Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP035807 | Spirochaeta perfilievii strain P chromosome, complete genome | 4 crisprs | DinG,DEDDh,WYL,PD-DExK,csa3,cas3,PrimPol,csn2,cas2,cas1,cas9 | 0 | 24 | 6 | 0 |
NZ_CP035808 | Spirochaeta perfilievii strain P plasmid pSpe, complete sequence | 0 crisprs | PD-DExK,PrimPol,RT | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP035807_1 | 862948-863044 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP035807_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP035807_1
>1.1|862973|47|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder TCAAGGCCTAAGAATGGGTCGAGGAATGGGTCGAGGAATGGGCCGAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP035807_1
The CRISPR arrays of NZ_CP035807_1 >merge|NZ_CP035807|1|862948-863044|CRISPRCasFinder GAATGGGTCAAGGCCTAAGAATGGGTCAAGGCCTAAGAATGGGTCGAGGAATGGGTCGAGGAATGGGCCGAGGAATGGGTCAAGGCCTAAGAATGGG >NZ_CP035807|1|1|862948-863044|CRISPRCasFinder GAATGGGTCAAGGCCTAAGAATGGG TCAAGGCCTAAGAATGGGTCGAGGAATGGGTCGAGGAATGGGCCGAG GAATGGGTCAAGGCCTAAGAATGGG
>NZ_CP035807.1|WP_149567145.1|862383_862764_+|dinitrogenase-iron-molybdenum-cofactor MCIYTELKEDNMRIGIPTNDRKTVEGHFGHCKEFVLFDIEDGKVTNTSYVTPPAHAPGVIPKFLADNKTNAIICGGMGQMAINIFKENNIDVILGAQGSVDENLQEFIKGELESTGTACEHDHDHH >NZ_CP035807.1|WP_149567144.1|862000_862330_+|hypothetical-protein MIAIPVVSKKIKSNISICFGRCNYFAVVDDNGQITFLENKCKNSPAEAGIIAVKLLLENNIKIIISSNIGSTTKSYLKNSSITVYDAGNLETADKALSFLKLNKLVKMI >NZ_CP035807.1|WP_149567143.1|861099_861936_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MVKIRVISNNNALEGFTNEHGFSVLIETETSSTLLDTGSGEAFIHNINILSIDISNIDSLVLSHGHFDHCGNINYILNNNNRIKIYHHPQLLVERYSIHKDRDPMVKFIGVNEVNKKSLKNCHSFLTEDITKISNNIFITGSIPRLSNEDTGGPFFFDTIGEKRDLILDDQAIWLNTKKGLLIITGCCHSGIINTVEYIKKYSGIDRVYGIVGGLHLSKALDKRVIETTKYLNSLNLTMIAPGHCTGDHIVEKLNKDLNCRVIDVYAGLDIILDVNID >NZ_CP035807.1|WP_149567142.1|860527_861028_-|DUF2202-domain-containing-protein MEEVMKKIIGLILLSLGGFTSFIFGENFGADGALNESNYTLEEMLEYAIEDEYLALNEYEALIEKFGPIKPFTNIIESEKTHIAYLKELYSSYNIEIPKVDTTSHLYIPKNVEEAAKIGVDAEVKNIAMYNKFLKEDLPLDVRNVFEFLKKASENHLKAFRRQLER >NZ_CP035807.1|WP_149569573.1|859865_860438_-|cob(I)yrinic-acid-a,c-diamide-adenosyltransferase MKELKETQSNKVKNASIDRGIIIVNTGDGKGKSSSAFGTVFRAVGQGLNVAVIQFIKGSWTTGEMNIFKKFESITHIVSGAGFTWDTQDKEKDILAALKGWEVAKEICRDKDNKFQLLVLDEINLALAYKFLDIKEVVEVLANKPDSLNIILTGRNAPSEVIEIADTVTEMVMIKHAFESGIKAQKGIEF >NZ_CP035807.1|WP_149567141.1|859176_859866_-|DUF554-family-protein MLGTYVNTLVIILGSILGLLIKNGLKEKYKTIVMNGVGLSVLFIGMSTTLNGILNGGEPILFIISIVIGGLIGEFIDIDLRLNRLGDSLQNRVGRGGEHNIAKGFVTASLIFCVGTMAILGSLESGLQGKHDMLYAKSVLDGVTSIILTSTLGIGVIFSSIAVLIYQGSITLLAKFIEPVLTVETIREISIIGGILIFSLGLNLLNIKKIKTANYLPAILIPPIYYLFI >NZ_CP035807.1|WP_149567140.1|857660_859184_+|DUF342-domain-containing-protein MDKDKYHHIKDKTISRVNSILEDKYINDLINETTDMLDEITSGDDIPEQEQKVFPGAINIVMEPMKMTATLEILKPINSSNEITIGKVKELINELGDFFESRVDWALIHDIYSRVIDDDEIVPPEIIARGIKVEAYIPEHIILEEKLLSTYMPLITSHGRADYHKINSLVFVKKGEFIGKIIPSTPGVVGKKLDGSDIPFPKMIINNYVADQNIYIEDNKLFSKIDGTFKIVDNRLMVAPCLLIQSDIDYHTGDIVFTGDVEIGGSIRSGFSVTSGGDLLIKGAVEPTNISCNSNLVVNEGIFGSKTSLIDVKGNLNTKHIENVRLKSIGNLFVRNSIMTSHILTNGKITMDKNGTILGSIVYSLNGITCHNVGNELGVHTEIYLGIDYIVMEKLKEIQEVSTIITNEMEELQQEINIMETREERDKGKYLFLSLKNRLNSLNNHSRSLLKSLDKNDRSSLTVTGTIYPGSRINICHISIDIKEPLKNVTLFLNKDHGRIDWTGFTK >NZ_CP035807.1|WP_149567139.1|855672_857616_+|hypothetical-protein MRFKILFLLFILMNSSLYSQSFITKDLSNKSVLLLNSYHKGFRWTDDITHEVIKGLSPYEIELHIEFMDSKRGWDREYQLKLADLLKYKVGRHNYDLILTSDDNAFNFVIENRAEIFKNKPIIFCGVNNLLADKASKYRDITGINEEIDIIGSLDLIKKLHPKIEKISIITDNTTTGQRLQKGINEVIPLYPELSIKLDYNLTGDELINLVESSGKDTVILFTLFYTDKNNDYYENILSEIYKVSINPIYGTWDFNLNNGIIGGVLVTGSSQGEFVAQKALEILGGKDINSIPIEYRTPTKTILDYNLLNRYAMDIPQNSQIELINKPDTFYNKYGYIINIIITIVVILLLSLLIISYAFLKSKRAESELNNYKAHLEEVVLERTEELQENIIELKNTQDELVESKKMAYLGSLVAGVAHKLNTPIGIGITSVTHLRSKSLKLHKEFSLNQLKKSSLMDYLLESKEALDLINSNLNKAADIITVFKQVAVDEIEDKKDRVNLSELVHGVVNRIISPIKGFNFDINIFCPDTIYLDTSPEILITIFTNLIRNSLEHGLKDLMYGSINIIINRDKDIINIKYYDSGHGISKDVIGRIFEPFFSTKKSNGNLGLGLNIVYNLVVNKLKGSIKCVNENDYTIFYIKLSVNK >NZ_CP035807.1|WP_149567138.1|854547_855540_-|L-glyceraldehyde-3-phosphate-reductase MEYIADKDRYNSMEYKRCGSSGILLPKISLGLWHNFSDSTVFENSRDMARVSFDLGITHFDLANNYGPPPGSAEENFGLILKKDLKPYRDELIISTKAGYDMWPGPYGNWGSRKYLISSCDQSLKRLGLDYVDVFYHHRPDPDTPLLETMTALDYIVRSGRAMYIGLSNYYLPEKAKEAFAILKDLGTPCLLHQVKYNMFDRRVENGLLDLHDSENIGVVTFSPLEKGILTNKYLNGIPNDSRAKKDGRFLKPDDITDDVVSRVLKLNSIAQSRGQTLAQMSLSWNLRHKSVSSVIIGASRSSQIKDCIGALENSEFSKDELDLIDKIVK >NZ_CP035807.1|WP_149567137.1|853858_854551_-|response-regulator MTKKHIAIIDDEISIQKTLSVALEAQGYTTTIYNSSSEALGKIKVDPPDLIILDIMMPGVDGITFCSIFRKMEYNIPIIFISSIVDEITKIEALERGGDDYLAKPFSIKELLVRVAVCLRRVDLYQTTSKRFKSNLSGFFIDDGAYQIFFNGSLINMSVTEFRIFKTLFESPNIVFSRDELMAQAYPEDTYISDRNVDTHITRIRKKIINIYSDFKGIESVYGLGYRYKK >NZ_CP035807.1|WP_149567147.1|863062_863422_+|hypothetical-protein MIIGIPVKEKGADPLIDERFGRCNYFCIIDDKEQITFLENSAKDQASGAGGQSVKLLADEDVDTIISPHIGPKAMDAIKLLNINVFSLGDSITVTQALKNIKAGKLELVDSEKKGLKRV >NZ_CP035807.1|WP_149567148.1|863423_864260_+|hypothetical-protein MNIVVLSGKGGTGKTTVSINLEAVSGNNTSLLDCDVEEPNSHLFCTKPFDTIDDVGVYYPEISEDLCIHCGKCGSFCQFHAILNTKRANIVMPELCHDCGGCKLVCPVDAIEFKSRSIGSIRKGKTDKNQNFIDGILNTGEFSSTKIIQQVLKEGLTTDDRIIDAPPGSACAAVETVQGADLGLIVTEPTPFALSDMKMVVEMLENLNIETAVFINKSGENEEKLIEYCKEKKLPILGRLPFNNSYAQSYAEGKVLVNEFPEVKEIFTNLWRIIKDEY >NZ_CP035807.1|WP_149567149.1|864249_865104_+|(4Fe-4S)-binding-protein MSIKEIVFISGKGGTGKTTMTSSFIPRFENLVIADCDVDAPDLDILLKPQILTTEDFIATTKAVINSDKCLNCGKCISFCNFNAIEAGDKTPIIKESHCEGCKTCTLVCKPNAIEIKPYKTGVIYKSTTDYGSMIHARLTPGEEVSGRLVSEVRKRAKLTAENNNNEIIIIDGPPGIACNVISAITGSSLAIIVTEPTVSGFHDLVRVNDTANKLRVKCAVIINKFGLSDRYTKEIEDYCERNSISILGKVSLNKEILRSVNKLEIPNINNHDMVNKIKEIIYN >NZ_CP035807.1|WP_149567150.1|865116_865398_+|DUF134-domain-containing-protein MPRRRKNRNCRILDGDRNFKPSGIPRSELNKIILDLDEFEALRLCDYDGLNQIEAGEALGVSRGTVQRLLLSGRKKIVEAILDSNELIIKGNH >NZ_CP035807.1|WP_149567151.1|865490_866831_+|CBS-domain-containing-protein MINFISLLQKKLVIVIPIVMLLGFLFGIQKDVSFLKGGIIPLTFLMVYPMMVTLPLKKVLEGGDSKVQLTAQFINFAVTPFIAYGLGILFFPNSKFLALGLLLTGLLPTSGMTISWTGMAKGNMAAAVKMTVLGLLIGSLLTPVYIKFLMGASVEIDIIGIFIQVAEIVVLPLILGNITQKILISRFGMAHYQEKLKKNFPPFSTLGVIGIVFVAMALKAKSIMGNPSALLIIFIPLLLLYIINFLISTIIGKMFFKRDDAIALLYGTVLRNLSIALAIAMTAFGKEGADIALVVALGYIIQIQLSAWAVKFTDKVYGPAGVTESSNIMHYGIYTLHSRNTVNDALKMLATEDIHSIVVIDDLEKPIGILTQKVIIKLLANKTPKDTVISDCTLEPVITTGLHIPIEKIIKTMDENQEFKVLVTDVKENIIGVLTASDIIKSTINK >NZ_CP035807.1|WP_149567152.1|866952_868071_+|hypothetical-protein MNKKFSPLSFLSSLGAGGIAIIPFAFFQYTYHTKPGLVTFNAIDHGSLNFAQLGLFYFFETVMIIFTLIHFFLTFKNLKELNYWSKTDEFKTFTQDPLSNAALMTPFLSLAMTMNVFIGPIRFFIPFFSKNFQGMMLPALIALIILASVALYWEIKLLKISFVNSFDVSKINFGWLIQPFALGMIAVTASGIAAMSKTETYAHIGAFITFTMGSMALFLLAVKLNSIFKSHFAAKGLPAKQFMPSYLIVLPIVTILSIAGFRLTHYFHNFFHVDLHALGIIIIAGSFAFETWYLLFGLALLKNYLKDDFKLKEYYVSQWGLVCPFVAYGTLGTMMWRNFVPNLLLYVVIIISALTAITFFIILARKQIKYAK >NZ_CP035807.1|WP_149567153.1|868120_868891_+|3'-5'-exonuclease-domain-containing-protein-2 MVILFMDNLNSIIDLKRLNLIKKQITPRESKKLEKKLSLLFKGFSKDSLNFISIIDRFNDPSFDQNKLEKYNTGTREIVIINRDYKIKDAISNILKEDFIGFDTEQRPTFKRGEKQKNFALIQIATKDFCYLFQTKYLHDIKPIIKIITNEKIIKVGFDLKNDNKEFKNQLNIEPKNIFDLSPFMKRNLLHKNQIGVKNSVALILLKQMQKSKKIAMSNWENRILNENQIKYASEDATAPYDIFSYLYNNFPTIIS >NZ_CP035807.1|WP_149567154.1|868987_869965_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MILAQKITKLRKQLGLSQEELAEKLEISRQSVSKWESTTSIPDLNKIIRLSELFGVTTDFLLKDDMELIDYTGEDKESGVLSISIEDTTNYIKTKVWLAKNISIGVLISILSIVPFLFLSALSEAEKGYLSEELAEGIGLTSLFVFITIAVIFFLRKSPQSLFIDELEKSNFDLSYGVRGIIVEKLQRFQGIYTKTLSLCTAMFIISVVPLFVSSLYTESDMILFLMLILMLVIVGVSLFILIPKVTENNCYNFLLGEGDFSKDRKLEIERDEKFAGFYWPLVTAGYIGWSLWTMEWGITWIIWPIAGIAFVGFTGLIRLLETKK >NZ_CP035807.1|WP_149567155.1|870171_870459_-|RNA-binding-protein MSTKLYIENINYNISYFELGSLFSKYGDIMHIDIINDIKSMKSKGSAFIEMADKKCAEKAMSALDKVIWMQRKISVKFAQKEERSNLSNRLYFPI >NZ_CP035807.1|WP_149567156.1|871407_873162_-|hypothetical-protein MDYVLYQFLAPLVAGFNILSILISFRYLKERISKIVLMFQLAALILLILEYMEFYLNNEYQMVFVIKLGHVVMQFYAVLWFIFCLNYTGYEKIINKRFITIIFAFILFNTFVVFTNDLHHQFYHNVSFLYKGGYSTIMAEYGFYFWIICSFNYIFIITGVIFIIVSYIRGGSYYRSQAQFIIIGYIVSLLVNIIYIFRLLPDFTKDFSAVTFAIISLCTFIGTYRFRILHYSPLSRNLVLQNMDDAIITLDLDYRIIDYNIKATRLFNLSERDLGQRVERGFLGTITGNVSTFFLNKDYVSFIKKIMDKSYNLNIRRLYDKQSDSKGIVLTFSDISDKIKLIDELDCSSKKIDNMQSFLVRSEKMAALGQLSAEISHEINNPLTYIKSNCHILQRYLDEDTFNNNIEDIKELVKDTNFGIQRISEVIKNMLSYTREDREDSEILYDINKGVESTLILARSVIRNRAELKLDLGCNIPKIKILGNKVDQVVLNLLVNSAHAIEEHRTDGIIKVSTYVNDCNIICDIYDNGIPINIEDRELLFEPFYTSTSTNNGTGLGLTLSRKIIESEFHGRLYIVDSIEKYFV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP035807_2 | 1189328-1189411 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP035807_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP035807_2
>2.1|1189351|38|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder TCCAATTTTTATCTTTATTATGATAATAACTAAGATCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP035807_2
The CRISPR arrays of NZ_CP035807_2 >merge|NZ_CP035807|2|1189328-1189411|CRISPRCasFinder TTCTTATTACCAACTCCCCATAATCCAATTTTTATCTTTATTATGATAATAACTAAGATCGTTTTTATTACCAACTCCCCATAA >NZ_CP035807|2|2|1189328-1189411|CRISPRCasFinder TTCTTATTACCAACTCCCCATAA TCCAATTTTTATCTTTATTATGATAATAACTAAGATCG TTTTTATTACCAACTCCCCATAA
>NZ_CP035807.1|WP_149567444.1|1188100_1188928_+|IS3-family-transposase MVSKDEKLSLSKQCDLLNINRSRIYYTPRTKSKEDLMIMRLIDALYQENPCMGSRRMSKEISKTHGIKLGRLRARRLMREMCISAIYPKKNLSVPDSEHKIYPYLLRNLRIERPNHVWSTDITYIPLSGGFVYLTAVIDWYSRKVLTWKLSNTMDVGFCKSVVVEAIAKYGTPEIFNTDQGSQYTSKEFTDLLKDHEIKISMDGKGRALDNVFVERLWRSVKQEDVYLKDYRDIRDAKRHLTNYFEYYNNRRRHQSLDDEFPEDIYYGKVKLIAA >NZ_CP035807.1|WP_149567443.1|1187793_1188072_+|transposase MGRRKKHDSAFKLKVALEAIKEEITVSEIASNYEIHPQQVRQWKREFLQNAESVFQKDDVDKKKVEELETEKEDLQSLIGQQTIEINFLKKT >NZ_CP035807.1|WP_149567442.1|1187132_1187573_-|hypothetical-protein MAKYGDFIYNSNTSVLTSYSIGVDCSGFMSQSANYNNNSYDTVKDLPQGMLEWGSWPTSQLMGPSGYDSASYTISEQNRSKLKPGDFIYKPGHVAIILRIEEGTEELDKRIYLLESAFDSGKYKVINLNTIFKYRNYTNFRTKRFK >NZ_CP035807.1|WP_149567441.1|1186146_1187124_-|hypothetical-protein MKRIYLIIILLILNQLSAEELELTLAKKFPKGTESFQLGFRPLFYDIYFYSGPSAFTIDSKDNFYIKDTMNSKIKKYDNNWDLTEEYSLSRGDEFIYIKNMYISNDTKYIYSTSSSHISYLNKGKVKYIFRDNTDIDGDVVFIDNKLFYTRRSNPEGLFYYIENGVNKGEFPPKYNLVNFSEDHVEIKLEDNLNIYAVSKSMAPYRKLFKNLKTNSAMDLKDSVFFDDTSYTSSEIIGFDKDLNSFWIIDYHNGKRNIVVLSKWGECLEYFTIPGLWYRHKPTVSLNGDLYFMLYGETETESIDFYSLTKESRINQRKVSENKKK >NZ_CP035807.1|WP_149567440.1|1185642_1185927_-|hypothetical-protein MSEEFSNRTAKLPFLDINEKSFDSIYGNKNPYIAIYLNYMIILLIIDIGSLRKVKSKITVIRFYINIGRMYYIKGVTGKLQEKFQESLHLRNSK >NZ_CP035807.1|WP_149567439.1|1183373_1184771_-|hypothetical-protein MESNIRPGDDFLLRFGKKNSEVITGVSKDEDFIAVYDKKMLWRANLYIEETNIEDWNDKYKWNAPLTINDTFNKGLSDEEHYNEFGFVKANGDSNDSEIIWYSENKWNHNGDEENVGNGGQVVDILQYNSIFGDTNKLDSVAYNYPESTTTINGRDTPFMFNDKILVQKNRLSEYYNNVGTRFKKAKTEWGNLENVTDRSLFTLEKYNELVEDYTADLNESEPFTDHGISLLSWNETTAFENNWDNYVKEQDQSIDLYLPGLGLIEWSKNPNIQASEEFRESIYSVVNNAEANGTFLAGKEYWSDRAAGVDCIGFAQNAANISGNKWPANNINRAYPRTLEDSQLRDENSTLNYSTFIVGKSNSETNNLGKYKVVGNYNFVKPGDIFYHIGDPDSNNPGGGKHIGIVLSIGRDSLGNIIPSECKIIESNFSDGGSNLSWVRNSQTLNWWVENDRHWRVVRLNKGE >NZ_CP035807.1|WP_149567438.1|1182813_1183371_-|hypothetical-protein MKRIVSLIVVILTINTIYCEIAINKVSMETLLEIPYGKSIRQLGKEYDYGGAEHQSITDIVITKDYFIFGDQWNNRFVKASHDLSDFIVLPNIDINTVSGFLEIKNNHLYNYDILSNSVFKYDLETNTMEFHSRSFLDGHTGLSTQKVIYWGSTIFEDLFIGEAKNNSFVVIDTKKKMRNLILYY >NZ_CP035807.1|WP_149567437.1|1182403_1182775_-|hypothetical-protein MLKIISEKYLFENDMFITKSPSKFLSFFKKSFSRDEIKSFKELEFEEDAKFSGIDKDGNYYWTSYAGCFVFDKTGKLLTLFVIDFKEARRSDMPRFAIDNDGNAYRLIKGEDCYYLKMVKRYW >NZ_CP035807.1|WP_149567436.1|1181886_1182138_+|transposase MNAYAERFIKSIRKECLDWFIIFKEKQLRNIIKEYIHNYNNYRPHQGINGIPNGKYPPENNKGNIKKQSLLFRLHNHHYREAS >NZ_CP035807.1|WP_149567435.1|1181168_1181645_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MRYFEQNNIKLPFSKEEKLFIYSFYSKKKNIHKYFTLIKPETILYSWKKAINNIWTYNSTCKRKGRPQISYKIRNLIKSMKVDNYLWGCLRIRDELIKLNIDISRETIRKIISDFRKQNIIKPNYSWSTFLRSHWNSLFACDFFTVDFFVGCIPSSKT >NZ_CP035807.1|WP_149567446.1|1190456_1191431_-|hypothetical-protein MKFRFVLVFFIICNYLYGEGFNNYDEQHVFTFSTGSMPGEIGLIEGVESKGNNELFPKLLKKYKDYFILFDTVNSRVNFYNVDFSLEKELEVDFRLLRNSKSKIMDNIIFSSGYNKFVTAFNISTGNITELNFPDSISSKDRVLFTDKVIFNYMNDGSLCSFVLVDEDEMKYSRLLNEEETLELFNEKDKYLLNGYTIDAKRRIFFKNHIQNNDFITLYNYWVELHDANNMTPPRIIPGVPDFEKLSGITSPFIGFDLSRNSYWSSKTGIIIFDSNGWVLDYLKFNNFAYLGPTINEDGDIYYATSEKVNGVTVFNTYKIPRQW >NZ_CP035807.1|WP_149567447.1|1191420_1194996_-|hypothetical-protein 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>NZ_CP035807.1|WP_149567448.1|1195242_1196220_-|hypothetical-protein MKKIGLFILVILISMDMLVAESKFEIDFVTSYKTGKGINEFATVYNKYLIDGAGDGPSIIYYDESKKVFYISDGYNKRLSVYDFNFKQIDEIDISNDIYLEYPHSIQIYKEGFILYQKYIGFTYHTWDGELQWQMNFVEKYYDNKLENNNFYYDEDNGIILFYMIDGEVICFSSLTKDSNGFVTTKGRDQINILIKNKDISNIKISESNKILVDNKIKSISGNDILDKDNDNGKRIYIGRNKNNYIYWTDADRRIRIYDSSKTFIISEIYREGYITGGSYMPGIHPSGDILYLIYNSHEVALKRIINTWDPKLREQWYKDHPNAK >NZ_CP035807.1|WP_149567449.1|1196315_1197206_-|IS3-family-transposase MFAYIKDQSVEESIPVIKMCKSLNVSETGFYKWKRNRNRPKAWQLLLVQMHEILDEHPDNENYGIERMQLALKQKGIIKCSRSTVIRAMRKGNLLHKSRRSPNGLTKSDKKANRPDNVIKRDFTASKPNEKWLTDITEIPCSDGKLYVAPIFDCFGGEIISLAMDSHMRKELCINAVKEAYKLRNPGNGVIIHSDAGSQYTSEKYKNTLGGFKAIQSMSDVGKCYDNSRMESFFATLKKEKVYKINTKKLKREEVKTIVWRYVMTYYNRQRICTVNEGGFPPTVFREMITEKLTAA >NZ_CP035807.1|WP_149567450.1|1197217_1197493_-|transposase MTTYSKEFKDQALKLSDEIGLKKASDQLGVKYSTLSGWRRNRSKKSINVVQKDTTPMTDRELKMQKEIQELKQANEILKDALGFFAKDRKK >NZ_CP035807.1|WP_149567451.1|1197535_1201792_-|hypothetical-protein 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QSRYFYIELTADVVDNKLTITGSQNLQLLELEVTRVEEPIETTITKLENRRVIKDMKWYQWNPDHYFPELDWFNSDKKNKYNHRTNSMRVWSEQVPARPSDRGNR 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP035807_3 | 1849620-1850249 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP035807_3
