Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP043770 | Haemophilus influenzae biotype aegyptius strain HE7/F1946 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas3,DEDDh,DinG | 0 | 0 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP043770_1 | 1548711-1548802 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP043770_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP043770_1
>1.1|1548741|32|NZ_CP043770|CRISPRCasFinder TGGTGGGCTTCAGTAGTTGTAGGGTGGGCTAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043770_1
The CRISPR arrays of NZ_CP043770_1 >merge|NZ_CP043770|1|1548711-1548802|CRISPRCasFinder AGCCCACCAACAAACAATCGTGAGATATTTTGGTGGGCTTCAGTAGTTGTAGGGTGGGCTAAAGCCCACCAACAAACAATCGTAAGATATTT >NZ_CP043770|1|1|1548711-1548802|CRISPRCasFinder AGCCCACCAACAAACAATCGTGAGATATTT TGGTGGGCTTCAGTAGTTGTAGGGTGGGCTAA AGCCCACCAACAAACAATCGTAAGATATTT
>NZ_CP043770.1|WP_150006483.1|1545470_1548428_-|TonB-dependent-hemoglobin/transferrin/lactoferrin-family-receptor MLSQPTNQPTNQPTNQPTNQPTNQNSNASEQLEQINVSGSTENTDTKAPPKIAETVKTAKTLEREQANNIKDIVKYETGVTVVEAGRFGQSGFAIRGVDENRVAINIDGLRQAETLSSQGFKELFEGYGNFNNTRNGAEIETLKEVNITKGANSIKSGSGSLGGSVIYKTKDARDYLINKDYYVSYKKGYATENNQSFNTLTLAGRYKKFDVLVVTTSRNGHELENYDYKNANSLTQGKKREKADPYKIEQDSTLLKFSFNPTENHRFTLAADLYEHRSRGQDLSYTLKYQKTNPDLPEVESRHTNDKTKRRNISFSYENFSQTPFWDTLKLTYSDQRIKTRARTDEYCDAGVRHCADIDNPAGLKVTNGKITRRDGTELEFKKKDGSNDTYDFGKFIDTDNKVIDSGGVLKFLTNSDTWYDCSIFNCEKGTKIKVGQSDGGYGYDGKWKEVELETKTLNGKKFARINDRNSYAKDYYNYDILPFSPGYLEHHWQEKGLDTNTQQLNLDLTKDFKTWHIEHNLQYGGSYNTAMKRMVDRISVYASDVQWWARRTLGTKKIYHPEEMEVPATCGDAHFPFMTNLCPHVGPKHYDLLPIKTTGKSVYLFDNFVITDYLSFDLGYRYDNIHYQPKYKHGITPELSYNNSIVTGLFIPLPKYHQCSMCVDGYYSYNDDQVKQNVIDNINYIVSQKKKYKAHSYSFVSTIDPTSFLRLQLKYSKGFRTPTSDEMYSTFKHPDFTILPNTDLKPEIAKTKEIAFTLHNDDWGFISTSLFKTNYKNFIDLVYKGEKFLSIGSALRYRLHQNINRDNASLKGIEINSKVFLGKMAKFMDGFNLSYKYTYQKGRMNGNIPMNAIQPKTMVYGLGYDHPNHKFGFDFYTTHVASKNPEDTYDIYAKDKRQTDTSIKWRSKSYTILDLIGYVQPIKNLTIRAGVYNLTNRKYITWDSARSIRSFGTSNVIDQSTGLGINRFYAPGRNYKMSVQFEF >NZ_CP043770.1|WP_041174972.1|1543377_1545294_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIIFSNLSLKRGQTELLENASATINPKQKVGLVGKNGCGKSSLFALLKKELMPEGGEVNYPANWRVSWVNQETPALDISAIDYVIQGDREYCRLQQELNEANERNDGHAIAHIHGQLETLDAWTIQSRAASLLHGLGFSQEETIQPVKAFSGGWRMRLNLAQALLCPSDLLLLDEPTNHLDLDAVIWLERWLVQYQGTLVLISHDRDFLDPIVTKILHIENQKLNEYTGDYSSFEVQRATKLAQQTAMYRQQQQKISHLQKYIDRFKAKATKAKQAQSRMKALERMELIAPAYVDNPFTFEFRPPQSLPNPLVMIEQASAGYGSGESAVEILSKIKLNLVPSSRIGLLGKNGAGKSTLIKLLAGELTALSGTVQLAKGVQLGYFAQHQLDTLRADESALWHMQKLAPEQTEQQVRDYLGSFAFHGDKVNQAVKSFSGGEKARLVLALIVWQRPNLLLLDEPTNHLDLDMRQALTEALVDYEGSLVVVSHDRHLLRNTVEEFYLVHDKKVEEFKGDLEDYQKWLSEQNSTSENKVSEKVGDNENSVQNRKEQKRREAELRQQTAPLRKKITQLEEKMNKFSSELANIENQLADAELYNAENKEKLTALLAQQVDVKKALDDVETEWMIAQEELEEMLQA >NZ_CP043770.1|WP_005650845.1|1542831_1543368_-|hypothetical-protein MNQSLFHHSKQQEYCPQCGAPLQIKQGKKGLFLGCSAYPECDYLRPLQRSEHKVLKTLDEICPKCSNLLQLKQGSFGMFIGCSHYPECDFVVREESESEEKIACPECKTGHLIPRRGRQGKIFYGCDNFPKCKFSLPAKPYAVPCPTCHFPLSLLKSENGEKQIFQCANKTCRHIFEQ >NZ_CP043770.1|WP_013526327.1|1542264_1542816_-|threonylcarbamoyl-AMP-synthase MNREQIADALRQNQVVAYPTEAVFGLGCNPQSESAVKKLLDLKQRPVEKGLILVAPSLDFFRPFVDFEQINDEQLSRLQGKYERPTTWIVPAKSTTPHFLTGKFDSIAIRLCDHPSVKALCELSGFALTSTSANLTGEPPCRTADEVRLQFGSDFPVLDEMVGRAHNPSEIRDLRTNQLFRQG >NZ_CP043770.1|WP_013526328.1|1541442_1542261_-|shikimate-dehydrogenase MDLYAVWGNPIVQSKSPLIQSQLAAQTHQTIEYIAKLGDLDAFEQQLLAFFDQGAKGCNITSPFKERAYQLADEYSQRAKLAEACNTLKKLDDGKLYADNTDGIGLVTDLERLNWLRPNQHVLILGAGGATKGVLLPLLQAQQNIVLANRTFSKAKELAERFQPYGNIQAVSMDSIPLQTYDVVINATSAGLSGGTASVDAEILKLGSAFYDMQYAKGTDTPFIALCKSLGLTNVSDGFGMLVAQAAHSFHLWRGVIPDFVAVYEQLKKAML >NZ_CP043770.1|WP_013526329.1|1540888_1541446_-|DNA-3-methyladenine-glycosylase-I MIIRCPWVGEQPIYIDYHDKEWGKPEFDSQKLFEKICLEGQQAGLSWITVLKKRESYREAFHQFDPKKIAKMTALDIDACMQNAGLIRHRAKLEAIVKNAKAYLAMEKCGENFSDFIWSFVNYKPIVNDVPDLRSVPAKTEASKALSKALKKRGFVFVGETTCYAFMQSMGLVDDHLNDCPCKTR >NZ_CP043770.1|WP_013526330.1|1540127_1540892_+|glycosyltransferase-family-2-protein MPTISVAMIVKNEAQDLANCLDTVKDWVDEIIILDSGSTDNTKEISLSYGAKFYENSNWQGFGKQRQLAQQYVTSDYVLWLDADERVTPKLQQAILSAVKNDRENTVYEIPRVSEVFGREIHHSGWYPDYVVRLYRTNYAQYNDSLVHEKVEFPAGTKVEKLTGDLEHFTYKSIHHYLVKSAGYAKAWADQRQAKGKKATLWQGISHALGCFMKMYLLKAGFLDGKQGFLLAVLSAHSTFVKYADLWERDQHKH >NZ_CP043770.1|WP_013526331.1|1538781_1540065_-|3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid-transferase MWRFFYTSLLLICQPLILCFIGLLSVKSPRYRQRLAERYGFYGNAPCPPPQGIFIHAASVGEVIAATPLVRQLQQDYPHLSITFTTFTPTGSERVKATFGDSVFHYYLPLDLPFSIHRFINFVQPKLCIVMETELWPNLIHQLFLRNIPFVIANARLSARSAHRYGKIKARLQTMWSQISLIAAQDNISGKRYATLGYPKEKLNITGNIKYDLNTNDELLRKIDSLRTLWKQDRPIWIAASTHNGEDEIILKSHRALLAKYPNLLLLLVPRHPERFNVVADLLKKEKFQFIRRSTNELPNENTQVILGDSMGELMLMYGVSDIAFVGGSLVKHGGHNPLEPLAFKMPVITGKHTFNFPEIFRMLVEVQGVLEVNSTADALERAVEALLNSKEARERLGNAGYEVLMENRGALQRLLDLLKPYLERNV >NZ_CP043770.1|WP_013526332.1|1538314_1538785_-|pantetheine-phosphate-adenylyltransferase MTSVIYPGTFDPITNGHLDIIERSAVIFPRVLVSVANSPSKKPLFSLDERVELVRQSVVHLSNVEVFGFSDLLANVIKQHNISAIIRGVRTTTDFEYELQLAALNRLLTKGVDSLFFPPVEKWAFVSSSIVREIYLHGGDVAELVPVSVFNALKAR >NZ_CP043770.1|WP_013526333.1|1538105_1538318_-|YceK/YidQ-family-lipoprotein MIKTFIFLTALIVLSGCGSVVKLIDPTEKYTAYAGVAYDLEMAQQWGLPILDLPLSFLLDTVLLPYTWAQ >NZ_CP043770.1|WP_005665578.1|1548988_1550518_-|YfcC-family-protein MDASKKKKTFNFPSAFTILFAILILAVGLTWVIPSGSYSKLTYNSTDNVFVVKAYGVDDKTYPATTDTLDNLNIKIKLSNFTEGVIKKPIAIPGTYQRVEQHHKGIEDITKSMVEGTIEAVDVMVFIFVLGGMIGVINRTGSFNAGLMALVKKTKGNEFFIVFCVSVLMVLGGTTCGIEEEAVAFYPILVPVFLALGYDAIVCVGAIFLAASMGTAFSTINPFSVVIASNAAGIQFTEGIGFRALGLVLGATCVIAYLYWYCKKIKADPSFSYTYDDREEFRQRYMKNFDPNTTIPFSARRKLILTLFCISFPIMIWGVMIGGWWFPQMAASFLAITIIIMFISGLSEKDVVESFTEGASELVGVSLIIGLARGVNLVLEQGMISDTILDYMSNVVSGMPGSVFILGQLVVFIFLGLIVPSSSGLAVLSMPIMAPLADSVGIPRDIVVSAYNWGQYAMLFLAPTGLVLVTLQMLHIPFDRWVKFVMPMIGCLLLIGSILLVVQVSLYSV >NZ_CP043770.1|WP_013526325.1|1550622_1551555_-|carbamate-kinase