Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP043307 | Acinetobacter johnsonii strain Acsw19 chromosome, complete genome | 2 crisprs | cas3,DEDDh,WYL,csa3 | 0 | 1 | 9 | 0 |
NZ_CP043308 | Acinetobacter johnsonii strain Acsw19 plasmid pAcsw19-1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP043310 | Acinetobacter johnsonii strain Acsw19 plasmid pAcsw19-3, complete sequence | 4 crisprs | NA | 0 | 4 | 0 | 0 |
NZ_CP043309 | Acinetobacter johnsonii strain Acsw19 plasmid pAcsw19-2, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP043307_1 | 779305-779441 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP043307_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP043307_1
>1.1|779343|61|NZ_CP043307|CRISPRCasFinder ACAGGGTGAGCAAGGTATCCAAGGTGTAAAAGGTGATACTGGAGCACAAGGTGAGCAAGGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043307_1
The CRISPR arrays of NZ_CP043307_1 >merge|NZ_CP043307|1|779305-779441|CRISPRCasFinder GCCACTGGAGCACAAGGTGAACAAGGTCTCCAAGGTTTACAGGGTGAGCAAGGTATCCAAGGTGTAAAAGGTGATACTGGAGCACAAGGTGAGCAAGGCCTCCAAGGTTTACAGGGCGAGCAAGGTATCCAAGGTGT >NZ_CP043307|1|1|779305-779441|CRISPRCasFinder GCCACTGGAGCACAAGGTGAACAAGGTCTCCAAGGTTT ACAGGGTGAGCAAGGTATCCAAGGTGTAAAAGGTGATACTGGAGCACAAGGTGAGCAAGGC CTCCAAGGTTTACAGGGCGAGCAAGGTATCCAAGGTGT
>NZ_CP043307.1|WP_004695443.1|778454_778709_+|50S-ribosomal-protein-L27 MATKKAGGSTKNGRDSNPKMLGVKIYGGQSVTAGNIIVRQRGTEFHAGQNVGMGRDHTLFATADGVVKFEVKGQFGRRYVTVEA >NZ_CP043307.1|WP_004695441.1|778123_778435_+|50S-ribosomal-protein-L21 MYAVIQSGGKQHRVVEGETLKVELLKAETGATITFDDVLMLVNGDSIQIGAPVVAGATVTAEVVSHGRHDKIRIVKMRRRKHYRKQQGHRQWFTELKITAISG >NZ_CP043307.1|WP_148825623.1|776678_777656_-|polyprenyl-synthetase-family-protein MTIDFKQDILAPVAQDFATMDTFINEGITSKVALVMAVSKHVVEAGGKRMRPIMCLLAAKACGAEDLERQRKLAAIIEMLHTATLVHDDVVDESGLRRGRPTANATWNNQTAVLVGDFLISRAFDLLVDLGDMTLLKDFSTGTCEIAEGEVLQLQAQHQPETTEQTYLDIIHGKTSRLFELATEGAAILSGTPQYREPLRLFAGHFGNAFQIIDDILDYTSDAETLGKNIGDDLMEGKPTLPLISALKNTTGEEHNIVRRSIATGGTTDLDQVIAIVNSSGALDYCRQRAHEETEAALQALQALPDSQYRQALVNLTQLALHRIQ >NZ_CP043307.1|WP_148825622.1|774590_776645_-|recombinase MHIKFNDLFSQMQQQLEQPQAVLNDQLLIELVERIRPIDAYQTDEIHQKFQALIQALLITPDAASTLQSFVLRLISQYKQTSLYADTGILSLDGFWNQLSQRLGAHFLPLINDETQLQDLVRRVFPNRSDKYWLDNIRDSDWLQLLNLLNHGHANQKEKVKIRSEVIKAITVLSYRISGIGLYPEFINAHPELTEYESPFLVQNREIIEFIQQYKKAHQEAETSSVVAPPDASQALVMIEQCRDVVLKIRRATKRIGVSVSLTYLISLLEQCLDRVELLLNLIVEEGEAHYEAVSLLLVDITAAIYSERSVRSLLTTNSELIALQVTENASKTGEHYVSTDKQGFLAMYKSAAGAGVIIATMATLKILSARMIMAPLMQAFVYSMNYSLGFMLIHVLHFTVATKQPAMTAAALAATVQQRKGSKTAQIAELAALIINIIRTQFIAILGNISIAIPVAAFITWAWATGMHEPLLNHAKAAKVLHDLNPFTSLAIPHAAIAGVCLFLSGLLAGYFDNMAVYRKVGPRLKAHPRLKKIMGQERLDKFAGYIERNLGALAGNFLFGIMLGSMGTIGYILGLPLDIRHIAFASANFIQGLMNINGSPEIGLIIVSFLGVLAIGLTNLFVSFTLTIIVALRARRVRFEQWKPLAKLVLTHFLTRPSDFFWPPKVPLEVEESSNNTKHHTK >NZ_CP043307.1|WP_148825621.1|773832_774444_-|phosphatase-PAP2-family-protein MPYLLLFIGIILFIISVLALSIQPLTALDLAMVEYFSTLRTEPIDKLAILLSALGGMPFVLFLTTLWCFHRAWYKKYRDVVFIGLGVVGSIASAWLLKFLISRPRPPEMFHLVTSYGASFPSAHSMYAATLACLAIFLSRPFPAHRYVVCIALLWMLMMGISRVYLGVHFPSDVLAGWSISIIWISLLYILCGRYTQLNTNYF >NZ_CP043307.1|WP_148825620.1|772562_773807_-|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MMSAKLWAPALTACALATSIALVGCSKDPKDAQQAGASQQMPPTEVGVIVAQPQNVEQSVELSGRTTAFEISEVRPQTSGIILKRLFAEGSYVREGQALYELDSRTNRATFDNAKAALLQQEANLSTLRTKLNRYQQLVSSNAVAKQDYDDLVGQVNVAEAQVAAARAQVKNAEVDLGYSTIRSPISGQTNRSTVTAGALVTANQTEPLVTIQRLDPIYVDINQSSSELLRLRQQLSKGSLDSSNNTRVKLKLEDGSDYPVEGRLAFSDASVNPDTGTVTIRAVFPNPNHLLLPGMFANAQIVQGVIPNAMLVPQIAVTRTPTGQAMAMIVNDKGVVEPRQITTVGIQGQDWIVTEGLKTGEKVIVDGIAKVKAEQKVVAKPYQPQAAAPQAPTTDAKKTEAGAKTEQKATSNA >NZ_CP043307.1|WP_148825619.1|769370_772550_-|multidrug-efflux-RND-transporter-permease-subunit-AdeJ MAQFFIHRPIFAWVIALVIMLAGILTLTKMPVAQYPTISPPSVTISATYPGASAQTVENTVTQIIEQQMNGLDGLRYISSNSAGNGQASINLNFEQGIDPDIAQVQVQNKLQSATALLPEDVQRQGLKVTKSGASFMQVLAFYSPDGSLSAADIKDYVNSNISEPLSRVAGVGEVQVFGGSYAMRIWLDPAKMTSLQITPSDVATAINAQNSQVAVGQLGGAPSVQGQVLNATVNAQSMLQTPEQFRNIFLKNTASGAQVRLGDVARVELGSDNYQFDSKFNGKAAGGVAIKLATGANALDTAAAVEKRLSELRKNYPNGLKDQLAYDTTPFIKLSIESVVHTLIEAVVLVFIVMFLFLQNWRATIIPTLAVPVVVLGTFAVINIFGFSINTLTMFAMVLAIGLLVDDAIVVVENVERVMQEEHLDPVAATEKSMQQISGALVGITSVLTAVFVPMAFFAGTTGVIYRQFSITLVTAMILSLIVALTFTPALCATLLKQHDPNKAESNNIFARFFRWFNSSFEKLSVKYQGGVNRMTHHKVFSGVVYLLVIAGLVGLYKALPSSFLPDEDQGVVMTLVQLPPSASLERTDKVITTMTDYFMNKEKEHVESIFTVSGFSFTGVGQNAGLAFIKLKDWSERTTPESQIGAIIQRGMALNMIVKDASYIMPLQLPAMPELGVSAGFDIQLKDASGQGHEKLIAARNAILGMAAQDKRLTGVRPNGQEDTPQYQISIDQAQAGAMGVSIADINTTMSMAWGGSYINDFVDRGRVKKVYVQGEANARMMPEDLNKWYVRNSSGTMVPFSAFATGEWTYGSPRLERYNGVSSVNIQGTPAPGVSSGDAMLAMEEIIGKLPSMGLQGFDYEWTGLSLEERDSGNQTAPLLVLSMLIVFLCLAALYESWSIPVSVLLVVPLGILGAFALTWLGMIIKGDPNLSFNIYFQVAIVAVIGLSAKNAILIVEFAKELQEQGEDLFDATLHAAKMRLRPIIMTTLAFGFGVLPLALSTGAGAGSQHSVGFGVLGGVISSTLLGIFFIPVFFVWIRSIFKYKPKKQNNQEQTS >NZ_CP043307.1|WP_010327336.1|767913_769371_-|multidrug-efflux-RND-transporter-AdeIJK-outer-membrane-channel-subunit-AdeK MQKVWSISGRSIAVSALALALTACQSMRGPEPVAQADIPTGYIGSTTGPSVAEQGYKDFFADQRLVQVIELALANNRDLRTATLNIQRAQQAYQISENNQLPTIGASGSVLRQDTLSSSKPMTTYNVGLGVTAYELDFWGRVRSLKDNALDSYLATQSARDATQISLIGQVAQAWLSYSFANANLKLADQTLKAQLESYNLNKKRFDVGIDSEVPVRQAQISVETARNDVANYKTQLAQAQNLLNLLVGQPVPANLLSPQPVKRITQSTALTAGLPSDLLNNRPDVRAAEYQLSAAGANIGAAKAQLYPTISLTGTAGYASTDLSDLFKSGAFVWSLGPSLDIPIFDWGTRRANVKISETDQKIALSDYEKTIQTAFREVNDALAVRENIGDRLAAQRRLVDATNTTYKLSTARFRAGIDNYLTVLDAQRTSYSAEQGLLLLEQANLNNQVEVYKTLGGGVKANTTDQVVKQPSSSDVKYNKTAN >NZ_CP043307.1|WP_094148967.1|767453_767810_-|YbjQ-family-protein MLLSNLESVPGHRISQQLDVVYGSTVRSKHVGRDFLAGLKNIVGGELTAYTELLEESRQEAMNRMIAKAQGLGANAIVGIRFSTSNIAQGASELFVYGTAVRVTPLDNHLPDPFPTQA >NZ_CP043307.1|WP_005400359.1|767012_767450_-|heavy-metal-binding-domain-containing-protein MESLVFQLLIFAVLFSVGFGFGRYNERKHLAELEQNEKRLAYITVGNLRKVSFEQSGHMISSNVVISHDYFKYVLATVQNFFGGRLTSYESVVDRARREAIVRLKLEAEKHGATHIACMRLATTEMGMQGGMVEVFAYGTAIQNP >NZ_CP043307.1|WP_010327331.1|780325_781024_+|outer-membrane-lipoprotein-chaperone-LolA MKMLRKTLCAMTVGVVTLGPVMSSTVFAAPVAASEQQATTSLVKQLSGIQSISSNFEQTTKVTNSSKAPKKQGLSAQHMNQTFKGVMKVERPGKFYWETTSPAKQTIVTSGKTVWIYDPDLQQAVRQTLDEQVANTPALLLSGNTEQIRKSYRITQPNQSKTYYTLYPKSDDGAFQSLTISFGAKNAPTLMILEDSLGQTTYVRFNNTKVNTNIPASTFNFTPPKGTDIIDQ >NZ_CP043307.1|WP_148827068.1|781197_781968_+|DUF3298-domain-containing-protein MILCTGLLSACQPQNDSNAAKSEETTKPAQVTQTLPLIEAKVRPLQLAHSIACDEEGCTQYQLYSLETNVPWINQYFDERMKKANPVAFESLKQSKPQIDENMLSETLSDVRYVAQRGKYADFVLMYYHYPARAAHGMYHNEYITLDLATKKRVALSDIVVDKTESQLLDALYGANSMWLSDHNISREQLKLTDNYYMSAKGVVFVYPLYELASYAEGMSELVLPYQQASGLIKAEYLPSFVDYAAEREKASKEKP >NZ_CP043307.1|WP_004695457.1|782068_783340_+|serine--tRNA-ligase MIDPKLLRNNIEAVNLALAKRGVQLNVEEWASLEARRKEIQSKTESLQAERNSGAKQVGQIKKAGGDASEIMTRMSAIGDEIKAAEVALSELQAELEAKSLSIPNLPDESVPEGKDESDNVEILTWGTPRTFDFEIKDHTDLGEWMGGLEFETATKLTGSRFSVLKGPLARLQRAITQFMLNTHTLENGYTEAYVPYLVNADSLRGTGQLPKFEEDLFKLQGEKEYYLIPTAEVPVTNFVRDEIIDADRLPLKYAAHTPCFRSEAGSYGRDTRGLIRQHQFDKVEMVQIVKPEDSMQALEELTGHAEGILKALGLPYRKIILCGGDMGFGATKTYDLEVWVPSQNTYREISSCSNMGDFQARRMKARYRADQKKTEFVHTLNGSGLAVGRTLLAVMENYQRADGSIEIPTVLRPYMGGAEYID >NZ_CP043307.1|WP_010327329.1|783416_784793_+|uroporphyrinogen-III-C-methyltransferase MDIFPISLKLQQQPCLIVGGGHIAYRKAVLLHKAGALIHVIAPDIDANLLQLVEESQGQYIQALYPAQIQLNDYRLVIAATDDYAVNTQVFEDCEALKILVNSVDDPPHCRFMVPAIVDRSPLVISVASNGTSPVLSRQIRTQLETSIPHGMGKLAEFSGKWRAAVKAKISNPDERRVFWEDLYASPLKEQVFHDNLTEADSLIEQALAEWKTPKGEVYLVGAGPGDPELLTLKALRLMQQADVVIYDRLVSPAIMELCRRDATKIYVGKARSNHAVPQEGINALLVEYASKGQRVCRLKGGDPFIFGRGGEEIQELFAAGVPFQVVPGITAASGCSAYAGIPLTHRDYAQSVRFLTGHLKEGSPELPWDELVYQNQTLVLYMGLVGLEKICEKLIEHGQRPDMPVALISKGTTLEQKVLVGTLADIASKVEENHIQAPTLTIIGDVVSLREQLQWQD >NZ_CP043307.1|WP_010327328.1|784825_785305_+|tRNA-(cytidine(34)-2'-O)-methyltransferase MIHVVLYEPEIPANTGNIIRLCANTGAQLHLVKPLGFELDDKKLKRAGLDYHEWARMQIWETFDECLANLAEKGVDINAIYPLTTKGTETPHTSDLNRPVALLMGPETRGLPEQVRMLFPKEHWIRLPMAENSRSLNLSNATAVIVYEAWRQQGFKPLA >NZ_CP043307.1|WP_004695464.1|785329_785716_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNKPMKFNIFHPDCPARLFFEKFADKWILLIVYTLDQESQHFNELKKNVLGISPKVLSQKLKILERDGFLTRTIHEDNVIRVEYALTEIGKDFAQNAYQMKDWVEANMLKVLKSRAGFDQKLEKTEPA >NZ_CP043307.1|WP_171522859.1|785831_786614_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MQRCHQTTLSQDTGNWMDHIMKVSEAVVFITGGNRGLGLAMAREARRQGAKKIYVGMRQIGSFQEEGLTPIQLDVNDKASIQQAAEQCADTTILVNNAGIALLNEHPVDASIITTTQKILETNLLGLMWVTQIFVPILQKNQQAYVVNILSDVSWEPSTVLTSYAISKAAAWSYTNSSRQWLSQFNIQVMGVHVGFIDTDLTRSLPIPKIASETVAQEIFQGIEQNAYEVLVGEKTQQLKQGLSAEVASYVKLKPDQASV >NZ_CP043307.1|WP_010327326.1|786704_787259_+|flavodoxin-family-protein MSNISVVFYSGYGHTKVIAQTFAQEIGANLVEIDPNGDISEQNWQTLDQSDAIVFGAPTYMGTAPWQFKKFADASSKKWFTRAWQDKIFGGFTNSASLNGDKQVTLIQLQTLASQHGGIWVSLGLLPANSKAATRQDVNNLGGSVGLLVQSPSDASTDEIPAGDLETTKAYAQRIAKMTKQFKG >NZ_CP043307.1|WP_148825625.1|787324_788719_-|amino-acid-permease MTNISGTQSAAKLQKTLGLWHIIIIGLAYIQPMTLFDTFGLVSEESHYHVPTSYIIALIAILFTSISYGHMIRRYPSSGSAYTYAQKSIHPNVGFMVGWSSWLDYLLSPMVNIILAVIYLEALFPDVNHWVWVVGLTAFMTAINLRGARFVANFNGLIVFVQLGVIAYFTWMVYSLLAGGVNADGTLVNAKYQLWSLEPFWNELTSLGALITGATLLCFSFTGFDSLSSLAEETKDTEKTLPKAIFLTALLAGVIFIISTYFMQIYFPNDPKTYFEDVAATQPDILQAVGGVAFKTVVLYFAIVTVMASGISAHAGVSRLMYVMGRDGVINKKIFGHISPKSFTPSYNILIVGAVALTAGFMDLDIVISMISFGALTAFTFVNLSVISRYALRDGRTKNIKDILSFVIIPMCGFLSIFAMWLEIEETALKFGLWWAMFGILYLGYKTKGFKQPAPQHNEFDDPL >NZ_CP043307.1|WP_148825626.1|788984_790169_-|iron-containing-alcohol-dehydrogenase MAKPYYEFFCPVKVIAGHAALEHIPFELATLGATRPLIITDKGVRANNLLAPIEAAFESTDAVIGAIFDDVPPDSSLETVRKAANLYREHQCDAIIAVGGGSVIDTSKATNILVSEGGDDLLKYSGAHNLPKPLKPFFVIPTTSGTGSEVTMVAVVSDPEKNVKLPFASYYLMPHAAILDPRMTQTLPPHLTAMTAMDAMTHAIEAYTCMAHNPISDAYATAAIKKVSNHLFNVLDNPNDANGRLELAQASTMAGIAFSNSMVGLVHSLGHALGAVAHLPHGLCMNLFLPYVLEFNKEVNGDKIAELLLPLAGPDIYAQTPAHLRADKAISTLLTMRDRLFTLTKLPRTLSETGKVTLEQLDEVAEKALNDGSIIYNPKEASLKDLKAILEKAW |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP043307_2 | 1301186-1301258 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP043307_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP043307_2
>2.1|1301210|25|NZ_CP043307|CRISPRCasFinder AACAAATCTCGATTATAAAGATAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043307_2
The CRISPR arrays of NZ_CP043307_2 >merge|NZ_CP043307|2|1301186-1301258|CRISPRCasFinder CATTATGCAACATGTTGCATTAAAAACAAATCTCGATTATAAAGATAAACATTATGCAACTTGTTGCATTAAA >NZ_CP043307|2|2|1301186-1301258|CRISPRCasFinder CATTATGCAACATGTTGCATTAAA AACAAATCTCGATTATAAAGATAAA CATTATGCAACTTGTTGCATTAAA
