Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NZ_CP042841 | Acinetobacter baumannii strain ATCC BAA-1790 chromosome, complete genome | 0 crisprs | cas3,DEDDh,RT,csa3,WYL | 0 | 0 | 7 | 0 |
NZ_CP042842 | Acinetobacter baumannii strain ATCC BAA-1790 plasmid unnamed, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1158757 : 1188752
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP042841|1158757:1188752|DBSCAN-SWA ATTAGTAGCTTTCTGGTACTGCACTTAAGAATTCACGGCGCGCTTCTTTATCGGTTTTAAAATCTCCGACAAATGAAACTGTACGGGTGGTAGATTCTTGTTTACCTACACCACGCATCATCATACACATATGTGCTGAATCGATGACTACAGCAACGCCACGAGCACCAGTCACTTCTGCAACAGCTTCAGCGATTTGCTGAGTAAGGTTTTCCTGAATTTGCAAACGACGAGCAAACATCTCGGTAATACGTGCAAATTTAGATAAGCCAAGAACTTTGCCTTCTGGTAAATAGGCAACATGAACACGGCCATAGAATGGGAGAAGATGGTGTTCGCAGAGCGAATAAAATTCAATATTCTTCACCAATACCATTTCATGGTTATCTGATGGGAAAACAGCATTATTGGTGACTTCTTCTAAAGTTTTACTATAGCCAGAAGTTAAATATGAAAAAGCTTTAGCCGCACGCACAGGCGTATCTTTAAGGCCGGGACGATTAAGGTCTTCACCGACGGCAGTCAGAATATTTGCGTACGATTGCTGCATTGACATAAGACGTATAAATTTACTCTATTAGACAAGCTCGGCATTGTATCAGAAACATGACCTGATGTTCATAAATCCTCGCACTATATTTATTTTGGTTTTTCCGTACGCTTGATAAAAGATGAATAAATTTCATGTTTTTTATCGTTAATAGTCAAGTGTTTGGACATGAAATGTGCGCTTAATATTGATAAGTTCTAAATGATCGCCTAATGGCATCATATTTGCACAGAAGCATTATTATAAAGCATAAGGATAAAACATGTTAGAACGTCCAATCACCTTCTTTTTCCGTGGTGGTCAGCAGCAAGTAGAAAATATAGTACCCACAATGACGGTTTTACAATTTCTGCGAGAATATACTCAAACTGGTAAGACTAGGCAGACTGGTACAAAAGAGGGATGTGCTGAGGGCGATTGTGGTGCATGTACAGTAGTGATTGGTGAATTGGTCAATGACAACCTGCAATTACGTAGTGTGAATGCGTGTATTCAGTTTTTACCAACTTTAGATGGTAAAGCCTTATTTACAGTAGAAGACCTTCATAGCTTATTGCCTGTACAAGATGGCACACTTCATCCTGTACAACAGGCGATGGTCGATATACATGGTTCACAATGCGGTTTTTGTACACCCGGTTTTATCATGTCGTTATGGTCAATGTATGAAAATGAACAACAGTCTCTAAGCAAAGATAAAATCAGTGATTATCTTTCTGGAAACTTATGTCGCTGTACAGGCTATCGCCCTATTTTAGATGCAGCACAAAAAGCTTATGACTATCCACGTGTGGTATTAGAACGTCAAAAAGTAATTGATGTATTAAAAGAGATCAGAACATTACCTGCATTGTATTTGAATGATCAAAAGCAGCAATTTTTTGCACCCAAGACTTTGCAGGATTTTGCTACTTTACGTTTACAGTTGCCGCAAGCACGTATTGTTGCAGGTAGCACAGATGTAGGTTTGTGGGTAACAAAGCAGGGCCGTGATTTGGGCGATATGCTTTATATTGGTCAAGTTGAAGAGCTAAAAAAGATTGTAGTCACAGACCTTGCTTTAACGATTGGGGCAAATGTAAGTTTGAGCGATGCACTCATTAAAATTTCAGATTTTTATCCCGATTTTCAAGAATTACAGCGCCGTTTTGCTTCCATGCCGATTAAAAATGCAGGCACACTAGGGGGAAATATTGCCAATGGTTCGCCTATTGGTGATTCAATGCCGGCATTAATTACGCTAGGTACACGATTGATTTTGCGTGTAGGTAAGCAGACTCGTGAAATTGCTTTGGAAGACTTTTATTTAGACTATCAAAAAACAGCATTACAACTTGGTGAGTTTGTTGAGGCGATTGTTATTCCGCTTCGTGAAGGGCAGACACGTTTTAAATTTGCCAGCTATAAAATTGCCAAACGATTTGAGCAAGATATTTCTGCGGTATGTGCAGCTATTTCTTGTGAGTTAGATAATGATGATGTCACTCACAATGTAAGAATTGCTTTTGGTGGCATGGCAGCTATTCCCAAACGTGCAAAATATGCAGAAGCCATATTAGAAGGCCAGCAAATTACAGCAGAATTGATCGTTCAGGCGCAGCAGGCATTGTCGCAAGACTATCAGCCTTTAGATGATGGACGTGCTAGCTCAGCGTATCGTTTACACGTCGCGAAAAACTGTTTAAAGCGCTTTTATTTAGAAAAAATTCTGTCTCAAACACTCACTCGTGTGAATGACCTGATTGCTATGGTGGAGATCTAATATGAATCAAACCATTGACTTAAATATTTCTAAAAAATCAGCTAAAGCAGGTGATTCGATTCCACACGAAAGTGCACATTTACATGTGACTGGGCAGGCAACTTATATTGATGATTTACCCGAGCTTGAAAATACCATGCATTTGGCAGTTGGATTTTCAAATTGTGCCAAAGGCAAAATCAGTAAGTTTGATTTGGATGCAGTACGTCAAGCTGATGGTGTCCATGCAGTTTTTTCTGCAAAAGATATTGAGGTTGAAAATAATTGGGGGCCAATTGTTAAAGATGATCCAATTTTTGCCGAGGAACAGGTTGAGTTTTATGGACAAGCCTTGTTTGTGGTTGTGGCCGAGAGTTATCAGCAAGCCCGTCAGGCAGTTCGCTTAGCAAAAATTGAGTATGTGCCCGAAACCCCAATTTTAACGATTCAAGATGCGATTAAAAAAGAATCGTGGGTGTTGCCGCCTGTTGAATTTAGCCATGGTGAAGTTGAGCAGGCATTTCAAAACGCAGCACATCAACTTTCAGGTGCTATTGAGCTGGGTGGGCAAGAGCATTTTTATCTTGAAGGGCAAATTTCCTATGCGATTCCACAAGAAAATCAGAGCTTAAAAGTCTATTGCTCGACACAACATCCAACCGAAATGCAGTTACTGATTTGTCATGCATTAGGCATGAATATGCATCAGGTCAGCGTGGAAAGTCGCCGTATGGGTGGCGGTTTTGGTGGTAAAGAGTCACAGTCAGCGCAGTGGGCATGCATTGCATCTTTGGCAGCAAAAAAAACGGGCCGTCCGTGTAAATTACGCTTAGATCGTGATGATGACATGAGTGCTACAGGCAAACGTCACGGTTTTGCTTATGAGTGGTCTGTAGCTTTTGATGACACTGGTATTTTGCAAGGCTTAAAGGTGCAATTGGCTTCAAACTGTGGTTTTTCGGCTGATCTTTCTGGGCCAGTGAATGAACGTGCGATTTGCCATATTGGCAATGCCTATTATCTAAATGCAGTTGAGCTACGTAACTTACGTTGTAAAACCAATACTGTTTCCAATACGGCATATCGTGGTTTTGGTGGACCGCAAGGTATGTTTGTCATTGAAAATATTATTGATGACATTGCTCGTTATTTAGGTTGTGATCCAGTTGAAATTCGTCAGCGCAATTTCTTTGCCGAGCAGCCCGGTGGTGGACGTGACCGTATGCACTATGGGGCAGAAGTCCGTGATAATGTTGCGCCAAAATTGGTAGCCGAACTATTGCAAAGTAGTGATTACGCGAAGCGTAGACAGACTATTCATGCCTTTAATCAGAACAATGACATCATTAAGCGTGGTATTGCGTTAACCCCATTAATGTTTGGTATTTCATTTAACGCCGTGCATTACAATCAGGCAGGTGCACTGGTCTATGTGTATATGGATGGTACTGTCGCGATTACACATGGTGGTACAGAAATGGGACAGGGGCTATATACCAAAGTACGGCAGGTTGCTGCACATGAGTTGGGTTTACCCATCGATAGCGTTCGTTTAATTGCAACCGATACTTCTCGTGTGCCAAATACTTCGGCAACTGCAGCATCGAGTGGCGCAGATCTAAACGGTAAAGCTGTTCAAAATGCCTGTATTAAAATTCGTGAGCGTCTGGCAAAACTTGCAGCCGAAATAAGTCAAAGTGAAGCTGACCAAGTCCAGTTTGAAGATAGTATGGTTTCAACAGCGAATGGTCATTCATGGACATTTCCTGACTTGGTTCAACGGGCATATATGGCACGTGTACAACTATGGGATAGTGGTTTTTATAAAACGCCAGAAATTCACTATGATCAGGTCAACCATTTAGGGCGTCCATTTTTCTATTATGCCTATGGTGCAGCGGTTAGCGAGGTCGCAATAGATACCTTAACTGGGGAAATGAAAGTATTACGTGCTGACATTTTGCATGACGTTGGGCAGTCAATTAACCCTGCAATTGATATTGGGCAAATTGAAGGTGGGTTTGTGCAAGGGATGGGATGGCTCACGACAGAAGAGTTGTATTGGCAGCCGCAGGGTCCACACGCAGGCCGATTATTTACCCATGCACCTTCAACTTACAAAATCCCGACCAGTGTGGACATTCCTCATATTTTTAATGTCAAACTATTTAATAATCAAAATCAGGCAGACACCATCTATCGCTCTAAAGCGGTAGGTGAACCGCCATTTATGTTGGCATTATCGGTTTTCTCTGCAATTCGTCAGGCAGTACAGGCGGCTATTCCAGAAAATGCACCGCTCGTACTCAATGCTCCGGCAACTCCCGAGGAAATTTTACGTGCAATTGCTATTGGACGGGGACAAGCTTTGGCTGCTCGCCCACAGGCTAAAATGTAGAAGATTATGCAACATTTACAATGGTGGACTGATTTTGTAGCGTGGCAAGCCGATGCGTTGCCTATGGTATTAGTCACAGTGGTCCGTGCTGATGGTTCAACACCACGAGAGGTTGGTGCAACGATGTTGTTGCGATTTAATTTGCAACAGCAATGGCAGCAGTCAGATACGATCGGTGGTGGGCATTTAGAGTTTCAGGCGATTGATATTGCTAAAGCAATGTTAAAAGAATCGGAAACTTGTGTGAGGCGTATTGAACGCTTTAACCTCAGTGCTCGGCTTGGGCAGTGTTGTGGCGGAGTAATGTGGTT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38 | Acinetobacter_phage(94.44%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1192350 : 1224814
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP042841|1192350:1224814|DBSCAN-SWA 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MKSHDHLLDRQYDEDHYNCVHFVHEAAMDLYGIDRAEALELFMQPKGKITFLSSRLKLLNPLPMPKEGCIVAFHPRQRNKPPHVGLFRGQKILHLMESGVTYLPEEVVMEMGFNRVSYYD >NZ_CP042841|1192350:1224814|1223837_1224227_+|WP_000433907.1|DBSCAN-SWA MEPVSTSGFTALLKLYGIAIMVTLAVGLVAAVVLMTRMPRSPQEWAVGLICTVVSSLAGGSFIIVKWGLHEWVTDVWGMIALGGFFFVCGLPGWALVRWIFNFIDKQEGKTIVEVIKEFKKARKDIENS |
39 | Acinetobacter_phage(93.33%) | transposase,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1230430 : 1290573
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP042841|1230430:1290573|DBSCAN-SWA 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50 | Escherichia_phage(33.33%) | integrase,transposase | attL 1226258:1226272|attR 1265957:1265971 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1795070 : 1828019