MRIVIALGGNALLRRGEPMTAENQRQNVRIACEQIDKIWPNNELVIAHGNGPQVGLLALQGAAYTDVPTYPLDVLGAETAGMIGYMIQQELGNLVPFEVPFATLLSQVEVDINDPAFKNPTKPIGPVYTKEEAERLAKEKNWSIAQDGDKYRRVVPSPLPKRIFEIRPVKWLLEKGSIVICAGGGGIPTYYDEHHNLQGVEAVIDKDLCSALLAENLDADLFIIATDVSATFVDWGKPNQKAISVASPEAISELGFASGSMGPKVQAAINFAKQTGKDAVIGSLSDIVDIVKGKAGTRITKKAEGISYYA >NZ_CP043770.1|WP_005651072.1|1551564_1552569_-|ornithine-carbamoyltransferase MAFNMKNRHLLSLVHHTEREIKYLLDLSRDLKRAKYAGTEQQKLKGKNIALIFEKTSTRTRCAFEVAAYDQGAQVTYIDPNSSQIGHKESMKDTARVLGRMYDGIEYRGFKQSIVQELADYAGVPVFNGLTDEFHPTQMLADVLTMIEHCDKPLSEISYVYIGDARNNMGNSLLLIGAKLGMDVRICGPKALLPEANLVEMCEKFAKESGARITVTEDIDKAVKGVDFIHTDVWVSMGEPLETWGERIKLLLPYQVTPELMKRTGNPKVKFMHCLPAFHNSETKVGRQIAEKYPELANGIEVTEEVFESPMNIAFEQAENRMHTIKAVMVASLA >NZ_CP043770.1|WP_005692782.1|1552965_1553784_+|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MNLPFRAMVSDLDGTLLTPEHLVGDLTIDTLRALEQKGVDIILATGRNHTDVSSILGKIGAERAVMITSNGARVRDLQGNLLYSNSLPEELVLELYKTPFDTSKVCMNSYQDEGWFTNKDIPAMRQFHKESGFDYNVVDFSKHHGRGTEKVFFIGKTPEDLVEVETYLRDKFGDVTTIVYSALACLEVMNKNVSKGDALKHLLESREYELKDCIAFGDGMNDVEMLSWAGKGCIMKDADIRLKMACPELEVIGSNKEESVARYLRTLFGLDY >NZ_CP043770.1|WP_005692779.1|1553783_1554170_+|fluoride-efflux-transporter-CrcB MQALLFISCGAILGASLRWAIGLLFNPLFSSFAFGTLIANLLGCLIIGVLLGLFWQFPQISSEWRLFLITGFLGSLTTFSSFSSEVVELFFNDKWLNGFCVLMMHLFGCLAMTVLGIWIYKICSQLLS >NZ_CP043770.1|WP_005692776.1|1554166_1554625_-|recombination-regulator-RecX MSSLAFNYIVNLLSHREYSEFELRNKMQEKNFSEEEIDDALSRCQAKNWQSDRRFSENYLNSRAQKGYGVGRIRQELRQLKGVSSDIIDEVLMESEIDWYEMAENLLRKKFPNYNEQQTPKMKQKIWQYMLSHGFRSDEFADLIGQNQSEWD >NZ_CP043770.1|WP_005654959.1|1554704_1555769_-|recombinase-RecA MATQEEKQKALAAALGQIEKQFGKGSIMKLGDTKTLDVESISTGSLGLDVALGIGGLPMGRIVEIFGPESSGKTTLTLSVIAQAQKAGKTCAFIDAEHALDPIYAAKLGVDVKELFVSQPDNGEQALEICDALVRSGAIDVIIVDSVAALTPKAEIEGDMGDSHMGLQARLMSQALRKLTGQIKNANCLVVFINQIRMKIGVMFGNPETTTGGNALKFYSSVRLDIRRTGSVKDGENIIGNETRVKVVKNKLAAPFRQVDFQILYGEGISKAGELLELGVKHKLVEKSGAWYSYNGEKIGQGKANSMKWLNENIEKSDELEARLRAELVANPEQALMADIEQSENNTESESDFE >NZ_CP043770.1|WP_005694574.1|1556088_1556742_+|TfoX/Sxy-family-DNA-transformation-protein MNIKDEHIDSVCSLLDQLVGNVSFKNLFTGYGLFHKEETMFAIWQNKKLYLRGEGVLAIQLTKLGCEPFTTNELNKRFVLSQYYALSDQILRSNRLCRKLIILSIKQILEQKLECTLRKLNRLKDLPNLTIKHERALIKVGITNVAMLREIGAENALVELKKSGSGATLDFYWKLVCALQNKNSQMLSQAEKERLLKKLNEVLRKNGLKGYRKLDDE >NZ_CP043770.1|WP_013526323.1|1563039_1563459_+|phosphate-starvation-inducible-protein-PsiE MEESPELEKLPRIITDVLKIVLCTALIVLAIVLIIALVKITYTLPMMVLNTSSVVPYDVAEQAVMFFLYFGFIGLIVQYFKSGYHFPLRYFIYAGITAMLRLIIVNHESSVDTILFAGAILIMVIALCLVLYSNKLKNI >NZ_CP043770.1|WP_013526322.1|1563522_1564809_-|heme-biosynthesis-protein-HemY MFRVLFLMLTLLVGLVAGPYISGQQGYVRIETANRIIEMSITTLVIFFIISLAIIYAFEWGIARFFRLSRSSYQWFSNRKRVKAQKQTLEGLVKMDEGDYAKAEKLIGKNAKHSAEPVLNLIKAAEAAQQRGDEFSANRYLIEATELAGSDNLLVEIARTRILLQQNKLPAARSSVDSLLEMARRNKEVLKLAVEIYLRSKAYQALDKILDNVANSGLFNDEEFKDLRSKTENGLLDEKMNEEGIDGLLTWWNQQPRHRRNNIELKISLIQRLIDCNDHESATELTFEILKKLGDNTAISLPLCTQITRLQPEDNSKLLKLIEKRAKRVDEKQKCCINRALGYLYVRNNEFIKAADVFKNVIACPEQLEQNDLMMASYVFEQAGDKALAEQVRQESLKSVMAIQDVIPESAEEKTEENSTALLESKSE |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
78485 : 86999
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP043770|78485:86999|DBSCAN-SWA TTTAATCAATATGGAAACAAGCGATTAATTTTCCATCAGTATATTGTTCCAAGTGCGGTTGATTTTCACGACATTTTTCTGTCGCTTTCCAACAACGAGGATTAAATGCACAGCCTTTTGGCGGATTAATTGGGCTTGGCAATTCGCCTGTCAGTTTTATGCGTTCACGGCGCAAGTTTGGCGACAAACGTGGTGTCGCTGAAAGTAACGCTTTGGTATAAGGATGCTGAGGATTAGAAAAAATCTGCTCTGTCGTCCCTTTTTCAATACAACGACCTAGATACATTACCATCACTTCATCAGCGATATGTTCTACCACAGAAAGATCGTGTGAAATGAACACGTAAGACAAGCCTAATTCATCTTGTAAATCCATCATTAAATTCAGTACTTGTGCACGCACGGAAACATCCAATGCAGAAACAGGCTCATCGGCAACAACGACATCGGGATCTAACATTAAACCACGAGCGATGGCAATACGTTGGCGTTGTCCGCCTGAGAACATGTGGGGATAACGATCATAAAATTCAGCGCGCAAGCCCACTTTTTCCATCATCGATAAAACTTTTTCTCGACGTTCTTTGGCGGAAAGTTTTGTATTGATGATTAATGGTTCTTCCAAAATTGAACCAATCTTTTTGCGTGGATTTAACGATGCGTAAGGATTTTGAAAAACTATTTGAATTTTTTTACGACGTAGTGCTTTTGTTTCAGAATCATTTTCTAAAAAATTATGTCCTTTGTAATAAAGTTCGCCTTTGGTTGGTTCTTCAATCATTGTCAATAAACGACCTAGCGTTGATTTTCCACAACCAGATTCCCCCACGACTGCTAAAGTTTTACCTCGTTCAAGCTGAAAAGAGACACCATCCAACGCTTTTACTTGCTGTGGTTTTGCAAACAAGCCTTTTTTTACAGGGTAATATTTTTTTAAGCCAATGGCATTTAATAATGGCGTATTTTCTTTTACTTCATTCGTCATTATTAAGCTCCTTGATATTCAACTGGATTGCCTTGCTCGTTCAGCGGAGTATGGCATTTTACTTTACGCGAACCGATATGATGCAATTGAGGTTCAACTTGGCGACAATATTCGGAGGCATAAGGGCAGCGAGGATTTAATAAACAGCCTGTTGGGCGATCGTATTTTCCAGGGACGACCCCTTGTAATGATTCTAAGCGAGATTTTCCCTCTGCAAATTCAGGTAATGAACGTAACAAGGCTTGTGTGTAAGGGTGTTTTGGCTCGCGGAAAATATCTTTTGTGGTGCCTTCTTCAACGATTTGTCCAGCATACATCACGATAATTCGCTCTGCCGCTTCAGCTACAAGTGCTAGATCGTGAGTAATCAAAATTAGGGACATGCATTCTTTCTTTTGCAATTCAAGTAAGAGTTCCATAATTTGAGCTTGGATAGTCACGTCCAATGCTGTGGTTGGTTCGTCAGCAATCAATAATTTAGGTCTGCAAGCAATTGCCATCGCAATCATCACGCGCTGGCTCATTCCACCAGACAGCTGATGGGGATAAACATCAATCCGAGATTCAGGATCAGGAATACCGACCAATTTTAAAAGCTCTAAAGTGCGGTCTTTTCTCGCCTTTTTTGTGCCGCCCTCGTGAGTTTTTAACGCCTCCATAATTTGGAAGCCCACAGTATAAGCTGGATTTAAACTTGTCATCGGATCTTGGAAAATCATTGCTACATCAGCACCAATAAGCTGGCGTTTAGCTTTACTCTCTAAAGTGAGTAAATCAGTATTTTCAAATTGCAAGGATTCAGCAGATACACGTCCAGGATGATCAATTAATCCCATAATTGCGAGAGAACTCACAGATTTACCTGAGCCGGATTCTCCTACAATGCCAAGCACTTCGCCTTGTGCGACTTGATAGCTAATGCGATCCACTGCTTTAAATGGCGTTTTTTTATCGCCAAAGTGAACAGAAAGTTCTTTTACGTCTAATAATGCCATTCTGTTTTCCTATTGTTTGAGTTTTGGATCAAGGGCATCACGCAAGCCATCGCCCATTAAGTTGAAAGCTAATACCAAAGATAAAATCACTAAGCCAGGAATTGTAACTAACCAGTTTGCCGCTTGCATAAAACCACGAGCTTCGGAAAGCATTGTACCAAGTTCTGGTGTTGGTGGTTTTGCACCAATGCCTAAGAAACCAAGTGTTGCGAGTTCTAAGATGGCATTGGAAATGCCCATTGTCATTTGCACAATTAAAGGGGCTAAACAGTTTGGTAAAATCACAATAAACATGAGGCGTAAAATACCTGCCCCTGCCACTTTAGATGAAGTCACATAATCACGATTTTTTTCATTCATCATCGCTGCTCGAGTTAAACGCACATAGCTAGGAATCGATACCACGGCGATCGCTAAAGTGGCATTGGCGAGTGATGGCTCTAAAATAGAGACGACTACAATCGTCAAAAGTAAGTTTGGAATTGCGAGCATAATATCAATTAGGCGAATGATAATTGTATCTAGCACGCCGCCATAATAGCCAGAAATCAAGCCAAGGCTGGTACCAAAGGCGCAAGATAGTAATACGATGATAAATCCCGCAAAGACGGAAATTCGCGTTCCATAAATAATACGCGAAAGAATATCTCGCCCAATATCGTCTGTGCCGAGTAAATAAGCAGGATTACCGCCCTCATACCAAGCGGGTGGCAATAAAAGTGCGGTACGATTTTGTTCTGTTGGATCAAAAGGCGCAATATAAGGCGCGAAAATGCTGATTAAGGCAACAATCAAAATAAAAATTAAACCAATTAGCGCGCCACGATTTTGTTTGAAGTAAAACCAAAATTCTTGCAAGGGAGTTTTTGGCGCAAAAGTTGAAGGCGTGTCAGACATAATTTCTCCTACAATTAATGACGGATACGCGGATTGACCACGCCGTAAAGTAAATCGACGGTTAAATTCACCACAATAATAATCGTCGCAATAATCAGTACAGAACCTTGTAATACCGGATAATCACGCGCTTGAATGGCATCAATAATCCATTTTCCAATCCCCGGCCAAGAGAAAATGGTTTCTGTGAGAACTGCACCAGAAAGCAATTGACCGACAATTAATCCCACCACAGTGACAACAGGAATTAACGCATTACGCAATGCATGCACAATGACGATTCGAGTATAACTTAGGCCTTTTGCTTTTGCCGTGCGAATGTAATCTTCGCCTAATACTTCCAGCATTGCAGATCGTGTCATACGCGTAATAATGGCGAGAGGAACTGTGCCTAGGACTATTGCAGGAAGAATTAAGGATTTCACCGCATTTTCGAAGGCACCAGAAACACCTGAAAGCCAGCTATCAATAAGCATAAATCCTGTTGGTGTATCGATCCAAAATTCATTATCTAAACGCCCACCTTGTGGCAAACCGAGTTGTGGCGAAACATATAAAATTAAAATTAAACCCCACCAGAAAATCGGCATAGAATAACCTGTGAGCGATGCAGCTGTAACGGTGTGAGAAATCCAACTGTCTTTTTTTACCGCGGCAATCGTGCCTAAAATTATTCCACCTAATAATGACCAAAATAACGCAAAAAAAGCTAATTCAGCGGTAGCAGGAAAAAGCGTAAAAAATTCAGTAAGGACAGGTTGTTGAGTGCGGAACGATGCACCGAAATCCCCTTGAATTACATTGCCAATATAGTGGAAATATTGCTGATAAAGAGGTAAATCTAAACCCAATTGGTGCATCATTTGTTGATGTACTTCTGCCGTTAAGCCGCGTTCCCCCATCATAATTTCCACAGGATCACCGGGAATAAAATGCACAAGGGCAAAGGTAATAAGAGTAATGGCAATAAAAGTAGGGATCACCATTAAGATTCGTTTGAATACAAATTTAAACATTCCATCACTCGTAGATAATAAAAGTGCGGTAAAAATTTACCGCACTTTTCAAAGAAATTAATCGGTAAAAAATATAATACTCTTGAATTCTACCGCACTTTTTCCAATTTTGCCAAATGCGCAATCAACCATTTAATGCCTTGCGCTTGGAATGCTATTTGTAAACGTGTGTTATTTTCAGATCCTTCCACATTAATCACTGTGCCGAAACCAAATTTTTCGTGTTTAACTTTTTGACCCATTTTCCATTCATTTTCGACCGCACTGGTATTAGACAATGAACCGACTTTGGCTAGATTCATCGCACGCGTGACAGTTCCTCGTAAACGAATTTCTTGGATACATTCTCTCGGTAATTCCGCTATAAAGCGTGATGGTAAATGGCGTTCTTCTTTGGCATATAATCGACGGCTTTCCGCATAAGAGATGGTCAGTTTTTTCTGCGCGCGAGTAATACCGACATAAGCTAAACGACGCTCTTCTTCTAAACGTCCGGGTTCTTCAAAAGAACGAAAACTTGGGAATAATCCTTCTTCTACGCCCACCATAAATACACGAGGAAATTCTAAGCCTTTCGCAGAGTGCAACGTCATCATTTCTACACAAGATTGATGCGGCGAGGCTTGTTCTTCGCCAGCTTCTAAGGAAGCGTGCGTTAAAAAGGCAGTGAGTTCGGTCATTTCTTCCGCATTATCAGGTTTGATAAATTCACGGGTTGCGGTAACTAATTCTTCCAAGTTTTCAATACGCACTTCGCCTTTTTCGCCTTTTTCTTGTTGATACATTTCATATAAGCCCGAATGTTTAATCACAAAATCAGTTTGTGCGAAAAGCGGCATTTCTGCGGTATCAAGTTGTAGTGAATTAATTAATTCTTGGAAACGTAATAAGGCTGTTGAGGCTCGCCCTGCCAACATATTTTCTTGTGTTGCGACTTGTACTGCTTGCCATAAGGTAATTTGGCGTTCACGTGTTAAGTTACGCAATATATCTAAAGTGCGGTCGCCAATGCCACGGGTTGGCGTATTAATTACACGCTCAAAAGCCGCATCGTCTTGACGATTATTAATCAAACGAAGATAGGCTAACGCATCTTTAATTTCTTGACGTTCGAAGAAACGCATACCGCCATAAATACGGTATGGAATTTGACAACGAATTAAAGCTTCTTCAATAACCCGTGATTGGCTATTACTACGATAAAGTACAGCGCAATCATCAAGTTTTCCGCCATGTTCTACCCAATCCTGAATTTGTGAAGCAACAAATTTTGCTTCATCTAATTCATTAAAGGCAGAATAGATGCCCACAGGATCGCCTTTTTCACCCTCTGTCCATAAATTTTTACCAAGACGATCACTATTGTTTGCAATTAATTCATTTGCGCTGTTTAGGATATTGGCGGTAGAACGATAGTTTTGTTCAAGGAGAATTGTCTCGGCTTTGAAATCTTTCAAGAATTTTTGGATATTTTCAATTTGCGCACCACGCCAACCGTATATAGATTGATCATCATCGCCCACAATCATGACTTTGCCTGTTTTTCCAGCAAGAATTTTAATCCACTTATATTGAATTTTATTGGTGTCTTGAAATTCATCCACCAAAATATGCTGAAAACGTTGTTGATAACGTTGCAAAATTAATGGTTTTTTCTCAAATAATTCATAGACCCGAATTAATAATTCAGCAAAATCGACCAACCCTGCGCGATCGCAAGTGTCTTGATAGATCTGATAAATTTTAATCCATTCACGTTCTTGGCGATCATTAAAATCTTCAATATCATTTGGTCGCAAGCCTTCATCTTTTTTGTTATTGATGTACCAACAAGCCTGTTTAGGCGGAAAAGCTTTTTCATCAAAATTATGTAATTTTAATAATCGTTTAATTAAACGAAGTTGATCTTCTGAATCTAAAATTTGGAAATCTTGTGGCAAGCCCACATCTAAATGATGAGCTCGTAATAAACGATGGGCAATGCTGTGGAAGGTGCCAATCCACATACCAAATAATTGATGTTGTGCGTGTTTGGCAAGGGTAGATTGAATACGATGACGCATTTCTGCTGCGGCTTTATTGGTAAACGTCACCGCCATAATGCTGCCTTCAGAAATATTTTCGACCGCAATTAACCAAGCAATACGGTGCGTCAATACACGCGTTTTGCCCGAGCCTGCACCAGCTAGCACTAAGTGATTACCAAGAGGAGCTGCTACGGCTTCGCGTTGTTTATCGTTGAGTCCGTCAAGTAATTCAGAAATATCCATCATAAACTATCTTTAATCTGTTTAAATTTACAGTTATTATAGCCCCATCTATCTTGTGAAACAATAAGATTTGTGAGTATATCAAAAGTAGGGTAGAACATTTTAAGAATAATATTAAGCGGGATTCTCCTATATCCTTAAACTCAACATCAAAACCATATGCTTTGAAAGCTATTTTTATACTATTTATAAACAAACTTTTAATTCGTTTACCTCTCATTCCTAAAATGCAAGGTTTCTCATTTTTCCAAAAATACCCATGATGAACAATAATAGCATAGGAATGTTGTTTAATGACTTAATCAATACTTGATTTGCTAGGATTCCTGTAATGATTTTATAAACATTTGCTTTTCCTTCTACTTGCACGCCATTTTACGCATAGTCGGTGATTTTGTCCGAATTAAGTTTTAGGTTAAAAAGTTACTCAAATTCAATGTTATTCATAATTAATACAAATAAGAAAGGGTGAGATATGGTACAAAATTCCAAAAAATGGTTAGCACAAAGGAATGGGAGAAGTGTGCTATCCAAGTTTCATTATGATCACTCTCTAAAGTAGAAAACGTCATATACTAAATTATATACTGATCAAAAAATAATATTTCCTTCTATTACTCAATACCAATCAATTTATGTGTTTGTAAACTTAGCTGCCATTTAGGTTTATTTGAACGTTGATTCAATTGACCAAGTAAAGTGATAGTCTCAAGTAAATTCATTTTCCCATCAATTTCACAAGGTGAAAGATAGTAATTCTTTGCTTTTATTTTTTGCTCGATCAATTCACAAAATGATGGCATATTACTGTCCATTACAATACGTACTTCATTTGCAAATGGAATGCAACGCTTTTCATACTTATGAGCATAAAGGCTCTTAGGACTCGTCGCAATATAATCTATTTGTGCAGGAATTGCTTTTAGACCATTGGTTTCAATTGCAAGAAAATAGCCATCTGATTTAAATTGCTCAAGTAAGTATTCAATTTTTGGTACAATTGTTGGCTCACCACCTGTGATGATAATATTCTTTGACGAAAATGACCGCACTTTTTCTAGAATTTGTGATACAGACCAGCGTTTAAAATTATTATAAGGTGTATCACACCAAGGACAGTCTAGATTGCATTTACCAAATCGTACAAAAACACTTGGCATTCCCGTATTGAAGCCCTCCCCTTGCAGACTTTCAAAAATTTCGACTATGTTAAAGTTCGGTTCAAAATCATGATATTTTTCCATCAACATTTACTCCTGATACTCGCAAAATGAAGTTGAGGTTTCCCATAAACGAATGGATGATATGGACAGTTGTTCCTCATGTTTTAAACGATTAAAAATAAAACGAGCTATTTCTTCTGCCGTAGTTCTAAAGGGAACACCAAAAGTTTTTGAGTTTAACTTTTGCAATAGACTGGCAATTTGGCTTTCTCGCTCATTGGTTTGATCATAAATAAAGGCGTGATCCATCGGATCTAAAATAACTTTTTTCACAATAGACTTTAGATCTGAAAAATCAATGACCATTGCTTTTTTTGCACCTGATTTATATAAGTCACCCGAAATTTCAACTTGTAATTTATATGTGTGTCCATGTAAATTTTGACATTTCCCATCATGTCCATCTAATAAATGTGCCATGTCAAAGCTAAATTCTTTGGAAATTTTAAACATTTTTTCTACCTTTTTGAGTCAAATATTTCTTTAGACCTTTATTGCGTAAAATACAGCTTGGGCATTTTCCGCATCCACCTTCGATGCCTTCATAGCAAGTGTGAGTATGTTTTTGTACATAATCTAATACGCCTAATTCATCAGCAAGCTGCCAAGTTTGGGCTTTAGTGAGATACATTAATGGTGTTTTGATATTGAATTGATAATCCATAGCTAAATTTAATGTGACATTCATTGACTTGATAAACACATCTCGGCAATCTGGATAACCGCTGAAATCTGTTTCACATACGCCAGTGATAATATCTTGAATGCCTTGGCCTTTCGCATAAATCGCTGCATAAAGTAAAAATAGGGCATTGCGACCATCAACAAAAGTGTTTGGCAATTCACTCTCTTTTTGCTCAATATGCGCCTGTTCATCCATTAATGCATTATGCGTGATAGCTTTCATAACAGATGTATCAATCAAGGTTTGTTTAATGCCGAGATCTTGCGCAATGGCGCGTGCCTTTTCTAATTCAATAGCATGACGCTGCCCATATTGAAAGGTAATGGCTTCTATGTTTTCTTTGCCGTATTCAGCAATAGCTTGGAATAAACAAGTCGTGGAGTCTTGTCCACCTGAAAAGATGACAATAGCTTTACGATCATGGTTTGGATTGAAAATATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP043770|78485:86999|84633_84867_-|WP_005653684.1|DBSCAN-SWA