CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP044119	Lactobacillus hilgardii strain LH500 chromosome, complete genome	1 crisprs	cas3,DEDDh,DinG,csa3,RT,cas14j	0	0	10	0

1. NZ_CP044119

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP044119_1

• CRISPR_ID: NZ_CP044119_1
• CRISPR_location: 2152261-2152363
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP044119_1

Consensus_repeat	Method
TTAGGACTGCTCCTCAAAGCAAC	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP044119_1

>1.1|2152284|57|NZ_CP044119|CRISPRCasFinder
ATTCGGAATGCTAACCGCTTGACTCCGAACGTTAACTGCTTTGCTCCGCACACTCTT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP044119_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP044119_1

>merge|NZ_CP044119|1|2152261-2152363|CRISPRCasFinder
TTAGGACTGCTCCTCAAAGCAACATTCGGAATGCTAACCGCTTGACTCCGAACGTTAACTGCTTTGCTCCGCACACTCTTTTAGGACTGCTCCTCAAAGCAAC

>NZ_CP044119|1|1|2152261-2152363|CRISPRCasFinder
TTAGGACTGCTCCTCAAAGCAAC	ATTCGGAATGCTAACCGCTTGACTCCGAACGTTAACTGCTTTGCTCCGCACACTCTT
TTAGGACTGCTCCTCAAAGCAAC

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP044119.1|WP_003559011.1|2157595_2158417_+|ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|224098
NZ_CP044119.1|WP_003635446.1|2165789_2166977_-|aminotransferase-class-I/II-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme	unknown	unknown	gnl|CDD|235985
NZ_CP044119.1|WP_040472770.1|2154185_2155160_-|asparaginase	unknown	unknown	gnl|CDD|199208
NZ_CP044119.1|WP_003635469.1|2149694_2150348_+|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT	unknown	unknown	gnl|CDD|223692
NZ_CP044119.1|WP_003635465.1|2152952_2154125_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP044119.1|WP_003559037.1|2147658_2148249_+|ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|227065
NZ_CP044119.1|WP_003635456.1|2156786_2157596_+|ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|224097
NZ_CP044119.1|WP_003636825.1|2151146_2152013_-|SDR-family-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|187578
NZ_CP044119.1|WP_003559025.1|2152459_2152696_-|zinc-ribbon-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|237756
NZ_CP044119.1|WP_003635477.1|2146044_2146887_-|HAD-IIB-family-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|369792
NZ_CP044119.1|WP_003559007.1|2159562_2159892_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP044119.1|WP_003635448.1|2164607_2165690_-|aspartate-semialdehyde-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|237845
NZ_CP044119.1|WP_003559009.1|2158413_2159484_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270381
NZ_CP044119.1|WP_003559043.1|2144370_2144997_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP044119.1|WP_003635472.1|2148264_2149695_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|213192
NZ_CP044119.1|WP_003635479.1|2145120_2146059_+|linear-amide-C-N-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|238303
NZ_CP044119.1|WP_056988841.1|2143021_2144050_-|IS30-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
NZ_CP044119.1|WP_003635468.1|2150460_2150775_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP044119.1|WP_003635458.1|2155687_2156773_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226361
NZ_CP044119.1|WP_003559029.1|2150834_2151032_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP044119.1|WP_003559011.1|2157595_2158417_+|ABC-transporter-permease	gnl|CDD|224098	COG1177, PotC, ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II [Amino acid transport and metabolism].	9.33124e-77
NZ_CP044119.1|WP_003635446.1|2165789_2166977_-|aminotransferase-class-I/II-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme	gnl|CDD|235985	PRK07309, PRK07309, pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase.	0
NZ_CP044119.1|WP_040472770.1|2154185_2155160_-|asparaginase	gnl|CDD|199208	cd08964, L-asparaginase_II, Type II (periplasmic) bacterial L-asparaginase. Asparaginases (amidohydrolases, E.C. 3.5.1.1) are enzymes that catalyze the hydrolysis of asparagine to aspartic acid and ammonia. In bacteria, there are two classes of amidohydrolases. This model represents type II L-asparaginases, which tend to be highly specific for asparagine and localized to the periplasm. They are potent antileukemic agents and have been used in the treatment of acute lymphoblastic leukemia (ALL), but not without severe side effects. Tumor cells appear to have a heightened dependence on exogenous L-aspartate, and depleting their surroundings of L-aspartate may starve cancerous ALL cells. Type II L-asparaginase acts as a tetramer, which is actually a dimer of two tightly bound dimers. A conserved threonine residue is thought to supply the nucleophile hydroxy-group that attacks the amide bond. Many bacterial L-asparaginases have both L-asparagine and L-glutamine hydrolysis activities, to a different degree, and some of them are annotated as asparaginase/glutaminase.	4.18991e-133
NZ_CP044119.1|WP_003635469.1|2149694_2150348_+|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT	gnl|CDD|223692	COG0619, CbiQ, ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ and related transporters [Inorganic ion transport and metabolism].	1.47569e-11
NZ_CP044119.1|WP_003635458.1|2155687_2156773_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|226361	COG3842, PotA, ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components [Amino acid transport and metabolism].	2.39837e-165
NZ_CP044119.1|WP_003559037.1|2147658_2148249_+|ABC-transporter-permease	gnl|CDD|227065	COG4721, COG4721, ABC-type cobalt transport system, predicted permease component [Inorganic ion transport and metabolism].	1.29546e-43
NZ_CP044119.1|WP_003635456.1|2156786_2157596_+|ABC-transporter-permease	gnl|CDD|224097	COG1176, PotB, ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component I [Amino acid transport and metabolism].	1.96539e-77
NZ_CP044119.1|WP_003636825.1|2151146_2152013_-|SDR-family-oxidoreductase	gnl|CDD|187578	cd05269, TMR_SDR_a, triphenylmethane reductase (TMR)-like proteins, NMRa-like, atypical (a) SDRs. TMR is an atypical NADP-binding protein of the SDR family. It lacks the active site residues of the SDRs but has a glycine rich NAD(P)-binding motif that matches the extended SDRs. Proteins in this subgroup however, are more similar in length to the classical SDRs. TMR was identified as a reducer of triphenylmethane dyes, important environmental pollutants. This subgroup also includes Escherichia coli NADPH-dependent quinine oxidoreductase (QOR2), which catalyzes two-electron reduction of quinone; but is unlikely to play a major role in protecting against quinone cytotoxicity. Atypical SDRs are distinct from classical SDRs. Atypical SDRs include biliverdin IX beta reductase (BVR-B,aka flavin reductase), NMRa (a negative transcriptional regulator of various fungi), progesterone 5-beta-reductase like proteins, phenylcoumaran benzylic ether and pinoresinol-lariciresinol reductases, phenylpropene synthases, eugenol synthase, triphenylmethane reductase, isoflavone reductases, and others. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold, an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Sequence identity between different SDR enzymes is typically in the 15-30% range; they catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser and/or an Asn, contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. In addition to the Rossmann fold core region typical of all SDRs, extended SDRs have a less conserved C-terminal extension of approximately 100 amino acids, and typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif.	1.6116e-72
NZ_CP044119.1|WP_003559025.1|2152459_2152696_-|zinc-ribbon-domain-containing-protein	gnl|CDD|237756	PRK14559, PRK14559, serine/threonine phosphatase.	0.0002032
NZ_CP044119.1|WP_003635477.1|2146044_2146887_-|HAD-IIB-family-hydrolase	gnl|CDD|369792	pfam08282, Hydrolase_3, haloacid dehalogenase-like hydrolase. This family contains haloacid dehalogenase-like hydrolase enzymes.	1.62705e-45
NZ_CP044119.1|WP_003559009.1|2158413_2159484_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|270381	cd13663, PBP2_PotD_PotF_like_2, The periplasmic substrate-binding component of an uncharacterized active transport system closely related to spermidine and putrescine transporters; contains the type 2 periplasmic binding fold. This group represents the periplasmic substrate-binding domain that serves as a primary polyamine receptor of an uncharacterized ABC-type transport system from gram-negative bacteria. Polyamine transport plays an essential role in the regulation of intracellular polyamine levels which are known to be elevated in rapidly proliferating cells and tumors. Natural polyamines are putrescine, spermindine, and spermine. They are polycations that play multiple roles in cell growth, survival and proliferation, as well as plant stress and disease resistance. They can interact with negatively charged molecules, such as nucleic acids, to modulate their functions. Members of this family belong to the type 2 periplasmic-binding fold superfamily. PBP2 is comprised of two globular subdomains connected by a flexible hinge and bind their ligand in the cleft between these domains in a manner resembling a Venus flytrap.	1.57492e-137
NZ_CP044119.1|WP_003635472.1|2148264_2149695_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|213192	cd03225, ABC_cobalt_CbiO_domain1, First domain of the ATP-binding cassette component of cobalt transport system. Domain I of the ABC component of a cobalt transport family found in bacteria, archaea, and eukaryota. The transition metal cobalt is an essential component of many enzymes and must be transported into cells in appropriate amounts when needed. This ABC transport system of the CbiMNQO family is involved in cobalt transport in association with the cobalamin (vitamin B12) biosynthetic pathways. Most of cobalt (Cbi) transport systems possess a separate CbiN component, the cobalt-binding periplasmic protein, and they are encoded by the conserved gene cluster cbiMNQO. Both the CbiM and CbiQ proteins are integral cytoplasmic membrane proteins, and the CbiO protein has the linker peptide and the Walker A and B motifs commonly found in the ATPase components of the ABC-type transport systems.	9.9819e-71
NZ_CP044119.1|WP_003635479.1|2145120_2146059_+|linear-amide-C-N-hydrolase	gnl|CDD|238303	cd00542, Ntn_PVA, Penicillin V acylase (PVA), also known as conjugated bile salt acid hydrolase (CBAH), catalyzes the hydrolysis of penicillin V to yield 6-amino penicillanic acid (6-APA), an important key intermediate of semisynthetic penicillins. PVA has an N-terminal nucleophilic cysteine, as do other members of the Ntn hydrolase family to which PVA belongs. This nucleophilic cysteine is exposed by post-translational prossessing of the PVA precursor. PVA forms a homotetramer.	4.23227e-72
NZ_CP044119.1|WP_056988841.1|2143021_2144050_-|IS30-family-transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	1.45644e-73
NZ_CP044119.1|WP_003635448.1|2164607_2165690_-|aspartate-semialdehyde-dehydrogenase	gnl|CDD|237845	PRK14874, PRK14874, aspartate-semialdehyde dehydrogenase; Provisional.	1.02469e-179