|
9 spacers
spacers of NZ_CP035807_3
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csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP035807_3
The CRISPR arrays of NZ_CP035807_3 >merge|NZ_CP035807|3|1849620-1850249|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAACAGATCGAATCTCTATACCCAAGAGCTATATGCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAACGCTTCATCATGAGAAATAATGCTATTTAAAGTTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAACACCTTCTGATTCCCACCGCTCTTGGATTAAGCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAACAAGAGTGCTTAGATCTTTATCTTTATCAAAGCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAACAGATATAAATCAAACGAGACTTAATAATATGCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAACTGTGATCTTAACTCGTTGGCTGTCTCTCAAGCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAACAAGTGGCAGGGTATTGTTAGGAGTATTGACGCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAACAGATAGATTATCTAGTTTATCCCATGATATGCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAACAGATCCAGGGAGATAGAATTTTCTGATGATGCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC >NZ_CP035807|3|1|1849620-1850249|PILER-CR GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC AGATCGAATCTCTATACCCAAGAGCTATAT GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC GCTTCATCATGAGAAATAATGCTATTTAAA GTTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC ACCTTCTGATTCCCACCGCTCTTGGATTAA GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC AAGAGTGCTTAGATCTTTATCTTTATCAAA GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC AGATATAAATCAAACGAGACTTAATAATAT GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC TGTGATCTTAACTCGTTGGCTGTCTCTCAA GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC AAGTGGCAGGGTATTGTTAGGAGTATTGAC GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC AGATAGATTATCTAGTTTATCCCATGATAT GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC AGATCCAGGGAGATAGAATTTTCTGATGAT GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC >NZ_CP035807|3|3|1849620-1850249|CRISPRCasFinder GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC AGATCGAATCTCTATACCCAAGAGCTATAT GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC GCTTCATCATGAGAAATAATGCTATTTAAA GTTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC ACCTTCTGATTCCCACCGCTCTTGGATTAA GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC AAGAGTGCTTAGATCTTTATCTTTATCAAA GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC AGATATAAATCAAACGAGACTTAATAATAT GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC TGTGATCTTAACTCGTTGGCTGTCTCTCAA GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC AAGTGGCAGGGTATTGTTAGGAGTATTGAC GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC AGATAGATTATCTAGTTTATCCCATGATAT GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC AGATCCAGGGAGATAGAATTTTCTGATGAT GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC >NZ_CP035807|3|1|1849620-1850249|CRT GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC AGATCGAATCTCTATACCCAAGAGCTATAT GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC GCTTCATCATGAGAAATAATGCTATTTAAA GTTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC ACCTTCTGATTCCCACCGCTCTTGGATTAA GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC AAGAGTGCTTAGATCTTTATCTTTATCAAA GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC AGATATAAATCAAACGAGACTTAATAATAT GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC TGTGATCTTAACTCGTTGGCTGTCTCTCAA GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC AAGTGGCAGGGTATTGTTAGGAGTATTGAC GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC AGATAGATTATCTAGTTTATCCCATGATAT GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC AGATCCAGGGAGATAGAATTTTCTGATGAT GCTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC
>NZ_CP035807.1|WP_149567966.1|1847562_1849287_-|alpha-glycosidase MNIQAIMHKPKSNYCYAYTRDNIHIRIRTAKDDVDRVLLVYGDKYEWEKKITTEMYRAFSDDLYDYYTISITATNNRLSYYFLLENRDESHYFTEWGVNDDIPEDELHLVQFHYPYINVADIHEIPDWVRDTVFYQIFPERYDNGNPDISPKNIVPWDSKPERDSFFGGDLQGIINHLDHIKDLGISGIYMTPIFKSTTNHKYDTTDYYTIDPNFGDKDTLKKLVSECHKRGIKVVLDAVYNHCGYKFDKFQDVVEKGKSSKYYNWFYIEEESEGNSEIKYEKFAFEQKMPKLRTSNPEVQKYLLDVASYWIKETDIDGWRLDVSNEVDHMFWKAFRKEIKSIKPDAYIVGENWHDSQPWLQGDQFDGIMNYPVNYSCLKYFAKSSITTETFKRMINESLMRNTWQVNEAMMNLLDSHDTARFVNLSDMDFRKSLLAMSFLLTFVGSTSIYYGTEIGLTGDGDPDCRKGMNWDKSTWNMTVYNMIQSLLQIRNNNKPLTRGSFSWIDCDLLAYKRSLGNEDIYVYINNNDNCKYCTLTNGTYIDLLKNEEIVVSADKNRVEFSEYSVNILKKKN >NZ_CP035807.1|WP_149567965.1|1847013_1847496_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MIRNVNIIDSQQICDIYNHYIEHTDITFEEDPVTVVEMSERIKKVTKDMPWIVYEEDGKILGYAYASPWRVRAAYRFCAETSLYVDINLSHRGVGTKLYKQLILELKDLGIHSVLGCLAMPNDKSQGLHEKLGFTKVAHFPEVGFKFGHWIDVGYWQLNL >NZ_CP035807.1|WP_149567964.1|1846394_1846949_-|hypothetical-protein 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MITMIIITGAVEGSMPFISGWIIDNVVETGNLDMLKIAGGIYTAVIIAQITTVYWFIFHAGKVESGMAYNIRKRGFAKLQRLSLSFYDKNSAGTTLSKLTSDVGRVCGTITWGIIDYTWGTVMMLTMSILMFIRSWQLALVTLAVMPILFGGGFLFQKIIINKYRAVRKINGIITGAYNEGIMGARTVKTLSQEERSHSEFKDKTHDMKQKAIKAGVIGGIFFPFVGFMASVGTALALWAGGVSVANEVITYGMFATFIFSSMQFFYPVYQMSQTFANLQYARAAGERIIDLMDTEEEIVDCTESDIPRKIEGNIEFKNVSFEYVKGERVLKNFSINIKKGESIALVGHTGSGKSTIVNLACRFYEPTEGTILIDGKDYKEISQRDLHSSLGYVLQSPYLFNDTIMENIRFGRLDATEEEIIQACKEINAHEFIMNLEFGYQTKAGESGKLLSTGQKQLISMARAVLADPSIFVLDEATSSVDGESEVKIQKATDRLLEGRTSFIIAHRLSTVVHADRILVVDKGVVIEEGSHNELISLEGHYHKLYTNQFFEEREAELLKEK >NZ_CP035807.1|WP_149567962.1|1842179_1842452_-|hypothetical-protein MVKEELNQKSPLRKLEAITEGGVGTGNIGVIASKQGIGKTACLVHIAVDSLLRDKHVIHVSFDKKTDYISAWYEDIFEEISKKEILSLQC >NZ_CP035807.1|WP_149567961.1|1841769_1842186_-|hypothetical-protein MLIHDQMIHNRIIMNFHHEYPVIKVLDAVGAMIDNGQNGTDVVIIDGYDFNRGAIKDIDQIKKFAKEKSVEVWFSDTIYPNSLDEDGIPKNLNPFIHDIKTVLTIKPDGNSLKLSFVKHGAISQESHLCLDAKTLLIC >NZ_CP035807.1|WP_149567960.1|1840679_1841726_+|hypothetical-protein MELLKMRGIKLLSTLSILFFGLTPLFSQNDYIKEESVNVSSAYYFPNLSGFELDGNFAPITYTPIISELDTQRDLGSTWGAVELKGNYKLTLKRNFLTGASALTKDNSLKHTFSFDISPVTVSLETSTTISPIAFLEFTLGTQLGSGWKAVGADGLALYTNPLGPEEEAFQGVFSKTWLSGTFQFDTAALMGGDTTWKHIVLLSNHNLMLKYFSAAGTDEPWIFQAGDPSYNGFRYEQSTFVGYQMPLVLDMAGILFETGANLFDNATRSTMDSSGWGSDFIDTKIGVLLNFKVGENGAFVLLPQIKKRLRYTDGSVKELYFINRKTDINDPYFWSFDRIAISYTYKL >NZ_CP035807.1|WP_149567959.1|1840495_1840708_+|DUF1456-family-protein MDNNEILKKLRIAFSMKDTDVQETLSKADMNLSKTEINALFRKRGQRNFVPCGDQILRRFLDGIIKNERD >NZ_CP035807.1|WP_149567958.1|1839970_1840432_-|hypothetical-protein MFSYQLDFKINEGNMNSFLIGTKTLFEKIYQLAKMLGSVIDVEILIEHKLIEIESSKISYQLDIDIKYPIQNALGSNINKHQIDDWISKGFQILLSYNSVDECISSLNSLVEKLKLYNYLLYVKIPEKKLKRSLEDMEKLSILLFNDLVFYEM >NZ_CP035807.1|WP_149567967.1|1850335_1851226_-|IS3-family-transposase MFTYIHEFQKELNLPVIRMCNALDVSETGYYKWKRTRNRPKAWQLLLVKIHEIIDEYPDNDNYGIERVMLGLKQRGIKNNSRSTVIRAMRKGNLLHKSRRSPNGLTKADKKANRPENIIKRDFSATKPDEKWLTDITEIPCSDGKLYVAPILDCFGGEIISLSMDSHMKKDLCIDAIKEAYKSRNPGNGVIIHSDAGSQYTSEKYKDTLGRFRAIQSMSDVGKCYDNSRMESFFATLKKEKIYKINTLKLKREEVKKIVWRYVMIYYNRQRINTMNKEGFPPSIYRNMTTDKQAVA >NZ_CP035807.1|WP_149567968.1|1851237_1851516_-|transposase MTKYSKEFKEQALGLSDDIGLKKASEQLGLKYSTLAGWRRIRNKKKNNTKDQTYSSPLTVREEEMQREIQELKQANEILKDALGFFAKDRKK >NZ_CP035807.1|WP_149567969.1|1853772_1854465_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MISFKISNFDELQFNDNLITLEIHNKQLYRNIIESFKAYVASTELKENIIFFENSKSVNWAKKIVICNPESIEYEMKNIQKKLITIISEELYSDIEFLSKLEVNYSTLIEQIEGKIIEHDIDLVINSDFTPDKFLKFVNLNIKLPDSGILSQLYQYVDVVTELNLYEVVVFTNIKLFLDSNELLELFKYIIYKKLNCILLENISNDIIDYETKLVIESDFNDYTENPSTT >NZ_CP035807.1|WP_149567970.1|1854461_1854767_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRVLLFFDLPMETPKERYFYNRFRRSLLKEGFIMQQKSVYTKLALNSSSVNLIKSRIKKDLPPNGLVQVLVVTERQFSSVDTFIGEVHYSNLDSTDRLIIL >NZ_CP035807.1|WP_149567971.1|1854778_1855651_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MSFRTVLVTSKCKLSYKNEHLYVRSDDLKLIHLSEIEMLIIDSTQVVITTYLLCELVKHKIYIVFCDETHNPQSQLLSLYGSYNTSKKLNKQLNWDVTTKEFVWTSIVTEKIRKQSQLLKANSKEESSILEGYYKGTEQNDPTNREGHAAKVYFNALFGKSFTRDNCSSINKALDYGYSIILSCFNKEVVSNGYFTQLGIWHKSEFNQFNLSSDLMEPFRILIDEYVFRNQDREFNTSYKQDLINILNRTVNINKKEQYVTNAIKIYVKSIFDSLDKNSVNSIKFYETKF >NZ_CP035807.1|WP_149567972.1|1855650_1859550_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MKNYSIGLDIGTASVGWSVVDENLNIIRKSGKNLMGVRLFDSGNTAVVRRTHRATRRRIARRKQRIQLLRTLFENEILPIDENFFRRMDNSFLWMEDKKQETKNILFEDETFDDKAYHQKYPTIYHLRKELLESDEKIDIRLLYLAVHHMIKFRGHFIYEEADFNTESGISKSIEKMLESISDFYDENMNLPTVNEVQVILLDKNKKKGDKQKEIVDLFDKQYKKEITEISKAIVGYKANFPKIFMVNDSDIKYNKSFSEELEDSVIMEITGDDYYLFESIEQVYSGFILSEILGDEHNISSAMVQRFNKHKKDKKHLKSLFKITTLKEYYKSIFHSKKAEKVSYTAYINNESSCSNEQLNKSIKAILEKYKVELSDNKDYIYCIEQIEKEDFLKKIRSKENVGIPYQLHKQELEQILVKQSKFYPSLDIEKILSILTFKIPYYVGPLVSEDKSEFAWMERLTEGEILPWNYKDVIDIDKTAEKFIRRMTNKCTYLPKEDVIPKNSILYSEFILLNELNKVRIGGKLLSMDLKRDIIRDVFKKYKNVTIKKIKDYLNNSDIAYSTKQGGVYNYDDEITGTQQENKFASSLTSYIDFEKIFGEGYVEDNPNKVEKIIEWLTIYNSKEIIRKQITKKYPEITKEQIKKILKKSYSGWSRLSARLLDGIKGNNVNHVDLTIINIMRKSNYNFMEIVNDDEFGFNDKINEIRLESNLNSTKVTYKEDIESLPTSPANKKGIWQSVKIVDEIIKIMSKGKDKNKPQRIYIEMARDNQEKKRTTSRRKMLDDLYKKIKNDSYFDYKIINDPEVVKDERIESSRLFLYLTQNGKCMYTGKPLHINQLSNYHIDHIIPQSFIKDDSFNNKVLVIAKANMDKLDQPVNSRMDIPKSVYILWENLEQQGLISKIKHNNLKKTSFSEQDYKGFISRQLVETRQISKHVLNIFKDYKYAKNVVSVKAQLTSSYRKANKLYKIRNLNDLHHAHDAYITCVVGKHIFDRQTKFTWKNYLKESTGSKYGFVIGGLNKNIELSDKVRKVLAYKNVLITKQLKENSGEDKGGFWKSTIHSNTSKGNNKIPLKENLSPEKYGFYTSENRAYCIAIEAKKGKKVFNRIVGVPVNIASSKNLEVALDKFIKDSLDVDEYKILKDKIYLNQLFIQGGSEFYIASEAYLHTATQLFLDNKFTLFIKDITSNKSIDKVNDSLFEEFYDYYIKKLETHYYKYSTISEKMTLNRDLFINLSKEEKTQIILKLLDVTKSGSSQIDLKKIGCSVGTGIIASFALNRDEMTFIDQSITGFYEKRYKL >NZ_CP035807.1|WP_149567973.1|1860123_1862877_-|ammonium-transporter METNLLDILWIIVASCLVFIMQAGFAMVESGLTRSKNSINVSIKNLTDLGVSTLFFWAIGFGLMFGKTKLGFIGRDNFLFSAKNTWVAAFFLFQAMFCSTSATIVSGAIAERVKYGAYIIATIFLSAIIYPIFGHWVWGGLINGNGSGWLSRLGFIDFAGSTVVHSLGGWVALAFLLIIGERTGRYDNNGIPVPINGNNIPMVVLGVLILWFGWFGFNGGSTLVMDSTVAGIILKTTLSASAGMVASLAFGWPILKKPDVTLVMNGALAGLVAITAPVHSVTEIQAIVIGLVGGVVMFLSTMVLDKLKIDDAVGAIPVHLSSGIWGTLAVGIFGNLDILNTGLNRGGQIIIQLVGIITCGVWAFGISFVFLFLLNKIYPLRIGLKEEIDGLNKSEHGTSTEIFDLYTVLHHQASTGDISLRAPVEPFTEVGQIAGIYNEVLDKLEENTVEKGDYLNILENVSDGIFLLSQNGGIGKYYSKSLELILEEKSLADFSFITFIEKILLEVDKNLFKDFLDVAFNPATQWRHVERLNPLREVDAYFDNNQGSFRTKHLVFNFKRVEKKGEIINLLVMVSDVSEEFELNKEIEHTRKKSHIEMELLYKILHVEPTVLREFFKFSNKDLIEINSIFQKGSDSSRDKLEKAFRLSHGIKGDAELLELNFISEKAEELELSMQKILKSSEIDTEDFIPLTLKFSELQNTFNKIQELLSKWAGFQANGGSIHNTDNYLKEHLVKMCSRLSTKYDKAVQLKLDGFSIEKFSEEQFKPIQNIIIQLMRNAIYHGIESSEKRVALGKKAIGLIYIKVEESEDTLHLVFSDDGEGLNLQNIRKKAYDERIITKEQFDKLSDNIIPRLIFKQGLSTAKKADVVAGKGVGMPLVNNLIRDLDGSITIRSRADVGCQFVIKIPKILNREVVTV >NZ_CP035807.1|WP_149567974.1|1862880_1863327_-|chemotaxis-protein-CheX MKESELKAFIKIVTEYFESITGIAAKMGLPFIKDESTGVFDFTGIIGVSGARKGGVYFTAPKELLYEFGGYLLEGDKVEDDDLYDLIGEMTNTISGNMREFFGTTFLISVPIVLKGQVENIDMRLNPPVFIIPIEWQYNDCHLAIGLE >NZ_CP035807.1|WP_149567975.1|1863323_1863689_-|response-regulator MKLLIVDDSNIMRRAINKYLKEFKLEIVGSACNGEEAVEICKSKKPDLVTLDITMPKMDGLTCLTEILKIAPETKILVISALSDYGTGLLALKKGAMGFLPKPFTASELQEEIKFICGIMV >NZ_CP035807.1|WP_149567976.1|1863866_1864970_+|aldo/keto-reductase MLYKMYGKTGKRVSAVGFGGMRFDETKTIEENAEIVRYASSKGINYFDTAPGYCSDTSEDIFGEAFKNMPNPFYVSTKGMPTTYDTAEKAIDAVKKSIKRMGLKKIDFYHIWCIRKSEHYELAMKPGGQYEGLLQCQKEGLIDHIVLSSHQNGNEVKEILIDKKIDGILLGVNILNFPYRWEAVETAYNMGYGVVAMNPLSGGAIPTHEKELQFLTNGKETATEAALRFVISCPQITIALNGFTTKEHIDTACKIANESKPFEQDEIKRIENLVGESMNEACTGCGYCDKCPQGIAIPSFLQYYNEKHVFHKSDKEMKENIVGAYEWGILAGKKGTAADCTSCGLCEDECTQHLPIIDRLKEITSWT |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP035807_4 | 1851587-1853734 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP035807_4
|
32 spacers
spacers of NZ_CP035807_4
