Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP043329 | Pedobacter sp. CJ43 chromosome, complete genome | 7 crisprs | WYL,DEDDh,RT,cas3,csa3,DinG,PD-DExK | 0 | 1 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP043329_1 | 94446-94681 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP043329_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP043329_1
>1.1|94496|43|NZ_CP043329|PILER-CR CCCTGTTTCCAGTTTTGTATCTATTAGACTATTTCTCTGCGGT >1.2|94589|43|NZ_CP043329|PILER-CR CCCTGTTTCCAGTTTTGTATCTATTAGACTATTTCTCTGCGGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043329_1
The CRISPR arrays of NZ_CP043329_1 >merge|NZ_CP043329|1|94446-94681|PILER-CR CTGTGGTCATCGGTCATCGGACTTCTACCATCTGTTTCCAGTTCGCTGTTCCCTGTTTCCAGTTTTGTATCTATTAGACTATTTCTCTGCGGTCTGCGGTCCTCGGTCATCGGACTTCTACCATCTGTTTCCAGTTCGCTGTTCCCTGTTTCCAGTTTTGTATCTATTAGACTATTTCTCTGCGGTCTGCGGTCCTCGGTCATCGGACTTCTACCATCTGTTTCCAGTTCGCTGTT >NZ_CP043329|1|1|94446-94681|PILER-CR CTGTGGTCATCGGTCATCGGACTTCTACCATCTGTTTCCAGTTCGCTGTT CCCTGTTTCCAGTTTTGTATCTATTAGACTATTTCTCTGCGGT CTGCGGTCCTCGGTCATCGGACTTCTACCATCTGTTTCCAGTTCGCTGTT CCCTGTTTCCAGTTTTGTATCTATTAGACTATTTCTCTGCGGT CTGCGGTCCTCGGTCATCGGACTTCTACCATCTGTTTCCAGTTCGCTGTT
>NZ_CP043329.1|WP_149073522.1|91990_92848_-|glycosyltransferase MNTKPVPISIIILTFNEEKNIKACVESALDFAEEIFVVDSGSTDATLEILKNYPVQIVQHPFENYSQQRNWAIQHLPIRTHWILNMDADHRLTEEFRLEVSAIFSKPIADDIHGFLASRKTIFMNKWIKYGGHYPTYHAVLFRKGKGLCEEKLYDQHFKVAGKTQKLKGDIIDLITESLSTFTLRHDKWSNLEAFEQFHPQQQGSVIKGSLQNDNPIARRRYMKNLYERFPLFVRPFVYFFIRYFLRLGFLDGKEGLIFHFLQCFWFRFLIDAKIYELKKQKDGL >NZ_CP043329.1|WP_168199340.1|91431_92001_-|exosortase/archaeosortase-family-protein MGYNQKLSKFVFALLLIYFALDYFFEFWIGICAPGGLYWPFAHQHLNFIAWYRDFLISGSQVIAALWGIKSISNATAMLLIGYGGVKIVYSCLGYGIISLLIAFGIAVPDKKFKNRLIFILSSVLLFSLFNMLRLFVVAFYAKTVAGMRVDHHDIFNWICYIIIFTGMYFWMNKKNAPNKKSHVGESTT >NZ_CP043329.1|WP_149073520.1|90896_91454_-|colanic-acid-biosynthesis-acetyltransferase-WcaF MSEKVQLKKKFDTGKFDHGASVLKQVLWYFCSALFFRSGLIPFSIILVWMLRLFGAKIGRDVRVKPYVHIKFPWKLSLGDHSWLAECFIENLDHVHIGANCCVSQGAMLMTGNHDYKSKNFDLLTKPIILEDGVWIGARAIVCPGVTCKSHAVLSMAAVAHHDLEAYSIYQGAPAVKVKERVVGG >NZ_CP043329.1|WP_149073519.1|89556_90645_+|chorismate-synthase MAGNSFGKVFRITTFGESHGAAIGVIIDGCPPNIALDLDFIQYELDKRKPGQSKITTQRKESDTCQILSGVFEGKTTGTPIAIVIPNEDQKSKDYDHNKDTFRPSHADYTYQHKYGIRDHRGGGRSSARETAARVAAGAIAKLALKKVGIEVVAHVSSVGTIDAPHIDFTSVEDFEALRESNIVRCADPSTAKEMINLIDQIRKEGDTIGGKVSCIVKNCPVGLGEPVFDKLHADLGKAMLSINAVHGFDYGSGFDGSTMRGSEHNDIFEKNHLGDVITRTNFSGGIQGGISNGMDINFRVAFKPVATIMTNQQTVNKDGDAAEIKGKGRHDPCVVPRAVAIVEAMAALVIIDHYLRNNLYQ >NZ_CP043329.1|WP_149073518.1|86833_88078_+|3-phosphoshikimate-1-carboxyvinyltransferase MSGNILISNAPKQIQETIRLTGSKSESNRALIIQALSGGKVKVENLSAAADTVTLNHILNSLAQEPAEVNVGPAGTAMRFLASYLTVKGVQTVLTGTERMKQRPIGILVDALNKIGGQITYVEKEGFPPLQIAPAFKQTQNKVSIKGDISSQYITSLLLVAAALEEGLTLDIEGELTSKPYVEMTLGFLVQCGIQHTWEDNQITIAHQEFESSTLVVEPDWSAASYWYAFAALADEATITLPYLRQNSLQGDSVIAAIMAHFGIATAYSEEGIIIKKVPHQLSEKFFDLKDCPDLAQTVIVCSAALGHEATFTGLETLKIKETDRVAALQNELAKIGVKLIEENLNYTLDCSGLHFPDKISIATYEDHRMAMAFAPLASFVKEVEVEEANVVEKSYPSYWEDVKKIGFRLDDLK >NZ_CP043329.1|WP_149073517.1|85730_86834_+|3-deoxy-7-phosphoheptulonate-synthase MKLNLNIQPLSSWMKVSSEPLIISGPCSAETEEQLLATAHLVKNTGKVSVLRAGIWKPRTRPGEFEGIGSIGLQWLKRAKEETGLPTAVEVATAKHVEEALAAGVDILWIGARSTVNPFTVQEIADALQGADVPVMVKNPINPDLALWIGALERINRAGITKLAAIHRGFSSFEKSAYRNEPMWDLAIHLKTLAPELPILNDPSHICGTRDLIPYISQQALDLDMQGLMIESHIDPSVAWTDAKQQVTPAALTEIVNNLTIRKADSSNPEFTDKLQGLRDSIDRIDDQILQKLGERMALVEKIGEYKRDNDVTILQVNRWEEILEKRTALASALKLEKDFTEKVLELIHGESIRKQTEIMNAKTELN >NZ_CP043329.1|WP_149073516.1|84840_85671_+|prephenate-dehydratase MSAKKRVAIQGIKASFHEEAAFKFFGEDIDTIECNSFKETFQKLKAGEADYVVMAIENSIAGSLLPNYTLLREYNFPVIGEVYLHIQLHLMALPGVKFEDIKTVTSHPIAIRQCNDFLDDFPHLKVVESSDTAACAKKIKEEQLTDTVAIANNLAAKLYGLEILERRIESNKKNYTRFLILTDKQVDIKDSNKASLCFQVNNNVGSLAAVLNIFAENKINMSKIQSMPVLGKRNEYNFYVDVEWKDTKQYDRAIRDSLKHTSNFSILGEYKKNDKV >NZ_CP043329.1|WP_149073515.1|83404_84472_+|3-dehydroquinate-synthase MNPIQSSTYQVYFDNSLQVLQDLLQQGNYSKVFIITDENTGQFCLPVLQEKLPALDNFDIIEIPYGEENKNIDYCIGIWRMLLDFEADRNALVINLGGGVVTDMGSFAASTYKRGIDFIQIPTTLLSQVDASVGGKTGIDIENVKNIIGTFALPQAVIICADFLQTLPERQIISGFAEVIKHGIIADAAYYQDIISLPHAKDISTAQIHASVAIKNKVVLEDPFEKGLRKILNFGHTIGHAVESWSLEHDSSPLLHGEAIAVGMICESYLAHMTGILEEEDFKTIVQDVLKFFPKYKLKEGIENDLLAIMQHDKKNSVGNINFSLPNKIGNCLYNQVVSKDLIIESLAYYRSLNS >NZ_CP043329.1|WP_039453661.1|83201_83408_+|RNA-binding-S4-domain-containing-protein MIEFKLEGEFIPLIQLLKATDLVSSGGEAQAVVIDGLVQYNGVTDYRKRLKVRKGDTVKFNNKTIKIV >NZ_CP043329.1|WP_039453658.1|82529_83171_+|HAD-family-phosphatase MKAVKTIIFDYGNVIFNIDFKRTQQAFIDLGIQNIEEFFAHKGHDPLFDEFEKGNISAAEWREGIRRKAKQPQLTDQQIDDAWNTLLLGVPDGNHDLLLKIKAQYPTFLLSNNNEIHYDWIMKYLKADFGLADNSSFFIKDYYSHLLRMRKPNADIFEYVLDTHGLKPEETLFIDDSPQHLKTAQELGLQTYLMTAPDNLQLYFSKNGLLRDL >NZ_CP043329.1|WP_149073524.1|94854_95118_-|hypothetical-protein MEWYIKKGVVLNLNHFLERAIMSGDWNKKTINKEEFISLIRERIAIVSMERVKADIKRFISNPNVLNIWSTPYFNDLIAHLQVSAEP >NZ_CP043329.1|WP_168199342.1|95388_95562_-|hypothetical-protein MTRSPGTEYGGPQSISAIDVKLETGNRELKTDGRSPMTEYGGPQPISARDVKLETGN >NZ_CP043329.1|WP_149073525.1|95676_97083_-|hypothetical-protein MGKFKSISPIGHIILVAGLIYSLLSVNPLHTFLAVVLPFILVKLSWKNDEAPILFTALMTQYMAISVKVFYANYSNLAFDDISLHRYPDYINEAYYWGMGGLVTLALGIHFAIRGFKHTNNTSILAASHQFNGDKLGKLYLLLAIAYPILFKLSFSIGGLQQPLSKLIEFKWALFFIFMIYAFYKNEKKMFLWIASAELLFSFTGFFSGFKDYFLILFIGMVVLYGQNFKLQNIIPLGVILIVGFYTLMIWQYVKPAYREFLNAGQKTQTSVRSTEESLFKLYNLVTEIDSTGIKEGFEATVNRLSYIEFLSGAIEHVPYQLEHTNGELWLGAVERVLKPRILFPEKAAIDDSEKARLYTGQDYSGVESGTSISLGYFAESYVDFGKTGMLLILLVFGFVIGSIYRYILKQSPDLLIGTALTIPLFFVIFNYERALDKIFGALFMYLIIYLAFNRLVIKKTIEYLKND >NZ_CP043329.1|WP_149073526.1|97113_98076_-|glycosyltransferase MKKISVILPVYNGEKFLIDAMESVLKQNLIDFDFLICDDCSTDKSWDLINKYANHPNIKIFKNKINLGLFKTLNFLLSKTSTDLIHLWSQDDVMKPHCLQECIIFHEKHPDLLMSYSGRDYIDENGKLIELYQKDETPEVISSELYAYISAYWGCIAGNIANVTLTKKGIAKAGNFNENYEVSGDFEMWTRLSKNGDIGFLNQPLIFLRRHLGQLSRSYKSTYLSMKEDIPILLNINEMVADEHRKKVQICLTWKTQVIYFNEMLFLVFKKEINLATKCLFLLANHSNIFLLFFRWLLIRFLRTLKKDMWFYKNILHILK >NZ_CP043329.1|WP_149073527.1|98041_99250_-|glycosyltransferase MIDKKLAIVTTHPIQYYAPLFQLLAKETNLMVFYTWGEGSLKKFDPGFGKVIEWDIPLLEDYPYQFLKNESKYPGSHHFKGIINPNLIEHIEEFNPDAIMLIGYAYQSHLQVLRHFKGKTPLWFRGDSTLLDKDTGWKKYIKSIYLKWVYSHVDLAFYVGTANKAYFKKYGLKERQLVFAPHAIDSGRFLVPRKNEAKALRARLGLSKLDILILFAGKFEPKKNPLLLLDAFIALNLPNAHLLFVGNGVLEESLKWRVETLKLKVKNEERKDNRVHFMNFQNQSQMPVVYQASDIFCLPSQGPGETWGLAINEAMISRNAIIASNKVGCAIDLVKNGENGYVFESSDLEGLKVCLSKITLSPSIHQMKDKSQDIIKEWSISNQLKAFINQLNEKNQCDSSSL >NZ_CP043329.1|WP_149073528.1|99665_100280_-|acyltransferase-family-protein MNNPTVLKPIGRITSVDMLRGIAALMVCIFHFTNGNKNYLASGHWFRNFGSYGWAGVEIFFIISGFIIPYSLNQSKYTYQNWKDFLIKRISRIEPPYFITILLILALNYVSTLSPYFKGKDLPIDYFNLALHIGYLNSFFDHPWLNPVFWTLAIEFQFYLLMALIFPLLIHSSTYVRATIVFAYLLSMFFFSSKFIFYYSAYFL >NZ_CP043329.1|WP_149073529.1|100276_101584_-|glycosyltransferase-family-4-protein MKKILIISPYFPPCNAADMQRIRMSLPYFKEFGWEANVVCVHPDFCEVNKDHLLLEAIPTDIKIYTVKPISKKWTKKIGLGSIAIRSLNAIRKKVDVLLNKEHFDLIYFSTTQFPVCILGNYWKKRFGIPYIIDMQDPWHSDYYINKPKAEQPPKYWFSYRLNKWLEPLAMKHVDGLISVSEAYIKTLQIRYHNILNIPYKVITFGAFDQDFSIAEKHQFDYSSMIPHKNEDVVNVVYVGRGGLDMKDALVKLFSAFRLGLRQEASLFKNIHFYFLGTSYAPDGQGKQTIFPLAQEMGIAAYVTEQTNRIPFYQTLNTLKSADLLFIAGSNDPQYTASKTYPYMFSKNPLLAIFHQDSSAAKIIRECNAGEVITFDMPEDTAIHQIYINLKNTLLKQGKPFIGNESELNNYSARNKTAEQCDFFELVLSSLNTSR >NZ_CP043329.1|WP_149073530.1|101588_102809_-|glycosyltransferase-family-4-protein MHQNIKRICLITPGHIASNPRLVKEATALDKAGYKVHIIFTQYMNYLINDDFDILKSNPNISFDYLDWTGSCIKSKVIKLLFGLIHKASLILNLNWLSNLILNRNYFWQLKSAKAYKADLYIAHNVGALSVAANAAEKTLSKYAFDAEDFHREENLSSKVLKSLIHVEDLYLPKAIYITASSPLIAQEYQRIYLRQVIPIMNVFPKIEHVVKKRIENQDKSIKLFWFSQKIGVDRGLIEVIEALGIIKNDLFELHLLGLYNKFTKETILSHVTKASLNHNKIYFYKPIPPDLIFDFAQQFDIGMATEIADVYNREICLTNKIFTYIQSGLAVIASNTVAQLNLFNDYPIDGILYQKRNSNSIAIALSTFLDENKLENSKQNNYILGQTTLNWDIEKQKFLFIINNL >NZ_CP043329.1|WP_149073531.1|102792_104034_-|glycosyltransferase MKCSVANPNIAPYIKQTVIAYQESNNLEKFYTTFFEHREYFLTKFLINYLPNLKKNIKRRNLNEIDFNLVKGKPFKELIRVFSARFLDTITTDKIWEWGELSFDQWVANQLDKSLSSIHTYEHAALKTLERAKELGILSFYEQPSQHHALFEKIVKEQLVLYPELKTKNIDLLTNDKAIKRNKRRDNELKVCDYIICNSTFTKKSLLAADIELKKIITIPYGFPKIETLISEKHPTEKISFMNAGSQNLRKGIHILFQAWKECNFGDKAELIMIGKNHLPTSFLKDLPENIKFIPNIPHEELMSFYAKSDVFVLPTLADGFGMVITEAMSRGMPVITTTHSGGPDIIEHKKNGIIIPPNDKEALIASLRWCVENKNKLKELGRNALIKADSYPWKNFRREVIKQIEEKIASKY >NZ_CP043329.1|WP_149073532.1|104023_105043_-|glycosyltransferase MRIAISADPFIPVPPINYGGIERIVELLINEYTNLGHTVVLFAHKESKVKCKLMPYPCEGLDKISTLRNTLFISRNIIFGQYDILHSFSRLAYLTFLLPLSIPKIMSYQREPTLSQVKLAQKLAQKNTLLFTGCSNYISKKIAPIAKTSTIYNGVLLDKYTFKPKIGVDAPLIFLGRIEPIKGTHIAIKVAIACRKKLVIAGNIPDNYQNYYRNEIKPFLNEDITYIGPVNDVEKNELLGNALAFLMPIEWNEPFGIVMAEAMACGTPVVAFKRGSVPEVVIDGENGFACDNLEDMICTIKKVANLDRRKVRNSVEKRFSSEVISRQYLSIYKKFNNEM |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP043329_2 | 262842-262927 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP043329_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP043329_2
>2.1|262866|38|NZ_CP043329|CRISPRCasFinder AACCATCTGAGCTACCCCGCCAAGGGTTATACATTTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043329_2
The CRISPR arrays of NZ_CP043329_2 >merge|NZ_CP043329|2|262842-262927|CRISPRCasFinder TCAGGGTTATGAATCCTGCGCTCTAACCATCTGAGCTACCCCGCCAAGGGTTATACATTTTTATCAGGTTATGAATCCTGCGCTCT >NZ_CP043329|2|1|262842-262927|CRISPRCasFinder TCAGGGTTATGAATCCTGCGCTCT AACCATCTGAGCTACCCCGCCAAGGGTTATACATTTTT ATCAGGTTATGAATCCTGCGCTCT
>NZ_CP043329.1|WP_149073630.1|261515_262427_+|IS982-family-transposase MLTSDKIIEIFVKVDDFCKEFEAEIVKHQLDAGHYKVRNRKASLADSEIMTILITFHSGYYTNLKHFYLGFICQHYKDHFPGLVSYNRFVELQQRVAVPMMLFLKTHCLGRSAGINFIDSTHIKVCHNRRIHNHKVFAAVAERGQCSIGWFYGFKLHLIINDKGEILSFYLTKGNVDDRNIKLMTSMTQDIFGKLFGDKGYISKALADLLWGNGIQMITKPRKNMKEFNISQADKIMLRKRAIIECVNDELKNICKLQHTRHRSINNFLMNTMGVLCAYHFFPKKPSLNIIFEDHDKQLLLAA >NZ_CP043329.1|WP_149073629.1|259565_261101_-|IS1182-family-transposase MPNKAPVFKPYNQHQIMMLPPSLEELIPESHTVRVVNEVINRINVEPLLSAYQTKGTSSYHPLMLLKVLVYGYVSNIYSSRKLEAACKENIHFMWLSAMNRPDHHTINRFRGERLKDALRKVFEQVVTLLAQEGLLSIEEVYTDGTKIEANANKYTFVWKKAIQTNKEKMKAQINQIWQYAQNISDTEDDLPEPPDLTTINKEKVEEAIAQLNEALADKKNIDKKVKAKLNYINKNFLKNMDKYEQQEAILGERNSYSKTDEDATFMRMKEDHMKNGQLKPGYNTQISTSNQYIVNYTIHPNPTDTTTLALHLAQHQQSFGTAPQSLTADAGYGSEENYALLEELNVAAFVKYGKFDKEQSQRYQDKQLFASDKLYYDEVNDQYICPMGQAMTYVGDSRKQTTTGFKQTYRRYQAKNCSHCPLNGVCHKSKENRIIEINASLNRLKEQAYQLLNSEQGVMHRKKRCYDVEPVFGNIKHNHGFKRFMLRGKKKVEIEWGLIAIAHNLRKKAA >NZ_CP043329.1|WP_149073628.1|257263_259408_+|1,4-beta-xylanase MKQYYKIAILGFLATVALGSCAKYETLDYKVDKPLSIANQEEIDSYKSLKSYIDSVKYPNFKFGAAINLSEYVSKGVMYRLINSNFNDITAGYEMKHSSIVRNDGTLNLTNLENLYKVASAAKVSVFGHTLAWHSGQNATYLNRLIAPRIIPGASVPTWDLVTGANFETDAATNYSLNANAVPSFTAAGAGAGGTGRALQVTNASVRTNDYDAQFFIRFSPAVQVGEKYELKMDVRSDVNASYSTQAHVTPGAYKHWDFFGTISSTPTWTNYTRQITVTADMATSGAIAFNLGKTATSFYFDNITLKKYNEKGSGNAGYAYFATNPAAINFWEAQFVHDIPTLQNGQEYTLKFAAKGSIAGNIRAELQSTSNYSSNAFGTIALTAGWKEYTMKVTTTAATRNRLVFSHGDYAGTVTIDNVKLMLGDGPANLIPTSDFETGTGAWGGWGPNTSRGRTADGGGFGGALDQIIEKTSAEKKLIITNAMKDFISKYVEFSKDYVKAWDVVNEPMDDGRPYELKTGIGRSSIAADEFFWQDYMGKDYAVEAFKLARLYGNPTDIHFINDYNLEYSMDKCKGLIEYVKYIESKGAKVDGIGTQMHISTTSDKAKIEEMFRLLAATGKLIKVSELDMGINNKKTTAITEEDLKVQQEMYKFVVEKYFEIIPAAQRYGITIWSPLDSPVNSFWRAGEPIGLWTEGMIRKPSYMGVAEGLKNK >NZ_CP043329.1|WP_149073627.1|256261_257233_+|DUF1735-domain-containing-protein MKKILNISIFLLAVLTSCKNGEWAFPDYKVQSVYFAYQTPIRTITLGEDIFDTTLDNEFKCQIMATTGGVYNNDDNINIDITVDNSLAQGLSFGSPIGGLIRAMPANYYSLSASNIVIPRGSLIGGVTVQLTDAFFADPLSARTTYVIPVRMTGVQKADSILSSKNYTLYAIKYINPWTGVYLRRGKDVMVGKNGNTALTQTIVRRQQFVEKDQINSINTRGLKQAEFPVTYRGVGGANVTLNLLLTFDDNGNFTVSPGATGFTATGSGKFVKRGEKKSWGDKDRDALYLNYSIDATDFSVSTTDTLVLRDRGVAFQTFTTVN >NZ_CP043329.1|WP_149073626.1|254459_256220_+|RagB/SusD-family-nutrient-uptake-outer-membrane-protein MNRIILFIGFLLTFSSCEKFTEPEPQNNGSFENIYTEPILAQGFLMNGYTRLPSNFWNFTDVATDDAVSNDVGNGFRRIATGQWASNFNPLDQWQNTRAGIQYLNLFLAEVDKVTFDTKDPILNRMFADRMKGEAYGVRAYFMFSLLQAHAGWVDGQLYGFPILTTPETPSSNFNIPRSTFEECMKQIYADLDKAEELLPLDYEDISSPSAIPTKYAGTNTETYNRVFGKLFKLLMTGRIAKAIRAKAALVAASPAFAAGNTTTWADAATYTAEVLNRNGGLSGIAPNGVTWYDNRAEIDALGSGANPREILWRNNISSNSDLELAHYPPSLNGQGRLNPTQNLVDAFPAINGYPISSPLSGFNAASQYANRDPRLARFILFNGGTAGPSSSVINTAADGTTLDALNRDATSTRTGYYMKKLLRQDVSRNPLSINNQKHYKPHIRYTEMYLAYAEAANEAYGPLGMSPNATYSAYDVIKAIRQRAGVGLSNNDAYLESIKGDKELMRALIRNERRLELCFEGFRFWDLRRWNAPLTETAKGVSITNNIHTIIDVEIRNYQDFMRFGPIPFDETLKFSTLKQNAGWQ >NZ_CP043329.1|WP_149075818.1|251382_254436_+|SusC/RagA-family-TonB-linked-outer-membrane-protein MRYSRIALFVCVLLTLITGIAIAQDSANITIKAVIKDNNGLPIIGANIIDKVNKIRTASDKTGSFIIETKPESILTINAFGYGIKTVTASKGVNEIILIPESKLTPIAFNTVAPEDVPPGVSNVDFAKMFENNYGTFGFENLEAFAEGFNGNGIWGMSQSLVLIDGVPRDITDIMPTEIDQVTFLKSAAAVALYGSRGANGVILVTTKTGSENGQSISIRSNAGLHVPKSYPGYLGSSEYRALYNEARVNDGLTRLYTDEDIYNHSGIDPIRYPSVDFYSSEYLKSSYARYDVTAEISGGNEKARYYTNMGFNSTGSLLDFGEAAKNNTADRFNIRGNVNMKLNNILKARINASAVFYTSKGVNTDYWGGAASIRPDRFTPLIPISRIDPTDETSLNLVNSSQNIIDGKFILGGRTLDQTNPIAAVYAGGTNNFNARQFQFTTGIGADLKGITKGLTFDSNLGIDYSSSYNQGYRNGYSTFEPTWTSFSGTSTIASLNRLGLDTKTGNEVIADSYYRQTLSLSGQLNYNRTFSEKHNVTGILMGGGFTQSVSQVYQKVTNANTGLSLGYNYNRKYFIELTGSRVNSPRLFGKNQNELSTAGSLGWEISEESFLKDVSFLDNLRITASAGILYTDLNINDYFLYEAIYTQSDGTWHSWNDGVLVRTTDSRRGENLDLKMARREEITLGLQGSIFNNTLSFSGNFFRSTMTGIPIQANVLFPNYFTTGFPNSSFIPFVNYNNDLRTGFDLSLRFNKRIGQVNWSAGSFTTFQSSKATKRAEIVANNNLLRQGRPLDGIWGLRSNGFYNTSEEAAAANAGNGAPKPAFGDVKPGDIKYIDLNNDGLINNQDEVYLGRGGFSGAPLTTGLNLSANWKNFTVFVLATARFGANGMKGFGNAAQSNYFWVNGEEKYSVEVRNRWTPETASTATFPRLTTLNGDNNNRASDFWMYSTDRFDLSKVQITYRLTNNVMKSKVFNGLDFYLTGFNLLTVSQERELLELNLGGTPQTRLYNLGVKASF >NZ_CP043329.1|WP_149073625.1|249458_251345_+|RagB/SusD-family-nutrient-uptake-outer-membrane-protein MKIFKKTATILALGVIMLVVVSCKEYLDREPESIVSEEIAFKDFTNFQGYTEELYNCIPDFTNRYWTNSWNWGEDEIQTTANTFHFVVKVDNGDFWGWQREFDGWGAGFMDNNGANTNDDRFTKGLYPLAWYGIRKVNVGLANIDLLKNATDEERNLIKGQLLFFRGWFHFMLIQYFGGLPYIDTVIPADQVFNAPRLKYQEAADKVAKDLREAADLLPINWDNTTVGRRTLGKNELRINKIMALGYLGKNYLWAASPLMNFESKGVKAYDVEYSKKAAAAFAELLNLTESGQAPHKLIPFERYYTNFYTFGQQWLIPGGTEAIFRGPYWGAHSSTYGTAKQYTPSIIEGDNIVFSPTANYVAYYGMANGLPIPNTSQADPVSGYDPQYPWRNRDPRFYNDIVFDGQKIVQGTMPANLESNRYTNLFTGGSFRDERSGSRTGYLLYKFTPRTSNRFDQGYAYGQNLNIKLPYMRLADIYLMYAEAITAGYNSANAKDPSFSKSAVDAINVIRDRAGVGHVAAQFIGDPVEFMKEVRRERAVELSFEGHRFNDLRRWLLLIEQPYTLKTAAEFDRAAPLNTALDPKLNRVVNYRERVILQRQFTQKHYWLPLKRADVNIYPQFSQNPGW >NZ_CP043329.1|WP_149073624.1|241547_245660_+|response-regulator MKIKLLKCFFIASWILLFVTKSNGQQLDLNFLNISSKDGLSSNLVNTILKDKYGFMWFGTDDGLNKFDGEHFTVYRHKADDNESISSNEILYLYEDEKANLWICTGSGLVLYDRNTDTFKNITSTKDFTVTSVCSYNNNIWVAHYSGLIIFNKEKNTLTQLSLKNKGDINLLAKGVLHIFKDSKNRIWIGTNTGLYSYNSKKQELEKFFHNSNPESIASDYINQIAEDLFGNIWFATDGGLSMWVRNTKKFINYKNNPKNINSLSNNIVYTLASASDGKLWVGTEDGLNIVNPITKKVERVAKNSRNKYGLVGKSVKEIFLDNQGIFWIATFRGGINKYDKNLAFFNLRQSNYFDVYGLSAPVVTSFAKHTKNSIFIGTDGGGLNLYQADNGSFKHITVADNPSEDKNLSILAMENDGDNLWIGTYLNGIYILNTKTGKLKQIKEGNNSQSLSNNNIFCLKRDSKGNIWIGTNGQGVDCYNLQKNEFVNYSSKKVGKYKLPVNGFIRALAEDKEGNIWIGTNGSGIAVYNPITGKSKLISKTNTKLPNDNIYSIYVAVDGKVWIASAGGGLTHYDIETGNMTSFSEEQGLANGVVYKIIEDSYGKIWLSTNKGISSFDTFTKKFKNYSYNNGVQRSPFVIGAGLKLDDGRIFFGGTDGFNYFNPKLISSNKNQQKVILTDLKINNLSVRPGEDSPIQNHISVANEINLDFKQNFLLSFVALNYSSPQENRYSYKLEKFDKEWNYIGQSQTAIYTNLDPGTYIFKVKASSDAGDWTTPITEIKIVVNPPFWRTIYAFILYLFIVVSVLFYIRHRGIQKLKSKFALEQERIQIQSLIEQERLESERIHEFDEMKIKFLTNISHEFRTPISLIIGPIAQLIQQETNSPKYQQLNMVMRNARRLLNLVNQLLDFRNISSNENKLNTTEGDFISFCKEVAESFKDLAEQKGINFDFQSEISSYYTTFDHNKIERIFFNLLSNAFKFTLEGGEIIFKIENAKRKEGLKITIIDTGIGIDENAKEKIFERFFQNESNPAILNQGSGIGLSIAKEFVKMHGGAIEVESIKGEGSTFIIYFPFEKIKNIESAKYKLDTNQDIKLTNEETELEIIVEKALKNEVKPSVLIVDDNEDFRHYLKENLKEQYTIIEAENGKDGWQKVLSSHPQLVVSDINMPQVTGIEFCRKIKLDKRTKHIPVILLTAITGEESQMLGLETGANDYLNKPFNFEILQFKIRNLLTMKEHLKNTYSKQMNVTVKEIEVESENEKLMNKVLHFIESNLTNPKLSVEELSSYIGMSRGSLYTKILEMTGETPVEFIRSIKLKKAANLLEKSDLNVAQICYAVGFSTPNYFARAFKTKYNMLPSEFINLKRNKGNS >NZ_CP043329.1|WP_149073623.1|239618_241334_+|family-43-glycosylhydrolase MKQKKWMIALSLALLSTAAFSQSKSENAPIFTQATYQGDDQIYKDNPLKPGEFYNPILQGCYPDPAITRKGDDYYLVVSSFAMFPGVPIFHSKDLVNWKQIGHVLDRVSQLDVHDTGISMGVYAPGITYNKNNDTFYMITTAFAGGLGNFVVKTKDPMKGWSDPIKLRFDGIDPSIFFDDDGKGYVVHNDAPAKGQELYNGHRVIKVWDYDVEKDQVVPGSDKMIVNGGVDLSKKPIWIEAPHLYKKDGRYFLMCAEGGTGGWHSEVVFVSNSPKGPFIPAGSNPILSQRYLPRDRKNKVDWAGHADLVLGPDNKYYGVFLGIRPNEKDRVNIGRETFILPVDWSGDFPVFENGLVPMEPKLKTPQSVENKTASKEFFPNGNFTYNENFTGSSLDFRWIGLRGPREDFITLTKKGLLIKPFETNVNELKPTSTLFYRQQHNTFSFSTTVDFKPQSEKNLAGIVCLQNEKFNYVFGITTNGKDRYLVLQRTEKGKSIILSSEKISAKGVVNLKVSAKGDQYQFSYSVDNINWINSGTVVSGDILSTNMAGGFTGCLIGLYATASNDAFPKLN >NZ_CP043329.1|WP_149073622.1|238256_239354_+|endo-1,4-beta-xylanase MLKFHKSLLFITVLACFIAGIAFKSINRKDVNKGLKSYYTSYFPVGVAVGARNLSGQSAEFIVKNFNSITPENAMKMGPIHPEENRYFWAEADSIVSFAQHHNLKVRGHNLCWHEQTPNWMFKNADGSEVSKEVLLRRLKDHINTVVKRYKGKIYVWDVVNEAIDDDSTKYLRNSQWYKICGEDFIIKAFEYAHEADPEAKLFYNDYNTERPEKTERVYRLVKSLVDKKVPIHGVGLQGHWSIFEPSEQELRNTINKFSSLGLEVQITELDMSVYRWEKERRPKRPDESDEYTAELQQKQAEQYQKVFQIFRDNKDKVTSVTFWNISDRYTWLDNYPVPGRKNYPLLFDTNFQPKQAYWSVVNFK >NZ_CP043329.1|WP_039449710.1|263078_263462_+|hypothetical-protein MADKVKFTLEYEIKCSPKILYSFISEPNGLSQWFADDVFIKDHVYTFVWDDGEEQKAKMLSSKESKSVKFAWIDDEPYTFFELEIMKDELTNDVALVITDFALQENLKDRQLIWNIQIENLLSVIGA >NZ_CP043329.1|WP_039449707.1|263481_264924_+|YjgP/YjgQ-family-permease MKKVHLLIIKAFIRPFIVTFFIVMFVLLMLFLFKYIDDLIGKGFEWYVILQLLMYAAATNVAMALPLAVLLSSIMTFGNLGENYELVAIKSAGISLQKAMAPLVAMVVGLSIAAFLFSDFMLPVANLKMGSLLYDVRNQKAAFLIEEGIFNNSIPGYSIRVKQKLLTDSGDVLKDIVIYDQSKNNGNTNVLMADEGEMYKTKDEKYLILKLKDGVRYEESNGKGYDPRERLTRFNFKETEQRFDLSSFNFKREDESLFKNNFQMMNLKELDSAEKDTRVRYDSIRMVGAKSLESYYKLYYSTAKYKTAVGKSGLNFKKDGVLAGLDSTQYASAVTSALDNVRYAKDGLETHIFQSEEFMKTIRRYLVEYNRKFTLSVSCLVLFFIGAPLGAIIRKGGLGLPVVVSVIFFLIYHVISTVGEKSVKEGSLSPVMGMWIAIFVLTPLGLFLTYKATVDSALFDADFYKNFFKRFFKKKEKSTL >NZ_CP043329.1|WP_039449703.1|265058_266264_+|bifunctional-3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate-synthase/GTP-cyclohydrolase-II MLNTIEEAIEDIKAGKIIIVVDDEDRENEGDFLTAARNATPEVINFMAKHGRGLICAPITTDRCRELNLELMVGKNTATFETNFTVSIDLIGHGCTTGISASDRSKTIMALIDPKIKAEDLGRPGHIFPLISKNGGVIRRAGHTEAAVDLAELAGFEPAGVICEIMNEEGEMARLPELLEMAKKLDMKIVSIQDLITYRLRTESLIKKEVSVKLPTEWGDFEMVAFTQVNTGENHLALVKGSWEEDEPILVRVHSSCMTGDIFGSCRCDCGPQLHKAMEMIEQEGKGLIVYMNQEGRGIGLVNKLKSYNLQENGMDTFEANIALGFGMDERDYGVGAQIIRSLGVRKMKLMSNNPTKRAGLIGYGLEVVDNVAIEIESNKHNELYLKAKRDKMGHTIMKER >NZ_CP043329.1|WP_149073631.1|266292_270711_-|translocation/assembly-module-TamB MIGTLIFSLQFKPVQTWAAKKAAVFLADELKTRVEIGSLYLKPFKSLVLEGLLVEDLEGDTLLLAPELEVDIDYFAPFSERRIDLDYAELTNAKFFLKSYKDSTTNLTFIINYFDSGVVDTTKKKRPFNFSLNNILIKNLDFRYINYLSEMVYKEGIDYNNIHLWNFSADINDLDTKNHLFKAQINKLRFKEKTGFVLNNLTGALTIDTNSITVENMLLQTPSTTLTDYYSMRFKSFKDFQDFNNKVTVEAHFKNAKVVAKDIAYFAPQLAKMDLVLDVTGTIKGRINNLKARDLTIKAGQATYIKGDFNLRGLPDWDNTFLDLRFDQVYSNKKDIDYILGKATGNKVKAIPAIIDKFGNINFNGQFTGFQNDFIAYGEFKTKLGRLKSDINMKIDKAGIPSYTGNLQAFDFNIGDLTNQPTLNRTSFTVDVKGRDFELNNLYEEIAASVRYFDFKGYRYSNIKVDGTINKQLFDGKVKVNDKNLKLDFNGLANLNPTLPEFKFKAQIRQANLHKLNLYKDTIQIDADFTTDFTGNSLDNIQGNLELSHVKATTKDSSFVIDSVFLRARGIGKDRLLALTSDIGDASIKGQYDLATLPSAFKTVVKKYIPSLKTKIVPPKDQNFEFNIDLKNFDYVSNIFFPQLKIPERGVFNGKFDSKNNLVNLNGYVKTIKYNNMVFNNLIIDQNTNSKSFEAILSLDKVDFSENGLFVQNIVLQNTLKSDSLTFNVKLSDKDAVNQLDLYGLVEFGSDTLAKVSILPSDIVIDNQIWKVEDKASIKFEENKTIIEGFELSNSTQLVAVNGAISASEDDLLEIVIENLQMSSLSQVTKNFGVELKGMMNGTANLSAILGNPNIGADITVDSLRYNRTEIGFVSLSSAYDNEENNINIKASVEKNNKKTTDITGIVDFNSETNNLDLAMNLDQTELILFEPFVKSLITKLKGNISSDLKITGKFSNPQIDGDVRLNNAGFMVNYLKTAYTINDEVNIENSLIRIEDLEIVDAFKNKAIANGIVDLKNPSNPLLDISVKANNFMSLNTTSKDNGIYYGTAFGTGTFTFKGPTDAMNINIKAKTEEGTVFTIPLNNASTIGNNDFITYIAKDTSLNKTKKENFFNGLTMEFELEVGQTSVTNILTEVGNLSGKGDGQLRLRITSLGDFEMFGDYIINEGKFDFTANNVINKTFDIRKGGTIRWTGDPSDANINLNAVYSTRASLLPLYQAAGTTLPDDQRNLRVLAEAEMMLKGSLLNPDIAFNLAFPNNTDIKTRLQGYLDNEDNEAQQVINLVVRNSFNGNSGGGIGFTNNDLLGSGLELAFSKINNIISQSLNIKNLDINVRSQNEIGGSYSFFNNRLRITGNFVNNRYSNDVLNNNLLNSNLNDLTRDVEMSFNINKDGSFVAKSFQRPTNQDLFNLNTDLYVNGFGLVYTQEYDTFKEFIRNTFARGKREAESKENAEDRRKTLSKPIIATPKEEEEN >NZ_CP043329.1|WP_149073632.1|270793_271813_+|tRNA-(adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase-complex-transferase-subunit-TsaD MAIILGIESSCDETSASVCIDGVIASNIIANQTIHHQYGGVVPELASRVHQQNIIPAVHQAIVEAKINKNQIDAVAFTRGPGLLGSLLVGTSFAKAFALANEIPLVEINHMQAHILAHFIPNQMEDKKLPQFPFICLTVSGGHTQIVLVKDYFEMEILGETTDDAAGEAFDKTAKILELPYPGGPLIDQYAKTGNPHAYQFPEPQIPGLNFSFSGLKTSILYFIRDNVKQNPNFVQENLADICASVQYRIVSILLNKLKKAAQEQQIKDIAIAGGVSANSGLRTALTGLAQQKGWNVFIPKFEYCTDNAAMIAIAGYYKFLKKDFVGQEIAPLARMPFA >NZ_CP043329.1|WP_149073633.1|271809_273813_+|hypothetical-protein MRYFIHQRKLTGLAIVLAGFSLLIFQHLWAYTGHFGFDDLNYAELAHAFFQKQPIWDNTFTFRFGIVIPLGILYWLFGVSDGVSIIFPMLVSLGLLLLVYDNLKGETYKTWIATAILLSNPWITFYSDKIGVDIPITLVILLAITILYKSRFGLYWQKKLVLSGFLLASTVFLGLLTKETIWFLFPLVVFFFFIDLIKLQRIKFWLSALVTLSLFLAVYFYWQYLQFGNWFYRFELIQKYDNTNLCSYDRQPLAIVLNRIGYELFLHFVKEAAFILPVLAVFLCIAKQTFINIRTKENFWLLSAIILILTANFWSISYHSYHPLCVDIRHYLFIMPVSAIAIAHHYKRLFRFWPLIFLLAASMLVIIFDEYWEMKTIAVYQAICLILIFGLMLLYTKHQKYIFLGIALLPLLNVYVQLKSAKAFNYPEQRAVAQQFIKDKKNTTVYAAETQIRLFKYHLGFQLNHFRLVPYDNFEKLEDGYHYWNYHAAYAAGELDFVPPEVNHFSVPEHQLLDTRDMKIWRINKQFLDAELEFYEAKKSPLWTGFVADTVLIKAKDEFGPTFKTMINADVKSINISAKWKLKKNDLKGATVIFTLEEQGKMIFWKPFSIYSDRAVVDNWYVLYKSVRFENFKISKQAELKVYIWNNFKTELEIAEASVSLVRGHKD >NZ_CP043329.1|WP_149073634.1|273815_274391_+|aminoacyl-tRNA-hydrolase MKYLIVGLGNIGPEYADNRHNIGFMVLDELAKQENAKFSMLKLAYYTEVSFKGRMLHLIKPTTYMNLSGKAVSYWMKELKIPIENVLIIVDDLAIPFGAIKLKPKGSPAGHNGLKSIEGLLGSNEYSRIKFGISDHFPKGRQADYVLSGFDQDELSDLPTLIERSIAIIKSFVTVGAELTMTNFNNLKLPK >NZ_CP043329.1|WP_052176804.1|274452_274671_+|hypothetical-protein MSIQFLSDENGRKLAVQVPIEEWEKIKAIHPDVEYLSNDLPQWQKTLIDKRLETIKVNPNSIKSADDLFLDL >NZ_CP043329.1|WP_149073635.1|274730_275726_-|aldo/keto-reductase MQYRKLGDTALELPVITFGAWAAGGWMWGGADDQEAIKAMLAAYDEGVNAIDTAPIYGQGHSEVLVGKAIKELSRDKVQILTKFGMRWDDNKGDFGFKSIDNFGKDIAIYKYAAKESIIKECEDSLKRLGTDYIDLYQIHWPDVTTPIQETMQAVEELIKAGKVRYAGVCNYDVAQMTEAEKYIKLASNQIPYSMVKRDIEQEIVPYCLALDKGILAYSPLERGLLTGKMKPGHVFNEGDHRAGIYFFKDENLVKVDAFLNKIKPLADERNMLVSQIVLRWTLEQPGITIALVGARNAKQAVENAKAARVQLSKEEIKFISNELDKLQLSL >NZ_CP043329.1|WP_149073636.1|275741_277766_-|TonB-dependent-receptor MKLHLFILATLVAGTTQAQELDSIKTLNEVKINAYLGEQILISLPATATIINKAQLEQRTQNTLLPALNSISGVKMEERSPGSYRLSIRGSLIRSPFGVRNVKVYYDDFPLTDAGGNTYLNLIDQNTVKGIEILKGPDGSLFGANSGGVVLINSSSSEKTSEFSAIRGSFGLFGQHFGVQNQVKNYEYSFNQAYQEADGYRINSAMRRLFFQTQQKWKYNQNGTVKFSGFYADMNYNTPGGLTAVQLVENPRAARARAEELNTGIYNKSVFLGLSHDYKITNSLRHYIGISGLVTDFKNPFFTNYEYRDENSYALRTYLELKNKETSSIKLQWNLGYEYQRTKTDFINYGNQAGNPTTIRDADEIKNFNEFIFNRFAVELLPELKIEASLSLNFNRFNFRTLPQSPRQDAGDGKFDPTFIPKLALSYLVTPHFSLRALVSKGYSTPTKDEIRPSNRIINTSLNAEEGWNYEVGFRLRTSDERIYADVSAFYYRLDNAIVRRVNASDEDFYVNAGGTNQLGAEIQLNANIIKADARALSIDYYNAITISKFEFRDYFIGSNNFSGNMLTGIPKLNWVNGLNISLFKKLNLFVQHQYNGKTSLNDAETVFADSFHLIQSKLNYIVPFNNVKLHITFGVDNLLNEKYSLGNDINAFGNRYFNPAATRNYYAGLALKW |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP043329_3 | 1152814-1153073 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP043329_3
|
4 spacers
spacers of NZ_CP043329_3
>3.1|1152834|46|NZ_CP043329|CRT TACTTTTCAACTCAACAGTTACTCTTAACTTATTACGCAAGTAAGC >3.2|1152900|46|NZ_CP043329|CRT AAAAGCACTTTTGAATTTTCACTTTTGACTTTTTAATTTAATAAGC >3.3|1152966|34|NZ_CP043329|CRT GAATTTTTAATTTAATAAGCACTTTTGAATTTTT >3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT GAATTTTTACTTTTGAATTTTTAATTTAATAAGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043329_3
The CRISPR arrays of NZ_CP043329_3 >merge|NZ_CP043329|3|1152814-1153073|CRT CAATTTGAATTTTTATTTTTTACTTTTCAACTCAACAGTTACTCTTAACTTATTACGCAAGTAAGCACTTTTGAATTTTTACTTTTAAAAGCACTTTTGAATTTTCACTTTTGACTTTTTAATTTAATAAGCACTTTTGAATTTTTACTTTTGAATTTTTAATTTAATAAGCACTTTTGAATTTTTACTTTTGAATTTTTACTTTTGAATTTTTACTTTTGAATTTTTAATTTAATAAGCACTTTTGAATTTTCAATTAA >NZ_CP043329|3|1|1152814-1153073|CRT CAATTTGAATTTTTATTTTT TACTTTTCAACTCAACAGTTACTCTTAACTTATTACGCAAGTAAGC ACTTTTGAATTTTTACTTTT AAAAGCACTTTTGAATTTTCACTTTTGACTTTTTAATTTAATAAGC ACTTTTGAATTTTTACTTTT GAATTTTTAATTTAATAAGCACTTTTGAATTTTT ACTTTTGAATTTTTACTTTT GAATTTTTACTTTTGAATTTTTAATTTAATAAGC ACTTTTGAATTTTCAATTAA
