Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP044161 | Campylobacter coli strain AR-0420 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,WYL,csa3 | 0 | 1 | 3 | 0 |
1. NZ_CP044161
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP044161_1 | 1394723-1394796 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP044161_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP044161_1
>1.1|1394746|28|NZ_CP044161|CRISPRCasFinder TTTATTGATGAAGTTTTGATTTATAAGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP044161_1
The CRISPR arrays of NZ_CP044161_1 >merge|NZ_CP044161|1|1394723-1394796|CRISPRCasFinder GTGATTTTTTAGAAAAAATTCCATTTATTGATGAAGTTTTGATTTATAAGGATGATTTTTTAGAAAAAATTCCA >NZ_CP044161|1|1|1394723-1394796|CRISPRCasFinder GTGATTTTTTAGAAAAAATTCCA TTTATTGATGAAGTTTTGATTTATAAGG ATGATTTTTTAGAAAAAATTCCA
>NZ_CP044161.1|WP_023362212.1|1393546_1394536_+|phosphoribosylformylglycinamidine-cyclo-ligase MKISYEDAGVSIDNGNAFVEAIKPLVKETFNDNVVGGIGSFAGAFRMPSGFKNPVILGATDGVGTKLRLAIDAKKYDTIGQDLVAMCVNDLICNFATPLFFLDYYATAKLEVEVAKAVVSGIAKGCKMANCALIGGETAEMPGMYAKDDFDLAGFAVGMAEEDEIDRSKFVKNGDILLALPSSGLHSNGYSLARKVLFESLKLKFDDKIEGKNLIDILLEPTRIYVRDFLTLKPYISALAHITGGGLVENLPRVLPRGMGATIRKHHLKTPEIFYTIGQAVEESEMYRSFNMGVGLVVVVDPSNVSRVLENSDAFIIGEICINEGIVLE >NZ_CP044161.1|WP_052780601.1|1392880_1393486_-|dephospho-CoA-kinase MKNAFFVTASIACGKSTFIEIANSLGFKSISADKIAHKILDENALELEKIFSPFSLKNLLTKEKKIDRKILGEIVFNNKEAKKILENFTHPKIRAKILEQMQILDKENKAFFVEIPLFFESGAYENLGKVIVIYTPKELSLKRIMQRDKLSLEAAKARLDSQINIEEKLKKADFIIKNTNSYADFRQECVKVIQEISKGKM >NZ_CP044161.1|WP_052780600.1|1392134_1392884_-|diaminopimelate-epimerase MKIYKYCASGNDFVITNADRKEDRSALAKELCNRYEGIGADGFIVILPHEKYDFEWEFYNNDGSRAAMCGNGSRAAAHFAHHINGIKPHMTFLTGAGVIKANVDNNSVEVSLGKIKNIQDAFSECEKNWQLCDTGVPHLVHFCENLDEFDLKLCKQMREKYNANVNFVKVENDNTLRVRTFERGVEDETQACGTGMGACFYLAFLNKKIHNQARVIPKSGEELSFKFENEELFFKGKVRYCFEANYNFS >NZ_CP044161.1|WP_002790275.1|1391428_1392160_-|mannosyl-glycoprotein-endo-beta-N-acetylglucosamidase MKRIIIFLSFYLLPLFGNSELKNGFGEEYYKLNVEQKRQIFFTKMNAMFDKSFEEIAKERAFVEAFFYDAYKNGLRNSNQNNLEKLINLKNKYRVENLYDFTEYKKRIQKIPKSMGIAQALVESAMGTSRFAREANNLFGEWTWGEKGLIPDLRYPDKKHKIRIFDSLQDSVDSYVLNLNRHFAYEEFRNERAKFESEGKEITGLEAIKTLDSYSERKGYYINIVTKIIQRYDLERYDTPKSF >NZ_CP044161.1|WP_002785830.1|1390384_1391422_+|ATP-binding-protein MKVLNFFYENHPKFEISYERKVQIPLCNIIIKGPKFSGKKTLIFNYLSQFKPNEILFLNLYDTRFENQSLGHLSNFLEKNVQIKFLCIYNVEFALNLQDIKIPIIISTDKKDLHIEGFQELELDYFDFEEFVSISRKNLPINNLVGLFLQSGRSKLGEKNILLRQNFNTLELEILKYLALNLGQQISISKLFLELKKKLKTSKDSVYHTIKELENTYIIHPISHDEKKLQKIYFRDFGLRNNLCIQKDFAHLFENLILNELFKFKQEFFYNKFFTFYSKVSKIAYISSPTLDIDLIKLRAKKILSKGLELGIFHVVFITLSSEDSFFEQGVKFEVLPFDKFSLGF >NZ_CP044161.1|WP_002790273.1|1389011_1389461_+|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MSVTKQLLQMQADAHHLWVKFHNYHWNVKGLQFYSIHEYTEKAYEEMAELFDNCAERALQLGEKAITCQKTLMENAKSPKVEKDCFTPVEVMELIKKDYEYLLAEFKKLNEEAEKASDTTTAAFAQENIAKYEKSLWMLASVLQNTCKM >NZ_CP044161.1|WP_002798730.1|1387666_1388887_+|glucose-6-phosphate-isomerase MLNNTLFFKESEIRTISSYANRINDEVESGDIGYYHLIDTSLTLIDESLNFIQDKEHVKNIVLVGMGGSSCGVKALRDMLFDEKSNQRELFILDNTSSHSFSRTLEKIKLEESLFLIISKTGSTIEVVSLFKLLIEHFKLDIQELKKYFIFITDKDSKLHKEGENLGIKCFFIPANVGGRFSILSAVGIVPLCFCGYNAKALLEGAKACFEDFFIHKKDEILQKAYHYCTHKSANINVLFSYSDAFKGFNEWYIQLIAESLGKKQGYKRIGLTPIALIGARDQHSFLQLIMDGPKNKTITFLKIKDSQKAPVIPDIHFKFLDDLSNKVNLHDLLNAQCDATMHALIAENLSVDIIELEKLDAWHAGYLMYYYELFTSACGVMLGINTYDQPGVEVGKLILKNILKS >NZ_CP044161.1|WP_002779506.1|1386848_1387673_+|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase-GalU MLQTCIFPAAGYGTRFLPATKALPKEMLPILTKPLIHYGVDEALEAGMDNMGFVTGRGKRALEDYFDISYELEHQISGTNKEYLLKDIRSLIHRCTFTFTRQNEMRGLGDAVLKGRPLAGDEAFGVILADDLCINEEGVNVMAQMVKIYEKYRCTIIAVMEVPKEQVSSYGVIAGNFVEEDLIMVNSMIEKPSPQEAPSNLAIIGRYILTPDIFGILENTKAGKNGEIQLTDALLTQATNGMVLAYKFKGKRFDCGSVEGFVEATNYFYEKSKC >NZ_CP044161.1|WP_002791442.1|1384767_1386738_+|acetate--CoA-ligase MRYQNTQGLFKPNKQLSRNARIKNLCEYYDLCDEVREDFEGFWKRQALEKIDWFSPFSRVLNDDKAPFYKWFEGGTLNVSYQCLDRHMKTRRNKAAIVFEGEMGDYEVYTYRRLLHEVCKAANLLKRFGVKKGDRVIIYMPMIPETAIVMLACARIGAIHSVVFGGFSPEALRDRIIDAGAKLVVTADGAFRRGKPYMLKPAVDKALSEGCESVEKVLIVIRNNEPIEYVKGRDYIYNELVKNESYKCEPEIMDSEDLLFLLYTSGSTGKPKGVMHASAGYILWAQMTMEWVFDIKDYDNYWCSADVGWITGHTYVVYGPLACGATTIMHEGTPTYPNSGRWWRMIEEYQVSKFYTSPTAIRMLHADAPDEPKKYDLNTLEVLGTVGEPINPSAWQWFYENIGNSKCSIVDTWWQTETGGHMITPLPGATPLKPGCATLPLPGIFAEVIDEEGNVKDVAEDGLLCITKPWPSMIRGIWGDENRYIESYFSQAKKEGKPVYFSGDGAFYDDNGYITITGRTDDVVNVAGHRIGTAEIESAIAKHPSVAESAVVSVLDAIKGESLFAFVVLNPTSSCDLGGAIETLKELNDILRAEIGPIAKIEKILYTTGLPKTRSGKIMRRILRTIARGEELKQDISTLEDSGVVQSIIDAAKTGI >NZ_CP044161.1|WP_002779508.1|1383631_1384627_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIELCNFKFNYGQKNILNIKHLCLDTDKISILMGSNGSGKSTLLRILKFLEGEFDNITYFGNKHLNSDEKRQIYLLFPEPVFLNRSVEKNFYFLLKTYKLDSKEIKKRLNEVLNLLEIDRSLLKKYPSELSSGQGQKIAFALALSVRAKYYLLDEPSAFLDKDTMILFKKAILYMQKTYKSGFLIASHDKNFLDSLAQKKYYLHAGEILEFENTNIFELENKGVNFSNFIDFSMCKNYICKDEISNKIAIDPYKISFLYPDDFSKQTFDFTLQKCIIIALRTRKEFVFIRVECGGKILEFALESERFKQEKLSLYQELCLVFNEEAICFLN >NZ_CP044161.1|WP_002790278.1|1395520_1397044_-|anaerobic-C4-dicarboxylate-transporter-DcuC MPIFMICSTLLAVIVVAYYILKKYNPIFVFFLSGIILLIFAFYITGTPIPKAPSREHASFLNVLLDSYAFITATFKSQLSGVGLIIMSVAGFAAYMKHINASAKLAFLANKPLGKIKNKYLILSGTFIVGMALKIVISSYAGLLLLLLACIYPVLISLKIRPITAVCVLSLIALDYGPKDGNSINMADMVGQSDNVMGLFLNYQIYSVIAYVMVIAILIPFYFAWVDKRDKEKGVLNDEVEIPPIIDPKCPTFYILFPWLPVVFLFIAYFFTIKLDVVTANFLSISLVFLVEFARHRNARKLGEDMMVILKAMAEIFISVVSIIIAAGVFAEGIKALGGVNILANAVSNLGTGNFAWFGILLSITVLSFLVYFATVIMGSGIAAFNAFGKLAPDIATKLGVAPITFVLPIEIASCLGRAASPIAGGIIALAGFAKVAPMDIIKRTTPLLLIAMLVNVLVAFYLAQTNPLPKEQNTTKIAVSLNNKYLLFYKNYKFSKLFSAFLVKIS >NZ_CP044161.1|WP_052780603.1|1397353_1397656_+|hypothetical-protein MQNLHEILLQKKIKEIHFKAIASIVCGFLGIIPYLGFLFALASWILFFILLYDLKIYGGAKNLFKNLFIAAGIRFFGILISTSSLFVILEPRTQLQPDLF >NZ_CP044161.1|WP_002792042.1|1398648_1399839_-|molybdopterin-molybdotransferase-MoeA MLMSYEESLKILHSHIKPFARVEKIALTECLGRILAQDIKASKNQPEFPTSAMDGYAIKFEDQDKPLKILGLTPAGTMPQFSVQNGTCVKTFTGSLMSEGSDTLVPVENIRIENDTLFIEKKVPQAFAVRAVGENYKKDEILLKKGTKLSYSEIALLAELGFFHISVFIKPIVGVLSSGSEIKDLGEALENPAQIRSSNHIAIANLAKNLNCDTRVFPLLKDDEKATFSTLESALQSCDILITTGGVSMGDFDFLKKAVKEYEIIIDKADIKPGRHIKIAKANEKFIIALPGFPYSAMVMFNLYAREILNSWLLQPKDYICKAFLQGSYKKKTPYLEFVACNVEFKNGRILANLEGKKEGSSAIINNLNNKAALMVVPKECEILENESLVDIIFMP >NZ_CP044161.1|WP_002787693.1|1399883_1400330_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaE MSEFVLTNNALDIPQIYAKWYEFAKDKNCGALLTFCGIVREEEGIEALSFDIYEPLLKKWFDEWQKRVKEEGVILLFAHSIGDVKTHESSYLAGVLSKQRKLGLKLINEFVEDFKASAPIWKYDVINKQRIYAKERSSKLCGAGLLKS >NZ_CP044161.1|WP_072227346.1|1400330_1400552_-|MoaD/ThiS-family-protein MVKVEFLGPINKENLELEVKNLKELKEILQKDESLKEWLELCAVSLNDEIVFDENTSLKDGDKIALLPPVCGG >NZ_CP044161.1|WP_150966452.1|1400553_1402095_-|multicopper-oxidase-CueO MNRRNFLKFNALTLASIGMAYASPMHDMHSMHKNHSINHDLDTSFINFAPKNLKLLDPKQFPQGEILKALPLLKNESKEKNIFRATIEIKENHIELIKGKKTLFYTYNGLVPAPKIEVFEGDKLEILVKNKLKEATTIHWHGVPVPPDQDGSPHDPILAGEERIYRFEIPQDSAGTYWYHPHPHFTTSKQVFMGLAGAFVIKAKKDALSHLKERDLMISDLRLDENAQIPNNNLNDWLNGREGEFVLINGQFKPKIKLATNERIRIYNATAARYLNLRIQGAKFILVGTDGGLIEKAIYKEELFLSPASRVEVLIDAPKDGEFRLESAYYDRDKMMVEEEPNTLFLASISLKKENLELPKKLKIFKPLEEPKEFKEIIMSEDHMQMHGMMGKSENELKIALASMFLINGKSYDLKRIDLSSKLGVVEDWIVINKSHMDHPFHIHGTQFELISSKLNGKVQKAEFRAFRDTINVRPNEELRLRMKQDFKGLRMYHCHILEHEDLGMMGNLEVKE >NZ_CP044161.1|WP_150966454.1|1402218_1403367_+|carboxynorspermidine-decarboxylase MFYENIQTPAYILEEDKLRRNCEILANVGEKSGAKVLLALKGFAFSGAMKIVGEYLKGCTCSGLWEAKFAKEYMDKEIHTYSPAFKEDEMSEIAHLSHHIVFNSLYQFDKFKSLCTNNSLGLRCNLEFSFAPKELYNPCGKYSRLGILSKDLENFDLSGVEGLHFHALCEESADALEAVLKAFEEKFGKWIGQMKWVNFGGGHHITKKGYDVEKLIALCKNFSDKYSVQVYLEPGEAVGWQSGVLVASVVDIVENEKRIAILDTSSEAHMPDTIIMPYTSEVLNARILATRENEKISDFKENEFAYLLTGNTCLAGDVMGEYAFKEELKRGDRVVFLDQIHYSIVKNTTFNGIRLPNLMLLNSKNELEMVREFSYKDYALRN >NZ_CP044161.1|WP_002829595.1|1403698_1404400_+|molecular-chaperone-TorD-family-protein MDLEKLRLARSLYYQCLGELFVFSFSENRLCNLKAYLEAMQEGLFDESLRTSFEILLRNLQDAQDLQAFYKEYDELFLALKNTIPMTFSYIEEGFENSKALLNVRQILAKSTIRRNEKIFKEAEDSVGFCFVLMSEFLKNKEDELAKALFEKVINQSIDEFLMLIFSNSKAKLYKEIANIAAQFIEFERYCFELEKPTIKPSKKVQNDLSRSEFLRREANKQRRSREKSQGIS >NZ_CP044161.1|WP_002779484.1|1404374_1404566_+|twin-arginine-translocation-signal-domain-containing-protein MKNRREFLKKSAIALGTASLLGGASVAFGQDEERKDLVRGKSKKKEVLYQRSANWEKYYMRAE >NZ_CP044161.1|WP_002784096.1|1404565_1405108_+|molybdopterin-dependent-oxidoreductase MSSMNETIKLNRRSFLKMAALSSLASPLLARSETLREANADELKEAYEGSQKIKSVCTACSVGCGIIAEVQNGVWLRQEIAQDHPVSSGGHCCKGSDMIDMVRSHVRLKYPMKKENGEWKRISYEQALSEIGEKLAAYRKENPESVMFLGSAKLNNEQAYYIRKFAAFFGTNNVDHQARI |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP044161_1 | 1.1|1394746|28|NZ_CP044161|CRISPRCasFinder | 1394746-1394773 | 28 | NZ_LR214939 | Mycoplasma salivarium strain NCTC10113 plasmid 2 | 452329-452356 | 7 | 0.75 |
| NZ_CP044161_1 | 1.1|1394746|28|NZ_CP044161|CRISPRCasFinder | 1394746-1394773 | 28 | MT774404 | CrAssphage cr114_1, complete genome | 25456-25483 | 7 | 0.75 |
1. spacer 1.1|1394746|28|NZ_CP044161|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR214939 (Mycoplasma salivarium strain NCTC10113 plasmid 2) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
tttattgatgaagttttgatttataagg CRISPR spacer attattgatgaagtattgattaattgat Protospacer ************* ****** ** ..