>NZ_CP043307.1|WP_058869883.1|1300609_1301149_-|PadR-family-transcriptional-regulator MSLAHVLLTSLIEKPSTGIELARRFDRSMGFFWNATHQQIYRELSAMQSKGWISTIEDDGATSRKKTYQAEQLGRTELADWLVKQSPPAQLREELMVRLRVEAQLGGNTVLPELERHLTLHKEKLQIYQSIFAKDFGHAEENDRTLYIHKMILQLGINLECGWIEWLETIIPALKNFEK >NZ_CP043307.1|WP_148825865.1|1299675_1300587_-|alpha/beta-fold-hydrolase MPHYLMPDGEKLYVREFGQGTPVLVLSGLGMQSWQWLPFLYQHRKKYRFYIPDWRGFGGSAQCKIPTLDAISSHWQDLNCFLNQYAYTAFHVIAYSMGATTAMHGMQYGRFQDHISSYLHIDQTPKISVDADWPHGLFAEKHADFKVILQNIADLLAQNAQYRLVSDLAASMRTELVKQWFAFIQLQATPSRTAALFQKAFQQPYLQKFMLPIQRLDYMAWYIQNYLDHQEDYRSALRQIDRPATFFIGEDSKLYPAQGQKLIASSVPHAKTVIFKKSGHTPLLSEPRKFSQEITRFLNATNI >NZ_CP043307.1|WP_148825864.1|1298738_1299518_+|glutathione-S-transferase-N-terminal-domain-containing-protein MVKHQIKVIQALFSGLAQGGRGVTGTPHPKQPEQPLKLYEFEGSPYCRRVREVLTLLNLDYEVYPCPKGGTKYRPLVKQLGGKTQFPFLLDENTDTKLYESEDIIHYLFEQYGRSGKAPKKYAHYPKTPYVAYVGTLVNGASGVWINKSIKDRVAPEQLLQLWGFEASPYTRVVRGLLTELELPFKFHNVPKERWQDQGPAVLRLKPGKYVPLAGGKREQVMQVMGRDIQVPYLVDPNTETALFESADIVAYLKQTYAA >NZ_CP043307.1|WP_062033117.1|1298176_1298689_+|ribonuclease-E-activity-regulator-RraA MVTTAFVTCDLLDDHPELDLQVVSPSMDGKFFRSYGARKTFGGEVVTVKCFEDNSRVKELLATDGTGKVLVVDGGASMRCALMGDLIAESAVKNHWNGVVIYGCVRDVDAIAELDLGVHALAAIPQKSNRKGVGEVDISLHFGGVTIQSGHYLYADNNGIVIAKEKLVDA >NZ_CP043307.1|WP_148825863.1|1297502_1298168_+|nucleoside-diphosphate-sugar-epimerase MTQNIEQAIVIGATGLVGINLIQQLQQLPSCSKILAVVRKHNVQLDHYDKVQQLELDDFLLLNHEDVQGYSHAFSCLGTTLKKAGSKEQFYAIDYVVNAHFAELFVLTKTHYVLISALGAQANSKVFYNRVKGELEETIRGLDLYKVSIMQPSLLIGQRNEDRMLEDIFQKAYTKLSHFIPKHFKYKPVTAEQVAHTMVEAAQTQTEKFEIYDNLRIQKTK >NZ_CP043307.1|WP_004696602.1|1297022_1297289_-|30S-ribosomal-protein-S20 MANSAQAKKRARQNVKARKHNASLRSMVRTYIKRTVAAIAAGDYAVASEAYKTAVPVIDRMADKGIIHKNKAARHKSRLNAQVKALAN >NZ_CP043307.1|WP_148825229.1|1295460_1296765_-|IS4-family-transposase MNLSQNLDLTLKQTLPSLSQFSELIDLNWIEDCLDQTGKASIRKRKLPAEHVVWLVIGLALFRNQPIWYVVQQLQLVFGTAEYCVPSASVQARQRLGLEPMSALFSTLSQAWFKDSQQQYSNFHGLCVCAVDGVVWSMPHTEENFKHFGSSKGKTAAAPYPQVRATCLVNTNTHEMIDAQMGSMDQGELTLASQLKAPVRSITLFDRAYFSADFLVSWQSQAEESHWLMRAKDNLRYEVIHHNAAHDFQIKMPVSARAKKINPSLGDYWEARLIEVEYAGKIRCYITSLTDSKVYPFKDLAMLYIQRWEIEMCYREIKSDLQDARILRSKQPDLVYQELWGVFIAYNILRRQMRFIAEHAKVSPLRISFHVASMSIINILRHTPLESAGNLPKHLAQLFEQSKIFVLPEKRQRQCPRVVKIKAQKYPRKCQSIS >NZ_CP043307.1|WP_058951778.1|1291865_1292306_-|hypothetical-protein MINKFLPTLEKFQPTEQQYIEYFHAKGEKDILAKVISNMRGTAEIQASQGVDAWLGYGVYLPAIERIFALHQGETEAEFYDRTQYPADVVNAYTLSNHEIATLIAADKYNRIHQHSVAVNTSLWPLNDEGLSIDLLDFPNRLKAKI >NZ_CP043307.1|WP_004696597.1|1290993_1291725_+|phosphoglycerate-mutase-family-protein MALELLPPSMLKAIDLLPDAKTPVTLFTRHSIREVVTGQGLAGYDLQLTHQGRDLAEAWGSYLIDNTDRVIQHCISSPIQRCIDTAALMIQGADGQTLEPNTHRIEIIEQGLLVEPGSFVLDIKQAGPYFQRQGALGFINSFVNNALPGMKHPIHGVVDVLELIYNTHPNNPYGLSLAVSHDTILAAILAVISGRTIVTKEDWPKMMEGLFVWFEGDVFLESKLKWIWRGEMNELNIHEFQNL >NZ_CP043307.1|WP_148825862.1|1290084_1290939_+|3'(2'),5'-bisphosphate-nucleotidase-CysQ MFKPTTAPQDALILQLVPIVTQACEILRAEYQAYVAGGDFTVERKSDHSPVTQADYRVNQFITDALNNTFPHLPVLSEEGQHAHRQQWQSFWMLDPLDGTKEFLHQRPEFTINLSLIEGAHTTFAVLAIPCEQQIYFCPLQGQPLKYNIEKDVWSEYVPVENHSAVKVGLSQSSQSKPQYHVYLEQLEKLTPIQEYRAGSAYKFCMVLEDRVDIYPRFHPTSEWDTSAGQCLLERIGGGLVDFQGRPFVYNQRLSLLNGGFIAYRNNDMKKLALQALELMPSSA >NZ_CP043307.1|WP_094148191.1|1301319_1303344_+|NADPH-dependent-2,4-dienoyl-CoA-reductase MSNYPHLLAPLDLGFTTLKNRVLMGSMHVGLEEVEGGYDRMAAFYAERAAGGVGLIVTGGISPNDHGVTFHGGSKLDTLEEAEKHKVITQAVHDAGGKIALQILHTGRYSYQAENVAPSAIQAPINPVKPHALTSAEVNQTIADFVNCAKLSQVAGYDGVEIMGSEGYLINEFIAARTNHRDDEWGGSYENRIRFPIEIVKRTRAEVGENFIIIYRLSMLDLVEGGSTLEEVIQLAKEIEKAGATIINTGIGWHEARIPTIATKVPRAAFTWVTKKLKGSVQIPLVTSNRINTPEMAEHVLAQGDADMVSMARPMLADAEFVLKAEQGRSDEINTCIGCNQACLDQIFSMQIATCLVNPRACYETELIFKESAVKKNIAVIGAGPAGLSFATYAADRGHQVTVFDAASQIGGQFNIAKTIPGKEEFYETLRYFKRKIELQPNIKLVLNHTATYEELSAENYDDIVVATGVTPRELTIEGIDHPKVLSYIEVLRERKSVGKKVAIIGAGGIGFDTAEYLSHEGESGSLNPQKFYDEWGIDTSYAHVGGLKQPVLEQSDREIYLLQRKAKAVGASLGKTTGWIHRTGLKHRDVKMIAGASYDKIDDQGLHITVNDQPTVLEVDHVIICAGQESYTAMYDQLKADGKNVHLIGGAKEAGELDAKRAIRQGAELAATI >NZ_CP043307.1|WP_004981883.1|1303535_1303949_+|nuclear-transport-factor-2-family-protein MSLATTKQALVRWHDMVTTRDMSILNELLAEDVVFRSPVAFNPYPGKQVVFFILSNVIQVFENFTYHREFFTEDGLSVVLEFSANVGEKKLKGIDMIRFNEQGQIVDFEVMIRPKSGLEALAVQMGQRMAAFAPQAG >NZ_CP043307.1|WP_148825866.1|1304030_1305107_+|alpha/beta-hydrolase MNAVFSLLNQLSQTAWDRVTGAEQPKLYINPKGQIQETVGALTQLQEKYRPTPWLSNTHAHLLYFDVIRKRRIQLEYDHFDQLEMQDGGVTGIMWFGYDLPEATPTVVVMHTITGSPESMREVVRDLNRYTGWRVALCLRRGHADLPMPVPKMNLFGSTDDLREQIAFIQSTFPSSTLYAVGSSAGTGLLVRYLGEEGSQTPFKAAFALCPGYNTELGFVNVHPFYSKVMTKKLFKKFIFPYQQTWQETASVSQVLMTKTLAEFESSYYEMAGYVDYDSYKQATNPIYVFENVTIPLLILNAEDDPVCHIKNFEPYKDMIRQMPNIAVVTTKKGSHCGFYEGVLNTESWATKLIADFL >NZ_CP043307.1|WP_148825867.1|1305184_1306354_-|MFS-transporter MKINFPLLALAVGAFAIGTTEFSPMGFLPEIANDLSVSIPQAGLLISAYAVGVMIGAPLMTLWLTRFPKKTALILLMAIFTIGNVLATVAPDYMSLMGARLITSLNHGAFFGLGSVVAASVVPKDKQASAVAMMFMGLTIANIGGVPLATWLSQNTSWRMAFAAISILGIITMLALWKALPQDHDVVKPNVAKELRVLTRAPVVLALLTTVMSAGAMFALYTYIAPSLHVFMQASPQTITLMLVLTGIGFSIGNHLGGKFADLSLEKTLIGFLVLLMVMMLVFPVLAQTTVGAAIGLVIWGAAAFAVVPPLQMRVMSVAADAPGLASSVNIGAFNLGNALGAFAGATVLSMQLSYAAVSYAGAALSFMALILVLLQMKFGLSKKACEAV >NZ_CP043307.1|WP_148825868.1|1306362_1307169_-|2,5-didehydrogluconate-reductase-DkgB MNIVPQFGLGTFRLTGDTVIESVKTALEVGYRAVDTAQIYGNEAEVGQAIELSGINRQDLFLTTKIWTENFSAEKLIPSLKESLHKLKTDTVNLTLIHWPAPSTDVNITELMQNLLQAKQQGLTEHIGISNFNIELTQQAIESIGLENIATNQIELSPYLQNHQLVDFLQAQNIDVTSYMTLAYGKVLNDPVLMHIAQQHQVSTAQISLAWALQRGFAVIPSSTKREHLMSNLKAQEIQLSSEEMMEITQLDRNQREVSPEGLAPIWD >NZ_CP043307.1|WP_094148194.1|1307279_1308170_+|LysR-family-transcriptional-regulator MKSTIEELTAFVSIVDSGSIVKAAQQLDQTTSGVSRALQRLESKLNVTLLERTTRKLKLTYEGQQFLTKARKILLDLTEAEESLQNNDAEASGLIRIDSATPFVLHVIVPLIEEFMQRYPKIDIEITNHDQVIDLLEHKTDVAIRFGELADSSLHAKLLCKSRLYIVASPVYAQKHGLPKNAAELSSHTLLGFSQPAHLNTWPIQLEDEPLTIQAKIKCSNGETVRQLALQGAGIACLSRFMVEQDIQDGQFIALLEDQIQIKEQKIHAVYYQQNYVPKRIRLFIDFLAEKLKAYL >NZ_CP043307.1|WP_148825869.1|1308230_1308632_-|internalin MNKKLLICGAIAAGLLLTACVKKEAPQEDEQEQVEVVTTEQQQTVELQPLAASEPEIPAQVEVIREETPNTTTEIRRETPAPAPAAQPAPKAEAPKAEEKPTQARPSNTNPNTQTEDDAVAAAIAAATPALEN >NZ_CP043307.1|WP_148825870.1|1308858_1310499_+|CTP-synthase MTHFIFVTGGVVSSLGKGISAASVAALLEARGLKVTMVKMDPYINVDPGTMSPFQHGEVFVTEDGAETDLDLGYYERFLRRAKMTKLNNFTSGRVYQDVLNKERRGDYLGGTVQVIPHITDNIKERVLRAGEGYDVAIVEIGGTVGDIESLPFMESVRQLMVELGHKRTMLMHLTLLPYIKSAAELKTKPTQHSVKELLSIGIQPDILICRTEYDVDADTTRKIALFTNVEARAVVVCKDARSIYQIPRTFYEQNVDDLICERFGFNDLPEADLTDWDNVVEALLNPEYTVRVAMVGKYVELPDAYKSVNEALLHAGIQNRVKVQIDYVNAEEIESQDVNEVLKDMDAILVPGGFGERGTEGKMQAIKFARENGVPFLGICLGMQLAVIEYARNVVGISDASSTEFNRSTKSPLIGLITEWLDERGEVQQRNVDSDLGGTMRLGAQKSELVEGTKTREVYGSADIIERHRHRYEMNNRFIPALEEAGMKISGYSPVQHLVETVEIPQHPWFIAVQFHPEFTSSPRDGHPLFASFIDAAKAQYKKAK >NZ_CP043307.1|WP_005401052.1|1310530_1311388_+|3-deoxy-8-phosphooctulonate-synthase MSQLKPQEIVRLGDIQMANHLPFVLFGGMNVLESKDLAFEIAETYVDICKRLEIPYVFKASFDKANRSSLNSFRGPGLEKGIEWLADIKKHFNVPIITDVHEPYQAAPVAEVADIIQLPAFLSRQTDLVEAMAKTDAIINIKKAQFLAPHEMRHILHKCLEAGNDKLIICERGSAFGYNNLVVDMLGFDIMKEMNVPVFFDVTHALQTPGGRADSAGGRRAQITTLARAGMATGLAGLFLEAHPDPEKAKCDGPCALRMSQLEPFLAQLKELDTLVKGFKKLDTH >NZ_CP043307.1|WP_094148196.1|1311448_1312738_+|phosphopyruvate-hydratase MSQIVDIRAREILDSRGNPTIEADVILASGVVGRACAPSGASTGSREALELRDGDKARYLGKGVKTAVNNVNTIIRDALVGKSVFEQKDIDNTMIELDGTENKEKLGANATLAVSLAAARAAADEKKIPLFQYIADLRGQTILTMPVPMMNIINGGSHADNNVDIQEFMIEPVGFTSFSEALRAGAEIFHSLKSVLNKKGLNTAVGDEGGFAPNLRSNEEAITVILEAIGQTGYKAGSDIMLALDCASSEFYKNGQYILAGEGNKAFTSNQFSDYLAGLVNQYPIISIEDGLDESDWEGWSYLTSILGDKIQLVGDDLFVTNPKILQRGINEKVGNSILIKYNQIGTLTETLDAIYLAKENGYSTVISHRSGETEDSTIADLAVGTAAGQIKTGSLCRSDRVAKYNQLLRIEELTNAAYRGKAEFKGLS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP043307_2 | 2.1|1301210|25|NZ_CP043307|CRISPRCasFinder | 1301210-1301234 | 25 | NZ_CP021332 | Maritalea myrionectae strain HL2708#5 plasmid pHL2708Y3, complete sequence | 138270-138294 | 4 | 0.84 |
1. spacer 2.1|1301210|25|NZ_CP043307|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021332 (Maritalea myrionectae strain HL2708#5 plasmid pHL2708Y3, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
aacaaatctcgattataaagataaa CRISPR spacer cacaaatattgattataaagataat Protospacer ****** *.**************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
905568 : 911785
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP043307|905568:911785|DBSCAN-SWA TATGAATGATGAATGCATGGCTAAATTGGCCGAGCAATGGGGGAAAATTTGCCAACATTATTCAGTGAATGATCACGTTAAAGCGCAAAATTTTATTCAGCAGCATTCGTCTGTATTGGTTAATGAATTTTATAGCAATATTGTCTTGGAGCCTGAGGCTGCAGATTTTTTTAAAGATGACATCATTCAACAACGTTTAAAAAACAGTTTAAACCAATGGCTCATTGAAAGTTTCGACGTGGCTGTGAATGAAGCTTATTATGCAGCAGTTGAAAAACAACAAAAAGTTGGGCAGGTACATGCGCGGGTGGGCATTCCTTCTTGGTTGATCATGCGCGGTATTCGCGAGATTGAAAACAAGATCTTGGAACTCTTGGCTGAACTTCCGCTGGAAAATAACCACCACATGCTGAGTTATATGCTGCAAATTATGGGCTTTGCGACAGAAATCATGTGTAGATCCTATGAAGCCAATACAGAGCGAAGCCATGAAGTTAAGCATAGCTATCGTTTATTTTCTGCAATGCAAGATGTCGCAGTACAAAAAGATAAGCAGCGCAGTATTTTGCTTGACTGGGAAAATGAGTTGATGTTCAAAGTCTTCTCCGAGCATCCGCAGTTACAACACATTGCTTTGTCTAAGTCGGAATTTGGTCTATGGTTTGTGCATAAAGCAGCGTATGCCTTTACGGGTGCAGAGCAGGTTGAGACCATTATCAGGCTGATTCAACAGGTCGATACCCTCAATTTTGACGTGCTCGACTGTCAGGATCAGACTCAGAAGGTAGAACGCATTCAAGAAATTCGTGATGTGAATCGACAGATTCAGCATTTGGTCGATCAACTGTTTCAAGTGACCGAATATATAGATTCAGGCAATGACTCGCTGACTCAGCTGTTAAACCGTCGATATTTAAGTACGATTGTGTCGCGTGAAATTAATTTTTCCCGTAAAAATGATGCTGCGTTGAGCTTACTAGCAATTGATGCGGATTATTTCAAACGTATCAACGATAAATATGGGCATACCGCAGGGGACTTGGCACTGCGTTTTATTGCTGAAGTCTTGTTAGATGTTGCGAAGGGTAGTGACTATGCCTTCCGTGTCGGTGGCGAAGAGTTCTTATTGCTGTTGGTCGACAGTGATCTCACACGTGCTTTACAAATTGCTGAAACGATTCGCATGCGGATACAGGAAACCCCAATTCGTACCGCTCATGGGCAAAGTTTTAGTTTTACCGTCAGTATTGGTTGTACGGTTTATAATGGTCATCCTGACTATCAACGCTTTTTAGACACTGCCGATTCGGCACTCTATGCCGCCAAAAATAAAGGGCGTAACTGTATTCATGTGACTGAAAAAGTGCTAAGTGTTTAAATCTCAGACTTAAACACGAGCTGTTCTAAGACGTTTCCAATCGGTTGTTGAGGTACTTATACCTCAACAATCACATAGTATTTTTTAACAGCTTCAACCACTTCAAATGTGCCGATAAAACTCGGTGGAATAATTCCTGCCTGACCGGCCTTGACTTCAATGAAGTCTTGAGTGTGGGCATCATGAATACGGATGCTGCCTTCCATCACTTGAAAGAATTCTTGTTTATTGTCGGCAAATTGAATATTCCATGAACCAACCTCACAGTGCCAAATCCCGCAGCCCATGTGTGGGTGTTCATATAGACTATAGGTCTGGCGCTGTGGATTGCCTTGAACCAAACGGTCTGGACGTGGAAAATCAATACTCTGTTCGCCTTGGGTCAAACCATGACCTGCTAACCAAATTGCTGACATTGCGTATTCCTCTAAACAAAAAATGAATCGTTCAATGATATATGCATAAAAAAAGCCCCAACAGAGGTTGAGGCTTTATGTTTCAATTAATAGCTTTCAGGGACTGCACTTAAAAACTCACGACGCTCTTCTTTATTGGTTTTAAAGTCACCAATAAAGGAAACGGTACGTGTAGTCGATTCTTGCTTGCCGACGCCGCGCATCATCATACACATATGTGCTGAATCAATCATAACAGCCACGCCACGTGCACCTGTCACTTCTGCAACCGCTTCTGCAATCTGCTGCGTCAGGTTTTCTTGAATCTGTAGACGACGTGCAAACATTTCGGTGATGCGTGCAAATTTAGAGAGTCCAAGGACATTGCCTTCAGGTAAATACGCAATATGTACGCGACCATAAAAAGGCAATAAATGGTGTTCACAGAGTGAATAAAACTCGATATTTTTAACCAGTACCATTTCACGGTTGTCCGATGGGAACACCGCATTATTGGTCACTTCTTCTAAGCTTTTGCTATAACCAGACGTTAAATACGAAAAAGCTTTAGCAGCACGCATAGGCGTATCGAGGAGACCTGGACGGGTTAGGTCTTCACCAACGGCAGTTAAGATGTTAGCGTAGGATTGCTGCATAGACATAAGACGTGTTCACTTACACTGATATTGAACAAGGACGGCATTGTAGCAGAAAACTATTCCAATGCCTTATTTTGGACAAAAATCCGATTACTGTTTAAACTTTGGGTTCTTTTCAGCACGTTTTAGCAACACTAAAACTGCACCTGTACCACCTTGCTTCTCTGGCGCACTCACAAAAGCCAGCACATCGCGGTGTTGACGCAGCCAACCATTCACATATGTTTTTAAAATGGCTTCCGGACCTTTGCCGTGCACAATTTTAATGACATTTTGATTTTCATCTTTGGCCATTTGAATGACTTGTAAAACTGCGACACGGGCTTCTTCAACGGTGCAACCATGCAAGTCGACTGCTTCAAACCAACGGATGTTACCCGCTTTTAAATCTTCAAATACTTTGTGTTGCAGCGTAGCAATGCGATAACTGAGCGCGGCTTGGCTTGCTACAGGGTTGAGCATCGCTTGAGTATCGGACAGCTCAGTTGCATCGGTATGCATTGGGCCTTCAGCCGCTGCACGTTTTGCTAAAGTTTGTGCATCGATTTTTTTCTTTGGATTTTTTTCTATTTTGGCAATGTTTGCGGTCTCCATTTTGTGGACACCTTGCATTTGTTTTTGAAACAACGCGAAATCATCTTCTGGCTCGGGTGGAGCAACTTGAGCTTGGGCCTCAGACTGCTTGATGGCAGTCGAATGCGGATTGGTGATTTGCTTTTTAAAGTCTTTCAGTAAATTAAACTGCTCTTTAGAAAGCGATGAATCGTGTTTGCTCATAGTGTCAGAAAAATACGCAAAATAAGAAATTAGGCGATAATTATAGTCTGATTTTCCCTATATTTGAACTGAATTGCATCATGCATAGAGGGTTGTATAAACTGAAAGCAGTGTTGAAGCTTTGATCGGCAGTTCTGGGCTTGAGGCCTTATATAGCTGAATACTTAATTTATTATCACACCTAAAAACATAGAAAATGAGGTTTTACAGATGTTTCCATGTGCTAGTGTTTTTAGAATTTAGCTATAGAAACGTGAAATCCAAATTTTAGAAAAATTAAGCCGTGGCTGTACCGATGCTGAAATATCTGAGTCGATTTTTTTGTCCATCAATACGGTGAAATGGCATCTGCGTAAAATCTATAACAAGTTGCAGGTCCGCTCTCGAATGGAAGCGGTGAATGAAGTCAAGAAGCAGGGTTTCATTGAGTAATTTAAAATTGAACAATTTTTTATATGTTACTGTTTAAGCAGATCTTCAACAGCTTTTTGAAAGTGCAAATCATAAAGTATTCAGGGCAAGAGCATGCCTTACCCTGAATATGCGATTAAAGTGATTTAGGTGTTCCAAACAGCTCAGTAAAGGCGTGGTCTGGACGCGGCTGCTTCATAAAACTTTCACCGACCAAGAAAGCATGAATGTCATGCTCTTGCATCATTGCCACATCTGCAGGAGTCGCAATCCCGCTTTCCGTGACCAGTAGACGAGATGGTTCAAGTAGTTTTTTCAGACGAATCGAGGTGTTTAAGTCCACATCAAAGGTTTTTAAGTTGCGGTTATTGACACCCAATACGCAACGCTCAGATAGACGTAAAGCACGTTCAAGTTCTGCTTCATCGTGTACTTCAACCAAGACATCTAAATTCTGCTCAAAAGCCGTTTTAGACATTTCTTCGAGTTGTTGATCGGACAAGCATGCCACAATCAGAAGAATACAGTCCGCATGTAAAGCTCGTGCTTCAATCACCCCATAAGGGTCAATCAGAAAGTCTTTGCGTAATGCAGGCAGGGCACAGTGAGAACGTGCAATTTGAATATTTTCATCGGCACCTTGGAAAAAATCGACATCGGTTAAAACCGATAAACATGCTGCACCTGCGGCTTCGTATTGCTGTGCGATTTCAGCAGGATCAAAGTTTTCACGAATGATGCCTTTAGATGGCGAAGCTTTCTTAATTTCAGCGATCACACCCGGTTGTTTGCTCAGTAAAGACTTTGCAAAACCACGCACAGGAGTTGCCTCAAGTGCCCATTCTTCAACATCTTTATAGCTACGTTGTTTGAGGCGTGCAGCAAACTCTTCCTGCTTACGATCCACAATTTTGCCTAAAATCGTATTTGCGATATCTACCATGACAAAATCCTGTCTATCAAGCGTCGTATTGTTTAAGGGTTTTGCTGAATTCAGCAAGGATGCTCATCTTTTCTAAGGCTTGTCCGCCGTAGATGATGTCATGTGCTAAAGCCACGCCTTGCTTATAACTGGTACAAAGTCCAGAGACATATAAACCGGCACCTGCATTTAAAGCAATCATATTGGCTGCTTTTTCACCTTTATCGGATTTGTTTTTACCTAAGGCATCTTTAATTAGGCTTAAACTTTCAGCAGAATCTTGAATGATTAAACCTGTTAAAGTTTGCGATTCGATTCCGACATCTTCAGGTTGAATTTCCCACTCGGTGACGTCGCCATTTTTGAGTTCAGCCACATAGGTGCTTGATGCAAGGCTAATTTCATCTAAACCATCTTTCGAATGAACCACCATGACATGTTCTGCGCCCAGTTGTTTCATCACTTCTGCAATAGGACGGCATAATTCAGTCGAAAACACCCCAATCACTAGACGTTTTACTCCAGCCGGATTCGTAAGCGGGCCAAGTAAATTGAAAATACTGCGAATGCCTAATTCACGACGCGGGCCTACCGCATACTTCATCGCTTTATGATGATTTGGAGCAAACAAGAAACCGACACCCATTTCACGAATACAACGTTCAGTTTGTTGCATGTTTAAGTCAAGTTGGATGCCCGCTTGTTCTAACAAGTCCGAGGAACCCGATTTGGTTGAAACACCACGGTTACCATGTTTAGCAATGGTTGCACCTGCCGCTGCAATCACAAAAGCAGATGCAGTCGAGACGTTAAATAAGTTCTGACCATCACCACCTGTACCGACGATGTCGACTAAATAAGGCACATCACTGACATCAATTTTGATGGCAAACTCGCGCATGACACGAGCCGCTGCGGTAATTTCATCAATACTTTCACCTTTTAAGCGAAGACCCATCATCAGCGCACCAATTTGGGCATCTGTTGCTTCACCATTCATGATGGTGCGCATGACGTCTTCCATTTGCGGCTGCGTCAACTCAATATTTTTAGTGATGTTATTTAAAGCTTGTTGCATATTCATTTTTCACTGCACTCATTTATGCGTAAATTTCTAAAAAGTTCTTAAAGATTTGATGGCCATGCTGACTCAAGATTGATTCTGGGTGAAATTGCACGCCTTCAACGGCAAGCGTCTTATGCTTTACACCCATGATTTCTTCAATTGAGCCATCTGCTTCATTGGTCCAGCAGGTCACTTCTAAGCATTCAGGCAAGCTTTCTTGATCAATCACCAGTGAGTGATAACGCGTTGCTGAAAACGGGGAAGGGAGGTTGCTAAAAATGCCTTGATTTGAGTGATGCATGTCAGACAAACGCCCATGCATCACTTTTTTGGCACGAATGATTTCGCCACCAAATGCTTGACCAATGGCCTGATGTCCTAAGCACACCCCTAATAATGGAATTTTTCCAGCAAAATGCTGAATAGCTGGAATAGAAATTCCTGCTTCCGAAGGTGAGCATGGACCGGGGCCAATCACAAGATACTTAGGTTGCCATCGCTCAATATCCTCCAATGTCACGGCATCATTACGTACTACTTTTACTTCTTGATTTAACTCGCCAAAATACTGGACGATGTTGTAGGTAAAAGAGTCATAGTTGTCGATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP043307|905568:911785|909323_910130_-|WP_062034010.1|DBSCAN-SWA MVDIANTILGKIVDRKQEEFAARLKQRSYKDVEEWALEATPVRGFAKSLLSKQPGVIAEIKKASPSKGIIRENFDPAEIAQQYEAAGAACLSVLTDVDFFQGADENIQIARSHCALPALRKDFLIDPYGVIEARALHADCILLIVACLSDQQLEEMSKTAFEQNLDVLVEVHDEAELERALRLSERCVLGVNNRNLKTFDVDLNTSIRLKKLLEPSRLLVTESGIATPADVAMMQEHDIHAFLVGESFMKQPRPDHAFTELFGTPKSL >NZ_CP043307|905568:911785|905568_906945_+|WP_010327245.1|DBSCAN-SWA MNDECMAKLAEQWGKICQHYSVNDHVKAQNFIQQHSSVLVNEFYSNIVLEPEAADFFKDDIIQQRLKNSLNQWLIESFDVAVNEAYYAAVEKQQKVGQVHARVGIPSWLIMRGIREIENKILELLAELPLENNHHMLSYMLQIMGFATEIMCRSYEANTERSHEVKHSYRLFSAMQDVAVQKDKQRSILLDWENELMFKVFSEHPQLQHIALSKSEFGLWFVHKAAYAFTGAEQVETIIRLIQQVDTLNFDVLDCQDQTQKVERIQEIRDVNRQIQHLVDQLFQVTEYIDSGNDSLTQLLNRRYLSTIVSREINFSRKNDAALSLLAIDADYFKRINDKYGHTAGDLALRFIAEVLLDVAKGSDYAFRVGGEEFLLLLVDSDLTRALQIAETIRMRIQETPIRTAHGQSFSFTVSIGCTVYNGHPDYQRFLDTADSALYAAKNKGRNCIHVTEKVLSV >NZ_CP043307|905568:911785|907447_907996_-|WP_171054237.1|DBSCAN-SWA MQQSYANILTAVGEDLTRPGLLDTPMRAAKAFSYLTSGYSKSLEEVTNNAVFPSDNREMVLVKNIEFYSLCEHHLLPFYGRVHIAYLPEGNVLGLSKFARITEMFARRLQIQENLTQQIAEAVAEVTGARGVAVMIDSAHMCMMMRGVGKQESTTRTVSFIGDFKTNKEERREFLSAVPESY >NZ_CP043307|905568:911785|911209_911785_-|WP_171056750.1|DBSCAN-SWA MIDNYDSFTYNIVQYFGELNQEVKVVRNDAVTLEDIERWQPKYLVIGPGPCSPSEAGISIPAIQHFAGKIPLLGVCLGHQAIGQAFGGEIIRAKKVMHGRLSDMHHSNQGIFSNLPSPFSATRYHSLVIDQESLPECLEVTCWTNEADGSIEEIMGVKHKTLAVEGVQFHPESILSQHGHQIFKNFLEIYA >NZ_CP043307|905568:911785|908089_908776_-|WP_148825677.1|DBSCAN-SWA MSKHDSSLSKEQFNLLKDFKKQITNPHSTAIKQSEAQAQVAPPEPEDDFALFQKQMQGVHKMETANIAKIEKNPKKKIDAQTLAKRAAAEGPMHTDATELSDTQAMLNPVASQAALSYRIATLQHKVFEDLKAGNIRWFEAVDLHGCTVEEARVAVLQVIQMAKDENQNVIKIVHGKGPEAILKTYVNGWLRQHRDVLAFVSAPEKQGGTGAVLVLLKRAEKNPKFKQ >NZ_CP043307|905568:911785|907001_907361_-|WP_010327244.1|DBSCAN-SWA MSAIWLAGHGLTQGEQSIDFPRPDRLVQGNPQRQTYSLYEHPHMGCGIWHCEVGSWNIQFADNKQEFFQVMEGSIRIHDAHTQDFIEVKAGQAGIIPPSFIGTFEVVEAVKKYYVIVEV >NZ_CP043307|905568:911785|910146_911193_-|WP_004695696.1|DBSCAN-SWA MNMQQALNNITKNIELTQPQMEDVMRTIMNGEATDAQIGALMMGLRLKGESIDEITAAARVMREFAIKIDVSDVPYLVDIVGTGGDGQNLFNVSTASAFVIAAAGATIAKHGNRGVSTKSGSSDLLEQAGIQLDLNMQQTERCIREMGVGFLFAPNHHKAMKYAVGPRRELGIRSIFNLLGPLTNPAGVKRLVIGVFSTELCRPIAEVMKQLGAEHVMVVHSKDGLDEISLASSTYVAELKNGDVTEWEIQPEDVGIESQTLTGLIIQDSAESLSLIKDALGKNKSDKGEKAANMIALNAGAGLYVSGLCTSYKQGVALAHDIIYGGQALEKMSILAEFSKTLKQYDA |
7 | Acinetobacter_phage(83.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1157914 : 1168979
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP043307|1157914:1168979|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP043307|1157914:1168979|1163873_1164539_-|WP_062033552.1|DBSCAN-SWA MQQMWTEIDNYIDAHLIPEDPILLQTLENTEKHGFPDHLAVAPNQGMLLQMLIQMNQCKRVLELGTFAAYSTMWLARALPEDGYILTIEGRDTHAAMGQENIDKAQLKQTVELKCGRAADILKSLPADIDPFDFIFIDADKQSYPEYLELSLNLSHSGTLIFLDNVIRAGDIINPENHKPSIEGIRDMFKAMQNHPKILSCTALQTVGSKGHDGFALAIVK >NZ_CP043307|1157914:1168979|1165524_1165848_-|WP_004696359.1|DBSCAN-SWA MTFVVTENCIKCKYQDCVEVCPVDCFYEGPNFLVINPDECIDCALCEPECPANAIFSEDELPEGQEVFIELNAELSQTWPNITQIGDQPADREEWNGKADKLQYLEK >NZ_CP043307|1157914:1168979|1162889_1163732_+|WP_004696353.1|DBSCAN-SWA MKRVIACIDSSPCINALAEAAAWIAKQTGRELVLLQVLDYYPASYHLGEISGVIGFESNAMLLKELAELEQKQSELALSYSNNLLDHISKLILETHGLHTTHIQEKGDFLEQSFNLLHEDDIVVIGRVGEKSAERNKPLGSNVENFIRGANCTVMTVGDSFKPPTRFIFAYEYSPTCVKMMKRIAQSDLLRLLQCHLVYVGDHPEILREPEQYLKDANLDVITEYRYGDVAENILEYQNEHGIQLIVLGAFSHSKIHQFFLGSIATTIFRNAKVPLLVAR >NZ_CP043307|1157914:1168979|1157914_1158892_+|WP_058869901.1|DBSCAN-SWA MSNPIDFQKVALETLEIERQALSVLAQQIDDRFSRACEIILKCKGRLVITGMGKSGHIGRKMAATFASTGTPSFFMHPGEAGHGDLGMLVAGDVLIAISNSGKSDEIMMLMPLIKYLGVPLITISGDERGPMPQNADVALTLGNIQEACPLGLAPTSSTTATLALGDALAVALLDARGFTSDDFARSHPAGALGKRLLLHVKHLMHTGDELPKVSPDTAMNKVLYEISNKRLGLTTIVDDNDHLLGIFTDGDLRRLIDKQQGFDVNLAVSDVMIKSPLTISPEARAVEALERMNEKKINQFVVVDESNKVIGVLSMHDLIQAGVN >NZ_CP043307|1157914:1168979|1160567_1161314_+|WP_004696348.1|DBSCAN-SWA MEQTLNQPQTLCIKHLAKNYSKRWVVKDVSFSMQSGQIVGLLGPNGAGKTTSFYMVVGLVRMDKGEIHLDDLDMSDLAMHERARKGIGYLPQEASIFRKLTISENIMSILETRKDLNKEQRKQRLHELLADFKISHIKDSLGMSVSGGERRRAEIARALAADPKFMLLDEPFAGVDPISVGDIKDIIRTLKDRGIGVLITDHNVRETLAICERAYIVSEGAVIAEGSPDEILANETVRQVYLGDDFTV >NZ_CP043307|1157914:1168979|1166345_1168979_-|WP_148825798.1|DBSCAN-SWA MSNSGIITDLSTLTPMMQQYMGVKMQHPHSLMFYRMGDFYELFFEDAHKAAKLLGITLTHRGKANGEPIPMAGVPYHAAEGYLARLVKKGETVVICEQIGEVTGKAPVERGVVRIITPGTLTDDALLTAHQSSNLVALCVQQNEIGIALLDLSAGLFKVQQQEFQLEQLGIELSRLMPSEILVDENIVDPNIIEHIKKLLDCPVTRRPNVDFNLNNAQKTLCDQFAVSTLAGFGIDHLPLAKAAAASLIHYAKETQKTALPHIRSIQLEQSSDFIALDPVTRKNLELVEPLFEHGTSLFQLINDCQTAMGGRLLSRTLMQPLRDTKLLDARLDATKSLVDGYHESPVRLVLKEIGDIERVLSRVALGNARPRDLVQLRQACAQVPYLRHAIQPVIQSKQSALITQLNEELGDFHGLHQRLMSAIVEHPPVLLRDGNVIAEGFDQELDELRKIRDHAGQYLIDLEIQERQNTGISTLKIGYNRVSGYYIELTRAQAEQAPDHYIRRQTLKNAERYITPELKTFEDKVLSSESRALAREKMLFEMLLDELRADIGHLQMMSSAIAQIDLLANFAHQARLRNWSRPEYSPEIGVKIIAGRHPVVEALNKATFTPNDTTLDFNHRMAIITGPNMGGKSTFMRQTALISLLAYCGSYVPAQSAVLGPIDRIFTRIGSADDLSTGKSTFMVEMTETSQILHHATNQSLVLMDEVGRGTSTYDGLSLAWACVLDLTKRIKCLCLFATHYFELTELAKETAIDNYHVTAKELNGNLILLHKVQHGPASQSHGLQVAKLAGIPASVIKEAQNRLKILEKQQLQKPKVVQNDLFAVIETPELEIIERVVEIEKPSAALELLKSIDVDNLSPREALQQLYALKDQLHS >NZ_CP043307|1157914:1168979|1164672_1165392_-|WP_148825797.1|DBSCAN-SWA MKKFLKGLFAVSIIPLVMIGCTTSSHKGKTITTPDGKRIFIPQEKISFDRPALPKIIPYTYNAWMSVGDTLARVREYEVFLERNGVGNIIPSFELLRTARDWQKCGRSQYMIPNRELWKNQIATLKVFKYLVAAKVLTDFEVTSVYRDLPLNQCAGGANSSRHLFNSAIDFRIGSENPQPEDYAYIENTKYRLCQFWTQHGQSLNMGLGLYASGQIHIDTQGYRTWGPDLSRNSSMCSY >NZ_CP043307|1157914:1168979|1160001_1160568_+|WP_148825794.1|DBSCAN-SWA MNHNLKFSISKTFLKQTLALSLGVAVSTFALALPSDRSKAISLVADRATFNEKTGVTTYTGNVIIEQGTMKLQADSIVANLNQTRQISTITANGKPARFQQQVSTNKGIAKGHAQKIIYNAETGIITLSGSALLEQDGASIRGNTLRYSMNKGDIEAIGTPNNSGSSSGRVQIVIPPSSSQSFPGARD >NZ_CP043307|1157914:1168979|1159469_1160012_+|WP_148825793.1|DBSCAN-SWA MDTKVLYITAVAIAAISSGYYYYSGKGQKLEVDGAQSMTYSAEQIQLTQTDEQGNLYVRAKVDRLEQDMQKKTSKLENLNAEMYKDGKVDATFYAKQANGINDNEKVVLTNQVVAKKMLDQGQMQFETAEMTAFPQTRELESQHQVVVTTPQSQFVSQGLKANLNTGQYDFFHIRGKYEP >NZ_CP043307|1157914:1168979|1162149_1162761_+|WP_148825796.1|DBSCAN-SWA MTDPLLKYREQHKHRLSYMPWLYWSLKPKNRVWAEAWQQEYQAYLMEMETVEIGQNCFISPLAHIFAEPGRKIVIGDNTFIAADCTLHGPLEIGNEVAINHHCILDGGRVGIKLHDQVRIAAYCHLYAFDHGMALSDPIYQQPVRSQGIEIGRDVWLGAHVGVKDGVKIGAHAVVGMNSMVTKDIAEQSIVAGNPAQFIRLRD >NZ_CP043307|1157914:1168979|1161560_1162157_+|WP_148825795.1|DBSCAN-SWA MPFTISSLVSYEEDIKKSRFQAFAVPVENEQAVKDFLEQYKDIGTTHQCWAWKIGHNVRFNDDGEPSGTAGRPILATIEGNELTNVLVLVNRWYGGVKLGTGGLVRAYGGTAGQCLLLAEKIELIEKKKVHFACQFNEWAIFRYELNSQQIEFNEQYTADGVLVEALLQVHQIEALRLKIQDLTRGREALKIVDDHYD >NZ_CP043307|1157914:1168979|1158895_1159435_+|WP_004982122.1|DBSCAN-SWA MASYILLEQARYVEALVLDVDGILSDGFVTLTNSGDEIKSFDIRDGLGMKLVQQAGVKVIIITGRKSQIVEKRMSDLGVDLVYQGREDKGVALREACAKFGISPEDCLYMGDDWPDLSAFAIAGMKVTVPNGHLEVRRRADLVTQAMGGRGAVREICDMILQAKGVYETLLEKYTAVPH |
12 | Tetraselmis_virus(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1295460 : 1355440
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP043307|1295460:1355440|DBSCAN-SWA 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57 | Staphylococcus_phage(10.0%) | protease,transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1735193 : 1772547
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP043307|1735193:1772547|DBSCAN-SWA 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53 | uncultured_Caudovirales_phage(40.74%) | protease,portal,tail,head,terminase,integrase | attL 1745136:1745151|attR 1774930:1774945 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2019844 : 2025829