>4.1|1851623|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT GTGTTGAATTAGTAGCTGAGGAAGAGTTAA >4.2|1851689|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT CCAGTAATCTTGTAATATACCCAATCTTCT >4.3|1851755|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT CACTAACAGTAGTGACATGATGGATAATAC >4.4|1851821|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT TCAAATGATCCTACTATGAGAAACATCTTC >4.5|1851887|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT ATGTAAAATGTTGGCATTACTTTAAAAATT >4.6|1851953|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT CTAGGGGTTCTGCAATATATGGGGAAGATA >4.7|1852019|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT TCCGGAAGCAACCAGGATGGTTACTAAAGT >4.8|1852085|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTATAATCTTTAGTAGTAGCCCTCTGGT >4.9|1852151|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGGAATACATAAGTGGTTCCTATTTCAATA >4.10|1852217|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCATCAACATTCTCATATTCAGGTAATTTT >4.11|1852283|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CACCAATTACTGATAACCTCTCTTGAAAGG >4.12|1852349|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATGGGTACTTAATAATCATGGATTGGCAG >4.13|1852415|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTCTTTTGTTGTATCGGGCAATCTGAGCTT >4.14|1852481|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTAGTTTAGCATTACTAGTTTTATTATTAG >4.15|1852547|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCTCACCCGATTCATCAAGAACATCTGTT >4.16|1852613|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTCCATTGCAATTTTAACTTTAGGCGTTA >4.17|1852679|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGGCTCTGTTAACTCTTCAAATGTATAAA >4.18|1852745|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGTGTTGCTAATCTGTTCTTGTTCGCCTGA >4.19|1852811|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AACAGTAACAGGCAATAGATGGTTCAATAT >4.20|1852877|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGAATCGGTATAAGTTCTATGTAACAACT >4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAAACGAAGGTTTTGATTACTTCTGGAAAA >4.22|1853009|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAGGTATTTAGTCAAATTATAGTTTGTATG >4.23|1853075|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGTGGTATCATGTGGGGCATGTTCACTCTT >4.24|1853141|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGAAAAGACACAACATACAAAGGCAAGAGA >4.25|1853207|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAGTCCAACCTCTGCCACAAAGTTATCCC >4.26|1853273|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTAGATGATTTGTTAGAAAACGGTTTTAT >4.27|1853339|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGCATCCGTGATAGAATAATTATTAATAGT >4.28|1853405|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTAGTAAACACATAATAGATAGCGAAAGAA >4.29|1853471|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATCTCAACATGGATTCCTTTTATATCAAAA >4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGTCCGTCTTCTTTAAATTCTGTCATTAAA >4.31|1853603|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTATGAAGTTCGCCCTGGAGGGGCACAAC >4.32|1853669|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATCATCGTAAGAACCTGTAACTTTATAT |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP035807_4
The CRISPR arrays of NZ_CP035807_4 >merge|NZ_CP035807|4|1851587-1853734|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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>NZ_CP035807|4|4|1851587-1853734|CRISPRCasFinder GTTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC GTGTTGAATTAGTAGCTGAGGAAGAGTTAA GTTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC CCAGTAATCTTGTAATATACCCAATCTTCT GTTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC CACTAACAGTAGTGACATGATGGATAATAC GTTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC TCAAATGATCCTACTATGAGAAACATCTTC GTTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC ATGTAAAATGTTGGCATTACTTTAAAAATT GTTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC CTAGGGGTTCTGCAATATATGGGGAAGATA GTTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC TCCGGAAGCAACCAGGATGGTTACTAAAGT GTTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC ATTTATAATCTTTAGTAGTAGCCCTCTGGT GTTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC GGGAATACATAAGTGGTTCCTATTTCAATA GTTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC TCATCAACATTCTCATATTCAGGTAATTTT GTTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC CACCAATTACTGATAACCTCTCTTGAAAGG GTTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC AATGGGTACTTAATAATCATGGATTGGCAG GTTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC GTCTTTTGTTGTATCGGGCAATCTGAGCTT GTTTTAGTTCCATCTAAAATGACACACATCTAAAAC GTAGTTTAGCATTACTAGTTTTATTATTAG 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>NZ_CP035807.1|WP_149567968.1|1851237_1851516_-|transposase MTKYSKEFKEQALGLSDDIGLKKASEQLGLKYSTLAGWRRIRNKKKNNTKDQTYSSPLTVREEEMQREIQELKQANEILKDALGFFAKDRKK >NZ_CP035807.1|WP_149567967.1|1850335_1851226_-|IS3-family-transposase MFTYIHEFQKELNLPVIRMCNALDVSETGYYKWKRTRNRPKAWQLLLVKIHEIIDEYPDNDNYGIERVMLGLKQRGIKNNSRSTVIRAMRKGNLLHKSRRSPNGLTKADKKANRPENIIKRDFSATKPDEKWLTDITEIPCSDGKLYVAPILDCFGGEIISLSMDSHMKKDLCIDAIKEAYKSRNPGNGVIIHSDAGSQYTSEKYKDTLGRFRAIQSMSDVGKCYDNSRMESFFATLKKEKIYKINTLKLKREEVKKIVWRYVMIYYNRQRINTMNKEGFPPSIYRNMTTDKQAVA >NZ_CP035807.1|WP_149567966.1|1847562_1849287_-|alpha-glycosidase 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MKNYSIGLDIGTASVGWSVVDENLNIIRKSGKNLMGVRLFDSGNTAVVRRTHRATRRRIARRKQRIQLLRTLFENEILPIDENFFRRMDNSFLWMEDKKQETKNILFEDETFDDKAYHQKYPTIYHLRKELLESDEKIDIRLLYLAVHHMIKFRGHFIYEEADFNTESGISKSIEKMLESISDFYDENMNLPTVNEVQVILLDKNKKKGDKQKEIVDLFDKQYKKEITEISKAIVGYKANFPKIFMVNDSDIKYNKSFSEELEDSVIMEITGDDYYLFESIEQVYSGFILSEILGDEHNISSAMVQRFNKHKKDKKHLKSLFKITTLKEYYKSIFHSKKAEKVSYTAYINNESSCSNEQLNKSIKAILEKYKVELSDNKDYIYCIEQIEKEDFLKKIRSKENVGIPYQLHKQELEQILVKQSKFYPSLDIEKILSILTFKIPYYVGPLVSEDKSEFAWMERLTEGEILPWNYKDVIDIDKTAEKFIRRMTNKCTYLPKEDVIPKNSILYSEFILLNELNKVRIGGKLLSMDLKRDIIRDVFKKYKNVTIKKIKDYLNNSDIAYSTKQGGVYNYDDEITGTQQENKFASSLTSYIDFEKIFGEGYVEDNPNKVEKIIEWLTIYNSKEIIRKQITKKYPEITKEQIKKILKKSYSGWSRLSARLLDGIKGNNVNHVDLTIINIMRKSNYNFMEIVNDDEFGFNDKINEIRLESNLNSTKVTYKEDIESLPTSPANKKGIWQSVKIVDEIIKIMSKGKDKNKPQRIYIEMARDNQEKKRTTSRRKMLDDLYKKIKNDSYFDYKIINDPEVVKDERIESSRLFLYLTQNGKCMYTGKPLHINQLSNYHIDHIIPQSFIKDDSFNNKVLVIAKANMDKLDQPVNSRMDIPKSVYILWENLEQQGLISKIKHNNLKKTSFSEQDYKGFISRQLVETRQISKHVLNIFKDYKYAKNVVSVKAQLTSSYRKANKLYKIRNLNDLHHAHDAYITCVVGKHIFDRQTKFTWKNYLKESTGSKYGFVIGGLNKNIELSDKVRKVLAYKNVLITKQLKENSGEDKGGFWKSTIHSNTSKGNNKIPLKENLSPEKYGFYTSENRAYCIAIEAKKGKKVFNRIVGVPVNIASSKNLEVALDKFIKDSLDVDEYKILKDKIYLNQLFIQGGSEFYIASEAYLHTATQLFLDNKFTLFIKDITSNKSIDKVNDSLFEEFYDYYIKKLETHYYKYSTISEKMTLNRDLFINLSKEEKTQIILKLLDVTKSGSSQIDLKKIGCSVGTGIIASFALNRDEMTFIDQSITGFYEKRYKL >NZ_CP035807.1|WP_149567973.1|1860123_1862877_-|ammonium-transporter METNLLDILWIIVASCLVFIMQAGFAMVESGLTRSKNSINVSIKNLTDLGVSTLFFWAIGFGLMFGKTKLGFIGRDNFLFSAKNTWVAAFFLFQAMFCSTSATIVSGAIAERVKYGAYIIATIFLSAIIYPIFGHWVWGGLINGNGSGWLSRLGFIDFAGSTVVHSLGGWVALAFLLIIGERTGRYDNNGIPVPINGNNIPMVVLGVLILWFGWFGFNGGSTLVMDSTVAGIILKTTLSASAGMVASLAFGWPILKKPDVTLVMNGALAGLVAITAPVHSVTEIQAIVIGLVGGVVMFLSTMVLDKLKIDDAVGAIPVHLSSGIWGTLAVGIFGNLDILNTGLNRGGQIIIQLVGIITCGVWAFGISFVFLFLLNKIYPLRIGLKEEIDGLNKSEHGTSTEIFDLYTVLHHQASTGDISLRAPVEPFTEVGQIAGIYNEVLDKLEENTVEKGDYLNILENVSDGIFLLSQNGGIGKYYSKSLELILEEKSLADFSFITFIEKILLEVDKNLFKDFLDVAFNPATQWRHVERLNPLREVDAYFDNNQGSFRTKHLVFNFKRVEKKGEIINLLVMVSDVSEEFELNKEIEHTRKKSHIEMELLYKILHVEPTVLREFFKFSNKDLIEINSIFQKGSDSSRDKLEKAFRLSHGIKGDAELLELNFISEKAEELELSMQKILKSSEIDTEDFIPLTLKFSELQNTFNKIQELLSKWAGFQANGGSIHNTDNYLKEHLVKMCSRLSTKYDKAVQLKLDGFSIEKFSEEQFKPIQNIIIQLMRNAIYHGIESSEKRVALGKKAIGLIYIKVEESEDTLHLVFSDDGEGLNLQNIRKKAYDERIITKEQFDKLSDNIIPRLIFKQGLSTAKKADVVAGKGVGMPLVNNLIRDLDGSITIRSRADVGCQFVIKIPKILNREVVTV >NZ_CP035807.1|WP_149567974.1|1862880_1863327_-|chemotaxis-protein-CheX MKESELKAFIKIVTEYFESITGIAAKMGLPFIKDESTGVFDFTGIIGVSGARKGGVYFTAPKELLYEFGGYLLEGDKVEDDDLYDLIGEMTNTISGNMREFFGTTFLISVPIVLKGQVENIDMRLNPPVFIIPIEWQYNDCHLAIGLE >NZ_CP035807.1|WP_149567975.1|1863323_1863689_-|response-regulator MKLLIVDDSNIMRRAINKYLKEFKLEIVGSACNGEEAVEICKSKKPDLVTLDITMPKMDGLTCLTEILKIAPETKILVISALSDYGTGLLALKKGAMGFLPKPFTASELQEEIKFICGIMV >NZ_CP035807.1|WP_149567976.1|1863866_1864970_+|aldo/keto-reductase MLYKMYGKTGKRVSAVGFGGMRFDETKTIEENAEIVRYASSKGINYFDTAPGYCSDTSEDIFGEAFKNMPNPFYVSTKGMPTTYDTAEKAIDAVKKSIKRMGLKKIDFYHIWCIRKSEHYELAMKPGGQYEGLLQCQKEGLIDHIVLSSHQNGNEVKEILIDKKIDGILLGVNILNFPYRWEAVETAYNMGYGVVAMNPLSGGAIPTHEKELQFLTNGKETATEAALRFVISCPQITIALNGFTTKEHIDTACKIANESKPFEQDEIKRIENLVGESMNEACTGCGYCDKCPQGIAIPSFLQYYNEKHVFHKSDKEMKENIVGAYEWGILAGKKGTAADCTSCGLCEDECTQHLPIIDRLKEITSWT >NZ_CP035807.1|WP_149567977.1|1865077_1866913_+|HAMP-domain-containing-protein 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_CP035807_4 | 4.16|1852613|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1852613-1852642 | 30 | NZ_CP015111 | Acinetobacter sp. TGL-Y2 plasmid unnamed1, complete sequence | 41649-41678 | 7 | 0.767 |
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NZ_CP035807_4 | 4.25|1853207|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853207-1853236 | 30 | MN855791 | Bacteriophage sp. isolate 82, complete genome | 3187-3216 | 7 | 0.767 |
NZ_CP035807_4 | 4.25|1853207|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853207-1853236 | 30 | KT240186 | Dickeya phage BF25/12, complete genome | 21225-21254 | 7 | 0.767 |
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NZ_CP035807_4 | 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853537-1853566 | 30 | MF288922 | Bacillus phage Janet, complete genome | 38827-38856 | 7 | 0.767 |
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NZ_CP035807_4 | 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853537-1853566 | 30 | MK215646 | Bacillus phage vB_BthM-Goe5, complete genome | 36617-36646 | 7 | 0.767 |
NZ_CP035807_4 | 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853537-1853566 | 30 | KU737346 | Bacillus phage Vinny, complete genome | 39089-39118 | 7 | 0.767 |
NZ_CP035807_4 | 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853537-1853566 | 30 | NC_024207 | Bacillus phage Evoli, complete genome | 38484-38513 | 7 | 0.767 |
NZ_CP035807_4 | 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853537-1853566 | 30 | MF498901 | Bacillus phage Anthony, complete genome | 39090-39119 | 7 | 0.767 |
NZ_CP035807_4 | 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853537-1853566 | 30 | NC_018856 | Bacillus phage Bastille, complete genome | 12736-12765 | 7 | 0.767 |
NZ_CP035807_4 | 4.32|1853669|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853669-1853698 | 30 | NC_008012 | Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 1, complete sequence | 463-492 | 7 | 0.767 |
NZ_CP035807_4 | 4.32|1853669|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853669-1853698 | 30 | NC_020128 | Lawsonia intracellularis N343 plasmid 1, complete sequence | 509-538 | 7 | 0.767 |
NZ_CP035807_3 | 3.3|1849788|30|NZ_CP035807|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1849788-1849817 | 30 | NZ_CP021819 | Sinorhizobium meliloti strain M162 plasmid psymA, complete sequence | 192803-192832 | 8 | 0.733 |
NZ_CP035807_3 | 3.4|1849854|30|NZ_CP035807|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1849854-1849883 | 30 | KX815270 | Methylophilaceae phage P19250A, complete genome | 13783-13812 | 8 | 0.733 |
NZ_CP035807_3 | 3.4|1849854|30|NZ_CP035807|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1849854-1849883 | 30 | MT774398 | CrAssphage cr60_1, complete genome | 87893-87922 | 8 | 0.733 |
NZ_CP035807_3 | 3.4|1849854|30|NZ_CP035807|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1849854-1849883 | 30 | NZ_AP019717 | Clostridium butyricum strain NBRC 13949 plasmid pCBU1, complete sequence | 247455-247484 | 8 | 0.733 |
NZ_CP035807_3 | 3.5|1849920|30|NZ_CP035807|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1849920-1849949 | 30 | NZ_LR214939 | Mycoplasma salivarium strain NCTC10113 plasmid 2 | 342965-342994 | 8 | 0.733 |
NZ_CP035807_3 | 3.8|1850118|30|NZ_CP035807|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1850118-1850147 | 30 | KY921761 | Bacillus phage BeachBum, complete genome | 8036-8065 | 8 | 0.733 |
NZ_CP035807_4 | 4.5|1851887|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT | 1851887-1851916 | 30 | NC_019774 | Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.04, complete sequence | 36679-36708 | 8 | 0.733 |
NZ_CP035807_4 | 4.15|1852547|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1852547-1852576 | 30 | NZ_CP023068 | Ensifer sojae CCBAU 05684 plasmid pSJ05684b, complete sequence | 417057-417086 | 8 | 0.733 |
NZ_CP035807_4 | 4.17|1852679|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1852679-1852708 | 30 | NZ_CP042840 | Enterococcus sp. DA9 plasmid unnamed4 | 51836-51865 | 8 | 0.733 |
NZ_CP035807_4 | 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1852943-1852972 | 30 | NZ_CP040783 | Bacillus thuringiensis strain HM-311 plasmid p1, complete sequence | 277107-277136 | 8 | 0.733 |
NZ_CP035807_4 | 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1852943-1852972 | 30 | AP017992 | Planktothrix agardhii NIES-204 plasmid plasmid1 DNA, complete sequence | 54610-54639 | 8 | 0.733 |
NZ_CP035807_4 | 4.23|1853075|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853075-1853104 | 30 | NZ_CP014580 | Burkholderia sp. OLGA172 plasmid pOLGA1, complete sequence | 225616-225645 | 8 | 0.733 |
NZ_CP035807_4 | 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853537-1853566 | 30 | NC_022880 | Enterococcus mundtii QU 25 plasmid pQY039, complete sequence | 13121-13150 | 8 | 0.733 |
