Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP043333 | Proteus mirabilis strain CRPM10 plasmid pNDM-5, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP043332 | Proteus mirabilis strain CRPM10 chromosome, complete genome | 5 crisprs | WYL,c2c9_V-U4,cas3,DEDDh,DinG,c2c10_CAS-V-U3,csa3,cas2,cas1,cas6e,cas5,cas7,cse2gr11,cas8e | 2 | 14 | 11 | 3 |
1. NZ_CP043332
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP043332_1 | 181111-181206 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP043332_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP043332_1
>1.1|181135|48|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder TATATTTTAAAAGATAAAACAGAATATAAGTTTATTATCTTGAAATAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043332_1
The CRISPR arrays of NZ_CP043332_1 >merge|NZ_CP043332|1|181111-181206|CRISPRCasFinder ATAGCTTAGAAAAATAAGTACTAATATATTTTAAAAGATAAAACAGAATATAAGTTTATTATCTTGAAATAGATAGCTTAGAAAAATAAGTGCTAA >NZ_CP043332|1|1|181111-181206|CRISPRCasFinder ATAGCTTAGAAAAATAAGTACTAA TATATTTTAAAAGATAAAACAGAATATAAGTTTATTATCTTGAAATAG ATAGCTTAGAAAAATAAGTGCTAA
>NZ_CP043332.1|WP_012368696.1|179523_180999_+|ketol-acid-reductoisomerase MANYFNTLNLRQQLSQLGKCRFMSRDEFADEANYLKGKKVVIVGCGAQGLNQGLNMRDSGLDIAYALRQEAIDEKRASWRRATENGFEVGTYEALIPQADLVVNLTPDKQHSAVVQAVQPLMKSGAALGYSHGFNIVEVGEKIRDDITVVMVAPKCPGTEVREEYKRGFGVPTLIAVHPENDAKGEGMAIAKAWAAATGGHRAGVLESSFVAEVKSDLMGEQTILCGMLQAGSLLCYDKMVAEGVEPGYAGKLIQFGWETITEALKQGGITLMMDRLSNPAKMRAYALSEQLKEIMAPLFAKHMDDIISGKFSETMMADWANDDKNLLTWREETGASAFENYPEYEGKISEQEYFDHGVLMVAMVKAGVELAFDTMIEAGIIAESAYYESLHELPLIANTIARKRLYEMNVVISDTAEYGNYLFSFAAVPMLKEFMTTLQSGDLAKHVPDSGTDNAQLRDINEAIRQHPIEIVGKKLRGYMTDMKKIAVAN >NZ_CP043332.1|WP_004246362.1|178463_179351_-|HTH-type-transcriptional-activator-IlvY MDIRDLKLFLHLAESCHFTKTAQAMHVSPSTLSRQIQRLEEQLGHPLFLRDNRQVTLTDAGEQLKRYAQHTLLQYKQLKHTLNQNSPSLSGELRLFCSVTAAYSHLPPILDRFRAENPLVEIKLTTGDAADAVDKVISDEADLGIAGKPEKLPENICFEKIGEIPLVLIAPALPGNVRHLATQEKPDWLNIPFIIPEHGPSRQRIALWFKRHRIQNPLIYATVSGHEAIVSMVALGCGIALIPQVVVDNCPEPVRNRISLLDNISLVEPFELGVCGLHKRLQEPVISAFWRLLHH >NZ_CP043332.1|WP_149127278.1|176903_178478_+|threonine-ammonia-lyase,-biosynthetic MAAFRPLTSAPSSAEYLKAALSAPVYEAAVVTPLQEMAKISQRLENTILVKREDRQPVHSFKLRGAYNMIAGLTPEQKAKGVVTASAGNHAQGVALSANRMGVKALIVMPIATADIKVDAVRQFGGEALLYGANFDEAKAKAIALAKEMGYTFVPPFDHPAVIAGQATLAMELLQQEVHLDRIFVPVGGGGLIAGVAVLIKQLMPEIKIIGVEAEDAACLKAALEAGHPVELPRVGLFAEGVAVKRIGDETFRLCQKYVDDVITVDSDAICAAVKDLFEDVRAIAEPSGALALAGLKKYVEEHQIKGERLAHVLSGANVNFHGLRYVSERCELGEKREALFAVTIPEQKGSFLRFCQILGQRVVTEFNYRYSDADPENARIFVGVRLSQGLQERKEIVQQLTEAGYQVSDLSDDEMAKLHVRYMVGGRPNQPLKERLFSFEFPEAPGALMKFLKTLGTYWNITLFHYRSHGTDYGRVLVAFELPETEGRFERHLDALGYEYHDETGNPSFQLFLSPQTASLVVE >NZ_CP043332.1|WP_004249676.1|175049_176900_+|dihydroxy-acid-dehydratase MPKYRSATTTHGRNMAGARALWRATGMTDADFGKPIIAVVNSFTQFVPGHVHLRDLGKLVAEQIEAAGGVAKEFNTIAVDDGIAMGHGGMLYSLPSRELIADSVEYMVNAHCADAMVCISNCDKITPGMLMASLRLNIPVIFVSGGPMEAGKTKLSDQLIKLDLVDAMIQGANPNVSDADSEQIERSACPTCGSCSGMFTANSMNCLTEALGLSQPGNGSLLATHADRKTLFINAGKRIVELTKRYYEQDDLSALPRNIAKKEAFENAMILDIAMGGSTNTVLHLLAAAQEGDVDFKMEDIDRLSRQVPHLCKVAPSTQKYHMEDVHRAGGVMGILGELDRAGLLNRNVNNILGLSLPETLAQYDVMLSQDEQVKSMYQAGPAGIRTTKAFSQDCRWPTLDTDREQGCIRSKAHAYSQDGGLAVLSGNLAQDGCIVKTAGVDEDNLVFSGPAKVYESQDDAVEAILGGKVVAGDVVIIRYEGPKGGPGMQEMLYPTSYLKSMGLGKACALITDGRFSGGTSGLSIGHVSPEAANGGIIGLVEEGDIVDINIPNREINLRVDEKTLAARREAQLARGDKAWTPKDRQRQVSFALRAYASLATSADKGAVRDKSKLGG >NZ_CP043332.1|WP_004246365.1|174050_174977_+|branched-chain-amino-acid-transaminase MTKQADYIWFNGEMVPWAEAKVHVMSHALHYGTSVFEGVRCYDSHKGPVVFRHREHMQRLHDSAKIYRMPVAQSVDELMEACRETLRKNQLVSAYIRPLVFIGDVGMGVNPPEGYKTDIIIAAFPWGAYLGEEALDKGIDAMVSSWHRAAPNTIPTAAKAGGNYLSSLLVGSEARRHGYQEGIALDVHGYLSEGAGENLFEVKDGVIFTPPFTSSALPGITRDAIIKLAKDLGYEIREQVLSRESLYLADEVFMSGTAAEITPVRSVDGIQVGIGRCGPVTKAIQKAFFGLFTGETEDKYGWLDPVNP >NZ_CP043332.1|WP_004246366.1|173761_174040_+|acetolactate-synthase-2-small-subunit MNQHNITIEARFCPEILERILRVIRHRGFHICSMNMNITESNYINLALTVSSQRPVDLLCSQLTKLADVAGIQVLHQQQKEKLQFISALSAM >NZ_CP043332.1|WP_063108950.1|172115_173765_+|acetolactate-synthase-2-catalytic-subunit MNGAQWLVQALRKQRVETVFGYPGGAIMPVYDALYDGGVEHVLCRHEQGAAIAAIGFARSTGTTGVCIATSGPGATNVITGLADALLDSVPVVAITGQVASNLIGTDAFQEVDVLGLSLACTKHSFLVSDVNELPRVVSEAFSIAKQGRPGPVLIDITKDVQLADASHLADYPLPQEQEFPYPEHEIAQALQMLAQAKKPILYVGGGVAMSQGVEALRSFVKQTQIPVVSTLKGLGCANAFDANYLGMLGMHGTKAANYAVQRSDLLIAVGARFDDRVTGRLNTFAPNAKVIHIDIDYAELNKLKQAHIALLGDAKVLLPKLSQPLAIEAWQEEVQQLIAEYAWRYDHPSEAIYAPLLLKQLSDAKPENSIVTTDVGQHQMWSAQHMTFDAPENFITSSGLGTMGFGIPAAIGAQIARPDACVICVSGDGSFMMNVQELGTIKRKQLPIKLVLLDNQRLGMVRQWQELFFEQRYSETILTDNPDFVALAKAFDIPGQRITEKAQVAEAIKCLLTSDGPYLLQVSIDDAENVWPLVPPGASNDEMMEKSK >NZ_CP043332.1|WP_017827031.1|171884_171986_+|ilv-operon-leader-peptide MNTIVLVISLIIVSVVVIINPLCGAALGRRKAN >NZ_CP043332.1|WP_149127805.1|169907_171440_-|YifB-family-Mg-chelatase-like-AAA-ATPase MALAVIYTRASLGISAPLITIEAHISQGLPGLTLVGLPETVVKEAKDRVRSALINSGYSYPAKRITINLSPADLPKEGARYDLPIALAILIASEQLISDKLNSYEFIGELALSGKLQKVNAVIPSILSANKDNRISIISIEHQSEVSLLPNKSALLASHLLDICHHLENNTPLIEAKNNINHKTIENQNNKDISDIIGQNNAKRAAEITAAGNHNILFLGPPGTGKTMLAQRINTLLPPLTAKEALDVLIISSLSNTIHHDGKWPLRPFRAPHHTASAVALTGGGSIPKPGEITLAHHGILFLDELPEFDRRVLDALREPLDACKITISRAKAKISYPANVLLVGALNPSPTGHYQGTHNRTPVKQVLRYLSKVSGPFLDRFDLSVEMPLLPQGALLQSTHTNESSSIIRARVLQARERQFQRSGKLNTYLSSKEIEHFCQLHTEDALFLEETLNKLGLSIRAWHKILRVSRTIADLENEQKIQRNHLIEALSFRAMDRLMIYLQKQLEG >NZ_CP043332.1|WP_004246370.1|169521_169860_+|DUF413-domain-containing-protein MAESFITTNRFFDNKHYPRGFSRHGDFTIKEAQILERHGQAFNELDLGKREPATEAEKLFVAMCRGEREAATVEEKIWKKYTSRISRPKRFHTLSGGKPQLDPSDDYTDSDD >NZ_CP043332.1|WP_004246360.1|181257_181527_-|type-II-toxin-antitoxin-system-mRNA-interferase-toxin,-RelE/StbE-family MRKVSYSGQFKKDLKLAEKRGKDINKLKEIILLLVQGKRLPAQLKDHPLTGNWKPRRDLHIEPDWLLIYKIDNDTVHFDRTGSHSDLFK >NZ_CP043332.1|WP_004253075.1|181527_181776_-|hypothetical-protein MSIKSELIATKVDIELKEAFVAIARNKHRPASQILRDLIRVYVESNQTQPNEKTLNTFAKTDKGDDVFYAEDAHDLFKKLDI >NZ_CP043332.1|WP_004249673.1|181948_183970_+|DNA-helicase-Rep MRLNPGQQKAVEYVSGPCLVLAGAGSGKTRVITNKIAYLIRQCRYSAKQIAAVTFTNKAAREMKERVAQTLGKQEAKGLMISTFHTLGLEIIKREYKALGIKSNFSLFDDQDQSALLKELTVDLLEEDKDLLSQLKSQISNWKNDMLTPEQVIGRAQSQQDHTFAECFRRYEQHLLSCNVLDFDDLISKPTLLLRTNEEVRARWQQRIRYLLVDEYQDTNTSQYELVKWLVGERARFTVVGDDDQSIYSWRGARPQNLVLLQKDFPQLNVIKLEQNYRSSGRILKSANILIENNPHVFEKRLFSELGYGDELRVLTANNEEHEAERVAGELIAHHFINKTNYKDYAILYRGNHQSRIFEKYLMQNRIPYRISGETSFFSREEIKDILAYLRVITNPDDDAAFLRIVNKPRREIGPMTIQKLGEWAKVRDKSLFNACFDLGLSQTLTGRGLSALQAFSQWMARIVQQSEREPLLAVRDLLHEMDYESWLYETSSSAKAAEMRMKNINQLFSWMSEMLEGDELHEPMTLSQVVNRFTLRDMMERGETDEELDQVQLMTLHASKGLEFPHVFLVGMEEGILPHQSSIDEDNVEEERRLAYVGITRAQKTLTFTLCKERRQYGELIRPEPSRFLYELPQDDLHWDTNKKKVLSAQEKQEKGQKGVAGLKAMLARHKP >NZ_CP043332.1|WP_004246357.1|184044_185553_-|guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate-diphosphatase MLKSSSLYAAIDLGSNSFHMLVVREIAGSIQVLSRVKRKVRLAAGLNKENELSEQAMERGWQCLRLFSEYLRDIPAEQIRVVATATLRIAKNADIFVAKASEILGNTVHVISGEEEARLIYRGVAHTTGGAEQRLVVDIGGGSTELVTGTGAKTTQLMSLSMGCVTWLERYFSDRSLTEENFAQAQQAAKAILAPVAEKLIQQGWQVCVGASGTVQALQEIMIAQGMDELITLPKLERLKQKAIECGKLEELEIEGLTFERALVFPSGLAILIAIFETLHIENMILAGGALREGLVYGMLHLPIEQDIRQRTLRNIQRRFQIDIEQAHRVQQLAEHFFIQVSKSWQLDNRCRELLSSACALHEIGLSVDFRQAPSHASYLVSHLDLPGYTPAQRRLIASFLRNQKGIIDLAPLNQQNALPINQAYRLVRLLRLAIIFASRRRDDTLPALRLRTEDEKLIITLPHQWIAEHPLRAENLHEEIQLQSYVHWPLMLEEQNNSRIG >NZ_CP043332.1|WP_004249672.1|185556_186855_-|ATP-dependent-RNA-helicase-RhlB MSKTYLTEKKFSDFALHPKVIEALEKKGFSNCTQIQALTLPITVKGHDIAGQAQTGTGKTLAFLTSTFHYLLTHPAKEGHEKNQPRALIMAPTRELAVQIYTDAQPLAQSTGIKMGLAYGGDGYDEQLKVLNNGVDIVIGTTGRLIDYVKQGHINLNAIQVVVLDEADRMYDLGFIKDIRWLFRRMPNAAERMNMLFSATLSYRVRELAFEQMNNPEYVEVEPEQKTGFSIKEELFYPSNEEKMRLLQTLIEEEWPERCIIFANTKHRCDDIWAHLAADGHRVGLLTGDVPQKKRLRILEDFTQGNIDILVATDVAARGLHIPSVTHVFNYDLPDDCEDYVHRIGRTGRAGKSGNSISLACEEYALNLPAIETYIQHAIPVSKYNSDALLTDLPEPKRRHRPRQGQPRRNNSAPRRGNNTQRNNRNKRPSHS >NZ_CP043332.1|WP_004246355.1|186974_187301_+|thioredoxin-TrxA MSDKILHLSDNTFDVDVLQATGPVLVDFWAEWCGPCKMIAPILDEVATEYAGKLTVAKLNIDENPATAPKYGIRGIPTLILFKNGAVAATKVGALSKTQLKEFLDENI >NZ_CP043332.1|WP_004246354.1|187862_189122_+|transcription-termination-factor-Rho MNLTELKNTPVSELIALGENMGLENLARMRKQDIIFSILKQHAKSGEDIFGDGVLEILQDGFGFLRSSDSSYLAGPDDIYVSPSQIRRFNLRTGDTIAGKIRPPKEGERYFALLKVNEVNFDKPENARSKILFENLTPLHANNRLRMERGNGSTEDLTARVLDLAAPIGRGQRGLIVAPPKAGKTMLLQNIAANIAHNYPDCVLMVLLIDERPEEVTEMQRLVKGEVIASTFDEPASRHVQVAEMVIEKAKRLVEHKKDVIILLDSITRLARAYNTVVPSSGKVLTGGVDANALHRPKRFFGAARNVEEGGSLTIIATALVDTGSKMDEVIYEEFKGTGNMELHLSRKIAEKRVFPAIDYNRSGTRKEELLTSQDELQKMWILRKIIHPMGEIDAMEFLINKLAMTKTNEEFFDFMKRS >NZ_CP043332.1|WP_004246352.1|189516_190608_+|UDP-N-acetylglucosamine--undecaprenyl-phosphate-N-acetylglucosaminephosphotransferase MDILKMSTNVFYVFLFSFAFLFVARKVAKKIGLVDKPNYRKRHHGLIPLVGGISVYFGIVFAFYVSDIYIPHKELYLICAGILVFIGALDDRYDISVKIRATIQALVGIAMMVFGGLKLESLGHAFGPWDMHLGPFGYIVTLFAVWAAINAFNMVDGIDGLLGGLSCVSFGALGILLYQSGSSALAFWCFSFIAAILPYIMLNLGVCGKKFKVFMGDAGSTLIGFTIIWLLISSTQVDPHPINAVTALWIIAIPLMDMVAIMYRRLRKGMSPFSPDRQHIHHLIMRAGFTPRQAFVLITLAAAVLAAIGIIGENLSFVPEWVMLALFLLAFVMYGYCIKRAWRVARFIKRYKRRLRKATQLKH >NZ_CP043332.1|WP_004249670.1|190631_191690_+|ECA-polysaccharide-chain-length-modulation-protein MNSENNVSRQGFSPDNELDIRGLCCALWSGKRWIIGFALLFALIALGASYLMQPKWSAIAMTERPTVNNLGSYYSQSQFLRNLDTQINPSVTVSQLSIPDEAYQEFVTQISAFDTRREFWLQTDYYKQRKENDAQADAALLDELINNIQFTPADEKKLVNDQLKLIAETANDSSQLLNEYIAFANKRAAEHLNEEVIAAWATRTQSMKALVKRQEMAAQAAYQRQINLLKQSIKVAEKQGISQKQTSIAIDELPDSKLFLLGVPLLQSQLETLMATGPDFDSDYDQNTAMLSTLAVGAKLQDNFQTYRFLRTPEDPVKRDSPRRAFMMVLWGAIGVLVGAGVALVRRSSLKK >NZ_CP043332.1|WP_004246349.1|191819_192950_+|UDP-N-acetylglucosamine-2-epimerase-(non-hydrolyzing) MKVLTVFGTRPEAIKMAPLVHALANDDSFEAKVCVTAQHREMLDQVLNLFEIKPDYDLNIMKPGQDLTDITCRILEGLKPVLASFQPDVVLVHGDTTTTMAASLAAFYQQIPVGHVEAGLRTGNLYSPWPEEANRTIAGHLAMYHFAPTETAKLNLVREAVADKNIFVTGNTVIDALFWVSERVMGNQTLLDELAVQYPFIQPERKMILVTGHRRESFGGGFERICQALAEIALAHPDVEVVYPVHLNPNVSEPVKRILHGINNIKLIQPQDYLPFVYLMNHAYLILTDSGGIQEEAPSLGKPVLVMRDTTERPEAVEAGSVRLVGTDTKRIVSEVTSLLTDENAYHQMSKATNPYGDGHACQRILEALKNNQVTL |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP043332_2 | 1574149-1574264 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP043332_2
|
2 spacers
spacers of NZ_CP043332_2
>2.1|1574174|19|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder GAAACGTCGAAAGTGAGGG >2.2|1574218|22|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder GAAACCGCAGAAATGCAGAATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043332_2
The CRISPR arrays of NZ_CP043332_2 >merge|NZ_CP043332|2|1574149-1574264|CRISPRCasFinder TCTGAAACGTCGAAAGTGAGGAATGGAAACGTCGAAAGTGAGGGATCGGAACGTCGAAACTGCGGAATGGAAACCGCAGAAATGCAGAATCATGGAAACGTCGAAAGTGAGGAATC >NZ_CP043332|2|2|1574149-1574264|CRISPRCasFinder TCTGAAACGTCGAAAGTGAGGAATG GAAACGTCGAAAGTGAGGG ATCGGAACGTCGAAACTGCGGAATG GAAACCGCAGAAATGCAGAATC ATGGAAACGTCGAAAGTGAGGAATC
>NZ_CP043332.1|WP_036904897.1|1573584_1573764_+|DUF4222-domain-containing-protein MSNENPNQLDRYYKNHRGIVVHVVRYDREKQRVIFMLDGCDDPQCEPVQRFKEKYTRVK >NZ_CP043332.1|WP_071425561.1|1572868_1573327_+|hypothetical-protein MSNQSIKQVVKEMCEATAGGREAMAGALGLSLTSFNNKLYEKNGCRSFDLNELLAMQDISKTVLFAEFVARESNRLLVDRISPADLDQTELFTLRSNVDEMQGRLALLMKDSLADGVIDNEEEQKIKMMLDGLISQIRTFMNAFVSLHQKRN >NZ_CP043332.1|WP_049210565.1|1572596_1572812_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MQTPLRLLRIKQNLTLSKVAEAVQIDVGNLSRIERGAQKTSLEVAERLVAFFNGELTEMQILYPKKFSNHK >NZ_CP043332.1|WP_049211705.1|1571809_1572499_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MEIGKKIRSIRLKRNMTIAELANAIDSDPGNVSRLETGKQKSFTEQQLKKIANALSISLLDLFSDEDNHTVYKHSNLNHDEMNEDLYKVQLLDISASAGPGCVRTSDVIDVIHSIEYDTEQAKLLFGSRPANSVKVINVRGDSMSGTIEPGDIIFVDISIDYIDGDGIYVFSFDGNIHVKRLQIVPDEIIVLSDNPKYTQWKINSTNEHRFCVHGKVLISQSLEYRRHA >NZ_CP043332.1|WP_149127445.1|1571458_1571662_-|hypothetical-protein MTTEPIIIAPDGFTNEDIAKWMRCKLLYIDYLPVLHGKRERLMSDVKKLDAEIAEYISKSAIQIQSK >NZ_CP043332.1|WP_149127444.1|1571144_1571327_-|hypothetical-protein MGVKKSNLQSARNPNPNRADETTGGPLFLIMTLTISKGTGIICEMSYQDYVNSLVPFLIV >NZ_CP043332.1|WP_149127443.1|1570746_1571121_-|hypothetical-protein MSKEDRKTNVPDFLSELDAGVFENKVSAVLNDVALGVLNNGGKGKVTIELDFARLSNSMEEKRVEITHKLKFSAPTPRGKRAEEDTTKTPMYVGKGGKLTIMQEDQGQLFSLQGQPDGKLKSVN >NZ_CP043332.1|WP_149127442.1|1569853_1570681_-|DUF2303-family-protein MSQLDGNAISQIQNMAVASLSLEAIEKSLCPAIVLPNEFKVSSLENLQEGRFRFRGEMKTTSISDFVKYSIKNAIDEGVSCFIDADEMSAKTIFNIGTIGEPGHADNTALVKLKQTAPFAALLKIDGVKHRQKELAEWLEDWRDYLMAFDADGNVLDIKQAISAVRRITIESTRSAEHEDHDFSAKRSVLENVEARSKDVMPTAFQFTCIPYDELKERSIKLRYSVLTGGDVPVLVLRIVQLENLEEQIAQEFRNLLCDEFDESDIETFIGKFSA >NZ_CP043332.1|WP_149127441.1|1569297_1569795_-|single-stranded-DNA-binding-protein MANGSVNKVILIGNLGRDPEIRYLPSGGAVANLAVATSEKWRDKQTGENREKTEWHRVVLFGKLADIASGYLCKGSQVYIEGQLQTREWDDNGVKRYTTEIVVKIGGSMQMLGGTSKSAGSQPAQQNPPPAQPQAQSSQPPMDFEDDIPFAPIGLMYPRHLINVV >NZ_CP043332.1|WP_149127808.1|1569084_1569264_-|hypothetical-protein MDMSKQMYLHASTNNIGSECKTELDITEDEWNKLTEKEQDQLIGEFIANVCNWWVQPEE >NZ_CP043332.1|WP_064506368.1|1574891_1575530_+|phage-N-6-adenine-methyltransferase MIDYALKLQELKNQPAHKLKEIGDQWQSPDNLYYGINSKYGPFTLDLFTDGQNSKCPHFYTVEDNALTQDWAEKLKEIGGSAFGNPPYSRSSYHEGQPLTGVGHIMSHALAMREKHGRYVFLLKAATSETWWPEEADHVCFIRGRIGFDVPEWFVPADEKQKPTGAFFAGAIVVFDKTWTGKKFDYIHRDELEQIGKAFIEQMKWLASRGVA >NZ_CP043332.1|WP_149127447.1|1575526_1575922_+|hypothetical-protein MKTTEQILNQYKEGDKIDRHIVSRDLGIALSSSSRALSYLNGLGALVRVGNEDRPVRYIVTNEAEHIYQAIIEERKLGESAYLQKLKTQKAKKRALPTIKWVKHATSNFDLMGKLPTEPYDSLVRTARGNH >NZ_CP043332.1|WP_049255030.1|1576096_1576900_+|KilA-N-domain-containing-protein MNGLIVIDGFQVRRDVAGRYCLNDLHRVSGGEKRHQPSNWSSLAQTKELIDEISTAPEITGAPIATVAGGYNQGTYVCKELVYAYAMWISASFHLKVIRTFDALVSQQHQEKLSDKVQAGVILLESMSKSLNFSNSSKLGAYQKLQAMAGLPELAPVYAIDAPSGSMDGSSRPTVALSTLIKKHNLPISAPQAFKRLAELGIVERLSRPSTKTASKVKEFWSVTARGCQFGKNMTSPNNPRETQPHFFESKTDELIRMVMLNKQVSA >NZ_CP043332.1|WP_149127448.1|1576896_1577922_+|DUF968-domain-containing-protein MKLLLTPYIQKELGVVLLKPGAELLEQFRNHQRVIISDVPQSLDVLPSGALTGDEQPILNNKHIVQFLNSKKVIHTIDKVSPMDTWVAHHIHCCQINNDADNYHHHELVTTFNEAGVIRTCWYHDNHIRNSSAGWVAELAHKNRIDWMLDTIRFRLRLDCGHQLTIPDFFTFAVMHNVIDELPDAILRRVLDWPDKPRERRVHGGFPEADIVPNEMSALSAMSGRLEVIKPVIKVAVDPEPPASFLLKPKMQRWENTQWLQWVKTQPCCVCGQQADDPHHIIGHGMGGIGTKAHDLFTIPLCRIHHDELHRDPKQWEVTHGNQLELLFHFLNRSLGIGAFI >NZ_CP043332.1|WP_036901017.1|1577949_1578630_+|hypothetical-protein MPIYAHDLKYLSDMASIATSNLRASTKGQLEAFEDFGLTDTRATPRVRIRDLKLNGRFVCRDTDPIYVLETRCRRTPKPMIEPVDFLLCSWRRAINALSEEQHSWIMYCYGYSLKFEHQVNISVHVWSEFEKQHKGKKITKKVKERLRSLVWLSVQAYTRRNYSQTELARLVGVKRDNWSKNYQVYWDYLLYVCYELDKLALLSMRRVRIELINKNNNDNLQKSTK >NZ_CP043332.1|WP_126656782.1|1578806_1578986_+|hypothetical-protein MTDEARVFFDKIPEDKLITAQFMFWETGFSVPKCGFLITQFVMAGLLRELGNGFFQKNI >NZ_CP043332.1|WP_149127449.1|1579053_1580076_+|site-specific-DNA-methyltransferase MQLFNDDALSILKTLPDNSIDLIATDPPYFRVKSCAWDNQWDNVESYLSWLDEVLAEFWRVLKPNGSLYLFCGSKLASDTELLVRGRFNVLSHIIWAKPSGPWKRQNKESLRAFFPSTERILFAEHYQKPVTAKGSEFSLKCKELKQNVFKPLIDYFRNARLALQVSAKEIDQATGKQMCSHWFSNSQWQLPSEEDYKKLQTLFTHIADKHEKLSPLSRQFTELEREQVTLQKDYQELIKEYGLLRRPFFVTADVPYTDVWAYPPVQYYPGKHPCEKPSAMMEHIIRSSSREGELVADFFMGSGATLKAALKLNRKVLGVELERERFEQTEQEIKALTCK >NZ_CP043332.1|WP_004250558.1|1580337_1580607_+|hypothetical-protein MRMDKLTNATYGTAGLTAFFASLSLYEWGFVIGMGFSMLLGLATYLMTRREQRKRTALFAELVHRNCSSDPREIEKIVGEMLTKAKKDI >NZ_CP043332.1|WP_149127450.1|1580606_1581077_+|glycoside-hydrolase-family-protein MNLKQKVTAVASAGAVSIALTVIGYFEGVRYEPYRDVAGILTVCYGHTGNDIIQGKTYTQQECDELLQKDFIRTQRQVDILVKVPVDDKTKASLYSFAFNVGTTAFARSTLLKKLNAGDQNGACEEMKRWVYAGGKVWRGLVSRRDAESALCHGNL >NZ_CP043332.1|WP_141192328.1|1581219_1581681_+|lysis-protein MKHWKLYIVVVMVGIVAGGCALINAQAKRINTLTENNKELTTALEEQKDINIDYQARIERLNQLDTRHTQELVNAKNEISRLRDISERNPDRVYIKAECPKSTTTSTASMDDATTARPTDTAIRNYWLLRERIAESEQIIKGLQDYIKQECME |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP043332_3 | 2625785-2626362 | TypeI-E |
I-E
Consensus repeat of NZ_CP043332_3
|
9 spacers
spacers of NZ_CP043332_3
>3.1|2625814|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT AATCCTGCTCGACTTTTTAAAGCCGTGGATAA >3.2|2625875|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAGATCCAAATAATATGAATTGGTTTACTGC >3.3|2625936|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTTTTGGCGTGATGATAGCAAAGTTTTTGTC >3.4|2625997|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGGTCAGTCCATTTTCTGGTTTGCAGAGAAC >3.5|2626058|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCGACGAAAGCCGTTATTCAATCGGCTAAATC >3.6|2626119|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTCTTGAAGGTCAACATCAATAGGGATTATTG >3.7|2626180|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCCCTGCATCTTCTTAATACTATCTAACGTTA >3.8|2626241|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCCCTGCATCTTCTTAATACTATCTAACGTTA >3.9|2626302|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATTAATTGCTCGCGTAACATTTGTTTTTTAG |