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP043307|2019844:2025829|DBSCAN-SWA CTTATGAAATAAACTTCAATGTATAAACCACCCGCCCTTCAACTGTTTCAATCGAAACCACTTCAAAAGACAGCCCCATCGGAATCAGTACACCGTTACCAGCATTCAGCATGTCCAGATCAATACCGAGCCCTTGAGCATTCTCAATCTTAATCACGATATCTGAAGCTGTATCAGCCATCAGCAACGGCGCATTCAATTGAACTGTTTGCCCTACCTGATAAGCCGCTACTTGATTAAGAGTTGCAGCACCTACTACGGTTGAAGCGGTATTACTCGCCACGGCGTTTAAGGCTTGCATGTCCTGTGTGAGCCAATGTTTTAAAACATCGTCCGCTTTCGAGCTCACAGACGCATTTAGGTAGTTCGTGATTGCTGCATCATTTCCCTGCACGTAATCCAAAAAAGTCTTAATCGCACTTGGTCTAATGGATGGATCTAAAGGAATAACCGTATTGGCTACTGTGTTAAATAAATCTCTCGATCTATCATTCATCGGGGCTAAAAGACTGGTGAGCTTTTTAGATGCAGTCCATTCAGCCTTAATTGCCTCTTTCTGCTCCAGTAGATACTCCTTATCAAGTAATGACTTGGAAATCTTCTGATCCACCAATGCCTCCAATTCTCCAAATTGCAGAGGATGTGAACTCCAATCCAAAGCTTCGGCAACCTCTGGCAACTTGTCATCAGGTGTAATGCCGTATTTAAGCGCTTGGGCTTCAGTTAATGCTATACACGTGCATCTACAGCGAAATCCAGTGGGAGGGTAATGTGTGAGCCAAAATGGGTGATCGATCGACAGTACAATTCGATTCAATGCCAAATGTGCAGGGCGCACACGTGAGTCATTGATAGCCGAATACATCAGATACTGACGTTTATCTTTATTTCGTTGCTGTTGCTGCCAACGTCCATGGCCATAGGCACTTTGGATATTGGTACGGAATACATTGTCTAGGTAGTGCTTGGGTAAAACGATTTCCGATTCAGCCACAAGCTTCTGAAAATCGTTGAAGGTGCCACCTGAAGCTAAAGTTTTGTTAAGTGACTTAATCACCGACTCAGCTTGTTCAAGACTCGACAAAAAACTAACCGTAGTTGCCATTTGCCGTGTCTTAAGATCCATTGAGTAAAACTCATCAGGCAGCACCACTTTCTTACTATGCGCATACTGCAGCGCTTCAAGAAACGTGACTGGTTGCATCTATTTCCCCTTAGCTGCTGTTGCATACCCCAATACATCGGCGGCATATAAAGCCTGATCCAAATGCGCTGTAAATTGCGACTGTGTTGCACCAGGTATTAATCGAGACAAATTGAATAGCAAAGCCTCCGGTGTCTCAGACTCAGCTGCCAATTGTCTAATCTGCTCATTGGTCAATAGCTCAAGTTGATCTTGGGCATCGGTCAGCTCATCCACCTCTTGCTGTTCAGGTGATGGCTTTTGCACTGATGCCTTAAAGCTGAATGCTTGGTGAGGTAGTGCATTAAATTGAGTGTTAGGGACGGTAGCGCTAGTACTCATCTTAAAGTGTTCAGCCTTAATGCCGTATGTCTCAATCACATATTGATCATTAAACTCAACACCTAATGTTTTAAGCTTAATATCACGATCAACAACAGCGACCTTAAGATCCTGCTCACCGCCCAGGACAATTGTGTGCTTTTCAAAGTTATTCAGCAGGCAGAGTGCGTCTATGAGCTCTTGAATCGTAGGCGTGATCATGCGTAGGTCTGAATTACGCTTATCTAAGCGAACATCGTTATGCACTTCACCCAAAGCTCGACTTCCAACACCATCAGTCCCACTTGTGAGCGTTTGGCCTAAGACCACCTTTTGAATACGGCGGGTTAATACATTATCAAAGGCTTCAAATGCTGTGCTGCCACCATTAGAAGAACTTCCACCTATAGTTTCTACCGAATCCTCTGCGCCAATAGACATAACTGATTGTGCATGAGCATTCAGTAAAGCCGCAGTCATCGCATCAATATCATCCTGTTTACGATCTTTACCCCCAACTTTCCCTAATAAGATTGGTGTGCCAAAGCGTTCTAAAAACTTGACCCAAAACTTTGTTGTATTGGTACGGAAGAACCATAGCCAATAAAGCTTCGACAGTAATGGATCACCATAAGGCTGTTTGAATGTAGGTTTACGGCGTGTCAAAAAGAACTTGAGTGGATATTTGGCATTCACATCAATTTCTGTAGCATTTTGTCGGTAAATTAAACGTCCATCATTCTTGGGCTCAAACCATTCTAGAGGCTTAACTACAATCTCATTTAAGGTGAATTTACTATCACTGGTAAGTGCATAGTTGGCTTCCATAACCGAATAACCATAAGGACAAGCTTCCCATGCACCTGAGACGATTTCAGCATGCCAACGAGTGAACAAATCCTTTAGAAAAACCGTTTGTTCACCATGATCTTCAACAAATCGCCACGGCGCATTGAGAACTGCATCAAGACGCGTTTCCATGGCCTGCGCAATCTCATCATCTACCATAAGGACTGATAATCGTTGCCGGGTTAGCCCAGCCTGGCGAAGTACTTCGTCAATATCGGCTTTACGCCCCAAAGTGAATGCAAGGTTCTCAACTGCAACCTCTGTCATCAAGCCGGCTGATTTAGGCTTTGTTTTCTTACTTTCTGACTTCTTTGCCATCTTAAAAACCTTTTAGAAACTTCGTGAACCTCCACCTCCTGGTCTTAATCGTGCAGGTGGTTTGATATCACTAAAACAGATCATGACGCTATCAGCCCGGTTAGGTGACAAGGCACCATCGGGTTGCTTATTTACAAGGATTTTGCCAGCACCGTTTTTACTGTAGGTCGGCTGTGATAACTCACGCTTGAGTTGCTCTAGTTCGCGCTTATCCAAATCTTCAGTCGACAGTGAGATAAGTGCATCAGGATCGTATTGCATGCCTTGTAGTGCTCTGTACGTGTTCTGGAAGCGCATACGCAAACTCCACCACATTTGAGCTTTTAGATTTGCGAAGAAATCGATATTCTTCCGAGCCTCTACCATCTCAAGCTCTGGGTTATGAACTGCGCCCGAGCCCCTGAACGGATCCACTTGGATCTCATCAATTCCTTTAGCACTGTTCTGCTCGTTAATGACTCGGGCATCACCGCGAACACCAGCCCCCAAACCATCAGCATCGTAAAAGAACAAATTCAGTTTTTGCTTTAAGCAAATATCAATCGCCTTTTGGGTTGTTCCAAAGATGTCATTACCAATGCCTGACCACGTATCCAAATACTGCAGAACAATGCCATGACGTGCGGCAAAGGAGTTTTTATCCTTACCCTCATCCGCCACATCAAGTGCACCATTACGCTCACCCGATGGCTGTATATCGAGTTTTAGGTGTGAATCTACAGCAGCCTCAACCCATGCTGATGGAATCAATACACCTTCAACTGAAGCAGCGTAATCAATATCAACCTCTTGAGCTAATACAATGTCGTCAAGCGTCGCAATTTGCTTTTCATACCACGGATGAATCAACTTCCCATGGAGTGAGACAGTCCAGTTTTTATCTGGGTTGTCCCGCCACGCCATCGTAAACACGGCGTAACGTCCGCTGAATCGATCTTGATGAAACTTGTCGCCAATACCGTTTGGCGTTGATCCCTTGATATGAACGTTTGTATTCTGCGATATAGCTGCATCTACAGCTTCTTGACGCTCTACGAATGCCCATTCATCAAGAAAGTACATCGTGGTACGTCCACCACGGCCAATGTTGTCTCCAGCCTCGCCCGTAACGGTCGCACCATTATCAGGATTGATAATACGCATGTAGTTGTCGTGGACCTTTTCGACGAATCCTTTTGGCTTCATCCAATCAGGAAGTTTTGAGAACATATCTCGGAACTTATGCAGCAGCGTTTTGGGGTCACCCTTCTTATCAACCAAATCCTCTTTACGACTACCCACACCACCAGCAAAGCCCTCTACAAATAACCATCGATGCAGATAAAACCCCAGCACAACATAGCTCATACCTTCATCACGACTCTTCTCAATGAGACCATGAGTTTGAGTGCTTTCACGCTCAAGTAACCAGTCGACCAATTCAACTTGACCAGGGCGAAGTACAAAAGGAATATTTGCCGGTAATCCAAAAGGCATCCCCCTTGGATCGTAAGTCCACACCCAATGATTAAACCAATGTGCTGGATCATTCTTGCACTTGTATATCTCTGCTTGAATGCTGAGTTCACTTTGCTCAATTACTGCTCGGTAATAGTAACGTCTGGTCATCTCAGCAATGACTTCAGGCAAACGTGTGTTCATCGTCCACTCTTTGATAAGGGGTGCTATTTCTTCAATTGCGTAACTCATAATTTGCCATTAATTGCTAAGCGAGATAGCTCTTGTGCGGACATCCCAGCAAGCTGCTCAGGGGTATACATAGCGGGGCGCTGGCTGTGCTCTGTTTCAGTTTTAATCGCACCACCATCTTTGCCTGTAATTTCTAACTTACGCTCGTAGTGGCCTTTCACAATCTTTTGAATTTGATCAATCAGCTTAATCGACATCACCACATTGCCTTTCTTGGAAACCAAAAGGTCACTCAAGATTTGCAATTGAATAATGTCGTTTGCACCGATGATGTTGTAGATCGGTTGATCAATATATTTCTGCCGAGCCTCATGGAATAAATCCACTAACTCTTGCGATAGATCTGCACCTGCAGTCTTTGTTGGGTCATAACATTCAACCTGTTGTCGAGACACATCAATCTTGAAATTTTCCTTGACAGCCTCTACTACTAGGGATGGTTCCATAAACTGTGCAAGTGACCGAACAATAAAGATTTTTTCTGCTTTTTTAAGTCTTGCCATTTCTCTCCATCCGTCAAGGTACGTCAAGGAAAGTGGGCAAAAAAATTAACCTATGACACAGTTCCCACAACACGCAGACACATTAAATTTAGACACAAACGGCGCATTCTTTGAGATTTCGACTAAGCGCTTAACAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP043307|2019844:2025829|2022526_2024203_-|WP_148826314.1|terminase|DBSCAN-SWA MSYAIEEIAPLIKEWTMNTRLPEVIAEMTRRYYYRAVIEQSELSIQAEIYKCKNDPAHWFNHWVWTYDPRGMPFGLPANIPFVLRPGQVELVDWLLERESTQTHGLIEKSRDEGMSYVVLGFYLHRWLFVEGFAGGVGSRKEDLVDKKGDPKTLLHKFRDMFSKLPDWMKPKGFVEKVHDNYMRIINPDNGATVTGEAGDNIGRGGRTTMYFLDEWAFVERQEAVDAAISQNTNVHIKGSTPNGIGDKFHQDRFSGRYAVFTMAWRDNPDKNWTVSLHGKLIHPWYEKQIATLDDIVLAQEVDIDYAASVEGVLIPSAWVEAAVDSHLKLDIQPSGERNGALDVADEGKDKNSFAARHGIVLQYLDTWSGIGNDIFGTTQKAIDICLKQKLNLFFYDADGLGAGVRGDARVINEQNSAKGIDEIQVDPFRGSGAVHNPELEMVEARKNIDFFANLKAQMWWSLRMRFQNTYRALQGMQYDPDALISLSTEDLDKRELEQLKRELSQPTYSKNGAGKILVNKQPDGALSPNRADSVMICFSDIKPPARLRPGGGGSRSF >NZ_CP043307|2019844:2025829|2021047_2022514_-|WP_148826313.1|DBSCAN-SWA MAKKSESKKTKPKSAGLMTEVAVENLAFTLGRKADIDEVLRQAGLTRQRLSVLMVDDEIAQAMETRLDAVLNAPWRFVEDHGEQTVFLKDLFTRWHAEIVSGAWEACPYGYSVMEANYALTSDSKFTLNEIVVKPLEWFEPKNDGRLIYRQNATEIDVNAKYPLKFFLTRRKPTFKQPYGDPLLSKLYWLWFFRTNTTKFWVKFLERFGTPILLGKVGGKDRKQDDIDAMTAALLNAHAQSVMSIGAEDSVETIGGSSSNGGSTAFEAFDNVLTRRIQKVVLGQTLTSGTDGVGSRALGEVHNDVRLDKRNSDLRMITPTIQELIDALCLLNNFEKHTIVLGGEQDLKVAVVDRDIKLKTLGVEFNDQYVIETYGIKAEHFKMSTSATVPNTQFNALPHQAFSFKASVQKPSPEQQEVDELTDAQDQLELLTNEQIRQLAAESETPEALLFNLSRLIPGATQSQFTAHLDQALYAADVLGYATAAKGK >NZ_CP043307|2019844:2025829|2019844_2021047_-|WP_148826312.1|capsid|DBSCAN-SWA MQPVTFLEALQYAHSKKVVLPDEFYSMDLKTRQMATTVSFLSSLEQAESVIKSLNKTLASGGTFNDFQKLVAESEIVLPKHYLDNVFRTNIQSAYGHGRWQQQQRNKDKRQYLMYSAINDSRVRPAHLALNRIVLSIDHPFWLTHYPPTGFRCRCTCIALTEAQALKYGITPDDKLPEVAEALDWSSHPLQFGELEALVDQKISKSLLDKEYLLEQKEAIKAEWTASKKLTSLLAPMNDRSRDLFNTVANTVIPLDPSIRPSAIKTFLDYVQGNDAAITNYLNASVSSKADDVLKHWLTQDMQALNAVASNTASTVVGAATLNQVAAYQVGQTVQLNAPLLMADTASDIVIKIENAQGLGIDLDMLNAGNGVLIPMGLSFEVVSIETVEGRVVYTLKFIS >NZ_CP043307|2019844:2025829|2024199_2024706_-|WP_148826315.1|DBSCAN-SWA MARLKKAEKIFIVRSLAQFMEPSLVVEAVKENFKIDVSRQQVECYDPTKTAGADLSQELVDLFHEARQKYIDQPIYNIIGANDIIQLQILSDLLVSKKGNVVMSIKLIDQIQKIVKGHYERKLEITGKDGGAIKTETEHSQRPAMYTPEQLAGMSAQELSRLAINGKL >NZ_CP043307|2019844:2025829|2025352_2025829_-|WP_148826317.1|DBSCAN-SWA MNADDYFWKTKKRPPKTKPRSKPLSKAKEAYLEAEEEFEHALGVLGIKYEKKFQFKSTKHWRFDFHLIEHRVLVEISGGPWSGGRGGKLANKAWSLDRYDDAAEMGYTVVRIESARRYKIDEVGPLQIEANFSSQWLKNLKRQIFNGTDQTIPTDGSH >NZ_CP043307|2019844:2025829|2024751_2025393_-|WP_148826316.1|DBSCAN-SWA MEQIRPFPPTDLIDQAEEEEAIRLAPAVELKEWVIKNYLTIGGHLHNPDHDHISELLHDDETFLAFAWASSACQSKKRMVLGQCEKVMFNQGGWKKARQEQQMRDWFGCVPVYLITIDASFCEQASDHDFCALIEHELYHIGVERDQDDEIIYSDNTGLPKHYLAGHDVEEFYGVVKRWGASETVKRLVEISKNAPFVSKFNVSACCGNCVIG |
6 | uncultured_Caudovirales_phage(66.67%) | terminase,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2028855 : 2045743
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP043307|2028855:2045743|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP043307|2028855:2045743|2036481_2037183_-|WP_115736954.1|DBSCAN-SWA MLEELMLSDGNSSTYNNDFYILVTLIFLPFFVFLDGLTLSLFNFFSAILLASCLICYYFLAFRYNKIYWLKIFLLIIFLSIYLFYFLFFFSFLYNKNNKWSDVSVDNFKKPLIVWIEDKLKELKEDKNLQANDIKVDITEKKEQIEYVEDDYYEEDYDEVVEYEDDESYSDESYHYSSSNSGYHSVEGYTRSDGTEVGGYVRGNPDGIEENNIEYMRDHGDQNGLEQAYSFLD >NZ_CP043307|2028855:2045743|2040496_2040841_+|WP_148826330.1|DBSCAN-SWA METKLLEPVEIIRGEMGTWTHPIYSNYVSENLDGKEYISRDEWDQLKNHFNIQTVTYWMEGHVNPDEWEKMMDACDISTWDPIAPCGFFLIDIHFGEDDAYALFARNKREIEVA >NZ_CP043307|2028855:2045743|2039707_2040385_+|WP_148826329.1|DBSCAN-SWA MNALILDTETHDLNGYPIEIAYAPCSFEQGVLVINQGEVFDEYFSCPEPIALGALVTHHILETDIAEKPSFDTFKMPQGVQYLIGHNIDYDITAIQKCQPDFTVKGICTLALCRMVWPELPHTLSAMYYHVMDDLELARKHLRHAHNAKADIYFTGVILKTLVEQLGIKDMNSLFIMSETARIPKYITFGKHKGTAVKDLDPSYVTWLLRQDDLDPYLRKAIEVA >NZ_CP043307|2028855:2045743|2037899_2038208_+|WP_125280162.1|DBSCAN-SWA MTTSTQKFSEFISQDEEGNIRMRLGHSTYFEKGRHIYVVNKDGTEQLITLEVHAAKPWIRENFERERTFQRKKNLAIALQRTHIPLRERREYKRRAGWVGAR >NZ_CP043307|2028855:2045743|2030755_2031364_-|WP_148826321.1|DBSCAN-SWA MSNIQLFEQAFAIDFPVEVADMVLQRMSDLYGSAFTKNFEVYADEELRQLACTVLNGLTPADIARGLARMNSEEWCPKNLPTFRSWCEQGGDWWTADMAWAKAMQFESDPQTKLTTLTKRVLDEVRHVLTAEGQKSAHFAFKDIYMDYLRRAKASGKQQEMWVKPKAPKQLDNHERNRTGVPCPPELAARIGKSFNRVGGEV >NZ_CP043307|2028855:2045743|2030501_2030759_-|WP_148826320.1|DBSCAN-SWA MKQQNFSTKQAVKQGERMVLVLKKIIQKSGRTSLKEVTEWMEISPRNANVFVNQLLAEGYLETNSKSPMSLKATEKAKQLFEVKG >NZ_CP043307|2028855:2045743|2038252_2038927_+|WP_058869364.1|DBSCAN-SWA MSIATLILGQSGTGKSTSLRNLDPRNVLLIQVIKKPLPFRSPNWKYITPENKQGSILVSDNPQFIINVINGSKRPIIIIDDFQYVMANEFMRRSSEKSFDKFTEIGRNAWDVFNAAINAHDHKRVYLLSHTEEDAQGKTKIKTIGKMLDEKITLEGMVTTCLQTAVINGQYVFQTKNNGNSTVKSPDGLFETDHIENDLNHVDVAICEFYGIPNPQIQTQDQSA >NZ_CP043307|2028855:2045743|2044363_2045743_-|WP_148826335.1|DBSCAN-SWA MKSRAIQTGFFAVACTMAAVQTQAAPVDFSNLVEQVSPAVVSVNVVKKMTQEELLQQQIPEILKRFFGNQVIIPQQQAPQEKTAYGSAFFISKDGYLLTNHHVVEDASKVTIMFNDRRELDATVVGSDERTDVALLKVNGTNFPSLRTGNVDQLRVGEPVLAIGSPFGFDYSASAGIVSAKMRNMMGETSVPFIQTDVALNPGNSGGPLFNQQGEVVGVNSRIFSGTGGYMGLSFSIPIDVAMDIADQLKKTGKVTRSYLGFNLQDLDRNLAESYNLPKPEGSLITNVQPNSPAQKAGLKAGDIILKFNGTPISRTSELLNYLNRTMPNQTVQLEVLRDDKKRNISATLTTAPDDTPAKSDTVTQSKGPVLGIAIRNLAPTELSQLNVKGGVLIQEVKRGGAAAQSGMAAGDVVTHINNKVVKDTNDFVQAASELKKGQVARVGIIRQGTPAILGMRIQ >NZ_CP043307|2028855:2045743|2035191_2035665_+|WP_148826325.1|DBSCAN-SWA MNDLEIQRLIKIEKVYSSGILRWKTQKKSKRCDCVLHTNGMDGYFVLYARQNEIDTENFSCGIKLVRSGKEDITLLRYNGSAHDHTNVLEREVIDFECHIHMATERYANTGYKIDHYAIRTNEYIDLKGAIECLISRSNIQGLTLSDFITQEGFSFD >NZ_CP043307|2028855:2045743|2040840_2041083_+|WP_148826331.1|DBSCAN-SWA MNNTPMDLNAVLFAQLDRLSNPNLKGGELEAEIQKAEAIEKISEQVIKNNNMRLNAAKLVAEYRGLKNADSVEIPQNLIG >NZ_CP043307|2028855:2045743|2032199_2032868_-|WP_148827091.1|DBSCAN-SWA 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MNKTLTPFNTIKISLGVAAVTIGVLSCGFKTAPQAAQPIVANVAPSEYQLLALRMTGDNHGEAVIRLDGFRVTARFEVEAFQDSYGVPGSEFTAVDVTSLDEVTVSDALGNPYNDFTNHIDHQNFNALIKGYIEKHRLVEAG >NZ_CP043307|2028855:2045743|2031360_2032203_-|WP_148826322.1|DBSCAN-SWA MSQFTPNSFQVPNAFVDDVLCQIGDVAAKLYLIICRKTRGWYKEHDSISLSQFQKMTGKSRPTVTKAIAELIQVGLVIECGSTIHGNTFKLNDECVVGWKMSFPSKNSLLPEGTSKKSLLVKKFNYASKESLPPLVKILYTQKTLSKDTLQNKKINKKSKSVPEQPKAEKLKAEKQNQFDPKSVELPANVNRDLWIQFVDMRNSIKKPLTENAVKLLINKLIDFSVGANQSLESSIIGSYQSVYPPKNTPAPVQQPLERRRFGSQANQPAPMRDVQGECA >NZ_CP043307|2028855:2045743|2030100_2030469_-|WP_148827090.1|DBSCAN-SWA MIGANKPKRGSKRPKVKGEKVQSEGEVILATALRALKIEFEQEFKFHPTRKWRADFHLKGKNILVEVEGGIWSNGRHTRGKGYLGDLDKYNEATMMGYQVIRFSTEQVKSGKAIEQILKLIG >NZ_CP043307|2028855:2045743|2033148_2033649_-|WP_058869369.1|DBSCAN-SWA MQEITLSREAQTAIFKMINQTKGISPKEIAQVTGDSHNTICNYGNVGMPNHLPSLKKLETIMLYTQNPEILKVWAHQMGYALVPVDCDSSKHHELSIFEAMMQHNIKSGKANRVVYEAYEDGVITPAEYEEIHQITQGLIELITAVDQAALKQMQKYTANAQKEKA >NZ_CP043307|2028855:2045743|2042128_2043352_-|WP_148826334.1|integrase|DBSCAN-SWA MAISEAWLKAQLGKDREKIEEFADRDAMSVRITPKGKIVFQLRYRYNGKQHRLDLGSYPNLTLKNARVESDRLRAELEKGLDPKQVRLKEKVSIRDAYTLETLFYEWYEKFCVPNKSSHNEIKRSFEIYVLPNIGKQNSDDISAYQWLSLLEDVAKKSPSISARLLINANQCLKWGQKRGLISVNHLMNVSAKHDLRIEKGVKERALSDKEIYLTWYALKRTKMTYKNKLFLTLLIIYGCRVGELKLAKKSHFDLQEMIWTVPPENHKTGKKSKKPILRPITENIKPYLLEAMEFSQGSEYLFTIDGTTRPLGETSHLTMPNNIFQWLKRHKGVDLEHWSVHDLRRTMRTNMSTIAQPHVCEIMLGHALPKIWGTYDKHDYLSEQKEAYEKWVDRLESIWKNEALDN >NZ_CP043307|2028855:2045743|2041682_2041892_+|WP_148826333.1|DBSCAN-SWA MMDLQHIAQELAEEFAPLVIGQSGTTKTFSAEQASALYHILVSFGYKDECKGLDTKLPFELIDIKKEVL |
27 | Acinetobacter_phage(47.06%) | integrase | attL 2027532:2027548|attR 2043477:2043493 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2504767 : 2562609