NZ_CP035807_3 | 3.2|1849722|30|NZ_CP035807|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1849722-1849751 | 30 | NZ_CP043512 | Enterobacter kobei strain EB_P8_L5_01.19 plasmid unnamed1, complete sequence | 124277-124306 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_3 | 3.3|1849788|30|NZ_CP035807|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1849788-1849817 | 30 | NZ_AP022607 | Mycobacterium branderi strain JCM 12687 plasmid pJCM12687 | 280575-280604 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.16|1852613|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1852613-1852642 | 30 | NZ_CP023312 | Vibrio anguillarum strain VIB12 isolate Sea bass plasmid p292, complete sequence | 57296-57325 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1852943-1852972 | 30 | NZ_KU302800 | Enterobacter cloacae strain SZECL1 plasmid pKPC3_SZ clone ST231, complete sequence | 4933-4962 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1852943-1852972 | 30 | NZ_CP040856 | Lactobacillus johnsonii strain G2A plasmid unnamed2, complete sequence | 49488-49517 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1852943-1852972 | 30 | NZ_CP042976 | Klebsiella pneumoniae strain KPN55602 plasmid pK55602_2, complete sequence | 6209-6238 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1852943-1852972 | 30 | NZ_MN268581 | Klebsiella pneumoniae strain KP18-50 plasmid pKP18-50-tet(A), complete sequence | 8072-8101 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1852943-1852972 | 30 | NZ_MF156712 | Morganella morganii strain GN28 plasmid pGN28-KPC, complete sequence | 4933-4962 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1852943-1852972 | 30 | NZ_MF156709 | Klebsiella aerogenes strain E20 plasmid pE20-KPC, complete sequence | 4933-4962 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1852943-1852972 | 30 | NZ_MF156710 | Proteus mirabilis strain GN2 plasmid pGN2-KPC, complete sequence | 4933-4962 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1852943-1852972 | 30 | NZ_MF156711 | Serratia marcescens strain GN26 plasmid pGN26-KPC, complete sequence | 4933-4962 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1852943-1852972 | 30 | MH926056 | Corynebacterium phage Cruella, complete genome | 21521-21550 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1852943-1852972 | 30 | MG198776 | Corynebacterium phage C3PO, complete genome | 21521-21550 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1852943-1852972 | 30 | MK977700 | Corynebacterium phage Stickynote, complete genome | 21788-21817 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1852943-1852972 | 30 | NZ_CP024709 | Klebsiella pneumoniae strain cr-hvkp3 plasmid pPUTH2, complete sequence | 44252-44281 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.22|1853009|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853009-1853038 | 30 | MH791397 | UNVERIFIED: Enterococcus phage EfsSzw-1, complete genome | 144923-144952 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.22|1853009|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853009-1853038 | 30 | AP017994 | Planktothrix agardhii NIES-204 plasmid plasmid3 DNA, complete sequence | 49606-49635 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.25|1853207|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853207-1853236 | 30 | MK268686 | Enterococcus phage vB_EfaH_EF1TV, complete genome | 9866-9895 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.25|1853207|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853207-1853236 | 30 | AP018714 | Enterococcus phage phiEF17H DNA, complete sequence | 118001-118030 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.25|1853207|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853207-1853236 | 30 | MK693030 | Enterococcus phage vB_EfaM_Ef2.1, complete genome | 10296-10325 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.25|1853207|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853207-1853236 | 30 | NC_009904 | Enterococcus phage phiEF24C, complete genome | 115098-115127 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.25|1853207|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853207-1853236 | 30 | AP009390 | Enterococcus phage phiEF24C DNA, complete genome | 115098-115127 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.25|1853207|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853207-1853236 | 30 | CAJDJY010000002 | Enterococcus phage 156 genome assembly, contig: phage156-genome, whole genome shotgun sequence | 115917-115946 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.25|1853207|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853207-1853236 | 30 | AB609718 | Enterococcus phage phiEF24C-P2 DNA, complete genome | 115098-115127 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.25|1853207|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853207-1853236 | 30 | LR031359 | Enterococcus phage 156, complete genome | 115917-115946 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.25|1853207|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853207-1853236 | 30 | NC_029026 | Enterococcus phage EFLK1, complete genome | 12983-13012 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.31|1853603|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853603-1853632 | 30 | NZ_CP013109 | Sinorhizobium americanum strain CFNEI 73 plasmid B, complete sequence | 527560-527589 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.31|1853603|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853603-1853632 | 30 | NZ_CP013053 | Sinorhizobium americanum CCGM7 plasmid B, complete sequence | 488139-488168 | 9 | 0.7 |
NZ_CP035807_4 | 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1853537-1853566 | 30 | MG543995 | Staphylococcus phage UPMK_1, partial genome | 11219-11248 | 10 | 0.667 |
1. spacer 3.9|1850184|30|NZ_CP035807|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031226 (Pseudomonas amygdali pv. lachrymans str. M301315 plasmid pMPPla107, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
agatccaggg--agatagaattttctgatgat CRISPR spacer --atcgagaggtagttagaattttctgatgat Protospacer *** **.* ** *****************
2. spacer 4.5|1851887|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT matches to KP735928 (Staphylococcus phage IME-SA4, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
atgta-aaatgttggcattactttaaaaatt CRISPR spacer -tgaacaaatgatggcattaatttaaaaata Protospacer ** * ***** ******** *********
3. spacer 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP062992 (Klebsiella phage AShe-2020a, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
gaaacg-aaggttttgattacttctggaaaa CRISPR spacer -atgcgtaaggttatgatttcttctggaaaa Protospacer * .** ****** ***** ***********
4. spacer 3.2|1849722|30|NZ_CP035807|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040343 (Bacillus cereus strain DLOU-Weihai plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
gcttcatcatgagaaataatgctatttaaa CRISPR spacer gatatttcatgaaaaataaagctatttaaa Protospacer * * . ******.****** **********
5. spacer 3.2|1849722|30|NZ_CP035807|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP041978 (Bacillus pacificus strain NCCP 15909 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
gcttcatcatgagaaataatgctatttaaa CRISPR spacer gatatttcatgaaaaataaagctatttaaa Protospacer * * . ******.****** **********
6. spacer 3.2|1849722|30|NZ_CP035807|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP041980 (Bacillus paranthracis strain NCCP 15910 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
gcttcatcatgagaaataatgctatttaaa CRISPR spacer gatatttcatgaaaaataaagctatttaaa Protospacer * * . ******.****** **********
7. spacer 3.2|1849722|30|NZ_CP035807|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP053317 (Salmonella enterica subsp. salamae serovar 6,8:a:z52 strain 62-3163 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
gcttcatcatgagaaataatgctatttaaa CRISPR spacer tcttcatcatgagtaataatgatacatgaa Protospacer ************ ******* **. *.**
8. spacer 4.1|1851623|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT matches to KF929199 (Staphylococcus phage vB_SepS_SEP9, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
gtgttgaattagtagctgaggaagagttaa CRISPR spacer ttatcaaattagtagtttaggaagagttaa Protospacer *.*..*********.* ************
9. spacer 4.7|1852019|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694730 (Marine virus AFVG_250M981, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tccggaagcaaccaggatggttactaaagt CRISPR spacer tccggaaggaaccagggtggttactgataa Protospacer ******** *******.********.* .
10. spacer 4.16|1852613|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY971610 (Pseudomonas phage PspYZU05, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
attccattgcaattttaactttaggcgtta CRISPR spacer attctcttgcaattttaactttagtcttat Protospacer ****. ****************** * *
11. spacer 4.29|1853471|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693652 (Marine virus AFVG_250M189, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
---atctcaacatggattccttttatatcaaaa CRISPR spacer ccagtttcatca---attccttttatatcaaaa Protospacer .*.*** ** ******************
12. spacer 3.4|1849854|30|NZ_CP035807|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT774383 (CrAssphage cr11_1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aagagtgcttagatctttatctttatcaaa CRISPR spacer ataaggatttaaatctttatctttatcaag Protospacer * .** ..***.*****************.
13. spacer 3.5|1849920|30|NZ_CP035807|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028328 (Lactobacillus sp. D1501 plasmid p2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
agatataaatcaaacgagacttaataatat CRISPR spacer ccttataaatcatacgaggcttaatacttt Protospacer ********* *****.******* * *
14. spacer 3.7|1850052|30|NZ_CP035807|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT767754 (Microcystis phage vB_MweS-yong1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aagtggcagggtattgttaggagtattgac-- CRISPR spacer tggtggcagggtattgttgggagtg--ggcta Protospacer .****************.*****. *.*
15. spacer 4.7|1852019|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694725 (Marine virus AFVG_250M823, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tccggaagcaaccaggatggttactaaagt CRISPR spacer tccggaaggaaccaggatcgttacggataa Protospacer ******** ********* ***** .* .
16. spacer 4.14|1852481|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_014633 (Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gtagtttagcattactagttttattattag CRISPR spacer gtattttagcagtactagttttagttgtgc Protospacer *** ******* *********** * *.
17. spacer 4.14|1852481|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694403 (Marine virus AFVG_250M373, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gtagtttagcattactagttttattattag CRISPR spacer gacctttagcattaccacttttattataaa Protospacer * ***********.* ********* *.
18. spacer 4.15|1852547|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LC553734 (Escherichia phage EK010 DNA, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ttctcacccgattcatcaagaacatctgtt CRISPR spacer cagtcaccagattcaacaagaacatcttgt Protospacer . ***** ****** *********** *
19. spacer 4.16|1852613|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP015111 (Acinetobacter sp. TGL-Y2 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
attccattgcaattttaactttaggcgtta CRISPR spacer catccatggcaattttaactttaagctaca Protospacer ***** ***************.** .*
20. spacer 4.22|1853009|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP031268 (Staphylococcus warneri strain 16A plasmid unnamed2) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
-----taggtatttagtcaaattatagtttgtatg CRISPR spacer gttaacagg-----agtcaaattatagtttctatg Protospacer .*** **************** ****
21. spacer 4.25|1853207|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN855796 (Siphoviridae sp. isolate 92, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aaagtccaacctctgccacaaagttatccc CRISPR spacer taaggccaacctctggcacaaagttcttga Protospacer *** ********** ********* *.
22. spacer 4.25|1853207|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN855791 (Bacteriophage sp. isolate 82, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aaagtccaacctctgccacaaagttatccc CRISPR spacer taaggccaacctctggcacaaagttcttga Protospacer *** ********** ********* *.
23. spacer 4.25|1853207|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KT240186 (Dickeya phage BF25/12, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aaagtccaacctctgccacaaagttatccc CRISPR spacer taaggccaacctctggcacaaagttcttga Protospacer *** ********** ********* *.