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP042841|1795070:1828019|DBSCAN-SWA AATGTCTAAATTTAGTGATGAGTATTGGATGCAGCTTGCTTACGAGCAAGCTGAATTAGCAGCCAAGCAGGGGGAAATTCCTGTAGGAGCTGTAATCGTGAGTCAAAACAAGTTAATTGGAGCTGGTTTTAATGCTCCAATTGGTTTATCTGATCCTACGGCTCATGCAGAAATTCAAGCTATTCGTGCGGCTTGTGAGTCATTGAAAAATTATCGTTTACCTGAAGATGCGACTTTGTACGTTACGCTTGAGCCGTGCACAATGTGTGTGGGAGCATTAGTACATGCAAGAATTAAACATGTCGTATTTGGAACAACAGAACCTAAAGCTGGCTCACTCGTGAGTGCACGTCAATTATTAGAAAATGGTTATTACAACCATAAATTTACTTTTGAGCATGGATATTTACATGAAAAATGTGCTCAACAGTTAAGTCTTTTTTTTAAGCAAAGACGTGAACAAAAGAAACAAGAGAAACAACAAAAAACGTCCTTAAATGATTAAAAAATGTCATGAGGTTATGGCACACTAACGCCGTTTCATTGACATGATTTATTTAAATAAGGAACTTTCATGCGTAATGTAATTACTATACAAAAAGAATTTAATGCTCCTCTTAGTGATGTCTTTAACCTGCTTTCTAAACATGCAGCTTACAACACTGCATTTGCTCCACTACAAGTTGTGCGTGTTAAAGATTCGGCAGATCCTGAAAGACCTGATGGAGTGGGTTCTGTTCGTCGTATGGGGTTTGGCGTGATTAAACCACTTAAAGAAGAAATCACGCATCTCGAAGAAAACAAACGTATTGAATATAAACTGATTGATAATCCTCTAGTGAAACACCATTTAGGTCGAATCGAGTTCTCAGAAATTACTCCTTATATTACTTTGGTTACGTATCGTATCGAATTAACCGCAAAAGCTCCTGTTGTAAGTAAATTAATTCTTGCACAGCTAAAACTAGCGATTACACTAGGCTTTTCGAGATTAGCTAAAGCATTTGCTTCTTCGTGAGAGTTCAATGACAGTTCAAATTATTACTATTGATGGTCCGAGTGGTTCGGGTAAAGGAACATTAGCGGCGAAACTTGCTGCGTATTATCAATTTCATTTACTTGATTCGGGTGCCTTATATCGTTTGTTAGGGTTGTCATTACATAAACATGATTTATTGGAAAAATTAGATAGCCATTTAGATGAGTGTGTTAACTATGCTCGTCAGCTTAATATTAAGTTTGAAACCTCGGCAGAGGGAACATTAGTTTTCCTCGATGGGGAAGATGTAACCCAAACTATCCGTACAGAGCGAGTTGGAGAATATGCATCTAAAGTTGCAGCAATACCAGAGCTCAGACAAGCACTTTTTGAGCGCCAAAGAGCATTTGCACAAACTCCGGGATTAGTTGCAGATGGCCGAGATATGGCAACATCAATTTTCCCGGAAGCTAATGCTAAAATTTATTTGACTGCTTCAGCTGAGTCGCGTGCTGAGCGAAGAGTAAAACAGTTGCAGGGTATGGGGCTAGATGCTAAAATAAACGACATTTTAGCTAATATACAAGCGCGTGACAAAAGAGACATGGAGCGAGAAGTAGCTCCTCTCAAGCCAGCCGCAGATGCTTATATTATTGATAGTTCGGAATTAACGATCGATCAAGTATTTAAGTTGATGGTTGATTACGTCAATAGCCGTACTGTTAGCAACTAAGATTATCAGTTGACGCATAGCTTGATCAGTCTATAAAGACTATGTTGATACTTAACTAAACCGGCCTTGTCTGATCCAAGACCGCTGACTTTATCAGGTATATCATGACCGAATCTTTTGCAGCCCTCTTTGAAGAAAGTGAATTAAACCTCAACGTTGAAAAGGGTGCAGTCATCCAAGGTGTTGTTGTAAACATCGATAGTGACTGGGTTACTGTTGACACTGGCCTTAAATCTGAAGGCATTGTTGACCGTGCTGAATTTTTAAATGAACAACGTGAACTTGAAGTTCAGGTTGGCGATACTGTTGACGTAGTTGTTGAAGCTCTTGACAACGGTATGGGTCAAACAGTTTTATCACGTGAAAAAGCTAAACGTGCTGAAACTTGGACTAAACTTGAAAAAATCTTTGAAGATGGCGAAATCGTTACTGGTGTTATCTCTGGTAAAGTTAAAGGCGGTTTCACTGTTGACATCGGTCCTGTTCGTGCGTTCTTACCAGGCTCATTAGTTGACACTCGTCCTATCCGTGACACAACTCACCTTGAAGGTAAAGAGTTAGAGTTTAAAGTAATCAAGCTTGATGCTAAACGTAACAACGTTGTTGTATCTCGTCGTGCTGTTATGGAAGCTGAATCTTCTGCTGACCGTGAAGCATTACTTGCTCAACTTGAAGAAGGTCAAACAGTTACAGGTACTATCAAAAACCTTACTGATTACGGTGCATTCGTTGATCTTGGTGGTATTGATGGTCTTCTTCATATCACAGATATGGCTTGGAAGCGTATCAAGCACCCTTCAGAAGTTGTTGAAGTTGGTCAAGAAGTTACTGTTAAAGTACTTAAGTTTGACCGTGAACGTAACCGCGTATCTTTAGGCCTTAAACAATTAGGTGAAGATCCATGGTTAGCGATCATGAGCCGTTACCCTAAAGGTTCTATCGTTAAAGCACGTGTTACTAACTTAACTGACTACGGTTGTTTCGCTGAAATCGCTGAAGGCGTTGAAGGTTTAGTACACGTTTCTGAAATGGACCATACTAACAAAAACATCCACCCATCTAAAGTTGTTCAGATCGGTGACGAAGTTGACGTTATGGTTCTTGAAGTTGACGAAGAACGTCGTCGTATCAGCCTTGGTATCAAACAAACTCGTGCTAACCCATGGGAAGAGTTTGCTAAGTCTCATGAGAAAGGCGAAAAAGTTTCAGGTACAATCAAGTCTATCACTGACTTTGGTATCTTCATTGGTTTAAATGGCGGTATTGACGGTCTAGTTCACTTGTCTGATATTTCTTGGAACGAACAAGGCGAAGAAGCTATCCGTCGTTACAAGAAAGGTGACACTGTTGAAGCAGTTATCTTGTCTGTAGACGCTGAAGGTAACCGTATCAGCCTTGGTATCAAGCAATTGAACAGCGATCCGTTCAATGATTTCTTAGCTGCTAACGAACGTGGTGCTTTAGTTAAAGGTACTGTAACTGCAGTTGATGCTCGTGGCGCAACTGTTAAGTTAGCTGACGAAGTAGAAGCTACTCTTAAAGCTTCTGAAATCAACCGTGACCGCGTTGAAGACGCAACTAAATTCTTAGAAGTTGGTCAAGAAGTTGAAGCGAAAATCATCAACGTTGACCGTAAATCTCGCTCTATCAACTTGTCTATCAAAGCGAAAGATGAAGCTGAAGAGAAAGAAGCAGTTGCTAACTTGCGTACAGCATCAGCTTCTCAAGACAATGGTCCTAAGACTATTGGTGACTTGATCAAAGCACAAATGAAGTAATAAGTTAACAAAGTACAGTTTCATGTAACGAAATTGTACTTTTTATACAAATTACTGTAAACGGTAGCGTAGTATTCAACATACTGCGCTACCGTTTTGTATTTAAACAGGTTATTATCAAACGACTTAGAGTAGTAATAAATAACGAGGTCGTAGATGACTACTGAAGCTCTTAATAAGTCTGATTTGATTGAACGCATTGCGCTAAAAAATCCACACTTGGCTGAACCATTAGTGGAAGAAGCGGTTAAGATTATGATTGACCAAATGATCGAAGCTCTTTCGTCTGACAATCGTATTGAAATCCGTGGTTTTGGTAGCTTTGCATTACACCACCGTGAACCTAGAGTTGGTCGTAACCCTAAAACAGGTAAGTCAGTAGATGTTGCAGCGAAGGCTGTTCCACATTTTAAACCAGGTAAAGCACTCCGTGATGCAGTGAATGAATCTGGAAAATAAATAAAACTCATAAGTGGGGTGCCTATGCGTTATATTCTAATTGCATTACTCATTATTGTATTTGGCTATTCTTTAGCACTTGTTTTGCAGAACCCAACAGAACTTCCTGTTGATTTATTATTTACTCAAGTTCCTGCAATGCGTTTAGGTTTATTATTGTTGCTTACCTTAGCGCTTGGAATTGTAGTTGGGCTTTTATTAGGTGTACAAGTTTTCCGAGTTTTCCAAAAAAGCTGGGAAATCAAACGTCTTCGCAAAGATATTGATCATTTGAGAAAAGAACAAATTCAAAGTGCTCAATTGGCTGCAGCAGAAGCAGCTGCAAATGTAAGACACGAAAAAACTGTTGTAGATATTTATCCGCAAGATAAAAATTCTACTCCTTTATAATTTTGGTACTACTCTTTATCTAGTCATAAAGAGTAGTATTTTCCCTTCTATATTCCTCATTATCCTTCTAGTTTAAAATCACTATTTCCTCATTTAAGAACTTGGTTCAATAGATTTCTTTATTACTGGCTGACTTGTCTATTATAATAGCGCTGATTTTATGTGATGGAAGAAAGTCTCTTGAGTATCATTGTTGCGTTGGACGCTAAAAGCCAATATGACGCTTTAAAAATTGTTGAACAACTTGATCCTACTTTATGTCGCGTAAAAGTAGGTAAAGAGCTTTTTACTCATGAAGGCCCATCTGTTGTAAAAAAACTTCAAGAAGAAAATTTCGAAGTTTTCCTAGATTTAAAATTCCATGATATTCCAAATACGACGGCTCAAGCTGTATGTGCTGCCGCAGACTTAGGTGTATGGATGGTTAACGTACATGCATCAGGTGGCCGTAAAATGATGGAAACCTGTGTGGAGCGTTTAAAAGCAGGTAATTATCAAACACAATTAATTGCGGTAACAGTTTTAACTTCTATGGGGCGTGAAGATTTAAAAGATATCGGGTTAGATATTGAACCTGTAGAACAAGTTAAAAGATTGGCGAAACTTACTAAAGAAAGTGGTTTAGATGGTGTAGTTTGTTCTGCTCAAGAAGCTAAAATTC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49 | uncultured_Caudovirales_phage(40.0%) | integrase,portal,head,terminase,tail,capsid,tRNA,protease | attL 1793564:1793580|attR 1807752:1807768 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2352148 : 2445245
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP042841|2352148:2445245|DBSCAN-SWA 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100 | Acinetobacter_phage(75.0%) | integrase,terminase,capsid,transposase,protease | attL 2408429:2408446|attR 2445406:2445423 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2804095 : 2815489
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP042841|2804095:2815489|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP042841|2804095:2815489|2814584_2815091_-|WP_000368381.1|DBSCAN-SWA MDNEYAKFFFNRKVDVYQLECIELSHPSFMNTYRIVRNDDRGVYVQHKEGSGQVYYEFLPASIQRSGMLGDLDQTLTVSISGLGDVMPDEFERVIEGQYPDVKPTVNYRIYSSDNLNSPMFYLLGLQLSSVAMNHKAVTFKAESPRLNTAKTGDIFSLDRFSGLKGAI >NZ_CP042841|2804095:2815489|2804095_2805637_+|WP_000872622.1|DBSCAN-SWA