>NZ_CP043329.1|WP_149074172.1|1151885_1152608_+|diphthine--ammonia-ligase MNRKPCIFNWSGGKDSALALYYLLQNPDYEVKYLVTTINDSLNRISMHGVRESLLLQQAASLGIPLYQIRLPEMPGMSVYDEIMHHHLTILKEEGITHSVFGDIFLEDLKAYREAKLQEVGMEAVFPLWQKDTKKLIHDFLNLGFKTVIACTQENLGAYVGKVIDIALINSLPENIDPCGENGEFHTFVFEGPIFKNAIPYTLGEKVFKSYPTPKNEDDVCFTKDDKPKNLGFWYVDLVG >NZ_CP043329.1|WP_149074171.1|1151200_1151893_+|NAD-dependent-deacylase MKKKIIVLTGAGISAESGLKTFRDADGLWEGYAIEDVATPEAWQRNPVLVQQFYNERRKGVLAAEPNPAHFALKKLEEKFEVLIITQNIDDLHERAGSSNIMHLHGEIVYARSSQNPALLYKLDKPEIEMGELCELGSQLRPHVVWFGEAVPMITKAMHEMPLADIVILIGSSLAVYPAAGLLELARKEVPVYVIDPKIPEVRISNPLIKIEEKASLAVPLLVEKLLKHE >NZ_CP043329.1|WP_149074170.1|1150688_1151192_+|bifunctional-adenosylcobinamide-kinase/adenosylcobinamide-phosphate-guanylyltransferase MIYYISGGARSGKSSYAQNLALSLTNKPVYLATARNWDKDFEKRIIRHQQDRDERWENIEEEKYPAKIDFTGKVVVIDCVTLWLTNFFVDTKYNVEASLEQIRQAFDDLTQQEATFIIISNELGMGLHADTESGRKFTDLQGWFNQYIAKKADKAIFMVSGLPLTLK >NZ_CP043329.1|WP_149074169.1|1149939_1150518_+|hypothetical-protein MSLNKINVRNWVLVVMILAAAATRFFSLGEQTAWSNFTPVGAIAMFGGTYFTNKYKAYLVPLITLFISDIFVTYSYTGEFTLFYNGFIWVYICFVAMVFIGSLIKTVNVNTVLLGSLAGVLIHWLVTDIEPWLGGTLYNKDITGYYQSLIAAIPFEKNLLLGNLVFGAVLYGGFELAKSKFTILKSQKELAY >NZ_CP043329.1|WP_149074168.1|1148098_1149904_+|TonB-dependent-receptor MVTASRSPKKISDIGKMVRVISREEIERSQGRTLPELLNTVPGLNVTGSGSALGEVKSVYLRGASSANTLILIDGIPVNDASGISGEYNLAAIAIDQIERIEVLKGASSTLYGSDAVAGVINVITKKGEGKLKTNALLSGGSYNTYKQAVGLNGNINKTAVALNFSNLDSKGFSSAQPLNAASLFEKDKFSQQGLSLNLSQYLNNTVKILGGLQLNNNKSGLDGGAFQDNTNYNYNKVALLGNIGLNVALRKGNLSLIASQNNVSNKFNNNGANSYYKGSITNVEGIFSYKVNNFLDLTSGANYKYSATDQFSGFGAPLTAGNANNNIASLFTSLFFNVKDVFRMELGGRYNNHSAFGDNFTYTFNPSVLLFNSIKVYGNISSAFRVPSLYQLTSEYADPNGLNPETSFNYEAGFSTDLFQNKLNINTSVFFREIDDVIDFGSRADGSFGYLNQNQQNDEGIETEIGFKPSDKLSISAFYAYVYGRVIKSPGTPGAFNLSRRPVNSSGANVSYNLNKNLSFSLLYKWTDSRRDIYYDTDFNEQNVVLTSYHKFDAYVQYKTKKNVTLFADVKNLFDARYNDFAGYNTMGTNFNAGISFLFQ >NZ_CP043329.1|WP_149074167.1|1147237_1147513_-|hypothetical-protein MKINIASNVKALKSKSALQTNFNHHQHRLSEELNKGKQHVLYTSLLYVLSILSIGSWIISLKLLPFGDMFQFLLGAAVLTVNLLIFRHAKI >NZ_CP043329.1|WP_168199389.1|1147074_1147251_-|hypothetical-protein MLKFKAMTFDEPQANRKDWKKQKAKRDLLVKRNDEIANKPVSIFETDNESSNKKKLKK >NZ_CP043329.1|WP_149074166.1|1145943_1147086_+|hypothetical-protein MQYSPKYQSAKIVAPKIEEHFLHHIALASHKGEQDIATIPQVSIIEAIIDVCFWASFRSEEGKYPRISLAFLSPEQALHPVVFQEKLSLNAYVLSKLAPGIEGAGIHLGVWYQDGELYVWGSTTSIPDYCFVLDVSEPGLLVIKHKRINGYGKFTNVVILKGDEIKIVNEDSGMLPDSPQILKSLLGFTAPYLRNDTANILIQLAVFMRSHGRGGTLLLTPSADEQWKSSLIQPFHYQLNPPFEGLANLILKDGANISESLWVSKLKREVDHIAGFTAIDGATIINDKYELLAFGVKIGKREGNTSVKKIAFIEPVIGGEASLLEVSRLGGTRHLSAAQFVFDNHDCIALVASQDGYFTVLSWSESMKCVQAHRIETLLF >NZ_CP043329.1|WP_149074165.1|1145437_1145923_+|cytochrome-C MKKKILLGLLAVLVIIQFIKPEKNVSSTPSVNSIHNKFPANEETMQILKTACNDCHTNNTVYPWYAHIQPVAWWLDSHVDDGKKHLNFDEFLTYKLKKQDHKLEELIESQEDHWMPLDSYTWIHKDAKLDEKQRLALVNWAKETRLKIQSDPAFALEEDKK >NZ_CP043329.1|WP_149074164.1|1144646_1145441_+|inositol-monophosphatase MLNYQELCDEVIRIAKEAGAFIRKESALFQSSKIEYKGTNDMVSYVDKTSEEMIISALAKVLPGSGFIAEEGEHQKAETFNWIIDPLDGTTNFIHGIPAFAVSIALQEGDELVLGVVYEIGKDECFYAWKGSAAFLNGKEIKVSASTKVADSLLATGFPYYDFTRKDAYMALFGDLIQSCHGLRRIGAASVDLVYTACGRFDAYFEYNLKPWDIAAGMFIVQQAGGENFDFEGGKNALKNCDIVSTNGHISQELLTVINKYFKS >NZ_CP043329.1|WP_149074174.1|1154549_1155467_-|amidinotransferase MQTTSQILMIRPVAFALNQQTLASNAFQDAQTEQEEVQEKALKEFDAFVEVLKANHIHINVIQDTLEPHTPDAIFPNNWISFHENGEIFLFPMLAENRRQERRADIIESLKKHYQVKILTDLSFYEKEHKFLEGTGSMVLDRENKIAYACLSARTHEDVLKEFCQRSGYEAIMFHAEDAKGIAIYHTNVMMCMATKFAIVCMDAVKDLKEQQIIKESLSKTGKLLIEISLAQMNQFAGNMLELQNTHGEHLLVMSRSAFKSLTSKQIQEIEQFVNILNVPLETIEKNGGGSARCMIAEVHLPSLS >NZ_CP043329.1|WP_149074175.1|1157050_1158436_+|tRNA-uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34)-synthesis-GTPase-MnmE MSLHQEETIVALATPAGIGAIGVIRLSGPEAISITNKVFYGKNLEAQDSHTIHFGTLRDGDFIIDEVLVSLFVAPKSYTKENVVEISCHGSDYIIASIIKLMIKNGARAAKAGEFTLRAFLNGGLDLSQAEAVADLIASSSKSAHQLALQQMRGGFSNELKNLREQLIHFASMIELELDFSEEDVEFANRDQLKQLILAINKVVSRLIQSFEMGNVIKNGVPVVIAGKPNVGKSTLLNVLLNEERAIVSDIAGTTRDTVEDEITLKGVRFRFIDTAGIRETADIIEAKGVERTFEKIKSSAIVLYLFDPRETSLTELKAIMDDLHQVIQENNSKLLLVANKTDETQVNNALTGFESLGEILNISAKEKYNIQLLEDELLKAANLSQINKDEVIVSNIRHLEALQKTEASLSRVLHGIDNPVTSDFLAMDIKQALYYLGEITGTVTTDDLLENIFSKFCIGK >NZ_CP043329.1|WP_039453719.1|1158921_1159446_+|hypothetical-protein MNNFVQIKKVAQYDKVSYYSVTINSETTSLFEQFIATHTANNKEKLNHILAWLQEIGIKYGAQTYLFRPEAYLSDTSALPPTGKDKEPTYIENGETESNNLRLYCFRLNENVVVLYSGDLKTADKAQDCINVKSHFLLANKLTRALENSIKENEVYWNEDCTDIIFDSDLEIAY >NZ_CP043329.1|WP_149074176.1|1159453_1159834_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MENNIISNWLKENGDPSIRKATEINLAIATKINNILQAKSLKAVDLAVKLNKNQSEVSKWLTGMHTFTTKTLAKISLALEEEIIFTEPKTKNIYFTVYKNENVNDGTEYETSEILASSIDLDRKIS >NZ_CP043329.1|WP_149074177.1|1159843_1160266_+|hypothetical-protein MIDPLKIHLTNIVKLTETISSDCLNRSVEEMEMDISHQMMHNLEKKKVKLNIQIAFLCKDKPDQQLAAFSYDFFYTIDDLEVHYQLTNEKPLFDGLFVSTLLGISYSTIRGILFQQLTEAPLKNILLPVINVPDLLKSKN >NZ_CP043329.1|WP_149074178.1|1162165_1163356_-|ADP-forming-succinate--CoA-ligase-subunit-beta MNIHEYQGKQILKSFGVRIQEGIVADTPEQAVEAAKKLKEDFGSDWVVVKAQIHAGGRGKGGGVKLAKNLDEVKQRASDIIGMQLITPQTGAEGKKVNKVLIAQDVYYPGESETKEFYVSVLLDRSRGRNIIMYSTEGGMDIEEVAEHTPHLIFKEEIDPKVGLQGFQTRKIAFNLGLSGNAFKEMTKFIAALYKAYEATDSSMFEINPVLKTSDDKILAVDAKVDLDDNGLFRHPDYAAMRDTSEEDPTEVEASESNLNYVKLDGNVGCMVNGAGLAMATMDIIKIAGGEPANFLDVGGTANATTVKAAFNIILKDPNVKAILINIFGGIVRCDRVAQGVIDAYKEIGDIRVPIIVRLQGTNAEEAKKLIDESGLKVFSAILLKEAADLVSEVLA >NZ_CP043329.1|WP_039453705.1|1163570_1164224_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLKAQSIKRKFGDLSILKGVDIDVAKGEIVSIVGASGAGKSTLLHIIGTLDKADEGSVEIDGIAINQLNARTLSRFRNKNIGFIFQFHHLLPEFTALENICIPAFIAKTSKNEAEKRAMELLAILGLADRAHHKPAALSGGEQQRVAVARALINKPALILADEPSGNLDSANAKELHQLFFSLRDQFNHTFIIVTHNDELAEMSDRKITMKDGYIFS >NZ_CP043329.1|WP_149074179.1|1164226_1164970_+|hypothetical-protein MKKTLITTASNATAYQLAYHLPHHEILFADTKDQKLIIPEGNKLSFAHELLSLCLDLDITLVFPLKLSEQKALAEAKILFEEYGITLALPDLIQAQKINPLAHLYPEQVINYQTVTDYASFSKAVLSLGYPDKQIAIGHHEGVGELIIIQDDKKSDIFSGIKTMPFTLAGKVLNQNPFTAIHLCALEGDMQIVRFIKLEDDLIYVNDVSEEIKKLIESLVSHLSSLGFYEMICSQGKIIRLNLVAVV >NZ_CP043329.1|WP_149074180.1|1164966_1165575_+|HAD-hydrolase-like-protein MISYSDLDADKKAFIFELDDVLIPEKDYDLQVYYLFANFVEYLETFPPAQDVVDFAKKRYEIYGKEDMFKALQEAFAIPVKYEENLNLLFTNARLPLKLLLYKEVLELLQEITINRKELYILTSGNPVTQLNKITQTEWNGLEKYLKVYFVDEFEPKPSFTSLDFLLEENKLNKSDVTYIGKNSLDEQFAINAGVSYQAVLS >NZ_CP043329.1|WP_149074181.1|1165649_1167245_+|PDZ-domain-containing-protein MLKRVYAIAFIIIIGFASCKKDKATTDNNKPTPTTIRAELTKDSIFLYAKQVYLWNDAIPDYSAVKPRNFNSSSNQLDNFNSLLFDITQYSRNPNNGNRPYEYWDDYPNEPKFSYIEDLVASGQIAIVNPKKSSVNLNGEGNDTGLNIGFYGNGNTAFRRDYFLIIRYVNENSSAADKKLNRGDTILTINGKTYGANFDQESDEVFDRLELDNIIVTGKKRGTGTSFSFTLNKTKYTASPILKDTVFTETGGKKVGYFAYARFSDETNSIPALNAVFDKFNTAGVTDLIVDLRYNGGGFVSTAEHLVNLIIPTQHNGKKMFSEFFNSTMREGKATILKNQPRRDQNGNITRGNYFDNTDYSVAGNTTNISKISGLANVNRVVFITGPGTASSSELVINSLKPYLGANLKIVGEQSYGKPVGFFPIRIDKYDVYFSMFETQNSLGQGAYYDGFVPDFNTGFDDAGKSFGDKNDLAVSQAINFIKNGSFSSSNVANTKGASVSSTSTNNMKSLDPKDLFSREFKGMIDYPGRR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP043329_4 | 1851341-1851440 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP043329_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP043329_4
>4.1|1851367|48|NZ_CP043329|CRISPRCasFinder TCTAACCAACTAACACCAACAACCTAACTAACTAACTAACTAACTAAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043329_4
The CRISPR arrays of NZ_CP043329_4 >merge|NZ_CP043329|4|1851341-1851440|CRISPRCasFinder CTAACTAATAACTAACAACCTAACCATCTAACCAACTAACACCAACAACCTAACTAACTAACTAACTAACTAACTAACTAACTAACTAACAACCTAACCA >NZ_CP043329|4|2|1851341-1851440|CRISPRCasFinder CTAACTAATAACTAACAACCTAACCA TCTAACCAACTAACACCAACAACCTAACTAACTAACTAACTAACTAAC TAACTAACTAACTAACAACCTAACCA
>NZ_CP043329.1|WP_039447423.1|1850983_1851214_-|hypothetical-protein MKVLSLKLDDEIFNEAEEITHELHIARNRYINEAVRIYNLVQKKRLLKKQLAKESALTSKESMDVLHEFERLLDEN >NZ_CP043329.1|WP_149074583.1|1850658_1850994_-|type-II-toxin-antitoxin-system-PemK/MazF-family-toxin MKIKQFDIWLADLNPSRGTEPGKIRPVVVIQTDLLNDIHPSTIICPITTNVQQDIQILRVHLNENQLDKLSDILVDQIRAIDNKRLMSKLGELTQNQKEKLKANLRIVLDI >NZ_CP043329.1|WP_039447418.1|1849990_1850464_+|hypothetical-protein MAKASISVIQALLKTVENLEKGAAYQWGHMGSCNCGNLAQVITNRDKAEIHKSAMRSRHGDWNEQLIDYCPTSGLPIDHIIDEMVAFGFTRADLAHLEKLSDPQVLRQLPASHKYLKHNQKADVILYLKTWVKVLENELIDTISLEDVNKGKELVTV >NZ_CP043329.1|WP_149074582.1|1849207_1849900_+|methyltransferase-domain-containing-protein MNDVYGDFLKDYLDKGKTSTIWLHNNYAEAEEMPAEVFFRKDYEITDLEAFALRQCKGKVLDIGAGAGAITLILQKRGFDVTALEISPGAAEVMQKRGVQKIINTNIFDYQDEQYDTLLLMMNGIGFCQYLDEIERFLHHAKKLLKPEGQILFDSSDVLYLYENKKYEDDGYYGEIDYQYEYKGKKGDWFTWIYVARDIMKEIATKCGFQMEVLFDDGSDQYLARLSLKS >NZ_CP043329.1|WP_039447413.1|1848937_1849150_-|DUF3820-family-protein MNPEILLDLVKVRMPFGKYKDRILCDLPVSYLEWMYTKGWPAGKLGQQLATIYEIKINGLEYLLKPLRNK >NZ_CP043329.1|WP_149074581.1|1848729_1848936_+|hypothetical-protein MQNSVLEITEQEYLIKLNKQEFDLSFIHALLKRIQSEKAFFSKIWDDDDIIAKGRFLEERDIDYLSEK >NZ_CP043329.1|WP_149074580.1|1846925_1848644_+|lysine--tRNA-ligase MSILSEQEIQRRQSLQELRNLGINPYPAEAFEINANALDITSNYERDKTSYKNISLAGRIMTRRIMGNASFVELQDATGRIQAYIRRDDVCPEEDKTLYNTVFKKLLDIGDYIGVTGFVFTTQTGEISIHVTEFKVLSKSLKPLPIVKRDDDGNVYDGFTDPEMRYRMRYVDLTVNPEFKEIFKTRSKVISTMRNYFDSQGWMEVETPILQAIHGGAAARPFNTYHNTLDMPLFLRIANELYLKRLIVAGFDGVYEFGKMFRNEGMDRTHNPEFTSMEIYVAYKDYIWMMSMVEECLEKVTTAIHGKTTIKVGNDEIDFAGPYEKLSMYDSIKKYTGIDVSQMNEQQLIDTCKSLNIEVDASMGKGKLVDAIFGEKVEHNLIQPTFITDYPIEMTPLAKKHRTTEGLVERFELFVQGKEIANAYSELNDAIDQKERFEDQLTLAARGDDEAMAMDDDFIRALEYGMPPTAGLGIGIDRLVMLMTNQSSIQEVLFFPQMRPEKKAKVTTDEDFVTAGIPAAWVQVIRKMGINTIEDLKAANPNKVFNDLGGMRKKLKLDLTMPQKEEVMEWFK >NZ_CP043329.1|WP_149074579.1|1846625_1846820_+|DUF4287-domain-containing-protein MNQTTETLMTAIEENTGHPLEHWIEIIRKSGKPDCQAITNFLIEEHQLNPVLAELIAQKAKGSH >NZ_CP043329.1|WP_149075881.1|1845266_1846562_+|DEAD/DEAH-box-helicase MSFDELDLINPIKKALQTEGYTKPTPIQAQAIPLVLDGNDLLGCAQTGTGKTAAFAIPIIQLLHNSSHQQAKGTRAIRALIVTPTRELAIQIADSFAAYGKNTPLKYAVIFGGVGQKAQTDALAKGVDILIATPGRLLDLMNQRYISLKSINLFVLDEADRMLDMGFIHDVKKLIAALPAKRQSLFFSATMPPVIQKLASEILKNPVKVEVTPESSTADTINQFVYMVDRDNKNKLLIHILEDKNIKTALVFTKTKHGADKVVKMLLNHGIKAAAIHGNKSQNARQRALEEFKSHKIRVLVATDIAARGIDVDDLAYVVNYEIPNIPETYVHRIGRTGRAGANGTAFSFCEIDEKEFLQDIQKIIGKTIPKAEENPFPMTKFTAAPSTKKGGKSGRSKSAAPHKAAQGNAKNNTAQTGKKKFFRKRKETNS >NZ_CP043329.1|WP_149074578.1|1844516_1845128_+|hypothetical-protein MENHKEIIPKQQEGIATDIKESITLSGSEEAIQFYDIAVNRLKDVNHWHLLTKHTGTKFTLRDKNGFEVKRQVVLGDYFQINIPFPGLDSGKGYDWVQVKELKEENNQQQDEQTFSMLVKPAHPPFEKETAHFFDAEASSTFSVLRNGTKITALVHGRNEKPNTFVHSLAGKIRNIIVALGSFLGFSYFQWKSLVKGLLSDNE >NZ_CP043329.1|WP_149074584.1|1851473_1852673_-|aminoacetone-oxidase-family-FAD-binding-enzyme MLETKYDAIIIGGGACGLMCAVQAGYLGKKTLILEKNAQVGAKILISGGGRCNYTNYYTTAQNFISENEHFCKSALSQWTVDDTISFFETYGITGQEKTLGQLFPTSNKAKDIVEVFKQICDDFGQDIYLNSHVLAVEKLDELFKITFERNGKTETLYSFKVVMASGGLPIAKMGATDFSLKIAKQFGLQVVQTAPALVPLTITGKDADWFAHLSGNSMPAVVSNDEISFEENILFTHWGLSGPAILQISSYWRPGQSIVIDLLPHQNIQELIEQERSANGKKLLANYLALFYTRKFIDALSDILPTHKNLASLTKDDFTAINEFIHHFKVKPAGDKGYDKAEVMRGGVDTNELSSKTLEAKKVPGLYFGGECVDVTGWLGGYNFQWAWASGFVIANSV >NZ_CP043329.1|WP_149074585.1|1852767_1853352_+|NAD(P)H-quinone-oxidoreductase-subunit-3 MEEYSQISAFGKVLIFLIMGIVFVMLAFITSKIIAPNKPNPEKNSSYECGEEVIGSSWIQFNSRFYVIALIFLLFDVEMVFIFPWAIVFSDATLIAQDQRWGWLSFTEMLIFISILLLGLVYVWRKKDLDWIKPVLKLPTVDTKIPLSAYQAINEAKYQPGLKNKQQENSSVVKENNIETENIKPKFVPRFKKS >NZ_CP043329.1|WP_026903629.1|1853348_1853831_+|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-B MSLEQQLENGGVVVTKLDDLLNWARLSSLWPLSFGIACCAIEMMGSMASNYDLDRFGVFPRPSPRQADVIIIAGTVTFKMAERIKRLYEQMPEPKYVISMGSCSNCGGPYWEHGYHVVKGVDRIIPVDIYVQGCPPRPEALIGGILELQKKISTQSLSTI >NZ_CP043329.1|WP_149074586.1|1853863_1855003_+|5-(carboxyamino)imidazole-ribonucleotide-synthase MKSNITQTRLGILGGGQLGRMLIQEAINFNLSISILDPDANAPCKNICDYFEVGSISDYETVYNFGKNLDLLTIEIEKVNIEALEDLEKEGVTVFPQPRIIRLIQDKGLQKQFFKENDIPTSEFQLIANKEQLLTDKIPFPYIQKLRKDGYDGKGVVKIVDESDLNKAFEQASIVEKWIDFEKEIAVIIARNENGQTKTFPLVEMDFNKEANLVEFLISPSTYNFEIQQKADKIARDIADCLNIVGLLAVEMFVTKNGEILVNELAPRPHNSGHHTIEGNVTSQFQQHLRAILNLPLGSTASIANAVMINLLGEAGYEGPAEYEGLKEVLQKEGVYVHLYGKVFTKPFRKMGHVTIVDQDRNAAIEKAQFVKEKLKVKS >NZ_CP043329.1|WP_149074587.1|1855002_1855515_+|5-(carboxyamino)imidazole-ribonucleotide-mutase MYKPKVGIIMGSRSDLPIMEEAANVLKELGVAYELTVVSAHRTPERMFEYANKAAERGLKVIIAGAGGAAHLPGMVASITTLPVIGVPVKSSNSIDGWDSVLSILQMPNGIPVATVALNAAKNAGILAAQILATADDHLAQQVAKFKNDLKAKIEESAELLKSEGYPSAF >NZ_CP043329.1|WP_149074588.1|1855511_1856075_-|YqgE/AlgH-family-protein MLSKVLPKVGDLLISEPFMLDENFKRSVVLLTERGDEGDVGYVLNHKSNLLLKDVVADCWDANFLIHIGGPVANGTLNFIHCCPDKIPGGTPIGKDLFWGGDFETLKLQINSYNITESEIKFFIGYSGWDKGQLVAEINENSWIVSDQYNPAMIFEYSDKNIWKEAILNLGVKYAHVANFPENPEWN >NZ_CP043329.1|WP_149074589.1|1856191_1856848_+|pyridoxamine-5'-phosphate-oxidase MSEQKLNLKDLRQDYRSAFLLEEDIEKTPLKQFEKWFKDALKAEILEPNAMTLATASREGIPSARIVLLKDYDEDGFTFFTNYSSNKGQQLTENPFAALVFFWGDLERQIRIEGVIEKISIHESTSYYHSRPKGSQLGAWASPQSSVIPNREFLELNLKKLEEQYKDKEVVPKPDFWGGYRLIPNLIEFWQGRSNRLHDRITYKRQKDESWTIERLAP >NZ_CP043329.1|WP_149074590.1|1856844_1857345_+|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-C MTFVEIKELLIQKFGTDSIEAEETQGLQPALVIKKDHIVEVCLALRDNEKTWFDFLSSLSGIDYGVEAQKFGVVYHLTSILKKHQLVLKVYQENDRDEQNLPVFKSVTSVWKTADWHEREAFDLLGIYFEGHPDLRRILLPDDWEGYPLRKDYKTAEQYHNIKIDL >NZ_CP043329.1|WP_149075882.1|1857385_1858534_+|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-D MNSVSSEEMVLNLGPQHPSTHGVLRLELITDGEIVKEVIPHLGYLHRCFEKHAEALNYGQIIPFTDRMDYMASMNNNHAFVMGVEKMLGIEDKIPKRVEYIRVLVCELNRIASHLIAIGTYGIDIGAFTPFLWCFRDREHIMNMLEWTSGARMLYNYIWVGGLFYDVPVGFEERCVEFVKYFKPKMKELNELLTENQIFISRTANVGVLPLDVAINYGCSGPMLRGSGLKYDLRREDEYSVYPELDFEIPYAKGEIGTVGDCWNRYKVRIDEIAESLKIIEQCAVKLQHEHKRTPDFDPRALVPKKVVPKQQDFYCRAENPKGEIGFYFIADGKSDKPFRVKSRGPSFNNLSVISEISKGVLIADLVAIIGSIDIVLGEVDR >NZ_CP043329.1|WP_149074591.1|1858613_1859711_-|trypsin-like-serine-protease MSSELVLIKRIEAYLYQEMSDEEMMQFEQERAENPALDAKVIAHIDFLKSLKNYGEVQDLKASMEDFHQELNVIALKEELEEKEPAVVLFFRKYKRNLAVAASVAILATLITLISTGQFRKATNSSTYNALKRDMESIKKSQNALIRDINSKSPNKEIAPSQFGGTGFALSSNGYLVTNYHVVQGADSVYIQNNKGESFKVQTIYIDPSYDIAILQIVDPLFESLSPLPYTFKKSSSDLGEDVYTIGYPRDEVVYGKGYLSAQTGFGGDSIAYQVSIPVNPGNSGGPLMDNRGNVIGVISGKQTQVDGAAFAIKSDYLLKAIDNIPQDSLKKKLKINHKNSLASFNRTQQIKKMQDYIFMVKVYN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP043329_5 | 2294030-2294140 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP043329_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP043329_5