24. spacer 4.26|1853273|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011737 (Gloeothece citriformis PCC 7424 plasmid pP742402, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cttagatgatttgttagaaaacggttttat CRISPR spacer tttagatgatttattagaaaacttgcttaa Protospacer .***********.********* .***
25. spacer 4.27|1853339|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN692986 (Marine virus AFVG_117M62, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
agcatccgtgatagaataattattaatagt CRISPR spacer agagataatggtagaataattattaatagt Protospacer ** . . .**.*******************
26. spacer 4.27|1853339|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP031652 (Pantoea agglomerans strain TH81 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
agcatccgtgatagaataattattaatagt CRISPR spacer acgctacgtgatagaataattaataatttt Protospacer * * **************** **** *
27. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_047733 (Synechococcus phage S-RIM8 isolate RW_22_0300, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer ctgaagtcttctttcaattatgtcattaac Protospacer * ********* **** *********
28. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JF974289 (Synechococcus phage S-RIM8 A.HR3, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer ctgaagtcttctttcaattatgtcattaac Protospacer * ********* **** *********
29. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK493323 (Synechococcus phage S-RIM8 isolate RW_03_0617, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer ctgaagtcttctttcaattatgtcattaac Protospacer * ********* **** *********
30. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK493325 (Synechococcus phage S-RIM8 isolate RW_62_0316, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer ctgaagtcttctttcaattatgtcattaac Protospacer * ********* **** *********
31. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK493322 (Synechococcus phage S-RIM8 isolate RW_01_0115_WH8101, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer ctgaagtcttctttcaattatgtcattaac Protospacer * ********* **** *********
32. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KX349288 (Synechococcus phage S-RIM8 isolate RW_08_0711, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer ctgaagtcttctttcaattatgtcattaac Protospacer * ********* **** *********
33. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_020486 (Synechococcus phage S-RIM8 A.HR1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer ctgaagtcttctttcaattatgtcattaac Protospacer * ********* **** *********
34. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KX349286 (Synechococcus phage S-RIM8 isolate RW_03_0807_WH8101, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer ctgaagtcttctttcaattatgtcattaac Protospacer * ********* **** *********
35. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to HQ317385 (Synechococcus phage S-RIM8 A.HR5, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer ctgaagtcttctttcaattatgtcattaac Protospacer * ********* **** *********
36. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK493324 (Synechococcus phage S-RIM8 isolate RW_22_0214, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer ctgaagtcttctttcaattatgtcattaac Protospacer * ********* **** *********
37. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KX349290 (Synechococcus phage S-RIM8 isolate RW_25_1112, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer ctgaagtcttctttcaattatgtcattaac Protospacer * ********* **** *********
38. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KX349285 (Synechococcus phage S-RIM8 isolate RW_01_0212_WH8101, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer ctgaagtcttctttcaattatgtcattaac Protospacer * ********* **** *********
39. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KX349287 (Synechococcus phage S-RIM8 isolate RW_06_0613, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer ctgaagtcttctttcaattatgtcattaac Protospacer * ********* **** *********
40. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY290955 (Aeromonas phage 65.2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgt-cttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer -atagatggttctttaaattctgtcaataaa Protospacer .* .* ***************** ****
41. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_015251 (Aeromonas phage 65, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgt-cttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer -atagatggttctttaaattctgtcaataaa Protospacer .* .* ***************** ****
42. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JF974293 (Cyanophage KBS-M-1A genomic sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer ctgaagtcttctttcaattatgtcattaac Protospacer * ********* **** *********
43. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN032614 (Aeromonas phage PS1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
-cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer gcattt-tcttctttaaattctgtttttaat Protospacer *.*.. *****************. ****
44. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH538296 (Bacillus phage Maceta, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer tctgcttcttttttcaattctgtcattaat Protospacer . * * ****.*** **************
45. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN453779 (Aeromonas phage PS2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
-cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer gcattt-tcttctttaaattctgtttttaat Protospacer *.*.. *****************. ****
46. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_007930 (Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pMP118, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer gaaccgtcttcgttaaatgctgtcataaga Protospacer . ******** ****** ******* *.*
47. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer gcttcgtgatctttaaattctgtcatttga Protospacer *.*** ****************** .*
48. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF288922 (Bacillus phage Janet, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer tctgcttcttttttcaattctgtcattaat Protospacer . * * ****.*** **************
49. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_024216 (Bacillus phage CAM003, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer tctgcttcttttttcaattctgtcattaat Protospacer . * * ****.*** **************
50. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ489400 (Bacillus phage Hoody T, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer tctgcttcttttttcaattctgtcattaat Protospacer . * * ****.*** **************
51. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF288921 (Bacillus phage OTooleKemple52, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer tctgcttcttttttcaattctgtcattaat Protospacer . * * ****.*** **************
52. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH638310 (Bacillus phage Kamfam, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer tctgcttcttttttcaattctgtcattaat Protospacer . * * ****.*** **************
53. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK215646 (Bacillus phage vB_BthM-Goe5, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer tctgcttcttttttcaattctgtcattaat Protospacer . * * ****.*** **************
54. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KU737346 (Bacillus phage Vinny, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer tctgcttcttttttcaattctgtcattaat Protospacer . * * ****.*** **************
55. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_024207 (Bacillus phage Evoli, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer tctgcttcttttttcaattctgtcattaat Protospacer . * * ****.*** **************
56. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF498901 (Bacillus phage Anthony, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer tctgcttcttttttcaattctgtcattaat Protospacer . * * ****.*** **************
57. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_018856 (Bacillus phage Bastille, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer tctgcttcttttttcaattctgtcattaat Protospacer . * * ****.*** **************
58. spacer 4.32|1853669|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_008012 (Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
taatcatcgtaagaacctgtaactttatat CRISPR spacer aatactacgttagaacctgtaaccttatat Protospacer * * *** ************.******
59. spacer 4.32|1853669|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_020128 (Lawsonia intracellularis N343 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
taatcatcgtaagaacctgtaactttatat CRISPR spacer aatactacgttagaacctgtaaccttatat Protospacer * * *** ************.******
60. spacer 3.3|1849788|30|NZ_CP035807|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021819 (Sinorhizobium meliloti strain M162 plasmid psymA, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
accttctgattcccaccgctcttggattaa CRISPR spacer accttctgattccgaccgctcgagggcagc Protospacer ************* ******* **.. .
61. spacer 3.4|1849854|30|NZ_CP035807|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX815270 (Methylophilaceae phage P19250A, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aagagtgcttagatctttatctttatcaaa CRISPR spacer atatacacttggatctttatctttaccaaa Protospacer * . ...***.**************.****
62. spacer 3.4|1849854|30|NZ_CP035807|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT774398 (CrAssphage cr60_1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aagagtgcttagatctttatctttatcaaa CRISPR spacer gcgttctcttaaatctttatctgtatcaaa Protospacer . * . ****.********** *******
63. spacer 3.4|1849854|30|NZ_CP035807|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP019717 (Clostridium butyricum strain NBRC 13949 plasmid pCBU1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aagagtgcttagatctttatctttatcaaa CRISPR spacer ttcaatcattatatctttatctttatcaag Protospacer *.* *** *****************.
64. spacer 3.5|1849920|30|NZ_CP035807|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR214939 (Mycoplasma salivarium strain NCTC10113 plasmid 2) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
agatataaatcaaacgagacttaataatat CRISPR spacer gtccataaatcaaaggagatttaataaagt Protospacer . .********** ****.******* .*
65. spacer 3.8|1850118|30|NZ_CP035807|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KY921761 (Bacillus phage BeachBum, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
agatagattatctagtttatcccatgatat CRISPR spacer tacaaagttatctagtttatcccaagataa Protospacer . *..***************** ****
66. spacer 4.5|1851887|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019774 (Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.04, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
atgtaaaatgttggcattactttaaaaatt CRISPR spacer atagtgctggttggcatttctttaaaaatt Protospacer **. . ********* ***********
67. spacer 4.15|1852547|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP023068 (Ensifer sojae CCBAU 05684 plasmid pSJ05684b, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ttctcacccgattcatcaagaacatctgtt CRISPR spacer cctgtaaccgattgaccaagaacatctgtt Protospacer ... .* ****** *.**************
68. spacer 4.17|1852679|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP042840 (Enterococcus sp. DA9 plasmid unnamed4) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctggctctgttaactcttcaaatgtataaa CRISPR spacer tagactgttttaactcttcaaatgtatttg Protospacer . *.** * ****************** .
69. spacer 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP040783 (Bacillus thuringiensis strain HM-311 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
gaaacgaaggttttgattacttctggaaaa CRISPR spacer aagaaaaaggttttgattacttcgggagtg Protospacer .*.* .***************** ***. .
70. spacer 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AP017992 (Planktothrix agardhii NIES-204 plasmid plasmid1 DNA, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
gaaacgaaggttttgattacttctggaaaa CRISPR spacer ttttctaaggttttaattaattctggaaac Protospacer * ********.**** *********
71. spacer 4.23|1853075|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP014580 (Burkholderia sp. OLGA172 plasmid pOLGA1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ggtggtatcatgtggggcatgttcactctt CRISPR spacer tatctgttcctgtggggcatgttcacgctt Protospacer .* ** **************** ***
72. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_022880 (Enterococcus mundtii QU 25 plasmid pQY039, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer atatctccttctttaattgctgtcattaaa Protospacer .* .********* * ***********
73. spacer 3.2|1849722|30|NZ_CP035807|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP043512 (Enterobacter kobei strain EB_P8_L5_01.19 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gcttcatcatgagaaataatgctatttaaa CRISPR spacer tactcataatgagaaataatgcttttgttt Protospacer .**** *************** **
74. spacer 3.3|1849788|30|NZ_CP035807|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP022607 (Mycobacterium branderi strain JCM 12687 plasmid pJCM12687) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
accttctgattcccaccgctcttggattaa CRISPR spacer gccttctgattcccagcgttcttgtgcggt Protospacer .************** **.***** .. .
75. spacer 4.16|1852613|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP023312 (Vibrio anguillarum strain VIB12 isolate Sea bass plasmid p292, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
attccattgcaattttaactttaggcgtta CRISPR spacer tacaagttgcaatcttaactttagtcgttg Protospacer . .*******.********** ****.
76. spacer 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KU302800 (Enterobacter cloacae strain SZECL1 plasmid pKPC3_SZ clone ST231, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gaaacgaaggttttgattacttctggaaaa CRISPR spacer aaaacgaaggttttgtttactttttccgtt Protospacer .************** ******.* .
77. spacer 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP040856 (Lactobacillus johnsonii strain G2A plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gaaacgaaggttttgattacttctggaaaa CRISPR spacer aatcacccagttttgatgacttctggaaaa Protospacer .* .******** ************
78. spacer 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP042976 (Klebsiella pneumoniae strain KPN55602 plasmid pK55602_2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gaaacgaaggttttgattacttctggaaaa CRISPR spacer aaaacgaaggttttgtttactttttccgtt Protospacer .************** ******.* .
79. spacer 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MN268581 (Klebsiella pneumoniae strain KP18-50 plasmid pKP18-50-tet(A), complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gaaacgaaggttttgattacttctggaaaa CRISPR spacer aaaacgaaggttttgtttactttttccgtt Protospacer .************** ******.* .
80. spacer 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MF156712 (Morganella morganii strain GN28 plasmid pGN28-KPC, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gaaacgaaggttttgattacttctggaaaa CRISPR spacer aaaacgaaggttttgtttactttttccgtt Protospacer .************** ******.* .
81. spacer 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MF156709 (Klebsiella aerogenes strain E20 plasmid pE20-KPC, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gaaacgaaggttttgattacttctggaaaa CRISPR spacer aaaacgaaggttttgtttactttttccgtt Protospacer .************** ******.* .
82. spacer 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MF156710 (Proteus mirabilis strain GN2 plasmid pGN2-KPC, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gaaacgaaggttttgattacttctggaaaa CRISPR spacer aaaacgaaggttttgtttactttttccgtt Protospacer .************** ******.* .
83. spacer 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MF156711 (Serratia marcescens strain GN26 plasmid pGN26-KPC, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gaaacgaaggttttgattacttctggaaaa CRISPR spacer aaaacgaaggttttgtttactttttccgtt Protospacer .************** ******.* .
84. spacer 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH926056 (Corynebacterium phage Cruella, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gaaacgaaggttttgattacttctggaaaa CRISPR spacer gcaacgaaggttttgattccttcgtatctc Protospacer * **************** **** .
85. spacer 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG198776 (Corynebacterium phage C3PO, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gaaacgaaggttttgattacttctggaaaa CRISPR spacer gcaacgaaggttttgattccttcgtatctc Protospacer * **************** **** .
86. spacer 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK977700 (Corynebacterium phage Stickynote, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gaaacgaaggttttgattacttctggaaaa CRISPR spacer gcaacgaaggttttgattccttcgtatctc Protospacer * **************** **** .
87. spacer 4.21|1852943|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP024709 (Klebsiella pneumoniae strain cr-hvkp3 plasmid pPUTH2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gaaacgaaggttttgattacttctggaaaa CRISPR spacer aaaacgaaggttttgtttactttttccgtt Protospacer .************** ******.* .
88. spacer 4.22|1853009|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH791397 (UNVERIFIED: Enterococcus phage EfsSzw-1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
taggtatttagtcaaattatagtttgtatg CRISPR spacer cttacatttactcaaattataatttgtaca Protospacer . ..***** **********.******..
89. spacer 4.22|1853009|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AP017994 (Planktothrix agardhii NIES-204 plasmid plasmid3 DNA, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
taggtatttagtcaaattatagtttgtatg CRISPR spacer agaagttttagtaaaattatagtttatatt Protospacer ... ****** ************.***
90. spacer 4.25|1853207|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK268686 (Enterococcus phage vB_EfaH_EF1TV, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aaagtccaacctctgccacaaagttatccc CRISPR spacer gttctccaagctctaccacaaagttatttg Protospacer . ***** ****.************..
91. spacer 4.25|1853207|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AP018714 (Enterococcus phage phiEF17H DNA, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aaagtccaacctctgccacaaagttatccc CRISPR spacer gttctccaagctctaccacaaagttatttg Protospacer . ***** ****.************..
92. spacer 4.25|1853207|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK693030 (Enterococcus phage vB_EfaM_Ef2.1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aaagtccaacctctgccacaaagttatccc CRISPR spacer gttctccaagctctaccacaaagttatttg Protospacer . ***** ****.************..
93. spacer 4.25|1853207|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_009904 (Enterococcus phage phiEF24C, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aaagtccaacctctgccacaaagttatccc CRISPR spacer gttctccaagctctaccacaaagttatttg Protospacer . ***** ****.************..
94. spacer 4.25|1853207|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AP009390 (Enterococcus phage phiEF24C DNA, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aaagtccaacctctgccacaaagttatccc CRISPR spacer gttctccaagctctaccacaaagttatttg Protospacer . ***** ****.************..
95. spacer 4.25|1853207|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CAJDJY010000002 (Enterococcus phage 156 genome assembly, contig: phage156-genome, whole genome shotgun sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aaagtccaacctctgccacaaagttatccc CRISPR spacer gttctccaagctctaccacaaagttatttg Protospacer . ***** ****.************..
96. spacer 4.25|1853207|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AB609718 (Enterococcus phage phiEF24C-P2 DNA, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aaagtccaacctctgccacaaagttatccc CRISPR spacer gttctccaagctctaccacaaagttatttg Protospacer . ***** ****.************..
97. spacer 4.25|1853207|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LR031359 (Enterococcus phage 156, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aaagtccaacctctgccacaaagttatccc CRISPR spacer gttctccaagctctaccacaaagttatttg Protospacer . ***** ****.************..
98. spacer 4.25|1853207|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_029026 (Enterococcus phage EFLK1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aaagtccaacctctgccacaaagttatccc CRISPR spacer gttctccaagctctaccacaaagttatttg Protospacer . ***** ****.************..