Protein sequences

>NZ_CP044119.1|WP_003636825.1|2151146_2152013_-|SDR-family-oxidoreductase
MKYAVTGSTGHFGKYAIPYLQKLIKPEDSIIALARSIEKAKSIYKDGVEVRPGTYEDPDQLIDSLKGVDKLLFISSQPGAVMSRIDQHNNVVQAAKAAGVKFIAYTSFPHADTTEAPLAADHKATEALIKKSGIAHSFLRNNWYLEDEMNFVEEASNGEPFVYSAGNGKVGWAPEALYAEAAATILTTEQPKEVYELAGPMHTYAELADVLRKVTGKQFEIASVSDDEFMANLRKYVPDQVDAIMTMIQKLIRNHALEEDTTDLADVLQKPVPTLEEQVQALFKTPEK
>NZ_CP044119.1|WP_003559029.1|2150834_2151032_+|hypothetical-protein
MEEFRMAEQFSTLAEEIINYQKKNDMPDTQLAFNLRITVERLHDIKSMESQPTPEEKKLIEDFVR
>NZ_CP044119.1|WP_003635468.1|2150460_2150775_+|hypothetical-protein
MRANQFAFAFGIFALIVGAIVDLYGVFTQFGTIDSAQEVLVGSFILGIGLAFLSIPNRLERYIVQGIIGIGIFYYFYIQNNNIWIALIIAFILVALLEYGLKHR
>NZ_CP044119.1|WP_003635469.1|2149694_2150348_+|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT
MNPGMKLLLVVLTALEISFTQSLIVNVILIAISFVYVMVKRMNFKTLFLLIFWPLFPALGLFVSQWLYGSDGIHFAWVLFTRIYAYVFLGATFTLTSSITDLALTLEQDFRLPSKFAYGVLAAFNLMPKIREEVQIIKTSALMRGEVFHVWSPKLYFKAILSSIQWSQNLAEAMTSHGFVEDEPRTHYRVIRITVLDWAMFAFLIIAVQVMLFFIRY
>NZ_CP044119.1|WP_003635472.1|2148264_2149695_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein
MTDVSISDFTYQYPKSETKVLNDLNLTFKHNHFSLLSGPSGSGKSTLLYFIAGLYPRFIGNDATGTIKFGDTNIKDIPRNHVSNHVAMMFQNPNQQFAMDTVIHELTFVLENIQTQPDQMDKIIDHALTFCGIEKLRDRIINTLSGGEKQRVALSCIVAMDAPVIVLDEPFASIDPDSRIDLIHKLKELQEKHGKTIILADHDLGNYQGVIDEFYYLDPQTHHIDLLNQAESQHFFDNFESTQTIDKQLALPPKNDKNSVIELRHFKLAPHDSLLLQLDHFNFYRQKTTLITGANGIGKSTLFNALTKLLPYAGIISYDGKNIKKIKPLNYAKNVTLLFQDAENQFLNVTVKEELDLSFSNRFNQDYTHEQVEQMLTQLGMQGRDEQVVYSLSEGQKKKLQIVEMLIMNPPVLLLDEPFKGLDYKSLRLMTDFLELAKTKYGQTQIIISHQLSGLEDLIDYHAHFENQNLTYQEVI
>NZ_CP044119.1|WP_003559037.1|2147658_2148249_+|ABC-transporter-permease
MENKSQASNNQHQSKWTLRNIILIALIAIFCGIIFWGIGFLYTALTVALTPIGAAPFANDILMGLWCMAGPLTGFIIRTAGSAFLGEFLGAAVEVFLGGQWGAGAFISGLVQGIGSELGFTFTGYKRYDWVSLNASIFTTVVVTFAWDMIKNGYDKFALPLLIGLFITRYISTFIFGGIVTKMIVKLLDRSNAFNL
>NZ_CP044119.1|WP_003635477.1|2146044_2146887_-|HAD-IIB-family-hydrolase
MKITIVRRIAVIKVIASDMDGTFLNEKGTFDENRFQGELDRLAQKQMHFVSASSNHYQHLLKTFEHVSGPISYVCNNGALVVDERGVIVSEDIIDHLVLRKALDWMLKTPSFFGAEIILVGRNGTYCNLPSQSKRFKASKYFYENMQSAKDLRLVFDSIYKIDITWETGGVLERQNEFNHQFSGRLSATSSGMNGLDVMNAGVTKLTGIQSLLNDWQLSFDDVAAFGDNGNDFEMVNAAREGYAMKNAAQDLLAKVEHVTHLTNDEQGVQEQIDHYLDEE
>NZ_CP044119.1|WP_003635479.1|2145120_2146059_+|linear-amide-C-N-hydrolase
MCTSLTLQTLNHHVLLARTMDFPVRAAWKPALINQDYYETALSGKRAIRYPYIGGGRTEENDQILVADGVNTKGLSCAELMFPLKAHYLDKPVADKLNLTPQDFLPWALGEHASLQEVKADLAHIAIIGQNWLAGNEIFAFHWILADQAGQTLLIEPTIKGLEIISDSIGVLTNSPTYPEHMARFAKSLHTNENLTELSQKSQQIVMSQKFPQATNTPTTRFLVTAINKLGAQPSRTQFEARNRLFNDLATVAIPYKPSMHQHPNFNYTHYISILDSTDQTYYFRYHDSKQVFSYSLSDELAQHTNQNLFLI
>NZ_CP044119.1|WP_003559043.1|2144370_2144997_-|hypothetical-protein
MKSTWNLIGMALWLILLIYLIWMVHDMRSRRLKVIVQEKKAFTWQNFWISCGELVVFLLVFWGMSYTTFFQDVKKLNPNAVRVSYSYKPLIIRYKTDQSDYVTVNNGNGRKPIQRYTYYVEGRKYQTDSTSATVVYGKSNLNVQAEAYKWNKEWLNHLDDRYQHAWVGTVTTTYKKNWFNGIGLHAGRQADRFNLIRIPDKSFMTVEK
>NZ_CP044119.1|WP_056988841.1|2143021_2144050_-|IS30-family-transposase
MTQTKNIMPKHYQQLQSFERGQIESLTRLEFGVRQIASRLHRSPSTISRELKRGLTTQIDSQKHRSYQGYFAERGAAYYREQRAKCHPKGLLQRAAVFFKSLPKALKAKPRVFSVDTYVHYFKAHYPGFPCPSTATVYRYIEAGKLPELHNYDLPMKLRRRVKRPNHRHARLNKKRLGQSIEDRPAVVRKRQELGHWEGDLVKAKRVESEPALMTLTERVSRMEIIVKLPDYRAETCRQALQDTIDDYGAENFRTITFDNGSEFASLNQVQGTEIYFAHPYSPWERGTNENVNGQLREFFPKGHSFKNLSLVDLQLVQDTLNHRPRRCLSYSCPADVMPQLV
>NZ_CP044119.1|WP_003559025.1|2152459_2152696_-|zinc-ribbon-domain-containing-protein
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>NZ_CP044119.1|WP_003635465.1|2152952_2154125_-|hypothetical-protein
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>NZ_CP044119.1|WP_040472770.1|2154185_2155160_-|asparaginase
MKTILAIHTGGTISMSQNEKGEVVPNDENPIAEEQVILNGQINLITDELFNLPSPHVTPEVMLQIKQRIIKAINDGVDGVVITHGTDTLEETAYFLDLTLPNTIPVVVTGAMRSSNEIGSDGLYNFQNAILVAATDESYGKGVLVVMNDEIHTARFVTKTHTTNVATFRTPTFGPIGIVTQNKAKYFQELIQTEVSDIDHVSAGVYLIKAYAGMNGDLFEAINRSTTNGLVIEGLGAGNLPPQTLPAIKRLIDNNIPIVLVSRCYNGVAQDIYDYEGGGIQLRKMGLILCQGLNGQKARIKLLVGLSAHKSGDDLRAFVSNAIS
>NZ_CP044119.1|WP_003635458.1|2155687_2156773_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein
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>NZ_CP044119.1|WP_003559007.1|2159562_2159892_+|hypothetical-protein
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Prophage detection

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DBSCAN-SWA_2	254445 : 286843	26	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus(25.0%)	bacteriocin,protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	350985 : 359549	9	Synechococcus_phage(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_4	617171 : 651533	29	Staphylococcus_prophage(25.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_5	663952 : 712487	41	Staphylococcus_phage(27.27%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_6	1225800 : 1274117	44	Streptococcus_phage(13.33%)	integrase,transposase,tRNA,protease	attL 1256377:1256433|attR 1265869:1265925
DBSCAN-SWA_7	1322844 : 1331344	8	Staphylococcus_phage(28.57%)	tRNA	NA
DBSCAN-SWA_8	1687722 : 1740129	52	Streptococcus_phage(16.67%)	plate,integrase,tRNA,transposase	attL 1725005:1725024|attR 1745781:1745800
DBSCAN-SWA_9	1842205 : 1930586	74	Lactobacillus_phage(45.71%)	integrase,capsid,portal,head,transposase,terminase,tail,tRNA,protease	attL 1870528:1870547|attR 1913812:1913831
DBSCAN-SWA_10	2225379 : 2302500	78	Lactobacillus_phage(40.74%)	capsid,plate,portal,transposase,terminase,tail,protease	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP044119|107514:149009|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_003634085.1|108900_110079_+	PLP-dependent transferase	A0A0B5JD48	Pandoravirus	1.9e-16	24.9
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WP_003551226.1|112492_113251_+	ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	4.2e-33	37.0
WP_133281483.1|113312_114087_+|transposase	IS5 family transposase	A0A0N9SHJ4	Paenibacillus_phage	2.3e-26	51.4
WP_003551228.1|114122_115163_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_003634094.1|115169_116264_+	Ldh family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_003634095.1|116270_117575_+	O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase/cysteine synthase	NA	NA	NA	NA
WP_003634097.1|117567_118740_+	amidohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_003634099.1|118749_119943_+	aminotransferase class I/II-fold pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_003634101.1|119939_120938_+	lactate dehydrogenase	M1HTA3	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	1.1e-33	30.6
WP_003634102.1|120954_121374_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_040472612.1|121757_122756_+	2-dehydropantoate 2-reductase	NA	NA	NA	NA
WP_003551247.1|123235_123934_+	amino acid ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_003551248.1|123948_124704_+	amino acid ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	3.2e-25	36.6
WP_150334559.1|124703_125519_+	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_040472613.1|125930_126929_+	2-dehydropantoate 2-reductase	NA	NA	NA	NA
WP_003556843.1|126933_127776_-	prephenate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_056988841.1|127862_128891_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.1e-36	32.2
WP_003634113.1|129290_130226_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_056956062.1|130673_131132_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_056956061.1|131339_131942_+	nitroreductase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003634118.1|132079_133225_+	low temperature requirement protein A	NA	NA	NA	NA
WP_003556866.1|133315_134287_-	NAD(P)-binding domain-containing protein	A0A1J0F959	Only_Syngen_Nebraska_virus	2.3e-28	31.4
WP_150334561.1|134641_135865_+|transposase	IS110 family transposase	M1NSC9	Streptococcus_phage	4.6e-74	44.1
WP_003556871.1|138157_138454_+	DUF3923 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003634124.1|138533_139151_-	isochorismatase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003634126.1|139306_140035_+	N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase	A0A1B1P878	Bacillus_phage	1.8e-17	35.6
WP_003634129.1|140192_141101_+	zinc ABC transporter solute-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_150334563.1|141309_143007_+|transposase	IS1182 family transposase	A0ZS58	Staphylococcus_virus	2.5e-94	40.2
WP_003634144.1|146551_147547_+	LacI family DNA-binding transcriptional regulator	C6ZCU4	Enterobacteria_phage	3.8e-10	23.6
WP_150334564.1|147980_149009_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	8.5e-37	32.2