cas2,cas1,cas6e,cas5,cas7,cse2gr11,cas8e,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043332_3
The CRISPR arrays of NZ_CP043332_3 >merge|NZ_CP043332|3|2625785-2626362|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATTTATCCCCGTATACACGGGGAACACAATCCTGCTCGACTTTTTAAAGCCGTGGATAACGGTTCATCCCCGTATGCACGGGGAACACAAAGATCCAAATAATATGAATTGGTTTACTGCCGGTTCATCCCCGTATGCACGGGGAACACTCTTTTGGCGTGATGATAGCAAAGTTTTTGTCCGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACATCTGGTCAGTCCATTTTCTGGTTTGCAGAGAACCGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACACGCGACGAAAGCCGTTATTCAATCGGCTAAATCCGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACACGTCTTGAAGGTCAACATCAATAGGGATTATTGCGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACACCCCCTGCATCTTCTTAATACTATCTAACGTTACGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACACCCCCTGCATCTTCTTAATACTATCTAACGTTACGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACACTATTAATTGCTCGCGTAACATTTGTTTTTTAGCGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC >NZ_CP043332|3|3|2625785-2626362|CRISPRCasFinder TAATTTATCCCCGTATACACGGGGAACAC AATCCTGCTCGACTTTTTAAAGCCGTGGATAA CGGTTCATCCCCGTATGCACGGGGAACAC AAAGATCCAAATAATATGAATTGGTTTACTGC CGGTTCATCCCCGTATGCACGGGGAACAC TCTTTTGGCGTGATGATAGCAAAGTTTTTGTC CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAT CTGGTCAGTCCATTTTCTGGTTTGCAGAGAAC CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC GCGACGAAAGCCGTTATTCAATCGGCTAAATC CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC GTCTTGAAGGTCAACATCAATAGGGATTATTG CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC CCCCTGCATCTTCTTAATACTATCTAACGTTA CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC CCCCTGCATCTTCTTAATACTATCTAACGTTA CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC TATTAATTGCTCGCGTAACATTTGTTTTTTAG CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC >NZ_CP043332|3|1|2625785-2626362|CRT TAATTTATCCCCGTATACACGGGGAACAC AATCCTGCTCGACTTTTTAAAGCCGTGGATAA CGGTTCATCCCCGTATGCACGGGGAACAC AAAGATCCAAATAATATGAATTGGTTTACTGC CGGTTCATCCCCGTATGCACGGGGAACAC TCTTTTGGCGTGATGATAGCAAAGTTTTTGTC CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAT CTGGTCAGTCCATTTTCTGGTTTGCAGAGAAC CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC GCGACGAAAGCCGTTATTCAATCGGCTAAATC CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC GTCTTGAAGGTCAACATCAATAGGGATTATTG CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC CCCCTGCATCTTCTTAATACTATCTAACGTTA CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC CCCCTGCATCTTCTTAATACTATCTAACGTTA CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC TATTAATTGCTCGCGTAACATTTGTTTTTTAG CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC >NZ_CP043332|3|1|2625846-2626362|PILER-CR CGGTTCATCCCCGTATGCACGGGGAACAC AAAGATCCAAATAATATGAATTGGTTTACTGC CGGTTCATCCCCGTATGCACGGGGAACAC TCTTTTGGCGTGATGATAGCAAAGTTTTTGTC CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAT CTGGTCAGTCCATTTTCTGGTTTGCAGAGAAC CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC GCGACGAAAGCCGTTATTCAATCGGCTAAATC CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC GTCTTGAAGGTCAACATCAATAGGGATTATTG CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC CCCCTGCATCTTCTTAATACTATCTAACGTTA CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC CCCCTGCATCTTCTTAATACTATCTAACGTTA CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC TATTAATTGCTCGCGTAACATTTGTTTTTTAG CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC
>NZ_CP043332.1|WP_049197437.1|2624392_2625616_-|alanine-racemase MSLGIRYLALLPLFVITACQQPVNYNPPATQVAQVQPAIVNNSWIEISRSALDFNVKKVQSLLGKQSSLCAVLKGDAYGHDLSLVAPIMIENNVQCIGVTNNQELKEVRDLGFKGRLMRVRNATEQEMAQATNYNVEELIGDLDMAKRLDAIAKQQNKVIAIHLALNSGGMSRNGLEVDNKSGLEKAKQISQLANLKVVGIMSHYPEEDANKVREDLARFKQQSQQVLEVMGLERNNVTLHMANTFATITVPESWLDMVRVGGIFYGDTIASTDYKRVMTFKSNIASINYYPKGNTVGYDRTYTLKRDSVLANIPVGYADGYRRVFSNAGHALIAGQRVPVLGKTSMNTVMVDITSLNNIKPGDEVVFFGKQGNSEITAEEIEDISGALFTEMSILWGATNQRVLVD >NZ_CP043332.1|WP_149127582.1|2621915_2624315_+|membrane-bound-PQQ-dependent-dehydrogenase,-glucose/quinate/shikimate-family MKISHFYRWIVFIILTILALYFTVLGGYLVSLAGSPFYLFTGVMLLIIAACFLSRKKSTLLLFNFLFLITIVWSIWESGFDFWALAPRLDIIFILGLLLIPFTLNNNVYTCRTNKIGLFTLLATTLIIILGSSLTDPHAINGQFTQQQPTNSISPIGVNDNDWPAYGRTQAGIRYSPLTQINSDNVDKLVEKWTFHTGDEKRANDAVEITNEVTPIKIEDNLFLCTPHQYLISLDPATGKEKWRFDSKLQYNKSFQHMTCRGVAYYNQNNSAEFAKSLEVRQPSISDECPEKVFLPVNDGRLIAVNAQTGNACRDFGQNGEINLLASMPYAYLGGYNPTSPPIVTGNTIIIGGSVTDNLSTQEPSGVIRGYDVNSGKLIWVFDTGAEDPNAMPGKETQFVHNSPNAWAPLAYDAQTDVVYIPTGVGTPDIWGGDRHPLKERYANSVLALKGSTGELLWHFQTTHHDLWDMDVPSQPLLVDIKTDKNETIPAIYIVTKTGNVFVLDRRDGTPIVPVTEKPVPTSVKYGPQTQGEHYSPTQPFSALNLAPKNKLQGSDMWGGTMADQLLCRIAFHQLNYEGIYTPPSENGTLVFPGNLGIFEWGGISVNQDRQVAVMNFITLPFISKLYLKDPQDSQAIDAGHGEQGLQPMTGTPYSVDIHPFLSPLGLPCKQPPWGFVAGVDLTKNELIWQQRFGTIRDSLPNLVELPPLKIGVPGLGGAISTAGNVMFVAASQDNYIRAFNVTNGKMLWEARLPAGGQATPMTYSIGGKQYVVIMAGGHGSFGTKMGDSLVAYGLPDNL >NZ_CP043332.1|WP_004247166.1|2621534_2621678_+|type-I-toxin-antitoxin-system-Hok-family-toxin MTKLALIGLITVCITVLCFTLLRHERLCSFNISSGNTLVQANLSCDK >NZ_CP043332.1|WP_004247166.1|2620993_2621137_+|type-I-toxin-antitoxin-system-Hok-family-toxin MTKLALIGLITVCITVLCFTLLRHERLCSFNISSGNTLVQANLSCDK >NZ_CP043332.1|WP_004247166.1|2620453_2620597_+|type-I-toxin-antitoxin-system-Hok-family-toxin MTKLALIGLITVCITVLCFTLLRHERLCSFNISSGNTLVQANLSCDK >NZ_CP043332.1|WP_041701186.1|2617973_2620118_+|phosphate-acetyltransferase MSRTIMLVPTDTRVGLTSVSLGVIRSMEQKGVRLSVFKPIAQPRVKGALDQTTAIIRSHSTIQSAEPLNMDYVESLLSSNKKDVLMEEIVARYHENTADAEVVLIEGLVPMRKHPFAQSLNYEIAKTLGAEIVFVTALGNNTAEQLKERIEFARAEFGGVKNQNITGVIVNKLNAPVDDQGRTRPDLSEIFDDSSKAIISNVDLNTIEKNSPLPLLGCIPWNFDLIATRATDMAKHLNATIVNKGDIETRRIKSVTFCARSIPHMLEHFRPGSLLVTSADRPDVLVSACLAAMNGVEIGAILLTGGYQIDAPIKQLCERAFETGLPIFMVNSNTWQTSLNLQSFSLEVPADDHERIEKIQNYVAQHINNQWIDSLTANSERPNRLSPPAFRYQLTELARKAKKRIVLPEGDEPRTVKAASICAERGIATCVLLGDPEEIRRVAAAQGVELGTGIELVNPKEVREIYVPRLVELRKNKGMTEVVAREQLEDNVVLGTLMLEKGVVDGLVSGAVHTTANTIRPPLQLIKTAPGSSLVSSVFFMLLPEQVYVYGDCAINPDPTAEQLAEIAIQSADSAKAFGIDPRVAMISYSTGNSGAGSDVEKVREATRLAQEKRPDLIIDGPLQYDAAVMADVAKSKAPNSPVAGKATVFIFPDLNTGNTTYKAVQRSADLVSIGPMLQGMRKPVNDLSRGALVDDIVYTVALTAIQASQQENA >NZ_CP043332.1|WP_149127581.1|2616693_2617896_+|acetate-kinase MSSKLVLVLNCGSSSLKFAIINPENGEEFLSGLAECFNLPEARLKWKMDGQKHEAALGAGAAHSEALNFIVNTILAEKPELSQQIAAIGHRIVHGGEKFTKSVVITDEVIKGIEAAIPFAPLHNPAHLIGIEEACKAFPHLINKMVAVFDTAFHQTMPEEAYLYALPYSLYKDHSIRRYGAHGTSHFFVSREAAKMLNKPVDELNVITCHLGNGGSVSAIVNGKCVDTSMGLTPLEGLVMGTRSGDIDPAIVFHLHDTLGMSVEDINKLLTKESGLLGLTEVTSDCRYVEDNYETKADAKRAMDVYCHRLAKYIGSYCALMEGRLDAIIFTGGIGENAAMVRELSLKKLALLGFEVDHQRNLDARFGKSGTITTDNSRLAVVIPTNEELVIAQDASRLTA >NZ_CP043332.1|WP_004243712.1|2615846_2616302_-|DUF412-domain-containing-protein MNEPTVTPPGFFKKLRLGNEYLKTWPVEKQLAPVFPENRMIKATRFGIRYMPPIAIFTLTWQIALGGDLGPAITTALFACSLPMQGLWWLGKRAATPLPAVLLNWFYEIREKFEQAGIALAPVEKTPTYLSLAHLLKRAFKQLDRSFLDDV >NZ_CP043332.1|WP_023843594.1|2615211_2615706_-|YfbU-family-protein MEMTHAQRLILSNQYKMMTMMDPDNAERYRRYQTIIERGYGLQLRELDRDFDEMSEETCRTIINIMEMYHALQVSRENLKSPEMPDARRVAFMGFDAATESRYLSYVRFMVNTEGRYTHFDSGSHGFNSQTPMWEKYQRMLAVWLACPRQYHLSSVEIQQILNA >NZ_CP043332.1|WP_004243707.1|2614514_2615177_-|sugar-phosphatase MTITCKGFLFDLDGTLVDSLPVVEYCWALFGERVGVSTQEINNYIHGKPAIESIRHFMPNATQAQIEETFRWLEKLEATQTEGLAPLPGAIELINRLNDLAIPWAIVTSGTVPIASTRQSVTGIPEPKHWVTAECITQGKPNPEPYLLGAKKLGLAPKECVVFEDAAAGIYSGLDAGCQVIAVHAPISLPRRNEIDLIIDSLNDLQIDKENQQVVIKHKC >NZ_CP043332.1|WP_017627993.1|2626420_2626717_-|type-I-E-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MSMIVVVTEAVPPRLRGRLAVWLLEVRAGVYVGNVSARIREMIWQQINEFAEDGNVVMAWGTNTESGFDFQTYGENRREPIDFDGLRLVLFKPYKEDV >NZ_CP043332.1|WP_017627992.1|2626719_2627640_-|type-I-E-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAFIPLRPIPIKDRHSMIFIGMGRIDVKDGAFVVIDEINGERMLIPVGSLACILLEPGTRISHAAVKLAATVGTLLIWVGEAGVRLYSVGQPGGARSDKLLYQAKLALDNDLRLKVVRKMFELRFGESAPLKRSVDQLRGIEGARVRKQYQMLAKKFKIDWKGRRYDPKDWEAGDIINRCISAATACLYGVTEAAILAAGYAPAIGFVHTGKPLSFVYDIADIIKFDTVVPVAFKVASYKAIAPDREVRIACREAFRKYQTLNKLIPLIEEVLSAGEITPPEPPIDAQPPAIPQAHPFGDEGHREK >NZ_CP043332.1|WP_049196926.1|2627640_2628318_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas6/Cse3/CasE MYLSRISIDYSADYLHSLLANKLPDGYTIHQLLWRLFTEEKERSFLYRLEIGKNGKPIFYILSSIAPTTKNNFFKIETKPFLPKLVKKMKLAFSLRANPTVCITDKEGKQHRHDVLMHAKKQAQLDGKDYSHDDIHHLMQQAALNWISSDDRLNKWGISLTQLPDIKAYTPERIKKPSGKIMSFSSVDYQGVLTIEEPHLFWQQYQQGFGRAKAFGCGLMLIRNI >NZ_CP043332.1|WP_017627990.1|2628317_2629055_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas5/CasD MAQYLVFRLYGPLASWGLPAVGGDRQTGIAPSRSAILGLLSASLGINRKDESKLLQLQQSVLVATKQLVPSMLLRDFHTAQVPSKRKNITHPTRRSELAEKDQNTILSSRDYRCDAIWIIAIKLTGHSQYTLEQLKNALLKPVYILSLGRKSCPLSLPMMPKIVEVEQLKEALDTQFPYITTSDKADSYWFHSDGWVTYFWEGNYQDIKGENIMTLYPWDDPINRQHWQFRQRKMYQMSVKRESE >NZ_CP043332.1|WP_036918645.1|2629067_2630102_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MSQFIQLHILTSYAPSNLNRDDLGRPKTAIMGGFERLRISSQSLKRHWRTSELFNIALSGNIGIRTKKFGLQLYDALIEGGVSEKNAKNWVELIIEQYGKIKKDSIETEQLVHISHLEKSLAFDLINLLIKEQREPTKQELESLKTINTSVDIALFGRMLASAPKYNIEAACQVAHAISVHSTVIEDDYFTAVDDLNNGETDTGSAHIGEAGFAAALFYSYICINKTQLIESLDGNEELANKAIQALTEVAIKVSPTGKQNSFASRAYASYVLAEKGSYQPRSLSVAFLKPIDDEDMENAAINALKFRMENFDKVYGTCAESRYQLNAVQGEGSLSGLLQFVAE >NZ_CP043332.1|WP_080973803.1|2630132_2630732_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MENNMGSYKSKNITLYNYPELKINVLRWWESLFLSPNELSKKGILPAPNRYKSELKRCDSITAIMLTEGFRALWLSFPVDLINNATAEDIERWATIVAILVYITQDSEKHFATIAGEKDESKKSCISESRFLQLQSSRTYDEFIRRLRRILIQIKGKSSVLSMCKDIEKWVLEKQRFSSIQTNKQIIIEWAMKYYQAAI >NZ_CP043332.1|WP_063108419.1|2630706_2632305_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse1/CasA MNIINQPWLPFRFRGGEIKTLPISAISHPDIIDFSLNRADFKGAAYQFAIGLLQTIFAPEDEDEWEEYFETPPSSKKLQSAFDKVAHAFNIMGDGPLFMQDFSTLEEQKNIPIAQLLIDAPGENGIKQNTDHFIKQGIADVMSLEMAVLALFTLQINAPSGGKGHLVSLRGGGPLTTLVYPAEENSTLWQKLWLNVINREFWEYDEPNFDDGSVFPWLIPLNLKEGKGEKVSPDDVHPLYMYWAMPRRIRLKVENKSVTCQISDMKSNFSVRYYVTKNYGLDYQEGWLHPLTPYYWDPKKPEMFPNSIKGRQGGIHYNLWDRLFLSSNENGQKSATVVSHYLKLYQLLEFTRKPRLLIFGYDMDNMKPRGWYNLEMPIFHVKDEYNNKIINEIKIIQKLTIDCLRSVKEQVKKAWFSSPKDMKGDISFIDLTFWQRSENIFFEVVQNIIVQIQKNDFLTHEQAKKWLNSIRKISISIFDEYALSALGTQKSVSGCIKARNGLIKDLYSNKRIKKFTEDFKITKENGEQYGIL >NZ_CP043332.1|WP_149127583.1|2632301_2634995_-|CRISPR-associated-helicase-Cas3' 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MDFFRFLMSDVLSEPAILVGLIALIGLIAQKKPATECIKGTVKTIMGFVILGAGAGLVINSLGDFSTIFQHAFGIQGVVPNNEAIVSIAQKSFGKEMALIMFFAMLINILIARLTPWKYIFLTGHHTLFMSMMVAVILATAGLEGAVLVAVGSLVVGVSMVFFPAIAHPYMKKITGSDDVALGHFSTISYVVSGFIGSKFGNKAHSTEEMNVPKSLLFLRDTPVAIAFTMGIIFIITCLFAGDTFVREVSGGKNWFMFSLMQSITFAAGVYIILQGVRMVIAEIVPAFKGISDKLVPNAKPALDCPVVFPYAPNAVLVGFLSSFAAGVIGMFILYALDWTVIIPGVVPHFFVGATAGVFGNATGGRRGAILGAFAQGLLITFLPVFLLPVLGDIGIANTTFSDADFGVIGILLGIIVR >NZ_CP043332.1|WP_012368108.1|2637398_2637686_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MKITVVCGNGLGSSLMMEMSIKSILKDLAVNADVDHVDLGSAKGTPSDIYVGTRDIAEQLNAQAVNGKIVSLDNMIDKVAMKEKLSTALRELGAL |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_CP043332_4 | 2635241-2636001 | TypeI-E |
I-E
Consensus repeat of NZ_CP043332_4
|
12 spacers
spacers of NZ_CP043332_4
>4.1|2635270|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAGATGAACCTAGAAAGCGCTGTTAAATATCA >4.2|2635331|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTACCAATAAACAGCAAAATGCGTTCAATTTC >4.3|2635392|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCCTCAGGAAATCCACCGTGCACTCTGCGCT >4.4|2635453|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTCCGTGCCGCCCTGACGTGGTGTCACAATG >4.5|2635514|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTAAAATGTCCGTTTTACTTTTCTCGTCTGA >4.6|2635575|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGTGTACCATCAGGTAATGTGATCTTTACGG >4.7|2635636|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACATCTTAAATTAAACACATCTCAACAGGTCG >4.8|2635697|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTACATCACCCGCCGTTAAACTAATATCAGCA >4.9|2635758|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCTGTGATGTATTGCGTCAAACGTTGATTTG >4.10|2635819|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGCGCTATGGCAATATCTGCCCAGTCCAATC >4.11|2635880|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAACACCATTTTCAAAAACGAGTCAGAGGAA >4.12|2635941|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACCAGCATCAATAACTCACATAAGCCAATAA |
cas3,cas8e,cse2gr11,cas7,cas5,cas6e,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043332_4
The CRISPR arrays of NZ_CP043332_4 >merge|NZ_CP043332|4|2635241-2636001|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGATTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACGAGATGAACCTAGAAAGCGCTGTTAAATATCACGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACTTACCAATAAACAGCAAAATGCGTTCAATTTCCGGTTCATCCCCGTACATACGGGGAACTCAGCCTCAGGAAATCCACCGTGCACTCTGCGCTCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACTTTCCGTGCCGCCCTGACGTGGTGTCACAATGCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACATTAAAATGTCCGTTTTACTTTTCTCGTCTGACGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACATGTGTACCATCAGGTAATGTGATCTTTACGGCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACACATCTTAAATTAAACACATCTCAACAGGTCGCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACCTACATCACCCGCCGTTAAACTAATATCAGCACGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACCTCTGTGATGTATTGCGTCAAACGTTGATTTGCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACTTGCGCTATGGCAATATCTGCCCAGTCCAATCCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACTAAACACCATTTTCAAAAACGAGTCAGAGGAACGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACTACCAGCATCAATAACTCACATAAGCCAATAACGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC >NZ_CP043332|4|2|2635241-2636001|PILER-CR CGATTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GAGATGAACCTAGAAAGCGCTGTTAAATATCA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TTACCAATAAACAGCAAAATGCGTTCAATTTC CGGTTCATCCCCGTACATACGGGGAACTC AGCCTCAGGAAATCCACCGTGCACTCTGCGCT CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TTTCCGTGCCGCCCTGACGTGGTGTCACAATG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ATTAAAATGTCCGTTTTACTTTTCTCGTCTGA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ATGTGTACCATCAGGTAATGTGATCTTTACGG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ACATCTTAAATTAAACACATCTCAACAGGTCG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC CTACATCACCCGCCGTTAAACTAATATCAGCA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC CTCTGTGATGTATTGCGTCAAACGTTGATTTG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TTGCGCTATGGCAATATCTGCCCAGTCCAATC CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TAAACACCATTTTCAAAAACGAGTCAGAGGAA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TACCAGCATCAATAACTCACATAAGCCAATAA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC >NZ_CP043332|4|4|2635241-2636001|CRISPRCasFinder CGATTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GAGATGAACCTAGAAAGCGCTGTTAAATATCA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TTACCAATAAACAGCAAAATGCGTTCAATTTC CGGTTCATCCCCGTACATACGGGGAACTC AGCCTCAGGAAATCCACCGTGCACTCTGCGCT CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TTTCCGTGCCGCCCTGACGTGGTGTCACAATG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ATTAAAATGTCCGTTTTACTTTTCTCGTCTGA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ATGTGTACCATCAGGTAATGTGATCTTTACGG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ACATCTTAAATTAAACACATCTCAACAGGTCG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC CTACATCACCCGCCGTTAAACTAATATCAGCA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC CTCTGTGATGTATTGCGTCAAACGTTGATTTG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TTGCGCTATGGCAATATCTGCCCAGTCCAATC CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TAAACACCATTTTCAAAAACGAGTCAGAGGAA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TACCAGCATCAATAACTCACATAAGCCAATAA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC >NZ_CP043332|4|2|2635241-2636001|CRT CGATTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GAGATGAACCTAGAAAGCGCTGTTAAATATCA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TTACCAATAAACAGCAAAATGCGTTCAATTTC CGGTTCATCCCCGTACATACGGGGAACTC AGCCTCAGGAAATCCACCGTGCACTCTGCGCT CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TTTCCGTGCCGCCCTGACGTGGTGTCACAATG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ATTAAAATGTCCGTTTTACTTTTCTCGTCTGA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ATGTGTACCATCAGGTAATGTGATCTTTACGG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ACATCTTAAATTAAACACATCTCAACAGGTCG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC CTACATCACCCGCCGTTAAACTAATATCAGCA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC CTCTGTGATGTATTGCGTCAAACGTTGATTTG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TTGCGCTATGGCAATATCTGCCCAGTCCAATC CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TAAACACCATTTTCAAAAACGAGTCAGAGGAA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TACCAGCATCAATAACTCACATAAGCCAATAA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC
>NZ_CP043332.1|WP_149127583.1|2632301_2634995_-|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MDKDYYSYWGKFKSENNHEYYHLLPYHSLDVAAVGMILFPENSKIIKDISTFLQIHPKEFSKLFLLLLSLHDIGKFSSSFQYINPNIIDKLKVPESRFSYDGNNYRHDRLGYYFWRKIKNTIFSSIIISNADYKERKISDGFWIIFETALGHHGKPINKNNIDESIENYIHKDNDKAAIDFTLDILKLFSPKLSVENFYDKGWKERLKQISWLLAGMVTLSDWIGSNRDYFPYYKKKIPLSEYWFLALNRAKKAVLSSGFNRNYQISPFISVEYHFGYKPTPLQQWAEKVTINEHPQLFILEDTTGSGKTEAALTLAHRLMEVDAADGFYFGLPTQATSNAMFLRIINHYKKIFDEKKEVPSIVLAHSASNMNEQFTKIIRDGNERYNISDNTASAQCYQWLSDSRKKALLATIGVGTLDQALLSMLPRRHQSLRLLGLNRKIIIFDEIHSADEFMFEIIEKLLSTHLHQGGSVILLTATLSLKQRKRIIDGWFNAFDQISPEIESKSFPLATHLTCFPKVIKKEYPLKSRNQVSRKVKVEIINKEDQCIDIIISAINNGNCVVWIRNTVNDAIKSYYDIKKRLSKDNNCLLFHSRFNLKDRKIREEQVLKYFGKNSTAQQRKGTVLIATQVFQESLDADADIMISDICPIDDLIQRSGRLHRHTRTKYGDYTSETIDKRRPPILYVHAPLFIETPSSCWLTEQFSSTEAVYRSPGRLWLTLRSLTRLGEINMPKDARQLIESVYSDNAYNEIPQSLIQKENNDIGEKKARVSKAKIQLLKINKGYSEESSEFWTEDHYDISTRYSDIEMVNILLLKKIKDNYVPWIEDSHFSIALSTVKISKKKYADKLVSVPQEVIDTINKQYPQARYLQLWIPDEDQYYQYDHLIGFCERQELS 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MDFFRFLMSDVLSEPAILVGLIALIGLIAQKKPATECIKGTVKTIMGFVILGAGAGLVINSLGDFSTIFQHAFGIQGVVPNNEAIVSIAQKSFGKEMALIMFFAMLINILIARLTPWKYIFLTGHHTLFMSMMVAVILATAGLEGAVLVAVGSLVVGVSMVFFPAIAHPYMKKITGSDDVALGHFSTISYVVSGFIGSKFGNKAHSTEEMNVPKSLLFLRDTPVAIAFTMGIIFIITCLFAGDTFVREVSGGKNWFMFSLMQSITFAAGVYIILQGVRMVIAEIVPAFKGISDKLVPNAKPALDCPVVFPYAPNAVLVGFLSSFAAGVIGMFILYALDWTVIIPGVVPHFFVGATAGVFGNATGGRRGAILGAFAQGLLITFLPVFLLPVLGDIGIANTTFSDADFGVIGILLGIIVR >NZ_CP043332.1|WP_012368108.1|2637398_2637686_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MKITVVCGNGLGSSLMMEMSIKSILKDLAVNADVDHVDLGSAKGTPSDIYVGTRDIAEQLNAQAVNGKIVSLDNMIDKVAMKEKLSTALRELGAL >NZ_CP043332.1|WP_004243724.1|2637715_2638159_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MLKTLLTPDVVQVIPQVKDWREAIKIACQPLIDKGCIEPRYVDAIYKSHEQIGPYYVLGPGIAMPHARPEEGVNQLSLALTIIEKGVEFGADENDPVKLLIVLAATDNDSHINAIVKLAELFDNQDDIDTLLQAKSKAEVLAVINHY >NZ_CP043332.1|WP_004243725.1|2638385_2639432_+|LacI-family-transcriptional-regulator MIKTRKRRNTGRVTLQEVAKHAGVGSMTVSRALRTPELVSDKLREKVNQAVAELGYIPNASAGALASAQSHIIAVLLPSFTDKASADFMQSLQQILSRHHYQILVGCYEYQLHKATDVINMLLQSNPAALVAFGSQLSDVQFLHISNANVPVVSVASQSNEQSAISIDCGYEKAAFDLTHYLIQQGKRCVGYVGALQGQRLHHQQITGWSRALLKNYLNAEQSVTTPDPASMAYGRQALTEILLRQPELDAVICSHESIALGMMFECQRRLIKIPQDLAIACLEGSENSAQIAPSLTSIHFNYHKIGKEAGKHLIALLQHLRDEVDNAMFENTVINYAYRLELGQSTP >NZ_CP043332.1|WP_004243726.1|2639428_2639971_-|NUDIX-hydrolase-YfcD MEQENTAVVEWVDIVDEKNEVVAQATRQQMRAENLRHRATYIVVHDGMGKILAQRRTETKDFYPGWLDATAGGVVQQGENALESARREAEEELGIAGVPFAEHGQFYYDDESCRVWGSLFSCVSHGPFALQPEEIEEVCWLTPLEITERCDEFTPDSLKALSLWLTRNNSTRLDTKETTD >NZ_CP043332.1|WP_004250689.1|2640167_2640782_+|thiol:disulfide-oxidoreductase MIDLYYANTPNGQKITLFLEEVAMPYTLHHVDIGKGDQFKPEFLAISPNNKIPAIVDNAPADGGEPLSIFESGAILIYLAEKSGKLLSHDLREKMTQLQWLFWQVGGFGPMLGQNHHFTRYAPEKVPYAINRYTKETERLYQVLESRLAQSPYLGGNDYSIADIATYTWARYHDTHHIDLADYPAVEKWLNTISQRPAAKKLFG >NZ_CP043332.1|WP_149127584.1|2640846_2641752_+|TIGR01777-family-protein MNILITGGTGLIGRALICQLALDKHNITVLSRSPQKVYSHFCNEMACWTHLDDKENLNQFDAVINLAGEPIADKRWTSEQKQTLVNSRCKLTQKLVDLIKASDSPPSVLISGSAVGFYGDQGENNVTEETPPKDEFTHQLCAKWENIALDAQTPLTRVCLLRTGIVLSTKGGALPKMSPPFKLGLGGKLGNGKQYMPWIHIDDMVNAIVFLLNNNNTQGAFNLTAPHPVQNKAFTTTLAHVLKRPAFMTVPATILKLMMGESATLVLGGQQAFPKKLLDAGFSFRYPQLEGALEDIIRHKK >NZ_CP043332.1|WP_017827869.1|2641771_2642353_-|UbiX-family-flavin-prenyltransferase MKKLIVGLTGASGAIYGIRLLEILKSVPSVETHLVISQAARRTISLETDYSLKDIHALADIIYDDRDIGATISSGSFRVNGMVILPCSIKSLSGIVHSYTDTLVTRAADVVLKEGRKLVLCVRETPLHLGHLRLMTQAAELGAIIMPPVPAFYFQPKTIDDIVNQTVNRVLDQFDIDLPDDLFQRWQGDKPAR >NZ_CP043332.1|WP_004243730.1|2642474_2643992_-|amidophosphoribosyltransferase MCGIVGIAGVNPVNQSIYDALTVLQHRGQDAAGIATIDENNGFRLRKANGLVKDVFETRHMLRLKGTIGIGHVRYPTAGSSSASEAQPFYVNSPFGITLAHNGNLTNAHLLRRQLFETARRHINTTSDSEILLNVLAYELDRFDHFPLEPDNIFTAVAAMHKKLRGAYACVALIIGHGLLAFRDPYGIRPLVLGKRTLEDGRSEYMVASESVALDTLGFEFLRDVAPGEAVYITEQGQLFTRQCAENPQLVPCLFEYVYFARPDSFIDKISVYNARLRMGQKLGAKIAKEWEDLQIDVVIPIPETSCDIALEIAHILNKPYRQGFVKNRYVGRTFIMPGQQERRKSVRRKLNANRAEFRDKNVLLIDDSIVRGTTSEQIVELAREAGAKKVYFASAAPEVRFPNVYGIDMPNANELIAHGREVDEIRKLIGADGLIFQDLSDLIAAVQEENPDINQFECSVFDGVYITKDIDQGYLDYLENLRRDDEHKIRDQHEAENLEIYNEG >NZ_CP043332.1|WP_004243731.1|2644022_2644514_-|colicin-V-production-protein MVWIDYAIIAIIGFSALVSLIRGFVREALSLITWGCGFFVASQFYPYLAVYFTRFEDELVRNGIAIVTLFIATLIVGAVINYVISSLVQRTGLSGTDRVLGICFGALRGVLIVSALLFVLGAFTPMADSADWQRSELIPQFNHIIRWFFDYLQNASSFVSEKM |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP043332_5 | 2902155-2902297 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP043332_5
|
2 spacers
spacers of NZ_CP043332_5
>5.1|2902178|37|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder TGGCGCTGGTAATGTCATTAAATCTGATGTTACACAA >5.2|2902238|37|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder CGGCATAGCAAATGTAATAAAACATAACTCTAATTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043332_5
The CRISPR arrays of NZ_CP043332_5 >merge|NZ_CP043332|5|2902155-2902297|CRISPRCasFinder GGTGATATCAATTTCACAGGTGGTGGCGCTGGTAATGTCATTAAATCTGATGTTACACAAGGTGATATCAATTTTACAGGTGGCGGCATAGCAAATGTAATAAAACATAACTCTAATTATGGTAATACCAACTTTACTGGTGG >NZ_CP043332|5|5|2902155-2902297|CRISPRCasFinder GGTGATATCAATTTCACAGGTGG TGGCGCTGGTAATGTCATTAAATCTGATGTTACACAA GGTGATATCAATTTTACAGGTGG CGGCATAGCAAATGTAATAAAACATAACTCTAATTAT GGTAATACCAACTTTACTGGTGG
>NZ_CP043332.1|WP_046334654.1|2900238_2900466_+|hypothetical-protein MNHIPASGFIYMASIIKSMLENPCINKEFEKLIAADLLPILQNKTNMTENFTALHLIKKTSNRRIILKKNLFIIN >NZ_CP043332.1|WP_004244067.1|2896820_2899418_-|bifunctional-aconitate-hydratase-2/2-methylisocitrate-dehydratase MLEEYRKHVAERAAEGVVPKPLDATQTAALVELLKSPPKGEEEFLLDLIVNRVPPGVDEAAYVKAGFLTALAKGETTSPLITPEKAVELLGTMQGGYNIHALIEALDNDKLAPIAAKALSHTLLMFDSFYDVEEKAKAGNVYAKQIMQSWADGEWFTERPELAEKITVTVFKVTGETNTDDLSPAPDAWSRPDIPLHALAMLKNAREGIEPDQPGSVGPIKQIEALNKKGFPLAYVGDVVGTGSSRKSATNSVLWFMGDDIPYVPNKRGGGVVLGGKIAPIFFNTMEDAGALPIEVDVSKLNMGDVIDIYPYKGEIRNHETNELLETFALKTEVLIDEVRAGGRIPLIIGRGLTSKARSALGLPPSTLFRHAKAVEQSDRGFSLAQKMVGRACGRDGIRPGEYCEPKMTSVGSQDTTGPMTRDELKDLACLGFSADLVMQSFCHTAAYPKPVDVTTHHTLPDFIMNRGGVSLRPGDGIIHSWLNRMLLPDTVGTGGDSHTRFPIGISFPAGSGLVAFAAATGVMPLDMPESVLVRFKGKMQPGVTLRDLVHAIPLYAIKEGLLTVEKKGKKNIFSGRILEIEGLPELKVEQAFELADASAERSAAGCTIKLDKAPIIEYLQSNIVLLKWMIAEGYGDRRTLERRITAMENWLADPQLLEADADAEYAAVIEIDLNEIKEPILCAPNDPDDARLLSEVANSKIDEVFIGSCMTNIGHFRAAGKLLDQHKGQLPTRLWVAPPTKMDAAQLTEEGYYSVFGKSGARIEVPGCSLCMGNQARVADGATVVSTSTRNFPNRLGTGANVYLASAELAAVASLLGRLPEPQEYLDFINKVDETAEDTYRYLNFDQLEQYTDKATQVIFQTTV >NZ_CP043332.1|WP_004244066.1|2896278_2896650_-|YacL-family-protein MDYEFQRDLTGGILARFSMDHEAIGYWLNDEIQGDISLIDQILTEMDEVKGSEKQWQLIGKEYSLSIDDEEIMVRANTLHFETDDLEEGMSYYDNESIAFCGLDDFATMLQKYRLFILENRRS >NZ_CP043332.1|WP_004248539.1|2895326_2896187_-|small-conductance-mechanosensitive-channel-MscS MNELPASLDEATGWFVANQELFIQYAVNIVAAFLILFIGLFVAKMVSKGVARILTLRHIDATVVTFLSVLVRYTVIAFTLIAVLGRLGVQTASVIAVLGAAGLAVGLALQGSLSNFAAGVLIVIFRPIRAGEYVMIGAVEGTVRDVQIFSTTLRSADDRIIVIPNSKIISSEVINLSREPNRRTQIIVGVAYDADIDKVKKVLGDVVAQDKRIQHNQGVTIRLHEMAPSSLNFVVRVWTTNDDAWPVYWDLMENFKRALDANNIGIPFPQMDVYMHQAQNTVMKAE >NZ_CP043332.1|WP_063108557.1|2894534_2895158_-|arginine-exporter-ArgO MLTTFFQGFLLSAAMILPIGAQNAFVLQQGSKKQYHLMSAFLCALSDVILISGGVFGGSALLSQSEYLLLLITWGGVAFLLWYGWNAFKTALTKEIELSQHKNQVKSRWRVIVTLVAVTWLNPHVYLDTFVVLGSIGGQLSAELRPWFTFGAVFASISWFFALSLLAAWFSPILSQVTAQRIINLFVGCVMWFIALQLAAQGWKNLF >NZ_CP043332.1|WP_004248538.1|2893709_2894444_-|oxidative-stress-defense-protein MKVKAMVLASMLALGAPSIALAGAVPEGPHITTSGNATIKATPDMATLNIQVSEKAKDAAQAKKQVDERVAKYFAFLKENGVTKEDIDAANIRTQPNYEYDKKAERSVINGYTATRTVDVKIKKLDQLNTLLDGALAAGLNEINNVEFGVNDPEQYKAKAREVAIKNAIQQASSVAKGFGADLGAVYSVSYRAPEATPYPIARMKMDAMALSAPSPEAVKETYQQQSIEFKDYVDVVFELKTAK >NZ_CP043332.1|WP_020946005.1|2892766_2893486_-|hypothetical-protein MKIKPLVEKEINRFEFGKIFTYRDLTPYLSNPETTVKAVSRLVKNGDIKRFAKGQFYRPKKGIFGEMQLSDTEKLKTFMYQNGKRKGYITGMGLYNRLGLTTQIPKTITIASDKSPQRKDFGTVEVKLVKAKVPVSESNREYLEILDVLSNIKKIPDSNPSEVMKVIAKKLKNIKKDGLYELINLASFYSPVTRALLGLLIENININLALELKKQLNPTTHYRIGLDSYWDNAEEWNIE >NZ_CP043332.1|WP_149127620.1|2891969_2892770_-|nucleotidyl-transferase-AbiEii/AbiGii-toxin-family-protein MNLHNNPDVFLELINRTAEYFKIPEVYVEKDYWVTHVLLQLSLSEFRNDFIFKGGTALSKVFGLIKRFSEDVDLAMFNNRGLSSNQIKKCMKVAEETIATGLTYIQKPDESKGSQFRKVYYKFPRIVSGEFGHASDVILLETNSFTSPEPFSFMPTESLIAEFIKKAQIEGGNEIITHYGLEKFEVNVLDIKRTVAEKILGLVRASSEADPKQALADKIRHIYDLCMIKRNKHYSQFFDSDSLWKMMDIVIQADRDQFREAGQWLD >NZ_CP043332.1|WP_004244059.1|2890694_2891594_+|LysR-family-transcriptional-regulator-ArgP MKRPDYRALQALDAVIRERGFERAAQKLCITQSAVSQRIKQLENLFGQPLLVRTVPPQPTEQGQKLLALLHQVEMLEEQWLGDENSGSTPLLLSLAVNADSLATWLLPALHPVLTQLPIRLNIQVEDETRTQERLRRGEVVGAISIQPQALPSCLVDQLGALDYLFVASPDFAQRYFANGVTKSSLLKAPAVAFDHLDDMHQAFLQQNFGLSPGSVPCHIVNSSEAFVQLAKQGSTCCMIPHLQIADELKSGELIDLTPGLCQRRMLYWHRFAPESRTMRKVTDALLDYGRKVLKQDEE >NZ_CP043332.1|WP_004244058.1|2889877_2890534_-|ribose-5-phosphate-isomerase-RpiA MTQDELKKAVGWAALEYVKPGTIVGVGTGSTASHFIDALATMKGQIEGAVSSSEASTAKLKSYGIPVFDCNEVDSLDIYVDGADEINHQMQMIKGGGAALTREKIIAAVAKTFVCIVDESKQVDVLGKFPLPVEVIPMARSYVARELVKLGGLPEYRENVVTDNGNVILDVYNLTILNPIELENKINSIAGVVTVGLFANRGADIVLMGTSEGVKTIK >NZ_CP043332.1|WP_004244077.1|2914734_2916162_-|dihydrolipoyl-dehydrogenase MSTEIKAQVVVLGAGPAGYSAAFRCADLGLDTVLVERHSTLGGVCLNVGCIPSKALLHVAKVIEEAKALSEHGVVFDAPKTDIDKIRIWKDKVISQLTGGLAGMAKGRKVNVVNGEARFTGSHTLSVEGSEGTTTITFENAIVAAGSRPIELPFIPHEDPRVWDSTDALQLKTVPERLLVMGGGIIGLEMGTVYHALGSQIDVVEMFDQVIPAADKDVVKVFTKRISKKFNLMLETKVTAVEAKEDGIYVTMEGKKAPAEPQRYDAVLVAIGRVPNGKLLDAGKAGIEVDDRGFIHVDKQMRTNVPHIFAIGDIVGQPMLAHKGVHEGHVAAEVISGKKHYFDPKVIPSIAYTEPEVAWVGMTEKEAKEKGVSYEVATFPWAASGRAIASDCADGMTKLIFDKETNRVIGGAIVGSNGGELLGEIGLAIEMGCDAEDIALTIHAHPTLYESIGMAAEVFEGSITDLPNPKAKKKK >NZ_CP043332.1|WP_017827184.1|2916363_2918235_-|pyruvate-dehydrogenase-complex-dihydrolipoyllysine-residue-acetyltransferase MSIEIKVPDIGADEVEVTEVMVKVGDRIEEEQSLITVEGDKASMEVPSPQAGIVKEIKIAVGDKVETGSLIMIFDTEEGAQAPAQEAAPAPSAAAPAASELKEVHVPDIGGDEVEVTEVMVNVGDTISEEQSLITVEGDKASMEVPAPFAGVVKEIKIAVGDKVSTGSLIMVFEVAGSAPAPSASAPAPAASAPAASAIKDVNVPDIGGDEVEVTEVMVKVGDTIAEEQSLITVEGDKASMEVPAPFAGVVKEIKIAVGDKVKTGSLIMTFEVAGAAPAAQAPAAPAASTSAAPAPSAPAKAPASAPAAKEEFVENEAYVHATPVIRRLAREFGVNLAKVKGTGRKGRILREDVQSYVKELIKRAESAPANAGGGLPGMLPWPKVDFSKFGEIEEVELSRIQKISGANLSRNWVMIPHVNLFDEADITEVEEFRKQQNKEAEKKKLDVKITPLVFVMKAAAKALADMPRFNSSISEDGQKLILKKYINIGIAVDTPNGLVVPVFKDVNKKGILELSYELAEVSKKARAGKLTASDMQGGCFTISSLGGIGTTGFAPIVNAPEVAIMGLSRSSMKPVWNGKEFVPRLMLPMSLSFDHRVIDGADGARFITLINQYMSDLRRLVM >NZ_CP043332.1|WP_149127621.1|2918247_2920914_-|pyruvate-dehydrogenase-(acetyl-transferring),-homodimeric-type MSDMLKNDVDPIETRDWLQAIDSVIREEGVERAQFLIDQVLKQARNGGLDIALGGSVHSDYINTIPVEDEPAYPGNLELERRIRSAIRWNAVIMVLRASKKDLELGGHMASYQSSATLYEVCFNHFFRAHNDNDGGDLVYFQGHISPGIYARAFLEGRLTEEQLNNFRQEIGGKGLSSYPHPKLMPEFWQFPTVSMGLGPLSAIYQAKFLKYLDHRGLKDTTKQRVYAFLGDGEMDEPESKGAITIAVREKLDNLCFVVNCNLQRLDGPVTGNGKIVNELEGIFAGAGWNVIKVMWGDRWDALLRKDTSGKLIQLMNETLDGDYQTFKSRDGAYVREHFFNRYPETAALVKDMTDDEIWALNRGGHDPKKVFAAFQKAKETKDKPTVILAQTIKGYGMGETAEGKNIAHQVKKMNMDGVKHFRDRFNIPVSDEKVAELPYITFDKDSEEYKYLHARRQELEGYLPARRTRFDEKLEIPTLEDFSQLLEEQSKEISTTIAFVRALNVMLKNKSIKDRLVPIIADEARTFGMEGLFRQIGIYSPNGQQYTPQDREQVAYYKEDVKGQILQEGINELGAGASWLAAATSYSTNNLPMIPFYIYYSMFGFQRIGDLCWAAGDQQARGFLIGGTSGRTTLNGEGLQHEDGHSHIQSLTIPNCISYDPAFAYEVAVIMQDGLERMYGDKQENVYYYITTLNENYHMPAMPAGAEEGIRKGIYKLESLEGAKGKVQLLGSGSILRHVREAAQILSTEYGIGSDVYSVTSFTELARDGQDCERWNMLHPSEEPRVPYIAQIMNDAPAVASTDYMKLFAEQVRTYVPADDYRVLGTDGFGRSDSRENLRHHFEVDTSYVIVAALGELAKRGEIDVKVVEEAIKKYNINPEKVNPRLA >NZ_CP043332.1|WP_049197544.1|2921077_2921848_-|pyruvate-dehydrogenase-complex-transcriptional-repressor-PdhR MAYTKIRQPKLSDVIEQQLEHLILEGTLRPGEKLLPERELAKQFDVSRPSLREAIQKLEAKGFLLRRQGGGTFVQDNLWQSFSDPLAQLLSGHPESQFDLLETRHALEGIAAYYAALRGTDDDLERIKASHARIIDAHDKGDIAAESDAVLQYQLIVTEAAHNVVLLHLLRCMVPMLEQNIRQNFEFLYTRKEMLTAVSEHRTQIYQAIINREPEVAREASHRHLAFIEDVLLDMSREHTRRERSLRRLQQHPDLF >NZ_CP043332.1|WP_004250361.1|2922174_2922717_-|1,6-anhydro-N-acetylmuramyl-L-alanine-amidase-AmpD MEIKQGWLTGVKHVPSPNYDNRPEGEIPSLLIIHNISLPPGQFGGPYIDQLFTNTLAVDDHPFFNEIAHLRVSAHCLIRRDGEIVQYVPFTARAWHAGVSFYKGREKCNDFSIGIELEGTDECDFTPQQYQQLSTLTQQLIEHYPGIKENITGHSDVAPGRKTDPGPHFNWSYYRALLAK >NZ_CP043332.1|WP_149127622.1|2922927_2923371_+|prepilin-peptidase-dependent-pilin MNTLNYHSTENGFTLMELMIVIAIISILSSVAIPAYHGYIQKAALTDVLQTLSPYRSAVELCHYEHQYNQCHADASFMPQQFRSRYLTDIHVANGVISAKGKDQLEGLTIVMTPAANSKETLPHWQINCTSTNTALQTLCHKVFKSH >NZ_CP043332.1|WP_149127623.1|2923470_2924574_+|Flp-pilus-assembly-complex-ATPase-component MNNTIHTATEFIEQLLRHSLAQRVSDLHLEPQQNSLRIRARIDNHLVLFSPPDNQLANEILTRLKILANINIAEKRLPQDGQFNWSYQKNNYSIRVATLPTLYGEKIVLRLMNNLQQPQLAQLGFQTIHLTLLKKYLTQPQGMILVTGPTGSGKTLTLYSCLQYLNKDNRNINSIEDPIELPLHGINQTQITEKSGITFATILRALLRQDPDVIMIGEIRDQQTAEIAIKAAQTGHLVLSTLHTNSTQATLARLANLGIAKDLIDSCVKLIISQRLVRCLCSNCKYPSPEQKNFIINNQQIILPNWQATGCQFCYSGYKGRTAIYDCFELAKQSLPSPYALFNSGIELIKKGITSLDEVYQVVGDIE >NZ_CP043332.1|WP_004244087.1|2926046_2926661_+|dephospho-CoA-kinase MTYTVALTGGIGSGKTTIANGFASLGVPLVDADVIARLVVEPDSPGLKALQQHFGDTILLPDGKLNRAQLRHIIFQNQQEKAWVNQLLHPLIQQETQKQIQQIRAPYFIWVVPLLVENKLTHLADRILVVDVTEEEQITRTMQRDGVSRDHVLKILQAQAKREQRLAVADDIIENHDNSLNQDEQIKQLHQHYLELAQKSNTGQ >NZ_CP043332.1|WP_004250354.1|2926663_2927416_+|cell-division-protein-ZapD MSEETSTIIFEHPLNEKMRSWLRIENSLIQLNSFQSINSLSSALSFFRAVSEFIEVLDRGEIRAELLKELEKRQKKLQQWLSFPNVDKEIVSHIINELSESACALSKAPRIGQHLKQDKIISLVKQRLSIPGGCCSFDVPTLHLWLNLPQTVRTEKLTCWQEGLYPLQNALNALLTLIRQSDTFKPVLSHSGFYQDSTEEGELLRIKLLASQQIYPQVSGHKNRYAIRFLPLDSEHGTIPSELPFEISCC >NZ_CP043332.1|WP_004244091.1|2927468_2927684_+|DNA-gyrase-inhibitor-YacG MSEKLIVKCPTCRTEVIWDESSPYRPFCCKRCQLIDLGEWAAEEKRIPSQSESNDSDEWSEMPEQDPKPFN |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP043332_4 | 4.7|2635636|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2635636-2635667 | 32 | NZ_CP043332.1 | 3093913-3093944 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP043332_4 | 4.3|2635392|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2635392-2635423 | 32 | NZ_CP043332.1 | 1577492-1577523 | 1 | 0.969 |
1. spacer 4.7|2635636|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 3093913-3093944, mismatch: 0, identity: 1.0
acatcttaaattaaacacatctcaacaggtcg CRISPR spacer acatcttaaattaaacacatctcaacaggtcg Protospacer ********************************
2. spacer 4.3|2635392|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 1577492-1577523, mismatch: 1, identity: 0.969
agcctcaggaaatccaccgtgcactctgcgct CRISPR spacer agcctcaggaaatccgccgtgcactctgcgct Protospacer ***************.****************
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP043332_3 | 3.1|2625814|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT | 2625814-2625845 | 32 | NZ_CP047287 | Proteus cibarius strain G11 plasmid p52, complete sequence | 26813-26844 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP043332_3 | 3.1|2625814|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT | 2625814-2625845 | 32 | NZ_CP047287 | Proteus cibarius strain G11 plasmid p52, complete sequence | 29782-29813 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP043332_3 | 3.1|2625814|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT | 2625814-2625845 | 32 | NZ_CP053373 | Proteus cibarius strain G32 plasmid pG32-51, complete sequence | 23124-23155 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP043332_3 | 3.1|2625814|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT | 2625814-2625845 | 32 | NZ_CP053373 | Proteus cibarius strain G32 plasmid pG32-51, complete sequence | 26093-26124 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP043332_3 | 3.1|2625814|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT | 2625814-2625845 | 32 | NZ_CP047341 | Proteus cibarius strain ZF1 plasmid pZF1-cfr, complete sequence | 7058-7089 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP043332_3 | 3.1|2625814|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT | 2625814-2625845 | 32 | NZ_CP047341 | Proteus cibarius strain ZF1 plasmid pZF1-cfr, complete sequence | 10027-10058 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP043332_3 | 3.1|2625814|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT | 2625814-2625845 | 32 | NZ_CP045009 | Proteus cibarius strain ZF2 plasmid pZF2-cfr, complete sequence | 24388-24419 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP043332_3 | 3.1|2625814|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT | 2625814-2625845 | 32 | NZ_CP045009 | Proteus cibarius strain ZF2 plasmid pZF2-cfr, complete sequence | 27357-27388 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP043332_4 | 4.1|2635270|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2635270-2635301 | 32 | MK047640 | Phage NV18, complete genome | 10382-10413 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP043332_4 | 4.7|2635636|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2635636-2635667 | 32 | MK047639 | Phage NGI4, complete genome | 18329-18360 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP043332_4 | 4.11|2635880|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2635880-2635911 | 32 | KY420199 | Proteus phage vB_PvuS_Pm34, complete genome | 7782-7813 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP043332_3 | 3.3|2625936|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2625936-2625967 | 32 | MK047642 | Phage NG55, complete genome | 38622-38653 | 1 | 0.969 |
