Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP041726 | Staphylococcus lugdunensis strain SL118 chromosome, complete genome | 6 crisprs | csa3,DEDDh,cas3,DinG,WYL | 3 | 3 | 9 | 0 |
1. NZ_CP041726
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP041726_1 | 77342-77627 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041726_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP041726_1
>1.1|77406|57|NZ_CP041726|PILER-CR GTGCCAAGAGGCCAAGATGGACATTCAGTCACTGTAAAAGAAAGTCATAAAGACCAA >1.2|77527|56|NZ_CP041726|PILER-CR GAAAAAGGTCGCGATGGACGTGACGGTCAAGATGGCAAATCAATTACAATTGTGAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041726_1
The CRISPR arrays of NZ_CP041726_1 >merge|NZ_CP041726|1|77342-77627|PILER-CR TCAAAGAGTAACTAAAGAAGGCAATACAATTGTTGAATTTAGTGATGGACATACAATTACTGTGCCAAGAGGCCAAGATGGACATTCAGTCACTGTAAAAGAAAGTCATAAAGACCAATCAGGCAATACAATTGTTGAATTTAGTGATGGTAATACAATTACAATAGAAAAAGGTCGCGATGGACGTGACGGTCAAGATGGCAAATCAATTACAATTGTGAGTCAAAGAGTAACTAAAGAAGGCAATACAATTGTCGAATTTAGTGATGGAAACTCAATCACTATA >NZ_CP041726|1|1|77342-77627|PILER-CR TCAAAGAGTAACTAAAGAAGGCAATACAATTGTTGAATTTAGTGATGGACATACAATTACTGTG CCAAGAGGCCAAGATGGACATTCAGTCACTGTAAAAGAAAGTCATAAAGACCAATCA GGCAATACAATTGTTGAATTTAGTGATGGTAATACAATTACAATAGAAAAAGGTCGCGATGGAC GTGACGGTCAAGATGGCAAATCAATTACAATTGTGAGTCAAAGAGTAACTAAAGAA GGCAATACAATTGTCGAATTTAGTGATGGAAACTCAATCACTATA
>NZ_CP041726.1|WP_070648312.1|68692_69298_+|class-A-sortase-SrtA MKKWTNQLMTIIGVILILVAIYLFAKPHIDSYLHDKDNSDKIENYDKTVSKANKNDKPTIPKDKAEMAGYLRILDADINEPVYPGPATPEQLNRGVSFAEEQESLDDQNIAIAGHTYIGRPHYQFTNLKAAKKGSKVYFKVGNETREYKMTTIRDVNPDEIDVLDEHRGDKNRLTLITCDDYNEKTGVWEKRKIFIAEQIK >NZ_CP041726.1|WP_002460446.1|68047_68542_-|N-acetyltransferase MIRHAERQDLPAILSIYNDAIINTTAVYSYESQTIEEREEWFERKVIAGEPILVFEQHQQVVGFATYGSFRDWPAYLYSIEHSIYVDSAYRGHGIASQLLSQLMQIAKDEGYRTMVAGIDASNEVSIHLHEKIGFIHAGTINNVGYKFNRWLDLAFYQIDLLTK >NZ_CP041726.1|WP_002460448.1|66647_67544_+|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-alpha MFDSIRETIDYAVENDMSFADIMINEEMELQGKSREDVRAIMKQNLEVMRAAVEKGTTGEGVKSVTGYTGQDAIKLNKYNESQHALSGHEMIEAVKGAVATNEVNAAMGIICATPTAGSSGTIPGVLFKLEKTHDLTEDQMIDFLFTSALFGRVVANNASVAGATGGCQAEVGSASAMAAAAAVAIFGGKPEASGHAMALAISNLLGLVCDPVAGLVEIPCVMRNAIGSGNALISADLALAGVESRIPVDEVIEAMDKVGRNLPASLRETGLGGLAGTPTGEAIKRKIFGDAEKKVNN >NZ_CP041726.1|WP_002460450.1|65953_66634_+|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-beta MAKKSYDYQSAFDIIGPVMMGPSSSHTAGAVKIGNSAGSVLGVTPQKIEIRYYESFAETHQGHGTDVAVIGGAMGYSTFDSRIKDALNIAESQGIKVDIIEDRGESLGEHPNCAYIKAEANGRHIEVIGNSIGGGTIKLKRINVEGLEVNFNHGLPILVMDGYTDKSTVNHFINFASEAGAAIDKEMTEMKDNQCLVVLPLSKALSESALEQIREKYSDLNVSYIN >NZ_CP041726.1|WP_070648314.1|64907_65951_+|transcriptional-regulator MNIILGVGTLVLVLAVMTLFLKYAPYGKQGLQALSGAACATFLPQAFLSYAIGGVFHIEFLKEIGDLVGGLSGVAVGILTCLKLNISPVFAVIVGLVLHDYKLLPAFIAAYIMAFGIKLIEKKVPEGLDLIVVILVAPAITFGLAHIISPGVMAVLRQIGGAVTSVGDNNPYALAIILGLVIPVTGMTPLSSMVLTSLLGLTGVPMAIGALTCMGSSFVNFVLFRTLKIGGPSKAFAVCIEPLTQIDLIAQYPLQLYGTNAIIGVVNACIVTFAGLVINVTGMATPIAGAIVLFGFNKPLPSVITIIVVAVVSIILAYIFGKLISKLNITKTDITIPGQNNQVKESV >NZ_CP041726.1|WP_070648316.1|62934_64422_+|xylulokinase MQEVVLGIDLGTSAVKIIAVDKEGQVLVTISEPLTLIQQQPGYNEQDPDEWLDAVKQGIKRVTQHDSLKHHTIQGISFSGQMHGLVPLDKNGWPVRHAILWNDTRNSAQCEQIIARYGQRLNGNPILEGFTLPKMLWMQQHEPELWKHVDTFVLPKDYIRYGLTGQIHMEYSDAASTLLLNPTTHEWTREIGDAFGLGEIYPPLIPSHGYVGNVKSGLAIELGLTSNVKVFAGGGDNACGAIGAGVVNDNDTLCSIGTSGVIVNVEKDEHTQYQNNIHFFNHSVPNTYYAMGVTLAAGYSLSWLKHTFFAADSYDDVIKLAASSSIGANRLLYTPYLAGERTPHGDAFIRGSFIGLSGSHKKEDFSRAVIEGVTYSLYDSIQLMRAAGKEITHVTSIGGGAKSEFWLQLQADVFNTTVRKLKHEEGPSMGAAMIAAVGLNWFESIEDCVDAFIDIVAEFRPNPERHRQYEQFYQVYQQVYAQTRTITQQLLTLEI >NZ_CP041726.1|WP_002478613.1|61059_62658_+|gamma-glutamyltranspeptidase MNIYNKMTLIVILIATIAVSFTFYLFQKEDNPNKDALYENKIADHKTPKDKKDYGVASNNYIAKRVGEKILQDGGNAVDAAIGVSYALAITEPHSSGLGGGGASLTYNGKDGEVPKMYEYKTLSSYDYKKGDQIGTPGFVRGMHDMHEREGKMDEKKILDYVIPLAQDGFEVDSELERSLKIYGSDIDRDSPFFKGSKTVREGDVVKQEALTKTLKGIQDKGPDYFYEDLGKSISKQVDDKLTEKDFSTFKTEEKEPVSTNYLNNKVYSASNPLGGTLMLQGLVLEESNNPGQQNEDNRIDYISSILKSRDLMYRNRDIVNGQEASNEQYLSKDYLLEKLNGINIDSSNFNKNQVDNTSTTHFVVIDKNGKVVSTTNTLSSFFGSGKYVKEGFYMNNSLTNFSSDPNSPNFGEKHKAPRSYTSPSIIVGPDFYMGIGTPGGNKIPTMLNEVIVDYLKGNGTLQESINKPRFYNDGSTIYYENATSDDDIQAFKSLGFNVEEKRNDPNFGSVQGAIYNKNSKKVEVGSDVGNR >NZ_CP041726.1|WP_002478611.1|59838_60903_+|CapA-family-protein MKKKLTASEWLLKQAKRHKRRNFLYTLIVLVITLVLLVVAISSQKVEPVDSIPKSGNNIRMTYLGNINLNSHIRNINLNDVFASLKQPLKQSDFSTASLHVNHFSDKSDENLKKNLENILFLKDQNIKSVNLINNEVDNVQAQDLSKKVEAQTEYNFLTGNGSNPINSKTVQQTIKNKKIANVSFTDVESNYTGPLKNTTSISLDPNIFMPLLKKLKQNNDYVVVNVDWGIPNERNVTERQREYAKALINSGADIIIGHNSVIQEIDKYKNKPIFYSLGNTTSDEFLSKNHKGMIVQQDWTGKASRFHLTPIKSSDGKITRDLMSKMEQRKFYNNIKGEHVNLKAEKDGGYSFE >NZ_CP041726.1|WP_002460457.1|59362_59815_+|poly-gamma-glutamate-biosynthesis-protein-PgsC MIGSELYFSLFVGIVLSLIFAEKFGINPAGLVVPGYLALIFDEPIMLLSVLVISCLTYFIVTFGISKWVILYGRRKFAAMILTGMVLKFIFDLIYPITPFEVVEVSGIGVVIPGIIANTIQKQGVVITLSTTMLLTCITYVILFLYSFIN >NZ_CP041726.1|WP_002478610.1|58203_59361_+|poly-gamma-glutamate-synthase-PgsB MILIIICVSLILWLGIKEKRRHTNRLNKIPVRININGIRGKSTITRMVYSVLREDHIRVVGKTTGTDARMLYWFTDKEYPVIRKPQGANIGEQRDIIRKVVKQRATALVNECMAVNPDYQITFQNDLVMANIGVIVNVMEDHMDVLGPTLQDVAQAFTATIPYNGKLVVMQDKYTKFFAKEARKRKTELIVVDKEKVPESYLRKFDYLVFPDNVAITLGVAQALGIDQQTALQGMLNAPPDPGAVEIKYFQANSTTNVFVNAFAANEPQSTKAILNKVESYDYPYSKKIVILNCRSDRVDRTRQFVENFIAEVDYDTLICTGKSTQMVTDKMQSQPNKRYLNLEGAPFADIERTILKESQHALVFCVGNIHGPGGRIAEFIEGIE >NZ_CP041726.1|WP_070648199.1|78959_79757_+|HAD-family-hydrolase MIKAIAVDMDGTFLDSQKHYDEVRFNQQFQKLQDKNIKFIAASGNQYAKLRSIFGDKEMYFIAENGAVIYQGNSLYDYKSFDIQDYQSLVQYLMLEQGLREFIICGLKSAYILKDTSQPFKENAHFYYHQLEEIDSFNVLPDDDYVKIAFNINRTTHPTLDEDMAIRFKYISSLVSSGHDSIDVIMPSMTKGEALKGLLTKWHIKPSELMAFGDANNDKDMLALAHYSYVMANSNDSELFDIAHAVAPSNDEQGVLQVIDDVVLS >NZ_CP041726.1|WP_002460442.1|79823_80816_-|D-lactate-dehydrogenase MTKIMFFGTRDYEKKDALNWGKAHNVEVVTSEEILSADTVDQLEGFDGVTTMQFGKLEDSVYPKLEGYGIKQIAQRTAGFDMYDLDLAKKHGIVISNVPSYSPETIAEYSVSIALQLVRKFPLIEKRVQAHNFKWAAPIMSTPVKNMTVAIIGTGRIGAATGKIYAGFGAKVVGFDAYPNHSLDFLEYKDSVEEAIKDADIISLHVPANKESFHLFDKSMFSKVKKGAILVNAARGAVIDTPALLDAVNDGTLSGAAIDTYENEADYFTYDWTGKDVDDPTLLELIRHENILVTPHIAFFSDEAVRNLVEGGLNAALSVIETGKCDTQLN >NZ_CP041726.1|WP_070648200.1|81169_81829_+|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MSQMNETIINALNFRHATKIFDSSKQVSDKDMQTILESGRLSPSSLGLEPWRFVVIESQELKDKLKPYSWGAQKQLDTASRFVVILAHKNVTAQSDYVQHILRDIKKYDTHTIPAVEQKFNDFQTNFHINDSERTLLDWASKQTYIALANMMTSAALLGIDSCPMEGFDLDKVTEILQDEGVIDTVHFAPSVMVAFGYRKDEPKGKVRQPATDVIEWVK >NZ_CP041726.1|WP_150908286.1|82024_82858_-|YSIRK-type-signal-peptide-containing-protein MKFYQQQRFGIRKFAIGIGSVGLATVVFLGANQDAYASETSRTATEQNQSHAQHQANTQNQHTSGKHTSEVDITSPYGKTTDIIEKNNSNQNSSSHSKTEIILGSTDGEWLINDITIINSETHHTSQNNHSSHNIKTEKQSTSKKIQHTGSSVKTVSQQRTSQSRLTKQAVQHQSQKQNVEKHSKIVNPSTAAVNVEQPFNPSQHNELNHTHQTLINQTKKPTVTHATSSNMTVTAPITHKALPNTGKEETPEHSMALASILAVLGSALFMRRRKHI >NZ_CP041726.1|WP_070648201.1|83257_84751_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein MSNVNIRDFIDEKYDLFINGEFQASDSGETLDVTNPANGETLAQVAKANQADVDKAVKAAQDAFDSWSKISKEERADYLLEISRRILEKKEHFATVESLQNGKPYRETSTIDIPQTANQYKYFASVLTTDEGSVNQIDDNTMSLVVNEPVGVVGAVVAWNFPFLLSSWKLAPALAAGNTVVIQPSSSTPLSLIELAKVFQDVLPKGVVNVVTGKGSESGDAIFKHEGVDKLSFTGSTDVGYGVAKAGAERIVPTTLELGGKSANIIFDDANLDQVVEGVQLGILFNQGEVCSAGSRLLVQTSIYDKVIPKLKEAFENIKVGDPFDKDIKMGAQTGPDQIEKIESYIKIAEEDSSSTILTGGHRLTDNGRDKGYFFEPTIIELKDNSHKLAQEEIFGPVLVVEKFEDENEAIQIANDSEYGLAGGIFTTNLNRALNVAKAMRTGRIWINTYNQIPAGAPFGGYKKSGIGREVYKDAIKNYQQVKNIFIDTSNQTKGLY >NZ_CP041726.1|WP_083309280.1|84819_85629_-|VOC-family-protein MMTSFHTIEATHVTNITLNVADLAKMTTFYSTILGFSIKARSEERTILNVGANGHTLTLNYLAEGRHPSFREAGLFHIAFLLPSRADLANFLYHVSRLNIAVGGGDHLVSEALYFNDPEGNGIEVYQDRPSDQWQWNDDFVKMDTLEVNADDLIAQRTNLGWQGWPANGKIGHLHLKTHDIKEAYDFYVSQLGLAHISKFPQALFMSTQYYHHHIAVNMWQSNQKRISNTESYGLVHFDIYKPNAEETHVTSPEGFDITIHSDTSTVAG >NZ_CP041726.1|WP_002460436.1|85955_86237_-|N-acetyltransferase MDNTIKQGHNQFYIGESEDNAQAVITFKQVDNNEIDIDHTGVPDELGGQGIGKELVAAVVNYARDNQLKIIASCPFAKHVLETNDDYQDVYLG >NZ_CP041726.1|WP_012990720.1|86291_86417_-|hypothetical-protein MHPVDNDTHILLIHNTIISITLVILNVFLAQFNVLKWLSHV >NZ_CP041726.1|WP_070648202.1|86516_87248_+|M48-family-metalloprotease MRLIAIIFLSLVILIKFDVIQVSLLGQTEIRYLFIFAFGLVGYAFISPYMYLFLSNRTEVNRTWLQQHIPEMETQQVTTYIGELPFKPNLFASGSGHRKVIAIDRRIEQALSIEELKFFILHEYSHIKDHDILKLSLMRSVVVALIPIIALLVSRTIHFNNVLLLLIFVVIVLSLYISGFFLFFHYARLKELKCDRFAAQFTSKTAQRQAFEKFIALGIMEDTKVKLMSTHPSLQQRLNHLNI >NZ_CP041726.1|WP_150908288.1|87496_88441_+|DUF1672-family-protein MKRTTSIVLCASLILGGCASMDKEQTKDIPKTVSVKDYDGKYIGEHKERNEIFLKKYKAEAEKKYKKYVKEVFNKDVKIIKVYSYTTSTGGKPFEGLTVMGTVDYDIPFNFNLNFEESKGHLGYSTITADQSNELKAAISALMFKRYENDIENARMKFKEEVEKQGYYAMNNKLMKQQEFRGVTRPYLNFSTNTSIGLNDFKKDFKPLLNVKDKSFYTRIDILSRKYPQLMDEMRTEFIAFYNKKAKDDVNKYSWNLQISTNDTMKKIPGTKMMYFYKDGVSPSELGGDGKLKRQTKDISMIGGEWDRIKKEKN |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_CP041726_2 | 305911-305995 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041726_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041726_2
>2.1|305938|31|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder GGCCCCCAACACAAAGAAATGCAACAAGCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041726_2
The CRISPR arrays of NZ_CP041726_2 >merge|NZ_CP041726|2|305911-305995|CRISPRCasFinder TTCCACGAACAACGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCCAACACAAAGAAATGCAACAAGCATTTCCACGAACAACGCAAGTTGGGGTGG >NZ_CP041726|2|1|305911-305995|CRISPRCasFinder TTCCACGAACAACGCAAGTTGGGGTGG GGCCCCCAACACAAAGAAATGCAACAAGCAT TTCCACGAACAACGCAAGTTGGGGTGG
>NZ_CP041726.1|WP_002478773.1|303914_305879_+|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit MTTTFIIGYIVVALIFIGLINFFVVKSRKKNKNKGQFKEQRNLQDSKSQQSKFKISDLDKEEMSKNGFNQSKSNDIEDDKRKHQFNDTTEHIATTETGDTSDKLQHADETSHGVNQGDDAHDAINPNSVEGRVNEQIKNQNEDFVFGKNVTRAQIIAAMLFGMFIAILNQTLLNVALPRINTEFNISASTGQWLMTGFMLVNGILIPISAFLFNKYSYRKLFIIALTLFTLGSLVCAISTNFPIMMTGRVLQAIGAGILMPLGSNVIVTIFPPERRGVAMGTMGIAMILAPAIGPTLSGYIVQNYHWNVMFYGMFILGLIAIIIGFIWFRLYQRTTNPKADYQGVVYSTIGFGALLYGFSEAGNKGWGSTEIIVMFILGAVFITLFVIRELTMKAPMLNLEVLKSSTYTLTTIINMVVMMSLFGGMILLPIYLQNLRGFSALDSGLLMLPGALVMGALGPVAGKLLDTVGLKPLALFGIAVMTYGTYELTKLNLDTPYMHIMSIYIIRSFGMAFVMMPLMTAAINALPPRLISHGNAFLNTMRQLAGSIGTAILVTVMTTQTTQHFNAFSTELDKTNPVVQDHMRELATQYGGEQGAMKVLSMFVQKISSVDGINDAFWIATALSILAFILSLFLKSKKKADAEHDKMMSKEHI >NZ_CP041726.1|WP_002460169.1|303254_303902_+|HlyD-family-secretion-protein MKKLILINVITIVVLAVIGIIGFHFYNNATSYVTTDNAKVDGKQIKIASPTSGQIKSFDAKEGDKLSKGDKVATVVGKSESGDTQSMDIKMPQNGTIVKTDGAEGSMAQAGNPIAYAYNLDELYITANVDEKDVSSIEKGNDVDVTIDAQGTTVSGKVEHVGQATANSFSLMPSSNSDGNYTKVSQVVPVKISLDSTPSKDVVPGMNAEVKIHKN >NZ_CP041726.1|WP_002478772.1|302570_303122_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MKNRAKYRIIFNFVHLLEQYPFEAITTKLICAHSNVNRSTFYANFKDKYDLYDIIQNYHKKKYINLLDTLYNDFEDVKSNNMKIHKFFVIVLKYIQRKKAFFHAVFITHPNREIAIEYFQLTKVKYEKILTDYNTTIENKSAFVTYTLGGQTAILLSWLKDGCQESPHKIADILLANTIKLQR >NZ_CP041726.1|WP_037545156.1|300923_302129_+|multidrug-effflux-MFS-transporter MSSQQRDKQSLIFIIILGALTAIGPLSIDMFLPGLPEIKHDFNTSTAISQLTLSLFMIGLALGNLFVGPISDAIGRKMPLVVSMFIFTLASFSIIFVSNIWVMIVLRFVQGLTGGASAVISRAIASDLYSGKALTKFLALLMLVNGIAPIIAPTLGGIILSVSIWRTVFIVLTVFGILMLLGSALKVTESLHIEQRETSGIKVIFKNFGKLLATPKYVLPMLIQGVTFIMLFSYISASPFLIQKIYGQSPFAFSLIFASIGVTLIISSQLTGKLVDYVDRQQLLRILTVIQIVGVIIVGFVLTNHWSFWILIIGLIVLVAPVTGVATLGFAIAMDERTTGSGSASSLLGLLQSLLGGLVTPLVNLKGEYNSTPYLIIISIAALALMMLQIVNYFVFKKSTE >NZ_CP041726.1|WP_012990757.1|299448_300822_+|zinc-ribbon-domain-containing-protein MTTCPKCGEEIKNEQTNHCPNCGATINDNGENSSNQASNEATIRLKKIVPWAIGGFIIILLIIVFVLLKNFNSPDAQAKILINAIDNDDSQKVATMLTTRDNKVDETEAQTYIKYIKKEVGMTKFIFDIRETVEKLNKSETRVAAYLQTRAGENVLRVSKNGRRYLIFNNMSFTPPTKEVTVKPKEDTKYEFKDDGRNKKVVAEADKETTIGKFIPGNYAIDAKKITDNGVFTGYLKFDFKYANSNTVDVNEDFNEAKVHVKIKNGEQLSRSSLKVKINDRTWDYGNAKVYGPYPKNKDITVSATGKVKGKTFETETKSIKADKLTDNTDVTVSFDDDDISDYIEKKEKEDNSLKNKLGSFFSSYSLSLNQAIAQSDFSLVHSFLKKGSSSYDKVRKNIASNTSARLVSPIILSVDQTGDTIKAKVQGFGLNGLPVVKNYVLEESKDDLGYKLVKVD >NZ_CP041726.1|WP_002460176.1|297761_298715_-|YdcF-family-protein MLSISIAFLTFICIVPTLFNSQTFVSLRLYFISVILAFSFVLINLWQQSFVLCYFSLFIVLVTVLFVKHFYLIKQQQGRQLLQELMKYIYRLLLFSCACAYISLIHVPVFNGLFIWFSLIAISTLTTFALYLCFSSAFGRMTNHCTFDGIIVLGAGIFTEAVTPLLASRLNRALSIYNQQSHCTIIVSGGQGKDEPISEALAMKRYLLSHGVPEQSIIMEAHSTNTAENFLYSKSIIDAMTPKPNKLLVVTSQFHILRALRFAQKFGLPVQGIGSSTPCHLLARSLIRDFLGLMHQYKLLLTLYFALLFISAILLNL >NZ_CP041726.1|WP_037545159.1|297002_297671_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MTLKVANLRKTFGQGEAKTQVLKGIDFEIADGEFVILNGASGSGKTTLLTMLGGLLTPTEGTIEVNDKPLFSTQSHNSALRLTDIGFIFQAAYLIPYLSVIEQLTLVGKEAGQSHNDAQQHARTLLSDIGLAHRLDAYPHMLSGGEKQRVAIMRAFMNQPKIILADEPTASLDAKRAVQVVDMIKTQIKSNHMMGIMITHDERLFAYADRVIQLYDGQIVPG >NZ_CP041726.1|WP_150908302.1|295944_297006_+|ABC-transporter-permease MMKLAWREITFYKFRYILITLIIILLASMVLFITGLAQGLARENISFFEQQHAQHYVMQKMSQPQLEKSNISAQDTSKVRTILQQQPTRLKPQVLTVNQDSLDVMTVTTDKTFKPQLQAGTYPKKVHDIAINNKLTAKGIQIGDKVHFKGHSTHYHVTGILENTMYAHSSMLWMTQEGFEQLNKQAAIVFPVKDLNEKQRSQLADDSKLELVKPDTLQANIASYQAEQAPLNLMVMSLFVITAIVLSAFFYVMTIQKISQIGILKAIGIKTRHLLIALIGQIMLITLFGVSIAVGLIWSLTFVMPVTMPFYIHLTNILVILGGFVFVALIGALLSMIKVLKVDPIEAIGGNAS >NZ_CP041726.1|WP_002460180.1|295142_295817_-|response-regulator-transcription-factor MVNCLIVDDDQTILDYVASHLNNEGYHTYTKPSGTAALQFLEQQTVDIAIVDIMMAGMDGFELCQQIKLDFDLPVIMLTARDALTDKERAFLSGTDDYVTKPFEIKELIFRIKAVLRRYQINAEHIIQLGNLTLNDNYMEVQVDHKTMTLPKKEFQLLYMLTSHPKQVFLRDTLIEKVWGFDYEGDERTLDVHIKRLRQRLSKLAANVTITTVRGQGYKVEAHV >NZ_CP041726.1|WP_002492213.1|293779_295150_-|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MFKSLYSRIAIYTITVILLSAILSFFISNVYYHFNLKPKNDQKIMTTLKDARQFDAAQQHQVSTSFFKHLADMNYQIMTVDNYGHKHFYGADFRKDTLSATNIQRVLQGHDYHGIAKQPFQLLVTGFFDNETDNTVGVRFKSSEGYVAVFMRPDIGQTFSEFRIFLALLIILLLIISISLIIASTYAIIKPIQSLKYATERLMHGDFDTPIKQTRTDEIGILQYRFDTMRQSLKQVDAMRQHFVQNVSHEMKTPLTHIHHALTQLQASDDKATQQTIINDLFTITSRLSDLTRELLILSELDNASHIQLNSTIQLDLLLQDLIRHEQYLIERKNIIVYAELLPSSLLGNERLMHQAFENLLRNAIKYTNNEGAINIKLQHRNNHVHFTIQNDGQPMTKEAQLHIFDRFYKVNSNDTSNGLGLSITQAIVQLHHGHIEVESNNLIGTQFTVILPFKP >NZ_CP041726.1|WP_002460164.1|306158_306866_-|hypothetical-protein MEQSRSQHPTYQRTQYQPDYQLQTTKKRSWVSIIIHFIVLVLTAISGYSMYKQPLFIFGLKDTEVGYTQLKNFKQSLSNLTELSINSDQVTKLNGLGLSDIAKQLEALSIKPEHIEQLKSVIEQINMLFNIFFGLCILSLILTILTLLFNRTLLKLLNFLSIASMLAIVVYFMIAIDYLAQRIAKLLNNAYVQITPDQVIIEADATHNAIILLICCLALIFLSLFFRSKRQIKRL >NZ_CP041726.1|WP_062077975.1|307074_307983_+|alpha/beta-hydrolase MRTYMMNRVVNKYLLHNRSIQFKDEGQFNQFMEKRRNANRLKHKQPSTLNVKSNLDKLMLDDMQVFRFNFRHETGKKILYLHGGYNTLQPSPFHWRLMDKLTLATLYEVVLPIYPKAPEFHIDDTFKAIQAVYVQLVDEVGAENIVVMGDGTGGALALSFVQSLIKQQLPMPRKLYLLSPLLDATLSNPEITEKLQQQDQFVNRQGVHDILSVWAAGKPLNNAEISPINGNLEGLPPIVMFGAGKEIYYPDMERLDFYLSEHRQPIEFFRYPKMIHDFSLFPIHESHKVVKQIAQTIDNDLR >NZ_CP041726.1|WP_070648165.1|308015_308405_-|hypothetical-protein MTKSSIEKIKSYLLDLHDDLKLNLIDMNQTKDMFMNGPSTELLRRALNMSYYQGQKQALDWLQYNVESQDSHTLMTLIEDKLHLLTEQDSKVKNLAIIAKELPEQLSQEAHRDGQRSILKHIKTRIDVF >NZ_CP041726.1|WP_070648166.1|308410_308878_-|thioesterase MIFTVQGMVQQSQIDHNAHMHDADYNYIFSDAINQFNYTHGLSLAERQALHYTIFTVEEHTTYLAEMSLGEHYTIQLFIYNYDDKRIHFFLKLIKENGTLAATNEVMMLGIDSTTRKAAAFPEPYFTEMTSYYKTQDISQWSKQLGHQIGIPNKG >NZ_CP041726.1|WP_002478778.1|308996_309944_+|magnesium/cobalt-transporter-CorA MSITIRYQTPHTSLTTVPDIADVPKDATIVWYDFEDATAKENDFLRENFDFNYLEIDDTITGVPRVKYKAYDDYQYIVFHSINSDDYSPRALNVFLKNNVLVTYHHKHFSSLMKVAKWNAYHHDGELDCADIVIHILDMMVDKYFDFVYDIEEKVYNFEDKHVDDALSKKVMDNVFKLRSDLIKIKRVMFPMQELVETIKSEGNLIVDSKHSMYIQHIDDHLIKQSNIIRTSQEMTNEIRENYESYSSFRMNSIMQILTLVSVIFSPLTFIAGVYGMNFDNMPELRWHYSYYICLVVMLVIAIALIIFFRKKRWF >NZ_CP041726.1|WP_070648167.1|309989_311042_+|type-2-isopentenyl-diphosphate-Delta-isomerase MSNFQREQRKNEHVEIAMAQQDAPASDFDRVRFVHHSIPHIDVAQVNLSTHTSNFKLDYPLYINAMTGGSEWTKQINEKLATVARETGLAMAVGSTHAALRNPDMIESFRIARQVNPEGVIFSNVGADVPVERAVEAVELMEAQALQIHVNAPQELVMPEGNRTFASWMDNIAKMINHVSVPVIIKEVGFGFSKETFKALKDIGVTYVDVSGRGGTNFVSIENERRSNKDMNYLANWGQSTVESLLESQAYQSSLNIFASGGIRTPLDAIKSLALGAKAVGMSRPFLNHVENEGVEQTITFVAQFTTQMQQIMTMLNAPDIEALKQSQLIFDQQLLSWMEQRHIDIDRGL >NZ_CP041726.1|WP_002492246.1|311166_311775_-|DNA-3-methyladenine-glycosylase MDFIVPSTIDTAKALLGVKVIYNDDGQIYSGYIVETEAYLGFDDRAAHGFGGKQTPKVTSLYQRGGTIYGHIMHTHLLINFVTQQAGVPEGVLIRAIEPVDGIEAMKINRGKHGYELTNGPGKWTKAFHIPRAIDGTLLNVGRLSIDTKNRKYPREIEASARIGIPNKGIWTSKPLRYTVKGNPYVSRIPKKNMRAAIDTWK >NZ_CP041726.1|WP_002460156.1|312012_312228_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKEVVTRLNKVKVYRGYSKISQLELARAVGVSRQTINMIENGKYNPSLKLCVNIAKTLGTTLDTLFWENDT >NZ_CP041726.1|WP_062077973.1|312782_313793_+|galactose-mutarotase MIVEVEKQRHGIDLIKIDNNETSIVFSNYGARIVAWKFHDNNIVLGNRVEADEFYLNNPLKFGATIGRYSGRIEAGAFKLNQDRYQLEQNDGLNHIHGGSNGCDQVLFDYDIVEGISDVKVIFRAKLNASDDGYPGDLALKVIHHYDIEHRWTITYEAETTATTIFNPTNHVYFNLNRDNNVIDNHQIHAKDLKMYLLNRQHFLLNDTPINLTSQFGSDHITFQEIFQAYQDDIKQQMERYQGLDHPFELSEQTLSVENGEFKLQIDTDMPYVVIYTMNHPETWESQLNIYKPHSGFTLETQFLPNDINYFGQQAPSILRAGQQFSSTTSYQISEQ >NZ_CP041726.1|WP_002478781.1|313868_314522_-|MOSC-domain-containing-protein MIPVVAISTGKIQHLPYSTKKPMISALDKIPFTGRMWLSIDGFSEDEQAYKDHGGPHKAVCCFSQSNYDMYKEDLAQLPTYAMFGENVTVKHLDERDVYFGNQYRLGEAILEVSEMREPCWKIQAKYQIPDLVKRMTASGKTGFYFRVIQEGYVSQEDNLELLTQANKASRLSVYELNDIYYNDRKNISRISYALNNPYLSPSRREKLSRLYHRACK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP041726_3 | 594669-594753 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041726_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041726_3
>3.1|594697|29|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder CAAAGACTTTCCAAAAGAAAGTCCACGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041726_3
The CRISPR arrays of NZ_CP041726_3 >merge|NZ_CP041726|3|594669-594753|CRISPRCasFinder CAACGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACACAAAGACTTTCCAAAAGAAAGTCCACGAACAACGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACAG >NZ_CP041726|3|2|594669-594753|CRISPRCasFinder CAACGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACA CAAAGACTTTCCAAAAGAAAGTCCACGAA CAACGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACAG
>NZ_CP041726.1|WP_150908325.1|592992_594501_+|hypothetical-protein MTRKKTKIKYLSASFAIAVSTQVISPHITHAQDNTLYNKVTNEKSTAHSDNLSQDNSNQKDSDNTNQPSNSSNSANNEGKDNRPNKPSDGTDNGGKDNRPNKPSNGTDNEGKDNKPNKPSDGTDNGGKDNKPNKPSDGTDNEGKDNKPNKPSDGTDHGGKDNKPNKPSDGTDHGGKDNRPNKPSDGTDNVGKDNKPNKPSDGTDHGGKDNKPNKPSDGTDHGGKDNKPSDGKDNGRTSSHPQTPTQNGGHGHKPTNQPNNKDNNNGQNNGNGNQGWNTSNGQQSPQNGEKTDHNISDDFINQINGRGHNSGRNSSSYFPRNHYDEGPVANNQRQSIMKRFKSLAIGSFKYNPFIIEQVNKLGESGNQVSDQDLYALFRKQNFSGNSYLNSLQRGSNYFRFEYFNPTNSSKYYKNLDEQVLALITGEIGSMRDLKKPVDKKGEDNHTQRSEDKIISAEGEDHKQGMTDVKFNRLNVTLIGSMCMIFVAVMIYWFINRQKEKEQ >NZ_CP041726.1|WP_062077860.1|592175_592799_-|nitroreductase-family-protein MGLFSKNSEKSFLNAIEERRTVYNLKESISISDEELEQIMTQAIKHVPSAFNSQSTRIVLLLNDKNKQFWDNTKAVLKEKMGADRDFTATEQKIDNFKHSYGTILYFEDQSVVKGLQEQMPSYAENFAIWSTQANAMHQFAIWTALSTKGIGASLQHYNPLVDAVTHQDFDIPETWELMAQMPFGDVREEPNEKEIQPVDARFLVRK >NZ_CP041726.1|WP_002477923.1|591255_592041_-|carbon-nitrogen-family-hydrolase MKLQLLQFNVAYADVNANEHKIKTWFSNSLQQDTDVVILPEMWNNGYALEQLEEKADFDLERSTDFIKNLALQYQVDIIAGSVSNKHHDHIFNTAFAIDKTGKVINQYDKMHLVPMLDEPAFLTAGKNVPETFKLSNGVKVTQMICYDLRFPELLRYPARSGATIAFYVAQWPSARLNHWQVLLKARAIENNMYVIGCNGCGYDGKTQYAGHSVVINPNGEIIQELSTTEKELTVTIDIDAVEQQRKAIPVFDSLVPHLYK >NZ_CP041726.1|WP_080606542.1|590061_590709_-|accessory-gene-regulator-AgrB MRIKQLGINDQMNCVKLYNDTKERDANLKAIDKKIERFARYLQRQNNLDHIQFLKIRLGIQVALGNFFKTIVTYGVALLFHTFLYTLITHLTYFFVRRFAHGAHARSSLLCHIQNLVLFVALPWSIVHFQVSWTFMILLAFIAFIIIICYAPAATKKQPILPHLRKKKKRNAILISICFLVLMLFVSEPYMQLIALGMCIEAITLLPIFFSKEET >NZ_CP041726.1|WP_002477921.1|589915_590059_-|cyclic-lactone-autoinducer-peptide MNLLSGLFTKGISAIFEFIGNFSAQDICNAYFDEPEVPQELIDLQRK >NZ_CP041726.1|WP_070648269.1|588604_589894_-|GHKL-domain-containing-protein MDLLNSIPLSIFQSLMLLFVAKIVADIKFQMRDYFAIFGIIIPSTILFGVIGRQSLIFLIIGCLIFFYLKIGLYSVLAIFGSALIMYVSNYISVILSVIADYFSLSYIVQIIIILVSFTLISIICAYFIRFLINKLKKTYLYFNKIYISVISIFLILSLIMLYLYTQIFKQEYQDLKIFAIIFVGILFFLAIFIIVITFSVHREMQYKRNLKEIETYYEYTLQIESINNEMRKFRHDYVNILSTMSEFIREDDMPGLREYFNDNIVSMKDNLQMNSIKINGTDKLKVRAIKGLVTTKILQAQEKNIPISIEVPELIEHIEMNTVDLSRVIGIIIDNAIEASESLEDALIRIAFIKNEDSVLFIVMNKCSDTTPKIHELFQENFSTKGKNRGLGLSNLKEITDATPNTLLDTTIDNGYFIQKVEILNNIP >NZ_CP041726.1|WP_002461418.1|587875_588592_-|response-regulator-transcription-factor MKIYICEDDVKQRENMVEIINNYIMIEEKPMEIALATDNPYEILKMSKENEDVGCYFLDIQLEADINGIKLGSEIRKYDPIGNIIFVTSHSELTYLTFVYKVSAMDFIFKDDPAELKTRIIDCLETAHTRLKLLSKERTVETIELKRGSNSVYVQYDEVMFFESSTNSHRLIAHLDNRQIEFYGNLKQISQIDDRFFRCHNSFVVNRHNISSINSKERVVYFKNGEHCYASVRNVKKI >NZ_CP041726.1|WP_070648268.1|586809_587784_+|carbohydrate-kinase MRTLYAIGEALIDFIPNVVNSELKDVTGFTRQVGGAPANVANTVARLGGQAHMITQLGQDAFGDIIVETLQQIGVGTSHIKRTDIANTALAFVSLKEDGQRDFSFYRKPSADMLYHPDNVEEIDVSSEDIMHFCSVDLIDSDMKQAHYKLIEKFEAQRGTIIFDPNVRLPLWKNAADCKKAINEFIPKANIVKVSDEELEFITGESSLEAGIQALFKGHVEAVIYTAGSNGASIYLKNGKHIYHEGFTVKAIDTTGAGDAFIGAVISRLLLAEDTPVTQQLEQDGAEILEFSNCVASTVTTKYGAIESIPTLEEVKQQLNKKTS >NZ_CP041726.1|WP_070648267.1|585324_586809_+|sucrose-6-phosphate-hydrolase MSEWTREQRYQGIDDVPQSQLIELKQKVDASHYRQTYHIQPETGLLNDPNGLIFYNGTYYVSHQWFPLGAVHGLKYWFNYTSKDLVSFTPHGPILEPDTAYDSHGVYSGSAFEYNGQLYYMYTGNHRDSEWNRHSSQMLAKVDEYGDAVKFEKPVIPAPPTGYTQHFRDPNVFQKDGQYFMIIAAQNEQENACLLLYKMEEQVNEWAFVGEIATQLSNFGYMWECPDFFNLNQTDVLLFCPQGISPEGERFNNIYQSGYLLGTLDIQKPAFEHQDFKELDYGFDFYAPQTFLDKQGNRILIGWMGMPDTHYPTDDEGWAHCLTLPRVLTVEHGKLIQRPLPALQKLRHNEETAEGYANKFTTKLHPYEGLHYELIIDILENEASEVYFELRTSKQHSTLITYNKQSQRLTLDRSDSGALPEPVKGTTRSTILDTPLSQLQIFVDTSSIEIFCNNGERVLTSRIFPDEQATGIKTSTESGQVYLKFTKYELKDEK >NZ_CP041726.1|WP_002461422.1|584274_585225_+|LacI-family-transcriptional-regulator MKNIADIARLAGVSKSTVSRYLNNGSVSTKTKEKLSKIIKEQDYQPNQFAQSLRARHTKMIGAIIPRMNSHAVDETIKGVAHVCKELEYQLLLNYTGLDLSEEIIALETLSRSKVDGIILMATRITPQHLDVINKINVPVILVGQEHSGVNSIIHDDYLAGSYVGRQIVEANYKQVYFFGVTEEDKAVGQQRKNGVLDILALNHIDVQVFKTSFQFMEAKNDVKLHLQSVHTADAIIGATDTIALAIHSYCSQPHHKLIPHKIYGFGGDPITQIVTPQINTVMYHYFKAGQQALSQLHRLINHHDAQLLTVIPVEL >NZ_CP041726.1|WP_002461411.1|595042_595783_-|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MSRIWISFLTIVIYALAQYLPVFIIKLTSFQIKSPTQLLHVAIYIQVILFIIAAIIIILLQKVIKNPTKLESDYKEPKRYLVQYALLGFIVVMIYQMFAGLINTWIFGELKASPNTERLMDIARQAPIFIILISIVGPILEEYVFRKVIFGEILDRLKGNIVMRFLIASVVSSLLFALAHNDITFIIVYFGMGMIFSLAYVLTKRIAVSIMIHMMQNGFVVIMQVCFGDVLKHLQTQANAIFHLFF >NZ_CP041726.1|WP_002461410.1|595963_596248_+|co-chaperone-GroES MLKPIGNRVVIEKKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGVVIAVGLGRQLENGQRITPDVNEGDRVVFQEYAGTEIKQGNDTYLILNADDILAIIE >NZ_CP041726.1|WP_150908327.1|596307_597930_+|chaperonin-GroEL MAKDLKFSEDARQAMLRGVDKLANAVKVTIGPKGRNVVLDKEYAAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVKVAIEALHDISQKVENKNEIAQVGAISAADEEIGQYISEAMDKVGNDGVITIEESSGFNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMTAELERPYILVTDKKISSFQDILPLLEQVVQSSRPILIVADEVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVAVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLELKDATMDMLGSANKVEVTKDNTTIVDGDGDNNNIDARVSQIKAQIEETDSDFDKEKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVNIYKKVSDIQAEGDVETGINIVLKALTAPVRQIAENAGLEGSIIVERLKHADSGVGFNAATNEWVNMLEAGIVDPTKVTRSALQHAASVAAMFLTTEAVVANIPEPESNNQPPMCGGMPGMM >NZ_CP041726.1|WP_150908329.1|598044_599220_-|tyrosine-type-recombinase/integrase MASYDQISKNNWRYRISLGKNTETGKYEYISKTGFKRKSDAKHQAEMIERQLRNGDYIAPSSSTFKQVAEDWIKQYANDVKVSSVRAREKAIQHAIQHFNTKPIQTIKKHDYQRFVDDMSMQYSKNYVDSIVASTNMIFKYAHDMRLIKVMPSEGIKRPKKKVSVEELEDIEIHKKFLEKDELFQFLEVAKYHHSPLNSFEVFTTLAYTGMRAGELLALKWSDIDFENNTISITKTYYNPNNNKKHYQILTPKTESSIGKISVDPHVIQLLKDYKVNVQDTWKNGLYVDNNFVFTDVNGYPLVIKKLSTWIQAIMKKTDITNKHISTHSFRHTHCALLIEAGVHIKEIQERLRHKDINTTMNIYAKITNSYKKDASQKFSQLMENVSKELF >NZ_CP041726.1|WP_037551234.1|599228_599756_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MNIGDNIKKIRKEKKVTQSELASSLKISQSYLSDLENNRKNLGIKTIEKIAKKLNVSVAYLTSGNKMLSDLTEDEINEQFSELRFKLNKDNTNRELNLKSNLLDLIQRDLKYIDIHYFNNVYNFYELEKTEDDNLLFISVLLQMLHQHKMSGSKEAYDDITNEFNDFLKSYLNIK >NZ_CP041726.1|WP_102961623.1|599988_600168_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MFLKGYDLSDLSIKTNVSKAYLSQIFNGKKIPSPKLAKNIANTLDVEIKDLFYFEEQEA >NZ_CP041726.1|WP_103433922.1|600171_600486_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MFNINIDEDEARALLEQAINERVDELVNEKYFITYKELAEYLNLSKPTIEELLINNGLKYYMVGSTYRFKKSDVDEFMEKITSHMDIHNNDLKQINVKKLLSTK >NZ_CP041726.1|WP_049375271.1|600498_600708_+|hypothetical-protein MKQQVVITKSVVGWFNVKDVEGNLLLNIAPDVFKENFPEVSPDISIACMELELNRIVELKEKKKKKASV >NZ_CP041726.1|WP_012085720.1|600711_601116_+|hypothetical-protein MEIKQKYQLSKVVKVLEKVLYEKDKDVFLSAKDRFHSITDYRYDDTAFYEHILKLIHKELFNILVELDFEDEAFYILDEVTMTLSDVMNEDKEIYYYTVTDSTGEHEHTTDREGHVIGILEWALDYIVGNIEVE >NZ_CP041726.1|WP_150908331.1|601120_601324_+|hypothetical-protein MAAKLDVNKQNIMHAINWIIKNEEEIIFESPSQLSFFSREDLEKIDYCKRTLESLIEAKEIYNKKIS |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP041726_4 | 1267335-1267420 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041726_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041726_4
>4.1|1267364|28|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder GGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCGAAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041726_4