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP044119|254445:286843|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_003634286.1|259041_259884_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
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WP_004561985.1|262313_263303_+|transposase	IS30 family transposase	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	9.9e-59	40.5
WP_003634296.1|265861_266719_+	DUF2877 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_040472681.1|266856_268104_+	amidohydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_133281483.1|268170_268945_+|transposase	IS5 family transposase	A0A0N9SHJ4	Paenibacillus_phage	2.3e-26	51.4
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WP_035462185.1|270088_270745_-	haloacid dehalogenase	NA	NA	NA	NA
WP_003634305.1|270876_272427_-	YfcC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003634307.1|272534_273833_+	sensor histidine kinase	NA	NA	NA	NA
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WP_003551587.1|274984_276019_+	putrescine carbamoyltransferase	M1I6M4	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	3.3e-12	37.6
WP_003551590.1|276040_277477_+	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_003551592.1|277516_278614_+	agmatine deiminase	M1I5R4	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	1.6e-118	55.7
WP_003634316.1|278626_279577_+	carbamate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_003634318.1|279716_280805_+	agmatine deiminase	O41120	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	3.4e-84	43.1
WP_003557133.1|280815_281604_+	MurR/RpiR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_003634320.1|281710_283558_-	cadmium-translocating P-type ATPase	A0A218MNH6	uncultured_virus	1.2e-46	29.8
WP_003557136.1|283756_284005_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003634322.1|284173_284614_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_003557140.1|284616_285012_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_003634326.1|285674_285833_+|bacteriocin	bacteriocin	NA	NA	NA	NA
WP_003634328.1|285955_286843_+|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP044119|350985:359549|DBSCAN-SWA
GATGGCAAACATCGTCGGGGTTGCAATGGGATCAATCTCGGATTGGCCAACAATGAAATTGGCCTGTCAGCAATTGGATAACTTGGGAATCTCGTATGAGAAGCACGTCATTTCAGCACATCGAATGCCCGATGAACTTCAAGCATTTGGAAAATCGGCACGAAATAAAGGCTTGAAAGTTATCATTGCAGGTGCCGGTGGGGCTGCCCATTTGCCGGGAATGATCGCCGCAAACACAACGCTGCCTGTCATCGGTGTACCAATTAAAACCCGAACATTAAATGGTGTTGATTCCTTGCTTTCAATTGTTCAAATGCCATTTGGTGCCCCCGTGGCTACTGTGAGTATAGGCGAATCCGGCGCAAAGAATGCTGCCTTGTTAGCCGCCCAGATTTTGGGAGTTGAAGATCAAGCAATTCAACAGAAACTTTTAGATTTAAAACACGAACAACGAGTGGAGGCCAAAAACAGTGAGCAGCAATTCGATTAAAACACTTTTGCCACCGGCAACCATCGGCATTGTTGGTGGTGGGCAACTCGGACAGATGATGGCGTTGATTGCCAAATCAATGGGATACAAAGTCGGTATTCTAGATCCAACGCCTCAGGCACCTGCCAGTCAGGTTGCCGACTTTCAGATTGTGGCTGAATACGATGACGTTGACTCACTGATGGAATTAGCCGATAAAAGCGACGTTTTAACCTATGAATTTGAAAATGTGGATGAAGATGCGCTGCTAAAAGCTAAAAAAGTGGCCGAACTCCCACAGGGTGTGGACTTACTGCACATCACCGGCGAACGTTTAAACGAAAAAAACTTTCTTCGCCAAGCCGGTATTCCGGTAACCAACTTTGCGGCTGTTTCAGATGAAGCATCTATGACAGATGCCATAAAAGAAGTCGGTTATCCGGCAATCCTGAAAACCGTGTCGGGCGGTTATGATGGTCACGGTCAAATGGATATTAACAGCCCTCAAGATATTGAAAAGGCCGTTGAACTTTATGGGAAAGCCCAATGCATTCTTGAAGCCCGCCAGTCCTTTATTGCCGAAGCATCGGTGATGGTTACAAGGGATGTCAACGGCAAGGTGATCACATTTTCATTGGTTGAAAATCGACATAAGAATCACATTCTTCATACAACGATCGCTCCCGGCCGGTTCTCAAAAACCATTCATCAAAAAGCCCATGACTATGCAGAAACTATTGCCAATAAACTTGATTTGTACGGTGTGCTCGGTATTGAACTCTTCGTCATTGATGACAAGGATTTGATGGTTAACGAGTTGGCACCCCGCCCACATAATTCAGGCCATTACACCATTGAAGCCTGCAACATTTCACAATTTGAAGCACATATCAGAAGCATTTGTGGATTGCCGATTCCTCAAATTGCACAAGAGAAGCCGGCTGTTATGAGAAACCTGCTTGGTGCCGACTTAACGCTTGCAAGGAACCTGCTTAAAGAGCATCCGGAATGGCATTTCCACGATTACGGAAAAGCGGAAATTCGACCACAACGCAAAATGGGTCATGTGACCGTTCTAGGTGATGACATCGACCAGTTACTGAAATCAACCGACATGTTAAAGGGAGAAAATTAAAATGACTGAAATTGCTGATATCGAAAAGAAAGATTTATTGTACAAAGGTAAAGCCAAAGAAATGTTTACCACAAATGATCCCGACATCATGTGGGTTCATTACATGGATCAAGTAACGGCTTTTAATGGTAAGAAAAAAGTTCAGATGCAGGGAAAAGGCCAGACCAACTGTGAAATTTCATCGTTAATTTTTACGGACTTGGCAAAGCACGGCATTGAAAATCACTTTATCAAGCAATTGGATGCTAACAACCAATTGGTTAAGCGGGTCAAAATCATTCCGTTGGAAACGGTCGTTCGAAATTTTGCTTCAGGCAGTTTTGAAAAACGGTATGGCGTCGAACATCTAATGGCATTTGAAAAGCCGGTTACCGAGTTTTTCTACAAGAGTGACGAGCTTGACGATCCCTTTATTAATGATTTTGATGCCGAAGCGCTTAATGTAGCAACCGAGGATCAAATGAAAAAAATCCGTGACATTGCTTTAAAGGTCAATGATCGCTTGAAAGAGATCTTTTCCGAAATGAATGTTGATTTGGTTGATTTCAAAGTTGAATTTGGTATGACCAGTGATGGTCAGTTGATTTTGGCAGATGAGATTTCACCAGACAGCTGTCGCTTAATTGATCGCACAACCAAGAAGTCGCTTGATAAAGATGTCTTTAGAAAAGGGCTTGGTGCATTGGTGCCTGTCTATAAAGAGCTGCTGGGGCGCTTGGAAAAAGTGGAGGATGTTCAATAATGGCTTTGGTAAAAGTATACGTTAACTATAAAAAATCAATTTTAAATCCTGAGGCACAAGCCATTCAGAAGGCACTCGGCCGTTTGGGATACGACAATGTCAATGATCTAAAACTTGGTAAATATTTTGAAATTACCGTTGCCGACGGCATTTCACGCGACGACTTGAATAAGGAAATTAACGATATCTGCGATAAGATGCTGGCTAACTATAACATGGAAAATTATCATTATGACATTACTGAAACGGAGGCTGCTCAATGAAATTTGCAATCCTTGCGTTCCCAGGTTCCAACTGTGAAATGGATCTGTACTACGCGATTCAAGACATTATGAATGAGGAAGTTGAATTGGTTTCTTACAAGAAGAACTCATTAGAAGGCTTTGACGCTGTCTTAATTCCCGGCGGCTTTTCATACGGAGATTATCTTCGCAGTGGTGCGATTGCCCGCTTCTCACCAATTATTCCGGCACTTCAGGAATTTGCCAAAAGTGGTCGACCGGTTCTGGGAATTTGCAACGGATTTCAGATTTTAACGGAAGCCGGGTTATTGCCCGGCAGCCTCCAAAAAAATGTTTCAGCCAAATTTATCTGTCAGACAGAACCGCTGGTCGTTAATAATGCTGGTTCACTATTTTCTTCAGCTTTTAAGTTGGCACAAATTATCAACCTGCCGATTGCTCATGGAGATGGTAATTATTACTGTGATCAGGAGACTTTAAAGCGGTTGATTGCCAATGATCAGATTATTTTTAAATATCGAAACAATCCCAACGGAAGCGTCGCCAACATTGCCGGAATTACCAATAAAGCCGGAAACGTCCTGGGTATGATGCCCCATCCGGAACGAGCCGTTGAAGATATCTTGGGATCAAGCGATGGCATTGGTATTTTTCAGTCAATTATTAACTATGTAAAAAGTCGAGAGGTAGTCGCTCATGGATAAAGTGATGAATCAACCGGTGGAGGCAACGCCGGAACAAATCAGGGATCAAAAATTGTATCAGTCAATGGGGTTGTCGGATCACGAATATCAGTTGATCAAGGATGACGTTTTACACCGGTTACCAAATTACACAGAAGTTGGCCTTTTTTCTGGCATGTGGAGCGAACATTGTTCCTATAAGAACTCTAAACCTGTATTAAAGAAGTTCTATACCAAGGGCGAACATGTTGTGAAGGGGCCTGGCGAGGGCGCCGGCATTATTGATATCGGCGATAACCAGGGGGTCGTTTTTAAAGCAGAAAGTCACAATCATCCTTCAGCCGTAGAGCCCTTTCAAGGTGCTACAACCGGTGTCGGCGGTATCTTAAGGGATATTTTTTCAATGGGTGCCCGGCCGATTGCCTGTCTTGACAGTCTGCGTTTCAGTACACCTAAAACCGATGAGGACCGTTACTTTATTTCTCAAATCGTAGCGGGAATCAGCTCTTACGGTAATTGTATCGGGGTACCAACCGTTGGCGGTGATACGACTTTCGACGATGCTTATGAACACAATCCATTGGTTAACGTCATGTGTGTTGGCTTGATGGACCTCGATAAGATTGAAGTCGGCGCTGCAGCCGGTGCCGGCAACAGCATTGTGTATGTGGGTGCCAAAACCGGTCGTGACGGTATAAACGGTGCTTCATTTGCTTCGTTCCAATTTGATTCCGAACATGAAAGCCAGCGTTCGGCTGTTCAGGTTGGGGATCCCTTTACTGAAAAATTGGTTATGGAAGCTTGCCTGGATGTTATTAATAATCATTCGGATTCACTGGTCGGTATTCAGGATATGGGAGCAGCCGGATTAGTATCATCATCAGCTGAAATGGGCTCTAAAGCCGGCGGTAACGGCATGGTTCTTGACCTTGATTTGGTACCGCAACGTGAAGCCGACATGACGCCATTTGAACTTATGCTGTCAGAGTCACAGGAAAGAATGCTGCTTTGCGTAAAGGCCGGCCATGAAGATGAAGTCTTGACCGTTTTTGACGATCATGGTGTTGATGCAGTTGTGATCGGCCATGTGACGGAAGGCGATCATTATCAATTGCTGCAGCACGGTAACGTTGTCGCAGACGTTCCGGTTGATTCATTGGCTTCTCAAGCACCGGTTTATCACCGAGAATCCGAAGTGCCGGCGCATTTAAAAGATTCCGATACCAAACAATTTGTGCCCGAAATTAAAAATCCAACAGCGACTTTAAAACAGATGTTGACGCAGTTAACGATTGCTTCAAAAGAAAGTATTTATCAAACATATGATACACAGGTTCAAACAAATACGGTGGTGGCACCGGGATCGGATGCCGCGGTTGTACGGGTTCGTCATTATGATAAAGCCTTGGCAATGACGACCGATGTCAATGGCCGCTATCTTTACTTGAACCCTCGGATTGGTGGCCAAATGGCAGTTGCCGAAGCAGCTCGAAACATCGTTGCTTCAGGAGCTGTCCCACTTGGCATTACTGATTGCCTGAACTTTGGCAATCCCGAAAAGCCGGATCAATTTTACGAATTGGATCAAGCGGTTATGGGGATGAGCGATGCCTGCGAGAAATTCAATGCACCGGTTATTTCAGGAAATGTCTCACTGAATAATGAATACGATAACGTCCCGATTTATCCAACGCCAATGGTTGGCATGGTTGGCTTGATCAAGGGGTTGAAGCATGTGACGACCCAGGACTTTAAACAGGCAGGTGACCTAGTTTACGTTGTCGGTCGAACAGGAAACGGATTTAACGGCTCTCAAATTCAAAAAATGCAGACCGGTAAGATTTCCGGAAAACTATTTGATTTTGACTTGGACTACGAAGCCCAAATGCAACAATTAGTGATCGACGCCATCCAAAATGATTTGGTACACAGTGCCCATGATATTTCAGAGGGCGGCCTGATTACGGCAGTTGCCGAAAGTACCTTCGGCAATCAACTCGGGGTTGATCTCACCAGCGACTTGCCTGTCGATCGATTCTTTTCGGAAAGCCAGTCACGATTTATTGTGTCAATTGCATCTGAAAATCAGGATGCGTTTGAAAAGTTGATGGGTGAAAATGCCGATTGTTTGGGAAAAGTCACTGACGATAATCATTTATTTGTTTCCGCAGCTGATGGTTACTTTGATATGGATGTTGATGATGCATTTCACCTTTGGAAGGGAGCACTGCCATGCAGCCTGAAGTAAAGAGTTTAAATGAAGAATGCGGCATCTTTGGCGTTTGGGGAACACCGGATGCCGCACGCTTAACTTACATTGGCCTGTTTGCCCTTCAGCATCGTGGTCAGGAAGGCGCCGGCATTACCGTTAATAATGATGGTGAGTTGCGTACCAAGCGCGGCTTTGGTCTGTTAACCGATGTTTTTGACTCACCAAATGCAGTCGCAGATCTTGACGGAAATGCCGCAATCGGACATGTCCGTTATTCCACGGCCGGTAGTAACTTGTTGGAAAATATCCAACCGTTGCCATTCAATTTCAGTGATACCCAGTTTGCATTAGCCCATAACGGCAATCTGACCAACGCTATTTCAATTCGAAAGCAGTTGGAGGATCGTGGGGCCATCTATCATTCAAGTTCCGATACCGAGAACCTGATGCATTTGATTCGCTTGAGTCAGGCGCCTGATTTGGATGATCAGGTAAAGGAAGCCTTGAATATCATCAAGGGTGGCTTTGCCTATCTGATTATCACAAAGGATCGACTGTACGCTGCTCTTGATCCAAACGGTTTTCGACCATTGGTTGTTGGCCAATTGCCCAACGGTGCTTATGTCGTCTGCAGTGAAACCTGCGCGCTGGAAGCAGTTGGTGCCAAGTTTAAATTTGATGTCCAACCTGGCCAATTAATCAAAATTGATGATACCGGGATTACGATTGATCAATATACCGATGACACACAGTTATCAATTTGTTCAATGGAATTTATTTATTTTGCCCGTCCGGATTCCGATATTTATGGGGTCAATGTTCATTCCGCCCGTAAGCGGATGGGAGAAATTTTGGCCAAGGAACAGCCGGCAGATGCCGATATTGTGACAGGTGTGCCAAATTCGTCACTGTCAGCAGCGATGGGTTTTGCCGAGGCAGCAGGTTTGCCTTATGAAATGGGACTTGTGAAGAATCAGTATTCGGCACGAACGTTTATTGAACCCACTCAGGAATTACGTGAGCAGGGTGTCAATATGAAACTTTCAGCAGTTAAGGGTGTTGTGAAAGGCAAGCGGGTTGTCTTGGTTGACGACTCAATTGTTCGTGGAACCACCAGTCGCCGGATTGTTAAATTATTGAAGGATGCCGGGGCCGCTTCGGTTCATTTGCGAATTGCGTCACCGCCGCTTCGCTACCCATGCTTTTATGGAATTGATATTCAACACGTCAGTGAGCTGATTGCTGCCAATCATACAATTGAAGAAATGCGTCAGATCTTTGATGCTGACTCACTGGGATTCTTGAGTGTGGAAAGTTTAATCGAAGCGGTTAACTTGAAAACCACTGCGCCTAATAAGGGTCTTTGTGTCGCATACTTTGATGGCAAATACCCAACGCCGCTTTATGATTATCAAAGAGAGTATGATCGTGATCAGGCTCAATTACACGCCGCAAAAATGGGATGAGAGGGAAATAAAATGGATGCCTATAAAAAAGCCGGTGTTGATATTAACGCCGGGTATAAATTGGTTGATGAAATTAAACAGTTATCTCATAACGATGCGCTGGGGGCCTTTGGCGGCATGTTTCCATTGAGTTTGGGTCATTATCAGAATCCGGTTTTAGTGTCTGGAACCGATGGTGTTGGTACCAAATTATTAATTGCAATTAAGGCCGGCATACATGACACAATTGGGGTTGATCTGGTTGCCATGTGTGTGAATGATGTGTTGGCACAGGGCGCTAAACCTCTTTTTTTCCTTGATTATTTGGGAACCGGTCATTTGAACCAATCTGAGGCAAAAGCCATTTTAACCGGTGTTGTTGATGGTGTTTCTCAAGCTGATGCAAAATTGGTTGGCGGCGAAACGGCTGAAATGCCGGATATGTATCAGCATGGTCACTATGATTTGGCCGGTTTTACCGTTGGGATCGCCGATCAGGATAAACTATTGAAATCGGACAATCTCCGAGAAGGCGATGTTTTGCTGGGCTTGGCCTCCAACGGCCTGCATTCCAACGGCTTTAGCTTGGTACGAGATATTTTGTTCAAACAAAACCACTATTCATTGGATGAGACATTACCAGGTTGTCAATTGGATCTAAAGCATGAGTTACTGCGACCAACTCGAATTTATGTCAAATCGGTTTTGCCGTTGATTGAACAGGGATTAATTCAATCAATTGCGCATATTACCGGTGGGGGACTGATTGAAAATGTCGGTCGGATTTTACCTGACCATTTGGATGCAGCATTCAACCTGAATAGTTGGCAGGTACCAGCCATCATGACGAATTTACAAAAAATCGACCACTTGTCATTTAATGACATGAAACAGACGTTTAATTTGGGACTTGGAATGGTATTGGCCATTCATCCGACAGATGTGGATCGTGTAAAGGCCGAATTGGAAAAAGCCGGCGAGACGGTTTACCAAGTCGGTAAATTGGTTTCCGGTTCAAAAAAAGTTGTGATTCGAGAGGATTTGTTATGAAACCAGACGTTAAAAGAATCGCCATTTTTGCTTCAGGTGAAGGGACTAATTTCACCGCGCTCTGTGAGTCGTTTAAGAAGGAAGGCTTACCGATTAATGTGACCTTATTGGTATGTGATCACCGCAAAGCCAACGTTTTGAATCGGGCTAAAAAAGAAAATGTGCCGACTTTTGTGATCAACTTTAAAGATTATCCCGATAAAGCGGCCGCTGAGAGGGTCATTGCCAAGAAACTGGCGGACGAAAAGATCGATTTTATCCTGTTGGCCGGCTACATGCGAATTATCGGGCCAACCCTGTTAGCGACTTATGAAGGAAAAATTGTGAATATCCATCCGGCCTTGTTACCTAAATTTCCGGGCCGTCACGGGATTGAAGATGCTTATCAGGCCGGTGTTGACGAAACAGGTGTCACTATTCACTGGGTTGACTCCGGAATCGATTCCGGAAAAGTGATTGCACAACGGATGGTGCCAGTGTATAAAGATGATAAGCTGAGTGAACTTGAGCAGCGAATTCACGCTACCGAACATCAATTATATCCAGAGGTAGTCAAACAACTATTAGAAAGAGGAGAAATATCATAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP044119|350985:359549|353589_354276_+|WP_003634413.1|DBSCAN-SWA
MKFAILAFPGSNCEMDLYYAIQDIMNEEVELVSYKKNSLEGFDAVLIPGGFSYGDYLRSGAIARFSPIIPALQEFAKSGRPVLGICNGFQILTEAGLLPGSLQKNVSAKFICQTEPLVVNNAGSLFSSAFKLAQIINLPIAHGDGNYYCDQETLKRLIANDQIIFKYRNNPNGSVANIAGITNKAGNVLGMMPHPERAVEDILGSSDGIGIFQSIINYVKSREVVAHG
>NZ_CP044119|350985:359549|353329_353593_+|WP_003557250.1|DBSCAN-SWA
MALVKVYVNYKKSILNPEAQAIQKALGRLGYDNVNDLKLGKYFEITVADGISRDDLNKEINDICDKMLANYNMENYHYDITETEAAQ
>NZ_CP044119|350985:359549|351454_352588_+|WP_003634411.1|DBSCAN-SWA
MSSNSIKTLLPPATIGIVGGGQLGQMMALIAKSMGYKVGILDPTPQAPASQVADFQIVAEYDDVDSLMELADKSDVLTYEFENVDEDALLKAKKVAELPQGVDLLHITGERLNEKNFLRQAGIPVTNFAAVSDEASMTDAIKEVGYPAILKTVSGGYDGHGQMDINSPQDIEKAVELYGKAQCILEARQSFIAEASVMVTRDVNGKVITFSLVENRHKNHILHTTIAPGRFSKTIHQKAHDYAETIANKLDLYGVLGIELFVIDDKDLMVNELAPRPHNSGHYTIEACNISQFEAHIRSICGLPIPQIAQEKPAVMRNLLGADLTLARNLLKEHPEWHFHDYGKAEIRPQRKMGHVTVLGDDIDQLLKSTDMLKGEN
>NZ_CP044119|350985:359549|352589_353330_+|WP_003551730.1|DBSCAN-SWA
MTEIADIEKKDLLYKGKAKEMFTTNDPDIMWVHYMDQVTAFNGKKKVQMQGKGQTNCEISSLIFTDLAKHGIENHFIKQLDANNQLVKRVKIIPLETVVRNFASGSFEKRYGVEHLMAFEKPVTEFFYKSDELDDPFINDFDAEALNVATEDQMKKIRDIALKVNDRLKEIFSEMNVDLVDFKVEFGMTSDGQLILADEISPDSCRLIDRTTKKSLDKDVFRKGLGALVPVYKELLGRLEKVEDVQ
>NZ_CP044119|350985:359549|350985_351474_+|WP_035462365.1|DBSCAN-SWA
MANIVGVAMGSISDWPTMKLACQQLDNLGISYEKHVISAHRMPDELQAFGKSARNKGLKVIIAGAGGAAHLPGMIAANTTLPVIGVPIKTRTLNGVDSLLSIVQMPFGAPVATVSIGESGAKNAALLAAQILGVEDQAIQQKLLDLKHEQRVEAKNSEQQFD
>NZ_CP044119|350985:359549|356487_357933_+|WP_040472684.1|DBSCAN-SWA
MQPEVKSLNEECGIFGVWGTPDAARLTYIGLFALQHRGQEGAGITVNNDGELRTKRGFGLLTDVFDSPNAVADLDGNAAIGHVRYSTAGSNLLENIQPLPFNFSDTQFALAHNGNLTNAISIRKQLEDRGAIYHSSSDTENLMHLIRLSQAPDLDDQVKEALNIIKGGFAYLIITKDRLYAALDPNGFRPLVVGQLPNGAYVVCSETCALEAVGAKFKFDVQPGQLIKIDDTGITIDQYTDDTQLSICSMEFIYFARPDSDIYGVNVHSARKRMGEILAKEQPADADIVTGVPNSSLSAAMGFAEAAGLPYEMGLVKNQYSARTFIEPTQELREQGVNMKLSAVKGVVKGKRVVLVDDSIVRGTTSRRIVKLLKDAGAASVHLRIASPPLRYPCFYGIDIQHVSELIAANHTIEEMRQIFDADSLGFLSVESLIEAVNLKTTAPNKGLCVAYFDGKYPTPLYDYQREYDRDQAQLHAAKMG
>NZ_CP044119|350985:359549|357945_358962_+|WP_003557257.1|DBSCAN-SWA
MDAYKKAGVDINAGYKLVDEIKQLSHNDALGAFGGMFPLSLGHYQNPVLVSGTDGVGTKLLIAIKAGIHDTIGVDLVAMCVNDVLAQGAKPLFFLDYLGTGHLNQSEAKAILTGVVDGVSQADAKLVGGETAEMPDMYQHGHYDLAGFTVGIADQDKLLKSDNLREGDVLLGLASNGLHSNGFSLVRDILFKQNHYSLDETLPGCQLDLKHELLRPTRIYVKSVLPLIEQGLIQSIAHITGGGLIENVGRILPDHLDAAFNLNSWQVPAIMTNLQKIDHLSFNDMKQTFNLGLGMVLAIHPTDVDRVKAELEKAGETVYQVGKLVSGSKKVVIREDLL
>NZ_CP044119|350985:359549|358958_359549_+|WP_003557259.1|DBSCAN-SWA
MKPDVKRIAIFASGEGTNFTALCESFKKEGLPINVTLLVCDHRKANVLNRAKKENVPTFVINFKDYPDKAAAERVIAKKLADEKIDFILLAGYMRIIGPTLLATYEGKIVNIHPALLPKFPGRHGIEDAYQAGVDETGVTIHWVDSGIDSGKVIAQRMVPVYKDDKLSELEQRIHATEHQLYPEVVKQLLERGEIS
>NZ_CP044119|350985:359549|354268_356503_+|WP_003557254.1|DBSCAN-SWA
MDKVMNQPVEATPEQIRDQKLYQSMGLSDHEYQLIKDDVLHRLPNYTEVGLFSGMWSEHCSYKNSKPVLKKFYTKGEHVVKGPGEGAGIIDIGDNQGVVFKAESHNHPSAVEPFQGATTGVGGILRDIFSMGARPIACLDSLRFSTPKTDEDRYFISQIVAGISSYGNCIGVPTVGGDTTFDDAYEHNPLVNVMCVGLMDLDKIEVGAAAGAGNSIVYVGAKTGRDGINGASFASFQFDSEHESQRSAVQVGDPFTEKLVMEACLDVINNHSDSLVGIQDMGAAGLVSSSAEMGSKAGGNGMVLDLDLVPQREADMTPFELMLSESQERMLLCVKAGHEDEVLTVFDDHGVDAVVIGHVTEGDHYQLLQHGNVVADVPVDSLASQAPVYHRESEVPAHLKDSDTKQFVPEIKNPTATLKQMLTQLTIASKESIYQTYDTQVQTNTVVAPGSDAAVVRVRHYDKALAMTTDVNGRYLYLNPRIGGQMAVAEAARNIVASGAVPLGITDCLNFGNPEKPDQFYELDQAVMGMSDACEKFNAPVISGNVSLNNEYDNVPIYPTPMVGMVGLIKGLKHVTTQDFKQAGDLVYVVGRTGNGFNGSQIQKMQTGKISGKLFDFDLDYEAQMQQLVIDAIQNDLVHSAHDISEGGLITAVAESTFGNQLGVDLTSDLPVDRFFSESQSRFIVSIASENQDAFEKLMGENADCLGKVTDDNHLFVSAADGYFDMDVDDAFHLWKGALPCSLK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_035462365.1|350985_351474_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	1.6e-17	48.4
WP_003634411.1|351454_352588_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_003551730.1|352589_353330_+	phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase	H8ZMN3	Synechococcus_phage	3.7e-42	39.6
WP_003557250.1|353329_353593_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurS	NA	NA	NA	NA
WP_003634413.1|353589_354276_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurQ	NA	NA	NA	NA
WP_003557254.1|354268_356503_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurL	A6N228	Microbacterium_phage	3.5e-136	40.6
WP_040472684.1|356487_357933_+	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	2.2e-51	35.0
WP_003557257.1|357945_358962_+	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	A0A0E3FC27	Synechococcus_phage	1.2e-62	42.2
WP_003557259.1|358958_359549_+	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	E3SNR5	Prochlorococcus_phage	2.5e-25	36.1