99. spacer 4.31|1853603|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013109 (Sinorhizobium americanum strain CFNEI 73 plasmid B, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tctatgaagttcgccctggaggggcacaac CRISPR spacer gggcagaagttcggcctggaggggcatggc Protospacer ******** ************...*
100. spacer 4.31|1853603|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013053 (Sinorhizobium americanum CCGM7 plasmid B, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tctatgaagttcgccctggaggggcacaac CRISPR spacer gggcagaagttcggcctggaggggcatggc Protospacer ******** ************...*
101. spacer 4.30|1853537|30|NZ_CP035807|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG543995 (Staphylococcus phage UPMK_1, partial genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.667
cgtccgtcttctttaaattctgtcattaaa CRISPR spacer taaggtagttctttaaattctgttattaac Protospacer .. ***************.*****
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
494253 : 523652
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP035807|494253:523652|DBSCAN-SWA GTTATACTTCACGTCTAGACCTCAACGTAGATTTAGAAATGATTCGAAATAAGAAGAACAAACCAAGCGATAAACACACTATACCCAAAATATCAAGATACCATACTTGAAATGAAACTGAATTATCTCTCGTATAACCGTTAATATTATGAATAATTTTAGAACTAATAAAACCCCATAAATTACTAAAAAAATGAATTACTACGCAATAAACAATTGAAGAACTGTAAACAAAAATAATAGCCAGAAGAATTCCTATTGGTAAAGCATATATAAATCTTAACACACCACTATGAAATAGTGAAAAAACTATAGAAGAAATAAGTATTGATTTAAAAACTGTTAAATATCGACAAAGGTAAGTCAAAAAAAGAAATCTAAATATCCACTCTTCCAACACAGAAGGGATAATACATAACTTAATGACACTTAGAATACTTATTTCATTATCATCAAAAAAAGAATTACTATTTTCGATTTTAAAAAAAAATACAAATATATTATTTATTTCAGAGCTTACAATATCATAGCCAAAAACAATAAGTAGTATTGGTATCAAAGATAGTAGGTTGAATCCTAGATGCTGCTTTTTAATTTCAAATAATTCCATAATTATTTTTGACTCCTTAAACCTCCCAATTAATTGAGAGGCTTTTGCTATTTGTTATCTATTATGTGTATTGATTCCTTCTCTACCATCTTTATACCCTGCAACAAATGACTTCCCTGCATCATATATTGCAGCAGCTGTTAATATTAAGCCGATAACTGCTAAGGGTGCAATTCCACCATTTACTCTTTGAGAATCTTCTTCAGTTAATTCTGTAAAACCTTTAAAATTTTTCATTATATACCATCCTATTAATATCTAGAATAACCAGGTAACTGGCTAACCGTTTTATTTACTACATATGTAGCTGCTTTTACTACTAAACTTTTAGCTGTATTGATAGTCGAAGTAACTGCCGAACCCACTTTATTACCTAACTCATACAGAGAGTCATTGATAATACTGCCTCCTGTACGTCCTCCATCAATCATTAACATTTCAGATTCATCAAGATTGTTAAAACTTATTGATTTCATTTTTTGTTCTTTTTTACTGGCCAGTTTTTATAGAACTTTTTTATCTAAACCTACATCAACGATGTATTAGTTTTTAATTATAACTTGTTAGGATTAACTCCTATATAAACATCAATCTCCATTTCATCAACAGAAATACCATGAGTCTGATCTTTTACACTTATATTGTAACCAGATGTTATAGGTTGTAGTCCATTTACTTGAATGTAAGTATTCATTTCATTATATGTATTTTGAATTAAATTAGGATTACCTACATGTTTCTTAAATATTGCATTTGTTAAATGGAATTCTTTTTTTAATAAATATGTATTATCAATTTTTACACTATGTTTTATAGGTATTAATATTTCCATATCTACAATTTGTTCATTAAGTATCTGTTCAACTGAAAATGTTGTAGTAACTATAGGACCATTTTTTTCAATATTGTTTTCTTTTAAATATTACTCTAGATTTAACATCTCTTCCTGAATCTGTTTCATTGTCATCTTTTTTCTTACCGATAAAAGATTCTCAAGTTTTAATTCTCTTGCTGTTTGTATCATTTTTAATAACCTCAACTTACATTACGAAGCAATATAAAAATTAGCAATCGCTCGTAAGAGTGAGTTCTAAAAGTACTCTAAAGTTCAACTAGAGTAAGATATTCATCCTTAAGAGTGATATAATTTACTCTATATTTTTATTTTTAAAGAGTGAAATATTTATGTTTGTTACAAAATATTTCACATCCTAAAGTTTGGATGTCTACAATATTCAAAAATAAGTGCTATATCTATTTTTTGACTAAGATGTAGTGTTTAGATTTGGCCTATGGATATAACGTGTAGTGATTTTTTTAATCAACTTACAAATACTTCATCGATTAAAAATAGAATGCTCCTAAAATTCCTAAAAATGTGAATATTATGGATGATAAAAATATCTCAAACACAAGTTTTTTATGGGGAAATATCAATGACAAAAAAAGGCTATAGAGTCCTTTAGTTTCATCCTTCTTCTCAAAGGACTTATCATGGATCATTAAAATAAGAACTCCTGACCAAATCTTACAAAAGTCCTCTACGGTATAAGTAACAATACCTTCTCCGGGATCTGCAACTAATAAAGAACCTTTCTTGATCCTATGAATAACAACATAGTATAATAAGTTATCTTTAATTACATGGGCAATAGCAGGCAGAGGGAAATCTCCAATAAGACTAGATTGATCCCCTTTAACCCCCTTAGCAATAAAACATAGCTTATCTGCAGCTTACCAATCCTAAAGCATTGGTACCCATCTTGTCAGTACCAGCTATCTCCCGAATCTGGGAAATAGGTTTTTTATACCCATACTGTCTACAAATTGTCGCCAAACATGCGGCACCACAGTCTGTTATGTCGTGTTGTTTTATACAGTTATACTTCATTAAAAATCTTATATTTTCTGTTAATTATATTTACAACATGAAAGATAGTAAATGCAATTGCATAAGCAAATAAAAAACCTAATGATACCATCGAATTATCATAAAAGGATTTTGAAATGTGGCTTAGTATTAGTAACTATAGGCGAAAAATCCTAAATTAACTCGATTATTTATAAAATTCTTTAAATGTAAAACAATTGCTGTTGATATAAAACCACAGTAAGGATCAAAAGAATTATTTAGGGTTTAATTCAATATTTTATGGCATAAAAGAGCCTAAATCTATATTGTCACCCTTATCTGCTATTTCTGAAAAGATAGAATTTAAGTATTTATAAGGTTCAATATTATTAATCAAGCACTCTCTATTTATGAGTATAAAATAGCTCTTGAATACACACCATCAGGATAGTTATTTGCTGTTAGTACTGAAGAAGTTAATAGAATCACGCTACCCGCATAAGAAATTAAGACAAAAAATATACATAAATCTATCACTCTTAAGGATGAAAAAATACTTCTAACCTCATTGTAAAGCACTTTAATTATTCATCCCTAAGAGCGATTGCTAATTTTTATATTGATTCGTAATATACGTTGAGGTTCATAAAAATGATACAAACAGCAAGAGAATTAAAGCTTGAAAATCTTTTATCATTAAGAAAAAAGATGACAATGAGGCAAATTCAGGTAGAGATGAAAAATATTGAGTTATATTAATAAATGAATTAATATAAGAAAAATCTAATGAAATGAATACATATATTCAAGTCAATGGGATACAACCATTAACATCTGGTTATAATATAAGTGTAAAAGATCAACCACATAGTATATCTGTTGATGAAATGGAGATTGATGTTTGTATAGGTGTTAATCCTAATAAAATATAGTTTAAAACTAATACATCGTTGATGTAGGTTTATATAAAAAAGTCTGTTAAAACTGGCCAGTTGGGAATAGAACTAAAGTAGGGAATAAATGAAAGTTATTAGTAAAAAAGAATTAGAGAGTATTAATGGTGGAATGCTTCCTCAAGATTTTTATGAAACAGGTAAAGATATGAGTATGTTAACAGAAAAACAATGGGCCTCAGCACGTAAAATGCAAAAAGCTGTTGTAAGAGAACTCGTTGATACTGTTGAAGCAGCAAGAAGTTTTCTGGATCCTATATCACTTATTGGTAAAGGTATAAAGTATCTAGCTAGATAGGTTTTGGTGGTCTATAGTACCACCATTTGAGGATCATAATGAATAAAACCATCATATTATCAATAATTTACCCATTAATTCTATTAGTTTTATATCGTTTAGATATAAAAAATAAGAAAAATATTAATGTCATTGTTAAAAGTATTATAATTCAATTTTATTATATTGTTGTATATATAATTAACCATATTAATATTCGCGATATAATTCATTACAATTTTAACTCTGATAATGTTTTTTTAGAAGACATTTTATTCATCATGAGTATAATTCTCATTATATTATTTGATTATTTATTATTAAAAAGAGCTATAATAATAATAATAAAAAGTTATAAGAGTATATATATTGAAACCTTCTTTAATAAGAAGTTTATTTTCGGATTATATTTTGTGTTATTGACTATACTATATTTGTTATTAAAATTTTATTTTTTAGGTTTTGATTTTAAAAACTTTAGTCCAATTTTAATCTTTTATATTATATTATTAGCATCATTGGAAGAATGTATTTTTAGATTATATCCGTTATTGGTTATCAAAAAAAATAAGCTAATTACCAATAAGTTTAAGTTGCAGATAATGTATTCACTTATATTTATTGTATATCATCTGGGTTTTAATGTTCCCCAGCTTATTTATTTATTATTTTTCTCACAATATATGTTTTTTATATTGGAAAAAACTCGGAATATATTATTTCCAATAATCATACATGCTTTATTAAATATTTTTGATTACTCAATGATTTAATATGATTATTCTATTGTCCATTAAATATGGAAAAGTACTTGCCATTCTCACTTGGTCGCAGTAAGAATACCTGTGGAAATGGCAAGTATAATTGTAACCGTCAATTTAGTATGCCCTTAAAAAAATAAATAAAATATTACACCCTTAAGTCCGAGGGATAATATGAAAAGTCGAAAGAGCCACGAAGAGTGGAAATTATTAGTATCAGAGTTCAATAAATCAGGCCAGTCAGTTGCAGCTTTTAGTAGAGAAAATAACCTAAAAGCATCAACTTTTATTTATTGGGTTAAAATGTTCTCTATAAATACTGAAAAATCAAATTTGGTTAAGATAAAACCTAAAACGAGTAATTCTAAGAAAACTCATGATATTAAAATTATTGTTAATGATACAAAGATTGAGATCTGTGGAGTTATAAATTCAGATAAAATTAGTAAAATAATCGCTGTACTAATGGAAGTTAACTGATGTTTTTAGACCTAACTAAAATATCAATCTTCGTTCGCCCTGGATCAACAGATATGAGATCTCAGAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP035807|494253:523652|518402_519746_+|WP_149566843.1|DBSCAN-SWA MHQSIKNIKEYLDIFDEDDLNNAIRDLTITEILDQWDEFTKEEMVRLFTHVDQEFKVGLISEIPTQDQETILIELSASGINNVLSDMEPDDLVDLIQQISPDVRQSVWDSLPNEVKEETEFLLKFDEDDAAGLMTPRYAAIRKDITVSQAINFIRKRVEKVETIYYLYVVDEFKKLVGVISLKEILTSEDNVTIDTIMERHVLSAREDTDQEHVVKIMEDHDLLALPVINRYNKLLGIITIDDAIDVMREEQTEDVYKMGAMSGDTDSYLESGIFKLILKRIPWLIILLLAGTASTNVIAAFSDVTSMAFVILFMGVITQTGGNCGTQSSTLMIRGLATGEIHFRDFFKIIRKELLVGSLIGLVTGIIIILRSFLLPPGGILIQEALTIGLSLNFVVIFATIIGASIPLTLHKIGLDPTVAAGPLMSTVIDVCGYAIYFTTIRLVLF >NZ_CP035807|494253:523652|497734_497965_+|WP_149566819.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MKVISKKELESINGGMLPQDFYETGKDMSMLTEKQWASARKMQKAVVRELVDTVEAARSFLDPISLIGKGIKYLAR >NZ_CP035807|494253:523652|506360_507611_-|WP_149566832.1|DBSCAN-SWA 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32 | Leptospira_phage(33.33%) | bacteriocin,transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
635192 : 689544
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP035807|635192:689544|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP035807|635192:689544|677058_677796_-|WP_149566984.1|DBSCAN-SWA MKLELKNLSKSFGNHRVLTDVSIKLEDFDSLVLIGPSGGGKTTLLRLLAGLEKPQGGDVIINNKQIIYDEKYLSQYRKRIGMVYQAYNLFPHLTAVENITLPLIKVHNVKPKIAKEMAFDLLDRFNLGNQGNKKPIALSGGQQQRIAICRAVAIKPEYLLLDEPTSALDPEYTSEVLDLIYELRNEGMQLVLVTHEMGFAKEAADKVMFIEDEGIVQCGSASDVLNNSEDPRVRKFLNKVLKHTK >NZ_CP035807|635192:689544|649203_650358_-|WP_149566958.1|DBSCAN-SWA MDRTKLSLLVFSIITLLIFPFFLIQMLSLFIIIIHLLSFLYSKYLYFNLDISFSKPIYYCNNREDEVVTITFRNRGYLPIDGALIHIRGNGCFTNIDGTFLTSLPPRGICSLDSHIITNVRGAHKIGPVFLNGSDPLNFFPWKKEIDISSEVVIYPKYQDINLIFNIGEKGGHHRVKNKMYEDQADLKSIREYRAGDSLKRINWKASAKVGSLQTMEFSNTLNSPLFILMDIDPLKYPIKQRYNYLERTIEVAASLVTSYSKNSNRCGLLTRDSKGVNYIPMAKGWDHTVAILDNLAKINFLNQKSESISIINTFFSKKINIPQGSFIYILLPKIDSLVVDSLFYFNRQRYNIKVVNTGGVSSTMKSSSYEFLTLTSYGKELFL >NZ_CP035807|635192:689544|669203_670349_+|WP_149566976.1|DBSCAN-SWA 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59 | Rhodococcus_phage(11.11%) | integrase,transposase,protease,tRNA | attL 632419:632435|attR 698606:698622 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1134235 : 1182138
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP035807|1134235:1182138|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP035807|1134235:1182138|1155634_1156717_+|WP_149567409.1|DBSCAN-SWA MKKHNVAILYGGKSGEHDVSLLSASSVERHLDKKKYNIHLIGITLEGLWYYQHNYTNSSQSLEIVRDESKLISLIPGKGIMYHGQILDIDFIFPILHGTFGEDGTLQGLLDIIDIPYAGSGMEGSFMAMDKEYAKIVWEKEGLPVVPFISIKKHTFIDNPNEIEKQINNKFNYPIFVKPVKTGSSVGVSRVDSSDKLLPALKNAFNYDHKVLIEPAINAREIECSVIGNNYPKTFSLGEIAPSHEFYDYEAKYIDPNGAKLIIPAILTENQKEEIKEIARKAYIAINCKGFSRVDFFLDIDTNSVMLNEINTIPGFTNVSMFSMLCAEDGLNYSDLLDKIFEYGQGKYREQQSIQYNHKG >NZ_CP035807|1134235:1182138|1154777_1154978_-|WP_149567407.1|DBSCAN-SWA MALLEIIEERHKIKSTIIVTQLPVSLWHDTIGEPTIADAILDRLVYNSHRIELDGPILRMKKQTIH |
53 | Leptospira_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1643022 : 1656256