The CRISPR arrays of NZ_CP041726_4 >merge|NZ_CP041726|4|1267335-1267420|CRISPRCasFinder GAAATTCGACAAACAAAGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCGAAATGAAATTCGACAAACAAAGCAAGTTGGGGT >NZ_CP041726|4|3|1267335-1267420|CRISPRCasFinder GAAATTCGACAAACAAAGCAAGTTGGGGT GGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCGAAAT GAAATTCGACAAACAAAGCAAGTTGGGGT
>NZ_CP041726.1|WP_141750749.1|1266058_1266931_-|DNA-protecting-protein-DprA MDDIVLLKLRYSGIQAPQFQRLIHGYPNFLSFSEDDLLNLLSKTEIKKWFGDIAAQYKRISEDYILTSLYDASVKFITINSQCYSTLLKEIYDFPPILFYRGDISLLNSNTTLAVVGSRKATSYSYKALDFLFSQFNRRFTIVSGLAKGADSMAHELAIQHHHATIAVLGFGHLTHYPKETYILRQKIEAHHLSISEYLPFEPVTKYHFPQRNRLISGISKGVLITEAEKRSGSQITIAHALDQNRNVYVLPGDLFNPLTQGNLYRAREGACIVTGAEDILMDYDINKVF >NZ_CP041726.1|WP_070481494.1|1263817_1265887_-|type-I-DNA-topoisomerase MADNLVIVESPAKAKTIEKYLGKKYKVIASMGHVRDLPRSQMGVDVDDNFEPKYITIRGKGPVVKELKKHAKKAKKVFLASDPDREGEAIAWHLSNILELEDSKENRVVFNEITKDAVKESFKHPRDIEMDLVDAQQARRILDRLVGYNISPVLWKKVKKGLSAGRVQSVALRLVIDRENEIRNFKPEEYWTIEGEFRYQKSKFTAKFLHYKNKPFKLQNKDDVNKVTAKLDGDQFEITNVNKKEKTRNPAQPFTTSTLQQEAARKLNFKARKTMMIAQQLYEGIDLKRQGTVGLITYMRTDSTRISDAAKNEAKSYITENYGSNYVSKRQAKGKQGDQDAHEAIRPTSAMRTPNEMKSYLSRDQHRLYKLIWERFVASQMAPAILDTVALDVTQNDIKFRANGQTIKFKGFMTLYVEAKDDKENDKENKLPNLKEGDKVTATQIEPAQHFTQPPPRYTEARLVKTLEELKIGRPSTYAPTIDTIQKRNYVKLDSKRFVPTELGEIVYEQVKEYFPEIIDVEFTVNMETLLDKIAEGDMKWRKVIDDFYNSFKLDVARAEKEMEKIEIKDEPAGEDCEVCGSPMVIKMGRYGKFMACSNFPDCRNTKAIVKTIGVTCPTCKKGDVVERKSKKNRIFYGCSNYPECDFISWDKPIGRDCPKCEHYLVEKKKGRSSQVVCSNCDYQEEAQK >NZ_CP041726.1|WP_002459294.1|1262458_1263766_-|FADH(2)-oxidizing-methylenetetrahydrofolate--tRNA-(uracil(54)-C(5))--methyltransferase-TrmFO MTQTVNVIGAGLAGSEAAYQLAQRGINVNLIEMRPVKQTPAHHTDKFAELVCSNSLRGNALTNAVGVLKEEMRRLDSLIIKAADQAKVPAGGALAVDRHDFAGYVTDALRSHPNVTVLNEEITQIPDGHSIIATGPLTTSSLAQEIVNITGKDQLYFYDAAAPIIEKDSIDMDKVYLKSRYDKGEAAYLNCPMTEEEFNRFYDAVLAAEVAPVNEFEKEKYFEGCMPFEVMAERGRKTLLFGPMKPVGLEDPKTGKRPFAVVQLRQDDAAGTLYNIVGFQTHLKWGAQKEVIQLIPGLENVEIVRYGVMHRNTFINSPDVLNEKYELIGNEHIQFAGQMTGVEGYVESAASGLVAGVNLAHKLLAKGEVIFPRETMIGSMAYYISHAKNDKNFQPMNANFGLLPVLEKRIKDKKERYETLANRALEYLEKYKKTL >NZ_CP041726.1|WP_002459293.1|1261433_1262327_-|tyrosine-recombinase-XerC MNEIQKAFLYMLKVERNFSDHTIKSYHDDLMQFNEFLAQEMLTLSTFEYKDARNYLSYLYNKNLKRTTVSRKISTLRSFYEYWMTQDETVINPFVQLVHPKKEQYLPQFFYEAEMDALFETVLHDAKKGLRDRVILELLYSTGMRVSELVHIKKMDIDLTLPGVKVLGKGSKERFLPFGEFCKQSIEQYLLEFGPVKQNDHPFLLVNMNGQPITERGVRYVLNDIVKRTAGVTDIHPHKLRHTFATHLLNQGADLRTVQSLLGHVNLSTTGRYTHVSKDQLRKVYLNAHPRAKKERN >NZ_CP041726.1|WP_002459292.1|1260890_1261433_-|ATP-dependent-protease-subunit-HslV MSTSIHATTIYAVRHNGEAAMAGDGQVTLGQQVIMKQTARKVRRLYDDKVLAGFAGSVADAFTLFEKFETKLQQFSGNLERAAVELAQEWRGDKQLRQLEAMLIVMDKSGILVVSGTGEVIAPDDDIIAIGSGGNYALSAGRALKRHAAHLSAKEMAYESLKVASDICVFTNDNIIVETL >NZ_CP041726.1|WP_002478282.1|1259440_1260844_-|ATP-dependent-protease-ATPase-subunit-HslU MDTNGIKLTPKDIVSQLNEYIVGQDDAKRKVAIALRNRYRRSLLDEETKQEIAPKNILMIGPTGVGKTEIARRMAKIVGAPFIKVEATKFTEVGYVGRDVESMVRDLVDVAVRLVKNQKKAMVKDEAVAKANDKLVKLLVPSMKKKAAQGNNPLENLFGGAIPNFGNNQEDEEEPPTEEIKTKRSEIRQQLLAGKLEDEKVRIKVEQDPGALGMLGTNQNQQMQDMMNQLMPKKKVEREVPVKTARNILADDFADELIDQETANQEAIELAEQMGIIFIDEIDKVATNNQSSGQDVSRQGVQRDILPILEGSMIQTKYGTVNTEHMLFIGAGAFHVSKPSDLIPELQGRFPIRVELESLTVNDFYRILTEPKLSLVKQYEALLKTEEVTVNFTDGAITKLAEIAYQVNQDTDNIGARRLHTILEKMLEDLSFEAPNMPNAVVDITPQYVDEKLKSISTNKDLSAFIL >NZ_CP041726.1|WP_002459290.1|1258645_1259419_-|GTP-sensing-pleiotropic-transcriptional-regulator-CodY MSLLSKTRELNTLLQKHKGIAVDFKDVAQTISNVTVTNVFIVSRRGKILGSSLNELLKSERINQMLESKHIPEEYTEQLMEVKQTQSNIDIDNVLTVFPPEDRETFINSRTTVFPILGGGERFGTLVLGRVKDDFNENDLVLGEYAATVIGMEILREKHNEVEKEARDKAAINMAINSLSYSEKEAIEHIFEELGGNEGLLIASKVADRVGITRSVIVNALRKLESAGVIESRSLGMKGTFIKVKKEKFLDELERNK >NZ_CP041726.1|WP_002459289.1|1257638_1258427_-|30S-ribosomal-protein-S2 MAVISMKQLLEAGVHFGHQTRRWNPKMKKYIFTERNGIYIIDLQKTVKKVEEAYNFIKQVSEDGGKVLFVGTKKQAQESVKAEAERAGQFYVNQRWLGGILTNYKTISKRIKRISEIEKMEEDGLFDVLPKKEVVELKKEYDRLIKFLGGIRDMKSMPQALFVVDPRKERNAIAEARKLNIPIVGIVDTNCDPDEIDYVIPANDDAIRAVKLLTGKMADAVLEGQQGVSNEEVAAEQNIDLDEKEEAKDAETTEENTSVESN >NZ_CP041726.1|WP_070648622.1|1256576_1257455_-|elongation-factor-Ts MAISAKLVKQLRERTGAGMMDCKKALTETDGDIDKAIDYLREKGIAKAAKKADRIAAEGLVHVEVKGNEAAIVEINSETDFVARNEGFQELVKEIANQILDTKPESVDALMETKLPNGHSVDEKMKEAISTIGEKLSIRRFAVKSKSDNDAFGAYLHMGGRIGVLSVVEGSTDEEAAKDVAMHIAAINPKYVSSEQVSEDEINHEREVLKQQALNEGKPANIVEKMVEGRLRKYLQEICAVDQNFVKDPDQTVEAFLKSKGGKLVDFVRYEVGEGMEKREENFADEVKGQMK >NZ_CP041726.1|WP_002459287.1|1255717_1256440_-|UMP-kinase MTQTSKYKRVVLKLSGEALAGEKGFGINPIIIKSVAEQVAEVAKMDCEIAVIVGGGNIWRGKTGSDLGMDRGTADYMGMLATVMNALALQDSLEQLDCDTRVLTSIEMKQVAEPYIRRRAIRHLEKKRVVIFAAGIGNPYFSTDTTAALRAAEVEADVILMGKNNVDGVYSADPKVDPNAVKYEHLTHIQMLQEGLQVMDSTASSFCMDNNIPLNVFSIMEEGNIKRAVMGEKIGTLITK >NZ_CP041726.1|WP_037545870.1|1267589_1268825_-|aminoacyltransferase MNFTTLTCEEFNTYVSKHFSHYTQSIQLYEYRKQQHKGVHLVGVKNIYGEVIAACLLTEARVLKIFKYFYSHRGPVMDYNDLSLVKFFFKHLTRYLKKQRGLFVLIDPYILENIRNAEGEIIHTYNNEKLIDTMHRLGYEHQGFSVGYSDMSQIRWHSVLNLQQKSEDQLLKEMSYQTRRNINKTFEMGVEVITLPIEETDRFYRLFKMAEEKHGFNFREESYFEEMQKIYHDNGCIKLAYINLTDYLTRLEKQRQKLIVLLNDVKETLEINPNSKKSKTKYQQLTQQLASIDKNIAKTQDLQQEDGNILDLAAALYVYNNHEMYYLSSGSNPKYNQYMGAYRLQWDMICFAKSHHIHRYNFYGITGDFSSQAEDYGVQQFKKGFNAFVEEYIGDFIKPLRPWLYKFYSRK >NZ_CP041726.1|WP_070648624.1|1268838_1269987_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MERQQLYCKKVINPKVLITSLIFFASFLMIGELNHAWAAEETVNSQKNINVNNTINLVEKNSLKSVDDKASYKETINNKISVFNNENKKGNLIGNKTKKRNIIVNYSDSKHNQKTTKNNKFKLSNDYLNRKDRNNTNIKITKSKDSKEKPQKQLLNKTFSNSGLVGFRSAENYNERTQNYVVKKGDYLGAIAKKFNTTVSKIQKLNNIKNPNFILIGQVLKVPFISSNNSSTNTNRRNNSSSTLNYLNSLAYKGWDFDGAYGNQCFDLVNVYWNHLYGHGLRGYGAKDIPFANNFRGEATVYRNTPTFKAELGDVAVFSGRYGGGFGHTAIVLNGNYDGKLMKFQSLDQNWYGGDSRRADIAHKVVHNYDYDMYFIRPYKKA >NZ_CP041726.1|WP_002478289.1|1270182_1271091_-|succinate--CoA-ligase-subunit-alpha MSVFIDKNTKVMVQGITGSTALFHTKQMLDYGTQIVAGVTPGKGGQVVEGVPVYNTVAEAKQETGANVSVVYVPAPFAADSILEAADADLDMVICITEHIPVVDMVKVKRYLEGRKTRLVGPNCPGVITADECKIGIMPGYIHKKGHVGVVSRSGTLTYEAVHQLTEEGIGQTTAVGIGGDPVNGTNFIDVLKAFNDDEETKAVVMIGEIGGTAEEEAAEWIKANMTKPVVGFVGGQTAPPGKRMGHAGAIISGGKGTAAEKIKTLNSCGVKTADTPSEIGTTLIAAAKEAGIYEQLLTIDK >NZ_CP041726.1|WP_070648626.1|1271112_1272279_-|ADP-forming-succinate--CoA-ligase-subunit-beta MNIHEYQGKEIFRSMGVAVPEGRVAFTAKEAVEKAKELNSDVYVVKAQIHAGGRGKAGGVKIAKSLSEVETYANELLGKQLVTHQTGPEGKEVKRLYIEQGCDIQKEYYVGFVIDRATDRITLMASEEGGTEIEEVAATTPEKIFKETIDPVVGLSPYQARRIAFNINIPKESINKAAKFLISLYNVFVEKDCSIVEINPLVTTGDGEVLALDAKINFDDNALFRHKDIQELRDLEEENPKEIEASKYDLSYIALDGDIGCMVNGAGLAMATMDTINHFGGNPANFLDVGGGATKEKVTEAFKIILGDDNVKGIFVNIFGGIMKCDVIAEGIVAAVKEVELTLPLVVRLEGTNVERGKEILNDSGLAIEPAATMAEGAQKIVKLVKEA >NZ_CP041726.1|WP_002478291.1|1272389_1273157_-|ribonuclease-HII MKITIKEAKAQLNKVTTLEALSNHALHLDERKGVKQAIRVRQRQLEKELKLEQDYQRMMKYEQEILQQQPDAIICGIDEVGRGPLAGPVVACAVILNANHHYLGLNDSKKVSAVNRAQLNQDLMANVRGYAYGIASAAEIDQLNIYRATQVAMQRAINQLQVRPTHLLIDAMSIDSTISQTAIIKGDAKSVSIAAASIMAKEYRDHLMRDYAQVYPYYGFDKNVGYGTKAHLAGLKQYGVTPIHRRTFEPVKSML >NZ_CP041726.1|WP_002493074.1|1273140_1274025_-|ribosome-biogenesis-GTPase-YlqF MAIQWYPGHMAKAKREVTEQLKKVDVVFELVDARIPYSSRNPMIDDVIKQKPRVVILNKKDMTNLKEMSKWEHYFVEQGFYPVAVDAKHGKNLKGVEAAAIEATKDKFAKEQAKGLKPRAIRAMIVGIPNVGKSTLINKLARKNIAQTGNKPGVTKQQQWIKVGKVLQLLDTPGILWPKFEDELVGKKLSLTGAIKDSIVHLDDVAIFGLNFLIQHDIETLRQHYHISVEEDAAILEWFDAIGRRRGLLQKGNEVDYEAVIELLINDLRNAKMGTYCFDLYSEMKRDIAHENND >NZ_CP041726.1|WP_070648628.1|1274281_1276873_+|YfhO-family-protein MTKKLLMIMLFLTLAIIGHTYILYRFIHDGILFTGPNDGIEQMIPMQMYLYDKWSQGQFFYATDFGLGGDFFSDLSYYFSTNLLFIINAIIIYITNLIVSLPTGNVTFWTINAIVISIVKATIAMLVTYLFSMRIVKHRVNSSLIAFLFVMSPLYYRFTVYWPFFSDVFIGLPLLLYAIEHMLQQKKIGLLILAITIIMINNFYFAYYFLLIGAGYLLIRITFAHKDDRMKRITALWLSVLCAFLGLANALFMFYYSAQSYINNRRIPYKDHVPVFESLNINNNIFIDNYLIILLFITIQALLTFKLYKHYYFRLFAFLTCITILFNFMPIVDQIFNGFSAPQKRWHFLLAFNSAMVIGLFIKYFSTIRIKTYIWTNIVAQLAVFISVIVYHQYVPWLVLVPIVSLIGLFTLIIKDATSRLIIKQIYVFSIISLSILVSAVFIKNQIYFKDHEQRANNMYIHSSLYNSELQRQLLSYMTHTKEPWERIDWRVNEQDNTPMYQKFKGLSLYSSIFHHNILDLYYDNLKINLAEESLSRYQSTNGRQNIASLFSVRYMMLKDYQNNLPAYFQKIKSSGQYAIYENKLNLPAVKVTNHLYNDQSIKTSIDREHAMLDGVIVHNGGNNYHKHSKNLLNKVSQSSQHIQCLSNKHIKVNSQQGGTIKLHLPKSIRQHYTDFYLTMYIKRGQPDSNYSVAINGYVNHRLYNQSTYRTGVNTQLYRTQPDENGNISIQLTPSGTFDMKLISLHGENYHKLVQTHRQANFDHRYQDIHDGVRITLAPHSQGMAVVNIPYRKGMMAYVDGKRINPIRVNTMMTGIPVKKSTTSIIIKYLPPHWIVMLLLSSISILCSIMITRIFTKKRKDEE >NZ_CP041726.1|WP_080606678.1|1276877_1279484_+|YfhO-family-protein MQKRTVQAMKTFVMITLISFIATLIIYFPFIKDWISKGYVFSGVGDGFRQMMPFQMYLYEHYTQLKGFYDHSFGLGGDYVKSLAYYYSLSPTMWCNFIMIWLGERLLHWNPHVIGFWPFNQLIVALGRSLLTFICAFYYFRYLKLKQAPLMIATILYGASTVGLYYNFTWSFYGDLLIFLPLSLWGMERFFQRGKIGVFIVAIAITLFSNFYFSYYQAIVLGIYFLLRIIFEYRYDIVTRWQKFYLLMFGTILALFSSIIGFYTGVSSFLNNDRQQNSDFKISLFTDLTQDNYYIFSNGFYITISIIALVALLSFKLYKHYYYKLFAIITWFLLIGSLTQYFDSAFNGFSLPQRRWVYFLVLSTSALMALHIQHISELSIKQYCFAAIPVFIFGLCRYLFAEHFVNWMLISLILIIILALLVWRKKWLYHPLVLLGIVVIFFVQQVVMTIESSKRTIGPYSTTMSTITDPSYYNTKLAKVIQQINHKNNNPLHRIDYMSFYALNSPFIYHYNGISLYSSIFDGSILNYYDHLMQINMPVDKNSTYRYLSNRANLEALWNVQDRFRHPNDLNIPYGFKKIDTIKNGNDTLIHSKNTINYPATHVTNKVFNASDLKSPLDREQAMLQGIVPSDGSIKANTAFKANQNLIDEAKRSTHNATWLNHSRLKVDKNNGGVTYTLPKNVAKKYKDLYVEMDVELLTPDKNHEVGVNEYVQDRNELTYKYRRFVTPVTMRIKAADKLNIHLSQGTYRLSVKGIYGEDYSSLQQSAKDLKAVSVKENKNGYTISKSKSTSGYVVLPMVYADGMKATVNGRNEDVKKVNGIMTAIPVNKGDTNIRLTYTPPHWHLLFIMSILGIFLSIAFRFWVKRKV >NZ_CP041726.1|WP_002459304.1|1279685_1280036_-|50S-ribosomal-protein-L19 MSNHKLIEAVTKSQLRTDLPSFRTGDTLRVHVRIIEGSRERIQVFEGVVIKRRGGGISETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRNLRGKAARIQEIR >NZ_CP041726.1|WP_002459305.1|1280141_1280879_-|tRNA-(guanosine(37)-N1)-methyltransferase-TrmD MKIDYLTLFPEMFEGVLNHSILKRAQDKGIINVNTINFRDYAVNKHNQVDDYPFGGGQGMVLKPEPVFNAMKDIQHNDETRVILMCPQGRPFTQKIAQELSSTEHIVFICGHYEGYDERIREHLVTDEISMGDYVLTGGELPAMTMTDAIVRLIPGVLGNQQSHQDDSFSDGLLEFPQYTRPREFQGMTVPDVLLSGNHAHIEKWRHKQKLIRTYLKRPDLLMAYPLSEQDKEIIESFKKQLKKG |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP041726_5 | 1731356-1731435 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041726_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041726_5
>5.1|1731379|34|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder GGCCCCAACAAAGAGAAATGCGAAAAGCATTTCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041726_5
The CRISPR arrays of NZ_CP041726_5 >merge|NZ_CP041726|5|1731356-1731435|CRISPRCasFinder CCAAGCAAAGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACAAAGAGAAATGCGAAAAGCATTTCGCCAAGCAAAGCAAGTTGGGGTGG >NZ_CP041726|5|4|1731356-1731435|CRISPRCasFinder CCAAGCAAAGCAAGTTGGGGTGG GGCCCCAACAAAGAGAAATGCGAAAAGCATTTCG CCAAGCAAAGCAAGTTGGGGTGG
>NZ_CP041726.1|WP_002479357.1|1730301_1731216_+|diacylglycerol-kinase-family-lipid-kinase MTDKYNHGVLFYHEHSGLKDIYNGLGEVTKALSSICKQLSIQVSENEGDIIKYCQKIKQGDYGQKIDILFILGGDGTVNEMVNGVMKHQLDLPIGIIPGGTFNDFTKTLNIHPNFKQASEQLKYAQIGQYDVIQVNKEFALNFVGLGLIVQNAENVQNGAKDIFGKLSYIGSTVKTLMDPSNFDFTLTIDGEKTTGNTSMLLIANGPNIGGSRIPLTDLSPQDGKLNTFIFDEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIDHISGKDIRIDTKPIMKVDIDGEIRLEAPLDIKVLPKALKLLTIPT >NZ_CP041726.1|WP_070647849.1|1728468_1729974_+|peptide-MFS-transporter MASHNSHELAVEKIPQKGFFGHPKGLGVLFFVEFWERFSYYGMRAMLIFYMYYAINQGGLGIDKATAMSIMSVYGALIYMSSIPGAWIADRITGTRGATLIGAVLIIIGHVCLSLPFQMFGLFASMFFIIVGSGLMKPNISNIVGRLYPENDVRIDAGFVIFYMSVNLGALISPIILQNFLDVNNFHGGFLIAAIGMALGLVWYILFNRKTLGQVGMQPTNPLTAEEKKKYTFIIGAIVAVITAVLVVTYLTNTLSFNLVSNTVLVLGIVLPIIYFATMIYSKDVDDTERSRVKAFIPLFILGMIFWSIQEQGSNVLNIYGLEKSDMHLNIFGWTTRFGEAWFQSINPLFILLFAPLISLMWMKMGKKQPSLPVKFALGTFLAGLSYLIMGLIGVSYVSTTFSVNWVILSYVICVVGELCLSPTGNSAAVKLAPKSFNAQMMSVWLLTNASAQAINGTVVKYIDDLGQTTYFILLGSIAVVVTLIVLAFTPIIKKAMKGIH >NZ_CP041726.1|WP_002479355.1|1727683_1728184_+|NADPH-dependent-7-cyano-7-deazaguanine-reductase-QueF MTQGRQEEEMKDITLLGNQNNNYQFDYRPDVLETFVNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPDTKYARMAEHRLMNHDMYPEKIDNR >NZ_CP041726.1|WP_002479354.1|1726801_1727671_+|DMT-family-transporter MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNFVAMFIPLFFIYKYKQPMFGKLRNQPLLIGRSTLGLIGVLLNIFAIDHMVLSDADTLMKLNPFWTILLSLLFLHEKVRKYQISAMIIAIMGMLLIVKPEFSSAMLPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSRREQPYTIVFYFSLFSVIVLIPFSIATFEPMTTTQILYLLGAGLAAAVGQIGITLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTALFGFILFGETPDMYAIVGYIIIISASYYMFDQARRESNTQQSH >NZ_CP041726.1|WP_002459743.1|1725529_1725928_-|class-Ib-ribonucleoside-diphosphate-reductase-assembly-flavoprotein-NrdI MKVIYFSFSGNVQRFIKRTELSDVMEITEDNCQEEVNEPYILVTGTIGFGEVPQEVQQFLQVNHQHLQAVAASGNRNWGQNFAKAGQTISEQYNVPLLMKFEVQGSNSDVKEFKDKVGQFNENYEREKIQSY >NZ_CP041726.1|WP_002459742.1|1723461_1725567_-|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha MKIMNEKKYNHIELNNEVTKRKESGFFNLEKDQEALKVYLEEIHDKTIYFDDEIERLHYLVDHDFYFNVFDKYSEIDLREITDFAKSIEFNFASYMSASKFYKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVTIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPVAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKQEYGVTLDDIDLEQYYDDMVANPNIIKKKKDAREMLNTIAQTQLQSGYPYLMFKDNANKVHANSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIDDEIKRDISCNLGSLNIVNVMETGKFRDSVFTGMDALTVVSDEANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYFAKNKIGYESEEAKDFANVFFMMMNYYSLERSMQIAKERGQVYQDFEQSDYANGKYFSFYTAQDITPRFAKVQQLFEGIEIPTAEDWKALQQQVEAHGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPETMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELSRLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCAI >NZ_CP041726.1|WP_070815431.1|1722253_1723222_-|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta MKAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLTDDERNTFKRALAGLTGLDTHQADDGMPLIMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDTWVIEEPHLKYKADKIIENYHKLWGKEASIYDQYIARVSSVFLETFLFYSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGIDAQSLRNELSENEKQQADKEMYILLEDLYSNEVSYTHMLYDDIGLTEDVLNYVKYNGNKALSNLGFDPYFEEKDFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYTLALNVEALRDEDFIFEN >NZ_CP041726.1|WP_002459740.1|1720907_1721885_-|ABC-transporter-permease MKLLLKGYTLLICLVIMSIISLFVGVSQLSITDIFHLTKEQLNILLSSRIPRTVSILISGSTLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILISLVCFPQGHILLKLAFAVLCSLFGTFLFVKLIEMIRVKEVIFVPLLGIMLGGIVSSFTTFIALRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLIITYIFANHFTIAGMGKDFSHNLGVNYEQIVRIALFITASITALVVVTVGTLPFLGLIVPNIISIYRGDHLKNALPHTMMLGACFVLFSDIIGRLIVYPFEINIGLTIGVFGTVIFLVLLMKGRKNYANDFE >NZ_CP041726.1|WP_002459739.1|1719967_1720927_-|iron-chelate-uptake-ABC-transporter-family-permease-subunit MQMTLNKKLCALIGVTVIAALFYLFVGLDYEIFDYQFQSRFRKFILIILVGGAIGTSVVVFQAITRNRLLTPSIMGLDSVYLFAKVIPIFLLGAQSQFVTNIYLNFALTLVGMVLFALILFQFMFKVGNFSVYFILLVGVILGTFFRSITSFIQLIMDPDSFLAVQSAMFANFDASNSNLVIGSAILLCTLVIVIIVILPYLDVLLLGRAQAMNLGVNYSRVTRLLLILVALLVSISTALVGPITFLGLLTVNLAHEFMKTFQHKYILPATILMGWISLFVAQWIVENLFEATTEVSLIIDLIGGSYFIYLLIKRRNTN >NZ_CP041726.1|WP_070647855.1|1719188_1719971_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MIRIKNMTQSIQGKAILKDISVDIKKGRLTSLIGPNGAGKSTLLSAISRIIEHDSGAIELEDIDIAAYRKNLLAQKLSILKQTNHTDMNITVEQLVNFGRFPYSKGRMKEADYEQVDYAINLLHLEDIRQRDLKTLSGGQRQRAYIAMTIAQNTDYILLDEPLNNLDMKHSVQIMQTLRRLCRELNKTIVIVLHDINFASCYSDNIIALKDGELVKADEKDAVIQKEVLQELYDMNVAIESIKGQRICLYFDEQLVEDVT >NZ_CP041726.1|WP_002459750.1|1731589_1732120_-|5'-3'-deoxyribonucleotidase MTRQKIAIDMDEVLADTLGAIIEAVNKQTNLGITMEGLNGKKLKHMIPEHDGLVREILNAPGFFRQLPVLPAAQEVVEKLAAQYDVYIATAAMDVPTSFHDKYEWLLQHFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLAIFEGEPIIYTAAHNVNETRFTRVNGWKEVEAYFLN >NZ_CP041726.1|WP_002459751.1|1732357_1733413_-|histidinol-phosphate-transaminase MKKQLDQLSAYQPGLSPRALKQQFGIEGELYKLASNENLYGPSPKVKQAITDHLDELYYYPETGSPSLRKAISAHLHIDESRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDKIVTSEATFGQYYHNAIVESADVVQVPLKNGGFDLEGILNEVDEQTALVWLCNPNNPTGTYFTHEKLHDFLSRVPSHVPVLIDEAYFEFVTAEDYPDTLKLQEEFDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVIATNEAIDKWNIIRPPFNVTRISEYAAIAALEDQDYLHDITQKNAQERQKFYAIPQSKHFLPSQTNFIFVVTDKVQELYQQLLQVGCITRPFPTGVRITIGFPEQNDKMIEVLQQFDY >NZ_CP041726.1|WP_002459752.1|1733535_1735050_-|peptide-MFS-transporter MNNKNYTRQEIVSSVPQKGFFGHPKGLSTLFFTEFWERFSYYGMKAILAYYLYYAVTDGGFGLSQATGLQIVSIYGALIYMSGSIGGWIADRIIGTRHALFYGGILIMFGHILLAIPGNFTLVLIALLLLITGTGLLKPNISTTVGDLYSHDDVRLDGAFTIFYMGINLGSLLAPFITGYLQTRLGFHVGFAAAAVGMFLGLVVYVVTNKRFLGLAGLSVPNPLKKEEIKRLSLMVGSAIIMFAIILIVLQFTGLLSLESFTLIVTIIGIVLPIYIFIYMITNKKTNEVERKRIYSYIPLFITSVAFWMIQEQGSTVLANFADQNTQLSMSKLTNGLIDFQIPAAWAQSLNPIFIVVLAPVFANLWTRLGKHNPSTVHKFALGAIFAGLSYLVMMIPLMSSTELTHPLWLALSFLFITVGELCISPVGLSVTSKLAPKHLSAQMMALWMLSNATAQSINSQTVVFFKRISEQQFFMYSGLFTLIIGVLLFLISPIVIRAMRGVH >NZ_CP041726.1|WP_002479360.1|1735330_1736845_-|ABC-transporter-permease/substrate-binding-protein MNEFITTLNARKEELLATLIEHIQISFIALLIAILIAVPLGIVLTKAKRISEIVMNIAAVLQTIPSLALLGLMIPLFGIGRVPAIIALVVYALLPILRNTYTGIKEVDPSLIEAAKGIGMKPFRRLTKVELPIAMPVIMAGIRTAMVLIIGTATLAALIGAGGLGDLILLGIDRNNPSLILIGAIPAALLAIIFDVILRLMAKLSYKKLMLATGAILLVIIIAIVAPLLSHKGDTITLAGKLGSEPSIITNMYKILIEEETDDTVEVKDGMGKTAFLFNALKSDDIDGYLEFTGTVLGELTKEDLKSKKEAAVYQQAKDSLQSKYDMTMLKPMKYNNTYALAVKRDFAQKHHLKTIDDLAKVTDQLKPGFTLEFNDRPDGFKAVKKAYNLNINNVKTMEPKLRYSAIEKGDINLIDAYSTDAELKQYDMVVLKDNKHVFPPYQGAPMFKEKFLNEHKEIKAPLNRLAGKISDEEMQEMNYKVTVKNEDPYQVAKAFLKKEGLIK >NZ_CP041726.1|WP_070647848.1|1736841_1737810_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIEFKNVTKRYGQNIAVHDLSFKINEGEFFVLIGPSGCGKTTTLKMINRLIPLTEGYIYFKDKPVSDFPVYEMRWDIGYVLQQIALFPHMTIKENIAQVPQMKKWKEKEIDQCVDELLEMVGLEPDKYKNRKPDELSGGQRQRVGVVRALAADPPVILMDEPFSALDPISREKLQDDLLALQTKINKTIVFVTHDIQEAMKLGDRICVMNQGHIEQIDTPLGFKTHPQSKFVQEFMGNYLQQTSVSQHIKLKELDITTPLNEMAASTDYPVVSADQYIDDLFDMLSKHEALLVENHDTHVQSLLTREDVFEYLAQGQRGETA >NZ_CP041726.1|WP_002459755.1|1738026_1739808_-|DNA-helicase-RecQ MEAILSHYFGYQSFRPGQKEIITKILAHHNVLGVLPTGGGKSICYQIPGLKLGGTTVVISPLISLMKDQVDQLKAMGIHAAYLNSSLSQKQQKQIEQELASGKIQFLYVAPERFENQYFLSILRKLEIHLIAFDEAHCISKWGHDFRPSYQNVIQKVMTLPQDFVVIALTATATTEVQRDIMDKLYISADNRVKTSTKRRNLIFKVNPTYQRQKFVLDYVQAHRDEAGIIYCSTRKQVEELQEAIQSIDLEAAIYHAGLSNKEREQAQNDFVYDRIKVVVATNAFGMGIDKSNVRYVIHYNMPGDLESYYQEAGRAGRDGLKSECILLYSERDKGLHEYFISVSQADDDYKDKMGEKLTKMLQYTKTKKCLEATIVHYFEPNEKLEECQQCSNCVQENKTYDMTKEAKMIVSCVARMRQQENYSVIIQVLRGEQSDYIKYNHYDQLSTYGIMKAYTTSELSHLIDELRFKGFLNEHNEILICDQSVQSLLKEDVTIFTTPFRQKSKEKVYINTVEGVDRALYNELVDVRKQLSNKLGIAPVSIFSDYTLEEFAKRKPASKQEMIAIEGVGSYKLKHYCPNFLERIQSYKANIS >NZ_CP041726.1|WP_002479361.1|1739821_1741705_-|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MEAYKIEHLNKSYADKVIFDDLSLAISNHEKIGLVGINGTGKSTLLKVMGGIDDDFTGDITHPNQYRIRYSSQKQDLDGNLSVFEAVLSSETSTLQIIKHYEQAVQQYTVEQTDRNFQAMMAAQEAMDRHEAWDYNAEIKTILSKLGIHDTTKQVSSLSGGQQKRVVLAKTLIEQPDLLLLDEPTNHLDFESINWLINYVKQYPYTVLFVTHDRYFLNEVSTRIVELDRGKLTTYPGNYEDYIAMRAEKEVIEQKQNDKQRALYKQELAWMRAGAKARSTKQQARIHRFNDLEADVKQQQTQDKGELNLAYSRLGKQVYELDSLTKIINGRTLFQDITQIIQSGQRIGIVGPNGAGKTTMLNILSGEDQQFEGTLKIGQTVKVAYFKQTEETLNRDIRMIDYLREESEVAKEKDGTTVSITQLLERFLFPSSTHGKKIYKLSGGEQKRLYLLRLLVHQPNVLLLDEPTNDLDTETLTILEDYIASFGGSVITVSHDRYFLNKVAQEYWFIHDGMMERIVGSFEDYETYKKEKDKQLAIEKQATNTSKTQIKERKKTGLSYKEKREYESLMSRIEETEIRLSEIEQEMIEASADYAKIKDLTIEQQQLEQTYDEDITRWSELEELKEV >NZ_CP041726.1|WP_070647846.1|1741816_1742632_+|ZIP-family-metal-transporter MEELFGSLPSYFQALIAGIITWLLTALGAAGVFIFNKVNGKVLASMQGFAAGIMIAASFWSLLQPSIEFKEGTTLPWLPAAIGFLLGGLFIRLLDAIIPHIHQRIGDKSHYREGVKTSLNKNTLLVLAITLHNIPEGLSIGVAFGGIASSNEHATFLGALGLAIGIGIQNIPEGAALSMPIRAAGASKWKAFNYGQASALVEPIFAILGAALIVVMTPVLPYALAFAAGAMIFVVVEELIPDSQSGNNTDLATLNLMIGFTIMMILDVALS >NZ_CP041726.1|WP_002479363.1|1742799_1744737_-|polyglycerol-phosphate-lipoteichoic-acid-synthase-LtaS MSIRKKKISLFTFFILTVLTVTLKTYFSYYVDFSLGVKGLVQNLILLMNPYSLVALILSVFLFFKGKKAYWFIFIAGFLLTFLLYANVVYFRFFTDFLTFSTLNQASNVESMGGAVTASFKWYDFVYFIDTFIYLFILIFKNNWLDKRVFSKKFVPVVMAASVALFFLNLAFAETDRPELLTRTFDHKYLVKYLGPYNFTVYDGVKTIQNNQQKALASEDDLTKVLNYTKQKRTKANPEYFGVAKKKNIIKIHLESFQTFLINKKVNGKEVTPFLNKLSSGKQDFRYYPNFFHQTGQGKTSDSEFMMDNSLYGLPQGSAFSLKGDNTYQSLPAILDQKQGYTSNVMHGDYKTFWNRDQIYRHFGIDKFYDATYYDMSEDNVVNLGLKDKEFFKESAGYQKKMKKPFYSHLITLTNHYPFTLDDKDADIDKPNTGDSTVDGYIQTAHYLDQALEQYVNDLKKEGLYDDSVIMIYGDHYGISENHNNAMEKLLGEQITPAKFTDLNRTGFWLKIPGKEGTVDKTYAGQMDVMPTILHLVGIDTKNYIMMGTDLLSKEHKDVIPFRNGDFITQNYKYVNGKIYSNKDNKLLEKKPKDFDKNKQQVEKDLEMSDSILNGDLFRFYNNPDFKKVNPAKYEYKTGPKGNQK >NZ_CP041726.1|WP_002479364.1|1745287_1746292_-|biotin-dependent-carboxyltransferase-family-protein MSIKVIKEGLFSSFQDFGRRGYEHDGVIPGGALDELAHEIANRLVANDKNEATLEMTHKLPTLQFTEPTLIALTGSNFKAQTEHLTITPYKLYLIQAGDTLTFNETSRTSRVYLAVGGGFQLDEWLGSSSTDFNTHIGGFKGRTLQAGDTIQLKNNYSHRHTKLFENLAESNQTDWGIDGYALSFNYISDVFHVIKNKGTEDFDEATVQRFTLGDYKVTSKANRMGMYLQGESIKAYYEDMPAHQSVKRGTIQVKRDGTPIILLNDHYTLGSYPQIGTIASYHLSKLAQKPQGARLKFQFIDVETAEKNVVKYSHWVNQIFHAIEYRMKLEMLK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP041726_6 | 1777442-1777531 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041726_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041726_6
>6.1|1777474|26|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder TGCAACGCAAGCTGGGGTGGGGCCCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041726_6
The CRISPR arrays of NZ_CP041726_6 >merge|NZ_CP041726|6|1777442-1777531|CRISPRCasFinder CAGCACAAAGAAATGCACCAAGCATTTCTACGTGCAACGCAAGCTGGGGTGGGGCCCTCAGCACAGAGAAATGCACCAAGCATTTCTACG >NZ_CP041726|6|5|1777442-1777531|CRISPRCasFinder CAGCACAAAGAAATGCACCAAGCATTTCTACG TGCAACGCAAGCTGGGGTGGGGCCCT CAGCACAGAGAAATGCACCAAGCATTTCTACG
>NZ_CP041726.1|WP_002479384.1|1776745_1777435_+|hypothetical-protein MKSTSQLMRENNVKSLRLNNTDREIFENYMTYVRAELSVNPYDSELMLNRILKQLLKAEDNGTLALEFFNHDPKAHAKQEIRALPNETINNIFNYIYQNFMFLIGIFCFCKGFIGFFIGGNNNRIYLYTFPIIVIIGLFIIFLFIWMIFKTVQLQCFNNKNLVWILTYIVIGLLISALVYVFFIPQSFLAIGPYITISNWHFIIASLIITPIAFYTKHRHTNKNANTRL >NZ_CP041726.1|WP_002459791.1|1776082_1776535_-|hypothetical-protein MKKGLVLLLAAIFLLTACGKGNDEKQSLEQDIQKLEKEKKDLEKQEEKLKSDKEKYKSQRETLEKEVEEMQSTSSDDDKDNKEKTSDKSKEKSSQHQTTHHQNKDQQNQHQNSNNTDNTQTDKDKTHKQQSSQSTKNDTQKQSKQPKQQQ >NZ_CP041726.1|WP_002459790.1|1775660_1775957_-|hypothetical-protein MHEQDFRILEGQDITLPELGRELETLTGRTIVDSTGEINRVVAHLPNFDSDFDTFVATYKLNHQNDFIDAIFTAPKAQRNRLKEIPVHIELISYISKA >NZ_CP041726.1|WP_002492957.1|1775004_1775547_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MTVYIETERLKLRDWEENDLLPFQKLNANPQVRRYFPSLLSYRRSALDMKQMQKNITATGIGLFAVELKETNEWIGFIGLNYIPKDSQYPFNNLPFYEIGWRLIPEVWGNGIATEGAEAVLKYAQKKGVYDIYSLTAETNLSSRKVMEKIGMKVFDRFEFPELNKYHPLKMQVRYYKNLK >NZ_CP041726.1|WP_002479382.1|1774406_1774973_+|TIGR00730-family-Rossman-fold-protein MKKIAVFCGASKGSNPTYVNEAYNLGKYMAQKGYELIFGAGSVGIMGAIQNGVLDHNGTVIGVMPKELDTKEITSQRVSELILVDSLHQRKEKMAELADAFILAPGGAGSLEEFFEIYSWTQIGIYQKPIGIYNLNGFFEPLHQLIIHMIQEGFIDEKYKALAPLYHTKEDLLHGLQNAKPLGERSYD >NZ_CP041726.1|WP_070647837.1|1773944_1774391_+|YaiI/YqxD-family-protein MTSIIIDGDACPVIQSVIELTSGTGIFVIIVRSFSHYTTQTYPEHVNTIYVDDGPDAVDYKIVQLAQSKDIVITQDYGLASLLLNKVKTVLHHKGYIYNSTNIDMLIQQRYNHAQLRKQSGRHKGPTPFSNKDQQHFEHIFRRVLSQI >NZ_CP041726.1|WP_111703912.1|1773354_1773570_-|DUF1736-domain-containing-protein MLSASLRFFFANFSPFFSIYSGSFSFAIFFNSRLLSCSCFLSITNSLTSVALLATVLDARDVAAVTFLTSE >NZ_CP041726.1|WP_002459785.1|1772049_1772922_+|undecaprenyl-diphosphate-phosphatase MFLLELIKGIILGIVEGLTEFAPVSSTGHMILMDDMWLKSTDFLGSESAFTFKVVIQLGSVFAAAWVFRERFFELLHIGKQHQAPISEEFRSKPRRLNLLHVLVGMIPAGILGLMFDDLIEKYLFSVPTVMIGLFLGAIYMIIADKYSEKVKHPQNVDQINYFQAFVIGISQAIAMWPGFSRSGSTISTGVLMKMNHKAASDFTFIMSVPIMLAASGLSLIKHYEYIHLAHIPFYLLGFLAAFIVGLIAIKTFLHLINKIKLVPFAIYRIILVVIIAILYFGFGIGKGIY >NZ_CP041726.1|WP_002459784.1|1771227_1771668_+|MarR-family-transcriptional-regulator MSEHHNLKEQLCFSLYNAQRQVNRYYSNKVFKKYNLTYPQFLVLSILWDESPVNVKKVVTELALDTGTVSPLLKRMEHVDLIKRERSEVDQREVFIHLTEKSEGIKPDLKDASSKVATASSLSADEAQELNRLLGKVINAFTENKE >NZ_CP041726.1|WP_070647839.1|1770070_1771003_-|GTP-binding-protein MKKHNCRNTYISIVSGFLGSGKTTFLQEYMQYLLKTDEKITIIMNEFGTFDVDSLTFNNEVAINALVNGCVCCDLKADLVAQLKNIIADGQTTHIIIEATGIAHPLEIMMACQDPEVIHLISEVKMIGILDASRFLHRHRYSLTTVELMEEQLAYSSTIIINKMDLINDQEQKKLSAELTQINPQATTCYTTFGQLDITTFNNIKHVDNMKSLAKHAHHHGIKSMQYTFSGPIDRQLFYQFILKLPQNVFRLKGFVRFRDRANVIYEFQYAHGLPSYGEVDKEVPLTIVIIGEHIDVERLRNNLDMLQFT >NZ_CP041726.1|WP_002479385.1|1777884_1778370_-|DUF456-domain-containing-protein MTVLLWLLIIFAFILAFVGLIKPVIPSVLMLWVGFLIYQFAFNNGELSWIFYVSMIVLTVLMFISDFAMNKYFVNKYGGSKISEYVALIGVLVGCFVFPPFGIIIIPFVAVFAVELMQDFDVNKAFKASLGSIVAFLTSNIAKAIIMFIMIVWFFIDVFVI >NZ_CP041726.1|WP_002459795.1|1778371_1779589_-|MFS-transporter MFKALLHIKNYKLFVVNMMLLGMGIAITVPYFVLFATNELGMTTNQFGILLALAAVSQFTINSIVARFSDTHNINRKFLIITALFMGAVSFSIYFYIHDIWLFIITYAIFQGLFAPAMPQLYASARESINISSSRKNAKFANTVLRSMFSFGFLFGPLIGSRLIHFNGYAGLFGGTVAIILFTLLLQVFFYQDLKLTGEQQVGGTAHIETTAPNMLKDVTLFLPFVAFILLHIGQWMYTMNMPLFVTKQLHISEDYVGTLASLCAGLEVPFMVILGMLATKLQTRTLLIVGALSGGAFYFSIGIFNNIYMMMLGQVFLAFFLAILLGLGISYFQDILPDFPGYASTLFANAMVIGQLCGNLLGGAMSQWVGLENVFFVSASSIFIGMVLIFFTKDQKFTEEKVIS >NZ_CP041726.1|WP_150908419.1|1779674_1780529_-|LysR-family-transcriptional-regulator MKIEDYRLLITLDETKTLRKAAELLYISQPAVTQRLKAIENNFGVDIFIRTKKQLITTTEGAMIIEHARDMLKRERLFYDKMQAHIGEVNGTISIGCSSLIGQTLLPDVLSLYNTQFPNVEIQVQVGSTEHIKAHHRDYHVMITRGNKVMNLTNTHLFNDEHYFIYPKDKRAEVDKLPFIEFQANPIYINQIKEWYNDNLGQDFHATITVDQVGTCKEMLLSGVGVTILPEVMMKYIDKNQFECEKVLIEGQPLIRSTFMSYEANMLQLPQVDSFVNLMYNFIR >NZ_CP041726.1|WP_002459797.1|1780979_1781600_-|DUF402-domain-containing-protein MAVKVKYIDKRHWRRLIEREYIEVKVNNKRFKGIIGLVTMNKVREPLEVTVVGKHMVVADDHYQWLQILPEKKRYSITAMFDDKGQPLEYYFDINIKNITQKGNARTLDLFLDVLVLPTGKYELVDEDDLMNALVNEQITKRQYHEAYMIAHQLMIEINDNFDELERRIMHCYRKMNQKKHKAKRHHHQAPQPQQRHKRKKRFTED >NZ_CP041726.1|WP_002459798.1|1781977_1782445_-|cupin-domain-containing-protein MISAEEWINRLELMPHPEGGYYKETLRPDDKKRASYSSIYFLLKDADVSHFHRIDADEVWYHHSGETLLIHMITTEGKYYVEQLGQNVADGDVLQCVVPKGTIFASSLKHSKGYGIVGCMCQPAFEFEHFELLAQAILLEKYPQHQEIIKAYAVE >NZ_CP041726.1|WP_002459799.1|1782444_1783161_-|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MGRKWNNIKEKKAQKDKNTSRIYAKFGKEIYVAAKSGEPDPNSNQALRLVLERAKTYSVPNHIIDKAIDKAKGAGEENFDHLRYEGFGPSGSMIIVDALTNNVNRTASDVRAAFGKNGGNMGVSGSVAYMFDDTATFAIEGKSADDVLEALMEQDVDVRDVIDEDGLTVVYAEPDQFAQVQEALRAIGVEEFKVAEFEMLPQTDIELSAEDQETFEKLVDALEELEDVQNVFHNVDLK >NZ_CP041726.1|WP_002459800.1|1783394_1783754_-|MarR-family-transcriptional-regulator MSKDKLNQLLNLYKKHKLLSEYIDKKYKLTLNDLAVLKLAKDYTSEEKVLMQSFLKLAIEELDLSRTKLLVSIRRLIDKEKLSKQRSEEDERKIFIYMNDDNIESFNDLFKDVEELLEI >NZ_CP041726.1|WP_070647836.1|1783897_1786042_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTNTFFRILTKEEYQPTRCIDGIIVILPIQGDLTIQHFANSTTISDEIYIINNKDIFTIKQNHKSLMLYITSDWFKNHDYVFFDYKYSVNLIKSINKLKQLMLKIAINYINQMPITSNENYIKQMVEVIATEGSVDLETAENQYKFLFYGELSQILEYINKHSHEKLTLNALSQNLFTSKSNISAQFHQNLNMGFKQYVDSLKIAESIEYLLTENSTISHISDKLEFSNSASYTKMFKSYIGITPNDYRSLNIKDKYLLMNYEVLSEDNEQHLKTVLRQQINYYQENIERKIFIDNNKVKTNQNFELVTQINTVEEFKELFFIKIKGKANINTENLIIYVNFGIGTLINNLSDAEIGDMFKKIAANNLHIAFKIQSLEIMDYIERIYVQVVERLNYKKSLANGDRGIIMLVFDMEVIELKEIYRLILKIQNKQFGLRFGLDISCLLNETVMFKTLESQIKRIGFDYLFIDNAHLEQPYLLEDSQHLLLKNILEYQNIEKILTQIDLSYSKVIFLNIENHQFLNNENDLSNSAPLIIETFLKTAELFDGMGVNLYFSRNSFNAIHIFDENGFKTVLGIIIGQIKWMMNQSRTIKDNYIVVENEAQYTLFLYDWRVFESEASITYFGDTEVLIHFEEVAEQSIRLIKSEKVDEKNGNINHIINRHIREKYNWTQELLKEIEDHLHTTMRIIEHDFRKDYFKVNLGYDSLRIIKIFK >NZ_CP041726.1|WP_002459802.1|1786349_1787003_-|membrane-protein MNDFSKKQRHMTDHSQSKSWAYSQVWLYFMYYWLIFGIGCYFGQYLPDEWRMPLSIGLLVLIFSTLIFKRARKYGLIISHIYAIIVGLLSYAMFTTYLQNLGADVFYKNIVLAIGAFVIFGVIGFFFIKDASSIGRYLFVTLLALIVASLIGLFIHNPVFYTVITVVSLFLFLLYTLYDFNRMKRGQFSPREMGFNLFINLLNIILDILSLANRFRN >NZ_CP041726.1|WP_002479388.1|1787370_1788174_+|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MKKLAFAITAASGAAAALTHQHAEAATQHTVKSGESLWSIAQQHNTTVNDIKQSNNLSNNFVFPGQVLSVGGNNTNSSQYSGQNSSATSHTVQAGESLNLIANQYGVSVNDLMRANNLNGYLIMPNQTLNIPSGSGNGAGSGGTTVTPSNTNTTPTFNHSNLYTSGQCTWYVFDRRSQAGKPISTYWSDAKYWAGNAANDGYRVDNSPEVGAIMQSTPGPYGHVAYVERVNGDGSILISEMNYTYGPYNTNTRTIPASEVSSYAFIH |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP041726_5 | 5.1|1731379|34|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder | 1731379-1731412 | 34 | NZ_CP041726.1 | 633321-633354 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP041726_5 | 5.1|1731379|34|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder | 1731379-1731412 | 34 | NZ_CP041726.1 | 794336-794369 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP041726_5 | 5.1|1731379|34|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder | 1731379-1731412 | 34 | NZ_CP041726.1 | 2223184-2223217 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP041726_2 | 2.1|305938|31|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder | 305938-305968 | 31 | NZ_CP041726.1 | 1368378-1368408 | 1 | 0.968 |
| NZ_CP041726_5 | 5.1|1731379|34|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder | 1731379-1731412 | 34 | NZ_CP041726.1 | 479509-479542 | 1 | 0.971 |
| NZ_CP041726_5 | 5.1|1731379|34|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder | 1731379-1731412 | 34 | NZ_CP041726.1 | 614858-614891 | 1 | 0.971 |
| NZ_CP041726_2 | 2.1|305938|31|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder | 305938-305968 | 31 | NZ_CP041726.1 | 1402184-1402214 | 2 | 0.935 |
| NZ_CP041726_2 | 2.1|305938|31|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder | 305938-305968 | 31 | NZ_CP041726.1 | 348565-348595 | 2 | 0.935 |
| NZ_CP041726_4 | 4.1|1267364|28|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder | 1267364-1267391 | 28 | NZ_CP041726.1 | 1387149-1387176 | 2 | 0.929 |
| NZ_CP041726_5 | 5.1|1731379|34|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder | 1731379-1731412 | 34 | NZ_CP041726.1 | 479566-479599 | 2 | 0.941 |
| NZ_CP041726_5 | 5.1|1731379|34|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder | 1731379-1731412 | 34 | NZ_CP041726.1 | 784203-784236 | 2 | 0.941 |
1. spacer 5.1|1731379|34|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder matches to position: 633321-633354, mismatch: 0, identity: 1.0
ggccccaacaaagagaaatgcgaaaagcatttcg CRISPR spacer ggccccaacaaagagaaatgcgaaaagcatttcg Protospacer **********************************
2. spacer 5.1|1731379|34|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder matches to position: 794336-794369, mismatch: 0, identity: 1.0
ggccccaacaaagagaaatgcgaaaagcatttcg CRISPR spacer ggccccaacaaagagaaatgcgaaaagcatttcg Protospacer **********************************
3. spacer 5.1|1731379|34|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder matches to position: 2223184-2223217, mismatch: 0, identity: 1.0
ggccccaacaaagagaaatgcgaaaagcatttcg CRISPR spacer ggccccaacaaagagaaatgcgaaaagcatttcg Protospacer **********************************
4. spacer 2.1|305938|31|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder matches to position: 1368378-1368408, mismatch: 1, identity: 0.968
ggcccccaacacaaagaaatgcaacaagcat CRISPR spacer ggcccccaacacaaagaaatgcatcaagcat Protospacer *********************** *******
5. spacer 5.1|1731379|34|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder matches to position: 479509-479542, mismatch: 1, identity: 0.971
ggccccaacaaagagaaatgcgaaaagcatttcg CRISPR spacer ggccccaacaaagagaaatgtgaaaagcatttcg Protospacer ********************.*************
6. spacer 5.1|1731379|34|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder matches to position: 614858-614891, mismatch: 1, identity: 0.971
ggccccaacaaagagaaatgcgaaaagcatttcg CRISPR spacer ggccccaacaaaaagaaatgcgaaaagcatttcg Protospacer ************.*********************
7. spacer 2.1|305938|31|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder matches to position: 1402184-1402214, mismatch: 2, identity: 0.935
ggcccccaacacaaagaaatgcaacaagcat CRISPR spacer gggccccaacaaaaagaaatgcaacaagcat Protospacer ** ******** *******************
8. spacer 2.1|305938|31|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder matches to position: 348565-348595, mismatch: 2, identity: 0.935
ggcccccaacacaaagaaatgcaacaagcat CRISPR spacer gggccccaacaaaaagaaatgcaacaagcat Protospacer ** ******** *******************
9. spacer 4.1|1267364|28|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder matches to position: 1387149-1387176, mismatch: 2, identity: 0.929
ggggccccaacaaagagaatttcgaaat CRISPR spacer ggggccccaacaaagaggctttcgaaat Protospacer *****************. *********
10. spacer 5.1|1731379|34|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder matches to position: 479566-479599, mismatch: 2, identity: 0.941
ggccccaacaaagagaaatgcgaaaagcatttcg CRISPR spacer gggcccaacaaagagaaatgtgaaaagcatttcg Protospacer ** *****************.*************
11. spacer 5.1|1731379|34|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder matches to position: 784203-784236, mismatch: 2, identity: 0.941
ggccccaacaaagagaaatgcgaaaagcatttcg CRISPR spacer ggctccaacaaagagaaatacgaaaagcatttcg Protospacer ***.***************.**************
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP041726_3 | 3.1|594697|29|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder | 594697-594725 | 29 | NC_018265 | Melissococcus plutonius DAT561 plasmid 1, complete sequence | 120055-120083 | 6 | 0.793 |
| NZ_CP041726_2 | 2.1|305938|31|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder | 305938-305968 | 31 | NC_007058 | Staphylococcus phage ROSA, complete genome | 41574-41604 | 8 | 0.742 |
| NZ_CP041726_2 | 2.1|305938|31|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder | 305938-305968 | 31 | KT186243 | Staphylococcus phage vB_SauS_phi2, complete genome | 37495-37525 | 8 | 0.742 |
| NZ_CP041726_2 | 2.1|305938|31|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder | 305938-305968 | 31 | AY954955 | Bacteriophage 42e, complete genome | 41355-41385 | 8 | 0.742 |
| NZ_CP041726_2 | 2.1|305938|31|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder | 305938-305968 | 31 | AY954961 | Bacteriophage ROSA, complete genome | 41574-41604 | 8 | 0.742 |
| NZ_CP041726_2 | 2.1|305938|31|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder | 305938-305968 | 31 | NC_007052 | Staphylococcus phage 42e, complete genome | 41355-41385 | 8 | 0.742 |
| NZ_CP041726_2 | 2.1|305938|31|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder | 305938-305968 | 31 | AP013478 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G18, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S26-C62 | 18066-18096 | 9 | 0.71 |
| NZ_CP041726_3 | 3.1|594697|29|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder | 594697-594725 | 29 | MT774376 | CrAssphage cr55_1, complete genome | 42412-42440 | 9 | 0.69 |
| NZ_CP041726_3 | 3.1|594697|29|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder | 594697-594725 | 29 | MT774380 | CrAssphage cr1_1, complete genome | 46180-46208 | 9 | 0.69 |
| NZ_CP041726_5 | 5.1|1731379|34|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder | 1731379-1731412 | 34 | MN094788 | Achromobacter phage Motura, complete genome | 4294-4327 | 9 | 0.735 |
1. spacer 3.1|594697|29|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder matches to NC_018265 (Melissococcus plutonius DAT561 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
caaagactttccaaaagaaagtccacgaa CRISPR spacer aaaagactttccataagaaagtctaaata Protospacer ************ *********.* . *
2. spacer 2.1|305938|31|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder matches to NC_007058 (Staphylococcus phage ROSA, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
ggcccccaacacaaagaaatgcaacaagcat CRISPR spacer agttaccaacacaaagaaacgcaccaaggaa Protospacer .*.. **************.*** **** *
3. spacer 2.1|305938|31|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder matches to KT186243 (Staphylococcus phage vB_SauS_phi2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
ggcccccaacacaaagaaatgcaacaagcat CRISPR spacer agttaccaacacaaagaaacgcaccaaggaa Protospacer .*.. **************.*** **** *
4. spacer 2.1|305938|31|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder matches to AY954955 (Bacteriophage 42e, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
ggcccccaacacaaagaaatgcaacaagcat CRISPR spacer agttaccaacacaaagaaacgcaccaaggaa Protospacer .*.. **************.*** **** *
5. spacer 2.1|305938|31|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder matches to AY954961 (Bacteriophage ROSA, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
ggcccccaacacaaagaaatgcaacaagcat CRISPR spacer agttaccaacacaaagaaacgcaccaaggaa Protospacer .*.. **************.*** **** *
6. spacer 2.1|305938|31|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder matches to NC_007052 (Staphylococcus phage 42e, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
ggcccccaacacaaagaaatgcaacaagcat CRISPR spacer agttaccaacacaaagaaacgcaccaaggaa Protospacer .*.. **************.*** **** *
7. spacer 2.1|305938|31|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder matches to AP013478 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G18, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S26-C62) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
ggcccccaacacaaagaaatgcaacaagcat CRISPR spacer gatgagttacataaagaaatgcaaaaagcat Protospacer *.. . ***.************ ******
8. spacer 3.1|594697|29|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder matches to MT774376 (CrAssphage cr55_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.69
caaagactttccaaaagaaagtccacgaa CRISPR spacer taaagactttcctaaagaaagtatttatc Protospacer .*********** ********* . ..
9. spacer 3.1|594697|29|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder matches to MT774380 (CrAssphage cr1_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.69
caaagactttccaaaagaaagtccacgaa CRISPR spacer taaagactttcctaaagaaagtatttatc Protospacer .*********** ********* . ..
