporter-permease-PstA MSIKKKFLKLLQSRRVHARIKRKNKKNRALRFCSFTALVISLGCPVCILLSILVNSYSALTVTKILLPVEINADLALASNPSDLRYKSIGLLNDSLRKVFGGTDFKDGDEILSRNSYKELEKFFRKKVKDSGEYEIWFTASSIINSINKDKYLNDRYAKLLDWLKEKRRVKKFFNKSLFLKSDSREPENAGILGAFIGSLMTIIVCLALALPIGIMSGICLYEFMPKNRLMTNIVEISINNLAAVPSIIFGVVGLTLYLGIFGLPRSSPLVGGMTLSFMMLPNIIIATKNAFANVPITIKDAAFALGAPHIKVILDHSLPIALPRIIHGTVLAIARILGESSPLLMMGMVAFIADTPTSFFDPATVLPVQIYIWSSNPEIAFVELAAIAIIALLLVLFALNLVANFVKRKFEFFNF >NZ_CP042904.1|WP_039964172.1|1008612_1008795_+|hypothetical-protein MQVADTGIQQALPANNFYIFHESTNQKENNECWIPVSEHWDDTTAGGKHNVRTVVCHALR >NZ_CP042904.1|WP_006279489.1|1008843_1009221_-|50S-ribosomal-protein-L19 MTNLLKKFNEQQMQVLAKEIPEFRPGDDLKVTFKVVDGTSERIQIFEGVCISKRNRGLHSSFAVRKVSHGESIVSQFFVYSPALVSVQVTRKGKVRRAKLYYLCKLFGKAARIKERTTYVKKKSK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP042904_10 | 1158433-1158543 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP042904_10
|
1 spacers
spacers of NZ_CP042904_10
>10.1|1158459|59|NZ_CP042904|CRISPRCasFinder AATGAATCGCGGTATGACGGTTCGCGGCGGCGTGACGATAAGCTCGTCATCCAGCTACG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042904_10
The CRISPR arrays of NZ_CP042904_10 >merge|NZ_CP042904|10|1158433-1158543|CRISPRCasFinder TGTTAGCGGGATCTAGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTTCGCGGCGGCGTGACGATAAGCTCGTCATCCAGCTACGTGTTAGCGGGATCTAGAGATACCGCG >NZ_CP042904|10|9|1158433-1158543|CRISPRCasFinder TGTTAGCGGGATCTAGAGATACCGCG AATGAATCGCGGTATGACGGTTCGCGGCGGCGTGACGATAAGCTCGTCATCCAGCTACG TGTTAGCGGGATCTAGAGATACCGCG
>NZ_CP042904.1|WP_007550279.1|1156825_1157578_-|5'/3'-nucleotidase-SurE MIILITNDDGFGSEGIKLLKEIARNFAPEIWIVAPDTDRSGAARSLDYPVKQSIGIKQHSEREFSVSGTPADCVIIALNKVMNKKPDLILSGVNIGSNVGDDICYSGTIGAVMEGAARSIPSIALSQVYHDKIDWHNTKVFAPKVIAKLVKVGWPKNIVMSVNFPATEKVKGVEFAEQGEYNIDGDLTFTENSNGSFSLNWSREHSGSGSINKIKEGFITITPVKLDFTDYDTLNTMKNSCADEFSSIAD >NZ_CP042904.1|WP_012673359.1|1155578_1156805_+|histidine--tRNA-ligase MTNQTVRGTKDFLFDEWYKFKHIEQTASRISNLYGFLPAQTPIFEYTEVFTKTLGDSSDIITKEMYSFNDKGGKSITLRPEFTAAIVRLLIEKKLQTPIKLFSTGPAFRYERPQKGRQRQFHQINFEVFGIEDPKADIELISLVQHLLTEFGINKNVKLEINSLGDGETITKYREALILYFTKYQNDLSEDSKNRLIKNPLRILDSKDEKDKSIISDAPKISNYYTKGSSDFFEQILNGLTILDIPYTVNNKLVRGLDYYCHTVFEFVTEDLGAQGAVFAGGRYDNLVSSVGGKHTPAIGFAGGIERIMELINYSPKEERPIYLIPIGREAEKHALTLANELRRNGLYVIYEYSGTLRTRMKKANQANAKAALIFGDEELSSKTLKIKNMNTGEEKIIARDNTIENIY >NZ_CP042904.1|WP_006280687.1|1155009_1155582_+|NifU-family-protein MFIQIEETPNPNTLKFLPGFEILNEGETTDFSNANEIKNSKLAANLFQIEHVVRVFFGHDFISVTKLGGINWDTLKVEILTTIMDHFTSGGKALDKEGVNDNNIPDEEFFDKNDIEIVNRIKELMESYIKPAVAQDGGDIKFRGYKDGIVYVELQGACSGCPSAAITLKQGVQNMLSYHIPEIAGIETTL >NZ_CP042904.1|WP_012673358.1|1154588_1154948_-|DnaJ-domain-containing-protein MSFIFFLFLVFIVITFVLPSVVIFFLFLTKKNNMSFMMNSILSKFLNEFSSSRSYTENYTGDNMSKDEALKILGLNPEASQNEINKAYQNLMKLVHPDKGGSEYFAQKLNAARDKLLKK >NZ_CP042904.1|WP_039964112.1|1153075_1154569_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MKIQLSKVNKYLLVLLITVSAFLISGQVSSSSNIENDFQDLQEKLPLLKDQDLLFLDPASALNYGDRAGKKVLMVIVHHTETSTLKGTKDTLNARGLSVHFIVDRDGNITLMVPLEKEAWHAGISYARVKVDSKLEELRKLNNYSVGIEIVNTGLEPFPEEQMRSVKELILYLMERFKIKRDMIFSHSEIGTIVYDPELGYTMRKPDPHKLFDWELLEKNEIGLHISDRINPKDAKHKMGKTLYKAGDRNEGILKLKQRLNRFFYKIEPWNDKKGNVIFPDNNADYSDEFDENFVWVIYQFSIHNLPREIRKDLPLKLEQADIFPEFFSEYSHGISSSYLTFSEKIKSTLQPCLSKVDYENLLSSLAQYENNISPDASTTLMYKIKLYYDSYLRYRIWSSLYKPFKLNVLEELEILKSGVLSLKSLDSSKAAEVSSLIDSFKVDISLEFQGFEKQWFQEFKNAWRQEFIPSLEEQITWTALHEAILEYLEKAKEEIR >NZ_CP042904.1|WP_010082675.1|1152800_1152971_-|DnaJ-domain-containing-protein MFRDGAFKVLGIDSGANQNEINKAYQNLMKLVHPDKGGSEYFAQKLNAARDRLLKR >NZ_CP042904.1|WP_006280242.1|1151466_1152696_-|cytochrome-b/b6 MQEDNKKETIKEEKGILGWIEYRLPIFSFLRHTASYQVPKNLNYAWNFGSLAGIALILQIITGIFLAMHYTPHVDYAFNSVERIMRDVNYGWLIRYTHAVGASLFFMVVYVHIMRGLYYGSYKRPREMVWFIGIFIFFAMMATAFMGYVLPWGQMSFWGATVITNLFSAIPLIGNKIVIWLWGGFSVDNPTLNRFFALHYLLPFVIIALAMLHVIALHRFGSGNPSGVEVKSDKDTIPLYPYYIVKDCITFGLFFVVLFAFVFYAPNYLGHPDNYIEADSMVTPVHIVPEWYFLPFYAMLRSIPDKLTGVLTMFASILVWFLLPWLDKSKVKSGAYRPVFKKFFWVFAINFVLLAWLGGQEVKEPYITMSRLSTLYYFAYFVIVLPLLSKYEKPKEPPKTLSDSVPEMR >NZ_CP042904.1|WP_012673357.1|1150339_1151098_-|cytochrome-c1 MGSNVFAIFCMLFLSSLISAEEFKSLPNKKIDWKFDGIVGSFDRESIQRGYKVYKEVCAACHSMNRVAFRNLQDVGFSEEDVKQIAASYQVKDGPNDLGEMFDRPGVPSDYFIAPFDTKEAAAASNNGAVPPDLSLIIKARHDGANYVYSLLTGYQNGEHDENDLYFNSYFPTGRLAMAPPLSEGMVEYDGARQATVENMAYDVINFLQWAAEPELERRHKLGLKVVAYFIILTVFFVLTNNKVWSKLYKKK >NZ_CP042904.1|WP_007550541.1|1149912_1150065_-|transposase MPAAYSYDLRKKAMEALDEGESREAVAARFKIGRTTLWEWQHCRLDHKLC >NZ_CP042904.1|WP_012673356.1|1149133_1149871_-|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA MRYKITVEYNGSSFSGWQKQQHSANSIQEKIENAIFNFSGEKIALYCGGRTDAGVHALGQVAHFDMEKECELYRIRNAINYHLKSIPIVVLNAEVVDDAFHARFSAKKRYYEYRIVNRYAPAALETGYVWQVFSPLDVNIMREAAKHLLGKHDLSSFRSKDCHAANPIRTIDDIDIVQNGNHIHIKISAISFLHNQVRIIAGTLVEFGKNRTNPQEMLHILSQCKRSAAGVTAPPFGLYLVKIDY >NZ_CP042904.1|WP_012673360.1|1158702_1160046_-|signal-recognition-particle-protein MFKSLTESLNSVFSKLRGKSIISEDDFNLAMREIRIALIEADVSLEVAKKFINDIKDKVIGEKVIKSVSPAQMIIKIVQDNLVAVLGSEKSDLNLAVKPPAVIMMVGLQGAGKTTTSGKLALKLKKQKKKVMLASLDIYRPAAQKQLEVLGKQIDVQTLPVVIDEKPITITKRALAAAKNDNYDVLILDTAGRLHIDNNMMNELKAVKEIASPAEVILVADAMIGQDAVNIAKSFNEVIGVTGIILTRVDGDARGGAALSMKMIADCPIKFIACGEKLSDLDDFYPDRIAKRILSMGDVVSLVEKAAEIVGQEEIDKLQKKVKKGKFDLNDLVGMLKTLSKMDGISNIMKFIPSSFTKKLSSSVPDDNKVKKYIAIINSMTEKERQNPDILNGKRRLRISKGSGTTVTDINLLIKQYNQMSSMVNKFSKVDHSKLKESDLMNMLSRK >NZ_CP042904.1|WP_012673361.1|1160030_1161590_-|cation:proton-antiporter MQLYKSSLLLLLTVLIVIVLKLPENLSIAVNWSLPILDFDLSFRTILISFLSVAFLAVLPAQNLTFSEMLSFAAYTISSLYAVLSEHMILVIIFCELMTISAFFIIAASCRDSGPAIRYACVHFFVGVILIAGLALQSTNLIILGLLINCACFPFSFWVVDAYPAASLYGTTYLSLFTTKVSFLVMLLHTYNLWQNCAEMLALVGTITAIYSIIFASLEQNIRRFLCYNVVGQMGLLIIAGGLLSPSEKAIPILILHIIFSLVYQSLLFVVSNSIISRTKTISFNGVGKLMSVEGMCAIIAILTMAAFPGTAGFISKSYITAEIEASGANLEVYKNLYKTLNLLLYLSVGLKFLYYLFIAKSKSKPLAEEGGKMTMIILAFICVIAGNPYLPIYNKPSIFDFVYNTKNILSQFNLLLCTTLLFILLRKLFYPRINFKMDVDWIFRAFIPYIILLFNQLVFKVREMSANVLQNLTNSLTSLYFDNITKLKEVLGYNSVSFVSASSLFLMSILLMLLCLSR >NZ_CP042904.1|WP_012673362.1|1161893_1164653_-|FAD-dependent-oxidoreductase MKLNFKISFSNLYTRNGLIKLDETFLNYIKSCDESLFCSLIEARENRIGDSQLIIDLSYLLDEFIAKLFNIKKEIEELKKKHNDFAVIYKCKRLFVQRYALKKYTNVENIDITNKLSHFLTLPTTEKNFAEQVMHWFEDKENHKEEIELAAQYAVWRVKNKQSILFSIHKKIDHENLIPFSKKEVDKVEVLHSNEVKRRYGFDLTSKKVSLNKALDNAHYCIFCHKQSKDSCSKGLINDDNTFKKSPLRVELHGCPLEQKISEMNLVKSEGYSIASLAIVMTDNPLCAATGHRICNDCMNSCIYQKQEPVNVPAIETRILDDVLSLPYGFEIYSLLSRWNPLNFQRSLPRGNTGKNVLVVGLGPAGFNLAHHLLNDGHNVIAIDGLKIEPLIDNFQLIKDFKHEKLSERTAGGFGGVAEYGITSRWDKNYLKIIRLLLERREHFALYGGIRFGGTINVDDAFNLGFDHIALALGSGKPRMIKIKNILARGVRMASDFLMSLQLTGALKFDSIANLQVRMPIVVIGAGLTAIDTATEALAYYPIQVKKFLLRYEILVDKYGKDCVEKDWTEAEREIANEFISHAKLIQAEQELAKKENREAKILELMQSLRGVKVVYRKELKDSPSYRLNSEEVQNALSEGIYFIENLEPVEVVTDKYNHAESIKLIDTKSGEIKRIKARSIFIAAGTEPNTVIATEDKRHFKLSNGYFTQLNSLGKEIDPIFSPKMQNKDRILVYKQGNKTISFFGDLHPSYSGSVVKAMASAKNGYPIISQLLNRVNSFVSVIPVCDVVGQKKNAWSSIEDLANKEFFNRIKEQFAAKVIKVQYLTDKVIEIVIKAPLAAKNFKPGQFFRLQNFETNGRKTNLAMEGIAVTGTEVDKKKGIISTIVLEIGGSTNLCRHLREGEQIILMGPTGRPTEVY >NZ_CP042904.1|WP_006279640.1|1164698_1165130_-|3-hydroxyacyl-ACP-dehydratase-FabZ MQFNISDIIKILPHSYPFLLVDRVIECDPGKSIKAIKNVTFNEPFFIGHFPGHPIMPGVLIIESLAQASAICVLGKETIENKVVYLRSIENAKFRKPVTPGDTLILQANIQSVCLGVHKFRCIASVSEEKVAEATISAVLQNK >NZ_CP042904.1|WP_012673363.1|1165134_1165686_-|OmpH-family-outer-membrane-protein MKYIQLFISVIALIISLFVGYKFVGYQPQNTKAAIIDSDKVINESLALQNIQQQIKEQNSRLQQEFENELEKLKPSKEEFELLSEEAKKEKTGQFNKHTVNTRDNYAKKMLHLEESYREAVESVFNKIKEVAKRTAEKNNIDLVLFISKKNQVLYSMDEVDLSDVVLKNVNKEVPEFALKGIE >NZ_CP042904.1|WP_012673364.1|1165686_1168023_-|outer-membrane-protein-assembly-factor-BamA MKKLFYILVVVFISFPALLVALGTAEKVQVKDVKCIGNERVSNQTIGFYIKLKSGDYINDDDIDSIIKDLYKTKLFASVNAYIDDKKNLVIKIQENPLINKIILKGNKLFNSKELLNNVIQSKSLTIFTETKLQNDLMNLITTYRNNGKVGVKIEYELEKLDSNRVNLIFKIKEGKTSKIKDIRFIGNKNFSENELEQVIKRHSNDIFSKLFRAIFKGENHYSPQYLLINTELLDRFYSSKGYIQNNIQPIVEVDNNNQTELTFLIDEGQQYLFGNNEVNIETEIQDLSLKEEILDFITEENDKIFNRVKINNTVEKINKYLNEKGYIFAKVNPEYAQRDNVVDVTYRVLPGKKIYINQITIDGNDRTLDKVIRSKLSVAEGDAYNISEIQKSRKKLMSSDFFETVKVNSYAVNDNAVNLDLSVKEKNTTSLYLGGGVSLPGGALIKIDLKDRNLFGTGKELSFALEKSQYVFSTDLEFVENNFNDSDTSLGVDVFYEKQDKPNTTFDSCDMGFFTKLSYKVTENLTNSLRYSYKYNHIHMDNKGGQDTDISEIILDRKGEHQISSVGYTLAYNKLDNLYTPKEGYLLRLSQDISGLGGNVNFLKSEFLSFYTHPILSKIDDDITLRFKMAAGHIFSYTDENLNIGQHFFKGGNEIRGFDLSGIGPRAEDKNKSSLGGKTYFNLTQQVDFPLPKLYDYAGIKGSLFVDYATLFGLDDKNKKYEGKYYDSKLVRVSPGFGFSMLSPFGRLRLDFGFPLVKESYDIIPSPNVKFSIEAGI >NZ_CP042904.1|WP_012673365.1|1168031_1169150_-|RIP-metalloprotease-RseP MELISNLIHQFSDGIYYFLSFSLIISVIVFVHEYGHYVVAKACKVKVESFSIGFGPEIFGFNDKSGTRWKLSAVPLGGYVKMLGDTNAASVPADQQELTEEEKLYSFHTKPRHKKAAVVFAGPFANMVFAVIAFTIFFSIAGYYRTPPVIENVIEGSAAKQAGLLPGDTITQINEHKIKYFEDISRVIMSNPKTRMEIEYSRNNEKHRTSLTPLIIKDKDVFGNTIERETIGIISVNTLKQSSFLGAVSLSVSETYHTMCLTIKALFHIIVGKRSINEIGGPIKIAKYSGQSAKKGFIMVLYFMAIISANLAAINLLPIPLLDGGHLFHYIIEAVIRRDLSLKCQKYAAIFGALVLFLLMATGMSNDIRDLF >NZ_CP042904.1|WP_006279484.1|1169249_1169528_+|succinate-dehydrogenase-assembly-factor-2 MTDTSLLRRKLIYRSWHRGCKETDILLGHFALKYLDKFSLSELIEYEKIVDLDDYELYCYITRKTNLPPGLNSQIVNLIACFIEANPLCTQD >NZ_CP042904.1|WP_007548735.1|1169502_1169829_-|cell-division-protein-ZapA MQVVEIVIRNNTYKISCESGKKSHLLRLANSFDKLVGSVSQKIGGKGSDALNFLLAALILEDKILELTKRLDEVNQERKKYRNEKRIEYTEVLDKVNKIITNLECIKD >NZ_CP042904.1|WP_007548734.1|1169901_1170180_-|integration-host-factor-subunit-beta MATKSDIIARVAKRHPFLDKIVIAAIVDRFFGILSSTLKHHNRVEIRGFGSFSVRSYNLKETSHLMLQKFTKNQYFKTYFRSSKKLSDLVNE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP042904_11 | 1281933-1282038 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP042904_11
|
1 spacers
spacers of NZ_CP042904_11
>11.1|1281958|56|NZ_CP042904|CRISPRCasFinder AAAGATAAGTCTCGTCATCCCGCTGCGTATTAGCGGAATCTCTTGTTAGCGCTGCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP042904_11
The CRISPR arrays of NZ_CP042904_11 >merge|NZ_CP042904|11|1281933-1282038|CRISPRCasFinder GCGGTATGACGGTTCGCGGCGGCATAAAGATAAGTCTCGTCATCCCGCTGCGTATTAGCGGAATCTCTTGTTAGCGCTGCGGCGGTATGACGGTTCGCGGTGGCAT >NZ_CP042904|11|10|1281933-1282038|CRISPRCasFinder GCGGTATGACGGTTCGCGGCGGCAT AAAGATAAGTCTCGTCATCCCGCTGCGTATTAGCGGAATCTCTTGTTAGCGCTGCG GCGGTATGACGGTTCGCGGTGGCAT
>NZ_CP042904.1|WP_007548792.1|1280223_1281336_+|tRNA-2-thiouridine(34)-synthase-MnmA MLKEFEIEPLLKDKAPHQIKAIVAMSGGVDSSVAAALLHNLGYQVIGVTLQLYGTDGNANARKGACCAGQDIYDAKRVAESVGFPHYILNYEEIFKKEVIEDFASTYMRGETPIPCVRCNQTVKFRDLLQVTKNLGADVLVTGHYVRRLEKNGEVKLCRSIDKSKDQSYFLFATTQEQLKLLRFPLGGFYKSDIRKLAKYFSLQISEKPDSQDICFVSESYSKTIAKLAPQSVQKGKIVDVNGKVLGEHSGIVNFTVGQRKGLGIAHNEPLYVIKINTENNEVIVGPINVLMQKKILIKELNWLEQPKEGMEVTVKLRSSHAGSLATIHSTDEKNKACVILNDDYFGISPGQACVAYKGEQVIGGGWICS >NZ_CP042904.1|WP_007548791.1|1278830_1279907_+|rod-shape-determining-protein MNFVRKLTGKFYSLFTFKGLFASDIAIDLGTANTLVYQKNQGIVLDEPSVVARIKEKGSYVPYAFGKKAKMMLGKTPGEIEAIRPLKDGVIADFKSAEEMLKYFIRSANTKFTVNKPNIIICVPSGSTPVERRAIQDAAESAGANEVFLIEEPMAAAIGAGLPVTEPEGSMIVDIGGGTTEVAIISLGGIVYSRSARVGGDIMDEAIKSYIRENHKLLIGETTAEKIKKSIGSASLPGENNKEGMIIKGRDLVSGMPKEMLLSEYQVAESLIEPVHQIISAIKTALESTPPELSSDIVDRGIVLSGGGGLLRNLGKVISETTKLPVRVADDPLCCVALGSGKVLENMDYFGHVLFKQD >NZ_CP042904.1|WP_007548790.1|1277385_1278807_+|carboxypeptidase MQSYKFLEEVLYRVKNIENTLKVLNQSQLNIEDKVEQMSLLEEIRHEIISHDAIKESLADALGNKKSANTQQLKLIERIHKSNSAVPIDLVKSLSKAKVECQDLWKLSHSETSNLEKLKERFTDLITLIREVASIKSQQLKCSKYDSLLADYDSDITEKNIREVFPKVGKFFSENVDKIIEKQKKDKVTNIQKVATQKQIELGSLCLQQMGIALNEIRTSYYYPIDYDESDFCYGLFSLLRHSGYAIYQKCLAQNSISSPITRHVMYETQGLFMERMIGTSREFIEFIQPHIKEKFAIKGKTNEKVSSVENLYLIFNEINLSSFLKNADEFSLLAHIMLRTRLEQDIINGTLEVKDLHDAWLEGMKHYKIPVKAENELNTYFQDEYWASGVMGYFPIKIIALIAAVQIFSFVKKNHYESLSAIIKGDFSLLISWLSQNVYSAKCGLELLKKVTGKGLDVECVTYYLSEKYNLS >NZ_CP042904.1|WP_007548789.1|1276630_1277110_-|OmpA-family-protein MWSRLVIMCCFCLLLTGVSSCPKKGANTTNKINSVVKQIGNKRVFFGYDESSIAEVSADALLDVMEVLQDNPDAKVTLTGHTDNRGSHEYNLALGARRADAAKKFMVSCTPYIENRIKTASKGETEPLVNVKDDSRNSKYEKEHAKNRRVEFSFSGIKK >NZ_CP042904.1|WP_007548788.1|1275150_1276446_-|tRNA-lysidine(34)-synthetase-TilS