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP044119|617171:651533|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

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>NZ_CP044119|663952:712487|683361_683613_-|WP_003634858.1|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_133281517.1|685605_685731_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081447188.1|686253_686706_-	winged helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_040472848.1|692257_692509_-|transposase	IS3 family transposase	Q6J1X3	Lactobacillus_phage	2.7e-37	95.2
WP_003635790.1|693063_694368_-	glycosyltransferase family 2 protein	NA	NA	NA	NA
WP_003558041.1|694852_695143_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_003635811.1|707430_708015_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003635812.1|708028_708238_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_150334582.1|708363_709392_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.1e-36	32.2
WP_003635815.1|709718_711113_+	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
WP_003635817.1|711320_712487_+|tRNA	tRNA epoxyqueuosine(34) reductase QueG	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP044119|1225800:1274117|DBSCAN-SWA
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MADKKDDSLKSNEPADDLASKNDHGHEKEVRDAKAAKKSDSSKTEKHDSADEVVKLKQTVVNLQKKLDDMENRYLRAEADIKNIQTHAKKEQADLIKYDGQQLAHDILPIVDNLQRALAVEATDENGKQLKKGVSMVFEHLTKALSDNGVEEIDALNKPFDPKLQQAIQTTTADEKHPADTVAQVLQSGYRLKDRVLRPAMVVVAK
>NZ_CP044119|1225800:1274117|1244182_1244500_+|WP_004561420.1|DBSCAN-SWA
MDNNQAILNFLGIAKRANKIVSGENTLLSEIRNGKVHFLFIASDTGPSTSKKFLDKSNYYHVSVNTMHTKEVLSNAIGMKRTIIGIKDQGISKKMIELTNRIKGE
>NZ_CP044119|1225800:1274117|1226904_1227903_+|WP_003553778.1|DBSCAN-SWA
MKIIAYGIRDDEKPYLDKWSEENPDVEVASTGELLDESTVDQAKGADGVVTYQQKPYTAAVLDKLGEFGIKFLSLRNVGVDNIDADAAKRNGIQVTNVPAYSPEAIAEFTVTQLMRLLRRTNTFDRKQANGDLRWAPDIAEELNQLTVGVFATGRIGRAAMRIYKGFGAKVIAYDIFHNPELEKEGVYVDSPDELYAQSDVLSIHAPATKENEHMLNDEAFSKMKDGVYILNPARGALVDTDALIRALDSGKVAGAALDVYENEVGIFNTDFGSFDKIPDERLKGLMKRENVLVSPHIAFYTKRAVRNMVYFAMDANKSLISTGKSDKLVKL
>NZ_CP044119|1225800:1274117|1235716_1237426_+|WP_004561417.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MKQSKILVPTLKETPKGAEALSHKMLVRAGYIKQISAGMYAYLPLAYRVLTKIETIVRQEMEKTSAHEMLMPDVLPAELWKESGRYETYGPELFKFKNRHDTDFILGPTHEETFTELIRDSIKSYKQLPLILYQIQNKYRDEDRPRYGLLRSREFIMKDAYSFAANEADLDDAYRAMEKAYRTIFDRIGLKYRVIIGDGGAMGGSDSKEFSAMAAVGEDTIVYSDESDYFANLEMAKSKVTDEPSTEAEADLKKVATPNVKSIDEVADFLGVSTKKTIKSMLYIADEKPVLVLVRGDYDVNDVKLKNYLKADFLDLATDEQAVKFLKADFGSLGPVGVSDDVRILADTRVGNMKNAVVGADEDGYHYVNANLNRDFRIDAVDDFVVVKEGELSPDGKGKLKFTRGIEIGHIFKLGTRYSKSLNANVLDENGRSIPVIMGSYGIGISRLLSAISEQNADENGLVWPVAVAPYTVHVIPINVKKEVQMNLANQIEEQLTENGIEVLVDDRRERPGVKFADSDLLGIPLRITVGKKADEGIVEIKIRKNGETVESKVEELSDTVKILLKNLN
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MPKLGIDVSSYQGSSLSYFQNFKKLGADFAVVKLTEGTNYVNPKASAQVTNSLKVFGSVSVYHFFQGYGIAEAKYFLAWVKKFGLDKSTVLVIDVEAPGLPYNTTPQVNTFLRYLINAGYRNVVTYGSSSWFNSGRIQRNALVDKHIWVASYRASQPGVANANAWQFSDNWHGVDASYDFDGSLSGSKTTEKPSYYVTPGLYQVRMKWLPMYNSMEFKKANKRADRYGTGSRFWATPVKHGKITRLYINGQGYVSSNKWYVKFLKKSKPKAK
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MTTKIWTADDVIKKVSEYMNDDHVKMVKRAYEFAKIAHKDQMRQSGEPYITHPIQVAGILADLHMDPETVSSGFLHDVVEDTGAELSDVQELFGNDVALIVDGVTKLSKIKYKSSEERLAENHRKLLLAMCKDIRVMIVKLADRLHNMRTLKSLRPDKQRRIAKETLEIYAPIADRLGIGTIKWELEDISLRYLNPQQYYRIVHLMNSRRDQRVDYIQKAINEVKSAISDLDIKSEIYGRPKHIYSVYKKMVDKHKQFSQIYDLLAIRVIVQSIKDCYAVLGAIHTEWKPMPGRFKDYIAMPKANMYQSLHTTVIGPEGKPLEVQIRTEEMHRVAEFGIAAHWAYKEGITNGVKGSQDNNKLNWFKQIIELQEDTDDAADFMDSVKGELFGDHVYVFTPKGDVFELPKGAGPLDMAYMIHTEVGNHTTGAKVNGKIVPLDHQVKNGDIVDIITSTSSSGPSRDWVKMVHTRRARNKIKQYFRLEDREKNIENGRNIITRKLREEGFDAHKILTPDRLNQAAVNMHYQRDEDLLAAIGFGDVQPTGVVNRLTQDVRAKLKRERQDQAEKEVLEEHQTISESTESTKQHKKARKSSNGIVIEGVDNLLVRLSHCCTPVPGDKIVGYITKGRGVSVHRVDCPNIAKAEQDGQRLIQVSWANEPGDRTIYSAIFSVQGYNRAGLLTNILNAVNNVTKTVSSVNGQVDNNKMATISLSVGIRNLEQLERLISTLKNIPDVYLVKRKFR
>NZ_CP044119|1225800:1274117|1249540_1250578_+|WP_003553820.1|DBSCAN-SWA
MLVLTDRQKDILKIIIRDYTRTGMPVGSKALASEFPTHVSSATVRNDMAALESKGLITKTHFSSGRVPSMQGYRYYVDNLVQPDPLDDSAEDLIKSSFNIEFNRIDEIIQESAKVLSDLTSYMAVTFNPEPGNNLKLGGFRLVKLDDRQVMAIIVTNTGHVVDKIFRLTNVSSEQLETIVNIINSELVGKPISQVADKLRIDIPMLMTKYIQTPQGFLKIFGEMLSEAGRDKVHVDGKLNLLKFAERQNIDRLKPLYNLLDTEDTVQKIINPDSHDVQVRIGSELRNDLLKDYSIITGTYDLNEYGHGVIAVIGPTRMPYSKIIGIVGALREELTKKLLGYYDDN
>NZ_CP044119|1225800:1274117|1268138_1269101_+|WP_004561440.1|DBSCAN-SWA
MQWTEVSIITTSEAVEAVSNILMTYGATGVSIEDAKDFEKLSTGMYGHHGGYIDLEDVPHISKGAIVSAYYPESRHIDQHAAEISSEVQGLTEFGLKSAPGELKISPVADENWKTAWEKYYHPFAVTRYLTVVPSWDDYKPKNSLEQLIRLDPGMAFGTGTHPTTQLSLQALEMVLRGGESIIDVGTGSGVLSIAAKLMGAKKITAYDVDDVAVESAKKNMRLNPQAADIPVAVNDLLKGIHTQVDLVVANILAEIIVPLVPQAYENLKPGGHFLMSGIIKDKYGLIINTLNQFHFKVDQSMKMGDWYAVIAEKTVEEDK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_004561411.1|1225800_1226553_+|tRNA	tRNA1(Val) (adenine(37)-N6)-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_003560080.1|1226536_1226809_+	GIY-YIG nuclease family protein	S6DF82	Invertebrate_iridovirus	2.3e-10	44.9
WP_003553778.1|1226904_1227903_+	D-2-hydroxyacid dehydrogenase	M1I4S0	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	3.0e-47	34.2
WP_004561412.1|1228011_1228737_-	HAD family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_004561413.1|1228978_1229785_+	30S ribosomal protein S2	NA	NA	NA	NA
WP_003560087.1|1229873_1230752_+	elongation factor Ts	NA	NA	NA	NA
WP_035444750.1|1230945_1231668_+	UMP kinase	NA	NA	NA	NA
WP_004561414.1|1231670_1232234_+	ribosome recycling factor	NA	NA	NA	NA
WP_004561415.1|1232249_1232705_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003560092.1|1232779_1233544_+	isoprenyl transferase	R9W0U9	Flavobacterium_phage	1.0e-26	51.6
WP_003560094.1|1233560_1234349_+	phosphatidate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_040472718.1|1234374_1235649_+|protease	RIP metalloprotease RseP	NA	NA	NA	NA
WP_004561417.1|1235716_1237426_+|tRNA	proline--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_004561418.1|1237547_1241864_+	PolC-type DNA polymerase III	U5PWL2	Bacillus_virus	7.5e-26	21.4
WP_003553802.1|1242060_1242534_+	ribosome maturation factor RimP	NA	NA	NA	NA
WP_004561419.1|1242551_1243874_+	transcription termination/antitermination protein NusA	NA	NA	NA	NA
WP_003560106.1|1243893_1244193_+	YlxR family protein	NA	NA	NA	NA
WP_004561420.1|1244182_1244500_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_040472719.1|1244504_1247015_+	translation initiation factor IF-2	A0A2H4UTS4	Bodo_saltans_virus	8.8e-19	23.6
WP_003553813.1|1247082_1247433_+	30S ribosome-binding factor RbfA	NA	NA	NA	NA
WP_004561422.1|1247529_1248441_+|tRNA	tRNA pseudouridine(55) synthase TruB	NA	NA	NA	NA
WP_004561423.1|1248458_1249415_+	riboflavin biosynthesis protein RibF	NA	NA	NA	NA
WP_003553820.1|1249540_1250578_+	heat-inducible transcription repressor HrcA	NA	NA	NA	NA
WP_004561424.1|1250596_1251217_+	nucleotide exchange factor GrpE	NA	NA	NA	NA
WP_004561426.1|1251243_1253130_+	molecular chaperone DnaK	A0A2P1EIW2	Megavirus	6.8e-141	47.2
WP_003560122.1|1253237_1254383_+	molecular chaperone DnaJ	A0A1V0SBY2	Catovirus	1.4e-27	28.4
WP_003560124.1|1254593_1256432_+	elongation factor 4	E4ZFJ7	Streptococcus_phage	3.3e-23	24.8
1256377:1256433	attL	NA	NA	NA	NA
WP_040472745.1|1256556_1257714_-|integrase	site-specific integrase	A0A2I7SCV1	Paenibacillus_phage	9.7e-98	48.4