10. spacer 5.1|1731379|34|NZ_CP041726|CRISPRCasFinder matches to MN094788 (Achromobacter phage Motura, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ggccccaacaaagagaaatgcgaaaagcatttcg CRISPR spacer agttccaacaaagagaactgcgaacagcgcgtgg Protospacer .*..************* ****** ***.. * *
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
595963 : 611446
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP041726|595963:611446|DBSCAN-SWA 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24 | uncultured_Caudovirales_phage(65.0%) | integrase,coat,terminase | attL 597913:597932|attR 614557:614576 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
732624 : 762878
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP041726|732624:762878|DBSCAN-SWA 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30 | Staphylococcus_phage(96.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
879579 : 888598
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP041726|879579:888598|DBSCAN-SWA TGTGGACGATAGAATGGTTGACCAATCATTTCACCAAGAAGATTCTGCATTTGAATATTCATTAAGACCAACATATTTAAAGCAATATATAGGTCAAACAACGATTAAAAGTAACTTAGAAGTATTTATTCAAGCCGCAAAATTAAGAGAAGAACCTTTAGACCATGTATTATTGTTCGGTCCCCCTGGTCTTGGTAAGACAACATTATCAAATATTATTGCAAATGAGATGGAAGTTAATATTAGAACTGTATCTGGTCCTTCTCTCGAGCGACCTGGAGATTTAGCTGCAATTTTATCTGGATTACAACCTGGGGATGTCTTATTTATAGATGAAATTCACCGTCTGAGTAGTGTAGTTGAAGAAGTTTTATATCCAGCAATGGAAGATTTTTTCCTAGATATCATCATTGGTAAAGGTGATGAAGCACGAAGCATTCGTATTGATTTACCTCCGTTTACATTAATAGGTGCAACGACAAGAGCCGGTAGTTTAACAGGACCTTTAAGAGACCGTTTTGGCGTGCATTTGCGTTTAGAATACTATAATGAACACGAATTAAAAGAAATAATTATTCGTACAGCAGATGTTTTAGGTACTTCTATTGATGATGAAAGTGCAGTTGAATTAGCTAAACGTTCTAGAGGTACACCAAGAGTAGCAAATCGTCTATTGAAGCGAGTTAGAGATTTTCAGCAAGTTAATGGTGATGATCAAATATATATAGAAACGACTAAGAAAGCTTTAAAGTTGCTACAAGTTGATGAGCAAGGTTTAGATTATATTGATCATAAAATGATGAATTGCATCATTAACCAGTATCAAGGTGGACCAGTTGGCTTAGATACTATTGCCGTATCTATTGGAGAAGAAAGAGTAACGATTGAAGACGTCTATGAACCTTTTTTAATTCAGAAAGGATTTATCGAACGTACCCCTAGAGGTCGTAAAGCAACTGCATTTGCTTATGAACACTTTATGAAATCGAAAGAGAAGAGGGAGTAAATTTGAATATTGAGGATTTTGACTATCATTTACCAGAATCTTTAATTGCACAAACACCTTTAAAAAATAGAGATCAAAGTCGCCTATTAGTATTAAATAAAGAAACAGGCGATATGAAACACCAACATTTTAAAGATGTCATTAATTATTTGAATCCTGGAGATACTTTAGTTCTGAATGATACACGCGTGATGCCTGCACGTTTATTCGGAGTTAAAGAAGAGACGGGTGCTAAAGTAGAAATGTTAATGCTAACTCAAATCGAAAATAACGATTGGGAAGTTTTACTTAAACCAGCCAAAAGAATCAAAGTAGGTAACCAACTGTCGTTTGGTGAAGGGAAAATAATAGCAGAATGTATTAAAGAATTAGACCAAGGTGGCAGAATCATGCGATTGCATTATGAAGGAATATTGCAGGAAAGGCTAGACGAGTTAGGTGAAATGCCTTTACCACCATATATAAAAGCGCGTTTAGACGATCCAGATCGATATCAAACTGTTTATGCTAAAGAGAATGGTTCAGCCGCTGCGCCCACTGCTGGACTACATTTCACTGATAATTTATTGAAAGATATTAAAGCTAAAGGTGTTAATATAGCTTTTATCACACTGCATGTTGGTTTAGGAACATTTAGGCCCGTGAGTGTAGAAAATATCAATGAACATGAGATGCATAGCGAATATTACCAAATGACCGAAAATACAGCAAAGTTATTGAACAATACAAAGTTACAAGGTCATCGAATCATTGCAGTAGGTACAACGTCGACACGAACTTTAGAAACGATTCGTCGAGATCATTCACAATTCATTGCTACGAGTGGATGGACAGATATATTTATTTATCCTGGTTTTGAGTTTAAAGCCATTGACGCACTTATTACTAACTTTCATCTGCCTAAGTCAACATTAGTCATGCTTGTGTCAGCATTTAGTAGTAGACAATTTATCTTAACGGCATACCGTAAAGCTGTAGAATTAGAATATCGATTCTTTAGTTTTGGTGATGCAATGTTAATTATTTAAGGAATGTGAGGTTTAATTATGCCAGCAGTAACATATGAACATATCAAGACTTGTAAACAATCTGGCGCGCGTTTAGGAATTGTTCACACGCCACATGGCTCGTTTGAAACACCAATGTTTATGCCTGTGGGGACAAAGGCGACAGTTAAAACTATGAGTCCTGAAGAATTAACAGATATAGAAGCTAAAATTATATTAGGTAATACCTATCATTTGTGGTTACAACCTGGAAATGATATTATCAAACAGGCTGGGGGCTTACATAAGTTCATGAATTGGAATGGTCCTATCTTAACTGATTCAGGTGGCTTTCAAGTTTTTAGTTTAAGTAATTTACGTAAGATTTCAGAAGAAGGTGTTGAGTTTCGACATCATACGAATGGCTCGAAACTCTTTTTAAGTCCGGAAAAATCCATGGAAATTCAAAATGATTTAGGGTCTGACATTATGATGGCCTTTGATGAATGTCCACCGATGCCTTCAGAATATAAATACGTAAAAGATTCAATTGAACGAACTTCTCGGTGGGCAGAACGTTGTTTAAAAGCACATAAACGACCTGATGATCAAGCATTATTTGGCATTATTCAAGGTGGAGAGTATAAAGATTTACGTGAACAAAGCGCTAAAGAACTTGTCGCATTAGATTTTCCTGGATATGCGATTGGTGGTTTATCTGTAGGCGAACCCAAACCTGTCATGTATAATATGGTGAAACACACAGAACAGTTTATGCCAAAAGATAAACCTAGATATTTGATGGGCGTAGGCTCACCAGATGCCTTGATTGAGTGTAGTATAAGAGGCATGGATATGTTCGACTGTGTACTACCTACACGTATTGCACGAAATGGCACTTGTATGACATCAATTGGACGTCTTGTAATTAAAAATGCACAATTTGCTAATGATTTCCGTCCACTAGATGAAAATTGTGATTGCTACACATGTAAAAATTATTCCAGAGCGTATATCAGACATTTAATTAAAGCAGAGGAAACGTTTGGTATTCGTCTTACTACTATTCATAATCTTCATTTTCTGCTAAAATTAATGGAAGATATTAGACAGGCCATAAGAGAAGATAGACTTTTAGATTTTAAAGAAGCGTTCTTTGAACAATATGGACTTAATGTTGAAAACCCTAAAAATTTTTAAATAAGGAGTAAGTACAGAATGAATTTAACAGCAATTTTAATACCAGTACTTTTTTTACTTGTATTCTACTTTTTAATTATTCGTCCACAACAAAAACGTGCTAAAGAGCACCGTGAAATGGTTAATAGAGTTGAAGCAGGTCAAAAAATCACAACAATTGGCGGTTTGAAAGGAACAGTTAAAGCTGTTGATGAAACAACAGTTGTTATCACTGTTAATGGTCATGGCACTGAAATGACTTTTGAAAAACCTGCAATTAAACAAGTAGATCCATCTTAATCACTGTGAGCCAAGAAGCATTTGTGTTTCTTGGTTTTTTTATGAATGAAGAAGAAATTTTCACATTATAGTTGAATATGTTAATATATATAAGTCTATATATGTCTATAAGGTCCATTTTTAACTTGCGAGCTATCGTTTGTTTGGATTATTCTAGATACATAAGTAAATAATGAGGTGTTTATGTGAAAAAAGGTAGTAGAATAGTTGCATTTATATTACTTATTGTCCTCCTCTTTGCAGGAATGGGGCTTACATATAAGAATGTAATTAAAAATGTTAACCTTGGTTTAGATTTACAAGGTGGTTTCGAAGTCCTTTATCAAGTTAAGCCATTGCAAAAAGGCGATAAAATTGATAAAAAAGCGCTTCAATCAACGGCTCAAACTTTAGAAAATCGTGTCAATGTGCTGGGGGTATCAGAACCACGAATTCAAGTTGAAGATCCAGACAGAATTAGAGTTCAACTTGCAGGCGTTAAAAATCAAAACCAAGCTCGTGACGTATTATCTTCCCAAGCTAATTTAACAATTCGGGATGCGAATGATAATGTTAAACTGACAGGAAAAGATATCGTACAAGGTTCAGCAAAACAAGAATTTAAACAACAAACTAATGAACCTACCGTTACATTTAAATTAAAAGATCGTGATAAGTTTAAAAAGGTAACTGAAGAAATCTCTAAGAAAAAAGAAAATATGATGGTTGTATGGCTTGATTATGAAAAAGGAGATAGTTATCACAAAGAACTTCAGAAAAAGAATGAAAATGATAGAAAATATGTGTCAGCTGCTTCTGTAAATCAACCAATTAATTCTGATAGTGTTGAAATATCTGGTGGTTTCCATGGCCAAGAAGGGGTTAAAAAAGCTAAACAAATTTCAGAATTGCTCAATGCTGGTTCATTACCAGTTAAACTTGACGAGTTGACATCTACATCAGTTGGTGCACAATTCGGGCAAGATGCATTAGATAAAACTATTTTTGCCTCATTTATAGGTATTGCTGTTATTTATCTATTTATGGTTGGTTTCTATAGATTACCAGGTTTTGTAGCAATTATCGCATTAACGACATATATTTATTTAACACTTGTCGCATTTAATTTCATTTCTGGTGTATTAACATTACCTGGTCTAGCTGCGCTTGTTTTAGGCGTAGGTATGGCAGTGGATGCCAATATCATTATGTACGAGCGAATAAAAGATGAATTGCGAATTGGTCGAACGCTTAAGCAAGCTTATACTAAAGCAAATCGAAGTTCGTTCCTTACCATTTTTGATTCAAACTTAACAACAGTTATTGCAGCCGCTGTATTATTCTTCTTTGGTGAAAGTTCGGTTAAAGGTTTTGCGACAATGCTGTTATTAGGGATATTAATGATTTTTGTAACTGCAGTCTTCCTTTCTAGAGGGCTATTATCATTACTGGTATCATCTAATTACTTCAAGAAAAAATTCTGGTTATTTGGTGTTAAGAAAAAACAATGTCATGATATCAATGAAGGTAAAGATGTTCACGATTTGAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP041726|879579:888598|882788_883049_+|WP_002458927.1|DBSCAN-SWA MNLTAILIPVLFLLVFYFLIIRPQQKRAKEHREMVNRVEAGQKITTIGGLKGTVKAVDETTVVITVNGHGTEMTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP041726|879579:888598|883234_885523_+|WP_070648431.1|DBSCAN-SWA MKKGSRIVAFILLIVLLFAGMGLTYKNVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVKPLQKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPRIQVEDPDRIRVQLAGVKNQNQARDVLSSQANLTIRDANDNVKLTGKDIVQGSAKQEFKQQTNEPTVTFKLKDRDKFKKVTEEISKKKENMMVVWLDYEKGDSYHKELQKKNENDRKYVSAASVNQPINSDSVEISGGFHGQEGVKKAKQISELLNAGSLPVKLDELTSTSVGAQFGQDALDKTIFASFIGIAVIYLFMVGFYRLPGFVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTLKQAYTKANRSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRGLLSLLVSSNYFKKKFWLFGVKKKQCHDINEGKDVHDLKTSFERWNFVKLAKPLIGLSILILIVGIVILSIFKLNLGIDFSSGSRVDVESNHSLSQAKVEKTMKDVGLKADEIQINGDGKKQATIMFKHDLAKKDIAKLNDKFKNEFGHSPSVNTVSPVIGQELAKNALKALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDAFMIVAVFSLFRIEVDITFIAAVLTIIGYSINDTIVTFDRVRENLHKLKVITSPEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILLFGAPSIFNFSLALLVGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSDKGKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_CP041726|879579:888598|888079_888598_+|WP_002458930.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKAGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDQIVTYAKEREVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEALGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_CP041726|879579:888598|880586_881612_+|WP_002478079.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEDFDYHLPESLIAQTPLKNRDQSRLLVLNKETGDMKHQHFKDVINYLNPGDTLVLNDTRVMPARLFGVKEETGAKVEMLMLTQIENNDWEVLLKPAKRIKVGNQLSFGEGKIIAECIKELDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKARLDDPDRYQTVYAKENGSAAAPTAGLHFTDNLLKDIKAKGVNIAFITLHVGLGTFRPVSVENINEHEMHSEYYQMTENTAKLLNNTKLQGHRIIAVGTTSTRTLETIRRDHSQFIATSGWTDIFIYPGFEFKAIDALITNFHLPKSTLVMLVSAFSSRQFILTAYRKAVELEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP041726|879579:888598|885783_888060_+|WP_070648433.1|DBSCAN-SWA MIKSKYTWNHNEPTQYIDEQIAKKYKLSPIIKKVLESKHIVNEKDIEGLLNGQQQLHEPWLLSDMTKAIERINLAIDKHERILIYGDYDADGVTSTTIMVKTLQSLGAEVGWYIPNRFSEGYGPNELAFKNAYDEGVSLIITVDNGIQGHREIEMIQELGVDVIVTDHHEMGSTLPDAFAIVHPMHPEFDYPCPNLCGAGVAYKVSQTLLKNNVPPYYIALASIGTIADLVSLTDENRTIVKTGLSILNDYQPIQIAALLNEANYNDPIDEETIGFIIGPRLNAVGRLEDASLAAELLMTEDAEEAAFLAEQVNHFNNERKDIVSKITEEALLLAKEEVAKGRQFLLLAKENWHEGVLGIVASRIVETYGLPTLILNIDDEQHYAKGSARSIEQVSMFEILSDHQNLISKFGGHHMAAGMTMPIENISELREGLNAWMANLAQTTSFDQKKQIDVKITEDEITVNNIYDIERLKPFGIDFNKPLFELDDVNVNSLKAIGKDKNHLKMTIGNSNLATLYWNSGSLVDELELNQPINMIGQLQINEWNGNQSPQFIIQDIAINQQQILDYRSKRKQLSIDFHDEQLAILIHPQKEKLDHNYYHYGETIDEHVNRVVLRDLPLSLAHLSESMNGHQFSQIYVVLQHQHSIYFEGMPDKKTFKACFKILMSKQKVNLVNDGMALSKFLGIQPNTLKFMLKVFLELGFIIDSNGIISVNQNPNKQDIEASQVYQTRKARIEVEKLMLYDDFQHLKHWIIEQMG >NZ_CP041726|879579:888598|879579_880584_+|WP_002478078.1|DBSCAN-SWA MDDRMVDQSFHQEDSAFEYSLRPTYLKQYIGQTTIKSNLEVFIQAAKLREEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLIGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNEHELKEIIIRTADVLGTSIDDESAVELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNGDDQIYIETTKKALKLLQVDEQGLDYIDHKMMNCIINQYQGGPVGLDTIAVSIGEERVTIEDVYEPFLIQKGFIERTPRGRKATAFAYEHFMKSKEKRE >NZ_CP041726|879579:888598|881630_882770_+|WP_002478080.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELTDIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKQAGGLHKFMNWNGPILTDSGGFQVFSLSNLRKISEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMEIQNDLGSDIMMAFDECPPMPSEYKYVKDSIERTSRWAERCLKAHKRPDDQALFGIIQGGEYKDLREQSAKELVALDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYNMVKHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSIGRLVIKNAQFANDFRPLDENCDCYTCKNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEAFFEQYGLNVENPKNF |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1014262 : 1022958
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP041726|1014262:1022958|DBSCAN-SWA AATGTATGAAGTAAAATTAGACGCTTTTAGCGGTCCACTCGATTTATTGCTCCATTTAATTCAGAAATATGAAATAGATGTTTATGACATTCCAATGAAAACATTAACTGAGCAATATATGCAATATGTACATACGATGAAGCGTCTAGAAATTAATATTGCTAGTGAATATCTCGTTATGGCTTCTGAACTCTTAATGATTAAAAGTAAATTACTTCTACCTCAATCAGATGATCATGTAGAATTTGAAGAAGATCCACGTGAAGATTTAGTAGGTAGACTAATTGAATATCAAAACTATAAAGAATATACAGAAATACTTGATAGTATGAAAGCAGAACGAGATCTCTACTTTACAAAACATCCGACAGATTTATCTCATTTAGAAACTAATGAAAGTTGGGATAAATCAAACACCATTGATTTGACAGAACTGATTGTTGCTTATCAAAGAGTGAAAAATCGCGTTGAGTATCACACACCAAAAACTGTAGAAATCAGTAAAGAAACATTCACTATTGAAGAAGCAACAGAAATTGTAACGACAAGATTACGTACACAAACAGCGTTTAATTTTTTCAGCTTATTTACTTTTCATGAACCAATTGAACAAGTCGTTACGCATTTTCTTGCTATTTTAGAAATGTCTAAGGCTGGCATAATAAACATAAGTCAAAAGCAAAATTTTGATGATATTGATATTGTAAGGGGAGTGAATTATCAAGTTGGATAAACAAGCAATCTTAGAGGCATTATTATATACAGCTGGCGATGAAGGTATTGACACAAAACAATTACTAGAGATACTGGACATTACTAAACCACAATTGATTGAATTAATCGATAATTATTCATCTCAAGGACTAGAAATTCATCACTACGGTCAAACTTATGTATTAACTACAAAAAAAGATGCTGCTAATTATATTGAAAAACTCGTTCAACAAAAGTCAAATATGAAATTATCACAAGCTGCAATGGAAACGTTATCAATCGTTGCTTATAATCAACCTATTACACGTAGTGATATTGAATTAATACGAGGTATTAATTCAGATGGTGCTGTTAGAACATTAGTTGCTCGTGGTATGATTGAAGCTAAAGATGTTGAACATTCAAGAAGCCATCACTTGTATACAACTGAATTATTTTTAAATGTATTTGGATTAGAAACAATAGAAGATTTACCAACTACCGAAGAAGATGATGAAGAAATAGAAGATTTCTTTAGTCAATTAGTTAATCAAAAGGGAGAATGATTATGAGCAAAGAACTAGAGCGATTGCAAAAAAGAATTGCTAATAGTGGTTATACGTCTAGAAGAAAAGCTGAAACATTGATTACTGAAGGTAAAGTCAAAGTGAATGGAGAAGTTGTCACTGAACTTGGCACAAAAGTAAAACCATCAGATCAAGTTGAAGTAGAAGGAATCAAAATGGAACAAGAAGATAAAATATATATTCTGTTTCATAAACCAGCGCAAGTCATTACTAGTGTATCAGATGACCGTGGAAGAACAGTTGTGACTGACTATTTTAAAGACTTAGATACTAGAATATATCCTGTTGGTCGTTTAGATTACGATACATCCGGAGTATTACTACTAACAAATGATGGTGAGTTCACTAATCTTATGACCCATCCACGGTACCATATACCAAAAACATATGTTGCCAAACTCAAAGGTTACCTTATGCGCGAAGAAGTAAAAGCACTTGAAGCAGGAATAGAACTTGAAGATGGTTTAACTCAACCCGCTACTGTTAAAATTAAACGCCAAGATAAAGACAAAAATACAACGTTAGTTGAGATTACCATTAGTGAAGGACGAAATCGACAAGTACGTCGTATGTTTGAGCATTTTGGCCATAGCGTTAATAAATTAACACGTATACAATTCGGTTCACTAAATTTAAAAGGTCTTAACGCTGGAGAAGGACGCGTATTAACACCTCATGAAGTAAAAGTATTACGTCATCAAGCAGAAAACGGCAATTGGTAAGCGGTTACATGTAGTTTGCTGAAGTTAATTTTATGGTTATAAAATCATGCTAATTTTTTCACAATCAAATTTGAAATTAGAGATTTAACAATTACCATATGCTATAATAAACAAGAAAATAGCATGTGTAGGAGGTATATGAATTAATGAGTAAGGAAATACTTATCGTAGATGATGAAGACAGAATTAGAAGATTACTCAAATTATACTTAGAGAGAGAATCTTTTAACATTCATGAGGCTAGTGACGGCAAAGAAGCCTATGAATTAGCCATGGACCACAATTATGCATGCATACTTTTAGACTTAATGCTTCCTGAAATGGATGGAATCGAGGTCGCATCAAAACTACGGGAGCATAAAGATACACCTATCATTATGCTTACTGCTAAAGGCGAAGAAACTAACCGAGTTGAAGGATTCGAATCAGGTGCTGATGATTATATTGTTAAACCATTCTCTCCACGTGAAGTGGTCTTAAGAGTGAAAGCGCTATTAAGACGTACACAATCAACAAGCGCCGAACAAAGCGAGCCTCATGCGAGAGATATCATAGAATTTAATCATTTACTTATTGATAATGATGCGCATCGTGTATTAGCTGATAATCAACAAGTTAACTTAACACCCAAAGAATATGAACTACTAATATATTTAGCTAAAACACCAAACAAAGTATTTGATAGAGAACAATTACTTAAAGAAGTTTGGCATTATGAATTTTATGGTGACTTAAGAACTGTTGATACCCATGTTAAACGCTTAAGAGAAAAACTTAATCGTGTTTCAGAAGATGCAGCACAAATGATTCAAACAGTATGGGGTGTTGGCTACAAATTTGAAGTTAGAGCTAGCGATGAGCCGACTAAATAGTGTTGTAATAAAACTGTGGTTAACTATTATCTTTATAGTAACGACAGTTTTAATTTTATTAAGTGCTGCATTAATAACTTTTATTCAATACTATTATACTGAGCAAACAGAAAAATCAATTCGTGATGATGCCAAAAGAATCAGTCATGTTGTTGAAACATCTAAAAATAAAAAGTTAGCTATTGAACATAGCCAAAAACTGATTAGTGGTTCTGGTGGCGTTATTATTATGAAAGACAAGTCAACACATCATAATGCTAAAGAGTCACAATTAAATAATCAAATGTTGGCTGAGATTAATCAAAACGAACACTTTTCTCCAGTGTTTAATAAAGGTCAATCTGCAACTCAAAATGTAACATTAAAACATAATGACCATTCTCGTTCTTATATCTTACTGGGTTATCCTATGAAAGCTCAAAAGGGAAGTCACAGTCATTATAGTGGCGTCTTTATTTATCAGGATTTAAAATCCATAGAAGATACCAATAACGCTATTACGATTATTATTCTGATAACTGCAATTATTTTCCTAGGTATTTCAACTGTCTTCGCCTTTTTCCTATCTAATAGAATTACTAAACCACTTAGAAAGCTTAGAAATCAGGCTAAAAGTGTTTCTAAAGGGGATTATTCTCAAATTTCATCTGTAACAACTAAAGATGAAATTGGTGAACTATCTCGCGCATTAAACGACATGAGTTTCGAAATTCAGGAAAATGTTCAAGCACTATCAACCTCAAAAAATATTCGTGATAGTTTAATTAATTCAATGGCTGAAGGTGTTGTAGGTATCAATGATCATCGCGACATTATATTATCAAATAAAATGGCAGATGAAATTTTACCAACTATTGATCAATCTATGTATGAACGAATTGAAGACCAAATCGAAGATACTTTTACAAGTAAAGGCACAGAATTTCGAGAATACGATTTTGACACACGCTATTATGTCTTCATTATGAGTTACATTCCTCAGATTCAAGAAGATGGTCGCAGTGGAATTGTCGTTATTATTCGTGATATGACTAATGAGCATAACTTAGATCAAATGAAAAAAGATTTCATTGCTAATGTTTCTCATGAATTGCGTACACCTATTTCATTATTACAAGGATATACAGAATCAATTGTTGACGGTATCGTTACAGAACCAGAAGAAATTAAAGAGTCATTATCAATTGTCTTAGATGAAACAAATAGGCTCAATCGTTTAGTTAATGAATTACTCAATGTTGCAAGAATGAATGCTGAAGGGGTATCTGTTAATAAAGAGATACAACCTATTGCACCATTATTAAACAAAATACAAACAAAGTATAGACAACAAGCTAGTGATTTATCATTAAATATGTACTTAACTCCAGAAACTAATGACGCATTGTGGTACTACGATTCTGATCGAATCGATCAAGTGCTCACAAATCTTATTGATAATGCTACAAGATATACTCAACCTGGTGATACAATTTCTATTACTAGCGAAGATACTGATAAGTACAATGTGCTTCACATAAATGATACAGGCAGTGGTATTGCTCCTGAACATTTAAATCTTGTTTTTGATCGCTTTTACAAGGTTGAAGCATCCAGAACACGTGGCAAACAAGGAACCGGCTTAGGATTATTCATTTGTAAAATGATTATAGAAGAACATGGAGGTACGATTACTGTATCAAGTGTCGTTGGAGAGGGAACAACATTTACAATCAAGTTACCGAAGCCTTAATCTTCAGGCTTATTTATAAAATTTATCAAAGATAATATCACTGAATTCAGACAGGGACATAAACCCGCAAATAATAGCACAAAGATGATTTAAAATTAAAAATCGTCTTTGTGCTTTTTTATATTCAATACTTTGTATGATCGACTCGCATGCTTAGGAGACTACTTCAGCTTGCTTTGTTAGAAAAAACTGGTTTAGTCAGTTTTTTCTGTGCTGGACTTTGACTTAATATAAAAATAAGGACGAAGGCTATTTAAGCAGAGACGTTTATGAGCCGACCTGACCTTATATATAGTTAATATCAGTTAAAACATATTGAGATTAACTATGCACGATATATTGGCAGTAGTTGACTGAATTGAAAATATCCTTATACCAAGCTTTTTCCATCCTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP041726|1014262:1022958|1019590_1020133_+|WP_002478165.1|DBSCAN-SWA MQQNKRLITISMLSAIGFVLTFLKFPLPFFPPYLTLDFSDVPTLLATFSMGPIAGIIVAFIKNLLNFFFNMGDPVGPVANFLAGISFLLTAYYVNKRGHVANKAMITALVMATLVMTIVLSILNYFVLLPLYGMIFNLADIVKNIKIIIVSGIIPFNIIKGAIISIIFILLYRRIKSVLK >NZ_CP041726|1014262:1022958|1014986_1015520_+|WP_070648508.1|DBSCAN-SWA MDKQAILEALLYTAGDEGIDTKQLLEILDITKPQLIELIDNYSSQGLEIHHYGQTYVLTTKKDAANYIEKLVQQKSNMKLSQAAMETLSIVAYNQPITRSDIELIRGINSDGAVRTLVARGMIEAKDVEHSRSHHLYTTELFLNVFGLETIEDLPTTEEDDEEIEDFFSQLVNQKGE >NZ_CP041726|1014262:1022958|1015522_1016263_+|WP_070648510.1|DBSCAN-SWA MSKELERLQKRIANSGYTSRRKAETLITEGKVKVNGEVVTELGTKVKPSDQVEVEGIKMEQEDKIYILFHKPAQVITSVSDDRGRTVVTDYFKDLDTRIYPVGRLDYDTSGVLLLTNDGEFTNLMTHPRYHIPKTYVAKLKGYLMREEVKALEAGIELEDGLTQPATVKIKRQDKDKNTTLVEITISEGRNRQVRRMFEHFGHSVNKLTRIQFGSLNLKGLNAGEGRVLTPHEVKVLRHQAENGNW >NZ_CP041726|1014262:1022958|1016409_1017135_+|WP_002459064.1|DBSCAN-SWA MSKEILIVDDEDRIRRLLKLYLERESFNIHEASDGKEAYELAMDHNYACILLDLMLPEMDGIEVASKLREHKDTPIIMLTAKGEETNRVEGFESGADDYIVKPFSPREVVLRVKALLRRTQSTSAEQSEPHARDIIEFNHLLIDNDAHRVLADNQQVNLTPKEYELLIYLAKTPNKVFDREQLLKEVWHYEFYGDLRTVDTHVKRLREKLNRVSEDAAQMIQTVWGVGYKFEVRASDEPTK >NZ_CP041726|1014262:1022958|1014262_1014994_+|WP_002459061.1|DBSCAN-SWA MYEVKLDAFSGPLDLLLHLIQKYEIDVYDIPMKTLTEQYMQYVHTMKRLEINIASEYLVMASELLMIKSKLLLPQSDDHVEFEEDPREDLVGRLIEYQNYKEYTEILDSMKAERDLYFTKHPTDLSHLETNESWDKSNTIDLTELIVAYQRVKNRVEYHTPKTVEISKETFTIEEATEIVTTRLRTQTAFNFFSLFTFHEPIEQVVTHFLAILEMSKAGIINISQKQNFDDIDIVRGVNYQVG >NZ_CP041726|1014262:1022958|1020274_1020523_-|WP_002449743.1|DBSCAN-SWA MAKYTIVDMDTCIACGACGAAAPDIYDYDDEGIAFVILDDNQGTAEVPEELYEDMEDALEGCPTDSIKIEEEPFDGDALKFE >NZ_CP041726|1014262:1022958|1021578_1022958_+|WP_002459069.1|DBSCAN-SWA MLEDKLKSWFGFDNFKAGQKEIIKSVLDSNHTLGILPTGSGKSLCYQMATYELQQSTLIISPLISLMDDQVAQLKMSGEQSVAYIHSGMDDNEKNWNMKRLAKSRFIFLSPEFILQPQNFKLISTIDFGLIVLDEAHCISEWGYDFRPHYALISKITNYYKNATILALTATAPPHLEQDLNQLLNVSFHVIKTHMNRPNISFQHINFRNDQEKMNWLMHYIEQSGPTIIYVSSKKMCVELAKTIYKHGYLTGIYHGDLSYQERQTVQQQFINNDIPVIVATSAFGMGVNKKDIRTVIHFHLSTSPSSYLQEIGRAGRDQQPSQAISLFQPDDRYLLETILFADMILPYDIDCYELGANIEPLKQDILEILHSHFTYAQLKQIFQIAQERKQLALNRMLSYSQLDQCRRKYLLEFFGEVPDIPSICCDHDTDIKPLKIYNRKKVKRQMSYEDKLKNLFLS >NZ_CP041726|1014262:1022958|1017118_1018867_+|WP_070815403.1|DBSCAN-SWA MSRLNSVVIKLWLTIIFIVTTVLILLSAALITFIQYYYTEQTEKSIRDDAKRISHVVETSKNKKLAIEHSQKLISGSGGVIIMKDKSTHHNAKESQLNNQMLAEINQNEHFSPVFNKGQSATQNVTLKHNDHSRSYILLGYPMKAQKGSHSHYSGVFIYQDLKSIEDTNNAITIIILITAIIFLGISTVFAFFLSNRITKPLRKLRNQAKSVSKGDYSQISSVTTKDEIGELSRALNDMSFEIQENVQALSTSKNIRDSLINSMAEGVVGINDHRDIILSNKMADEILPTIDQSMYERIEDQIEDTFTSKGTEFREYDFDTRYYVFIMSYIPQIQEDGRSGIVVIIRDMTNEHNLDQMKKDFIANVSHELRTPISLLQGYTESIVDGIVTEPEEIKESLSIVLDETNRLNRLVNELLNVARMNAEGVSVNKEIQPIAPLLNKIQTKYRQQASDLSLNMYLTPETNDALWYYDSDRIDQVLTNLIDNATRYTQPGDTISITSEDTDKYNVLHINDTGSGIAPEHLNLVFDRFYKVEASRTRGKQGTGLGLFICKMIIEEHGGTITVSSVVGEGTTFTIKLPKP |
8 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1427050 : 1435520
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP041726|1427050:1435520|DBSCAN-SWA CTTATTTAATAACCTTAGCTATAACACTAGGATAAAGTTCATATTCTAATTGTTTGACACGTTCTTCCAAATTTTCTTTGGTATCATCCGGTTTGATCTCGCATTGTTTTTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATGCCACTATCGACATAATGAACTGTTGATCCTGTAACATTATCACCACTATTAAAAGCCTGACCAATAGCATCTTTCCCCTTATATTTTGGCAATAATGATGGATGAATATTTAAAATCTTACCTTCGTATGCGTCTAACAAATCAGGACCAATTAGCCTCATATAACCTGCGAGAATAATCCATTCAACTTCTTCACGCTCTAGTATACGAATCAAATGGTGTTCATAGGCAGATTTTGAGTCAAAATCTTTTGGTTCGTTGATATTAACTGCTACCTTTAACTGTTTTGCGCGTTCAATACAATACGCATCGTGATGATCAGTATAAAGTGAAGTAATTTCTATATTGTTGAGTTCTCCTTTATCCACTTTTAAAACAATATTTTCGAAATTACTGCCCGATCCAGAGGCAAAAATAGCTACCTTAGTCACTATTCTACCCCCTTGAGATAAATAGGCACATGTGCATCTTCTATAACATTGCCTATGTGATAAGCAGGGACATCGTGTTTTTTTAGGACATCTAGTGCTTTAGCAATGTCATCTTGACTAACGATGACCGTATACCCTATTCCCATATTAAAAATGTTATACATTTCATCCGTAGAAATTTGTCCTTGTTGTTGTAACCAGTCAAAAATAGGAGGTGTTGGGAATGTATTCACATCAATTTGCGCAGCTAAACCATCAGGTAACACTCTAGGAATATTTTCATAAAATCCACCACCAGTGATATGATTCATCCCCATGATTGTTACTTTATCTTTTAAATCAAGTATCGGTTTCACATAGAGTCGCGTAGGTGTTAAGAATGTATCTAAATATGTTTGACCATTGAAGTCATCGTATAAATCAATGTCAGTCTGTTTAATTAATTTACGTACTAAGCTATAACCATTTGAATGTATCCCACTAGAAGCTAAACCAATAATTGCATGACCTGCTTTTATATTTGAGCCATCAATGTATTCTGCTTTTTCAACAGCACCGACAGCAAAGCCAGCTAAGTCATACTCACCTTCATGATACATTTCTCCCATCTCCGCGGTTTCACCACCAATCAGTGCGGTATTTGTTTGTTGACATCCTTCGCTGACTCCTTTTACAATCTGCTCAATAACTTCTGGAACAACTTTATTTGCCGCAATATAATCTAAAAAATATAATGGTTCTGCTCCAGTTGTAAGAATGTCATTCACACACATGGCTACGGCATCAATTCCAATGGTGTCATGTCTGTCATAATCGATAGCTAACTTTAACTTTGTTCCTACACCGTCTGTACCTGACACAAGCATAGGCGCTGTCATCTGCAATTGTGATAAGTCAAATGTCGCACCAAAACCACCTAAGCCACCTAAGACTTCTTTTCGTAGTGTTCGCTTTACATGTGCTGACATTCTTTCTACTGCTTCATATCCTGCTTCTATATCTACTCCAGATTGTTCATAAGCTTTAGACATTTTTATTTCCCTCTCGATCATAATAGTGTTGGTGATTCTCGATATATGCTTTTTGTCGTGGGCTCAAGTGCTTAAAATAATTTTCTTCATAATCATACAAACCAGCTGGATAATCACCTGTAAAACTTTCTAAACATAGACCACTATATGGCGCATCATAGTCTAAGCCAATAGCTTCTATTAAACCATCAACGCTTAAATAGGCTAATGAGTCGGCACCTATATGGTCACAAATTTCTTCAGGTGATTTACTCGCTGAAATCAACTCAGCAGTAGTTGAAACATCAATACCATAAAAGCTTGGAAACATAAATTCTGGTGATGCGATCCTTACATGTACTTCTTTAGCACCGGAATCTTTGAGCATTTTGACTATACGTTTAATAGTTGTGCCACGTACAATTGAGTCATCGACTAAAATAATTTTTTTACCTTCTACAATGTCTTTGACAGCTGATAGTTTGACACGTACCCCTTGTTCTCTCAATTCTTGAGTTGGTTGGATGAACGTTCTAGCGACATATTGATTTTTAACTAATCCCATTTCATAAGGCAGCTGGCTTTCTTCAGCATAGCCACTAGCTGCTGATAATGATGAATTAGGTACACCAATAACCATATCTGCTTCTACAGGATTTTCTTGAGCTAATTTCTTTCCAGAAGCTTTACGAACTGCATGCACATTCTTACCAGCTATTGTAGAGTCTGGACGCGCAAAATAAATATATTCCATTGCTGAAATCGCAGTACTTGTGTGTTTTGTATATGATTTTATTTTTATACCTTCGTCATTGATAACGACATATTCTCCTGCGTGAACATCTTGGATAAATTCTCCACCTAAAACATCAATAGCGCATGTTTCACTTGCTAATATATAAGTTCCATCTTGCATTTTACCGACCGCTAATGGTCTAATGGCATTAGGATCAACTGCACCATATAAAGCATCCTTCGTCAAAATCGTAAAGGTAAAACCACCTTTAATTTGGCGTAGACTTTCTTTTAGTGCTTCTTCAAATGTTGGTGCTTTACTTCTACGAATTAAATGCATAATCACTTCAGTATCTGAAGACGAATGAAATATTGCCCCATGCTTTTCTAAGTATTGTCGTAATGATTGTGCGTTGATCAAATTTCCGTTATGACATACTGCAACGCTCATATCATAAAAATGATAGAGAAATGGTTGAATATTCTCGATACCTTTATTGCCTGATGTTGCATAACGTACATGACCTATAGCGTTACGACCTGTTTTTAATTGTTCCATTTGCACTTCTTTGATTGCTTCAGTTAACAGCCCTACACCACGTTCACCTTTTAATGTGTTACCATCTGTGACAACAATTCCAGCGCCTTCTTGACCGCGATGTTGTAAACTATGCAATCCCATATATGTCAATTGAGCTGCCTCTGCATGGTTCCAAATTCCAAATACGCCACACTCTTCGTTTAATCCACTGTAGTTAAACATTGCGCAATAGCTCCTTCCCATTGTGCTTTTATATCAGAAGCTCTCTTAGAAATTGATGTATGAGCAGCTGCAACATTAAATTCATCCGTATCTGTAAGTTGACCTATTTCAATTGCATGCTCAATATTTAATTCTTGTCCTGCTTTAACAGCAATCACATAACGTCCTTGCGTTTCACTGAATAACTGTGCATCTGAAAGATTTACTTTAGCTTTTAATCCAAGACTATAATGCGCACTGATTCTAGCGAGAGTAATTAACAATCCACCTTTGCCAACAGTCTGTACGTGTGAAGCCACACCATTTCTAATTGCCTTTTTAACGGCTTCACCCTTTGTCACTTCATCGCTTAAATCAATCGCTTCAAATTCATGATTCACTTTGCCGTATAACAATTTTTCAATTTGACTGCCACCGAAATCATCCCTAGTATCTCCAACTAAGTACAATTTATGTCCTGCTTGAGGATGGAAATCATTTAAATATTCGATATTTTCAATTAGCCCTACCATACCAACAACTGGTGTTGGAAAAATAGATGTACCACGTGTTTCGTTATAAAGCGAAACATTACCAGATACTACTGGTGTTTTTAAAATTTCACATGCTTCTGACATCCCTTTTGTTGAATCTATTAATTGTTGATAGATTTCTTTTTTCTCAGGAGAACCATAATTTAAGCAATCTGTCATTGCAAGTGGCGTGGCACCAACAGCAATTAAATTGCGATAGGCTTCTGCCACTACCATTTTTCCACCTTCATATGGTTGATTAAAGACATAACGTGCTTCGCCATCAATGGTAGAAGCAATCGCTTTTTGGGTACCTTCAACACGAACAACTGAAGCCTGTAAACCTGGTTTAATGATTGTATTGGCACCCACTTGTTGATCATATTGTTCATATAAATAATGTTTTGATGCAATTGTTGGATGTGTGAGTAACTGGTCAAATACCTCTTGAACATTGATAGAATTATAATCATTTTTAGAAGTATTATATGCCTTTTCTTCGCCTTCAAGCACATAAACAGGTGCTTCATCAGCTAGTGATTGCACTGGAATATCTGCAAATACTTCATCCTCATATTTAAGTATAAAACGGTCTGTATTTGTTACTTCACCAATAACAGCACTATCTAATTCATGTTTATCAAATAAATCTAAGAATTTTTGTTCCGTACCCTTTTCAACAACAAGTAACATTCTTTCTTGTGTTTCAGAAAGCATCATTTCATAAGGAGATATGCCAGGTTCTCTAGTCGGCACTTGGTCTAAATTTAATATTAAGCCACTGCCACCTTTAGCTGCCATTTCAGACGATGACGATGTTAATCCGGCTGCTCCCATATCTTGAATACCTACGAGCTCTTTGTATGTAATTGCTTCTAGGGTAGCTTCCATTAATTTCTTACCTACAAAAGGGTCGCCAATTTGAACTGAAGGACGTTTACTTTCACTTTCTTCCGTCAATTCTTCAGACGCAAACGTTGCACCATGAATACCATCACGACCTGTTTTCAAACCAACATATATAACTGAATTTCCTTCGCCTTTAGCCGTCCCTTTTTGAATCATATCATGGTCAATAATACCTACACACATCGCATTAACTAATGGATTGCCATCATAACGATCATCAAATTCAATTTCACCTGCAGTAGTAGGAATACCGATACAGTTACCATAGCCACCTATACCGCGAACGACCCCTTTTAGTAGTCGTTGATTTTGTTTCACTGATAATTCACCAAAACGCAAACTGTTTAATAAATTAATAGGTCGTGCACCTATTGACACAATGTCACGAATAATCCCACCTACGCCAGTTGCTGCACCTTGATATGGTTCAATTGCTGAAGGGTGATTATGTGATTCAACTTTAAAAACGACCGCTTGGTTATCACCAATATCAACTACACCAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP041726|1427050:1435520|1427050_1427617_-|WP_037545988.1|DBSCAN-SWA MTKVAIFASGSGSNFENIVLKVDKGELNNIEITSLYTDHHDAYCIERAKQLKVAVNINEPKDFDSKSAYEHHLIRILEREEVEWIILAGYMRLIGPDLLDAYEGKILNIHPSLLPKYKGKDAIGQAFNSGDNVTGSTVHYVDSGMDTGEIIEQKQCEIKPDDTKENLEERVKQLEYELYPSVIAKVIK >NZ_CP041726|1427050:1435520|1432285_1432957_-|WP_002478380.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMYNAAIKTGAEAEYVDYRETSLEGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPVIDEVKRLASEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNETLKIVNNQTPFTNLYENNDLVVYPVAHGEGHYYCTDDIYEELVTNNQIILTYQDNPNGSYKDIAGIVNKEGNVCGMMPHPERALETILGTDSGVKLFEAMVNSWREQHV >NZ_CP041726|1427050:1435520|1430103_1432293_-|WP_070647953.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSIEEIKVEKLYQDMGLSDAEYTKVCDVLGREPNFTEVGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTTGERILMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELSVKQNQRLLKGVVRGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDDRYDGNPLVNAMCVGIIDHDMIQKGTAKGEGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITYKELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLILNLDQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTNTDRFILKYEDEVFADIPVQSLADEAPVYVLEGEEKAYNTSKNDYNSINVQEVFDQLLTHPTIASKHYLYEQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTQKAIASTIDGEARYVFNQPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMSEACEILKTPVVSGNVSLYNETRGTSIFPTPVVGMVGLIENIEYLNDFHPQAGHKLYLVGDTRDDFGGSQIEKLLYGKVNHEFEAIDLSDEVTKGEAVKKAIRNGVASHVQTVGKGGLLITLARISAHYSLGLKAKVNLSDAQLFSETQGRYVIAVKAGQELNIEHAIEIGQLTDTDEFNVAAAHTSISKRASDIKAQWEGAIAQCLTTVD >NZ_CP041726|1427050:1435520|1432958_1433219_-|WP_002459451.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQALNRAVHDLGYTQVNDIRVGKVLYMSVDEATDEAVDNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKIVDEKENA >NZ_CP041726|1427050:1435520|1435037_1435520_-|WP_002478383.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCAMLEEFGIPFDKKVVSAHRTPKLMYDFANQARANDYDIIIAGAGGAAHLPGMVASMTTLPVIGVPIESKSLKGLDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGKSGAKNAGILAARILSISHKSVLEKLENYEKTLVKKVGDMQHELQ >NZ_CP041726|1427050:1435520|1433218_1433923_-|WP_002478381.1|DBSCAN-SWA MALLYEGKAKRVFSTEVENQLRVEYKDEVTAGNGAKKDTMKGKGRLNNQITSIIFDYLSHKGIESHFIKQLSETEQLVKEVKIIPLEVVVRNVAAGSITKRLGLDKGYQFNEPLVEFFYKNDDLNDPLITDDHVKLLNIANDEEIQTLKQMAKDINHVLIQLMDEMDLQLVDFKIEFGKTQDGKILLADEISPDTCRIWDKDSGTNFDKDVYRNETGSLIDTYQTFLNKLEEVK >NZ_CP041726|1427050:1435520|1433923_1435051_-|WP_002478382.1|DBSCAN-SWA MSFNKLKFGDTIGIIGGGQLGKMMTQSAQKMGFKVICLDPNTDCPCHHIANEFITAAYDDTQALQELGEKSDVITYEFENISAQQLKTLSEQFNIPQGYQAIELLQDRLTEKQTLERAGAHIVPFLSINNIDDLYNAIEELGYPFIIKTRFGGYDGKGQILVKDHTAIEEAKQLIAQQECVAEQYLDIEREVSLTVTIGNQKQTTYFPLQENEHRNQILFKTIVPARSDKEQLARIEVNKIIDTVHFVGTFTVEFFIDKQNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAITGQTLPQTIELLKPAVMMNLLGRDLDLLEDDFGQHPEWHVHIYGKAERKPDRKMGHMTILTDDVNATEATMLKQFEGREL >NZ_CP041726|1427050:1435520|1427616_1428648_-|WP_070647954.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVDIEAGYEAVERMSAHVKRTLRKEVLGGLGGFGATFDLSQLQMTAPMLVSGTDGVGTKLKLAIDYDRHDTIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIAANKVVPEVIEQIVKGVSEGCQQTNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDLAGFAVGAVEKAEYIDGSNIKAGHAIIGLASSGIHSNGYSLVRKLIKQTDIDLYDDFNGQTYLDTFLTPTRLYVKPILDLKDKVTIMGMNHITGGGFYENIPRVLPDGLAAQIDVNTFPTPPIFDWLQQQGQISTDEMYNIFNMGIGYTVIVSQDDIAKALDVLKKHDVPAYHIGNVIEDAHVPIYLKGVE >NZ_CP041726|1427050:1435520|1428640_1430125_-|WP_002459448.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHAEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVTDGNTLKGERGVGLLTEAIKEVQMEQLKTGRNAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVAVCHNGNLINAQSLRQYLEKHGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRQIKGGFTFTILTKDALYGAVDPNAIRPLAVGKMQDGTYILASETCAIDVLGGEFIQDVHAGEYVVINDEGIKIKSYTKHTSTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQENPVEADMVIGVPNSSLSAASGYAEESQLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVEGKKIILVDDSIVRGTTIKRIVKMLKDSGAKEVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEICDHIGADSLAYLSVDGLIEAIGLDYDAPYSGLCLESFTGDYPAGLYDYEENYFKHLSPRQKAYIENHQHYYDREGNKNV |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