MELELLFQNVVNSFAFYNNQVAVAVSGGVDSIVLLHLMTNWAKKNKLSLPTALTVNHGLRPESQKEADFVVSYAKELGAKESFILNWEKQNIKGNIQLQARKARYKLLAEWCKNNNVKYLLVAHHKDDQAETFLLRLERGSGVDGLSSMDYKSFLNGIYIFRPLLNFSRSEIEKYAKLHRLKWIEDRSNYDLKYRRTLYRNLLKASDNQEILTERICLTALHMKRAAKALMHYTRLAFNDCVNVHDLGYIEIKLSEFYQLPEEIALRLLLYSIMAIASKHYKPRYNSLIVIFNKILQKDSNVNCTLSGCKIRKHGENILIIRESSKIQEITLNLPLNEPTQWDNRFSCTILGNQECSVIIAPLKKTQKVPEFLKDYNCCPEVFYSLPVVLKDGKVLAYPDVNYNGKNTNDDKVQCIINSTIKQNLVSLISI >NZ_CP042904.1|WP_012673393.1|1273299_1275138_-|ATP-dependent-metallopeptidase-FtsH/Yme1/Tma-family-protein MKKFLEGLLIWLVIIVLISVAYIQFSGNVGKSKTIIPFSEFLTRLEDNDVENIVIKNQSIEGKFRDGSSFNSSGVIYSDLIKNLHDRKVRFSFSTGDSAMNVIGGLLISWVPTFIFIGFLLFFLKQTQAGGNRTISFGKSRARLMTSGKKVTFDDVAGIDEAKEELVEIVDFLKQRQKFQILGGKIPKGCLLIGSPGTGKTLLARAIAGEANVPFFSISGSDFVEMFVGVGASRVRDMFDQGKKNAPCIIFIDEIDAVGRHRGIGLGGGNDEREQTLNQLLVEMDGFESNEGVIIIAATNRPDVLDPALLRPGRFDRQITISLPDINGREKILNTHIKKISIAPDVNVKTVARGTPGFSGADLANLVNESALIAARRNKKIVTMDDFEYARDKVMMGVERRSLIMTEEEKRLTAYHEAGHAMIAVNMPASDPIHKATIIPRGRALGLVMRLPETDRVSLTREKMLADITVAMGGRVAEELIFGYDKVTSGASSDIKQASDLSRAMVTKWGMSDKIGPIYHNREQTIHGSEIISEDTLKLIDEEVKKVVSSCYEKAKDILTKHKKGLDLIAENLLEFETLTGDEIKDILNGKKIVREENEKNEKIKKSSLYES >NZ_CP042904.1|WP_007548786.1|1272476_1273145_-|hypothetical-protein MIDIASIGVSTVIDQNYRRKAQLCLSGLFVTVSIATVTWFIFPASQNVLAPFLLPAMFLLFTLSMGYYMFIFSCEEKSLVKNVLGMVEPAESVKRVHCQENIKSLLAEVRSTTKDRFRNVLVNLCFEDRSKAHKLALYVKEIDNIVSSIKNKDLLDHFDQFFTITEVSNKKNRSELMNLARAYKMISEEDPDKIQDFLATQTKSYSYEIMLPEIDNFLSQAR >NZ_CP042904.1|WP_015589469.1|1271893_1272484_+|dTMP-kinase MFITFEGIDGSGKTTQSKLLANHFKQIHGENNVVLTREPGGTNFAEKIRGVLLTNNIDPISELLLLISMRREHMKKLILPALAEGKIVICDRFIDSTIAYQGYGLSVDLGLIRDLHKLVEIKCPDITFILDIDVKVGLNRAKDKNKYEEMDVNFYNKVRKGFQEIAIKEPVRCSVITGIETKNDNHVHNEIIDKIT >NZ_CP042904.1|WP_007548785.1|1271212_1271785_-|thioredoxin-family-protein MVALNTPKVDFSFTAKDFNLLGVDNKYYTLSDCCGKNGLIVMFICNHCPYVQSIISNLVSDVDQLKKDYQVNTIAIMPNDVNEYPEDSFENMINFAKENKFTFPYLIDSTQKIAKEYGAVCTPDFFGFNSNLNLCYRGRFNDAKKEKVQSYEVGSSDLFQAMKFIAETGNSPIDQKSSIGCSIKWSNSTG >NZ_CP042904.1|WP_010963130.1|1269488_1271207_-|potassium-transporter MHSGSQHLFDIIILLSAAVFIVIAFWKMNISPVLGYFVAGAVIGSHGFNLIHSAEAMDNLAEFGVVFLLFIIGLELTFERLIAMRIHVFGFGSLQVIVTMVAIWCIALAFGVNTNIATVIGGGLALSSTAIVLQVLQEKGSQASQVGRLSIAVLLMQDFAVVPLIVLVPLLTGNSEHSLISSLAGSLVQAAIALVLIFITGRLLLRPLFSVIAKMESNEIFISTTLLIVLGAAFITEQFHLSLALGAFVAGLLVAETEYRHSVEHAVLPFKDLFLGLFFMTVGMSINTELLLNKLPLITLLSIILIVLKTSIIYILCRFFGFKSAPAIQAGLLLSQGGEFAFILFRLADELNVLPSEIAQVLMMVTTVTMAFTPLLSGLGDWIANSFSTEKTILDDEAVETDTQDLYNHVIVAGFGRVGYMVTKMLTAEHLSYVVVDIQSKIVKEGKSDSFPIYLGDVTRCEILKSVGIERAQALVISIKNEVTIKKVVSLVAANFPHVNIVIRLPDLSNVEVYRDLGASKIIPETSEIGLQLGGAALSLSGISESGVTSLKSRFRKGNYSMLKDLGSDKDE >NZ_CP042904.1|WP_012673394.1|1282285_1283509_+|hypothetical-protein MIKEIEELIKIVGKGNLLETLFIFLGSFQHADLGRFMDHRNHFGLSEFIRKKEEPLDKYFNLKFSLQGLFLIYAQAYRILSENNNLNTKDVIDKIYEVIKGSELNEYINEVVDGRKLDLLNILANPKREPIFKTEEDFENKVLIGLRKLLSEGNTLNKYDREFALNKCVISSYYSIHDIKADKDIALFFSLGGHYKELSSSNKTVKREVLEICENQLIESYIMFLAGKLHMIGLSSRDKYTIDHENVDRQEKALKMDGLIYPINTKNTLEQLLKNQNSDEFEQLITSPDNIYYSVLQEENECRPNPITSKKKEKDHKNTVCKLILGMFVLSVGLYVADYFFMEQKLFNPIKGVLPQDNFVNLVIAAVLTIVIVYALFQLLKPPQEPPLSTVNKMMNENLGPLHAKQA >NZ_CP042904.1|WP_012673395.1|1283578_1284094_+|inorganic-diphosphatase MDLSKITAGPNAVNVVIEISANAEPVKYEFNKEFGLLQVDRFLSTSMTYPCNYGFIPNTCAGDGDPVDVLVLTQFPLASSVLISVRPIGALLTKDEKGEDEKILAVPVSSVDSYYDNIKDYSDLSKSLLDKITHFFSHYKDLEKGKTVAVGEWVGVEEAKQIVASSIKSGN >NZ_CP042904.1|WP_153801321.1|1284129_1284282_+|hypothetical-protein MKNNKFVIPLRVSGIYTAHNCTNIAIWHIVNDVIPVRDTGIQTFRKNVIF >NZ_CP042904.1|WP_007548451.1|1284759_1285905_+|peptidylprolyl-isomerase MYKILILLLIVLPLRLLATEIEIVADVNGEPISNLDIEKRINFINSLFGTQSVNQKEAKPQVLRELIDEIVIINEAQRLNIKLSNEELDNAIMLFLTQSFKLKANEVDQYIEKHNIDLGILRKQIKCQLLWSKIIEVRIVPFINISDKEINDVKRQTEKPNYLITFQEFIIPDQKDKDVYGIAEDLVKKLRNSNNPESPIKMRKATVNLSQLKGKLKSVLEGLETSDIAGPFSFSEGYSVIKVIDKVQLNHALLESTLKLKQIVVEGSESLLDNLKEQKVNCLNFDKLADNFKLPNAKEFEIKMRDLNPDLQILFSKTSVNEIVELRENGTAKLMMLCDIKSNVAGIEAIKQKMYQQKIMIQSNLLLDDMRKNAAISYRYS >NZ_CP042904.1|WP_006280380.1|1285992_1286613_+|hypothetical-protein MKNIMLIGGGVGNAVLFSIGKACLENNNKVLYFAGYKKLSDVFKRALIERASNAVVWVCEEGLIETSRDQDKSFHGNIVDAIVSYQQGRLGINLNVIDKIITIGSDKMMKAVNEARKTILKPYLKSSHIAISSVNSPMQCMMKEICAQCVQQHINKETGERSFVYSCSNQDQDMEFIDFDFLSERLKQNSLQEKLTAKWIDHVQRY >NZ_CP042904.1|WP_006280381.1|1286596_1287148_+|5-formyltetrahydrofolate-cyclo-ligase MFKDIKQHKKEIREQYRAIRKDIDESYSSYAANSLINLFNQNLSYVKGKTIAAYIPMDGEIDVVPLMHSLLDLDYKVAIPNKNKLLKFEEWNKTNEDVIPDTIITPVIAFDDHFNRLGFGGGWYDTMIKKLRPLGKIFIGVAYEKQYCKNLPVEQHDQKLDIIITEMCVRFESGLLKKVDKKE >NZ_CP042904.1|WP_121721669.1|1287192_1288230_-|hypothetical-protein 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_CP042904_7 | 7.1|816302|51|NZ_CP042904|CRISPRCasFinder | 816302-816352 | 51 | NZ_CP042904.1 | 726656-726706 | 1 | 0.98 |
NZ_CP042904_7 | 7.1|816302|51|NZ_CP042904|CRISPRCasFinder | 816302-816352 | 51 | NZ_CP042904.1 | 1158367-1158417 | 1 | 0.98 |
NZ_CP042904_1 | 1.1|51724|57|NZ_CP042904|CRISPRCasFinder | 51724-51780 | 57 | NZ_CP042904.1 | 901263-901319 | 2 | 0.965 |
1. spacer 7.1|816302|51|NZ_CP042904|CRISPRCasFinder matches to position: 726432-726482, mismatch: 1, identity: 0.98
agataccgcgaatgaatcgcggtatgacggtgtaatgacggttaagtaatt CRISPR spacer agataccgcgaatgaatcgcggtatgacggtgtaatgatggttaagtaatt Protospacer **************************************.************
2. spacer 7.1|816302|51|NZ_CP042904|CRISPRCasFinder matches to position: 726544-726594, mismatch: 1, identity: 0.98
agataccgcgaatgaatcgcggtatgacggtgtaatgacggttaagtaatt CRISPR spacer agataccgcgaatgaatcgcggtatgacggtgtaatgatggttaagtaatt Protospacer **************************************.************
3. spacer 7.1|816302|51|NZ_CP042904|CRISPRCasFinder matches to position: 726656-726706, mismatch: 1, identity: 0.98
agataccgcgaatgaatcgcggtatgacggtgtaatgacggttaagtaatt CRISPR spacer agataccgcgaatgaatcgcggtatgacggtgtaatgatggttaagtaatt Protospacer **************************************.************
4. spacer 7.1|816302|51|NZ_CP042904|CRISPRCasFinder matches to position: 1158367-1158417, mismatch: 1, identity: 0.98
agataccgcgaatgaatcgcggtatgacggtgtaatgacggttaagtaatt CRISPR spacer agataccgcgaatgaatcgcggtatgacggtgtaatgatggttaagtaatt Protospacer **************************************.************
