Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP044163 | Campylobacter coli strain AR-0418 chromosome, complete genome | 0 crisprs | cas14j | 0 | 0 | 3 | 0 |
1. NZ_CP044163
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
442040 : 448127
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP044163|442040:448127|DBSCAN-SWA TTCATTCCTTTGTTTTTTTAAACAATTTATAATCTTGTGGTACCCCAATATCTATAAAATAATCATCAAAAATTTGGGTTTGTATTTTTAATGATTTATAGTTTTCTTGCAAAAATTCTTCAAAAGAAAATTTCTTCTCTAAACTAAATTCATCAAAAATATCTTTTTTGAGTAAGTATATACCACCGTTGATTAAACCCTGCTTTTTAAATACCTTTTCTTCAAAAGATGTCACAATACCTTGCTCATCAACATTGACTGTACCATATCTATCAAAATTTTGCATTTGTTTTAAAGCTATGCAAATTTTACTACCATTTAAAACAAGCTTTTTTAAATCAATGTCAAAAAAAGTATCTCCATTTACAACATAGACTTCATTTTTTACCAATTTTAAAGCATCTTTTATAGCTCCACCTGTACCTAAAAGCTCTTTTTCGACGTTATAGCGTATTTTCATACCTTCAAATTCATCTTTAAAATACTCTTGGATGAGTTCATATTTATACGAAACACTTAGAATAATCTCAGTAATTCCTTGCTTTTTCAAATACTCTAAAACAAAAGCTAAAAAGGGTTTTCCATTGATCGGCGCCATAGGCTTTGGAAGATCTTGTACTACGCTTCTAAGCCTAGTGCCAAGACCCCCAGCTAAAACTATAGCTTGCAATCAAATCCCTTGCCAAAAAGCTCTTCTTCTACTATAGCACAGATAATATGCCCTATCAAAATATGTGCTTCTTGAATTCTTGGCGTACAAGATGATGGCACTTTGATACAATAATCACAAAGTTCATTCATAGCTCCGCCACTAGCTCCGGTTAAACCTATGCTTAAAATTCCTTTTTCTTTGCAAACCTCCAAAGCTTTTAAGATGTTTTTACTATTTCCACTTGTAGAAATTCCTATAAAAACATCCCCACTCGCACTTTGAGCTTGTACTTGTCTAGCAAATAAATTTTCATAGCCATAATCATTGCCAATAGCTGTTAATATACTCGTATCCGTTGTTAAAGCTATACTTGCAATACCTGGTCTATCAAAGTAAAATCTACTTACAAACTCCCCTGCTATGTGCTGTGCATCAGCTGCGCTTCCTCCATTGCCTGCTAGTAAGGTTTTATGGCCATTTTTGTAAGCGCTGATAACTTTTAAAGATGCTTCTTTGATCAAATTGATCATATTATCATCATTTAATATTTTATCTTTAACATCAATCGAATCGCTAAAATGAGATTTTATATATAGGTTTAAATTTTCCATGATTTTGCCCCCTCTTTTGTAAAATAAAATTCCTGTACATAGCCTTGCTGTTCATTTAAAATTTTTCTAAGCTTATATTTTTTCACAGGATCTACCATAAAAAACATAAATCCTCCAGCACCTGCTCCGCTTGTCTTGCCACTATAAGCACCATTTTCCATAGCTAAATGATAAATCCTTTCAAGCTCATCATTGCTAACAATTTCAGAAATAATCTTTTTTGATTGCCAAGATTTACCTAAAATTTGTGCTATTTTTTCAAAATCAGCTCTAAATAACGCCTCTTTCATATCTAACGCATCTTGTTTTATCGCATGCATGGCATTAAGTGAGTTTTCATCTCCTAGCTTTCCCTTTTTATGCTCTTCTATGTCCTTTGCTTCTCTAGTGATATTTGTAAAATAAAGCAAAACCCTAGCTTCAAGCTCACTTGCTATCCAGTTTTTAATGCGTAGAGGATTGACTATAACTCTTTTTTGATCATAAAATTCCATAAAATTAAATCCACCAAAAGTCGCAGCGTATTGATCTTGTGCGCCTCCTACTATAGCCATATCTTCCCTTTCTATCTCATAAGCCAAACGAGCGATTTCATACTCACCTAAAGGAAGATTGAGCCACTCAGCAAATGCTTTGATGATACCTACTACCAAAGTAGAACTACCCCCTAGTCCACTACCACTTGGTACATCTGAATAAGTATGCAAAGAAAAACTTAAAGGTCTTTTAACATAGTCTTTTATCAAGCGATTATAAATCGCTTTGTAAAGATCTAATTTGCCATCATTTTCTAAAAACTCTTTACTTTGATACTCTACTCTTATGCCAGTATCAGAAGAATCAAAAACGATTTTTTGATCATTTCTTTCTGTCAAAGTACAATGCACATAAAGAGATACTGTCGCATTTAAAACATAACCTGTGTATTGATCACAATATAAATTTATATCAGTACCCCCACCGGCCAAACCTAAACGCAAAGGTGTTTGAGAACGGATTATCATGATCTGCTACCTATTAAGTGGGATTCTGCCCATGGAGATTTCTTTTCTCCAATGATTTAGTAAATCTTCAAACATTTTTTTAGTTGGAATTTCTGGCTTCCAATCGATATAACTTTTTATTTTGGTATTGTCAAACATTTGATAGTCTGCATCAATAGGACGTAATCTTTCTTCATCTTGCTCCACTTTGATATCTTTTCTTGTAGAAAAACCTAAAAGTATATCAATAACTTCAGGAAGTTTAAAGGCTTCTTCACCGGCTATGTTAAAAGCTTCGCCGCAAGGAACATTGCCTTTTTCACTTTCTAATGAAAGTAGATAATAAGCTCTTATAGCATCACGACAATCCTGAAAGGTTCTTACACTGGATAAATTTCCTACTTTTACAACAGGCTCTTGATACCCTGCTTCTATCAAGGCAATCTGCTTTGCAACAGTGCTTTCAAAAAATACATCAGAACGCCTTGGGCCACTATGAGTTCCCATTCTGGTAACATATGTTTTTATACCATAGGCCTCACCGTAAAATCTTCCTAAATAGTCCGTGCCAATTTTACTTATACTATAAGGGCTTGCACCATGAAAAGTCGTATCTTCATTTAGCTTGACACCCACTTTTGCCCTACCATAAACTTCACTAGAAGAGCAAACATGTACCACAGGATCATAGCCATCTTTAGCTTTTAATAATCTAATATTTTCTAAAATATTTGCTGTGCCTATGATGTTCGTCTGTAGAGTTTCTATAGGTATATCAAAAGAGGTTTTTGGATAAGACTGTGCGGCTAGATGAAAGATCACATCAGGTCTTTTGCTTTCAAAAAGCTTTTGAATACTTGAGTAATCGTTTAAATCAGCATAAAAAATGCTGATTCTATCTTTTTTATTTATCCTGTCGCTTAAATGATAGATATTATCCATTGGCTCTTGCCAACGCATCATGCCTATAACATCATAGTCTGTATTTTCTAGTAAAAAATCTGCCATTTGCGAGCCAACTTGCCCTGTAAAACCAGTAATTAACGCTGTTTTTTTCATAGACTATCCAATACTTTTTTAAACAAACTAATTTGTTCACTAATACTAAATTGGTGATTACCCACAAAAAATCCTTTTTCATGAATATATTTTGCATTTTTTAATTCCTGATGAATTTCATAGTCAAAATACTTAATTACCTCATTTTGTGTAAAATCTCCAGTAGCTATAGGACGGTATTCTATATCATTTTCTTCTAATTTTTTAATAATATCTTTTCTTTGTAATTTCGAATTTGGTCTAATTACCAAAGAAAATCCAAACCACGAACTACTTCCAATTTCCTTTTGCATAATAAATTCAGGGTGGTTTTTAAAATACTCACAAAATAATTTAGCATTTTCTCTACGATGTTTTAAAAACATAGGTAATTTTTTAAGTTGTTCTATGCCTATAGCTCCACTCATTTCCACTGGACGCACATTATACCCTGGCAATACAAAACGAAATGACTCGCTAAACCAATCATCGCTTTTATTAGCTACTAAATTTTCTTTTGGAAGATTTCTAGTCCAACCATGCGCTCTTAAACAAAGAAGTATATGATACAACTCATCATCATCTGTTACCACAAATCCACCTTCCATTGTAGCCATATGATGAGAAAAGAATGTTGAAAAAGTTCCCATAATACCAAAAGTTCCGGCTTGGCTACCTTTATACTCTGCACCCATTGATTCGCAATTATCTTCTAGCAAGATAATATCTTTTCCCTTAATAAGATCATTAATTACATCAAAATCATTAGGATTTCCCAATAAATTCACAATCATGATCATTTTTGTTTTATCACTAATAGCACTATTTAAAGCATCTAAATCATAATTTAACGTCTCTAGATCTATATCAACGAATTTTAGCTTTAAACCATACTGATAAAGCGGATAATAAGTGGTGCTCCATGATACTGCGGGAACTATAACTTCATCTCCTTTTTTTAATTTAGGGTTTTTTGTATAAAATAAGGCTGCCGTTGCTATCAAATTTGCAGTTGAACCCGAGCTTGTCATAACCGCATACTTGGAACCTGTAAATTTAGCAAAATCTTTTTCAAATTCAGCCACCTTTGTACCCATAGTAAACATATCACTTTTGATAACATCTTGTATTGCTTGCAATTCTTTTTCATCCCAAGTTGATGAAGCTAACGTATATTTTTTCATCTATTTTACTCCTTTTTTTATATAGTCTTGATACATTCTTGTCAAGCCATCTCTTAACTCTATCTTAGAATACCATCCCAATGTTCTAATTTTATTAATATCTACGACCTTTCTGATAGTTCCATCGTTTTCTATTTTATTTTCAAAAATCACTTCTCCTTTGTATTCAAGAATATCTTTAATCATATAAGCTAATTCCTTAATTGATATATCCACTCCCGTTCCAATATTAACATGAGAATTACCTTTATGTTGCCTTTCTTGTTCAATCACATCATTAAAAGAAACATTTTTCATAATATAAACACTAGCCTCTGCTAAATCATCACAATGCAAAAACTCTCTTCGTGAATTACCAGTTCCTAGTAACCTTACAGTTTTATTATCAATATTGATTTTATTTAGTATATCCAAAGCAGTTTCCTTTGTTTTAACCCCTAAATCATCAATTAATTCTCTATAACAACCTTCGTTTAATAATTTTGCTAAATAAATTTTTCTAAAAATAGCAGCTTGAACATGAGCTGTGTATAAATCAAAATTATCATTTGAACCATAGATACTAACAGGCATAATCGAGATATAATCAACATCATACTGTAGACTATAAAATTCACACATTTTCAGTCCTGCTATTTTAGCAATAGCATATGGTTCATTATTATACTGTAATTTCCCATCAAATAAACTATTTTCCTTAATAGGTAATTGAGCTTCTTCGGGGTAAATACAAATACTCCCTAAATAGATAAGTTTTTTTACTCCATTTAAGTAAGAGTAATGAATTACATTATTTTGCATAGTAATGTTATTATATAAAAATTCTGCACGCTGACTTAACTGAGCGAGCATTCCTCCTACTTTTGCCGCGCAAAAAAATACATATTCGGGTTTCTCTTTTTCAAAAAAACATTTCACCGCTTCTTGATCCATTAAATCCAACTCTTGATGGGTTTTGCAAACAATATTACAAAAACCATCTTGTTGCAATTTCTTTAAAATTGCAGATCCTATTAAACCCGAGTGACCTGCAACATATATTTTAGATTGTTTATTCATATTTTAGCCTTTTGTGTGATCATTAGTTGTCGCATCAATATCTCTATCTGATAATATAGGGTTGCTTGTCGGCCAATTTATAGCAATTCTACTATCATTCCATGCATATGTAAACTGATCTTTGGCATCAACATATTCACCATCATAAGCCCACTTGTAATAATATAAAGCGTCACTTTTTGAGCTAACATACTGTGCATTTCCAAAATACGGAGGTATTAGAATCAATTTTCTGTTATTTTCATTAATAATAAATCTCTCCCACTTTAGATAAGTAGGAGAGTCTTTTCTGCAATCAACCACTACTTGATGCACTTCACCATATGCGCAAGTTACTAATTTCCAAGACTTATGATCACCGTGTATACCTCTTAATACATTATGTTTAGATAATGTAAATTTATCTAGCACAAATTTCAAATTTGAAGGTAATAAATTTTCTATATCTTTGCTAGAAAAAACAGACCAAATTTCTCCTCTTAAATCCTTAAAACTATTTGGTGTTATTATAAAAACACCTTTTAGAATTCTTGATTCTTGTATATCAAATTCAATTGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP044163|442040:448127|443289_444309_-|WP_088567398.1|DBSCAN-SWA