WP_082603025.1|1257805_1258417_-	DNA cytosine methyltransferase	A0A0R6PG08	Moraxella_phage	7.3e-28	39.7
WP_004561985.1|1258495_1259485_+|transposase	IS30 family transposase	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	9.9e-59	40.5
WP_133281516.1|1259445_1259925_-	DNA cytosine methyltransferase	M1PSQ0	Streptococcus_phage	6.3e-19	40.0
WP_056988841.1|1260288_1261317_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.1e-36	32.2
WP_082603043.1|1261358_1263044_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_150334588.1|1263287_1264356_+|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_133281484.1|1264467_1264704_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_040472721.1|1264696_1265515_+	autolysin	A0A0A7DMK9	Lactobacillus_phage	9.8e-20	33.5
WP_004561438.1|1266297_1266732_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
1265869:1265925	attR	NA	NA	NA	NA
WP_004561439.1|1267065_1267488_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003553836.1|1267740_1268088_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004561440.1|1268138_1269101_+	50S ribosomal protein L11 methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_004561441.1|1269100_1269847_+	16S rRNA (uracil(1498)-N(3))-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_056956056.1|1269983_1272215_+	bifunctional (p)ppGpp synthetase/guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase	A0A292GI44	Xanthomonas_phage	8.4e-05	27.5
WP_003560300.1|1272227_1272674_+|tRNA	D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase	NA	NA	NA	NA
WP_040472846.1|1272914_1274117_-|transposase	IS110 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP044119|1322844:1331344|DBSCAN-SWA
CATGGCAAACAAAGCAGAATTAGTAACTAACGTCGCCACAGAAACTGGCTTGACTAAGAAAGATGCTACAGCAGCTGTGGATGCAGTATTTGATTCAATCCAAGCTAGCTTGGCAAAAGGCGAAAAGGTTCAATTGATCGGCTTCGGTAACTTCGAAGTACGTCAACGTGCAGCTCGTAAGGGTCGCAACCCACAAACAGGTCAAGAAATTCAAATTCCTGCAAGCAAGGTACCAGCTTTTAAACCTGGTAAGGCGCTTAAGGATGCTGTTAAATAGTATTCATCTGTTAAGTCAGAACGGCAATTGTCGGACTGGCTTTTTTGTTACTATTTGTTACCAATGGAGGAATTTTATGAGTTATTCACAAACTGCATTAGATCAGCTCGAACGAGGTCAACTTGACGAGTTTGAGCAATCTTTTAAAAAAGCATTAACAAACGATTCTGACGACATATTATATTCGTTGGCCGAGGAACTGTATTCGTTGGGATTTTCCAACTATTCCAAGACAATTTATGAACAACTACTAACCAAATTTCCCGATGATGATTCAATTAAAATCAATTTAGCAGAATTAGCCATTGATGTGGATAACGATGATTTGGCACTTAACTATCTCTCTCAGATTTCAGAGCAATCGGCCGAATACGTTCGCTCTTTGATGGTTTCAGCCGATTTATACCAGACTCAAGGTCTCTTTGACGTGAGTGAGCAAAAGCTCTTAGAAGCCCAGAGAATCGAACCTGATGAGCCTGTTATTTCGTTTGCACTCGCGGAATTTTACTTTAATACCCGAAATTATCGTAAGGCAATTAATCTATATCTTGATTTAATTAAATCAGGAACACTTGAACTATCTGCAGTAAATTTGGTTGAACGGTTGGGTGTGTCCTATGCTGAGATCGGTAAGTTTGAACAGGCGCTTGGCTACTTGGAACAAATTAAACCGGTTCATATGAATAGCGACGTCAAATTCGAACTTGCATTTACGTACTTTAATTTGAAAGACTATCAAAAAGCCGTTAAAGCCTTTACAGATTTACGAGATTCCGATCCACAATATAGTTCTCTGTATCCTTACCTGGCTGATTCATATGTTGAATTAAAACAAACAGATTATGCACTTAAAACCATTCAAGAAGGCATTTCCATCGACCAATTTAATGAAAAAATTTGGCAAAAAGCCGGTCAGATTGCAACGATGGCTGGAGAGGATGAATTGGCACTAAAATACCTTAAAAAGGGCCATGAGATCGCGCCTGAGGATATGGAAATCCTTAATCTGATATCTGACTGGTATATTATCCATGAACAATACAAGGACAATCTGAAGCTTTTAGAGCCATTGGAAGAAGACCATGTCTTTGATGCACATTTGGCCTATAATCTGGCCCAATCATATCAAGATGCGGGTGAATTTAAAAAAGCCGCCAGTAATTACGAACTGGCAAGTCACGAATTAAATGATAATCCTGAGTTCTTAAAACATGCTGCGTTGTTTTATCGTGAAAACGGTCATGTAAAAGAAGAACGTCGCTATCTTAAACGTTATTTGGTGCTGGTGCCTAACGATATGGAAATGGCCTCGATGTATGAGGAAGATGAAAACGAAGATTATTAAACCTTACTTCAACAAATAGCCTCTTTAATTTCCGCGTACCGTTTCTAATTTAGAATATGATCAGATATTGCTTGGTGACACATGAGCTTTGATCTAGTCATCATAAAAAATGTGAGACAAGGGACAGAAAGTTGCCCTTTGTTTCACATTTTTGTCGGTTATCATTACGATCACAAAAAAAGGGGCCGAGGCAAAATTACTTTTGTCTCAGCCTCAAGTTATACATAGCTATTATAATATTTTGAATTTTTTAGGCCGCTTGTAAGTAAATCCCTCGCCAATTGCTTCGTTAACCTCCATAACCGATATAAAGGCTTCCTTGTCAATGGATTCAACAAGCTTTTTAAGCGTATGAAGTTCGCTTGGTGACACAACACAGTAAACGATATCTTTTCCTTTTCGTGAGTAACCGCCTTCAGCCTTTAAAAAGGTTGTCCCACGATTCAACTGTTCCATAATGGCTTCGGAAATGGTCGCAGACTGGTTACTGATAATTAAGATTCCCCGAGCAGCATAAGCACCTTGTTGTGTAAAATTAACAATCATTGAAAAAATCCATACATAAATCAATGTATAAGCCATTTGGCGAATATCCAGATAAATCAATGATGATAAAAGAACCAAGACGTCAATTGCCAGCAGTGTTTCCCCCATCTGAACACCCTTGAACCGTTCAAATAGGCGTGCAACAATATCTACGCCACCGGTCGTGCCGCCAAAACGGTATACAATCCCACAGCCAAAACCGCCAAATAGACCGGCTCCAAGGGCGGCAAGCAGTAAATCGTGTTGAATGTTAATTTCAATAGGAACTCGCTGCCAGATCCAAAGAAATATTGACAACATTGCGGTACCGTATAATGTGTAAAACATGTCTTTTTTACCTAAATAGCGATAGCCGATTGCGAATAAAGGAATATTGACCAGAATAGTGGAATAGGCTGGATCCATATGGAAAAGAGCCCTCAAAATCAAAGTAATACCGGTTACGCCACCATCTGCAAGATGATTATAAATATTAAAAAATACAATTCCAAACGAATAAATAGCTGAGCCAAGTGCAATGACAACCAAATCAACGACCGAAATATCCAGCTGGAATTTCTTCTTTTTTTGTGCCATATTTTCCCTCCAATATGATTTTTATGTCTTTCAGTTTGCTTTAAAAAGTCGAACATAATAACAAACACTTATCATAGCAAGGTATCTGTATAAAAGGCAATCTTTTTGACAAACTTTTTTCATGTTCAAATTTCTGTTAGAATTGTTTGGTAAATAAATACAAGATGGATGGCGATACTGTGCAAATAAAAAACATGCCAAGTGAATTTGAGAAAGCACTGCCAATCCTGCGAAAAATCGAAGCAGCAGGGTATGAAGCATATTTTGTGGGTGGTTCTGTAAGGGATACAATATTACAGCGGCCAATTCATGATGTTGATATTGCAACAAGTGCTTATCCAAGTGAGGTAAAGAGTCTTTTCAAAAGAACGGCCGATACCGGAATTGAACATGGAACCGTGATGATTTTGGATCATGGGACAGGATATGAAGTAACAACTTTCAGAACGGAATCCGGCTATCAGGATTATCGTCGTCCGGATAAGGTTACTTTCGTCAGATCACTAAAAGAAGATTTAAAACGACGGGATTTTACAATTAATGCATTAGCATTAAGCGAGAACGGTAAAATAACCGACTTGTTTGGTGGCTTGAATGATATGAGCAAAAAAATTATTCGAGCAGTAGGTGATCCAGAAGAACGTTTTAATGAAGATGCACTGCGAATGATGCGTGCAGTCCGTTTTGCCAGTCAATTAGACTTTAAAATCGAACAGCAAACATTAACCGGCATTTATGATCACAGTGAGTTACTGAAAAAAATTGCAGTGGAACGAATTCATTCGGAGTTTGTCAAAATGATGCTAGGTGTTGACGCTAAAAATGGTTTGAACTTAATGATAAAAAGCCAGCTATATCAATTTGTGCCAGATTTTTCCGAACATTTGACAGTACTTCAAAAGATTGTCGCTACTCATTTTGATTTGGATAACGAAGTTCAGGTTTGGGCATTGTTTACATCAATGTTTCAGTTCAATCGTGATCAGGTGATCTCTTTTTTAAAAAGATGGAAGACGGCCAATAAAATAATTAATGATGTTATACTTACAACTGAATTGATTTTTCAGATTAAGTCCCATAAAGTTGGCAATCTCGAATTATATAAAGCTGGAAAGCAAAATGTTCAAAATGCTGTTGCAATTATTTCCAACTATACAGATTTTGATTCAGCAAAATTGATTAAGGCCTATGATCAATTGCCGATTACGACCAAAAAGCAACTCAACGTTACCGGTGGTGACTTAATTAAGCGGGGGATTTTAAATCCGGGTCCAAAGTTGGGAGAAACGCTGGAGGCATTGGAAAAAGCAGTCATACTTGGTAAAATAAACAATCAGGATTCAGAACTAATTGCTGCGGCAATGGCATTAAATAAGGAATGATTAGTGAATGGAAACAATGCGAGTAGAAGGGCTGACAAAAACATATGGTGAAAAAACACTGTTTGACAGCCTTGATTTTTTAATTAACGAACAAGACCGGATTGGCTTGATTGGCACAAACGGAACTGGGAAAACATCGTTGCTAAATGCTATTTCAGGCCACGATCATGATTCAACTGGAGACATTATTACCTCTAGATCCTATACAATCGGTTATTTGACCCAGAATCCCAAATTGGATGATCGTTTATCAATCATGGATGCTGTTTTCTCCGGATCCCAAAAGGTTTACCAAACTATCCGAAATTATGAATCTGCCTTGGATAAATACTCAAAGTATCCAGAAGATCAGGATGCCTTGAAGCGGTTTACGAAGGCTGAAGCCAAGATGAACGAAGACGATGCTTGGAATGCACAAAGTGATGTCGAAACAATTTTAAGTCAATTAAAAATTACCGACTATCAGCAAAAGGTCGCTGAACTTTCAGGAGGTCAGCGCCGCCGAGTGGGCTTGGCACAAGTGCTTATCCAGTCACCTGATCTGTTGTTACTTGATGAACCAACCAACCATCTGGATTTTGATTCAATTGAATGGCTGGAAAAGTATTTAGCCGGTTACAAGGGTGCATTAATTGTTGTTACCCATGACCGTTACTTTCTCGATCGGGTTGCAAATAAAATCTGGGAACTTTCTTTTGGCAAGCTCTATCAATACGAAGGAAATTACCAAGATTATGTTGAACAAAAGGCAACTCGCGTGCAGGGCGCTATTGAATCGCAACACAAAACGCAACAACTATATAAATCTGAACTGGCATGGATGAAAACAGGAGCCAAGGCGCGCTCAACCAAGCAACAGGCCCGGATTAACCGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_004561473.1|1324696_1325587_-	YitT family protein	M1Q1P6	Streptococcus_phage	5.2e-59	38.7
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WP_040472725.1|1328908_1329859_+	thymidylate synthase	A0A0N9SH48	Staphylococcus_phage	2.4e-118	60.8
WP_004561476.1|1329900_1330389_+	dihydrofolate reductase	A0A1Y0SUI9	Pseudomonas_phage	4.6e-17	33.6
WP_003560385.1|1330495_1331344_+	DegV family protein	A0A0N9SI50	Staphylococcus_phage	4.0e-16	34.4