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP035807|1643022:1656256|DBSCAN-SWA TGTGGCACAAAAGAAGAGAGGTAATTATATAATGAGAATGAGTCAGCTATTTTCTAGGACTTTAAGACCTACAGGAAAAGATGAGACAGCAAGTGCCGAATATTTAATTCGAGCAGGTTTTATACGACAACTTGCAGCGGGGATTTATAGTTATCTACCTATTGCTCAACGAACAATTAATAAGATTGAGAATATTATACGGGAAGAGATGGATAGAATTGGTGGTCAAGAGATTACGATGCCTGTTGTACATCCTGCAGACCACTGGAAAGAGACAAACAGATTCTATGAAATAGATAAAGAGTTAACTAAATTCAGCGATCGATGGGGTAGAGATATGGTATTAGCCATGACCCATGAAGAGATTGCAACATCATTAATTAAAAGTGAAATTATATCATATAAACAACTCCCACAAACCATTTATCAGATCCAGACAAAGTGGAGGGATGACGCTAGACCAAGGGCTGGACTTATTAGAGTAAGAGAGTTCACCATGAAGGATAGTTATAGTGCTGCTGCTAACTGGGAGCAACTAGATGACCAGTACCAAGAACACTTTCATGCTTATTTTAAAATGTTTAATAGATGTGGACTTCCTGTAATTACGGTTCAATCAGATATGGGAATGATGGGTGGTAAAATGGCCCATGAGTATATGTACCTAACTCCTATGGGAGAGGATAGTTTAGTAACCTGTGATTGTGGATATACAGCAAATAGAGAGGTTGCAATTTTTAAGAAGGAGTTCTTCCCTAAACAGGAAGAGGTTGAACTAAAAGAGATTGAAACCCCAGGAACTAAAAGTATTGAGGATTTGTGTTCATTCTTAAGTGTTGAGACAAAGGATACAGCAAAGGCTGTATTTTATGTTGGAACATTCCAAGACGGAGAGTCTGAAGTTGACAAATTTGTAATAGCCCTAATTAGGGGGGACCTACTAGTTAATGAGACAAAAATACAAAACACAATAAAAGCTAAGGCATTAAGACCAGCAGCTGATGATGAAATATTAGAGGCTGGATCAGTTCCTGGTTATGGATCATCTATTGGAATTAAAAATGCGGTTGTTGTAGTTGATGAAACAATTCAAAAAAATAGAAACTATATTGCTGGGGCAAATAGAGAGAATTTCCATGTAAGTGGTGTTAGACTAGGTAGAGATTTTACACCTAATTTTATTGGGGATATATCTAATGCAGAAGAGGGTGTTTTATGTTCATCATGTGGAAAACAGCTAAACTTCTCTAGAGGTGTAGAGGTTGGTAATATATTTAAGTTAGGAACTAAATACTCTGAGTCAATTGGTGCAACATTTAACGATATTGATGGAAAAGAAAAACCAGTAATTATGGGTTCCTACGGGATTGGAGTTGGTAGACTTTTAGCAAGTATAGTAGAAGAGCACCACGATGATGATGGAATAATTTGGCCAATGGCTGTTGCGCCTTACCATATACACCTGATCAACTTAAGTAAAAGTTCTCCAAAAGCCGAGGAGCTTTATAAAGAGTTTATGGATAACGGTTTTGAAGTTCTATTTGATGACAGGAAAAAAGAGAGAGCTGGTGTTAAATTTAAAGATGCAGACCTTATTGGGATCCCTTTACGAGTAATTGTAGGGGATAAAACACTGGAAAACAGTGAGGTAGAGTTTAAAACTAGGTGTGGTAATGAAAATAGAAATATTAAATTAGATGACCTTTTAGATACTCTTAAAAATAAGAGATCTGAACTTCTTAAAAAAGAAACCCTTGATACAAAGGGAACATTATAAAATAGAAAGCACCCTTAATTGGGTGCTTTTTTTTAAACCATTCTTACTGTTATGTCTTCATCTAACTCTCTTAAAGCTGACTGAATAAACTGGAGGGTTCCAGTACCTGAAGATGCACATCCGGCACATGCTCCCTGATATTTTATAGAAACCAATGTATAATCAGGATCAAAATAGATATCATCAATCTCTACATTTCCACCATCTCTAACTAAAAGAGGTCTAATTTCACCATCAAAAACCTTCTCTAAGGCTAGTGTTTTTTTATAATTACTCATAGAAGCGTAGCTCTCTTCTCCACCCTTCTCCTTAGCCATCTCTGCTAAAGTATCCCTTAAAATATCAACAAGATAGTGTTCTTTTTTCTCATGTCCACCAGGTTTGATACAAGATTTACAAAATGCTCCTGCCTTTGTATATTGGGTAATCTCCTCTACTGTAGTTAAATTATTAATTCTAATTGCATCTTTTATTGTACTCATACTTACCCTAGCACACTCACATACAATCTCTTGGTCTTCAAGAGTAGCAAACTCCACACCCTTATAGTTAGCAGCAGCCTGTTTAATTACATCGTATGCCATAACACTACAGTGCATTTTTTGTGGAGGAACTGCAGGAATATCAGGGTTATCCCTCATGGCAAACTCAACATCTATATTAGTTATTTTTAGAGCCTCATCAACGGTTTTTCCTAGGCATAATTCCGCCATTGTATCGCTGGAAGCTATTGCAGTTCCGCAACCAAAACTCTTAAATTTAGACGAGATAATAACATCTGTATCTTCATTTACAATCCAAAACAACCTAACAGCATCACCACAAGACTCTGCACCAAAATCCGCAACAATAAGTTTTCCACCCATCTGCTTAGCATCTTCTTCTGTTAACGATCCCATATGCTTTGGATTATTCATCCTATCAGAAACAATATCTGAGTAGTTGTCCCAAAGTGAACCACCTACTAAACTATTTTTTGCCATATTATTCTCCTTTTACGTAGGTAGATGAAATCTCCCTTAATCTCTTAACACTTTTTTTAACAACCTCGATAACTCGGTCGATCTCGTCCTCTGTATTAAATCTAGATAGACTAAATCTTACTCCGGTATGGGCTAAATCTGCATCTATACTCATTGCAACAAATGTAGGGTCAGCTTCTAAATCCTCACTGGAGCAGGCACTGCCAGTAGAAGCGGCAATTCCATTTTGGTTTAGATCCCACAAAAAGGACTCTCCTTCAATACCTTTAAAACTAGCAAGGATTGTATTTGGAGTTCTATAATTTCTATCACCTATAACAATTGTATCGTCTAGGGAATTTATAACATCTTCTAATCTATCTCTTAAACTTCTAACAAATTTGTTTTCATACTCTAGTGCTTCTGTTGAAGTAGCTAACTCCATAGCATATCCCATTGCAACCATTCCTGGAACATTAACAGTTCCAGCACGTTTACCTGCCATTTGCTCCCCACCATGGAATAGAGGTGTAAGCTCTAGGTTTTCTCTTATATATAAGCCTCCAACACCCTTAGGTCCATGGAATTTATGGGCACTAAAAGTTAAAAAGTCGACTTCTGTATCTTGAACATCTACCTTTACCTTCCCAATAGCTTGCACAGCGTCGGTATGGAAAAGAGCACCATTCTCATGGGCGATTTTAGCCAACTCTTTAACAGGGTTAATAAGGCCTGTTTCATTATTTGCCCACATTATAGAGACTAAAGCTGTCTCATCCTTAATTATAGCTTCTTTTAAAGAGTCTGGTGTAATTAAACCTTCAGGGGATACTGGAAGTCTAGTTACCTTTGTCCCTAAAGATTCTAAAAAGTTTATTGTATGGGACACTGCAGGGTGTTCTATTTGGGATGTAATTATATGTTTTTTATCGCTATTTTGGATAAAGTCAAAATAAATACCCTTTAAAACAGTATTATTACCCTCTGTAGCGCAGGAATTTATTATTATATCGGACTCATCAGATGCATTAATACCGGCATATAACTGATCTAGAGCCTTTATCATATCTTTGTGAACCTCTGTTCCAAAAGAGTGGAGGGAGTTAGGGTTTCCAAATTTATCCTTTAAAAATGGCTCCATAACCTTGAAAACTTCTGGATCTATCATTGTTGTAGCATTATTATCGAGATAAATTCTCTCCATATCTACTCCTTACATATCTAATTCGGACTAATTTAGTCCTATTTAATTTTCTATATTTTAATAATAATAATAAAAAGAGCATTGGGCAACTACCTTATATTTTAAATAGTTAACAAAGTGAAATAAAAATGATATTCTCTACTTATGAAAGATATGCAGAGAACCGTAACATGCGGTGAACTTAGAAAAGAGTATGATGGAAAAGAGATTATATTAAACGGATGGGTTCATAAAAATAGAAACCATGGTGGAGTACACTTTATAAATCTTAGGGATAAATATGGTATTACTCAGGTTGTTATTGATGAGGATGCAACTCAAGACCTTATAGATATTGCGTCGGATCTTAAGTTTGAATACTGTGTTGCCATAAGAGGAACTGTTAGAAAAAGACCAGAATCTATGGTTAATCCAGATATGAAAACTGGAGAAATTGAAGTTTCTGCAAAAGAGATTAGCATTTTAAACAAGTGTGAAACCCTACCTTTTATGATAGAAGATGAATCTAAAGCAAATGAAACACTACGTTTAAAATATAGATACCTGGATTTAAGATCTACAGGAATGCAAAACAGAATAAAATTAAGAAGTGATGTAGCCTATGCAACTAGAGAGTTTTTAAATGGCCAAGGGTTTATGGAAATTGAGACCCCAACACTTATTAAAGCAACTCCCGAGGGAGCTAGAGACTTTTTAGTACCTTCCAGGGTTCACCCAGGAAAGTTTTTTGCCCTACCACAATCACCACAACTATATAAGCAGATATTAATGGTATCGAACTTTGATAAATACTTCCAAGTAGCAAGATGTTATAGGGATGAGGATGCAAGGGGGGATAGACAACTTGAATTTACTCAGATTGATATTGAGCAAAGTTTTGTATCTGCTGATGATATATTTAAGATGACTGAGGGATTAATGTCCCATATATTCAAAAAAACTATGGATATTACACTCCCTGAAACATTCCAAAGATTAAGTTATATGGATGCAATGAATACCTACGGTAGTGATAAACCTGAACTACGTTTTGATATGAAGCTCCAAGACTTCTCAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP035807|1643022:1656256|1643022_1644798_+|WP_149567786.1|tRNA|DBSCAN-SWA MAQKKRGNYIMRMSQLFSRTLRPTGKDETASAEYLIRAGFIRQLAAGIYSYLPIAQRTINKIENIIREEMDRIGGQEITMPVVHPADHWKETNRFYEIDKELTKFSDRWGRDMVLAMTHEEIATSLIKSEIISYKQLPQTIYQIQTKWRDDARPRAGLIRVREFTMKDSYSAAANWEQLDDQYQEHFHAYFKMFNRCGLPVITVQSDMGMMGGKMAHEYMYLTPMGEDSLVTCDCGYTANREVAIFKKEFFPKQEEVELKEIETPGTKSIEDLCSFLSVETKDTAKAVFYVGTFQDGESEVDKFVIALIRGDLLVNETKIQNTIKAKALRPAADDEILEAGSVPGYGSSIGIKNAVVVVDETIQKNRNYIAGANRENFHVSGVRLGRDFTPNFIGDISNAEEGVLCSSCGKQLNFSRGVEVGNIFKLGTKYSESIGATFNDIDGKEKPVIMGSYGIGVGRLLASIVEEHHDDDGIIWPMAVAPYHIHLINLSKSSPKAEELYKEFMDNGFEVLFDDRKKERAGVKFKDADLIGIPLRVIVGDKTLENSEVEFKTRCGNENRNIKLDDLLDTLKNKRSELLKKETLDTKGTL >NZ_CP035807|1643022:1656256|1649037_1650621_+|WP_149567619.1|transposase|DBSCAN-SWA MYITDFSNHKQSYLDLNISIPLKVTDHEAALMLMLQGLDYSKFEKPKKKSGRPPAVDSYTMMLILLYARTQGKYSSRDTEKLCKRDLFLLKVLDGKKAPDHSTIDRFIQQHSDAIDNLFYQQINRLGSLGELTKNIVFQDGTKIESKANRYTFIWKKSIKKNLPKLINHIEEIIHESVNLYPIELENSSPEDALKSIIEYLMGTTDNLKPNKTGRGHRITAEQRIFRDTNIYLKKLEDYKSQLDAMPERNSMSKTDPDATFMRMKEDHMRNGQLKPAYNLQVLVDGGYIVGNYASSDRTDYATMIPAIDHMHERIDWKYKKYCADSGYDCQHNHEALEKRDIESYIKPMKYEHSKKRKVKSDIGLKDNMTYDKDNDCFICSRGKKLVLKHLKVKKDKYGNEQVTHVYRCKRGCKSCLVKSACMKKSKAKYKQVQINHTLAEFQRKSTERISSPLGKEIRVNRSIQAEGAFAQIKNNWSFKRFLRKGIKGIHTDWNLMCMSMNIIHLGYRLARNELGIPFYHTLENSA >NZ_CP035807|1643022:1656256|1653079_1654165_-|WP_149567793.1|DBSCAN-SWA MDKYFMKRALDIALGGKGRVAPNPLVGALIVKNKKIISQGYHEKHGGKHAEINAIDSCSVPLNGATLYCNLEPCSSLYLGKKNPPCCDRIISSGISRVVIGQIDPNPMVSGKGVARLKEAGIDVIVGVLEKEALEINMGYNSLMEKGRPYVHLKWAQTLDGKIAANSGKSKWISSQTCRANTHYLRSKYDGILVGRTTYELDNPVLNTRYGYTPSPRPIVIDPLLKLSPKLNVFKRNPVIFCSQDTLEVDRKDRKGEYILLPGRKFQLNQILTSLKELGINSLFVEGGRELLTQFIRDEIWDRITIYIAPKILGDGMSPIGDLNIETPSKAINFKHIDMDIIENHTVFNGYREELVLCLPE >NZ_CP035807|1643022:1656256|1654667_1655618_+|WP_149567794.1|DBSCAN-SWA MFLTTLLVLLSFFCSFNFYFSDNKRDFLLICVPSVMQLFTLVIIEVSNSNIINSYTIIIFKLLLIISLLLNIWKKKRLIFISYILPFSLSFFHHYGTIYSLILPLVLIYLNLKSDRAVIVSELGAQRILNSLDEGVLISTKDSVILINNKMKDIFGLKTLNLSDISEKIFNNSKEILDLLKYKKTIDLVIFNGRDHYQINSSFNKNSIILTGINVSKEIKLRDELNNNIKELEDLSIRLEELSKERERSGLTKEKEQVYGYIEDLINRGLNNLHSDLLQISNVPPVSYEGILRSSRSLLSEIREIVKNWRLFRGEE >NZ_CP035807|1643022:1656256|1644830_1645781_-|WP_149567787.1|DBSCAN-SWA MAKNSLVGGSLWDNYSDIVSDRMNNPKHMGSLTEEDAKQMGGKLIVADFGAESCGDAVRLFWIVNEDTDVIISSKFKSFGCGTAIASSDTMAELCLGKTVDEALKITNIDVEFAMRDNPDIPAVPPQKMHCSVMAYDVIKQAAANYKGVEFATLEDQEIVCECARVSMSTIKDAIRINNLTTVEEITQYTKAGAFCKSCIKPGGHEKKEHYLVDILRDTLAEMAKEKGGEESYASMSNYKKTLALEKVFDGEIRPLLVRDGGNVEIDDIYFDPDYTLVSIKYQGACAGCASSGTGTLQFIQSALRELDEDITVRMV >NZ_CP035807|1643022:1656256|1645782_1646964_-|WP_149567788.1|DBSCAN-SWA MERIYLDNNATTMIDPEVFKVMEPFLKDKFGNPNSLHSFGTEVHKDMIKALDQLYAGINASDESDIIINSCATEGNNTVLKGIYFDFIQNSDKKHIITSQIEHPAVSHTINFLESLGTKVTRLPVSPEGLITPDSLKEAIIKDETALVSIMWANNETGLINPVKELAKIAHENGALFHTDAVQAIGKVKVDVQDTEVDFLTFSAHKFHGPKGVGGLYIRENLELTPLFHGGEQMAGKRAGTVNVPGMVAMGYAMELATSTEALEYENKFVRSLRDRLEDVINSLDDTIVIGDRNYRTPNTILASFKGIEGESFLWDLNQNGIAASTGSACSSEDLEADPTFVAMSIDADLAHTGVRFSLSRFNTEDEIDRVIEVVKKSVKRLREISSTYVKGE >NZ_CP035807|1643022:1656256|1652471_1653095_-|WP_149567792.1|DBSCAN-SWA MFTGIIEEIGLVKSIKHGYRSRVVVIECQTVLENTVLGDSIAINGVCQTVTSLNKSSFIVDVLEQTLLKTNLNLLKKGDSVNLERAITLNRPFGGHFVQGHIQGVGTISSIKKQKDNMYLRIKLPKDIRDNIIKEGSITVDGLSLTVADIIKDEIVINIIPHTKTESTVGSFRVGRVVNIEPDMLVKSVIKNEVQGLTKEKLISWGF >NZ_CP035807|1643022:1656256|1655617_1656256_+|WP_149567795.1|DBSCAN-SWA MNIVIAEDQTLLRDSLKVYLEGNKDFSVIGTVSNGEQAIEICDRLDIDIIIMDVKMPKLNGIEATKQIKKLYPHIKILILTLYESETDILEAIEVGANGYLLKDIEPEALISALKTISFGITIFKYGALTPLLNLVSPLKGDNDIVVEDFSNSEIEVIKLICQGLKNLEIADELGLSLATIKNRVGSILSKTNLNDRTQIVIYAVKNGLLNC >NZ_CP035807|1643022:1656256|1647108_1648884_+|WP_149567789.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKDMQRTVTCGELRKEYDGKEIILNGWVHKNRNHGGVHFINLRDKYGITQVVIDEDATQDLIDIASDLKFEYCVAIRGTVRKRPESMVNPDMKTGEIEVSAKEISILNKCETLPFMIEDESKANETLRLKYRYLDLRSTGMQNRIKLRSDVAYATREFLNGQGFMEIETPTLIKATPEGARDFLVPSRVHPGKFFALPQSPQLYKQILMVSNFDKYFQVARCYRDEDARGDRQLEFTQIDIEQSFVSADDIFKMTEGLMSHIFKKTMDITLPETFQRLSYMDAMNTYGSDKPELRFDMKLQDFSQFVPGSDFGVFKSVLESDGAVRAIVVEGVAPDYSRKKITELEEIAKQYGAKGLAWMKVKTDSFDGGVSKFYNNQYKEITEGLGAKENDLILLMGADWKTSVTSLGAVRKKLGDDLNLFDPKSFHFCWIVDFPLFEKNEAGEWEACHHLFSMPQDQYLDSMEENPGEVKGDLYDLVLNGYELASGSIRVHDPEIQKRIFSIVGIKEEEAMEKFGFLLESFKFGAPPHGGIAPGLDRLVMIMAGEDSIREVIPFPKNAMAMSPMDNSPAEVEPEQIEELSLKIILPKED >NZ_CP035807|1643022:1656256|1650818_1651280_-|WP_149567790.1|DBSCAN-SWA MREIRGDLSAKELKIGVVVARFNSFITERLLEGAVDCITRHGGSKDNIDVVRVPGAFEIPLITQKMAKTKKYDGIICLGAVIRGDTSHYDYVCNEAVKGISHVSLNSDIPVMFGILTTDSIEQAIERAGTKGGNKGFDSALGVIEMINLIKNL >NZ_CP035807|1643022:1656256|1651282_1652470_-|WP_149567791.1|DBSCAN-SWA MDRFKEVIEILEDFKKGNMIIVTDNEDRENEGDLVMAGELITPDDITFMATKARGLICAPISLEYSKRLGLKRMSNQEDKQGTAFTVSCDVKEGTTTGISSSDRAKTIKALSNPESKKEDFHHPGHIFPLIAKKQGVLEREGHTEAAIDLCLLSGLKPCGVICEIINDDGTMARGNDLDEFELKYNLKRLTIKELKEYKRFLYEKKPILIPTKYGSFYLESLDNKKNESMPHLLIYQDKMENPLNLRIHSECLTGDLLGSKRCDCGDQLDLSLKYIGERGGAIIYLRQEGRGIGLINKLRAYNLQDKGLDTLDANLVLGFKEDEREYSMVSSLLKERGILEVNLLTNNPLKVTGLEDTGINVVSRIPIEGETCISNKRYLETKKDRMGHLLSNRG |
11 | Staphylococcus_phage(40.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2831103 : 2883931
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP035807|2831103:2883931|DBSCAN-SWA 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60 | Wolbachia_phage(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
3534231 : 3598475
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP035807|3534231:3598475|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP035807|3534231:3598475|3538790_3539267_-|WP_149569445.1|DBSCAN-SWA MSKISEEALECFKKSISEIMNESGFHNATISLEERDIESSILITIGFTGRLHGYLMLQTDFESATNFVNILADYIGMEIDSSSFGDFHKSTFCEITNQISGRSTIHLSSIGLDSNITPPSIIVGSSIYSSVSDYDVSQTYYINDAFGTFKIFICINIT >NZ_CP035807|3534231:3598475|3561463_3562054_+|WP_149569453.1|DBSCAN-SWA MDKRTLSVVKRTSVGKNSLKSLRKEGFIPAVMYGHSDNTLFSVNEREFGKKFKVISENTIIDLKDGKDVYHVLIKDFDEDVLKGNILHLDFYEVEKGKSLNTIVPLHIEGSSVGVRLGGSLETLVHEIQVECLPKDIPEEIIVNIENLEIGQSIHVKDLAEIKGVKFLTSPEQVITHVTKAGAAAIEEDEAETVEE >NZ_CP035807|3534231:3598475|3534231_3534591_+|WP_149569437.1|protease|DBSCAN-SWA MIEVICITEDSYLTYLKVSGHASKDRNNTIICSAVSCLTRTVCEITTRLKGVSSKCSAPNPGDVLLTIERVNENIKDRFCGITDYLLIGIIGVVRDYPDSVTLKINNKEWYDGSQKRWW >NZ_CP035807|3534231:3598475|3594810_3595053_-|WP_149569487.1|DBSCAN-SWA MSNMNITTARKDLYKIVKSVNETHEPVFITGKNSSAILIGEEDWRSIQETLLLTSIPGMRESIIEGMNTDTDELSVDLDW >NZ_CP035807|3534231:3598475|3561040_3561319_+|WP_149569452.1|DBSCAN-SWA 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56 | uncultured_Mediterranean_phage(20.0%) | integrase,transposase,protease,tRNA | attL 3542393:3542409|attR 3593508:3593524 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
0 : 4174