>5.1|2294056|59|NZ_CP043329|CRISPRCasFinder TTCCTATCCCAAAAACTAGATTATGTAGATGACAACCTCTCATTGCGCTCGTTTGCAAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043329_5
The CRISPR arrays of NZ_CP043329_5 >merge|NZ_CP043329|5|2294030-2294140|CRISPRCasFinder GAGTACTTAAAATGGACTTTCGATTTTTCCTATCCCAAAAACTAGATTATGTAGATGACAACCTCTCATTGCGCTCGTTTGCAACGAGTGCTTAAAATGGACTTTCGATTT >NZ_CP043329|5|3|2294030-2294140|CRISPRCasFinder GAGTACTTAAAATGGACTTTCGATTT TTCCTATCCCAAAAACTAGATTATGTAGATGACAACCTCTCATTGCGCTCGTTTGCAAC GAGTGCTTAAAATGGACTTTCGATTT
>NZ_CP043329.1|WP_149074830.1|2293508_2293916_-|hypothetical-protein MGIHKLTEENQYNLIELILRLHKIDLKLFKSDDDLKALLKFNEVFQIDVSHYDDFHRRICYLRVAKEIYLLKIKSDNYYVDFRQLLKDVRYLNLSSNEDVQELIDEVINKDNLIHYKVLSKSYSYWGEIQKRIIF >NZ_CP043329.1|WP_039452193.1|2292218_2293277_+|3-isopropylmalate-dehydrogenase MKLNIALLAGDGIGPEVINQAVKVVNAVATKFNHEINWTSALTGACAIDDCGEPYPDSTHEVCMAADAVLFGAIGHPKYDNDPKATVRPEQGLLKMRQKLGLFANVRPTFTFPSLIDNSPLKRERIEGTDLIILRELTGGIYFGERGRKDNGNTAFDTCTYTRAEIQRLAKLGFEIAMTRSKKLCCVDKANVLESSRLWRETVQDMEKDYPEVTVSYEFVDAVAMRLVQWPNSYDVLITENLFGDILTDEASVISGSMGLMPSASKGLHTSLYEPIHGSYPQAAGKDIANPLATVLSAAMMFEDAFGLHAEAAAIRDVVNKSLAEGVVTEDLSGSNKAYKTSEVGDWLAKNV >NZ_CP043329.1|WP_149074829.1|2290608_2292126_+|2-isopropylmalate-synthase MVNRKIEIMDTTLRDGEQTSGVSFSASEKLTIAQLLLEELHVDRVEIASARVSDGEFQAVKAIMDWANQNGYTNRIEVLSFVDNGVSINWMLNAGVKVQNLLTKGSLNHLTHQLKKTAEQHFAEIAAVIALASQNQIETNVYLEDWSNGMRNSKDYVFQFLDFLSQQSVKRVLLPDTLGVLTPSETYDYIDELKSKYPNIHFDFHAHNDYDLSTANVLEAVKAGIDGLHLTVNGMGERAGNAPMASAVAVINDFLPEVKISLKESSIFKVSKLVETFSGIRIPANKPIVGDNVFTQTAGIHADGDNKNNLYFNDLLPERFGRKRTYALGKTSGKANIEKNLQELGLKLNDEDLKKVTQRVIELGDKKETVTKEDLPYIISDVLDSKLYEEKVTVQSYVLTHAKGLRPSATISVSIEGEHFEENAQGDGQFDAFMNALNKVYAKKKRQLPKLVDYAVRIAPGSDSDALCEAIITWETDKKSFKTRGLDSDQTVCAIKATQKMLNII >NZ_CP043329.1|WP_149074828.1|2289806_2290403_+|3-isopropylmalate-dehydratase-small-subunit MAYDKFNILKSSAVPLSIENVDTDQIIPARFLKATERVGFGDNLFRDWRYNPDNTPKPDFVLNNPTYSGKILVGGKNFGSGSSREHAAWAVYDYGFRAVVSSFFADIFKNNCLNIGVLPVQVSPEFLDKIFKAIAADPKTALEINLPAQTITLTSTGEQESFDISSYKKENMMNGFDDIDYLQNIKSEIQEFATHLPL >NZ_CP043329.1|WP_149074827.1|2288248_2289658_+|3-isopropylmalate-dehydratase-large-subunit MSKTLFDKVWDKHVVRKIEGGPDVLFIDRHLIHEVTSPVAFLGLKTRGIKVLYPERTFATADHNTPTINQHLPVADPLSANQLKALEANSKEYGISHWGLGHQKNGIVHVVGPEYGITQPGATIVCGDSHTSTHGAFGAIAFGIGTSEVEMVLSTQCIMQPKPKKMRITINGTLSRGVTPKDVALFIISKLTTSGATGYFVEYAGEVFEKMSMEGRMTVCNLSIEMGARGGMIAPDETTFNYIQGREFTPKGAAWDKAMEYWKTLKTDADAVFDKELTYSASEIEPMITYGTNPGMGIGISNQIPDAEQVEGGVETYEKSLNYMGFNEGDSMIGKPVDYVFVGSCTNGRIEDFRAFASVVKGKQKAENVTVWLVPGSHIVESQIKEEGILDILTEAGFTLRQPGCSACLAMNDDKIPAGKYAVSTSNRNFEGRQGPGSRTMLASPLVAAAAAVTGKVTDPRELMEELVG >NZ_CP043329.1|WP_149074826.1|2285105_2286617_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MSQPVVHINNLNLQYPQTLVLEDLNWTILLGENWLLGGNSGNGKTSLAKAIAGLIPAFGNIEINFNDTSKLPAKVLLVESWYQFKNLEGVANFYYQQRYTSQQAKDTLTVKAELAYYAKEHHLNIADVEPILDRLDFTSLQNSQLIELSSGEHKKLQLVKALWLKPQVLIIDQPYTGLDLKSRKNLNLLLDEAASSGVTLILISNDDDLPSSINRFATIANKKLVAVNTKTDLQQFIPLKENKTVPAFLRTSPVYSSQQIAKMENIQISYGEKQVLKNINWEVKAGEKWLLQGHNGSGKSTLLSLINGDHPQSYANTLYLFGHKRGSGESIWDIKQHIGLISPEFHWYFDASATVWESVASGLYDSVGLFRQLPYSKSILVDELVAYFGLTKEKNRLLNTLPLGAQRLVLLARTIIKNPELLILDEPCQGLDKQQTQYFNQLVDELGSNGMTIIYVGHFESQLPNCLEKRIVLENGEVLLIEEIDKENKKHKALNELSLALSI >NZ_CP043329.1|WP_039452214.1|2283487_2284969_+|ketol-acid-reductoisomerase MANYFNTLPLREKLNQLGVCEFMDNAEFADGVNALKGKKIVVVGCGAQGLNQGLNLRDSGLDVSYTLRKEAIEGKRDSWKNATENNFKVGTYEELIPSADVVVNLTPDKQHTAVVNAIMPLMKQGSTLLYSHGFNIVEEGMQIRKDITVIMVAPKCPGSEVRAEYVRGFGVPTLIAVHPENDPEGKGLAQAKAYCVGTGGHRAGVLKSSFVAEVKSDLMGEQTILCGLLQTGSILSFDKMTEKGIDAGYASKLVQYGVEVITEALKHGGVSGMMDRLSNVAKVKAFEVSEELKDIMRPLFQKHQDDIMSGEFSRTMMEDWANGDKNLLAWRAETGETAFEKTAAGDVKIGEQEYFDNYLLMVAFVRAGVELAFETMVEAGIKPESAYYESLHETPLIANTIARKKLFEMNRVISDTAEYGCYLFDQACKPLLADFMKKVDTDLVGKNFNEGKDGSVDNRRLVEINEILRSHQVEVVGVKLRKAMTAMKAIKTA >NZ_CP043329.1|WP_149074825.1|2282743_2283346_+|acetolactate-synthase-small-subunit MESKLEKKEFNITVYTENQVGLLSRIAIIFSRRKLNIESLNTSPSEVESIHRFNIVINETEEVVRKVARQLEKQVEVLKVYYNTNEDVIWQELALYKVPTEIIAEHVSVERLLREYGARAVVIRKDYTVFETTGHREETDALVVVLQQYGLIEFVRSARVAIIKASDGFHTKLKQFENREPGESASENEYLNNGDKVFTM >NZ_CP043329.1|WP_149074824.1|2280978_2282724_+|biosynthetic-type-acetolactate-synthase-large-subunit MQQKDALLMSSEEETAITVEQLKGSEILLNGLIAEGVETIFGYPGGAIMPIYDALYDYQDRLKHILVRHEQGATHAAQGYARTSGKVGVVFATSGPGATNLITGLADAQIDSTPMVCITGQVFAHLLGTDAFQETDVINITTPVTKWNYQVTDASEIAEVLAKAFHIAKTGRPGPVLIDITKNAQLQLTAYNGYQKCEHIRSYRPAPIIRNNYIEQAAALINEAKKPFVLFGQGVLLGNAEQEFKAFVEKTGIPAAWTILGAGAIPTDHPLNVGMLGMHGNYGPNVLTNECDVLIAIGMRFDDRVTGRLDKYAKQAKVIHLDIDPAEIDKNVKAHVPVWGDCKETLPLLTALVKEKKHEEWLEKFRTYTREEIEQCIDAEINPQSGELTMGEVINQLNQLTKGDAIIVTDVGQHQMVACRYAKFNHTRSNITSGGLGTMGFALPAAIGAKFGAPEKTVVAVIGDGGFQMTLQELGTIMQSGIDVKIMILNNQFLGMVRQWQELFHDRRYSFVDITSPDFVALAKSYYIDGQKISERAELKDALKTMLDHKGSYLLEVMVTKENNVFPMVPQGCSVSEIRLK >NZ_CP043329.1|WP_149074823.1|2279333_2281013_+|dihydroxy-acid-dehydratase 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MTPLITVHNIYKNFTDATHSGVSGINLEINEGEIVSIVGESGSGKTTLLKLIYGYLIPQGGEVLFEGKRVLGPTEKLIPGHDEMKMVTQELTLNLYARVYDNISSLLSNTDLEVKRDLTMQTMEFLRIDHLAYKKIVELSGGEQQRVAIARAVITEPRVLLLDEPFSQVDTILKKQLRDDIERLARFLKITVIMVSHDPSDGLSLSDKLVIVKDGKVVREGKPQEIYYEPQHAYVAQLIGKANILNGLSFLENGKYAVYPQDVFVNQDGMTAKVKSVHFGGLYQEVEYIAEDKTILSYDFDFIPLAKGDEVNIAFKKLMKLDS >NZ_CP043329.1|WP_149074833.1|2296014_2296830_-|outer-membrane-beta-barrel-protein MKQLILIACTVFSFAQLAQAQATDSTVVKKEKNAQVEISKEGVNIHIGKTDSTKKDNKGSFPKVSFGLNIEHFDIGLSKYHNGSDFGFPSSYDFLENNNWKTHTVGFDLLQFGVRFNPNFKIALAGGIDWNHIRLERDVTIRPDAAVLTADPSSETNLEKNRFSSRYLRVPLYFEYRSKQDKHKNRFSFVAGPEVGFLIDGKVKQKTDGGEKIKVKDDYNFTQFRYGANVRLGYGGTGLFFKYYFNDVFADNTAPGLEGYKNLSFGLTFGF >NZ_CP043329.1|WP_168199421.1|2296836_2297589_-|hypothetical-protein MEPMSDKELDLLFKSKFTDYEVEPSVSSWSKIEEQLSVKPMQRKKVPFLWMAAASVVVVFGLGLLLWNKPQEQIMLKGKPAVEEGDRVIAQNNAVNTIDEVITNTQPAEAKVETVSRVAQEETPNTTEESNSQENYLASIQTENPEAEQEFAATRTEPVKRITVTELMLLEEENTVKTNKIKSTMLSSLSSSKDESSNQQERIRSVGDLVNFVIAKVDKRENKVLKISKTDESDIEITGINLGLFKYKKD >NZ_CP043329.1|WP_149074835.1|2297569_2298142_-|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MNLQHKYAQEEIIQGCQAGERRYQELLYKMMSSKMLGVCMRYAKDQFEAEDMMQTAFVKVFRNINAYRGEGSFEGWIRRIMVNTSIEVYRKNLRSLNVVDIDETHDHQASTAFDMSRLNIADLMRLIRNLSDGYRLVFNMYAIEGYSHKEIAKELGITEGASKSQLSRARAILREQILKMEGNSYGTHVG >NZ_CP043329.1|WP_149074836.1|2298210_2299728_-|GH3-auxin-responsive-promoter-family-protein MTIVNSFLNWIMKKRMHQIELFMKYPNEVQEEWLNTLINSAENTEWGKLYDYKSIENERQFKERVPLQSYDTLKPFIEKMLKGEQNILWPSEIKWFAKSSGTTSDRSKFIPVSEEALEECHFKGGKDMLAIYCNNRPDAKMFTGKSLVLGGSHQINQLSPDSFYGDLSAVIIKNLPIWAEMMRTPDMSIALMDNYEEKIEKMARATMDVNVTNIAGVPTWTIVLAKRVLELTGKNNLMEVWPNLELYVHGAVNFEPYQEQFKMLIPNEQMFYLETYNASEGFFGIQDQSEDKDLLLMLDYGIYYEFLPMEHFDEENPKTLSLSEVELNKNYAIIISTNAGLWRYVIGDTVKFTSLDPYRIKITGRTKHFINAFGEEVIIDNAEKALTKACAETNAIIKDYTACPIYFQGNEAGGHEWIIEFEKKPNEFNRFVDILDNTLREVNSDYDAKRFKDMALRRPTVHIAPDNTFYKWLKQKGKLGGQHKVPRLANNRTYVDEILQIIQSS >NZ_CP043329.1|WP_149074837.1|2299767_2300508_-|LPS-export-ABC-transporter-ATP-binding-protein MILRAENLIKKYKQRTVVNNVSFHVGQGEIVGLLGPNGAGKTTSFYMIVGLIRPNEGNVFLEDENITQDPMYRRAQKGIGYLAQEASVFRKLTVEDNIKAVLEMTQLSKAEQKDKLEQLIDEFSLHKVRKNRGDLLSGGERRRTEIARALAADPKFILLDEPFAGVDPIAVEEIQTIVARLKHRNIGILITDHNVNETLSITDRAYLLAEGKIMLAGTPQEIADNEMARKFYLGQHFVLKIKNFKV >NZ_CP043329.1|WP_149074838.1|2300518_2302219_-|single-stranded-DNA-specific-exonuclease-RecJ MEKRWVEHSIQDLETVNLLSEELNIDEILAQMLVARGIKTFEQAKLFFRPSLDDLHDPFLMNGMEEAVSRIQRAIKNQEHILIYGDYDVDGTTSVALTYSFFKDLYPHLTYYIPDRYVEGYGISTQGIDYAAHHGISLIIALDCGIKSIDKVEYAKEKGIDFIICDHHLPGDEIPDAIAVLDPKRKDCNYPYKELSGCGLGFKLIQAFASRNDIPQEKVLKYLDLVVVSIASDIVPITGENRILAHYGLKKLNSEPCNGLKALIELSGKADDFTITDIVFSIGPRINAAGRIDDAKQAVKLLIASSTQLAEDAGFIINLKNSERKEFDNNITEQALNMILNSPEMEKRKSTVVYHETWHKGVIGIVASRLTEKYYRPTIVLTQSNGHIAGSARSVLGYDLYEALCECSDLLEQFGGHKYAAGLTMKPENLPAFIHKFEEVVSATITDDMLMQVIEAEKCIDLKDITPKFFRILKQFAPFGPQNMAPVFISRNVYSYGYGSIVGNNHLKMSVRQKDSQVFDCIAFGHGDFLEQINRGIPFDICYTIEENVWKDKRSIQLNIKGIKTY >NZ_CP043329.1|WP_149074839.1|2302323_2303100_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MLEIIALNEGSYSVDSSKKFIPFDPSIHKASERPASLFIHINPFLIKTEKELLILDTGLGYNDEKGNLILHENIKKAGYHPDDVTKVLMSHLHYDHSGGMVWDKQGKLEPSFANAEYIIQQGEWETAYAKQSSSYKTEIFDVIQRSGQVHFIEGNGILTDEISYELTGGHCEYHQVYHIKNDEHEIFFGGDVVPEPEQLQRNFIAKYDYDGKLAKDLRTEYGKKAAINNWICLFYHAKNRAIGTVKEDEQGNIRVDAF >NZ_CP043329.1|WP_149074840.1|2303096_2303507_-|response-regulator MIDETLHILIIDDDEINNFIAAKLIDKIPPRARVSTCLNGQEGINYITSRLNNQKDLPDIIFLDINMPIMNGWEFLEEYAAVTHQISKKIVINMLSSSVYNDDISKSKTYPTVNRFISKPLTIEKIQDLYQSLGIS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP043329_6 | 2701265-2701394 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP043329_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP043329_6
>6.1|2701305|50|NZ_CP043329|CRISPRCasFinder GCGCTCGTTTCTAAAAAGTGCTAAATATGGTTTTGCGATTCTATCGCAGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043329_6
The CRISPR arrays of NZ_CP043329_6 >merge|NZ_CP043329|6|2701265-2701394|CRISPRCasFinder TTATTTTGGAATTACGATTGACGATTTTTGATTTTTCCTTGCGCTCGTTTCTAAAAAGTGCTAAATATGGTTTTGCGATTCTATCGCAGCTTTATTTTGAATTACGATTGACGATTTTTGATTTTTCCTT >NZ_CP043329|6|4|2701265-2701394|CRISPRCasFinder TTATTTTGGAATTACGATTGACGATTTTTGATTTTTCCTT GCGCTCGTTTCTAAAAAGTGCTAAATATGGTTTTGCGATTCTATCGCAGC TTTATTTTGAATTACGATTGACGATTTTTGATTTTTCCTT
