Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP043004 | Aggregatibacter actinomycetemcomitans strain HK_973 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas3,DEDDh,cas7,cas4,cas2,DinG | 0 | 1 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP043004_1 | 1399760-1399969 | Orphan |
NA:I-F
Consensus repeat of NZ_CP043004_1
|
3 spacers
spacers of NZ_CP043004_1
>1.1|1399788|32|NZ_CP043004|CRISPRCasFinder ATAAAAAAAGTCGGCATGTGCAGGGTTACGAT >1.2|1399848|32|NZ_CP043004|CRISPRCasFinder CTAAAAACAAATATCAATTCCCAGATGAAAAC >1.3|1399908|32|NZ_CP043004|CRISPRCasFinder TGCTATAACTGTGAAGGAAGGCATCTTGGTAC >1.4|1399788|42|NZ_CP043004|CRT ATAAAAAAAGTCGGCATGTGCAGGGTTACGATTTTCTAAGCT >1.5|1399848|42|NZ_CP043004|CRT CTAAAAACAAATATCAATTCCCAGATGAAAACTTTCTAAGCT >1.6|1399908|42|NZ_CP043004|CRT TGCTATAACTGTGAAGGAAGGCATCTTGGTACTTTCTAAGCC >1.7|1399850|28|NZ_CP043004|PILER-CR AAAAACAAATATCAATTCCCAGATGAAA >1.8|1399910|28|NZ_CP043004|PILER-CR CTATAACTGTGAAGGAAGGCATCTTGGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043004_1
The CRISPR arrays of NZ_CP043004_1 >merge|NZ_CP043004|1|1399760-1399969|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTCTAAGCCGCCTATTCGGCAGTAAAGATAAAAAAAGTCGGCATGTGCAGGGTTACGATTTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAGCTAAAAACAAATATCAATTCCCAGATGAAAACTTTCTAAGCTGCTTATTCGGCAGTGAAGTGCTATAACTGTGAAGGAAGGCATCTTGGTACTTTCTAAGCCGCCTATTCGGCAGTGAAGTG >NZ_CP043004|1|1|1399760-1399967|CRISPRCasFinder TTTCTAAGCCGCCTATTCGGCAGTAAAG ATAAAAAAAGTCGGCATGTGCAGGGTTACGAT TTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAG CTAAAAACAAATATCAATTCCCAGATGAAAAC TTTCTAAGCTGCTTATTCGGCAGTGAAG TGCTATAACTGTGAAGGAAGGCATCTTGGTAC TTTCTAAGCCGCCTATTCGGCAGTGAAG >NZ_CP043004|1|1|1399770-1399967|CRT GCCTATTCGGCAGTAAAG ATAAAAAAAGTCGGCATGTGCAGGGTTACGATTTTCTAAGCT GCCTATTCGGCAGTGAAG CTAAAAACAAATATCAATTCCCAGATGAAAACTTTCTAAGCT GCTTATTCGGCAGTGAAG TGCTATAACTGTGAAGGAAGGCATCTTGGTACTTTCTAAGCC GCCTATTCGGCAGTGAAG >NZ_CP043004|1|1|1399818-1399969|PILER-CR ATTTTCTAAGCTGCCTATTCGGCAGTGAAGCT AAAAACAAATATCAATTCCCAGATGAAA ACTTTCTAAGCTGCTTATTCGGCAGTGAAGTG CTATAACTGTGAAGGAAGGCATCTTGGT ACTTTCTAAGCCGCCTATTCGGCAGTGAAGTG
>NZ_CP043004.1|WP_151294563.1|1399373_1399628_-|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MVINLFNRQVVDWKLSRYHDSELVVDALHHAMLSVRKTAKMIFHSDQGSIYGSQLFSQTVQNYGLAQSMTAVVIVERANGALVS >NZ_CP043004.1|WP_151294561.1|1399145_1399361_-|hypothetical-protein MDARGGGYLTLGQAIDDVRDYVMYYNFVRPHRYNLGLPQKQPIRTVELVGHYRLIKVRWQKLRRIFSSKIS >NZ_CP043004.1|WP_151295053.1|1398691_1399030_+|transposase MILNREGITLVGDVYIEGELVMEEEEEEVEGVDVFSTQINRPDLPHMKVKFLQSPHSKKPMIGMPYRHLVENAFALLKQYRAIATRYDKLARNYASSLAFTCCIRWVRLIFG >NZ_CP043004.1|WP_151294559.1|1396799_1397123_+|hypothetical-protein MSFKLSEGLSEPFRLELMLSSIDPNVSFSALMDKPVTFTFRQGDKAVRYLNGIVTGLGVGNSGFVRTYYHMVVEPALVRSMLQSDSRIFQHQNSEKSSARYCKKPCG >NZ_CP043004.1|WP_148325553.1|1395221_1396208_-|catabolite-repressor/activator MKLDEIAKLAGVSCTTVSYVVNGKAKQYRVSDSTIEKVQALIKQYDFKPNAMAASLRVGKSKTIGLVIPDFENISYAKIANNLENRLREKGYQLLIACSNDKVENEQDCVKHLLQRQVDALLVSSALPPDTDFYQNASVPIIGFDRRISSPKVVNALTDDEGDTYRLTKELLKIPHQKRILFFGALPDLPTSREREEGFRSALRYRKASAEYLYGDMFRKNEAAQCFAQWLENNPLPTAIFTTSFTLLEGVLLVLLQKLGQVPKDLVIATFGHVEMLELLENRVLCSVQDYDKVSQSLLTLTFDAMSKKHKNRVNTTPLTRSIIKYHC >NZ_CP043004.1|WP_005542400.1|1394524_1395238_+|membrane-protein MKLNLKEKLQAYLTATQIKRIGRYFALFFAGFALLLIVVDQIIGYYVRKDIYYDIDKVPNRPYGLVLGTSKYFSNNTLNLFYYNRLLAAQRLFEARKVDYLLLSGDNRTLQYNEPRTMLQDLKKMGVPQEFIYLDFAGFRTLDSVIRADQVFKAHSLTIISQKFHCERALFIAKFHNIDAICFAADYPQVYSFVRVREFFARLQAVWDLLVEREPHFLGAPEPLPPPVTIPDVNSDI >NZ_CP043004.1|WP_148325555.1|1393228_1394332_-|homoserine-O-acetyltransferase MTIKKTTVFTHQPLHLVLGGQLQQIDVAYQTYGELNADKNNAVLICHALTGDAEPYFDKSTNQEGWWQNFMGDGLALDTSRYFFICSNVLGGCKGTTGPSSINPQTNRPYGSEFPAVIVQDIIKVQRALLDFLEIPHLHAIIGGSFGGMQATQWAIDYPDFVSNVVNLCSSLSLSAEAIGFNHVMRQAVMNDPNFNNGDYYDGERPDKGLAIARMLGMLTYRTDVQLSKAFGRATKAEGHLQGDYFQVESYLSYQGQKFLTRFDANSYLHLLRALDLYDPSIGYADLKTALSRIKARYTLVSVDNDQLFKLPELRKSKQLLEQYGVNLNYYEFNSDYGHDAFLVDYAFFENKIRNGLAGGNQDLTKK >NZ_CP043004.1|WP_148325556.1|1391924_1392923_-|HTH-type-transcriptional-repressor-PurR MATIKDVAKMAGVSTTTVSHVINKTRFVAAETKQQVLQAIKDLNYSPSAVARSLKVNTTKSIGMIVTTSEAPYFAEIIHAVEEHCYRQGYSLFLCNTQNNAEKIKNHLVMLAKKRVDGILVMCSEYLQDPQDLLTAFSSIPMVVMDWGPNAHTNIIQDNSFDGGYLATKHLIENGHKNIGIIAGELNKTTAKTRYEGFVHAMQEAGLAINPNWVMEGFFEPEDGYECMNKILRQETLPTAVFCCNDVMALGAISAIGEKGLCVPDDISIIGYDNIHASRFYSPPLTTIHQSKSRLSVQAVNLLFERINHKSDQRKTIEIHPELVIRKSVKKL >NZ_CP043004.1|WP_148325557.1|1391131_1391452_-|DUF440-family-protein MTELTRLDPDKAIDIAYDIFLEIAPENLDPADIMLFNLQFEEHGAVEFVETADNWEEQIGILIDPQEYAEVWIGLVNKQDEMDNIFAKFLISHREEDRQYHIIWKA >NZ_CP043004.1|WP_151294557.1|1390189_1391017_+|2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate-N-succinyltransferase MSNLQQLIENAFEKRTEITPKTIDVQTRAAVEEVIEGLDSGKYRVAEKIDGEWVTHQWLKKAVLLSFRINDNQLVEGAETKYYDKVPLKFADYTEERFQQEGFRVVPFATVRKGAYIAKNCVLMPSYVNIGAHVGEGTMVDTWATVGSCAQIGKNVHLSGGVGIGGVLEPLQANPTIIGDNCFIGARSEVVEGVIVEDGCVISMGVFIGQSTKIYDRETGEVYYGRVPAGSVVVSGSLPSKDGKYSLYCAVIVKKVDAKTLGKVGINELLRSIEE >NZ_CP043004.1|WP_151294565.1|1400145_1401654_-|lysine--tRNA-ligase MSEQEVKELDLNGEMLVRREKLAALRAKGNAFPNQFRRDALAQDLHDKYDAEEGEALKEKHIEVAVAGRIMTRRAMGKATFVTIQDMSGKIQLYVARDNLPEGVYKDDVGHWDLGDIVGIKGSLFKTKTDELTVKATEVQLLTKALRPLPDKFHGLTDQEVRYRQRYLDLISNEESRRTFIIRSKVVAGIREYFLSKGFMEVETPMLQVIPGGAAARPFVTHHNALDVDMYLRIAPELYLKRLVVGGFERVFELNRNFRNEGVSVRHNPEFTMLEYYQAYADYHDLMDNTEELLRKLAIDILGTTIVKYGDLEFDFGKPFERITLHDATIKYGAEKGIVKEDLYDFNRAKATAERLGIEVQKSWGLGSIVNAIFEEVAEHHLIQPTFLMAHPAEISPLARRNNENPEVTDRFELFIGGREIGNGFSELNDAEDQNDRFDAQVTAKEAGDDEAMFKDEDFVIALEHGLPPTAGEGLGIDRLAMLYANAPSIRDVILFPAMRQK >NZ_CP043004.1|WP_148327105.1|1401709_1402738_-|peptide-chain-release-factor-2 MFDFDAKVERLEEVNAELEQPDVWNDAEKAQALGKERVSLELVVNTIKNLEQGLEDVDGLLELAVEAGDEDTFNEAIAELNELEQQLEKLEFRRMFSGEHDACDCYVDLQAGSGGTEAQDWTEMLLRMYLRWAESKGFKTELMEVSDGDVAGLKSATIKVSGEYAFGWLRTETGIHRLVRKSPFDSNNRRHTSFSAAFVYPKIDDDIDIEINPADLRIDVYRASGAGGQHVNKTESAVRITHIPSGIVVQCQNDRSQHKNKDQAMKQLKAKLYELELQKKNADKQAMEDNKSDIGWGSQIRSYVLDDSRIKDLRTGVENRNTQAVLDGDLDRFIEASLKAGL >NZ_CP043004.1|WP_005573686.1|1402730_1402892_-|hypothetical-protein MEFRSLYPIPAKSLIIPHLIYLFTTFIIMFEINPIKNKIADLTDRTSVLRGYL >NZ_CP043004.1|WP_005538329.1|1402975_1403659_+|bifunctional-protein-disulfide-isomerase/oxidoreductase-DsbC MKKIITTLSLLAISMSVTANDAALKSKLEKLGVKDIDIQTSPIKGLKTVVSDQGIFYASEDGEYLLQGKIYKLTDKGISNVTNKVLLDKLNALKNEMIVYPAKNEKHVITVFMDITCHYCHLLHQQVKEYNDLGITVRYLAFPRAGMESQTAGQMEAIFTAKDPTFALNEAEKGNLPKELKTPNVVRKHYLLGAQFGVNGTPTIITSEGEVIGGYLKPADLLAALEG >NZ_CP043004.1|WP_148327106.1|1403671_1405393_+|single-stranded-DNA-specific-exonuclease-RecJ MQKQILRREVPAGNKLCDDPLLDRLYRSRHIKNACQLDRTLAAIHNPNLMSGLDDAVALLLEAYEKQQKIVIVGDFDADGATSTALAVLALRQLGFVNVAYLVPNRFEQGYGLSVAVAQEALALDVELLITVDNGVSSHEGVAFLKERGVNVIVTDHHLPPESLPSADAIINPNLAHCGFPSKNLAGVGVAFYLMLALRAKFRELGMFDAKNQPNFTELLDLVALGTVSDVVPLDQNNRILVYQGLARIKAQRCRFGIRALAEVAKRDLAGFSASDLGFSIAPRLNAAGRLDNMSVGVELLLAEDMENARALALELDSLNQARKEIEQGMKLEALKICQNLTALENQLPHSIVLYQADWHQGVLGIVASRIKDQFHRPVIAFAQEQDSILKGSARSIPGLHIRDALERVYSQHPDLILKFGGHAMAAGLSINENYFADFQRIFNETVSELLAQEQLQGSIWTDGELSVNELNLNTAERLKSAGPWGQAFPEPLFDGEFKILQQRLVGEKHLKMMVESKLGGPLMDAIAFNVDTRYYPDLSIKTAKLVYKLDINEFRGNRDIQLLIDYIEPLEN >NZ_CP043004.1|WP_148327107.1|1405401_1406073_+|thiol:disulfide-interchange-protein-DsbA/DsbL MLRVGLFIMLLCVGGFAAAQAGDESVAPDPAVLLDEESPEFEDGKDYFSYEYPIAMPARNDHRVIIQFFFDYDCRVCSSAQDILELYTQINRDRVVLEEFPVATNKARFTAGVFFSLQALNAERLSSALLFETSERQRYIKLSRIENLVHWLQKQGIERDSFLEMYHSDQIHQKVNDAVLMTEEYGVFTFPYVIINGKYVLTASTLYNDDYALAVLDFLVNRK >NZ_CP043004.1|WP_148325548.1|1406089_1406782_+|5'-methylthioadenosine/adenosylhomocysteine-nucleosidase MKIGIVGAMAQEVEILVGLMSDKNVTKLASGTIYEGKIHGKNIALLQSGIGKVAAAMGTTALLQLAKPNLVINTGSAGGVAEGLHVGDVIVSTETQYHDADVTAFGYAKGQLPTCPVTFVSDARLVELAERTAKQLGQRVKRGLICSGDSFIQGGERLAQIKQDFPNVIAVEMEATAIAQVCHAFNVPFVVVRAISDAGDGKANMSFEEFLPLAAKQSSDMVVAMLAELN >NZ_CP043004.1|WP_151294567.1|1406960_1407656_+|DUF4198-domain-containing-protein MKFKKTTAILTALFVASVANAHNVWLEPVKEANSTGQYVVKFGHEQTEIYPEHKLKTVKLLDNNGNLTNATHQFKQGEAYLNAENASQVFIRFDNGVWSKLPSGKYVEKTKQQEPTAEFAVNPVKFGKAILHWDAQALKAHGMEYELVPQEKAQAGKLLPILVLHNGKPVKDIKVGLGEDAPFNLTNEKGIAEFTPQKGNNKVWAEFSENVKGNPDYDRRSVEYMLTFEAE >NZ_CP043004.1|WP_005566749.1|1407662_1408166_+|hypothetical-protein MKKTPYFLTALLGLCVAPHAWTHALYVFAQYDGQTVTGKSYYSDMTPAVETYVEVLRQGENQPLLTGKTDNGGYFHLPLKADPNMALKVVVEGEEGHRATVVADRITANAGATTRAGDESLLLLRGDIAQLRDKIYLHDILGGIGYIVGIAGIAAWLKARKLRKGHQ >NZ_CP043004.1|WP_148327109.1|1408165_1408819_+|cobalt-transporter-CbiM MHLSEGVLHTPVLLAGVALTVVGVAVGLRRLDNERLPLTALFAAAFFVAGTIHVPVGIGSVHLILNGMAGLFLGWAVFPAFLIALLLQVLFFSFGGFAVLGVNLCVMALPAVAAHYLLRGYLHPDMGKMAKLFAGVGVGVIGVGGAGALASLVLELDGGKHYQDLIVLLLLSHLPVFVLDSIISYGVISLLGKMYPVALQPVALSQKTMSYSKRCAQ |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP043004_1 | 1.7|1399850|28|NZ_CP043004|PILER-CR | 1399850-1399877 | 28 | NC_018878 | Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_502p, complete sequence | 308170-308197 | 7 | 0.75 |
NZ_CP043004_1 | 1.7|1399850|28|NZ_CP043004|PILER-CR | 1399850-1399877 | 28 | MK250021 | Prevotella phage Lak-B2, complete genome | 413285-413312 | 7 | 0.75 |
NZ_CP043004_1 | 1.7|1399850|28|NZ_CP043004|PILER-CR | 1399850-1399877 | 28 | MK250024 | Prevotella phage Lak-B5, complete genome | 405608-405635 | 7 | 0.75 |
NZ_CP043004_1 | 1.7|1399850|28|NZ_CP043004|PILER-CR | 1399850-1399877 | 28 | MK250028 | Prevotella phage Lak-B9, complete genome | 410499-410526 | 7 | 0.75 |
NZ_CP043004_1 | 1.7|1399850|28|NZ_CP043004|PILER-CR | 1399850-1399877 | 28 | MK250023 | Prevotella phage Lak-B4, complete genome | 412496-412523 | 7 | 0.75 |
NZ_CP043004_1 | 1.7|1399850|28|NZ_CP043004|PILER-CR | 1399850-1399877 | 28 | MK250025 | Prevotella phage Lak-B6, complete genome | 409161-409188 | 7 | 0.75 |
NZ_CP043004_1 | 1.7|1399850|28|NZ_CP043004|PILER-CR | 1399850-1399877 | 28 | MK250022 | Prevotella phage Lak-B3, complete genome | 409252-409279 | 7 | 0.75 |
NZ_CP043004_1 | 1.7|1399850|28|NZ_CP043004|PILER-CR | 1399850-1399877 | 28 | MK250027 | Prevotella phage Lak-B8, complete genome | 412755-412782 | 7 | 0.75 |
NZ_CP043004_1 | 1.7|1399850|28|NZ_CP043004|PILER-CR | 1399850-1399877 | 28 | MK250026 | Prevotella phage Lak-B7, complete genome | 411791-411818 | 7 | 0.75 |
NZ_CP043004_1 | 1.7|1399850|28|NZ_CP043004|PILER-CR | 1399850-1399877 | 28 | MK250020 | Prevotella phage Lak-B1, complete genome | 410482-410509 | 7 | 0.75 |
1. spacer 1.7|1399850|28|NZ_CP043004|PILER-CR matches to NC_018878 (Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_502p, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
aaaaacaaatatcaattcccagatgaaa CRISPR spacer aaaaacaaatatcaatttccaaacccgc Protospacer *****************.***.*. .