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP043307|2504767:2562609|DBSCAN-SWA TTTAAGTGGCAACTTGGGTGTGAGGTCGACCTAAATCTGTAAATTTATTTAATACGGCCACACGTGCATGAATCTCATTGACTTGGCTTTGAAAGTTTCTCGCACGGAGTTTATCGCCTAATAATTTGATGCAATGCATCTTGGTTTCAACTAAACTTCGACGATGATAGCCTGACCAATTTTTCCATATTGTTCTTCCTAAACGTTTAACTGTTCGAAGTAATTCATTTCGCTCTAGCGAGCTGGTCTTTGTATCTTTACAAGGTTTCGCATTTTTTCTTGGCGGAATCACCGCATGTGCTTGTCGGTCTGCAATTACTTGACGGCATTGCTTGGTGTCATAAGCCCCATCAGTATAGACAGAGTCAATCTGCTCATCTTGTGGAATCTGATCGAGTAAATCACCAAGCACTTGTGAATCACTCACATTATTTGTAGTGAGTTGAATAGCGCGTATTTGAAGGGTTTCAGCATCGATGCCAATATGAAGCTTACGCCATTGGCGACGATATTCAGGTCCATGTTTCTTACGTTTCCACTCACCTTCACCTAGAAACTTTAAGCCAGTTGAGTCGACGAGTAGATGTAGCCCATCACTACTTTTTTGATAGCTAATCGCAATATCAATATGTTTTTGTCTTCGACAAAGCGTACTGTAATCTGGTGCGGTCCAATTTAATCCACAAAGTTTAATCAGACTTTGAACAAAACCTGTGACCATGCGTAAAGAGAGTCTAAATAAAGATTTGATCATTAAACAGCATTGAATAGCCGTATCGGAGTAAGTTTGATTTCGACCTTGCTTGTTTTGTGGTTGTGCATACCACTGAGTGTTTGGATCAAACCAAATGGAAATGTTGCCCCGATTAATGAGAGCGCGATTATAGGAAGACCAGTTGGTTGTACGATAAGTTTTAGGAGTAGGTTTATTCATTTTGAAATTATAGGACTGAATAAACCTTATAGGCTAGGTTTGTGCAACAAAGCCTATTGAAACTAAAAACCTCTTAGGAATTGGGTGATTTAGCATTTTATGGTCATAAAGCAAATACGACACTATTAAAAATAGAGTAGGGAAAGAAAAGAAATACATTAAAAATATGTAAATCCAAGCTCTAACCTCAATAATATTTAACAAGGAAACATCAATATAAAATGGAAGAAATCTTAATATTAATTCCAAATTAATCAATATTATATCTTTATCAAAAAAAACAAGAAGAAACTCAGATAACAATACCATAACTCCACTAAATAAAAATGAAGCCTTGAAATCAAAACCTACCTTACCCATACCATACTCGCTTATCAGCATAATAACCAAACTACAATAAAAAAATATTTTAATATTGATATTTTATTTATTAAGCCCGCTATGTACACTAAATAGACTTATTTTAAATATAATTAAATTCAATATTATTTAAATTAATATACCCAAAAAATAATAAAAACCTCTGATTCTCATACTCCACTACACCTGAAATTTTTTCCATGTATTGCATGAGTTCTTGTGTTTTTTCTGCTTGAATCATTTTTACAGTTCGAGATGGCTTTGTTGCACAAACCTAGCCTATAAGGTTTATTCAGTCCTATAATTTCAAAATGAATAAACCTACTCCTAAAACTTATCGTACAACCAACTGGTCTTCCTATAATCGCGCTCTCATTAATCGGGGCAACATTTCCATTTGGTTTGATCCCAAGACTCAATGGTACGCTCAACCCAAAGGTAAACATGGTCGAAATCAAACTTATTCAGATACAGCCATCCAATGCTGTTTAATGATCAAATCCTTATTTCGTCTTTCTTTACGCATGGTCACTGGCTTTGTGCAAAGTCTCATTCATCTTTGTAGATTAGATTGGACAGCACCAGACTATTCCACCATCTGCAGAAGACAAAAGCATATTGATATTGCAATTAACTATCAAAAAAGCAGTAATGGTCTCCAGCTACTCGTCGATTCTACTGGCTTAAAGTTTCTAGGCGAAGGTGAGTGGAAACGTAAGAAACATGGACCTGAATATCGTCGCCAATGGCGTAAGCTTCATATTGGCATCGATGCTGAAACCCTTCAAATACGCGCTATTCAACTCACTACAAATAATGTGAGTGATTCACAAGTGCTTGGTGATTTACTCGATCAGATTCCACAAGATGAGCAGATTGACTCTGTCTATACTGATGGGGCTTATGACACCAAGCAATGCCGTCAAGTAATTGCAGACCGACAAGCACATGCGGTGATTCCGCCAAGAAAAAATGCGAAACCTTGGAAAGATACAAAGACCAGCTCGCTAGAGCGAAATGAATTACTTCGAACAGTTAAACGTTTAGGAAGAACAATATGGAAAAATTGGTCAGGCTATCATCGCAGAAGTCTGATAGAAACCAAGATGCATTGCATCAAATTATTAGGCGATAAACTCCGTGCGAGAAACTTTCAAAGCCAAGTCAATGAGATTCATGCACGTGTGGCCGTATTAAATAAATTTACAGATTTAGGTCGACCTCACACCCAAGTTGCCACTTAAATTTAGATAACTTGGAAGAAGTTTAGCTTTTGAATGTTTGTGCAACAAAGCCGCTTCGAATTATAAGAGGATTATGACTAGACCATACAATATTAAAAATAAACCGACTCTTAACTAATATACACCCATAAAAAATCAGCCTTGAATGGGCAAGGCTGATTTTTAAACTGAAGGGTATTGGACTATCTTAAACCGATAAATCCACGCACAAATATTTCATTTCGAGATATTCGTCGATACCAAATTTAGAGCCTTCACGACCTAAGCCAGACTGCTTCACACCACCAAAGGGAGCCACTTCATTTGAAATCGCACCCGTGTTAATGCCGACCATACCGTACTCAAGTGCTTCACCAACACGCCACTGACGTGCGGTATTCTGCGTAAATAGGTAAGTTGCTAAACCAAACTCGGTGTCATTGGCCATTTGCACTGCTTCTTCTTCTGTTTTAAAACGGAATAAGGGTGCTAATGGACCAAAGGTTTCTTCTTTCGCGACTTTCATCTCTTGCGTCACTTCCGTTAAAAGTGTCGGTTCAAAGAAAGTACCACCTAAGCTTGAACGTTGACCACCGGTTTTAAGCTGCGCACCTTTGCTAATGGCATCGGCAATATGCGACTGTACTTTTTCAATCGCGGCTTCATCGATCAGCGGGCCTTGTGTTGAAGTCTCAACTCGGCCATCACCCACTTGTAAGTTCGCTACAGCAACTGCCAGTTTTTCAACCAAGGCATCGTAAATACCGTCTTGTACATAAATACGGTTGGCACATACACAGGTCTGTCCGCTATTGCGGAACTTGCTGGCCATAATGCCTTGTACAGCTTGCTCAAGATTGGCATCATCAAACACCAAAACAGGTGCATTACCGCCTAATTCTAAAGACAGTTTTTTGATGGTTGGCGCACATTGTTGCATCAAGATACGACCAACTTGAGTTGAACCTGTGAAGCTCAACTTTTTCACCGTGTCGCTTTCACACAGTGTTTTACCCACTTCGCTTGAATCACCACTGATGTGTAATAACACGTCTTGTGGCAAACCCGCTCGTAGCGCTAACACTTCTAAAGCATAAGCTGTTAAAGGCGTTTGCTCAGCAGGTTTCACAATCATCGAGCACCCTGCTGCAATTGCAGGTGCTGCTTTACGTGTGATCATCGCCGCTGGGAAGTTCCACGGTGTAATTGCTGCCGTAACCCCAATCGCCTGTTTGATCACCAACAAACGCTGAGTAGCAACCGTTGGCATCAACACTTCACCATCGATACGACGCGCTTGTTCTGCAAACCAACGAATAAATGAAGCAGCATAGCCAATTTCACCGCGTGCTTCAGCTAAAGGCTTACCTTGTTCAGCAGTCAAAATCTGAGCCAATGACTCTTTATTTTCCTGCATCAAATCAAACCAAGCCCAAAGCACATCAGCGCGTTGTAGTGCTGTTTGTGCTTTCCACGCAGTTTGTGCCTTTTGAGAGCGAGCAATCACTTGCTCAACTGACGCGCGGTCATGGGATTTCACCCATGCCAAAGTGTCATGTGTTGCGGCATCTTTGACTTCGATGTAACCGCCATTTTCAGGCACATCAAAACGAATATCTGGATGCTGTAATAAATCTTTATATTGCGCTTGAAGCATCATCATTACTCTTCAATTATGCTGCAGCAGAAAGTGCAAAACCTTGTTTTAAAATGTTTAAGCCAGCACGGAATTGTTCTGCAGGAATCGTTAAAGGATATAAGAAACGGATCACATTACCATAACGACCACAGGTCAAAATAAGCAAGCCATTTTGCATTGCATAGTTTTGAATTGCTTTCGCTTGATCCGCCGTTTCCAACTCAATCGCGACCATTGAACCCAACGCACGAATTTCTTGGACTGTAGACGAAGACTGTTTGAGTTCATTCAGAACTTCAACCAACTCTGCGCCCAATACATTTGCACGTTCGCAAAGACCTTCTTCTTCAATCACGTCCAGTACGGCATGCGCAGAAGCTACAGCCACTGGGTTACCTGCATAAGTCCCACCTAGACCGCCTGGGTTTGGTGCATCCATCACTTCAGCACGGCCAACCACACCAGAGATTGGGAAACCACCACCAAGACTTTTCGCCATCGTGATTAAATCCGCTTTGGTCTCATAGTGATCCATGGCAAATAACTTACCAGTACGTGCAAAGCCTGTCTGTACTTCATCTGCAATAATCAAAATACCGTGTTGATCACATAGCGCACGTAAACGCTTTAAGAATTCAGCAGGAACAACGTTGAAACCGCCTTCACCTTGAACAGGTTCAAGCACAATAGCGGCAACATCATGTGCCGCAATATCTTCTGCAAAAATGTCTTCAATGCTTTCAATCGCAGCATCGACAGTAATGCCTTTTGACTCTACAGGATAGCGCGCATGGAAAACACCTGAAGGCATCACACCAAAGTCACGTTTGTACGGTGCAGTTTT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52 | Enterobacteria_phage(30.77%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2776117 : 2781318
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP043307|2776117:2781318|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP043307|2776117:2781318|2780504_2780825_-|WP_004723201.1|DBSCAN-SWA MDQINFFKCLADDTRFNIVMLVLGNNEQCVCDLTEKLELSQPKISRHLALLRSSGLLQDRRQGQWVYYSLNPNLPTWCIDVLNTLKNADLQPKVAPSFQQINSYCE >NZ_CP043307|2776117:2781318|2777292_2778246_-|WP_148826714.1|DBSCAN-SWA MQKRHSKLVILGSGPAGYSAAVYAARANLKPTLIAGLQLGGQLTTTTEVDNWPGDSAGLTGPALMERMQAHAERFGTEIVYDHINEVDLSVRPFVLKGDMEEFTCDALIIATGATAQYLGLESEAKFMGQGVSACATCDGFFYKNQKVMVVGGGNTAVEEALYLSNIAEHVTLVHRRDSLRSEKILQDHLFAKEKDGKISILWNNQVDEVIGDNTGVTSVRLKSTLDQTIQDVEVQGLFVAIGHKPNTGMFDGQLNLREGYIQVQSGTSGNATATSVAGVFAAGDVADSIYRQAITSAGSGCMAALDAEKYLDQLSN >NZ_CP043307|2776117:2781318|2776117_2777191_-|WP_148826713.1|DBSCAN-SWA MTQLQTEVDVIIIGGGQAALATAYFLKRKKIPFIILDDQSQAGGAWSHAWESLRLFSPNTWSSLSGWMMPTTEQTYPTRNEVIGYLSAYEQRYQFPIIRPIHVDHIEQKDGYLDVYAGDQYWRAKAVVSATGTWSQPYIPHYEGYERFEGLQTHSAHYVNPEPFINKKVIVVGGGNSGAQILAEVSKVADTTWVTVTPPQFLSDDVDGRVLFLRATERLKAQQEGCVIDQPVGGLGDIVMIDSVKEARERGVLHSREPFTSFEEHSVVWADGTRQAVDAVIWCTGFKASLTHLRSLDVVEPDQTVTVNDGRSVKINNLWLVGYGEWTGMASATLIGVSRTARATVDQIAAYLARINY >NZ_CP043307|2776117:2781318|2778263_2778968_-|WP_148826715.1|DBSCAN-SWA MTLPNVDMNLLDQPTLEKVQAKVLDHPPRILLLYGSNRERSYSRLAVMEAGRILEQFGAEVKIFHPKGLPLPEDADTEHPKVKELHDLLAWAEGMVWCSPERHGSMSSIFKSQIDWIPLAGGAIRATQGKTLALMQVSGGSQSFNSLNQMRILGRWMRMITIPNQSSIPKAFLEFDEDGRMKPSSFYDRIVDVMEELYKFTLLTRGQSQYLTNRYSERKESAEELSKRVNQRSL >NZ_CP043307|2776117:2781318|2780883_2781318_-|WP_087550548.1|DBSCAN-SWA MSATPNVKIYHNPECGTSRNTLALIRNANIEPEVIEYLVNPPSKSELIQLIADAGLTVREAIRKNVAPYTDLGIDQEDWTEDQLLNFMLQYPILINRPFVVTELGTRLSRPSELVLEILPLPQKGAFTKEDGEQVLDANGQRLK >NZ_CP043307|2776117:2781318|2780024_2780498_-|WP_148826717.1|DBSCAN-SWA MKFLFLCTGNSCRSILSEVLFNSRAPEGWKAYSAGSKPSGQVHPLTIETLENLGLSTDGMWSKTIDDCEQYQPDVVITVCDSAAQEACPLYLGGAIKAHWGLADPSHLDLPKEEKLKAFQVTVDHINRRLDALFALDTAHMSRPELIASINHISDIE >NZ_CP043307|2776117:2781318|2778973_2780017_-|WP_148826716.1|DBSCAN-SWA MAQQKLSFLDRNLTLWIFIAMGLGIAIGVFFPQASVALDKMSVDSVNIPIAIGLILMMYPPLAKVDYAALPQVFKDKKTLTLSLVQNWVIAPLLMFALAIIFLHSYPEYMTGLILIGLARCIAMVLVWNGLACGDNQYVAALVAFNSIFQILFFSTYAWLFLTFLPPYFGVAGQVINVDFWTITHAVLVYLGIPFFLGFMTRFTLVKAKGLDWYQHVFLPKISPLSLLALLFTIVAMFSLKGNDVVSLPMDVLRIAIPLTIYFIVMFFISFFMSKWMGNDYPKTTAISFTAAGNNFELALAVAIATFGLASPVAFTTVIGPLVEVPVLIALVSVSLWLRKKFFKTEV |
7 | uncultured_Caudovirales_phage(83.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2792675 : 2838865
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP043307|2792675:2838865|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP043307|2792675:2838865|2796617_2797708_-|WP_085940648.1|transposase|DBSCAN-SWA MTHLNELYLILNKSLKWNKSHLKCFALIMLVIILKQTCNLSSASKALPIKCLPQSFYRRMQRFFAGQYFDYRQISQLIFNMFSFDQVQLTLDRTNWKWGKRNINILMLAIVYRGIAIPILWTLLNKRGNSDTKERIALIQRFIAIFGKDRIVNVFADREFIGEQWFTWLIEQDINFCIRVKKNFIVTNHLGKNHKISDLFRHLKVGQIECRKRRILVGRVKLYISALQLENGELLLVVSPQFNANAIQDYALRWEIETLFSCLKGRGFNLENTRLTDPRRVKKLIAVLAISFCWCYLTGEWQHNQKKAIKIKKHGRLSMSLFRYGLDYVQMAIQRLIGFGKKEEFKEILAILRKQNPDRIRVL >NZ_CP043307|2792675:2838865|2836125_2836674_+|WP_148826739.1|DBSCAN-SWA MKKLNHILCGITLCVLTTASFAKPATEASVEKALKLGDIKGTLAQSQQEMRPVYDQQAEEIIKNIFKTSTLNTEQQEATKQIAEITASFSSKLISDPKFMQMLKNVYMQTFTEEEVLANIQFLETPLGQSINKKSSKMMSEIMRNSIAMSAEMMQDPAIQLEMNRQNEKTLTPLFEQAKKAQ >NZ_CP043307|2792675:2838865|2793692_2793989_+|WP_148827114.1|DBSCAN-SWA MKTGKMNLSDYLFMQFKTMTPTLEQVGAMYYPHLSKAKLLEKARKMEFPFVCFKLDESQKSPYLVDIIDLAFVLNKRYEEQAKEYETFMKVALTASQN >NZ_CP043307|2792675:2838865|2815372_2817451_-|WP_148826732.1|DBSCAN-SWA MMHVHYDFSLVLGSIVVALLACFFAVSTERLLFRTWRKKFQTVLILLSSFFLGCAIWAMHFVGMLACDLPTHSYFDPALTILSFFIAFIASVFSIWLTTRQTLPFLRLVLGSLLMGLGISGMHYTGMMGLIIEGYQSVYDPLLTVFSILLAISGSGLTFWLIFKYKSAVSKKLLYQWYVAGMMALTIVSMHYTGMLAVSFYPTHSDKLVMPLEAGQGIVLFVVIFITCLILVAAFVVAVLEQRLEERNIQLSLANKELANQAVQDNLTKLPNRLYLAEYAHFLFTDHRLRNESIAFLYIDLDRFKAVNDVFGHHVGDQLLVQLTTRIHRHLSKNEKILRIGGDEFLMVLEQATAEQACQMAEQVLELIQDSFLIAGKEINVSASIGIAMYPEHGSNLQDLLINADAAMLTSKYQGRNTYSIFNYSFDQQEAKSQTKLINDLYKAVEEQQFVLYYQPKFTIQDQRICGVEALIRWKHPTLGLLTPNMFIKGAEKTGLIIQMGYWALEQACKQLQIWEREKIELYPIAVNLSAVQFEHKHLFNNLEHLFDKYKVNPNHLIIEITESTAMHHIEASIRTLQRLREMGIRLAIDDFGTGHSSFLYLKNLPVDELKIDRGFIHELTVGSKDEMILESIVHLAIRLGLVVTAEGVESPLQMEILSRLGCQQLQGYLLGMPMDVKRLEEFEYTSSTYFN >NZ_CP043307|2792675:2838865|2837554_2838865_-|WP_010325894.1|protease|DBSCAN-SWA MSEHPQGQKHCSFCGKTQSEVGKLIAGEDAYICNECVDVCLDLVQTSQQVESGDWAAKPLPKPHEIRAALDQYVIGQDVAKKTLSVAVYNHYKRLKATHGGHKHDDAVEIAKSNILLVGPTGSGKTLLAQTMARLLDVPFAMADATTLTEAGYVGEDVENIVQKLLQKADYDVEKAQKGIIYIDEIDKITRKSENPSITRDVSGEGVQQALLKMIEGTVASIPPQGGRKHPQQEFIQIDTSNILFICGGAFSGLEKIVQQRQEKGGIGFTAEVKKKDEGKKLSDLFRQVEATDLVKFGLIPEFIGRLPVIATLEELDEEALMQILTEPKNALTRQYQHLFDMENVDLVFEDSALRAVAKKALDRNTGARGLRSILENTLLETMYDLPSRTDVGTVVVNEDVINGTAAPLFKPERLPRIEQKDAAKVDLKVINSKSA >NZ_CP043307|2792675:2838865|2807997_2810751_-|WP_148826728.1|DBSCAN-SWA MARYSKINSFNALQTLAVGEKSYQIFNLPQAAQTLGNIDQLPKSLKVLLENLLRFEDQKSVKVEHIQALVDWQKTRSSDQEIQYRPARVLMQDFTGVPAVVDLAAMRAAMAQAGGDPNLINPLSPVDLVIDHSVMVDHFADKDAFAENVEIEMQRNGERYQFLRWGQSAFNNFSVVPPGTGICHQVNLEYLAQAVWLGEDEGQTFAFPDTLVGTDSHTTMINGLGVLGWGVGGIEAEAAMLGQPVSMLIPEVIGFKLTGKLNEGITATDLVLTITQMLRQKGVVGKFVEFYGDGLADLPLADRATIANMAPEYGATCGFFPIDDVTLAYLALTGREQQRIDLVEAYSKAQGLWRNAGDEPVFTDTLSLDMSTVQASLAGPKRPQDRVLLADVPKTFHDLMELNLKPAKEAKERLENEGGGTAVEAKKANLPHEEPSCTIDGKSYPLNHGDVVISAITSCTNTSNPSVMLAAGLLAKKAIEKGLQRKPWVKSSLAPGSKVVTDYLAAAGLTPYLDELGYNLVGYGCTTCIGNSGPLPEPIEEAIQCHDLNVASVLSGNRNFEGRVHPLVKTNWLASPPLVVAYGLTGNIRTDLTTQPIGLGKDGQAVYLKDIWPSQAEIDHALQSVNTAMFHKEYAAVFDGDAAWQAIQIPQSQTYAWQENSTYIRHPPFFEEIGQPPKPITNIEQARILAVLGDSVTTDHISPAGNIKKDSPAGRYLQEQGVEPKDFNSYGSRRGNHEVMMRGTFANIRIKNEMLGGEEGGNTIYIPTGETLPIYDASMLYQQQHTPLIIIAGKEYGTGSSRDWAAKGTNLLGVKAVIAESFERIHRSNLVGMGVLPLQFVDGQTRQSLNLTGREVLSIHGLSDDIQPHQTLDIQVLREDGSQDQFTVLCRIDTLNEVEYFKAGGILHYVLRNLIAA |
38 | uncultured_virus(10.0%) | tRNA,integrase,transposase,protease | attL 2782439:2782452|attR 2830096:2830109 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP043310_1 | 3080-3184 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP043310_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP043310_1
>1.1|3110|45|NZ_CP043310|CRISPRCasFinder CTATGTCCGGTAAAAGTAGTTTTTTAAGTCCATTTTGTCCGGCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043310_1
The CRISPR arrays of NZ_CP043310_1 >merge|NZ_CP043310|1|3080-3184|CRISPRCasFinder TTGTAGTTTAATGTCCGGTAAAAGTAGTTTCTATGTCCGGTAAAAGTAGTTTTTTAAGTCCATTTTGTCCGGCATTTGTAGTTTAATGTCCGGTAAAAGTAGTTT >NZ_CP043310|1|1|3080-3184|CRISPRCasFinder TTGTAGTTTAATGTCCGGTAAAAGTAGTTT CTATGTCCGGTAAAAGTAGTTTTTTAAGTCCATTTTGTCCGGCAT TTGTAGTTTAATGTCCGGTAAAAGTAGTTT