>NZ_CP043329.1|WP_149075070.1|2700005_2701262_-|aminotransferase-class-I/II-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MKVSVLAETLIGSEIIKIAGEVNQMKAKGAQIANLTIGDFDAQLYPIPAELQSNIVDAYADFQTNYPPADGVLTLRESVSDFLKSRMGLDYAAKNEILISGGSRPLIYATYLALIDAGDKVVFPAPSWNNNHYVHLLGAHGISVATQPENNFMPTAAELKPHLKGASLLALCSPLNPTGTMFSEQGLREICELVIAENKSRTAGEKPLYILYDQIYAQLTFGEHQHVDPVTLFPELRDYTVFIDGSSKCFAATGVRVGWGFGPAEIIDKMKAIVGHMGAWAPKAEQVAMAKYLKDTLAVDTYLGDFKTRIQNSLDTLYKGINALKNEGFAVDAIEPMGAIYLTLKIDYLGKSTPEGEVLKSSIDLNFYLIKEANIALVPFSAFGTNDMCWYRASVGACSADEIAAKIPQLKEALAKLK >NZ_CP043329.1|WP_149075069.1|2697815_2699999_+|oligosaccharide-flippase-family-protein METLLLNPISLWLRWLFTKAVYLFKNRGKHLKIEYMVELSSCTFGSYNTIYKYTRLRNSTIDSFSYVARNTLVQHAKIGKFCCIGPHVSIGLGAHPSSQYVSSHPLFYSIIGQASGLTLVEKELFQEYQETIIENDVWIGAQVIIKSGVKIGNGAIIASGSVVTKDVEPYSVVGGVPAKFIKYRFAQEQITFLQKFKWWEQNLDWLKEHKDLFLDVDLLMKNLIVNSLDRKESYKTGTIGSQTIKGSIYSYLGIIIGFFSVTVLRSHGLGPEENGILDLILSFTMILAQLGSLGFFNASIRCFPYFRDETKNHNGFMFLLLAIPFVGLLLFTLLFYLGKSVLPVESNFTTLFQDYTPVILALTLGTVLFNALDTFNRTALLDAVTGSTLKEFVQKLTVAIAMGLMLYFTLPFPLFLWIWVLANLIPTVWIFIKLYRKKVFNLKPDFAFLNPEMVKMLSSVSLFAVLTGFTTMIIQYIDKIMINEMINTSLTGIYSITAFFGTVVLMPSRIMYRIGGIIIAEKWKVHDIDGIKSVYKKSCINQLLIAMLIFIGIWANIDNVFEMIPKEYEAGKYVILFISLSGLIEMATGFNGVIIATSKYYKYDTYFFLALIFITIATNYIFIPIWGITGSAMATALATLLFNFFRYLFLVIKFKMQPMGLNNLFILMIGLFTLFIIGYLPKQSFFVWDIILRSGIITLVYVSSIYVLKLAPEMNTIIDKYKTKLLS >NZ_CP043329.1|WP_149075068.1|2696940_2697816_+|DUF115-domain-containing-protein 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MNWFKKNGIHLAVIGVFVILCFIYFAPAFQGKVLVQNDVSQAKAMQMEIMKYKEIDGKAPLWTNSMFGGMPSYQIWATYPKNITTYIMTSYRALFPNPVDMVLLYMLGSYLLFNVLLGLYNDKQKSLNAYLAAIGALAFTFSSYNFIIIEAGHGNKALAIGFFAPVLAGILLTLRGRYLLGAALTALFIALEIRVNHIQMTYYLFLALLILVGIEFYHAYKQKLTKDFFKSIGYLTGAVLIAVIINASMLWTTYEYGQLSIRGKSNLTSTNTPANTGLDKEYAYQWSQGVGESITFLIPNAYGGGSASLLDEKSEVVKNLTSKGIDINQSLDFAKQLPGYWGPKPFTSGPWYFGAFVFFLFVLGLFIVKSRLKWWLLSATLLSLFLSFGKNFSLISDLFFDYFPLYNKFRAVESTLVIASLCIPILAILAFAEILKADKDQKAILKALKNTSYILGGIVVVLLAVPTLLFSFKADNHQDFITQLNQVTGDMSFATSIAQSLVEDRISLFKADALRTLIFIAVGAGILWAIISKKINTTLGTLAIGVLIVTDLWAVDKRYLNNENFVAKAVIDQQFKTREVDEFILRDPDPNYRVLDLTIPTFSSANATYFHKTVGGYHAAKLKRFQEVIEKQFTGSMNQDVLDMLNTKYFITPSKDGQNTSMQVNSTACGNAWFVDKVQFVKNNDEEMVAISSFDPKKEAIINDEFKAQLDDKNLGTSFNGKINLTSYHPDHLKYEYSIGKSALAVFSEVWYPKGWKMYIDGEEKPYIRANYLLRAAKLPGGNHTLEWKFEPESYYFGEKISLIGSILLSLILAFAFYKERIQKLKA >NZ_CP043329.1|WP_149075065.1|2692736_2693168_-|hypothetical-protein 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MNFKIESYYKPTGDQPTAIKQLVEGVKSGENYQTLLGVTGSGKTFTVANVIEQTQKPTLILSHNKTLAAQLYGEFKQFFPDNAVNYFVSYYDYYQPEAFLPTTNTYIEKDLQINEEIEKLRLRTTSALMSGRRDVIVVSSISCIYGMGNPEDFSNSVFRFGVGTRISRNAFLHRLVEILYSRTTLEFKRGTFRVKGDTVDIYPAYLDLAYRISFFGDDIEEISAIDPASGKTLEKMDQVAVFPANLFVTPRDRFTSVLHQIGEDMESRKKQFEGEGRFLEAKRLEERTNYDMEMMRELGYCSGIENYSRYFDGRTPGMRPFCLLDYFPDDYLMVIDESHVTVPQIRAMYGGDRSRKLSLVEYGFRLPAALDNRPLNFNEFENLAPQTIYVSATPGDYELEKTEGVVIEQVIRPTGLLDPLIEVRPVINQVDDLLDEIDKTIKLGDRILVTTLTKRMAEELAKYMDRLNIKVRYIHSEVKTLERVEILRGLRLGEFDVLIGINLLREGLDLPEVSLVAILDADKEGFLRSERSLIQTIGRAARNDRGRVIMYADKITDSMRITMEETERRREKQIKYNEEHGIVPKTVGKSREAIIEQTSVVDFKGGVQQTYVDNAEVTLAADPIVQYMTKAQLKKSLDNTKKDMLAAAKDMDFLLAAKLRDEMFALEKMMEEKFGK >NZ_CP043329.1|WP_149075063.1|2689354_2690065_-|SDR-family-oxidoreductase MQKLQDKVALITGGSKGIGFGIAEALLKQGIKVAITSRSLASAEAAAQKLGHDVLALEADVKDFSSQQEVINKMIAKWGKLDFLIANAGVGHFASIEDLSVSDWNDTIDTNLTGVFYSIKAALPELKKTTGYIFTIASLAGTNFFAGGAAYNASKFGLVGFTQAIMLDLRQYGIKVSTIMPGSVSTHFNEHEPNTEKDAWKIQPEDMGQMVVDLLNMHPRVLPSKVEVRPTKTTNS >NZ_CP043329.1|WP_149075062.1|2687712_2688984_-|hypothetical-protein MQLLIYTPKLNSRKQYIFDFLFSQVLGINHQVLDDASTFSNYQGPKISYAPEALADEIHFKSYGLLDELGLKHQDLVSIDYHDVQVFFPVQSSVMPFDVFAASFYLLSRYEEYTNKGRDQHRRFPAKYSISKANSFLHKPVIDIWAYDILNIIHNYYPDLAFQKRQFKFIPTLDIDRPYYFKTEKFTRRILKQFKSLLKGKFTDPFDVYKQVAQWDKYYQTQTQYFILMGNKHQFDVAPDNHNPKFRKLLSKLALGYELGIHPSYESHIHQEEVLKEKQALEDIIQHPIKKSRQHYLKFNLPETFENLLEAGITEDYSMAYADDIGFRAGTCTPFYWYNLKTERSTSLKVFPTVVMDQTLRSYLGLKPQEATEVLNKLIQEVKNVNGTFISLWHNESLSNFGVWKAWKPVYMKLLENASNTNK >NZ_CP043329.1|WP_149075071.1|2701465_2702797_-|argininosuccinate-lyase MKLWQKNTSTNNLVETFTVGQDREMDLYLAAFDVLGSLAHTQMLESIGLMTKEDLDKVQHELKNIYREIADGNFTIEDGVEDVHSQVEMLLTQRVGEAGKKIHSGRSRNDQVLVDLKLFFRSQIQEMVLSTKELFDLLTQLAEQHQDKLLPGYTHLQIAMPSSFGLWFGAYAESLIDDLELMLAAFKISNKNPLGSAAGYGSSFPLNRTLTTQLLGFDTLNYNVVYAQMGRGKSERVVAQAMSSIAATLNRMAMDACLFMNQNFGFISFPDELTTGSSIMPHKKNPDVWELIRGRTNQLQALPNQIMMLTTNLPSGYHRDMQLLKETLFPAFNSLMSCLDMAKLMLKNIKIKDNILADDKYAYLFSVEVVNNLVLAGMPFREAYKKVGLDIEAGNFETDRKVNHTHEGSIGNLNLPEVKAMMQNLQAQFKFDKIEMAIDKLVK >NZ_CP043329.1|WP_039448831.1|2702876_2704226_-|Fic-family-protein MSRTIEIIDQLWTRLEALKPIKPEYKTKLDKKFRLEFNFNSNHLEGNTLTYGETELLLIFDDTKGNHTLREYEEMKAHDVAYLLVEEWAQDKESPLIEQKIKNLNEIILVRPFWKEAITPDGQNTRRLINIGNYKNHPNSVRLANGEIFHYTSPTDTPFEMQDLIKWYAEGEDNLHPVKLAAMLHYKFVRIHPFDDGNGRVSRLLMNYVLLKHNYPPIIIKSADKQNYLRALHLADVGDYEPFIEYISQQVKWSLEISIKAAKGETIDEQGDLEKKISVLKKKLKQDKEVKLKFDNSVLEKLVKKHIFPLAYEWEKGLKKFDQFFFSREVALNTEFGRVSGMEINEKLTNNFLNKLLLLINNNQKIIRIRFSSSYRKLKSVKDSGSFNGGFIEIQFHQNAYEISYSGSKTTISKLYDEELTKEEMESITNSIGNWFYTQIENAIELYNK >NZ_CP043329.1|WP_039448830.1|2704262_2705324_-|M20-family-metallo-hydrolase MDLDILFQDALALLQRLIAIPSLSKEEAKTADEIAVFLQQRGINIHRKGNNIWAYNQHFDAKKPTILLNSHHDTVKPNQGYTRDPFLPEIIDGKLYGLGSNDAGGALVSLIATFLYFYPEENLKYNILIAATAEEEISGKEGLERIVPDLGKLEFAIVGEPTEMHLAVAEKGLLVLDCVTKGKSGHAARNEGENAIYNALKDIAWFRDYQFTKVSPTLGPIKTTVTIINAGSQHNVVPDECKFTVDVRVTDAYTNEEVLKIIRQFVDCEVIPRSTRLKPSSIPIDHPIVQAGMALGRKTYGSPTTSDQALLNIPSLKCGPGDSARSHTADEFIYVDEIEEGIKLYVKMISEII >NZ_CP043329.1|WP_026905346.1|2705330_2706152_-|pyrroline-5-carboxylate-reductase MDFKKSNQIAILGSGNIGLSLAKGLAQSGLYPASSITLTRRNIEALDEYKFQGFQVSADNVSASAQADIIVLAVLPQQLNQVLDQIAGQIDVSKHLIISVISGVSCEDIRNRLKKDVQVVRVMPNTAIAIKQSMTCISVGNASQENIELVKNIFNTVGICVVINEELMTSATALCACGIAFFLRSIRAASQGGVEVGFHAGEALKMAAQTAKGAADLLLQLASHPEHEIDKVTSPKGCTIAGLNEMEHNGFSSAMIKGIKLSAQKAGELYDKD >NZ_CP043329.1|WP_149075072.1|2706156_2707011_-|acetylglutamate-kinase MGKNNPQDKLDHGSLSFGEGRGEALYIIKIGGNVIDNPIQLAQFLKDFAGLSGAKILIHGGGKIATQTAAKLGVQTQMVNGRRITDAAMLDVVTMVYGGLVNKNIVAQLQANQVNAIGMTGADANAIKAVKRPVKDVDFGFVGDLLPDAVNANIIKTLLEAGLVPVFNALTHDGNGQLFNTNADTIASALALGLSSLYETKLIYCFEKNGVMRDINDDNSVIQEINPSYFEELKADGIIADGMLPKLQNAFDAIQNGVKEVYIGHAAKLAALQKESIFGTRLTK >NZ_CP043329.1|WP_149075073.1|2707091_2708045_-|acetylornithine-carbamoyltransferase MKLFSSVKDVSDVNQLVSEAIQLKANPFADEHLGKHKTLGLIFLNPSLRTRLSTQKAAMNLGMQVMVMNMDKEGWALETQDGIIMNGTTVEHIREAAGVMGEYCDIIGIRSFPGLKDRNEDYSELIFNKFVQFCGVPVVSLESATRHPLQSLADLITIEELKTTAKPRVVLTWAPHVKPLPQAVANSFAEWMNKADYDFVITHPAGYDLAPEFVGNAIVTNNQDEALAGADFVYVKNWSSYQDYGKILSDGEGWMMTNEKLKLTNNAGVMHCLPVRRGLELSHEILDGPNSLVLNQANNRVWAAQAVLKMCLTQTLS >NZ_CP043329.1|WP_149075074.1|2708063_2708354_-|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MKFEIRWSDEAEVTFDAIYQFVSIQWNIKQAEKLRVQTLKVLEQIAVNPYLFKESEIKNVRKAFISKHTSLFYETSQQTILLVFFWDNRQNPMINI >NZ_CP043329.1|WP_026905351.1|2708350_2708548_-|hypothetical-protein MTVTYLVDEKGNKTAVQLSMEDYLSLLESANLLPDHVKEGIKRGQEQGKAGLTKSTEEVMRKYNV >NZ_CP043329.1|WP_149075075.1|2708585_2709719_-|aminotransferase-class-III-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MKLFDVYPINNIEIVKGQGSLVWDDKGQEYLDLYGGHAVISIGHTHPHYVERLTQQLGKLGFYSNSIKIPLQEELADKLGKISGREDYQLFLCNSGAEANENALKLASFANGRKKIVAFTKAFHGRTSLAVSATDNPKIIAPVNQTENVVFLPHNDVDALKTLFAEQGNEICAVIIEGIQGVGGIQVASDEFLQSIRSLCTQYGAYFIADSVQCGYGRSGKFYASDFAGVDADIYTMAKGMGNGFPIGGISISPALKPWHGMLGTTFGGNHLACAAALAVLEVMEQEHLMDNAAKIGGYLIQELQKLNHIKEVRGKGLMIGIDLPEELNQVKKNLLFNHHIFTGEAKPNVIRLLPALNLTREHADRFLEALSKELKA >NZ_CP043329.1|WP_039448824.1|2709761_2710115_-|four-helix-bundle-protein MQNYKDLRVWVKSHELTLKIYSVTKNFPKEEIYSVTSQIRRASSSIPANIAEGCGKNTKNDFGKYLNIALGSANETEYFLLLAKDLGYLPIEDYLILEKNINEVKAMLILLIQKVRA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP043329_7 | 3460927-3461018 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP043329_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP043329_7
>7.1|3460954|38|NZ_CP043329|CRISPRCasFinder GTTTAGGGACTGCCTTTTAAGTAGAAAGTACAGAGTAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043329_7
The CRISPR arrays of NZ_CP043329_7 >merge|NZ_CP043329|7|3460927-3461018|CRISPRCasFinder AAAGTAAAAAGATGCCTAAAAAGCGATGTTTAGGGACTGCCTTTTAAGTAGAAAGTACAGAGTACAAAGTATAAAGATGCCTAAAAAGCGAT >NZ_CP043329|7|5|3460927-3461018|CRISPRCasFinder AAAGTAAAAAGATGCCTAAAAAGCGAT GTTTAGGGACTGCCTTTTAAGTAGAAAGTACAGAGTAC AAAGTATAAAGATGCCTAAAAAGCGAT
>NZ_CP043329.1|WP_149075560.1|3458894_3460532_+|chaperonin-GroEL MAKQVKYNVEARDALKRGVDILANAVKVTLGPKGRNVIIDKKFGSPAITKDGVTVAKEIELKDALENMGAQMVKEVASKTADIAGDGTTTATVLAQAIVTAGIKNVAAGANPMDLKRGIDKAVTAVVANLKSQSQTVGEDNNKIKQVASISANNDDVIGSLIAEAMAKVGKDGVITVEEAKGTETEVKTVEGMQFDRGYLSPYFVTNADKMEVELDNPYILIYDKKISNMKELLPVLEKQVQTGKPLLIIAEDLDGEALATLVVNKIRGSLKVAAVKAPGFGDRRKAMLEDIAILTGGTVISEERGYKLENADLSYLGQAEKITVDKDNTTIINGVGNSEDIKARVNQIKAQIETTTSDYDKEKLQERLAKLAGGVAVLYVGAATEVEMKEKKDRVDDALHATRAAVEEGIVAGGGVAFIRAVESLEGLKGANEDETTGIKIIKRAIEEPLRQICANAGIEGSIVVHNVKQGKADYGYNARTDVYENLIGAGVIDPTKVSRVALENAASIAAMLLTTECVLADEAEEGSSSPAMPPMGGGMGGMM >NZ_CP043329.1|WP_149075559.1|3458454_3458730_+|co-chaperone-GroES MALNIKPIADRVVVEAAPAEEKTASGIYIPDTAKEKPQSGTVVAVGNGKVDEPMTVKVGDQVLYGKYSGTEITYEGKEYLIMRESDIYAVL >NZ_CP043329.1|WP_039454431.1|3457876_3458218_+|preprotein-translocase-subunit-SecG MTTFLIILAIVICVLLVLIILVQNPKGGGLSSGFSSSNNIMGVQRTGDFLEKGSWGLAIALMVIALLINVSSPSATTGSGPARDSKIQEQIDKTAAPSALPSLPQGKPADTAK >NZ_CP043329.1|WP_149075558.1|3456453_3457869_+|hypothetical-protein MEQLEYKHIKELKFSDYLFDLNQLDEGKLADLEILINKYPYCQTLYLLAAKTAQNTPNFTQKLAQAAAMLPDRTVLYHVIHHPDKLNKDYTVAASQEKEIQPEALVSIIEEDVTLPHALVDVPSETESETALEADSFNHDDEVYEEIADVVVEHISPADEEVKDEHDLNFDTSTPSEFIIEEETEEVVESAQEEAPNAIAEDVIESKEETATTEEVNLEPVFVEIETPDQNTLPFESIIRTGEVTVTTEQVPENDITEEEQPIVETVAAQEPYIENIAQEIEEPEHSTKSEQIKALQISQQKNYISKYDDERLPYTFLWWLAKTRKEYENIQPYASFKLDTSKEIAVKEDVLSHQIAENIFHLRTVDDLTHQQTQTVPFDFRRKEYQIIERFIKEEPQIKPPPANKIDTENKAKRSSEDSHELVSETLAKVYVEQMLYHKALEVYKKLSLKYPEKSTYFASQIKYLELKVN >NZ_CP043329.1|WP_039454430.1|3455903_3456416_+|LptE-family-protein MRKRAYILLCAMLMLLNACGIYSFTGGSISAGMKTVSVALFENNAPLVVPILSQSFTEALKDRIRTQTSLSFLRTNGDADFQGRITDYNIQPVAIQGDQQVSAGLNRLTITVQVKYTNTIEPDKSFEQSFTRFRDFSTQGSAFASQEQALIKDINAQLTEDIYNRAFANW >NZ_CP043329.1|WP_149075557.1|3454669_3455899_+|sigma-54-interacting-transcriptional-regulator MDIQEIKQRFGIIGASPLLHRAIDIARQVAPTDITVLITGESGSGKEVFSHIIHQLSARKHGPFIAVNCGAIPEGTIDSELFGHEKGSFTGAHEARKGYFEVVNGGTIFLDEVGELPLGTQARLLRVLESGEYIRVGSSKVQKTDVRVVAATNVEMYEAVKAGKFREDLYYRLNTVPLKIPPLRDRREDIHLLFRKFVADFSDKYRSPNVTLDEGAVQVLTNFNWPGNVRQLKNIAEQIAVLEKNRHITAQTLLSYIPQDQQSSLPMRLDNGKKEDFSERDILYKVLFDMKKDMVELKKLVADIIQSGDNVSSYAASHPQILNSLYQDLDVQHVEPQLTIQQPVVNRQDDFHITQDAEEIEESLSLIDKEADMIKKALKKHKGKRKSAAEELGISERTLYRKIKELNLN >NZ_CP043329.1|WP_149075556.1|3453008_3454544_+|tRNA-(N6-isopentenyl-adenosine(37)-C2)-methylthiotransferase-MiaB MLELNIPSKEHDEARQGEALVIEATKNNNGRKLYIESYGCAMNFSDSEIVASILADDGFVTTADFTEADIVFINTCSIRENAEVRVRNRLKQFSASKAKNPGMIVGVLGCMAERLKAKFLEEEKLVDVVVGPDAYRDLPNLINKVDDGNKAVNVLLSREETYADINPVRLNSNGISAFISIMRGCDNMCSFCVVPFTRGRERSRDAHSVVKEAQDLYAAGYREVTLLGQNVDSYKWKKPHPQSLSEGEVSAGDSLEALDNKVIIQEEPLDRSSLSFGEGGGEVVNFAQLLEMVALVSPDLRVRFSTSHPKDITDEVLHTIAKYDNICNYIHLPVQSGNSRVLEIMNRTYDRQWYMERVEAIRRIIPECSISTDIITGFCSETEEEHQDTLSMMDFVKYEFAYMFSYSERPGTPAAKKFKDDIPEEVKQRRLEEVIAKQQINSHYRAQRRIGKVEKVLIEGFSKKSKNDYCGRSDQNFMVIFPVGDAYKPGDYVNVLVEKTTTATLIGKVVE >NZ_CP043329.1|WP_149075555.1|3452477_3452867_-|hypothetical-protein MDTGPKPQKFLILKWLLGVFLVVILLLGVGAYYLNKQWKPLLTDALQKAVTDVSDSLYKVKFSDIRINVLTGSAYLDSIHIYPDTSVYNKLIAQKKAPENLFELKISNLGLKMSIHLKYILIENWIWMP >NZ_CP043329.1|WP_149075554.1|3451071_3452490_-|hypothetical-protein MDAITITRPELNIIYTRLKYPKKRLEDNRTTYQKIKHLLKSARVGSIFLNNIKFKYIDKSLSLNKPDITNLDNLNIRLNDILIDSAAQYDSTRIFTSKDIIAELKDYSYSTADSLYYIRLAKMQFSTLKKEFLVTQFRLIPRYSEMDFSNLFVKQHERYKISFDTISLKNINYPSLIDERLVSAQKVLLKNGDVSVFLNRGKAPKGIDKGKNFPHLALQRVNWSIHTDSVELNNTKIAYAEYNPKTGAKGTITFHQLRGYLLNVTNTEAFLAKNHFADAHLQTKLLGRGDLNIHIKFDLTDKLGAFSYKGSLGKMPIETINPITRPLAMVMIRSGTINSLDFSAKGNIRSASGFVKINYHDLSVTLMKKDEDNNLKKMGLISLVANALLLKQSNPSKNEALRVSYPTYSRPADGSFFNLMWKVIFMGLKESVGISKEQEEKITEKASKLKEAKIRREKRKAERQQRRRDKQD >NZ_CP043329.1|WP_149075553.1|3449765_3451070_-|serine-hydrolase MFKSIKYFSFIAALWLTSACSEQITDKLVASQNLKKLQIEGTNLERIDSLIGSALINNWTAGATALVAKNGEVIYDKGFGFKDRETKSLMRPTDIFRIASMSKPIISVATMILVEQGKLKLDDPVSKYIPEFKNPQVLASFNATDTTYTTVPANKEITIKHLLTHTSGIGYGFADSTLKKIYDKHDIPDLATVKNITIEQSMKKLGTLPLGVQPDAKFYYGLSTDVLGYVIEVASGKKLDFFLKEYIFSPIGMNSTYFFLPPESTYRLAAMYSETPEGRLIKTYPISGKFNINYPIRGAKTYLSGGSGLCSTVEDYALFLQMILNKGTYGGKRILKAETIELMSQNHIGDLQVGKNKFGLGFEIATEQGLANGAKVGKLSWSGAFNTMFWIDPQRNAIAVLMTQVYPAIHKREFYNKFETLVNDALDRGLKEKD >NZ_CP043329.1|WP_149075561.1|3462013_3463507_-|hypothetical-protein MVLSLAIDLGTTNLKVGLVNESGEIISIRSVAVPVKSNQKGEAEHDPEELKKLILGLCKELLVGDTKNQVAYIVSSTYQFGLMLLDAHKKPLTGITLLSDIRSQKTFDAFLESYSAFDIYAQTGCPLISPYVLARLFYFSTQEKDLFKKAQYFSDSKSFLFNWLTGEFTTDMSTAAASQAYNITNGTWDDTLLGHIGLEGKQFPEIKDGTSYLSSLQEDIRTELGLKQGVKVLLGVYDGAALAIGSGALQKGVGIMNVGTSAMLRVAGQIPAFDQDDNKRIQPYALNKQLFLNGGALNNAALPINWLRNSLFDVDLHDEAMLNLGTTAPLICLPYLTSERDSKTGPYASGVFFGLRQYHSKTDMARSVLEGVAYSMRYIFDALKENQLLITELRMGGGGTNIKPWVQIFANIMGLPIHIPSGDELGIVGSAMLAFAAEDKDKNINTIGSHGLGNNMTIYPDAAAVEVHHQRYQFFKKLRETLGPLYKEHAALANHPS >NZ_CP043329.1|WP_149075562.1|3463491_3464514_-|hydroxyacid-dehydrogenase MRRPLISILNSSTFGKHFADHMSTLEAFADIKHITVPADIDGDALAEYLKDADGIIASVTPKIPRATLEKCKNLVLLVRHGIGCDNVDLEAATELGIMVSRVKGIIEKEAVAEYAVSLLMAGSRKLVSGSRAVRNSDWSKRAGMIGMEIKGKTIGIIGLGNIGSRSSEILAKGFGANVVASDPYIAKERFAQFGAKEVSLDELIKTSSAILFHCPLTDETKRMLGKAQFDSMQKDAVLVNTCRGELVDEDALYAALQNGPLGVYATDVVEGEPIDGNHRLAKLENTIITPHLGGYSWESLHGMGQTCVDDAVSVFQNNGVAGELANPEVLQTKRRVWSSH >NZ_CP043329.1|WP_149075563.1|3464681_3465389_-|lipoyl(octanoyl)-transferase-LipB MKNNKVFFQDWGLVPYQQAWDKQEAVFAETVAIKTVNRNHPETAQQTPNYLIFVEHPHVYTLGKSGKAENLLLNEQALIEKEASFHKINRGGDITYHGPGQLVGYPILDLDNFFTDIHLYLRTLEEAVILTLKDYGITAGRYEGYTGVWLDADNEKARKICAMGVRCSRWVTMHGFAFNVNANLDYFKNIVPCGIDDKDVTSMQRELGKAIDMDEVKAKLKQHIANLFEMDLSNT >NZ_CP043329.1|WP_149075564.1|3465378_3466029_-|4'-phosphopantetheinyl-transferase-superfamily-protein MPLTFLEEIHPNTYIGLWKIEEEPAVLEKQLQLKDHEKEVLKGLNTQKRNLHWLATRVLLRKMLNTEEYIDCQPDENGKPVLLNMPHHISLSHSYDYAAVIISKDKRVGIDIEIIKDKITRVQQKFMSPQELSFMDEQYAIEHLYVCWCAKEALYKLNGKKETSFKDDIHLEEFPYQTKGVLKGSIHKEPLVKNYKIAYRKFEDYMLGYVYEEDEE >NZ_CP043329.1|WP_149075565.1|3466104_3466641_+|dCTP-deaminase MILSDQRILEEIEKGTIIIEPFKKECLGTNSYDVHLGKYLACYTDRILDAKKHNQIEHFEIPKEGFVLQPNTLYLGVTLEYTETHQHVPFLEGKSSTGRLGIDIHATAGKGDVGFCNTWTLEISVAQPVRIYAGMPIGQLIYFVVEGDIQTLYNTKGNAKYNNKTTRPVESMMWKNNF >NZ_CP043329.1|WP_149075566.1|3466716_3469422_+|TonB-dependent-receptor-plug-domain-containing-protein MRKFHFLFLLFIASIFVAFVAQDDKLKQVMANFNKFHTSHTQEKIYLHTDKPYYATGDQIWFKAYVVDAQTMRPSALSKIMYVDLINQKNQVKKTLRLPLTAGFGWGNIELADSLKEGNYRLRAYTNWMRNFDEAFFYNQTFKVGDIRSSQVITQTNYEFSKADGKELVVAKINFKNVDGFPYANREVEYTVELDGRQTERGKANTDDKGNVIINITNNKPEIIKSGMLSTALKISEGTLVNKFIPIISTSNQIDVQFFPEGGDMITQVRSRVAFKAVGSDGLGKAIKGYVQDNNGKRIANITSRYAGMGYFSIYPEANLTYEAVVTFDDGSEKKFPLPAVKPEGIVLSAIDRGQDSLLLRVQTNDAYSSTHLGKNFTVVAQSSGNIIYSAVAKLSKNGFAAYIPKVQFPTGIIQLTLFNDQMQPLSERLIFHAHTKDFLNIEVKPDKEVYTKRGKVNIAVTAKTNENNPMVSSLSMSVIDEGKVPVKPEEEHTILSELLLKSDLKGHIENPNYYFHEVDDKKKGDLDVLLMTQGWRRFNWQNLITNTLPSLAFKPEKTLSIAGTVTNNKKPVVNGNITVFSSSGGTFIIQAKTDEAGKFEIDSLLFPDSTKFVVQARTIKDRKFVEIVMDEFGKHPVQTPFAKSELSANINSSMAAYIKNSKSQYEELLKNGLITRSIMLDEISVIEKREKLQNSSNLNGGGNADRVITAEELQNAPNLEFALQGKVAGMMIQNGEIFFMRNMGGPPAQIILDGIFVEADFLNTIAPQDVESIEIMKPGALTSIYGSRGGSGVIVINTKRGGGNYTSTNTYTPGLIAYQPIGFTAMKQFYVPAYDKAETKKDMADFRSTIYWNPTVITDTTGNAKVNYFNADGTGTYRVVVEGLDIYGRLGRKVIRYKVN >NZ_CP043329.1|WP_149075567.1|3469425_3470196_+|enoyl-CoA-hydratase/isomerase-family-protein MNTLSVTIREKVAIIALNRGKSNAMNAELVKELKSLIKNIEQDDQILGAILTGKEGFFTAGLDLIELYAYDENQIKSFWVDFLDLVKTLTLFKKPLVAAISGHSPAGGCVMALCCDYRVMAEGKYIIGLNEVPVGIIVPDSIFHLYAFWLGQAKAYQSLLEGKLFSVDEAKQIGLLDATSDISSLMSHAQKKIQSYLQYDATTWQQSKLNLRKELIAKVSADQTSTLDIMLKQWWAPSTRSILKTIIENLKGGSEK >NZ_CP043329.1|WP_149075568.1|3470473_3471349_+|SDR-family-oxidoreductase MYNQPMLRDNALEGKTFVVTGGGTGLGKAMSTYLLELGAQVVITSRKLEVLQKTAQELEAKTGGKVLPLACDVRNAEQVDEVLAASLAAFGKVDGLLNNAAGNFISPTERLSANAFSTIIDIVLKGTVNCTLAFGKHWIKEKQAASILNIVTTYAFTGSGYVVPSACAKGGVLAMTKSLAAEWGRYQIRCNAIAPGPFPTKGAWERLLPGDMAKKFDFKNRVPLKRVGEHQELANLAAYLLSDFSNYINGEIITIDGGEWLQGAGQFNGLEMISPEMWDALEAMIRNTKGS >NZ_CP043329.1|WP_039454874.1|3471520_3471907_+|RidA-family-protein MTNRQNFTTGSPWEDIIGYCRAVKVGNTIEIAGTTMAKDADGNAITTLYGQTKAILEKLKSVLEDADASLENVVRTRMFLTDISQWEEAAKAHGEYFKDIKPVTTMVEVSKLIDPEILIEIEVTAILG >NZ_CP043329.1|WP_149075569.1|3474375_3477690_+|preprotein-translocase-subunit-SecA MLNFISKLFGSKSERDVKSLRPIVDKINEEFQKLAHISHDELRAKTSEFKQRIQESLSEINGKITDIKNTVEQNPELSLHEKTAYYDEVDRLEKERNKKLEATLLEILPEAFAVVKETAKRFTEHETIEVSATPFDRELAAKKANVVINGEKAIHHNSWIAAGTEVKWNMIHYDVQLIGGMVLHQGKIAEMATGEGKTLVGTLPIYLNALSGMGIHVVTVNDYLARRDSEWNGPLFEFHGLSVDCIDKHYPNSADRRKAYQADVVYGTNNEFGFDYLRDNMTRTPEELVQGKLHFAIVDEVDSVLIDDARTPLIISGPIPRGDQHEFYDLKPRIERLVNTQRNFITNVLNEAKKQINEGKTGVEEGGLALLRAYRGLPKNKALIKFLSEPGMRQVLTKAENYYMQDQNKEMHKADAELYFIIDEKNNQVELTEKGIELITASGEDPHFFVLPDVGTEIADIEKSTISNEQKANQKDELIRDYSIKSERIHSVNQLLKAYTLFEKDTEYIIDEGKVKIVDEQTGRIMDGRRYSDGLHQAIEAKENVKIEDATQTYATITLQNYFRMYHKLAGMTGTAVTEAGELWQIYKLDVVEIPTHRPTSRTDMQDKVYRTMREKYNAVAEEIVELTKAGRPVLVGTTSVEISELLSRMLKLRGIKHNVLNAKLHQKEADIVAEAGKSGTVTIATNMAGRGTDIKLGPGVKEAGGLAIVGTERHESRRVDRQLRGRSGRQGDPGSSQFFVSLEDNLMRLFGSERIANLMVKMGIEDGEVIQHSMITSSIERAQKKVEENNFGIRKRLLEYDDVMNSQRTVIYTKRKNALFGERLDLDIENMVVDVIDDIVTEYKDANNYEGFKLELIRIFAIDTAITHEEFTGSNINKLSDIIFEEATEAYKRKSDAIAQQAYPVLKEVLDTRGQAIESIIVPFTDGTHGIQVAAPLKKSVETQGKEVVKAFEKNVVLALIDDTWKEHLREMDDLKQSVQNAVYEQKDPLVVYKMEAFNLFKGMLAGVNKEVVSFLFKGIIPTNDGHAAPVQEARQAPQTDMRQMKVSKPELARESNGVPVDDTRELQRTQPVVRHEDKIGRNDPCPCGSGKKYKNCHGLSAS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP043329_3 | 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT | 1153020-1153053 | 34 | NZ_CP046705 | Nostoc sp. ATCC 53789 plasmid pNsp_b, complete sequence | 234311-234344 | 7 | 0.794 |
NZ_CP043329_3 | 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT | 1153020-1153053 | 34 | NZ_CP010386 | Enterobacter hormaechei subsp. xiangfangensis strain 34399 plasmid p34399-121.660kb, complete sequence | 23104-23137 | 8 | 0.765 |
NZ_CP043329_3 | 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT | 1153020-1153053 | 34 | NZ_AP014953 | Klebsiella oxytoca strain JKo3 plasmid pKO_JKo3_2, complete sequence | 93570-93603 | 8 | 0.765 |
NZ_CP043329_3 | 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT | 1153020-1153053 | 34 | NZ_CP027605 | UNVERIFIED_ORG: Enterobacter cloacae strain AR_0093 plasmid unnamed1, complete sequence | 66084-66117 | 8 | 0.765 |
NZ_CP043329_3 | 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT | 1153020-1153053 | 34 | NZ_CP013914 | Serratia fonticola strain GS2 plasmid pSF001, complete sequence | 106055-106088 | 9 | 0.735 |
NZ_CP043329_3 | 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT | 1153020-1153053 | 34 | NZ_CP022182 | Aeromonas salmonicida strain S68 plasmid pS68-1, complete sequence | 66349-66382 | 9 | 0.735 |
NZ_CP043329_3 | 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT | 1153020-1153053 | 34 | NC_003276 | Nostoc sp. PCC 7120 = FACHB-418 plasmid pCC7120alpha, complete sequence | 213967-214000 | 9 | 0.735 |
NZ_CP043329_3 | 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT | 1153020-1153053 | 34 | NZ_CP022177 | Aeromonas salmonicida strain S44 plasmid pS44-2, complete sequence | 14287-14320 | 9 | 0.735 |
NZ_CP043329_3 | 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT | 1153020-1153053 | 34 | NZ_CP017144 | Aeromonas salmonicida subsp. masoucida strain RFAS1 plasmid unnamed1, complete sequence | 50557-50590 | 9 | 0.735 |
NZ_CP043329_3 | 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT | 1153020-1153053 | 34 | NZ_CP022171 | Aeromonas salmonicida strain S121 plasmid pS121-2, complete sequence | 63733-63766 | 9 | 0.735 |
NZ_CP043329_3 | 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT | 1153020-1153053 | 34 | NZ_CP038909 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence | 43641-43674 | 9 | 0.735 |
NZ_CP043329_3 | 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT | 1153020-1153053 | 34 | MN693074 | Marine virus AFVG_25M380, complete genome | 540-573 | 9 | 0.735 |
NZ_CP043329_3 | 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT | 1153020-1153053 | 34 | KJ010489 | Enterococcus phage IME-EFm1, complete genome | 29393-29426 | 9 | 0.735 |
NZ_CP043329_3 | 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT | 1153020-1153053 | 34 | NZ_CP013914 | Serratia fonticola strain GS2 plasmid pSF001, complete sequence | 106062-106095 | 10 | 0.706 |
NZ_CP043329_3 | 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT | 1153020-1153053 | 34 | MK765621 | Tortoise microvirus 53 isolate 53_SP_156, complete genome | 3188-3221 | 10 | 0.706 |
NZ_CP043329_3 | 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT | 1153020-1153053 | 34 | MK765603 | Tortoise microvirus 51 isolate 51_SP_173, complete genome | 3188-3221 | 10 | 0.706 |
NZ_CP043329_3 | 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT | 1153020-1153053 | 34 | LC377538 | Staphylococcus aureus plasmid pNTUH_3874 NTUH_3874 DNA, complete sequence | 6598-6631 | 10 | 0.706 |
NZ_CP043329_3 | 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT | 1153020-1153053 | 34 | NZ_CP047806 | Staphylococcus aureus strain UP_1654 plasmid unnamed, complete sequence | 8279-8312 | 10 | 0.706 |
NZ_CP043329_3 | 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT | 1153020-1153053 | 34 | NZ_CP046705 | Nostoc sp. ATCC 53789 plasmid pNsp_b, complete sequence | 234318-234351 | 11 | 0.676 |
NZ_CP043329_3 | 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT | 1153020-1153053 | 34 | NZ_CP024792 | Nostoc flagelliforme CCNUN1 plasmid pNFSY07, complete sequence | 287654-287687 | 12 | 0.647 |
1. spacer 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT matches to NZ_CP046705 (Nostoc sp. ATCC 53789 plasmid pNsp_b, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
gaatttttacttttgaatttttaatttaataagc CRISPR spacer taatttttaatttttaatttttaattgattcacc Protospacer ******** **** *********** * * * *
2. spacer 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT matches to NZ_CP010386 (Enterobacter hormaechei subsp. xiangfangensis strain 34399 plasmid p34399-121.660kb, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
gaatttttacttttgaatttttaatttaataagc CRISPR spacer aaatatggttttttcgatttttaatttaataagc Protospacer .*** * .**** .******************
3. spacer 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT matches to NZ_AP014953 (Klebsiella oxytoca strain JKo3 plasmid pKO_JKo3_2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
gaatttttacttttgaatttttaatttaataagc CRISPR spacer aaatatggttttttcgatttttaatttaataagc Protospacer .*** * .**** .******************
4. spacer 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT matches to NZ_CP027605 (UNVERIFIED_ORG: Enterobacter cloacae strain AR_0093 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
gaatttttacttttgaatttttaatttaataagc CRISPR spacer aaatatggttttttcgatttttaatttaataagc Protospacer .*** * .**** .******************
5. spacer 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT matches to NZ_CP013914 (Serratia fonticola strain GS2 plasmid pSF001, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gaatttttacttttgaatttttaatttaataagc CRISPR spacer taatttttaatttttaatttttaatttttatcgt Protospacer ******** **** ************ *.
6. spacer 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT matches to NZ_CP022182 (Aeromonas salmonicida strain S68 plasmid pS68-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gaatttttacttttgaatttttaatttaataagc CRISPR spacer tgttttttaatttttaatttttaatttaaagtgg Protospacer . ****** **** ************** . *
7. spacer 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT matches to NC_003276 (Nostoc sp. PCC 7120 = FACHB-418 plasmid pCC7120alpha, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gaatttttacttttgaatttttaatttaataagc CRISPR spacer taattttgaattttgaatttttaattttgaattg Protospacer ****** * ***************** . *
8. spacer 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT matches to NZ_CP022177 (Aeromonas salmonicida strain S44 plasmid pS44-2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gaatttttacttttgaatttttaatttaataagc CRISPR spacer tgttttttaatttttaatttttaatttaaagtgg Protospacer . ****** **** ************** . *
9. spacer 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT matches to NZ_CP017144 (Aeromonas salmonicida subsp. masoucida strain RFAS1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gaatttttacttttgaatttttaatttaataagc CRISPR spacer tgttttttaatttttaatttttaatttaaagtgg Protospacer . ****** **** ************** . *
10. spacer 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT matches to NZ_CP022171 (Aeromonas salmonicida strain S121 plasmid pS121-2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gaatttttacttttgaatttttaatttaataagc CRISPR spacer tgttttttaatttttaatttttaatttaaagtgg Protospacer . ****** **** ************** . *
11. spacer 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gaatt---tttacttttgaatttttaatttaataagc CRISPR spacer ---ttcagtttatttttgaattttgaatttaatcgtt Protospacer ** ****.*********** ******** . .