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP044119|1687722:1740129|DBSCAN-SWA
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MTDMNYTYLKLVKIVFPNTILVVDKFHIINALNRAFNKTGVRLVCDIF
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MKYYSDEFKNNIVKLYHNENRSKKSLANEYGVHPTTISHWIKRAKLVELPDGGVTSVEAFKQLQKENQQLKEENEILKAGGGVTGKALGKVKAIDFINEQLCKHRLWIILKALGLSKSTYYHWKHYQISRHDKQDTILKSQIFEIWKNNYKAYGYPRITIAMRRLGVVIGPNRVYRLMQELGIRSLMGRRFKKPGTHVDYSQRPNLIKNHPIGTIWRADITYLELRPGTWVYLSTIFDQASKQIIAFNIGKEMASKLIIKTLLQALSRASKPTFLHSDMGSQYTSIAYEGLLKRHLIRHSYSKQGYPYDNGPLEAFHSLLKREFIFQTRFTSFEDLVLRVENYINWYNTERIRING
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MYNNNINNSYYGGDFIVLDRRYETFLTLAKTVSYTKTAQKLYITQPAVTQQIASLQKDLQIELVRYERPNLIITSAGKELAKYIENVRIKSHQLLQHLQRPNDKRSLKFGATLSFNTIVEPNFIKHIAPKFTNIDCLVANTDQILTQIDNGQIEFGLVEGNFKLSDYDSIPIFKDDFIAVCNPQNPLANQKRVDLKACLKFPLLLREVGSGTRSILEDWLAMVNHSVSDFSKIITIGDMSTIISLLQANMGISFMYRSLLTEKLSTHQLVQLPLTSFDITRTLSMVFQQQSYYETQYHQLADDIKTILAK
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MTFDRWIELITVTLGICGSVYGVLRVLLKPLTQRLEDVAESIRDTSNRLEQFVKDQYSIKETLAVSRGEHKAINQRIDQLEDDVKELKDKN
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MITQRSFDTKSKYGTLYLVPTPIGNLEDMTFRAVSVMKQVDLIAAEDTRNTQKLLNHFEIETKQISFHEHNTVQRIPELIDKLKKGISIAQVSDAGMPSISDPGHELVVACIKSEITVVPLPGANAGITALIASGVSPQPFYFYGFLSRKPKEQRDELAKLVNRQETLIFYEAPHRLLKTLKSLQNSFGGLRAASLCRELTKKHEEFIRGTLDQVIEWANSTTIRGEFVIIVSGNAQPLEENKIDNLMENLSLTQQVDIYIKDGLSVNESIKKVAKAHNLRKQVVYNEYHGIK
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MWRYLKRLLIGKPLKTTDEGGQALTKFKALALLSSDALSSVAYGTEQITTILITLSAAALMYQIWVAALVLVLLAAITLSYQQIIHAYPSGGGAYVVASTNWGERAGLVAGGSLLVDYMLTVAVSTTSATEAITSAIPSLYSHQVLISCLIVVGIMLLNLRGIRESASFLTLPVYLFIVMILVMIIYGGYNILSGHIQYHAAAHIGAPVEGMTLVLFFRAFSSGSSSLTGVEAISNAVPNFKKPKSHNASATLAIMATILACFFGGITYMSYYLGIVPNGHETVLSQIGVAVFGHGIIYYVLQLSTAMILAVAANTGFSAFPILAYNLAKDKFLPHAYLDKGDRLGYSNGIISLAVGAIVLIQIFGGRTNSLIPLYAVGVFIPFTLSQSGMIIHWYRHRGRNWQLKSVINFIGAFISLALVTCLFLLRFPNVWPYLIVMPILLRIFYKINRHYKRVAEQLRVVEEDTQITATHHYDGSTVIVLVGGVTRVTANAISYAQSIGDYVIAMHVSFDSNPEKEHKTSEEFKKEFPNVRFVDIHSSYRSIAQPTLRFCDVIAKRAADRNYSTTVLVPQFVPKHRWENLLHNQTSLRLRTILNSRQNIIISTYNYHLRE
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MMAEIHGAALNGKVLFENKDDTLIAPSNIPAGVTTTGGIRVEGNLLVISLAIDTPVGKSWYGWFSIFNDLSSITDGKTVVPTQITGKSYADATNTVAAGDMMVNFGYGSFKWNNKIAIYPGYNLGSECWTMYNGTALLIDN
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MAKDVYINDQGDFEQDDKGNVAMVDGLDEIAQSCMIALNTRKGGWVLDTDEGLDWGAVIGSNVHDQFVTAAIRETLLEDPRIDDLHDISFERDSRQLKIYITIEVKNQLKEVVWEAGVVND