>NZ_CP043310.1|WP_148827140.1|1069_1501_+|hypothetical-protein MKNFLTVLAIVGSTSSFAGLSEMMNIYNNPTIAPKYTACQSNLYCNGFTALSKQWDTIPKSYRYKGNMTLEKWQKLEMLSSLYRGFSFGEEESTFYFIEAGADTYYQYDSKHKSDLNLLEELPYYFIWWTKTVGNNRAVFYCW >NZ_CP043310.1|WP_000110201.1|5524_5827_+|hypothetical-protein MSVETLEQKIAKQEERLRQLKAQKQAIAAREKKKNSDRQRKDDTRRKILLGAWVLNKLKNDESFKGQLTDFEKFLSTESKTEENRQKDKDLFNGVIWNNT >NZ_CP043310.1|WP_000184943.1|5888_6152_-|Txe/YoeB-family-addiction-module-toxin MTNRNVEWTDNAWDEYIYWQTQDKKILKRINTLIKECQRTPFEGTGKPEPLKANLSGFWSRRIDEKHRLVYEVTDERISIIQCRFHY >NZ_CP043310.1|WP_000557944.1|6138_6402_-|type-II-toxin-antitoxin-system-prevent-host-death-family-antitoxin MHVFTYTDARNNLKSVLDKVIDDVDVAFITRKEGGHAVVMGQDHYDSLMETLYLLSSPNNASRLNESIAQLRAGKTKHRELIEDDES >NZ_CP043310.1|WP_065995571.1|6537_7017_-|cysteine-hydrolase-family-protein MKPVLLIIDVQSTFNPPNWLIQKLEKLLPSVHSIATIELHDESIVPFKSQLNWAPSEFDECPLKVEKVFIKYGYSPTDDLIQYLKGLDTQQVYVCGIQTDTCVLAAGFRLFDAGLFPCLVTDLTVGSSLDRSGNLGIQLWKHHFRSITTSENLSSNTMI >NZ_CP043310.1|WP_148827141.1|8300_8540_-|hypothetical-protein MSPGIFFEDFEKTENSITTWCIRSLLVIATRFDLYVRKESKAIKIKEEVILSNYRKNKFNELDTENEIKKLRNEAELIN >NZ_CP043310.1|WP_020846814.1|9702_10644_-|replication-initiation-protein MDENKKTYPLSWVVMQNNVQECFKSMNIDEKRMLILASPIARTTDATEKDRIMITAEEFARECGIKTHSAYTQLELASKNLLKRNFSYNNERGKKVLSNWVIDCTYEDGGIAIRFPEIVLLMLKEFDKLNPYTKYKKDIVLSLKKDYSFDLYHLAKKHQAMGQFEMSLEHIKNELGLPKSYDKLCNLKDRVMKPSLNEITTNTDIELTYENVKKGRSVVGFKFIVKEKPKPKLIAPQRDQRTIDMFCNLSDAQINKYSTILSKLSELSDLSNFPDYPTFALWISGILRDPKSVREETTKRIFKALHSKTDFKP >NZ_CP043310.1|WP_000110201.1|13219_13522_+|hypothetical-protein MSVETLEQKIAKQEERLRQLKAQKQAIAAREKKKNSDRQRKDDTRRKILLGAWVLNKLKNDESFKGQLTDFEKFLSTESKTEENRQKDKDLFNGVIWNNT >NZ_CP043310.1|WP_000184943.1|13583_13847_-|Txe/YoeB-family-addiction-module-toxin MTNRNVEWTDNAWDEYIYWQTQDKKILKRINTLIKECQRTPFEGTGKPEPLKANLSGFWSRRIDEKHRLVYEVTDERISIIQCRFHY >NZ_CP043310.1|WP_000557944.1|13833_14097_-|type-II-toxin-antitoxin-system-prevent-host-death-family-antitoxin MHVFTYTDARNNLKSVLDKVIDDVDVAFITRKEGGHAVVMGQDHYDSLMETLYLLSSPNNASRLNESIAQLRAGKTKHRELIEDDES >NZ_CP043310.1|WP_065995571.1|14232_14712_-|cysteine-hydrolase-family-protein MKPVLLIIDVQSTFNPPNWLIQKLEKLLPSVHSIATIELHDESIVPFKSQLNWAPSEFDECPLKVEKVFIKYGYSPTDDLIQYLKGLDTQQVYVCGIQTDTCVLAAGFRLFDAGLFPCLVTDLTVGSSLDRSGNLGIQLWKHHFRSITTSENLSSNTMI |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP043310_2 | 10765-10869 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP043310_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP043310_2
>2.1|10795|45|NZ_CP043310|CRISPRCasFinder CTATGTCCGGTAAAAGTAGTTTTTTAAGTCCATTTTGTCCGGCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043310_2
The CRISPR arrays of NZ_CP043310_2 >merge|NZ_CP043310|2|10765-10869|CRISPRCasFinder TTGTAGTTTAATGTCCGGTAAAAGTAGTTTCTATGTCCGGTAAAAGTAGTTTTTTAAGTCCATTTTGTCCGGCATTTGTAGTTTAATGTCCGGTAAAAGTAGTTT >NZ_CP043310|2|2|10765-10869|CRISPRCasFinder TTGTAGTTTAATGTCCGGTAAAAGTAGTTT CTATGTCCGGTAAAAGTAGTTTTTTAAGTCCATTTTGTCCGGCAT TTGTAGTTTAATGTCCGGTAAAAGTAGTTT
>NZ_CP043310.1|WP_020846814.1|9702_10644_-|replication-initiation-protein MDENKKTYPLSWVVMQNNVQECFKSMNIDEKRMLILASPIARTTDATEKDRIMITAEEFARECGIKTHSAYTQLELASKNLLKRNFSYNNERGKKVLSNWVIDCTYEDGGIAIRFPEIVLLMLKEFDKLNPYTKYKKDIVLSLKKDYSFDLYHLAKKHQAMGQFEMSLEHIKNELGLPKSYDKLCNLKDRVMKPSLNEITTNTDIELTYENVKKGRSVVGFKFIVKEKPKPKLIAPQRDQRTIDMFCNLSDAQINKYSTILSKLSELSDLSNFPDYPTFALWISGILRDPKSVREETTKRIFKALHSKTDFKP >NZ_CP043310.1|WP_148827141.1|8300_8540_-|hypothetical-protein MSPGIFFEDFEKTENSITTWCIRSLLVIATRFDLYVRKESKAIKIKEEVILSNYRKNKFNELDTENEIKKLRNEAELIN >NZ_CP043310.1|WP_065995571.1|6537_7017_-|cysteine-hydrolase-family-protein MKPVLLIIDVQSTFNPPNWLIQKLEKLLPSVHSIATIELHDESIVPFKSQLNWAPSEFDECPLKVEKVFIKYGYSPTDDLIQYLKGLDTQQVYVCGIQTDTCVLAAGFRLFDAGLFPCLVTDLTVGSSLDRSGNLGIQLWKHHFRSITTSENLSSNTMI >NZ_CP043310.1|WP_000557944.1|6138_6402_-|type-II-toxin-antitoxin-system-prevent-host-death-family-antitoxin MHVFTYTDARNNLKSVLDKVIDDVDVAFITRKEGGHAVVMGQDHYDSLMETLYLLSSPNNASRLNESIAQLRAGKTKHRELIEDDES >NZ_CP043310.1|WP_000184943.1|5888_6152_-|Txe/YoeB-family-addiction-module-toxin MTNRNVEWTDNAWDEYIYWQTQDKKILKRINTLIKECQRTPFEGTGKPEPLKANLSGFWSRRIDEKHRLVYEVTDERISIIQCRFHY >NZ_CP043310.1|WP_000110201.1|5524_5827_+|hypothetical-protein MSVETLEQKIAKQEERLRQLKAQKQAIAAREKKKNSDRQRKDDTRRKILLGAWVLNKLKNDESFKGQLTDFEKFLSTESKTEENRQKDKDLFNGVIWNNT >NZ_CP043310.1|WP_148827140.1|1069_1501_+|hypothetical-protein MKNFLTVLAIVGSTSSFAGLSEMMNIYNNPTIAPKYTACQSNLYCNGFTALSKQWDTIPKSYRYKGNMTLEKWQKLEMLSSLYRGFSFGEEESTFYFIEAGADTYYQYDSKHKSDLNLLEELPYYFIWWTKTVGNNRAVFYCW >NZ_CP043310.1|WP_000110201.1|13219_13522_+|hypothetical-protein MSVETLEQKIAKQEERLRQLKAQKQAIAAREKKKNSDRQRKDDTRRKILLGAWVLNKLKNDESFKGQLTDFEKFLSTESKTEENRQKDKDLFNGVIWNNT >NZ_CP043310.1|WP_000184943.1|13583_13847_-|Txe/YoeB-family-addiction-module-toxin MTNRNVEWTDNAWDEYIYWQTQDKKILKRINTLIKECQRTPFEGTGKPEPLKANLSGFWSRRIDEKHRLVYEVTDERISIIQCRFHY >NZ_CP043310.1|WP_000557944.1|13833_14097_-|type-II-toxin-antitoxin-system-prevent-host-death-family-antitoxin MHVFTYTDARNNLKSVLDKVIDDVDVAFITRKEGGHAVVMGQDHYDSLMETLYLLSSPNNASRLNESIAQLRAGKTKHRELIEDDES >NZ_CP043310.1|WP_065995571.1|14232_14712_-|cysteine-hydrolase-family-protein MKPVLLIIDVQSTFNPPNWLIQKLEKLLPSVHSIATIELHDESIVPFKSQLNWAPSEFDECPLKVEKVFIKYGYSPTDDLIQYLKGLDTQQVYVCGIQTDTCVLAAGFRLFDAGLFPCLVTDLTVGSSLDRSGNLGIQLWKHHFRSITTSENLSSNTMI >NZ_CP043310.1|WP_148827134.1|15670_16240_-|hypothetical-protein MSPGIFFEDFEKTENSDYLHGVFGRCLVIATRFDSMCVRMSKAIKIKEEVILRIIEKQFNELDTENEIKKLRNEAEFNQLVEKTLSKYLTLDKSIRTLGLPEQLSAILHEARKSRNEIAHSLTRDLEGCIDTKIDNTILIKKIEKLIENIVEGDIIISILISIFNEDPILNSQNLSQYKDKIIDWVISP >NZ_CP043310.1|WP_148827135.1|16447_16852_+|hypothetical-protein MKNFLTVLAIVGSTSSFAGLSEMMNIYNNPTIAPKYTACQSNLYCNGFTALSKQWDTIPKSYRYKGEYDIRKMAEIGDASSLYRGFSFGEEESTFYFIEAGADTYYQYDSKHKSDLTFARGIAVLLYMVDKNGW >NZ_CP043310.1|WP_004870774.1|17113_17401_-|hypothetical-protein MRTKAELDAMSHQELKDYEQSLLALWTPRMAIESDIERLSTHHSELLEVFNQLKNPDAPKNSRLKDSILSLKYKIESLEGKLSDLIQDNRLNSAD >NZ_CP043310.1|WP_020846814.1|17397_18339_-|replication-initiation-protein MDENKKTYPLSWVVMQNNVQECFKSMNIDEKRMLILASPIARTTDATEKDRIMITAEEFARECGIKTHSAYTQLELASKNLLKRNFSYNNERGKKVLSNWVIDCTYEDGGIAIRFPEIVLLMLKEFDKLNPYTKYKKDIVLSLKKDYSFDLYHLAKKHQAMGQFEMSLEHIKNELGLPKSYDKLCNLKDRVMKPSLNEITTNTDIELTYENVKKGRSVVGFKFIVKEKPKPKLIAPQRDQRTIDMFCNLSDAQINKYSTILSKLSELSDLSNFPDYPTFALWISGILRDPKSVREETTKRIFKALHSKTDFKP >NZ_CP043310.1|WP_004870770.1|19050_20703_-|MobA/MobL-family-protein MAIYHFSVKTISRGNGRSAVACAAYRSSEKLVCDFYGKEQDYTRKTGVEFTKIYAPENTNTELLKRQTLWNEVEKVERRKDALLAREFEIAFPSELNAEQRENMLNELCRNLVKKYGVIVDAAIHAPHTDSGSDERNYHAHIMFTTRSINEQGGFSAKKYRDFSRDNGTETVSHWRESFAELCNHHLEQNGFDERVDHRSYEDQESDLEATQHEGPQATYLRRRGIFTEISLKNDEIKLRNLKIKKVIALDENIKVSEDLVQKVRSELQFQYSQAEYSEKTSQKLYEFQNEELSKLTTKLDTMSSAISELRKKEPLFFKTKWINQINDLIDQHNTQLDIQKHISGLSEIEKKERYSDHLNKWTEENQLLQPKKSFAKFDEPNITVKQRKLNDQISNIDHQISEISRRETEYQEYVRDQRLEIINSYIFEEDNYGNKYFSPQNGEKQKRLYAEEMEDLKIQELHAAFTKKIETEAQQEFSQKRAIQLENDRKDRESREQQLRKEREQQEQRYAQEREQQEHLAFVRRQEQEKQQRNEPKKPENDNNHDYTP >NZ_CP043310.1|WP_000110201.1|20914_21217_+|hypothetical-protein MSVETLEQKIAKQEERLRQLKAQKQAIAAREKKKNSDRQRKDDTRRKILLGAWVLNKLKNDESFKGQLTDFEKFLSTESKTEENRQKDKDLFNGVIWNNT |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP043310_3 | 18460-18564 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP043310_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP043310_3
>3.1|18490|45|NZ_CP043310|CRISPRCasFinder CTATGTCCGGTAAAAGTAGTTTTTTAAGTCCATTTTGTCCGGCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043310_3
The CRISPR arrays of NZ_CP043310_3 >merge|NZ_CP043310|3|18460-18564|CRISPRCasFinder TTGTAGTTTAATGTCCGGTAAAAGTAGTTTCTATGTCCGGTAAAAGTAGTTTTTTAAGTCCATTTTGTCCGGCATTTGTAGTTTAATGTCCGGTAAAAGTAGTTT >NZ_CP043310|3|3|18460-18564|CRISPRCasFinder TTGTAGTTTAATGTCCGGTAAAAGTAGTTT CTATGTCCGGTAAAAGTAGTTTTTTAAGTCCATTTTGTCCGGCAT TTGTAGTTTAATGTCCGGTAAAAGTAGTTT
>NZ_CP043310.1|WP_020846814.1|17397_18339_-|replication-initiation-protein MDENKKTYPLSWVVMQNNVQECFKSMNIDEKRMLILASPIARTTDATEKDRIMITAEEFARECGIKTHSAYTQLELASKNLLKRNFSYNNERGKKVLSNWVIDCTYEDGGIAIRFPEIVLLMLKEFDKLNPYTKYKKDIVLSLKKDYSFDLYHLAKKHQAMGQFEMSLEHIKNELGLPKSYDKLCNLKDRVMKPSLNEITTNTDIELTYENVKKGRSVVGFKFIVKEKPKPKLIAPQRDQRTIDMFCNLSDAQINKYSTILSKLSELSDLSNFPDYPTFALWISGILRDPKSVREETTKRIFKALHSKTDFKP >NZ_CP043310.1|WP_004870774.1|17113_17401_-|hypothetical-protein MRTKAELDAMSHQELKDYEQSLLALWTPRMAIESDIERLSTHHSELLEVFNQLKNPDAPKNSRLKDSILSLKYKIESLEGKLSDLIQDNRLNSAD >NZ_CP043310.1|WP_148827135.1|16447_16852_+|hypothetical-protein MKNFLTVLAIVGSTSSFAGLSEMMNIYNNPTIAPKYTACQSNLYCNGFTALSKQWDTIPKSYRYKGEYDIRKMAEIGDASSLYRGFSFGEEESTFYFIEAGADTYYQYDSKHKSDLTFARGIAVLLYMVDKNGW >NZ_CP043310.1|WP_148827134.1|15670_16240_-|hypothetical-protein 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>NZ_CP043310.1|WP_020846814.1|25092_26034_-|replication-initiation-protein MDENKKTYPLSWVVMQNNVQECFKSMNIDEKRMLILASPIARTTDATEKDRIMITAEEFARECGIKTHSAYTQLELASKNLLKRNFSYNNERGKKVLSNWVIDCTYEDGGIAIRFPEIVLLMLKEFDKLNPYTKYKKDIVLSLKKDYSFDLYHLAKKHQAMGQFEMSLEHIKNELGLPKSYDKLCNLKDRVMKPSLNEITTNTDIELTYENVKKGRSVVGFKFIVKEKPKPKLIAPQRDQRTIDMFCNLSDAQINKYSTILSKLSELSDLSNFPDYPTFALWISGILRDPKSVREETTKRIFKALHSKTDFKP >NZ_CP043310.1|WP_004870770.1|26744_28397_-|MobA/MobL-family-protein 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP043310_4 | 26155-26259 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP043310_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP043310_4
>4.1|26185|45|NZ_CP043310|CRISPRCasFinder CTATGTCCGGTAAAAGTAGTTTTTTAAGTCCATTTTGTCCGGCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043310_4
The CRISPR arrays of NZ_CP043310_4 >merge|NZ_CP043310|4|26155-26259|CRISPRCasFinder TTGTAGTTTAATGTCCGGTAAAAGTAGTTTCTATGTCCGGTAAAAGTAGTTTTTTAAGTCCATTTTGTCCGGCATTTGTAGTTTAATGTCCGGTAAAAGTAGTTT >NZ_CP043310|4|4|26155-26259|CRISPRCasFinder TTGTAGTTTAATGTCCGGTAAAAGTAGTTT CTATGTCCGGTAAAAGTAGTTTTTTAAGTCCATTTTGTCCGGCAT TTGTAGTTTAATGTCCGGTAAAAGTAGTTT