1715559 : 1733413
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP041726|1715559:1733413|DBSCAN-SWA 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15 | uncultured_Caudovirales_phage(58.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
1747935 : 1754556
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP041726|1747935:1754556|DBSCAN-SWA 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CACTTTGATTGTCCCGCTTCACGTTCTACATTTTTATATGAAAAGACTTTTGTATTATAACCAATCCAAGCAAATAATCCTTTTGAAAAACGATTGTTCTCTTGCAACTTAGCAATTGCACACACAGCTCGTTGACTCAACAATCTAAAATCTCCTACCCCATCGACAAACTGGACATCTTCAACAAATGCATTAATCAATTTATAATACATCTTTGTCACTATTTTACGTGATAGCTGTTCGCCTTCTCTATCACGTTGGGCAATGACTTGATCATAACCCTCTAGATAACCATCAATCATATTGGGTATAAATTCAGGAGGATGCTGTAAATCACCATCTATCATAATGACAGCGTCTACATCAACACTATGGTGAAAACCTGCAATCATCGCTGATTCTTTACCAAAATTCCTACTAAATGAAATAAACTTTACGTGTTTATCTTCTAACGACAATTGCTGTATGTGTTGAATCGTACTATCTTTGCTACCATCATCAATAAATAATAAATCATAGTCATAATTTTTTTCGTTACTGTCTTTCAACATAATTTCAGTCAATCGCTCATATGTTTTTAATACGACTTCTCCTTCGTTATAACAGGGGACAATGACTCTGATTTTCATCCGATTACTTCCTTTACTTATTTCTTAATACTATTTTATCAATTTATTCATAAAACGCGCTAGTATCGTTCTTTAATTTTACAAAAAATTAATAAAGTTGCAAGCGAACTAGTTTTTAAAGCTATTTTATTTTTTTAAGTAGGCTTATCATTTGTACTATTTTAAATCGCCAATGCTAACATCATCAGGATCTTTCCCTTGTCTTGCATTGCGATTCAAACTATCAATTTCTGCAATTTCAGCTAATTCCAAATTAAAATTAAATAAATCGAAATTTTCTTTAATTCGTGAAGGTGTCTGAGACTTAGGTATAATGATACGATTATGTGCTAAGTGCCAACGCAACACGATTTGAGCCGGTGTCTTGTCGTGTTGTTGGGCAATATGTTGAATTGTTGAATCATCTAATAATCCGCGATTGCGCATTAATGGCATCCATGCCGTTACAGTAATATCGTGTTTATCGCAAAAGTCTTGAACATCCTGTTGATTAAAGTAAGGATGCAATTCAATTTGGTTAATTTGTGGAACGATATTGGTTTCTTGCATTAATTTTTCCAAGTGATGAATTTTAAAATTACATACGCCAATCGCTTTTACTTTACCTTCATGATATAAATCCTCTAGTGCTTTATATGTTTCAATATATCGTCCATTCTGTTCACATGGCCAATGAATCAAGAATAAATCAAAATAATCAAGACCCATGTTATCTAAAGAACGTTGGAAATAGGCTTTCGTCTGTTCATAACCTTGATGATCATTCCATACCTTAGACGTGATAAACAATTCTTCACGTGGCACACCACTGTTCTTTAAAGCCTGTCCTAATGATGCCTCATTGCCATAAAAATATGCAGTATCAAATGCACGATAGCCGGTTTCTATAGCTTGTTGAATGACTTTCGGCATATCTTCATCAGTGATTTTATAAACACCAAAACCTACTTTGGGCATAGGATAGCCATTATTTAATAATTGCGTATCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP041726|1747935:1754556|1751909_1752500_+|WP_002459767.1|DBSCAN-SWA MIIYVLLNIAVVLAIVGFDLYRQQYKQLKFSSLLLAIVINTTINMFIIQKYNFISTYTTALLIIWLLLQLYVNYKVHPFVINNQKFLASIFAIILSLSAFIMDISSDQSVYMSIPYLSPAIFLIGAIILFTGTFKSTERNRLPLFKRIQAPIMIGTIIIALSFVVMMMLTPFWYIFLGIYVLFIAFIIWQKVFQHY >NZ_CP041726|1747935:1754556|1751094_1751811_+|WP_002459766.1|DBSCAN-SWA MAAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKDQIQLMSATEIYEKLIEIGGDCFDHVTISGGNPALIKGIQDLVDLFETEHIATALETQGSKFQPWMTQINDLTISPKPPSSSMTPNLEVLDQVIAQCVPQSLNLKVVVFDDEDYAFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLADDVANHTEKLLSRYEQLVEKVMHSNDMNRAYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP041726|1747935:1754556|1752540_1753563_-|WP_070647844.1|DBSCAN-SWA MKIRVIVPCYNEGEVVLKTYERLTEIMLKDSNEKNYDYDLLFIDDGSKDSTIQHIQQLSLEDKHVKFISFSRNFGKESAMIAGFHHSVDVDAVIMIDGDLQHPPEFIPNMIDGYLEGYDQVIAQRDREGEQLSRKIVTKMYYKLINAFVEDVQFVDGVGDFRLLSQRAVCAIAKLQENNRFSKGLFAWIGYNTKVFSYKNVEREAGQSKWNFRKLFNYGIDGLISFNSKPLRTMIYFGLFIFAISLIYIIYLSIGIIVNGISNPGYFTTIAAILLLGGIQLISIGVVGEYIGRIYYEVKQRPKYIVQASNLTYENGHSPNAYQCNINHEHTVKDKEKEHI >NZ_CP041726|1747935:1754556|1753719_1754556_-|WP_002479368.1|DBSCAN-SWA MNDTQLLNNGYPMPKVGFGVYKITDEDMPKVIQQAIETGYRAFDTAYFYGNEASLGQALKNSGVPREELFITSKVWNDHQGYEQTKAYFQRSLDNMGLDYFDLFLIHWPCEQNGRYIETYKALEDLYHEGKVKAIGVCNFKIHHLEKLMQETNIVPQINQIELHPYFNQQDVQDFCDKHDITVTAWMPLMRNRGLLDDSTIQHIAQQHDKTPAQIVLRWHLAHNRIIIPKSQTPSRIKENFDLFNFNLELAEIAEIDSLNRNARQGKDPDDVSIGDLK >NZ_CP041726|1747935:1754556|1750675_1751095_+|WP_002459765.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSVSHPYQFELNKDFNFSAAHFIPCKDAGKCVRTHGHTYFVNLTIAGDTLDHNGFLINFQELKALIHDQFDHYLLNDLPHFKDQSPSTEIVAQTIYNMIENHLMQYTNRPHCVQVYLRETPTSYVVYRPKVQH >NZ_CP041726|1747935:1754556|1750002_1750674_+|WP_002459764.1|DBSCAN-SWA MTETTLNNNKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFDEVELVTFNYGQRHNTEIEVAKSIAHEQGLAHHILDMSLLSQLTPNALTQHDMKIETNDDGMPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQLNAKHIITGVCETDFSGYPDCRDNFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAQTWALSDELGVLDYIRHQTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRARGLQQYLNSKGAK >NZ_CP041726|1747935:1754556|1749070_1749667_-|WP_002479366.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYFKTVTDIEIIVYRINQVTIQSLQQLNPSALVISPGPGKPSDYPIIAQIIAAFKKRIPILGVCLGFQCIYDYFGGRIIHGKRPVHGHTTKLNHNNKGIFAQLPQHFEVMRYHSLIAERQSLPAQLEISAENDEGIIMAVQHRQWPIYAVQYHPESILSEHGHAQIELFIKTLGVNQCDNTI >NZ_CP041726|1747935:1754556|1747935_1749087_-|WP_002459762.1|DBSCAN-SWA MTIQFNYRYYLDDSRYETHQLKLTERLGQYLAYEMKDVGDVINFAEQQQKEGKYVALYMTYEAAQYFNPDMAVHPTADDAILAAAYSYQSAQPIQQETSIKHYNNKPQHQFAFQVKEATMIQHIKAVQAAIIDGETYQVNYTTRVSSPVQMPIKDLYDKLTQTKNGNYTMLMDTEDVQVASISPELFFQKGPFDGQDNVVVSKPMKGTMPRSDVKQQDQYNYKYLQQSLKDRAENVMIVDLLRNDIARIARKGTVHVYRPFFIETYATVYQMTSMVAGQLSNATLPLATLFHALFPCGSITGAPKLNTMSYIHKLEDQPRYIYCGTLGILMPDDKMIFNVPIRTIEYRDNKAIYGVGAGITIDSDPENEVQEFRDKAKILEML |
8 | Pandoravirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
1836064 : 1900100
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP041726|1836064:1900100|DBSCAN-SWA CTTATAAATTCAATGCAATCACTGTTTGATTTTTCTCAATTTTCTTAATGCCAATAAACTTCATTGTTTCTTGCGTCGTCTGGTGACCTAAATATTTTTGTATTATCGAAATTGAAATACCCGATTCATAGGCATGATATGCAAATGTTTTGCGCAAAGTTGTTAATCCTATATGTAAAATACCTAATTCTTCTGCTGCTTGATGAATAATTCTATAGGCCTGCTGTCTTGAAAGCGCCTGATGTGTACGTATTGATTGGAATAATAATTGCTGATTAGCCAATTGATAGTCATCAATATAATCTGTCAGTTCTTGACGTAATGTTTCAGGCAACTTAATCTTAATTGACGGTACTGTGTTTTCAATCCAAGCTGTTTTAATATTCCCTCTTTGCGGATTTTTAATATCTTTCACTTCTAATTTTAATAAGTCTGTCAATCTAATGCCGGTATGAATTGCTAATTTGAAAAATAAATAATCTCGCTTAGATTTCATGCTAAGCACTTGATACATACGCTTAATATCTTCTTTATTTCTAATAGGTTCTACTTGATTCATTTGGCCACCTCATAATTGTTTCTCATTTAATAATAATACATATTTAAGTTACATAAAAGAATTATGCTTATATATTCAAATTCATTTGGCTCTTTTGATAATGCGCAACGATATATAAAGTGTAAGGAGGTGAAAATAATGAATCAAATCAATCAACTGACTGTTCAGCTTACTGAAATCAAACTTAATGATGCAGGTAAAGCACAAGAACAAAAACGACGCTTTGCAAAACTGAATCCACAAGCCACTGCAGACCAAATCAAATCATTTTCTCAAATTATAAGTCAACTTACTGGTTTAAAATTTGATAAAGTGGAAGCGATTAAAACTGAAGAAATTGTATAATAAGGAGGACATATCATGCCAAAAACTCTAGAATTAGTATTTAAAACGGCTGATAATAAAAATGCTAGACTGCAAGTTCCAAATATCGTTGCAACAACCGATGCAGATCATGTTAAAGAAGCCATGAATAACTTAATTGCATTGAAAATTTTAAATCCAACAACTGGTTTACCAGTTAAAGCTATTGCGGCTTATCTCATTGACAAATCAACAACTGCCATTTTTGAAGAAAAGTAACTTGTTCATACTAATATCCATAGCAATTGATTATTATTAACCATTTTTGACGGAGTCTGGGGCATCATTATTTTTCAGGCTCTGAACTCTATATTGATGGTAGTTAACTGGATTGAAAATACGCTTACACCAAGCTTTTCAATCCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACTACGAATTCACAATGAATTCTGTCCCGCCCCCTATCTATTTTTTAACAACTATCTTTTATCGTACTTTTATTTCAGCTATAATAAGGCCAATCACTTATTTTAAAGAAAGCGTGTTTACTTATGATATTACTATTTATATTCGGTCTTATTGCCGGTATGGTCGTACCTATTCAAACGTCAATTAATTCAAGGCTAAGCTATTATACGAAGTCATCATTTTATGCATCGACCATTTCCTTTTTCACCGGAACACTTTTTTTAGTTGTGCTTAATTTAATATTCAATCCACAGCTACTACATATCATACATACTCAACAAACTTCTTTTAATTACACATGGTTTGTAGGTGGTTTACTTGGCGTTTGTTTTCTAACAGGTAACTTACTGTTATTACCACGACTGGGTGCTGCTTTGACAGTTGTCATGACCGTAACTGGGCAAATTTTCATGGGGGTAATTATCGATACCTTTGGCATACTTGGAGCTCAGCAACATACGTTCACTACGCTCAAAGCTTTAGGTACATGTTGTTTGCTTTTAGGAATTATTTTAATGAACTATTTGCCGAAATCAAAGTTGACTGAAACCAAACAGCCACGTTTTTATTTATGGCTTATCATTGGTCTCATTTTTGGTTTTGCACCCCCGTTACAAACAACAATTAATAGTTCGCTAGCCCAACAAGTGCATTCCTCCCTTTTTGCATCTCTAGTGTCTTTTAGTGTTGGAACAATGGCTTTATTCATCTTAACATTATTATTTCATCGTAATTTACGTCTTGAGCGTTACCATGAAACGCAAGGAGCATTGCATCCGATACATTTTATCGGAGGTCTGCTAGGCGTAGCATTTGTCACTGCAAACATTGTCCTAATGCCTCATTTAGGTGCAGCTTTAACTACGATTATAGGTATGTTAGGTCAAATGCTTATGGGTGTTATTATTGATCATTTCGGTTTATTGGGGACACCTCAAAATCGTATCACTATAAGAAAAACATTCGGTCTTATCGCCATTGCTTTAGGGATTATTTTGCTGCGGCTTTTTTAATAGACATTTGTCTTGTCTCAAGCCTTAGAACGTGAAATCATTTAATATCGTTCTGAGGCTTTCAATATAGCCAAAATATTGTATAATATTTTTATAAAATAACCCCGAGGTGATTTAACTTGCCCACAATATTCAAACATCGTTTTATTTTCCCCTTACTCCTACTATTAATTGTTCTAGCTATTTGCCTGATGGTTTATCACACGTATTTTAATCAACCTAAATCTTCCCCAACTTTAATAACCGTGAAACCATACCAATCAGCCTCATTTACCGCTATGGAACAACCTAAATCCTTTTATGAATTACGTTATCACTCAAGCTATGGCTATATAGATCATATTTATGTCAAAAATCAGCAACTCATCCAAAAACAGACACCTTTATTAACTTACTATAATCCTCAATTAGAACCCCTTATTCTTGCACAAAAGAAATTGCTTACTCAAATTAATCATTCAAACGTTTCTAACACATTTAAAGATCAAGCCCGTTTAAAATTTATTAGTGATATTGCAGTTGAACAAAATCATTTAGTAACACGTTTAACTTCTCCAATCAAGGGGTATGTTTTGATAAACAACACGACGCCCTCAAAAGAAAATGATATTATCTTAACGATTACAAGTGAAGAGCATATCATCGTTGGAGATTTACCAGAAACATTCCGCAATAAATTTAAAATAGATGAAGAAGTTACATTACTAACCAGCAATAATCAACAATTTTATGGCAAAATCAATAGTATTTCTCCAATTCCTAAGGCATATCATACAAAAAATTCTGTTTATCGCGTTATAATAAAATCTGATAAAAATTGTCCTCTTGGCACACACATTAAAGTTGCACCGTACCACACAACTTTTGAACTACCACAGTCAGTATTAATTCAAAAAGATTGCGTTTTGATTTCAAAAAATAACAAATTAATTAAAAGAGAAGTAAAATACACTAAGAGTTCAAAAAAAGGGTATATTATTATAACGCAAGGTTTAAATATTAATGACCGCGTTGTAAGACATCCTGAAGCCAAAGATATTTATGATTGAGCACACTTAATGACACTTAACTAATTTTTTTATATAATGAGACTAAACTAAATTACGCCGACATTAATTTGTAATATGAAAATTCTGTTAAATAAAAACTAACTTATCTCAAAACAATATTTTGTTTTATTAAGTGTTTTTATGTTTACTTTTTATTTTTATTTAGTTATAATTAACTAAATAATATAGCATTAAGTGCATTTAAATAAGTTTTATTGACTTCAAACTATCCATAGGCAACGCTTTAATTTTTTTATAAATCTGTATGATTATTAAATTGGGTACGGTGTCTTATAGTAAATGAGGAAATATATTGGGGAGGTTTCACATATGGCAGTTTCAAAAATCAATGATTGCTTTGAATTATTAGCGATGGTTACTTATGCTGACAAATTGAAAGGTATTATAAAGAAAGAATTCTCAATTAGTTTTGAAGAATTCGCAGTTTTAACATATATCAGTCAAAATAAAGAGGATAAATATTATTTGAAAGATATTATTAATCATTTAAATTACAAACAACCACAAGTTGTTAAAGCTGTTAAAAATTTGTCTCAAGAAAACTATTTCGATAAAAGACGTAACGAACATGATGAAAGAACTGTATTAATTTTTGTTAATGCAACACAACGCAAAAAAATCGACAAGCTATTAGAGCAAGTAAACAACCGTATTACAGAAGCAAATAAAGATGCATAAGTCAGCACATAATAATGCAATATTATTGCATAAACGCGATCAGCTATAAGCTAATCGCGTTTTTTATTGACTAGAAAATGAGTGTAATAACAAACTTATTCTAGTTTTACTAATAGTATGATCAAAACACATTTCACTACACAAATTAAGCCATTAAAAACATATTTGTCCATAATCTTTTACTATAGACTATTAAATTTCAATAGATCTCAATCTCGCTTATTATCATGTTAAGAATGACTTGCATCAATAAACTGAGTTAAAAATGACAAAAAGTGATCAGGTTCTTCAATGTGTGGTGCATGTCCTGAGTATTCAAACAACTCCTTTTGGACACGCGTAAAATGGTTATCAATATCATCGTCACTAATTAATGGATCATATTTGCCATCAATAACCAATGTTGGCACATGTATAGTCGCTGGTTGTTCAGCTTGACTATTGCTTATTGAATATAATGCTCTACTGGCAGTCGCATTGTCTTCTGACGTAGCCTTATGATATAAATATTGTGCTTGGAACCATTTCATTGCCCGACTTTGTTCCTTGAAAATGTAAGGAAATAATATCAAAATAGCCTCTGAACGATTGAAACCTTGAATCTCTTCTTGATGCTCAATCATCAACTGTGTAAAACCATGGACGACGGCCTTACGTTTAGAAGAAATCAACGTTAAAGACAACACTCGGCTAGGATATTGTTCAGTAAATTCACGTGCAACCATGCCCCCCATCTCATGGCCGACTAAATGAGCCGTACAGATTCCCAAATGACGCATGATTGCTTTTAAATCCCCAATATGGTCAGATAAGTGATACACATCTGGTCTCGAAGACTTACCATGACCACGTAAATCATATGTAATAACTCGATACTGTGTTTTTAACTCT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75 | Staphylococcus_phage(52.38%) | holin,capsid,tRNA,portal,tail,head,integrase,terminase | attL 1835678:1835699|attR 1858673:1858694 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
2111335 : 2128427
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP041726|2111335:2128427|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP041726|2111335:2128427|2122251_2122431_-|WP_060795430.1|DBSCAN-SWA MKIYIELVVIIVITLLVAATVNFYSGMATYLVGVTYLFITKYCVTGLEETEDQESYEKN >NZ_CP041726|2111335:2128427|2122441_2122645_-|WP_060795468.1|DBSCAN-SWA MTKVDLNKQNVINAVRWIIRNQESIIFNRQHELSFFSKEDLEHINYCRMVLDSLIESKHIYDKQKIS >NZ_CP041726|2111335:2128427|2125954_2126197_-|WP_002461103.1|DBSCAN-SWA MAGGPRRGGRRRKKVCYFTANGITHIDYKDTELLKRFISERGKILPRRVTGTSAKYQRMLTTAIKRARHMALLPYVKEEN >NZ_CP041726|2111335:2128427|2115981_2116572_-|WP_060795417.1|DBSCAN-SWA MKTEKYFNEYNEYVTGQNVSINELEKEKHELKLKIDDDKAKYKELVANAEDDKADELYSTFDINEKKLKALNKRLETKKEVFQEAKRKKAIELIKYQADLPNLYQNVKDELISKIKAITEEYNKVIDEIDEINNKYDDEFNRFVGVYDRLELYDDEEAKKELRNYYRSDKVNEYINGSDLPYEYRKKLVFRGANNE >NZ_CP041726|2111335:2128427|2127388_2128174_+|WP_002479241.1|DBSCAN-SWA 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24 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | integrase,terminase | attL 2122512:2122527|attR 2132432:2132447 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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