| NZ_CP043332_4 | 4.6|2635575|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2635575-2635606 | 32 | MK047642 | Phage NG55, complete genome | 3338-3369 | 1 | 0.969 |
| NZ_CP043332_3 | 3.4|2625997|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2625997-2626028 | 32 | MK047640 | Phage NV18, complete genome | 24001-24032 | 2 | 0.938 |
| NZ_CP043332_3 | 3.4|2625997|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2625997-2626028 | 32 | NZ_CP039845 | Acetobacter pasteurianus strain CICC 22518 plasmid pAP22518-1, complete sequence | 361-392 | 3 | 0.906 |
| NZ_CP043332_3 | 3.7|2626180|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2626180-2626211 | 32 | KY420199 | Proteus phage vB_PvuS_Pm34, complete genome | 20382-20413 | 3 | 0.906 |
| NZ_CP043332_3 | 3.8|2626241|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2626241-2626272 | 32 | KY420199 | Proteus phage vB_PvuS_Pm34, complete genome | 20382-20413 | 3 | 0.906 |
| NZ_CP043332_3 | 3.7|2626180|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2626180-2626211 | 32 | MK047643 | Phage NGI136, complete genome | 6568-6599 | 4 | 0.875 |
| NZ_CP043332_3 | 3.8|2626241|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2626241-2626272 | 32 | MK047643 | Phage NGI136, complete genome | 6568-6599 | 4 | 0.875 |
| NZ_CP043332_3 | 3.6|2626119|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2626119-2626150 | 32 | MT833387 | Escherichia phage HF4s, complete genome | 17925-17956 | 5 | 0.844 |
| NZ_CP043332_3 | 3.2|2625875|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2625875-2625906 | 32 | NZ_CP044979 | Bacillus thuringiensis strain BT62 plasmid pBT62A, complete sequence | 507402-507433 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP043332_3 | 3.3|2625936|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2625936-2625967 | 32 | NZ_CP030790 | Vibrio campbellii strain DS40M4 plasmid unnamed1, complete sequence | 18178-18209 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP043332_3 | 3.3|2625936|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2625936-2625967 | 32 | NZ_CP015865 | Vibrio campbellii CAIM 519 = NBRC 15631 strain ATCC 25920, CAIM 519T plasmid unnamed, complete sequence | 15854-15885 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP043332_3 | 3.3|2625936|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2625936-2625967 | 32 | NC_010114 | Vibrio sp. 09022 plasmid p09022A, complete sequence | 280-311 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP043332_3 | 3.6|2626119|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2626119-2626150 | 32 | NC_048720 | Streptomyces phage Blueeyedbeauty, complete genome | 67614-67645 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP043332_4 | 4.2|2635331|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2635331-2635362 | 32 | MT408532 | Synechococcus phage SynMITS9220M01, complete genome | 6572-6603 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP043332_4 | 4.10|2635819|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2635819-2635850 | 32 | NZ_CP053710 | Acetobacteraceae bacterium strain PAMC 26569 plasmid unnamed2, complete sequence | 124979-125010 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP043332_3 | 3.4|2625997|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2625997-2626028 | 32 | KT367887 | Klebsiella phage vB_Kp3, complete genome | 41729-41760 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP043332_3 | 3.4|2625997|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2625997-2626028 | 32 | MH884514 | Bacillus phage vB_BpsM-61, complete genome | 314-345 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP043332_4 | 4.2|2635331|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2635331-2635362 | 32 | CP011076 | Brevibacillus laterosporus strain B9 plasmid unnamed2, complete sequence | 1061224-1061255 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP043332_3 | 3.4|2625997|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2625997-2626028 | 32 | MK387337 | Vibrio phage ValB1MD, complete genome | 81586-81617 | 10 | 0.688 |
| NZ_CP043332_3 | 3.6|2626119|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2626119-2626150 | 32 | MN582058 | Caudovirales sp. ctOwN3, complete genome | 51007-51038 | 10 | 0.688 |
| NZ_CP043332_4 | 4.2|2635331|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2635331-2635362 | 32 | NC_049511 | Acinetobacter phage AM101, complete genome | 132124-132155 | 10 | 0.688 |
| NZ_CP043332_4 | 4.2|2635331|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2635331-2635362 | 32 | NC_049445 | Acinetobacter phage AbTZA1, complete genome | 84988-85019 | 10 | 0.688 |
| NZ_CP043332_4 | 4.2|2635331|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2635331-2635362 | 32 | NC_049494 | Acinetobacter phage vB_AbaM_PhT2, complete genome | 77876-77907 | 10 | 0.688 |
| NZ_CP043332_4 | 4.5|2635514|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2635514-2635545 | 32 | NC_014633 | Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence | 874905-874936 | 10 | 0.688 |
1. spacer 3.1|2625814|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP047287 (Proteus cibarius strain G11 plasmid p52, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatcctgctcgactttttaaagccgtggataa CRISPR spacer aatcctgctcgactttttaaagccgtggataa Protospacer ********************************
2. spacer 3.1|2625814|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP047287 (Proteus cibarius strain G11 plasmid p52, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatcctgctcgactttttaaagccgtggataa CRISPR spacer aatcctgctcgactttttaaagccgtggataa Protospacer ********************************
3. spacer 3.1|2625814|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053373 (Proteus cibarius strain G32 plasmid pG32-51, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatcctgctcgactttttaaagccgtggataa CRISPR spacer aatcctgctcgactttttaaagccgtggataa Protospacer ********************************
4. spacer 3.1|2625814|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053373 (Proteus cibarius strain G32 plasmid pG32-51, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatcctgctcgactttttaaagccgtggataa CRISPR spacer aatcctgctcgactttttaaagccgtggataa Protospacer ********************************
5. spacer 3.1|2625814|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP047341 (Proteus cibarius strain ZF1 plasmid pZF1-cfr, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatcctgctcgactttttaaagccgtggataa CRISPR spacer aatcctgctcgactttttaaagccgtggataa Protospacer ********************************
6. spacer 3.1|2625814|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP047341 (Proteus cibarius strain ZF1 plasmid pZF1-cfr, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatcctgctcgactttttaaagccgtggataa CRISPR spacer aatcctgctcgactttttaaagccgtggataa Protospacer ********************************
7. spacer 3.1|2625814|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045009 (Proteus cibarius strain ZF2 plasmid pZF2-cfr, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatcctgctcgactttttaaagccgtggataa CRISPR spacer aatcctgctcgactttttaaagccgtggataa Protospacer ********************************
8. spacer 3.1|2625814|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045009 (Proteus cibarius strain ZF2 plasmid pZF2-cfr, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatcctgctcgactttttaaagccgtggataa CRISPR spacer aatcctgctcgactttttaaagccgtggataa Protospacer ********************************
9. spacer 4.1|2635270|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK047640 (Phage NV18, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gagatgaacctagaaagcgctgttaaatatca CRISPR spacer gagatgaacctagaaagcgctgttaaatatca Protospacer ********************************
10. spacer 4.7|2635636|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK047639 (Phage NGI4, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
acatcttaaattaaacacatctcaacaggtcg CRISPR spacer acatcttaaattaaacacatctcaacaggtcg Protospacer ********************************
11. spacer 4.11|2635880|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KY420199 (Proteus phage vB_PvuS_Pm34, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taaacaccattttcaaaaacgagtcagaggaa CRISPR spacer taaacaccattttcaaaaacgagtcagaggaa Protospacer ********************************
12. spacer 3.3|2625936|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK047642 (Phage NG55, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
tcttttggcgtgatgatagcaaagtttttgtc CRISPR spacer tcttttggcgtgatgacagcaaagtttttgtc Protospacer ****************.***************
13. spacer 4.6|2635575|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK047642 (Phage NG55, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
atgtgtaccatcaggtaatgtgatctttacgg CRISPR spacer atgtgtgccatcaggtaatgtgatctttacgg Protospacer ******.*************************
14. spacer 3.4|2625997|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK047640 (Phage NV18, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
ctggtcagtccattttctggtttgcagagaac CRISPR spacer ttggtctgtccattttctggtttgcagagaac Protospacer .***** *************************
15. spacer 3.4|2625997|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP039845 (Acetobacter pasteurianus strain CICC 22518 plasmid pAP22518-1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.906
ctggtcagtccattttctggtttgcagagaac CRISPR spacer ctgatcagtccattttctggtctgcagagagc Protospacer ***.*****************.********.*
16. spacer 3.7|2626180|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY420199 (Proteus phage vB_PvuS_Pm34, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.906
cccctgcatcttcttaatactatctaacgtta CRISPR spacer cccctgcatctttttaatactatctagcgtaa Protospacer ************.*************.*** *
17. spacer 3.8|2626241|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY420199 (Proteus phage vB_PvuS_Pm34, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.906
cccctgcatcttcttaatactatctaacgtta CRISPR spacer cccctgcatctttttaatactatctagcgtaa Protospacer ************.*************.*** *
18. spacer 3.7|2626180|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK047643 (Phage NGI136, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
cccctgcatcttcttaatactatctaacgtta CRISPR spacer cccctgcatcttcttaatgctatctagtgtaa Protospacer ******************.*******..** *
19. spacer 3.8|2626241|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK047643 (Phage NGI136, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
cccctgcatcttcttaatactatctaacgtta CRISPR spacer cccctgcatcttcttaatgctatctagtgtaa Protospacer ******************.*******..** *
20. spacer 3.6|2626119|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT833387 (Escherichia phage HF4s, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
gtcttgaaggtcaacatcaatagggattattg CRISPR spacer gtcttgcaggtcaacatcaataggaataacgg Protospacer ****** *****************.** *. *
21. spacer 3.2|2625875|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP044979 (Bacillus thuringiensis strain BT62 plasmid pBT62A, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aaagatccaaataatatgaattggtttactgc CRISPR spacer aataggacaaataatatcaattggtttaatga Protospacer ** .. ********** ********** **
22. spacer 3.3|2625936|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP030790 (Vibrio campbellii strain DS40M4 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tcttttggcgtgatgatagcaaagtttttgtc CRISPR spacer gcttttggcgtgaggacagcaaagcggtttac Protospacer ************ **.*******. ** *
23. spacer 3.3|2625936|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP015865 (Vibrio campbellii CAIM 519 = NBRC 15631 strain ATCC 25920, CAIM 519T plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tcttttggcgtgatgatagcaaagtttttgtc CRISPR spacer gcttttggcgtgaggacagcaaagcggtttac Protospacer ************ **.*******. ** *
24. spacer 3.3|2625936|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_010114 (Vibrio sp. 09022 plasmid p09022A, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tcttttggcgtgatgatagcaaagtttttgtc CRISPR spacer gcttttggcgtgaggacagcaaagcggtttac Protospacer ************ **.*******. ** *
25. spacer 3.6|2626119|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_048720 (Streptomyces phage Blueeyedbeauty, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
gtcttgaaggtcaacatcaatagggattattg CRISPR spacer ctcttcaaggtcaacatcaatcggaacgatgc Protospacer **** *************** **.*. **
26. spacer 4.2|2635331|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT408532 (Synechococcus phage SynMITS9220M01, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ttaccaataaacagcaaaatgcgttcaatttc CRISPR spacer taaagaacaaacaacaaaatgcgttcaactaa Protospacer * * **.*****.**************.*
27. spacer 4.10|2635819|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053710 (Acetobacteraceae bacterium strain PAMC 26569 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ttgcgctatggcaatatctgcccagtccaatc CRISPR spacer tgggcgcatggcaatttctgtccagtccaacc Protospacer * * .******** ****.*********.*
28. spacer 3.4|2625997|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KT367887 (Klebsiella phage vB_Kp3, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ctggtcagtccattttctggtttgcagagaac CRISPR spacer gctgtcagtccattttcgtgtttgcagctttc Protospacer . ************** ******** *
29. spacer 3.4|2625997|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH884514 (Bacillus phage vB_BpsM-61, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ctggtcagtccattttctggtttgcagagaac CRISPR spacer ctgatcagtccgttttctggtttatatgctat Protospacer ***.*******.***********..* . *.
30. spacer 4.2|2635331|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP011076 (Brevibacillus laterosporus strain B9 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttaccaataaacagcaaaatgcgttcaatttc CRISPR spacer atatcaataaacagcaaaatacgttacaaaaa Protospacer **.****************.**** *
31. spacer 3.4|2625997|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK387337 (Vibrio phage ValB1MD, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ctggtcagtccattttctggtttgcagagaac CRISPR spacer tgagctcttccattttctggtttccatagaag Protospacer . .*.. *************** ** ****
32. spacer 3.6|2626119|32|NZ_CP043332|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN582058 (Caudovirales sp. ctOwN3, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
gtcttgaaggtcaacatcaatagggattattg CRISPR spacer gtcttgagggtcgacatcaatagttcacctaa Protospacer *******.****.********** . * .
33. spacer 4.2|2635331|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_049511 (Acinetobacter phage AM101, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttaccaataaacagcaaaatgcgttcaatttc CRISPR spacer caagatgtaaacagcaaaatgggctcaattga Protospacer . * .************** *.******
34. spacer 4.2|2635331|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_049445 (Acinetobacter phage AbTZA1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttaccaataaacagcaaaatgcgttcaatttc CRISPR spacer caagatgtaaacagcaaaatgggctcaattga Protospacer . * .************** *.******
35. spacer 4.2|2635331|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_049494 (Acinetobacter phage vB_AbaM_PhT2, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttaccaataaacagcaaaatgcgttcaatttc CRISPR spacer caagatgtaaacagcaaaatgggctcaattga Protospacer . * .************** *.******
36. spacer 4.5|2635514|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_014633 (Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
attaaaatgtccgttttacttttctcgtctga CRISPR spacer gataaaatgttctttttacttttcttgatact Protospacer . ********.* ************.* .