2. spacer 1.7|1399850|28|NZ_CP043004|PILER-CR matches to MK250021 (Prevotella phage Lak-B2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
aaaaacaaatatcaattcccagatgaaa CRISPR spacer ggaaacaaatatcaattaccagaattat Protospacer ..*************** ***** *
3. spacer 1.7|1399850|28|NZ_CP043004|PILER-CR matches to MK250024 (Prevotella phage Lak-B5, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
aaaaacaaatatcaattcccagatgaaa CRISPR spacer ggaaacaaatatcaattaccagaattat Protospacer ..*************** ***** *
4. spacer 1.7|1399850|28|NZ_CP043004|PILER-CR matches to MK250028 (Prevotella phage Lak-B9, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
aaaaacaaatatcaattcccagatgaaa CRISPR spacer ggaaacaaatatcaattaccagaattat Protospacer ..*************** ***** *
5. spacer 1.7|1399850|28|NZ_CP043004|PILER-CR matches to MK250023 (Prevotella phage Lak-B4, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
aaaaacaaatatcaattcccagatgaaa CRISPR spacer ggaaacaaatatcaattaccagaattat Protospacer ..*************** ***** *
6. spacer 1.7|1399850|28|NZ_CP043004|PILER-CR matches to MK250025 (Prevotella phage Lak-B6, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
aaaaacaaatatcaattcccagatgaaa CRISPR spacer ggaaacaaatatcaattaccagaattat Protospacer ..*************** ***** *
7. spacer 1.7|1399850|28|NZ_CP043004|PILER-CR matches to MK250022 (Prevotella phage Lak-B3, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
aaaaacaaatatcaattcccagatgaaa CRISPR spacer ggaaacaaatatcaattaccagaattat Protospacer ..*************** ***** *
8. spacer 1.7|1399850|28|NZ_CP043004|PILER-CR matches to MK250027 (Prevotella phage Lak-B8, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
aaaaacaaatatcaattcccagatgaaa CRISPR spacer ggaaacaaatatcaattaccagaattat Protospacer ..*************** ***** *
9. spacer 1.7|1399850|28|NZ_CP043004|PILER-CR matches to MK250026 (Prevotella phage Lak-B7, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
aaaaacaaatatcaattcccagatgaaa CRISPR spacer ggaaacaaatatcaattaccagaattat Protospacer ..*************** ***** *
10. spacer 1.7|1399850|28|NZ_CP043004|PILER-CR matches to MK250020 (Prevotella phage Lak-B1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
aaaaacaaatatcaattcccagatgaaa CRISPR spacer ggaaacaaatatcaattaccagaattat Protospacer ..*************** ***** *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
567492 : 613834
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP043004|567492:613834|DBSCAN-SWA AATGAAAAGAGCAAGACGTTTTTTCAGCCCGGAGTTCAAAGCTGAAGCGGTCAAATTAATCAAAGAACGTGGTTATTCGGTTGCACAAACCTGCCGAGAATGAGACATCGGAGAAACGGCATTGCGTCGCCGGATAAACCAGGTTGAAGCGGAGAATCAAGGTTATGTCTTACCCGGCAGCAAACCGATTTCACCCGAGCAACAACGTATTTACGAGTTGGAAAAACGCATCAAAGAATTGGAAGAAGACAAGCTCATTCTAAAAAAGGCTACCGCGATTTTAATGTCTCTCGAGCAGCAAAATACCAAGCCATCATGACGTTAAAATCGCGCGGAATCAAACGACTTTGTGCGCTGTTTGAGGTGTCTGAAAGTGCGTATTATGCCTAATGTAAAGCGGTAAAAACGCCACAAAAACACACCGCACTTTCACCGGAAATTAAATCTCTATTTGTTGAAAGTCGTGGCTCGGCAGGCAAGCGAACATTACGTGATTTATTGAGACAGAAAAGTATCTTTGTTGGGCTGTATTTGATTCAAAAATTGATGAAACAGCAGGGATTATTCAGCAAACAACCGCAAAAATGGCAAAATCGAAATAAAGAGAATGGGCAGATTTTTACGAATCATTTGAACCGAGAATTTACACCGAATGCGGATACGACGGTGCTTTGTGGCGATACGACCTATCTCAAGGTGAATGGCATTTGGTGCTATTTAGCGGTGGTGATTAATCTCTGCAACCGCCAAGTGGTAGGCTGGAAACCAAGTCGCCATCACGACAGCGACTTGGTTGTCGAGGCATTGCATCACGCAATGCTTAACGTCAAAAAGACGGCGAAAATGATTTTCCATTCAGACCAAGGCAGTATTTATGGTAGCAAGGTATTTTGCAAAACCGTGCAAGGTTACGGTTTAACCCAAAGCATGAGTTGCCGTGGTAATTGTCGGCACAATGCGCCAATGGAGCGCTGGTTCCGCAGTTTTAAATATGAGTGGATGCAAGAGGGCGGCTATTTAACTTTCGGGCTGGCGATAGACGATGTGAGGGATTATGTAATGTATTACAATTTTGTTCGCCCACATCGTTATAATCAAGGCTTGCCACCCATTTTAACAAAAACAACCTATCGGGGACTGTTGAATTAGTTGATCACTACACAGAAACCATTTGAGCTTATGAGTTTATCTTCATTTAATTGAAGTAGTGATATAAAGCCTTTTACATTTACCAAGATAATTAATGAGATAAAGGATGTTAGTAAAACTTTTACTGCATTATTAGTTTTTTTACAGAAGTATTTTATATCTGAGGATAGAGTTAATAGCCACTGCTTTCATTCAGTGAGTTCAAGTTTACATCTATCTAAGAATCTTTTTATATAACTTTTGTCGTTCATGGTATTTTCTTAAGTTAGTTTATATAAGTAATTGTTTTTAAGTAATAATTATTTATATGAGATTGTTGTGAATAGTATTCACCCCATACAACGGCACATTCACCACCCAATCCTGTTCCTTATAATCTGCCATTGAAAACCGTAAAGCGCGTTTGGGTTGGAATTGATCTACGTAGACTTTTAAACTCTTTGCCTTTAAATTTTCTTCCGCTTTCACTTCAATTGGGGTGATGTCTTGTCCTTGTTGCAGCACAAAATCCACTTCTGCCGTGCCTTTTTCCGTTGCCCAGTAGAAAACGGGATTGTCTTGCAGCACCAAAAGTTGTTGCAGGACATATTGTTCGGTCAGTGCGCCTTTGAATTCGGTGAATAGGCGGTTGCCTTCCAAAAGCACTGTCGGGTCTAAATAGCTTTGTGCGCCGAGCAAGCCCACATCAAGGCTGAATAATTTAAAGGCGTTGTCTTGATAGGCGCTCAGTGGTAAATGCGGTTTTTTAATACGTGGCACGACATGGACTAAGCCGCTGTCTTTTAACCATTGCAGGGCGATTTCATAATCTTTACTGCGCGCTCCTTTTTGCAGTTGGGAATAGACGAATTTTTTGTTTTCTTTTGCCAGCTGTCCCATAATGCACGTACCCGCTGCACCGTTTGCCCGTCGCTAATGTGTTTGGAAAAATCCTGTTCGTATGCCATCAACAAATTGCGTTGGATTTGCCGAACCTCATTCAAATTCTGCGTCTCCACAAAGGTTTTGACCGCTTCCGGCATACCGCCCACAAAATAATATTGGCGCAGTAAGTCAATGTATGTGGATTTCATTGCGCTAATTAACGCCCAATCGTGCATTTCCAGTAATTGCACGAGATCCGGCTTGCCCATGGCAAGTAAAAATTCGCGAAAATCCATGGGATAGATAGGCTGAAAATCCACTTTTCCCACAGGGAAAGAGGCTTGATGATGGAGCGAAACACCAAGCAACGAGCCGGCGGCGACAATGTAAAAGTGCGGTGCGTTTTCATAAAAATATTTGAGAGAGGAGAGGGCTTGTGGCACTTCTTGGATTTCATCAAAAATGATTAGCGTGTTGTCCGCTTGAATATCCACGCCACTTTCGATTTTTAACCCGAGGATTAAACGATCGATATTGTAATCGCCTGCGAAGAGGGTTTTCATGCGCGGATTATTATCGAAGTTAATGTAGGCGGCTTGTTCAAAAGCCTGTTCGCCAAAATGTTTCATTGCCCAGGTTTTGCCCACTTGTCTAGCACCTTGAATAATTAATGGTTTACGATTGGGCTTGGTTTTCCACTTTTGTAATAAGTCTAAGATATAGCGTTTCATCGTTGATCCCCTTATTGGATTTCTCGCTATTCTAACGCAGGCTTTACATTTTTTCTAAGGAAAGTAAAATTCACCTAAAAAAATATTCATAAATCACTGAAGTGATTTATTCACCCCTTCGGGGCCGTTGGCATAGCCAACGTTCAAAAAACGGAATTTTTTGTGACCGCACTTTTGAGACAAAAGTGCGGTCGGTTCTTGAGTTAAATTTGAATTAGGCGAGTTTTGCGCGAATGGCGTTTGCCAATTCTATGTTGACTTGCTCAAAATGTGCCAATTAGCGTTCTACCACGTATCGGTGACCTCTGCCAGACCAGCGGCGAAGTTGCCTGCGAGGTTGTAGTGTTGCGCATCTTGATAATAGGACGAGCGTCCCTGCAACTTAATGCCACTCAGCTGACATGATTATTTAACGGTTTCTGCCGTGGTTGAAGCGCTCGGTTTGCGGCGCTTACCAATGTTTTTACGATCTTGATGGCGCTGTTTGACCTTCTTATCCGCTTTTTTCCGCGCTTCACGTTTTTCGAGTTTCTTCGCTTTTTGTTTCTTGCTAACGGTCTTGATTTCTCCGTCTTTCGGTGCTTTGGTGCGTGGTTCCAAGCCTTCAATGACGCGTGCTTTTAAGATTTCGCCGGTATAACGTTTGATTTTGCCGAGCAGGCGGTAATCGTGAGCTTCCACAAAAGACACCGCCGTGCCTTTTTTGCCAGCGCGTGCAGTGCGACCGATGCGGTGCAAATACGTGTCGGCGCTGTACGGCAAATCGAAATTCATAATGTGGCTGACATCATCAATATCAATGCCACGTGCGGAGACATCCGTGGAAACCAGCACTGTTACCACGCCGTTTTTCAGCTTGTCGATGGCATTATTGCGCTGGGTTTGTGCCATTTCGCCTTCCAGATAGGCGCTGCGAATACCACGCTTACGCAAATTTTCCGCCAGTTCGCGCACTTCTTCGCGGCGACGCACGAACACAATGCCTTTGCTCACCTGCTCCTGCTCAATGAAGCGTGCCAGCAATTTGAATTTATGCTCATTACTGTCGGCGTGATAATACCATTGCTGAATTTTCTTGCGTTCACGGCGGCTCGGTTCCGCCTCAATTTTTACCGGTTCGTTTAAAGTACGTGCGGCAAAATCCTCCAGCAAATCGCCTTCAAGGGTTGCGGAGAACAACAAGGTTTGCTTGCGCCAGCGGGTTTCCGCCGCAATTTTTTCCGCATCCTGCCCGAACCCCATTTGCAACATTCTGTCCGCTTCATCGAAAATAAGAATCTCCACCGCGCGGCAATCAAAATTTTCTTCTTTAATGTATTGCAACAACCGTCCCGGCGTGGCAACGACAATATCTTGATTTTTATCGAAAATTTCCCCGTGATTTTGATACGCCACACCGCCCGTAATGGTGGCAATGCTGAGTTTGGTGAAGCAGGCAAGCTCCTTCGCCTGTTCCGCTACCTGCATGGCAAGTTCGCGGGTCGGCGTTAACACCAACACGCGCGGCGCACCCGGTTTACGACGTGGGTAATCCAGCAAATGCTGAATCGCCGGCAACAAAAATGCCGCCGTTTTACCGGTGCCGGTGGGCGCGGAACCCAATACGTCACCGCCTTCCATCGCCGCTGGAATGGTTTCCTGCTGGATCGCGGTGGGGCGCTGATAACCTTTTTTCTGAAGGGCGTTGAGTAGTTCGGGCGCGAAATCAAAATCTGCAAATTGGATGAGGTTTGTCATTGGTATTTATCGTTCATTAGCATTAAAATTGCGCCGAATTATACCGCACTTTGCTATTAAAGTGCGGTTGTTTTTAGTGATGTTTTTTGATGAACAATATGGGATTTCAATTTAAGCAATTTCGCGTAAATCATGATCGCAGTGCCATGAAGGTCGGCACGGATGGCATTTTATTAGGCGCTTGGGCGAATGTGACGCAGGCAAAACAGATTTTGGATTTGGGCTGCGGTAGCGGGCTGATCGCCTTGATGTTGGCGCAGCGGAGTTCGGCGGAAAGTCGAATTTGCGCCGTGGAAATCGATCCTGCCGCCGCACAACAGGCGCAGGAAAACGTATCGGCATCGCCTTGGAAAGATAAAATTCAGGTGTATCAACAGGATATAGAAACTTTCTGTGCGCAAAGTAAGCACGCGTTTGACTTGATTGCCGCCAACCCACCCTATTTTCAAACGGGCGTGGATTGCCGTAATGAGGCGCGCAATACCGCCCGTTATTTGGCTTCCCAAAGCCATTTGCATT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP043004|567492:613834|579338_580106_+|WP_005577219.1|DBSCAN-SWA