MKYDFEQSDKAFFGHPKPLQTLFFTELWERFSYYGIRPLLVLYMIAMVNDGGLALDRPTAAAIVGLFAGSMYLMTVFGGWVADNWLGQARAVWYGSIIIALGHLSIALTSVFDQSFFYLGLVLIVLGTGLFKTCISVIVGTLYKANDARRDAGFSIFYMGINMGSFIAPLITGLLAKDHGWHLGFGIGGIGMLIALLIFRFMAMPQLQTFNELRQEANSCSKPVVENKNAPKIVFSFLFAVAVVIALTFLGIIHINPVAVATYLTVGISIGIIAYFAYLLLFLNLEQHEKFKIIICFVLLAASALFWSAFEQKPTTFTLFAQDYTDRIVFGFEIPTVWFESINALFIIIFAPVAAWLWAKLGKANKDPSYISKFIIALLFAAGGFLLMSLASHFAIHGGVVSPFWLVGTLFLLTIGELCLSPIGLSTMTKLAPDVIRSQIMGLWFTGTALGNLMAGLIGGQVSADGINHLPSLFMRCVLALVIGAIVLFLLKKPMNKLMDKSTNKVQPDLETI >NZ_CP042841|2804095:2815489|2810786_2814233_-|WP_000590484.1|DBSCAN-SWA MIKIIYKQDPLSEDKTIEHAETLGQWLTSKYDHMPEHVRIFHTISNMDHAEISFANEVTPKNAYELKQLDFLPGTFIVIENPKGIDPITLAWIAVASIVMGVAVALLMPVPSITQTNQNNNQSSSANNELSNRENKTRVNGRIADIYGAAHDTPDLITVPYKVYENNVEVEHVVGCIGRGHYKINGAYDGETNIVDIAGASVEVFRPGVDIVSGEPYFSLGTEITTPPLTVQHQTSVNGQVLRPADTQSLEGTNYLHFAYPNEILRATANNTDLTTKFVSNDRVEITNASFTFNGQTYDLNGTYSVLSVADDRMTLSNPAAVNANWLKLKELNNQQTAALSPKISSIGEKWIGPFILDNVERSRVLCNFVATNGLYTVSSGGNQGAVNVTIEVEVTPVNESGAAIGNPMLKQIILKGSAKSRQTVGATLDMVTFQGRCSVRARRLTPTPAVTTVVDEVKWQALYGAYPLQSTVYEHETVFRARTYATTGALSVKSRKINFDLQRMLPTFKNGAMTTELFPTSSFADALVSMALDDKIGRRTIDEIDLENIYRTYNDVVDYFGTPLAAEFCTTIDDTNLSFEELVTNLCDAVFCTAYRQNNKLKLYFERPTDNSVMLFNFRNIIPDSYKHDLTFGVMDDYDGLIYEYTDPTDDSRINIYLPDKGAKNPKEVKSVGVRNKWQAHFNAYRIWNKLRFQRKSITFDAAPESELLVLRDRIAVADYRNGIHQSGEVVQQEGLILTLSHDVDFIAGKSYVIYLQMGDGTVDLIPITPGSAKNKVVLGRLPNGALKLSPDDFVNTIYTVVNDDTKGSLPYLVAKREPADQFSNTITAINYDERYYLNDKDFIDVPVDDSPIYIRYDQLDINLARLYQMQRGDLPTTGEISFVVEAGALVSSSSSYRPETRFVYKFDYNSSPPKREYIVPAASELPAIDTGEFPPDLVVNLTIKGAVVGRGGDGGLPHLAFGAWSTDPDYNFTKTRRDGFQGAPGLLNRHSKLNLIIDGGTLARGGSGGGATPSGIYTGLSYGVQGIPGGAGAPFGRVMTGQPITNDSQDWRWYFNGDFMVVKVTDAEATVPGKGYRTQNDRYGSPLSGDGGSWGQLGTESTNDGTWNWQYHGTTEGQPGPGGPAIVGVAPLTTQLINGGKILQTL >NZ_CP042841|2804095:2815489|2809744_2810287_-|WP_001019395.1|DBSCAN-SWA MNIEKYLDELIKREGGYVNNPADRGGATKYGITQAVARENGWNGNMKDLPLDVAKAIYKKQYWTAPRFDQVNAVSSAVAEELLDTGVNCGTGFAKPLLQRALNLLNNQGKAGYADLEVDGVYGSATLGALKTYLSKRGKEGEKVLVRVLNIMQGQRYIEICERNPKQEQFFYGWIANRIG >NZ_CP042841|2804095:2815489|2814225_2814588_-|WP_000835156.1|DBSCAN-SWA MKSHDHLLDKQYDEEHYNCVHFAHEAAMDLYDIDRGEALEFFMKPVKEKVFLPSRLKLLNPLPMPKEGCIVAFHSRYRNKPPHVGLFRLGRILHLQESGVSWMPIQVVQAFGFNRVSFYD >NZ_CP042841|2804095:2815489|2815090_2815489_-|WP_000277446.1|DBSCAN-SWA