5. spacer 1.1|51724|57|NZ_CP042904|CRISPRCasFinder matches to position: 901263-901319, mismatch: 2, identity: 0.965
ctgagataccgcgaatgaatcgcggtatgacggttcgtggcggcgtgacgataagct CRISPR spacer ctgagataccgcgaatgaatcgcggtatgacggttcgcggcggcatgacgataagct Protospacer *************************************.******.************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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1. spacer 6.1|805667|57|NZ_CP042904|CRT matches to MN180249 (UNVERIFIED: Wolbachia phage WO isolate Seq2WORi_AMD2 genomic sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.807
gatctatgccgagataccgcggcggtatgacggttcgcggtggcatgacgataagct CRISPR spacer tagcggctaagagataccgtgacggtatgacggttcgcggtggcatgacgataagcc Protospacer * * .. *********.*.**********************************.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
29337 : 73142
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP042904|29337:73142|DBSCAN-SWA 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39 | Shigella_phage(18.18%) | tail,tRNA,transposase,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
77635 : 270826
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP042904|77635:270826|DBSCAN-SWA 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174 | Shigella_phage(14.29%) | integrase,tRNA,transposase | attL 197630:197672|attR 264490:265974 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
276109 : 351753
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP042904|276109:351753|DBSCAN-SWA 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57 | Tupanvirus(20.0%) | tRNA,transposase,protease,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
356492 : 421393
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP042904|356492:421393|DBSCAN-SWA 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55 | Wolbachia_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
429350 : 473959
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP042904|429350:473959|DBSCAN-SWA 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42 | Shigella_phage(23.53%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
486956 : 532712
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP042904|486956:532712|DBSCAN-SWA 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40 | uncultured_virus(18.18%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
556855 : 608297
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP042904|556855:608297|DBSCAN-SWA 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34 | Wolbachia_phage(73.33%) | terminase,transposase,tail,plate,capsid,portal,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
624732 : 753609
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP042904|624732:753609|DBSCAN-SWA 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114 | Wolbachia_phage(73.77%) | terminase,transposase,tail,tRNA,plate,capsid,portal,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