>NZ_CP043310.1|WP_020846814.1|25092_26034_-|replication-initiation-protein MDENKKTYPLSWVVMQNNVQECFKSMNIDEKRMLILASPIARTTDATEKDRIMITAEEFARECGIKTHSAYTQLELASKNLLKRNFSYNNERGKKVLSNWVIDCTYEDGGIAIRFPEIVLLMLKEFDKLNPYTKYKKDIVLSLKKDYSFDLYHLAKKHQAMGQFEMSLEHIKNELGLPKSYDKLCNLKDRVMKPSLNEITTNTDIELTYENVKKGRSVVGFKFIVKEKPKPKLIAPQRDQRTIDMFCNLSDAQINKYSTILSKLSELSDLSNFPDYPTFALWISGILRDPKSVREETTKRIFKALHSKTDFKP >NZ_CP043310.1|WP_004870774.1|24808_25096_-|hypothetical-protein MRTKAELDAMSHQELKDYEQSLLALWTPRMAIESDIERLSTHHSELLEVFNQLKNPDAPKNSRLKDSILSLKYKIESLEGKLSDLIQDNRLNSAD >NZ_CP043310.1|WP_148827135.1|24142_24547_+|hypothetical-protein MKNFLTVLAIVGSTSSFAGLSEMMNIYNNPTIAPKYTACQSNLYCNGFTALSKQWDTIPKSYRYKGEYDIRKMAEIGDASSLYRGFSFGEEESTFYFIEAGADTYYQYDSKHKSDLTFARGIAVLLYMVDKNGW >NZ_CP043310.1|WP_148827134.1|23365_23935_-|hypothetical-protein MSPGIFFEDFEKTENSDYLHGVFGRCLVIATRFDSMCVRMSKAIKIKEEVILRIIEKQFNELDTENEIKKLRNEAEFNQLVEKTLSKYLTLDKSIRTLGLPEQLSAILHEARKSRNEIAHSLTRDLEGCIDTKIDNTILIKKIEKLIENIVEGDIIISILISIFNEDPILNSQNLSQYKDKIIDWVISP >NZ_CP043310.1|WP_065995571.1|21927_22407_-|cysteine-hydrolase-family-protein MKPVLLIIDVQSTFNPPNWLIQKLEKLLPSVHSIATIELHDESIVPFKSQLNWAPSEFDECPLKVEKVFIKYGYSPTDDLIQYLKGLDTQQVYVCGIQTDTCVLAAGFRLFDAGLFPCLVTDLTVGSSLDRSGNLGIQLWKHHFRSITTSENLSSNTMI >NZ_CP043310.1|WP_000557944.1|21528_21792_-|type-II-toxin-antitoxin-system-prevent-host-death-family-antitoxin MHVFTYTDARNNLKSVLDKVIDDVDVAFITRKEGGHAVVMGQDHYDSLMETLYLLSSPNNASRLNESIAQLRAGKTKHRELIEDDES >NZ_CP043310.1|WP_000184943.1|21278_21542_-|Txe/YoeB-family-addiction-module-toxin MTNRNVEWTDNAWDEYIYWQTQDKKILKRINTLIKECQRTPFEGTGKPEPLKANLSGFWSRRIDEKHRLVYEVTDERISIIQCRFHY >NZ_CP043310.1|WP_000110201.1|20914_21217_+|hypothetical-protein MSVETLEQKIAKQEERLRQLKAQKQAIAAREKKKNSDRQRKDDTRRKILLGAWVLNKLKNDESFKGQLTDFEKFLSTESKTEENRQKDKDLFNGVIWNNT >NZ_CP043310.1|WP_004870770.1|19050_20703_-|MobA/MobL-family-protein MAIYHFSVKTISRGNGRSAVACAAYRSSEKLVCDFYGKEQDYTRKTGVEFTKIYAPENTNTELLKRQTLWNEVEKVERRKDALLAREFEIAFPSELNAEQRENMLNELCRNLVKKYGVIVDAAIHAPHTDSGSDERNYHAHIMFTTRSINEQGGFSAKKYRDFSRDNGTETVSHWRESFAELCNHHLEQNGFDERVDHRSYEDQESDLEATQHEGPQATYLRRRGIFTEISLKNDEIKLRNLKIKKVIALDENIKVSEDLVQKVRSELQFQYSQAEYSEKTSQKLYEFQNEELSKLTTKLDTMSSAISELRKKEPLFFKTKWINQINDLIDQHNTQLDIQKHISGLSEIEKKERYSDHLNKWTEENQLLQPKKSFAKFDEPNITVKQRKLNDQISNIDHQISEISRRETEYQEYVRDQRLEIINSYIFEEDNYGNKYFSPQNGEKQKRLYAEEMEDLKIQELHAAFTKKIETEAQQEFSQKRAIQLENDRKDRESREQQLRKEREQQEQRYAQEREQQEHLAFVRRQEQEKQQRNEPKKPENDNNHDYTP >NZ_CP043310.1|WP_020846814.1|17397_18339_-|replication-initiation-protein MDENKKTYPLSWVVMQNNVQECFKSMNIDEKRMLILASPIARTTDATEKDRIMITAEEFARECGIKTHSAYTQLELASKNLLKRNFSYNNERGKKVLSNWVIDCTYEDGGIAIRFPEIVLLMLKEFDKLNPYTKYKKDIVLSLKKDYSFDLYHLAKKHQAMGQFEMSLEHIKNELGLPKSYDKLCNLKDRVMKPSLNEITTNTDIELTYENVKKGRSVVGFKFIVKEKPKPKLIAPQRDQRTIDMFCNLSDAQINKYSTILSKLSELSDLSNFPDYPTFALWISGILRDPKSVREETTKRIFKALHSKTDFKP >NZ_CP043310.1|WP_004870770.1|26744_28397_-|MobA/MobL-family-protein MAIYHFSVKTISRGNGRSAVACAAYRSSEKLVCDFYGKEQDYTRKTGVEFTKIYAPENTNTELLKRQTLWNEVEKVERRKDALLAREFEIAFPSELNAEQRENMLNELCRNLVKKYGVIVDAAIHAPHTDSGSDERNYHAHIMFTTRSINEQGGFSAKKYRDFSRDNGTETVSHWRESFAELCNHHLEQNGFDERVDHRSYEDQESDLEATQHEGPQATYLRRRGIFTEISLKNDEIKLRNLKIKKVIALDENIKVSEDLVQKVRSELQFQYSQAEYSEKTSQKLYEFQNEELSKLTTKLDTMSSAISELRKKEPLFFKTKWINQINDLIDQHNTQLDIQKHISGLSEIEKKERYSDHLNKWTEENQLLQPKKSFAKFDEPNITVKQRKLNDQISNIDHQISEISRRETEYQEYVRDQRLEIINSYIFEEDNYGNKYFSPQNGEKQKRLYAEEMEDLKIQELHAAFTKKIETEAQQEFSQKRAIQLENDRKDRESREQQLRKEREQQEQRYAQEREQQEHLAFVRRQEQEKQQRNEPKKPENDNNHDYTP >NZ_CP043310.1|WP_148827134.1|31012_31582_-|hypothetical-protein MSPGIFFEDFEKTENSDYLHGVFGRCLVIATRFDSMCVRMSKAIKIKEEVILRIIEKQFNELDTENEIKKLRNEAEFNQLVEKTLSKYLTLDKSIRTLGLPEQLSAILHEARKSRNEIAHSLTRDLEGCIDTKIDNTILIKKIEKLIENIVEGDIIISILISIFNEDPILNSQNLSQYKDKIIDWVISP >NZ_CP043310.1|WP_148827135.1|31790_32195_+|hypothetical-protein MKNFLTVLAIVGSTSSFAGLSEMMNIYNNPTIAPKYTACQSNLYCNGFTALSKQWDTIPKSYRYKGEYDIRKMAEIGDASSLYRGFSFGEEESTFYFIEAGADTYYQYDSKHKSDLTFARGIAVLLYMVDKNGW |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_CP043310_1 | 1.1|3110|45|NZ_CP043310|CRISPRCasFinder | 3110-3154 | 45 | NZ_CP043310 | Acinetobacter johnsonii strain Acsw19 plasmid pAcsw19-3, complete sequence | 10795-10839 | 0 | 1.0 |
NZ_CP043310_1 | 1.1|3110|45|NZ_CP043310|CRISPRCasFinder | 3110-3154 | 45 | NZ_CP043310 | Acinetobacter johnsonii strain Acsw19 plasmid pAcsw19-3, complete sequence | 18490-18534 | 0 | 1.0 |
NZ_CP043310_1 | 1.1|3110|45|NZ_CP043310|CRISPRCasFinder | 3110-3154 | 45 | NZ_CP043310 | Acinetobacter johnsonii strain Acsw19 plasmid pAcsw19-3, complete sequence | 26185-26229 | 0 | 1.0 |
NZ_CP043310_1 | 1.1|3110|45|NZ_CP043310|CRISPRCasFinder | 3110-3154 | 45 | NZ_CP032104 | Acinetobacter lwoffii strain EK30A plasmid pALWEK1.11, complete sequence | 6066-6110 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP043310_2 | 2.1|10795|45|NZ_CP043310|CRISPRCasFinder | 10795-10839 | 45 | NZ_CP044487 | Acinetobacter schindleri strain HZE30-1 plasmid pHZE30-1-4, complete sequence | 70-114 | 0 | 1.0 |
NZ_CP043310_2 | 2.1|10795|45|NZ_CP043310|CRISPRCasFinder | 10795-10839 | 45 | NZ_CP032272 | Acinetobacter sp. WCHAc010034 plasmid p4_010034, complete sequence | 9932-9976 | 0 | 1.0 |
NZ_CP043310_2 | 2.1|10795|45|NZ_CP043310|CRISPRCasFinder | 10795-10839 | 45 | NZ_CP031712 | Acinetobacter wuhouensis strain WCHA60 plasmid p4_010060, complete sequence | 9568-9612 | 0 | 1.0 |
NZ_CP043310_2 | 2.1|10795|45|NZ_CP043310|CRISPRCasFinder | 10795-10839 | 45 | NZ_CP032282 | Acinetobacter sp. WCHA55 plasmid p3_010055, complete sequence | 2163-2207 | 0 | 1.0 |
NZ_CP043310_2 | 2.1|10795|45|NZ_CP043310|CRISPRCasFinder | 10795-10839 | 45 | NZ_CP043310 | Acinetobacter johnsonii strain Acsw19 plasmid pAcsw19-3, complete sequence | 3110-3154 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP043310_2 | 2.1|10795|45|NZ_CP043310|CRISPRCasFinder | 10795-10839 | 45 | NZ_CP043310 | Acinetobacter johnsonii strain Acsw19 plasmid pAcsw19-3, complete sequence | 18490-18534 | 0 | 1.0 |
NZ_CP043310_2 | 2.1|10795|45|NZ_CP043310|CRISPRCasFinder | 10795-10839 | 45 | NZ_CP043310 | Acinetobacter johnsonii strain Acsw19 plasmid pAcsw19-3, complete sequence | 26185-26229 | 0 | 1.0 |
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8. spacer 1.1|3110|45|NZ_CP043310|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP043310 (Acinetobacter johnsonii strain Acsw19 plasmid pAcsw19-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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9. spacer 1.1|3110|45|NZ_CP043310|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP043310 (Acinetobacter johnsonii strain Acsw19 plasmid pAcsw19-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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27. spacer 3.1|18490|45|NZ_CP043310|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032282 (Acinetobacter sp. WCHA55 plasmid p3_010055, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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41. spacer 4.1|26185|45|NZ_CP043310|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP043310 (Acinetobacter johnsonii strain Acsw19 plasmid pAcsw19-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctatgtccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcat CRISPR spacer ctatgtccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcat Protospacer *********************************************
42. spacer 4.1|26185|45|NZ_CP043310|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP043310 (Acinetobacter johnsonii strain Acsw19 plasmid pAcsw19-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctatgtccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcat CRISPR spacer ctatgtccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcat Protospacer *********************************************
43. spacer 4.1|26185|45|NZ_CP043310|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032104 (Acinetobacter lwoffii strain EK30A plasmid pALWEK1.11, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctatgtccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcat CRISPR spacer ctatgtccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcat Protospacer *********************************************
44. spacer 4.1|26185|45|NZ_CP043310|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044469 (Acinetobacter schindleri strain HZE23-1 plasmid pHZE23-1-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctatgtccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcat CRISPR spacer ctatgtccggtaaaagtagttttttaagtccattttgtccggcat Protospacer *********************************************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
13126 : 62451
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP043309|13126:62451|DBSCAN-SWA CTTAGAGACCGAAAACCCTGTTGATTAGACACACTTCACCCTGAGGCTGACCATAATAAAATGACGATGCTTGTCCTTTACGTAGTGCACGCATGACTTCAATACCTTTAATTGTGGCATAAGCAGTCTTCATAGATTTGAATCCTAATGTGGCCCTGATGATTCGCTTTAACTTACCATGATCACATTCAATGACATTATTTTTATACTTAATCTGCCTGTGCTCAATATCTACTGGACATTTTCCTTCTCGCTTTAATCGTGATAAAGCATGGCCATAGGTCGCTGCTTTATCTGTATTGATGACCCGTGGAATTTGCCATTTTTTCACCGTATTGAAGATCTTTCCTAGAAAACTATAGGCTGATTTACTGTTCCGTCTAGCGGAAAGGTAAAAGTCAATCGTATGACCCCGTTGATCAACTGCACGATACAGGTAAGTCCATCGCCCCTTCACTTTGATATAAGTCTCATCCATATGCCATGAATGTAAATCTGTAGGATTACGCCAATACCAGCGTAACCGTTTTTCCATTTCTGGAGCATAACGCTGAACCCAACGATAAATTGTACTGTGATCCACATTTATGCCTCGTTCAGCGAGCATTTCTTGAAGTTCACGATAGCTGATGCCATATTTACAATACCAACGAACAGCCCAAAGAATGATTTCACCTTGAAAGTGCCGACCGTGGAAGGGATTCATCTGCTGTATCTCGAAATAAATAAGATATTTAGCTTATCATGTCAGCCTATTTGCAACAGTGCCTCTCTAATTAGTAATATTGTAGTTTCAAGCTTGAGTACAACAGGTATTTTTTTGATAATAGATGTAGAAAAGTAGTGGAATTTTAAAGTTTTTAAACAATAGAAATTTAATAACATGAATTGATTATGGATTTACCAACTCTTAAATTTTTTAACTGATATTATTGTTATATAAGATATTTTGGTTCTTTAAGATTAATTACTAATAATTGTTAAAAAATTATCGATTTAAGGTTGTTAGGGTGCTTTATGGCTAGACCTCTAAGAAAGGTTAATAGGGAAGGTGTTTTATACACTCGGCGTAGTATTGTTGAATGTGAGATTGATGAACTAGAAAAAATCAGTCATGAGGAGATTGTTGCCAGAAGTATTATTTGGCCAAAATCAATTGAGGGTTTTATATCAAGTGAAACATTGCTCTATTTTATTCGAAATACTGATAATTCTTGGCTTCGTGAAAAGTTACTCCTAGCTCTCTTAGAAAGAATACATCGTAATCTTCCTAAACCTCATAGCCTAGATGGAAGAACTTCTTCCTTAAGTAATATGGAAATCCGCGATAAAGTTCGTGATGATTTTATCGATTTACTATTAGTGGATCAGGATAGTTATGAGGAGCGTCTTGATTATTTTGAAGTCAACTTTAACAGCGCATTAGCTAAAGACCGAGTTGATGCACAAAATAAAATTCAAAATAAAGATAATCTCACTCAAGGATTATATGGTGAAGATGAAAATATCTTACCAGAGGTTGAAAATGCGTTAGAACCCTATGATCCTTTTGATGCAAATGAACTTGACAAAGAATATTACCGACGAAGTCTACATGAGGCGATTAATGTTTTATCACCACTTCAGCAACGTATTGTCGTAATGTGGTGTCACGATATACCCATTATTTCGAAAGATCCCAATGAAATGACAATCACTAAAACGTTGAAGAAGTCAGATAAAACTATTCGCACGCACCGTGATTTTGCGCTTGCAATATTGCGTAAACAACTAGAAAATAAGGAGAAATTTTAATGAGAGATCAAAATATTTCTCGTGAGGATGTACTGAGAGACTTCTCAGTAGAATTTGATTCTAGTAAAGATATCTTACTAAAGTATCTCATAGAGTTTCCTGAATATTCTAATGAATTAGTCGATCTGTCACTCGAGCTGTCTCGTGAAATTGATGACTGTGTACCACTTACCCCAGATGATGAAATAAGTATTGAGTCTGCTTTGGATCGATTTCGTAGGGGGCTTACCCAGCAATCGGAACAAATAGATATACCTCCACAGCGTTTCTCAAATGCAGCAAAGTTATTAAATCTTCCCAAACAAGTTTTAATGGCTTTTGGAGTAAGAAGAGTTGAACTGTCATCTGTTCCATTACATTTTATTAATAGGCTTGCGATAGTTCTACAGGTAACGACTGCTCAGTTGAAGGCCTTTCTTGCACTACCACCACAAGCACAACATAGCCGAAGTTATAAATCTAATGTAAAACCAACTGCGCCAAGCAAGGTATCTTTCGAAAAGATTCTTCATGATGCACTTATTCCAGAAGAACGAATTCAAGAGATAATAAATAGAGACGAATGATATGGATGCTATCGAGATCGCTCGCCAGCGCGCTGACAAACTACATCATGAGGCTGTAGGCAGAGGGCTAGATCCTTGGAACTCTTATGCTTTTGCTGTTGCTGAAGCTGCGTTTCGAGATATTGACGTAGAGAAGTGTTTACAATGTTCCGATGAATTAAATGGCGCACGGGCGTTCTTTGATAGCACATATAGATTAATTACACATGAGGATTTTGGTTCATCTTTTGAACAGGCATTTCTTGTAGCGCATGAAATTGGTCATGTTGAGCTAGGAGATGATACACAAGATGAATATGTTATTAGTATTGACCCTAGCCGTACAGCAGAATCTGAACTATCAGGAATAAGTCGCGTTGTGGATTATAACCATCGACAACGACGTGAAGTTCAGATGGATCTTTTCGCCCGAGAATTCTTGCTTCCGCGTTCAGTTGTTAAAAAAATGCATCTTGAATGCCATATGACTTGTAGTGATATCGCTAGTAAGCTCGGAGCACCTTTTGAGGTTGTTGCACAGCAAATGCTTGATGCAATGCTGTTGCCTATGGTTGAAAATAAACCACAAGAAATTGATCCAGAGATGCCTCTCAATGAAAAGCAGAATGATGCAGTAAATCATAGAGGTTCTGCTTTTTTACTTCAGGCTGGTCCAGGTACAGGTAAGACTCGAACTCTCATAGCAAGAGTTGAAAGTTTGCTGAATGAAGAGGTTGATCCTCGACGGATATTGTTATTAACCTTCTCGAATAAAGCAGCTGCGGAAATATCAGAACGTATCGCACGAAAGCAGCCCCATGAGGCAGCGGCTCTTTGGATAGGGACTTTTCATGGGTTTGGCCTTGATCTGCTTCGTCGATTTCATGATTTATGTGATTTACCAGCGGAACCCCGCTTAATGGATCGTTCAGAGGCTGTAGAACTTCTGGAAGAGGAGTTCTTACGTCTTAATTTAAATCATTATCGTGATTTGTACGATCCTTCTCAAAATATTGTCGATATTTTGAATGCTATTTCCCGGGCAAAGGATGAGGTGATAGATGCATTACAGTACCGAATTCTTGCAGAGAATATGCTAGCAAAGGCCAGTAGTGCAGAAGAACGTGAAACTGCTGAACGAGCATTAGAAGTTGCTGTAGTATACGAAGCTTATGAAAAGATAAAGAAACAAGAAAATTGTTTAGATTTTGGTGATTTAGTGATGCTACCAGTACAACTGCTGGAGGCTAATGCAGAGTTACGTCAACAGTTGCAGCATGATTATCTGCATGTATTGGTGGATGAATATCAGGATGTTAATAGGAGCAGTATCAGGTTATTAAAGGCTCTCAAACCATATGGTGATAATCTTTGGGTCGTTGGTGATGCAAAGCAGTCAATTTATCGGTTTCGTGGAGCCTCGTCATTTAATATATCGCGTTTTTGCGTGGATGATTTTCCCGGGAGTGTAGGTCAATCACTGAAAATTAATTACCGCTCTGCTTCAGAGATCGTGACATCATTTTCAAGCTTTGCATCAGATATGAAAACAGGCGGTACACACAGTGCTCTTACTGCAAATCGCCCTGCATCAGGTTTTCTTCCGGAAATACGAACAGTAGAAAGTGGTGACCTGGTAAGTTCCGCTTTAGCTGAATCAATTAATAAAATGTGTGATCTTGGTTTTAAGTATCGAGATCAAGCAGTTTTGTGTCGGGGAAATGACAAGCTCTCAGAATTAGGGCGGGATCTGGAACGATTGGGAATTCCGGTATTATTTCTGGGTAGCTTATTTGAGCGACCAGAAATTAAAGACCTTATAGCATTGGTCTCTATTTTGACAGATAAACGCGCTTCCGGATTGATTCGTATTGCATGTTGTACAGAATTTAAGATGCCAATGGAAGATGTCACTCAAATTCTAGAGCATCTACGCACAAGCGAAAGAGAACTTTGTGACTGCGACATATCATTGTTAGCTTTATCCCCAGAGGGATTATCTTCACTTGAAAAATTAAAAAATGTACTACAGGGTTTTAGTAATCACTCACACCCTTGGAATGTTTTAGCGACTGTGCTTTTCGATCGCACACGAATGATAGCTGAAATTGCAACATCAGAGTCTGTTGGAGGGAAAGCTGAAGGAATTGCTATTTGGCAGTTTATGAATTTTGCTCGGCAACAACTTAAAGGTAGTGCCTTTCCCATAGTAAAAATGATAATGCGAATACGTCGTTTACTTAAGCTTAACGATGATCGTGATCTCAGTCAGCTTCCGACAGCGGCCCAAAATATTGATGCAGTCAAATTGATGACGATTCATAGTTCAAAAGGTCTTGAGTTTCCTGTTGTTCATTTAAGTGGGGTTAATAAAGATACACTACCTGGCTCATATAGACGGACAAAATGTCCACCACCTGAGGGTATGGTTGCTGGTGGTAAAGGTTCATCTAATGATGTAGCCAGAGAAGCTCACGACAATGAGCAAGAATGTCTTTTTTACGTAGCAATGTCACGTGCACGAGAAAGACTATTTTTTTATGGTGCAAGGACTAAAGGTCAGAAAAAAATCCAACGTCCACTTTCTGGTTTTTTGGAAAGGATTGGCCCTGTTTCGCACATAAAAACTCTCCCAGTATTACAATTACCAATAGCGCCGGA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44 | Escherichia_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