12. spacer 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT matches to MN693074 (Marine virus AFVG_25M380, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gaatttttacttttgaatttttaa-------tttaataagc CRISPR spacer gaattttttattttgaatttttaacaggttcttt------- Protospacer ******** ************** ***
13. spacer 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT matches to KJ010489 (Enterococcus phage IME-EFm1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gaatttttacttttgaatttttaatttaataagc CRISPR spacer ttatttttccttttgattttttaattaatccatc Protospacer ****** ******* ********* * . * *
14. spacer 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT matches to NZ_CP013914 (Serratia fonticola strain GS2 plasmid pSF001, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
-------gaatttttacttttgaatttttaatttaataagc CRISPR spacer taatttttaatttttaatttttaatttttaattt------- Protospacer ******** **** ************
15. spacer 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT matches to MK765621 (Tortoise microvirus 53 isolate 53_SP_156, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gaatttttacttttgaatttttaatttaataagc CRISPR spacer atttttttatttttgattttttaattttttttgt Protospacer . ******.****** ********** * *.
16. spacer 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT matches to MK765603 (Tortoise microvirus 51 isolate 51_SP_173, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gaatttttacttttgaatttttaatttaataagc CRISPR spacer atttttttatttttgattttttaattttttttgt Protospacer . ******.****** ********** * *.
17. spacer 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT matches to LC377538 (Staphylococcus aureus plasmid pNTUH_3874 NTUH_3874 DNA, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gaatttttacttttgaatttttaatttaataagc CRISPR spacer cccctattacttatgaatttttaattgaatcaat Protospacer .* ****** ************* *** *..
18. spacer 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT matches to NZ_CP047806 (Staphylococcus aureus strain UP_1654 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gaatttttacttttgaatttttaatttaataagc CRISPR spacer cccctattacttatgaatttttaattgaatcaat Protospacer .* ****** ************* *** *..
19. spacer 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT matches to NZ_CP046705 (Nostoc sp. ATCC 53789 plasmid pNsp_b, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
-------gaatttttacttttgaatttttaatttaataagc CRISPR spacer ttttttttaatttttaatttttaatttttaattg------- Protospacer ******** **** ***********
20. spacer 3.4|1153020|34|NZ_CP043329|CRT matches to NZ_CP024792 (Nostoc flagelliforme CCNUN1 plasmid pNFSY07, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.647
gaatttttacttttgaatttttaatttaataagc CRISPR spacer taatttttaatttttaatttttaataccccgtag Protospacer ******** **** ********** . .. .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
2764703 : 2771617
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP043329|2764703:2771617|DBSCAN-SWA ATTACATGCCAAATCTTGATTTTAATACATTATAATTTTGTTGAATTTCTGAAGCTGTTAATTCGCGATTATAAATTCTAAGATTACCATATTGCATATTTCCGAGAAAACCTCCATTGTTCCAACTACATAATCTTAGGTTGTTGTTAAAACCAGGAATATTAGCATCAGTTCTTACTACCGGAGTTAGTACCCCCACATCAACACCGTCTATATAAATTTTATTTGTAGATAATAGGCCTGAACTTTTCATAACAAATGTATAATGGTGCCAATTACCCACTAAGTTTAAATTCGAAACTATAGCAGCCGATATTCCAACTACATTACCCCCTCCGGTATTATAACCGAGTGTTCCACTTTCAGTCCATACATCATAAGTAGTGAAACCAAAAAACATCCCTCCAGAGCCAGAAACCCATTTCACAAAACCCTCTATGGTTAGTATGGTTGCCGAGCCGAATGAATTAGAAGTGATATCGGCATAATCATTTACACCATCAAAAACTAAAGATCCACCATTTGAACTATTAAAGGCGACCCCATTAAATAAAGTACCATGATTACCGTTACCACTTAAATCTGTCCAAGTAATGCCATTTCCAGGGTATGATGACGTATTACCAGCATCTAGATTTACAATTAAACTGTTAGTAACCAAATTACTAGTGTTAATCTTAGATTGATAAAAGCTAAAAGGCATTACTTGCGAAAACCCTAATGAAGATGATAAGAATAGAAAGGAGAAGAAAGATGATTTAAGTTTTTTCATATTTAGAGTATTTTAATGCCGAATTTTAGTTTATAAATTAAGTTATCTAACCCAATACCATAAAATACCAGGATTGGGATTTGTTGTGCCCCCACCCGCATTATCTATCCAAGGAGTTGGAATCCAGCCAGTACAACGAGAAACTAAGGTTCCCCACCAATTGCCTCCGCCATTATCGGTAGTTATTTGTCCGCAATCATTTTGGTACCATGGCATTCTTTCGCTAATACCATTATCATTTATATAAGCCCAATTACCAAATTTGGTATTAATTGTAATGTTGGTTTGAGAATTATCGGTTTTCACAAAACTATAATTACCGTTAGCAGTCCAAATTGCACCATGGCTTCTTCTTGTTGTTGCATCAATCATGTATTGAAAGCCGGATGCACTTCTTTTGATAAAATCTGCCCAGCCAATGATAGAATAATTAGCTGTTGATGTACTGATGACATCTGCAGTATTAGTAAATGGCATAGATGTATTTAATGAAATTGCATTTTCATATGTCCAGCCAGCACTATTAGAATTCTTTAAAATCAAAGTCCAGCCACCACCATCAGTAGTCATATCTGCATAAATTTGAAATGGCGTATTACTATTGATATTTACATTCTTAATCCAATAAATACCATCTGTAGAACTTGGATAATCTCTCTTAATTTGAAAAGCACTGCTACCAGCTGTAGCACTTGTTTTACCATCGCCAAAGCCCGACGCATTATTTCTCTGAATAAAACTCATAGGCATAACCTGAGCATGTGCCAAAAAAGGAATAATTATTATAAAAAGTAGAACGTTTAATTTAAGATGGTTCATTTTTGCATATTTAAATTAAAGACCAAACCTTGATTTTAATGCATTATAATTTTGTTGAATTTCTAAATCCGTAAGTGTTCTATTGTAAATTCTAACTATAGCAATTCTTCCATTCAATCGGGAATTAACATCAGATCTAGTACCGCCAAAATTTAATACTCCGTATGGATTTTCATTTCCGGTTCCAGTATGTTTAGTTTGATTGATAAACAGATTAGCCCCCTTAGTAATACAGAACCTATACCAAGTATTTAGAGGAGGTTGTCCTACTGTGCCGTAACTTCTTCCTCCTAAACCATTACCATCAGTTCTAAACGATGAACCATTGAATGTGTAAGATCCTGCATTCCCATTGTAAGATAAGATATCTCTCTCTCCACTGCTCCGTGTATCATAAATCCAGATTTCTAAAGTAAAATTAGTGTAGGATGATAAATTTATACTTGATACAATATCATCAGCACCGTCTAATCTTAAATATCCCCCATTGCCACTATTGTAACTAACACCATTTTGAAGAGTTGCATGATTGCCATTACCACTTAAATCTGTCCAAGTTGTTCCAGTTCCAGAGTAAGATGCTGTATTACCTGCATCTAGGTTTACAACTAATCCAGAATTTATTATGGGGCCGTCAGCTATAGTAGCTTGTGGTGGTTTTCCTAAAAAACTTACTGGCACTACTTGTGCTTTTCCCAACCATGGAGTTATTAGAAAAAGAAATAAGATAGTTGATTTTAATTGTTTCATTGTGTAGTTTACTTAACTAATATCCAAACCTGGATTTAAGTGCTTCAAAATTGTCTAGGACTTGTTTTGCTGTTAAAACAATGGAGTAGGCTTGGGCAATGGCAATATTTCCTGCAAACTTTGGGTCGCCAGTAACATTTGCGTTATAAGCAATACCAATTTTAGAAGGTCCAGTTAAGGACCCCGTAGAGGTAGTAAAAGTTTTATCTAAAACACCATCAATATACAAATTAACCTCTCCAGAAGTAGCATTTCTAGTTACTGTAATATAATGCCATAAGTTATCATTGATAGATTTTGTGGTGTAGGATGTAATGTCGTTTGCTCCGTTTCCAAAACCTAATTTACCGTTACCCATTACTACTGCATAATCATTAGTACCGCCGGGCATCTCACCTCCAAAAATAGAATAAGCCGTATAAAATTGGCCTGATCCACCCCCAGTCTGACTGGTTTTAATCCAAGCTGCCCAAGTCATATTATCTTGTACTGGTCTGGCAAGAGAGAATCCATTCGTACCATTAAAATTGAAATAACTAGCTGCTCCATTAACTGTGAATGTAGGATTACTTGGATTACTATACATAGTTGCATTATAGGTAGTTCCTCCAGTACCTTTATTTATCCAAGTGGTTCCGGTACCTGCATAGCTGGTTATATCTCCCGCATCTAAATTTAAAATTAGGCTATTGGTAACAATTGAAGGCACAGCGTTTCTTTGTAAAAAACTTATAGGTACTACTTGTGCAGCTCCTAACAATGGGACTAGTAGAAAAAGAAATAAAATACTTGATTTAATATTTTTCATCGTATTAAATTTACAAACCGTATTTAGCCTTGTTAGCATTAAAATTTTGTAGAATTTCTGAGTCGGAGAGCGCTCTATTATAAACTAATATTTGGTAAATCTGTCCGTTTGGCCCCCAAACCTCGCTACCAGTTACTCTATGTCCAATTCTAGCTTCGGCTATACCAGTGTTTATGGAAGCAGAAACACCTGATCCCTGCGAAACACCATTTATCCAAAATTTATGCAGTGTATTAGCATGAGTATAAGTTACTGCAAAAAATAATTTGTTGCAGTAGCAACCGTGGCACCCTGCCCTGGGTATGTGGCCCATGTGTGTGAATTTAATTGGCCATTAGATAATGCTAATCCAAATGTTTGATTGTTAGACGTAGAGCCCCAATGTATAATGTGATTTAAAATAATAAAACTTGTTGGGGTTTTTACAAAAGCAATAATTGTTCTATCGCTAGTACCTATGGGTAGCTTTGATGGATTTAAGCTAACATATTGGCCAGAACCGTTAAAATTAAAATATCCACCATTACTTGAATTGAAAGTAACTCCGTCTATTAAAGTACCATGATTAGCAGTACCACTTAAATCTGTCCAAACAGTACCAGTGCCAAGGTAAGACGCTTGATTACCTGCTTCTAAATGCAAAACCAATCCATTAGTATATGGAGCTTTTGGTATATAGGAGTTATTACTTCGAAATAAGCTTTGTTGGGCTTGTAAGTTTAAGTTAAACACTAAACAAACTAGAAGGGTTAATTTAAATTTCATGGCTGTTATATTATTAAAAAATAACTTCTATACTTAAACTAATCGATAACTTTTTACTATAAAATTGCCCATCTCTAATGATGTAGGATGGGCAATTTGTTTTTAATCTTAATATTTGTTAGCTGTAATTATTAAGATTTCCATTAGAAATTTTGCAAAATAGCTGCGTAATACGTTGTGCCATCATAAATAATGGTTACAATATCAGTTTTACTAGCCCCAGTTGTTATTGTAGGTATAGTACCCCGCTCCATTTCCAATTTGCAGGAAAAGTTACTGTTTTAGAACCAGTTCCGTCTTGTGTAAACTCTATAATGTAAGTTCCGGGAGTTGGATTTGTAAAAGACAGCGTACTAATATTAGTCCCTAAAGTAACTTGAAATAAGTTTCCATCAGATAAATTAAGCGTTGTTGTTGCCGCCGCTGCAACAGTTGGCGCTGTAATGGTATATTTTTTGGCTGTTACGCTACCTGCAACACCTACACCACCATTAACTACTAATGCTCCTGTGGTAGTACTAGTTGAAGCTGTTGTAGGTAAGACTGATACTTTACCAGGCGCAATTTCAAAAATTGAAGGCGCAACATTATTTGCAGTAGCTATACGGAATTTTAGAGTTGATATACGAGCTGGATTAGTAGTACCCTCATCTGGGAAATCATTAAACATCCCTGTATTTCTTGCCCAATCACCTCCTATAAAAGAGAATCCAACTGCCTCATTGTAAGTACTTCCAGCTGCGGCTCTCATTGCAGTCGCTGTTGGCGCCGCCCAAGTAGGCAAACCGCTGGCTAGGGTTAATACTTGTCCATCTGACCCTTTCCCTAATCTTGTTCCTGTACCGCTGGTTCCACCATAGATGATATCGCCTGAAGCAGTCATCGGAGATAAAGCATCAAAAGCAGCCGCTTTAGTAGTTGCATTAGTACCACCATTAGCGATTGATAATGTACCAGTAACACCAGTAGCTAAATTTGTTGCGGCTGCAGCAGGTGCTGCAGTACCATATCCTTGCCCAACATTCCAATAGTATGTAGAGCCATTATAATAAAAACTAACAATATCTACAGCATTACCTGCCGTTGATAAACCAACAGTAGTTGTTGAAGTAGAGCCTAATACTCTATGTGTACCTGAAGGTAATGTTAGAGTAGCGCCACCGCCTGCAGGTTGTGTTACTACTAATGTACCATAGGTACCGCTTGCTGGTGCAGAACTAAAAGCTAAAGTGCTATTTCCTGTTAATGTTACCGAAGCATTTAACCCTTTAGCTGGATCCCATGTAATGGTAGAGCCTGAAGGACTTATTGGGTTTGGCGTTGAAGCATAAATAGGTGAAGTAACCGTTCCGGTAAAGGTTGGTGAAGCTAATGGTGCTTTTGCATCTAAAGCAGTTTGAGTAGCCGTTGAAATTGGTTTACTTAAATCTGTAGTATTATCTACATTACCTAAACCTACCATGGTTTTTGTTATACCTGATACTGTTCCAGTAAAAGTTGGTGAAGCTAATGGCGCTTTTAAAGCTAAGTCTGTATTTGATGCTTTTGCATCTAATGCTGTTTGAGTAGCTGTTGAAATCGGTTTACTTAAATCTGTAGTATTATCTACATTACCTAAACCTACCATAGTTTTTGTGATACCTGATACTGTTCCAGTAAAGGTTGGTGAGGCTAATGGTGCTTTTAAAGCTAAAGCAGGTACTGTTGGAGATTCTGCACTTCCTGCTAAATCACCTGTTAGTTTAATAATGCCTTTAGTAGAACCATCAGCAGTTGGCACCCCTCCTGATGTAAAAGAATTATCTACATACTGTTTAATCGCTTTTACAGTTGGGTATTTATCATCAGAACTAGCATCCTCTGTAATATCGGTTGATTTATTCGATTTATCTTCTTTAGTTAACTCTGCTGCTTTTGCTCTATTCTCTTCAGCCACAATTGCATCGGCATTAGCTTGCTCTGCAGCTCTTGTTATTTCATTTGAAATTGCAGTTGAATTATCAGACTCCGCCAATTTAGCTCTAGTTTCTTCAGCTGCAATTGCATCGGCATTAGCCTGCTCTGCAGCTTTTGCTCTTGTTATTTCATTTGAAATTGCAGTTGCATTAACTTCTAAACCAGGTACCTTTGGTAAATCTGCAGTTCCACCTAAATCTCCCGCTAATTGTATTTTGCCTTTAACTGCAACACTAGCATCCGCTAAAATAGATCCATCAGCACCAGCTGGGCCTTGTGGCCCGATAGGTCCTGCTGGACCAGTTTCCCCTGTTTCTCCTTTGTCTCCTTTTAATCCTTGTGCACCGGCTACTCCATCTGCACCTGCTGGACCTTGCGGACCTGCTGGACCAGTTGCTCCTGTTTCTCCCTTATCTCCTTTCAATCCTTGTGGACCTTGTAGACCGATAGGGCCAGCTGGACCTTGAGGGCCTGTATCTCCTTTTATACCACTTCCTACTGAAGCGAAGGTATTATCTACATAACTTTTAACAGCTTTTTGTGTTGGATACAATACATCGCTTGTTCCTAAAGCAATAGACGAAGACTTATTAGCTATATTCTCTTTAGTATCTAGAGCAGTTTTTGTTGCATTACTTACAGGTTTATTTGCATCACTGGTATTATCAACATTACCTAAACCTACTTTTGATGGACTTATTCCAGATGCTATTTTAACATCTGTTATGGCTCCATCAGCTAATTTAACTGTCGTGATATTTCCATCACTTACTGATGCATTTTCTGAGAATAGCGCATAAGGAACAGACATAAAGGGCTGCTCACTAATCTTCGTATAAGAAGCACATGCTCCTGTAGTATTTAAGCTTACTACCAATTTCTTGTTTCCTAAAGACCAGCGGATTTTATCAAATGCCGATGCATAACCTCCAGTTTTAGTTCCTGTTCCAATCATCAGGTTAACCATACCAAACATATCTGTTGTTGTTTGTATAGATTCTTGATATTCTACTTGTGATGATCCATCAACAATCTCAAAAAGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP043329|2764703:2771617|2768100_2768616_-|WP_149075113.1|DBSCAN-SWA MKFKLTLLVCLVFNLNLQAQQSLFRSNNSYIPKAPYTNGLVLHLEAGNQASYLGTGTVWTDLSGTANHGTLIDGVTFNSSNGGYFNFNGSGQYVSLNPSKLPIGTSDRTIIAFVKTPTSFIILNHIIHWGSTSNNQTFGLALSNGQLNSHTWATYPGQGATVATATNYFLQ >NZ_CP043329|2764703:2771617|2768842_2771617_-|WP_168199483.1|DBSCAN-SWA MLFEIVDGSSQVEYQESIQTTTDMFGMVNLMIGTGTKTGGYASAFDKIRWSLGNKKLVVSLNTTGACASYTKISEQPFMSVPYALFSENASVSDGNITTVKLADGAITDVKIASGISPSKVGLGNVDNTSDANKPVSNATKTALDTKENIANKSSSIALGTSDVLYPTQKAVKSYVDNTFASVGSGIKGDTGPQGPAGPIGLQGPQGLKGDKGETGATGPAGPQGPAGADGVAGAQGLKGDKGETGETGPAGPIGPQGPAGADGSILADASVAVKGKIQLAGDLGGTADLPKVPGLEVNATAISNEITRAKAAEQANADAIAAEETRAKLAESDNSTAISNEITRAAEQANADAIVAEENRAKAAELTKEDKSNKSTDITEDASSDDKYPTVKAIKQYVDNSFTSGGVPTADGSTKGIIKLTGDLAGSAESPTVPALALKAPLASPTFTGTVSGITKTMVGLGNVDNTTDLSKPISTATQTALDAKASNTDLALKAPLASPTFTGTVSGITKTMVGLGNVDNTTDLSKPISTATQTALDAKAPLASPTFTGTVTSPIYASTPNPISPSGSTITWDPAKGLNASVTLTGNSTLAFSSAPASGTYGTLVVTQPAGGGATLTLPSGTHRVLGSTSTTTVGLSTAGNAVDIVSFYYNGSTYYWNVGQGYGTAAPAAAATNLATGVTGTLSIANGGTNATTKAAAFDALSPMTASGDIIYGGTSGTGTRLGKGSDGQVLTLASGLPTWAAPTATAMRAAAGSTYNEAVGFSFIGGDWARNTGMFNDFPDEGTTNPARISTLKFRIATANNVAPSIFEIAPGKVSVLPTTASTSTTTGALVVNGGVGVAGSVTAKKYTITAPTVAAAATTTLNLSDGNLFQVTLGTNISTLSFTNPTPGTYIIEFTQDGTGSKTVTFPANWKWSGVLYLQ >NZ_CP043329|2764703:2771617|2764703_2765474_-|WP_149075109.1|DBSCAN-SWA MKKLKSSFFSFLFLSSSLGFSQVMPFSFYQSKINTSNLVTNSLIVNLDAGNTSSYPGNGITWTDLSGNGNHGTLFNGVAFNSSNGGSLVFDGVNDYADITSNSFGSATILTIEGFVKWVSGSGGMFFGFTTYDVWTESGTLGYNTGGGNVVGISAAIVSNLNLVGNWHHYTFVMKSSGLLSTNKIYIDGVDVGVLTPVVRTDANIPGFNNNLRLCSWNNGGFLGNMQYGNLRIYNRELTASEIQQNYNVLKSRFGM >NZ_CP043329|2764703:2771617|2765516_2766293_-|WP_039454896.1|DBSCAN-SWA MNHLKLNVLLFIIIIPFLAHAQVMPMSFIQRNNASGFGDGKTSATAGSSAFQIKRDYPSSTDGIYWIKNVNINSNTPFQIYADMTTDGGGWTLILKNSNSAGWTYENAISLNTSMPFTNTADVISTSTANYSIIGWADFIKRSASGFQYMIDATTRRSHGAIWTANGNYSFVKTDNSQTNITINTKFGNWAYINDNGISERMPWYQNDCGQITTDNGGGNWWGTLVSRCTGWIPTPWIDNAGGGTTNPNPGILWYWVR >NZ_CP043329|2764703:2771617|2766308_2767043_-|WP_149075110.1|DBSCAN-SWA MKQLKSTILFLFLITPWLGKAQVVPVSFLGKPPQATIADGPIINSGLVVNLDAGNTASYSGTGTTWTDLSGNGNHATLQNGVSYNSGNGGYLRLDGADDIVSSINLSSYTNFTLEIWIYDTRSSGERDILSYNGNAGSYTFNGSSFRTDGNGLGGRSYGTVGQPPLNTWYRFCITKGANLFINQTKHTGTGNENPYGVLNFGGTRSDVNSRLNGRIAIVRIYNRTLTDLEIQQNYNALKSRFGL >NZ_CP043329|2764703:2771617|2767059_2767851_-|WP_168199439.1|DBSCAN-SWA MKNIKSSILFLFLLVPLLGAAQVVPISFLQRNAVPSIVTNSLILNLDAGDITSYAGTGTTWINKGTGGTTYNATMYSNPSNPTFTVNGAASYFNFNGTNGFSLARPVQDNMTWAAWIKTSQTGGGSGQFYTAYSIFGGEMPGGTNDYAVVMGNGKLGFGNGANDITSYTTKSINDNLWHYITVTRNATSGEVNLYIDGVLDKTFTTSTGSLTGPSKIGIAYNANVTGDPKFAGNIAIAQAYSIVLTAKQVLDNFEALKSRFGY >NZ_CP043329|2764703:2771617|2767861_2768164_-|WP_149075112.1|DBSCAN-SWA MGHIPRAGCHGCYCNKLFFAVTYTHANTLHKFWINGVSQGSGVSASINTGIAEARIGHRVTGSEVWGPNGQIYQILVYNRALSDSEILQNFNANKAKYGL |