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
945929 : 992500
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP043332|945929:992500|DBSCAN-SWA CTTAAACAATAAAATCAGTTTCGTAATTAACAAAACCTACGATATCAATTTTAAAATCAGGATTATAATTATAGCCATAAGCATTAATGGCTAATTCAGAAGCATTGGTTACTTCATTATAGCTAAGAGTTGCTTCGCCAGCATTTCCTGTAAAGTTATCAACAAAGTTAAGAATTTTGCTACTAAATGTATCTTGAATTAATGTTGATAAATCAATTTTATCAATACCGGTTTTGAAATCCATTATTTTATCTGCGGCTGTTACTAAAGAATCTGCAATTTCTTTATAAATAAAGGTATTGCTTCCTGTGCCACCATGTAATGTATCTTGTCCACGACCACCATAAATAGTGTTATTACCACTATGGCCATAGATAATATCGTCTCCTTCGCCTCCAATAAGAGTATTATCAGCATCATTACCATGAATAATATCATTACCAAAACCACCAATTGCGTTTTCTATGGTAACATTTTGTGCAATGGAAACATTTTTCTGTAATCCCCCCACATCAGAAAAGTTCCCAGCACGTAAATCAATCAGTTGATCTTGATAGAAGCCTGAGAAATCAAATGTATCGTTACCACCACTATCCCATACAGAGAAAATTAATTTATCATTGCTATCAGTAGCCGTATAATAATCAATCCCAGTATTTGAATTGAAACCATATACATCATCACCTGTTCTGGTAGTCGTATTTGCGCCATAGAGATATTGCATAGCAGAAATATCATGAAGGAGAGGGGCTCCGGCATAAGCACCTTGGAAGTGGGCACCTGTTTCATACTCATCCCAATAGCTCATTACTGTATATTGGCGACTATCTTCCGCATAATCAGATTTTAAATAACCTGGAACATTCTGACCTGCGTTATAATCACCAGGATGCATAAGACCCAGTGTATGACCAATTTCATGGATAATAGTTAAACGACCATAATTACCCAATTCTGGTGTAGTATTACCTGCATAATGATAATCACTAAACCATGCTTGGCCAGAAAGATCTTTTCCATAAGCATAGGTATTAGGCAATGTTGCATAAGCCTGAAATGTGCCATTGGGATCATAGATATTACCAAAAGTAATATCTGTTTTTACGTCAGAAGCCTTCATTCCATCAACATTCCCAACAGCAACTTCAGTAAATTTAATATTTGCAATATCAGACCATGCATCTAAAGATTTTCTTGCATGCTCTTTTTGTAATTCATTAAATTCATAAGGATTCTTATTACCAAATTGATTAAATTTGCCTTCCCATTTTGGGAATGAATAAGTCACCTCAGCGGGTTGCCCAATAACATATTTGCCATTCCAAGTGGAATCTTCACGGGCTATATGTTTTCCTGCGGTATCATAATCAAAAGAAGGTAATACTTTGGTTGAATAGTTATAGAAGATCCCGCTTTTATCTAATAAATCAGAAATATTAGATAACCCAACGGCTTTTTTTAATAAAAAAGATCCCATAATATCCTCCAGATATAAATTTAGGTTAAGTTTATTTTCATACTGAAAATATATTTATCTGGCGAATGCCATTGAGGATAAAGATAGACATTAATTATTATTAATCTAGGGGGGTAAAATAAGTTTTTAAATAATTGTGAAGTAAAGTGTGTTTTAAGTCAGAATAATTTAATGAGGTGAATATAAGTATAGTTATATTTTATTTTTAGATGATTTCTATTGTTAGTTATTGTTTTATAATTGAAAGGAAAATTTTACTTAAGTTTGATTTTTAATTTAATTAATGGGTTTGTTTAAATGAATGTATCGTTTATTATGTTAAGTTGTTTGAAGTTTGAAGTTTGAAGTTTGAAGTTTGAAGTTTGAAGTTTGAAGTTTGAAGTTTGAAGTTTGAAGTTTGAAGTTTGAAGTTTGAAGTTTGATGTTTGTTTTATTTCTATAGTAATAATAATATTGGTGAATAATAAATAAAATAAAAATAACATAATGTATTATTTTTATACTGTTAAAAAACAGAACACCTCAATAAAAAAAAGGACTACAATGTAATCCTTATTATTAATAAAAATAATATCTTTATATATCTAAAAGATCATTGTAACTTAATATACCCTCAAGTTTTATAAAGATAGTCGAATGATGGTCGTTATTGGCTGTTGAAATTGTTATTGTGGTTTTATTTGTATGAATATCATTATGTAAAACTATTTCATTTTCATTTCCTGATAATTGTTCTACTCGTTTCATTTTTGATATATCGATTTTTTTATAATTTTTATCAACAAAAATAATTTTGTCTTCATTCGTATTAAAATCAAAAATTAAATTATAACTTTTAGCGCCTTTATAGCATAAGAAGTTAAAAGTATCATTTCCTTGTTCACCACATAATAGATTAGTACCTAATCCACAATAAAATATATCATTCCCTTCACCACCTTGAAGTTCATTATGTCCTGCCTTTGATATAGAAAATAATATATCATTACCTTTACCACCAATAAATGTATTACTTCCATAATAATCAACAAGGGTATCATCTCCATCACCACCAAAGAGTTGATCATTACCTTTATTTCCATAGAGGTAATCATTACCCATACTACCATGGAGAATATCATTACCCATACCACCATGGAGAATATCATCACCTATACCTCCATAGAGATAATCATTACCTATATCACCATACAGAATATCATTACCCATACCACCATAGAGGTGATCATTACCCAAACCACCATTGATAGTATCATTACCATCACCACCTAGAAGTTCATTATTAGCACTATTTCCTATGATAGTATCATGACCTGATCCACCAATAGCATTTTCAATAATCGTTTTGTAGGCAATAGAGATATTACTACGTAACCCGCCAATATCTGAAAAGCTACCTTCATTTAAATTAATGACTTGATTAACGGTATATAGGGAAAAGTCTAATGTATCAATTCCCCCCGAATCCCAAATACAACTTACTAATTTATCTTCTATGCTTTTTAAGGAGTAAGCGGCACGTCCCGTATTAGAATGAAATCCATAGATATTATTTTCAAGGCGTGTGGTCATATTTGGGCCATAGAGATATTGCAATAATAATATATCTAGTAACATAAAGGTCATGGGATAAAGACCACCAAAATCAGCATGCTCTGAGGTTGGCATCTTATAACCCATAACAGAATATTTCAATGAAGCTAATACATGATTTTTATCTTTATATTCTAAGTATTGCCAGCTATGGTTTAGCCCGAGTGCATGACCAACTTCATGTAAAATAACTTTATAATGATATGTTCCTGGTTGATATTTATTATTTTTTAGTGTTTCAATTAGAGTATTAGTTTTTTTTATTATTAGAATAGTATCATTATCATAAAATTTAAACACATCACCAATATTACCTTCTGTTTTTATATAATTATCAAGATCATGTTGATGTATTATCTTATAATATTGGTGTGATGATAAATTTAAAAATATAGTTCCAGAGTATTGATATTGTTCATCAATATTTATCTTTTTTATGGGGGTTGAATACCAACTAGGGTAGGTTGCAAAACCTCTGGTGGTATATTCAAATTCTATTGAACCATGACGAATATGAAAATCATCGTAAAAACCAAATTTTATATCGGCATCGTATTCTGGATGAGATGCAACAAACTTTGCTTGTGTTATACGGGAAATTTCACTAAGAATATCGGAAATAACTTCTTGTTGATGAGGATATATGGTTGTTTGTGTATTATAAAAATAAGGATGTATACTATTCTTATTTTTATTAATACTATTTTCTATATCCTCTATATCTTTTTCTAATTCAGCTATTCTGCTTATTGAATATTTATTCATGTCATATTTTAATGAAGTGATTTCTTTTTCTTTTTTTTCCTTAAGATAGATCAATTCATATATTTTAGCGGTATGTTTTATTGATTCTATTCTATCTTTTTCTGTTACTGAATATTTTTTATTTGAGTATTTTCTTTTTTTATCATAATCAGGAAATATATATGTTATTTTTGTTATATTACTATGAGATTGTCTAGGCCAACCATACATATCATCTATAACTATTTTACCATCAGAAAAATAGACGTAAGTTGGTTTTTTTATTGAGTTAAAACTATTCATACTAAATCCTTTTTATCAAAAGAGAATATTTTATATTCTATAATTAAGGGATATATAGAGAGAAATAAAATTTATAAAAACACACTATTTATTGTATGTTTTTTAGTTAGTTGCTATTAATTATTTTATACGTATATTATGCTGGGTTAATATTAATATAATCATTGATGATTGTTTATAGAGTAATAATTTAACAAATAATGTAGTGAAATGTATTTATACAGCAAAGAGTTCATCGTGGTTAAATATACCGACAATCTCTATATGTACAATGGACTTATTGTCATCAGAAGATGTTGAAACATCTATTATGGTCTTGTTGGCTTGGTTGTCATAATTTAATGAAAATTCATTTTTATCGCCTGATAACTTATCAATTTTTTTCATTTTTGATATATCTACTTTTCTAAAATCTCTAGTGATTAACGTTATTTTATCCTTGTTTTTTTCAAAATCCCAAATTGAACTATTGCTTTCAACGCCCTCATAACAGAAAAAATTAAAGGTATCATTTCCTTGTCCACCAGTTATACGATGAGTTCCTGTACCCAAATATATTTCATCATCACCTTCTCCCCCTAGAATGATATTTCTGCCTGGAAGCCCTCTATCTGTTGAGGCTACACAGATCCGATCATTACCCTTACCACCATCTAACATATTGGCACCATAATAATCAATAAGCATATCATCCCCATCATCACCAAAGAGCACATCATTTCCCAATTCTCCGTATATAACATCGTTTCCAGAACCACCATAAAGTAAATCATTGCCAGCACCGCCATAGAATAAATCATTGCCATCACCACCACTAAGATTATTATCAAAACGATTTCCTATGAGAGTATCATCACCTTTACCACCAATAGCATTTTCAATA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29 | Organic_Lake_phycodnavirus(100.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1196387 : 1207742
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP043332|1196387:1207742|DBSCAN-SWA CTTACTCATTTGGTGTCTCCTTATCCAGTGCTTGTAACAACATTCCTTTCGAAATTAAACCGATATAACGGTTTTTTTCATCAATAACAGGGATCGCACAGGGAGATTGCGCAACAGTAGAAATCAGTTCATTTAATGGTGTATCACCATTAATCGCACAAGGTTCAGTTAAAATAGCGGATCCAATAGGTTGCTTCGCTTTTAATGCTTCTTCAAGAGAAGTGACAGAAACAATACCTGCAAATTTCCGCCCTCGCTCAATTAAATAACCAAAGTTTCTATCTTCATCTTCCAGTACTTTTAATGCTGAACGGGGGCCAAAACCTGGCGCAATATGCAGCAGTGTTTCTGGGCGACGTTTAGCAATATCTTTAGCGCTAAATACATGACTGATATCAACGCCACGGAAGAAGGTACGTACATAATCATTGGCTGGGTTATTAAGAATTTCATCAGGGGTACCGATTTGTACCACCACACCGCCTTGCATAATCGCGATACGATCACCAATACGCATGGCTTCATCCAGATCATGAGAAATAAATACAATGGTGCGTTGTTTATCACCTTGTAAGCTCAATAACTCATCTTGCATTTCTGTTCGGATTAATGGGTCAAGTGCGGAGAATGCCTCATCCATTAATAAGATATCAGGATCATTGGCCAGTGCACGAGCAAGCCCAATACGTTGTCGCATCCCACCGGATAACTCATCCGGCCAAGATTGAGCATGAGAGCTTAAGTTAACTTGCTCTAATGCTGCCATGGCTTTTTCATAGCGCTCTTCTTTGCTAATGCCTGCAAGCTCCATACCAAATGCTGTATTATCGAGTACATTCATATGAGGCATTAAAGCGAATGATTGAAACACCATACTGATTTTTTTACGTCGAACTTGTCGTAAATCTTTATCAGACATGGTGGTGATGTTTTCACCATCAATAAGGACTTCGCCTTTAGTGGGATCTATCAGACGATTGAGAAGGCGCACTAATGTAGATTTACCAGAGCCTGATAATCCCATGATGACAAATATTTCGCCTTCTTCAATGGCCAGATTGGCATTTTGCACACCAACGGTTAACCCTGTTTTATCAAAGATTTGGTCTTTGTTCATACCAGATCCTAATAATTCAAAGGCACGTTTAGGGTGCTCACCAAATATTTTATATAGGTTTTTTACTTCGAGTTTAATTGCCATGCAATATCTATTTTCCTATTTAAATATGAAAGGAATAAATTAAATGTTAATAAATTAGTTTGTTGTTTTTCCTAAATTGAGATTTTTAGTAGGGGAATTACCCTATCATAATGAACAAGCCTGACAACCCTATGTTAATTATAATTAAACAAATAATTTTGTGATTTTTTTAGGTTTTTTTTGATAATTAATAATTAAATAAAGTAAAATTATAGAAAAGAAAGAAGTCAAAAAAAACATACTAACTGTATGAAATAACATTATTTTTATTCAGATGTTAATTTTAATTATCATCACAATAGAAATAACAACAAAATAAAAAAATGTAAAAAGATACTAATAAAATAAAAATAGAAAAAAATGCATTAACATTAAAAAATCTTATGTTTTTAAAGGGGTGATCTTAAGTTATCGATAACTAGTCATAAAAATCATTCGTAAAAAATTGATAATTCTGGTTAATGGGACGGTAAAAATTACACAATCAGGTTGTTTTTCAAGCAAATAAAAAGGCACTAAAAAATAAGTTTTATTTTTCAGTGCATTATATTAATTGATTAATTCATAATTAATATGAATGTATTCTGTTTTTTGCTGTAGAGGGTTAGCTAGAAATCCCAGTCATCATCTTCGGTATTGATCGTTTTACCAATAACATAAGAAGAGCCTGAGCCAGAAAAGAAATCATGATTTTCATTTGCATCTGGCGATAGTGATGAAAGTATTGCTGGACTAACATTAGTTATTTCATCTGGAAATAGTGCTTCATAACCTAAATTCATCAGCGCTTTATTCGCATTATAATGAAGGAATTTTTTTACATCTTCTGTCCAACCGACAGGATCGTAGAGATCTTCTGTATATTTAACTTCATTATCATATAAATCTAATAATAATGAGAAAGCAAAATCTTTAATATCTTGTTTCTCTAATGATGATTTATTTAATAACTGATTTTGGAATTTATAGCCAATATAATAACCATGAACGGCTTCGTCACGAATAATTAAACGAATTAAGTCGGCTGTATTGGTTAATTTCCCTCGACTTGACCAATACATCGGTAAATAAAATCCAGAATAGAATAAAAAAGACTCTAAAAATACACTGGCAATTTTTTTCTTTAATGGATCACTATCTTGATAATAACGCAGAATAATATCTGATTTCTTTTGCAAATAGGTATTTTCTTCACTCCAACGATAAGCATCATCAACATCTGTTGTTAAGCAGAGTGTCGAAAATATCGAGCTATAAGAGCGAGCATGTACCGCTTCCATAAAACAGATATTCGATAATACCGCCTCTTCATGGGGAGTCTGAGCATCAGGCATTAAGGTTGGTGCCCCGACCGTATTTTGTATCGTATCGAGCAGTGTAAGCCCTGTAAATACACGGATAGTCAACTGTTTTTCAGCTTGGGTTAAGGTATTCCATGAAGGTATATCATTAGAAAGTGGAATTTTTTCGGGTAACCAAAAATTCATGGTTAAACGGTTCCAAACTTCTAAATCTTTTTCGTCTTCAATACGATTCCAATTTATCGCATTAACACGACTTAAATAAGATGCAGACATAGTAACACTTTCCTTATCATTATTATTAAAGGGCGCATGAAACACAGCCTTTTATTTCTGTGCCGGCTAATGCTGTTTGTCTAATACGAATGTAATACAAGGTCTTTATACCTTTACGCCATGCATAAATTTGTGCTTTATTAACATCCCTTGTGGTTGCTTCATCAGAAAAGAATAATGTTAGCGATAATCCTTGGTCGATATGTTGTGATGCTTGGGCATAGGTATCGATAATTTTTTCTGCGCCAATTTCATAAGCATCTTGATAAAAATGACGGTTTTCATTGGTCATAAAAGGGGCGGGGTAATAAACCCGACCGATTTTACCTTCTTTTCTTATTTCAATCGGTGCCACAATGGGGTGAATACTCGATGTAGAGTGATTGATATAAGAGATTGATCCTGTTGGCGGTATTGCTTGTAAGTTTTGATTATAAATACCGTGAGTCATAATCGAGAGCTTAAGTTTTTGCCAATCTTCTTGGGTTGGAATATGAATATTGGATTGGTTAAATAGCTGGTGGACTTTTTGGGTTTTAGGTAACCACTGTTTTGATAAATATTTATCAAAATACTCCCCAGTGGCATATTTTGACTGTTCAAATCCTTTAAAGCGCTGTTTAGTCTCTATCGCTAATTGGTTAGAGGCTAAAAGGGCATAGTATGTTACGGTATAGAAATAGATATTGGTAAAATCAAGCCCTTCTTCTGAACCGTAATAAATCCCTTCACGGGCTAAATAACCATGTAAGTTCATTTGCCCTAAACCAATGGCATGAGATGCTTGGTTGCCTTTTTCAATAGAAGGTACTGATTCTATTTTAGTCATTTGTGCCACACTCGTCAGTGCTCTGATGGCAACATTTACGGTATGCGCAAAATCTGGTGAGTCCATCGCCATAGCGATATTCATTGATCCGAGATTACAGCTAATATCATGACCAATTTGTCGATAACTTAAATCAGGATTGTATTCACTGGCACTATTTACTTGTAAGATTTCTGAGCATAAATTGCTCATATTAATTCGGCCCGCAATCGGATTTGCGCGATTGACGGTATCTTCAAACATAATATAGGGATAACCTGATTCAAATTGAATTTCAGCTAAAGTTTGAAAAAATGCCCGAGCTTTAATTTTTTTCTTACGTATCTCTGCATTGTTGACCATTTCAGTATATTTTTCGCTAATACTGATTTCTGACATAGGAACGCCATATACTCGTTCTACATCATAAGGTGAAAATAGATACATATCTTCGTTGCGTTTAGCTAATTCAAAGGTGATGTCGGGAATAACGACACCTAATGAAAGCGTCTTAATACGTATTTTCTCATCGGCATTTTCTCGTTTTGTATCTAGAAAATGATAGATATCAGGATGATGAGCATGGAGATAAACCGCTCCAGCACCTTGTCTTGCGCCTAATTGATTGGCATATGAGAAGGCATCTTCAAGCATTTTCATTACCGGTACTACGCCAGACGATTGGTTTTCAATGCGTTTTATGGGAGCTCCTGCTTCTCGTAAATTAGTCAGTAAGAAAGCAACACCTCCGCCACGTTTCGACAATTGCAACGCAGAATTGACTGCTCGTCCAATGGACTCCATGTTGTCTTCGATACGTAATAAAAAACAAGAGACCAATTCGCCACGCTGTTTTTTTCCACAATTTAAGAAAGTAGGGGTTGCAGGCTGAAAACGGCCACTAATTATCTCATCGACAAGGTGAGTGGCGAGTTTGGTATTCCCCTGTGCTAGGGTTAAGGCAACCATACAAACACGATCTTCATAGCGTTCGAGATAACGCTCACCATCAAAGGTTTTTAAGGTGTAACTGGTGTAGTATTTAAATGCACCTAGGAACGATTGAAAGCGAAATTTTTTGCTATAGGCATGCTTAAAAAGCTGTTTGATAAACGGGAAATCATACTGCTCTAATACTTGTGCTTCGTAGTAGTGTTGTTGCACCAGAAAATCGAGCTTTTCTTTTAGATCATGAAAAAACACCGTATTTTGATTAACGTGTTGACGAAAAAAATGGTGGGTGGCTAATTTGTCTTTATCAAACTGGATATTGCCTTGTTCATCATAGAGATTGAGCATGGCATTTAAGGCGTGATAATCGAGTTGTTCTATAGAGTGGGTCATATTTTTTATCTCATTCACTTTTTAGTCATTATTTGCTAGCTGACCAAAATGTGCTTAATCCGGTTTTTAC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CCTCATCAGCACAAATAAAAAGCGCATTCCTTCTATAATGAGGAATGCGATACTGATAGTTAGGGTAAATATAGAATGGGTAAATGTGTTTATTCCAATATCGATATAATCTTTATATATGGACACATTTATCCTTTTCAAGCCTTAACCAAACCAACGTGAAAATAATAATTTGATGTAATCAATCAAGCGGCTGAAAATGCCACCTTCTTTCACTTCATTCATAACAACAAGTGGACGTTGTTCAATGACTTGCCCATCAAGTTGGAAATTAATGGTGCCAACCACTTGGTTTTTACTGACTGGGGCATGTAATTCAACATTATCTAATACATAACTGGCCTTTAGATCTTTGAGTCGGCCACGGGGGATCGTGAGATAAACATCTTTATCAACCCCTAATTGCACTTTATCAGTATCACCATACCAGATAGGTTCAGCAGCAAATTCTTTACCCACTTGCAGTGGTTTTACCGTTTCAAAGAAGCGAAAACCCCAAGTAAGTAGTTTTTTACTTTCAGCATCACGGCCTTTAGATGAGTGTCCACCCATCACGGCAGAAATCAAGCGCATATTTCCTTCTGTTGCAGAGGCAACAAGATTATAACCTGCAGCTTCAGTATGACCCGTTTTAATACCATCAACATTGAGGCTAGTATCCCAAAGTAAACCATTACGGTTAGTTTGACGGATATTATTGTAGGTAAACTCTTTTTCTTTATAAATGGCATATTCTTCTGGAACATCACGAATTAATGCGGCGCCAATCAATGCCATATCTCGTGCACTACTGTATTGCCCAGGTGCATCTAAACCATGTACAGTTTGAAATTGTGTGTTTTGTAAACCTAGACGCTTAACATAGTCATTCATCATAGTGACAAAGGTATCTTGGCTTCCTGCAACATAAGAGGCCATTGCTACACAGGCATCATTACCTGATTGTAGATTGATACCGCGTGTTAATTGTGAAACGGTGACTTTATCACCGGGTTTTAAAAACATTAATGATGAACCGCGAAATACAGGGTTGCCCGTTGCCCATGCTTCTTCACCAATAGGAACAATATCGTTGTTCGATATTTTTCCTGCACGAATGGCTTGACCTATAACATAACTGGTCATCATTTTGGTTAAACTGGCTGGATCACGACGGACATCTGCATTTTTTTCCGCGAGGACTTTCCCAGAATTATAGTCGATAAGAATATAGGATTCGGCTTCGATATTAGGAACAGCGGGTATCATTGTTTTTAATGTGTCATCAGCAATAGCATGATGGCTAATAGCTAATAATATAAAGGTTGCACTAAATAGACGTGTTCTTAGTAATTTCACTGGGCGTGTCTGTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP043332|1196387:1207742|1203995_1204961_-|WP_004246057.1|DBSCAN-SWA MSKPIQMERGVKYRDADKMALIPVKTIVTEREELLRKPEWMKIKLPADSSKIQGIKAAMRKNGLHSVCEEASCPNLAECFNHGTATFMILGAICTRRCPFCDVAHGRPNAPDPQEPIKLAQTIKDMGLRYVVITSVDRDDLRDGGAQHFADCITAIREKNPNIRIETLVPDFRGRMDKALEILTDTPPDVFNHNLENVPRVYRQVRPGANYQWSLTLLERFKQAHPNIPTKSGLMVGLGETNEEIIDVMRDLRKHGVTMLTLGQYLQPSRHHLPVQRYVSPDEFEYMKEQALAMGFTHAACGPFVRSSYHADLQAQGIEVK >NZ_CP043332|1196387:1207742|1199189_1201316_-|WP_075206322.1|DBSCAN-SWA MTHSIEQLDYHALNAMLNLYDEQGNIQFDKDKLATHHFFRQHVNQNTVFFHDLKEKLDFLVQQHYYEAQVLEQYDFPFIKQLFKHAYSKKFRFQSFLGAFKYYTSYTLKTFDGERYLERYEDRVCMVALTLAQGNTKLATHLVDEIISGRFQPATPTFLNCGKKQRGELVSCFLLRIEDNMESIGRAVNSALQLSKRGGGVAFLLTNLREAGAPIKRIENQSSGVVPVMKMLEDAFSYANQLGARQGAGAVYLHAHHPDIYHFLDTKRENADEKIRIKTLSLGVVIPDITFELAKRNEDMYLFSPYDVERVYGVPMSEISISEKYTEMVNNAEIRKKKIKARAFFQTLAEIQFESGYPYIMFEDTVNRANPIAGRINMSNLCSEILQVNSASEYNPDLSYRQIGHDISCNLGSMNIAMAMDSPDFAHTVNVAIRALTSVAQMTKIESVPSIEKGNQASHAIGLGQMNLHGYLAREGIYYGSEEGLDFTNIYFYTVTYYALLASNQLAIETKQRFKGFEQSKYATGEYFDKYLSKQWLPKTQKVHQLFNQSNIHIPTQEDWQKLKLSIMTHGIYNQNLQAIPPTGSISYINHSTSSIHPIVAPIEIRKEGKIGRVYYPAPFMTNENRHFYQDAYEIGAEKIIDTYAQASQHIDQGLSLTLFFSDEATTRDVNKAQIYAWRKGIKTLYYIRIRQTALAGTEIKGCVSCAL >NZ_CP043332|1196387:1207742|1206530_1207742_-|WP_004246054.1|DBSCAN-SWA MKQTRPVKLLRTRLFSATFILLAISHHAIADDTLKTMIPAVPNIEAESYILIDYNSGKVLAEKNADVRRDPASLTKMMTSYVIGQAIRAGKISNNDIVPIGEEAWATGNPVFRGSSLMFLKPGDKVTVSQLTRGINLQSGNDACVAMASYVAGSQDTFVTMMNDYVKRLGLQNTQFQTVHGLDAPGQYSSARDMALIGAALIRDVPEEYAIYKEKEFTYNNIRQTNRNGLLWDTSLNVDGIKTGHTEAAGYNLVASATEGNMRLISAVMGGHSSKGRDAESKKLLTWGFRFFETVKPLQVGKEFAAEPIWYGDTDKVQLGVDKDVYLTIPRGRLKDLKASYVLDNVELHAPVSKNQVVGTINFQLDGQVIEQRPLVVMNEVKEGGIFSRLIDYIKLLFSRWFG >NZ_CP043332|1196387:1207742|1196387_1197587_-|WP_004246075.1|DBSCAN-SWA MAIKLEVKNLYKIFGEHPKRAFELLGSGMNKDQIFDKTGLTVGVQNANLAIEEGEIFVIMGLSGSGKSTLVRLLNRLIDPTKGEVLIDGENITTMSDKDLRQVRRKKISMVFQSFALMPHMNVLDNTAFGMELAGISKEERYEKAMAALEQVNLSSHAQSWPDELSGGMRQRIGLARALANDPDILLMDEAFSALDPLIRTEMQDELLSLQGDKQRTIVFISHDLDEAMRIGDRIAIMQGGVVVQIGTPDEILNNPANDYVRTFFRGVDISHVFSAKDIAKRRPETLLHIAPGFGPRSALKVLEDEDRNFGYLIERGRKFAGIVSVTSLEEALKAKQPIGSAILTEPCAINGDTPLNELISTVAQSPCAIPVIDEKNRYIGLISKGMLLQALDKETPNE >NZ_CP043332|1196387:1207742|1202937_1203147_+|WP_004246068.1|DBSCAN-SWA MSKLKGNVKWFNETKGFGFITPEDGSKDVFVHFSAIVSEGFKTLAEGQKVEFEVTDGAKGPSAANVVAI >NZ_CP043332|1196387:1207742|1202266_1202740_+|WP_017827772.1|DBSCAN-SWA MYQDYLNTPKGFPKPYISITADDDGITSLNFVSEKEALVNSNAIVDQCIKQLKEYFSGKRTLFSVPLAPKGTEFQIRVWQTLQSIPYGEIWSYKKLALTLGSVNYCRAVGMANSRNPISLIIPCHRVIGHNGKLVGYTGGLDIKRWLLHYEKVDIDE >NZ_CP043332|1196387:1207742|1205062_1205707_-|WP_004246056.1|DBSCAN-SWA MKIFTVQDKTIIIRQLGMKPYLPVSDSMHQFTEKRESHTPDEIWLVQHEQVFTQGQAGKAEHLLNTGSIPVIQSDRGGQVTYHGPGQQVMYVLLDLKRNHIGVRQLVTVLENTVINTLAEFNVDAYARADAPGVYVNGDKICSLGLRIRKGCSFHGLALNVDMDLSPFTRINPCGYPDLKMTQLVDLAPNATSEQVASLLINHFCTQLGFQPQQ >NZ_CP043332|1196387:1207742|1201760_1201985_-|WP_004246071.1|DBSCAN-SWA MSVILYTKPNCVQCSATERALQQQKIPFTAVDLTQDTQALAKIVSMGYRQVPVVVNGDEHWSGFCPDKIRQIAR >NZ_CP043332|1196387:1207742|1203605_1203980_-|WP_004246058.1|DBSCAN-SWA MLNIAIAVFIGGGLGSVLRWLISYRLNSLFPHFATGTLVANCIGAFIIAFGIAWFSKAPNIDPIWKIMLTTGFCGGLTTFSTFSVEVVALFNEGRIGWALGTMGANLAGSFLMTAFAFWLLREM >NZ_CP043332|1196387:1207742|1206068_1206332_-|WP_026090527.1|DBSCAN-SWA MKTKLNELLEFPCSFTYKVMGHAKPELVDQVVEVIQRHAPGDYTPSVKPSSKGNYHSVSVTINATHIEQVETLYKELGELELVRMVL >NZ_CP043332|1196387:1207742|1198195_1199164_-|WP_149127390.1|DBSCAN-SWA MSASYLSRVNAINWNRIEDEKDLEVWNRLTMNFWLPEKIPLSNDIPSWNTLTQAEKQLTIRVFTGLTLLDTIQNTVGAPTLMPDAQTPHEEAVLSNICFMEAVHARSYSSIFSTLCLTTDVDDAYRWSEENTYLQKKSDIILRYYQDSDPLKKKIASVFLESFLFYSGFYLPMYWSSRGKLTNTADLIRLIIRDEAVHGYYIGYKFQNQLLNKSSLEKQDIKDFAFSLLLDLYDNEVKYTEDLYDPVGWTEDVKKFLHYNANKALMNLGYEALFPDEITNVSPAILSSLSPDANENHDFFSGSGSSYVIGKTINTEDDDWDF >NZ_CP043332|1196387:1207742|1201344_1201749_-|WP_149127391.1|DBSCAN-SWA MQSTAPLIYFSSRSENCHRFVQKLNLQATRIKEDEPLQATQPFVLLCPTYGGGGVKGAVPKAVIQFLNIPKNRQLIRGVIASGNTNFGSAYGLAGDIIAQKCQVPFLYCFELLGTPEDVKRVKTGLSTFWSASK |