MRGKRIKSLFINSIKIAFKAYGFDVEFKDIGESRLILFLKCSTLLLIYSQILLFHKIDGAIITVNLNRLKIVYDGYF >NZ_CP043770|78485:86999|86315_86999_-|WP_013526026.1|DBSCAN-SWA MNIFNPNHDRKAIVIFSGGQDSTTCLFQAIAEYGKENIEAITFQYGQRHAIELEKARAIAQDLGIKQTLIDTSVMKAITHNALMDEQAHIEQKESELPNTFVDGRNALFLLYAAIYAKGQGIQDIITGVCETDFSGYPDCRDVFIKSMNVTLNLAMDYQFNIKTPLMYLTKAQTWQLADELGVLDYVQKHTHTCYEGIEGGCGKCPSCILRNKGLKKYLTQKGRKNV >NZ_CP043770|78485:86999|81375_82347_-|WP_013526029.1|DBSCAN-SWA MVIPTFIAITLITFALVHFIPGDPVEIMMGERGLTAEVHQQMMHQLGLDLPLYQQYFHYIGNVIQGDFGASFRTQQPVLTEFFTLFPATAELAFFALFWSLLGGIILGTIAAVKKDSWISHTVTAASLTGYSMPIFWWGLILILYVSPQLGLPQGGRLDNEFWIDTPTGFMLIDSWLSGVSGAFENAVKSLILPAIVLGTVPLAIITRMTRSAMLEVLGEDYIRTAKAKGLSYTRIVIVHALRNALIPVVTVVGLIVGQLLSGAVLTETIFSWPGIGKWIIDAIQARDYPVLQGSVLIIATIIIVVNLTVDLLYGVVNPRIRH >NZ_CP043770|78485:86999|85897_86323_-|WP_013526027.1|DBSCAN-SWA MFKISKEFSFDMAHLLDGHDGKCQNLHGHTYKLQVEISGDLYKSGAKKAMVIDFSDLKSIVKKVILDPMDHAFIYDQTNERESQIASLLQKLNSKTFGVPFRTTAEEIARFIFNRLKHEEQLSISSIRLWETSTSFCEYQE >NZ_CP043770|78485:86999|79471_80464_-|WP_013526031.1|DBSCAN-SWA MALLDVKELSVHFGDKKTPFKAVDRISYQVAQGEVLGIVGESGSGKSVSSLAIMGLIDHPGRVSAESLQFENTDLLTLESKAKRQLIGADVAMIFQDPMTSLNPAYTVGFQIMEALKTHEGGTKKARKDRTLELLKLVGIPDPESRIDVYPHQLSGGMSQRVMIAMAIACRPKLLIADEPTTALDVTIQAQIMELLLELQKKECMSLILITHDLALVAEAAERIIVMYAGQIVEEGTTKDIFREPKHPYTQALLRSLPEFAEGKSRLESLQGVVPGKYDRPTGCLLNPRCPYASEYCRQVEPQLHHIGSRKVKCHTPLNEQGNPVEYQGA >NZ_CP043770|78485:86999|82466_84650_-|WP_013526028.1|DBSCAN-SWA MMDISELLDGLNDKQREAVAAPLGNHLVLAGAGSGKTRVLTHRIAWLIAVENISEGSIMAVTFTNKAAAEMRHRIQSTLAKHAQHQLFGMWIGTFHSIAHRLLRAHHLDVGLPQDFQILDSEDQLRLIKRLLKLHNFDEKAFPPKQACWYINNKKDEGLRPNDIEDFNDRQEREWIKIYQIYQDTCDRAGLVDFAELLIRVYELFEKKPLILQRYQQRFQHILVDEFQDTNKIQYKWIKILAGKTGKVMIVGDDDQSIYGWRGAQIENIQKFLKDFKAETILLEQNYRSTANILNSANELIANNSDRLGKNLWTEGEKGDPVGIYSAFNELDEAKFVASQIQDWVEHGGKLDDCAVLYRSNSQSRVIEEALIRCQIPYRIYGGMRFFERQEIKDALAYLRLINNRQDDAAFERVINTPTRGIGDRTLDILRNLTRERQITLWQAVQVATQENMLAGRASTALLRFQELINSLQLDTAEMPLFAQTDFVIKHSGLYEMYQQEKGEKGEVRIENLEELVTATREFIKPDNAEEMTELTAFLTHASLEAGEEQASPHQSCVEMMTLHSAKGLEFPRVFMVGVEEGLFPSFRSFEEPGRLEEERRLAYVGITRAQKKLTISYAESRRLYAKEERHLPSRFIAELPRECIQEIRLRGTVTRAMNLAKVGSLSNTSAVENEWKMGQKVKHEKFGFGTVINVEGSENNTRLQIAFQAQGIKWLIAHLAKLEKVR >NZ_CP043770|78485:86999|78485_79469_-|WP_005663823.1|DBSCAN-SWA MTNEVKENTPLLNAIGLKKYYPVKKGLFAKPQQVKALDGVSFQLERGKTLAVVGESGCGKSTLGRLLTMIEEPTKGELYYKGHNFLENDSETKALRRKKIQIVFQNPYASLNPRKKIGSILEEPLIINTKLSAKERREKVLSMMEKVGLRAEFYDRYPHMFSGGQRQRIAIARGLMLDPDVVVADEPVSALDVSVRAQVLNLMMDLQDELGLSYVFISHDLSVVEHIADEVMVMYLGRCIEKGTTEQIFSNPQHPYTKALLSATPRLSPNLRRERIKLTGELPSPINPPKGCAFNPRCWKATEKCRENQPHLEQYTDGKLIACFHID >NZ_CP043770|78485:86999|85261_85897_-|WP_005686506.1|DBSCAN-SWA MLMEKYHDFEPNFNIVEIFESLQGEGFNTGMPSVFVRFGKCNLDCPWCDTPYNNFKRWSVSQILEKVRSFSSKNIIITGGEPTIVPKIEYLLEQFKSDGYFLAIETNGLKAIPAQIDYIATSPKSLYAHKYEKRCIPFANEVRIVMDSNMPSFCELIEQKIKAKNYYLSPCEIDGKMNLLETITLLGQLNQRSNKPKWQLSLQTHKLIGIE >NZ_CP043770|78485:86999|80473_81361_-|WP_013526030.1|DBSCAN-SWA MSDTPSTFAPKTPLQEFWFYFKQNRGALIGLIFILIVALISIFAPYIAPFDPTEQNRTALLLPPAWYEGGNPAYLLGTDDIGRDILSRIIYGTRISVFAGFIIVLLSCAFGTSLGLISGYYGGVLDTIIIRLIDIMLAIPNLLLTIVVVSILEPSLANATLAIAVVSIPSYVRLTRAAMMNEKNRDYVTSSKVAGAGILRLMFIVILPNCLAPLIVQMTMGISNAILELATLGFLGIGAKPPTPELGTMLSEARGFMQAANWLVTIPGLVILSLVLAFNLMGDGLRDALDPKLKQ |
9 | Bacillus_virus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
185402 : 251027
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP043770|185402:251027|DBSCAN-SWA ATTACATTTTTTCTACGGTTTTAATACCGAGTAACGTTAAACCCTGTTTTAAGGTTTTTTCCGTTAATAATGCTAATTTCAAACGACTTAATTTTATAGATTCATCTTCAGCATTTAAAATTGGACAATGTTCGTAGAATGACGAGAAGATGCCAGCAAGTTCATATAAATAAGCACAAAGCACGTGCGGCGTGCCTTCTTTTCCGACAGTTTGCACGGCTTCTTCAAATTGTAGAAGTTTAATAGCAAGCGTTCTTTCTTTATCATCTTTAATAGTTAAAGGTGCAGCCAAAAGTGCGGTTGAATTTATATCTGTTTTATTAAAGATCGAACGAATACGGGTGTAGGCATATTGCATATAAGGTGCCGTGTTACCTTCGAAACTTAACATATTATCCCAATCAAAAACGTAATCCGTGGTGCGGTTTTTGGATAGATCCGCATATTTTACCGCACCGATACCGACAGCCTTAATCACGGCTTCTTTTTCATCATTAGATAAATTTGTATTTTTTTCATTAATTAATACAGTGGAACGTTCAATTGCTTCATCTAATAGATCGGCTAATTTCACCGTGCCACCGGTACGGGTTTTAAATGGTTTGCCATCTTTACCAAGCATCATCCCAAAGTTTTTATGCTCTAACGAGAAACTATCTGGTACATAACCTGCTTTACGAGTAATTAACCAAGCTTGTTGCATATGTTGGCTTTGGCGAGTATCTGAAAAAACAAGGGCGCGATTAGCTTTTAATGTTTCATAACGATATTTTGCTGCAGCAATATCTGTTGTAGTATAAAGGAAACCGCCGTCTTTTTTTTGAACGATTACACCCATTGGGTCGCCATCTTTATTTTTAAATTCATCTAAATAAACAACCAATGCACCATCATTTTCCACAGCCAAACCTTGTTTTTTAAGATCTTCTACGATGCTTGGTAACATAGGATTATAAAGACTTTCACCCATCACATCTTTTTCGGTTAAAGTCACGTTTAAGCGATTATAGTTGTGCTGATTTTGTTGCATAGTGATATCGACTAAACGTTTCCACATCGTTCGACAATATTCATCTCCACTTTGTAATTTTACAACATAATTACGTGCTTTTTCTGCGAATATTTCATCTTCATCGTAATGTTTTTTGGCTTCGCGGTAAAAGGCTTCAAGATCTTGTAATTCCATTTCACTGGCGTGTTCATTTTGCATTTTTTCAAGATAAGCAATAAGCATTCCGAATTGCGTTCCCCAGTCGCCTACGTGGTTAGCGCGGATGACATTGTGACCTAAAAACTCAAGGGTTCTGGCTACAGCATCGCCGATTATCGTAGAGCGTAAATGACCTACGTGCATTTCTTTTGCTACGTTTGGAGATGAATAATCAATCACAACTGTTTGTTTATTGGTAGCTTGAATACCTAAATTTTTGTGGGAAAGTGCAGCTGAAATTTCAGTTGTTAGCCAAGTTGGATTTAAGAAAATATTGATAAAACCTGGACCTGCGATTTCTAATTTTTCTGCAATATCAGATAGTTGAAGATTGTCTAAAACTTTTTGAGCAAATTCTCGTGGATTTAAACCTAATTTTTTTGCCGCAGCCATAATGCCATTGGCTTGATAATCGCCAAATTGTGGTTTTCCTGATTGACGAATAAGCGCATCGCAAGATTGATCAGCACCTGCAAGAATCATCGCTTGTTTAATTTTATCGGATAGAATAGATTGAATATTCACGTTTTTTCCTATGTTTAAATTGAATAATAAAAATAATCGGTTATGATACCGTTCTTTGTATATTTCTCAAAGGGACAAAATGACAAATTTACAGGAAAATTTAACCGCACTTTTAGCAGATTTAGCAATATTTGAAAGAAAAATTCAGCATTTAGCCAAAGAAATGACAATAGATCTGTCTCACTATGAAATTGATCATCTTGCATTACGGGTAAATAGTGAGCAAAGTGCTAAAAATTGGCTGATACTTTTATTAAAGTGTGGTAAAATCTTATCTGGTAATATTGTTAATGGTCGTAAGATTTATCTTATTGAATTAGAAAAACCAGTTAAATTTGCCAATCAATTTGTGGATATTATTGAACTTCCACTTCCTAAAAATAAAAAATATCCAATTGAGGGATGGGAACATATTGAGATTGTAATGCCATTTTTACCGAAAGAATCGATAAATGAATGGATTAACCGTGTTAATATGTATTTTTTATGGGACAAATTAACTCAATTAACCATTAAAGTGAGCGAGCCTAAAGTGGATGGGGAAAGATTACCAAATCCATCTATTGCAGTAAGTTTTACGGATAAAACAGTAAATCATACTTGCATTAAGGTTCATCCTTATTCTATAAAAAAAATACTTGAGGTTTAGTAAAAATGAATAAATTATCACTTGCATTTGTTGTTTTAGCTACAGTAGGCTTGAGTGCTTGTTCTGCTTTTCAAAAGGAGGAGGGTACTTATAAAGGTCAAATTATTTTTAGTCAAATGGAAGGCAAAAATCTAAAATTAACTGTTCGTAAAAATGATTGTTCTGGTAACCAGCAGAAAGGAGAGGAAGTTGTTATTGTGCATAAGTATGATTCAACTTTAGTTGTTGGTGCTTGTGTTTTAGTATCTGACAATGGTAATACTAAAAACATTTCAACTTTTTCTCCAAGAAACCCACTTTAATTCCTTCTAATATAGAGAATATGATATGAAAAAAATAAATATGGCATTAGTACTGTTAGTTGCTTTTAGTGTAACTGGTTGTGCAAATACAGATATTTTCAGCGGTGATGTTTATAGCGCATCTCAAGCAAAGGAAGCGCGTTCAATTACTTATGGTACGATTGTTTCTGTACGCCCTGTTAAAATCCAAGCTGATAATCAAGGTGTAGTAGGTACGCTTGGTGGCGGTGCGTTAGGTGGTATTGCTGGTAGTGCAATTGGCGGTGGTCGTGGTCAAGCTATTGCTGCAGTAGTTGGCGCAATTGGCGGTGCAATAGCTGGAAGCAAAATCGAAGAAAAAATGAGTCAAGTAAACGGTGCTGAACTTGTAATTAAGAAAGATGATGGTCAAGAGATCGTTGTTGTTCAAAAGGCTGACAGCAGTTTTGTAGCTGGTCGCCGAGTTCGTATTGTTGGTGGCGGCTCAAGCTTAAATGTTTCTGTGCTATAACCAATAGCATTAAAGTCTAATATGATTAATCAGTGTCTTAACTTAGTAAGGCACTGATTTTTTATAATTAAATTCATTTAAAATATATATTTATCGTCTATCTAAGATAAATTTAAAGGACTAAATTAGAATTTAGTCCTTTAGAAAACTTGGAATTTGTTCCTCCCCTTTCTGAACACTCTATCTAAAATATAACATTTATTTTTCTTATGAACTTTTTTATAATCTTTAAATTTTGCTTTAAATCAAATAATTCAAGATGATATTTAATAAAATGTAAGAGTGAGGTTATAGTATATTTATCTAAGCTCATATACATCTCATAAAGTATACTTTTCAACACTTTATTACTTTTATCCACATGATATATTTCTAGCAATGACACACTATTAATTACGTTTATACCTATCTTATTAAGGTAATATGTAATATTTTCCCTCTTTATCTTTTTAGCTACCTCATTTTGCTTATGATTATGAACTGATGATGTTTGGTTTCCATGTAGTCTATATTGTACCAATGCTTCAGGATAATTAGCTAAACAACCAAGCCTACTAACCTCTGACCAAAACTTATAATCTTCTGCATACGGATAATCTTTATTAAAGATTAATTTATGCTCTCTATATACATTTGCTCTCATAATCATAGTATTGTTATGTATCGGATTATAGAAAAGCATAGCTTCACAAATCTCATTATGTAGCAATGGATTTTTCCATATATCACCAGTTTTATATTTAGAACCGATAATTCCACATTCTTTTTCTACAATAATCTCTAAGTATGATCCCATTGCTGTAATATGATCATTTTTCTCTAGATAGGTAACTATTTTCTCAATCCACGATGGTTTAGCTATATCATCAGCATCCATTCTAGCAATATATTTACCTGAAAAACAACCAAGACCTATATTCAAAGAATTTATGAACCCTAAATTATATTTATTACTGATAATTTTTATCCTTTTATCTAATTTAGATATTTCTTCTAAATGAGACAAAGTCAAATCTGTTGAACCATCATTGATAACTATAATTTCTAGATTTTCATAAGTCTGATTAATAATGGATGAAATGCTTTCATCTATATATTGCTCAGCGTTATAAGCACAAACAATAACCGATACTAATGGGAAATTTTCCATATAAGCTCTAATTTTACACTCTTATTTAAACTATTTTATACGTTATTTAAATAACAAAAGGAGATGCATAGATAACCAATTAAAACTCTCCTAAATTAATTGTTTTGAAATAGAAATTTGAGTTTTTTTAAATCACTGTGATTAAAACGCCATTCATATTCCTTTAAATATAGCTTAAGAATATCATAACCTCTGTAGAAATTCATATAAATAATACTACCTTGTTTACCTTTTCTCGAATAATCGGTAACAGTGTTGCAGATTGCATATTCATAACCACCACAGTGTTACTTTGCCATTTCGTTTCAAAAAACAAATTACGAAGTTTTTCCAGCTTCTCCTTGACCAAGTTTACCTTTCAGAGCACCACCAAAATAGCTTTCATTCGCTTGAATTTCACTTTCAAACATTCCCATATGTAGGTTGCTTTGAGTGATAAACAATGGTAGACGATGAAAGTAATAAGCTGAAGTTTATTTATATTTACCAACTTAGCTGCGGCTAGAGCTGTCACACTTGCCAGAAATATCTCAATAAGTTTATTTTGTTTATATTGACTTAAGCGACTTTCTCTCATTTGATTATCTTAACCTAAATAGAGTTTTTAGTCGTTATTTGTGATAGCTCTAGAATTATTCAAATCCAAATAATTAACGCCATGCTTTAAATTGATT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82 | Haemophilus_phage(37.29%) | integrase,holin,terminase,tRNA,plate,tail,bacteriocin | attL 177317:177334|attR 258048:258065 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
655133 : 748119
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP043770|655133:748119|DBSCAN-SWA 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102 | Burkholderia_virus(16.67%) | integrase,transposase,terminase,tRNA,plate,tail | attL 661121:661147|attR 738121:738147 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
751452 : 789482
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP043770|751452:789482|DBSCAN-SWA 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50 | Pseudomonas_phage(15.15%) | plate,tail,tRNA,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
840152 : 849045
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP043770|840152:849045|DBSCAN-SWA AATGATGCGTACACATTATTGCGGAGCATTAAACCGTAACAATATCGGACAAGACGTAACATTAAGCGGTTGGGTTCATCGCCGTCGTGATTTAGGTGGCTTGATTTTTATTGATATGCGTGATCGTGATGGCATTGTGCAAGTTTGTTTTGATCCGAAATATCAAGATGCATTGACAGCGGCTGCGGGTTTACGTAACGAATTCTGTATTCAAATTAAAGGCGAAGTGATTGCGCGTCCTGAAAACCAAATCAATAAAAATATGGCAACAGGCGAAGTGGAAGTGTTAGCGAAAGAATTACGCATCTACAATGCTTCTGACGTTTTACCATTAGACTTCAACCAAAACAATACTGAAGAACAACGTTTAAAATACCGTTATTTAGATTTACGTCGTCCTGAAATGGCGCAGCGTTTGAAAACCCGTGCAAAAATCACCAGCTTTGTGCGTCGCTTTATGGATGATAATGGTTTCCTTGATATTGAAACCCCAATGCTAACCAAAGCAACGCCAGAAGGCGCGCGCGACTATTTAGTGCCAAGCCGTGTGCATAAAGGCAAATTCTATGCATTGCCGCAATCACCACAGCTTTTCAAACAGCTTTTAATGATGTCTGGTTTTGACCGCTATTATCAAATCGTAAAATGTTTCCGTGATGAAGATTTACGAGCAGATCGTCAGCCTGAGTTTACTCAAATCGATGTGGAAACTTCTTTCCTAACTGCGCCAGAAGTCCGCGAAATTATGGAACGTATGGTGCACGATTTATGGCTTGATACCATTGGTGTAGATTTAGGTAAGTTCCCAGTGATGACTTGGCAAGAAGCAATGTGTCGTTTTGGTTCGGATAAGCCAGATTTGCGTAACCCATTAGAAATGGTAGATGTAGCAGATATCGTAAAAGACGTTGAATTTAAAGTATTTAATGAGCCAGCAAACAATCCAAATGGCCGTGTTGCAGTCATTCGAGTACCAAATGGTGCAGAAATTACTCGTAAACAAATTGATGAATATACACAATTTGTAGGCATCTACGGTGCAAAAGGTTTGGCTTGGGCAAAAGTAAACGATATTAATGCTGGTCTTGAAGGCGTGCAAAGTCCGATTGCGAAATTCTTAAATGAAGAGGTATGGAAAGCGTTAGCAGAACGTGTGAATGCACAAACTGGCGATATTTTATTCTTCGGTGCAGACAAATGGCAAACGACCACTGATGCAATGGGCGCGTTACGTTTGAAATTAGGTCGTGATCTTGGCTTAACTCGTTTAGACGAATGGAAACCGCTTTGGGTCATTGATTTCCCAATGTTTGAACGTGATGAAGAAGGTAATCTTGCAGCAATGCACCATCCATTCACTTCACCAAAAGATTTTACGCCAGAACAATTAGAAGTGAATCCAACCGATGCGGTAGCAAATGCTTACGATATGGTCATCAACGGCTACGAAGTGGGTGGTGGTTCTGTACGTATTTTTGATCCGAAAATGCAACAAACTGTGTTCCGTATTCTTGGTATTGACGAAGAACAACAACGCGAGAAATTCGGTTTCTTATTAGATGCGTTAAAATTTGGTACACCGCCACACGCAGGTCTTGCATTCGGTTTAGACCGCTTAACCATGCTTTTAACAGGCACGGAAAACATTCGCGATGTAATTGCTTTTCCTAAAACTACGGCAGCAGCGTGCTTAATGACGGAAGCCCCGAGTTTTGCAAATCCGCAAGCATTGGAAGAGTTGGCAATTTCTGTCGTTAAAGCAGAATAAGTTTGAAATATTAGGAATGAAGTGCGGTCAGATTTGACCGCATTTTTAATGATGCAATACAAAAATAATCAATCTGTTCTCGTTGTAATTTACACTAAAGATACAAACAGAGTTTTAATGCTCCAACGCCAAGATGATCCTGATTTTTGGCAGTCTGTTACTGGCACCATTGAAAGTGGTGAAACACCAAAAAAAACAGCAATTCGTGAGCTATGGGAAGAAGTGCGGTTAGAAATTTCGGAAAATTCCACCGCACTTTTTGATTGCAATGAGAGCATAGAATTTGAAATTTTTCCACATTTCCGCTATAAATACGCACCGAATATTACTCACTGCAAAGAACATTGGTTTTTGTGTGAGGTGGAAAAAGAATTTATGCCAGTATTGAGTGAGCATTTAGATTTTTGCTGGATATCGGCGAAAAAAGCAGTAGAAATGACGAAATCCCAGAATAATGCGGAAGCTATTAAAAAATATCTTTTTAATCTCCGTAGGTAAGTATAATCACAGCTAATTATGGTAATAGCGGTTCTCTTTTGGGAAAAGCTACATCCACCCCCAACGGGGTAACACTTTTACTAACTTAGGCTATACCTAGCCTAGGTCAAAACGTTTAATTAAATCAAGATCAATAAGATCAAAACAGAAGGAAATAAAATGGCAGGTCATAGTAAGTGGGCTAATATTAAACACCGCAAAGCAGCACAAGATGCACAACGCGGTAAAATTTTTACTAAATTAATTCGTGAACTTGTTACCGCAGCTAAAATTGGTGGTGGCGATGTGAGTGCTAACCCGCGTTTACGTGCAGCAGTAGATAAAGCACTTAGCAACAATATGACGCGCGATACTATCAACCGCGCTATTGATCGTGGCGTAGGTGGTGGCGATGACACCAATATGGAAACCAAAATCTATGAAGGTTATGGTCCAGGCGGTACAGCGGTTATGGTTGAATGTTTAAGTGATAATGCAAACCGTACGATCTCACAAGTACGCCCAAGTTTTACTAAATGTGGTGGTAACTTGGGAACAGAAGGTTCTGTGGGTTATTTATTTAGCAAAAAAGGTTTAATCTTAATCGCAGAAGCGGATGAAGATGCCTTAACTGAAGCGGCAATCGAAGCGGGTGCTGATGATATTCAACCACAAGATGATGGTTCATTTGAAATCTATACTGCTTGGGAAGATTTAGGTTCAGTGCGCGATGGCATTGAAGCAGCTGGTTTTAAAGTACAAGAAGCTGAAGTAACGATGATTCCATCAACAACCGTCGATCTTGATATTGAAACTGCACCAAAATTACTTCGTTTAATTGATATGTTGGAAGATTGTGATGACGTACAAAACGTATATCACAACGGAGAAATCTGTGACGAAGTGGCATCTCAACTTTAATAATGCAATAAATGGGTAATTTAATTACCCATTTTTTATAGAAATTATGAGCATTATTTTAGGTATTGACCCTGGATCTCGCGTAACGGGTTACGGTGTGATTCGCCAAACAGGGAGACATTTAGAATATCTCGGTAGTGGCGCAATTCGTACTCAAGTTGAAGATTTACCCACCCGTTTGAAACGCATTTATGCTGGAGTAACTGAAATCATCACGCAATTTCAACCTAATATGTTTGCGATTGAGCAAGTGTTTATGGCGAAGAATGCGGATTCAGCATTGAAACTTGGGCAGGCTCGCGGCACGGCGATTGTTGCAGCGGTAAATCATGATTTACCTGTTTTTGAATATGCCGCACGTTTAGTAAAACAAACGGTTGTGGGCATTGGTTCGGCAGATAAAGTGCAAGTGCAAGAAATGGTGACTCGTATTTTGAAGTTATCAGATAAACCTCAAGCCGATGCAGCGGATGCGTTGGCTATTGCGATTACACACGCTCATTCTATTCAACATTCTTTACATATTGCCAATTCTGTGAAAATGACAGAAACGCAAGAAAAAATGACCGCACTTTTAAAGACCAGATATAGCCGAGGACGCTTTAGATTAAAAATTTAACTGGATGTTCGTCCAGTTTTATTTTATTCTATGCGTTAATTTTTTTATCATTCGGAAGAATTATGATTGGTCGCTTACAAGGCATTCTTTTAGAAAAACAACCTCCAGAAATTTTACTCAATGTGCAAGGCGTAGGCTATGAATTGCTTTTGCCGATGACGAGTTTCTATGATTTACCAGAAATTGGACAAGAAACTACTTTATTCACCCATCTTGTTGTTCGGGAAGATGCTCACTTACTCTTTGGATTTGCCCAGAAAACAGACCGCACTTTATTTCGTGAATTAATTAAAACAAATGGGGTTGGGCCTAAATTAGCCTTAGCGATTTTATCCGCCATGTCGGTCGAACAATTTGCTTACGCAATTGAGAGAGAAGAACTTTCTAAACTCACTAAAATTCCAGGTGTTGGCAAAAAAACAGCTGAACGTTTGTTAGTTGAACTCAAAGGTAAATTTAAAGGCATAAAACAAAGTGATTTCTTTGTAGAAAGTACGCATATTCCATTATCCCCATCTATTGAATCCCACTCGGAAAGTTCATCTGATGAAGCAATTTCAGCCTTGATTGCTTTAGGTTATAAACCTGCAGAAGCAGAAAAAATGGTAAAACTCGTTGCTAAACCTGAATTAACCAGTGAACAAGTTATTCGTGAAGCATTAAAAGCCGCATTGTAGGAAAAATATGATTGAAGCAGATAGAATTATTAGCGGGCAAGCTAAGGTTGATGAAGATGTTATCGACCGTGCTATTCGTCCTAAACTATTAGCAGATTATGTTGGGCAGCCGCAAGTATGCGAGCAGATGGATATTTTCATCAAGGCAGCCAAACTACGTCAAGATGCCTTAGATCATTTATTGATTTTTGGCCCTCCAGGTTTGGGAAAAACAACGCTTGCTAATATTGTGGCAAATGAAATGGGCGTGAATATTCGTACGACGTCAGGGCCTGTATTAGAAAAAGCGGGAGATTTAGCCGCAATGCTTACTAATCTTGAACCGCACGATGTATTATTTATTGATGAAATCCATCGACTTTCCCCTGCTATTGAAGAAGTCCTTTATCCAGCAATGGAAGACTATCAGTTGGATATTATGATTGGTGAAGGGCCTGCTGCTCGTTCCATTAAATTAGATTTACCCCCTTTTACTTTGGTTGGTGCGACCACTAGAGCTGGTTCTTTGACTTCACCATTGCGTGATCGTTTTGGTATT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP043770|840152:849045|843998_844613_+|WP_013525542.1|DBSCAN-SWA MIGRLQGILLEKQPPEILLNVQGVGYELLLPMTSFYDLPEIGQETTLFTHLVVREDAHLLFGFAQKTDRTLFRELIKTNGVGPKLALAILSAMSVEQFAYAIEREELSKLTKIPGVGKKTAERLLVELKGKFKGIKQSDFFVESTHIPLSPSIESHSESSSDEAISALIALGYKPAEAEKMVKLVAKPELTSEQVIREALKAAL >NZ_CP043770|840152:849045|848229_849045_-|WP_013525538.1|DBSCAN-SWA MQHKLIAFIGGGNMAQAIILGLLKQGYPAEQIIVNDPNEEKRAFFANLGMATSENNVESATKAEVVLLAVKPQMMADVCLPLSAVDFSDKLLISIAAGISTERLNALIPSLKSIVRVMPNTPALVGEGMAGLFAPKNTSENHRTFAQDLLGAVGRTVWVNDETQMHAVTAASGSSPAYFFLMLEAMQKALVKMNIEEKTARELVQQSMLGAAKMVTENPQIALSTLRENVTSKGGTTAAALAVFDAQHFNQTIEQAMQACLSRSQEMETLF >NZ_CP043770|840152:849045|843363_843936_+|WP_005659992.1|DBSCAN-SWA MSIILGIDPGSRVTGYGVIRQTGRHLEYLGSGAIRTQVEDLPTRLKRIYAGVTEIITQFQPNMFAIEQVFMAKNADSALKLGQARGTAIVAAVNHDLPVFEYAARLVKQTVVGIGSADKVQVQEMVTRILKLSDKPQADAADALAIAITHAHSIQHSLHIANSVKMTETQEKMTALLKTRYSRGRFRLKI >NZ_CP043770|840152:849045|842576_843317_+|WP_005649034.1|DBSCAN-SWA MAGHSKWANIKHRKAAQDAQRGKIFTKLIRELVTAAKIGGGDVSANPRLRAAVDKALSNNMTRDTINRAIDRGVGGGDDTNMETKIYEGYGPGGTAVMVECLSDNANRTISQVRPSFTKCGGNLGTEGSVGYLFSKKGLILIAEADEDALTEAAIEAGADDIQPQDDGSFEIYTAWEDLGSVRDGIEAAGFKVQEAEVTMIPSTTVDLDIETAPKLLRLIDMLEDCDDVQNVYHNGEICDEVASQL >NZ_CP043770|840152:849045|846139_847033_-|WP_013525540.1|DBSCAN-SWA MKNLALIDLFLNEYWIEKGLSENTVQSYRLDLTALCDWLDKNGLSLETLDAVDLQGFLGERLEKGYKATSTARMLSAMRKLFQYLYREKYRVDDPSAVLSSPKLPSRLPKYLTEQQVSDLLNTPDVEVPLELRDKAMLELLYATGLRVTELVSLTIENMSVQQGVVRVIGKGNKERIVPMGEEAAYWVRQFMLYGRPVLLNGQSSDVVFPSQRTQQMTRQTFWHRVKHYAILADIDADALSPHVLRHAFATHLVNHGADLRVVQMLLGHTDLSTTQIYTHVAKERLKRLHERFHPRG >NZ_CP043770|840152:849045|840152_841919_+|WP_013525543.1|tRNA|DBSCAN-SWA MMRTHYCGALNRNNIGQDVTLSGWVHRRRDLGGLIFIDMRDRDGIVQVCFDPKYQDALTAAAGLRNEFCIQIKGEVIARPENQINKNMATGEVEVLAKELRIYNASDVLPLDFNQNNTEEQRLKYRYLDLRRPEMAQRLKTRAKITSFVRRFMDDNGFLDIETPMLTKATPEGARDYLVPSRVHKGKFYALPQSPQLFKQLLMMSGFDRYYQIVKCFRDEDLRADRQPEFTQIDVETSFLTAPEVREIMERMVHDLWLDTIGVDLGKFPVMTWQEAMCRFGSDKPDLRNPLEMVDVADIVKDVEFKVFNEPANNPNGRVAVIRVPNGAEITRKQIDEYTQFVGIYGAKGLAWAKVNDINAGLEGVQSPIAKFLNEEVWKALAERVNAQTGDILFFGADKWQTTTDAMGALRLKLGRDLGLTRLDEWKPLWVIDFPMFERDEEGNLAAMHHPFTSPKDFTPEQLEVNPTDAVANAYDMVINGYEVGGGSVRIFDPKMQQTVFRILGIDEEQQREKFGFLLDALKFGTPPHAGLAFGLDRLTMLLTGTENIRDVIAFPKTTAAACLMTEAPSFANPQALEELAISVVKAE >NZ_CP043770|840152:849045|847063_848230_-|WP_013525539.1|DBSCAN-SWA MQVRPFYWLALSFLGYYCAYGVFLPFFPAWLKSQQYGEEMIGLVIGSAYIFRFAGGLFFSSLIKKANHIISSLRLLALASAIIMAAMSLVAHNFWLLFIAIGLYASVNSAGMPIGDSLASTWQRQIGLDYGKVRLIGSSAFILGVVVFGGMIGWVGEQNIVWILTALLSFYTIIQLLKPTIPPKDEIPEDGVQNDVGFIALLKNPMTLRVMVAVGLIQGSHAAYYVYSTIYWTSIGISVSQTSLLWGIGVLAEIVLFFFSRHLFQNISISVLLYISAFACVGRWAVMGYIEDFWLIFLLQLIHSFTYAVCHYAIVRYITTQPQSHIAKLQGLYNGLSNGVLIAIFTAIAGMIYPTSPAMTFVFMSIIAAAAFFVIPRKLNAFLIVQHK >NZ_CP043770|840152:849045|844620_845628_+|WP_013525541.1|DBSCAN-SWA MIEADRIISGQAKVDEDVIDRAIRPKLLADYVGQPQVCEQMDIFIKAAKLRQDALDHLLIFGPPGLGKTTLANIVANEMGVNIRTTSGPVLEKAGDLAAMLTNLEPHDVLFIDEIHRLSPAIEEVLYPAMEDYQLDIMIGEGPAARSIKLDLPPFTLVGATTRAGSLTSPLRDRFGIVQRLEFYSVEDLTSIVARSAGCLNLELEQQAAFEVARRSRGTPRIANRLLRRVRDYADVRNGGIISINVAKQALSMLDVDDAGFDYLDRKLLSAVIERFDGGPVGLDNLAAAIGEERDTIEDVLEPYLIQQGFLQRTPRGRIATSQTYRHFGLQKLSD >NZ_CP043770|840152:849045|841952_842417_+|WP_014550473.1|DBSCAN-SWA MTAFLMMQYKNNQSVLVVIYTKDTNRVLMLQRQDDPDFWQSVTGTIESGETPKKTAIRELWEEVRLEISENSTALFDCNESIEFEIFPHFRYKYAPNITHCKEHWFLCEVEKEFMPVLSEHLDFCWISAKKAVEMTKSQNNAEAIKKYLFNLRR >NZ_CP043770|840152:849045|845679_845967_-|WP_005659998.1|DBSCAN-SWA MKKITLFFTALLCLFSTSVLAESNSMPKQCEQLFKETENLIAQAEKQPGTHIQVNKIKSKLNQSKQQILQMELATQLKSCEVGLAKLSNLKSYSE |