222406 : 258809
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP043309|222406:258809|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP043309|222406:258809|231782_232076_-|WP_010591688.1|DBSCAN-SWA MMEAFVVFTREETSDPHALATYSAGVGPSFDGHDVTFLAAYGAIQHLEGPPIEGAVILRFPTMQAARDWYDSPAYQTIAAQRFAGSRYRAFIIEGRR >NZ_CP043309|222406:258809|251764_252193_-|WP_033917495.1|DBSCAN-SWA MNNKTIAKKMINQVKSVITDPQAKSLLAAYHVETSFTHFYETHSHIYLVGKDITAVMAKHFPYFTFKTRDNKKARHGIGDGSMSDCLNKLRRVYRLEIKKPISEKFIAEAGAPTFTKSQSVSPVAYLIDEVVQLSLHIKDLN >NZ_CP043309|222406:258809|234097_235066_-|WP_002118270.1|DBSCAN-SWA MTIIAAYYYNEGKRVREIRLDEHVELNENRSGFCWIALSEPTADELSAIQTTYNLHPLAIDNAMHPLCPPKLEVYNDELYVVAQTAELVGDRISYGKMAIFTGHNHLITVRHGNAGALGKLREQLEASPTQFGKGVDYVLHAILHRVVDQYLPIFEMIEDDVLAMERRSLHDFLGPEEVARIFELRSELTRFQRTLGAMAELVRKLVRGHFPCISAEMTPYFHDVADHVHRVQSMVDGLLLVLSTVFEASSLLEAQRIGVVTRQLAAWAAILTVPTAIAGIYGMNFKHMPELDTPYGYFVVLGVIAVFCLLLFMRFKKAKWL >NZ_CP043309|222406:258809|257783_258809_+|WP_001988464.1|transposase|DBSCAN-SWA 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MVTRGFTGRGSGDQSDRIPPGQHLVEDFPVLSAGPTPRVEPSDWKFTVKIGPKPVKTWNWGEFNTLPKTQVTKDIHCVTSWSKLDTVWEGVLIEDILADAELDRPTDFVLAHCYDNYSTNVPLTDLLSGKAMVALSYAGKPLSRDHGGPARLLVPHLYFWKSAKWVNALQFTTRDEAGFWELHGYHIYGDPWREQRYTHD >NZ_CP043309|222406:258809|222406_223482_-|WP_117008103.1|transposase|DBSCAN-SWA MLYLILNKSLKWNKSHLKCFALIMLVIILKQTCNLSSASKALPIKCLPQSFYRRMQRFFAGQYFDYRQISQLIFNMFSFDQVQLTLDRTNWKWGKRNINILMLAIVYRGIAIPILWTLLNKRGNSDTKERIALIQRFIAIFGKDRIVNVFADREFIGEQWFTWLIEQDINFCIRVKKNFIVTNHLGKNHKISDLFRHLKVGQIECRKRRILVGRVKLYISALQLENGELLLVVSPQFNANAIQDYALRWEIETLFSCLKGRGFNLENTRLTDPRRVKKLIAVLAISFCWCYLTGEWQHDQKKAIKIKKHGRLSMSLFRYGLDYVQMAIQRLIGFGKKEEFKEILAILRRQNPDRIRVL >NZ_CP043309|222406:258809|254310_255459_-|WP_058952573.1|DBSCAN-SWA MSHFTVAVVTTPDGDVVDALEPFYEFECSGIKNKYCISESSLDEIKDQYESTEITLMKNSKPIIDDGEERYAFLDDPRFVRDATDLELYAIKNNKGDIFADFPNGGKHLSVVQVKNDDGTYSSRIRDLGMFIQWHQKDVPCTEVFELQQFINWYNEKVTPTVLTGEKPDESWTEWIELDADGKVVDYFTTTNPNPKYDWYEIGGRWKNMLLRLDGRKVDSCPIGELDFETEINRLKTEANRVYDYFEKCIGDASRTWRSWADVWSDESIESVNDKRNFYHNQDAILLMKASDTDNLFGIFGHEFDEFLVSREEFLAKKSANPFGTYCFLDATSGDEIGDWTGSECGMFGLDIRKEEDWENKNQALLKSFPSDYIITIVDCHI >NZ_CP043309|222406:258809|232134_232566_-|WP_005006001.1|DBSCAN-SWA MTKSIATASINRETAVALIDAALAAARAIGIPAAVAVVDATGNLRAFERTDDAPFLTVDVAIDKAWSSASFGFPTHVWNDYVTNDPKVAPLAYRPRMVAVGGGYPILEDGKLIGGIGISGGNYQQDQDACVEALMKIGFQLPA >NZ_CP043309|222406:258809|241988_242135_-|WP_005028587.1|transposase|DBSCAN-SWA MSKKHKTYTTEFKAEAIKLIEANQGNVSETALLHKPICKGFFSDIIFK >NZ_CP043309|222406:258809|230783_231254_+|WP_039048263.1|DBSCAN-SWA MKKAILLVVSHVCVLAAGFALGVYALPILTAPTAPTLAETSLAASQSIYKGEFRRDLKDSDALHWGQGTVNVGSKSIAFTGKLAPGPDYKLYLSPEFVETEKDFARLKPQMKRIGDVRTFENFVVPVPESIDVSQYKAVIVWCESFSQFITAAEYR >NZ_CP043309|222406:258809|236448_236892_-|WP_003464965.1|DBSCAN-SWA MKFEKSQTAIDHLTPEQHRITQEAGTERPFTGEYNDNKEPGIYVDIVSGEPLFASTDKFDSGTGWPSFTKPIVSANVNEVRDSAHGMVRTEVRSVHADSHLGHVFPDGPSDRGGLRYCINSASLRFIPRDEMESEGYGEYLDQVEEA >NZ_CP043309|222406:258809|253507_253933_-|WP_033917496.1|DBSCAN-SWA MNYYNTFTIPCNFKVQHIEDGQFVVFFADGTQLSYQIENTSKVKWIEPEAFSLEQVRLSSKEPINADDIDIIKYASYRLIADTPLIDDDGSNPEPDCLYCKKSSDTLNSLILQVTEAHTLSCWLLTSNGVHILDINELTEA >NZ_CP043309|222406:258809|243148_244474_+|WP_005006017.1|DBSCAN-SWA MFNLLPHELIVDNFAGGGGTSTGLERAFGRPIDIAINHDPKALAMHRVNHPLTKHYCESVWDVDPVEITGNQPVGLVWLSPDCKHHSKAKGGKPLNKNIRGLAWIALRWAAKVRPRVIMLENVTEFAEWGDLDKDGRPCPKRKGRTFNCFVNALKYQGYSVEYKELKACDFGSPTIRNRFFLIARRDGLPIVWPKETHGNPNTSLVKKGRLLPWRTAAECVDLSFDCPSIFKRKKALAPATLERIVRGILKYIVHNPEPYIVDAAAPILTECANGSSRRSMPIDEPLRTITAETKGGTHSLYVCHLSKMKNGCTGQELNEPMHTLTTVNQFAEVRALLTRFTEGLNFKNELFEKFGIIEINGERYCIEDIGFRMLQPFELYKAQGFPHDYIFSYGHDENNQQLKLTKQDQYRMVGNSVPPDLSYALVLANFTHEQEYSLAS >NZ_CP043309|222406:258809|232638_233652_-|WP_002118279.1|DBSCAN-SWA MKAIGYKVPGPIAADAALVDINLPRPVAAGYDILVEVKAVSVNPVDYKVRNSTPPADGDWKVLGWDAAGIVREVGPDVTQFELGDEVYYAGSITRPGTNAEFHLVDARIVGHKPASLSWAEAAALPLTTLTAWEAMFDRLDVAKPVPGAAEAILIIGGAGGVGSIAVQIARQRTDLTVIATASRPETQEWVRGLGAHHVIDHSRPLAPQIAELGIGAPAFVFSTTHTEQHVADIAELIAPQGRFGLIDDPKAFDIMVFKRKAVSIHHELMFTRSIYGTPDMNEQGEILDAMAALVDDGKIRTTLTRRLSPINAANLKTVHALIESGAAKGKIVLEGF >NZ_CP043309|222406:258809|244842_246222_-|WP_005006018.1|DBSCAN-SWA MSEMMPIIHYLTVQVCKRVFIEPNYGVMRSNDPLVIDPDLSMQPLCLLGISVNDFPLNYTEYYEKNDSSCSLSKFLKTFWSRYYKTNGPNIPLVFGIPDILVIDHRVKDIINQSFYSWLDSNNIQYEFSDSKNKKAIANFRQHQHYPYIECYSEIDVLDTYKTKNEEYALPLSVLNTMTNYLDSVFLLSKHRKTLIAYTSRPIKHPTFTECCPNDLRLFDITPLESKADRTLQDAYWVSSDLENGNYGYLRNRQVKEDIDCTREDKKAFLALIKSLPVTQWMDIFTSNQIELLNQLKKQRYKDTIDIDQINYADMCFKLGLSRDSQYTVLALETSKLKRSEMIELWDQYSHGGDVKYSCEIMLPDWYSSRNDKIYRYFYLSMWNSSIIFISESGSPATKCFDQDECINYMSKNQFKIHNLSNIVDIRHFDELLLNNRQYLLNIVKEMDAFELLKDLNTV >NZ_CP043309|222406:258809|230010_230604_-|WP_080755359.1|integrase|DBSCAN-SWA MMTTQHPKLFDLVRQRIRYKHMSYRTEQAYCGWIKRYVIFHQMRHPQEMGRLEVESYLSHLVNVGNVSQSTHHQALSALLFLYKEVLGVGLPWLLELNRPNKPKRLPVALTHLEVQSVFKHLSGIHLLMAKMLYGTGMRLTELLQLRIKDIDLSIGSIKHLFTPKLKYHTRNCCSFLLPKPQNLASQRLKQVVFWSI >NZ_CP043309|222406:258809|225250_225532_-|WP_003464986.1|DBSCAN-SWA MVSAIWKDTTIATSDETVIVEGNHYFPPSGVDLSLLEMSPHTSVCPIKGAARFFHVRAGDALNVNAAWTYPAPTPDAEGIRDYIAFWKGVDVA >NZ_CP043309|222406:258809|238261_239426_+|WP_085944217.1|transposase|DBSCAN-SWA MSKKHKTYTTEFKAEAIKLIEANQGNVSETARQLSISMQTLSNWNTKAKAGTLAGTKQYSPDLNALLEENKKLKQQLKIAEMEREFFKKGSSVLCQRKSVRYAYMKQKRYSFPITLMARLLHVSVSCFYDWLKRGVSKRTIQRNQQTILVKIAHEETRQSYGYIRLTKYLQAQGIKMSMYAVRQIKALNHLYCKRHKRFKRTTNSDHNRAIYENLLEQQFSMTRPNQAWSSDITYIWTVEGWLYLAAVKDLYTKQVVGYSLNERMTAQLVCNALNMAIHNQKPTKELIVHSDRGSQYCSHEYRNILEQYGFQGSMSKRGDCYDNAPIESFWGILKNELVHHYNYQTREEAKADIIKYIELFYNHRRIQKGLGFKTPNQMAEDFYKLAA >NZ_CP043309|222406:258809|237412_238171_-|WP_074964445.1|DBSCAN-SWA MATAWAELTAQGESNTASSKWLLEHLLEQEHTDRAMRSVSHQMNMAKLPMHRDLAGFDFSASSADARLISELASLAFTDTAQNVVLIGGPGTGKTHLATALAVSGITRHGKRVRFYSTVDLVNLLEREKHDGKAGRIAQALLRMDLVILDELGYLPFSQAGGALLFHLLSKLYEHTSVVITTNLSFAEWSSVFGDAKMTTALLDRLTHHCHIVETGNESYRLQHSSLAAQAKIKSRERKRKGGQEPEDDEPF >NZ_CP043309|222406:258809|233697_234006_-|WP_005006003.1|DBSCAN-SWA MTSQVTDVLEAVQSFIANGYDREYRVKDGNLVDLELGSTLDACSIRVDAALRLESGDDGEDASNIYAITDPATEHKGLLIDVFDEICYRDPVQESGPQCRRS >NZ_CP043309|222406:258809|248353_248602_-|WP_033917550.1|DBSCAN-SWA MTKRCSVDVKSPWFFIEDQIPNKDGTAFIVWDEFLDHEIKPIRWSDKIRDYASGEVEWSGSFLFWRYDDGTPAESPRSYQQS >NZ_CP043309|222406:258809|256924_257704_+|WP_000422636.1|DBSCAN-SWA MELPNIIQQFIGNSVLEPNKIGQSPSDVYSFNRNNETFFLKRSSTLYTETTYSVSREAKMLSWLSEKLKVPELIMTFQDEQFEFMITKAINAKPISALFLTDQELLAIYKEALNLLNSIAIIDCPFISNIDHRLKESKFFIDNQLLDDIDQDDFDTELWGDHKTYLSLWNELTETRVEERLVFSHGDITDSNIFIDKFNEIYFLDLGRAGLADEFVDISFVERCLREDASEETAKIFLKHLKNDRPDKRNYFLKLDELN >NZ_CP043309|222406:258809|249215_249854_-|WP_004201168.1|DBSCAN-SWA MPAKIKICGISTPEALDATIAARADYAGLVFYPASPRAVTSNVAGALTSRAAGQIAMVGLFVDADDAVIADALVAAKLNALQLHGSESPERVAQLRARFGKPVWKALPVASASDVARAAAYAGAADLILFDAKTPKGALPGGMGLAFDWSLLAGYRGALPWGLAGGLNPTNVAEAIARTGAPLVDTSSGVESAPGVKDTDKITNFAFAVRLA >NZ_CP043309|222406:258809|223579_223954_+|WP_005005993.1|DBSCAN-SWA MNKKRPVNLDIRTIQLPLTALTSILHRISGIMLFIFLGLILYMLSKSLESEKGFNEVKEIFSSPFGKVSFWLVYSSFIYHLVAGIRHLVMDVGVGHTLKGSNRASTIVLVVSGVLMVAGAVWIW >NZ_CP043309|222406:258809|226325_227072_-|WP_002118292.1|DBSCAN-SWA MTENEAQVRSWQSCVIDDIIQQTPSIKSFFLRLSKPFAHTAGQHVDIRLTAPDGYSAMRSYSIASSAVSTPIVEIAIERMPDAEVSPFFHDIAAIGDEIEVRGPLGGHFLWPEPAIDPVLLIGGGSGLVPLMAMIRQRRALAQAVPTALLLSARTAEDVLFSEELHCIEISDPAFVLALAITREKPVRASDFARRIDGMMVQEILTRLQGKPTQVFVCGSNGFVNIATDSALLAGLDASIIKTERYGG >NZ_CP043309|222406:258809|246372_246933_+|WP_005006020.1|DBSCAN-SWA MSTCSSTSGKPETKVIAFSGANKKISDILDLEHVRSNSLLQIPIAAELLSAGFPSPAQDFIEKSVDLNEMLITNEYSTFIGKVGSRSMLNAGIDINDKLIIDRSFNAKHLDIIVAQLETDFTVKRLMITKQMSAGEINEIFGPDAKSIPPVWLKAENQEHSHIFLKPEQELIVWGVVTYIIKDARK >NZ_CP043309|222406:258809|255798_256824_+|WP_087554627.1|transposase|DBSCAN-SWA MEYIKLSYHHLNFEDRTALMLESRKEGFSARKFAELIKRHPSTIYRELKRNSINDVYQAQYASDNTFARRRRGHRKLKIDSILWKFIVEAIRCLWSPQQIAKRLKTFPDLDQTMNVSHTTIYSTIRALPKGELKKDLLSCLRHENKKRKANGEPKKDSILQDIKTIHERPAEVQERKIPGHWEADLIKGKDNKSSIATLIERNTRLCILATLPDAKAESVRKALTEALKYLPAEVRKTLTYDRGREMSEHKILEEDLGIDVYFCDPHSPWQKGTCENMNGLIRQYLPKGIDLNQADQHYLNQVAMSLNTRPRKALDWLTPLEKFAQLVDYHMAFETVAPHV >NZ_CP043309|222406:258809|235062_235767_-|WP_005006007.1|DBSCAN-SWA MPDLSSFPITQRWPASHPDRLQLYAAPTPNGVKVSIMLEETGLAYEPHLIDISNNESKDPAFVSLNPNGRIPAIIDPAGPDGRPIALWESGAILLYLADKTGQFISTEPGQRYETLAWVFFQMSAIGPMFGQLGFFLRFAGKDYEDKRPRQRFVDESRRLLGVLDHRLEGREWIVDDYSIADIATFGWVNALVEFYAAGDILGLSSYSNVQAWLERGLARPAVQRGLRIPARPA >NZ_CP043309|222406:258809|235907_236447_-|WP_003464967.1|DBSCAN-SWA MHQRAVLAGGCFWGMQDLIRKRPGIISTRVGYTGGDIPNATYRNHGTHAEGIEIVFDPTVTSYRNILEFFFQIHDPTTLNRQGNDRGLSYRSGIYYVDEEQKRVAEDTIADVDASGLWDGKVVTEVQPVGEFWEAEPDHQDYLEKRPGGYTCHFVRPGWVLPKRQKVDDVQPAAGTAAE >NZ_CP043309|222406:258809|225599_225872_-|WP_005005995.1|DBSCAN-SWA MTTDVLLYTTNWCPFCRRAKALLKEKGVRWKELDIEADPAHRQAMAEASGRSSVPQIFINGTLIGGSDELFALDVRGELDKLLGRNPPAT >NZ_CP043309|222406:258809|250227_251040_-|WP_004201164.1|DBSCAN-SWA MELPNIMHPVAKLSTALAAALMLSGCMPGEIRPTIGQQMETGDQRFGDLVFRQLAPNVWQHTSYLDMPGFGAVASNGLIVRDGGRVLVVDTAWTDDQTAQILNWIKQEINLPVALAVVTHAHQDKMGGMDALHAAGIATYANALSNQLAPQEGMVAAQHSLTFAANGWVEPATAPNFGPLKVFYPGPGHTSDNITVGIDGTDIAFGGCLIKDSKAKSLGNLGDADTEHYAASARAFGAAFPKASMIVMSHSAPDSRAAITHTARMADKLR >NZ_CP043309|222406:258809|246929_248219_+|WP_038350012.1|DBSCAN-SWA MTNRVFIHVDINSAYCSMEAFWNPKLKGKPCVVLSSNDGTIIARSAEAKLLKIPMGAPLFKVQDIINKHNVHVLSSNFALYGEMSRRFHGILSGFVDPSCYSIYSIDEGFIEFTQFTKNFDATEMAREIRHQVYKFIGLTTCVGVGRTLTESKMANNLAKKNPELNGICNLVTMSLVDVESYYQSMPVDEIWGVGRKYAKKLNDMGILSVLDLATSNPNRMRELFNVNMQSTILELLGQPCFEFESSPKAKQQIVSSKSFGQKITELSILQEAVSKYTHNAFNRLVAEHQLCGSLIVFLQSNPFDQSKPYYSKSLTYTFTQPTNNLMQLVKAATSLIDKLYKEGIEFKKCGVMLCELIKEEHRTIGLLTDVEQLEKEQALMTAFQNIQSKFGKAKIAAGSCNLKNRDWEPKSERQSRNYFSEAGMIVFN >NZ_CP043309|222406:258809|249858_250224_-|WP_004201167.1|DBSCAN-SWA MADHVTPNLPSRDFDVTEAFYAKLGFATSWKDRGWMILQRGGLQLEFFPYPDLDPATSSFGCCLRLDDLDAMVALVNAAGAEEKSTGWPRFKAPQLEASGLRIGYLIDPDCTLVRLIQNPD |
34 | uncultured_Caudovirales_phage(18.18%) | integrase,transposase | attL 220677:220706|attR 264064:264093 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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