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_057808143.1|1688468_1689671_-|transposase	IS110 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_003560995.1|1690121_1691963_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_003636257.1|1692150_1693767_-	chaperonin GroEL	A0A240F779	uncultured_virus	2.4e-155	52.1
WP_003554622.1|1693837_1694158_-	co-chaperone GroES	A0A221S322	uncultured_virus	6.1e-10	32.6
WP_003554624.1|1694489_1695122_-	redox-sensing transcriptional repressor Rex	NA	NA	NA	NA
WP_003636252.1|1695345_1697292_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A1V0SGN0	Hokovirus	1.4e-53	27.0
WP_003636250.1|1697401_1698445_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex transferase subunit TsaD	NA	NA	NA	NA
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WP_003636248.1|1699018_1699750_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit type 1 TsaB	NA	NA	NA	NA
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WP_003636244.1|1700651_1701533_-	16S rRNA (cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase	M1PLC5	Streptococcus_phage	9.1e-80	53.1
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WP_003561016.1|1704086_1704356_-	YaaL family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003554648.1|1704368_1704968_-	recombination protein RecR	NA	NA	NA	NA
WP_003554650.1|1704991_1705303_-	YbaB/EbfC family nucleoid-associated protein	NA	NA	NA	NA
WP_003561018.1|1705326_1707219_-	DNA polymerase III subunit gamma/tau	A0A1U9WR94	Streptococcus_virus	5.5e-58	40.5
WP_003561020.1|1707535_1708009_-	nucleoside deaminase	NA	NA	NA	NA
WP_003636240.1|1708031_1708640_-	class I SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_003561022.1|1708801_1709032_+	glutaredoxin-like protein NrdH	X2KRY7	Enterococcus_phage	3.6e-12	48.0
WP_003561024.1|1709131_1711297_+	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit alpha	A8E2R1	Enterococcus_phage	1.3e-257	61.2
WP_003554662.1|1711339_1712296_+	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit beta	A0A096XT60	Enterococcus_phage	1.1e-120	65.3
WP_003636235.1|1712424_1713420_-	D-2-hydroxyacid dehydrogenase	M1HUT5	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	1.1e-44	36.7
WP_003636232.1|1713584_1715051_-	UDP-glucose--hexose-1-phosphate uridylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_003636229.1|1715056_1716058_-	UDP-glucose 4-epimerase GalE	A0A2K9L5H6	Tupanvirus	1.1e-52	37.9
WP_003636227.1|1716084_1717260_-	galactokinase	NA	NA	NA	NA
WP_003636225.1|1717633_1718662_-	putative sulfate exporter family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_003561048.1|1718729_1719662_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_003561050.1|1719805_1720381_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003636223.1|1720478_1723046_-	bifunctional lysylphosphatidylglycerol flippase/synthetase MprF	NA	NA	NA	NA
WP_003636220.1|1723564_1724788_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
1725005:1725024	attL	NA	NA	NA	NA
WP_082603033.1|1725493_1726339_-	cation transporter	NA	NA	NA	NA
WP_056988841.1|1726452_1727481_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.1e-36	32.2
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WP_003636212.1|1728091_1728937_-	autolysin	L0P6H6	Lactobacillus_phage	3.9e-11	27.5
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WP_003636206.1|1730837_1731239_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003636204.1|1731350_1731932_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_003636198.1|1733421_1734042_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003636196.1|1734028_1735186_-|plate	baseplate J/gp47 family protein	G0YPL8	Erwinia_phage	9.3e-16	30.9
WP_003560260.1|1735178_1735544_-	DUF2634 domain-containing protein	E5DV62	Deep-sea_thermophilic_phage	2.6e-09	36.8
WP_003636194.1|1735553_1735970_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003636192.1|1735966_1737199_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003636190.1|1737195_1737672_-	hypothetical protein	A8ATH8	Listeria_phage	3.6e-14	36.0
WP_109249140.1|1738044_1739113_+|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	6.6e-08	24.3
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1745781:1745800	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP044119|1842205:1930586|DBSCAN-SWA
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MKYYSDEFKNNIVKLYHNENRSKKSLANEYGVHPTTISHWIKRAKLVELPDGGVTSVEAFKQLQKENQQLKEENEILKAGGGVTGKALGKVKAIDFINGQLCKHRLWIILKALGLSKSTYYHWKHYQTSRHDKQDTILKSQIFEIWKNNYKAYGYPRITIAMRRLGVVIGPNRVYRLMQELGIRSLMGRRFKKPGTHVDYSQRPNLIKNHPIGTIWRADITYLELRPGTWVYLSTIFDQASKQIIAFNIGKEMALKLIIKTLLQALSRASKPTFLHSDMGSQYTSIAYEGLLKRHLIRHSYSKQGYPYDNGPLEAFHSLLKREFIFQTRFTSFEDLVLRVENYINWYNTERIRING
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_003636486.1|1853454_1854432_+	polyprenyl synthetase family protein	A0A1V0SE37	Indivirus	2.3e-07	27.1
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WP_003636480.1|1856968_1858708_-	thiol reductant ABC exporter subunit CydC	A0A1V0SE00	Indivirus	1.8e-23	33.3
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WP_003636474.1|1863455_1865096_+	FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
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WP_003636467.1|1866943_1867849_-	heme ABC transporter substrate-binding protein IsdE	NA	NA	NA	NA
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WP_040472819.1|1910377_1910776_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003636345.1|1910874_1911549_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_150334609.1|1911535_1912135_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_003635756.1|1919772_1921836_-	LTA synthase family protein	W6LM83	Streptococcus_phage	3.4e-154	47.1
1913812:1913831	attR	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP044119|2225379:2302500|DBSCAN-SWA
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MIKLESEDGKNYLVFDGETEGVTLSLKVALDDATIVNTVKTLASGTSLAKGLFKLAMDKVTNTNFKAHSDSTTAVKDVPQSAVSQNIAK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_003635362.1|2232291_2233071_-	LPXTG cell wall anchor domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003635360.1|2233215_2234541_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_056956037.1|2234566_2239237_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_150334616.1|2239466_2240669_+|transposase	IS110 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_056956031.1|2240775_2242269_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003558859.1|2242653_2243436_-	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	7.2e-12	24.7
WP_003635351.1|2243663_2244710_-	ketol-acid reductoisomerase	NA	NA	NA	NA
WP_150334613.1|2244817_2246521_-	biosynthetic-type acetolactate synthase large subunit	A0A0P0CDR3	Ostreococcus_lucimarinus_virus	1.1e-57	29.3
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WP_003635345.1|2247270_2247999_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003635340.1|2249824_2251567_+	dihydroxy-acid dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_003635339.1|2251620_2252610_+	bile acid:sodium symporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003635338.1|2252699_2253719_-	lipoate--protein ligase	NA	NA	NA	NA
WP_003635332.1|2254294_2254741_-	universal stress protein	NA	NA	NA	NA
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