10 | Tupanvirus(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
955910 : 1024850
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP043770|955910:1024850|DBSCAN-SWA ATTATTTGCCGATAACGTCTAATCCGCCCATATATGGACGTAGCACTTCTGGTACGGTGATTGAACCATCGGCATTTTGATAGTTTTCAAGCACAGCTACTAAAGTACGACCAACCGCTAAGCCTGAACCATTTAAAGTGTGCACTAAGCGAGTTTTCTTATCGCCTTTTGCTTTACAGCGAGCTTGCATACGGCGAGCTTGGAAATCCCACATATTTGAGCAAGAAGAAATTTCTCGATAAGTATTTTGTGCAGGCACCCAAACTTCTAAATCGTAAGTTTTGCAAGAACCAAAGCCCATATCGCCTGTGCAAAGTAAAACTTTACGGTATGGTAAATTTAATAATTGCAATACTTTTTCCGCATGACCTGTTAATTCTTCAAGTGCTTCCATTGATTTATCTGGATCAACGATTTGTACCATTTCTACTTTATCAAATTGGTGCATACGAATTAAACCACGAGTATCACGACCGTAAGAGCCTGCTTCAGAACGGAAACATGGCGTATGTGCGGTCATTTTTATTGGTAATTCTGCTTCATCAATAATTACATCACGCACTAAATTAGTGACTGGCACTTCTGCGGTTGGAATTAATGCGTAAGGTTGTTCGCCTTGTAAGGCTAAAGTATGGAATAAATCTTCCCCGAATTTTGGTAATTGCCCTGTACCATAAAGTGTTGCGTGATTTACTAAATAAGGCACATAGGTTTCTAAATAGCCGTGTTGTTCAGTATGAAGATCTAACATGAATTGTGCCAATGCACGGTGCATTTTGGCGATTTGACCTTTCATTACGGCGAAACGCGCACCAGTTAATTTAGCCCCAGCAGCAAAATCTAAGCCATTTGCTTCTTTACCCAAAGTGACATGATCTTTCACTTCAAAATCAAATGTACGCGGTGTACCCCAACGTAAGATTTCTTTATTTTCTGTGTCATCTTTGCCTAATGGCACTTCGTCTGCGGGTAGATTTGGAATACTTAATGCAATTTGATTGATTTCTGCAAGTACCGCATCTAATTGTGCTTTTGCTTCAGTCAATTGATTGCCTATATCATCCATTTCTGCCAATAATGGTGCGATATCTTTACCACGCGCTTTAGCAGCACCAATGGCTTTGGAACGAGCATTACGTTCCGCTTGTAAGTTTTCGGTAGTGACTTGTAAGTTTTTGCGCTGATCTTCTAACGCGGTGAGTTTTTCCGTATCAAGCATAAAGTTGCGTTTTACTTTTAATTTTTCTGCGACTTCTGCTAAATTATTACGGAGTAAATTTGGATCGATCATAGAATTTCCTTACTTTTTTCGTTGAAATGAAAACAACCTTATTCTAGCGTGCTTTCTTCAAATAAACCAGTTTAAAAGCCAACGTATAAAAATAAAGAAAAATTGACCGCACTTTGTATTAGAATCCACGCCCCATTTAGTTAGTCTGAATTTTAGGTAAATTATGAGAAAATTTATTCTTTCTTTTCTGTTTATGCTTATCGGTGGCGGGCTTGGTTTTGCAGGGGCGCATGTTCATCCCATAAAATGGCAAGTGCGAGCGCAGTTTGAAGCCCTAAAATAAATGAACTCGGCAATTATTTTTCTCTTTTTTCTACATACAGTTTAGTTAGTGGTGATGCTGATGCCGTTGATATGGTAAAAATTGAGCGTAAGGCGACAGATTCTGCGTATCATGAATTTACAAAAATTCTTACTTCATCCGCTCAATTAATGGCTTTTTTAAATCAATCTGATTTTGTGAAAGCGGGAGCTAAAGTTGAAAATGAAACCGTTCAGCAAATTGCCTCACATTTTAAGTTTTCTCAAGAAAATAATCTTAATCAATTAATTCTATCCTCTTTTGATCGTAAAGAAGAGGATCAACTTTTTGTGGAATACATTCGTTATGTGAATAATCAAGCGCGCCAAACATTAAATAATGAATTGATTACAAAATGGAAATCGTTATTTGAAAAAAGAAAAATTACGGATTAAAGATGAGCTTTATGAATACCTCAAGAAAAAATCACAAGAATAGTAGAAAGCCGACAAATGTCGGCTTTTTTGTTGCACTGTTTTTAGTGTTACACCACAGGTTTTTGTCGATAAAACAATAAGCCTGGTAAAGCTAATCCAAATACTATTGCGCCTAGGATAAAACTGGTATTAATAAAGGAGCTAATCATCTGTTCAAATAAAGCATCAGAAAAGCCAAAATGATGAATTTGTACCATTGAAATCATTGCTTTATAAGCATGAACACCGGGGATCATGGGGATAATTGCGGCAACGGTGAAGGCTTTGGGATGGGCTAAATAACGATGGGAAAGATGCACGCCTAAAAATCCAATCACACAAGTGGCAAAGAATGTAGCAAATACAATAGGCATATTAATATGCAGTAATAATGTGCGTGTAACATGCCCAAGTGCGGCTAAAATTGCACAATATTTTAAGGCTTTGGGCGGCACATTAAATACTAAAGCAAAGCCCACCGCTGGAATCGCAGCACATAGCATATCATCGAGTAATTTCAAGATAAATATTGTGATGTCTGATAACATTTTAATGCCCCCAAGTTGTAATATGTAATAGGCTTAAAGCGAATACAATACCAAGACATGCGCCAAAAGTGAGAACAGTCGCAATCGTCCAACGGCCTAATCCCATATTCACATAACCTTTTAATATATCCGCCAAAGAATTAATCAGAGGAAACCCTGGCACAAGTAATAACACACTAGACGCTAAAGCAATTTGAGGATCGTTACCTAAGTTATATTTTAAGCTCACGCCAGAAATCAGAGAGGCGACGAAAGAGGTGATGGAAAAGACGATAAGGGGATTATAGTGCCGTTTAGAAAATTCTTGTCGCACAAACATGGCAATGGCGGCTGCCACAAAGGTAATGCTACAAATTATCCAGTCTCCGCCAGATAAATGGGCGAATGCTGCACAAGATAAGCCAATCATGAATACAACTAACCATCGGTTATATTTAAGCGGTTTTAATTGATCCAGTTTTCTTTGTACGATCTCTAACTCATACAAATGATGCTCAACGGCAATCACAATGCGTTGAACATCAGTAACCATTTGCATATTAATGCCTTTATCTGTATTTTTTCGTGCGGTAGTAATGCAATGATTATCTGATAAGGTCGTCAGCACAACTGCATTTGCCGTAAGCGCACATTCTACACTTTCTACGCCAAGTGCTACGCCTAAACGCTGTGCCATTTGCACCACCACGGTACTTTCTGCCCCATGTTGTAACAAGAGCAGTGCCGTTTGTACGCACACGCGAGTCACCGCCCGTTGATATTCGTGTTCCATATCTTTCTTCTCTATCAAAATATACCTAGAAAGAATTATAAAAATCTTTTCTAAAAAATGCGCAAAAAAAGAACCGCACTTATGATCCAAGTCAAAAGTGCGGTTCAATTTGGCGGAGTTTTTTATGATTAAAGTTTGACGACTTTCGCCTGTTTTATCATATTATCGCCCACTTCAAGAATAGTGATTAGCAAACCATCAATTTCGCAAATCGTGCCTTCATCGGGTATTTCCTCTAAGTGTTCTAAGATTAAACCATTAAAAGTACGAGCATCTTCTGTATCTAATTCCCAGTTAAACATTTTGTTGAGATCGCGTAGATTAGCGGAGCCATCGATAATCATTGAACCATCAGACTGTTGAATTACTTCTTTGTCAATGCTTGGGGCGGTGGAAGTGGTAAAATCCCCAACAATTTCTTCCAAAATATCTTCCAACGTCACAAGCCCTTTAATATCGCCGTATTCATCTACAACTAAGCCAATTCGCTCTTTATTTGTACGGAAATTTGCAAGTTGCGTTTTTAATGGCGTGCTTTCAGGAATGAAATACACTTCATCTGCGGCACGAATTAAGGTTTCTTTGGTAAATTCATTTTTTTCAAGCAGTAAGCGGAATGCTTCACGCACGCGCAAAATGCCAAGCACTTGTTCATCAAGGCTGCCTTTGTAAAGCACCACGCGGTTATGTGCAGCATGATTGAGCTGGCGCATAATAGCTCGCCAATCATCATCAATATTTATACCGCCGATTTCGTTGCGGGGAACCATAATGTCATCAACAGTGACTGTCTCCATATCCAAAATAGACAGCAACATTTGTGGATGTTGTTCATTTGGTGTTGCTTCGCCTGCTTCTGACACAATACTACGCAGTTCTTCACTACTAATTACTTGTTTTTGCATATCAAGTTTTAACCCTACTATTTGCATCAAGGATTTAGTAAAAATATTCATTAACCAAACGAGCGGATAAAAGATTTTAAGCAATGAAGTTAAAATATGACTTGAAAAAAAACTCACTTTTTCTGCGTGCATTGCAGCCACCGTTTTGGGGAATATTTCAGAAAATACAAGCATTACGAAAGTGAGCAAACCCGTTGCAATCGCCACGCCAGCATCGCCATATAAACGCATACCAATTACTGTTGCAATTGCAGATGCGCTGATATTCACAAGGTTATTAAAAATAAGAATAAAACTTAACAAAGTATCTGGCTTTTCTAGCAGTTTTTCCGCTTTTTTCGCGCCTTTATTGCCTTGTTCAGATAGAAAACGAAGACGATATTTATTGAGGGAGAGTAGTCCAGTTTCAGAACCAGAAAAATAGGCTGATAAAACTAAACAGATAATAAGAATAATAAATAAAGTACTAAGGGGAATGCTATCCAAGGGAAAATCCTTTTGTTCGTTAATCAACAAAAAGTGCGGTCATTTTTCACCGCACTTTTTACCTGTTATTTGATTTTGCTAAATCAAATAGCTGCTCAAATAGCCAAGAGTGGGCAGAATAATACCTGAAATTGGCTAAATAATCATTCTTTTTCCTTATCTCCTATGCTTTCTTCATGAAATTGCCTACTCAAAAATCCATTTTCATTTGAAATGATGAAAAACGCCTAAATTTCGGTATAATCAGCACAATTTTTTAAGAAAAACAGGATTGTTAGCCA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67 | Haemophilus_virus(56.1%) | integrase,head,capsid,holin,portal,tRNA,tail | attL 982814:982831|attR 1004818:1004835 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1828998 : 1844718