2. spacer 1.1|1394746|28|NZ_CP044161|CRISPRCasFinder matches to MT774404 (CrAssphage cr114_1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
tttattgatgaagttttgatttataagg CRISPR spacer ggtattgattatgttttgatttatattc Protospacer ******* * *************
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
253758 : 261444
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP044161|253758:261444|DBSCAN-SWA ATCACTCATTATTTAGCTCCTTTATTTTACTTATCTGAATTTCACATTGTTTGTATTTATAGAAAAGCATAGAATAAGCATTTAAAATATCTAGTTCATTTTTTGCCTTTGGCTTTTCAAGGGGACTTAATGTTAATAACTCTTGCGGAATTCTAACTTTTTGAATTTCTATTTTGGTTACTACTTGTTGAGTTTGCATCCCACAACCTATCAACGACATCGTTAAAAAGCTTGGTAATATTATTTTCATTGCTTTTATAAATGTATTCTTTAACATATTGCACCCTTTCTTGTACTTGATTTTTTTGATTGTTTGCTTCATTTAAAGCCTTTAATTCTGTTTTATGAATTTGATTTAATTCTTTTAATTTTTCTTGATTATTTTCATTGACTTTTAAAGCCAAAGCTAAATCACTTCGACTTTTTTCTAATTTGGCCTTTGTGCTATCAAGTCTTAGATAAAAATATCCTGCTAAGATTGCCATTAATACTAAAGCGATATAAAGCTTTGCATTTCCAAATAAAAGATTTATCATATTTTGTTTTAGAAGTCTAAGTAAGGTTTTTGTATAATACCCCTAAGGGTTAGCCGTAGGTCTGACCCCCTATGGCTAAATTTTACCCGTGAAAGTGGGTGATTTTTATGATTACATATCACCAAATAATCGTTATAATTATACTCTTATGTATAATTATTGTCAAGGCTTATTAGTCTTGTCCCCTTTTAGGGGATTATTTGGTAACCTACTTAAATTTCTTTCTCCTTTCTATGCTAACTCATTTGTTATTTCTAATTTAATGTCTTCAAGATTTTTACCATACATGAAATCATAAAATTCTTTACAAGCTTGTCTGCTTTGACCGACACTTTCATTATTATTATCTTTAGTAAGCCCCAGCAAGATACAACCTTGTGTGTCTTTGTCAGTGTTTCCCCAGTGTATTAAAATATGTCTATCAAATGGGACTTTTTCATTAAACACATTAATCATTGTATCATCATCTTTTTTTGTGATACTTCTTAAAGTGTTTTCAAATCTTGAAGGAGAATGCCTTTTTAAATCGTAAATGCCTTCTGGTATTCTCAAATCCTTGTTTCTTTCAACTCCTTCTTTATCCTCTTCTAAAGAAAAGCATTCAAATAGCAATTTATCATCATCATTAAAAACTTTAAATTTGCCTATAACACAAGTTTTTCCAGTGTATCTTCTAATGATTTTAATTTTCATTTGTATCCTTTAGTTTTTTATATAATCTATTAGGACTTGAACTTCCTGCATTCATATCTCCTAGCTTAACCAAACCACCTATTTGCAACGCTCTTATTATGATTTCAGAACAAAACCATTTGTCTTCACTATCTTTTGTGAATGTGAAAAAGCCCAAAATTCCTAAAAAATCATATTTTTTTCCTATTTGAGAGTAAAGAAATTCTTTTATTTTTGTCTCATTTATATCATTGATTTCTATAAAATCCCATCTGCCACTGTCTTTAAATTCTTTTATTCTTACTCCTTTATCTCTAGGACTTGAGCTAATCATTAAATTGTCTAAGATTATTTCACAGTGAGAATAGGATTTTAAAAAATCTCCATTTAATCTTTCTTTCCAAGATGAAGTAAAAAAAGCTATTGTTTTATCAAGAAAAGTAGATTTGTCATTTTCTTTAACTTTATAAAATGCAATTTTCATTCGTTTTCCTTTCTTTTATAAATCATTCTTAACTCATCATTTCTTATTTGAGTAAGCTTAACAAGCCTTTCATCCATTCGCATAAGATCTGTTTCTATAGCTTCTAGCTTATCGTTAGTTTTAGAGCAATGCGTTTGTATAAATTTGATTAAGCTATCATTGCTTGCTCTGGATACTGCAATTTGTTCTCTAATAAGAACATTAGTATTTTTGGTTTCACTTATAAGTTCTTTTGTTCTTTCCCCAGCTTCTTTATGTAAAGTTTTATATAAATGCCATGCAATCCCAGCTAAGACAAAAACCATCAATCCTAATAATGCAGATCCACTTAAAGAACCGAGTATAGCACCTTCTTTTATTATATTTTCAGTACTCATTTTTCACTCTCCCATGCAATTAAATTTAATTCTTCTAAAGATGTGGCATTTTTCACTTTATTTCTTAGTTCATCATTTTTAAAAATAATACTTTCCGTATATTTAGCAATATTAACCCCAAATTCTAAAAATTCTTCTTTGTTAAATGTAATGATTTTATTATCTTTATCAATCCAAGCAATATTTTCCAAAGGAGTATTATTGAGATTTGCTAACATTATCTCGCTAACTTTTCCGCTGATATTAATTTTTGCTTCAGTATCAATTTGAAATGTAGTATTTTTAAAAGGCATAAATAAAAGCTTTTCTTCTTTTATTGCTTTTAACTCTTCTAATTTTAATTCTTTTAACTCTTCTAAGGTTTTTTCTTTAATCTCGTAAGAAATAATATAAAGATTACTTTTTTCATCGTAATTTTGAACTTGGTTAAGCTTCTGTGTTTTTTCATTAAAGCTTGGCGCTTCTTCTTCTTTAACTTTAGCAAAACCGAGCTCTTTTAAAAGCCCATCATCGCAAGCACTTAAGAAATAAGTATCTTGTGCATCAATTTCACCTTCTTCGTTCTGTATTTTTACATCTTTTAAAAAAATATCATCATATTTTAAACTTTTATTTTTTAAATCATAAAACATATTTACCCTTTCTTAATTCCAGTATAATGTTAAATTTGCTCTTGGGTTTAATCTATTCCCATCATTTAAGTTCCAACCACCCCTTGCATTTGCACTACCACTTTGATAAGAACTTAGCATTATTTGTAAGTTATTTATATTTCCAAAATTGAATTTTTTCTCTACTTTGATTTTTGCATTGGCAGTGTAATATTTACTTAAAGCATGCAATTCTACACTAGAGTTAAAATTGTTCCATGTGATATGCAAAGTATTTGCAGAAGTTTTGTTAGACATATTTCCAGTCGTCCAAACTTCGCCTAACATAACCACTTCTTTATTATTAATATTTGATGGCAATACCACTGCTTGTTTATAAATCATGTCTAGCTTTAACATATAATTATAATTTGTAACCGAGCCTCCTAAAGATGGAGGTAAATTTAGTGCTATGCCATTATTAGAAAGAAGGAGGCAGTTCATTTTAAGTCCTTACTAATCTTACATTATTCGAAGCTATGCAAAAATAAGCAAAAGTTTCAGTGCCACTAAATCCACTTTGAGCTACTCTAAATTTAAAAGGTGCCGAAAAAGCAGTGATATTTTGAGCATTATTGACAGTGATAGTTCCACTTTTACCTGCTCCACCCCAATTTGCTATACCAATAGCTCCTCTGGCTGTCATTGTTAAGATAAAATGCTGAGCTTGTCTTAAATCTATTTTTGGTACTGTTTGATTTCCTAAGTTCTTAATTCCGCCGCCATAATCCACATACCATTTTCTTGCCAATTGTGCATCTTGTGTGGGATTAGCACCACACATAGGTGGTACTGAGAATGTTTTTACACCTGCTATGATTTGATTTCCGCTTAATGCAACTTTGCTATTTCCGACTGTATCTACATATGATTTGTTTGCTACTTGATTGTTAGCAGTAGGATTAGTTGCTGATACAGGTGGTACTGAGAATGTTTTTACACCTGCTATGATTTGATTTCCGCTTAATGCAACTTTGCTATTTCCGACTGTATCTACATATGATTTGTTTGCTACTTGATTGTTAGCAGTAGGATTAGTTGCTGATACAGGTGGTACTGAGAATGTTTTTACACCTGCTATGGTTTGATTTCCGCTTAATGCAACTTTGCTATTTCCGACTGTATCTACATATGATTTGTTTGCTACTTGATTGTTAGCAGTAGGATTAGTTGCTGATACAGGTGGTACTGAGAATGTTTTTACACCTGCTATGGTTTCATCTCCAGTTTTTGTTACCTTATTGTCTATTTTCGAATTTAATTCCGTTTTTGCACCATTGATCTGCTCGGTTATTTTGGTATCCATAGCTTGAACTTGCGCATTAATATTGGCAATATCATACTCATTAGCTTTTGCATCAATTTCATTAATATATTCATTCTTCTTAGTTTCTAACTCTTGTTTATGCTCTTCCTTTTTATTTGATATTTCAGTTGTAGCTGTATTTTTAGCTTCGTTGACCAAATTTAAGGATGTGTCTTTTAACTGCGAAATTTGACTTGTAGCTGTATTGCTTATAGTTTGTATTTCTTGTAGCGCATCAGATTTTGCACTATCTAGCGCACCTGTTATTTCTGTATTTTTATTATCTAGTAAATCTAAAGCACCATCATATTTTTCTCTTAACTCTTGTAAGCTTTGTGATGCCAAATTTAAATCATTTACAACTTGCTCTAAGTCCGCCATTCTTTACTCCTTATAACTTAATTTAATTATTTTTTTATCAAATAAAACATTTTCGATTGAAAAAATGTGAGAATAAATTCCACCCAAATTATCTTTTATAATTTCATCAAATTTAGCTAGTTTTTCTTCGCTGGCTGTATCTAATCTGCTTATATTTTCATCTGTTTTATTTTGTATATTTGTTATACTTTCTTCACTGAGTGAATTAATAGAAGTTAATTTCTCATTAGTATTAGAATTAAATTCGTTAAGTTTGTTTTGATAATTTGAGTTAAAGTTGTTGATTAAAGTATCTAAATCTGATTTTCCTTGTGCCATGATAAGCTCTATTTGGTTTTTTTGAGCTAATATTCCACTTGTTTCATCTGTAACGCTATTTGACACTTCTTTCATTTCATCAACGATACTTTTTTTAAGTTCTAGCAAATAGCTTTCAATAGCTGTTTTATCATTAGCGAGTTCTGTTCTTGCTACTTCAGCCAATCTTCCTAAATCTTCATTAGCTATTTTAGATCTTTCTATAAAGTTAGCTAAAGCCACATCTACGGTATTTTTATTAGCTTCTACATATGCTTCAATTTGATTTTTTAGAGTCTCAATGCTTGAAATCTTAGCATCTACGCTTGAGTTTGCTTCTGCTAATTTTAAATCAAGTTGCCCTTTTAATCTTTCGCCATAGCTTTCTAAATCTGCTTTTAGATTAGAAATTTCTGTTTTGAAATCGTTGATAATAGCTGTAAAACTTCTCATATCTTCGCTTATTTGTTCGCTTTGTTTTACTGCTTCTCTCAAATCATTTATAATTCCAGTTGATGAGTTTATAAGATCTTCTATTTTTAAAATATCTTCATATTTTCCTACTATTTCATCCTCTAGCTTCTCGCAACGCTTTAGTAGATCAATCATATTTTGATTTAATCTTTGATTTTCAAAAAGAATAGTGTTTATTTTAAGTTTTATTGTTGCTTCAGCATCATTAACTATATTTTGAACTTCTGATTTTACATTTTTAAAATTATTGGTTATAGATATAATCTCATTCTTTGTTGCCACGATATTTGAAACAAGTTTATTTACAAGCTCTATATTAGAATGCAAATCTTCTTTAATACTTTGTGCGTGTTCTAGTTCTTGTAAGATTTGTTGCTTAAGTTCTATGGATAAATCTAAATAGGATTTGGTAAGATTTTTGTTTTCCTCTATTTTTTTAAGACCTGCATTAAAATCAACAGCTATGTTGTAATATTCTTCAAGTTTTATTTTTATAATTTCAAAATTTTTATTAAACTCATTAAGTTCAGGATATTTGTCTTTAACAAAATTAACTCCATTGCTTATATCTTTTTCTGATTTTATAATGTTGTTGTAGATTTCTTCTATATTATTTAAAGTATTTTTTATTTCATTGCTTATTTTTTCAATTTCATTTCTTTTGTTTTTAGTAAAATCAGTATTGCTTTGAGTAAGCTCGCTATTTTTTACAACTAAATTTTTAAGCTCTAAAATTTGATTATAAAAATTATTAACTTGTTCTTTTAGTCCTACAATTTCTTCTATTCTGGTATTATCCAAAGCAGTAGCAACATTTGAAATTCTTGCCAAAACTTGATTTATAATCTCAAGTTTTTCTCTACCTGTTTTTAACTCATTTAAGCTTGTTCCCATTTTTAACCTTCATAATAATCACTATCTTTGATTCTCTTTTCACAAAAGAAAAGCAGATCATCCATGGCTAAAAGCCATTTTTTATCATCTAAATAAGCTATAAAATCAGCACTATTTATACTTTGAGCATAGTCTTTATAACTCAAAGCTCGATTAAATTTATTTGTAAAATTACACTCACAACCATGTTCTTTCATCATCAAGCTCCTTGCCATCGTTAGCTATATACTCATTAATTATCTTGTCACATAATGCCAGAAAGTCTTTTTCTTCGCATCTTGTAATCAAATAACAAACATAATTAATCACAGCAAAACTAAGTGCTTCATCTATCATTAAATGTTCTTTTTCATTGTCAAAATCAGGCTCATCAGGAATAATCAAAAAATGATTATTTCTAACTTGCCTGAAAACTTTTTCGCCTTGTTCTACATTTTTTAAAAGAACACTAGGAACACATTTTGATAAAATATAATAAAATGCTTCCATAAAATAGGCTTTCAAAACTTCATCATCTTCTATCATTTTGTAAGAATTTTTAACTTTAGCGATAATGAGTTTTTTAGCCATAATACAAAGCATTATGCACCTTTTGCTGCTTTTAAAACCGCTTTAGCCTTTGCATTATTTCCACTAGTTAATCCCACGCCTATAGCAAAAGCATCAGCATTTCTTACTTCTAAAGTGCTTTGCGTATAAAATCTTTTTGCTTTTGCAGTAATATCAGTTGGAACATCTTCAATCATAGTAGGAATATAAAGCCCATGTTTCATATACTCAAAATCTCCAGCAATTAAAACATCACCCAAACCATATTTAGGGCTTAATAATCTATGCATATGGAAATTTACCGTTCCAAAATCTGTTTCAAGGCTTACTACTTGTCCTGCTAGTTTTGTTTCATTGCCTAAAATTCTTGTAGCAAATTTATTGATAGCTCCTTTTAAGTCAGCTCCTAAAAAGACATCTTTAGGCGTAACTCCGCTATTCCAAATGGTTTGCAAAATTTGATTAAGTTTATCTTCTGTTAGTTCTGTTGCAGTTCCGCTCCAATCTCCTGTTTCATCAAAAGCTAATACATTTCCACGCTTTCCATCAGCAAAGCTATCTTTTCCTTTAGCGATATAATGAAAAAGTCCAGCCATTTCTCCACTTGTTGCTTCTTGTGCTTGAACATAATCTTTGAAAACTGATTTTTTTACATCACTATCTCTGCCTAGACCAAATAAAGCATATTCCATATCCATTTTATGTTCTTTGGTTTTTTTGCCTATTTGATACTCCATTTCATTTCCACCATATTGATTTGCTTTTAATAAAGCTTTTGATACCATGGCTTCGGTAATGAATATTTGAGTAGCATTTGTAGTTTTTTGAGCTGTGTTTTTTGTTTCCCCTACAAATTTGCTCAATTCCAAATTTGCGTTCTTTTTTGGTTCTTCAAAAGTGTCTGTAAGCCAACTATGGGTTAAAGGATTTGTAACCTTTGAAGTGCCTATTTTATTTAAAATTGGTGTTTCAGTAGCTCCAATTTTAATAATCGTTTCATATATTGATTGTTTTAACTTAACATTTTCTGTTGCGGGTGCTGTATGTCCCATTGAAGGTAAAGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP044161|253758:261444|260409_261444_-|WP_002792660.1|DBSCAN-SWA MALPSMGHTAPATENVKLKQSIYETIIKIGATETPILNKIGTSKVTNPLTHSWLTDTFEEPKKNANLELSKFVGETKNTAQKTTNATQIFITEAMVSKALLKANQYGGNEMEYQIGKKTKEHKMDMEYALFGLGRDSDVKKSVFKDYVQAQEATSGEMAGLFHYIAKGKDSFADGKRGNVLAFDETGDWSGTATELTEDKLNQILQTIWNSGVTPKDVFLGADLKGAINKFATRILGNETKLAGQVVSLETDFGTVNFHMHRLLSPKYGLGDVLIAGDFEYMKHGLYIPTMIEDVPTDITAKAKRFYTQSTLEVRNADAFAIGVGLTSGNNAKAKAVLKAAKGA >NZ_CP044161|253758:261444|254975_255449_-|WP_150966223.1|DBSCAN-SWA MKIAFYKVKENDKSTFLDKTIAFFTSSWKERLNGDFLKSYSHCEIILDNLMISSSPRDKGVRIKEFKDSGRWDFIEINDINETKIKEFLYSQIGKKYDFLGILGFFTFTKDSEDKWFCSEIIIRALQIGGLVKLGDMNAGSSSPNRLYKKLKDTNEN >NZ_CP044161|253758:261444|253909_254293_-|WP_002818614.1|DBSCAN-SWA MINLLFGNAKLYIALVLMAILAGYFYLRLDSTKAKLEKSRSDLALALKVNENNQEKLKELNQIHKTELKALNEANNQKNQVQERVQYVKEYIYKSNENNITKLFNDVVDRLWDANSTSSNQNRNSKS >NZ_CP044161|253758:261444|254524_254986_-|WP_150966221.1|DBSCAN-SWA MKIKIIRRYTGKTCVIGKFKVFNDDDKLLFECFSLEEDKEGVERNKDLRIPEGIYDLKRHSPSRFENTLRSITKKDDDTMINVFNEKVPFDRHILIHWGNTDKDTQGCILLGLTKDNNNESVGQSRQACKEFYDFMYGKNLEDIKLEITNELA >NZ_CP044161|253758:261444|255445_255826_-|WP_002810252.1|DBSCAN-SWA MSTENIIKEGAILGSLSGSALLGLMVFVLAGIAWHLYKTLHKEAGERTKELISETKNTNVLIREQIAVSRASNDSLIKFIQTHCSKTNDKLEAIETDLMRMDERLVKLTQIRNDELRMIYKRKENE >NZ_CP044161|253758:261444|258166_259828_-|WP_150966227.1|DBSCAN-SWA MGTSLNELKTGREKLEIINQVLARISNVATALDNTRIEEIVGLKEQVNNFYNQILELKNLVVKNSELTQSNTDFTKNKRNEIEKISNEIKNTLNNIEEIYNNIIKSEKDISNGVNFVKDKYPELNEFNKNFEIIKIKLEEYYNIAVDFNAGLKKIEENKNLTKSYLDLSIELKQQILQELEHAQSIKEDLHSNIELVNKLVSNIVATKNEIISITNNFKNVKSEVQNIVNDAEATIKLKINTILFENQRLNQNMIDLLKRCEKLEDEIVGKYEDILKIEDLINSSTGIINDLREAVKQSEQISEDMRSFTAIINDFKTEISNLKADLESYGERLKGQLDLKLAEANSSVDAKISSIETLKNQIEAYVEANKNTVDVALANFIERSKIANEDLGRLAEVARTELANDKTAIESYLLELKKSIVDEMKEVSNSVTDETSGILAQKNQIELIMAQGKSDLDTLINNFNSNYQNKLNEFNSNTNEKLTSINSLSEESITNIQNKTDENISRLDTASEEKLAKFDEIIKDNLGGIYSHIFSIENVLFDKKIIKLSYKE >NZ_CP044161|253758:261444|256921_258163_-|WP_150966225.1|DBSCAN-SWA MADLEQVVNDLNLASQSLQELREKYDGALDLLDNKNTEITGALDSAKSDALQEIQTISNTATSQISQLKDTSLNLVNEAKNTATTEISNKKEEHKQELETKKNEYINEIDAKANEYDIANINAQVQAMDTKITEQINGAKTELNSKIDNKVTKTGDETIAGVKTFSVPPVSATNPTANNQVANKSYVDTVGNSKVALSGNQTIAGVKTFSVPPVSATNPTANNQVANKSYVDTVGNSKVALSGNQIIAGVKTFSVPPVSATNPTANNQVANKSYVDTVGNSKVALSGNQIIAGVKTFSVPPMCGANPTQDAQLARKWYVDYGGGIKNLGNQTVPKIDLRQAQHFILTMTARGAIGIANWGGAGKSGTITVNNAQNITAFSAPFKFRVAQSGFSGTETFAYFCIASNNVRLVRT >NZ_CP044161|253758:261444|259830_260025_-|WP_002782214.1|DBSCAN-SWA MKEHGCECNFTNKFNRALSYKDYAQSINSADFIAYLDDKKWLLAMDDLLFFCEKRIKDSDYYEG >NZ_CP044161|253758:261444|255822_256458_-|WP_038850912.1|DBSCAN-SWA MFYDLKNKSLKYDDIFLKDVKIQNEEGEIDAQDTYFLSACDDGLLKELGFAKVKEEEAPSFNEKTQKLNQVQNYDEKSNLYIISYEIKEKTLEELKELKLEELKAIKEEKLLFMPFKNTTFQIDTEAKINISGKVSEIMLANLNNTPLENIAWIDKDNKIITFNKEEFLEFGVNIAKYTESIIFKNDELRNKVKNATSLEELNLIAWESEK >NZ_CP044161|253758:261444|256470_256920_-|WP_038850909.1|DBSCAN-SWA MNCLLLSNNGIALNLPPSLGGSVTNYNYMLKLDMIYKQAVVLPSNINNKEVVMLGEVWTTGNMSNKTSANTLHITWNNFNSSVELHALSKYYTANAKIKVEKKFNFGNINNLQIMLSSYQSGSANARGGWNLNDGNRLNPRANLTLYWN >NZ_CP044161|253758:261444|253758_253956_-|WP_002796174.1|DBSCAN-SWA MQTQQVVTKIEIQKVRIPQELLTLSPLEKPKAKNELDILNAYSMLFYKYKQCEIQISKIKELNNE >NZ_CP044161|253758:261444|260005_260410_-|WP_002784034.1|DBSCAN-SWA MLCIMAKKLIIAKVKNSYKMIEDDEVLKAYFMEAFYYILSKCVPSVLLKNVEQGEKVFRQVRNNHFLIIPDEPDFDNEKEHLMIDEALSFAVINYVCYLITRCEEKDFLALCDKIINEYIANDGKELDDERTWL |
12 | Campylobacter_phage(87.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1366785 : 1374329
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP044161|1366785:1374329|DBSCAN-SWA TTTAGGTAATATTTTGTATTTTTTGTAAAAGTTCATTGGCTTTTTCTTGATTTGCCTTTAAAGTGCTTAGGATTTCTTCTACTTCGCGCAAGGTTTTTTCTTCTTTGGAATTTGGATTTTTAGCACTTATATCATAGTTTCTTTCTTCAAGTTCTTTTATGCTAACTAGATAAGAATGAGGAGTGATTTTTCTTTCCTTATAGATTTTTAAAAATTCCTCAAAATGTGCGTATTCTAAAGGCTTGTTTTTGGTGAGTTTAAAAGGTGGTATAAGCTCATAATAATACACCTTATCATCTTCACCACAAATACTTCTTTTTCCTTTTGAGAAAAAAAGCACATTGGTTTTTACCGCACTATAAGGTAAAAATACCCCGCTTGGCAAGCTTAAAACGCATTCGAGATTGAAATTTTCTAGCAAGTCTTTTTTCACGCTTACAAAGGCATTTGAATTTTGAAAAAGCACGCCCTCAGGCACTATTATAGCACATCTTCCGTTGTTGTTTAAAGATTTTAAGATATGTTGTAAAAATAAAAGCTCAGTAGCGTTTGATTTTACGGGAAAGTTGTTTTGAATTTGTTCTTTTTCCTTGCCTCCAAAGGGTGGATTTGCCAAAATCACTTCATATTTTTCGCTTTGGGTTATGTCTGTGATTTTTTTATTTAGAGTGTTTGTTTTGATGATATTTGGAGATTTTACCTCGTGCAAGATCATATTCATCACGCCCATTGCGTAGCTTAGTGGGGTTTTTTCTTTGCCAAATAATGCATCATTTTGTAAAAATTCAAGCTCTTCTACGCTTAAATTTGCTTTTTTGTTTTTATTCCTGTCTTCATACAAGATATGCAAAAAGCTTTCTACTAAAAACCCACAACTCCCACAAGCAGGATCATAAATCCTTTCTTTTGCTTTAGGATCTATCACTTCTACCATAGCTCTTATCAAAGGGCGTGGCGTGTAAAATTCTCCACTATTTCCCCCATCGCTTCCCATATCTTTTAAAAGCTTTTCATAAACTTCACCTAAGGCAAATACATCACTTTCTTTACTAAAGCTTAGCTCATCGACTAAATTTATAACCTCTCTTAAGGTGTGTCCGTTGGCTATGCGATTGTCTATAAACTCGAAAATTCCGCCTATTTTATACTCTATGCTTTTGAAATTTTCATTATCTTTAAAGCTTTTTAGATATGCAAAAAGCTCGTTATTTACAAAGCTAAGCAAATCATCTCCGCTTAAAGCATTTTTTACATCAAGTTTGCCATCTTTTTTAGGCGCTGCCCAAACACTCCAGCTAAATTTTTCTTGCAAAATGCTTTTATAATCTTTGCCATCTAAAAACGCTAAATCTTTTAAATTTGTCTCATAATCATCTAAAAATTTTAAAAAAAGTATCCAGCCAATCTGCTCTGTATAGTGCATAGCACCACTTATGCCATCATCTCTTCTTAGAATATCTGTGATTTTATCGATTTTGTTTTGCATTTTCTCCCTTTAAAGCTTTTAAAATAGTTTTGTCAAAGTCTAGTTTTATTTTTTATTTTTGTTTTTGAATTACCGAGATTTCCTCGGTAGTTGCGATTTATATTTTTAAACTGCAATATGTTAAAAAAATCAAAAATTTTTAACATATCAAGCCAATGTGTTAAAATTTGGCAAATTTTTTAACATTATAATTCTCCCTTAAAAGCTTTATTAAGCAAGGATTGCTTAAGCTCTTCATAATCTTTTAGTTCTTTGGTATAAAGCTCTTTTAAAGCCTTTGCCTTTTCAAAGATAAAATCTAAATGTTTTGTGATTGTTTCTTGCTTTTTGAGTGAGGGTAGGGGGATTTGTAAATTTTTTATATAGGTTTGACTTATGTTAGGTTGAGCTCCGCCGAAAGAATCTTTGATGATTTTATCTCTTAGAAAAAATAGAAAATAAAAAAGAAAATTTTTTAAGGATTTAATATTTTATCATTATTATATAAAAAAAGTAAAAATGGATTAAAAATTAAAAATCTTGCAAACAAAAATATATTCCATATGGTTTTTAAAATTTGTCTTCCCACTATTAAAAGCTTTGTATGGGATCTTATAGGAAATAGGTTTACCAAAAGATTCTAAAATTGCTTGAATAGTTTCTAGGCTTATTTTTGTATTACTTCTTACATTTGCACTATTTGTATTGTTGTAAGTTACTACAAAAAATCTTGCGATCTTGCTTAAATCCTCACATAGCTCACGAAATACAGATTCTGCCCCTACTTTACAATATTCACTCATATTTTCAGGTTCTCTTTTTAGGGTTATGCCATAAAGTTTCGGTTTGTCATTGAGCGTAATGGTTTCTAGCAAATGATAAAATCTGCTATATTGCCTTGAGTTGTAAGGTGGATCAATGAAAGCTACATCTATTTTTCTTTTTTCTTTGATAAAATCTTTAACAAGCTTATTTGAATCTTCTTTAAAAATTTCTACTTTAGATTTTGTAGTAATTGGTCGGATAAGCTCAAAAATAAATTTATCTTTTAATGCTATATTTTTACGATAGGCATCATAATGTCCCACTGTGTTTGCTACTTTATCAAGACTATATAAAAGGCTTGAAAGTAAAATATAATACTCTTTTGTGTTTATTTTTTTACTCTCTTTTAAATTTTCTATTTCTTCTCGTATTGTGCCTATTTTTATGGAATCTTTTAAGCTAAAAAACTTATCTCCAAAATTTAAAGAATAATAATTTTGCTCTTTAGAATCTATTGCGTTAAAAGCATTAACTAGCTTTTCCAATGTGTCTTTACTAAAAGCTTCTTGCTTAAAAAATCCTTGATAAATTACATAGTTTGAATGTAAAAAATCATTAATTATAAAATGATTGAAATATGGATTTTTTAAAAAATATTCACCCACAACTCCAGTACCACCAAAGACATCAAAAAAGCTTAAATCATTATATTTTGTGTAATCAAAGCCTTGCTTCAAAGTGTAATCTATAGAGTCTAAAAGCTTGGTTTTGGCGCCTGTATAACGACGCGATGAAATGTTAAACATTAATTAAACCTTTTATAAAAGGAGCTATTTCATTGTTATACCATTTGCTTCCCCAAGTATTTTTACTACCCAAAAGACTATAAAAATACTCTAATAACTTATCATAAGTGTGGTTTGTTTCTAAAATTATTTTTAAATCATCTACGCTTAAAGGTAGAATTTTCATTCCATAAATAAAGCTTGTATTATTTTCATAATAACATGTAAGCCTACTTCTAAAATCATTTAATACATTTTTATCTAAATATGGAGCAATAAAAATACCATAGCTTTGGGCTTGCACTTTGGTTTCCAAGCTTAGTAATAAATTCCCTAGATGCCTTGAAACACTCTCCATTTCTGCTCTTCTTTGATTTGTTTTTTCTGTTAAAGTTACTTCTATCATTAAAGAATGGTCTTTGTAATGATATATAAAATCTGCATTACCACCTACCGCATGACTTTTTGGCAACATTTCAGAATCTAGACTTAATCCAGCTTCTAAGATTCTATTCTTATTAAAATTATCGATATAGCACCAAGCAATCGCAATAATATATTCAAAAATAGTAGGTATAGTGGCTTCTGTAGTTACCAAATTAAAGATTTTTTCATCATTTTTTCTGTCATTAAAAAGGGGTAATATCTCACAAATTTTATCCTTTGAGAATCTCTCTTTTAGCAAAATATCTAATTTTTGATTATCTAAATTTGTTTTATAATTGCTTAAATCTTGCAGGGTTATAATATCAAATTCTTTTAGTAAAAGCTTCATTTCATTATCATTAAAATAATTGCTTAGCATATCTTTTGAAATAGTATTTTGTGCTATTGTGTTTAAAATGACTTCGCTTTTAGAATGCTTTAAAATAATCTTAAAAATAATGCTAACACTTACACAATCATCACTAAAATCAAAAATGCCTGTGAGTCTTAAATGTCTCTTATTTAAATCTAAATAATCATCTAAGTTCGATTGTATTTTGCTTGTGGCAATAAATCTAAAAAACCTCTTGCCAAAGTCTAAAATATCACCTTCACAAAAATGTGATAATTGCTCGATTTTGTCATCTATTTTTATTTTATAACAGATATAGCCTAAATAAAGTTCTTTAAAGCGTTTATATTTTGTATCTTTTGATTTTAAAAAGTTACTTAAAATAGCCTTGTCTTTTCTTTGTCTAAAATCTAAAAAGACCTTAAGTGCTTCGACAATATTCTTTGCGCTTTGATCCCCCTTTGCTGTTATGAAATATTTTATATCTATAACATCTTCTTGCAAATCTTTTAAAAAAGCCTCTAAATCATCTTTAAATTTTTGATTATTATCTAAAATTTCATTAATCATATTTCCATTTTTGGCACACTCACAAAAAGATTCTATATTTTTAAAATTATCAATAAGTGGTAGTAAATAAAAAATATCTCTGCTTAATGAGCCATTAAAATAACGAAAAACTTTTATATATTTTAAAAATAAGTCTTTTACATTATCTTTTTGAAACAAGAAACTAGATTTAAGAAAAAATAGTGAGATTAAATCAATTTGTAGAAAATCGTTTATTTCTTTGTAGCTTTGATTTTCTATTAAGCTTAAAAGTTCATATCCTTGTTCTGTAATTAGCTTTTCTTTTCTTTTGATAAGTCCATAATTTTCAAGTGGAGCTGATTTAACCCTAGCGTCTTTTGTGCCAAGATGTGTAGTTTTATTTTTTGATTTTAAAAGATTATGTTGTTCTAAAAGTTCTAAATAACGAATCTGCAACTCCGAATCATTACTCCAAACATCATTTTTAGAAGCATTTTTAAAAAGATCATCAAATAAGATAAGTTGTGTTTCAAAATTATAAAGCAAATTTTTTACTCTATTGCTTGTATTGCCAAAATAACTATATTTTATATCCATTTTTTAACTCAATAATTTGTAATTAACACTTCTTTAGATTCTGTTCTCTTGGTTTGATAGTTGCAGTTTTTATAATGAAAGTCCAAATTATGCACTTTTAGATGCGGATTAGAATCTAGCCATTTTTGAAGCAGTGTATGATCTACTCCCTTATGAAAAAGCACATTAGAGAATGCAAATTTGATATTTTTAGAATCTAGTTTTTGCATAAAATCATATAACATAAGTTCTATACTCTCACTCCATAATCCATTTTCATTATAACTTGCACAACTTAACAAATAAGGTGGATCAATATATACAAAATCATCACACTTAATGTTTGAAATATCAAAATCAACAAAATCCAAAGAGCTAAATTCTATATTTTTATTTTGCAATGCATTTATAAATTTTTTTAATTTTTCTTGCATATTTTTATTAAAATCCCTTTTACCACAAGGAAGATTGAAATCCCCTTTAGAATTAAATCGCATTTGATTATTAAAGCTAAAAATAAGCAATACAAAAAGTTCGAGCTGATTTTTATTTTTATTATAAGATTCTTTTAGCTTGGCAAATCCAGCTTTATTATAGCTTGATAGCCCATTGGCGCTATTGCAATTATAATATTCATAGCCTAGAATATCACTCTTTGAGAGATTGAATTTATCTATAATAAAAAAAATAGAATCTAAAAGATTCTCATAGTTTTGTTTTTGAAAGAGTCTAAAAATATCAATAAGTTCGCTTTGTTTGTCATTGAGAATAATTTTTTTAGCATTGATATTAATTCCAACACTCCCACCACCACAAAAAAGGTCGATAATTGTATTTATAGTTTTGGGAAACAGTGGTAAAATGCTTCGTAATAGTTTAAATTTTGAGCCGGTATAGTTAAATGGAGGATTTATAAAATCCATTTTATATACATGACACTCAAACGAACCTTTCACATAAGTCAAATACTACCCTTTTTTAGTTTTTGTTATTATATAGCACAAATGTTGATAGTCGTATTAAAGACTTATTTTTTATCACTTTTTCTATATTTTATCTTGACTTATAGCTACTCTAATGTTTTATAATTATAAAAAACCAAAAAAGGAGCAAAAATGCAATACAAAATTTTAGAAAACAATCGCATTGCAAGTAAAGGCTATGCAATGCTTAGCAAGGATGCGAAATTCACACCCTTTGAATTTAGCCGCCACGCTATTGGCGATAATGATATTTTGATTAAAATCTTATATGCAGGCATTTGTCATAGCGATATTCACACCGCAAGAAGCGAGTGGGGAGAAGCTGTGTATCCTTGTGTGCCAGGGCATGAGATAGCAGGAGAAGTGATCGCAGTGGGTAAAAATGTGAGCAAATTTAAAGTAGGGGATTATGCAGGGGTTGGCTGTATGGTAAATTCATGCGGAGAATGCGAAGCATGCAAAAAGTCCCAAGAGCAATTTTGCGAAAAAGGACAAACCATCTATACTTACAATAGCTGCGATATTTTTCATGATAATGAAAACACCTATGGAGGCTACTCAAACAACATAGTCGTAAGTGAAAAATTTGCTGTTTGTGTGCCAAAAGATGCACCGATGGAAAAAGTCGCGCCTTTGCTTTGTGCAGGAATTACCACTTATTCTCCGCTTAAATTTTCAAACATTAAAGCTGGCTCAAGCGTAGCAGTAGCAGGATTTGGCGGACTTGGTATGATGGCGGTTAAATATGCTGTGAAAATGGGTGCAAAAGTAAGTGTTTTTGCTAGAAATGAAAACAAAAAAGCCGATGCTTTGGCTATGGGCGTGAGTTCTTTTTATACAAGCACAGATAAAAATGCTGTAAAAGAACGCTTTGATCTTATTATCTCTACCATCCCAACTCCTTATGATCCTAGTGCTTATATGGATTTGCTTAAATTTGGCGGTGAAATGGCGATAGTGGGCTTGCCACCTCACGAAGTTGCTCCAAGTATCAGCGTGATAACCTTTGTGCATAAAGCGGGTAAAAAAGTCTATGGTTCACTAATCGGCGGAATCGCAGAAACTCAAGAAATGCTTGATTTTTCTTTAAAGCATAAAATTTACCCTGAAACCGAACTCATCACTTCAAAAGATATCGACAAAGCTTATGAAAATCTCACTTCAGGAAAAGCAAAATTCCGCTATGTGATCGATATGAGAGATGAGTAATTAATACTTATCAAAAACTATATCGCTAATGTCAAAACCTTTTTGCTTAGCGATATCTAAAAGTTTATCTATCTCTTTTTTATCGATGATTTTTCTAGATAAAATCCAAAGATACTCTTTATCAGGACTTCCAACGACAGCGACTTCATAGTTTGTGTCTATAAAGAGAATTTCATAATTTGTTTTATTAAATAAATTCATAAAAATGCTAAATTTCACCGATAAAGCTCTTGGGGATTTTACTTTGGCTTTGCCTTGTACTTGCGAAACCTCTCCATCTTTTTTAACACAGATATTTTTTATATTTACAACAGGGGTAGAGCCTTCGTATTCTAGTTGATATTCAGCTTTAGACTGAACGCAAGATTTTTGAAAAAATGCAGGTTTTCTAGCCATTTCAAGCCAAGTTCCCATATATTTTTCTAAATTAACATCTCCTATAAGTTCTATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP044161|1366785:1374329|1372799_1373876_+|WP_057993662.1|DBSCAN-SWA MQYKILENNRIASKGYAMLSKDAKFTPFEFSRHAIGDNDILIKILYAGICHSDIHTARSEWGEAVYPCVPGHEIAGEVIAVGKNVSKFKVGDYAGVGCMVNSCGECEACKKSQEQFCEKGQTIYTYNSCDIFHDNENTYGGYSNNIVVSEKFAVCVPKDAPMEKVAPLLCAGITTYSPLKFSNIKAGSSVAVAGFGGLGMMAVKYAVKMGAKVSVFARNENKKADALAMGVSSFYTSTDKNAVKERFDLIISTIPTPYDPSAYMDLLKFGGEMAIVGLPPHEVAPSISVITFVHKAGKKVYGSLIGGIAETQEMLDFSLKHKIYPETELITSKDIDKAYENLTSGKAKFRYVIDMRDE >NZ_CP044161|1366785:1374329|1371713_1372649_-|WP_002781061.1|DBSCAN-SWA MTYVKGSFECHVYKMDFINPPFNYTGSKFKLLRSILPLFPKTINTIIDLFCGGGSVGININAKKIILNDKQSELIDIFRLFQKQNYENLLDSIFFIIDKFNLSKSDILGYEYYNCNSANGLSSYNKAGFAKLKESYNKNKNQLELFVLLIFSFNNQMRFNSKGDFNLPCGKRDFNKNMQEKLKKFINALQNKNIEFSSLDFVDFDISNIKCDDFVYIDPPYLLSCASYNENGLWSESIELMLYDFMQKLDSKNIKFAFSNVLFHKGVDHTLLQKWLDSNPHLKVHNLDFHYKNCNYQTKRTESKEVLITNY >NZ_CP044161|1366785:1374329|1369812_1371705_-|WP_002781062.1|DBSCAN-SWA MDIKYSYFGNTSNRVKNLLYNFETQLILFDDLFKNASKNDVWSNDSELQIRYLELLEQHNLLKSKNKTTHLGTKDARVKSAPLENYGLIKRKEKLITEQGYELLSLIENQSYKEINDFLQIDLISLFFLKSSFLFQKDNVKDLFLKYIKVFRYFNGSLSRDIFYLLPLIDNFKNIESFCECAKNGNMINEILDNNQKFKDDLEAFLKDLQEDVIDIKYFITAKGDQSAKNIVEALKVFLDFRQRKDKAILSNFLKSKDTKYKRFKELYLGYICYKIKIDDKIEQLSHFCEGDILDFGKRFFRFIATSKIQSNLDDYLDLNKRHLRLTGIFDFSDDCVSVSIIFKIILKHSKSEVILNTIAQNTISKDMLSNYFNDNEMKLLLKEFDIITLQDLSNYKTNLDNQKLDILLKERFSKDKICEILPLFNDRKNDEKIFNLVTTEATIPTIFEYIIAIAWCYIDNFNKNRILEAGLSLDSEMLPKSHAVGGNADFIYHYKDHSLMIEVTLTEKTNQRRAEMESVSRHLGNLLLSLETKVQAQSYGIFIAPYLDKNVLNDFRSRLTCYYENNTSFIYGMKILPLSVDDLKIILETNHTYDKLLEYFYSLLGSKNTWGSKWYNNEIAPFIKGLINV >NZ_CP044161|1366785:1374329|1368773_1369820_-|WP_002781063.1|DBSCAN-SWA MFNISSRRYTGAKTKLLDSIDYTLKQGFDYTKYNDLSFFDVFGGTGVVGEYFLKNPYFNHFIINDFLHSNYVIYQGFFKQEAFSKDTLEKLVNAFNAIDSKEQNYYSLNFGDKFFSLKDSIKIGTIREEIENLKESKKINTKEYYILLSSLLYSLDKVANTVGHYDAYRKNIALKDKFIFELIRPITTKSKVEIFKEDSNKLVKDFIKEKRKIDVAFIDPPYNSRQYSRFYHLLETITLNDKPKLYGITLKREPENMSEYCKVGAESVFRELCEDLSKIARFFVVTYNNTNSANVRSNTKISLETIQAILESFGKPISYKIPYKAFNSGKTNFKNHMEYIFVCKIFNF >NZ_CP044161|1366785:1374329|1373876_1374329_-|WP_002778497.1|DBSCAN-SWA MIELIGDVNLEKYMGTWLEMARKPAFFQKSCVQSKAEYQLEYEGSTPVVNIKNICVKKDGEVSQVQGKAKVKSPRALSVKFSIFMNLFNKTNYEILFIDTNYEVAVVGSPDKEYLWILSRKIIDKKEIDKLLDIAKQKGFDISDIVFDKY >NZ_CP044161|1366785:1374329|1366785_1368270_-|WP_150966448.1|DBSCAN-SWA MQNKIDKITDILRRDDGISGAMHYTEQIGWILFLKFLDDYETNLKDLAFLDGKDYKSILQEKFSWSVWAAPKKDGKLDVKNALSGDDLLSFVNNELFAYLKSFKDNENFKSIEYKIGGIFEFIDNRIANGHTLREVINLVDELSFSKESDVFALGEVYEKLLKDMGSDGGNSGEFYTPRPLIRAMVEVIDPKAKERIYDPACGSCGFLVESFLHILYEDRNKNKKANLSVEELEFLQNDALFGKEKTPLSYAMGVMNMILHEVKSPNIIKTNTLNKKITDITQSEKYEVILANPPFGGKEKEQIQNNFPVKSNATELLFLQHILKSLNNNGRCAIIVPEGVLFQNSNAFVSVKKDLLENFNLECVLSLPSGVFLPYSAVKTNVLFFSKGKRSICGEDDKVYYYELIPPFKLTKNKPLEYAHFEEFLKIYKERKITPHSYLVSIKELEERNYDISAKNPNSKEEKTLREVEEILSTLKANQEKANELLQKIQNIT |
6 | Acinetobacter_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DBSCAN-SWA_3 |
1491567 : 1496471
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP044161|1491567:1496471|DBSCAN-SWA AATGGCTATAGAATTTGATATACAAGAATCAAAAATTTTAAAAGGAGTGTATATCGTAACTCCAAATAAATTTAGAGATTTAAGAGGTGAGATTTGGACGGCTTTTACAAGTGGGACTATAGATAAGCTTTTACCAAATGGATTAAAATTTATACATGATAAATTTATACACTCTAAACACAATGTTATTCGTGGTATTCATGGTGATATAAAAACTTACAAATTGGCTACTTGTGTTTATGGAGAAGTGCATCAGGTGGTTGTTGATTGTAGGAAAGATTCTCCTACTTATTTAAAATATGAAAAATTTATTATAAATCAAGATAATCAGCAAATTATCCTAGTGCCAGCAGGTTTTGGAAATGCTCATTATGTAAGTAGTGAAAGTGCTGTATATTATTACAAATGTGCTTATTTAGGAGAGTATGTGGATGCTGATGATCAATTTACTTATGCTTGGAATGATGAGAGAATTGGTATAAATTGGCCAACAAATTCGCCTATTCTTTCAGATCGAGATGTTTTGGCGGTAAATAAGGGTTAAAATATGGAAAAAAATTCTAGAATTTATATAGCAGGTCATAGGGGTTCGGCAGGAAGTGCCATAATGGAAAAATTACAAAATTTAGGTTTTGATAATTTAATTTATGCGACTCGAGAAGAGTTGGATTTACTTGATTTTGATGCTGTTAAAAATTTTTTCGATGATAATCAGCCAGAATATGTTTTTTTTGCGGCAGCTAAAATGAGTGCTTTAGGAGTTAGGGCTCCAGCTGATATTTTATATGAAAATCTAGCAATACAGAATAATATTTTTCATAACTCATATCTTTCAAATGTTAAAAAATTAATTTTTTTTGGTAGTTCTTGGATGTATCCACAATATACCCAAAATCCCATAAAAGAAGATAGTTTGCTTACTGGTGAATTAGAATATAATGCTGAGCCATATGCTTTGGCAAAAATTGCTGGAGTTAGAATGTGTGAATTTTATAATTTGCAATATAATACCAATTTTATTTCGGTTGCTTTAACTAATTTGTATGGAAAAACAGCTGATTTTAATTTAAAAACAGCTAGAGTGCTACCAGTAATGCTTAGAAAATTTCATTTGGCAAAACTACTTAATGAAAAGAAATATGGCGATATTTTATTGGATCTTAACTTACAAGATGAAAACGAAGCAATAAGCTATCTTAAGACAAACGGAATTTATGAGGAATATATAGAACTTTGGGGGACGGGCAAAACTAGAAGAGAGTTTATACATTCAGATGATTTAGTGGATGCTTGTATGTATATAATGAAACATGTTAATTTCAGTGATTTGTCTAAAAATAATATAAAAAATACGCATATTAATATAGGTACCGGAAGTGATTTGTCTATTGCCGAGCTAGCTCTTTTGATAAAAAAAATTACGCAATATAAGGGCGAAATAAAATTTGATATAAGCAAGCCAGATAGTCCTATGAATAGATTGCTTGATTGCTCTAAAATTCATTCTTTAGGATGGAAACACAAGATAGAGCTTGAAGAGGGTGTTAAAATAATGTATGAAGATTATCTTCAAAATAGTAAAAGAGTTTTAAGAGGTTAAAGTGAAAAAAATAGCATTAATTACTGGTTTTACAGGTCAAGTTGGCTCGCAAATGGCAGATTTTTTACTAGAAAATACAGACTATGATGTTATAGGCATGATGCGTTGGCAAGAGCCAATGGATAATATCTATCATTTAAGCGACAGGATAAACAAAAAAGATAGGATCAGCATTTTTTATGCTGATTTAAACGATTACTCAAGTATTCAAAAGCTTTTTGAAAGCAAAAGACCTGATGTGATCTTTCATCTAGCCGCACAGTCTTACCCAAAAACTTCTTTTGATATACCTATAGAAACTCTACAGACAAATATCATAGGCACAGCAAATATTTTAGAAAATATTAGATTATTAAAAGCTAAAGATGGTTACGATCCTGTGGTGCATGTTTGCTCTTCTAGTGAAGTTTATGGCAGGGCAAAAGTTGGTGTCAAGCTAAATGAAGATACGACTTTTCACGGTGCAAGCCCTTATAGTATAAGTAAAATTGGCACGGATTATTTAGGAAGATTTTACGGTGAGGCCTATGGTATAAAAACATATGTTACCAGAATGGGAACTCATAGTGGTCCAAGGCGCTCTGATGTATTTTTTGAAAGCACTGTTGCAAAGCAGATTGCCTTGATCGAAGCAGGGTATCAAGAGCCTGTTGTAAAAGTAGGAAACTTATCTAGTGTAAGAACCTTTCAGGATTGTCGTGATGCTATAAGAGCTTATTATCTACTTTCATTAGAAAGTGAAAAAGGCAAGGTTCCTTGTGGAGAAGCTTTTAACATAGCCGGTGAAGAAGCCTTTAAACTTCCTGAAGTTATTGATATACTTTTAGGTTTTTCTACAAGAAAAGATATCAAAGTGGAAGAAGATGAAGAAAGATTACGTCCTATTGATGCAGACTATCAAATGTTTGACAATACTAAAATCAAAAGTTATATCAATTGGAAGCCAGAAATTCCAGCTAGAAAAATGTTTGAGGATTTATTAAATCATTGGAGAAAAGAAATTTCCATGGGCAGAATCCCACTTAATAGGTAGCAGATCATGATAATCCGTTCTCAAACACCTTTGCGTTTAGGTTTAGCGGGGGGGGGTACTGATATAAATTTATATTGTGATCAATATACAGGTTATGTTTTAAATGCGACAGTATCTCTTTATGTGCATTGTACTTTGACAGAAAGAAATGATCAAAAAATCATTTTTGACTCTTCTGATACTGGCATAAAAGTAGAGTATCAAAGTAAAGAGTTTTTAGAAAATGATGGTAAATTAGATCTTTACAAAGCGATTTATAATCGCTTGATAAAAGACTATATTAAAAGACCTTTAAGTTTTTCTTTGCACACTTATTCAGATGTACCAAGTGGTAGTGGACTAGGGGGTAGTTCTACTTTGGTAGTAGGTATCATCAAAGCATTTGCAGAATGGCTCAATCTTCCTTTAGGTGAGTATGAAATCGCTCGTTTGGCTTATGAGATAGAAAGGGAAGATATGGCTATAGTAGGGGGTGCACAAGATCAATACGCTGCGACTTTTGGTGGATTTAATTTTATGGAATTTTATGATCAAAAAAGAGTTATAGTCAATCCTTTACGCATTAAAAACTGGATAGCAAGTGAACTTGAAGCTAGGGTTTTGCTTTATTTTACAAATATCACTAGAGAAGCAAAGGACATAGAGGAGCATAAAAAGGGAAAGCTAGGAGATGAAAACTCACTTAATGCCATGCATGCGATAAAACAAGATGCGTTAGATATGAAAGAGGCGTTATTTAGAGCTGATTTTGAAAAAATAGCACAAATTTTAGGTAAATCTTGGCAATCAAAAAAGATTATTTCTGAAATTGTTAGCAATGATGAGCTTGAAAGGATTTATCATTTAGCTATGGAAAATGGTGCTTATAGTGGCAAGACAAGCGGAGCAGGTGCTGGAGGATTTATGTTTTTTATGGTAGATCCTGTGAAAAAATATAAGCTTAAAAAAATTTTAAATGAACAGCAAGGGTATGTACAGGAATTTTATTTTACAAAAGAGGGGGCAAAATCATGGAAAATTTAAACCTATATATAAAATCTCATTTTAGTGATTCGATTGATGTTAAAGATAAAATATTAAATGATGATAATATAATCAATTTGATCAAAGAAGTATCTTTAAAAGTTATCAGTGCTTACAAAAATGGCCATAAAACCTTACTAGCAGGCAATGGAGGAAGCGCAGCTGATGCACAGCACATAGCAGGGGAGTTTGTAAGTAGATTTTACTTTGATAGACCAGGTATTGCAAGTATAGCTTTAACAACGGATACTAGTATATTAACAGCTATTGGCAATGATTATGGCTATGAAAATTTATTTGCTAGACAGGTGCAAGCTCAAGGTGTGAGTGGGGATGTTTTTATAGGAATTTCTACAAGTGGAAATAGTAAAAACATCTTAAAAGCTTTGGATGTTTGTAAAGAAAAAGGAATTTTAAGCATAGGTTTAACCGGAGCTAGTGGCGGAGCTATGAATGAACTTTGTGATTATTGTATCAAAGTGCCATCATCTTGTACGCCAAGAATTCAAGAAGCACATATTTTGATAGGGCATATTATCTGTGCTATAGTAGAAGAAGAGCTTTTTGGCAAGGGGTTTGATTGCAAGCTATAGTTTTAGCTGGGGGTCTTGGCACTAGGCTTAGAAGTGTAGTGCAAGATCTTCCAAAGCCTATGGCACCGATCAATGGAAAACCCTTTTTAGCTTTTGTTTTAGAGTATTTGAAAAAGCAAGGAATTACTGAGATTATTCTAAGTGTTTCGTATAAATATGAACTGATTCAAGAGTATTTTAAAGATGAATTTCATGGTATGAAAATACACTATAACATCGAAAAAGAGCTTTTGGGTACAGGTGGAGCTATAAAAGATGCTTTAAAATTGGTAAAAAATGAAGCCTATGTTGTAAATGGAGATACTTTTTTTGACATTGATTTAAAAAAGCTTGTTTTAAACAGTAGTAAAATTTGTATAGCTTTAAAACAAATGCAAAATTTTGATAGATATGGTACGGTCAATGTTGATGAGCAAGGTATTGTGACATCTTTTGAAGAAAAGGTGTTTAAAAAGCAGGGTTTAATCAATGGTGGTATATACTTACTCAAAAAAGATATTTTTGATGAATTTAGTTTAGAGAAGAAATTTTCTTTTGAAGAGTTCTTGCAAGAAAACTATAAATTATTAAAAATACAAACCCAAATTTTTGATGATTATTTTATAGATATTGGCATACCTGAAGATTATATAAAATTTATTAAGTTAAGAAAGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP044161|1491567:1496471|1492113_1493166_+|WP_002830390.1|DBSCAN-SWA MEKNSRIYIAGHRGSAGSAIMEKLQNLGFDNLIYATREELDLLDFDAVKNFFDDNQPEYVFFAAAKMSALGVRAPADILYENLAIQNNIFHNSYLSNVKKLIFFGSSWMYPQYTQNPIKEDSLLTGELEYNAEPYALAKIAGVRMCEFYNLQYNTNFISVALTNLYGKTADFNLKTARVLPVMLRKFHLAKLLNEKKYGDILLDLNLQDENEAISYLKTNGIYEEYIELWGTGKTRREFIHSDDLVDACMYIMKHVNFSDLSKNNIKNTHINIGTGSDLSIAELALLIKKITQYKGEIKFDISKPDSPMNRLLDCSKIHSLGWKHKIELEEGVKIMYEDYLQNSKRVLRG >NZ_CP044161|1491567:1496471|1494202_1495222_+|WP_139850248.1|DBSCAN-SWA MMIIRSQTPLRLGLAGGGTDINLYCDQYTGYVLNATVSLYVHCTLTERNDQKIIFDSSDTGIKVEYQSKEFLENDGKLDLYKAIYNRLIKDYIKRPLSFSLHTYSDVPSGSGLGGSSTLVVGIIKAFAEWLNLPLGEYEIARLAYEIEREDMAIVGGAQDQYAATFGGFNFMEFYDQKRVIVNPLRIKNWIASELEARVLLYFTNITREAKDIEEHKKGKLGDENSLNAMHAIKQDALDMKEALFRADFEKIAQILGKSWQSKKIISEIVSNDELERIYHLAMENGAYSGKTSGAGAGGFMFFMVDPVKKYKLKKILNEQQGYVQEFYFTKEGAKSWKI >NZ_CP044161|1491567:1496471|1495802_1496471_+|WP_002830419.1|DBSCAN-SWA MQAIVLAGGLGTRLRSVVQDLPKPMAPINGKPFLAFVLEYLKKQGITEIILSVSYKYELIQEYFKDEFHGMKIHYNIEKELLGTGGAIKDALKLVKNEAYVVNGDTFFDIDLKKLVLNSSKICIALKQMQNFDRYGTVNVDEQGIVTSFEEKVFKKQGLINGGIYLLKKDIFDEFSLEKKFSFEEFLQENYKLLKIQTQIFDDYFIDIGIPEDYIKFIKLRK >NZ_CP044161|1491567:1496471|1495209_1495815_+|WP_002830417.1|DBSCAN-SWA MENLNLYIKSHFSDSIDVKDKILNDDNIINLIKEVSLKVISAYKNGHKTLLAGNGGSAADAQHIAGEFVSRFYFDRPGIASIALTTDTSILTAIGNDYGYENLFARQVQAQGVSGDVFIGISTSGNSKNILKALDVCKEKGILSIGLTGASGGAMNELCDYCIKVPSSCTPRIQEAHILIGHIICAIVEEELFGKGFDCKL >NZ_CP044161|1491567:1496471|1491567_1492110_+|WP_002830392.1|DBSCAN-SWA MAIEFDIQESKILKGVYIVTPNKFRDLRGEIWTAFTSGTIDKLLPNGLKFIHDKFIHSKHNVIRGIHGDIKTYKLATCVYGEVHQVVVDCRKDSPTYLKYEKFIINQDNQQIILVPAGFGNAHYVSSESAVYYYKCAYLGEYVDADDQFTYAWNDERIGINWPTNSPILSDRDVLAVNKG >NZ_CP044161|1491567:1496471|1493167_1494199_+|WP_002830388.1|DBSCAN-SWA MKKIALITGFTGQVGSQMADFLLENTDYDVIGMMRWQEPMDNIYHLSDRINKKDRISIFYADLNDYSSIQKLFESKRPDVIFHLAAQSYPKTSFDIPIETLQTNIIGTANILENIRLLKAKDGYDPVVHVCSSSEVYGRAKVGVKLNEDTTFHGASPYSISKIGTDYLGRFYGEAYGIKTYVTRMGTHSGPRRSDVFFESTVAKQIALIEAGYQEPVVKVGNLSSVRTFQDCRDAIRAYYLLSLESEKGKVPCGEAFNIAGEEAFKLPEVIDILLGFSTRKDIKVEEDEERLRPIDADYQMFDNTKIKSYINWKPEIPARKMFEDLLNHWRKEISMGRIPLNR |
6 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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