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP035808|0:4174|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP035808|0:4174|3334_4174_+|WP_149569648.1|transposase|DBSCAN-SWA MKVPMVSKDEKLSLSKQCDLLNINRSRIYYTPRTKSKEDLMIMRLIDALYQENPCMGSRRMSKEISKTHGIKLGRLRARRLMREMCISAIYPKKNLSVPDSEHKIYPYLLRNLRIERPNHVWSTDITYIPLSGGFVYLTAVIDWYSRKVLTWKLSNTMDVGFCKSVVVEAIAKYGTPEIFNTDQGSQYTSKEFTDLLKDHEIKISMDGKGRALDNVFVERLWRSVKQEDVYLKDYRDIRDTKRHLTNYFEYYNNRRRHQSLDDEFPEDIYYGKVKLIAA >NZ_CP035808|0:4174|2188_2869_-|WP_149569647.1|DBSCAN-SWA MEKAIKLKTPDLYFLLHKKAYELALDNNNWNLLIDKQQEKPTRIISPAYKELLQVANKLNNVVDDYIKEAGKQKLKPKLLKKIPIISTPVIAVHYYCNTTFTKHIVNTSPDSLFERVTKNINIKKMYNPNIHDIDKDRFLSDYECLLKKLNGRNLFQRPASNAWRITVHYNDNSREIFQYRRGLALILPEDTPQNIVIPFRKNIKERTSKYNYISFCELDNLCYIN >NZ_CP035808|0:4174|1147_1846_-|WP_149569645.1|DBSCAN-SWA MFEKLKKTHTLQDWVVNKIVILRTPYNPRYYYLLFLIIFFSGNCLIFSDTNYKNLPEYKKLKLNDYILITGYLPEFSYNILENSFSLQISLNAIISNSLALYENQLNKDIFKNKYLKEISDKSESEKKHLASEKKLSEEQTQKIHNEIISIEQEIFSLEALIVHQKQLADICLEIYNYHDKEFQDGVISTIEFLKYKKDYLSVVFKYEELVYSKGVLENEKRSKRSQIPNSI >NZ_CP035808|0:4174|3038_3338_+|WP_149568881.1|transposase|DBSCAN-SWA MGRRKKHDSAFKLKVALEAIKEEITVSEIASNYEIHPQQVRQWKREFLQNAESVFQKDDVDKKKVEELETEKEDLQSLIGQQTIEINFLKKNLKKLNID >NZ_CP035808|0:4174|1838_2039_-|WP_149569646.1|DBSCAN-SWA MFAGILVSTQNNKILHSTVLKESVEEVEKALEELPERFQKRRKYYQVVKLSSVGSDESKKYGVILV |
5 | Shigella_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
10211 : 16220
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP035808|10211:16220|DBSCAN-SWA AATGAGAGACGCTGGTTTTAATATAATTGCTGCGGTAGAATATAACCCTCAAATAGCAAAGACCTATATGCATAATCATCCTGAAACAAAAATGTTCGTGGATGATATAAGAAATATTACTACAGATGAAATAGAAAAAATATTCATGTCACAAAAAGTACAATGTGATATTATTTTCGGTGGACCTCCATGCCAAGGATTTAGTATGGCTGGAAAACGTATTCGTGCGAAAAAATCTTTTTTAAAAGATGAGCGTAACTATTTGTTCAAAGAATATATAAGAATGGTAGAAAAACTACGACCCAAAATATTTATAATAGAGAATGTCCCTGGAATACTAAATTATAATAACGGAGAAGTAAAACAGGAGATCTTTGAAACTTTTAGAGATTTAGGATATGTGTTGGATGCTCAATTACTTTGTGCTGCAGATTATGGAGTACCCCAATTAAGAAAACGTGCAATCTTTATCGGAAATCGTATAGGGATTAATCCTAAGATATTATTTCCAATGAAAACAAATAGTTTAAATAATTATGTTACTGTACGAGATGCCATAAGTGATTTACCACCTTTAGATTCAGGAACAGGGCAAGTGCAAACTAATTATATCAAAAACTTTATTCTAACAAGTTATCAACAACGAATGGTTTCTAAGTCTGGAATAGTTTTTAATCATCTTAGTTCTAAGCATAAACCTGAAACATTAAAATTATTATCAATGATAAAACAAGGTGAAACCATGAAGGATTTGCCTGAAAAACTTAGAACTAAATCCGTTCATAGTGGAGCTTATGGCCGGATGGTATACGATGAACCAGCATATACTTTAACAACGAGGCTAAATACCCCCTCAGTTGGAAGGATCACTCATCCTGTGCAGGATAGAACTATAACACCACGAGAGGCTGCTAGAATACAATCTTTCCCAGATGATTATCTTTTTATAGGTGATATAACATCTATTGGAATGCAAATTGGAAATGCTGTACCGCCTTTATTAGCAGAAAAAATAGGGCGAAATATATTAAATATTTTATGACTGATATATAATTTTTATTGCTATCCTCATCTAAAGGTACTTTTAGGTGAGGTTAATAGTATTAAGGTAAGTTTTTCTTGATTTTTTTATTCTGTATAATTCTATATTGCTGTTTTTCTACTATTTTAAAAATATCATATGGGATTTTAGGAATATTAAATCTACCTGCTATTATTATCTTCCAACAACTTATAGAATTCATTTAATTTCTTCTGCAGAACTCTTTTAGGTATTAGTTTTGTTTCATATTCAGCTATAACAGCAGGACTCATAGACCTACTAAGAGCATACTTTACAACTTCATCGTTCTTTTCCCGACACAGTAATATACCTATACTTGGATTTTCATCATTTCTTTTTACATCCCTATCAAGAGCTTCTAAATAGAACTCTAGTTGGCCAAGATCTGCTGGCTTGAACTTAGTTGTTTTAAGTTCAAATGCAACTAGGCATTTTAAATGTCTATGAAAAAATAGAAGATCAATAAAGAAATCATCAGTTCCAACCTGGACCTTGTATTCTTGGCCAATAAAAGAAAATCCGGAACCTAGTTCTAGTATAAAATCTTTCAGTGAAGAAATAAGAGCAGCAGAAAGATCTTTTTCCTTATATGGAATAGGCAAATCAAGAAATTCCAATACATAACTATCCTTGAAAATACCATCTGTATTTTGAGGTAAGTTTTTTATAACATCAGAGACTTTATTATCAGCAAGCATGGTTCTTTCAAAAGTAGAACTGTCTATAAGTCTATTTAACTCTCTTACTGAATAATTTTGTTTAGAGCAAACAGTTAAATAAAATGCTCTTTCCTCTTCTGTTTTAAGAGTCATTATTCTTGTATTATGACTCCAGGTTAATTCTGCCGACAGTGTCGACAGTTTTGTATTATTACTATAAGTTTCGTAGAATTGTTTCATTCTCCATATGTTACGAGAGCTGAAACCCTTAATTGTTGGGTTTGATTCTTTAATGAAATGAGAAAGATCATCAACAACAGATTTCCCCCATAAAGCATTGCTAACCTTTTCAGATACATACTTCCCCACAGAATAATATAAGCTGTTAAGCTGATTGTTAAGCTGCTTATATGCACTAGATTTTGCTTTATGTATTAGTGATAATATATAGTTAAAGTCTTCTTCGATTAAATCTGGCAATGCAATAACCTATGATTTAACGGTCTGTTTAAAGTTTTTACAAATGATATCAAACTCTTTTTCAGTTAAGAATCCACTACTTTTTAATATTTCGACTAACATCAAATAAGATTGATCAGCACTATTAGAAGAAAACCCTTTAATAGCAGGGTGAGTACTTATTAGTGTAGAAGATAGAGAGCTACTTGGTTTTTGTATATTTGATTTAGGTTTAGATATACCATAGGATTCTTTTAGATTTTTTGCTTCTTCAGACAACTCTCTAAAAGACTTTCTATCTAAGTTATTAAATACTTCATCCCTTAAACTATCTTTAGCATCAGAGTCCATTTTATCACTTTTAAATAGAGGCATGAACGCTCTTATCTTAGATTGGTTAGAAGATAATTTTTCTATGTCCTCTTGTGATATTAAGTTCTTAGGAGTAATTACTTGCTCTACTATATCTATGTAGTTGTAAACACTCTTCTTGCTTATTTTTAATTCGCTGTCAATAAATGATTTAAAGTCTAAATAACCATCTTCTTTATATAGTTCGTTATCTCTTATAGATTTTAGGCGTATAGCCATATATATACCAGAGACCTCATGGAGATCAGCAAGGTACTTAGCTTCTCTTTTAAGGTCGCTGTAATTAGATGGTAGAGTATTAACTGAAAAGGCTTTGATAAATAAAATTTGAATATTATCCAATAAATCTGCTGAAGCTACGGATAGAGCAGAATCTGATTGTACTGCTGCTACAGCCTTTTCTTTGTTTTCTATAGTAGGTTCCTGTTCAAATATCTTAACTGCTTCAACTGTTTCTGATTTACCTTCAAATTCTTTAACAACCTCTGACATAGGTTTACTTCTTTTGTTTATATCAAACTTTTTTTTAGCCATCTATTAAGCACCTTCATATATCGATTTGTCTATTGCATCAAATACTGCTAGTATTTTCTCAATAGCATTGTTAGAACTTGTATATTGGTTAAAGAGGTTATCTGTTAGAGGCCTCTCTTTTATTCCTACAAAGTTTGGAATAGAACCTTCTACTAGATAATCCTTTAGTTCATCCTTAGCCATTGTTATATACTCTTCCTGTATTCTTATTGATCTTTGCTCATGTGCATTTATAAGAACCTTTAAAGACTTAAAGTATTCAGAATATTTCTTTACCTGATTAACAGTTCCAATAGCATCTTTAACACCATCATAATTGAAAGGCTCTGGAACGAACGGAATGATTACATGATTAGCAGAAAGCAAACCGAACTTAGAAAGACTATTTACATCAGGGCAACAATCTAATATAACAACATTATATTTCTTGAAAGTTGAATAAAAGCTTTTAACGAACTTATCTAGGTCATCAATATCATAGTCTCTCTTCTTTGTCATAAGCTTTAGAGAAGATGGAATCACATCAATATAGTCATTATATTTAAGAACCAGCTTATTAACTGGTGTATTATCCTCAAAGAAATTATATAAACTCTTAGATTCAGCAAGTGTTTGGTAATCAAAGAATGTTTTTGAAGTATTCATTTGAGGGTCTAAATCAACAACTAGTGTTGTATAACCCTTCTTCTCATAATAATCAGCAAGGGTAATTGATGTACTAGTTTTACCTGGACCACCTTTCTGATTAAACACACAAAGAACACTTGGAACTTGTAACATTATCTCTCTTTTATCTAGCAAGTAGGTGTTAGAAGACTCTTCTATTTGAGCATTAACTCGACCTTCTGAAATATATTTTCTAATTGTTGTTTCTGCTAAACCTGTATATGCAGAAGCATCTTTAACATTAACTAACCCCATAGAGACTCCTTTTAATTACATAAATAGTATCACAATAGAGAGAGTGTTGTCAAAGAGATGCAATATTTATTTTTCGTAACAAAAAAATATTGCACAAATAGGATTTATAAGCTAAATTCTAATTCAGAAACATATTTAGAGTAAAAAAAAGACAGCCAATCAGCTGCCATTTTTTATAGTCAAACGTATATCGCCAAATATACGGTTTATAAATAGATATAATCATCTATGTCGTAGTTGTCTTGATTATAATCTTTTTTAATAAAATTTGTCTATAAAAAATACAGGAAAAATCTGTCTAAATTTTTTTCTCAATAAAATACTGAATTTATAGCGAAAATATTTGCTATAAAAATTGCAAAAGGATTTTTTTTGGAAAAAGTAAACGGAATGTCTTGTGTTAAAATTATCTGATTTTAAGCAAACAATTAAATTTAAAAATTTACCAACTCACAAAACCACAGCTATTAAAATTCAAAGCAAAAGGTTTTGCTCTCTTTCTTCCTTCTTAAAACCTAACACCCTTTTTGGAGGTGTTTACTATCAAAGGAGACATTTGAACTAAAGTAGTTAAACCCTTAAGCAGTATATTTTCTCATTCCCGACAGATCCCTTTAGCTCTGTAAGGTGAGGTTTATCAAAATAATAATGCTGATTTATTAGCGAAAAAATCCTGAAAAGGTTCCTATGTCCTTGGCATCATGAGAATGGGGTATAGTAGAGGTCTATCTTGAATAGGCTACTTGTTAGAAGGTGAGAGCAAAAGCAAGAGGCAGGGGAGGTTTGATCCAGTACAGCCTAAGCTCCAAAGTTGCAGATTTGAATAGTACGGATGTTGAGATAGGCCTGCAAGCTAAATCAACCGCCCAATGATGGCCGGCTCCGATGGTGAAAATCATAGAGATACGGAAAGGGTGATCTCCTCCAGTCAATCCTATAGTAGGAGGGGCTGGGGGAAGTCCGCCCTTCTTCAAGCACTCACCAATAATGATAAACCATCGGATTAATATAATTTATATATATAAGGAGTTTTTATAATGGCAGAATTTTTTGAGATTTTAAAAGAACATAGGAAGAGCAACAATATAGATAGAAGTGTTGTTGAAAAGTTAGCACATATAAACTACCAGACTATAACTAAAATAGAAAATGGAGATTTTAAATCAGTTAATGCCTCTGATTTATTAGCTTATTTTAGAGTTTTGGGATTTAAAATATCAGCAGGAAAGCCAAGGCTGTAAAATTATTTACATTTAGAGTGTTTAAATAATCGACCGGTTAATTGAACACTCCAAACCCAGCAACAAGAACTACAAAACTGTAAATAAAATACTACCAATAAAAGACTTAACTAAACAAAAAAGTAATAGACCTGTAAAATTAAAAGCATTACACTAAAATAGTTATGATAATTGCCTACAGTAGAGTAAGTTCTAAGGAACAAGATAAAGAAAAATACAGGACCTTTTTCAACCGGTACGAAAATACCATGAACATTAAATTCAACGACATTATCCTGGAACAAGTATCAGCTTCTAAAACAAAACTAGAAGATAGAAATCTCTGGAATTATATAACTAACCCTAACATAAAAAAAATAGTAGTAACAGAAATATCCAGGATAGGAAGAAATACTAGGGATGGAGTAAAACTACTAAAACATATAACTAACCAGCGTGAAGACCTGGAGATCTATGTAGTAATGTCTAACCTAACAATCAAATCAAATATGTCTGCTGAAGAAGAATTTATATTCGACCTGCAGCTCTCTTTAGCAAAAAGAGAAGTAAAACTCCTTGGAGAAAGAACCAAATTAGGAATACAAAGAGCAAGAGAATCTGGTAAACATATAGGCAGACCATTTGGATCTACTAAGATAACCAAAGAAAAAGAGCTGCAGATAAAAGCGTTATTAGCTCTTGGAGAAAAGAAATCAGAAATAGCTAGAGTAACTAATATCAGCCGGACAACCCTTTACAACTATCTTAGTGATAAAGGATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP035808|10211:16220|13300_14218_-|WP_149569652.1|DBSCAN-SWA MGLVNVKDASAYTGLAETTIRKYISEGRVNAQIEESSNTYLLDKREIMLQVPSVLCVFNQKGGPGKTSTSITLADYYEKKGYTTLVVDLDPQMNTSKTFFDYQTLAESKSLYNFFEDNTPVNKLVLKYNDYIDVIPSSLKLMTKKRDYDIDDLDKFVKSFYSTFKKYNVVILDCCPDVNSLSKFGLLSANHVIIPFVPEPFNYDGVKDAIGTVNQVKKYSEYFKSLKVLINAHEQRSIRIQEEYITMAKDELKDYLVEGSIPNFVGIKERPLTDNLFNQYTSSNNAIEKILAVFDAIDKSIYEGA >NZ_CP035808|10211:16220|12421_13297_-|WP_149569651.1|DBSCAN-SWA MAKKKFDINKRSKPMSEVVKEFEGKSETVEAVKIFEQEPTIENKEKAVAAVQSDSALSVASADLLDNIQILFIKAFSVNTLPSNYSDLKREAKYLADLHEVSGIYMAIRLKSIRDNELYKEDGYLDFKSFIDSELKISKKSVYNYIDIVEQVITPKNLISQEDIEKLSSNQSKIRAFMPLFKSDKMDSDAKDSLRDEVFNNLDRKSFRELSEEAKNLKESYGISKPKSNIQKPSSSLSSTLISTHPAIKGFSSNSADQSYLMLVEILKSSGFLTEKEFDIICKNFKQTVKS >NZ_CP035808|10211:16220|15623_16220_+|WP_149569654.1|DBSCAN-SWA MIIAYSRVSSKEQDKEKYRTFFNRYENTMNIKFNDIILEQVSASKTKLEDRNLWNYITNPNIKKIVVTEISRIGRNTRDGVKLLKHITNQREDLEIYVVMSNLTIKSNMSAEEEFIFDLQLSLAKREVKLLGERTKLGIQRARESGKHIGRPFGSTKITKEKELQIKALLALGEKKSEIARVTNISRTTLYNYLSDKG >NZ_CP035808|10211:16220|11413_12400_-|WP_149569671.1|DBSCAN-SWA MEEDFNYILSLIHKAKSSAYKQLNNQLNSLYYSVGKYVSEKVSNALWGKSVVDDLSHFIKESNPTIKGFSSRNIWRMKQFYETYSNNTKLSTLSAELTWSHNTRIMTLKTEEERAFYLTVCSKQNYSVRELNRLIDSSTFERTMLADNKVSDVIKNLPQNTDGIFKDSYVLEFLDLPIPYKEKDLSAALISSLKDFILELGSGFSFIGQEYKVQVGTDDFFIDLLFFHRHLKCLVAFELKTTKFKPADLGQLEFYLEALDRDVKRNDENPSIGILLCREKNDEVVKYALSRSMSPAVIAEYETKLIPKRVLQKKLNEFYKLLEDNNSR >NZ_CP035808|10211:16220|15255_15459_+|WP_149569653.1|DBSCAN-SWA MAEFFEILKEHRKSNNIDRSVVEKLAHINYQTITKIENGDFKSVNASDLLAYFRVLGFKISAGKPRL >NZ_CP035808|10211:16220|10211_11252_+|WP_149569670.1|DBSCAN-SWA MRDAGFNIIAAVEYNPQIAKTYMHNHPETKMFVDDIRNITTDEIEKIFMSQKVQCDIIFGGPPCQGFSMAGKRIRAKKSFLKDERNYLFKEYIRMVEKLRPKIFIIENVPGILNYNNGEVKQEIFETFRDLGYVLDAQLLCAADYGVPQLRKRAIFIGNRIGINPKILFPMKTNSLNNYVTVRDAISDLPPLDSGTGQVQTNYIKNFILTSYQQRMVSKSGIVFNHLSSKHKPETLKLLSMIKQGETMKDLPEKLRTKSVHSGAYGRMVYDEPAYTLTTRLNTPSVGRITHPVQDRTITPREAARIQSFPDDYLFIGDITSIGMQIGNAVPPLLAEKIGRNILNIL |
6 | Streptococcus_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
23856 : 24777
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP035808|23856:24777|DBSCAN-SWA CTTAACCCCCACACGTTGAGCATGGTTTACCTTCTTCTTTATCAGTAAAATAACCAGACTTGGTATTATTGTAATATTTACAACTACTGTTATGACGTGTCATAGAGTTGCTGTTAATCCAATATGTTTCCGAAATATTAGAAGTTTGTTCTTGATCAATATATGTCTTAGGGAAAGAAGTAATATTGAAAGACCATAAATCTAAATTAACATTAGCCTCTATCATATTTTCAATTGAGTCTTCTAAAGAGGGATATAGGTCAAAACCTAAAAGTTGTTCAAGTTCATCAATAGAGTAAATATATGTTTGTAGAGCATATTTATTCTTACCTTCTATATTTGGGAGGACAAAACCAATAACTTGCCACTGATTGTTTTTAAATAGAAGAATAGCCTTATAATAGTAATCAGGGATAGATACCTTATTTGGACCTATAGAAGGAAAATCATTTCTATTTAATATAGGACCTGTAACAATATAAGCTGCTCCATATACATAAACCCAGGAACGAACTAGTTCTTCTAAATTTTTCCAACGACCTCTGTTTAGAGAAGGAAGTTGAGGAGACATATTACTCATATAAAATGAGTCTGACATGGAATCTTTATTAAGTTTCATATCAGCAGCAGGAGCAAGATGACCTCTATCGTAACCTGAACCTTTATAATCAGATAAAGAAGCGGATCCTGTTTTAACCAATGGATCTTCCCGAAAGTTGTCCGTTCTATCGATATCATTGATTATTTCTGATTTTAAAAGTTCATAAGCAACCCAGTCAGCCTGTTCATGCTGTTCATTATATTGAAGGGTATAATTATCTCTAGTAATTACCGCAGTAGATTTAGTTATCTCAGGGATTTCCAGCTGAGCAAATAGATTGAAGAATATAAATAGAATAAGAACTAGTATTATTTTTCTCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP035808|23856:24777|23856_24777_-|WP_149569664.1|DBSCAN-SWA MRKIILVLILFIFFNLFAQLEIPEITKSTAVITRDNYTLQYNEQHEQADWVAYELLKSEIINDIDRTDNFREDPLVKTGSASLSDYKGSGYDRGHLAPAADMKLNKDSMSDSFYMSNMSPQLPSLNRGRWKNLEELVRSWVYVYGAAYIVTGPILNRNDFPSIGPNKVSIPDYYYKAILLFKNNQWQVIGFVLPNIEGKNKYALQTYIYSIDELEQLLGFDLYPSLEDSIENMIEANVNLDLWSFNITSFPKTYIDQEQTSNISETYWINSNSMTRHNSSCKYYNNTKSGYFTDKEEGKPCSTCGG |
1 | Lake_Baikal_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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