12 | Mycobacterium_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1407652 : 1486565
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP043332|1407652:1486565|DBSCAN-SWA AATGGGTCAGTTTGATTTTTTAACAGAAACTACACTAGGGGAGAAGGTCTCTCAGTTAAATGAGCCACCTGCGATGTATAAGGTGATCTTGAATAATGATGATTACACCCCCATGGATTTTGTTGTAGAAGTATTAACAATGTATTTTTTTCTTAACGAAGAAAAAGCCACACAAATTATGTTGGACGTTCATCATAAAGGGAAGGGAGTGTGTGGTGTCTATAGTGCGGATATCGCTGAAACTAAAGTTGCACAAGTGAATCAATACGCCAGAGAAAATGGCCATCCACTTTTGTGTACACTGGAAAAAGCGTAGTCCGGTGAGTCTTTTAAGGAGGAGGTGCTTATGCTTAATCACGAATTAGAGCTTAGTCTTAACATTGCATTCGCGAAAGCCCGTGATAACAGACACGAATTTATGACTGTAGAGCACCTGTTGCTGGCGCTATTAAGTAACAAATCGGCGCGTGAAGCATTGGAAGCTTGTAAAGTCGATTTAGCAGTCTTACGCGAAGAGCTTGAAATCTTTATTCGTAAAACGACACCTATTTTACCCGAGCATGTCGATAGAGAAACACAGCCAACCTTGAGTTTCCAACGTGTATTACAACGTGCTGTGTTCCATGTGCAATCTTCAGGTAAAAATGAAGTTTCCGGTGCCAATGTGCTAGTGGCGATTTTTAGTGAGCAAGAGTCTCACGCCGCTTATCTACTACGTAAACATGATGTTAGCCGTCTTGATGTGGTTAATTTTATCTCTCATGGCATTTTAAAAGATGATCAACAAAACAGTGATGATCAGTCTGATATGGGCGATATAAATGCACAATCTCAACAAGAGATGCCACAAGGCGATGATCGCATGGATAATTTTACCACTAACTTAAACCAGTTGGCGCGTCAGGGTAAAATTGATCCACTTATCGGCCGTCAAGCGGAATTAGAAAGAACGATACAAGTCTTATGTCGTCGACGTAAAAATAACCCATTACTGGTCGGTGAATCGGGTGTCGGTAAAACGGCAATTGCAGAAGGGCTCGCATGGCGTATTGAACAAAATGATGTGCCTGATGTGATGAAAGGCTGTACGCTCTATTCTCTTGATATTGGATCTTTATTAGCAGGAACCAAATATCGTGGTGATTTCGAAAAACGCTTTAAAGCGTTATTGAAAACACTTGAAAAAGATGAAAAAAGTATCTTATTTATCGATGAAATTCATACCATCATTGGTGCTGGTGCCGCCTCTGGTGGACAAGTTGATGCCGCTAACTTAATTAAACCACTATTATCAAGTGGTCGTATTCGTGTGATTGGTTCAACCACTTATCAAGAATTTAGTCAGATCTTTGAAAAAGATCGCGCCTTGGCTCGTCGTTTCCAAAAAATTGATGTAATTGAGCCTTCGGCAGATGAAACTGTATTAATTATTAAGGGATTGCGTCAGAAGTATGAAGCACATCACGATGTGCGTTATACCAATAAGGCAATTCAGGCAGCTGTTGATTTATCGGTTAAATACATTACTGATAGACACCTTCCTGATAAAGCCATTGATGTTATTGATGAAGCCGGTGCGAAAACCCGTTTAATTGCACCAAGTAAACGTAAAAAGACGATTAATGTCTCTGATATTGAATCGGTAGTAGCAAAAATTGCCCGTATTCCAGAAAAAACGGTTTCTAGCAGTGATAAGTCAATGCTAAAAAATCTGGATAACCAATTGAAAATGTTGGTGTTCGGTCAAGATCAAGCCATTCATGCCTTGGCTGAATCTATCAAAATGAGCCGAGCAGGTTTAGGGCAAGAGAATAAGCCGGTTGGCTCTTTCTTATTTGCCGGACCAACTGGGGTGGGTAAAACAGAAGTAACGGTCCAGTTGGCGAAAGCGCTTAATATTAAGCTACTGCGCTTTGATATGTCTGAATATATGGAACGACATACGGTAAGCCGTTTAATTGGGGCACCTCCTGGTTATGTTGGTTTTGATCAAGGTGGATTACTCACAGATGCGGTGATTAAAAACCCTTATTCTGTAGTGTTACTTGATGAGATTGAAAAAGCACATCCCGATGTGTTTAACATTCTGCTACAAGTGATGGATAACGGAACACTTACTGATAATAATGGCCGTAAAGCTGATTTTCGTAATGTGATTTTGGTGATGACAACCAATGCGGGTGTTCATGAAACGCAACGTAAATCGATAGGGTTTACTGAACAAGATCATAGCACTGATGCCATGGTTGAAATCAAAAAAGCGTTTTCCCCAGAGTTTCGTAACCGTTTGGATGGCATTATTTGGTTTAATGCGCTATCAGCCGATATTATTGCTATGGTGGTTGATAAATTTATTGTCGAGTTACAAGCTCAATTGGATGATAAAGGGGTATCGCTAGAGGTAAGTCAAGAAGCTCGCCAATGGCTAAGTGATAAAGGTTACGATAAAGCAATGGGAGCAAGACCTATGGCGCGCGTAATTCAAGAAAATCTGAAAAAACCATTAGCCAATGAAATTCTGTTTGGCTCGTTAGTTAATGGCGGATCGGTTTCTGTGACCTTAAATGACCAAGAAAATAAATTACAGTACCAATTTACTAGCCAAGAAAAATTGGCTAAAAAAGAAGATACCGTTATTTAATAATAGCGGTTTATCTTAGGCTAAAAAGCAGACACCACAGGTCAGCATCAATTCATGCTTTGCCTGTGGTGTTTTTTTTCACCCGAAATGATGATATTGCGGGAGAGAATGGATTGGGATCAACGGCTACGGAAGATGATACGGCCTTTGCTCAGGTCATATGGGGTCAGCTCAACGGTAACCTTGTCGCCTGTCAGGATACGAATATAGTTTTTACGCATTTTTCCTGAAATATGAGCGGTAACGACGTGTCCGTTTTCTAATTCTACACGGAACATCGTGTTTGGCAGAGTATCCAGTACAGTGCCTTGCATTTCAATGTTGTCTTCTTTGGCCATCTAATCCTCTAAGTTTTAATAACCATATTTTTTAAACGGCAAGATAATGCCGAAAATATTGTCCTATGTAAAGGAATGTTATTGGTTAACAAAGATGTTTGCTTTGCTAACAAGTTAATATTCCTTACCGTTACTTGTGTTTTAGTTGCTGAAAAACAAGGTTAATAACACAAGTCATAATTCTTTATTGTGCGGTATTTATTGCAATAAAATAACAACATCCAAACCACACTTTGGATGTGCAAGATGAATTTTTGTATAGACCACAGCAGTGAAATTCTATTTAAAATCTGATGGGCTTTACAAAAACGAGTGGTGATTATAATTCCAACGATTGCTGATACCAACACTTTTTATCAATAATCACCTTTTTCCAACGAGATAGCGCCTCTAAATAGCGATCTCTGGCAATTTCTATCGCACCTAATGCTGCCGTATGAGAGTTTAACACTTGGCAATCAAATAGTTGACCCCCATAACGCAGAAAATGGTTATAAAAAGCAACAAAGGCACATTTAGAAGCATTATTTCGACGACTAAACATTGATTCACCGCAGAAAACGGCACCAACGTTAACTCCATATAAACCACCGACCAATTCGTCGCCCTCCCAAACTTCTACCGAATGGGCTTCTCCTTGTTGGTGCAATGCCCGATAGCCGTTTTTTATATCAGGGCCTATCCAAGTTCCCTCATCACGTATACTACAGGCCTCAATGACATCAGAGAATGCCTGATTTAAGGTGATGGTATAAGGCGCTTGGCGTAAAAACTTACGTAACGTACGACCAATATGCAATGTTCCTGCGGGTAAGACGGCTCGGGGATCGGGGGACCACCATAACGGCGTTTCATGGGGTGTATACCAAGGGAAAATCCCCGTTTGATAAGCCTCTTTCAAACGAGCAGGGGAAATATCGCCGCCAATTGCCAATAACCCACTTGGCTCTTTTAAAGCCAAATGGGGGGCAGGAAAAGTCACATCGTGTTCATCTAATTGAAACAACGGCATATTACGCCTCATCATGTGGCATTAACAATGCTTGTCTTTGATGAAATTTAGCATACTGACCTTGCTGTTGTAATAACTGACGATGCGTGCCGGTTTCGACAATGTGACCGCCATCCATCACACAAATTTTATCCATTTTATCTAGCCCAGAAAGTCGGTGGGTGATCATTAATACCGCTTTTCCTTGGCAATGTTGCTGTAATAGCGCGAGGATCTGTTGCTCTGTATCTGCATCAAGACCTTCTGTTGGCTCATCAAGTAAAATTAGTGGTGCATTATGGAGTATGGCTCTTGCCAGCCCTAAACGTCGTTGTTCGCCTCCAGAAAGCTGTCTTCCACCATCACCCATCCATGCATTTAAACCTTCATCATTTTCGACCAGTTGTTCAAGACCCACTTGGCGGAGAACATGAGTAAGCTCTTCATCTGTCGCATCGTCTTTTGCCATAATTAAGTTCTCTCTTAAAGTATGGCTGAAAACATGCACACGTTGAGGTACAACAGACATCATTGAACGTAATGTCGCTTCATCATAATCAGCAAGAGGCAAATGATTTAAAGTGATCATACCCTGAGAGGGATCGAACGCGCGATTGACTAACTGTAAGAGTGTTGATTTACCACAACCTGTTTTACCGAGTAATGCCACATGTTGTCCCGCTTCAATGGTGAGATCAACATGATTGATCACAGGCATGGGTTGATTAGGATAGGTAAAGCAGACATCCCGTAGCGTTAATGAGGCGCTCTGTTTTATCTCTCCCCCTTGGGCTGGGAAGGTGACATCGGGTTGTTGCTCAATTAAATGTGTAATACGCGTAGCCGATGTCATGACTTGCCCTAAATGTTGAAATGCGACAGTCACAGGGCCGAGCGATTCAAATGCCGCTAATGCACAGAAAGTAAAGAGAGCGATGAGTGCTTCTGGCATAAAGTGGGCATCAATACCATCGGCAGCTAACCATAAAATCAGTGTGGCGGTTAATCCCGAGGCTAAAATCATTAGCGA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58 | Bacillus_phage(17.65%) | plate,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1562672 : 1601874
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP043332|1562672:1601874|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP043332|1562672:1601874|1575526_1575922_+|WP_149127447.1|DBSCAN-SWA MKTTEQILNQYKEGDKIDRHIVSRDLGIALSSSSRALSYLNGLGALVRVGNEDRPVRYIVTNEAEHIYQAIIEERKLGESAYLQKLKTQKAKKRALPTIKWVKHATSNFDLMGKLPTEPYDSLVRTARGNH >NZ_CP043332|1562672:1601874|1564756_1565308_-|WP_049208654.1|DBSCAN-SWA MDLKQCDKKQLKEEFNRLTALTSYKSTMGVFDIFTRLPELLNNDETVLCVNSGIVKSNIWLIIPTNKRIIFLHKKSGLFHKKVDLSSVNYDAITSIDSSSGLTGGKIKINTPGTIYEIGTLQKNSVQPLVDIILSKKNNSSSQSSNNSGDDLLSKLEKLGKLKESGVLTEEEFQEQKSKLLNL >NZ_CP043332|1562672:1601874|1587030_1587636_+|WP_036905264.1|head,protease|DBSCAN-SWA MSSEKETRCYVGEVRAEVGEENKPTHIVGLGSVFDSRSELIYGFREIIKPGAFDDVLNDDVRGLFNHDPNYILGRTTAGTLSLSVNERGLVYDITAPETQTIRDLVLAPMKRGDINQSSFAFRVARDGEEWYQDEEGVVIREITRFSRLYDVSPVTYPAYQDADSAVRSMNAWKEARDSGDLQKAINQKLARERLMTLLNA >NZ_CP043332|1562672:1601874|1569297_1569795_-|WP_149127441.1|DBSCAN-SWA 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52 | Morganella_phage(27.91%) | lysis,portal,terminase,tail,protease,capsid,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1680712 : 1715282
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP043332|1680712:1715282|DBSCAN-SWA 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48 | Morganella_phage(19.35%) | tRNA,integrase,lysis,portal,terminase,tail,protease,capsid,head | attL 1674816:1674832|attR 1721835:1721851 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
2000667 : 2010659
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP043332|2000667:2010659|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP043332|2000667:2010659|2000667_2002725_-|WP_017628120.1|DBSCAN-SWA MKKTPLFNRKTMMSAFLDAIKKCTPQAQWHNPVMFIVYVGALLTTGIWFAVLLGYLPPDNHFTFQVMLWLWITLLFANFAESLAESRSKAQAASLRGAKQQSKAVRLQHADLHAPQEIIDSLLLHKGDIVLVNAGEVIPCDGEVIEGGASVDESAITGESAPVIRESGGDFSSVTGGTRVLSDWLIIRCSAEAGNSFLDRMIGMVEGAKRRKTPNEIALTILLTALTLIFLFACTTLYPFSVFAVQFQHHGEVISVVTLIALLVCLIPTTIGGLLSSIGVAGMSRMLDANVIATSGRAVEAAGDVDVLLLDKTGTITLGNRQASRFIPLSGITEKQLADAAQLSSLADETPEGRSIVILAKQRFNLRERDLTSMGASFVPFSAMTRMSGVNIGERIIRKGSVDAIRRHIEVSHSHFPDEVNTIVEQVARAGATPLVVVENQNILGVVELKDIVKGGIKERFAQLRQMGIKTVMITGDNHLTAAAIAAESGVDDFLAQATPEAKLALIRQYQSEGRLVAMTGDGTNDAPALAQADVAVAMNSGTQAAKEAGNMVDLDSNPTKLIEVVHIGKQMLMTRGALTTFSIANDIAKYFAIIPAAFAVTYPQLNMLNIMGLHSPASAMLSAVIFNALIIVFLIPLALKGVHYRPVSAHSLLRRNLSLYGISGLIVPFLGIKLIDMILAIIGL >NZ_CP043332|2000667:2010659|2002736_2004437_-|WP_004248043.1|DBSCAN-SWA MATTTLIYIAVFLTVLLIMGKVIGNYLARLIEGDLPHWVTKTEQVIWRSCGFKPAGKAIQSMSWYHYMFALLIFNSMGALLLLVILLNQGYLPLNPQFAPNMSWDLALNTTISFITNTNWQAYSGETAVSYLSQMMGLTVQNFLSATTGIAVAFVLIRALTQSSCHSIGNAWVDIGRITLYLLLPLAIIWSLLFVSQGVIQNFHPALLSQGLENQQWLPMGPVASQEAIKLLGTNGGGYFAANSAHPYENPTSFSNFLQILAIFLLPTALCFAFGRLSGTQRQGYTLLWVMTLIFIVAVSVIVWAEWRGNPQFTLMGADSSLNMEGKESRFGLIGSALFVAVTTAASCGAVNAMHDSLTALGGMVPMWLMQTGEVIFGGVGSGFYGMILYVLLAVFIAGLMVGRAPEYLGKKIGVAEMKWVAVAILISPAITLLGTTLALFSEVGREAILNPGPHGFSEVLYAFTSAANNNGSAFAGLNANSVFYNLLLGITMLVGRFGVMLPVLAIAGSLAIKKRQAESLATLSTTSPLFIFLLFLTVIMIGALTFVPALALGPIAEHLQLLWAK >NZ_CP043332|2000667:2010659|2004772_2005459_+|WP_004242887.1|DBSCAN-SWA MNAIYLKTKWFFYFLGLLMVSSIFMVKAMANSDKADLVTLAQEGNLPELKRQIAQGENIEQRDIKLRTPLMAATHANQIEVAKYLIEQGANVNARDAIYDSPYLYAGARGLQEILALTLAHGADLNSINRYGGTALIPAAERGHVATVKTLIDAGVDVNHVNRLGWTALIEAIILGDGSQKYADIVTLLIDGGADVNLADGSGRTPLTLAKDKGYTNIINILQQAGAK >NZ_CP043332|2000667:2010659|2008214_2010659_-|WP_020945635.1|DBSCAN-SWA MKNIKEMTLLSTPLSRRRFVKVGAAGGLVATAGGLSLPFSQAIASEQTAPTSTNKEKVVWSACTVNCGSRCPLRMHVVDGEIKYVETDNTGNDVYDEFHQVRACLRGRSMRRRVYNPDRLRYPMKRVGKRGEGKFERISWDEAFDTISDTMKRLIKDYGNESIYLNYGTGTLGGTMTKSWPPGATLIARLMNCCGGYLNHYGDYSTAQIAAGLNYTYGGWADGNSPSDIENTKLVVMFGNNPGETRMSGGGVTYYVEQAREKSDARMIIIDPRYTDTGAGREDEWIPIRPGTDAALVNALAYVMIKEDLVDKPFLDKYCVGYDETTMPEGAPKNAHYKAYILGDGADGQPKTPEWAAQITGIPAARIVKLAREIAGAKPAYITQGWGPQRRSNGELASRAIAMLAILTGNVGINGGNTGAREGSYSIPFVRMPTLTNPVTTSISMFMWTDAILRGPEMTATRDGVRGKDKLDVPIKMVWNYAGNCLVNQHSEINRTHEILQDDKKCEMIVVIDNHMTASAKYADILLPDCTASEQMDFCMDASAGNMAYVIFADQAIKPRFESRNIYEMTSEIAKRMGVGEKFTENRTQEEWLRHLYEQSRQNLPELPTFEEFRAQGIFKKRDPQGHHVAYREFRADPLNNPLTTPSGKIEIYSSQLAEIKATWELAADDVIDPLPIYSAGFESYGDPAMDKYPLQMTGFHYKARTHSTYGNVDVLKAACPQEIWINPVDATKRGIKHGDLVRIYNDRGEVRINAKVTPRILPGVVGLSEGAWYNPDSNRIDHAGCINVLTTQRPSPLAKGNPSHSNLVEVVKA >NZ_CP043332|2000667:2010659|2005972_2006584_-|WP_004242890.1|DBSCAN-SWA MEQQVITDISLSARIIGAAFYYPPTEKSDIVELLSSGKWLTEWPYGSEEEKQRIASLLAQTTYQDETLAQAYQRLFIGPYALPAPPWGSVYLDHENVLFGDSTLDLREWMLENGIDIALTQNEPEDHFGLMVMMVAWVAETRPEKLTELLAEHLLPWAYRYLEKLSLQGAFPYYEGLAMLATLTLKSWQSLLSITPVEKQLFC >NZ_CP043332|2000667:2010659|2006723_2007584_-|WP_004242891.1|DBSCAN-SWA MGMGLHEWPLMFFTVIGQSVAGAFIIMGCAILSGKLPEALNRKVHYSMFGLWLLMGIGFLLSMIHMGTPMRAFNSFIRFGHSSLSNEIASGATFFALGGLYWLISVLNKMPAALGKLWLVVVMILAVLFITAISRVYQIDTVPTWYNGYTTVNFVLTAFIGGPILAALLMRIAGFNLNCISALPLLSVIAIIISAIVATSQGFELGSIQTSVQKAVDLVPDYGFLMGIKLIALTLGLACWIAPLLRKNNPSVSLMVLGFILVFVGEFIGRGVFYGLHMTVGMAVVG >NZ_CP043332|2000667:2010659|2005458_2005920_+|WP_004242888.1|DBSCAN-SWA MSDKQFIQQAISLATENVKVGGRPFGAVIVKNGQVIAHAVNQITATNDPTAHAELLALREAGKVLGRAKLDDCVVYASGQPCPMCLAAMRMAGISQIFYAYSNDDAQPYGLSTANIAKALRVAPEQQEGLQFVQIKPEDEKQPALYQLWSQQS >NZ_CP043332|2000667:2010659|2007585_2008203_-|WP_004242892.1|DBSCAN-SWA MSTQYGFYIDSSRCTGCKTCELACKDFKNLSPEVNFRRIYEYAGGDWTEQDGVYTQNVFAYYLSISCNHCDDPACVKVCPSGAMHKREDGFVVVNEEVCIGCRYCHMACPYGAPQFDEVKGHMTKCDGCYERVAEGKKPICVGSCPLRALDMAPIEELRAKYGDLAEIAPLPSAKYTKPNIVLKLNANSRPVGDTTGHLANPEEV |
8 | Escherichia_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
2540845 : 2559735
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP043332|2540845:2559735|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP043332|2540845:2559735|2557385_2557835_-|WP_036907811.1|lysis|DBSCAN-SWA MNNLTKIIIIIMLCLIAGLFWVIDRNKILKQKYVKINETLTQQIVENKNYQLRIKQLYQMDTQRLQELASAKSEIDRLRSYAERDPERVYIRASCAKNDANSTPRVDDATRARPTDAAIRNYWILRERIAQSESIILGLQDYIRQECIN >NZ_CP043332|2540845:2559735|2558919_2559735_-|WP_020945914.1|DBSCAN-SWA MRLADLPKYFSPKSVVLSDVRTPKAVDSLSITDVMASISLATRKGRMGIELFLAKHHINRPEEAIESLYQCALTQVNQYKMIDKLAEHDKAKVLHIIAEYAFQDYARSAASKRACPDCDDGFIEVEVFTTKCHGRKTTQQVTQNAKPHLKTTSSNKASFREVREVTRVICPTCKGKAEIRLACRCHGRGKIIDKKQTELQGVAVFKPCRQCAGRGYPRLKFSEVLQQLQHVVSISKTAAYSHYKPLFDFLVAECFKEESLSDKFLQEVTVK >NZ_CP043332|2540845:2559735|2543295_2543913_+|WP_004243609.1|DBSCAN-SWA MKQYGFYFDSTKCTGCKTCQVSCKDEKDLDLGPKFRRVYEYGGGSWAKQDGIWTQNIYSYYLSISCNHCSNPTCVAGCPTGAMHKREEDGLVVVNQDVCVGCRYCELRCPYGAPQFDEKKKLMSKCDGCYERVAQGMKPVCVESCPQRALDFDDIEVIRAKHGTECGIAPMPDPSLTNPNIVIKAHKDAKPSGDKTGSVQNAAEV >NZ_CP043332|2540845:2559735|2543916_2544693_+|WP_004243611.1|DBSCAN-SWA 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21 | Escherichia_phage(21.43%) | lysis,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_8 |