7 | Synechococcus_phage(83.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
3254254 : 3331404
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP043329|3254254:3331404|DBSCAN-SWA ATTAATCATCTTTTTTAAAGCCCCCGAACACCATTTTAATAACAGCCAGAACCAAAGCAAATAATAAAGCCGATAAAAAGCCAGAAGTATTAAAGCTAGTCATCACTTCATCAACCAGTAAAACCATTAAAACGGTAATGATGAAAGACATCAGCCCCAGCGTAAGAAAATTAATGGGGAAAGTAAAAATCCTTAAGATAAAACCAATAGTAGCATTAGCTAAAGCGATTAATATACCAGCTAAAACCGCTGATAAATAACCATCCACACTCACTCCTGGAATTAAAAATGCAGCAATAGCTACCGCTAAGCCCATCAATAAAATTTCTATTATTAAACTCATCACAAAAGATTTTAATCCTAATCTAACAAAATTTAAGCCATTTGGGTAGGTTTTTAGTGATTAGTTGGTTAGGTTGTTAGTCAATAGTTGGTTAGTTGGTTAGTTTGTTAGTGATTAGTTGGTTAGGTTGTTAGTCAATAGTTGGGTAGGCCCGATAGCTATCGGGAGTTGGTCCTAAATATGGGTCAAAGGATTTCTAGTAAATGAGATGTGATTTTAATATGTCCACTGTTAGCCTTTTTACTTCCGCTTTTCGCTTTCCGCCTTTAATCAAGCCACTTGATAATCAAAATTTTAAAATCTGAAAAATTTTATTACATTTGCAGTGTTGAAAAAAGAGGGGGCTAATATTGTCCCCTCTTTTCATTTATCCAAAAACTATTGTCATGGGTGTTGAACAGAGAGTTAGAGCTTTAGCAGAAGAAAAAATAGCAGACAGACCTGATTTATTTATTGTTGAAATTAAAGTCATCAATAACACCAAAGTTATTATTCTTTTAGATGGCGATAATGGTGTAGGAATACACGATTGCGCTTTGGTAAGCAGACACGTTGGTTACCATTTAGAAGAAGAAAATTTGCTAGACCACGCCTACAATTTAGAAGTAAGTTCGCCTGGTTTAGATACACCTTTAATTTTGGATAGGCAGTTTGCTAAAAACATAGGTAGAAATGTAACCGTAAAACACCTTAACGGTGATAAAGTGGAAGGCACTTTACTATCGGCAGATGAAGAAAGCATAACGGTAGCACATCAAGTAAAAGCTAAAGGTGCAAAAACCAAAAAAGCAGAACTTGTAGAAAGTAAAATTTTAAAAAATAGTATCGCTGAAGTAAAAGTAAGCGTATCTTTTAAATAGTAGCATTAATAAAATATTGATGAGAATAAAATGAATAGCATTAACTTAATTGATTCATTTCAGGAGTTTAAAGACTTCAAAAATATCGACAGACCAACCGTTATCAGCGTGTTGGAAGAAGTGTTTCGCAGTATGCTGCGTAAGCGTTTTGGTACCGATGAGAATTGTGATGTGATTGTGAATCCTGATAATGGGGATTTGGAGATTTGGAGAACTAGAACCGTTATGGAAGATGGTTTCTCTGAAGATGATGACCTGGAAATAGAATTGGCAGATGCACATAAAATTGATGCTGATTTAGAAGTTGGTGATGATTTTATCGAGCAAATCACTTTAGAAAGCTTTGGAAGAAGAGCTATTTTAGCTGCTCGTCAGACTTTAGTATCTAAAATTTTAGAATTAGAGAAAGATGAGATCTTCAAAAACTATAAAGATAGAATTGGTGAGATTGTAACTGGCGAGGTTTATCAGGTTTGGAAAAAAGAAACTTTAGTTTTGGATGATGAGGGTAACGAGTTGATTTTACCTAAAACAGAACAAATTCCTGCAGATTATTTCAAAAAAGGCGATACCGTTAGAGCGGTAGTGCTTAAAGTTGAAATGTTAAACAGCAATCCAAGAATCATCATTTCAAGAACAGCTCCTGCATTCTTACAAAGATTATTTGAGCTTGAAGTTCCTGAGATTTTTGATGGCTTAATTACCATTAAAAACATCGTTCGCGAGCCAGGAGAAAGAGCAAAAGTTGCAGTAGAATCTTATGATGACCGTATAGATCCAGTAGGAGCTTGCGTAGGTATGAAAGGTTCTCGTATACATGGTATTGTTCGTGAATTGAAAAACGAAAATATCGATGTTATCAACTTCACCAATAACATCTCTTTATACATCCAAAGAGCTTTATCGCCAGCAAAAATATCATCTATTAAATTAGATGACGAAACCATGAGAGCAGCCGTTTACTTGAAACCAGACCAGGTTTCTTTAGCTATCGGACGTGGCGGACATAACATAAAATTGGCAGGTAAATTGACGGGCTACGAAATAGATGTTTACCGCGAATCATCAGAAGAAGACGAAGACGTAGACTTAGAAGAATTCTCTGATGAAATTGACGGCTGGATTATAGACGAATTTAGAAAAGTTGGTTTAGATACAGCTAAGAGTGTATTAGCACTTAATGTAAATGAATTAGTGAAACGTACTGATTTAGAAGAGGAAACTATCGAAGAAGTACTAGAAATTTTAAGAGCAGAGTTCGAATAATTTTAGATTTGCATTAAGTAAACGTACTTTTGTTTTAAAATTAGAATAGAAAGATCATAATAGATGTCAGAAGACAAAAAGTTAGGAATATTAAAAGTTGCAAAAGAACTAAACATCGGTATTGGTACGATAGCTGATTTTTTAGGTACTAAAGGTTTCTCTGTAGAAGCCAAACCTAATACAAAGCTAACCGATGAGATGTACGGAGCTCTTTTAAAAGAATATCAGGGAGATAAAATCCTGAGAGAAGAAGCTAAAAACATTGTTATTGGCAAGATCCGTCGTGATGACGCTACTCAGGTGAATGAAAAACCAGAATCTACTGAAAGACAAGAATCTCAGGACTCAGACAATGAAATCCTGATAAAGAATACAGGTTCAGCAGTTCCGGTTTCACAAGAGACTGAGAAAGTAGAAGCTCCAAAAGCGGAGCCTGCGCCAAATACTGGCGGTGTAAAAATTATTGGTAAAATAGACCTTGATAGTTTAAATTCTAAAACTCGTCCTGACAAGAGGAAAGAAGAAGTAAAACCGCAGGCAGCGGCACCTCAAGAAGTTAAAAAACCTGATGCACCACAACCAGTACCGGCTCCAGAGCCAGTTGCTGAGGTTGTAAAACCTGTTTTAGAAGTTAAACCAGAGCCTAAAGTTGAGGTTAAAGCAGAACCAGTTGCAGAGCTTGTAAAACCTGTGGAAGAGGTTAAACCAGAGCCCAACGTGGAGGTTAAACCAGAGCCTAAAGCAGAAGTTAAACCAGAGCCAGTTGCTCCTAAGGCAGAAGAAATTAAACCAGAGCTTAAAGCTGAGGTTAAACCAGAGCCAGTTATAGAGCCTGTAAAGCCTGCTCAAGAAGAGCCTGTTGATGATGAAGTAATTAGAGCTAAAGCTCAGCAATTAAGCGGACCTAAAATTATTGGTAAAATACAACTACCTGTTAATAAGAAAAAAGATCAGCCTGTTGCATCTTCATCAAACCCTAACACGGCAGATAATAAGAGAAAACGTAAGCGTAAGCCTGCACCAGGTGGCCAGCAAAATAGGCCAGGTGGCGGCGCTCCAAATACCAACCCAGGAGGAGGGCAACCTGCTACGGGTGGTGGTTACCAAGGTAACCGTCCACAAGGTGGAGGCCCAGGACAGGGAGGTCAGAACAGACCTGCTTCAGGCGGACAAGATAATAAAGGCGGAAGACCACCACACAAAAGAGGTCAGCCTTTACCACCTAAGGTAGAGCCTACAGAAAAGGAAATCCAAGACCAAATTAAAGCTACTTTAGCCCGTTTAAGCGGTGCCGGTAAATCTGGTAAGTTTGCACAACGTTCTAAATTGCGTGGGCAGAAGAGAGATAGAGCATCAGCAAATGCCGAAGAAGCAGCATTAGAACAAGAATTACAATCTAAATATTGAAAGTAACAGAATTTGTTACTGCCAATGAGTTAGCTAACATGATGGATGTTTCTGTTACAGAAGTTATCTCTACATGTATGAGCTTAGGAATGTTTGTATCTATTAACCAAAGGTTAGATGCAGAAGCCTTAACCATTGTTGCTGATGAGTTTGGATATGAAGTTCAGTTTGTAAGTGCAGAGGAAGAAGAGTTTAATTTAGAAGAAGAAGATACAGAAGAAGCCTTAATCCCTCGTTCTCCAATTGTTACCGTAATGGGTCACGTAGACCACGGTAAAACATCTTTGTTAGACTTTGTGCGTAAAGCCAATGTTATTGCAGGTGAAGCCGGTGGTATTACGCAGCACATTGGTGCATACGAAGTAGTAGTAGAGGGCGATAAGAAAATTACTTTCTTAGATACACCGGGTCACGAAGCGTTTACCGCAATGAGGGCTCGTGGTGCTAAAGTAACAGACGTAGCTATTATTGTAATTGCTGCGGATGATAGCGTGATGCCTCAAACCATTGAAGCAATAAACCATGCACAAGCGGCAAGTCTTCCAATTGTATTTGCGTTTAATAAAATAGATAAGCCAGGTGCTAATACCGATAAGATAAGAGAACAACTAGCTGCTATGAATATTTTAGTAGAAGAATGGGGTGGTAAATACCAAACTCAGGAAATTTCTGCTAAATCTGGCTTAAACATAGATAAGCTATTAGAAAAAGTATTGTTAGAGGCAGAATTATTAGACTTAAAAGCTAATCCTAATAAGAGAGCTGTAGGTACAGTAATTGAAGCACAATTAGATAAAGGTAGAGGTTATGTAGCTACAGTTTTAGTAGAAGCAGGTACTTTAAGAGTTGGAGATCCGATATTAGCAGGTTCTTACAGCGGACGTGTTAAAGCGTTATATAATGAGCGTGGTAATCGTGTAGAAAAAGCTGGTCCAGCGGCACCAGTTCAAGTATTAGGTTTCCAAGGTGCACCACAAGCAGGTGATAAGTTTAACGGTGTAGAAAGCGAACCAGAAGCTCGTGATATTGCAAACAAACGTTTACAATTACAACGTGAGCAAGGTTTAAGAACCCAGAAACACATTACACTGGATGAAATTGGTCGTCGTTTAGCTATTGGTAAC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58 | Acidithiobacillus_phage(36.36%) | tRNA,holin,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
3386789 : 3444875
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP043329|3386789:3444875|DBSCAN-SWA AATGAATACACATATATATTCTTTAAACCCAACTTGTACCCAACCCAGAGGTGTAGGCAAATCTGTAAAAGATAAATGGTATGTCTATTTCTATTATACTAATAGCAATGGAATAAGAAAATCCTTTAAAAGTTATAAAGACCTAAACAATAAAAATCAAGATTTAAATCAGCGTAGAAAGTTATTAGCAGAAACCGTAGCAAAATTTGATGAATTGCTGAAAACCAAAAAATTTGATATTGAAACTGGAATATTTATAAAAACAGTATCAGAACAAGTATTAATAAATAATCTAATTGAAGATTACCTAAAATTCAAAAAAGCCATTATAAGCCACTACACCTATTTAAATTATAACTCCTTATTTGAAAGATTCAAACTATCTGCTAAAGGATTAACCCTCTCCCAGATAGACCAACAGTTTATTAAAGACTTTCTGAAGAAAACTCCTGCTAAACCACAATCAAAAAGAAGTTATAGAACCTATGTATCAGGTTTTTTTAATTGGTTAAAAGATGAAAAGGATATTAATATCATTAATCCTACACATGGTTTAAGGTTAGACAGGAATGAACCTGTAGAAAGGCATAAAATCTATTCTAAAGAAGAAATTAAAGCCATTATAGACTACTGTGATGCCAATGGTCATGTTATCCTCAAAACAATTATTTATTTAGTATACGGAGCTCAAATGAGGATTTCAGAGATACTAAGAATTCAGGTAGAAGATATAAATCTGGACTATAATAAAATTGTGCTTCCTAAAGGTAAAGGCAAGATTAAAAATAGGGAAAAGATTGTTCTGCTGGATGAGCCATTAAAAGTTTACCTCTTAAATATGGGACTTGATTTTAAGGATAAGGATAACCAGAAATTATATTTTATTGGTCAAAAGAGAGCTTATGATAAAGCCAAATTTTTTGGAAGATATCCTATTTCTAAAAACACCATTGATACCAGATTTAAACTGCTTAAAAAAGATCTTAATATTAGCCTGCATAAGACGCTTTACAGCTTTAAACATACTGGTAATGTTAATCTTTTGCTAAGTGGAGCAGACCTTATAGAATTGATGTATAAGAACGGACATAAGAAGATATCACAGACAGAAACTTATGCTAGACAGTTGATAGAACAAGTGCCAGAGACTAAATATATTAGGAAAAGTAGGGATGATCTAGATTTTAAGTAATTTAGGACCTAATTTCATTTATGATAAGTAAAATTAAACACCTACTTATATTTTTTTTAGCAGTATTTATTAGCTCTTGTAATCAAAAAAGTAAATCTGAAGAAATAGAGGAACTTGTAATTTTTGGAAATTCTGGCTTCTGTCTAAAAGATAATAACGGGAACTCTTATTCTTCTACTTACTGGATTGATTGTGATTCATGTGATACTAAAGACCTGAAATACGATTCAACTAAACTGGATATAAGGTTATATTTTGAATACAAAAAGGATGATCATACCAAAACTTCTATTAGAAAGCCTGAAAGTACAACTGAATATTACATATTATCAGAACAAGAGACTCAAGGGTTTAAGAGTTTAATTAATTCTACTCTTCTTAGTAATAACCTGAGTTCGATTAATCAAAAAGCTAAGATTTGATTAGAATTAGCATTTTGATATTTAATTGAAGGTTTTTTAGGAAAAAAAGAATAGGCAATTAATGCGGCAATCATGTTGGATATAAAATTTGTAAAAGACCTATGTCTTGAATGCTCAATTTGGCAAATGTTTTTTAGTTCATCGTTTACCGTTTCTATTACTGATCTTTTTCTAAGAGTAATCTTATCATTCATAGTCATTAAGCTGTTTTTCATATTGTTACGAATGCTCGTAATTAGATGTATATCATTGACAAACAATATATTGGCTAGTTTCTCAGAAATATATCCCTTATCTGCGAATAGTTTTCCAAATACTGATTTCAGGAAGTTTTCATTTTTGAGCGGATCTCTGTCATCAACATTTGCCTGTGTAATTGCAAAGTTTAAAATTTCTCCTTTATCGTTGATTACAATGTGGAGCTTAAATCCATAAAACCAGCCCATTGTAGATTTACCTACCTCTGCAATGCCCTTAAATACCTTATTCCGTTTTATTCGCTTATTGTTACATACCCTAACTGGGGTTGAATCTACAAATGAAATACCGCTACAAATACCTAAACAGCAGGTCTTCAAAAATATGGTCATCGGCATAAGTATGCTTTGGCTAAGCTCAACAAAGCGATTATAAGAAACCGTTTTTGGAAATTCGGACTGCATGTGTCGTTGAATATAAAACAGATAAAAGTGCTTAAAGCACCTGAAACCACTAAGATGAAAGAATAGGCAAATCGATATAACCTCACTCTTGGACATCACTGGTGGTCGCTTAGAAGCTTTTCCCAGTAGAAAGGAATGTGTATTGTTATCGAAATCTTTGCAAAATTCATCCACAAGACAAAAAATATCGCTAATTTTAGAGTAGTCAATCATATATAATTATAGTTAAGTATTTGATTTTAAGACACTTAAATATAACTATTTTTATTATGATTGACTAATTTATTTTAAAATATTAATCGAACTCAGGTTAATAAGTACAAAAATAAATATGCTCCCATAAAACCTATAGTTTATGATGGATGGACATATACTTTGTATTTTAAAACTTCTAAGGGAACGGAAAAGGTTATAAACTACATTCCTAACTATTTACCTGATTCCTTAAAAACTTTGCATGACACATTAAGAGAAATAACACTTAAGCAATCTAAGGTAACCTCTGATAGTTTTAAATATCATGAAATTGTTAATGATGAGTCTATAAAACAATATGTTAGTAATCCACCTCCTGTCTTACCTATAAAAGAACAAATTAAGTTCCCACTAGACAAATAGATAGATAAACGTTACAAATTTTAAATTACAATTAGAAATTACCTGGATTTTAAATAATTCAGGTATTTCTATTTACAGGTTATGCTGTATTATGCTTTACTACTTTGATTTGAGATGGTTTAACCTGTTTAAAAGAAAAACCCATGAAATGTAGAGTAGATTTTAATCTCTAATACTTATTATCATTATATATGTAACCATTATCAATACATATTTCCAGAGCTTTTTTGAATACGTGAAATGGATTCGGATTAATATAAACTTCTGATTCAGAAATCTTACCAATAATTATCCCAGTATTATTGACTGCCTTTTTGAAATAGAAAGATAAACTATCAGTTTCCCAATCCTCTTTAACATCATAAACCAGAAAAATCCTCTCTCCAAATTCATTATCCACGCCTATTATTAAATCCTCAGTTATCTTAATATTCTTTCTTATATCTCTTATTTCAATAAAAAAGGGGATAGAGTAGGAAATTAAAAAATAATCATGATTCCAAATTACTTCTCTACTAGTTCCATAGTTAGAACTATAGTTATCACTTAAATCACCAATGATTCTGACAAAATCTTCAATTCTAGGAAAAAACTGACACATTATATTGGTCATGATTAATAGAGGAAAATTGCTAACATGATAGCTTCTTCCCTTTACCTTTATTTCACAATCAGGAATAGAAAAATCAGTAAGCTTTTTCAAGTTCCTAATCCGAAGAATATCTTTATCTATGAATTTATAAGTTAATCTTAAAATATCACTAAAAAAATTGCTATCCTTATTTATCTTTCTATGCTTTGTGTTGCTATTTTCTATGAAAGAACTATCCAGATAATCGGAAATTTTTTCTTTTAAATACTGCTTGTGATTAAAAAAATATGGCTTATAAGAATAAAACTTATCTATATATCCTTCAAAATTTGATTTAGCTCCAAATTTATGATGGAACATATGTTCTATGTTTGGAATATCGCATACAAAAATAACTTTATCAAATCCAAACTTATTGGTATCACTTTTACTGTCATGATGAGCAGTAAAAATATTAAATAACCTAAAGGTGTGATCCGGATCTAACCTATCTAAATCGTCAATTACTAACACAAATTCTTTATTCTCTCTTTTAACCTTTATTCTTTTTAAAAAGTCTTGGATAAGGACAGTAAACTCATCTCGCTCTTTATATGAACCCTTTTTATATTCTATTGAGGTCATAAATTTTAATAACTGTTCTACCTCACCTTCTTCAACATCTTTTTTAAAGCGTTTGAAATCATTAATCAATTCCTTTGTGTCCTTAATAATATCTACTAAACCCTCTATTTTAGGAAAGAACTTACTAAGTGAACTTAGAAATGGAAACAAGTTTAGTTTACTACTCACAAAGCTTTGAGCCAGTAATAAGTTTGAAAAATCATCCTTTTTCAGATCTAGTTCTTCAAAATAATGGTCAATTAAGTAATCAAAAATATCGAACTTTATTAGTTCAAATATATCCTCGTTAGAGGCCACAGAATAATCCACTGGAAATAAAGTTATTTTAAGATATTCTTGACTATTCTCGAAAAATTCGTTTAGGAAATATGATTTTCCACTTCCAAATGGCGCAGTAAATAATACTCTTTTATTATCTTTTAGCTTCAAATGAATATTAAACAGCTCAAGTACTGAAGAATTGTCAACAATTATTTCTTCCATATTAACTTATATCTCTTAACTATTTACTAAAATAAACTTTATAACTTCTACTTCCCCCCTTAACTGAACATTTTACTATTTTACAGTCATTAATTACTAAAAACTAATATTAATGAATTTAGATATAAAAGAAGAAGCCAAACATTTACTAATAACAGAAGAAAAAAAGGGAGTTTTAGAATTAACAATAAAGGATAACTCTAAAAAATTAGGAGAAATACTAAATTTCCTACCTCATGGAATTATTGATAAAACAGTAACTGGAATTGGAGCCACAACTTTAGAAATCTATTCTAAAAGGAATTCCATAATCGTAGTCCCACTAAAAATAATAGCTGCTTCTAAAGTTGAACAACATCCAGAGAACTGTTATTATGTTGGTAGTGCTATAAATAATTTTCAAACAT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>NZ_CP043329|3386789:3444875|3388000_3388402_+|WP_149075506.1|DBSCAN-SWA MISKIKHLLIFFLAVFISSCNQKSKSEEIEELVIFGNSGFCLKDNNGNSYSSTYWIDCDSCDTKDLKYDSTKLDIRLYFEYKKDDHTKTSIRKPESTTEYYILSEQETQGFKSLINSTLLSNNLSSINQKAKI |
54 | Myxococcus_phage(25.0%) | tRNA,integrase,protease,transposase | attL 3386552:3386611|attR 3398809:3398879 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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