MYKLKLNPQTSGYGVTPGDDVKRQQMDGGRGRYYIDVKRNSHIVDVNWNLSKTDFNKMMAFWRVYQNKPASFYADLVIDQGARQQYLCNFIPNSFKTNEVNGNLYRVNAQLEVVQNQPNLTADIALIKDWEV >NZ_CP042841|2804095:2815489|2805633_2807436_+|WP_000999148.1|DBSCAN-SWA MNDLTVPEKLAKLRELMTNQSIDALVVMSADPHMSEYLPDYWKARQWLSGFSGSVGTLVVTQNFAGLWADGRYWVQAEQQLAGTGFQLQKLTSDESSTHLAWIEKNLPAGSVISVNGQTLSIQQFKALENTAKQLGFKLETQQDLIGLIWLNRPELPLEQIHLMPEGLNALSRKEKIQAIRETLKTKAIEGHFISSLDDIAWVLNARGQDVEYNPVFLSHLYISAQQAVLFIDSNKVDLTTQQAFKADGIEIRDYQDSAQFLANISNASVLLDPAKVSIYHEQAIAKDIQVVYDINPSTLFKSRKHESEIAHIRHAMVKDGVALCHFFHWLEKAFHQSQRISELTIDEKITAFRAQQEGFIGPSFSTIAGFNANGALPHYRATEEHYSFIEGDGLLLIDSGGQYVDGTTDITRVVPVGTPTEQQKRDYTLVLKCHIALAKTIYPEGLAAPLLDSICRHTLWQHGLDYRHGTGHGVGFALNVHEGPQVLSYYAPIHAYSKLREGMILSNEPGLYHEGQYGIRIENLVANRLHSGFEKTYGDFLEFETLTLCPIHLDCIVVDMLTDEEKDWLNSYHQTVQERLAEHLSGDVLDWLIYNTRKI >NZ_CP042841|2804095:2815489|2810329_2810719_-|WP_000433918.1|DBSCAN-SWA MEPVSTSGLTAILKFYGAAIMVTLAVALVAAVVLMTRMPRSPQEWAVGLICTVVSSLAGGSFIIVKWGLHEWVTDVWGMIALGGFFFVCGLPGWALVRWIFNFIDKQEGKTIVEVIKEFKKARKDIENS >NZ_CP042841|2804095:2815489|2809116_2809311_-|WP_000098296.1|DBSCAN-SWA MSSQLIKIHYHAYSRVADLLADLDKKGEVTKIYDLNGNELKINFLRDEVYYKKVWWHFQKKQGG >NZ_CP042841|2804095:2815489|2807923_2809120_+|WP_000947611.1|integrase|DBSCAN-SWA MLSDSKIRSAKPKEKLYRLGDSDGLCVEIKPNGKKYWRYRFQWLKKTQMMSLGEYPIVGLAEARTKRDEAKSLVASGINPVEEKENQKKAKSDEYDNRVLFKHVAAEYKAEKLNNRSERYQEAFQRALDKDILKVIGDKDIKEVTSADVLTIMKKTIARVKRQKNHGTGEVSAIQNRTFIGGVMRYAIATLRADYDPTYAVKNVVERPEIEHARPMEKYEAVQLRNKLNSYGGSTTVKNAGLVMLYSMLRTIEIRRMKWEYVDFEARTITFPKEMMKKKRIHIVPMSDQVFNILQEQRNIVGNREYVFPAIYQDGMLSATTMNKMLDYIGLSDVTAHDFRATASTLLNEKDYDDKWIEKQLAHADGNKTRATYNHAKYLESRRKMLQDWANIVDSWAV |
10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | integrase | attL 2796656:2796669|attR 2812098:2812111 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2823052 : 2859902
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP042841|2823052:2859902|DBSCAN-SWA 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64 | Acinetobacter_phage(94.34%) | transposase,terminase,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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