3062082 : 3130781
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP043332|3062082:3130781|DBSCAN-SWA 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97 | Morganella_phage(26.47%) | integrase,tRNA,lysis,holin,terminase,tail,head | attL 3077897:3077943|attR 3126390:3126436 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
3389742 : 3398610
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP043332|3389742:3398610|DBSCAN-SWA TTTATTCTTGTTCATTGATTAACTCTTGTTTCTGCTCTGGCTCTTTTTCGAGATCGTCAATATTAAAGACTGCGACATTATCCATCAGCACTTGTGCTTTATCGTTTAACATCATGGTAGAAGAGGCGGCGAGATCGACCAAAGAGGCATTTTGTTGTACTACCGTATCCATTTGATTAATTGCTACTGCAATTTGTTCGACACCAAGACGTTGCTCTTCAGACGCTAAACTAATCCCTTGCATGATCTTGTTTACTTTTGAAATAGAAGAGACAATCTCTTGCATGCACTCACCGCTTTTATTAACTAAATTTGTACCATAGGTAACATCATTGATAGATGCTTTAAGAACTTGGCTAATCTCTTTTGCTGCTTCAGCACTTTTTGCGGCTAAGTTCCTTACCTCAGCGGCCACAACGGTGAACCCACGCCCTTGCTCGCCAGCTCTTGCTGCTTCTACGGCAGCATTTAAGGCCAAAATATTAGTTTGATTGGCTAATTTATTAATAACATCATTAATTTCCCCAACTTTCACTGCACCTTGTTCTATTTTCTTCATCGATAATACAGCTTCTTTCATGACATTAGCGCCATCCATAACAATGTCAGTAGATTGATTAATAATATTATTTGCTTCAATTGTGTTATCGGTATTGTTAGCAACGGCTATTTTAATCTGCTCCATACTGGCAGCGGTTTGTTGTAAAGCACTAGATTGTTCTTCTGTACGAGATGAAAGCTCTTGATTACCAGAAGCAATTTTAAATGCGCCCCCTTTTATATCCATAGCCTCTTTTTTGACAGAAAAGATTGTCGAGGTTAATGCTTTTTGCATATCACTGACACGAGAAAAAAGTTTACCAAACTCATCATTTTTTACTTGTGGTACAGAAAAAACCAAGTCAGCATTACCTACTTTATTTAATATCTCAGACAATGTATTAAGATTAGAGACAAAAGTTTTATTGATCCACTGAAGCACAAAGTATAAAACAATTAATAAAATAATTAATGAGATAATTGTTGAGTAGATAGAAAACTCAACCATTGAATCTTGTTTATGAGTAAGATAGATACTATTTTTATTTCTAGTCTGAATATACCTTTCAAATAATTGATCAAGATGTTCAAAATCTTGATCAAACTGATTAGATTTTATATCTATTGTCGATAATTTATTGGGTGCCAAAACTAATCTATCTATAACACTATAAAATAACGTCGAAATATCATTAGCATCTTTTTGTGCTGCGACTGTCATTTTCTTTTCTTTAACCCATGTTTCCATGGTATTTTTAGCCATGATAGCTAGCTTTTTATTTTGCTGAATAATTTTATTACGATCTGCGACACGACTATCTTTGTCTTGTAATAGATAATTGACATTAGAACGCATAATAGCCAGTTGATAACGAGCCATCAAAACATCGTCATAACGTGCAGATAAGACATCAACTTGAGTAAAATTGTTTTGCATTTTATAAATAAAAAATGAAGATAAGGCAGACGATAGAATAAAAATCAATAACAGTAAAGAAGAGCCTAATTTTACGGTTCGTTTAATACTCATGATAAAAATACCTATATGCGCATATCGATAAGATTTATTTTTTATCGACACAATGATATTTTTATTTAATAATTAGGGATAGCACTAGGTCATTGATTTTTATTTTAAATAAATTTTTATATCATAAACAAAATAAGTTATTTTTAATAACTGCTATTATTATTGGTATATTATAAAATAAAACAAACCAATTCTTTTAAAACATAACCCGTTATCAATTAGCACATTCTTCTTTATACTCAATATCGATTTTCATTTTATATGACTAATATCATCAACGATTAAAAATAAAAACCTTATTTTTTCAATAAGATACTGATGATACTATCTCATTTTGAGAACAATGATATAATAGGCGCTTTACCTCATAAACTCTGATGATTTACGGAGCTCAATATTTATGCAACCACAATTTGAAAACGCAAAAAACACCGTAAAAACATTATCAGTGTTTGATTTTGATGGTACGTTAACCTATCACGATAGCTTTATCCCTTTTCTAAAGTTTGCCTTTGGGCGTCGTAAATTTGCTCGTCGTATTATCAAAATGGTATTCCCCACATTACGTTGTTTTAGACGTAAACTGACTCGTGATGAATTAAAAGAAGTGCTGATTAAAACTTTTTTAACCGATATCAAAGAAGAATGGCTCAAAGAAAAAGCCGAAGCCTTTTGTAAAGCCTACTGGAGTAAGTTAATGCGTCCTGCAGGTTTATTAGCCGTTGCTGAAGAGATTAACCGTCATGCTGAAGTGACCATTTGTTCAGCTTCTCCAGCTATGGTGTTGCAACCTTTTGCGGATCGACTCGGTATAAAGTTAATAGGAACAACACTTGAAGTGGTTGATGGTGTGCTGACAGGAAAAATCATTGGCAATAACTGTCGTTGTGGCGAAAAAATCAAACGATTAGAGCGTGTCTATGGCGATCTTACTCAATACCACTTAAGGGCGTGGGGCGATTCACGTGGTGATCATGAATTACTCTATGCTGCACAAGATCCACATTGGCGCTATTTCCACACAGGAAGTAATAAGTCAAAAAAATCACCTATTAAAATAACGCTTAAAAAAGACTCATAAGTGATTATATAAAAATAAAGCGGGAAACATATTTTCCCGCTTTATCCATAAACTAACTATTTATCTAGTCATCTTGGCGCTTTTATTAGCGAAAGATTAAATATTGACGCCATGTTGTGCGGCTAGTGCGCCTAAACCACCCGCAAAACCTTGGCCTACTGCTTTAAATTTCCAATCTGAACCATGACGATAGAGTTCACCAAAGATCATCGCCGTCTCCGTAGAGGCATCTTCAGAAAGATCAAAACGTGCAATTTCAGTGTTATTGTCGTTATTATAAACGCGCATAAAACTGTTGCTCACCATACCAAAGTTTTGTTTGCGGTTTTCAGCATCGTAAATAGTGACAGCAAAAACCAGTTTTTTCACTTCAGCAGGAACTTTGGATAAAGTGATTTTGACTTGTTCATCATCACCTTCGCCTTCTCCAGTACGATTATCGCCTTGGTGTTCAACACTACCACATTGGCTCACTTTATTATTAAAGAAGATAAAACTTGCATCTGAAAGCACTTTTCCATCTTCACCGACCATGAATACTGACGCATCTAAATCAAATTCAGCGCCATCTGTCACGCGGGCATCCCATCCTAAACCAACCATAGCCACCGTCATGGTTGGTGCTTCTTTAGTTAGCGAAACATTACCACCTTTAACAAGGGAAACAGCCATATCAAAGCTCCTACTGTGTTGAATAAACTGGCAATTAGGAATAACTGCCAGTAATTTGTGATTTCATAACATACGATTAAGAGGCGTTAATACCATATTGCGCACATACTGAGCCTAAGCCCCCTGCATATCCTTGGCCTACAGCACGGAATTTCCACTCACCGTTATGACGATATAACTCACCAAATAACATCGCCGTTTCCGTTGATGCATCTTCCGTTAAATCATAACGAGCAACTTCAATTTGGTTGTCATCATTAACTAAACGAATAAACGCACCAGATACCTGACCAAAGCTTTGACGACGCGCTTGCGCTTCATGGATAGTCACAACAAAAATAATTTTTTCGACATCACTGGGGATGGTATCTAGTTTGATTTTTAGTGCTTCATCATCACCATCACCTTCACCTGTTCGGTTATCACCAGTGTGAACAACAGAGCCGTCGGCAGATCTTAAGTTGTTATAAAAAATGAAATCGGCATCGCTACGTACTTTTCCATTAGCGGCTAACAGAAATGCAGATGCATCTAAGTCAAAATCTTGACCATCTGTAGAACGGGCATCCCAACCAAGTCCGACTAGGACGTTTTTCATCGTTGGGGCTGCTTTGCTTAAAGAAACATTACCACCTTTAGAAAGAGAAACGCTCATCTTCAACCTCTTCAATTTATGTTGCGATATTCTAATTTCCCAAGAATATCGGTTATCATTATTTACCTTATTTATTCTTTTTTTCTGGGAATACAAAACTTGCCAGAATACCCAGAGCAAGAACACCAAGCACTACGAATAGGCTGGTTGTCGCGGAAATGCTATATCCATGCTGCCAAATATGATCTGTTGCATTAAGCCCCAGCTTTACAGCAATAAAGAACAGCAATGCAATAACCGCTTTTTCAAGGTGAATCAGATACTGTTTTAATGCCTCTAACACAAAGTAGAGAGTACGTAAGCCCAAAATAGCGAACATCATTGCACTATAAACAATCAGTGGCTCACGGCTAACGGCAATGATTGCAGGCACCGAATCGAAAGCAAACATCACATCAGAAAGCTCTACCACCGCCACACACAACATAAGCGGTGTCGCATATAACGCAGCTTTTGTACCTCGCCCGATAGTTATGTCTTTGTTTTCCGGTTTTGCTAACTCTACATCAACCTCTTTTTGTGTTAATAAGAAGGCATGTCCAGTAATTTTTGGCCATATAGGGAAAAATCGTTTTACTAGGCGATAAGCAAGGTGCTGTGAATAGTCTTCAATTTCTTCACTATCATTCCCACTTCTCAGCATCATTACGGCTGTCCAAGCAACAATCAGAGCAAAGACTATCTCAACGTAAGGCCCTAAACTTAATAAGCCGGTACCAATAGCAACAAAGATCGCACGGAATACAATGGCACCAATGATCCCCCAATACAGAATGCGGTGACGGAAACGATCAGGAACCGCAAACCAAGAGAAAATCGCCATCATGACAAATAGGTTATCGACAGACAGTACTTTCTCTAATGCATAACCCGTCACGAATAAGCTTGCAACTTCTGCACCATGGTGGACGTATAAAAAACCCGCGAATGCCATGGCAACGACTACCCAGAATATTGACCAAAAAACAGCATTCTTTAACGTTATCGGCTTATCTGCACGATGCATAAATAAATCGATAAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP043332|3389742:3398610|3396487_3397072_-|WP_004250201.1|DBSCAN-SWA MVSLRKDQTVSLSKQAPALSHLMFGLGWDPIKKKGFLGGLFGGNNSIDLDASCVLLDVNGKQIDTIWFRKLKSTCQSVIHSGDNLTGEGDGDDETIFVDLNRLPSLVEYLVFTVNSFRGQTFNEVENAFCRVVDKTTNKELAHYKLTEQGAHTGIVIAALQRNQGQWDFTAFGSPCKGLVIDEMMPDILATVVR >NZ_CP043332|3389742:3398610|3393786_3394812_-|WP_004245605.1|DBSCAN-SWA MVSTHIGFPTETVIVFVVLAIGAIFIDLFMHRADKPITLKNAVFWSIFWVVVAMAFAGFLYVHHGAEVASLFVTGYALEKVLSVDNLFVMMAIFSWFAVPDRFRHRILYWGIIGAIVFRAIFVAIGTGLLSLGPYVEIVFALIVAWTAVMMLRSGNDSEEIEDYSQHLAYRLVKRFFPIWPKITGHAFLLTQKEVDVELAKPENKDITIGRGTKAALYATPLMLCVAVVELSDVMFAFDSVPAIIAVSREPLIVYSAMMFAILGLRTLYFVLEALKQYLIHLEKAVIALLFFIAVKLGLNATDHIWQHGYSISATTSLFVVLGVLALGILASFVFPEKKNK >NZ_CP043332|3389742:3398610|3389742_3391311_-|WP_041701270.1|DBSCAN-SWA MSIKRTVKLGSSLLLLIFILSSALSSFFIYKMQNNFTQVDVLSARYDDVLMARYQLAIMRSNVNYLLQDKDSRVADRNKIIQQNKKLAIMAKNTMETWVKEKKMTVAAQKDANDISTLFYSVIDRLVLAPNKLSTIDIKSNQFDQDFEHLDQLFERYIQTRNKNSIYLTHKQDSMVEFSIYSTIISLIILLIVLYFVLQWINKTFVSNLNTLSEILNKVGNADLVFSVPQVKNDEFGKLFSRVSDMQKALTSTIFSVKKEAMDIKGGAFKIASGNQELSSRTEEQSSALQQTAASMEQIKIAVANNTDNTIEANNIINQSTDIVMDGANVMKEAVLSMKKIEQGAVKVGEINDVINKLANQTNILALNAAVEAARAGEQGRGFTVVAAEVRNLAAKSAEAAKEISQVLKASINDVTYGTNLVNKSGECMQEIVSSISKVNKIMQGISLASEEQRLGVEQIAVAINQMDTVVQQNASLVDLAASSTMMLNDKAQVLMDNVAVFNIDDLEKEPEQKQELINEQE >NZ_CP043332|3389742:3398610|3395326_3396487_-|WP_149127712.1|DBSCAN-SWA MTLTPGGNISVPDQTLMVRIHSGSPVDVSAFRLYASGKVNGDADMVFYGQTTNDDRTIIYATAGNSTSFTVDLTRLRPDVDRIAFTATCEGQQTIAHLQHLSIQVDANNNVVANGHVDIDGRTEAALILGELYRRNGSWKFRFIAQGFNGGLKPLAEYFGVDIADPEPAPAPAPAPAPAPSSVKLSKVSLTKEKPAISLTKKDDFGKIRINLDWHRESKNGGSGLLGGLFGGNKGIDLDIGAFVELQDGYKSVIQALGNGFGDFNRMPYVELQGDDRTGDVAGGEWIFINGREWKNIKQVLIFTFIYEGVPNWSKTDGVVTIHVPEQPPIETRLTDGNNGRAMCAIARLINENGSIKVERLNEFFKGHRDMDNAYGWGFRWTAGSK >NZ_CP043332|3389742:3398610|3391711_3392392_+|WP_012368337.1|DBSCAN-SWA MQPQFENAKNTVKTLSVFDFDGTLTYHDSFIPFLKFAFGRRKFARRIIKMVFPTLRCFRRKLTRDELKEVLIKTFLTDIKEEWLKEKAEAFCKAYWSKLMRPAGLLAVAEEINRHAEVTICSASPAMVLQPFADRLGIKLIGTTLEVVDGVLTGKIIGNNCRCGEKIKRLERVYGDLTQYHLRAWGDSRGDHELLYAAQDPHWRYFHTGSNKSKKSPIKITLKKDS >NZ_CP043332|3389742:3398610|3394846_3395302_-|WP_004245607.1|DBSCAN-SWA MSFFNKLKEGFNSGRAELTKQVSRFKNKKFMQGTVAVCARIAIASDGVSSEEKQKMLGFLKASEELKVFDTSEVIEFFNKLISSFEFDTEVGKGETMKYILAMKDQPEAAQLAIRVGIAVAKSDGDFDNDEKEAVRAIAVALGFEPAEFDL >NZ_CP043332|3389742:3398610|3397464_3398610_+|WP_017827550.1|DBSCAN-SWA MNSLIGSSVYRRQLTCGTLSVTPNCSLEHLDELFDIAERRNPKRAFLFVSKVLGRHIPVSPKKMRETYQQMAKQFPQSLEGPILFIGMAETAVGLGAGIFDEVRDRYPQALYLTSTRHPIADGELFCKFKENHSHATDHLLYLPHNLEQRQWIQQAKTIVLIDDEATTGNTFLNLLSALREEGKLTQIKQIIAVTLTDWSGDALQKRSPLPITTFSLVQGKWQWQANPDAPLPVMPNVNITASGQVAITGKQSWGRLGMTTPANDLGLFIHVSEGEKILVLGSGEFVWEPFLLAERLEKQGAIVKYSSTTRSPIATNFAIQSAITFTDNYGLGIPNFVYNVAHQQFDRILLCCETPAESIDSQLIEALYKVAPIVEVISYD >NZ_CP043332|3389742:3398610|3392488_3393064_-|WP_004245603.1|DBSCAN-SWA MAVSLVKGGNVSLTKEAPTMTVAMVGLGWDARVTDGAEFDLDASVFMVGEDGKVLSDASFIFFNNKVSQCGSVEHQGDNRTGEGEGDDEQVKITLSKVPAEVKKLVFAVTIYDAENRKQNFGMVSNSFMRVYNNDNNTEIARFDLSEDASTETAMIFGELYRHGSDWKFKAVGQGFAGGLGALAAQHGVNI >NZ_CP043332|3389742:3398610|3393140_3393719_-|WP_004249446.1|DBSCAN-SWA MSVSLSKGGNVSLSKAAPTMKNVLVGLGWDARSTDGQDFDLDASAFLLAANGKVRSDADFIFYNNLRSADGSVVHTGDNRTGEGDGDDEALKIKLDTIPSDVEKIIFVVTIHEAQARRQSFGQVSGAFIRLVNDDNQIEVARYDLTEDASTETAMLFGELYRHNGEWKFRAVGQGYAGGLGSVCAQYGINAS |
9 | Caulobacter_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
4040264 : 4097356
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP043332|4040264:4097356|DBSCAN-SWA TTCATTTTATTATTTCTACTACACGGCTTTTCCGACGAATGATTTTTCTTGCACACCAAGCATAAAGCAACCCAGAGATAACGCCTGCGATATGTGATTCTGTAGAAACCCCTAATTGCCCGGGGATTAATCCATAAGCCATAGAGCCGTAATAAAACAGCACAAATAAGGCGATGACGATATCGATAATTTTATGGCGAGTAAAAGCATGGGCAATTAGCAGTGACCATAATCCAAAGATCCACCCACTTGCACCGACATGAATAGCGTTACGCCCAAATAACCAAACTAATAACCCACTGATGATAATGATAAAAATACTTGAATAGCAATATTCTCGTAATGACTGTGTCATCAATAAAAAGCTAAGGATAAGAAAAGGTAATAAATTACTAAAAAGGTGAGACCATGATCCATGAATAAAAGGTGAAATAAAGATACCGAATAAACCTTCGCCGCTTCTTGGAATAATACCATATTGAAGAAGATGGACTGGGAAGAGGCTCCCTATAATTTGTAATAAGAAAAGAAGGATAGTTAAACCACCGAGAATATAAATTCTTCTTTTTAGCCAGAGACGATCCATAACGATAAGCCTTTATTGTAGGTGATGACCTTTATTTCTGAATCTACTGTAAAGAGAAGAGCCTTTCTGTTAGATGGCTCTTCTTCTATTATATTCAGTCTAATAAATTTAAGCAGGCAGCCCCTCTTGCTCCACCCGCATCACCATAACGTGCTTTTTCTATTGTTGGAATTTGCGTATTACCGTATACGCAATGTGAGAGATAATCGGGTAATAGGGTATACAGTGCGTCAAATTGCGATAAACCGCCACCAATGACAATTAAATGTGGGTCAAGTACAGTCAGAATATTGCTAAGGTAAATGGCTAATACTTTCATATAGCGGTCAACATGCTGTTGGGTCTGTTCATCACCTTGATAATATTGTGCAACGATATCTACTGCTCTTTGTGGTGAGCCATTAAAGGCTTTATACATACGTTCAAAACCACGACCAGATAAATAAGTCTCAAAGCAGGCTTTTCTACCACAACCGCACAATATTTTTGGCATGGTCTCACCAATCACATTATCAGCATCTACATTAAGATTCATGTGACCTATTTCACCGGCAATACCATTTTTGCCAGAGAGTACTTTGCCATCAATGACAAAACCACCGCCAACACCCGTACCTAATATTAAACCCAGTACTGAAGGATAATGACGAAATTCAGGATCCCATGCTTCTGATAAGGCAAAACAGTTCGCATCATTCTCAACTTTGACGGGGCGTTCAAGAATATTAGCCAGATCGTGGATCATCGGTTTATATTTGGCAGCAGGCACGTTGGTGGTAAATACAGTTCCTTCTTTTGCGTTGACGATGCCAGGAACACCGATACCTATTTTTCCTTTACAGCCTAAATCATTATCAGCTTCTAAAGTGAGTGTTTTAAAAACATTTAATAGAGCTTGATAATCATTCTTTGGCGTTGGTACACGTTTTTGCCATACTTGAGTCAGATCTTTATCAAAAACGGCGAGCTCGATTTTTGTGCCGCCCATATCAAAACCATAATACATATCAGTCTCTTAGTTATCCTGTAAATGTAATCCGTAGCTTAATTAAATAGAGAAGAAGCTATGGTGCTTAATGGTCATCACTTCAGTTAATGCGTTTTTTCTCTGTCTATTACTTCCACAGATTATAAGATTTATCACTATTTATTAAAGATAGCATAGAAACAATCGTAGATAAGCGCATTTTGTGATCTTGTCAGGAGGTGAAACGTTTTTTCTAACCCCATTTTTAATAGAAAAAACTATCATAAAATGACTGGTTTTTAGATTTTAATAAAGAAAATATGGATTAATATGATAGGAATACTCTTAAAAAGAGTGGCTATAAAAATGTTATCGTTAACATTGCATCTAAAATAGATAGTTGTTATTTGATGTGTTTTTATTAGTATAAAAACGTAGTTAAGTGCTATTTAATGATATAAAAAAATAAAAATATACGTATGAATACGTGTATATAGTAATAGTATCTACAAGGTATACATTATTTATTATAAATCAGTTGGTTAAAAATTTATTGTTATTATAGTGTTAAAGTTAATTAATGTATTCGTATCTAGTATATTTATTCTTTTTATTAAGTATTATTAACAATATTATTTAATACGTAAAATATAATCTTAGTTAATTATCCTGATTTTATGGTTAATGATAGTTGTTTTTCCTATTAATAAACAATAAAGAATATTGTTATTAAATCATCGCTTTTAAGTTATTTTTTTTAGATTATCTTAATGGGTCTGAATAAATAAAGTTATTTTCTTTTTATAGCATGACAATGTGTTAGCTACTCTATGAAAAAAATACACTTTTCGCTTATAAAAATGTGTCTTTTTTTGATGATGATCAACACAAAAAACAACATCGCATTTTGCTTTGTGAGCCATATTTTACATTTAAAAAAGATCAGTAGCTGAAAATTTTCATATTACTTTTCTCAATGTTTTTTCTTCTTAGAATAAATTATATTACAAGGTAATAATTACAGGATTTTATTTTTATAAAATTTATACAATTTGTTATTAGTTTTATCACGTTATTATATGGGGAATTAACCTGCTTTTTTACGTTAAAAAGTGACTTTCTTTTTGTGTTTTTCATTAACATTGTATTAAGTAAAAATACACAGTTAGATAAAATAAAATACAAGCTGAGCAAAAAATAGCTATTTTGGAGACGTTGTATTTCCTATTAAAATAATTATACAATTCAAATTAAATAATCATTACTTACAATTAGACAGTGTCTTTTTTATTAGATGAAATATTTTACAAGTAAAATTACTCTGCATGATTTAGATTTGTATAAATAAATGAAAGTTGTCCTGCAACTCTTAGGTGTTAGCTTTTAAATAAGCTTATTTTAATTGTTTTCGTATCCTTATCTTGGTGAGGTTTTTAATTGTTTGACAAGGTGTTAGGTGCGATTATTTAAGGGTTCATATTATGTATGATGATATAAATAATTTAAAAAATAAGTTCCAGGAAGAGGGATTTACTTTTCAAGATTTCTCTTCTCAAACGACAGGTAATATAGCCTGTAATATTAGTAATAGTGTTATAAATCAACAGGATAATAAAGAATCCCTATCAGAGGATAATGAAGAGTTCTTGAATATATCTAAAGTTAAAAATAGGCAAAAACAAACAGCTAATATAGCGACCTCTCTTTCTTATTCACAAGATTTAGCCTCGGAAGTAAAAGAAAAAAATAGAGTTAATAAGCGAAGTAAGTGTTTGCTAGATAATCAGTTATTTGAAAAAAAAACCACAGATAAGTGCCAAGTAAATGAAAAGCTCTCATTGCAAAAGATATTTTCATTTATTGCATCAGCTAATTAAACAAGCTCTTATATATAAATAATATTGACTTATGTCAATTTATAGCTATTGGTATTTTCTTTTTTTAAAAGAATTTATTGGTCTATTGTACCAAGAATAAATTTTTTCTTAAAAAAGAAAATAATAGCAATGGCAAGGTACGGGGTTATGAATAAATTATTTAAATTATTAATAACAGCTTTTTTATTAATAACAATGTTTTCGCTTATTGTTATGCCAATGAGTGCTAAACAACAATATATATTTGGTATAATTAATATTCTGCTATTATTTATTATTGGCTCTAAAAAGTCAAAAAAACGATTATTAACAATGATTTTTTTATCATTGTTAATGTCTACACGTTATCTGTATTGGCGAGCAACCCACACACTTAATTTTAATACCTCTATTGAAGGGATATTGGGTACAGGATTATTTTTAGCTGAGATCTACTCTTGGATTATTTTAGTTTTAGGTTATTTCCAAACAGCTTGGCCATTAAATAGAAAAATAGCGCCATTACCAAAAGATATCTCGTTATGGCCAACAGTGGATATTTATGTACCCACATATAACGAAAGTTTAGATGTGGTGCGTGATACGGTTTTAGCTGCACAAGGTATTGATTATCCAAAAGATAAAATGAAAGTTTATCTTTTGGATGATGGTAGCCGTGAAGAGTTTAAGCAATTCGCCAATGATGTTGGTGTGACTTATATTGAGCGTGAAGAGCACGATCACGCTAAGGCAGGTAATCTAAATCACGCAATGGCATTAACTGATGGTGAGCTTATTTGCGTCTTTGATTGTGACCATATCTCTACCCGTATATTTTTACAGGCAACGGTGGGTTATTTCCTTGAAGATCCAAAATTAGCTTTGGTGCAAACACCACACTATTTTTATTCACCCGATCCTTTTGAACGTAATTTAAGTGCCGCCAAAAACGGCCCTCACGAAGGTGCACTTTTTTATGGCCCTGTTCAACGAGGTAATGATAATTGGAATGCAACCTTCTTCTGTGGTTCATGTGCGGTAATGCGTCGTAGTGCCCTAGAAGAAATAGGTGGTATTGCGGTTGAGACAGTCACAGAAGATGCCCATACGGCATTAAAATTACAACGTTTAGGTTGGAATTCGGCATTTATTGATATTCCTTTAGCTGCAGGTCTAGCAACAGAGCGTTTAGCATTACATGTTAATCAACGTATTCGTTGGGCTAGAGGAATGACACAAATCTTTCGTGTTGATAACCCTATGTTAGGCCGTGGCTTAACGTTTCCTCAGCGGTTATGTTATCTCAATGCGATGATGCATTTTCAGTATGGATTGCCTCGGATTATCTTTTTAACCGCACCTTTACTGTTTATGTTATTCAACCTCAATATTATCGCCTCTTCTGCCAGTATGATTTTTGCCTTTGCATTACCACATTTAATTATGTCGGTGTATGTAAACTCACGAAATATTGGTAAATATCGCTATTCTTTCTGGGGAGAAATCTATGAAACAGTGATGGCATTTAGTTTAGTACTGCCTACATTGCTCAGTTTAGTCTCGCCTAAATTAGGTAAATTTAATGTCACTG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49 | Escherichia_phage(44.44%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_11 |