MARRPLVMGNWKLNGSKVFTRELITGLKEELHGVTGCDVAIAPPVMYLAEAEAALVGSQIVLGAQNVDVNVKGAFTGDISTDMLKDFGAKYIIIGHSERRTYHKESDEFVAKKFGALKEAGLVPVLCIGESEAENEAGKTEEVCARQIDAVINLLGVEAFNGAVIAYEPIWAIGTGKSATPAQAQAVHAFIRGHIAKKSQAVADQVIIQYGGSVNDANAAELFTQPDIDGALVGGASLKAPAFAVIVKAAAKAKN >NZ_CP043004|567492:613834|595483_596857_-|WP_148323420.1|DBSCAN-SWA MSLEDVLSAINTFVWGPPLLILLSGTGLYLTLRLGFIQIIQLPRALRYLFKRDSGLQQKGDVSSFAALCTALAATIGTGNIVGVATAVQAGGPGAIFWMWLVALLGMATKYAECLLAVKYRVRDKNGFMAGGPMYYIERGLGLGWLAKLFAVFGVLVAFFGIGTFPQVNAITHAMNDTFSIPIPATAAVITILVGLIILGGVKRIALVSSYIVPFMALSYVATSIVIMLLNLEKIPTALQLIVHSAFNPEAALGGALGFSVMKAIQSGVARGIFSNESGLGSAPIAAAAAQTKEPVRQGLISMTGTFLDTIIVCTMTGIVLVLTGAWQSPGMEGAAVTNFAFSSGLNSSVGATIVTIGLLFFAFTTILGWCYYGERCFVYLVGIKGIKLYRAVFIALVGCGAFIQLNLIWILADIVNGLMVFPNLVALIGLRKVVIKETKDYFTRLKTNQRDLDEME >NZ_CP043004|567492:613834|587448_588837_+|WP_151294235.1|DBSCAN-SWA 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46 | uncultured_Mediterranean_phage(25.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
635866 : 684229
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP043004|635866:684229|DBSCAN-SWA 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37 | uncultured_virus(21.43%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
786591 : 870695
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP043004|786591:870695|DBSCAN-SWA 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58 | Escherichia_phage(15.38%) | transposase,integrase,tRNA,head | attL 846893:846910|attR 876270:876287 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1526000 : 1663990
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP043004|1526000:1663990|DBSCAN-SWA 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103 | Paenibacillus_phage(16.67%) | integrase,tRNA,lysis,protease,transposase,tail | attL 1530925:1530984|attR 1664126:1664147 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1706805 : 1714360
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP043004|1706805:1714360|DBSCAN-SWA AATGGCGGACTTTAACGGCTATCAACAACACGAAAATCTGAGCAAAATTAAAAAAATCGTGGCAATTGGCGGAGGACACGGATTAGGTCGGGTCATGTCAGCCTTAAGTTTTATGAACGAACGCCTCACCGCCATTGTCACCACCACCGATAACGGCGGTTCCACCGGACGCATTCGTAGTGCTCAAGGCGGCATTGCCTGGGGTGATTTACGCAATTGTTTAAATCAAATCATCATACAACCGAGTACCGCCTCCGCCTTATTTGAATATCGTTTCAGCGGCAACGGCGAACTGGCGGGGCACAATCTCGGCAACTTGATGCTAAAAGCATTGGAAGATTTACATATTCGCCCAATGGAAGCGGTTAACCTGATTCGTGATTTGCTTGATGTCAAATCCTTCATCATCCCAATGTCAGAACAGCCCGTGCACCTCGCCGCCATTTCAGGCAGCGGCGCCAGCGTGGTAGGCGAAGTGAGCGTGGACAGCTTAACCGAACTGCCAAAATCCATTTTTCTCGTGCCCTATGTGCAAGCCACACCGGAAGCCATTAGCGCGCTAAAAGAAGCGGAAGTCATTTTATTCGGACCCGGCAGTTTTTTAACCAGCATTCTACCGCCGATTCTCTTGCCTGAAGTCATTGAACAATTACAACAAAGCCAAGCCAAGAAAATTTTTATTGATAATCTCGGTATCGAACGCAGCCCCGCAGCAAGGCTTTCCCTTGCCGATCGTATCCACTGGATTAACGACACCATCGGCAAACCGATCATTGATGCCGCCATTGTCCCTTTTGACAACACACCGGAAAATCTGCACGACATCAAAATCCTCGCCGGTCGCCTTAACGCCGACGACATCACCTACCGCCACGACCGCGCCCTCCTCTGCTCCGCCATTGACCAGCTATTGGGCGAACTGCCGGAATCGCAGGACGACGAAGAACATTTGGAAGCCATTAATATCTAAAAAAGTGCGGTGAAAAAACACAAAGAATTTTCACCGCACTTTTATTTATTCTAAAGTTTGAATGTTAGGGCATGCTGATCTTTCCAGTATAAAAAATAAACGACATAGAAGTTTGGTATAATTGAGTCCGCAAACACCTGAATAAACCTTACAAACTATGTCGTTGAGAACTATTTTAACAGATAAACTGTGGGATCGCCTAGCTTATTTACTTGACCGAACAGGTCGTGTTTACAATAAACCCGAACATCGCAATACCGTCGAAGGTATTCTGTATCGTATTCGCACAGGATGTCCTTGGCGTGATTTACCTGCAGAATTTGGTTTGTGGAACACCGTTTATCGCTGTTTCAATCTATGGTCAAAGAAAGGTATTTGGCAAAAAGTGCTAAAGTTCTTTCGGCAGTGTATTGATTCTGAATGGATTTTTATTGATGGCAGCATCGTCAAAGCACATCAACACGCAATGGGGGCTAGCGGTCAAAATCCGCAAGCTATTGGCAAATGCGTAGCGGGCAATACGACGAAAATCCATTTGGCAGTGGATAGTTGTGGTAATCCTATCGACTTTATTTTAACGGGAGGCGAAGTTCACGACAGCAAAGCCGCACCTGATTTAGTGGCATTATTGCCTGATAGTGAAGCGATTATTGCAGACCGCGGATACGACTGCCAAGCCTTGCGAGAGCTGATTTTAACTGATAAAAAAGCGATTCCCGTACTACCGGGAAAGCGAAATTCAAAGGTAGGAAATGATGATGTGGATTGGTGCCTTTAGCGCCGCTTCACTGGTGCTTCCGGAACCTGCAAAGCAATCTACAACCAAATCGCCTTGGCTTGAGCTTTGTTTAATCAGCAATTCGGCAATGGTGGAGGGCTTTTCCGTTGGGTAGCCGCGCGCAATGCGTTTTTCGCTGATCACGTCGGCCATGCCTAAATCGTGTAATTTGCGTTTGTCTTTTTCAAAAAACAGGATGAATTCATAGCACGCCCGGTAGTGATAGCCCATGCCTATGCACTGCTTATCCCAAACTAGCGGCTTCCAGAATTTAAATCCGCACTTTTCTGCGATCGGTTTTGCCGCAAACATGGTTTCTTGATCGCAAAACAAGTAAAAATGGCTGTTCAGTTTTAATACGCGGTAAATCTCGCTAAATAGCTCCTCAAACCGCACATTAGGAAAGATTTCAAACCATTCGTTACTGCTTGCCGCACTTTGTTTTAGTCGCGTTGTTGTGCCGCGTTTGCGGTGTTTTTCCAACGATTCGTAAGGCGGGTCGGTGATAAATAAATCCACACTTCCGGTGGTGAGTGTTTTTAAAAAATCTAGCGCGTCTGCATTTATAATTCTGGACAAAACTCCAAGCGGGGCTATGCCCCTTATTTGTTTCGGTGGTCTCCGAATCGGCATTTTTCGAATGAATCATGCCTTTCTTAATCACCCAATTTTTTAGTTTTGTTCTCACTGTCGCTAAGCTAAAGCGGTTTTTCACCCCCACAATTTTCTTTCTGGTTTCGCCGTATTGATTCGGCTCGGTTTCTTCATACTCAATGCAAAGCGGTTGGTCGGTGCGTTTTGTCATCGCCTCACCCTGCACCTGCAAATAACTGGCAAAACAGGACACATCCGCCACGGCACGCGCCGTGTCAATGGTGTCGTCTTCTTCGCTCATGTCTTTTGTCATCTTGCGTAACTCACGCCACACGGAAATCGGCGGATTACCATAGAACTGAAATTGGCGAATGCCCCAAAGGTTCGCCCAAGCCCGCACCGTTGCACGTTTTCATCTAACTTCAAACCTTCCACCTCGTCGGAATCCTCGTCTTTTTGTTTACCGGCATAGATATTCTTGGCAATGTATTTCGCGATGTAGGACACGGCGGAACCTTTCTCTTTGTCGATTTCATCCACGCGGCAACGGTGTTTTTTCGCGCCGAATTCATCGCCGTCCAATTCCAGGGCTTTTGCTTTGAACAGACGAATCACTTCGTCTTTGTGTCGTGCGTCGATATAAAGCAACAAATGCCAGTGCGGGGTTGCGTCGTGGTGTGGTTCCACCCCACGCATACCGAAAAAACCGATGTCGCGTTTGGCAAACAAGGTGCACAACTGTTGCAACACTTTATTCAAATACGCGTGAGTTTGGCGCGGGTCTGCCCCTTGCCATTTTTTTATTATTAGTGCCATTGTTGTACGTAGCGTGGAAAGATGAAGGTGCCGTCATGGTTAAAAATAAAGAGATATAGCCGTTTTCTTCCGCCCATCCGTCCACACTGCGCAATCTGTTCATCATTTCGTTATAGCGAATGGCAGGGTTACCGGAAGAACGCAACCACATTTCCAACAATTCAACCTGTTCATTCGGGTCATCAATATTTTCGATGATCATCTGCTTTAAATATTCCAGGTTGGATTTGCGCTGTTCTTTGAATTCACGGAACGCACCTTGGGAAATATACGGGCTGACTTTTGCCGACACTTCGCCGCAACATATCGCCAAATGCTCAATCAAACATTTTTGTGCCGTGCGCAACGTGCGGAACCAATGCTTATCGCACACGATTTTCAACAATTCGGTTTCAATGGTTTGAGATGAAATCTGCTTTCCTTCGTTAAAACGTGTCCAACTTTTCAATGGAAAGCCAATGCCCCAACAGGTATCACCGCATAATTGATAAAGCTCCCGTTCCAAACGGTTGAAATCGTCCATTGAAATCAAGCCCTGTTCTTTTTCCTCGGCACGCTCGGCAACGAAATCCGCTTGTAATTTGGTGAACAGGTTGGAAAGTTTGCAGGCGATTTCTTTCAATTGGCGTTCGCCCAATAAATAGAAATGCAACCCTTCCGGGTTCACCTGTTTTTGTTGTGCCAGTTCGACGAAATAGGCTTGGCGATTTAACAGCCAAGAAACGGAAATGCGATAATGTTCAAAAACCGCTCTCAAACGGGTGCTTAAAATCTCGCGCAAATAATTGTTGGCATAGGTGGCTTGTTTATTACCGGCGCGGAACGAAATAGACCCGTCATCCGCCACCGATTGAAAAGCACGTAGCCACACATTGCGGAAATGTTCGCGCTGACGTTTGCTCGGCAATGAAGAAAGCAGTTTTTCAACATAATCATAAGAAGCGGGGACAACGGCAAATAGCTCCAATTGCGCAGAGGTTGCCTGCGCATTGTGTAAAGTGCGGTCGTTTTTCACCGCACTTTGTGCCATAGCCAAACGCGCCGCTTCCATTGCCTGTTCACGCTTGGCAAGGTTGATGTCGCGTTGTTGCTCCCAGTTCAAATACATTTTGTTTTTGCAGCCGATGTTGTGCCGGCAGCACAATGCGTTCCAGATTTGCCAAACGCGCCAAGATTTCTTCATTGGTGATGATCTGATTGGTGTTTAATTGCACCTGTTTGGCATTAATGCGGTTTTGCAAGTCGAATTGTTTTTTCACGTCATTCATAAACTGAAAAATGATGTGCGTTTTTTGTTTTGTGTCACCACTTTGCGGCTGTATTTTTGTTTAACTATTCCGAATCACCGCCCAATCCACATCAGAGCGGAGGTCTTCGGGTTTTACTGCGCCGTTTATGGCCTTGATAATGGCAGGAATGTGTTTTACATCCATTTTCCCACCATTTACCCACAAACTGACTATTTGTTGACTTACGCCACATTCCTTTGCCAGTACTTGCTGTGAGCCAATACCTAGAATAGCCTTTACAAATTTTTCGTTAATCTTGCTCATATTCCAGCTCTTACTTGTTAAGTTGAAAAACATATCACAAGTTTTTTTGTAAAAATACAACAAATTTTCTTGTTTAAATTGTTACAATTTCACTTGTATATTCACACAACAAGGAGATTTGTAATGAAAACCCTATCTAAAAGACTAAGATATTTATTAAAAGTCAATGAATTAACAGAAGATGCGCTAGCAAAACAAGTAAACGTATCTCAACAAGCGGTTAATTATGTTTTGAATGGCAAAACGAGATCACCAAAAAATATCTTAGAAATAGCGACCGCACTTGGGG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP043004|1706805:1714360|1706805_1707774_+|WP_151294733.1|DBSCAN-SWA MADFNGYQQHENLSKIKKIVAIGGGHGLGRVMSALSFMNERLTAIVTTTDNGGSTGRIRSAQGGIAWGDLRNCLNQIIIQPSTASALFEYRFSGNGELAGHNLGNLMLKALEDLHIRPMEAVNLIRDLLDVKSFIIPMSEQPVHLAAISGSGASVVGEVSVDSLTELPKSIFLVPYVQATPEAISALKEAEVILFGPGSFLTSILPPILLPEVIEQLQQSQAKKIFIDNLGIERSPAARLSLADRIHWINDTIGKPIIDAAIVPFDNTPENLHDIKILAGRLNADDITYRHDRALLCSAIDQLLGELPESQDDEEHLEAINI >NZ_CP043004|1706805:1714360|1713267_1713501_+|WP_151294743.1|DBSCAN-SWA MPVSLSSDAAPVPKEIYSQFKGIDVANLERDIDLTDGVLWIRMNFDEPIPEALGSSTIFSEACMNMYMNLKLGKNTR >NZ_CP043004|1706805:1714360|1712448_1713216_+|WP_151294074.1|transposase|DBSCAN-SWA MSLRTILTDKLWDRLAYLLDRTGRVYNKPEHRNTVEGILYRIRTGCPWRDLPAEFGLWNTVYRCFNLWSKKGIWQKVLKFFRQCIDSEWIFIDGSIVKAHQHAMGASGQNPQAIGKCVAGNTTKIHLAVDSCGNPIDFILTGGEVHDSKAAPDLVALLPDSEAIIADRGYDCQALRELILTDKKAIPVLPRKRNSKVGNDDVDWCLYRYRHLVENAFALLKQYRAIATRYDKLARNYASSLAFTCCIRWVRLIFG >NZ_CP043004|1706805:1714360|1711290_1711515_-|WP_148327618.1|DBSCAN-SWA MSKINEKFVKAILGIGSQQVLAKECGVSQQIVSLWVNGGKMDVKHIPAIIKAINGAVKPEDLRSDVDWAVIRNS >NZ_CP043004|1706805:1714360|1711584_1712322_+|WP_151294741.1|DBSCAN-SWA MFKLLQFHLYIHTTRRFVMKTLSKRLRYLLKVNELTEDALAKQVNVSQQAVNYVLNGKTRSPKNILEIATALGVNPHWLKTGEGSPDIDVSAFTSEKDDDHDLRVDLLDAELAAHSSGIINLKYPDVISTIFFTHEGVKRILGRTTTDGVYMFKVLTDSMAPTITQNDIVFIDTNVKEYIGEGVYSFNLNGETYIKRLQRLPTGVIMALSDNPLYHPFEITEALLDTAEIIGKFIKAVELKPKDL >NZ_CP043004|1706805:1714360|1708513_1709185_-|WP_151294736.1|DBSCAN-SWA MPIRRPPKQIRGIAPLGVLSRIINADALDFLKTLTTGSVDLFITDPPYESLEKHRKRGTTTRLKQSAASSNEWFEIFPNVRFEELFSEIYRVLKLNSHFYLFCDQETMFAAKPIAEKCGFKFWKPLVWDKQCIGMGYHYRACYEFILFFEKDKRKLHDLGMADVISEKRIARGYPTEKPSTIAELLIKQSSSQGDLVVDCFAGSGSTSEAALKAPIHIIISYL >NZ_CP043004|1706805:1714360|1710727_1710952_-|WP_151294739.1|DBSCAN-SWA MRRQPLRNWSYLPLSPLLMIMLKNCFLHCRANVSANISAMCGYVLFNRWRMTGLFRSAPVINKPPMPTIICARF >NZ_CP043004|1706805:1714360|1708973_1709546_-|WP_151294737.1|DBSCAN-SWA MRAWANLWGIRQFQFYGNPPISVWRELRKMTKDMSEEDDTIDTARAVADVSCFASYLQVQGEAMTKRTDQPLCIEYEETEPNQYGETRKKIVGVKNRFSLATVRTKLKNWVIKKGMIHSKNADSETTETNKGHSPAWSFVQNYKCRRARFFKNTHHRKCGFIYHRPALRIVGKTPQTRHNNATKTKCGKQ >NZ_CP043004|1706805:1714360|1713709_1714360_-|WP_151294747.1|transposase|DBSCAN-SWA MTLKLRQMGFHLNHKTVLKLMNALGIHSILRKKRHGKRGKTSHIAPNVLNRDFTATALNQKWVTDVTEFRVGEEKLYFSPLMDLANREIIAYNFAKRPKFSLVKRMPEEGLGKLKPSECPIIHSDQGVLYGSAEWVKMLEGKAIQSMSRRGNCYDNAVIESFFAILKSECFYSRTYTSIAELQAEIEEYLVYYNQERIKLDLKGLSPVQYRAQYLS |
9 | Streptococcus_phage(14.29%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1821053 : 1882291
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP043004|1821053:1882291|DBSCAN-SWA 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54 | Paenibacillus_phage(16.67%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2138408 : 2260130
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP043004|2138408:2260130|DBSCAN-SWA 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112 | Paenibacillus_phage(19.35%) | transposase,integrase,tRNA,protease | attL 2155792:2155811|attR 2179806:2179825 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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