MMIIRSQTPLRLGLAGGGTDINLYCDQYTGYVLNATVSLYVHCTLTERNDQKIVFDSSDTGIRVEYQSKEFLENDGKLDLYKAIYNRLIKDYVKRPLSFSLHTYSDVPSGSGLGGSSTLVVGIIKAFAEWLNLPLGEYEIARLAYEIEREDMAIVGGAQDQYAATFGGFNFMEFYDQKRVIVNPLRIKNWIASELEARVLLYFTNITREAKDIEEHKKGKLGDENSLNAMHAIKQDALDMKEALFRADFEKIAQILGKSWQSKKIISEIVSNDELERIYHLAMENGAYSGKTSGAGAGGFMFFMVDPVKKYKLRKILNEQQGYVQEFYFTKEGAKSWKI >NZ_CP044163|442040:448127|447569_448127_-|WP_052781505.1|DBSCAN-SWA MAIEFDIQESRILKGVFIITPNSFKDLRGEIWSVFSSKDIENLLPSNLKFVLDKFTLSKHNVLRGIHGDHKSWKLVTCAYGEVHQVVVDCRKDSPTYLKWERFIINENNRKLILIPPYFGNAQYVSSKSDALYYYKWAYDGEYVDAKDQFTYAWNDSRIAINWPTSNPILSDRDIDATTNDHTKG >NZ_CP044163|442040:448127|446507_447566_-|WP_058001889.1|DBSCAN-SWA MNKQSKIYVAGHSGLIGSAILKKLQQDGFCNIVCKTHQELDLMDQEAVKCFFEKEKPEYVFFCAAKVGGMLAQLSQRAEFLYNNITMQNNVIHYSYLNGVKKLIYLGSICIYPEEAQLPIKENSLFDGKLQYNNEPYAIAKIAGLKMCEFYSLQYDVDYISIMPVSIYGSNDNFDLYTAHVQAAIFRKIYLAKLLNEGCYRELIDDLGVKTKETALDILNKINIDNKTVRLLGTGNSRREFLHCDDLAEASVYIMKNVSFNDVIEQERQHKGNSHVNIGTGVDISIKELAYMIKDILEYKGEVIFENKIENDGTIRKVVDINKIRTLGWYSKIELRDGLTRMYQDYIKKGVK >NZ_CP044163|442040:448127|442696_443302_-|WP_002836597.1|DBSCAN-SWA MENLNLYIKSHFSDSIDVKDKILNDDNMINLIKEASLKVISAYKNGHKTLLAGNGGSAADAQHIAGEFVSRFYFDRPGIASIALTTDTSILTAIGNDYGYENLFARQVQAQSASGDVFIGISTSGNSKNILKALEVCKEKGILSIGLTGASGGAMNELCDYCIKVPSSCTPRIQEAHILIGHIICAIVEEELFGKGFDCKL >NZ_CP044163|442040:448127|444312_445344_-|WP_002836601.1|DBSCAN-SWA MKKTALITGFTGQVGSQMADFLLENTDYDVIGMMRWQEPMDNIYHLSDRINKKDRISIFYADLNDYSSIQKLFESKRPDVIFHLAAQSYPKTSFDIPIETLQTNIIGTANILENIRLLKAKDGYDPVVHVCSSSEVYGRAKVGVKLNEDTTFHGASPYSISKIGTDYLGRFYGEAYGIKTYVTRMGTHSGPRRSDVFFESTVAKQIALIEAGYQEPVVKVGNLSSVRTFQDCRDAIRAYYLLSLESEKGNVPCGEAFNIAGEEAFKLPEVIDILLGFSTRKDIKVEQDEERLRPIDADYQMFDNTKIKSYIDWKPEIPTKKMFEDLLNHWRKEISMGRIPLNR >NZ_CP044163|442040:448127|442040_442709_-|WP_151036023.1|DBSCAN-SWA MQAIVLAGGLGTRLRSVVQDLPKPMAPINGKPFLAFVLEYLKKQGITEIILSVSYKYELIQEYFKDEFEGMKIRYNVEKELLGTGGAIKDALKLVKNEVYVVNGDTFFDIDLKKLVLNGSKICIALKQMQNFDRYGTVNVDEQGIVTSFEEKVFKKQGLINGGIYLLKKDIFDEFSLEKKFSFEEFLQENYKSLKIQTQIFDDYFIDIGVPQDYKLFKKTKE >NZ_CP044163|442040:448127|445340_446507_-|WP_052781507.1|DBSCAN-SWA MKKYTLASSTWDEKELQAIQDVIKSDMFTMGTKVAEFEKDFAKFTGSKYAVMTSSGSTANLIATAALFYTKNPKLKKGDEVIVPAVSWSTTYYPLYQYGLKLKFVDIDLETLNYDLDALNSAISDKTKMIMIVNLLGNPNDFDVINDLIKGKDIILLEDNCESMGAEYKGSQAGTFGIMGTFSTFFSHHMATMEGGFVVTDDDELYHILLCLRAHGWTRNLPKENLVANKSDDWFSESFRFVLPGYNVRPVEMSGAIGIEQLKKLPMFLKHRRENAKLFCEYFKNHPEFIMQKEIGSSSWFGFSLVIRPNSKLQRKDIIKKLEENDIEYRPIATGDFTQNEVIKYFDYEIHQELKNAKYIHEKGFFVGNHQFSISEQISLFKKVLDSL |
7 | Synechococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
992685 : 1061432
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP044163|992685:1061432|DBSCAN-SWA AATGCCTAGAAAATGCAGTTTTTGTAATGAAGTGGAAAATCCACAAAGAAGAATTTTAGCCAATGAAAACGATGATGCATTTATTTGTGAGTATTGTGTTGAGGGGGCTTATAGTATTATCTATGGGGAAGAAAAAGAATTTAAAGAGCCAAAACATGAACATGGCGTTGATTTTAAAGATATTACCCCAAAAGAATTAAAAGCTTATTTGGATCGCTATGTCATAGGGCAAGATAGGGCTAAAAAAGTTTTTAGTGTAGGGGTTTATAATCACTATAAAAGACTTTTCAAATCTGAACTTCAAGATGATGATGTGGAGCTTTTTAAATCCAATATCCTTCTTATAGGTCCTACAGGTAGTGGAAAAACCTTACTTGCTCAAACTTTAGCTAAATTTTTGGATGTACCTATAGCCATTTGCGATGCGACTTCTTTAACCGAAGCAGGTTATGTGGGCGAGGATGTAGAAAATATTTTAACCCGTCTTTTGCAAGCTGCTGATGGAGATGTAGAAAGAGCTCAAAAGGGCATAGTATTTATCGATGAGATTGATAAAATAGCTAGAATGAGTGAAAATCGCTCTATCACTCGTGATGTGAGTGGAGAAGGCGTGCAGCAAGCTTTGCTTAAGATTATAGAAGGAAGCTTGGTTAATATTCCGCCTAAAGGAGGAAGAAAACATCCTAATCAAGATTTTATTCAAATTGATACTTCAAATATTTTATTTGTTTGTGGTGGTGCATTTGATGGCTTAGAAACTATACTTAAGAGAAAATTAGGCGATAAGGTCGTAGGCTTTTTCGATAATGAAAAAGAAAATAGCAAAGCTTTGCTTGAAAAGATAGAGCCTGATGATTTAGTGCATTTTGGCCTTATACCTGAACTTATAGGGCGCTTACATGTTATAACTTCTTTAAACGAGCTTAATGAAGATGATATGGTAAGAATTTTGACCGAGCCAAAAAATGCTATCGTAAAGCAATATCAAAAACTTTTTGCTATTGATGGCGTGAACTTAAAATTTGAAGATGATGCTTTAAGAGAAATTGCAAAATTAGCCTTAGAACGAAAAACGGGCGCTAGAGGACTTAGAAGTATTATAGAAGAAATAATGGTGGATTTGATGTTTGAGTTACCAGAATATAAAAATTATGATATCGTTATCACCAAAGAAGTGGTAAGAGATGGTGCAAAAGCGTTATTAATCAAAAAGAAAATAAGCTAAAAAAGGGATAAAAATGATTTTAGATCAACTTATAGGATTTTTTTCAAGCGATATGGGTATAGACTTAGGAACTGCTAATACTCTTGTTTTGGTAAAAGATAAGGGCATAGTTATTAATGAGCCTTCTGTTGTGGCTGTAGAGAGAGAAAAGTATGGTTCTAGGGCTAAAATTTTAGCTGTAGGAAAAGAAGCTAAAGATATGGTTGGTAAAACCCCAGGAAATATCGAAGCTATTCGCCCGATGAAAGATGGAGTTATTGCTGATTTTGATATGACAGAAAAAATGATTCGTTACTTTATAGAAAAAACTCACCGCAGAAAAAGTTTTTTAAGACCTAGAATCATCATTTCAGTCCCTTATGGCTTAACTCAAGTTGAAAGAAAGGCTGTTAGAGAAAGTGCCTTAAGTGCAGGTGCAAGAGAAGTATTTTTGATAGAAGAACCTATGGCAGCAGCTATTGGGGCAAATTTACCTATACAAGAACCTAAAGGAAATTTAGTTGTAGATATAGGGGGTGGAACAACTGAAATTGGTGTGATTTCACTAGGTGGGCTTGTTATTTCAAAGTCTATTCGTACTGCAGGTGATAAGCTTGATACAAGTATAGTAAATTATGTCAAAGAAAAATACAATCTTATCATTGGCGAAAGAACGGGTGAGGAGATTAAGATCGCTATTGGTTCAGCTATCCAGCTTCCAAAAGAACTTTCTATGGTTGTAAAGGGGCGCGATCAAGTGAGTGGACTTTTAAGTCGTATCGAGCTTACAAGTGAAGATGTTAGAGAGGCGATGAGGGAATATTTAAAAGAAATAGCAGATGCTTTAAAAATGGTACTTGAAATGATGCCACCTGATCTTGCAAGTGATATAGTAGAAAATGGTGTTGTCTTAACAGGTGGTGGAGCATTGATTCGTGGACTTGATAAATATTTAAGTGAAATTGTTCGCTTGCCAGTATATATTGCTGATGAACCACTTTTAGCCGTGGCTAAGGGAACGGGTAAAGCTTTGGAGGAAATTTCACTATTACAACAATTGACGAATGAAGAATAAGCTTATCTTTGTCCTTGTTTTATTTTTTTTAGTTTTTATATCTTTTTACTATGGGGGCTTGGTAAAAAAAAATGTTCTTTTGGTAAATGATACGGTGTTAGAAAAATTTTATGGAATTAAGGATACTATCACCGAATTTTTTTCCAAGCATTTTGATCAAGTAGATCAAATTGAACAATTAAAAGCAAGAAATCAAGAGCTAGAATATGCAGCTGTATTAACTACAAGCTTTGCAAACCAATTAAATCGTATTTTAGAGGATAAAAATTCAACAAGATACTTACCTCAAGTTTCTTTAGTAAGAGTTATTTCTTATGTAAAATTAAATGATTATAAAAGATTGTGGCTTGATTTTGCCAAAGTATCTCCTAATAAAAATAAAGGTTTGATTCATCAAGGATACACTATAGGCATTGCGATCAATAAAGATGGCAGAGCTATGGCACTTTTACAGGGTGATGAACAATGTGTTTTTTCTGTATATATAGGTAAAAATAAAATTCCTGGCCTTATCCAAGGCGAAGATGATAAACTTAAGGTTAAATTTATACCCAAATGGGCAAAAATTAATATAGGAGATGAGATTTTAACAAGTGGCCTTGACAATATCTTTTTTTCAGATGTTCCAGTGGGTATTGTAAGTGCAATCAAAGATGAGGATATGTATCAAAGTGTTGAAGTAAAACCTTATGCTAATATCAATATCCCTGCCTATCTTTATATAATCGATAGTTTATAAATCAACACTTAGACTCTTTTTAAATAAATTTCCATATGGGCTTTTTTTATCTAGGATATCACAGCTTTCTTTAATGTCTAAATTGTCTTTTAAACATTGTAATAAAATTTCCATGATAAAACATGCATCTTGAGTTAAAATATGCGCAGGACATTTTTTTGCATGGGTATAATGCTCGTGAATTTTATGAACTAGGGTTGAGTTTTTAATCTCGACTAATAGCATTTCCAAAGGGGCTTTAAAAAACATTGTATTTTCTTTAGCATTGATAGAAAGATAAAACACATCAAGCCCATAAATTTTTTTATCATAAGAATCAAAGAAATATAAAGATTTGTTAAGATTATCTTTAAAGGTATTAATCATGAGTTCTAAAATTTGAATTTTTTGTTCTTTTGTATAAAAATTTCCTATAGGCGAAAAACAAAATTCAAGTAAAGACTTGATAGAATACCACTCGCTTGCATTAAAAGAATGTGCTCTCATTTTTTCACCCCTTTTTATGCGATATATTCTAGCCTCTTCGCTGTCGTTATTTTGATATACTAAAGGCACGATAAAATCCCTATAAGCGGGATTTGGAAAAGCAGGGTGTAATATAAGTGAACCTTCATTTTCATTTTCAAAAATATATTTTAATCCTCCGATGTATCCTTCGTCAATGATGCGAATTTCATTATTTTCTATTTGATTTAAGAGTGTATAAAATTCGTTTTCATTGCTTTCCCATATTTTAAAAGGATAGCGAAAAAATTCACAAATTTTTTCTTTACTTTTGGTATCGAGTTCTTTTACTGTGTCATTTTCTATAAATTTAGCAAGTGTTCTACGATCTTTGCCCAAAATTGTTGCAAATTTGCTCAAACTTAAGCCTGATTTTTCCAAAATTACTTGTGTTCTATCTTTAGAATTTAACATTGTCTCACTCTTAAAAATTATTTTTGTTACTTTTTGATACAAACATATTTTTTTCATTATTTTTTATATTTTCTAATTATTAAAAATATAGGTAAATATATATACAAAAATTAAAATTTTGTTCAAAAAATATACAAAATTTATTTTTTTAGCTACAAAATCACACAATTAAACCAAAAAATTGGCATTTTATTTTTCAAACAAAAACTCTATAATGCAAATTCAACTTATCAAGAAAGGATGGATTATGGGTATTGTTTATGAGCAGACTTATCGAGAATCTCTTCAAAATCCTGAAGCATTTTGGGCTGAAGCAGCTAAAAAAGTGCATTGGTATAATGAATGGGATAGGGTGCTTGATGATAGCGATGGGCATTACAGATGGTTTGTTGGCGGGTGTATGAATACTTGTTATAATGCACTTGATTTACATGTACACAATGGCAGGGGCGATCAATTAGCACTGATTTATGATTCTCCTGTTACGGATACAAAGAAAAAATATACTTATAAGCAACTTCGTGATCGTGTTGCAAAAGTAGCCGGAATTTTAGCAAATAAGGGCGTGGTTAAAGGGGATCGCGTTGTTATTTATATGCCAATGATACCTGAAGCACTTATAGCCATGCTTGCTTGTGCTAGGCTTGGAGCTATTCATAGTGTTGTATTTGGAGGCTTTGCAGCACATGAACTTGCTACGAGGATAGAAGATGCTAAACCTAGAATGATTATTAGTGCAAGTTGCGGGATAGAAGTAAGTAGCATTATCGAGTATAAACCTATTTTAGATGAGGCTATTAAAAAATGTACTCATAAGCCTACGACTTGTTTGATTTGGCAACGCCCACAATATAGAGCAAATATGCTTCCTTGGAGGGATATTGATTGGGAGCTTGAAGAGGAAAAAACTCGGGGTGTAGATCCTGTACCTGTTTTAGCTACCGATCCGCTTTATATACTTTATACTTCAGGCACCACAGGTTCTCCAAAAGGAGTAATCCGCTCTAATGGAGGTCATTCTGTGGCTATGAAATGGTCGATGGATAATATTTATAATGCTAAAG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MKAIDEFNAKNSCSIPYFIADSFINYYKQDDGRWLMANKKPLKCWKRALNSTWLPKLANKYKNKDKQKALASWLEEEF |
80 | Campylobacter_phage(37.5%) | plate,protease,integrase,transposase,tRNA,tail | attL 1020808:1020829|attR 1055722:1055743 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1632813 : 1698765
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP044163|1632813:1698765|DBSCAN-SWA 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69 | Campylobacter_phage(46.88%) | plate,tRNA,terminase,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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