4109012 : 4117186
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP043332|4109012:4117186|DBSCAN-SWA ATTAACAATCTCTCTCAAAAGTCTTGATGATTTTGTGGTCTTTGATCTCGTAGATAATGTCAGCAATATTATCGACCAATTGCTTGTCATGAGATACGAAGATAATAGTTCCTGCATAGGACTTCATCATTGTTTCTAATGCGGCAATACTTTTTAGGTCAAGATAGTTTCCTGGTTCATCCATAAGCAAAATATTATATTTTCCTAAAAGCATTTTGGATAAAAGCAGTTTGATGATTTCACCTCCCGATAAGTCGGATAAGTTTTTTTGAATATCATTCGCTCCGATCCCCATTGAAGCCAATACTGCACGAATTTCCGCAACTGTGTACTCGCACTCTTCCTGCATAAAGGAGAGCACAGATTTATGCGTGTTAAATTTATATCCTGTTTGTGTAAAGTAGCCAATTTCAGCTTTTGGAGATATGGTTAATCCATCAGCACGTTCTGATATCATTTTTAACAAGGACGTTTTCCCTGTTCCATTCGATCCAGTTATAGCGACTTTAGCGCCAAGCGGTATTATAAAGTTAGCGTCATCAAAGATAGTACGGCTACCAAATTTTAAGCTCAGACCATCTGCCGTAATCGGGAACTTATTGTGCAGTTCTAGGGCTGAACTTTGACGAAAACGAATAGAACGCAAATGCTCTGGTGCTTGAATATCTTCTAATGCAGCCAAACGCTTTTCCATACTCTTAGCTGCCTGATACAGTTTTCTTTGCTTGGTGCCAGTCATTTTTGCATGCCCAAGTCGTCCAGCACTTTCGGTAGAGTTTTTGGATTTTTCTCCTTTTTTCTTATTGTCTAATCGATTAGCTTGCTGGCGTTTTTCTTGCACAGCAGATTCTAATCGCTCCCGTTCCTTCATCATCAGCTCATATTCTACGGCTTGGTGTTGTCGCTCTTCTTCTTTTTGACGCAAGTAATCCGAGTAACCACCCCAATATTCCGTAATTTTACCGTCTTTTAACTCCCATATCTTGTCTACAACCATATCAAGAAAATATCGGTCATGACTGATAACAAGTAATGCTCCATCAAATGCTTTAAGTTGACCAATAAGTAGATCTATTCCATTGAGATCAAGGTGGCTGGTTGGTTCATCCGCTAGAATGCCATGTACTTGTTGGGAAAATGCGGCAGCAATTTTTGCACGAGTTTCCTCTCCGCCACTCATTGTGTCGTTTTGTACATTGGAAACACCAAGGCGAGATAACATTGCCCGGTCTTCGACCGTTTCTATTTCGATTCCGCCCAGTTGGCTGATATGTGCAAAATCACCAAAACGCTGTAATGTCGCTTCGGCTAAAACAATTTCGCCATTAAGTACTTTGAGTAAACTACTCTTTCCTGCTCCGTTATCACCCACAAGACCAATACGGTCATAAGAGTGAATTTCCAATTCATCAATATCCAAAACATCACGCCCAGCATAATCCAAGCGTATGTTTCTCGCTTTAATAATTAAACTCATTTTTATTTACTCCTGTTTAGCTCTTGAAATTTTTTATGCAGCAAACAGGATTTAGGTGAAAACAAAAGCTAGCATCACAGTGTCCTCCCAAAAAAAAAGCTATTCATCCACAGGGTGGACAAATAGCTAGTCAATTAAGTTATAACTGGAAACTATGCACTAAAAGCATACTTATAAATTAAGCATACTTTTACTTTATATATCCGCATATATTCTTAAAGACACAACAAAAGCCCACCATTATAAAATAGTGTCACTATGCAAATAGTTGTGTCTTAACGAATGCGGATAGAATGCATAAACTTACCTAAAAAATAAAATTCAGTTTTATGATAACTTTACTGTTAAAAGAAGTCTAGACAACCTTGTTTTATGCTTGGATATAAGGCTTATTTTAGGCACTGTTGCAAAGTTAGCGATGAGGCAGCCTTTTGTCTTATTCAAAGGCCTTACATTTCAAAAACTCTGCTTACCAGGCGCATTTCGCCCAGGGGATCACCATAATAAAATGCTGAGGCCTGGCCTTTGCGTAGTGCACGCATCACCTCAATACCTTTGATGGTGGCGTAAGCCGTCTTCATGGATTTAAATCCCAGCGTGGCGCCGATTATCCGTTTCAGTTTGCCATGATCGCATTCAATCACGTTGTTCCGGTACTTAATCTGTCGGTGTTCAACGTCAGACGGGCACCGGCCTTCGCGTTTGAGCAGAGCAAGCGCGCGACCATAGGCGGGCGCTTTATCCGTGTTGATGAATCGCGGGATCTGCCACTTCTTCACGTTGTTGAGGATTTTACCCAGAAACCGGTATGCAGCTTTGCTGTTACGACGGGAGGAGAGATAAAAATCGACAGTGCGGCCCCGGCTGTCGACGGCCCGGTACAGATACGCCCAGCGGCCATTGACCTTCACGTAGGTTTCATCCATGTGCCACGGGCAAAGATCGGAAGGGTTACGCCAGTACCAGCGCAGCCGTTTTTCCATTTCAGGCGCATAACGCTGAACCCAGCGGTAAATCGTGGAGTGATCGACATTCACTCCGCGTTCAGCCAGCATCTCCTGCAGCTCACGGTAACTGATGCCGTATTTGCAGTACCAGCGTACGGCCCACAGAATGATGTCACGCTGAAAATGCCGGCCTTTGAATGGGTTCATGTGCAGCTCCATCAGCAAAAGGGGATGATAAGTTTATCACCACCGACTATTTGCAACAGTGCCCGAAAAACCACGTTAAGAAAGCAACCTTCTGAAAAGGCGACGTTTATCAGTTTTTTTTCCGGCCATAAAGGGGGCGGAAATTATTCCCTGCACGGGTATTCGCAAGGATTTCGGTAGTGCTCTGGCTCTGCCCCCCATAACCTGGCGGACAGAGCATGATTGGGAAAGCGGTACCCTCACGGCAGAAACGATTGACGCAGGCTATATTTCTATTATTCTGGAAATATAGATAAAGGAGGTATTATGGATTTAAACACTGCTGCAAACGCACTTCGAGAACTGGGCCACCCGACACGTCTCAGCATATACCGGGAGCTGGTCAGGGCGGGTCATGAAGGCCTGCCGGTTGGCGAACTGCAGAAGCACCTTGAGATTCCTGCCTCCACGCTCAGCCATCATCTTTCAGCGCTGATATCCGCTGGACGGCACTGTTGCAAATAGTCGGTGGTGATAAACTTATCATCCCCTTTTGCTGATGGAGCTGCACATGAACCCATTCAAAGGCCGGCATTTTCAGCGTGACATCATTCTGTGGGCCGTACGCTGGTACTGCAAATACGGCATCAGTTACCGTGAGCTGCAGGAGATGCTGGCTGAACGCGGAGTGAATGTCGATCACTCCACGATTTACCGCTGGGTTCAGCGTTATGCGCCTGAAATGGAAAAACGGCTGCGCTGGTACTGGCGTAACCCTTCCGATCTTTGCCCGTGGCACATGGATGAAACCTACGTGAAGGTCAATGGCCGCTGGGCGTATCTGTACCGGGCCGTCGACAGCCGGGGCCGCACTGTCGATTTTTATCTCTCCTCCCGTCGTAACAGCAAAGCTGCATACCGGTTTCTGGGTAAAATCCTCAACAACGTGAAGAAGTGGCAGATCCCGCGATTCATCAACACGGATAAAGCGCCCGCCTATGGTCGCGCGCTTGCTCTGCTCAAACGCGAAGGCCGGTGCCCGTCTGACGTTGAACACCGACAGATTAAGTACCGGAACAACGTGATTGAATGCGATCATGGCAAACTGAAACGGATAATCGGCGCCACGCTGGGATTTAAATCCATGAAGACGGCTTACGCCACCATCAAAGGTATTGAGGTGATGCGTGCACTACGCAAAGGCCAGGCCTCAGCATTTTATTATGGTGATCCCCTGGGCGAAATGCGCCTGGTAAGCAGAGTTTTTGAAATGTAAGGCCTTTGAATAAGACAAAAGGCTGCCTCATCGCTAACTTTGCAACAGTGCCAATTTATGAGTAAAGGATTATGTCCACGATAAGCACCTGGGTCGATTCCTGGGAGGCGGCCATGAGGGTAGGGAAGCGCCGTCCCGTCAAGTCAGCGTAATGCTCTGCCAGTGTTACAACCAATTAACCAATTCTGATTAGAAAAACTCATCGAGCATCAAATGAAACTGCAATTTATTCATATCAGGATTATCAATACCATATTTTTGAAAAAGCCGTTTCTGTAATGAAGGAGAAAACTCACCGAGGCAGTTCCATAGGATGGCAAGATCCTGGTATCGGTCTGCGATTCCGACTCGTCCAACATCAATACAACCTATTAATTTCCCCTCGTCAAAAATAAGGTTATCAAGTGAGAAATCACCATGAGTGACGACTGAATCCGGTGAGAATGGCAAAAGCTTATGCATTTCTTTCCAGACTTGTTCAACAGGCCAGCCATTACGCTCGTCATCAAAATCACTCGCATCAACCAAACCGTTATTCATTCGTGATTGCGCCTGAGCGAGACGAAATACGCGATCGCTGTTAAAAGGACAATTACAAACAGGAATCGAATGCAACCGGCGCAGGAACACTGCCAGCGCATCAACAATATTTTCACCTGAATCAGGATATTCTTCTAATACCTGGAATGCTGTTTTCCCGGGGATCGCAGTGGTGAGTAACCATGCATCATCAGGAGTACGGATAAAATGCTTGATGGTCGGAAGAGGCATAAATTCCGTCAGCCAGTTTAGTCTGACCATCTCATCTGTAACATCATTGGCAACGCTACCTTTGCCATGTTTCAGAAACAACTCTGGCGCATCGGGCTTCCCATACAATCGATAGATTGTCGCACCTGATTGCCCGACATTATCGCGAGCCCATTTATACCCATATAAATCAGCATCCATGTTGGAATTTAATCGCGGCCTCGAGCAAGACGTTTCCCGTTGAATATGGCTCATAACACCCCTTGTATTACTGTTTATGTAAGCAGACAGTTTTATTGTTCATGATGATATATTTTTATCTTGTGCAATGTAACATCAGAGGGCACTGTTGCAAATAGTCGGTGGTGATAAACTTATCATCCCCTTTTGCTGATGGAGCTGCACATGAACCCATTCAAAGGCCGGCATTTTCAGCGTGACATCATTCTGTGGGCCGTACGCTGGTACTGCAAATACGGCATCAGTTACCGTGAGCTGCAGGAGATGCTGGCTGAACGCGGAGTGAATGTCGATCACTCCACGATTTACCGCTGGGTTCAGCGTTATGCGCCTGAAATGGAAAAACGGCTGCGCTGGTACTGGCGTAACCCTTCCGATCTTTGCCCGTGGCACATGGATGAAACCTACGTGAAGGTCAATGGCCGCTGGGCGTATCTGTACCGGGCCGTCGACAGCCGGGGCCGCACTGTCGATTTTTATCTCTCCTCCCGTCGTAACAGCAAAGCTGCATACCGGTTTCTGGGTAAAATCCTCAACAACGTGAAGAAGTGGCAGATCCCGCGATTCATCAACACGGATAAAGCGCCCGCCTATGGTCGCGCGCTTGCTCTGCTCAAACGCGAAGGCCGGTGCCCGTCTGACGTTGAACACCGACAGATTAAGTACCGGAACAACGTGATTGAATGCGATCATGGCAAACTGAAACGGATAATCGGCGCCACGCTGGGATTTAAATCCATGAAGACGGCTTACGCCACCATCAAAGGTATTGAGGTGATGCGTGCACTACGCAAAGGCCAGGCCTCAGCATTTTATTATGGTGATCCCCTGGGCGAAATGCGCCTGGTAAGCAGAGTTTTTGAAATGTAAGGCCTTTGAATAAGACAAAAGGCTGCCTCATCGCTAACTTTGCAACAGTGCCTTTAAGCGTGCATAATAAGCCCTACACAAATTGGGAGTTAGACATCATGAGCAACGCAAAAACAAAGTTAGGCATCACAAAGTACAGCATCGTGACCAACAGCAACGATTCCGTCACACTGCGCCTCATGACTGAGCATGACCTTGCGATGCTCTATGAGTGGCTAAATCGATCTCATATCGTCGAGTGGTGGGGCGGAGAAGAAGCACGCCCGACACTTGCTGACGTACAGGAACAGTACTTGCCAAGCGTTTTAGCGCAAGAGTCCGTCACTCCATACATTGCAATGCTGAATGGAGAGCCGATTGGGTATGCCCAGTCGTACGTTGCTCTTGGAAGCGGGGACGGACGGTGGGAAGAAGAAACCGATCCAGGAGTACGCGGAATAGACCAGTTACTGGCGAATGCATCACAACTGGGCAAAGGCTTGGGAACCAAGCTGGTTCGAGCTCTGGTTGAGTTGCTGTTCAATGATCCCGAGGTCACCAAGATCCAAACGGACCCGTCGCCGAGCAACTTGCGAGCGATCCGATGCTACGAGAAAGCGGGGTTTGAGAGGCAAGGTACCGTAACCACCCCATATGGTCCAGCCGTGTACATGGTTCAAACACGCCAGGCATTCGAGCGAACACGCAGTGATGCCTAACCCTTCCATCGAGGGGGACGTCCAAGGGCTGGCGCCCTTGGCCGCCCCTCATGTCAAACGTTGGGCGAACCCGGAGCCTCATTAATTGTTAGCCGTTAAAATTAAGCCCTTTACCAAACCAATACTTATTATGAAAAACACAATACATATCAACTTCGCTATTTTTTTAATAATTGCAAATATTATCTACAGCAGCGCCAGTGCATCAACAGATATCTCTACTGTTGCATCTCCATTATTTGAAGGAACTGAAGGTTGTTTTTTACTTTACGATGCATCCACAAACGCTGAAATTGCTCAATTCAATAAAGCAAAGTGTGCAACGCAAATGGCACCAGATTCAACTTTCAAGATCGCATTATCACTTATGGCATTTGATGCGGAAATAATAGATCAGAAAACCATATTCAAATGGGATAAAACCCCCAAAGGAATGGAGATCTGGAACAGCAATCATACACCAAAGACGTGGATGCAATTTTCTGTTGTTTGGGTTTCGCAAGAAATAACCCAAAAAATTGGATTAAATAAAATCAAGAATTATCTCAAAGATTTTGATTATGGAAATCAAGACTTCTCTGGAGATAAAGAAAGAAACAACGGATTAACAGAAGCATGGCTCGAAAGTAGCTTAAAAATTTCACCAGAAGAACAAATTCAATTCCTGCGTAAAATTATTAATCACAATCTCCCAGTTAAAAACTCAGCCATAGAAAACACCATAGAGAACATGTATCTACAAGATCTGGATAATAGTACAAAACTGTATGGGAAAACTGGTGCAGGATTCACAGCAAATAGAACCTTACAAAACGGATGGTTTGAAGGGTTTATTATAAGCAAATCAGGACATAAATATGTTTTTGTGTCCGCACTTACAGGAAACTTGGGGTCGAATTTAACATCAAGCATAAAAGCCAAGAAAAATGCGATCACCATTCTAAACACACTAAATTTATAAAAAATCTAATGGCAAAATCGCCCAACCCTTCAATCAAGTCGGGACGGCCAAAAGCAAGCTTTTGGCTCCCCTCGCTGGCGCTCGGCGCCCCTTATTTCAAACGTTAGACGGCAAAGTCACAGACCGCGGGATCTCTTATGACCAACTACTTTGATAGCCCCTTCAAAGGCAAGCTGCTTTCTGAGCAAGTGAAGAACCCCAATATCAAAGTTGGGCGGTACAGCTATTACTCTGGCTACTATCATGGGCACTCATTCGATGACTGCGCACGGTATCTGTTTCCGGACCGTGATGACGTTGATAAGTTGATCATCGGTAGTTTCTGCTCTATCGGGAGTGGGGCTTCCTTTATCATGGCTGGCAATCAGGGGCATCGGTACGACTGGGCATCATCTTTCCCGTTCTTTTATATGCAGGAAGAACCTGCATTCTCAAGCGCACTCGATGCCTTCCAAAAAGCAGGTAATACTGTCATTGGCAATGACGTTTGGATCGGCTCTGAGGCAATGGTCATGCCCGGAATCAAGATCGGGCACGGTGCGGTGATAGGCAGCCGCTCGTTGGTGACAAAAGATGTGGAGCCTTACGCTATCGTTGGCGGCAATCCCGCTAAGAAGATTAAGAAACGCTTCACCGATGAGGAAATTTCATTGCTTCTGGAGATGGAGTGGTGGAATTGGTCACTGGAGAAGATCAAAGCGGCAATGCCCATGCTGTGCTCGTCTAATATTGTTGGCCTGCACAAGTATTGGCTCGAGTTTGCCGTCTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP043332|4109012:4117186|4114900_4115455_+|WP_063840321.1|DBSCAN-SWA MTNSNDSVTLRLMTEHDLAMLYEWLNRSHIVEWWGGEEARPTLADVQEQYLPSVLAQESVTPYIAMLNGEPIGYAQSYVALGSGDGRWEEETDPGVRGIDQLLANASQLGKGLGTKLVRALVELLFNDPEVTKIQTDPSPSNLRAIRCYEKAGFERQGTVTTPYGPAVYMVQTRQAFERTRSDA >NZ_CP043332|4109012:4117186|4116553_4117186_+|WP_000186237.1|DBSCAN-SWA MTNYFDSPFKGKLLSEQVKNPNIKVGRYSYYSGYYHGHSFDDCARYLFPDRDDVDKLIIGSFCSIGSGASFIMAGNQGHRYDWASSFPFFYMQEEPAFSSALDAFQKAGNTVIGNDVWIGSEAMVMPGIKIGHGAVIGSRSLVTKDVEPYAIVGGNPAKKIKKRFTDEEISLLLEMEWWNWSLEKIKAAMPMLCSSNIVGLHKYWLEFAV >NZ_CP043332|4109012:4117186|4112192_4112897_+|WP_001067855.1|transposase|DBSCAN-SWA MNPFKGRHFQRDIILWAVRWYCKYGISYRELQEMLAERGVNVDHSTIYRWVQRYAPEMEKRLRWYWRNPSDLCPWHMDETYVKVNGRWAYLYRAVDSRGRTVDFYLSSRRNSKAAYRFLGKILNNVKKWQIPRFINTDKAPAYGRALALLKREGRCPSDVEHRQIKYRNNVIECDHGKLKRIIGATLGFKSMKTAYATIKGIEVMRALRKGQASAFYYGDPLGEMRLVSRVFEM >NZ_CP043332|4109012:4117186|4113086_4113902_-|WP_000018329.1|DBSCAN-SWA MSHIQRETSCSRPRLNSNMDADLYGYKWARDNVGQSGATIYRLYGKPDAPELFLKHGKGSVANDVTDEMVRLNWLTEFMPLPTIKHFIRTPDDAWLLTTAIPGKTAFQVLEEYPDSGENIVDALAVFLRRLHSIPVCNCPFNSDRVFRLAQAQSRMNNGLVDASDFDDERNGWPVEQVWKEMHKLLPFSPDSVVTHGDFSLDNLIFDEGKLIGCIDVGRVGIADRYQDLAILWNCLGEFSPSLQKRLFQKYGIDNPDMNKLQFHLMLDEFF >NZ_CP043332|4109012:4117186|4114052_4114757_+|WP_001067855.1|transposase|DBSCAN-SWA MNPFKGRHFQRDIILWAVRWYCKYGISYRELQEMLAERGVNVDHSTIYRWVQRYAPEMEKRLRWYWRNPSDLCPWHMDETYVKVNGRWAYLYRAVDSRGRTVDFYLSSRRNSKAAYRFLGKILNNVKKWQIPRFINTDKAPAYGRALALLKREGRCPSDVEHRQIKYRNNVIECDHGKLKRIIGATLGFKSMKTAYATIKGIEVMRALRKGQASAFYYGDPLGEMRLVSRVFEM >NZ_CP043332|4109012:4117186|4115585_4116416_+|WP_001334766.1|DBSCAN-SWA MKNTIHINFAIFLIIANIIYSSASASTDISTVASPLFEGTEGCFLLYDASTNAEIAQFNKAKCATQMAPDSTFKIALSLMAFDAEIIDQKTIFKWDKTPKGMEIWNSNHTPKTWMQFSVVWVSQEITQKIGLNKIKNYLKDFDYGNQDFSGDKERNNGLTEAWLESSLKISPEEQIQFLRKIINHNLPVKNSAIENTIENMYLQDLDNSTKLYGKTGAGFTANRTLQNGWFEGFIISKSGHKYVFVSALTGNLGSNLTSSIKAKKNAITILNTLNL >NZ_CP043332|4109012:4117186|4110937_4111642_-|WP_001067855.1|transposase|DBSCAN-SWA MNPFKGRHFQRDIILWAVRWYCKYGISYRELQEMLAERGVNVDHSTIYRWVQRYAPEMEKRLRWYWRNPSDLCPWHMDETYVKVNGRWAYLYRAVDSRGRTVDFYLSSRRNSKAAYRFLGKILNNVKKWQIPRFINTDKAPAYGRALALLKREGRCPSDVEHRQIKYRNNVIECDHGKLKRIIGATLGFKSMKTAYATIKGIEVMRALRKGQASAFYYGDPLGEMRLVSRVFEM >NZ_CP043332|4109012:4117186|4109012_4110488_-|WP_000052512.1|DBSCAN-SWA MSLIIKARNIRLDYAGRDVLDIDELEIHSYDRIGLVGDNGAGKSSLLKVLNGEIVLAEATLQRFGDFAHISQLGGIEIETVEDRAMLSRLGVSNVQNDTMSGGEETRAKIAAAFSQQVHGILADEPTSHLDLNGIDLLIGQLKAFDGALLVISHDRYFLDMVVDKIWELKDGKITEYWGGYSDYLRQKEEERQHQAVEYELMMKERERLESAVQEKRQQANRLDNKKKGEKSKNSTESAGRLGHAKMTGTKQRKLYQAAKSMEKRLAALEDIQAPEHLRSIRFRQSSALELHNKFPITADGLSLKFGSRTIFDDANFIIPLGAKVAITGSNGTGKTSLLKMISERADGLTISPKAEIGYFTQTGYKFNTHKSVLSFMQEECEYTVAEIRAVLASMGIGANDIQKNLSDLSGGEIIKLLLSKMLLGKYNILLMDEPGNYLDLKSIAALETMMKSYAGTIIFVSHDKQLVDNIADIIYEIKDHKIIKTFERDC |
8 | Escherichia_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP043332.1|WP_004247755.1|3102377_3102560_-|hypothetical-protein |
3102377_3102560_-
Protein sequences of NZ_CP043332.1|WP_004247755.1|3102377_3102560_-|hypothetical-protein>NZ_CP043332.1|WP_004247755.1|3102377_3102560_-|hypothetical-protein MNKYHVIATKKDGTTYEGMMTTKEPRVTNGLIGIASLDGSWVYISPDEISDIKYVPVVEQ |
60 aa aa | NA | NA | NA | 3062082-3130781 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 4.7|2635636|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP043332 position: 3093944-3093913, mismatch: 0 acatcttaaattaaacacatctcaacaggtcg CRISPR spacer acatcttaaattaaacacatctcaacaggtcg Protospacer ******************************** |
||||||||||||||
| NZ_CP043332.1|WP_049257606.1|3102756_3103020_-|hypothetical-protein |
3102756_3103020_-
Protein sequences of NZ_CP043332.1|WP_049257606.1|3102756_3103020_-|hypothetical-protein>NZ_CP043332.1|WP_049257606.1|3102756_3103020_-|hypothetical-protein MKNNDNLENDTDIAIGLIPVSDNGRITAFTSDGKPIRGLVCCNVDSDHGDLVRMTLTVEVTNRDGKLAICNFKKDEIEEIRANFLMK |
87 aa aa | NA | NA | NA | 3062082-3130781 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 4.7|2635636|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP043332 position: 3093944-3093913, mismatch: 0 acatcttaaattaaacacatctcaacaggtcg CRISPR spacer acatcttaaattaaacacatctcaacaggtcg Protospacer ******************************** |
||||||||||||||
| NZ_CP043332.1|WP_149127659.1|3103053_3103293_-|hypothetical-protein |
3103053_3103293_-
Protein sequences of NZ_CP043332.1|WP_149127659.1|3103053_3103293_-|hypothetical-protein>NZ_CP043332.1|WP_149127659.1|3103053_3103293_-|hypothetical-protein MDRKSEEFWLAEITTEEFERIGGIPGIKLKYSEEISSILEKVKKEYGPLDSYNVGEPVCAPVGSPKKIGVKVWYFNNEQ |
79 aa aa | NA | NA | NA | 3062082-3130781 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 4.7|2635636|32|NZ_CP043332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP043332 position: 3093944-3093913, mismatch: 0 acatcttaaattaaacacatctcaacaggtcg CRISPR spacer acatcttaaattaaacacatctcaacaggtcg Protospacer ******************************** |