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP043770|1828998:1844718|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP043770|1828998:1844718|1842985_1843906_+|WP_013526155.1|tail|DBSCAN-SWA MSINKAQVLNHITEAFRKEFIKGLENHPTQWAKIAMEISSTTKTNTYGFLGTFPKMREWVGQRQIQSMQAQGTSITNKKFESTVGIPREDIEDDQVGLYTPMMQLAGQSAAELPDDEVFSLLKKGKSTLCYDGQNFFDTDHPVFEKVDGTGNSTTQVNLTVGTDNDAPTFYIVDARLPIKPLIWQKRTAPEIEPKFDPAKSEHVFMEDEYLWGVRARGAAGFGFWQLIHRVEKTNLTKENVQKVIQTMKGLKGDGGKALNIQPNLILVPTNLEYAAKELFKTKQINGTTNILESELDVLASPFINE >NZ_CP043770|1828998:1844718|1833422_1833839_+|WP_013526165.1|DBSCAN-SWA MFYPATFTPAEEGGYVVTFADLPEAITQGDTIEEAQEMAEDVLISCVEIYFDEERPFPLARACDSDETAVFMPDSVYAKVLLHNAMLAENVSKAQLARLTYIRPPEIQRILAPRHTTKIDTIAKALLGLGKQLQLSVV >NZ_CP043770|1828998:1844718|1829190_1829808_+|WP_013526168.1|DBSCAN-SWA MKQMIEGKEYWRDARGNLTPAELVKDIDKARDVLVREWVEKGVSLNKEMRNFKDGIFGDIQAFIELSAEKYNAKMGGSKGNITLYSYDGKYKIQRAINDHLQFDERIQAAKVLIDACLNEWSEGSRPELKALIERAFNVDKEGNLNTSRILGLRRVDIQDERWQNAMQAISESVQVVSSKAYVRLYERVGESDQYVPIALDVAGV >NZ_CP043770|1828998:1844718|1831030_1831429_+|WP_013526167.1|DBSCAN-SWA 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MHYASAEDFVLRVGEVQAIELTDRDLTGQVNDNLLDVALSDSSSQIDGYLAARYTLPLVSVPQNLVRLCCDLARYRLASMSHVTITEEIITRYKLSLKELEDISMGKISLGLPPTENNDANEHDNGVIFTNPKNRIFARDHSN >NZ_CP043770|1828998:1844718|1835406_1835664_+|WP_013526161.1|DBSCAN-SWA MSMQIILAGLGIFALLGAYVMFKLKQARREIEQLLKTNEQLQMQKAVVETQVKHFEVRKKNEENTRHTSHNDVINRLQQSGDLRD >NZ_CP043770|1828998:1844718|1836962_1838612_+|WP_013526159.1|terminase|DBSCAN-SWA MKNKELLAELKAYSDSLRQKVEAKFEGWDDSLAAISERRKKVLDPVSGYDFFVSNYFPHYVRSRSRSQLHNYLFEQLPQVLQQPSSVHLAIAAPRGEAKSTLVSQLFTLYCLVTQKKRYALIVMDSIDQAYPMLEAIKVELEFNQRLRIDFPEMAGQGRVWQAATIITKANQKVQVAGSGKKLRGLRHGAYRPDLVVLDDIENDEQVRSPEQRDKLHDWLKKTVLPLGAAGDKLDVVYIGTILHYDSVLNRTLSSKAWKTAKFKALIRQPDDMSLWDKWEDFYLNEGEAVADAFYTQNQAAMDKGAVVSWAARPILTLMKIRARDGHATFDSEYQNDPLSSDDAMFANSLTYWTELPANLIYFGALDPSLGKAGASRDPSAILVGGYHRETGKLYVVEAQVKKRLPDLIIEDVIRMQKQYHCQRWFVETVQFQEFLKDELVKRSAQRGIPVPATATKPNTDKMLRIESLQPHTVNGLILLHSSQATLISQLRHFPKADHDDGPDALEMLWRNAVGSSAAIEWIGLDQLDTFDVEDEDDEDDDLYSFWRD >NZ_CP043770|1828998:1844718|1836312_1836813_+|WP_013526160.1|DBSCAN-SWA MAHDEKTKADVRRYYVFDCLTLELAAEKAGVSYNTARRWKREAEARGDNWDKVRDANTMASGKVEDVARGMLTAFVLYFENTMDEIKRTEALPVSEKAKLIQGLGDSYSKMVASSKRLLPEVSEMATAIKTITMFGDYIQANKPELINEFADLLEGFGKTLDKEFK >NZ_CP043770|1828998:1844718|1832195_1832837_+|WP_013526166.1|DBSCAN-SWA MTHFNITTFNGSIQNQSVQLINARELHEALKVSTRFQDWIKRRIADYGFTENEDYTCFSNLRSTENTGLNRFWGGQNKIEYHITLDMAKELCMLERSEIGRQARRHFIKMEQHAIALATEMQAQMLAIPTFLRNNPDELARLITTAQTAFLTANPQAKDFLRYREMGLSYREIGTLLGKTKDSVKWMAFKMRNLGFFSSTLPKTTAVQLDLLA >NZ_CP043770|1828998:1844718|1829994_1830192_+|WP_006996621.1|DBSCAN-SWA MNKNIHKFDRFKYYSEQAANSERRGELQDAKAQWAIAELNAPNARNQEWCKHRAAFCDRVLRKPF >NZ_CP043770|1828998:1844718|1835787_1836045_+|WP_005684166.1|DBSCAN-SWA MIDDKVFIGIGTTLIMTLVGWVWKSVNDKVAENEHGIKALEKQMQQDFQSKELAEVKDKHFESILKEVRDQLKEINQKLDKKVDK >NZ_CP043770|1828998:1844718|1828998_1829190_+|WP_005647090.1|DBSCAN-SWA MATRRQIYAVYRGEENLGDGTAEELAKKLNVSEKTIYSSATVARCKRDKGKRLVVIKLDKEEL >NZ_CP043770|1828998:1844718|1841996_1842986_+|WP_086935082.1|DBSCAN-SWA MQLLPYGKFRATDGRPTDVEAWYVTDTNGADVVALANNQRNPLPIDYEHQIIHSLKNGKEAPSAGWMEYFYFTPQGIFADVRWTDKAADYIKNGEYRYISAVFAYDTDGYVRKIFHAALTNTPALDGMDEAMVAASVNLLQEDNPMDKKLLAALCSLFVLKADASEADITEKVTALSAAKGDSPVDVLDVYAKLAEKEQSVAALSTQVGNPDPAKFVPVEQVAALQADFNALKTSVEADKKAALITAALSQGKLAPALKDWAQSLSIEALTGYLDKATPIAALAGGHQANEDPDKGNVAALTAEQQAAAKMLGMNDADYIKKYQSQEAK >NZ_CP043770|1828998:1844718|1840296_1841613_+|WP_013526158.1|head|DBSCAN-SWA MPSAPKFAIGVEPKQAIEFLRQKKMLASKVLAKEMHDSALARATTIAHLTSLDMTKDIYQSLETAMREGKGFHVWKKELVSEFERKGWIFGKDPSIRGIDGHLLADPKTGEYFGTPRRLNTIYRVNMQSAYSAARYQRLRDNVDNRPYWQYSAVGDARTRPAHLALSGKVYRYDDPFWATFYPPNGFNCRCTVIALGERDLKRRGIDKPDDSSEFLVEVERPADKQGNREKTVGFKLPDGTIRVTDKGFDYNVGRLNYKPNLDLYPEKLAHAFAKVEMKGGEFKHDFELLAKHMAEMKQTLSLDGKKLTADQMLQVRDSLTKNFKFAAGVLSAESKDLLKSKTGTVWLSDDTLIKQFNSRDGQDFGLESYALFPDLFNQPDIVLQDNDRFYFIKNFEKQRILGVIKHLSKFNEIFVLSAREINIKEVEKMKGKLAVIK >NZ_CP043770|1828998:1844718|1843941_1844277_+|WP_013526154.1|DBSCAN-SWA MAKKNQKDDVTQDVQTAPDEQAQPQVETSADNAESAVEKYDESDDKEGQVIVPIGYSVKLREIHPQATYGRCGYRFNKESAVEIPVENLTSEQVIMLAEDPWLELIPICEK >NZ_CP043770|1828998:1844718|1831455_1831659_+|WP_006996626.1|DBSCAN-SWA MKNQIILANEVIALDEHGRISLNTLHKLSGTGKEKQPALWLRLHGTQELIAELDRSTDLKIAYTAKA >NZ_CP043770|1828998:1844718|1832847_1833066_+|WP_005641522.1|DBSCAN-SWA MSIGYELEHQFDEIQSSLGGLHCLRQFLEITDNTADTLSYSQLAGMIAVFTAALDCQVSTVRQLVKELPIKA >NZ_CP043770|1828998:1844718|1836044_1836311_+|WP_005661915.1|DBSCAN-SWA MSARERKRLAQLAEKQEINAKLDEILALSRQANHKIDRLDGRVDDIDTRLAKVEESLAKLGVRAAVIGGLSGLVVSVGFELIKAKFGG >NZ_CP043770|1828998:1844718|1833191_1833368_+|WP_041174961.1|DBSCAN-SWA MKQSEFLKWLKANGVEVENGSKHLKLYYQGKISHLPRHPAQELKKGLVEGIKKQLGLK >NZ_CP043770|1828998:1844718|1835116_1835407_+|WP_041174960.1|DBSCAN-SWA MNKFFELFTNSDGRASTTGFIQFFGFLVMAGVLIYAVYLDRSTVTDLFFYFACFCGGSAATKGAVMAFQAKQTKLEEQITSETYVEPEQTDRPRGI >NZ_CP043770|1828998:1844718|1834459_1834963_+|WP_013526163.1|DBSCAN-SWA MSLTFTQIFNRLIGHEGGYVNDPRDPGGETHWGMTKRTALANGYQGNMRVMTRDQAFKIYYCAFWLRYQCDKMPEAVAYQFFDAAVNHGLGNASRMLQRAVNVADDGIIGNMTIAAIKQMAISDVIMRLNAERLEFYCKLGTFATFGKGWVRRVAGNLKYGAIDNEV |
25 | Haemophilus_phage(58.82%) | tail,terminase,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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