767681 : 902790
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP042904|767681:902790|DBSCAN-SWA 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116 | Wolbachia_phage(32.14%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
927070 : 963655
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP042904|927070:963655|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP042904|927070:963655|941618_941822_+|WP_007549940.1|transposase|DBSCAN-SWA MYPSDISDKEWEILEPHVAQGKIGRPRKHNIRTIINAIRYIMRGGCQWRMLPKDFPPWKTVYDYFLR >NZ_CP042904|927070:963655|948141_948450_+|WP_006012916.1|DBSCAN-SWA MEIGLNHFLIVAAVLFTIGVCGIFINRKSIINILLSIEILLLAININLVAFSAFMNDIVGQIFVMFVLTVAAAESGVGLAILVVYYRSRGNIDVEQANLMKE |
35 | Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
976854 : 1031710
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP042904|976854:1031710|DBSCAN-SWA 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56 | Wolbachia_phage(18.75%) | terminase,transposase,protease,tRNA,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1041744 : 1112690
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP042904|1041744:1112690|DBSCAN-SWA 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59 | Wolbachia_phage(67.44%) | terminase,transposase,tail,plate,capsid,portal,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1116619 : 1172667
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP042904|1116619:1172667|DBSCAN-SWA 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52 | Indivirus(18.18%) | holin,tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1206250 : 1221290
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP042904|1206250:1221290|DBSCAN-SWA 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12 | Erwinia_phage(50.0%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1275150 : 1314778
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP042904|1275150:1314778|DBSCAN-SWA 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37 | Wolbachia_phage(75.0%) | terminase,transposase,tRNA,plate,capsid,portal,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP042904.1|WP_007551133.1|1140557_1140836_-|DUF2671-domain-containing-protein |
1140557_1140836_-
Protein sequences of NZ_CP042904.1|WP_007551133.1|1140557_1140836_-|DUF2671-domain-containing-protein>NZ_CP042904.1|WP_007551133.1|1140557_1140836_-|DUF2671-domain-containing-protein MSYTIASEVETLNKKSNKNEGVMLLNNPAYREKYKERFDEAQRKVMDMVQFYDGTIVLIENKIAMYYYAWHSKKREFERKKQQTVVKNNDSA |
92 aa aa | NA | NA | NA | 1116619-1172667 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 7.1|816302|51|NZ_CP042904|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP042904 position: 1158367-1158417, mismatch: 1 agataccgcgaatgaatcgcggtatgacggtgtaatgacggttaagtaatt CRISPR spacer agataccgcgaatgaatcgcggtatgacggtgtaatgatggttaagtaatt Protospacer **************************************.************ |